TW201443234A - 重組酵母菌轉形株及使用該轉形株製備免疫球蛋白ｆｃ片段之方法 - Google Patents

重組酵母菌轉形株及使用該轉形株製備免疫球蛋白ｆｃ片段之方法 Download PDF

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Abstract

本發明係關於轉形株，其係藉由將包含編碼人類免疫球蛋白Fc片段之多核苷酸的表現載體導入畢赤屬酵母菌而製備；關於免疫球蛋白Fc片段的製造方法，該方法包含培養上述轉形株，且由培養物回收免疫球蛋白Fc片段；以及使用作為藥物載劑之免疫球蛋白Fc片段，其係由上述方法所製備。建議以轉形株作為與使用大腸桿菌或動物細胞作為宿主以製造有用於作為藥物載體的免疫球蛋白Fc片段相關問題的解決方案，由此可發現各種應用於有效與經濟性的製造藥物。

Description

重組酵母菌轉形株及使用該轉形株製備免疫球蛋白FC片段之方法
本發明係關於重組酵母菌(亦稱為酵母)轉形株，以及使用該轉形株製備免疫球蛋白Fc片段之方法。更具體地，本發明係關於藉由將包含編碼人類免疫球蛋白Fc片段的多核苷酸的表現載體導入至畢赤屬(pichia sp.)酵母菌而製備之轉形株，以及製造免疫球蛋白Fc片段的方法，該方法包含培養轉形株以及自培養物回收免疫球蛋白Fc片段，以及藉由上述方法所製備之免疫球蛋白Fc片段用於作為藥物載劑。
隨著生物工程與生物技術的進步，許多生物活性多肽(蛋白質)以及肽藥物已開發作為對於多種疾病的治療選項。然而，由於其低的安定性，該等多肽或肽醫藥容易變性且因而高度傾向於腎清除或肝清除。因此，包含多肽作為醫藥活性成分之蛋白質醫藥之缺點在於需要經常對患者投藥以維持其合適的血清濃度與效價。因此對於開發蛋白質醫藥而使其於體內維持合適的濃度而無需經常投藥為重要的。
為了解決該等問題，已有大量的努力致力於改良蛋白質藥物的血清安定性以及長時間於血液中維持高的藥物濃度以最佳化該藥物的醫藥藥效，因而已嘗試改良蛋白質調配物的變化，與其他蛋白質融合或結合聚合物。近年來，最適的方法之一已著眼於免疫球蛋白與蛋白質的融合。
已完成許多嘗試於藉由使用免疫球蛋白及其片段而增加蛋白質藥品的安定性，如美國專利第5,045,312號所揭示者，其中人類生長激素係經由交聯劑接合於牛血清白蛋白或小鼠免疫球蛋白。相較於未經改質的生長激素，該接合物具有增強的活性。在免疫球蛋白的Fc片段連結至干擾素(韓國專利公開案第10-2003-0009464號)、介白素-4受體、介白素-7受體或促紅血球生成素(韓國專利第10-249572號)之後，也製備其他各種融合蛋白質而表現於哺乳動物。PCT專利公開案WO 01/03737揭示一種融合蛋白質其中細胞激素或生長因子係經由寡肽連結子連結至免疫球蛋白的Fc片段。再者，美國專利第5,116,964號揭示使用基因重組技術融合至免疫球蛋白Fc片段之胺基終端或羧基終端的蛋白質。美國專利第5,349,053號揭示一種融合蛋白質其中IL-12經由肽鍵聯連結至免疫球蛋白Fc片段。
已揭示使用基因重組技術構築許多其他的Fc融合蛋白質，其實例包括具有干擾素-β或其衍生物的免疫球蛋白Fc片段(PCT專利公開案WO 00/23472)以及具有IL-5受體的免疫球蛋白Fc片段(美國專利第5,712,121號)的融合蛋白質。進一步地，如美國專利第7,736,653號所揭示者，免疫球蛋白Fc片段係使用作為載劑而非融合伴(fusion partner)。
免疫球蛋白或免疫球蛋白Fc片段的製造主要以於大腸桿菌中進行。美國公司Amgen於美國專利第6,660,843號及美國專利公開案第2004-0044188號與第2004-0053845號中，說明具有於絞鏈區的前五個胺基酸殘基之胺基酸刪除的人類IgG1 Fc衍生物，其融合至治療性蛋白質或由肽模擬之治療性蛋白質的胺基終端或羧基終端，且其製造係使用大腸桿菌宿主。然而，此不具有信號序列的融合蛋白質係表現為包含體，以及因而必須進行額外的再折疊步驟。此蛋白質再折疊步驟降低產率，以及特別是蛋白質呈同元二倍體或異元二倍體時，顯著的降低二倍體產生。再者，當不具有信號序列的蛋白質係表現於大腸桿菌時，因為大腸桿菌的蛋白質表現系統的特徵而將甲硫胺酸殘基添加至表現產物的N-終端。前述Amgen公司的表現產物具有N-終端甲硫胺酸殘基，當對人體重複或過量投藥會誘發免疫回應。再者，由於該等融合分子係藉由將編碼治療性蛋白質的基因連結至難以於大腸桿菌中表現的Fc基因，而於大腸桿菌中表現為融合蛋白質形式，如果其於大腸桿菌中表現為融合形式則難以於大腸菌中產生治療性蛋白質，將導致活性的顯著降低或損失。進一步地，由於二個分子的融合於二個蛋白質之間的相連域創造非天然發生的異常胺基酸序列，融合蛋白質可有潛力藉由免疫系統辨識外來物質，且因而誘發免疫回應。
如上所述，使用大腸桿菌的優勢為在大腸桿菌的快速生長速率以及醱酵與生物工程的技術累積，治療有效的蛋白質可以高產率的表現為非糖基化形式，但缺點為相對於天然蛋白質，重組蛋白質具有甲硫胺酸作為第1個胺基終端殘基，且考慮 需要複合的純化方法以移除大腸桿菌衍生的致熱原(內毒素)以及需要蛋白質再折疊。
另一方面，使用動物細胞的優勢係可製造如糖基化蛋白質類似於天然免疫球蛋白形式之融合蛋白質，但蒙受具有高製造成本的缺點，且為高度易於受到動物衍生的病毒或蛋白質的汙染。因此對於解決上述問題有增加的需求。建議的方針為利用具有大腸桿菌與動物細胞的優勢的酵母菌作為宿主細胞。
使用於蛋白質製造的酵母菌中代表者為釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)。除了對人體為安全的之外，真核細胞的釀酒酵母易於基因操作且以大規模培養。再者，已開發對於真核細胞的各種表現系統。當使用重組方法製造高等細胞衍生的蛋白質，例如人類蛋白質，此微生物更提供具有能力分泌至細胞外且例如經由糖基化可進行後轉譯修飾的蛋白質。此外，酵母菌的重組蛋白質進行摺疊以及雙硫鍵形成、於分泌信號驅動之細胞外分泌期間的糖基化，而發展為完全的生物活性形式。因為酵母不需要低效率的細胞溶解與蛋白質再折疊，因此也為經濟上有益的。然而，釀酒酵母的蛋白質分泌系統已顯示成為問題的是根據人類蛋白質的種類而於分泌率有大的變動。通常，使用作為高價的人類藥物的蛋白質，於釀酒酵母中難以表現與分泌(韓國專利第10-0798894號)。
導引至本發明，由本發明人經過強力且全面的研究使用酵母菌製造用於人類藥物的蛋白質，結果發現壁赤屬(Pichia sp.)酵母菌，甲醇營養型(methylotrophic)酵母菌之一種，可使用於製造分泌性免疫球蛋白Fc片段，有用於作為藥物載劑，以高表現程度而不需要額外的再折疊步驟，也不需要利用額外胺基酸修飾N-終端，而且該分泌性免疫球蛋白Fc片段可使用簡單過程純化，其具有最低載量的內毒素量或動物衍生的外來病原體。
本發明之目標係提供藉由將包含編碼人類免疫球蛋白Fc片段的多核苷酸的表現載體導入至畢赤屬酵母菌所製備的轉形株。
本發明之另一目標係提供用於製造免疫球蛋白Fc片段的方法，包含培養該轉形株，以及由培養物回收免疫球蛋白Fc片段。
本發明之進一步的目標係提供由上數方法製造之免疫球蛋白Fc片段，使用作為藥物載劑。
本發明的重組轉形株可克服與使用大腸桿菌或動物細胞作為宿主細胞以製造免疫球蛋白片段相關的問題，有用於作為藥物載劑，且發現可用於有效及合乎經濟的藥物製造的應用。
第1圖為說明構築重組表現載體pPIC9K-IgG4Fc的模式圖。
第2圖為說明構築重組表現載體pPIC9K-mPSCFc的模式圖。
第3圖為顯示感興趣的基因併入經3mg/ml與4mg/ml健那黴素(Geneticin)選擇的多套組(multi-copy)純株的基因體DNA的PCR 影像圖。
此態樣之一具體例中，本發明闡述一轉形株，其係藉由將包含編碼人類免疫球蛋白Fc片段的多核苷酸導入至畢赤屬酵母菌而修飾。
如使用於本文，詞語「免疫球蛋白」亦已知為「抗體」，意指回應抗原刺激而由免疫系統產生的蛋白質，且於警覺期間經由血液與淋巴特異性地結合至抗原以顯現抗原-抗體反應。免疫球蛋白基本上由二個相同的全長輕鏈與二個相同的全長重鏈所組成，於重鏈與重鏈之間以及重鏈與輕鏈之間係藉由雙硫鍵連結。根據其恆定域的胺基酸序列的差異而有五種不同型的重鏈：gamma(γ)、mu(μ)、alpha(α)、delta(δ)以及epsilon(ε)，以及重鏈包含下述次分類：gamma 1(γ1)、gamma 2(γ2)、gamma 3(γ3)、gamma 4(γ4)、alpha 1(α1)以及alpha 2(α2)。根據重鏈之恆定域的特徵，免疫球蛋白分類為五種同型(isotype)：IgG、IgA、IgD、IgE及IgM。代表性同型IgG進一步分為IgG1、IgG2、IgG3及IgG4次分類。對於本發明之目的，詞語「免疫球蛋白」包括免疫球蛋白分子的功能性片段以及完整免疫球蛋白分子。功能性片段意指保有抗原結合功能的片段，且包括Fab、F(ab')、F(ab')2、Fv、scFv、Fd及Fc。
在免疫球蛋白片段之中，Fab含有氫鏈與重鏈的可變區、輕鏈的恆定區，以及重鏈的第1恆定區(CH1)，且具有單一抗原-結合位點。就具有於重鏈CH1域的C-終端含有一個或多個半胱胺酸殘基的絞鏈區而言，Fab'片段不同於Fab片段。F(ab')2片 段係產生為在Fab'片段的絞鏈區的半胱胺酸殘基之間形成雙硫鍵結的Fab’片段對。Fv為僅含有重鏈可變區及輕鏈可變區的最小抗體片段。scFv(單鏈Fv)片段包含藉由肽連結子彼此連結的重鏈可變區及輕鏈可變區且因此呈單一多肽鏈。再者，Fd片段僅包含重鏈的可變區及CH1域。該些免疫球蛋白分子的功能性片段可使用蛋白質分解酵素(例如完整抗體係利用木瓜酵素(papain)分解而分解為Fab以及利用胃蛋白酶(pepsin)分解而分解為F(ab’)2)或經由基因重組技術而獲得。
如使用於本文，詞語「免疫球蛋白Fc片段」意指一免疫球蛋白Fc片段係包含提供二個恆定域(CH2及CH3)的二個重鏈，而缺乏氫鏈與重鏈的可變域，重鏈之恆定域1(CH1)與氫鏈的恆定域(CL1)。視需要地，免疫球蛋白Fc片段可進一步包含連結至重鏈的恆定域的絞鏈區。由於其為可於活體內代謝的生物可降解多肽，免疫球蛋白Fc片段安全於使用作為藥物載劑。此外，就接合物的製備、純化及產率而言，因分子量較低，免疫球蛋白Fc片段相較於完整的免疫球蛋白分子為有利的。由於不具有在抗體彼此之間的胺基酸序列不同的異源性的Fab片段，期望免疫球蛋白Fc片段大幅增加接合物的同源性，而降低引起該接合物之血液抗原性的可能性。
本發明之免疫球蛋白Fc片段可為延伸的Fc片段其包含重鏈的恆定域1(CH1)及/或輕鏈的恆定域1(CL1)的部份或全體而缺乏重鏈與輕鏈的可變區域，只要為顯示實質上相同於或優異於傳統Fc片段的效果者。進一步地，本發明之免疫球蛋白Fc片段可為包含缺乏胺基酸序列之明顯部分的CH2及/或CH3。因 此，本發明之免疫球蛋白Fc片段可包含1)CH1域、CH2域、CH3域及CH4域，2)CH1域及CH2域，3)CH1域及CH3域，4)CH2域及CH3域，5)一個或多個恆定域與免疫球蛋白絞鏈區(或部分絞鏈區)的組合，或6)各重鏈之恆定域及氫鏈之恆定域的二倍體。
此外，本發明之免疫球蛋白Fc片段意圖不僅含括天然胺基酸序列也含括其突變體。胺基酸序列突變體意指藉由一個或多個胺基酸殘基的刪除、***、非保留性或保留性取代或其組合而不同於天然序列的胺基酸序列。例如，已知於抗體結合中扮演中重要角色之IgG Fc的位置214至238、297至299、318至322或327至331的胺基酸殘基，可經修飾以使用作為合適的結合位點。此外，各種突變體可為，例如，缺乏形成雙硫鍵的殘基或天然Fc之數個N-終端胺基酸，或於天然Fc的N-終端具有額外的甲硫胺酸殘基。進一步地，起效子功能可藉由移除補體結合功能域(complement binding motif)，例如C1q結合功能域或ADCC(抗體-依賴性細胞媒介細胞毒性)功能域而刪除。可參照PCT專利公開案第97/34631號與96/32478號關於免疫球蛋白Fc片段的胺基酸序列突變體的製備。Fc片段可為自人類與其他動物，包括牛、山羊、豬、小鼠、兔、倉鼠、大鼠及天竺鼠，所單離之天然形式，或可為自經轉形的動物細胞或微生物所獲得之重組物或其衍生物。在前者的情況中，整體免疫球蛋白係自人類或動物單離，接著進行酵素的處理。當利用木瓜酵素處理時，整體免疫球蛋白分為Fab與Fc。胃蛋白酶裂解整體免疫球蛋白為pF'c與F(ab)。由該等片段，可使用尺寸排除層析將Fc或pF'c分離。較佳之重組免疫球蛋白Fc域係於微生物中衍生自人類Fc域者。
對於本發明之目的，免疫球蛋白Fc片段可為衍生自IgG者，例如IgG1 Fc片段、IgG2 Fc片段、IgG3 Fc片段、IgG4 Fc片段等，較佳為IgG2 Fc片段或IgG4 Fc片段，更佳為IgG4 Fc片段，以及最佳為序列編號1或序列編號2所示核苷酸序列所編碼之IgG4 Fc片段，或包含序列編號10或序列編號11所示胺基酸序列之IgG4 Fc片段。
免疫球蛋白Fc片段可進行胺基酸取代而不改變天然蛋白質或肽整體的活性。最典型的取代發生於Ala/Ser、Val/Ile、Asp/Glu、Thr/Ser、Ala/Gly、Ala/Thr、Ser/Asn、Ala/Val、Ser/Gly、Thy/Phe、Ala/Pro、Lys/Arg、Asp/Asn、Leu/Ile、Leu/Val、Ala/Glu及Asp/Gly。必要時，胺基酸可藉由，例如，磷酸化、硫酸化、丙烯酸化、糖基化、甲基化、法尼基化、乙醯基化、醯胺化等進行修飾。該等修飾方法於此項技術領域為已知(H.Neurath,R.L.Hill,The Proteins,Academic Press,New York,1979)。
如使用於本文，詞語「轉形」或「修飾」意指使用基因操作技術，無論是否使用質體進行，因外源性基因材料的導入而造成宿主細胞(涵蓋原核細胞、真核細胞、動物細胞與植物細胞)的基因性改變。詞語「轉形」意指安定地保有且表現由外側導入的外源性基因材料的細胞，無論是否使用質體進行，甚至細胞***多次。任何核酸材料可導入至有機體、細胞、組織、器官或核酸材料的方法皆可用於進行本發明之轉形。較佳地，此項技術領域已知的方法可根據宿主細胞選擇。轉形至酵母菌宿主典型地可使用由Van Solingen(J.Bact.,1977,130：946)與Hsiao等人(Proc.Natl.Acad.Sci.(USA),1979,76：3829)所揭示的方法實施。轉形酵母 菌的方法包含，但不限於，使用電子裝置的電穿孔法，以及使用無細胞壁之原生球質體之勝任細胞法(spheroplasting)。對於本發明之目的，轉形株因免疫球蛋白GFc基因併入至酵母菌宿主的基因體而可為多套組純株形式。對於本發明之目的，只要轉形株攜帶包含編碼人類免疫球蛋白Fc片段之多核苷酸的表現載體，即對於轉形株不需要給予特別限制。例如，可使用畢赤巴斯德酵母菌(克馬格特勒)(Pichia(Komagataella)pastoris)HMC041(存取編號KCCM11348P)其具有包含免疫球蛋白Fc片段-編碼多核苷酸的表現載體pPIC9K-IgG4Fc，或畢赤巴斯德酵母菌(克馬格特勒)(Pichia(Komagataella)pastoris)HMC042(存取編號KCCM11350P)其具有包含編碼免疫球蛋白Fc片段之多核苷酸的表現載體pPIC9K-mPSCFc。
如使用於本文，詞語「宿主細胞」意指對其導入外源性基因材料的目標細胞。有用於本發明之宿主細胞之實例包含，但不限於酵母菌(如畢赤巴斯德酵母菌(Pichia pastoris)、釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、裂殖酵母菌屬(Schizosaccharomyces sp.)、麵包黴菌(Neurospora crassa))。較佳地，由於其可表現結構性類似於天然形式的重組免疫球蛋白，不具有額外胺基酸的N-終端修飾，亦不需要再摺疊步驟，且可安全的免於動物來源的汙染，因此酵母菌可應用作為宿主細胞。更佳為畢赤屬酵母菌(Pichia sp.)，最佳為畢赤巴斯德酵母菌(Pichia pastoris)。
詞語「表現載體」，如使用於本文，其敘述能於合適宿主細胞中表現目標蛋白質的載體，意指於包含主要調節單元且其基因***係以能於宿主細胞中表現的方式而操作性連結的基因構築體。對於表現載體不需要賦予特別限制只要其攜帶編碼本發 明之免疫球蛋白Fc片段的多核苷酸者即可。對於本發明之目的，表現載體係構形為在轉形至畢赤屬酵母菌之後，表現免疫球蛋白Fc片段。例如，其可為第1圖的裂解圖所示之pPIC9K-IgG4Fc或第2圖的裂解圖所示之pPIC9K-mPSCFc。
詞語「操作性連結」，如使用於本文，意指核酸表現調節序列與編碼目標蛋白質的核酸序列之間以可允許一般功能的方式的功能性連結。對重組載體的操作性連結可使用此項技術領域已知的基因重組技術而製備，以及定點專一性DNA裂解與接合可使用此項技術領域已知的酵素進行。
根據本發明一具體例，構築表現載體pPIC9K-IgG4Fc與pPIC9K-mPSCFc，各包含免疫球蛋白Fc片段-編碼多核苷酸。表現載體pPIC9K-IgG4Fc與pPIC9K-mPSCFc係經轉形至畢赤巴斯德酵母菌(Pichia pastoris)以製備轉形株，該等轉形株命名為「畢赤巴斯德酵母菌(克馬特格勒)(Pichia(Komagataella)pastoris)HMC041」以及「畢赤巴斯德酵母菌(克馬特格勒)(Pichia(Komagataella)pastoris)HMC042」，且於2013年1月7日寄存於大韓民國微生物保存中心(位於361-221，弘濟洞，西大門區，首爾市)，存取編號分別為KCCM11348P與KCCM11350P。
詞語「多套組純株」，如使用於本文，意指一轉形株，其藉由基因操作將外源性基因導入至宿主細胞後，在外源性基因與宿主細胞的某些基因體基因或位點相交時，外源性基因的多套組係藉由重組或重排而隨機地併入宿主細胞的基因體。整體而言，多套組純株可為其中藉由健那黴素標記可選擇基因的一個或多個套組係***至宿主細胞的基因體的轉形株，以及較佳為其中 藉由3mg/ml或更高的健那黴素標記可選擇的基因的5個或更多個套組係***至基因體的轉形株。
根據其另一態樣，本發明闡述用於製備免疫球蛋白Fc片段的方法，包含培養轉形株；且由培養物回收免疫球蛋白Fc片段。而此方法特徵在於不需要額外的蛋白質再摺疊步驟。
重組畢赤巴德酵母菌(Pichia pastoris)可在此項技術領域中已知合適的條件下於適當培養基培養。培養方法可由此項技術領域中具有通常知識者根據所使用的菌株而容易地調整。
由培養物回收的免疫球蛋白Fc片段可不經進一步純化而使用，或使用透析、鹽析及層析純化後使用。其中，最廣為使用者為層析。目前沒有通用性應用不同種類與順序的管柱的通則。根據抗體的目標蛋白質的特徵及培養步驟，可選擇離子交換層析、尺寸排除層析、親和性層析、疏水性層析及蛋白質-A親和性管柱。
根據其進一步的態樣，本發明揭示免疫球蛋白Fc片段，由此方法所製備，用以使用作為藥物載劑。作為載劑，免疫球蛋白Fc片段與藥物形成接合物且可增加藥物的生體可利用性。
如使用於本文，詞語「藥物」意指當對人類或動物投藥時顯現治療效果的物質。作為非顯制性實例，肽、多肽、化合物、萃取物及核酸物落入藥物的範疇，較佳為肽或多肽。
如使用於本文，詞語「載劑」意指連結至藥物的物質，而有助於藥物生理活性減低之最小化與藥物活體安定性增加。亦即，本發明提供用於實質上增加藥物的活體持續性與藥物活體活性減低最小化的多種可能的IgG1、IgG2、IgG3與IgG4 Fc 片段。較佳地，提供IgG2 Fc與IgG4 Fc片段。更佳地，本發明提供IgG4 Fc片段。然而，只要其具有活體內持續性所需的FcRn受體結合位點，任何Fc片段皆可落入本發明的範疇。
使用本發明的方法所製備的Fc片段，享有不需要額外的再折疊步驟且於N-終端無額外的胺基酸殘基的優勢。再者，其可以增加的程度被表現，具有極低載量的內毒素或源自動物的病原體，且可使用簡單的步驟純化。由於其為可於活體內代謝的生物可降解多肽，具有該等優勢的免疫球蛋白Fc片段可使用作為藥物載劑。此外，就接合物的製備、純化及產率而言，因免疫球蛋白Fc片段較低之分子量，相較於完整的免疫球蛋白分子為有利的。由於不具有由於抗體彼此間的胺基酸序列不同的異源性的Fab片段，期望免疫球蛋白Fc片段大幅增加接合物的同源性而降低引起該接合物之血液抗原性的可能性。
在IgG的次分類中，IgG4最少不易結合至補體(C1q)。由於補體的特定較低親和性，Fc片段較不適於調整例如ADCC(抗體依賴性細胞之細胞毒素)以及CDC(補體-依賴性細胞毒素)之起效子功能，且因而於活體內引起不必要的免疫回應。對於C1q的親和性，IgG2片段與IgG4 Fc片段係較低於IgG1 Fc片段，且最低為IgG4 Fc片段。為了使用作為藥物載劑，接合至藥物的Fc片段較佳需顯示低的如ADCC與CDC的起效子功能。因而對於本發明的目的，IgG2 Fc片段與IgG4 Fc片段為有用的，而較高的偏好性為IgG4 Fc片段。亦即，根據本發明之有用於作為藥物載劑的免疫球蛋白Fc片段可為衍生自人類IgG4 Fc片段或其缺少部分絞鏈的衍生物的Fc段，如序列編號10或序列編號11所示，其可具有 與由揭示於韓國專利第10-824505號的大腸桿菌轉形株HM11201(KCCM-10660P)所產生的蛋白質為相同的胺基酸序列。
[實施例]
經由下述實施例，可獲得本發明之較佳瞭解，但該等實施例係用於說明，不用於意圖限制本發明。
實施例1：構築用以於畢赤巴斯德酵母菌中產生免疫球蛋白Fc片段的表現載體
如下述，構築用以於畢赤巴斯德酵母菌中表現人類免疫球蛋白Fc片段的重組表現載體係以定錨編碼由IgG4鉸鏈區及IgG4恆定域CH2及CH3所組成之人類免疫球蛋白Fc片段的核苷酸序列(序列編號1)。
人類免疫球蛋白Fc片段的DNA係由PCR獲得，利用揭示於韓國專利第10-0725314號的質體pBG4CH1-3作為模板。首先，設計前置引子(序列編號3)以含有SnaB I限制位點用以融合α因子分泌信號序列而構形反置引子(序列編號4)以具有EcoR I限制位點。編碼免疫球蛋白G4 Fc片段的DNA係使用該等引子藉由PCR擴增。PCR係進行30個循環的95℃變性40秒、60℃黏合30秒以及68℃延伸50秒。
5'-GCTTACGTAGAGTCCAAATATGGTCCCCCATGCC-3'(序列編號3)
5'-CCGGAATTCTCATTTACCCAGAGACAGGGAGAGG-3'(序列編號4)
由此獲得之免疫球蛋白G4 Fc片段的DNA(約700bp)選殖至pPIC9K載體(Invitrogen)。為了框入α因子分泌信號序列，免疫球 蛋白G4 Fc片段的PCR產物以限制酵素SnaB I及EcoR I分解，然後於T4接合酶的存在下接合至預先以相同的限制酵素處理的pPIC9K載體。所得重組表現載體含有免疫球蛋白G4 Fc基因緊接於α因子分泌信號序列的上游，但由前置引子所表示的SnaB I辨識位點也留在載體，因此免疫球蛋白G4 Fc片段，如果由載體表現時，將於N-終端具有二個非期望的胺基酸殘基。為了將***在α因子分泌信號序列與免疫球蛋白G4 Fc基因之間的連接點的SnaB I辨識位點刪除，使用序列編號6及7所示之引子對進行定點突變(site-directed mutagenesis)，且所得表現載體指名為pPIC9K-IgG4Fc(第1圖)。
5'-GAGAAAAGAGAGGCTGAAGCTGAGTCCAAATATGGTCCCCCA-3'(序列編號6)
5'-TGGGGGACCATATTTGGACTCAGCTTCAGCCTCTCTTTTCTC-3'(序列編號7)
第1圖為說明構築重組表現載體pPIC9K-IgG4Fc的示意圖。如第1圖可見，pPIC9K-IgG4Fc表現載體含有受到5’醇氧化酶1(AOX1)基因啟動子調控的序列編號1的DNA，且可經由位於免疫球蛋白G4 Fc基因下游的3’醇氧化酶1(AOX1)組入至宿主細胞的基因體DNA。
實施例2：構築用以於畢赤巴斯德酵母菌中製造鉸鏈部分缺乏的免疫球蛋白Fc片段的表現載體
根據實施例1所述的相同方案，構築用以於畢赤巴斯德酵母菌中表現鉸鏈區部分經缺乏的免疫球蛋白Fc片段的表現載體以定錨由部分的IgG4鉸鏈以及IgG4的恆定域CH2與CH3所組成之 人類免疫球蛋白Fc片段的核苷酸序列(序列編號2)。
編碼鉸鏈區部分缺乏的人類免疫球蛋白Fc片段的DNA係由PCR獲得，利用韓國專利第10-0725314號揭示的質體pBG4CH1-3作為模板。
首先，設計前置引子(序列編號5)以含有SnaB I限制位點用以融合α因子分泌信號序列而構形反置引子(序列編號4)以具有EcoR I限制位點。編碼免疫球蛋白G4 Fc片段的DNA係使用該等引子藉由PCR擴增。PCR係進行30個循環的95℃變性40秒、60℃黏合30秒以及68℃延伸50秒。
5’-GCTTACGTACCATCATGCCCAGCACCTGAGTTCC-3'(序列編號5)
由此所獲得之免疫球蛋白G4 Fc片段DNA(約680bp)選殖至pPIC9K載體(Invitrogen)。為了框入α因子分泌信號序列，免疫球蛋白G4 Fc片段的PCR產物以限制酵素SnaB I及EcoR I分解，然後於T4接合酶的存在下接合至預先以相同的限制酵素處理的pPIC9K載體。所得重組表現載體含有免疫球蛋白G4 Fc基因緊接於α因子分泌信號序列的下游，但由前置引子所表示的SnaB I辨識位點也留在載體，因此免疫球蛋白G4 Fc片段，如果由載體表現時，將於N-終端具有二個非期望的胺基酸殘基。為了將***在α因子分泌信號序列與免疫球蛋白G4 Fc基因之間的連接點的SnaB I辨識位點刪除，使用序列編號8及9所示之引子對進行定點突變，且所得表現載體指名為pPIC9K-mPSCFc(第2圖)。
5'-TCTCTCGAGAAAAGAGAGGCTGAAGCTCCATCATGCCCAGCACCTGAGTTCCTG-3'(序列編號8)
5'-CAGGAACTCAGGTGCTGGGCATGATGGAGCTTCAGCCTCTCTTTTCTCGAGAGA-3'(序列編號9)
第2圖為說明構築重組表現載體pPIC9K-mPSCFc的示意圖。如第2圖可見，pPIC9K-mPSCFc表現載體含有受到5’醇氧化酶1(AOX1)基因啟動子調控的序列編號2的DNA，且可經由位於免疫球蛋白G4 Fc基因下游的3’醇氧化酶1(AOX1)組入至宿主細胞的基因體DNA。經表現載體轉形之宿主細胞，因α因子分泌信號序列的驅動，可將鉸鏈區部分缺乏的免疫球蛋白Fc片段分泌至培養基。
實施例3：對畢赤巴斯德酵母菌的轉形以及多套組純株的選擇
為了用於安定的轉形與組入至基因體DNA，分別將實施例1與實施例2所獲得之重組載體pPIC9K-IgG4Fc與pPIC9K-mPSCFc，藉由限制酵素SalI的分解而直線化。直線化的重組IgG Fc片段表現載體係設計為藉由與宿主的醇氧化酶基因位點的重組而組入至宿主基因體DNA。使用畢赤巴斯德酵母菌KM71與GS115作為實施例1與實施例2所獲得之重組載體轉形的宿主。轉形係藉由電穿孔進行，其已知為對酵母菌最常見且有效的。為了使用於轉形，根據美國Invitrogen公司所提供的準則，製備畢赤巴斯德酵母菌KM71與GS115的原生質球體。
在10ug之各直線化重組載體與80ul的KM 71或GS115的原生質球體良好混合後，混合物在冰上於0.2cm-間隙-測光管中培養5分鐘。然後，於Gene Pulser電穿孔裝置(BIO-Rad)以2000V、200Ω、25uF對測光管施用電擊以誘導轉形。反應混合物添加1ml 經冷卻的1M山梨醇，且塗布於MD(最低葡萄糖)瓊脂盤後於28℃培養3日以選擇His+陽性轉形株。為了區別多套組純株，形成於MD瓊脂盤的His+陽性轉形株均勻地懸浮於1ml的無菌蒸餾水中且將該懸浮物以對應於105細胞的量，塗布於含有各種健那黴素濃度(0.5、1.0、2.0、3.0、4.0mg/ml)的YPD瓊脂盤，接著於28℃培養5日。而選擇健那黴素-抗性，多重套組純株，將形成於含有3.0mg/ml與4.0mg/ml的YPD瓊脂盤的純株，進行菌落PCR(colony PCR)以檢測免疫球蛋白片段基因是否併入基因體DNA。簡言之，PCR應用序列編號3與4的引子對，以檢測免疫球蛋白Fc片段基因的併入，以及應用序列編號5與4的引子對，以檢測編碼絞鏈區部分缺乏的免疫球蛋白Fc片段的基因的併入。PCR進行30個循環的95℃變性40秒、60℃黏合30秒以及68℃延伸50秒(第3圖)。第3圖為顯示以3mg/ml與4mg/ml健那黴素選擇之感興趣的基因併入多套組純株的基因體DNA的PCR影像。如可見於第3圖，PCR顯示免疫球蛋白Fc片段基因併入宿主細胞的基因體。
將以分別帶有免疫球蛋白Fc片段基因的表現載體pPIC9K-IgG4Fc與pPIC9K-mPSCFc轉形畢赤巴斯德酵母菌菌株所製備的轉形株，分別命名為「畢赤巴斯德酵母菌(克馬特格勒)(Pichia(Komagataella)pastoris)HMC041」以及「畢赤巴斯德酵母菌(克馬特格勒)(Pichia(Komagataella)pastoris)HMC042」，且於2013年1月7日寄存於大韓民國為生物保存中心(位於361-221，弘濟洞，西大門區，首爾市)，存取編號分別為KCCM11348P與KCCM11350P。
為了說明而揭示本發明之較佳具體例，但此項技術 領域中具有通常知識者應知，只要不悖離揭示於隨附的申請專利範圍所揭示的發明的範疇與精神，可進行各種修改、增加及取代。
<110> 韓美藥品股份有限公司
<120> 重組酵母菌轉形株及使用該轉形株製備免疫球蛋白FC片段之方法
<130> OPA13188/TW
<160> 11
<170> KopatentIn 2.0
<210> 1
<211> 690
<212> DNA
<213> IgG Fc片段
<400> 1
<210> 2
<211> 666
<212> DNA
<213> IgG Fc片段
<400> 2
<210> 3
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引子
<400> 3
<210> 4
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引子
<400> 4
<210> 5
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引子
<400> 5
<210> 6
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引子
<400> 6
<210> 7
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引子
<400> 7
<210> 8
<211> 54
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引子
<400> 8
<210> 9
<211> 54
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 引子
<400> 9
<210> 10
<211> 229
<212> PRT
<213> IgG Fc片段
<400> 10
<210> 11
<211> 221
<212> PRT
<213> IgG Fc片段
<400> 11
由於本案的圖為實驗結果數據，並非本案的代表圖。故本案無指定代表圖。

Claims (12)

  1. 一種轉形株，其係經藉由將包含編碼人類球蛋白Fc片段之多核苷酸的表現載體導入至畢赤屬(Pichia sp.)酵母菌而改質。
  2. 如申請專利範圍第1項所述之轉形株，其中該畢赤屬酵母菌為畢赤巴斯德酵母菌(Pichia pastoris)。
  3. 如申請專利範圍第1項所述之轉形株，其中該免疫球蛋白為IgG。
  4. 如申請專利範圍第3項所述之轉形株，其中該IgG為IgG1、IgG2、IgG3或IgG4。
  5. 如申請專利範圍第1項所述之轉形株，其中該免疫球蛋白Fc片段包含序列編號10或序列編號11所示之胺基酸序列。
  6. 如申請專利範圍第1項所述之轉形株，其中該多核苷酸包含序列編號1或序列編號2所示之核苷酸序列。
  7. 如申請專利範圍第1項所述之轉形株，其中該表現載體為如第1圖之裂解圖所示之pPIC9K-IgG4Fc，或如第2圖之裂解圖所示之pPIC9K-mPSCFc。
  8. 如申請專利範圍第1項所述之轉形株，其為畢赤巴斯德酵母菌(克馬特格勒)(Pichia(Komagataella)pastoris HMC041(存取編號KCCM11348P)或畢赤巴斯德酵母菌(Pichia(Komagataella)pastoris)HMC042(存取編號KCCM11350P)。
  9. 一種製備免疫球蛋白Fc片段的方法，其包含：(a)培養申請專利範圍第1至8項中任一項所述之轉形株；以及(b)由培養物回收免疫球蛋白Fc片段。
  10. 一種免疫球蛋白Fc片段，其係由申請專利範圍第9項所述之方法製備，係使用作為藥物載劑。
  11. 如申請專利範圍第10項所述之免疫球蛋白Fc片段，其包含序列編號10或序列編號11所示之胺基酸序列。
  12. 如申請專利範圍第9項所述之方法，其中該方法不需要額外的蛋白質再摺疊步驟。
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