ES2635051T3 - Mutaciones en K-ras y terapia con anticuerpos anti-EGFR - Google Patents
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Abstract
Un método para predecir si un paciente que sufre de cáncer colorrectal no responderá al tratamiento con panitumumab, que comprende la determinación de la presencia o ausencia de una mutación T20M y G12V en K-ras en un tumor de dicho paciente, en donde la presencia de las mutaciones indica que el paciente no responderá al tratamiento con panitumumab.
Description
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combinado con un agente quimioterapéutico o antineoplásico y/o terapia de radiación. En ciertas realizaciones, el agente de unión específica es el panitumumab. Los diseños de protocolo abordarán la eficacia evaluada por la reducción de la masa tumoral, así como la capacidad para reducir las dosis habituales de la quimioterapia convencional. Estas reducciones de dosificación permitirán una terapia adicional y/o prolongada reduciendo la toxicidad relacionada con la dosis del agente quimioterapéutico.
"Monoterapia" se refiere al tratamiento de un trastorno mediante la administración la inmunoterapia a pacientes sin un agente quimioterapéutico o antineoplásico acompañantes. En ciertas realizaciones, la monoterapia comprende la administración de panitumumab en la ausencia de un agente quimioterapéutico o antineoplásico y/o terapia de radiación.
Ciertas realizaciones
En ciertas realizaciones, se describe un método para diagnosticar una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones K-ras en un sujeto.
En ciertas realizaciones descritas en la presente memoria, un método para diagnosticar una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones K-ras en un sujeto, comprende: (a) determinar la presencia o cantidad de expresión de un polipéptido de K-ras mutante en una muestra del sujeto; y (b) diagnosticar una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones K-ras en base a la presencia o cantidad de expresión del polipéptido. En ciertas realizaciones descritas en la presente memoria, un método de diagnóstico de una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones K-ras en un sujeto comprende: (a) determinar la presencia o cantidad de transcripción o traducción de un polinucleótido K-ras mutante en una muestra del sujeto; y (b) diagnósticar una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones K-ras en base a la presencia o cantidad de transcripción o traducción del polinucleótido. En ciertas realizaciones descritas en la presente memoria, la enfermedad o afección es cáncer.
En ciertas realizaciones descritas en la presente memoria, un método de diagnóstico de una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones K-ras en un sujeto comprende: (a) determinar la presencia o cantidad de expresión de un polipéptido que comprende al menos una secuencia de aminoácidos seleccionada entre el SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEC ID NO: 10, SEC ID NO: 12, SEC ID NO: 14, SEC ID NO: 16, y SEQ ID NO: 18; y (b) diagnosticar una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones Kras en base a la presencia o cantidad de expresión del polipéptido. En ciertas realizaciones descritas en la presente memoria, un método de diagnóstico de una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones K-ras en un sujeto comprende: (a) determinar la presencia o cantidad de transcripción o traducción de un polinucleótido que codifica al menos la secuencia aminoácidos seleccionada de entre el SEC ID NO: 4, SEC ID NO: 6, SEC ID NO: 8, SEC ID NO: 10, SEC ID NO: 12, SEC ID NO: 14, SEC ID NO: 16, y SEQ ID NO: 18 en una muestra del sujeto; y (b) diagnosticar una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones K-ras en base a la presencia o cantidad de transcripción o traducción del polinucleótido. En ciertas realizaciones descritas en la presente memoria, la enfermedad o afección es cáncer.
En ciertas realizaciones, se describe un método para diagnosticar una susceptibilidad a una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones K-ras en un sujeto. En ciertas realizaciones descritas en la presente memoria, un método de diagnóstico de una susceptibilidad a una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones K-ras en un sujeto comprende: (a) determinar la presencia o cantidad de expresión de un polipéptido de K-ras mutante en una muestra del sujeto; y (b) diagnósticar una susceptibilidad a una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones K-ras en base a la presencia o cantidad de expresión del polipéptido. En ciertas realizaciones descritas en la presente memoria, un método de diagnóstico de una susceptibilidad a una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones K-ras en un sujeto comprende: (a) determinar la presencia o cantidad de transcripción o traducción de un polinucleótido de K-ras mutante en una muestra del sujeto; y (b) diagnósticar una susceptibilidad a una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones K-ras en base a la presencia o cantidad de transcripción o traducción del polinucleótido. En ciertas realizaciones descritas en la presente memoria, la enfermedad o afección es cáncer.
En ciertas realizaciones descritas en la presente memoria, un método de diagnóstico de una susceptibilidad a una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones K-ras en un sujeto comprende: (a) determinar la presencia o cantidad de expresión de un polipéptido que comprende al menos una secuencia de aminoácidos seleccionada del SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEC ID NO: 10, SEC ID NO: 12, SEC ID NO: 14, SEC ID NO: 16, y SEQ ID NO: 18 en una muestra del sujeto; y (b) diagnósticar una susceptibilidad a una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones K-ras en base a la presencia o cantidad de expresión del polipéptido. En ciertas realizaciones descritas en la presente memoria, un método de diagnóstico de una susceptibilidad a una enfermedad o afección que están relacionadas con una o más mutaciones K-ras en un sujeto comprende: (a) determinar la presencia o cantidad de transcripción o traducción de un polinucleótido que codifica al menos una aminoácidos seleccionada entre la SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEC ID NO:
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presencia o ausencia de la mutación de K-ras G13D en el sujeto. En algunas de tales realizaciones, un agente de unión específica a un polipéptido de EGFr es un anticuerpo para EGFr. En algunas de tales realizaciones, el anticuerpo es panitumumab.
En ciertas realizaciones, se describe un método de predicción de la falta de respuesta al tratamiento con un agente de unión específica a un polipéptido de EGFr en un sujeto que padece cáncer, que comprende determinar la presencia o ausencia de la mutación de K-ras T20M en el sujeto. En algunas de tales realizaciones, un agente de unión específica a un polipéptido de EGFr es un anticuerpo para EGFr. En algunas de tales realizaciones, el anticuerpo es panitumumab.
En ciertas realizaciones, se describe un método de predicción de la falta de respuesta al tratamiento con un agente de unión específica a un polipéptido de EGFr en un sujeto que padece cáncer, que comprende determinar la presencia o ausencia de la mutación de K-ras en el aminoácido 12 de K-ras y/o el aminoácido 13 y/o el aminoácido 20 de K-ras en el sujeto. En algunas de tales realizaciones, un agente de unión específica a un polipéptido de EGFr es un anticuerpo para EGFr. En algunas de tales realizaciones, el anticuerpo es panitumumab.
En ciertas realizaciones, se describe un kit para detección de un polinucleótido que codifica un polipéptido de K-ras mutante en un sujeto. En algunas de tales realizaciones, el kit comprende una sonda que hibrida con un polinucleótido que codifica una región de un polipéptido de K-ras mutante, en donde la región comprende al menos una mutación de K-ras seleccionada entre G12S, G12V, G12D, G12A, G12C, G13A, G13D, y T20M. En algunas de tales realizaciones, el kit comprende adicionalmente dos o más cebadores de amplificación. En algunas de tales realizaciones, el kit comprende adicionalmente un componente de detección. En algunas de tales realizaciones, el kit comprende adicionalmente un componente de muestreo de ácido nucleico.
En ciertas realizaciones descritas en la presente memoria, la falta de respuesta al tratamiento con un agente de unión específica a un polipéptido de EGFr se determina utilizando los criterios RECIST (Criterios de Evaluación de Respuesta en Tumores Sólidos). La respuesta completa y la respuesta parcial de acuerdo con los criterios RECIST son consideradas ambas como sensibles al tratamiento con un agente de unión específica a un polipéptido de EGFr. Se considera que tanto la enfermedad estable como la enfermedad progresiva no responden al tratamiento con un agente de unión específica a un polipéptido de EGFr. Los RECIST son conocidos en la técnica y son descritos, p. ej., por Therasse et al., Febrero de 2000, "New Guidelines to Evaluate the Response to Treatment in Solid Tumors,"
J. Natl. Cancer Inst. 92(3): 205-216.
En ciertas realizaciones, se detecta una mutación de K-ras. En ciertas realizaciones, se detecta una mutación de Kras mediante la detección del polinucleótido de K-ras mutante. En ciertas realizaciones, se detecta una mutación de K-ras mediante la detección del polipéptido de K-ras mutante.
Ciertos métodos de detección de una mutación en un polinucleótido son conocidos en la técnica. Ciertos métodos ilustrativos de tales métodos incluyen, pero no se limitan a, secuenciación, reacciones de extensión del cebador, electroforesis, ensayos de Picogreen, ensayos de ligación de oligonucleótidos, ensayos de hibridación, ensayos TaqMan, ensayos de SNPlex, y ensayos descritos, p. ej., en las Patentes de los Estados Unidos Núms. 5.470.705, 5.514.543, 5.580.732, 5.624.800, 5.807.682, 6.759.202, 6.756.204, 6.734.296, 6.395.486, y la Publicación de Patente de los Estados Unidos 2003-0190646 A1.
En ciertas realizaciones, la detección de una mutación en un polinucleótido comprende amplificar primero un polinucleótido que puede comprender la mutación. Ciertos métodos para la amplificación de un polinucleótido son conocidos en la técnica. Tales productos de amplificación se pueden utilizar en cualquiera de los métodos descritos en la presente memoria, o conocidos en la técnica, para la detección de una mutación en un polinucleótido.
Ciertos métodos de detección de una mutación en un polipéptido son conocidos en la técnica. Ciertos métodos ilustrativos de tales métodos incluyen, pero no se limitan a, la detección utilizando un agente de unión específica específico para el polipéptido mutante. Otros métodos de detección de un polipéptido mutante incluyen, pero no se limitan a, electroforesis y secuenciación de péptidos.
Algunos métodos ilustrativos para la detección de una mutación en un polinucleótido y/o un polipéptido se describen, por ejemplo, en Schimanski et al. (1999) Cancer Res., 59: 5169-5175; Nagasaka et al. (2004) J. Clin. Oncol, 22: 4584-4596; la Publicación PCT Núm. WO 2007/001868 A1; la Publicación de Patente de los Estados Unidos Núm. 2005/0272083 A1; y Lievre et al. (2006) Cancer Res. 66: 3992-3994.
En ciertas realizaciones, se describen micromatrices que comprenden uno o más polinucleótidos que codifican uno o más polipéptidos de K-ras mutante. En algunas de tales realizaciones, se proporcionan micromatrices que comprenden uno o más polinucleótidos complementarios a uno o más polinucleótidos que codifican uno o más polipéptidos de K-ras mutante.
- Número de Histología
- Número de Paciente Número de Paciente del Ensayo Clínico
- 04H-746XC
- 18215 5101
- 04H-747SH
- 18230 5133
- 04H-748JA
- 18244 5097
- 04H-750GR
- 18275 5115
- 04H-752HBM
- 18321 5105
- 04H-753JR
- 18333 5106
- 04H-754BLB
- 18347 5113
- 04H-755JE
- 18361 5110
- 04H-758GDM
- 18396 5120
- 04H-759JH
- 18410 5123
- 04H-760OGM
- 18422 5124
- 04H-762GRK
- 18449 5131
- 04H-763CHK
- 18463 5129
- 04H-765DB
- 18491 5136
- 04H-766LA
- 18505 5137
- 04H-768LGL
- 18526 5119
- 04H-771WRH
- 18554 5102
- 04H-772CEM
- 18569 5125
- 04H-773LOO
- 18583 5096
- 04H-775BM
- 18614 5107
- 04H-776LAP
- 18628 5108
- 04H-780GL
- 18688 5135
- 04H-781JLK
- 18702 5121
- 05H-5686FEC
- 23458 5030
- 05H-5690JFF
- 23481 5079
- 05H-5696REF
- 23534 5144
El ADN genómico se preparó a partir de los portaobjetos de muestra utilizando Pinpoint Slide DNA Isolation System (Zymo Research, Orange, CA) de acuerdo con el protocolo del fabricante. El producto de ADN genómico aislado final se disolvió en 500 µl de agua.
5 La secuencia de polipéptido de K-ras de tipo salvaje se muestra en la Figura 1A (SEQ ID NO: 2; Núm. de Acceso Genbank NP_004976). La secuencia de ADNc de K-ras de tipo salvaje también se muestra en la Figura 1A (SEQ ID NO: 1; Núm. de Acceso Genbank NM_004985). La secuencia de nucleótidos de K-ras de tipo salvaje genómico se encuentra en el Núm. de Acceso Genbank NM_004985. Las secuencias de los cebadores para cada exón se
10 diseñaron utilizando las secuencias intrónicas 5' y 3' para el exón 2 en la secuencia de ADNc de K-ras de tipo salvaje (SEQ ID NO: 1). Las secuencias correspondientes al exón 2 de K-ras humano se amplificaron mediante PCR utilizando cebadores específicos: cebador 3401-41 (5'-AAGGTACTGGTGGAGTATTTG-3' SEC ID NO. 19) y el cebador 3401-44 (5'-GTACTCATGAAAATGGTCAGAG-3' SEQ ID NO. 20).
15 La PCR se realizó con ADN polimerasa Taq (Roche Diagnostics Corp) o equivalente y las siguientes condiciones: se combinaron y mezclaron 5 µl de 10x tampón de Taq, 0,5 µL de MgCl2 24 mM, 1 µl de ADN genómico (aproximadamente 0,5 ng), 7 µl de dNTP 2,5 mM, 1 µl de polimerasa Taq (5U) y 29,5 µl ddH2O. Se añadieron a cada tubo 6 µl de provisión de partida de cebadores combinados (10 µM de cada uno). El protocolo de ciclo fue de 1 ciclo de 4 minutos a 93°C; 10 segundos a 93°C, 30 segundos a 62°C, 30 segundos a 72°C durante 35 ciclos; y 1 ciclo de
20 4 minutos a 72°C. Al final de la reacción la temperatura se mantuvo a 4°C.
Los productos de PCR para cada exón individual se purificaron en gel. Las secuencias exónicas amplificadas purificadas se subclonaron en un vector pCR2.1 usando un kit de clonación TOPO-TA (Invitrogen Corp) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Se recogieron las colonias de E. coli que contenían el vector y el exón insertado de interés mediante un Genetix Colony Picker. Estas colonias se cultivaron durante la noche en medio líquido. El
5 ADN plasmídico de cada cultivo bacteriano durante la noche se aisló usando un QIAGEN Bio-Robot 9600, 3000, u 8000 (Qiagen) de acuerdo a las instrucciones del fabricante.
El ADN plásmido aislado que contenía cada exón se secuenció utilizando un kit BigDye Terminator 3.1 (Applied Biosystems, Inc.) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Los datos de secuenciación se recogieron
10 mediante un Analizador Genético 3700, 3100 o 3730 (Applied Biosystems, Inc.), y se analizaron utilizando el programa Sequencher (GeneCodes Corp.). Las secuencias exónicas de las muestras de los pacientes se compararon con las secuencias exónicas de tipo salvaje.
El análisis mutacional de las muestras tumorales de pacientes de CRC, identificó 13 pacientes con una mutación en
15 el exón 2 de K-ras (Tabla 2). La respuesta tumoral se evaluó a través de CT o MRI y se analizó estadísticamente utilizando RECIST (Criterios de Evaluación de Respuesta en Tumores Sólidos), que establece las directrices para la identificación de la respuesta completa, la respuesta parcial, la enfermedad estable o la progresión de la enfermedad basándose en el tamaño del tumor (véase, p. ej.,Therasse et al., Febrero de 2000, "New Guidelines to Evaluate the Response to Treatment in Solid Tumors," J. Natl. Cancer Inst. 92(3): 205-216).
20 Tabla 2: Resultado de muestras de pacientes de CRC
- PTS ID
- Mutación Respuesta
- 5149
- WT EP
- 5152
- G12S EP
- 5139
- G12V EP
- 5150
- WT EP
- 5147
- WT EP
- 5093
- G12D EE
- 5143
- G13D EP
- 5151
- WT EP
- 5141
- G12V EP
- 5072
- WT EP
- 5145
- WT EE
- 5101
- WT EE
- 5133
- WT EE
- 5097
- WT RP
- 5115
- G12A EE
- 5105
- WT RP
- 5106
- G12D EP
- 5113
- G12C EP
- 5110
- WT EE
- 5120
- WT RP
- 5123
- WT EE
- 5124
- WT EP
- 5131
- WT EP
- 5129
- WT EE
- 5136
- WT EP
- 5137
- G12V EP
- PTS ID
- Mutación Respuesta
- 5119
- WT EE
- 5102
- G12V EP
- 5125
- G12V, T20M EE
- 5096
- WT EE
- 5107
- G12D EP
- 5108
- WT EP
- 5135
- WT EE
- 5121
- WT EE
- 5030
- WT RP
- 5079
- WT EE
- 5144
- G12D EP
EP es sinónimo de enfermedad progresiva, RP es sinónimo de respuesta parcial y EE significa enfermedad estable.
5 De los treinta y siete tumores, 13 tenían mutaciones en el exón 2 de K-ras (36%) y 24 eran de tipo salvaje en el exón 2 de K-ras (64%). De los 13 tumores con una mutación en el exón 2 de K-ras, ninguno (0%) mostró una respuesta parcial a panitumumab. En contraste, 4 de los tumores con el exón 2 de K-ras de tipo salvaje (17%) mostraron una respuesta parcial a panitumumab. Del mismo modo, sólo 3 (23%) de los tumores con una mutación en el exón 2 mostraron estabilización de la enfermedad después del tratamiento panitumumab, mientras que 11 (46%) de los
10 tumores con el exón 2 de K-ras de tipo salvaje mostraron estabilización de la enfermedad. Finalmente, 10 (77%) de los tumores con una mutación en el exón 2 mostraron enfermedad progresiva después del tratamiento con panitumumab, mientras que sólo 9 (37%) de los tumores con el exón 2 de K-ras de tipo salvaje mostraron enfermedad progresiva.
15 Estos datos se resumen en la Tabla 3.
Tabla 3. Resumen del estado de mutación del paciente de CRC y respuesta al panitumumab
- imagen13
- mut+ mut-
- RP
-
imagen14 0 (0%) 4 (17%)
- EE
-
imagen15 3 (23%) 11 (46%)
- EP
-
imagen16 10 (77%) 9 (37%)
20 En ese análisis, una mutación en el exón 2 de K-ras, especialmente las mutaciones G12S, G12V, G12D, G12A, G12C, G13A, G13D y T20M, se correlacionaron con la falta de respuesta a la terapia con panitumumab.
Otras realizaciones serán evidentes para los expertos en la técnica a partir de la consideración de la memoria descriptiva y la práctica de la invención descrita en la presente memoria. Se entiende que la memoria descriptiva y 25 los ejemplos se consideran meramente ilustrativos.
La invención se refiere adicionalmente a los siguientes apartados:
1. Un método para predecir si un paciente no responderá al tratamiento con un agente de unión específica a
30 un polipéptido de EGFr, que comprende determinar la presencia o ausencia de una mutación de K-ras en un tumor del paciente, en donde la mutación de K-ras está en el codón 12 o en el codón 13 o en el codón 20; y en donde si está presente una mutación de K-ras, se pronostica que el paciente no es sensible al tratamiento con un agente de unión específica a un polipéptido de EGFr.
2. El método del apartado 1, en donde la determinación de la presencia o ausencia de una mutación de K-ras
35 en un tumor comprende la amplificación de un ácido nucleico de K-ras del tumor y la secuenciación del ácido nucleico amplificado.
3. El método del apartado 1, en donde el agente de unión específica a un polipéptido de EGFr es un anticuerpo para EGFr.
- 4.
- El método del apartado 3, en donde el anticuerpo para EGFr es panitumumab.
- 5.
- El método del apartado 1, en donde la terminación de la presencia o ausencia de una mutación de K-ras en un tumor comprende la detección de un polipéptido de K-ras mutante en una muestra del tumor utilizando un agente de unión específica a un polipéptido de K-ras mutante.
5 6. El método del apartado 1, en donde la mutación de K-ras se selecciona entre G12S, G12V, G12D, G12A, G12C, G13A, G13D y T20M.
7. Un método para predecir si un tumor no responderá al tratamiento con un agente de unión específica a un polipéptido de EGFr, que comprende determinar la presencia o ausencia de una mutación de K-ras en una muestra de dicho tumor, en donde la mutación de K-ras está en el codón 12 o en el codón 13 o en el codón
10 20; y en donde la presencia de la mutación de K-ras indica que el tumor no responderá al tratamiento con un agente de unión específica a un polipéptido de EGFr.
8. El método del apartado 7, en donde la terminación de la presencia o ausencia de una mutación de K-ras en una muestra de dicho tumor comprende la amplificación del ácido nucleico de K-ras del tumor y la secuenciación del ácido nucleico amplificado.
15 9. El método del apartado 7, en donde el agente de unión específica a un polipéptido de EGFr es un anticuerpo para EGFr.
- 10.
- El método del apartado 9, en donde el anticuerpo para EGFr es panitumumab.
- 11.
- El método del apartado 7, en donde la terminación de la presencia o ausencia de una mutación de K-ras
en la muestra de dicho tumor comprende la detección de un polipéptido de K-ras mutante utilizando un 20 agente de unión específica a un polipéptido de K-ras mutante.
12. El método del apartado 7, en donde la mutación de K-ras se selecciona entre G12S, G12V, G12D, G12A, G12C, G13A, G13D y T20M.
25
Claims (1)
-
imagen1
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| NZ602920A (en) * | 2010-04-12 | 2014-07-25 | Response Genetics Inc | Kras primers and probes |
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| SG10201707548RA (en) * | 2013-03-19 | 2017-10-30 | Toppan Printing Co Ltd | Method for predicting sensitivity to egfr inhibitor |
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| BRPI0508286B8 (pt) | 2004-03-31 | 2021-05-25 | Dana Farber Cancer Inst Inc | método para determinar a probabilidade de eficácia de um inibidor da tirosina quinase egfr para tratar câncer, uso de um inibidor da tirosina quinase de egfr, sonda, kit, e, par de iniciadores |
| US7932026B2 (en) * | 2004-06-04 | 2011-04-26 | Genentech, Inc. | EGFR mutations |
| CA2584723A1 (en) * | 2004-10-22 | 2006-05-04 | Redpath Integrated Pathology, Inc. | Enhanced amplifiability of minute fixative-treated tissue samples, minute stained cytology samples, and other minute sources of dna |
| BRPI0609615A2 (pt) | 2005-04-01 | 2010-04-27 | Amgen Inc | métodos de predição da eficácia de tratamento de agente de ligação especìfica a egfr em tratamento de cáncer relacionado com egfr num sujeito, de tratamento do mesmo e de determinação da eficácia de tratamento em paciente |
| US20090269344A1 (en) * | 2005-04-14 | 2009-10-29 | Salvatore Siena | Anti-EGFR antibody therapy based on an increased copy number of the EGFR gene in tumor tissues |
| ES2398709T5 (es) * | 2005-06-28 | 2017-04-18 | Genentech, Inc. | Mutaciones en EGFR y KRAS para predecir la respuesta de un paciente al tratamiento con inhibidores de EGFR |
| US8703769B2 (en) * | 2005-07-15 | 2014-04-22 | The University Of North Carolina At Chapel Hill | Use of EGFR inhibitors to prevent or treat obesity |
| ATE520979T1 (de) * | 2005-08-24 | 2011-09-15 | Bristol Myers Squibb Co | Biomarker und verfahren zur bestimmung der empfindlichkeit gegenüber modulatoren des egf(epidermal growth factor)-rezeptors |
| WO2007109571A2 (en) * | 2006-03-17 | 2007-09-27 | Prometheus Laboratories, Inc. | Methods of predicting and monitoring tyrosine kinase inhibitor therapy |
| WO2008033442A2 (en) * | 2006-09-12 | 2008-03-20 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Methods and compositions for performing low background multiplex nucleic acid amplification reactions |
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