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Abstract
Description
(a)複数の前駆体イオン種の質量を示す量を求めるステップと、
(b)複数の前駆体イオンに由来する複数のフラグメントイオンを形成するために、複数の前駆体イオン種のイオンをフラグメント化するステップと、
(c)複数の前駆体イオン種に由来するフラグメントイオンを一緒に/同時に質量分析するステップと、
(d)複数のフラグメントイオン種の1つまたは複数の試料セットを複数の前駆体イオン種の特定の1つに割り当てるステップであって、上記または各試料セットが、ステップ(c)で求められた合算した質量が前駆体試料イオン種の特定の1つの質量に対応するフラグメントイオン種を含み、それらのフラグメントイオン種がその前駆体試料イオン種に割り当てられるステップと、
(e)前駆体イオン種の1つまたは複数に関して、(i)ステップ(a)で識別された特定の前駆体試料イオン種の質量と、(ii)その特定の前駆体イオン種に関する上記または各割り当てられた試料セット中の複数のフラグメントイオン種の質量とを識別する試料データを比較手段に転送するステップであって、それにより、前駆体イオン種および割り当てられたフラグメントイオン種の質量を示す量を、それぞれ、基準フラグメントイオンデータおよび基準前駆体イオンデータの1つまたは複数の基準セット中のイオンの質量を示す量と比較するステップと、
(f)比較手段から、複数のフラグメント試料イオン種が割り当てられた前駆体イオン種を同定することを目的とした前記比較の結果を示す情報を受け取るステップと
を含む方法が提供される。
Claims (35)
- 前駆体イオン種をそれらのフラグメントから同定する方法であって、
(a)複数の前駆体イオン種の質量を示す量を求めるステップと、
(b)複数の前駆体イオンに由来する複数のフラグメントイオンを形成するために、複数の前駆体イオン種のイオンをフラグメント化するステップと、
(c)複数の前駆体イオン種に由来するフラグメントイオンを一緒に/同時に質量分析するステップと、
(d)複数のフラグメントイオン種の1つまたは複数の試料セットを複数の前駆体イオン種の特定の1つに割り当てるステップであって、前記または各試料セットが、ステップ(c)で求められた合算した質量が前駆体試料イオン種の特定の1つの質量に対応するフラグメントイオン種を含み、前記フラグメントイオン種が前記前駆体試料イオン種に割り当てられるステップと、
(e)前駆体イオン種の1つまたは複数に関して、(i)ステップ(a)で識別された特定の前駆体試料イオン種の質量と、(ii)前記特定の前駆体イオン種に関する前記または各割り当てられた試料セット中の複数のフラグメントイオン種の質量とを識別する試料データを比較手段に転送するステップであって、それにより、前駆体イオン種および割り当てられたフラグメントイオン種の質量を示す量を、それぞれ、基準フラグメントイオンデータおよび基準前駆体イオンデータの1つまたは複数の基準セット中のイオンの質量を示す量と比較するステップと、
(f)比較手段から、複数のフラグメント試料イオン種が割り当てられた前駆体イオン種を同定することを目的とした前記比較の結果を示す情報を受け取るステップと
を含む方法。 - フラグメントイオン種の前記または特定の試料セットが由来する可能性が高い候補前駆体イオン種であると考えられる前駆体イオン種を示すステップをさらに含む請求項1に記載の方法。
- 特定の試料セット中のフラグメントイオン種が由来すると考え得る複数の前駆体イオン種を、前記フラグメントイオン試料セットが当該の複数の前駆体イオン種それぞれに合致する可能性の順序と共に示すステップをさらに含む請求項2に記載の方法。
- 複数の前駆体イオン種の質量を示す量を求める前記ステップ(a)が、
第1の前駆体イオン種のイオンを隔離するステップと、
少なくとも1つのさらなる前駆体イオン種のイオンを隔離するステップと、
前記複数の前駆体イオンに由来する前記複数のフラグメントイオンを形成するために、隔離された各前駆体イオン種のイオンの少なくともいくつかをフラグメント化するステップと
を含む請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。 - 第1の前駆体イオン種のイオンを隔離する前記ステップが、前記または各さらなる前駆体イオン種のイオンを隔離する前記ステップとは異なる時点に行われる請求項4に記載の方法。
- 前記第1の前駆体イオン種の前記隔離されたイオンを、前記または各さらなる前駆体イオン種の前記隔離されたイオンと共に貯蔵するステップと、前記複数の異なるイオン種のイオンが貯蔵された後、各前駆体イオン種のイオンの少なくともいくつかを実質的に同時にフラグメント化するステップとをさらに含む請求項5に記載の方法。
- 前記第1の前駆体イオン種のイオンの少なくともいくつかを、前記または各さらなる前駆体イオン種のイオンのフラグメント化とは別個にフラグメント化するステップと、前記複数の前駆体イオンに由来する前記複数のフラグメントイオンとして、各前駆体イオン種から得られたフラグメントを一緒に貯蔵するステップとをさらに含む請求項4に記載の方法。
- 複数のフラグメントイオン種の1つまたは複数の試料セットを割り当てる前記ステップ(d)の後、各前駆体イオン種に関するフラグメントイオンの部分質量スペクトルを、前記前駆体イオン種に関するフラグメントイオンの前記割り当てられた試料セットから構成するステップをさらに含み、基準フラグメントイオンデータの前記または各基準セットが、基準フラグメントイオン質量スペクトルであり、前記試料データを転送する前記ステップ(e)が、前記前駆体イオン種を同定することを目的として、フラグメントイオンの部分質量スペクトルを転送して、前記部分質量スペクトルと前記または各基準フラグメントイオン質量スペクトルとを比較するステップと、それぞれの前駆体イオン種の質量または質量に関連付けられる値を転送するステップとを含む請求項1〜7のいずれか一項に記載の方法。
- 前記複数の前駆体イオン種の前駆体質量スペクトルを得るステップと、
前記構成されたフラグメントイオン質量スペクトル微細構造の特定の1つを前記前駆体質量スペクトルの特定の1つと相関させることを目的として、前記前駆体試料の質量スペクトルの微細構造を、前記構成されたフラグメントイオンの質量スペクトルの微細構造と比較するステップと
をさらに含む請求項8に記載の方法。 - 前記前駆体およびフラグメントイオンの一方または両方から同位体除去および電荷除去するステップをさらに含む請求項1〜9のいずれか一項に記載の方法。
- 複数のフラグメントイオン種を割り当てる前記ステップ(d)が、総質量が前駆体イオン種の1つの質量に前記前駆体イオン種質量の周りの質量窓内で対応する、または総質量が前駆体イオン種の1つからの所定のオフセットでの質量に前記オフセットされた前駆体イオン種質量の周りの質量窓内で対応する複数のフラグメントイオン種を同定するステップを含む請求項1〜10のいずれか一項に記載の方法。
- 前記質量窓が、20ppm、10ppm、5ppm、2ppm、1ppm、0.5ppm、および0.2ppmを含むリストから選択される請求項11に記載の方法。
- 前記ステップ(a)〜(f)が第2のサイクルで繰り返され、前記第2のサイクルに先立つ第1のサイクルでのステップ(a)、(b)、および(c)から得られた第1のデータセットに対して、複数のフラグメントイオンを割り当てる前記ステップ(d)および比較のために試料セットを転送する前記ステップ(e)が行われ、その一方で、第2のサイクルのステップ(a)、(b)、および/または(c)の1つまたは複数の少なくとも一部が行われる請求項1〜12のいずれか一項に記載の方法。
- 同じ同定された前駆体イオンに関して、1つまたは複数の後続のサイクルでステップ(a)〜(f)を繰り返すステップをさらに含み、しかし各場合に、前記同じ前駆体イオンをフラグメント化するステップ(b)が、異なるフラグメント化エネルギーおよび/またはフラグメント化メカニズムを採用することを含む請求項1〜13のいずれか一項に記載の方法。
- ステップ(d)の後に割り当てられずに残っているフラグメントイオンがあればそれを無視する、または除外するステップをさらに含む請求項1〜14のいずれか一項に記載の方法。
- 任意の単一のフラグメントイオン種の質量が、前記単一のフラグメントイオン種が特定の前駆体イオン種からしか生じる可能性がないことを示すようなものであるときに、前記単一のフラグメントイオン種を前記特定の前駆体イオン種に直接割り当てるステップをさらに含む請求項1〜14のいずれか一項に記載の方法。
- 前記前駆体およびフラグメント試料イオンの質量が、5000以上の分解能で、20ppm以下の質量精度で決定される請求項1〜16のいずれか一項に記載の方法。
- 前記前駆体およびフラグメントイオンの質量が、5000以上、10000以上、25000以上、50000以上、100000以上の分解能で、10ppm以下、5ppm以下、2ppm以下、1ppm以下、0.5ppm以下、0.2ppm以下、および0.1ppm以下を含むリストから選択される質量精度で決定される請求項17に記載の方法。
- 前記フラグメントイオンデータおよび前記前駆体イオンデータを前記比較手段に転送する前記ステップ(e)と、前記比較手段から情報を戻して受け取る前記ステップ(f)との間に、
複数の割り当てられたフラグメントイオン種が由来する前駆体イオン種および/または前記前駆体イオン種に関係付けられた材料を同定することを目的として、前記前駆体イオン種の特定の1つに割り当てられた複数のフラグメントイオン種の1つまたは複数の試料セットの質量(または関連の量)を、基準フラグメントイオンデータの前記1つまたは複数の基準セット中のイオンの質量(またはそれぞれの関連の量)と比較するステップをさらに含み、各基準セットが、既知の同定および/または質量のそれぞれの前駆体イオン種に由来する請求項1〜18のいずれか一項に記載の方法。 - 前記比較ステップに続いて、複数のフラグメントイオンが関連付けられている前記前駆体イオン種および/または前記前駆体イオン種に関係付けられた材料を同定するステップをさらに含む請求項19に記載の方法。
- 前記比較ステップに続いて、前記比較に基づいて、考え得る候補前駆体イオン種のリストを生成するステップをさらに含む請求項19に記載の方法。
- 前記比較ステップが、フラグメントイオンの複数の個別の試料セットであって、特定の試料セットに関して複数の前駆体イオンのそれぞれ1つに由来しているものと同定された複数のフラグメントイオン種の質量に関するデータがそれぞれ集められている複数の個別の試料セットそれぞれに関して、
各試料セットがそれぞれ由来する可能性が最も高い前駆体イオン種または前記前駆体イオン種に関係付けられる分子を個別に同定することを目的として、各前記試料セット中の前記フラグメントイオンの質量(または質量に関係付けられる量)を、基準フラグメントイオンデータの複数の基準セット中のイオンの質量(または質量に関係付けられる量)と比較するステップを含む請求項19、20、または21のいずれか一項に記載の方法。 - 前記比較ステップが、
(n+1)個の各試料セットがそれぞれ由来する可能性が最も高い前駆体イオン種または前記前駆体イオン種に関係付けられた分子を同定することを目的として、第1の試料セット中のイオンの質量(または関連の量)を複数の基準セット中のイオンの質量(または関連の量)と比較し、次いで、さらなるn(≧1)個の試料セット中のイオンの質量(または関連の量)を順次に、複数の基準セット中のイオンの質量(または関連の量)とそれぞれ比較するステップを含む請求項22に記載の方法。 - 前記比較ステップが、先行するステップ(a)〜(e)および後続のステップ(f)から離して行われる請求項19〜23のいずれか一項に記載の方法。
- 前記前駆体および/またはフラグメントイオンの質量に関する情報を、前記比較手段によって好まれる形式で前記比較手段に提供するステップをさらに含む請求項19〜23のいずれか一項に記載の方法。
- 前記前駆体および/またはフラグメントイオンの質量に関する情報を、前記比較手段に前記情報を提供する前に第1の形式から第2の形式に変換するステップをさらに含む請求項25に記載の方法。
- 前記前駆体および/またはフラグメントイオンの質量に関する情報が、前記前駆体および/またはフラグメントイオンの質量あるいは質量電荷比のいずれかである請求項1〜26のいずれか一項に記載の方法。
- 前記前駆体および/またはフラグメントイオンの質量に関する情報を質量単位に変換するステップをさらに含み、任意選択で、付加物または中性ロスに関して質量を調節するステップをさらに含む請求項1〜26のいずれか一項に記載の方法。
- 複数のフラグメントイオン種の1つまたは複数の試料セットを割り当てる前記ステップ(d)が、前記複数の前駆体イオンに由来する前記複数のフラグメントイオンから、フラグメントイオン種の対の1つまたは複数の試料セットを割り当てるステップを含み、前記または各試料セット中のフラグメントイオン種の対が、前記複数の前駆体イオン種の1つの質量に対応する合算した質量を有する請求項1〜28のいずれか一項に記載の方法。
- 前記または各対の質量が1つまたは複数の前駆体イオン種の質量に対応するときにフラグメントイオン種の対の前記または各試料セットを割り当てる前記ステップが、前記または各対の質量が前記複数の前駆体イオン種の1つから所定の量だけオフセットされるときにフラグメントイオン種の対の前記または各試料セットを割り当てるステップを含む請求項29に記載の方法。
- 前記複数の前駆体イオン種のイオンをフラグメント化する前記ステップ(b)の後に、
(g)複数の孫フラグメントイオンを形成するために前記複数のフラグメントイオンをフラグメント化する追加のステップと、
(h)複数のフラグメントイオン種に由来する前記孫フラグメントイオンを一緒に/同時に質量分析する追加のステップと、
(i)複数の孫フラグメントイオン種の1つまたは複数の試料セットを、前記孫フラグメントイオンが形成された複数のフラグメントイオン種の特定の1つに割り当てる追加のステップであって、複数の孫フラグメント化種の前記または各試料セットが、ステップ(h)で決定された合算した質量がフラグメントイオン種の特定の1つの質量に対応する孫フラグメントイオン種を含み、前記孫フラグメントイオン種が前記フラグメントイオン種に割り当てられる追加のステップと、
(j)前記フラグメントイオン種の1つまたは複数に関して、(i)識別された特定のフラグメントイオン種の質量と、(ii)前記特定のフラグメントイオン種に関する前記または各割り当てられた試料セット中の複数の孫フラグメントイオン種の質量とを識別する試料データを比較手段に転送するステップであって、それにより、フラグメントおよび割り当てられた孫フラグメントイオン種の質量を示す量を、それぞれ、基準孫フラグメントイオンデータおよび基準フラグメントイオンデータの1つまたは複数の基準セット中のイオンの質量を示す量と比較する追加のステップと、
(k)前記比較手段から、複数の孫フラグメントイオン種が割り当てられたフラグメントイオン種を同定することを目的とした前記比較の結果を示す情報を受け取る追加のステップと
をさらに含む請求項1〜30のいずれか一項に記載の方法。 - 分析に利用可能な前駆体イオン種すべてのサブセットを形成する第1の複数の前駆体イオン種を同定するステップと、
前記同定された第1の複数の前駆体イオン種に対して前記方法ステップを実施するステップと、
分析に利用可能であり、前記サブセット中に含まれていなかった前駆体イオン種すべてのうちの前記前駆体イオンの少なくともいくつかに関して前記方法ステップを繰り返すステップと
をさらに含む請求項1〜31のいずれか一項に記載の方法。 - 実行されたときに、請求項1〜32のいずれか一項に記載のステップを1つまたは複数の処理装置に行わせるコンピュータプログラム。
- 請求項33に記載のコンピュータプログラムをロードされたときの質量分析計用の制御装置。
- 請求項34に記載の制御装置を含む質量分析計。
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