ES2874561T3 - Inhibidores de MK2 y usos de los mismos - Google Patents

Inhibidores de MK2 y usos de los mismos Download PDF

Info

Publication number
ES2874561T3
ES2874561T3 ES15842903T ES15842903T ES2874561T3 ES 2874561 T3 ES2874561 T3 ES 2874561T3 ES 15842903 T ES15842903 T ES 15842903T ES 15842903 T ES15842903 T ES 15842903T ES 2874561 T3 ES2874561 T3 ES 2874561T3
Authority
ES
Spain
Prior art keywords
mmol
int
methyl
synthesis
stirred
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
ES15842903T
Other languages
English (en)
Inventor
Matthew David Alexander
Claudio Chuaqui
John Malona
Joseph John Mcdonald
Yike Ni
Deqiang Niu
Russell C Petter
Juswinder Singh
Chittari Pabba
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Celgene CAR LLC
Original Assignee
Celgene CAR LLC
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Celgene CAR LLC filed Critical Celgene CAR LLC
Application granted granted Critical
Publication of ES2874561T3 publication Critical patent/ES2874561T3/es
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D495/00Heterocyclic compounds containing in the condensed system at least one hetero ring having sulfur atoms as the only ring hetero atoms
    • C07D495/12Heterocyclic compounds containing in the condensed system at least one hetero ring having sulfur atoms as the only ring hetero atoms in which the condensed system contains three hetero rings
    • C07D495/14Ortho-condensed systems
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33Heterocyclic compounds
    • A61K31/395Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/55Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having seven-membered rings, e.g. azelastine, pentylenetetrazole
    • A61K31/551Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having seven-membered rings, e.g. azelastine, pentylenetetrazole having two nitrogen atoms, e.g. dilazep
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders

Abstract

Un compuesto seleccionado de: **(Ver fórmula)** o **(Ver fórmula)** o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.

Description

DESCRIPCIÓN
Inhibidores de MK2 y usos de los mismos
CAMPO TÉCNICO DE LA INVENCIÓN
La presente invención se refiere a compuestos útiles como inhibidores de quinasas MK2. La invención también proporciona composiciones farmacéuticamente aceptables que comprenden compuestos de la presente invención. Se divulgan métodos para usar dichas composiciones en el tratamiento de varios trastornos.
ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN
La búsqueda de nuevos agentes terapéuticos se ha visto muy favorecida en los últimos años por una mejor comprensión de la estructura de las enzimas y otras biomoléculas asociadas con enfermedades. Una clase importante de enzimas que ha sido objeto de extensos estudios son las proteínas quinasas.
Las proteínas quinasas constituyen una gran familia de enzimas relacionadas estructuralmente que son responsables del control de una variedad de procesos de transducción de señales dentro de la célula. Se piensa que las proteínas quinasas han evolucionado a partir de un gen ancestral común debido a la conservación de su estructura y función catalítica. Casi todas las quinasas contienen un dominio catalítico similar de 250-300 aminoácidos. Las quinasas pueden clasificarse en familias por los sustratos que fosforilan (por ejemplo, proteínatirosina, proteína-serina/treonina, lípidos, etc.).
La proteína quinasa 2 activada por proteína quinasa activada por mitógenos (MAPKAP K2 o MK2) media múltiples respuestas celulares dependientes de p38 MAPK. MK2 es un importante regulador intracelular de la producción de citoquinas, como el factor de necrosis tumoral alfa (TNF-a), la interleucina 6 (IL-6) y el interferón gamma (IFNy), que están implicados en muchas enfermedades inflamatorias agudas y crónicas, por ejemplo artritis reumatoide y enfermedad inflamatoria intestinal. MK2 reside en el núcleo de células no estimuladas y tras la estimulación, se trasloca al citoplasma y fosforila y activa la tuberina y HSP27. MK2 también está implicada en insuficiencia cardíaca, lesión isquémica cerebral, regulación de la resistencia al estrés y producción de TNF-a. (ver Deak et al., EMBO. 17:4426-4441 (1998); Shi et al., Biol. Chem. 383:1519-1536 (2002); Staklatvala., Curr. Opin. Pharmacol. 4:372-377 (2004), and Shiroto et al., J. Mol. Cardiol. 38:93-97 (2005)).
Muchas enfermedades están asociadas con respuestas celulares anormales desencadenadas por eventos mediados por proteína quinasas como se ha descrito anteriormente. Estas enfermedades incluyen, pero no se limitan a, enfermedades autoinmunes, enfermedades inflamatorias, enfermedades óseas, enfermedades metabólicas, enfermedades neurológicas y neurodegenerativas, cáncer, enfermedades cardiovasculares, alergias y asma, enfermedad de Alzheimer y enfermedades relacionadas con hormonas. Por consiguiente, sigue habiendo una necesidad de encontrar inhibidores de las proteína quinasas útiles como agentes terapéuticos.
SUMARIO DE LA INVENCIÓN
El alcance de la invención está definido por las reivindicaciones adjuntas. Cualquier ejemplo o realización que no esté dentro del alcance de las reivindicaciones adjuntas se describe con propósitos de referencia.
Ahora se ha descubierto que los compuestos de esta invención, y composiciones farmacéuticamente aceptables de los mismos, son eficaces como inhibidores de MK2. La invención proporciona compuestos seleccionados de:
Figure imgf000002_0001
Figure imgf000003_0001
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
La invención también proporciona composiciones farmacéuticamente aceptables que comprenden los compuestos anteriores de la invención y un portador, adyuvante o vehículo farmacéuticamente aceptable.
Los compuestos de la presente invención, y las composiciones farmacéuticamente aceptables de los mismos, son útiles para tratar una variedad de enfermedades, trastornos o afecciones, asociados con respuestas celulares anormales desencadenadas por eventos mediados por proteína quinasas. Tales enfermedades, trastornos o afecciones incluyen las descritas en la presente.
Los compuestos proporcionados por esta invención también son útiles para el estudio de quinasas en fenómenos biológicos y patológicos; el estudio de las vías de transducción de señales intracelulares mediadas por tales quinasas; y la evaluación comparativa de nuevos inhibidores de quinasas.
DESCRIPCIÓN DETALLADA DE CIERTAS REALIZACIONES
1. D escripción g en e ra l de los com p uestos de la invención:
En ciertas realizaciones, la presente invención proporciona inhibidores irreversibles de MK2. En algunas realizaciones, tales compuestos incluyen los de las fórmulas descritas en la presente, o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
En algunas realizaciones, la presente invención proporciona compuestos seleccionados de:
Figure imgf000004_0001
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
2. C om puestos y d efin ic iones:
Como se usan en la presente, se aplicarán las siguientes definiciones a menos que se indique lo contrario. Para los propósitos de esta invención, los elementos químicos se identifican de acuerdo con la Tabla Periódica de los Elementos, versión CAS, Handbook of Chemistry Handbook of Chemistry and Physics, 75a Ed. Además, los principios generales de química orgánica se describen en "Organic Chemistry", Thomas Sorrell, University Science Books, Sausalito: 1999, y "March’s Advanced Organic Chemistry", 5a Ed., Ed.: Smith, M.B. and March, J., John Wiley & Sons, New York: 2001.
Como se usa en la presente, el término "sal farmacéuticamente aceptable" se refiere a aquellas sales que, dentro del alcance del buen juicio médico, son adecuadas para su uso en contacto con los tejidos de humanos y animales inferiores sin toxicidad, irritación, respuesta alérgica y similares indebidas, y están en consonancia con una relación beneficio/riesgo razonable. Las sales farmacéuticamente aceptables son bien conocidas en la técnica. Por ejemplo, S.M. Berge et al., describen sales farmacéuticamente aceptables en detalle en J. Pharmaceutical Sciences, 1977, 66, 1-19. Las sales farmacéuticamente aceptables de los compuestos de esta invención incluyen las derivadas de ácidos y bases inorgánicos y orgánicos adecuados. Ejemplos de sales de adición de ácido no tóxicas farmacéuticamente aceptables son sales de un grupo amino formado con ácidos inorgánicos como ácido clorhídrico, ácido bromhídrico, ácido fosfórico, ácido sulfúrico y ácido perclórico o con ácidos orgánicos como ácido acético, ácido oxálico, ácido maleico, ácido tartárico, ácido cítrico, ácido succínico o ácido malónico o usando otros métodos usados en la técnica como intercambio iónico. Otras sales farmacéuticamente aceptables incluyen sales de adipato, alginato, ascorbato, aspartato, bencenosulfonato, benzoato, bisulfato, borato, butirato, canforato, canforsulfonato, citrato, ciclopentanopropionato, digluconato, dodecilsulfato, etanosulfonato, formiato, fumarato, glucoheptonato, glicerofosfato, gluconato, hemisulfato, heptanoato, hexanoato, hidroyoduro, 2-hidroxietanosulfonato, lactobionato, lactato, laurato, lauril sulfato, malato, maleato, malonato, metanosulfonato, 2-naftalenosulfonato, nicotinato, nitrato, oleato, oxalato, palmitato, pamoato, pectinato, persulfato, 3-fenilpropionato, fosfato, pivalato, propionato, estearato, succinato, sulfato, tartrato, tiocianato, p-toluenosulfonato, undecanoato, valerato y similares.
Las sales derivadas de bases apropiadas incluyen sales de metales alcalinos, metales alcalinotérreos, amonio y N+(alquilo C1-4K Las sales de metales alcalinos o alcalinotérreos representativas incluyen sodio, litio, potasio, calcio, magnesio y similares. Otras sales farmacéuticamente aceptables incluyen, cuando sea apropiado, cationes de amonio, amonio cuaternario y amina no tóxicos formados usando contraiones como haluro, hidróxido, carboxilato, sulfato, fosfato, nitrato, sulfonato de alquilo inferior y arilsulfonato.
A menos que se indique lo contrario, también se pretende que las estructuras representadas en la presente incluyan todas las formas isoméricas (por ejemplo, enantioméricas, diastereoméricas y geométricas (o conformacionales)) de la estructura; por ejemplo, las configuraciones R y S para cada centro asimétrico, isómeros de doble enlace Z y E, e isómeros conformacionales Z y E. Por lo tanto, los isómeros estereoquímicos individuales así como las mezclas enantioméricas, diastereoméricas y geométricas (o conformacionales) de los presentes compuestos están dentro del alcance de la invención. Además, a menos que se indique lo contrario, todas las formas tautoméricas de los compuestos de la invención están dentro del alcance de la invención. Además, a menos que se indique lo contrario, también se pretende que las estructuras representadas en la presente incluyan compuestos que difieren solo en la presencia de uno o más átomos enriquecidos isotópicamente. Por ejemplo, los compuestos que tienen las presentes estructuras que incluyen el reemplazo de hidrógeno pr deuterio o tritio, o el reemplazo de un carbono por 13C- o 14C- están dentro del alcance de esta invención. Tales compuestos son útiles, por ejemplo, como herramientas analíticas, como sondas en ensayos biológicos o como agentes terapéuticos de acuerdo con la presente invención.
Las combinaciones de sustituyentes y variables contempladas por esta invención son solo aquellas que dan como resultado la formación de compuestos estables. El término "estable", como se usa en la presente, se refiere a compuestos que poseen estabilidad suficiente para permitir la fabricación y que mantienen la integridad del compuesto durante un período de tiempo suficiente para ser útil para los propósitos detallados en la presente (por ejemplo, administración terapéutica o profiláctica a un sujeto).
La enumeración de una lista de grupos químicos en cualquier definición de una variable en la presente incluye definiciones de esa variable como cualquier grupo individual o combinación de grupos enumerados. La enumeración de una realización para una variable en la presente incluye esa realización como una realización individual o en combinación con cualquier otra realización o partes de la misma.
El término "muestra biológica", como se usa en la presente, incluye, sin limitación, cultivos celulares o extractos de los mismos; material de biopsia obtenido de un mamífero o extractos del mismo; y sangre, saliva, orina, heces, semen, lágrimas u otros fluidos corporales o extractos de los mismos. La inhibición de la actividad de una proteína quinasa, por ejemplo, MK2 o un mutante de la misma, en una muestra biológica es útil para una variedad de propósitos que son conocidos por los expertos en la técnica. Los ejemplos de tales propósitos incluyen, pero no se limitan a, transfusión de sangre, trasplante de órganos, almacenamiento de especímenes biológicos y ensayos biológicos.
Como se usa en la presente, una "enfermedad o trastorno asociado con MK2" o, alternativamente, "una enfermedad o trastorno mediado por MK2" significa cualquier enfermedad u otra afección perjudicial en la que se sabe o se sospecha que MK2, o un mutante del mismo, desempeña un papel.
El término "sujeto", como se usa en la presente, significa un mamífero e incluye sujetos humanos y animales, como animales domésticos (por ejemplo, caballos, perros, gatos, etc.). Los términos "sujeto" y "paciente" se usan indistintamente. En algunas realizaciones, el "paciente" o "sujeto" significa un animal, preferiblemente un mamífero, y lo más preferiblemente un humano.
El término "portador, adyuvante o vehículo farmacéuticamente aceptable" se refiere a un portador, adyuvante o vehículo no tóxico que no destruye la actividad farmacológica del compuesto con el que está formulado. Los portadores, adyuvantes o vehículos farmacéuticamente aceptables que pueden usarse en las composiciones de esta invención incluyen, pero no se limitan a, intercambiadores de iones, alúmina, estearato de aluminio, lecitina, proteínas del suero, como albúmina de suero humano, sustancias tampón como fosfatos, glicina, ácido sórbico, sorbato de potasio, mezclas de glicéridos parciales de ácidos grasos vegetales saturados, agua, sales o electrolitos, como sulfato de protamina, hidrogenofosfato de disodio, hidrogenofosfato de potasio, cloruro de sodio, sales de zinc, sílice coloidal, trisilicato de magnesio, polivinilpirrolidona, sustancias a base de celulosa, polietilenglicol, carboximetilcelulosa de sodio, poliacrilatos, ceras, polímeros de bloque de polietilenopolioxipropileno, polietilenglicol y grasa de lana. La cantidad de compuestos de la presente invención que pueden combinarse con los materiales portadores para producir una composición en una forma de dosificación individual variará dependiendo del huésped tratado, el modo particular de administración, etc. Preferiblemente, las composiciones proporcionadas se formulan de tal manera que pueda administrarse una dosificación de entre 0,01 y aproximadamente 100 mg/kg, o de aproximadamente 0,1 mg/kg a aproximadamente 50 mg/kg, y preferiblemente de aproximadamente 1 mg/kg a aproximadamente 25 mg/kg, del peso corporal del sujeto/día del inhibidor a un paciente que recibe estas composiciones para obtener el efecto terapéutico deseado. La cantidad de un compuesto de la presente invención en la composición también dependerá del compuesto particular en la composición.
La expresión "forma de dosificación unitaria" como se usa en la presente se refiere a una unidad físicamente discreta de un compuesto proporcionado y/o composiciones del mismo apropiadas para el sujeto a tratar. Se entenderá, sin embargo, que el uso diario total del agente activo (es decir, compuestos y composiciones de la presente invención) será decidida por el médico tratante dentro del alcance del buen juicio médico. El nivel de dosis eficaz específico para cualquier sujeto (es decir, paciente) u organismo particulares dependerá de una variedad de factores que incluyen el trastorno que se está tratando y la gravedad del trastorno; la actividad del agente activo específico empleado; la composición específica empleada; edad, peso corporal, salud general, sexo y dieta del sujeto; momento de administración, vía de administración y tasa de excreción del agente activo específico empleado; duración del tratamiento; y factores similares bien conocidos en las técnicas médicas.
El término "parenteral", como se usa en la presente, incluye técnicas de inyección o infusión subcutánea, intravenosa, intramuscular, intraarticular, intrasinovial, intraesternal, intratecal, intrahepática, intralesional e intracraneal.
Como se usa en la presente, una "cantidad terapéuticamente eficaz" significa una cantidad de una sustancia (por ejemplo, un agente terapéutico, composición y/o formulación) que provoca una respuesta biológica deseada. En algunas realizaciones, una cantidad terapéuticamente eficaz de una sustancia es una cantidad que es suficiente, cuando se administra como parte de un régimen de dosificación a un sujeto que padece o es susceptible a una enfermedad, trastorno y/o afección, para tratar, diagnosticar, prevenir y/o retrasar la aparición de la enfermedad, trastorno y/o afección. Como apreciarán los expertos en esta técnica, la cantidad eficaz de una sustancia puede variar dependiendo de factores como el criterio de valoración biológico deseado, la sustancia a administrar, la célula o tejido objetivo, etc. Por ejemplo, la cantidad eficaz de un compuesto proporcionado en una formulación para tratar una enfermedad, trastorno, y/o condición es la cantidad que alivia, mejora, mitiga, inhibe, previene, retrasa el inicio, reduce la gravedad y/o reduce la incidencia de uno o más síntomas o características de la enfermedad, trastorno y/o afección. En algunas realizaciones, una "cantidad terapéuticamente eficaz" es por lo menos una cantidad mínima de un compuesto proporcionado, o una composición que contiene un compuesto proporcionado, que es suficiente para tratar uno o más síntomas de una enfermedad o trastorno mediado por MK2.
Como se usa en la presente, los términos "tratamiento", "tratar" y "tratando" se refieren a aliviar, inhibir, retrasar el inicio, prevenir, mejorar y/o mitigar parcial o completamente un trastorno o afección, o uno o más síntomas del trastorno o afección, como se describe en la presente. En algunas realizaciones, el tratamiento puede administrarse después de que se hayan desarrollado uno o más síntomas. En algunas realizaciones, el término "tratar" incluye prevenir o detener la progresión de una enfermedad o trastorno. En otras realizaciones, el tratamiento puede administrarse en ausencia de síntomas. Por ejemplo, el tratamiento puede administrarse a un individuo susceptible antes de la aparición de los síntomas (por ejemplo, a la luz de un historial de síntomas y/o a la luz de factores genéticos u otros factores de susceptibilidad). El tratamiento también puede continuarse después de que los síntomas hayan desaparecido, por ejemplo, para prevenir o retrasar su reaparición. Por tanto, en algunas realizaciones, el término "tratar" incluye prevenir la recaída o la reaparición de una enfermedad o trastorno.
Como se usa en la presente, el término "inhibidor" se define como un compuesto que se une a y/o inhibe la proteína quinasa objetivo, MK2, con afinidad medible. En ciertas realizaciones, un inhibidor tiene una IC50 y/o constante de unión de menos de aproximadamente 50 pM, menos de aproximadamente 1 pM, menos de aproximadamente 500 nM, menos de aproximadamente 100 nM, o menos de aproximadamente 10 nM.
Los términos "afinidad medible" e "inhibir mediblemente", como se usan en la presente, significan un cambio medible en la actividad de MK2 entre una muestra que comprende un compuesto de la presente invención, o composición del mismo, y MK2, y una muestra equivalente que comprende MK2, en ausencia de dicho compuesto, o composición del mismo.
Como se usa en la presente, el término "irreversible" o "inhibidor irreversible" se refiere a un inhibidor (es decir, un compuesto) que puede unirse covalentemente a una quinasa de una manera sustancialmente no reversible. Es decir, mientras que un inhibidor reversible puede unirse (pero generalmente no puede formar un enlace covalente con) una quinasa y, por lo tanto, puede disociarse de la quinasa, un inhibidor irreversible permanecerá sustancialmente unido a una quinasa una vez que se haya producido el enlace covalente. Los inhibidores irreversibles muestran habitualmente dependencia del tiempo, por lo que el grado de inhibición aumenta con el tiempo con el que el inhibidor está en contacto con la enzima. En ciertas realizaciones, un inhibidor irreversible permanecerá sustancialmente unido a una quinasa una vez que se haya producido el enlace covalente y permanecerá unido durante un periodo de tiempo que es mayor que la vida de la proteína.
Los métodos para identificar si un compuesto actúa como inhibidor irreversible son conocidos por los expertos en la técnica. Tales métodos incluyen, pero no se limitan a, análisis cinético enzimático del perfil de inhibición del compuesto con una quinasa, el uso de espectrometría de masas del objetivo de fármaco proteíco modificado en presencia del compuesto inhibidor, exposición discontinua, también conocida como “lavado”, experimentos, y el uso de marcado, como un inhibidor radiomarcado, para mostrar la modificación covalente de la enzima, así como otros métodos conocidos por un experto en la técnica.
Como se usa en la presente, el término "resistencia a fármacos" se refiere a cambios en la secuencia de ácidos nucleicos de tipo salvaje que codifica una proteína objetivo, y/o la secuencia de aminoácidos de la proteína objetivo, y/o la secuencia de aminoácidos de otra proteína, tales cambios disminuyen o anulan el efecto inhibidor del inhibidor sobre la proteína objetivo. Sin desear estar limitado por ninguna teoría en particular, se cree que ciertos compuestos de la presente invención, es decir, compuestos que son inhibidores irreversibles de quinasas, pueden ser inhibidores efectivos de formas de proteína quinasas resistentes a fármacos.
3. D escripción de rea lizac iones e jem plares:
Como se describe en la presente, la presente invención proporciona inhibidores irreversibles de la quinasa MK2. Sin desear estar limitados por ninguna teoría particular, se cree que los compuestos de la invención comprenden un fracción capaz de unirse covalentemente a un residuo de cisteína clave en el dominio de unión de la quinasa MK2. A Tal fracción se hace referencia en la presente como una "fracción reactiva". Un experto en la técnica apreciará que la quinasa MK2, y los mutantes de la misma, tienen un residuo de cisteína en el dominio de unión. Sin desear estar limitados a ninguna teoría en particular, se cree que la proximidad de una fracción reactiva, presente en un inhibidor de MK2 proporcionado, a la cisteína de interés facilita la modificación covalente de esa cisteína por la fracción reactiva.
Los residuos de cisteína de interés también pueden describirse mediante una porción de identificación de la secuencia de aminoácidos de la quinasa MK2 que incluye la cisteína de interés. Por tanto, en ciertas realizaciones, Cys140 de MK2 se caracteriza porque Cys140 es la cisteína incorporada en la siguiente secuencia de aminoácidos de MK2:
SEQ ID NO. 1:
MLSNSQGQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNA
IIDDYKVTSOVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPKARREVELHWRASQ
CPHIVRIVDVYENLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSI
GEAIQYLHSINIAHRDVKPENLLYTSKRPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPY
YVAPEVLGPEKYDKSCDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPGMKTRIRMGQ
YEFPNPEWSEVSEEVKMLIRNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTS
RVLKEDKERWEDVKEEMTSALATMRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALE
AAALAH.
Para mayor claridad, Cys140 se proporciona en la secuencia de aminoácidos abreviada a continuación: SEQ ID NO. 2:
NLYAGRKCLLIVMEC(140)LDGGELFSRIQDR.
En ambas SEQ ID NO. 1 y 2, la cisteína 140 está resaltada en negrita con subrayado.
En algunas realizaciones, los compuestos de la presente invención incluyen una fracción reactiva caracterizada porque los compuestos proporcionados modifican covalentemente Cys140 de MK2.
En ciertas realizaciones, los compuestos de la presente invención incluyen una fracción reactiva caracterizada porque un compuesto modifica covalentemente un objetivo de Cys140 de MK2, inhibiendo de este modo irreversiblemente la quinasa.
Por tanto, en algunas realizaciones, una fracción reactiva presente en un compuesto inhibidor de MK2 proporcionado es capaz de unirse covalentemente a un residuo de cisteína inhibiendo de este modo irreversiblemente la enzima. En algunas realizaciones, el residuo de cisteína es Cys140 de MK2. Un experto en la técnica reconocerá que una variedad de fracciones reactivas, como se define en la presente, son adecuadas para tal enlace covalente. Tales fracciones reactivas incluyen, pero no se limitan a, las descritos en la presente y representadas a continuación.
De acuerdo con un aspecto, la presente invención proporciona compuestos seleccionados de:
Figure imgf000008_0001
o
Figure imgf000009_0001
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
Como se ha descrito anteriormente, y como se expone en las reivindicaciones adjuntas, la invención proporciona compuestos específicos (compuestos 1-82, 1-96, 1-97, I-100, 1-121, 1-127 y1 -135), y sales farmacéuticamente aceptables de los mismos. Los compuestos de la invención se representan en la Tabla 1, a continuación, junto con otros compuestos divulgados.
Tabla 1
Figure imgf000010_0001
(continuación)
Figure imgf000011_0001
(continuación)
Figure imgf000012_0001
(continuación)
Figure imgf000013_0001
Figure imgf000014_0001
(continuación)
Figure imgf000015_0001
(continuación)
Figure imgf000016_0001
(continuación)
Figure imgf000017_0001
(continuación)
Figure imgf000018_0001
continuación
Figure imgf000019_0001
Ĩcontinuación)
Figure imgf000020_0001
Ĩcontinuación)
Figure imgf000021_0001
Ĩcontinuación)
Figure imgf000022_0001
Ĩcontinuación)
Figure imgf000023_0001
Ĩcontinuación)
Figure imgf000024_0001
continuación
Figure imgf000025_0001
Ĩcontinuación)
Figure imgf000026_0001
Ĩcontinuación)
Figure imgf000027_0001
continuación
Figure imgf000028_0001
(continuación)
Figure imgf000029_0001
(continuación)
Figure imgf000030_0001
(continuación)
Figure imgf000031_0001
continuación
Figure imgf000032_0001
continuación
Figure imgf000033_0001
continuación
Figure imgf000034_0001
continuación
Figure imgf000035_0001
continuación
Figure imgf000036_0001
continuación
Figure imgf000037_0001
Figure imgf000038_0001
En algunas realizaciones, la presente invención proporciona un compuesto de la invención (uno de los compuestos I-82, I-96, 1-97, I-100, I-121, I 127 and 1-135), representados en la Tabla 1, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
4. Usos, form ulación y adm in istrac ión :
C om posic iones farm acéuticam ente aceptab les
De acuerdo con otra realización, la invención proporciona una composición que comprende un compuesto de esta invención o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo y un portador, adyuvante o vehículo farmacéuticamente aceptable. En ciertas realizaciones, la cantidad de compuesto en las composiciones de esta invención es tal que es eficaz para inhibir de forma medible MK2, o un mutante del mismo, en una muestra biológica o en un paciente. En ciertas realizaciones, se formula una composición de esta invención para su administración a un paciente con necesidad de dicha composición. En algunas realizaciones, se formula una composición de esta invención para la administración oral a un paciente.
Los compuestos y composiciones, de acuerdo con el método divulgado en la presente, se administran usando cualquier cantidad y cualquier vía de administración eficaz para tratar o disminuir la gravedad de un trastorno proporcionado en la presente (es decir, una enfermedad o trastorno mediado por MK2). La cantidad exacta requerida variará de un sujeto a otro, dependiendo de la especie, la edad y el estado general del sujeto, la gravedad de la infección, el agente particular, su modo de administración y similares. Los compuestos de la invención se formulan preferiblemente en forma de dosificación unitaria para facilitar la administración y la uniformidad de dosificación.
Las composiciones de la presente invención pueden administrarse por vía oral, parenteral, por pulverización por inhalación, por vía tópica, rectal, nasal, bucal, vaginal, intraperitoneal, intracisternal o mediante un depósito implantado. En algunas divulgaciones, las composiciones se administran por vía oral, intraperitoneal o intravenosa.
Las formas inyectables estériles de las composiciones de esta invención pueden ser una suspensión acuosa u oleaginosa. Estas suspensiones pueden formularse de acuerdo con técnicas conocidas en la técnica usando agentes dispersantes o humectantes y agentes de suspensión adecuados. La preparación inyectable estéril también puede ser una solución o suspensión inyectable estéril en un diluyente o solvente parenteralmente aceptable no tóxico, por ejemplo como una solución en 1,3-butanodiol. Entre los vehículos y solventes aceptables que pueden emplearse se encuentran el agua, la solución de Ringer y solución isotónica de cloruro de sodio. Además, los aceites fijos estériles se emplean convencionalmente como solvente o medio de suspensión.
Para este propósito, puede emplearse cualquier aceite fijo insípido incluyendo mono o diglicéridos sintéticos. Los ácidos grasos, como el ácido oleico y sus derivados glicéridos, son útiles en la preparación de inyectables, al igual que los aceites naturales farmacéuticamente aceptables, como el aceite de oliva o el aceite de ricino, especialmente en sus versiones polioxietiladas. Estas soluciones o suspensiones oleosas también pueden contener un diluyente o dispersante de alcohol de cadena larga, como carboximetilcelulosa o agentes dispersantes similares que se usan comúnmente en la formulación de formas de dosificación farmacéuticamente aceptables, incluyendo emulsiones y suspensiones. También pueden usarse otros surfactantes comúnmente usados, como Tweens, Spans y otros agentes emulsionantes o potenciadores de biodisponibilidad que se usan comúnmente en la fabricación de formas de dosificación sólidas, líquidas, u otras para propósitos de formulación.
Las formulaciones inyectables pueden esterilizarse, por ejemplo, mediante filtración a través de un filtro de retención bacteriano o incorporando agentes esterilizantes en forma de composiciones sólidas estériles que pueden disolverse o dispersarse en agua estéril u otro medio inyectable estéril antes de su uso.
Para prolongar el efecto de un compuesto de la presente invención, a menudo es deseable ralentizar la absorción del compuesto por inyección subcutánea o intramuscular. Esto puede lograrse mediante el uso de una suspensión líquida de material cristalino o amorfo con poca solubilidad en agua. La velocidad de absorción del compuesto depende entonces de su velocidad de disolución que, a su vez, puede depender del tamaño del cristal y de la forma cristalina. Alternativamente, la absorción retardada de una forma de compuesto administrada por vía parenteral se logra disolviendo o suspendiendo el compuesto en un vehículo oleoso. Las formas de depósito inyectables se preparan formando matrices microencapsuladas del compuesto en polímeros biodegradables como polilactida-poliglicólido. Dependiendo de la relación de compuesto a polímero y la naturaleza del polímero particular empleado, puede controlarse la velocidad de liberación del compuesto. Ejemplos de otros polímeros biodegradables incluyen poli(ortoésteres) y poli(anhídridos). Las formulaciones inyectables de depósito también se preparan atrapando el compuesto en liposomas o microemulsiones que son compatibles con los tejidos corporales.
En algunas realizaciones, se formulan composiciones farmacéuticamente aceptables para administración oral. Tales formulaciones pueden administrarse con o sin alimentos. En algunas divulgaciones, las composiciones farmacéuticamente aceptables de esta invención se administran sin alimentos. En otras divulgaciones, las composiciones farmacéuticamente aceptables de esta invención se administran con alimentos. Las composiciones farmacéuticamente aceptables de esta invención pueden administrarse por vía oral en cualquier forma de dosificación aceptable por vía oral, incluyendo pero no limitado a, cápsulas, comprimidos, suspensiones o soluciones acuosas. En el caso de comprimidos para uso oral, los portadores comúnmente usados incluyen lactosa y almidón de maíz. También se añaden típicamente agentes lubricantes, como estearato de magnesio. Para administración oral en forma de cápsula, los diluyentes útiles incluyen lactosa y almidón de maíz seco. Cuando se requieren suspensiones acuosas para uso oral, el ingrediente activo se combina con agentes emulsionantes y de suspensión. Si se desea, también pueden añadirse ciertos agentes edulcorantes, aromatizantes o colorantes.
Las formas de dosificación sólidas para administración oral incluyen cápsulas, comprimidos, píldoras, polvos y gránulos. En tales formas de dosificación sólidas, el compuesto activo se mezcla con por lo menos un excipiente o portador inerte farmacéuticamente aceptable, como citrato de sodio o fosfato dicálcico y/o a) cargas o extensores como almidones, lactosa, sacarosa, glucosa, manitol y ácido silícico, b) aglutinantes como, por ejemplo, carboximetilcelulosa, alginatos, gelatina, polivinilpirrolidinona, sacarosa y goma arábiga, c) humectantes como glicerol, d) agentes disgregantes como agar-agar, carbonato de calcio, almidón de patata o tapioca, ácido algínico, ciertos silicatos y carbonato de sodio, e) agentes retardantes de la solución como parafina, f) aceleradores de la absorción como compuestos de amonio cuaternario, g) agentes humectantes como, por ejemplo, alcohol cetílico y monoestearato de glicerol, h) absorbentes como caolín y arcilla bentonita, y/o i) lubricantes como talco, estearato de calcio, estearato de magnesio, polietilenglicoles sólidos, lauril sulfato de sodio y mezclas de los mismos. En el caso de cápsulas, comprimidos y píldoras, la forma de dosificación también puede comprender agentes tamponadores.
También pueden emplearse composiciones sólidas de un tipo similar como cargas en cápsulas de gelatina rellenas blandas y duras usando excipientes como lactosa o azúcar de leche, así como polietilenglicoles de alto peso molecular y similares. Las formas de dosificación sólidas de comprimidos, grageas, cápsulas, píldoras y gránulos pueden prepararse con recubrimientos y cubiertas como recubrimientos entéricos y otros recubrimientos bien conocidos en la técnica de formulación farmacéutica. Pueden contener opcionalmente agentes opacificantes y también pueden ser de una composición que liberen el ingrediente o los ingredientes activos solo, o preferentemente, en una cierta parte del tracto intestinal, opcionalmente, de manera retardada. Los ejemplos de composiciones de inclusión que pueden usarse incluyen sustancias poliméricas y ceras. También pueden emplearse composiciones sólidas de un tipo similar como cargas en cápsulas rellenas de gelatina blandas y duras usando tales excipientes como lactosa o azúcar de la leche así como polietilenglicoles de alto peso molecular y similares.
Los compuestos activos también pueden estar en forma microencapsulada con uno o más excipientes como se ha indicado anteriormente. Las formas de dosificación sólidas de comprimidos, grageas, cápsulas, píldoras y gránulos pueden prepararse con recubrimientos y cubiertas como recubrimientos entéricos, recubrimientos de control de liberación y otros recubrimientos bien conocidos en la técnica de formulación farmacéutica. En tales formas de dosificación sólidas, el compuesto activo puede mezclarse con por lo menos un diluyente inerte, como sacarosa, lactosa o almidón. Tales formas de dosificación también pueden comprender, como es práctica normal, sustancias adicionales distintas de los diluyentes inertes, por ejemplo, lubricantes para comprimidos y otros coadyuvantes para formar comprimidos como estearato de magnesio y celulosa microcristalina. En el caso de cápsulas, comprimidos y píldoras, las formas de dosificación también pueden comprender agentes tamponadores. Pueden contener opcionalmente agentes opacificantes y también pueden ser de una composición tal que liberen el ingrediente o los ingredientes activos solamente, o preferentemente, en una determinada parte del tracto intestinal, opcionalmente, de manera retardada. Los ejemplos de composiciones de inclusión que pueden usarse incluyen sustancias poliméricas y ceras.
Las formas de dosificación líquidas para administración oral incluyen, pero no se limitan a, emulsiones, microemulsiones, soluciones, suspensiones, jarabes y elixires farmacéuticamente aceptables. Además de los compuestos activos, las formas de dosificación líquidas pueden contener diluyentes inertes usados comúnmente en la técnica como, por ejemplo, agua u otros solventes, agentes solubilizantes y emulsionantes como alcohol etílico, alcohol isopropílico, carbonato de etilo, acetato de etilo, alcohol bencílico, benzoato de bencilo, propilenglicol, 1,3-butilenglicol, dimetilformamida, aceites (en particular, aceites de semilla de algodón, cacahuete, maíz, germen de trigo, oliva, ricino y sésamo), glicerol, alcohol tetrahidrofurfurílico, polietilenglicoles y ésteres de ácidos grasos de sorbitán y mezclas de los mismos. Además de diluyentes inertes, las composiciones orales también pueden incluir adyuvantes como agentes humectantes, agentes emulsionantes y de suspensión, agentes edulcorantes, aromatizantes y perfumantes.
Alternativamente, las composiciones farmacéuticamente aceptables de esta invención pueden administrarse en forma de supositorios para administración rectal. Estos pueden prepararse mezclando el agente con un excipiente no irritante adecuado que sea sólido a temperatura ambiente pero líquido a temperatura rectal y, por lo tanto, se derretirá en el recto para liberar el fármaco. Tales materiales incluyen manteca de cacao, cera de abejas y polietilenglicoles.
Las composiciones para administración rectal o vaginal son preferiblemente supositorios que pueden prepararse mezclando los compuestos de esta invención con excipientes o portadores no irritantes adecuados como manteca de cacao, polietilenglicol o una cera para supositorios que son sólidos a temperatura ambiente pero líquidos a temperatura corporal y por lo tanto se funden en el recto o la cavidad vaginal y liberan el compuesto activo.
Las composiciones farmacéuticamente aceptables de esta invención también pueden administrarse por vía tópica, especialmente cuando el objetivo del tratamiento incluye áreas u órganos fácilmente accesibles mediante aplicación tópica, incluyendo enfermedades de los ojos, la piel o el tracto intestinal inferior. Las formulaciones tópicas adecuadas se preparan fácilmente para cada una de estas áreas u órganos.
La aplicación tópica para el tracto intestinal inferior puede efectuarse en una formulación de supositorio rectal (ver más arriba) o en una formulación de enema adecuada. También pueden usarse parches tópicamente transdérmicos.
Para aplicaciones tópicas, las composiciones farmacéuticamente proporcionadas pueden formularse en una pomada adecuada que contenga el componente activo suspendido o disuelto en uno o más portadores. Los portadores para la administración tópica de los compuestos de esta invención incluyen, pero no se limitan a, aceite mineral, vaselina líquida, vaselina blanca, propilenglicol, polioxietileno, compuesto de polioxipropileno, cera emulsionante y agua. Alternativamente, las composiciones farmacéuticamente aceptables proporcionadas pueden formularse en una loción o crema adecuada que contenga los componentes activos suspendidos o disueltos en uno o más portadores farmacéuticamente aceptables. Los portadores adecuados incluyen, pero no se limitan a, aceite mineral, monoestearato de sorbitán, polisorbato 60, cera de ésteres cetílicos, alcohol cetearílico, 2-octildodecanol, alcohol bencílico y agua.
Para uso oftálmico, las composiciones farmacéuticamente aceptables proporcionadas pueden formularse como suspensiones micronizadas en solución salina estéril con pH ajustado isotónica o, preferiblemente, como soluciones en solución salina estéril con pH ajustado isotónica, con o sin un conservante como cloruro de bencilalconio. Alternativamente, para usos oftálmicos, las composiciones farmacéuticamente aceptables pueden formularse en una pomada como vaselina.
Las composiciones farmacéuticamente aceptables de esta invención también pueden administrarse mediante aerosol nasal o inhalación. Tales composiciones se preparan de acuerdo con técnicas bien conocidas en la técnica de la formulación farmacéutica y pueden prepararse como soluciones en solución salina, empleando alcohol bencílico u otros conservantes adecuados, promotores de la absorción para mejorar la biodisponibilidad, fluorocarbonos y/u otros agentes solubilizantes o dispersantes convencionales.
Las formas de dosificación para la administración tópica o transdérmica de un compuesto de esta invención incluyen pomadas, pastas, cremas, lociones, geles, polvos, soluciones, espráis, inhalantes o parches. El componente activo se mezcla en condiciones estériles con un portador farmacéuticamente aceptable y cualquier conservante o tampón necesario, según se requiera. La formulación oftálmica, las gotas para los oídos y las gotas para los ojos también se contemplan dentro del alcance de esta invención. Además, la presente invención contempla el uso de parches transdérmicos, que tienen la ventaja adicional de proporcionar una administración controlada de un compuesto al cuerpo. Tales formas de dosificación pueden elaborarse disolviendo o dispersando el compuesto en el medio apropiado. También pueden usarse potenciadores de la absorción para aumentar el flujo del compuesto a través de la piel. La velocidad puede controlarse proporcionando una membrana de control de la velocidad o dispersando el compuesto en una matriz de polímero o gel.
Usos de com p uestos y com p osic iones farm acéuticam ente aceptab les
Los compuestos y composiciones descritos en la presente son generalmente útiles para la inhibición de la actividad de quinasas de una o más enzimas. Ejemplos de quinasas que son inhibidas por los compuestos y composiciones descritos en la presente y contra las cuales son útiles los métodos descritos en la presente incluyen MK2, o un mutante de la misma.
La actividad de un compuesto utilizado en esta invención como inhibidor de una quinasa MK2, o un mutante de la misma, puede ensayarse in vitro, in vivo o en una línea celular. Los ensayos in vitro incluyen ensayos que determinan la inhibición de la actividad de fosforilación y/o las consecuencias funcionales posteriores, o la actividad de ATPasa de la quinasa MK2 activada, o un mutante de la misma. Los ensayos in vitro alternativos cuantifican la capacidad del compuesto de prueba para unirse a MK2. La unión del inhibidor puede medirse radiomarcando el compuesto de prueba antes de la unión, aislando el complejo compuesto de prueba/MK2 y determinando la cantidad de radiomarcado unido. Alternativamente, la unión del inhibidor puede determinarse realizando un experimento de competición en el que los compuestos de prueba se incuban con la quinasa MK2 unida a radioligandos conocidos. Las condiciones detalladas para ensayar un compuesto utilizado en esta invención como inhibidor de MK2, o un mutante de la misma, se exponen en los Ejemplos a continuación.
De acuerdo con una divulgación, se describe un método para inhibir la actividad de la proteína quinasa en una muestra biológica que comprende el paso de poner en contacto dicha muestra biológica con un compuesto de esta invención, o una composición que comprende dicho compuesto.
De acuerdo con otra divulgación, se proporciona un método para inhibir la actividad de la quinasa MK2, o un mutante de la misma, en una muestra biológica que comprende el paso de poner en contacto dicha muestra biológica con un compuesto de esta invención, o una composición que comprende dicho compuesto. En ciertas divulgaciones, se describe un método para inhibir irreversiblemente la actividad de la quinasa MK2, o un mutante de la misma, en una muestra biológica que comprende el paso de poner en contacto dicha muestra biológica con un compuesto de esta invención, o una composición que comprende dicho compuesto.
De acuerdo con otra divulgación, se proporciona un método para inhibir la actividad de la quinasa MK2, o un mutante de la misma, en un paciente que comprende el paso de administrar a dicho paciente un compuesto de la presente invención, o una composición que comprende dicho compuesto. De acuerdo con ciertas divulgaciones, se proporciona un método para inhibir irreversiblemente la actividad de la quinasa MK2, o un mutante de la misma, en un paciente que comprende el paso de administrar a dicho paciente un compuesto de la presente invención, o una composición que comprende dicho compuesto. En otras divulgaciones, se proporciona un método para tratar una enfermedad o trastorno mediado por MK2, en un paciente con necesidad de ello, que comprende el paso de administrar a dicho paciente un compuesto de acuerdo con la presente invención o una composición farmacéuticamente aceptable del mismo. Tales trastornos se describen con detalle en la presente.
Q uinasa M K 2
La proteína quinasa 2 activada por MAP quinasa (“MK2”) es una enzima que en los humanos está codificada por el gen MAPKAPK2. Este gen codifica un miembro de la familia de las proteínas quinasas Ser/Thr. Esta quinasa está regulada a través de la fosforilación directa por la p38 MAP quinasa. Junto con la p38 MAP quinasa, se sabe que esta quinasa está implicada en muchos procesos celulares, incluyendo respuestas inflamatorias y al estrés, exportación nuclear, regulación de la expresión génica y proliferación celular. Se ha demostrado que la proteína de choque térmico HSP27 es uno de los sustratos de esta quinasa in vivo. Se han encontrado dos variantes de transcripción que codifican dos isoformas diferentes para este gen.
MK2 es una proteína de múltiples dominios que consta de un dominio rico en prolina N-terminal, un dominio catalítico, un dominio autoinhibidor y en el extremo C-terminal una señal de exportación nuclear (NES) y una señal de localización nuclear (NLS). Se han caracterizado dos isoformas de MK2 humana. Una isoforma consiste de 400 aminoácidos y la otra isoforma de 370 residuos que se cree que es una variante de corte y empalme que carece del NLS C-terminal. MK2 se localiza en el núcleo de la célula y tras la unión y fosforilación por p38, la MK2 NES se vuelve funcional y ambas quinasas se cotransportan fuera del núcleo al citoplasma. Curiosamente, el transporte del complejo MK2/p38 no requiere MK2 catalíticamente activa, ya que el mutante del sitio activo, Asp207Ala, todavía se transporta al citoplasma. Se cree que la fosforilación de MK2 humana por p38 en los residuos T222, S272 y T334 activa la enzima induciendo un cambio conformacional del dominio autoinhibidor, exponiendo por tanto el sitio activo para la unión del sustrato. Las mutaciones de dos residuos de dominio autoinhibidor W332A y K326E en MK2 murino demuestran un aumento en la actividad basal y una deleción C-terminal del dominio autoinhibidor hace que la enzima sea constitutivamente activa, proporcionando evidencia adicional del papel de este dominio en la inhibición de la actividad de MK2.
Las enfermedades o trastornos asociados con MK2 que se tratan con compuestos de la presente invención incluyen trastornos autoinmunes, trastornos inflamatorios crónicos, trastornos inflamatorios agudos, trastornos autoinflamatorios, trastornos fibróticos, trastornos metabólicos, neoplasias o trastornos cardiovasculares o cerebrovasculares. Por tanto, en algunas divulgaciones, se proporciona un método para tratar una enfermedad o trastorno mediado por MK2 en un paciente con necesidad de ello, en donde dicho método comprende administrar a dicho paciente una cantidad terapéuticamente eficaz de un compuesto proporcionado o una composición del mismo. Tales enfermedades o trastornos mediados por MK2 incluyen, pero no se limitan a, los descritos en la presente.
En algunas divulgaciones, la enfermedad o trastorno mediado por MK2 es un trastorno autoinmune, un trastorno inflamatorio crónico y/o agudo, y/o un trastorno autoinflamatorio. Los trastornos autoinmunes y/o inflamatorios y/o autoinflamatorios ejemplares incluyen: enfermedades inflamatorias del intestino (por ejemplo, colitis ulcerosa o enfermedad de Crohn), esclerosis múltiple, psoriasis, artritis, artritis reumatoide, osteoartritis, artritis juvenil, artritis psoriásica, artritis reactiva, espondilitis anquilosante, síndromes periódicos asociados con criopirina, síndrome de Muckle-Wells, síndrome autoinflamatorio por frío familiar, enfermedad inflamatoria multisistémica de inicio neonatal, sindroma periódico asociado al receptor de TNF, pancreatitis aguda y crónica, aterosclerosis, gota, espondilitis anquilosante, trastornos fibróticos (por ejemplo, fibrosis hepática o fibrosis pulmonar idiopática), nefropatía, sarcoidosis, esclerodermia, anafilaxia, diabetes (por ejemplo, diabetes mellitus tipo 1 o diabetes mellitus tipo 2), retinopatía diabética, enfermedad de Still, vasculitis, sarcoidosis, inflamación pulmonar, síndrome de dificultad respiratoria aguda, degeneración macular húmeda y seca relacionada con la edad, síndromes hemolíticos autoinmunes, hepatitis autoinmune e inflamatoria, neuropatía autoinmune, insuficiencia ovárica autoinmune, orquitis autoinmune, trombocitopenia autoinmune, enfermedad autoinmune asociada a implantes de silicona, síndrome de Sjogren, fiebre mediterránea familiar, lupus eritematoso sistémico, síndromes de vasculitis (por ejemplo, arteritis temporal, de Takayasu y de células gigantes, enfermedad de Behget o granulomatosis de Wegener), vitiligo, manifestación hematológica secundaria de enfermedades autoinmunes (por ejemplo, anemias), autoinmunidad inducida por fármacos, tiroiditis de Hashimoto, hipofisitis, pupura trombocítica idiopática, autoinmunidad inducida por metales, miastenia grave, pénfigo, sordera autoinmune (por ejemplo, enfermedad de Menier), síndrome de Goodpasture, enfermedad de Graves, síndromes autoinmunes relacionados con HW, enfermedad de Gullain-Barre, enfermedad de Addison, síndrome antifosfolípido, asma, dermatitis atópica, enfermedad celíaca, síndrome de Cushing, dermatomiositis, atrofia suprarrenal idiopática, trombocitopenia idiopática, síndrome de Kawasaki, síndrome de Lambert-Eatnicon, anemia perniciosa, polinosis, poliarteritis nodosa, cirrosis biliar primaria, colangitis esclerosante primaria, síndrome de Raynaud, síndrome de Reiter, policondritis recidivante, síndrome de Schmidt, tirotoxidosis, sepsis, choque séptico, choque endotóxico, choque tóxico inducido por exotoxinas, sepsis gramnegativa, síndrome de choque tóxico, glomerulonefritis, peritonitis, cistitis intersticial, inflamaciones inducidas por hiperoxia, enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC), vasculitis, reacción de injerto contra huésped (por ejemplo, enfermedad de injerto contra huésped), rechazos de aloinjerto (por ejemplo, rechazo agudo de aloinjerto o rechazo crónico de aloinjerto), rechazo temprano de trasplante (por ejemplo, rechazo agudo de aloinjerto), lesión por reperfusión, dolor (por ejemplo, dolor agudo, dolor crónico, dolor neuropático o fibromialgia), infecciones crónicas, meningitis, encefalitis, miocarditis, gingivitis, trauma posquirúrgico, lesión tisular, lesión cerebral traumática, enterocolitis, sinusitis, uveítis, inflamación ocular, neuritis óptica, úlceras gástricas, esofagitis, peritonitis, periodontitis, dermatomiositis, gastritis, miositis, polimialgia, neumonía y bronquitis.
En algunas divulgaciones, la enfermedad o trastorno mediado por MK2 es un trastorno fibrótico. Los trastornos fibróticos ejemplares incluyen esclerosis/esclerodermia sistémica, nefritis lúpica, enfermedad del tejido conectivo, curación de heridas, cicatrización quirúrgica, lesión de la médula espinal, cicatrización del SNC, lesión pulmonar aguda, fibrosis pulmonar (por ejemplo, fibrosis pulmonar idiopática o fibrosis quística), enfermedad pulmonar obstructiva crónica, síndrome de dificultad respiratoria del adulto, lesión pulmonar aguda, lesión pulmonar inducida por fármacos, glomerulonefritis, enfermedad renal crónica (por ejemplo, nefropatía diabética), nefropatía inducida por hipertensión, fibrosis del tracto alimentario o gastrointestinal, fibrosis renal, fibrosis hepática o biliar, fibrosis hepática (por ejemplo, esteatohepatitis no alcohólica, hepatitis C o carcinoma hepatocelular), cirrosis (por ejemplo, cirrosis biliar primaria o cirrosis debida a enfermedad del hígado graso (por ejemplo, esteatosis alcohólica y no alcohólica)), fibrosis inducida por radiación (por ejemplo, cabeza y cuello, gastrointestinal o pulmonar), colangitis esclerosante primaria, reestenosis, fibrosis cardíaca (por ejemplo, fibrosis endomiocárdica o fibrosis auricular), cicatrización oftálmica, fibroesclerosis, cánceres fibróticos, fibromas, fibroma, fibroadenomas, fibrosarcomas, arteriopatía de trasplante, queloide, fibrosis mediastínica, mielofibrosis, fibrosis retroperitoneal, fibrosis masiva progresiva, y fibrosis sistémica nefrogénica.
En algunas divulgaciones, la enfermedad o trastorno mediado por MK2 es un trastorno metabólico. Los trastornos metabólicos ejemplares incluyen obesidad, resistencia a los esteroides, intolerancia a la glucosa y síndrome metabólico.
En algunas divulgaciones, la enfermedad o trastorno mediado por MK2 es una neoplasia. Las neoplasias ejemplares incluyen cánceres. En algunas realizaciones, las neoplasias ejemplares incluyen trastornos de angiogénesis, mieloma múltiple, leucemias (por ejemplo, leucemia linfocítica aguda, leucemia mielógena aguda y crónica, leucemia linfocítica crónica, leucemia linfoblástica aguda o leucemia promielocítica), linfomas (por ejemplo, linfoma de células B), linfoma de células T, linfoma de células del manto, linfoma de células pilosas, linfoma de Burkitt, tumores de mastocitos, enfermedad de Hodgkin o enfermedad no de Hodgkin), síndrome mielodisplásico, fibrosarcoma, rabdomiosarcoma; astrocitoma, neuroblastoma, glioma y schwannomas; melanoma, seminoma, teratocarcinoma, osteosarcoma, xenoderma pigmentoso, queratoctantoma, cáncer folicular de tiroides, sarcoma de Kaposi, melanoma, teratoma, rabdomiosarcoma, trastornos metastásicos y óseos, así como cáncer de hueso, boca/faringe, esófago, laringe, estómago, intestino, colon, recto, pulmón (por ejemplo, cáncer de pulmón de células no pequeñas o cáncer de pulmón de células pequeñas), hígado, páncreas, nervios, cerebro (por ejemplo, glioma o glioblastoma multiforme), cabeza y cuello, garganta, ovario, útero, próstata, testículos, vejiga, riñón, mama, vesícula biliar, cuello uterino, tiroides, próstata y piel.
En algunas divulgaciones, el trastorno mediado por MK2 es un trastorno cardiovascular o cerebrovascular. Los trastornos cardiovasculares ejemplares incluyen aterosclerosis, reestenosis de una arteria coronaria aterosclerótica, síndrome coronario agudo, infarto de miocardio, vasculopatía por aloinjerto cardíaco y derrame cerebral. Las enfermedades cerebrovasculares ejemplares incluyen trastornos del sistema nervioso central con un componente inflamatorio o apoptótico, enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, enfermedad de Huntington, esclerosis lateral amiotrófica, lesión de la médula espinal, isquemia neuronal y neuropatía periférica. EJEMPLIFICACIÓN
Como se representa en los Ejemplos a continuación, en ciertas realizaciones ejemplares, los compuestos se preparan de acuerdo con los siguientes procedimientos generales. Se apreciará que, aunque los métodos generales representan la síntesis de ciertos compuestos de la presente invención, los siguientes métodos generales y otros métodos conocidos por un experto en la técnica, pueden aplicarse a todos los compuestos y subclases y especies de cada uno de estos compuestos, como se describe en la presente.
El alcance de la invención se define en las reivindicaciones adjuntas. Cualquiera de los siguientes ejemplos que no entre dentro del alcance de las reivindicaciones adjuntas se describe con propósitos de referencia.
Los compuestos enantioenriquecidos de la invención se prepararon en forma enantioenriquecida usando materiales de partida quirales, o se separaron después de la reacción con un material de partida racémico, usando cromatografía quiral. Para compuestos preparados como mezclas racémicas o diastereoméricas, los isómeros individuales pueden prepararse en forma ópticamente pura empleando materiales de partida quirales o realizando cromatografía quiral.
En los ejemplos ilustrativos que siguen, las reacciones se llevaron a cabo a temperatura ambiente, en el intervalo de 18-25° C a menos que se indique lo contrario. Las soluciones orgánicas se secaron sobre sulfato de magnesio anhidro o sulfato de sodio y se llevó a cabo la evaporación del solvente usando un evaporador rotatorio a presión reducida. En general, los cursos de las reacciones fueron seguidos por TLC o LCMS y los tiempos de reacción son representativos. Los rendimientos se dan solo con propósitos de ilustración y no son necesariamente los que pueden obtenerse mediante el desarrollo diligente del proceso.
Las reacciones de microondas se realizaron en un sistema de microondas de reacción Biotage Explorer. Los datos de 1H NMR están en valores delta para los principales protones de diagnóstico, expresados en partes por millón (ppm) con respecto al tetrametilsilano (TMS) o el solvente residual. Los espectros de 1H NMR se determinaron a 400 MHz. Las proporciones de solventes se dan en términos de volumen: volumen (v/v). Los datos de espectros de masas (MS) se generaron en un sistema LCMS en el que el componente de HPLC comprendía generalmente o un instrumento Agilent o Shimadzu LCMS-2020 y se realizaron en una columna Sepax BR-C18 (4,6 x 50 mm, 3 pm) o similar, eluyendo con eluyente ácido (por ejemplo, usando un gradiente entre el 0-95% de agua/acetonitrilo con 0,1% de ácido fórmico o ácido trifluoroacético). Los cromatogramas fueron en electropulverización (ESI) positiva, negativa y/o UV. Los valores de LCMS para m/z se proporcionan en todas partes y generalmente, solo se informan los iones que indican la masa original. A menos que se indique lo contrario, el valor indicado es (M+H) o (M+1) para el modo de iones positivos. La HPLC preparativa se realizó en sílice de fase inversa C18 usando mezclas cada vez menos polares como eluyente, por ejemplo, mezclas cada vez menos polares de agua y acetonitrilo que contenía un 1% de ácido trifluoroacético.
Los compuestos finales y los productos intermedios enantioenriquecidos se sintetizaron usando materiales quirales disponibles comercialmente y su estereoquímica como se registra es absoluta. A menos que se especifique lo contrario, los materiales de partida estaban disponibles comercialmente o se sintetizaron de acuerdo con métodos conocidos.
Tabla de abreviaturas
Figure imgf000044_0001
Los números de los compuestos utilizados en los Ejemplos a continuación corresponden a los números de los compuestos indicados en la Tabla 1, supra.
Síntesis de productos intermedios comunes
Esquema 1A
Figure imgf000045_0003
Figure imgf000045_0001
S1-Paso 1: Síntesis de 6-aminoquinolina-5-carbonitrilo (S1-2)
A una solución de 6-nitroquinolina (100 g, 0,57 mol) en dimetilformamida (1 l), se le añadieron hidróxido de potasio (96,4 g, 1,7 mol) y cianoacetato de etilo (183,3 ml, 1,7 mmol) y la reacción se agitó a temperatura ambiente. durante 48 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. Al residuo resultante, se le añadió HCl al 30% (1,0 l) y se agitó a 100° C durante 3 h. La mezcla de la reacción se enfrió a 0° C y se basificó con una solución de hidróxido de sodio 2N (800 g) y se formó un sólido. El sólido se filtró y se lavó con agua. Luego se disolvió en 20 volúmenes de acetato de etilo y se calentó a 60° C y se trató con carbón vegetal (20,0 g) durante 1 h. La mezcla de la reacción se filtró a través de celite y se concentró a presión reducida. El sólido amarillo obtenido se secó para proporcionar el compuesto del título S1-2 (55,0 g, 56%). 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 56.84 (br s, 2H), 7.26 (d, J=9.3 Hz, 1H), 7.51 (dd, J=4.2 Hz, 8.3 Hz, 1H), 7.90 (d, J=9.3 Hz, 1H), 8.03 (d, J=8.3 Hz, 1H), 8.60 (d, J=4.2 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 170.1.
Figure imgf000045_0002
S1-Paso 2: Síntesis de 6-bromoquinolina-5-carbonitrilo (S1-3)
A una solución de 6-aminoquinolin-5-carbonitrilo (S1-2) (55,0 g, 325 mmol) en acetonitrilo (1,3 l), se le añadió nitrito de terc-butilo (102 ml, 858,5 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción se agitó a 0° C durante 1 h. Luego se añadió bromuro de cobre (II) (115 g, 520 mmol) a 0° C y se agitó y luego se calentó a 60° C durante 12 h. Luego, la mezcla de la reacción se enfrió a temperatura ambiente y se añadió agua (2,5 l). Esta mezcla se extrajo con cloroformo al 2% en metanol (2,5 l). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida. El sólido que se había formado mientras se concentraba se filtró y se secó para proporcionar el compuesto del título S1-3 (45,0 g, 62%) como un sólido marrón. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 57.85 (dd, J=4.2 Hz, 8.5 Hz, 1H), 8.15 (d, J=9.1 Hz, 1H), 8.28 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.48 (d, J=8.5 Hz, 1H), 9.10 (d, J=3.6 Hz, 1H) MS m/z (M+H): 233.2.
Figure imgf000046_0001
S1-Paso 3: Síntesis de 1-aminotieno[3,2-f]quinolin-2-carboxilato de metilo (S1-4)
A una solución de 6-bromoquinolina-5-carbonitrilo (S1-3) (45,0 g, 193 mmol) en metanol (500 ml), se le añadió metóxido de sodio (20,8 g, 386 mmol) seguido de tioglicolato de metilo (30,7 g, 289,6 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 90° C durante 4 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El residuo obtenido se diluyó con agua y se agitó durante 15 min a temperatura ambiente, tras lo cual se formó un sólido. El sólido se filtró y se secó para proporcionar el compuesto del título S1-4 (40 g, 80%) como un sólido de color amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMsO-d6) 5 3.84 (s, 3H), 7.09 (br s, 2H), 7.68 (dd, J=4.2 Hz, 8.5 Hz, 1H), 8.03 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.15 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.93 (d, J=3.5 Hz, 1H), 9.12 (d, J=8.5 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 259.0
Figure imgf000046_0002
S1-Paso 4: Síntesis de 1-bromotieno[3,2-f]quinolin-2-carboxilato de metilo (S1-5)
A una solución de 1-aminotieno[3,2-f]quinolin-2-carboxilato de metilo (S1-4) (40 g, 154,8 mmol) en acetonitrilo (1000 ml), nitrito de terc-butilo (27,6 ml, 232 mmol) se añadió gota a gota a 0° C y se agitó durante 1 h a 0° C.A la mezcla resultante, se le añadió bromuro de cobre (II) (41,5 g, 185,8 mmol) en porciones a 0° C y se agitó a temperatura ambiente durante 3 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se diluyó con agua (3,0 l) y se extrajo con metanol al 2% en cloroformo (3,0 l). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida para proporcionar el compuesto del título S1-5 (20 g, 40%) como un sólido amarillo pálido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds) 53.93 (s, 3H), 7.77 (dd, J=4.2 Hz, 8.7 Hz, 1H), 8.14 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.40 (d, J=9.0 Hz, 1H), 9.02 (d, J=3.1 Hz, 1H), 10.10 (d, J=8.8 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 323.9.
Figure imgf000046_0003
S1-Paso 5: Síntesis de 1-[[(2R)-2-(terc-butoxicarbonilamino)propil]amino]tieno[3,2-f]quinolin-2-carboxilato de metilo (S1-6)
A una solución de 1-bromotieno [3,2-f] quinolin-2-carboxilato de metilo (S1-5) (14 g, 43,4 mmol) en tolueno (140 ml), se le añadieron carbonato de cesio (28,3 g, 86,9 mmol) y 1-aminopropan-2-ilcarbamato de (R)-terc-butilo (11,3 g, 65,0 mmol, preparado como se describe en el Esquema 2, a continuación) a temperatura ambiente y se desgasificaron durante 15 min. A la mezcla resultante, se le añadió BINAP (2,7 g, 4,3 mmol) y Pd2(dba)3 (3,9 g, 4,3 mmol) a temperatura ambiente y se desgasificó de nuevo durante 10 min. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 110° C durante 16 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se filtró a través de celite y se lavó con acetato de etilo y se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante cromatografía en columna para proporcionar el compuesto del título S1-6 (12 g, 66%) como un sólido blanquecino. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.01 (d, J=6.5 Hz, 3H), 1.34 (s, 9H), 3.12 (m, 2H), 3.63 (m, 1H), 3.88 (s, 3H), 6.55 (t, J=7.0 Hz, 1H), 6.71 (br s, 1H), 7.70 (dd, J=4.2 Hz, 8.3 Hz, 1H), 8.04 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.21 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.94 (d, J=3.9 Hz, 1H), 9.04 (d, J=8.3 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 416.1.
Figure imgf000047_0001
S1-Paso 6: Síntesis de 1-[[(2R)-2-aminopropil]amino]tieno[3,2-f]quinolin-2-carboxilato trifluoroacetato de metilo (S1-7)
A una solución de 1-[[(2R)-2-(terc-butoxicarbonilamino)propil]amino]tieno[3,2-f]quinolin-2-carboxilato de metilo (S1-6) (11 g, 26,0 mmol) en diclorometano (120 ml), se le añadió ácido trifluoroacético (24,0 g, 211,8 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 25° C durante 2 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida, se co-destiló con diclorometano (3 x 20 ml) para proporcionar el compuesto del título S1-7 (9,0 g, bruto) como un sólido amarillo pálido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 5 1.26 (d, J=6.2 Hz, 3H), 3.16-3.19 (m, 1H), 3.36-3.49 (m, 2H), 3.92 (s, 3H), 6.39 (br s, 1H), 7.76 (dd, J=4.2 Hz, 8.5 Hz, 1H), 7.86 (br s, 2H), 8.09 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.27 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.99 (d, J=4.2 Hz, 1H), 9.10 (d, J=8.5 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 316.1.
Figure imgf000047_0002
S1-Paso 7: Síntesis de (14R)-14-Metil-20-tia-16,17,18-triazatetraciclooctadeca-2(6),3(8),4,9(16),10,12-hexaen-15-ona (S1-8)
A una solución de sal de trifluoroacetato de 1-[[(2R)-2-aminopropil]amino]tieno[3,2-f]quinolin-2-carboxilato de metilo (S1-7) (9,0 g, 28,5 mmol) en metanol (640 ml), se le añadió metóxido de sodio (7,7 g, 142,7 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 90° C durante 12 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El residuo obtenido se diluyó con agua y se agitó durante 15 min, tiempo durante el cual se formó un sólido. El sólido se filtró y se secó al vacío para proporcionar el compuesto del título S1-8 (4,5 g, 55%) como un sólido verde. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.18 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.46 (d, J=2.4 Hz, 2H), 3.59-3.61 (m, 1H), 7.06 (br s, 1H), 7.64 (dd, J=4.2 Hz, 8.5 Hz, 1H), 7.94 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.00 (br s, 1H), 8.09 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.89 (d, J=4.0 Hz, 1H), 9.15 (d, J=8.5 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 284.1.
Figure imgf000047_0003
S1-Paso 8: Síntesis de (20R)-20-metil-21-oxo-34-tia-26,27,28-triazatetraciclooctadeca-8(12),9(14),10,15(26),16,18-hexano-27,28-dicarboxilato de di-terc-butilo (S1-9)
A una solución de (14R)-14-metil-20-tia-16,17,18-triazatetraciclooctadeca-2(6),3(8),4,9(16),10,12-hexaen-15-ona (S1-8) (4,5 g, 15,9 mmol) en diclorometano (100 ml), se le añadieron 4-dimetilaminopiridina (0,5 g, 4,0 mmol) y trietilamina (5,5 ml, 39,7 mmol) a temperatura ambiente. La reacción se agitó durante 10 min, luego se añadió dicarbonato de di-terc-butilo (15,5 ml, 67,5 mmol) a temperatura ambiente y se continuó agitando durante 4 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se diluyó con diclorometano y se lavó con agua. La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante cromatografía en columna para proporcionar el compuesto del título S1-9 (6,8 g, 88%) como un sólido blanco. MS m/z (M+H): 484.2.
Figure imgf000048_0001
S1-Paso 9: Síntesis de (20R)-20-metil-26-oxido-21-oxo-35-tia-27,28-diaza-26-azoniatetraciclooctadeca-8(12),9(14),10,15(26),16,18-hexano-27,28-dicarboxilato de di-terc-butilo (S1-10)
A una solución de (20R)-20-metil-21-oxo-34-tia-26,27,28-triazatetraciclooctadeca-8(12),9(14),10,15(26),16,18-hexano-27,28-dicarboxilato de di-terc-butilo (S1-9) (6,8 g, 14,0 mmol) en diclorometano (200 ml), se le añadió ácido m-cloroperoxibenzoico (3,6 g, 21,0 mmol) en porciones a 0° C. la mezcla de la reacción resultante se agitó a 30° C durante 3 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se diluyó con agua con hielo y se extrajo con diclorometano. La capa de diclorometano se lavó con una solución de bicarbonato de sodio, se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró a presión reducida. El residuo obtenido se trituró con éter dietílico para proporcionar el compuesto del título S1-10 (6,5 g, 92%) como un sólido amarillo pálido. MS m/z (M+H): 500.1.
Figure imgf000048_0002
S1-Paso 10: Síntesis de (20R)-16-cloro-20-metil-21-oxo-34-tia-26,27,28-triazatetraciclooctadeca-8(13),9,11(16),14(26),15(17),18-hexano-27,28-dicarboxilato de di-terc-butilo (S1-11)
A una solución de (20R)-20-metil-26-oxido-21-oxo-35-tia-27,28-diaza-26-azoniatetraciclooctadeca-8(12),9(14),10,15(26),16,18-hexano-27,28-dicarboxilato de di-terc-butilo (S1-10) (4,0 g, 8,0 mmol) en dimetilformamida (100 ml), se le añadió cloruro de oxalilo (1,03 ml, 12,0 mmol) gota a gota a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El residuo obtenido se diluyó con agua y se agitó durante 5 min, durante ese tiempo se formó un sólido. El sólido se aisló por filtración y se lavó con éter de petróleo para proporcionar el compuesto del título S1-11 (3,9 g, 93%) como un sólido blanquecino. MS m/z (M+H): 518.1.
Figure imgf000048_0003
S1-Paso 11: Síntesis de (R)-3-cloro-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (S1-12)
A una solución de (20R)-16-cloro-20-metil-21-oxo-34-tia-26,27,28-triazatetraciclooctadeca-8(13),9,11(16),14(26),15(17),18-hexano-27,28-dicarboxilato de di-terc-butilo (S1-11) (3,0 g, 5,8 mmol) en diclorometano (30,0 ml), se le añadió gota a gota ácido trifluoroacético (3,3 g, 28,9 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida y se co-destiló con diclorometano tres veces. El residuo obtenido se basificó con solución saturada de bicarbonato de sodio (pH ~8) y se formó un sólido. El sólido se filtró y se secó para proporcionar el compuesto del título S1-12 (1,8 g, 96%) como un sólido amarillo. H NMR (400 m Hz, DMSO-d6): 5 1.18 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.44 (m, 2H), 3.59 (m, 1H), 7.07 (br s, 1H), 7.72 (d, J=8.9 Hz, 1H), 7.89 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.10 (d, J=4.1 Hz, 1H), 8.20 (d, J=8.9 Hz, 1H), 9.21 (d, J=8.9 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 318.2.
Figure imgf000049_0001
Una solución del compuesto S1-4 (200 g, 775 mmol) en DMF (7,75 l) se enfrió a 0° C bajo nitrógeno. Se añadió NaH (37,2 g, 930 mmol, 60% en mineral) en porciones durante 0,5 h. La mezcla se agitó a 0° C durante otras 0,5 horas y se añadió el compuesto S2-6 (185,5 g, 783 mmol) en porciones durante 0,5 horas. Una vez completada la adición, el análisis de TLC mostró que el material de partida estaba casi consumido. Se añadió lentamente agua (4 l) y la mezcla se agitó durante 10 min. Luego se añadió HCl acuoso (4 l, 1 N) y la mezcla se agitó a temperatura ambiente durante 1 h. Se añadió Na2CÜ3 para ajustar el pH 8 y el sólido resultante se recogió por filtración, se lavó con agua y luego se disolvió en DCM (2,0 l). La fase orgánica se separó, se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró. El residuo se suspendió en acetato de etilo (2,0 l) durante 1 hora y luego se filtró. La torta de filtración se secó al vacío para proporcionar el compuesto S1-6 (196 g, rendimiento del 61%) como un sólido blanco. H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 51.01 (d, J=6.5 Hz, 3H), 1.34 (s, 9H), 3.12 (m, 2H), 3.63 (m, 1H), 3.88 (s, 3H), 6.55 (t, J=7.0 Hz, 1H), 6.71 (br, 1H), 7.70 (dd, J=4.2 Hz, 8.3 Hz, 1H), 8.04 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.21 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.94 (d, J=3.9 Hz, 1H), 9.04 (d, J=8.3 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 416.1.
Figure imgf000049_0002
Una solución del compuesto S1-6 (450 g, 1,08 mol) en DCM (5,4 l) se enfrió a 0° C. Se añadió gota a gota TFA (989 g, 8,67 mol) y la mezcla de la reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche. La mezcla se vertió en NaHCO3 acuoso (1,0 kg en 10,0 l de H2O) con agitación. Se separaron dos fases y la fase acuosa se extrajo con DCM. Las fases orgánicas se combinaron, se lavaron con agua, se secaron sobre sulfato de sodio anhidro y se concentraron para producir el compuesto S1-7 como base libre (330 g, rendimiento del 96%) como un aceite marrón. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 51.07 (d, J=6.4 Hz, 3H), 3.08 (m, 1H), 3.12 (m, 2H), 3.95 (s, 3H), 6.67 (t, J=6.0 Hz), 7.52 (m, 1H), 7.92 (d, 8.8 Hz, 1H), 8.06 (d, 8.8 Hz, 1H), 8.92 (m, 1H), 9.15 (d, J=8.4 Hz, 1H).
Figure imgf000050_0001
A una solución de base libre S1-7 (170 g, 0,54 mol) en metanol (9 l) se le añadió metóxido de sodio (29 g, 0,54 mol). La mezcla de la reacción se agitó a 70° C durante la noche y luego se concentró. Se añadió agua (7,0 l) y la mezcla resultante se agitó durante 20 min y se filtró. La torta del filtro se lavó con agua, se secó al vacío y luego se suspendió en DCM (3,0 l) durante 1 h. La mezcla se filtró y la torta del filtro se lavó con DCM y se secó al vacío para proporcionar el compuesto S1-8 (274 g, rendimiento del 90%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.18 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.46 (d, J=2.4 Hz, 2H), 3.59-3.61 (m, 1H), 7.06 (br s, 1H), 7.64 (dd, J=4.2 Hz, 8.5 Hz, 1H), 7.94 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.00 (br s, 1H), 8.09 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.89 (d, J=4.0 Hz, 1H), 9.15 (d, J=8.5 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 284.1.
Figure imgf000050_0002
S2-Paso 1: Síntesis de (R)-2-(terc-butoxicarbonilamino)propil metanosulfonato (S2-2)
A una solución agitada de 1-hidroxipropan-2-ilcarbamato de (R)-terc-butilo (S2-1) (10,0 g, 57 mmol) en diclorometano (100 ml), se le añadieron gota a gota trietilamina (8,65 g, 86 mmol) y cloruro de metanosulfonilo disueltos en diclorometano (5 ml, 63 mmol) a 0° C. La solución resultante se agitó durante 2 h, después de lo cual la mezcla de la reacción se repartió entre diclorometano (200 ml) y agua (100 ml). La fase orgánica se lavó con una solución de HCl 0,1 M (50 ml), una solución de bicarbonato de sodio (50 ml) y salmuera (50 ml). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida para obtener el compuesto del título S2-2 (12 g, 83%) como un sólido amarillo claro. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 5 1.06 (d, J=6.6 Hz, 3h), 1.37 (s, 9H), 3.15 (s, 3H), 3.73 (m, 1H), 4.03 (d, J=5.8 Hz, 2H), 6.92 (d, J=7.6 Hz, 1H).
m / ^ N H B oc
n 3 y
S2-3
S2-Paso 2: Síntesis de 1-azidopropan-2-ilcarbamato de (S)-terc-butilo (S2-3)
A una solución de (R)-2-(terc-butoxicarbonilamino)propil metanosulfonato (S2-2) (12 g, 47 mmol) en dimetilsulfóxido (75,0 ml), se añadió lentamente azida sódica (3,7 g, 57 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla resultante se calentó a 45° C durante 24 horas. Después, la mezcla de la reacción se repartió entre diclorometano (200 ml) y agua con hielo (100 ml). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida para obtener el compuesto del título S2-3 (6,0 g, 64%) como un aceite amarillo claro. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 51.02 (d, J=6.0 Hz, 3H), 1.37 (s, 9H), 3.20 (d, J=6.0 Hz, 2H), 3.64 (m, 1H), 6.84 (br s, 1H).
Figure imgf000051_0001
S2-Paso 3: Síntesis de 1-aminopropan-2-ilcarbamato de (R)-terc-butilo (S2-4)
A una solución agitada de 1-azidopropan-2-ilcarbamato de (S)-terc-butilo (S2-3) (6,0 g, 30 mmol) en acetato de etilo (50,0 ml), se le añadió Pd/C al 10% (2,3 g). La mezcla de la reacción se agitó en una atmósfera de hidrógeno (1 atm) durante 15 h a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se filtró a través de celite, el celite se lavó con acetato de etilo y el filtrado se concentró a presión reducida para obtener el compuesto del título S2-4 (4,8 g, 92%) como un sólido amarillo pálido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) ó 0.95 (d, J=6.6 Hz, 3H), 1.36 (s, 9H), 2.49 (m, 2H), 3.32 (m, 1H), 6.49 (br s, 1H).
Esquema 2B
Figure imgf000051_0004
Figure imgf000051_0002
Una solución de (R)-aminopropan-1-ol (100 g, 1,33 mol) en metanol (1,0 l) se enfrió a 0° C. Se añadieron TEA (278 ml, 2,0 mol) y Boc2O (320 g, 1,47 mol). La mezcla de la reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 1 h. La mezcla se concentró y el residuo se disolvió en DCM (1,0 l). La solución resultante se lavó con NH4Cl acuoso saturado. La fase acuosa se volvió a extraer con DCM (0,2 l). Las fases orgánicas se combinaron, se lavaron con NH4Cl acuoso saturado, se secaron sobre sulfato de sodio anhidro y se concentraron para proporcionar el compuesto S2-1 como un aceite viscoso (240 g), que se usó en el paso siguiente sin purificación adicional.
Se enfrió una solución de imidazol (562 g, 8,26 mol) en DCM (5,5 l) a 0° C. A esta solución se le añadió una solución de cloruro de tionilo (180 ml, 2,48 mol) en DCM (1,9 l) gota a gota durante 0,5 h. Se retiró el baño de enfriamiento y la mezcla se agitó a temperatura ambiente durante 1 h. La mezcla se enfrió a -10° C y se añadió gota a gota una solución del compuesto S2-1 (obtenido en el paso anterior) en DCM (2,6 l). Se retiró el baño de enfriamiento y la mezcla de la reacción se agitó a temperatura ambiente durante 10 min. Se añadió ácido cítrico acuoso (7,2 l, 10%) y la mezcla resultante se agitó durante 15 min. La fase orgánica se separó, se lavó con salmuera (10 l), se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró para proporcionar el compuesto S2-5 como una mezcla de diastereómeros, que se usó en el paso siguiente sin purificación adicional. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) ó 1.29 (d, J=6.4 Hz, 1.6H), 1.50 (d, J=6.0 Hz, 1.5H), 1.53 (s, 9H), 4.06 (m, 0.5H), 4.31 (m, 1H), 4.68 (t, J=9.6 Hz, 0.5H), 4.79 (t, J=9.2 Hz, 0.5H), 5.02 (m, 0.5H).
O Nal04
S RuCI3 (0.05% mol)
O ' "NBoc -------------------------------
\---- l(R>
Figure imgf000051_0003
S2-5
A una solución de compuesto S2-5 bruto (320 g) en acetonitrilo (5,0 l) se le añadió RuCh (150 mg, 0,725 mmol) seguido de una solución de NaIO4 (310 g, 1,45 mol) en agua (3,3 l). La mezcla de la reacción se agitó a temperatura ambiente durante 40 min y luego se diluyó mediante la adición de DCM (5,0 l) y agua (5,0 l). La fase orgánica se separó, se lavó con salmuera, se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró para proporcionar el compuesto S2-6 (218 g) como un sólido marrón. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) ó 1.51 (d, J=6.4 Hz, 3H), 1.56 (s, 9H), 4.20 (dd, J=9.2 Hz, 6.4 Hz, 1H), 4.42 (m, 1H), 4.67 (dd, J=8.8 Hz, 6.0 Hz, 1H).
Figure imgf000052_0001
Síntesis de (S)-3-cloro-10-(hidroximetil)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-1)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que (R)-3-cloro-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (S1-12), sustituyendo 4-(aminometil)-2,2-dimetiloxazolidin-3-carboxilato de (S)-terc-butilo por (1-aminopropan-2-il)carbamato de (R)-terc-butilo. Esto dio el compuesto del título INT-1. Ver Anderson, D.; Meyers, M. et al. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 19 (2009) 4878-4881.
Figure imgf000052_0002
Síntesis de 3-amino-10-metil-8-oxo-10,11-dihidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolina-12(9H)-carboxilatode (R)-terc-butilo (INT-2)
Una solución de 3-cloro-10-metil-8-oxo-10,11-dihidro-8H-[1,4]diazepino-[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolina-9,12-dicarboxilato de (R)-di-terc-butilo (S1-11) (400 mg, 0,7 mmol) en THF se trató con Pd2(dba)3 (76 mg, 0,07 mmol) y 2-(diciclohexilfosfino)bifenilo (65 mg, 0,18 mmol) en un tubo sellado. La solución resultante se desgasificó brevemente aplicando vacío y luego se lavó con nitrógeno tres veces. Luego se añadió hexametildisilazida de litio (1,0 M en THF) (1,9 ml, 1,9 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se agitó a 65° C durante 1 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se inactivó con agua fría (10,0 ml) y se extrajo con acetato de etilo (3 x 15 ml). Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre sulfato de sodio anhidro y se concentraron a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante cromatografía en gel de sílice para proporcionar el compuesto del título INT-2 (180 mg, 58%) como un sólido marrón. MS m/z (M+H): 399.1.
Figure imgf000052_0003
Síntesis de (R)-3-amino-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolina-8-ona (INT-3)
Se disolvió 3-amino-10-metil-8-oxo-10,11 -dihidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolina-12(9H)-carboxilato de (R)-terc-butilo (INT-2) (8,0 mg, 0,02 mmol) en diclorometano (1 ml) y se agitó a temperatura ambiente. A esta solución se le añadió ácido trifluoroacético (0,5 ml, 6,49 mmol). La reacción se agitó a temperatura ambiente durante una hora, después de lo cual se eliminaron los volátiles a presión reducida. El residuo resultante se volvió a disolver en diclorometano, se concentró sobre gel de sílice y se purificó mediante cromatografía en gel de sílice (8:1 MeOH/NH4OH en diclorometano (0-10%) para proporcionar el compuesto del título INT-3 (4,0 mg, 67% de rendimiento). MS: m/z 299.0 (M+H) 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 59.01 (d, 1H), 8.04 (d, 1H), 7.88 (d, 1H), 6.96 (d, 1H), 6.45 (m, 1H), 3.68 (m, 2H), 3.52 (m, 1H), 1.36 (d, 3H).
Figure imgf000053_0001
Síntesis de 3-bromo-10-metil-8-oxo-10,11-dihidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolina-9,12-dicarboxilato de (R)-di-terc-butilo (INT-4)
A una solución de (R)-9,12-bis(terc-butoxicarbonil)-10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolina4-óxido (S1-10) (2,5 g, 5,0 mmol) en dimetilformamida (70,0 ml), se añadió oxibromuro de fósforo (2,15 g, 7,5 mmol) en porciones a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 h. Una vez completada la reacción, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El residuo obtenido se diluyó con agua y se agitó durante 5 min y se formó un sólido. El sólido obtenido se filtró y se lavó con éter de petróleo para proporcionar el compuesto del título INT-4 (2,4 g, 78%) como un sólido blanquecino. MS m/z (M+H): 562.1.
Figure imgf000053_0002
Síntesis de (R)-3-bromo-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolina-8-ona (INT-5)
A una solución de 3-bromo-10-metil-8-oxo-10,11-dihidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolina-9,12-dicarboxilato de (R)-di-terc-butilo (INT-4) (1,4 g, 2,5 mmol) en diclorometano (90,0 ml), se le añadió ácido trifluoroacético (36,0 ml, 12,4 mmol) a 0° C La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 h. Una vez completada la reacción, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida y se co­ destiló con diclorometano tres veces. El sólido bruto obtenido se diluyó con solución saturada de bicarbonato de sodio a 0° C hasta pH ~8 y se agitó durante 10 min. En este tiempo se formó un sólido. El sólido se filtró y se secó para proporcionar el compuesto del título INT-5 (830 mg, 88%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 5 1.18 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.44 (s, 2H), 3.60 (br s, 1H), 7.05 (br s, 1H), 7.81 (d, J=8.9 Hz, 1H), 7.90 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.06 (d, J=3.16 Hz, 1H), 8.19 (d, J=8.9 Hz, 1H), 9.10 (d, J=8.9 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 362.0.
Figure imgf000053_0003
Síntesis de (R)-3-hidroxi-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino-[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-6)
En un vial de microondas de 10 ml se suspendió (R)-3-cloro-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona, sintetizada en el Esquema (S1-12) (0,1 g, 0,315 mmol) en 3 ml de ácido acético glacial con 1 ml de H2O. El vial se selló y se irradió a 130° C durante 3 h en un reactor de microondas Biotage Explorer. La reacción se enfrió, el precipitado formado se aisló por filtración, se lavó 3 veces con agua y se secó a vacío alto. El filtrado se concentró sobre gel de sílice y se cromatografió con MeOH/NH4OH 8:1 en diclorometano (0-10%). El precipitado y el producto aislado por cromatografía se combinaron para proporcionar el compuesto del título INT-6 (0,080 g, 0,267 mmol, 85% de rendimiento) como un polvo amarillo.
Figure imgf000054_0001
Síntesis a gran escala de (R)-3-h¡drox¡-10-metil-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no-[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-6)
Se suspendió (R)-3-cloro-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (S1-12, 40 g, 0,126 mol) en 300 ml de ácido acético glacial con 100 ml de H2O. La mezcla se agitó a 110° C durante 4 d y luego se enfrió y se concentró hasta la sequedad. Se añadió hidróxido de amonio (28-30% ac) (200 ml) al residuo y la mezcla resultante se agitó a temperatura ambiente durante 30 min y luego se filtró. La torta se lavó con agua y se secó al vacío. El producto bruto se suspendió en acetato de etilo (350 ml) durante 1 h y luego se filtró. La torta se secó al vacío para proporcionar INT-6 como un sólido amarillo (33 g, 87,6%). 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.16 (d, J=6.8 Hz, 3H), 3.40 (br, 2H), 3.56 (br, 1H), 6.61 (d, J=10.0 Hz, 1H), 6.88 (br, 1H), 7.44 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.94 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.12 (d, J=4.0 Hz, 1H), 8.81 (d, J=10 Hz, 1H) 11.99 (br, 1H). MS m/z (M+H): 300.1.
Figure imgf000054_0002
Síntesis de ((R)-3-mercapto-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-7)
A una solución de S1-12 (150 mg, 0,5 mmol), en dimetilformamida (2,0 ml), se le añadió hidrosulfuro de sodio (30% p/v, 52,9 mg, 0,9 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 100° C durante 5 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se inactivó con agua y se acidificó con HCl 1N (pH ~2), después de lo cual se formó un sólido. El sólido se filtró y se secó al vacío para proporcionar el compuesto del título INT-7 (100 mg, 55%) como un sólido de color amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 51.16 (d, J=6.6 Hz, 3H), 3.39 (br s, 2H), 3.56 (br s, 1H), 6.91 (br s, 1H), 7.36 (d, J=9.3 Hz, 1H), 7.72 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.04 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.07 (br s, 1H), 8.66 (d, J=9.4 Hz, 1H), 13.87 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 316.2.
Figure imgf000054_0003
Síntesis de 4-amino-2-(metiltio)pirimidina-5-carboxilato de etilo (INT-8)
En un vial de 15 ml, se disolvió 4-cloro-2-(metiltio)pirimidina-5-carboxilato de etilo (1,00 g, 4,30 mmol) en THF (10 ml) y se añadió trietilamina (2,00 ml, 14,35 mmol), seguido de amoniaco (2 ml, 4,30 mmol). La mezcla resultante se agitó durante la noche a temperatura ambiente. Una vez completada la reacción, los solventes se evaporaron y la mezcla bruta se purificó por cromatografía en gel de sílice usando hexano/acetato de etilo (0-40%) como eluyente para dar el compuesto del título INT-8 (0,72 g, 3,38 mmol, 79% de rendimiento) como un sólido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 58.55 (s, 1H), 8.02 (br s, 1H), 7.64 (br s, 1H), 4.24 (q, 2H), 2.44 (s, 3H), 1.27 (t, 3H).
Figure imgf000055_0001
Síntesis de 2-((4,6-difluoropirimidin-2-il)oxi)-N,N-dimetiletanamina (S3-2a) y 2-((2,6-difluoropirimidin-4-il)oxi)-N,N-dimetiletanamina (S3-2b)
En un matraz de fondo redondo de 20 ml se disolvió 2,4,6-trifluoropirimidina (S3-1) (0,370 ml, 4,48 mmol) en tetrahidrofurano (8 ml) para dar una solución incolora. Se añadió 2-(dimetilamino)etanol (0,450 ml, 4,48 mmol) a -78° C y la reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 1 h. Una vez completada, la reacción se concentró sobre gel de sílice y se cromatografió con MeOH/NH4OH 8:1 en diclorometano (0-10%). Las fracciones que contenían el producto se recogieron y concentraron para producir los compuestos del título (S3-2a) (0,500 g, 2,462 mmol, 55% de rendimiento) y (S3-2b) (0,045 g, 0,224 mmol, 5% de rendimiento) como una mezcla inseparable. Esta mezcla se usó tal cual en los pasos posteriores.
Figure imgf000055_0002
Síntesis de 2-(2-(dimetilamino)etoxi)-6-fluoropirimidin-4-amina (S3-3a)
Se añadió amoniaco 7N en MeOH (0,352 ml, 2,461 mmol) a una solución de 2-((4,6-difluoropirimidin-2-il)oxi)-N,N-dimetiletanamina (S3-2a) (0,5 g, 2,461 mmol)) y 2-((2,6-difluoropirimidin-4-il)oxi)-N,N-dimetiletanamina (S3-2b) (0,045 g, 0,221 mmol) en metanol (3 ml). Luego, la reacción se calentó a 70° C. Después de 30 min de calentamiento se formó un precipitado blanco. La reacción se enfrió, se diluyó con diclorometano y se lavó con bicarbonato de sodio saturado (ac.). La capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo 3 veces adicionales con diclorometano. Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre sulfato de sodio y se concentraron para proporcionar un sólido blanco que se recristalizó a partir de acetato de etilo y heptano para proporcionar el compuesto del título S3-3a (0,246 g, 1,230 mmol, rendimiento del 50%).
Figure imgf000056_0001
Síntesis de 6-fluoro-2-(oxetan-3-iloxi)pirimidin-4-amina (INT-9a) y 4-fluoro-6-(oxetan-3-iloxi)pirimidin-2-amina (INT-9b)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que 2-(2-(dimetilamino)etoxi)-6-fluoropirimidin-4-amina (S3-3a) sustituyendo oxetan-3-ol por 2-(dimetilamino)etanol. La mezcla de la reacción se calentó a 45° C y el producto se aisló mediante cromatografía en gel de sílice proporcionando el compuesto del título INT-9a (0,266 g, 1,437 mmol, rendimiento del 62%). También se aisló como subproducto una pequeña cantidad de 4-fluoro-6-(oxetan-3-iloxi)pirimidin-2-amina (INT-9b).
Figure imgf000056_0002
Síntesis de (rac)-6-fluoro-2-((1-metilpiperidin-3-il)oxi)pirimidin-4-amina (INT-10)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que 2-(2-(dimetilamino)etoxi)-6-fluoropirimidin-4-amina (S3-3a) sustituyendo 1 -metilpiperidin-3-ol por 2-(dimetilamino)etanol. La mezcla de la reacción se calentó a 45° C y el producto se aisló mediante cromatografía en gel de sílice, proporcionando el compuesto del título INT-10 (20 mg, rendimiento del 41%) como un aceite incoloro. MS m/z (M+H): 227.0.
Figure imgf000056_0003
S3-1 INT-11
Síntesis de 6-fluoro-2-(2-(4-metilpiperazin-1-il)etoxi)pirimidin-4-amina (INT-11)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que 2-(2-(dimetilamino)etoxi)-6-fluoropirimidin-4-amina (S3-3a) sustituyendo 2-(4-metilpiperazin-1-il)etanol por 2-(dimetilamino)etanol. La mezcla de la reacción se calentó a 45° C y el producto se aisló mediante cromatografía en gel de sílice, proporcionando el compuesto del título INT-11 (60 mg, 51,6%) como un sólido pegajoso incoloro. 1H NMR (400 m Hz, DMSO-d6): 52.34 (s, 3H), 2.34­ 2.36 (m, 1H), 2.50-2.54 (m, 6H), 2.55-2.65 (m, 3H), 4.25 (t, J=5.6 Hz, 2H), 5.63 (s, 1H), 7.19 (br s, 2H). MS m/z (M+H): 256.2.
Figure imgf000057_0001
S3-1 INT-12
Síntesis de (R)-6-fluoro-2-((1-metilpirrolidin-3-il)oxi)pirimidin-4-amina (INT-12)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que 2-(2-(dimetilamino)etoxi)-6-fluoropirimidin-4-amina (S3-3a) sustituyendo (R)-1-metilpirrolidin-3-ol por 2-(dimetilamino)etanol. La mezcla de la reacción se calentó a 45° C y el producto se aisló mediante cromatografía en gel de sílice, proporcionando el compuesto del título INT-12 (60 mg, 51,6%) (140 mg, 70%) como un sólido blanco. MS m/z (M+H): 2l3.1.
Figure imgf000057_0002
Síntesis de 4,6-difluoro-2-((3-metiloxetan-3-il)metoxi)pirimidina (INT-13) y 2,4-difluoro-6-((3-metiloxetan-3-il)metoxi)pirimidina (INT-14)
En un vial de 20 ml se disolvieron (3-metiloxetan-3-il)metanol (0,744 ml, 7,46 mmol), carbonato de cesio (2,430 g, 7,46 mmol) y 2,4,6-trifluoropirimidina (S3-1) (1 g, 7,46 mmol) en 10 ml de THF seco para dar una suspensión incolora. La reacción se agitó a temperatura ambiente durante 1 hora, se vertió en bicarbonato de sodio saturado (ac.) y se extrajo 3 veces con diclorometano. Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre sulfato de sodio, se decantaron, se concentraron sobre gel de sílice y se purificaron por cromatografía (acetato de etilo al 0-100% en heptano) para dar una mezcla inseparable 1,3:1 de isómeros INT-13 e INT-14, favoreciendo 4,6-difluoro-2-((3-metiloxetan-3-il)metoxi)pirimidina INT-13. La mezcla se usó tal cual para los pasos posteriores.
Figure imgf000057_0003
Síntesis de 6-fluoro-2-((3-metiloxetan-3-il)metoxi)pirimidin-4-amina (INT-15a) y 4-fluoro-6-((3-metiloxetan-3-il)metoxi)pirimidina-2-amina (INT-15b)
En un vial de 20 ml, la mezcla aislada anterior se calentó a 40° C durante la noche en 10 ml de NH37N en metanol. Una vez completada, la reacción se enfrió y se concentró sobre gel de sílice a presión reducida. Se aisló 6-fluoro-2-((3-metiloxetan-3-il)metoxi)pirimidin-4-amina (INT-15a) mediante cromatografía en gel de sílice (acetato de etilo al 0-100% en heptano) como la fracción más polar (0,557 g, 2,6 mmol, rendimiento del 35,0%). También se aisló como subproducto una pequeña cantidad de 4-fluoro-6-((3-metiloxetan-3-il)metoxi)pirimidin-2-amina (INT-15b).
Figure imgf000058_0001
Síntesis de 4,6-difluoro-2-(2-metoxietoxi)pirimidina (INT-16) y 2,4-difluoro-6-(2-metoxietoxi)pirimidina (INT-17) El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que 4,6-difluoro-2-((3-metiloxetan-3-il)metoxi)pirimidina (INT-13) sustituyendo 2-metoxietanol por (3-metiloxetan-3-il)metanol. Esto dio una mezcla inseparable (1:1) de los compuestos del título INT-17 e INT-16 como un líquido incoloro. 1H NMR (400 MHz, CDCh): 5 6.24 (s, 1H), 6.15 (s, 1H), 4.50 (m, 2H), 4.48 (m, 2H), 3.71 (m, 4H), 3.39 (s, 6H).
Figure imgf000058_0002
Síntesis de 4-fluoro-6-(2-metoxietoxi)pirimidin-2-amina (INT-18) y 6-fluoro-2-(2-metoxietoxi)pirimidin-4-amina (INT-19)
En un vial de 20 ml, se calentó luego una mezcla (1:1) de 2,4-difluoro-6-(2-metoxietoxi)pirimidina (INT-17) y 4,6-difluoro-2-(2-metoxietoxi)pirimidina (INT-16) a 65° C en 10 ml de NH3 al 30% en agua. Una vez completada, la reacción se enfrió, se extrajo tres veces con diclorometano y los extractos orgánicos combinados se secaron sobre sulfato de sodio. Luego, la fracción orgánica se concentró sobre gel de sílice y se purificó por cromatografía en gel de sílice (0-100% de acetato de etilo en heptano) para dar los compuestos del título INT-181H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 55.62 (1H), 5.09 (br s, 2H), 4.40 (m, 2H), 3.69 (m, 2H), 3.39 (s, 3H) y INT-191H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 55.67 (1H), 5.10 (br s, 2 H), 4.42 (m, 2H), 3.67 (m, 2H), 3.40 (s, 3H) como fracciones separadas.
Figure imgf000058_0003
Síntesis de (S)-2,4-difluoro-6-((tetrahidrofuran-3-il)oxi)pirimidina (INT-20) y (S)-4,6-difluoro-2-((tetrahidrofuran-3-il)oxi)pirimidina (iNt-21) (1,00: 0,77)
Los compuestos del título se sintetizaron de la misma manera que 4,6-difluoro-2-((3-metiloxetan-3-il)metoxi)irimidina (INT-13) sustituyendo (S)-tetrahidrofuran-3-ol por (3-metiloxetan-3-il)metanol. Se aisló una mezcla inseparable de (S)-2,4-difluoro-6-((tetrahidrofuran-3-il)oxi)pirimidina (INT-20) y (S)-4,6-difluoro-2-((tetrahidrofuran-3-il)oxi)pirimidina (INT-21) (1,00: 0,77) y se usó directamente en el paso siguiente. 1H NMR (400 MHz, CDCh): 56.19 (s, 1H), 6.17 (s, 1H), 5.60 (m, 1H), 5.47 (m, 1H), 3.98 (m, 4H), 3.91 (m, 4H), 2.27 (m, 2H), 2.24 (m, 2H).
Figure imgf000059_0001
Síntesis de (S)-4-fluoro-6-((tetrahidrofuran-3-il)oxi)pirimidin-2-amina (INT-22) y (S)-6-fluoro-2-((tetrahidrofuran-3-il)oxi)pirimidin-4-amina (INT-23) (1,00:0,77)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que 4-fluoro-6-(2-metox¡etox¡)p¡rim¡d¡n-2-am¡na (INT-18) y 6-fluoro-2-(2-metoxietoxi)pirimidin-4-amina (INT-19) para dar una mezcla de los compuestos del título INT-22 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 57.04 (br s, 2H), 5.66 (s, 1H), 5.44 (m, 1H), 3.84-3.72 (m, 4H), 2.20-2.15 (m, 1H), 1.97-1.95 (m, 1H) y INT-231H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 57.23 (br s, 2H), 5.63 (s, 1H), 5.31 (m, 1H), 3.83-3.71 (m, 4H), 2.17-2.12 (m, 1H), 1.95-1.92 (m, 1H) que se separaron por cromatografía en gel de sílice (0-100% acetato de etilo en heptano).
Figure imgf000059_0002
Síntesis de (R)-2,4-difluoro-6-((tetrahidrofuran-3-il)oxi)pirimidina (INT-24) y (R)-4,6-difluoro-2-((tetrahidrofuran-3-ilo)oxi)pirimidina (INT-25) (1.3:1)
Los compuestos del título se sintetizaron de la misma manera que 4,6-difluoro-2-((3-metiloxetan-3-il)metoxi)pirimidina (INT-13) sustituyendo (R)-tetrahidrofuran-3-ol por (3-metiloxetan-3-il)metanol. Se aisló una mezcla inseparable de (R)-2,4-difluoro-6-((tetrahidrofuran-3-il)oxi)pirimidina (INT-24) y (R)-4,6-difluoro-2-((tetrahidrofuran-3-il)oxi)pirimidina (INT-25) (1,3:1) y se usó directamente en el siguiente paso. 1H NMR (400 MHz, CDCla): 56.19 (s, 1H), 6.17 (s, 1H), 5.60 (m, 1H), 5.48 (m, 1H), 3.98 (m, 4H), 3.91 (m, 4H), 2.30 (m, 2H), 2.20 (m, 2H).
Figure imgf000059_0003
Síntesis de (R)-4-fluoro-6-((tetrahidrofuran-3-il)oxi)pirimidin-2-amina y (R)-6-fluoro-2-((tetrahidrofuran-3-il)oxi)pirimidin-4-amina (1.3: 1)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que 4-fluoro-6-(2-metoxietoxi)pirimidin-2-amina (INT-18) y 6-fluoro-2-(2-metoxietoxi)pirimidin-4-amina (INT-19), partiendo de una mezcla de (R)-2,4-difluoro-6-((tetrahidrofuran-3-il)oxi)pirimidina (INT-24) y (R)-4,6-difluoro-2-((tetrahidrofuran-3-il)oxi)pirimidina (INT-25) para dar una mezcla de los compuestos del título iNT-261H NMR (400 MHz, CDCl3): 55.64 (s, 1H), 5.43 (m, 1H), 5.13 (br s, 2H), 4.05-3.88 (m, 4H), 2.18-2.16 (m, 2H) y INT-271H NMR (400 MHz, CDCla): 55.61 (s, 1H), 5.49 (m, 1H), 5.10 (br s, 2H), 3.96-3.86 (m, 4H), 2.21 -2.11 (m, 2H) que se separaron por cromatografía en gel de sílice (acetato de etilo al 0-100% en heptano).
Figure imgf000060_0003
Figure imgf000060_0001
S4-Paso 1: Síntesis de N-terc-butil-6-cloro-2-yodo-pirimidin-4-amina (S4-2)
A una solución agitada de hidruro de sodio (122 mg, 5,1 mmol) y 2-metilpropan-2-amina (399 mg, 5,4 mmol) en tetrahidrofurano (15,0 ml), se le añadió 4,6-dicloro-2-yodo-pirimidina (S4-1) (1,0 g, 3,6 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 5 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se diluyó con acetato de etilo y se lavó con agua. La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante cromatografía en gel de sílice (mesh 100-200) usando 2-5% de acetato de etilo/éter de petróleo para proporcionar el compuesto del título S4-2 (480 mg, 42,3%) como un sólido amarillo pálido. MS m/z (M+H): 312.0.
Figure imgf000060_0002
S4-Paso 2: Síntesis de (rac)-N-terc-butil-6-cloro-2-[(1-metil-3-piperidil)oxi]pirimidin-4-amina (S4-3)
A una solución de hidruro de sodio (18 mg, 0,7 mmol) en tetrahidrofurano (10,0 ml) se le añadieron (rac)-1-metilpiperidin-3-ol (85 mg, 0,7 mmol) y N-terc-butil-6-cloro-2-yodo-pirimidin-4-amina (S4-2) (200 mg, 0,6 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 24 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El material bruto se purificó mediante cromatografía en columna de gel de sílice usando metanol al 5% en diclorometano para proporcionar el compuesto del título S4-3 (100 mg, 52%) como un líquido gomoso. EM: m/z 299.1 (M+H).
Figure imgf000061_0001
S4-Paso 3: Síntesis de (rac)-6-cloro-2-[(1-metil-3-piperidil)oxi]pirimidin-4-amina (S4-4)
A una solución agitada de (rac)-N-terc-butil-6-cloro-2-[(1-metil-3-piperidil)oxi]pirimidin-4-amina (S4-3) (25 mg, 0,1 mmol) en diclorometano (6,0 ml), se le añadió ácido sulfúrico (4,1 mg, 0,04 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 60° C durante 1 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se basificó con una solución acuosa de amoniaco y se extrajo con diclorometano. La capa orgánica se lavó con agua, solución de salmuera, se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida para proporcionar el compuesto del título S4-4 (10 mg, 49%) como un sólido blanquecino. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 51.33-1.34 (m, 2H), 1.42­ 1.51 (m, 1 H), 1.67-1.71 (m, 1H), 1.87-1.89 (m, 1H), 1.99-2.02 (m, 2H), 2.15 (s, 3H), 2.75-2.81 (m, 1H), 4.81-4.87 (m, 1H), 6.08 (s, 1H), 7.12 (br s, 2H). MS: m/z 243.1 (M+H).
Figure imgf000061_0002
S4-1 INT-28
Síntesis de (R)-6-cloro-2-((1-metilpirrolidin-3-il)oxi)pirimidin-4-amina (INT-28)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que (rac)-6-cloro-2-[(1-metil-3-piperidil)oxi]pirimidin-4-amina (S4-4) sustituyendo (R)-1 -metilpirrolidina -3-ol por (rac)-1-metilpiperidin-3-ol en el Paso 2 de la síntesis de S4-4 para dar el compuesto del título INT-28 (90 mg, 58%) como un sólido blanquecino. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 5 1.76-1.80 (m, 1H), 2.20-2.27 (m, 1H), 2.31 (s, 3H), 2.43-2.45 (m, 1H), 2.62-2.65 (m, 1H), 2.71-2.75 (m, 1H), 2.83-2.88 (m, 1H), 5.19-5.22 (m, 1H), 6.10 (s, 1H), 7.13 (br s, 2H). MS m/z (M+H): 229.1.
Figure imgf000061_0003
S5-Paso 1: Síntesis de 2,6-dicloro-N-(4-metoxibencil)pirimidin-4-amina (S5-2)
A una solución de 2,4,6-tricloropirimidina (2,0 g, 0,01 mol mmol) en t-butanol (5,0 ml), se le añadieron trietilamina (2,2 g, 0,02 mol) y p-metoxibencil amina (1,6 g, 0,012 mol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 75° C durante 4 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se diluyó con diclorometano y se lavó con agua y salmuera. La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida. El sólido obtenido se purificó mediante cromatografía en columna con acetato de etilo al 1-10% en éter de petróleo para proporcionar el compuesto del título S5-2 (650 mg, 17%) como un sólido blanquecino. 1H NMR: (400 MHz, DMSO-d6): 5 3.72 (s, 3H), 4.42 (d, J=4.8 Hz, 2H), 6.54 (s, 1H), 6.89 (d, J=8.8 Hz, 2H), 7.23 (d J=8.8 Hz, 2H), 8.51 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 284.3.
Figure imgf000062_0001
S5-Paso 2: Síntesis de 6-cloro-N-(4-metoxibencil)-2-(2-metoxietoxi)pirimidin-4-amina (S5-3)
A una solución de 2,6-dicloro-N-(4-metoxibencil)pirimidin-4-amina (S5-2) (750 mg, 2,6 mmol) en tetrahidrofurano (15,0 ml), se añadió hidruro de sodio (76,02 mg, 3,2 mmol) a 0° C y se agitó durante 10 min. A la mezcla resultante, se añadió 2-etoxietanol (241,01 mg, 3,2 mmol) a 0° C. La reacción se dejó calentar a 25° C y se agitó durante 12 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se diluyó con agua con hielo (30,0 ml) y se extrajo con acetato de etilo (2 x 50 ml). La capa orgánica se lavó con una solución de salmuera (50,0 ml), se secó sobre sulfato de sodio anhidro, se filtró y se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante cromatografía en columna con 20% de acetato de etilo en hexano para proporcionar el compuesto del título S5-3 (550 mg, 64%) como un sólido blanco. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 53.26 (s, 3H), 3.57 (t, J=4.7 Hz, 2H), 3.72 (s, 3H), 4.29 (t, J=4.6 Hz, 2H), 4.42 (br s, 2H), 6.20 (s, 1H), 6.89 (d, J=8.5 Hz, 2H), 7.23 (d, J=8.5 Hz, 2H), 8.09 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 324.1.
Figure imgf000062_0002
S5-Paso 3: Síntesis de 6-cloro-2-(2-metoxietoxi)pirimidin-4-amina (S5-4)
Se enfrió a 0° una solución de 6-cloro-N-(4-metoxibencil)-2-(2-metoxietoxi) pirimidin-4-amina (S5-3) (350 mg, 1,1 mmol) en diclorometano (10,0 ml). C y se añadió ácido sulfúrico (212,05 mg, 2,1 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 30 min. Una vez completada, la mezcla de la reacción se inactivó con una solución de amoniaco y se extrajo con diclorometano (2 x 100 ml). La capa orgánica se lavó con 2 x 50 ml de agua, seguido de 20 ml de solución de salmuera saturada. La capa orgánica se secó sobre sulfato de magnesio anhidro, se filtró y se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante TLC preparativa para proporcionar el compuesto del título S5-4 (200 mg, 89%) como un sólido blanco. MS m/z (M+H): 204.1.
Figure imgf000062_0003
Síntesis de 6-cloro-2-(2-(4-metilpiperazin-1-il)etoxi)pirimidin-4-amina (INT-29)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que 6-cloro-2-(2-metox¡etox¡)p¡rim¡d¡n-4-am¡na (S5-4) sustituyendo 2-(4-metilpiperazin-1-il)etanol por 2-metoxietanol en S5-Paso 2 para dar 6-cloro-2-(2-(4-metilpiperazin-1-il)etoxi)pirimidin-4-amina INT-29 (120 mg, 57%) como un sólido blanco. MS m/z (M+H): 272.3.
Figure imgf000063_0003
Figure imgf000063_0001
S6-paso 1: Síntesis de 4,6-dicloro-2-yodo-pirimidina (S6-2)
A una solución de 4,6-dicloropirimidin-2-amina (S6-1) (5,0 g, 30,5 mmol) en tetrahidrofurano (40,0 ml), se le añadieron yoduro de cobre (I) (5,8 g, 30,5 mmol), yodometano (41,6 g, 155,5 mmol) y nitrito de isoamilo (10,7 g, 91,4 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 80° C durante 3 h. Una vez completada, se filtró a través de un lecho de celite y el filtrado se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se disolvió en acetato de etilo (60 ml) y se lavó con agua (2 x 30 ml) seguido de solución de salmuera (30 ml). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro, se filtró y se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante cromatografía en columna de gel de sílice con acetato de etilo al 10% en hexano para proporcionar el compuesto del título S6-2 (4,2 g, 50%) como un sólido amarillo pálido. 1H NMR (400 MHz, CDCh): 57.38 (s, 1H).
Figure imgf000063_0002
S6-Paso 2: Síntesis de 6-cloro-2-yodo-N-(4-metoxibencil)pirimidin-4-amina (S6-3)
A una solución de 4,6-dicloro-2-yodo-pirimidina (S6-2) (2,0 g, 7,3 mmol) en t-butanol (20,0 ml), trietilamina (1,47 g, 14,5 mmol) y p-metoxibencil amina (1,0 g, 7,3 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 70° C durante 2 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El residuo obtenido se disolvió en acetato de etilo (20,0 ml) y la capa orgánica se lavó con agua (2 x 10 ml) seguido de solución de salmuera saturada (1 x 10 ml). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró a presión reducida. El material bruto se purificó mediante cromatografía en columna ultrarrápida con acetato de etilo al 10% en hexano para proporcionar el compuesto del título S6-3 (1,8 g, 65%) como un sólido blanquecino. MS m/z (M+H): 376.1.
Figure imgf000064_0001
S6-Paso 3: Síntesis de 4-cloro-6-((4-metoxibencil)amino)pirimidina-2-carboxilato de metilo (S6-4)
A una solución de 6-cloro-2-yodo-N-(4-metoxibencil)pirimidin-4-amina (S6-3) (1,0 g, 2,6 mmol) en metanol (8,0 ml), se le añadieron trietilamina (1,1 ml, 8,0 mmol)) y complejo de dicloro[1,1'-bis(difenilfosfino)ferroceno]paladio (II) diclorometano (108,6 mg, 0,1 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 80° C en atmósfera de CO(g) durante 5 h. Una vez completada, la reacción se filtró a través de celite y el filtrado se concentró a presión reducida. El residuo obtenido se disolvió en acetato de etilo (20,0 ml) y la capa orgánica se lavó con agua (2 x 10 ml) seguido de una solución de salmuera (1 x 10 ml). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio y se concentró a presión reducida. El material bruto se purificó mediante cromatografía en columna ultrarrápida eluyendo en acetato de etilo al 5% en hexano para proporcionar el compuesto del título S6-4 (800 mg, 97%) como un líquido marrón. MS m/z (M+H): 308.2.
Figure imgf000064_0002
S6-Paso 4: Síntesis de 4-amino-6-cloropirimidina-2-carboxilato de metilo (S6-5)
Se enfrió 4-cloro-6-((4-metoxibencil)amino)pirimidina-2-carboxilato de metilo (S6-4) (400 mg, 1,3 mmol) a 0° C y se añadieron ácido trifluoroacético (0,2 ml, 6,5 mmol) y ácido trifluorometanosulfónico (0,2 ml, 6,5 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 30 min. Una vez completada, la reacción se concentró a presión reducida. El residuo obtenido se diluyó con solución saturada de bicarbonato de sodio y se extrajo con diclorometano (20,0 ml). La capa orgánica se lavó con 2 x 10 ml de agua seguido de 10 ml de solución de salmuera saturada. Luego, la capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró a presión reducida. El material bruto se purificó mediante cromatografía en columna ultrarrápida con metanol al 1% en cloroformo para proporcionar el compuesto del título S6-5 (110 mg, 45%) como un sólido marrón. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 63.81 (s, 3H), 6.51 (s, 1H), 7.57 (br s, 2H).
E squem a 7
Figure imgf000064_0003
Figure imgf000065_0001
S7-Paso 1: Síntesis de N4-terc-butil-6-fluoro-pirimidina-2,4-diamina (S7-2)
En un tubo sellable, se añadieron una solución de 4,6-difluoropirimidin-2-amina (1,0 g, 7,6 mmol) en 1,4-dioxano/dimetilformamida (20,0 ml, 1:1), carbonato de potasio (1,6 g, 11,9 mmol) y terc-butilamina (1,7 g, 23,0 mmol). La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 48 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El material bruto se diluyó con agua fría (10,0 ml) después de lo cual se formó un sólido. El sólido se filtró y se secó al aire para proporcionar el compuesto del título S7-2 (1,2 g, 85%) como un sólido blanquecino. MS m/z (M+H): 185.1.
Figure imgf000065_0002
S7-Paso 2: Síntesis de N-terc-butil-6-fluoro-2-yodo-pirimidin-4-amina (S7-3)
A una solución de N4 -terc-butil-6-fluoro-pirimidina-2,4-diamina (S7-2) (2,1 g, 11,4 mmol) en tetrahidrofurano (10,0 ml), se le añadieron yoduro de cobre (I) (3,0 g 15,7 mmol), diyodometano (3,16 ml, 39,2 mmol) y nitrito de isoamilo (5,0 ml, 34,2 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 70° C durante 2 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se filtró a través de celite y luego se concentró a presión reducida. El material bruto se purificó mediante cromatografía en columna de gel de sílice para proporcionar el compuesto del título S7-3 (1,5 g, 45%) como un líquido aceitoso marrón. MS m/z (M+H): 296.0.
Figure imgf000065_0003
S7-Paso 3: Síntesis de 4-(terc-butilamino)-6-fluoropirimidina-2-carboxilato de metilo (S7-4)
A una solución de N-terc-butil-6-fluoro-2-yodo-pirimidin-4-amina (S7-3) (1,5 g, 5,1 mmol) en metanol (20,0 ml), se le añadieron PdCl2(dppf) (0,33 g, 0,4 mmol) y trietilamina (0,8 g, 7,6 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 20 psi CO durante 4 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se filtró a través de celite y se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante cromatografía en columna de gel de sílice para proporcionar el compuesto del título S7-4 (800 mg, 69%) como un líquido marrón. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.39 (s, 9H), 3.83 (s, 3H), 6.20 (s, 1H), 7.72 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 228.1.
Figure imgf000066_0001
S7-Paso 4: Síntesis de (4-(terc-butilamino)-6-fluoropirimidin-2-il)metanol (S7-5)
A una solución de 4-(terc-butilamino)-6-fluoropirimidin-2-carboxilato de metilo (S7-4) (800 mg, 3,5 mmol) en metanol (20,0 ml), se le añadió borohidruro de sodio (1,3 g, 35,2 mmol) a temperatura ambiente y la reacción se agitó durante 3 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El material bruto se disolvió en agua (10,0 ml) y se extrajo con acetato de etilo (2 x 10,0 ml). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida para proporcionar el compuesto del título S7-5 (600 mg, 86%) como un líquido blanquecino. MS m/z (M+H): 200.1.
Figure imgf000066_0002
S7-Paso 5: Síntesis de N-(terc-butil)-6-fluoro-2-(yodometil)pirimidin-4-amina (S7-6)
A una solución de (4-(terc-butilamino)-6-fluoropirimidin-2-il)metanol (S7-5) (600 mg, 3,0 mmol) en diclorometano (20,0 ml), se le añadieron imidazol (512 mg, 7,5 mmol) y trifenilfosfina (1,6 g, 6,0 mmol) seguido de la adición en porciones de yodo (382 mg, 1,5 mmol) a 25° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 1 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se inactivó con una solución saturada de tiosulfito de sodio (3,0 ml) y se extrajo con diclorometano (2 x 10 ml). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro, se filtró y se concentró a presión reducida. El material bruto se purificó mediante cromatografía en gel de sílice para proporcionar el compuesto del título S7-6 (400 mg, 43%) como un sólido viscoso.
1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 51.39 (s, 9H), 4.22 (s, 2H), 5.89 (s, 1H), 7.45 (br s, 1H).
Figure imgf000066_0003
S7-Paso 6: Síntesis de N-(terc-butil)-6-fluoro-2-(piperidin-1-ilmetil)pirimidin-4-amina (S7-7)
A una solución de piperidina (82,6 mg, 0,97 mmol) en acetonitrilo (5,0 ml), se le añadió carbonato de potasio (220 mg, 1,6 mmol) seguido de la adición de N-(terc-butil)-6-fluoro-2-(yodometil)pirimidin-4-amina (S7-6) (250 mg, 0,8 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 30 min. Una vez completada, la mezcla de la reacción se diluyó con agua (10,0 ml) y se extrajo con acetato de etilo (2 x 10 ml). La capa orgánica se separó, se secó sobre sulfato de sodio anhidro, se filtró y se concentró a presión reducida. El material bruto se purificó mediante TLC preparativa para proporcionar el compuesto del título S7-7 (170 mg, 79%) como un líquido verde pálido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.33-1.36 (m, 2H), 1.38 (s, 9H), 1.44-1.50 (m, 4H), 2.44-2.46 (m, 4H), 3.37 (s, 2H), 5.90 (s, 1H), 7.26 (br s, 1H).
Figure imgf000067_0001
S7-Paso 7: 6-fluoro-2-(p¡per¡d¡n-1-¡lmet¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-am¡na (S7-8)
A una solución de N-(terc-butil)-6-fluoro-2-(yodometil)pirimidin-4-amina (S7-7) (170 mg, 0,6 mmol) en diclorometano (15,0 ml), se le añadió H2SO4 concentrado (0,3 ml) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 h. Una vez completada, se decantó el diclorometano y al sólido gomoso resultante se le añadieron unas pocas gotas de solución de NH3 seguido de destilación azeotrópica usando tolueno (2 x 5 ml) para producir el producto bruto. El sólido se trituró con metanol al 10% en cloroformo (4 x 5 ml). La capa orgánica se separó, se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida para proporcionar el compuesto del título S7-8 (120 mg, 95%) como un sólido blanquecino. MS m/z (M+H): 211.1.
Esquema 8
Figure imgf000067_0003
Figure imgf000067_0002
S8-2
S8-Paso 1: Síntes¡s de metanosulfonato de (S)-(3-cloro-8-oxo-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1.4] d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-10-¡l)met¡lo (S8-2)
A una solución agitada de S)-3-cloro-10-(hidroximetil)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-1) (50 mg, 0,1 mmol) en diclorometano (5,0 ml) se le añadió trietilamina (0,86 ml, 0,4 mmol) seguido de cloruro de metanosulfonilo (0,24 ml, 0,2 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 10 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El material bruto resultante se diluyó con agua con hielo y se formó un sólido. El sólido se filtró y se secó para proporcionar el compuesto S8-2 (50 mg, 81%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 53.18 (s, 3H), 3.42-3.43 (m, 1H), 3.85-3.90 (m, 2H), 4.09-4.13 (m, 1H), 4.28-4.32 (m, 1H), 7.13 (br s, 1H), 7.72 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.90 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.21 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.34 (d, J=5.2 Hz, 1H), 9.16 (d, J=8.8 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 412.2.
Figure imgf000068_0001
S8-Paso 2: Síntesis de (S)-10-(azidometil)-3-cloro-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (S8-3)
A una solución agitada de metanosulfonato de (S)-(3-cloro-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-10-il)metilo (S8-2) (50,0 mg, 0,1 mmol) en dimetilformamida (2,0 ml), se le añadió azida sódica (15,78 mg, 0,2 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción se agitó a 50° C durante 10 h. Una vez completada la reacción, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El bruto se diluyó con agua con hielo, después de lo cual se formaron sólidos. Los sólidos obtenidos se filtraron y se secaron para proporcionar el compuesto S8-3 (30 mg, 69%) como un sólido amarillo pálido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 53.37-3.51 (m, 2H), 3.63-3.66 (m, 1H), 3.74-3.79 (m, 1H), 7.15 (br s, 1H), 7.72 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.90 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.20 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.33 (d, J=5.2 Hz, 1H), 9.17 (d, J=8.8 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 359.1.
Figure imgf000068_0002
S8-Paso 3: Síntesis de (S)-10-(azidometil)-3-((6-fluoropirimidin-4-il)amino)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (S8-4)
Se desgasificó brevemente una solución de (S)-10-(azidometil)-3-cloro-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (S8-3) (200 mg, 0,5 mmol) en 1,4-dioxano (6,0 ml) aplicando vacío y luego se enjuagó abundantemente con nitrógeno. A esta 6-fluoropirimidin-4-amina (75,4 mg, 0,7 mmol), se le añadieron secuencialmente Pd2(dba)3 (50,9 mg, 0,06 mmol), Xantphos (32,1 mg, 0,06 mmol) y carbonato de cesio (541,9 mg, 1,6 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla se desgasificó de nuevo y se agitó a 90° C durante 10 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El material bruto se lavó con agua, seguido de metanol al 5% en diclorometano para proporcionar el compuesto S8-4 (80 mg, 32%) como un sólido amarillo pálido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 53.42-3.55 (m, 2H), 3.63-3.66 (m, 1H), 3.76-3.80 (m, 1H), 7.07 (br s, 1H), 7.69 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.90 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.06 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.17 (br s, 1H), 8.26 (d, J=5.2 Hz, 1H), 8.58 (br s, 1H), 9.07 (d, J=8.8 Hz, 1H), 10.92 (br s, 1H).
Figure imgf000068_0003
S8-Paso 4: Síntesis de ((3-((6-fluoropirimidin-4-il)amino)-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-10-il)metil)carbamato de (S)-terc-butilo (S8-5)
A una solución agitada de (S)-10-(azidometil)-3-((6-fluoropirimidin-4-il)amino)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (S8-4) (150 mg, 0,3 mmol) en tetrahidrofurano/agua (2:1) (6,0 ml) se le añadió trifenilfosfina (270 mg, 1,0 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 85° C durante 16 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El material bruto se lavó con éter dietílico seguido de metanol al 5% en diclorometano para proporcionar (R)-10-(aminometil)-3-((6-fluoropirimidin-4-il)amino)-9,10,11,12bruto.-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (100 mg) como un sólido amarillo pálido. El material bruto aislado se disolvió en dimetilformamida (5,0 ml) y se añadieron trietilamina (86 mg, 0,7 mmol) y dicarbonato de di-terc-butilo (106 mg, 0,4 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 10 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El material bruto se purificó mediante HPLC preparativa para proporcionar el compuesto S8-5 (20 mg, 11% después de 2 pasos) como un sólido amarillo. MS m/z (M+H): 510.1.
Figure imgf000069_0001
Síntesis de 6-fluoro-2-((4-metilpiperazin-1-il)metil)pirimidin-4-amina (INT-30)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que 6-fluoro-2-(piperidin-1-ilmetil)pirimidin-4-amina (S7-8) sustituyendo piperidina por 1-metilpiperazina en S7-Paso 6 para dar el compuesto del título INT-30 (120 mg, 88%) como un sólido blanquecino. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) (D2O Exchange): 52.29 (s, 3H), 2.52-2.65 (m, 8H), 3.36 (s, 2H), 5.90 (s, 1H), 7.12 (br s, 2H). MS m/z (M+H): 226.2.
Figure imgf000069_0002
Síntesis de 4-cloro-6-(4-metilpiperazin-1-il)-1,3,5-triazin-2-amina (INT-31)
En un matraz de fondo redondo de 10 ml se disolvieron 4,6-dicloro-1,3,5-triazin-2-amina (0,047 g, 0,285 mmol) y 1-metilpiperazina (0,032 ml, 0,285 mmol) en tetrahidrofurano (5 ml) para dar una solución incolora. La reacción se calentó a 65° C y después de una hora la reacción se volvió turbia. La reacción se enfrió y se concentró sobre gel de sílice y se cromatografió con MeOH/NH4OH 8:1 en diclorometano (0-10%) para proporcionar el compuesto del título INT-31 (0,057 g, 0,251 mmol, 88% de rendimiento).
Figure imgf000069_0003
Síntesis de N1-(6-fluoropirimidin-4-il)-N2,N2-dimetiletano-1,2-diamina (INT-32)
En un matraz de fondo redondo de 10 ml, se añadieron 4,6-difluoropirimidina (0,305 g, 2,63 mmol) y K2CO3 (0,363 g, 2,63 mmol) a 1,4-dioxano (5 ml) para dar una suspensión incolora. A esto se añadió N1,N1-dimetiletano-1,2-diamina (0,287 ml, 2,63 mmol) y la reacción se agitó a temperatura ambiente. Después de una hora, la reacción se concentró sobre sílice y gel y se cromatografió con MeOH/NH4OH 8:1 en diclorometano (0-10%) para proporcionar el compuesto del título INT-32 (0,290 g, 1,577 mmol, rendimiento del 60%).
Figure imgf000070_0001
Síntesis de 6-fluoro-N-(2-metoxietil)pirimidin-4-amina (INT-33)
En un m a tra z de fo n d o red on do de 10 ml, se d iso lv ie ro n 4 ,6 -d iflu o ro p ir im id in a (0 ,35 ml, 4 ,13 m m ol) y base de H ün ig (0 ,722 ml, 4 ,13 m m ol) en te tra h id ro fu ra n o (5 m l) p a ra d a r un a so lu c ió n in co lo ra . La re a cc ión se e n frió a 0° C y se añ ad ió 2 -m e to x ie ta n a m in a (0 ,322 ml, 4 ,13 m m ol). S e d e jó c a le n ta r la rea cc ión a te m p e ra tu ra a m b ie n te y se ag itó d u ra n te 3 ho ras. U n a ve z c o m p le ta d a , la rea cc ión se c o n c e n tró so b re ge l de s ílic e p u rifica d o p o r c ro m a to g ra fía (a ce ta to de e tilo al 0 -100 % en h e p tan o) p a ra d a r el c o m p u e s to de l t ítu lo INT-33 (0 ,318 g, 1 ,859 m m ol, 45 % de re n d im ie n to ).
Figure imgf000070_0002
Síntesis de 2,4-dicloro-6-(pirrolidin-1-il)-1,3,5-triazina (INT-34)
A 2 ,4 ,6 -tr ic lo ro -1 ,3 ,5 -tr ia z in a (662 m g, 3 ,59 m m ol) en 4 m l de T H F a 0° C se le a ñ a d ió ba se de H ün ig (732 pl, 4 ,19 m m ol) se g u id a de p irro lid in a (100 pl, 1 ,197 m m ol) en 2 ml de T H F g o ta a go ta . La rea cc ión se ag itó a 0° C. La LC M S d e sp u é s de 1 h m o stró la m a sa d e s e a d a co m o el p ico p rin c ip a l y u n a p e q u e ñ a c a n tid a d de a d uc to de dip irro lid in a . La m e zc la b ru ta se filtró , se c o n c e n tró y se pu rificó m e d ia n te c ro m a to g ra fía en ge l de s ílic e (0 -25% de a ce ta to de e tilo /h e p ta n o s ) p a ra d a r el c o m p u e s to de l t ítu lo INT-34 (223 m g, 1 ,018 m m ol, re n d im ie n to de l 85 % ) co m o un só lido b lanco . M s m /z: 219.1 [M H ].
Figure imgf000070_0003
Síntesis de 4-(4,6-dicloro-1,3,5-triazin-2-il)morfolina (INT-35)
El c o m p u e s to de l t ítu lo se s in te tizó de la m ism a m a n e ra q u e 2 ,4 -d ic lo ro -6 -(p irro lid in -1 - il)-1 ,3 ,5 -tria z in a (INT-34) s u s titu y e n d o p irro lid in a p o r m o rfo lin a p a ra d a r el c o m p u e s to de l t ítu lo INT-35 co m o un s ó lid o b lanco . EM: m /z 235. [M H ].
Figure imgf000070_0004
Síntesis de 2,4-dicloro-6-(piperidin-1-il)-1,3,5-triazina (INT-36)
A 2,4,6-tricloro-1,3,5-triazina (300 mg, 1,627 mmol) y carbonato de sodio (259 mg, 2,440 mmol) se le añadió tetrahidrofurano (8 ml) a 0° C, seguido de piperdina (163 gl, 1,627 mmol). La mezcla de la reacción se volvió turbia en unos pocos minutos. La LCMS después de 1 h mostró la masa deseada como el producto principal y algún aducto de di-adición como el producto secundario. El material bruto se filtró, se concentró y se purificó mediante cromatografía en gel de sílice (0-20% de acetato de etilo/heptanos) para producir una mezcla del compuesto del título (INT-36, principal) y di-aducto (secundario). LCMS m/z: 233.0 [M+H].
Figure imgf000071_0001
c i
INT-37
Síntesis de 4,6-dicloro-N,N-dimetil-1,3,5-triazin-2-amina (INT-37)
A 2,4,6-tricloro-1,3,5-triazina (300 mg, 1,627 mmol) y carbonato de cesio (689 mg, 2,115 mmol) en tetrahidrofurano (8 ml) se le añadió dimetilamina (1 M en THF (813 gl, 1,627 mmol)) gota a gota a 0° C. Después de 45 min, la LCMS mostró la masa deseada como producto principal y una cantidad menor de aducto de di-adición. La mezcla bruta se filtró y se purificó mediante cromatografía en gel de sílice (0-20% de acetato de etilo/heptanos) para obtener 144 mg de mezcla de principalmente el compuesto del título INT-37 y algo de 6-cloro-N2,N2,N4,N4-tetrametil-1,3,5-triazina-2,4-diamina no deseado. La mezcla se usó en el paso siguiente sin más purificación.
Figure imgf000071_0002
INT-38
Síntesis de 2,4-dicloro-6-metoxi-1,3,5-triazina (INT-38)
A 2,4,6-tricloro-1,3,5-triazina (300 mg, 1,627 mmol) en MeOH (32,500 ml) se le añadió bicarbonato de sodio (137 mg, 1,627 mmol) y la mezcla se agitó a temperatura ambiente durante 45 minutos. Luego, la mezcla se diluyó con agua y se extrajo con diclorometano, se lavó con NaCl saturado (ac.), se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró para dar el compuesto del título INT-38 (271 mg, 1,506 mmol, rendimiento del 93%) como un sólido blanco. 1H-NMR (400 MHz, CDCla): 54.14 (s, 3H).
Figure imgf000071_0003
Síntesis de 2,4-dicloro-6-(3,3-difluoropirrolidin-1-il)-1,3,5-triazina (INT-39)
A 2,4,6-tricloro-1,3,5-triazina (150 mg, 0,813 mmol) y carbonato de cesio (583 mg, 1,789 mmol) en THF (8 ml) a 0° C se le añadió clorhidrato de 3,3-difluoropirrolidina (120 mg, 0,813 mmol) en una porción. A esto se le añadieron 2,2 eq (313 gl) de base de Hünig. La LCMS después de 2 h mostró la masa deseada como el pico principal. La mezcla de la reacción se filtró, se concentró y se purificó mediante cromatografía en gel de sílice (0-10% de acetato de etilo/heptanos) para dar el compuesto del título INT-39 (123 mg, 0,482 mmol, 59,3% de rendimiento) como un sólido blanco. MS m/z: 254.8 [M+H].
Figure imgf000072_0001
Síntesis de 2,4-dicloro-6-(3,3-difluoropiperidin-1-il)-1,3,5-triazina (INT-40)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que la 2,4-dicloro-6-(3,3-d¡fluorop¡rrolid¡n-1 -il)-1,3,5-triazina (INT-39) sustituyendo el clorhidrato de 3,3-difluoropiperidina por clorhidrato de 3,3-difluoropirrolidina para dar el compuesto del título INT-40. MS: m/z 268.9 [M+H].
Figure imgf000072_0002
Síntesis de ácido (R) -2-cloro-4-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)pirimidin-5-carboxílico (INT-41)
En un vial de 20 ml se añadió 2-cloro-4-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6',4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)pirimidin-5-carboxilato de (R)-etilo (1-18) (0,112 g, 0,232 mmol) a 5 ml de solución de metanol/agua 4:1. Se añadió LiOH (0,371 ml, 0,371 mmol) y la reacción se calentó a 35° C. Una vez completada, se añadió HCl (0,371 ml, 0,371 mmol) y el producto precipitó de la solución. La reacción se filtró y los sólidos se enjuagaron con agua fría y se secaron al vacío para proporcionar el compuesto INT-41 (0,103 g, 0,226 mmol, rendimiento del 98%).
Figure imgf000072_0003
Síntesis de 10-metil-3-((2-(metilsulfonil)pirimidin-4-il)amino)-8-oxo-10,11-dihidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolina-12(9H)-carboxilato de (R)-terc-butilo (INT-42)
A una solución de 3-amino-10-metil-8-oxo-10,11-dihidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolina-12(9H)-carboxilato de (R)-terc-butilo (INT-2) (100,0 mg, 0,2 mmol) en 1,4-dioxano (2,0 ml), se le añadieron 4-cloro-2-metilsulfonilpirimidina (58,0 mg, 0,3 mmol) y carbonato de potasio (102,4 mg, 0,7 mmol), a temperatura ambiente. La solución resultante se desgasificó brevemente aplicando vacío y luego se enjuagó con nitrógeno tres veces. Finalmente, se añadieron Pd2(dba)3(45,9 mg, 0,05 mmol) y DavePhos (2,5 mg, 0,01 mmol) a temperatura ambiente y la mezcla se desgasificó adicionalmente. Se dejó agitar la mezcla de la reacción a 100° C durante 3 h. Una vez completada la reacción, la mezcla de la reacción se diluyó con agua (10,0 ml) y se extrajo con acetato de etilo (2 veces, 10,0 ml). Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre sulfato de sodio anhidro y se concentraron a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante preparativo para proporcionar el compuesto INT-42 (45 mg, 32%) como un sólido marrón. MS m/z: 555.2 (M+H).
Figure imgf000073_0001
Síntesis de 4-amino-2-cloro-N-(4-metoxibencil)pirimidina-5-carboxamida (INT-43b)
A una solución agitada de 2,4-dicloro-N-[(4-metoxifenil)metil]pirimidina-5-carboxamida (INT-43a, 500 mg, 1,6 mmol, preparada de acuerdo con el procedimiento descrito en la WO 2011/090760 A1) en THF (5 ml) se le añadió amoniaco (1 ml, 24,03 mmol) a 0° C y se agitó a temperatura ambiente durante 30 min. Una vez completada, la mezcla de la reacción se diluyó con agua y se extrajo con acetato de etilo. La capa orgánica combinada se lavó con agua seguido de solución de salmuera, se secó sobre Na2SO4 anhidro y se concentró a presión reducida para proporcionar 1 (440 mg, 85% de rendimiento) como un sólido blanquecino. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 53.71 (s, 3H), 4.35 (d, J=6 Hz, 2H), 6.88 (d, J=8.6 Hz, 2H), 7.23 (d, J=8.5 Hz, 2H), 8.22 (s, br, 2H), 8.54 (s, 1H), 9.09 (d, J=5.7 Hz, 1H).
Figure imgf000073_0002
Síntesis de (R)-2-cloro-N-(4-metoxibencil)-4-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)pirimidina-5-carboxamida (INT-43)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-1 sustituyendo INT-43b por 5-fluoro-2-nitroanilina y (R)-3-bromo-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-5) por (R)-3-cloro-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona. El calentamiento se realizó de forma convencional a 100° C durante 6 h (en lugar de mediante irradiación con microondas). Esto dio (R)-2-cloro-N-(4-metoxibencil)-4-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)pirimidin-5-carboxamida INT-43 (141 mg, 88%) como un sólido amarillo. MS m/z (M+H): 574.1.
Figure imgf000073_0003
Síntesis de (R)-2-cloro-N-(4-metoxibencil)-4-(metil(10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)pirimidina-5-carboxamida (INT-44)
A una solución agitada de (R)-2-cloro-N-(4-metoxibencil)-4-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] )diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)pirimidina-5-carboxamida (INT-43) (180 mg, 0,3 mmol) en dimetilformamida (2,0 ml) se le añadieron carbonato de potasio (86,66 mg, 0,6 mmol), yoduro de potasio (10,4 mg, 0,06 mmol) y yoduro de metilo (66,7 mg, 0,5 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 75° C durante 1 h. Una vez completada la reacción, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El producto bruto se diluyó con agua y los sólidos formados se filtraron y lavaron con agua y luego se secaron al vacío para proporcionar el compuesto INT-44 (120 mg, 53%) como un sólido amarillo. MS m/z (M+H): 588.4.
Figure imgf000074_0001
Síntesis de 4-cloro-6-(2-metoxietoxi)pirimidin-2-amina (INT-45)
A una solución de 4,6-dicloropirimidin-2-amina (1,0 g, 6,1 mmol) en tetrahidrofurano (20,0 ml), se le añadió hidruro de sodio (175,6 mg, 7,3 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 0° C durante 10 min. A la mezcla de la reacción se le añadió 2-metoxietanol (556,8 mg, 7,3 mmol) a 0° C y se agitó a temperatura ambiente durante 4 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se inactivó con agua con hielo (50 ml), se extrajo con acetato de etilo (2 x 50 ml) y se lavó con salmuera (50,0 ml). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida para producir 1 (900 mg, 68%) como un sólido amarillo pálido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 5 3.27 (s, 3H), 3.58-3.61 (m, 2H), 4.33-4.35 (m, 2H), 6.08 (s, 1H), 6.96 (br s, 2H). MS m/z (M+H): 204.1.
Figure imgf000074_0002
Síntesis de 4-cloro-6-[2-(4-metilpiperazin-1-il)etoxi]pirimidin-2-amina (INT-46)
A una suspensión de hidruro de sodio (13,4 mg, 0,3 mmol) en tetrahidrofurano (5,0 ml) se le añadió 2-(4-metilpiperazin-1-il)etanol (43,9 mg, 0,3 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción se agitó a temperatura ambiente durante 30 min. Se añadió una solución de 4,6-dicloropirimidin-2-amina (50 mg, 0,3 mmol) en dimetilformamida (0,5 ml) a la mezcla de la reacción a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 3 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El residuo obtenido se lavó con éter dietílico para proporcionar el compuesto 1 (20 mg, 24%) como un sólido marrón. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 2.11 (s, 3H), 2.26 (br s, 4H), 2.41 (br s, 4H), 2.58-2.61 (t, J=5.8 Hz, 2H), 4.29-4.32 (t, J=5.9 Hz, 2H), 6.06 (d, J=3.1 Hz, 1H), 6.99 (br s, 2H). MS m/z (M+H): 272.1.
Figure imgf000074_0003
Síntesis de (R)-10-(aminometil)-3-cloro-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolina-8-ona (INT-47)
A una solución agitada de (S)-10-(azidometil)-3-cloro-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[Ala3,2-f]quinolin-8-ona (S8-3) (50 mg, 0,1 mmol) en agua/tetrahidrofurano (1:3, 4,0 ml) se le añadió trifenilfosfina (146 mg, 0,4 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 85° C durante 16 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El material bruto se lavó con éter dietílico para proporcionar el compuesto INT-47 (35 mg, 76%) como un sólido amarillo pálido. MS m/z (M+H): 333.2.
Figure imgf000075_0001
Síntesis de (S)-3-cloro-10-((dimetilamino)metil)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-48)
A una solución de (R)-10-(aminometil)-3-cloro-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (10,0 mg, 0,03 mmol) (INT-47) en metanol (4,0 ml) se le añadió formaldehído (0,01 ml, 0,6 mmol) y la reacción se agitó durante 10 min. a temperatura ambiente. Se añadieron ácido acético (1,0 gl) y cianoborohidruro de sodio (1,9 mg, 0,03 mmol) y se continuó agitando a 25° C durante 1 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El material bruto se diluyó con agua y se extrajo con acetato de etilo. La capa orgánica se lavó con agua seguido de salmuera. La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida. El material bruto se purificó mediante cromatografía en gel de sílice usando metanol al 5% en diclorometano como eluyente para proporcionar el compuesto INT-48 (7,0 mg, 64%) como un sólido amarillo.
1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 52.21 (s, 6H), 2.33-2.35 (m, 2H), 3.37-3.45 (m, 1H), 3.53-3.62 (m, 1H), 3.63-3.70 (m, 1H), 7.07 (t, J=4.8 Hz, 1H), 7.62 (br s, 1H), 7.70 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.89 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.19 (d, J=8.8 Hz, 1H), 9.19 (d, J=9.2 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 361.3.
Figure imgf000075_0002
Síntesis de (S)-3-cloro-10-(yodometil)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolina-8-ona (INT-49)
A una solución agitada de metanosulfonato de (S)-(3-cloro-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-10-il)metilo (S8-2) (140 mg, 0,3 mmol) en acetona (5,0 ml) se le añadió yoduro de sodio (506,46 mg, 3,4 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 60° C durante 16 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El material bruto se diluyó con agua con hielo, después de lo cual se formaron sólidos. Los sólidos se filtraron y se secaron para proporcionar el compuesto INT-49 (135 mg, 90%) como un sólido amarillo pálido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 3.20-3.24 (m, 1H), 3.31-3.35 (m, 1H), 3.42-3.45 (m, 1H), 3.68-3.71 (m, 1H), 3.86-3.89 (m, 1H), 7.18 (br s, 1H), 7.74 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.89 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.20 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.33 (d, J=4.8 Hz, 1H), 9.18 (d, J=8.8 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 444.2.
Figure imgf000075_0003
Síntesis de (R)-3-cloro-10-((metilamino)metil)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-50)
Se agitó una mezcla de (S)-3-cloro-10-(yodometil)-9,10,11,12-tetrahidro-8H
[1 ,4 ]d ia z e p in o [5 ',6 ':4 ,5 ]tie n o [3 ,2 -f]q u in o lin -8 -o n a (INT-49) (20 m g, 0 ,05 m m ol) y m e tila m in a (2 M en T H F ) (1,8 m l, 4 m m ol) a 90° C d u ra n te 3 h. D e spu és , la m e zc la de la rea cc ión se co n c e n tró a p re s ión red uc id a . El m a te ria l b ru to o b te n id o se p u rificó m e d ia n te T L C p re p a ra tiv a p a ra p ro p o rc io n a r el c o m p u e s to INT-50 (6 ,0 m g, 40 % ) co m o un só lido a m a rillo . 1H N M R (400 M H z, D M S O -d6): 5 2.25 (s, 3H ), 2.52 -2.54 (m , 2H ), 3.22 -3.25 (m, 1H ), 3.32 -3.35 (m, 1H), 3.5 5 -3.60 (m , 1H), 7.14 (t, J= 5.6 Hz, 1H ), 7.70 (d, J = 9.2 Hz, 1H), 7.89 (d, J= 8.8 Hz, 1H), 8.19 (d, J= 8.8 Hz, 1H ), 8.23 (b r s, 1H), 9.24 (d, J= 9.2 Hz, 1H). M S m /z (M H ): 347.1.
Figure imgf000076_0001
Síntesis de (R)-6-cloro-N-(4-metoxibencil)-4-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)nicotinamida (iNt-51)
El c o m p u e s to de l t ítu lo se s in te tizó de la m ism a m a n e ra q u e 1-1 s u s titu y e n d o 4 -a m in o -6 -c lo ro -N -(4 -m e to x ib e n c il)n ic o tin a m id a p o r 5 -f lu o ro -2 -n itro a n ilin a . El ca le n ta m ie n to se re a lizó de fo rm a co n v e n c io n a l a 100° C d u ra n te 3 h (en lu g a r de m ed ia n te irra d ia c ió n con m ic ro o n d a s ) p a ra p ro p o rc io n a r el c o m p u e s to INT-51 (15 m g, re n d im ie n to de l 47 % ) co m o un só lido am a rillo . EM : m /z 573.2 (M h ).
Figure imgf000076_0002
Síntesis de (S)-2-cloro-4-((10-(hidroximetil)-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)-N-(4-metoxibencil)pirimidina-5-carboxamida (INT-52)
El c o m p u e s to de l t ítu lo se s in te tizó de la m ism a m a n e ra q u e 1-17 s u s titu y e n d o 4 -a m in o -2 -c lo ro -N -(4 -m e to x ib e n c il)p ir im id in a -5 -c a rb o x a m id a p o r 6 -flu o ro p ir im id in -4 -a m in a p a ra p ro p o rc io n a r el c o m p u e s to INT-52 (22 mg, 14% ) co m o un só lido am a rillo p á lid o . M S m /z (M H ): 590.3.
Figure imgf000077_0001
Síntesis de 5-(hidroximetil)pirimidina-2,4(1H,3H)-diona (S9-1)
A una mezcla de 1H-pirimidina-2,4-diona (20 g, 178,4 mmol) en una solución acuosa de hidróxido de potasio (8,0 g, 142,7 mmol) en agua (160,0 ml), se le añadió paraformaldehído (6,96 g, 231,9 mmol) en porciones a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 55° C durante 36 h. Una vez completada, la reacción se enfrió a temperatura ambiente y se concentró a 1/3° del volumen a presión reducida para obtener una masa espesa blanca. El residuo se diluyó con acetona (150 ml) y se agitó a 25° C durante 15 min, momento en el que se formó un precipitado. El sólido se filtró y se lavó con acetona (3 x 50 ml) y se secó al vacío para producir S9-1 (25 g, 98%) como un sólido blanco. MS m/z (M-H): 140.9.
Figure imgf000077_0002
Síntesis de 2,4-dicloro-5-(clorometil)pirimidina (S9-2)
A una suspensión de S9-1 (25 g, 175,9 mmol) en tolueno (50,0 ml), se le añadió oxicloruro de fósforo (134,87 g, 879,6 mmol) a 0° C y se continuó agitando durante 15 min. A la mezcla de la reacción, se le añadió gota a gota DIPEA (68,1 g, 527,7 mmol) mientras se mantenía la temperatura a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 120° C durante 7 h. Una vez completada la reacción, la mezcla de la reacción se enfrió a temperatura ambiente y se vertió en una mezcla bifásica agitada de acetato de etilo y agua (150 ml/150 ml) a 0° C durante un período de 45 min y se agitó a la misma temperatura. temperatura durante otras 1,5 h. Después, la mezcla de la reacción se extrajo con acetato de etilo al 25% en tolueno (4 x 150 ml). La capa orgánica combinada se lavó con agua (2 x 500 ml) y una solución de salmuera saturada (1 x 500 ml). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida para proporcionar S9-2 (28 g, 81%) como un líquido marrón que se usó sin purificación adicional. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 58.96 (s, 1H), 4.84 (s, 2H).
Figure imgf000077_0003
Síntesis de 2,4-dicloro-5-(yodometil)pirimidina (INT-53)
A una solución de yoduro de sodio (23,4 g, 156,0 mmol) en acetona seca (150 ml), se le añadió S9-2 (28,0 g, 141,8 mmol) a temperatura ambiente y se agitó durante 30 min. La mezcla de la reacción resultante se calentó a 65° C durante 20 min. Una vez completada, la mezcla de la reacción se enfrió a temperatura ambiente, se filtró y se lavó con acetona (2 x 50 ml). El filtrado combinado se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante cromatografía en columna ultrarrápida (gel de sílice 60-120, acetona al 10% en éter de petróleo) para producir INT-53 (21 g, 48%) como un sólido amarillo claro. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 58.95 (s, 1H), 4.53 (s, 2H). MS m/z (M+H): 287.9.
Figure imgf000078_0001
Síntesis de 2,4-dicloro-5-((metilsulfonil)metil)pirimidina (INT-54)
Se disolvió INT-53 (0,3 g, 1,038 mmol) en 10 ml de DCM con 2 ml de DMSO. Se añadió metanosulfinato de sodio (0,106 g, 1,038 mmol) y la reacción se calentó a 50° C. Después de 3 h, la reacción se diluyó con heptano, se filtró y se concentró para dar INT-54 en DMSO que se usó directamente para el siguiente paso. MS m/z (M+H): 241.0, 243.0.
Figure imgf000078_0002
Síntesis de 2,4-dicloro-5-((difluorometoxi)metil)pirimidina (INT-55)
A una solución agitada de (2,4-dicloropirimidin-5-il)metanol (400 mg, 2,23 mmol) en CH3CN (16 ml) se le añadió yoduro de cobre (I) (45,6 mg, 0,24 mmol) a temperatura ambiente bajo atmósfera inerte seguid de agitación a 60° C durante 10 min. Se añadió gota a gota ácido 2,2-difluoro-2-(fluorosulfonil)acético (2,39 g, 14,4 mmol) y la mezcla de la reacción se mantuvo a 60° C durante otras 4 h. La mezcla de la reacción se inactivó mediante la adición de agua con hielo (30 ml) y se extrajo con acetato de etilo (2 x 50 ml). La capa orgánica combinada se lavó con salmuera (50 ml), se secó sobre Na2SO4 anhidro.y se concentró a presión reducida para obtener el material bruto. La purificación mediante cromatografía en columna sobre gel de sílice (eluyente: EtOAc/hexanos al 15%) para proporcionar el compuesto INT-55 (200 mg, 0,55 mmol, 24,5%) como un aceite incoloro. MS m/z (M+H): 229.0.
Figure imgf000078_0003
Síntesis de 5-(terc-butoximetil)-2,4-dicloropirimidina (INT-56)
A una solución agitada de (2,4-dicloropirimidin-5-il)metanol (200 mg, 1,12 mmol) en una mezcla de DCM (2 ml) y ciclohexano (2 ml) se le añadió 2,2,2-tricloroetanimidato de terc-butilo (268,56 mg, 1,23 mmol) y BF3Et2O (50 ul) a temperatura ambiente. La reacción se agitó a temperatura ambiente durante 15 h. El producto bruto se purificó mediante TLC preparativa (hexano/acetato de etilo, 5:1) para obtener INT-56 (200 mg, 76,1%) como un sólido blanquecino. 1H NMR (400 MHz, CDCla) 58.71 (s, 1H), 4.52 (s, 2H), 1.33 (s, 9H).
Figure imgf000079_0001
reflujo/4 h
INT-57
Síntesis de 5-(bromometil)-4-cloropirimidina (INT-57)
A una solución agitada de 4-cloro-5-metil-pirimidina (1,2 g, 9,33 mmol) en CCl4 (30 ml) se le añadió 1-bromopirrolidina-2,5-diona (2,66 g, 14,9 mmol) y AIBN (0,31 g, 1,87 mmol) a temperatura ambiente y se agitó a 80° C durante 4 h. La reacción se detuvo mediante la adición de Na2SO3 acuoso saturado (40 ml). La capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con diclorometano (2 x 30 ml). La capa orgánica combinada se lavó con salmuera (100 ml), se filtró y se concentró a presión reducida para dar el material bruto. La purificación por cromatografía en columna (éter de petróleo: acetato de etilo = 10:1) proporcionó INT-57 (500 mg, 25,8%) como un aceite incoloro.
Figure imgf000079_0002
Síntesis de N-((4-cloropirimidin-5-il)metil)-N,2-dimetilpropan-2-amina (INT-58)
A una solución agitada de 5-(bromometil)-4-cloro-pirimidina (300,0 mg, 1,45 mmol) en MeCN (20 ml) se le añadió N, 2-dimetilpropan-2-amina (113,4 mg, 1,3 mmol) y K2CO3 (393,3 mg, 2,9 mmol) a 0° C y se agitó a esta temperatura durante 1,5 h. La mezcla de la reacción se filtró a través de una almohadilla de Celite® y el filtrado se concentró a presión reducida para dar el material bruto. La purificación por cromatografía en columna (éter de petróleo: acetato de etilo = 15:1) proporcionó INT-58 (140 mg, 45,3%) como un aceite incoloro.
Figure imgf000079_0003
5-(Aliloximetil)-2,4-dicloropirimidina (INT-59)
A una solución de alcohol alílico (0,08 ml, 1,25 mmol) en tetrahidrofurano (3,0 ml), se le añadió tercbutóxido de potasio (174,8 mg, 1,56 mmol) a 0° C y se agitó durante 30 min seguido de la adición de INT-53 (300 mg, 1,0 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 0° C durante 15 min. Una vez completada, se añadió agua con hielo (5,0 ml) a la mezcla de la reacción y luego se extrajo con acetato de etilo (10,0 ml). La capa orgánica se lavó con agua (10,0 ml) seguido de una solución de salmuera saturada (10,0 ml). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida para obtener un residuo bruto (300 mg). El residuo se purificó mediante TLC preparativa para proporcionar INT-59 (50 mg, 10%) como un líquido marrón. MS /z (M+H): 219.1
Figure imgf000080_0001
2,4-D¡cloro-5-(etoximet¡l)p¡r¡m¡d¡na (INT-60): Método A
Se agitó una solución de hidruro de sodio (o KOtBu, 8,3 mmol) (199,4 mg, 8,3 mmol) en etanol (15,0 ml) a 50° C durante 45 min. A la mezcla, se añadió INT-53 (3,0 g, 10,4 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 10 min. Una vez completada, la mezcla de la reacción se diluyó con agua con hielo (50,0 ml), se extrajo con acetato de etilo (2 x 100 ml) y se lavó con solución de salmuera (50 ml). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida (2,8 g). El material bruto obtenido se purificó mediante TLC preparativa para producir INT-60 (402 mg, 19%) como un líquido incoloro. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) 58.66 (s, 1H), 4.56 (s, 2H), 3.69-3.64 ((m, 2H), 1.30 (t, J=7.2 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 207.1.
Síntesis alternativa de 2,4-dicloro-5-(etoximetil)pirimidina (INT-60): Método B
Figure imgf000080_0003
A una solución de etanol (20 ml) se le añadió cloruro de acetilo (0,55 g, 7,04 mmol). La mezcla se agitó a temperatura ambiente durante 10 min y luego se añadió S9-1 (1,0 g, 7,04 mmol). La mezcla se calentó a 75-80° C durante la noche, se enfrió y luego se concentró para proporcionar 5-(etoximet¡l)p¡r¡m¡dina-2,4(1H,3H)-d¡ona (1,15 g, 96%) bruta como un sólido blanco, que se usó para el siguiente paso sin purificación adicional.
A una suspensión de 5-(etoximet¡l)p¡r¡m¡dina-2,4(1H,3H)-d¡ona (0,5 g, 2,94 mmol) en tolueno (1 ml), se le añadió oxicloruro de fósforo (0,67, 7,35 mmol) a 0° C. y se agitó durante 15 min. A la mezcla de la reacción, se le añadió gota a gota base de Hünig (0,77 ml, 4,41 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 120° C durante 1 h, luego se enfrió a temperatura ambiente y se vertió en una mezcla bifásica agitada de acetato de etilo y agua (1/1, v/v) a 0° C durante un período de 45 min. Se continuó la agitación a la misma temperatura durante 1,5 h más. Luego, la mezcla de la reacción se extrajo con acetato de etilo. La capa orgánica combinada se lavó con agua y salmuera, se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida para proporcionar INT-60 (0,40 g, 65%) como un líquido marrón. El producto bruto se purificó adicionalmente mediante cromatografía en gel de sílice (éter de petróleo/acetato de etilo, 30/1 a 30/1). 1H NMR (400 MHz, CDCh): 58.67 (s, 1H), 4.56 (s, 2H), 3.66 (q, J=7.2 Hz, 2H), 1.30 (t, J=7.2 Hz, 3H).
Método C
Figure imgf000080_0002
A una suspensión de NaH (79,75 mg, 3,32 mmol) en THF anhidro (50 ml) a 0° C en atmósfera de nitrógeno se le añadió 3-metiloxetan-3-ol (268,39 mg, 3,05 mmol). Después de agitar durante 30 min a 0° C, la mezcla de la reacción se transfirió mediante una cánula a una solución de INT-53 (800 mg, 2,77 mmol) en THF anhidro (50 ml). Después de agitar durante 2 h más a 0° C, se añadió NH4Cl (saturado acuoso) y la reacción se extrajo con acetato de etilo (3 x 50 ml). Los extractos orgánicos combinados se secaron sobre MgSÜ4, se concentraron a presión reducida y el residuo resultante se purificó mediante cromatografía en columna de sílice eluyendo con una mezcla de éter de petróleo: acetato de etilo (1/1). Se obtuvo INT-61 (350 mg, 51%) como un sólido marrón. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): 58.71 (s, 1H), 4.77-4.75 (d, J=6.8 Hz, 2H), 4.53 (s, 2H), 4.48-4.46 (d, J=7.2 Hz, 2H), 1.66 (s, 3H). MS m/z (M+H): 249.1.
Los siguientes productos intermedios se sintetizaron mediante uno o más del Método A, Método B o Método C como se ha descrito anteriormente, reemplazando el etanol o 3-metiloxetan-3-ol de esos métodos con el alcohol respectivo en la columna marcada como "Alcohol" para dar los compuestos que se muestran en la columna "producto" de la tabla a continuación.
Métodos A y C
Figure imgf000081_0001
Método B
Figure imgf000082_0001
(continuación)
Figure imgf000083_0002
Figure imgf000083_0001
Síntesis de rac-2,4-dicloro-5-((2-(metoximetil)pirrolidin-1-il)metil)pirimidina
A una suspensión agitada de INT-53 (500,0 mg, 1,73 mmol) en CH3CN anhidro (20 ml, DMF también es un solvente aceptable para esta transformación) se le añadió carbonato de potasio (358,3 mg, 2,6 mmol) y clorhidrato de rac-2-(metoximetil)pirrolidina (262,4 mg, 1,73 mmol) a 0° C para dar una solución marrón. La solución se agitó durante 3 h. La mezcla de la reacción se diluyó con cloroformo y se concentró. La purificación por TLC preparativa (hexano: acetato de etilo 3/1) proporcionó INT-69 (160 mg, 33,4%) MS m/z (M+H): 276,2.
Los siguientes productos intermedios se sintetizaron por el mismo método que INT-69 reemplazando el clorhidrato de rac-2-(metoximetil) pirrolidina con la amina respectiva en la columna marcada como “Amina” usando el procedimiento anterior para dar los compuestos mostrados en la columna de producto.
Figure imgf000084_0001
Figure imgf000084_0002
(continuación)
Figure imgf000085_0001
continuación
Figure imgf000086_0001
continuación
Figure imgf000087_0001
continuación
Figure imgf000088_0001
(continuación)
Figure imgf000089_0002
Figure imgf000089_0001
Síntesis de 2-cloro-6-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)oxi)pirimidina-4-carboxilato de (R)-metilo (INT-91)
Se añadió INT-6 (0,3 g, 1,002 mmol) a 15 ml de DMF seca y se sonicó. A la solución resultante, se le añadió K2CO3 (1,385 g, 10,02 mmol) y la reacción se calentó a 90° C durante 10 min. Luego, la reacción se enfrió y se añadió 2,6-dicloropirimidin-4-carboxilato de metilo (0,270 g, 1,303 mmol). La reacción se lavó abundantemente con argón y se calentó de nuevo a 90° C durante 3 h. Una vez que se consideró que se hubo completado la reacción, la reacción se enfrió, se filtró y se vertió en agua. El precipitado amarillo que se desarrolló se aisló por filtración, se trituró con EtOAc y se secó al vacío durante la noche. El polvo resultante, INT-91 (0,373 g, 0,794 mmol, rendimiento del 79%) se usó sin purificación adicional para transformaciones posteriores. MS m/z (M+H): 470.0.
Figure imgf000090_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-6-(hidroximetil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-92)
Se disolvió INT-91 (0,373 g, 0,794 mmol) en DCM (6 ml) con MeOH (1,2 ml) y se enfrió a 0° C. Se añadió borohidruro de sodio (0,120 g, 3,18 mmol) en dos porciones en el transcurso de 30 min. Se dejó agitar la reacción durante dos horas, después de lo cual se diluyó con 5 ml de metanol y se concentró sobre gel de sílice. Luego se purificó mediante cromatografía ultrarrápida usando un gradiente de MeOH al 0-10% en DCM para producir INT-92 (0,141 g, 0,319 mmol, rendimiento del 40,2%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 9.35 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.17 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.14 (d, J=5.2 Hz, 1H), 7.83 (d, J=8.7 Hz, 1H), 7.62 (d, J=8.7 Hz, 1H), 7.25 (s, 1H), 7.15 (br, 1H), 4.56 (s, 2H), 3.59 (m, 1H), 3.44 (m, 2H), 1.16 (d, J=6.4 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 442.1.
Figure imgf000090_0002
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-6-(clorometil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-93)
En un vial de 20 ml, se agitaron CCL (0,277 ml, 2,87 mmol) y trifenilfosfina (753 mg, 2,87 mmol) a temperatura ambiente en 5 ml de DCM durante 15 min. La solución mencionada anteriormente se transfirió luego a un vial que contenía INT-92 (141 mg, 0,319 mmol). Se añadieron 2 ml de DMF seca para ayudar a solubilizar el material de partida y la reacción se calentó a 50° C durante la noche. A la mañana siguiente se consideró que la reacción se había completado, se concentró sobre gel de sílice y se purificó mediante cromatografía ultrarrápida usando un gradiente de MeOH al 0-10% en DCM para producir INT-93 (137 mg, 0,298 mmol, rendimiento del 93%). MS m/z (M+H): 460,0; 462.0.
Figure imgf000090_0003
Síntesis de 4-(2-cloro-4-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6' :4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)oxi)pirimidin-5-il)-5,6-dihidropiridin-1(2H)-carboxilato de (R)-terc-butilo (iNt-94)
Se desgasificaron 1-116 (240 mg, 0,489 mmol), 4-(4,4,5,5-tetrametil-1,3,2-dioxaborolan-2-il)-5,6dihidropiridina-1 (2H)-carboxilato de terc-butilo (227 mg, 0,734 mmol), carbonato de potasio (203 mg, 1,467 mmol) y PdCÍ2(dppf) (35,8 mg, 0,049 mmol) en DMF (8,0 ml) mediante evacuación/sonicación (3x), rellenando cada vez con N2. La mezcla de la reacción se calentó a 85° C con agitación. Después de 3 h, la mezcla se diluyó con agua y se extrajo con DCM (5x). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera, se secaron sobre Na2SÜ4, se filtraron y se concentraron. La purificación por HPLC (10-95% de MeCN/agua, 0,1% de TFA) dio INT-94 (54 mg, 0,091 mmol, 19% de rendimiento) como un sólido amarillo.
Figure imgf000091_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-(1,2,3,6-tetrahidropiridin-4-il)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-95)
Se disolvió INT-94 (54 mg, 0,091 mmol) en TFA (1,0 ml) para dar una solución roja. Después de 3 min, la UPLC muestra una reacción completa. El TFA se eliminó mediante evaporación rotatoria y el residuo rojo oscuro resultante se trató con hidróxido de amonio (~2 ml, con cuidado, gota a gota). El color cambió de rojo oscuro a amarillo y se formó un precipitado. La mezcla se sonicó para formar una suspensión que se concentró por evaporación rotatoria para dar un residuo sólido amarillo que se usó directamente sin purificación adicional.
Figure imgf000091_0002
Síntesis de (R)-3-((5-((aliloxi)metil)-2-cloropirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-96)
A una solución de INT-6 (50 mg, 0,2 mmol) en dimetilformamida (1,0 ml), se le añadió terc-butóxido de potasio (37,2 mg, 0,3 mmol) a 0° C y se agitó durante 10 min seguido de la adición de INT-59 (72,7 mg, 0,3 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 1 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se inactivó con agua (5,0 ml) y se extrajo con 10% de metanol/diclorometano (2 x 10 ml). La capa orgánica se lavó con agua (10 ml) seguido de una solución de salmuera saturada (10 ml). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido (50 mg) se purificó mediante TLC preparativa para producir INT-96 (5 mg, 6%) como un sólido amarillo pálido. MS m/z (M+H): 482.1.
Figure imgf000092_0001
Síntesis de 2,4-dicloro-5-((4-(2-metoxietoxi)piperidin-1-il)metil)pirimidina (INT-99)
A una suspensión agitada de K2CO3 (539,0 mg, 3,9 mmol) e INT-53 (750 mg, 2,6 mmol) en CH3CN (25,0 ml) se le añadió clorhidrato de 4-(2-metoxietoxi)piperidina (250,0 mg, 1,3 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se filtró a través de una almohadilla de Celite® y el filtrado se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante cromatografía en columna para proporcionar INT-99 (152,0 mg, 36,5%) como un líquido incoloro.
1H NMR (400 MHz, CDCh) 5 8.66 (s, 1H), 3.62-3.53 (m, 6H), 3.45-3.37 (m, 4H), 2.85-2.72 (m, 2H), 2.35-2.22 (m, 2H), 2.00-1.82 (m, 2H), 1.72-1.55 (m, 2H). MS m/z (M+H): 320.1.
Figure imgf000092_0002
Síntesis de 2,4-dicloro-5-((4-(2-fluoroetoxi)piperidin-1-il)metil) (INT-100)
A una suspensión agitada de K2CO3 (602,0 mg, 4,4 mmol) e INT-53 (1,6 g, 5,5 mmol) en CH3CN (25,0 ml) se añadió clorhidrato de 2-(piperidin-4-iloxi)etanol (604,0 mg, 2,2 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se filtró a través de una almohadilla de Celite® y el filtrado se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante cromatografía en columna para proporcionar 2-((1-((2,4-dicloropirimidin-5-il)metil)piperidin-4-il)oxi)etan-1-ol (304,0 mg, 45%) como líquido incoloro. MS m/z (M+H): 302.1.
A una solución agitada de 2-((1-((2,4-dicloropirimidin-5-il)metil)piperidin-4-il)oxi)etan-1-ol (304,0 mg, 1,0 mmol) en CH2Cl2 (8,0 ml) se añadió DAST (322,0 mg, 2,0 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante cromatografía en columna para proporcionar INT-100 (70,0 mg, 23%) como un líquido incoloro. MS m/z (M+H): 308.2.
Figure imgf000092_0003
Síntesis de 2,4-dicloro-5-((4-(metoxi-d3)piperidin-1-il)metil)pirimidina (INT-101)
A una suspensión agitada de K2CO3 (539,0 mg, 3,9 mmol) e INT-53 (750 mg, 2,6 mmol) en CH3CN (25,0 ml) se le añadió clorhidrato de 4-(metoxi-d3)piperidina (250,0 mg, 1,3 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se filtró a través de una almohadilla de Celite® y el filtrado se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante cromatografía en columna para proporcionar INT-101 (167,0 mg, 46%) como un líquido incoloro.
1H NMR (400 MHz, CDCla) 5 8.65 (s, 1H), 3.57 (s, 2H), 3.31-3.20 (m, 1H), 2.78-2.65 (m, 2H), 2.38-2.22 (m, 2H), 1.95-1.82 (m, 2H), 1.70-1.54 (m, 2H). MS m/z (M+H): 279.1.
Figure imgf000093_0001
Síntesis de 2,4-dicloro-5-((4-isopropoxipiperidin-1-il)metil)pirimidina (INT-102)
A una suspensión agitada de K2CO3 (1,45 g, 10,5 mmol) e INT-53 (2,0 g, 6,9 mmol) en CH3CN (50 ml) se le añadió clorhidrato de 4-isopropoxipiperidina (623 mg, 3,5 mmol) a 0° C en porciones. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se filtró a través de una almohadilla de Celite® y el filtrado se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante cromatografía en columna para proporcionar INT-102 (547 mg, 51,5%) como un líquido incoloro.
1H NMR (400 MHz, CDCla) 5 8.66 (s, 1H), 3.72-3.66 (m, 1H), 3.61-3.54 (m, 2H), 3.47-3.38 (m, 1H), 2.81-2.69 (m, 2H), 2.35-2.22 (m, 2H), 1.93-1.79 (m, 2H), 1.68-1.54 (m, 2H), 1.14 (d, J=4.0 Hz, 6H). MS m/z (M+H): 304.2.
Figure imgf000093_0002
Síntesis de 5-((4-(terc-butoxi)piperidin-1-il)metil)-2,4-dicloropirimidina (INT-103)
A una suspensión agitada de K2CO3 (478,0 mg, 3,5 mmol) e INT-53 (500,0 mg, 1,7 mmol) en CH3CN (15,0 ml) se le añadió clorhidrato de 4-terc-butoxipiperidina (200,0 mg, 1,0 mmol). a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante la noche. Una vez completada, la mezcla de la reacción se filtró a través de una almohadilla de Celite® y el filtrado se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante cromatografía en columna para proporcionar INT-103 (168 mg, 53%) como un líquido incoloro. 1H NMR (400 MHz, CDCla) 58.67 (s, 1H), 3.58 (s, 2H), 3.53-3.47 (m, 1H), 2.80-2.76 (m, 2H), 2.35-2.20 (m, 2H), 1.83­ 1.69 (m, 2H), 1.66-1.54 (m, 2H), 1.20 (s, 9H). MS m/z (M+H): 318.0.
Figure imgf000093_0003
Síntesis de 2,4-dicloro-5-((etoxi-d5)metil)pirimidina (INT-104)
Se preparó etan-1-olato-d5 de sodio (0,969 mmol) en 3,0 ml de THF como sigue. A una suspensión de hidruro de sodio (60% en aceite mineral, 44,3 mg, 1,108 mmol) en THF (3,0 ml) a 0° C se le añadió etan-1,1,2,2,2-ds-1 -ol-d (0,057 ml, 0,969 mmol). Se retiró el baño de enfriamiento y la mezcla resultante se agitó a temperatura ambiente durante 40 min.
Una primera porción de etan-1-olato-d5 de sodio en THF (3,0 ml;. 0,969 mmol) se preparó de acuerdo con el procedimiento anterior y se enfrió a 0° C. A la solución enfriada de etan-1-olato-d5 de sodio en THF se le añadió una solución de INT-53 (400 mg, 1,385 mmol) en THF (3,0 ml). Después de 2 h, se preparó una segunda porción de etan-1-olato-d5 de sodio en THF (3,0 ml; 0,969 mmol) de acuerdo con el procedimiento anterior, se enfrió a 0° C y se añadió a la mezcla de la reacción. Después de 14 h, la mezcla de la reacción se diluyó con solución saturada de cloruro de amonio (5,0 ml), se extrajo con acetato de etilo (2 x 20 ml) y se lavó con solución de salmuera (5 ml). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante cromatografía ultrarrápida en una columna de gel de sílice eluyendo con un gradiente de EtOAc-heptano del 5% al 20% para proporcionar INT-104 (99 mg, rendimiento del 34%) como un líquido incoloro. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 58.76 (s, 1H), 4.53 (s, 2H). MS m/z (M+H): 212.1.
Ejemplo 1
Figure imgf000094_0001
Síntesis de 2-cloro-4-((10-met¡l-8-oxo-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nolin-3-il)amino)pirimidina-5-carboxilato de (R)-et¡lo (1-18)
En un vial de 20 ml, se añadieron (R)-3-amino-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-3) (0,095 g, 0,318 mmol), 2,4-dicloropirimidina-5-carboxilato de etilo (0,084 g, 0,382 mmol) y base de Hünig (0,111 ml, 0,637 mmol) a 5 ml de i-PrOH. El vial se selló y la suspensión se calentó a 95° C durante 24 horas. Una vez que se determinó que estaba completa, la reacción se enfrió y se formó un precipitado. Se añadieron 5 ml de éter etílico, el vial se sonicó brevemente y el producto se aisló por filtración para proporcionar el compuesto I-18 (0,112 g, 0,232 mmol, 72,8% de rendimiento). 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 5 1.18 (d, J=6.7 Hz, 3H), 1.35 (t, J=7 Hz, 3H), 3.42-3.46 (m, 2H), 3.60 (m, 1H), 4.39 (q, J=7 Hz, 2H), 7.08 (br s, 1H), 7.81 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.06 (d, J=4 Hz, 1H), 8.10 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.54 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.93 (s, 1H), 9.27 (d, J=9.3 Hz, 1H), 10.99 (s, 1H). MS m/z (M+H): 483.29.
Ejemplo 2
Figure imgf000094_0002
Síntesis de (R)-2-cloro-4-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)pirimidina-5-carbonitrilo (1-16)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-18 sustituyendo 2,4-dicloropirimidina-5-carbonitrilo en lugar de 2,4-dicloropirimidina-5-carboxilato de etilo para proporcionar el compuesto I-16 (13 mg, rendimiento del 11%) como sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.17 (d, J=6.5 Hz, 3H), 3.40-3.44 (m, 2H), 3.56-3.60 (m, 1H), 7.08 (br s, 1H), 7.84 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.89 (s, 1H), 8.09 (s, 1H), 8.13 (d, J=8.6 Hz, 1H), 8.81 (br s, 1H), 9.20 (d, J=9.4 Hz, 1H), 11.14 (s, 1H). MS m/z (M+H): 436.27.
Ejemplo 3
Figure imgf000095_0001
Síntesis de (R)-2-cloro-4-((10-met¡l-8-oxo-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no-[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-3-¡l)am¡no)-N-(1-met¡lp¡per¡d¡n-4-¡l)p¡r¡mid¡n-5-carboxam¡da (1-19)
En un vial de 4 dram, se añadió DMF (0,5 ml) a la mezcla de ácido (R)-2-cloro-4-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-J]quinolin-3-il)amino)pirimidina-5-carboxílico (INT-41) (10 mg, 0,022 mmol) y HATU (9,19 mg, 0,024 mmol). La mezcla resultante se enfrió a 0° C usando un baño de enfriamiento con hielo y metanol. Luego, se añadieron lentamente 1-metilpiperidin-4-amina premezclada (2.51 mg, 0.022 mmol) y DIPEA (0,012 ml, 0,066 mmol) en 0.5 ml de DMF (0,5 ml) a la mezcla anterior, y la reacción se agitó mientras se calentaba a temperatura ambiente durante 30 minutos. Después de que se hubo completado la reacción, la mezcla en bruto se purificó en HPLC preparativa usando acetonitrilo/H2O (01% de TFA) para proporcionar el compuesto I-19 (4 mg, 7,26 mol, 33,0% de rendimiento) como un sólido. 1H NMR (400 MHz, D m S O -d6): 59.20-9.04 (m, 3H), 8.38-8.09 (m, 4H), 7.40 (d, 1H), 7.13 (br s, 1H), 3.52-3.36 (m, 4H), 3.05-3.01 (m, 2H), 2.73 (m, 3H), 2.17-1.71 (m, 4H), 1.17 (d, 3H). MS m/z: 514.9 (M-36+).
Ejemplo 4
Figure imgf000095_0002
Síntes¡s de (R)-2-cloro-N-c¡cloprop¡l-4-((10-met¡l-8-oxo-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]diazepino[5,,6,:4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)pirimidina-5-carboxamida (1-21)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que 1-19 usando cicloproilamina en lugar de 1-metilpiperidin-4-amina para proporcionar el compuesto 1-21 como un sólido. MS m/z: 457.9 (M-36).
Ejemplo 5
Figure imgf000096_0001
Síntesis de (R)-2-cloro-4-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)-N-(oxetan-3-il)pirimidin-5-carboxamida (1-20)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-19 usando oxetan-3-amina en lugar de 1-metilpiperidin-4-amina para proporcionar el compuesto I-20, aislado como un sólido. MS m/z: 473.9 (M-36).
Ejemplo 6
Figure imgf000096_0002
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((R)-3-(dimetilamino)pirrolidina-1-carbonil)pirimidin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-24)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-19 usando (R) -N,N-dimetilpirrolidin-3-amina en lugar de 1-metilpiperidin-4-amina para proporcionar el compuesto I-24, aislado como un sólido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.90 (br s, 1H), 9.24 (d, 1H), 9.20 (d, 1H), 9.04 (d, 1H), 8.20 (m 1H), 8.19 (d, 1H), 7.34 (m, 1H), 7.11 (br t, 1H), 4.07-3.30 (m, 5 h , parcialmente superpuesto por agua), 2.87 (br s, 6H), 2.49-2.15 (m, 2H, parcialmente fusionado con el pico de los solventes), 1.17 (d, 3H).
Ejemplo 7
Figure imgf000096_0003
Síntesis de (R)-6-cloro-4-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)nicotinonitrilo (I-25)
A una solución de (R)-3-amino-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-3) (60 mg, 0,2 mmol) en 1,4-dioxano (3,0 ml), se añadieron 6-cloro-4-yodonicotinonitrilo (63,8 mg, 0,2 mmol) y carbonato de potasio (55,6 mg, 0,4 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se desgasificó durante 5 minutos seguido de la adición de Pd2(dba)3 (9,1 mg, 0,01 mmol) y Xantphos (19,2 mg, 0,03 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 100° C durante 8 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El residuo obtenido se diluyó con agua (7,0 ml), dando lugar a la formación de un precipitado sólido. Los sólidos se filtraron y se secaron al aire, luego se cristalizaron a partir de dimetilsulfóxido/agua para proporcionar el compuesto I-25 (40 mg, 43%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 5 1.19 (d, J=6.6 Hz, 3H), 3.45 (br s, 2H), 3.59 (br s, 1H), 7.01 (br s, 1H), 7.64 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.79 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.03-8.08 (m, 2H), 8.68 (s, 1H), 8.83 (s, 1H), 9.13 (d, J=9.3 Hz, 1H), 10.1 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 435.2.
Ejemplo 8
Figure imgf000097_0001
Síntesis de (R)-6-fluoro-4-((10-met¡l-8-oxo-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]tieno[3,2-f]qu¡nol¡n-3-¡l)am¡no)n¡cotinon¡tr¡lo (I-27)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-25, sustituyendo 6-fluoro-4-yodonicotinonitrilo por 6-cloro-4-yodonicotinonitrilo para proporcionar el compuesto I-27 (40 mg, 28%), aislado como un sólido amarillo.
1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 5 1.19 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.45 (br s, 2H), 3.55 (br s, 1H), 7.01 (br s, 1H), 7.67 (d, J=9.1 Hz, 1H), 7.86 (d, J=8.7 Hz, 1H), 8.03-8.07 (m, 2H), 8.51 (s, 1H), 8.61 (s, 1H), 9.14 (d, J=9.0 Hz, 1H), 10.1 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 419.3.
Ejemplo 9
v
Figure imgf000097_0002
Síntes¡s de (R)-6-fluoro-4-((10-met¡l-8-oxo-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-3-il)amino)nicotinamida (1-29)
Se trató (R)-6-fluoro-4-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)nicotinonitrilo (I-27) (30 mg, 0,1 mmol) con H2SO4 conc. (0,5 ml) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 60° C durante 1 h. Una vez completada la reacción, la mezcla de la reacción se inactivó con agua fría (1,0 ml), después de lo cual se formaron sólidos. Los sólidos obtenidos se filtraron y se secaron al aire para obtener el producto bruto. El producto bruto se disolvió en dimetilsulfóxido (1,0 ml) y se calentó a 80° C y luego se filtró para eliminar las partículas no disueltas. Se añadió agua (1,0 ml) al filtrado. Los sólidos formados se filtraron y se secaron al aire para proporcionar el compuesto I-29 (6,0 mg, 17%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-de): 5 1.19 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.44 (br s, 2H), 3.58-3.59 (m, 1H), 7.01 (br s, 1H), 7.28 (d, J=6.7 Hz, 1H), 7.85 (br s, 1H), 7.88 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.02 (br s, 1H), 8.06 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.42 (br s, 1H), 8.63 (s, 1H), 8.85 (s, 1H), 9.11 (d, J=8.9 Hz, 1H), 12.08 (s, 1H). MS m/z (M+H): 437.2.
Ejemplo 10
Figure imgf000098_0001
Síntesis de (R)-10-met¡l-3-((2-(met¡lsulfon¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)am¡no)-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1.4] d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nolin-8-ona (I-14)
A una solución de 10-metil-3-((2-(metilsulfonil)pirimidin-4-il)amino)-8-oxo-10,11 -dihidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolina-12(9H)-carboxilato de (R)-terc-butilo (INT-42) (15,0 mg, 0,03 mmol) en diclorometano (2,0 ml), se añadió ácido trifluoroacético (2,0 ml) a 0° C. Se dejó agitar la mezcla de la reacción resultante a 0° C durante 20 min. Una vez completada la reacción, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida y se destiló azeotrópicamente con cloroformo (2 x 10 ml). El residuo obtenido se diluyó con solución saturada de bicarbonato de sodio (10 ml) y se extrajo con acetato de etilo (2 x 10 ml). Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre sulfato de sodio anhidro y se concentraron a presión reducida. El producto bruto obtenido se purificó mediante TLC preparativa para proporcionar el compuesto I-14 (6,0 mg, 49%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.18 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.39 (s, 3H), 3.45 (br s, 2H), 3.59 (br s, 1H), 7.02 (br s, 1H), 7.88 (d, J=8.9 Hz, 1H), 7.93 (br s, 1H), 8.03 (d, J=4.1 Hz, 1H), 8.45 (br s, 1H), 8.09 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.70 (d, J=5.9 Hz, 1H), 9.15 (d, J=9.3 Hz, 1H), 11.19 (br s, 1H). MS: m/z 455.3 (M+H).
Ejemplo 11
Figure imgf000098_0002
Síntes¡s de (R)-3-((5-fluoro-2-n¡trofen¡l)am¡no)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-1)
Se trató (R)-3-cloro-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolina-8-ona (S1-12) (120 mg, 0,4 mmol) en 1,4-dioxano (5 ml) con 5-fluoro-2-nitroanilina (70 mg, 0,4 mmol). La solución resultante se desgasificó brevemente aplicando vacío y luego se lavó abundantemente con nitrógeno. Se añadieron carbonato de cesio (246 mg, 0,7 mmol), Pd2(dba)3 (17 mg, 0,01 mmol) y Xantphos (43 mg, 0,07 mmol) y la mezcla se desgasificó adicionalmente como se ha descrito anteriormente. La mezcla de la reacción se agitó con irradiación de microondas a 130° C durante 1 h. Una vez completada la reacción, la mezcla de la reacción se filtró a través de celite, se lavó con acetato de etilo y se concentró a presión reducida. El residuo resultante se trituró con éter dietílico y se purificó adicionalmente mediante HPLC preparativa para proporcionar el compuesto I-1 (16 mg, 10%) como un sólido marrón pálido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.18 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.44 (br s, 2H), 3.58 (br s, 1H), 7.00­ 7.04 (m, 2H), 7.47 (d, J=9.1 Hz, 1H), 7.73 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.01-8.03 (m, 2H), 8.24 (dd, J=6.1, 9.2 Hz, 1H), 8.73 (dd, J=2.6, 12.1 Hz, 1H), 9.07 (d, J=9.1 Hz, 1H), 10.26 (s, 1H). MS: m/z (M+H): 438.22 (M+H).
Ejemplo 12
Figure imgf000099_0001
Síntesis de (R)-4-fluoro-2-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)benzonitrilo (1-2)
El c o m p u e s to de l t ítu lo se s in te tizó de la m ism a m a n e ra qu e I-1 s u s titu y e n d o 2 -a m in o -4 -flu o ro b e n z o n ¡tr ilo p o r 5 -flu o ro -2 -n itro a n ilin a pa ra p ro p o rc io n a r el co m p u e s to I-2, o b te n id o co m o un só lid o a m a rillo . 1H N M R (400 M H z, D M S O -d6): 5: 1.18 (d, J= 6.7 Hz, 3H ), 3.44 (s, 2H ), 3.57 -3.59 (m , 1H ), 6.97 (t, J= 5 Hz, 1H), 7.03 (dt, J= 2.5 , 8.4 Hz, 1H), 7.45 (d, J= 9 Hz, 1H), 7.70 (d, J= 9 Hz, 1H), 7.86 (dd, J= 6.4 , 8.7 Hz, 1H), 7.98 (d, J = 8.8 Hz, 1H), 8.02 (d, J= 4.3 Hz, 1H), 8.35 (dd, J= 2.5 , 12 Hz, 1H), 9.03 (d, J= 9 Hz, 1H), 9.61 (s, 1H). M S: m /z 418.1 (M H ).
Ejemplo 13
Figure imgf000099_0002
Síntesis de (R)-3-((2-cloropirimidin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-5)
El co m p u e s to de l t ítu lo se s in te tizó de la m ism a m a n e ra q u e I-1 s u s titu y e n d o 2 -c lo ro p ir im id in -4 -a m in a p o r 5-flu o ro -2 -n itro a n ilin a p a ra p ro p o rc io n a r el co m p u e s to I-5, o b te n id o c o m o un só lid o a m a rillo p á lid o . 1H N M R (400 M H z, D M S O -d6): 5 1.17 (d, J = 6.7 Hz, 3H ), 3.44 (b r s, 2H ), 3.58 -3.59 (m , 1 H), 7.07 (d, J= 5 Hz, 1H), 7.76 (d, J= 8.6 Hz, 1 H), 7.8 5 (d, J= 9 Hz, 1H), 8.03 -8.08 (m , 2H ), 8.33 (b r s, 1H), 8.45 (d, J= 6 Hz, 1H ), 9.15 (d, J= 9.2 Hz, 1H), 10.99 (s, 1H). M S: m /z 411.1 (M H ).
Ejemplo 14
Figure imgf000099_0003
[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]tieno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-8)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-1 sustituyendo 2-fluorop¡rim¡d¡n-4-am¡na por 5-fluoro-2-nitroanil¡na. El calentamiento se realizó de manera convencional a 90° C durante 16 h (en lugar de mediante irradiación con microondas) para proporcionar el compuesto I-8 (8 mg, rendimiento del 11%), obtenido como un sólido blanquecino. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5: 1.17 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.44 (s, 2H), 3.58 (s, 1H), 7.05 (br s, 1H), 7.80 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.86 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.04 (d, J=4.2 Hz, 1H), 8.07 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.21 (br s, 1H), 8.46 (d, J=4.7 Hz, 1H), 9.15 (d, J=9.2 Hz, 1H), 10.98 (s, 1H). MS: m/z 395.32 (M+H).
Ejemplo 15
Figure imgf000100_0001
Síntesis de 4-((10-met¡l-8-oxo-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-3-il)am¡no)-2-(metiltio)pirimidina-5-carboxilato de (R)-et¡lo (1-12)
En un vial de 15 ml, se añadió 1,4-dioxano a (R) -3-bromo-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-5) (10 mg, 0,028 mmol) y 4-amino-2-(metiltio)pirimidina-5-carboxilato de etilo (INT-8 ) (8,83 mg, 0,041 mmol) seguido de NaOt-Bu (7,96 mg, 0,083 mmol) y precatalizador BrettPhos-G1 (4,00 mg, 0,552 gmol). La mezcla heterogénea resultante se purgó con argón durante 3 minutos y se calentó a 80° C durante la noche. Una vez que se hubo completado, la reacción se purificó por HPLC preparativa usando acetonitrilo/H2O (0,1% de TFA) para proporcionar el compuesto I-12 (6 mg, 0,012 mmol, 43,9% de rendimiento) como un sólido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 511.01 (s, 1H), 9.23 (d, 1H), 8.86 (d, 1H), 8.69 (d, 1H), 8.10 (m, 2H), 7.81 (d, 1H), 7.10 (br.s, 1H), 4.38 (q, 2H), 3.60 (m, 1H), 3.45 (m, 2H), 2.66 (s, 3H), 1.35 (d, 3H), 1.18 (t, 3H). MS m/z: 494.9 (M+H).
Ejemplo 16
Figure imgf000100_0002
Síntesis de (R)-2-cloro-4-(metil(10-met¡l-8-oxo-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]diazep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)pirimidina-5-carboxamida (1-34)
A una solución agitada de (R)-2-cloro-N-(4-metoxibencil)-4-(metil(10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)pirimidin-5-carboxamida (INT-44) (60 mg, 0,1 mmol) en diclorometano (1,0 ml) se añadieron ácido trifluoroacético (1,0 ml, 0,1 mmol) y ácido trifluorometanosulfónico (153,12 mg, 1,0 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 25° C durante 1 h. Una vez completada la reacción, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El residuo se diluyó con agua y los sólidos formados se filtraron y lavaron con agua y luego se secaron al vacío. El producto bruto se purificó mediante TLC preparativa eluyendo con metanol al 5% en diclorometano para proporcionar el compuesto I-34 (6,0 mg, 12%) como un sólido naranja. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.17 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.42 (m, 2H), 3.57 (m, 1H), 4.14 (s, 3H), 7.09 (t, J=5.5 Hz, 1H), 7.76 (br s, 1H), 7.84 (d, J=9.9 Hz, 1H), 8.05 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.15 (d, J=3.8 Hz, 1H), 8.26 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.79 (s, 1H), 8.85 (br s, 1H), 9.10 (d, J=9.9 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 468.4.
Ejemplo 17
Figure imgf000101_0001
Síntesis de (R)-2-cloro-4-((10-met¡l-8-oxo-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]tieno[3,2-f]qu¡nol¡n-3-il)amino)pirimidina-5-carboxamida (1-9)
A una solución agitada de (R)-2-cloro-N-(4-metoxibencil)-4-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4])diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)pirimidin-5-carboxamida (INT-43) (20 mg, 0,03 mmol) en diclorometano (1,0 ml) se añadieron ácido trifluoroacético (1 ml) y ácido trifluorometanosulfónico (0,03 ml, 0,3 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 25° C durante 1 h. Una vez completada la reacción, la mezcla de la reacción se diluyó con agua y los sólidos formados se filtraron, se lavaron con diclorometano y se secaron. El polvo resultante se purificó mediante TLC preparativa eluyendo con MeOH al 5% en diclorometano para proporcionar el compuesto I-9 (11 mg, 68%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 51.18 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.46 (m, 2H), 3.60 (m, 1H), 7.06 (br s, 1H), 7.82 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.01 (br s, 1H), 8.07-8.09 (m, 2H), 8.51 (br s, 1H), 8.61 (d, J=9.4 Hz, 1H), 8.90 (s, 1H), 9.26 (d, J=9.5 Hz, 1H), 12.11 (br s, 1H). MS: m/z 454.3 (M+H).
Ejemplo 18
Figure imgf000101_0002
Síntesis de (R)-3-((6-fluoropirimidin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-11)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-1 sustituyendo 6-fluoropirimidin-4-amina por 5-fluoro-2-nitroanilina. El calentamiento se realizó de forma convencional a 100° C durante 16 h (en lugar de mediante irradiación con microondas) para proporcionar el compuesto I-11 como un sólido marrón. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 5: 1.17 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.44 (s, 2H), 3.59-3.60 (m, 1H), 6.99 (t, J=5 Hz, 1H), 7.68 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.89 (d, J=9 Hz, 1H), 8.03 (s, 1H), 8.06 (d, J=9 Hz, 1H), 8.17 (s, 1H), 8.59 (d, J=2 Hz, 1H), 9.10 (d, J=9 Hz, 1H), 10.93 (s, 1H). MS: m/z 395.1 (M+H).
Ejemplo 19
Figure imgf000102_0001
Síntesis de (R)-3-((6-cloropirimidin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-7)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-1 sustituyendo 6-clorop¡r¡mid¡n-4-am¡na por 5-fluoro-2-nitroanilina. El calentamiento se realizó de forma convencional a 100° C durante 16 h (en lugar de mediante irradiación con microondas) para proporcionar el compuesto I-7 como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.17 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.47 (br s, 2H), 3.58 (br s, 1H), 7.00 (br s, 1H), 7.76 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.84 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.04-8.08 (m, 2H), 8.46 (s, 1H), 8.64 (s, 1), 9.11 (d, J=9.3 Hz, 1H), 10.88 (s, 1H). MS m/z (M+H): 411.3. Ejemplo 20
Figure imgf000102_0002
Síntesis de (R)-3-((6-fluoropirimidin-4-il)(metil)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-38)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-1 sustituyendo 6-fluoro-N-metilpirimidin-4-amina por 5-fluoro-2-nitroanilina. El calentamiento se realizó de forma convencional a 90° C durante 16 h (en lugar de mediante irradiación con microondas) para proporcionar el compuesto I-38 como un sólido amarillo claro. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 51.18 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.44-3.46 (m, 2H), 3.59-3.60 (m, 1H), 3.68 (s, 3H), 6.88 (s, 1H), 7.10 (t, J=5.4 Hz, 1H), 7.80 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.85 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.05 (d, J=4.3 Hz, 1H), 8.11 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.49 (d, J=2.2 Hz, 1H), 9.18 (d, J=9.1 Hz, 1H). MS: m/z 409.3 (M+H).
Ejemplo 21
Figure imgf000102_0003
Síntesis de (R)-6-cloro-4-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)nicotinamida (I-15)
A una solución agitada de (R)-6-cloro-N-(4-metoxibencil)-4-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4])diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)nicotinamida (INT-51) (20 mg, 0,04 mmol) en diclorometano: ácido trifluoroacético (2 ml, proporción 1:1), se añadió ácido trifluorometanosulfónico (52 mg, 0,34 mmol) a 0° C y se agitó a temperatura ambiente durante 2 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida y se añadió solución de NaHCÜ3 acuosa saturada (3 ml) a 0° C y se agitó durante 20 min. El sólido formado se filtró y se lavó con agua y el compuesto bruto se purificó mediante HPLC preparativa para proporcionar el compuesto 1-15 (8 mg, rendimiento 61) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-D6): 5: 1.20 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.44-3.49 (m, 2H), 3.58 (d, J=3.1 Hz, 1H), 7.04 (, J=5.4 Hz, 1H), 7.29 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.83 (d, J=9 Hz, 1H), 7.93 (br s, 1H), 8.08 (d, J=9 Hz, 2H), 8.48 (br s, 1H), 8.72 (s, 1H), 9.10 (d, J=9.3 Hz, 1H), 9.27 (s, 1H), 11.97 (s, 1H). MS: m/z 453.28 (M+H).
Ejemplo 22
Figure imgf000103_0001
Síntesis de 4-cloro-2-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)pirimidina-5-carboxilato de (R)-etilo (I-23)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-1 sustituyendo 2-amino-4-cloro-pirimidin-5-carboxilato de etilo por 5-fluoro-2-nitroanilina y (R)-3-bromo-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-5) por (R)-3-cloro-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (S1-12). El compuesto del título I-23 se obtuvo como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 5 1.18 (d, J=6.7 Hz, 3H), 1.32 (t, J=7.0 Hz, 3H), 3.45 (br s, 2H), 3.60 (br s, 1H), 4.32 (q, J=7.0 Hz, 2H), 4.29-4.34 (m, 2H), 7.07 (t, J=5.0 Hz, 1H), 7.80 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.03 (d, J=4.0 Hz, 1H), 8.06 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.40 (d, J=9.3 Hz, 1H), 8.96 (s, 1H), 9.19 (d, J=9.3 Hz, 1H), 11.2 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 483.1.
Ejemplo 23
Figure imgf000103_0002
Síntesis de (R)-3-((2,6-difluoropiridin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-6)
Una solución de (R)-3-cloro-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (S1-12) (50 mg, 0,16 mmol), 2,6-difluoropiridin-4-amina (40,9 mg, 0,3 mmol) y carbonato de cesio (154 mg, 0,5 mmol) en 1,4-dioxano (5 ml) se desgasificó con argón durante 10 min. Se añadieron BINAP (9,8 mg, 0,02 mmol) y Pd2(dba)3 (14,4 mg, 0,02 mmol), la solución se desgasificó de nuevo con argón durante 5 min y luego se calentó a 100° C durante 16 h. Una vez completada la reacción, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El compuesto bruto resultante se purificó mediante cromatografía en columna (malla de sílice 100-200, metanol al 10% en diclorometano como eluyente) seguido de concentración de las fracciones relevantes y purificación adicional por HPLC de fase inversa para proporcionar el compuesto 1-6 (7 mg, rendimiento del 10%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5: 1.17 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.43 (s, 2H), 3.59 (d, J=4 Hz, 1H), 6.98 (d, J=5.3 Hz, 1H), 7.24 (d, J=9 Hz, 1H), 7.59 (s, 2H), 7.87 (d, J=9 Hz, 1H), 8.03-8.06 (m, 2H), 9.09 (d, J=9 Hz, 1H), 10.51 (s, 1H). MS: m/z 412.1 (M+H).
Ejemplo 24
Figure imgf000104_0001
Síntesis de (R)-3-((2-fluorop¡r¡d¡n-4-¡l)am¡no)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1.4] diazep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nolin-8-ona(I-3)
En un vial de microondas de 10 ml, se disolvieron Pd2(dba)3 (21,61 mg, 0,024 mmol), carbonato de cesio (77 mg, 0,236 mmol), 2-diciclohexilfosfino-2 '-(N,N-dimetilamino)-bifenilo (DavePhos, 18,58 mg, 0,047 mmol), 4-amino-2-fluoropiridina (8,82 mg, 0,079 mmol) y (R)-3-cloro-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (S1-12) (25 mg, 0,079 mmol) en 0,5 ml de t-BuOH seco. La reacción se puso al vacío y luego se volvió a llenar con nitrógeno. La reacción se calentó a 100° C durante la noche, luego se enfrió, se filtró y se concentró hasta la sequedad. El residuo se volvió a disolver en DMSO y se purificó por HPLC de fase inversa con 95%-5% de H2O (que contiene TFA al 0,5% v/v)/acetonitrilo para proporcionar el compuesto I-3 (0,004 g, 7,8 pmol, rendimiento del 10,0%). MS: m/z 393.6 (M+H), 391.7 (M-H). 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 5 1.13 (d, 3H), 3.39 (m, 2H), 3.55 (m, 1H), 6.94 (br s, 1H), 7.20 (d, 1H), 7.81 (d, 1H), 7.99 (m, 4H), 9.02 (d, 1H), 10.21 (s, 1H).
Ejemplo 25
Figure imgf000104_0002
Síntes¡s de (R)-3-((2-clorop¡r¡d¡n-4-¡l)am¡no)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-4)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-3 sustituyendo 4-amino-2-cloro piridina por 4-amino-2-fluoropiridina para proporcionar el compuesto I-4 (0,003 g, 5,7 pmol, 7,3% de rendimiento). MS: m/z 409.7 (M+H), 407.8 (M-H). 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 5 1.13 (d, 3H), 3.38 (br s, 2H), 3.55 (m, 1H), 6.95 (br s, 1H), 7.17 (d, 1H), 7.72 (d, 1H), 7.78 (d, 1H), 8.01 (m, 2H), 8.16 (d, 1H), 9.03 (d, 1H).
Ejemplo 26
Figure imgf000105_0001
Síntesis de (R)-3-((2-(2-(dimetilamino)etoxi)-6-fluoropirimidin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (1-32)
En un vial de microondas de 5 ml, se suspendieron (R)-3-cloro-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (S1-12) (0,04 g, 0,126 mmol), BINAP (7,84 mg, 0,013 mmol), Pd(OAc)2 (8,48 mg, 0,013 mmol), carbonato de cesio (0,082 g, 0,252 mmol) y 2-(2-(dimetilamino)etoxi)-6-fluoropirimidin-4-amina (S3-3a) (0,028 g, 0,138 mmol) en 3 ml de 1,4-dioxano. La reacción se puso al vacío, se sonicó y luego se volvió a llenar con nitrógeno. La reacción se irradió en un microondas Biotage Explorer a 130° C durante 1 h. La reacción se enfrió, se filtró y se concentró hasta la sequedad. El residuo se volvió a disolver en DMSO y se purificó por HPLC de fase inversa con 95%-5% de H2O (que contenía TFA al 0,5% v/v)/acetonitrilo para proporcionar el compuesto I-32 (0,017 g, 0,035 mmol, rendimiento del 28,0%). MS: m/z 466.1 (M+H), 463.8 (M-H). 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 51.18 (d, 3H), 2.88 (s, 6H), 3.43 (m, 2H), 3.59 (m, 3H), 4.67 (m, 2H), 7.04 (m, 1H), 7.78 (br s, 1H), 7.88 (d, 1H), 8.08 (d, 1H), 9.14 (d, 1H), 9.89 (br s, 1H), 10.93 (s, 1H).
Ejemplo 27
Figure imgf000105_0002
Síntesis de (R)-3-((6-fluoro-2-(oxetan-3-iloxi)pirimidin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-37)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-32 sustituyendo 6-fluoro-2-(oxetan-3-iloxi)pirimidin-4-amina (INT-9a) por 2-(2-(dimetilamino)etoxi)-6-fluoropirimidin-4-amina para proporcionar el compuesto I-37 (0,0033 g, 7,07 pmol, 5,6% de rendimiento). MS: m/z 467.1 (M+H), 464.6(M-H).
Ejemplo 28
Figure imgf000105_0003
Síntesis de (R)-3-((6-fluoro-2-((3-metiloxetan-3-il)metoxi)pirimidin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-39)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-32 sustituyendo 6-fluoro-2-((3-metiloxetan-3-il)metoxi)pirimidin-4-amina (INT-15a) por 2-(2-(dimetilamino))etoxi)-6-fluoropirimidin-4-amina (S3-3a) para proporcionar el compuesto I-39 (0,01 g, 0,02 mmol, 12,9% de rendimiento). m S: m/z 495.0 (M+H). 1H n M r (400 MHz, DMSO-ds): 51.18 (d, 3H), 1.38 (s, 3H), 3.55 (m, 3H), 4.33 (d, 2H), 4.42 (s, 2H), 4.51 (d, 2H), 7.03 (t, 1H), 7.75 (br s, 1H), 7.88 (d, 1H), 8.07 (m, 2H), 9.12 (d, 1H), 10.91 (s, 1H).
Ejemplo 29
Figure imgf000106_0001
Síntesis de (R)-3-((4-fluoro-6-(oxetan-3-¡lox¡)p¡r¡m¡d¡n-2-il)am¡no)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-42)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-32 sustituyendo 4-fluoro-6-(oxetan-3-¡lox¡)p¡rim¡d¡n-2-am¡na (INT-9b) por 2-(2-(dimetilamino)etoxi)-6-fluoropirimidin-4-amina (S3-3a). Esto proporcionó el compuesto I-42 (0,02 g, 0,04 mmol, rendimiento del 26,7%). MS: m/z 467.1 (M+H). 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.20 (d, 3H), 3.47 (m, 2H), 3.62 (m, 1H), 4.64 (m, 2H), 4.97 (m, 2H), 5.67 (m, 1H), 6.28 (sm 1H), 7.08 (br s, 1H), 7.77 (d, 1H), 8.07 (d, 1H), 8.29 (d, 1H), 9.18 (d, 1H), 10.66 (s, 1H).
Ejemplo 30
Figure imgf000106_0002
Síntes¡s de (R)-3-((4-fluoro-6-((3-met¡loxetan-3-¡l)metox¡)p¡r¡m¡d¡n-2-¡l)am¡no)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-43)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-32 sustituyendo 4-fluoro-6-((3-metiloxetan-3-il)metoxi)pirimidin-2-amina (INT-15b) por 2-(2-(dimetilamino)etoxi)-6-fluoropirimidin-4-amina. Esto produjo el compuesto I-43 (0,01 g, 0,02 mmol, rendimiento del 13,8%). MS: m/z 495.1 (M+H). 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.18 (d, 3H), 1.38 (s, 3H), 3.46 (br s, 2H), 3.61 (m, 1H), 4.33 (d, 2H), 4.52 (m, 4H), 6.25 (s, 1H), 7.17 (s, 1H), 7.77 (d, 1H), 8.07 (d, 1H), 8.40 (d, 1H), 9.17 (d, 1H), 10.64 (s, 1H).
Ejemplo 31
Figure imgf000106_0003
Síntes¡s de (R)-3-((6-fluoro-2-(((S)-tetrah¡drofuran-3-¡l)ox¡)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)am¡no)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-40)
El c o m p u e s to de l t ítu lo se s in te tizó de la m ism a m a n e ra q u e I-32 s u s titu ye n d o (S )-6 -flu o ro -2 -(( te tra h ¡d ro fu ra n -3 -¡l)o x ¡)p ¡r im ¡d ¡n -4 -a m ¡n a (INT-23) p o r 2 -(2 -(d im e tila m in o )e to x i)-6 -flu o ro p ir im id in -4 -a m in a pa ra p ro p o rc io n a r el c o m p u e s to I-40 co m o un só lido . 1H N M R (400 M H z, D M S O -d 6 ): 5 10.82 (s, 1H), 9.11 (d, 1H), 8.06 (d, 2H ), 7.84 (d, 2H ), 7.53 (b r s, 1H), 7.01 (s, 1H), 5.47 (t, 1H ), 3.95 -3.78 (m, 4H ), 3.78 -3.30 (m, 4H ), 2.27-2.01 (m, 2H ), 1.17 (d, 3H ). M S m /z: 480.8 (M H ).
Ejemplo 32
Figure imgf000107_0001
Síntesis de (R)-3-((4-fluoro-6-(((S)-tetrah¡drofuran-3-¡l)ox¡)p¡r¡m¡d¡n-2-¡l)am¡no)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-50)
El c o m p u e s to de l t ítu lo se s in te tizó de la m ism a m a n e ra q u e I-32 s u s titu ye n d o (S )-4 -flu o ro -6 -((te tra h id ro fu ra n -3 - il)o x i)p ir im id in -2 -a m in a (INT-22) p o r 2- (2 -(d im e tila m in o )e to x i)-6 -flu o ro p ir im id in -4 -a m in a pa ra p ro p o rc io n a r el c o m p u e s to I-50 co m o un só lido . 1H n M r (400 M H z, D M S O -d 6 ): 5 10.61 (s, 1 H), 9.15 (d, 1H), 8.36 (d, 1H), 8.05 (d, 2H ), 7.76 (d, 1H), 7.05 (s, 1H), 6.19 (s, 1H), 4.01 -3.83 (m, 4H ), 3.60 -3.45 (m, 3H ), 2.48-2.01 (m, 2H ), 1.18 (d, 3H ). M S m /z: 480.8 (M H ).
Ejemplo 33
Figure imgf000107_0002
Síntes¡s de (R)-3-((6-fluoro-2-(((R)-tetrah¡drofuran-3-¡l)ox¡)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)am¡no)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-41)
El c o m p u e s to de l t ítu lo se s in te tizó de la m ism a m a n e ra q u e I-32 s u s titu y e n d o (R )-6 -flu o ro -2 -((te tra h id ro fu ra n -3 - il)o x i)p ir im id in -4 -a m in a (INT-27) p o r 2 -(2 -(d im e tila m in o )e to x i)-6 -flu o ro p ir im id in -4 -a m in a pa ra p ro p o rc io n a r el c o m p u e s to I-41 co m o un só lido . 1H N m R (400 M H z, D M S O -d 6 ): 5 10.83 (s, 1 H), 9.11 (d, 1H), 8.05 (d, 2H ), 7.84 (d, 2H ), 7.65 (b r s, 1H), 7.01 (s, 1H), 5.48 (t, 1H ), 3.95 -3.82 (m, 4H ), 3.51 (m , 1H), 3.43 (m, 2H ), 2.30 -2.06 (m , 2H ), 1.17 (d, 3H ). M S m /z: 481.0 (M H ).
Ejemplo 34
Figure imgf000108_0001
Síntesis de (R)-3-((6-fluoro-2-(2-metoxietoxi)pirimidin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-J]quinolin-8-ona (I-44)
El c o m p u e s to de l t ítu lo se s in te tizó de la m ism a m a n e ra q u e I-32 s u s titu y e n d o 6 -flu o ro -2 -(2 -m e to x ¡e to x ¡)p ¡rim ¡d ¡n -4 -a m ¡n a (INT-19) p o r 2 -(2 -(d im e tila m in o )e to x i)-6 -flu o ro p ir im id in a -4 -a m in a p a ra p ro p o rc io n a r el c o m p u e s to I-44 (18 m g, 0 ,038 m m ol, re n d im ie n to de l 27 ,2% ) en fo rm a de só lido . 1H N M R (400 M H z, D M S O -d 6 ): 5 10.82 (s, 1H), 9.10 (d, 1H), 8.05 (m , 2H ), 7.84 (m, 2H ), 7.01 (b r s, 1H), 4.42 (t, 2H ), 3.67 (m, 2H ), 3.58 (m, 1H), 3.42 (m, 2H ), 3.30 (s, 3H ), 1.16 (d, 3H ). M S m /z: 469.0 (M H ).
Ejemplo 35
Figure imgf000108_0002
Síntesis de (R)-3-((4-fluoro-6-(((R)-tetrahidrofuran-3-il)oxi)pirimidin-2-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-46)
El c o m p u e s to de l t ítu lo se s in te tizó de la m ism a m a n e ra q u e I-32 s u s titu y e n d o (R )-4 -flu o ro -6 -((te tra h id ro fu ra n -3 - il)o x i)p ir im id in -2 -a m in a (INT-26) p o r 2 -(2 -(d im e tila m in o )e to x i)-6 -flu o ro p ir im id in -4 -a m in a pa ra p ro p o rc io n a r el c o m p u e s to I-46 co m o un só lido . 1H N m R (400 M H z, D M S O -d 6 ): 5 10.61 (s, 1 H), 9.14 (d, 1H), 8.35 (d, 1H), 8.04 (d, 2H ), 7.75 (d, 1H), 7.04 (s, 1H), 6.18 (s, 1H), 5.57 (t, 1H ), 3.98 (m, 1H), 3.87 -3.77 (m, 3H ), 3.61 (m, 1H), 3.44 (m, 2H ), 2.31 (m, 1H), 2.04 (m, 1H), 1.17 (d, 3H ). M S m /z: 481.0 (M H ).
Ejemplo 36
Figure imgf000108_0003
Síntesis de (R)-3-((4-fluoro-6-(2-metoxietoxi)pirimidin-2-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-45)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-32 sustituyendo 4-fluoro-6-(2-metox¡etox¡)p¡rim¡d¡n-2-am¡na (INT-18) por 2-(2-(dimetilamino)etoxi)-6-fluoropirimidina-4-amina para proporcionar el compuesto I-45 como un sólido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 10.62 (s, 1H), 9.15 (d, 1H), 8.37 (d, 1H), 8.07 (m, 2H), 7.76 (d, 1H), 7.05 (br s, 1H), 6.20 (s, 1H), 4.52 (t, 2H), 3.69 (t, 2H), 3.59 (m, 1H), 3.44 (m, 2H), 3.30 (s, 3H), 1.17 (d, 3H). MS m/z: 469.0 (M+H).
Ejemplo 37
Figure imgf000109_0001
Síntesis de (R)-3-((6-cloro-2-(metoximetil)pirimidin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-51)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-32 sustituyendo 6-cloro-2-(metoximetil)pirimidin-4-amina por 2-(2-(dimetilamino)etoxi)-6-fluoropirimidin-4-amina. Esto produjo el compuesto I-51 (0,025 g, 0,06 mmol, rendimiento del 10,7%). MS: m/z 454.9 (M+H). 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 5 1.18 (d, 3H), 3.41 (s, 3H), 3.44 (m, 3H), 4.49 (s, 2H), 7.05 (br s, 1H), 7.85 (d, 1H), 8.08 (m, 2H), 9.12 (d, 1H), 10.99, (s, 1H). Ejemplo 38
Figure imgf000109_0002
Síntesis de (10R)-3-((6-fluoro-2-((1-metilpiperidin-3-il)oxi)pirimidin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (mezcla 1:1 de diastereómeros) (I-47)
Una solución de (R)-3-cloro-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5,,6,:4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (S1-12) (150 mg, 0,47 mmol) y (rac)-6-fluoro-2-[(1-metil-3-piperidil)oxi]pirimidin-4-amina (INT-10) (128,1 mg, 0,56 mmol) disuelta en 1,4-dioxano (6,0 ml) se desgasificó brevemente aplicando vacío y luego se lavó abundantemente con nitrógeno tres veces. A la solución anterior se le añadió carbonato de cesio (461,3 mg, 1,41 mmol), Pd2(dba)3(43,2 mg, 0,05 mmol) y Xantphos (27,3 mg, 0,05 mmol) a temperatura ambiente y la solución se desgasificó de nuevo durante 5 minutos. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 100° C durante 6 h. Una vez completada la reacción, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida, tras lo cual se formaron sólidos. Los sólidos obtenidos se lavaron con agua, éter dietílico y acetona para proporcionar el compuesto I-47 (30 mg, 12%) como un sólido amarillo pálido. 1H NMR (400 MHz, DMSo-d6): 51.18 (d, J=6.6 Hz, 3H), 1.43-1.57 (m, 2H), 1.73 (m, 1H), 1.97-2.15 (m, 2H), 2.19 (s, 4H), 2.5 (m, 1H), 2.88 (d, J=9.4 Hz, 1H), 3.44-3.49 (m, 2H), 3.55-3.59 (m, 1H), 4.99 (m, 1H), 6.99 (s, 1H), 7.69 (s, br, 1H), 7.79 (d, J=7.2 Hz, 1H), 7.86 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.01-8.06 (m, 2H), 9.10 (d, J=9.1 Hz, 1H), 10.76 (s, br, 1H). MS m/z (M+H): 508.3.
Ejemplo 39
Figure imgf000110_0001
Síntesis de (R)-3-((6-fluoro-2-(2-(4-met¡lp¡peraz¡n-1-¡l)etox¡)p¡rim¡d¡n-4-¡l)am¡no)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (l-48)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-47 sustituyendo 6-fluoro-2-(2-(4-met¡lp¡peraz¡n-1-¡l)etox¡)p¡r¡mid¡n-4-am¡na (INT-11) por (rac)-6-fluoro-2-[(1-metil-3-piperidil)oxi]pirimidin-4-amina (INT-10) para proporcionar el compuesto I-48 como un sólido amarillo pálido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.18 (d, J=6.4 Hz, 3H), 2.12 (s, 3H), 2.29 (br s, 4H), 2.49 (br s, 4H), 2.68 (br s, 2H), 3.43 (br s, 2H), 3.58 (br s, 1H), 4.41 (s, 2H), 6.99 (s, 1H), 7.58 (br s, 1H), 7.78-7.85 (m, 2H), 8.00-8.05 (m, 2H), 9.12 (d, J=9.1 Hz, 1H), 10.39 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 537.2.
Ejemplo 40
Figure imgf000110_0002
Síntes¡s de (R)-3-((6-fluoro-2-(((R)-1-met¡lp¡rrol¡d¡n-3-¡l)ox¡)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)am¡no)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-49)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-47 sustituyendo (R)-6-fluoro-2-((1-metilpirrolidin-3-il)oxi)pirimidin-4-amina (INT-12) por (rac)-6-fluoro-2-[(1-metil-3-piperidil)oxi]pirimidin-4-amina (INT-10) al compuesto I-49 (8,0 mg, 16%) como un sólido amarillo claro. 1H NMR (400 MHz, DMSo-d6): 5 1.19 (d, J=6.7 Hz, 3H), 2.27 (s, 3H), 2.31-2.40 (m, 2H), 2.61-2.68 (m, 3H), 2.82-2.84 (m, 1H), 3.44 (br s, 2H), 3.59 (br s, 1H), 5.33 (br s, 1H), 6.99 (br s, 1H), 7.49 (br s, 1H), 7.83-7.85 (m, 2H), 8.01 (br s, 1H), 8.05 (d, J=8.8 Hz, 1H), 9.13 (d, J=9.3 Hz, 1H), 10.75 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 494.5.
Ejemplo 41
Figure imgf000111_0001
Síntesis de (10R)-3-((6-cloro-2-((1-metilpiperidin-3-il)oxi)pirimidin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (mezcla 1:1 de diastereómeros) (I-59)
Se desgasificó brevemente una solución de (R)-3-bromo-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-5) (100 mg, 0,3 mmol) y (rac)-6-cloro-2-((1-metilpiperidin-3-il)oxi)pirimidin-4-amina (S4-4) (67 mg, 0,3 mmol) disuelto en 1,4-dioxano (5,0 ml) aplicando vacío y luego se lavó con nitrógeno tres veces. A la solución anterior se le añadió carbonato de cesio (269,8 mg, 0,8 mmol), Pd2(dba)3 (25,3 mg, 0,03 mmol) y xantfos (15,9 mg, 0,03 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla resultante se desgasificó adicionalmente y se agitó a 100° C durante 6 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró y se formó un sólido. El sólido obtenido se lavó con agua, diclorometano y se purificó mediante HPLC preparativa para proporcionar el compuesto I-59 (13 mg, 9%) como un sólido rojo. 1H NMR (400 MHz, CD3OD): 5 1.35 (d, J=6.8 Hz, 3H), 1.88-1.97 (m, 2H), 2.19-2.30 (m, 2H), 2.94 (s, 3H), 3.07-3.15 (m, 2H), 3.51-3.60 (m, 3H), 3.70-3.79 (m, 1H), 3.88-3.91 (m, 1H), 5.57 (br s, 1H), 7.54 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.86 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.00 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.18 (s, 1H), 9.08 (d, J=9.2 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 524.6.
Ejemplo 42
Figure imgf000111_0002
Síntesis de (R)-3-((6-cloro-2-(((R)-1-metilpirrolidin-3-il)oxi)pirimidin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-60)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-59 sustituyendo (R)-6-cloro-2-((1-metilpirrolidin-3-il)oxi)pirimidin-4-amina (INT-28) por (rac)-6-cloro-2-((1-metilpiperidin-3-il)oxi)pirimidin-4-amina para proporcionar el compuesto I-60 (10,0 mg, 7%) como un sólido amarillo pálido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 51.19 (d, J=6.5 Hz, 3H), 2.27 (s, 3H), 2.32-2.36 (m, 2H), 2.66-2.68 (m, 3H), 2.83-2.87 (m, 1H), 3.45 (br s, 2H), 3.60 (br s, 1H), 5.34 (br s, 1H), 6.98 (br s, 1H), 7.72-7.74 (m, 1H), 7.81 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.91 -7.97 (m, 2H), 8.06 (d, J=8.9 Hz, 1H), 9.14 (d, J=9.3 Hz, 1H), 10.7 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 510.4.
Ejemplo 43
Figure imgf000112_0001
Síntesis de (R)-3-((6-cloro-2-(2-metoxietoxi)pirimidin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-67)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-59 sustituyendo 2-cloro-6-(2-metox¡etox¡)p¡rim¡d¡n-4-am¡na (S5-4) por (rac)-6-cloro-2-((1-metilpiperidin-3-il)oxi)pirimidin-4-amina para dar el compuesto I-67 (25 mg, 18%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 51.19 (d, J=6.6 Hz, 3H), 3.34 (s, 3H), 3.45 (br s, 2H), 3.60 (br s, 1H), 3.68 (t, J=4.4 Hz, 2H), 4.44 (t, J=4.4 Hz, 2H), 6.98 (br s, 1H), 7.79-7.82 (m, 2H), 7.97-7.98 (m, 2H), 8.06 (d, J=8.8 Hz, 1H), 9.14 (d, J=9.3 Hz, 1H), 10.73 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 485.4.
Ejemplo 44
Figure imgf000112_0002
Síntesis de (R)-3-((6-cloro-2-(2-(4-metilpiperazin-1-il)etoxi)pirimidin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-66)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-59 sustituyendo 6-cloro-2-(2-(4-metilpiperazin-1-il)etoxi)pirimidin-4-amina (INT-29) por 6-cloro-2-(2-(4-metilpiperazin-1-il)etoxi)pirimidin-4-amina para dar el compuesto I-66 (10 mg, 4,1%) como un sólido amarillo claro. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.19 (d, J=6.7 Hz, 3H), 1.88 (s, 1H), 2.13 (s, 3H), 2.30 (br s, 4H), 2.50 (br s, 4H), 2.67-2.70 (t, J=5.7 Hz, 2H), 3.45 (br s, 2H), 3.60 (br s, 1H), 4.41-4.43 (t, J=5.6 Hz, 2H), 7.80-7.91 (br m, 3H), 7.98 (d, J=3.7 Hz, 1H), 8.06 (d, J=8.9 Hz, 1H), 9.13 (d, J=9.3 Hz, 1H), 10.72 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 553.1.
Ejemplo 45
Figure imgf000113_0001
Síntesis de (R)-3-((4-cloro-6-(2-(4-metilpiperazin-1-il)etoxi)pirimidin-2-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-61)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-59 sustituyendo 6-cloro-2-(2-(4-met¡lp¡peraz¡n-1-¡l)etox¡)p¡r¡mid¡n-4-am¡na (INT-46) por (rac)-6-cloro-2-((1-metilpiperidin-3-il)oxi)pirimidin-4-amina para proporcionar el compuesto I-61 (14 mg, 14,6%) como un sólido amarillo claro. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 51.19 (d, J=6.6 Hz, 3H), 2.11 (s, 3H), 2.27 (br s, 4H), 2.49 (br s, 4H), 2.67-2.70 (t, J=5.6 Hz, 2H), 3.45 (br s, 2H), 3.60 (br s, 1 H), 4.49-4.52 (t, J=5.6 Hz, 2H), 6.54 (s, 1H), 7.01 (br s, 1H), 7.76 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.97 (d, J=3.2 Hz, 1H), 8.04 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.39 (d, J=9.2 Hz, 1H), 9.15 (d, J=9.3 Hz, 1H), 10.39 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 553.2.
Ejemplo 46
Figure imgf000113_0002
Síntesis de (R)-3-((4-cloro-6-(2-metoxietoxi)pirimidin-2-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-69)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-59 sustituyendo 4-cloro-6-(2-metoxietoxi)pirimidin-2-amina (INT-45) por (rac)-6-cloro-2-((1-metilpiperidin-3-il)oxi)pirimidin-4-amina para dar el compuesto I-69 (8,0 mg, 12%) como un sólido amarillo. 1H n Mr (400 MHz, DMsO-ds): 51.19 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.30 (s, 3H), 3.45 (s, 2H), 3.59-3.60 (br m, 1H), 3.70 (t, J=4.5 Hz, 2H), 4.52 (t, J=4.3 Hz, 2H), 6.57 (s, 1H), 7.00 (br s, 1H), 7.76 (d, J=8.9 Hz, 1H), 7.96 (br s, 1H), 8.03 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.40 (d, J=9.3 Hz, 1H), 9.15 (d, J=9.4 Hz, 1H), 10.41 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 485.1.
Ejemplo 47
Figure imgf000114_0001
Síntesis de 4-cloro-6-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)pirimidina-2-carboxilato de (R)-metilo (1-70)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que 1-59 sustituyendo 4-amino-6-cloropirimidin-2-carboxilatodemetilo (S6-5) por (rac)-6-cloro-2-((1-metilpiperidin-3-il)oxi)pirimidin-4-amina para dar el compuesto 1-70 (10,0 mg, 11%) como un sólido amarillo pálido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.19 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.45 (br s, 2H), 3.60 (br s, 1H), 3.92 (s, 3H), 6.98 (br s, 1H), 7.80 (br s, 1H), 7.87 (d, J=8.9 Hz, 1H), 7.98 (br s, 1H), 8.08 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.67 (br s, 1H), 9.14 (d, J=9.2 Hz, 1H), 11.23 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 469.0.
Ejemplo 48
Figure imgf000114_0002
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que 1-59 sustituyendo 6-fluoro-2-(piperidin-1-ilmetil)pirimidin-4-amina (S7-8) por (rac)-6-cloro-2-((1-metilpiperidin-3-il)oxi)pirimidin-4-amina para dar el compuesto 1-74 (44 mg, 29%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 5 1.18 (d, J=6.8 Hz, 3H), 1.38 (m, 2H), 1.51 (m, 4H), 2.45-2.48 (m, 4H), 3.44 (m, 2H), 3.52 (s, 2H), 3.59 (m, 1H), 6.96 (m, 1H), 7.71 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.87 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.96 (m, 1H), 8.03-8.05 (m, 2H), 9.08 (d, J=9.2 Hz, 1H), 10.89 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 492.4. Ejemplo 49
Figure imgf000115_0001
Síntesis de (R)-3-((6-fluoro-2-((4-metilpiperazin-1-il)metil)pirimidin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-73)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-59 sustituyendo 6-fluoro-2-((4-metilpiperazin-1-¡l)met¡l)p¡r¡mid¡n-4-am¡na (INT-30) por (rac)-6-cloro-2-((1-metilpiperidin-3-il)oxi)pirimidin-4-amina para dar el compuesto I-73 (40 mg, 39%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSo-ds): 51.18 (d, J=6.8 Hz, 3H), 2.14 (s, 3H), 2.32-2.40 (m, 4H), 2.52-2.58 (m, 4H), 3.44 (m, 2H), 3.55 (s, 2H), 3.59-3.65 (m, 1H), 6.96 (m, 1H), 7.72 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.87 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.97 (m, 1H), 8.03-8.05 (m, 2H), 9.09 (d, J=9.6 Hz, 1H), 10.89 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 507.5.
Ejemplo 50
Figure imgf000115_0002
Síntesis de (R)-3-((4-cloro-6-(4-metilpiperazin-1-il)-1,3,5-triazin-2-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-10)
En un matraz de fondo redondo de 10 ml había (R)-3-bromo-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-31) (0,03 g, 0,083 mmol), 4-cloro-6-(4-metilpiperazin-1-il)-1,3,5-triazin-2-amina (0,019 g, 0,083 mmol, ver la sección "síntesis de productos intermedios" para la síntesis) y K2CO3 (0,034 g, 0,248 mmol) en 1,4-dioxano (5 ml) para dar una suspensión amarilla. Se añadieron Pd2(dba)3 (7,58 mg, 8,28 gmol) y 2'-(diciclohexilfosfino)-N,N-dimetil-[1,1'-bifenil]-2-amina (DavePhos 6,52 mg, 0,017 mmol) y la reacción se calentó a reflujo bajo nitrógeno durante 4 horas. Después, la reacción se enfrió, se filtró sobre una almohadilla de sílice y se concentró. El residuo resultante se volvió a disolver en 1 ml de DMSO y se purificó mediante HPLC de fase inversa con 95%-5% de H2O (que contenía TFA al 0,5% v/v)/acetonitrilo para proporcionar el compuesto I-10 (0,0027 g, 5,29 gmol, rendimiento del 6,39%). MS: m/z 510.1 (M+H), 507.7 (M-H).
Ejemplo 51
Figure imgf000116_0001
Síntesis de (R)-3-((4-cloropirimidin-2-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-13)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-10 sustituyendo 4-clorop¡r¡mid¡n-2-am¡na por 4-cloro-6-(4-met¡lp¡peraz¡n-1-¡l)-1,3,5-triaz¡n-2-am¡na para proporcionar el compuesto I-13 (0,0018 g, 4,38 gmol, rendimiento del 5,29%). MS: m/z 410.2 (M+H).
Ejemplo 52
Figure imgf000116_0002
Síntesis de (R)-3-((2-(dimetilamino)etil)(6-fluoropirimidin-4-il)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-33)
En un vial de microondas de 10 ml se disolvieron Pd2(dba)3 (7,20 mg, 7,87 gmol), carbonato de cesio (0,051 g, 0,157 mmol), diciclohexil(2',6'-diisopropoxi-[1,1'-bifenil]-2-il)fosfina (SPhos, 7,34 mg, 0,016 mmol), N1-(6-fluoropirimidin-4-il)-N2,N2-dimetiletano-1,2-diamina (INT-32) (0,017 g, 0,094 mmol) y (R)-3-cloro-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (S1-12) (0,025 g, 0,079 mmol) en 5 ml de 1,4-dioxano seco. La reacción se puso al vacío, se sonicó y se volvió a llenar con nitrógeno. La reacción se irradió en un microondas Biotage Explorer a 130° C durante 3 horas. La reacción se enfrió, se filtró y se concentró hasta la sequedad. El residuo se volvió a disolver en DMSO y se purificó por HPLC de fase inversa con 95%-5% de H2O (que contenía TFA al 0,5% v/v)/acetonitrilo para proporcionar el compuesto I-33 (0,0066 g, 0,014 mmol, rendimiento del 18,02%). 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 5 1.18 (d, 3H), 2.99 (s, 6H), 3.48 (m, 6H), 3.60 (m, 2H), 4.61 (m, 2H), 7.17 (t, 1H), 7.85 (d, 1H), 7.96 (d, 1H), 7.18 (m, 2H), 8.61 (s, 1H), 9.24 (d, 1H), 9.58 (br s, 1H).
Ejemplo 53
Figure imgf000117_0001
Síntesis de (R)-3-((6-fluoropirimidin-4-il)(2-metoxietil)amino)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-36)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-33 sustituyendo 6-fluoro-N-(2-metox¡et¡l)p¡rim¡d¡n-4-am¡na (INT-33) por N1-(6-fluoropirimidin-4-il)-N2,N2-dimetiletano-1,2-diamina para proporcionar el compuesto I-36 (0,0019 g, 4,20 gmol, rendimiento del 3,34%). MS: m/z 453.0 (M+H), 450.8 (M-H).
Ejemplo 54
Figure imgf000117_0002
Síntesis de (R)-3-((2-fluoropirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-52)
En un vial de 20 ml se suspendió (R)-3-hidroxi-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-6) (0,072 g, 0,241 mmol) en 3 ml de DMF seca. Se añadió hidruro de sodio (60% en peso en aceite de dispersión, 9,62 mg, 0,241 mmol) y la reacción se calentó a 90° C. El material de partida se disuelve lentamente en la solución a medida que se libera gas y el color se vuelve ámbar oscuro. Después de 10 min de calentamiento, la reacción se enfría a 0° C y se añade gota a gota 2,4-difluoropirimidina (0,028 g, 0,241 mmol). La reacción se agitó a temperatura ambiente o se calentó a 50° C. Una vez completada, la reacción se inactivó con NH4Cl saturado (ac.) y se vierte en agua. La reacción se extrajo tres veces con diclorometano y los extractos orgánicos se combinaron, se secaron sobre sulfato de sodio y se concentraron al vacío. El residuo resultante se volvió a disolver en DMSO y se purificó por HPLC de fase inversa con 95%-5% de H2O (que contenía TFA al 0,5% v/v)/acetonitrilo para proporcionar el compuesto I-52 (0,036 g, 0,091 mmol, rendimiento del 37,9%). MS: m/z 395.9 (M+H), 393.7 (M-H). 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 51.17 (d, 3H), 3.43 (m, 2H), 3.59 (m, 1H), 5.72 (s, 1H), 7.14 (t, 1H) 7.39 (m, 1H), 7.64 (d, 1H), 7.84 (d, 1H), 8.15 (m, 2H), 8.77 (m, 1H), 9.36 (d, 1H).
Ejemplo 55
Figure imgf000118_0001
Síntesis de (R)-3-((6-cloro-2-metilpirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-58)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-52 sustituyendo 4,6-d¡cloro-2-met¡lp¡r¡m¡dina por 2,4-difluoropirimidina para proporcionar el compuesto I-58 (0,005 g, 0,01 mmol, rendimiento del 16,9%). MS: m/z 425.9 (M+H), 423.6 (M-H). 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.42 (d, 3H), 3.59 (m, 1H), 3.75 (d, 1H), 3.84 (m, 1H), 5.36 (br s, 1H), 7.07 (br s, 1H), 7.13 (s, 1H), 7.26 (s, 1H), 7.36 (d, 1H), 7.92 (d, 2H), 7.99 (d, 1H) 9.00 (d, 1H).
Ejemplo 56
Figure imgf000118_0002
Síntesis de (R)-3-((6-cloro-2-(metoximetil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-57)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-52 sustituyendo 4,6-dicloro-2-(metoximetil)pirimidina por 2,4-difluoropirimidina para proporcionar el compuesto I-57 (0,025 g, 0,055 mmol, rendimiento del 11%) MS: m/z 455.8 (M+H), 453.6 (M-H). 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 5 1.18 (d, 3H), 3.27 (s, 3H), 3.61 (m, 3H), 4.42 (s, 2H), 7.15 (br s, 1H), 7.55 (s, 1H), 7.60 (d, 1H), 7.83 (d, 1H), 8.16 (m, 2H), 9.35 (d, 1H). Ejemplo 57
Síntesis de (R)-3-((6-cloropirazin-2-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-55)
Figure imgf000119_0001
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-52 sustituyendo 2,6-dicloropirazina por 2,4-difluoropirimidina para proporcionar el compuesto I-55 (2,4 mg, 4,51 pmol, rendimiento del 9,01%) como un sólido amarillo. LCMS m/z: 411.8 [M+H].
Ejemplo 58
Figure imgf000119_0002
Síntesis de (R)-3-((6-clorop¡r¡m¡d¡n-4-¡l)oxi)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-56)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-52 sustituyendo 4,6-dicloropirimidina por 2,4-difluoropirimidina para proporcionar el compuesto I-56. MS m/z: 411.8 [M+H]. 1H-NMR (400 MHz, CDCh): 59.02 (d, 1H), 8.65 (s, 1H), 8.04-7.92 (m, 2H), 7.39 (d, 1H), 7.30 (s, 1H), 3.86 (m, 1H), 3.80-3.72 (m, 1H), 3.60 (m, 1H), 1.44 (d, 3H).
Ejemplo 59
Figure imgf000119_0003
Síntesis de (R)-3-((2-cloropirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-53)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-52 sustituyendo 2,4-dicloropirimidina por 2,4-difluoropirimidina para proporcionar el compuesto I-53 (30 mg, 20%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.20 (d, J=6.6 Hz, 3H), 3.46 (br s, 2H), 3.60 (br s, 1H), 7.10 (br s, 1H), 7.42 (d, J=5.6 Hz, 1H), 7.61 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.84 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.04 (br s, 1H), 8.17 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.74 (d, J=5.6 Hz, 1H), 9.37 (d, J=9.0 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 412.3.
Ejemplo 60
Figure imgf000120_0001
Síntesis de (R)-3-((6-fluoro-2-met¡lp¡r¡m¡d¡n-4-il)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-65)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-52 sustituyendo 4,6-d¡fluoro-2-met¡lp¡rim¡d¡na por 2,4-difluoropirimidina para proporcionar el compuesto I-65 como un sólido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): d 9.33 (d, 1H), 8.15 (m, 2H), 7.82 (m, 1H), 7.56 (d, 1H), 7.13 (br s, 1H), 7.03 (s, 1H), 3.58-3.43 (m, 3H), 2.40 (s, 3H), 1.17 (d, 3H). MS m/z: 409.9 (M+H).
Ejemplo 61
Figure imgf000120_0002
Síntes¡s de (R)-met¡l4-cloro-6-((10-met¡l-8-oxo-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]quinolin-3-il)oxi)pirimidina-2-carboxilato (I-71)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-52 sustituyendo 4,6-dicloropirimidina-2-carboxilato de metilo por 2,4-difluoropirimidina para proporcionar el compuesto I-71 (16 mg, 11,3%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 5 1.20 (d, J=6.6 Hz, 3H), 3.46 (br s, 2H), 3.61 (br s, 1H), 3.82 (s, 3H), 7.10 (br s, 1H), 7.61 (d, J=9.1 Hz, 1H), 7.82 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.86 (s, 1H), 8.05 (br s, 1H), 8.17 (d, J=8.9 Hz, 1H), 9.37 (d, J=9.1 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 470.1.
Ejemplo 62
Figure imgf000120_0003
Síntesis de (R)-3-((6-cloro-2-(hidroximetil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-68)
A una solución de 4-cloro-6-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6'):4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)oxi)pirimidin-2-carboxilato de (R)-metilo (I-71) (30 mg, 0,06 mmol) en tetrahidrofurano (3,0 ml), se le añadió hidruro de diisobutilaluminio (1 M) (72,6 mg, 0,50 ml, 0,5 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se inactivó con una solución saturada de cloruro de amonio (5 ml) y se extrajo con acetato de etilo (2 x 15 ml). La capa orgánica se lavó con (2 x 10 ml) agua seguido de salmuera (1 x 10 ml). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida. El producto bruto se purificó mediante TLC preparativa para proporcionar el compuesto I-68 (6,0 mg, 18%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 51.19 (d, J=6.6 Hz, 3H), 3.46 (br s, 2H), 3.60 (br s, 1H), 4.43 (d, J=6.6 Hz, 2H), 5.34 (t, J=6.2 Hz, 1H), 7.09 (br s, 1H), 7.44 (s, 1H), 7.57 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.82 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.04 (br s, 1H), 8.15 (d, J=8.8 Hz, 1H), 9.35 (d, J=9.1 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 442.4. Ejemplo 63
Figure imgf000121_0001
Síntesis de (R)-3-((4-cloro-6-(pirrolidin-1-il)-1,3,5-triazin-2-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-62)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-52 sustituyendo 2,4-dicloro-6-(pirrolidin-1-il)-1,3,5-triazina (INT-34) por 2,4-difluoropirimidina para proporcionar el compuesto I-62. MS: m/z: 481.9 [M+1]. 1H-NMR (400 MHz, CDCla): 58.98 (d, 1H), 7.99-7.88 (m, 2H), 7.32 (d, 1H), 6.12 (s, 1H), 5.28 (t, 1H), 3.87-3.79 (m, 1H), 3.76­ 3.69 (m, 1H), 3.63 (t, 2H), 3.60-3.52 (m, 1H), 3.44 (t, 2H), 2.02-1.89 (m, 4H), 1.40 (d, 3H).
Ejemplo 64
Figure imgf000121_0002
Síntesis de (R)-3-((4-cloro-6-morfolino-1,3,5-triazin-2-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-63)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-52 sustituyendo 4-(4,6-dicloro-1,3,5-triazin-2-il)morfolina (INT-35) por 2,4-difluoropirimidina para proporcionar el compuesto I-63. MS: m/z 497.9 [M+H]. 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.33 (d, 1H), 8.20-8.13 (m, 2H), 7.87 (d, 1H), 7.62 (d, 1H), 7.15 (s, 1H), 3.80-3.70 (m, 3H), 3.68-3.62 (t, 2H), 3.59-3.53 (m, 4H), 3.45 (m, 2H), 1.199d, 3H).
Ejemplo 65
Figure imgf000122_0001
Síntesis de (R)-3-((4-cloro-6-(p¡per¡d¡n-1-¡l)-1,3,5-tr¡az¡n-2-il)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-64)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-52 sustituyendo 2,4-dicloro-6-(piperidin-1 -il)-1,3,5-triazina (INT-36) por 2,4-difluoropirimidina para producir compuesto I-64. MS: m/z: 495.8 [M+H].
Ejemplo 66
Figure imgf000122_0002
Síntes¡s de (R)-3-((4-cloro-6-(d¡met¡lam¡no)-1,3,5-tr¡az¡n-2-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-75)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-52 sustituyendo 4,6-dicloro-N,N-dimetil-1,3,5-triazin-2-amina (INT-37) por 2,4-difluoropirimidina para proporcionar el compuesto I-75. MS: m/z 455.8 [M+H]. 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.33 (d, 1H), 8.21-8.14 (m, 2H), 7.889d, 1H), 7.63 (d, 1H), 7.15 (s, 1H), 3.65-3.57 (m, 1H), 3.50-3.44 (m, 2H), 3.12 (s, 3H0, 2.96 (s, 3H), 1.199d, 3H).
Ejemplo 67
Figure imgf000123_0001
Síntesis de (R)-3-((4-cloro-6-metoxi-1,3,5-triazin-2-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-76)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-52 sustituyendo 2,4-dicloro-6-metoxi-1,3,5-triazina (INT-38) por 2,4-difluoropirimidina para proporcionar el compuesto I-76. MS: m/z 442.7 [M+H]. 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.38 (d, 1H), 8.24-8.14 (m, 2H), 7.92-7.87 (m, 1H), 7.71-7.66 (m, 1H), 7.17 (s, 1H), 3.96 (s, 3H), 3.66-3.56 (m, 1H), 3.50-3.40 (m, 2H), 1.19 (d, 3H).
Ejemplo 68
Figure imgf000123_0002
Síntesis de (R)-3-((4-cloro-6-(3,3-difluoropirrolidin-1-il)-1,3,5-triazin-2-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-77)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-52 sustituyendo 2,4-dicloro-6-(3,3-difluoropirrolidin-1 -il)-1,3,5-triazina (INT-39) por 2,4-difluoropirimidina para proporcionar el compuesto I-77. MS: m/z 517.8 [M+H].
Ejemplo 69
Figure imgf000123_0003
Síntesis de (R)-3-((4-cloro-6-(3,3-difluoropiperidin-1-il)-1,3,5-triazin-2-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-78)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-52 sustituyendo 2,4-dicloro-6-(3,3-difluoropiperidin-1 -il)-1,3,5-triazina (INT-40) por 2,4 -difluoropirimidina para proporcionar el compuesto I-78. MS: m/z 531.8 [M+H]. 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 9.34 (dd, 1H), 8.20 (dd, 1H), 8.16 (d, 1H), 7.88 (dd, 1H), 7.66 (dd, 1H), 7.16 (s, 1H), 4.15 (t, 1H), 3.97 (t, 2H), 3.84 (t, 3H), 3.65 (m, 2H), 2.12 (m, 2H), 1.78-1.60 (m, 2H), 1.19 (d, 3H).
Ejemplo 70
Figure imgf000124_0001
Síntesis de (R)-3-((6-cloropiridazin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-J]quinolin-8-ona
En un vial de microondas, se añadió NaH (26,7 mg, 0,668 mmol) a INT-6 (50 mg, 0,167 mmol) en DMF (4 ml) y se calentó convencionalmente a 55° C durante una hora. Luego, la mezcla de la reacción se enfrió a 0° C y se añadió 3,5-dicloropiridazina (49,8 mg, 0,334 mmol) en 0,5 ml de DMF. La mezcla resultante se irradió a 100° C durante 1 h 45 min. Una vez completada la reacción, la mezcla bruta se purificó directamente mediante HPLC preparativa usando CH3CN/H2O (ácido fórmico al 0,1%) como eluyentes para proporcionar I-79 (15 mg, 0,036 mmol, rendimiento del 21,80%) como un sólido. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.43 (s, 1H), 9.34 (d, 1H), 8.14-8.07 (m, 3H), 7.74 (d, 1H), 7.56 (d, 1H), 7.10 (br t, 1H), 3.44-3.30 (m, 3H, fusionado con DMSO-H2O pico), 1.16 (d, 3H). MS m/z=411.8 (M+1+).
Ejemplo 71
Figure imgf000124_0002
Síntesis de (R)-3-((6-fluoropirimidin-4-il)tio)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-54)
A una suspensión de hidruro de sodio (22,83 mg, 0,9 mmol) en dimetilformamida (1,0 ml), se añadieron ((R)-3-mercapto-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6' :4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (iNt-7) (100 mg, 0,3 mmol) y 4,6-difluoropirimidina (73,6 mg, 0,6 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 90° C durante 2 h. Una vez completada la reacción, la mezcla de la reacción se inactivó con agua y se extrajo con metanol al 5% en diclorometano (3 x 5 ml). La capa se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante TLC preparativa para proporcionar el compuesto I-54 (15 mg, 10%) como un sólido amarillo. 1H n M r (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.19 (d, J=6.7 Hz, 3H), 3.46 (br s, 2H), 3.61 (br s, 1H), 7.11 (br s, 1H), 7.48 (s, 1H), 7.92-7.96 (m, 2H), 8.05 (br s, 1H), 8.20 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.78 (br s, 1H), 9.25 (d, J=9.0 Hz, 1H). MS: m/z 412.3 (M+H).
Ejemplo 72
Figure imgf000125_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloropirimidin-4-il)tio)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-72)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-54 sustituyendo 2,4-dicloropirimidina por 4,6-difluoropirimidina para proporcionar el compuesto I-72 (25 mg, 18%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 1.19 (d, J=6.6 Hz, 3H), 3.45 (br m, 2H), 3.60 (br m, 1H), 7.12 (br s, 1H), 7.57 (d, J=5.4 Hz, 1H), 77.95­ 7.97 (m, 2H), 8.07 (br s, 1H), 8.21 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.53 (d, J=5.4 Hz, 1H), 9.26 (d, J=8.9 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 428.3.
Ejemplo 73
Figure imgf000125_0002
Síntesis de (S)-3-((6-fluoropirimidin-4-il)amino)-10-(hidroximetil)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-17)
A una solución agitada de (S)-3-cloro-10-(hidroximetil)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-1) (50 mg, 0,15 mol) 6-fluoropirimidin-4-amina (33,9 mg, 0,3 mmol) en 1,4-dioxano (10 ml) se le añadió carbonato de cesio (146,42 mg, 0,45 mmol) y la solución se desgasificó con argón durante 10 min. A la solución anterior se le añadió Xantphos (8,6 mg, 0,015 mmol) seguido de Pd2(dba)3 (14 mg, 0,015 mmol) y la solución se desgasificó de nuevo durante 5 min con argón y se agitó a 100° C durante 16 h. Una vez completada, se añadieron agua con hielo (5 ml) y diclorometano (10 ml) a la mezcla de la reacción y se agitó durante 30 min. Se formó un sólido y se recogió por filtración y se lavó con agua (5 ml) seguido de metanol (5 ml) para proporcionar el compuesto I-17 (40 mg, rendimiento del 63%) como un sólido marrón. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 53.43-3.59 (m, 5H), 4.95 (t, J=5 Hz, 1H), 6.96 (t, J=4.8 Hz, 1H), 7.68 (d, J=9 Hz, 1H), 7.84 (s, 1H), 7.89 (d, J=9 Hz, 1H), 8.05 (d, J=9 Hz, 1H), 8.17 (s, 1H), 8.58 (s, 1H), 9.09 (d, J=9 Hz, 1H), 10.92 (s, 1H). MS m/z (M+H): 411.2.
Ejemplo 74
Figure imgf000126_0001
Síntesis de (S)-3-((6-cloropirimidin-4-il)amino)-10-(hidroximetil)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-22)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-17 sustituyendo 6-clorop¡r¡mid¡n-4-am¡na por 6-fluorop¡rim¡d¡n-4-am¡na para proporcionar el compuesto 1-22 (20 mg) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-D6): 5: 3.43-3.59 (m, 5H), 4.95 (t, J=5 Hz, 1H), 6.96 (t, J=4.8 Hz, 1H), 7.75 (d, J=9 Hz, 1H), 7.82 (s, 1H), 7.85 (s, 1H), 8.06 (d, J=9 Hz, 1H), 8.46 (br s, 1H), 8.63 (s, 1H), 9.10 (d, J=9.3 Hz, 1H), 10.86 (s, 1H). MS m/z (M+H): 427.37.
Ejemplo 75
Figure imgf000126_0002
Síntesis de (S)-2-cloro-4-((10-(hidroximetil)-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)pirimidina-5-carboxamida (I-30)
A una solución de (S)-2-cloro-4-((10-(hidroximetil)-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6'4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)amino)-N-(4-metoxibencil)pirimidin-5-carboxamida (INT-52) (22 mg, 0,04 mmol) en diclorometano (2,0 ml) se añadieron ácido trifluoroacético (0,5 ml, 0,04 mmol) seguido de ácido trifluorometanosulfónico (55,9 mg, 0,4 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 1 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida y se co-destiló con diclorometano (2 x 10 ml). El material bruto obtenido se diluyó con solución saturada de bicarbonato de sodio (10 ml) y se agitó durante 10 min. después de lo cual se formó un precipitado. El precipitado se filtró y se lavó con agua seguido de metanol al 2% en diclorometano y se secó para proporcionar el compuesto I-30 (11 mg, 52%) como un sólido marrón. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 3.42-3.50 (m, 3H), 3.55-3.58 (m, 2 h ), 4.95 (br s, 1H), 7.04 (br s, 1H), 7.82 (d, J=8.9 Hz, 1H), 7.85 (br s, 1H), 8.07-8.09 (m, 2H), 8.52 (s, 1H), 8.61 (d, J=9.3 Hz, 1H), 8.90 (s, 1H), 9.25 (d, J=9.5 Hz, 1H), 12.12 (s, 1H). MS m/z (M+H): 470.2.
Ejemplo 76
Figure imgf000126_0003
Síntesis de (R)-10-(aminometil)-3-((6-fluoropirimidin-4-il)amino)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (S8-6 , I-26)
A una solución agitada de ((3-((6-fluoropirimidin-4-il)amino)-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1.4] Seañadiódiazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-l0-il)metil)carbamato de (S)-terc-butilo (S8-5) (16,0 mg, 0,03 mmol) en diclorometano (2,0 ml) se le añadió ácido trifluoroacético (1,1 ml) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 1 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se concentró a presión reducida. El material bruto se trituró con éter dietílico para producir la sal de trifluoroacetato del compuesto I-26 (14 mg) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 52.81-2.88 (m, 1H), 2.97-3.02 (m, 1H), 3.78-3.80 (m, 1H), 3.80-3.88 (m, 2H), 7.05 (br s, 1H), 7.72 (d, J=9.3 Hz, 1H), 7.83 (br s, 2H), 7.93 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.07-8.10 (m, 2H), 8.17 (s, 1H), 8.59 (s, 1H), 9.07 (d, J=9.1 Hz, 1H), 10.94 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 410.3. Ejemplo 77
Figure imgf000127_0001
Síntesis de (R)-10-(aminometil)-3-((6-cloropirimidin-4-il)amino)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (1-28)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que 1-17 sustituyendo 6-cloropirimidin-4-amina por 6-fluoropirimidin-4-amina y (R)-10-(aminometil)-3-cloro-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-47) por (S)-3-cloro-10-(hidroximetil)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-1) para proporcionar el compuesto I-28 como un sólido naranja. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 2.79-2.80 (m, 1H), 2.98-3.01 (m, 2H), 3.07-3.10 (m, 1H), 3.69-3.79 (m, 2H), 3.82-3.88 (m, 1H), 7.78-7.88 (m, 3H), 8.08-8.10 (m, 2H), 8.45 (br s, 1H), 8.64 (s, 1H), 9.08 (d, J=9.1 Hz, 1H), 10.89 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 426.3.
Ejemplo 78
Figure imgf000127_0002
Síntesis de (S)-10-((dimetilamino)metil)-3-((6-fluoropirimidin-4-il)amino)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-31)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-17 sustituyendo (S)-3-cloro-10-((dimetilamino)metil)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-48 ) por (S)-3-cloro-10-(hidroximetil)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (InT-1 ), para proporcionar el compuesto I-31 (6,0 mg, 40%) como un sólido amarillo. 1H N m R (400 MHz, DMSO-d6): 5 2.25 (s, 3H), 2.52-2.54 (m, 2H), 3.22-3.25 (m, 1H), 3.32-3.35 (m, 1H), 3.55-3.60 (m, 1H), 7.14 (t, J=5.6 Hz, 1H), 7.70 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.89 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.19 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.23 (br s, 1H), 9.24 (d, J=9.2 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 347.1. Ejemplo 79
Figure imgf000128_0001
Síntesis de (R)-3-((6-fluoropirimidin-4-il)amino)-10-((metilamino)metil)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-35)
El compuesto del título se sintetizó de la misma manera que I-17 sustituyendo (R)-3-cloro-10-((metilamino)met¡l)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (INT-50) por (S)-3-cloro-10-(hidroximetil)-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (iNt-1 ) para proporcionar el compuesto I-35 (17 mg, 14%) como un sólido marrón claro. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 52.26 (s, 3H), 2.31-2.33 (m, 1H), 2.40-2.50 (m, 1H), 3.22-3.25 (m, 1H), 3.55 (m, 2H), 7.05 (m, 1H), 7.69 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.90 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.06 (d, J=8.9 Hz, 1H), 8.17 (d, J=9.5 Hz, 2H), 8.58 (s, 1H), 9.14 (d, J=9.1 Hz, 1H), 10.9 (br s, 1H). MS m/z (M+H): 424.2.
Ejemplo 80
Figure imgf000128_0002
Síntesis de (R)-3-((5-((terc-butil(metil)amino)metil)-2-cloropirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-80)
A una suspensión agitada de INT-6 (75 mg, 0,2 mmol) en DMF anhidra (5 ml) se le añadió t-BuOK (28,1 mg, 0,25 mmol) a 0° C para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-90 (93,2 mg, 0,4 mmol) en DMF (2 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (20 ml) y agua (30 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 20 ml). La capa orgánica combinada se lavó con salmuera (50 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó el producto deseado I-80 (24 mg, 18%) como un sólido amarillo. (400 MHz, DMSo-d6): 59.34 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.70 (s, 1H), 8.15 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.03 (br, 1H), 7.82 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.56 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.10-7.11 (m, 1H), 3.66 (s, 2H), 3.61 (br, 1H), 3.46 (br, 2H), 2.17 (s, 3H), 1.19 (d, J=6.8 Hz, 3H), 1.10 (s, 9H). MS m/z (M+H): 511.3.
Ejemplo 81
Figure imgf000129_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((2-metoxietoxi)metil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-81)
En un matraz de fondo redondo de 100 ml, purgado y mantenido con una atmósfera inerte de nitrógeno, se disolvió INT-6 (115,9 mg, 0,39 mmol) en DMF (10 ml). Se añadió lentamente t-BuOK (1 M en THF) (0,64 ml, 0,64 mmol) mediante una jeringuilla a la solución a 0° C y la reacción cambió a marrón claro. La solución resultante se agitó durante 20 min a 0° C. Después de estos 20 min, se añadió gota a gota INT-64 (137 mg, 0,58 mmol) en DMF (2 ml) con agitación a 0° C. La solución resultante se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante la noche. La LCMS confirmó la formación del producto deseado. La reacción se concentró hasta la sequedad y el residuo se diluyó con EtOAc (300 ml) y se lavó con 2 x 300 ml de agua y luego 1 x 300 ml de solución de salmuera saturada. A continuación, el extracto orgánico se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró a sequedad. Luego, el material bruto se purificó mediante cromatografía en columna (DCM: MeOH = 30:1). Las fracciones deseadas se concentraron hasta la sequedad al vacío y se purificaron adicionalmente mediante HPLC preparativa para obtener (I-81) (536,7 mg, 28,5%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.37 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.72 (s, 1H), 8.20 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.15 (d, J=4.4 Hz, 1H), 7.87 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.63 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.19-7.16 (m, 1H), 4.71 (s, 2H), 3.73-3.71 (m, 2H), 3.63-3.61 (m, 1H), 3.55-3.54 (m, 2H), 3.51-3.44 (m, 2H), 3.28 (s, 3H), 1.20 (d, J=6.8 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 500.0.
Ejemplo 82
Figure imgf000129_0002
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-(etoximetil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-82)
A una solución de INT-6 (270 mg, 0,9 mmol) en DMA (o DMF) (3,0 ml) se le añadió terc-butóxido de potasio (202,4 mg, 1,8 mmol) a 0° C y se agitó durante 10 min. A la mezcla resultante se le añadió INT-60 (280,1 mg, 1,4 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 25° C durante 30 min. Una vez completada, la mezcla de la reacción se diluyó con agua (20,0 ml), después de lo cual se formó un sólido. El sólido se filtró y se secó al vacío produciendo 250 mg. El bruto se purificó mediante HPLC preparativa de fase inversa (10-95% de MeCN/agua, 0,1% de TFA) para producir I-82 (80 mg, 19%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.35 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.70 (br, 1H), 8.17 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.11 (d, J=4.0 Hz, 1H), 7.84 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.61 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.14 (t, J=4.8 Hz, 1H), 4.64 (s, 2H), 3.60-3.64 (m, 2H), 3.58 (br, 1H), 1.17-1.20 (m, 6H). MS m/z (M+H): 470.5. Ejemplo 83
Figure imgf000130_0001
Síntesis de ((10R)-3-((5-((3-azab¡c¡clo[3.1.0]hexan-3-¡l)met¡l)-2-clorop¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]tieno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-83)
A una suspensión agitada de INT-6 (130 mg, 0,43 mmol) en DMF anhidra (15 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,87 ml, 0,87 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 h a esta temperatura. Se añadió gota a gota I-75 (110 mg, 0,45 mmol) en DMF (3 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (50 ml) y agua (20 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 50 ml). Los extractos orgánicos combinados se lavaron con salmuera (30 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó el producto deseado I-83 (57,7 mg, 26,5%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 59.36 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.64 (s, 1H), 8.20-8.14 (m, 2H), 7.85 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.60 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.18-7.16 (m, 1H), 3.77 (s, 2H), 3.63-3.43 (m, 3H), 2.98 (d, J=8.4 Hz, 2H), 2.46 (d, J=8.0 Hz, 2H), 1.40-1.38 (m, 2H), 1.20 (d, J=6.8 Hz, 3H), 0.68­ 0.65 (m, 1H), 0.36-0.29 (m, 1H).
Ejemplo 84
Figure imgf000130_0002
Sintes¡s de ((R)-3-((2-cloro-5-((((S)-tetrah¡drofuran-3-¡l)ox¡)met¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,41]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-84)
A una solución agitada de INT-6 (207 mg, 0,690 mmol) en DMF (15 ml) se le añadió t-BuOK (155,19 mg, 1,38 mmol) a 0° C y la reacción se agitó durante 10 min. Luego se añadió una solución de INT-66 (189,47 mg, 0,76 mmol) en DMF (5 ml) a 0° C y la reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (50 ml) y agua (20 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 50 ml). Los extractos orgánicos combinados se lavaron con salmuera (30 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó el producto deseado I-84 (63,3 mg, 18%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.34 (d, J=8.0 Hz, 1H), 8.71 (s, 1H), 8.19-8.12 (m, 2H), 7.84 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.61 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.16-7.14 (m, 1H), 4.70-4.63 (m, 2H), 4.36-4.32 (m, 1H), 3.80-3.77 (m, 2H), 3.75-3.67 (m, 2H), 3.61-3.60 (m, 1H), 3.47-3.46 (m, 2H), 2.02-1.97 (m, 2H), 1.22-1.17 (m, 3H). MS m/z (M+H): 511.9.
Ejemplo 85
Figure imgf000131_0001
Síntesis de (R)-3-((5-((3-azab¡c¡clo[3.1.1]heptan-3-¡l)met¡l)-2-clorop¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]tieno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-85)
A una suspensión agitada de INT-6 (100 mg, 0,33 mmol) en DMF anhidra (10 ml), se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,67 ml, 0,67 mmol) a 0° C para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 h a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-76 (110 mg, 0,40 mmol) en DMF (3 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (50 ml) y agua (20 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 50 ml). La capa orgánica combinada se lavó con salmuera (30 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó el producto deseado I-85 (43,7 mg, 24,7%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds) 59.36 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.73 (s, 1H), 8.19-8.13 (m, 2H), 7.84 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.59 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.18-7.15 (m, 1H), 3.84 (s, 2H), 3.62-3.42 (m, 3H), 2.91 (s, 4H), 2.32-2.30 (m, 2H), 1.97-1.92 (m, 2H), 1.50-1.46 (m, 2H), 1.22 (d, J=11.2 Hz, 3H).
Ejemplo 86
Figure imgf000131_0002
Síntes¡s de (R)-3-((2-cloro-5,7-d¡h¡drofuro[3,4-d]p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-86)
En un vial de 20 ml, se añadió INT-6 (0,05 g, 0,167 mmol) a 3 ml de DMF seca y se sonicó brevemente. A esto, se le añadió K2CO3 (0,231 g, 1,670 mmol) y la reacción se calentó a 90° C durante 10 min. Luego, la reacción se enfrió a temperatura ambiente y se añadió 2,4-dicloro-5,7-dihidrofuro[3,4-d]pirimidina (0,055 g, 0,288 mmol) y posteriormente se calentó a 90° C durante 2 h. Una vez completada, la reacción se enfrió, se filtró para eliminar cualquier carbonato de potasio no disuelto y la mezcla de la reacción bruta se purificó directamente mediante HPLC preparativa de fase inversa (10-95% de MeCN/agua, 0,1% de TFA) para producir I-86 (0,052 g, 0,114 mmol, rendimiento del 68%) como un sólido amarillo después de la liofilización. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.31 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.13 (d, J=8.7 Hz, 1H), 8.10 (d, J=4.6 Hz, 1H), 7.79 (d, J=8.7 Hz, 1H), 7.58 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.11 (br, 1H), 4.98 (s, 4H), 3.55 (m, 1H), 3.39 (m, 2H), 1.12 (d, J=6.9 Hz, 3H) MS m/z (M+H): 453.8.
Ejemplo 87
Figure imgf000132_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((d¡¡soprop¡lam¡no)met¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-87)
A una suspensión de INT-6 (128 mg, 0,429 mmol) en DMF (3 ml) a temperatura ambiente se le añadió hidruro de sodio (60% en aceite) (20,59 mg, 0,515 mmol). El color de la reacción cambió de amarillo verdoso a marrón oscuro y en 10 minutos la reacción se volvió homogénea. Después de 20 min, la mezcla de la reacción se enfrió a 0° C y se añadió gota a gota una solución de INT-89 (135 mg, 0,515 mmol) en DMF (1,5 ml) durante 2 min. La reacción se agitó durante la noche y a la mañana siguiente la reacción se enfrió a 0° C, se inactivó con NH4Cl acuoso saturado (~1 ml, inicialmente gota a gota, precaución: desprendimiento de gas) y agua ~3 ml. Se retiró el baño de enfriamiento y se continuó agitando a RT durante 10 min para dar una suspensión amarilla. La reacción se extrajo con DCM (5 x 10 ml), la emulsión era persistente. Los extractos orgánicos se filtraron a través de Na2SO4 y se concentraron. El producto bruto se purificó mediante HPLC preparativa (10-95% de MeCN/agua, 0,1% de TFA). Se obtuvo I-87 (133 mg, 0,253 mmol, rendimiento del 59,0%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 59.36 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.88 (br, 2H), 8.17 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.13 (d, J=4.6 Hz, 1H), 7.83 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.63 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.14 (br, 1H), 4.51 (d, J=5.0 Hz, 2H) 3.82 (m, 2H), 3.57 (m, 1H), 3.42 (m, 2H), 1.40 (d, J=6.4 Hz, 6H), 1.34 (d, J=6.4 Hz, 6H), 1.14 (d, J=6.9 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 524.8.
Ejemplo I-88
Figure imgf000133_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((diisobutilamino)metil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-88)
A una suspensión agitada de INT-6 (31,3 mg, 0,1 mmol) en DMF anhidro (4 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,2 ml, 0,2 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón y la solución resultante se agitó durante 0,5 horas adicionales a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-77 (60,2 mg, 0,2 mmol) en DMF (1 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (5 ml) y agua (5 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 5 ml). La capa orgánica combinada se lavó con salmuera (10 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4., se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-88 (8,5 mg, 13,8%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.37 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.72 (s, 1H), 8.19-8.15 (m, 2H), 7.83 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.55 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.17-7.15 (m, 1H), 3.66-3.61 (m, 3H), 3.61-3.48 (m, 2H), 2.19­ 2.17 (m, 4H), 1.84-1.77 (m, 1H), 1.23-1.18 (m, 3H), 0.86-0.82 (m, 12H). MS m/z (M+H): 553.1.
Ejemplo 89
Figure imgf000133_0002
Síntesis de (10R)-3-((2-cloro-5-((2-(metoximetil)pirrolidin-1-il)metil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-89)
A una suspensión agitada de INT-6 (100 mg, 0,3 mmol) en DMF anhidra (10 ml) se añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,7 ml, 0,7 mmol) a 0° C, gota a gota, para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 10 min más a temperatura ambiente. Se añadió gota a gota INT-78 (184 mg, 0,6 mmol) en DMF (2 ml) a la solución anterior y se agitó 4 h a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (30 ml) y agua (40 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 30 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (80 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4., se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-89 (72,5 mg, 38,6%) como una mezcla 1:1 de diastereómeros. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 59.35 (d, J=9.1 Hz, 1H), 8.70 (s, 1H), 8.25­ 8.09 (m, 2H), 7.84 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.59 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.16 (t, J=5.2 Hz, 1H), 4.17 (d, J=14.8 Hz, 1H), 3.70­ 3.55 (m, 2H), 3.52-3.34 (m, 3H), 3.30-3.17 (m, 4H), 3.10-2.95 (m, 1H), 2.90-2.75 (m, 1H), 2.50-2.25 (m, 1H), 2.00­ 1.80 (m, 1H), 1.75-1.59 (m, 2H), 1.57-1.40 (m, 1H), 1.19 (d, J=6.8 Hz, 3H) MS m/z (M+H): 539.2.
Ejemplo 90
Figure imgf000134_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-(((2-metox¡et¡l)(met¡l)am¡no)met¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-90)
A una suspensión agitada de INT-6 (72 mg, 0,24 mmol) en DMF anhidra (5 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,48 ml, 0,48 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-79 (120 mg, 0,48 mmol) en DMF (1 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (20 ml) y agua (30 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 20 ml). La capa orgánica combinada se lavó con salmuera (50 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-90 (36,9 mg, 28,4%) como un sólido amarillo. 1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) 59.35 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.71 (s, 1H), 8.19-8.13 (m, 2H), 7.84 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.60 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.17-7.13 (m, 1H), 3.71 (s, 2H), 3.51-3.49 (m, 1H), 3.48-3.46 (m, 4H), 3.23 (s, 3H), 2.74-2.59 (m, 2H), 2.30 (s, 3H), 1.19 (d, J=6.6 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 513.0.
Ejemplo 91
Figure imgf000134_0002
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((isopropil(metil)amino)metil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-91)
A una suspensión agitada de INT-6 (39,9 mg, 0,13 mmol) en DMF anhidra (4 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,26 ml, 0,26 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-70 (62 mg, 0,26 mmol) en DMF (1 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (5 ml) y agua (5 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 5 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (10 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-91 (19 mg, 29%) como un sólido amarillo. 1H-NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.36 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.68 (s, 1H), 8.19-8.14 (m, 2H), 7.85 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.60 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.17-7.15 (m, 1H), 3.65-3.61 (m, 3H), 3.48-3.46 (m, 2H), 2.94-2.87 (m, 1H), 2.18 (s, 3H), 1.19 (d, J=6.8 Hz, 3H), 1.03 (d, J=6.4 Hz, 6H). MS m/z (M+H): 497.0.
Ejemplo 92
Figure imgf000135_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((ciclohexil(metil)amino)metil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-92)
A una suspensión agitada de INT-6 (198 mg, 0,66 mmol) en DMF anhidra (15 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 1,3 ml, 1,32 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón y la solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-72 (199,5 mg, 0,73 mmol) en DMF (5 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (20 ml) y agua (30 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 20 ml). La capa orgánica combinada se lavó con salmuera (50 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó el producto deseado I-92 (19,4 mg, 9,7%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.35 (d, J=8.0 Hz, 1H), 8.67 (s, 1H), 8.19-8.14 (m, 2H), 7.84 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.59 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.18-7.15 (m, 1H), 3.71 (s, 2H), 3.62-3.61 (m, 1H), 3.48-3.47 (m, 2H), 2.46-2.44 (m, 1H), 2.24 (s, 3H), 1.81 -1.71 (m, 4H), 1.32-1.15 (m, 9H). MS m/z (M+H): 537.4. Ejemplo 93
Figure imgf000136_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((4-metoxipiperidin-1-il)metil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-93)
A una suspensión agitada de INT-6 (90 mg, 0,3 mmol) en DMF anhidra (9 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,6 ml, 0,6 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón y la solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-73 (166,1 mg, 0,6 mmol) en DMF (2 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (30 ml) y agua (40 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 30 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (80 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-93 (43,5 mg, 26,2%) como un sólido amarillo. 1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) 59.35 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.19-8.14 (m, 2H), 7.84 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.60 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.18-7.15 (m, 1H), 3.64 (s, 3H), 3.61-3.46 (m, 2H), 3.22-3.15 (m, 4H), 2.77-2.75 (m, 2H), 2.27-2.20 (m, 2H), 1.86-1.72 (m, 2H), 1.51-1.40 (m, 2H), 1.20 (d, J=6.6 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 539.0.
Ejemplo 94
Figure imgf000136_0002
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((4-etilpiperazin-1-il)metil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-94)
A una suspensión agitada de INT-6 (80 mg, 0,27 mmol) en DMF anhidra (8 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,54 ml, 0,54 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón y la solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-74 (147,1 mg, 0,54 mmol) en DMF (2 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (30 ml) y agua (40 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 30 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (80 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-94 (38,9 mg, 26,7%) como un sólido amarillo. 1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) 59.31 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.20-8.14 (m, 2H), 7.84 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.61 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.18-7.16 (m, 1H), 3.66-3.62 (m, 2H), 3.47-3.45 (m, 2H), 2.49­ 2.27 (m, 10H), 1.19 (d, J=6.6 Hz, 3H), 0.99 (br s, 3H). MS m/z (M+H): 538.1.
Ejemplo 95
Figure imgf000137_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((3,3-d¡met¡lp¡per¡d¡n-1-¡l)met¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-95)
A una suspensión agitada de INT-6 (115 mg, 0,38 mmol) en DMF anhidra (15 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,76 ml, 0,76 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-80 (115,8 mg, 0,42 mmol) en DMF (5 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (30 ml) y agua (40 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 30 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (80 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-95 (33,5 mg, 29,1%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.33 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.67 (s, 1H), 8.17-8.12 (m, 2H), 7.82 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.56 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.15-7.13 (m, 1H), 3.60-3.58 (m, 3H), 3.58-3.41 (m, 2H), 2.39-2.31 (m, 2H), 2.14-2.06 (m, 2H), 1.56-1.52 (m, 2H), 1.20-1.13 (m, 5H), 0.90 (s, 6H). MS m/z (M+H): 537.0. Ejemplo 96
Figure imgf000137_0002
Síntes¡s de (R)-3-((2-cloro-5-(metox¡met¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-96)
A una suspensión agitada de INT-6 (203,3 mg, 0,68 mmol) en DMF anhidra (17 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 1,36 ml, 1,36 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-63 (262,2 mg, 1,36 mmol) en DMF (3 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (40 ml) y agua (50 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 40 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (80 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-96 (110,4 mg, 35,5%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 59.37 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.72 (s, 1H), 8.19 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.14 (d, J=4.4 Hz, 1H), 7.87 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.64 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.18-7.16 (m, 1H), 4.62 (s, 2H), 3.62-3.61 (m, 1H), 3.51 -3.47 (m, 2H), 3.42 (s, 3H), 1.19 (d, J=6.8 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 455.9.
Ejemplo 97
Figure imgf000138_0001
Síntesis de (R)-3-((5-(terc-butox¡met¡l)-2-clorop¡r¡m¡d¡n-4-il)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-97)
A una solución agitada de INT-6 (100 mg, 0,3 mmol) en DMF (10 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,7 ml, 0,7 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón que se agitó durante 10 min. Se añadió gota a gota INT-56 (157 mg, 0,7 mmol) en DMF (2 ml) a la solución anterior y se agitó durante 2 h a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (50 ml) y agua (50 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 50 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (100 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-97 (70,4 mg, 42,2%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 5 9.35 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.21-8.10 (m, 2H), 7.85 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.61 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.17-7.14 (m, 1H), 4.59 (s, 2H), 3.70-3.55 (m, 1H), 3.54-3.38 (m, 2H), 1.25 (s, 9H), 1.18 (d, J=6.8 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 498.1. Ejemplo 98
Figure imgf000138_0002
Síntes¡s de (R)-3-((2-cloro-5-(((tetrah¡dro-2H-p¡ran-4-¡l)ox¡)met¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-98)
A una suspensión agitada de INT-6 (170 mg, 0,57 mmol) en DMF anhidra (17 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 1,14 ml, 1,14 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-67 (179,3 mg, 0,68 mmol) en DMF (2 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (40 ml) y agua (50 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 40 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (80 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-98 (78,9 mg, 26,1%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 59.37 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.75 (s, 1H), 8.20­ 8.14 (m, 2H), 7.86 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.63 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.18-7.16 (m, 1H), 4.73 (s, 2H), 3.86-3.81 (m, 2H), 3.74­ 3.70 (m, 1H), 3.63-3.61 (m, 1H), 3.49-3.47 (m, 2H), 3.38-3.34 (m, 2H), 1.96-1.92 (m, 2H), 1.55-1.46 (m, 2H), 1.20 (d, J=6.6 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 526.2.
Ejemplo 99
Figure imgf000139_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-(((R)-2-met¡lp¡rrol¡d¡n-1-¡l)met¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-99)
A una solución agitada de INT-6 (100 mg, 0,3 mmol) en DMF (10 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,7 ml, 0,7 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón y la reacción se agitó durante 10 min. Se añadió gota a gota INT-81 (90 mg, 0,4 mmol) en DMF (2 ml) a la solución anterior y la reacción se agitó 4 h a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (20 ml) y agua (50 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 20 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (80 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-99 (16,5 mg, 9,3%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds) 59.33 (d, J=9.1 Hz, 1H), 8.67 (s, 1H), 8.23-8.09 (m, 2H), 7.83 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.68-7.55 (m, 1H), 7.20­ 7.10 (m, 1H), 4.02 (d, J=14.8 Hz, 1H), 3.70-3.55 (m, 1H), 3.54-3.38 (m, 3H), 3.05-2.90 (m, 1H), 2.56-2.50 (m, 1H), 2.30-2.15 (m, 1H), 2.00-1.85 (m, 1H), 1.70-1.55 (m, 2H), 1.40-1.22 (m, 1H), 1.18 (d, J=6.8 Hz, 3H), 1.09 (d, J=6.0 Hz, 3H) MS m/z (M+H): 509.1.
Ejemplo 100
Figure imgf000139_0002
Síntes¡s de (R)-3-((2-cloro-5-((2-fluoroetox¡)met¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-100)
A una suspensión agitada de INT-6 (444. mg, 1,48 mmol) en DMF anhidra (40 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 3 ml, 3 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-65 (400,6 mg, 1,8 mmol) en DMF (2 ml) a la solución anterior y la reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (60 ml) y agua (40 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 30 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (60 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-100 (187,5 mg, 25,9%) como un sólido amarillo. 1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) 59.37 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.74 (s, 1H), 8.21-8.11 (m, 2H), 7.86 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.63 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.18-7.14 (m, 1H), 4.75 (s, 2H), 4.70 (t, J=3.9 Hz, 1H), 4.54 (t, J=3.9 Hz, 1H), 3.90 (t, J=3.9 Hz, 1H), 3.80 (t, J=3.9 Hz, 1H), 3.62-3.46 (m, 3H), 1.19 (d, J=6.6 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 488.0.
Ejemplo 101
Figure imgf000140_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-(((S)-2-met¡lp¡rrol¡d¡n-1-¡l)met¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]diazep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nolin-8-ona (I-101)
A una solución agitada de INT-6 (100 mg, 0,3 mmol) en DMF (10 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,7 ml, 0,7 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón y la reacción se agitó durante 10 min. Se añadió gota a gota INT-82 (164 mg, 0,6 mmol) en DMF (2 ml) a la solución anterior y se agitó 4 h a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (20 ml) y agua (40 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 20 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (100 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-101 (32,0 mg, 18,1%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 5 9.33 (d, J=9.1 Hz, 1H), 8.67 (s, 1H), 8.23-8.09 (m, 2H), 7.83 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.68-7.55 (m, 1H), 7.20-7.10 (m, 1H), 4.02 (d, J=14.4 Hz, 1H), 3.68-3.55 (m, 1H), 3.54-3.37 (m, 3H), 3.05-2.90 (m, 1H), 2.56-2.50 (m, 1H), 2.30-2.15 (m, 1H), 2.00-1.85 (m, 1H), 1.71-1.55 (m, 2H), 1.40-1.22 (m, 1H), 1.18 (d, J=6.8 Hz, 3H), 1.09 (d, J=6.0 Hz, 3H) MS m/z (M+H): 509.1.
Ejemplo 102
Figure imgf000141_0001
Síntesis de (R)-3-((5-((terc-butilamino)metil)-2-cloropirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-102)
A una suspensión de INT-6 (77 mg, 0,256 mmol) en DMF (5 ml) a temperatura ambiente se le añadió carbonato de potasio (283 mg, 2,050 mmol). La mezcla se desgasificó por evacuación y se volvió a llenar con N2 (3x). La mezcla se calentó a 90° C durante 10 min y luego se añadió mediante una jeringuilla una solución de INT-88 (78 mg, 0,333 mmol) en DMF (2 ml). Después de 1 h a 90° C se completó la reacción. La mezcla de la reacción se filtró y se diluyó con agua y toda la masa de reacción se purificó directamente mediante HPLC preparativa de fase inversa (10-95% de MeCN/agua, 0,1% de TFA) para dar I-102 (136 mg, 0,223 mmol, 87% de rendimiento) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 59.41 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.96 (br, 2H), 8.85 (s, 1H), 8.23 (d, J=8.7 Hz, 1H), 8.18 (d, J=4.6 Hz, 1H), 7.87 (d, J=8.7 Hz, 1H), 7.64 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.18 (br, 1H), 4.36 (br, 2H) 3.80-3.48 (m, 4H), 1.42 (s, 9H), 1.19 (d, J=6.9 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 497.1.
Ejemplo 103
Figure imgf000141_0002
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-(((3-metiloxetan-3-il)oxi)metil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-103)
A una suspensión agitada de INT-6 (251 mg, 0,84 mmol) en DMF anhidra (15 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 1,68 ml, 1,68 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón y la solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-61 (190 mg, 0,76 mmol) en DMF (5 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (30 ml) y agua (40 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 30 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (80 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-103 (53,1 mg, 27,9%) como un sólido amarillo. 1H NMR (300 MHz, DMSO-d6): 59.37 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.79 (s, 1H), 8.21-8.13 (m, 2H), 7.87 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.64 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.18-7.15 (m, 1H), 4.67-4.65 (m, 4H), 4.37 (d, J=6.0 Hz, 2H), 3.62-3.61 (m, 1H), 3.47-3.46 (m, 2H), 1.59 (s, 3H), 1.24-1.18 (m, 3H). MS m/z (M+H): 512.1.
Ejemplo 104
Figure imgf000142_0001
Síntesis de (R)-3-((5-((terc-but¡l(met¡l)am¡no)met¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]diazep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nolin-8-ona (I-104)
A una solución agitada de INT-6 (100 mg, 0,3 mmol) en DMF (10 ml) se le añadió NaH (33 mg, 0,8 mmol) a 0° C y se agitó durante 2 h. Se añadió gota a gota INT-58 (86 mg, 0,4 mmol) en DMF (2 ml) a la solución anterior y luego se calentó a 135° C durante 70 min con irradiación de microondas. La mezcla de la reacción se enfrió y se repartió entre acetato de etilo (50 ml) y agua (40 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 50 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (80 ml), se secaron sobre Na24, se filtraron y se concentraron a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa de fase inversa (10-95% de MeCN/agua, 0,1% de TFA) proporcionó I-104 (21,4 mg, 13,3%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 59.31 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.76 (s, 1H), 8.68 (s, 1H), 8.20-8.09 (m, 2H), 7.78 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.49 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.13-7.11 (m, 1H), 3.70-3.52 (m, 3H), 3.50-3.38 (s, 2H), 2.25-2.13 (m, 5H), 1.90-1.75 (m, 1H), 1.18 (d, J=6.8 Hz, 3H), 0.85 (d, J=6.4 Hz, 6H). MS m/z (M+H): 477.2.
Ejemplo 105
Figure imgf000142_0002
Síntes¡s de (R)-3-((2-cloro-6,6-d¡óx¡do-7,8-d¡h¡dro-5H-t¡op¡rano[4,3-d]p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-105)
Se suspendió INT-6 (50 mg, 0,167 mmol) en 10 ml de DMF seca y el recipiente se enjuagó abundantemente con nitrógeno. Se añadió carbonato de potasio (0,231 g, 1,670 mmol) y la reacción se calentó a 90° C durante 10 min. A esta mezcla, se le añadió 6 ,6-dióxido de 2,4-dicloro-7,8-dihidro-5H-tiopirano[4,3-d]pirimidina (51 mg, 0,200 mmol) y la reacción se agitó durante 1 hora más a 90° C. La reacción se consideró completa por LC/MS, se vertió en NH4Cl saturado (ac.) y se extrajo 3 veces con DCM. El DCM combinado se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró. Luego, el material bruto se purificó mediante HPLC de fase inversa para proporcionar I-105 (4 mg, 7,75 pmol, rendimiento del 4,64%). 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.31 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.14 (d, J=8.4 Hz, 1H), 8.09 (d, J=4.5 Hz, 1H), 7.80 (d, J=8.7 Hz, 1H), 7.57 (d, J=8.7 Hz, 1H), 3.62 (t, J=6.9 Hz, 2H), 3.57 (m, 1H), 3.38 (m, 4H), 1.12 (d, J=6.9 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 516.0.
Ejemplo 106
Figure imgf000143_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-(((S)-3-metox¡p¡per¡d¡n-1-¡l)met¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-il)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]diazep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nolin-8-ona (I-106)
A una suspensión agitada de INT-6 (90 mg, 0,3 mmol) en DMF anhidra (9 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,6 ml, 0,6 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 h más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-85 (166 mg, 0,6 mmol) en DMF (2 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (30 ml) y agua (40 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 30 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (80 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-106 (4,0 mg, 2,5%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds) 59.34 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.67 (s, 1H), 8.17-8.12 (m, 2H), 7.82 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.58 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.16-7.14 (m, 1H), 3.66-3.52 (m, 3H), 3.47-3.44 (m, 2H), 3.23-3.20 (m, 4H), 2.98-2.95 (m, 1H), 2.70-2.67 (m, 1H), 2.11-2.06 (m, 1H), 2.01-1.96 (m, 1H), 1.86-1.89 (m, 1H), 1.67-1.62 (m, 1H), 1.45-1.36 (m, 1H), 1.21-1.12 (m, 4H). MS m/z (M+H): 539.2.
Ejemplo 107
Figure imgf000143_0002
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-(((R)-3-metoxipiperidin-1-il)metil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-107)
A una suspensión agitada de INT-6 (90 mg, 0,3 mmol) en DMF anhidra (9 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,6 ml, 0,6 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 h adicionales a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-86 (166 mg, 0,6 mmol) en DMF (2 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (30 ml) y agua (40 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 30 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (80 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-107 (56,3 mg, 33,6%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 59.34 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.68 (s, 1H), 8.17-8.12 (m, 2H), 7.82 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.58 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.16-7.14 (m, 1H), 3.66 (s, 1H), 3.62-3.57 (m, 3H), 3.47-3.44 (m, 2H), 3.23-3.20 (m, 4H), 2.98-2.95 (m, 1H), 2.70-2.67 (m, 1H), 2.11-2.06 (m, 1H), 2.01-1.96 (m, 1H), 1.86-1.89 (m, 1H), 1.67-1.62 (m, 1H), 1.45-1.36 (m, 1H), 1.21-1.12 (m, 4H). MS m/z (M+H): 539.1.
Ejemplo 108
Figure imgf000144_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-(((2-etoxietil)(metil)amino)metil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-108)
A una suspensión agitada de INT-6 (400 mg, 1,34 mmol) en DMF anhidra (35 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 2,67 ml, 2,67 mmol) a 0° C para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-87 (271,4 mg, 1,34 mmol) en DMF (5 ml) a la solución anterior y la reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (30 ml) y agua (40 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 30 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (80 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-108 (36,9 mg, 13,6%) como un sólido amarillo.1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.33 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.17-8.11 (m, 2H), 7.83 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.58 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.16-7.13 (m, 1H), 3.60-3.59 (m, 1H), 3.50-3.40 (m, 2H), 2.80-2.79 (m, 2H), 2.74-2.71 (m, 2H), 1.84-1.83 (m, 4H), 1.17 (d, J=9.2 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 466.0.
Ejemplo 109
Figure imgf000145_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5,6,7,8-tetrahidroquinazolin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-109)
A una suspensión agitada de INT-6 (339 mg, 1,13 mmol) en DMF anhidra (25 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 2,26 ml, 2,26 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota 2,4-dicloro-5,6,7,8-tetrahidroquinazolina (299,1 mg, 1,13 mmol) en DMF (5 ml) a la solución anterior y la reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (30 ml) y agua (40 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 30 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (80 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-109 (87,4 mg, 29,2%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.34 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.71 (s, 1H), 8.18-8.11 (m, 2H), 7.83 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.58 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.10-7.20 (m, 1H), 3.70 (s, 2H), 3.60-3.50 (m, 1H), 3.52-3.36 (m, 6H), 2.63-2.60 (m, 2H), 2.29 (s, 3H), 1.17 (d, J=7.8 Hz, 3H), 1.06 (t, J=7.8 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 527.0.
Ejemplo 110
Figure imgf000145_0002
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((2,2-difluoroetoxi)metil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-110)
A una suspensión agitada de INT-6 (154,4 mg, 0,52 mmol) en DMF anhidra (30 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,5 ml, 0,88 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-62 (150,4 mg, 0,62 mmol) en DMF (2 ml) a la solución anterior y la reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (20 ml) y agua (30 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 20 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (40 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-110 (70,0 mg, 26,8%) como un sólido amarillo. 1H NMR (300 MHz, DMSO-d6): 59.37 (br d, J=9.0 Hz, 1H), 8.74 (s, 1H), 8.19 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.13 (d, J=4.2 Hz, 1H), 7.86 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.62 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.16 (br t, J=4.8 Hz, 1H), 6.45-6.42 (m, 1H), 4.82 (s, 2H), 3.96-3.84 (m, 2H), 3.65-3.56 (m, 1H), 3.47 (t, J=4.5 Hz, 2H), 1.19 (d, J=6.6 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 506.0.
Ejemplo 111
Figure imgf000146_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-4-((10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]quinolin-3-il)oxi)pirimidin-5-il)metoxi)propanonitrilo (I-111)
A una suspensión agitada de INT-6 (120 mg, 0,4 mmol) en DMF anhidra (12 ml) se le añadió t-BuOK (1M en THF, 0,8 ml, 0,8 mmol) gota a gota a 0° C para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-68 (186 mg, 0,8 mmol) en DMF (2 ml) a la solución anterior y la reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (30 ml) y agua (40 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 30 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (80 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-111 (55,9 mg, 27,6%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 59.35 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.73 (s, 1H), 8.19­ 8.12 (m, 2H), 7.85 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.62 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.16-7.14 (m, 1H), 4.75 (s, 2H), 3.77 (t, J=6.0 Hz, 2H)), 3.60-3.59 (m, 1H), 3.49-3.45 (m, 2H), 2.88-2.85 (m, 2H), 1.18 (d, J=6.8 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 495.1.
Ejemplo 112
Figure imgf000146_0002
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((metilsulfonil)metil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-112)
Se disolvió INT-6 (0,207 g, 0,692 mmol) en 2 ml de DMF seca y se añadió K2CO3 (0,956 g, 6,92 mmol). La reacción se calentó a 90° C durante 5 min, se enfrió y se añadió INT-54 (0,250 g, 1,038 mmol) en DMSO. La reacción se agitó a 90° C durante 3 h, momento en el que se determinó que la reacción se había completado. Se enfrió la reacción y se filtró el exceso de base. La mezcla de la reacción bruta se purificó mediante HPLC de fase inversa para dar I-112 (0,105 g, 0,208 mmol, 30% de rendimiento). 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.34 (d, J=8.2 Hz, 1H), 8.75 (s, 1H), 8.18 (d, J=8.7 Hz, 1H), 8.14 (d, J=2.8 Hz, 1H), 7.85 (d, J=8.7 Hz, 1H), 7.58 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.16 (t, J=5.5 Hz, 1H), 4.75 (s, 2H), 3.59 (m, 1H), 3.44 (m, 2H), 3.17 (s, 3H), 1.16 (d, J=6.9 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 504.0.
Ejemplo 113
Figure imgf000147_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((d¡fluorometox¡)met¡l)p¡rim¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-113)
A una suspensión agitada de INT-6 (109,0 mg, 0,36 mmol) en DMF anhidra (10 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,62 ml, 0,62 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-55 (100,1 mg, 0,42 mmol) en DMF (2 ml) a la solución anterior y la reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (10 ml) y agua (10 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 10 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (10 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. El bruto se pasó a través de gel de sílice (DCM/MeOH 30:1) para producir I-113 (13,4 mg, 7,48%) como un sólido amarillo. 1H NmR (400 MHz, DMSO-d6): 5 9.34 (d, J=8.7 Hz, 1H), 8.78 (s, 1H), 8.18-8.09 (m, 2H), 7.84 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.59 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.13-6.62 (m, 2H), 5.09 (s, 2H), 3.57-3.56 (m, 1H), 3.50-3.49 (m, 2H), 1.15 (d, J=6.0 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 492.2.
Ejemplo 114
Figure imgf000147_0002
Síntes¡s de (R)-3-((5-((3-oxa-8-azab¡c¡clo[3.2.1]octan-8-¡l)met¡l)-2-clorop¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-114)
A una suspensión agitada de INT-6 (120,0 mg, 0,40 mmol) en DMF anhidra (12 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,8 ml, 0,8 mmol) gota a gota a 0° C para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-83 (131,9 mg, 0,48 mmol) en DMF (3 ml) a la solución anterior y la reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (30 ml) y agua (40 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 40 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (80 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na24, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-114 (40,9 mg, 19%) como una mezcla de diastereoisómeros. 1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) 59.31 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.80 (s, 1H), 8.15-8.08 (m, 2H), 7.80 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.57 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.12-7.09 (m, 1H), 3.58-3.54 (m, 5H), 3.45-3.39 (m, 4H), 3.11-3.09 (m, 2H), 1.94-1.90 (m, 2H), 1.76-1.72 (m, 2H), 1.15 (d, J=6.6 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 537.0.
Ejemplo 115
Figure imgf000148_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-(((3R,5S)-3,5-d¡met¡lp¡peraz¡n-1-¡l)met¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]tieno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-115)
A una solución agitada de INT-6 (215,37 mg, 0,720 mmol) en DMF (30 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF) (0,96 ml, 0,960 mmol) a 0° C y la reacción se agitó a esta temperatura durante 20 minutos para dar una solución marrón. Luego se añadió INT-84 (360 mg, 0,96 mmol) a la mezcla de la reacción a 0° C, se calentó a temperatura ambiente y se dejó en agitación durante la noche. La mezcla de la reacción se diluyó con agua, la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (3 x 50 ml) y el extracto orgánico se lavó con 2 x 20 ml de solución de salmuera saturada. La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y luego se concentró. El material bruto se filtró a través de gel de sílice eluyendo con acetato de etilo para obtener (2R,6S)-4-((2-cloro-4-(((R)-10-metil-8-oxo-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-3-il)oxi)pirimidin-5-il)metil)-2,6-dimetilpiperazin-1-carboxilato de terc-butilo (180 mg, 29%) como un sólido amarillo. A este material (100,0 mg, 0,16 mmol) disuelto en DCM, se le añadió TFA (1,0 ml, 0,16 mmol) y la reacción se agitó a temperatura ambiente durante 1 minuto. La mezcla se inactivó con NaHCO3 acuoso saturado (10 ml) seguido de extracción con acetato de etilo (3 x 30 ml). Los extractos orgánicos combinados se secaron sobre sulfato de sodio anhidro, se filtraron y se concentraron al vacío. La purificación adicional mediante TLC preparativa sobre gel de sílice (DCM: MeOH = 4:1) proporcionó I-115 (67 mg, 65,5%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 59.35 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.71 (s, 1H), 8.20-8.12 (m, 2H), 7.82 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.58 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.16-7.14 (m, 1H), 3.66-3.52 (m, 3H), 3.49-3.41 (m, 2H), 3.11-2.79 (m, 4H), 1.91-1.75 (m, 2H), 1.22-1.17 (m, 4H), 1.02 (d, J=5.6 Hz, 6H). MS m/z (M+H): 538.1.
Ejemplo 116
Figure imgf000149_0001
Síntesis de (R)-3-((5-bromo-2-cloropirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-116)
Se suspendió INT-6 (1,6 g, 5,34 mmol) en 20 ml de DMF seca. Se añadió K2CO3 (7,39 g, 53,4 mmol) y la reacción se lavó abundantemente con nitrógeno. La reacción se calentó a 90° C durante 10 minutos, se enfrió y se añadió 5-bromo-2,4-dicloropirimidina (1,583 g, 6,95 mmol). La reacción se calentó de nuevo a 90° C durante 4 h más. La reacción se enfrió, se filtró para eliminar cualquier base no disuelta y luego se vertió en agua (200 ml). El precipitado resultante se recogió por filtración y se secó a presión reducida para proporcionar I-116 (1,922 g, 3,92 mmol, 73,3% de rendimiento) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMsO-d6): 59.39 (d, J=9.6 Hz, 1H), 9.03 (s, 1H), 8.21 (d, J=8.7 Hz, 1H), 8.16 (d, J=4.1 Hz, 1H), 7.87 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.71 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.18 (t, J=5.5 Hz, 1H), 3.61 (m, 1H), 3.46 (m, 2H), 1.19 (d, J=6.9 Hz, 3H).
Ejemplo 117
Figure imgf000149_0002
Síntesis de (R)-3-((6-((terc-butilamino)metil)-2-cloropirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-117)
Se disolvieron t-butilamina (0,019 ml, 0,363 mmol), yoduro de sodio (0,272 g, 1,814 mmol) y (R)-INT-93 (0,167 g, 0,363 mmol) en 3 ml de DMF seca. La reacción se agitó a temperatura ambiente durante 8 horas. Una vez completada, la reacción se filtró para eliminar el exceso de sales y se purificó directamente mediante HPLC preparativa de fase inversa (10-95% de MeCN/agua, 0,1% de TFA) para dar I-117. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 9.40 (d, J=9.2 Hz, 1H), 9.10 (t, J=6.0 Hz, 1H), 8.20 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.16 (d, J=4.1 Hz, 1H), 7.82 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.63 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.51 (s, 1H), 7.16 (m, 1H), 4.39 (t, J=4.0 Hz, 2H), 3.59 (m, 1H), 3.44 (m, 2H), 1.33 (s, 9H), 1.17 (d, J=6.9 Hz). MS m/z (M+H): 484.1.
Ejemplo 118
Figure imgf000149_0003
Síntesis de (R)-3-((6-((terc-butil(metil)amino)metil)-2-cloropirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-118)
Se disolvieron 1-117 (0,025 g, 0,050 mmol) y formaldehído (37% ac.) (0,011 ml, 0,151 mmol) en 3 ml de THF, 1 ml de MeOH y 0,1 ml de ácido acético. A esta mezcla se le añadió triacetoxiborohidruro de sodio (0,053 g, 0,252 mmol). La reacción se agitó durante 2 h a temperatura ambiente, se concentró hasta la sequedad y se volvió a disolver en 3 ml de DMSO con 1 ml de H2O y se purificó directamente mediante HPLC preparativa de fase inversa (10-95% de MeCN/agua, 0,1%de TFA) para dar I-118. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.62 (br, 1H), 9.40 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.20 (d, J=8.7 Hz), 8.16 (d, J=4.1 Hz, 1H), 7.83 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.63 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.59 (s, 1H), 7.17 (br, 1H), 4.69 (d, J=15.1 Hz, 1H), 4.27 (dd, J=13.3 Hz, 8.7 Hz, 1H), 3.60 (m, 1H), 3.45 (m, 2H), 2.72 (d, J=5.0 Hz, 3H), 1.41 (s, 9H), 1.17 (d, J=6.9 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 511.1.
Ejemplo 119
Figure imgf000150_0001
Síntesis de (R)-3-((2-fluoro-5,7-dihidrofuro[3,4-d]pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nolin-8-ona (I-119)
A una solución de I-86 (302 mg, 0,66 mmol) en DMSO (15 ml), se le añadió KF (383,3 mg, 6,6 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla resultante se agitó a 110° C durante 2 h. La reacción se repartió entre acetato de etilo (20 ml) y agua (30 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 20 ml). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (50 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa de fase inversa (10-95% de MeCN/agua, 0,1% de TFA) proporcionó el producto deseado I-119 (24,4 mg, 8,4%) como un sólido amarillo. 1H NMR (300 MHz, DMSO-ds): 59.38 (d, J=9.3 Hz, 1H), 8.20 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.14-8.12 (m, 1H), 7.86 (d, J=8.7 Hz, 1H), 7.65 (d, J=8.7 Hz, 1H), 7.15-7.10 (m, 1H), 5.04 (s, 4H), 3.68-3.55 (m, 1H), 3.47-3.42 (m, 2H), 1.19 (d, J=6.6 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 438.1.
Ejemplo 120
Figure imgf000150_0002
Síntesis de (R)-3-((5-((terc-butil(metil)amino)metil)-2-fluoropirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-120)
A una solución de I-80 (80,0 mg, 0,16 mmol) en DMSO (6 ml), se añadió KF (90,8 mg, 1,57 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 110° C durante 2 h. La reacción se enfrió y luego se repartió entre acetato de etilo (20 ml) y agua (30 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 20 ml). La capa orgánica combinada se lavó con salmuera (50 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa de fase inversa (10-95% de MeCN/agua, 0,1% de TFA) proporcionó el producto deseado, I-120 (10,4 mg, 12,8%) como un sólido amarillo. 1H NMR (300 MHz, DMSO-d6): 59.35 (d, J=9.3 Hz, 1H), 8.70 (s, 1H), 8.18 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.15-8.11 (m, 1H), 7.84 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.61 (d, J=8.7 Hz, 1H), 7.17-7.15 (m, 1H), 3.70-3.65 (m, 3H), 3.47­ 3.41 (m, 2H), 2.18 (s, 3H), 1.19 (d, J=6.3 Hz, 3H), 1.13 (s, 9H). MS m/z (M+H): 495.2.
Ejemplo 121
Figure imgf000151_0001
Síntesis de (R)-3-((5-(etoximetil)-2-fluoropirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-121)
A una solución de I-82 (180 mg, 0,38 mmol) en DMSO (15 ml), se le añadió KF (222,2 mg, 3,8 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 110° C durante 2 h. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (20 ml) y agua (30 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 20 ml). La capa orgánica combinada se lavó con salmuera (50 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa de fase inversa (10-95% de MeCN/agua, 0,1% de TFA) proporcionó el producto deseado, I-121 (49,2 mg, 26,9%) como un sólido amarillo. 1H NMR (300 MHz, DMSO-d6): 59.33 (d, J=9.3 Hz, 1H), 8.72 (s, 1H), 8.19 (d, J=8.7 Hz, 1H), 8.09­ 8.07 (m, 1H), 7.86 (d, J=9.3 Hz, 1H), 7.64 (d, J=8.7 Hz, 1H), 7.14-7.05 (m, 1H), 4.67 (s, 1H), 3.64-3.62 (m, 3H), 3.47­ 3.41 (m, 2H), 1.23-1.18 (m, 6H). MS m/z (M+H): 454.1.
Ejemplo 122
Figure imgf000151_0002
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-(1-metil-1,2,3,6-tetrahidropiridin-4-il)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-122)
A una solución de INT-95 en THF (2 ml) y metanol (1 ml) se le añadió ácido acético (10,45 pl, 0,183 mmol) y formaldehído (0,068 ml, 0,913 mmol) (37% en agua). Después de agitar durante 10 min, se añadió triacetoxiborohidruro de sodio (58,0 mg, 0,274 mmol). Después de 40 min, la mezcla de la reacción se enfrió a 0° C, se inactivó con NaHCO3 saturado acuoso, se extrajo con DCM-MeOH (4x, 9:1). Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre Na2SO4, se filtraron y se concentraron. La purificación por HPLC (10-95% de MeCN/agua, 0,1% de TFA) dio I-122 (9,0 mg, 0,018 mmol, 19% de rendimiento). 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.90 (br, 1H), 9.38 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.72 (s, 1H), 8.22-8.17 (m, 2H), 7.86 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.67 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.18 (t, J=5.3 Hz, 1H), 6.38 (s, 1H), 4.10-3.74 (m, 2H), 3.62-3.28 (m, 5H), 2.97-2.81 (m, 5H), 1.19 (d, J=6.9 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 507.0.
Ejemplo 123
Figure imgf000152_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-(piridin-3-il)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-123)
A una suspensión de I-116 (30,1 mg, 0,062 mmol) en 1,4-dioxano anhidro (1,5 ml) se le añadió Pd(dppf)Cl2-CH2CI2 (0,12 ml, 5% en moles, 0,025 M en 1,4-dioxano anhidro) a temperatura ambiente para dar una solución en lechada marrón claro. Se añadió 3-(4,4,5,5-tetrametil-1,3,2-dioxaborolan-2-il)piridina (15,2 mg, 0,074 mmol) en 1,4-dioxano anhidro (0,2 ml) a la solución resultante seguido de la adición de Cs2CO3 (0,1 ml, 1,0 M en agua). La mezcla resultante se desgasificó con nitrógeno y se agitó a 80° C en un agitador durante la noche. Después de enfriar a temperatura ambiente y eliminar los solventes, el residuo se disolvió en DMSO (3,0 ml) y se filtró. La solución filtrada se purificó mediante HPLC de fase inversa (ácido fórmico al 0,01% en agua-CH3CN) para proporcionar el producto deseado I-123 (6,1 mg, 20,6%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) 59.34 (d, J=8.7 Hz, 1H), 8.97 (d, J=1.8 Hz, 1H), 8.94 (s, 1H), 8.66 (dd, J=4.8, 1.8 Hz, 1H), 8.21 (m, 1H), 8.16 (d, J=8.7 Hz, 1H), 8.13-8.14 (br, 1H), 7.82 (d, J=8.7 Hz, 1H), 7.71 (d, J=8.7 Hz, 1H), 7.58 (dd, J=8.2, 1.0 Hz, 1H), 7.17 (t, J=5.7 Hz), 3.57-3.60 (m, 1H), 3.45-3.46 (m, 2H), 1.19 (d, J=6.6 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 489.4.
Ejemplo 124
Figure imgf000152_0002
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-(3,6-dihidro-2H-piran-4-il)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (1-124)
Se disolvieron I-116 (180 mg, 0,367 mmol), 2-(3,6-dihidro-2H-piran-4-il)-4,4,5,5-tetrametil-1,3,2-dioxaborolano (154 mg, 0,733 mmol), PdCb(dppf) (0,027 g, 0,037 mmol) y carbonato de potasio (152 mg, 1,100 mmol) en 8 ml de DMF seca y se desgasificaron mediante evacuación/sonicación (2x) rellenando cada vez con argón. Luego, la reacción se calentó a 85° C con agitación. Una vez que se determinó que se hubo completado la reacción por LC/MS, la mezcla se enfrió, se vertió en agua y se extrajo 3 veces con DCM. Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron. El residuo resultante se purificó mediante HPLC de fase inversa para proporcionar I-124 (16 mg, 0,032 mmol, rendimiento del 8,84%). 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds) 59.34 (d, J=9.6 Hz, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.17 (d, J=9.2 Hz, 1H), 9.34 (m, 1H), 7.84 (d, J=9.6 Hz, 1H), 7.65 (d, J=11 Hz, 1H), 7.17 (br, 1H), 6.43 (s, 1H), 4.23 (m, 1H), 4.06 (m, 1H), 3.79 (t, J=6.0 Hz, 1H), 3.60 (t, J=5.5 Hz, 1H), 3.45 (m, 1H), 2.03 (m, 1H), 1.19 (d, J=6.6 Hz, 3H).
Ejemplo 125
Figure imgf000153_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5,6,7,8-tetrahidropirido[4,3-d]pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-125)
Se suspendió INT-6 (50 mg, 0,167 mmol) en 10 ml de DMF seca y se enjuagó con nitrógeno. Se añadió carbonato de potasio (0,231 g, 1,670 mmol) y la reacción se agitó a 90° C durante 10 min. A esta mezcla, se le añadió 2,4-dicloro-7,8-dihidropirido[4,3-d]pirimidin-6(5H)-carboxilato de terc-butilo (61 mg, 0,200 mmol) y la reacción se agitó 1 hora a 90° C. Una vez que la reacción se consideró completa por LC/MS, la mezcla se vertió en NH4Cl saturado, extraído 3x con DCM. Los extractos de DCM combinados se secaron sobre sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron sobre sílice. Luego, el material bruto se purificó mediante cromatografía ultrarrápida usando un gradiente de MeOH al 0-30% en EtOAc. Las fracciones que contenían el producto se combinaron, se concentraron y luego el residuo resultante se disolvió en TFA (1,162 ml, 15,08 mmol) y se agitó durante 1 h a temperatura ambiente. Una vez completada, la reacción se concentró, se trató con 3 ml de NH4OH (ac.) y el sólido resultante se aisló por filtración, se lavó con agua y se secó a alto vacío para dar I-125 como un sólido amarillo (68 mg, 87 % producir). 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.40 (d, J=8.0 Hz, 1H), 9.53 (br, 1H), 8.22 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.18 (d, J=4.1 Hz, 1H), 7.85 (d, J=9.2 Hz, 1H) 7.18 (br, 1H), 4.45 (br, 1H), 3.62 (m, 1H), 3.56 (m, 2H), 3.46 (m, 2H), 3.12 (t, J=6.4 Hz, 1H), 2.54 (s, 3H), 1.19 (d, 6.4 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 466.6.
Ejemplo 126
Figure imgf000153_0002
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-6-metil-5,6,7,8-tetrahidropirido[4,3-d]pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-126)
Se disolvió I-125 (0,1 g, 0,214 mmol) en 3 ml de una mezcla 1:2 de MeOH-THF. Se añadieron ácido acético (0,025 ml, 0,428 mmol) y formaldehído (0,080 ml, 1,071 mmol) y la reacción se agitó durante 10 min y luego se añadió triacetoxiborohidruro de sodio (0,136 g, 0,642 mmol). Se dejó agitar la reacción durante una hora más a temperatura ambiente. Una vez completada, la reacción se diluyó con 1 ml de agua, se concentró y el residuo resultante se disolvió en 4 ml de DMSO y se purificó directamente mediante HPLC preparativa de fase inversa (10-95% de MeCN/Agua, 0,1% de TFA) para dar I-126 (0,05 g, 49% de rendimiento). 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 5 9.36 (d, J=11.4 Hz, 1H), 8.09 (d, J=8.7 Hz, 1H), 7.83 (d, J=8.7 Hz, 1H), 7.52 (d, J=9.2 Hz, 1H), 4.65 (br, 2H), 3.75 (m, 3H), 3.59 (m, 2H), 3.20 (s, 3H), 1.32 (d, J=6.9 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 480.8.
Ejemplo 127
Figure imgf000154_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-(hidroximetil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (1 -127)
A una solución de INT-96 (60 mg, 0,1 mmol) en dimetilformamida (2,0 ml), se le añadieron tetraquis(trifenilfosfina)paladio (0) (14,4 mg, 0,01 mmol) y trietilsilano (72,4 mg, 0,6 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se diluyó con agua (4,0 ml) y se extrajo con 10% de metanol/diclorometano (2 x 10 ml). La capa orgánica se lavó con agua (5 ml) seguido de una solución de salmuera saturada (5 ml). La capa orgánica se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante HPLC preparativa para proporcionar I-127 (22 mg, 40%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 51.18 (d, J=6.8 Hz, 3H), 3.46 (br s, 1H), 3.60 (br s, 1H), 4.68 (s, 2H), 5.66 (br s, 1H), 7.15 (t, J=5.2 Hz, 1H), 7.60 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.84 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.11 (d, J=4.4 Hz, 1H), 8.17 (d, J=8.8 Hz, 1H), 8.69 (s, 1H), 9.35 (d, J=8.8 Hz, 1H). MS m/z (M+H): 442.4.
Ejemplo 128
Figure imgf000154_0002
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((4-h¡drox¡p¡per¡d¡n-1-¡l)met¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-128)
A una suspensión agitada de INT-6 (150,0 mg, 0,5 mmol) en DMF anhidra (7,5 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,6 ml, 0,6 mmol) gota a gota a 0° C para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-97 (144,5 mg, 0,55 mmol) en DMF (2 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (10 ml) y agua (20 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 10 ml). La capa orgánica combinada se lavó con salmuera (30 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-128 (30 mg, 11,4%) como un sólido amarillo. 1H NMR (300 MHz, DMSO-d6): 59.35 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.68 (s, 1H), 8.19-8.12 (m, 2H), 7.84 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.59 (d, J=9.3 Hz, 1H), 7.15 (t, J=2.4 Hz, 1H), 4.56 (d, J=4.2 Hz, 1H), 3.63 (s, 3H), 3.47­ 3.45 (m, 3H), 2.81-2.71 (m, 2H), 2.30-2.11 (m, 2H), 1.75-1.65 (m, 2H), 1.46-1.40 (m, 2H), 1.19 (d, J=6.6 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 525.0.
Ejemplo 129
Figure imgf000155_0001
(R)-3-((2-cloro-5-((4-etox¡p¡per¡d¡n-1-¡l)met¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-il)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nolin-8-ona (1-129)
A una suspensión agitada de INT-6 (131,0 mg, 0,44 mmol) en DMF anhidra (11 ml) se le añadió t-BuOK (1 M en THF, 0,72 ml, 0,72 mmol) a 0° C gota a gota para dar una solución marrón. La solución resultante se agitó durante 0,5 horas más a esta temperatura. Se añadió gota a gota INT-98 (128,0 mg, 0,44 mmol) en DMF (1 ml) a la solución anterior y se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de la reacción se repartió entre acetato de etilo (15 ml) y agua (15 ml), la capa orgánica se separó y la capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 15 ml). La capa orgánica combinada se lavó con salmuera (30 ml) y la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró a presión reducida. La purificación por HPLC preparativa proporcionó I-129 (49,8 mg, 20,4%) como un sólido amarillo. 1H NMR (300 MHz, DMSO-d6): 59.89 (brs, 1H), 9.39 (d, J=4.5 Hz, 1H), 8.88 (s, 1H), 8.23-8.14 (m, 2H), 7.88 (d, J=4.4 Hz, 1H), 7.66 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.20-7.05 (m, 1H), 4.68-4.43 (m, 2H), 3.80­ 3.63 (m, 2H), 3.60-3.44 (m, 6H), 3.26-3.03 (m, 2H), 2.27-2.17 (m, 1H), 2.16-1.88 (m, 2H), 1.76-1.56 (m, 1H), 1.21 (d, J=6.0 Hz, 3H), 1.19-1.02 (m, 3H). MS m/z (M+H): 553.
Ejemplo 130
Figure imgf000155_0002
Síntes¡s de (R)-3-((2-cloro-5-((4-(2-metox¡etox¡)p¡per¡d¡n-1-¡l)met¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-¡l)ox¡)-10-met¡l-9,10,11,12-tetrah¡dro-8H-[1,4]d¡azep¡no[5',6':4,5]t¡eno[3,2-f]qu¡nol¡n-8-ona (I-130)
A una solución de INT-6 (135,6 mg, 0,4 mmol) en DMF (20 ml) se le añadió carbonato potásico (625,9 mg, 4,5 mmol) a temperatura ambiente y se agitó a 90° C durante 10 min. A la mezcla resultante, se le añadió INT-99 (145,0 mg, 0,4 mmol) a 90° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 90° C durante 1 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se diluyó con agua con hielo (15,0 ml), se extrajo con acetato de etilo (2 x 10 ml) y se lavó con solución de salmuera (30 ml). La capa orgánica se separó, se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida para dar material bruto. El bruto se purificó mediante HPLC preparativa de fase inversa (10-95% de MeCN/agua, 0,05% de NH4HCO3) para proporcionar I-130 (14,5 mg, 6%) como un sólido amarillo. 1H NMR (300 MHz, DMSO-ds) 59.35 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.18 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.12-8.08 (m, 1H), 7.84 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.59 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.15 (t, J=5.4 Hz, 1H), 3.63-3.52 (m, 3H), 3.52-3.39 (m, 7H), 3.23 (s, 3H), 2.78-2.74 (m, 2H), 2.26-2.19 (m, 2H), 1.84-1.81 (m, 2H), 1.50-1.44 (m, 2H), 1.20 (d, J=5.4 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 583.4.
Ejemplo 131
Figure imgf000156_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((4-(2-fluoroetoxi)piperidin-1-il)metil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-131)
A una solución INT-6 (54,4 mg, 0,2 mmol) en DMF) (10 ml) se le añadió terc-butóxido de potasio (1 M en THF, 0,4 ml, 0,4 mmol) a 0° C y se agitó durante 10 min. A la mezcla resultante, se añadió INT-100 (56,0 mg, 0,2 mmol) a 0° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 25° C durante la noche. Una vez completada, la mezcla de la reacción se diluyó con agua con hielo (15,0 ml), se extrajo con acetato de etilo (2 x 10 ml) y se lavó con solución de salmuera (30 ml). La capa orgánica se separó, se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida para dar material bruto. El bruto se purificó mediante HPLC preparativa de fase inversa (10-95% de MeCN/agua, 0,05% de NH4HCO3) para proporcionar I-131 (19,3 mg, 19%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.35 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.18 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.12-8.08 (m, 1H), 7.84 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.59 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.15 (t, J=5.4 Hz, 1H), 4.57 (t, J=3.9 Hz, 1H), 4.41 (t, J=3.9 Hz, 1H), 3.68 (t, J=4.2 Hz, 1H), 3.64 (s, 3H), 3.58 (t, J=4.2 Hz, 1H), 3.47-3.43 (m, 2H), 3.36-3.33 (m, 1H), 2.78-2.75 (m, 2H), 2.27-2.20 (m, 2H), 1.87-1.83 (m, 2H), 1.50-1.47 (m, 2H), 1.20 (d, J=6.6 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 571.0.
Ejemplo 132
Figure imgf000156_0002
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((4-(metoxi-d3)piperidin-1-il)metil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-132)
A una solución de INT-6 (107,2 mg, 0,4 mmol) en DMF (15 ml) se le añadió carbonato potásico (495,0 mg, 3,6 mmol) a temperatura ambiente y se agitó a 90° C durante 10 min. A la mezcla resultante se le añadió INT-101 (100,0 mg, 0,4 mmol) a 90° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 90° C durante 1 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se diluyó con agua con hielo (30,0 ml), se extrajo con acetato de etilo (2 x 20 ml) y se lavó con solución de salmuera (50 ml). La capa orgánica se separó, se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida para dar material bruto. El bruto se purificó mediante HPLC preparativa de fase inversa (10-95% de MeCN/agua, 0,05% de NH4HCO3) para proporcionar I-132 (7,6 mg, 4%) como un sólido amarillo.
1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 59.35 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.18 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.12-8.08 (m, 1H), 7.84 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.59 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.15 (t, J=5.4 Hz, 1H), 3.64-3.53 (m, 3H), 3.47-3.40 (m, 2H), 3.28-3.17 (m, 1H), 2.76-2.73 (m, 2H), 2.27-2.24 (m, 2H), 1.87-1.83 (m, 2H), 1.47-1.44 (m, 2H), 1.20 (d, J=6.6 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 542.0.
Ejemplo 133
Figure imgf000157_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((4-isopropoxipiperidin-1-il)metil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-133)
A una solución de INT-6 (147,6 mg, 0,5 mmol) en DMF (30,0 ml) se le añadió carbonato potásico (681,5 mg, 5,0 mmol) a temperatura ambiente y se agitó a 90° C durante 10 min. A la mezcla resultante se le añadió INT-102 (150,0 mg, 0,5 mmol) a 90° C. La mezcla de la reacción resultante se agitó a 90° C durante 1 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se diluyó con agua con hielo (30,0 ml), se extrajo con acetato de etilo (2 x 20 ml) y se lavó con solución de salmuera (50 ml). La capa orgánica se separó, se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida para dar material bruto. El bruto se purificó mediante HPLC preparativa de fase inversa (10-95% de MeCN/agua, 0,05% de NH4HCO3) para proporcionar I-133 (24,2 mg, 10,2%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 59.35 (d, J=9.3 Hz, 1H), 8.67 (br, 1H), 8.17 (d, J=9.0 Hz, 1H), 8.12-8.08 (m, 1H), 7.84 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.59 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.15 (t, J=4.8 Hz, 1H), 3.70-3.63 (m, 4H), 3.53-3.47 (m, 2H), 3.41-3.36 (m, 1H), 2.78-2.74 (m, 2H), 2.26-2.19 (m, 2H), 1.79-1.63 (m, 2H), 1.44-1.41 (m, 2H), 1.20 (d, J=6.6 Hz, 3H), 1.05 (d, J=6.0 Hz, 6H). MS m/z (M+H): 567.1.
Ejemplo 134
Figure imgf000157_0002
Síntesis de (R)-3-((5-((4-(terc-butoxi)piperidin-1-il)metil)-2-cloropirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (I-134)
A una solución de INT-6 (158,0 mg, 0,5 mmol) en DMF (20 ml) se le añadió carbonato de potasio (828,0 mg, 6,0 mmol) a 90° C y se agitó durante 10 min. A la mezcla resultante, se le añadió INT-103 (168,0 mg, 0,5 mmol) y se agitó a 90° C durante 1 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se diluyó con agua con hielo (30,0 ml), se extrajo con acetato de etilo (2 x 20 ml) y se lavó con solución de salmuera (50 ml). La capa orgánica se separó, se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se concentró a presión reducida para dar material bruto. El bruto se purificó mediante HPLC preparativa de fase inversa (10-95% de MeCN/agua, 0,05% de NH4HCO3) para producir I-134 (11,7 mg, 4%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): 59.35 (d, J=9.3 Hz, 1H), 8.68 (s, 1H), 8.18 (d, J=8.7 Hz, 1H), 8.12-8.08 (m, 1H), 7.84 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.60 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.15 (t, J=4.8 Hz, 1H), 3.68-3.55 (m, 3H), 3.54-3.40 (m, 3H), 2.76-2.73 (m, 2H), 2.27-2.24 (m, 2H), 1.69-1.63 (m, 2H), 1.44-1.41 (m, 2H), 1.20 (d, J=6.6 Hz, 3H), 1.13 (s, 9H). MS m/z (M+H): 581.2.
Ejemplo 135
Figure imgf000158_0001
Síntesis de (R)-3-((2-cloro-5-((etoxi-d5)metil)pirimidin-4-il)oxi)-10-metil-9,10,11,12-tetrahidro-8H-[1,4]diazepino[5',6':4,5]tieno[3,2-f]quinolin-8-ona (1-135)
A una suspensión de INT-6 (66 mg, 0,220 mmol) en DMF (3,0 ml) se le añadió carbonato de potasio (274 mg, 1,980 mmol) y la mezcla resultante se agitó a 90° C durante 10 min. Se añadió una solución de INT-104 (56 mg, 0,264 mmol) en DMF (2,0 ml). La mezcla de la reacción resultante se agitó a 90° C durante 4 h. Una vez completada, la mezcla de la reacción se filtró y los filtrados se concentraron a presión reducida. El material bruto obtenido se purificó mediante cromatografía ultrarrápida en una columna de gel de sílice eluyendo con un gradiente de MeOH-EtOAc del 1% al 15% para producir I-135 (68 mg, rendimiento del 65%) como un sólido amarillo. 1H NMR (400 MHz, DMSO-ds): 59.34 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.17 (d, J=9.2 Hz, 1H), 8.14 (d, J=4.6 Hz, 1H), 7.84 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.61 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.16 (t, J=5.0 Hz, 1H), 4.63 (s, 2H), 3.56-3.60 (m, 1H), 3.40-3.47 (m, 2H), 1.16 (d, J=6.9 Hz, 3H). MS m/z (M+H): 475.1.
Ejemplos biológicos
A continuación se describen ensayos in vitro usados para medir la actividad biológica de los compuestos proporcionados como inhibidores selectivos de MK2.
EJEMPLO 136
Ensayo Omnia® de proteína quinasa 2 activada por proteína quinasa activada por mitógenos para la evaluación de la potencia de compuestos
El siguiente protocolo describe un ensayo de quinasa de lectura continua optimizado para medir la potencia de los compuestos contra la enzima proteína quinasa 2 activada por proteína quinasa activada por mitógeno activada por p38a (MAPKAP-K2 o MK2). Detalles adicionales de este ensayo se describen por Life Technologies, Carlsbad, CA en su sitio web en la siguiente URL: http://tools.lifetechnologies.com/content/sfs/manuals/omnia_kinase_assay_man.pdf.
[Reactivo] usado:
[MK-2] = 0,4 nM,
[ATP] = 10 |jM y
[ST3-Sox] = 10 jM (ATPappKM = 10 jM)
Brevemente, se prepararon soluciones madre 10X de MK2 (PV3317, de Life Technologies), 1,13x ATP (AS001A) y sustrato peptídico conjugado con Sox, S/T3-Sox, (KZN1031) en tampón de reacción de quinasa 1X que consiste de 20 mM Tris, pH 7,5, MgCl25 mM, EGTA 1 mM, p-glicerofosfato 5 mM, glicerol al 5% (10X stock, KB001A) y DTT 0,2 mM (DS001A). Se añadió solución enzimática (5 jl) a cada uno de DMSO (5 jl) o compuestos de prueba diluidos en serie preparados en DMSO en una placa de microtitulación de superficie sin unión, blanca, de 384 pocillos Corning (N° 3574) (Corning, NY). Las reacciones de quinasa se iniciaron con la adición de 45 jl de la mezcla de sustrato ATP-péptido S/T3-Sox y se monitorizaron cada 71 segundos durante 120 minutos a Aex360/Aem485 en un lector de placas Synergy H4 de BioTek (Winooski, VT) a temperatura ambiente.
Las señales de fondo de los pocilios de control sin enzimas se restaron de todas las curvas de progreso. Las porciones lineales iniciales de las curvas de progreso neto se ajustaron de acuerdo con una ecuación lineal para producir la pendiente y el porcentaje de inhibición (% de inhibición) en cada concentración de compuesto. Las curvas de progreso neto obtenidas durante las dos primeras horas de reacciones también se ajustaron de acuerdo con una ecuación ascendente exponencial simple (Ec. 1) para producir valores de kobs en cada concentración de compuesto. Los gráficos de % de inhibición frente a las concentraciones de inhibidor se ajustaron de acuerdo con una ecuación de dosis-respuesta (Ec. 2) para generar valores de IC50 y pendiente de Hill, mientras que los gráficos de kobs frente a la concentración de inhibidor se ajustaron de acuerdo con la Ecuación 3 (Ec.3) para generar valores kinact/KI aparente usando el software GraphPad PRISM (Versión 6.00; GraphPad San Diego, CA).
Figure imgf000159_0001
donde F es la intensidad de fluorescencia del lector de placas, V0 es una constante que refleja la relación entre la lectura del instrumento y la concentración de producto, t es el tiempo, e es el número de Euler y kobs es la constante de velocidad de inactivación observada.
Figure imgf000159_0002
donde el % de inhibición es porcentaje de inhibición, de IC50 es la concentración inhibidora máxima media, [I] es la concentración de inhibidor, y n es la pendiente de Hill.
Figure imgf000159_0003
donde kobs es la constante de velocidad de inactivación observada, kinact es la constante de velocidad de inactivación aparente, KI es la constante de inhibición aparente y [I] es la concentración de inhibidor. Los resultados de este ensayo, que muestran IC50 (es decir, la concentración a la que un de compuesto de prueba inhibe el 50% de fosforilación del péptido sustrato) se informan en nanomolar. Los resultados de potencia de los compuestos probados se muestran en la Tabla A en la columna titulada "MK2 IC5 0".
EJEMPLO 137
Ensayo de espectrometría de masas para detectar el nivel de modificación covalente de MK2
Los compuestos I-1 a I-50 de la invención se probaron en un ensayo de espectrometría de masas para medir su capacidad para modificar covalentemente la proteína MK2. A continuación se describe el procedimiento para este ensayo. La proteína MK2 intacta (Invitrogen, N° de cat. PR5320A) se incubó durante 60 minutos a temperatura ambiente con un exceso de 10 veces del compuesto de prueba con respecto a la proteína. Se diluyeron alícuotas de la mezcla resultante (6 gl cada una) con ácido trifluoroacético (TFA, 10 gl) al 0,2% antes de micro C4 ZipTipping directamente sobre el objetivo MALDI usando ácido sinapínico como matriz de desorción (10 mg/ml en TFA al 0,1%: acetonitrilo 50:50, v/v). La masa del centroide de la proteína objetivo en la muestra de control se comparó con la masa del centroide de la proteína objetivo incubada con el compuesto. Un cambio en la masa del centroide de la proteína tratada en comparación con la proteína no tratada se dividió por el peso molecular del compuesto. Este número corresponde al porcentaje de proteína modificada (una medida de la proporción de proteína objetivo total unida covalentemente al compuesto de prueba) después de una hora de incubación. Los resultados de este ensayo se informan en la Tabla A bajo la columna “Modificación de Masa”.
Los compuestos I-51 a I-129 se probaron en un ensayo de espectrometría de masas de perlas magnéticas para medir su capacidad para modificar covalentemente la proteína MK2. A continuación se describe el procedimiento para este ensayo. La proteína MK2 (Invitrogen, N° de Cat. PR5320A) se incubó durante 60 minutos a temperatura ambiente con un exceso de 10 veces de compuesto de prueba a proteína. Se añadieron 3 gl de perlas magnéticas de Ni-NTA a las alícuotas de 6 gl de muestra, se lavaron, se eluyeron con ácido trifluoroacético (TFA, 2 gl) al 0,2% y se colocaron directamente sobre el objetivo MALDI usando ácido sinapínico como matriz de desorción (10 mg/ml en TFA al 0,1%: acetonitrilo 50:50, v/v). La masa del centroide de la proteína objetivo en la muestra de control se comparó con la masa del centroide de la proteína objetivo incubada con el compuesto. Un cambio en la masa del centroide de la proteína tratada en comparación con la proteína no tratada se dividió por el peso molecular del compuesto. Este número corresponde al porcentaje de proteína modificada (una medida de la proporción de proteína objetivo total unida covalentemente al compuesto de prueba) después de una hora de incubación. Los resultados de este ensayo se informan en la Tabla A bajo la columna “Modificación de Masa”.
EJEMPLO 138
Ensayo Celular de MK2 - Detección de Hsp27 total y fosfo (Serina 78) por MSD ELISA (Thp1)
Los compuestos de la invención se probaron en células de leucemia monocítica aguda humana Thp-1 para medir la inhibición de la actividad MK2. Se cultivaron células Thp-1 en medio de cultivo que contenía RPMI/FBS (suero bovino fetal) al 10%/2-mercaptoetanol 0,05 mM.72 horas antes del ensayo, se sembraron 8 x 104 células por pocillo en una placa de 96 pocillos de fondo plano junto con 10 ng/ml de forbol 12-miristato 13-acetato (PMA). Las células se cultivaron en una incubadora a 37° C hasta que se necesitaron para el ensayo. El medio de la placa celular se reemplazó con medio de cultivo justo antes del ensayo mientras se realizaban las diluciones del compuesto.
Se prepararon soluciones madre del compuesto de prueba, 1 mM en DMSO. Se añadieron 0,9 pl de compuesto de prueba a 300 pl de medio celular para una concentración de partida de 3000 nM. Se realizaron diluciones en serie de tres veces (1:3) en medio de ensayo celular hasta la concentración final de 0,15 nM. Se descartó el medio de la placa celular, seguido de la adición de 100 pl del medio que contenía el compuesto. La preparación resultante se incubó a 37° C durante 1 hora.
Se eliminó el medio de ensayo celular que contenía el compuesto de prueba y las células se lavaron una vez con medio de ensayo celular. Se añadió medio de ensayo celular que contenía 50 ng/ml de LPS (lipopolisacárido) a cada pocillo y se incubó durante 45 minutos. Después de la incubación con LPS, las células se lavaron una vez con PBS (solución salina tamponada con fosfato) y se lisaron con 60 pl de tampón de extracción celular (Invitrogen N° FNN0011) más inhibidores de proteasa y fosfatasa. Luego, la placa se almacenó a -80° C hasta su análisis posterior.
Se adquirió el kit de ensayo ELISA MULTI-SPOT Phospho(Ser78)/Total HSP27 de Meso Scale Delivery (MSD; N° de catálogo K15128D). MSD proporciona una placa que ha sido prerrevestida con anticuerpos de captura para phosphor-HSP27 (Ser78) y HSP27 total. La placa MSD prerrecubierta se bloqueó con 150 pl/pocillo de bSa al 3% en tampón de lavado MSD. La preparación se colocó en un agitador a temperatura ambiente durante una hora. Mientras se bloqueaba la placa ELISA, la placa de ensayo celular almacenada a -80° C se colocó en un agitador a 4° C durante 1 hora para descongelar.
La placa MSD bloqueada se lavó en un lavador de placas, extrayendo el último bit de solución de lavado, seguido de la adición de 30 pl del lisado de la placa de ensayo celular. La preparación se cubrió y se incubó durante 1 hora a temperatura ambiente. Se eliminó el lisado, se lavó la placa 3 veces en un lavador de placas y se extrajo el último bit de tampón de lavado y se reemplazó con 25 pl/anticuerpo de detección de pocillo (anti-HSP27 total conjugado con un compuesto electroquimioluminiscente, etiqueta MSD SULFO-TAG, suministrado en el kit) elaborado en tampón de lavado BSA/MSD al 1%. La placa se incubó durante 1 hora a temperatura ambiente en un agitador, seguido de 3 lavados. Se extrajo el último bit de tampón de lavado. Se añadieron 150 pl/pocillo de tampón de lectura 1x MSD (tampón de lectura 4x suministrado con el kit) y la placa se analizó en el MSD SECTOR® Imager para su análisis. El SECTOR® Imager mide la intensidad de la luz emitida para proporcionar una medida cuantitativa de HSP27 fosforilada (Ser78) y HSP27 total presente en la muestra. El porcentaje relativo de fosfoproteína en una muestra se calcula dividiendo la intensidad de la señal de Fosfo-HSP27 entre la intensidad de la señal de HSP27 total medida en cada pocillo. Se realizó un análisis de ajuste de curva usando el software Graph Pad Prism para generar una EC50 basada en las respuestas inhibidoras de la relación de señal p-HSP27/HSP27 total inducida por LPS normalizada a los controles tratados con DMSO (ajustado al 100% de intensidad de señal). Los resultados de este ensayo, que muestran la EC50 (es decir, la concentración a la que un compuesto de prueba inhibe la fosforilación de Hsp27 en el 50%) se presentan en nanomolar. Los resultados de este ensayo se informan en la Tabla A bajo la columna "EC50 de señalización de pHSP27 ".
La Tabla A muestra datos para compuestos seleccionados en varios ensayos. Los compuestos que tienen una actividad designada como "A" proporcionaron una EC50/IC50<100 nM; los compuestos que tienen una actividad designada como "B" proporcionaron una EC50/IC50 de 101-500 nM; los compuestos que tienen una actividad designada como "C" proporcionaron una EC50/IC50 de 501-999 nM; los compuestos que tienen una actividad designada como "D" proporcionaron un EC50/IC50 de >1000 nM. Los compuestos que tienen una actividad designada como "E" proporcionaron una modificación en masa de >70%; los compuestos que tienen una actividad designada como "F" proporcionaron una modificación en masa del 31-69%; los compuestos que tienen una actividad designada como "G" proporcionaron una modificación de masa de <30%.
Tabla A.
Figure imgf000161_0001
continuación
Figure imgf000162_0001
continuación
Figure imgf000163_0001
continuación
Figure imgf000164_0001
Aunque hemos descrito una serie de realizaciones de esta invención, es evidente que nuestros ejemplos básicos pueden modificarse para proporcionar otras realizaciones que utilicen los compuestos de esta invención. Por lo tanto, se apreciará que el alcance de esta invención se define por las reivindicaciones adjuntas en lugar de por las realizaciones específicas que se han representado a modo de ejemplo.

Claims (1)

  1. REIVINDICACIONES
    1. Un compuesto seleccionado de:
    Figure imgf000165_0001
    o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
    2. El compuesto de la reivindicación 1, donde el compuesto es:
    Figure imgf000166_0001
    o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
    3. El compuesto de la reivindicación 1, donde el compuesto es:
    Figure imgf000166_0002
    o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
    4. El compuesto de la reivindicación 1, donde el compuesto es:
    Figure imgf000166_0003
    o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
    5. El compuesto de la reivindicación 1, donde el compuesto es:
    Figure imgf000166_0004
    o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
    6. El compuesto de la reivindicación 1, donde el compuesto es:
    Figure imgf000167_0001
    o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
    7. El compuesto de la reivindicación 1, donde el compuesto es:
    Figure imgf000167_0002
    o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
    8. El compuesto de la reivindicación 1, donde el compuesto es:
    Figure imgf000167_0003
    o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
    9. Una composición farmacéuticamente aceptable que comprende el compuesto de acuerdo con la reivindicación 2 y un portador, adyuvante o vehículo farmacéuticamente aceptable.
    10. Una composición farmacéuticamente aceptable que comprende el compuesto de acuerdo con la reivindicación 3 y un portador, adyuvante o vehículo farmacéuticamente aceptable.
    11. Una composición farmacéuticamente aceptable que comprende el compuesto de acuerdo con la reivindicación 4 y un portador, adyuvante o vehículo farmacéuticamente aceptable.
    12. Una composición farmacéuticamente aceptable que comprende el compuesto de acuerdo con la reivindicación 5 y un portador, adyuvante o vehículo farmacéuticamente aceptable.
    13. Una composición farmacéuticamente aceptable que comprende el compuesto de acuerdo con la reivindicación 6 y un portador, adyuvante o vehículo farmacéuticamente aceptable.
    14. Una composición farmacéuticamente aceptable que comprende el compuesto de acuerdo con la reivindicación 7 y un portador, adyuvante o vehículo farmacéuticamente aceptable.
    15. Una composición farmacéuticamente aceptable que comprende el compuesto de acuerdo con la reivindicación 8 y un portador, adyuvante o vehículo farmacéuticamente aceptable.
ES15842903T 2014-09-17 2015-09-16 Inhibidores de MK2 y usos de los mismos Active ES2874561T3 (es)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201462051788P 2014-09-17 2014-09-17
US201562199927P 2015-07-31 2015-07-31
PCT/US2015/050495 WO2016044463A2 (en) 2014-09-17 2015-09-16 Mk2 inhibitors and uses thereof

Publications (1)

Publication Number Publication Date
ES2874561T3 true ES2874561T3 (es) 2021-11-05

Family

ID=55454109

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
ES15842903T Active ES2874561T3 (es) 2014-09-17 2015-09-16 Inhibidores de MK2 y usos de los mismos

Country Status (30)

Country Link
US (5) US9458175B2 (es)
EP (2) EP3193611B1 (es)
JP (3) JP6556225B2 (es)
KR (1) KR102457848B1 (es)
CN (1) CN106998692B (es)
AU (1) AU2015317741B2 (es)
BR (1) BR112017005266B1 (es)
CA (1) CA2961607C (es)
CL (1) CL2017000576A1 (es)
CO (1) CO2017003279A2 (es)
CY (1) CY1124215T1 (es)
DK (1) DK3193611T3 (es)
EA (1) EA037299B1 (es)
EC (1) ECSP17023281A (es)
ES (1) ES2874561T3 (es)
HR (1) HRP20210529T1 (es)
HU (1) HUE054347T2 (es)
IL (1) IL251051B (es)
LT (1) LT3193611T (es)
MA (1) MA40534B1 (es)
MX (2) MX2017003359A (es)
NZ (1) NZ730603A (es)
PL (1) PL3193611T3 (es)
PT (1) PT3193611T (es)
RS (1) RS62017B1 (es)
SA (1) SA517381115B1 (es)
SG (2) SG11201701861RA (es)
SI (1) SI3193611T1 (es)
TW (1) TWI744217B (es)
WO (1) WO2016044463A2 (es)

Families Citing this family (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20150133172A (ko) 2013-03-15 2015-11-27 셀진 아빌로믹스 리서치, 인코포레이티드 Mk2 억제제 및 이의 용도
ES2874561T3 (es) 2014-09-17 2021-11-05 Celgene Car Llc Inhibidores de MK2 y usos de los mismos
CN106632077B (zh) * 2016-10-10 2019-01-22 上海再启生物技术有限公司 一种2-氨基-4-溴嘧啶的制备方法
AU2018236290B2 (en) * 2017-03-16 2022-06-02 Bristol-Myers Squibb Company MK2 inhibitors, synthesis thereof, and intermediates thereto
WO2018170200A1 (en) * 2017-03-16 2018-09-20 Celgene Car Llc Heteroaryl compounds useful as mk2 inhibitors
EP3595658A4 (en) * 2017-03-16 2020-11-25 Celgene CAR LLC FORMS AND COMPOSITIONS OF A MK2 INHIBITOR
JP2020511468A (ja) * 2017-03-16 2020-04-16 セルジーン シーエーアール エルエルシー Mk2阻害剤の重水素化アナログおよびその使用
EP3596084A4 (en) * 2017-03-16 2020-12-23 Celgene CAR LLC 9,10,11,12-TETRAHYDRO-8H- [1,4] DIAZEPINO [5 ', 6': 4.5] THIENO [3,2-F] QUINOLINE-8-ON COMPOUNDS AND USES THEREOF
CN107058259A (zh) * 2017-05-18 2017-08-18 南京中医药大学 分子标志物mk2基因及其应用
US20220251105A1 (en) * 2019-05-17 2022-08-11 Celgene Car Llc Methods of treating a mk2-mediated disorder
AU2021218740A1 (en) * 2020-02-14 2022-09-22 Salk Institute For Biological Studies Mono and combination therapies with ULK1/2 inhibitors
EP4114411A4 (en) * 2020-03-02 2024-04-24 Washington University St Louis COMPOSITIONS AND METHODS FOR THE TREATMENT OF PANCREATIC CANCER
JP2023536427A (ja) * 2020-07-24 2023-08-25 ブリストル-マイヤーズ スクイブ カンパニー 急性呼吸器障害の治療方法
EP4079855A1 (en) * 2021-04-20 2022-10-26 Eberhard Karls Universität Tübingen Medizinische Fakultät Compound and method for the prophylaxis and treatment of leukemia
WO2023025298A1 (zh) * 2021-08-27 2023-03-02 瑞石生物医药有限公司 喹啉并呋喃衍生物及其用途
WO2024044731A1 (en) * 2022-08-26 2024-02-29 Matchpoint Therapeutics Inc. Diazepino-thieno-quinoxaline compounds and their use in therapy

Family Cites Families (40)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5015778A (en) 1989-12-18 1991-05-14 The Dow Chemical Company Catalytic method to produce hydroxy substituted arylophenones
JP3696884B2 (ja) 1994-03-25 2005-09-21 アイソテクニカ、インコーポレーテッド ジュウテリウム化による薬物の効能の増強
US5441946A (en) 1994-04-14 1995-08-15 Rhone-Poulenc-Rorer Pharmaceuticals, Inc. Phosphonate derivatives of lipophilic amines
GB9828511D0 (en) * 1998-12-24 1999-02-17 Zeneca Ltd Chemical compounds
US6861440B2 (en) * 2001-10-26 2005-03-01 Hoffmann-La Roche Inc. DPP IV inhibitors
TW200413273A (en) 2002-11-15 2004-08-01 Wako Pure Chem Ind Ltd Heavy hydrogenation method of heterocyclic rings
EP1572693A1 (en) 2002-12-20 2005-09-14 Pharmacia Corporation Mitogen activated protein kinase-activated protein kinase-2 inhibiting compounds
JP5010917B2 (ja) 2003-08-29 2012-08-29 エグゼリクシス, インコーポレイテッド c−Kit調節因子および使用方法
WO2005105814A1 (en) 2004-04-28 2005-11-10 Incyte Corporation Tetracyclic inhibitors of janus kinases
AU2006210513C1 (en) 2005-02-04 2012-10-25 Senomyx, Inc. Compounds comprising linked heteroaryl moieties and their use as novel umami flavor modifiers, tastants and taste enhancers for comestible compositions
EP1849781A1 (en) 2006-04-28 2007-10-31 Laboratorios del Dr. Esteve S.A. Substituted 3-Amino-4-hydroxy pyrrolidines compounds, their preparation and use as medicaments
JP2010505961A (ja) 2006-10-09 2010-02-25 タケダ サン ディエゴ インコーポレイテッド キナーゼ阻害剤
JP2010533674A (ja) 2007-07-16 2010-10-28 ノバルティス アーゲー Mk2阻害剤として有用なヘテロ環式化合物
US8907095B2 (en) 2007-10-22 2014-12-09 Merck Sharp & Dohme Corp. Bicyclic heterocycle derivatives and their use as modulators of the activity of GPR119
US8338439B2 (en) 2008-06-27 2012-12-25 Celgene Avilomics Research, Inc. 2,4-disubstituted pyrimidines useful as kinase inhibitors
KR20110025224A (ko) 2008-06-27 2011-03-09 아빌라 테라퓨틱스, 인크. 헤테로아릴 화합물 및 이의 용도
WO2010048149A2 (en) 2008-10-20 2010-04-29 Kalypsys, Inc. Heterocyclic modulators of gpr119 for treatment of disease
US20110269744A1 (en) * 2010-03-12 2011-11-03 Astellas Pharma Inc. Benzazepine Compound
WO2011153553A2 (en) * 2010-06-04 2011-12-08 The Regents Of The University Of California Methods and compositions for kinase inhibition
EP2508511A1 (en) 2011-04-07 2012-10-10 Laboratoire Biodim Inhibitors of viral replication, their process of preparation and their therapeutical uses
EP2511273B8 (en) * 2011-04-15 2019-06-26 Hivih Inhibitors of viral replication, their process of preparation and their therapeutical uses
CN107057719A (zh) 2012-02-22 2017-08-18 默克专利股份有限公司 液晶介质
JPWO2013146963A1 (ja) * 2012-03-28 2015-12-14 武田薬品工業株式会社 複素環化合物
TW201406758A (zh) * 2012-06-28 2014-02-16 Daiichi Sankyo Co Ltd 三環性化合物
US9085586B2 (en) * 2012-07-11 2015-07-21 Nimbus Iris, Inc. IRAK inhibitors and uses thereof
US20150269216A1 (en) * 2012-09-24 2015-09-24 Claremont Speede Mobile sender controlled data access and data deletion method and system
TW201417817A (zh) * 2012-09-25 2014-05-16 Daiichi Sankyo Co Ltd Gsk3抑制劑與抗dr5抗體之組合
KR20150133172A (ko) * 2013-03-15 2015-11-27 셀진 아빌로믹스 리서치, 인코포레이티드 Mk2 억제제 및 이의 용도
WO2014139144A1 (en) 2013-03-15 2014-09-18 Agios Pharmaceuticals, Inc. Therapeutic compounds and compositions
WO2015050957A2 (en) 2013-10-02 2015-04-09 Treatments For Systemic Lupus Erythematosus Treatments for systemic lupus erythematosus
US10512651B2 (en) 2014-08-25 2019-12-24 Stc.Unm Inhibition of MK2 in the treatment of cancer
ES2874561T3 (es) 2014-09-17 2021-11-05 Celgene Car Llc Inhibidores de MK2 y usos de los mismos
BR112017014737A2 (pt) 2015-01-08 2018-01-16 Moerae Matrix Inc formulação de peptídeos inibidores de mk2
JP2020511468A (ja) 2017-03-16 2020-04-16 セルジーン シーエーアール エルエルシー Mk2阻害剤の重水素化アナログおよびその使用
EP3595658A4 (en) 2017-03-16 2020-11-25 Celgene CAR LLC FORMS AND COMPOSITIONS OF A MK2 INHIBITOR
WO2018170200A1 (en) 2017-03-16 2018-09-20 Celgene Car Llc Heteroaryl compounds useful as mk2 inhibitors
AU2018236290B2 (en) 2017-03-16 2022-06-02 Bristol-Myers Squibb Company MK2 inhibitors, synthesis thereof, and intermediates thereto
EP3596084A4 (en) 2017-03-16 2020-12-23 Celgene CAR LLC 9,10,11,12-TETRAHYDRO-8H- [1,4] DIAZEPINO [5 ', 6': 4.5] THIENO [3,2-F] QUINOLINE-8-ON COMPOUNDS AND USES THEREOF
US20220251105A1 (en) 2019-05-17 2022-08-11 Celgene Car Llc Methods of treating a mk2-mediated disorder
JP2023536427A (ja) 2020-07-24 2023-08-25 ブリストル-マイヤーズ スクイブ カンパニー 急性呼吸器障害の治療方法

Also Published As

Publication number Publication date
JP2017529367A (ja) 2017-10-05
TW201617351A (zh) 2016-05-16
EP3193611B1 (en) 2021-03-24
JP2022078315A (ja) 2022-05-24
WO2016044463A3 (en) 2016-09-01
US10253040B1 (en) 2019-04-09
CN106998692B (zh) 2020-09-08
IL251051B (en) 2019-11-28
CA2961607C (en) 2023-03-28
SA517381115B1 (ar) 2021-03-09
MA40534B1 (fr) 2021-04-30
US20160075720A1 (en) 2016-03-17
BR112017005266B1 (pt) 2022-11-01
ECSP17023281A (es) 2017-06-30
CL2017000576A1 (es) 2017-12-01
CA2961607A1 (en) 2016-03-24
CN106998692A (zh) 2017-08-01
JP7375072B2 (ja) 2023-11-07
MX2017003359A (es) 2017-11-22
JP6556225B2 (ja) 2019-08-07
LT3193611T (lt) 2021-08-25
PL3193611T3 (pl) 2021-10-04
CO2017003279A2 (es) 2017-09-29
HRP20210529T1 (hr) 2021-08-06
EP3193611A2 (en) 2017-07-26
WO2016044463A2 (en) 2016-03-24
SI3193611T1 (sl) 2021-08-31
PT3193611T (pt) 2021-05-28
NZ730603A (en) 2024-02-23
US9790235B2 (en) 2017-10-17
US20210053984A1 (en) 2021-02-25
BR112017005266A2 (pt) 2017-12-12
EA201790380A1 (ru) 2017-08-31
KR102457848B1 (ko) 2022-10-25
US20170114073A1 (en) 2017-04-27
RS62017B1 (sr) 2021-07-30
SG10201902326XA (en) 2019-04-29
AU2015317741A1 (en) 2017-04-20
US20190375762A1 (en) 2019-12-12
IL251051A0 (en) 2017-04-30
US11584757B2 (en) 2023-02-21
MX2020005213A (es) 2020-08-20
EA037299B1 (ru) 2021-03-05
US10577380B2 (en) 2020-03-03
US9458175B2 (en) 2016-10-04
HUE054347T2 (hu) 2021-08-30
JP2019194236A (ja) 2019-11-07
SG11201701861RA (en) 2017-04-27
TWI744217B (zh) 2021-11-01
DK3193611T3 (da) 2021-05-10
AU2015317741B2 (en) 2020-01-16
EP3193611A4 (en) 2018-02-28
MA40534A (fr) 2016-03-24
KR20170063734A (ko) 2017-06-08
CY1124215T1 (el) 2022-05-27
EP3912981A1 (en) 2021-11-24

Similar Documents

Publication Publication Date Title
ES2874561T3 (es) Inhibidores de MK2 y usos de los mismos
JP7022131B2 (ja) ブルトン型チロシンキナーゼのイミダゾピラジン阻害剤
AU2005322855B2 (en) Pyrimidine derivatives as kinase modulators and method of use
US11098057B2 (en) 9,10,11,12-tetrahydro-8H-[1,4]diazepino[5′,6′:4,5]thieno[3,2-F]quinolin-8-one compounds and uses thereof
ES2792979T3 (es) Compuestos de pirimidina sustituidos, composiciones y aplicaciones médicas de los mismos
AU2017296338A1 (en) Novel pyrimidine carboxamides as inhibitors of vanin-1 enzyme
US20200239470A1 (en) Substituted Pyrimidine Compound for Treating Cancer
US20200190068A1 (en) Substituted pyrimidines, pharmaceutical compositions and therapeutic methods thereof
WO2016090079A1 (en) Heteroaryl compounds and uses thereof
CN111170986A (zh) 布鲁顿酪氨酸激酶的抑制剂
CN113227100B (zh) 噻吩并吡啶酮化合物
WO2024092115A2 (en) Mk2 inhibitors and uses thereof