JP7306676B2 - Lipid profiling system, lipid profiling method, and lipid profiling program - Google Patents

Lipid profiling system, lipid profiling method, and lipid profiling program Download PDF

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Description

本発明は、脂質プロファイリングシステム、脂質プロファイリング方法、及び脂質プロファイリングプログラムに関する。 The present invention relates to a lipid profiling system, a lipid profiling method, and a lipid profiling program.

脂質の脂肪酸側鎖は、主に飽和脂肪酸、不飽和脂肪酸、高度不飽和脂肪酸の3種類に大別でき、各脂質クラスによってある程度メインとなる化合物が決まっている。また、高度不飽和脂肪酸は、各グリセロリン脂質を生合成する前駆体として使用されるジグリセリド(DG)ではほとんど存在しないにも関わらず、グリセロリン脂質ではその比率が大きく上昇する。このような高度不飽和脂肪酸の比率の上昇は、生体内における脂質の質を考察する上で非常に重要である。近年の質量分析装置の高感度化により、これらグリセロリン脂質の脂肪酸側鎖を定性し、そのイオン強度を測定することが可能になっている。
例えば、特許文献1には、質量スペクトルから脂質を同定する質量分析システムが記載されている。
Fatty acid side chains of lipids can be broadly classified into three main types: saturated fatty acids, unsaturated fatty acids, and highly unsaturated fatty acids. Each lipid class determines the main compound to some extent. In addition, although highly unsaturated fatty acids are hardly present in diglycerides (DG) used as precursors for biosynthesis of each glycerophospholipid, their proportion is greatly increased in glycerophospholipids. Such an increase in the ratio of polyunsaturated fatty acids is very important in considering the quality of lipids in vivo. Recent advances in the sensitivity of mass spectrometers have made it possible to qualitatively characterize the fatty acid side chains of these glycerophospholipids and measure their ionic strength.
For example, Patent Literature 1 describes a mass spectrometry system that identifies lipids from mass spectra.

特開2006-226730号公報JP-A-2006-226730

脂質分子の定量値は、化学合成標準品による外部検量線を作成して算出するのが一般的である。しかし、全ての脂質分子の標準品を入手することは現実的に難しいため網羅的な脂質分子の定量には至っていない。また、脂肪酸側鎖を2個以上有する脂質分子はプロダクトイオン強度が脂質分子により異なるため、同じ脂質分子同士で量を比較することはできても、異なる脂質分子同士で量を比較することはできない。 Quantitative values of lipid molecules are generally calculated by preparing an external calibration curve using chemically synthesized standard products. However, since it is practically difficult to obtain standards for all lipid molecules, comprehensive quantification of lipid molecules has not been achieved. In addition, since the product ionic strength of lipid molecules with two or more fatty acid side chains differs depending on the lipid molecule, it is possible to compare the amounts of the same lipid molecules, but it is not possible to compare the amounts of different lipid molecules. .

本発明は、上記事情に鑑みてなされたものであり、2個以上の脂肪酸側鎖を有する、異なる脂質分子間で、量比を算出することができる、脂質プロファイリングシステム、脂質プロファイリング方法、及び脂質プロファイリングプログラムを提供することを目的とする。 The present invention has been made in view of the above circumstances, and a lipid profiling system, a lipid profiling method, and a lipid that can calculate the quantitative ratio between different lipid molecules having two or more fatty acid side chains. The purpose is to provide a profiling program.

本発明の一実施形態は、脂肪酸側鎖を2個以上有する脂質の、タンデム質量分析により得られた、前記脂肪酸側鎖の種類、及び前記脂肪酸側鎖のイオン強度を、同じ脂質クラスに属する複数種類の脂質についてそれぞれ取得する取得部と、第1種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、第2種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質との間の量比を算出する、脂質量比算出部と、を備える、脂質プロファイリングシステムである。 In one embodiment of the present invention, the type of fatty acid side chain and the ionic strength of the fatty acid side chain obtained by tandem mass spectrometry of a lipid having two or more fatty acid side chains are determined from a plurality of groups belonging to the same lipid class. an acquisition unit that acquires each type of lipid, the product ionic strength of the first type of fatty acid side chain possessed by the first type of lipid, and the product ionic strength of the first type of fatty acid side chain possessed by the second type of lipid; and a lipid amount ratio calculator that calculates the amount ratio between the first type of lipid and the second type of lipid based on the ratio of .

本発明の一実施形態は、上述の脂質プロファイリングシステムにおいて、前記第1種類の脂質は、第1種類の脂肪酸側鎖と第2種類の脂肪酸側鎖とを有し、前記脂質量比算出部は、前記第1種類の脂質が有する前記第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、前記第2種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比が示す第1の補正係数と、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質との間の前記量比と、前記第1種類の脂質が有する前記第2種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、第3種類の脂質が有する前記第2種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比と、に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質と前記第3種類の脂質との間の量比を算出する。 In one embodiment of the present invention, in the lipid profiling system described above, the first type of lipid has a first type of fatty acid side chain and a second type of fatty acid side chain, and the lipid amount ratio calculation unit is , a first correction coefficient indicated by the ratio of the product ionic strength of the first type of fatty acid side chain of the first type of lipid and the product ionic strength of the second type of fatty acid side chain; said quantitative ratio between one type of lipid and said second type of lipid; the product ionic strength of said second type of fatty acid side chain possessed by said first type of lipid; and said calculating the quantitative ratio between the first type of lipid, the second type of lipid, and the third type of lipid based on the product ionic strength of the second type of fatty acid side chain and the ratio of .

本発明の一実施形態は、上述の脂質プロファイリングシステムにおいて、前記第2種類の脂質は、前記第1種類の脂肪酸側鎖と第3種類の脂肪酸側鎖とを有し、前記脂質量比算出部は、更に、前記第2種類の脂質が有する前記第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、前記第3種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比が示す第2の補正係数と、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質との間の前記量比と、前記第2種類の脂質が有する前記第3種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、第4種類の脂質が有する前記第3種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比と、に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質と前記第4種類の脂質との間の量比を算出する。 In one embodiment of the present invention, in the lipid profiling system described above, the second type of lipid has the first type of fatty acid side chain and the third type of fatty acid side chain, and the lipid amount ratio calculation unit is further a second correction factor indicated by the ratio of the product ionic strength of the first type of fatty acid side chain and the product ionic strength of the third type of fatty acid side chain of the second type of lipid; and , the quantitative ratio between the first type of lipid and the second type of lipid, the product ionic strength of the third type of fatty acid side chain possessed by the second type of lipid, and the fourth type of lipid The quantitative ratio between the first type of lipid, the second type of lipid, and the fourth type of lipid based on the ratio of the product ionic strength of the third type of fatty acid side chain having Calculate

本発明の一実施形態は、上述の脂質プロファイリングシステムにおいて、前記脂質量比算出部は、更に、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質と前記第3種類の脂質との間の前記量比と、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質と前記第4種類の脂質との間の前記量比と、に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質と前記第3種類の脂質と前記第4種類の脂質との量比を算出する。 In one embodiment of the present invention, in the lipid profiling system described above, the lipid amount ratio calculation unit further includes the said first type of lipid and said second type of lipid based on the quantitative ratio and said quantitative ratio between said first type of lipid, said second type of lipid and said fourth type of lipid and the quantitative ratio between the third type of lipid and the fourth type of lipid.

本発明の一実施形態は、上述の脂質プロファイリングシステムにおいて、前記第1種類の脂質の濃度を取得する濃度取得部と、前記濃度取得部が取得した前記第1種類の脂質の濃度と、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質との間の量比とに基づいて、前記第2種類の脂質の濃度を算出する脂質濃度算出部と、を更に備える。 In one embodiment of the present invention, in the lipid profiling system described above, the concentration acquisition unit acquires the concentration of the first type of lipid, the concentration of the first type of lipid acquired by the concentration acquisition unit, A lipid concentration calculation unit that calculates the concentration of the second type of lipid based on the quantitative ratio between the one type of lipid and the second type of lipid.

本発明の一実施形態は、上述の脂質プロファイリングシステムにおいて、前記脂質濃度算出部は、前記濃度取得部が取得した前記第1種類の脂質の濃度と、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質と前記第3種類の脂質との間の前記量比とに基づいて、前記第2種類の脂質の濃度及び前記第3種類の脂質の濃度を算出する。 In one embodiment of the present invention, in the lipid profiling system described above, the lipid concentration calculation unit calculates the concentration of the first type of lipid acquired by the concentration acquisition unit, the concentration of the first type of lipid and the second type of lipid. calculating the concentration of the second type of lipid and the concentration of the third type of lipid based on the quantitative ratio between the lipid of and the third type of lipid.

本発明の一実施形態は、上述の脂質プロファイリングシステムにおいて、前記脂質濃度算出部は、前記濃度取得部が取得した前記第1種類の脂質の濃度と、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質と前記第4種類の脂質との間の前記量比とに基づいて、前記第2種類の脂質の濃度及び前記第4種類の脂質の濃度を算出する。 In one embodiment of the present invention, in the lipid profiling system described above, the lipid concentration calculation unit calculates the concentration of the first type of lipid acquired by the concentration acquisition unit, the concentration of the first type of lipid and the second type of lipid. calculating the concentration of the second type of lipid and the concentration of the fourth type of lipid based on the quantitative ratio between the lipid of and the fourth type of lipid.

本発明の一実施形態は、上述の脂質プロファイリングシステムにおいて、前記脂質クラスが、ジアシルグリセロール、トリアシルグリセロール、フォスファチジルコリン、フォスファチジルエタノールアミン、フォスファチジン酸、フォスファチジルセリン、フォスファチジルイノシトール、及びフォスファチジルグリセロールからなる群より選択される。 One embodiment of the present invention is the lipid profiling system described above, wherein the lipid classes are diacylglycerols, triacylglycerols, phosphatidylcholines, phosphatidylethanolamines, phosphatidic acids, phosphatidylserines, phosphatides. selected from the group consisting of dilinositol and phosphatidylglycerol;

本発明の一実施形態は、脂肪酸側鎖を2個以上有する脂質であって、同じ脂質クラスに属する複数種類の脂質を、タンデム質量分析装置により分析するステップと、前記タンデム質量分析により得られた、前記脂肪酸側鎖の種類、及び前記脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度を、前記脂質の種類毎に取得するステップと、第1種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、第2種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質との間の量比を算出する、ステップと、を含む、脂質プロファイリング方法である。 One embodiment of the present invention is a step of analyzing a plurality of types of lipids belonging to the same lipid class, which are lipids having two or more fatty acid side chains, with a tandem mass spectrometer, and , obtaining the type of the fatty acid side chain and the product ionic strength of the fatty acid side chain for each type of the lipid; and the product ionic strength of the first type of fatty acid side chain possessed by the first type of lipid; calculating the quantitative ratio between the first type of lipid and the second type of lipid based on the ratio of the product ionic strength of the first type of fatty acid side chain possessed by the second type of lipid; and a method of lipid profiling.

本発明の一実施形態は、コンピュータに、脂肪酸側鎖を2個以上有する脂質であって、同じ脂質クラスに属する複数種類の脂質について、タンデム質量分析により得られた、前記脂肪酸側鎖の種類、及び前記脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度を、前記脂質の種類毎に取得するステップと、第1種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、第2種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質との間の量比を算出する、ステップと、を実行させるための、脂質プロファイリングプログラムである。 One embodiment of the present invention provides a computer with lipids having two or more fatty acid side chains, which are obtained by tandem mass spectrometry for a plurality of types of lipids belonging to the same lipid class, the types of the fatty acid side chains, and obtaining the product ionic strength of the fatty acid side chain for each type of the lipid; calculating the quantitative ratio between the first type of lipid and the second type of lipid based on the ratio of the product ionic strength of one type of fatty acid side chain and A lipid profiling program.

本発明によれば、2個以上の脂肪酸側鎖を有する、異なる脂質分子間で、量比を算出することができる、脂質プロファイリングシステム、脂質プロファイリング方法、及び脂質プロファイリングプログラムが提供される。 According to the present invention, a lipid profiling system, a lipid profiling method, and a lipid profiling program are provided that are capable of calculating quantitative ratios between different lipid molecules having two or more fatty acid side chains.

脂質の分類を説明する図である。It is a figure explaining the classification of a lipid. 脂肪酸側鎖の種類を説明する図である。It is a figure explaining the kind of fatty acid side chain. タンデム質量分析の概要を説明する図である。(A)は、タンデム質量分析装置の概要を説明する図であり、(B)は、タンデム質量分析による脂質のフラグメンテーションの模式図である。BRIEF DESCRIPTION OF THE DRAWINGS It is a figure explaining the outline|summary of tandem mass spectrometry. (A) is a diagram explaining the outline of a tandem mass spectrometer, and (B) is a schematic diagram of lipid fragmentation by tandem mass spectrometry. 本発明の一実施形態にかかる脂質プロファイリングシステムの構成の一例を示す図である。It is a figure showing an example of composition of a lipid profiling system concerning one embodiment of the present invention. 本発明の一実施形態にかかる脂質プロファイリングシステムの動作の一例を示す図である。FIG. 4 is a diagram showing an example of the operation of the lipid profiling system according to one embodiment of the present invention; 本発明の一実施形態にかかる脂質プロファイリングシステムの動作の一例を示す図である。FIG. 4 is a diagram showing an example of the operation of the lipid profiling system according to one embodiment of the present invention; 本発明の一実施形態にかかる脂質プロファイリングシステムの動作の具体例を示す図である。FIG. 4 is a diagram showing a specific example of the operation of the lipid profiling system according to one embodiment of the present invention; 本発明の一実施形態にかかる脂質プロファイリングシステムの検証結果の一例を示す図である。It is a figure which shows an example of the verification result of the lipid profiling system concerning one Embodiment of this invention. 脂質プロファイリングの具体例で用いたMRM条件を示す。MRM conditions used in specific examples of lipid profiling are shown. 脂質プロファイリングの具体例で算出した、各脂質クラスにおける各脂肪酸側鎖の補正係数を示す。Correction factors for each fatty acid side chain in each lipid class calculated in the specific example of lipid profiling are shown. 脂質プロファイリングの具体例により、正常肝臓サンプルと非アルコール性脂肪肝炎(nonalcoholic steato-hepatitis:NASH)サンプルを解析した結果を示す。A specific example of lipid profiling shows the results of analyzing a normal liver sample and a nonalcoholic steato-hepatitis (NASH) sample. 脂質プロファイリングの具体例により、正常脳サンプルと非アルコール性脂肪肝炎(nonalcoholic steato-hepatitis:NASH)マウスの脳サンプルを解析した結果を示す。A specific example of lipid profiling shows the results of analyzing normal brain samples and nonalcoholic steato-hepatitis (NASH) mouse brain samples. 脂質プロファイリングの具体例により、正常肝臓サンプルと脂肪肝サンプルを解析した結果を示す。A specific example of lipid profiling shows the results of analyzing a normal liver sample and a fatty liver sample. 脂質プロファイリングの具体例により、正常脳サンプルと非アルコール性脂肪肝炎(nonalcoholic steato-hepatitis:NASH)マウスの脳サンプルを解析した結果を示す。A specific example of lipid profiling shows the results of analyzing normal brain samples and nonalcoholic steato-hepatitis (NASH) mouse brain samples.

[脂質]
図1は、脂質の分類を説明する図である。脂質は、アルコールと脂肪酸のエステルである単純脂質(Simple Lipid)、分子中にリン酸や糖を含む複合脂質(Complex Lipid)、単純脂質や複合脂質から加水分解によって誘導される誘導脂質(Derived Lipid)に大別される。
単純脂質は、グリセロール骨格、ステロール骨格又はセラミド骨格を有するものに分類される。グリセロール骨格を有する脂質は、モノアシルグリセロール(MG)、ジアシルグリセロール(DG)、及びトリアシルグリセロール(TG)の脂質クラスに分類される。
複合脂質は、グリセロリン脂質とスフィンゴリン脂質に分類される。グリセロリン脂質は、フォスファチジルコリン(PC)、フォスファチジルグリセロール(PG)、フォスファチジルイノシトール(PI)、フォスファチジルエタノールアミン(PE)、フォスファチジン酸(PA)、フォスファチジルセリン(PS)等の脂質クラスに分類される。
[Lipid]
FIG. 1 is a diagram explaining the classification of lipids. Lipids include simple lipids that are esters of alcohol and fatty acids, complex lipids that contain phosphoric acid and sugar in the molecule, and derived lipids that are derived from simple lipids and complex lipids by hydrolysis. ).
Simple lipids are classified as having a glycerol backbone, a sterol backbone or a ceramide backbone. Lipids with a glycerol backbone fall into the monoacylglycerol (MG), diacylglycerol (DG), and triacylglycerol (TG) lipid classes.
Complex lipids are classified into glycerophospholipids and sphingolipids. Glycerophospholipids include phosphatidylcholine (PC), phosphatidylglycerol (PG), phosphatidylinositol (PI), phosphatidylethanolamine (PE), phosphatidic acid (PA), phosphatidylserine ( PS) and other lipid classes.

図2は、脂質の脂肪酸側鎖の種類を説明する図である。脂肪酸側鎖は、飽和脂肪酸からなる側鎖と、不飽和脂肪酸からなる側鎖とに分類される。 FIG. 2 is a diagram illustrating types of fatty acid side chains of lipids. Fatty acid side chains are classified into side chains composed of saturated fatty acids and side chains composed of unsaturated fatty acids.

本発明の実施形態にかかる脂質プロファイリングシステムは、2個以上の脂肪酸側鎖を有する脂質クラス(DG、TG、PC、PG、PI、PE、PA、PSなど)に適用可能である。 The lipid profiling system according to embodiments of the present invention is applicable to lipid classes with two or more fatty acid side chains (DG, TG, PC, PG, PI, PE, PA, PS, etc.).

[タンデム質量分析]
図3は、タンデム質量分析の概要を示す図である。図3(A)は、タンデム質量分析を実現するタンデム質量分析装置の概要を示す図である。質量分析(MS)法は、試料中の化合物を気体状にイオン化し、m/z(質量電荷比)に従って分離し、各イオンのイオン強度を測定する分析法である。タンデム質量分析装置(MS/MS)は、2台の質量分析計が直列に結合され、その間に衝突室を備えた装置である。図3(A)に示すように、イオン化された試料は、第1質量分析部(Q1)で特定のm/z値のイオン(プリカーサーイオン)が選択され、衝突室(Q2)でフラグメント化(フラグメンテーション)される。プリカーサーイオンのフラグメント化により生じたフラグメントイオン(プロダクトイオン)は、第2質量分析部(Q3)でm/z値に応じて分離されて、検出器で検出される。
[Tandem mass spectrometry]
FIG. 3 is a diagram showing an outline of tandem mass spectrometry. FIG. 3A is a diagram showing an outline of a tandem mass spectrometer that implements tandem mass spectrometry. Mass spectrometry (MS) is an analytical method in which compounds in a sample are gaseously ionized, separated according to m/z (mass-to-charge ratio), and the ion intensity of each ion is measured. A tandem mass spectrometer (MS/MS) is a device with two mass spectrometers coupled in series with a collision chamber in between. As shown in FIG. 3(A), in the ionized sample, ions with a specific m/z value (precursor ions) are selected in the first mass spectrometer (Q1) and fragmented ( fragmentation). Fragment ions (product ions) generated by fragmentation of precursor ions are separated according to m/z values in the second mass spectrometer (Q3) and detected by a detector.

図3(B)は、ジアシルグリセロール(DG)及びリン脂質(PC、PE、PS、PI、PG)におけるフラグメンテーションの模式図を示す。 FIG. 3(B) shows a schematic representation of fragmentation in diacylglycerol (DG) and phospholipids (PC, PE, PS, PI, PG).

[実施態様]
以下、図面を参照して本実施形態の脂質プロファイリングシステム10について説明する。
図4は、本実施形態の脂質プロファイリングシステム10の機能構成の一例を示す図である。この脂質プロファイリングシステム10は、試料中の同じ脂質クラスに属する脂質間の量比LRや濃度COを算出する。
[Implementation]
The lipid profiling system 10 of this embodiment will be described below with reference to the drawings.
FIG. 4 is a diagram showing an example of the functional configuration of the lipid profiling system 10 of this embodiment. This lipid profiling system 10 calculates the amount ratio LR and concentration CO between lipids belonging to the same lipid class in a sample.

図4では、タンデム質量分析装置20により、脂質L1~Lnを含む試料が分析され、各脂質の各脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度が測定されている。
複数種類の脂質L1~Lnは、同じ脂質クラスLCに属し、共通のヘッドグループHGを有し、脂肪酸側鎖FCを2個以上有する。脂質L1は、脂肪酸側鎖の種類L1(k1),L1(k2)として、脂肪酸側鎖α及び脂肪酸側鎖xを有している。脂質L2は、脂肪酸側鎖の種類L2(k1),L2(k2)として、脂肪酸側鎖α及び脂肪酸側鎖yを有している。脂質L3は、脂肪酸側鎖の種類L3(k1),L3(k2)として、脂肪酸側鎖z及び脂肪酸側鎖xを有している。脂質Lnは、脂肪酸側鎖の種類Ln(k1),Ln(k2)として、脂肪酸側鎖z及び脂肪酸側鎖yを有している。
In FIG. 4, the tandem mass spectrometer 20 analyzes a sample containing lipids L1 to Ln, and measures the product ion intensity of each fatty acid side chain of each lipid.
A plurality of types of lipids L1 to Ln belong to the same lipid class LC, have a common head group HG, and have two or more fatty acid side chains FC. Lipid L1 has a fatty acid side chain α and a fatty acid side chain x as fatty acid side chain types L1(k1) and L1(k2). Lipid L2 has a fatty acid side chain α and a fatty acid side chain y as fatty acid side chain types L2(k1) and L2(k2). Lipid L3 has a fatty acid side chain z and a fatty acid side chain x as fatty acid side chain types L3(k1) and L3(k2). Lipid Ln has fatty acid side chain z and fatty acid side chain y as fatty acid side chain types Ln(k1) and Ln(k2).

タンデム質量分析装置20においては、第1質量分析部(Q1)で、脂質L1~Lnのイオン化により生じたプリカーサーイオンがm/z値に従って分離され、衝突室(Q2)で分離されたプリカーサーイオンがフラグメント化されて、脂質L1~Lnの各脂肪酸側鎖に由来するプロダクトイオンL1(p1)~L1(p2)がそれぞれ生成される。第2質量分析部(Q3)では、プロダクトイオンL1(p1)~L1(p2)がm/z値に従って分離され、図示しない検出器で各プロダクトイオンのイオン強度L1(i1)~Ln(i2)が検出される。脂肪酸側鎖の種類L1(k1)~Ln(k2)は、プロダクトイオンL1(p1)~L1(p2)の各m/z値に基づいて同定される。すなわち、脂質L1は、プロダクトイオンL1(p1),L1(p2)の各m/z値に基づいて、脂肪酸側鎖の種類L1(k1),Ln(k2)として、脂肪酸側鎖α,xを有していると同定される(L1(α)、L1(x))。脂質L2~Lnについても同様に、脂肪酸側鎖の種類が同定される。 In the tandem mass spectrometer 20, the precursor ions generated by the ionization of the lipids L1 to Ln are separated according to the m/z value in the first mass spectrometry section (Q1), and the separated precursor ions are separated in the collision chamber (Q2). It is fragmented to produce product ions L1(p1)-L1(p2) derived from each fatty acid side chain of lipids L1-Ln, respectively. In the second mass spectrometer (Q3), the product ions L1(p1) to L1(p2) are separated according to the m/z value, and the ion intensities L1(i1) to Ln(i2) of each product ion are detected by a detector (not shown). is detected. Fatty acid side chain types L1(k1) to Ln(k2) are identified based on the respective m/z values of product ions L1(p1) to L1(p2). That is, the lipid L1 has the fatty acid side chains α and x as the fatty acid side chain types L1 (k1) and Ln (k2) based on the m/z values of the product ions L1 (p1) and L1 (p2). identified as having (L1(α), L1(x)). Similarly, the types of fatty acid side chains are identified for lipids L2-Ln.

前記のように同定された脂質L1~Lnの各脂肪酸側鎖の種類及びプロダクトイオン強度L1(k1,i1)~Ln(k2,i2)は、脂質プロファイリングシステム10に入力され、脂質プロファイリングシステム10により脂質L1~Ln間の量比LR、及び脂質L1~Lnの濃度CO1~COnが算出される。 The types of fatty acid side chains and the product ionic strengths L1 (k1, i1) to Ln (k2, i2) of the lipids L1 to Ln identified as described above are input to the lipid profiling system 10, and the lipid profiling system 10 The quantity ratio LR between the lipids L1-Ln and the concentrations CO1-COn of the lipids L1-Ln are calculated.

[脂質プロファイリングシステム10の機能構成及び動作]
脂質プロファイリングシステム10の具体的な機能構成及び動作について説明する。
脂質プロファイリングシステム10は、取得部110と、脂質量比算出部120と、脂質濃度取得部130、脂質濃度算出部140と、出力部150と、記憶部160とを備える。なお、この一例においては、脂質プロファイリングシステム10が記憶部160を内蔵するものとして説明するが、これに限られない。例えば、記憶部160がクラウドサーバなどによって実現されるなど、脂質プロファイリングシステム10と記憶部160とが別々の装置として構成されてもよい。
[Functional configuration and operation of lipid profiling system 10]
A specific functional configuration and operation of the lipid profiling system 10 will be described.
The lipid profiling system 10 includes an acquisition unit 110 , a lipid amount ratio calculation unit 120 , a lipid concentration acquisition unit 130 , a lipid concentration calculation unit 140 , an output unit 150 and a storage unit 160 . In this example, the lipid profiling system 10 is described as including the storage unit 160, but the present invention is not limited to this. For example, the lipid profiling system 10 and the storage unit 160 may be configured as separate devices, such as the storage unit 160 being realized by a cloud server or the like.

図5は、本実施形態の脂質プロファイリングシステム10の動作の一例を示す図である。以下、図4及び図5を参照しつつ、脂質プロファイリングシステム10の動作の一例について説明する。なお、以下の例では、3種類の脂質L1~L3の量比を求める場合について記載するが、これに限定されず、脂質L1~Lnの任意の脂質について同様に脂質間の量比を求めることができる。 FIG. 5 is a diagram showing an example of the operation of the lipid profiling system 10 of this embodiment. An example of the operation of the lipid profiling system 10 will now be described with reference to FIGS. 4 and 5. FIG. In the following example, the case of determining the quantitative ratio of three types of lipids L1 to L3 will be described, but it is not limited to this, and the quantitative ratio between lipids can be similarly determined for any lipid of lipids L1 to Ln. can be done.

(ステップS10)
取得部110は、脂肪酸側鎖FCを2個以上有する脂質L1~L3の、タンデム質量分析により得られた、前記脂肪酸側鎖の種類L1(k1)~L3(k2)、及び前記脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度L1(i1)~L3(i2)を、同じ脂質クラスLCに属する複数種類の脂質L1~L3について、それぞれ取得する。
(Step S10)
The acquisition unit 110 obtains the fatty acid side chain types L1 (k1) to L3 (k2) and the fatty acid side chain types L1 to L3 (k2) obtained by tandem mass spectrometry of lipids L1 to L3 having two or more fatty acid side chains FC. Product ionic intensities L1(i1) to L3(i2) are obtained for multiple types of lipids L1 to L3 belonging to the same lipid class LC, respectively.

取得部110が取得する脂肪酸側鎖の種類L1(k1)~L3(k2)は、プロダクトイオンL1(p1)~L3(p2)の各m/z値であってもよい。この場合、記憶部160は、プロダクトイオンの各m/z値から、脂肪酸の種類L1(k1)~L3(k2)を参照する脂肪酸種類参照テーブルを記憶していてもよい。 The fatty acid side chain types L1(k1) to L3(k2) acquired by the acquisition unit 110 may be m/z values of the product ions L1(p1) to L3(p2). In this case, the storage unit 160 may store a fatty acid type reference table that refers to fatty acid types L1(k1) to L3(k2) from each m/z value of product ions.

取得部110が取得する脂肪酸側鎖の種類L1(k1)~L3(k2)、及び脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度L1(i1)~L3(i2)は、脂質プロファイリングシステム10に接続された他の装置などから供給される。脂質プロファイリングシステム10に接続された他の装置には、例えば、タンデム質量分析装置20や、脂質プロファイリングシステム10の上位のコンピュータ装置や、脂質プロファイリングシステム10のキーボードやタッチパネルなどの操作デバイスが含まれる(いずれも不図示)。
取得部110は、取得した脂肪酸側鎖の種類L1(k1)~L3(k2)、及び脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度L1(i1)~L3(i2)を脂質量比算出部120に出力する。
The fatty acid side chain types L1(k1) to L3(k2) and the product ionic strengths L1(i1) to L3(i2) of the fatty acid side chains acquired by the acquisition unit 110 are obtained from other sources connected to the lipid profiling system 10. Supplied from a device or the like. Other devices connected to the lipid profiling system 10 include, for example, the tandem mass spectrometer 20, a host computer device of the lipid profiling system 10, and an operation device such as a keyboard or touch panel of the lipid profiling system 10 ( not shown).
The acquisition unit 110 outputs the acquired fatty acid side chain types L1 (k1) to L3 (k2) and the product ionic intensities L1 (i1) to L3 (i2) of the fatty acid side chains to the lipid amount ratio calculation unit 120.

(ステップS20)
脂質量比算出部120は、第1種類の脂質L1が有する第1種類の脂肪酸側鎖αのプロダクトイオン強度L1(iα)と、第2種類の脂質L2が有する第1種類の脂肪酸側鎖αのプロダクトイオン強度L2(iα)と、の比を算出する。
(Step S20)
The lipid amount ratio calculator 120 calculates the product ionic strength L1(iα) of the first type of fatty acid side chain α of the first type of lipid L1 and the first type of fatty acid side chain α of the second type of lipid L2. and the product ion intensity L2(iα) of .

脂質L1は、脂肪酸側鎖の種類L1(k1)として、脂肪酸側鎖αを有しており、そのプロダクトイオン強度L1(i1)をL1(iα)とする。脂質L2は、脂肪酸側鎖の種類L2(k1)として、脂肪酸側鎖αを有しており、そのプロダクトイオン強度L2(i1)をL2(iα)とする。脂質量比算出部120は、第1種類の脂肪酸側鎖として脂肪酸側鎖αを有する脂質(脂質L1,脂質L2)間で、当該脂肪酸側鎖αのプロダクトイオン強度の比(L2(iα)/L1(iα))を算出する。 The lipid L1 has a fatty acid side chain α as the type L1(k1) of the fatty acid side chain, and its product ionic strength L1(i1) is L1(iα). The lipid L2 has a fatty acid side chain α as the fatty acid side chain type L2(k1), and its product ionic strength L2(i1) is L2(iα). The lipid amount ratio calculator 120 calculates the product ionic strength ratio (L2(iα)/ L1(iα)) is calculated.

(ステップS30)
脂質量比算出部120は、前記ステップS20で算出した、脂肪酸側鎖αを有する脂質間(L1,L2)での脂肪酸側鎖αのプロダクトイオン強度の比(L2(iα)/L1(iα))に基づいて、第1種類の脂質L1と第2種類の脂質L2との間の量比LR(α)を算出する。
(Step S30)
The lipid amount ratio calculation unit 120 calculates the product ionic strength ratio of the fatty acid side chain α between the lipids (L1, L2) having the fatty acid side chain α (L2(iα)/L1(iα) ), the quantitative ratio LR(α) between the first type of lipid L1 and the second type of lipid L2 is calculated.

同じ脂質クラスLCに属する脂質L1,L2から生じた同じ脂肪酸側鎖αのプロダクトイオン強度の比は、脂質L1,脂質L2の量比に比例している。そのため、脂肪酸側鎖αのプロダクトイオン強度比(L2(iα)/L1(iα))から、脂質L1,L2の量比LR(L1,L2)を算出することができる。すなわち、LR(L1,L2)=L2(iα)/L1(iα)として算出することができる。 The product ionic strength ratio of the same fatty acid side chain α generated from lipids L1 and L2 belonging to the same lipid class LC is proportional to the quantitative ratio of lipid L1 and lipid L2. Therefore, the quantitative ratio LR (L1, L2) between the lipids L1 and L2 can be calculated from the product ionic strength ratio (L2(iα)/L1(iα)) of the fatty acid side chain α. That is, it can be calculated as LR(L1, L2)=L2(iα)/L1(iα).

(ステップS40)
第1種類の脂質L1は、第1種類の脂肪酸側鎖L1(k1)として脂肪酸側鎖αを有しており、そのプロダクトイオン強度度L1(i1)をL1(iα)とする。脂質L1は、さらに、第2種類の脂肪酸側鎖L1(k2)として脂肪酸側鎖xを有しおり、そのプロダクトイオン強度度L1(i1)をL1(ix)とする。
ステップS40では、脂質量比算出部120は、脂質L1が有する第1種類の脂肪酸側鎖αのプロダクトイオン強度L1(iα)と、第2種類の脂肪酸側鎖xのプロダクトイオン強度L1(ix)と、の比が示す第1の補正係数CF(α,x)を算出する。
補正係数CF(α,x)は、脂質L1における脂肪酸側鎖αのプロダクトイオン強度L1(iα)に対する脂肪酸側鎖xのプロダクトイオン強度L1(ix)の比(L1(ix)/L1(iα))により算出される。
(Step S40)
The first type of lipid L1 has a fatty acid side chain α as the first type of fatty acid side chain L1(k1), and its product ionic strength L1(i1) is L1(iα). The lipid L1 further has a fatty acid side chain x as the second type of fatty acid side chain L1(k2), and its product ionic strength L1(i1) is L1(ix).
In step S40, the lipid amount ratio calculator 120 calculates the product ionic strength L1(iα) of the first type fatty acid side chain α of the lipid L1 and the product ionic strength L1(ix) of the second type fatty acid side chain x. , and a first correction coefficient CF(α, x) is calculated.
The correction factor CF (α, x) is the ratio of the product ionic strength L1 (ix) of the fatty acid side chain x to the product ionic strength L1 (iα) of the fatty acid side chain α in the lipid L1 (L1 (ix) / L1 (iα) ).

(ステップS50)
脂質量比算出部120は、ステップS40で算出した補正係数CF(α,x)と、脂肪酸側鎖αを有する脂質L1,脂質L2間の量比LR(L1,L2)と、脂質L1が有する第2種類の脂肪酸側鎖xのプロダクトイオン強度L1(ix)と第3種類の脂質L3が有する脂肪酸側鎖xのプロダクトイオン強度L3(ix)との比(L3(ix)/L1(ix))と、に基づいて、脂質L1と脂質L2と脂質L3との間の量比LR(L1,L2,L3)を算出する。
(Step S50)
The lipid amount ratio calculation unit 120 calculates the correction coefficient CF (α, x) calculated in step S40, the amount ratio LR (L1, L2) between the lipid L1 and the lipid L2 having the fatty acid side chain α, and the lipid L1 has The ratio of the product ionic strength L1 (ix) of the second type of fatty acid side chain x to the product ionic strength L3 (ix) of the fatty acid side chain x of the third type of lipid L3 (L3 (ix) / L1 (ix) ), and the quantitative ratio LR (L1, L2, L3) between the lipid L1, the lipid L2, and the lipid L3.

(ステップS55)
脂質L2の脂肪酸側鎖L2(k2)と脂質L3の脂肪酸側鎖L3(k1)が同じ種類の脂肪酸側鎖である場合(すなわち、y=z)、脂質L2が有する脂肪酸側鎖α,yのプロダクトイオン強度L2(iα),L2(iy)と、の比が示す補正係数CF(α,y)を算出し、前記補正係数CF(α,y)と、量比LR(L1,L2)と、プロダクトイン強度の比(L3(iz)/L2(iy))(ただし、y=z)と、に基づいて、脂質L1と脂質L2と脂質L3との間の量比LR’(L1,L2,L3)を算出してもよい。次いで、ステップ50で算出した量比LR(L1,L2,L3)と、前記量比LR’(L1,L2,L3)とを比較し、その差が閾値以下であれば、ステップS60に進み、その差が閾値以上であれば、ステップS40に戻って、補正係数CF(α,x)、補正係数CF(α,y)の値を調整してもよい。各補正係数の調整には、最尤法を用いてもよい。
(Step S55)
When the fatty acid side chain L2 (k2) of the lipid L2 and the fatty acid side chain L3 (k1) of the lipid L3 are the same type of fatty acid side chain (that is, y = z), the fatty acid side chains α and y of the lipid L2 A correction coefficient CF (α, y) indicated by the ratio of the product ion intensities L2 (iα) and L2 (iy) is calculated, and the correction coefficient CF (α, y) and the quantity ratio LR (L1, L2) are calculated. , the product-in intensity ratio (L3(iz)/L2(iy)) (where y=z), and the quantity ratio LR′(L1, L2 , L3) may be calculated. Next, the quantity ratio LR (L1, L2, L3) calculated in step 50 is compared with the quantity ratio LR' (L1, L2, L3). If the difference is equal to or greater than the threshold, the process may return to step S40 to adjust the values of the correction coefficient CF(α, x) and the correction coefficient CF(α, y). A maximum likelihood method may be used to adjust each correction coefficient.

(ステップS60)
ステップS60では、ステップS50で算出した脂質間量比LR(L1,L2,L3)を出力部150に出力し、処理を終了する。
(Step S60)
In step S60, the lipid ratio LR (L1, L2, L3) calculated in step S50 is output to the output unit 150, and the process ends.

上記では、脂質L1,脂質L2,脂質L3の3種類の脂質間の量比を算出したが、4種類以上の脂質間で量比を算出する場合には、ステップS10で、脂質L1~Lnの脂肪酸側鎖の種類及び各脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度L1(k1,i1)~Ln(k2,i2)を取得し、任意の3種類の脂質間でステップS20~ステップS50と同様のステップを繰り返し、脂質L1~Ln間での量比を算出すればよい。例えば、脂質Lnが脂肪酸側鎖z,yを有する場合には、ステップS20及びステップS30により、脂質L1,脂質L2の間の量比LR(L1,L2)を算出し、ステップS40で、脂質L2の脂肪酸側鎖αと脂肪酸側鎖yとのプロダクトイン強度の比から、補正係数CF(α,y)を算出してもよい。次いで、ステップ50で、補正係数CF(α,y)と、脂質L1,脂質L2の間の量比LR(L1,L2)と、脂質L2の脂肪酸側鎖yのプロダクトイオン強度L2(iy)と脂質Lnの脂肪酸側鎖yのプロダクトイオン強度Ln(iy)との比と、に基づいて、脂質L1,脂質L2,脂質Lnの3種類の脂質間でステップS20~ステップS50を行うことにより、脂質間量比LR(L1,L2,Ln)を算出することができる。さらに、脂質L1及び脂質L2に対する脂質L3及び脂質Lnのそれぞれの量比に基づいて、脂質L1,脂質L2,脂質L3,脂質Lnの量比LR(L1,L2,L3,Ln)を算出することができる。同様にして、L1~Lnの全ての脂質間の量比を算出するまで、ステップS20~ステップS50を繰り返し、脂質L1~Lnの量比を算出してもよい。前記の脂質L1~Ln間の量比の算出には、最尤法を用いてもよい。 In the above, the quantitative ratio between the three types of lipids, lipid L1, lipid L2, and lipid L3, was calculated. Acquire the type of fatty acid side chain and the product ionic strength L1 (k1, i1) to Ln (k2, i2) of each fatty acid side chain, and repeat steps similar to steps S20 to S50 between any three types of lipids. , the quantitative ratio between lipids L1 to Ln. For example, when the lipid Ln has fatty acid side chains z and y, the quantitative ratio LR (L1, L2) between the lipid L1 and the lipid L2 is calculated in steps S20 and S30, and in step S40, the lipid L2 The correction factor CF(α, y) may be calculated from the ratio of the product-in intensity of the fatty acid side chain α and the fatty acid side chain y. Next, in step 50, the correction factor CF (α, y), the quantitative ratio LR (L1, L2) between the lipid L1 and the lipid L2, and the product ionic strength L2 (iy) of the fatty acid side chain y of the lipid L2 Based on the ratio of the product ionic strength Ln (iy) of the fatty acid side chain y of the lipid Ln and the lipid The interval ratio LR (L1, L2, Ln) can be calculated. Furthermore, based on the respective quantitative ratios of lipid L3 and lipid Ln to lipid L1 and lipid L2, the quantitative ratio LR (L1, L2, L3, Ln) of lipid L1, lipid L2, lipid L3, and lipid Ln is calculated. can be done. Similarly, steps S20 to S50 may be repeated to calculate the quantitative ratios of the lipids L1 to Ln until the quantitative ratios among all the lipids L1 to Ln are calculated. A maximum likelihood method may be used to calculate the quantitative ratio between the lipids L1 to Ln.

本実施形態の脂質プロファイリングシステム10は、脂質L1の濃度を取得して、脂質L2~Lnの濃度を算出する機能を有していてもよい。
図6は、本実施形態の脂質プロファイリングシステム10の脂質濃度算出にかかる動作の一例を示す図である。以下、図4及び図6を参照しつつ、脂質プロファイリングシステム10の脂質濃度算出にかかる動作の一例について説明する。
The lipid profiling system 10 of the present embodiment may have a function of acquiring the concentration of lipid L1 and calculating the concentrations of lipids L2 to Ln.
FIG. 6 is a diagram showing an example of the lipid concentration calculation operation of the lipid profiling system 10 of the present embodiment. An example of the operation of the lipid profiling system 10 for calculating the lipid concentration will be described below with reference to FIGS. 4 and 6. FIG.

(ステップS110)
濃度取得部130は、第1種類の脂質L1の濃度CO1を取得する。例えば、タンデム質量分析装置20により分析する試料に、放射線標識された標準試料として既知量の脂質L1を添加し、当該添加量を脂質L1の濃度CO1として用いることができる。
脂質濃度取得部130が取得する脂質L1の濃度CO1は、脂質プロファイリングシステム10に接続された他の装置などから供給される。脂質プロファイリングシステム10に接続された他の装置には、例えば、タンデム質量分析装置20や、脂質プロファイリングシステム10の上位のコンピュータ装置や、脂質プロファイリングシステム10のキーボードやタッチパネルなどの操作デバイスが含まれる(いずれも不図示)。
脂質濃度取得部130は、取得した脂質L1の濃度CO1を脂質濃度算出部140に出力する。
(Step S110)
The concentration acquisition unit 130 acquires the concentration CO1 of the first type of lipid L1. For example, a known amount of lipid L1 is added as a radiolabeled standard sample to the sample to be analyzed by the tandem mass spectrometer 20, and the added amount can be used as the concentration CO1 of the lipid L1.
The concentration CO1 of the lipid L1 acquired by the lipid concentration acquisition unit 130 is supplied from another device or the like connected to the lipid profiling system 10 . Other devices connected to the lipid profiling system 10 include, for example, the tandem mass spectrometer 20, a host computer device of the lipid profiling system 10, and an operation device such as a keyboard or touch panel of the lipid profiling system 10 ( not shown).
The lipid concentration acquisition unit 130 outputs the acquired concentration CO1 of the lipid L1 to the lipid concentration calculation unit 140 .

(ステップS120)
脂質濃度算出部140は、脂質量比算出部120から、前記ステップS30又はステップ50により算出された脂質間の量比を取得する。
(Step S120)
The lipid concentration calculator 140 acquires the lipid ratio calculated in step S30 or step 50 from the lipid ratio calculator 120 .

(ステップS130)
脂質濃度算出部140は、濃度取得部130が取得した脂質L1の濃度CO1と、脂質L1と脂質L2との間の量比LRに基づいて、脂質L2の濃度CO2を算出する。あるいは、脂質濃度算出部140は、濃度取得部130が取得した脂質L1の濃度CO1と、脂質L1と脂質L2と脂質L3との間の量比LRとに基づいて、脂質L2の濃度CO2及び脂質L3の濃度CO3を算出する。他の脂質L4~Lnについても同様に、脂質L1との濃度CO1と、脂質L1との量比から、濃度を算出することができる。
(Step S130)
The lipid concentration calculation unit 140 calculates the concentration CO2 of the lipid L2 based on the concentration CO1 of the lipid L1 acquired by the concentration acquisition unit 130 and the quantitative ratio LR between the lipid L1 and the lipid L2. Alternatively, the lipid concentration calculation unit 140 calculates the concentration CO2 of the lipid L2 and the lipid Calculate the concentration CO3 of L3. Concentrations of the other lipids L4 to Ln can be similarly calculated from the ratio of the concentration CO1 to the lipid L1 and the lipid L1.

(ステップS140)
ステップS140では、ステップS130で算出した脂質L2~Lnの濃度を出力部150に出力し、処理を終了する。
(Step S140)
In step S140, the concentrations of lipids L2 to Ln calculated in step S130 are output to the output unit 150, and the process ends.

[脂質プロファイリングシステムの具体的動作例]
以下、本実施形態の脂質プロファイリングシステムの具体的動作例について説明する。
[Specific operation example of lipid profiling system]
A specific operation example of the lipid profiling system of this embodiment will be described below.

図7は、脂質プロファイリング例における脂質プロファイリングシステム10の動作の具体例を示す図である。左図のフローチャートに従い、タンデム質量分析によるプロダクトイオン強度から、最尤法等を用いて、Quantity Ratio Tableを作成する。(A)は、Quantity Ratio Tableの具体例を示す。
次に、Quantity Ratio Tableに基づき、仮想的検量線(Virtual Calibration Curve)を作成する。(B)及び右下のグラフは、仮想的検量線の具体例を示す。右下のグラフは、脂肪酸側鎖(18:1)のイオン強度を縦軸として、仮想的検量線を作成した図である。ここで、仮想的検量線は、定量値をソルバーで変化させながら、プロダクトイオン強度の実測値との誤差が最小になるように傾きを設定する(最小二乗法)。仮想的検量線の信頼性は、Rで判定し、Rが所定の範囲内(例えば、R>0.94)であれば、左のフローチャートで「Calculate Distribution Ratio」に進み、前記仮想的検量線を利用して、(C)のように脂質の量比を算出する。
なお、前記仮想的検量線の傾きは、図5で説明した補正係数CFに対応する。
FIG. 7 is a diagram illustrating a specific example of the operation of lipid profiling system 10 in a lipid profiling example. According to the flow chart on the left, a Quantity Ratio Table is created from the product ion intensity obtained by tandem mass spectrometry using the maximum likelihood method or the like. (A) shows a specific example of the Quantity Ratio Table.
Next, based on the Quantity Ratio Table, a virtual calibration curve is created. (B) and the bottom right graph show a specific example of a virtual calibration curve. The lower right graph shows a virtual calibration curve with the ionic strength of the fatty acid side chain (18:1) as the vertical axis. Here, the slope of the virtual calibration curve is set so that the difference between the measured value of the product ion intensity and the measured value of the product ion intensity is minimized while changing the quantitative value with a solver (least squares method). The reliability of the virtual calibration curve is determined by R 2 , and if R 2 is within a predetermined range (e.g., R 2 > 0.94), proceed to "Calculate Distribution Ratio" in the left flowchart and A quantitative calibration curve is used to calculate the lipid ratio as in (C).
The slope of the virtual calibration curve corresponds to the correction coefficient CF described with reference to FIG.

タンデム質量分析による各脂質のプロダクトイオン強度の測定値から、各脂質の量比を算出する方法は、特に限定されないが、例えば、最尤法を利用することができる。以下に最尤法による脂質の量比の算出例を示す。 Although the method for calculating the quantitative ratio of each lipid from the measured value of the product ion intensity of each lipid by tandem mass spectrometry is not particularly limited, for example, the maximum likelihood method can be used. An example of calculation of the lipid ratio by the maximum likelihood method is shown below.

Figure 0007306676000001
Figure 0007306676000001

Figure 0007306676000002
Figure 0007306676000002

Figure 0007306676000003
Figure 0007306676000003

図8は、仮想的検量線のRによる仮想的検量線の検証方法について説明する図である。脂質分子の定量値が脂肪酸側鎖毎のプロダクトイオン強度と正比例の関係にあれば、(A)のようにRは1に収束する。ただし、実際は測定誤差などが存在するものと思われるため、(B)のような形でR>0.94程度を許容ラインとする。(C)のように正比例していないサンプル(PC(18:0)(18:1))が存在する場合は、すべての検量線が0.94以内に収束する事はない。(C)では、(18:1)ではR>0.94で検量線が引けているが、(18:2)ではR<0.94と誤差が大きく、(18:0)では全く収束しない。 FIG. 8 is a diagram illustrating a method of verifying a virtual calibration curve by R2 of the virtual calibration curve. If the quantified value of the lipid molecule is directly proportional to the product ion intensity of each fatty acid side chain, R2 converges to 1 as in (A). However, since it is believed that there is actually a measurement error or the like, the allowable line is defined as R 2 >0.94 in the form of (B). When there are samples that are not in direct proportion (PC(18:0)(18:1)) as in (C), all calibration curves do not converge within 0.94. In (C), the calibration curve is drawn at (18:1) with R 2 > 0.94, but at (18: 2) there is a large error of R 2 < 0.94, and at (18: 0) there is no do not converge.

以上、本発明の実施形態を、図面を参照して詳述してきたが、具体的な構成はこの実施形態に限られるものではなく、本発明の趣旨を逸脱しない範囲で適宜変更を加えることができる。 Although the embodiments of the present invention have been described above in detail with reference to the drawings, the specific configuration is not limited to these embodiments, and modifications can be made as appropriate without departing from the scope of the present invention. can.

なお、上述の各装置は内部にコンピュータを有している。そして、上述した各装置の各処理の過程は、プログラムの形式でコンピュータ読み取り可能な記録媒体に記憶されており、このプログラムをコンピュータが読み出して実行することによって、上記処理が行われる。ここでコンピュータ読み取り可能な記録媒体とは、磁気ディスク、光磁気ディスク、CD-ROM、DVD-ROM、半導体メモリ等をいう。また、このコンピュータプログラムを通信回線によってコンピュータに配信し、この配信を受けたコンピュータが当該プログラムを実行するようにしてもよい。 Each of the devices described above has a computer inside. The process of each process of each device described above is stored in a computer-readable recording medium in the form of a program, and the above process is performed by reading and executing this program by a computer. Here, the computer-readable recording medium refers to magnetic disks, magneto-optical disks, CD-ROMs, DVD-ROMs, semiconductor memories, and the like. Alternatively, the computer program may be distributed to a computer via a communication line, and the computer receiving the distribution may execute the program.

また、上記プログラムは、前述した機能の一部を実現するためのものであってもよい。
さらに、前述した機能をコンピュータシステムにすでに記録されているプログラムとの組み合わせで実現できるもの、いわゆる差分ファイル(差分プログラム)であってもよい。
Further, the program may be for realizing part of the functions described above.
Further, it may be a so-called difference file (difference program) that can realize the above-described functions in combination with a program already recorded in the computer system.

[脂質プロファイリングの具体例]
本実施形態の脂質プロファイリングシステム10を用いて、脂質プロファイリングを行った具体例を以下に示す。
[Specific examples of lipid profiling]
Specific examples of lipid profiling using the lipid profiling system 10 of the present embodiment are shown below.

脂質プロファイリングの具体例に用いた材料及び分析方法等は以下の通りである。 Materials and analysis methods used in specific examples of lipid profiling are as follows.

<化合物及び試薬>
蒸留水(LC/MSグレード)及びメタノール(LC/MSグレード)を関東化学株式会社(東京、日本)から購入した。HPLCグレードのクロロホルムをキシダ化学株式会社(大阪、日本)から購入した。全ての主な脂質クラスを含むSPLASHTM LipidomixTM Mass Spec Standard(15:0/[D7]18:1-PA(7ng),15:0/[D7]18:1-PC(160ng),15:0/[D7]18:1-PE(5ng),15:0/[D7]18:1-PG(30ng),15:0/[D7]18:1-PI(10ng)及び15:0/[D7]18:1-PS(5 ng)per1μL Methanol)を含む)を、Avanti Polar Lipid Inc.(Alabaster,AL,USA)から購入した。酢酸アンモニウムをSigma-Aldrich Co.(St.Louis,MO,USA)から購入した。二酸化炭素(99.5%グレード,)を株式会社吉田酸素(福岡、日本)から購入し、SFC移動相として使用した。DG(18:0/20:4)、PE(18:0/20:4)、PG(16:0/18:1)、PS(18:0/18:1)、PI(18:0/20:4)、及び10種のPCを、Avanti Polar Lipids Inc.から購入した。
<Compounds and Reagents>
Distilled water (LC/MS grade) and methanol (LC/MS grade) were purchased from Kanto Kagaku Co., Ltd. (Tokyo, Japan). HPLC grade chloroform was purchased from Kishida Chemical Co., Ltd. (Osaka, Japan). SPLASH Lipidomix Mass Spec Standard including all major lipid classes (15:0/[D7]18:1-PA (7 ng), 15:0/[D7]18:1-PC (160 ng), 15: 0/[D7]18:1-PE (5 ng), 15:0/[D7]18:1-PG (30 ng), 15:0/[D7]18:1-PI (10 ng) and 15:0/ [D7] 18:1-PS (5 ng) per 1 μL Methanol) was obtained from Avanti Polar Lipid Inc.; (Alabaster, AL, USA). Ammonium acetate was obtained from Sigma-Aldrich Co. (St. Louis, MO, USA). Carbon dioxide (99.5% grade,) was purchased from Yoshida Oxygen Co., Ltd. (Fukuoka, Japan) and used as the SFC mobile phase. DG (18:0/20:4), PE (18:0/20:4), PG (16:0/18:1), PS (18:0/18:1), PI (18:0/ 20:4), and 10 PCs from Avanti Polar Lipids Inc. purchased from

<動物及び食餌処理>
すべての動物のケア及び試験プロトコールは、九州大学医学部のAnimal Ethics Committeeにより承認され、九州大学医学部Committee for Care and Use of Laboratory Animalsの推奨されるものに従って行った。
<Animal and diet treatment>
All animal care and testing protocols were approved by the Animal Ethics Committee of Kyushu University School of Medicine and were performed in accordance with the recommendations of the Kyushu University School of Medicine Committee for Care and Use of Laboratory Animals.

<MCD食餌処理>
雄C57BL6マウス、5週齢を日本チャールス・リバー株式会社(横浜、日本)から購入し、24℃、12h/12h明暗サイクルで維持した。急性病理モデルを、メチオニン-コリン欠乏(MCD)の餌(オリエンタル酵母工業株式会社、東京、日本)をマウスに給餌することにより、生育させた。試験前に、全ての動物を通常の餌で1週間順応させ、水道水と適切な餌(MF diet,オリエンタル酵母工業株式会社)に自由にアクセスできるようにした。6週齢で、マウスを2グループ(n=5)に分け、通常の餌又はMCD dietで2週間維持した。
<MCD diet treatment>
Male C57BL6 mice, 5 weeks old, were purchased from Japan Charles River Co., Ltd. (Yokohama, Japan) and maintained at 24° C. with a 12 h/12 h light/dark cycle. An acute pathology model was developed by feeding mice a methionine-choline deficient (MCD) diet (Oriental Yeast Co., Ltd., Tokyo, Japan). Prior to testing, all animals were acclimated on normal diet for 1 week and allowed free access to tap water and appropriate diet (MF diet, Oriental Yeast Co., Ltd.). At 6 weeks of age, mice were divided into 2 groups (n=5) and maintained on normal chow or MCD diet for 2 weeks.

<マウス肝臓及び脳における脂質の抽出>
20mgのマウス肝臓試料を2mLのエッペンドルフチューブにそれぞれ入れた。肝臓及び脳から脂質を抽出するために、1mLの氷冷メタノールを試料に加え、1分間超音波処理して、脂質を抽出した。遠心分離(16,000×g、4℃、1分)した後、500μLの上清を採取し、Bligh-Dyer抽出法により抽出した。混合溶媒(MeOH:CHCl:HO=10:5:3(v/v/v))を添加し、1分間ボルテックスした後、遠心分離(16,000×g、4℃、5分)し、不純物を除去した。その後、300μLの下相(クロロホルム相)を他のガラスチューブに採取した。最後に、300μLのメタノールを、チューブに添加し、solutionAを添加して、分析するまで-80℃で保存した。
<Lipid extraction in mouse liver and brain>
A 20 mg mouse liver sample was placed in each 2 mL Eppendorf tube. To extract lipids from liver and brain, 1 mL of ice-cold methanol was added to the samples and sonicated for 1 minute to extract lipids. After centrifugation (16,000×g, 4° C., 1 minute), 500 μL of supernatant was collected and extracted by the Bligh-Dyer extraction method. A mixed solvent (MeOH:CHCl 3 :H 2 O=10:5:3 (v/v/v)) was added, vortexed for 1 minute, and then centrifuged (16,000×g, 4° C., 5 minutes). and remove impurities. After that, 300 μL of lower phase (chloroform phase) was collected in another glass tube. Finally, 300 μL of methanol was added to the tube, solution A was added and stored at −80° C. until analysis.

<SFC/QqGMS分析>
LabSolutions version 5.80(株式会社島津製作所、京都、日本)により制御される、LCMS8060 QqQMSを装備したNexera UC system(SFC)(株式会社島津製作所、京都、日本)を脂質の分離に用いた。DEA column(100x3.0mm i.d.,ACQUITY UPC2TM Torus diethyl amine, Waters Corp.)を、分離に用いた。SFC条件は、以下の通りとした:移動相A,SCCO;移動相B,95%メタノール/5%水 with 0.1%(w/v)酢酸アンモニウム;背圧,10MPa;カラム温度,50℃;サンプルトレイ温度,5℃。移動相は、流速1.0mL/分でカラムに送出した。移動相の勾配プログラムは、以下の通りとした:A/B=100/0, followed by a linear gradient to A/B = 30/70 for 15 min and held for 3 min, followed by a linear gradient to A/B = 100/0 for 0.1 min, and terminating at A/B = 100/0 for 1.9 min。2μLのサンプルをオートサンプラーでインジェクトした、QqQMSは、最適化後に行った。MRM条件は図9に示した。
<SFC/QqGMS Analysis>
A Nexera UC system (SFC) (Shimadzu Corporation, Kyoto, Japan) equipped with an LCMS8060 QqQMS controlled by LabSolutions version 5.80 (Shimadzu Corporation, Kyoto, Japan) was used for lipid separation. A DEA column (100×3.0 mm id, ACQUITY UPC2™ Torus dimethylamine, Waters Corp.) was used for the separation. SFC conditions were as follows: mobile phase A, SCCO2 ; mobile phase B, 95% methanol/5% water with 0.1% (w/v) ammonium acetate; back pressure, 10 MPa; °C; sample tray temperature, 5°C. The mobile phase was delivered to the column at a flow rate of 1.0 mL/min. The mobile phase gradient program was as follows: A/B = 100/0, followed by linear gradient to A/B = 30/70 for 15 min and held for 3 min, followed by linear gradient to A /B = 100/0 for 0.1 min, and terminating at A/B = 100/0 for 1.9 min. QqQMS, in which 2 μL of sample was injected with the autosampler, was performed after optimization. MRM conditions are shown in FIG.

<MRMトランジション設定の最適化>
6つの脂質クラス(DG、PC,PE、PS、PG、PI)のそれぞれのプリカーサーイオンの同定とフラグメンテーションパターンの分析は、ポジティブ又はネガティブイオンモードにおけるSFCフローインジェクション分析により行った。各脂質のプリカーサーイオンを、酢酸アンモニウムの添加によるポジティブイオンモード([M+H]又は[M+NH)及び/又はネガティブイオンモード([M-H]又は[M+CH3COO])で観察した。最も豊富な付加イオンに基づいて、LCMS8060の各脂質クラスのMS衝突エネルギーを最適化した。図9に、6種の脂質のMS衝突エネルギーの最適化結果と、7種の脂肪酸側鎖のMRMトランジション設定を示す。全てのMRMトランジションを生成した後、モノイソトニックイオンの存在比を算出した。モノイソトニックイオンの存在比は、脂肪酸側鎖によって異なるからである。
<Optimization of MRM transition settings>
Identification of precursor ions of each of the six lipid classes (DG, PC, PE, PS, PG, PI) and analysis of fragmentation patterns were performed by SFC flow injection analysis in positive or negative ion mode. Precursor ions of each lipid were observed in positive ion mode ([M+H] + or [M+NH 4 ] + ) and/or negative ion mode ([M−H] or [M+CH3COO] ) by addition of ammonium acetate. We optimized the MS collision energies for each lipid class of LCMS8060 based on the most abundant adduct ions. Figure 9 shows the optimization results of MS collision energies for six lipids and the MRM transition settings for seven fatty acid side chains. After generating all MRM transitions, the abundance ratio of monoisotonic ions was calculated. This is because the abundance ratio of monoisotonic ions varies depending on the fatty acid side chain.

<化合物のアノテーション>
LabSolutions version 5.80(株式会社島津製作所、京都、日本)をMRMスペクトルデータの解析のために用いた。さらに、データ(lcdフォーマット)を、ProteoWizard version 3を用いて、mzMLフォーマットに変換した。その後、これらのデータを、MRMPROBS version 2.26にインプットした。次いで、MRMスペクトルデータのスムージング(smoothing method,linear weighted moving average;smoothing level,5 scan;minimum peak width,5 scan;minimum peak height,100 amplitude)を、MRMPROBSを用いて行った。
化合物は、基本的に、化合物のMRMトランジションの全てのピークがリテンションタイム(RT)にあるときに、アノテーションした。これらのデータを用いて、各サンプルの化合物の平均値及び標準偏差を、Excel 2013を用いて算出した。
<Compound annotation>
LabSolutions version 5.80 (Shimadzu Corporation, Kyoto, Japan) was used for the analysis of MRM spectral data. Furthermore, the data (lcd format) were converted to mzML format using ProteoWizard version 3. These data were then input into MRMPROBS version 2.26. Then, smoothing of MRM spectral data (smoothing method, linear weighted moving average; smoothing level, 5 scan; minimum peak width, 5 scan; minimum peak height, 100 amplitude) was performed using MRMPROBS.
Compounds were annotated essentially when all peaks of the compound's MRM transitions were at the retention time (RT). Using these data, the mean and standard deviation of the compounds in each sample were calculated using Excel 2013.

<脂質プロファイリング方法>
2本の脂肪酸側鎖を有する脂質クラス(DG,PC,PE,PS,PI,PG)の脂質では、それぞれ28種の化合物うち、2本の脂肪酸側鎖が同じ化合物は7種類、2本の脂肪酸側鎖が違う化合物が21種類存在する(28=7+21)。2本の脂肪酸側鎖が違う化合物21種類には、それぞれ2つのMRMトランジションが存在し、この2つのトランジションは脂肪酸側鎖の種類によってイオン強度が異なるが、1化合物として定量値は同じである。また、2つのトランジションのイオン強度比は質量分析装置のフラグメント効率の差によって決定され、濃度によらず一定である。そのため、求めるべき21種類の化合物の定量値(未知数)に対して、42種類のイオン強度で化合物濃度とプロダクトイオン強度は正比例するという前提で連立方程式が組める。図7のフローチャートに従い、連立方程式より、それぞれの脂質クラスについて7種類の脂肪酸側鎖から6点の検量点をもった仮想的検量線を作成した。仮想的検量線の相関係数Rを算出し、0.99以上であれば検量線として信頼に値するとして正式な補正係数として採用し、すべての化合物について検量線を使って量比を算出した。
標準物質として、脂質クラス毎に、同位体ラベルした(18:1)の脂肪酸側鎖を有する化合物(Lipidomix Splash,Avanti Inc.)を混合し、(18:1)の脂肪酸側鎖のイオン強度を基準として、7種類の脂肪酸側鎖での検量線を用いて各脂肪酸側鎖の相対定量(mg/ml)を行った。図10の棒グラフは、(18:1)の脂肪酸側鎖を基準値1として、他の脂肪酸側鎖の補正係数を示している。
<Lipid profiling method>
In lipid classes with two fatty acid side chains (DG, PC, PE, PS, PI, PG), among the 28 compounds each, 7 compounds with the same two fatty acid side chains There are 21 types of compounds with different fatty acid side chains (28=7+21). Each of the 21 types of compounds with two different fatty acid side chains has two MRM transitions, and these two transitions differ in ionic strength depending on the type of fatty acid side chain, but the quantitative value is the same for one compound. Also, the ion intensity ratio between the two transitions is determined by the difference in fragmentation efficiency of the mass spectrometer and is constant regardless of concentration. Therefore, simultaneous equations can be constructed on the premise that the compound concentration and the product ion intensity are directly proportional to the quantitative values (unknowns) of the 21 kinds of compounds to be obtained at 42 kinds of ion intensities. According to the flowchart in FIG. 7, a virtual calibration curve with 6 calibration points was created from 7 types of fatty acid side chains for each lipid class from simultaneous equations. The correlation coefficient R 2 of the virtual calibration curve was calculated, and if it was 0.99 or more, it was adopted as a formal correction coefficient as a reliable calibration curve, and the quantitative ratio was calculated using the calibration curve for all compounds. .
As a standard substance, an isotope-labeled (18:1) compound having a fatty acid side chain (Lipidomix Splash, Avanti Inc.) was mixed for each lipid class, and the ionic strength of the (18:1) fatty acid side chain was determined. Relative quantification (mg/ml) of each fatty acid side chain was performed using a calibration curve with 7 types of fatty acid side chains as a reference. The bar graph in FIG. 10 shows the correction factors for other fatty acid side chains, with the (18:1) fatty acid side chain as a reference value of 1.

<標準品との比較>
脂肪酸側鎖が脂質のsn-1,sn-2のそれぞれの位置にどの程度の割合で結合しているかは不明である。用意できた標品を用いて同様のMRMトランジションで測定した結果を表1に示す。それぞれの標品はsn-1,sn-2に結合している脂肪酸側鎖があらかじめ分かっているため、脂肪酸側鎖の種類と結合様式があらかじめ分かった状態でイオン強度比を求めることができる。標準品と比較すると、測定されたサンプルの通常のリン脂質はsn-1に飽和脂肪酸、sn-2に不飽和脂肪酸が配置されている標準品と値が近い。特に位置異性体の標準品を用意できたPC(18:0/18:1)、PC(16:0/18:1)に関しては明らかである。
<Comparison with standard product>
It is unknown to what extent the fatty acid side chains are bound to each of the sn-1 and sn-2 positions of the lipid. Table 1 shows the results of measurement at similar MRM transitions using prepared specimens. Since the fatty acid side chains bound to sn-1 and sn-2 of each sample are known in advance, the ionic strength ratio can be obtained with the type and bonding mode of the fatty acid side chains known in advance. When compared with the standard, the normal phospholipids of the measured samples are close in value to the standard with saturated fatty acids at sn-1 and unsaturated fatty acids at sn-2. This is particularly evident for PC (18:0/18:1) and PC (16:0/18:1) for which positional isomer standards were available.

Figure 0007306676000004
Figure 0007306676000004

<脂質プロファイリング結果>
脂質プロファイリングの結果を図11及び図12に示す。図11は、正常肝臓とNASH(非アルコール性脂肪肝炎:nonalcoholic steato-hepatitis)マウスの肝臓で脂質プロファイリングを行った結果を示す。NASHでは、ほとんどの脂質クラスにおいて脂質量が上昇している。また、脂肪酸側鎖が1つしか結合していないリゾフォスファチジルコリン(LPC)とリゾフォスファチジルエタノールアミン(LPE)の定量値も参考として掲載した。LPCとLPEでは、脂肪酸側鎖はポジティブイオンモードでMRM測定をしている。注目すべきはPGであり、PG全体として増加しているが、パルミチン酸(16:0)はまったく増加していない(ゆえに構成比率としては減少している)。NASHが肝臓のミトコンドリア不全である事を考えると、ミトコンドリア内にのみ存在するPGの変化はNASHを研究する上では重要かもしれない。またLPCとLPEは6種類の脂肪酸側鎖のみの合計値であるが,他のリン脂質は増加しているにもかかわらず減少している。
<Results of lipid profiling>
The results of lipid profiling are shown in FIGS. 11 and 12. FIG. FIG. 11 shows the results of lipid profiling of normal liver and NASH (nonalcoholic steato-hepatitis) mouse liver. NASH has elevated lipid abundance in most lipid classes. Quantitative values of lysophosphatidylcholine (LPC) and lysophosphatidylethanolamine (LPE) having only one fatty acid side chain are also shown for reference. In LPC and LPE, fatty acid side chains are MRM-measured in positive ion mode. Noteworthy is PG, and although PG as a whole has increased, palmitic acid (16:0) has not increased at all (and therefore decreased as a composition ratio). Given that NASH is a hepatic mitochondrial deficiency, changes in PGs present only in mitochondria may be important in studying NASH. Also, LPC and LPE are total values of only 6 kinds of fatty acid side chains, but the values of other phospholipids are decreased although they are increased.

図12は、NASHマウスの脳抽出物で脂質プロファイリングを行った結果を示す。肝臓の時ほど顕著ではないが、リン脂質の増加と、LPC及びLPEの若干の減少が確認されたが、構成脂肪酸の組成比にはほとんど変化がない。 FIG. 12 shows the results of lipid profiling on NASH mouse brain extracts. An increase in phospholipids and a slight decrease in LPC and LPE were confirmed, although not as marked as in the liver, but there was almost no change in the composition ratio of constituent fatty acids.

図13及び図14に、化合物毎の詳細な定量値を示す。定量した全ての化合物の量を全て合算したものをトータル量として図の上部に示し、その内訳の割合を図の下部に示した。 13 and 14 show detailed quantitative values for each compound. The total amount of all quantified compounds is shown in the upper part of the figure as a total amount, and the ratio of the breakdown is shown in the lower part of the figure.

<脂質プロファイリング結果の考察>
各脂質の脂肪酸側鎖のイオン強度比の補正係数の結果(図10)から、DGの定量用トランジションにおける飽和脂肪酸((16:0),(18:0))のニュートラルロスと、高度不飽和脂肪酸((20:4),(22:6))のニュートラルロスを比較すると、5~10倍以上のイオン強度差となっている。この結果からアラキドン酸、DHAともに他の脂肪酸側鎖と比較すると非常に脱離しやすい化合物と言える。PSの定量用トランジションにおける飽和脂肪酸のイオン強度と高度不飽和脂肪酸のイオン強度とでは、6~20倍以上のイオン強度差が存在する。また、他のグリセロリン脂質においても、PSと同様に脂肪酸側鎖のイオン強度を測定しているが、PCとPEは比較的類似の傾向を示しており、ともに(18:2)が脱離しやすい。グリセロリン脂質の種類によって同じ脂肪酸側鎖であっても、そのイオン強度比がかなり異なる事が分かった。全体的にはグリセロリン脂質のトランジションは、DGのニュートラルロスと逆の傾向となり、高度不飽和脂肪酸のイオン強度は他の脂肪酸と比較すると特にDHAは低くなっている。また、あらかじめsn-1,sn-2の分かっている標品を測定した結果(表1)から、同じ脂肪酸でもsn-1,sn-2と位置異性体でイオン強度が逆転していることが伺える。この事実から、脂肪酸側鎖を2本有する脂質に関して、質量分析を用いる場合はsn-2に結合している脂肪酸側鎖は非常に脱離しやすい傾向がある。すなわち、高度不飽和脂肪酸は通常の生体内ではsn-2に結合しているため、脂肪酸側鎖の種類以外の部分でもプロダクトイオン強度が高くなったと考えられる。この事実は、通常、生体内に存在している脂質は飽和脂肪酸がsn-1に、不飽和脂肪酸はsn-2に結合している事実と合致する。実際に(18:0)/(18:1)と(16:0)/(18:1)を脂肪酸側鎖として結合しているPCの標準品のイオン強度比と、生体サンプルのイオン強度比とを比較すると、sn-1,sn-2の結合様式が明確に分かる。そのイオン強度比から飽和脂肪酸がsn-1に、不飽和脂肪酸がsn-2に結合していることが証明された。PC(16:0/18:0)に関しては、標準品と生体サンプルのイオン強度比に開きがあることから、生体サンプルのPC(16:0/18:0)は必ずしもsn-1が16:0とはなっておらず、半数程度がsn-1に18:0が結合しているものと思われる。このように、生体サンプルのみでもsn-1,sn-2のどちらに脂肪酸側鎖が結合しているかは不明のまま定量を行うことになるが、位置異性体の標準品が存在する場合はそのイオン強度比をつかってsn-1,sn-2のどちらにどの程度の脂肪酸が結合しているかを求めることも可能である。
<Discussion of lipid profiling results>
From the result of the correction factor of the ionic strength ratio of the fatty acid side chain of each lipid (Fig. 10), the neutral loss of the saturated fatty acid ((16:0), (18:0)) in the transition for quantification of DG and the highly unsaturated Comparing the neutral losses of fatty acids ((20:4), (22:6)), the ionic strength difference is 5 to 10 times or more. From these results, it can be said that both arachidonic acid and DHA are compounds that are very easily eliminated compared with other fatty acid side chains. There is an ionic strength difference of 6 to 20 times or more between the ionic strength of the saturated fatty acid and the ionic strength of the highly unsaturated fatty acid in the transition for quantitative determination of PS. In addition, in other glycerophospholipids, the ionic strength of the fatty acid side chain was measured in the same way as PS, but PC and PE show relatively similar trends, and both (18: 2) are easy to detach. . It was found that the ionic strength ratios of the same fatty acid side chains differ considerably depending on the type of glycerophospholipid. Overall, the transition of glycerophospholipids has a tendency opposite to the neutral loss of DG, and the ionic strength of polyunsaturated fatty acids, especially DHA, is low compared to other fatty acids. In addition, from the results of measuring samples with known sn-1 and sn-2 in advance (Table 1), it was found that the ionic strength was reversed between positional isomers of sn-1 and sn-2 even for the same fatty acid. I can ask. Based on this fact, with respect to lipids having two fatty acid side chains, the fatty acid side chain bound to sn-2 tends to be released very easily when mass spectrometry is used. In other words, it is thought that the product ionic strength also increased in parts other than the types of fatty acid side chains, since polyunsaturated fatty acids usually bind to sn-2 in vivo. This fact agrees with the fact that saturated fatty acids are usually bound to sn-1 and unsaturated fatty acids are bound to sn-2 in lipids present in vivo. The ratio of the ionic strength of the standard PC, which actually binds (18:0)/(18:1) and (16:0)/(18:1) as fatty acid side chains, to the ionic strength ratio of the biological sample. , the binding modes of sn-1 and sn-2 can be clearly seen. From the ionic strength ratio, it was proved that the saturated fatty acid was bound to sn-1 and the unsaturated fatty acid was bound to sn-2. Regarding PC (16:0/18:0), there is a difference in the ionic strength ratio between the standard and the biological sample, so the PC (16:0/18:0) of the biological sample does not necessarily have sn-1 of 16: It is not 0, and about half of them are thought to have 18:0 bound to sn-1. In this way, even if only a biological sample is used, quantification is performed without knowing which of sn-1 and sn-2 the fatty acid side chain is bound to. Using the ionic strength ratio, it is also possible to determine to which of sn-1 and sn-2 how much fatty acid is bound.

本発明によれば、2個以上の脂肪酸側鎖を有する、異なる脂質分子間で、量比を算出することができる、脂質プロファイリングシステム、脂質プロファイリング方法、及び脂質プロファイリングプログラムが提供される。 According to the present invention, a lipid profiling system, a lipid profiling method, and a lipid profiling program are provided that are capable of calculating quantitative ratios between different lipid molecules having two or more fatty acid side chains.

10…脂質プロファイリングシステム、20…タンデム質量分析装置、110…取得部、120…脂質量比算出部、130…脂質濃度取得部、140…脂質濃度算出部、150…出力部、160…記憶部、HG…ヘッドグループ、L…脂質、CO…濃度、LR…脂質量比、FC…脂肪酸側鎖、LC…脂質クラス、sn…stereospecifically numbered、LPC…リゾフォスファチジルコリン、LPE…リゾフォスファチジルエタノールアミン 10... lipid profiling system, 20... tandem mass spectrometer, 110... acquisition unit, 120... lipid amount ratio calculation unit, 130... lipid concentration acquisition unit, 140... lipid concentration calculation unit, 150... output unit, 160... storage unit, HG: head group, L: lipid, CO: concentration, LR: lipid amount ratio, FC: fatty acid side chain, LC: lipid class, sn: stereospecifically numbered, LPC: lysophosphatidylcholine, LPE: lysophosphatidylethanol Amine

Claims (10)

複数種類の脂質を含む試料がタンデム質量分析装置により分析された分析結果に基づいて、前記試料の脂質プロファイリングを行う脂質システムであって、
前記分析結果から、脂肪酸側鎖を2個以上有する脂質の前記脂肪酸側鎖の種類、及び前記脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度を、同じ脂質クラスに属する前記複数種類の脂質についてそれぞれ取得する取得部と、
前記取得されたプロダクトイオン強度を用いて、第1種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、前記第1種類の脂質と同じ脂質クラスに属する第2種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質との間の量比を算出する、脂質量比算出部と、
を備える、脂質プロファイリングシステム。
A lipid system that performs lipid profiling of a sample containing multiple types of lipids based on the analysis results of a tandem mass spectrometer,
an acquiring unit that acquires, from the analysis results, the type of the fatty acid side chain of a lipid having two or more fatty acid side chains and the product ionic strength of the fatty acid side chain for each of the plurality of types of lipids belonging to the same lipid class; ,
Using the obtained product ionic strength, the product ionic strength of the first type of fatty acid side chain possessed by the first type of lipid and the second type of lipid belonging to the same lipid class as the first type of lipid possessed a lipid amount ratio calculation unit that calculates the amount ratio between the first type of lipid and the second type of lipid based on the ratio of the product ionic strength of the first type of fatty acid side chain;
A lipid profiling system comprising:
前記第1種類の脂質は、前記第1種類の脂肪酸側鎖と第2種類の脂肪酸側鎖とを有し、
前記脂質量比算出部は、前記取得されたプロダクトイオン強度を用いて、
前記第1種類の脂質が有する前記第2種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、前記第1種類の脂質と同じ脂質クラスに属する第3種類の脂質が有する前記第2種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第3種類の脂質との間の量比を算出する、
請求項1に記載の脂質プロファイリングシステム。
The first type of lipid has the first type of fatty acid side chain and the second type of fatty acid side chain,
The lipid amount ratio calculation unit uses the acquired product ion intensity,
The product ionic strength of the second type of fatty acid side chain possessed by the first type of lipid and the product ionic strength of the second type of fatty acid side chain possessed by the third type of lipid belonging to the same lipid class as the first type of lipid. Calculate the quantitative ratio between the first type of lipid and the third type of lipid based on the ratio of the product ionic strength,
A lipid profiling system according to claim 1 .
前記第2種類の脂質は、前記第1種類の脂肪酸側鎖と第3種類の脂肪酸側鎖とを有し、
前記脂質量比算出部は、更に、前記取得されたプロダクトイオン強度を用いて、
前記第2種類の脂質が有する前記第3種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、前記第1種類の脂質と同じ脂質クラスに属する第4種類の脂質が有する前記第3種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比に基づいて、前記第2種類の脂質と前記第4種類の脂質との間の量比を算出する、
請求項2に記載の脂質プロファイリングシステム。
The second type of lipid has the first type of fatty acid side chain and the third type of fatty acid side chain,
The lipid amount ratio calculation unit further uses the acquired product ion intensity,
The product ionic strength of the third type of fatty acid side chain possessed by the second type of lipid and the product ionic strength of the third type of fatty acid side chain possessed by the fourth type of lipid belonging to the same lipid class as the first type of lipid. Calculate the quantitative ratio between the second type of lipid and the fourth type of lipid based on the ratio of the product ionic strength,
A lipid profiling system according to claim 2.
前記脂質量比算出部は、更に、
前記第1種類の脂質が有する前記第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、前記第2種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比が示す第1の補正係数を傾きとする仮想的検量線と、
前記第2種類の脂質が有する前記第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、前記第3種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比が示す第2の補正係数を傾きとする仮想的検量線と、を作成する、
請求項2に記載の脂質プロファイリングシステム。
The lipid amount ratio calculation unit further
Hypothetical first correction coefficient indicated by the ratio of the product ionic strength of the first type of fatty acid side chain and the product ionic strength of the second type of fatty acid side chain possessed by the first type of lipid to be the slope standard calibration curve and
Hypothetical second correction coefficient indicated by the ratio of the product ionic strength of the first type of fatty acid side chain and the product ionic strength of the third type of fatty acid side chain possessed by the second type of lipid is assumed to be the slope create a standard calibration curve and
A lipid profiling system according to claim 2.
前記第1種類の脂質の濃度を取得する濃度取得部と、
前記濃度取得部が取得した前記第1種類の脂質の濃度と、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質との間の量比とに基づいて、前記第2種類の脂質の濃度を算出する脂質濃度算出部と、
を更に備える請求項1に記載の脂質プロファイリングシステム。
a concentration acquisition unit that acquires the concentration of the first type of lipid;
Based on the concentration of the first type of lipid acquired by the concentration acquisition unit and the quantitative ratio between the first type of lipid and the second type of lipid, the concentration of the second type of lipid is determined. A lipid concentration calculation unit to calculate,
The lipid profiling system of claim 1, further comprising:
前記第1種類の脂質は、前記第1種類の脂肪酸側鎖と第2種類の脂肪酸側鎖とを有し、
前記脂質量比算出部は、前記取得されたプロダクトイオン強度を用いて、
前記第1種類の脂質が有する前記第2種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、前記第1種類の脂質と同じ脂質クラスに属する第3種類の脂質が有する前記第2種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第3種類の脂質との間の量比を算出し、
前記脂質濃度算出部は、
前記濃度取得部が取得した前記第1種類の脂質の濃度と、前記第1種類の脂質と前記第3種類の脂質との間の前記量比とに基づいて、前記第3種類の脂質の濃度を算出する、
請求項5に記載の脂質プロファイリングシステム。
The first type of lipid has the first type of fatty acid side chain and the second type of fatty acid side chain,
The lipid amount ratio calculation unit uses the acquired product ion intensity,
The product ionic strength of the second type of fatty acid side chain possessed by the first type of lipid and the product ionic strength of the second type of fatty acid side chain possessed by the third type of lipid belonging to the same lipid class as the first type of lipid. Calculate the quantitative ratio between the first type of lipid and the third type of lipid based on the ratio of the product ionic strength,
The lipid concentration calculator,
of the third type of lipid based on the concentration of the first type of lipid obtained by the concentration obtaining unit and the quantitative ratio between the first type of lipid and the third type of lipid; calculate the concentration,
Lipid profiling system according to claim 5.
前記第2種類の脂質は、前記第1種類の脂肪酸側鎖と第3種類の脂肪酸側鎖とを有し、
前記脂質量比算出部は、更に、前記取得されたプロダクトイオン強度を用いて、
前記第2種類の脂質が有する前記第3種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、前記第1種類の脂質と同じ脂質クラスに属する第4種類の脂質が有する前記第3種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比に基づいて、前記第2種類の脂質と前記第4種類の脂質との間の量比を算出し、
前記脂質濃度算出部は、
前記第2種類の脂質の濃度と、前記第2種類の脂質と前記第4種類の脂質との間の前記量比とに基づいて、前記第4種類の脂質の濃度を算出する、
請求項5に記載の脂質プロファイリングシステム。
The second type of lipid has the first type of fatty acid side chain and the third type of fatty acid side chain,
The lipid amount ratio calculation unit further uses the acquired product ion intensity,
The product ionic strength of the third type of fatty acid side chain possessed by the second type of lipid and the product ionic strength of the third type of fatty acid side chain possessed by the fourth type of lipid belonging to the same lipid class as the first type of lipid. Calculate the quantitative ratio between the second type of lipid and the fourth type of lipid based on the ratio of the product ionic strength,
The lipid concentration calculator,
Calculate the concentration of the fourth type of lipid based on the concentration of the second type of lipid and the quantitative ratio between the second type of lipid and the fourth type of lipid;
Lipid profiling system according to claim 5.
前記脂質クラスが、ジアシルグリセロール、トリアシルグリセロール、フォスファチジルコリン、フォスファチジルエタノールアミン、フォスファチジン酸、フォスファチジルセリン、フォスファチジルイノシトール、及びフォスファチジルグリセロールからなる群より選択される、請求項1~7のいずれか一項に記載の脂質プロファイリングシステム。 said lipid class is selected from the group consisting of diacylglycerols, triacylglycerols, phosphatidylcholines, phosphatidylethanolamines, phosphatidic acids, phosphatidylserines, phosphatidylinositols, and phosphatidylglycerols A lipid profiling system according to any one of claims 1-7. 複数種類の脂質を含む試料をタンデム質量分析装置により分析するステップと、
前記タンデム質量分析装置の分析により得られた、脂肪酸側鎖を2個以上有する脂質であって、同じ脂質クラスに属する前記複数種類の脂質の、前記脂肪酸側鎖の種類、及び前記脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度を、前記脂質の種類毎に取得するステップと、
前記取得されたプロダクトイオン強度を用いて、第1種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、前記第1種類の脂質と同じ脂質クラスに属する第2種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質との間の量比を算出する、ステップと、
を含む、脂質プロファイリング方法。
analyzing a sample containing multiple types of lipids with a tandem mass spectrometer;
A lipid having two or more fatty acid side chains obtained by the analysis of the tandem mass spectrometer, the types of the fatty acid side chains, and the types of the fatty acid side chains of the plurality of types of lipids belonging to the same lipid class obtaining a product ionic strength for each type of lipid;
Using the obtained product ionic strength, the product ionic strength of the first type of fatty acid side chain possessed by the first type of lipid and the second type of lipid belonging to the same lipid class as the first type of lipid possessed calculating the quantitative ratio between the first type of lipid and the second type of lipid based on the ratio of the product ionic strength of the first type of fatty acid side chain;
A method of lipid profiling, comprising:
コンピュータに、
複数種類の脂質を含む試料がタンデム質量分析装置により分析された分析結果から、脂肪酸側鎖を2個以上有する脂質であって、同じ脂質クラスに属する前記複数種類の脂質について、前記脂肪酸側鎖の種類、及び前記脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度を、前記脂質の種類毎に取得するステップと、
前記取得されたプロダクトイオン強度を用いて、第1種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、前記第1種類の脂質と同じ脂質クラスに属する第2種類の脂質が有する第1種類の脂肪酸側鎖のプロダクトイオン強度と、の比に基づいて、前記第1種類の脂質と前記第2種類の脂質との間の量比を算出する、ステップと、
を実行させるための、脂質プロファイリングプログラム。
to the computer,
From the analysis results of a sample containing multiple types of lipids analyzed by a tandem mass spectrometer, lipids having two or more fatty acid side chains and belonging to the same lipid class, the multiple types of lipids belong to the same lipid class. obtaining the type and product ionic strength of the fatty acid side chain for each type of the lipid;
Using the obtained product ionic strength, the product ionic strength of the first type of fatty acid side chain possessed by the first type of lipid and the second type of lipid belonging to the same lipid class as the first type of lipid possessed calculating the quantitative ratio between the first type of lipid and the second type of lipid based on the ratio of the product ionic strength of the first type of fatty acid side chain;
A lipid profiling program for running
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