CN117337306A - 靶向pd-l1和cd73的特异性结合蛋白 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及靶向PD‑L1和CD73的特异性结合蛋白,所述特异性结合蛋白能够与PD‑L1和/或其片段,以及CD73和/或其片段特异性结合。本发明还涉及所述特异性结合蛋白在治疗、预防和/或诊断疾病中的用途,所述疾病例如为免疫性疾病,急性和慢性炎性疾病,以及肿瘤疾病。
Description
本发明涉及生物医药领域,更具体地涉及抗体治疗领域。
背景介绍
程序性死亡配体1(PD-L1),是程序性死亡受体1(PD-1)的两种细胞表面糖蛋白配体之一(另一种是PD-L2),其在结合PD-1时下调T细胞激活和细胞因子的分泌。PD-L1也称为分化簇274(CD274)或B7同系物1(B7-H1),是一种40kDa的I型跨膜蛋白,PD-L1含IgV(免疫球蛋白可变区)样区、IgC(免疫球蛋白恒定区)样区、跨膜区和细胞质尾区,其中细胞质尾区与细胞内的信号转导相关;IgV区和IgC区则参与细胞间的信号转导。PD-L1与PD-1结合时,募集Src同源区2蛋白酪氨酸磷酸酶(SHP-2),从而减弱淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶(LCK)诱导的ζ链-相关蛋白(ZAP70)磷酸化和抑制RAS-MEK-ERK/PI3K-Akt-mTOR通路,进而有效抑制T细胞的转录,最终抑制T细胞的免疫功能,在免疫应答的负性调控方面发挥着重要作用。因此,通常认为,阻断PD-1/PD-L1信号通路可使T细胞活化上调,激活内源性抗肿瘤免疫反应,从而发挥对肿瘤的治疗作用。
以PD-1/PD-L1、CTLA-4单抗为代表的第一代免疫检查点抑制剂已逐渐成为肿瘤免疫治疗的代表,特别是在过继细胞转移治疗和免疫检查点阻断(ICB)中发挥重要作用。靶向PD-1/PD-L1的肿瘤免疫治疗已被批准用于多种不同的实体肿瘤治疗,并于2018年获得诺贝尔生理学或医学奖。然而,抗PD-1/PD-L1治疗的临床数据显示其应答率有限。一些患者产生原发耐药,对PD-1/PD-L1治疗没有应答,一些应答者则在最初反应后也出现了获得性耐药。
而寻找安全有效,并且能与PD-1/PD-L1产生协同效应的新一代肿瘤免疫靶点,是现阶段肿瘤免疫治疗关注的焦点,也由此涌现出如LAG3,TIGIT,TIM3,CD47,OX40,4-1BB等一系列免疫抑制性或激动性靶点。
白细胞分化抗原73(CD73),也称为5'-核苷酸酶,是人体中由NT5E基因编码的酶。CD73是由两个相同的70-KD亚基组成的二聚体,由一个糖基磷脂酰肌醇连接到质膜的外表面。已知CD73催化细胞外单磷酸核苷去磷酸化成核苷,例如腺苷。癌组织中细胞外腺苷的积累构成肿瘤免疫逃逸的重要机制。其他作用中,肿瘤来源的腺苷通过腺苷酸环化酶激活的A2A受体很大程度上抑制浸润的效应T细胞(Ohta等人,(2006)Proc Natl Acad Sci USA 103:13132-13137)。已报道CD73在多种肿瘤细胞中表达,包括白血病,膀胱癌,神经胶质瘤,成胶质细胞瘤,卵巢癌,黑色素瘤,***癌,甲状腺癌,食道癌和乳腺癌(Jin等人,Cancer Res 2010;70:2245-55和Stagg等人,PNAS 2010;107:1547-52)。
对于实体瘤治疗而言,要克服耐药性提高疗效,很重要的一个方面就是解除肿瘤微环境(Tumor micro-environment,TME)对免疫效应细胞的抑制作用。TME是非常复杂的***,由多种细胞、胞间质、酶、细胞因子、代谢产物等构成,有显著的低氧、低pH以及高压的特点,与正常组织差异巨大。其间很重要的一个免疫抑制机制由CD73-腺苷代谢信号途径介导。腺苷可以通过腺苷受体(A2AR)抑制T细胞的免疫杀伤作用,使肿瘤实现免疫逃逸,而CD73则是催化腺苷产生的关键酶。
PD-1/PD-L1的免疫检查点阻断已成为免疫治疗的里程碑。但是,尽管抗PD-1/PD-L1治疗在实体瘤治疗中显示出令人印象深刻的效果,持久的应答却只在一小部分患者中发生,一些最初对治疗有反应的患者最终产生了后天抵抗力,因此,亟待出现疗效更好的PD-1/PD-L1抑制剂以及能与PD-1/PD-L1产生协同效应的肿瘤免疫靶点。
发明内容
本发明提供了能够特异性结合PD-L1或其片段的抗原结合蛋白,其能够阻断PD-1与PD-L1的结合。本发明还提供了多特异性结合蛋白,所述多特异性结合蛋白能够以高亲和力、高特异性与一种或多种抗原结合,所述抗原为PD-L1或其片段,和/或CD73或其片段。本发明还提供了编码所述抗原结合蛋白,以及所述多 特异性结合蛋白的核酸分子,用于产生所述抗原结合蛋白,以及所述多特异性结合蛋白的表达载体,宿主细胞以及用于制备所述抗原结合蛋白,以及所述特异性结合蛋白的方法。本发明还涉及所述抗原结合蛋白,以及多特异性结合蛋白在治疗、预防和/或诊断疾病中的用途,所述疾病例如为免疫性疾病,急性和慢性炎性疾病,以及肿瘤疾病。
第一方面,本发明提供了一种特异性结合PD-L1或其片段的分离的抗原结合蛋白。
所述特异性结合PD-L1或其片段的分离的抗原结合蛋白具有以下一种或者多种特性:(a)能够以高亲和力结合人PD-L1和/或食蟹猴PD-L1;(b)对PD-1信号通路有抑制作用;(c)能够增强激活T淋巴细胞;以及(d)显示体内肿瘤抑制活性。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含以下的互补决定区或其突变体:
SEQ ID NO:9的氨基酸序列所示的HCDR1;
SEQ ID NO:23的氨基酸序列所示的HCDR2;和/或
SEQ ID NO:36的氨基酸序列所示的HCDR3。
所述突变体为在所述VH的HCDR1、HCDR2、HCDR3的氨基酸序列的基础上分别具有1、2、3或4个氨基酸的***、缺失或取代。本领域技术人员知晓,可以对HCDR1、HCDR2和HCDR3中的1个,2个或3个CDR分别进行1、2或3个氨基酸的***、缺失或取代突变。例如,可以对HCDR1进行1个氨基酸的突变,对HCDR2和HCDR3不进行氨基酸的突变,或者,对HCDR1和HCDR2分别进行1个氨基酸的突变,对HCDR3不进行氨基酸的突变。
在一些实施方案中,所述HCDR1的氨基酸序列为GFX
1FSX
2Y,所述HCDR2的氨基酸序列为X
3YX
4GX
5X
6,所述HCDR3的氨基酸序列为NRAX
7FGVX
8PDX
9SDI,其中,X
1、X
2、X
3、X
4、X
5、X
6、X
7、X
8或X
9为选自N、T、D、S、W、R、K、E、I、A、V和L中的任一种。在一些实施方案中,X
1为T、D或N;X
2为N或S;X
3为W或R;X
4为D或T;X
5为T或S;X
6为K、R或E;X
7为I或L;X
8为V或I;和/或,X
9为A或D。
在一些实施方案中,所述HCDR1的氨基酸序列为GF(N/T/D)FS(N/S)Y。在一些实施方案中,所述HCDR2的氨基酸序列为(W/R)Y(D/T)G(T/S)(K/R/E)。在一些实施方案中,所述HCDR3的氨基酸序列为NRA(I/L)FGV(V/I)PD(A/D)SDI。
在一些实施方案中,HCDR1的突变体具有SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14中任一项所示的氨基酸序列。
在一些实施方案中,HCDR2的突变体具有SEQ ID NO:24或SEQ ID NO:27所示的氨基酸序列。
在一些实施方案中,HCDR3的突变体具有SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40和SEQ ID NO:41中任一项所示的氨基酸序列。
优选地,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含以下的互补决定区或其突变体:
SEQ ID NO:9-11和SEQ ID NO:13-14中任一项的氨基酸序列所示的HCDR1;
SEQ ID NO:23-24和SEQ ID NO:27中任一项的氨基酸序列所示的HCDR2;和/或
SEQ ID NO:36和SEQ ID NO:39-41中任一项的氨基酸序列所示的HCDR3。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:9,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:36所示。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:36所示。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:24 和SEQ ID NO:36所示。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:36所示。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:13,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:36所示。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:39所示。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:40所示。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:41所示。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:36所示。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:39所示。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:40所示。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:41所示。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:14,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:36所示。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:14,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:39所示。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:14,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:40所示。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:14,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:41所示。
优选地,所述VH还包含重链可变区框架区(VH FWR),所述VH FWR可以包含VH FWR1,VH FWR2,VH FWR3和VH FWR4。
在一些实施方案中,所述VH FWR1具有SEQ ID NO:3-5中任一项所示的氨基酸序列。
在一些实施方案中,所述VH FWR2具有SEQ ID NO:17或SEQ ID NO:20所示的氨基酸序列。
在一些实施方案中,所述VH FWR3具有SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:31所示的氨基酸序列。
在一些实施方案中,所述VH FWR4具有SEQ ID NO:43所示的氨基酸序列。
优选地,所述VH包含SEQ ID NO:74-77,SEQ ID NO:79-80和SEQ ID NO:82-92中任一项所示的氨基酸序列,或与其具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性的氨基酸序列。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白还包含Fc区,或者与免疫球蛋白的Fc区等同的区域,优选地,所述Fc区为人Fc。更优选地,所述人Fc为人IgG1Fc。
优选地,所述Fc包含L234A、L235A和P329G突变,或L234A和L235A突变,或者包含S298A,E333A和K334A中的一个、两个或三个突变,更优选地同时包含S298A,E333A和K334A三个突变。
在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1或其片段的分离的抗原结合蛋白包含与SEQ ID NO:99、100、101、102、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116或117具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性的氨基酸序列的重链。在一些实施方案中,所述特异性结合PD-L1或其片段的分离的抗原结合蛋白包含SEQ ID NO:99-102,SEQ ID NO:104-105和SEQ ID NO:107-117中任一项所示重链的氨基酸序列。
在一些实施方案中,所述抗原结合蛋白还可以是抗原结合片段,例如可以为Fab、Fab’、F(ab’)
2、Fv、scFv、VH、或者HCAb的形式。所述Fab、Fab’、F(ab’)
2、Fv、scFv或VH的数量优选为一个或多个。
第二方面,本发明提供了分离的核酸,其编码本发明第一方面所述的分离的抗原结合蛋白。
第三方面,本发明提供了表达载体,其包含本发明第二方面所述的分离的核酸,能够将其表达为第一方面的分离的抗原结合蛋白。
所述表达载体可以是真核细胞表达载体和/或原核细胞表达载体,例如为质粒。
第四方面,本发明提供了宿主细胞,所述宿主细胞包含第二方面的分离的核酸,或第三方面的表达载体。
第五方面,本发明提供了抗体药物偶联物,其包含:本发明第一方面所述的分离的抗原结合蛋白;和,与所述抗原结合蛋白共价连接的药物。在一些实施方案中,所述药物选自化学治疗剂、放射治疗剂、免疫抑制剂和细胞毒性药物。
第六方面,本发明提供了嵌合抗原受体,其包括胞外抗原结合结构域、跨膜结构域和胞内信号传导结构域,其中所述胞外抗原结合结构域包含本发明第一方面所述的分离的抗原结合蛋白。
第七方面,本发明提供了修饰的免疫细胞,其包含本发明第六方面所述的嵌合抗原受体。
第八方面,本发明提供了多特异性抗体,其包含两个或两个以上的抗原结合结构域,其中一个抗原结合结构域包含本发明第一方面所述的分离的抗原结合蛋白。
第九方面,本发明提供了第一方面的分离的抗原结合蛋白的制备方法。
在一些实施方案中,利用杂交瘤技术或者本领域的其他常规技术制备,例如人源化技术等制备第一方面的分离的抗原结合蛋白。
在一些实施方案中,所述制备方法包括培养第四方面的宿主细胞的步骤。
在一些实施方案中,利用Harbour HCAb转基因小鼠(以下简称HCAb转基因小鼠)制备第一方面的分离的抗原结合蛋白。
所述HCAb转基因小鼠是一种携带人免疫球蛋白免疫库的转基因小鼠,能够产生全新的仅“重链”抗体,该抗体的大小只有传统IgG抗体的一半。其产生的抗体仅具有人的抗体“重链”可变结构域和小鼠Fc恒定结构域。
优选地,所述利用HCAb转基因小鼠制备第一方面的分离的抗原结合蛋白的方法包括如下步骤:
(a)利用人PD-L1抗原免疫HCAb转基因小鼠,更优选地,所述人PD-L1抗原为重组人PD-L1-mFc,具体地,所述抗原为人PD-L1连接Fc构成的重组融合蛋白;
(b)利用免疫后的HCAb转基因小鼠脾B细胞的RNA反转录后的cDNA,以及特异性引物扩增人VH基因;
(c)将扩增的VH基因构建到编码人IgG抗体重链Fc结构域序列的哺乳动物细胞表达载体中;和
(d)纯化步骤(c)获得的全人源PD-L1单抗。
优选地,所述IgG抗体为IgG1抗体或IgG4抗体。
在一些实施方案中,所述方法还包括通过对CDR区域进行突变对全人源PD-L1单抗进行亲和力改造的步骤。
优选地,通过胚系化回复突变和/或翻译后修饰(PTM)去除对全人源PD-L1单抗进行优化。
第十方面,本发明提供了一种药物组合物,所述药物组合物包含:第一方面所述的分离的抗原结合蛋白,第五方面所述的抗体药物偶联物,第六方面所述的嵌合抗原受体,第七方面所述的修饰的免疫细胞或第八方面所述的多特异性抗体;以及,药学上可接受的载体。
所述药物组合物还可以包含其他治疗剂,包括但不限于,化学治疗剂、放射治疗剂、免疫抑制剂、细胞毒性药物等。在一些实施方案中,所述药物组合物中的化学治疗剂、放射治疗剂、免疫抑制剂或细胞毒性药物,与第五方面所述的抗体药物偶联物中的药物相同或不同。
第十一方面,本发明提供了第一方面所述的分离的抗原结合蛋白、第二方面所述的分离的核酸、第五方面所述的抗体药物偶联物,第六方面所述的嵌合抗原受体,第七方面所述的修饰的免疫细胞或第八方面所述的多特异性抗体或第十方面的药物组合物在制备用于预防、治疗和/或诊断免疫性疾病,急性和慢性炎性疾病,以及肿瘤疾病的药物中的应用。
所述肿瘤可以为乳腺癌、肾细胞癌、黑色素瘤、结肠癌,以及B细胞淋巴瘤,黑色素瘤,头颈癌,膀胱癌,胃癌,卵巢癌,恶性肉瘤,尿路上皮癌,肝癌,食道癌,胃食管交界癌,鼻咽癌,小细胞肺癌,***,子宫内膜癌,胰腺癌,***癌,胶质瘤,非小细胞肺癌,急性粒细胞白血病,霍奇金淋巴瘤,皮肤鳞状细胞癌,局部晚期或转移性恶性肿瘤等。
所述炎性疾病可以为特应性皮炎、溃疡性结肠炎等。
所述免疫性疾病可以为移植物抗宿主病、类风湿性关节炎、***性红斑狼疮、哮喘等。
第十二方面,本发明提供了用于检测样品中的PD-L1的方法,所述方法包括用第一方面的分离的抗原结合蛋白检测样品中的PD-L1的步骤。
所述样品可以是生物学样品,例如,全血,红血细胞浓缩物,血小板浓缩物,白细胞浓缩物,组织,骨髓吸出物,血浆,血清,脑脊液,粪便,尿液,培养的细胞,唾液,口腔分泌物,和鼻腔分泌物等生物学样品。
在一些实施方案中,所述检测样品中的PD-L1的方法可以为非诊断目的的。
第十三方面,本发明提供了多特异性结合蛋白,所述特异性结合蛋白包含至少两个结构域,能够结合PD-L1或其片段,和/或CD73或其片段。
在一些实施方案中,所述特异性结合蛋白包含第一结构域和第二结构域,所述第一结构域结合CD73或其片段,并且所述第二结构域结合PD-L1或其片段。所述第一结构域与所述第二结构域连接形成双特异性结合蛋白。
在一些实施方案中,所述第一结构域为CD73抗体或其抗原结合片段。
在一些实施方案中,所述第二结构域为PD-L1抗体或其抗原结合片段。
在一些实施方案中,所述第一结构域和/或所述第二结构域为IgG、Fab、Fab’、F(ab’)
2、Fv、scFv、VH、或者HCAb的形式。
所述Fab、Fab’、F(ab’)
2、Fv、scFv、VH的数量为一个或多个。
在一些实施方案中,所述第一结构域为IgG的形式。优选地,所述IgG的重链恒定区为人重链恒定区,更优选为人IgG1、人IgG2、人IgG3或人IgG4重链恒定区;其中人IgG优选包含L234A、L235A和P329G中的一个、两个或三个突变,更优选地包含L234A和L235A的突变,或者包含S298A,E333A和K334A中的一个、两个或三个突变,更优选地包含S298A,E333A和K334A突变。
优选地,所述第一结构域中IgG的Fc为人IgG1的Fc,更优选地,所述Fc包含L234A、L235A和P329G突变,或L234A和L235A突变,或者包含S298A,E333A和K334A中的一个、两个或三个突变,更优选地包含S298A,E333A和K334A突变。
在一些实施方案中,所述第一结构域为Fab的形式,更优选地,所述第一结构域包括2个Fab。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含一个或多个VH。
优选地,所述VH为人VH。更优选地,所述第二结构域具有两个VH。
在一些实施方案中,所述第二结构域还包含Fc,与免疫球蛋白的Fc区等同的区域,优选地,所述Fc为人IgG1的Fc,更优选地,所述Fc包含L234A、L235A和P329G突变,或L234A和L235A突变,或者包含S298A,E333A和K334A中的一个、两个或三个突变,更优选地包含S298A,E333A和K334A突变。
在一些实施方案中,所述第一结构域与所述第二结构域直接连接或经连接肽L连接形成双特异性结合蛋白。
在一些实施方案中,所述第二结构域连接在所述第一结构域的C末端或N末端。
在一些实施方案中,所述双特异性结合蛋白包含短链和长链。
优选地,所述短链具有N’-VL
1-CL
1-C’所示的结构;所述长链具有N’-VH
1-CH1-h-CH2-CH3-L-VH
2-C’所示的结构;
或者,所述短链具有N’-VL
1-CL
1-C’所示的结构;所述长链具有N’-VH
2-L-VH
1-CH1-h-CH2-CH3-C’所示的结构;
或者,所述短链具有N’-VH
1-CH-C’所示的结构;所述长链具有N’-VL
1-CL
1-L-VH
2-CH2-CH3-C’所示的结构,
其中,所述VL
1和VH
1分别为第一结构域的VL和VH,所述VH
2为第二结构域的VH,所述h为铰链区,所述的L为连接肽,所述CL
1是第一结构域的CL。其中,所述的铰链区为免疫球蛋白领域常见的铰链区,通常含大量脯氨酸,具有挠性,形成2-5个二硫键。
优选地,所述L为长度为0-30个氨基酸长度的肽。在一些实施方案中,所述L的氨基酸序列如SEQ ID NO:136-157任一所示。
在一些实施方案中,所述长链的CH3与VH
2直接连接,即L的长度为0。
在一些实施方案中,所述长链的CH3经由连接肽L连接到VH
2。在一些实施方案中,所述连接肽L为长度为0-30个氨基酸长度的肽。在一些实施方案中,所述连接肽L可以是如SEQ ID NO.136-157中任一项所示的氨基酸序列。
在一些实施方案中,所述长链的VH
1与VH
2直接连接,即L的长度为0。
在一些实施方案中,所述长链的VH
1经由连接肽L连接到VH
2。在一些实施方案中,所述连接肽L为长度为0-30个氨基酸长度的肽。在一些实施方案中,所述连接肽L可以是如SEQ ID NO.136-157中任一项所示的氨基酸序列。
在一些实施方案中,所述长链的VH
2与CL
1直接连接,即L的长度为0。
在一些实施方案中,所述长链的VH
2经由连接肽L连接到CL
1。在一些实施方案中,所述连接肽L为长度为0-30个氨基酸长度的肽。在一些实施方案中,所述连接肽L可以是如SEQ ID NO.136-157中任一项所示的氨基酸序列。
在一些实施方案中,所述第一结构域包含轻链可变区(VL)和重链可变区(VH),所述VL包含选自如下的互补决定区:
SEQ ID NO:51,SEQ ID NO:52和SEQ ID NO:53中任一项的氨基酸序列所示的LCDR1;
SEQ ID NO:57,SEQ ID NO:58和SEQ ID NO:59中任一项的氨基酸序列所示的LCDR2;和/或
SEQ ID NO:65,SEQ ID NO:66和SEQ ID NO:67中任一项的氨基酸序列所示的LCDR3;
所述VH包含选自如下的互补决定区:
SEQ ID NO:8,SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:10中任一项的氨基酸序列所示的HCDR1;
SEQ ID NO:22,SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26中任一项的氨基酸序列所示的HCDR2;和/或
SEQ ID NO:35,SEQ ID NO:37和SEQ ID NO:38中任一项的氨基酸序列所示的HCDR3。
优选地,所述第一结构域包含轻链可变区(VL)和重链可变区(VH),所述VL和VH包含选自如下的互补决定区:
分别如SEQ ID NO:51,SEQ ID NO:57和SEQ ID NO:65所示的LCDR1,LCDR2和LCDR3;和,分别如SEQ ID NO:8,SEQ ID NO:22和SEQ ID NO:35所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;
分别如SEQ ID NO:52,SEQ ID NO:58和SEQ ID NO:66所示的LCDR1,LCDR2和LCDR3;和,分别如SEQ ID NO:12,SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:37所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;
分别如SEQ ID NO:53,SEQ ID NO:59和SEQ ID NO:67所示的LCDR1,LCDR2和LCDR3;和,分别如SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:26和SEQ ID NO:38所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3。
在一些实施方案中,所述第一结构域包含VL和VH,其中,所述VL的氨基酸序列与SEQ ID NO:94,SEQ ID NO:95或SEQ ID NO:96具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性;所述VH的氨基酸序列与SEQ ID NO:73,SEQ ID NO:78或SEQ ID NO:81具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性。
优选地,所述第一结构域包含VL和VH,其中所述VL具有SEQ ID NO:94,SEQ ID NO:95和SEQ ID NO:96中任一项所示的氨基酸序列;所述VH具有SEQ ID NO:73,SEQ ID NO:78和SEQ ID NO:81中任一项所示的氨基酸序列。
优选地,所述第一结构域包含VL和VH,所述VL和VH的氨基酸序列分别如SEQ ID NO:94和SEQ ID NO:73所示;或分别如SEQ ID NO:95和SEQ ID NO:78所示;或分别如SEQ ID NO:96和SEQ ID NO:81所示。
在一些实施方案中,所述第一结构域包含氨基酸序列与SEQ ID NO:119,SEQ ID NO:120或SEQ ID NO:121具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性的轻链;以及氨基酸序列与SEQ ID NO:98,SEQ ID NO:103或SEQ ID NO:106具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性的重链。
优选地,所述第一结构域包含SEQ ID NO:119,SEQ ID NO:120和SEQ ID NO:121中任一项所示的轻链;以及SEQ ID NO:98,SEQ ID NO:103和SEQ ID NO:106中任一项所示的重链。
优选地,所述第一结构域包含SEQ ID NO:119所示的轻链和SEQ ID NO:98所示的重链。
优选地,所述第一结构域包含SEQ ID NO:120所示的轻链和SEQ ID NO:103所示的重链。
优选地,所述第一结构域包含SEQ ID NO:121所示的轻链和SEQ ID NO:106所示的重链。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含以下的互补决定区或其突变体:
SEQ ID NO:9的氨基酸序列所示的HCDR1;
SEQ ID NO:23的氨基酸序列所示的HCDR2;和/或
SEQ ID NO:36的氨基酸序列所示的HCDR3。
所述突变体为在所述VH的HCDR1、HCDR2、HCDR3的氨基酸序列的基础上分别具有1、2或3个氨基酸的***、缺失或取代。本领域技术人员知晓,可以对HCDR1、HCDR2和HCDR3中的1个,2个或3个CDR分别进行1、2或3个氨基酸的***、缺失或取代突变。例如,可以对HCDR1进行1个氨基酸的突变,对HCDR2和HCDR3不进行氨基酸的突变,或者,对HCDR1和HCDR2分别进行1个氨基酸的突变,对HCDR3不进行氨基酸的突变。
在一些实施方案中,所述HCDR1的氨基酸序列为GFX
1FSX
2Y,所述HCDR2的氨基酸序列为X
3YX
4GX
5X
6,所述HCDR3的氨基酸序列为NRAX
7FGVX
8PDX
9SDI,其中,X
1、X
2、X
3、X
4、X
5、X
6、X
7、X
8或X
9为选自N、T、D、S、W、R、K、E、I、A、V和L中的任一种。在一些实施方案中,X
1为T、D或N;X
2为N或S;X
3为W或R;X
4为D或T;X
5为T或S;X
6为K、R或E;X
7为I或L;X
8为V或I;和/或,X
9为A或D。
在一些实施方案中,所述HCDR1的氨基酸序列为GF(N/T/D)FS(N/S)Y。在一些实施方案中,所述HCDR2的氨基酸序列为(W/R)Y(D/T)G(T/S)(K/R/E)。在一些实施方案中,所述HCDR3的氨基酸序列为NRA(I/L)FGV(V/I)PD(A/D)SDI。
在一些实施方案中,HCDR1的突变体具有SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14中任一项所示的氨基酸序列。
在一些实施方案中,HCDR2的突变体具有SEQ ID NO:24或SEQ ID NO:27所示的氨基酸序列。
在一些实施方案中,HCDR3的突变体具有SEQ ID NO:39,SEQ ID NO:40和SEQ ID NO:41中任一项所示的氨基酸序列。
优选地,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含以下的互补决定区或其突变体:
SEQ ID NO:9-11和SEQ ID NO:13-14中任一项的氨基酸序列所示的HCDR1;
SEQ ID NO:23-24和SEQ ID NO:27中任一项的氨基酸序列所示的HCDR2;和/或
SEQ ID NO:36和SEQ ID NO:39-41中任一项的氨基酸序列所示的HCDR3.
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:9,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:36所示。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:36所示。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:24和SEQ ID NO:36所示。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:36所示。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:13,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:36所示。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:39所示。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:40所示。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:41所示。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:36所示。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:39所示。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:40所示。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:41所示。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:14,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:36所示。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:14,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:39所示。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:14,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:40所示。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含抗体重链可变区VH,所述VH包含HCDR1,HCDR2和HCDR3,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:14,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:41所示。
优选地,所述VH还包含重链可变区框架区(VH FWR),所述VH FWR可以包含VH FWR1,VH FWR2,VH FWR3和VH FWR4。
在一些实施方案中,所述VH FWR1具有SEQ ID NO:3-5中任一项所示的氨基酸序列。
在一些实施方案中,所述VH FWR2具有SEQ ID NO:17或SEQ ID NO:20所示的氨基酸序列。
在一些实施方案中,所述VH FWR3具有SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:31所示的氨基酸序列。
在一些实施方案中,所述VH FWR4具有SEQ ID NO:43所示的氨基酸序列。
优选地,所述VH包含SEQ ID NO:74-77,SEQ ID NO:79-80和SEQ ID NO:82-92中任一项所示的氨基酸序列,或与其具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性的氨基酸序列。
在一些实施方案中,所述第二结构域还包含Fc区,或与免疫球蛋白的Fc区等同的区域,优选地,所述Fc区为人Fc。更优选地,所述人Fc为人IgG1Fc。
优选地,所述Fc包含L234A、L235A和P329G突变,或L234A和L235A突变,或者包含S298A,E333A和K334A中的一个、两个或三个突变,更优选地包含S298A,E333A和K334A突变。
在一些实施方案中,所述第二结构域包含与SEQ ID NO:99、100、101、102、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116或117具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性的氨基酸序列的重链。在一些实施方案中,所述第二结构域包含SEQ ID NO:99-102,SEQ ID NO:104-105和SEQ ID NO:107-117中任一项所示重链的氨基酸序列。
在一些实施方案中,所述特异性结合蛋白的长链包含与SEQ ID NO:122、123、124、125、126、127、128、129、130、132或133具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性的氨基酸序列;以及所述特异性结合蛋白的短链包含与SEQ ID NO:119、120、121或131具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性的氨基酸序列。在一些实施方案中,所述特异性结合蛋白的长链具有选自SEQ ID NO:122-130和SEQ ID NO:132-133中任一项所示的氨基酸序列;以及所述特异性结合蛋白的短链具有选自SEQ ID NO:119-121和SEQ ID NO:131中任一项所示的氨基酸序列。
在一些实施方案中,所述特异性结合蛋白具有SEQ ID NO:122所示的长链以及SEQ ID NO:119所示的短链。
在一些实施方案中,所述特异性结合蛋白具有SEQ ID NO:123所示的长链以及SEQ ID NO:120所示的短链。
在一些实施方案中,所述特异性结合蛋白具有SEQ ID NO:124所示的长链以及SEQ ID NO:121所示的短链。
在一些实施方案中,所述特异性结合蛋白具有SEQ ID NO:125所示的长链以及SEQ ID NO:119所示的短链。
在一些实施方案中,所述特异性结合蛋白具有SEQ ID NO:126所示的长链以及SEQ ID NO:119所示的短链。
在一些实施方案中,所述特异性结合蛋白具有SEQ ID NO:127所示的长链以及SEQ ID NO:119所示的短链。
在一些实施方案中,所述特异性结合蛋白具有SEQ ID NO:128所示的长链以及SEQ ID NO:119所示的短链。
在一些实施方案中,所述特异性结合蛋白具有SEQ ID NO:129所示的长链以及SEQ ID NO:119所示的短链。
在一些实施方案中,所述特异性结合蛋白具有SEQ ID NO:132所示的长链以及SEQ ID NO:131所示的短链。
在一些实施方案中,所述特异性结合蛋白具有SEQ ID NO:130所示的长链以及SEQ ID NO:119所示的短链。
在一些实施方案中,所述特异性结合蛋白具有SEQ ID NO:133所示的长链以及SEQ ID NO:131所示的短链。
在一些实施方案中,所述双特异性结合蛋白为包含两条第一多肽链以及两条第二多肽链形成的四价对称结构。
第十四方面,本发明提供了分离的核酸,其编码本发明第十三方面所述的特异性结合蛋白或其片段。
第十五方面,本发明提供了表达载体,其能够将第十四方面所述的分离核酸表达为第十三方面的多特异性结合蛋白或其片段。
所述表达载体可以是真核细胞表达载体和/或原核细胞表达载体,例如为质粒。
第十六方面,本发明提供了宿主细胞,所述宿主细胞包含第十四方面的分离的核酸,或第十五方面的表达载体。
所述宿主细胞为本领域常规的宿主细胞,只要能使第十五方面的表达载体稳定地将所携带的核酸表达为第十三方面的特异性结合蛋白或其片段。优选地,所述宿主细胞为原核细胞和/或真核细胞,所述原核细胞优选E.coli细胞如TG1、BL21(表达单链抗体或Fab抗体),所述真核细胞优选HEK293细胞或CHO细胞(表达全长IgG抗体)。将第十五方面的表达载体转化至宿主细胞中,即可得本发明的宿主细胞。其中所述转化方法为本领域的常规转化方法,较佳地为化学转化法,热激法或电转法。
第十七方面,本发明提供了包含第十三方面的特异性结合蛋白或其片段的抗体药物偶联物。所述抗体药物偶联物还包含与所述结合蛋白或其片段共价连接的药物。在一些实施方案中,所述药物选自化学治疗剂、放射治疗剂、免疫抑制剂和细胞毒性药物。
第十八方面,本发明提供了第十三方面的特异性结合蛋白或其片段的制备方法。
在一些实施方案中,利用杂交瘤技术或者本领域的其他常规技术制备,例如人源化技术等制备第十三方面的特异性结合蛋白或其片段。
在一些实施方案中,所述制备方法包括培养第十六方面的宿主细胞的步骤。
在一些实施方案中,利用Harbour HCAb转基因小鼠(以下简称HCAb转基因小鼠)制备第十三方面的特异性结合蛋白的第二结构域。
所述HCAb转基因小鼠是一种携带人免疫球蛋白免疫库的转基因小鼠,能够产生全新的仅“重链”抗体,该抗体的大小只有传统IgG抗体的一半。其产生的抗体仅具有人的抗体“重链”可变结构域和小鼠Fc恒定结构域。
优选地,所述利用HCAb转基因小鼠制备第十三方面的特异性结合蛋白的第二结构域的方法包括如下步骤:
(a)利用人PD-L1免疫HCAb转基因小鼠,更优选地,所述人PD-L1抗原为重组人PD-L1-Fc,具体地,所述抗原为PD-L1连接Fc构成的重组融合蛋白;
(b)利用免疫后的HCAb转基因小鼠脾B细胞的RNA反转录后的cDNA,以及特异性引物扩增人VH基因;
(c)将扩增的VH基因构建到编码人IgG抗体重链Fc结构域序列的哺乳动物细胞表达载体中;和
(d)纯化步骤(c)获得的全人源PD-L1单抗。
在一些实施方案中,所述方法还包括通过对CDR区域进行突变对全人源PD-L1单抗进行亲和力改造的步骤。
优选地,还可以通过胚系化回复突变和/或翻译后修饰(PTM)去除对全人源PD-L1单抗进行优化。
在一些实施方案中,利用Harbour H2L2转基因小鼠(以下简称H2L2转基因小鼠)制备第十三方面的特异性结合蛋白的第一结构域。
所述H2L2转基因小鼠是一种携带人免疫球蛋白免疫库的转基因小鼠,其产生的抗体具有完整的人的抗体可变结构域和大鼠恒定结构域。
优选地,所述利用H2L2转基因小鼠制备第十三方面的特异性结合蛋白的第一结构域的方法包括如下步骤:
(a)利用人CD73免疫H2L2转基因小鼠,更优选地,所述人CD73抗原为可溶性的重组人CD73-hFc,具体地,所述抗原为CD73连接Fc构成的重组融合蛋白;
(b)免疫后的H2L2转基因小鼠脾细胞与骨髓瘤细胞系融合得到杂交瘤细胞,分离的杂交瘤表达具有完整的人可变结构域和大鼠恒定结构域的重链和轻链的抗体分子;
(c)将步骤(b)获得的抗体轻链可变结构域序列(VL)通过基因合成并克隆到编码人抗体κ轻链恒定结构域序列的哺乳动物细胞表达载体中,以编码产生抗体的全长轻链;
(d)将步骤(b)获得的抗体重链可变结构域序列(VH)通过基因合成并克隆到编码人IgG抗体重链恒定结构域序列的哺乳动物细胞表达载体中,以编码产生IgG抗体的全长重链;
(e)将步骤(c)和(d)的表达载体同时转染哺乳动物宿主细胞,利用常规的重组蛋白表达和纯化技术,可以得到轻重链正确配对组装的重组抗体。
优选地,将步骤(b)获得的抗体重链可变结构域序列(VH)通过基因合成并克隆到编码人IgG1抗体重链恒定结构域序列的哺乳动物细胞表达载体中,以编码产生IgG1抗体的全长重链。
在一些实施方案中,所述方法还包括通过对CDR区域进行突变对全人源CD73单抗进行亲和力改造的步骤。
优选地,还可以通过胚系化回复突变和/或翻译后修饰(PTM)去除对全人源CD73单抗进行优化。
在一些实施方案中,将所制备的第二结构域和所制备的第一结构域组合成双特异性结合蛋白。所述双特异性结合蛋白可以同时结合两个靶点,其中第一结构域可以识别肿瘤细胞表面特异表达的CD73,而第二结构域可以结合T细胞上的PD-L1分子,所述特异性结合蛋白结合到肿瘤细胞表面后,可以招募并激活肿瘤细胞附近的T细胞,从而杀死肿瘤细胞。
在一些实施方案中,将所制备的第二结构域和所制备的第一结构域构建成双特异性结合蛋白。所述双特异性结合蛋白可以同时结合两个靶点,其中第一结构域可以识别肿瘤细胞表面特异表达的CD73,而第二结构域可以结合细胞表达的PD-L1分子。所述双特异性结合蛋白能够有效结合可溶性以及细胞表面的CD73和PD-L1,能够抑制CD73的酶活,而且还能阻断PD-L1与PD-1的结合,还能够激活T细胞。
优选地,所述双特异性结合蛋白为四价对称结构。
优选地,所述双特异性结合蛋白具有第十三方面中所述的结构和序列。
第十九方面,本发明提供了一种药物组合物,所述药物组合物包含第十三方面所述的特异性结合蛋白或第十七方面的抗体药物偶联物,以及药学上可接受的载体。
在一些实施方案中,所述药物组合物还包括其他的成分作为活性成分,例如其他的小分子药物或者抗体或多肽作为活性成分。
在一些实施方案中,所述药物组合物还包含选自化学治疗剂、放射治疗剂、免疫抑制剂和细胞毒性药物的治疗剂。在一些实施方案中,所述药物组合物的化学治疗剂、放射治疗剂、免疫抑制剂和细胞毒性药物的治疗剂,与第十七方面的抗体药物偶联物中的药物不同或者相同。
所述的药学上可接受的载体可为本领域常规的载体,所述的载体可以为任意合适的生理学或药学上可接受的药物辅料。所述的药物辅料为本领域常规的药物辅料,优选地包括药学上可接受的赋形剂、填充剂或稀释剂等。更优选地,所述的药物组合物包括0.01~99.99%的所述特异性结合蛋白和/或其他的小分子药物或者抗体或多肽,以及0.01~99.99%的药用载体,所述百分比为占所述药物组合物的质量百分比。
所述的药物组合物的给药途径可以是经肠胃外、注射或口服给药。所述药物组合物可以制备成适于给药的形式,例如固体、半固体或液体的形式,可以为水溶液、非水溶液或混悬液,粉末、片剂、胶囊、颗粒、注射剂或输注剂的形式。可以经血管内、皮下、腹膜内、肌内、吸入、鼻内、气道滴注或胸腔内滴注施用。所述药物组合物还可以气雾剂或喷雾剂的形式施用,例如经鼻施用;或者,鞘内、髓内或心室内施用,还可以经透皮、经皮、局部、肠内、***内、舌下或经直肠施用。所述的药物组合物可根据需要制成各种剂型,并可由医师根据患者种类、年龄、体重和大致疾病状况、给药方式等因素确定对病人有益的剂量进行施用。
在一些实施方案中,所述特异性结合蛋白中的第一结构域和第二结构域可以同时给药或者按顺序给药。
在一些实施方案中,所述药物组合物中的特异性结合蛋白与其他的活性成分可以同时给药或者按顺序给药。
在一些实施方案中,所述特异性结合蛋白是双特异性结合蛋白。
第二十方面,本发明提供了第十三方面所述的特异性结合蛋白、第十四方面所述的分离的核酸、第十七方面的抗体药物偶联物或第十九方面的药物组合物在制备用于预防、治疗和/或诊断免疫性疾病,急性和慢 性炎性疾病,以及肿瘤疾病的药物中的应用。
所述肿瘤可以为乳腺癌、肾细胞癌、黑色素瘤、结肠癌,以及B细胞淋巴瘤,黑色素瘤,头颈癌,膀胱癌,胃癌,卵巢癌,恶性肉瘤,尿路上皮癌,肝癌,食道癌,胃食管交界癌,鼻咽癌,小细胞肺癌,***,子宫内膜癌,胰腺癌,***癌,胶质瘤,非小细胞肺癌,急性粒细胞白血病,霍奇金淋巴瘤,皮肤鳞状细胞癌,局部晚期或转移性恶性肿瘤等。
所述炎性疾病可以为特应性皮炎、溃疡性结肠炎等。
所述免疫性疾病可以为移植物抗宿主病、类风湿性关节炎、***性红斑狼疮、哮喘等。
第二十一方面,本发明提供了用于检测样品中的PD-L1和CD73的方法,所述方法包括用第十三方面的特异性结合蛋白检测样品中的PD-L1和CD73的步骤。
所述样品可以是生物学样品,例如,全血,红血细胞浓缩物,血小板浓缩物,白细胞浓缩物,组织,骨髓吸出物,血浆,血清,脑脊液,粪便,尿液,培养的细胞,唾液,口腔分泌物,和鼻腔分泌物等生物学样品。
第二十二方面,本发明提供了一种套装药盒,该套装药盒包括一个或多个药盒,包含第一方面所述的抗原结合蛋白、第五方面的抗体药物偶联物或第十方面所述的药物组合物。
在一些实施方案中,所述套装药盒包括第一药盒和第二药盒,所述第一药盒包括第一方面所述的抗原结合蛋白、第五方面的抗体药物偶联物或第十方面所述的药物组合物,且所述第二药盒包含其他治疗剂,所述其他治疗剂包括,但不限于化学治疗剂、放射治疗剂、免疫抑制剂和细胞毒性药物。在一些实施方案中,所述套装药盒中的化学治疗剂、放射治疗剂、免疫抑制剂和细胞毒性药物,与第五方面的抗体药物偶联物相同或不同。
在一些实施方案中,上述第一药盒和第二药盒可以同时使用,也可以先使用上述第一药盒再使用上述第二药盒,还可以先使用上述第二药盒再使用上述第一药盒,可以根据具体应用时的实际需求而定。
第二十三方面,本发明提供了一种套装药盒,该套装药盒包括一个或多个药盒,包含第十三方面所述的特异性结合蛋白、第十七方面的抗体药物偶联物或第十九方面所述的药物组合物。
在一些实施方案中,所述套装药盒包括第一药盒,所述第一药盒包括第十三方面所述的第一结构域和第二结构域组成的双特异性结合蛋白、第十七方面的抗体药物偶联物或第十九方面所述的药物组合物。
在一些实施方案中,所述套装药盒可以进一步包括第二药盒,所述第二药盒包括其他治疗剂,所述其他治疗剂包括,但不限于化学治疗剂、放射治疗剂、免疫抑制剂和细胞毒性药物。在一些实施方案中,所述套装药盒中的化学治疗剂、放射治疗剂、免疫抑制剂和细胞毒性药物,与第十七方面的抗体药物偶联物相同或不同。
在一些实施方案中,上述第一药盒和第二药盒可以同时使用,也可以先使用上述第一药盒再使用上述第二药盒,还可以先使用上述第二药盒再使用上述第一药盒,可以根据具体应用时的实际需求而定。
第二十四方面,本发明提供了给药装置,其包含第一方面的抗原结合蛋白,第五方面的抗体药物偶联物,或第十方面的药物组合物。在一些实施方案中,所述给药装置是预填充注射器。
第二十五方面,本发明提供了给药装置,其包含第十三方面的抗原结合蛋白,第十七方面的抗体药物偶联物,或第十九方面的药物组合物。在一些实施方案中,所述给药装置是预填充注射器。
第二十六方面,本发明提供了预防、治疗和/或诊断免疫性疾病、急性和慢性炎性疾病以及肿瘤疾病的方法,其包括向受试者施用治疗有效量的第一方面的抗原结合蛋白,第五方面的抗体药物偶联物,或第十方面的药物组合物。
第二十七方面,本发明提供了预防、治疗和/或诊断免疫性疾病、急性和慢性炎性疾病以及肿瘤疾病的方法,其包括向受试者施用治疗有效量的第十三方面的抗原结合蛋白,第十七方面的抗体药物偶联物,或第十九方面的药物组合物。
本发明的双特异性结合蛋白具有如下的一种或多种特性:
(a)双特异性结合蛋白能够以高亲和力特异性结合人PD-L1和CD73;
(b)能够抑制CD73的酶活性;
(c)双特异性结合蛋白对PD-1信号途径具有抑制作用;
(d)双特异性结合蛋白能够增强激活T淋巴细胞分泌细胞因子IL-2和IFN-γ;以及
(e)显示体内肿瘤抑制活性。
定义
除非另有定义,否则本发明使用的所有技术术语和科技术语都具有如在本发明所属领域中通常使用的相同含义。出于解释本说明书的目的,将应用以下定义,并且在适当时,以单数形式使用的术语也将包括复数形式,反之亦然。
“约”和“大约”通常意指鉴于测量的性质或精度,所测量值的可接受误差范围。通常误差范围在所给出的值或值范围的20%范围内,一般在10%的范围内,甚至更一般在5%的范围内。
术语“抗原结合分子”或“特异性结合蛋白”泛指特异性结合抗原决定簇的分子。抗原结合分子或特异性结合蛋白包括例如抗体、抗体片段和骨架抗原结合蛋白。
本发明的术语“抗体”涵盖各种抗体结构,包括但不限于单克隆抗体、多克隆抗体、单特异性和多特异性抗体(例如,双特异性抗体或三特异性抗体),单链分子以及抗体片段,只要表现出所需的抗原结合活性即可。
本发明的术语“单克隆抗体”是指从基本上同质的抗体群获得的抗体,即,除了可能微量存在的变异抗体(例如含有天然存在的突变或在单克隆抗体制剂的生产过程中产生的,通常以少量存在)之外,所述抗体群所包含的各个抗体是相同的和/或结合相同的表位。与通常包括针对不同抗原决定簇(表位)的不同抗体的多克隆抗体制剂不同,单克隆抗体制剂中的每种单克隆抗体针对抗原上的单个决定簇。
本发明的术语“多特异性抗体”按其最广义使用,涵盖具有多表位特异性的抗体。这些多特异性抗体包括但不限于:包含重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的抗体,其中该VH-VL单元具有多表位特异性;具有两个或多个VL和VH区的抗体,每个VH-VL单元与不同的靶点或同一个靶点的不同表位结合;具有两个或更多个单可变区的抗体,每个单可变区与不同的靶点或同一个靶点的不同的表位结合;全长抗体、抗体片段、双特异性抗体(diabodies)、和三抗体(triabodies)、共价或非共价连接在一起的抗体片段等。
本发明的术语“双特异性结合蛋白”或“双特异性抗体”是指能够特异性结合至少两种不同的抗原决定簇,例如各自由一对抗体重链可变结构域(VH)和抗体轻链可变结构域(VL)形成的两个结合位点与不同抗原或同一抗原上的不同表位结合。双特异性抗体可以是1+1形式,2+1形式(包含第一抗原或表位的两个结合位点和第二抗原或表位的一个结合位点)或2+2形式(包含第一抗原或表位的两个结合位点和第二抗原或表位的两个结合位点)。通常,双特异性抗体包含两个抗原结合位点,每个抗原结合位点特异性针对不同的抗原决定簇。
本发明的术语“价”表示抗原结合分子存在指定数目的结合结构域。因此,术语“二价”“四价”和“六价”分别表示抗原结合分子中存在两个结合结构域、四个结合结构域和六个结合结构域。所述双特异性抗体至少是“二价的”,并且可以是“三价的”,“四价的”或“更多价的”)。在一些情况下,所述抗体具有两个或更多个结合位点并且是双特异性的。也就是说,即使在存在多于两个结合位点(即抗体是三价的或多价的)的情况下,抗体也可以是双特异性的。
本发明的术语“全长抗体”和“完整抗体”在本文中可互换使用,指代与天然抗体结构基本上相似的抗体。“天然抗体”是指天然存在的免疫球蛋白分子。例如,天然IgG类抗体是约150,000道尔顿的异四聚体糖蛋白,由二硫键键合的两条轻链和两条重链组成。从N末端到C末端,每条重链具有可变区(VH)(也称为可变重链结构域或重链可变结构域)和三个恒定结构域(CH1、CH2和CH3)(也称为重链恒定区)。从N末端到C末端,每条轻链具有可变区(VL)(也称为可变轻链结构域或轻链可变结构域)和轻链恒定结构域(CL)(也称为轻链恒定区)。抗体的重链可以是五种类型中的一种,所述五种类型为α(IgA)、δ(IgD)、ε(IgE)、γ(IgG)或μ(IgM),还可以进一步分为亚型,例如γ1(IgG1)、γ2(IgG2)、γ3(IgG3)、γ4(IgG4)、α1(IgA1)和α2(IgA2)。抗体的轻链基于其恒定结构域的氨基酸序列,可以是两种类型中的一种,所述两种类型为κ轻链和λ轻链。
在轻链和重链内,可变区和恒定区通过大约12或更多个氨基酸的“J”区连接,重链还包含大约3个或更多个氨基酸的“D”区。各重链由重链可变区(VH)和重链恒定区(CH)组成。重链恒定区由3个结构域(CH1、CH2和CH3)组成。各轻链由轻链可变区(VL)和轻链恒定区(CL)组成。轻链恒定区由一个结构域CL组成。 抗体的恒定区可介导免疫球蛋白与宿主组织或因子,包括免疫***的各种细胞(例如,效应细胞)和经典补体***的第一组分(C1q)的结合。
“抗体片段”包含完整抗体的一部分。抗体片段的示例包括但不限于Fab、Fab’、F(ab’)
2和Fv;双体抗体、三体抗体、四体抗体、交叉Fab片段;线性抗体;单链抗体分子(例如scFv);由抗体片段和单结构域抗体(单域抗体)形成的多特异性抗体。
本发明的术语“抗原结合结构域”或“抗原结合位点”是指抗原结合分子中特异性结合抗原决定簇的部分。更具体地,术语“抗原结合结构域”是指抗体的一部分,所述部分包含与抗原的一部分或全部特异性结合并互补的区域。在抗原分子很大的情况下,抗原结合分子可以仅结合抗原的特定部分,该部分称为表位。抗原结合结构域可以由例如一个或多个可变结构域(也称为可变区)提供。优选地,抗原结合结构域包含抗体轻链可变区(VL)和抗体重链可变区(VH)。在一个方面,抗原结合结构域能够结合其抗原并阻断或部分阻断所述抗原的功能。
本发明的术语“抗原决定簇”与“抗原”和“表位”同义,并且是指多肽大分子上的位点(例如一段连续的氨基酸或由非连续氨基酸的不同区域组成的构象构型),抗原结合部分与所述位点结合,从而形成抗原结合部分-抗原复合物。抗原决定簇可以存在于例如肿瘤细胞的表面、微生物感染细胞的表面、其他患病细胞的表面、免疫细胞的表面、血清中游离物和/或细胞外基质(ECM)中。除非另有说明,本发明中用作抗原的蛋白可以是任何脊椎动物来源的任何天然形式的蛋白质,所述脊椎动物来源包括诸如灵长类动物(例如人类)和啮齿类动物(例如小鼠和大鼠)等哺乳动物。抗原也可以是人蛋白质,或者抗原为“全长”、未加工的蛋白质,以及由细胞内加工而产生的任何形式的蛋白质,或者为天然存在的蛋白质变体,例如剪接变体或等位基因变体。
“特异性结合”是指对于抗原具有结合选择性,并且可以与不需要的或非特异性的结合区分开来。抗原结合分子与特定抗原结合的能力可以通过酶联免疫吸附测定(ELISA)或本领域技术人员熟悉的其他技术(例如表面等离子体共振(SPR)技术以及传统的结合测定进行测量。在一个实施例中,例如通过SPR所测得的,抗原结合分子与不相关蛋白的结合程度小于所述抗原结合分子与抗原的结合程度的约10%。在某些实施例中,与抗原结合的分子的解离常数(Kd)为≤1μM、≤100nM、≤10nM、≤1nM、≤0.1nM、≤0.01nM或≤0.001nM(例如10
-7M或更低,例如10
-7M至10
-13M,例如10-
9M至10
-13M)。
“亲和力”或“结合亲和力”是指分子(例如抗体)的单个结合位点与其结合配体(例如抗原)之间的非共价相互作用的强度。结合亲和力通常可以用解离常数(Kd)表示,解离常数(Kd)是解离速率常数与缔合速率常数(分别为K
off和K
on)的比率。因此,等效亲和力可以包括不同的速率常数,只要速率常数的比率保持相同即可。亲和力可以通过本领域已知的常规方法测量,例如表面等离子体共振(SPR)。
本发明的术语“高亲和力”是指抗体对靶抗原的Kd为10-
9M或更低,甚至10
-10M或更低。本发明的术语“低亲和力”是指抗体的Kd为10
-8M或更高。
“亲和力成熟的”的抗体是指在一个或多个高变区(HVR)中具有一个或多个修饰的抗体,与不具有此类修饰的亲本抗体相比,此类修饰导致了抗体对抗原的亲和力的改善。
本发明的术语“单域抗体”和“纳米抗体”具有相同的含义,指仅具有抗体重链的可变区,构建仅由一个重链可变区组成的单域抗体,它是具有完整功能的最小的抗原结合片段。
本发明的术语“重链抗体”也称为HCAb抗体,是指相对双链抗体(免疫球蛋白)来说,缺失抗体轻链,只包含重链的抗体,具体来说包含重链可变结构域和Fc恒定结构域。
特异性结合蛋白包含第一结构域和第二结构域,所述第一结构域结合CD73或其片段,并且所述第二结构域结合PD-L1或其片段。
术语“包含特异性结合CD73的第一结构域和特异性结合PD-L1的第二结构域的双特异性抗体”“特异性结合CD73和PD-L1的双特异性抗体”“特异于CD73和PD-L1的双特异性抗原结合分子”或“抗CD73/抗PD-L1抗体”在本文中可互换使用,并且是指能够以足够的亲和力结合CD73和PD-L1,使得该抗体可用作靶向CD73和PD-L1的诊断和/或治疗剂的双特异性抗体。
本发明的术语“T效应细胞”指具有细胞溶解活性的T细胞(例如,CD4+及CD8+T细胞)以及T辅助(Th)细胞,T效应细胞分泌细胞因子、且激活并引导其他免疫细胞,但不包括调控性T细胞(Treg细胞)。
本发明的术语“调节性T细胞”或“Treg细胞”是指特殊类型的CD4+T细胞,能阻断其它T细胞的应答。Treg细胞特征在于表达CD4,IL-2受体的α亚基(CD25)和转录因子FOXP3,并且在诱导和维持外周自体耐受中发挥至关重要作用,所述耐受针对肿瘤表达的抗原。
本发明的术语术语“CD73”,即分化簇73,也称为5’-外切核苷酸酶,通常是指能够将细胞外核苷5‘单磷酸转化为核苷,即单磷酸腺苷(AMP)转化为腺苷的酶(核苷酸酶)。CD73是一种由糖基磷脂酰肌醇(GPI)连接的细胞表面酶,CD73广泛表达于人体内皮细胞、淋巴细胞,如Treg,DC,MDSC,NK等细胞的表面。CD73也可在癌细胞上表达,包括结肠癌、肺癌、胰腺癌、卵巢癌、膀胱癌、白血病、胶质瘤、胶质母细胞瘤、黑色素瘤、甲状腺癌、食道癌、***癌和乳腺癌等。据报道,高CD73表达与多种癌症适应症(例如,肺癌、黑色素瘤、乳腺癌、鳞状头颈癌和结直肠癌)的不良预后相关。CD73的主要功能是将细胞外核苷酸(例如5'-AMP)转化为高度免疫抑制分子腺苷。本发明的术语“CD73”包括细胞天然表达的CD73的任何变体或同工型。CD73或其任何变体和同工型可以从天然表达它们的细胞或组织中分离,或者可以使用本领域中熟知的技术和/或本文所述的技术重组产生。相应地,本文所述的抗原结合蛋白可以与人以外的物种(例如食蟹猴CD73)交叉反应。或者,本发明的针对CD73的抗原结合蛋白,抗体或结构域可以对人CD73具有特异性,并且可以不与其他物种表现出任何交叉反应性。
本发明的术语“CD73抗体”或者“特异性结合CD73和/或其片段的分离的抗原结合蛋白”能够结合CD73,并具有足够的亲和力以使得所述抗体可用作靶向CD73的诊断和/或治疗剂。通常情况下,经放射免疫测定(RIA)或流式细胞术(FACS)或使用生物传感器***通过表面等离子体共振测定,CD73抗体与不相关的CD73蛋白的结合能力小于所述抗体与CD73的结合能力的约10%。在某些实施方案中,结合CD73的抗体具有≤1μM,≤100nM,≤10nM,≤1nM,≤0.1nM,≤0.01nM,或≤0.001nM(例如10
-8M或更低,例如10
-13M到10
- 8M,例如10
-13M到10
-9M)的解离常数(KD)。
本发明的术语程序性细胞死亡1配体1(PD-L1),也称为分化簇CD274或B7同系物1(B7-H1),是调节PD-1受体的活化或抑制的B7家族中的一员。PD-L1的开放阅读框编码290个氨基酸的I型跨膜蛋白,其包括胞外Ig结构域(N端V样结构域和IgC样结构域)、疏水性跨膜结构域和30个氨基酸的细胞质尾区。30个氨基酸胞内(细胞质)结构域不含明显的信号传导,但确实具有用于蛋白激酶C磷酸化的潜在位点。研究表明,在干扰素γ刺激的作用下,PD-L1在免疫细胞上的表达增强。PD-L1还在非免疫细胞上表达,包括胰岛、肝脏的库普弗细胞(Kupffer cells)、脉管内皮和选定上皮,例如气管上皮和肾小管上皮,其中其表达在炎症发作期间增强。在多种肿瘤上还发现增大水平的PD-L1表达,所述肿瘤包括但不限于乳癌、卵巢癌、子***、结肠癌、结肠直肠癌、包括非小细胞肺癌的肺癌、包括肾细胞癌的肾癌、胃癌、食道癌、膀胱癌、肝细胞癌、头部和颈部鳞状细胞癌(SCCHN)和胰脏癌、黑素瘤和葡萄膜黑素瘤(uveal melanoma)。
本发明的术语“PD-L1抗体”或者“特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白”能够结合PD-L1,尤其是在细胞表面上表达的PD-L1多肽,并具有足够的亲和力以使得所述抗体可用作靶向PD-L1的诊断和/或治疗剂。通常情况下,经放射免疫测定(RIA)或流式细胞术(FACS)或使用生物传感器***通过表面等离子体共振测定,PD-L1抗体与不相关的非PD-L1蛋白的结合能力小于所述抗体与PD-L1的结合能力的约10%。在某些实施方案中,结合人PD-L1的抗原结合蛋白的KD值≤1μM、≤100nM、≤10nM、≤1nM、≤0.1nM、≤0.01nM或≤0.001nM(例如10
-8M或更低,例如10
-13M至10
-8M,例如10
-13M至10
-9M)。在一些实施方案中,在表面等离子体共振测定中,使用人PD-L1,尤其是带有组氨酸标签的人PD-L1测定结合亲和力的相应KD值,以获得PD-L1结合亲和力。PD-1/PD-L1抗体的治疗策略是几种转移性肿瘤中的标准治疗策略,并已显示出它们在早期疾病阶段和辅助治疗中的作用,尤其是黑色素瘤和非小细胞肺癌。
本申请中的术语“H2L2转基因小鼠”或“Harbour H2L2小鼠”是一种携带人免疫球蛋白免疫库的转基因小鼠,所述小鼠产生具有完全人可变区的由两条重链和两条轻链(H2L2)组成的传统四聚体抗体,具有完整的人抗体可变结构域和大鼠恒定结构域。由所述转基因小鼠所产生的抗体亲和力成熟,可变区完全人源化,并且具有优异的溶解性。
本申请中的术语“Harbour HCAb小鼠”(WO2002/085945A2)是一种携带人免疫球蛋白免疫库的转基因小鼠,能够产生全新的仅“重链”抗体,该抗体的大小只有传统IgG抗体的一半。其产生的抗体仅具有人的抗 体“重链”可变结构域和小鼠Fc的恒定结构域。由于不含轻链这一特点,所述抗体几乎解决了轻链错配和异源二聚化的问题,使得这一技术平台能够开发出传统抗体平台难以实现的产品。
本发明的术语“可变区”或“可变结构域”是指参与抗原结合分子与抗原结合的抗体重链或轻链的结构域。天然抗体的重链和轻链的可变结构域(分别为VH和VL)通常具有相似的结构,其中每个结构域包含四个保守框架区(FR)和三个高变区(HVR)。单个VH或VL结构域可足以赋予抗原结合特异性。
本发明的术语“可变”是指可变域的某些区段在抗体之间在序列上普遍不同。V结构域介导抗原结合并限定特定抗体对于其特定抗原的特异性。然而,可变性在整个可变域并非均匀分布的。相反,集中于轻链与重链可变域内三个称为高变区(HVR)的区段中。可变域的更高度保守部分被称作框架区(FR)。天然重链与轻链的可变域各自包含四个FR区,大部分采用β-折叠构型,由三个HVR连接,其形成环连接,并且在一些情况下形成β-折叠结构的一部分。每条链中的HVR通过FR区紧密保持在一起,并且与其它链的HVR一起促成抗体的抗原结合位点的形成(参见Kabat等,Sequences of Immunological Interest,第5版,National Institute of Health,Bethesda,MD(1991))。恒定域不直接参与抗体与抗原的结合,具有其他效应功能,例如参与抗体的抗体依赖性细胞毒性。
本发明的术语“高变区”或“HVR”是指在抗体可变结构域区域中序列上高变和/或形成结构上限定的环(“高变环”)的区域。通常,天然四链抗体包含六个HVR:三个存在于VH中(H1、H2、H3),三个存在于VL中(L1、L2、L3)。HVR通常包含来自高变环和/或来自“互补决定区(CDR)”的氨基酸残基,来自“互补决定区(CDR)”的氨基酸残基具有最高的序列可变性和/或参与抗原识别。示例性CDR(CDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3)发生在氨基酸残基26-32(L1)、50-52(L2)、91-96(L3)、26-32(H1)、53-55(H2)和96-101(H3)处(Chothia等人,J.Mol.Biol.196:901-917(1987)。示例性CDR(CDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3)发生在氨基酸残基24-34(L1)、氨基酸残基50-56(L2)、氨基酸残基89-97(L3)、氨基酸残基31-35(H1)、氨基酸残基50-65(H2),以及氨基酸残基95-102(H3)处(Kabat等人,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991)。作为比较,在下表1中列出了包含上文引用的参考文献中所定义的CDR的相应氨基酸残基。在本申请中,上述所列CDR的氨基酸序列均是按照Chothia定义规则所示出的(本申请的权利要求中也是按照Chothia定义规则所示出的序列)。但是,本领域人员公知,在本领域中可以通过多种方法来定义抗体的CDR,例如基于序列可变性的Kabat定义规则和基于结构环区域位置的Chothia定义规则(参见J Mol Biol273:927-48,1997)。在本申请中,还可以使用包含了Kabat定义和Chothia定义的Combined定义规则确定可变结构域序列中的氨基酸残基。其中Combined定义规则即是将Kabat定义和Chothia定义的范围相结合,基于此取了一个更大的范围。本领域技术人员应当理解的是,除非另有规定,否则术语给定抗体或其区(例如可变区)的“CDR”及“互补决定区”应了解为涵盖如通过本发明描述的上述已知方案中的任何一种界定的互补决定区。虽然本发明中请求保护的范围是基于Chothia定义规则所示出的序列,但是根据其他CDR的定义规则所对应的氨基酸序列也应当落在本发明的保护范围中。
表1:不同编号下本发明的CDR定义在抗体轻链或重链中的位置
CDR\编号体系 | Kabat | Chothia | Combined |
LCDR1 | 24-34 | 26-32 | 24-34 |
LCDR2 | 50-56 | 50-52 | 50-56 |
LCDR3 | 89-97 | 91-96 | 89-97 |
HCDR1 | 31-35 | 26-32 | 26-35 |
HCDR2 | 50-65 | 52-58 | 50-65 |
HCR3 | 95-102 | 95-102 | 95-102 |
“框架”或“FR”是指除高变区(HVR)残基之外的可变结构域残基。可变结构域的FR通常由以下四个FR结构域组成:FR1、FR2、FR3和FR4。因此,HVR和FR序列通常在VH(或VL)中以如下序列出现:FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4。
抗体的“类别”是指抗体的重链所具有的恒定结构域或恒定区的类型。存在五类抗体:IgA、IgD、IgE、IgG和IgM,并且这些类别中的若干可以进一步分为亚类(同种型),例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1 和IgA2。对应于不同类别的免疫球蛋白的重链恒定结构域分别称为α、δ、ε、γ和μ。
“人源化抗体”包含来自非人HVR的氨基酸残基和来自人FR的氨基酸残基。在某些实施例中,人源化抗体包含至少一个,通常两个可变结构域,其中所有或基本上所有HVR(例如CDR)对应于非人抗体的HVR,并且所有或基本上所有的FR对应于人抗体的FR。人源化抗体任选地可以包含来源于人抗体的抗体恒定区的至少一部分。“人源化形式”的抗体,例如非人抗体,是指已经经历了人源化的抗体。
“人抗体”具有的氨基酸序列与由人或人细胞产生的或来源于利用人抗体库或其他人抗体编码序列的非人来源的抗体的氨基酸序列相对应。人抗体的该定义特别地排除了包含非人抗原结合残基的人源化抗体。
本发明的术语“Fc结构域”或“Fc区”用于定义含有恒定区的至少一部分的抗体重链C末端区域。该术语包括天然序列Fc区和变体Fc区。IgG Fc区包含IgG CH2结构域和IgG CH3结构域。本文的CH2结构域可以是天然序列CH2结构域或变体CH2结构域。本文的CH3区可以是天然序列CH3结构域或变体CH3结构域。CH2结构域可包含一种或多种减少或消除CH2结构域结合一种或多种Fcγ受体(例如FcγRI、FcγRIIa、FcγRIIb、FcγRIII)和/或补体的突变。推测减少或消除与Fc受体γ的结合将减少或消除抗体分子介导的ADCC。类似地,减少或消除与补体的结合预期将减少或消除抗体分子介导的CDC。减少或消除CH2结构域与一种或多种Fcγ受体和/或补体结合的突变是本领域已知的(Wang等,2018)。这些突变包括所谓的LALA突变”,所述突变涉及将CH2域的IMGT位置的1.3和1.2处的亮氨酸残基替换为丙氨酸(L1.3A和L1.2A)。或者,通过将CH2结构域中IMGT位置的84.4位的天冬酰胺(N)突变为丙氨酸、甘氨酸或谷氨酰胺(N84.4A、N84.4G或N84.4Q),从而将保守的N-链糖基化位点突变产生a-糖基抗体,以降低IgG1效应子功能也是已知的(Wang等,2018)。作为另一选择,已知补体激活(C1q结合)和ADCC可通过将CH2结构域的IMGT位置114位的脯氨酸突变为丙氨酸或甘氨酸(P114A或P114G)而降低(Idusogie等,2000;Klein等,2016)。这些突变可以被组合,以产生具有进一步降低或没有ADCC或CDC活性的抗体分子。
“与免疫球蛋白的Fc区等同的区域”包括免疫球蛋白Fc区的天然存在等位基因的变体,以及具有产生取代、添加或缺失但基本上不降低免疫球蛋白介导的效应子功能(诸如抗体依赖性细胞毒性)的能力的修饰变体。例如,可以使一个或多个氨基酸从免疫球蛋白的Fc区的N末端或C末端缺失,而基本上不丧失生物学功能。可以根据本领域中已知的一般规则来选择此类变体,以便对活性具有最小的影响(参见例如Bowie,J.U.等人,Science 247:1306-10(1990))。
本发明的术语“效应子功能”可归因于抗体的Fc区,是随着抗体同种型的变化而变化的生物活性。抗体效应子功能的示例包括:C1q结合和补体依赖性细胞毒性(CDC)、Fc受体结合、抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)、抗体依赖性细胞吞噬作用(ADCP)、细胞因子分泌、免疫复合物介导的抗原呈递细胞的抗原摄取、下调细胞表面受体(例如B细胞受体),以及B细胞激活等。
本发明的术语“肽接头”或者“连接肽”是指包含一个或多个氨基酸,通常为约2至20个氨基酸的肽。肽接头是本领域中已知的或在本文中描述的。
本发明的术语“融合至”,“融合联结”或“连接至”是指区段(例如抗原结合结构域和FC结构域)或者直接地或经由一个或多个肽接头而通过肽键连接。
本发明还涉及本发明的双特异性抗体的氨基酸序列变体。双特异性抗体的氨基酸序列变体可以通过向编码分子的核苷酸序列中引入适当的修饰或通过肽合成来制备。这类修饰包括例如抗体氨基酸序列中残基的缺失、***和/或取代。可以进行缺失、***和取代的任何组合获得最终的构建体,最终构建体具有所需的特性,例如抗原结合活性。用于取代的位点通常包括HVR和框架(FR)。参见下表2中氨基酸的可能取代。
表2:保守氨基酸取代
氨基酸残基 | 保守取代 | 优选保守取代 |
Ala(A) | Val;Leu;Ile | Val |
Arg(R) | Lys;Gln;Asn | Lys |
Asn(N) | Gln;His;Asp;Lys;Arg | Gln |
Asp(D) | Glu;Asn | Glu |
Cys(C) | Ser;Ala | Ser |
Gln(Q) | Asn;Glu | Asn |
Glu(E) | Asp;Gln | Asp |
Gly(G) | Ala | Ala |
His(H) | Asn;Gln;Lys;Arg | Arg |
Ile(I) | Leu;Val;Met;Ala;Phe;Nle | Leu |
Leu(L) | Nle;Ile;Val;Met;Ala;Phe | Ile |
Lys(K) | Arg;Gln;Asn | Arg |
Met(M) | Leu;Phe;Ile | Leu |
Phe(F) | Trp;Leu;Val;Ile;Ala;Tyr | Tyr |
Pro(P) | Ala | Ala |
Ser(S) | Thr | Thr |
Thr(T) | Val;Ser | Ser |
Trp(W) | Tyr;Phe | Tyr |
Tyr(Y) | Trp;Phe;Thr;Ser | Phe |
Val(V) | Ile;Leu;Met;Phe;Ala;Nle | Leu |
本发明的术语“多核苷酸”或“核酸”或“核苷酸序列”指分离的核酸分子或构建物,例如信使RNA(mRNA),病毒衍生的RNA或质粒DNA(pDNA)。多核苷酸可包含常规的磷酸二酯键或非常规键(例如酰胺键,诸如在肽核酸(PNA)中找到的)。术语“核酸分子”指多核苷酸中存在的任一个或多个核酸区段,例如DNA或RNA片段。
本发明的术语“分离的”核酸分子或多核苷酸是指已经与其天然环境分隔开的核酸分子,DNA或RNA。在本发明中,载体中包含的编码多肽的重组多核苷酸也是分离的。分离的多核苷酸的其他实例包括在异源宿主细胞中的重组多核苷酸或溶液中纯化的多核苷酸。分离的多核苷酸包括通常是含有该多核苷酸分子的细胞中所含有的多核苷酸分子,但是该多核苷酸分子存在于染色体外或与其天然染色***置不同的染色***置。分离的RNA分子包括本发明的体内或体外RNA转录物,为正和负链形式,和双链形式。本发明的分离的多核苷酸或核酸进一步包括合成生成的此类分子。另外,多核苷酸或核酸可以为或可以包括调节元件,诸如启动子,核糖体结合位点,或转录终止子。
本发明的术语“表达盒”指重组或合成生成的多核苷酸,具有允许特定核酸在靶细胞中转录的一系列核酸元件。重组表达盒可导入质粒,染色体,线粒体DNA,质体DNA,病毒或核酸片段。典型地,在其它序列以外,表达载体的重组表达盒部分包括要转录的核酸序列和启动子。在某些实施方案中,本发明的表达盒包含编码本发明的双特异性抗原结合分子或其片段的多核苷酸序列。
本发明的术语“载体”或“表达载体”与“表达构建物”可以互换使用,将与其可操作连接的特定基因导入靶细胞并指导表达的DNA分子。所述载体包括作为自身复制性核酸结构的载体以及并入其已经导入的宿主细胞的基因组的载体。本发明的表达载体包含表达盒。表达载体可以进行大量稳定mRNA的转录。一旦表达载体在靶细胞内,则由细胞转录和/或翻译机制生成由该基因编码的核糖核酸分子或蛋白质。在一个实施方案中,本发明的表达载体包括含有编码本发明的双特异性抗原结合分子或其片段的多核苷酸序列的表达盒。
术语“宿主细胞”,“宿主细胞系”和“宿主细胞培养物”可互换使用,是指其中已经导入外源核酸的细胞,还包括这类细胞的后代。宿主细胞包括“转化体/转化子”和“转化细胞”,包括原代转化细胞以及由其衍生的后代。后代的核酸与亲本细胞可以不完全一致,可含有突变。宿主细胞是可用于生成本发明的双特异性抗原结合分子的任何类型的细胞。宿主细胞包括培养的细胞,例如培养的哺乳动物细胞,诸如CHO细胞,HEK293细胞,BHK细胞,NS0细胞,SP2/0细胞,YO骨髓瘤细胞,P3X63小鼠骨髓瘤细胞,PER细胞,PER.C6细胞或杂交瘤细胞,酵母细胞,昆虫细胞和植物细胞,还包括转基因动物,转基因植物或培养的植物或动物组织内所包含的细胞。
胚系化回复突变是指将抗体的超体细胞突变回复突变为相应胚系序列的过程。抗体的重链可变结构域序列来源于染色体上重链基因群的胚系基因V、D、J基因片段的基因重排和体细胞高频突变等事件;轻链可变结构域序列来源于轻链基因群的胚系基因V、J基因片段的基因重排和体细胞高频突变等事件。基因重排和体细胞高频突变是增加抗体多样性的主要因素。来源于相同胚系V基因片段的抗体也可能产生不同的序列,但总体上相似性较高。利用一些算法,例如IMGT/DomainGapAlign(http://imgt.org/3Dstructure- DB/cgi/DomainGapAlign.cgi)或者NCBI/IgBLAST(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/),可以从抗体的可变结构域序列推测出其发生基因重排时可能的胚系基因片段。
术语“翻译后修饰(PTM)”是指蛋白质或多肽氨基酸链在细胞中翻译合成后,引入化学修饰的过程。对于抗体而言,一些PTM的位点是非常保守的,例如,在人的IgG1抗体的恒定结构域的第297位(EU编号)的保守氨基酸天冬酰胺Asn通常会发生糖基化修饰形成糖链,而该糖链结构对于抗体结构和相关的效应子功能是至关重要的。但是,如果在抗体的可变结构域尤其是抗原结合区域(如CDR)中存在PTM,那么这些PTM的存在有可能会对抗原的结合有较大的影响,也可能对抗体的物理化学性质带来变化。例如,糖基化、脱酰胺、异构化、氧化等都可能增加抗体分子的不稳定性或异质性,从而增加抗体开发的难度和风险。因而去除PTM以降低序列不稳定性的过程,从而避免一些潜在的PTM对于治疗性抗体的开发是非常重要的。随着经验的积累,人们发现一些PTM与氨基酸序列的组成,尤其与相邻氨基酸组成的“模式”是高度相关的,这样使得可以从蛋白质的一级氨基酸序列预测出潜在的PTM。例如,N-x-S/T(第一位是天冬酰胺,第二位是非脯氨酸以外的任意氨基酸,第三位是丝氨酸或者苏氨酸)的序列模式预测出N-连接糖基化位点。引起PTM的氨基酸序列模式有可能来源于胚系基因序列,例如人胚系基因片段IGHV3-33天然地在FR3区域存在糖基化模式NST;也可能来源于体细胞高频突变。可以通过氨基酸突变来破坏PTM的氨基酸序列模式,从而降低或者去除特定PTM的形成。根据抗体序列和PTM序列模式的不同,有不同的突变设计方法。一种方法是将“热点”氨基酸(如NS模式中的N或S)替换成物理化学性质相似的氨基酸(如把N突变为Q)。如果PTM序列模式来源于体细胞高频突变,而并不存在于胚系基因序列中,那么另一种方法可以是把该序列模式替换成对应的胚系基因序列。实际操作中,对同一个PTM序列模式可能采用多种突变设计方法。
术语“抗体药物偶联物”或“ADC”指与一个或多个化学药物化学连接的结合蛋白(如抗体或其抗原结合片段)。在优选的实施方案中,ADC包括结合蛋白,药物,和连接所述结合蛋白与药物的接头。
术语“嵌合抗原受体”或“CAR”指具有期望抗原特异性和信号传导结构域,以在抗原结合时传播细胞内信号的受体。例如,T淋巴细胞经由T细胞受体(TCR)与由I类或II类主要组织相容性复合物(MHC)分子呈递的短肽的相互作用来识别特异性抗原。对于初始活化和克隆扩增来说,初始T细胞依赖于提供额外共刺激信号的抗原呈递细胞(APC)。在一些实施方案中,可将单核细胞和巨噬细胞工程化以例如表达嵌合抗原受体(CAR)。修饰细胞可募集至肿瘤微环境,在此其通过浸润肿瘤并杀伤靶标癌细胞而用作强力免疫效应物。CAR可包括抗原结合结构域、跨膜结构域和细胞内结构域。抗原结合结构域结合至靶细胞上的抗原。可用作结合至CAR的抗原结合结构域的抗原的细胞表面标志物的实例包括与病毒、细菌、寄生虫感染、自身免疫疾病和癌细胞相关者(例如肿瘤抗原)。
术语“修饰的免疫细胞”指免疫细胞已经被基因修饰,以表达CAR。在一些实施方案中,所述免疫细胞是T细胞,或由其衍生的细胞。在一些实施方案中,所述免疫细胞是自然杀伤(NK)细胞,或由其衍生的细胞。在一些实施方案中,所述免疫细胞是B细胞,或由其衍生的细胞。在一些实施方案中,所述免疫细胞是B细胞,或由其衍生的细胞。在一些实施方案中,所述免疫细胞是单核细胞或巨噬细胞,或由其衍生的细胞。
术语“套装药盒”指一种或多种活性成分存在于多以一个单位的组合。套装药盒中存在多种活性成分时,各活性成分可以同时或顺序给药。
术语“给药装置”指用于向受试者给药的任何工具。
术语“预填充注射器(prefilled syringe)”是指在注射器的操作者接近或使用之前已经装载有药物的注射器。预填充注射器可以是任何材料(例如,玻璃、塑料或金属)。在一些实施方案中,预填充注射器是玻璃注射器。
药物的“有效量”指在接受其施用的细胞或组织中导致生理变化所必需的量。“有效量”包含足以改善或预防医学疾病的症状或病症的量。有效量还意指足以允许或促进诊断的量。用于特定患者或兽医学受试者的有效量可依据以下因素而变化:例如,待治疗的病症、患者的总体健康情况、给药的方法途径和剂量以及副作用的严重性。有效量可以是避免显著副作用或毒性作用的最大剂量或给药方案。
依照本发明的双特异性抗体具有协同效应。“协同效应”是指两种药物的组合效果大于它们单独的效果之 和且在统计学上不同于对照和单一药物。本发明的叠加效应是指两种药物的组合效果是它们单独的效果之和且在统计学上不同于对照和/或单一药物。
药物(例如药用组合物)的“治疗有效量”指在剂量和给药间隔和时间上有效实现想要的治疗或预防效果必需的量。例如,治疗有效量的药物消除、减轻/减少、延迟、最小化或预防疾病的不利影响。
术语“个体”或“受试者”是指哺乳动物。哺乳动物包括但不限于驯养的动物(例如牛,绵羊,猫,犬和马),灵长类动物(例如人和非人灵长类,诸如猴),家兔和啮齿类动物(例如小鼠和大鼠)。具体地,个体或受试者是人。
术语“药物组合物”表示含有一种或多种本公开的抗体或其抗原结合片段与其他化学组分的混合物,所述其他组分例如生理学/可药用的载体或赋形剂。药物组合物的目的是促进对生物体的给药,利于活性成分的吸收进而发挥生物活性。
术语“药学可接受的载体”指药用组合物中除了活性组分以外,对受试者无毒的组分。药学可接受赋形剂包括但不限于缓冲剂,稳定剂和/或防腐剂。
术语“癌症”是指描述哺乳动物中以细胞生长不受调节为特征的疾患。癌症的例子包括但不限于肿瘤,淋巴瘤、母细胞瘤、肉瘤和白血病或淋巴样恶性肿瘤。癌症更具体的实例包括但不限于鳞状细胞癌(例如上皮鳞状细胞癌)、肺癌(包括小细胞肺癌、非小细胞肺癌、腺癌和肺的鳞癌)、腹膜癌、肝细胞癌、胃癌(包括胃肠癌和胃肠基质癌)、骨癌、胰腺癌、成胶质细胞瘤、***、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、尿道癌、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、结肠直肠癌、子宫内膜癌或子***、唾液腺癌、肾癌或输尿管癌、***癌、***癌、外阴癌、甲状腺癌、***癌、***癌、黑素瘤、胆管癌、中枢神经***(CNS)肿瘤、脊椎轴肿瘤、脑干胶质瘤、多形性成胶质细胞瘤、星形细胞瘤、神经鞘瘤、室管膜瘤、成髓细胞瘤、脑膜瘤、鳞状细胞癌、垂体腺瘤和尤文氏肉瘤、浅表扩散性黑素瘤、恶性雀斑样痣黑素瘤、肢端黑素瘤、结节性黑素瘤、多发性骨髓瘤和B细胞淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、急性成淋巴细胞性白血病(ALL)、毛细胞性白血病、慢性成髓细胞性白血病和移植后淋巴增殖性疾病(PTLD)、以及与瘢痣病(phakomatoses)、水肿(诸如与脑瘤有关的)和梅格斯氏(Meigs)综合征有关的异常血管增殖、脑瘤和脑癌、以及头或颈癌和相关的转移癌。
术语“治疗”是指给予患者内用或外用治疗剂,例如包含本公开的任一种抗体或其抗原结合片段的组合物或编码抗体或其抗原结合片段的核酸分子,所述患者具有一种或多种疾病或症状,所述治疗剂对这些疾病或症状具有治疗作用。通常,在受治疗患者或群体中以有效缓解一种或多种疾病或症状的量给予治疗剂,以诱导这类症状退化或抑制这类症状发展到任何临床可测量的程度。
术语“预防癌症”是指在哺乳动物中延迟、抑制或防止癌症发作,所述哺乳动物中癌发生或肿瘤发生的起始尚未得到证实,但是通过例如遗传筛查或其它方法确定,已鉴定其具有癌症易感性。该术语还包括治疗具有癌变前病症的哺乳动物以终止所述癌变前病症向恶性肿瘤的进展或导致其消退。
本申请的抗体的序列编号(SEQ ID NO:)见下表3。
表3:
本申请的双抗的序列编号(SEQ ID NO:)见下表4。
表4:
蛋白编号 | 多肽链1 | 多肽链2 |
PR003569 | 122 | 119 |
PR003739 | 123 | 120 |
PR004295 | 124 | 121 |
PR006268 | 125 | 119 |
PR006269 | 126 | 119 |
PR006270 | 127 | 119 |
PR006271 | 128 | 119 |
PR006663 | 129 | 119 |
PR006667 | 132 | 131 |
PR006664 | 130 | 119 |
PR006668 | 133 | 131 |
图1A、图1B显示本申请所述PD-L1抗原结合蛋白结合过表达人PD-L1的CHO-K1细胞的结果。图1C显示本申请所述PR000960翻译后修饰(PTM)变体结合过表达人PD-L1的CHO-K1细胞的结果。图1D、图1E、图1F显示本申请所述PR002082亲和力成熟变体结合过表达人PD-L1的CHO-K1细胞的结果。
图2A显示本申请所述PD-L1抗原结合蛋白结合过表达食蟹猴PD-L1的CHO-K1细胞的结果。图2B显示本申请所述PR000960翻译后修饰(PTM)变体结合过表达食蟹猴PD-L1的CHO-K1细胞的结果。图2C显示本申请所述PR002082亲和力成熟变体结合过表达猴PD-L1的CHO-K1细胞的结果。
图3A显示本申请所述PD-L1抗原结合蛋白对PD-1信号通路的抑制作用。图3B显示本申请所述PR000960翻译后修饰(PTM)变体对PD-1信号通路的抑制作用。图3C、图3D显示本申请所述PR002082亲和力成熟变体对PD-1信号通路的抑制作用。
图4显示在供体对#1的MLR实验中本申请所述PD-L1抗原结合蛋白增强激活T淋巴细胞分泌细胞因子IL-2(图4A)和IFN-γ(图4B)的结果。
图5显示在供体对#2的MLR实验中本申请所述PD-L1抗原结合蛋白增强激活T淋巴细胞分泌细胞因子IL-2(图5A)和IFN-γ(图5B)的结果。
图6显示在供体对#3的MLR实验中本申请所述PR000960翻译后修饰(PTM)变体增强激活T淋巴细胞分泌细胞因子IL-2(图6A)和IFN-γ(图6B)的结果。
图7显示在供体对#4的MLR实验中本申请所述PR002082亲和力成熟变体增强激活T淋巴细胞分泌细胞因子IL-2(图7A)和IFN-γ(图7B)的结果。
图8显示在供体对#5的MLR实验中本申请所述PR002082亲和力成熟变体增强激活T淋巴细胞分泌细 胞因子IL-2(图8A)和IFN-γ(图8B)的结果。
图9显示在供体对#6的MLR实验中本申请所述PR002082亲和力成熟变体增强激活T淋巴细胞分泌细胞因子IL-2(图9A)和IFN-γ(图9B)的结果。
图10显示在供体对#7的MLR实验中本申请所述PR002082亲和力成熟变体增强激活T淋巴细胞分泌细胞因子IL-2(图10A)和IFN-γ(图10B)的结果。
图11显示在供体对#8的MLR实验中本申请所述PR002082亲和力成熟变体增强激活T淋巴细胞分泌细胞因子IL-2(图11A)和IFN-γ(图11B)的结果。
图12显示在供体对#9的MLR实验中本申请所述PR002082亲和力成熟变体增强激活T淋巴细胞分泌细胞因子IL-2(图12A)和IFN-γ(图12B)的结果。
图13A显示NCG小鼠重建人PBMC免疫***的A375肿瘤模型的体内抗瘤效果。图13B显示在实验过程中各组动物体重改变的结果。
图14显示本发明的双特异性分子的结构示意图。
图15显示抗体与稳定表达人CD73和人PD-L1的CHO-K1细胞的结合。
图16显示抗体抑制CD73酶活性的实验结果。
图17显示利用报告基因细胞系检测抗体对PD-1/PD-L1信号通路的抑制作用。
图18显示MLR法体外检测融合蛋白对T细胞的激活作用。
下面显示的实施例意在说明本发明的具体实施方案,并且不意在以任何方式限制本说明书或权利要求书的范围。实施例不包括对传统方法的详细描述,如那些用于构建载体和质粒的方法,将编码蛋白的基因***到这样的载体和质粒的方法或将质粒引入宿主细胞的方法.这样的方法对于本领域中具有普通技术的人员是众所周知的,并且在许多出版物中都有所描述,包括Sambrook,J.,Fritsch,E.F.和Maniais,T.(1989)MolecuLar Cloning:A Laboratory Manual,2nd edition,Cold spring Harbor Laboratory Press。
实施例
实施例1.PD-L1抗原结合蛋白的制备
为获得针对PD-L1特异性结合的抗体分子,通常可以利用PD-L1抗原对实验动物进行免疫,该实验动物可以是小鼠、大鼠、兔、羊、骆驼等,但是得到的抗体分子是非人源的。在获得非人源抗体后,需要对这些分子利用抗体工程技术进行人源化改造,以降低免疫原性并提高成药性。然而,抗体的人源化过程有其技术复杂性,经过人源化改造的分子往往会降低对抗原的亲和力。另一方面,转基因技术的进步使得可以培育出基因工程化小鼠,其携带人免疫球蛋白免疫库并使其内源的鼠的免疫库缺失。这种转基因小鼠产生的抗体具有全人源的序列,因而无需再进一步做人源化改造,大大提高了治疗性抗体开发的效率。
Harbour HCAb小鼠(Harbour Antibodies BV,WO 2002/085945 A3)是一种携带人免疫球蛋白免疫库的转基因小鼠,能够产生全新的仅“重链”抗体,该抗体的大小只有传统IgG抗体的一半。其产生的抗体仅具有人的抗体“重链”可变结构域和小鼠Fc恒定结构域。由于不含轻链的这一特点,该抗体几乎解决了轻链错配和异源二聚化的问题,使得这一技术平台能够开发出传统抗体平台难以实现的产品。
1.1 PD-L1免疫HCAb小鼠
用可溶的重组人PD-L1-mFc融合蛋白(Novo Protein Inc.#CM06,批号0330837)对6~8周龄Harbour HCAb人源抗体转基因小鼠进行多轮免疫。每只小鼠每次免疫时通过皮下经腹股沟注射或通过腹腔注射接受的总注射剂量是100μL。在首轮免疫中,每只小鼠接受用50μg抗原蛋白与完全弗氏佐剂(Sigma,#F5881)以体积比1:1混合配制的免疫原试剂的免疫。在随后的每轮增强免疫中,每只小鼠接受用25μg抗原蛋白与Ribi佐剂(Sigma Adjuvant System,#S6322)混合配制的免疫原试剂的免疫。每轮增强免疫的间隔时间至少为两周,通常不超过五轮增强免疫。免疫时间为第0天、第14天、第28天、第42天、第56天、第70天;并且在第49天、第77天,检测小鼠血清抗体滴度。在进行HCAb小鼠脾B细胞分离前5天,以每只小鼠 25μg抗原蛋白的剂量进行最后一次增强免疫。
1.2获得抗PD-L1的HCAb抗体序列
当检测小鼠血清中PD-L1特异的抗体滴度达到一定的水平后,将小鼠的脾细胞取出分离B细胞,用BD FACS AriaII Cell Sorter分选CD138阳性的浆细胞和人PD-L1抗原阳性的B细胞群。提取B细胞的RNA,反转录cDNA(SuperScript IV First-Strand synthesis system,Invitrogen,#18091200),然后用特异性的引物PCR扩增人VH基因。PCR引物5’-GGTGTCCA GTGTSAGGTGCAGCTG-3’(SEQ ID NO:134),5’-AATCCCTGGGCACTGAAGAGACGG TGACC-3’(SEQ ID NO:135)。将扩增的VH基因片段,构建到编码人IgG1抗体重链Fc结构域序列的哺乳动物细胞表达质粒pCAG载体中。
构建好的质粒转染哺乳动物宿主细胞(如人胚肾细胞HEK293),以表达获得的HCAb抗体。检测表达HCAb的上清与过表达人PD-L1的CHO-K1/hPD-L1(GenScript,#M00543)稳定细胞系的结合,同时用阳性抗体PR000151(Atezolizumab类似物,申请人根据Atezolizumab序列合成表达)作为阳性对照,进行Miroball荧光流式仪器(Sptlabtech)筛选。
具体步骤是:用无血清的F12K培养基(Thermofisher,#21127022)洗涤CHO-K1/hPD-L1细胞,将其用无血清的培养基重悬至1×10
6/mL。加入Draq5荧光探针(CTS,#4048L)(1μL Draq5至1mL CHO-K1/hPD-L1细胞中,1:1000稀释),在避光处孵育30分钟。离心细胞后用培养基洗涤细胞,调整细胞密度至1.0×10
5细胞/mL。再加入1:1000稀释后的Alexa
488 AffiniPure Goat Anti-Human IgG,FcγFragment Specific二抗(Jackson ImmunoResearch,#109-545-098),取每孔30μL的该混合物加入384孔板(Greiner,#781091)。再在384孔板中加入10μL阳性对照或者表达HCAb的上清,孵育2小时。在Miroball荧光流式仪器上读取荧光值。阳性克隆抗体进一步用FACS检测与CHO-K1/hPD-L1细胞的结合,以及和食蟹猴PD-L1-his蛋白(Acrobiosystems,#PD-1-C52H4)的ELISA检测来验证结合交叉结合活性。利用常规的测序手段对阳性抗体进行测序,获得编码抗体分子可变结构域的核苷酸序列以及对应的氨基酸序列。
1.3重组全人源抗体的制备
上述实施例1.2中得到编码抗体分子的重链可变结构域序列以后,可以采用常规的重组DNA技术,将重链可变结构域序列和相应的人的抗体重链恒定结构域序列进行融合表达,得到重组抗体分子。
将编码抗体重链的质粒转染哺乳动物宿主细胞(如人胚肾细胞HEK293),利用常规的重组蛋白表达和纯化技术,可以得到具有HCAb重链重组抗体。
具体说来,将HEK293细胞在FreeStyle
TM F17 Expression Medium培养基(Thermo,#A1383504)中扩培。瞬时转染开始之前,调节细胞浓度至(6~8)×10
5细胞/mL,于37℃,8%CO
2摇床中培养24小时,细胞浓度在1.2×10
6细胞/mL。准备30mL培养的细胞。将上述编码HCAb的重链质粒溶解于1.5mL Opti-MEM减血清培养基(Thermo,#31985088),并用0.22μm滤膜过滤除菌。再取1.5mL Opti-MEM溶入1mg/mL PEI(Polysciences Inc,#23966-2)120μL,静置5分钟。将PEI缓慢加入质粒中,室温孵育10分钟,边摇晃培养瓶边缓慢滴入质粒PEI混合溶液,于37℃8%CO
2摇床中培养5天。5天后观测细胞活率。收集培养物,以3300g转速离心10分钟后取上清;然后将上清高速离心去除杂质。用PBS(pH7.4)平衡含有MabSelect
TM(GE Healthcare Life Science,#71-5020-91AE)的重力柱(Bio-Rad,#7311550),2-5倍柱体积冲洗。将上清样品过柱。用5-10倍柱体积的PBS冲洗柱子。再用pH3.5的0.1M甘氨酸洗脱目的蛋白,后用pH 8.0的Tris-HCl调节至中性,最后用超滤管(Millipore,#UFC901024)浓缩换液至PBS缓冲液,得到纯化的抗体溶液。然后用NanoDrop(Thermo Scientific
TM NanoDrop
TM One)测定浓度,分装、存储备用。
1.4 PD-L1全人重组抗体的序列
表5列出了本实施例中PD-L1抗体的重链可变结构域氨基酸序列,重链全长氨基酸序列和根据Chothia定义规则定义的CDR的氨基酸序列。同时,本申请的抗PD-L1的阳性对照抗体Atezolizumab类似物,其相应的氨基酸序列来源于IMGT数据库,抗体重链序列SEQ ID NO:97,抗体轻链序列SEQ ID NO:118。
表5抗PD-L1 HCAb抗体的序列编号(SEQ ID NO:)
1.5利用HPLC-SEC分析蛋白纯度和多聚体
使用分析型分子尺寸排阻层析色谱法(SEC)来分析蛋白样品的纯度和聚体形式。将分析型色谱柱TSKgel G3000SWxl(Tosoh Bioscience,#08541,5μm,7.8mm×30cm)连接到高压液相色谱仪(HPLC)(型号:Agilent Technologies,Agilent 1260 Infinity II),用PBS缓冲液室温下平衡至少1小时。适量蛋白样品(至少10μg,样品浓度调整到1mg/mL)用0.22μm滤膜过滤后注射入***,并设定HPLC程序:用PBS(pH 7.4)缓冲液将样品以1.0mL/min的流速流过色谱柱,最长时间为25分钟;检测波长280nm。采集后用ChemStation软件对色谱图进行积分并计算相关数据,生成分析报告,报告出样品内不同分子尺寸组份的滞留时间。
PD-L1抗体的产量和纯度分析结果见表6。
表6:PD-L1抗体的产量和纯度分析
实施例2抗体序列的优化
2.1 PTM位点的去除
将实施例1中的抗体序列进行分析,其重链可变结构域(VH)的胚系基因V基因片段,以及可变结构域VH预测的PTM,列于表7。
表7抗PD-L1 HCAb抗体的序列胚系基因分析
表8列出了对自实施例1的具有潜在PTM位点的PR000960抗体的序列,进行氨基酸突变得到的新的抗体分子(称为PTM变体)。表9列出了PR000960的PTM变体的CDR、VH和HC的氨基酸序列,和根据Chothia定义规则定义的CDR的氨基酸序列。所有设计出来的PTM变体按照实施例1.3中描述的方法得到纯化的重组抗体,并在后续的功能实验中进一步验证。PR000960的PTM变体的产量和纯度分析结果见表10。
表8PR000960的突变位点设计
表9 PR000960的PTM变体的CDR、VH和HC的氨基酸序列
表10:PR000960翻译后修饰(PTM)变体的产量和纯度分析
2.2优化HCAb抗体序列提高结合PD-L1的亲和力
通过对CDR区域进行随机突变的方法建立酵母展示抗体突变库,借助于BD FACS AriaIII分选平台对PR002082分子进行亲和力的改造。此亲和力成熟的方法分为三轮。
首先,对母本分子PR002082的三个CDRs随机引入突变,建立3CDRs(CDR1、CDR2、CDR3)酵母展示突变库;然后用MACS分选方法进行富集;随后用流式FACS进行多轮分选,富集高亲和力的突变分子。在本实施例中,抗体可变结构域的CDR序列通过Chothia规则进行分析。
第一轮,用0.1nM生物素化的PD-L1-his分选出结合力更高的酵母细胞;然后继续培养诱导。
第二轮,用0.01nM生物素化的PD-L1-his进一步分选出结合力更高的酵母细胞;然后继续培养诱导。
第三轮,继续降低分选时抗原的浓度,用0.003nM生物素化的PD-L1-his进行最后一轮分选。
最后,将前面三轮分选到的分子测序,找到突变位点进行随机组合,建立组合突变库。然后用FACS继续以更低的抗原浓度分选出更高亲和力突变分子。在本实施例中,经亲和力成熟得到的抗体重链可变结构域序列(VH)通过基因合成,并克隆到编码Flag和6xHis标签的哺乳动物细胞表达质粒载体中,以编码产生重组HCAb单域抗体分子。
得到PR002082变体(均为单域抗体)的序列如下表11所示。
表11:PR002082变体的序列编号表(SEQ ID NO:)
2.3 PR002082亲和力变体的生产和纯化
上述实施例2.2中得到编码PR002082亲和力变体可变结构域的序列以后,可以采用常规的重组DNA技术,将重链可变结构域序列和相应的纯化标签进行融合表达,得到重组HCAb单域抗体分子。
将编码重组HCAb单域抗体的质粒转染哺乳动物宿主细胞(如中国仓鼠卵巢细胞CHO),利用常规的重组蛋白表达和纯化技术,可以得到相应的纯化重组抗体。
具体说来,将ExpiCHO-S
TM细胞(Gibco,#A29127)在ExpiCHO
TM Expression Medium培养基(Gibco,#A2910001)扩培。瞬时转染开始之前,调节细胞浓度至(3~4)×10
6细胞/mL,于37℃8%CO
2摇床中培养24小时,细胞浓度至(7~10)×10
6细胞/mL,再稀释至6×10
6细胞/mL,准备10mL培养的细胞。将上述编码HCAb单域抗体的质粒8μg(质粒与细胞的比例为0.8μg:1mL)溶解于0.4mL OptiPRO
TM SFM培养基(Gibco,#12309019),并用0.22μm滤膜过滤除菌。再取32μL ExpiFectamine
TM CHO试剂(Gibco,#A29129)加入0.37mL OptiPRO
TM SFM培养基(Gibco,#12309019)。立即将ExpiFectamine
TM CHO试剂溶液缓慢加入质粒溶液中,颠倒混匀,边摇晃培养瓶边缓慢滴入质粒和转染试剂混合溶液,于37℃8%CO
2摇床中培养8-9天。8天后观测细胞活率。收集培养物,以3300g转速离心10分钟后取上清,然后将上清用0.22μm滤膜过滤去除杂质。用PBS(pH7.4)平衡含有Ni Sepharose excel(GE Healthcare Life Science,#17531802)的重力柱(Bio-Rad,#7311550),2-5倍柱体积冲洗。将上清样品过柱。先后用5-10倍柱体积的PBS和5-10倍柱体积的20mM咪唑溶液(pH7.4)冲洗柱子。再用500mM咪唑溶液(pH7.4)洗脱目的蛋白,最后用超滤管(Millipore,#UFC901024)浓缩换液至PBS缓冲液,得到纯化的抗体溶液。然后用NanoDrop(Thermo Scientific
TM NanoDrop
TM One)测定浓度,分装、存储备用。PR002082亲和力成熟变体的制备见表12。
表12:PR002082亲和力成熟变体的制备
实施例3抗原结合蛋白与过表达人/食蟹猴PD-L1的细胞的结合(FACS)
本实施例为了研究PD-L1抗原结合蛋白在体外结合人/食蟹猴PD-L1的活性,采用过表达人PD-L1的CHO-K1细胞株(CHO-K1/hPD-L1,南京金斯瑞,M00543)或过表达食蟹猴PD-L1的CHO-K1细胞株(CHO-K1/cynoPD-L1,南京金斯瑞,M00573)进行细胞水平的结合实验。简言之,消化PD-L1细胞,并用F-12K完全培养基重悬,将细胞密度调整为1×10
6细胞/mL。以100μL细胞/孔接种于96孔V底板(Corning,3894),随后加入100μL/孔,2倍于终浓度的5倍浓度梯度稀释的待测抗原结合蛋白,混合均匀,其中抗原结合蛋白最高终浓度为100nM,共8个浓度,同型抗体hIgG1iso作为对照。将细胞放置于4℃,避光孵育1小时。之后,加入100μL/孔预冷PBS漂洗细胞两次,于500g 4℃下离心5分钟,弃上清。再加入100μL/孔荧光二抗(山羊抗人IgG(H+L)第二抗体,Alexa Fluor 488 conjugate,Invitrogen,A11013,1:1000稀释),4℃,避光孵育30分钟。用200μL/孔预冷PBS洗涤细胞两次,于500g 4℃下离心5分钟,弃上清。最后,200μL/孔预冷PBS重悬细胞。使用BD FACS CANTOII读取荧光发光信号值。使用流式细胞仪BD FACS CANTOII或FACS ACEA读取荧光发光信号值,并用软件FlowJo v10(FlowJo,LLC)处理和分析数据。应用软件GraphPad Prism 8进行数据处理和作图分析,通过四参数非线性拟合,得到结合曲线及EC
50值等参数。
图1(A、B)结果显示,本申请所述PD-L1抗原结合蛋白均能结合过表达人PD-L1的CHO-K1细胞。
图1(C)结果显示,本申请所述PR000960翻译后修饰(PTM)变体均能结合过表达人PD-L1的CHO-K1细胞。
图1(D、E、F)结果显示,本申请所述PR002082亲和力成熟变体均能结合过表达人PD-L1的CHO-K1细胞,且作用均强于亲本序列抗体PR002082。
图2(A)结果显示,本申请所述PD-L1抗原结合蛋白均能结合过表达食蟹猴PD-L1的CHO-K1细胞。
图2(B)结果显示,本申请所述PR000960翻译后修饰(PTM)变体均能结合过表达食蟹猴PD-L1的CHO-K1细胞。
图2(C)结果显示,本申请所述PR002082亲和力成熟变体均能结合过表达猴PD-L1的CHO-K1细胞,且作用均强于亲本序列抗体PR002082。
实施例4.利用BLI方法测定抗原结合蛋白与人PD-L1的亲和力
该实施例利用Octet Red96e仪器对PR002082亲和力成熟突变体进行了亲和力的测定。具体方法是,带有组氨酸标签的人PD-L1蛋白购自厂家ACROBiosystems(#PD-1-H5258,测试缓冲液为1×动力学缓冲液(从10×动力学缓冲液(ForteBio,#18-1105)稀释),用于亲和力测试以及抗原、抗体的稀释。通过生物膜干涉(BLI)技术,使用Octet分子相互作用分析仪(ForteBio,型号Octet Red96e),来进行抗原抗体之间的结合动力学分析。
测定抗原和抗体的亲和力时,传感器转动速度为1000转/分钟。先将置于一列的2个HIS1K传感器在测试缓冲液中平衡10分钟,然后用HIS1K传感器捕获His PD-L1,捕获高度0.9-1.1nm,然后将HIS1K传感器在测试缓冲液中平衡2分钟,然后将HIS1K传感器与抗原结合蛋白(60nM以及0nM)结合3分钟,最后解离15分钟。将HIS1K传感器浸入10mM甘氨酸(pH 1.5)溶液进行再生,以洗脱结合在传感器上的蛋白。
使用Octet Data Analysis软件(Fortebio,版本11.0)进行数据分析时,选择单扣除模式(reference well)扣除参照信号,选择“1:1 Local/full fitting”方法进行数据拟合,计算出抗原与抗体结合的动力学参数,得到K
on(1/Ms)值、K
dis(1/s)值和KD(M)值。
结果如表13所示,PR02082的亲和力成熟变体与PD-L1均能结合,且多数变体的亲和力较PR002082有明显提高。
表13:PR002082亲和力成熟变体与人PD-L1蛋白的亲和力
实施例5.利用报告基因细胞系检测抗原结合蛋白对PD-1信号通路的抑制作用
将表达PD-L1和OS8(CD3单链抗体跨膜蛋白)的293T(eBioscience)细胞铺到96孔板上,细胞量为1.25×10
4/孔,100μL/孔。37℃在5%CO
2环境下孵育过夜。去除上清液,加入50μL/孔的待测抗原结合蛋白稀释液,起始浓度为100nM,5倍浓度稀释,hlgG1为对照组。加入5×10
4/孔的可持续表达PD-1和NFAT-荧光素酶报告基因的Jurkat报告细胞(UPharm)50μL/孔。37℃在5%CO
2环境下培养6小时。加入ONE-GloTM荧光素酶试剂(Promega,#E6110),室温孵育5分钟,酶标仪检测发光值。结果如图3所示。结果显示本申请所述HCAb抗体对PD-1信号通路有抑制作用。
图3(A)结果显示,本申请所述PD-L1抗原结合蛋白均对PD-1信号通路有抑制作用。
图3(B)结果显示,本申请所述PR000960翻译后修饰(PTM)变体均对PD-1信号通路有抑制作用。
图3(C、D)结果显示,本申请所述PR002082亲和力成熟变体均对PD-1信号通路有抑制作用,且多数变体的抑制作用较PR002082有明显提高。
实施例6.抗原结合蛋白在混合淋巴细胞反应(MLR)中刺激细胞因子分泌
购买AllCells PBMC细胞,分离单核细胞,加入重组人源白介素4(IL-4)(R&D,#204-GMP)和人源GM-CSF(R&D,#215-GM/CF)诱导6天后,获得未成熟的人CD14+树突状细胞(iDC细胞)。加入1μg/mL的脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS;Sigma,#L2630),诱导24小时,获得成熟的树突状细胞(mDC细胞)。采用T细胞分离试剂盒(StemCell,#17951)从第二供体PBMC细胞中分离得到T淋巴细胞。将1×10
5/孔的T淋巴细胞和1×10
4/孔的mDC细胞按10:1比例接种至96孔板,加入10倍或者对应倍数的稀释的各抗原结合蛋白及阴阳性对照抗体。于37℃5%CO
2培养箱孵育5天。收集第三天和第五天的上清液,采用ELISA试剂盒,分别检测IL-2(ThermoFisher,#88-7025-88)和IFN-γ(ThermoFisher,#88-7316-88)的分泌量。
本实施例使用了18个供体的PBMC分成了9组供体配对进行混合淋巴细胞反应(MLR)。
图4和图5结果显示,在两次独立的MLR实验中,本申请所述PD-L1抗原结合蛋白均能增强激活的T淋巴细胞分泌细胞因子IL-2和IFN-γ。
图6结果显示,本申请所述PR000960翻译后修饰(PTM)变体均能增强激活的T淋巴细胞分泌细胞因 子IL-2和IFN-γ。
图7、图8、图9、图10、图11、图12结果显示,在6次独立的MLR实验中,本申请所述PR002082亲和力成熟变体均能增强激活的T淋巴细胞分泌细胞因子IL-2和IFN-γ。
实施例7.抗原结合蛋白的体内抑制肿瘤活性
NCG小鼠重建人PBMC免疫***的A375肿瘤模型的体内抗瘤效果参见图13A。具体地,溶媒对照组小鼠在给药后第23天平均肿瘤体积为1336mm
3。测试药Atezolizumab(10mg/kg)治疗组在接种后第23天平均肿瘤体积为343mm
3,相较溶媒对照组有显著性差异(p值=0.002),肿瘤抑制率TGI(%)为74.33%。测试药PR002079(5mg/kg)治疗组在接种后第23天平均肿瘤体积为728mm
3,相较溶媒对照组有显著性差异(p值=0.021),肿瘤抑制率TGI(%)为45.51%。测试药PR002082(5mg/kg)治疗组在接种后第23天平均肿瘤体积为891mm
3,相较溶媒对照组没有显著性差异(p值=0.139),肿瘤抑制率TGI(%)为33.31%。
图13B结果显示,在实验过程中,各组动物体重均出现增长,表明动物对受试品耐受良好。未对动物产生明显毒性作用,安全性较好。
实施例8.CD73抗体的获得
CD73抗体的获得参见公开申请WO2021032173A1的说明书中实施例1,实施例2和实施例3的记载。
具体而言,使用Harbour H2L2小鼠,将CD73蛋白用作免疫原以产生抗CD73抗体。通过皮下注射和腹膜内注射,与佐剂一起使用(Sigma,S6322)给每只小鼠第一次加强用50μg蛋白质,随后加强用25μg蛋白质。每两周进行1次这种免疫,共6次。最终免疫是通过经腹膜内注射用PBS稀释的免疫原进行。使用ELISA和FACS测试针对人CD73的血清效价。在指定的时间点,对小鼠血清进行采样并滴定以进行ELISA和FACS分析,以测试与CD73蛋白或CD73稳定细胞系的结合。在蛋白质免疫阵列(protein immunization cohort)中观察到良好的血清效价。
使用细胞融合发生器(BEX-LF301),通过基于电场的电穿孔器,将从免疫小鼠中分离的小鼠脾细胞与小鼠骨髓瘤细胞系SP2/0(ATCC,CRL-1581)融合,以获得杂交瘤。在融合后9-14天,在各个孔中筛选人抗CD73抗体。杂交瘤亚克隆后,选择对CD73表现出良好结合活性的单克隆38H6进行测序。鉴定并获得重链可变区和轻链可变区。然后合成重链可变区和轻链可变区,并分别克隆到编码人IgG1恒定区的质粒和编码人Igκ区的质粒中。
使用PEI(Polyscience,24885)将编码目标抗体的重组质粒瞬时共转染到HEK293-6E或HEK293-F细胞培养物中。30μg质粒与120μL PEI在室温下混合并孵育15分钟。接下来,将混合物逐滴加入以1×106细胞/毫升的浓度悬浮于Opti-MEM的293细胞中。转染后,将细胞在37℃、5%CO2的条件下,以120rpm摇床培养。在第6-7天收集的细胞培养上清液用于纯化。
在转染后6-7天通过离心和过滤收获含有目标抗体的上清液。使单克隆抗体通过rProtein A(GE,17-1279-02)预装柱(Bio-Rad,7311550)进行纯化。通过将0.2mL rProtein A树脂装填到一个柱中,然后用10柱体积的ddH2O和10柱体积的PBS冲洗来制备Protein A柱。将细胞培养上清液过柱,然后用10倍柱体积的PBS洗涤。然后用8倍柱体积的洗脱缓冲液(Thermo,21004)洗脱蛋白质,并在洗脱后立即与640μL的中和缓冲液(1M Tris-HCl,pH 9.0;Teknova,T1090)进行混合。在浓缩器(Millipore,UFC903024)中,通过3800rpm(Eppendorf,5810R)4℃离心,将缓冲液与DPBS进行500倍以上的交换,最后浓缩至合适的体积。纯化的抗CD73抗体的浓度通过在280nm(NanoDrop)处的UV吸光度确定。通过SEC-HPLC和SDS-PAGE测定抗体纯度。重组抗体PR000506被成功表达并纯化用于表征。
抗CD73抗体的VH和VL序列通过胚系化回复突变和PTM去除操作进行了进一步优化:
在胚系化程序中,抗体VH或VL序列首先通过例如NCBI/Ig-BLAST的算法比对到最接近的人类胚系序列,然后将框架区的具有不同于胚系序列的残基反转为胚系序列中的对应残基。然后通过成熟的分子生物学技术重组产生胚系化后的由序列变体组成的抗体。
在哺乳动物细胞中表达的蛋白质中广泛观察到翻译后修饰(PTM)。除了抗体中保守的PTM位点(例如IgG1抗体CH2结构域上的N-糖基化保守位点)外,在抗体抗原结合位点(即CDR区)内发生的其他PTM位点可能会降低抗原结合活性或降低化学稳定性。例如,脱酰胺或异构化可以使分子变得不稳定和异 质化。为了减少序列不稳定性,可以通过突变去除PTM基序。查找VH或VL序列的PTM基序,例如异构化基序(例如DG)。然后将“热点”残基(例如,DG基序中的D或G)突变为胚系序列中的对应残基或具有类似生物物理特性的其他残基。然后,通过成熟的分子生物学技术重组产生由PTM去除后的序列变体组成的抗体。
获得了以下表14的抗CD73抗体:
表14:
抗体编号 | PTM去除 | 轻链 | 重链 | VL | VH |
PR000846 | 去除 | 119 | 98 | 94 | 73 |
PR001408 | 去除 | 120 | 103 | 95 | 78 |
PR003836 | 去除 | 121 | 106 | 96 | 81 |
实施例9 CD73/PD-L1双特异性抗体的制备
本实施例利用抗CD73的IgG抗体PR000846、PR001408、PR003836的抗原结合结构域Fab,与抗PD-L1的HCAb抗体PR002082以及亲和力成熟变体PR005263、PR005872、PR005875、PR005878、PR006246、PR006248的抗原结合结构域VH,来构建CD73×PD-L1的双特异性抗体分子。
抗CD73的H2L2抗体的序列编号见表15,抗PD-L1的HCAb抗体的序列编号见表16。
表15:抗CD73的H2L2抗体的序列编号(SEQ ID NO:)
抗体编号 | 轻链 | 重链 | VL | VH |
PR000846 | 119 | 98 | 94 | 73 |
PR001408 | 120 | 103 | 95 | 78 |
PR003836 | 121 | 106 | 96 | 81 |
表16:抗PD-L1的HCAb抗体的序列编号(SEQ ID NO:)
抗体编号 | 重链 | VH |
PR005263 | 107 | 82 |
PR005872 | 111 | 86 |
PR005875 | 112 | 87 |
PR005878 | 113 | 88 |
PR006246 | 115 | 90 |
PR006248 | 117 | 92 |
PR002082 | 105 | 80 |
图14列出了本申请所包含的双特异性结合蛋白的分子结构,每一个结构会在下文进一步描述。在本实施例以及本发明申请的其他部分,当提及分子结构所含多肽链数目的时候,通常是指“不同的多肽链”的数目; 例如常规IgG抗体有两条不同的多肽链,即重链和轻链,尽管IgG抗体分子本身是含有两条相同的重链和两条相同的轻链的四肽链蛋白分子,但是描述其结构特征时特指其两条不同的多肽链。结合价数是指该分子结构中的抗原结合位点的数目,例如常规IgG抗体能同时结合两个相同的抗原分子,其结合价数为二。
表17列出了本发明申请的结构设计中可能用到的连接肽序列。
表17:连接肽序列表
9.1构建IgG_HC-VH四价对称结构的双特异性抗体
利用抗CD73的H2L2抗体和抗PD-L1的HCAb抗体构建IgG-VH四价对称结构的双特异性抗体。IgG_HC-VH四价对称结构(如图14A所示)的结合蛋白包含两条多肽链:多肽链1,也称短链,从氨基末端到羧基末端,其包含VL_A-CL;多肽链2,也称长链,从氨基末端到羧基末端,其包含VH_A-CH1-h-CH2-CH3-L-VH_B。h是IgG抗体的铰链区或衍生序列。在一个实施方案中,多肽链2的CH3与VH_B直接融合联结,即L的长度为0。在另一个实施方案中,多肽链2的CH3经由连接肽L联结到VH_B;L可以是表17中所列的序列。
9.2构建VH-IgG_HC四价对称结构的双特异性抗体
利用抗CD73的H2L2抗体和抗PD-L1的HCAb抗体构建IgG-VH四价对称结构的双特异性抗体。VH-IgG_HC四价对称结构(如图14B所示)的结合蛋白包含两条多肽链:多肽链1,也称短链,从氨基末端到羧基末端,其包含VL_A-CL;多肽链2,也称长链,从氨基末端到羧基末端,其包含VH_B-L-VH_A-CH1-h-CH2-CH3。h是IgG抗体的铰链区或衍生序列。多肽链2的VH_A经由连接肽L联结到VH_B,连接肽L可以是表17中所列序列。在一个实施方案中,多肽链2的VH_A与VH_B直接融合联结,即L的长度为0。
9.3构建Fab(CL)-VH-Fc结构的双特异性抗体分子
利用抗CD73的H2L2抗体和抗PD-L1的HCAb抗体构建IgG-VH四价对称结构的双特异性抗体。Fab(CL)-VH-Fc对称结构(如图14C所示)的结合蛋白包含两条多肽链,多肽链1,也称短链,从氨基末端到羧基末端,其包含VH_A-CH1;多肽链2,也称长链,从氨基末端到羧基末端,其包含VL_A-CL-L1-VH_B-L2-CH2-CH3。多肽链2的连接肽L1和L2可以是表17中所列序列。在一个实施方案中,多肽链2的CL与VH_B直接融合联结,即L1的长度为0。
CD73×PD-L1双特异性抗体为IgG1,具有Fc突变L234A和L235A或者L234A和L235A和G237A(根据EU索引编号)。
本发明制备得到的CD73×PD-L1双特异性抗体总结在表18;所得双抗分子的多肽链的氨基酸序列的序列编号见表19。所得双抗分子的抗原结合结构域的CDR的序列编号见表20。制备的CD73×PD-L1双抗抗体分子样品理化性质分析总结于表21。
表18:利用抗CD73的IgG抗体和抗PD-L1的重链抗体设计的CD73×PD-L1双抗分子
表19:本申请的CD73×PD-L1双抗分子的序列编号
结构编号 | 抗体编号 | 多肽链1 | 多肽链2 |
2 | PR006268 | 125 | 119 |
2 | PR006269 | 126 | 119 |
2 | PR006270 | 127 | 119 |
2 | PR006271 | 128 | 119 |
1 | PR006663 | 129 | 119 |
3 | PR006667 | 132 | 131 |
1 | PR006664 | 130 | 119 |
3 | PR006668 | 133 | 131 |
2 | PR003569 | 122 | 119 |
2 | PR003739 | 123 | 120 |
2 | PR004295 | 124 | 121 |
表20:CD73×PD-L1双抗分子的抗原结合结构域的CDR的序列编号
表21:CD73×PD-L1双抗分子蛋白的表达和物理化学性质
实施例10.CD73×PD-L1双特异性抗体与过表达人PD-L1或人CD73的细胞的结合(FACS)
为了研究CD73×PD-L1双特异性抗体与结合人CD73和PD-L1的活性,采用过表达人CD73或PD-L1的CHO-K1细胞株(CHO-K1-hCD73,CHO-K1-hPD-L1)进行细胞水平的结合实验。简言之,消化CHO-K1-hCD73和CHO-K1-hPD-L1细胞,并用F-12K完全培养基重悬,将细胞密度调整为1×10
6细胞/mL。以100μL细胞/孔接种于96孔V底板(Corning,#3894),随后加入100μL/孔,于500g 4℃离心5分钟,弃上 清。稀释抗体至最高终浓度50nM,3倍稀释,共8个浓度。取100μL稀释后的抗体加入到细胞中,将细胞放置于4℃,避光孵育1小时。之后,加入100μL/孔预冷PBS漂洗细胞两次,于500g 4℃离心5分钟,弃上清。再加入100μL/孔荧光二抗(山羊抗人IgG(H+L)第二抗体,Alexa
488 conjugate,Invitrogen,#A11013,1:1000),4℃,避光孵育30分钟。用200μL/孔预冷PBS洗涤细胞两次,于500g 4℃离心5分钟,弃上清。最后,200μL/孔预冷PBS重悬细胞,使用BD FACS CANTOII读取荧光发光信号值。
图15结果显示,本申请的抗CD73抗体PR000846和PR001408能够特异性结合过表达人CD73的CHO-K1细胞(图15A);本申请的CD73×PD-L1双特异性抗体(PR003569和PR003739)能够结合过表达人CD73的CHO-K1细胞(图15A);本申请的抗CD73抗体PR003836能够特异性结合过表达人CD73的CHO-K1细胞(图15B);本申请的CD73×PD-L1双特异性抗体PR004295能够结合过表达人CD73的CHO-K1细胞(图15B);
本申请的抗CD73抗体PR000846能够特异性结合过表达人CD73的CHO-K1细胞(图15C、图15D);本申请的CD73×PD-L1双特异性抗体(PR006268、PR006269、PR006270、PR006271、PR006661、PR006662、PR006663、PR006664、PR006667、PR006668)能够结合过表达人CD73的CHO-K1细胞(图15C、图15D);本申请的抗PD-L1抗体PR002082能够结合过表达人PD-L1的CHO-K1细胞(图15E);本申请的CD73×PD-L1双特异性抗体PR003569、PR003739和PR004295能够结合过表达人PD-L1的CHO-K1细胞(图15E、图15F)。
本申请的抗CD73抗体,抗PD-L1抗体以及CD73×PD-L1双特异性抗体的EC50值在0.3418nM-2.929nM的范围内。图15C中起始浓度为50nM,3倍梯度稀释,共八个浓度;图15D中起始浓度为100nM,3倍梯度稀释,共八个浓度。
实施例11.CD73×PD-L1双特异性抗体抑制CD73的酶活性
利用孔雀绿法测定抗体抑制可溶性重组CD73的酶活性,首先在384孔板(Corning,#3799)中加入12.5μL 1nM重组CD73蛋白和12.5μL 1nM的抗体(实验缓冲液为25mM Tris pH 7.5,5mM MgCl
2,0.005%吐温-20),室温孵育1小时。加入25μL AMP(最高浓度200μM,用实验缓冲液2倍稀释至8个浓度),室温孵育15分钟。检测每个孔中无机磷酸盐的浓度,无机磷酸盐浓度的测定按照供应商的说明书操作。测定结束后用Molecular Devices(SPECTRAMax plus384)读板机记录620nm光吸收值。实验结果用GraphPad Prism 8.0分析作图。
图16结果显示,本申请的CD73×PD-L1双特异性抗体PR003569、PR003739、PR006268、PR006269、PR006270、PR006271、PR006663、PR006664、PR006667、PR006668能够非竞争性的抑制CD73蛋白酶活性,和亲本单克隆抗体PR000846活性相当。
实施例12.利用报告基因细胞系检测CD73×PD-L1双特异性抗体对PD-1信号通路的抑制作用
将表达PD-L1和OS8(CD3单链抗体跨膜蛋白)的HEK293T(eBioscience)细胞铺到96孔板上,细胞量为1.25×10
4/孔,100μL/孔。在37℃5%CO
2环境下孵育过夜。加入50μL/孔的待测抗原结合蛋白稀释液,起始浓度为100nM,5倍浓度稀释,hlgG1为对照组。加入5×10
4/孔的可持续表达PD-1和NFAT-荧光素酶报告基因的Jurkat报告细胞(UPharm)50μL/孔。在37℃5%CO
2环境下培养6小时。加入ONE-GloT荧光素酶试剂(Promega,#E6110),室温孵育5分钟,酶标仪检测发光值。
图17结果显示,利用报告基因细胞系检测本申请的CD73×PD-L1双特异性抗体PR003569,PR003739以及PR004295对PD-1信号通路具有抑制作用。
实施例13.CD73×PD-L1双特异性抗体在混合淋巴细胞反应(MLR)试验中激活T细胞
购买AllCells PBMC细胞,分离CD14+单核细胞,加入重组人源白介素4(IL-4)(R&D,#204-GMP)和人源GM-CSF(R&D,#215-GM/CF)诱导6天后,获得未成熟的人树突状细胞(iDC细胞)。继续加入1μg/mL的脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS;Sigma,#L2630),诱导24小时,获得成熟的树突状细胞(mDC细胞)。采用Pan-T细胞分离试剂盒(Miltenyibiotec,#130-096-535)从第二供体PBMC细胞中分离得到T淋巴 细胞。将1×10
5/孔的T淋巴细胞和1×10
4/孔的mDC细胞按10:1比例接种至96孔板,加入稀释的抗原结合蛋白和及阴阳性对照抗体。在37℃5%CO
2培养箱孵育5天。收集第三天和第五天的上清液,采用ELISA试剂盒,分别检测IL-2(ThermoFisher,#88-7025-88)和IFN-γ(ThermoFisher,#88-7316-88)的分泌量。
图18结果显示,MLR法体外检测本申请的CD73×PD-L1双特异性抗体PR003569,PR003739和PR004295对T细胞具有激活作用。与人同种型IgG相比,单独的抗PD-L1单抗PR002082相比,以及与单独的抗CD73单抗PR000846,PR001408和PR003836相比,以及与抗PD-L1单抗PR002082与抗CD73的单抗PR000846的组合相比,以及与抗PD-L1单抗PR002082与抗CD73的单抗PR003836的组合相比,CD73×PD-L1双特异性抗体PR003569,PR003739和PR004295在10nM的浓度下对于激活T细胞分泌IL-2更显著有效。而且基于CD73×PD-L1双特异性抗体PR003569,PR003739和PR004295与抗PD-L1单抗PR002082与抗CD73的单抗PR000846的组合相比,以及与抗PD-L1单抗PR002082与抗CD73的单抗PR003836的组合相比更显著的效果,可以认为CD73×PD-L1双特异性抗体PR003569,PR003739和PR004295具有协同效果。
类似地,与人同种型IgG相比,与单独的抗PD-L1单抗PR002082相比,以及与单独的抗CD73单抗PR000846,PR001408和PR003836相比,以及与抗PD-L1单抗PR002082与抗CD73的单抗PR000846的组合相比,以及与抗PD-L1单抗PR002082与抗CD73的单抗PR003836的组合相比,CD73×PD-L1双特异性抗体PR003569,PR003739和PR004295在10nM的浓度下对于激活T细胞分泌IFN-γ显著更有效。而且基于CD73×PD-L1双特异性抗体PR003569,PR003739和PR004295与抗PD-L1单抗PR002082与抗CD73的单抗PR000846的组合相比,以及与抗PD-L1单抗PR002082与抗CD73的单抗PR003836的组合相比更显著的效果,可以认为CD73×PD-L1双特异性抗体PR003569,PR003739和PR004295具有协同效果。
Claims (69)
- 特异性结合PD-L1和/或其片段的分离的抗原结合蛋白,其包含抗体重链可变区VH,所述VH包含以下的互补决定区或其突变体:SEQ ID NO:9的氨基酸序列所示的HCDR1;SEQ ID NO:23的氨基酸序列所示的HCDR2;和/或SEQ ID NO:36的氨基酸序列所示的HCDR3。
- 根据权利要求1所述的分离的抗原结合蛋白,其中,所述突变体为在所述VH的HCDR1、HCDR2、HCDR3的氨基酸序列上分别具有1、2、3或4个氨基酸的***、缺失或取代,优选地,所述HCDR1的氨基酸序列为GFX 1FSX 2Y,所述HCDR2的氨基酸序列为X 3YX 4GX 5X 6,所述HCDR3的氨基酸序列为NRAX 7FGVX 8PDX 9SDI,其中,X 1、X 2、X 3、X 4、X 5、X 6、X 7、X 8或X 9为选自N、T、D、S、W、R、K、E、I、A、V和L中的任一种;更优选地,X 1为T、D或N,X 2为N或S,X 3为W或R,X 4为D或T,X 5为T或S,X 6为K、R或E,X 7为I或L,X 8为V或I,和/或X 9为A或D。
- 根据权利要求1或2所述的分离的抗原结合蛋白,其中,所述HCDR1的突变体具有SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14中任一项所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求1或2所述的分离的抗原结合蛋白,其中,所述HCDR2的突变体具有SEQ ID NO:24或SEQ ID NO:27所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求1或2所述的分离的抗原结合蛋白,其中,所述HCDR3的突变体具有SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40和SEQ ID NO:41中任一项所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求1所述的分离的抗原结合蛋白,其中,所述VH包含以下的互补决定区或其突变体:SEQ ID NO:9-11和SEQ ID NO:13-14中任一项的氨基酸序列所示的HCDR1;SEQ ID NO:23-24和SEQ ID NO:27中任一项的氨基酸序列所示的HCDR2;和/或SEQ ID NO:36和SEQ ID NO:39-41中任一项的氨基酸序列所示的HCDR3。
- 根据权利要求1或2所述的分离的抗原结合蛋白,其中,所述VH包含以下互补决定区:分别如SEQ ID NO:9,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:36所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;或分别如SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:36所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;或分别如SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:24和SEQ ID NO:36所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;或分别如SEQ ID NO:11,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:36所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;或分别如SEQ ID NO:13,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:36所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;或分别如SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:39所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;或分别如SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:40所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;或分别如SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:41所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;或分别如SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:36所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;或分别如SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:39所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;或分别如SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:40所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;或分别如SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:41所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;或分别如SEQ ID NO:14,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:36所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;或分别如SEQ ID NO:14,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:39所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;或分别如SEQ ID NO:14,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:40所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;或分别如SEQ ID NO:14,SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:41所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3。
- 根据权利要求1或2所述的分离的抗原结合蛋白,其中,所述VH还包含重链可变区框架区VH FWR,所述VH FWR包含VH FWR1,VH FWR2,VH FWR3和VH FWR4,所述VH FWR1具有SEQ ID NO:3-5中任一项所示的氨基酸序列,所述VH FWR2具有SEQ ID NO:17或SEQ ID NO:20所示的氨基酸序列,所述VH FWR3具有SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:31所示的氨基酸序列,以及所述VH FWR4具有SEQ ID NO:43所示的氨基酸序列。
- 根据权利要求1或2所述的分离的抗原结合蛋白,其中,所述VH包含SEQ ID NO:74-77,SEQ ID NO:79-80和SEQ ID NO:82-92中任一项所示的氨基酸序列或与其具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性的氨基酸序列。
- 根据权利要求1或2所述的分离的抗原结合蛋白,其还包含Fc区,或者与免疫球蛋白的Fc区等同的区域,优选地,所述Fc区为人Fc,更优选地,所述人Fc为人IgG1 Fc。
- 根据权利要求10所述的分离的抗原结合蛋白,其中,所述Fc包含L234A、L235A和P329G突变,或L234A和L235A突变,或者包含S298A,E333A和K334A中的一个、两个或三个突变,更优选地包含S298A,E333A和K334A突变。
- 根据权利要求1或2所述的分离的抗原结合蛋白,其包含氨基酸序列与SEQ ID NO:99、100、101、102、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116或117具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性的重链。
- 根据权利要求1或2所述的分离的抗原结合蛋白,其是HCAb形式或纳米抗体形式的抗原结合片段。
- 分离的核酸,其编码根据权利要求1-13中任一项所述的分离的抗原结合蛋白。
- 表达载体,其包含根据权利要求14所述的分离的核酸。
- 宿主细胞,其包含根据权利要求14所述的分离的核酸,或根据权利要求15所述的表达载体。
- 抗体药物偶联物,其包含:根据权利要求1-13中任一项所述的分离的抗原结合蛋白;和,与所述抗原结合蛋白共价连接的药物。
- 根据权利要求17所述的抗体药物偶联物,所述药物选自化学治疗剂、放射治疗剂、免疫抑制剂和细胞毒性药物。
- 嵌合抗原受体,其包括胞外抗原结合结构域、跨膜结构域和胞内信号传导结构域,其中所述胞外抗原结合结构域包含权利要求1-13中任一项所述的分离的抗原结合蛋白。
- 修饰的免疫细胞,其包含根据权利要求19所述的嵌合抗原受体。
- 多特异性抗体,其包含两个或两个以上的抗原结合结构域,其中一个抗原结合结构域包含根据权利要求1-13中任一项所述的分离的抗原结合蛋白。
- 药物组合物,其包含:根据权利要求1-13中任一项所述的分离的抗原结合蛋白,根据权利要求17或18所述的抗体药物偶联物,根据权利要求19所述的嵌合抗原受体,根据权利要求20所述的修饰的免疫细胞或根据权利要求21所述的多特异性抗体;以及,药学上可接受的载体。
- 根据权利要求22所述的药物组合物,还包含选自化学治疗剂、放射治疗剂、免疫抑制剂和细胞毒性药物的治疗剂。
- 根据权利要求1-13中任一项所述的分离的抗原结合蛋白、根据权利要求14所述的分离的核酸、根据权利要求17或18所述的抗体药物偶联物、根据权利要求19所述的嵌合抗原受体、根据权利要求20所述的修饰的免疫细胞或根据权利要求21所述的多特异性抗体、根据权利要求22或23所述的药物组合物在制备用于预防、治疗和/或诊断免疫性疾病,急性和慢性炎性疾病,以及肿瘤疾病的药物中的应用。
- 根据权利要求24所述的应用,所述肿瘤为乳腺癌、肾细胞癌、黑色素瘤、结肠癌,以及B细胞淋巴瘤,黑色素瘤,头颈癌,膀胱癌,胃癌,卵巢癌,恶性肉瘤,尿路上皮癌,肝癌,食道癌,胃食管交界癌,鼻咽癌,小细胞肺癌,***,子宫内膜癌,胰腺癌,***癌,胶质瘤,非小细胞肺癌,急性粒细胞白血病,霍奇金淋巴瘤,皮肤鳞状细胞癌,局部晚期和转移性恶性肿瘤中的一种或多种;所述炎性疾病为特应性皮炎或溃疡性结肠炎中的一种或多种;所述免疫性疾病为移植物抗宿主病、类风湿性关节炎、***性红斑狼疮或哮喘中的一种或多种。
- 用于检测样品中的PD-L1的方法,所述方法包括用根据权利要求1-13中任一项所述的分离的抗原结合蛋白检测样品中的PD-L1的步骤,所述样品为全血,红血细胞浓缩物,血小板浓缩物,白细胞浓缩物,组织,骨髓吸出物,血浆,血清,脑脊液,粪便,尿液,培养的细胞,唾液,口腔分泌物和/或鼻腔分泌物;优选地,所述方法为非诊断目的的。
- 特异性结合蛋白,其包含至少两个结构域,并且能够结合PD-L1或其片段,和/或CD73或其片段。
- 根据权利要求27所述的特异性结合蛋白,其包含第一结构域和第二结构域,所述第一结构域结合CD73或其片段,并且所述第二结构域结合PD-L1或其片段,所述第一结构域与所述第二结构域连接形成双特异性结合蛋白。
- 根据权利要求28所述的特异性结合蛋白,其中,所述第一结构域为CD73抗体或其抗原结合片段,所述第二结构域为PD-L1抗体或其抗原结合片段,所述第一结构域和/或所述第二结构域选自IgG、Fab、Fab’、F(ab’) 2、Fv、scFv、VH、或者HCAb的形式,优选地,所述Fab、Fab’、F(ab’) 2、Fv、scFv、VH的数量为一个或多个。
- 根据权利要求28所述的特异性结合蛋白,其中,所述第一结构域为IgG的形式,优选地,所述IgG的重链恒定区为人重链恒定区,更优选为人IgG1、人IgG2、人IgG3或人IgG4重链恒定区。
- 根据权利要求30所述的特异性结合蛋白,其中,IgG包含L234A、L235A和P329G中的一个、两个或三个突变,更优选地包含L234A和L235A的突变;或者包含S298A,E333A和K334A中的一个、两个或三个突变,更优选地包含S298A,E333A和K334A突变;优选地,IgG的Fc为人IgG1的Fc。
- 根据权利要求28所述的特异性结合蛋白,其中,所述第一结构域为Fab的形式,更优选地,所述第一结构域包括2个Fab。
- 根据权利要求28所述的特异性结合蛋白,其中,所述第二结构域为VH,优选地,所述VH为人VH,更优选地,所述第二结构域具有两个VH。
- 根据权利要求28所述的特异性结合蛋白,其中,所述第二结构域为HCAb形式,优选地,所述HCAb的恒定区包含L234A、L235A和P329G突变,或L234A和L235A突变,或者包含S298A,E333A和K334A中的一个、两个或三个突变,更优选地包含S298A,E333A和K334A突变。
- 根据权利要求28所述的特异性结合蛋白,其中,所述第一结构域与所述第二结构域直接连接或经连接肽L连接形成双特异性结合蛋白,所述第二结构域连接在所述第一结构域的C末端或N末端。
- 根据权利要求35所述的特异性结合蛋白,其中,所述双特异性结合蛋白包含短链和长链,所述短链具有N’-VL 1-CL 1-C’所示的结构;所述长链具有N’-VH 1-CH 1-h-CH 2-CH 3-L-VH 2-C’所示的结构;或者,所述短链具有N’-VL 1-CL 1-C’所示的结构;所述长链具有N’-VH 2-L-VH 1-CH 1-h-CH 2-CH 3-C’所示的结构;或者,所述短链具有N’-VH 1-CH 1-C’所示的结构;所述长链具有N’-VL 1-CL 1-L-VH 2-CH 2-CH 3-C’所示的结构,其中,所述VL 1和VH 1分别为第一结构域的VL和VH,所述VH 2为第二结构域的VH,所述h为铰链区,所述的L为连接肽,所述CL 1是第一结构域的CL。
- 根据权利要求35或36所述的特异性结合蛋白,其中,所述L为长度为0-30个氨基酸长度的肽,优选地,其氨基酸序列包括SEQ ID NO:136-157任一所示。
- 根据权利要求35或36所述的特异性结合蛋白,其中,所述长链的CH 3经由连接肽L连接到VH 2;L为0-30个氨基酸的多肽,优选地,L包括SEQ ID NO.136-157中任一项所示的氨基酸序列;或者长链的CH3与VH 2直接连接。
- 根据权利要求35或36所述的特异性结合蛋白,其中,所述长链的VH 1经由连接肽L连接到VH 2;L为长度为0-30个氨基酸长度的肽,优选地,L包括SEQ ID NO.136-157中任一项所示的氨基酸序列;或者所述长链的VH 1与VH 2直接连接。
- 根据权利要求35或36所述的特异性结合蛋白,其中,所述长链的VH 2经由连接肽L连接到CL 1;L是如SEQ ID NO.136-157中任一项所示的氨基酸序列;或者所述长链的VH 2与CL 1直接连接。
- 根据权利要求28所述的特异性结合蛋白,其中,所述第一结构域包含轻链可变区VL和重链可变区VH,所述VL包含选自如下的互补决定区:SEQ ID NO:51,SEQ ID NO:52和SEQ ID NO:53中任一项的氨基酸序列所示的LCDR1;SEQ ID NO:57,SEQ ID NO:58和SEQ ID NO:59中任一项的氨基酸序列所示的LCDR2;和/或SEQ ID NO:65,SEQ ID NO:66和SEQ ID NO:67中任一项的氨基酸序列所示的LCDR3;所述VH包含选自如下的互补决定区:SEQ ID NO:8,SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:10中任一项的氨基酸序列所示的HCDR1;SEQ ID NO:22,SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26中任一项的氨基酸序列所示的HCDR2;和/或SEQ ID NO:35,SEQ ID NO:37和SEQ ID NO:38中任一项的氨基酸序列所示的HCDR3。
- 根据权利要求28所述的特异性结合蛋白,其中,所述第一结构域包含轻链可变区VL和重链可变区VH,所述VL和VH包含选自如下的互补决定区:分别如SEQ ID NO:51,SEQ ID NO:57和SEQ ID NO:65所示的LCDR1,LCDR2和LCDR3;和,分别如SEQ ID NO:8,SEQ ID NO:22和SEQ ID NO:35所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;分别如SEQ ID NO:52,SEQ ID NO:58和SEQ ID NO:66所示的LCDR1,LCDR2和LCDR3;和,分别如SEQ ID NO:12,SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:37所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3;分别如SEQ ID NO:53,SEQ ID NO:59和SEQ ID NO:67所示的LCDR1,LCDR2和LCDR3;和,分别如SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:26和SEQ ID NO:38所示的HCDR1,HCDR2和HCDR3。
- 根据权利要求28所述的特异性结合蛋白,其中,所述第一结构域包含VL和VH,所述VL的氨基酸序列与SEQ ID NO:94,SEQ ID NO:95或SEQ ID NO:96具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性;所述VH的氨基酸序列与SEQ ID NO:73,SEQ ID NO:78或SEQ ID NO:81具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性。
- 根据权利要求28所述的特异性结合蛋白,其中,所述第一结构域包含VL和VH,所述VL和VH的氨基酸序列分别如SEQ ID NO:94和SEQ ID NO:73所示;或分别如SEQ ID NO:95和SEQ ID NO:78所示;或分别如SEQ ID NO:96和SEQ ID NO:81所示。
- 根据权利要求28所述的特异性结合蛋白,其中,所述第一结构域包含氨基酸序列与SEQ ID NO:119,SEQ ID NO:120或SEQ ID NO:121具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性的轻链;以及氨基酸序列与SEQ ID NO:98,SEQ ID NO:103或SEQ ID NO:106具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性的重链。
- 根据权利要求28所述的特异性结合蛋白,其中,所述第一结构域包含:SEQ ID NO:119所示的轻链和SEQ ID NO:98所示的重链;或SEQ ID NO:120所示的轻链和SEQ ID NO:103所示的重链;或SEQ ID NO:121所示的轻链和SEQ ID NO:106所示的重链。
- 根据权利要求28所述的特异性结合蛋白,其中,所述第二结构域为权利要求1-13任一项的分离的抗原结合蛋白。
- 根据权利要求28所述的特异性结合蛋白,其中,所述特异性结合蛋白的长链包含与SEQ ID NO:122、123、124、125、126、127、128、129、130、132或133具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性的氨基酸序列;以及所述特异性结合蛋白的短链包含与SEQ ID NO:119、120、121或131具有至少80%、85%、88%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或100%一致性的氨基酸序列。
- 根据权利要求28所述的特异性结合蛋白,其中,所述特异性结合蛋白具有:SEQ ID NO:122所示的长链以及SEQ ID NO:119所示的短链;或SEQ ID NO:123所示的长链以及SEQ ID NO:120所示的短链;或SEQ ID NO:124所示的长链以及SEQ ID NO:121所示的短链;或SEQ ID NO:125所示的长链以及SEQ ID NO:119所示的短链;或SEQ ID NO:126所示的长链以及SEQ ID NO:119所示的短链;或SEQ ID NO:127所示的长链以及SEQ ID NO:119所示的短链;或SEQ ID NO:128所示的长链以及SEQ ID NO:119所示的短链;或SEQ ID NO:129所示的长链以及SEQ ID NO:119所示的短链;或SEQ ID NO:132所示的长链以及SEQ ID NO:131所示的短链;或SEQ ID NO:130所示的长链以及SEQ ID NO:119所示的短链;或SEQ ID NO:133所示的长链以及SEQ ID NO:131所示的短链。
- 根据权利要求28所述的特异性结合蛋白,其中,所述双特异性结合蛋白为包含两条第一多肽链以及两条第二多肽链形成二价结构或四价对称结构。
- 分离的核酸,其编码根据权利要求28-50中任一项所述的特异性结合蛋白或其片段。
- 表达载体,其包含根据权利要求51所述的分离的核酸。
- 宿主细胞,其包含根据权利要求51所述的分离的核酸,或根据权利要求52所述的表达载体。
- 抗体药物偶联物,其包含:根据权利要求28-50中任一项所述的分离的抗原结合蛋白;和,与所述抗原结合蛋白共价连接的药物。
- 根据权利要求54所述的抗体药物偶联物,所述药物选自化学治疗剂、放射治疗剂、免疫抑制剂和细胞毒性药物。
- 药物组合物,其包含:根据权利要求28-50中任一项所述的特异性结合蛋白,或根据权利要求54或55所述的抗体药物偶联物;以及,药学上可接受的载体。
- 根据权利要求56所述的药物组合物,其还包含选自化学治疗剂、放射治疗剂、免疫抑制剂和细胞毒性药物的治疗剂。
- 根据权利要求28-50中任一项所述的特异性结合蛋白、根据权利要求51所述的分离的核酸、根据权利要求54或55所述的抗体药物偶联物或根据权利要求56或57所述的药物组合物在制备用于预防、治疗和/或诊断免疫性疾病,急性和慢性炎性疾病,以及肿瘤疾病的药物中的应用。
- 根据权利要求58所述的应用,所述肿瘤为乳腺癌、肾细胞癌、黑色素瘤、结肠癌,以及B细胞淋巴瘤,黑色素瘤,头颈癌,膀胱癌,胃癌,卵巢癌,恶性肉瘤,尿路上皮癌,肝癌,食道癌,胃食管交界癌,鼻咽癌,小细胞肺癌,***,子宫内膜癌,胰腺癌,***癌,胶质瘤,非小细胞肺癌,急性粒细胞白血病,霍奇金淋巴瘤,皮肤鳞状细胞癌,局部晚期和转移性恶性肿瘤中的一种或多种;所述炎性疾病为特应性皮炎或溃疡性结肠炎中的一种或多种;所述免疫性疾病为移植物抗宿主病、类风湿性关节炎、***性红斑狼疮或哮喘中的一种或多种。
- 用于检测样品中的PD-L1和CD73的方法,所述方法包括用根据权利要求28-50中任一项所述的特异性结合蛋白检测样品中的PD-L1和CD73的步骤,所述样品为全血,红血细胞浓缩物,血小板浓缩物,白细胞浓缩物,组织,骨髓吸出物,血浆,血清,脑脊液,粪便,尿液,培养的细胞,唾液,口腔分泌物和/或鼻腔分泌物。
- 套装药盒,其包括一个或多个药盒,所述药盒包含根据权利要求1-13中任一项所述的抗原结合蛋白, 根据权利要求17或18所述的抗体药物偶联物,或根据权利要求22或23所述的药物组合物。
- 根据权利要求61所述的套装药盒,所述套装药盒包括第一药盒和第二药盒,其中,所述第一药盒包括根据权利要求1-13中任一项所述的抗原结合蛋白,根据权利要求17或18所述的抗体药物偶联物,或根据权利要求22或23所述的药物组合物;其中,所述第二药盒包含选自化学治疗剂、放射治疗剂、免疫抑制剂和细胞毒性药物的治疗剂。
- 套装药盒,其包括一个或多个药盒,所述药盒包含根据权利要求28-50中任一项所述的特异性结合蛋白,根据权利要求54或55所述的抗体药物偶联物,或根据权利要求56或57所述的药物组合物。
- 根据权利要求63所述的套装药盒,所述套装药盒包括第一药盒和第二药盒,其中,所述第一药盒包括根据权利要求28-50中任一项所述的抗原结合蛋白,根据权利要求54或55所述的抗体药物偶联物,或根据权利要求56或57所述的药物组合物;其中,所述第二药盒包含选自化学治疗剂、放射治疗剂、免疫抑制剂和细胞毒性药物的治疗剂。
- 给药装置,其包含根据权利要求1-13中任一项所述的抗原结合蛋白,根据权利要求17或18所述的抗体药物偶联物,或根据权利要求22或23所述的药物组合物,优选地,所述给药装置是预填充注射器。
- 给药装置,其包含根据权利要求28-50中任一项所述的特异性结合蛋白,根据权利要求54或55所述的抗体药物偶联物,或根据权利要求56或57所述的药物组合物,优选地,所述给药装置是预填充注射器。
- 预防、治疗和/或诊断肿瘤疾病、急性和慢性炎性疾病和/或免疫性疾病的方法,其包括向受试者施用治疗有效量的根据权利要求1-13中任一项所述的抗原结合蛋白,根据权利要求17或18所述的抗体药物偶联物,或根据权利要求22或23所述的药物组合物。
- 预防、治疗和/或诊断肿瘤疾病、急性和慢性炎性疾病和/或免疫性疾病的方法,其包括向受试者施用治疗有效量的根据权利要求28-50中任一项所述的抗原结合蛋白,根据权利要求54或55所述的抗体药物偶联物,或根据权利要求56或57所述的药物组合物。
- 根据权利要求67或68所述的方法,其中所述肿瘤为乳腺癌、肾细胞癌、黑色素瘤、结肠癌,以及B细胞淋巴瘤,黑色素瘤,头颈癌,膀胱癌,胃癌,卵巢癌,恶性肉瘤,尿路上皮癌,肝癌,食道癌,胃食管交界癌,鼻咽癌,小细胞肺癌,***,子宫内膜癌,胰腺癌,***癌,胶质瘤,非小细胞肺癌,急性粒细胞白血病,霍奇金淋巴瘤,皮肤鳞状细胞癌,局部晚期和转移性恶性肿瘤中的一种或多种;所述炎性疾病为特应性皮炎或溃疡性结肠炎中的一种或多种;所述免疫性疾病为移植物抗宿主病、类风湿性关节炎、***性红斑狼疮或哮喘中的一种或多种。
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