ES2229673T3 - Ensayo para pronosticar alergia o inflamacion. - Google Patents

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Abstract

Un método para predecir el pronóstico de un trastorno alérgico o inflamatorio, que comprende, preparar una biblioteca de epítopos lineales y conformacionales, evaluar en una muestra de anticuerpos del individuo la inmuno-reactividad con epítopos lineales frente a conformacionales, y correlacionar la presencia de anticuerpos IgE, IgA o IgG reactivos con epítopos lineales frente a conformacionales con el pronóstico a largo plazo del trastorno.

Description

Ensayo para pronosticar alergia o inflamación.
Las reacciones de hipersensibilidad a alimentos afectan a hasta un 6% de los niños durante sus primeros años de vida (Bock, S.A. 1987. Pediatrics 79:683-688), siendo las respuestas alérgicas más documentadas las referentes a la leche, al huevo y al cacahuete (James JM y Sampson HA. 1992. Pediatr Allergy & Immunol 3:67-78). La mayor parte de los niños alérgicos a la leche desarrollan hipersensibilidad a la leche de vaca durante el primer año de vida y, después, aproximadamente el 80% de estos niños "superan" su reactividad (es decir, se hacen clínicamente tolerantes) a los tres años de edad (Host, A. 1994. Pediatr Allergy Immunol 5:5-36). La hipersensibilidad al huevo de gallina y al cacahuete se reconoce más a menudo durante el segundo año de vida. La alergia al huevo parece ser más persistente que la alergia a la leche de vaca, mientras que la alergia al cacahuete se "supera" en muy pocas ocasiones (Bock, S.A. 1982. J Allergy Clin Immunol 69:173-17; Sampson, H.A. y S.M. Scanlon. 1989. J Pediatr 115:23-27; Bock, S.A. and F.M. Atkins. 1989. J Allergy Clin Immunol 83:900-904). Se desconoce la base para estas diferencias en la persistencia de hipersensibilidad clínica a diferentes alergenos alimentarios.
La alergia al huevo está presente en casi dos terceras partes de los niños con dermatitis atópica (Sampson, H.A. J. 1997 Roy. Soc. Med. 90(suppl 30):3-9). Cuando a los niños alérgicos al huevo se les pone una dieta que carece de todas las proteínas del huevo, aproximadamente una tercera parte desarrollan tolerancia clínica al huevo en 2 años, aunque los anticuerpos IgE contra el huevo (por ejemplo, ensayo de pinchazos en la piel positivos) persisten durante varios años (Sampson 1989). El ovomucoide (Gal d 1) es el alergeno dominante en el huevo de la gallina, y los niños con alergia persistente al huevo tienen concentraciones significativamente mayores de anticuerpos IgE anti-ovomucoide que aquellos que "superan" su reactividad (Bernhisel-Broadbent, J., et al. 1994. J Allergy Clin Immunol 93:1047-1059). El ovomucoide es una glucoproteína compuesta por 186 aminoácidos dispuestos en tres dominios en tándem que contienen nueve enlaces disulfuro intra-dominio y cinco cadenas laterales de carbohidrato (Kato, et al. 1987. Biochemistry 296:193-201).
El alergeno principal del cacahuete, Ara h 2, se reconoce por la IgE del suero en >90% de los pacientes con hipersensibilidad al cacahuete (Stanley et al, 1997, Archives of Biochemistry and Biophysics, vol. 342(2):244-253). Los principales epítopos lineales de unión a inmunoglobulina E (IgE) de este alergeno se localizaron en el mapa genético usando péptidos solapantes. Se reconocieron tres epítopos en todos los pacientes ensayados y se demostró que eran los epítopos inmuno-dominantes de la proteína Ara h 2 (Stanley et al, 1997, supra).
Un objeto de esta invención es proporcionar un ensayo que incluya métodos y reactivos para predecir la probabilidad que tienen los niños de superar una alergia, especialmente una alergia alimentaria.
Otro objeto de la presente invención es proporcionar un método y reactivos para evaluar la presencia de anticuerpos contra epítopos lineales frente a conformacionales en las muestras de los pacientes.
Otro objeto más de la presente invención es proporcionar un método y reactivos para evaluar pacientes con enfermedad inflamatoria intestinal para determinar la probabilidad de que tengan un desarrollo más progresivo y refractario.
Sumario de la invención
Se proporcionan métodos y reactivos para uso en la predicción de la probabilidad de que un niño supere una alergia, especialmente una alergia alimentaria, mediante la evaluación de la inmunorreactividad de anticuerpos IgE con epítopos lineales en comparación con epítopos conformacionales. El niño primero se evalúa usando técnicas convencionales para determinar los antígenos a los que el niño es alérgico. Después se caracterizan las inmunoglobulinas de la muestra del paciente usando el antígeno purificado natural, un antígeno recombinante, un antígeno reducido y alquilado, fragmentos proteolíticos del antígeno o péptidos sintéticos con una longitud comprendida entre 4 y 40 aminoácidos, preferiblemente de seis a diez aminoácidos, que pueden inmovilizarse para una evaluación rápida y precisa. Los anticuerpos del paciente, típicamente presentes en una muestra de suero o plasma, se hacen reaccionar con la proteína o los péptidos para determinar los péptidos que se unen por los anticuerpos. Estos anticuerpos después se caracterizan para determinar si los epítopos a los que se unen son lineales o conformacionales. Los pacientes que tengan anticuerpos principalmente reactivos con epítopos conformacionales (es decir, reactivos con la proteína nativa o con fragmentos proteolíticos, en comparación con la proteína reducida y alquilada o péptidos lineales sintéticos) típicamente superarán sus alergias. Los que son reactivos principalmente con epítopos lineales es posible que no superen su reactividad y pueden necesitar tratamiento para inducir tolerancia.
El método de evaluación se demuestra en un ejemplo utilizando suero recogido de pacientes alérgicos al huevo y decapéptidos sintéticos solapantes derivados de la secuencia del ovomucoide. Se descubrió que el ovomucoide posee cinco epítopos alergénicos de unión a IgE. La evaluación de los epítopos alergénicos con sueros de pacientes individuales reveló tres modelos de unión a los epítopos: unión considerable de IgE a decapéptidos de los tres dominios del ovomucoide, unión de IgE predominantemente a péptidos del primer dominio, y prácticamente ausencia de unión de IgE a ningún péptido sintético, lo que indica que la mayoría de los anticuerpos IgE del último grupo reconocían epítopos conformacionales. En todos los pacientes se observó una unión considerable de anticuerpos IgE a péptidos sintéticos lineales, mientras que todos los controles no alérgicos al huevo reconocieron sólo epítopos conformacionales. Los pacientes del grupo con una unión considerable de IgE a decapéptidos lineales solían tener mayor edad y solían tener síntomas alérgicos más severos y generalizados después de la ingestión de huevo que el grupo de pacientes con pocos anticuerpos IgE contra péptidos sintéticos. Estos hallazgos indican que el procesamiento de antígenos diferencial y el reconocimiento estructural anticuerpo-epítopo participan en el curso clínico de la sensibilidad a alergenos.
Puede usarse un método similar para evaluar los anticuerpos IgG o IgA para predecir el pronóstico de ciertos trastornos inflamatorios, especialmente aquellos en los que está implicado el tracto gastrointestinal, tales como la enfermedad de Crohn, la colitis ulcerosa y la enfermedad celíaca.
Breve descripción de los dibujos
Figura 1. Puntuaciones acumulativas de DO de IgE Gal d 1 en SPOTs para cada uno de los 89 decapéptidos sintéticos solapantes generados en la membrana SPOTs. Las puntuaciones reflejan la unión total de los 17 pacientes alérgicos al huevo estudiados.
Figura 2. Puntuaciones acumulativas de DO de IgG Gal d 1 en SPOTs para cada uno de los 89 decapéptidos sintéticos solapantes generados en la membrana SPOTs. Las puntuaciones reflejan la unión total de los 17 pacientes alérgicos al huevo estudiados.
Figuras 3a-c. Modelos de unión de IgE específica de ovomucoide a decapéptidos sintetizados, mostrados como puntuaciones medias acumulativas de DO de IgE Gal d 1 en SPOTs: Grupo 1; Figura 3a, poseía anticuerpos IgE contra epítopos en los tres dominios del ovomucoide, Grupo 2; Figura 3b, tenía anticuerpos IgE específicos de ovomucoide principalmente contra epítopos del primer dominio del ovomucoide, y Grupo 3, Figura 3c, tenía una cantidad insignificante de anticuerpos IgE contra cualquier decapéptido sintético.
Figuras 4a-e. Puntuaciones medias acumulativas de DO de IgG Gal d 1 en SPOTs, pacientes alérgicos al huevo (Figuras 4a-4c) y controles no alérgicos al huevo: pacientes con dermatitis atópica sin alergia al huevo (Figura 4d) y controles normales no alérgicos (Figura 4e).
Figuras 5a-b. Se comparó la relación entre anticuerpos IgE (Figura 5a) e IgG (Figura 5b) específicos de ovomucoide y ovomucoide nativo y "linealizado" (reducido y alquilado) para cada grupo de pacientes alérgicos al huevo.
Descripción detallada de la invención
En la generación de anticuerpos específicos de IgE, las células B se activan después de la unión de la IgM de la superficie a oligopéptidos expuestos en la proteína nativa. Posteriormente, los anticuerpos IgE producidos pueden dirigirse a epítopos lineales que representan 8-20 aminoácidos consecutivos (secuenciales) o a epítopos conformacionales que comprenden restos aminoacídicos de diferentes regiones del alergeno. Se han definido tanto los epítopos lineales (por ejemplo, Phl p 1; heno de fleo (Ball, et al. 1994. J Biol Chem 269:28232-28242) y conformacionales (Bet v 1; polen de abedul (Laffer, et al. 1996. J Immunol 157:4953-4962)) de células B contra aeroalergenos inhalados, aunque se supone que predominan los últimos. Como los alergenos alimentarios se someten a una digestión química y proteolítica considerable antes de la absorción y la captación por las células del tejido linfoide asociado con el intestino, se ha deducido que los epítopos alergénicos alimentarios tienen una naturaleza predominantemente lineal. Sin embargo, en un estudio previo que utiliza sueros recogidos de pacientes alérgicos al huevo, se identificaron 5 sitios de unión a anticuerpos IgE y 7 sitios de unión a anticuerpos IgG a lo largo de los 186 restos aminoacídicos que constituyen el ovomucoide (Cooke y Sampson J. Immunol. 1997 159, 2026-2032). La evaluación del ovomucoide reducido y alquilado, es decir "linealizado" sugirió que no todos los pacientes tenían anticuerpos anti-ovomucoide que reconocían epítopos lineales, y que algunos tenían anticuerpos predominantemente contra epítopos conformacionales.
En el siguiente ejemplo, se utilizaron decapéptidos lineales solapantes y ovomucoide entero linealizado (reducido y alquilado) para comparar el reconocimiento de anticuerpos IgE de pacientes individuales de epítopos lineales del ovomucoide. Se seleccionaron sueros de 17 niños alérgicos al huevo con niveles relativamente altos de anticuerpos IgE específicos de huevo (mayores o iguales a 35 kUA/L) para evaluar los epítopos del ovomucoide. Cuando se comparó la unión de IgE a los decapéptidos sintetizados, parecía que había tres modelos diferentes de unión de anticuerpos. Como se representa en la Figura 3a - 3c, los anticuerpos IgE de un grupo de pacientes reconocieron la mayor parte de los epítopos alergénicos del ovomucoide previamente identificados (Cooke y Sampson 1997), la IgE de un grupo reconoció epítopos alergénicos principalmente en el primer dominio del ovomucoide, y el tercer grupo prácticamente no presentó ninguna unión de IgE a ninguno de los decapéptidos sintetizados. En los pacientes alérgicos al huevo estudiados, se observaron tres modelos de unión de IgE específica de ovomucoide a los decapéptidos sintetizados. Como se refleja en las puntuaciones medias acumulativas de OD de IgE Gal d en SPOTs, un grupo de pacientes (Grupo 1; Figura 3a) poseía anticuerpos IgE contra epítopos de los tres dominios del ovomucoide, otro grupo tenía anticuerpos IgE específicos del ovomucoide principalmente contra epítopos del primer dominio del ovomucoide (Grupo 2; Figura 3b) y otro grupo tenía un nivel insignificante de anticuerpos IgE contra cualquier decapéptido sintético (Grupo 3; Figura 3c).
Como las cantidades de anticuerpos IgE específicos de huevo fueron similares en los tres grupos, esto sugirió que el tercer grupo de pacientes poseía anticuerpos IgE específicos de ovomucoide que reconocían epítopos principalmente conformacionales. Esta suposición se confirmó por hallazgos que comparaban la unión de IgE específica de ovomucoide de pacientes a ovomucoide "nativo" y "linealizado" (reducido y alquilado) (Figura 5a). Aunque la unión de anticuerpo IgE específico de ovomucoide al ovomucoide nativo fue similar en tres grupos de pacientes, sólo aproximadamente un 22% de la IgE específica de ovomucoide del tercer grupo se unía al ovomucoide linealizado en comparación con la forma nativa, mientras que más del 50% de la IgE específica de ovomucoide del primer grupo se unía a la forma linealizada del ovomucoide.
Estos estudios han llevado al desarrollo de un método y un kit de ensayo para determinar la probabilidad de que cualquier individuo particular "supere" una alergia, especialmente una alergia alimentaria.
Ensayo para Determinar la Probabilidad de Superar una Alergia Método
El método se basa en el descubrimiento de que los niños tienen mayor probabilidad de hacerse tolerantes o de "superar" alergias contra epítopos conformacionales en comparación con epítopos lineales. Por lo tanto, el ensayo típicamente se realizará usando muestras de sangre o suero, más preferiblemente de niños, aunque pueden someterse al ensayo individuos de cualquier edad. Estos individuos primero se identifican por medio de la evaluación de las alergias usando ensayos convencionales, por ejemplo, mediante el ensayo de pinchazos en la piel o la inyección de uno o más antígenos a titulaciones diferentes para determinar si el individuo es alérgico al antígeno y la medida en la que el individuo es alérgico. Los anticuerpos típicamente se obtienen extrayendo una muestra de la sangre del paciente, después retirando los glóbulos rojos y ensayando el suero o plasma restante. En las muestras después puede evaluarse la reactividad de la IgE con epítopos definidos presentados por el antígeno (Cooke y Sampson 1997) o los anticuerpos IgE pueden separarse de los otros anticuerpos usando métodos conocidos por los especialistas en la técnica y evaluarse su reactividad. Opcionalmente, en la muestra también pueden evaluarse los anticuerpos IgG reactivos con los epítopos.
Aunque los 17 pacientes alérgicos al huevo del estudio descritos en el ejemplo desarrollaron su hipersensibilidad al huevo los dos primeros años de vida, el primer grupo de pacientes tenía más edad y tenía reacciones alérgicas más pronunciadas después de la ingestión de huevo que el tercer grupo de pacientes. La unión considerable del anticuerpo IgE específico de ovomucoide del primer grupo de pacientes a numerosos epítopos alergénicos lineales es similar a la unión observada en pacientes alérgicos al cacahuete a los alergenos principales del cacahuete Ara h 1 y Ara h 2, (Stanley, et al. 1997 Arch. Biochem. & Biophysic. 342, 244-253). Los pacientes con alergia al cacahuete suelen tener una reactividad "prolongada" (a lo largo de la vida) al cacahuete (Bock y Atkins 1989), lo que sugiere la posibilidad de que la hipersensibilidad alimentaria "prolongada" esté asociada con el desarrollo de cantidades significativas de anticuerpos IgE contra epítopos lineales. Debe tenerse en cuenta que un individuo alérgico al huevo de 32 años, que no forma parte de los 17 pacientes originales que se ensayaron, que había experimentado reacciones anafilácticas repetidas al huevo, tenía anticuerpos IgE específicos de ovomucoide con una unión considerable a los decapéptidos lineales, como se observa en el primer grupo de pacientes de este estudio.
El ejemplo confirma la asociación entre la unión de IgE a la estructura del epítopo, es decir, lineal frente a conformacional, y el desarrollo de hipersensibilidad alimentaria "prolongada". Se ha demostrado que los niños tienen mayores niveles de proteínas alimentarias en la circulación después de las comidas, lo cual se supone que es secundario a un retraso en la maduración en el desarrollo del procesos digestivos, por ejemplo, acidez de estómago, actividad de enzimas proteolíticas, composición de mucina etc., y una mayor captación de antígenos (Hyman, et al. 1985. J. Pediatr 106:467-471; Lebenthal, E. y P. C. Lee. 1980. Pediatrics 66:556-560; Shub, et al. 1983. Biochem J 215:405-411; Bresson, et al. 1984. Pediatr Res 18:984-987). El intestino "con fugas" del niño permitiría el acceso de cantidades significativas de proteínas alimentarias conformacionalmente intactas a células B locales que tras la activación generan anticuerpos IgE específicos de ovomucoide en hospedadores genéticamente predispuestos. Con la maduración del tracto gastrointestinal, tendrían acceso menos proteínas conformacionalmente intactas para activar el tejido linfoide asociado con el sistema digestivo y mastocitos de tejidos que llevan IgE, dando como resultado una pérdida de reactividad clínica y la pérdida final de síntesis de anticuerpos IgE específicos de alergeno. La exclusión total de la dieta de la proteína del huevo promovería adicionalmente la pérdida de reactividad clínica, mientras que una exposición continuada a pequeñas cantidades de proteína del huevo podría dar como resultado el desarrollo de anticuerpos IgE contra epítopos lineales del ovomucoide y una reactividad prolongada. En el intestino maduro, pequeñas cantidades de proteínas inmunológicamente intactas (probablemente epítopos lineales) atraviesan la barrera gastrointestinal (Host 1994; Brunner, M y Walzer M. 1928. Arch Intern Med 42: 173-179; Wilson SJ y Walzer M. 1935. Am J Dis Child 50:49-54; Husby, et al. 1985. Scand J Immunol 22:83-92).
Probablemente quedan excluidas las proteínas conformacionalmente intactas. Esto es coherente con la observación de que la probabilidad de perder reactividad clínica está asociada con la edad del paciente en el momento del diagnóstico, el grado de evitación del alergeno responsable, y el alergeno en cuestión (las alergias al cacahuete, la nuez y al marisco rara vez "se superan"). Los niños más pequeños producen IgE conformacional. Cuando menor sea la edad del paciente en el momento en el que se diagnostica la sensibilidad alimentaria y/o cuanto más rigurosa sea la evitación del alergeno, más probabilidad tendrá el paciente de "superar" su alergia alimentaria (Bock 1982; Sampson and Scanlon 1989; Pastorello, et al 1989. J Allergy Clin Immunol 84:475-483).
Alergenos
Para la evaluación descrita en este documento puede usarse cualquier antígeno. Los antígenos más típicos serán alergenos alimentarios, tales como huevo, nueces, cacahuetes y leche. Otros alergenos comunes incluyen polen, moho y ácaros del polvo, así como insectos, animales domésticos (perro, gato, pájaro) y plantas. Los alergenos son antígenos que proporcionan una respuesta de IgE.
Para ensayar la reactividad con epítopos conformacionales, los alergenos pueden utilizarse como la proteína intacta, una proteína recombinante o fragmentos proteolíticos. Las propiedades del alergeno pueden modificarse por selección del hospedador de expresión - por ejemplo, los sistemas de expresión bacterianos típicamente no glicosilan proteínas, los sistemas de levadura y baculovirus/insecto producen una glicosilación modificada, e incluso dentro de los sistemas de expresión eucariotas, puede haber modificaciones en la glicosilación y fosforilación, para alterar la reactividad y caracterizar adicionalmente el epítopo.
Los epítopos lineales pueden ser fragmentos proteolíticos cortos o péptidos obtenidos por la expresión de ADN recombinante o sintéticamente usando la tecnología convencional. Los péptidos típicamente tendrán una longitud de cuatro a cuarenta aminoácidos, más preferiblemente de seis a veinte, y aún más preferiblemente ocho. Se diseñan basándose en la secuencia de aminoácidos conocida, normalmente disponible en una fuente pública tal como el GenBank. En la realización preferida, los péptidos se sintetizan empezando en uno a nueve restos aminoacídicos, dos a diez y así sucesivamente hasta el final de la proteína.
El alergeno o la porción del mismo a ensayar con respecto a la unión preferiblemente se inmoviliza, por ejemplo, en una placa de 96 pocillos o en una pieza de papel cromatográfico, y después se ensaya con respecto a la unión como se describe en el ejemplo. El alergeno puede unirse a una partícula o a otro medio conocido para el ensayo en fase de solución, o puede ensayarse en un ELISA o usando una técnica fluorométrica.
Kits
El método preferiblemente se realiza usando kits que contienen los reactivos para identificar los anticuerpos IgE en una muestra de un paciente reactiva con suficientes epítopos lineales y conformacionales para caracterizar el pronóstico del paciente. Un kit típico incluirá un dispositivo de múltiples pocillos que tiene inmovilizados epítopos lineales o conformacionales contra uno o más alergenos. El kit también incluirá reactivos para la detección o separación de IgE de IgG, tales como inmunoglobulina marcada fluorescente que sea específica para IgE, y tampones para retirar por medio de lavado el material no unido. El kit puede usarse para determinar las cantidades relativas de IgE contra anticuerpos lineales frente a conformacionales evaluando la reactividad a diferentes titulaciones a uno o más epítopos lineales y a uno o más epítopos conformacionales, y después determinando sus proporciones relativas.
El resultado del ensayo típicamente es una relación de la proporción de IgE reactiva con epítopos lineales frente a conformacionales, sin hacer referencia a un control negativo o positivo, aunque puede ser deseable incluir muestras de IgE positivas y negativas reactivas con epítopos lineales o conformacionales para asegurar la integridad de los reactivos del kit de ensayo y las condiciones de ensayo.
Métodos para el Tratamiento de Alergias, especialmente Alergias Alimentarias
Los individuos que tienen IgE principalmente reactiva con epítopos conformacionales tiene mayor probabilidad de superar la alergia que los caracterizados principalmente por la reactividad con epítopos lineales. Esto se demuestra adicionalmente por los ejemplos. En niños con predisposición a padecer atopia, el desarrollo de anticuerpos IgE contra epítopos conformacionales frente a lineales puede reflejar en parte un retraso en la maduración y/o diferencias moleculares en el procesamiento de los antígenos por el tracto gastrointestinal, inmadurez del intestino, y exposición a alergenos. Ciertos estudios sobre la prevención de la alergia en niños con "alto riesgo" de desarrollar atopia han demostrado que la evitación completa de la leche de vaca (un alergeno alimentario importante) durante al menos el primer año de vida tiene como resultado menos alergia a la leche en comparación con los niños no sometidos a la restricción dietética (Zeiger, et al. 1989, J. Allergy Clin Immunol 84:72-89; Halken, et al. 1992, Allergy 47:545-553).
Basándose en la información anterior, se pueden desarrollar métodos de evaluación generalizados y formulaciones para la evaluación, para ayudar en la decisión de si un paciente debe someterse o no a una modalidad inmunoterapéutica para inducir tolerancia en pacientes alérgicos. Las modalidades inmunoterapéuticas que pueden prescribirse basándose en los resultados de la evaluación incluyen una evitación completa del alergeno, por ejemplo, el alimento que contiene los epítopos reactivos con la IgE del paciente, o una terapia de desensibilización.
Método para Evaluar el Pronóstico en Trastornos Inflamatorios
Pueden detectarse anticuerpos IgG contra proteínas alimentarias en prácticamente todos los individuos expuestos a antígenos alimentarios (Johansson, et al. Ann Allergy 53: 665-672; Savilhati et al. 1987. Acta Paediatr Scand 76:1-6) aunque los niveles de anticuerpos IgG específicos de alimentos tienden a disminuir con la edad (Kletter, et al. 1971. Int Arch Allergy Appl Immunol 40:656-666). Los pacientes con alergias alimentarias o trastornos inflamatorios del intestino (por ejemplo, enfermedad celíaca, enfermedad inflamatoria del intestino, etc.) tienden a tener niveles notablemente elevados de IgG específica de alimentos (May, et al. 1977, Clin Allergy 7:583-595). Esto mismo se esperaría en el caso de anticuerpos IgA, que se encuentran predominantemente en el revestimiento del tracto gastrointestinal.
El ejemplo demuestra que los pacientes con alergia al huevo prolongada poseen grandes cantidades de anticuerpos IgE que se unen a epítopos lineales del ovomucoide, mientras que los pacientes de menor edad poseen principalmente anticuerpos IgE que se unen a epítopos conformacionales. Además, los pacientes alérgicos al huevo desarrollan cantidades significativas de anticuerpos IgG específicos de ovomucoide contra epítopos lineales y conformacionales, mientras que los individuos no alérgicos al huevo desarrollan IgG específica de ovomucoide casi exclusivamente contra epítopos conformacionales.
Como se ha indicado anteriormente, también se observan niveles elevados de anticuerpos IgG específicos de alimentos en trastornos marcados por una inflamación del tracto gastrointestinal, por ejemplo enfermedad de Crohn, colitis ulcerosa, enfermedad celíaca, etc. (Sampson, H.A.: 1995 11(6), 548-553). Se cree que la elevación de los anticuerpos específicos de alimentos es secundaria al aumento de la permeabilidad del intestino en estos trastornos y que no es patogénica. En trastornos inflamatorios del intestino sin complicaciones, es probable que estos anticuerpos IgG específicos de alimentos se dirijan a epítopos conformacionales. Sin embargo, en la enfermedad intestinal progresiva y refractaria, se cree que los anticuerpos IgG específicos de alimentos se dirigen a epítopos lineales, indicando una respuesta inmune anormal y un pronóstico desfavorable.
Como se muestra por el ejemplo, cuando se evaluó la unión de anticuerpos IgG específicos de ovomucoide a decapéptidos lineales, se observaron diferencias significativas entre los grupos de pacientes alérgicos al huevo y los controles. El primer grupo de pacientes, que tenía la mayor cantidad de IgE específica de ovomucoide contra los decapéptidos lineales, mostraba una unión de anticuerpos IgG específicos de ovomucoide a los decapéptidos del ovomucoide significativamente menor que el segundo y el tercer grupos de pacientes (Figuras 4a - 4c). Como se refleja en las puntuaciones medias acumulativas de DO de IgG Gal d 1 en SPOTs, los pacientes alérgicos al huevo (Figuras
4a - 4c) tenían una unión considerable de IgG a epítopos de los tres dominios del ovomucoide y significativamente más anticuerpos IgG específicos de ovomucoide contra los decapéptidos de SPOTs que los controles no alérgicos al huevo: pacientes con dermatitis atópica sin alergia al huevo (Figura 4d) y controles normales no alérgicos (Figura 4e). El segundo (Figura 4b) y tercer (Figura 4c) grupos de pacientes alérgicos al huevo tuvieron significativamente más unión de anticuerpos IgG a los péptidos sintetizados que el primer grupo (Figura 4a). Sin embargo, no hubo ninguna diferencia significativa en el porcentaje de unión de IgG específica de ovomucoide al ovomucoide "linealizado" en comparación con la forma nativa (Figura 5b). Los grupos de control que constaban de pacientes con dermatitis atópica que no eran alérgicos al huevo y los controles normales no alérgicos tuvieron anticuerpos IgG significativos contra el ovomucoide nativo, pero prácticamente no tuvieron anticuerpos IgG específicos de ovomucoide contra los decapéptidos lineales (Figuras 4d - 4e). Estos resultados sugieren una diferencia cualitativa a nivel del procesamiento de antígenos entre individuos alérgicos y no alérgicos a los alimentos en su respuesta inmune contra alergenos ingeridos.
Por lo tanto, es posible seleccionar los individuos que tienen trastornos inflamatorios con probabilidad de caracterizarse por enfermedad inflamatoria progresiva y refractaria, en comparación con trastornos inflamatorios del intestino sin complicaciones. Los métodos y reactivos son similares a los utilizados para determinar la probabilidad de que un individuo supere una alergia basándose en las proporciones relativas de IgE inmunorreactiva con epítopos lineales frente a epítopos conformacionales, pero examinando la inmunorreactividad de IgG contra epítopos lineales frente a epítopos conformacionales.
La presente invención se entenderá adicionalmente haciendo referencia al siguiente ejemplo no limitante.
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Ejemplo
Evaluación de muestras de pacientes para caracterizar la inmunorreactividad de IgE e IgG anti-huevo Métodos y materiales
Abreviaturas:
PBS - solución salina tamponada con fosfato
SDS-PAGE = electroforesis en gel de poliacrilamida y dodecilsulfato sódico
Población de Pacientes
A diecisiete niños (edad media: 4 años, intervalo: 1 - 15 años; 10 niños, 7 niñas) que se presentaron para la evaluación de dermatitis atópica se les diagnosticó hipersensibilidad al huevo mediante una exposición al huevo controlada con placebo doble ciego, como se describe por Sampson, H.A. y C.C. McCaskill, 1985. J Pediatr 107:669-675; y Sampson, H.A. 1992. Acta Derm Veneorol (Stockh) Suppl. 176:34-37. Se obtuvo sangre por punción venosa y el suero se separó y se almacenó congelado a -20ºC hasta que se usó en el estudio. Se determinaron las concentraciones de IgE específicas de huevo en suero utilizando el sistema CAP-RAST FEIA^{TM} (Pharmacia Diagnostics; Uppsala, Suecia).
Preparación de ovomucoide reducido y alquilado
El ovomucoide se redujo y se alquiló disolviendo ovomucoide entero en PBS a una concentración de 50 mg/ml, como describen Cooke y Sampson. J. Immunol. 1997.
Electroforesis en Gel de Poliacrilamida – SDS
Las proteínas se separaron por SDS-PAGE como se ha publicado previamente (Bernhisel-Broadbent, et al. 1989, J Allergy Clin Immunol 84:701-709). Las concentraciones de muestra de proteína se optimizaron para proporcionar una señal equivalente cuando se tiñeron por negro amido y se analizaron por densitometría láser. Las proteínas resueltas posteriormente se transfirieron a nitrocelulosa y después se tiñeron con negro amido para buscar la transferencia de proteína total, o se bloquearon con PBS-Tween con gelatina porcina al 0,5% para el sondeo con sueros de pacientes.
Sondeo de Inmunotransferencias con Sueros de Pacientes
Los sueros de los pacientes se diluyeron a 1:10 en PBS-Tween más gelatina, se incubaron con inmunotransferencias durante 2 horas con agitación suave a temperatura ambiente y se revelaron para determinar los anticuerpos IgE e IgG como se ha descrito previamente (Cooke y Sampson 1997). Las inmunotransferencias se revelaron con BCIP/NBT (SigmaFAST: Sigma Chemical, St. Louis, MO) y se exploraron con un densitómetro láser (Ultrascan SL; Pharmacia Biotech, Piscataway, NJ) para determinar la cantidad de anticuerpo específico de ovomucoide unido.
Selección de Epítopos de IgE e IgG
En este estudio se usó la membrana SPOTs^{TM} (Genosys Biosystems; The Woodlands, TX), una membrana de celulosa modificada, para generar decapéptidos en una matriz de 8 x 12 de pequeñas manchas circulares. Usando este método, se generaron 89 decapéptidos que representaban la secuencia entera de Gal d 1; los péptidos solapaban en 8 aminoácidos, por ejemplo, péptido nº 1 = aminoácidos 1-10 de Gal d 1, péptido nº 2 = aminoácidos 3 -12 de Gal d 1, péptido nº 3 = aminoácidos 5-14 de Gal d 1, etc.
Antes de la evaluación de los péptidos Gal d 1 solapantes con los sueros de los pacientes, la membrana SPOTs se bloqueó con PBS (pH 7,2) que contenía Tween 20 al 0,01%, gelatina porcina al 0,5% y suero humano al 1% (de un donante sin IgE detectable contra proteínas del huevo). Los sueros de los pacientes individuales se diluyeron 1:12 en PBS con Tween 20 al 0,01% y gelatina porcina al 0,5% (PBS-Tween+gel), se incubaron en una plataforma oscilante a temperatura ambiente durante 2 horas y se revelaron para determinar los anticuerpos IgE como se ha descrito previamente (Cooke y Sampson 1997). Para detectar los anticuerpos IgG de los pacientes, los sueros de los pacientes se diluyeron 1:10 en PBS-Tween-gel. Los tiempos de incubación y los lavados fueron los mismos que para el anticuerpo IgE. El anticuerpo de detección usado fue conjugado de IgG-HRP de conejo anti-humano (Dako Corp, Santa Barbara, CA). La membrana se reveló con el kit de detección de HRP quimioluminiscente ECL (Amersham, Arlington Heights, IL).
Después del revelado de la película de rayos X, se midió la densidad óptica (DO) de cada péptido individual usando un densitómetro de reflexión (The Answer II MacBeth, Newburgh, NY). La DO de cada mancha de péptido se registró como la diferencia entre la DO de la mancha de péptido real y la DO de fondo de la película. A cada uno de los 89 decapéptidos se le asignó una puntuación acumulativa de DO de IgE e IgG Gal d 1 de SPOTs que representaba la suma de las DO para cada uno de los 89 péptidos SPOT Gal d 1 para los 17 pacientes estudiados. Cada paciente recibió una puntuación "acumulativa de paciente" de DO de IgE e IgG Gal d 1 que representaba la suma de las DO para los 89 péptidos SPOT Gal d 1 para ese paciente.
La membrana SPOTs pudo regenerarse y volverse a sondear de 8 a 10 veces. Después de aclarar la membrana minuciosamente en agua destilada desionizada, se lavó tres veces en urea 8 M que contenía SDS 35 mM y BME al 0,1% durante 10 minutos cada vez para eliminar la IgE o 30 minutos para eliminar la IgG. La membrana después se lavó tres veces (lavados de 10 minutos) en etanol al 50% y ácido acético al 10%, dos veces (lavados de 10 minutos) en metanol, y después se volvió a bloquear para el segundo sondeo. La incubación de la membrana con el anticuerpo secundario solo (IgE o IgG anti-humana) después del procedimiento de purificación en ausencia del suero del paciente no reveló ninguna unión no específica, lo cual indicó que el procedimiento de depuración había regenerado satisfactoriamente la membrana SPOTs.
Análisis Estadístico
Todos los análisis de los datos se realizaron con ensayos no paramétricos, el ensayo de los signos de 2 muestras por parejas y el ensayo de Mann Whitney.
Resultados
En el estudio se utilizaron sueros de 17 niños con alergia al huevo confirmada por exposiciones a alimentos doble ciego controladas por placebo. Todos tenían unos niveles séricos de IgE específica de huevo notablemente elevados; media - 83 Kua/L; intervalo - de 35 a más de 100 kUA/L. Los sueros de los pacientes individuales se usaron para sondear en la membrana SPOTs anticuerpos específicos de péptidos IgE e IgG. La Figura 1 representa las puntuaciones acumulativas de D.O. de IgE Gal d 1 en SPOTs para cada uno de los 89 péptidos sintéticos. Los péptidos nº 1, nº 5, nº 6, nº 24, nº 25 y nº 57 se unieron por los anticuerpos IgE en más de un 50% de los pacientes, indicando que estos péptidos representan "epítopos alergénicos principales". Estos epítopos alergénicos principales representan los aminoácidos 1-10 de Gal d 1 (péptido 1, AEVDCSRFPN), 9-20 (péptidos 5 y 6, PNATDKEGKDVL), 47-58 (péptidos 24 y 25, SIEFGTNISKEH), y 113-122 (péptido 57, VEQGASVDKR). Otros péptidos sintéticos con puntuaciones de DO de IgE Gal d 1 en SPOTs significativas incluían los péptidos 2 (aminoácidos 3-12, VDCSRFPNAT), 4 (aminoácidos 7-16, RFPNATDKEG), 21 (aminoácidos 41-50, CLLCAYSIEF), 38 y 39 (aminoácidos 75-86, NTTSEDGKVMVL), 53 (aminoácidos 105-114, ECLLCAHKVE) y 89 (aminoácidos 177-186, TLTLSHFGKC). La mayoría de estos péptidos se unieron por anticuerpos IgE de 6 o más pacientes. La Figura 2 representa las puntuaciones acumulativas de DO de IgG Gal d 1 de SPOTs para cada uno de los 89 decapéptidos sintéticos. Hubo una unión más considerable de anticuerpos IgG a los péptidos sintéticos de Gal d 1 en comparación con la unión de IgE.
Cuando los anticuerpos IgE se unían a las membranas SPOTs; se compararon los decapéptidos para cada paciente, observándose tres modelos diferentes de unión a péptidos: Grupo 1 - los anticuerpos IgE se unieron a epítopos en dos o más dominios de Gal d 1, Grupo 2 - anticuerpos IgE específicos para péptidos principalmente en el primer dominio de Gal d 1 y Grupo 3 - unión insignificante de IgE a ninguno de los decapéptidos en la membrana SPOTs. Aunque no hubo diferencias significativas (p>0,4) en las concentraciones séricas de IgE específica de huevo entre los 3 grupos de pacientes (Grupo 1 (n=5) - 80 kUA/L, Grupo 2 (n=5) - 92 kUA/L y Grupo 3 (n=7) - 73 kUA/L), las puntuaciones medias acumulativas de DO de IgE Gal d 1 de SPOTs para los tres grupos de pacientes diferían significativamente. Los pacientes del Grupo 1 tuvieron significativamente más unión de IgE (DO media acumulativa = 27,9) a los decapéptidos de Gal d 1 sintetizados que el Grupo 2 (DO media acumulativa = 7,0; p<0,05) o el Grupo 3 (DO media acumulativa = 2,7; p<0,01), y el Grupo 2 tuvo significativamente más unión de IgE a los péptidos Gal d 1 que el Grupo 3 (p<0,05). En la Figura 3 se representa la unión media de IgE a decapéptidos individuales para cada grupo de pacientes. De manera interesante, los pacientes de los Grupos 1 y 2 solían tener mayor edad con una alergia al huevo más antigua en comparación con los pacientes del Grupo 3; edad media 10 y 6 años, respectivamente, habiéndose diagnosticado la alteración en los pacientes en los 2 primeros años de vida.
La Figura 4a - 4e representa la unión media de IgG a decapéptidos individuales para cada uno de los 3 grupos de pacientes y 2 series de controles. Se vieron diferencias significativas en las puntuaciones medias acumulativas de los pacientes de DO de IgG Gal d 1 entre los tres grupos de pacientes y los controles: Grupo 1 - 52,4 Grupo 2 - 70,6, Grupo 3 - 69,8, controles con dermatitis atópica sin alergia alimentaria (n=5) - 9,6, controles no alérgicos (n=5) - 11,6. Los pacientes del Grupo 1 tuvieron significativamente menos unión de anticuerpos IgG a decapéptidos de Gal d 1 que los Grupos 2 y 3 (p<0,01), mientras que no hubo ninguna diferencia significativa entre los Grupos 2 y 3 (p=0,4). Los tres grupos de pacientes alérgicos al huevo tuvieron significativamente más unión de IgG a los decapéptidos del ovomucoide que los dos grupos de control no alérgicos al huevo (p<0,01). Los controles de pacientes con dermatitis atópica no alérgicos al huevo y los controles no atópicos mostraron una unión de anticuerpos IgG mínima similar (p=0,4) a los 89 decapéptidos SPOTs.
La falta de unión de IgE a los péptidos sintetizados por los pacientes alérgicos al huevo del Grupo 3 sugirió que la mayoría de sus anticuerpos IgE específicos de ovomucoide reconocían epítopos conformacionales. Para examinar esto, se compararon las uniones de anticuerpos IgE al ovomucoide nativo y reducido y alquilado (linealizado) en los tres grupos de pacientes. Las Figuras 5a-b representan la relaciones entre la unión de anticuerpos IgE (DO) al ovomucoide reducido y alquilado en comparación con la unión del anticuerpo IgE al ovomucoide nativo. Las relaciones entre anticuerpos IgE e IgG específicos de ovomucoide y ovomucoide nativo y "linealizado" (reducido y alquilado) se compararon para cada grupo de pacientes alérgicos al huevo. Aunque las concentraciones de anticuerpos IgE contra el ovomucoide nativo fueron comparables para todos los grupos, los pacientes del Grupo 1, que tenían mayor edad con un alergia al huevo antigua, tenían significativamente más anticuerpos IgE contra el ovomucoide linealizado que los pacientes del Grupo 3, que tenían menor edad (Figura 5a). (Figura 5a - medias: 52% frente a 22% para los Grupos 1 y 3, respectivamente, p<0,05). No se observaron diferencias significativas en la relación entre anticuerpos IgG y ovomucoide linealizado-nativo entre los grupos de pacientes alérgicos al huevo (Figura 5b).

Claims (30)

1. Un método para predecir el pronóstico de un trastorno alérgico o inflamatorio, que comprende,
preparar una biblioteca de epítopos lineales y conformacionales,
evaluar en una muestra de anticuerpos del individuo la inmuno-reactividad con epítopos lineales frente a conformacionales, y
correlacionar la presencia de anticuerpos IgE, IgA o IgG reactivos con epítopos lineales frente a conformacionales con el pronóstico a largo plazo del trastorno.
2. El método de la reivindicación 1, donde los epítopos de la biblioteca se seleccionan entre el grupo compuesto por antígeno purificado natural, antígeno recombinante, antígeno reducido y alquilado, fragmentos proteolíticos del antígeno, y péptidos sintéticos con una longitud comprendida entre 4 y 40 aminoácidos.
3. El método de la reivindicación 2, donde los epítopos de la biblioteca se inmovilizan para la evaluación.
4. El método de la reivindicación 1, donde el individuo se ha evaluado para determinar los antígenos a los que el individuo es alérgico.
5. El método de la reivindicación 1, para determinar la probabilidad de que un individuo supere una alergia, que comprende
evaluar en una muestra que comprende anticuerpos IgE de un individuo con una alergia la reactividad de los anticuerpos IgE con uno o más epítopos lineales y uno o más epítopos conformacionales, y determinar si la IgE es principalmente reactiva con epítopos de la biblioteca que son epítopos conformacionales seleccionados entre el grupo compuesto por proteína nativa y fragmentos proteolíticos de proteína nativa, caso en el que se predice que el individuo superará la alergia a los epítopos reactivos con la IgE, o si la IgE es principalmente reactiva con epítopos de la biblioteca que son epítopos lineales seleccionados entre el grupo compuesto por proteínas reducidas y alquiladas y péptidos lineales sintéticos, caso en el que se predice que el individuo no superará la alergia a los epítopos reactivos con la IgE.
6. El método de la reivindicación 5, donde los epítopos proceden de antígenos seleccionados entre el grupo compuesto por alimentos, polen, polvo, mohos, insectos, animales y proteínas vegetales.
7. El método de la reivindicación 6, donde los antígenos proceden de alimentos.
8. El método de la reivindicación 7, donde los epítopos proceden de antígenos seleccionados entre el grupo compuesto por cacahuete, huevo, nueces, leche, pescado y marisco.
9. El método de la reivindicación 1 para determinar la probabilidad de que un trastorno inflamatorio sea progresivo y refractario, que comprende
evaluar en una muestra que comprende anticuerpos IgG o IgA de un individuo con un trastorno inflamatorio la reactividad de los anticuerpos IgG o IgA con uno o más epítopos lineales y uno o más epítopos conformacionales, y determinar si la IgG o IgA es principalmente reactiva con epítopos de la biblioteca que son epítopos conformacionales seleccionados entre el grupo compuesto por proteína nativa y fragmentos proteolíticos de proteína nativa, caso en el que el trastorno inflamatorio probablemente no es progresivo y refractario, o la IgG o IgA es principalmente reactiva con epítopos de la biblioteca que son epítopos lineales seleccionados entre el grupo compuesto por proteína reducida y alquila-
da y péptidos lineales sintéticos, caso en el que el trastorno inflamatorio probablemente es progresivo y refractario.
10. El método de la reivindicación 9, donde el trastorno inflamatorio es del tracto gastrointestinal.
11. El método de la reivindicación 10, donde el trastorno inflamatorio se selecciona entre el grupo compuesto por enfermedad de Crohn, colitis ulcerosa, y enfermedad celíaca.
12. El método de la reivindicación 11, donde los anticuerpos son anticuerpos IgA.
13. Un kit que comprende:
una primera composición que comprende al menos un epítopo lineal de un antígeno, careciendo dicha composición de cualquier epítopo conformacional del antígeno;
una segunda composición que comprende al menos un epítopo conformacional del antígeno; y
reactivos para la detección de anticuerpos IgE, IgA o IgG.
14. El kit de la reivindicación 13, donde la primera composición comprende sustancialmente todos los epítopos lineales del antígeno.
15. El kit de las reivindicaciones 13 o 14, donde la primera composición comprende antígeno reducido y alquilado o un fragmento reducido y alquilado del mismo.
16. El kit de la reivindicación 13, donde la primera composición comprende uno o más péptidos con una longitud comprendida entre aproximadamente 4 y 40 aminoácidos.
17. El kit de la reivindicación 16, donde la primera composición comprende una colección de péptidos solapantes que abarcan la longitud del antígeno.
18. El kit de la reivindicación 13, donde la segunda composición comprende antígeno natural purificado.
19. El kit de la reivindicación 13, donde la segunda composición comprende uno o más fragmentos de antígeno, reteniendo al menos un fragmento una estructura tridimensional suficiente para la retención de al menos un epítopo conformacional.
20. El kit de la reivindicación 13, donde el antígeno es un antígeno proteico.
21. El kit de la reivindicación 13, donde el antígeno está asociado con un trastorno inflamatorio.
22. El kit de la reivindicación 13, donde el antígeno esta asociado con la enfermedad inflamatoria del intestino;
y los reactivos detectan IgA o IgG.
23. El kit de la reivindicación 22, donde el trastorno inflamatorio se selecciona entre el grupo compuesto por enfermedad de Crohn, colitis ulcerosa y enfermedad celíaca.
24. El kit de la reivindicación 13, donde el antígeno está asociado con la alergia.
25. El kit de la reivindicación 24, donde el antígeno está asociado con la alergia a alimentos, polen, polvo, moho, insectos, animales o plantas.
26. El kit de la reivindicación 24, donde el antígeno está asociado con alergia alimentaria.
27. El kit de la reivindicación 26, donde el antígeno está asociado con alergia al cacahuete, huevo, nueces, leche, pescado o marisco.
28. El kit de la reivindicación 26, donde el antígeno es una proteína de cacahuete, huevo o leche.
29. El kit de la reivindicación 13, donde el antígeno está asociado con alergia y
los reactivos detectan IgE.
30. El kit de la reivindicación 13, donde una o tanto la primera como la segunda composiciones comprenden epítopos de más de un antígeno.
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