JP2012521781A - 生物学的及び化学的収集及び検出 - Google Patents
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- 試料を収集するステップと、
収集した試料を該試料内に関心のある生物が存在するかを同定する試薬で処理し、関心のある潜在的な生存生物を前記試薬との反応の結果として生成されるマーカに少なくとも部分的に基づいて同定可能にする、ステップと、
マイクロスコープを用いて前記試料の画像データを収集するステップと、
前記収集した試料の少なくとも一つの画像内におけるマーカの発生を自動的に位置決定する画像処理を用いて前記収集した試料内の潜在的な生存生物を位置決定するステップと、
前記収集した画像データから導出される前記試料内のマーカの対応するインスタンスの位置に基づいて選択される、前記試料内の少なくとも一つの標的位置を、潜在的な生存生物のスペクトルインタロゲーションのために特定するステップと、
前記試料内の各特定した標的位置のスペクトル情報を取得するステップと、
取得したスペクトル情報を、少なくとも一つの対応する位置決定された潜在的な生存生物の少なくとも少しあいまいな予備同定を自動的に作成するために分析するステップと、
前記予備同定の結果に関連する情報をユーザによる最終確認のために提供するステップと、
を備える、関心のある生物を同定する方法。 - 前記試料を収集するステップは、空気を試料収集し、収集した試料を非ラマン活性メンブレンフィルタ上に堆積させるエアロゾルコレクタを用いて試料を収集するステップを含む、請求項1記載の方法。
- 前記収集した試料を処理するステップは、前記収集した画像データ内で蛍光検出により掲出可能なグローを生存生物に少なくとも有限時間に亘って発光させるバイアビリティ染色で前記試料を処理するステップを含む、請求項1記載の方法。
- 前記収集した試料を処理するステップは、励起に対して前記対応する画像データ内に同定可能な特定のスペクトル応答を生じさせるレポータ染料を有する試薬で前記試料を処理するステップを含む、請求項1記載の方法。
- 前記収集した試料を処理するステップは、生存生物を少なくとも有限時間に亘り前記収集した画像データ内で検出可能な特性にさせるアッセイで前記試料を処理するステップを含む、請求項1記載の方法。
- 前記収集した試料を処理するステップは、前記収集した画像データ内で検出されるマーカを発生する少なくとも一つの特定の生物を標的にするアッセイで前記試料を処理するステップを含む、請求項1記載の方法。
- 前記マイクロスコープを用いて試料の画像データを収集するステップは、前記収集した試料の少なくとも一つの焦点画像を自動的に撮像するステップを含む、請求項1記載の方法。
- 前記試料内の少なくとも一つの標的位置を潜在的な生存生物のスペクトルインタロゲーションのために特定するステップは、インタロゲーションのために前記試料内にて単一の潜在的生存生物を正確に示すのに十分に小さい領域に対応する標的位置を選択するステップを含む、請求項1記載の方法。
- 前記試料内の各特定した標的位置のスペクトル情報を取得するステップは、ラマンスペクトロメータを用いて各標的位置に対してラマンスペクトルを収集するステップを含む、請求項1記載の方法。
- 前記予備同定の結果に関連する情報をユーザによる最終確認のために提供するステップは、前記収集した試料を前記予備同定結果のユーザ確認のための可視マイクロスコープに供与するステップを含む、請求項1記載の方法。
- 試料をフィルタ上に収集する収集サブシステム、
前記収集サブシステムから前記試料を受け取り、前記収集サブシステムにより収集された前記試料を、該試料内に関心のある生物が存在するかを同定する試薬を用いて処理し、関心のある潜在的な生存可能生物を、試薬との反応の結果として生成されるマーカに少なくとも部分的に基づいて同定可能にする、試薬処理サブシステムと、
前記試薬処理サブシステムから処理された試料を受け取り、前記処理された試料の少なくとも一つの画像を自動的に撮像する蛍光イメージングサブシステムと、
前記蛍光サブシステムから前記試料を受け取り、前記処理された試料の少なくとも一つの画像に基づいて位置決定された潜在的な生存生物のスペクトルを測定するラマンスペクトロスコピーサブシステムと、
前記ラマンマイクロスコピーサブシステムにより分析された生物の可視画像を提供する可視画像化マイクロスコープサブシステムと、
前記ラマンスペクトロスコピーサブシステムにより標的にされた前記試料内の潜在的な生存生物を位置決定するための画像処理を実行し、更に、前記可視画像化マイクロスコープサブシステムを用いるユーザの最終確認のための前記標的生物の予備同定を生成するために、前記ラマンスペクトロスコピーサブシステムにより記録されたスペクトルを分析するプロセッサと、
を備える、生物同定システム。 - 前記フィルタを少なくとも2つのサブシステムの間で自動的に移動させる自動化段を更に備える、請求項11記載のシステム。
- 前記蛍光イメージングサブシステム、ラマンスペクトロすコピーサブシステム、自動化段サブシステム及び可視画像化マイクロスコープサブシステムはラマンマイクロスコープに統合されている、請求項11記載のシステム。
- 前記収集サブシステムは試料を収集するエアロゾルコレクタを備え、前記フィルタは前記コレクタにより収集された試料を受け取る非ラマン活性のメンブレンフィルタ材を備える、請求項11記載のシステム。
- 前記試薬処理サブシステムは、前記収集サブシステムにより収集された試料を、前記収集した画像データ内で蛍光検出により検出可能なグローを生存生物に少なくとも有限時間に亘って発光させるバイアビリティ染色として実現された試薬を用いて処理する、請求項11記載のシステム。
- 前記試薬処理サブシステムは、前記収集サブシステムにより収集された試料を、励起に応答して前記対応する画像データ内に同定可能な特定のスペクトル応答を生じさせるレポータ染料として実現された試薬を用いて前記試料を処理する、請求項11記載のシステム。
- 前記蛍光イメージングサブシステムは、前記プロセッサの制御の下で少なくとも一つの画像を撮像する自動化マイクロスコープを備え、前記プロセッサは更に画像処理を利用して前記収集した試料の少なくとも一つの画像内に前記マーカの発生があるかを自動的に決定する、請求項11記載のシステム。
- 前記ラマンスペクトロスコピーサブシステムは、前記プロセッサから標的位置情報を受け取り、試料内の特定の潜在的な生存生物を標的インタロゲーションのために標的にして生存生物のスペクトルを測定する自動化マイクロスコープを備え、前記プロセッサは少なくとも一つの画像内に位置する前記マーカの同定に基づいて前記標的位置を決定する、請求項11記載のシステム。
- 前記プロセッサは、前記標的生物の予備同定を評価中の生物の少なくとも小さなあいまい範囲内で作成するために前記ラマンスペクトロスコピーサブシステムにより記録されたスペクトルを分析する、請求項11記載のシステム。
- メモリ装置及び前記プロセッサに結合され少なくとも一つの画像データ及び予備同定情報を外部装置に送る少なくとも一つの入力出力装置を更に備える、請求項11記載のシステム。
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