JP2008261842A - 光線を放射及び検出するための装置 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】励起光源モジュール(11)にロータリー・フィルタ・ホイールを備え、ライトガイド(31)で複数の反応セル(1)に励起光を照射し、発生した蛍光をライトガイド(32)で検出モジュール(21)に導光し、ロータリー・フィルタ・ホイール(23)を備えた検出モジュールで検出する。
【選択図】図1
Description
本発明の第1対象は、光線を放射及び検出するための装置であって、
−少なくとも2つの反応領域、
−異なるスペクトル及び波長の励起ビームを提供することが可能な少なくとも2つの励起光源を含む励起モジュール、
−少なくとも2つの第1ライトガイド(各々の第1ライトガイドは該励起光源の1つから少なくとも1つの該反応領域に放射される光線を誘導することが可能である)、
−少なくとも2つの第2ライトガイド(各々の第2ライトガイドは該反応領域の1つから発光モジュールに放射される光線を誘導することが可能である)、
−少なくとも2つの反応領域のそれぞれから別々かつ同時に放射されたビームを検出することが可能な発光モジュール(該発光モジュールは、少なくとも、2つの検出器及びロータリー・フィルター・ホイールを備え、該ロータリー・フィルター・ホイールは、少なくとも2つの第2ライトガイドと検出器の間に位置する)、及び
−該励起光源及び該発光モジュールの起動を制御することが可能な制御ユニット、
を具備し、
ここで、前記励起光源の起動及び前記発光モジュールのロータリー・フィルター・ホイールの回転が電子的に連動しており、そしてここで、前記少なくとも2つの励起光源の第1励起光源が第1波長の光を放射し、該光は第1ライトガイドを介して少なくとも第1反応領域に伝えられ、そして前記少なくとも2つの励起光源の第2励起光源が、前記第1波長とは異なる第2波長の光を放射し、該光は第2ライトガイドを介して少なくとも第2反応領域に伝えられることを特徴とする各励起ビームにより、前記反応領域が励起されるときに、各々の反応領域のために前記ロータリー・フィルター・ホイールに取り付けられたフィルターの透過スペクトルが各反応領域から放射された前記光線の発光スペクトルに対応するように該ロータリー・フィルター・ホイールが回転する、装置である。
−複数の成分、及び励起において標的が存在する場合には標的が存在しない場合とは異なる光放射を産生することが可能な検出可能なマーカーを含む、少なくとも2つの反応領域の一方に置かれた試料、
−該試料を増幅及び/又は融解反応にかけるためのデバイス、及び
−本発明の装置、
を具備する、機器である。
−少なくとも2つの検出可能なマーカーを含んで成る少なくとも2つの反応領域の1つにおいて試料を提供する工程であって、ここで各々の検出可能なマーカーがそれぞれ、各々の励起波長の光を含む励起ビームで放射されたときに検出可能な光線を放射する、工程、
−少なくとも2つの励起光源から放射された異なる波長スペクトルの励起ビームで該試料を照射する工程、及び
−検出可能なマーカーが各々の励起ビームにより励起される間、発光モジュールにより試料から放射される放射ビームを検出する工程、
を含んで成る方法である。
本発明は、光線を放射及び検出するための装置、及びこのような装置を具備する核酸を増幅及び検出するための機器に関する。本明細書において、本発明に従う「光源」は、好ましくは発光ダイオード(LED)、有機発光ダイオード、レーザー(例えば、ガスレーザー、化学レーザー、エキシマーレーザー、半導体レーザー、色素レーザー、マイクロ−ワイヤーレーザー)、又はこれらの組み合わせである。
図7は、上述したリアルタイム・マルチプレックスHCV−PCRの操作の増幅曲線を示す。PCR混合物を含有する10種の試料を増幅し、そして該シグナルをFAMチャネルにおいてリアルタイムに測定した。FAMチャネルにおいて部分的に励起され、検出されるHEXマーカー色素でラベルされた定量標準からもたらされたクロストークについて該データを補正する。有意なシグナルの増加は、ターゲット配列が存在する指標である。有意なシグナル増加が生じる場合のサイクル数は、初期ターゲット濃度の測定におけるものとする。サイクル数をより小さくすると初期ターゲット濃度はより高くなる。この特徴的なサイクル数は、エルボー数(elbow number)と称される。該エルボー数の決定は、増幅曲線を分析するために使用されるアルゴリズムのタイプの特別な特性である。異なるアルゴリズムは、同じ増幅曲線の異なるエルボー数を決定することができる。以下の表は、図7に示される増幅曲線のエルボー数を示す:
11 励起モジュール
12 励起光源
13 ロータリー・ホイール
21 発光モジュール
22 検出器
23 ロータリー・フィルター・ホイール
31 第1ライトガイド
32 第2ライトガイド
41 制御ユニット
Claims (14)
- 光線を放射及び検出するための装置であって、
−少なくとも2つの反応領域、
−異なるスペクトル及び波長の励起ビームを提供することが可能な少なくとも2つの励起光源を含む励起モジュール、
−少なくとも2つの第1ライトガイド(各々の第1ライトガイドは該励起光源の1つから少なくとも1つの該反応領域に放射される光線を誘導することが可能である)、
−少なくとも2つの第2ライトガイド(各々の第2ライトガイドは該反応領域の1つから発光モジュールに放射される光線を誘導することが可能である)、
−少なくとも2つの反応領域のそれぞれから別々かつ同時に放射されたビームを検出することが可能な発光モジュール(該発光モジュールは、少なくとも、2つの検出器及びロータリー・フィルター・ホイールを備え、該ロータリー・フィルター・ホイールは、少なくとも2つの第2ライトガイドと検出器の間に位置する)、及び
−該励起光源及び該発光モジュールの起動を制御することが可能な制御ユニット、
を具備し、
ここで、前記励起光源の起動及び前記発光モジュールのロータリー・フィルター・ホイールの回転が電子的に連動しており、そしてここで、前記少なくとも2つの励起光源の第1励起光源が第1波長の光を放射し、該光は第1ライトガイドを介して少なくとも第1反応領域に伝えられ、そして前記少なくとも2つの励起光源の第2励起光源が、前記第1波長とは異なる第2波長の光を放射し、該光は第2ライトガイドを介して少なくとも第2反応領域に伝えられることを特徴とする各励起ビームにより、前記反応領域が励起されるときに、各々の反応領域のために前記ロータリー・フィルター・ホイールに取り付けられたフィルターの透過スペクトルが各反応領域から放射された前記光線の発光スペクトルに対応するように該ロータリー・フィルター・ホイールが回転する、装置。 - 前記少なくとも2つの励起光源がロータリー・ホイール上に取り付けられ、そしてここで該励起光源を有する該ロータリー・ホイールが、前記励起光源の1つが1つの規定した第1ライトガイドに光線を放射させる前記第1ライトガイドの位置に相対して回転することができ、そしてここで該ロータリー・ホイールの所定の位置への回転が、制御ユニットにより制御される、請求項1に記載の装置。
- 前記少なくとも2つの励起光源のそれぞれが、各種の異なる波長スペクトルの励起ビームを提供することが可能であることを特徴とする、請求項1に記載の装置。
- 前記励起光源が、発光ダイオード(LED)であることを特徴とする、請求項1〜3のいずれか一項に記載の装置。
- 前記第1ライトガイドが、前記励起光源の1つから少なくとも2つの前記反応領域に放射される光線を導くことが可能な単一又は分岐したライトガイド束であることを特徴とする、請求項1〜4のいずれか一項に記載の装置。
- 前記励起光源が、それぞれ異なる励起波長を示すことを特徴とする、請求項1、2、4及び5のいずれか一項に記載の装置。
- ロータリー・フィルター・ホイールが回転する間、制御ユニットにより前記励起光源の電源が切られることを特徴とする、請求項1〜6のいずれか一項に記載の装置。
- 前記少なくとも1つの第1ライトガイドは、その一端において、1つの励起光源と1つのライトガイドを光学的に接触させる前記励起モジュール上に取り付けられ、かつ前記少なくとも1つの第1ライトガイドは、その他端において、前記励起光源から前記少なくとも1つの反応領域の規定位置に放射される光線を仲介する少なくとも1つの反応領域に取り付けられること特徴とする、請求項1〜7のいずれか一項に記載の装置。
- 前記励起光源を有するロータリー・ホイールの回転と前記発光モジュールのロータリー・フィルター・ホイールの回転が電子的に連動されていることを特徴とする、請求項2及び4〜8のいずれか一項に記載の装置。
- さらに、光源の電源をモニタリングするための少なくとも1つのコントロールライトガイドを具備することを特徴とする、請求項1〜9のいずれか一項に記載の装置。
- 核酸を増幅及び検出するための機器であって、少なくとも、
−複数の成分、及び励起において標的が存在する場合には標的が存在しない場合とは異なる光放射を産生することが可能な検出可能なマーカーを含む、少なくとも2つの反応領域の一方に置かれた試料、
−該試料を増幅及び/又は融解反応にかけるためのデバイス、及び
−請求項1〜10のいずれか一項に記載の装置、
を具備する、機器。 - 請求項1〜10のいずれか一項に記載の装置を使用して試料中の特定の検体を検出するための方法であって、
−少なくとも2つの検出可能なマーカーを含んで成る少なくとも2つの反応領域の1つにおいて試料を提供する工程であって、ここで各々の検出可能なマーカーがそれぞれ、各々の励起波長の光を含む励起ビームで放射されたときに検出可能な光線を放射する、工程、
−少なくとも2つの励起光源から放射された異なる波長スペクトルの励起ビームで該試料を照射する工程、及び
−検出可能なマーカーが各々の励起ビームにより励起される間、発光モジュールにより試料から放射される放射ビームを検出する工程、
を含んで成る方法。 - 前記特定の検体が核酸であることを特徴とする、請求項12に記載の方法。
- さらに、
−前記試料中の少なくとも1つの標的核酸を増幅及び/又は融解する工程、
を含んで成る、請求項13に記載の方法。
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Cited By (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2011016509A1 (ja) * | 2009-08-06 | 2011-02-10 | ユニバーサル・バイオ・リサーチ株式会社 | 光ファイバ測定装置およびその測定方法 |
JP2015503108A (ja) * | 2011-12-22 | 2015-01-29 | エフ ホフマン−ラ ロッシュ アクチェン ゲゼルシャフト | 光学システムにおける光源寿命の延長 |
JP2016526670A (ja) * | 2013-06-19 | 2016-09-05 | エリューム・ピーティーワイ・リミテッド | 蛍光標識を用いた分析装置 |
JP2017227642A (ja) * | 2016-06-24 | 2017-12-28 | タイゲン バイオサイエンス コーポレイション | 多重チャンネル蛍光検出システムおよびそれを使用する方法 |
JP2018506039A (ja) * | 2015-02-06 | 2018-03-01 | ライフ テクノロジーズ コーポレーション | 生体サンプルを評価するためのシステムおよび方法 |
KR20220061504A (ko) * | 2020-11-06 | 2022-05-13 | (주)바이오젠텍 | 형광 다중 유전자 등온증폭기 |
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Families Citing this family (19)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP2525211B1 (en) | 2011-05-16 | 2018-01-03 | F. Hoffmann-La Roche AG | Instrument and method for detecting analytes |
GB201209738D0 (en) * | 2012-05-31 | 2012-07-18 | Ge Healthcare Bio Sciences Ab | Methods and apparatus for measuring the concentration of a substance in a solution |
JP6294823B2 (ja) | 2012-07-17 | 2018-03-14 | ユニバーサル・バイオ・リサーチ株式会社 | 反応容器用光測定装置およびその方法 |
EP2883039A1 (en) * | 2012-08-10 | 2015-06-17 | Streck Inc. | Real-time optical system for polymerase chain reaction |
EP2929308A4 (en) | 2012-12-05 | 2015-12-16 | Genepoc Inc | OPTICAL INTERROGATION DEVICE |
AU2015275317A1 (en) * | 2013-03-14 | 2016-01-21 | Gen-Probe Incorporated | Indexing signal detection module |
AU2013202788B2 (en) | 2013-03-14 | 2015-10-01 | Gen-Probe Incorporated | Indexing signal detection module |
EP3014251A1 (en) | 2013-06-28 | 2016-05-04 | Streck Inc. | Devices for real-time polymerase chain reaction |
KR102126032B1 (ko) * | 2013-07-31 | 2020-07-08 | 삼성전자주식회사 | 다채널 형광 검출 모듈 및 이를 포함하는 핵산 분석 시스템 |
FI128285B (en) * | 2014-06-27 | 2020-02-28 | Metso Automation Oy | Multichannel optical measurement unit, multichannel optical detector unit and related measurement method |
CN104614351A (zh) * | 2015-01-21 | 2015-05-13 | 南京中科神光科技有限公司 | 一种快速、多通道实时荧光定量检测装置 |
CN106680250B (zh) * | 2015-11-10 | 2023-06-30 | 北京万泰生物药业股份有限公司 | 用于聚合酶链式反应的检测机构及聚合酶链式反应装置 |
GB201603380D0 (en) * | 2016-02-26 | 2016-04-13 | Ge Healthcare Bio Sciences Ab | Apparatus and method for measuring the light absorbance of a substance in a solution |
SE1650816A1 (en) | 2016-06-10 | 2017-11-21 | Bomill Ab | A detector system comprising a plurality of light guides and a spectrometer comprising the detector system |
CN107101945A (zh) * | 2017-05-26 | 2017-08-29 | 北京智云达科技股份有限公司 | 一种多通道多波长光谱检测装置 |
EP3658898B1 (en) | 2017-07-26 | 2024-05-01 | Gen-Probe Incorporated | Optical signal detection modules and methods |
CN107478629A (zh) * | 2017-09-04 | 2017-12-15 | 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 | 一种大面积数字pcr微滴荧光高通量检测装置和方法 |
EP3931549A4 (en) * | 2019-02-27 | 2022-11-23 | Seegene, Inc. | LIGHT MODULE |
US20230137550A1 (en) * | 2020-03-31 | 2023-05-04 | Seegene, Inc. | Optical signal detection device |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2001255272A (ja) * | 2000-01-14 | 2001-09-21 | Becton Dickinson & Co | 核酸アッセイ用自動光学リーダ |
JP2004147706A (ja) * | 2002-10-28 | 2004-05-27 | Matsushita Electric Works Ltd | 非侵襲型生体成分の定量装置及び定量方法 |
JP2004537053A (ja) * | 2001-07-25 | 2004-12-09 | アプレラ コーポレイション | 電気泳動検出システムにおける時間遅延積分 |
JP2006215026A (ja) * | 2005-02-03 | 2006-08-17 | Samsung Electronics Co Ltd | 多チャンネル蛍光測定用の光学系及びそれを採用した多チャンネル蛍光試料の分析装置 |
Family Cites Families (16)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4477190A (en) * | 1981-07-20 | 1984-10-16 | American Hospital Supply Corporation | Multichannel spectrophotometer |
DK171161B1 (da) | 1985-03-28 | 1996-07-08 | Hoffmann La Roche | Fremgangsmåde til påvisning af forekomst eller fravær af mindst én specifik nukleinsyresekvens i en prøve eller til skelnen mellem to forskellige nukleinsyresekvenser i denne prøve |
US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
CA1339653C (en) | 1986-02-25 | 1998-02-03 | Larry J. Johnson | Appartus and method for performing automated amplification of nucleic acid sequences and assays using heating and cooling steps |
US5994056A (en) | 1991-05-02 | 1999-11-30 | Roche Molecular Systems, Inc. | Homogeneous methods for nucleic acid amplification and detection |
DE4424961C2 (de) | 1993-07-15 | 2002-05-08 | Perkin Elmer Corp | Wählvorrichtung für ein photometrisches Instrument mit Lichtleitfasern zur Analyse von entfernt befindlichen Proben |
US6326605B1 (en) * | 1998-02-20 | 2001-12-04 | Ljl Biosystems, Inc. | Broad range light detection system |
US6369893B1 (en) * | 1998-05-19 | 2002-04-09 | Cepheid | Multi-channel optical detection system |
EP0953837A1 (en) | 1998-05-01 | 1999-11-03 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Fluorescence light measuring device and an apparatus wherein such a device is used |
EP0953838A1 (en) * | 1998-05-01 | 1999-11-03 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Apparatus for simultaneously monitoring reactions taking place in a plurality of reaction vessels |
DE10131687A1 (de) | 2001-06-29 | 2003-01-16 | Eppendorf Ag | Vorrichtung zur Durchführung von Nukleinsäure-Amplifikationsreaktionen bei gleichzeitiger Verfolgung der Bildung von Amplifikationsprodukten |
US7280207B2 (en) * | 2001-07-25 | 2007-10-09 | Applera Corporation | Time-delay integration in a flow cytometry system |
AU2003245302A1 (en) | 2002-05-17 | 2003-12-02 | Applera Corporation | Apparatus and method for differentiating multiple fluorescence signals by excitation wavelength |
CN101793826B (zh) * | 2004-06-07 | 2016-04-13 | 先锋生物科技股份有限公司 | 用于微流体器件的光学透镜***和方法 |
US7791728B2 (en) * | 2005-08-11 | 2010-09-07 | Hewlett-Packard Development Company, L.P. | System for optically analyzing a substance with a selected single-wavelength |
WO2007091230A1 (en) * | 2006-02-07 | 2007-08-16 | Stokes Bio Limited | A microfluidic analysis system |
-
2007
- 2007-02-21 EP EP07102771A patent/EP1962084A1/en not_active Ceased
-
2008
- 2008-02-18 AU AU2008200772A patent/AU2008200772A1/en not_active Abandoned
- 2008-02-19 US US12/033,711 patent/US7947442B2/en not_active Expired - Fee Related
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- 2008-02-20 EP EP08003078A patent/EP1962085A3/en not_active Ceased
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2001255272A (ja) * | 2000-01-14 | 2001-09-21 | Becton Dickinson & Co | 核酸アッセイ用自動光学リーダ |
JP2004537053A (ja) * | 2001-07-25 | 2004-12-09 | アプレラ コーポレイション | 電気泳動検出システムにおける時間遅延積分 |
JP2004147706A (ja) * | 2002-10-28 | 2004-05-27 | Matsushita Electric Works Ltd | 非侵襲型生体成分の定量装置及び定量方法 |
JP2006215026A (ja) * | 2005-02-03 | 2006-08-17 | Samsung Electronics Co Ltd | 多チャンネル蛍光測定用の光学系及びそれを採用した多チャンネル蛍光試料の分析装置 |
Cited By (14)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPWO2011016509A1 (ja) * | 2009-08-06 | 2013-01-10 | ユニバーサル・バイオ・リサーチ株式会社 | 光ファイバ測定装置およびその測定方法 |
US8696992B2 (en) | 2009-08-06 | 2014-04-15 | Universal Bio Research Co., Ltd. | Optical fiber measurement device and measurement method using same |
JP5608652B2 (ja) * | 2009-08-06 | 2014-10-15 | ユニバーサル・バイオ・リサーチ株式会社 | 光ファイバ測定装置およびその測定方法 |
WO2011016509A1 (ja) * | 2009-08-06 | 2011-02-10 | ユニバーサル・バイオ・リサーチ株式会社 | 光ファイバ測定装置およびその測定方法 |
JP2015503108A (ja) * | 2011-12-22 | 2015-01-29 | エフ ホフマン−ラ ロッシュ アクチェン ゲゼルシャフト | 光学システムにおける光源寿命の延長 |
US11442012B2 (en) | 2013-06-19 | 2022-09-13 | Ellume Limited | Assay device employing fluorescent labels |
JP2016526670A (ja) * | 2013-06-19 | 2016-09-05 | エリューム・ピーティーワイ・リミテッド | 蛍光標識を用いた分析装置 |
US10578556B2 (en) | 2013-06-19 | 2020-03-03 | Ellume Limited | Assay device employing fluorescent labels |
JP2018506039A (ja) * | 2015-02-06 | 2018-03-01 | ライフ テクノロジーズ コーポレーション | 生体サンプルを評価するためのシステムおよび方法 |
US11920191B2 (en) | 2015-02-06 | 2024-03-05 | Life Technologies Corporation | Systems and methods for assessing biological samples |
JP2017227642A (ja) * | 2016-06-24 | 2017-12-28 | タイゲン バイオサイエンス コーポレイション | 多重チャンネル蛍光検出システムおよびそれを使用する方法 |
KR102503418B1 (ko) * | 2020-11-06 | 2023-02-27 | (주)바이오젠텍 | 형광 다중 유전자 등온증폭기 |
KR20220061504A (ko) * | 2020-11-06 | 2022-05-13 | (주)바이오젠텍 | 형광 다중 유전자 등온증폭기 |
JP7438580B2 (ja) | 2020-12-30 | 2024-02-27 | 北京中科生儀科技有限公司 | Pcr検出器及びその方法 |
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US20090068747A1 (en) | 2009-03-12 |
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US20230137550A1 (en) | Optical signal detection device |
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