CN114774451A - 一种重组大肠杆菌及其生产酪醇、羟基酪醇或红景天苷的方法 - Google Patents

一种重组大肠杆菌及其生产酪醇、羟基酪醇或红景天苷的方法 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种重组大肠杆菌及其生产酪醇、羟基酪醇或红景天苷的方法,所述重组大肠杆菌为在宿主菌中表达了酪醇合成途径酶融合体来生产酪醇,再引入4‑羟基苯乙酸3‑羟化酶生产羟基酪醇,引入糖基转移酶生产红景天苷;Spy(或Snoop)环化还可通过热处理以增加细胞的通透性,避免细胞的传质限制。通过模块共培养因将长代谢途径分割成多个途径、并可利用不同宿主细胞进行表达,减轻了对宿主细胞的代谢负担;而且不同途径可选用各自最合适的宿主细胞进行表达;可通过调整模块菌的比例来控制模块的适配性;即插即用,容易组装成不同途径以合成不同产物。还能避免代谢中间物和目标产物毒性的影响。

Description

一种重组大肠杆菌及其生产酪醇、羟基酪醇或红景天苷的 方法
技术领域
本发明属于生物工程技术领域,具体涉及一种重组大肠杆菌及其生产酪醇、羟基酪醇或红景天苷的方法。
背景技术
酪醇,对羟基苯乙醇,是天然酚类抗氧化剂。它具有抗氧化、抗疲劳、抗缺氧、抗应激、抗寒冷、抗敏、镇静、预防心血管疾病、预防高血压、预防骨质减少、预防色素沉积等生物活性。它又是合成心血管药物倍他洛尔和美托尔的前体。酪醇还可作为合成羟基酪醇盒红景天苷的前体。羟基酪醇具有防治、红景天苷具有。所以,酪醇作为精细化学品和制药工业中的生物活性物,备受研究者的关注。酪醇最初来源于橄榄油,但在橄榄油中浓度低(25mg/kg)等问题,提取难以实现工业化。目前化学合成是其主要的生产方法。但化学合成过程繁琐、环境污染重,生物合成却是其最有效的替代方法。
羟基酪醇,3,4-二羟基苯乙醇,是酪醇的羟化产物。具有比酪醇更强的抗氧化活性。因其高抗氧化活性对人体健康大有益处,具有癌症癌症化学预防、抗动脉粥样硬化、抑制DNA氧化损伤、保护皮肤光损伤、抗炎和抗微生物等活性。
红景天苷是红景天的主要活性物质、酪醇的糖基化产物。,红景天苷不但有抗缺氧、抗寒冷、抗疲劳、抗微波辐射、抗病毒、抗肿瘤等明显功能,而且还具有增强注意力、提高工作效率、延缓机体衰老、防止老年疾病等功效,尤其在军事医学、航天医学、运动医学和保健医学等方面具有十分重要的应用价值,是一种极具开发前景的环境适应药物,近年来备受关注。
多项发明专利构建了产酪醇的重组大肠杆菌(ZL201310133238.7、ZL20140115011.4、ZL201710091999.9、ZL201711054680.5、ZL201811234765.6、CN202110292484.1和ZL201910754497.9)和重组酿酒酵母(ZL201810601213.8、ZL201711479443.3和CN201910911304.6。上述重组微生物通过表达-酮酸脱羧酶(或芳香醛合酶)和醇脱氢酶,实现了酪醇的从头合成。一些发明专利(ZLZL201910882020.9、CN202010582557.6、CN202110292118.6、CN202110546281.0、CN202110176003.0)公开了一些生产羟基酪醇的重组微生物及其构建方法。一些发明专利(ZL201410115011.4、ZL201610395330.4、ZL201610408741.2、ZL201610361309.2、ZL201711479443.3、CN201811116170.0、CN201910911304.6、CN202011466963.2、CN202111307645.6)公开了一些生产红景天苷的重组微生物及其构建方法。
上述重组微生物的生产水平还难以达到产业化水平,尚需提高。
发明内容
本发明的目的在于提供一种高效合成酪醇、羟基酪醇或红景天苷的新菌种,为酪醇、羟基酪醇或红景天苷的生产提供一种新方法。
本发明所采取的技术方案是:
本发明的第一方面,提供一种基因表达模块,所述基因为:酪醇合成途径酶融合体基因、4-羟基苯乙酸3-羟化酶基因、糖基转移酶基因中的至少一种,所述酪醇合成途径酶融合体、4-羟基苯乙酸3-羟化酶和糖基转移酶均为Spy/Snoop环化。
在本发明的一些实施方式中,所述酪醇合成途径酶融合体基因包括:芳香醛合成酶AAS(Uniprot Q06086)或α-酮酸脱羧酶基因,以及醇脱氢酶基因。
在本发明的一些实施方式中,所述α-酮酸脱羧酶基因为ipdC(Uniprot O07043)、ARO10(Uniprot Q06408)、KDC4(Uniprot C4R7I0)或PDC(Uniprot C5MDS4)。所述醇脱氢酶基因为yahK(Uniprot P75691)、ADH6(Uniprot Q04894)、ahr(Uniprot A0A024L8S1)或adh(Uniprot A0A7M3GDV1)。
在本发明的一些实施方式中,所述4-羟基苯乙酸3-羟化酶基因为EchpaBC(GenBank ACT46003.1、ACT46002.1)、hpaB-hpaC杂合体或sam5(GenBank ABC88666.1);所述hpaB-hpaC杂合体不限定物种来源。
在本发明的一些实施方式中,所述糖基转移酶基因为RrUGT33(UniprotA0A2I6B3R9)、AtUGT85A1(Uniprot W8Q3R5)、RsUGT73B6(Uniprot Q6QDB6)、RsAS(UniProtKB:Q9AR73)、GeGT1(GeneBank MW015078)或VvGT2(Uniprot G9FKG7)。
在本发明的一些实施方式中,所述Spy为SpyTag/SpyCatcher;所述Snoop为SnoopTag/SnoopCatcher。
SpyTag、SnoopTag、SpyCatcher、SnoopCatcher的氨基酸序列如下:
SpyTag:AHIVMVDAYKPTK;
SnoopTag:KLGDIEFIKVNK;
SpyCatcher:GDSATHIKFSKRDEDGKELAGATMELRDSSGKTISTWISDGQVKDFYLYPGKYTFVETAAPDGYEVATAITFTVNEQGQVTVNG;
SnoopCatcher:KPLRGAVFSLQKQHPDYPDIYGAIDQNGTYQNVRTGEDGKLTFKNLSDGKYRLFENSEPAGYKPVQNKPIVAFQIVNGEVRDVTSIVPQDIPATYEFTNGKHYITNEPIPPK。
本发明的第二方面,提供一种重组载体,包含本发明第一方面所述基因表达模块。
在本发明的一些实施方式中,所述重组载体的出发载体为pZBKBP、pZEABP、pZACBP、pZSABP或任何大肠杆菌表达载体。
本发明的第三方面,提供一种重组菌,包含本发明第一方面所述的基因表达模块或本发明第二方面所述的重组载体。
在本发明的一些实施方式中,所述重组菌为以下任一种:
(a)将本发明第一方面所述的酪醇合成途径酶融合体基因导入宿主菌中得重组菌1;
(b)将本发明第一方面所述的4-羟基苯乙酸3-羟化酶导入宿主菌中得重组菌2;
(c)将本发明第一方面所述的糖基转移酶基因导入宿主菌中得重组菌3。
在本发明的一些实施方式中,所述宿主菌是普通大肠杆菌,如K12衍生菌(BW25113、MG1665、W3110、DH10B、BW2952、MDS42及其衍生菌)、BL21(DE3)及其衍生菌、BREL606、W、DH1等,也可以是产酪氨酸的大肠杆菌,优选是产酪氨酸的大肠杆菌。
在本发明的一些实施方式,本发明第一方面所述的基因表达模块通过重组载体导入宿主菌中。
本发明的第四方面,提供本发明第一方面所述的基因表达模块或本发明第二方面所述的重组载体或本发明第三方面所述的重组菌在制备酪醇、羟基酪醇或红景天苷中的应用。
本发明的第五方面,提供一种制备酪醇、羟基酪醇或红景天苷的方法,应用本发明第三方面任一项所述的重组菌发酵,得到酪醇、羟基酪醇或红景天苷。
在本发明的一些实施方式中,具体为在含有葡萄糖、酪氨酸的培养基中应用本发明第三方面任一项所述的重组菌发酵,得到酪醇、羟基酪醇或红景天苷。
在本发明的一些实施方式中,所述酪氨酸可以是外源添加,也可以是添加酪氨酸产生菌。
在本发明的一些实施方式中,所述酪氨酸产生菌可以为任何产酪氨酸的大肠杆菌,如本实验之前公开的酪氨酸产生菌大肠杆菌TYR-14B1(Frontiers in Microbiology,12(2021)710405)。
在本发明的一些实施方式中,所述发酵可以采用单菌发酵法、模块共培养法和模块共催化法。
在本发明的一些优选实施方式中,优选为模块共催化法。
在本发明的一些实施方式中,对酪醇合成而言,采用酪氨酸产生菌和重组菌1进行模块共催化;对羟基酪醇合成而言,采用酪氨酸产生菌、重组菌1和重组菌2进行模块共催化;对红景天苷合成而言,采用酪氨酸产生菌、重组菌1和重组菌3进行模块共催化。
在本发明的一些实施方式中,对酪醇合成而言,酪氨酸产生菌和重组菌1的重量比为(1-5):(1-5)。
在本发明的一些实施方式中,对羟基酪醇合成而言,酪氨酸产生菌、重组菌1和重组菌2的重量比为(1-5):(1-5):(1-5)。
在本发明的一些实施方式中,对红景天苷合成而言,酪氨酸产生菌、重组菌1和重组菌3的重量比为(1-5):(1-5):(1-5)。
在本发明的一些实施方式中,所述菌的接种量为:起始OD600为20~50。
在本发明的一些实施方式中,所述催化条件为30~42℃、150~250rpm下生物催化20~40h。
本发明的有益效果是:
本发明在宿主菌中表达了酪醇合成途径酶融合体来生产酪醇,再引入4-羟基苯乙酸3-羟化酶HpaB生产羟基酪醇,引入糖基转移酶生产红景天苷;Spy(或Snoop)环化还可通过热处理以增加细胞的通透性,避免细胞的传质限制。通过模块共培养因将长代谢途径分割成多个途径、并可利用不同宿主细胞进行表达,减轻了对宿主细胞的代谢负担;而且不同途径可选用各自最合适的宿主细胞进行表达;可通过调整模块菌的比例来控制模块的适配性;即插即用,容易组装成不同途径以合成不同产物。还能避免代谢中间物和目标产物毒性的影响。
具体实施方式
以下将结合实施例对本发明的构思及产生的技术效果进行清楚、完整地描述,以充分地理解本发明的目的、特征和效果。显然,所描述的实施例只是本发明的一部分实施例,而不是全部实施例,基于本发明的实施例,本领域的技术人员在不付出创造性劳动的前提下所获得的其他实施例,均属于本发明保护的范围。
SpyTag、SnoopTag、SpyCatcher、SnoopCatcher的氨基酸序列如下:
SpyTag:AHIVMVDAYKPTK(SEQ ID NO.1);
SnoopTag:KLGDIEFIKVNK(SEQ ID NO.2);
SpyCatcher:GDSATHIKFSKRDEDGKELAGATMELRDSSGKTISTWISDGQVKDFYLYPGKYTFVETAAPDGYEVATAITFTVNEQGQVTVNG(SEQ ID NO.3);
SnoopCatcher:KPLRGAVFSLQKQHPDYPDIYGAIDQNGTYQNVRTGEDGKLTFKNLSDGKYRLFENSEPAGYKPVQNKPIVAFQIVNGEVRDVTSIVPQDIPATYEFTNGKHYITNEPIPPK(SEQ ID NO.4)。
实施例1模块菌的构建
提供酪氨酸的模块菌为产酪氨酸大肠杆菌,如本实验之前公开的酪氨酸产生菌大肠杆菌TYR-14B1为酪氨酸模块菌(Frontiers in Microbiology,12(2021)710405)。
AAS(Uniprot Q06086)、yahK基因(Uniprot P75691)(它们各自的序列可在Uniprot数据库中可以查到),用(GSG)2进行融合表达,而且在N端加上SpyTag序列、在C端加上SpyCatcher序列,委托商业公司进行全基因合成SpyTag-(GSG)2-aas-(GSG)2-yahK-(GSG)2-SpyCatcher片段,NheI/KpnI酶切连接到实验室之前构建的表达载体pZBKBP(Journal of Industrial Microbiology Biotechnology 42(2015)627-636),得到pZBK-ST-AAS-yahK-SC;转化到大肠杆菌BW25113化学感受态细胞中,得到酪醇模块菌大肠杆菌BW25113(pZBK-ST-AAS-yahK-SC),即前述重组菌1。
EchpaBC(GenBank ACT46003.1、ACT46002.1),在N端加上SpyTag序列、在C端加上SpyCatcher序列,委托商业公司进行全基因合成SpyTag-(GSG)2-hpaBC-(GSG)2-SpyCatcher片段,NheI/KpnI酶切连接到pZBKBP载体,得到pZBK-ST-hpaBC-SC;转化到大肠杆菌BW25113化学感受态细胞中,得到羟基酪醇模块菌大肠杆菌BW25113(pZBK-ST-hpaBC-SC)。
AtUGT85A1(Uniprot W8Q3R5),在N端加上SpyTag序列、在C端加上SpyCatcher序列,委托商业公司进行全基因合成SpyTag-(GSG)2-AtUGT85A1-(GSG)2-SpyCatcher片段,NheI/KpnI酶切连接到pZBKBP载体得到pZBK-ST-AtUGT85A1-SC;转化到大肠杆菌BW25113化学感受态细胞中,得到红景天苷模块菌大肠杆菌BW25113(pZBK-ST-AtUGT85A1-SC)。
实施例2模块共催化合成酪醇
挑取LB(1%胰蛋白胨、0.5%酵母抽提物、1%NaCl)平板上的酪氨酸模块菌和酪醇模块菌单菌落,接种至LB液体培养基中,于37℃、200rpm下培养约14h。于4℃、2800g离心15min冷冻离心、并用冷的生理盐水洗涤、收集菌体。将酪醇模块菌重悬在0.1M pH7.0磷酸盐缓冲液中至OD600为100制备菌悬液。菌悬液置于55℃热处理20min。菌悬液再次冷冻离心并用冷生理盐水洗涤收集菌体。最后将酪氨酸模块菌和酪醇模块菌按4:1(g/g)比例重悬至10mL含20g/L葡萄糖、10mM硫酸镁和1.5g/L维生素C的0.1M pH7.0磷酸盐缓冲液中至OD600为25,于37℃、200rpm下生物催化24h。HPLC(LC-20A,岛津)分析酪醇产量。
色谱条件:色谱柱Inertsil ODS-SP柱(5μm,4.6×150mm,GL Sciences Inc.);流动相:A为0.2%三氟乙酸、B相为100%甲醇;梯度洗脱:0-20min、甲醇浓度由14%升至45%;20-30min、甲醇浓度由45%降至14%;流速0.5mL/min;柱温30℃;检测波长280nm。
结果可产1.3g/L酪醇。
实施例3模块共催化合成羟基酪醇
挑取LB平板上的酪氨酸模块菌、酪醇模块菌和羟基酪醇模块菌单菌落,接种至LB液体培养基中,于37℃、200rpm下培养约14h。冷冻离心并用冷的生理盐水洗涤、收集菌体。将酪醇模块菌和羟基酪醇重悬在0.1M pH7.0磷酸盐缓冲液中至OD600为100制备菌悬液。菌悬液置于55℃热处理20min。菌悬液再次冷冻离心并用冷生理盐水洗涤收集菌体。最后将酪氨酸模块菌:酪醇模块菌:羟基酪醇按4:1:1(g/g)比例重悬至10mL含20g/L葡萄糖、10mM硫酸镁和1.5g/L维生素C的0.1M pH7.0磷酸盐缓冲液中至OD600为25,于37℃、200rpm下生物催化24h。HPLC(LC-20A,岛津)分析羟基酪醇产量。
色谱条件:色谱柱Inertsil ODS-SP柱(5μm,4.6×150mm,GL Sciences Inc.);流动相:A为0.2%三氟乙酸、B相为100%甲醇;梯度洗脱:0-20min、甲醇浓度由14%升至45%;20-30min、甲醇浓度由45%降至14%;流速0.5mL/min;柱温30℃;检测波长280nm。
结果可产193.2mg/L羟基酪醇。
实施例4模块共催化合成红景天苷
挑取LB平板上的酪氨酸模块菌、酪醇模块菌和红景天苷模块菌单菌落,接种至LB液体培养基中,于37℃、200rpm下培养约14h。冷冻离心并用冷的生理盐水洗涤、收集菌体。将酪醇模块菌和红景天苷模块菌重悬在0.1M pH7.0磷酸盐缓冲液中至OD600为100制备菌悬液。菌悬液置于55℃热处理20min。菌悬液再次冷冻离心并用冷生理盐水洗涤收集菌体。最后将酪氨酸模块菌:酪醇模块菌:红景天苷模块菌按4:1:1(g/g)比例重悬至10mL含20g/L葡萄糖、10mM硫酸镁和1.5g/L维生素C的0.1M pH7.0磷酸盐缓冲液中至OD600为25,于37℃、200rpm下生物催化24h。
按实施例2方法HPLC(LC-20A,岛津)分析红景天苷产量,可产146.1mg/L红景天苷。
除了本实施例提及的方式外,还可采用模块共培养的方法生产酪醇、羟基酪醇或红景天苷。即不同模块菌分别进行种子培养,按一定比例接种到发酵培养基中进行发酵,也可以单菌发酵法。环化酶也可以直接转化到酪氨酸产生菌中进行单菌发酵。环化酶基因也可以整合到大肠杆菌染色体上,构建相应的重组大肠杆菌。
除了本实施例提及的方式外,相应酶还可以用其它表达载体进行表达,也可以整合到大肠杆菌染色体上进行表达。
上述具体实施方式对本发明作了详细说明,但是本发明不限于上述实施例,在所属技术领域普通技术人员所具备的知识范围内,还可以在不脱离本发明宗旨的前提下作出各种变化。此外,在不冲突的情况下,本发明的实施例及实施例中的特征可以相互组合。
SEQUENCE LISTING
<110> 中山大学
<120> 一种重组大肠杆菌及其生产酪醇、羟基酪醇或红景天苷的方法
<130>
<160> 4
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 13
<212> PRT
<213> SpyTag
<400> 1
Ala His Ile Val Met Val Asp Ala Tyr Lys Pro Thr Lys
1 5 10
<210> 2
<211> 12
<212> PRT
<213> SnoopTag
<400> 2
Lys Leu Gly Asp Ile Glu Phe Ile Lys Val Asn Lys
1 5 10
<210> 3
<211> 84
<212> PRT
<213> SpyCatcher
<400> 3
Gly Asp Ser Ala Thr His Ile Lys Phe Ser Lys Arg Asp Glu Asp Gly
1 5 10 15
Lys Glu Leu Ala Gly Ala Thr Met Glu Leu Arg Asp Ser Ser Gly Lys
20 25 30
Thr Ile Ser Thr Trp Ile Ser Asp Gly Gln Val Lys Asp Phe Tyr Leu
35 40 45
Tyr Pro Gly Lys Tyr Thr Phe Val Glu Thr Ala Ala Pro Asp Gly Tyr
50 55 60
Glu Val Ala Thr Ala Ile Thr Phe Thr Val Asn Glu Gln Gly Gln Val
65 70 75 80
Thr Val Asn Gly
<210> 4
<211> 112
<212> PRT
<213> SnoopCatcher
<400> 4
Lys Pro Leu Arg Gly Ala Val Phe Ser Leu Gln Lys Gln His Pro Asp
1 5 10 15
Tyr Pro Asp Ile Tyr Gly Ala Ile Asp Gln Asn Gly Thr Tyr Gln Asn
20 25 30
Val Arg Thr Gly Glu Asp Gly Lys Leu Thr Phe Lys Asn Leu Ser Asp
35 40 45
Gly Lys Tyr Arg Leu Phe Glu Asn Ser Glu Pro Ala Gly Tyr Lys Pro
50 55 60
Val Gln Asn Lys Pro Ile Val Ala Phe Gln Ile Val Asn Gly Glu Val
65 70 75 80
Arg Asp Val Thr Ser Ile Val Pro Gln Asp Ile Pro Ala Thr Tyr Glu
85 90 95
Phe Thr Asn Gly Lys His Tyr Ile Thr Asn Glu Pro Ile Pro Pro Lys
100 105 110

Claims (10)

1.一种基因表达模块,所述基因表达模块包含:酪醇合成途径酶融合体基因、4-羟基苯乙酸3-羟化酶基因、糖基转移酶基因中的至少一种;所述酪醇合成途径酶融合体、4-羟基苯乙酸3-羟化酶和糖基转移酶均为Spy/Snoop环化。
2.根据权利要求1所述的基因表达模块,其特征在于,所述酪醇合成途径酶融合体基因包含:芳香醛合成酶AAS/α-酮酸脱羧酶基因和醇脱氢酶基因;所述α-酮酸脱羧酶基因为ipdC、ARO10、KDC4或PDC;所述醇脱氢酶基因为yahK、ADH6、ahr或adh。
3.根据权利要求1所述的基因表达模块,其特征在于,所述4-羟基苯乙酸3-羟化酶基因为EchpaBC、hpaB-hpaC杂合体或sam5。
4.根据权利要求1所述的基因表达模块,其特征在于,所述糖基转移酶基因为RrUGT33、AtUGT85A1、RsUGT73B6、RsAS、GeGT1或VvGT2。
5.一种重组载体,包含权利要求1~4任一项所述的基因表达模块。
6.一种重组菌,包含权利要求1~4任一项所述的基因表达模块或权利要求5所述的重组载体。
7.根据权利要求6所述的重组菌,其特征在于,所述重组菌为以下任一种:
(a)将权利要求1~4任一项所述的酪醇合成途径酶融合体基因导入受体菌中;
(b)将权利要求1~4任一项所述的4-羟基苯乙酸3-羟化酶基因导入受体菌中;
(c)将权利要求1~4任一项所述的糖基转移酶基因导入受体菌中。
8.权利要求1~4任一项所述的基因表达模块或权利要求5所述的重组载体或权利要求6~7任一项所述的重组菌在制备酪醇、羟基酪醇或红景天苷中的应用。
9.一种制备酪醇、羟基酪醇或红景天苷的方法,其特征在于,通过权利要求7~8任一项所述的重组菌发酵。
10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,所述发酵方法为单菌发酵法、模块共培养或模块共催化法;优选为模块共催化法。
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