JPH04503014A - ウィルムス腫瘍遺伝子の位置決定と特徴付け - Google Patents

ウィルムス腫瘍遺伝子の位置決定と特徴付け

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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 ウィルムス腫瘍遺伝子の位置決定と特徴付は資金援助 ここに記載する研究は、国立保健研究所、カナダ医学研究会議、国立癌研究所の 資金援助を受けた。
背景 ウィルムス腫瘍(WT)は、腎臓に見られる胎児性悪性腫瘍であって、約10. 000人の乳児・幼児の内−人がこれに侵される。 Msltonagt Hn min Geneli’cs、57:231−246 (1981)。
ウィルムス腫瘍の分子面の基礎はまだよく分かっていない。
ウィルムス腫瘍症例の一部(約2%)は、泌尿生殖器異常や精神薄弱ばかりでな く、無虹彩(AN2)にともなって現われ群を形成し、これは、WAGR複合体 として知られている1群の遺伝子におけるヒト染色体11のIIp13帯での体 賀的欠失が24 :1BS−192(1979)。この場合、しばしば、両側性 ウィルムス腫瘍が観察されるが、それと同時に、周囲の腎組織に異形成度化も認 められる(腎芽細胞腫症)。後者は、悪性転換に先行する現象と考えられている 。BoVe及びMcAd*ms、Pettptcj+yes onPedi*I r1c PI[bol、、 3:185−223 (1976) o劣性癌遺伝 子または癌抑制遺伝子として、ウィルムス腫瘍遺伝子座は、未分化の腎細胞の成 長を妨げる。これは一般に、癌発生に関する2段階突然変位モデルに一致し、遺 伝的には、染色体13q上の網膜芽腫遺伝子座と同様である。これらの所見から 次の結論が導かれる。
少なくとも、ウィルムス腫瘍のこの一部に関しては、網膜芽腫(RB)遺伝子と 同様、11p13における遺伝子の不活性化が、腫瘍形成を左右する重要事項で ある。WTの原因となる遺伝子の位置を特定するために、これまで相当の努力が 払われてきた。
このことは、そのような努力の跡を記載する多数の報告によって明かである。例 えば、冬型遺伝子座についてヘテロ接合性を持たない、散発性ウィルムス腫瘍の ゲノム分析では、ウイルムス腫瘍遺伝子は11913の部位にあることが支持さ れる。Koalos。
el sl、、 肛1ort、309:170−172(1984); 0rk in、tl sl、、N*jwre。
309:172−174 (19114); Rseye、 ell、、 N5 Lare、309:174−176(1984); F…on、 et *1. 、 Ns+mr*、309:176−178 (1984)。
その他の研究に基づいて言うと、ウィルムス腫瘍は、別の遺伝子座で機能喪失が 生ずることによって起こるようである。遺伝的にウィルムス腫瘍にかかりやすい 2家系の調査において、11p遺伝子マーカーとの結合は排除された。このこと から、少なくとも、他にもう一つウイルムス腫瘍遺伝子座があることが明らかに なった。GruIld7. el sl、、 N5lure、336: 374 −376(198B); l(u目、 tl Il、、 N1ters、皿:  377−378 (198B)。その後の研究では、ウイルムス腫瘍のへテロ接 合性の喪失は、1ip13ではなく、11p15に認められた。Reewt、e t *1.、Mo1. Ce1l子座の可能性が考えられるけれども、11pH のウイルムス腫瘍遺伝子座は、体質性WAGR欠失や、散発性腫瘍の一部におけ る体細胞性染色体再編成と関連していることは明かである。
L!vis、el sl、、Genosics、 3: 25−31 (198 8)。
ウィルムス腫瘍遺伝子を特定することには相当の関心がよせられており、そのこ とを目標にした研究があるにも拘らず、現在までのところ、ウイルムス腫瘍遺伝 子を含むと特定された領域の転写マツプは、まだ特定されていない。
発明の概要 本発明は、ウィルムス(tilIls )腫瘍遺伝子に関しての細胞分析法に関 わる。また、ウィルムス腫瘍遺伝子転写部分またはコードされるポリペプチドに 関しての細胞分析法にも関わる。
ここでいう、ウィルムス腫瘍遺伝子またはウイルムス腫瘍DNAとは、染色体1 1のバンド13 (11pH)における障害を指す。この障害は、WAGRまた はウイルムス腫゛瘍(すなわち、この病状を持つ細胞に見られる)の特徴である が、他の腫瘍タイプと関連していたり、または、−その原因となることも十分に 予想されるものである。本発明はさらに、ゲノム・クローン、cDNAクローン 両方のDNA塩基配列にも関わる。この配列は、ウィルムス腫瘍遺伝子座をヒト 染色体11のpバンド13(11p13 )に位置づける体質性および癌性欠失 の境界内にマツプされる。初めて、ウイルムス腫瘍遺伝子を含む領域にマツプさ れる転写部分を特定した。この転写部分の特徴を明らかにし、それが、約50k bに長さに渡っていること、長さ約3kbのm RN A (WT mRN^と 呼ぶ)をコードしていること、を示した。
WT mRN^は、小数の細胞型(すなわち、主に腎臓細胞と、造血細胞の一部 )で発現されることが明らかになった。
この配列によってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列についても明らかに され、そのポリペプチドの性質についても調べた。これらの性質の内のいくつか 、例えば、4個のジンク・フィンガー領域の存在並びにプロリン及びグルタミン 富裕領域の存在は、転写調節における役割を示している。11p13という遺伝 子位置、組織特異的な発現性及び予想される機能は、11p13ウイルムス腫瘍 遺伝子であることを裏付ける。本発明は、さらに、ウィルムス腫瘍遺伝子を特定 する方法;単離したウイルムス腫瘍遺伝子、単離した遺伝子転写部分;単離した コードされたポリペプチド;並びに、それらに基づく診断法および試薬をも含む 。本発明は、あるサンプルについて、明らかに、11pHウイルムス腫瘍遺伝子 座内に存在するDNA、そのmRNA転写部分またはウイルムス腫瘍コードポリ ペプチドを特定する方法、並びに、この方法に用いられる材料(例えば、核酸プ ローブ、抗つィルムス腫瘍ポリペプチド抗体)を初めて利用可能にする。このこ とは、特に貴重である。なぜならば、ウイルムス腫瘍は極めて悪性であり、急速 に成長するものではあるけれども、有効な治療処方を開発することによって得ら れた、小児腫瘍学における明瞭な成功例の一つとなるものであるからである。本 発明は、WAGRまたはウィルムス腫瘍の発生の危険度を、その出現前に推測す る手段を、また、一旦発病したならば、その存在を確定する手段を、提供する。
これにより、発病前に、または、病気の初期に治療を開始することが可能である 。
本発明はまた、ウィルムス腫瘍遺伝子と同一の、または、同様の配列を有するD NAの存在を、他の腫瘍型(例えば、白血病細胞、畢丸腫瘍)において検出する ことのできる方法を提供する。これは、ウィルムス腫瘍遺伝子コードポリペプチ ドにたいする特異的なりNAプローブまたは抗体を用いることによる。
図の簡単な説明 第1図は、ウィルムス腫瘍遺伝子の単離、その特徴付けを示す図式である。
第2図は、WAGR領域の図式であり、単一コピー・プローブ、+7−18p2 . +8−3p4および、+8−3と相同のcDNAのマツプ位置を示す。
第3図は、Wi33 cDNAのヌクレオチド配列と、ヌクレオチド1から10 35にわたるオーブンリーディングフレームのアミノ酸配列を示す。プロリン・ グルタミン富裕領域(ヌクレオチド6から468まで)におけるプロリン及びグ ルタミン残基を、四角で囲み、4ジンク・フィンガー(ヌクレオチド670から 1002まで)にあって、ジンク・フィンガーコンセンサスに適合するアミノ酸 に下線をづ匹また。
第4図は、Wi33 cDNAの図式マツプである。オーブンリーディングフレ ームを、四角く囲った領域として表わし、それから得られた、プロリン・グルタ ミン富裕領域のアミノ酸配列を、陰をつけたオーブンリーディングフレームの上 に表わす。
第5図は、Wi33からジンク・フィンガーコンセンサス領域までの配列と、ヒ トEGRI、EGR2−遺伝子の配列との比較を示す図式マツプである。
第6図は、ウィルムス腫瘍cDNAと各種DNAとのハイブリダイゼーシヨンに ついてのサザーン・プロット分析の結果を示す。
第6A図は、Wi33とハイブリダイズしたEcoR1消化ヒトリンパ芽細胞D NAのサザーン・プロット分析の結果を示す。
第6B図は、EcoRIで消化し、Wi2とハイブリダイズさせた、Wi 1− 13ハイブリツド細胞系のサザーン・プロット分析の結果を示す。
第7図は、Wi33 mRNAをコードする、6個の重複コスミドのゲノム構成 を示す。Wi33 cDNAを含む93Kbpゲノム領域の、EeoRI複合制 限マツプを図の上段に示す。
第8図は、各種組織、腫瘍細胞系におけるWT33発現のノーザン・プロット分 析の結果を示す。
第8A図は、ヒトにおける、Wi33の組織特異性発現の、ノーザン・プロット による分析結果を示す。
第8B図は、マウス及びヒトの組織から得たRNAの組織特異的分布を、ノーザ ン・プロットによって分析した結果を示す。
第8C図は、腫瘍細胞系におけるWT33発現をノーザン・プロットによって分 析した結果を示す。
第9図は、ウィルムス腫瘍融合蛋白の発現を示す。
発明の詳細な記載 本発明は、ウィルムス腫瘍遺伝子、当該遺伝子のmRNA転写部分の特定と特徴 付けに基づく。また、ウィルムス腫瘍遺伝子によってコードされたポリペプチド の特徴付けに基づく。下記に詳細に述べるように、染色体11バンドp13 ( llp13 )上のウィルムス腫瘍遺伝子座を特定する体質性、腫瘍性欠失の境 界内にマツプされる一連のゲノム・クローン、cDN人クワクローン離し、その 特徴を明らかにした。同様に、後述するように、当該クローンに対応する転写単 位によつてコードされるmRNAの発現パターンを決めた。さらに、ウィルムス 腫瘍遺伝子座によってコードされるポリペプチドの特徴を調べたところ、このポ リペプチドが、転写の調節にあづかっていることを示唆するいくつかの特性を持 つことが明らかになった。
ここに記載する研究に基づき、ウィルムス腫瘍DNAの有無を測定する方法が、 細胞内におけるウィルムス腫瘍DNA定量法と同様に、開発された。ウィルムス 腫瘍DNAとハイブリダイズする核酸プローブ、ウィルムス腫瘍DNAの転写部 分とハイブリダイズする核酸プローブも生産され、この方法の中で用いられた。
ここでは、これを、ウィルムス腫瘍遺伝子またはウィルムス腫瘍DNAと呼ぶが 、染色体11バンド13上の遺伝子座をこのように呼ぶのは、簡単のためであっ て、本発明を、WAGRやウィルムス腫瘍と呼ばれる医学上の状態にのみ限定す ることを意味するものではない。したがって、ウィルムス腫瘍DNAと呼ばれる 11p13遺伝子座が、他の腫瘍型、例えば、白血病細胞、畢丸腫瘍にも見られ る(に伴う、を引き起こす)と期待しても当然である。本発明は、そのような存 在をも含むことを意図したものであり、また、等測的遺伝子またはDNA配列( すなわち、ここに記載するプローブと交差ハイブリダイズし、それが存在する細 胞において劣性癌遺伝子または癌抑制遺伝子として働<DNA配列である)・を 、他の腫瘍型においても特定することのできる方法を提供する。
下記は、ウィルムス腫瘍ゲノムDNAとcDN^、 mRN^転写部分、コード されたポリペプチドの単離及び特徴付けを記載したものである。
分子レベルのマツピング実験によって、WAGR領域は、11p13中の特定間 隔に狭められた。こ−の間隔は、赤血球カタラーゼ(CAT)をコードする遺伝 子と、卵胞刺激ホルモン(FSHB)のサブユニットをコードする遺伝子によっ て境されている。
おける遺伝子の位置をさらに明確にするために、3つの互いに相補う戦略を用い た。すなわち、体細胞遺伝学、分子クローニング、パルス式フィールド・ゲル電 気泳動である。特定の転座・欠失染色体を分離する体細胞ハイブリッドは、WA GR領域内における個々の遺伝子の位置を解明し、特定するのに効果的な試薬で ある。さらに、相当数の11p13 DNAマーカーが、染色体11特異的DN Aライブラリーから単離され、その特徴が明らかにされた。Levis、el  Il、、1bid (1988); Complon、ej sl、。
Ce1l、 55:827−1136 (1988); Devis、 et  sl、、 Gcnomics、3:24−27(1988暑); Dtyis、  eI*1.、5cience 、241:840−842(1988b);G e5sler、zt rl、、]、 Am、 Hut Geaet、、 44: 4BG−495(1989*);Gzssler、 tl *1.、5cien ce 、lt:15?5−1572 (1989b)。パルス式フィールド・ゲ ル電気泳動によって構築された長尺の制限マツプによって、いくつかのWAGR 疾病遺伝子について、比較的長い間隔が明確になる。
ウィルムス腫瘍DNAの単離法を、第1図に、図式的に表わす。最初、ヒト染色 体11の短腕が、他のヒト・ゲノムから分離されているハムスター・ヒト体細胞 系(11−11’)を用いて、コスミド・ライブラリーを作りた。その方法は、 実施例に記載しである通りである。いずれも、染色体11の短腕にマツプされる ヒトDNAを含む、119個のコスミド・クローンを、このライブラリーから単 離した。次に、WAGR領域を含むクローンを特定した。これは、ヒト染色体1 1pの各種フラグメントを含む体細胞ハイブリッドのマツピングパネルを用いて 行なった。
このようにして単離したクローンの内、3種(JT−18,18−3゜JIG− 15)が、ウィルムス腫瘍遺伝子を含む領域にもつとも近接してマツプされてい るようであった。l1l−3,110−15の制限マツプから、相当な重複が明 らかになったので、このコスミドの内の一つ(38−3)だけをさらに分析する ことにした。
IT−18P2. J8−3p4と名付けた単一コピー配列をサブクローンし、 それぞれ、JT−18,18−3コスミドから特定した。これら単一コピーのD NA配列の微細な位置については、一連の体細胞ハイブリッドにたいするハイブ リダイゼーションによって決めた。このハイブリッドは、WAGR領域内の特定 の間隔を示す転座および欠失を有する患者から得たものである。これは、実施例 に詳細に記述し、その所見を要約したマツプは第2図に示す。
cDN^ライブラリーをスクリーンするためのプローブとして、J8−3p4を 用いた。J8−3p4をこの目的のために選んだのは、そのマツプ位置から、こ れが、ウイルムス腫瘍遺伝子座にごく近いか、その内部に含まれることが示され たからである。さらに、実施例で説明するように、二つの観察所見から、1B− 3p4が、転写単位の一部を含んでいることが示唆されたからである。ヒト胎児 性腎(HE K)細胞から得たcDN^ライブラリーを、38−3p4でスクリ ーニングした。ノーザン・プロットの結果に基づき(実施例参照)、ヒト成人腎 ライブラリー、ヒト前B細胞ライブラリーもスクリーニングした。この3個のラ イブラリーから得た4種のcDNAクローンを詳細に調べた。すなわち、HEK から得たちの二つ(WT4. WT2) 、ヒト成人腎臓からのもの一つ(WT 22) 、前B細胞系から得たちの一つ(WT33)である。もう一つ別の相同 性cDN^クローン(WT13)を、HEKライブラリーから単離した。これに は、独立に単離した保存ゲノムDNAクローン、λに13を用いた。G I s  s e r、 T、著、ヒト11番目染色体の微細構造と進化、理学博士論文 、マサチューセッツ工科大学、ケンブリッジ、マサチューセッツ州(198g) 。
cDNAクローンWT33は、長さが2313塩基対(b p)で、単離した中 では最長のものである。このものは、単離したクローンの5°、3°の両方向へ もつとも遠くまで延びている。他の4つのcDH^は、長さが約1000から1 200bpであるDNA配列の共通内部領域を共有している。
cDN人クロりンWT33を選んでその後の分析対象とした。このことについて は、実施例に詳細に記載しである。WT33ヌクレオチド配列を決定し、予測し たアミノ酸配列を得た。いずれも第3図に示しである。塩基配列分析から、34 5個のアミノ酸から成る連続オーブンリーディングフレームの存在が明らかにな った。これは、ヌクレオチド1から1035に渡っている。このオーブンリーデ ィングフレームが、WT33コード部分の大部分を代表しているようであるが、 イニシエーターのメチオニン・コドンを含んではいないらしい。プライマー拡張 実験によって、WT33に相当するmRN^の5゛末端に、さらに2oobpが 存在することが示唆された。このcDNAに相当する遺伝子座の転写パターンは 、多少、複雑である。RNA PCR(ポリメラーゼ連鎖反応)を用いた実験に よって、mRN^のコード領域の5°セグメントのmRNA塩基配列に変動のあ ることがあきらかになった。これから、各組織タイプ間には、いろいろのスプラ イシングパターンのあることが示唆された。
特に興味深いのは、ヌクレオチド670から1002までが、4個の、相接触す る「ジンク・フィンガー」領域をコードしていることである。WT33 (第5 図)によってコードされる4個のジンク・フィンガーは、すべて、ジンク・フィ ンガーの共通配列に適合する(Miller、J、、 elsl、 EMBOL 、4: 1609−1614(1985); Eyxns、 R,N、、 ej  sl、、Ce1l、 52:i3 (198g) ) 、ジンク・フィンガー 間+7)H/C結合は、TGE−R/に−P−F/Y−Xというアミノ酸配列に よって代表されるが、これも、得られたアミノ酸配列の中に保存されている(S huh、 R,、el tl、、 Ce1l、 47:1025−1032 ( 1986))。
他のポリペプチドについても、WT33に関連する配列を調べていくと、最近特 定された、2種のヒト初期成長反応(esr17growth respons e )遺伝子EGRI(Sukhxlu、 el II、、 Ce1l、 53 :37−43 (19811))とPCR2(lostph、cl Il、、P roc、N5j1. Ac1d。
のアミノ酸配列との間に51%の類似性のあることが明らかになった。初期成長 反応遺伝子は、細胞増殖を制御する経路にも関わりでいるらしいことが示唆され ている。WT33の個々のジンク・フィンガーは、ジンク・フィンガー共通配列 に従って配列しており、また、第5図のように、EGRI及びPCR2のジンク ・フィンガーと比較される。WT33ポリペプチドは、TFIII^及びSpl を含む他の蛋白のジンク・フィンガーにたいして相同性を有しているが、その相 同の程度は、EGRI及びPCR2にたいしてもつとも高く、シかも、その相同 性は、3個の相接触するジンク・フィンガー全てにわたって観察された。
ジンク・フィンガー領域の5′ アミノ末端のアミノ酸の内容も、転写因子と考 えられる蛋白質独特のものである。アミノ末端から、最初のジンク・フィンガー の起始部まで、高濃度のセリン(10,2%)、プロリン(9,8%)、グリシ ン(9,7%)、スレオニン(8,8%)、グルタミン(7,9%)の諸残基が 存在する。これらのアミノ酸は、EGRI及びEGII2によってコードされる ポリペプチドのアミノ腋末端にも高頻度で見られる。
プロリン及びグルタミン富裕領域は、数種の疑転写因子及び転写因子においても 特色として特定されている。Milcbell xndTiian、5cien ce、245+371−378 (1989) oまた、高濃度のスレオニン及 びセリンが、Splを含む数種の転写因子にも観察されている。Cou+e7.  et at、、 Ce1l、55:887−898 (1911B)。
前述のように単離したcDN^DNAンと、1lp13におけるゲノムDNA配 列との関係についても、探査の目を向けた。これは、実施例に詳細に記述した通 りである。簡単に言うと、WT33cDN^セグメントを、ヒト2倍体細胞系由 来のゲノムDNAにハイブリダイズさせ、かつ、1団の体細胞7%イブリッドに ハイブリダイズさせた。これにより、11p13内における微細な構造マツピン グが得られた(表)。第6A図に示したように、WT33cDN^は、正常ヒト DNAの7個のEco旧フラグメントとハイブリダイズする。それぞれ長さは、  13.5. 10.4. 6.1. 5.7゜3.7.3.1及び1.85k bである。体細胞ノーイブリッドの分析によって、これら制限フラグメントのす べてが、染色体11のバンド])13に位置することが確認された。さらに、こ れらのDNA配列は、WiT−H細胞系およびこの系由来の/’tイブリッドか ら、すべてホモ接合的に欠失している(第6B図、および、未発表データ)。
この領域内部におけるゲノムDNAの構造をさらに分析するために、WT33を プローブとして用い、他のニスミドDNAクローンを単離した。第7図は、この 分析によって得た4個のコスミド(L156. Li5Q、 Li2Q、Li2 S−1)に加えて2個の最初のコスミド(]8−3及び月0−15) 、および 、ファージ・クローンλk13の複合マツプを示す。Glgset、 T、著、 ヒト11番目染色体の微細構造と進化、理学博士論文、マサチューセッツ工科大 学、ケンブリッジ、マサチューセッツ州(1988)。クローンされたゲノム配 列は、90kbより長いDNAセグメントに広がっていた。ゲノムクローンとc DNAクローンとを関係づけるために、各コスミドのEcoR1消化物を、WT 33 cDNAセグメントとハイブリダイズさせた。このようにして、ゲノムD NAにたいするcDNAのサザーン・ハイブリダイゼーションによって観察され た7個のEcoRIフラグメントのすべてが、この重複クローン集合中に特定さ れた(第7図)。転写単位の方向性は、各コスミドの制限消化物を、WT33  cDNAの各種部分領域由来のプローブとハイブリダイズさせることによって確 定した(実施例参照)。これらのデータから、WT31の転写単位は、コスミド L156のNo11部位近接位置から始まり、3°方向に続いて、1.85kb EcoR1フラグメントまで延びていることが示される。このフラグメントは、 コスミドL109. L155−1. 110−15. 18−3およびクロー ンλk13に共通である。これらのハイブリダイズするEcoR1フラグメント は約50 kbにわたった。WT33 cDNAは、完全長ではないので(上記 参照)、全遺伝子のサイズは、50kbよりも大きいであろう。
クローンしたゲノムDNA中の制限酵素認識部位の分析によって、同領域のパル ス式フィールド・ゲル電気泳動マツプとの直接比較が可能である。第7図に示し たように、WT33 cDNAの5°末端をコードする、ゲノムDNAセグメン トの5°末端は、制限酵素Not Iの認識部位を含んでいる。パルス式フィー ルド・ゲルマツピングによって、11p13ウイルムス腫瘍遺伝子は、2個の隣 接するNot lフラグメントの境界内に位置することが証明された。このフラ グメントの長さは、500kbと325kbである。Ski l及びNot 1 両方によって消化されたゲノムDNAのハイブリダイゼーションの結果から、コ スミドL156におけるNet 1部位は、325kbと500kbのMal  l制限フラグメント間の接合部を表わすことが確認された。パルス式フィールド ・ゲル分析によって、500kb Not lフラグメントは、325kbNo t 1よりも動原体よりであることが分かっているから、転写は、動原体から末 端小粒の方向に向かって進行するに違いない。
コスミドL156は、いくつかの制限酵素にたいして、ジヌクレオチドCpGを 含む認識配列を備えた部位を持つ。この制限酵素としては、Not l、 Bs 5HIf及びE*11がある。上記データ及びパルス式フィールド・ゲル分析か ら、Not 1部位を取り囲むゲノムDNA領域にrHTF島(isl*ad)  Jのあることが明らかになった。HTF島は、転写単位の5°末端によく見ら れる。
Bird、^、、sl If、、C!ll、40:91−99 (1985);  Bind、A、、Ntlure。
321:209−213 (1986); Lindss7. S、、!l t l、、Nsj++re、327:336 (1987)、これから、コスミ゛ド L156のゲノムDNAは、W丁33転写単位の5°末端を含んでいる可能性が あることが示唆゛された。
WT33転写部分(2)の大きさ、組織分布についても評価した。
これは、一連のノーザン・プロット実験によって行なった。第8A図は、ヒヒの 各種組織から単離した全細胞性RNAにたいするWT33 CDNAのハイブリ ダイゼーションを示す。約3kb長のa+RN八種がへヒヒの腎臓、膵臓RNA 中に検出された。3kbのかすかなハイブリダイゼーション・バンドが、長く露 光すると、心臓に認められた(第8B図)。一方、筋、肝臓、空腸、回腸及び脳 由来のRNAには、検出可能なハイブリダイゼーションは認められなかった(第 8A図)。WT33は、マウス組織由来のRNAとのハイブリダイゼーションに おいても、有効なプローブである。WT33と相同な3kb dNA種も、マウ ス組織内に認められた。WT33と相同な3kb dN人種は、マウス腎臓に観 察される(第8B図)。成熟マウスにおける、WT33 mRN^の組織特異性 発現パターンは、ヒヒのものと似ている。マウスにおける発生研究から、WT  33 dNAは、胎児腎臓にもっとも高度に発現することが判明した。この発現 は、ウィルムス腫瘍の起源組織と考えられている、後腎芽体における成長調節に あづかる遺伝子と一致する。Bove、@l tl、、(1976) 1bid 、EGRI及びEGR2遺伝子と相同性であるという所見からも、WT33が、 腎芽細胞の成長調節にあづかっていることが示唆される。
下記のものを含む腫瘍細胞系スペクトラムは、WT33 cDNAにたいして検 出可能なハイブリダイゼーションを°示さなかった。
すなわち、神経芽細胞腫の2種(SK−N−Bs (2)及びNGP) 、網膜 芽細胞腫(VERI)、乳癌(MCF7) 、−骨肉腫の2種(HOS及び02 05)、黒色腫の2種(SK−MEL−130及びSK−MEL−147) 、 膀胱癌(Ei)、結腸癌の2種(SE48G及びWIDR) 、子宮頚癌(Ht Ls)及びEpsjein−Bsrrウィルス形質転換B細胞系の2種(TSH −1及びTS)I−2)である。対照的に、いくつかの散発性ウィルムス腫瘍か ら単離したRNAでは、3kb位置に、WT33 cDNAにたいして強度のハ イブリダイゼーションが認められた。1例を、第8C図に示す。
同様に、2種の造血細胞系、すなわち、浄血白血病(K562)と急性リンパ性 白血病(CEM )から単離したRNAも、3kb位置に、WT33にたいする 強いハイブリダイゼーションを呈した。
この結果から、腎臓細胞や、造血細胞系株の一部にWT33転写部分の発現が証 明された。この結果は、ヒヒの腎臓及び膵臓で主に観察された組織特異的発現と 一致する。
かくして、前記の方法を用いて、ウィルムス腫瘍遺伝子に対応するDNAが特定 され、単離され、配列決定された。このDNAは、約50kbの広がりを持ち、 長さ約3kbのdN^をコードする転写単位をコードしていることが判明した。
このmRNAは、ごく限られた範囲の細胞型にしか発現されない。すなわち、主 に、腎臓、造血細胞の一部である。この遺伝子座によってコードされるポリペプ チドは、転写の調節にあづかっている可能性を示唆するいくつかの特性を有する 。この特性の中には、4個のジンク・フィンガー領域の存在、プロリン及びグル タミン富裕領域の存在も含まれる。予測されるポリペプチドのアミノ酸配列から 、2種の、は乳類成長調節ポリペプチド、EGRI、EGR2にたいする目立っ た相同性が明らかにされた。この遺伝子の遺伝学的位置、組織特異的発現及びそ の配列から予測される機能は、この遺伝子が、11p13ウイルムス腫瘍遺伝子 であることを示す。
ウィルムス腫瘍遺伝子の単離と特徴付けの結果、ウィルムス腫瘍遺伝子または、 ウィルムス腫瘍遺伝子の代表的な部分に関してサンプルを分析する方法が、この 方法に有効な試薬(例えば、核酸プローブ、抗体)と同様に利用できるようにな った。
この方法は、診断目的にも用いることができる。例えば、WAGR症候群、およ び/またはウィルムス腫瘍発症の可能性・危険度を推定する場合、WAGRまた はウィルムス腫瘍と関連する、または、おそらくその兆候である症状を呈する個 人について、その病気の有無を決める場合、などである。例えば、ある個人から 得た細胞を、既知の技法を用いて、第3図に示したヌクレオチド配列の全部もし くは一部をプローブとして調べることができる。このようなプローブのヌクレオ チド配列は、第3図のものと厳密に同じである必要はない。第3図の配列と、用 いた条件下でウィルムス腫瘍遺伝子とハイブリダイズするのに十分な類似性を持 っていればよい。細胞(例えば、血液、腎臓)は、出生前でも出生後に入手した ものでもよい。ウィルムス腫瘍遺伝子の存在は推測できる。細胞は、ウィルムス 腫瘍DNAや、コードされたRNA転写部分および/またはウィルムス腫瘍遺伝 子によってコードされたポリペプチドに関して分析することができる。例えば、 細胞を、出生前、または出生後に入手して、分析し、ウィルムス腫瘍DNAに関 して分析することができる。
これは、普通のプロット法(例えば、サザーン・プロット法)や、ウィルムス腫 瘍のすべて、または、一部とハイブリダイズする(と相補的な)、放射性ラベル したDNAプローブを用いて、実行できる。放射性ラベルしたDNAプローブは 、ハイブリダイゼーションを起こすのに適当な条件下で、その細胞DNAを、相 補的DNAとハイブリダイズできるように処理した細胞DNAと結合させること ができる。サンプル中の標識DNAプローブと相補的DNA (もしあれば)と がハイブリダイズし、標識DNAプローブ/サンプルDNA複合体を形成するの に十分な時間を経過させた後、既知の方法を用いて(例えば、オートラジオグラ フィー)、標識DNAプローブ/サンプルDNA複合体の検出を実行する。標識 は、検出することができ、その存在が、プローブDNAが相補的DNAと結合す る能力に干渉しないものである限りどんな物質でもよい(例えば、蛍光物質)。
標識DNAプローブ/サンプルDNA複合体を検出する方法は、用いる標識の型 に依存する(例えば、蛍光発光団を用いる場合には、蛍光検出法を用いる)。必 要なら、サンプルから入手したDNAを増幅することもできる。これには、ポリ メラーゼ連鎖反応のような既知の技法を用い、この増幅したDNAを、ウィルム ス腫瘍DNAの有無の分析に供する。たとえサンプルDNAが増幅されても、生 成物は、対象の増幅DNA(ウィルムス腫瘍DNAを含むDNA)と、対象のD NA以外の増幅DNAを含む、増幅混合体である。一般に、増幅混合体中のDN Aは、既知の技法を用いて、大きさに基づいて分離される。化学的な検出方法も 用いられる。分離された増幅DNAは、既知の技法を用いて、対象DNAについ て分析する。既知の技法とは、例えば、サザーン・プロット法、DNA配列決定 、適当な制限エンドヌクレアーゼによる消化または臭化エチジウム染色ゲルによ る可視化等である。
また、プローブとして、ウィルムス腫瘍遺伝子の全部、または、一部を用いて、 サンプル中のmRNAを検出することができる。この方法は、ある個人の細胞か ら得たmRNAを用いても、または、細胞から得たmRNAを既知の増幅法、例 えば、RNAPCR等によって増幅して用いてもよい。いずれの場合にしろ、R NAは、既知の技法、例えば、ノーザン・プロット法を用いて分析される。
ウィルムス腫瘍遺伝子コードポリペプチド(または、あるポリペプチド部分)に たいして特異的なW体も、診断目的に使用することができる。このような抗体は 、既知の方法で生産することができる。Msiis目$、T、ら、「分子クロー ン法、実験室操作法J 、Co1d SpringHsrbor (1982)  o本実施態様においては、ウィルムス腫瘍遺伝子゛によってコ・−ドされるポ リペプチド(例えば、第3図の配列のすべて、もしくは、一部、または、それと 機能的に等価のものによってコードされるもの)にたいして特異的な抗体を、あ る個人から得たサンプル(例えば、腎臓細胞、血液細胞)と混合する。使用した 抗体は、検出できるように標識できる(例えば、放射性物質または蛍光物質で) 。標本中のポリペプチドおよび抗体が、合体あるいは結合し、ウィルムス腫瘍遺 伝子によってコードされたポリペプチド/特異的抗体複合体が形成するのに十分 な時間を経過させた後、複合体の存在(有無、および・または量)を、既知の技 法を用いて決定する。もし標識した特異的抗体を用いたのであれば、標識複合体 の存在を決定する(例えば、オートラジオグラフィー、蛍光検出法によって)。
または、サンプルを、固相の支持体(例えば、ニトロセルロース、ガラス・スラ イド、ポリスチレン・ビーズ、免疫磁性体ビーズ)と混合させてもよい。この支 持体には、複合体中に存在する抗体にたいして特異的な抗体を付しておく。これ により、サンプル中の(例えば、ポリペプチド/特異的抗体複合体中の)特異的 抗体が、固相の支持体に結合する。
このようにして得られた固相支持体結合複合体をサンプルから°取り出し、既知 の技法を用いて検出する。例えば、ウィルムス腫瘍遺伝子にコードされたポリペ プチド・特異的抗体複合体中の抗体が標識されているならば、支持体結合複合体 の検出は、その標識を検出することによって実行される。
前記のプローブ(例えば、DNAプローブ、allllAプローブ及び抗体プロ ーブ)を用いて、個人個人のウィルムス腫瘍遺伝子の違いを決定することができ る。この違いは、当該遺伝子における、前述した欠失または置換である場合もあ る。この遺伝子について、観測するのに好都合な部分と言えば、ジンク・フィン ガー領域をコードする部分、もしくは、その発現産物、好ましくは、ジンク・フ ィンガー領域の少なくとも一部をコードするヌクレオチドであり、抗体プローブ は、当該残基そのものとの親和性を検出する。前述したように、プローブは、第 3図に示した遺伝子全体、または、その一部に対するものである。この技術分野 でよく知られているように、このような部分は、少なくとも、約20ヌクレオチ ド長でなければならない。ある好ましい実施態様では、あるプローブは、PCR のプライマーのうち少なくとも一つとして、DNAもしくはmRNAを調べるこ とによりてその遺伝子の中の欠失または変更を決定するのに役立つ。本開示に基 づく技法から明かな通りである。ある機能的な部分に、このような欠失または変 更のあることを検出したことは、癌性または前癌性状態の存在を示唆する。上記 プローブは、ヒト由来の細胞、液体を調べることができる。例えば、ヒトから、 あらかじめ定めた細胞または液体サンプルを取り、プローブを、その細胞または 液体サンプルに加え、プローブから、ウィルムス腫瘍遺伝子の機能的部分に変更 または欠失があるかどうかを確かめる。そのような変更または欠失は、癌性もし くは前癌性状態の存在を示す。標準的な技法、例えば、サザーン・プロット法、 ノーザン・プロット法、PCR,ELIS^、イムノアッセイを、この確定に用 いることができる。
本法は、WAGR及びウィルムス腫瘍の早期発見に有効である。
結果として、外科、化学療法、および/または放射線療法という形での早期治療 が可能になる。例えば、本法は、腹部に成長する塊、腹痛、血尿、または、ウィ ルムス腫瘍を疑わせる身体的症状(例えば、発熱、おう吐、食欲不振、不快、赤 血球増加症、高血圧)を有する患者において、上記状態を診断するのに用いるこ とができる。
ウィルムス腫瘍遺伝子を検出する本法は、また、他の腫瘍型において、ウィルム ス腫瘍の場合と同一のまたは相似の障害を特定するのにも用いることができる。
すなわち、ある特定の型の腫瘍の形成に直接あづかったり、または、その唯一の 原因であるということはないにしても、ウィルムス腫瘍遺伝子(すなわち、本明 細書中で、ウィルムス腫瘍遺伝子と呼ぶDNA配列)または、それと緊密な関連 を持つ遺伝子が他の腫瘍型(例えば、白血病細胞、畢丸腫瘍)に発現すること、 および、そのような遺伝子が、それらの腫瘍型と因果的に結びついていたり、ま たは、そのような腫瘍型の、信頼度の高い指標(マーカー)として役立つことを 期待するのは当然だからである。従って、本法、および、適当な試薬、例えば、 ここに記載したコスミド・クローンやウィルムス腫瘍遺伝子自体のDNA配列等 を用いて、他の腫瘍型においても、染色体11バンド13における同様の障害を 特定することができる。ここに記載したDNA配列を用いて、ある腫瘍サンプル について(例えば、白血病細胞、畢丸腫瘍)、既知の技法やここに記載した方法 を用いて、変化した11p13配列を特定することができる。
このポリペプチドまたは、その免疫活性部分を、治療的または診断的目的のため に用いることができる。
例えば、ウィルムス腫瘍遺伝子cDNA配列を、好ましくは、第3図に示した配 列、または、ATG開始配列を含む、それと機能的に等価のもの、cDN^配列 から下流の3′方向のポリアデニル化配列、さらにできれば複製開始部を含むベ クターを用いて、細胞にトランスフェクトすることができる。ベクターにはまた 、サプレッサー遺伝子の発現を促進するためにプロモーターを含ませる。ベクタ ーで用いるプロモーターは、既知のプロモーターのいずれであってもよく、その 選択は、使用したい宿主細胞によって支配される。すなわち、この細胞は、所期 の生成物の発現を可能にするように選ばれたものである。レトロウィルスプロモ ーターが好ましい。そのようなプロモーターとして、^ky、 5L3−3及び フレンド・ウィルスのようなレトロウィルスプロモーターが挙げられる。ベクタ ーは、好ましくは、エンハンサ−を含むものがよい。そのようなエンハンサ−は 本技術分野で既知であり、例えば、ウィルス性エンハンサ−がある。
さらに好ましくは、組織特異性のエンハンサーを含むことが望ましい。ベクター は、さらに、マーカー遺伝子を含むものが好ましい。それによって、形質転換細 胞検出が容易になるからである。そのようなマーカーは、この技術分野において はよく知られており、抗生物質耐性遺伝子を含んでもよい。例えば、細菌性ネオ マイシン耐性遺伝子が挙げられるが、これは、真核細胞において、抗生物質64 1gにたいして、優勢な、選択可能な耐性を付与する。
異なる細胞系は、トランスフェクトされたサプレッサー遺伝子DNAを取り込み 、適当なプロモーターを用いて発現するにあたって、その能力はまちまちである が、広範な宿主細胞を使用することができる。例えば、NIH3T3. CIO ,CO3,5F−9(^TCCNo、 CRL 1711)及び5F−21が好 ましい。普通、は乳類細胞が好ましいが、本発明の細胞系は、それだけに限られ るものではない。例えば、大腸菌のような細菌細胞を用いることもできる(実施 例参照)。
細胞系を形質転換させるのに、ベクターを用いることができる。例えば、この技 術分野でよく知られた様々の方法を用いて、psi/2 (エコトロピック、  ecolropic ) 、psiAM (アンホトロピック、 xmphol +opic )細胞系に導入することによる。好ましい方法としては、燐酸カル シウム共沈澱法があり、これについてはWigler、el !+、、 Ce具  16:777−785 (1979)を参照されたい。上記細胞系は、ベクタ ー由来のゲノムを含む、感染性、複製欠損、マウス白血病ウィルスを構成的に生 産する。Cone、elI+、、 PNAS 81:6349−6353 (1 984); Mxnn、 et xl、、Ce具 U;153−159 (19 83) トランスフェクションの二日後、マーカー、すなわち、抗生物質耐性遺 伝子を調べることによって、細胞を選択することができる。また、ベクターもこ の遺伝子を含んでいることが好ましい。抗生物質耐性クローン、例えば、G41 8は、短期間に、通常7−10日で、明らかになる。
抗生物質耐性クローン、pii/2. pci/AMを単離し、大量のサプレッ サー遺伝子産物を生産するクローンを選び出す。次に、この細胞を、標準培養液 で培養し、必要に応じて、収穫する。
次に、この細胞の生産するタンパク質を用いて、サプレッサー遺伝子産物(蛋白 質)にたいする抗体を生成する。得られた抗体は、意図する特定の応用に従って 、ポリクロナールでも、モノクロナールでもよい。このような抗体は、当業者に よく知られた技法を用いて調製することができる。例えば、蛋白質、または、そ の蛋白質の抗原性部分を、カサガイのヘモシアニン(K L H)に結合させ、 ウサギのような動物の中で抗体を生成させることができる。通常、抗体を生成す るには、ペプチド−KLHの複合体を、約2カ月に渡って、数回注入する。次に 、標準法を用いて、抗体を、血清から収集する。また、別のやり方として、細胞 内に、モノクロナール抗体を生産させることもできる。すなわち、細胞に、ハイ ブリドーマ細胞を形成するのに用いられる標準融合法によって、その蛋白にたい する抗体を生産させることもできる。(Kohle+、 G、、el 11.、  Nslwre 256:495 (1975L引用によって、この内容に含め ることにする)。
通常、この方法では、抗体産生細胞と、恒久細胞系、例えば、ミエローマ細胞と を融合させ、ハイブリッド細胞を作る。また別のやり方として、Ho5e他の方 法を用いてモノクロナール抗体を、細胞から生産することもできる(H■e、  el if、、 5cience246:1275 (1989)、引用によっ て、この内容に含めることにする)。
例えば、ハイブリドーマは、サプレッサー遺伝子含有ベクターによって形質転換 した生細胞で、マウスを免疫することで生産することができるが、これは、この サプレッサー遺伝子産物を発現する。例えば、蛋白質全長を免疫原として用い、 その蛋白質全長に渡る特異性を持つ一群のモノクロナール抗体を生産することも 可能である。好ましくは、抗体をプローブとして作成する場合には、転写領域の いずれかのような遺伝子配列、例えば、ジンク・フィンガー領域のいずれかのよ うな遺伝子配列及び欠陥蛋白を示すと思われるポリペプチドの免疫原部分を用い るのがよい。できれば、この領域のシスティン残基のどれかの欠失または変化を 検出できる抗体を生産することが好ましい。
免疫原ペプチドは、少なくとも、8アミノ酸長でなければならない。実施例に示 したウィルムス腫瘍融合蛋白を用いて、標準法により、抗体を生産することがで きる。
宿主細胞の、十分な数の生細胞で、腹腔(1,P、)注入によりマウスを免疫す ることができる。この宿主細胞は、サプレッサー遺伝子ベクターでトランスフェ クトされることになっている。この腹腔注入の直後に、例えば、水に溶かしたサ イクロホスファミドの腹腔注射を行なってもよい。このサイクロホスファミド投 与は、第1回注入後1日か2日に繰り返す。免疫化の約2週間後、マウスに、形 質転換宿主細胞の十分量を注入し、さらに2週間、間をおく。そこで、全工程を もう一度繰り返す。
第2回の形質転換細胞注入後4日目に、動物を層殺し、第1回の融合用に、その 膵臓を入手する。
ハイブリドーマは、例えば、下記のような通常の方法を用いて、細胞を融合する ことによって生産される。すなわち、5P210 ミエローマ細胞で免疫したマ ウスから、ポリエチレン・グリコール(PEG)法によって生産することができ る。細胞は、免疫マウスから無菌的に取り出し、膵臓細胞の単一細胞懸濁を、腎 臓を血清非含有培養液(例えば、DME)で潅流して入手する。膵臓細胞とミエ ローマ細胞を一緒に、例えば、膵臓細胞対ミエローマ細胞が5対1の比率で混合 する。次に、細胞を遠心し、上清を吸引で除去する。次に、細胞を標準法を用い て培養液中で増殖させる。ハイブリドーマは、融合操作の後増殖するが、次に、 抗ヒト・サプレッサー産物抗体の分泌について、スクリーニングを行なう。これ には、細胞の溶解産物にELISA法を用いる。陽性の結果を呈したハイブリド ーマは、限界希釈によって希釈し、クローンする。これは、細胞と、それに由来 する抗体が、本当に、モノクロナールであることを確実にするためである。ヒト ・サプレッサー遺伝子産物にたいする抗体の存在がテストの結果陽性であったハ イブリドーマ・コロニーを、培養液中で、例えば、1ml当り5ハイブリドーマ 細胞の濃度となるように希釈する。一旦、コロニーが成長したら、再び、その上 清について、ヒト拳サプレッサー遺伝子産物にたいする抗体の有無についてテス トする。もし、ELISAアッセイでテストして見て、その結果が陽性であるな らば、そのコロニーを再び限界希釈でクローンする。
ここに得られた抗体は、前述したアッセイ法のプローブとして用いることができ る。このような抗体プローブは、得られる蛋白産物に影響するサプレッサー遺伝 子の変化、欠失にたいして特に感受性が高い。したがって、この抗体プローブは 、遺伝子の欠失ないし変化が、機能単位に影響を及ぼしているかどうかを調べる 場合、簡単で、能率的な手段となる。抗体プローブを用いることによって、発現 蛋白質のレベルや、発現に変化があるかどうか、についても確定することができ る。結果を、サンプリングした材料の基礎レベル、例えば、血中のサプレッサー 遺伝子産物のレベルと対照させて比較したり、あるいは、ある個体の試験細胞( あらかじめ選んだ細胞)を、同一個体のもので、悪性のものでないと思われる、 別の細胞と比較する。もし変化があれば(例えば、変化した電気泳動度を持った 反応蛋白質が無ければ)、試験細胞は、悪性であることを示す。さらに、同一個 体から、様々な時間に細胞サンプルを採取して、それを比較のレベルとすること もできる。これは、ヌクレオチド−プローブについても実行することができる。
本発明に基づいて、抗体、またはプローブの混合体、例えば、抗体プローブ(複 数)を検出のために用いることができる。プローブ、例えば、抗体を、直接リポ ータ−でラベルしたり、従来の方法を用いて、特異的な結合ペアの片割れ(メン バー)を用いて間接的にラベルすることもできる。
特異的な結合ペアは、免疫型でも非免疫型でもよい。免疫性特異的結合ペアにつ いては、ハプテン/抗ハブテン系の抗原抗体システムが例示される。これには、 フルオレセイン/抗フルオレセイン、ジニトロフェニル/抗ジニトロフェニル、 ビオチン/抗ビオチン、ペプチド/抗ペプチド等が含まれる。特異的結合ペアの 抗体メンバーは、その技術分野に熟練した人々にはよく知られている通例の方法 をもちいて生産することができる。
このような方法は特異的結合ペアの抗原メンバーで動物を免疫化することを含む 。もし特異的結合ペアの抗原メンバーが、免疫性のものでなかったら、例えば、 ノ\ブテンだとしたら、キャリアー蛋白に共有的に結合させて、免疫性にするこ とができる。
非免疫性結合ベアには、二つの成分が、互いに自然の親和性を有し、抗体ではな い、システムが含まれる。非免疫性ペアの例としては、ビオチン−ストレプトア ビジン、内在因子−ビタミンB129葉酸−葉酸結合蛋白質、等がある。
抗体を、特異的結合ペアのメンバーで共有結合的にラベルする方法は様々ある。
方法は、特異的結合ペアのメンバーの性質、望ましい結合型、抗体の、各種結合 化学作用にたいする許容度に基づいて選ぶ。ビオチンは、市販されている活性誘 導体を用いて抗体に共有結合的に結合させることができる。この内のいくつかを 挙げると、蛋白質のアミン基に結合するビオチン−N−ヒドロキシスクシンイミ ド;炭水化物部分、アルデヒド及びカルボキシル基にカルボジイミド結合を介し て結合するビオチンヒドラジド;スルフヒドリル基に結合するビオチンマレイミ ドとヨードアセチルビオチンがある。フルオレセインは、フルオレセインイソチ オシアネートを用いて、蛋白質のアミン基に結合させることができる。ジニトロ フェニル基は、2.4−ジニトロベンゼンサルフェートまたは2.4−ジニトロ フルオロベンゼンを用いて、蛋白質のアミン基に結合させることができる。他の 標準的な結合法を用いて、特異的結合ペアの片割れに、モノクロナール抗体を結 合させることができる。この結合法には、ジアルデヒド、カルボジイミド結合、 同種官能性架橋結合、及び異種二官能性架橋結合が含まれる。カルボジイミド結 合は、ある物質上のカルボキシル基を、もう一つの物質のアミン基に結合させる 有効な方法である。カルボディミド結合は、市販の試薬1−エチル−3−(ジメ チルアミノプロピル)−カルボジイミド(EDAC)を用いると容易である。
同種二官能性架橋結合物質(クロスリンカ−)は、二官能性イミドエステル及び 二官能性トヒドロキシスクシンイミドエステルを含めて、市販されており、ある 物質上のアミン基を、別の物質のアミン基に結合させるのに用いられる。異種二 官能性架橋結合物質は、異なる官能基を育する試薬である。もつともi平凡な市 販の異種二官能性架橋結合物質は、1官能基にアミン反応性のN−ヒドロキシス クシンイミドエステルを有し、第2の官能基として、スルフヒドリル反応性基を 有する。もつとも平凡なスルフヒドリル反応性基は、マレイン酸イミド、ピリジ ルジスルフィド、活性ハロゲンである。官能基の一つとして、光活性アリール・ ナイトレンがある。これは照射されると、いろいろな基と反応する。
検出できるように標識したプローブ、例えば、抗体、検出できるように標識した 抗体、あるいは、特異的結合ペアの、検出できるように標識したメンバーを、レ ポーターに結合させる。
レポーターは、放射性同位元素でも、酵素でも、蛍光性、化学発光性または電気 化学物質であってもよい。通常用いられる二つの放射性同位元素は、I、Hであ る。標準的な、放射性同位元素標識法には、クロラミンT、ラクトパーオキシダ ーゼと、 ■にはBollon−Hunle+法、3Hにはメチル化還元がある 。
本発明に用いるのが適当な酵素としては、次のものがあるが、それに限定される ものではない。西洋ワサビ・パーオキシダーゼ、アルカリ性ホスファターゼ、β −ガラクトシダーゼ、グルコースオキシダーゼ、ルシフェラーゼ、β−ラクタマ ーゼ、ウレアーゼ及びリゾチーム。酵素標識は、ジアルデヒド、カルボジイミド 結合、また、抗体の特異的結合ペアの片割れへの結合に関して記載したように、 同種二官能性架橋結合物質、異種二官能性架橋結合物質を用いることによって促 進される。
選ぶ標識法は、酵素に付属する官能基、標識の対象となる物質、および、その両 方の結合条件にたいする許容能力による。
本発明に用いられる標識法は、下記のものを含む、最近よく用いられる方法の内 のどれかであってよいが、それらのみに限定されるものではない。すなわち、E ngvsll xnd Petrl+unn。
Immonoassa7 4 (3) :209−327 (1983)及びJ gblonski、 Al11l。
Biochem、 148:199 (1985) らの記載した方法である。
標識は、例えば、スペーサーや、特異的結合ペアの他の片割れを用いるような間 接法によって行なってもよい。この1例として、ビオチン化した抗体を、無標識 のストレプトアビジン及びビオチン化酵素で検出するやり方がある。この場合、 ストレプトアビジンとビオチン化酵素は、順番に加えたり、同時に加えたりする 。したがって、本発明では、検出に用いられる抗体は、直接レポーターで、検出 できるように標識されたものでもよいし、特異的結合ペアの第一メンバーで間接 的に検出できるように標識されたものでもよい。抗体が、ある特異的結合ペアの 第1メンバーに結合している場合は、検出は、抗体と特異的結合第1メンバーの 複合体を、前述したように、標識または無標識の特異的結合ペアの第2メンバー と反応させて行なわれる。
さらに、無標識検出用抗体は、この無標識抗体にたいして特異的な、標識抗体と 、無標識抗体を反応させて、検出することができる。このような抗−抗体は、前 述した方法のどれかを用いて、直接または間接に標識することができる。例えば 、抗−抗体は、ビオチンに結合させることができるが、これは、前述したストレ プトアビジン−西洋ワサビ・パーオキシダーゼ系と反応させることによって、検 出することができる。
ある好ましい実施態様として、ビオチンを利用するものがある。ビオチン化抗体 を、次に、ストレプトアビジン−西洋ワサビ・パーオキシダーゼ複合体と反応さ せる。オルトフェニレンジアミン、4−クロロナフトールまたはテトラメチルベ ンジジン(TMB)を用いて、呈色性検出を行なうことができる。
本発明を実行するにあたって、望ましいイムノアッセイ方式は、フォワードサン ドウィッチ・アッセイであって、この方式においては、捕捉試薬は、通例の技法 を用いて、支持体表面に固定させる。
アッセイに用いられる適当な支持体には、合成ポリマー支持体が含まれる。例え ば、ポリプロピレン、ポリスチレン、置換ポリスチレン(例えば、アミノ化ポリ スチレン、カルボキシル化ポリスチレン)、ポリアクリルアミド、ポリアミド、 ポリ塩化ビニル等、ガラス・ビーズ、アガロース、ニトロセルロース等、がある 。
。前述したように、癌性状態、前癌性状態に侵されている人を、好ましくは、上 記プローブで診断された人を、治療することも可能である。これは、ウィルムス 履瘍サプレッサー遺伝子産物の治療量を供給することによって行なう。これは、 この技術分野で既知の、いくつかの方法によって実施することができる。
遺伝子移送法を用いて、ウィルムス腫瘍遺伝子またはその機能的フラグメントに 一致するヌクレオチド配列を含むベクターを調製し、そのようなベクターを用い て、悪性細胞を形質転換してもよい。ベクターは、好ましくは、Brownと5 coffが記載したようなレトロウィルスベクターがよい。Brown ■d  5cot。
in DNA CIoIliB 、wol Ill、 A Pr>clicsl ^ppro1ch、cb、9゜”Rffijrovirsl Vectors″ 、 CRL Press (19B?)。
また、例えば、ウイルムス腫瘍形賀転換細胞系を用いて、機能的ウィルムス腫瘍 遺伝子産物を多量に生産することもできる。
次に、これを、単離・精製し、発熱物質やエンドトキシンをほとんど含まないよ うにする。この遺伝子産物は、好ましくは、少なくとも約90%の純度に、より 好ましくは、少なくとも95%の純度に、さらにより好ましくは、少なくとも9 8%の純度になるように精製する。次に、この精製蛋白を、標準的な製薬法を用 いて、例えば、注入、キャリヤー結合性調剤等によって、悪性細胞に移送される ようにパッケージする。この精製蛋白は、治療的に有効な量を使用する。治療的 に有効な量は、本開示に基づいて、簡単に経験的に決めることができる。
次に、本発明を、下記の実施例を用いてさらに具体的に説明する。
患者細胞系、DG−85−1436,GM4613から、染色体11または転座 染色体を含む、体細胞ハイブリッドを分離した。DG85−1436は、家族性 無虹彩を持つ患者から得た繊維芽細胞系であって、染色体11.22の細胞学的 にはバランスした転座を含む(t(11;22) (913;R12,2))  。Moose、el gl、、hm、Genej、、72: 297−302  (1986)。GM4613は、繊維芽細胞系であり(ヒト突然変異細胞保存施 設(8+101111 Guelic Mul*nl Ctll Re5po@ 1lor7 )、Csmden、ニューシャーシー)、染色体2.11に関わる 、細胞学的にバランスした転座を示す(l (2;11) (pH;p13)) 。これは、ボッター症候群を呈する新生児から得たものである。Power。
In : Normxl snd Abnormsl Dtwzlopmenl  of lbe Kidne7. YearBook MedicII Pub l、、 Cbielgo、IL、、 pp、 3−79.83−123及び25 9−281 (1972)。体細胞ハイブリッドは、先に記載されたようにして 単離された。G15ser、el 11.、 N5lure、321: 282 −887(1986)。これらハイブリッドの染色体11の半数型を、染色体1 1の短腕と長腕の両方に対するDNAプローブを使用して、RFLP分析で確定 した。最初のDGハイブリッドはすべてder (IIL der (22)及 び正常染色体11を保持していた。細胞表面抗原研究によって、あるハイブリッ ドDG−7A−3の小集団は、der (22)染色体しか持たないことが判明 した。der (22)染色体しか持たない2種のハリブリッド、R19−2C ,R19−3Bを、DG−7^−3集団から、細胞表面抗原選択法によって単離 した。これは、11p+5のm5r2表面抗原を保持しているものを選択し、か つ、11p13の転座位置にたいして動原体側にあるMICI表面抗原を排除す るように選択することによった。ボッター患者の場合、der (II) (H G2−5)、 der 2(BY^2−5)、または、正常の染色体11 (B Y 82−31のみを保持するGM46Hハイブリッドが、PFLP分析によっ て特定された。
患者HVは、家族性無虹彩を持っており、これは、染色体11および41(4;  11) (q22; p13)に関わる細胞学的にバラン・マウスハイブリッ ドR195は、der (11)染色体を含み、Hvハイブリッド、L)IV− 1^5は、der (4)染色体を含む。WAGR患者、JH,MHlNWから 得たハイブリッドについては既に記載された。Glxter、 el ml、、  Nature、321:882−887(1986)。ウィルムス腫瘍患者D Rから得たヒト・マウスハイブリッド15.14ハイブリツドは、1Ip13− p12という介在欠失を持つが(7arleau。
el ml、、Hum、 Genel、、67:455−456 (1986)  ) 、その特性は既に明らかにされている。この細胞系のゲノムDNAは、C 1*udineInnien (INSERM 、パリ)によって恵与された。
細胞系株WiT−13は、古典的三相組織構造を有する段階111のウィルムス 腫瘍の異種間移植培養から得た。腫瘍は、その他の点では健康な2才の女児に散 発的に発生したものである。Levis、 ej xi、。
高分子量DNAを、11・11ハイブリツドから調製した。このハイブリッドは 、チャイニーズ・ハムスター・ヒト体細胞ハイブリッドで、ヒト染色体11の短 腕しか有していない。
Kgo、st al、、Proc、 N11l、 Actd、 Sci、 US A、 73: 193−197(1976)。このDNAを用いて、ベクターp JB8 (lsh−Horovm。
el al、、Nucl、 Ac1d、 Rei 、、 9: 2989−29 98(1981))及びpWels中のコスミド・ライブラリーを、Eマ1nl とLhlの方法に従って構築した。Evins、el xl、、1Jejhod t in Entya、、152:604−610(19871,DNAは制限 酵素Mbo Iで部分的に消化し、5−25%N5CI勾配を用いて、35から 45kbのフラグメントを分離した。このDNAを、ベクターDNAに連結させ 、ファージとしてパックしくGigxpsck Gold、 Str*jxge ne、ラホヤ、カリフォルニア州)、これを、大腸菌株104GまたはDH5に 感染させた。コロニーは、LB−アンピシリン平板に低濃度(150mmプレー ト当り1.000から2.000個)でプレートした。
Msni*jis、ej sl、、Mo1ecolxr Cloning: ^  Lsbotttor7 Msnaxl。
Co1d 5priB Harbor Lsborilor7. Co1d S pring ’fixrbor、NY標準スクリーニング法を実行した。これは 、MIia口$、e【11、、(198211bidの概説した通りである。レ プリカ・フィルターを、ヒト陽性に関してスクリーニングした。そのために、放 Sci、USA、 77:1398−1402(1980))または、Co1t  ヒト反復を多く含むDNA(Sbih、et sl、、 Ce1l、 29: f+16−619 (1982)) とハイブリダイゼーションをさせた。月− 11ライブラリーのコロニーの内約0.5−1%がヒト陽性であることが判明し た。コスミドDNAを、これらヒト陽性コロニーの各々について行なった小規模 の培養から、Mll+目1isらの方法にしたがって単離した。
Mxntxlis、eI!1.、(1982) 1bid 0コスミドのEco RI制限パターンは、標準アガロース・ゲル電気泳動によって分析した。
コスミドのマツピング ヒト染色体lipの定められたセグメントを持つJ1細胞ハイブリッドの、省略 形マツピング・パネルを、11p13におけるヒト・コスミドを速やかに特定す るために用いた。ヒト・コスミドのマツピングは、放射性標識したDNAを、ヒ ト反復列からの信号をできるだけ抑えるために、完全に1本鎖にしたヒトの、E co R1消化DNAのナイロン(z611bind、八MF−Cuno)フィ ルターとハイブリダイズさせて、行なった。
単一コピー配列の単離 単一コピー配列をコスミドから下記のようにサブクローンした。コスミドを、S *u3A lで完全に消化し、生成したフラグメントを、プラスミドpUc19 のBsm IIポリリンカ一部位にサブクローンした。挿入体を含むクローンを 、ニトロセルロース・フィルターにグリッド状に付着させ、単一コピー配列を持 つものを、反復の多い(Co111DNAにたいするハイブリダイゼーシヨンの 欠如で特定した。さらに、ランダムな単一コピー・フラグメントを、低溶解度ア ガロースゲルスライスから分離した放射性標識を有する挿入体を、ヒトとλフア ージDNAのニトロセルロースフィルターにハイブリダイズすることによってテ ストした。プローブ37−1892. 39−3p4は、これらコスミドから特 定された単一コピー配列の中にあったものである。
DNAプローブの起源 ヒトコスミドJ7−18. 38−3. JIG−15は、H−11/pWe1 5 ニアスミドライブラリ−から単離された。さらに4種のコスミド(Li2S 。
Li2Q、L155−1. LiO2)が、ヒト pWe15の全コスミドライ ブラリーから単離された(SjrstBene、ラホヤ(Ls Jolly)、 カリフォルニア州)。これには、プローブとして、WT33 cDNAの1.8 kbのEcoR1フラグメントを用いた。111113にたいする全ゴスミドの 位置決定は、体細胞マツピングによって証明された。ゲノム・プローブ37−1 8p2. 18−3p4は、それぞれ、コスミドJ7−18、J8−3由来のp uct9における、0.5kb、1.3kb長の、単一コピーEco R1/旧 ndlllフラグメントと特定された。ファージに13は、Ga5s−Hsrr is ハイブリッド3^のB>m旧完全消化物から構築したλダッシュ(Str stsgene)ライブラリーから単離された。CATプローブは、cDN^ク ローンpC24の0.6kbGeae1.、 36:245 (1984) 、  F SHBプローブは、pysn−t、 4の205−212 (19B7) 。
サザーン・プロット法 ゲノムDNAの単離と消化、DNAのナイロン膜への移送、放射性標識プローブ のハイブリダイゼーシ確ン、フィルターの洗浄、オートラジオグラフィーは、G 15Ierらの記述に従って行なった。Gl■er、et Il、、(1986 )凹。DNAは、ランダムム・プライマー法にしたがって、32P−adCTP  (New England胎児腎臓、成人腎臓、前B細胞起源のヒトcDNA ライブラリーをスクリーニングした。Msoi暑目1.el 11.、(198 2) 1bid0各ライブラリーをスクリーニングするために、全数106個の ファージを、NXC7Mアガロース・プレートにプレートし、各プレートにつき 2個のレプリカを、ニトロセルロース・フィルターで作成した。5chleic ber及び5cboll。このレプリカ・フィル液、中性化液、2xSCC(I XSCC−0,15M NiC1,0,015Mクエン酸ナトリウム)で、それ ぞれ、5分間処理し、次に、真空オーブン中で、80℃で、2時間乾燥させた。
レプリカ・フィルターは、保存しておいた単一コピー・プローブJll−3p4 または、WTcDNAのサブフラグメントとハイブリダイズさせた。
ノーザン・プロット法 全RNAは、塩化リチウム/尿素法によって単離した。^anrB、el tl 、、Eur、 J、 Biocbem、、107:303−314 (1980 ) o細胞を収穫し、ペレットにし、3M塩化リチウム/6M尿素に再懸濁し、 4℃でホモジエネートした。RNAを沈澱させ、3M塩化リチウム/6M尿素で 洗浄し、沈澱させ、TE/SDS中に再懸濁した。RNAは、フェノールクロロ ホルムで抽出しく2〜3X。
エタノールで沈澱させ、凍結乾燥し、再懸濁、定量後、−20℃で保存した。1 0−20PgのRNAを、1%アガロース37%ホルムアルデヒドRNAゲル上 を移動させ、Gen65cree Plul(New Englxnd Bio lxbs)膜上にプロットした。フィルターを、50%ホルムアミド、5 x  Denbs+dts液、0.5%SDS Cドデシル硫酸ナトリウム)、109 6硫酸デキストラン、0.1%ピクリン酸塩及び100μg/mlサケ***DN Aの溶液中で、42℃で24時間、プレハイブリダイズ及びハイブリダイズした 。プロットは、保存ゲノム・プローブ3g−314,cDNA2−1 (1,5 kb Pst I/Eco R1フラグメント) 、cDNA2−1の0.5k b S。
3IIサブクローン、または、cDNA WT33の1. 8kb I!coR Iフラグメントとハイブリダイズさせた。18−36時間のハイブリダイゼーシ ジン後、プロットは、2xssc、o、t%SDSで30分間室温で2度洗い、 1xssc、 0.1%SOSで、30分間55−60℃で1回から2回洗浄し た。
DNA塩基配列の決定 DNA塩基配列決定は、2重鎖DNAの鋳型を用いるチェーン停止法によって行 なった。Sager、et sl、、Proc、Net、Actd、 Sci、  US^、 74:5463−5467 (1977) 、 WT33 cDN Aの制限フラグメントをpUc19またはBIwesc+ipt(New En llud Biolsbs)でサブクローンした。Bloescripl用の直 接配列決定用プライマーは、New Engl■d Biolsbtから入手し た。このcDNAに相当する、別のオリゴヌクレオチド・プライマー(Rese arch Gc++e目CS。
Hmnlsマ11e、アリシナ州)も、このcDN^配列決定に用いた。
さらに、他のcDNA(WT2. WT4. WT22)の領域についても、配 列を確認した。配列決定反応物は、6%、8%ポリアクリルアミド・ゲルで電気 泳動し、乾燥し、オートラジオグラフィーで調べた。Fist−Pアルゴリズム を用いた。Lips+xn、eIsl、。
5etence 、227:1435−1441 (1985) 。cDNA  W733 (7)予測アミノ酸配列を、国立生物医学研究所(Nalionsl  Biomedicxl Retexrch Fowndstion )の蛋白 同定リソース(ltoteia Idenlilec*目on Rego*rc e ) (NBRF/FIRデータ・ベース)に保存されている蛋白配列と比較 した。
コスミド・ライブラリーは、ハイブリッド細胞系、Jl、−11から構築した。
この系においては、染色体11の短腕が、チャイニーズ・ハムスターをバックグ ラウンドとして、他のヒトゲノムから分離されていた。Kso、el xi、、 (1976) 1bid0 ヒトDNA配列を含む、全数119個のコスミド・ クローンが単離された。そのいずれも染色体11の短腕にマツプされた。WAG R領域内のクローンを特定するために、ヒト染色体11pの各種フラグメントを 含む体細胞ハイブリッドのマツピング・パネルを用いた。Glgser、el  gl、、(1989) 1bid。3個のコスミド、 JT−18、JH−3, JIG−15が、ウィルムス腫瘍遺伝子を含む領域にもっとも近接していること が明らかになった。コスミドJ−8,JIO−15の制限マツプは、かなりの重 複を示した。したがって、単一コピー配列(JT−18p2. JH−3p4  )をサブクローンし、それぞれ、コスミドJ7−18. JH−3から特定した 。
11、p13内における、これら単一コピーDNA配列の微細な位置については 、一連の体細胞ハイブリッドにたいするハイブリダイゼーションによって決定し た。このハイブリッドは、WAGR領域内部に特定の間隔を示す転座、欠失を有 する患者から得たものである。サブクローンJ7−18p2.1g−3p4は、 無虹彩患者DGから得たハイブリッド細胞からのDNAとハイブリダイズさせた 。この患者は、バンド11p13を分断する、細胞学的にはバランスした11  、22転座を持っている。この転座は、この家系において、無虹彩とともに、数 世代受は継がれており、Moore。
el If、、(1986) 1bid、断点での小分子量の欠失と関連する。
Diyis、et 11.、 (1988b) 1bid、; Ge5sler 、rl gl、、 (1989b)皿。プローブJ7−18p2. JH−3p 4と相同的なヒトDNA配列は、細胞系R19−2C,R19−38には存在し ないことが判明した。その細胞系は、派生的(der) (221染色体しか含 んでいなかった。
上記の結果と、この患者から得た線維芽細胞DNA中の正常遺伝子量を考え合わ せると、JT−18p2. JH−3p4は、染色体11のDG転座断点の動原 体側にあることになる。同様の結果が、もう−人、先のとは無関係の患者(HV )で、やはりl 1. p I 3転座(表)を持つものからのハイブリッド細 胞についても得られた。
したがって、両コスミドは、AN2にたいして動原体側に、ウィルムス腫瘍遺伝 子座近傍にマツプされた。
患者ハイブリッドによる11p13プローブのマツピング染色体11 プローブ 表現型 患者ハイブリッド 内容 JT−18p1238−3p4 cDNA無 虹彩 DG R19−2Cder (22)HV R195der[) ND  + +1(V LHV−1^5 der(4)泌尿器 BY )12−3 N1 (11) + + +糸欠陥 BW G2−5 der (11)BY A2− 5 der(2) + + +WAGRJHC/h del (lip14、1 −pH,2) NW F3 del(11p13) −−−MJ A9 del(11p13)  −−−WT DR15,14del(11)P13−p12) ”’ −(体 質性) + WT WiT−13D2 & R87del(11)P△S)+ −−(散発性 ) WiT−13R91tel (11) +1△L)−−−第2の患者(BW )から得た体細胞ハイブリッドからのDNAに、37−18p2をハイブリダイ ズしたものを、37−18p2及びJ8−3p4とハイブリダイズさせた。この 患者は、泌尿器に多発性欠陥(ボッター症候群)と、l(2;11) (pH; pH)転座を持っていた(GM4613. ヒト突然変位細胞保存施設、C*m de++、 ニュー El−り州)。この転座の断点は、泌尿生殖異常の遺伝的 決定要素と思われる部位に特定された。Porleus、 tj sl、、(1 987)凹。両プローブは、del(2)染色体を含む細胞系A2−5にはハイ ブリダイズするが、der(11)染色体を含む細胞系G2−5とはハイブリダ イズしない。したがって、両者は共に、無虹彩転座とボッター転座の両断点間に ある。この間隔は、ウイルムス腫瘍遺伝子を含んでいるのだから、この所見から 、JT−18p2. J8−3p4は、ウィルムス腫瘍遺伝子座の近傍、または 、その内部にあることは明かである。
WAGRおよびウィルムス腫瘍患者(表)の染色体11の欠失の分析から、これ らプローブの、ウイルムス腫瘍遺伝子にたいする位置をより厳密に知ることがで きた。JT−18p2. J8−3p4のいずれも、テストした3個の体質性W AGR欠失(患者JH,MJ。
NW)においては、ヘミ接合的に欠けていた。これは、ウイルムス腫瘍遺伝子座 のごく近傍にある、こ゛れらのDNA配列の位置と一致した。
ウィルムス腫瘍遺伝子座にたいする、37−18p2. 1g−3p4の相対的 位置を、二人のウィルムス腫瘍患者由来の細胞系から得た、DNAにハイブリダ イズさせることにより、さらに研究した。
患者DRは、11p12−p13という体質性欠失を持つ患者であり、Coui llin、ttsl、、(1988) 1bid、この欠失部は、ウイルムス腫 瘍とAN2部位(表)の間で終結している。JT−18p2は、患者DRの欠失 染色体11にあるのに、3g−3114は無い。カタラーゼは、DRに欠けてい るのだから、JT−18p2は、J8−3114にたいして末端小粒側にあるに 違いない。この二つのプローブ間の距離は、340kb未満である。DRデータ から、次のことが判明する。患者WiT−13のウイルムス腫瘍を含むにちがい ない領域の末端側境界は、無芯のDNAセグメント011587のホモ接合性欠 失から明かなように、腫瘍組織の重複する11p13欠失を担ッテイることが以 前示されている(Lewis、ej sl、、(198B)ibid)。JT− 18p2はこの染色体にあり、1B−394は無いのであつのプローブの間に断 点を持っているのに違いない。1B−3p4は、ΔL (大)欠失染色体にも欠 けていることが判明したので、WiT−13において、ホモ接合的に欠失してい る。ウイルムス腫瘍遺伝子座の位置の中心側の限界は、WiT−13の△L欠失 の終点である。したがって、1g−3p4が、WiT−13において、ホモ接合 的に欠失している所見から、これは、ウイルムス腫瘍遺伝子座を含む11p13 領域にマツプされる。その間隔は、パルス式フィールド・ゲル電気泳動による分 析では、345kb以下である。上記所見をまとめたマツプを第2図に示す。
cDNAクローンの単離 J8−394のマツプ位置から、このプローブが、ウイルムス腫瘍遺伝子座の近 傍にあるか、その内部にあることは明かであった。
二つの観察所見から、1g−3p4は、転写単位の一部を含むことが示唆された 。第一に、ハムスターおよびマウスDNAゲノム配列にたいする強い、異種間ハ イブリダイゼーションが、1B−3p4を有する体細胞ハイブリッドに観察され た(第1A、18図)。
異種間保存が、発現されたDNA配列に伴うことがしばしばある。第二に、18 −3p4は、ヒヒ腎臓及び膵臓から単離されたRNAとのハイブリダイゼーショ ンを示した。1B−3114を、ヒト胎児腎臓(HE K)細胞から得たcDN ^DNAラリーのスクリーニングにプローブとして用いた。ノーザン・プロット 法の結果に基づいて、ヒト成人腎臓、ヒト前B細胞ライブラリーもスクリーニン グした。4つのcDN^DNAンについて、二つはHEK由来のものであり(W T4. WT2) 、一つはヒト成人腎臓から(WT22)、一つは前B細胞か ら(WT33)であるが、詳細に調べた。もう一つ、独立に単離した、保存ゲノ ムDNAクローン、λに13を用いて、五つ目の相同性cDNAクローン(WT 13)もHEKライブラリーから単離した。単離したもののうち、もつとも長い cDN^DNAン、WT33は、長さが、2313塩基対である(第3図、4図 )。WT33 cDNAは、5’ 、3’ いずれの方向にももっとも長く延び ている。他の4つのcDNAは、DNA配列の共通の内部領域を分かち持ってい る。その長さは、約1000から1200塩基対である。
WT33 cDNAの配列分析 WT33 cDNAのヌクレオチド配列を決定し、予測されるアミノ酸配列を得 た。WT33 の配列から、345アミノ酸から成る、連続オープンリーディン グフレームが明らかにされた。このフレームは、ヌクレオチド1から1035に わたっている。WT33cDN^を図式的に表わしたものを第3図に示す。この オーブンリーディングフレームは、 WT33のコード・セグメントの大部分を 占めているが、イニシエーターであるメチオニン・コドンを含んではいない。プ ライマー拡張実験から、さらに200bpが、WT33に対応するmRN人の5 °末端にあることが明らかにされた。すなわち、WT33に対応する遺伝子座の 転写パターンである。これらのcDNAに対応する遺伝子座の転写パターンは多 少複雑である。RNA PCR(ポリメラーゼ連鎖反応)を利用した実験では、 mRN人のコード領域の5′セグメントのmRNA配列に変動のあることが明ら かにされた。このことから、各種組織タイプの間に、別々のスプライシングパタ ーンのあることが示唆された。
特に興味あるのは、ヌクレオチド670から1002が、4個の相接する「ジン ク・フィンガー」領域をコードしていることである。ジンク・フィンガー・モチ ーフが最初に記載されたのは、ゼノブス(Xenopas1丁F−111人にお いてであり、5S遺伝子の内部コントロール領域のDNAに結合している。Mi ller、etジンクフィンガー領域を含むことが報告された。Klog、r璽 I+、。
TlB5. !2:464(1987);Evxns、 el *1.、 Ce 具、 52:i3 (19881゜ジンク・フィンガー配列モチーフは、29か ら30個のアミノ酸)tlk リ返り単位カラ成す(v/F−x−C−12,− C−X3−F−X、−t−X −H−X −Tl−X 式中、Xはアミノ酸であ れば何でもよ2 3−4 6−7゜ い)、このアミノ酸は、一対のシスティンとヒスチジン間に亜鉛原子をキレート する領域の中に折たたまれる。Disknn、etすべて、ジンク・フィンガー 共通配列に一致する。ジンク・フィンガー間+7)H/C結合は、丁GE−R/ に−P−F/Y−Xなルアミノ酸配列に代表されるが、Sub、 el il、 、Ce1l、 47:1025−1032 (1986)、これも、WT33に ついて得られたアミノ酸配列に保存されていた。
ウィルムス腫瘍遺伝子産物の細菌発現 グルタチオン S−トランスフエラーゼーウイルムス腫瘍融合蛋白を、ウィルム スのcDNAのフラグメントを、細菌発現ベクターpGE!−31(Pbarm icixlに挿入して、生成した。プラスミドWT33を、Bll Hl で消 化し、Klenovでプラントにし、つぎに、Psr IIで制限処理した。生 成したフラグメントを、停止コドンを含むDNAリンカ−(McGilt大学、 生化学部)に結合させ、pGEX−31のプラント処理したBll H1部位に サブクローンした。生成したプラスミド、pGEX/h W、 丁、 を大腸菌 株11842に導入した。このプラスミドは、ウィルムス腫瘍蛋白の97−29 5アミノ酸(番号は、第3図を参照)を含む融合蛋白を発現することができる。
融合蛋白の増殖誘発と分離は、メーカーの説明書にしたがって実行した。発現は 、5DS−PAGEによって分析した。
ウィルムス腫瘍蛋白の95−295アミノ酸を含むグルタチオン s−hランス フェラーゼ(G S T)ウイルムス腫瘍融合蛋白(GST−WT)をコードす るプラスミドが生成された。第9図は、このプラスミドが、〜50 kDxの蛋 白を発現できることを示している。pGEXと標識されたレーン1と3は、ベク ターによって発現される融合蛋白のG37部分の発現を示している。この蛋白は 、溶解性に富み、グルタチオン・セファロース(ph*rixci* $17− 0756−01 )に効率的に結合する。(レーン1と4は、上清であり、レー ン2と5は、ペレットであり、レーン3と6は、グルタチオンアフィニテイであ る)矢印は、約50 kDxの融合蛋白の発現を示す。G37部分だけの場合と 対照的に、GST−WT蛋白は、不溶性で、グルタチオン・セファロース・アフ イニティ・クロマトグラフィーでは精製されない。レーン3.6参照のこと。
等価対象物 本技術分野に熟練している人々であれば、はんの通例の実験法を用いるだけで、 ここに記載した発明の特定の実施態様について、たくさんの等価的対象物を理解 し、確かめることができるであろう。そのような等価的対象物は、本発明の範囲 内に含まれるものとする。
rXGIJRE 1 rlGLIRE 3 プφリン/ゲ;し7ミン電柊 rlGLIRE 4 FIGLIIIE 5 FIGURE g八 FIGURE 6B FIGURE 8A FIGURE 8B ン FICUP、E 8C Ftt;uえc’1 国際調査報告 にコシシン復6四

Claims (45)

    【特許請求の範囲】
  1. 1.ヒト染色体11バンドp13のウィルムス腫瘍遺伝子座のヌクレオチドから 本質的に成る単離DNA。
  2. 2.サイズが約50kbである請求項1の単離DNA。
  3. 3.第3図のヌクレオチド配列の全部または一部を有する請求項1の単離DNA 。
  4. 4.単離したウィルムス腫瘍DNA、またはその一部。
  5. 5.ジンク・フィンガーを含むポリペプチドをコードする請求項4の単離DNA 。
  6. 6.ヌクレオチド配列が、第3図に示したヌクレオチド配列の全てまたはその一 部、または、実質的に相同なヌクレオチド配列である、llp13ウィルムス腫 瘍遺伝子を含む単離DNAまたはその一部。
  7. 7.約3kbの分子量を有し、請求項1の単離DNAに結合する単離mRNA。
  8. 8.請求項1のDNAの全部、または、一部によってコードされるポリペプチド 。
  9. 9.第3図に示したアミノ酸配列の少なくとも一部、または、実質的に相同なア ミノ酸配列から本質的に成る単離ポリペプチド。
  10. 10.ウィルムス腫瘍DNAによってコードされるポリペプチドにたいして特異 的な抗体。
  11. 11.請求項10の抗体によって検出可能な実質的に純粋な蛋白。
  12. 12.第3図のアミノ酸配列の全部または一部を有するポリペプチドにたいして 特異的な抗体。
  13. 13.a)細胞中に存在するDNAを、相補性DNAとハイプリダイゼーション できるようにし、 b)手順aで形成されたDNAを、ヒト染色体11バンド13のウィルムス腫瘍 遺伝子座の全部または一部にたいして相補的なヌクレオチド配列であるDNAプ ローブと、相補的ヌクレオチド配列のハイプリダイゼーションが起こるのに適当 な条件下で接触させ、 c)細胞中に存在するDNAの、DNAプローブとのハイプリダイゼーションを 検出する(細胞中に存在するDNAの、DNAプローブとのハイプリダイゼーシ ョンは、ウィルムス腫瘍DNAの存在を示す。) ことから成る細胞中のウィルムス腫瘍DNAの検出法。
  14. 14.DNAプローブが検出可能なように標識されている請求項13の方法。
  15. 15.DNAプローブのヌクレオチド配列が、第3図のヌクレオチド配列の全部 または一部である請求項14の方法。
  16. 16.DNAプローブのヌクレオチド配列が、ジンク・フィンガーを含むポリペ プチドをコードする部分である請求項15の方法。
  17. 17.DNAプローブのヌクレオチド配列が、第5図に示したWT33ジンク・ フィンガーの一つを含むペプチドをコードするヌクレオチド配列に対応する請求 項14の方法。
  18. 18.DNAプローブのヌクレオチド配列が、プロリン/グルタミン富裕領域を コードするヌクレオチド配列の一部である請求項14の方法。
  19. 19.プロリン/グルタミン富裕領域が第4図に示したものである請求項18の 方法。
  20. 20.ヒトから得た細胞または生物性液体を、a)細胞または液体を、ウィルム ス腫瘍DNA、ウィルムス腫瘍mRNA、または、ウィルムス腫瘍遺伝子産物と 結合することができる少なくとも1個のプローブに接触させ、そして、b)結合 が起こったかどうかを決める ことによって、変化のないウィルムス腫瘍遺伝子または遺伝子産物の有無につい てテストすることから成るヒトにおけるウィルムス腫瘍遺伝子の変化の検出法。
  21. 21.ヒトから得た細胞または生物性液体中の、ウィルムス腫瘍遺伝子産物の存 在を検出ないし定量するイムノアッセイであって、 a)細胞または液体を、ウィルムス腫瘍遺伝子産物に結合することのできる、少 なくとも1種の第1モノクロナール抗体と反応させ、 b)手順(a)の産物を、第1抗体の結合するエピトープとは別のエピトープで 、ウィルムス腫瘍遺伝子と結合することができる、少なくとも1種の、検出でき るように標識された第2モノクロナール抗体と反応させ、 c)手順(b)の産物を検出または定量することから成る該イムノアッセイ。
  22. 22.免疫反応性フラグメントを用いる請求項21のアッセイ。
  23. 23.検出可能な標識が、放射性同位元素、酸素、蛍光性、化学発光性及び電気 化学的物置から成る群から選ばれる請求項21のアッセイ。
  24. 24.第2の抗体が、ビオチンと結合している請求項21のアッセイ。
  25. 25.ヒト細胞中の、癌または前癌状態の有無を調べるアッセイ法であって、 a)ヒトから、あらかじめ定めた細胞または液体サンプルを取り、 b)ヒトウィルムス腫瘍遺伝子または遺伝子産物にたいするプロープを、あらか じめ定めた細胞または液体サンプルに加え、c)このプローブから、あらかじめ 定めた細胞サンプルの中のウィルムス腫瘍遺伝子の機能部分に変化または欠失が あるかどうかを決める(ウィルムス腫瘍遺伝子または遺伝子産物の変化または欠 失は、癌または前癌状態を示す。)ことから成る該アッセイ法。
  26. 26.プローブがヌクレオチド・プローブである請求項25の方法。
  27. 27.プローブが、欠失があるかどうかを決めるのに使用される請求項25の方 法。
  28. 28.プローブが、ウィルムス腫瘍遺伝子を含む染色体における欠失に関するプ ローブである請求項25の方法。
  29. 29.プローブが、第3図で示したウィルムス腫瘍遺伝子からの少なくとも20 個のヌクレオチドに対応する請求項28の方法。
  30. 30.欠失があるかどうかを決める方法が、ポリメラーゼ連鎖反応の使用を含む 請求項29の方法。
  31. 31.プローブが抗体プローブである請求項25の方法。
  32. 32.治療的に有効な量のウィルムス遺伝子産物を、疾患細胞に加えることから 成る、ウィルムス腫瘍遺伝子の変化または欠失で引き起こされた癌または前癌状 態の治療法。
  33. 33.治療的に有効な量のウィルムス遺伝子産物を、機能的ウィルムス腫瘍遺伝 子を含むレトロウイルスベクターを用いる遺伝子移送技術によって、疾患細胞に 加える請求項32の方法。
  34. 34.a)機能的なヒトウィルムス腫瘍遺伝子、または、その機能的なフラグメ ントに対応する、ウィルムス腫瘍サプレッサー活性を持つ蛋白を発現させるのに 十分な数のヌクレオチド(当該ベクターは、ヒト全染色体を含まない。)及び、 b)このヌクレオチドセグメントの上流にあるプロモーターを含むヌクレオチド セグメントを含むベクター。
  35. 35.ヌクレオチドセグメントが、第3図に示した配列と実質的に対応する請求 項34のベクター。
  36. 36.プロモーターがウィルス性プロモーターであり、ベクターが、エンハンサ ーとポリアデニル化配列も含んでいる請求項34のベクター。
  37. 37.a)細胞中に存在するDNAを、相補性DNAとハイプリダイゼーション できるようにし、 b)手順(a)で形成されたDNAを、ヒト染色体11バンド13のウィルムス 腫瘍部位の全部または一部にたいして相補的なヌクレオチド配列である、検出可 能なように標識されたDNAプローブと、生じる相補的ヌクレオチド配列のハイ プリダイゼーションと、ウィルムス腫瘍DNA/検出可能標識DNAプロープ複 合体の形成に適切な条件下で接触させ、c)ウィルムス腫瘍DNA/検出可能標 識DNAプローブ複合体の量を測定する ことから成る細胞中のウィルムス腫瘍DNAの定量法。
  38. 38.第3図のヌクレオチド配列、または、その一部と対応する請求項37の方 法で用いるDNAプローブ。
  39. 39.第3図のヌクレオチド配列、または、その一部から本質的に成る請求項3 7の方法で用いるDNAプローブ。
  40. 40.個体から得たサンプル中の、ウィルムス腫瘍遺伝子がコードするポリペプ チドの検出法であって、a)サンプルを、第3図のアミノ酸配列の全部または一 部を有するポリペプチドにたいして特異的な、少なくとも1種の抗体と、ウィル ムス腫瘍遺伝子がコードするポリペプチドと抗体の結合、及び、ウィルムス腫瘍 遺伝子コードポリペプチド/抗体複合体の形成に、適切な条件下で混合させ、b )ウィルムス腫瘍遺伝子コードポリペプチド/抗体複合体を検出する ことから成る該検出法。
  41. 41.さらに、ウィルムス腫瘍遺伝子コードポリペプチド/抗体複合体を、上記 複合体中に存在する、検出可能に標識された抗体の量を測定することによって定 量することを含む請求項40の方法。
  42. 42.a)ウィルムス腫瘍DNAの全部または一部にたいして相補的なヌクレオ チド配列であるDNAプローブ、及び、b)容器 を含む、細胞中のウィルムス腫瘍DNAを検出するためのキット。
  43. 43.a)第3図のアミノ酸配列の全部または一部を有するポリペプチドにたい して特異的な単離抗体、及び、b)容器 を含む、細胞中の、ウィルムス腫瘍遺伝子がコードするポリペプチドを検出する ためのキット。
  44. 44.モノクロナール抗体である請求項10の抗体。
  45. 45.モノクロナール抗体である請求項12の抗体。
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