CN102174420A - 生产高纯度头孢菌素c的基因工程菌及其应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了生产高纯度头孢霉素的基因工程菌及其应用。本发明所提供的基因工程菌,为将如下融合基因导入宿主菌得到的基因工程菌:序列表中序列1中第7-1194位核苷酸所示DNA片段与蛋白cefF的编码基因构成的融合基因。将所得到的的基因工程菌中的一株命名为顶头孢霉cefF基因工程菌(Acremonium chrysogenum),其保藏号为CGMCC No.4515。本发明将带有顶头孢霉菌启动子PpcbC的棒状链霉菌来源的基因cefF转入顶头孢霉菌中,使其在体内转录表达,增强DAOC羟化生成DAC这一催化反应,从而降低DAOC在终产物CPC中的含量,达到提高工业产品纯度的目的。
Description
技术领域
本发明涉及基因工程菌及其应用,特别涉及生产高纯度头孢菌素C的基因工程菌及其应用。
背景技术
头孢菌素C(Cephalosporin C,CPC)是工业生产头孢菌素的原料,头孢菌素属于β内酰胺类抗生素,是一类具有重要应用价值的广谱抗生素。头孢菌素C的工业生产菌是顶头孢霉菌(Acremonium chrysogenum)。头孢菌素C在顶头孢霉菌中的生物合成途径已经研究得十分清楚,为利用基因工程手段改造顶头孢霉菌奠定了良好基础。去乙酰氧头孢菌素C(Deacetoxycephalosporin C,DAOC)是头孢菌素C生物合成过程中的一种中间产物。在生物合成中,青霉素N(penicillin N)被由基因cefEF编码的扩环/羟化双功能酶催化,首先扩环生成DAOC,然后羟化生成DAC(Deacetylcephalosporin C)。在工业发酵生产过程当中,DAOC会累积在发酵液中,占终产物CPC总量的1%到2%之间。当CPC作为原料进入下游化学合成头孢菌素的过程中,DAOC也会相应的变成无法去除的杂质,影响到产品的纯度。
蛋白cefF的氨基酸序列如序列表中序列2所示。
发明内容
本发明的一个目的是提供顶头孢霉cefF基因工程菌(Acremonium chrysogenum),其保藏号为CGMCC No.4515。
本发明的另一个目的是提供一种基因工程菌。
本发明所提供的基因工程菌,为将如下融合基因导入宿主菌得到的基因工程菌:序列表中序列1中第7-1194位核苷酸所示DNA片段与蛋白cefF的编码基因构成的融合基因。
所述蛋白cefF的编码基因的核苷酸序列如序列表中序列1中第1203-2275位核苷酸所示;
所述宿主菌为顶头孢霉菌(Acremonium chrysogenum);
所述融合基因是通过重组表达载体导入宿主菌的。
所述重组表达载体为将所述融合基因***表达载体pAg1-H3的多克隆位点得到的重组表达载体;
所述融合基因的核苷酸序列为序列表中序列1所示。
所述顶头孢霉cefF基因工程菌或所述基因工程菌在生产头孢菌素C中的应用也属于本发明的保护范围。
本发明的又一个目的是提供含有如下融合基因的重组质粒:序列表中序列1中第7-1194位核苷酸所示DNA片段与蛋白cefF的编码基因构成的融合基因。
所述重组质粒为将所述融合基因***表达载体pAg1-H3的多克隆位点得到的重组表达载体;
所述蛋白cefF的编码基因的核苷酸序列如序列表中序列1中第1203-2275位核苷酸所示;
所述融合基因的核苷酸序列为序列表中序列1所示。
蛋白cefF或蛋白cefF的编码基因在用发酵菌制备头孢菌素C的过程中降低产物中去乙酰氧头孢菌素C的产量中的应用也属于本发明的保护范围。
所述蛋白cefF的编码基因的核苷酸序列如序列表中序列1中第1203-2275位核苷酸所示。
本发明的又一个目的是提供一种制备头孢菌素C的方法,包括如下步骤:发酵所述顶头孢霉cefF基因工程菌或所述工程菌,得到头孢菌素C。
本发明将带有顶头孢霉菌启动子PpcbC的棒状链霉菌来源的基因cefF转入顶头孢霉菌中,使其在体内转录表达,增强DAOC羟化生成DAC这一催化反应,从而降低发酵产物中DAOC的量,达到提高工业产品CPC纯度的目的。
附图说明
图1为PCR扩增PpcbC产物的琼脂糖凝胶电泳图。
图2为PCR扩增cefF产物的琼脂糖凝胶电泳图。
图3为重组质粒pAg1-H3-cefF的构建。
图4为PCR验证基因工程菌株的扩增产物琼脂糖凝胶电泳图。
图5为野生型菌株中DAOC与CPC的检测结果图。
图6为基因工程菌株中DAOC与CPC的检测结果图。
具体实施方式
下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。
下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。
实施例1、生产高纯度头孢霉素的基因工程菌及其应用
顶头孢霉(Acremonium chrysogenum)CGMCC 3.3795购自中国普通微生物保藏管理中心(CGMCC);
棒状链霉菌(Streptomyces clavuligerus)ATCC27064购自美国典型培养物保藏中心(ATCC)。
一、构建重组质粒pAg-H3-cefF
1、PCR扩增启动子PpcbC
以顶头孢霉(Acrernonium chrysogenum)CGMCC 3.3795基因组DNA为模板,对基因pcbC的启动子区设计引物对:
上游引物为:5′-GactagtGTGGATGGCACCTTTTGGG-3′,小写字母为酶切位点SpeI,
下游引物为:5′-CggcgcgccGGTGACGGTTTGTCCTGCC-3′,小写字母为酶切位点AscI。
PCR扩增得到1188bps大小DNA片段,使用SpeI和AscI双酶切,回收1.1kb片段,如图1(图1中泳道1为DNA marker,泳道2为PpcbC的PCR扩增产物)所示;并将所得到的PCR产物连接到克隆载体pEASY-Blunt(购自全式金公司)上进行测序。序列测定结果表明,PCR反应获得的片段的核苷酸序列与启动子PpcbC基因序列(genebank号为X74601.1)一致,即序列表中序列1中第7-1194位核苷酸。
2、PCR扩增基因cefF
以棒状链霉菌(Streptomyces clavuligerus)ATCC27064基因组DNA为模板,对基因cefF设计引物对:
上游引物:5′-AggcgcgccCGAAGGAGCAGGGGAACA-3′,小写字母为酶切位点AscI,
下游引物:5′-CcctgcaggCGGCTTGAATGCAACGAC-3′,小写字母为酶切位点SbfI。
PCR扩增得到1091bps大小DNA片段,使用AscI和SbfI双酶切,回收1kb片段,如图2(图2中泳道1为DNA marker,泳道2为cefF的PCR扩增产物)所示;并将所得到的PCR产物连接到克隆载体pEASY-Blunt(购自全式金公司)上进行测序。序列测定结果表明,PCR反应获得的片段的核苷酸序列为cefF基因序列,即序列表中序列1中第1203-2275位核苷酸。该基因编码的蛋白序列如序列表中序列2所示。
3、构建重组质粒pAg-H3-cefF
使用SpeI和SbfI双酶切质粒pAg1-H3(公众可从中国科学院微生物研究所获得,记载过该质粒的非专利文献是:A.Zhang et al.Efficient disruption of a polyketide synthase gene(pksl)for melanin synthesis through Agrobacterium-mediated transformation of Glarea lozoyensis Mol Gen Genomic(2003)268:645-655),回收6.4kb DNA片段,与上述两条DNA回收片段连接,方法是:将回收6.4kb的质粒DNA片段与步骤1回收的1.1kb启动子PpcbC片段以及步骤2回收的cefF基因1kb片段加入同一连接体系,使用T4DNALigase(NEB cat#M0202S),16摄氏度反应,得到重组质粒。
将重组质粒转入大肠杆菌中,卡那霉素抗性筛选,挑取阳性克隆,将阳性克隆进行液体培养,提取阳性克隆质粒进行测序验证,测序结果表明在质粒pAg1-H3的SpeI和SbffI酶切位点间***了序列表中序列1所示DNA片段,其中第第7-1194位为启动子PpcbC,第1203-2275位为cefF基因,证明质粒构建正确,将构建重组质粒命名为pAg-H3-cefF(图3)。
二、重组质粒pAg1-H3-cefF转化根瘤农杆菌
制备根瘤农杆菌AGL-1感受态细胞:
(1)将根瘤农杆菌AGL-1(购自ATCC,产品目录号为BAA-101)甘油保存液接种在含100μg/mL羧苄青霉素的LB琼脂平板上,28℃静置培养两天;
(2)挑取单菌落接种在4mL含100μg/mL羧苄青霉素的LB液体培养基中,28℃、250rpm振荡过夜培养;
(3)将4mL培养液转接至含有100mL LB液体培养基的500mL锥形瓶中,28℃、250rpm培养至OD600=0.5;
(4)将培养液置于冰上10分钟,4000rpm离心10分钟收集菌体;
(5)弃上清,用2mL 20mM CaCl2重悬菌体,100μL分装。浸入液氮1分钟后放入-80℃保存。
提取步骤一构建的重组质粒pAg1-H3-cefF DNA,取1μg该质粒DNA,将其加入上述制备的根瘤农杆菌AGL-1感受态细胞中混匀,放入液氮中5分钟。37℃热激20分钟后加入700μL LB培养基,28℃振荡培养2小时。将菌液均匀涂布在含有卡那霉素(75μg/mL)的LB琼脂平板上,28℃倒置培养2天,得到含有重组质粒pAg1-H3-cefF的根瘤农杆菌单菌落。
三、构建含有cefF基因的顶头孢霉工程菌株
向培养7天的顶头孢霉(Acremonium chrysogenum)CGMCC 3.3795琼脂平板上滴加2mL无菌水,用无菌棉棒将菌体刮下,得到溶液用无菌脱脂棉过滤,得到顶头孢霉孢子悬液。
将步骤二得到的含有重组质粒pAg1-H3-cefF的根瘤农杆菌单菌落接种于5mLMM液体培养基中,28℃振荡培养2天。用IM培养基将菌体稀释到OD600=0.15,28℃振荡培养6小时,至OD600=0.6。取100μL菌液与等体积顶头孢霉孢子悬液混合(悬液浓度=107个孢子/mL),均匀涂布在CM培养基平板上,25℃倒置培养3天。用棉签将平板上菌体转接至含有50μg/mL潮霉素B和200μm/mL噻孢霉素钠的TSA培养基平板上,28℃倒置培养5天至含有抗性筛选标记的转化子长出可见单菌落,再次转接进行纯化培养,纯化培养的方法为:使用含有50μg/mL潮霉素B和200μm/mL噻孢霉素钠的TSA培养基抑制农杆菌的生长,使农杆菌与顶头孢霉转化子分离,多次传代,得到转化重组质粒pAg1-H3-cefF的基因工程菌株。设未转化的顶头孢霉菌为野生型对照菌株。分别提纯基因工程菌株和野生型对照菌株的基因组DNA和总RNA。通过RT-PCR扩增,分别得到基因工程菌株和野生型对照菌株的cDNA。RT-PCR扩增的引物为:
上游引物:5′-AggcgcgccCGAAGGAGCAGGGGAACA-3′,小写字母为酶切位点AscI,
下游引物:5′-CcctgcaggCGGCTTGAATGCAACGAC-3′,小写字母为酶切位点SbfI。
以重组质粒pAg1-H3-cefF DNA为模板作为阳性对照,分别以基因工程菌株和野生型对照菌株的基因组DNA及cDNA为模板,进行PCR验证。使用的引物对如下:
上游引物:5′-aggcgcgccCGAAGGAGCAGGGGAACA-3′,
下游引物:5′ccctgcaggCGGCTTGAATGCAACGAC-3′。
结果如图4所示(图4中,泳道1为1kb DNA marker,泳道2为以基因工程菌株的基因组DNA为模板得到的PCR扩增产物;泳道4为以基因工程菌株的cDNA为模板得到的PCR扩增产物;泳道6为以重组质粒pAg1-H3-cefF DNA为模板得到的PCR扩增产物;泳道3为以野生型对照菌株的基因组DNA为模板得到的PCR扩增产物;泳道5为以野生型对照菌株的cDNA为模板得到的PCR扩增产物)。从图4可见,以基因工程菌株基因组DNA及cDNA为模板,均扩增得到了约1000bps大小DNA片段,而以野生型对照菌株基因组DNA及cDNA为模板均未出现该DNA片段。结果表明cefF基因已整合在获得的基因工程菌株的基因组DNA上,并能够在体内正常转录。
将上述获得的基因工程菌株中的一株命名为顶头孢霉cefF基因工程菌(Acremonium chrysogenum)。
该顶头孢霉cefF基因工程菌已于2010年12月27日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(简称CGMCC,地址:北京市朝阳区北辰西路1号院3号,中国科学院微生物研究所,邮编100101),保藏号为CGMCC No.4515。
以上各培养基的配制方法如下:
(1)MM培养基(100mL):
K-buffer(K2HPO420g,KH2PO414.5g,加水至100mL,pH7.0) 1mL
M-N(MgSO4·7H2O 3g,NaCl 1.5g,加水至100mL) 2mL
1%CaCl2·2H2O水溶液(质量百分比) 0.1mL
微量元素(ZnSO4·7H2O 0.01g,CuSO4·5H2O 0.01g,H3BO3 0.01g,MnSO4·H2O 0.01g,Na2MoO4·2H2O 0.01g,加水至100mL) 1mL
20%NH4NO3水溶液(质量百分比) 0.25mL
20%葡萄糖水溶液(质量百分比) 1mL
0.01%FeSO4水溶液(质量百分比) 1mL
50mg/mL卡那霉素水溶液 0.15mL
纯水 93.5mL
(2)IM培养基(100mL):
K-buffer(K2HPO4 20g,KH2PO4 14.5g,加水至100mL,pH7.0) 1mL
M-N(MgSO4·7H2O 3g,NaCl 1.5g,加水至100mL) 2mL
1%CaCl2·2H2O水溶液(质量百分比) 0.1mL
微量元素(ZnSO4·7H2O 0.01g,CuSO4·5H2O 0.01g,H3BO30.01g,MnSO4·H2O 0.01g,Na2MoO4·2H2O 0.01g,加水至100mL) 1mL
20%NH4NO3水溶液(质量百分比) 0.25mL
20%葡萄糖水溶液(质量百分比) 1mL
0.01%FeSO4水溶液(质量百分比) 1mL
50%甘油(质量百分比) 1mL
2-(N-***啉)乙磺酸(1M,pH5.3) 4mL
50mg/mL卡那霉素水溶液 0.15mL
乙酰丁香酮 0.2mL
纯水 88.5mL
(3)CM培养基(100mL):
K-buffer(K2HPO4 20g,KH2PO4 14.5g,加水至100mL,pH7.0) 1mL
M-N(MgSO4·7H2O 3g,NaCl 1.5g,加水至100mL) 2mL
1%CaCl2·2H2O水溶液(质量百分比) 0.1mL
微量元素(ZnSO4·7H2O 0.01g,CuSO4·5H2O 0.01g,H3BO30.01g,MnSO4·H2O 0.01g,Na2MoO4·2H2O 0.01g,加水至100mL) 1mL
20%NH4NO3水溶液(质量百分比) 0.25mL
20%葡萄糖水溶液(质量百分比) 1mL
0.01%FeSO4水溶液(质量百分比) 1mL
50%甘油(质量百分比) 1mL
2-(N-***啉)乙磺酸(1M,pH5.3) 4mL
50mg/mL卡那霉素水溶液 0.15m
乙酰丁香酮 0.2mL
琼脂 1.5g
纯水 88.5mL
(4)TSA培养基(1L)
蛋白胨; 17g
酶消化豆粕(购自OXOID公司,产品目录号为CM0129) 3g
葡萄糖 2.5g
NaCl 5g
K2HPO4 2.5g
琼脂 15g
纯水 1L
四、含有cefF基因的顶头孢霉工程菌株的应用
1、发酵实验
对步骤三获得的顶头孢霉cefF基因工程菌和野生型对照菌株进行多次摇瓶发酵;将摇瓶内的所有物质记作发酵液。
顶头孢霉cefF基因工程菌摇瓶发酵:
(1)将顶头孢霉cefF基因工程菌和野生型对照菌株接种在产孢培养基琼脂平板上,暗处28℃生长7天,收集孢子;
(2)分别取1mL顶头孢霉cefF基因工程菌和野生型对照菌株的孢子悬液(107个/mL)加100mL种子液培养基(500mL锥形瓶),28℃,摇床培养48h;
(3)分别取10mL生长48h的顶头孢霉cefF基因工程菌和野生型对照菌株种子液,加入到100mL发酵培养基中(500mL锥形瓶),28℃,摇床培养7天。
顶头孢霉产孢培养基:
葡萄糖 1g
酵母抽提物 2g
NaCl 1.5g
CaCl2 10g
琼脂 25g
加蒸馏水至1L,pH 6.8。
顶头孢霉种子液培养基MDIA:
葡萄糖 10g
CaCO3 5g
玉米浆 30g
淀粉 30g
加蒸馏水至1L,pH 7.0。
顶头孢霉发酵培养基MDFA:
蔗糖 36g
葡萄糖 27g
DL-甲硫氨酸 3.2g
L-天冬氨酸 12g
2%Fe(NH4)(SO4)2·6H2O 8mL
微量元素液 144mL
加蒸馏水至1L,pH 7.4,
上述微量元素液:
K2HPO4 104g
KH2PO4 102g
Na2SO4·10H2O 11.5g
MgSO4·7H2O 2.4g
ZnSO4·7H2O 0.2g
MnSO4·H2O 0.2g
CuSO4·5H2O 0.05g
CaCl2·2H2O 0.5g
加蒸馏水至1L。
2、对发酵液中DAOC与CPC的高效液相色谱分析和质谱分析
将上述步骤1得到的顶头孢霉cefF基因工程菌和野生型对照菌株的发酵液分别在室温离心,13000rpm,离心10分钟,取上清进行高效液相色谱分析和质谱分析。
标准品为头孢霉素C锌盐(Cephalosporin C zinc salt)(购自sigma公司,产品目录号为C3270)采用Agilent液质联用***(Agilent 1200&6520Q-TOF mass)进行分析。
色谱条件:
色谱柱:Thermo Hypersil Gold C18(4.6×25cm,5μm);
流动相:乙腈(acetonitrile)∶0.05%甲酸(methanoic acid)(梯度:从2∶98(v/v)到20∶80(v/v),20min);
柱温:35℃;
流速:1mL/min;
进样量:20μL。
质谱检测条件:正离子模式;加热管温度:300℃;干燥气体流速:10L/min;碎裂电压:115V;扫描范围:100-1000。
结果:
在如上条件下,Cephalosporin C zinc salt标准品中CPC的保留时间为10.2min,DAOC的保留时间为9.5min。野生型顶头孢霉的发酵液中,CPC和DAOC的保留时间如图5中A所示,其中CPC的保留时间为10.279min,DAOC的保留时间为9.476min;CPC和DAOC的峰面积值如图5中B所示,DAOC与CPC的峰面积比值为1.60。顶头孢霉cefF基因工程菌的发酵液中,CPC和DAOC的保留时间如图6中A所示,其中CPC的保留时间为10.253min,DAOC的保留时间为9.530min;CPC和DAOC的峰面积值如图6中B所示,DAOC与CPC的峰面积比值为0.24;从图5中B和图6中B可见,顶头孢霉cefF基因工程菌与野生型对照菌株相比,发酵液中DAOC的含量显著下降,CPC的含量升高,同时,DAOC与CPC含量的比值下降。与此结果说明,构建的顶头孢霉cefF基因工程菌可生产更高纯度的头孢菌素(CPC)。
Claims (10)
1.顶头孢霉cefF基因工程菌(Acremonium chrysogenum),其保藏号为CGMCC No.4515。
2.一种基因工程菌,为将如下融合基因导入宿主菌得到的基因工程菌:序列表中序列1中第7-1194位核苷酸所示DNA片段与蛋白cefF的编码基因构成的融合基因。
3.根据权利要求2所述的基因工程菌,其特征在于:
所述蛋白cefF的编码基因的核苷酸序列如序列表中序列1中第1203-2275位核苷酸所示;
所述宿主菌为顶头孢霉菌(Acremonium chrysogenum);
所述融合基因是通过重组表达载体导入宿主菌的。
4.根据权利要求2或3所述的基因工程菌,其特征在于:
所述重组表达载体为将所述融合基因***表达载体pAg1-H3的多克隆位点得到的重组表达载体;
所述融合基因的核苷酸序列为序列表中序列1所示。
5.权利要求1所述的顶头孢霉cefF基因工程菌或权利要求2-4中任一所述的基因工程菌在生产头孢菌素C中的应用。
6.含有如下融合基因的重组质粒:序列表中序列1中第7-1194位核苷酸所示DNA片段与蛋白cefF的编码基因构成的融合基因。
7.根据权利要求6中所述的重组质粒,其特征在于:
所述重组质粒为将所述融合基因***表达载体pAg1-H3的多克隆位点得到的重组表达载体;
所述蛋白cefF的编码基因的核苷酸序列如序列表中序列1中第1203-2275位核苷酸所示;
所述融合基因的核苷酸序列为序列表中序列1所示。
8.蛋白cefF或蛋白cefF的编码基因在用发酵菌制备头孢菌素C的过程中降低产物中去乙酰氧头孢菌素C的产量中的应用。
9.根据权利要求8中所述的应用,其特征在于:所述蛋白cefF的编码基因的核苷酸序列如序列表中序列1中第1203-2275位核苷酸所示。
10.一种制备头孢菌素C的方法,包括如下步骤:发酵权利要求1所述的顶头孢霉cefF基因工程菌或权利要求2-4中任一所述工程菌,得到头孢菌素C。
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