JP2017019758A - 化合物、該化合物を含有するタンパク質修飾試薬およびタンパク質の標識方法 - Google Patents
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しかしながら、2001年にスクリプス研究所のK.B.Sharplessによって提唱されたクリックケミストリー(Click Chemistry)により、比較的シンプルな構造の化合物同士を高い反応性と選択性で炭素−ヘテロ原子結合反応により新たな機能分子を合成することが可能となった(非特許文献1参照)。代表的なのは、1,3−双極子付加環化反応であり、有機アジドとアルキンの付加環化反応はクリックケミストリーに最適である。現在、このクリックケミストリーを中心として、修飾機構の異なる多くのタンパク質修飾試薬が開発されている。
また、従来の水溶性のタンパク質修飾試薬であるN−Hydroxysulfosuccinimideは、特定の分子(カルボン酸を有する分子)のみ導入可能であった。
[1]一般式(1)で表される化合物又はその塩。
[2][1]に記載の化合物又はその塩を含有するタンパク質修飾試薬。
[3]任意のタンパク質を標識する方法であって、
(a)下記一般式(1)で表される化合物又はその塩と任意のタンパク質とを混合して、前記任意のタンパク質の表面に前記一般式(1)で表される化合物中のRを導入する工程と、
(b)前記一般式(1)で表される化合物−タンパク質複合体と、該複合体中のRと結合する官能基を有する標識試薬とを混合し、タンパク質を標識する工程と、
を有することを特徴とするタンパク質の標識方法。
本発明者らは、新規の水溶性タンパク質修飾試薬として活用できる化合物を探索する過程で、ハロゲン化アルキルから誘導されるシステインを基盤とした下記一般式(1)で表される化合物を見出した。
本明細書において、「任意の化合物が有する特定の官能基と共有結合し得る基」とは、クリックケミストリーを活用した1,3−双極子付加環化反応を行うことができる官能基を意味する。「1,3−双極子(1,3−dipole)」とは、三原子からなる4π電子化学種であり、アルケニル基やアルキニル基などの親双極子(dipolarophile)を有する化合物と付加環化反応を起こし、5員複素環化合物を形成するものを意味する。よって、Rが「1,3−双極子」を有するとき、任意の化合物の特定の官能基は「親双極子」を有し、逆にRが「親双極子」を有するとき、任意の化合物の特定の官能基は「1,3−双極子」を有することができる。
本実施形態において、Rに適用可能な「1,3−双極子」としては、アゾメチンイリド基、ニトロン基、ニトリルイリド基、ジアゾメチル基、アジド基、ニトリルオキシド基などが挙げられる。また、本実施形態において、Rに適用可能な「親双極子」としては、アルケニル基、アルキニル基が挙げられる。
例えば、Rがニトロン基を末端に含む基であるとき、アルケニル基を有する化合物と付加環化反応を起こし、イソオキサゾール環を形成する。また、Rがアジド基を末端に含む基であるとき、アルキニル基を有する化合物と付加環化反応を起こし、トリアゾール環を形成する(この反応をヒュスゲン環化付加反応という)。また、Rがニトリルオキシド基を末端に含む基であるとき、アルケニル基を有する化合物と付加環化反応を起こし、イソオキサゾール環を形成する。上述の例において、Rが「1,3−双極子」を有し、任意の化合物が「親双極子」を有する場合について例示したが、Rが「親双極子」を有し、任意の化合物が「1,3−双極子」を有する場合であっても同様の反応を行うことができる。
この中でも、Rは、アルキニル基又はアジド基を末端に含む基が好ましく、無置換又は置換基を有する炭素数2〜8の直鎖状又は分岐鎖状のアルキニル基、あるいは、炭素数1〜8の直鎖状又は分岐鎖状のアルキル基を有するアジド基がより好ましい。高い親水性を保つ観点から、炭素数2〜3の直鎖状又は分岐鎖状のアルキニル基もしくは、炭素数1〜2の直鎖状又は分岐鎖状のアルキル基を有するアジド基であることが特に好ましい。
Tは、単結合、或いは、無置換又は置換基を有する炭素数1〜6の直鎖状又は分岐鎖状のアルキル基を表す。システインから容易に誘導できることから、炭素数1の直鎖状のアルキル基であることが好ましい。
前記炭素数1〜6の直鎖状又は分岐鎖状のアルキル基の置換基としては、特に限定されないが、フッ素原子、塩素原子、臭素原子、ヨウ素原子等のハロゲン原子などが挙げられる。
前記炭素数1〜8の直鎖状又は分岐鎖状のアルキル基の置換基としては、特に限定されないが、フッ素原子、塩素原子、臭素原子、ヨウ素原子等のハロゲン原子などが挙げられる。
以下に、前記一般式(1)で表される化合物の製造方法について、詳細に説明する。
前記一般式(1)において、Rがアルケニル基を含み、Yが前記式(2)で表される基である化合物は、下記反応式[A−1]に示すように、触媒存在下で、式(3)で表される化合物であるシステインに、式(4)で表される化合物を反応させることにより、合成中間体である式(5)で表される化合物を得ることができる。式(5)で表される化合物を得る際の反応条件について、温度は室温でよく、時間は18〜24時間が好ましい。触媒としては、トリエチルアミン、ピリジン類等の有機アミンが好ましい。溶媒は、本反応に不活性な溶媒であれば特に限定されず、エタノールおよび水を混合したもの等が挙げられる。
さらに、式(5)で表される化合物に酸化剤を作用させることにより、目的の化合物である式(1−1−1)で表される化合物を得ることができる。また、酸化剤と共に親水性を有する強酸を混合することにより、式(1−1−1)で表される化合物の塩である式(6)で表される化合物を得ることができる。式(1−1−1)又は式(6)で表される化合物を得る際の反応条件について、温度は室温程度でよく、反応溶媒及び試薬が揮発しないという観点から、15〜30℃が好ましい。反応時間は、30分〜24時間が好ましい。酸化剤としては、特に限定はないが、例えば、過酸化水素、オキソン、過安息香酸等が挙げられる。溶媒としては、本反応に不活性な溶媒であれば特に限定されず、水、メタノール、エタノール等が挙げられる。親水性を有する強酸としては、前記と同じ意味を表す。
また、反応式[A−1]〜[A−3]中、Qは、前記と同じ意味を表す。Xは、親水性を有する強酸のプロトンが解離した際のアニオンを表す。
さらに、式(8)で表される化合物に酸化剤を作用させることにより、目的の化合物である式(1−1−2)で表される化合物を得ることができる。また、前記酸化剤と共に親水性を有する強酸を作用させることにより、式(1−1−2)で表される化合物の塩である式(9)で表される化合物を得ることができる。式(1−1−2)および式(9)で表される化合物を得る際の反応条件は、上述のとおりである。
反応式[B−1]〜[B−3]中、LおよびXは、前記と同様の意味を表す。
本発明は、前記一般式(1)で表される化合物又はその塩を含有するタンパク質修飾試薬である。
また、本実施形態のタンパク質修飾酵素の用途としては、本発明の効果を奏する範囲で適宜選択され、以下に限定されるものではないが、ケミカルバイオロジー、創薬研究などに用いる生化学系試薬等を例示することができる。また、本実施形態に係る試薬を組み合わせて試薬キットとして用いることもできる。
本発明の任意のタンパク質を標識する方法は、以下工程(a)、(b)を有する。
(a)下記一般式(1)で表される化合物と任意のタンパク質とを混合して、前記任意のタンパク質の表面に前記一般式(1)で表される化合物中のRを導入する工程。
(b)前記一般式(1)で表される化合物−タンパク質複合体と、該複合体中のRと結合する官能基を有する標識試薬とを混合し、タンパク質を標識する工程。
反応式[C−1]、[C−2]は、任意のタンパク質を標識する工程を示した反応式の一例である。以下、各工程について、詳細に説明する。
工程(a)は、式(1−1−1)で表される化合物と任意のタンパク質とを混合して、前記任意のタンパク質の表面に、式(1−1−1)で表される化合物中のアルケニル基およびQを含む基を導入する工程である。反応条件は、上述の通り、温和な条件で行うことができる。よって、容易に任意のタンパク質の表面に、式(1−1−1)で表される化合物中のアルケニル基およびQを含む基が導入され、式(10)で表される化合物を得ることができる。
[システイン誘導体の合成]
反応式[D−1]、[D−2]はシステインからシステイン誘導体である新規化合物を合成する工程を示した反応式である。まず式(3)で表される化合物(システイン)に式(13)で表される化合物(4−Bromo−1−butyne)を、エタノールと水とを2:1で混合した溶媒中において、触媒であるTriethylamineの存在下で、室温で18時間反応させて、合成中間体である式(14)で表される化合物を得た。さらに水溶媒中において、酸化剤である過酸化水素を室温で24時間作用させることで、システイン誘導体である新規化合物(15)(ジアスレオマー混合物)を得た。
δppm(500MHz,DMSO−d6);2.99−3.02,2.86−2.87,2.67−2.81,2.62−2.72,2.41−2.44,1.14.
反応式[E−1]、[E−2]はウシ血清アルブミン(Bovine serum albumin、BSA)を蛍光標識する方法を示した反応式である。まず、システイン誘導体である新規化合物(15)をタンパク質修飾試薬として用いて、BSAとを25℃で24時間混合し、アルケニル基が表面に導入されたBSA(16)を得た。次に、アルケニル基が表面に導入されたBSA(16)と、AHC(3−azido−7−hydroxycoumarin(成績体の蛍光:励起波長404nm、検出波長477nm)(17)とを、硫酸銅(II)およびTHPTA(Tri(3−Hydroxypropyltriazolylmethyl)amine)触媒存在下で、37℃、1時間混合して、蛍光修飾されたBSA(18)を得た。
[GODの蛍光標識]
実施例1と同様の方法で、BSAの代わりにグルコースオキシダーゼ(GOD)を用いて、蛍光修飾されたGODを得た。さらに、電気泳動後のアクリルアミドゲルについて、GelDok(登録商標)を用いて励起波長404nmを中心とした光を照射し、検出波長477nmの蛍光を検出した後に、クマシーブリリアントブルー染色(CBB染色)した。結果を図5に示す。図5中、左側が蛍光検出した結果であり、右側がCBB染色した結果である。
なお、GODは、β−グルコースに特異的な酵素であり、β−グルコースはGODにより酸化され、過酸化水素を生成する。生成された過酸化水素は酸化触媒酵素ペルオキシダーゼと共に、ABTSをラジカル化させる。ラジカル化ABTSは安定的で青緑色をしており、600nmの吸光度で測定することができる。
[BSAのビオチン標識]
実施例1と同様にアルケニル基が表面に導入されたBSA(18)を合成した後に、アルケニル基が表面に導入されたBSA(18)と、アジド基が導入されたビオチン(21)とを、硫酸銅(II)およびTHPTA触媒存在下で、37℃、1時間混合して、ビオチン修飾されたBSAを得た(下記反応式[F−1]参照)。ビオチン修飾されたBSAと、西洋ワサビパーオキシダーゼ(HRP)標識されたストレプトアビジン(21)とを、混合して室温で1時間抗原抗体反応を行った(下記反応式[F−2]参照)。さらに、式(22)で表される化合物(BSA−ビオチン−HRP標識されたアビジン複合体)を含むサンプル溶液を用いてウェスタンブロット法を行い、得られたメンブレンを化学発光検出およびTMB(3,3’,5,5’−tetramethylbenzidine)染色した。結果を図6に示す。図6中、化学発光検出した結果であり、右側がTMB染色した結果である。
[AODの標識]
実施例1で合成したシステイン誘導体である新規化合物(15)と、アルコール酸化酵素(Alcohol oxidase,AOD)とを25℃で24時間混合し、アルケニル基が導入されたAOD(23)を得た。
Claims (3)
- 一般式(1)で表される化合物又はその塩。
- 請求項1に記載の化合物又はその塩を含有するタンパク質修飾試薬。
- 任意のタンパク質を標識する方法であって、
(a)下記一般式(1)で表される化合物又はその塩と任意のタンパク質とを混合して、前記任意のタンパク質の表面に前記式(1)で表される化合物中のRを導入する工程と、
(b)前記一般式(1)で表される化合物−タンパク質複合体と、該複合体中のRと結合する官能基を有する標識試薬とを混合し、タンパク質を標識する工程と、
を有することを特徴とするタンパク質の標識方法。
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