CN104762228B - 一种源于象草的巨大芽孢杆菌及其用途 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种源于象草的巨大芽孢杆菌及其用途,属于应用微生物技术领域。所述菌为象草内生菌巨大芽孢杆菌pp02,分类名为巨大芽孢杆菌pp02(Bacillus megaterium pp02),于2014年7月4号在中国微生物保藏中心保藏,保藏号CGMCC 9415;该菌株具有产铁载体、固氮、产IAA的特性,IAA产量达10.57μg/mL,且在植物根部定殖能力强,耐盐能力强,在5%NaCl(50g/L)培养基中能生长,是一种优良的植物促生内生菌菌株;利用该菌株侵染杂交狼尾草,能显著提高植株的耐盐能力,促进其生长,植株地上部鲜重、干重、植株高度显著增加;该菌株的发现对于杂交狼尾草微生物肥料研制,促进其在盐碱边际土地植物的生长发育有重要的开发应用前景。
Description
技术领域
本发明涉及一种源于象草的巨大芽孢杆菌及其用途,属于应用微生物技术领域。
背景技术
近年来,随着生物质能源产业的兴起,象草(Pennisetum purpureum schum.)及杂交狼尾草因其生物量大,再生能力强,纤维素、半纤维素含量高,生态适应性强等特性,发展为一种新型的能源植物。我国具有沿海滩涂、盐碱地、荒地、贫瘠地等大面积的宜能边际性土地,目前生物质生产潜力超过2亿吨标准煤。在宜能边际性土地种植象草、杂交狼尾草等能源草,开发生物质能源,符合我国“不与粮争地,不与人争粮”的能源发展目标。但是这些区域生产条件较差,缺乏灌溉保障,盐碱危害严重,严重影响象草、杂交狼尾草等能源草的生物质产量。
植物促生内生菌(Plant Growth-Promoting bacteria endophyte, PGPE)是指一类能够定殖在植物体内,并与植物体形成特异的共生关系,并因此对双方都有益处的细菌。植物促生内生菌可以通过固氮作用、分泌植物生长调节物质、合成铁载体及抑制一些疾病的发生等方式促进植物的生长,此外,它们还具有促进土壤中营养物质的循环、调节土壤结构、对污染的土壤进行生物修复等作用。研究与开发优良高效的植物促生菌(PlantGrowth-Promoting Rhizobacteria , PGPR)生物肥料,对提高土壤中营养物质的利用率、减少农药和化肥的施用、促进植物的生长发育、增强植物对逆境的适应性及耐受性受有重要作用。
所以,研究与开发优良高效的象草促生菌生物肥料,对增强象草、杂交狼尾草的抗性,促进植株生长发育,提高其在沿海滩涂、盐碱地等边际性土地产量有重要意义。但目前促生长植物内生细菌主要是来自水稻、玉米、小麦、甘庶、苹果、柑橘、高丛蓝莓、桑葚、杏,还没有来源于象草的促生长内生菌的报道((1) Kloepper, J.W. 1994. Plant growthpromoting bacteria (other systems). In: Okon, J. (Ed.), Azospirillum/PlantAssociation. CRC Press, Boca Raton, pp. 137–154.;(2) De Silva, A., Petterson,K., Rothrock, C., Moore, J. Growth promotion of high bush blue berry byfungal and bacterial inoculants. 2000. HortScience 35, 1228–1230.;(3)Sudhakar, P., Chattopadhyay, G.N., Gangwar, S.K., Ghosh, J.K. Effect offoliar application of Azotobacter, Azospirillum and Beijerinckia on leafyield and quality of mulberry (Morus alba),2000, J. Agric. Sci. 134, 227–234.;(4) Esitken, A., Karlidag, H., Ercisli, S., Sahin, F. Effects of foliarapplication of Bacillus substilis Osu-142 on the yield, growth and control ofshot-hole disease (Coryneum blight) of apricot, 2002, Gartenbauwissenschaft 67, 139–142;(5) Esitken, A., Karlidag, H., Ercisli, S., Turan, M., Sahin, F.The effect of spraying a growth promoting bacterium on the yield, growth andnutrient element composition of leaves of apricot (Prunus armeniaca L. cv.Hacihaliloglu), 2003, Aus. J. Agric. Res. 54, 377–380.)。本发明提供的巨大芽孢杆菌pp02,是从象草中筛选的优良促生内生菌菌株,能更有效地增强杂交狼尾草的耐盐能力,显著提高杂交狼尾草苗期的产量,对其在边际性土地的种植有重要应用价值。
发明内容
本发明的目的在于提供一种象草巨大芽孢杆菌,该菌株具有产铁载体、固氮、产IAA的特性,IAA产量达10.57μg/mL,且在植物根部定殖能力强,耐盐能力强,在5% NaCl(50g/L)培养基中能生长,是一种优良的植物促生内生菌菌株。能促进盐胁迫下的杂交狼尾草苗的生长,对杂交狼尾草作为能源草在盐碱性边际土地上的推广种植有重要意义。
为了实现以上目的,本发明提供的技术方案是:
本发明提供一种象草内生菌,该菌是从象草植株中分离到的一株内生菌,经传统方法及分子鉴定表明它属于巨大芽孢杆菌,命名为巨大芽孢杆菌 pp02 (Bacillus sp. pp02 ),已于2014年7月4号在中国微生物保藏中心保藏,保藏号CGMCC 9415。
本发明的象草内生菌巨大芽孢杆菌 pp02,具有如下生物学特征:
1.菌落形态特征:在LB固体培养基上生长良好,菌落较大而且厚,呈圆形,白色不透
明,表面较干燥有褶皱,边缘不整齐;
2.菌体形态特征:杆状,末端圆,单个或成对排列,0.75~1μm×2.75~5μm,革兰氏阳性;
3.部分生理生化特征:可在LB培养基上良好生长,最适生长温度28℃,最适生长pH7.0;
4. 遗传学特征:根据《常见细菌***鉴定手册》(东秀珠,蔡妙英,科学出版社,2001),
本发明的巨大芽孢杆菌CGMCC 9415形态特征与芽孢杆菌属最接近,经16S rRNA通用引物27F和534R进行PCR 扩增部分基因序列(496bp)已向美国国家生物技术信息中心(NCBI)的Genbank基因序列数据库提交,登录号为KM886123。该巨大芽孢杆菌CGMCC 941516S rDNA序列分析表明,与Genbank国际数据库中记录的最相似的菌株Bacillus megaterium DSM319 (NC014103.1)的相似性为99%。因此,该该巨大芽孢杆菌CGMCC 9415应属于巨大芽孢杆菌属(Bacillus sp.)。
本发明的象草内生菌巨大芽孢杆菌pp02,是按如下方法从象草中分离培养得到的:
(1)取自江苏省农科院试验田的象草苏牧2号,取根部经表面消毒杀灭供试材料表面微生物,加适量石英砂研磨,加无菌水混匀,100μL涂布于LB固体培养基上,28℃,培养48h;
(2)挑取单菌落在LB固体培养基上反复划线纯化,直到得到纯系菌株为止;
(3)将纯系菌株接种于LB液体培养基中,28℃培养18h,取菌液700μL加入质量浓度为50%的甘油300μL,混合后置于-70℃冰柜中冷冻保存;
(4)将所得的纯系菌株,通过杂交狼尾草苗接种试验验证其促生长活性后,鉴定,并保存菌种,其中一株分离纯化所得的内生细菌命名为pp02。
本发明的另一目的是提供该象草内生菌巨大芽孢杆菌pp02的应用。
所述的内生菌用于促进植物的生长,可以通过以下方法验证:
将杂交狼尾草种子消毒,置于1/2 MS 培养基,25℃,暗培养48小时催芽,将催芽后的种子播种于装满蛭石的盆钵中,苗长至10天左右,用pp02发酵原液灌根,侵染3天后,开始并每隔四天浇6mg/mL盐水,20天后测量苗高并称鲜重。
所述的内生菌能在植物体内定殖,是按如下方法进行验证:
取上述灌根侵染巨大芽孢杆菌pp02 3天的杂交狼尾草苗的根,经表面消毒,石英砂研磨,加无菌水混匀,100μL涂布于LB固体培养基上,30℃,培养 48h,观察菌落生长情况,并随机挑取3个单克隆,摇菌,经16SrDNA测序对菌株进行分子鉴定,以未侵染的杂交狼尾草苗根作为对照。结果表明,巨大芽孢杆菌pp02成功侵染到杂交狼尾草根内,LB固体培养基上观察到菌落长出,测序结果也证明了其是巨大芽孢杆菌pp02。
本发明对所述象草内生巨大芽孢杆菌PP02,具有固氮、产铁载体、分泌植吲哚乙酸(IAA)等促生特性,其产IAA的量达10.57μg/mL;侵染定殖能力强,接种试验证明灌根处理三天,该巨大芽孢杆菌pp02 就能够在植物体内定殖,侵染效率为4.9cfu/g植物根鲜重;耐盐能力强,在5%NaCl (50g/L) 培养基中能生长。巨大芽孢杆菌pp02菌株对杂交狼尾草苗灌根处理,植株地上部鲜重质量相对未接种的阴性对照组增加74.01%;干重质量相对未接种的阴性对照组增加45.70%;植株高度相对未接种的阴性对照组增30.92%。这表明巨大芽孢杆菌pp02较高的促生能力,并且在植物体内定殖能力强,可在植物生长过程中为其体输送必要的生长素、氮、铁等营养元素,增强对盐胁迫抗性能力,促生植物的生长发育。
本发明的有益效果:与现有的技术相比,本发明对提供的巨大芽孢杆菌PP02,是专一地针对象草、杂交狼尾草筛选的促生内生菌菌株;具有固氮、产铁载体能力,有效改善土壤中有效氮、铁元素的含量;分泌吲哚乙酸(IAA),产量达10.57μg/mL,能增强植物对盐胁迫的抗性,促生植物的生长发育,显著提高杂交狼尾草苗期的生物质产量;该菌株耐盐能力强,在植物体内侵染定殖能力强,是一株优良的促生内生菌菌株,为杂交狼尾草生物肥料的开发奠定了基础,有良好的应用前景。
附图说明
图1为蛭石盆栽的杂交狼尾草幼苗。其中CK表示以无菌水代替巨大芽孢杆菌(Bacillus sp.)pp02 菌液的阴性对照;
图2巨大芽孢杆菌 (Bacillus sp.) pp02 对盐胁迫下杂交狼尾草苗株高(㎝)的影响;
图3巨大芽孢杆菌 (Bacillus sp.) pp02 对盐胁迫下杂交狼尾草苗鲜重(g)的影响;
图4巨大芽孢杆菌 (Bacillus sp.) pp02 对盐胁迫下杂交狼尾草苗干重(g)的影响;
图5巨大芽孢杆菌 (Bacillus sp.) pp02 促生特性 a:分泌植物生长素IAA b:产铁载体能力c:固氮能力;
图6巨大芽孢杆菌 (Bacillus sp.) pp02定殖后根扫描电镜图 a:对照植株 b:侵染植株;
图7不同盐浓度对巨大芽孢杆菌 (Bacillus sp.) pp02生长的影响。
具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明所述的菌种的获得及用途进一步的说明。
实施例1:
巨大芽孢杆菌pp02 菌株的分离培养
本实施方式中促生植物内生巨大芽孢杆菌pp02 是从象草的根中分离到的,象草取自江苏省农科院试验田的象草苏牧2号,其分离方法如下:
(1)将象草根部用流水冲洗干净,取1g作为供试材料,依次用质量浓度为70%的酒精5分钟,无菌水冲洗3-5次,质量浓度为1%的次氯酸钠浸泡20min,杀灭供试材料表面微生物;
(2)在无菌环境中,供试材料用无菌水冲洗3次,取100μ L最后1次无菌水冲洗液涂布于LB固体培养基上培养48h,观察有无菌落产生;
(3)向供试材料加适量石英砂研磨,加5mL无菌水混匀,取100μL涂布于LB固体培养基上(胰蛋白胨10g/L,酵母提取物5g/L,氯化钠10g/L,琼脂粉15g/L),28℃,培养 48h,挑取单菌落在LB固体培养基上反复划线纯化,直到得到纯系菌株为止;
(4)将纯系菌株接种于LB液体培养基(胰蛋白胨10g/L,酵母提取物5g/L,氯化钠10g/L)中,28℃培养18h,取菌液700μL加入质量浓度为50%的甘油300μL,混合后置于-70℃冰柜中冷冻保存;将其中一株分离纯化所得的内生细菌命名为pp02 ;
其中步骤2目的是验证供试材料表面微生物是否能全部杀死,若有菌落产生,则证明材料表面微生物没有全部杀死,反之则无。
经上述方法筛选的菌株,用通用引物27F和534R PCR 扩增16S rDNA基因序列,产物送生工生物工程(上海)股份有限公司测序,测序结果在Genbank国际数据库中blast分析,Bacillus megaterium DSM319 (NC014103.1)的相似性为99%。结合该菌的菌落特征,该巨大芽孢杆菌pp02应属于巨大芽孢杆菌属(Bacillus sp.)。于2014年7月4号在中国微生物保藏中心保藏,保藏号CGMCC 9415。
实施例2:
巨大芽孢杆菌pp02的培养制种方法,按照以下步骤进行:
(1)取-70℃冷冻保存的巨大芽孢杆菌CGMCC 9415菌液,划线接种于LB固体培养基上,
28℃恒温箱中培养18~20h,挑取单菌落接种于5mL的LB液体培养基中,28℃震荡培养18〜20h,得活化菌液;
(2)将1mL 活化菌液接种于装有100mL LB液体培养基的500mlL三角瓶中,28℃,150
〜250r/min振荡培养12h〜16h,得到OD约为1的处于对数生长期的发酵液;
实施例3:
巨大芽孢杆菌pp02 对植物促生作用的试验:
为保证实验材料的均一性,本发明的下述实验均以杂交狼尾草种子为实验对象。
(1)杂交狼尾草种子的消毒过程为:用质量浓度为70%的酒精5分钟,无菌水冲洗3-5次,质量浓度为10%的双氧水浸泡30min,无菌水冲洗5次;
(2)杂交狼尾草种子的催芽:消毒后的种子然后置于1/2 MS 培养基,25℃,暗培养48小时催芽;
(3)杂交狼尾草幼芽的移植:将催芽的棉花种子播种于装有50g灭菌蛭石(121℃,2h)的温室盆钵中,每盆5棵苗,每个处理设置5盆重复;
(4)杂交狼尾草苗的侵染:苗长至10天左右,用巨大芽孢杆菌pp02发酵原液灌根侵染,具体操作为:向每盆杂交狼尾草苗基部加入50mL巨大芽孢杆菌pp02发酵原液,3天后开始盐胁迫处理,即向每盆杂交狼尾草苗基部浇50mL 6㎎/mL的NaCl溶液(无菌水配置),将上述无菌水代替发酵菌液,其余处理相同,作为空白对照。
(5)杂交狼尾草苗的培养:将上述实验组与对照组放置在28℃,光照培养(光循环:16小时光照,8小时黑暗),光照强度:10000Ix,20天后测量苗高并称鲜重。
试验结果表明该菌株对胁迫下的杂交狼尾草苗具有明显的促生长作用(图1),实验组的杂交狼尾草苗生长状态明显好于对照组,实验组株高比对照照增长30.92%(图2),鲜重及干重比对照增长74.01%(图3),45.7%(图4)。
实施例4:
巨大芽孢杆菌 pp02 促生特性的检测:
1. 分泌植物生长激素(IAA)能力检测
(1)根据参考文献(Sheng XF,Xia JJ, Liang CY, He LY, Qian M.Characterization of heavy metal-resistant endophytic bacteria from rape(Brassica napus) roots and their potential in promoting the growth and leadaccumulation of rape, 2008, Envrionmental pollution, 156:1164~1170)所述的Salkowski 比色法测定巨大芽孢杆菌pp02分泌植物生长激素(IAA)能力。
将活化的巨大芽孢杆菌 (Bacillus sp.)pp02菌液接种于终浓度为0.5mg/ml的SMS培养基中,28℃摇床,180rpm 震荡培养4d。取1mL菌悬液(发酵液)加入2ml的Salkowski’s显色剂充分混合,在室温下反应20min,出现粉红色的为阳性,说明此菌株能够产生IAA,而且红色越深说明产IAA的能力越强。将加入1mL 50mg/L IAA的比色液作为对照。实验设三次重复。
SMS培养基配方为:蔗糖10g、(NH4)2SO4 1g、K2HPO4 2g、MgSO4 0.5g、NaCl 0.1g、酵母粉0.5g、CaCO3 0.5g,调节pH为7.2。
Salkowski’s显色剂:250mL去离子水、150mL浓硫酸、7.5mL 0.5mol/L的FeCl3•H2O。
结果显示,在巨大芽孢杆菌 (Bacillus sp.)pp02菌悬液滴加Salkowski比色液后,菌液颜色变红,表明巨大芽孢杆菌 (Bacillus sp.)pp02 能够分泌植物生长激素(IAA)(图5 a)。
(2)产吲哚乙酸(IAA)的定量检测
将活化的巨大芽孢杆菌pp02菌株在King培养基中培养4d,将菌悬液在10000rpm下离心10min,取上清,在PC比色液中各等体积加入1mLl上清液,在黑暗中静30min,取出后在OD530nm下测定采用纯 3-IAA(3-吲哚乙酸)制作标准曲线计算IAA产量,以不接菌的培养基作为对照调零。试验重复三次。
King 培养基组分:蛋白胨20g, K2HPO4 1.15g,MgSO4.7H2O 1.5g,丙三醇15mL,L-色氨酸0.5g。
PC比色液的组成:FeCl3 12g,7.9M H2SO41L。
结果表明,巨大芽孢杆菌 (Bacillus sp.)pp02 分泌吲哚乙酸(IAA),产量达10.57μg/mL。
2、产铁载体能力检测
根据参考文献(Vendan, Regupathy Thamizh; Yu, Young Joon; Lee, Sun Hee;Rhee, Young Ha. Isolation and characterization of plant growth promotingendophytic diazotrophic bacteria from Korean rice cultivars. The Journal ofMicrobiology48.5,(Oct2010):559-65.)所述:将四种溶液混合均匀后,制成铁载体检测平板。将活化的菌种点接在铁载体检测培养基上,在28℃下倒置培养,观察平板上的颜色变化,若平板上菌落周围产生了橙色圈就证明产生了铁载体。
四种溶液的配方为:
溶液一:60.5 mg CAS溶解于50 mL水,10 mL三价铁溶液(1mM FeCl3•6H2O,10 mMHCl),两者混合均匀,将72.9 mg HDTMA(十六烷基三甲基溴化铵)溶解于40 mL水中,然后缓慢搅拌加入以上混合溶液中,将上述深蓝色混合溶液在121℃下高压蒸汽灭菌20min,冷却至50℃。
溶液二:将0.3 g KH2PO4,0.5 gNaCl及1.0 g NH4Cl溶解于750mL水中,再加入30.24 g PIPES(哌嗪-1,4-二乙磺酸)于以上盐溶液中,用50% (w/w) KOH溶液调节pH至6.8,加入15g琼脂粉,在121℃下高压蒸汽灭菌20min,冷却至50℃。
溶液三:100mL15× KB培养基(蛋白胨3.2g,K2HPO4 0.115g,MgSO4·7H2O 0.15 g,丙三醇1.5g)与70mL含有2 g葡萄糖、2 g甘露醇、439 mg MgSO4•7H2O、11 mg CaCl2、1.17mgMnSO4•H2O、1.4mgH3BO3、0.04mgCuSO4•5H2O、1.2mgZnSO4•7H2O、1.0mg Na2MoO4•2H2O的溶液混合,在121℃下高压蒸汽灭菌20min,冷却至50℃。
溶液四:30mL 10%的酪蛋白氨基酸溶液,过滤除菌。
结果显示,巨大芽孢杆菌(Bacillus sp.)pp02平板上的菌落周围能产生较明显的橙色圈,证明该菌能够分泌铁载体,促进植物对铁的吸收(图5 b)。
3、固氮能力检测
根据参考文献(张振粉,牧草内生枯草芽孢杆菌的功能多样性及16S rDNA鉴定[D], 2010, 兰州,甘肃农业大学)所述,用阿须贝氏(Ashby)培养基测定巨大芽孢杆菌(Bacillus sp.)pp02的固氮能力。将活化好的菌株接种到阿须贝培养基中,每个菌株3次重复,以接种无菌水为对照,在28℃下恒温培养,在第3天及第7天观察其生长状况,其明显浑浊的为阳性。
结果显示,巨大芽孢杆菌(Bacillus sp.)pp02培养管菌液明显浑浊,说明巨大芽孢杆菌(Bacillus sp.)pp02具有较强固氮能力(图5 c)。
实施例5:
巨大芽孢杆菌pp02在植物体内的定殖能力鉴定
(1)取实施例1中所述的灌根侵染巨大芽孢杆菌pp02 3天的杂交狼尾草苗的根,经表面消毒,石英砂研磨,加无菌水混匀,100μL涂布于LB固体培养基上,30℃,培养48h,观察菌落生长情况,并随机挑取3个单克隆,摇菌,经16SrDNA测序对菌株进行分子鉴定,以未侵染的杂交狼尾草苗根作为对照。
接种验证试验证明灌根处理三天,该巨大芽孢杆菌pp02就能够在植物体内定殖,侵染效率为4.9cfu/g植物根鲜重。
(2)取实施例1中所述的灌根侵染巨大芽孢杆菌pp02 3天的杂交狼尾草苗的根,洗去蛭石,然后-20℃冰箱冷冻24h,再置于冷冻干燥机中干燥,用刀片法将根纵向剖开,扫描电镜观察内生菌定殖情况,拍照。
结果表明,侵染约7天,巨大芽孢杆菌pp02已大范围定殖在根的皮层内,少数定殖到了维管束内(图6)。
实施例6:
巨大芽孢杆菌pp02的耐盐能力鉴定
(1)取-70℃冷冻保存的巨大芽孢杆菌CGMCC 9415菌液,划线接种于LB固体培养基上,28℃恒温箱中培养18〜20h,挑取单菌落接种于5mL的LB液体培养基中,28℃震荡培养18〜20h,得活化菌液;
(2)活化好的菌接种在NaCl浓度为0%、0.5%、1%、1.5%、3%、5%、7%、9%、11%的LB培养基中,培养24小时后分光光度计测定菌液OD值(OD600)。
结果显示,巨大芽孢杆菌pp02耐盐能力较强,NaCl浓度在1.5%以下时对于其生长几乎没有影响,在NaCl浓度3~5%时,pp02的生长虽然受到了部分抑制,但是仍能维持正常的生长代谢,培养24h时菌体浓度OD可达2.5左右(图7)。
以上所述仅是本发明的优选实施方式,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以做出若干改进和润饰,这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。
Claims (5)
1. 一种能促进盐胁迫条件下杂交狼尾草生长的巨大芽孢杆菌pp02 (Bacillusmegaterium pp02 ),于2014年7月4号在中国微生物保藏中心保藏,保藏号CGMCC 9415;所述巨大芽孢杆菌pp02来源于象草。
2.根据权利要求1所述的一种能促进盐胁迫条件下杂交狼尾草生长的巨大芽孢杆菌pp02,其特征在于,所述巨大芽孢杆菌pp02是按如下方法从象草中分离培养得到的:
(1)取自江苏省农科院试验田的象草苏牧2号,取根部经表面消毒杀灭供试材料表面微生物,加适量石英砂研磨,加无菌水混匀,涂布于LB固体培养基上,28℃培养 48h;
(2)挑取单菌落在LB固体培养基上反复划线纯化,直到得到纯系菌株为止;
(3)将纯系菌株接种于LB液体培养基中,28℃培养18h,取菌液加入质量浓度为50%的甘油中,混合后置于-70℃冰柜中冷冻保存;
(4)将所得的纯系菌株,通过杂交狼尾草苗接种试验验证其促生长活性后,鉴定,并保存菌种,其中一株分离纯化所得的内生细菌命名为pp02。
3.权利要求1所述的一种巨大芽孢杆菌pp02在促进盐胁迫条件下杂交狼尾草生长中的应用。
4.根据权利要求1所述的一种能促进盐胁迫条件下杂交狼尾草生长的巨大芽孢杆菌pp02,其特征在于,所述巨大芽孢杆菌pp02能在象草或杂交狼尾草体内定殖。
5.权利要求1所述的一种能促进盐胁迫条件下杂交狼尾草生长的巨大芽孢杆菌pp02,其特征在于,所述巨大芽孢杆菌pp02能够分泌植物生长激素吲哚乙酸,具有有固氮能力,并能够产铁载体。
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