JP4839449B2 - 電気泳動用バッファ及び電気泳動法 - Google Patents
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Description
(a)β−グルカン又はメチルセルロースを含む電気泳動用バッファを用いる。
(b)チャネルに試料を導入する際に加圧を行う。
まず、この発明の実施に適用して好適な電気泳動に用いる装置について説明する。ここで、電気泳動とは、溶液中で電位差により試料としての高分子化合物などを移動させ、試料のサイズの違いにより生じる泳動速度の差を利用して試料を分離する手法のことを意味する。電気泳動法には種々の手法があるが、この項では、この発明を適用して好適なマイクロチップ電気泳動への応用について主に説明する。
図1を参照して、マイクロチップ電気泳動に用いられる一般的なマイクロチップについて説明する。図1は、マイクロチップの平面図である。
導入チャネル12は、マイクロチップ10の表面に形成された、均一な幅と深さとを有する溝である。この導入チャネル12は、分離チャネル14と交差する直線的な交差溝部分と、この溝部分の両端部分が、それぞれ逆方向に交差溝部分と直交する方向に屈曲して直線的に延在する端部の溝部分とを有している。
分離チャネル14は、マイクロチップ10の表面に形成された直線的に延在する溝であり、均一な幅と深さとを有している。分離チャネル14は、交差部16において導入チャネル12に直角に交差しており、導入チャネル12よりも全長が長く形成されている。分離チャネル14には、後述するバッファが充填される。分離チャネル14は、交差部16に存在する試料をバッファ貯留孔14bに向けて電気泳動させて、サイズごとに分離するために用いられる。
続いて、この発明のバッファについて説明する。
母液は、親水性のゲルを含んだ水溶液として調製される。
ZnO微粒子は、この発明のバッファの必須構成要件である。
(a)ZnO微粒子を分散させた分散液を母液に添加して攪拌する方法(以降、「希釈法」と称する)。
(b)ZnO微粒子を母液に直接添加して攪拌する(以降、「直接添加法」と称する)。
この発明の好適な実施例によれば、バッファは、ZnO微粒子とともに気泡を含むのがよい。以下、この気泡について説明する。
バッファは、ZnO微粒子又はZnO微粒子+気泡の他に、バクテリアセルロース又はバクテリアセルロース誘導体を材料とする微小網目構造体を含んでいてもよい。ここで、バクテリアセルロースとは、セルロース生産菌によって生産されたセルロースのことを意味する。このバクテリアセルロースは、太さが10〜100nmの範囲内にある繊維がランダムに絡み合っている。その結果、バクテリアセルロースは、網目のサイズが0.1〜1μmの範囲内にある3次元の微小網目構造体を形成している。
続いて、この発明の電気泳動法について、遅延期導入法を中心に説明する。この発明の電気泳動法では、充填工程、導入工程、遅延期導入工程及び本泳動工程をこの順序で実施する。以下、それぞれの工程について詳細に説明する。
電気泳動を行うに当っては、まず、マイクロチップ10の導入チャネル12と、これに交差する分離チャネル14のそれぞれにバッファを充填する充填工程を実施する。具体的には、導入チャネル12及び分離チャネル14の双方に、この発明のバッファを公知の方法により充填する。その後に、試料リザーバ12aにマイクロピペットなどを用いて、適当量の試料を導入する。
導入工程においては、導入チャネル12に対して導入用電圧を印加する。一般に、試料(核酸、タンパク質又はペプチドなど)はバッファ中でマイナス(−)に帯電している。従って、アウトレット12bを正極(+)とし、及び試料リザーバ12aを負極(−)として、導入チャネル12に導入用電圧を印加することにより、試料を、試料リザーバ12aから導入チャネル12へと導入することができる。
導入工程の終了後、分離チャネル14に分離用電圧を断続的に印加して、試料を分離チャネル14に導入する遅延期導入工程を実施する。具体的には、導入工程の終了後、約1秒の電圧切り替え時間(電圧未印加期間)を経て、分離チャネル14に分離用電圧を印加する。
遅延期導入工程の終了後、分離チャネル14に分離用電圧を印加して、試料を泳動させる本泳動工程を実施する。
実験は大きく分けて、(実験群1)、(実験群2)及び(実験群3)に分類される。
重複した説明を避けるために、この項においては、各実験に共通した条件を以下の各項にまとめる。
(A)第i回目(iは1≦i≦各実験の実施回数N)の測定で検出される第jピーク(jは1≦j≦(1試料で検出されるピークの本数PN))の蛍光強度Ij(i)(生データ)を、実施回数Nで平均して、第j平均ピーク強度AvIj(=(ΣIj(i=1〜N))/N)を求めた。
(B)ピーク位置ごとに、各実験の平均ピーク強度AvIjを、対照実験(実験A)の平均ピーク強度(AvCIj)で除して、平均ピーク強度比率RIj(=AvIj/AvCIj)を求めた。
(C)この平均ピーク強度比率RIjを、更に、1試料で検出されるピークの本数PNで平均して、後述する図4や表3〜7に示した相対蛍光強度(=(ΣRIj(j=1〜PN))/PN)とした。
(実験群1)及び(実験群2)に属する実験A〜Iは、ほぼ同様の手順で行われている。そこでこの項においては、両実験群についてまとめて説明する。
以下、実験A〜Iについて、詳細な実験条件を説明する。
実験Aは、従来法で行った電気泳動である。すなわち、バッファには、ZnO微粒子及び気泡は分散されていない。また、試料の遅延期導入を行っていない。従って、実験Aは「比較例」に対応する。また、実験Aは、その他の実験において相対蛍光強度を求める際の基準値を与える対照実験である。
実験Bは、気泡が分散されたバッファの効果を確認するための実験である。つまり、バッファには気泡のみが分散されている。また、バッファ単体の効果を確認するために、試料の遅延期導入を行っていない。従って、実験Bは「比較例」に対応する。
実験Cは、ZnO微粒子が分散されたバッファの効果を確認するための実験である。つまり、バッファには、ZnO微粒子のみが低濃度で分散されている。また、バッファ単体の効果を確認するために、試料の遅延期導入を行っていない。従って、実験Cは「実施例」に対応する。
実験Dは、ZnO微粒子及び気泡の両者が分散されたバッファの効果を確認するための実験である。つまり、バッファには、ZnO微粒子と気泡とが分散されて含まれている。なお、実験DにおけるZnO微粒子の濃度は、実験Cよりも高濃度とした。また、バッファ単体の効果を確認するために、試料の遅延期導入は行っていない。従って、実験Dは「実施例」に対応する。
実験Eは、遅延期導入の効果を確認するための実験である。つまり、バッファとして母液(ZnO微粒子及び気泡が添加されていない)を用い、この発明の遅延期導入を行った。従って、実験Eは、「比較例」に対応する。
実験Fは、遅延期導入の効果を確認するための実験である。つまり、この発明の遅延期導入工程の効果を確認するために、第1及び第2サブ工程における電圧印加時間を、この発明の範囲外の値に変更した。具体的には、実験Fでは、第1サブ工程の電圧印加時間を20秒とし、及び第2サブ工程の電圧印加時間を10秒とした。
実験Gは、この発明の電気泳動法の効果を確認するための実験である。つまり、バッファとして、ZnO微粒子及び気泡が分散されたものを用いて遅延期導入を行った。
実験Hは、この発明の電気泳動法の効果を確認するための実験である。つまり、バッファとして、ZnO微粒子及び気泡が分散されたものを用いて遅延期導入を行った。
実験Iは、この発明の電気泳動法の効果を確認するための実験である。つまり、実験Hと同様のバッファを用いてはいるが、遅延期導入をこの発明の範囲外の方法で行っている。
表3及び図4に実験結果を示す。また、下記表4に、気泡、ZnO微粒子及びこの発明の遅延期導入の3条件の有無と、検出感度の増加の程度との関係を示す。なお、表4の一番左側の列に、上述の3条件の中で幾つの条件が満足されているかを“○”の数で示している。
(4−1)実験J
実験Jにおいては、気泡の分散条件を変化させて、試料の検出感度を比較した。具体的には、ボルテックスミキサの攪拌時間を1〜5分の間で変化させた以外は、既に説明した実験Bと同様にして実験J1〜J5を行った。その結果を下記表5に示す。
実験Kは、遅延期導入の好適条件を確認するための実験である。つまり、遅延期導入工程において、第1サブ工程の分離用電圧の印加時間を種々に変更した実験K1〜K6を行った。なお、実験K1〜K6において、第1サブ工程の電圧印加時間以外の条件は、既に説明した実験Eと同様である。その結果を下記表6に示す。
実験Lは、遅延期導入の好適条件を確認するための実験である。つまり、遅延期導入工程において、第2サブ工程の繰り返し回数を0〜3回の間で変更した実験L1〜L4を行った。なお、実験L1〜L4において、第2サブ工程の繰り返し回数以外の条件は、既に説明した実験Eと同様である。
12 導入チャネル
12a 試料リザーバ
12b アウトレット
14 分離チャネル
14a バッファ注入孔
14b バッファ貯留孔
16 交差部
20 製造装置
22 チャンバ
24 カーボン電極
26 導電性ハース
28 真空排気系
30 ガス導入系
32 Znインゴット
Claims (18)
- ゲルを含んだ水溶液であって、
該水溶液中に酸化亜鉛微粒子を含むことを特徴とする電気泳動用バッファ。 - 前記酸化亜鉛微粒子が、酸素ガスと窒素ガスとを含む混合ガスを雰囲気ガスとして、該雰囲気ガス中で亜鉛を加熱して蒸発させることで製造されたものであること特徴とする請求項1に記載の電気泳動用バッファ。
- 前記酸化亜鉛微粒子が、円柱形の形態をしていて、その長さが50〜250nmの範囲内にあって、その直径が50〜120nmの範囲内にあることを特徴とする請求項1又は2に記載の電気泳動用バッファ。
- 前記酸化亜鉛微粒子が、棒状、粒状又は板状の形態をしていて、一辺が50〜1000nmの仮想的な立方体の内部に納まる大きさであることを特徴とする請求項1又は2に記載の電気泳動用バッファ。
- 前記酸化亜鉛微粒子が、中心の核から4本以上の棒状結晶が放射状に延在する形態をしていて、前記棒状結晶の長さが50〜1000nmの範囲内にあることを特徴とする請求項1に記載の電気泳動用バッファ。
- 前記酸化亜鉛微粒子として、(1)円柱形の形態をしていて、その長さが50〜250nmの範囲内にあって、その直径が50〜120nmの範囲内にある酸化亜鉛微粒子、(2)棒状、粒状又は板状の形態をしていて、一辺が50〜1000nmの仮想的な立方体の内部に納まる大きさの酸化亜鉛微粒子、及び(3)中心の核から4本以上の棒状結晶が放射状に延在する形態をしていて、前記棒状結晶の長さが50〜1000nmの範囲内にある酸化亜鉛微粒子からなる群より選択された2種類以上の当該酸化亜鉛微粒子を混合したものを用いることを特徴とする請求項1に記載の電気泳動用バッファ。
- 前記酸化亜鉛微粒子の濃度が、0.02〜100mg/mLの範囲内にあることを特徴とする請求項1〜6のいずれか一項に記載の電気泳動用バッファ。
- 前記酸化亜鉛微粒子が凝集して形成されたコロイド粒子を含むことを特徴とする請求項1〜6のいずれか一項に記載の電気泳動用バッファ。
- 前記酸化亜鉛微粒子の濃度が、50〜100mg/mLの範囲内にあることを特徴とする請求項8に記載の電気泳動用バッファ。
- 前記酸化亜鉛微粒子とともに、気泡を含むことを特徴とする請求項1〜9のいずれか一項に記載の電気泳動用バッファ。
- 前記気泡の粒径が30μm未満であることを特徴とする請求項10に記載の電気泳動用バッファ。
- 前記ゲルが、メチルセルロース、ヒドロキシメチルセルロース、カルボキシルメチルセルロース、ヒドロキシエチルセルロース、ヒドロキシプロピルセルロース及びヒドロキシプロピルメチルセルロースからなるセルロース誘導体群より選択された一種類のセルロース誘導体又は二種類以上を混合したセルロース誘導体からなり、
前記ゲルの濃度が0.01〜3wt%の範囲内にあることを特徴とする請求項1〜11のいずれか一項に記載の電気泳動用バッファ。 - 前記ゲルの濃度が、0.7〜1wt%の範囲内にあることを特徴とする請求項12に記載の電気泳動用バッファ。
- 前記ゲルに加えて、バクテリアセルロース、又はバクテリアセルロース誘導体を材料とする微小網目構造体が添加されていることを特徴とする請求項12又は13に記載の電気泳動用バッファ。
- マイクロチップ上で請求項1〜14のいずれか一項に記載の電気泳動用バッファを用いて試料を分離する方法であって、以下の工程を有することを特徴とする電気泳動法。
(1)前記マイクロチップの導入チャネルと、該導入チャネルに交差する分離チャネルのそれぞれに前記電気泳動用バッファを充填する充填工程。
(2)前記導入チャネルに導入用電圧を印加して、該導入チャネルに試料を導入する導入工程。
(3)前記分離チャネルに分離用電圧を断続的に印加して、前記試料を該分離チャネルに導入する遅延期導入工程。
(4)前記分離チャネルに前記分離用電圧を印加して、前記試料を泳動させる本泳動工程。 - 前記導入工程で、前記導入チャネルに、30〜100V/cmの範囲内の値の前記導入用電圧を、該導入チャネルの単位長さ(1mm)当たり6.5〜10.5秒間内の期間だけ印加することを特徴とする請求項15に記載の電気泳動法。
- 前記遅延期導入工程は、前記分離チャネルに175〜300V/cmの範囲内の値の前記分離用電圧を、該分離チャネルの単位長さ(1cm)当たり2〜2.5秒間内の期間だけ印加する第1サブ工程と、
該第1サブ工程終了後、0.5〜1秒間内の期間の電圧未印加状態を経て、前記分離チャネルに前記分離用電圧を、該分離チャネルの単位長さ(1cm)当たり4〜5秒間内の期間だけ印加する第2サブ工程とを含むことを特徴とする請求項15又は16に記載の電気泳動法。 - 前記本泳動工程で、前記分離チャネルに前記分離用電圧を、該分離チャネルの単位長さ(1cm)当たり40〜50秒間内の期間だけ印加することを特徴とする請求項15〜17のいずれか一項に記載の電気泳動法。
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