JP6632746B2 - 癌を治療するための1−テトラヒドロピラニルカルボニル−2,3−ジヒドロ−1h−インドール化合物 - Google Patents
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Description
R1aは、水素、メチル、エテニル、シアノ、フルオロ、クロロ、フルオロメチル、またはジフルオロメチルであり、
R1bは、水素、フルオロ、またはクロロであり、
R1cは、水素、ヒドロキシ、フルオロ、ベンジルオキシ、またはヒドロキシエチルアミノであり、
R2は、水素またはメチルであり、
R2aは、水素またはメチルであり、
R3aは、テトラヒドロピラニルである。
a)R1aは、水素、メチル、シアノ、フルオロ、またはクロロであり、
b)R1bは、水素、フルオロ、またはクロロであり、
c)R1cは、水素またはヒドロキシであり、
d)R2は、水素またはメチルであり、
e)R2aは、水素またはメチルであり、
f)R3aは、テトラヒドロピラニルであり、
g)R1aはフルオロであり、R1bは水素であり、R1cは水素であり、R2は水素であり、R2aは水素であり、R3はテトラヒドロピラニルである。
1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エタノンの合成
TEA(51.9mL、372.2mmol)およびテトラヒドロピラン−4−カルボニルクロリド(22.1g、148.9mmol)を、DCM(496mL)中の1−インドリン−5−イルエタノン(20.0g、124.1mmol)の混合物に加える。得られた混合物を室温で2時間撹拌する。反応混合物をDCM(500mL)で希釈し、飽和重炭酸ナトリウム水溶液で洗浄する。有機層を単離し、水層をDCM(500mL)で2回抽出する。合わせた有機層を飽和塩化ナトリウム水溶液で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濾液を濃縮して、表題化合物を淡黄色固体として定量的に得る。ES/MS(m/z):274.0(M+H)。
生成物をヘプタンで処理し、濃縮する。処理および濃縮を再度繰り返す。ヘプタンで処理し、0〜5℃に冷却する。濾過により生成物を回収し、ヘプタンですすぎ、乾燥して、表題化合物を得る。
[5−(N−ヒドロキシエタンイミドイル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−イル](テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イル)メタノンの合成
ヒドロキシルアミン(水中50質量%、22.8mL、372mmol)を、EtOH(1240mL)中の1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エタノン(調製1)(33.9g、124.0mmol)の混合物に加える。得られた混合物を室温で3日間撹拌する。反応混合物を濃縮して、表題化合物をE/Z異性体の混合物として定量的に得る。ES/MS(m/z):289.0(M+H)。
ラセミ体[5−(1−アミノエチル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−イル](テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イル)メタノンの合成
RANEY(登録商標)ニッケル(EtOH中のスラリー、60g)を2250mLのPARR(登録商標)シェーカーボトルに加え、窒素でパージする。MeOH(700mL)中の2Mアンモニア、次いで、MeOH(700mL)中の2Mアンモニア中の[5−(N−ヒドロキシエタンイミドイル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−イル](テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イル)メタノン(調製2)(35.8g、124.0mmol)の溶液を加える。必要に応じて、潜在的に発熱性の混合物を室温に冷却し、密閉し、窒素で、次いで水素でパージする。水素下(60psiまたは414kPa)、4時間、室温で撹拌する。固体を濾過除去し、濾液を濃縮する。EtOAc中の7〜26%(MeOH中7Mアンモニア)を用いたシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、表題化合物(26.5g、78%)をオフホワイトの固体として得る。ES/MS(m/z):275.0(M+H)。
[5−(1−アミノエチル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−イル](テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イル)メタノン、異性体1、および[5−(1−アミノエチル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−イル](テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イル)メタノン、異性体2の分離
キラルSFCにより、ラセミ体[5−(1−アミノエチル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−イル](テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イル)メタノン(調製3)を精製して、第1の溶出エナンチオマー(異性体1)を得る。ES/MS(m/z):275.0(M+H)。精製条件:CHIRALPAK(登録商標)AD−H、50×150cmカラム;移動相:CO2中の40%EtOH(0.5%N,N−ジメチルエチルアミンを含む);カラム温度:40℃;流速:300g/分;UVW:260nm。キラル分析用SFC(>99%ee、Rt:1.35分;カラム:CHIRALPAK(登録商標)AD−H、4.6×150mm;移動相:CO2;中の40%EtOH(0.5%N,N−ジメチルエチルアミンを含む);流速:5mL/分;UVW:260nm)により、またはキラル分析用HPLC(97.4%ee、Rt:6.48分;カラム:CHIRALPAK(登録商標)AD−H、4.6mm×150mm;移動相:100%EtOH(0.2%イソプロピルアミンを含む);流速:1mL/分;UVW:225nm)により、異性体1のエナンチオマー濃縮を確認する。
(R)−2−メチル−N−{1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エチリデン}プロパン−2−スルフィンアミドの合成
チタン(IV)エトキシドを、THF(43.9mL)中の1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エタノン(調製1)(3.0g、11.0mmol)および(R)−2−メチルプロパン−2−スルフィンアミド(1.6g、13.2mmol)の混合物に加える。得られた混合物を24時間還流する。反応混合物を室温に冷却する。混合物をEtOAc(100mL)および飽和塩化ナトリウム水溶液(40mL)で希釈し、15分間激しく撹拌する。有機層を単離し、水層をEtOAc(100mL)で2回抽出する。合わせた有機層を飽和水性塩化ナトリウムで洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濾液を濃縮する。DCM中の10〜100%ACNを用いたシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、表題化合物(3.7g、87%)を淡黄色固体として得る。ES/MS(m/z):377.0(M+H)。
反応物を室温に冷却する代わりに、反応混合物を10℃に冷却し、次いで濾過する。固体をトルエンですすぎ、乾燥して、表題化合物を得る。
(R)−2−メチル−N−{1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エチル}プロパン−2−スルフィンアミド、異性体Aの合成
iPrOH(2mL)中のジクロロ(p−シメン)ルテニウム(II)二量体(0.021g、0.033mmol)、2−アミノ−2−メチル−1−プロパノール(0.006g、0.066mmol)、およびモレキュラーシーブ(4Å、0.5g)の混合物を加熱還流し、次いで50℃に冷却する。iPrOH(8.8mL)中の(R)−2−メチル−N−{1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エチリデン}プロパン−2−スルフィンアミド(調製5)(0.5g、1.33mmol)の溶液、およびiPrOH(1.6mL)中のカリウムtert−ブトキシド(0.019g、0.17mmol)の溶液を加える。得られた混合物を55℃で2時間加熱する。次いで、iPrOH(2mL)中のジクロロ(p−シメン)ルテニウム(II)二量体(0.021g、0.033mmol)、2−アミノ−2−メチル−1−プロパノール(0.06g、0.66mmol)、およびモレキュラーシーブ(4Å、0.5g)の追加の混合物を加熱還流し、50℃に冷却し、上記反応混合物に加える。iPrOH(1.6mL)中のカリウムtert−ブトキシド(0.019g、0.17mmol)の溶液を、上記反応混合物に加える。混合物を55℃で20分加熱する。反応物を室温に冷却し、一晩撹拌する。反応物をDCM(20mL)で希釈し、珪藻土パッドで濾過する。パッドをDCM中の5%MeOHで洗浄し、濾液を濃縮して、表題化合物を定量的に得る。ES/MS(m/z):379.0(M+H)。
反応物を室温に冷却する代わりに、反応混合物を28〜32℃に冷却し、次いで珪藻土で濾過する。濾過固体をジクロロメタンですすぎ、濃縮し、表題化合物を得る。
[5−(1−アミノエチル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−イル](テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イル)メタノン、異性体1の合成
塩酸(1,4−ジオキサン中4M、1.66mL、6.64mmol)を、MeOH(6.6mL)中の(R)−2−メチル−N−{1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エチル}プロパン−2−スルフィンアミド、異性体A(調製6)(503mg、1.33mmol)の混合物に加える。得られた混合物を室温で1時間撹拌する。残渣を逆相クロマトグラフィー(Redisep Rf Gold高速C18逆相カラム、10mM重炭酸アンモニウム水溶液中の0〜100%ACN)によって濃縮し、精製する。濃縮して表題化合物を得る(265mg、73%)。キラル分析用HPLC(98.8%ee、Rt:6.40分;カラム:CHIRALPAK(登録商標)AD−H、4.6mm×150mm;移動相:100%EtOH(0.2%イソプロピルアミンを含む);流速:1mL/分;UVW:225nm)により、エナンチオマー濃縮を確認する。調製4Aの異性体1であることが確認された。ES/MS(m/z):275.0(M+H)。
塩酸(iPrOH中5.5M、400mL、2.20mol)を、EtOAc(1.2L)中の(R)−2−メチル−N−{1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エチル}プロパン−2−スルフィンアミド、異性体A(162.3g、364mmol)の5℃のスラリーに、オーバーヘッド機器での撹拌を行いながら、滴下して加える。100mLの酸溶液を加えた後、冷却浴を取り除く。添加を続け、得られた混合物を室温で3時間撹拌する。3℃に冷却し、濾過する。洗浄液が透明になるまで、濾過ケーキを1〜1.5LのEtOAcですすぐ。回収した固体を家庭用真空オーブン中60℃で乾燥して、表題化合物をオフホワイトの固体(96.4g、82.5%)として得る。キラル分析用HPLC(98%ee、Rt:6.45分;カラム:CHIRALPAK(登録商標)AD−H、4.6mm×150mm;移動相:100%EtOH(0.2%イソプロピルアミンを含む);流速:1mL/分;UVW:225nm)により、エナンチオマーの濃縮を確認する。調製4Aの異性体1であることが確認された。ES/MS(m/z):275.0(M+H)。調製4Aの異性体1であることが確認された。ES/MS(m/z):275.1(M+H)。
tert−ブチル5−アセチル−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−カルボキシレートの合成
トルエン(12mL)中の1−インドリン−5−イルエタノン(1.00g、6.02mmol)の100℃の溶液を、トルエン(12mL)中の二炭酸ジ−tert−ブチル(1.97g、9.03mmol)の溶液で、20分間にわたって滴下して処理する。混合物の加熱を30分間続ける。反応混合物を濃縮する。ヘキサン中の15〜35%(1:1 EtOAc:DCM)を用いたシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、表題化合物(1.52g、97%)を白色固体として得る。ES/MS(m/z):262.0(M+H)。
tert−ブチル5−[メトキシ(メチル)カルバモイル]−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−カルボキシレートの合成
DMF(200mL)中の1−(tert−ブトキシカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−カルボン酸(14.0g、53.2mmol)およびN,N−ジイソプロピルエチルアミン(28.0mL、161mmol)の溶液を、1−[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]−1H−1,2,3−トリアゾロ[4,5−b]ピリジニウム−3−オキシドヘキサフルオロホスフェート(23.3g、61.1mmol)で処理する。得られた混合物を室温で5分間撹拌する。N,O−ジメチルヒドロキシルアミン塩酸塩(7.26g、74.4mmol)を加える。得られた混合物を室温で一晩撹拌する。反応混合物をEtOAcで希釈し、飽和重炭酸ナトリウム水溶液で洗浄する。有機層を単離し、水層をEtOAcで2回抽出する。合わせた有機層を水で2回洗浄し、飽和塩化ナトリウム水溶液を加えて相分離を促進する。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濾液を濃縮する。ヘキサン中の10〜32%アセトンを用いたシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、表題化合物を透明な無色の濃密な油状物として定量的収率で得る。ES/MS(m/z):307.0(M+H)。
tert−ブチル5−プロパノイル−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−カルボキシレートの合成
THF(311mL、無水)中のtert−ブチル5−[メトキシ(メチル)カルバモイル]−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−カルボキシレート(調製11)(14.3g、46.7mmol)の溶液を0℃に冷却する。臭化エチルマグネシウム(ジエチルエーテル中3M、39.0mL、117mmol)を25分間にわたり滴下して加える。0℃で1.5時間撹拌した後、反応混合物を飽和塩化アンモニウム水溶液で注意深く急冷する。EtOAcで3回抽出する。合わせた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濾液を濃縮する。ヘキサン中の15〜30%(1:1 EtOAc:DCM)を用いたシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、表題化合物(11.7g、91%)を白色固体として得る。ES/MS(m/z):276.0(M+1)。
(キラル分離のための)tert−ブチル5−[1−アミノプロピル]−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−カルボキシレート、異性体1、およびtert−ブチル5−[1−アミノプロピル]−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−カルボキシレート、異性体2の分離
キラルクロマトグラフィーにより、ラセミ体tert−ブチル5−[1−アミノプロピル]−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−カルボキシレート(調製16)を精製して、最初の溶出エナンチオマー(異性体1)を得る。MS(m/z):260.0(M−NH2)+。精製条件:CHIRALPAK(登録商標)AD、8×33.5cmカラム;移動相:100%MeOH(0.2%N,N−ジメチルエチルアミンを含む);流速:400mL/分;UVW:240nm。キラル分析用HPLC(>99%ee、Rt:9.2分;カラム:CHIRALPAK(登録商標)AD−H、4.6×150mm;移動相:100%MeOH(0.2%N,N−ジメチルエチルアミンを含む);流速:0.6mL/分;UVW:280nm)により、異性体1のエナンチオマー濃縮を確認する。
ラセミ体tert−ブチル5−{1−[(4−フルオロベンゾイル)アミノ]エチル}−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−カルボキシレートの合成
DCM(57mL)中のラセミ体tert−ブチル5−[1−アミノエチル]−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−カルボキシレート(調製15)(3.00g、11.4mmol)の溶液を、N,N−ジイソプロピルエチルアミン(4.0mL、57.2mmol)で処理する。4−フルオロベンゾイルクロリド(1.52mL、12.6mmol)を加え、一晩撹拌する。反応混合物を水で急冷し、飽和重炭酸ナトリウム水溶液を加える。層を分離し、DCMで2回抽出する。合わせた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濾液を濃縮する。ヘキサン中の50〜75%(DCM中の10%アセトン)を用いたシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、淡黄色固体として表題化合物(4.29g、98%)を得る。ES/MS(m/z):407.0(M+Na)+、383.0(M−H)−。
tert−ブチル5−[1−{[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}プロピル]−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−カルボキシレート、異性体Aの合成
DCM(47.0mL)中のtert−ブチル5−[1−アミノプロピル]−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−カルボキシレート、異性体2(調製17B)(3.25g、11.8mmol)の溶液を、室温で、N,N−ジイソプロピルエチルアミン(4.53mL、25.9mmol)で処理する。クロロギ酸ベンジル(2.12mL、14.1mmol)を加え、一晩撹拌する。反応混合物を追加のN,N−ジイソプロピルエチルアミン(2.06mL、11.8mmol)およびクロロギ酸ベンジル(0.707mL、4.70mmol)で処理する。30分間撹拌する。反応混合物を水で急冷し、飽和重炭酸ナトリウム水溶液を加える。層を分離し、水層をDCMで2回抽出する。合わせた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濾液を濃縮する。ヘキサン中の5〜35%アセトンの勾配で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、表題化合物(4.47g、93%)を白色フォームとして得る。ES/MS(m/z):433.2(M+Na)+、409.0(M−H)−。
ラセミ体N−[1−(2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル)エチル]−4−フルオロベンズアミドの合成
1,4−ジオキサン(27.9mL、112mmol)中の4M塩酸を、DCM(112mL)中のラセミ体tert−ブチル5−{1−[(4−フルオロベンゾイル)アミノ]エチル}−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−カルボキシレート(調製18)(4.29g、11.2mmol)の混合物に加える。得られた混合物を40℃で6時間加熱する。2NのNaOH水溶液で中和する。4:1のCHCl3:IPAを加え、粘着性の固体を溶解し、層を分離する。塩水で有機層を洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濾液を濃縮する。ヘキサン中30〜60%(DCM中25%アセトン)の勾配で溶出するシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、わずかにオフホワイトのフォームとして表題化合物(2.48g、78%)を得る。ES/MS(m/z):285.0(M+H)。
(キラル分離のための)N−[1−(2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル)エチル]−4−フルオロベンズアミド、異性体1、およびN−[1−(2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル)エチル]−4−フルオロベンズアミド、異性体2の分離
キラルSFCにより、ラセミ体N−[1−(2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル)エチル]−4−フルオロベンズアミド(調製21)を精製して、最初の溶出エナンチオマー(異性体1)を得る。ES/MS(m/z):285.0(M+H)。精製条件:CHIRALPAK(登録商標)AS−H、5×15cmカラム;移動相:CO2中の15%iPrOH;カラム温度:40℃;流速:300g/分;UVW:250nm。キラル分析用SFC(>99%ee、Rt:1.47分;カラム:CHIRALPAK(登録商標)AS−H、4.6×150mm;移動相:CO2中の25%iPrOH;流速:5mL/分;UVW:300nm)により、異性体1のエナンチオマー濃縮を確認する。
{5−[1−アミノプロピル]−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−イル}(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イル)メタノン、異性体Aの合成
EtOH(35mL)中のベンジル{1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]プロピル}カルバメート、異性体A(調製9)(2.12g、5.02mmol)の溶液を、PARR(登録商標)シェーカーボトル中で、EtOH(35mL)中の20%水酸化パラジウム炭素(2.12g)の窒素パージした懸濁液に加える。シールし、窒素でパージし、次いで水素でパージする。414kPa(60psi)の水素雰囲気下、室温で3.6時間振盪する。反応混合物を珪藻土で濾過し、濾液を濃縮して、表題化合物(1.36g、94%)を灰白色の固体として得る。ES/MS(m/z):289.2(M+H)、272.0(M−NH2)+。
2−メチル−2−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]プロパン酸メチルの合成
n−ブチルリチウム(3.6mL、8.9mmol、ヘキサン中2.2M)を、窒素下、トルエン(25mL)中のジシクロヘキシルアミン(1.9mL、9.6mmol)の0℃の撹拌溶液に加え、20分間撹拌する。トルエン(5mL)中のイソ酪酸メチル(0.83g、8.2mmol)の溶液を、先に調製した混合物に滴下して加え、0℃で30分間撹拌する。[5−ブロモ−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−イル](テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イル)メタノン(調製8)(2.3g、7.4mmol)を加え、得られた混合物を窒素で脱気する。ジ−μ−ブロモビス(トリ−t−ブチルホスフィン)ジパラジウム(I)(50mg、0.06mmol)を加え、得られた混合物を窒素下で室温に温める。2時間後、ジ−μ−ブロモビス(トリ−t−ブチルホスフィン)ジパラジウム(I)(50mg、0.06mmol)の第2の部分を加え、室温で窒素下で一晩撹拌する。EtOAcおよび1N HCl水溶液で希釈し、10分間撹拌する。固体を濾過し、EtOAcですすぐ。濾液層を分離し、有機層を飽和重炭酸ナトリウム水溶液および塩水で洗浄する。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、濾液を濃縮する。ヘキサン中の20〜60%EtOAcを用いたシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、白色固体として表題化合物(2.3g、収率94%、純度89%)を得る。ES/MS(m/z):332.2(M+H)。
2−メチル−2−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]プロパン酸の合成
2−メチル−2−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]プロパン酸メチル(調製26)(2.2g、6.6mmol)をTHF(66mL)に溶解し、カリウムトリメチルシラノレート(1.1g、8.6mmol)を加える。室温で4日間撹拌する。固体を濾過し、THFで洗浄する。固体を水に溶解し、5NのHCl水溶液で酸性化する。冷蔵庫中で30分間冷却する。濾過して、表題化合物(1.20g、57%)を白色固体として回収する。ES/MS(m/z):318.0(M+H)。
2−メチル−2−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]プロパンアミドの合成
1,1’−カルボニルジイミダゾール(126mg、0.763mmol)を、DCM(6.4mL)中の2−メチル−2−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]プロパン酸(調製27)(202mg、0.636mmol)の撹拌溶液に加え、窒素下、室温で45分間撹拌した。水酸化アンモニウム(1mL、9.55mmol、水中25%w/v)を加え、室温で窒素下で90分間撹拌する。溶解性を促進するためにDMF(3mL)を加え、室温で2時間撹拌を続ける。濃縮し、DCM中の0〜10%EtOHを用いたシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、表題化合物(180mg、89%)を白色固体として得る。ES/MS(m/z):317.0(M+H)。
[5−(1−アミノ−1−メチルエチル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−イル](テトラヒドロピラン−4−イル)メタノンの合成
[ビス(トリフルオロアセトキシ)ヨード]ベンゼン(115mg、0.26mmol)を、ACN(0.25mL)および水(0.25mL)中の2−メチル−2−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]プロパンアミド(調製28)(81mg、0.26mmol)の撹拌混合物に加え、室温で窒素下で一晩撹拌する。濃縮して、表題化合物(140mg、94%、50%純物質)を淡ピンク色の固体として得る。ES/MS(m/z):289.2(M+H)、272.0(M−NH2)+。
メチル4−フルオロ−2−[(2−ヒドロキシエチル)アミノ]ベンゾエートの合成
メチル−2−アミノ−4−フルオロベンゾエート(2.81g、15.9mmol)および2−ヨードエタノール(0.879mL、11.2mmol)の混合物を90℃で6時間加熱し、次いで室温に冷却する。ニートの(neat)混合物をEtOAcに溶解し、1NのNaOH水溶液で3回洗浄し、続いて塩水で洗浄する。有機層を無水硫酸マグネシウムで乾燥し、濾過し、濾液を濃縮し、2.94gの淡褐色油状物を得る。2−ヨードエタノール(1.26mL、15.9mmol)を加え、混合物を100℃で一晩加熱する。追加の2−ヨードエタノール(0.314mL、3.99mmol)を加え、100℃で2時間加熱を続ける。室温まで冷却する。ニートの(neat)混合物をEtOAcに溶解し、1NのNaOH水溶液で3回洗浄し、続いて塩水で洗浄する。有機層を無水硫酸マグネシウムで乾燥し、濾過し、濾液を濃縮し、2.50gの褐色固体を得る。ヘキサン中の20〜40%EtOAcを用いたシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、表題化合物(1.12g、33%)を白色固体として得る。ES/MS(m/z):214.0(M+H)。
4−フルオロ−2−[(2−ヒドロキシエチル)アミノ]安息香酸の合成
水酸化ナトリウム(0.49mL、2.4mmol、水中5M)を、1,4−ジオキサン(2.4mL)中の4−フルオロ−2−[(2−ヒドロキシエチル)アミノ]安息香酸メチル(調製30)(104mg、0.488mmol)の撹拌溶液に加える。30分間室温で蓋をして撹拌し、次いで70℃で2時間加熱する。濃縮し、1NのHCl水溶液で約pH1〜2に酸性化し、DCMで2回抽出する。合わせた有機層を無水硫酸マグネシウムで乾燥し、濾過し、濾液を濃縮して、表題化合物(89mg、92%)を黄褐色固体として得る。ES/MS(m/z):200.0(M+H)。
1−(2,4−ジフルオロフェニル)−3−(2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イルメチル)尿素の合成
DCM(100mL)中のtert−ブチル5−(アミノメチル)インドリン−1−カルボキシレート(4.1g、17mmol)および2,4−ジフルオロ−1−イソシアナトベンゼン(3mL、24mmol)の混合物を1時間撹拌する。MeOHおよび水で反応物を急冷し、濃縮する。残渣をDCM(30mL)に溶解し、TFA(15mL)を加え、室温で2時間放置する。濃縮し、飽和重炭酸ナトリウム水溶液を加える。MeOH/DCM(1/5、v/v)で混合物を抽出する。有機層を無水硫酸マグネシウムで乾燥し、濾過し、濾液を濃縮する。EtOHから再結晶して2つの収穫物を得る。収穫物を合わせて表題化合物(3.5g、68%)を得る。ES/MS(m/z):304.0(M+H)。
1−(2,4−ジフルオロフェニル)−3−{[1−(3,4,5−トリブロモベンゾイル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]メチル}尿素の合成
DMF(2mL)中の1−(2,4−ジフルオロフェニル)−3−(2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イルメチル)尿素(参照調製1)(70mg,0.23mmol)、3,4,5−トリブロモ安息香酸(170mg、0.24mmol)、および1−[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]−1H−1,2,3−トリアゾロ[4,5−b]ピリジニウム3−オキシドヘキサフルオロホスフェート(134mg、0.35mmol)の溶液を脱気する(N2)。TEA(0.08mL、0.6mmol)を加え、室温で1時間撹拌する。逆相精製(カラム:Redisep Rf Gold高速C18逆相カラム;溶出液:A:5%MeOH(pH10)を含む水中の10mM重炭酸アンモニウム、B:ACN;勾配:5分間40%B、次いで15分間にわたり40〜95%B;流速60mL/分、UVW219/254nM)により反応混合物を直接精製し、生成物を凍結乾燥により単離し、表題化合物(149mg、54%)を得る。ES/MS(m/z、79Br/81Br):644.0/646.0(M+H)。
ラセミ体4−フルオロ−N−{1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エチル}ベンズアミド
4−フルオロ−N−{(1R)−1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エチル}ベンズアミド
合成法1:
TEA(9.8mL、70.3mmol)、次いで4−フルオロベンゾイルクロリド(5.85g、36.9mmol)を、DCM(176mL)中の[5−(1−アミノエチル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−イル](テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イル)メタノン、異性体1(調製4A)(9.65g、35.2mmol)の溶液に0℃で加える。得られた混合物を室温に温め、一晩撹拌する。反応混合物をEtOAc(300mL)で希釈し、シリカゲルパッドで濾過し、EtOAcで洗浄する。濾液を濃縮し、DCM中の25〜30%ACNの勾配を用いるシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、表題化合物(9.4g、67.1%)をオフホワイトの固体として得る。MS(m/z):397.2(M+H)。キラル分析SFC(>99%ee、Rt:1.74分;カラム:CHIRALPAK(登録商標)AD−H、4.6×150mm;移動相:CO2中の40%MeOH;流速:5mL/分;UVW:225nm)により、エナンチオマー濃縮を確認する。1H NMR(d6−DMSO)δ8.73(d、J=8Hz、1H)、7.98(d、J=8Hz、1H)、7.93−7.89(m、2H)、7.28−7.23(m、2H)、7.22(s、1H)、7.12(d、J=8Hz、1H)、5.07(quin、J=8Hz、1H)、4.14(t、J=8Hz、2H)、3.85(m、2H)、3.36(m、2H)、3.09(t、J=8Hz、2H)、2.80(m、1H)、1.57−1.66(m、4H)、1.41(d、J=7Hz、3H)。
TEA(65mL、468mmol)を、DCM(700mL)中の[5−(1−アミノエチル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−1−イル](テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イル)メタノン塩酸塩、異性体1(調製7B)(70g、225mmol)の混合物に0〜5℃で加える。4−フルオロベンゾイルクロリド(37.85g、239mmol)を滴下して加える。混合物を室温に温め、2時間撹拌する。温度を30℃未満に保つ速度で水を滴加して加え、混合物を20〜30℃で1時間撹拌する。層を分離し、有機層を18%H2SO4水溶液で洗浄する。層を分離し、有機層を7%NaHCO3水溶液で洗浄する。層を分離し、有機層を水で洗浄する。層を分離し、次いで、有機溶液を炭素フィルターに通す。溶液をSI−チオール(7g)で処理し、混合物を40℃に加熱する。得られた混合物を12時間撹拌する。混合物を室温に冷却し、混合物を珪藻土で濾過する。有機層を200mL(約3体積)に濃縮する。アセトン(140mL、2体積)を加え、得られた混合物を200mL(約3体積)に濃縮する。追加のアセトン(280mL、4体積)および水(280mL、4体積)で処理する。反応が透明な溶液になるまで、65℃で2時間加熱する。3時間にわたってゆっくりと30℃に冷却する。30℃で1時間撹拌する。水(140mL、2体積)を滴下して加え、30℃で1時間撹拌を続ける。約2時間にわたってゆっくりと3〜8℃に冷却する。この温度で6時間撹拌する。固体を濾過し、水(140mL、2体積)ですすぐ。固体を55℃で4〜6時間乾燥する。所望の生成物を白色固体として得る(55g、61.6%)。
結晶性固体のXRDパターンは、CuKa源(λ=1.54060Å)およびVantec検出器を備えたBruker D4 Endeavor X線粉末回折計で35kVおよび50mAで操作して得られる。試料は、2θにおける0.0087°の工程サイズおよび0.5秒/工程の走査速度で、0.6mmの発散スリット、5.28mmの固定散乱防止スリット、および9.5mm検出スリットを用いて、2θにおける4〜40°で走査される。乾燥粉末を石英試料ホルダに充填し、ガラススライドを使用して滑らかな表面を得る。周囲温度および相対湿度で結晶形回折パターンを収集する。
実施例1A(合成法3)の調製試料は、CuKa放射線を用いたXRDパターンにより、以下の表1に記載される回折ピーク(2θ値)を有すると特徴付けられる。具体的には、パターンは、0.2度の回折角の許容範囲(2θ±0.2°)で、12.51°、15.65°、16.37°、17.56°、21.48°、および25.23°からなる群から選択される1つ以上のピークと組み合わせて17.38°にピークを含む。
10mgの4−フルオロ−N−{(1R)−1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エチル}ベンズアミドを、1:1EtOH/ヘプタン(1.75mL)に懸濁し、オービタルシェーカーで3日間スラリーにすることにより、4−フルオロ−N−{(1R)−1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エチル}ベンズアミドの単結晶を調製する。X線結晶解析のため、約0.020mm×0.080mm×0.300mmの寸法を有する、4−フルオロ−N−{(1R)−1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エチル}ベンズアミドの無色の刃状の試料を用いる。IμCuKα放射線源(λ=1.54178Å)および光子100SLエリア検出器を備えたBruker D8 Ventureに基づく3軸ゴニオメータ回折計を用いて、X線強度データを測定する。合計8840のフレームを収集する。狭フレーム(narrow−frame)アルゴリズムを用いたBruker SAINTソフトウェアパッケージで、フレームを積算する。単斜晶系単位格子を用いたデータの積算は、最大θ角68.28°(0.83Å分解能)までの合計7242の反射をもたらしたが、そのうち3059は独立し(平均多重度2.367、完全性=95.9%、Rint=5.83%、Rsig=6.58%)、2893(94.57%)は2σ(F2)より大きい。a=5.5831(13)Å、b=5.1082(9)Å、c=35.013(6)Å、β=90.578(17)°、体積=998.5(3)Å3の最終格子定数は、10.09°<2θ<136.8°を伴う、20σ(I)を上回る6280反射のXYZ−重心の精密化に基づく。マルチスキャン法(SADABS)を使用して吸収効果のデータを修正する。最大みかけ透過率に対する最小みかけ透過率の比は0.784である。計算された最小および最大透過係数(結晶サイズに基づく)は、0.8020および0.9850である。Bruker SHELXTLソフトウェアパッケージを使用して、空間群P21を使用し、C23H25FN2O3の化学式単位についてはZ=2を用いて構造を解析し、精密化する。264変数でのF2についての最終的な異方性完全行列(full−matrix)最小二乗法による精密化は、観測データではR1=9.17%に収束し、すべてのデータではwR2=23.48%に収束する。適合度は1.141である。最終の差電子密度合成における最大ピークは0.506e−/Å3であり、最大孔が−0.358e−/Å3であり、RMS偏差が0.088e−/Å3である。最終モデルに基づき、計算密度は1.319g/cm3およびF(000)、420e−である。絶対構造パラメータは、0.12(16)に精密化され、キラル中心の立体化学を検証する。絶対構造は、立体中心においてR−立体配置であると決定される。
4−フルオロ−N−{(1S)−1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エチル}ベンズアミド、異性体2
4−クロロ−N−{1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エチル}ベンズアミド、異性体1、および4−クロロ−N−{1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エチル}ベンズアミド、異性体2
2,4−ジフルオロ−N−{1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エチル}ベンズアミド、異性体1、および2,4−ジフルオロ−N−{1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エチル}ベンズアミド、異性体2
ジアステレオマー4−フルオロ−N−[1−{1−[テトラヒドロ−2H−ピラン−3−イルカルボニル]−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル}エチル]ベンズアミド(2つのジアステレオマーの混合物)
4−フルオロ−N−[1−{1−[テトラヒドロ−2H−ピラン−3−イルカルボニル]−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル}エチル]ベンズアミド、異性体1、および4−フルオロ−N−[1−{1−[テトラヒドロ−2H−ピラン−3−イルカルボニル]−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル}エチル]ベンズアミド、異性体2
4−フルオロ−2−ヒドロキシ−N−{1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]エチル}ベンズアミド、異性体A
ラセミ体4−フルオロ−N−{1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]プロピル}ベンズアミド
4−フルオロ−N−{1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]プロピル}ベンズアミド、異性体1、および4−フルオロ−N−{1−[1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]プロピル}ベンズアミド、異性体2
1−(2,4−ジフルオロフェニル)−3−{[1−(3,4,5−トリトリチオベンゾイル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]メチル}尿素
1−(2,4−ジフルオロフェニル)−3−{[1−(フェニルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]メチル}尿素
このアッセイの目的は、ある種の例示化合物がインビトロでIDO1に結合することを実証することである。具体的には、このアッセイは、トリチウム化スパイ分子1−(2,4−ジフルオロフェニル)−3−[[1−(3,4,5−トリトリチオベンゾイル)インドリン−5−イル]メチル]尿素と競合する試験化合物の能力を評価し、結合親和性IC50の計算を可能にする。
DPBSに希釈した300nM His6−IDO1(Proteros,SwissProtID P14902,カタログ番号 PR−0278,バッチ19/59,25mM MES中98mg/mL pH6.5,150mM KCl,純度>95%)をニッケル被覆プレート(Sigma、カタログ番号S5563)の各ウェルにロードし、4℃で一晩インキュベートする。BIOTEK(登録商標)マイクロプレートウォッシャーでプレートを300μL DPBSで4回洗浄することにより、未結合のタンパク質を除去する。1ウェルあたり100μLのブロッキングバッファー(0.05%TWEEN(登録商標)20/DPBS)を加え、室温で1時間インキュベートし、非特異的結合を低減させる。プレートをブロックしながら、DPBSに希釈することにより50nM 1−(2,4−ジフルオロフェニル)−3−[[1−(3,4,5−トリトリチオベンゾイル)インドリン−5−イル]メチル]尿素(Biocair、カタログ番号TRQ41455)を調製し、DMSO中で2.5倍の未標識ストック溶液を段階希釈して、11点の希釈曲線を作成する。5μLの段階希釈した非標識化合物を50nM 1−(2,4−ジフルオロフェニル)−3−[[1−(3,4,5−トリトリチオベンゾイル)インドリン−5−イル]メチル]尿素95μLに加え、混合物をプレート中のウェルに加え、穏やかに振とうしながら室温で4時間インキュベートする。トリチウム化スパイ分子(1−(2,4−ジフルオロフェニル)−3−[[1−(3,4,5−トリトリチオベンゾイル)インドリン−5−イル]メチル]尿素の最大変位を測定するために、過剰量の非標識1−(2,4−ジフルオロフェニル)−3−{[1−(フェニルカルボニル)−2,3−ジヒドロ−1H−インドール−5−イル]メチル}尿素(ChemDiv、カタログ番号G714−0242)100μM〜50nM 1−(2,4−ジフルオロフェニル)−3−[[1−(3,4,5−トリトリチオベンゾイル)インドリン−5−イル]メチル]尿素を加え、プレート中の非特異的結合参照ウェルに加える。4時間のインキュベーション後、MultiMek96を使用してウェルを吸引し、BIOTEK(登録商標)マイクロプレートウォッシャーを用いて、プレートを300μLの氷冷DPBSで1回すばやく洗浄する。PBS pH7.5中の100mMイミダゾール100μLを各ウェルに加え、室温で10分間インキュベートして、ニッケル被覆プレートからのIDO1リガンド複合体を置換する。MultiMek96を用いて、1ウェルあたり200μLのMicroscint−20(Perkin Elmer、カタログ番号6013621)を含む96ウェルの白色透明底プレート(Costar、カタログ番号3632)に置換されたIDO1リガンド複合体を移す。1−(2,4−ジフルオロフェニル)−3−[[1−(3,4,5−トリトリチオベンゾイル)インドリン−5−イル]メチル]尿素配位子の全結合および非特異的結合(NSB)を、Trilux Microbetaカウンターを用いて定量化する。GraphPad Prismでの非線形回帰分析を用いて、全結合およびNSB値を用いて非結合化合物のIC50を計算する。このアッセイの結果は、ある種の例示化合物がIDO1に結合することを示す。例えば、実施例1Aおよび1Bは、1.5μM未満のIC50値を示す。具体的には、実施例1AのIC50は0.033μM±0.0028(n=2)である。
このアッセイの目的は、IDO1発現癌細胞におけるキヌレニン、N−ホルミル−キヌレニンの生成およびトリプトファンの枯渇の阻害を評価し、化合物がこれらの細胞に対して明らかに毒性であるかを評価することである。例示的な化合物を、IDO1を本来的に発現する卵巣癌細胞株であるSKOV3(ATCC、カタログ番号HTB−77)でのIDO1活性の阻害について試験する。IDO1発現に起因して、SKOV3細胞は、キヌレニンの付随的な生成を伴いながらトリプトファンを分解し、化合物をキヌレニン、N−ホルミル−キヌレニンの生成およびトリプトファンの枯渇を阻害する能力について試験する。任意選択により、化合物の明白な毒性は、細胞生存率をモニターすることによって評価することができる。
N−ホルミルL−キヌレニン−d4の合成
(2S)−2−アミノ−4−オキソ−4−(2,3,4,5−テトラジュウテリオ−6−ホルムアミド−フェニル)ブタン酸
1ウェル当たり20,000細胞でIDO1発現卵巣癌細胞株であるSKOV3細胞を、96ウェル組織培養プレート(BD Biosciences)中の非必須アミノ酸(Gibco、カタログ番号11140−050)、1mMピルビン酸ナトリウム(Gibco、カタログ番号11360−070)、および10%ウシ胎児血清を補充した100μLのMcCoys 5A培地(Gibco、カタログ番号16600−082)(完全培地)にプレーティングする。次に、5%CO2を含む37℃のインキュベーターで16時間、細胞をインキュベートする。DMSO中の10mMストック試験化合物から化合物の段階希釈液を調製する。ストック溶液をDMSOで3倍に段階希釈し、95μLの完全培地を含む中間投与プレートに5μLの化合物を移し、1μM〜0.5pMまたは10μM〜0.5nMのいずれかの範囲の最終化合物濃度で、10点の希釈曲線を作成する。細胞が入ったプレートから培地をデカントし、ペーパータオル上にブロットする。ウェルあたり90μLの完全培地でプレートを2回洗浄し、最後の洗浄液を90μLの完全培地と交換する。洗浄後、10μLの段階希釈した化合物を中間投与プレートからプレートの各ウェルに加え、5%CO2を含む37℃インキュベーターで18時間インキュベートする。アッセイでの最終DMSO濃度は0.5%である。18時間のインキュベーションの終了時に、96ウェルのv底プレート(Thermo Scientific)に各ウェルから50μLの培地を移し、プレートをシールし、キヌレニン、N−ホルミル−キヌレニンおよびトリプトファンの質量分析に基づくその後の測定のために−80℃で保存する。任意選択により、元のプレートをさらに24時間インキュベーターに戻し、等しい体積のCELLTITER−GLO(登録商標)(Promega)を加えることにより細胞の生存率を測定し、PERKIN ELMER(登録商標)EnVisionプレートリーダーで発光を測定する。
SKOV3細胞に基づくアッセイから採取した試料を氷上で解凍し、プレートを3220xgで4℃で1分間遠心分離することにより細胞破片を取り除く。2.5μg/mLのL−トリプトファン−2’,4’,5’,6’,7’−d5(CDN同位体、カタログ番号D−1522)、L−キヌレニン硫酸塩−環−d4,3,3−d2(Cambridge Isotope Laboratories、カタログ番号DLM−7842−0.01)および内部で調製したN−ホルミルL−キヌレニン−d4からなる12.5μLの内部標準を加える。すべてのプレートをEasy Peelシール(ThermoScientific)でヒートシーリングし、1〜2分間ボルテックスして混合し、4℃で3220xgで1分間遠心分離する。それぞれを水に溶解することによりキヌレニンおよびN−ホルミルキヌレニンの定量化のための標準較正溶液を生成し、1mg/mLの最終濃度を得る。各1mg/mLのストックから20.8μLのキヌレニンおよび23.6μLのN−ホルミルキヌレニンを分取し、McCoys 5A培地を用いて1mLに希釈し、各標準について100μMの最終濃度を得る。完全培地中で較正溶液を2倍に段階希釈し、最終濃度が5μM〜0.313μM(キヌレニン)および2μM〜0.125μM(N−ホルミルキヌレニン)の5点標準曲線を得る。SHIMADZU(登録商標)Prominence 30A HPLCシステムとAB SCIEX(登録商標)5500トリプル四重極質量分析計からなるLC/MS−MSシステムに、1μLの培地試料(未知)または標準較正溶液を注入する。35℃に維持したXBridge(商標)C18カラム(2.1×50mm、3.5μm(Waters、カタログ番号186003021))で、移動相流速0.7mL/分で分析物を分離する。移動相Aは0.1%ギ酸水溶液であり、移動相BはMeOHである。勾配プロフィールは、0分、0.5%B;0.8分、98%B;1.10分、98%B;1.11分、0.5%B;1.7分であり、その後に停止した。APCI陽性多重反応モニタリングモードで質量分析計を操作する。標準曲線試料のデータを使用し、MultiQuan(商標)ソフトウェアを使用して、各分析物について線形適合検量線を作成する。生成された標準曲線を使用して、未知物について分析物濃度を計算する。
このアッセイの目的は、インビボでの癌細胞におけるキヌレニン生成およびトリプトファン枯渇の阻害を評価することである。卵巣癌細胞株であるSKOV3X(インディアナ大学研究技術センター)は、本来的にIDO1を発現し、無胸腺ヌード−Foxn1nuマウス(Harlan)の腹腔内に容易に腫瘍を形成する。IDO1発現の結果として、SKOV3X腫瘍は、トリプトファンを局所的に枯渇させ、腫瘍微小環境において高レベルのキヌレニンを付随的に生成する。このアッセイの目的は、腫瘍のキヌレニンレベルの明らかな減少によって明示されるIDO1を阻害する試験化合物の能力を測定することである。
非必須アミノ酸(Gibco、カタログ番号11140−050)、1mMピルビン酸ナトリウム(Gibco、カタログ番号11360−070)、および10%FBSを補充したMcCoys 5A培地(Gibco、カタログ番号16600−082)でSKOV3Xを培養し、5%CO2中、37℃でインキュベートする。細胞をトリプシン処理し、培養物から単離し、細胞をハンクス平衡塩溶液(HBSS)に再懸濁する。2×106個のSKOV3X細胞を、各無胸腺ヌード−Foxn1のnuマウス(Harlan)の腹腔内に移植する。移植後約3週間して、触診して腫瘍形成を確かめ、担癌マウスをビヒクル対照および化合物処置群に無作為化する。1%ヒドロキシエチルセルロース(HEC)および0.025%TWEEN(登録商標)80および0.05%消泡剤を含有するビヒクル中に処方された化合物または単独でビヒクルを、強制経口投与により投与する。担癌動物に単回投与することによって時間経過阻害プロファイルを生成し、投与後2,4,8,12、および24時間で血漿、肝臓、および腫瘍試料を回収する。EDTA含有血液採取チューブ(Greiner bio−one、カタログ番号450474)に血液を採取し、2365xgで遠心分離し、血漿を単離し、−80℃で凍結する。肝臓および腫瘍の断片を分離し、重さを記録し、瞬間凍結し、−80℃で保存する。
透析により、L−キヌレニンおよびL−トリプトファンが枯渇した血漿および組織ホモジネートであるストリッピングした(stripped)マトリックスを最初に作製することにより、L−キヌレニンおよびL−トリプトファンの較正標準を調製する。次いで、既知量のL−キヌレニンおよびL−トリプトファンでストリッピングしたマトリックスを強化する。10mLのEDTA処理マウス血漿(Bioreclamation IVT、カタログ番号MSEPLEDTA3)をSPECTORA/POR(登録商標)FLOAT−A−LYZER(登録商標)G2(Spectrum Labs、カタログ番号G235063)に加え、この透析装置を1000mLのリン酸緩衝生理食塩水および透析液中に一晩置くことにより、ストリッピングしたマウス血漿を生成する。その後、この装置を1000mLの新鮮なリン酸緩衝化生理食塩水に移し、透析を繰り返す。ストリッピングしたマウス血漿を清潔な容器に移し、将来の使用のために−20℃で保存する。対照マウス肝臓1gあたり3mLのMeOH/水(1:1、v/v)を加えることにより対照の肝ホモジネートを調製し、超音波プローブでホモジナイズする。腫瘍組織をホモジナイズするために組織粉砕機を使用することを除いて、同じ様式で腫瘍ホモジネートを調製する。10mLの対照組織ホモジネート、肝臓、および腫瘍を別々のSPECTRA/POR(登録商標)FLOAT−A−LYZER(登録商標)G2装置に加え、1000mLのMeOH/水(1:1、v/v)で一晩透析し、次いで、それぞれを新鮮な1000mLのMeOH/水(1:1、v/v)に移し、透析を繰り返す。ストリッピングした組織ホモジネートを別々の容器に移し、将来の使用のために−20℃で保存する。
マウス同系Colon26モデル:
10mM HEPES、1nMピルビン酸ナトリウム、および10%ウシ胎仔血清を補充したRPMI 1640培地中で、マウスBALB/c由来Colon26結腸癌細胞株を増殖させる。サブコンフルエント細胞をトリプシンを用いて獲得し、血清を欠く完全増殖培地で2回すすぐ。免疫能のあるBALB/cマウス(Envigo、Indianapolis、IN)の後部脇腹にHBSSに再懸濁した1×106個の細胞を注射することにより、皮下腫瘍を開始する。腫瘍移植後6日目に、動物を体重に基づいて無作為化し、示されるように1群当たりの動物の数を用いて各処置群に入れる。
10%ウシ胎仔血清を補充したRPMI 1640培地中でヒトNSCLC細胞株L55を増殖させる。サブコンフルエント細胞をトリプシンを用いて獲得し、血清を欠く増殖培地で2回すすぐ。T細胞、B細胞、NK細胞を欠き、サイトカインシグナル伝達が欠失しているNOD scidガンマ鎖ノックアウトマウス(NSG)マウス(Jackson Laboratory、メイン州バーハーバー)としてより一般的に知られているNOD.Cg−PrkdcscidIl2rgtm1Wj1/SzJマウスの後部脇腹に、HBSSおよびMATRIGEL(登録商標)(BD Biosciences、ニュージャージー州フランクリンレイクス)の1:1混合物中の5x106を注射することにより、皮下腫瘍の増殖を開始する。平均腫瘍体積が約200〜300mm3に達したら、腫瘍サイズおよび体重で動物を無作為化し、示されるように各処置群に入れる。無作為化後、レシピエントの尾静脈にPBS単独(PBMCなし)または1×107のヒトPBMCを含むPBSで担癌マウスに負荷させる。
スタディディレクターを使用して腫瘍の大きさと体重を収集する。式:V=0.536×L×W2(ここで、L=より大きい測定された直径、W=より小さい垂直の直径である)を用いて腫瘍体積(V)を推定する。腫瘍体積データを対数スケールに変換して、時間および処置群の分散を均等にする。SASソフトウェア(バージョン9.2)のMIXED手順を用い、時間および処置による反復のある分散の二元配置分散分析(two−way repeated measures analysis of variance)を用いて、対数体積データを分析する。反復測定の相関モデルはSpatial Powerである。各時点で対照群に対して処置群を比較する。各処置群についても別々にMIXED手順を使用して、各時点での調整された平均および標準誤差を計算する。両方の分析は、各動物内の自己相関、および大きな腫瘍を有する動物が早期に研究から除外されたときに生じたデータの消失を説明する。実施例1Aを投与した最終日に最も近くに取得した腫瘍体積測定を用い、式%ΔT/C=100×ΔT/ΔC(ここで、T=化合物処置群の平均腫瘍体積、ΔT=化合物処置群の平均腫瘍体積−ベースライン日の平均腫瘍体積、C=対照(ビヒクル)群の平均腫瘍体積、およびΔC=対照群の平均腫瘍体積−ベースライン日の平均腫瘍体積)を用いて、腫瘍体積の相対的変化(%ΔT/C)を計算する。ΔT<0の場合、腫瘍後退値が、%T/Cの代わりに%後退=100×ΔT/T最初により計算され、T最初=ベースライン日の平均腫瘍容積となるようにする。
単剤処置実施例1A
Colon26腫瘍を有するBALB/cマウス(n=10)を、1日2回、21日間、10、50、および100mg/kgの用量で強制経口投与により、実施例1Aで処置する。腫瘍移植の6日後に実施例1Aの投与を開始し、処置期間中、腫瘍増殖および体重を1週間に2回監視する。
L55腫瘍増殖に対するhPBMC効果
L55 NCLCヒト癌細胞株は、hPBMCの注射に関連するアロ−応答に対して本来的に耐性である。これらの研究の目的は、適応免疫系を欠くマウス(NSGマウス)において、ヒトT細胞がヒトL55腫瘍を標的化し、その増殖を制限することを可能にする化合物のアロ反応を増強する化合物の能力を評価することである。L55腫瘍の腫瘍増殖阻害に対するhPBMCの寄与を評価するために、hPBMCを欠くhPBSまたは1×107のhPBMCを含むPBSで、約250mm3に達した確立されたL55腫瘍を有するNSGマウス(n=10)を模擬注射する。処置期間中、腫瘍体積および体重を週2回測定する。
hPBMCによって仲介されるL55腫瘍成長阻害を増強する実施例1Aの能力を評価するために、約250mm3に達した確立されたL55腫瘍を有するNSGマウス(n=10)をhPBMCを欠くPBSで模擬注射し、別のグループ(n=10)を1×107のhPBMCを含むPBSで模擬注射する。両方の群を、75mg/kgの実施例1Aで強制経口投与により1日2回、21日間処置する。処置期間中、腫瘍体積および体重を週2回測定する。
hPBMCによって仲介されるL55腫瘍成長阻害を増強するLY3300054の能力を評価するために、約250mm3に達した確立されたL55腫瘍を有するNSGマウス(n=10/群)の2群をhPBMCを含むPBSで注射する。1群を10mg/kg IgG−エフェクターヌル(IgG−EN)対照抗体で、他方を10mg/kg LY3300054で、1週間に1回4週間、腹腔内注射により処置する。処置期間中、腫瘍体積および体重を週2回測定する。
約250mm3に達したL55担癌NSGマウス(n=10)をhPBMCで注射し、75mg/kgの実施例1Aで1日2回強制経口投与により21日間、および10mg/kgのLY3300054で週に1回4週間、腹腔内注射により処置する。処置期間中、腫瘍体積および体重を週2回測定する。
腫瘍体積データを対数スケールに変換して、時間および処置群の分散を均等にする。SASソフトウェア(バージョン9.3)のMIXED手順を用い、時間および処置による反復のある二元配置分散分析を用いて、対数体積データを分析する。反復測定の相関モデルはSpatial Powerである。各時点で処置群を対照群と比較する。各処置群について別々にMIXED手順を使用して、各時点での調整された平均および標準誤差を計算する。両方の分析は、各動物内の自己相関、および大きな腫瘍を有する動物が早期に研究から除外されたときに生じたデータの消失を説明する。時間に対する各処置群の調整された平均および標準誤差をプロットする。
反復測定分析の結果とともに、コントラストステートメント(contrast statement)を用いて各時点での相互作用効果を試験し、ビヒクルおよび組み合わせ群の平均を2つの単剤群の平均と比較する。これは、相加性を試験するためのブリスインディペンデンス法と等しい。組み合わせについて予想される相加反応(EAR)は、腫瘍体積スケールで、EAR容積=V1*V2/V0として計算され、ここで、V0、V1、およびV2は、それぞれビヒクル対照、処置1単独、および処置2単独についての推定の平均腫瘍体積である。相互作用試験が有意である場合、観察された組み合わせの平均体積がEAR体積よりも小さいかまたは大きいことに依存して、組み合わせ効果が相加的より大きいまたは相加的より小さいと統計的に言明される。さもなくば、統計的結論は相加的である。
アミノ酸およびヌクレオチド配列
配列番号1(ヒトPD−L1)
MRIFAVFIFMTYWHLLNAFTVTVPKDLYVVEYGSNMTIECKFPVEKQLDLAALIVYWEMEDKNIIQFVHGEEDLKVQHSSYRQRARLLKDQLSLGNAALQITDVKLQDAGVYRCMISYGGADYKRITVKVNAPYNKINQRILVVDPVTSEHELTCQAEGYPKAEVIWTSSDHQVLSGKTTTTNSKREEKLFNVTSTLRINTTTNEIFYCTFRRLDPEENHTAELVIPELPLAHPPNERTHLVILGAILLCLGVALTFIFRLRKGRMMDVKKCGIQDTNSKKQSDTHLEET
配列番号2(LY3300054のHCDR1)
KASGGTFSSYAIS
配列番号3(LY3300054のHCDR2)
GIIPIFGTANYAQKFQG
配列番号4(LY3300054のHCDR3)
ARSPDYSPYYYYGMDV
配列番号5(LY3300054のLCDR1)
SGSSSNIGSNTVN
配列番号6(LY3300054のLCDR2)
YGNSNRPS
配列番号7(LY3300054のLCDR3)
QSYDSSLSGSV
配列番号8(LY3300054のHCVR)
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSSYAISWVRQAPGQGLEWMGGIIPIFGTANYAQKFQGRVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSPDYSPYYYYGMDVWGQGTTVTVSS
配列番号9(LY3300054のLCVR)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNTVNWYQQLPGTAPKLLIYGNSNRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCQSYDSSLSGSVFGGGIKLTVLG
配列番号10(LY3300054のHC)
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSSYAISWVRQAPGQGLEWMGGIIPIFGTANYAQKFQGRVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSPDYSPYYYYGMDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAEGAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号11(LY3300054のLC)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNTVNWYQQLPGTAPKLLIYGNSNRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCQSYDSSLSGSVFGGGIKLTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPAECS
配列番号12(LY3300054のHCのDNA)
CAGGTCCAGCTGGTCCAGTCAGGGGCCGAGGTCAAAAAGCCAGGGTCATCTGTCAAAGTGTCTTGTAAGGCATCCGGGGGCACATTTTCCAGCTACGCTATCTCCTGGGTGAGACAGGCACCAGGGCAGGGTCTGGAGTGGATGGGCGGAATCATTCCCATCTTCGGGACCGCCAACTACGCTCAGAAGTTTCAGGGAAGGGTCACTATTACCGCCGACAAAAGCACATCTACTGCTTATATGGAGCTGTCTAGTCTGAGGTCTGAAGATACCGCAGTGTACTATTGCGCCCGGAGTCCCGACTATAGCCCTTACTATTACTATGGCATGGATGTCTGGGGCCAGGGAACCACAGTGACAGTCTCATCCGCTAGCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAAGCCGAGGGGGCACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTATGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAAGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCATCCTCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAAGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTATTCCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGCAAA
配列番号13(LY3300054のLCのDNA)
CAGTCCGTCCTGACACAGCCACCCTCAGCCTCTGGCACCCCTGGGCAGCGAGTGACAATCTCTTGTTCTGGGAGTTCCTCAAATATTGGTAGTAACACCGTGAATTGGTACCAGCAGCTGCCCGGCACAGCACCTAAGCTGCTGATCTATGGAAACTCAAATAGGCCATCCGGAGTCCCCGACCGGTTCTCTGGTAGTAAATCAGGCACTTCCGCCAGCCTGGCTATTAGCGGGCTGCAGTCTGAGGACGAAGCCGATTACTATTGCCAGTCTTACGATTCCAGCCTGTCTGGAAGTGTGTTTGGCGGAGGGATCAAGCTGACCGTCCTGGGCCAGCCTAAGGCTGCCCCCTCGGTCACTCTGTTCCCGCCCTCCTCTGAGGAGCTTCAAGCCAACAAGGCCACACTGGTGTGTCTCATAAGTGACTTCTACCCGGGAGCCGTGACAGTGGCCTGGAAGGCAGATAGCAGCCCCGTCAAGGCGGGAGTGGAGACCACCACACCCTCCAAACAAAGCAACAACAAGTACGCGGCCAGCAGCTACCTGAGCCTGACGCCTGAGCAGTGGAAGTCCCACAGAAGCTACAGCTGCCAGGTCACGCATGAAGGGAGCACCGTGGAGAAGACAGTGGCCCCTGCAGAATGCTCT
Claims (12)
- 請求項3に記載の化合物の結晶。
- 12.51°、15.65°、16.37°、17.56°、21.48°、および25.23°(2θ±0.2°)からなる群から選択される1つ以上のピークと組み合わせて17.38°に少なくとも1つのピークを含むX線粉末回折パターン(Cu放射線、λ−1.54060Å)によって特徴付けられる、請求項5に記載の結晶。
- 治療に使用するための、請求項1〜4のいずれか一項に記載の化合物または請求項5もしくは6に記載の結晶を含む、薬学的組成物。
- 1つ以上の薬学的に許容される賦形剤、担体、または希釈剤とともに、請求項1〜4のいずれか一項に記載の化合物または請求項5もしくは6に記載の結晶を含む、薬学的組成物。
- 癌の治療に使用するための、請求項7または8に記載の薬学的組成物。
- 前記癌が、メラノーマ、急性骨髄性白血病、慢性リンパ球性白血病、結腸直腸癌、腎細胞癌、乳癌、肺癌、卵巣癌、卵管癌、原発性腹膜癌、子宮頸癌、胃癌、肝臓癌、膵臓癌、甲状腺癌、神経膠腫、非ホジキンリンパ腫、およびホジキンリンパ腫からなる群から選択される、請求項9に記載の薬学的組成物。
- 癌の治療のための薬剤の製造における、請求項1〜4のいずれか一項に記載の化合物または請求項5もしくは6に記載の結晶の使用。
- 前記癌が、メラノーマ、急性骨髄性白血病、慢性リンパ球性白血病、結腸直腸癌、腎細胞癌、乳癌、肺癌、卵巣癌、卵管癌、原発性腹膜癌、子宮頸癌、胃癌、肝臓癌、膵臓癌、甲状腺癌、神経膠腫、非ホジキンリンパ腫、およびホジキンリンパ腫からなる群から選択される、請求項11に記載の使用。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
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