JP2015010910A - Detection method, detection device, biochip screening method, screening device and biochip - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、検出方法、検出装置、バイオチップのスクリーニング方法、スクリーニング装置及びバイオチップに関する。 The present invention relates to a detection method, a detection apparatus, a biochip screening method, a screening apparatus, and a biochip.
生体分子と検体に含まれる標的との間の親和性を検出する手法として、例えば、バイオチップ上のマトリクス状の複数の領域に配置された生体分子をそれぞれ検体(標的)と反応させ、該複数の領域ごとに生じる蛍光によって反応後の生体分子を蛍光測定する手法が知られている(例えば、特許文献1参照)。この検査では、顕微鏡装置(測定装置)のステージ上にバイオチップを配置した後、このバイオチップを撮像し、撮像結果を用いて蛍光の輝度を算出する。 As a technique for detecting the affinity between a biomolecule and a target contained in a specimen, for example, a plurality of biomolecules arranged in a plurality of matrix-like regions on a biochip are reacted with a specimen (target), respectively. There is known a method of measuring fluorescence of a biomolecule after reaction by fluorescence generated in each region (see, for example, Patent Document 1). In this inspection, after placing a biochip on the stage of a microscope apparatus (measuring apparatus), the biochip is imaged, and the fluorescence brightness is calculated using the imaging result.
バイオチップにおける該複数の領域の互いの位置関係を正確に認識するため、例えばアライメントマークが形成されたバイオチップを用いる場合がある。この場合、蛍光測定の撮像に先立ってアライメントマークを撮像し、このアライメントマークの像を用いることにより、バイオチップにおける複数の領域の位置関係を正確に認識することができる。 In order to accurately recognize the positional relationship between the plurality of regions in the biochip, for example, a biochip on which an alignment mark is formed may be used. In this case, the positional relationship between a plurality of regions on the biochip can be accurately recognized by imaging the alignment mark prior to imaging the fluorescence measurement and using the image of the alignment mark.
しかしながら、上記構成においては、ステージに対するバイオチップの配置方向が変化した場合(例、バイオチップが90°又は180°回転した場合)、当該バイオチップの配置方向の変化を正確に検出できない場合がある。この場合、バイオチップの検出精度が低下することがある。 However, in the above configuration, when the arrangement direction of the biochip relative to the stage changes (eg, when the biochip rotates 90 ° or 180 °), the change in the arrangement direction of the biochip may not be detected accurately. . In this case, the detection accuracy of the biochip may be lowered.
以上のような事情に鑑み、本発明は、バイオチップを高精度に検出することが可能な検出方法、検出装置、バイオチップのスクリーニング方法、スクリーニング装置及びバイオチップを提供することを目的とする。 In view of the circumstances as described above, an object of the present invention is to provide a detection method, a detection device, a biochip screening method, a screening device, and a biochip capable of detecting a biochip with high accuracy.
本発明の第一の態様に従えば、バイオチップを用いる検出方法であって、バイオチップの第一面に形成された互いに異なる2つのアライメントマークを光学的に検出するマーク検出工程と、2つのアライメントマークの検出結果に基づいて、バイオチップのアライメントを行うアライメント工程と、アライメント工程後に、バイオチップの第一面に配置された生体分子と検体に含まれる標的との親和性を検出する親和性検出工程と、を備える検出方法が提供される。 According to the first aspect of the present invention, there is provided a detection method using a biochip, wherein a mark detection step for optically detecting two different alignment marks formed on the first surface of the biochip, Based on the detection result of the alignment mark, the alignment step for aligning the biochip, and the affinity for detecting the affinity between the biomolecule placed on the first surface of the biochip and the target contained in the specimen after the alignment step And a detection method comprising: a detection step.
本発明の第二の態様に従えば、バイオチップを用いる検出装置であって、バイオチップが配置されるステージと、バイオチップの第一面に形成された互いに異なる2つのアライメントマークを光学的に検出するマーク検出部と、2つのアライメントマークの検出結果に基づいて、バイオチップのアライメントマークを行うアライメント部と、バイオチップの第一面に配置された生体分子と検体に含まれる標的との親和性を検出する親和性検出部と、を備える検出装置が提供される。 According to the second aspect of the present invention, there is provided a detection device using a biochip, wherein a stage on which the biochip is arranged and two different alignment marks formed on the first surface of the biochip are optically connected. Affinity between a mark detection unit to be detected, an alignment unit that performs an alignment mark of a biochip based on detection results of two alignment marks, and a biomolecule arranged on the first surface of the biochip and a target contained in the specimen There is provided a detection device including an affinity detection unit for detecting sex.
本発明の第三の態様に従えば、本発明の第一の態様に従う検出方法を用いる検出工程と、バイオチップに検体を分注する分注工程と、バイオチップを乾燥させる乾燥工程と、を備えるバイオチップのスクリーニング方法が提供される。 According to the third aspect of the present invention, a detection step using the detection method according to the first aspect of the present invention, a dispensing step of dispensing a specimen on the biochip, and a drying step of drying the biochip, A biochip screening method is provided.
本発明の第四の態様に従えば、本発明の第二の態様に従う検出装置と、バイオチップに検体を分注する分注装置と、を備えるスクリーニング装置が提供される。 According to the fourth aspect of the present invention, there is provided a screening apparatus comprising: the detection apparatus according to the second aspect of the present invention; and a dispensing apparatus for dispensing a specimen on a biochip.
本発明の第五の態様に従えば、検体に含まれる標的と特異的に反応可能な生体分子と、生体分子を支持する第一面を有する基板本体と、基板本体の配置方向に関するマークであり、第一面に形成された互いに異なる2つのアライメントマークと、を備えるバイオチップが提供される。 According to the fifth aspect of the present invention, a biomolecule that can specifically react with a target contained in a specimen, a substrate body having a first surface that supports the biomolecule, and a mark relating to an arrangement direction of the substrate body. A biochip comprising two different alignment marks formed on the first surface is provided.
本発明の態様によれば、バイオチップを高精度に検出することが可能となる。 According to the aspect of the present invention, the biochip can be detected with high accuracy.
以下、本発明の実施の形態を、図面を参照して説明する。
以下の説明においては、XYZ直交座標系を設定し、このXYZ直交座標系を参照しつつ各部材の位置関係について説明する。そして、水平面内の所定方向をX軸方向、水平面内においてX軸方向と直交する方向をY軸方向、X軸方向及びY軸方向のそれぞれに直交する方向(すなわち鉛直方向)をZ軸方向とする。また、X軸、Y軸、及びZ軸まわりの回転(傾斜)方向をそれぞれ、θX、θY、及びθZ方向とする。
Hereinafter, embodiments of the present invention will be described with reference to the drawings.
In the following description, an XYZ orthogonal coordinate system is set, and the positional relationship of each member will be described with reference to this XYZ orthogonal coordinate system. The predetermined direction in the horizontal plane is the X-axis direction, the direction orthogonal to the X-axis direction in the horizontal plane is the Y-axis direction, and the direction orthogonal to each of the X-axis direction and the Y-axis direction (that is, the vertical direction) is the Z-axis direction. To do. Further, the rotation (inclination) directions around the X axis, Y axis, and Z axis are the θX, θY, and θZ directions, respectively.
図1は、本実施形態に係る検出装置MS(20)の構成を示す図である。
図1に示すように、検出装置MS(20)は、本体部21と、制御部22と、表示部23とを備えている。本体部21は、バイオチップ(生体分子アレイ)50を用いた検出を行う。制御部22は、本体部21の動作を制御する。制御部22は、コンピュータシステムを含む。表示部23は、例えば液晶ディスプレイなどのフラットパネルディスプレイを含む。
FIG. 1 is a diagram showing a configuration of a detection device MS (20) according to the present embodiment.
As shown in FIG. 1, the detection device MS (20) includes a
本体部21は、ボディ24と、光源装置(光源)31と、対物レンズ32を含む光学システム25と、ステージ装置26と、接眼部27と、センサ(マーク検出部、親和性検出部)28を含む観察カメラ29と、を有している。ボディ24は、上記の光源装置31、光学システム25、ステージ装置26、接眼部27及び観察カメラ29を支持する。
The
光源装置31は、バイオチップ50を観察する所定波長帯域の照明光(第一の光)L1と、バイオチップ50で所定の蛍光(第三の光)L3を発生させるための所定波長帯域の励起光(第二の光)L2と、を射出可能である。照明光L1と励起光L2とは、互いに波長が異なっている。
The
光学システム25は、照明光学系(マーク検出部、親和性検出部、光学系)36と、結像光学系33とを有している。照明光学系36は、光源装置31から射出された光を用いてバイオチップ50を照明する。照明光学系36は、対物レンズ32と、照明光L1及びその反射光L4と、励起光L2と蛍光L3とを分離可能な光学ユニット37とを含む。
The
対物レンズ32は、無限系の対物レンズであり、ステージ装置26に支持されているバイオチップ50と対向可能である。対物レンズ32は、バイオチップ50の+Z側(上方)に配置されている。
The
結像光学系33は、対物レンズ32からの光を分離する光学素子47と、反射ミラー45とを有している。光学素子47は、ハーフミラーを含む。光学素子47は、入射した光の一部を透過すると共に、一部を反射する。光学素子47は、ダイクロイックミラーであってもよいし、光路を切り替える機能を有する全反射ミラー(例、クイックリターンミラー)であってもよい。結像光学系33は、バイオチップ50の像をセンサ28及び接眼部27の近傍に形成する。接眼部27及びセンサ28は、結像光学系33の像面側に配置されている。
The imaging
センサ28は、ケーブル48を介して制御部22に接続されている。センサ28で取得したバイオチップ50の像情報(画像信号)は、ケーブル48を介して、制御部22に伝送される。制御部22は、センサ28からの像情報(撮像結果)を、表示部23に表示する。表示部23は、センサ28で取得したバイオチップ50の像情報を拡大及び縮小して表示することができる。
The sensor 28 is connected to the
ステージ装置26は、結像光学系33の物体面側でバイオチップ50を支持して移動可能である。ステージ装置26は、バイオチップ50を支持するステージ本体(ステージ)51と、ベース部材52上でステージ本体51を移動する駆動装置53とを備えている。ステージ本体51は、ベース部材52上において、XY平面内及びZ方向に移動可能であり、θZ方向に回動可能である。
The
駆動装置53と制御部22とはケーブル49で接続されている。制御部22は、駆動装置53を用いて、ステージ本体51をXY平面内で移動可能であり、θZ方向に回動可能である。これにより、バイオチップ50は、上面を対物レンズ32と対向させた状態でXY平面内を移動可能となり、かつ、θZ方向に回動可能となるようにステージ装置26に支持されたものとなっている。制御部22は、駆動装置53の移動量及び回動量を調整することにより、ステージ本体51のXY平面内の位置、Z方向における位置及びθZ方向における位置を調整可能である。この構成により、検出装置MSは、ステージ本体51に支持されるバイオチップ50のXY平面内の位置、Z方向における位置及びθZ方向などの位置をアライメントすることが可能である。
The driving
バイオチップ50から対物レンズ32を介して光学素子47に入射した光(蛍光L3、反射光L4)の一部は、光学素子47を透過して、接眼レンズ43に導かれ、接眼部27より射出される。バイオチップ50の像は、結像光学系33により、接眼部27の近傍に形成される。これにより、観察者は、接眼部27を介して、生体分子支持領域(スポット)Sの像を確認できる。
Part of the light (fluorescence L3, reflected light L4) incident on the
また、バイオチップ50から対物レンズ32及び対物レンズ46を介して光学素子47に入射した光(蛍光L3、反射光L4)の一部は、光学素子47及び反射ミラー45で順に反射されて、観察カメラ29のセンサ28に入射する。バイオチップ50の像は、結像光学系33により、センサ28に形成される。これにより、観察カメラ29のセンサ28は、バイオチップ50の像情報(撮像情報)を取得可能である。
Further, part of the light (fluorescence L3, reflected light L4) incident on the
図1に示したように、観察カメラ29のセンサ28と制御部22とは、ケーブル48を介して接続されており、センサ28で取得したバイオチップ50の像情報は、ケーブル48を介して、制御部22に出力される。制御部22は、アライメント部22aを有している。アライメント部22aは、駆動装置53の駆動を制御することにより、バイオチップ50のアライメントを行う。また、制御部22は、センサ28からの像情報を、表示部23を用いて表示する。表示部23は、センサ28で取得したバイオチップ50の像情報を拡大して表示することができる。
As shown in FIG. 1, the sensor 28 of the
次に、バイオチップ50の一例を説明する。
図2(a)はバイオチップ50の形状を示す図であり、図2(b)は、バイオチップ50の要部を示す拡大断面図である。また、図3は、バイオチップ50の要部を示す拡大平面図である
Next, an example of the
FIG. 2A is a diagram showing the shape of the
バイオチップ50は、例えば矩形(又は正方形)に形成されている。バイオチップ50は、一方向に長手となるように形成された基板本体60を有している。基板本体60の表面(第一面)60aには、複数の生体分子支持領域(スポット)Sが形成されている。第一面60aは、複数の生体分子支持領域Sを支持する支持面である。複数の生体分子支持領域Sは、バイオチップ50の形状に沿って、マトリクス状に配置されている。また、生体分子支持領域Sは、m行×n列(例、4行×4列)ごとにギャップ(ギャップ領域)11が形成された状態で配置されている。隣り合う生体分子支持領域S同士の間は、所定の間隔が空けられている。
The
このようにマトリクス状に配置された複数の生体分子支持領域Sにより、バイオチップ50の第一面60aに生体分子支持領域の列が形成されている。各生体分子支持領域Sには、バイオチップ50における当該生体分子支持領域Sの位置を識別できるようにアドレスが設定されている。当該アドレスは、例えば制御部22の記憶部に記憶されている。
A row of biomolecule support regions is formed on the
なお、本実施形態において、第一面60aには、生体分子支持領域Sを1つ以上含む領域(支持領域)Saが形成されている。本実施形態では、例えば第一面60aのうち全ての生体分子支持領域Sが配置される矩形領域が1つの支持領域(配置領域)Saとなっている。なお、支持領域Saは、三角形や多角形、円形など、他の平面形状であってもよい。
In the present embodiment, a region (support region) Sa including one or more biomolecule support regions S is formed on the
各生体分子支持領域Sは、平面視で矩形や円形、多角形など様々な形状をとることができる。本実施形態では、図2(a)に示すように、例えば矩形に形成されている。各生体分子支持領域Sには、検体(例、血清や血漿など)に含まれ標識された標的と特異的に反応可能な種々の生体分子(計測対象)Bが配置されている(図2(b)参照)。例えば、蛍光色素で標識された標的を用いる場合、バイオアッセイ後に励起光を生体分子支持領域Sに照射することによって所定の蛍光(L3:図1参照)が発生する。発生した蛍光(L3)は、生体分子支持領域S毎にバイオチップ50(基板本体60)の表面から放出されるようになっている。 Each biomolecule support region S can take various shapes such as a rectangle, a circle, and a polygon in plan view. In this embodiment, as shown to Fig.2 (a), it forms in the rectangle, for example. In each biomolecule support region S, various biomolecules (measurement objects) B that can specifically react with a labeled target contained in a specimen (eg, serum, plasma, etc.) are arranged (FIG. 2 ( b)). For example, when a target labeled with a fluorescent dye is used, predetermined fluorescence (L3: see FIG. 1) is generated by irradiating the biomolecule supporting region S with excitation light after the bioassay. The generated fluorescence (L3) is emitted from the surface of the biochip 50 (substrate body 60) for each biomolecule support region S.
例えば、生体分子Bは、プローブとして配置される。また、バイオチップ50は、蛍光標識された標的を有する検体として全血や血清などが当該バイオチップ50の生体分子支持領域Sに注入された後に、洗浄が行われる。
For example, the biomolecule B is arranged as a probe. Further, the
なお、上記プローブは、例えば、シリコンウエハからなる上記基板本体60上の生体分子支持領域Sの形成領域に所定の生体分子形成材料を配置する工程と、マスクを介して生体分子形成材料に所定波長の光を選択的に照射する露光工程と、を複数回繰り返すことにより、複数の生体分子を積層することで形成される。このようにして形成された生体分子は、測定対象である上記検体の標的との間で親和性を有する場合には、標的と特異的な反応をし、所定の波長帯域の励起光の照明によって所定の波長帯域の蛍光を発生させることが可能である。
The probe has a step of placing a predetermined biomolecule-forming material in a formation region of the biomolecule support region S on the
図3は、基板本体60の第一面60aの構成を示す図である。
図3に示すように、本実施形態における検出装置MSにおける1つの視野領域100の大きさは、支持領域Saよりも小さい。したがって、検出装置MSを用いて支持領域Sa全体に配置された複数の生体分子支持領域Sを撮像する場合、支持領域Saを複数の撮像領域(検出領域)に分割して撮像する必要がある。例えば、検出装置MSは、バイオチップ50と光学システム25(例、対物レンズ32)の視野領域100とを相対的に移動させつつ該複数の撮像領域に応じて複数回撮像し、それらの撮像結果のうち隣接する撮像結果同士を合成(スティッチング)している。
FIG. 3 is a diagram illustrating the configuration of the
As shown in FIG. 3, the size of one
この場合、図3に示すように、検出装置MSは、基板本体60(バイオチップ50))と視野領域100とを相対的に移動させることにより、第一面60a上の視野領域101〜104を含む複数の検出領域に視野領域100を配置することができる。
In this case, as shown in FIG. 3, the detection apparatus MS moves the substrate body 60 (biochip 50)) and the
バイオチップ50は、例えば、テストパターン63及び64と、バーコード65と、基板本体60の第一面60aに形成され互いに異なる2種類(例、形状、光量など)のアライメントマーク61、62とを有している。以下、アライメントマーク61を第一マーク61と表記し、アライメントマーク62を第二マーク62と表記する場合がある。第一マーク61、第二マーク62は、撮像された場合の形態が互いに区別できるように形成されている。本実施形態では、例えばZ方向視における形状が第一マーク61と第二マーク62とで異なっている。
The
第一マーク61、第二マーク62は、光源装置31からの照明光L1を反射可能に形成されている。第一マーク61、第二マーク62は、例えば金属(他の物質であってもよい)などの光反射率の高い材料を用いて膜状に形成されている。第一マーク61、第二マーク62は、第一面60aのうちどの位置に設けられてもよい。本実施形態では、第一マーク61、第二マーク62は、例えば第一面60a上の支持領域Saから外れた領域に共に配置されている。
The
第一マーク61は、第一面60aのうち図3の+Y側の2つの角部(縁部)に1つずつ配置されている(第一マーク61A、61B)。第一マーク61は、平面視で円形、矩形、多角形あるいは他の形状など、どのような形状に形成されていてもよい。本実施形態では、第一マーク61は、Z方向視においてX字状に形成されている。
One
第二マーク62は、第一面60aのうち図3の−Y側の2つの角部(縁部)に1つずつ配置されている(第二マーク62A、62B)。第二マーク62は、第一マーク61とは異なる形状に形成されている。第二マーク62は、第二マーク62と異なる形状であれば、平面視で円形、矩形、多角形あるいは他の形状など、どのような形状に形成されていてもよい。本実施形態では、第一マーク61は、Z方向視において+字状に形成されている。
One
2種類の第一マーク61、第二マーク62が上記のように配置されることにより、バイオチップ50(基板本体60)を90°ずつ回転した場合に、例えばバイオチップ50の四辺のうち任意の一辺に沿って並ぶアライメントマーク61、62の並び順が4通り形成される。
By arranging the two types of the
図4(a)〜図4(e)は、バイオチップ50の第一面60aの構成を模式的に示す図である。図4(a)〜図4(e)においては、第一マーク61、62のみを示しており、生体分子支持領域S、テストパターン63及び64、バーコード65など、他の構成についての図示を省略している。
4A to 4E are diagrams schematically showing the configuration of the
図4(a)に示すように、例えばバイオチップ50のうち−X側の辺(所定の一辺)を例に挙げて説明すると、当該辺の+Y側が第一マーク61(61A)であり、−Y側が第二マーク62(62A)である(第一状態)。
As shown in FIG. 4A, for example, the −X side (predetermined one side) of the
このバイオチップ50の第一状態から、座標軸を固定させて、バイオチップ50を時計回りに90°回転させた場合、図4(b)に示すように、−X側の辺の+Y側は第二マーク62(62A)となり、−Y側は第二マーク62(62B)となる(第二状態)。
When the coordinate axis is fixed from the first state of the
次に、この第二状態から、座標軸を固定させて、バイオチップ50を更に時計回りに90°回転させた場合、図4(c)に示すように、−X側の辺の+Y側は第二マーク62(62B)となり、−Y側は第一マーク61(61B)となる(第三状態)。
Next, from this second state, when the coordinate axis is fixed and the
そして、この第三状態から、座標軸を固定させて、バイオチップ50を更に時計回りに90°回転させた場合、図4(d)に示すように、−X側の辺の+Y側は第一マーク61(61B)となり、−Y側は第一マーク61(61A)となる(第四状態)。
From this third state, when the coordinate axis is fixed and the
なお、この第四状態から、座標軸を固定させて、バイオチップ50を更に時計回りに90°回転させた場合、図4(a)に示すように、上記第一状態となる。すなわち、−X側の辺の+Y側は第一マーク61(61A)となり、−Y側は第二マーク62(62A)となる。
From this fourth state, when the coordinate axis is fixed and the
このように、検出装置MSは、バイオチップ50の一辺に並んだ2つのアライメントマーク61、62の並び順により、ステージ本体51におけるバイオチップ50の回転方向の位置(配置方向)が回転角度(例、90°)ごとに判別可能である。また、図4(e)に示すように、検出装置MSは、バイオチップ50が例えば第一状態に対して90°(又はその整数倍の角度)とは異なる角度だけ回転方向にずれている場合であっても、勿論当該ズレを検出可能である。また、検出装置MSは、バイオチップ50の2つのアライメントマーク61、62によって、ステージ本体51におけるバイオチップ50の面内方向の位置を判別可能である。したがって、本実施形態の検出装置MSは、ステージ本体51におけるバイオチップ50の位置関係に変動(例、回転方向のずれ)がある場合でも、バイオチップ50における複数の生体分子支持領域Sの互いの位置関係を正確に検出することができるためにバイオチップ50を高精度に検出できるし、生体分子支持領域Sの位置を間違えることがないために該位置の誤検出を低減することができる。また、本実施形態における検出装置MSは、上記の第一マーク61及び第二マーク62を用いて、ステージ本体51におけるバイオチップ50の基準配置位置からのバイオチップ50の変動量を正確に検出することが可能なため、その変動量に応じてステージ本体51の移動を制御して検出できるし、その変動量に応じてバイオチップ50の位置を補正することができる。
As described above, in the detection apparatus MS, the position (arrangement direction) in the rotation direction of the
また、バイオチップ50の第一面60aには、テストパターン63、64と、バーコード65とが形成されている。テストパターン63、64は、支持領域Saの外側に配置されている。テストパターン63、64は、第一面60aのうち例えば−X側の辺及び+X側の辺のそれぞれに沿って形成されている。
In addition,
バーコード65は、第一面60aのうち例えば−Y側の辺に沿って形成されている。バーコード65は、バイオチップ50における生体分子支持領域S(生体分子)の情報、製造年月日などを情報として含む構成とすることができる。なお、このような情報を含む構成として、バーコード65の代わりに情報を書き換え可能なICタグが用いられていてもよい。なお、第一面60aにおいて、複数回撮像した結果同士を合成(スティッチング)する際に、画像同士の位置決めに用いるアライメントマークが設けられていてもよい。
The
次に、上述の構成を有する検出装置MSを用いて、バイオチップ50の各生体分子支持領域Sで発せられた蛍光の検出方法について説明する。
まず、後述の分注装置5を用いてバイオチップ50の各生体分子支持領域Sに検体を分注し、所定時間経過させることで生体分子支持領域Sに形成された生体分子と検体に含まれ標識された標的とを反応させる(S1:分注工程)。各生体分子支持領域Sに対する検体の分注工程は、例えば、分注装置5のノズルにより所定量の検体を分注することが行われる。なお、検体を貯留する検体貯留タンク内にバイオチップ50を浸漬することで検体と生体分子とを反応させるようにしても良い。
Next, a method for detecting fluorescence emitted from each biomolecule support region S of the
First, a sample is dispensed into each biomolecule support region S of the
生体分子と標的とを反応させた後、後述の洗浄部7を用いて洗浄液を吹き付けることでバイオチップ50の洗浄を行う(洗浄工程)。これにより、バイオチップ50に付着した検体及び未反応の標的を洗い流すことができる。なお、バイオチップ50の洗浄方法は、洗浄液の吹き付けに限定されることはなく、例えば、洗浄液を貯留した貯留部にバイオチップ50を浸漬するようにしてもよい。このとき、洗浄工程は、貯留部において洗浄液に一定の流れを付与し、バイオチップ50に常に新鮮な洗浄液が供給されるようにしてもよい。
After reacting the biomolecule with the target, the
次に、洗浄後のバイオチップ50を乾燥させる工程が行われる(S2:乾燥工程)。例えば、乾燥工程は、後述の乾燥部8のファン等によって乾燥用の温風をバイオチップ50に向けて噴き出す。これにより、洗浄液で濡れたバイオチップ50を乾燥させることができる。なお、上述したバイオチップ50の洗浄工程および乾燥工程は、複数回ずつ繰り返して行うようにしても構わない。
Next, a step of drying the washed
バイオチップ50の洗浄及び乾燥工程が終了した後、検出装置MSは、バイオチップ50の検出を行う(S3〜S6:検出工程)。まず、図1に示した検出装置MSのステージ本体51上にバイオチップ50(又はバイオチップ50が固定されたプレート)を載置する。このとき、バイオチップ50(又は該プレート)をステージ本体51上の所定の位置に位置決めする。
After the cleaning and drying steps of the
次に、検出装置MSは、光源装置31から照明光L1を選択して射出させ、バイオチップ50(基板本体60)の第一面60aを照明する。光源装置31から射出された照明光(第一の光)L1は、光学ユニット37で反射光と透過光とに分離されて、部分反射及び部分透過し、部分反射した照明光が対物レンズ32を透過した後に、基板本体60(バイオチップ50)の第一面60aを照明する。基板本体60の第一面60aで反射した照明光(反射光L4)は、対物レンズ32、光学ユニット37を透過して光学素子47に入射する。
Next, the detection device MS selects and emits the illumination light L1 from the
そして、光学素子47に入射した反射光L4の一部は、光学素子47を透過して、接眼レンズ43に導かれ、接眼部27より射出される。これにより、バイオチップ50の生体分子支持領域Sの像が、接眼部27の近傍に形成される。また、光学素子47に入射した反射光L4の一部は、光学素子47および反射ミラー45で順次反射されて、観察カメラ29のセンサ28に入射する。
A part of the reflected
ここで、検出装置MSは、センサ28の撮像特性及び所定の倍率に応じた大きさの視野領域100内に複数の生体分子支持領域Sの像がセンサ28に形成される。センサ28は、生体分子支持領域Sの像情報(生体分子支持領域Sの受光情報)を取得する。
Here, in the detection device MS, images of a plurality of biomolecule support regions S are formed on the sensor 28 in the
この工程において、検出装置MSは、バイオチップ50に形成されたアライメントマーク61、62を測定可能となる撮像領域に視野領域100が配置されるように、ステージ本体51をXY平面内で移動させる。ステージ本体51を移動した後、検出装置MSは、光源装置31から照明光L1を射出させ、アライメントマーク61、62を照明し、アライメントマーク61、62の像を撮像する(S3:マーク検出工程)。
In this step, the detection apparatus MS moves the
このとき、制御部22は、ステージ本体51を移動させることにより、バイオチップ50の4辺のうちの一辺に沿って並ぶアライメントマーク61、62を順次撮像させる。なお、1つの視野領域100(又は撮像領域)の内部に2つのアライメントマーク61、62を配置させ、同時に検出するようにしてもよい。制御部22は、アライメントマーク61、62の並び順により、バイオチップ50の配置方向を求め、当該配置方向が予め設定された配置方向に一致するか否かの判断を行う。
At this time, the
アライメント部22aは、求められた配置方向が予め設定された配置方向に一致する場合には、ステージ本体51をXY平面内で移動させてXY平面上の位置合わせを行う。また、求められた配置方向が予め設定された配置方向に一致しない場合には、アライメント部22aは、バイオチップ50が予め設定された方向に配置されるように、ステージ本体51をθZ方向に回動させる(S4:アライメント工程)。このように、アライメント工程では、バイオチップ50の配置方向に関する位置合わせを行う。なお、アライメント部22aは、アライメント工程において、ステージ本体51を移動させずに複数の生体分子支持領域Sの位置座標(位置情報)のデータをそれぞれ補正することにより、バイオチップ50の配置方向に関する位置合わせを行ってもよい。また、アライメント部22aは、ステージ本体51の移動と生体分子支持領域Sの位置座標のデータの補正とを組み合わせ行ってもよい。
When the obtained arrangement direction matches the preset arrangement direction, the
その後、検出装置MSは、バイオチップ50の第一面60aをZ方向の所定位置に位置決めしてフォーカス調整を行った後、蛍光測定を行うために、光源装置31から射出される光を所定波長帯域の励起光L2に切り替える。光源装置31から射出された励起光(第二の光)L2は、光学ユニット37で反射(全反射)し、対物レンズ32を透過した後に、基板本体60の第一面60aを照明する。この励起光L2により、第一面60aに配置される複数の生体分子支持領域Sが照明される。励起光L2で照明された複数の生体分子支持領域Sのうち、蛍光標識された標的と生体分子とが特異的な反応により結合(親和性を有する)した生体分子支持領域Sにおいて蛍光(第三の光)L3が発生する。発生した蛍光L3は、対物レンズ32、および光学ユニット37を透過して光学素子47に入射する。
Thereafter, the detection device MS adjusts the focus by adjusting the
本実施形態では、検出装置MSの視野領域100がバイオチップ50の測定対象領域(支持領域Sa)の面積よりも小さい。このため、測定対象領域と視野領域100とを相対的に移動させながら順次撮像を行うことで、測定対象領域全体の撮像結果が得られる(S5:親和性検出工程)。制御部22は、測定対象領域のうち第一の撮像領域(例、視野領域101)の計測が完了した後、ステージ本体51をXY平面内で移動させ、第一の撮像領域と隣り合う第二の撮像領域(例、視野領域102)にバイオチップ50を移動させる。そして、検出装置MSは、上記第一の撮像領域に対する撮像処理と同様に、バイオチップ50に励起光L2を照射することにより、生体分子支持領域Sの計測を実施する。
In the present embodiment, the
そして、測定対象領域の全ての計測が完了するまで計測処理を実施した後、制御部22は、各撮像領域(例、視野領域101〜104)における照明光による生体分子支持領域の計測結果(撮像結果)を画像合成するとともに、蛍光による生体分子支持領域の計測結果を画像画面合成する(S6:スティッチング工程)。なお、上記アライメント工程は、例えば、複数の検出領域におけるスティッチングの位置合わせでもある。また、本実施形態におけるアライメント工程は、複数のバイオチップ50を1つの板状のプレート部材(保持部材)に固定させた状態で親和性を検出する場合においても用いることができる。例えば、バイオチップ50が該プレート部材に配置方向をずれて固定された場合、検出装置は、上記の2つのアライメントマーク61、62を用いて、該プレートにおけるバイオチップ50の配置方向の変化(変動)を検出することが可能である。
Then, after performing the measurement process until all the measurement of the measurement target region is completed, the
以上のように、本実施形態の検出装置MSは、2つのアライメントマーク61、62の検出結果に基づいてバイオチップ50のアライメントを行うため、バイオチップ50の配置方向が変化した場合(例、バイオチップが90°又は180°回転した場合など)には、バイオチップ50の配置方向の変化を検出することが可能となる。これにより、検出装置MSは、バイオチップ50を高精度に検出可能となる。
As described above, since the detection apparatus MS of the present embodiment performs alignment of the
本発明の技術範囲は上記実施形態に限定されるものではなく、本発明の趣旨を逸脱しない範囲で適宜変更を加えることができる。
上記実施形態では、形状の異なる第一マーク61及び第二マーク62が支持領域Saの外側に配置された構成を例に挙げて説明したが、これに限られることはない。
図6は、変形例に係るバイオチップ50Aの構成を示す平面図である。
図6に示すように、バイオチップ50Aを構成する基板本体60の第一面60aには、例えばアライメントマーク66が形成されている。このアライメントマーク66は、支持領域Saの内側に配置されている。また、当該第一面60aには、例えばアライメントマーク67が形成されている。このアライメントマーク67は、支持領域Saの内側から外側にかけて配置されている。このように、アライメントマークの少なくとも一部が支持領域Saの内側に配置されていてもよい。
The technical scope of the present invention is not limited to the above-described embodiment, and appropriate modifications can be made without departing from the spirit of the present invention.
In the above embodiment, the configuration in which the
FIG. 6 is a plan view showing a configuration of a
As shown in FIG. 6, for example, an
また、アライメントマーク66は、X方向を基準にしてY方向について非対称となる形状を有している。このため、座標軸を固定させたままバイオチップ50Aを時計回りまたは反時計回りに90°または180°回動させた場合、Z方向視におけるアライメントマーク66の形状が変化する。このとき、撮像されたアライメントマーク66の像は、バイオチップ50Aの配置方向に応じてそれぞれ異なる形状となる。このように、検出装置MSは、バイオチップ50Aを回動させることで、撮像された場合の形態が異なる2種類(またはそれ以上の種類)のアライメントマークを取得可能な構成であってもよい。なお、アライメントマーク67についても、アライメントマーク66と同様の説明が可能である。
The
また、図6では、アライメントマーク66及びアライメントマーク67を1つのバイオチップ50Aに配置した構成を例に挙げて説明したが、これに限られることはない。例えば、アライメントマーク66、67のいずれか一方のみがバイオチップ50Aに形成されていてもよい。
In FIG. 6, the configuration in which the
また、上記実施形態では、アライメントマークが第一面60a上に形成された膜パターンである例を説明したが、これに限られることはない。
図7(a)は、変形例に係るバイオチップ50Bの構成を示す平面図である。
図7(a)に示すように、バイオチップ50Bを構成する基板本体60の第一面60aには、アライメントマーク68、69が形成されている。アライメントマーク68のZ方向視における形状は、上記実施形態のアライメントマーク61と同一である。また、アライメントマーク69のZ方向視における形状は、上記実施形態のアライメントマーク62と同一である。
Moreover, although the said embodiment demonstrated the example whose alignment mark is a film | membrane pattern formed on the
FIG. 7A is a plan view showing a configuration of a
As shown in FIG. 7A, alignment marks 68 and 69 are formed on the
図7(b)は、図7(a)におけるA−A´断面に沿った構成を示す図であり、アライメントマーク68、69の断面構成を示す図である。
図7(b)に示すように、アライメントマーク68は、第一面60aに例えば凹部として形成されている。また、アライメントマーク69は、第一面60aに例えば凸部として形成されている。このように、第一面60aに凹部または凸部としてアライメントマークが形成された構成であってもよい。
FIG. 7B is a diagram showing a configuration along the section AA ′ in FIG. 7A, and is a diagram showing a sectional configuration of the alignment marks 68 and 69.
As shown in FIG. 7B, the
上記実施形態では、第一マーク61、第二マーク62の形状が異なる構成を例に挙げて説明したが、これに限られることはない。例えば、第一マーク61、第二マーク62の形状が同一であり、寸法が異なる構成であってもよい。この構成であっても、検出装置MSは、撮像された第一マーク61と第二マーク62とを互いに区別することが可能である。
In the above embodiment, the configuration in which the shapes of the
図8は、変形例に係るバイオチップ50Cの構成を示す平面図である。
図8に示すように、バイオチップ50Cの第一面60aには、第一マーク71(71A、71B)と、第二マーク72(72A、72B)が形成されている。第一マーク71、第二マーク72は、同一形状を有している。一方、第一マーク71、第二マーク72は、照明光L1の反射光の波長が異なるように形成された構成であってもよい。すなわち、第一マーク71、第二マーク72は、いわゆるカラーマークであり、これらカラーマークの色が互いに異なる構成であってもよい。この場合、第一マーク71及び第二マーク72によって反射される反射光L4のそれぞれの波長は、観察カメラ29のセンサ28によって識別可能な波長であればよい。
FIG. 8 is a plan view showing a configuration of a biochip 50C according to a modification.
As shown in FIG. 8, a first mark 71 (71A, 71B) and a second mark 72 (72A, 72B) are formed on the
また、検出装置MSは、上記実施形態に記載のアライメントマーク61、62を、バイオチップ50の位置の基準を示すマーク(位置基準マーク)として用いてもよい。例えば、検出装置MSは、第一面60a上の撮像領域101〜104を撮像するためのアライメントマークとして用いてもよいし、撮像後にこれらの隣接する画像を合成(スティッチング)する場合、異なる画像同士の位置を合わせるためのアライメントマークとして用いてもよい。これらの場合、アライメントマーク61、62は、バイオチップ50の配置方向を示すマークと、位置基準マークとを兼ねることとなる。
In addition, the detection apparatus MS may use the alignment marks 61 and 62 described in the above embodiment as marks (position reference marks) indicating the reference of the position of the
図9は、変形例に係るバイオチップ50Dの構成を示す平面図である。
図9に示すように、アライメントマーク73〜76が形成されている。アライメントマーク73〜76は、各撮像領域(例、視野領域101〜104)に対応する位置に配置されている。これらアライメントマーク73〜76は、バイオチップ50Dの+Y側の辺からの距離又は−Y側の辺(端)からの距離が異なっている。
FIG. 9 is a plan view showing a configuration of a
As shown in FIG. 9, alignment marks 73 to 76 are formed. The alignment marks 73 to 76 are arranged at positions corresponding to the respective imaging regions (for example, the
アライメントマーク73は、第一の撮像領域(例、視野領域101)の内部であって、バイオチップ50Dの+Y側の辺から距離t1だけ離れた位置に形成されている。アライメントマーク74は、第二の撮像領域(例、視野領域102)の内部であって、バイオチップ50Dの+Y側の辺から距離t2だけ離れた位置に形成されている。アライメントマーク75は、第三の撮像領域(例、視野領域103)の内部であって、バイオチップ50Dの−Y側の辺から距離t3だけ離れた位置に形成されている。アライメントマーク76は、第四の撮像領域(例、視野領域104)の内部であって、バイオチップ50Dの−Y側の辺から距離t4だけ離れた位置に形成されている。ここでは、t1<t2<t3<t4としているが、距離t1〜距離t4は全て異なる値であってもよい。また、バイオチップ50Dを90°ずつ回転した場合に、同一配置とならない範囲で、距離t1〜距離t4を適宜設定することが可能である。
The
図10は、変形例に係るバイオチップ50Eの一部の構成を示す平面図である。
図10に示すように、マトリクス状に配置された生体分子支持領域Sの間に、直線状のアライメントマーク77(直線部77a〜77c)が直線状に形成されていてもよい。直線部77aは、X方向に延びており、矩形の視野領域110がX方向に2つ並ぶ寸法に形成されている。直線部77b、77cは、直線部77aから−Y側に延びている。直線部77aと直線部77bとの交点は、左側の視野領域111の中央部に一致している。また、直線部77aと直線部77cとの交点は、右側の視野領域111の中央部に一致している。この構成によれば、バイオチップ50EがθZ方向に回転した場合、アライメントマーク77の形状がバイオチップ50Eの配置方向によって異なることとなる。また、視野領域111が例えば−Y側へずれた場合(例、ズレ量:△y)であっても、そのズレを検出することができる。
FIG. 10 is a plan view showing a partial configuration of a
As shown in FIG. 10, linear alignment marks 77 (
図11は、変形例に係るバイオチップ50Fの一部の構成を示す平面図である。
図11に示すように、マトリクス状に配置された生体分子支持領域Sの角部同士の間(ギャップ領域)に、生体分子支持領域Sとほぼ同一形状(矩形)で同一寸法のアライメントマーク(矩形部78a〜78c)が配置されていてもよい。
FIG. 11 is a plan view showing a partial configuration of a
As shown in FIG. 11, alignment marks (rectangles) having the same shape (rectangle) as the biomolecule support region S and the same size are provided between the corners (gap regions) of the biomolecule support regions S arranged in a matrix.
矩形部78a〜78cは、一の生体分子支持領域Sの周りを囲うように配置されている。これら矩形部78a〜78cは、生体分子支持領域Sの4つの角部のうち3つに対応する部分に配置されている。このため、バイオチップ50FがθZ方向に回転した場合、矩形部78a〜78cの配置がバイオチップ50Eの配置方向によって異なることとなる。
The
また、上記実施形態では、第一面60aにはアライメントマーク61、62の他に、テストパターン63、64やバーコード65が設けられた構成を例に挙げて説明したが、これらテストパターン63、64やバーコード65の少なくとも一部をアライメントマーク又はその一部として用いてもよい。
In the above embodiment, the
例えばバーコード65は、一方向におけるパターンが対称ではないため、バイオチップ50が回転した場合、撮像された像の形態がバイオチップ50の配置方向によって異なる。このため、バイオチップ50の配置方向を検出するためのアライメントマークとして有用である。なお、バーコード65をアライメントマークとして用いる場合、バーコード65は、バイオチップ50の配置方向を示すマークと、バイオチップ50(基板本体60)に関する情報を示す基板情報マークとを兼ねることとなる。なお、バーコード65は、支持領域Saの内部に配置されていてもよい。
For example, since the pattern of the
また、上記実施形態では、検出装置MSの構成について、アライメントマーク61、62に照明光L1を照射するための光路と、生体分子支持領域Sに励起光L2を照射するための光路とが共通であり、蛍光L3の光路と、反射光L4の光路とが共通である構成を例に挙げて説明したが、これに限られることは無い。 Moreover, in the said embodiment, the optical path for irradiating the illumination light L1 to the alignment marks 61 and 62 and the optical path for irradiating the biomolecule support area | region S with the excitation light L2 are common about the structure of the detection apparatus MS. There has been described as an example a configuration in which the optical path of the fluorescence L3 and the optical path of the reflected light L4 are common, but is not limited thereto.
図12(a)は、変形例に係る検出装置20Aの構成を示す図である。
図12(a)に示すように、検出装置20Aは、本体部21Aと、制御部22Aとを備えている。本体部21Aは、光源装置(光源)31と、光学システム25Aと、ステージ装置26と、マーク検出用センサ(マーク検出部)38Aと、親和性検出用センサ39Aとを有している。
FIG. 12A is a diagram illustrating a configuration of a
As shown in FIG. 12A, the
マーク検出用センサ38Aは、反射光L4の像を撮像する。反射光L4の像は、アライメントマーク61、62の像を含む。また、親和性検出用センサ39Aは、蛍光L3の像を撮像する。蛍光L3の像は、バイオチップ50の第一面60aに配置された生体分子と検体に含まれる標的との親和性に関する情報を含む。このように、図12(a)の検出装置20Aは、アライメントマーク61、62を検出するマーク検出用センサ38Aと、親和性を検出する親和性検出用センサ39Aとが別々に設けられている。なお、マーク検出用センサ38A及び親和性検出用センサ39Aにおける撮像結果は、それぞれ制御部22Aに送信される。
The
光学システム25Aは、ダイクロイックミラー34Aを有している。ダイクロイックミラー34Aは、アライメントマーク61、62で反射される反射光L4を反射すると共に、生体分子支持領域Sにおいて発生した蛍光L3を透過する。ダイクロイックミラー34Aによって反射された反射光L4は、マーク検出用センサ38Aに入射する。一方、ダイクロイックミラー34Aを透過した蛍光L3は、親和性検出用センサ39Aに入射する。
The
図12(a)に示す構成では、光源31から射出された照射光L1及び励起光L2は、光源31からステージ本体51(又はバイオチップ50)までの光路が一致している。一方、反射光L4及び蛍光L3は、ステージ本体51からダイクロイックミラー34Aまでは光路が一致しているが、ダイクロイックミラー34から各センサ(マーク検出用センサ38A、親和性検出用センサ39A)までは光路が異なっている。このように、検出装置20Aは、アライメントマーク61、62に照明光L1を照射するための光路と、生体分子支持領域Sに励起光L2を照射するための光路とが共通であるが、反射光L4の光路と蛍光L3の光路とが一部異なる構成であってもよい。
In the configuration shown in FIG. 12A, the irradiation light L1 and excitation light L2 emitted from the
また、上記実施形態及び変形例では、検出装置MS、20Aの構成は、照明光L1を照射するための光路と、励起光L2を照射するための光路とが共通(共に照明光学系36の光軸)である構成を例に挙げて説明したが、本実施形態における検出装置は、これに限られることは無く、照明光L1の光路及び励起光L2の光路のうち少なくとも一部が異なっている構成でもよい。 In the embodiment and the modification, the configuration of the detection devices MS and 20A has a common optical path for irradiating the illumination light L1 and an optical path for irradiating the excitation light L2 (both of the light of the illumination optical system 36). However, the detection apparatus in the present embodiment is not limited to this, and at least a part of the optical path of the illumination light L1 and the optical path of the excitation light L2 is different. It may be configured.
図12(b)は、変形例に係る検出装置20Bの構成を示す図である。
図12(b)に示すように、検出装置20Bは、本体部21Bと、制御部22Bとを備えている。本体部21Bは、マーク検出用光源装置(光源)31Bと、親和性検出用光源装置35Bと、マーク検出用光学システム25Bと、親和性検出用光学システム30Bと、ステージ装置26と、マーク検出用センサ(マーク検出部)38Bと、親和性検出用センサ39Bとを有している。
FIG. 12B is a diagram illustrating a configuration of a
As shown in FIG. 12B, the
マーク検出用光源装置31Bは、上記実施形態における照明光L1を射出可能である。マーク検出用光学システム25Bは、照明光L1をバイオチップ50に照射する。また、マーク検出用光学システム25Bは、バイオチップ50で反射された反射光L4をマーク検出用センサ38Bに照射する。
The mark detection
親和性検出用光源装置35Bは、上記実施形態における励起光L2を射出可能である。親和性検出用光学システム30Bは、励起光L2をバイオチップ50に照射する。また、親和性検出用光学システム30Bは、バイオチップ50で生じた蛍光L3を親和性検出用センサ39Bに照射する。
The affinity detection
このように、図12(b)の検出装置20Bは、アライメントマーク61、62を検出するためのマーク検出部(マーク検出用光源装置31B、マーク検出用光学システム25B、マーク検出用センサ38B)と、親和性を検出するための親和性検出部(親和性検出用光源装置35B、親和性検出用光学システム30B、親和性検出用センサ39B)とが別々に設けられている。
As described above, the
図12(b)に示す構成では、マーク検出用光源装置31Bから射出された照射光L1と、親和性検出用光源装置35Bから射出された励起光L2とは、互いに異なる光学系により、互いに異なる光路で、ステージ本体51(又はバイオチップ50)まで導光される。また、反射光L4及び蛍光L3についても、互いに異なる光学系により、互いに異なる光路で、マーク検出用センサ38B、親和性検出用センサ39Bに導光される。なお、マーク検出用センサ38B及び親和性検出用センサ39Bにおける撮像結果は、それぞれ制御部22Bに送信される。このように、検出装置20Bは、アライメントマーク61、62に照明光L1を照射するための光路と、生体分子支持領域Sに励起光L2を照射するための光路とが共通であるが、反射光L4の光路と蛍光L3の光路とが異なる構成であってもよい。
In the configuration shown in FIG. 12B, the irradiation light L1 emitted from the mark detection
[スクリーニング装置]
図13は、スクリーニング装置SCの概略的な構成を示す図である。
図13に示すように、スクリーニング装置SCは、プレアッセイ部PAと、アッセイ部(分注装置)ASと、計測部(検出装置)MSと、受渡部TR1、TR2とを備えている。スクリーニング装置SCは、上記実施形態に記載のバイオチップ50(又はバイオチップ50A〜50G)を用いた生体分子アレイのスクリーニングを行う。計測部MSとして、例えば上記実施形態に記載の検出装置20(MS)が用いられている。
[Screening equipment]
FIG. 13 is a diagram showing a schematic configuration of the screening apparatus SC.
As shown in FIG. 13, the screening device SC includes a pre-assay unit PA, an assay unit (dispensing device) AS, a measuring unit (detection device) MS, and delivery units TR1 and TR2. The screening apparatus SC performs screening of a biomolecule array using the biochip 50 (or
プレアッセイ部PAは、実装部1、マーキング部2、受渡部3を備えている。実装部1は、バイオチップ50をアレイボックス11に実装するものであり、マニピュレータ(例、コンピュータ制御で自動駆動可能な機械的な腕)と、アームを備えるロボット装置とを備えている。
The pre-assay unit PA includes a mounting unit 1, a marking
アッセイ部(バイオアッセイ装置)ASは、読取部4、分注装置(分注部)5、反応部6、洗浄部7、乾燥部8、受渡部9を備えている。読取部4は、撮像装置14と、上記プレアッセイ部PAの移載装置12と同様の構成を備える移載装置13とを備えている。撮像装置14は、バイオチップ50の基板側の面に形成されたバイオチップ50の識別情報を撮像して読み取る装置であって、例えば、CCDカメラ等で構成される。撮像装置14を用いて識別情報を撮像することによって識別情報信号が生成され、該識別情報信号は制御装置CONTに出力される。
The assay unit (bioassay device) AS includes a
分注装置5は、例えば検体が分注された反応容器15に対して、ノズルを有するマニピュレータを用いて生体分子と特異的に反応可能な標的を含む検体を注入(分注)する分注処理が行われるものである。
For example, the
反応部6は、バイオチップ50の生体分子支持領域Sに配置される生体分子と、検体に含まれる標的とを所定の温度条件下で反応させる反応処理を行う。反応部6は、分注装置5に設けられた反応容器15と同一構成の反応容器と、バイオチップ50を吸着保持する吸着保持装置16とを備えている。なお、吸着保持装置16は、バイオチップ50に直接的に接触して吸着してもよいし、吸着保護層のような膜を介してバイオチップ50を間接的に吸着してもよい。
The
洗浄部7は、バイオチップ50を洗浄する洗浄処理を行う。洗浄部7は、洗浄液が貯溜された洗浄容器17を備えている。
乾燥部8は、洗浄されたバイオチップ50の乾燥処理を行う。乾燥部8は、例えば乾燥用の気体を噴出する乾燥装置18を備えている。
受渡部9は、読取部4と反応部6との間でバイオチップ50の受け渡し処理を行う。また、受渡部TR1は、マーキング部2と読取部4との間でバイオチップ50の受け渡し処理を行う。受渡部TR2は、アッセイ部AS(反応部6)と計測部MSとの間でバイオチップ50の受渡処理を行う。
The cleaning unit 7 performs a cleaning process for cleaning the
The drying unit 8 performs a drying process on the washed
The delivery unit 9 performs a delivery process of the
上記のスクリーニング装置SCを用いて、生体分子アレイの処理方法を含むバイオチップ50のスクリーニングを行う場合、生体分子を有するバイオチップ50の計測に関連する処理として、例えば、実装処理、マーキング処理、読取処理、分注処理、反応処理、洗浄処理、乾燥処理、計測処理(検出処理)及びこれらの処理の間でバイオチップ50を移送する移送処理が適宜行われる。例えば、スクリーニング装置SCを用いて、上記実施形態及び図5に記載の分注工程(S1)、乾燥工程(S2)、マーク検出工程(S3)、アライメント工程(S4)、親和性検出工程(S5)及びスティッチング工程(S6)を行うことができる。
When screening the
L1…照明光 L3…蛍光 L2…励起光 L4…反射光 S…生体分子支持領域 Sa…支持領域 SC…スクリーニング装置 CONT…制御装置 5…分注装置 18…乾燥装置 20…検出装置 22…制御部 22a…アライメント部 25…光学システム 26…ステージ装置 28…センサ 29…観察カメラ 31…光源装置 36…照明光学系 47…光学素子 50、50A、50B、50C、50D…バイオチップ 51…ステージ本体 53…駆動装置 60…基板本体 60a…第一面 61、62…アライメントマーク(61…第一マーク、62…第二マーク) 66〜69、71〜78…アライメントマーク 100…視野領域 101〜104…撮像領域
L1 ... illumination light L3 ... fluorescence L2 ... excitation light L4 ... reflected light S ... biomolecule support region Sa ... support region SC ... screening device CONT ...
Claims (22)
前記バイオチップの第一面に形成された互いに異なる2つのアライメントマークを光学的に検出するマーク検出工程と、
前記2つのアライメントマークの検出結果に基づいて、前記バイオチップのアライメントを行うアライメント工程と、
前記アライメント工程後に、前記バイオチップの第一面に配置された生体分子と検体に含まれる標的との親和性を検出する親和性検出工程と、
を備える検出方法。 A detection method using a biochip,
A mark detection step for optically detecting two different alignment marks formed on the first surface of the biochip;
An alignment step of aligning the biochip based on the detection results of the two alignment marks;
After the alignment step, an affinity detection step for detecting the affinity between the biomolecule disposed on the first surface of the biochip and the target contained in the specimen;
A detection method comprising:
を含む請求項1に記載の検出方法。 The detection method according to claim 1, wherein the alignment step includes performing alignment with respect to an arrangement direction of the biochip on a stage where the biochip is held.
を含む請求項1又は2に記載の検出方法。 The detection method according to claim 1, wherein the mark detection step includes detecting reflected light of the two alignment marks.
を含む請求項1から3のいずれか一項に記載の検出方法。 The detection method according to any one of claims 1 to 3, wherein the mark detection step includes simultaneously detecting the two alignment marks in a visual field of an optical system.
を含む請求項1から3のいずれか一項に記載の検出方法。 The detection method according to any one of claims 1 to 3, wherein the mark detection step includes sequentially detecting the two alignment marks.
請求項1から5のいずれか一項に記載の検出方法。 The detection method according to any one of claims 1 to 5, wherein the two alignment marks are formed in a support region where a plurality of the biomolecules are arranged.
得られた複数の前記親和性の検出結果をスティッチングする工程、を備える
請求項1から6のいずれか一項に記載の検出方法。 The affinity detection step includes dividing a support region in which a plurality of the biomolecules are arranged into a plurality of imaging regions, and detecting the affinity for the plurality of imaging regions, respectively.
The detection method according to any one of claims 1 to 6, further comprising a step of stitching a plurality of obtained affinity detection results.
前記バイオチップが配置されるステージと、
前記バイオチップの第一面に形成された互いに異なる2つのアライメントマークを光学的に検出するマーク検出部と、
前記2つのアライメントマークの検出結果に基づいて、前記バイオチップのアライメントマークを行うアライメント部と、
前記バイオチップの第一面に配置された生体分子と検体に含まれる標的との親和性を検出する親和性検出部と、
を備える検出装置。 A detection device using a biochip,
A stage on which the biochip is disposed;
A mark detection unit for optically detecting two different alignment marks formed on the first surface of the biochip;
Based on the detection results of the two alignment marks, an alignment unit that performs alignment marks of the biochip,
An affinity detection unit for detecting the affinity between the biomolecule disposed on the first surface of the biochip and the target contained in the specimen;
A detection device comprising:
請求項8に記載の検出装置。 The said mark detection part is equipped with the optical system which guides the 1st light inject | emitted from a light source to the said alignment mark, and the sensor which light-receives the 1st light through the said alignment mark. Detection device.
請求項8又は9に記載の検出装置。 The affinity detection unit includes an optical system that guides second light to the biochip, and a sensor that receives third light generated by irradiating the first surface of the biochip with second light. The detection device according to claim 8 or 9.
前記バイオチップに前記検体を分注する分注工程と、
前記バイオチップを乾燥させる乾燥工程と、
を備えるバイオチップのスクリーニング方法。 A detection step using the detection method according to any one of claims 1 to 7;
A dispensing step of dispensing the sample onto the biochip;
A drying step of drying the biochip;
A biochip screening method comprising:
前記バイオチップに前記検体を分注する分注装置と、
を備えるスクリーニング装置。 The detection device according to any one of claims 8 to 10,
A dispensing device for dispensing the sample onto the biochip;
A screening apparatus comprising:
前記生体分子を支持する第一面を有する基板本体と、
前記基板本体の配置方向に関するマークであり、前記第一面に形成された互いに異なる2つのアライメントマークと、
を備えるバイオチップ。 A biomolecule capable of specifically reacting with a target contained in a specimen;
A substrate body having a first surface for supporting the biomolecule;
A mark related to the arrangement direction of the substrate body, two different alignment marks formed on the first surface;
Biochip with.
請求項13に記載のバイオチップ。 The biochip according to claim 13, wherein the two alignment marks are provided in each of target areas to be subjected to a predetermined process on the first surface.
請求項13又は請求項14に記載のバイオチップ。 The biochip according to claim 13 or 14, wherein the predetermined process is at least one of an imaging process of the target area and a synthesis process of an image of the captured target area.
請求項13から請求項15のうちいずれか一項に記載のバイオチップ。 The biochip according to any one of claims 13 to 15, wherein the alignment mark is capable of reflecting predetermined imaging light.
請求項13から請求項16のうちいずれか一項に記載のバイオチップ。 The biochip according to any one of claims 13 to 16, wherein the alignment mark includes a position reference mark indicating a position reference on the first surface.
請求項13から請求項17のうちいずれか一項に記載のバイオチップ。 The biochip according to any one of claims 13 to 17, wherein the alignment mark includes a substrate information mark indicating information related to the substrate body.
請求項13から請求項18のうちいずれか一項に記載のバイオチップ。 The biochip according to any one of claims 13 to 18, wherein the alignment mark includes a concave portion or a convex portion formed in the substrate body.
前記アライメントマークは、前記第一面のうち前記支持領域とは異なる非支持領域に設けられている
請求項13から請求項19のうちいずれか一項に記載のバイオチップ。 The first surface has a plurality of support regions in which the biomolecules are arranged,
The biochip according to any one of claims 13 to 19, wherein the alignment mark is provided in a non-support region different from the support region in the first surface.
前記アライメントマークは、複数の前記支持領域に囲まれた位置に配置されている
請求項20に記載のバイオチップ。 The plurality of support regions are arranged in a matrix within a predetermined region of the first surface,
The biochip according to claim 20, wherein the alignment mark is disposed at a position surrounded by the plurality of support regions.
請求項13から請求項21のうちいずれか一項に記載のバイオチップ。 The biochip according to any one of claims 13 to 21, wherein the alignment mark is formed using the biomolecule.
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