KR20130091746A - 췌장암의 치료를 위한 베바시주맙 병용 치료법을 위한 혈장 생체마커 - Google Patents

췌장암의 치료를 위한 베바시주맙 병용 치료법을 위한 혈장 생체마커 Download PDF

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폴 델마르
도로티 포언즐러
프리데만 크라우스
스테판 쉐러
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에프. 호프만-라 로슈 아게
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Abstract

본 발명은 췌장암, 특히 전이성 췌장암으로 진단된 환자의 대조군 수준에 비해 상대적인 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준, 특히 혈장 발현 수준을 측정함으로써 베바시주맙(bevacizumab)(아바스틴(Avastin)(등록상표))을 화학치료 요법에 추가하여 췌장암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 화학치료 요법의 치료 효과를 개선하는 방법을 제공한다. 특히, 본 발명은 치료 효과를 개선하는 방법을 제공하고, 이때 상기 치료 효과는 상기 환자의 전체 생존율 및/또는 무진행 생존율이다. 추가로, 본 발명은 췌장암, 특히 전이성 췌장암으로 진단된 환자의 대조군 수준에 비해 상대적인 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준, 특히 혈장 발현 수준을 측정함으로써 화학치료 요법과 병용되는 베바시주맙(아바스틴(등록상표))에 대한 환자의 민감성 또는 반응성을 평가하는 방법을 제공한다.

Description

췌장암의 치료를 위한 베바시주맙 병용 치료법을 위한 혈장 생체마커{Blood Plasma Biomarkers for Bevacizumab Combination Therapies for Treatment of Pancreatic Cancer}
본 발명은 췌장암, 특히 전이성 췌장암으로 진단된 환자의 대조군 수준에 비해 상대적인 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준, 특히 혈장 발현 수준을 측정함으로써 베바시주맙(bevacizumab)(아바스틴(Avastin)(등록상표))을 화학치료 요법에 추가하여 췌장암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 화학치료 요법의 치료 효과를 개선하는 방법을 제공한다. 특히, 본 발명은 치료 효과를 개선하는 방법을 제공하고, 이때 상기 치료 효과는 상기 환자의 전체 생존율 및/또는 무진행 생존율이다. 추가로, 본 발명은 췌장암, 특히 전이성 췌장암으로 진단된 환자의 대조군 수준에 비해 상대적인 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준, 특히 혈장 발현 수준을 측정함으로써 화학치료 요법과 병용되는 베바시주맙(아바스틴(등록상표))에 대한 환자의 민감성 또는 반응성을 평가하는 방법을 제공한다.
따라서, 본 발명은 화학치료 요법, 예컨대, 젬시타빈-에를로티닙(gemcitabine-erlotinib)(GE) 치료법과 병용되는 혈관신생 억제제, 예를 들면, 베바시주맙(아바스틴(등록상표))에 대한 민감성 또는 반응성과 상관관계를 갖는, 췌장암, 특히 전이성 췌장암의 생체마커의 확인 및 선별에 관한 것이다. 이와 관련하여, 본 발명은 (a) 표준 화학치료법에의 혈관신생 억제제, 예를 들면, 베바시주맙(아바스틴(등록상표))의 추가에 민감하거나 반응하는 환자를 확인하기 위한, 췌장암, 특히 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 확립된 대조군에 비해 상대적인 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 혈장 특이적 발현 프로파일(들)의 용도에 관한 것이다. 추가로, 본 발명은 혈관신생 억제제, 예를 들면, 베바시주맙(아바스틴(등록상표))을 표준 화학치료법, 예를 들면, 젬시타빈-에를로티닙(GE) 치료법에 추가하고 (a) 췌장암, 특히 전이성 췌장암으로 진단된 환자의 대조군에 비해 상대적인 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 혈장 특이적 발현 수준(들)을 측정함으로써 췌장암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 치료 효과, 특히 전체 생존율 및/또는 무진행 생존율을 개선하는 방법에 관한 것이다. 추가로, 본 발명은 본 발명의 방법에 따라 측정되고 정의된, 혈관신생 억제제, 특히 베바시주맙(아바스틴(등록상표))에 민감하거나 반응하는 환자를 확인하기 위한 키트 및 조성물을 제공한다.
혈관신생은 암 발생에 필수적으로, 일차 종양 크기 및 성장을 조절할 뿐 아니라 침윤 및 전이력에 영향을 미친다. 따라서, 혈관신생 과정을 매개하는 기작이 유도 항암 치료법을 위한 잠재적 표적으로서 연구되어 왔다. 혈관신생 조절인자에 대한 연구 초기에, 혈관 내피 성장 인자(vascular endothelial growth factor, VEGF) 신호전달 경로가 여러 종류의 암에서 혈관신생 활성을 우선적으로 조절하는 것으로 밝혀졌다. 이 인자는 혈관신생을 매개하는 주요 VEGF 신호전달 수용체인 VEGF 수용체 2(VEGFR-2)를 통해 신호를 전달한다. 이 경로를 다양한 시점에서 조절하기 위한 여러 치료제들이 개발되었다. 이들 치료법은, 특히 베바시주맙, 수니티닙, 소라페닙 및 바탈라닙을 포함한다. 임상에서 혈관신생 억제제의 사용은 성공적인 것으로 밝혀졌지만, 모든 환자들이 혈관신생 억제제 치료법에 반응하지 않거나 충분히 반응하지 못한다. 이러한 불완전한 반응의 근본적인 기작(들)은 공지되어 있지 않다. 그러므로, 항-혈관신생 암 치료법에 민감하거나 반응하는 환자 하위군의 확인에 대한 필요성이 증가하고 있다.
많은 혈관신생 억제제가 알려져 있지만, 가장 두드러진 혈관신생 억제제는 베바시주맙(아바스틴(등록상표))이다. 베바시주맙은 VEGF(혈관 내피 성장 인자)에 특이적으로 결합하고 그의 생물학적 효과를 차단하는 재조합 인간화된 단일클론 IgG1 항체이다. VEGF는 종양 성장 및 전이, 즉, 신체 다른 부위로의 종양의 확산에 필요한 필수 과정인 종양 혈관신생의 핵심 유발자이다. 아바스틴(등록상표)은 총체적으로 매년 250만명 이상의 사망을 야기하는 4종의 일반 암, 즉 대장암, 유방암, 비-소세포 폐암(NSCLC) 및 신장암의 진행된 단계의 치료용으로 유럽에서 승인되었다. 미국에서는, 아바스틴(등록상표)이 FDA에 의해 승인된 최초의 항-혈관신생 치료법이었으며, 현재 5종의 종양, 즉 대장암, 비-소세포 폐암, 유방암, 뇌암(교모세포종) 및 신장암(신세포암종)의 치료용으로 승인되어 있다. 지금까지 50만명 이상의 환자들이 아바스틴으로 치료받았으며, 450회 이상의 임상 시험을 갖는 포괄적인 임상 프로그램이 다양한 셋팅(예를 들면, 진행된 또는 초기 단계 질환)에서 여러 종류의 암(대장암, 유방암, 비-소세포 폐암, 뇌암, 위암, 난소암 및 전립선암을 포함함)의 치료에 있어서 아바스틴의 추가의 사용을 연구하고 있다. 중요하게는, 아바스틴(등록상표)은 광범위한 화학치료법 및 다른 항암 치료와 병용될 때 효능을 나타내는 병용치료제(co-therapeutic)로서의 가능성을 보였다. 베바시주맙과 표준 화학치료 요법의 병용의 유리한 효과를 입증하는 III 기 연구가 공개되었다(예를 들면, 문헌(Saltz et al., J. Clin. Oncol., 26:2013-2019 (2008)); 문헌(Yang et al., Clin. Cancer Res., 14:5893-5899 (2008)); 및 문헌(Hurwitz et al., N. Engl. J. Med., 350:2335-2342 (2004)) 참조). 그러나, 혈관신생 억제제의 선행 연구들에서와 같이, 이들 III 기 연구 중 몇몇은 환자들의 일부가 화학치료 요법에의 베바시주맙(아바스틴(등록상표))의 추가에 대해 불완전한 반응을 경험한다는 것을 밝혔다.
따라서, 혈관신생 억제제, 특히 베바시주맙(아바스틴(등록상표))을 포함하는 병용 요법에 반응하거나 반응할 가능성이 있는 환자들을 확인하는 방법에 대한 필요성이 존재한다. 따라서, 본 발명의 근본적인 기술적 문제는, 화학치료법, 예를 들면, 젬시타빈-에를로티닙(GE) 치료법에의 혈관신생 억제제, 특히 베바시주맙(아바스틴(등록상표))의 추가로부터 이익을 얻을 수 있는, 췌장암, 특히 전이성 췌장암 앓고 있거나 앓기 쉬운 환자(들)를 확인하는 방법 및 수단의 제공이다.
상기 기술적 문제는 특허청구범위에 특징지어진 실시양태의 제공에 의해 해결된다.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 췌장암을 앓고 있는 환자의 화학치료 요법의 치료 효과를 개선하는 방법을 제공한다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 췌장암을 앓고 있는 환자의 화학치료 요법의 치료 효과를 개선하는 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 또는 VEGFR2의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA 또는 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 또는 VEGFR2의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA 또는 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 또는 VEGFR2의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA 또는 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 또는 VEGFR2의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA 또는 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 또는 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA 또는 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 또는 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA 또는 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 또는 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA 또는 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 또는 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA 또는 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법을 제공한다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
상기 췌장암은 전이성 췌장암일 수 있다.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
상기 췌장암은 전이성 췌장암일 수 있다.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법을 제공한다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
상기 췌장암은 전이성 췌장암일 수 있다.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
상기 췌장암은 전이성 췌장암일 수 있다.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법을 제공한다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 및 VEGFR2의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 및 VEGFR2의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 및 VEGFR2의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 및 VEGFR2의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법을 제공한다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 및 VEGFR2의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 및 VEGFR2의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 및 VEGFR2의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 및 VEGFR2의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법을 제공한다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 및 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 및 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 및 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 및 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법을 제공한다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 및 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 및 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 및 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가함으로써 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하는 방법으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함하는, 방법에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 및 PLGF의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은 췌장암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있거나, 앓고 있는 것으로 의심되거나 앓기 쉬운 환자로부터의 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 화학치료 요법에의 베바시주맙 치료의 추가에 반응하거나 민감한 환자를 확인하는 시험관내 방법을 제공하는데, 이때 췌장암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상은 상기 화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 대한 상기 환자의 민감성을 표시한다. 상기 화학치료 요법은 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함할 수 있다.
따라서, 본 발명은
(a) 췌장암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있거나, 앓고 있는 것으로 의심되거나 또는 앓기 쉬운 환자로부터 샘플을 수득하는 단계; 및
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계
를 포함하는, 화학치료 요법에의 베바시주맙 치료의 추가에 반응하거나 민감한 환자를 확인하는 시험관내 방법에 관한 것으로서, 이때 췌장암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상은 상기 화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 대한 환자의 민감성을 표시한다. 상기 화학치료 요법은 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함할 수 있다.
도 1은 전이성 췌장암에 대해 치료받고 있는 환자를 위한 베바시주맙 + 젬시타빈-에를로티닙 치료법 대 대조군 플라세보 + 젬시타빈-에를로티닙 치료법에 있어서 전체 생존율(도 1a) 및 무진행 생존율(도 1b)에 대한 카플란 메이에르(Kaplan Meier) 곡선을 보여준다. 도면에서, 직선은 베바시주맙/젬시타빈-에를로티닙 치료를 나타내고, 점선은 플라세보/젬시타빈-에를로티닙 치료를 나타낸다.
도 2는 전이성 췌장암에 대해 치료받고 있는 환자를 위한 베바시주맙 + 젬시타빈-에를로티닙 치료법 대 대조군 플라세보 + 젬시타빈-에를로티닙 치료법에 있어서 고 발현 수준(≥152.9 pg/㎖) 및 저 발현 수준(<152.9 pg/㎖)의 경우 마커 VEGFA에 대한 전체 생존율에 대한 치료 효과와의 관련성(도 2a) 및 마커 VEGFA에 대한 무진행 생존율에 대한 치료 효과와의 관련성(도 2b)에 대한 카플란 메이에르 곡선을 보여준다. 도면에서, 직선은 베바시주맙/젬시타빈-에를로티닙 치료를 나타내고, 점선은 플라세보/젬시타빈-에를로티닙 치료를 나타낸다.
도 3은 전이성 췌장암에 대해 치료받고 있는 환자를 위한 베바시주맙 + 젬시타빈-에를로티닙 치료법 대 대조군 플라세보 + 젬시타빈-에를로티닙 치료법에 있어서 고 발현 수준(≥9.9 ng/㎖) 및 저 발현 수준(<9.9 ng/㎖)의 경우 마커 VEGFR2에 대한 전체 생존율에 대한 치료 효과와의 관련성에 대한 카플란 메이에르 곡선을 보여준다. 도면에서, 직선은 베바시주맙/젬시타빈-에를로티닙 치료를 나타내고, 점선은 플라세보/젬시타빈-에를로티닙 치료를 나타낸다.
도 4는 전이성 췌장암에 대해 치료받고 있는 환자를 위한 베바시주맙 + 젬시타빈-에를로티닙 치료법 대 대조군 플라세보 + 젬시타빈-에를로티닙 치료법에 있어서 최적화된 고 발현 수준(≥36.5 pg/㎖) 및 저 발현 수준(<36.5 pg/㎖)의 경우 마커 PLGF에 대한 무진행 생존율에 대한 치료 효과와의 관련성에 대한 카플란 메이에르 곡선을 보여준다. 도면에서, 직선은 베바시주맙/젬시타빈-에를로티닙 치료를 나타내고, 점선은 플라세보/젬시타빈-에를로티닙 치료를 나타낸다.
도 5는 전이성 췌장암에 대해 치료받고 있는 환자를 위한 베바시주맙 + 젬시타빈-에를로티닙 치료법 대 대조군 플라세보 + 젬시타빈-에를로티닙 치료법에 있어서 고 발현 수준(수학식 1 ≥ -0.1) 및 저 발현 수준(수학식 1 < -0.1) 둘다에 대한 조합된 발현 수준으로서 마커 VEGFA 및 VEGFR2에 대한 전체 생존율에 대한 치료 효과와의 관련성(도 5a), 및 고 발현 수준(수학식 2 ≥ -0.042) 및 저 발현 수준(수학식 2 < -0.042) 둘다에 대한 조합된 발현 수준으로서 마커 VEGFA 및 PLGF에 대한 전체 생존율에 대한 치료 효과와의 관련성(도 5b)에 대한 카플란 메이에르 곡선을 보여준다. 도면에서, 직선은 베바시주맙/젬시타빈-에를로티닙 치료를 나타내고, 점선은 플라세보/젬시타빈-에를로티닙 치료를 나타낸다.
도 6은 전이성 췌장암에 대해 치료받고 있는 환자를 위한 베바시주맙 + 젬시타빈-에를로티닙 치료법 대 대조군 플라세보 + 젬시타빈-에를로티닙 치료법에 있어서 고 발현 수준(수학식 1 ≥ -0.1) 및 저 발현 수준(수학식 1 < -0.1) 둘다에 대한 조합된 발현 수준으로서 마커 VEGFA 및 VEGFR2에 대한 무진행 생존율에 대한 치료 효과와의 관련성(도 6a), 및 고 발현 수준(수학식 2 ≥ -0.042) 및 저 발현 수준(수학식 2 < -0.042) 둘다에 대한 조합된 발현 수준으로서 마커 VEGFA 및 PLGF에 대한 무진행 생존율에 대한 치료 효과와의 관련성(도 6b)에 대한 카플란 메이에르 곡선을 보여준다. 도면에서, 직선은 베바시주맙/젬시타빈-에를로티닙 치료를 나타내고, 점선은 플라세보/젬시타빈-에를로티닙 치료를 나타낸다.
도 7은 전이성 췌장암에 대해 치료받고 있는 환자를 위한 베바시주맙 + 젬시타빈-에를로티닙 치료법 대 대조군 플라세보 + 젬시타빈-에를로티닙 치료법에 있어서 고 발현 수준(수학식 3 ≥ 0.837) 및 저 발현 수준(수학식 3 < 0.837) 둘다에 대한 조합된 발현 수준으로서 마커 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF에 대한 전체 생존율에 대한 치료 효과와의 관련성(도 7a), 및 고 발현 수준(수학식 3 ≥ 0.837) 및 저 발현 수준(수학식 3 < 0.837) 둘다에 대한 조합된 발현 수준으로서 마커 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF에 대한 무진행 생존율에 대한 치료 효과와의 관련성(도 7b)에 대한 카플란 메이에르 곡선을 보여준다. 도면에서, 직선은 베바시주맙/젬시타빈-에를로티닙 치료를 나타내고, 점선은 플라세보/젬시타빈-에를로티닙 치료를 나타낸다.
도 8은 VEGFA의 예시적 아미노산 서열(서열번호: 1)이다.
도 9는 VEGFR2의 예시적 아미노산 서열(서열번호: 2)이다(도 9a 및 도 9b).
도 10은 PLGF의 예시적 아미노산 서열(서열번호: 3)이다.
도 11은 IMPACT 칩 상에서 측정된 증가하는 농도의 VEGF111, VEGF121, VEGF165 및 VEGF189의 측정을 보여준다.
도 12는 자동화된 엘렉시스(Elecsys)(등록상표) 분석기 상에서 엘렉시스(등록상표) 분석을 이용함으로써 측정된 증가하는 농도의 VEGF111, VEGF121 및 VEGF165의 측정을 보여준다.
도 13은 IMPACT 분석에 의해 2회 측정된 동일 환자로부터의 EDTA 및 시트레이트 샘플로부터의 데이터를 보여준다. VEGFA 농도는 EDTA-시트레이트 방법 비교에 대한 약 0.8의 스페어만(Spearman) 상관계수를 가지면서 시트레이트-혈장보다 EDTA-혈장의 경우 약 40% 더 높다.
도 14는 이. 콜라이 또는 HEK 세포에서 재조합적으로 제조된 증가하는 농도의 VEGF165가 자동화된 엘렉시스(등록상표) 분석기 상에서 측정되었을 때 측정된 카운트(ECL-신호)를 보여준다.
본 발명은 전이성 췌장암을 앓고 있거나, 앓고 있는 것으로 의심되거나 앓기 쉬운 환자로부터의 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 화학치료 요법에의 베바시주맙 치료의 추가에 반응하거나 민감한 환자를 확인하는 시험관내 방법을 제공하는데, 이때 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2, VEGFA 및 PLGF, 또는 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF는 상기 화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 대한 상기 환자의 민감성을 표시한다. 상기 화학치료 요법은 젬시타빈-에를로티닙 치료법을 포함할 수 있다.
따라서, 본 발명은 놀랍게도 췌장암, 특히 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적인, 주어진 환자에서의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 혈장 특이적 발현 수준이 화학치료 요법과 함께 혈관신생 억제제를 투여받은 환자에서 치료 효과와 상관관계를 갖는다는 것을 밝혔다는 점에서 확인된 기술적 문제를 해결한다. 특히, VEGFA, VEGFR2 및/또는 PLGF의 단백질 발현 수준의 변화는 놀랍게도 젬시타빈-에를로티닙의 화학치료 요법에의 베바시주맙(아바스틴(등록상표))의 추가에 반응하여 개선된 전이성 췌장암 환자의 전체 생존율 및/또는 무진행 생존율에 대한 마커/예후자로서 확인되었다. 화학치료 요법에의 베바시주맙(아바스틴(등록상표))의 추가에 대한 반응성 또는 민감성을 나타내는 환자는 췌장암, 특히 전이성 췌장암으로 진단된 환자로부터 수득된 샘플에서 확립된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 단백질 발현 수준의 하나 이상의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 것으로 확인되었다. 용어 "마커"와 "예후자"는 상호교환적으로 사용될 수 있고 본원에 기재된 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준을 의미한다. 본 발명은 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 혈장 발현 수준들 중 임의의 2개 이상의 조합을 의미하기 위한 용어 "마커" 및 "예후자"의 사용을 포함한다.
본 발명과 관련하여, "VEGFA"는 도 8에 나타낸 서열번호: 1(스위스 프롯(Swiss Prot) 접수번호 P15692, 유전자 ID (NCBI): 7422)로 예시된 혈관 내피 성장 인자 단백질 A를 의미한다. 용어 "VEGFA"는 서열번호: 1의 아마노산 서열을 갖는 단백질뿐만 아니라 이의 상동체(homologue) 및 동형체(isoform)도 포함한다. 또한, 용어 "VEGFA"는 문헌(Ferrara Mol. Biol. Cell 21:687 (2010)), 문헌(Leung et al. Science 246:1306 (1989)) 및 문헌(Houck et al. Mol. Endocrin. 5:1806 (1991))에 기재된 바와 같이 VEGF165의 플라스민 절단에 의해 발생된 110개 아미노산 인간 혈관 내피 세포 성장 인자를 포함하는 VEGFA의 공지된 동형체, 예를 들면, 스플라이스 동형체, 예를 들면, VEGF111, VEGF121, VEGF145, VEGF165, VEGF189 및 VEGF206뿐만 아니라 이들의 변이체, 상동체 및 동형체도 포함한다. 본 발명의 구체적 실시양태에서, "VEGFA"는 VEGF121 및/또는 VEGF110을 의미한다.
본 발명과 관련하여, 용어 "VEGFA"는 서열번호: 1의 아미노산 서열에 대해, 또는 이의 변이체 및/또는 상동체의 아미노산 서열 및 이 서열들의 단편에 대해 85% 이상, 90% 이상 또는 95% 이상의 상동성을 갖는 단백질도 포함하되, 상기 변이체 단백질(동형체를 포함함), 상동성 단백질 및/또는 단편은 하나 이상의 VEGFA 특이적 항체, 예컨대, 각각 벤더 렐리아테크(Bender RELIATech) 및 알앤드디 시스템스(R&D Systems)로부터 입수가능한 항체 클론 3C5 및 26503, 및 문헌(Kim et al., Growth Factors 7(1): 53-64 (1992))에 기재된 A4.6.1에 의해 인식된다. 본 발명과 관련하여, VEGF 또는 VEGF-A의 용어 "동형체"는 스플라이스 동형체, 및 효소적 절단(예를 들면, 플라스민)에 의해 발생된 형태 둘다를 의미한다.
한 실시양태에서, "VEGFA"는 비-변형된 VEGF를 의미한다. 본 발명과 관련하여, "비-변형된" VEGF는 VEGF의 비-변형된 아미노산 서열, 이의 동형체 및 이의 절단 생성물에 관한 것이다. 비-변형된 VEGF는 예를 들면, 합성적으로 제조될 수 있거나, 바람직하게는 원핵 발현 시스템, 예를 들면, 이. 콜라이에서 재조합적으로 제조될 수 있다. 비-변형된 VEGF는 예를 들면, 번역 후 변형, 예컨대, 글리코실화를 보유하지 않는다. 본 발명과 관련하여, 용어 "비-변형된 VEGF-A"는 이의 변이체 및/또는 상동체뿐만 아니라 VEGF-A의 단편도 포함하되, 상기 변이체 단백질(동형체를 포함함), 상동성 단백질 및/또는 단편은 비-변형된 VEGF-A 특이적 항체, 예컨대, 렐리아테크 게엠베하(독일 불펜부텔 소재)로부터 입수가능한 항체 클론 3C5에 의해 인식된다.
본 발명과 관련하여, "VEGFR2"는 도 9에 나타낸 서열번호: 2(스위스 프롯 접수번호 P35968, 유전자 ID (NCBI): 3791)로 예시된 혈관 내피 성장 인자 수용체 2를 의미한다. 용어 "VEGFR2"는 서열번호: 2의 아미노산 서열을 갖는 단백질뿐만 아니라 이의 상동체 및 동형체도 포함한다. 본 발명과 관련하여, 용어 "VEGFR2"는 서열번호: 2의 아미노산 서열에 대해, 또는 이의 변이체 및/또는 상동체의 아미노산 서열 및 이 서열들의 단편에 대해 85% 이상, 90% 이상 또는 95% 이상의 상동성을 갖는 단백질도 포함하되, 상기 변이체 단백질(동형체를 포함함), 상동성 단백질 및/또는 단편은 하나 이상의 VEGFR2 특이적 항체, 예컨대, 알앤드디 시스템스로부터 입수가능한 항체 클론 89115 및 89109에 의해 인식된다.
본 발명과 관련하여, "PLGF"는 도 10에 나타낸 서열번호: 3(스위스 프롯 접수번호 P49763, 유전자 ID (NCBI): 5228)으로 예시된 태반 성장 인자를 의미한다. 용어 "PLGF"는 서열번호: 3의 아미노산 서열을 갖는 단백질뿐만 아니라 이의 상동체 및 동형체도 포함한다. 본 발명과 관련하여, 용어 "PLGF"는 서열번호: 3의 아미노산 서열에 대해, 또는 이의 변이체 및/또는 상동체의 아미노산 서열 및 이 서열들의 단편에 대해 85% 이상, 90% 이상 또는 95% 이상의 상동성을 갖는 단백질도 포함하되, 상기 변이체 단백질(동형체를 포함함), 상동성 단백질 및/또는 단편은 하나 이상의 PLGF 특이적 항체, 예컨대, 로슈 다이아그노스틱스 게엠베하(Roche Diagnostics GmbH)로부터 입수가능한 항체 클론 2D6D5 및 6A11D2에 의해 인식된다.
따라서, 본 발명은 본원에 기재된 바와 같은 아미노산 서열을 포함하나 이로 한정되지는 않는 단백질의 발현 수준의 측정을 포함한다. 이와 관련하여, 본 발명은 VEGFA, VEGFRA 및 PLGF 중 하나 이상의 상동체, 변이체 및 동형체의 검출을 포함하고, 상기 동형체 또는 변이체는 특히 대립형질 변이체 또는 스플라이스 변이체를 포함할 수 있다. 예를 들면, 서열번호: 1, 서열번호: 2 또는 서열번호: 3의 아미노산 서열 또는 이의 단편에 대해 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 이상의 서열 동일성을 갖는, 본원에 기재된 바와 같은 VEGFA, VEGFRA 및 PLGF 중 하나 이상에 대해 상동성을 갖는 단백질, 또는 이의 단편의 검출도 예상된다. 대안적으로 또는 추가로, 본 발명은 서열번호: 1, 서열번호: 2 또는 서열번호: 3을 코딩하는 핵산 서열 또는 이의 단편, 변이체 또는 동형체와 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 이상 동일한 핵산 서열에 의해 코딩된 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준의 검출을 포함한다. 이와 관련하여, 용어 "변이체"는 VEGFA, VEGFR2 및/또는 PLGF 아미노산 서열, 또는 상기 아미노산 서열을 코딩하는 핵산 서열이 돌연변이, 예를 들면, 결실, 부가, 치환, 역위 등에 의해, 서열번호: 1, 서열번호: 2 또는 서열번호: 3에 의해 확인되고/되거나 상기 확인된 스위스 프롯 접수 번호 하에 입수가능한 상이한 서열들과 구별된다는 것을 의미한다. 또한, 용어 "상동체"는 서열번호: 1, 서열번호: 2 또는 서열번호: 3에 나타낸 바와 같은 폴리펩티드 중 하나 이상 또는 이의 단편(들)에 대해 60% 이상, 보다 바람직하게는 80% 이상, 가장 바람직하게는 90% 이상의 서열 동일성을 갖는 분자를 의미한다.
아미노산 또는 핵산 서열이 본원에 기재된 바와 같은 아미노산 또는 핵산 서열에 대해 일정한 정도의 동일성을 갖는지를 확인하기 위해, 당업자는 수동적으로 또는 당업계에서 공지되어 있거나 본원에 기재된 컴퓨터 프로그램을 이용하여, 당업계에서 잘 공지되어 있는 수단 및 방법, 예를 들면, 정렬(alignment)을 이용할 수 있다.
본 발명에 따라, 2개 이상의 아미노산 또는 핵산 서열과 관련하여 용어 "동일한" 또는 "% 동일성"은 비교창에 걸쳐, 또는 당업계에 공지된 바와 같은 서열 비교 알고리즘의 사용 또는 수동 정렬 및 육안 검사에 의해 측정된 바와 같은 지정된 영역에 걸쳐 최대 상응성에 대해 비교하고 정렬될 때 동일한 2개 이상의 서열 또는 하위서열 또는 특정된 비율의 동일한(예를 들면, 서열번호: 1, 서열번호: 2 또는 서열번호: 3의 아미노산 서열과 60% 또는 65% 동일한, 바람직하게는 70% 내지 95% 동일한, 보다 바람직하게는 95% 이상 동일한) 아미노산 잔기 또는 뉴클레오티드를 갖는 2개 이상의 서열 또는 하위서열을 의미한다. 예를 들면, 60% 내지 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 서열은 실질적으로 동일한 것으로 간주된다. 이러한 정의는 또한 시험 서열의 보체에도 적용된다. 바람직하게는, 기재된 동일성은 약 15 내지 25개 이상의 아미노산 또는 뉴클레오티드 길이의 영역에 걸쳐, 보다 바람직하게는 약 50 내지 100개 아미노산 또는 뉴클레오티드 길이의 영역에 걸쳐 존재한다. 당업자는 예를 들어, 알고리즘, 예컨대, 당업계에서 공지된 바와 같은 CLUSTALW 컴퓨터 프로그램(Thompson Nucl. Acids Res. 2, 4673-4680 (1994)) 또는 FASTDB(Brutlag Comp. App. Biosci. 6, 237-245 (1990))에 근거한 알고리즘을 이용하여 서열들 사이에서/중에서 % 동일성을 측정하는 방법을 인식할 것이다.
FASTDB 알고리즘은 전형적으로 그의 계산에서 서열 내의 내부 비-매칭 결실 또는 부가, 즉, 갭(gap)을 고려하지 않지만, 이것은 % 동일성의 과대평가를 방지하기 위해 수동적으로 보정될 수 있다. 그러나, CLUSTALW는 서열 갭을 그의 동일성 계산에서 고려한다. 이 분야에서 기술을 가진 자에게 BLAST(Basic Local Alignment Search Tool) 및 BALST 2.0 알고리즘(Altschul, Nucl. Acids Res. 25:3389-3402 (1997); Altschul, J. Mol. Evol. 36:290-300 (1993); Altschul, J. Mol. Biol. 215:403-410 (1990))도 이용가능하다. 핵산 서열용 BLASTN 프로그램은 디폴트(default)로서 11의 단어 길이(W), 10의 기대값(E), M=5, N=4, 및 두 가닥의 비교를 이용한다. 아미노산 서열의 경우, BLASTP 프로그램은 디폴트로서 3의 단어 길이(W) 및 10의 기대값(E)을 이용한다. BLOSUM62 스코어링 행렬(scoring matrix)(Henikoff, PNAS 89:10915 (1989))은 50의 정렬값(B), 10의 기대값(E), M=5, N=4 및 두 가닥의 비교를 이용한다.
전술한 바와 같은 BLAST 알고리즘은 서열 유사성을 측정하기 위한 아미노산 및 뉴클레오티드 서열 둘다의 정렬을 제공한다. 정렬의 국소적 성질로 인해, BLAST는 정확한 매치를 측정하거나 유사한 서열을 확인하는 데에 특히 유용하다. BLAST 알고리즘 출력물의 기본 유닛은 하이-스코어링 분절 쌍(High-scoring Segment Pair, HSP)이다. HSP는 그의 정렬이 국소적으로 최대이고 그에 대한 정렬 스코어가 사용자에 의해 설정된 임계치 또는 컷-오프 스코어를 충족시키거나 초과하는, 임의적이지만 동일한 길이를 갖는 2개의 서열 단편으로 이루어진다. BLAST 방법은 질의(query) 서열과 데이터베이스 서열 사이에 HSP를 찾고, 발견된 임의의 매치의 통계학적 유의성을 평가하고, 유의성의 사용자-선택된 임계치를 충족시키는 매치만을 기록하는 것이다. 파라미터 E는 데이터베이스 서열 매치를 기록하기 위한 통계학적으로 유의한 임계치를 확립한다. E는 전체 데이터 베이스 검색의 내용 내에서 HSP(또는 HSP 세트)의 우연한 발생의 예상된 빈도의 상한으로서 해석된다. 그의 매치가 E를 충족시키는 임의의 데이터베이스 서열은 프로그램 출력물에 기록된다.
BLAST를 이용하는 유사한 컴퓨터 기법을 이용하여 진뱅크(GenBank) 또는 EMBL과 같은 단백질 또는 뉴클레오티드 데이터베이스 내에서 동일하거나 관련된 분자를 검색할 수 있다. 이 분석은 다중 막 기초 혼성화보다 훨씬 빠르다. 또한, 컴퓨터 검색의 민감도를 변화시켜 임의의 특정한 매치가 정확한 매치 또는 유사한 매치로서 분류되는지를 확인할 수 있다. 검색의 기초는 다음과 같이 정의되는 곱 스코어(product score)이며, 두 서열 사이의 유사성 정도 및 서열 매치의 길이 둘다가 고려된다: [% 서열 동일성 x % 최대 BLAST 스코어]/100. 예를 들면, 40의 곱 스코어의 경우, 매치는 1% 내지 2% 오차 내에서 정확할 것이며, 70의 곱 스코어의 경우, 매치는 정확할 것이다. 유사한 분자들은 통상적으로 15 내지 40의 곱 스코어를 나타내는 것들을 선택함으로써 확인되지만, 더 낮은 스코어도 관련 분자를 확인할 수 있다. 서열 정렬을 발생시킬 수 있는 프로그램에 대한 또 다른 예는 당업계에 공지되어 있는 바와 같이, CLUSTALW 컴퓨터 프로그램(Thompson, Nucl. Acids Res. 2:4673-4680 (1994)) 또는 FASTDB(Brutlag, Comp. App. Biosci. 6:237-245 (1990))이다.
본원에 기재된 본 발명과 관련하여, VEGFA, VEGFR2 및/또는 PLGF의 발현 수준, 특히 단백질 발현 수준은 개별 마커로서 또는 2개 이상의 군으로 발현 프로파일 또는 마커 패널로서 별도로 고려될 수 있다. 본원에 기재된 본 발명과 관련하여, 2개 이상의 마커의 발현 프로파일이 함께 고려될 수 있는 발현 프로파일 또는 마커 패널은 조합된 발현 수준으로도 지칭될 수 있다. 예를 들면, 2개 이상의 마커의 발현 수준은 함께 합해져 유사하게 측정된 대조군 조합된 발현 수준과 비교될 수 있다. 따라서, 본 발명의 방법은 2개 이상의 마커의 발현 수준에 근거하여 조합된 발현 수준을 포함하는 발현 프로파일을 확인하는 것을 포함한다.
본원에 기재된 본 발명과 관련하여 첨부된 예증적 실시예에 따라, VEGFA, VEGFR2 또는 PLGF를 별도로 고려하기 위해, 하기 값들이 마커의 상응하는 고 또는 저 발현 값으로서 사용되었다: 고 VEGFA(≥152.9 pg/㎖), 저 VEGFA(<152.9 pg/㎖), 고 VEGFR2(≥9.9 ng/㎖), 저 VEGFR2(<9.9 ng/㎖). 이들 수준들은 예정된 통계학적 분석 계획에 따라 이용가능한 샘플의 중간값에 의해 결정되었다. 추가로, 특정 마커의 고 발현과 저 발현 사이의 컷-오프 값을 구성하는 최적화된 수준은 컷-오프 초과 및 컷-오프 미만의 환자 하위세트가 관련 통계학적 최적 기준을 충족시킬 때까지 상기 컷-오프를 변화시킴으로써 측정될 수 있다. 예를 들면, 초과 하위세트와 미만 하위세트 사이의 치료 위험 비의 차이를 최대화하거나 1개의 하위군에서 치료 효과를 최대화하는 최적 컷-오프 점, 또는 임의의 다른 관련 통계학적 기준이 선택될 수 있다. 본원에 기재된 본 발명 및 첨부된 예증적 실시예에 따라, 별도로 고려되는 PLGF에 대한 최적화된 발현 값은 고 PLGF(≥ 36.5 pg/㎖) 및 저 PLGF(<36.5 pg/㎖)이었다. 이 수준은 이용가능한 데이터의 42번째 백분위수로서 결정되었다. 이 수준은 고 수준과 저 수준 사이의 치료 효과의 통계학적 차이를 증가시키도록 결정되었다. 그러나, 당업자는 특정 마커의 발현 수준 및 이에 따라 무엇이 고 또는 저 발현 수준을 구성하는지가 환자 및 환자 집단에 따라 변화될 수 있다는 것을 이해할 것이다. 따라서, 당업자는 첨부된 예증적 실시예에 기재된 검출 방법 이외의 검출 방법을 이용하고 첨부된 예증적 실시예에 기재된 환자 및 환자 집단 이외의 환자 및 환자 집단을 연구할 때 당업자가 특정 생체마커에 대한 고 및/또는 저 발현 수준을 얼마로 생각하는지가 본원에 기재된 값과 상이할 수 있다는 것을 이해할 것이다. 본원에 기재된 방법이 주어진 한, 당업자는 무엇이 특정 생체마커의 고 및/또는 저 발현 수준을 구성하는지를 확인할 수 있다.
당업자가 인식할 바와 같이, 연구되는 진단 문제를 개선하기 위해 2개 이상의 마커의 측정을 이용하는 많은 방법들이 존재한다. 꽤 단순하지만 그럼에도 불구하고 종종 효과적인 방법에서, 양성 결과는 샘플이 연구되는 마커들 중 하나 이상에 대해 양성을 나타내는 경우 추정된다.
그러나, 마커들의 조합물도 평가될 수 있다. 마커 패널의 마커들, 예를 들면, VEGFA 및 VEGFR2, VEGFA 및 PLGF, 또는 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF에 대해 측정된 값들(또는 조합된 발현 수준)은 수학적으로 조합될 수 있고, 조합된 값은 근본적인 진단 문제와 상관관계를 가질 수 있다. 마커 값들은 임의의 적절한 현재 기술 수준의 수학적 방법에 의해 조합될 수 있다. 마커 조합물을 질환 또는 치료 효과와 서로 관련시키는 잘 공지된 수학적 방법은 판별 분석(DA)(즉, 선형, 이차 또는 정칙화된(regularized) DA), 커넬(Kernel) 방법(즉, SVM), 비-파라미터적 방법(즉, k-최근접-인접 분류기(k-Nearest-Neighbor Classifiers)), PLS(부분적 최소 자승), 트리 기초(Tree-Based) 방법(즉, 로직 회귀(Logic Regression), CART, 랜덤 포레스트(Random Forest) 방법, 부스팅/백깅(Boosting/Bagging) 방법), 일반화된 선형 모델(즉, 로지스틱 회귀), 주요 구성요소 기초 방법(즉, SIMCA), 일반화된 부가 모델, 퍼지 로직(Fuzzy Logic) 기초 방법, 뉴랄 네트워크스(Neural Networks) 및 제네틱 알고리즘 기초 방법과 같은 방법을 이용한다. 당업자는 본 발명의 마커 조합물을 평가하는 적절한 방법을 선택함에 있어서 문제를 갖지 않을 것이다. 본원에 개시된 본 발명에 따른 마커 조합물을, 예를 들면, 화학치료제/화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 대한 개선된 전체 생존율, 무진행 생존율, 반응성 및 민감성, 및/또는 (하나 이상의 화학치료제/화학치료 요법 이외에) 베바시주맙에 대한 반응성 또는 민감성의 예측과 서로 관련시키는 데에 이용되는 방법은 DA(즉, 선형, 이차 또는 정칙화된 판별 분석), 커넬 방법(즉, SVM), 비-파라미터적 방법(즉, k-최근접-인접 분류기), PLS(부분적 최소 자승), 트리 기초 방법(즉, 로직 회귀, CART, 랜덤 포레스트 방법, 부스팅 방법) 및 일반화된 선형 모델(즉, 로지스틱 회귀)로부터 선택된다. 이들 통계학적 방법들에 관한 세부사항은 하기 참고문헌들에서 발견된다: 문헌(Ruczinski, I., et al, J. of Computational and Graphical Statistics, 12 (2003) 475-511); 문헌(Friedman, J. H., J. of the American Statistical Association 84 (1989) 165-175); 문헌(Hastie, Trevor, Tibshirani, Robert, Friedman, Jerome, The Elements of Statistical Learning, Springer Series in Statistics, 2001); 문헌(Breiman, L., Friedman, J. H., Olshen, R. A., Stone, C. J. (1984) Classification and regression trees, California: Wadsworth; Breiman, L., Random Forests, Machine Learning, 45 (2001) 5-32); 문헌(Pepe, M. S., The Statistical Evaluation of Medical Tests for Classification and Prediction, Oxford Statistical Science Series, 28 (2003)); 및 문헌(Duda, R. O., Hart, P. E., Stork, D. G., Pattern Classification, Wiley Interscience, 2nd Edition (2001)).
따라서, 본원에 개시된 본 발명은 생물학적 마커들의 근본적인 조합을 위한 및 상태 B로부터 상태 A를 구별하기 위한, 예를 들면, 화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 잘 반응하지 않는 환자로부터 화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 반응하거나 민감한 환자를 구별하기 위한 최적화된 다변량 컷-오프의 용도에 관한 것이다. 이러한 유형의 분석에서, 마커들은 더 이상 독립적이지 않고 마커 패널 또는 조합된 발현 수준을 형성한다.
따라서, 본 발명은 VEGFA, PLGF 및 VEGFR2 중 2개 이상의 발현 수준을 측정하고 각각의 발현 수준이 체중 함수(또는 체중 계수)와 곱해지도록 이들 발현 수준을 합함으로써 베바시주맙을 화학치료 요법에 추가하여 췌장암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 화학치료 요법의 치료 효과를 개선하는 방법에 관한 것이다. 놀랍게도, 결과("값", 수학적 연산의 결과 또는 조합된 발현 수준)는 미리 특정된 (다변량) 컷-오프 초과의 값이 환자에 대한 보다 우수한 치료 효과를 표시하고, 이 컷-오프 미만의 값이 보다 좋지 않은 치료 효과를 표시할 정도로 병용 화학치료 섭생법으로 베바시주맙을 투여받은 환자에서 치료 효과와 상관관계를 갖는다.
따라서, 본 발명은 VEGFA 및 VEGFR2의 발현 수준을 측정하고 각각의 발현 수준이 체중 함수(또는 체중 계수)와 곱해지도록 이들 발현 수준을 합함으로써 암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 화학치료 요법의 치료 효과를 개선하는 방법에 관한 것이다. 놀랍게도, 결과("값", 수학적 연산의 결과 또는 조합된 발현 수준)는 미리 특정된 (다변량) 컷-오프 초과의 값이 환자에 대한 보다 우수한 치료 효과를 표시하고, 이 컷-오프 미만의 값이 보다 좋지 않은 치료 효과를 표시할 정도로 병용 화학치료 섭생법으로 베바시주맙을 투여받은 환자에서 치료 효과와 상관관계를 갖는다.
또한, 본 발명은 VEGFA 및 PLGF의 발현 수준을 측정하고 각각의 발현 수준이 체중 함수(또는 체중 계수)와 곱해지도록 이들 발현 수준을 합함으로써 암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 화학치료 요법의 치료 효과를 개선하는 방법에 관한 것이다. 놀랍게도, 결과("값", 수학적 연산의 결과 또는 조합된 발현 수준)는 미리 특정된 (다변량) 컷-오프 초과의 값이 환자에 대한 보다 우수한 치료 효과를 표시하고, 이 컷-오프 미만의 값이 보다 좋지 않은 치료 효과를 표시할 정도로 병용 화학치료 섭생법으로 베바시주맙을 투여받은 환자에서 치료 효과와 상관관계를 갖는다.
또한, 본 발명은 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 발현 수준을 측정하고 각각의 발현 수준이 체중 함수(또는 체중 계수)와 곱해지도록 이들 발현 수준을 합함으로써 암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 화학치료 요법의 치료 효과를 개선하는 방법에 관한 것이다. 놀랍게도, 결과("값", 수학적 연산의 결과 또는 조합된 발현 수준)는 미리 특정된 (다변량) 컷-오프 초과의 값이 환자에 대한 보다 우수한 치료 효과를 표시하고, 이 컷-오프 미만의 값이 보다 좋지 않은 치료 효과를 표시할 정도로 병용 화학치료 섭생법으로 베바시주맙을 투여받은 환자에서 치료 효과와 상관관계를 갖는다.
예를 들면, 첨부된 예증적 실시예에서 나타낸 바와 같이, 치료 효과가 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자에서 전체 생존율일 때 VEGFA 및 VEGFR2 또는 VEGFA 및 PLGF의 조합된 발현 수준을 평가하는 데에 하기 수학식들이 이용될 수 있다:
수학식 1: norm(VEGFA)+1.3*norm(VEGFR2), 컷-오프 = 중간값 또는 0
등가 수학식: VEGFA+3.3*VEGFR2, 컷-오프 = 중간값 또는 0
수학식 2: 0.25*norm(VEGFA)+0.21*norm(PLGF), 컷-오프 = 중간값 또는 0
등가 수학식: 0.19*VEGFA+0.67*PLGF, 컷-오프 = 중간값 또는 4.8
상기 식들에서, 본 발명자들은 log2 변환 및
Figure pct00001
를 이용하였다.
따라서, 본원에 기재된 본 발명과 관련하여 첨부된 예증적 실시예에 따라, 전체 생존율에 대한 VEGFA와 VEGFR2의 조합된 고 발현 수준은 (수학식 1 ≥ -0.1)이고 VEGFA와 VEGFR2의 조합된 저 발현 수준은 (수학식 1 < -0.1)이다. 본원에 기재된 본 발명과 관련하여 첨부된 예증적 실시예에 따라, 전체 생존율에 대한 VEGFA와 PLGF의 조합된 고 발현 수준은 (수학식 2 ≥ -0.042)이고 VEGFA와 PLGF의 조합된 저 발현 수준은 (수학식 2 < -0.042)이다. 그러나, 당업자는 마커 패널의 마커들, 예를 들면, VEGFA 및 VEGFR2 또는 VEGFA 및 PLGF에 대해 측정된 발현 수준(또는 조합된 발현 수준)은 수학적으로 조합될 수 있고, 조합된 발현 수준은 1종 초과의 방식으로 근본적인 진단 문제와 상관관계를 가질 수 있다는 것을 이해할 것이다. 따라서, 마커 수준은 임의의 적절한 현재 기술 수준의 수학적 방법에 의해 조합될 수 있다.
첨부된 예증적 실시예에 나타낸 바와 같이, 치료 효과가 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자에서 무진행 생존율일 때 VEGFA 및 VEGFR2 또는 VEGFA 및 PLGF의 조합된 발현 수준을 평가하는 데에 하기 수학식들이 이용될 수 있다:
수학식 1: norm(VEGFA)+1.3*norm(VEGFR2), 컷-오프 = 중간값 또는 0
등가 수학식: VEGFA+3.3*VEGFR2, 컷-오프 = 중간값 또는 0
수학식 2: 0.25*norm(VEGFA)+0.21*norm(PLGF), 컷-오프 = 중간값 또는 0
등가 수학식: 0.19*VEGFA+0.67*PLGF, 컷-오프 = 중간값 또는 4.8
상기 식들에서, 본 발명자들은 log2 변환 및
Figure pct00002
를 이용하였다.
따라서, 본원에 기재된 본 발명과 관련하여 첨부된 예증적 실시예에 따라, 무진행 생존율에 대한 VEGFA와 VEGFR2의 조합된 고 발현 수준은 (수학식 1 ≥ -0.1)이고 VEGFA와 VEGFR2의 조합된 저 발현 수준은 (수학식 1 < -0.1)이다. 본원에 기재된 본 발명과 관련하여 첨부된 예증적 실시예에 따라, 무진행 생존율에 대한 VEGFA와 PLGF의 조합된 고 발현 수준은 (수학식 2 ≥ -0.042)이고 VEGFA와 PLGF의 조합된 저 발현 수준은 (수학식 2 < -0.042)이다. 그러나, 당업자는 마커 패널의 마커들, 예를 들면, VEGFA 및 VEGFR2 또는 VEGFA 및 PLGF에 대해 측정된 발현 수준(또는 조합된 발현 수준)은 수학적으로 조합될 수 있고, 조합된 발현 수준은 1종 초과의 방식으로 근본적인 진단 문제와 상관관계를 가질 수 있다는 것을 이해할 것이다. 따라서, 마커 수준은 임의의 적절한 현재 기술 수준의 수학적 방법에 의해 조합될 수 있다.
예를 들면, 첨부된 예증적 실시예에 나타낸 바와 같이, 치료 효과가 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자에서 전체 생존율 또는 무진행 생존율일 때 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 조합된 발현 수준을 평가하는 데에 하기 수학식이 이용될 수 있다:
수학식 3: 0.0127*ln(PLGF+1)+0.144*ln(VEGFR2+1)+0.0949*ln(VEGFA+1)
상기 식에서, ln은 log 무리수 e이다.
따라서, 본원에 기재된 본 발명과 관련하여 첨부된 예증적 실시예에 따라, 전체 생존율에 대한 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 조합된 고 발현 수준은 (수학식 3 ≥ 0.837)이고 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 조합된 저 발현 수준은 (수학식 1 < 0.837)이다. 본원에 기재된 본 발명과 관련하여 첨부된 예증적 실시예에 따라, 무진행 생존율에 대한 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 조합된 고 발현 수준은 (수학식 3 ≥ 0.837)이고 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 조합된 저 발현 수준은 (수학식 3 < 0.837)이다. 그러나, 당업자는 마커 패널의 마커들, 예를 들면, VEGFA, VEGFR2 및 PLGF에 대해 측정된 발현 수준(또는 조합된 발현 수준)은 수학적으로 조합될 수 있고, 조합된 발현 수준은 1종 초과의 방식으로 근본적인 진단 문제와 상관관계를 가질 수 있다는 것을 이해할 것이다. 따라서, 마커 수준은 임의의 적절한 현재 기술 수준의 수학적 방법에 의해 조합될 수 있다.
마커 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준은 환자 샘플 중의 특정 단백질 수준의 측정에 적합한, 당업계에서 공지된 임의의 방법에 의해 평가될 수 있고 바람직하게는 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상에 대해 특이적인 항체를 사용하는 면역분석 방법, 예컨대, ELISA에 의해 측정된다. 이러한 방법은 당업계에서 잘 공지되어 있고 상용적으로 수행되고, 상응하는 상업적 항체 및/또는 키트는 용이하게 입수될 수 있다. 예를 들면, VEGFA, VEGFR2 및 PLGF에 대한 상업적으로 입수될 수 있는 항체/시험 키트는 벤더 렐리아테크 및 알앤드디 시스템스로부터 각각 클론 3C5 및 26503으로서, 알앤드디 시스템스로부터 각각 클론 89115 및89109로서, 및 로슈 다이아그노스틱스 게엠베하로부터 각각 클론 2D6D5 및 6A11D2로서 입수될 수 있다. 바람직하게는, 본 발명의 마커/표시자 단백질의 발현 수준은 항체 또는 키트 제조자의 시약 및/또는 프로토콜 권장의 이용을 통해 평가된다. 당업자는 면역분석 방법으로 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준을 측정하기 위한 추가 수단도 알고 있을 것이다. 따라서, 본 발명의 마커/표시자 중 하나 이상의 발현 수준은 과도한 실험 없이 당업자에 의해 상용적으로 재현가능하게 측정될 수 있다. 그러나, 정확하고 재현가능한 결과를 보장하기 위해, 본 발명은 시험 절차의 검증을 보장할 수 있는 전문화된 실험실에서의 환자 샘플의 시험도 포함한다.
VEGF121 및 VEGF110 단백질은 당업계에서 공지된 임의의 방법의 이용을 통해 검출될 수 있다. 예를 들면, 포유동물로부터의 조직 또는 세포 샘플은 웨스턴, ELISA 등의 이용을 통해 예를 들면, 단백질에 대해 편리하게 분석될 수 있다. 상기 기법들을 적용함에 있어서 지침을 제공하는 많은 참고문헌들이 이용될 수 있다(Kohler et al., Hybridoma Techniques (Cold Spring Harbor Laboratory, New York, 1980); Tijssen, Practice and Theory of Enzyme Immunoassays (Elsevier, Amsterdam, 1985); Campbell, Monoclonal Antibody Technology (Elsevier, Amsterdam, 1984); Hurrell, Monoclonal Hybridoma Antibodies: Techniques and Applications (CRC Press, Boca Raton, FL, 1982); and Zola, Monoclonal Antibodies: A Manual of Techniques, pp. 147-1 58 (CRC Press, Inc., 1987)).
VEGF121 및 VEGF110의 검출 또는 수준이 언급되는 경우, 이것은 두 분자의 합계가 예를 들면, VEGF121 및 VEGF110 둘다를 검출하는 분석의 이용을 통해 측정된다는 것을 의미한다. 분자 VEGF121 및 VEGF110 둘다를 검출하는 분석은 예를 들면, 상응하는 다른 형태(즉, VEGF110이 더 잘 인식되는 경우 VEGF121, 또는 VEGF121이 더 잘 인식되는 경우 VEGF110)에 대해 25% 이상의 민감도를 갖는 분석을 포함한다. 일부 실시양태에서, 상기 분석은 상응하는 다른 형태에 대해 50%, 75%, 80%, 85% 또는 90% 이상의 민감도를 갖는다. 한 실시양태에서, VEGF121 및 VEGF110 둘다가 본질적으로 동일한 민감도로 측정된다.
VEGF121 및 VEGF110 단백질의 검출에 대하여, 다양한 분석이 이용될 수 있다. 예를 들면, 샘플은 (예를 들면, 샌드위치 분석에서) 긴 천연 VEGF-A 동형체 VEGF165 및 VEGF189 각각에 비해 짧은 VEGF-A 동형체 VEGF121 및 VEGF110에 우선적으로 또는 특이적으로 결합하는 항체 또는 항체 조합물과 접촉될 수 있다. 바람직하게는, 상기 짧은 동형체는 긴 동형체에 비해 3배 이상 더 높은 민감도로 검출된다. 3배 이상 더 높은 민감도는 동일한 시약 및 동일한 표준 곡선을 이용하여 짧은 동형체(SDS-PAGE에 의해 측정된 90% 이상의 순도 및 OD 280 nm에 의해 측정된 농도) 및 예정된 농도의 긴 동형체(SDS-PAGE에 의해 측정된 90% 이상의 순도 및 OD 280 nm에 의해 측정된 농도)에 대해 표준 곡선을 확립하고 표준 곡선의 판독 값이 예측된 농도의 단지 3분의 1 이하인 경우 인정된다. 또한, 바람직하게는, 짧은 동형체에 대한 민감도는 긴 동형체에 비해, 특히 VEGF165에 비해 4배 이상, 5배 이상, 6배 이상, 7배 이상, 8배 이상 또는 9배 이상 더 높다.
한 실시양태에서, 두 짧은 동형체 VEGF121 및 VEGF110은 특이적으로 검출된다. 이러한 특이적 검출은 예를 들면, VEGF121에서 엑손 4와 엑손 8의 연결에 의해 발생된 서열 또는 VEGF110의 자유 C-말단에 결합하는 항체, 특히 단일클론 항체가 사용되는 경우 가능하다. 이러한 VEGF110 항-C-말단 항체는 긴 폴리펩티드 쇄의 일부로서 아미노산 110을 포함하는 임의의 VEGF-A 동형체, 또는 예를 들면, 아미노산 109에서 종결되는 짧은 VEGF-A 단편에 결합하지 않는다. VEGF121에서 엑손 4와 엑손 8의 연결에 의해 발생된 서열에 결합하는 단일클론 항체는 긴 VEGF 동형체 165 및 189에 포함된 아미노산 서열에 결합하지 않을 것인데, 이는 엑손 4와 엑손 7의 연결 및 엑손 4와 엑손 5의 연결 각각으로 인해 내부에 다른 아미노산 서열이 존재하기 때문이다(문헌(Ferrara, N., Mol. Biol, of the Cell 21 (2010) 687-690) 참조). 상기 의미에서 특이적 결합은 사용된 항체가 짧은 단편과 10% 미만의 교차반응성을 나타내고 항-VEGF110 항체의 경우 자유 C-말단 아미노산 110을 갖지 않는 VEGF-A 동형체 또는 항-VEGF121 항체의 경우 엑손 4와 엑손 8의 연결에 의해 발생된 서열을 포함하지 않는 동형체와 10% 미만의 교차반응성을 나타내는 경우 인정된다. 또한, 바람직하게는, 상기 교차반응성은 짧은 단편, 및 자유 C-말단 아미노산 110을 갖지 않는 VEGF 동형체 또는 엑손 4와 엑손 8의 연결에 의해 발생된 서열을 갖지 않는 VEGF 동형체 둘다에 대해 각각 5%, 4%, 3%, 2% 및 1% 미만일 것이다.
짧은 VEGF 동형체 VEGF121 또는 VEGF110에만 결합하는 적절한 특이적 항체는 표준 절차에 따라 수득될 수 있다. 통상적으로, VEGF110의 주로 C-말단에 존재하는 4개, 5개, 6개, 7개, 8개, 9개 또는 10개 이상의 아미노산을 나타내거나 포함하는 펩티드, 또는 VEGF121의 아미노산 115에 대해 C-말단 및 N-말단에 존재하는 아미노산을 포함하는 5개, 6개, 7개, 8개, 9개 또는 10개 이상의 아미노산을 나타내거나 포함하는 펩티드가 합성될 것이고 임의적으로 담체에 커플링될 것이고 면역화를 위해 사용될 것이다. 특이적 다클론 항체는 적절한 면역흡착 단계에 의해 수득될 수 있다. 단일클론 항체는 VEGF121 또는 VEGF110과의 반응성 및 적절한 낮은 교차반응성에 대해 용이하게 스크리닝될 수 있다. VEGF110 특이적 항체의 관점에서 낮은 교차반응성은 VEGF110의 짧은 단편(예를 들면, VEGF110의 C-말단 아미노산을 결여함) 및 VEGF110의 자유 C-말단 아미노산을 갖지 않는 VEGF-A 동형체 둘다에 대해 평가될 수 있다. VEGF121 특이적 항체의 관점에서 낮은 교차반응성은 엑손 4와 엑손 7의 연결 시 및 엑손 4와 엑손 5의 연결 시에 형성된 아미노산 서열을 함유하는 VEGF 동형체의 사용을 통해 평가될 수 있다.
VEGF111 단백질 또는 핵산은 당업계에 공지된 임의의 방법의 이용을 통해 검출될 수 있다. 예를 들면, 포유동물로부터의 조직 또는 세포 샘플을 예를 들면, 단백질에 대해 웨스턴 또는 ELISA를 이용하여 편리하게 분석할 수 있고 관심있는 유전적 생체마커로부터의 mRNA 또는 DNA에 대해 노던, 도트-블롯 또는 중합효소 연쇄 반응(PCR) 분석, 어레이 혼성화, RNase 보호 분석, 상업적으로 입수가능한 DNA SNP 칩 마이크로어레이(DNA 마이크로어레이 스냅샷(snapshot)을 포함함)를 이용하여 편리하게 분석할 수 있다. 예를 들면, 실시간 PCR(RT-PCR) 분석, 예컨대, 정량 PCT 분석은 당업계에서 잘 공지되어 있다. 본 발명의 예증적 실시양태에서, 생물학적 샘플 중의 관심있는 유전적 생체마커로부터 mRNA를 검출하는 방법은 하나 이상의 프라이머를 사용하는 역전사로 상기 샘플로부터 cDNA를 생성하는 단계; 이로써 생성된 cDNA를 증폭시키는 단계; 및 증폭된 cDNA의 존재를 검출하는 단계를 포함한다. 추가로, 이러한 방법은 (예를 들면, "하우스킵핑" 유전자, 예컨대, 액틴 과 구성원의 비교 대조군 mRNA 서열의 수준을 동시에 조사함으로써) 생물학적 샘플 중의 mRNA의 수준을 측정할 수 있게 하는 하나 이상의 단계를 포함할 수 있다. 임의적으로, 증폭된 cDNA의 서열을 확인할 수 있다.
상기 기법들을 적용함에 있어서 지침을 제공하는 많은 참고문헌들이 이용될 수 있다(Kohler et al., Hybridoma Techniques (Cold Spring Harbor Laboratory, New York, 1980); Tijssen, Practice and Theory of Enzyme Immunoassays (Elsevier, Amsterdam, 1985); Campbell, Monoclonal Antibody Technology (Elsevier, Amsterdam, 1984); Hurrell, Monoclonal Hybridoma Antibodies: Techniques and Applications (CRC Press, Boca Raton, FL, 1982); and Zola, Monoclonal Antibodies: A Manual of Techniques, pp. 147-158 (CRC Press, Inc., 1987)).
VEGF111 단백질의 검출에 대하여, 다양한 분석이 이용될 수 있다. 예를 들면, 샘플은 (예를 들면, 샌드위치 분석에서) 긴 천연 VEGF-A 동형체 VEGF165 및 VEGF189 각각에 비해 VEGF111에 우선적으로 또는 특이적으로 결합하는 항체 또는 항체 조합물과 접촉될 수 있다. 바람직하게는, 짧은 동형체 VEGF111은 긴 동형체에 비해 3배 이상 더 높은 민감도로 검출된다. 3배 이상 더 높은 민감도는 동일한 시약 및 동일한 표준 곡선을 이용하여 짧은 동형체(SDS-PAGE에 의해 측정된 90% 이상의 순도 및 OD 280 nm에 의해 측정된 농도) 및 예정된 농도의 긴 동형체(SDS-PAGE에 의해 측정된 90% 이상의 순도 및 OD 280 nm에 의해 측정된 농도)에 대해 표준 곡선을 확립하고 표준 곡선의 판독 값이 예측된 농도의 단지 3분의 1 이하인 경우 인정된다. 또한, 바람직하게는, 짧은 동형체에 대한 민감도는 긴 동형체에 비해 4배 이상, 5배 이상, 6배 이상, 7배 이상, 8배 이상 또는 9배 이상 더 높다.
한 실시양태에서, 동형체 VEGF111은 특이적으로 검출된다. 이러한 특이적 검출은 예를 들면, VEGF111에 대해 독특한 엑손 연접부에 결합하는 항체, 특히 단일클론 항체가 사용되는 경우 가능하다. 이러한 항체는 이 특이적 엑손 연접부를 포함하지 않는 다른 VEGF-A 동형체 또는 이의 절단 생성물에 결합하지 않는다. 상기 의미에서 특이적 결합은 사용된 항체가 이 독특한 엑손 연접부를 갖지 않는 다른 VEGF-A 동형체, 예컨대, VEGF121 또는 VEGF165와 10% 미만의 교차반응성을 나타내는 경우 인정된다. 또한, 바람직하게는, 예를 들면, VEGF121과의 교차반응성은 각각 5%, 4%, 3%, 2% 및 1% 미만일 것이다.
한 실시양태에서, VEGF111에 대한 특이성은 동일한 시약을 사용하여 VEGF111 (SDS-PAGE에 의해 측정된 90% 이상의 순도 및 OD 280 nm에 의해 측정된 농도)을 VEGF121(SDS-PAGE에 의해 측정된 90% 이상의 순도 및 OD 280 nm에 의해 측정된 농도)과 비교함으로써 평가된다. 이 비교에서 VEGF112에 대해 수득된 신호가 VEGF111 물질의 사용에 의해 수득된 신호의 단지 10분의 1 이하인 경우, VEGF121에 대한 교차반응성은 10% 미만이다. 당업자는 VEGF121 신호가 바람직하게는 VEGF111에 대한 최대 신호의 약 50%를 생성하는 농도에서의 판독치라는 것을 인식할 것이다.
짧은 VEGF 동형체 VEGF111에만 결합하는 적절한 특이적 항체는 표준 절차에 따라 수득될 수 있다. 통상적으로, VEGF111의 아미노산 105에 대한 C-말단 및 N-말단에 존재하는 아미노산들을 나타내거나 포함하는 펩티드가 합성될 것이고 임의적으로 담체에 커플링될 것이고 면역화를 위해 사용될 것이다. 바람직하게는, 이러한 펩티드는 길이에 있어서 6개 이상의 아미노산을 가질 것이고 적어도 VEGF111의 아미노산 105 및 106을 포함할 것이다. 또한, 바람직하게는, 상기 펩티드는 적어도 VEGF111의 104, 105, 106 및 107을 포함할 것이다. 당업자는 예를 들면, VEGF111의 아미노산 105와 106 사이의 엑손 연접부에 대해 N-말단 및 C-말단에 존재하는 3개 이상의 아미노산을 포함하는 보다 긴 펩티드가 VEGF111에 특이적으로 결합하는 항체를 수득하는 데에 사용될 수도 있다는 것을 인식할 것이다.
비-변형된 VEGF 단백질은 당업계에 공지된 임의의 적절한 방법의 이용을 통해 검출될 수 있다. 바람직하게는, 변형된 VEGF에 비해 비-변형된 VEGF에 대해 적어도 렐리아테크 게엠베하(독일 불펜부텔 소재)로부터 상업적으로 입수가능한 MAB 3C5만큼 우선적인 결합 성질을 갖는 항체가 사용될 것이다. 예를 들면, 포유동물로부터의 조직 또는 세포 샘플을 비-변형된 VEGF 단백질에 대해 웨스턴, ELISA 등을 이용하여 편리하게 분석할 수 있다. 상기 기법들을 적용하는 데 있어서 지침을 제공하는 많은 참고문헌들이 이용될 수 있다(Kohler et al., Hybridoma Techniques (Cold Spring Harbor Laboratory, New York, 1980); Tijssen, Practice and Theory of Enzyme Immunoassays (Elsevier, Amsterdam, 1985); Campbell, Monoclonal Antibody Technology (Elsevier, Amsterdam, 1984); Hurrell, Monoclonal Hybridoma Antibodies: Techniques and Applications (CRC Press, Boca Raton, FL, 1982); and Zola, Monoclonal Antibodies: A Manual of Techniques, pp. 147-158 (CRC Press, Inc., 1987)).
비-변형된 VEGF의 검출 또는 수준이 언급되는 경우, 이것은 예를 들면, MAB 3C5에 의해 결합된 비-변형된 VEGF-분자(동형체 또는 절단 생성물)가 측정된다는 것을 의미한다.
비-변형된 VEGF 단백질의 검출에 대하여, 다양한 분석이 이용될 수 있다. 예를 들면, 샘플은 (예를 들면, 샌드위치 분석에서) 예를 들면, 변형된 VEGF, 예를 들면, 환자 샘플에서 천연적으로 발생하는 변형된 VEGF에 비해 비-변형된 VEGF에 우선적으로 또는 특이적으로 결합하는 항체 또는 항체 조합물과 접촉될 수 있다. 바람직하게는, 비-변형된 VEGF는 비-변형된 VEGF에 특이적으로 결합하는 항체, 즉, 변형된 VEGF165에 비해 비-변형된 VEGF165에 대한 3배 이상 더 높은 민감도를 갖는 항체의 사용을 통해 검출된다. 비-변형된 VEGF에 대한 이러한 3배 이상 더 높은 민감도는 동일한 시약을 사용하여 이. 콜라이에서 재조합적으로 제조된 VEGF165(SDS-PAGE에 의해 측정된 90% 이상의 순도 및 OD 280 nm에 의해 측정된 농도)를 HEK 세포에서 재조합적으로 제조된 VEGF165(SDS-PAGE에 의해 측정된 90% 이상의 순도 및 OD 280 nm에 의해 측정된 농도)와 비교함으로써 평가된다. 이 비교에서 HEK에 의해 제조된 물질에 대해 수득된 신호가 이. 콜라이로부터 유래된 물질의 사용에 의해 수득된 신호의 단지 3분의 1 이하인 경우, 비-변형된 VEGF는 3배 이상 더 높은 민감도로 검출된다. 당업자가 인식할 바와 같이, 상기 신호는 바람직하게는 최대 신호의 약 50%의 판독치이다. 바람직하게는, 이 평가에서 실시예 5의 분석이 이용된다. 또한, 바람직하게는, 비-변형된 VEGF(이. 콜라이에서 제조된 VEGF165)에 특이적으로 결합하는 항체는 변형된 VEGF 물질(HEK 세포에서 제조된 VEGF165)에 비해 4배 이상, 5배 이상, 6배 이상, 7배 이상, 8배 이상, 9배 이상 또는 10배 이상 더 높은 민감도로 비-변형된 VEGF를 검출하는 항체이다.
한 실시양태에서, 비-변형된 VEGF는 변형된 VEGF에 비해 비-변형된 VEGF에 대해 적어도 상업적으로 입수가능한 MAB 3C5와 동일한 결합 선호도를 갖는 항체의 사용을 통해 특이적으로 검출된다. 한 실시양태에서, 비-변형된 VEGF에 대한 항체의 상대적 민감도 또는 우선적인 결합은 샌드위치 면역분석에서 평가되고, 이때 비-변형된 VEGF에 대한 항체는 포획 항체로서 사용되고, 모든 주요 VEGF 동형체들 또는 절단 생성물들에 존재하는 에피토프에 결합하는 검출 항체가 사용된다. 한 실시양태에서, 검출 항체는 MAB 3C5에 대한 에피토프 외부의 에피토프에 결합할 것이다(즉, 상기 항체는 VEGF의 아미노산 33 내지 43에 걸쳐 있는 합성 펩티드에 포함된 에피토프에 결합하지 않을 것이다). 바람직하게는, 검출 항체는 아미노산 1 내지 32 또는 44 내지 105에 포함된 에피토프, 성숙 VEGF165의 마지막 6개 아미노산, 또는 MAB 3C5에 의해 결합되는 에피토프와 중첩되지 않는 입체구조적 에피토프에 결합할 것이다. 한 실시양태에서, 변형된 VEGF에 비해 비-변형된 VEGF165에 특이적으로 결합하는 항체는 VEGF의 아미노산 33 내지 43에 걸쳐 있는 합성 펩티드에 포함된 에피토프에 결합하는 성질을 갖는다.
비-변형된 VEGF에 특이적으로 결합하는 적절한 특이적 항체는 표준 절차에 따라 수득될 수 있다. 통상적으로, 이. 콜라이에서 재조합적으로 제조되거나 합성적으로, 예를 들면, 고체상 폴리펩티드 합성에 의해 수득된 VEGF의 동형체, 또는 이. 콜라이에서 재조합적으로 제조되거나 합성적으로, 예를 들면, 고체상 폴리펩티드 합성에 의해 수득된 VEGF의 에피토프를 나타내거나 포함하는 펩티드는 면역원으로서 사용될 것이다. 단일클론 항체는 표준 프로토콜에 따라 용이하게 제조될 수 있고 비-변형된 VEGF와의 반응성 및 변형된 VEGF와의 적절한 낮은 교차반응성에 대해 스크리닝될 수 있다. 한 편리하고 바람직한 스크리닝 방법은 이. 콜라이에서 재조합적으로 제조된 VEGF165(SDS-PAGE에 의해 측정된 90% 이상의 순도, 및 OD 280 nm에 의해 측정된 농도) 및 HEK 세포에서 재조합적으로 제조된 VEGF165(SDS-PAGE에 의해 측정된 90% 이상의 순도, 및 OD 280 nm에 의해 측정된 농도) 각각의 사용에 근거한다.
VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준은 생물학적 샘플인 환자 샘플에서 평가될 수 있다. 상기 환자 샘플은 혈액 샘플, 혈액 혈청 샘플 또는 혈장 샘플일 수 있다. 한 실시양태에서, 상기 샘플은 EDTA-혈장이다. 한 실시양태에서, 상기 샘플은 시트레이트-혈장이다. 혈액 샘플, 혈액 혈청 샘플 및 혈장 샘플을 수득하는 방법은 당업계에서 잘 공지되어 있다. 환자 샘플은 신보조(neoadjuvant) 치료법 전 또는 후에, 또는 보조 치료법 전 또는 후에 환자로부터 수득될 수 있다.
본 발명과 관련하여, 베바시주맙은 당업계에서 공지된 표준 화학치료 요법의 일부로서 투여되는 하나 이상의 화학치료제 이외에 투여되거나 이러한 화학치료제와 함께 병행치료법 또는 병행치료로서 투여된다. 이러한 표준 화학치료 요법에 포함되는 약제의 예에는 5-플루오로우라실, 류코보린, 이리노테칸, 젬시타빈, 에를로티닙, 카페시타빈, 탁산, 예컨대, 독세탁셀 및 파클리탁셀, 인터페론 알파, 비노렐빈 및 백금 기제 화학치료제, 예컨대, 카보플라틴, 시스플라틴 및 옥살리플라틴이 포함된다. 첨부된 예증적 실시예에서 입증된 바와 같이, 젬시타빈-에를로티닙 치료법에의 베바시주맙의 추가는 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준에 따라 정의되고 선택된 환자 및/또는 환자 집단에서 전체 생존율 및/또는 무진행 생존율을 증가시킨다. 따라서, 베바시주맙은 첨부된 예증적 실시예에서 입증된 바와 같이 화학치료 요법, 예컨대, 젬시타빈-에를로티닙 치료법과 병용될 수 있다.
통상적인 투여 방식은 일정 시간에 걸쳐 볼루스(bolus) 용량으로 또는 관주로서 비경구 투여, 예를 들면, 10분, 20분, 30분, 40분, 50분, 60분, 75분, 90분, 105분, 120분, 3시간, 4시간, 5시간 또는 6시간에 걸쳐 총 1일 용량의 투여를 포함한다. 예를 들면, 체중 kg 당 2.5 mg 내지 체중 kg 당 15 mg의 베바시주맙(아바스틴(등록상표))이 치료될 암의 종류에 따라 매주, 2주마다 또는 3주마다 투여될 수 있다. 용량의 예에는 매주, 2주마다 또는 3주마다 제공되는 체중 kg 당 2.5 mg, 체중 kg 당 5 mg, 체중 kg 당 7.5 mg, 체중 kg 당 10 mg 및 체중 kg 당 15 mg이 포함된다. 용량의 추가 예는 2주마다 체중 kg 당 5 mg, 2주마다 체중 kg 당 10 mg, 3주마다 체중 kg 당 7.5 mg 및 3주마다 체중 kg 당 15 mg이다. 췌장암, 특히 전이성 췌장암의 치료를 위한 용량은 2주마다 체중 kg 당 5 mg, 2주마다 체중 kg 당 10 mg, 3주마다 체중 kg 당 7.5 mg 및 3주마다 체중 kg 당 15 mg을 포함한다. 당업자는 구체적인 환자 및 화학치료 요법에 의해 결정되는 베바시주맙의 추가 투여 방식이 본 발명에 포함되고 구체적인 투여 방식 및 치료 용량은 당업계에서 공지된 방법에 따라 치료 의사에 의해 가장 잘 결정된다는 것을 인식할 것이다.
본 발명의 방법에 따라 선택된 환자는 화학치료 요법과 함께 베바시주맙으로 치료되고, 하나 이상의 추가의 항암 치료법으로 더 치료될 수 있다. 일부 양태에서, 상기 하나 이상의 추가의 항암 치료법은 방사선이다.
또한, 본 발명은 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준의 측정에 적합한 올리고뉴클레오티드 및 폴리펩티드를 포함하는 진단 조성물 또는 키트에 관한 것이다. 본원에 상세히 기재된 바와 같이, 올리고뉴클레오티드, 예컨대, DNA, RNA 또는 DNA 프로브와 RNA 프로브의 혼합물은 마커/표시자 단백질의 mRNA 수준을 검출하는 데에 사용될 수 있는 반면, 폴리펩티드는 특정 단백질-단백질 상호작용을 통해 마커/표시자 단백질의 단백질 수준을 직접적으로 검출하는 데에 사용될 수 있다. 본 발명의 바람직한 양태에서, VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준에 대한 프로브로서 포함되고 본원에 기재된 키트 또는 진단 조성물에 포함되는 폴리펩티드는 이들 단백질들에 대해 특이적인 또는 이들의 상동체 및/또는 절두체(truncations)에 대해 특이적인 항체이다.
따라서, 본 발명의 추가 실시양태에서, 본 발명은 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준을 측정할 수 있는 올리고뉴클레오티드 또는 폴리펩티드를 포함하는, 본원에 기재된 방법을 수행하기에 유용한 키트를 제공한다. 상기 올리고뉴클레오티드는 본원에 기재된 마커/표시자 중 하나 이상을 코딩하는 mRNA에 대해 특이적인 프라이머 및/또는 프로브를 포함할 수 있고, 상기 폴리펩티드는 마커/표시자 단백질과 특이적으로 상호작용할 수 있는 단백질, 예컨대, 마커/표시자 특이적 항체 또는 항체 단편을 포함한다.
따라서, 본 발명은 췌장암을 앓고 있는 환자를 위한 개선된 화학치료 요법에서 사용될 베바시주맙에 관한 것으로서, 이때 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준이 측정되고, 이에 따라 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 증가된 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자는 화학치료 요법 이외에 베바시주맙을 투여받는다.
하기 유사한 용도가 필요한 부분만 약간 수정되어 적용될 수 있다.
본 발명은 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 췌장암을 앓고 있는 환자의 화학치료 요법의 치료 효과를 개선하기 위한 베바시주맙의 용도에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 증가된 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
상기 췌장암은 전이성 췌장암일 수 있다. 상기 화학치료 요법은 젬시타빈-에를로티닙 치료법일 수 있다.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 췌장암을 앓고 있는 환자의 화학치료 요법의 치료 효과를 개선하기 위한 베바시주맙의 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 증가된 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
상기 췌장암은 전이성 췌장암일 수 있다. 상기 화학치료 요법은 젬시타빈-에를로티닙 치료법일 수 있다.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 증가된 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
상기 췌장암은 전이성 췌장암일 수 있다. 상기 화학치료 요법은 젬시타빈-에를로티닙 치료법일 수 있다.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 증가된 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
상기 췌장암은 전이성 췌장암일 수 있다. 상기 화학치료 요법은 젬시타빈-에를로티닙 치료법일 수 있다.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 증가된 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
상기 췌장암은 전이성 췌장암일 수 있다. 상기 화학치료 요법은 젬시타빈-에를로티닙 치료법일 수 있다.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 증가된 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
상기 췌장암은 전이성 췌장암일 수 있다. 상기 화학치료 요법은 젬시타빈-에를로티닙 치료법일 수 있다.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 또는 VEGFR2의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 증가된 수준의 VEGFA 또는 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
상기 췌장암은 전이성 췌장암일 수 있다. 상기 화학치료 요법은 젬시타빈-에를로티닙 치료법일 수 있다.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 또는 VEGFR2의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 증가된 수준의 VEGFA 또는 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
상기 췌장암은 전이성 췌장암일 수 있다. 상기 화학치료 요법은 젬시타빈-에를로티닙 치료법일 수 있다.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 또는 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 증가된 수준의 VEGFA 또는 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
상기 췌장암은 전이성 췌장암일 수 있다. 상기 화학치료 요법은 젬시타빈-에를로티닙 치료법일 수 있다.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 또는 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 증가된 수준의 VEGFA 또는 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
상기 췌장암은 전이성 췌장암일 수 있다. 상기 화학치료 요법은 젬시타빈-에를로티닙 치료법일 수 있다.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도를 제공한다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 및 VEGFR2의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 및 VEGFR2의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법인, 용도에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 및 VEGFR2의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법인, 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 및 VEGFR2의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도를 제공한다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 및 VEGFR2의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 및 VEGFR2의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도으로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법인, 용도에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 및 VEGFR2의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법인, 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 및 VEGFR2의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 VEGFR2를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도를 제공한다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법인, 용도를 제공한다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법인, 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도를 제공한다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법인, 용도를 제공한다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법인, 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도를 제공한다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법인, 용도에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 전체 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법인, 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도를 제공한다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
본 발명은, 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법인, 용도에 관한 것이다:
(a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
따라서, 본 발명은, 하기 단계 (a) 내지 (c)를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 무진행 생존율을 개선하기 위한 베바시주맙의 용도로서, 이때 상기 화학치료 요법이 젬시타빈-에를로티닙 치료법인 용도에 관한 것이다:
(a) 상기 환자로부터 샘플을 수득하는 단계;
(b) VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
(c) 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 조합된 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 조합된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
첨부된 예증적 실시예에 기재된 바와 같이, 본 발명은 놀랍게도 췌장암, 특히 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적인, 주어진 환자에서의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준이 젬시타빈-에를로티닙 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여받은 환자에서 치료 효과와 상관관계를 갖는다는 것을 밝혔다는 점에서 확인된 기술적 문제를 해결한다. 첨부된 예증적 실시예에 나타낸 바와 같이, 놀랍게도 VEGFA 또는 VEGFR2의 증가된 단백질 발현 수준이 플라세보 및 젬시타빈-에를로티닙 화학치료 요법으로 치료받은 환자에 비해 베바시주맙 및 젬시타빈-에를로티닙 화학치료 요법으로 치료받은, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 개선된 전체 생존율과 상관관계를 갖는다는 것이 발견되었다(도 2 및 3). 놀랍게도 VEGFA 또는 PLGF의 증가된 단백질 발현 수준이 플라세보 및 젬시타빈-에를로티닙 화학치료 요법으로 치료받은 환자에 비해 베바시주맙 및 젬시타빈-에를로티닙 화학치료 요법으로 치료받은, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 개선된 무진행 생존율과 상관관계를 갖는다는 것이 발견되었다(도 2 및 4). 추가로, 놀랍게도 VEGFA 및 VEGFR2의 증가된 단백질 발현 수준이 플라세보 및 젬시타빈-에를로티닙 화학치료 요법으로 치료받은 환자에 비해 베바시주맙 및 젬시타빈-에를로티닙 화학치료 요법으로 치료받은, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 개선된 전체 생존율 및 무진행 생존율과 상관관계를 갖는다는 것이 발견되었다(도 5 및 6). 놀랍게도 VEGFA 및 PLGF의 증가된 단백질 발현 수준이 플라세보 및 젬시타빈-에를로티닙 화학치료 요법으로 치료받은 환자에 비해 베바시주맙 및 젬시타빈-에를로티닙 화학치료 요법으로 치료받은, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 개선된 전체 생존율 및 무진행 생존율과 상관관계를 갖는다는 것도 발견되었다(도 5 및 6). 추가로, 놀랍게도 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 증가된 단백질 발현 수준이 플라세보 및 젬시타빈-에를로티닙 화학치료 요법으로 치료받은 환자에 비해 베바시주맙 및 젬시타빈-에를로티닙 화학치료 요법으로 치료받은, 전이성 췌장암을 앓고 있는 환자의 개선된 전체 생존율 및 무진행 생존율과 상관관계를 갖는다는 것도 발견되었다(도 7). 이들 결과들은 이들 개별 마커들 및 이들 마커들의 전술된 조합물이 국소적으로 진행된, 재발성 또는 전이성 HER-2 음성 유방암을 앓고 있는 환자에서 독세탁셀 치료법 + 베바시주맙 또는 플라세보를 비교하는 연구로부터의 환자 혈장 샘플에서 분석되었을 때 전체 생존율과 상관관계를 보이지 않는다는 점에서 특히 놀랍다.
따라서, 본 발명은 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 조합된 발현 수준을 포함하는 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 췌장암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있거나, 앓고 있는 것으로 의심되거나 앓기 쉬운 환자의 화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 대한 반응성 또는 민감성을 예측하는 시험관내 방법에 관한 것이다. 따라서, 본원에 기재된 본 방법과 관련하여, 본 발명은 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 조합된 발현 수준을 포함하는 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 췌장암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있거나, 앓고 있는 것으로 의심되거나 앓기 쉬운 환자의 화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 대한 반응성 또는 민감성을 예측하기 위한 진단 조성물의 제조를 위한 특이적 프로브(예를 들면, 결합 분자, 예컨대, 항체 및 앱타머(aptamer)를 포함함)의 용도를 제공한다.
따라서, 본 발명은 환자 샘플 중의 VEGFA 및 VEGFR2의 조합된 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있거나, 앓고 있는 것으로 의심되거나 앓기 쉬운 환자의 화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 대한 반응성 또는 민감성을 예측하는 시험관내 방법을 제공한다. 따라서, 본원에 기재된 본 방법과 관련하여, 본 발명은 환자 샘플 중의 VEGFA 및 VEGFR2의 조합된 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있거나, 앓고 있는 것으로 의심되거나 앓기 쉬운 환자의 화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 대한 반응성 또는 민감성을 예측하기 위한 진단 조성물의 제조를 위한 특이적 프로브(예를 들면, 결합 분자, 예컨대, 항체 및 앱타머를 포함함)의 용도를 제공한다.
본 발명은 환자 샘플 중의 VEGFA 및 PLGF의 조합된 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있거나, 앓고 있는 것으로 의심되거나 앓기 쉬운 환자의 화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 대한 반응성 또는 민감성을 예측하는 시험관내 방법을 제공한다. 따라서, 본원에 기재된 본 방법과 관련하여, 본 발명은 환자 샘플 중의 VEGFA 및 PLGF의 조합된 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있거나, 앓고 있는 것으로 의심되거나 앓기 쉬운 환자의 화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 대한 반응성 또는 민감성을 예측하기 위한 진단 조성물의 제조를 위한 특이적 프로브(예를 들면, 결합 분자, 예컨대, 항체 및 앱타머를 포함함)의 용도를 제공한다.
본 발명은 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 조합된 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있거나, 앓고 있는 것으로 의심되거나 앓기 쉬운 환자의 화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 대한 반응성 또는 민감성을 예측하는 시험관내 방법을 제공한다. 따라서, 본원에 기재된 본 방법과 관련하여, 본 발명은 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 조합된 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 전이성 췌장암을 앓고 있거나, 앓고 있는 것으로 의심되거나 앓기 쉬운 환자의 화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 대한 반응성 또는 민감성을 예측하기 위한 진단 조성물의 제조를 위한 특이적 프로브(예를 들면, 결합 분자, 예컨대, 항체 및 앱타머를 포함함)의 용도를 제공한다.
본 발명과 관련하여 어구 "반응하는"은 췌장암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있거나, 앓고 있는 것으로 의심되거나 앓기 쉬운 대상체/환자가 베바시주맙의 추가를 포함하는 화학치료 요법에 대한 반응을 보인다는 것을 의미한다. 당업자는 본 발명의 방법에 따라 베바시주맙으로 치료받은 사람이 반응을 보이는지를 용이하게 확인할 것이다. 예를 들면, 반응은 전이성 췌장암의 감소된 통증, 예컨대, 감소된 및/또는 중단된 종양 성장, 종양 크기의 감소, 및/또는 상기 암의 하나 이상의 증상의 호전에 의해 반영될 수 있다. 바람직하게는, 반응은 췌장암의 전이성 전환의 감소된 또는 경감된 지수, 예컨대, 전이물의 형성의 예방 또는 전이물의 수 또는 크기의 감소에 의해 반영될 수 있다(예를 들면, 문헌(Eisenhauser et al., New response evaluation criteria in solid tumours: Revised RECIST guideline (version 1.1) Eur. J. Cancer 2009 45: 228-247) 참조).
본 발명과 관련하여 어구 "민감한"은 췌장암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있거나, 앓고 있는 것으로 의심되거나 앓기 쉬운 대상체/환자가 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 사용하는 치료에 대한 양성 반응을 몇몇 방식으로 보인다는 것을 의미한다. 환자의 반응은 전술된 바와 같은 "반응하는" 환자와 비교되었을 때 덜 현저할 수 있다. 예를 들면, 환자는 종양 성장 또는 전이성 표시자의 감소가 측정될 수 없고/없거나 화학치료 요법과 병용되는 베바시주맙에 대한 환자의 반응이 단지 일시적인 반응일 수 있을지라도, 즉 (a) 종양 및/또는 (b) 전이물(들)의 성장이 단지 일시적으로 감소되거나 중단될 수 있을지라도 질환과 관련된 통증을 덜 경험할 수 있다.
본 발명과 관련하여 어구 "앓고 있는 환자"는 췌장암, 특히 전이성 췌장암의 임상적 징후를 보이는 환자를 의미한다. 전이성 췌장암과 관련하여 어구 "앓고 있는 것으로 의심되는", "걸리기 쉬운", "앓기 쉬운" 또는 "쉬운"은 예를 들면, 가능한 유전적 소인, 위험한 및/또는 발암성 화합물에의 사전 노출 또는 우발적 노출, 또는 발암성 신체적 위험, 예컨대, 방사선에의 노출에 근거한 환자의 징후 질환을 의미한다.
본 발명과 관련하여 어구 "화학치료 요법의 치료 효과"는 용어 "전체 생존율" 및 "무진행 생존율"을 포함한다.
본 발명과 관련하여 어구 "전체 생존율"은 치료 동안 및 치료 후 환자가 생존하는 시간의 길이를 의미한다. 당업자가 인식할 바와 같이, 환자의 전체 생존율은 상기 환자가 또 다른 환자 하위군에 비해 통계학적으로 유의하게 더 긴 평균 생존 시간을 갖는 환자 하위군에 속하는 경우 개선되거나 향상된다.
본 발명과 관련하여 어구 "무진행 생존율"은 치료 동안 및 치료 후 치료 의사 또는 연구자의 평가에 따를 때 환자의 질환이 악화되지 않은, 즉 진행되지 않은 시간의 길이를 의미한다. 당업자가 인식할 바와 같이, 환자의 무진행 생존율은 환자가 유사한 상황의 대조군 환자의 평균 또는 중간 무진행 생존 시간에 비해 질환이 진행되지 않는 보다 긴 길이의 시간을 경험하는 경우 개선되거나 향상된다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "투여" 또는 "투여하는"은 혈관신생 억제제, 예를 들면, 베바시주맙(아바스틴(등록상표)), 및/또는 혈관신생 억제제, 예를 들면, 베바시주맙(아바스틴(등록상표))을 포함하는 약학 조성물/치료 요법을, 치료 항체의 투여를 위한 당업계에서 공지된 임의의 적합한 수단으로 이러한 치료 또는 의학적 중재가 필요한 환자에게 투여하는 것을 의미한다. 투여의 비-한정적 경로는 경구 투여, 정맥내, 복강내 투여, 피하, 근육내 투여, 국소 투여, 피내 투여, 비내 투여 또는 기관지내 투여(예를 들면, 흡입에 의해 수행됨)를 포함한다. 본 발명과 관련하여 비경구 투여, 예를 들면, 정맥내 투여가 특히 바람직하다.
본원에서 용어 "항체"는 가장 넓은 의미로 사용되고, 원하는 생물학적 활성, 특히 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상, 또는 이들의 상동체, 변이체, 단편 및/또는 동형체와의 특이적 결합을 나타내는 단일클론 항체, 다클론 항체, 다중특이적 항체(예를 들면, 이중특이적 항체), 키메라 항체, CDR 이식된 항체, 인간화된 항체, 낙타화된 항체, 단일 쇄 항체 및 항체 단편 및 단편 구축물, 예를 들면, F(ab')2 단편, Fab-단편, Fv-단편, 단일 쇄 Fv-단편(scFvs), 이중특이적 scFvs, 다이아바디, 단일 도메인 항체(dAbs) 및 미니바디를 포함하나 이들로 한정되지 않는다.
본원에서 용어 "앱타머"는 가장 넓은 의미로 사용되고, 원하는 생물학적 활성, 특히 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상, 또는 이들의 상동체, 변이체, 단편 및/또는 동형체와의 특이적 결합을 나타내는 RNA, DNA 및 RNA/DNA 분자를 포함하는 올리고뉴클레오티드 또는 펩티드 분자를 포함하나 이들로 한정되지 않는다.
본원에서 사용된 바와 같이, "화학치료 요법" 또는 "화학치료제"는 항암 치료 효과를 제공할 수 있는 임의의 활성 약제를 포함하며, 특히 암 또는 종양 세포를 방해할 수 있는 화학 약제 또는 생물 약제일 수 있다. 바람직한 활성 약제는 악성 세포의 발생, 성숙 또는 증식을 억제하거나 방지하는 항-신생물제(화학독성제 또는 화학정지제(chemostatic))로 작용하는 약제들이다. 화학치료 요법 또는 화학치료제의 비-한정적 예에는 하기 약제들이 포함된다: 알킬화제, 예를 들면, 질소 머스타드(예를 들면, 메클로레타민, 사이클로포스파미드, 이포스파미드, 멜팔란 및 클로람부실), 니트로소우레아(예를 들면, 카무스틴(BCNU), 로무스틴(CCNU) 및 세무스틴(메틸-CCNU)), 에틸렌이민/메틸멜라민(예를 들면, 트라이에틸렌멜라민(TEM), 트라이에틸렌, 티오포스포라미드(티오테파), 헥사메틸멜라민(HMM, 알트레타민)), 알킬 설포네이트(예를 들면, 부설판), 및 트라이아진(예를 들면, 다카바진(DTIC)); 항-대사물질, 예를 들면, 폴산 유사체(예를 들면, 메토트렉세이트, 트라이메트렉세이트), 피리미딘 유사체, (예를 들면, 5-플루오로우라실, 카페시타빈, 플루오로데옥시우리딘, 겜시타빈, 시토신 아라비노사이드(AraC, 시타라빈), 5-아자시티딘, 2,2'-다이플루오로데옥시시티딘), 및 퓨린 유사체(예를 들면, 6-머캅토퓨린, 6-티오구아닌, 아자티오프린, 2'-데옥시코포마이신(펜토스타틴), 에리트로하이드록시노닐아데닌(EHNA), 플루다라빈 포스페이트 및 2-클로로데옥시아데노신(클라드리빈, 2-CdA)); 천연 생성물로부터 개발된 항유사분열 약물(예를 들면, 파클리탁셀, 빈카 알칼로이드(예, 빈블라스틴(VLB), 빈크리스틴 및 비노렐빈), 독세탁셀, 에스트라무스틴 및 에스트라무스틴 포스페이트), 에피포도필로톡신(예, 에토포시드, 테니포시드), 항생물질(예를 들면, 액티노마이신 D, 다우노마이신(루비도마이신), 다우노루비신, 독소루비신, 에피루비신, 미토잔트론, 이다루비신, 블레오마이신, 플리카마이신(미트라마이신), 미토마이신C, 액티노마이신), 효소(예를 들면, L-아스파라기나제), 및 생물 반응 조절제(예를 들면, 인터페론-알파, IL-2, G-CSF, GM-CSF); 백금 배위 착체(예를 들면, 시스플라틴, 카보플라틴, 옥살리플라틴), 안트라센다이온(예를 들면, 미토잔트론), 치환된 우레아(즉, 하이드록시우레아), 메틸하이드라진 유도체(예를 들면, N-메틸하이드라진(MIH), 프로카바진), 부신피질 억제제(예를 들면, 미토테인(o,p'-DDD), 아미노글루테티미드)를 포함하여 다양한(miscellaneous) 약제; 부신피질스테로이드 길항물질(예를 들면, 프레드니손 및 등가물, 덱사메타손, 아미노글루테티미드), 프로게스틴(예를 들면, 하이드록시프로게스테론 카프로에이트, 메드록시프로게스테론 아세테이트, 메게스트롤 아세테이트), 에스트로겐(예를 들면, 다이에틸스틸베스트롤, 에티닐 에스트라다이올 및 그의 등가물)을 포함하여 호르몬 및 길항물질; 항에스트로겐(예를 들면, 타목시펜), 안드로겐(예를 들면, 테스토스테론 프로피오네이트, 플루옥시메스테론 및 그의 등가물), 항안드로겐(예를 들면, 플루타미드, 고나도트로핀-방출 호르몬 유사체, 류프롤리드), 비-스테로이드성 항안드로겐(예를 들면, 플루타미드), 표피 성장 인자 억제제(예를 들면, 에를로티닙, 라파티닙, 제피티닙), 항체(예를 들면, 트라스투주맙), 이리노테칸 및 다른 약제, 예컨대, 류코보린. 췌장암, 특히 전이성 췌장암의 치료를 위해, 베바시주맙과 함께 투여될 화학치료제 또는 화학치료 요법은 젬시타빈 및 에를로티닙 및 이들의 조합물을 포함한다(본원에서 제공된 첨부된 예증적 실시예 또한 참조).
본 발명과 관련하여, 아미노산 서열에 대한 "상동성"은 본원에 제공된 서열번호들에 의해 정의된 서열의 전체 길이에 걸쳐 80% 이상의 서열 동일성, 특히 85% 이상, 90% 이상 또는 95% 이상의 동일성을 의미하는 것으로 이해된다. 본 발명과 관련하여, 당업자는 상동성이 상이한 집단 및 인종 군에서 마커/표시자 단백질의 추가 대립형질 변이(들)를 포함한다는 것을 이해할 것이다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "폴리펩티드"는 주어진 길이의 아미노산 쇄를 포함하는 펩티드, 단백질, 올리고펩티드 또는 폴리펩티드에 관한 것이고, 이때 아미노산 잔기들은 공유 펩티드 결합에 의해 연결된다. 그러나, 이러한 단백질/폴리펩티드의 펩티드유사체(peptidomimetics)도 본 발명에 포함되고, 이때 아미노산(들) 및/또는 펩티드 결합(들)은 기능성 유사체, 예컨대, 20개의 유전자 코딩된 아미노산들 중 하나 이외의 아미노산 잔기, 예를 들면, 셀레노시스테인으로 치환되어 있다. 펩티드, 올리고펩티드 및 단백질은 폴리펩티드로 지칭될 수 있다. 용어 폴리펩티드 및 단백질은 본원에서 상호교환적으로 사용된다. 용어 폴리펩티드는 폴리펩티드의 변형, 예컨대, 글리코실화, 아세틸화, 인산화 등도 의미하고 이들을 배제하지 않는다. 이러한 변형은 기본 교재 및 보다 상세한 논문뿐만 아니라 방대한 연구 문헌에도 잘 기재되어 있다. 용어 폴리펩티드는 본원에서 사용된 바와 같이 용어 "항체"도 의미하고 이를 포함한다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "치료하는" 및 "치료"는 질환 또는 이의 임의의 파라미터 또는 증상의 교정, 개선, 중증도의 완화 또는 시간 경과의 감소를 의미한다. 바람직하게는, 상기 환자는 인간 환자이고, 치료될 질환은 췌장암, 특히 전이성 췌장암이다.
이러한 환자의 용어 "평가하는" 또는 "평가"는 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF를 포함하는, 본원에 기재된 마커/표시자 단백질들 중 하나 이상의 발현 수준을 측정하는 방법, 및/또는 췌장암, 특히 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 확립된 대조군 수준에 비해 상대적인 이러한 마커/표시자 단백질의 발현 수준에 근거하여 이러한 환자를 선택하는 방법에 관한 것이다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "발현 수준"은 샘플 중의 본 발명의 마커/표시자 단백질의 농도 또는 양을 의미할 수도 있다.
전술된 방법 이외에, 본 발명은 예컨대, 웨스턴 블롯팅 및 ELISA 기초 검출을 이용하여 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준을 평가하거나 측정하는 추가 면역분석 방법도 포함한다. 당업계에서 이해되는 바와 같이, 본 발명의 마커/표시자 단백질의 발현 수준은 당업계에서 공지된 임의의 적합한 방법, 예컨대, 노던 블롯팅, 실시간 PCR 및 RT-PCR에 의해 mRNA 수준에서 평가될 수도 있다. 면역분석 및 mRNA 기초 검출 방법 및 시스템은 당업계에서 잘 공지되어 있고 표준 교재, 예컨대, 문헌(Lottspeich (Bioanalytik, Spektrum Akademisher Verlag, 1998)) 또는 문헌(Sambrook and Russell (Molecular Cloning: A Laboratory Manual, CSH Press, Cold Spring Harbor, NY, U.S.A., 2001))으로부터 추론될 수 있다. 기재된 방법들은 췌장암, 특히 전이성 췌장암으로 진단된 집단에서 확립된 대조군 수준에 비해 상대적인 환자 또는 환자 군에서의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 발현 수준을 측정하는 데에 특히 유용하다.
VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준은 면역응집, 면역침전(예를 들면, 면역확산, 면역전기영동, 면역고정), 웨스턴 블롯팅 기법(예를 들면, (제자리) 면역세포화학, 친화성 크로마토그래피, 효소 면역분석) 등을 이용함으로써 단백질 수준에서 측정될 수도 있다. 용액 중의 정제된 폴리펩티드의 양은 물리적 방법, 예를 들면, 광측정법에 의해 측정될 수도 있다. 혼합물 중의 특정 폴리펩티드를 정량하는 방법은 통상적으로 예를 들면, 항체의 특이적 결합에 의존한다. 항체의 특이성을 이용하는 특이적 검출 및 정량 방법은 예를 들면, 면역분석 방법을 포함한다. 예를 들면, 환자 샘플 중의 본 발명의 마커/표시자 단백질의 농도/양은 효소 연결된 면역흡착 분석(ELISA)에 의해 측정될 수 있다. 대안적으로, 웨스턴 블롯 분석 또는 면역염색이 수행될 수 있다. 웨스턴 블롯팅은 전기영동에 의한 단백질 혼합물의 분리와 항체를 사용한 특이적 검출을 조합한다. 전기영동은 다차원, 예컨대, 2D 전기영동일 수 있다. 통상적으로, 폴리펩티드는 2D 전기영동에서 한 차원에 따라 그의 겉보기 분자량에 의해 분리되고 다른 방향에 따라 그의 등전점에 의해 분리된다.
전술된 바와 같이, 본 발명에 따른 마커/표시자 단백질의 발현 수준은 VEGFA, VEGFR2 및/또는 PLGF를 코딩하는 상응하는 유전자(들)의 증가된 발현에서 반영될 수도 있다. 따라서, 상응하는 유전자(들)의 발현을 평가하기 위해 번역 전 유전자 생성물(예를 들면, 스플라이싱된, 비-스플라이싱된 또는 부분적으로 스플라이싱된 mRNA)의 정량적 평가를 수행할 수 있다. 당업자는 이와 관련하여 이용될 표준 방법들을 알고 있고 표준 교재(예를 들면, 앞에서 인용된 문헌(Sambrook, 2001))로부터 이들 방법들을 추론할 수 있다. 예를 들면, VEGFA, VEGFR2 및/또는 PLGF 중 하나 이상을 코딩하는 mRNA의 각각의 농도/양에 대한 정량적 데이터는 노던 블롯, 실시간 PCR 등에 의해 수득될 수 있다.
본 발명의 추가 양태에서, 본 발명의 키트는 본 발명의 방법을 수행하는 데에 유리하게 사용될 수 있고 특히 다양한 적용분야, 예를 들면, 진단 분야에서 사용될 수 있거나 연구 수단으로서 사용될 수 있다. 본 발명의 키트의 구성요소들은 바이알 내에 개별적으로 포장될 수 있거나 용기 또는 다중용기 유닛 내에 함께 포장될 수 있다. 키트의 제조는 바람직하게는 당업자에게 공지된 표준 절차를 따른다. 키트 또는 진단 조성물은 예를 들면, 본원에 기재된 면역조직화학 기법을 이용하는 본원에 기재된 본 발명의 방법에 따라 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준의 검출을 위해 사용될 수 있다.
베바시주맙의 사용에 의해 예시되어 있지만, 본 발명은 표준 화학치료 요법과 함께 사용될 당업계에 공지된 다른 혈관신생 억제제의 사용을 포함한다. 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "혈관신생 억제제"는 혈관신생(즉, 혈관을 형성하는 과정)을 변경시키는 모든 약제를 의미하고 혈관의 형성을 차단하고/하거나 혈관의 성장을 중단시키거나 늦추는 약제를 포함한다. 혈관신생 억제제의 비-한정적 예에는 베바시주맙 이외에 페가프타닙, 수니티닙, 소라페닙 및 바탈라닙이 포함된다. 바람직하게는, 본 발명의 방법에 따라 사용될 혈관신생 억제제는 베바시주맙이다. 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "베바시주맙"은 USA, 유럽 및 일본으로 구성된 국가 군으로부터 선택된 국가 또는 지역에서 동일한 또는 유사생물(biosimilar) 제품으로서 시판 권한을 수득하는 데에 필요한 요건들을 충족시키는 모든 상응하는 항-VEGF 항체 또는 항-VEGF 항체 단편을 포함한다.
본원에 기재된 검출 방법에서 사용되기 위해, 당업자는 본 발명에 포함되는 폴리펩티드, 예를 들면, 항체 또는 올리고뉴클레오티드를 표지하는 능력을 갖는다. 당업계에서 상용적으로 실시되는 바와 같이, mRNA 수준을 검출하는 데에 사용될 혼성화 프로브, 및/또는 면역분석 방법에서 사용될 항체 또는 항체 단편은 당업계에서 공지된 표준 방법에 따라 표지되고 가시화될 수 있고, 통상적으로 사용되는 시스템의 비-한정적 예에는 방사성 표지, 효소 표지, 형광 태그, 바이오틴-아비딘 착물, 화학발광 등의 사용이 포함된다.
당업자, 예를 들면, 주치 의사는 본원에서 선택되고 정의된 환자/환자 군에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 용이하게 투여한다. 일부 환경 하에서, 주치 의사는 그의/그녀의 전문 경험에 따라 베바시주맙 및 화학치료 요법에 대한 투여 방안을 변형하거나, 변화시키거나 수정할 수 있다. 따라서, 본 발명의 일부 양태에서, 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 사용하여 췌장암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있거나 앓고 있는 것으로 의심되는 환자를 치료하거나 상기 환자의 전체 생존율 및/또는 무진행 생존율을 개선시키는 방법이 제공되고, 이때 상기 환자/환자 군은 상기 환자로부터의 생물학적 샘플(특히, 혈장 햄플)의 평가에서 상기 샘플이 췌장암, 특히 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 확립된 대조군 샘플에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 나타내는 것을 특징으로 한다. 또한, 본 발명은 췌장암, 특히 전이성 췌장암을 앓고 있거나 앓고 있는 것으로 의심되는 환자의 치료를 위한 약학 조성물의 제조에 있어서 베바시주맙의 용도를 제공하고, 이때 상기 환자는 본원에 개시된 단백질 마커/표시자 상태(즉, 췌장암, 특히 전이성 췌장암으로 진단된 환자에서 확립된 대조군 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상)에 의해 선택되거나 이러한 상태를 특징으로 한다.
본 발명은 하기 비-한정적 예증적 실시예에 의해 더 예증된다.
실시예 1
전이성 췌장 선암종을 갖는 환자를 젬시타빈-에를로티닙 + 베바시주맙(n=306) 또는 플라세보(n=301)로 무작위적으로 나누었다.
전이성 췌장암의 치료를 위한 젬시타빈-에를로티닙 치료법에의 베바시주맙의 추가의 결과를 비교하는 무작위화된 III 기 연구에 참여하는 환자로부터 혈장 샘플을 수집하였다(BO17706 연구, 도 1 참조, 문헌(Van Cutsem, J. Clin. Oncol. 2009 27:2231-2237) 또한 참조). 전이성 췌장 선암종을 갖는 환자를 젬시타빈-에를로티닙 + 베바시주맙(n=306) 또는 플라세보(n=301)로 무작위적으로 나누었다. 전이성 췌장 선암종을 갖는 환자는 젬시타빈(1,000 mg/㎡/주), 에를로티닙(100 mg/일) 및 베바시주맙(2주마다 5 mg/kg), 또는 젬시타빈, 에를로티닙 및 플라세보를 받도록 무작위적으로 배정되었다.
혈관신생 및 종양발생과 관련된 생체마커의 상태의 연구는 전체 생체마커 환자 집단에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적인 3개의 생체마커의 발현 수준이 개선된 치료 파라미터와 상관관계를 갖는다는 것을 보여주었다. 특히, 전체 생체마커 환자 집단에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 더 높은 VEGFA의 발현 수준을 나타내는 환자는 젬시타빈-에를로티닙 치료법에의 베바시주맙의 추가에 반응하여 연장된 전체 생존율 및 연장된 무진행 생존율을 보였다. 전체 생체마커 환자 집단에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 더 높은 VEGFR2의 발현 수준을 나타내는 환자는 젬시타빈-에를로티닙 치료법에의 베바시주맙의 추가에 반응하여 연장된 전체 생존율을 보였다. 전체 생체마커 환자 집단에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 더 높은 PLGF의 발현 수준을 나타내는 환자는 젬시타빈-에를로티닙 치료법에의 베바시주맙의 추가에 반응하여 연장된 무진행 생존율을 보였다. 또한, 전체 생체마커 환자 집단에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 더 높은 VEGFA 및 VEGFR2의 조합된 발현 수준을 나타내는 환자는 젬시타빈-에를로티닙 치료법에의 베바시주맙의 추가에 반응하여 연장된 전체 생존율 및 연장된 무진행 생존율을 보였다. 또한, 전체 생체마커 환자 집단에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 더 높은 VEGFA 및 PLGF의 조합된 발현 수준을 나타내는 환자는 젬시타빈-에를로티닙 치료법에의 베바시주맙의 추가에 반응하여 연장된 전체 생존율 및 연장된 무진행 생존율을 보였다. 전체 생체마커 환자 집단에서 측정된 대조군 수준에 비해 상대적으로 더 높은 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 조합된 발현 수준을 나타내는 환자는 젬시타빈-에를로티닙 치료법에의 베바시주맙의 추가에 반응하여 연장된 전체 생존율 및 연장된 무진행 생존율을 보였다.
환자 및 면역조직화학 방법
BO17708 연구에 참가한 총 607명의 환자들, 및 참가자들 중 224명으로부터 수득된 혈장 샘플이 생체마커 분석을 위해 이용될 수 있었다. 생체마커 분석에서 224명의 환자들의 기준 특성은 하기 표 1에 제공되어 있다.
[표 1]
Figure pct00003
혈장 분석
혈장 샘플을 무작위화 후 및 임의의 연구 치료가 환자에게 제공되기 전에 수집하였고, 로슈 다이아그노스틱스 게엠베하로부터의 다중 ELISA 분석(Impact)을 이용하여 VEGFA, 혈관 내피 성장 인자 수용체 1(VEGFR1), VEGFR2, PLGF 및 E-셀렉틴을 측정하였다.
IMPACT 다중 분석 기술
로슈 프로페셔날 다이아그노스틱스(로슈 다이아그노스틱스 게엠베하)는 작동 명칭 IMPACT(면역학적 다중파라미터 칩 기술) 하에 다중마커 플랫폼을 개발하였다. 상기 기술은 유럽 특허 제0939319호 및 유럽 특허 제1610129호에 개시된 절차에 의해 제작된 작은 폴리스티렌 칩에 근거한다. 상기 칩 표면을 스트렙타비딘 층으로 코팅한 후, 모든 분석을 위해 바이오티닐화된 항체를 상기 층 상에 스폿팅하였다. 각각의 마커에 대해, 항체의 스폿을 상기 칩 상에 수직선으로 적재하였다. 분석 동안, 특정 분석물을 함유하는 표본 샘플로 어레이를 프로빙하였다.
1개의 칩 상의 모든 마커들을 측정하기 위해 표본 당 요구되는 혈장 부피는 8 ㎕이었고, 이것을 32 ㎕의 항온처리 완충제(50 mM HEPES pH 7.2, 150 mM NaCl, 0.1% 테싯(Thesit), 0.5% 소 혈청 알부민 및 방부제로서의 0.1% 옥시피리온(Oxypyrion))와 함께 적용하였다. 상기 칩을 12분 동안 항온처리하고 세척 완충제(5 mM 트라이스(Tris) pH 7.9, 0.01% 테싯 및 0.001% 옥시피리온)를 사용하여 세척한 후, 다이곡시제닐화된(digoxigenylated) 단일클론 항체 혼합물(다이곡시제닌으로 표지된 분석물 특이적 항체들의 혼합물을 포함하는 40 ㎕의 항온처리 완충제)을 첨가하고 추가 6분 동안 항온처리하여 포획된 분석물 상에 결합시켰다. 형광 라텍스와 커플링된 항-다이곡시제닌 항체 접합체를 포함하는 40 ㎕의 시약 완충제(62.5 mM TAPS pH 8.7, 1.25 M NaCl, 0.5% 소 혈청 알부민, 0.063% 트윈 20 및 0.1% 옥시피리온)를 사용하여 제2 항체를 최종적으로 검출하였다. 이 표지를 사용하여, fmol/L 농도까지 매우 높은 민감성을 나타내는 10개의 개별 결합 사건들을 단일 스폿 내에서 검출할 수 있었다. 칩을 검출 유닛 내로 옮겼고, 전하 커플링된 장치(CCD) 카메라는 전용 소프트웨어를 이용하여 신호 강도로 전환되는 영상을 발생시켰다. 개별 스폿들을 예정된 위치에 자동으로 위치시키고 영상 분석으로 정량하였다. 각각의 마커에 대해, 10개 내지 12개의 스폿으로 구성된 선을 상기 칩 상에 적재하였고, 샘플의 평균 농도를 측정하기 위해 최소 5개의 스폿이 요구되었다. 이 기술의 장점은 샌드위치 또는 경쟁 형식으로 최대 10개의 파라미터를 다중분석하는 능력이다. 보정제 및 환자 샘플을 이중으로 측정하였다. 하나의 실시가 실시 대조군으로서의 2개의 다중 대조군을 포함하는 총 100회의 측정을 함유하도록 디자인되었다. 선택된 분석물들 중 몇몇은 서로 반응하기(즉, VEGFA 및 PLGF와 VEGFR1, VEGRF2 또는 VEGFA는 PLGF와 함께 이종이량체를 형성함) 때문에, 5개의 분석물들이 하기와 같이 3개의 상이한 칩 상에 나누어졌다:
칩 1: VEGFA
칩 2: VEGFR1, VEGFR2, E-셀렉틴
칩 3: PLGF
하기 항체들이 상이한 분석을 위해 사용되었다:
Figure pct00004
통계학적 분석
샘플 중간값을 이용하여 생체마커 값을 낮은(중간값 미만의) 또는 높은(중간값 이상의) 값으로서 이분화하였다.
높은 또는 낮은 생체마커 수준을 갖는 환자들의 하위군에서 치료 효과의 위험 비를 비례 위험 콕스 회귀 분석으로 평가하였다.
추가로, 비례 위험 콕스 회귀를 이용하여 생체마커 수준과 치료 효과 사이의 관련성을 평가하였다. 모델은 하기 공변량을 포함하였다: 시험 치료, 생체마커 수준, 생체마커 수준에 의한 치료의 상호작용 항(term). 상호작용 항에 대한 왈드(Wald) 검정을 이용하여 생체마커 수준과 치료 효과 사이의 관련성을 측정하였다. 0.05 미만의 P 값은 유의한 것으로 간주되었다.
결과
혈장 마커
생체마커의 기준 기술 통계학이 하기 표 2에 제공되어 있다.
[표 2]
Figure pct00005
표 3은 선택된 생체마커와 전체 생존율에 대한 치료 효과 사이의 관련성의 일변량 분석을 제공한다.
[표 3]
Figure pct00006
본 분석에서, VEGFA에 대해 저 수준 VEGFA <152.9 pg/㎖ 및 고 수준 VEGFA ≥ 152.9 pg/㎖를 사용하였고, VEGFR2에 대해 저 수준 VEGFR2 < 9.9 pg/㎖ 및 고 수준 VEGFRA ≥ 9.9 pg/㎖를 사용하였고, PLGF에 대해 저 수준 PLGF < 36.5 pg/㎖ 및 고 수준 PLGF ≥ 36.5 pg/㎖를 사용하였다.
VEGFA 및 VEGFR2에 대해, 예정된 분석 계획에 따라 환자의 50%가 고 발현을 갖고 환자의 50%가 저 발현을 갖도록 컷-오프 수준을 샘플 데이터 중간값으로서 결정하였다. PLGF 컷-오프 수준을 상기 데이터의 42번째 백분위수로서 결정하였다. 따라서, 58%의 환자들이 PLGF의 고 발현을 갖고, 42%의 환자들이 저 발현을 갖는다. 상기 컷-오프는 고 수준 하위군의 치료 효과와 저 수준 하위군의 치료 효과 사이의 통계학적 차이를 증가시키도록 결정되었다.
이 결과 표는 치료 효과에 대한 위험 비가 저 수준 VEGFA를 갖는 환자에 비해 고 수준 VEGFA를 갖는 환자의 하위세트에서 유의하게 더 우수하다는 것을 보여준다. 또한, 이 결과 표는 치료 효과에 대한 위험 비가 저 수준 VEGFR2를 갖는 환자에 비해 고 수준 VEGFR2를 갖는 환자의 하위세트에서 유의하게 더 우수하다는 것을 보여준다. 따라서, VEGFA 및 VEGFR2는 전체 생존율에 대한 베바시주맙 치료 효과에 대한 각각의 독립적인 예측 생체마커이다.
표 4는 선택된 생체마커와 무진행 생존율에 대한 치료 효과의 관련성의 일변량 분석을 제공한다.
[표 4]
Figure pct00007
본 분석에서, VEGFA에 대해 저 수준 VEGFA <152.9 pg/㎖ 및 고 수준 VEGFA ≥ 152.9 pg/㎖를 사용하였고, VEGFR2에 대해 저 수준 VEGFR2 < 9.9 pg/㎖ 및 고 수준 VEGFRA ≥ 9.9 pg/㎖를 사용하였고, PLGF에 대해 저 수준 PLGF < 36.5 pg/㎖ 및 고 수준 PLGF ≥ 36.5 pg/㎖를 사용하였다. VEGFA 및 VEGFR2에 대해, 예정된 분석 계획에 따라 환자의 50%가 고 발현을 갖고 환자의 50%가 저 발현을 갖도록 컷-오프 수준을 샘플 데이터 중간값으로서 결정하였다. PLGF 컷-오프 수준을 상기 데이터의 42번째 백분위수로서 결정하였다. 따라서, 58%의 환자들이 PLGF의 고 발현을 갖고, 42%의 환자들이 저 발현을 갖는다. 상기 컷-오프는 고 수준 하위군의 치료 효과와 저 수준 하위군의 치료 효과 사이의 통계학적 차이를 증가시키도록 결정되었다.
이 결과 표는 치료 효과에 대한 위험 비가 저 수준 VEGFA를 갖는 환자에 비해 고 수준 VEGFA를 갖는 환자의 하위세트에서 유의하게 더 우수하다는 것을 보여준다. 또한, 이 결과 표는 치료 효과에 대한 위험 비가 저 수준 PLGF를 갖는 환자에 비해 고 수준 PLGF를 갖는 환자의 하위세트에서 유의하게 더 우수하다는 것을 보여준다. 따라서, VEGFA 및 PLGF는 무진행 생존율에 대한 베바시주맙 치료 효과에 대한 각각의 독립적인 예측 생체마커이다.
표 5는 생체마커 조합물과 전체 생존율에 대한 치료 효과의 관련성의 분석을 제공한다.
이 분석을 위해 하기 수학식들이 사용되었다:
수학식 1: norm(VEGFA)+1.3*norm(VEGFR2), 컷-점 = 중간값 또는 0
등가 수학식: VEGFA+3.3*VEGFR2, 컷-점 = 중간값 또는 0
수학식 2: 0.25*norm(VEGFA)+0.21*norm(PLGF), 컷-점 = 중간값 또는 0
등가 수학식: 0.19*VEGFA+0.67*PLGF, 컷-점 = 중간값 또는 4.8
상기 식들에서, 본 발명자들은 log2 변환 및
Figure pct00008
를 이용하였다.
[표 5]
Figure pct00009
본 분석에서, VEGFA와 VEGFR2의 조합된 고 발현 수준은 (수학식 1 ≥ -0.10)이고, VEGFA와 VEGFR2의 조합된 저 발현 수준은 (수학식 1 < -0.10)이고, VEGFA와 PLGF의 조합된 고 발현 수준은 (수학식 2 ≥ -0.042)이고, VEGFA와 PLGF의 조합된 저 발현 수준은 (수학식 2 < -0.042)이다.
이 결과 표는 치료 효과에 대한 위험 비가 저 수준 VEGFA & VEGFR2 조합물을 갖는 환자에 비해 고 수준 VEGFA & VEGFR2 조합물을 갖는 환자의 하위세트에서 유의하게 더 우수하다는 것을 보여준다. 또한, 이 결과 표는 치료 효과에 대한 위험 비가 저 수준 VEGFA & PLGF 조합물을 갖는 환자에 비해 고 수준 VEGFA & PLGF 조합물을 갖는 환자의 하위세트에서 유의하게 더 우수하다는 것을 보여준다. 따라서, VEGFA & VEGFR2 조합물 및 VEGFA & PLGF 조합물은 전체 생존율에 대한 베바시주맙 치료 효과에 대한 각각의 독립적인 예측 생체마커이다.
표 6은 생체마커 조합물과 무진행 생존율에 대한 치료 효과의 관련성의 분석을 제공한다.
이 분석을 위해 하기 수학식들이 사용되었다:
수학식 1: norm(VEGFA)+1.3*norm(VEGFR2), 컷-점 = 중간값 또는 0
등가 수학식: VEGFA+3.3*VEGFR2, 컷-점 = 중간값 또는 0
수학식 2: 0.25*norm(VEGFA)+0.21*norm(PLGF), 컷-점 = 중간값 또는 0
등가 수학식: 0.19*VEGFA+0.67*PLGF, 컷-점 = 중간값 또는 4.8
상기 식들에서, 본 발명자들은 log2 변환 및
Figure pct00010
를 이용하였다.
[표 6]
Figure pct00011
본 분석에서, VEGFA와 VEGFR2의 조합된 고 발현 수준은 (수학식 1 ≥ -0.10)이고, VEGFA와 VEGFR2의 조합된 저 발현 수준은 (수학식 1 < -0.10)이고, VEGFA와 PLGF의 조합된 고 발현 수준은 (수학식 2 ≥ -0.042)이고, VEGFA와 PLGF의 조합된 저 발현 수준은 (수학식 2 < -0.042)이다.
이 결과 표는 치료 효과에 대한 위험 비가 저 수준 VEGFA & VEGFR2 조합물을 갖는 환자에 비해 고 수준 VEGFA & VEGFR2 조합물을 갖는 환자의 하위세트에서 유의하게 더 우수하다는 것을 보여준다. 또한, 이 결과 표는 치료 효과에 대한 위험 비가 저 수준 VEGFA & PLGF 조합물을 갖는 환자에 비해 고 수준 VEGFA & PLGF 조합물을 갖는 환자의 하위세트에서 유의하게 더 우수하다는 것을 보여준다. 따라서, VEGFA & VEGFR2 조합물 및 VEGFA & PLGF 조합물은 무진행 생존율에 대한 베바시주맙 치료 효과에 대한 각각의 독립적인 예측 생체마커이다.
표 7 및 8은 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 생체마커 조합물과 전체 생존율 및 무진행 생존율 각각에 대한 치료 효과의 관련성의 분석을 제공한다.
본 분석에서, 하기 수학식이 사용되었다:
수학식 3: 0.0127*ln(PLGF+1)+0.144*ln(VEGFR2+1)+0.0949*ln(VEGFA+1)
상기 식에서, ln은 log 무리수 e이다.
[표 7]
Figure pct00012
[표 8]
Figure pct00013
본 분석에서, 전체 생존율에 대해 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 조합된 고 발현 수준은 (수학식 3 ≥ 0.837)이고 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 조합된 저 발현 수준은 (수학식 3 < 0.837)이고, 무진행 생존율에 대해 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 조합된 고 발현 수준은 (수학식 3 ≥ 0.837)이고 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 조합된 저 발현 수준은 (수학식 3 < 0.837)이다.
이 결과 표는 치료 효과에 대한 위험 비가 저 수준 VEGFA & VEGFR2 & PLGF 조합물을 갖는 환자에 비해 고 수준 VEGFA & VEGFR2 & PLGF 조합물을 갖는 환자의 하위세트에서 유의하게 더 우수하다는 것을 보여준다. 따라서, VEGFA & VEGFR2 & PLGF 조합물은 무진행 생존율에 대한 베바시주맙 치료 효과에 대한 예측 생체마커이다.
이 결과 표는 전체 생존율에 대해 치료 효과에 대한 위험 비가 저 수준 VEGFA & VEGFR2 & PLGF 조합물을 갖는 환자에 비해 고 수준 VEGFA & VEGFR2 & PLGF 조합물을 갖는 환자의 하위세트에서 유의하게 더 우수하다는 것을 보여준다. 따라서, VEGFA & VEGFR2 & PLGF 조합물은 전체 생존율에 대한 베바시주맙 치료 효과에 대한 예측 생체마커이다.
실시예 2: IMPACT 분석을 이용한 VEGF-A의 짧은 동형체의 검출
본 실시예는 IMPACT 플랫폼 상의 VEGF-A의 검출에 사용된 항체에 근거하여 VEGF-A의 짧은 동형체가 VEGF-A의 긴 동형체에 비해 우선적으로 측정된다는 것을 입증한다.
"통계학적 분석" 단락 앞에 기재된 표에 나열된 항체들을 사용하여 IMPACT 기술에 관한 단락에 전술되어 있는 바와 같이 본 분석을 수행하였다.
4종의 상이한 VEGF-A 형태, 즉 VEGF111, VEGF121(둘다 이. 콜라이에서의 발현으로부터 유래됨) 및 VEGF165(곤충 세포주에서 재조합적으로 수득됨)를 알앤드디 시스템스(미국 미네아폴리스 소재)로부터 구입하였고, VEGF189를 렐리아테크(독일 볼펜부텔 소재)로부터 입수하였다. VEGF189는 다소 불안정한 듯하고 이 물질을 사용하여 수득한 데이터는 신뢰할 수 없다는 것이 추후에 판명되었다. 도 11에 나타낸 바와 같이, 이. 콜라이에서 제조되었고 이차적으로 변형되지 않은, 예를 들면, 글리코실화되지 않은, 각각 111개 또는 121개의 아미노산을 갖는 짧은 동형체들은 각각 165개의 아미노산을 갖는 긴 동형체에 비해 더 잘 검출된다. VEGF165는 곤충 세포주에서 수득되었고 적어도 부분적으로 글리코실화되어 있다. 생물학적으로 흥미로운 플라스민 절단 생성물 VEGF110은 이 시점에서 시험을 위해 입수될 수 없었지만, 이 동형체의 검출은 111개의 아미노산을 갖는 VEGF 분자에 대해 관찰된 검출에 필적할만할 것으로 예측되어야 한다.
실시예 3: 엘렉시스 분석기를 이용한 짧은 VEGF 동형체의 검출
본 실시예는 엘렉시스(등록상표) 분석기를 이용하는 분석 및 상응하는 분석을 이용하여 인간 혈장에서 짧은 VEGF 동형체를 검출할 수 있다는 것을 입증하는 실험을 기술한다.
VEGF-A 분석은 IMPACT로부터 자동화된 시험관내 진단 시스템 엘렉시스(등록상표)(로슈 다이아그노스틱스 게엠베하, 독일 만하임 소재)로 넘어갔다. IMPACT 분석에서의 포획 항체와 동일한 포획 항체인 <hVEGF-A>-m3C5(렐리아테크, 독일 불펜부텔 소재)를 사용한 반면, IMPACT 시스템 상에서 사용된 포획 항체 <hVEGF-A>-m25603(알앤드디 시스템스, 미국 미네아폴리스 소재)을 <hVEGF-A>-mA4.6.1(제넨테크, 미국 사우쓰 샌프란시스코 소재)로 교체하였다.
자동화된 엘렉시스(등록상표) 시스템 상에서 수행되는 면역분석은 전기화학발광(ECLIA)을 신호 발생 기술로서 이용하는 면역분석이다. 본 샌드위치 분석에서, 바이오티닐화된 포획 항체는 스트렙타비딘으로 코팅된 자기 마이크로입자에 결합하고, 루테닐화된 검출 항체는 신호 발생을 가능하게 한다. 반응 완충제(50 mM 트라이스(pH 7.4), 2 mM EDTA, 0.1% 테싯(Thesit), 0.2% 소 IgG, 1.0% 소 혈청 알부민) 중의 1.5 ㎍/㎖ 농도의 75 ㎕ 바이오티닐화된 <VEGF-A>-m3C5 및 2 ㎍/㎖ 농도의 75 ㎕ 루테닐화된 <VEGF-A>M-A.4.6.1을 20 ㎕의 샘플과 9분 동안 항온처리하였다. 항온처리의 처음 9분 후 30 ㎕의 마이크로입자 현탁액을 첨가한 후, 전체 혼합물을 추가 9분 동안 항온처리하였다. 이들 항온처리 단계들 동안 마이크로입자에 결합되는 항체-분석물-항체 샌드위치가 형성된다. 최종적으로, 마이크로입자를 신호 발생 및 판독을 위한 엘렉시스 시스템의 검출 챔버로 옮겼다.
엘렉시스(등록상표) VEGF-A 분석의 절단 생성물/동형체 선호도를 하기 정제된 재조합 단백질을 사용하여 평가하였다: VEGF110(제넨테크(미국 사우쓰 샌프란시스코 소재)에서 플라스민 절단에 의해 제조됨), VEGF121 및 VEGF165(둘다 곤충 세포주에서 제조되었고 알앤드디 시스템스(미국 미네아폴리스 소재)에 의해 공급됨). IMPACT(등록상표) 분석을 이용하였을 때 관찰된 짧은 VEGF 동형체의 우선적인 결합이 엘렉시스 분석에서 확인되었다. 도 12에 나타낸 바와 같이, 엘렉시스(등록상표) 분석에서 동형체 VEGF121 및 플라스민 절단 생성물 VEGF110 둘다 각각 VEGF165보다 약 5배 더 높은 민감도로 검출되었다.
실시예 4 : Na 시트레이트 및 EDTA에서 수집된 혈장 중의 짧은 VEGF 동형체의 검출
HER2+ 국소적 재발성 또는 전이성 유방암을 갖는 환자로부터 쌍을 이룬 혈장 샘플들을 EDTA 모노베트(5 ㎖) 및 시트레이트 모노베트 수집 튜브(5 ㎖) 둘다 내로 수집하였다. 혈액 수집의 30분 이내에, 혈액 튜브를 원심분리기 내에 넣었고 세포와 혈장이 분리될 때까지 실온에서 1500 g로 10분 동안 원심분리하였다. 원심분리 직후, 피펫을 이용하여 혈장을 프로필렌 전달 튜브 내로 조심스럽게 옮긴 후 2개의 저장 튜브(각각 약 1.25 ㎖의 절반 부피) 내로 동등하게 분취하였다. 샘플 중의 VEGF-A의 수준을 전술된 IMPACT 분석을 이용하여 측정하였다. 도 13에 나타낸 바와 같이, VEGFA 농도는 치료 전 수집된 기준 샘플의 경우 EDTA-시트레이트 MC에 대한 약 0.8의 스페어만 상관계수를 가지면서 시트레이트에 수집되고 저장된 혈장 샘플에 비해 EDTA에 수집되고 저장된 혈장 샘플의 경우 약 40% 더 높다.
실시예 5: 엘렉시스 분석기 상에서의 비-변형된 VEGF 165 및 변형된 VEGF 165 의 비교 측정
본 실시예는 엘렉시스(등록상표) 분석기 및 상응하는 분석이 인간 혈장에서 비-변형된 VEGF를 검출하는 데에 이용될 수 있다는 것을 입증하는 실험을 기술한다.
VEGF-A 분석은 IMPACT로부터 자동화된 시험관내 진단 시스템 엘렉시스(등록상표)(로슈 다이아그노스틱스 게엠베하, 독일 만하임 소재)로 넘어갔다. IMPACT 분석에서의 포획 항체와 동일한 포획 항체인 <hVEGF-A>-m3C5(렐리아테크 게엠베하, 독일 불펜부텔 소재)를 사용한 반면, IMPACT 시스템 상에서 사용된 검출 항체 <hVEGF-A>-m25603(알앤드디 시스템스, 미국 미네아폴리스 소재)을 <hVEGF-A>-mA4.6.1(제넨테크, 미국 사우쓰 샌프란시스코 소재)로 교체하였다.
자동화된 엘렉시스 시스템 상에서 수행되는 면역분석은 전기화학발광(ECLIA)을 신호 발생 기술로서 이용하는 면역분석이다. 본 샌드위치 분석에서, 바이오티닐화된 포획 항체는 스트렙타비딘으로 코팅된 자기 마이크로입자에 결합하고, 루테닐화된 검출 항체는 신호 발생을 가능하게 한다. 반응 완충제(50 mM 트라이스(pH 7.4), 2 mM EDTA, 0.1% 테싯(Thesit), 0.2% 소 IgG, 1.0% 소 혈청 알부민) 중의 1.5 ㎍/㎖ 농도의 75 ㎕ 바이오티닐화된 <VEGF-A>-m3C5 및 2 ㎍/㎖ 농도의 75 ㎕ 루테닐화된 <VEGF-A>M-A.4.6.1을 20 ㎕의 샘플과 9분 동안 항온처리하였다. 항온처리의 처음 9분 후 30 ㎕의 마이크로입자 현탁액을 첨가한 후, 전체 혼합물을 추가 9분 동안 항온처리하였다. 이들 항온처리 단계들 동안 마이크로입자에 결합되는 항체-분석물-항체 샌드위치가 형성된다. 최종적으로, 마이크로입자를 신호 발생 및 판독을 위한 엘렉시스 시스템의 검출 챔버로 옮겼다.
엘렉시스 VEGF-A 분석의 선호도를 하기 정제된 재조합 단백질을 사용하여 평가하였다: (펩프로텍(Peprotech)에 의해 이. 콜라이에서 재조합적으로 제조된) VEGF165 및 (로슈 다이아그노스틱스(독일 소재)에서 HEK 세포에서 재조합적으로 제조된) VEGF165. IMPACT 분석을 이용하였을 때 관찰된 비-변형된 VEGF165의 우선적인 결합이 엘렉시스 분석에서 확인되었다. 도 14에 나타낸 바와 같이, 엘렉시스 분석에서 비-변형된 VEGF165는 변형된 VEGF165보다 약 5배 더 높은 민감도로 검출되었다.
SEQUENCE LISTING <110> F. Hoffmann-La Roche AG <120> Blood plasma biomarkers for Bevacizumab combination therapies for treatment of pancreatic cancer <130> S1945 PCT S3 <140> PCT/EP2011/062226 <141> 2011-07-18 <150> EP 10170004.5 <151> 2010-07-19 <160> 3 <170> PatentIn version 3.3 <210> 1 <211> 232 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 1 Met Asn Phe Leu Leu Ser Trp Val His Trp Ser Leu Ala Leu Leu Leu 1 5 10 15 Tyr Leu His His Ala Lys Trp Ser Gln Ala Ala Pro Met Ala Glu Gly 20 25 30 Gly Gly Gln Asn His His Glu Val Val Lys Phe Met Asp Val Tyr Gln 35 40 45 Arg Ser Tyr Cys His Pro Ile Glu Thr Leu Val Asp Ile Phe Gln Glu 50 55 60 Tyr Pro Asp Glu Ile Glu Tyr Ile Phe Lys Pro Ser Cys Val Pro Leu 65 70 75 80 Met Arg Cys Gly Gly Cys Cys Asn Asp Glu Gly Leu Glu Cys Val Pro 85 90 95 Thr Glu Glu Ser Asn Ile Thr Met Gln Ile Met Arg Ile Lys Pro His 100 105 110 Gln Gly Gln His Ile Gly Glu Met Ser Phe Leu Gln His Asn Lys Cys 115 120 125 Glu Cys Arg Pro Lys Lys Asp Arg Ala Arg Gln Glu Lys Lys Ser Val 130 135 140 Arg Gly Lys Gly Lys Gly Gln Lys Arg Lys Arg Lys Lys Ser Arg Tyr 145 150 155 160 Lys Ser Trp Ser Val Tyr Val Gly Ala Arg Cys Cys Leu Met Pro Trp 165 170 175 Ser Leu Pro Gly Pro His Pro Cys Gly Pro Cys Ser Glu Arg Arg Lys 180 185 190 His Leu Phe Val Gln Asp Pro Gln Thr Cys Lys Cys Ser Cys Lys Asn 195 200 205 Thr Asp Ser Arg Cys Lys Ala Arg Gln Leu Glu Leu Asn Glu Arg Thr 210 215 220 Cys Arg Cys Asp Lys Pro Arg Arg 225 230 <210> 2 <211> 1356 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2 Met Gln Ser Lys Val Leu Leu Ala Val Ala Leu Trp Leu Cys Val Glu 1 5 10 15 Thr Arg Ala Ala Ser Val Gly Leu Pro Ser Val Ser Leu Asp Leu Pro 20 25 30 Arg Leu Ser Ile Gln Lys Asp Ile Leu Thr Ile Lys Ala Asn Thr Thr 35 40 45 Leu Gln Ile Thr Cys Arg Gly Gln Arg Asp Leu Asp Trp Leu Trp Pro 50 55 60 Asn Asn Gln Ser Gly Ser Glu Gln Arg Val Glu Val Thr Glu Cys Ser 65 70 75 80 Asp Gly Leu Phe Cys Lys Thr Leu Thr Ile Pro Lys Val Ile Gly Asn 85 90 95 Asp Thr Gly Ala Tyr Lys Cys Phe Tyr Arg Glu Thr Asp Leu Ala Ser 100 105 110 Val Ile Tyr Val Tyr Val Gln Asp Tyr Arg Ser Pro Phe Ile Ala Ser 115 120 125 Val Ser Asp Gln His Gly Val Val Tyr Ile Thr Glu Asn Lys Asn Lys 130 135 140 Thr Val Val Ile Pro Cys Leu Gly Ser Ile Ser Asn Leu Asn Val Ser 145 150 155 160 Leu Cys Ala Arg Tyr Pro Glu Lys Arg Phe Val Pro Asp Gly Asn Arg 165 170 175 Ile Ser Trp Asp Ser Lys Lys Gly Phe Thr Ile Pro Ser Tyr Met Ile 180 185 190 Ser Tyr Ala Gly Met Val Phe Cys Glu Ala Lys Ile Asn Asp Glu Ser 195 200 205 Tyr Gln Ser Ile Met Tyr Ile Val Val Val Val Gly Tyr Arg Ile Tyr 210 215 220 Asp Val Val Leu Ser Pro Ser His Gly Ile Glu Leu Ser Val Gly Glu 225 230 235 240 Lys Leu Val Leu Asn Cys Thr Ala Arg Thr Glu Leu Asn Val Gly Ile 245 250 255 Asp Phe Asn Trp Glu Tyr Pro Ser Ser Lys His Gln His Lys Lys Leu 260 265 270 Val Asn Arg Asp Leu Lys Thr Gln Ser Gly Ser Glu Met Lys Lys Phe 275 280 285 Leu Ser Thr Leu Thr Ile Asp Gly Val Thr Arg Ser Asp Gln Gly Leu 290 295 300 Tyr Thr Cys Ala Ala Ser Ser Gly Leu Met Thr Lys Lys Asn Ser Thr 305 310 315 320 Phe Val Arg Val His Glu Lys Pro Phe Val Ala Phe Gly Ser Gly Met 325 330 335 Glu Ser Leu Val Glu Ala Thr Val Gly Glu Arg Val Arg Ile Pro Ala 340 345 350 Lys Tyr Leu Gly Tyr Pro Pro Pro Glu Ile Lys Trp Tyr Lys Asn Gly 355 360 365 Ile Pro Leu Glu Ser Asn His Thr Ile Lys Ala Gly His Val Leu Thr 370 375 380 Ile Met Glu Val Ser Glu Arg Asp Thr Gly Asn Tyr Thr Val Ile Leu 385 390 395 400 Thr Asn Pro Ile Ser Lys Glu Lys Gln Ser His Val Val Ser Leu Val 405 410 415 Val Tyr Val Pro Pro Gln Ile Gly Glu Lys Ser Leu Ile Ser Pro Val 420 425 430 Asp Ser Tyr Gln Tyr Gly Thr Thr Gln Thr Leu Thr Cys Thr Val Tyr 435 440 445 Ala Ile Pro Pro Pro His His Ile His Trp Tyr Trp Gln Leu Glu Glu 450 455 460 Glu Cys Ala Asn Glu Pro Ser Gln Ala Val Ser Val Thr Asn Pro Tyr 465 470 475 480 Pro Cys Glu Glu Trp Arg Ser Val Glu Asp Phe Gln Gly Gly Asn Lys 485 490 495 Ile Glu Val Asn Lys Asn Gln Phe Ala Leu Ile Glu Gly Lys Asn Lys 500 505 510 Thr Val Ser Thr Leu Val Ile Gln Ala Ala Asn Val Ser Ala Leu Tyr 515 520 525 Lys Cys Glu Ala Val Asn Lys Val Gly Arg Gly Glu Arg Val Ile Ser 530 535 540 Phe His Val Thr Arg Gly Pro Glu Ile Thr Leu Gln Pro Asp Met Gln 545 550 555 560 Pro Thr Glu Gln Glu Ser Val Ser Leu Trp Cys Thr Ala Asp Arg Ser 565 570 575 Thr Phe Glu Asn Leu Thr Trp Tyr Lys Leu Gly Pro Gln Pro Leu Pro 580 585 590 Ile His Val Gly Glu Leu Pro Thr Pro Val Cys Lys Asn Leu Asp Thr 595 600 605 Leu Trp Lys Leu Asn Ala Thr Met Phe Ser Asn Ser Thr Asn Asp Ile 610 615 620 Leu Ile Met Glu Leu Lys Asn Ala Ser Leu Gln Asp Gln Gly Asp Tyr 625 630 635 640 Val Cys Leu Ala Gln Asp Arg Lys Thr Lys Lys Arg His Cys Val Val 645 650 655 Arg Gln Leu Thr Val Leu Glu Arg Val Ala Pro Thr Ile Thr Gly Asn 660 665 670 Leu Glu Asn Gln Thr Thr Ser Ile Gly Glu Ser Ile Glu Val Ser Cys 675 680 685 Thr Ala Ser Gly Asn Pro Pro Pro Gln Ile Met Trp Phe Lys Asp Asn 690 695 700 Glu Thr Leu Val Glu Asp Ser Gly Ile Val Leu Lys Asp Gly Asn Arg 705 710 715 720 Asn Leu Thr Ile Arg Arg Val Arg Lys Glu Asp Glu Gly Leu Tyr Thr 725 730 735 Cys Gln Ala Cys Ser Val Leu Gly Cys Ala Lys Val Glu Ala Phe Phe 740 745 750 Ile Ile Glu Gly Ala Gln Glu Lys Thr Asn Leu Glu Ile Ile Ile Leu 755 760 765 Val Gly Thr Ala Val Ile Ala Met Phe Phe Trp Leu Leu Leu Val Ile 770 775 780 Ile Leu Arg Thr Val Lys Arg Ala Asn Gly Gly Glu Leu Lys Thr Gly 785 790 795 800 Tyr Leu Ser Ile Val Met Asp Pro Asp Glu Leu Pro Leu Asp Glu His 805 810 815 Cys Glu Arg Leu Pro Tyr Asp Ala Ser Lys Trp Glu Phe Pro Arg Asp 820 825 830 Arg Leu Lys Leu Gly Lys Pro Leu Gly Arg Gly Ala Phe Gly Gln Val 835 840 845 Ile Glu Ala Asp Ala Phe Gly Ile Asp Lys Thr Ala Thr Cys Arg Thr 850 855 860 Val Ala Val Lys Met Leu Lys Glu Gly Ala Thr His Ser Glu His Arg 865 870 875 880 Ala Leu Met Ser Glu Leu Lys Ile Leu Ile His Ile Gly His His Leu 885 890 895 Asn Val Val Asn Leu Leu Gly Ala Cys Thr Lys Pro Gly Gly Pro Leu 900 905 910 Met Val Ile Val Glu Phe Cys Lys Phe Gly Asn Leu Ser Thr Tyr Leu 915 920 925 Arg Ser Lys Arg Asn Glu Phe Val Pro Tyr Lys Thr Lys Gly Ala Arg 930 935 940 Phe Arg Gln Gly Lys Asp Tyr Val Gly Ala Ile Pro Val Asp Leu Lys 945 950 955 960 Arg Arg Leu Asp Ser Ile Thr Ser Ser Gln Ser Ser Ala Ser Ser Gly 965 970 975 Phe Val Glu Glu Lys Ser Leu Ser Asp Val Glu Glu Glu Glu Ala Pro 980 985 990 Glu Asp Leu Tyr Lys Asp Phe Leu Thr Leu Glu His Leu Ile Cys Tyr 995 1000 1005 Ser Phe Gln Val Ala Lys Gly Met Glu Phe Leu Ala Ser Arg Lys 1010 1015 1020 Cys Ile His Arg Asp Leu Ala Ala Arg Asn Ile Leu Leu Ser Glu 1025 1030 1035 Lys Asn Val Val Lys Ile Cys Asp Phe Gly Leu Ala Arg Asp Ile 1040 1045 1050 Tyr Lys Asp Pro Asp Tyr Val Arg Lys Gly Asp Ala Arg Leu Pro 1055 1060 1065 Leu Lys Trp Met Ala Pro Glu Thr Ile Phe Asp Arg Val Tyr Thr 1070 1075 1080 Ile Gln Ser Asp Val Trp Ser Phe Gly Val Leu Leu Trp Glu Ile 1085 1090 1095 Phe Ser Leu Gly Ala Ser Pro Tyr Pro Gly Val Lys Ile Asp Glu 1100 1105 1110 Glu Phe Cys Arg Arg Leu Lys Glu Gly Thr Arg Met Arg Ala Pro 1115 1120 1125 Asp Tyr Thr Thr Pro Glu Met Tyr Gln Thr Met Leu Asp Cys Trp 1130 1135 1140 His Gly Glu Pro Ser Gln Arg Pro Thr Phe Ser Glu Leu Val Glu 1145 1150 1155 His Leu Gly Asn Leu Leu Gln Ala Asn Ala Gln Gln Asp Gly Lys 1160 1165 1170 Asp Tyr Ile Val Leu Pro Ile Ser Glu Thr Leu Ser Met Glu Glu 1175 1180 1185 Asp Ser Gly Leu Ser Leu Pro Thr Ser Pro Val Ser Cys Met Glu 1190 1195 1200 Glu Glu Glu Val Cys Asp Pro Lys Phe His Tyr Asp Asn Thr Ala 1205 1210 1215 Gly Ile Ser Gln Tyr Leu Gln Asn Ser Lys Arg Lys Ser Arg Pro 1220 1225 1230 Val Ser Val Lys Thr Phe Glu Asp Ile Pro Leu Glu Glu Pro Glu 1235 1240 1245 Val Lys Val Ile Pro Asp Asp Asn Gln Thr Asp Ser Gly Met Val 1250 1255 1260 Leu Ala Ser Glu Glu Leu Lys Thr Leu Glu Asp Arg Thr Lys Leu 1265 1270 1275 Ser Pro Ser Phe Gly Gly Met Val Pro Ser Lys Ser Arg Glu Ser 1280 1285 1290 Val Ala Ser Glu Gly Ser Asn Gln Thr Ser Gly Tyr Gln Ser Gly 1295 1300 1305 Tyr His Ser Asp Asp Thr Asp Thr Thr Val Tyr Ser Ser Glu Glu 1310 1315 1320 Ala Glu Leu Leu Lys Leu Ile Glu Ile Gly Val Gln Thr Gly Ser 1325 1330 1335 Thr Ala Gln Ile Leu Gln Pro Asp Ser Gly Thr Thr Leu Ser Ser 1340 1345 1350 Pro Pro Val 1355 <210> 3 <211> 221 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 3 Met Pro Val Met Arg Leu Phe Pro Cys Phe Leu Gln Leu Leu Ala Gly 1 5 10 15 Leu Ala Leu Pro Ala Val Pro Pro Gln Gln Trp Ala Leu Ser Ala Gly 20 25 30 Asn Gly Ser Ser Glu Val Glu Val Val Pro Phe Gln Glu Val Trp Gly 35 40 45 Arg Ser Tyr Cys Arg Ala Leu Glu Arg Leu Val Asp Val Val Ser Glu 50 55 60 Tyr Pro Ser Glu Val Glu His Met Phe Ser Pro Ser Cys Val Ser Leu 65 70 75 80 Leu Arg Cys Thr Gly Cys Cys Gly Asp Glu Asn Leu His Cys Val Pro 85 90 95 Val Glu Thr Ala Asn Val Thr Met Gln Leu Leu Lys Ile Arg Ser Gly 100 105 110 Asp Arg Pro Ser Tyr Val Glu Leu Thr Phe Ser Gln His Val Arg Cys 115 120 125 Glu Cys Arg His Ser Pro Gly Arg Gln Ser Pro Asp Met Pro Gly Asp 130 135 140 Phe Arg Ala Asp Ala Pro Ser Phe Leu Pro Pro Arg Arg Ser Leu Pro 145 150 155 160 Met Leu Phe Arg Met Glu Trp Gly Cys Ala Leu Thr Gly Ser Gln Ser 165 170 175 Ala Val Trp Pro Ser Ser Pro Val Pro Glu Glu Ile Pro Arg Met His 180 185 190 Pro Gly Arg Asn Gly Lys Lys Gln Gln Arg Lys Pro Leu Arg Glu Lys 195 200 205 Met Lys Pro Glu Arg Cys Gly Asp Ala Val Pro Arg Arg 210 215 220

Claims (26)

  1. 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 베바시주맙(bevacizumab)을 화학치료 요법에 추가함으로써 췌장암을 앓고 있는 환자의 화학치료 요법의 치료 효과를 개선하는 방법:
    (a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
    (b) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
  2. 췌장암을 앓고 있는 것으로 의심되거나 앓기 쉬운 환자로부터의 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 화학치료 요법에의 베바시주맙 치료의 추가에 반응하거나 민감한 환자를 확인하는 시험관내 방법으로서, 이때 췌장암을 앓고 있는 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상이 상기 화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 대한 상기 환자의 민감성을 표시하는, 방법.
  3. 하기 단계 (a) 및 (b)를 포함하는, 췌장암을 앓고 있는 환자의 화학치료 요법의 치료 효과를 개선하기 위한 베바시주맙의 용도:
    (a) 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계; 및
    (b) 췌장암으로 진단된 환자에서 측정된 대조군 발현 수준에 비해 상대적으로 증가된 발현 수준의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 갖는 환자에게 화학치료 요법과 함께 베바시주맙을 투여하는 단계.
  4. 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 단백질 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 췌장암을 앓고 있는 것으로 의심되거나, 앓고 있거나 앓기 쉬운 환자의 화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 대한 반응성 또는 민감성을 예측하는 시험관내 방법.
  5. 환자 샘플 중의 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 췌장암을 앓고 있거나, 앓고 있는 것으로 의심되거나 앓기 쉬운 환자의 화학치료 요법에의 베바시주맙의 추가에 대한 반응성 또는 민감성을 예측하기 위한 진단 조성물의 제조를 위한 특이적 프로브의 용도로서, 이때 상기 프로브가 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF 중 하나 이상을 검출할 수 있는, 용도.
  6. 제5항에 있어서,
    프로브가 항체와 같은 결합 분자인, 용도.
  7. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서,
    치료 효과가 무진행 생존율인, 방법 또는 용도.
  8. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서,
    치료 효과가 전체 생존율인, 방법 또는 용도.
  9. 제4항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서,
    측정된 단백질 발현 수준이 VEGFA 또는 PLGF의 단백질 발현 수준인, 방법 또는 용도.
  10. 제4항 내지 제6항 및 제8항 중 어느 한 항에 있어서,
    측정된 단백질 발현 수준이 VEGFA 또는 VEGFR2의 단백질 발현 수준인, 방법 또는 용도.
  11. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서,
    측정된 단백질 발현 수준이 VEGFA 및 VEGFR2의 조합된 발현 수준인, 방법 또는 용도.
  12. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서,
    측정된 단백질 발현 수준이 VEGFA 및 PLGF의 조합된 발현 수준인, 방법 또는 용도.
  13. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서,
    측정된 단백질 발현 수준이 VEGFA, VEGFR2 및 PLGF의 조합된 발현 수준인, 방법 또는 용도.
  14. 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서,
    발현 수준이 면역분석 방법에 의해 검출되는, 방법 또는 용도.
  15. 제14항에 있어서,
    면역분석 방법이 ELISA인, 방법 또는 용도.
  16. 제1항 내지 제15항 중 어느 한 항에 있어서,
    환자 샘플이 혈액 샘플인, 방법 또는 용도.
  17. 제1항 내지 제16항 중 어느 한 항에 있어서,
    환자 샘플이 혈장 샘플인, 방법 또는 용도.
  18. 제1항 내지 제17항 중 어느 한 항에 있어서,
    췌장암이 전이성 췌장암인, 방법 또는 용도.
  19. 제18항에 있어서,
    화학치료 요법이 젬시타빈(gemcitabine) 및 에를로티닙(erlotinib)을 포함하는, 방법 또는 용도.
  20. 제1항 내지 제19항 중 어느 한 항에 있어서,
    환자가 하나 이상의 항암 치료법으로 병행치료되는(co-treated), 방법 또는 용도.
  21. 제20항에 있어서,
    항암 치료법이 방사선인, 방법 또는 용도.
  22. 제1항 내지 제21항 중 어느 한 항에 있어서,
    샘플이 신보조(neoadjuvant) 또는 보조 치료법 전에 수득되는, 방법 또는 용도.
  23. 제1항 내지 제21항 중 어느 한 항에 있어서,
    샘플이 신보조 또는 보조 치료법 후에 수득되는, 방법 또는 용도.
  24. VEGFA, VEGFR2 및/또는 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준을 측정할 수 있는 폴리펩티드를 포함하는, 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항의 방법을 수행하는 데에 유용한 키트.
  25. 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항에서 VEGFA, VEGFR2 및/또는 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준을 측정하기 위한 폴리펩티드의 용도.
  26. 제24항 또는 제25항에 있어서,
    VEGFA, VEGFR2 및/또는 PLGF 중 하나 이상의 발현 수준을 측정할 수 있는 폴리펩티드를 포함하는 키트 또는 용도로서, 이때 상기 폴리펩티드가 면역분석 방법에서 사용되기에 적합하고/하거나 VEGFA, VEGFR2 또는 PLGF에 대해 특이적인 항체인, 키트 또는 용도.
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