JP2015504943A - 高密度蛍光色素クラスター - Google Patents
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Abstract
Description
[B]v[S−B−F]w[B−F]x[B−S]y[B−C]z
式中、
Bは、適宜置換されたモノマー単位であり、
S−B−Fは、立体的増強発光色素及び可溶化剤が結合したモノマー単位であり、
B−Fは、立体的増強発光色素が結合したモノマー単位であり、
B−Sは、可溶化剤が結合したモノマー単位であり、
B−Cは、コンジュゲーション部位が結合したモノマー単位であり、
v+w+x+y+zは3〜100であり、w+xは3以上である。
−(CH2)x−
−((CH2)p−O−(CH2)q)−y
−((CH2)p−CONH−(CH2)q)−y、又は
−((CH2)p−Ar−(CH2)q)−yであり、
xは1〜30、好ましくは1〜10であり、
pは、1〜5であり、
qは、0〜5であり、
yは、1〜5である。
本発明の1つの実施形態は、クラスターが標的分子に結合する条件下で、標識すべき標的分子をある量の色素クラスターと共にインキュベートする段階を含む、標的分子を標識する方法を含む。具体的な実施形態では、標的分子は生体分子である。
SEED色素の異なるクラスの代表的な合成
以下のスキームは、SEED色素の調製のための代表的な合成スキームである。各スキームで表される出発物質又は反応条件を変更することによって、代表的なSEED色素の変形体を調製することができる。
SEED分子は、2つの方法でクラスターに結合することができる。方法Aでは、クラスターを形成するために、付加されたSEED分子を有するモノマー単位が用いられる。方法Bでは、SEED分子とポリマー鎖の両方の上の反応性基を介して、SEED分子を予め形成されたポリマー鎖に加えることができる。
コンジュゲーション部位を含むクラスターの合成も、様々な方法で合成することができる。1つのスキームでは、それが形成するときにポリマー鎖にコモノマーとして反応(又は官能)基を導入することができ、したがって、単一のポリマーは複数の反応(又は官能)基を導入できる。この実施形態では、モノマーは2つの官能性を含まなければならず、第1は、それが重合して(例えば、アクリレート、メタクリレート、エポキシドなど)ポリマーを形成するときに骨格との反応が可能である化学的性質、並びに本明細書に規定される反応(又は官能)基のリストから選択される第2の反応性基。
この化合物を作製するために、J. Org. Chern., 2005, 70, 3765に報告される文献手法に従った。ジフェニルアセチレン(4g、22.5mmol)を250mLの火炎乾燥丸底フラスコにとり、p−ヨードフェノール(14.8g、67.5mmol)及びフェニルボロン酸(8.16g、67.5mmol)を加えて100mLの80/20のDMF/H2O(v/v)に溶解し、続いて炭酸水素カリウム(6.7g、67.5mmol)を添加した。この反応混合液に栓をし、撹拌下で30分間、窒素パージをした。30分後に、PdCh(PhCNh触媒(0.086g、0.22mmol)を加え、反応混合液を室温で一晩撹拌した。反応混合液を200mLの水で希釈し、有機化合物を200mLの塩化メチレンに抽出し(2回)、MgSO4で乾燥させた。TPE−OHはヘキサンに難溶性であるので、唯一の副産物(p−ヒドロキシビフェニル)をヘキサン洗浄によって除去した。精製の後、3.6gのTPE−OHが単離された。
TPE−OH(2g、6.57mmol)を250mLの火炎乾燥丸底フラスコにとり、トリエチルアミン(0.73g、7.2mmol)を加えた。この混合液を100mLの塩化メチレンに溶解し、フラスコに栓をし、30分間窒素パージした。その後、塩化メタクリロイル(0.718g、6.9mmol)を30mLの塩化メチレンに溶解して、氷浴上の反応混合液に滴下した。30分間以上の滴下添加の後、反応混合液を室温になるまで放置し、一晩撹拌した。反応を100mLの水でクエンチし、100mLの塩化メチレンで2回抽出し、有機層をMgSO4で乾燥させた。カラムクロマトグラフィー(シリカ)を用いて、生成物を溶出剤酢酸エチル:ヘキサン=10:90で精製した。カラムクロマトグラフィーから最初に溶出された分画が本生成物であった。収量:1.3g。
TPE−M−モノマー(トルエンに30重量%、0.7gトルエンに0.3g)を単口丸底フラスコにとり、栓をして30分間窒素パージした。可能な限り多くの酸素を除去した後に、4モル%のアゾビスイソブチロニトリル(AIBN)を加え、冷水凝縮器をフラスコに取り付けて80℃で一晩還流させた。反応をクエンチするために、反応混合液を5mLの塩化メチレンで希釈した。溶液を撹拌しながら、この反応混合液をビーカー中の20mLのメタノールに滴下添加した。ポリマーを沈殿させ、溶媒を濾過して0.2gのポリマーを単離した。
TPE−M−モノマー(トルエンに30重量%、0.7gトルエンに0.3g)を単口丸底フラスコにとり、栓をして30分間窒素パージした。この混合液に、20mol%のAPES−10(アンモニウムアリルポリエトキシ(10)アルコキシル化アクリレート)を、水可溶化モノマーとして加えた。可能な全ての酸素を除去した後に、4モル%のAIBNを加え、冷水凝縮器をフラスコに取り付け、反応混合液を80℃で一晩還流させた。完了後、反応混合液を5mLの塩化メチレンで希釈した。次に、溶液を撹拌しながら、この混合液をビーカー中の20mLのメタノールに滴下添加した。ポリマーを沈殿させ、溶媒を濾過して0.2gのポリマーを単離した。
APES−10のmol%を20から67mol%に変更して水溶性を増加させることによってTPE−M−ポリマーの異なる水溶性バージョンを作製するために、類似の手法を用いた。さらに、水可溶化モノマーとしてAPES−10の代わりに2−アクリルアミドメチルプロパンスルホン酸を用いた第2のTPE−M−ポリマーを作製するために、類似した手法に従った。このモノマーは50mol%比で試験され、APES−10より優れた水可溶化を示すことが見出された。
吸光度/蛍光研究のために、最初に色素クラスターを10.8mg/mlの濃度でジメチルスルホキシド(DMSO)に溶解した。この溶液を水に希釈して、水に5.4μg/ml〜108μg/mlの濃度の水溶液を生成した。高濃度試料を濾過し(0.2ミクロンテフロン(登録商標)膜)、その水力学的サイズをBrookhaven Dynamic光散乱機器で測定した。色素クラスターの初期のバッチのサイズは、直径18nmであることが見出された(溶液中でのクラスターの低い散乱断面のために、このサイズは概算である)。
当業者であれば、通常の実験しか用いなくとも、本明細書に記載される具体的な手法の複数の均等を認識するか、確かめることができる。そのような均等は、本発明の適用範囲内であるとみなされ、以下の請求項によって保護される。
Claims (28)
- 適宜置換された2以上のモノマー単位を含むポリマー骨格と、
可溶化剤と、
コンジュゲーション部位部位と、
ポリマー骨格に沿って配置された複数の立体的増強発光色素分子と
を含むクラスター。 - 2種以上の立体的増強発光色素が1以上のモノマー単位に結合した、請求項1記載のクラスター。
- ポリマーが3〜100モノマー単位からなる、請求項1記載のクラスター。
- ポリマーが10〜40モノマー単位からなる、請求項3記載のクラスター。
- クラスターの流体力学的径が100nm未満である、請求項1記載のクラスター。
- クラスターの流体力学的径が2〜15nmである、請求項5記載のクラスター。
- 各モノマー単位が、アルケニル、アクリレート、エーテル及びアミン又はこれらの組合せから独立に選択される基から形成される、請求項1記載のクラスター。
- モノマー単位が、アクリレート、メチルアクリレート、ビニル、ウレタン及びエポキシド又はこれらの組合せから選択される基から形成される、請求項7記載のクラスター。
- 可溶化剤が、親水性立体反発基、正荷電基、負荷電基及び双性イオン型荷電基又はこれらの組合せを含む群から選択される、請求項1記載のクラスター。
- 立体的増強発光色素が各々独立に1以上のモノマー単位に直接又はリンカーを介して結合している、請求項1記載のクラスター。
- クラスター内の各立体的増強発光色素が同一である、請求項1記載のクラスター。
- クラスター内に2種以上の異なる立体的増強発光色素が存在する、請求項1記載のクラスター。
- 異なる立体的増強発光色素が異なる吸収及び/又は発光波長を有する、請求項12記載のクラスター。
- 波長が300〜850nmである、請求項13記載のクラスター。
- 各クラスター内の異なる立体的増強発光色素間の比が制御されている、請求項14記載のクラスター。
- 各立体的増強発光色素が、ローダミン、フルオレセイン、エオシン、シアニン、ホウ素ジピリジル、キサンテン、カルボピリニン、アクリジニウム、ベンゾピリニウム又はアクリジニウムからなる群から独立に選択される、請求項1記載のクラスター。
- 各クラスター内の立体的増強発光色素と可溶化剤との比が制御されている、請求項1記載のクラスター。
- コンジュゲーション部位が、ビオチン、カルボキシル、スクシンイミジルエステル、スルホ−スクシンイミジルエステル、N−ヒドロキシスクシンイミジルエステル、カダベリン、イソチオシアネート、イソシアネート、マレイミド、ハロアセトアミド(例えばブロモアセトアミド)、酸ハライド、ヒドラジド、ヒドラジン、ビニルスルホン、ジクロロトリアジン、ホスホラミダイト、スルホニルハライド、アルキルイミドエステル、アリールイミドエステル、カルボジイミド、無水物及びアシルアジ化物から選択される反応性基、或いは、一級アミン、二級アミン、ヒドラジン誘導体、ヒドロキシルアミン誘導体、ピラゾロン、スルフヒドリル、カルボキシル、ヒドロキシル、チオール、イミダゾール、チオホスフェート並びにアルデヒド及びケトンを含むカルボニルから選択される官能基である、請求項1記載のクラスター。
- コンジュゲーション部位が、ポリマーの末端又はポリマーの骨格に沿ってある、請求項18記載のクラスター。
- コンジュゲーション部位が標的に結合できる、請求項18記載のクラスター。
- 標的が生体分子である、請求項20記載のクラスター。
- 生体分子が、核酸(例えばDNA又はRNA)、ヌクレオチド、アミノ、スルフヒドリル、カルボニル、ヒドロキシル、カルボキシル及びチオホスフェート基の1以上を含有するか含有するように誘導体化されるヌクレオチド、アミノ、スルフヒドリル、カルボニル、ヒドロキシル、カルボキシル及びチオホスフェート基の1以上を含有するか含有するように誘導体化されるオキシ−又はデオキシポリ核酸、微生物細胞、外膜小胞、ウイルス、薬物、ホルモン、細胞、細胞膜、毒素、オリゴヌクレオチド、アプタマー、タンパク質、タンパク質断片、抗体、抗原、抗体断片(例えばFab)、炭水化物、プロテオグリカン、レクチン、脂質、ペプチド、小分子(例えばビオチン、増殖因子、ホルモン、ビタミン、治療薬、薬物)、ポリマー粒子又はガラスビーズを含む、請求項21記載のクラスター。
- 適宜置換された2以上のモノマー単位を含むポリマー骨格と、
可溶化剤と、
コンジュゲーション部位部位と、
回転による減衰が抑制されて発光が持続するようにポリマー骨格に沿って配置された複数の立体的増強発光色素分子と
を含む、持続発光高密度発光クラスター。 - 次式で表される持続発光高密度発光クラスター。
[B]v[S−B−F]w[B−F]x[B−S]y[B−C]z
式中、
Bは、適宜置換されたモノマー単位であり、
S−B−Fは立体的増強発光色素及び可溶化剤が結合したモノマー単位であり、
B−Fは、立体的増強発光色素が結合したモノマー単位であり、
B−Sは、可溶化剤が結合したモノマー単位であり、
B−Cは、コンジュゲーション部位が結合したモノマー単位であり、
v+w+x+y+zは3〜100であり、w+xは3以上である、 - 適宜置換されたモノマーBが、ラジカルスカベンジャー、三重項消光剤又は一重項酸素スカベンジャーなどの光安定化部分を含む、請求項24記載のクラスター。
- 適宜置換されたモノマーBが、蛍光性pHセンサー、温度センサー又はイオンセンサーなどの環境センサーを含む、請求項24記載のクラスター。
- クラスターが標的分子に結合する条件下で、標識すべき標的分子を請求項1又は請求項23記載のクラスターと共にインキュベートする段階を含む、標的分子を標識する方法。
- 標的分子が生体分子である、請求項27記載の方法。
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