JP2781438B2 - 白血病及びリンパ腫におけるモノクローナリテイーの診断法 - Google Patents

白血病及びリンパ腫におけるモノクローナリテイーの診断法

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Description

【発明の詳細な説明】 本発明は悪性腫瘍(malignancy)を検出し、その直系
を測定するために白血病及びリンパ腫において使用する
ことができる診断法に関する。
免疫応答性細胞であるリンパ球には (a)各々、特定の外来抗原に結合する特異性免疫グロ
ブリン分子を産生するB−リンパ球、及び (b)各々、細胞をして特定の外来抗原に結合するのを
可能にする特異性表面リセプターを有するT−リンパ球 という2つのタイプがある。
各B−リンパ球は他の全てのB−リンパ球の免疫グロ
ブリン遺伝子とは構造がやや異なり、他方T−リンパ球
を含めて他の全ての体細胞(body cells)の免疫グロブ
リン遺伝子とは構造が著しく異なる、他にはない独特の
免疫グロブリン遺伝子を含む。同様に、各T−リンパ球
は他の全てのT−リンパ球のT−リセプタ遺伝子とは構
造がやや異なり、他方B−リンパ球を含めて全ての体細
胞のT−リセプタ遺伝子とは構造が著しく異なる、他に
はない独特のT−リセプタ遺伝子を含む。
リンパ系白血病及びリンパ腫はリンパ組織の癌の1形
態である。各白血病又はリンパ腫は単一のB−又はT−
リンパ球から生じ、それが複合し、拡がり、そして治療
しなければ最後には死をもたらす。腫瘍の細胞は全て単
一の細胞に由来するので、それらは全て遺伝的に同一で
あり、全て同一の唯一の遺伝子、即ち腫瘍がB−リンパ
球に生じた場合は独特の免疫グロブリン遺伝子を、又は
腫瘍がT−リンパ球に生じた場合は独特のT−リセプタ
遺伝子を含む。
逆に、もし組織に白血病又はリンパ腫によって冒され
ている疑いがある場合、上記の独特の免疫グロブリン遺
伝子が検出されれば、それはB−リンパ球腫瘍を推定さ
せる証拠となり、これに対して独特のT−リセプタ遺伝
子が検出されれば、それはT−リンパ球腫瘍を推定させ
る証拠となる。
本発明の目的は組織の試料の中に白血病又はリンパ腫
が存在するか、それとも存在しないかを、その試料の中
にモノローナルのB−またはT−リンパ球集団が存在す
るか、存在しないかを測定することによって判定するこ
とである。一般的に言うと、本発明は免疫グロブリン分
子またはT−リセプタ分子の個別セグメントに焦点を当
て、そして組織試料中のこれらセグメントの全て又は大
部分が再配置され、かつ正確に同一の長さを有するかど
うかを測定することによって上記の判定を行うものであ
る。ここで、それらセグメントの全て又は大部分が同一
の長さを持つことはそれらセグメントが同じ独特の分子
に由来することを意味する。
現在のモノクローナリティー(monoclonality)の検
出法は制限酵素の消化、続いてサウザン・ブロッティン
グ(southern blotting)及び遺伝子の精査に基づく。
このアプローチは複雑で、高価で、しかも時間がかか
り、そのため情報は、それが実質的に実用価値のあるも
のとするには通常余りにも遅く提供される。
これに対して、本発明の方法は速やかで、かつ敏感な
診断試験法を提供する。更に、組織試料として使用する
ことができる材料として血液、節又は骨髄中の腫瘍組
織、ホルマリン固定され、包埋された組織材料、アスピ
レート(aspirate)された細胞材料又はスライド上の細
胞があるので、本発明の方法は用途が非常に多い。
本発明によれば、組織の試料の中の免疫グロブリン遺
伝子及び/又はT−リセプタ遺伝子のセグメント長の均
一性又は不均一性を判定して試料中のB−及び/又はT
−リンパ球集団のモノクローナリティーの存否を表示す
ることを含んで成る、組織試料におけるリンパ系白血病
及び/又はリンパ腫の検出法が提供される。
本発明の1態様によれば、 (a)組織の試料の中の免疫グロブリン遺伝子及び/又
はT−リセプタ遺伝子のセグメントをそれらセグメント
のための特異性プライマー又は特異性プライマー混合物
を使用するポリメラーゼの連鎖反応で拡大する工程、及
び (b)拡大されたセグメントを大きさに基づいて分離し
てそれら拡大セグメントの長さの均一性又は不均一性を
判定する工程 を含んで成る、組織試料におけるモノクローナリティー
及び推定悪性腫瘍を検出し、及び/又は主要のB−リン
パ球又はT−リンパ球の起源を判定する方法が提供され
る。1つの特定の態様において、使用されるプライマー
は免疫グロブリン遺伝子及び/又はT−リセプタ遺伝子
のセグメントのためのコンセンサスプライマー(consen
sus primers)である。
本発明はまた組織の試料の中の免疫グロブリン遺伝子
及び/又はT−リセプタ遺伝子のセグメントをポリメタ
ラーゼの連鎖反応で拡大するための、免疫グロブリン遺
伝子及び/又はT−リセプタ遺伝子のセグメント用の1
組の特異性プライマーまたは特異性プライマー混合物を
含んで成る、上記で広く概説した本発明の方法を実施す
るためのキットにも及ぶ。
もう1度述べると、1つの特定の態様において、使用
されるプライマーは免疫グロブリン遺伝子及び/又はT
−リセプタ遺伝子のセグメントのためのコンセンサスプ
ライマーである。
免疫グロブリン(Ig)及びT−リセプタ(Tr)の遺伝
子は総ての細胞の中に存在する。各遺伝子は4つの族、
即ち可変(V)領域、不同(D)領域、結合(J)領域
及び不変(C)領域の族(Dセグメントを欠く免疫グロ
ブリンの軽鎖を除く)より成る。B−またはT−リンパ
球の発生過程において、遺伝子は各族のランダムに選択
された1員が一緒に結合されて最終分子を形成するよう
に再配置される。VD、DJ及びJCの各結合点ではランダム
な突然異変も起こる。このランダムな結合と突然変異の
結果、最終の免疫グロブリン又はT−リセプタの分子は
事実上他には見られない独特なものとなる。しかし、本
発明に関して特に重要な2つの特徴がある。
即ち、 (a)VD、DJ及びJC結合点において取り除かれ及び/又
は挿入される塩基数が極めて変りやすく、そのため異な
る免疫グロブリン又はT−リセプタの分子、特にVD、DJ
及びJCの各結合間のセグメントは長さが実質的に異な
る。
(b)遺伝子内に絶対的同一性がないとしても遺伝子内
には類似性を持つ若干の領域が存在する。これらの領域
は“フレームワーク(framework)”と称されるV領域
のある特定の部分、及びJ領域とC領域の部分を含む。
本発明はポリメラーゼの連鎖反応(PCR)の新しい様
式での使用を含む。PCRは1985年に初めて記載された
が、今や周知のものであって、小さいcDNAセグメントの
配列が知られているという条件でそれらのセグメントの
指数関数的な拡大を可能にする。PCRの原理は2つのDNA
プライマー(その1つは各DNA鎖についてのものであ
る)が変性とそれに続くDNA合成の連続サイクルにおい
て使用され、これによってプライマーにより結合された
DNAのセグメントの指数関数的拡大がもたらされる、と
いうことである。各サイクルには6〜7分間要するの
で、20〜30サイクルを実施するのが実際的であり、また
各サイクルの効率は最大で70〜80%であるので、高忠実
度においては最大106倍の拡大が可能である。
記載したPCRはプライマーに基づくものであり、各各
は既知の配列に対して正確に相補性である。本発明の1
つの態様において、免疫グロブリン及びT−リセプタの
分子を拡大するという問題はコンセンサスプライマーを
免疫グロブリン及びT−リセプタの遺伝子の中に類似し
ているが同一ではない配列をそれぞれ有する領域に対し
て使用することによって解決された。これらの領域は免
疫グロブリンのV領域のフレームワーク部、T−リセプ
タ遺伝子の保存V領域、並びに免疫グロブリン遺伝子又
はT−リセプタ遺伝子のD、J及び/又はC領域の1部
分を含んで成る。これらの領域に対するプライマーは2
つの理由から作用する。第一に、それらプライマーは免
疫グロブリン又はT−リセプタのDNAまたはRNAの適切な
領域に対して十分に相同性である構造を有し、それによ
って全DNA又はRNAにおけるそのような領域だけを認識す
ることである。第二に、PCR領域は2つのプライマーに
よって認識される配列が短かい場合に作用するだけであ
る、ということである。この状態はV、D及びJ(又は
C)領域が一緒に結合されており、成熟した免疫グロブ
リン又はT−リセプタの分子が形成されているDNA又はR
NAのそのようなセグメントについて達成されるに過ぎな
い。これら2つの性質の結果として、プライマーは最終
の成熟免疫グロブリン又はT−リセプタ分子だけを認識
し、拡大するのである。
PCRにおいてこれらプライマーを使用すると、組織試
料の中の成熟免疫グロブリン又はT−リセプタの全分子
のプライマー間セグメントが拡大される。拡大されたセ
グメントはVD、DJ(及びJC)の結合点を横断している。
その結果、DNA配列に無関係にDNAの最終拡大片は、組織
中の免疫グロブリン又はT−リセプタの遺伝子が全てモ
ノクローナルな悪性の集団に由来する場合には単一の長
さを有し、あるいはそれらの分子が不均質な悪性でない
集団に由来する場合には不均一な長さを有する。免疫グ
ロブリン分子のためのプライマーはB−リンパ球起源の
悪性集団を同定し、他方T−リセプタ分子のためのプラ
イマーはT−リンパ球起源の悪性腫瘍を同定する。
DNAの拡大片の長さは分子を大きさに基づいて分離す
る方法でDNA分子を分離することによって簡単に測定る
ことができる。現在、アガロースゲル又はポリアクリル
アミドゲル中での電気泳動が用いられているが、クロマ
トグラフィーが自動化の可能性のために色々な利点を持
つと思われる。大きさに基づいて分離された分子は非同
位体手段、例えばエチジウムブロマイド染色法で、若し
くは放射性同位体の組み込みで、または内部プローブへ
のサウザン転移(Souther transfer)とハイブリダイゼ
ーションで同定することができる。
本発明の更に他の特徴は次の詳細な説明によって明ら
かになるだろう。
A.プライマーの合成 1.免疫グロブリン遺伝子のためのプライマー 総ての免疫グロブリン重鎖遺伝子において同様である
DNA配列の4つの領域は次の通りである: (a) J−領域の3′末端において、34塩基のうち30
塩基が全6本の生殖系列のJ−鎖の中の保存される。DN
A(+)鎖に付く3つのDNAプライマーが用いられた。即
ち、 (ただし、Nは4種のヌクレオチド塩基のいずれかを表
わす。) である。
(b)〜(d) V−領域は3つの“フレームワーク”
領域とその中に介在する“鎖決定”領域に細分すること
ができる。“フレームワーク”領域はあらゆる免疫グロ
ブリンの中で同様であり、他方“鎖決定”領域は大幅に
変化する。17リンパ球系列の配列を比較することによっ
て、DNAの保存伸張鎖(conserved stretches)を各フレ
ームワーク領域において同定した。しかし、それらの配
列は余り保存されない。不適組合わせのPCRに対する影
響の仕方は不明確であるので、若干の合成プライマーに
は重復が導入された。DNAの(−)鎖にハイブリダイズ
するプライマーに次のものがある: DNAの(+)鎖に付くプライマーには がある。
DNAの反対鎖に付くプライマー及び/又は他の免疫グ
ロブリン鎖のためのプライマーも等しく十分に使用する
ことができるだろう。
内部の又は末端の制限酵素部位を含有するように変性
されたプライマーを使用しても好結果が得られた。それ
らは引続くクローニングの助けになる。
2.T−リセプタ遺伝子のためのプライマー T−リセプタ遺伝子のために類縁のプライマーが使用
される。これら遺伝子のためのプライマーを選択する際
に適用される原理は免疫グロブリン遺伝子についての原
理と同じであるが、強調しなければならないいくつかの
相違点がある。特に、VD、DJ及びJC結合部におけるヌク
レオチドの除去とランダムヌクレオチドの挿入による不
同性の発生に更に強い力点がある。T−リセプタのV−
領域は可変性がより小さい領域及び“フレームワーク”
領域、並びに可変性のより大きい“鎖決定”領域に容易
には分割することができない。しかし、VD結合部付近で
は約20塩基の伸張鎖が保存される。
(a)T−リセプタのα鎖 JAT2はPCRのためのJ−領域プライマーである。
JAT1は内部プローブである。
3VTAはPCRのためのV−領域プライマーで、JAT1から
約80塩基対である。
5VTAはJAT1から200〜300塩基対のV−領域プライマー
である。
CTAとPTAは不変領域内にある。
V−及びJ−領域プライマーはコンセンサンプライマ
ーである。
(b)T−リセプタのβ鎖 JBT2はPCRのためのJ−領域プライマーである。
JBT1は内部プローブである。
3VTB1と3VTB2はそれぞれTCRベーター副分類のベータ
及びベーターのための、JBT1から約80塩基対のV
−領域プライマーである。
5VTB1と5VTB2はそれぞれTCRベーター副分類のベータ
及びベーターのための、JBT1から200〜300塩基対
のV−領域プライマーである。
CTBとPTBはβ遺伝子総てのための不変領域内にある。
V−及びJ−領域プライマーはコンセンサスプライマ
ーである。
(c)T−リセプタのγ鎖 JGT12はPCRのためのJ−領域プライマーである。それ
はTCRクラスのガンマーの4つの公知のJ−鎖のうちの
2つの配列に基づく。
3VTGはJGT12から約80塩基対のV−領域プライマーで
ある。
CTGとPTG不変領域内にある。
不変領域のプライマーは、個々のケースによるが、場
合によっては拡大のために使用されるので、RNAから出
発し、そして1回の逆転写を行うことによってしRCRの
拡大を先行させることが必要であろう。
上記の内部プローブJAT1及びJBT1は、拡大産生物をエ
チジウム−染色バンドとして可視化することができない
場合、その拡大産生物の最終検出のために使用すること
ができる。プローブには通常は放射線で標識を付けるこ
とができ、それによって非常に敏感で特異性の、拡大産
生物の検出法が得られる。
γ鎖(Tgリセプタ)に適用可能なもう1つの別のアプ
ローチは9V−領域と5J−領域のためのプライマー混合物
を使用するものである。使用配列は次の通りである: V−領域プライマーは標的に精密にマッチする20〜40
塩基(3′末端に最も近いもの)を含有する。それらプ
ライマーはまた5′末端付近に制限酵素のための部位と
して配列CTGCAGを含有する。この部位は、クローニング
が必要な場合に、後続のクローニングの助けになる。
B.DNAの拡大 DNA又はRNAは共に用いることができる。
cDNAを逆転写酵素及び1つの又は両PCRプライマーを用
いてRNAから作る。cDNAを沈殿させ、そして水に再懸濁
し、次いでPCR反応を用いる。この反応をサーマス・ア
クアティカス(Thermus apuaticus)からのポリメラー
ゼを用いて約30サイクル行う。この反応の産生物類をア
ガロースゲル上で分離し、そしてエチジウムブロマイド
による染色を行って可視化する。プライマーの結合部位
に内部結合するDNAプローブへのサウザン・ブロッティ
ングとハイブリダイゼーションも通常に行われる。拡大
されたセグメントの大きさの測定にはコントロール・サ
イズ−マーカー(Contorol size−markers)が助けにな
る。
C.免疫グロブリンのコンセンサスプライマーを使用して
モノクローナリティーについての試験結果 第1表及び第2表に免疫グロブリン遺伝子だけを用い
てモノクローナリティーについて各種試料を試験した結
果を示す。
これらの結果は前記のプライマーLJH−及びFR3Aを用
いて得られたものである。30サイクルの拡大を行い、拡
大されたフラグメントを2%の寒天中での電気泳動で分
離し、そしてエチジウムブロマイドで染色して紫外光で
の可視化を可能にした。同様に結果が最後の5サイクル
の拡大のための放射性ヌクレオチド(CTP)を加え、電
気泳動を行い、そしてフラグメントをオートラジオグラ
フィーで可視化することによって得られた。
D.T−リセプタのプライマーを使用してのモノクローナ
イティについての試験結果 コンセンサンプライマーの1つの対又は他の対を用
い、上記と同じPCR法を使用すると、個別の再配置が検
出された。この検出においては8つの正常T−細胞クロ
ーンのうち6つに1つのプライマー対又は他のプライマ
ー対が用いられた。
同様に、前記の全9つのV−領域プライマーの混合物
の(TCRVG2PST−TCRVG12PST、並びにJGT12,JGT3及びJGT
4)を用いると、4つの正常T−細胞クローンのうちの
3つに個別再配置が検出された。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (58)調査した分野(Int.Cl.6,DB名) C12Q 1/68

Claims (17)

    (57)【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】組織の試料中の免疫グロブリン遺伝子及び
    /又はT−リセプタ遺伝子のセグメント長の均一性又は
    不均一性を判定して該試料中のB−及び/又はT−リン
    パ球集団のモノクローナリティーの存否を表示すること
    を含んで成る、組織試料におけるリンパ系白血病及び/
    又はリンパ腫の検出法。
  2. 【請求項2】(a)組織の試料中の免疫グロブリン遺伝
    子及び/又はT−リセプタ遺伝子のセグメントをそれら
    セグメントのための特異性プライマー又は特異性プライ
    マー混合物を使用するポリメラーゼの連鎖反応で拡大
    し、そして (b)拡大されたセグメントを大きさに基づいて分離し
    てそれら拡大セグメントの長さの均一性又は不均一性を
    判定する 工程を含んで成る、組織試料におけるモノクローナリテ
    ィー及び推定悪性腫瘍を検出し、及び/又は腫瘍のB−
    リンパ球又はT−リンパ球の起源を判定する方法。
  3. 【請求項3】該プライマーが免疫グロブリン遺伝子及び
    /又はT−リセプタ遺伝子のセグメントのためのコンセ
    ンサスプライマーである、請求の範囲第2項に記載の方
    法。
  4. 【請求項4】該組織試料が血液、節又は骨髄における腫
    瘍組織、ホルマリン固定され、包埋された組織材料、ア
    スピレートされた細胞材料及びスライドガラス上の細胞
    から選択されたものである、請求の範囲第1項又は第2
    項に記載の方法。
  5. 【請求項5】大きさに基づいて分離する該工程が電気泳
    動法及びクロマトグラフィーから選択されたものであ
    る、請求の範囲第2項に記載の方法。
  6. 【請求項6】大きさに基づく該分離工程がアガロースゲ
    ル又はポリアクリルアミドゲルによる電気泳動法から成
    る、請求の範囲第5項に記載の方法。
  7. 【請求項7】大きさに基づいて分離され、拡大された該
    遺伝子のセグメントを非同位体手段、放射性同位体の組
    み込み、又は内部プローブへのサウザン転移又はハイブ
    リダイゼーションによって検出する、請求の範囲第2項
    に記載の方法。
  8. 【請求項8】非同位体手段による該検出がエチジウムブ
    ロマイド染色法を含んで成る、請求の範囲第7項に記載
    の方法。
  9. 【請求項9】免疫グロブリン遺伝子のセグメントのため
    の該プライマーが免疫グロブリンのV領域のフレームワ
    ーク部に対するプライマー及び該遺伝子のD.J及び/又
    はC領域の一部分に対するプライマーから成る、請求の
    範囲第2項に記載の方法。
  10. 【請求項10】免疫グロブリン遺伝子のセグメントのた
    めの該プライマーが (ただし、Nはヌクレオチド塩基のうちのいずれかを表
    わす) から選択されたものである、請求の範囲第9項に記載の
    方法。
  11. 【請求項11】T−リセプタ遺伝子のセグメントのため
    の該プライマーがT−リセプタ遺伝子の保存V領域に対
    するプライマー及び該遺伝子のD.J及び/又はC領域の
    一部分に対するプライマーから成る、請求の範囲第2項
    に記載の方法。
  12. 【請求項12】T−リセプタ遺伝子のセグメントのため
    の該プライマーが (a)T−リセプタのα−鎖プライマー: (b)T−リセプタのβ−鎖プライマー: (c)T−リセプタのγ−鎖プライマー: から選択されたものである、請求の範囲第11項に記載の
    方法。
  13. 【請求項13】T−リセプタ遺伝子のセグメントのため
    の該プ から選択された、V−領域及びJ−領域のためのT−リ
    セプタ遺伝子のγ−鎖プライマーの混合物から成る、請
    求の範囲第11項に記載の方法。
  14. 【請求項14】組織の試料中の免疫グロブリン遺伝子及
    び/又はT−リセプタ遺伝子のセグメントをポリメラー
    ゼの連鎖反応で拡大するための、免疫グロブリン遺伝子
    及び/又はT−リセプタ遺伝子のセグメント用の1組の
    特異性プライマー又は特異性プライマー混合物を含んで
    成る、請求の範囲第2項に記載の方法を実施するための
    キット。
  15. 【請求項15】免疫グロブリン遺伝子及び/又はT−リ
    セプタ遺伝子のセグメントのための1組のコンセンサス
    プライマーを含んで成る、請求の範囲第14項に記載のキ
    ット。
  16. 【請求項16】請求の範囲第9項または第10項に記載
    の、免疫グロブリン遺伝子のセグメントのためのプライ
    マーを含んで成る、請求の範囲第14項に記載のキット。
  17. 【請求項17】請求の範囲第11項若しくは第12項又は第
    13項に記載の、T−リセプタ遺伝子のセグメントのため
    のプライマーを含んで成る、請求の範囲第14項に記載の
    キット。
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