TWI262083B - Microbially-expressed thermotolerant phytase for animal feed - Google Patents

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TWI262083B TW091137674A TW91137674A TWI262083B TW I262083 B TWI262083 B TW I262083B TW 091137674 A TW091137674 A TW 091137674A TW 91137674 A TW91137674 A TW 91137674A TW I262083 B TWI262083 B TW I262083B
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l262〇83 故、發明說明: 【相關申請案】 本申 中請案 【發明 請案主張讓年12月28日所中請之第細44,523號 之優先權,其係在此併為參考、 所屬之技術領域】 本發明大體上係有關於分子生物學領域,且更特定言之 為關於耐熱植酸酶之用途。 【先前技術】 j酸酶(肌醇六磷酸鹽麟酸二脂梅:Ec 31·3·8)為可將肌 _六磷酸(肌醇六鱗酸鹽)水解成為肌醇及無機鱗酸鹽之酵 素。此種酵素為重要的飼料添加劑。於二十世紀末,作為 動物飼料添加劑之植酸酶的年銷售額估計超過一億美金, 且市場繼續成長中。 一般家禽及豬之飼料係以穀類、豆類及含油種子產品為 f。^在於這些飼料原料中大約三分之二的鱗(ρ)係以肌醇 六磷酸型式存在,即植酸(肌醇六磷酸鹽,Insp6)之鹽類(強 布拉德(Jongbloed)等人,1993)。植物中之植酸磷為一種植 酸之鈣-鎂-鉀混合鹽類,其係以螯合物型式出現且其溶解度 非常低(帕拉夫(Pallauf)及林姆巴哈(Rimbach),199乃。此種 型式的磷對單胃動物(如人類、豬及家禽)而言難以消化/利 用。 為了能利用植酸磷及束縛在植酸複合物中的礦物質與微 量兀素’需藉植酸酶將植酸之依酯類型式結合之磷酸鹽基 團加以水解(林姆巴哈等人,1994”植酸酶屬於一種特殊的 82696.doc 1262083 磷酸酶群組,此類磷酸酶可將肌醇六磷酸水解為一系列之 低級肌醇錢鹽@旨及磷酸鹽。已知植酸酶有二種:%植酸 =6-植酸酶’其各代表其所開始作用之賴賴。雖然 早胃動物缺乏足以有效利用植酸狀植酸酶,#多真菌、 細菌及酵母可製造能用於補充動物飼糧之植酸酶。’、 補充植酸酶對磷的消化性及動物表現之益處已廣見於文 獻中(姆羅兹(Mr。2)等人’ 19从寇梅傑(Komegay)等人,1996 ,·勞(Rao)等人,丨999;雷文德蘭(Ravindran)等人,1999)。 然而,這些研究中大部分係以特定之基礎來進行,其通常 僅提供該類酵素粗淺的資訊以迎合廠商的銷售策略。任何 酵素製備物之功效不僅取料其類型、含有量及表現活性 程度’其5F需仰賴酵素在通過胃腸道及在食品或飼料調配 物預處理時所遭遇的各種狀況中維持其活性的能力。 雖然許多植酸酶刊用做為增_,但許多酵素具有某 二缺點如"午夕目‘使用之植酸酶會於飼料製粒過程中因 加熱處理而喪失活性。此外,許?目前使用之植酸酶並不 適用於含低量添加磷酸鈣之飼糧。 因此,動物飼料及食品處理需要一種具有增進特性之植 酸酶。 【發明内容】 因此本發明可楗供製備及使用可編碼耐熱植酸酶之核 酸分子(多核菩酸)的彳法,即於約峨中、3〇分鐘後仍可保 留至少4G%活性之耐熱植酸酶,且其擁有高度比活性,即於 37°C及酸性pH (如pH 4.5)中至少約2〇〇 u/mg。於一具體實 82696.doc 1262083 施例中,本發明係提供一種可製備耐熱植酸酶之方法。此 方法包括於微生物宿主細胞中表現出表現匣,該表現匣包 括此經操作連接至可編碼耐熱植酸酶之核酸分子的啟動子 ,泫耐熱植酸酶於60°C中30分鐘後仍可保留至少4〇%活性且 於pH 4.5及37°C中具有大於200 U/mg之比活性。微生物宿主 細胞可為原核細胞,如細菌細胞(如艾歇立希菌、假單胞菌 、礼酸菌及桿菌)、酵母(如酵母菌、裂殖酵母屬、畢赤酵 母屬(Pichia)或漢遜酵母屬(Hansueia))或真菌(如麴菌屬或 木黴菌屬(Trichoderma))細胞。於一較佳具體實施例中,用 於製備重組耐熱植酸酶之微生物細胞可產生糖化型式的重 組耐熱植酸酶。 較佳可編碼耐熱植酸酶(第一種多核苷酸)之多核苷酸能 經操作連接至少一個調節序列,如啟動子、增強子、*** 、終止序列或其任何混合物,且可視需要連接至第二種可 編碼訊號序列之多核苷酸,後者可將第一種多核苷酸所編 碼之酵素指派至特定細胞位置,如細胞外位置。啟動子可 為組成性啟動子或誘導性(調整性)啟動子。如在此所述者, 利用可編碼植酸酶之親代(細菌)多核苷酸的致突變可製備 各種(合成)由DNA所編碼之植酸酶,其較親代多核荅酸所編 碼之植酸酶具有增進之特性。於一具體實施例中,將一些 變異DNA所含之突變加以混合以製備一種可編碼植酸酶之 合成多核苷酸,該植酸酶具有比親代多核苷酸所編碼之植 酸酶更強的耐熱性及胃穩定性且具有類似或更高之比活性 。親代多核苷酸可取自任何來源,包含植物、細菌或真菌 82696.doc 1262083 核酸,且可應用任何方法自所選出之親代多核芬酸製備本 發明的合成多核:y:酸,如組合致突變、遞迴致突變扣__ mutagenesis)及/或 dna重排。 Q此於本發明一具體實施例中,其耐熱植酸酶相具有 比相關(參考對照)植酸酶增加一或多種胺基酸取代基,此種 取代基係與在60 C或更高之溫度中保留活性有關。耐敎植 酸酶較佳於約帆中3〇分鐘仍具有i少4〇%活性,更佳為於 約65 C中30分鐘仍具有至少術〇活性,更佳為於70°c中30 刀4里仍具有至少35%活性,且其比活性為於坑中至少有 400 U/mg,更佳為至少_ u/mg,且尤更佳為至少_ u/呵 如低於pH5〇iL更佳為低於pH4〇、高 万;pH 1.5。本發明示範性的耐熱植酸酶之一請見序列鑑別編 號:1。 本發明亦提供包括本發明表現®或多㈣酸之載體及包 括本發明多m表現Ε或載體之轉化微生物細胞。本 發明載體可編碼-種以上的多肽,其中包含—種以上的耐 熱植酸酶;或可編碼包括本發明耐熱植酸酶之融合多肤; 而轉化微生物細胞可包括—或多種本發明之載體。本發明 (轉化細胞可料製備本發明之重组对熱植酸酶。因此, 本1月可k供自本發明轉化微生物細胞分離出之耐熱植酸 酶,以及合成製備酵素。 本發明進-步提供調配耐熱植酸酶、植酸酶調配物或調 配<酵素混合物的方法。重組耐熱植酸酶或其調配物可於 食品或飼料加工前、加工時或加工後添加於食品或動物飼 82696.doc 1262083 枓中或食品及飼料成分中做為補充劑。本發明之重组耐埶 植酸酶較佳於製粒機中加熱(如蒸汽加熱)處理前及/或於加 =(如蒸汽加熱)處理時添加至飼料成分混合物中。因此,本 發明包含製造及使用耐熱植酸酶之方法。 更進-步,由於如本發明之植酸酶於飼料調配時可耐受 ^两用製粒機中的加熱處理步驟’因此本發明提供一種製 造動物飼料之方法,如包括該耐熱植酸酶之硬粒狀飼料顆 粒。製造飼料時,經調配之植酸酶可與飼料成分混合,再 將混合物於製粒機中經蒸汽處理,而經預先熱處理:素之 錄保留至少观,最後將飼料經顆粒模擦出成形。因此, 植酸酶可獨自用於動物飼料作為增補劑,或再加上維生素 :礦物質、其它飼料酵素、農業副產品(如小麥麵粉或玉米 4粉)或與後列者混合。酵素亦可添加至糊狀飼糧,即未經 成粒之飼糧。 、因為目㈤可用之商品化植酸酶酵素並不耐熱,其經常於 成粒後才加人,通常係將酵素溶液噴灑至已成粒飼料上。 與噴霧方法有關的某些問題為僅有低百分比之顆粒可與酵 素接觸_素僅存在於包覆顆粒之表面,且飼料壓製機尚 需額外投資操作複雜的喷霧機。相對地,具有較其它市; 酵素高8倍比活性之本發明耐熱植酸酶可於製粒前添加^ 此可幫助生產酵素分佈更均勻之飼料。此外,包括本發明 耐熱植酸酶之飼料具有較以植酸酶錢的飼料更長之耐儲 時二因為赁霧步驟所導入之濕氣可於貯藏期間供應真菌 及細菌生長。另外,本發明耐熱植酸酶較高之比活性容許 82696.doc 1262083 飼料製料於飼料中使用遠較低量㈣酸鹽。如—般建議 添加目前之市售植酸酶的飼糧應使用基本濃度Q45%之益 機磷酸鹽。採用本發明之耐熱植酸酶可補充較低量的磷酸 鹽’如於家禽飼糧中僅補充約〇.225%。 因此,本發明提供一種製備動物飼料之方法,其包括提 供G括或多種飼料成分及包括本發明耐熱植酸酶之製 備物的混合物,並於適當溫度及濕度環境中處理該混合物 ,以便將存在於混合物巾之植酸水解。同時亦提供藉此方 法製備之動物飼料。本發明進一步提供一種製備可供飼料 調配物採用之含耐熱植酸酶的組合物之方法,其包括混合 含本發明耐熱植酸酶之液體溶液及豆粉(如大豆粉)以產生 混合物,並冷凍乾燥該混合物以產生泠凍乾燥組合物。 本發明進-步提供—種方法,其中將包括動物飼料成分 之混合物及包括本發明耐熱植酸酶的製備物以熱處理而產 生一經加熱處理之動物飼料混合物。本發明亦提供經此法 所製備之熱處理動物飼料。植酸酶製備物可為液體或固體 製備物,且較佳包括低於約1%之無機磷酸鹽。於一具體實 她例中,將包括本發明耐熱植酸酶之液體溶液混以大豆粉 而產生一混合物並隨後將該混合物冷凍乾燥。該混合物較 佳包括低於0.45%之無機磷酸鹽,其亦可包括至少一種維生 素、礦物質、一種耐熱植酸酶以外之酵素、有機酸、腸道 显菌(probiotic)產品、精油或穀物加工副產品。經熱處理之 飼料可進一步處理,如經由製粒機將經熱處理之飼料擠壓 成形以產生顆粒飼#。亦提供—種包括本發明耐熱植酸酶 82696.doc -11- 1262083 -力物飼科通合物及包括此種耐熱植酸酶之酵 劑或食品添加劑。 μ ]科‘力口 、尽發明亦提供一種降低飼料轉換比並增進動物體重之方 法,其包括餵食動物包括耐熱植酸酶之飼料。進一步亦提 供一種減少動物飼糧中磷(如無機磷)需求量之方法。本== 包括餵食動物包括本發明耐熱植酸酶之飼料,其用量足以 增㈣動物飼料中狀生物利时,較佳為其中無機鱗的 生物利用率。亦提供增進存在於動物飼料中之磷的利用率 的万法’ &方法包括銀食動物—種包括本發明耐熱植酸酶 之飼料,其耐熱植酸酶用量可有效增加動物飼料中磷的生 物利用率。 此外,本發明提供一種減少動物***物中磷酸鹽濃度之 万法,其包括餵食動物包括低於0 45%無機磷及可降低動物 ***物磷酸鹽濃度之有效量的本發明耐熱植酸酶之飼料。 本發明提供一種增進動物飼料或人類食品之營養價值的 万法。孩方法包括於製備動物飼料或人類食品時添加本發 明耐熱植酸酶。本發明亦提供一種製備人類食品之方法, 其包括k供食品成分及包括本發明耐熱植酸酶之製備物的 混合物,並於適當溫度及濕度環境中處理該混合物以促進 存在於混合物之植酸進行水解。 屬於本發明範圍内之動物包含多胃動物(如牛),以及單胃 動物,如豬、家禽(如雞、火雞、鵝、鴨、雉雞、松難、鵪 4及鴕鳥)、馬、綿羊、山羊、犬及貓、以及魚和甲殼綱動 物。飼料或食品中之植酸酶濃度較佳為約5〇s5〇〇〇u/kg, 82696.doc -12- 1262083 更佳為 100至 1200 u/kg43〇c^ 12〇〇 u/kg。 發明詳細說明 定義 在此所用之”微生物,,宿主細胞意指細菌、酵母及真菌。 改’交私度”係指與正常或未轉化細胞或生物所表現程度 不同之由轉化或轉殖基因細胞或生物所表現之程度。 ’’反向抑制”係指所產生之反向RNA轉錄本可抑制源自内 源基因或轉殖基因之蛋白質表現。 奴口係用以表示由一種以上不同來源之Dna序列所組 成的DNA序列(如載體或基因),其係藉重組dna技術融合在 一起而產生一種非天然存在之DNA序列。”嵌合基因”一詞 係扣任何包含以下各物的基因:丨)dna序列,包含調節及 密碼序列,後二者於自然狀態下未曾見其併存,或2)可編 碼非天然毗鄰之蛋白質部分的序列,或3)非天然毗鄰之啟 動子4分。因此,嵌合基因可包括來自不同來源之調節序 列及密碼序列或包括來自相同來源之調節序列及密碼序列 ,但其與自然狀態所見之排列方式不同。 、’’染色體性-合併,,係指利用共價鍵將外來基因或DNA結構 導入宿主DNA中。當基因並非,,染色體性_合併,,,其可能僅 供”短暫表現,’。基因短暫表現係指一未合併至宿主染色體 〈基因的獨自作用表現,其可能為如獨立自主之複製質體 或表現匣之部分,或為另一種生物系統(如病毒)之部分。 ’,選殖載體”典型上包含—或少量之限制性核酸内切酶識 別部位,於該部位可***外來DNA序列之可決定樣式而: 82696.doc -13 - 1262083 致於喪.失載體必要的生物功能,同時並***一可用於鑑別 及選擇可以選殖載體轉化之細胞標記基因。標記基因典型 上包含可提供對抗生素(如四環黴素、效高黴素 (hygromycin)或胺苄青黴素)之耐受性,或其它可供選擇轉 化細胞方法之基因。 ’’密碼序列"係指可編碼特定胺基酸序列之Dna或rna序 列且不包括非·密碼序列,即自5,端及3,端至密碼序列間者 。其可組成一”連續密碼序列,,,即缺乏***序列,如於cDNA 中,或其可包含一或多個由適當接合點所分界之***序列馨 。”***序列”係一種RNA序列,其係包含於原始轉錄本中 ,但藉由***移除並於細胞中將RNA再次_連結以產生可轉 譯為蛋白質之成熟mRNA。 ff組成性表現”係指使用組成性啟動子或調節啟動子之表 現。凋整性’’及”調節表現”係指由調節啟動子所控制之表現。 "接觸”一詞可包含任何已知的或曾描述過的將核酸片段 導入細胞之方法。 ’’表現”係指在宿主細胞中之内源基因或轉殖基因的轉錄籲 及/或轉譯作用。如就反向構造而言,表現僅與反向^^^八之 轉錄有關。此外,表現亦指有意義(mRNA)或功能性rna之· 轉錄及穩定累積。表現亦可指蛋白質產生。 · 在此所用之,,表現匣"意指可於適當宿主細胞内指揮特定 核苷酸序列表現之DNA序列,其包括將啟動子經操作連接 至所欲之核苷酸序列’後者再經操作連接至終止訊號。其 典型上亦包括供核:y:酸序列適當轉譯所需之序列。包括所 82696.doc -14- 1262083 欲核芬酸序列之表現匣可為嵌合物,即對於其中至少另一 組分而τ ’其中至少有一組分為異種來源。表現匿亦可為 天然存在但經過重组成為適合異種表現。表現Μ之核替酸 序列表現可為組成性啟動子或誘導性啟動子所控制,如此 僅有當宿主細胞暴露於某些特定的外來刺激時才合開始轉· 錄。 曰 ,啟動子(無論有否增強子)之"表現型式"為表現程度之型 式田個啟動子(表現顯示出與另一個啟動子之表現型 式有少許重疊時,則這组啟動子之表現型式稱為互補。啟籲 2子之表現程度可藉由測量標準轉錄通訊mRNA之,穩定狀 怨’私度來測^。由於通訊mRNA程度不僅取決於其合成速 率而且亦取決於mRNA之降解速率,此測量法係間接的。因 此穩定狀態程度係合成速率及降解速率之結果產物。 然而,當轉錄相同的序列時,降解速率可視為以固定速 率進行,因此該數值可充作合成速率之測量值。告以此法 評比啟動子時,熟諳此藝者可用之技術為雜交幻_麗%分 析法、北方墨點法(Northern bl〇ts)及競爭性RT_pcR法。上秦 列各法並不代表所有可用的技術,其僅敘述一般用於分析 轉錄活性及mRNA表現程度之常用步驟。 k 在幾乎所有啟動子之轉錄起始點的分析中顯示出於轉錄_ 起始點通常沒有個別的鹼基,取而代之者為或多或少成群 的起始點组,其中每一個都負責某些mRNA2起始點。由於 各啟動子之分佈情況各有不同,各族群之通訊mRNA序列亦 各不相同。由於各mRNA種類皆多少會降解,並無單一的降 82696.doc -15 > 1262083 解速率可適合各種不同之通訊As。研究顯示出在各種 真核生物啟動子序列中,圍繞起始部位(,起始因子,)周圍之 序列在決定由該特定啟動子所指揮的RNa表現程度上扮演 重要的角色。此亦包含部分的轉錄序列。因此啟動子與通 訊序列直接融合可導致次佳(sub〇ptimal)轉錄程度。 ’’5’端非-密碼序列”係指位於5’端(上游)至密碼序列間之 核苷酸序列。其出現在完整處理過之mRNA中的起始密碼子 上游,其並可影響初級轉錄成為mRNA之加工步驟、 之足性或轉潭效率(透納(Turner)等人,1995)。 基因,一同係廣泛用於任何與生物功能相關之核酸片段 因此,基因包含莕碼序列及/或其表現所需之調節序列。 如,基因可指一種可表現mRNA或特定蛋白質之核酸片段, 包含調節序列。基因亦可包含非表現性謝片[如其可 形成供識別其它蛋白質之識別序列。I因可由各種來源獲 得,其包含自所欲之來源進行選殖或由已知或推測序料 絲進行合成,並可包含經設計擁有所欲特徵之序列/、 ’’基因性穩^”及”可遺傳的”係指》色體.經整合之遺傳元 件,其可穩定維持在宿主細胞中並可通過連續的世代穩定 的由後代繼承。 〜 ”基因組”係指生物完整的遺傳物質。 在此所用之|,異種DNA序列,,、"外源DNA片 核::等詞各指對特定宿主細胞而言,源自外來來源:序: 2右起源自相同來源,則已經修改,並非其原始型式。 因此,宿主細胞中之異種基因包含了對特定宿主細胞而言 82696.doc -16- I262〇83 為内源基因但經過修改者,如使用dna置換修改者。這些 名峒亦包含天然存在DNA序列之非天然發生的多數複本。 因此’此名同係指對細胞為外來或異種之dna片段,或雖 對細胞為同源但對於宿主細胞核酸而言有些位置元件並非 原始所見之DNA片段。外源讓片段經表現後可產生外源· 性多肽。 "誘導性啟動子”係指可於細胞中藉由外來刺;敫(如化學刺 激、光、激素、緊返或病原體)發動之調節啟動子。 八起始邵位,,係轉錄序列中之第一個核誓酸周目的位置部 刀:其吓可定義為+1位置。根據此部位,可將所有其它基因 的序列及其控制區域加以編號。下游序列(即往3,端方向之 以下蛋白質編碼序列)稱為正向(pQsitive),而上游序列(往 端,方向者’大部分為控制區域)稱為負向(negative)。 ”細胞内定位序列"―詞係指可編碼細胞内標的訊號之核 答酸序列。”細胞内標的訊號,,係_種胺基酸序列,其可與 蛋白質共同轉譯並指引該蛋白質至特定的次'細胞區域。" 内質網(ER)終止運送訊號,,係、指多肽之叛基端延長部分,並 可與多肽共同進行轉譯並致使進人分泌路徑之蛋白質停留 在内質網中。’’内質網软μ 、、,、 、 、1止運項:序列”係指可編碼内質網 的訊號之核:y:酸序列。 w 本發明涵蓋分離之或眘所 。 、 ^貝上、、,屯化之核酸或蛋白質組合物 ;"月内又中’ ”分離”或"純化"之多核酸 段或"分離,,或"純化”之多肝^ 极甘心)片 天钬产产中、农 多肽為經由人工處理、非存在其原有 兄中《多核酸片段或多月太,因此其非天然產物。分 82696.doc 1262083 離:!核酸片段或多肽可以純化型式存在或可存在於非- ,=然%境中,如轉殖基因宿主細胞中。如,,,分離”或"純化 ,夕核fee片段或蛋白質,或其生物活性部分在經由重組體技 製備:實質上不含其它細胞物質或培養基,或者在化學 :成時男質上不含化學前驅物或其它化學物質。較佳地,,, 分離,、,多核酸中不含原本在其所來源之生物基因組議中 :列於核酸(較佳為蛋白質編碼序列)周圍之序列(即位於核 酉又5及3响〈序列)。如於各種具體實施例中,分離之核酸 分子僅包含祕約 5kb、4kb、3kb、2kb、ikb、G5^ ^ ^疋原本在其所來源之細胞基因組爾中屏列於核酸 刀子周圍《核酸序列。實質上不含細胞物質(包含蛋白質或 多肽製備物)之蛋白質僅具有低料3q%、2g%、齡%(就 乾燥重量而言)之不純蛋白質。當本發明蛋白質或其生物活 片Μ如催化性片段)係經重組製備時,培養基較佳含低於 ^0% 20% 10% '或5% (就乾燥重量而言)之化學前驅物 或非所欲蛋白質化學物。本發明所揭露核嘗酸序列及其所 編碼(蛋白質或部分_長度蛋白質的片段及變異物亦包含 t本發明範圍中。,,片段”係指核《序列之-部分或胺基 酸序列之—部分,以及其所編碼之多肽或蛋白質之-部分。 ”標記基m碼出選擇性或可篩選特徵。 、成…蛋自S Θ係指經轉譯-後處理、去除其訊號肤·後 义少月太則驅,蛋白質係指mRNA轉譯後之初始產物。”訊 & Hi <胺基端延長部’其與多肽共同進行轉譯, 形成刖驅肽’且其為該多肽進入分泌路徑所必需。"訊號序 82696.doc •18- 1262083 列^詞係指可編碼訊號肽之核^:酸序列。 "天然基因”-詞係指出現於未轉化細胞基i组之基因。 ,’、u係、用以描述可見於自然環境之物體,相對 U k ^現彳生物(包含病毒)之蛋白質或核菩酸序列 ’其可由天然來源分龅+ n + 、 W刀離出且未經實驗室人工蓄意修改者稱 為天然發生。 ’丨多核^酸丨丨、Π Μ龄丨丨、丨,夕1、Α ^ ^ 极蚊 多核酸f•或••多核酸片段”等詞係指 2氧核糖核苷酸或核糖核苷酸及其單股-或雙股型式之聚 口物,其由包含糖、磷酸鹽及一個鹼基(嘌呤或嘧啶)之單 體(核菩酸)所組成。除非特別限定,這些名詞所包含之核 酸中含有天然核苷酸之已知類似物,其具有與相關核酸類 似之結合特性且其係以類似天然發生核苷酸之方式進行新 陳代謝。除非另外指定,特定核酸序列亦含蓄地包含其保 留性經修改變異物(如簡併密碼取代基)與互補序列以及明 確扣定過之序列。特定言之,簡併密碼取代基可藉由產生 序列來達成’該序列中一或多個特選(或全部)密碼子之第三 個位置為合-驗基及/或脫氧肌菩⑽he)殘基所取 代(巴特熱(Batzer)等人,1991 ;歐祖卡(Ohtsuka)等人,1985 ;羅梭里尼(Rossolini)等人,1994)。 NOV9X及Nov9X於此可替換使用。 ’·核酸片段”係特定核酸分子之片段。去氧核糖核酸(DNA) 為遺傳物質,而核糖核酸(RNA)係與將包含於DNA内之資訊 轉換為蛋白質有關。”基因組”為包含於生物中各細胞之全 部遺傳物質。”核苷酸序列”一詞係指DNA或RNA之聚合物 82696.doc -19- 1262083 /、可為單版或雙股,並可視需要包含各種可併入DNA或 R &物之&成、非天然或修改過之核苷酸驗基。"核酸 ”或”核酸序列”等詞亦可與基因、gDna、dna及基因所編碼 之RNA人互使用(巴特熱等人,i99i、歐祖卡等人,MM ; ^钕里尼等人,1999)。表現匣可應用於將本發明之可編碼 ㈣酶的開放性密碼導入宿主細胞中,其較佳包括與開放 性密碼連接之轉錄性起始部位。此種表現g可包含多重限 制性部位以供***開放性密碼及/或其它DNA,如轉錄調節 部位及/或可選擇性標記基因。 錄卡g中自5’端_3,端之轉錄方向可包含可於微生物細 I中作用《轉錄及轉譯起始部位、所欲dna序列、及轉錄 和I睪終止邵位。終止部位可為天然連附轉錄起始部位、 可,為天然連附所欲舰序列、或可源自其它來源。 △— 開放性达、碼”及”〇RF”等詞係指在密碼序列中由轉譯起 I碼子及終止密碼子之間的區域所編碼的胺基酸序列〇 起始密碼P及"終止密碼子”等詞係指密瑪序歹^ 一组三 個毗連的核甞酸(,密碼子,),其可分別指定蛋白質合: (mRNA轉譯)鏈之起始及終止。 、j操作連接”當針對核酸時意指連結成為同—核酸分号 d分’適當地放置並定向以利於轉錄可自啟動子啟每 -ϋN AJT ^作連接至啟動子後即受到啟動子之,,轉綠起始韻 即。达、碼序列可以正向或反向經操作-連接至調節序列。 當針對多肽時,"經操作連接”意指連結成為同-多肽之— 邵分,即經由肽鍵連結。 82696.doc -20- 1262083 、過度表現如扣在轉殖基因細胞或生物之表現程度超趟 正常或未轉化細胞或生物所表現之程度。
已知多聚酶鏈反應法”PCR”包含(但不限於)使用成對引 丁、巢狀化(nested)引子、單一特定引子、降解引子、基因 -特定引子、載體-特定引子、部分錯配引子及其類似物。亦· 見於印尼司(innis)等人,1995及吉爾方德(Gelfand),丨995 ;及印尼司與吉爾方德,1999。 A 啟動子係指一核苷酸序列,通常位於密碼序列之上游 (5’端),其提供RNA多聚酶之識別及其它適當轉錄所需因素 # ,故可控制密碼序列之表現。”啟動子,,包含最小啟動子, 其為一種短DNA序列,包括—TA 丁冬盒及其它可供指定轉錄 起始4位之序列,其上再加入調節元件以便控制表現。,,啟 動子’、指一核苷酸序列,其包含了最小啟動子以及可控制 密碼序列或功能性RNA表現之調節元件。此類型之啟動子 序列包含近端及較遠端上游元件,後者元件通常稱為增強 子。因此,”增強子”係一種可促進啟動子活性之序列 ’且可為啟動子中之固有元件或是為促進啟動子之強度或籲 、、、、我特”丨生而***之兴種元件。其於兩種方向(正常或翻轉) ϋ操作且甚至典淪向啟動子之上游或下游移動都仍然 可以發揮作用。增強子及其它上游啟動子元件兩者皆結合· 了序列-特兴性DNA-結合蛋白質,後者可調解前二者之作用 。啟動子可為來自天然基因之完整啟動子,或由源自不同 之天然可見啟動子的不同元件所組成,或甚至由合成dna 片段組成。啟動子亦可包含與蛋白質因子之結合相關之 82696.doc -21 - 1262083 、να序列,其中蛋白質因子可控制與生理學或發展條件狀 沉相關之轉錄起始效力。 因缺乏上游活化作用而不活化或啟動子活性大幅降低之 啟動:元件’特定言之為ΤΑΤΑ元件,稱為”最小或核心啟動 子”。當加入適當轉錄因子或適當因子,該最小啟動子即可 ^用允許轉錄1此,,最小或核d動子,'僅含轉錄起始所 需乏基本元件,如一 TATA盒及/或一起始因子。 =白貝、,肽’’及"多肽”等詞在此可互相交替使用。 調節啟動子"係指可指揮基因表現之啟動子,其指揮方 式並非組成性,而是暫時性-及/或空間性-調節方式,且其 包含組織特異性與誘導性兩種啟動子。其可包含天然及合 成序列以及合成與天然序列混合之序列。不同啟動子可: :基因於不同組織或細胞種類、或在不同發展時期或不同 環境狀況中之表現。 ^ 調節序歹I”及”適當調#序列,,各係指位於密碼序列上游 (5’端非-密碼序列)、上下游間或下游(3,端非-密碼序歹”之核 嘗酸序列,且其可影響轉錄、爾加工或穩定性,或相關 密碼序列之轉譯。調節序列包含增強子、啟動子、轉譯前 導序列、插人序列及聚腺^:酸化作用訊號序列。其可包含 天然及合成序列以及合成與天然序列混合之序列。如上所 提者’ ”適當調節序列,,-詞並不限於啟動子。某些適用於 本發明之適當調節序列可包本(作了 ^ ° 不限於)組成性啟動子、誘 導性啟動子及病毒啟動子。 聚酶所催化轉錄DNA序 ”RNA轉錄本"一詞係指由RNA多 82696.doc •22- 1262083 J〜產物s RNA轉錄本為DNA序列之完美互補複本時, 其%為初級轉錄本,或當該RNA序列係源自初級轉錄之轉 4後加工產物,則其稱為成熟^^八。,,信使RNA,,(mRNA)係 相去除***序列且可供細胞轉譯成蛋白質之rNA。,,cDNA,, 仏指早股或雙股DNA,其係源自mRNA並與mRNA互補。 %疋轉化”係指細胞轉化後經過篩選並於特選培養基上 再生。 响非在碼序列”係指位於密碼序列3,端(下游)之核甞 ^序列並包含聚腺^:酸化作用訊號序列及其它能編碼出可 曰 A加工或基因表現之碉節訊號的序列。聚腺甞酸化 乍用汛唬足通$特徵為可影響聚腺苷酸束附加至前 驅物之3’端。 、 一 v、,、i付琢碉即訊铌义核:y: 序列,其包含-或多種如聚腺苷酸化作用訊號序列。 ”轉化詞係指將核酸片段轉移至宿主細胞之基因組 已口轉化核酸片段《宿主細胞稱為’,轉殖基因"細胞。 ”經轉化” ”轉殖基因"及,,重組體,,係指已導入異種核酸 子…細胞(如細菌)。核酸分子可藉由山姆布魯 (Sam—等人⑽賴露之此項技藝中眾所皆知的: =疋接合至基因組中。如’ ”經轉化”、"轉化株”及”轉; 土因’’細胞已通過轉化步驟並包含—外來基因,如游離基[ 元件型式或接合至其染色體中。" 經過轉化步驟之細胞。 π轉殖基因”係指藉轉化導 入至基因組中並穩定維持之基 82696.doc -23- 1262083 因。、轉殖基因可包+,如與欲轉化之特定細胞基因互為異 種或同源的基因。此外,轉殖基因可包括插人至非_天然生 物或叙口基因足天然基因。,,内源基因,,一詞係指位於生物 基:組中天然原有位置之天然基因。,,外來,,基因係指並非 正$見於佰王細胞而係藉由基因轉移導入之基因。 知暫性轉化,’係指細胞中導人了表現g、多料酸或轉 殖基因,但未經篩選以確保穩定維持。 轉#岫導序列”係指介於啟動子及密碼序列間之基因的 DNA序列邵分’其經轉錄成為RNA並置於完全加工過之 —HA中轉譯起始密碼子之上游(5’端)。轉譯前導序列可影 響初級轉錄成*mRNAi處理、mRNA穩定性或轉譯效率。 π轉譯中止片段”係指包含一或多個調節訊號之可終止轉 譯的核苷酸序列,調節訊號可為如一或多個三聯密碼之終 止密碼子。於毗連或接近起始密碼子之密碼序列的5,端嵌入 轉譯中止片段可導致無法轉譯或錯誤轉譯。藉由特定位基 因重組法切除轉譯中止片段可於密碼序列中產生一特定位 序列’其不致於干擾使用起始密碼子的適當轉譯過程。 可顯現出”植酸酶”活性或,,植酸酶”之多肽或酵素意欲包 含任何可影響由各種肌醇磷酸鹽釋出無機磷酸鹽或鱗之酵 素。此種肌醇磷酸鹽(植酸酶基質)實例為植酸及其任何·鹽類 ’如肌醇六磷酸鈉或肌醇六磷酸鉀或混合型鹽類。同樣地 任何肌醇之單-、二-、三-四-或五-磷酸鹽的立體異構物可 充當植酸酶基質。依上述定義,無論使用其中那一種基質 白了利用相對應的分析法來測定植酸酶活性。本發明耐熱 82696.doc -24- 1262083 植酸酶包含源自特定耐熱植酸酶之各種多肽,其修改方式 包含刪除(稱為截斷)或添加一或多個胺基酸至天然蛋白質 之N-端及/或c-端、於天然蛋白質一或多個部位刪除或添加
一或多個胺基酸、或於耐熱植酸酶之一或多個部位取代一 或多個胺基酸。此類變異物可來自於如人類之控制。此類 &制方法毛本技藝中為眾所皆知。如多肽之胺基酸序列變 兴物可藉由DNA突變來製備。致突變及核苷酸序列變更之 方法於此項技藝中已為人所熟知。請見於如昆凱(κ仙kd) ,1985、昆凱等人,1987、美國專利案號4,873,192、華爾 克(Walker)及盍斯詫⑴⑽价勾,1983,以及其中所引用之參 考又獻。至於不影響所欲蛋白質之生物活性的適當胺基酸 取代基 < 指導原則可見於戴霍夫⑴等人之模型, 1978丨以引用之方式併人本文中。較佳者為保守性取— ,如與其它具有類似特性之一個胺基酸進行交換。— 因此,本發明之耐熱植酸酶基因及核甞酸序列同時包< :然發生序列以及突變型式。同樣地,本發明之耐熱植自
酶多肤同時包含天然發生蛋白質以及其變異物與經修改3 式、叩Θ夂兴物仍可持續保有所欲之活性。在此涵蓋之j 肽^列的刪除、插人及取代並非欲製造該多肽特性之根4 改邊。然而’熟諳此藝者應了解其效果可藉由例行篩選矣 析加以評估。太於明士技 、,、 奉毛明又核鉍可以最佳化以便於所欲宿主細 胞中增進表現性。鹿了 I 了解所有或任何部分之基因序列皆月 乂取佳化或合成。即,合成或部分最佳化之 用。各種核苷酸序列及蛋合砰、—人 知 蛋白貝亦包含了源自致突變及重细 82696.doc -25- 1262083 基因步驟(如DN A置換)之序列及蛋白質。運用此方法,可操 作一或多種不同密碼序列以產生一種具有所欲特性之新型 多肽。依此方式,可自相關序列多核苷酸族群中建立重組 體多核茹酸庫,該相關序列多核甞酸所包括之序列部位實 質上具有相同序列且可於活體外或活體内加以同源重組。 該類DNA置換之策略在本技藝中為人所知。見於如史丹摩 (Stemmer),1994;史丹摩,1994;克拉莫力(crameri)等人 ,1997 ;莫爾(Moore)等人,1997 ;冉(Zhang)等人,1997 ;克 拉莫力等人,1998 ;及美國專利案號5,605,793與5,837,458。 π變異物π係形容大體上類似之序列。對核嘗酸序列而言 ’變異物包含雖基因密碼退化但仍能編碼與相同的參照蛋 白質胺基酸序列之核苷酸序列。此類天然發生之對偶基因 變異物可使用眾所周知的分子生物技術(如多聚酶鏈式反 應(PCR)及雜X技術)來加以鑑別。變異核菩酸序列亦包本 合成而來的核苷酸序列,如藉由使用可編碼參照蛋白質之 部位-指揮致突變所產生者,以及可編碼具有胺基酸取代基 之多肽者。通常,本發明核苷酸序列之變異物具有與天然 核替酸序列至少4G%、5G%、6G% ’較佳為鳩,更佳為嶋 ’更佳為90%,最佳為99%之雷同性’且包含各百分比等級 之每-個位數單位。如71%、72%、73%及其類似比例,其 可向上延伸90%級以上。變異物亦可包含相當於同一基因片 段之完整長度的基因。 載體”《定義為包含,特定言之’任何質體、黏接質體 、嗤菌體或其它雙股或單股之線狀或環狀型式的載體,其 82696.doc -26- 1262083 為(或非為)可自我傳送或可移動,且其可藉由接合至細胞基 因、、且或另存於額外的染色體(如具有複製起源之自主複製 質體)中來轉化原核或真核宿主。 【實施方式】 佳構造及宿古細构 本發明較佳可提供-種表現E,其包括可指揮能於活體· 外或活體内編碼耐熱植酸酶之多核苷酸表現性的核酸序列 (欠動子)製備及/或鑑別耐熱植酸酶之方法包含致突變, 如遞迴致突變及/或選擇或篩選如於6 〇。〇以上之溫度中仍讀 具有活性的植酸酶。致突變及核苷酸序列修改為此項技藝 中吾人所熟知之方法。見於如昆凱,1985、昆凱等人,1987 、美國專利案號4,873,192 ;華爾克及蓋斯詫,1983,以及 其中所引用之參考文獻;及阿諾(Arn〇ld)等人,1996。 A.供轉化之DNA及宿主細胞 - 用於轉化細胞之載體、質體、黏接質體、YACs (酵母人 工染色體)BACs、(細菌人工染色體)及DNA片段通常包括可 編碼植酸酶之DNA以及其它DNA如cDNA、基因或欲導入細儀 胞之基因。這些DNA構造可進一步視需要包含如啟動子、 增強子、多連結子(polylinkers)或甚至是調節基因。為供細 — 胞導入作用所選擇之DNA片段或基因應可編碼能於所產生, 之轉化(重組)細胞中表現之蛋白質,如可產生可篩選或可選 擇性特性並/或可使轉化細胞之表現型更加改善。然而,亦 不見得永遠如此,本發明亦涵蓋併入非-表現型轉殖基因之 轉化細胞。 82696.doc -27- 1262083 可用於導入細胞之DN A包含起源或分離自任何來源者, 其隨後可以結構、大小及/或功能、化學改變加以特徵分類 並再導入至細胞中。π起源”自某來源之DNA實例可為一種 DNA序列,其經過確認為適合某特定生物之有用片段,且 可經化學合成成為實質上純化型式。此種π分離π自某來源 之DNA實例係藉由化學方法(如藉由使用限制性核酸内切 酶)自該來源切割或移出之有用DNA序列,後者可進一步加 以操作(如藉由遺傳工程方法加以放大)後運用於本發明。此 種DNA通稱為’’重組DNA”。 因此,有用之DNA包含完整合成之DNA、半合成DNA、 分離自生物來源之DNA及起源自導入RNA之DNA。通常, 導入之DNA並非原本存在於接受者DNA之基因型中,但本 發明範圍亦包含自特定基因型中分離出一基因,並接著將 該基因之多重複製本導入同一基因型中,以便如增加特定 基因產物之產量。 - 導入之DNA包含(但不限於)如源自細菌、酵母、真菌或病 毒基因之DNA。導入之DNA可包含經修改或合成之基因、 部分基因或嵌合型基因,其中包含源自相同或相異基因型 之基因。’’嵌合型基因’’或π嵌合DNA’f等詞定義為一種基因或 DNA序列或片段,其包括至少二種DNA序列或片段,其來 自於天然狀態下並不會混合DNA的品種,或該DNA序列或 片段之排位方式或連結方式未正常見於天然未轉化細胞之 基因組中。 在此供轉化使用之導入DNA可為環狀或線狀、雙股或單 82696.doc -28- 1262083 股。通常,DNA為嵌合DNA型式,如質體][^八,其亦可包 含密碼區’並有調節序列排列於侧,後者可促進存於轉化 細胞中之重組DNA的表現性。如dna本身可包括啟動子或 由啟動子構成(¾啟動子可於細胞中作用且係源自除該細 胞外之來源)’或可利用先前已存在於該轉化目標細胞中之 啟動子。 通常導入之DNA相當小,即小於約3〇kb以便儘量減少對 物理、化學或酵素降解之任何可能敏感性,已知A尺寸 愈大愈容易受到這些因素影響。導入至細胞之蛋白質、R N A 轉綠本或其混合物數量較佳為預先選定且經過確定,如所 導入之DNA可形成由1至約5_1〇個產物。 適當表現載體之選擇取決於宿主細胞。表現載體典型上 包含(1)供細菌來源複製的原核生物之DNA元件密碼以及一 抗生素耐性基因以供細菌宿主中表現載體之放大及選擇、 ⑺控制轉錄起始之DNA_,如啟動子;⑺可控制轉錄加 工之DNA元件,如***序列、轉錄終止/聚腺苷酸化作用之 序列;及(4)經操作連接至控制轉錄起始之dna元件上的所 欲基因。適用之表現載體為可於上述宿主中進行自主複製 或可併入至染色體内,其原本即包含—啟動子,該啟動子 之位置可使所連結之植酸酶基因進行轉錄。 若使用原核生物(如細菌)為宿主,則植酸酶之表現載體較 佳為可於微生物中自主複製並包括啟動子、核糖體·結合序 列、新穎之植酸酶基因與轉錄終止序列。該載體亦可包含 碉節啟動子之基因。 82696.doc -29- 1262083 酵母或真菌表現載體可包括複製起源、適當啟動子及增 強子,以及任何必需之核糖體結合部位、聚腺苷酸化作用 部位、接合供體及受體部位、轉錄終止序列及51端側列之非 轉錄序列。 適當載體包含,以實例而言:細菌之載體:PQE70、pQE60 、pQE-9 (Qiagen)、pBluescript II (Stratagene)、pTRC99a、 pKK223-3 、pDR540、pRIT2T (Pharmacia);真核細月包之載體 :pXTI、pSG5 (Stratagene) pSVK3、pBPV、pMSG、pSVLSV40 (Pharmacia)。該類商品化載體包含:如 pKK223-3 (Pharmacia Fine Chemicals,Uppsala,瑞典)及 GEM1 (Promega Biotec, Madison,Wis,,USA)。然而,只要能在宿主中複製及發育者 ,任何其它質體或載體亦可使用。 可以提及之適當宿主之代表性實例有··細菌細胞,如大 腸桿菌、鏈球菌屬、枯草桿菌及各種艾歇利希菌屬、偽單 胞菌屬、鋸桿菌屬、鏈球菌屬、棒狀桿菌屬、短菌屬、桿 菌屬、微小細菌屬及葡萄球菌屬細菌,當然其它細菌亦可 能加以選用;真菌細胞,如麴菌屬、根黴菌屬、木黴菌屬 、脈孢菌屬、毛黴菌屬、青黴菌屬等;酵母,如克魯酵母 菌屬(Kluyveromyces)、酵母菌屬、裂殖酵母屬、毛髮芽苞 菌屬、絲孢酵母菌屬、舒旺酵母菌屬(Schwanniomyces)及類 似物。 依照現有揭露文獻,熟諳此藝者可瞭解可應用於本發明 之載體的結構(見於如山姆布魯克等人,1989 ;吉爾文 (Gelvin)等人,1990)。本發明之表現匣可包含一或多個限制 82696.doc -30- 1262083 性部位以供放置可編碼為調節序列所調節之耐熱植酸酶的 多核苷酸。表現E亦可包含終止訊號,其經操作連接至夕 核苷酸以及通當多核苷酸轉譯所需之調節序列。包含本笋 明多核苷酸之表現匣可為嵌合型,即對至少一種其它成八 而言’其中至少有另一種成分為異種。表現…多核: 酸表現可為組成性啟動子、誘導錢動子、調節啟動子甘 病毒啟動子或合成啟動子所控制。 表現E在5,·3,端之轉錄方向中可包含轉錄及轉譯起妒部 位、本發明之多核菩酸及可於活體内及/或活體外作用 錄與轉譯終止部位。終止部位可來自與轉錄起始部位同一 天然來源、可來自血多访甘妒 木目/、夕核甘鉍冋一天然來源或源自其它來 源。調節序列可位於密碼序列上游(5,端非-密碼序列)、上 下游間(***序列)或下游(3,端非,碼序列),並可影響轉錄 、腿加工或穩定性及/或相關密碼序列之轉譯。調 :包含(但不限於)增強子、啟動子、抑制子結合部位、轉譯 則導序歹^***序列及聚腺苷酸化作用訊號序列。其可包 含天然及合成序列與合成及天然㈣ B運二本广明之載體亦可包含供放大表現之適當序列。 β · 调即序列 所:種藉由提供辨識RNA聚合酶及其它適當轉錄 、w &、碼序列表現的核#酸序列。啟動子包 令^^取小韵1動子 /各. 所組成 ’二《由轉錄起始所需之全部基本元件 …及其::且:气起始因子,起始因子係-種由 ’、/、把“足轉錄起始部位之序列所組成 82696.doc -31 - 1262083 的短DNA序列 其中加入調節元件以控制其表現。啟動子 或可由起源自不同天然啟動子 可冗全起源自天然的基因 之成刀所組成’或甚至包括合成之dNA片段。啟動子所包 口足DNA序列可牽涉到與蛋白質因子之結合,該蛋白質因 子可根據生理或發展條件狀況而控制轉錄起始之效力。啟 動丁亦可包含取小啟動子加上一調節元件或可控制密碼序 列或功能性RNA表現之元件 此類啟動子序列包含近端及 較遠端元件,後者通常稱為增強子。 啟動丁艾代表性實例包含(但不限於)已知可於原核或真 核、田胞或其病毒中控制基因表現之啟動子。特定之細菌啟 動子包含大腸桿菌lac或trp、噬菌體λρ[、laci、丨扣冗、丁3、 T7、gpt、及 動子。 任何能表現於酵母宿主之啟動子皆可作為啟動子。其實 例包含糖酵解路徑中之己糖激酶及類似物基因之啟動子' 以及如gal 1啟動子、gal 1〇啟動子、熱休克蛋白質啟動子、 MFa-Ι啟動子及cup 1啟動子等啟動子。 任何可表現於絲狀黴菌之啟動子皆可使用。實例為可由 澱粉或纖維素強烈引發之啟動子,如源自麴菌屬之葡糖澱 粉酶或α-澱粉酶或源自木黴菌屬之纖維素酶(纖維生物水 解酶(cell〇bi〇hydrase))的啟動子、糖酵解途徑之酵素的啟動 子’如鱗酸甘油酸激酶(pgk)及甘油醛3_磷酸鹽脫氫酶^ 等。 Ρ 已知有二種主要的控制表現性之方法,即過度表現及不 足表現(underexpression)。過度表現可藉由嵌入—戈多於一 82696.doc -32- 1262083 個選疋基因之額外副本而達成。不足表現則有二種主要的 方法元此技藝中通稱為η反股向下調節(downregulation),, 及f’正股向下調節”。這些步驟通常稱為,,基因默化(gene silencing)”。這二種方法皆可導致標的基因表現之抑制。 此項技藝中已知有數種謗導性啟動子。許多係見述於蓋 茲(Gatz)(1996)(亦見於蓋茲,1997)。實例包含四環黴素抑 制系統、Lac抑制系統、銅-謗導性系統、水楊酸鹽誘導性 系統(如PRla系統)、糖皮質激素-誘導性(歐亞馬(A〇yama)T. 等人’ 1997)及虫兒變激素_誘導性系統。同時亦包含苯績酿胺 -誘導性(美國專利案號5,364,780)及酒精-誘導性(w〇 97/06269及WO 97/06268)誘導性系統及穀胱甘肽轉移酶 啟動子。 嵌合處理病毒複製蛋白質表現之調節可進一步藉其它遺 傳策略來進行調節。如Cre-媒介性基因活化作用,見述於 歐戴耳(Odell)等人,1990。依此,介於啟動子與複製蛋白 質密碼序列之包含為lox部位所連結之3,調節序列的dnA片 段(可自啟動子阻斷篏合複製基因表現),可藉Cre_媒介性切 除法來加以移除並導致反式-作用複製基因之表現。在此例 中,彼合Cre基因、嵌合反式-作用複製基因或二者皆可為 特異啟發性或誘導性啟動子所控制。另一種遺傳策略法是 採用tRNA抑制基因。如調節tRNA抑制基因之表現即可條件 性控制包含適當終止密碼子之反式-作用複製蛋白質密碼 序列的表現,請見烏爾馬索夫(Ulmasov)等人1997。再者, 無論嵌合tRNA抑制基因、嵌合反式-作用複製基因或二者皆 82696.doc -33 - 1262083 可為特異啟發性或誘導性啟動子所控制 元件亦可影響轉殖基 示増強轉殖基因表現 除使用特定啟動子外,其它類型之 因之表現。特定言之,***序列已顯 之能力。 其它兀素包含可藉内源或外源藥劑進行調節,如使用鋅 指蛋白質,包含天然存在的鋅指蛋白質或嵌合喪合型鋅指· 蛋白質。見如美國專利案號5,789,538、w〇 99/489〇9、w〇-
99/45132 ^ WO 98/53060 ^ WO 98/53057 ^ W〇 98/53058 ^ WO 00/23464、WO 95/19431 及 WO 98/543 1 1。 φ 增強子係一種DNA序列,其可刺激啟動子活性且可為啟 動子之固有元件之一或是***後可增強特定啟動子之作用 程度或組織特異性的異種元件。增強子可於二種方向操作 (相對於所欲密碼序列之基因的5,至3,端及3,至5,端),並甚至 可自啟動子之上游或下游發生作用。增強子及其它上游啟 動子元件二者皆可結合序列_特異性DNA_結合蛋白質,後者 可媒介前者之作用。 如本發明所使用之載體可為包含增強子元件。本發明構鲁 造亦同時包含所欲基因與3,端之DNA序列,後者可作為終止 轉錄訊號並提供所產生之mRNA的聚腺苷酸化作用。 . 由於介於轉錄起始部位及密碼序列之DNA序列(即未轉 , 譯i導序列)起始部位可影響基因表現,因此也可以採用特 疋(珂導序列。可考慮之較佳前導序列包含其中包含預期 可指揮其所附基因最佳表現性的序列,即其中包含較佳的 致丨生别導序列者,後者可增加或維持mRNA穩定性並預防 82696.doc -34- !262083 不當的轉譯起始。熟諳此 擇該類序列。 U日-本發明所揭露内容選 :鏗別轉化株之能力’可應用選擇性或可篩選標記 ;二為所欲表現之基因’或聯合所欲表現之基因。|,標記 =系可給予能表現該標記基因之細胞獨特表現型的基 ',其因此可使該轉化細胞與不含標記之細胞有所區別。 w基因可編碼選擇性或可筛選標記’其取決㈣標記所 提供者為可藉化學方法選擇之特性,即藉由使用選擇劑(如 &生素或其類似物)進行選擇’或只是提供簡單可由觀察或 測試即可鑑別的特徵,即所謂的‘篩選法,。當然,本技藝中 仍有卉多適當標記基因之實例可適用於實施本發明。 ,1擇性或可篩選標記基因等名詞中亦包含可編碼,,可分 ‘、祆u己之基因,其分泌作用可供檢測作為鑑別或選擇轉化 、.田胞的万法。包含能編碼可分泌抗原之標記的實例為可藉 =抗體交互作用來鑑別,或甚至可藉其催化活性檢測之可 分泌酵素。可分泌蛋白質可分為數種等級,包含小型、擴 散性蛋白質(如可藉由ELISA檢測者),以及可於細胞外溶液 檢測出之小型活性酵素。 用於原核生物之可選擇性標記包含抗四環黴素或抗胺苄 同黴素基因。可應用之可篩選標記包含(但不限於)b-葡萄 糖菩酸酶或uidA基因(GUS),其可編碼含各種已知色原性基 質的酵素·,β_内醯胺酶基因(蘇特可立夫(Sutcliffe),1978), 其可編碼含各種已知色原性基質的酵素(如PADAC,一種色 82696.doc -35- 1262083 原性頭孢菌素)、xylE基因(祖卡斯基(Zukowsky)等人,1 983) ,其可編碼能轉化色原性兒茶酚之兒茶酚二加氧酶、α-澱 粉酶基因(依庫塔(Ikuta)等人,1990)、酪胺酸酶基因(卡茲 (Katz)等人,1983),其可編碼能將酪胺酸氧化為DOPA與多 巴醌之酵素,DOPA與多巴醌隨後再濃縮形成易於檢測之化 合物黑色素、β -半乳糖甞酶基因,其可編碼一種内含色原 性基質之酵素、蟲螢光素酶(lux)基因(歐(〇w)等人,1986) ,其可供生物發光檢測、或甚至為水母發光蛋白基因(普拉 捨(Prashei·)等人,1985),其可應用於鈣-敏感生物發光檢測 或綠色螢光蛋白質基因(尼茲(Niedz)等人,1995)。 轉化 表現匣或包含表現匣之載體結構可***至細胞中。表現 匣或載體結構可為游離基因方式所攜帶或接合至細胞之基 因組中,如SV40衍生物、細菌質體、噬菌體DNA、竿狀病 毒、酵母質體、源自質體及噬菌體DNA之結合體的載體-、 病毒DNA,如牛痘、腺病毒、禽痘病毒及假性狂犬病。然 而,只要其可於宿主中複製及運作,任何載體皆可使用。 有各種技術皆可將構造導入至細胞宿主並為熟諳此藝者 所熟知。欲達成微生物細胞之轉化作用可使用聚乙二醇、 氯化4弓、病毒感染、DEAE葡聚糖、嗟菌體感染、電穿孔法 及其它此項技藝中已知之方法。真菌之轉化可採用鞏尼 (Gonni)等人之方法,(1987)。將重組體載體導入至酵母之 方法可包含電穿孔法、使用原生質球狀體、醋酸鋰及其類 似物。任何可將DNA導入至動物的方法皆可使用,如:電 82696.doc -36- 1262083 穿孔法、磷酸鈣、微脂粒感染及其類似物。 為製備重組體植酸酶,在轉化適當宿主株(如細菌或酵母 宿王)並將該宿主株培養至適當細胞密度之後,將選定之啟 動子藉適當方法(如溫度變動或化學物誘導)謗發,再將細胞 圪養段適當的時間以便產生重組酵素。採集細胞時典型 上經過離心、以物理或化學方法打破細胞、並保留所得之 粗提取物以供進一步純化。 應用於表現蛋白質之微生物細胞可藉任何便利的方法加 以破裂,這些方法包含凍融循環、超音波、機械性***或 使用細胞溶解劑,此類方法皆為熟諳此藝者所熟知。 •酵素可自重組細胞培養物中藉下歹^法加以回收並純化 、去ι。石儿酸銨或乙醇沉澱、酸提取(Mid eMudion)、 ,離子或陽離子叉換色譜法1酸纖維素色譜法、忌水性 =互作用色瑨法、親和色譜法、羥磷灰石色譜法及外源凝 f素色譜法。可視需要使用蛋白質再折疊⑽〇idmg)步驟以 &成成^白質4結構。最後可應用高性能液相層析法 (HPLC)作為最終之純化步驟。 仙本發:酵素可為化學合成步驟之產物或藉由重組技術由 " 伤王(如細菌、酵母及真菌細胞培養物)所製造。依應 用於重組生產步w p^ 座少值王的不同,本發明酵素或可經由糖 化作用加以共價性修拎。 、 夕 万;真核細胞,所分泌蛋白質經糖 乍用後可棱供通度蛋白質折疊、構造穩定性及耐熱穩定 j蛋白質水解〈抵抗性。若以特定運用植酸酶而言, 82696.doc -37- 1262083 糖化版之酵素優於非-糖化型式。如於動物飼料中使用糖化 植奴扭,則於飼料成粒時可繁助保護酵素免於熱變性作用 且於通過動物的胃時可保護酵素免於蛋白質水解之不活化 作用,可幫助遞送活性酵素至腸道及作用部位。運用在食 口口加工時’酵素活性僅為加工時所需’而非最終產物所需 故非_糖化、不耐熱、且對蛋白質水解敏感性之植酸酶為 藉由1各種彳政生物宿主製造本發明植酸酶,可同時 改變耐熱性及對蛋白質水解降解作用之敏感性。如,當於 大腸桿菌中製造時,本發明植酸酶顯示出於仿造胃液中之 T衰期為8·4分鐘’而於巴斯德畢赤酵母(piehia卿〇叫及 裂殖酵母菌(Seh⑽saeeh⑽町⑽p。*)所生產者之數值 、,印為10.4及29.2分鐘。大腸桿菌並未擁有可糖化蛋白質 =細胞機制’而裂殖酵母菌之糖化作用程度大於畢赤酵母 =同樣地,州t:加熱步驟5分鐘後之殘餘活性隨糖化作 ij矛王度增加而增加。於士 、人 万、大腸和囷組可測得10%殘餘活性,而 A畢赤酵母菌及裂殖酵母菌時該數值八Μ 。本發明㈣別胃加430及50% 殘基。 0 (戍不匕3)—初始甲硫胺酸胺基酸 本發明酵素可應用於 口 /、要其中必需或需求此 "/性。於—較佳具體實施例中,此種酵辛可#人 催化動物㈣中^、Η 畔素了應用於 例中,此稀睡Γ 解。於另—較佳具體實施 舰㈣^ 中肌k磷酸之水解。 通系’植酸酶組合物為液態或 木j怨。硬態組合物僅 82696.doc •38- 1262083 需包含植酸酶酵素,_ — <、、τ 佳為高度純化型式。然而,可添加 穩足劑,如甘油、山梨 _ 、 °醇或單丙二醇。液態組合物亦可 包括其它添加劑,如矂 二 |、糠、防腐劑、pH-調節劑、蛋白質 及肌醇六鱗酸(一種括π仏 或油基聚狀物。如有::基質)。典型的液體組合物為水性 & 過程,則液態組合物可於之前或 之後添加至食品或飼料中。 乾燥组合物可為A $ 、 Y,東乾燥或噴霧乾燥之組合物,在此狀 :下、且口物僅而包含乾燥型式之酵素。乾燥組合物可為 粒狀,其可直接混入, … ^ ^ ^ 如’食品或飼料成分中或更佳者為 > 一預混物組分。酵素顆粒之大小較佳為相容於 混合物成分大小。★ 、 1此可提供安全及便利的方法將酵素 入如加工食品或動物飼料中。 μ 如’穩定之植酸醃睡本 液與增量劑(如磨碎的大=物之製備可先將液態酵素溶 燥該混合物而成。減,,、:合物加以冷滚,再冷滚乾 乂 /”,、度以及植酸酶與增量劑之处八丄 所丨4 ,皿度。儘量減少乾燥調配物中的蛋白 素活性可進—步提高其穩定性,蛋白質水解酵素 產=標的酵素時所使用之液態發酵混合物的副產品。所 酵素-大豆粉混合物可禁得起極高的: 留⑽之衫酵鐘後,該乾燥酵素調配物仍可保 '、有酵素活性。此種調配酵素混合物可做 及豬等畜產之飼料增補劑。例如, 本:禽 耐熱植酸酶添加至】t、神、佳 好京早仫<本發明 土1 kg疋標準玉米-大豆家禽飼糧中可減少 82696.doc -39- 1262083 ㈡Μ用於補充動物營養之無機磷酸鹽濃度,即由0.45%至 〇·225%。以増補經調配植酸酶之0.225%磷酸鹽飼糧所飼養 的雄表現同於以含0.45%磷酸鹽之標準飼糧所飼養者。此外 減V 酸鹽補充可使磷酸鹽污染濃度減少,其因而可明 頭減少密集式商業動物畜產業之環境影響。 後#乾燥之酵素製備物後,附聚顆粒之製備係於高剪力 丰機中使用附聚技術將填充物及酵素共同-結塊以形成 :、· 及收顆粒之製備係使載劑物質核心吸收/包覆酵素而 、弋表丨生的填充物為鹽類,如硫酸納。其它填充料包本 阿嶺土、滑石、矽酸鋁鎂鹽及纖維素纖維。亦可選用黏合 劑(如葡聚糖)包含於附聚顆粒中。 代表性載劑物質包含殿粉,如樹薯、玉米、馬铃著、米 及小麥等型式。亦可使用鹽類。 顆粒亦可選用塗層混合物來包覆。此類混合物包括塗佈 劑,較佳為忌水性塗佈劑,如氫化棕櫚油及牛油,若需要 時可使用其它添加劑,如碳酸鈣或高嶺土。 此外,植酸酶組合物可白八甘—ν 、 初了包含其它取代物,如著色劑、 味化合物、穩定劑、維生素、礦物質、其它詞料或”加 _人^及㈣物。此_^卩特定言之所謂的預混^ ?或飼枓添加劑’’係意欲添加或適合添加至食 :貫質純化合物或多成分組合物。❹言之,該類物質 係I成為食品或飼料產物之 ’ 料μ 、杯又成分义一、或欲影響食品或飼 科產奴任-㈣1此,植酸酶添㈣理 酸酶並非飼料或食品主要物 心㈢μ植 天…、成刀或並未存在其天 82696.doc -40- 1262083 飼:::Γ如’植酸酶(單獨或加上其它飼料添加劑)“ 多:質分別添加至飼料中。典型的添加劑通常包括= 夕種化合物,如維4本 .^ L枯或 劑及/或賦形劑。'、、質或甸料加強酵素及適當載 加:食型在此…並非與動物飼料或 接鎮養給人辨偏…古用鐵酶添加劑可直 -…物或較佳直接與其它飼料或食品成分m :後W。如,根據本發明觀點之飼料添加劑可 :成分來製造匈料。該類其它飼料成分包含;多二 2 = 圭為耐熱性的)酵素增補劑、維生素飼料添加劑物 貝飼料添加劑及胺基酸旬料添加劑。所產生之(混合)飼二 U可能包含數種不同型態之化合物,其隨 ,:、、 其它飼料成分(如_ U ^ 以通!與 科。可使用任何目前使用之加工裝置來將:: 出機。 ^製粒機、延展機或壓 同樣地,如本發明觀點之食品添加劑 混合以製造加工今σ力仏 、匕艮ρ口成为 種其它(較佳為耐食品成分包含-或多 麻^人 的)酵素增補劑、維生素食品添加劑及 廣物貝食品添加劑。所產生之(混合)食品添加劑可包本數種 不同類化合物,其隨後可再與適量之其它食品成:(; = 及植物蛋白質)混合以形成加工食品產物。將這此成八:: 成=食品產:時可採用任何目前所使用之:工二 万、較佳具體:Τ施例中,本發明植酸酶組合物可額外包 82696.doc -41 - 1262083 :有效量之::多種飼料或食品加強酵 自以下飼料或食品加強酵素所組 》<為選 半乳_每,特定言之為乳糖酶、其= «菩酶、卜 酶,特定言之為内_β_Μ·葡聚糖酶及内彳::水糖 、細胞素酶、木糖:¾:酶、聚半乳糖酶,特」^4)葡永㈣ 半乳聚糖m卜半乳料酶及****** 半乳糖苷酶、内葡聚糖酶,特定+之水、'1,3'β' 、内-Μ +葡聚糖酶及内]3 β葡1/二内],2·β-葡聚糖酶 特定m心 酶、果料解酵素、 rs"、果膠脂酶、果膠酶、多聚半乳_酸 :=伯=、鼠李半乳_酸酶、氣李半讓酸 1乙::、李半乳糖趁酸蝴糖菩酶, yase), α-半礼糖苷酶、甘露聚糖酶甘 ♦ 聚糖乙醯酯酶、木聚糖乙醯 : 路 日孕蛋白扭、木聚糖酶、阿 拉伯木聚糖酶及脂肪分解㈣,如脂肪酶、磷脂酶及角質 酉母(cutinase)。 本發明之動物飼料添加劑可於餵食飼糧之前或同時供給 車乂佳,也本發明《動物飼料添加劑係與飼糧同時供 給動物。 /一或旬料中 <植酸酶有效量為由約⑺至別,咖FTU/kg ’較佳由約腿15,咖FTu/kg,更佳為由約1〇至1〇,_ g特疋&乏為由約1〇〇至5,〇〇〇 FTu/kg,特別係由約 100至約2,_FTU/每公斤飼料或食品。 本發明範園亦包含植酸酶於加工及製造人類食品及動物 5、斗用/ΖΓ。供給人類食品之穀類及麵粉可以植酸酶酵素 82696.doc -42- 1262083 處:以踯少茲原料之M醇六磷酸鈣鎂含量。肌醇六磷酸舞 鎂很度之降低可增加必需礦物質(如鐵、鈣及鋅)之營養可利 2性因而增加食品品質。除增加食品的營養品質外,於食 叩加工時使用植酸酶可全面增進食品生產法之效率。如於 大豆蛋白質分離製造時將植酸酶添加至白大豆片可明: 加可萃取蛋白質之產量及品質。於食品製造時,植酸酶^ - 万、製込及加工時具有活性,而於最終食品產物中不具活性 。這點對,如麵糰製造及烘培相當的重要。同樣地:、動物 飼料毅物’如經烘培之大豆粉或齐花籽粉可於化合物飼料參 製造前以植酸酶預先處理。於化合物飼料加工前移除動物 飼料成分中之抗-營養因子可產生較佳營養品質及更有價 值之動物飼料成分。於此加工法中,植酸酶於飼料製造時 具有活性’而當當動物攝取經處理之飼料時,在其消化道 中可具有或不具有活性。 — 除了使用植酸酶幫助食品加工以外,本發明範圍亦涵業 以植酸酶補充幫助人類消化的料。片劑型式之植酸酶可 於進食時攝人而將活性酵素遞送至接受者的胃腸道。攝取 者可感受生體中營養的獲取,且對於無法於加工時以植酸 酶處理之食品而言,其可與食品一起攝食。 本發明範圍亦包含於製備食品或飼料製備物或添加劑時 本發明植酸酶之用it,即植酸酶僅於製造期間具有活性而 於最終之食品或飼料產品中不具活性。對於如^麵栖製造 及烘培與生產其它即可食榖類為主的產品而言,此㈣的 意義特別重大。 82696.doc -43- 1262083 植酸酶亦可有利地使用於單胃以及多胃動物,尤其是小 。魚及甲殼動物之飼糧亦可補充植酸酶以進一步改盖飼 枓轉換比並減少密集飼^統***物中之磷濃度。如本發 明之铜料亦可供給如家禽(如火難、鶴、鴨)以及豬、馬、牛 、綿早、山羊、m以及魚和甲殼動物等動物。然而 ’特佳者為將該飼料供給豬或家禽,包含(但不限於)肉難、 母雄,特定言之為產蛋難、火雞及鴨。 ϋϋΑ合物及#用古法 本發明之植酸酶(如上述調配)可與其它成分混合以產生 具有特定優點之新穎飼料組合物。 例如’②、集動物生產操作時較佳應限制包含㈣產生動 物排池物中的磷酸鹽污染。存在料糧中之磷酸鹽含量盘 鱗酸鹽對該動物之有效性係影響動物***物中所排出磷酸 鹽的主要时。—般存在於大豆粉、玉米粒(及其它飼料原 物或穀類㈣中之_鹽有效性較低’因為其鱗酸 鹽王要為植酸型式。為強化動物之生長效率,可將無機磷 敗鹽添加至飼料中以產生包含適量可用磷酸鹽之飼料组合 物。然而’這些飼料調配物包含過多總磷酸鹽並產生磷酸 鹽污染。 雖然目前可用之商品化植酸酶能產生較高之磷酸鹽有效 性’但其部建議與高濃度添加的無機磷酸鹽併用。因本發明 植酸酶作用效力甚強,故可用於產生新穎之動物飼料調配 物^後者可a)明顯降低無_酸鹽濃度,及b)可提供比標準 飼糧較佳之飼料轉換比並促進體重增加。目前可用之商2 82696.doc -44- 1262083 化植酸酶無法使用不添加無機磷之飼科讓動物有效生產。 特定言之,本發明動物飼科包括本發明植酸酶與動物飼 料成分之混合以形成實質上具有較低無機磷濃度之飼料。 於-較佳具體實施例中,本發明飼料組合物包括典型飼料 成分、微量營養素、維生素等,以及有效量之耐熱性植酸
酶及無機磷酸鹽,#中植酸酶及磷之用量由濃度介於約每 公斤飼料50-20,000單位之植酸酶及〇.45%以下之無機磷,較 佳濃度介於每公斤飼料1〇(M〇,〇〇〇單位之植酸酶及〇 225% 以下之無機磷,特定言之為濃度介於每公斤飼料ΐ5〇_ι〇,〇〇〇 單位之植酸酶及〇.15%以下之無機磷,或特佳者為濃度介於 每公斤飼料250-20,000單位植酸酶且無外來添加之無機磷。
同時,本發明範圍亦包含促進農場動物生產之體重增加 及飼料轉換比(FCR)的方法。本發明之植酸酶可促進增加體 重及FCR,特別是當與低無機磷酸鹽含量之飼糧混用時、 具體而言,本發明方法可改善低無機磷酸鹽飼糧 to重*曰加狀況,其係利用餵食動物一種包括本發明植酸酶 及相當於或低於0.45%無機磷酸鹽之飼糧。較佳地,本方法 包括餵食包含植酸酶及低於〇·225%無機磷酸鹽之飼糧,或 更佳地,本方法包括餵食包含植酸酶且無添加無機磷之飼 糧0 本發明動物飼料可用於單胃或多胃動物。本發明動物飼 牛了I &豕禽、或豬或牛或伴侣動物,如犬或描或馬。兮 飼枓及其於飼料中用法之實例見於實例3。 本發明亦提供一種動物飼養方法,其可明顯減少環境磷 82696.doc -45 - 1262083 酸鹽負荷。本方法包括餵食整個禽群或畜群之農場動物包 含本發明植酸酶及減量之無機鱗(低於〇·45%)之飼料組人物 。更佳地,本方法包括餵食整個禽群或畜群之農場動物包 含本發明植酸酶及大幅減量之無機磷(低於〇·225%)之韵料 組合物,或最佳地,本方法包括餵食整個禽群或畜群之農 場動物包含本發明植酸酶且不含無機磷之飼料組合物。本 方法可供向密度飼養動物並將由養殖運作所釋放至環境中 之磷酸鹽減至最低。 本發明將進一步藉下列實例描述,其並非欲以任何方式 限制本發明範圍。 實例1 盤備及鑑別耐熟植酸酶重組體表現之示範性古法 為促成在黑麴菌(Aspergillus niger)之表現,可以黑麴菌 NW205 (ura- arg- nic-)作為轉化並篩選成為可製造植酸酶 之轉化株’如見述於帕薩蒙提斯(passarn〇ntes)等人(1997)。 為促成在啤酒酵母菌(Saccharomyces cerevisiae)之表現, 將植酸酶基因選殖入一以2μ-為主之載體中,如存在縮短版 之gap(FL)啟動子及ph〇5終止子(傑尼司(Janes)等人,1990) ’以及一個選擇標記之中者。將植酸酶基因選殖至 EcoRI-BamHI鈍端表現匣中gap(FL)啟動子之下游。採用啤 /酉酵母菌YMR4 (urg- his- leu- pho3- pho5_)作為轉化之用。將 獨立轉化株在最低營養要求培養基中進行初步培養1至2天 。於YPD培養基中後續培養2至3天後檢驗植酸酶產量。 為促成在多形漢遜酵母(Hansenula polymorpha)之表現, 82696.doc -46- 1262083 可將植酸酶基因以EcoRI片段型式選殖入多形漢遜酵母表 現載體pFP(Gellisen等人1991)之相關部位、置於甲酸脫氳酶 (FMD)啟動子(EPA 299108)之下游。所產生之質體可轉化為 多形漢遜酵母RB 11。將轉化株個別接種入最低營養要求培 養基(含2%葡萄糖之YNB)中。於數個傳代後、以特定壓力 將表現性質體之多重整合物併入多形漢遜酵母之基因組中 ,測試單一穩定選殖株之植酸酶活性。 為促成在畢赤酵母屬之表現,將可編碼植酸酶之pPIcocA 載體轉化入畢赤酵母菌strain X33,其係採用電穿孔法以廠 商指示方法進行(Invitrogen)。將經轉化細胞塗在 YPD-Zeocin瓊脂培養基上並於含甘油之最低營養要求培養 基(BMGY)中培養陽性菌落24小時。當酵母細胞密度達2.5 X 108細胞/ml (〇D60〇=5)時,將細胞離心並懸浮於0.5%甲醇培 養基(BMMY)中以誘發基因表現。 蛋白質純化 - 將肉湯培養基(典型地由500至1,000 ml)離心以移除細胞 並藉由超過滤以 Amicon 8400 cells (PM30膜;Grace Ag, Wallisellen,瑞士)及 ultrafree -15 離心過滤裝置(Biomax-30K; Millipore,Bedford,Mass.)加以濃縮。濃縮液(通常為1.5至5 ml)以 Fast Desalting HR 10/10 或 Sephadex G-25 Superfine columns(Pharmacia Biotech, Dubendorf,瑞士)去除鹽分,其 中使用10 mM醋酸鈉(pH 5.0)作為洗脫緩衝溶液。將去除鹽 分之樣本直接裝至1.7 ml之Poros HS/M陽離子-交換色譜柱 中(PerSeptive Biosystems,Framingham,Mass.)或裝入 1.7-ml 82696.doc -47 - 1262083
Por〇s HQ/Μ陰離子-交換色譜柱中。經由這兩種陰離子-交換 及陽離子-交換色譜法,都可藉由使用最佳化之氯化鋼梯度 將植酸酶洗脫成為純化型式。 由酵母(如啤酒酵母菌或裂殖酵母菌)所表現之去鹽化植 酸酶在去鹽化之後置於2 M (NH4)2S〇4中並裝入1-ml Butyl Sepharose 4 Fast Flow忌水***互作用色譜柱(Pharmacia Biotech)中。酵素以含2至0 M (NH4)2S〇4線性梯度之20 mM 醋酸鈉(pH 5.0)進行洗脫。植酸酶經離子交換洗脫並濃縮且 裝填入120-ml Sephacryl S-300凝膠滲透性色譜柱(Pharmacia Biotech)中。 處理畢赤酵母屬所表現之酵素時,首先將酵素懸浮於50 mM Tris-HCl (pH 7)並添加硫酸銨至25%飽和度。混合物離 心後(25,000重力加速度,20分鐘),將丸狀物懸浮於10 1111^ 之25mM的Tris-HCl(pH7)中。以相同緩衝溶液將懸浮液透 析隔夜並裝填入DEAE-Sepharose管拄(Sigma)中,以25 mM Tris-HCl pH 7力口 以平衡。以 200 mL之 25 mM Tris-HCl (pH 7) 沖洗管柱後,再以0·2 Μ之NaCl、25 mM Tris-HCl (pH 7)洗 脫蛋白質。分析所有分段收集部分之植酸酶活性及蛋白質 濃度(婁瑞(Lowry)等人,1951)。整個純化作用係於4°C中進 行’且並將所得分段部分貯存於-2 0 C。 植酸酉每活{生之評估 植酸酶活性之測定係根據估計植酸水解所釋出之無機碟 酸鹽,其可於37°C中依照如英格連(Engelen)等人(2001)所述 之方法進行。一單位酵素活性定義為於分析狀況中每分鐘 82696.doc -48- !262083 可釋出1 μιηοΐ無機磷酸鹽的酵素用量。例如,測量植酸酶 活性時可於37t之增補1 mM (:叫的⑽續酷酸鈉緩衝溶 = (ΡΗ 5·5)中,培養2·〇㈤酵素製備物與4〇㈤之以福肌醇 六磷酸鈉60分鐘。於培養後,添加4〇ml之停止色素生成劑 來中止反應(由等量10% (w/v)鉬酸銨及〇·235% (w/v)釩酸銨 儲液所組成)。對照一磷酸鹽標準組,在415nm波長下、以 分光光度測定釋出之磷酸鹽。由使用預建磷酸鹽標準曲線 所知 < 包含植酸酶樣本的A^5 nm吸收值可内推計算出植酸 酶/舌性。或者,藉由使用廠商確認之標準化植酸酶參考值所 產生 < 植酸酶活性曲線,可代替磷酸鹽標準曲線來測定酵 素活性。比活性可表達為每毫克蛋白質之酵素活性單位。 或者,在檢測植酸酶活性時,可根據估計植酸水解時所 釋出的播機磷酸鹽來計算,其係依如英格連等人(1994)所述 之方法於37°C進行。一單位酵素活性定義為於分析狀況下 每分鐘可釋出1 μχηοΐ無機磷酸鹽之酵素量。如植酸酶活性 之測量可藉由於37t中、在增補過/mM CaCl2i1〇〇 mM Tds HC1緩衝溶液(PH 7.5)中培養150 ml之酵素製備物與6⑻ ml之2 mM的肌醇六磷酸鈉30分鐘來實行。於培養後,添加 750 ml之5%三氟醋酸中止反應。添加15〇〇 ml之著色劑後(4 份1.5%鈿酸銨in 5·5%硫酸及1份2·7%硫酸鐵;虛米儒 (Shimizu)’ 1992),比對700 nm波長之磷酸鹽標準分光光度 測定結果來測定嶙酸鹽。或者,利用包含〇·5()/。(約5 mM)之 植酸及200 Mm醋酸鈉(pH 5.0)之分析混合物來測定植酸酶 活性。於37°C (或於37至90°C間之溫度)培養15分鐘後,添加 82696.doc -49- 1262083 等量之15%三氟醋酸中止反應。將100 ml之分析混合物及 900 ml 之 H20 與 1 ml 之 0.6 M H2S〇4-2% 抗壞血酸-0.5% 鉬酸 銨混合後測定磷酸鹽離子釋出量。於50°C培養20分鐘後, 測量820 nm波長之吸收狀況。比活性可表示為每單位蛋白 質之酵素活性。 pH作用影孿 為研究pH作用影響,將植酸酶稀釋於pH 5.5之200 mM酷 酸鈉緩衝溶液中。使用下列各種緩衝溶液來製備基質溶液 :200 mM甘胺酸,pH 2.0、2.5或3.0 ; 200 mM醋酸鈉緩衝 溶液,卩113.5、4.0、4.5、5.0、5.5、6.0或6.5及200 11^丁1^-11(:1 ,pH 7·0、7·5、8·0、8.5或9·0。所有緩衝溶液皆補充} mM 之CaCh。該基質溶液包含i〇 來自米之植酸(C6H6024Na12 ,Sigma-Aldrich Chemie GmbH,Steinheim,德國)。 二當升酵素製備物於試驗溫度下水浴中預先培養5分鐘 ,並添加4 ml之基質溶液開始酵素反應。由於混合比例會
稍微改變混合物之pH,混合物可於培養前調整至所欲之pH 。混合物於37 C之溫度下培養一段時間,如6〇分鐘。添加4 ml足歐凡納鉬試劑(molybd〇vanadate)試劑以終止培養。該 試劑之製備如英格連等人所述(1994)。隨後測定酵素活性。 埶作用影響 為"、彳走最佳度曲線,依如上所述酵素及基質溶液以及 其此口比例進仃製備。然而,混合物之阳則採用經測定最 佳者將此口物培養一段時間,如6〇分鐘,培養溫度採用 下列一或多個溫度:3〇、40、50、55、60、65'7〇、75、 82696.doc -50- 1262083 8〇及l〇〇t。根據無機正碰鹽釋出量來測試活性。進行水 合液中I耐難研究時,植酸酶可於升高之溫度下預先培 養。於預先培養期之桉,Μ 4笨士、A t " 。 Λ <傻將樣本於冰上冷卻3〇分鐘。其於 37 C中再次培養並測定酵素之殘餘活性。 水性培養基中 < 熱穩定性並無法正確地表現飼料成粒過 程中之穩定性。因酵素若要供廣泛應用為飼料添加劑,其 應:禁得起飼料預先處理所需之溫度條件。動物飼料之1 種吊見〈預先處理為成粒。為研究飼料混合物之耐熱性, 可迖擇包3小麥做為主要成分並加強維生素及礦物質之實 用飼糧於不同成粒溫度中進行成粒試驗。由於小麥包含相 當Κ天然植酸酶活性,故先將該飼糧於不同溫度中成粒 以測量其天然植酸酶活性不活化之程度。更改導入處理器 之蒸汽及調整處理器中之溫度可改變熱處理程度(請注意 模具之溫度可較處理器中之溫度高出7至1〇。〇。處理器中 I溫度控制係藉由裝在機器中之感應器持續地進行。成粒 時使用孔徑5 mm、長15 mm之模具。為計算所添加之植酸 酶的殘餘活性,以各種溫度處理時之天然植酸酶活性應自 總活性中減掉。顆粒隨後於批式冷卻器中冷卻。分析所產 生顆粒樣品中殘留之植酸酶,比較最初添加至原料粗粉中之 植酸酶活性程度,並應考慮到以各溫度處理時之天然植酸 酉母’舌性。大部分肉難及小豬之飼糧係於約70°C之溫度中成 粒0 致量不活化作闬之耐受性 植酸酶對蛋白酶不活化作用之耐受性可使用來自豬胃黏 82696.doc -51 - 1262083 膜之胃蛋白酶及來自豬胰臟之胰酶來加以研究。胃蛋白酶
Sigma P7012 (Sigma-Aldrich Chemie GmbH,Steinheim,德 國)包含每毫克蛋白質2,500至3,500單位之活性,而胰酶, Sigma P1500(來自同一供應商)包含之活性相當於美國藥典 (Umted States Pharmacopeia,U.S.P·)。將胃蛋白酶懸浮於 〇1 M HC1 (pH 2.0)中,而胰酶則分散於〇1 M NaHC〇3 (pH 7 中。 分析胃蛋白酶時,將包含3000 U/瓜丨之1 ml新鮮製備的胃 蛋白酶溶液與1 ml之新鮮製備的植酸酶溶液(〇〇2 u/2 ml, 在最終測量植酸酶活性階段時以緩衝溶液稀釋後成為〇 〇8 U/2ml)於試管中混合。混合物於37。〇、pH2 〇水浴中培養〇 至45分鐘(胃蛋白酶活性之最佳狀況)。於培養後,將1 溶液以緩衝溶液溶液(pH 5.5)稀釋(1 : 9)並完全混合。將2 mi 之溶液與4 ml植酸基質溶液於40°C及pH 5.5培養60分鐘並 測足植酸酶活性。分析胰酶時,將含4·81 mg/mi之1 ml新鮮製 備的胰酶溶液與1 ml之植酸酶溶液混合。該混合物於4〇。〇及 pH 7.0中培養〇至45分鐘。以上述相同方法稀釋及調整pH值 後測量植酸酶活性。 或者,依照廠商(Sigma)指示方法將純化植酸酶(2 mg/ml) 與不同量之胃蛋白酶及胰蛋白酶共同培養。將胃蛋白酶 (800 U/mg蛋白質)及胰蛋白酶(1500 BAEE單位/mg蛋白質) 分別溶於 10 mM HC1,pH 2 (0_1 mg/mL)。一 BAEE單位定義 為於pH 7.6及25°C中、以BAEE做為基質、使用253 nm波長 時、每分鐘之0.001吸光度變化程度。以最終量為100 mL為 82696.doc -52- 1262083 準,將10 mg純化之植酸酶(〇·〇8至〇·ι u)與胰蛋白酶或胃蛋 白酶於37°C中培養1至120分鐘,蛋白酶/植酸酶(w/w)比例範 圍由〇·〇01至0·01。反應於冰上終止並將混合物pH值調整至8 以進行蛋白質電泳及植酸酶活性分析。經消化之蛋白質混 合物藉由硫酸十二酯鈉(SDS)聚丙缔醯胺或尿素-sds-聚丙 烯醯胺凝膠進行電泳分析。 上清液中之穩宕抖 自產蛋難採集消化物樣本。以頸部錯位殺死母難並移出 消化道。由嗉囊、胃(前胃)、十二指腸(幽門至膽管入口) 、空腸(膽管入口至梅克耳氏(Meckel,s)憩室)及迴腸(梅克耳 氏憩室至迴盲腸接合處)採集消化物樣本。使用數位
(Ingol Messtechnik AG,Urdorf,瑞士)測定消化樣本 ipH 。啼囊、胃、十二指腸、空腸及迴腸等部分之阳讀數分別 為 5.02、2·75、6.28、6.63及 6.98。 一 將樣本冷;東於-2(TC直到需使用之時或者立即使用。將消 化物樣本以1:1比例稀釋於蒸餾水中,完全混合並於1〇,〇〇〇 g離心ίο分鐘。將上清液回復並調整其pH值使其pH值相當 於最初在各消化道之不同部位。將恢復之消化物上清液置 於於冰/水浴中直到使用之時為止。進行分析時,將丄⑹之 消化物上清液與1如酵素溶液混合並將該混合物於机中 培育0及2◦分鐘。為測試殘餘植酸酶活性,將1 ml溶液以緩 衝命液(pH 5.5)稀釋,9)。接著將2ml溶液與斗⑹基質溶液 混合並於40°C中培育60分鐘。 f例2 82696.doc -53 - 1262083 熱植酸酶之分離及锻別 鑑別所欲之之植酸酶基因時可利用基因發現及酵素最佳 化,如藉由混合所欲之突變及/或經由DNA置換來達成目的 選擇耐熱植酸酶及/或經過最佳化以符合所欲之活性輪廓 。其包含,如高比活性(如>8〇〇 u/mg、於卩^^ 4·5及37它中、使 用植酸(包含其衍生物,即具有丨至6個磷酸鹽基團之肌醇) 作為基貝)、特足溫度(如37^ )之活性、低口^值(如豬之pH 最佳;I於2.5至3.5或低於4·〇)之活性、胃穩定性(如於家禽及 豬之模擬或真實胃液中之半衰期>3〇分鐘)' 加工穩定性(如 I 85 C凋配狀態中半衰期分鐘,通過商業上可接受之成 粒步驟後至少保留50%活性)、降低使用比率(如有效劑量為 低於0.5克酵素/噸飼料即可減少磷酸鹽釋出75%以上)及/或 基貝特并性(如對肌醇單磷酸鹽之特異活性)。 A·新植酸酶基因 - 為鑑別新穎之植酸酶基因,可使用一些不同的方法。其 中一種方法中,由14種不同的大腸桿菌K-12菌株直接選殖 appA基因可產生2種新穎植酸酶基因,各具有2個胺基酸的 差異。 為最佳化大腸桿菌植酸酶(appA)(親代)基因,可進行飽和 致突變,使基因中之每個密碼子皆改變成僅編碼胺基酸。 (見於如 WO 01/90333,Diversa C〇rP〇mion)。測試所有突變 型加熱(7(TC)後之殘餘活性。可鑑別出16個獨特的選殖株1 其較親代基因具有更強之耐熱性。各獨立突變以組合方式 混合,依各種組合製備選殖株並測試這些選殖株相對於野 82696.doc -54- 1262083 大腸桿菌植酸酶之耐熱性(圖1及2)。於各種溫度下3〇 分鐘後,具有8個胺基酸取代基與一個不活動密碼子異變之 選殖株NOV9X的殘餘活性輪廓顯示於圖3A,而其i 〇〇。〇中之 殘餘活性曲線圖顯示於圖3B。表丨概述各種植酸酶之特性。 表1 ----—— 特性 AppA 納畜佛司 Nov9x app A-2 * SA# —------ 10 1_0___ 10 查穩定性 100〇C 為 3% ND 100°C 為 40% ND # > _ 1 相對於pH 4.5 2大腸桿菌基因變異物 表現於各種值主細胞之NQV9X植酸酶的胃中穩定性及耐 熱性顯示於圖4。NOV9X植酸酶可於三種不同的微生物中製 造,大腸桿菌、巴斯德畢赤酵母及裂殖酵母菌。大腸桿菌 並不會糖化蛋白質,而巴斯德畢赤酵母可將蛋白質糖化至 某種程度且裂殖酵母菌糖化能力甚至更佳。愈佳之糖化作 用程度似乎與愈佳的胃穩定性有關。數據資料亦顯示耐熱 I4生Ik糖化作用私度而增加。此作用未見於其它類型之植酸 酶。如懷斯(WySS)等人(1999)報告不同之糖化作用程度並未 影響真菌植酸酶(A· fumigatus)之耐熱性。同樣地,羅迪高 茲(Rodriguez)等人(2〇〇〇)亦描述經遺傳修改以產生高度糖 化作用並未增進大腸桿菌植酸酶耐熱性(巴斯德畢赤酵母 所表現者)。因此,N0V9X植酸酶具有數種有利特性,如增 強之耐煞性、南度的比活性及增強的胃穩定性。 82696.doc -55- 1262083 有關於胃穩定性及糖化作用,文獻中僅有一些比較性研 究’且結論相互矛盾。羅迪高茲等人(1 999)的論文揭露由巴 斯德畢赤酵母所表現之親代大腸桿菌植酸酶基因對胃蛋白 酶極具抵抗性,但對胰蛋白酶之蛋白質水解卻非常敏感。 相反地,可發現納畜佛司對胰蛋白酶具抵抗性而對胃蛋白 酶敏感。 實例! 在巴斯德畢赤酵母中可編碼具植酸酶及酸性磷酸脂酶 (Acid Phosphatase)活性之多肽的n〇v9X基因之建構及過度 表現性 基因來源及蛋白質序列。建構一可編碼Nov9X植酸酶胺 基酸序列(參考Diversa公司專利之Nov9X序列)之合成基因 並選殖入標的選殖載體pPCR-Nov9X。該基因序列係設計為 適用於酵母之密碼子並由轉化Epicurian Coli XLl-Blue MRFf細胞(Stratagene,La Jolla,CA)所提供。 表現性宿主及載體。巴斯德畢赤酵母pPIC9表現載體及巴 斯德畢赤酵母 GS115 株得自 Invitrogen (Carlsberg,CA)。 pPIC9表現載體包含乙醇氧化酶1啟動子(AOX1)且為甲醇誘 導性。將Nov9X基因選殖入載體之啤酒酵母菌α-因子前肽原 分泌訊號結構中可產生於細胞外表現之重組蛋白質。 建構巴斯德畢赤酵母轉化載體。由pPCR-Nov9X(Qiaprep Spin Miniprep protocol,Qiagen,Valencia,CA)開始製備質體 ,將標的Nov9X基因之密碼部位以限制性核酸内切酶消化 作用切除,其係使用Bgl II及Xbal限制性酵素(New England 82696.doc -56- 1262083
Biolabs,Beverly,ΜΑ)。典型的限制性消化係於37°C中進 行60分鐘,隨後再於65°C中進行20分鐘之熱不活化作用。 釋出之1242鹼基對DNA片段以凝膠純化(QIAquick Gel Extraction Kit, Qiagen,Valencia,CA)並用以作為DNA模版 以進行PCR放大作用。利用下列之合成寡核苷酸引子1及 2(Sigma-Genosys,The Woodlands,TX)及 PFU Turbo DNA聚 合酶(Stratagene,La Jolla,CA)來放大標的 DNA : 上游引子 1 : 5'-gaaggggtat ctctcgagaa aagagaggct caatctgaac cagaattgaa gttggaatct (序列鑑別編號:2) 下游引子 2 : 3f-attattcgcg gccgcctatt acaaggaaca ggctgggatt ct (序列鑑別編號:3) 使用下述共30回之熱循環輪廓以放大Nov9X基因: 94°C、5分鐘-初始模版去活性 94°C、30秒-去活性 61°C、30秒-黏接 72°C、90秒-引子延長 經Nov9X放大之PCR產物(序列鑑別編號:4)以凝膠純化 (QIAquick Gel Extraction Kit,Qiagen,Valencia,CA),並以 Not I及 Xho I(New England Biolabs,Beverly,MA)及核酸内 切酶消化。巴斯德畢赤酵母表現載體pPIC9 (Invitrogen, Carlsbad,CA)之製備係同樣地藉由Not I及Xho I之核酸内切 酶消化並藉凝膠萃取純化。經核酸内切酶切割之Nov9X PCR產物於16°C中、在T4 DNA連接酶存在之下與直線化的 pPIC9表現載體(New England Biolabs,Beverly,ΜA)進行連 82696.doc -57- 1262083 結過夜,隨後並轉化進入大腸桿菌ToplOF’反應潛能細胞 (Invitrogen,Carlsbad,CA),該細胞即製造Nov9X酵母轉化結 構者。包含所欲基因之Nov9X/pPIC9選殖株係利用以Not I 及Xho I所進行之質體DNA限制圖譜分析而鑑定。Nov9X轉 化構造之完整性可藉由DNA序列分析來確定。此種選殖策 略可產生一種構造,其中之Nov9X基因序列可選殖進入載 體之啤酒酵母菌α-因子前肽原分泌訊號之框架結構中以供 細胞外蛋白質表現。 製備供酵母轉化之Nov9X/pPIC9DNA。對包含Nov9X/pPIC9 表現構造之質體DNA進行純化,其係將50 mL之於LB肉汁 (增補100 pg/mL胺苄青黴素)中生長過夜之大腸桿菌 ToplOF’細胞的培養物加以純化。分離之質體DNA以Bgl II 核酸内切酶之消化作用於37°C中進行線性化60分鐘。消化 後以20分鐘、65°C之培養期將Bgl II加以熱-不活化處理。線 性化之Nov9X/pPIC9 DNA首先以酚純化再接著以酚-氯仿 -3-甲基丁醇萃取。使用異丙醇自最終抽出物之水相中將 DNA沉澱、離心、以70%乙醇沖洗並再懸浮於TE緩衝溶液 (10 mM Tris-HCn,0·1 mM EDTA,pH 8.0)中。 製備巴斯德畢赤酵母GS115反應潛能細胞。酵母細胞之製 備係藉由將細胞塗至YPD瓊脂糖板上。於30°C生長隔夜後 ,將單一的酵母菌落自YPD瓊脂糖板轉移至10 mL之YPD液 態肉汁中,並於30°C生長隔夜。自該10 mL之種子培養物中 採用 100 pL接種至500 mL之額外YPD肉汁中。此大規模培 養物係於30°C生長隔夜至光密度成為1.25 (以595 nm波長測 82696.doc -58- 1262083 量)。藉由離心採集細胞、再懸浮,並依嚴商指示以一系列 之水及山梨糖醇沖洗處理(Invitrogen Pichia Expression Kit Instruction Manual,version L,pg 59) 〇 將Nov9X/pPIC9 DNA轉化入巴斯德畢赤酵母GS115〇將經 Bgl II限制性消化之Nov9X/pPIC9質體DNA (4.6 pg)混以80 μί之經山梨糖醇處理的巴斯德畢赤酵母GS 11 5細胞,置於一 0.2 cm之電穿孑L法小玻璃管中(Gene Pulser Cuvettes, BioRad,Hercules,CA)並於冰上培養5分鐘。將該電穿孔法 小玻璃管置入BioRad Gene Pulser II裝置中並以1.5 kV、25 pF及200 Ω之設定進行脈衝。將冰冷的山梨糖醇(1.0 mL)加 至電穿孔法混合物中,隨後將其薄塗至不含組織胺酸、最 基本營養·葡萄糖(MD)試盤上。於30°C培養達3日使菌落成 長。 篩選供植酸酶表現之轉化株。自該初級轉化株所薄塗之 MD試盤組中取出單一菌落接種於25 mL之BMGY肉汁(加上 甘油的經緩衝之最基本營養培養基)並於30°C中生長過夜 。將取自25 mL BMGY液態培養物之2 mL中,使用YeaStaf 基因組DNA純化組(Zymo Research,Orange,CA)將基因組 DNA純化。將純化之基因組DNA以及前列之寡核菩酸引子i 及2用於PCR篩選法中以鑑別含有吾人所欲之植酸酶基因 的巴斯德畢赤酵母選殖株。上述熱循環條件狀況係用於濟j 試基因組選殖株組。可產生1281個鹼基對之PCR片段的選歹直 株可進一步定性其Nov9X蛋白質表現性。將剩餘的23 mL之 來自選殖株的畢赤酵母屬培養物(其經PCR篩選測試為 82696.doc -59- 1262083 Ν ο v 9 X基因〶性)於2 q q q Γρ m離心1 〇分鐘,倒出上清液,並 將細胞顆粒再懸浮於10 mL之BMMY (含甲醇之經緩衝最低 營養培養基)以引發蛋白質表現。於30°C培養24小時之後, 以SDS-PAGE分析經澄清之培養肉湯可確認能表現n〇v9X植 酸酶之選殖株。功能活性分析可測量自鈉植酸酶基質釋出 典機鱗酸鹽,其可確認出可分泌功能活性蛋白質的表現植 酸酶之培養物。 實例4 餵食試驗 糊狀韵料 圖5說明包含NOV9X植酸酶之飼糧對家禽生長表
Tjr 用,其藉由飼料轉換比(FCR)來代表。飼料轉換比係指飼料 杈取里除以小雞之淨體重增加。較低的比例顯示每單位攝 之飼料可使小雞增加更多的體重。較低的比例顯示雞可 更有=地利用所攝取之飼料。使用標準的家禽飼糧時添加 二種濃度之無機磷酸鹽至飼糧中,0.45%及0.225%。0.45% 為—般用於商品化家禽飼糧之濃度。此試驗中採用由重组 畢赤酵母菌所產生之Ν〇ν9χ植酸酶。 多組每欄1〇隻的小雞直到21日②,好^^ 重複 J斧且㈠1並精由減去1日齡雞的體 ,測定最終體重。記錄各欄小雞之飼料攝取量,並測定飼 2平均消耗量。刪9X植酸酶可藉由冷;束液體酵素溶液 =量劑(於此例子中為磨碎的大豆粉)之混合物來調配,隨 雄仃冷凍乾燥。此種調配物可直接添加至飼糧中“内玄 佛司可依廠商建議使用。 、.,内田 82696.doc -60- 1262083 控制組飼糧(未補充酵素)清楚顯示出需要補充磷酸鹽。低 磷酸鹽濃度之FCR為1.603,而高磷酸鹽控制組之FCR為 1.391。添力口 NO V9X植酸酉每之濃度為25 0、500及1000 U/kg 均可改進低及高磷酸鹽飼糧之FCR。當添加越多酵素,難 生長表現越加增進,其由FCR數值之降低可以得見。另人 驚訝地,除了可大幅減少低P飼糧之磷酸鹽以外,500 U/kg NOV9X低磷酸鹽飼糧(FCR為1.393)甚至表現幾乎與高磷酸 鹽控制組(FCR 1.391)—樣好。此外,於高及低磷酸鹽二種 飼糧中(作為陽性控制組中,納畜佛司廠商建議使用之磷酸 鹽量為0.45%,且在添加500 U之納畜佛司後其僅減少0.1 % 之磷酸鹽),NOV9X植酸酶表現較納畜佛司(1040 U/kg)為佳 。因此,使用本發明耐熱植酸酶以補充飼料可減少為增進 FCR所需添加之磷酸鹽濃度。 成粒飼料 以類似上述設計來進行餵食試驗,但使用成粒飼料取代 糊狀飼糧。將飼料組分與NO V9X植酸酶酵素(由畢赤酵母菌 或裂殖酵母菌製造)或納畜佛司混合再接著使用蒸汽喷射 於85°C中調製成粒狀。以該飼糧餵食重複多欄小難並測定 42日齡小難之重量增加。 未添加植酸酶之控制組飼糧包含0.45%磷酸鹽。所有其它 飼糧(含100、300及900單位/kg之納畜佛司或NOV9X)則包含 0.225%磷酸鹽。重量增加之數據顯示於圖6。這些數據顯示 NOV9X植酸酶於成粒過程後可殘留活性並使改進攝取該飼 糧之小難的表現。相對於無酵素之控制組而言,實驗組可 82696.doc -61 - 1262083 j’”-員促進重里&加且其效果約相當於陽性控制組(含Ο·*?/。 冋%1鹽而不含酵素之旬糧)。這些數據亦證實相對於納玄 佛司,NOV9X植酸酶之耐熱性表現較佳。 '、印 實例5 银食試驗 "進行七項更進-步的試驗,某些進行至21曰齡而其它進 仃土 42日齡。於各試驗中,N⑽各種濃度投藥,且在 大Ρ刀的4 U自與納頁佛司作比較。隨後將來自此7項及 上述2項試驗之動物表現數據填人數據表中並使用梯式線 性退化万法統計分析以測定35種組合變化(飼糧、酵素及 理改變)在數據表上表現最佳。有意義模式同時以獲得體重 及FCR的方式描述並以繪圖顯示於圖7及8。對所測得之體 重獲知及FCR炎化來說,酵素來源(即納畜佛司或 證實”要的衫因素。因此可證實就體重增加及FCR二 者而言,在9項輸入數據表的試驗巾,NOV9X平均優於納玄 佛司。此種多重-因子或變化_分析方法於測定產品之相對I 力時車乂可靠’因其可避免過度依賴單項試驗。 以t m而吕,此實例之資料顯示Ν〇ν9χ植酸酶可明顯更 有效釋出存在於飼料中大豆及玉米部分的有機鱗酸鹽1 使用NOV9X植酸酶時,很明顯可比使用納畜佛司時添加較 /的典機鱗酸鹽而仍能維持動物表現。其顯示當將飼糧調 配為可利用各產品之最大效能時,使用NOV9X比納畜佛司 更能減少糞肥中之淨磷排出量。 此外,巧些結果顯示具有低無機磷酸鹽濃度之新穎化合 82696.doc -62- 1262083 物的動物飼料可用於有效生產農場動物,同時因大幅減少 動物***物中釋放於環境中之磷酸鹽,而帶給地理環境極 大的好處。這代表生產這些動物之農場所產生之環境衝擊 更少。 參考文獻
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Met Ala Gin Ser Glu Pro Glu Leu Lys Leu Glu Ser Val Val He Val 1 5 10 15
Ser Arg His Gly Val Arg Ala Pro Thr Lys Ala Thr Gin Leu Met Gin 20 25 3〇
Asp Val Thr Pro Asp Ala Trp Pro Thr Trp Pro Val Lys Leu Gly Glu 35 40 45
Leu Thr Pro Arg Gly Gly Glu Leu 工le Ala Tyr Leu Gly His Tyr Trp 50 55 60
Arg Gin Arg Leu Val Ala Asp Gly Leu Leu Pro Lys Cys Gly Cys Pro 65 7 0 75 80
Gin Ser Gly Gin Val Ala lie lie Ala Asp Val Asp Glu Arg Thr Arg 85 90 95
Lys Thr Gly Glu Ala Phe Ala Ala Gly Leu Ala Pro Asp tys Ala lie 100 105 no
Thr Val His Thr Gin Ala Asp Thr Ser Ser Pro Asp Pro Leu Phe Asn 115 120 125 82696.doc 1262083
Pro Leu Lys Thr Gly Val Cys Gin Leu Asp Asn Ala Asn Val Thr Asp 130 135 140
Ala lie Leu Glu Arg Ala Gly Gly Ser lie Ala Asp Phe Thr Gly His 145 150 155 160
Tyr Gin Thr Ala Phe Arg Glu Leu Glu Arg Val Leu Asn Phe Pro Gin 165 170 175
Ser Asn Leu Cys Leu Lys Arg Glu Lys Gin Asp Glu Ser Cys Ser Leu 180 185 190
Thr Gin Ala Leu Pro Ser Glu Leu Lys Val Ser Ala Asp Cys Val Ser 195 200 205
Leu Thr Gly Ala Val Ser Leu Ala Ser Met Leu Thr Glu lie Phe Leu 210 215 220
Leu Gin Gin Ala Gin Gly Met Pro Glu Pro Gly Trp Gly Arg lie Thr 225 230 235 240
Asp Ser His Gin Trp Asn Thr Leu Leu Ser Leu His Asn Ala Gin Phe 245 250 255
Asp Leu Leu Gin Arg Thr Pro Glu Val Ala Arg Ser Arg Ala Thr Pro 260 265 270
Leu Leu Asp Leu lie Lys Thr Ala Leu Thr Pro His Pro Pro Gin Lys 275 280 285
Gin Ala Tyr Gly Val Thr Leu Pro Thr Ser Val Leu Phe lie Ala Gly 290 295 300
His Asp Thr Asn Leu Ala Asn Leu Gly Gly Ala Leu Glu Leu Asn Trp 305 310 315 320
Thr Leu Pro Gly Gin Pro Asp Asn Thr Pro Pro Gly Gly Glu Leu Val '325 330 335
Phe Glu Arg Trp Arg Arg Leu Ser Asp Asn Ser Gin Trp lie Gin Val 340 345 350 82696.doc 1262083
Ser Leu Val Phe Gin Thr Leu Gin Gin Met Arg Asp Lys Thr Pro Leu 355 360 365
Ser Leu Asn Thr Pro Pro Gly Glu Val Ly.s Leu Thr Leu Ala Gly Cys 370 375 1 380
Glu Glu Arg Asn Ala Gin Gly Met Cys Ser Leu Ala Gly Phe Thr Gin 385 390 395 400 lie Val Asn Glu Ala Arg lie Pro Ala Cys Ser Leu 405 410
<210> 2 <211> 60 <212> DNA <213>人工序列 <220> <223> 正向引導子 <400> 2 gaaggggtat ctctcgagaa aagagaggct caatctgaac cagaattgaa gttggaatct <210> 3 <211> 42 <212> DNA <213>人工序列 <220〉 -...............-- - <223>反向引導子 <400> 3 attattcgcg gccgcctatt acaaggaaca ggctgggatt ct <210> 1281 DNA 人工序列 <211> <212> <213> <220> <223〉Nov9X 基因 <400> 4 gaaggggtat ctctcgagaa aagagaggct caatctgaac cagaattgaa gttggaatct gttgtcattg tctccagaca cggtgttaga gctccaacta aggctactca gttgatgcaa gatgttactc cagatgcttg gcctacctgg cctgttaagt tgggtgaatt gactccaaga ggtggtgaat tgattgctta cttgggtcac tactggagac aaagattggt tgctgatggt 82696.doc 1262083
ttgttgccaa agtgtggttg tccacaatct ggtcaagttg ctatcattgc tgatgttgat 、 300 gaaagaacta gaaagactgg tgaagccttc gctgccggtt tggccccaga ctgtgctatc 360 actgttcaca ctcaagctga tacttcctct ccaga.tccat tgttcaaccc attgaagact 420 ggtgtctgtc aattggataa cgctaacgtt actgatgcca tcttggaaag agctggtggt 480 tctatcgctg acttcactgg tcactaccaa actgccttca gagaattgga aagagtcttg 540 aacttcccac aatctaactt gtgtttgaag agagagaagc aagacgaatc ttgttccttg 600 actcaagcct tgccatctga attgaaggtc tctgctgatt gtgtctcctt gactggtgct 660 gtctccttgg cttctatgtt gactgaaatc ttcttgttgc aacaagctca aggtatgcca 720 gaaccaggtt ggggtagaat cactgattct caccaatgga acaccttgtt gtccttgcac 780 aacgctcaat tcgatttgct gcagagaact ccagaagtcg ctagatccag agctactcca 840 ttgttggact tgatcaagac cgctttgact ccacacccac cacagaagca agcttacggt 900 gttaccttgc caacttctgt cttgttcatt gccggtcacg atactaactt ggctaacttg 960 ggtggtgcct tggaattgaa ctggaccttg ccaggtcaac cagataacac tccaccaggt 1020 ggtgaattgg tcttcgaaag atggcgtcga ctgtctgata actctcaatg gattcaagtc 1080 tccttggtct tccaaacctt gcaacaaatg agagacaaga ctccattgtc cttgaacact 1140 ccaccaggtg aagtcaagtt gaccttggct ggttgtgaag aaagaaacgc tcaaggtatg 1200 tgttctttgg ctggtttcac tcaaatcgtc aacgaagcca gaatcccagc ctgttccttg 1260 taataggcgg ccgcgaataa t 1281 4- 82696.doc

Claims (1)

126208_37674號專利申請案 丄!爷申請專利範圍替換本m年11月)7 LHjfi、申請專利範圍:’ 11 1 · 一種製備耐熱植酸酶之方法,其包括於微生物宿主細胞 中表現一表現g,該表現匣包括能經操作連接至可編碼 耐熱植酸酶之核酸分子的啟動子,該耐熱植酸酶於6(rc 中30分鐘後可保留至少40%活性且於pH 4.5及37°C中具 有大於200 U/mg之比活性,且該核酸分子包括被限制酶 Xho I及Not I位置包圍之描述於SEq m NO : 4之核酸序 列。 2·如申請專利範圍第1項之方法,其進一步包括分離該耐熱 植酸酶之方法。 3 ·如申請專利範圍第1項之方法,其中之宿主細胞為細菌細 胞。 4.如申請專利範圍第1項之方法,其中之宿主細胞為艾歇利 希氏菌(Eschericia)、假單胞菌(pseud〇monas)、乳酸菌 (Lactobacillus)或桿菌(Bacillus)。 5 ·如申請專利範圍第1項之方法,其中之宿主細胞為酵母細 胞。 6·如申請專利範圍第1項之方法,其中之宿主細胞為克魯酵 母菌屬(Kluyveromyces) ' 酵母菌(Saccharomyces)、裂殖 酵母屬(Schizosaccharomyces)、絲孢酵母菌屬 (Trichosporon)、舒旺酵母菌屬(schwanni〇myCes)、畢赤 酵母屬(Pichia)或漢遜酵母屬(Hansuei)細胞。 7·如申請專利範圍第1項之方法,其中之宿主細胞為啤酒酵 母菌(Saccharomyces cerevisiae)、巴斯德畢赤酵母(Pichia 82696-941118.doc 1262083 pastoris)、多形漢遜酵母(Hansenula polymorpha)或裂殖酵 母菌(Schizosaccharomyces pombe)細胞。 8. 如申請專利範圍第1項之方法,其中之宿主細胞為真菌細 胞。 9. 如申請專利範圍第1項之方法,其中之宿主細胞為麴菌 (Aspergillus)、根黴(Rhizopus)、木黴菌屬(Trichoderma) 、脈孢菌屬(Neurospora)、白黴屬(Mucor)、或青黴菌屬 (Penicillium)細胞。 10·如申請專利範圍第1項之方法,,其中之宿主細胞為黑麴 菌(Aspergillus niger)細胞。 11 ·如申請專利範圍第1項之方法,其中之耐熱植酸酶包括描 述於SEQ ID NO : 1之多肽序列,或其變異多肽,該變異 多肽具有刪除或添加一或多個胺基酸至該多肽序列之N-端及/或C-端。 12 ·如申請專利範圍第1項之方法,其中耐熱植酸酶之比活性 於 pH 4.5 及 37°C 中大於 400 U/mg。 如申請專利範圍第1項之方法,其中耐熱植酸酶之比活性 於 pH 4·5 及 37°C 中大於 600 U/mg。 14 ·如申請專利範圍第1項之方法,其中耐熱植酸酶之比活性 於pH 4·5及 37°C 中大於 800 U/mg。 15·如申請專利範圍第1項之方法,其中之核酸分子可編碼包 括耐熱植酸酶之融合多肽。 1 6·如申請專利範圍第15項之方法,其中之融合多肽包括可 經操作連接至耐熱植酸酶之訊號序列。 82696-941H8.doc 1262083 1 7·如申請專利範圍第丨項之方法,並 '、甲义耐熱植酸酶於pH 大於2·〇至低於4·〇中之摹擬胃半衰期大於25分鐘。 1 8。如申凊專利範圍第尋之方法,並 /、τ <耐熱植酸酶已經糖 基化。 19。一種製備動物飼料之方法,其包括: a)提供—種包括飼料成分及包括如中請專利範圍第2項 耐熱植酸酶之製備物的混合物;及 =可將存在於混合物中之植酸水解以便產生動物飼料 之溫度及濕度狀況下處理混合物。 镛 2〇。如申請專利範圍第19項之方法所製備之動物飼料,其中 該動物飼料之植酸含量低於未處理之動物飼料之植酸 含量。 21« 種製備動物飼料之方法,其包括: a) 提供包括動物飼料成分及如申請專利範圍第2項之耐 熱植酸酶的混合物;及 b) 於50 C以上之溫度加熱混合物以產生一經熱處理之動 物飼料混合物。 _ 22.如申請專利範圍第21項之方法,其中之含植酸酶製備物 為液體製備物。 23·如申請專利範圍第21項之方法,其中之含植酸酶製備物 為固體製備物。 24。如申請專利範圍第2丨項之方法,其中幻中之混合物可進 一步包括至少一種維生素、礦物質、除耐熱植酸酶外之 酵素、有機酸、腸道益菌產品、精油或穀類加工副產品。 82696-941118.doc l262〇83 2 5 ^ •。申請專利範圍第21項之方法,其中之含植酸酶製備物 包括低於約1%無機磷酸鹽。 如申凊專利範圍第21項之方法,其中a)中之混合物的無 機鱗酸鹽低於0.45%。 27 _ # ’ 種藉由如申請專利範圍第2 1項之方法製造之經熱處理 的動物飼料混合物。 2 8 4 ,口申請專利範圍第21項之方法,其進一步包括經由製粒 機擦壓出經熱處理之混合物以產生成粒動物飼料。 •一種藉由如申請專利範圍第28項之方法所製造之成粒動 物飼料。 種包括如申請專利範圍第2項之耐熱植酸酶的動物飼 料組合物。 3 1 ·如申請專利範圍第3〇項之動物飼料組合物,其中植酸酶 之比活性於pH 4.5及3 7°C中大於400 U/mg。 32·如申請專利範圍第3〇項之動物飼料組合物,其中植酸酶 〈比活性於pH 4.5及37°C中大於600 U/mg。 33·如申請專利範圍第30項之動物飼料組合物,其中植酸酶 之比活性於pH 4.5及37°C中大於800 U/mg。 Μ.如申請專利範圍第3〇項之動物飼料組合物,其中之耐熱 植酸酶於pH大於2.0至低於4.〇之摹擬胃液中半衰期大: 2 5分鐘。 、 35‘ 一種包括如申請專利範圍第2項之耐熱植酸酶的酵素飼 料添加劑。 # ' 36.如申請專利範圍第35項之酵素飼料添加劑,其中耐熱植 82696-941118.doc 1262083 酸酶之比活性於pH 4.5及3 7。(:中大於4〇〇 u/mg。 A如中請專利範圍第35項之酵素飼料添加劑,其中耐熱植 酸酶之比活性於ΡΗ4·5及37°C中大於6〇〇 u/mg。 I如中請專利範圍第35項之酵素飼料添加劑,其中耐熱植 酸酶之比活性於!^4.5及37。(:中大於80〇1;/1^。 39.如申請專利範圍第35項之酵素飼料添加劑,其中之耐熱 植酸酶於pH大於2.0及低於4.〇之摹擬胃液中半衰期大於 2 5分鐘。 4〇· 一種製備供飼料調配物之包含耐熱植酸酶組合物的方 法,其包括: a) 混合-包括如中請專利範圍第2項之耐熱植酸酶之液 體溶液及大豆粉以產生混合物;及 b) 冷凍乾燥該混合物以產生冷凍乾燥組合物。 41.如申請專利範圍第4G項之方法,其進_步包括混合冷;東 乾燥組合物及其它飼料組分以產生進一步之混合物。 仏如申請專利範圍第則之方法,其中之耐熱植^酶之比 /舌性於pH 4.5及37 °C時大於800 U/mg。 Μ‘如申請專利範圍第40項之方法’其中之耐熱植酸酶於pH 大於2.0及低於4·〇時之半衰期大於25分鐘。 44·種藉由如申請專利範圍第40項之方法所製備之冷凍乾 燥組合物。 45· —種降低飼料轉換比並增加動物獲得體重之方法,其包 括: 餵食動物包括可有效降低動物飼料轉換比用量之如 82696-941118.doc 1262083 申請專利範圍第2項的耐熱植酸酶飼料 46. 一種經由餵食無機磷酸鹽濃度低於〇 4 、‘ 飼糧而降低 飼料轉換比或增加動物獲得體重之方法, /、包括: 餵食動物包括低於0.45%無機磷酸 飼料轉換比或增加動物體重用量之如 項的耐熱植酸酶之飼料。 鹽以及可有效降低 申請專利範圍第2 47. 一種將動物飼糧中無機磷需求量減至最小的方去,其勺 48. 49. 嚴良動物包括如申請專利範圍第2J 員耐熱植酸酶之飼 料,該耐熱植酸酶用量可有效增加動㈣ 物利用率。 T外Μ王 -種將動物飼糧中磷t求量減 π 4 N >0床,並包括· 餵食動物包括如申請專利範圍第2项耐熱植酸酶之飼 ::熱植酸酶用量可有效增加動物對飼料中鱗的生 -種提高動_用存在於飼料巾的磷之方n 申請專利範圍第之耐熱植酸酶的 =用:耐熱植酸酶用量可有效增加動物飼料中濟的生 50. 一種加強利用來自動物飼料 鹽之方法’其包括: 之有機5粦來源的有機鱗
圍第2項之耐熱植酸酶的 效增加動物飼料中無機磷 餵食動物包括如申請專利範 飼料,該耐熱植酸酶用量可有 的生物利用率。 82696-941118.doc 1262083 5 1 · —種減少動物***物中磷酸鹽濃度之方法,其包括: 餵食動物包括如申請專利範圍第2項之耐熱植酸酶的 飼料,該耐熱植酸酶用量可有效減少動物***物中磷酸 鹽濃度。 5 2. —種減少動物***物中磷酸鹽濃度之方法,其包括: 餵食動物包括低於0.45%無機磷及可有效減少動物排 泄物中磷酸鹽濃度用量之如申請專利範圍第2項的耐熱 植酸酶之飼料。 53·如申請專利範圍第45至52項中任一項之方法,其中之飼 料為家禽飼料。 54·如申請專利範圍第45至52項中任一項之方法,其中之飼 料為豬飼料。 55,如申請專利範園第45至52項中任一項之方法,其中之处 熱植酸酶包括SEQ ID NO : 1。 从如申請專利範圍第45至52項中任一項之方法,其中耐杳 植酸酶於動物消化道中之半衰期約3 〇分鐘。 57. —種增進動物飼料營養價值之方法,其包括: 旦A製備動物飼料時添加可有效增進飼料營養價值用 里《如申請專利範圍第2 J頁的耐熱植酸酶。 58. 一種增進人類食品營養價值之方法,其包括: \氣備人類食品時添加可有效增進令Cf ,, …申請專利範圍第2項:耐熱:二 A合Γ包括如中請專利範圍第2項之耐熱植酸酶的食品组 82696-941118.doc 1262083 60· —種製備人類食品之方法,其包括: a) 提供一種食品成分與包括如申請專利範圍第2項之耐 熱植酸酶製備物之混合物;及 b) 於可水解存在於混合物之植酸的溫度及濕度之狀況下 處理該混合物以便產生經處理之人類食品。 61· —種藉由如申請專利範圍第6〇項方法所製備之經處理人 類良P口,其中遠人類食品所含植酸量低於未經處理之人 類食品含量。 62· —種食品添加劑,其包括如申請專利範圍第2項之耐熱植 酸酶。 63 ·如申請專利範圍第62項之食品添加劑,其中之耐熱植酸 酶比活性於pH 4.5及37°C中大於400 U/mg。 64·如申請專利範圍第62項之食品添加劑,其中之耐熱植酸 酶比活性於pH 4.5及37°C中大於600 U/mg。 65 ·如申請專利範圍第62項之食品添加劑,其中之耐熱植酸 酶比活性於pH 4.5及3 7°C中大於800 U/mg。 66·如申请專利範圍第62項之食品添加劑,其中之耐熱植酸 酶於pH大於2.0且低於4.0時之半衰期大於25分鐘。 6 7 · —種製備供食品調配物使用之包含耐熱植酸酶組合物 的方法,其包括·· a) 混合包括如申請專利範圍第2項之耐熱植酸酶之液態 溶液及豆粉以產生一種混合物;及 b) 冷;東乾燥該混合物以產生經冷;東乾燥之組合物。 6 8 ·如申請專利範圍第6 7項之方法’其進一步包括結合冷;東 82696-941118.doc 1262083 乾燥組合物及其它食品成分以產生更進一步之混合物。 69·如申凊專利範圍第67項之方法,其中之耐熱植酸酶比活 性於pH 4.5及37t中大於800 U/mg。 70·如申請專利範圍第67項之方法,其中耐熱植酸酶於pH大 於2.0且低於4.0時之半衰期大於25分鐘。 7 1 · —種藉由如申請專利範圍第62項之方法所製造之冷凍乾 燥組合物。 72· —種包括如申請專利範圍第2項之耐熱植酸酶的飼料顆 粒。 73· 種核故为子,其編碼耐熱植酸酶,其中該核酸分子包 括被限制酶Xho I及Not I位置包圍之描述於SEQ m N〇 :4之核酸序列。 82696-941118.doc _9_
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