CN113474347A - Mat2a的aza杂双环抑制剂和用于治疗癌症的方法 - Google Patents

Mat2a的aza杂双环抑制剂和用于治疗癌症的方法 Download PDF

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M.李
S.K.雷兹尼克
隋治华
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Abstract

本公开提供了如本公开所述的根据式I、式II的化合物及其药学上可接受的盐、互变异构体和/或同位素异数体。所述化合物是甲硫氨酸腺苷转移酶同种型2A(MAT2A)的抑制剂。本公开还提供了药物组合物和使用所述化合物来治疗癌症的方法,所述癌症包括其中编码甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)的基因缺失的一些癌症。

Description

MAT2A的AZA杂双环抑制剂和用于治疗癌症的方法
相关申请的交叉引用
本申请要求2018年12月27日提交的美国临时专利申请号62/785,574的优先权,该临时专利申请的公开内容整体并入本文。
背景技术
甲硫氨酸腺苷转移酶(MAT),也称为S-腺苷甲硫氨酸合成酶,是一种催化从甲硫氨酸和ATP合成S-腺苷甲硫氨酸(SAM或AdoMet)的细胞酶;所述催化被认为是甲硫氨酸循环的限速步骤。SAM是聚胺生物合成中的丙氨基供体,是DNA甲基化的主要甲基供体,参与基因转录和细胞增殖以及次级代谢物的产生。
指定为MAT1A和MAT2A的两个基因分别编码两种不同的催化MAT同种型。第三个基因MAT2B编码MAT2A调节亚基。MAT1A在成人肝脏中特异性表达,而MAT2A则广泛分布。由于MAT同种型在催化动力学和调节性质方面不同,表达MAT1A的细胞具有比表达MAT2A的细胞高得多的SAM水平。已经发现,MAT2A启动子的低甲基化和组蛋白乙酰化导致MAT2A表达的上调。
在肝细胞癌(HCC)中,发生MAT1A的下调和MAT2A的上调,这被称为MAT1A:MAT2A转换。这种转换伴随着MAT2B的上调,导致SAM含量降低,这为肝癌细胞提供了生长优点。由于MAT2A在促进肝癌细胞的生长方面起着至关重要的作用,因此它是抗肿瘤治疗的靶标。最近的研究表明,通过使用小干扰RNA进行沉默可以基本上抑制肝癌细胞的生长并诱导肝癌细胞的凋亡。参见,例如,T.Li等人,J.Cancer 7(10)(2016)1317-1327。
一些MTAP缺陷的癌细胞系对MAT2A的抑制特别敏感。Marjon等人(Cell Reports15(3)(2016)574–587)。MTAP(甲硫腺苷磷酸化酶)是一种在正常组织中广泛表达的酶,可催化甲硫腺苷(MTA)转化为腺嘌呤和5-甲硫核糖-1-磷酸。腺嘌呤的补救生成单磷酸腺苷,并且5-甲硫核糖-1-磷酸转化为甲硫氨酸和甲酸。由于这种补救途径,当从头嘌呤合成(例如通过抗代谢物(诸如丙氨菌素(L-alanosine))合成)被阻断时,MTA可以作为替代性嘌呤来源。
MAT2A在缺乏MTAP缺失的其他癌症(包括肝细胞癌和白血病)中失调。J.Cai等人,Cancer Res.58(1998)1444-1450;T.S.Jani等人,Cell.Res.19(2009)358-369。通过RNA干扰沉默MAT2A表达会在若干癌症模型中产生抗增殖作用。H.Chen等人,Gastroenterology133(2007)207-218;Q.Liu等人Hepatol.Res.37(2007)376-388。
很多人和鼠恶性细胞缺乏MTAP活性。MTAP缺陷不仅存在于组织培养细胞中,而且还存在于原发性白血病、胶质瘤、黑素瘤、胰腺癌、非小细胞肺癌(NSCLC)、膀胱癌、星形细胞瘤、骨肉瘤、头颈癌、粘液样软骨肉瘤、卵巢癌、子宫内膜癌、乳腺癌、软组织肉瘤、非霍奇金淋巴瘤和间皮瘤。编码人类MTAP的基因映射到人类染色体9p上的9p21区域。该区域还包含肿瘤抑制基因p16INK4A(也称为CDKN2A)和pl5INK4B。这些基因编码p16和p15,它们分别是细胞周期蛋白D依赖性激酶cdk4和cdk6的抑制剂。
p16INK4A转录物也可以是剪接成编码pl4ARF的转录物的替代阅读框(ARF)。pl4ARF与MDM2结合并防止p53的降解(Pomerantz等人(1998)Cell 92:713-723)。9p21染色体区域很受关注,因为它经常在多种癌症中纯合缺失,包括白血病、NSLC、胰腺癌、胶质瘤、黑素瘤和间皮瘤。缺失常常使一个以上的基因失活。例如,Cairns等人((1995)Nat.Gen.11:210-212)报道了,在研究了500多个原发性肿瘤后,几乎所有在此类肿瘤中鉴定的缺失都涉及包含MTAP、pl4ARF和P16INK4A的170kb区域。Carson等人(WO 99/67634)报道了肿瘤发展阶段与编码MTAP的基因和编码p16的基因的纯合性丧失之间存在相关性。例如,据报道,MTAP基因而非p16INK4A的缺失表明癌症处于早期发展阶段,而据报道,编码p16和MTAP的基因的缺失则表明癌症处于更晚期的肿瘤发展阶段。在一些骨肉瘤患者中,MTAP基因在诊断时存在,但在稍后的时间点缺失(Garcia-Castellano等人,Clin.Cancer Res.8(3)2002782-787)。
发明内容
本公开提供了抑制MAT2A的化合物。所述化合物及其药物组合物可用于治疗各种癌症,包括标准治疗(诸如手术、放射疗法、化学疗法和激素疗法)难治的那些癌症的方法。
因此,根据一些实施方案,本公开提供了一种根据式I的化合物或其药学上可接受的盐、互变异构体和/或同位素异数体:
Figure BDA0003224737400000021
在式I中,X1是N或CR5,并且X2是N或CR6,其中X1和X2不同时为N。
L是O、S、NR或键。取代基R是H或C1-C6-烷基。
R1选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C3-C6-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基)和-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基),其中R1中的任何烷基是直链的或支链的。
此外,R1任选地被1-6个卤代取代。当X1是N,X2是CR6,L是NR或S,R是H,并且R1是C1-C6-烷基时,则R1被1-6个卤代取代。
或者,在一个实施方案中,当L是NR时,则R和R1可以与L组合在一起形成任选地被一个或多个RA取代的3至6元杂环烷基(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S)。
R2和R3独立地选自由以下各项组成的组:任选地取代的C6-C10-芳基、任选地取代的C3-C6-碳环基、任选地取代的5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S)和任选地取代的3至14元杂环烷基(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S)。
R2和R3独立地和任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:RA、ORA、卤代、-N=N-RA、NRARB、-(C1-C6-烷基)NRARB、-C(O)ORA、-C(O)NRARB、-OC(O)RA、和-CN。
在其他方面,R2和R3独立地和任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:RA、ORA、卤代、-N=N-RA、-NRARB、-(C1-C6-烷基)NRARB、-C(O)ORA、-C(O)NRARB、-OC(O)RA、-NRAC(O)NRARB、和-CN。在其他方面,R2和/或R3是-NRAC(O)NRARB
R4选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、氧代、–CN和-NRCRD
R5选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、–CN和-NRCRD
R6选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基(任选地被一个或多个卤代取代)、-O(C1-C6-烷基)(任选地被一个或多个卤代取代)、-OH、卤代、-CN、-(C1-C6-烷基)NRARB和-NRARB
RA和RB独立地选自由以下各项组成的组:H、-CN、-羟基、氧代、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、-NH2、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、-S(O)0-2-(C6-C10-芳基)、-C(O)(C1-C6-烷基)、-C(O)(C3-C14-碳环基)、-C3-C14-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C14-碳环基)、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S)和5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S)。
在RA和RB中,每个烷基、烷氧基、烯基、炔基、芳基、碳环基、杂环烷基和杂芳基部分任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:氘、羟基、卤代、-NR′2(其中每个R′独立地选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S)和5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S)、-NHC(O)(OC1-C6-烷基)、-NO2、-CN、氧代、-C(O)OH、-C(O)O(C1-C6-烷基)、-C1-C6-烷基(C1-C6-烷氧基)、-C(O)NH2、C1-C6-烷基、-C(O)C1-C6-烷基、-OC1-C6-烷基、-Si(C1-C6-烷基)3、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、C6-C10-芳基、-(C1-C6-烷基)(C6-C10-芳基)、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环)(其中1-4个杂环成员独立地选自N、O和S)和-O(C6-C14-芳基)。每个烷基、烯基、芳基和杂环烷基取代基任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:羟基、-OC1-C6-烷基、卤代、-NH2、-(C1-C6-烷基)NH2、-C(O)OH、CN和氧代。
RC和RD各自独立地选自H和C1-C6-烷基。
在一些方面,本公开涉及下式的化合物
Figure BDA0003224737400000041
其中
X1是N或CR5
X2是N或CR6,其中X1和X2不同时为N;
L是O、S、NR或键;
R是H或C1-C6-烷基;
R1选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C3-C6-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基)和-(C1-C6-烷基)(C3-C6-环烯基),其中R1中的任何烷基均为直链的或支链的,R1任选地被1-6个卤代取代;当X1是N,X2是CR6,L是NR或S,R是H,并且R1是C1-C6-烷基时,则R1被1-6个卤代取代;
或者,当L是NR时,则R和R1可以与L组合在一起形成任选地被一个或多个RA取代的3至6元杂环烷基(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S);
R2和R3独立地选自由以下各项组成的组:C6-C10-芳基、C3-C6-碳环基、5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S),和3至14元杂环烷基(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S),其中R2和R3独立地和任选地被一个或多个取代基取代,所述取代基选自由以下各项组成的组:RA、ORA、卤代、-N=NRA、-NRARB、-(C1-C6-烷基)NRARB、-C(O)ORA、-C(O)NRARB、-OC(O)RA和-CN;
R4选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、氧代、–CN和-NRCRD
R5选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、–CN和-NRCRD
R6选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基(任选地被一个或多个卤代、-O(C1-C6-烷基)(任选地被一个或多个卤代取代)、-OH、卤代、-CN、-(C1-C6-烷基)NRARB和-NRARB
RA和RB独立地选自由以下各项组成的组:H、-CN、-羟基、氧代、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、-NH2、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、-S(O)0-2-(C6-C10-芳基)、-C(O)(C1-C6-烷基)、-C(O)(C3-C14-碳环基)、-C3-C14-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C14-碳环基)、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S)以及5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S);其中RA和RB的每个烷基、烷氧基、烯基、炔基、芳基、碳环基、杂环烷基和杂芳基部分任选地被一个或多个取代基取代,所述取代基选自由以下各项组成的组:氘、羟基、卤代、-NR’2(其中每个R’独立地选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S)以及5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S))、-NHC(O)(OC1-C6-烷基)、-NO2、-CN、氧代、-C(O)OH、-C(O)O(C1-C6-烷基)、-C1-C6-烷基(C1-C6-烷氧基)、-C(O)NH2、C1-C6-烷基-C(O)C1-C6-烷基、-OC1-C6-烷基、-Si(C1-C6-烷基)3、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、C6-C10-芳基、-(C1-C6-烷基)(C6-C10-芳基)、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环)(其中1-4个杂环成员独立地选自N、O和S)以及-O(C6-C14-芳基),其中每个烷基、烯基、芳基和杂环烷基任选地被一个或多个取代基取代,所述取代基选自由以下各项组成的组:羟基、-OC1-C6-烷基、卤代、-NH2、-(C1-C6-烷基)NH2、-C(O)OH、-CN和氧代;
RC和RD各自独立地选自H和C1-C6-烷基;
或其药学上可接受的盐。
在一些方面,本公开涉及式I的化合物:
Figure BDA0003224737400000051
其中
X1是N或CR5
X2是N或CR6,其中X1和X2不同时为N;
L是O、S、NR或键;
R是H或C1-C6-烷基;
R1选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C3-C6-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基)和-(C1-C6-烷基)(C3-C6-环烯基),其中R1中的任何烷基均为直链的或支链的,R1任选地被1-6个卤代取代;当X1是N,X2是CR6,L是NR或S,R是H,并且R1是C1-C6-烷基时,则R1被1-6个卤代取代;
或者,当L是NR时,则R和R1可以与L组合在一起形成任选地被一个或多个RA取代的3至6元杂环烷基(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S);
R2和R3独立地选自由以下各项组成的组:C6-C10-芳基、C3-C6-碳环基、5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S),和3至14元杂环烷基(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S),其中R2和R3独立地和任选地被一个或多个取代基取代,所述取代基选自由以下各项组成的组:RA、ORA、卤代、-N=NRA、-NRARB、-(C1-C6-烷基)NRARB、-C(O)ORA、-C(O)NRARB、-OC(O)RA、-NRAC(O)NRARB和-CN;
R4选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、氧代、–CN和-NRCRD
R5选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、–CN和-NRCRD
R6选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基(任选地被一个或多个卤代、-O(C1-C6-烷基)(任选地被一个或多个卤代取代)、-OH、卤代、-CN、-(C1-C6-烷基)NRARB和-NRARB
RA和RB独立地选自由以下各项组成的组:H、-CN、-羟基、氧代、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、-NH2、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、-S(O)0-2-(C6-C10-芳基)、-C(O)(C1-C6-烷基)、-C(O)(C3-C14-碳环基)、-C3-C14-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C14-碳环基)、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S)以及5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S);其中RA和RB的每个烷基、烷氧基、烯基、炔基、芳基、碳环基、杂环烷基和杂芳基部分任选地被一个或多个取代基取代,所述取代基选自由以下各项组成的组:氘、羟基、卤代、-NR’2(其中每个R’独立地选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S)以及5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S))、-NHC(O)(OC1-C6-烷基)、-NO2、-CN、氧代、-C(O)OH、-C(O)O(C1-C6-烷基)、-C1-C6-烷基(C1-C6-烷氧基)、-C(O)NH2、C1-C6-烷基-C(O)C1-C6-烷基、-OC1-C6-烷基、-Si(C1-C6-烷基)3、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、C6-C10-芳基、-(C1-C6-烷基)(C6-C10-芳基)、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环)(其中1-4个杂环成员独立地选自N、O和S)以及-O(C6-C14-芳基),其中每个烷基、烯基、芳基和杂环烷基任选地被一个或多个取代基取代,所述取代基选自由以下各项组成的组:羟基、-OC1-C6-烷基、卤代、-NH2、-(C1-C6-烷基)NH2、-C(O)OH、-CN和氧代;
RC和RD各自独立地选自H和C1-C6-烷基;
或其药学上可接受的盐。
本公开的另一个实施方案是根据式II的化合物或其药学上可接受的盐、互变异构体和/或同位素异数体:
Figure BDA0003224737400000071
在式II中,X1是N,并且X2是CR6,X1是CR5,并且X2是CR6,X1和X2均为N,或者X1是CR5,并且X2是CR6
L是O、S、NR或键。取代基R是H或C1-C6-烷基。
R1选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C3-C6-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基)和-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基),其中R1中的任何烷基是直链的或支链的。R1任选地被1-6个卤代取代。
在一个实施方案中,当L是NR时,则R和R1可以与L组合在一起形成任选地被一个或多个RA取代的3至6元杂环烷基(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S)。
R2和R3独立地选自由以下各项组成的组:C6-C10-芳基、C3-C6-碳环基、5至10元杂芳基(其中1--4个杂芳基成员独立地选自N、O和S)和3至14元杂环烷基(其中1--4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S)。R2和R3独立地和任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:RA、ORA、卤代、-N=N-RA、NRARB、-(C1-C6-烷基)NRARB、-C(O)ORA、-C(O)NRARB、-OC(O)RA、和-CN。
R4选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、氧代、–CN和-NRCRD
R5选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、–CN和-NRCRD
R6选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基(任选地被一个或多个卤代取代)、-O(C1-C6-烷基)(任选地被一个或多个卤代取代)、-OH、卤代、-CN、-(C1-C6-烷基)NRARB和-NRARB
RA和RB独立地选自由以下各项组成的组:H、-CN、-羟基、氧代、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、-NH2、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、-S(O)0-2-(C6-C10-芳基)、-C(O)(C1-C6-烷基)、-C(O)(C3-C14-碳环基)、-C3-C14-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C14-碳环基)、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S)和5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S)。
RA和RB的每个烷基、烷氧基、烯基、炔基、芳基、碳环基、杂环烷基和杂芳基部分任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:羟基、卤代、-NR′2(其中每个R′独立地选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S)和5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S))、-NHC(O)(OC1-C6-烷基)、-NO2、-CN、氧代、-C(O)OH、-C(O)O(C1-C6-烷基)、-C1-C6-烷基(C1-C6-烷氧基)、-C(O)NH2、C1-C6-烷基、-C(O)C1-C6-烷基、-OC1-C6-烷基、-Si(C1-C6-烷基)3、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、C6-C10-芳基、-(C1-C6-烷基)(C6-C10-芳基)、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环)(其中1-4个杂环成员独立地选自N、O和S)和-O(C6-C14-芳基)。每个烷基、烯基、芳基和杂环烷基取代基任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:羟基、-OC1-C6-烷基、卤代、-NH2、-(C1-C6-烷基)NH2、-C(O)OH、CN和氧代。
RC和RD各自独立地选自H和C1-C6-烷基。
在另一个实施方案中,本公开提供了一种药物组合物,所述药物组合物包含治疗有效量的如本文所述的化合物或其药学上可接受的盐、互变异构体和/或同位素异数体,以及药学上可接受的载剂。
根据另一个实施方案,本公开提供了一种用于治疗患有癌症的受试者的癌症的方法,所述方法包括向所述受试者施用有效量的如本文所述的MAT2A抑制剂,即化合物,或药学上可接受的盐、互变异构体和/或同位素异数体。
在另一个实施方案中,本公开还提供了一种用于抑制细胞中的S-腺苷甲硫氨酸(SAM)的合成的方法,所述方法包括将有效量的如本文所述的化合物或其药学上可接受的盐、互变异构体和/或同位素异数体引入细胞中。
在另一个实施方案中,本公开还提供了一种用于抑制受试者中的S-腺苷甲硫氨酸(SAM)的合成的方法,所述方法包括向所述受试者施用有效量的如本文所述的化合物或其药学上可接受的盐、互变异构体和/或同位素异数体。
在另一个实施方案中,本公开提供了一种用于治疗患有癌症的受试者的癌症的方法,所述方法包括向所述受试者施用有效量的如本文所述的化合物,或其药学上可接受的盐、互变异构体和/或同位素异数体。
根据又一个实施方案,本公开提供了一种用于治疗患有癌症的受试者的癌症的方法,其中与其中MTAP基因或蛋白质存在和/或完全发挥功能的癌症相比,所述癌症的特征在于甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)基因表达的降低或缺失、MTAP基因的缺失或MTAP蛋白的功能降低。所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的如本文所述的化合物或其药学上可接受的盐、互变异构体和/或同位素异数体。
在一个实施方案中,本公开提供了一种用于抑制S-腺苷甲硫氨酸(SAM)的合成的如本文所述的化合物或其药学上可接受的盐、互变异构体和/或同位素异数体。
另一个实施方案是一种用于治疗患有癌症的受试者的癌症的如本文所述的化合物或其药学上可接受的盐、互变异构体和/或同位素异数体。
另一个实施方案是一种用于治疗患有癌症的受试者的癌症的如本文所述的化合物或其药学上可接受的盐、互变异构体和/或同位素异数体。
本公开还提供了一种用于制备治疗癌症的药物的如本文所述的化合物或其药学上可接受的盐。
具体实施方式
本文所述的化合物是MAT2A的抑制剂。因此,本公开不仅涉及此类符合式I或II的化合物,而且还涉及它们的药物组合物、互变异构体和/或同位素异数体。所述化合物和组合物可用于治疗癌症。一些癌症包括各种MTAP缺失的癌症,即特征在于MTAP基因的缺乏或缺失或MTAP蛋白的功能降低的那些癌症。
定义
“烷基”是指包含1至约20个碳原子的直链或支链烃基。例如,烷基可具有1至10个碳原子或1至6个碳原子。示例性烷基包括直链烷基,诸如甲基、乙基、丙基、丁基、戊基、己基、庚基、辛基、壬基、癸基、十一烷基、十二烷基等等,并且还包括直链烷基的支链异构体,例如但不限于-CH(CH3)2、CH(CH3)(CH2CH3),CH(CH2CH3)2,-C(CH3)3,C(CH2CH3)3,-CH2CH(CH3)2,-CH2CH(CH3)(CH2CH3),-CH2CH(CH2CH3)2,-CH2C(CH3)3,-CH2C(CH2CH3)3,-CH(CH3)CH(CH3)(CH2CH3),-CH2CH2CH(CH3)2,-CH2CH2CH(CH3)(CH2CH3),-CH2CH2CH(CH2CH3)2,-CH2CH2C(CH3)3,-CH2CH2C(CH2CH3)3,-CH(CH3)CH2CH(CH3)2,-CH(CH3)CH(CH3)CH(CH3)2,等等。因此,烷基包括伯烷基、仲烷基和叔烷基。烷基可以是未取代的或任选地被一个或多个如下文所述的取代基取代。
短语“取代的烷基”是指在一个或多个位置,例如1、2、3、4、5或甚至6个位置上被取代的烷基,这些取代基连接在任何可用的原子上以产生具有如本文所述的取代的稳定化合物。“任选地取代的烷基”是指烷基或取代的烷基。
术语“卤素”、“卤化物”和“卤代”中的每个均指-F、-Cl、-Br或-I。
术语“烯基”是指包含2至约20个碳原子且具有1-3、1-2或至少一个碳碳双键的直链或支链烃基。烯基可以是未取代的或任选地被一个或多个如下文所述的取代基取代。
“取代的烯基”是指在1个或多个,例如1、2、3、4、5或甚至6个位置上被取代的烯基,这些取代基连接在任何可用的原子上以产生具有如本文所述的取代的稳定化合物。“任选地取代的烯基”是指烯基或取代的烯基。
“炔烃”或“炔基”是指具有指定数量的碳原子和至少一个三键的直链或支链不饱和烃。(C2-C8)炔基的实例包括但不限于乙炔、丙炔、1-丁炔、2-丁炔、1-戊炔、2-戊炔、1-己炔、2-己炔、3-己炔、1-庚炔、2-庚炔、3-庚炔、1-辛炔、2-辛炔、3-辛炔和4-辛炔。炔基可以是未取代的或任选地被一个或多个如下文所述的取代基取代。
“取代的炔基”是指在1个或多个,例如1、2、3、4、5或甚至6个位置上被取代的炔基,这些取代基连接在任何可用的原子上以产生具有如本文所述的取代的稳定化合物。“任选地取代的炔基”是指炔基或取代的炔基。
术语“烷氧基”是指具有指定数量的碳原子的-O-烷基。例如,(C1-C6)烷氧基包括-O-甲基、-O-乙基、-O-丙基、-O-异丙基、-O-丁基、-O-仲丁基、-O-叔丁基、-O-戊基、-O-异戊基、-O-新戊基、-O-己基、-O-异己基和-O-新己基。
术语“碳环基”是指单环、双环、三环或多环的3至14元环系,它是饱和的(诸如“环烷基”)或不饱和的(诸如“环烯基”)。术语“环烯基”特指环状烯基,诸如C3-C6-环烯基。碳环基可以通过任何原子连接。例如,碳环基还考虑稠合环,其中例如碳环基稠合至如本文所定义的芳基或杂芳基环。碳环基的代表性实例包括但不限于环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环丙烯基、环丁烯基、环戊烯基、环己烯基、苯基、萘基、蒽基、苯并呋喃基和苯并噻吩基。碳环基可以是未取代的或任选地被一个或多个如下文所述的取代基取代。
“取代的碳环基”是指在1个或多个,例如1、2、3、4、5或甚至6个位置上被取代的碳环基,这些取代基连接在任何可用的原子上以产生具有如本文所述的取代的稳定化合物。“任选地取代的碳环基”是指碳环基或取代的碳环基。
“芳基”当单独使用或作为另一个术语的一部分使用时是指稠合的或非稠合的具有指定数量的或未指定数量的碳原子的碳环芳族基团,如果数量未指定,则为最多14个碳原子,诸如C6-C14-芳基。具体的芳基是苯基、萘基、联苯基、菲基、萘基等等(参见例如Lang’sHandbook of Chemistry(Dean,J.A.编)第13版,表7-2[1985])。具体的芳基是苯基。“芳基”还包括任选地与碳环基环稠合的芳环系,如本文所定义。芳基可以是未取代的或任选地被一个或多个如下文所述的取代基取代。
“取代的芳基”是被一个或多个连接在任何可用的原子上的取代基独立地取代以产生稳定化合物的芳基,其中所述取代基如本文所述。“任选地取代的芳基”是指芳基或取代的芳基。
术语“杂原子”是指N、O和S。包含N或S原子的本发明的化合物可以任选地被氧化成相应的N-氧化物、亚砜或砜化合物。
“杂芳基”,单独或与本文所述的任何其他部分组合,是指含有5至10个(诸如5或6个环原子)的单环芳族环结构,或者具有8至10个原子、含有一个或多个(诸如1-4、1-3或1-2个)的双环芳族基团杂原子,所述杂原子独立地选自由O、S和N组成的组。杂芳基还旨在包括氧化的S或N,诸如亚磺酰基、磺酰基和叔环氮的N-氧化物。碳或杂原子是杂芳环结构的连接点,从而产生稳定的化合物。杂芳基的实例包括但不限于吡啶基、哒嗪基、吡嗪基、喹喔啉基、吲哚嗪基、苯并[b]噻吩基、喹唑啉基、嘌呤基、吲哚基、喹啉基、嘧啶基、吡咯基、吡唑基、噁唑基、噻唑基、噻吩基、异噁唑基、噁噻二唑基、异噻唑基、四唑基、咪唑基、***基、呋喃基、苯并呋喃基和吲哚基。杂芳基可以是未取代的或任选地被一个或多个如下文所述的取代基取代。
除非另外指明,否则“取代的杂芳基”是被一个或多个连接在任何可用的原子上的取代基,例如1、2、3、4或5个,以及1、2或3个取代基,以及1个取代基独立地取代以产生稳定化合物的杂芳基,其中所述取代基如本文所述。“任选地取代的杂芳基”是指杂芳基或取代的杂芳基。
“杂环烷基”是指饱和的或不饱和的非芳族单环、双环、三环或多环环系,它具有3至14个(诸如3至6个)原子,其中环中的1至3个碳原子被O、S或N的杂原子取代。杂环烷基任选地与5-6个环成员的芳基或杂芳基稠合,并且包括氧化的S或N,诸如亚磺酰基、磺酰基和叔环氮的N-氧化物。杂环烷基环的连接点在碳或杂原子处,从而保持稳定的环。杂环烷基的实例包括但不限于吗啉基、四氢呋喃基、二氢吡啶基、哌啶基、吡咯烷基、哌嗪基、二氢苯并呋喃基和二氢吲哚基。杂环烷基可以是未取代的或任选地被一个或多个如下文所述的取代基取代。
“任选地取代的杂环烷基”表示被1至3个连接在任何可用的原子上的取代基,例如1、2或3个取代基取代以产生稳定化合物的杂环烷基,其中所述取代基如本文所述。
术语“腈”或“氰基”可互换使用,是指与杂芳环、芳环和杂环烷基环的碳原子结合的-CN基团。
术语“氧代”是指连接到饱和或不饱和部分的=O原子。=O原子可以连接到碳、硫或氮原子,所述碳、硫或氮原子是环或无环部分的一部分。
“羟基(hydroxyl)或(hydroxy)”是指-OH基团。
取代基-CO2H可以被生物电子等排取代物取代,所述生物电子等排取代物诸如:
Figure BDA0003224737400000121
等等,其中R具有与本文定义的RA相同的定义。参见,例如,THE PRACTICE OFMEDICINAL CHEMISTRY(Academic Press:New York,1996),第203页。
本文所述的化合物可以以各种异构体形式存在,包括构型、几何和构象异构体,包括例如顺式或反式构象。化合物也可以一个或多个互变异构形式存在,包括单一互变异构体和互变异构体的混合物。术语“异构体”旨在涵盖本公开的化合物的所有异构体形式,包括化合物的互变异构体形式。本公开的化合物还可以以开链或环化形式存在。在一些情况下,一种或多种环化形式可以是由于失水而产生的。开链和环化形式的具体组成可以取决于化合物的分离、储存或施用方式。例如,所述化合物在酸性条件下可以主要以开链形式存在,但在中性条件下环化。所有形式都包括在本公开中。
本文所述的一些化合物可具有不对称中心,因此以不同的对映异构体和非对映异构体形式存在。如本文所述的化合物可以是旋光异构体或非对映异构体的形式。因此,本公开涵盖如本文所述的化合物以及它们的用途,所述化合物为其旋光异构体、非对映异构体以及它们的混合物(包括外消旋混合物)形式。本公开的化合物的旋光异构体可以通过已知技术获得,诸如不对称合成、手性色谱、模拟移动床技术或者经由通过使用光学活性拆分剂的立体异构体的化学分离。
除非另外指明,否则术语“立体异构体”是指化合物的一种立体异构体,它基本上不含该化合物的其他立体异构体。因此,具有一个手性中心的立体异构纯化合物将基本上不含所述化合物的相反对映异构体。具有两个手性中心的立体异构纯化合物将基本上不含所述化合物的其他非对映异构体。典型的立体异构纯化合物包含大于约80重量%的化合物的一种立体异构体和小于约20重量%的化合物的其他立体异构体,例如大于约90重量%的化合物的一种立体异构体和小于约10重量%的化合物的其他立体异构体,或大于约95重量%的化合物的一种立体异构体和小于约5重量%的化合物的其他立体异构体,或大于约97重量%的化合物的一种立体异构体和小于约3重量%的化合物的其他立体异构体,或大于约99重量%的化合物的一种立体异构体和小于约1%的化合物的其他立体异构体。如上文所述的立体异构体可被视为包含两种立体异构体的组合物,所述立体异构体以本文所述的它们各自的重量百分比存在。
如果所描绘的结构与赋予该结构的名称之间存在差异,则以所描绘的结构为准。此外,如果结构或结构的一部分的立体化学没有用例如粗体或虚线表示,则结构或结构的部分将被解释为涵盖其所有立体异构体。然而,在一些其中存在多于一个手性中心的情况下,结构和名称可以表示为单个对映异构体,以帮助描述相对立体化学。有机合成领域的技术人员将知道所述化合物是否通过用于制备它们的方法制备为单个对映异构体。
如本文所用,术语“同位素异数体”是同位素富集的化合物。如本文所用,除非另外指明,否则术语“同位素富集的”是指具有不同于该原子的天然丰度同位素组成的同位素组成的原子。“同位素富集的”还可以指含有至少一个这样的原子的化合物:所述原子具有不同于该原子的天然同位素组成的同位素组成。在同位素异数体中,“同位素富集”是指分子中给定原子的特定同位素的量代替该原子的天然同位素组成的掺入百分比。例如,给定位置的1%的氘富集意味着给定样品中1%的分子在指定位置含有氘。由于氘的天然分布为约0.0156%,因此在使用非富集起始材料合成的化合物中的任何位置的氘富集为约0.0156%。
因此,如本文所用,除非另外指明,否则术语“同位素富集因子”是指指定同位素的同位素组成与天然同位素组成之间的比率。
关于本文提供的化合物,当特定原子的位置被称为具有氘或“D”或“2H”时,应当理解该位置处的氘丰度基本上大于氘的天然丰度(为约0.015%)。在特定实施方案中,在每个指定氘原子处,称为具有氘的位置通常具有的最小同位素富集因子为至少1000(15%氘掺入)、至少2000(30%氘掺入)、至少3000(45%氘掺入)、至少3500(52.5%氘掺入)、至少4000(60%氘掺入)、至少4500(67.5%氘掺入)、至少5000(75%氘掺入)、至少5500(82.5%氘掺入)、至少6000(90%氘掺入)、至少6333.3(95%氘掺入)、至少6466.7(97%氘掺入)、至少6600(99%氘掺入)、或至少6633.3(99.5%氘掺入)。本文提供的化合物的同位素富集和同位素富集因子可以使用本领域的普通技术人员已知的常规分析方法(包括质谱和核磁共振光谱)确定。
如本文所用,除非另外指明相反,否则术语“化合物”是包容性的,因为它涵盖化合物或其药学上可接受的盐、立体异构体、同位素异数体和/或互变异构体。因此,例如,式I或II的化合物包括所述化合物的同位素异数体的药学上可接受的盐。
在本说明书中,“药学上可接受的盐”是本文所述的化合物的药学上可接受的有机或无机酸式或碱式盐。代表性的药学上可接受的盐包括例如碱金属盐、碱土金属盐、铵盐、水溶性和水不溶性盐、诸如乙酸盐、氨芪磺酸盐(4,4-二氨基芪-2,2-二磺酸盐)、苯磺酸盐、苯甲酸盐、碳酸氢盐、硫酸氢盐、酒石酸氢盐、硼酸盐、氢溴酸盐、丁酸盐、钙盐、乙二胺四乙酸钙、樟脑磺酸盐、碳酸盐、盐酸盐、柠檬酸盐、克拉维酸盐、二盐酸盐、乙二胺四乙酸盐、乙二磺酸盐、依托酸盐、乙磺酸盐、延胡索酸盐、葡庚糖酸盐、葡萄糖酸盐、谷氨酸盐、甘草酸盐、六氟磷酸盐、己基间苯二酸盐、海巴明盐、氢溴酸盐、盐酸盐、羟基萘甲酸盐、氢碘酸盐、异硫代硫酸盐、乳酸盐、乳糖醛酸盐、月桂酸盐、苹果酸盐、马来酸盐、扁桃酸盐、甲磺酸盐、甲基氢溴酸盐、甲基硝酸盐、甲基硫酸盐、粘酸盐、萘磺酸盐、硝酸盐、N-甲基葡萄糖胺铵盐、3-羟基-2-萘甲酸盐、油酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、巴莫酸盐(1,1-亚甲基-双-2-羟基-3-萘甲酸盐、双羟萘酸盐)、泛酸盐、磷酸盐/二磷酸盐、苦味酸盐、聚半乳糖醛酸盐、丙酸盐、对甲苯磺酸盐、水杨酸盐、硬脂酸盐、碱式乙酸盐、琥珀酸盐、硫酸盐、磺基水杨酸盐、苏拉明酸盐、单宁酸盐、酒石酸盐、茶氯酸盐、甲苯磺酸盐、三乙基碘盐和戊酸盐。药学上可接受的盐在其结构中可具有多于一个带电原子。在这种情况下,药学上可接受的盐可以具有多个抗衡离子。因此,药学上可接受的盐可以具有一个或多个带电原子和/或一个或多个抗衡离子。
术语“治疗(treat)、(treating)和(treatment)”是指疾病或与疾病相关的症状的改善或根除。在某些实施方案中,此类术语是指使一种或多种预防剂或治疗剂施用于患有这种疾病的患者所产生的疾病的传播或恶化最小化。
术语“预防(prevent)、(preventing)和(prevention)”是指预防患者因施用预防剂或治疗剂而导致疾病的发作、复发或扩散。
术语“有效量”是指足以在疾病的治疗或预防中提供治疗或预防有益效果或者延迟或使与疾病相关的症状最小化的如本文所述的化合物或其他活性成分的量。此外,关于如本文所述的化合物的治疗有效量是指单独或与其他疗法组合的治疗剂在疾病的治疗或预防中提供治疗有益效果的量。与如本文所述的化合物结合使用,该术语可涵盖改善总体治疗、减少或避免疾病的症状或病因、或者增强另一种治疗剂的治疗功效或与另一种治疗剂协同作用的量。
“患者”或“受试者”包括动物,诸如人类、奶牛、马、绵羊、羔羊、猪、鸡、火鸡、鹌鹑、猫、狗、小鼠、大鼠、兔或豚鼠。根据一些实施方案,动物是哺乳动物,诸如非灵长类动物和灵长类动物(例如,猴和人)。在一个实施方案中,患者是人类,诸如人类婴儿、儿童、青少年或成人。
“抑制剂”是指防止或减少SAM的合成量的化合物。在一个实施方案中,抑制剂结合至MAT2A。
化合物
如上文通常所述,本公开提供了化合物及其药学上可接受的盐、互变异构体和/或同位素异数体,其中所述化合物符合式I:
Figure BDA0003224737400000151
在式I中,X1是N或CR5,并且X2是N或CR6,其中X1和X2不同时为N。
L是O、S、NR或键。取代基R是H或C1-C6-烷基。
R1选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C3-C6-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基)和-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基),其中R1中的任何烷基是直链的或支链的。
此外,R1任选地被1-6个卤代取代。当X1是N,X2是CR6,L是NR或S,R是H,并且R1是C1-C6-烷基时,则R1被1-6个卤代取代。
或者,在一个实施方案中,当L是NR时,则R和R1可以与L组合在一起形成任选地被一个或多个RA取代的3至6元杂环烷基(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S)。
R2和R3独立地选自由以下各项组成的组:任选地取代的C6-C10-芳基、任选地取代的C3-C6-碳环基、任选地取代的5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S)和任选地取代的3至14元杂环烷基(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S)。
R2和R3独立地和任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:RA、ORA、卤代、-N=N-RA、-NRARB、-(C1-C6-烷基)NRARB、-C(O)ORA、-C(O)NRARB、-OC(O)RA、和-CN。在一些实施方案中,R2和R3独立地和任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:RA、ORA、卤代、-N=N-RA、-NRARB、-(C1-C6-烷基)NRARB、-C(O)ORA、-C(O)NRARB、-OC(O)RA、-NRAC(O)NRARB、和-CN。在其他实施方案中,R2和/或R3是-NRAC(O)NRARB
R4选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、氧代、–CN和-NRCRD
R5选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、–CN和-NRCRD
R6选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基(任选地被一个或多个卤代取代)、和-O(C1-C6-烷基)(任选地被一个或多个取代基取代,所述取代基选自由以下各项组成的组:卤代、-OH、卤代、-CN、-(C1-C6-烷基)NRARB和-NRARB)。
RA和RB独立地选自由以下各项组成的组:H、-CN、-羟基、氧代、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、-NH2、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、-S(O)0-2-(C6-C10-芳基)、-C(O)(C1-C6-烷基)、-C(O)(C3-C14-碳环基)、-C3-C14-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C14-碳环基)、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S)和5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S)。
在RA和RB中,每个烷基、烷氧基、烯基、炔基、芳基、碳环基、杂环烷基和杂芳基部分任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:氘、羟基、卤代、-NR′2(其中每个R′独立地选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S)和5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S)、-NHC(O)(OC1-C6-烷基)、-NO2、-CN、氧代、-C(O)OH、-C(O)O(C1-C6-烷基)、-C1-C6-烷基(C1-C6-烷氧基)、-C(O)NH2、C1-C6-烷基、-C(O)C1-C6-烷基、-OC1-C6-烷基、-Si(C1-C6-烷基)3、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、C6-C10-芳基、-(C1-C6-烷基)(C6-C10-芳基)、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环)(其中1-4个杂环成员独立地选自N、O和S)和-O(C6-C14-芳基)。每个烷基、烯基、芳基和杂环烷基取代基任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:羟基、-OC1-C6-烷基、卤代、-NH2、-(C1-C6-烷基)NH2、-C(O)OH、CN和氧代。
RC和RD各自独立地选自H和C1-C6-烷基。
本公开的另一个实施方案是根据式II的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0003224737400000161
在式II中,X1是N,并且X2是CR6,X1是CR5,并且X2是CR6,X1和X2均为N,或者X1是CR5,并且X2是CR6
L是O、S、NR或键。取代基R是H或C1-C6-烷基。
R1选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C3-C6-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基)和-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基),其中R1中的任何烷基是直链的或支链的。R1任选地被1-6个卤代取代。
在一个实施方案中,当L是NR时,则R和R1可以与L组合在一起形成任选地被一个或多个RA取代的3至6元杂环烷基(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S)。
R2和R3独立地选自由以下各项组成的组:任选地取代的C6-C10-芳基、任选地取代的C3-C6-碳环基、任选地取代的5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S)和任选地取代的3至14元杂环烷基(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S)。R2和R3独立地和任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:RA、ORA、卤代、-N=N-RA、NRARB、-(C1-C6-烷基)NRARB、-C(O)ORA、-C(O)NRARB、-OC(O)RA、和-CN。
R4选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、氧代、–CN和-NRCRD
R5选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、–CN和-NRCRD
R6选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基(任选地被一个或多个卤代取代)、和-O(C1-C6-烷基)(任选地被以下一者或多者取代:卤代、-OH、卤代、-CN、-(C1-C6-烷基)NRARB和-NRARB)。
RA和RB独立地选自由以下各项组成的组:H、-CN、-羟基、氧代、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、-NH2、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、-S(O)0-2-(C6-C10-芳基)、-C(O)(C1-C6-烷基)、-C(O)(C3-C14-碳环基)、-C3-C14-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C14-碳环基)、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S)和5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S)。
RA和RB的每个烷基、烷氧基、烯基、炔基、芳基、碳环基、杂环烷基和杂芳基部分任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:羟基、卤代、-NR′2(其中每个R′独立地选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S)和5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S))、-NHC(O)(OC1-C6-烷基)、-NO2、-CN、氧代、-C(O)OH、-C(O)O(C1-C6-烷基)、-C1-C6-烷基(C1-C6-烷氧基)、-C(O)NH2、C1-C6-烷基、-C(O)C1-C6-烷基、-OC1-C6-烷基、-Si(C1-C6-烷基)3、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、C6-C10-芳基、-(C1-C6-烷基)(C6-C10-芳基)、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环)(其中1-4个杂环成员独立地选自N、O和S)和-O(C6-C14-芳基)。每个烷基、烯基、芳基和杂环烷基任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:羟基、-OC1-C6-烷基、卤代、-NH2、-(C1-C6-烷基)NH2、-C(O)OH、CN和氧代。
RC和RD各自独立地选自H和C1-C6-烷基。
在一些式I化合物中,根据一个实施方案,X1是N,并且X2是CR6。在其他实施方案中,X1是CR5,并且X2是CR6。在另外其他实施方案中,X1是CR5,并且X2是N。或者,X1是CR5,并且X2是CR6
在一些式II化合物中,根据各种实施方案,X1是N,并且X2是CR6。其他实施方案提供了X1和X2,它们都可作为N。在其他实施方案中,X1是CR5,并且X2是CR6
结合本文所述的任何实施方案,根据一个实施方案,R4和R5(当存在时)中的每个独立地选自H和C1-C6-烷基。此外,R6(当存在时)选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基(任选地被一个或多个卤代取代)、-O(C1-C6-烷氧基)、-(C1-C6-烷基)NRARB和-NRARB(其中RA和RB独立地选自H和C1-C6-烷基)。
在多个实施方案中,任选地结合本文所述的任何其他实施方案,R4、R5和R6(当存在时)中的至少一个是H。因此,例如,至少R4是H,R5是H,或者R6是H。满足本文任何实施方案中描述的结构要求的示例性化合物也是其中R4、R5和R6(当存在时)中的每个是H的化合物。
根据任选地结合任何其他实施方案的另一个实施方案,本公开提供的化合物R2是任选地取代的C6-C10-芳基或任选地取代的5至10元杂芳基。因此,例如,R2是任选地取代的C6-C10-芳基,诸如任选地取代的苯基。或者,R2是任选地取代的5至10元杂芳基,并且其中1个环成员是N。R2的实例是任选地取代的吡啶基。
根据各种实施方案,化合物的子集是其中R3是任选地取代的3至14元杂环烷基或任选地取代的5至10元杂芳基的化合物。R3的实例包括苯并噻唑基、苯并异噻唑基、苯并噁唑基、吡啶基、吡啶酮基、哒嗪基、苯并咪唑基、苯并***基、吲唑基、喹喔啉基、喹啉基、喹唑啉基、咪唑并吡啶基、吡唑并吡啶基、***并吡啶基、噌啉基、异噁唑基、吡唑基、苯并呋喃基、二氢苯并呋喃基、二氢苯并二噁英基和四氢苯并二噁英基,其中上述部分中的任一者是任选地取代的。
在其他实施方案中,R3是任选地取代的C6-C10-芳基。在本文中,R3的一个实例是任选地取代的苯基。
任选地结合任何其他实施方案,本公开的一些实施方案提供了其中R2是任选地取代的苯基并且R3是任选地取代的3至14元杂环烷基或任选地取代的5至10元杂芳基的化合物。
在一个实施方案中,如任何其他实施方案所述的化合物是其中L是O或NR的化合物。任选地结合该实施方案,R1是任选地取代的C1-C6-烷基或任选地取代的C3-C6-碳环基。一个示例性实施方案是其中R1是任选地被1-3个F取代的C1-C3-烷基的化合物。
在任选地结合本文所述的任何其他实施方案的多个实施方案中,L是O或NR并且R是H;R1是C1-C3-烷基(任选地被1-3个F取代);R2是任选地取代的3至14元杂环烷基或任选地取代的5至10元杂芳基(其中1个杂环烷基或杂芳基成员是N)或任选地取代的C6-C10-芳基;R3是任选地取代的3至14元杂环烷基、任选地取代的5至10元杂芳基,其中1至3个杂环烷基或杂芳基成员独立地选自N、O和S,或任选地取代的C6-C10-芳基;并且R4、R5和R6(当存在时)中的每个是H。
例如,L是NR。或者或此外,R2是任选地取代的苯基;并且R3是任选地取代的5至10元杂芳基,其中1至3个杂芳基成员独立地选自N、O和S。例如,R3选自由以下各项组成的组:任选地取代的苯并噻唑基、苯并异噻唑基、苯并噁唑基、吡啶基、吡啶酮基、哒嗪基、苯并咪唑基、苯并***基、吲唑基、喹喔啉基、喹啉基、喹唑啉基、咪唑并吡啶基、吡唑并吡啶基、***并吡啶基、噌啉基、异噁唑基、吡唑基、苯并呋喃基、二氢苯并呋喃基、二氢苯并二噁英基和四氢苯并二噁英基,它们中的任一者可以是任选地取代的。
在其他实施方案中,R2是任选地取代的5至10元杂芳基,其中1至3个杂芳基成员独立地选自N、O和S;并且R3是任选地取代的苯基。在另外其他实施方案中,R2和R3独立地是任选地取代的苯基。
在多个实施方案中,本公开提供了分别如下表1和表2以及表3和表4所示的式I和式II化合物及其药学上可接受的盐、互变异构体和/或同位素异数体的具体实例。
表1:式I化合物的实例
Figure BDA0003224737400000191
Figure BDA0003224737400000201
Figure BDA0003224737400000211
Figure BDA0003224737400000221
Figure BDA0003224737400000231
Figure BDA0003224737400000241
Figure BDA0003224737400000251
Figure BDA0003224737400000261
Figure BDA0003224737400000271
Figure BDA0003224737400000281
Figure BDA0003224737400000291
Figure BDA0003224737400000301
Figure BDA0003224737400000311
Figure BDA0003224737400000321
Figure BDA0003224737400000331
Figure BDA0003224737400000341
Figure BDA0003224737400000351
Figure BDA0003224737400000361
Figure BDA0003224737400000371
表2:式II化合物的实例
Figure BDA0003224737400000372
Figure BDA0003224737400000381
表3:式I和II化合物的实例
Figure BDA0003224737400000382
Figure BDA0003224737400000391
Figure BDA0003224737400000401
Figure BDA0003224737400000411
表4:式I化合物的实例
Figure BDA0003224737400000421
药物组合物
本公开还提供了一种药物组合物,所述药物组合物包含与药学上可接受的载剂混合的治疗有效量的一种或多种根据式I、式II的化合物或其药学上可接受的盐、立体异构体、互变异构体和/或同位素异数体。在一些实施方案中,根据药物试剂的可接受规范,所述组合物还包含一种或多种另外的治疗剂、药学上可接受的赋形剂、稀释剂、佐剂、稳定剂、乳化剂、防腐剂、着色剂、缓冲剂、风味赋予剂。
在一个实施方案中,所述药物组合物包含选自表1和2中所示的那些化合物或其药学上可接受的盐、立体异构体、互变异构体和/或同位素异数体,以及药学上可接受的载剂。
本公开的药物组合物以符合良好医学实践的方式配制、给药和施用。在此背景下考虑的因素包括所治疗的具体病症、所治疗的具体受试者、受试者的临床状况、病症的致因、药剂的递送部位、施用方法、施用时间表以及从业医生已知的其他因素。
所施用的化合物(或其药学上可接受的盐、立体异构体、互变异构体和/或同位素异数体)的“治疗有效量”受此类考虑控制,并且是对癌症发挥细胞毒性作用,或抑制MAT2A活性,或它们二者所需的最小量。这种量可以低于对正常细胞或整个受试者有毒的量。通常,所施用的本公开的化合物(或其药学上可接受的盐、立体异构体或互变异构体)的初始治疗有效量在约0.01至约200mg/kg或约0.1至约20mg/kg患者体重/天的范围内,典型的初始范围为约0.3至约15mg/kg/天。口服单位剂型,例如片剂和胶囊剂,可以含有约1mg至约1000mg的本公开的化合物(或其药学上可接受的盐、立体异构体或互变异构体)。在另一个实施方案中,此类剂型含有约50mg至约500mg的本公开的化合物(或其药学上可接受的盐、立体异构体或互变异构体)。在又一个实施方案中,此类剂型含有约25mg至约200mg的本公开的化合物(或其药学上可接受的盐、立体异构体或互变异构体)。在又一个实施方案中,此类剂型含有约10mg至约100mg的本公开的化合物(或其药学上可接受的盐、立体异构体或互变异构体)。在另一个实施方案中,此类剂型含有约5mg至约50mg的本公开的化合物(或其药学上可接受的盐、立体异构体或互变异构体)。
本发明的组合物可以以剂量单位制剂的形式口服、局部、肠胃外、通过吸入或喷雾或直肠施用。本文使用的术语肠胃外包括皮下注射、静脉内、肌肉内、胸骨内注射或输注技术。
如本文所述的合适的口服组合物包括但不限于片剂、糖锭剂、锭剂、水性或油性混悬剂、可分散粉末剂或颗粒剂、乳剂、硬胶囊剂或软胶囊剂、糖浆剂或酏剂。
在另一个方面,还涵盖适合单一单位剂量的药物组合物,所述药物组合物包含本公开的化合物或其药学上可接受的立体异构体、盐或互变异构体和药学上可接受的载剂。
适合口服使用的本发明的组合物可以根据本领域已知的用于制造药物组合物的任何方法来制备。例如,本发明的化合物的液体制剂含有一种或多种选自由以下各项组成的组的试剂:甜味剂、调味剂、着色剂和防腐剂,以提供可药用的MAT2A抑制剂制备物。
对于片剂组合物,本公开的化合物与无毒的药学上可接受的赋形剂混合用于制备片剂。此类赋形剂的实例包括但不限于惰性稀释剂,诸如碳酸钙、碳酸钠、乳糖、磷酸钙或磷酸钠;造粒剂和崩解剂,例如玉米淀粉或藻酸;粘合剂,例如淀粉、明胶或***胶,以及润滑剂,例如硬脂酸镁、硬脂酸或滑石。片剂可以是未包衣的,或者它们可以通过已知的包衣技术进行包衣,以延迟在胃肠道中的崩解和吸收,从而在所期望的时间期内提供持续的治疗作用。例如,可以使用延时材料,诸如单硬脂酸甘油酯或二硬脂酸甘油酯。
口服制剂也可以作为硬明胶胶囊,其中活性成分与惰性固体稀释剂混合,所述惰性固体稀释剂例如碳酸钙、磷酸钙或高岭土,或作为软明胶胶囊,其中活性成分与水或油介质混合,所述油介质例如花生油、液体石蜡或橄榄油。
对于水性混悬剂,将本公开的化合物与适用于维持稳定混悬剂的赋形剂混合。此类赋形剂的实例包括但不限于羧甲基纤维素钠、甲基纤维素钠、羟丙基甲基纤维素钠、藻酸钠、聚乙烯吡咯烷酮、黄蓍胶和***胶。
口服混悬剂还可以含有分散剂或润湿剂,诸如天然存在的磷脂,例如卵磷脂,或环氧烷与脂肪酸的缩合产物,例如聚氧乙烯硬脂酸酯,或环氧乙烷与长链脂肪醇的缩合产物,例如十七乙烯氧基鲸蜡醇,或环氧乙烷与来源于脂肪酸和己糖醇的偏酯的缩合产物,诸如聚氧乙烯山梨糖醇单油酸酯,或环氧乙烷与来源于脂肪酸和己糖醇酐的偏酯的缩合产物,例如聚乙烯脱水山梨糖醇单油酸酯。水性混悬剂还可以含有一种或多种防腐剂(例如对羟基苯甲酸乙酯或对羟基苯甲酸正丙酯)、一种或多种着色剂、一种或多种调味剂和一种或多种甜味剂(诸如蔗糖或糖精)。
油性混悬剂可以通过将本公开的化合物悬浮于植物油(例如花生油、橄榄油、芝麻油或椰子油)中,或悬浮于矿物油(诸如液体石蜡)中来配制。油性混悬剂可以含有增稠剂,例如蜂蜡、硬石蜡或鲸蜡醇。
可以加入甜味剂(诸如上述甜味剂)和调味剂以提供可口的口服制备物。这些组合物可以通过添加抗氧化剂(诸如抗坏血酸)来保存。
适用于通过添加水来制备水性混悬剂的可分散粉末剂和颗粒剂提供与分散剂或润湿剂、助悬剂和一种或多种防腐剂混合的本公开的化合物。合适的分散剂或润湿剂和助悬剂的示例为上文已经提及的那些。还可以提供另外的赋形剂,例如甜味剂、调味剂和着色剂。
本公开的药物组合物也可以是水包油乳剂的形式。油相可以是植物油(例如橄榄油或花生油)或矿物油(例如液体石蜡)或它们的混合物。合适的乳化剂可以是天然存在的树胶(例如***胶或黄蓍胶)天然存在的磷脂(例如大豆磷脂)、卵磷脂和来源于脂肪酸和己糖醇的酯或偏酯、酸酐(例如脱水山梨糖醇单油酸酯)以及所述偏酯与环氧乙烷的缩合反应产物(例如聚氧乙烯脱水山梨糖醇单油酸酯)。乳剂还可以含有甜味剂和调味剂。
糖浆剂和酏剂可以与甜味剂一起配制,所述甜味剂例如甘油、丙二醇、山梨糖醇或蔗糖。此类制剂还可以包含缓和剂、防腐剂以及调味剂和着色剂。药物组合物可以是无菌注射剂、水性混悬剂或油性混悬剂的形式。该混悬剂可以根据已知技术使用上文提及的那些合适的分散剂或润湿剂和悬浮剂来配制。无菌注射用制备物也可以是在无毒的肠胃外可接受的稀释剂或溶剂中的无菌注射用溶液剂或混悬剂,例如作为溶于1,3-丁二醇中的溶液。在可以采用的可接受的媒介物和溶剂中有水、林格氏溶液和等渗氯化钠溶液。另外,无菌的不挥发性油照常规用作溶剂或悬浮介质。为此,可以使用任何温和的不挥发性油,包括合成的甘油单酯或甘油二酯。此外,脂肪酸(诸如油酸)可用于制备注射剂。
对于药物的直肠施用,通式I或II的化合物也可以栓剂形式施用。这些组合物可以通过将药物与合适的无刺激性赋形剂混合来制备,所述赋形剂在常温下为固体,但在直肠温度下为液体,因此会在直肠中熔化以释放药物。这种材料是可可脂和聚乙二醇。
用于肠胃外施用的组合物在无菌介质中施用。根据所使用的媒介物和制剂中药物的浓度,肠胃外制剂可以是含有溶解药物的混悬剂或溶液剂。佐剂(诸如局部麻醉剂、防腐剂和缓冲剂)也可以添加到肠胃外组合物中。
使用方法
MAT2A酶在细胞中催化从甲硫氨酸和ATP合成S-腺苷甲硫氨酸(SAM)。因此,在本公开的另一个实施方案中,提供了一种抑制细胞中的SAM合成的方法,所述方法包括将有效量的式I或II的化合物或其药学上可接受的盐、立体异构体、互变异构体和/或同位素异数体引入细胞中。在本公开的其他实施方案中,提供了一种抑制细胞中的SAM合成的方法,所述方法包括将有效量的至少一种本文所述的化合物或其药学上可接受的盐、立体异构体、互变异构体和/或同位素异数体引入细胞中。在一些实施方案中,细胞在受试者中。在一些实施方案中,式I或式II化合物用于鉴定作为MAT2A的抑制剂的其他化合物,例如在用于结合至MAT2A或用于抑制SAM产生的竞争测定中。可以在存在和不存在本公开的未标记化合物的情况下测量具有可检测标记的测试化合物对MAT2A的结合或对SAM产生的抑制。
本公开还提供了一种用于治疗患有癌症的受试者的癌症的方法,所述方法包括向所述受试者施用有效量的如本文所述的MAT2A抑制剂化合物。在一些实施方案中,MAT2A抑制剂是式I或II化合物或其药学上可接受的盐、立体异构体、互变异构体和/或同位素异数体。在一个实施方案中,任选地与任何其他实施方案组合,受试者是哺乳动物,诸如人类。
在一个实施方案中,癌症是MTAP缺失的癌症。在一些实施方案中,癌症选自由以下各项组成的组:间皮瘤、神经母细胞瘤、肠癌(诸如直肠癌)、结肠癌、家族性腺瘤性息肉病性癌和遗传性非息肉病性结肠直肠癌、食道癌、唇癌、喉癌、下咽癌、舌癌、唾液腺癌、胃癌、腺癌、甲状腺髓样癌、甲状腺***样癌、肾癌、肾薄壁组织癌、卵巢癌、***、子宫体癌、子宫内膜癌、绒毛膜癌、胰腺癌、***癌、膀胱癌、睾丸癌、乳腺癌、泌尿系癌、黑素瘤、脑肿瘤、头颈癌、淋巴瘤、急性淋巴性白血病(ALL)、慢性淋巴性白血病(CLL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性骨髓性白血病(CML)、肝细胞癌、胆囊癌、支气管癌、小细胞肺癌(SCLC)、非小细胞肺癌(NSCLC)、多发性骨髓瘤(MM)、基底细胞瘤、畸胎瘤、视网膜母细胞瘤、脉络膜黑素瘤、***瘤、横纹肌肉瘤、骨肉瘤、软骨肉瘤、肌肉瘤、脂肪肉瘤、纤维肉瘤、尤文氏肉瘤和浆细胞瘤。
在其他实施方案中,癌症选自肺癌、非小细胞肺癌、细支气管肺泡细胞肺癌、骨癌、胰腺癌、皮肤癌症、头颈癌、皮肤或眼内黑素瘤、子宫癌、卵巢癌、直肠癌、***区癌症、胃部癌、胃癌、结肠癌、乳腺癌、子宫癌、输卵管癌、子宫内膜癌、***、***癌、外阴癌、霍奇金氏病、食管癌、小肠癌、内分泌***癌症、甲状腺癌症、甲状旁腺癌症、肾上腺癌症、软组织肉瘤、尿道癌症、***癌症、***癌、膀胱癌症、肾或输尿管癌症、肾细胞癌、肾盂癌、间皮瘤、肝细胞癌、胆道癌、慢性或急性白血病、淋巴细胞性淋巴瘤、中枢神经***(CNS)的赘生物、脊柱肿瘤、脑干胶质瘤、多形性胶质母细胞瘤、星形细胞瘤、神经鞘瘤、室管膜瘤、成神经管细胞瘤、脑膜瘤、鳞状细胞癌、脑垂体腺瘤(包括任何上述癌症的耐药性和/或难治性形式)以及一种或多种上述癌症的组合。
在一些实施方案中,癌症选自由以下各项组成的组:B细胞急性淋巴细胞性白血病(B-ALL)、间皮瘤、淋巴瘤、胰腺癌、肺癌、胃癌、食管癌、膀胱癌、脑癌、头颈癌、黑素瘤和乳腺癌。
在其他实施方案中,肺癌是非小细胞肺癌、小细胞肺癌、肺腺癌和肺鳞状细胞癌。
在其他实施方案中,乳腺癌是三阴性乳腺癌(TNBC)。
在其他实施方案中,脑癌是脑肿瘤,所述脑肿瘤选自由以下各项组成的组:胶质瘤、胶质母细胞瘤、星形细胞瘤、脑膜瘤、成神经管细胞瘤、外周神经外胚层肿瘤和颅咽管瘤。
在另外其他实施方案中,癌症是淋巴瘤,所述淋巴瘤选自由以下各项组成的组:套细胞淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)和成人T细胞白血病/淋巴瘤(ATLL)。如本文所用,表述成人T细胞白血病/淋巴瘤是指可在血液(白血病)、***(淋巴瘤)、皮肤或身体的多个区域中存在的罕见和常见浸润性T细胞淋巴瘤。
如上文通常所述,甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)是一种存在于所有正常组织中的酶,它催化甲硫腺苷(MTA)转化为腺嘌呤和5-甲硫核糖-1-磷酸。腺嘌呤的补救生成单磷酸腺苷,并且5-甲硫核糖-1-磷酸转化为甲硫氨酸和甲酸。由于这种补救途径,当从头嘌呤合成(例如通过抗代谢物(诸如丙氨菌素(L-alanosine))合成)被阻断时,MTA可以作为替代性嘌呤来源。很多人和鼠恶性细胞缺乏MTAP活性。MTAP缺陷不仅存在于组织培养细胞中,而且还存在于原发性白血病、胶质瘤、黑素瘤、胰腺癌、非小细胞肺癌(NSCLC)、膀胱癌、星形细胞瘤、骨肉瘤、头颈癌、粘液样软骨肉瘤、卵巢癌、子宫内膜癌、乳腺癌、软组织肉瘤、非霍奇金淋巴瘤和间皮瘤。例如,MTAP无效,即MTAP缺失的癌细胞的增殖通过用shRNA敲低MAT2A表达来抑制,这已经使用MAT2A的小分子抑制剂得到证实。K.Marjon等人,Cell Reports 15(2016)574–587,该文献以引用的方式并入本文。MTAP无效或MTAP缺失的癌症是其中MTAP基因已缺失或丢失或失活的癌症,或者其中MTAP蛋白功能降低或受损或存在减少的癌症。
因此,在本公开的一个实施方案中,提供了一种用于治疗受试者的癌症的方法,其中与其中MTAP基因或蛋白质存在和/或完全发挥功能的癌症相比,或与具有野生型MTAP基因的癌症相比,所述癌症的特征在于MTAP表达的降低或缺失、或MTAP基因的缺失或MTAP蛋白的功能降低。所述方法包括向受试者施用治疗有效量的式I或II的化合物或其药学上可接受的盐、立体异构体、或互变异构体。
在另一个实施方案中,提供了治疗受试者的MTAP缺失癌症的方法,所述方法包括向受试者施用有效量的式I、式II的化合物或其药学上可接受的盐、立体异构体、互变异构体和/或同位素异数体。在一个实施方案中,MTAP缺失的癌症选自白血病、胶质瘤、黑素瘤、胰腺癌、非小细胞肺癌(NSCLC)、膀胱癌、星形细胞瘤、骨肉瘤、头颈癌、粘液样软骨肉瘤、卵巢癌、子宫内膜癌、乳腺癌、软组织肉瘤、淋巴瘤和间皮瘤。
在一个实施方案中,MTAP缺失的癌症是胰腺癌。在另一个实施方案中,MTAP缺失的癌症选自膀胱癌、黑素瘤、脑癌、肺癌、胰腺癌、乳腺癌、肝癌、食道癌、胃癌、结肠癌、头颈癌、肾癌、结肠癌、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、急性淋巴性白血病(ALL)、套细胞淋巴瘤(MCL)、多形性胶质母细胞瘤(GBM)和非小细胞肺癌(NSCLC)。
MTAP无效细胞系的基因组分析显示,包含KRAS突变或p53突变的细胞系对MAT2A抑制敏感。因此,本公开的一个实施方案提供了一种用于治疗受试者的癌症的方法,其中所述癌症的特征在于MTAP表达的降低或缺失、或MTAP基因的缺失或MTAP蛋白的功能降低,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的式I或II的化合物、或其药学上可接受的盐、立体异构体、互变异构体和/或同位素异数体,其中所述癌症的特征还在于突变KRAS或突变p53的存在。在一个实施方案中,提供了一种治疗受试者中具有突变KRAS或突变p53的MTAP无效癌症的方法,所述方法包括向受试者施用有效量的式I或II的化合物或其药学上可接受的盐、立体异构体、互变异构体和/或同位素异数体。例如,癌症是MTAP无效和KRAS突变、MTAP无效和p53突变,或MTAP无效、KRAS突变和p53突变中的每个。
术语“突变KRAS”或“KRAS突变”是指KRAS蛋白结合了改变其正常功能的活化突变和编码这种蛋白质的基因。例如,突变KRAS蛋白可以在第12或13位结合单个氨基酸置换。在一个特定实施方案中,KRAS突变结合了G12X或G13X置换,其中X表示指定位置处的任何氨基酸变化。在一个特定实施方案中,置换是G12V、G12R、G12C或G13D。在另一个实施方案中,置换是G13D。所谓“突变p53”或“p53突变”是指p53蛋白(或编码所述蛋白质的基因)结合了抑制或消除其肿瘤抑制功能的突变。在一个实施方案中,所述p53突变是Y126_splice、K132Q、M133K、R174fs、R175H、R196*、C238S、C242Y、G245S、R248W、R248Q、I255T、D259V、S261_splice、R267P、R273C、R282W、A159V或R280K。在一个实施方案中,前述癌症是非小细胞肺癌(NSCLC)、胰腺癌、头颈癌、胃癌、乳腺癌、结肠癌或卵巢癌。
在另一个实施方案中,本文公开的化合物可用作降解疾病相关蛋白的配体。这种方法的一个实例是PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)。PROTAC是双功能分子,它包含选自本文公开的化合物之一的配体部分(所述配体部分能够结合靶蛋白)和连接酶靶向部分(诸如被E3连接酶识别和多泛素化的肽部分(称为降解决定子))。因此,PROTAC与靶蛋白非共价结合,并通过降解决定子募集E3连接酶,这导致结合靶标的多泛素化和降解。许多出版物描述了PROTAC在各种治疗领域(包括肿瘤学)的临床前使用。参见,例如,Lu等人Chemistry&Biology 22(2015)755-763。
方面
方面1.一种根据式I的化合物:
Figure BDA0003224737400000481
其中
X1是N或CR5
X2是N或CR6,其中X1和X2不同时为N;
L是O、S、NR或键;
R是H或C1-C6-烷基;
R1选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C3-C6-碳环基、
-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基)和-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基),其中
R1中的任何烷基是直链的或支链的,
R1任选地被1-6个卤代取代;并且
当X1是N,X2是CR6,L是NR或S,R是H,并且R1是C1-C6-烷基时,则R1被1-6个卤代取代;
或者,当L是NR时,则R和R1可以与L组合在一起形成任选地被一个或多个RA取代的3至6元杂环烷基(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S);
R2和R3独立地选自由以下各项组成的组:C6-C10-芳基、C3-C6-碳环基、5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S)和3至14元杂环烷基(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S),
其中R2和R3独立地和任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:RA、ORA、卤代、-N=N-RA、-NRARB、-(C1-C6-烷基)NRARB、-C(O)ORA、-C(O)NRARB、-OC(O)RA、和-CN;
R4选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、氧代、–CN和-NRCRD
R5选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、–CN和-NRCRD
R6选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基(任选地被一个或多个卤代、-O(C1-C6-烷基)(任选地被一个或多个卤代取代)、-OH、卤代、-CN、-(C1-C6-烷基)NRARB和-NRARB
RA和RB独立地选自由以下各项组成的组:H、-CN、-羟基、氧代、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、-NH2、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、-S(O)0-2-(C6-C10-芳基)、-C(O)(C1-C6-烷基)、-C(O)(C3-C14-碳环基)、-C3-C14-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C14-碳环基)、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S)和5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S);
其中RA和RB的每个烷基、烷氧基、烯基、炔基、芳基、碳环基、杂环烷基和杂芳基部分任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:羟基、卤代、-NR′2(其中每个R′独立地选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S)和5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S))、-NHC(O)(OC1-C6-烷基)、-NO2、-CN、氧代、-C(O)OH、-C(O)O(C1-C6-烷基)、-C1-C6-烷基(C1-C6-烷氧基)、-C(O)NH2、C1-C6-烷基、-C(O)C1-C6-烷基、-OC1-C6-烷基、-Si(C1-C6-烷基)3、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、C6-C10-芳基、-(C1-C6-烷基)(C6-C10-芳基)、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环)(其中1-4个杂环成员独立地选自N、O和S)和-O(C6-C14-芳基),其中每个烷基、烯基、芳基和杂环烷基任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:羟基、-OC1-C6-烷基、卤代、-NH2、-(C1-C6-烷基)NH2、-C(O)OH、CN和氧代,
RC和RD各自独立地选自H和C1-C6-烷基;
或其药学上可接受的盐。
方面2.一种根据式II的化合物:
Figure BDA0003224737400000501
其中
X1是N,并且X2是CR6,或者X1是CR5,并且X2是CR6,X1和X2均为N,或者X1是CR5,并且X2是CR6
L是O、S、NR或键;
R是H或C1-C6-烷基;
R1选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C3-C6-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基)和-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基),其中
R1中的任何烷基是直链的或支链的,
R1任选地被1-6个卤代取代;
或者,当L是NR时,则R和R1可以与L组合在一起形成任选地被一个或多个RA取代的3至6元杂环烷基(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S);
R2和R3独立地选自由以下各项组成的组:C6-C10-芳基、C3-C6-碳环基、5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S)和3至14元杂环烷基(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S),
其中R2和R3独立地和任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:RA、ORA、卤代、-N=N-RA、-NRARB、-(C1-C6-烷基)NRARB、-C(O)ORA、-C(O)NRARB、-OC(O)RA、和-CN;
R4选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、氧代、–CN和-NRCRD
R5选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、–CN和-NRCRD
R6选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基(任选地被一个或多个卤代、-O(C1-C6-烷基)(任选地被一个或多个卤代取代)、-OH、卤代、-CN、-(C1-C6-烷基)NRARB和-NRARB
RA和RB独立地选自由以下各项组成的组:H、-CN、-羟基、氧代、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、-NH2、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、-S(O)0-2-(C6-C10-芳基)、-C(O)(C1-C6-烷基)、-C(O)(C3-C14-碳环基)、-C3-C14-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C14-碳环基)、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S)和5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S);
其中RA和RB的每个烷基、烷氧基、烯基、炔基、芳基、碳环基、杂环烷基和杂芳基部分任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:羟基、卤代、-NR′2(其中每个R′独立地选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S)和5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S))、-NHC(O)(OC1-C6-烷基)、-NO2、-CN、氧代、-C(O)OH、-C(O)O(C1-C6-烷基)、-C1-C6-烷基(C1-C6-烷氧基)、-C(O)NH2、C1-C6-烷基、-C(O)C1-C6-烷基、-OC1-C6-烷基、-Si(C1-C6-烷基)3、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、C6-C10-芳基、-(C1-C6-烷基)(C6-C10-芳基)、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环)(其中1-4个杂环成员独立地选自N、O和S)和-O(C6-C14-芳基),其中RA和RB中的每个烷基、烯基、芳基和杂环烷基任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:羟基、-OC1-C6-烷基、卤代、-NH2、-(C1-C6-烷基)NH2、-C(O)OH、CN和氧代,
RC和RD各自独立地选自H和C1-C6-烷基;
或其药学上可接受的盐。
方面3.根据方面1所述的化合物,其中X1是N,并且X2是CR6
方面4.根据方面1所述的化合物,其中X1是CR5,并且X2是CR6
方面5.根据方面1所述的化合物,其中X1是CR5,并且X2是N。
方面6.根据方面2所述的化合物,其中X1是CR5,并且X2是CR6
方面7.根据方面2所述的化合物,其中X1是N,并且X2是CR6
方面8.根据方面2所述的化合物,其中X1和X2均为N。
方面9.根据方面2所述的化合物,其中X1是CR5,并且X2是CR6
方面10.根据方面1-9中任一项所述的化合物,其中R4和R5(当存在时)中的每个独立地选自H和C1-C6-烷基,并且R6(当存在时)选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基(任选地被一个或多个卤代取代)、C1-C6-烷氧基、-(C1-C6-烷基)NRARB和-NRARB(其中RA和RB独立地选自H和C1-C6-烷基)。
方面11.根据方面1至9中任一项所述的化合物,其中R4、R5和R6(当存在时)中的至少一个是H。
方面12.根据方面1至11中任一项所述的化合物,其中R4是H。
方面13.根据方面1至11中任一项所述的化合物,其中R5是H。
方面14.根据方面1至11中任一项所述的化合物,其中R6是H。
方面15.根据方面1至14中任一项所述的化合物,其中R4和R5和R6(当存在时)中的每个是H。
方面16.根据方面1至15中任一项所述的化合物,其中R2是C6-C10-芳基或5至10元杂芳基。
方面17.根据方面16所述的化合物,其中R2是C6-C10-芳基。
方面18.根据方面17所述的化合物,其中R2是苯基。
方面19.根据方面16所述的化合物,其中R2是5至10元杂芳基,并且其中1个环成员是N。
方面20.根据方面19所述的化合物,其中R2是吡啶基。
方面21.根据方面1至20中任一项所述的化合物,其中R3是3至14元杂环烷基或5至10元杂芳基。
方面22.根据方面21所述的化合物,其中R3选自由以下各项组成的组:苯并噻唑基、苯并异噻唑基、苯并噁唑基、吡啶基、吡啶酮基、哒嗪基、苯并咪唑基、苯并***基、吲唑基、喹喔啉基、喹啉基、喹唑啉基、咪唑并吡啶基、吡唑并吡啶基、***并吡啶基、噌啉基、异噁唑基、吡唑基、苯并呋喃基、二氢苯并呋喃基、二氢苯并二噁英基和四氢苯并二噁英基。
方面23.根据方面1至20中任一项所述的化合物,其中R3是C6-C10-芳基。
方面24.根据方面23所述的化合物,其中R3是苯基。
方面25.根据方面1至15中任一项所述的化合物,其中R2是苯基,并且R3是3至14元杂环烷基或5至10元杂芳基。
方面26.根据方面1至25中任一项所述的化合物,其中L是O或NR。
方面27.根据方面26所述的化合物,其中R1是C1-C6-烷基或C3-C6-碳环基。
方面28.根据方面26或27所述的化合物,其中R1是任选地被1-3个F取代的C1-C3-烷基。
方面29.根据方面1-9中任一项所述的化合物,其中
L是O或NR,并且R是H;
R1是任选地被1-3个F取代的C1-C3-烷基;
R2是3至14元杂环烷基或5至10元杂芳基(其中1个杂环烷基或杂芳基成员是N)或C6-C10-芳基;
R3是3至14元杂环烷基、或5至10元杂芳基,其中1至3个杂环烷基或杂芳基成员独立地选自N、O和S,或者C6-C10-芳基;并且
R4、R5和R6(当存在时)中的每个都是H。
方面30.根据方面29所述的化合物,其中L是NR。
方面31.根据方面29或30所述的化合物,其中
R2是任选地取代的苯基;并且
R3是任选地取代的5至10元杂芳基,其中1至3个杂芳基成员独立地选自N、O和S。
方面32.根据方面29或30所述的化合物,其中
R2是任选地取代的5至10元杂芳基,其中1至3个杂芳基成员独立地选自N、O和S;并且
R3是任选地取代的苯基。
方面33.根据方面31所述的化合物,其中R3选自由以下各项组成的组:任选地取代的苯并噻唑基、苯并异噻唑基、苯并噁唑基、吡啶基、吡啶酮基、哒嗪基、苯并咪唑基、苯并***基、吲唑基、喹喔啉基、喹啉基、喹唑啉基、咪唑并吡啶基、吡唑并吡啶基、***并吡啶基、噌啉基、异噁唑基、吡唑基、苯并呋喃基、二氢苯并呋喃基、二氢苯并二噁英基和四氢苯并二噁英基。
方面34.根据方面29或30所述的化合物,其中R2和R3独立地是任选地取代的苯基。
方面35.根据方面1所述的化合物,其中所述化合物选自下表:
Figure BDA0003224737400000541
Figure BDA0003224737400000551
Figure BDA0003224737400000561
Figure BDA0003224737400000571
Figure BDA0003224737400000581
Figure BDA0003224737400000591
Figure BDA0003224737400000601
Figure BDA0003224737400000611
Figure BDA0003224737400000621
Figure BDA0003224737400000631
Figure BDA0003224737400000641
Figure BDA0003224737400000651
Figure BDA0003224737400000661
Figure BDA0003224737400000671
Figure BDA0003224737400000681
Figure BDA0003224737400000691
Figure BDA0003224737400000701
Figure BDA0003224737400000711
方面36.根据方面2所述的化合物,其中所述化合物选自下表:
Figure BDA0003224737400000712
Figure BDA0003224737400000721
方面37.一种药物组合物,所述药物组合物包含治疗有效量的根据方面1至36中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的载剂。
方面38.一种用于治疗患有癌症的受试者的癌症的方法,所述方法包括向所述受试者施用有效量的根据方面1-36中任一项所述的MAT2A抑制剂化合物或其药学上可接受的盐。
方面39.根据方面38所述的方法,其中所述癌症是MTAP缺失的癌症。
方面40.一种用于抑制细胞中的S-腺苷甲硫氨酸(SAM)的合成的方法,所述方法包括将有效量的根据方面1至36中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐引入所述细胞中。
方面41.根据方面40所述的方法,其中所述细胞在受试者中。
方面42.一种用于抑制受试者中的S-腺苷甲硫氨酸(SAM)的合成的方法,所述方法包括向所述受试者施用有效量的至少一种根据方面1至36中任一项所述的化合物或其盐。
方面43.一种用于治疗患有癌症的受试者的癌症的方法,所述方法包括向所述受试者施用有效量的根据方面1至36中任一项所述的化合物。
方面44.根据方面43所述的方法,其中所述癌症是MTAP缺失的癌症。
方面45.根据方面38、39、43或44所述的方法,其中所述癌症选自由以下各项组成的组:间皮瘤、神经母细胞瘤、直肠癌、结肠癌、家族性腺瘤性息肉病性癌和遗传性非息肉病性结肠直肠癌、食道癌、唇癌、喉癌、下咽癌、舌癌、唾液腺癌、胃癌、腺癌、甲状腺髓样癌、甲状腺***样癌、肾癌、肾薄壁组织癌、卵巢癌、***、子宫体癌、子宫内膜癌、绒毛膜癌、胰腺癌、***癌、膀胱癌、睾丸癌、乳腺癌、泌尿系癌、黑素瘤、脑肿瘤、淋巴瘤、头颈癌、急性淋巴性白血病(ALL)、慢性淋巴性白血病(CLL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性骨髓性白血病(CML)、肝细胞癌、胆囊癌、支气管癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、多发性骨髓瘤、基底细胞瘤、畸胎瘤、视网膜母细胞瘤、脉络膜黑素瘤、***瘤、横纹肌肉瘤、骨肉瘤、软骨肉瘤、肌肉瘤、脂肪肉瘤、纤维肉瘤、尤文氏肉瘤和浆细胞瘤。
方面46.根据方面43或44所述的方法,其中所述癌症选自由以下各项组成的组:B细胞急性淋巴细胞性白血病(B-ALL)、间皮瘤、淋巴瘤、胰腺癌、肺癌、胃癌、食管癌、膀胱癌、脑癌、头颈癌、黑素瘤和乳腺癌。
方面47.根据方面46所述的方法,其中所述癌症是肺癌,所述肺癌选自由以下各项组成的组:非小细胞肺癌、小细胞肺癌、肺腺癌和肺鳞状细胞癌。
方面48.根据方面46所述的方法,其中所述癌症是脑肿瘤,所述脑肿瘤选自由以下各项组成的组:胶质瘤、胶质母细胞瘤、星形细胞瘤、脑膜瘤、成神经管细胞瘤、外周神经外胚层肿瘤和颅咽管瘤。
方面49.根据方面46所述的方法,其中所述癌症是三阴性乳腺癌(TNBC)。
方面50.根据方面46所述的方法,其中所述癌症是淋巴瘤,所述淋巴瘤选自由以下各项组成的组:套细胞淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤和成人T细胞白血病/淋巴瘤。
方面51.一种用于治疗患有癌症的受试者的癌症的方法,其中与其中MTAP基因或蛋白质存在和/或完全发挥功能的癌症相比,所述癌症的特征在于甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)基因表达的降低或缺失、MTAP基因的缺失或MTAP蛋白的功能降低,所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的根据方面1至36中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐。
方面52.根据方面1至36中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,用于抑制S-腺苷甲硫氨酸(SAM)的合成。
方面53.根据方面1至36中任一项的所述化合物或其药学上可接受的盐,用于治疗患有癌症的受试者的癌症。
方面54.根据方面53所述的化合物,其中所述癌症是MTAP缺失的癌症。
方面55.根据方面53或54所述的化合物,其中所述癌症选自由以下各项组成的组:间皮瘤、神经母细胞瘤、直肠癌、结肠癌、家族性腺瘤性息肉病性癌和遗传性非息肉病性结肠直肠癌、食道癌、唇癌、喉癌、下咽癌、舌癌、唾液腺癌、胃癌、腺癌、甲状腺髓样癌、甲状腺***样癌、肾癌、肾薄壁组织癌、卵巢癌、***、子宫体癌、子宫内膜癌、绒毛膜癌、胰腺癌、***癌、膀胱癌、睾丸癌、乳腺癌、泌尿系癌、黑素瘤、脑肿瘤、淋巴瘤、头颈癌、急性淋巴性白血病(ALL)、慢性淋巴性白血病(CLL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性骨髓性白血病(CML)、肝细胞癌、胆囊癌、支气管癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、多发性骨髓瘤、基底细胞瘤、畸胎瘤、视网膜母细胞瘤、脉络膜黑素瘤、***瘤、横纹肌肉瘤、骨肉瘤、软骨肉瘤、肌肉瘤、脂肪肉瘤、纤维肉瘤、尤文氏肉瘤和浆细胞瘤。
方面56.根据方面53或54所述的化合物,其中所述癌症选自由以下各项组成的组:B细胞急性淋巴细胞性白血病(B-ALL)、间皮瘤、淋巴瘤、胰腺癌、肺癌、胃癌、食管癌、膀胱癌、脑癌、头颈癌、黑素瘤和乳腺癌。
方面57.根据方面56所述的化合物,其中所述癌症是肺癌,所述肺癌选自由以下各项组成的组:非小细胞肺癌、小细胞肺癌、肺腺癌和肺鳞状细胞癌。
方面58.根据方面56所述的化合物,其中所述癌症是三阴性乳腺癌(TNBC)。
方面59.根据方面56所述的化合物,其中所述癌症是脑肿瘤,所述脑肿瘤选自由以下各项组成的组:胶质瘤、胶质母细胞瘤、星形细胞瘤、脑膜瘤、成神经管细胞瘤、外周神经外胚层肿瘤和颅咽管瘤。
方面60.根据方面56所述的化合物,其中所述癌症是淋巴瘤,所述淋巴瘤选自由以下各项组成的组:套细胞淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)和成人T细胞白血病/淋巴瘤。
实施例
参考以下实施例将更充分地理解本公开。然而,所述实施例不应被解释为限制本公开的范围。
单位和术语列表:
anhy. 无水
aq. 水性
min 分钟
mL 毫升
mmol 毫摩尔
mol 摩尔
MS 质谱
NMR 核磁共振
TLC 薄层色谱
HPLC 高效液相色谱
RT 室温
(r.t.)
NMR波谱
Hz 赫兹
δ 化学位移
J 耦合常数
s 单峰
d 双峰
t 三峰
q 四峰
m 多峰
br 宽
qd 四个双峰
dquin 两个五峰
dd 两个双峰
dt 两个三峰
溶剂和试剂:
CHCl3 氯仿
DCM 二氯甲烷
DMF 二甲基甲酰胺
Et2O ***
EtOH 乙醇
EtOAc 乙酸乙酯
EA 乙酸乙酯
MeOH 甲醇
MeCN 乙腈
PE 石油醚
THF 四氢呋喃
AcOH 乙酸
HCl 盐酸
H2SO4 硫酸
NH4Cl 氯化铵
KOH 氢氧化钾
NaOH 氢氧化钠
K2CO3 碳酸钾
Na2CO3 碳酸钠
TFA 三氟乙酸
Na2SO4 硫酸钠
NaBH4 硼氢化钠
NaHCO3 碳酸氢钠
LiHMDS 六甲基二甲硅烷基氨基锂
NaHMDS 六甲基二甲硅烷基氨基钠
LAH 氢化铝锂
NaBH4 硼氢化钠
LDA 二异丙基氨基锂
Et3N 三乙胺
DMAP 4-(二甲基氨基)吡啶
DIPEA N,N-二异丙基乙胺
NH4OH 氢氧化铵
EDCI 1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺
HOBt 1-羟基苯并***
HATU O-(7-氮杂苯并***-1-基)-N,N,N′,N′-四甲基脲
Xphos 2-二环己基膦-2′,4′,6′-三异丙基联苯
BINAP 2,2′-双(二苯基膦酰基)-1,1′-联萘
一般实验
在以下实施例中,除非另外指明,否则试剂和溶剂购自商业渠道(诸如Alfa、Acros、Sigma Aldrich、TCI和上海化学试剂公司),无需进一步纯化即可使用。使用具有200-300目硅胶颗粒的色谱柱在Ez Purifier III上进行快速色谱。分析和制备薄层色谱(TLC)板是HSGF 254(0.15-0.2mm厚,中国上海安邦公司)。核磁共振(NMR)波谱在BruckerAMX-400 NMR(Brucker,Switzerland)上获得。化学位移以四甲基硅烷的低场百万分之几(ppm,δ)报告。质谱通过来自Waters LCT TOF质谱仪(Waters,USA)的电喷雾电离(ESI)给出。HPLC色谱图在Agilent 1200液相色谱仪(Agilent,USA,色谱柱:Ultimate 4.6mm×50mm,5μm,流动相A:0.1%甲酸水溶液;流动相B:乙腈)上记录。微波反应在Initiator2.5Microwave合成仪(Biotage,Sweden)上运行。
一般程序I:
Figure BDA0003224737400000761
结构1.6的化合物通过如一般程序I所述的方案获得。从腈1.1开始,碱介导的芳族取代用于在结构1.2中引入所需的R1基团。然后使用铜介导的N-C交叉偶联反应在结构1.3中引入所需的R2基团。然后在氢化条件下将腈1.3还原以提供二胺1.4。使用CDI将二胺1.4转化为环脲1.5。最后,使用铜介导的NC交叉偶联引入所需的R3基团,以提供结构1.6的化合物。
通过一般程序I制备实施例101:
Figure BDA0003224737400000771
步骤A:2-氨基-6-乙氧基烟腈
向2-氨基-6-氯烟腈(5.0g,32.6mmol,1.0当量)在EtOH(30mL)中的溶液分批添加EtONa(6.7g,97.8mmol,3.0当量),然后将反应混合物在室温下搅拌30分钟。通过LC-MS(ESI)监测反应进程,反应完成后,用冰水(50mL)淬灭反应,过滤所得沉淀,收集滤饼并减压干燥,得到2-氨基-6-乙氧基烟腈(3.9g,收率73%)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 252[M+H]+
步骤B:2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-6-乙氧基烟腈
将2-氨基-6-乙氧基烟腈(3.9g,23.9mmol,1.0当量)、CuI(4.4g,23.9mmol,1.0当量)、CsF(10.7g,71.7mmol,3.0当量)、1-溴-4-(二氟甲氧基)苯(7.8g,35.1mmol,1.5当量)和N1,N2-二甲基环己烷-1,2-二胺(6.8g,47.8mmol,2.0当量)在MeCN(50ml)中的混合物在100℃N2气氛下搅拌15小时。反应混合物用H2O(100ml)稀释,用EtOAc(100mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(50ml)洗涤,用Na2SO4干燥,减压浓缩,残留物通过硅胶快速柱色谱纯化得到2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-6-乙氧基烟腈(3.7g,51%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 306[M+H]+
步骤C:2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-6-乙氧基烟腈
向2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-6-乙氧基烟腈(1.0g,3.2mmol,1.0当量)在MeOH(40mL)中的溶液添加Raney Ni(300mg)和浓NH4OH(4mL),反应混合物在H2气球(1atm)下于室温搅拌15小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,催化剂通过
Figure BDA0003224737400000772
短垫过滤,滤液减压浓缩得到粗3-(氨基甲基)-N-(4-(二氟甲氧基)苯基)-6-乙氧基吡啶-2-胺(1.0g)浅黄色油状物,无需进一步纯化即可用于下一步。LC-MS(ESI):m/z 310[M+H]+
步骤D:1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-乙氧基-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
向3-(氨基甲基)-N-(4-(二氟甲氧基)苯基)-6-乙氧基吡啶-2-胺(1.0g,3.2mmol,1.0当量)在无水DMF(20mL)中的溶液中以一份添加CDI(1.1g,6.4mmol,2.0当量)和t-BuOK(1.45g,12.8mmol,4.0当量),将所得混合物在60℃N2气氛下搅拌4小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,反应用冰水(50mL)淬灭,用DCM(40mL×3)萃取,合并的有机层用Na2SO4干燥,减压浓缩加压并通过硅胶快速柱色谱纯化,得到1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-乙氧基-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(0.9g,83%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 336[M+H]+
步骤E:1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-乙氧基-3-(咪唑并[1,2-a]吡啶-6-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-乙氧基-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(50mg,0.15mmol,1.0当量)、6-溴咪唑并[1,2-a]吡啶(44mg,0.22mmol,1.5当量)、CsF(45mg,0.3mmol,2.0当量)、CuI(28mg,0.15mmol,1.0当量)和N1,N2二甲基环己烷-1,2-二胺(42mg,0.3mmol,2.0当量)在MeCN(3mL)中的混合物在60℃N2气氛下搅拌15小时。反应混合物用EtOAc(40mL)稀释,用H2O(2×10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,减压浓缩并通过RP-prep-HPLC纯化,得到1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-乙氧基-3-(咪唑并[1,2-a]吡啶-6-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例101)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.75(s,1H),7.96(s,1H),7.72-7.50(m,3H),7.46-7.33(m,3H),7.30(t,JHF=76Hz,1H),7.28-7.13(m,2H),6.44(d,J=8.0Hz,1H),4.92(s,2H),3.86(q,J=8.0Hz,2H),1.05(t,J=8.0Hz,3H).
LC-MS(ESI):m/z 452[M+H]+.
通过使用适当的起始材料,使用上文针对一般程序I所述的程序合成以下化合物:
Figure BDA0003224737400000781
Figure BDA0003224737400000791
Figure BDA0003224737400000801
Figure BDA0003224737400000811
Figure BDA0003224737400000821
Figure BDA0003224737400000831
Figure BDA0003224737400000841
Figure BDA0003224737400000851
Figure BDA0003224737400000861
Figure BDA0003224737400000871
一般程序II:
Figure BDA0003224737400000872
结构2.5的化合物通过如一般程序II所述的方案获得。从醛2.1开始,使用还原胺化作用引入所需的R3基团,得到胺2.2。然后在碱性条件下将胺2.2环化为尿素2.3。然后通过钯介导的C-X偶联引入所需的R1和R2基团以生成化合物2.4,然后通过铜介导的C-N偶联以提供化合物2.5(方法A),或通过铜介导的C-N偶联以生成化合物2.6,然后通过钯介导的C-X偶联得到2.5(方法B)。
通过一般程序II(方法A)制备实施例131:
Figure BDA0003224737400000881
步骤A:(6-氯-3-(((2-甲基-2H-吲唑-5-基)氨基)甲基)吡啶-2-基)氨基甲酸叔丁酯
向(6-氯-3-甲酰基吡啶-2-基)氨基甲酸叔丁酯(商购获得)(3.8g,15mmol,1.0当量)和2-甲基-2H-吲唑-5-胺(2.0g,14mmol,0.93当量)在DCE(50mL)中的溶液添加AcOH(3.26g,54mmol,3.6当量),将反应混合物在室温下搅拌5小时。然后将反应混合物冷却至0℃,分若干份添加NaBH(OAc)3(8.64g,41mmol,2.7当量)。添加后,使混合物升温至室温并再搅拌16小时。用冰冷却的NaHCO3(饱和水溶液)(30mL)淬灭反应,用EtOAc(50mL×3)萃取,用盐水(30mL)洗涤合并的有机层并用Na2SO4干燥,减压浓缩并通过硅胶快速柱色谱纯化,得到(6-氯-3-(((2-甲基-2H-吲唑-5-基)氨基)甲基)吡啶-2-基)氨基甲酸叔丁酯(3.2g,61%收率)淡绿色固体。LC-MS(ESI):m/z 388[M+H]+
步骤B:7-氯-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
将(6-氯-3-(((2-甲基-2H-吲唑-5-基)氨基)甲基)吡啶-2-基)氨基甲酸叔丁酯(3.2g,8.25mmol,1.0当量)和K2CO3(11.4g,82.5mmo1,10.0当量)在二噁烷(40mL)中的混合物在100℃下搅拌16小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,反应混合物用冰水(50mL)淬灭,收集沉淀并减压干燥,得到7-氯-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(2.2g,85%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 314[M+H]+
步骤C:7-乙氧基-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
将7-氯-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(2.2g,7.0mmol,1.0当量)、Cs2CO3(6.86g,21mmol,3.0当量)、Pd2(dba)3(0.64g,0.70mmol,0.1当量)和t-BuXPhos(0.6g,1.4mmol,0.2当量)在EtOH(300mL)和甲苯(30mL)的混合物在80℃N2气氛下搅拌16小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,反应混合物通过
Figure BDA0003224737400000892
短垫过滤,减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到7-乙氧基-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮白色固体(2.0g,88%收率)。LC-MS(ESI):m/z324[M+H]+
步骤D:1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-乙氧基-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
将7-乙氧基-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(50mg,0.15mmol,1.0当量)、1-溴-4-(二氟甲氧基)苯(35mg,0.15mmol,1.0当量)、CsF(70mg,0.45mmol,3.0当量)、CuI(29mg,0.15mmol,1.0当量)和N1,N2-二甲基环己烷-1,2-二胺(44mg,0.3mmol,2.0当量)在DMSO(3mL)中的混合物在100℃N2气氛下搅拌16小时。反应混合物用H2O(10mL)稀释,用EtOAc(10mL×3)洗涤,合并的有机层用盐水(10mL)洗涤并经Na2SO4干燥,减压浓缩,残余物经RP-prep-HPLC纯化,得到1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-乙氧基-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例131)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.35(s,1H),7.69(d,J=1.6Hz,1H),7.59(t,J=8.4Hz,2H),7.39(t,J=8.8Hz,2H),7.30(t,JHF=74Hz,1H),7.28(dd,J=9.6Hz,2.0Hz,1H),7.24(d,J=8.8Hz,2H),6.42(d,J=8.0Hz,1H),4.91(s,2H),4.17(s,3H),3.86(q,J=7.2Hz,2H),1.06(t,J=7.2Hz,3H).
LC-MS(ESI):m/z 466[M+H]+.
通过一般程序II(方法B)制备实施例132:
Figure BDA0003224737400000891
步骤A:7-氯-1-(4-甲氧基苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
向7-氯-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(1.0g,3.19mmol,1.0当量)在DMSO(15mL)中的溶液添加1-碘-4-甲氧基苯(0.90g,3.82mmol,1.2当量)、CuI(0.61g,3.19mmol,1.0当量)、CsF(1.45g,9.56mmol,3.0当量)和N1,N2-二甲基环己烷-1,2-二胺(0.91g,6.37mmol,2.0当量),将反应混合物在100℃N2气氛下搅拌16小时。通过LC-MS监测进程,完成后,反应用H2O(20mL)稀释,用EtOAc(40mL×3)萃取,经Na2SO4干燥,减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到7-氯-1-(4-甲氧基苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(900mg,57%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 420[M+H]+
步骤B:7-(乙硫基)-1-(4-甲氧基苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
7-氯-1-(4-甲氧基苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(50mg,0.12mmol,1.0当量)、Pd(OAc)2(3mg,0.012mmol,0.1当量)、t-BuXPhos(10mg,0.024mmol,0.2当量)和Cs3CO2(116mg,0.36mmol,3.0当量)在DMSO(3mL)中的混合物,***用氮气脱气,然后通过注射器添加乙硫醇(0.3mL),在密封管中进行反应并在70℃下搅拌16小时。通过LC-MS监测进程,完成后,反应用H2O(20mL)稀释,用EtOAc(40mL×3)萃取,经Na2SO4干燥,减压浓缩并通过RP-prep-HPLC纯化,得到7-(乙硫基)-1-(4-甲氧基苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例132)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.35(s,1H),7.69(s,1H),7.57(d,J=9.2Hz,1H),7.51(d,J=7.6Hz,1H),7.27(d,J=8.8Hz,1H),7.23(d,J=8.8Hz,2H),7.00(d,J=8.8Hz,2H),6.88(d,J=7.6Hz,1H),4.93(s,2H),4.17(s,3H),3.79(s,3H),2.64(q,J=7.2Hz,2H),0.92(t,J=7.2Hz,3H).
LC-MS(ESI):m/z 446[M+H]+.
通过使用适当的起始材料,使用上文针对一般程序II(方法A)所述的程序合成以下化合物:
Figure BDA0003224737400000901
Figure BDA0003224737400000911
Figure BDA0003224737400000921
Figure BDA0003224737400000931
Figure BDA0003224737400000941
Figure BDA0003224737400000951
Figure BDA0003224737400000961
Figure BDA0003224737400000971
Figure BDA0003224737400000981
Figure BDA0003224737400000991
通过使用适当的起始材料,使用上文针对一般程序II(方法B)所述的程序合成以下化合物:
Figure BDA0003224737400000992
Figure BDA0003224737400001001
Figure BDA0003224737400001011
Figure BDA0003224737400001021
Figure BDA0003224737400001031
Figure BDA0003224737400001041
Figure BDA0003224737400001051
一般程序III:
Figure BDA0003224737400001052
例I.A=N,B=C,D=N
例II.A=C,B=C-F,D=N
例III.A=C-CH3,B=C,D=N
例IV.A=C,B=N,D=C
结构3.7(例I-IV)的化合物通过如一般程序III所述的方案获得。从芳基氯化物3.1开始,使用碱介导的芳族取代引入所需的R2基团以生成胺3.2。然后将芳基酸3.2转化为Weinreb酰胺3.3,然后使用氢化物源将其还原为醛3.4。然后使用还原胺化引入所需的R3基团以生成二胺3.5。然后通过钯介导的C-X偶联反应引入所需的R1基团以生成二胺3.6。然后二胺3.6与CDI反应形成环脲3.7。
通过一般程序III(例I)制备实施例180:
Figure BDA0003224737400001061
步骤A:5-氯-3-((4-甲氧基苯基)氨基)吡嗪-2-羧酸
向4-甲氧基苯胺(1.28g,10.4mmol,2.0当量)在无水THF(10mL)中的溶液通过注射器在-78℃N2气氛下添加LiHMDS(1M,在THF中,10.4mL,10.4mmol,2.0当量)。在相同温度下再搅拌0.5小时后,通过注射器添加3,5-二氯吡嗪-2-羧酸(1.0g,5.2mmol,1.0当量)在无水THF(5mL)中的溶液10分钟。在-78℃下再搅拌0.5小时后,将反应混合物加热至室温并搅拌18小时。混合物用水(20mL)淬灭,然后通过加入稀HCl(2N,水溶液)调节至pH=2。所得的混合物用EtOAc(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到5-氯-3-((4-甲氧基苯基)氨基)吡嗪-2-甲酸(1.3g,90%收率)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 280[M+H]+
步骤B:5-氯-N-甲氧基-3-((4-甲氧基苯基)氨基)-N-甲基吡嗪-2-甲酰胺
将5-氯-3-((4-甲氧基苯基)氨基)吡嗪-2-甲酸(1.70g,6.08mmol,1.0当量)、N,O-二甲基羟胺盐酸盐(0.89g,9.12mmol,1.5当量)、DIPEA(3.14g,24.31mmol,4.0当量)和HATU(3.46g,9.12mmol,1.5当量)在DCM(10mL)中的溶液在室温下搅拌过夜。通过加入H2O(20mL)淬灭所得混合物,然后用DCM(30mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(30mL)洗涤并用Na2SO4干燥,减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到5-氯-N-甲氧基-3-((4-甲氧基苯基)氨基)-N-甲基吡嗪-2-甲酰胺(1.26g,64%收率)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 323[M+H]+
步骤C:5-氯-3-((4-甲氧基苯基)氨基)吡嗪-2-甲醛
向5-氯-N-甲氧基-3-((4-甲氧基苯基)氨基)N-甲基吡嗪-2-甲酰胺(1.26g,3.9mmol,1.0当量)在无水THF(15mL)中的溶液在-78℃N2气氛下通过注射器添加DIBAL-H(1.5M,在甲苯中,3.9mL,5.86mmol,1.5当量)。将混合物在-78℃下再搅拌0.5小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,反应混合物用NH4Cl(饱和水溶液)(20mL)淬灭并用EtOAc(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(30mL)洗涤并通过Na2SO4干燥,在减压下浓缩,得到5-氯-3-((4-甲氧基苯基)氨基)吡嗪-2-甲醛(1.6g,粗品),无需进一步纯化即可用于下一步。LC-MS(ESI):m/z 264[M+H]+
步骤D:N-((5-氯-3-((4-甲氧基苯基)氨基)吡嗪-2-基)甲基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺
将5-氯-3-((4-甲氧基苯基)氨基)吡嗪-2-甲醛(1.6g,6.07mmol,1.0当量)、2-甲基-2H-吲唑-5-胺(0.89g,6.07mmol,1.0当量)和AcOH(1.5mL,24.27mmol,4.0当量)在DCE(10mL)中的溶液在室温下搅拌过夜。然后在0℃下分若干份添加NaBH(OAc)3(3.86g,18.20mmol,3.0当量),加入后,将混合物加热至室温并搅拌过夜。通过加入冰水(10mL)淬灭反应并用EtOAc(30mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(30mL)洗涤并经Na2SO4干燥,经盐水(30mL)洗涤且经Na2SO4干燥,减压浓缩,残余物经硅胶快速柱色谱纯化,得到N-((5-氯-3-((4-甲氧基苯基)氨基)吡嗪-2-基)甲基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺(1.25g,52%收率)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 395[M+H]+
步骤E:N-((5-(2,2-二氟乙氧基)-3-((4-甲氧基苯基)氨基)吡嗪-2-基)甲基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺
将N-((5-氯-3-((4-甲氧基苯基)氨基)吡嗪-2-基)甲基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺(600mg,1.52mmol,1.0当量)、2,2-二氟乙醇-1-醇(374mg,4.56mmol,3.0当量)、Pd(OAc)2(68mg,0.304mmol,0.2当量)、t-BuXPhos(129mg,0.304mmol,0.2当量)和Cs2CO3(1.49g,4.56mmol,3.0当量)在DMSO(10mL)中的溶液在密封管中在100℃N2气氛下搅拌过夜。将所得混合物浓缩并通过硅胶柱纯化残余物以得到N-((5-(2,2-二氟乙氧基)-3-((4-甲氧基苯基)氨基)吡嗪-2-基)甲基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺(250mg,37%收率)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 441[M+H]+
步骤F:7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-甲氧基苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢蝶呤-2(1H)-酮
将N-((5-(2,2-二氟乙氧基)-3-((4-甲氧基苯基)氨基)吡嗪-2-基)甲基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺(280mg,0.64mmol,1.0当量)、CDI(206mg,1.27mmol,2.0当量)和t-BuOK(285mg,2.55mmol,4.0当量)在DMF(10mL)中的溶液在50℃下搅拌4小时。将所得混合物浓缩,残余物通过RP-prep-HPLC纯化,得到7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-甲氧基苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢蝶呤-2(1H)-酮(实施例180)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.36(s,1H),7.93(s,1H),7.76(d,J=1.2Hz,1H),7.59(d,J=9.2Hz,1H),7.37-7.22(m,3H),7.04-6.99(d,J=8.8Hz,2H),6.15(tt,JHF=54.8Hz,J=3.6Hz,1H),5.03(s,2H),4.30-4.03(m,2H),4.18(s,3H),3.80(s,3H).
LC-MS(ESI):m/z 467[M+H]+.
通过使用适当的起始材料,使用上文针对一般程序III所述的程序合成以下化合物:
Figure BDA0003224737400001081
Figure BDA0003224737400001091
Figure BDA0003224737400001101
Figure BDA0003224737400001111
一般程序IV:
Figure BDA0003224737400001121
结构4.7的化合物通过如一般程序IV所述的方案获得。从醛4.1开始,使用还原胺化作用引入所需的R3基团以生成二胺4.2。二胺4.2进行CDI以形成环脲4.3。然后以两种方式之一装载所需的R1和R2。在方法A中,通过铜介导的C-N与尿素4.3的偶联反应引入所需的R2基团(任选保护的)以生成化合物4.4。然后将硫醇4.4氧化成砜4.5,然后使用碱介导的芳族取代反应用所需的R1置换,得到化合物4.6。如有必要,然后将化合物4.6脱保护以得到化合物4.7。在方法B中,硫醇4.3被氧化为砜4.8,然后使用碱介导的芳族取代反应将其置换为所需的R1,得到化合物4.9。然后通过铜介导的C-N与尿素4.9的偶联反应引入所需的R2基团(任选保护的)以生成化合物4.6。如有必要,然后将化合物4.6脱保护以得到化合物4.7。
通过一般程序IV(方法A)制备实施例188:
Figure BDA0003224737400001122
步骤A:5-(((4-甲氧基苯基)氨基)甲基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺
将4-氨基-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲醛(1.14g,6.74mmol,1.0当量)、4-甲氧基苯胺(0.91g,7.42mmol,1.1当量)和AcOH(1.2mL,20.23mmol,3.0当量)溶解在DCE/MeOH(6mL/6mL)中,在室温下搅拌3小时。然后分若干次在0℃下添加NaBH3CN(0.47g,7.42mmol,1.1当量),然后将反应混合物加热至室温并搅拌过夜。用冰水(10mL)淬灭反应,用DCM(20mL×3)萃取,合并的有机层用Na2SO4干燥,减压浓缩,残留物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到5-(((4-甲氧基苯基)氨基)甲基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺(1.7g,91%收率)灰色固体。LC-MS(ESI):m/z 277[M+H]+
步骤B:3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
将5-(((4-甲氧基苯基)氨基)甲基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺(0.83g,3.0mmol,1.0当量)溶解在无水DMF(20mL)中。分若干份添加t-BuOK(1.35g,1.2mol,4.0当量)和CDI(0.97g,6.01mmol,2.0当量)。将反应混合物加热至50℃并搅拌4小时。反应混合物用冰水(20mL)处理,收集所得沉淀并用H2O(10mL×3)洗涤,减压干燥,得到3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
5-(((4-甲氧基苯基)氨基)甲基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺(0.69g,76%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 303[M+H]+
步骤C:3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲硫基)-1-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
在室温下向3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(604mg,2.0mmol,1.0当量)在MeCN(8mL)中的溶液添加CuI(190mg,1.0mmol,0.5当量)、CsF(912mg,6.0mmol,3.0当量)、N1,N2-二甲基环己烷-1,2-二胺(284mg,2.0mmol,1.0当量)和3-(4-溴苯基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***(参考:WO2008156726 A1)(850mg,2.4mmol,1.2当量),混合物在100℃下搅拌16小时。然后用冰水(20mL)淬灭反应混合物并用EtOAc(20mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余混合物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲硫基)-1-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(580mg,50%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 576[M+H]+
步骤D:3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲基磺酰基)-1-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲硫基)-1-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)-苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(676mg,1.1mmol,1.0当量)在DCM(10mL)中的溶液在室温下分若干份添加m-CPBA(571mg,3.3mmol,3.0当量)。将所得混合物在室温下搅拌另外2小时。然后用NaHSO3(饱和水溶液)(30mL)淬灭过量的m-CPBA,用DCM(10mL×3)萃取所得混合物。合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,通过硅胶快速柱色谱法纯化残余物以得到3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲基磺酰基)-1-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(600mg,90%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z608[M+H]+
步骤E:7-((2,2-二氟乙基)氨基)-3-(4-甲氧基苯基)-1-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲基磺酰基)-1-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(130mg,0.21mmol,1.0当量)在DMSO(5mL)中的溶液在室温下添加CsF(32mg,0.21mmol,1.0当量)、DIPEA(0.18mL,1.07mmol,5.0当量)和2,2,2-三氟乙胺(109mg,1.1mmol,5.0当量)。将得到的混合物在80℃下在密封管中搅拌16小时。然后用冰水(10mL)淬灭反应混合物并用DCM(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(15mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到7-((2,2-二氟乙基)氨基)-3-(4-甲氧基苯基)-1-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(30mg,23%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 609[M+H]+
步骤F:1-(4-(1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-7-((2,2-二氟乙基)氨基)-3-(4-甲氧基苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向7-((2,2-二氟乙基)氨基)-3-(4-甲氧基苯基)-1-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(30mg,0.05mmol,1.0当量)在DCM(2mL)中的溶液在0℃下添加TFA(0.5mL)。然后将反应混合物在室温下搅拌5小时。大多数溶剂在减压下蒸发。残留物用MeOH(2mL)稀释,加入浓NH4OH(0.5mL)并在室温下搅拌2小时。然后减压浓缩反应混合物。通过RP-prep-HPLC纯化残余物以提供1-(4-(1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-7-((2,2-二氟乙基)氨基)-3-(4-甲氧基苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例188)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):14.23(bs,1H),8.69-8.35(m,1H),8.12-8.07(m,3H),7.43(d,J=8.0Hz,2H),7.69-7.08(m,1H),7.36(d,J=8.8Hz,2H),6.98(d,J=8.8Hz,2H),5.88(bs,1H),4.78(s,2H),3.78(s,3H),3.70-3.50(m,2H).
LC-MS(ESI):m/z 479[M+H]+.
通过一般程序IV(方法B)制备实施例189:
Figure BDA0003224737400001141
步骤A:3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲基磺酰基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(0.8g,2.65mmol,1.0当量)在DCM(20mL)中的溶液在室温下分若干份添加3-氯苯过氧酸(2.28g,13.24mmol,5.0当量)。将混合物在40℃下搅拌3小时。反应混合物用NaHSO3(饱和水溶液)(50mL)淬灭以消耗过量的m-CPBA,然后反应混合物用冰水(20mL)淬灭并用EtOAc(20mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物混合物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲基磺酰基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮白色固体(0.8g,90%收率)。LC-MS(ESI):m/z 335[M+H]+
步骤B:3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
将3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲基磺酰基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(0.1g,0.3mmol,1.0当量)、CsF(0.14g,0.9mmol,3.0当量)、DIPEA(0.19g,1.497mmol,5.0当量)和2,2,2-三氟乙烷-1-胺(0.59g,5.99mmol,20当量)在DMSO(2mL)中的混合物在密封管中在80℃下搅拌24小时。然后在减压下除去过量的2,2,2-三氟乙-1-胺,添加冰水(20mL)并用EtOAc(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,用Na2SO4干燥并在减压下浓缩,残留混合物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮棕色固体(55mg,52%收率)。LC-MS(ESI):m/z354[M+H]+
步骤C:3-(4-甲氧基苯基)-1-(4-(甲基磺酰基)苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(35mg,0.1mmol,1.0当量)和1-溴-4-(甲基磺酰基)苯(47mg,0.2mmol,2.0当量)在MeCN(2mL)中的混合物添加N1,N2-二甲基环己烷-1,2-二胺(17mg,0.1mmol,1.0当量)、CsF(27mg,0.2mmol,2.0当量)和CuI(11mg,0.1mmol,1.0当量)。在N2气氛下在微波辐射下将混合物在110℃下搅拌1小时。将混合物冷却至室温,并用水(15mL)淬灭并用EtOAc(20mL×3)萃取。合并的有机层用Na2SO4干燥,减压浓缩,残留物通过RP-prep-HPLC纯化,得到3-(4-甲氧基苯基)-1-(4-(甲基磺酰基)苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例189)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):8.04(s,1H),8.03(d,J=8.6Hz,2H),7.53(d,J=8.5Hz,2H),7.28(d,J=8.9Hz,2H),6.94(d,J=8.9Hz,2H),5.23(bs,1H),4.79(s,2H),4.25-3.54(m,2H),3.08(s,3H),2.35(s,3H).
LC-MS(ESI):m/z 508[M+H]+
通过使用适当的起始材料,使用上文针对一般程序IV(方法A)所述的程序合成以下化合物:
Figure BDA0003224737400001161
Figure BDA0003224737400001171
Figure BDA0003224737400001181
Figure BDA0003224737400001191
通过使用适当的起始材料,使用上文针对一般程序IV(方法B)所述的程序合成以下化合物:
Figure BDA0003224737400001192
Figure BDA0003224737400001201
Figure BDA0003224737400001211
Figure BDA0003224737400001221
Figure BDA0003224737400001231
Figure BDA0003224737400001241
一般程序V:
Figure BDA0003224737400001242
结构5.7的化合物通过如一般程序V所示的方案获得。从芳基氯5.1开始,使用碱介导的芳族取代反应引入所需的R1基团以产生5.2。通过铜介导的C-N与尿素5.2的偶联反应引入所需的R2基团(任选保护的)以生成化合物5.3。使用氢化条件将腈5.3还原为胺5.4。使用CDI将二胺5.4转化为环脲5.5。通过铜介导的C-N与尿素5.5的偶联反应引入所需的R3基团(任选保护的)以生成化合物5.6。如有必要,将化合物5.6脱保护以得到化合物5.7。
通过一般程序V制备实施例214:
Figure BDA0003224737400001251
步骤A:4-氨基-2-((2,2,2-三氟乙基)氨基)嘧啶-5-甲腈
向4-氨基-2-氯嘧啶-5-甲腈(1.0g,6.5mmol,1.0当量)在DMSO(10mL)中的溶液在室温下添加2,2,2-三氟乙烷-1-胺(1.9g,19.5mmol,3.0当量)和DIPEA(2.5g,19.5mmol,3.0当量),将反应混合物在80℃下在密封管中搅拌2小时。然后用冰水(30mL)淬灭反应混合物并用EtOAc(50mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过快速柱色谱硅胶纯化,得到4-氨基-2-((2,2,2-三氟乙基)氨基)嘧啶-5-甲腈(1.3g,93%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 218[M+H]+
步骤B:2-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-4-((4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)氨基)嘧啶-5-甲腈
向4-氨基-2-((2,2,2-三氟乙基)氨基)嘧啶-5-甲腈(1.1g,5.1mmol,1.0当量)在MeCN(10mL)中的溶液在室温下添加CuI(960mg,5.1mmol,1.0当量)、CsF(2.3g,15.3mmol,3.0当量)、N1,N2-二甲基环己烷-1,2-二胺(1.1g,7.7mmol,1.5当量)和3-(4溴苯基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***(参考:WO2008156726 A1)(2.7g,7.7mmol,1.5当量),所得的混合物在100℃下再搅拌16小时。然后用冰水(30mL)淬灭反应混合物并用EtOAc(50mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到2-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-4-((4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)氨基)嘧啶-5-甲腈(1.8g,72%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z491[M+H]+
步骤C:5-(氨基甲基)-N2-(2,2,2-三氟乙基)-N4-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)嘧啶-2,4-二胺
向2-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-4-((4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)氨基)嘧啶-5-甲腈(800mg,1.6mmol,1.0当量)在NH3-THF(7mol/L,10mL,7.0mmol,4.4当量)中的溶液在室温下添加Raney Ni(180mg)。用H2气球(1atm)在室温下搅拌反应混合物16小时。完成后,过滤除去催化剂,滤液减压浓缩得到粗5-(氨基甲基)-N2-(2,2,2-三氟乙基)-N4-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)嘧啶-2,4-二胺(800mg)白色固体,无需进一步纯化即可用于下一步。LC-MS(ESI):m/z 495[M+H]+
步骤D:7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-1-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向5-(氨基甲基)-2-(甲硫基)-N-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)嘧啶-4-胺(800mg,1.6mmol,1.0当量)在DCM(10mL)中的溶液在室温下添加CDI(520mg,3.2mmol,2.0当量)和t-BuOK(718mg,6.4mmol,4.0当量)。并将反应混合物在室温下搅拌16小时。然后用冰水(30mL)淬灭反应混合物并用DCM(30mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥并在减压下浓缩。残余物通过硅胶快速柱色谱纯化得到7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-1-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(750mg,90%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 521[M+H]+
步骤E:3-(2,3-二氢苯并[b][1,4]二噁英-6-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-1-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-1-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(50mg,0.1mmol,1.0当量)在MeCN(2mL)中的溶液在室温下添加CuI(20mg,0.1mmol,1.0当量)、CsF(46mg,0.3mmol,3.0当量)、N1,N2-二甲基环己烷-1,2-二胺(21mg,0.15mmol,1.5当量)和6-溴-2,3-二氢苯并[b][1,4]二氧杂环己烯(32mg,0.15mmol,1.5当量),并且将所得混合物在90℃下搅拌16小时。然后用冰水(30mL)淬灭反应混合物并用EtOAc(30mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到3-(2,3-二氢苯并[b][1,4]二噁英-6-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-1-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(50mg,77%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 655[M+H]+
步骤F:1-(4-(1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-3-(2,3-二氢苯并[b][1,4]二噁英-6-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向3-(2,3-二氢苯并[b][1,4]二噁英-6-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-1-(4-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(50mg,0.08mmol,1.0当量)在DCM(3mL)中的溶液在室温下添加TFA(0.5mL)。将所得混合物再搅拌16小时。大部分溶剂在减压下蒸发,残留物用MeOH(1mL)稀释,添加浓NH4OH(0.5mL)并在室温下搅拌2小时。然后减压浓缩反应混合物。粗残留物通过RP-prep-HPLC纯化,得到1-(4-(1H-1,2,4-***-3-基)苯基)-3-(2,3-二氢苯并[b][1,4]二噁英-6-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例214)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):14.16(s,1H),8.46(s,1H),8.12(s,1H),8.07(d,J=8.4Hz,2H),7.53-7.41(m,3H),6.97(s,1H),6.89(s,2H),4.76(s,2H),4.26(s,4H),4.10-3.52(m,2H).
LC-MS(ESI):m/z 525[M+H]+.
通过使用适当的起始材料,使用上文针对一般程序V所述的程序合成以下化合物:
Figure BDA0003224737400001271
Figure BDA0003224737400001281
Figure BDA0003224737400001291
Figure BDA0003224737400001301
Figure BDA0003224737400001311
Figure BDA0003224737400001321
Figure BDA0003224737400001331
Figure BDA0003224737400001341
一般程序VI:
Figure BDA0003224737400001342
结构6.6的化合物通过如一般程序VI所述的方案获得。从醛6.1开始,使用还原胺化作用引入所需的R3基团以生成化合物6.2。通过使胺6.2与适当的异氰酸酯反应生成无环脲6.3来引入所需的R2基团。使用碱介导的芳族取代反应将无环脲6.3转化为环脲6.4。然后将芳基硫醇6.4氧化成砜6.5,并使用碱介导的芳族取代反应引入所需的R1基团(当X=NH时为任选地保护的)以得到化合物6.6。
通过一般程序VI制备实施例235:
Figure BDA0003224737400001351
步骤A:N-((4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯胺
将4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲醛(0.94g,5.0mmol,1.0当量)、4-甲氧基苯胺(0.62g,5.0mmol,1.0当量)和AcOH(0.9mL,15.0mmol,3.0当量)溶解于DCE(6mL)中,在室温下搅拌所得的混合物3小时,然后在0℃下以若干份添加NaBH(OAc)3(1.17g,5.5mmol,1.1当量),添加后,使反应混合物升温至室温并搅拌过夜。将反应混合物用冰水(10mL)淬灭并用DCM(20mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(30mL)洗涤并经Na2SO4干燥,减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化得到N-((4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯胺(1.33g,90%收率)灰色固体。LC-MS(ESI):m/z 296[M+H]+
步骤B:1-((4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲基)-3-(4-(二氟甲氧基)苯基)-1-(4-甲氧基苯基)脲
向N-((4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯胺(130mg,0.44mmol,1.0当量)在DCM(5mL)中的溶液添加1-(二氟甲氧基)-4-异氰酸根合苯(163mg,0.88mmol,2.0当量)并在室温下搅拌过夜。然后减压浓缩反应混合物,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到1-((4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲基)-3-(4-(二氟甲氧基)苯基)-1-(4-甲氧基苯基)脲(120mg,57%收率)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 481[M+H]+
步骤C:1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向1-((4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲基)-3-(4-(二氟甲氧基)苯基)-1-(4-甲氧基苯基)脲(120mg,0.25mmol,1.0当量)在THF(5mL)中的溶液添加t-BuOK(84mg,0.75mmol,3.0当量),并在室温下搅拌1小时。然后将反应混合物用冰水(10mL)处理,用EtOAc(10mL×3)萃取,合并的有机层用Na2SO4干燥,减压浓缩,残留物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(80mg,72%收率)黄色油状物。LC-MS(ESI):m/z 445[M+H]+
1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-(2,2,2-三氟乙氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例235)由1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮和2,2,2-三氟乙胺通过一般程序IV合成(步骤D、E)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.12(s,1H),7.69-7.39(m,1H),7.38-7.31(m,4H),7.30(t,JHF=74.0Hz,1H),7.24(d,J=8.8Hz,2H),6.96(d,J=8.8Hz,2H),4.76(s,2H),4.19-3.49(m,2H),3.77(s,3H).
LC-MS(ESI):m/z 496[M+H]+.
通过最后脱保护的一般程序VI制备实施例236:
Figure BDA0003224737400001361
1-(4-溴苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向(2,2,2-三氟乙基)氨基甲酸叔丁酯(150mg,0.753mmol)在THF(2.510ml)中的溶液在0℃下添加氢化钠(36.1mg,0.904mmol)并搅拌10分钟,然后再加热至室温30分钟。将0.5mL该混合物(约0.15mmol,1.5当量)滴加到另一个含有1-(4-溴苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲基磺酰基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(50mg,0.102mmol,1.0当量,使用一般程序VI步骤AD产生)在THF(0.5ml)中的溶液的反应瓶中,并且将所得反应混合物搅拌30分钟直到通过LCMS监测到反应完成,形成(8-(4-溴苯基)-6-(4-甲氧基苯基)-7-氧代-5,6,7,8-四氢嘧啶[4,5-d]嘧啶-2-基)(2,2,2-三氟乙基)氨基甲酸叔丁酯。向该反应混合物添加HCl(150μl,0.600mmol)在二噁烷中的溶液,然后将所得混合物加热至60℃再保持30分钟,直到Boc脱保护完成。然后用固体碳酸氢钠(86mg,1.022mmol)淬灭反应并与硅胶混合。浓缩后除去有机溶剂。将粗物质干载并通过柱色谱纯化以得到1-(4-溴苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶基[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮。(实施例236)
1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.00(s,1H),7.57(d,J=8.7Hz,2H),7.28(d,J=9.0Hz,2H),7.17(d,J=8.7Hz,2H),6.93(d,J=9.0Hz,2H),5.14(brs,1H),4.75(s,2H),3.90(brs,2H),3.81(s,3H).
LC-MS(ESI):m/z 510.0[M+H]+
通过使用适当的起始材料,使用上文针对一般程序VI所述的程序合成以下化合物:
Figure BDA0003224737400001371
Figure BDA0003224737400001381
Figure BDA0003224737400001391
Figure BDA0003224737400001401
Figure BDA0003224737400001411
Figure BDA0003224737400001421
一般程序VII:
Figure BDA0003224737400001431
结构7.6的化合物通过如一般程序VII所述的方案获得。胺7.1(从一般程序VII,步骤A获得)与氯甲酸甲酯反应生成氨基甲酸酯7.2。使用碱介导的芳族取代反应引入所需的R2基团以产生化合物7.3。使用碱介导的环化将化合物7.3转化为环状脲7.4。然后将芳基硫醇7.4氧化成砜7.5,并使用碱介导的芳族取代反应引入所需的R1基团,得到化合物7.6。
通过一般程序VII制备实施例257:
Figure BDA0003224737400001432
步骤A:(4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲基(4-甲氧基苯基)氨基甲酸甲酯
向N-((4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯胺(500mg,1.7mmol,1.0当量,从一般程序VI,步骤A获得)和K2CO3(701mg,5.1mmol,3.0当量)在甲苯(20mL)中的溶液在0℃下通过注射器添加甲基碳酰氯(240mg,2.6mmol,1.5当量)。所得溶液在室温下搅拌过夜。然后反应混合物用冰水(10mL)处理,用EtOAc(10mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(20mL)洗涤并用Na2SO4干燥,减压浓缩,通过硅胶快速柱色谱纯化残留物,得到(4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲基(4-甲氧基苯基)氨基甲酸甲酯(580mg,97%收率)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 354[M+H]+
步骤B:4-甲氧基苯基((4-(5-甲氧基吡啶-2-基氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲基)氨基甲酸甲酯
向(4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲基(4-甲氧基苯基)氨基甲酸甲酯(300mg,0.8mmol,1.0当量)和5-甲氧基吡啶-2-胺(158mg,1.3mmol,1.6当量)在THF(10mL)中的溶液在-65℃下通过注射器添加LiHMDS(1.0MTHF溶液,2.4mL,2.4mmol,3.0当量)10分钟。添加后,使反应混合物升温至室温并再搅拌4小时。然后将反应用H2O(15mL)淬灭,用EtOAc(20mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(30mL)洗涤并用Na2SO4干燥,减压浓缩,残留物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到甲基-4-甲氧基苯基((4-(5-甲氧基吡啶-2-基氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲基)氨基甲酸甲酯(135mg,36%收率)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 442[M+H]+
步骤C:3-(4-甲氧基苯基)-1-(5-甲氧基吡啶-2-基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
4-甲氧基苯基((4-(5-甲氧基吡啶-2-基氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲基)氨基甲酸酯(135mg,0.3mmol,1.0当量)和K2CO3(2.1g,15.3mmol,51.0当量)在DMF(20mL)中的溶液。将混合物在130℃搅拌48小时。减压浓缩反应混合物,用H2O(20mL)处理残余物,用EtOAc(30mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(20mL)洗涤并用Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到3-(4-甲氧基苯基)-1-(5-甲氧基吡啶-2-基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(100mg,80%收率)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 410[M+H]+
3-(4-甲氧基苯基)-1-(5-甲氧基吡啶-2-基)-7-(2,2,2-三氟乙氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例257)由3-(4-甲氧基苯基)-1-(5-甲氧基吡啶-2-基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮和2,2,2-三氟乙胺通过一般程序IV(步骤D、E)合成。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):8.28(d,J=2.4Hz,1H),7.99(s,1H),7.40-7.27(m,4H),6.92(d,J=8.7Hz,2H),5.25(br s,1H),4.76(s,2H),4.01-3.71(m,2H,重叠),3.91(s,3H),3.81(s,3H).
LC-MS(ESI):m/z 461[M+H]+.
通过使用适当的起始材料,使用上文针对一般程序VII所述的程序合成以下化合物:
Figure BDA0003224737400001441
Figure BDA0003224737400001451
一般程序VIII:
Figure BDA0003224737400001461
结构8.6的化合物通过如一般程序VIII所述的方案获得。从芳基氯8.1开始,使用碱介导的芳族取代反应引入所需的R2基团(任选地保护的)以生成杂芳基胺8.2。通过在碱性条件下使氨基酯8.2与适当的异氰酸酯反应形成环脲8.3,从而引入所需的R3基团。芳基硫醇8.3被氧化成砜8.4,并且使用碱介导的芳族取代反应引入所需的R1基团以提供化合物8.5。如有必要,然后将化合物8.5脱保护以得到化合物8.6。
通过一般程序VIII制备实施例262:
Figure BDA0003224737400001462
步骤A:4-((4-(苄氧基)苯基)氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲酸乙酯
向4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲酸乙酯(1.0g,4.3mmol,1.0当量)在DMSO(10mL)中的溶液在室温下添加4-(苄氧基)苯胺(950mg,4.7mmol,1.1当量)和DIPEA(1.6g,12.9mmol,3.0当量)。将反应混合物在80℃下搅拌2小时。然后用冰水(50mL)淬灭反应混合物并用EtOAc(50mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,用Na2SO4干燥并在减压下浓缩,通过硅胶快速柱色谱法纯化残余物,得到4-((4-(苄氧基)苯基)氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲酸乙酯(1.6g,95%产率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 396[M+H]+
步骤B:1-(4-(苄氧基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲硫基)嘧啶[4,5-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
向4-((4-(苄氧基)苯基)氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲酸乙酯(1.0g,2.5mmol,1.0当量)在DMF(10mL)中的溶液在室温下添加1-异氰酸根合-4-甲氧基苯(560mg,3.7mmol,1.5当量)和K2CO3(690mg,5.0mmol,2.0当量)。将所得混合物搅拌16小时。然后用冰水(10mL)淬灭反应混合物并用EtOAc(20mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,用Na2SO4干燥并在减压下浓缩,通过快速柱色谱纯化残余物,得到1-(4-(苄氧基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲硫基)嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(300mg,24%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 499[M+H]+
步骤C:1-(4-(苄氧基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲基磺酰基)嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
向1-(4-(苄氧基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲硫基)嘧啶[4,5-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(300mg,0.6mmol,1.0当量)在DCM(10mL)中的溶液在室温下分若干份添加m-CPBA(310mg,1.8mmol,3.0当量)。将所得混合物搅拌2小时。然后用NaHSO3(饱和水溶液)(10mL)淬灭反应混合物,用DCM(20mL×2)萃取。合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,通过柱色谱纯化残余物,得到1-(4-(苄氧基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲基磺酰基)嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(260mg,82%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 531[M+H]+
步骤D:1-(4-(苄氧基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
向1-(4-(苄氧基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-(甲基磺酰基)嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(260mg,0.5mmol,1.0当量)在DMSO(5mL)中的溶液在室温下添加CsF(74mg,0.5mmol,1.0当量)、DIPEA(194mg,1.5mmol,3.0当量)和2,2,2-三氟乙胺(150mg,1.5mmol,3.0当量)。将得到的混合物在80℃下在密封管中搅拌16小时。然后用冰水(30mL)淬灭反应混合物并用DCM(30mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,用Na2SO4干燥并在减压下浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到1-(4-(苄氧基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(100mg,36%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z550[M+H]+
步骤E:1-(4-羟基苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮
向1-(4-(苄氧基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)嘧啶[4,5-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(50mg,0.1mmol,1.0当量)在MeOH(5mL)中的溶液在室温下添加5重量%Pd/C(10%w/w,5mg)。并且在H2气氛(1atm)下将反应混合物在室温下搅拌16小时。完成后,过滤除去催化剂,减压浓缩滤液。(粗LC-MS显示形成了约30%过度还原的加合物(M+2+H)+),然后将粗混合物重新溶解在无水THF(5mL)中,以一份添加DDQ(45mg),所得混合物在室温下再搅拌2小时。然后用NaHSO3(饱和水溶液)(10mL)淬灭反应混合物,用EtOAc(10mL×3)萃取所得混合物。合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥并在减压下浓缩。通过RP-prep-HPLC纯化粗残余物以得到1-(4-羟基苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)嘧啶[4,5-d]嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮(实施例262)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)(如下所示的两种互变异构体的混合物,比率:约1:1)δ(ppm):9.69(m,1H,重叠),8.87和8.82(两组s,共1H),8.75-8.70和8.50-8.45(两组m,共1H),7.33-7.03(多个双峰,6H),6.91-6.78(m,2H),4.24-4.08(m,1H),3.85-3.75(m,1H),3.78(s,3H,重叠)。
LC-MS(ESI):m/z 460[M+H]+
Figure BDA0003224737400001481
一般程序IX
Figure BDA0003224737400001482
结构9.5的化合物通过如一般程序IX所述的方案获得。从醛9.1开始,使用还原胺化作用引入所需的R3基团以生成胺9.2。通过使胺9.2与适当的异氰酸酯反应形成无环脲9.3来引入所需的R3基团。然后使化合物9.3经受碱性条件以形成环脲9.4。然后通过碱介导的亲核取代(例I)或钯介导的C-X偶联(例II)引入所需的R1基团,得到化合物9.5。
通过一般程序IX(例I)制备实施例263:
Figure BDA0003224737400001491
步骤A:3-(4-氯苯基)-1-((2,4-二氯嘧啶-5-基)甲基)-1-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)脲
将2,4-二氯嘧啶-5-甲醛(500mg,2.83mmol,1.0当量)溶解在DCM(7mL)中,然后加入乙酸(485μl,8.48mmol,3.0当量)。在添加2-甲基-2H-吲唑-5-胺(416mg,2.83mmol,1.0当量)之前将混合物冷却至0℃。在0℃下,以一份添加三乙酰氧基硼氢化钠(898mg,4.24mmol,2.0当量)。在LC-MS监测反应完全后(检测到m/z 308[M+H]+),将反应混合物直接用于步骤B。
步骤B:3-(4-氯苯基)-1-((2,4-二氯嘧啶-5-基)甲基)-1-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)脲
将1-氯-4-异氰酸根合苯(434mg,2.83mmol,2.0当量)添加至来自步骤A的反应混合物粗3-(4-氯苯基)-1-((2,4-二氯嘧啶-5-基)甲基)-1-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)脲(粗品,435mg,1.4mmol,1.0当量)。30分钟后,将硅胶添加至反应混合物中,样品浓缩至干燥。将粗固体干燥装载并通过柱色谱纯化,得到3-(4-氯苯基)-1-((2,4-二氯嘧啶-5-基)甲基)-1-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)脲(366.2mg,0.793mmol,56.1%收率)。LC-MS(ESI):m/z 461[M+H]+
步骤G:7-氯-1-(4-氯苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
将3-(4-氯苯基)-1-((2,4-二氯嘧啶-5-基)甲基)-1-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)脲(330.3mg,0.715mmol,1.0当量)溶解于THF中并冷却至0℃,然后添加KOtBu(96mg,0.858mmol,1.2当量)。使混合物升温至室温。搅拌15分钟后,再添加0.2当量KOtBu,并将反应混合物加热至60℃。加热20分钟后,反应完成。向反应混合物中添加硅胶,然后减压浓缩。将粗固体干燥加载并通过柱色谱纯化,得到7-氯-1-(4-氯苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮,并浓缩为产物(248.7mg,0.585mmol,82%收率)。LC-MS(ESI):m/z 425[M+H]+
步骤D:1-(4-氯苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
将7-氯-1-(4-氯苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(50mg,0.118mmol,1.0当量)溶解于DMSO(392μl)中,快速添加氟化铯(35.7mg,0.235mmol,2.0当量)、DIPEA(41.1μl,0.235mmol,2.0当量)和2,2,2-三氟乙烷-1-胺(46.1μl,0.588mmol,4.0当量)。然后将反应密封并加热至110℃5小时。然后用乙酸乙酯稀释反应混合物并用去离子水洗涤。收集有机层并用硫酸钠干燥。过滤后,用硅胶浓缩溶液,然后干装,通过柱色谱纯化得到1-(4-氯苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例263)。
1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.02(s,1H),7.89(s,1H),7.71(d,J=9.2Hz,1H),7.61(s,1H),7.42(d,J=8.6Hz,2H),7.28–7.24(m,3H),5.16(brs,1H),4.83(s,2H),4.22(s,3H),3.90(brs,2H).LC-MS(ESI):m/z 488.0[M+H]+.
通过一般程序IX(例II)制备实施例264:
Figure BDA0003224737400001501
步骤E:1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
将7-氯-1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(50mg,0.110mmol,1.0当量)、三(二亚苄基丙酮)二钯(0)氯仿加合物(5.68mg,5.48μmol,0.05当量,从一般程序IX,步骤A-C获得)、叔丁醇钠(15.81mg,0.165mmol,1.5当量)和二环己基(2′,4′,6′-三异丙基-[1,1′-联苯]-2-基)膦(5.23mg,10.97μmol,0.1当量)溶解在二噁烷(366μl)中。将2,2,2-三氟乙烷-1-胺(43.0μl,0.548mmol,5.0当量)添加至所得混合物中。小瓶用盖子密封并加热至100℃3小时。将硅胶直接加入粗反应混合物中,然后将其浓缩,干载并通过柱色谱纯化,得到1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例264)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.33(s,1H),7.67(s,1H),7.56(d,J=9.1Hz,1H),7.37(d,J=8.2Hz,1H),7.32(d,J=8.4Hz,2H),7.28(t,JH-F=63.6Hz 1H),7.25(s,1H),7.21(d,J=8.4Hz,2H),7.09–7.03(m,1H),6.24(d,J=8.2Hz,1H),4.82(s,2H),4.16(s,3H),3.67(p,J=9.6Hz,2H).
LC-MS(ESI):m/z 519.1[M+H]+.
通过使用适当的起始材料,使用上文针对一般程序IX所述的程序合成以下化合物:
Figure BDA0003224737400001511
Figure BDA0003224737400001521
Figure BDA0003224737400001531
Figure BDA0003224737400001541
4-(3-(4-甲氧基苯基)-2-氧代-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)-基)苯甲酰胺(实施例276)的合成
Figure BDA0003224737400001542
步骤A:4-(3-(4-甲氧基苯基)-2-氧代-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)-基)苯甲酸甲酯
将1-(4-溴苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-(2,2,2-三氟乙氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(由N-((4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯胺和1-溴-4-异氰酸根合苯通过一般程序VI(步骤B-E)合成)(355mg,0.7mmol,1.0当量)、TEA(212mg,2.1mmol,3.0当量)和Pd(dppf)Cl2(51mg,0.07mmol,0.1当量)在甲苯/MeOH(10mL,10/1)中的混合物在100℃CO气氛下搅拌14小时。然后将反应混合物倒入H2O(10mL)中并用EtOAc(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,用Na2SO4干燥并在减压下浓缩,通过硅胶快速柱色谱纯化残余物,得到4-(3-(4-甲氧基苯基)-2-氧代-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)-基)苯甲酸甲酯(300mg,88%收率)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 488[M+H]+
步骤B:4-(3-(4-甲氧基苯基)-2-氧代-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)-基)苯甲酸
将4-(3-(4-甲氧基苯基)-2-氧代-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)-基)苯甲酸甲酯(292mg,0.6mmol,1.0当量)和LiOH(aq.)(1N,6mL,6mmol,10.0当量)在THF(6mL)中的溶液在室温下搅拌过夜。添加稀HCl(1N,aq.)调节pH=6,所得混合物用EtOAc(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,用Na2SO4干燥并在减压下浓缩,通过硅胶快速柱色谱纯化残余物,得到4-(3-(4-甲氧基苯基)-2-氧代-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)-基)苯甲酸(244mg,86%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 474[M+H]+
步骤C:4-(3-(4-甲氧基苯基)-2-氧代-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)-基)苯甲酰胺
将4-(3-(4-甲氧基苯基)-2-氧代-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)-基)苯甲酸(47mg,0.1mmol,1.0当量)、NH4Cl(32mg,0.6mmol,6.0当量)、DIPEA(77mg,0.6mmol,6.0当量)和HATU(76mg,0.2mmol,2.0当量)在DCM(3mL)中的混合物在室温下搅拌1小时。然后将反应混合物倒入H2O(10mL)中并用DCM(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,在Na2SO4上干燥并在减压下浓缩,通过RP-prep-HPLC纯化残余物,得到4-(3-(4-甲氧基苯基)-2-氧代-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)-基)苯甲酰胺(实施例276)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.19(s,1H),8.09(s,1H),7.99(d,J=8.4Hz,2H),7.56(br s,1H),7.45-7.40(m,3H),7.40(d,J=8.8Hz,2H),7.03(d,J=8.8Hz,2H),4.83(s,2H),4.00-3.50(m,2H),3.83(s,3H).
LC-MS(ESI):m/z 473[M+H]+.
4-(3-(4-甲氧基苯基)-2-氧代-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)的合成-基)-N-甲基苯甲酰胺(实施例277)
Figure BDA0003224737400001551
遵循获得实施例276的程序(步骤C)。因此,4-(3-(4-甲氧基苯基)-2-氧代-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)-基)-N-甲基苯甲酰胺(实施例277)由4-(3-(4-甲氧基苯基)-2-氧代-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)-基)苯甲酸(实施例276,步骤B)和甲胺盐酸盐合成。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.56(q,J=4.0Hz,1H),8.19(s,1H),7.95(d,J=8.4Hz,2H),7.55(br s,1H),7.44(d,J=8.4Hz,2H),7.40(d,J=8.8Hz,2H),7.03(d,J=9.2Hz,2H),4.77(s,2H),4.00-3.50(m,2H),3.76(s,3H),2.80(d,J=4.4Hz,3H).
LC-MS(ESI):m/z 487[M+H]+.
1-(4-(1-羟基环丙基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]的合成嘧啶-2(1H)-酮(实施例278)
Figure BDA0003224737400001561
步骤A:4-(3-(4-甲氧基苯基)-2-氧代-7-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)-基)苯甲酸甲酯
向4-(3-(4-甲氧基苯基)-2-氧代-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)-基)苯甲酸甲酯(实施例276,步骤A)(500mg,1.03mmol,1.0当量)在DMF(5mL)中的溶液在0℃下添加NaH(60%,在矿物油中,82mg,2.06mmol,2.0当量)。将混合物在0℃下搅拌0.5h。然后添加SEMCl(256mg,1.53mmol,1.49当量)。将反应混合物在室温下搅拌1小时,并在0℃下用NH4Cl(饱和水溶液)(10mL)淬灭。然后反应混合物用EtOAc(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到4-(3-(4-甲氧基苯基)-2-氧代-7-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)-基)苯甲酸甲酯(550mg,87%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 618[M+H]+
步骤B:1-(4-(1-羟基环丙基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向4-(3-(4-甲氧基苯基)-2-氧代-7-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-1(2H)-基)苯甲酸甲酯(240mg,0.39mmol,1.0当量)在***(3mL)中的溶液在-78℃下逐滴添加异丙醇钛(IV)(222mg,0.78mmol,2.0当量)。10分钟后,逐滴添加EtMgBr(1M,在THF中,2.3mL,2.33mmol,6.0当量)。然后使所得混合物升温至室温并再搅拌4小时。所得混合物用NH4Cl(饱和水溶液)(10mL)淬火并用EtOAc(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到1-(4-(1-羟基环丙基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(74mg,31%收率)。LC-MS ESI m/z=616[M+H]+
步骤C:1-(4-(1-羟基环丙基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例278)由1-(4-(1-羟基环丙基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮通过一般程序IV(方法A,步骤F)合成。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):7.92(s,1H),7.31(d,J=8.4Hz,2H),7.22(d,J=9.2Hz,2H),7.19-7.16(m,2H),6.85(d,J=9.2Hz,2H),5.10(br s,1H),4.69(s,2H),3.95-3.59(m,2H),3.74(s,3H),1.27-1.21(m,2H),1.05-0.99(m,2H).
LC-MS(ESI):m/z 486[M+H]+.
3-(4-甲氧基苯基)-1-(4-(2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基)苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例279)的合成
Figure BDA0003224737400001571
步骤A:1-(4-(2-氟吡啶-3-基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
将1-(4-溴苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(由N-((4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯胺和1-溴-4-异氰酸根合苯通过一般程序VI(步骤B-E)合成)(101mg,0.2mmol,1.0当量)、(6-氟吡啶-3-基)硼酸(56mg,0.4mmol,2.0当量)、Pd(dppf)Cl2(15mg,0.02mmol,0.1当量)和K2CO3(83mg,0.6mmol,3.0当量)在DMF(5mL)中的溶液在100℃N2气氛下搅拌14小时。将反应混合物冷却至室温,用水(10mL)稀释,用EtOAc(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(2mL)洗涤,用Na2SO4干燥并在减压下浓缩,通过硅胶快速柱色谱法纯化残余物,得到1-(4-(2-氟吡啶-3-基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(100mg,95%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 525[M+H]+
步骤B:3-(4-甲氧基苯基)-1-(4-(2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基)苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
1-(4-(2-氟吡啶-3-基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(53mg,0.1mmol,1.0当量)在HCl(1N,水溶液)中的溶液(3mL)在100℃下搅拌2小时。在减压下浓缩反应混合物并通过RP-prep-HPLC直接纯化,得到3-(4-甲氧基苯基)-1-(4-(2-氧代-1,2-二氢吡啶-3-基)苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例279)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):11.78(br s,1H),8.13(s,1H),7.80(d,J=8.4Hz,2H),7.70(dd,J=10.0Hz,2.0Hz,1H),7.53(br s,1H),7.41(dd,J=10.0Hz,2.0Hz,1H),7.35(d,J=8.8Hz,2H),7.30(d,J=8.4Hz,2H),6.97(d,J=9.2Hz,2H),6.32(t,J=6.4Hz,1H),4.77(s,2H),4.07-3.81(m,2H),3.77(s,3H).
LC-MS(ESI):m/z 523[M+H]+.
1-(4-(1H-吡咯-3-基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例280)
Figure BDA0003224737400001581
步骤A:3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-1-(4-(1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯-3-基)苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮通过类似的方法通过实施例279(步骤A),从1-(4-溴苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮和3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯(参考:Eur.J.Med.Chem.,2015,103,105-122)白色固体合成。LC-MS(ESI):m/z 651[M+H]+
步骤B:1-(4-(1H-吡咯-3-基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
将3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-1-(4-(1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯-3-基)苯基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(65mg,0.1mmol)在TFA/DCM混合物(3mL,1/5,v/v)中的溶液在室温下搅拌14小时。然后将反应混合物减压浓缩并通过RP-prep-HPLC纯化,得到1-(4-(1H-吡咯-3-基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例280)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):10.95(s,1H),8.11(s,1H),7.57(d,J=8.4Hz,2H),7.48(br s,1H),7.34(d,J=8.8Hz,2H),7.25(d,J=2.0Hz,1H),7.18(d,J=8.4Hz,2H),6.97(d,J=8.8Hz,2H),6.81(dd,J=4.4Hz,2.4Hz,1H),6.46(dd,J=4.0Hz,2.4Hz,1H),4.76(s,2H),4.15-3.68(m,2H),3.77(s,3H).
LC-MS(ESI):m/z 495[M+H]+.
1-(4-(2-羟基环丙基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例281)的合成
Figure BDA0003224737400001591
将3-(4-甲氧基苯基)-1-(4-(2-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼烷-2-基)环丙基)苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(由3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮和2-(2-(4-溴苯基)环丙基)-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷(参考:Organic andBiomolecular Chemistry,2016,14,6591-6595)通过一般程序IV(方法B,步骤C)合成)(100mg,0.17mmol,1.0当量)和H2O2(30%,在H2O中,0.34mL,3.4mmol,20当量)在MeOH(3mL)中的溶液在0℃下下搅拌2小时。然后用水(10mL)稀释反应混合物并用EtOAc(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,用Na2SO4干燥并在减压下浓缩,通过RP-prep-HPLC纯化残余物,得到1-(4-(2-羟基环丙基)苯基)-3-(4-甲氧基苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例281)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.11(s,1H),7.33(d,J=8.8Hz,2H),7.13(d,J=8.4Hz,2H),7.05(d,J=8.4Hz,2H),6.96(d,J=8.8Hz,2H),4.76(s,2H),3.95-3.83(m,2H),3.77(s,3H),3.39-3.33(m,1H),2.00-1.93(m,1H),1.15-1.09(m,1H),0.98-0.93(m,1H).
LC-MS(ESI):m/z 486[M+H]+.
7-乙氧基-1-(6-(氟甲基)吡啶-3-基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例282)的合成
Figure BDA0003224737400001592
向7-乙氧基-1-(6-(羟甲基)吡啶-3-基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(由7-乙氧基-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮和(5-溴吡啶-2-基)甲醇通过一般程序II(方法A,步骤D)合成)(112mg,0.26mmol,1.0当量)在DCM(10mL)中的溶液在0℃下添加DAST(84mg,0.52mmol,2.0当量)。然后将反应混合物搅拌30分钟。所得混合物用冰水(10mL)淬灭,并用EtOAc(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,用Na2SO4干燥并在减压下浓缩,通过RP-prep-HPLC纯化残余物,得到7-乙氧基-1-(6-(氟甲基)吡啶-3-基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例282)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.57(d,J=2.4Hz,1H),8.36(s,1H),7.92(dd,J=8.0Hz,2.4Hz,1H),7.72(dd,J=2.0Hz,0.8Hz,1H),7.66-7.55(m,3H),7.30(dd,J=9.2Hz,2.0Hz,1H),6.46(d,J=8.0Hz,1H),5.54(d,JHF=48.0Hz,2H),4.94(s,2H),4.17(s,3H),3.86(q,J=7.2Hz,2H),1.07(t,J=7.2Hz,3H).
LC-MS(ESI):m/z 433[M+H]+.
1-(苯并[d]噁唑-5-基)-7-(2,2-二氟乙氧基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例283)
Figure BDA0003224737400001601
步骤A:7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-羟基-3-硝基苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
向7-(2,2-二氟乙氧基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(500mg,1.39mmol,1.0当量)(通过一般程序II,方法A,步骤A-C获得)在DMSO(2mL)中的溶液添加CsF(630mg,4.08mmol,3.0当量)、N1,N2-二甲基环己烷-1,2-二胺(395mg,2.78mmol,2.0当量)和CuI(264mg,1.39mmol,1.0当量),将反应混合物在100℃N2气氛下搅拌16小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,反应混合物用水(20mL)稀释并用EtOAc(30mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,通过Na2SO4干燥并减压浓缩,残留物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-羟基-3-硝基苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(432mg,56%收率)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 497[M+H]+
步骤B:1-(3-氨基-4-羟基苯基)-7-(2,2-二氟乙氧基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
向7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-羟基-3-硝基苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1H,2H,3H,4H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-2-酮(200mg,0.4mmol,1.0当量)在MeOH(2mL)中的溶液添加乙酸(0.5mL)和锌(79mg,1.20mmol,3.0当量),将反应混合物在室温下搅拌2小时。反应混合物用水(10mL)稀释并用EtOAc(10mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥并在减压下浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到1-(3-氨基-4-羟基苯基)-7-(2,2-二氟乙氧基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(138mg,73%收率)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 467[M+H]+
步骤C:1-(苯并[d]噁唑-5-基)-7-(2,2-二氟乙氧基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
将1-(3-氨基-4-羟基苯基)-7-(2,2-二氟乙氧基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1H,2H,3H,4H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-2-酮(118mg,0.25mmol,1.0当量)在HC(OEt)3(4mL)中的悬浮液在120℃下搅拌8小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,减压除去过量的HC(OEt)3,用水(20mL)稀释残余物并用EtOAc(20mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过RP-prep-HPLC纯化,得到1-(苯并[d]噁唑-5-基)-7-(2,2-二氟乙氧基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例283)。LC-MS(ESI):m/z 477[M+H]+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.79(s,1H),8.36(s,1H),7.86-7.81(m,2H),7.72(d,J=2.0Hz,1H),7.69(d,J=8.0Hz,1H),7.58(d,J=9.2Hz,1H),7.45(dd,J=8.8Hz,1.6Hz,1H),7.30(dd,J=9.2Hz,1.6Hz,1H),6.55(d,J=8.0Hz,1H),5.94(tt,JHF=55.2Hz,J=4.0Hz,1H),4.98(s,2H),4.17(s,3H),3.97(td,JHF=14.4Hz,J=3.6Hz,2H).
6-氯-7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢喹唑啉-2(1H)-酮(实施例284)的合成
Figure BDA0003224737400001611
步骤A:5-氯-4-氟-2-硝基苯甲醛
向在H2SO4(4mL)中的3-氯-4-氟苯甲醛(1g,6.30mmol,1.0当量)溶液在0℃下小心地添加HNO3(1mL),将反应混合物加热至室温并再搅拌2小时。将反应混合物倒入冰水(10mL)上并用EtOAc(40mL×3)萃取,将合并的有机层用盐水(30ml)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到5-氯-4-氟-2-硝基苯甲醛(960mg,75%收率)白色固体。
步骤B:5-氯-4-(2,2-二氟乙氧基)-2-硝基苯甲醛
向5-氯-4-氟-2-硝基苯甲醛(50mg,0.24mmol,1.0当量)在乙腈(4mL)中的溶液添加K2CO3(68mg,0.49mmol,2.0当量)和2,2-二氟乙-1-醇(24mg,0.29mmol,1.2当量),将反应混合物在80℃下搅拌℃15小时。反应混合物用H2O(10mL)稀释,用EtOAc(10mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩,残留物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到5-氯-4-(2,2-二氟乙氧基)-2-硝基苯甲醛(25mg,38%收率)。LC-MS(ESI):m/z 266[M+H]+
步骤C:N-(5-氯-4-(2,2-二氟乙氧基)-2-硝基苄基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺
向5-氯-4-(2,2-二氟乙氧基)-2-硝基苯甲醛(400mg,1.50mmol,1.0当量)和2-甲基-2H-吲唑-5-胺(244mg,1.65mmol,1.1当量)在DCE(4mL)中的混合物添加MgSO4(1807mg,15.06mmol,10.0当量)和HOAc(361mg,6.02mmol,4.0当量),将反应混合物在25℃下搅拌16小时。在0℃下分若干份添加NaBH(OAc)3(477mg,2.25mmol,3.0当量),之后将反应混合物加热至室温并再搅拌4小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,反应用NaHCO3(饱和水溶液)(20mL)淬灭,用EtOAc(20mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到N-(5-氯-4-(2,2-二氟乙氧基)-2-硝基苄基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺(472mg,79%收率)淡黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 397[M+H]+
步骤D:N-(5-氯-4-(2,2-二氟乙氧基)-2-硝基苄基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺
向N-(5-氯-4-(2,2-二氟乙氧基)-2-硝基苄基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺(2.0g,5.04mmol,1.0当量)在MeOH(10mL)中的溶液添加Pd/C(200mg,10重量%,湿),将反应混合物在H2气球(1atm)在25℃下搅拌3小时。通过TLC监测反应进程,完成后,通过
Figure BDA0003224737400001621
短垫过滤除去催化剂,减压浓缩滤液,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到N-(5-氯-4-(2,2-二氟乙氧基)-2-硝基苄基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺(800mg,43%)灰白色固体。LC-MS(ESI):m/z367[M+H]+
步骤E:6-氯-7-(2,2-二氟乙氧基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢喹唑啉-2(1H)-酮
向N-(5-氯-4-(2,2-二氟乙氧基)-2-硝基苄基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺(300mg,0.81mmol,1.0当量)在THF(5mL)中的溶液在0℃下添加三光气(97mg,0.32mmol,0.4当量)加热至室温并搅拌16小时。反应用NaHCO3(饱和水溶液)(20mL)淬灭,用EtOAc(40mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,用Na2SO4干燥并在减压下浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到6-氯-7-(2,2-二氟乙氧基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢喹唑啉-2(1H)-酮(130mg,40%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 367[M+H]+
步骤F:6-氯-7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢喹唑啉-2(1H)-酮
向6-氯-7-(2,2-二氟乙氧基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1,2,3,4-四氢喹唑啉-2-酮(87mg,0.22mmol,1.0当量)在二噁烷(3mL)中的溶液添加1-溴-4-(二氟甲氧基)苯(74mg,0.33mmol,1.5当量)、CsF(101mg,0.66mmol,3.0当量)、N1,N2-二甲基环己烷-1,2-二胺(63mg,0.44mmol,2.0当量)和CuI(42mg,0.22mmol,1.0当量),将反应混合物在在90℃N2气氛下搅拌16小时。反应混合物用H2O(20mL)稀释,用EtOAc(20mL×3)萃取,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过RP-prep-HPLC纯化,得到6-氯-7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢喹唑啉-2(1H)-酮(实施例284)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.34(s,1H),7.66(d,J=1.2Hz,1H),7.56(d,J=9.2Hz,1H),7.50-7.43(m,3H),7.35(t,JHF=74.0Hz,1H),7.33(d,J=8.8Hz,2H),7.25(dd,J=9.2Hz,2.0Hz,1H),6.28(tt,JHF=54.0Hz,J=3.2Hz,1H),5.92(s,1H),4.93(s,2H),4.17(s,3H),4.09(td,JHF=14.8Hz,J=3.2Hz,2H).
LC-MS(ESI):m/z 535[M+H]+.
7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-6-氟-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢喹唑啉-2(1H)-酮(实施例285)的合成
Figure BDA0003224737400001631
步骤A:4-溴-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苯甲酸
向4-(二氟甲氧基)苯胺(269mg,1.6mmol,2.0当量)在THF(6mL)中的溶液在-78℃下添加LiHMDS(2.53mL,2.53mmol,1M,3.2当量),在搅拌30分钟后,逐滴添加4-溴-2,5-二氟苯甲酸(200mg,0.8mmol,1.0当量)在THF(2mL)中的溶液。使所得混合物升温至室温并搅拌16小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,用H2O(10mL)淬灭反应混合物,用稀HCl(1N,aq.)将水层调整至pH=2,用EtOAc(30mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到4-溴-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苯甲酸(167mg,53%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 376[M+H]+
步骤B:4-溴-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苯甲酸甲酯
向4-溴-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苯甲酸(860mg,2.28mmol,1.0当量)和Cs2CO3(1.5g,4.57mmol,2.0当量)在DMF(5mL)中的混合物在0℃下逐滴添加CH3I(645mg,4.56mmol,2.0当量),将反应混合物搅拌30分钟。通过LC-MS监测反应进程,完成后,反应混合物用H2O(20mL)稀释,用EtOAc(30mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,通过Na2SO4干燥并在减压下浓缩,通过硅胶快速柱色谱纯化残余物,得到4-溴-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苯甲酸甲酯(780mg,87%收率)白色固体。
LC-MS(ESI):m/z 390[M+H]+.
步骤C:2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼烷-2-基)苯甲酸甲酯
向4-溴-2-{[4-(二氟甲氧基)苯基]氨基}-5-氟苯甲酸甲酯(500mg,1.28mmol,1.0当量)和4,4,5,5-四甲基-2-(四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1,3,2-二氧杂硼烷(488mg,1.92mmol,1.5当量)在二噁烷(6mL)中的混合物添加KOAc(354mg,2.56mmol,2.0当量)和Pd(dppf)Cl2(87mg,0.12mmol,0.1当量),将反应混合物在90℃N2气氛下搅拌4小时。反应混合物用H2O(20mL)稀释,用EtOAc(20mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二噁硼烷-2-基)苯甲酸甲酯(518mg,92%收率)无色油状物。LC-MS(ESI):m/z 438[M+H]+
步骤D:2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟-4-羟基苯甲酸甲酯
向2-{[4-(二氟甲氧基)苯基]氨基}-5-氟-4-(四甲基-1,3,2-二氧硼烷-2-基)苯甲酸甲酯(518mg,1.18mmol,1.0当量)在THF(4mL)中的溶液添加AcOH(0.2mL)和H2O2(30%,1mL),将反应混合物在25℃下搅拌1小时。通过TLC(石油醚/EtOAc=10:1)检测反应完成。完成后,过量的H2O2用Na2SO3(饱和水溶液)(10mL)在0℃下淬灭,用EtOAc(20mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟-4-羟基苯甲酸甲酯(310mg,80%收率)。LC-MS(ESI):m/z 328[M+H]+
步骤E:4-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苯甲酸甲酯
向2-{[4-(二氟甲氧基)苯基]氨基}-5-氟-4-羟基苯甲酸甲酯(310mg,0.94mmol,1.0当量)和Cs2CO3(621mg,1.89mmol,2.0当量)在DMF(4mL)中的混合物添加1,1-二氟-2-碘乙烷(364mg,1.89mmol,2.0当量),将反应混合物在100℃下搅拌2小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,反应混合物用H2O(20mL)稀释,用EtOAc(15mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到4-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苯甲酸甲酯(258mg,70%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 392[M+H]+
步骤F:(4-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苯基)甲醇
向LiAlH4(76mg,1.99mmol,3.0当量)在THF(3mL)中的悬浮液在0℃下逐滴添加4-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苯甲酸甲酯(260mg,0.66mmol,1.0当量)在THF(1mL)中的溶液,将反应混合物加热至室温并搅拌2小时。通过LC-MS监测反应的进展,完成后,将反应混合物冷却至0℃,用水(0.1mL)淬灭,按顺序添加NaOH水溶液(0.1mL,15%)和H2O(0.3mL),然后通过
Figure BDA0003224737400001651
短垫过滤,滤液减压浓缩,残留物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到(4-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苯基)甲醇(230mg,95%收率)无色油状物。LC-MS(ESI):m/z364[M+H]+
步骤G:4-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苯甲醛
向(4-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苯基)甲醇(250mg,0.69mmol,1.0当量)在CHCl3(5mL)中的溶液分若干份添加MnO2(897mg,10.3mmol,15.0当量),将反应混合物在40℃下搅拌16小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,通过短垫
Figure BDA0003224737400001652
过滤过量的MnO2,减压浓缩滤液,通过硅胶快速柱色谱纯化残余物,得到4-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苯甲醛(70mg,28%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 362[M+H]+
步骤H:N-(4-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苄基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺
向-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苯甲醛(44mg,0.12mmol,1.0当量)在DCE(10mL)中的溶液添加2-甲基-2H-吲唑-5-胺(22mg,0.15mmol,1.2当量)和AcOH(29mg,0.49mmol,4.0当量),反应混合物在室温下搅拌15小时。然后将反应混合物冷却至0℃,以一份添加NaBH(OAc)3(77mg,0.36mmol,3.0当量),将反应混合物加热至室温并搅拌3小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,用冰水(10mL)淬灭反应并用DCM(20mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,通过柱色谱纯化残余物,得到N-(4-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苄基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺(48mg,80%收率)淡绿色固体。LC-MS(ESI):m/z 493[M+H]+
步骤I:7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-6-氟-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢喹唑啉-2(1H)-酮
向N-(4-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-氟苄基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺(50mg,0.1mmol,1.0当量)在THF(2mL)中的溶液在0℃下添加三光气(30mg,0.1mmol,1.0当量),使反应混合物加热至室温并搅拌1小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,将反应混合物用冰冷的NaHCO3(饱和水溶液)(10mL)淬灭,用EtOAc(20mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,用Na2SO4干燥并在减压下浓缩,通过RP-prep-HPLC纯化残余物,得到7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-6-氟-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢喹唑啉-2(1H)-酮(实施例285)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.34(s,1H),7.65(s,1H),7.55(d,J=9.2Hz,1H),7.46(d,J=8.8Hz,2H),7.35(t,JHF=74.0Hz,1H),7.34-7.24(m,4H),6.27(tt,JHF=54.0Hz,3.2Hz,1H),5.94(d,JHF=7.2Hz,1H),4.93(s,2H),4.16(s,3H),4.13(td,JHF=14.8Hz,J=3.2Hz,2H).
LC-MS(ESI):m/z 519[M+H]+.
7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-4-甲基-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶基[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例286)的合成
Figure BDA0003224737400001661
步骤A:1-(6-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(甲氧基-d3)苯基)氨基)吡啶-3-基)乙烷-1-酮
向6-(2,2-二氟乙氧基)-3-异氰基-N-(4-(甲氧基-d3)苯基)吡啶-2-胺(500mg,1.62mmol,1.0当量)(通过程序I,步骤A-B制备)在THF(20mL)中的溶液在0℃N2气氛下逐滴添加CH3Li(5.1mL,8.1mmol,1.6M,5.0当量),将反应混合物搅拌2小时。通过TLC监测反应。完成后,将反应用H2O(10mL)淬灭,用EtOAc(20mL×3)萃取,将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤并用Na2SO4干燥并减压浓缩,纯化残余物通过快速柱色谱纯化,得到1-(6-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(甲氧基d3)苯基)氨基)吡啶-3-基)乙烷-1-酮(250mg,48%)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 326.1[M+H]+
步骤B:1-(6-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(甲氧基-d3)苯基)氨基)吡啶-3-基)乙-1-酮肟
向1-(6-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(甲氧基-d3)苯基)氨基)吡啶-3-基)乙-1-酮(250mg,0.77mmol,1.0当量)和盐酸羟胺(267mg,3.85mmol,5.0当量)在MeOH(5mL)中的溶液添加NaOH(215mg,5.39mmol,7.0当量),反应混合物在60℃下搅拌6小时。反应混合物用H2O(20mL)淬灭并用EA(20mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(10mL)洗涤并经Na2SO4干燥,减压浓缩并通过快速柱色谱纯化,得到1-(6-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(甲氧基-d3)苯基)氨基)吡啶-3-基)乙烷-1-酮肟(220mg,84%收率)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 341.1[M+H]+
步骤C:3-(1-氨基乙基)-6-(2,2-二氟乙氧基)-N-(4-(甲氧基-d3)苯基)吡啶-2-胺
向1-(6-(2,2-二氟乙氧基)-2-((4-(甲氧基-d3)苯基)氨基)吡啶-3-基)乙烷-1-酮肟(220mg,0.65mmol,1.0当量)和Zn(420mg,6.50mmol,10当量)在MeOH(15mL)中的溶液在60℃下逐滴添加浓盐酸(1.0mL),反应混合物在60℃下搅拌3小时。然后将反应混合物冷却至0℃,用H2O(20mL)稀释并过滤,滤饼用EtOAc(10mL×3)洗涤,滤液用EtOAc(20mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,通过快速柱色谱纯化残余物,得3-(1-氨基乙基)-6-(2,2-二氟乙氧基)-N-(4-(甲氧基-d3)苯基)吡啶-2-胺(170mg,81%收率)褐色油状物。LC-MS(ESI):m/z 327.2[M+H]+
步骤D:7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-4-甲基-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
向3-(1-氨基乙基)-6-(2,2-二氟乙氧基)-N-(4-(甲氧基-d3)苯基)吡啶-2-胺(170mg,0.52mmol,1.0当量)在THF(10mL)中的溶液添加CDI(169mg,1.04mmol,2.0当量)和t-BuOK(117mg,1.04mmol,2.0当量),将反应混合物在65℃下搅拌2小时。然后将反应混合物用H2O(20mL)淬灭并用EtOAc(20mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过快速柱色谱纯化,得到7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-4-甲基-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(130mg,71%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z=353.1[M+H]+
步骤E:7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-4-甲基-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
向7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-4-甲基-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(100mg,0.28mmol,1.0当量)在DMSO(6mL)中的溶液添加5-溴-2-甲基-2H-吲唑(418mg,1.99mmol,7.0当量)、N1,N2-二甲基环己烷-1,2-二胺(81mg,0.57mmol,2.0当量)、CuI(109mg,0.57mmol,2.0当量)、NaI(85mg,0.57mmol,2.0当量)和Cs2CO3(185mg,0.57mmol,2.0当量),将反应混合物在140℃下搅拌8小时,并在110℃N2气氛下搅拌15小时。反应用H2O(15mL)稀释并用EtOAc(20mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥并在减压下浓缩,残余物通过RP-Prep-HPLC纯化,得到7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-4-甲基-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.35(s,1H),7.73-7.66(m,2H),7.60(d,J=8.8Hz,1H),7.25(d,J=8.8Hz,2H),7.20(dd,J=9.2Hz,1.6Hz,1H),6.99(d,J=8.8Hz,2H),6.54(d,J=8.4Hz,1H),6.02(tt,JHF=55.6Hz,J=4.0Hz,1H),5.04(q,J=6.4Hz,1H),4.17(s,3H),4.15-3.97(m,2H),1.44(d,J=6.4Hz,3H).
LC-MS(ESI):m/z=483.2[M+H]+.
1-(4-甲氧基苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-丙基-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例294)的合成
Figure BDA0003224737400001681
向7-氯-1-(4-甲氧基苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(109mg,0.26mmol,1.0当量)和Fe(acac)3(93mg,0.26mmol,1.0当量)在THF(5mL)和NMP(1mL)中的混合物在0℃N2气氛下逐滴添加正丙基溴化镁(1M,在***中,4.0mL,4.0mmol,15.4当量)。将混合物在室温下搅拌过夜并小心地用冰水(10mL)淬灭。粗混合物用EtOAc(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,并在减压下浓缩。粗残留物通过RP-prep-HPLC纯化,得到1-(4-甲氧基苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-丙基-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例294)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:8.34(s,1H),7.67(d,J=1.5Hz,1H),7.56(dd,J=8.3Hz,3.8Hz,2H),7.26(dd,J=9.2Hz,2.0Hz,1H),7.19(d,J=8.8Hz,2H),6.97(d,J=8.8Hz,2H),6.87(d,J=7.5Hz,1H),4.94(s,2H),4.17(s,3H),3.80(s,3H),2.43(t,J=7.5Hz,2H),1.54-1.37(m,2H),0.79(t,J=7.3Hz,3H).
LC-MS(ESI):m/z 428.1[M+H]+.
7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-羟基苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例295)的合成
Figure BDA0003224737400001691
向7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-甲氧基苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例141)(150mg,0.32mmol,1.0当量)在DCM(4mL)中的溶液在-78℃下逐滴添加BBr3(403mg,1.61mmol,5.0当量),将反应混合物在-78℃下搅拌0.5小时,然后将其加热至0℃。通过添加NaHCO3(饱和水溶液)(10mL)淬灭反应,用DCM(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,用Na2SO4干燥并在减压下浓缩,残余物通过RP-prep-HPLC纯化,得到7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-羟基苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例295)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:9.50(s,1H),8.34(s,1H),7.68(d,J=1.6Hz,1H),7.65(d,J=8.4Hz,1H),7.57(d,J=9.2Hz,1H),7.26(dd,J=9.2Hz,2.0Hz,1H),7.12(d,J=8.8Hz,2H),6.82(d,J=8.8Hz,2H),6.51(d,J=8.0Hz,1H),6.03(tt,JHF=55.6Hz,J=4.0Hz,1H),4.92(s,2H),4.17(s,3H),4.08(td,JHF=14.4Hz,J=4.0Hz,2H).LC-MS(ESI):m/z 452.2[M+H]+.
7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-甲氧基环己基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1H,2H,3H,4H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-2-酮(实施例427)的合成
Figure BDA0003224737400001692
步骤A:7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-甲氧基环己-1-烯-1-基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1H,2H,3H,4H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-2-酮
向7-(2,2-二氟乙氧基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1H,2H,3H,4H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-2-酮(400mg,1.11mmol,1.0当量)在DMSO(8mL)中的溶液添加Cs2CO3(1.09g,3.33mmol,3.0当量)、CuI(212mg,1.11mmol,1.0当量)、(1R,2R)-N1,N2-二甲基环、乙烷-1,2-二胺(315mg,2.22mmol,2.0当量)和4-甲氧基环己-1-烯-1-基三氟甲磺酸酯(参考:J.Am.Chem.Soc.,2018,140,2446-2449)(579mg,2.22mmol,2.0当量),将混合物在100℃N2气氛下搅拌12小时。完成后,将反应用水(50mL)淬灭并用EtOAc(80mL×3)萃取。合并的有机层用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,残留物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-甲氧基环己-1-烯-1-基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1H,2H,3H,4H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-2-酮(480mg,92%)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 470[M+H]+
步骤B:7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-甲氧基环己基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1H,2H,3H,4H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-2-酮
向7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-甲氧基环己-1-烯-1-基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1H,2H,3H,4H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-2-酮(120mg,0.25mmol,1.0当量)在MeOH(8mL)中的溶液添加PtO2(12mg,0.05mmol,0.2当量),反应混合物用H2脱气,并在50℃H2气氛(1atm)下搅拌下12小时。如LCMS所示,反应完成。反应混合物通过
Figure BDA0003224737400001702
短垫过滤,滤液减压浓缩,残余物通过RP-prep-HPLC纯化,得到7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-甲氧基环己基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1H,2H,3H,4H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-2-酮(实施例427)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.30(s,1H),7.57(d,J=8.5Hz,1H),7.57(s,1H),7.53(d,J=9.1Hz,1H),7.16(d,J=9.2Hz,1H),6.50(d,J=8.0Hz,1H),6.40(tt,JHF=55.5Hz,J=3.8Hz,1H),4.69(s,2H),4.62(td,JHF=14.9Hz,J=3.5Hz,2H),4.55-4.45(m,1H),4.15(s,3H),3.22(s,3H),3.24-3.18(m,1H),2.90-2.72(m,2H),2.01-1.96(m,2H),1.50-1.38(m,4H).
LC-MS(ESI):m/z 472.6[M+H]+.
1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢吡啶并[3,2-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例428)的合成
Figure BDA0003224737400001701
步骤A:3-溴-5-((2,2,2-三氟乙基)氨基)吡啶甲腈
向3-溴-5-氟吡啶甲腈(5.0g,24.9mmol,1.0当量)和DIEA(9.7g,74.6mmol,3.0当量)在DMF(50mL)中的溶液添加2,2,2-三氟乙烷-1-胺(7.4g,74.6mmol,3.0当量),将反应混合物密封在管中并在100℃下搅拌15小时。然后将反应混合物倒入H2O(50mL)中并用EtOAc(50mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,用Na2SO4干燥并在减压下浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到3-溴-5-((2,2,2-三氟乙基)氨基)吡啶甲腈(4.5g,65%收率)淡黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 280,282[M+H]+
步骤B:3-溴-5-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)吡啶甲腈
向3-溴-5-((2,2,2-三氟乙基)氨基)吡啶甲腈(1.13g,4.04mmol,1.0当量)在DMF(10mL)中的溶液在0℃下分若干份添加NaH(60重量%,悬浮于矿物油中)(323mg,8.07mmol,2.0当量),将反应混合物在室温下搅拌0.5小时。然后将反应混合物冷却至0℃,逐滴添加SEMCl(807mg,4.84mmol,1.2当量),将反应混合物加热至室温并再搅拌2小时。完成后,将反应混合物倒入冰水(30mL)中,并用EtOAc(40mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化得到3-溴-5-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)吡啶甲腈(1.1g,66%)淡黄色油。LC-MS(ESI):m/z 410,412[M+H]+
步骤C:3-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)吡啶甲腈
将3-溴-5-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)吡啶甲腈(400mg,0.97mmol,1.0当量)、4-(二氟甲氧基)苯胺(155mg,0.97mmol,1.0当量)、RuPhos-Pd-G3预催化剂(81mg,0.097mmol,0.1当量)和K2CO3(269mg,1.95mmol,2.0mL)在甲苯(5mL)中的混合物在100℃下搅拌15小时。然后将反应混合物用H2O(15mL)稀释并用EtOAc(20mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(15mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱得到3-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)吡啶甲腈(200mg,42%)淡黄色油状物。LC-MS(ESI):m/z 489[M+H]+
步骤D:2-(氨基甲基)-N3-(4-(二氟甲氧基)苯基)-N5-(2,2,2-三氟乙基)-N5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)吡啶-3,5-二胺
向3-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)吡啶甲腈(90mg,0.18mmol,1.0当量)在MeOH(3mL)中的溶液添加Raney Ni(30mg),将反应混合物用H2脱气,然后添加NH4OH(1mL),将反应混合物在H2气氛(1atm)在室温下搅拌5小时。反应混合物通过
Figure BDA0003224737400001711
短垫过滤,滤液减压浓缩,得到2-(氨基甲基)-N3-(4-(二氟甲氧基)苯基)-N5-(2,2,2-三氟乙基)-N5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)吡啶-3,5-二胺(90mg,粗制)棕色油状物,无需进一步纯化即可用于下一步。LC-MS(ESI):m/z 493[M+H]+
步骤E:1-4-(二氟甲氧基)苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)-3,4-二氢吡啶并[3,2-d]嘧啶-2(1H)-酮
向2-(氨基甲基)-N3-(4-(二氟甲氧基)苯基)-N5-(2,2,2-三氟乙基)-N5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)吡啶-3,5-二胺(90mg,0.18mmol,1.0当量)在DMF(2mL)中的溶液添加CDI(89mg,0.54mmol,3.0当量)和t-BuOK(82mg,0.72mmol,4.0当量),将反应混合物在50℃下搅拌5小时。然后将反应混合物倒入冰水(10mL)中并用EtOAc(20mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(15mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化得到1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)-3,4-二氢吡啶并[3,2-d]嘧啶-2(1H)-酮(52mg,53%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z519[M+H]+
步骤F:1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)-3,4-二氢吡啶并[3,2-d]嘧啶-2(1H)-酮
将1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)-3,4-二氢吡啶并[3,2-d]嘧啶-2(1H)-酮(52mg,0.1mmol,1.0当量)、5-溴-2-甲基-2H-吲唑(32mg,0.15mmol,1.5当量)、N1,N2-二甲基环己烷-1,2-二胺(29mg,0.2mmol,2.0当量)、CuI(19mg,0.1mmol,1.0当量)和CsF(46mg,0.3mmol,3.0当量)在DMSO(1.5mL)中的混合物用N2脱气并在100℃N2气氛下搅拌3小时。然后反应混合物用水(10mL)稀释并用EtOAc(20mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(15mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物经硅胶快速柱色谱纯化得到1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)-3,4-二氢吡啶并[3,2-d]嘧啶-2(1H)-酮(18mg,28%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 649[M+H]+
步骤G:1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢吡啶并[3,2-d]嘧啶-2(1H)-酮
向1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)氨基)-3,4-二氢吡啶并[3,2-d]嘧啶-2(1H)-酮(18mg,0.028mmol,1.0当量)在DCM(1mL)中的溶液添加TFA(0.5mL),将反应混合物在室温下搅拌5小时。然后减压浓缩反应混合物,残余物用DCM(20mL)稀释,用NaHCO3(饱和水溶液)(10mL)洗涤,减压浓缩,残余物通过RP-prep-HPLC纯化得到1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢吡啶并[3,2-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例428)
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.33(s,1H),7.75(s,1H),7.70(s,1H),7.56(d,J=9.2Hz,1H),7.45(d,J=8.5Hz,2H),7.35(t,JHF=75.4Hz,1H),7.34(d,J=8.5Hz,2H),7.28(d,J=9.2Hz,1H),6.44(t,J=6.8Hz,1H),5.94(s,1H),4.90(s,2H),4.16(s,3H),3.92-3.80(m,2H).
LC-MS(ESI):m/z 519[M+H]+.
7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(反-4-甲氧基环己基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例429)的合成
Figure BDA0003224737400001731
步骤A:6-(2,2-二氟乙氧基)-N-甲氧基-2-((反-4-甲氧基环己基)氨基)-N-甲基烟酰胺
向6-氯-N-甲氧基-2-((反-4-甲氧基环己基)氨基)-N-甲基烟酰胺(由2,6-二氯烟酸和反-4-甲氧基环己-1-胺通过一般程序III(步骤A和B)合成)(210mg,0.64mmol,1.0当量)在甲苯/2,2-二氟乙醇-1-醇(5mL,10/1,v/v)中的溶液添加Cs2CO3(626mg,1.92mmol,3.0当量)、Pd(OAc)2(14mg,0.064mmol,0.1当量)和t-BuXPhos(54mg,0.13mmol,0.2当量),反应混合物用N2脱气并在100℃N2气氛下搅拌3小时。然后将反应混合物倒入H2O(10mL)中并用EtOAc(20mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到6-(2,2-二氟乙氧基)-N-甲氧基-2-((反-4-甲氧基环己基)氨基)-N-甲基烟酰胺(170mg,71%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 374[M+H]+
步骤B:6-(2,2-二氟乙氧基)-2-((反-4-甲氧基环己基)氨基)烟醛
向6-(2,2-二氟乙氧基)-N-甲氧基-2-((反-4-甲氧基环己基)氨基)-N-甲基烟酰胺(170mg,0.455mmol,1.0当量)在THF(3mL)中的溶液在-65℃下添加LiAlH4(52mg,1.37mmol,3.0当量),将反应混合物在-65℃下搅拌2小时。用NH4Cl(饱和水溶液)(5mL)淬灭反应,然后加热至室温,用EtOAc(20mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到6-(2,2-二氟乙氧基)-2-((反-4-甲氧基环己基)氨基)烟醛(105mg,73%)无色油状物。LC-MS(ESI):m/z 315[M+H]+
步骤C:N-((6-(2,2-二氟乙氧基)-2-((反-4-甲氧基环己基)氨基)吡啶-3-基)甲基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺
向6-(2,2-二氟乙氧基)-2-((反-4-甲氧基环己基)氨基)烟醛(104mg,0.33mmol,1.0当量)和2-甲基-2H-吲唑-5-胺(58mg,0.4mmol,1.2当量)在DCE(3mL)中的溶液添加MgSO4(398mg,3.3mmol,10.0当量)和AcOH(79L,1.32mmol,4.0当量),在室温下搅拌反应混合物15小时。然后将反应混合物冷却至0℃,以一份添加NaBH(OAc)3(210mg,0.99mmol,3.0当量),将所得混合物加热至室温并搅拌5小时。完成后,将反应混合物用NaHCO3(饱和水溶液)(10mL)在0℃下淬灭,并用EtOAc(15mL×3)萃取,合并的有机层经Na2SO4干燥并在减压下浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到N-((6-(2,2-二氟乙氧基)-2-((反-4-甲氧基环己基)氨基)吡啶-3-基)甲基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺(70mg,47%)浅绿色固体。LC-MS(ESI):m/z 446[M+H]+
步骤D:7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(反-4-甲氧基环己基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
向N-((6-(2,2-二氟乙氧基)-2-((反-4-甲氧基环己基)氨基)吡啶-3-基)甲基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺(50mg,0.112mmol,1.0当量)和DIEA(58mg,0.45mmol,4.0当量)在THF(2mL)中的溶液在0℃下添加三光气(13mg,45 mol,0.4当量),反应混合物在50℃下搅拌下3小时,然后冷却至室温,添加t-BuOK(25mg,0.22mmol,2.0当量),并将反应混合物在室温下再搅拌2小时。完成后,将反应混合物倒入冰水(10mL)中并用EtOAc(15mL×3)萃取,合并的有机层用Na2SO4干燥并减压浓缩,残留物通过RP-Prep-HPLC纯化向,得到7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(反-4-甲氧基环己基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例429)。
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):7.87(s,1H),7.68(d,J=9.2Hz,1H),7.51(s,1H),7.33(d,J=8.0Hz,1H),7.25-7.21(m,1H),6.45(d,J=7.6Hz,1H),6.13(t,JHF=54.8Hz,1H),4.66(s,2H),4.64-4.47(m,3H),4.22(s,3H),3.36(s,3H),3.25-3.15(m,1H),2.63-2.54(m,2H),2.23-2.16(m,2H),1.90-1.85(m,2H),1.40-1.31(m,2H).
LC-MS(ESI):m/z 472[M+H]+.
5-氨基-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-的合成3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例430)
Figure BDA0003224737400001751
步骤A:4-氯-6-((4-(甲氧基-d3)苯基)氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲醛
向4-(甲氧基-d3)苯胺(2.5g,19.82mmol,1.0当量)在THF(70mL)中的溶液添加Et3N(3.0g,30.0mmol,1.5当量),反应混合物在0℃下搅拌10分钟。然后添加4,6-二氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲醛(4.4g,19.82mmol,1.0当量),使混合物升温至室温并搅拌2小时。减压浓缩反应混合物,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化得到4-氯-6-((4-(甲氧基-d3)苯基)氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲醛(5.9g,97%)黄色固体。
LC-MS(ESI):m/z 313[M+H]+.
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):11.05(s,1H),10.23(s,1H),7.49-7.43(m,2H),6.87-6.79(m,2H),2.44(s,3H).
步骤B:(4-氯-6-((4-(甲氧基-d3)苯基)氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲醇
向4-氯-6-((4-(甲氧基-d3)苯基)氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲醛(1.3g,4.16mmol,1.0当量)在THF(10mL)和水(2mL)中的溶液在0℃下添加NaBH4(0.24g,6.23mmol,1.0当量)。然后将反应混合物在20℃下搅拌4小时。反应混合物用水(40mL)淬灭并用EtOAc(40mL×3)萃取,合并的有机层用无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,残留物通过硅胶快速柱色谱纯化得到(4-氯-6-((4-(甲氧基-d3)苯基)氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲醇(600mg,46%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 315[M+H]+
步骤C:5-(叠氮甲基)-6-氯-N-(4-(甲氧基-d3)苯基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺
向(4-氯-6-((4-(甲氧基-d3)苯基)氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲醇(720mg,2.29mmol,1.0当量)在DCM/甲苯(1/1,v/v)(16mL)中的溶液添加DBU(696mg,4.57mmol,2.0当量),将反应混合物冷却至0℃,并添加DPPA(1.1g,4.57mmol,2.0当量),然后将反应混合物在室温下搅拌15小时。完成后,反应混合物用H2O(30mL)稀释,并用DCM(40mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到5-(叠氮甲基)-6-氯-N-(4-(甲氧基-d3)苯基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺(370mg,48%)淡黄色油。LC-MS(ESI):m/z 340[M+H]+
步骤D:5-(氨基甲基)-6-氯-N-(4-(甲氧基-d3)苯基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺
向5-(叠氮甲基)-6-氯-N-(4-(甲氧基-d3)苯基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺(370mg,1.09mmol,1.0当量)在THF(4mL)中的溶液添加H2O(39L,2.18mmol,2.0当量)和PPh3(571mg,2.18mmol,2.0当量),反应混合物在室温下搅拌3小时。完成后,反应混合物用水(20mL)稀释,用EtOAc(40mL×3)萃取。合并合并的有机层并用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到5-(氨基甲基)-6-氯-N-(4-(甲氧基-d3)苯基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺(280mg,82%)淡黄色油状物。LC-MS(ESI):m/z 314[M+H]+
步骤E:5-氯-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向5-(氨基甲基)-6-氯-N-(4-(甲氧基-d3)苯基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺(280mg,0.89mmol,1.0当量)和Et3N(361mg,3.57mmol,4.0当量)在DCM(5mL)中的溶液在0℃下以一份添加三光气(132mg,0.45mmol,0.5当量),将反应混合物在室温下搅拌2小时。完成后,通过加入冰冷却的NaHCO3(饱和水溶液)(30mL)淬灭反应混合物,用EtOAc(30mL×3)萃取,合并的有机层并用盐水(15mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化得到5-氯-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(250mg,82%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z340[M+H]+
步骤F:5-氯-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向5-氯-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(500mg,1.47mmol,1.0当量)和(2-甲基-2H-吲唑-5-基)硼酸(388mg,2.21mmol,1.5当量)在DMF(10mL)中的溶液添加Cu(OAc)2(267mg,1.47mmol,1.0当量)和吡啶(141L,1.77mmol,1.2当量),将反应混合物在50℃空气气氛下搅拌24小时。将反应混合物通过
Figure BDA0003224737400001761
短垫过滤,滤液用H2O(40mL)稀释,用EtOAc(20mL×3)萃取,合并的有机层用Na2SO4干燥,减压浓缩,残留物用通过硅胶快速柱色谱纯化得到5-氯-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(310mg,45%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 470[M+H]+
步骤G:5-((2,4-二甲氧基苄基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
将5-氯-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(450mg,0.96mmol,1.0当量)、(3,4-二甲氧基苯基)甲胺(240mg,1.44mmol,1.5当量)和K2CO3(397mg,2.87mmol,3.0当量),在DMAc(10mL)中的溶液在80℃下搅拌2小时。TLC显示反应完成。反应用水(30ml)稀释,用DCM(30mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到5-((2,4-二甲氧基苄基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(320mg,56%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 601[M+H]+
步骤H:5-((2,4-二甲氧基苄基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-(甲基磺酰基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向5-((2,4-二甲氧基苄基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(100mg,0.17mmol,1.0当量)在DCM(4mL)中的溶液在0℃下以一份添加mCPBA(103mg,0.51mmol,3.0当量),将反应混合物在0℃下搅拌2小时。完成后,混合物用Na2S2O3(饱和水溶液)(10mL)淬灭,用DCM(20mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,用无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到5-((2,4-二甲氧基苄基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-(甲基磺酰基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(90mg,84%)灰白色固体。LC-MS(ESI):m/z 633[M+H]+
步骤I:5-((2,4-二甲氧基苄基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
将5-((2,4-二甲氧基苄基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-(甲基磺酰基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(90mg,0.14mmol,1.0当量)、CsF(22mg,0.14mmol,1.0当量)、DIEA(55mg,0.43mmol,3.0当量)和2,2,2-三氟乙烷-1-胺(70mg,0.71mmol,5.0当量)在DMSO(6mL)中的混合物在100℃下在密封管中搅拌12小时。然后将Cs2CO3(139mg,0.43mmol,3.0当量)添加至混合物中,然后在100℃下再搅拌12小时。反应混合物用水(20mL)稀释,用DCM(30mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,用无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到5-((2,4-二甲氧基苄基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(70mg,77%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z652[M+H]+
步骤J:5-氨基-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
将5-((2,4-二甲氧基苄基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(60mg,0.09mmol,1.0当量)在TFA(4mL)中的溶液在50℃下搅拌15小时。减压浓缩反应混合物,残余物用DCM(30mL)稀释,用NaHCO3(饱和水溶液)(10mL)和盐水(10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,残留物通过RP-pre-HPLC纯化,得到5-氨基-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例430)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.35(s,1H),7.69(s,1H),7.57(d,J=9.2Hz,1H),7.30-7.24(m,1H),7.12(d,J=8.8Hz,2H),6.92(d,J=8.8Hz,2H),6.77(s,1H),6.38(s,2H),4.61(s,2H),4.16(s,3H),3.76(s,2H).
LC-MS(ESI):m/z 502[M+H]+.
7-(2,2-二氟乙氧基)-3-(2-甲氧基-1-甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例431)的合成
Figure BDA0003224737400001781
步骤A:3-(4-氨基-3-(甲氨基)苯基)-7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
向7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(3-(甲氨基)-4-硝基苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(170mg,0.35mmol,1.0当量)(由5-溴-N-甲基-2-硝基苯胺和7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮经由尿素一般程序I(步骤E)合成)在EtOAc(8mL)中的溶液添加下10%Pd/C(20mg),反应混合物用2脱气,在H2气氛(1atm)下在室温下搅拌12小时。通过
Figure BDA0003224737400001782
短垫过滤反应混合物,减压浓缩滤液,得到3-(4-氨基-3-(甲基氨基)苯基)-7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(110mg,粗制)棕色油,无需进一步纯化直接用于下一步。LC-MS(ESI):m/z 459[M+H]+
步骤B:7-(2,2-二氟乙氧基)-3-(2-甲氧基-1-甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
将3-(4-氨基-3-(甲氨基)苯基)-7-(2,2-二氟乙氧基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(40mg,0.087mmol,1.0当量)和四甲氧基甲烷(1mL)的混合物在N2气氛下在密封管中在100℃下搅拌12小时。将反应混合物倒入H2O(20mL)中并用DCM(15mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过RP-Prep-HPLC纯化,得到7-(2,2-二氟乙氧基)-3-(2-甲氧基-1-甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例431)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):7.65(d,J=8.1Hz,1H),7.43(d,J=2.0Hz,1H),7.40(d,J=8.4Hz,1H),7.29-7.19(m,2H),7.13(dd,J=8.4Hz,2.0Hz,1H),7.05-6.95(m,2H),6.52(d,J=8.0Hz,1H),6.00(tt,JHF=55.6Hz,J=3.9Hz,1H),4.90(s,2H),4.10(s,3H),4.05(td,JHF=14.5Hz,J=3.9Hz,2H),3.53(s,3H).
LC-MS(ESI):m/z 499[M+H]+.
1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-5-(甲基氨基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例432)的合成
Figure BDA0003224737400001791
步骤A:5-((2,4-二甲氧基苄基)(甲基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-(甲基硫代)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向5-((2,4-二甲氧基苄基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(200mg,0.33mmol,1.0当量)在DMF(6mL)中的溶液在0℃下以一份添加NaH(60%,在矿物油中)(40mg,0.99mmol,3.0当量),将反应混合物在0℃下搅拌另外的30分钟。然后通过注射器添加MeI(140mg,0.99mmol,3.0当量),将所得混合物在0℃下搅拌2小时。完成后,将反应用冰水(20mL)淬灭并用DCM(20mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到5-((2,4-二甲氧基苄基)(甲基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(170mg,83%)灰白色固体。LC-MS(ESI):m/z 615[M+H]+
步骤B:5-((2,4-二甲氧基苄基)(甲基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-(甲基磺酰)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向5-((2,4-二甲氧基苄基)(甲基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(170mg,0.28mmol,1.0当量)在DCM(4mL)中的溶液在0℃下分若干份添加mCPBA(168mg,0.83mmol,3.0当量),将反应混合物在0℃下搅拌2小时。反应用Na2S2O3(饱和水溶液)(10mL)淬灭,用DCM(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到5-((2,4-二甲氧基苄基)(甲基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-(甲基磺酰)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(120mg,66%)灰白色固体。LC-MS(ESI):m/z 647[M+H]+
步骤C:5-((2,4-二甲氧基苄基)(甲基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
将5-((2,4-二甲氧基苄基)(甲基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-的混合物(甲基磺酰基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(120mg,0.18mmol,1.0当量)、CsF(28mg,0.18mmol,1.0当量)、DIEA(71mg,0.54mmol,3.0当量)和2,2,2-三氟乙烷-1-胺(89mg,0.90mmol,5.0当量)在DMSO(6mL)中的溶液在100℃下在密封管中搅拌12小时。然后加入Cs2CO3(176mg,0.54mmol,3.0当量),将所得混合物在100℃下再搅拌12小时。反应混合物用水(20mL)稀释,用DCM(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,用无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到5-((2,4-二甲氧基苄基)(甲基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(80mg,67%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 666[M+H]+
步骤D:1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-5-(甲基氨基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
将5-((2,4-二甲氧基苄基)(甲基)氨基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(80mg,0.12mmol,1.0当量)在TFA(4mL)中的溶液在50℃下搅拌15小时。减压浓缩反应混合物,用DCM(20mL)稀释残余物,用NaHCO3(饱和水溶液)(10mL)和盐水(10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并在下浓缩减压下,残余物通过RP-prep-HPLC纯化,得到1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-5-(甲氨基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例432)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):8.30(s,1H),7.67(s,1H),7.56(d,J=9.2Hz,1H),7.24(dd,J=9.2Hz,2.0Hz,1H),7.08(d,J=8.9Hz,2H),6.91(d,J=8.9Hz,2H),4.56(s,2H),4.13(s,3H),3.43(s,2H),2.77(s,3H).
LC-MS(ESI):m/z 516.1[M+H]+.
3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1-(6-甲基吡啶-3-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例433)的合成
Figure BDA0003224737400001811
步骤A:4-((6-甲基嘧啶-3-基)氨基)-2-(甲基硫代)嘧啶-5-甲醛
向4-氯-2-(甲基硫烷基)嘧啶-5-甲醛(1.0g,5.3mmol,1.0当量)在DMF(10mL)中的溶液添加DIEA(1.02g,8.0mmol,1.5当量)和6-甲基吡啶-3-胺(573mg,5.3mmol,1.0当量),将反应混合物在0℃下搅拌20分钟,然后将其加热至室温并再搅拌14小时。完成后,反应混合物用H2O(50mL)稀释,用EtOAc(20mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,并用Na2SO4干燥,并在减压下浓缩,通过快速色谱纯化残余物,得到4-[(6-甲基吡啶-3-基)氨基]-2-(甲基硫烷基)嘧啶-5-甲醛(1.21g,88%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 261[M+H]+
步骤B:2-甲基-N-((4-((6-甲基嘧啶-3-基)氨基)-2-(甲基硫代)嘧啶-5-基)甲基)-2H-吲唑-5-胺
向4-2-(甲基硫烷基)嘧啶-5-甲醛(750mg,2.9mmol,1.0当量)和2-甲基-2H-吲唑-5-胺(466mg,3.2mmol,1.1当量)在DCE/MeOH(6mL,1/1,v/v)中的溶液在0℃下添加HOAc(0.5mL,8.7mmol,3.0当量)。将混合物在室温下搅拌30分钟,然后在0℃下分若干份添加NaBH3CN(908mg,14.4mmol,5.0当量),添加后,将反应混合物加热至室温,并在相同温度下再搅拌1小时。完成后,通过加入NaHCO3(饱和水溶液)(20mL)淬灭反应混合物,用EtOAc(30mL×3)萃取,将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并在减压下浓缩,残余物通过快速色谱纯化,得到2-甲基-N-({4--2-(甲基硫烷基)嘧啶-5-基}甲基)-2H-吲唑-5-胺(1.01g,90%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 392[M+H]+
步骤C:3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1-(6-甲基吡啶-3-基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向2-甲基-N-({4--2-(甲基硫烷基)嘧啶-5-基}甲基)-2H-吲唑-5-胺(550mg,1.4mmol,1.0当量)在1,4-二噁烷(5mL)中的溶液添加三光气(250mg,0.84mmol,0.6当量)、DIPEA(725mg,5.6mmol,4.0当量)和DMAP(17mg,0.14mmol,0.1当量),得到的混合物在80℃下搅拌4小时。完成后,通过加入2N HCl(aq.)将pH值调节至~6,然后用H2O(50mL)稀释,用EtOAc(20mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,用无水Na2SO4干燥并减压浓缩,残留物通过快速色谱纯化,得到3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1-(6-甲基吡啶-3-基)-7-(甲基硫烷基)-1H,2H,3H,4H-二嗪基嘧啶-2-酮(446mg,76%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 418[M+H]+.
步骤D:3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1-(6-甲基吡啶-3-基)-7-(甲基磺酰基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1-(6-甲基嘧啶-3-基)-7-(甲基磺酰)-1H,2H,3H,4H-二嗪基嘧啶-2-酮(100mg,0.24mmol,1.0当量)在DCM(1mL)中的溶液以一份添加mCPBA(97mg,0.48mmol,2.0当量),将反应混合物在室温下搅拌1小时,完成后,将反应用Na2S2O4(饱和水溶液)淬灭以破坏过量的氧化剂,用EtOAc(10mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并在减压下浓缩,通过硅胶快速色谱纯化残余物,得到7-甲磺酰基-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1-(6-甲基吡啶-3-基)-1H,2H,3H,4H-二嗪并嘧啶-2-酮(106mg,98%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z450[M+H]+.
步骤E:3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1-(6-甲基吡啶-3-基)-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例433)
向7-甲磺酰基-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1-(6-甲基吡啶-3-基)-1H,2H,3H,4H-二嗪基嘧啶-2-酮(108mg,0.24mmol,1.0当量)在DMSO(1mL)中的溶液添加DIEA(155mg,1.2mmol,5.0当量)、2,2,2-三氟乙烷-1-胺(119mg,1.2mmol,5当量)、CsF(37mg,0.24mmol,1.0当量),所得混合物在100℃下搅拌14小时。完成后,反应混合物用H2O(10mL)稀释,用EtOAc(10mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(20mL)洗涤并用Na2SO4干燥并减压浓缩,残留物通过RP-prep-HPLC纯化,得到3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1-(6-甲基嘧啶-3-基)-7--1H,2H,3H,4H-二嗪基嘧啶-2-酮。(实施例433)
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):δ:8.37(d,J=2.4Hz,1H),8.36(s,1H),8.15(s,1H),7.71(d,J=1.4Hz,1H),7.66(dd,J=8.1Hz,2.4Hz,1H),7.59(d,J=9.2Hz,1H),7.50(br,1H)7.35(d,J=8.2Hz,1H),7.28(dd,J=9.2Hz,2.0Hz,1H),4.85(s,2H),4.17(s,3H),3.82(br,2H),2.51(s,3H).
LC-MS(ESI):m/z 469[M+H]+.
3-(1,2-二甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-7-异丙氧基-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例434)的合成
Figure BDA0003224737400001831
步骤A:7-氯-3-(3,4-二甲氧基苄基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
将7-氯-3-(3,4-二甲氧基苄基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(300mg,0.9mmol,1.0当量)、1-溴-4-(甲氧基-d3)苯(256mg,1.4mmol,1.5当量)、CuI(171mg,0.9mmol,1.0当量)、(1R,2R)-N1,N2-二甲基环己烷-1,2-二胺(256mg,1.8mmol,2.0当量)、CsF(410mg,2.7mmol,3.0当量)和ACN(4mL)的混合物在85℃N2气氛下搅拌14小时。完成后,减压浓缩反应混合物,残余物经硅胶柱纯化,得到7-氯-3-(3,4-二甲氧基苄基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(200mg,50%)棕色固体。
LC-MS(ESI):m/z 443[M+H]+.
步骤B:3-(3,4-二甲氧基苄基)-7-异丙氧基-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
向7-氯-3-(3,4-二甲氧基苄基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(150mg,0.34mmol,1.0当量)、Pd(OAc)2(7.6mg,0.03mmol,0.1当量)、t-BuXPhos(28.8mg,0.07mmol,0.2当量)在i-PrOH(4mL)和甲苯(1mL)中的溶液添加Cs2CO3(331mg,1mmol,3.0当量)。将混合物在80℃N2气氛下搅拌14小时,在完成后,将反应混合物在减压下浓缩,将残余物通过快速柱纯化,得到3-(3,4-二甲氧基苄基)-7-异丙氧基1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(45mg,29%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 467[M+H]+.
步骤C:7-异丙氧基-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮
向3-(3,4-二甲氧基苄基)-7-异丙氧基-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(50mg,0.1mmol,1.0当量)在TFA(4mL)中的溶液缓慢添加CF3SO3H(47L,0.5mmol,5.0当量)。将混合物在室温下搅拌3小时。通过加入冰冷的NaHCO3(饱和水溶液)(10mL)淬灭反应,然后用EtOAc(10mL×3)萃取,将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥并浓缩减压下,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到7-异丙氧基-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(30mg,88%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 317[M+H]+.
步骤D:3-(1,2-二甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-7-异丙氧基-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例434)
将化合物7-异丙氧基-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(30mg,0.1mmol,1.0当量)、6-溴-1,2-二甲基-1H-苯并[d]咪唑(32mg,0.14mmol,1.5当量)、CuI(19mg,0.1mmol,1.0当量)、(1R,2R)-N1,N2-二甲基环己烷-1,2-二胺(27mg,0.2mmol,2.0当量)、Cs2CO3(93mg,0.3mmol,3.0当量)和二噁烷(1.5mL)的混合物添加至密封管中,将得到的混合物在120℃下微波(150W)照射1.5小时。在减压下浓缩反应混合物,通过RP-prep-HPLC纯化残余物以得到3-(1,2-二甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-7-异丙氧基-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-3,4-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例434)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.57(d,J=6.4Hz,1H),7.55(s,1H),7.50(d,J=8.8Hz,1H),7.22(d,J=9.2Hz,2H),7.17(dd,J=8.8Hz,2.0Hz,1H),6.98(d,J=9.2Hz,2H),6.34(d,J=8.0Hz,1H),4.89(s,2H),4.55-4.49(m,1H),3.72(s,3H),2.52(s,3H),1.05(d,J=6.4Hz,6H).
LC-MS(ESI):m/z 461[M+H]+.
3-(1,2-二甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-5-甲基-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例435)的合成
Figure BDA0003224737400001841
步骤A:向在无水THF(30mL)中的4-氯-6-((4-(甲氧基-d3)苯基)氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲醛4-(甲氧基-d3)苯胺(2.5g,19.82mmol,1.0当量)添加Et3N(4.12mL,29.73mmol,1.5当量),将所得混合物用冰水浴冷却至0℃,并再搅拌30分钟,然后在0℃下逐滴添加在无水THF(10mL)中的4,6-二氯-2-(甲基硫代)嘧啶-5-甲醛(4.4g,19.82mmol,1.0当量),然后升温至室温并再搅拌2小时。完成后,通过添加H2O(30mL)淬灭反应,用EtOAc(20mL×3)萃取,合并的有机层用稀HCl(0.5N,水溶液)(10mL)、盐水(20mL)洗涤,用无水Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到4-氯-6-((4-(甲氧基-d3)苯基)氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲醛(5.9g,97%)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 313[M+H]+
步骤B:(E)-6-氯-5-(((2,4-二甲氧基苄基)亚氨基)甲基)-N-(4-(甲氧基-d3)苯基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺
向在干燥DCE(100mL)中的4-氯-6-((4-(甲氧基-d3)苯基)氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲醛(6.6g,21.2mmol,1.0当量)添加2,4-二甲氧基苯基)甲胺(3.34mL,22.3mmol,1.05当量)、研磨的
Figure BDA0003224737400001851
分子筛(5g)和几滴AcOH,所得混合物在室温下搅拌14小时。完成后过滤除去分子筛,滤液减压浓缩得粗(E)-6-氯-5-(((2,4-二甲氧基苄基)亚氨基)甲基)-N-(4-(甲氧基-d3)苯基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺(10g,粗品)黄色稠油状物,无需进一步纯化即可用于下一步。LC-MS(ESI):m/z 462[M+H]+.
步骤C:将6-氯-5-(((2,4-二甲氧基苄基)氨基)甲基)-N-(4-(甲氧基-d3)苯基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺(E)-6-氯-5-(((2,4-二甲氧基苄基)亚氨基)甲基)-N-(4-(甲氧基-d3)苯基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺(8.0g,17.35mmol,1.0当量)溶解在无水DCE(100mL)中,并用冰水浴冷却至0℃,然后在30分钟内分若干份添加NaBH3CN(5.47g,86.8mmol,5.0当量),在添加后,使反应混合物升温至室温,并再搅拌3小时。完成后,通过加入冰水(100mL)小心地淬灭反应混合物,用DCM(100mL×5)萃取。合并的有机层用盐水(200mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到6-氯-5-(((2,4-二甲氧基苄基)氨基)甲基)-N-(4-(甲氧基-d3)苯基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺(5.2g,65%)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 464[M+H]+.
步骤D:5-氯-3-(2,4-二甲氧基苄基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
将6-氯-5-(((2,4-二甲氧基苄基)氨基)甲基)-N-(4-(甲氧基-d3)苯基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-胺(5.2g,11.2mmol,1.0当量)和DIEA(7.224g,56.0mmol,5.0当量)溶解在无水THF(50mL)中,用冰水浴将混合物冷却至0℃,然后经由注射器逐滴添加在THF(5mL)中的三光气(1.99g,6.7mmol,0.6当量)。添加后,使反应混合物升温至室温并再搅拌1小时。完成后,通过添加NaHCO3(饱和水溶液)(50mL)淬灭反应,用EtOAc(50mL×3)萃取,将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并浓缩减压下,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到5-氯-3-(2,4-二甲氧基苄基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(4.2g,76%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 490[M+H]+.
步骤E:3-(2,4-二甲氧基苄基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-5-甲基-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
向5-氯-3-(2,4-二甲氧基苄基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(1.5g,3.07mmol,1.0当量)、2,4,6-三甲基-1,3,5,2,4,6-三氧杂三硼烷(385mg,3.07mmol,1.0当量)和K2CO3(1.3g,9.21mmol,3.0当量)在DMF(20mL)中的混合物添加Pd(dppf)Cl2(449mg,0.62mmol,0.2当量),将得到的混合物在100℃N2气氛下搅拌14小时。完成后,反应混合物通过
Figure BDA0003224737400001861
短垫过滤,滤液减压浓缩,残留物通过硅胶快速柱色谱纯化得到3-(2,4-二甲氧基苄基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-5-甲基-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(670mg,47%)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 470[M+H]+.
步骤F:1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-5-甲基-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
将3-(2,4-二甲氧基苄基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-5-甲基-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(670mg,1.43mmol,1.0当量)溶解在无水TFA(5mL)中,所得混合物在室温下搅拌3小时。在减压下浓缩反应以除去过量的TFA,并将残余物重新溶解在EtOAc(10mL)中,添加NaHCO3(饱和水溶液)直到水层的pH=8,然后用EtOAc(10mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,用无水Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-5-甲基-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(400mg,88%)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z320[M+H]+
步骤G:3-(1,2-二甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-5-甲基-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
将1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-5-甲基-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(400mg,1.25mmol,1.0当量)、6-溴-1,2-二甲基-1H-苯并[d]咪唑(参考:Bioorg.Med.Chem.,2016,24,2486-2503)(395mg,1.88mmol,1.5当量)、CuI(239mg,1.25mmol,1.0当量)、Cs2CO3(1.23mg,3.75mmol,3.0当量)和反-N1,N2-二甲基环己烷-1,2-二胺(357mg,2.508mmol,2.0当量)的混合物悬浮在无水ACN(10mL)中,将所得混合物在100℃下搅拌14小时。完成后,通过加入H2O(20mL)淬灭反应,并用EtOAc(20mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到3-(1,2-二甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-5-甲基-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(250mg,43%)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z464[M+H]+
步骤H:3-(1,2-二甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-5-甲基-7-(甲基磺酰基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮
将3-(1,2-二甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-5-甲基-7-(甲硫基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(250mg,0.54mmol,1.0当量)溶解于无水DCM(10mL)中,用冰水浴冷却至0℃,然后分若干份添加mCPBA(70重量%)(280mg,1.62mmol,3.0当量),添加后,让混合物升温至室温并再搅拌14小时。完成后,通过添加NaHSO3饱和水溶液淬灭过量的mCPBA。(直到KI-淀粉试纸不再呈蓝色),然后用EtOAc(10mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到3-(1,2-二甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-5-甲基-7-(甲基磺酰基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮种(100mg,37%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 496[M+H]+
步骤I:3-(1,2-二甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-5-甲基-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例435)
将3-(1,2-二甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-5-甲基-7-(甲基磺酰基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(100mg,0.202mmol,1.0当量)、DIEA(166μL,1.01mmol,5.0当量)、CsF(30mg,0.202mmol,1.0当量)和2,2,2-三氟乙烷-1-胺(80μL,1.01mmol,5.0当量)溶解在DMSO(5mL)中,所得混合物在100℃下微波(150W)辐射2小时。完成后,将反应混合物减压浓缩,残余物通过RP-prep-HPLC纯化,得到3-(1,2-二甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-基)-1-(4-(甲氧基-d3)苯基)-5-甲基-7-((2,2,2-三氟乙基)氨基)-3,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例435)
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.36(s,1H),7.57(d,J=1.6Hz,1H),7.51(d,J=8.4Hz,1H),7.20(dd,J=8.8Hz,2.0Hz,1H),7.16(d,J=8.8Hz,2H),6.96(d,J=8.8Hz,2H),4.82(s,2H),3.88-3.79(m,2H),3.72(s,3H),2.53(s,3H),2.20(s,3H).
LC-MS(ESI):m/z 515[M+H]+.
一般程序X:
Figure BDA0003224737400001871
结构10.5的化合物可以通过描述为一般程序X的方案获得。从起始醛10.1开始,可以进行还原胺化以引入所需的R3基团。然后所得二胺10.2可以与CDI反应以形成环状脲10.3。然后可以通过铜介导的C-N偶联反应引入所需的R2基团以得到10.4。最后,所需的R1基团可以通过钯介导的C-X偶联反应进行装载,得到结构10.5的化合物。
通过一般程序X制备实施例287:
Figure BDA0003224737400001881
步骤A:N-(2-氨基-4-溴苄基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺
向2-氨基-4-溴苯甲醛(500mg,2.5mmol,1.0当量)和2-甲基-2H-吲唑-5-胺(368mg,2.5mmol,1.0当量)在DCM(15mL)中的混合物在0℃下添加AcOH(600mg,10mmol,4.0当量)。将反应混合物在室温下搅拌3小时。然后将反应混合物冷却至0℃,在30分钟期间以若干份添加NaBH(OAc)3(1657mg,7.5mmol,3.0当量),添加后,将反应混合物加热至室温,并搅拌5小时。反应物通过在0℃下添加NaHCO3(饱和水溶液)(15mL)淬灭,用EtOAc萃取(20mL×3)。合并的有机层用Na2SO4干燥,减压浓缩,通过硅胶柱色谱纯化,得到N-(2-氨基-4-溴苄基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺(650mg,78.5%收率)棕色固体。LC-MS(ESI):m/z=331,333[M+H]+
步骤B:7-溴-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢喹唑啉-2(1H)-酮
向N-(2-氨基-4-溴苄基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺(650mg,1.9mmol,1.0当量)在THF(15mL)中的溶液添加CDI(477mg,2.9mmol,1.5当量),将反应混合物在80℃下搅拌8小时。通过LC-MS(ESI)监测反应进程,完成后,反应用冰水(15mL)淬灭并用EtOAc(20mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,通过Na2SO4干燥,减压浓缩,残留物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到7-溴-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢喹唑啉-2(1H)-酮(450mg,66%收率)棕色固体。LC-MS(ESI):m/z=357,359[M+H]+
步骤C:7-溴-1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-3,4-二氢喹唑啉-2(1H)-酮
向7-溴-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1,2,3,4-四氢喹唑啉-2-酮(150mg,0.42mmol,1.0当量)在DMF(5mL)中的溶液添加1-(二氟甲氧基)-4-碘苯(340mg,1.26mmol,3.0当量)、Cs2CO3(410mg,1.26mmol,3.0当量)、CuI(80mg,0.42mmol,1.0当量)和N1,N2-二甲基环己烷-1,2-二胺(0.13mL,0.84mmol,2.0当量),将反应混合物在100℃N2气氛下搅拌24小时。通过LC-MS(ESI)监测反应进程,完成后,反应用水(15mL)稀释并用EtOAc(20mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,通过Na2SO4干燥,减压浓缩,粗残留物经硅胶快速柱色谱纯化,得到7-溴-1-[4-(二氟甲氧基)苯基]-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1,2,3,4-四氢喹唑啉-2-酮(65mg,31%收率)黄色油状物。LC-MS(ESI):m/z=499,501[M+H]+
步骤D:1-[4-(二氟甲氧基)苯基]-7-乙氧基-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1,2,3,4-四氢喹唑啉-2-酮
向7-溴-1-[4-(二氟甲氧基)苯基]-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1,2,3,4-四氢喹唑啉-2-酮(55mg,0.11mmol,1.0当量)在甲苯(7mL)和EtOH(0.7mL)中的溶液添加Cs2CO3(108mg,0.33mmol,3.0当量)、Pd(OAc)2(3mg,0.011mmol,0.1当量)和t-BuXPhos(9mg,0.022mmol,0.2当量),将反应混合物在100℃N2气氛下搅拌12小时。通过LC-MS(ESI)监测反应进程,完成后,反应用水(10mL)稀释并用EtOAc(20mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,并通过Na2SO4干燥,在减压下浓缩,通过Prep-HPLC纯化粗残余物,得到1-[4-(二氟甲氧基)苯基]-7-乙氧基-3-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-1,2,3,4-四氢喹唑啉-2-酮(实施例287)。LC-MS(ESI):m/z 465.1[M+H]+
1H NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):7.96(s,1H),7.76(d,J=9.2Hz,1H),7.66(s,1H),7.48(d,J=8.8Hz,1H),7.38(d,J=8.4Hz,2H),7.25(d,J=8.4Hz,2H),7.06(d,J=8.4Hz,1H),6.57(dd,J=9.6Hz,2.0Hz,1H),6.56(t,JHF=74.0Hz,1H),5.89(d,J=2.0Hz,1H),4.91(s,2H),4.34(s,3H),3.89(q,J=7.2Hz,2H),1.33(t,J=7.2Hz,3H).
通过使用适当的起始材料,使用上文针对一般程序X所述的程序合成以下化合物:
Figure BDA0003224737400001891
Figure BDA0003224737400001901
下表提供了式II的预测化合物的列表,它们可以使用上文所示的一般程序X或使用普通技术的本文所述的其他程序的组合来合成。
Figure BDA0003224737400001902
Figure BDA0003224737400001911
一般程序XI:
Figure BDA0003224737400001921
结构11.6的化合物可以通过如一般程序XI所述的方案获得。从芳基氟11.1开始,所需的R1基团可以通过碱介导的芳族取代引入以生成化合物11.2。然后可以通过钯介导的C-N偶联反应引入所需的R2基团以生成芳胺11.3。然后可以用氢化物源还原腈11.3以生成二胺11.4。然后可以使用三光气环化二胺11.4以生成环状脲11.5。最后,可以通过铜介导的C-N偶联反应引入所需的R3基团,以提供结构11.5的化合物。
通过一般程序XI制备实施例289:
Figure BDA0003224737400001922
步骤A:3-溴-5-乙氧基吡啶甲腈
向3-溴-5-氟吡啶-2-甲腈(1.0g,4.9mmol,1.0当量)在EtOH(5mL)中的溶液分批添加EtONa(339mg,4.9mmol,1.0当量),然后将反应混合物在室温下搅拌3小时。通过LC-MS(ESI)监测反应进程,完成后,将反应混合物冷却至室温并减压浓缩,残余物用水(30mL)稀释,用DCM(20mL×2)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,通过Na2SO4干燥并在减压下浓缩,通过硅胶快速柱色谱法纯化残余物,得到3-溴-5-乙氧基吡啶-2-甲腈(620mg,55%收率)黄色固体。LC-MS(ESI):m/z 228[M+H]+
步骤B:3-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-乙氧基吡啶甲腈
向3-溴-5-乙氧基吡啶-2-甲腈(200mg,0.88mmol,1.0当量)在甲苯(5mL)中的溶液添加Cs2CO3(867mg,2.64mmol,3.0当量)、BINAP(55mg,0.09mmol,0.1当量)、Pd(OAc)2(20mg,0.09mmol,0.1当量)和4-(二氟甲氧基)苯胺(140mg,0.88mmol,0.1当量),在90℃N2气氛下搅拌反应混合物15小时。反应混合物用H2O(20mL)稀释,用EtOAc(20mL×3)萃取,合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,用Na2SO4干燥并减压浓缩,残留物通过在硅胶上进行快速柱色谱,得到3-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-乙氧基吡啶甲腈(122mg,45%收率)固体。LC-MS(ESI):m/z 306[M+H]+
步骤C:2-(氨基甲基)-N-(4-(二氟甲氧基)苯基)-5-乙氧基吡啶-3-胺
向LiAlH4(115mg,3.02mmol,2.0当量)在THF(4mL)中的悬浮液在0℃下逐滴添加3-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)-5-乙氧基吡啶甲腈(462mg,1.51mmol,1.0当量)在THF(1mL)中的溶液,将反应混合物在0℃下搅拌0.5小时。通过TLC监测反应进程,完成后,将反应用无水THF(10mL)稀释并用水(0.12mL)淬灭。按顺序添加NaOH(0.12mL,15重量%)和水(0.36mL),然后添加无水Na2SO4(5g),将所得混合物再剧烈搅拌30分钟,通过
Figure BDA0003224737400001931
短垫过滤,滤液减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到2-(氨基甲基)-N-(4-(二氟甲氧基)苯基)-5-乙氧基吡啶-3-胺(272mg,58%收率)。LC-MS(ESI):m/z 310[M+H]+
步骤D:1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-乙氧基-3,4-二氢吡啶并[3,2-d]嘧啶-2(1H)-酮
向2-(氨基甲基)-N-(4-(二氟甲氧基)苯基)-5-乙氧基吡啶-3-胺(100mg,0.31mmol,1.0当量)在THF(4mL)中的溶液添加三光气(78mg,0.26mmol,2.0当量),将反应混合物在室温下搅拌4小时。反应进程通过LC-MS(ESI)监测,完成后,反应用水(15mL)淬灭并用乙酸乙酯(20mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,用Na2SO4干燥,减压浓缩,残余物通过硅胶快速柱色谱纯化,得到1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-乙氧基-3,4-二氢吡啶并[3,2-d]嘧啶-2(1H)-酮(80mg,74%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 336[M+H]+
步骤E:1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-乙氧基-3-(4-甲氧基苯基)-3,4-二氢吡啶并[3,2-d]嘧啶-2(1H)-酮
将1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-乙氧基-3,4-二氢吡啶并[3,2-d]嘧啶-2(1H)-酮(40mg,0.12mmol,1.0当量)、1-碘-4-甲氧基苯(42mg,0.18mmol,1.5当量)、CuI(23mg,0.12mmol,1.0当量)、N1,N2-二甲基环己烷-1,2-二胺(34mg,0.24mmol,2.0当量)和CsF(54mg,0.36mmol,3.0当量)在DMSO(2mL)中的混合物在100℃N2气氛下搅拌16小时。反应混合物用EtOAc(40mL)稀释,用H2O(2×10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,减压浓缩并通过RP-prep-HPLC纯化,得到1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-乙氧基-3-(4-甲氧基苯基)-3,4-二氢吡啶并[3,2-d]嘧啶-2(1H)-酮(实施例289)。LC-MS(ESI):m/z 442[M+H]+.
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):7.91(d,J=2.4Hz,1H),7.46(d,J=8.8Hz,2H),7.38-7.30(m,4H),7.34(t,JHF=73.8Hz,1H),6.96(d,J=8.8Hz,2H),5.95(d,J=2.4Hz,1H),4.91(s,2H),3.95(q,J=6.8Hz,2H),3.77(s,3H),1.24(t,J=6.8Hz,3H).
通过使用适当的起始材料,使用上文针对一般程序XI所述的程序合成以下化合物:
Figure BDA0003224737400001941
下表提供了式II的预测化合物的列表,它们可以使用上文所示的一般程序XI或使用普通技术的本文所述的其他程序的组合来合成。
Figure BDA0003224737400001942
Figure BDA0003224737400001951
Figure BDA0003224737400001961
一般程序XII:
Figure BDA0003224737400001962
结构12.7的化合物可以通过如一般程序XII所述的方案获得。从芳基氯12.1开始,可以通过碱介导的芳族取代引入所需的R2基团以产生化合物12.2。然后可以用氢化物源还原芳基酯12.2以生成醇12.3。然后可以将醇12.3氧化成醛12.4。可以通过与醛12.4的还原胺化来引入所需的R3基团以生成二胺12.5。然后可以使用CDI将二胺12.5环化以生成环状脲12.6。最后,所需的R1基团可以通过钯介导的C-X偶联反应引入,以提供结构12.7的化合物。
通过一般程序XII制备实施例292:
Figure BDA0003224737400001971
步骤A:6-氯-4-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)哒嗪-3-羧酸甲酯
向4,6-二氯哒嗪-3-羧酸甲酯(1.0g,4.8mmol,1.0当量)在二噁烷(15mL)中的溶液添加4-(二氟甲氧基)苯胺(850mg,5.3mmol,1.1当量)和DIPEA(1.370g,10.6mmol,2.2当量),将反应混合物在100℃下搅拌20小时。然后用冰水(40mL)淬灭反应混合物并用EtOAc(100mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,通过柱色谱纯化残余物,得到6-氯-4-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)哒嗪-3-甲酸甲酯(1100mg,收率69%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 330[M+H]+
步骤B:(6-氯-4-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)哒嗪-3-基)甲醇
向6-氯-4-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)哒嗪-3-羧酸甲酯(500mg,1.5mmol,1.0当量)在THF(6mL)和MeOH(4mL)中的溶液在0℃下添加NaBH4(288mg,7.5mmol,5.0当量)和CaCl2(370mg,3.0mmol,2.0当量)。使反应混合物升温至室温并搅拌2小时。通过LC-MS(ESI)监测反应进程,完成后,反应混合物用冰水(20mL)淬灭并用EtOAc(50mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过柱色谱纯化得到(6-氯-4-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)哒嗪-3-基)甲醇(420mg,收率92%)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 302[M+H]+
步骤C:6-氯-4-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)哒嗪-3-甲醛
向(6-氯-4-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)哒嗪-3-基)甲醇(420mg,1.4mmol,1.0当量)在CHCl3(10mL)中的溶液添加MnO2(1.21g,14.0mmol,10.0当量),将反应混合物在室温下搅拌16小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,通过
Figure BDA0003224737400001981
短垫过滤除去MnO2,减压浓缩滤液,得到粗6-氯-4-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)哒嗪-3-甲醛(380mg)白色固体,无需进一步纯化即可用于下一步。LC-MS(ESI):m/z 300[M+H]+
步骤D:N-((6-氯-4-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)哒嗪-3-基)甲基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺
向6-氯-4-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)哒嗪-3-甲醛(380mg,1.3mmol,1.0当量)在DCM(10mL)中的溶液添加2-甲基-2H-吲唑-5-胺(190mg,1.3mmol,1.0当量)和AcOH(80mg,1.3mmol,1.0当量),将反应混合物在室温下搅拌1小时。然后将反应混合物冷却至0℃,添加NaBH3CN(82mg,1.3mmol,1.0当量),将反应混合物加热至室温并搅拌1小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,用冰水(15mL)淬灭反应并用DCM(50mL×2)萃取。合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩,通过柱色谱纯化残余物,得到N-((6-氯-4-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)哒嗪-3-基)甲基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺(480mg,88%收率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 431[M+H]+
步骤E:3-氯-5-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7,8-二氢嘧啶并[5,4-c]哒嗪-6(5H)-酮
向N-((6-氯-4-((4-(二氟甲氧基)苯基)氨基)哒嗪-3-基)甲基)-2-甲基-2H-吲唑-5-胺(480mg,1.1mmol,1.0当量)在THF(10mL)中的溶液添加CDI(360mg,2.1mmol,2.0当量)和t-BuOK(250mg,2.2mmol,2.0当量),将反应混合物在60℃下搅拌2小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,将反应混合物用冰水(15mL)淬灭并用EtOAc(50mL×3)萃取。合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,用Na2SO4干燥并在减压下浓缩,通过柱色谱法纯化残余物,得到3-氯-5-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7,8-二氢嘧啶并[5,4-c]哒嗪-6(5H)-酮(450mg,88%产率)白色固体。LC-MS(ESI):m/z 457[M+H]+
步骤F:5-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-乙氧基-7-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7,8-二氢嘧啶并[5,4-c]哒嗪-6(5H)-酮
将3-氯-5-(4-(二氟甲氧基)苯基)-7-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7,8-二氢嘧啶并[5,4-c]哒嗪-6(5H)-酮(50mg,0.11mmol,1.0当量)、Pd(OAc)2(2.44mg,0.011mmol,0.1当量)、t-BuXPhos(10mg,0.022mmol,0.2当量)和Cs2CO3(107mg,0.33mmol,3.0当量)在EtOH(2mL)和甲苯(2mL)中的混合物在100℃N2气氛下搅拌15小时。通过LC-MS监测反应进程,完成后,反应混合物用水(10mL)稀释并用EtOAc(20mL×3)萃取。合并的有机层用Na2SO4干燥并减压浓缩,残余物通过柱色谱和Prep-HPLC纯化,得到5-(4-(二氟甲氧基)苯基)-3-乙氧基-7-(2-甲基-2H-吲唑-5-基)-7,8-二氢嘧啶并[5,4-c]哒嗪-6(5H)-酮(实施例292)。LC-MS(ESI):m/z=467[M+H]+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:8.37(s,1H),7.78(d,J=1.6Hz,1H),7.60(d,J=9.6Hz,1H),7.50(d,J=8.4Hz,2H),7.36(d,J=8.8Hz,2H),7.34(t,JHF=74.0Hz,1H),7.31(dd,J=9.6Hz,2.0Hz,1H),5.54(s,1H),5.17(s,2H),4.40(q,J=6.8Hz,2H),4.18(s,3H),1.29(t,J=6.8Hz,3H).
通过使用适当的起始材料,使用上文针对一般程序XII所述的程序合成以下化合物:
Figure BDA0003224737400001991
下表提供了式II的预测化合物的列表,它们可以使用上文所示的一般程序XII或使用普通技术的本文所述的其他程序的组合来合成。
Figure BDA0003224737400001992
Figure BDA0003224737400002001
下表提供了式II的预测化合物的列表,它们可以使用上文所示的一般程序III(例IV)、一般程序IX(例II)或使用普通技术的本文所述的其他程序的组合来合成。
Figure BDA0003224737400002011
Figure BDA0003224737400002021
生物化学测定
MAT2A蛋白通过重组杆状病毒在SF9感染的细胞中表达,使用Bac至Bac***克隆到pFASTBAC1载体(Invitrogen,Carlsbad,CA)。使用HP Ni Sepharose柱色谱从150g感染细胞的细胞裂解物中分离出重组MAT2A。重组MAT2A同源二聚体用250和500mM咪唑洗脱,含有MAT2A的级分通过十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定并合并。
为了测定化合物对MAT2A同源二聚体的抑制效力,将蛋白质在测定缓冲液(50mMTris,pH8.0,50mM KCl,15mM MgCl2,0.3mM EDTA,0.005%[w/v]牛血清白蛋白[BSA])溶解至4μg/mL。测试化合物在100%二甲亚砜(DMSO)中以50倍所需的最终浓度制备。将1μL体积的化合物稀释液添加到40μL酶稀释液中,并使混合物在25℃下平衡60分钟。通过添加10μL底物混合物(500μM ATP,pH7.0,1×测定缓冲液中的400μM L-甲硫氨酸)启动酶促测定,并将混合物在25℃下再温育60分钟。停止反应并使用PiColorLock Gold试剂盒(InnovaBiosciences,UK)测量酶通过产生S-腺苷甲硫氨酸(SAM)以化学计量的量释放的磷酸盐。通过与磷酸钾缓冲液pH8.0的标准曲线进行比较来确定绝对产物量。
在上述测定中测试了本文公开的特定化合物,并根据以下评分确定它们以IC50抑制MAT2A:(A)小于100nM(>40%最大抑制),(B)在100nM和1μM(>38%最大抑制)之间,(C)在1μM和10μM(>40%最大抑制)之间,以及(D)大于10μM,如下表5所示。
靶标接合的细胞分析(SAM)
细胞中MAT2A活性的测量是通过直接定量其酶活性产物SAM的丰度来进行的。用候选MAT2A抑制剂处理癌细胞一段合适的温育期,然后使用能淬灭任何进一步酶活性的试剂裂解细胞。收集包括SAM在内的可溶性代谢物,并使用定量LC-MS/MS从裂解物中直接测量SAM本身。
使用HCT116人结肠癌细胞系进行了典型的分析,该细胞系经过基因改造以删除MTAP基因(可从Horizon Discovery商购获得)。使用该细胞系是因为确定MTAP基因的丢失可预测对MAT2A抑制剂的敏感性。将细胞以适当的细胞密度接种于96孔培养皿中。24小时后,然后用候选MAT2A抑制剂处理细胞。在添加细胞之前,化合物首先在100%DMSO中连续稀释,通常以3倍连续稀释,从500×最高剂量开始,10个剂量点,包括仅DMSO对照。然后通过在495μL细胞培养基中添加5μL DMSO化合物,将化合物转移到细胞培养基中的工作储备板中。然后通过另外的5倍稀释将此工作储液添加到细胞中,方法是将25μL工作储液添加到培养基中的100μL细胞中。添加化合物后,将细胞在37oC/5%CO2下培养72小时。
为了在化合物处理后定量SAM水平,将细胞在碳酸铵缓冲液(75mM,pH7.4)中轻轻洗涤一次,置于干冰上,并用代谢物提取缓冲液(80%冷甲醇和20%水(v/v)与最终浓度为1M的乙酸,使用200ng/mL的氘化d3-SAM作为内部对照)。在4o C下以3,200rpm离心30分钟后,收集上清液并储存在-80oC直至通过液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)进行分析。LC-MS/MS分析使用API6500质谱仪(Sciex,Framingham,MA,USA)进行,该质谱仪以正离子喷雾模式运行,并配备有Waters UPLC Acquity(Waters,Milford,MA,USA)BEH Amide色谱柱。使用质量转换对分别在m/z 399.2→250.1和402.2→250.1处获取的d3-SAM标准品的多反应监测数据。在典型的LC-MS/MS分析中,25%流动相A(乙腈和水的比例为5:95(v/v),含1%甲酸和10mM乙酸铵)的初始流速为0.5ml/min,并且75%流动相B(95:5(v/v)的乙腈和水,含1%甲酸和10mM乙酸铵),0.2–0.5分钟,含75%-35%流动相B,25%-65%流动相A,0.5分钟,65%流动相A和35%流动相B,1.0–1.1分钟,35%–75%流动相B,65%-25%流动相A,1.1分钟,25%流动相A和75%流动相B,总运行时间为1.5分钟。
在上述测定中测试了本文公开的特定化合物,并根据以下评分确定它们以IC50抑制SAM:(A)小于100nM(>60%最大抑制),(B)在100nM和1μM之间(>60%最大抑制),(C)大于或等于1μM(>60%最大抑制),以及(NT)未测试,如下表5所示。
细胞增殖抑制测定
通过用化合物处理癌细胞4天然后使用基于ATP的细胞增殖读数(Cell TiterGlo,Promega Corporation)测量增殖来评估测试化合物对癌细胞生长的影响。
在典型的测定中,将一对仅在MTAP缺失状态(HCT116 MTAP+/+和HCT116 MTAP-/-)上有所不同的同基因对HCT116人结肠癌细胞系以适当的细胞密度接种在96孔培养皿中。24小时后,然后用候选MAT2A抑制剂处理细胞。在添加细胞之前,化合物首先在100%DMSO中连续稀释,通常以3倍连续稀释,从500×最高剂量开始,10个剂量点,包括仅DMSO对照。然后通过在495μL细胞培养基中添加5μL DMSO化合物,将化合物转移到细胞培养基中的工作储备板中。然后通过另外的5倍稀释将此工作储液添加到细胞中,方法是将25μL工作储液添加到培养基中的100μL细胞中。添加化合物后,将细胞在37oC/5%CO2下培养4天。
为了测量细胞增殖的抑制,让细胞平衡至室温30分钟,然后用125μL细胞滴定Glo试剂处理。然后将板用铝箔覆盖并摇动15分钟以确保完全混合和全细胞裂解。然后使用基于板的发光计Veritas 1.9.2版使用ATP标准曲线测量发光信号,以确认每次运行的测定重现性。通过从每个数据点中减去从库(无细胞)孔中测得的ATP发光信号并除以在0.2%DMSO对照孔中测量的ATP发光信号(针对空白孔中的信号进行调整),将该发光测量值转化为增殖指数。然后将化合物活性表示为相对于以摩尔(M)为单位的化合物浓度log10相对于板内DMSO对照的增殖百分比变化。
在上述测定中测试了本文公开的特定化合物,并根据以下评分确定它们用IC50抑制细胞增殖:(A)小于100nM(对于MTAP-/->30%最大抑制;对于MTAP+/+>10%最大抑制),(B)在100nM和1μM之间(对于MTAP>30%最大抑制-/-;>10%最大抑制MTAP+/+),(C)大于或等于1μM,和(NT)未测试,如下表5a和表5b所示。
表5a
Figure BDA0003224737400002041
Figure BDA0003224737400002051
Figure BDA0003224737400002061
Figure BDA0003224737400002071
Figure BDA0003224737400002081
Figure BDA0003224737400002091
Figure BDA0003224737400002101
表5b
Figure BDA0003224737400002111
Figure BDA0003224737400002121
Figure BDA0003224737400002131
Figure BDA0003224737400002141
Figure BDA0003224737400002151
Figure BDA0003224737400002161
Figure BDA0003224737400002171
下表6比较了根据本公开的选择化合物对的测定结果。
表6
Figure BDA0003224737400002172
Figure BDA0003224737400002181

Claims (64)

1.一种根据式I的化合物:
Figure FDA0003224737390000011
其中
X1是N或CR5
X2是N或CR6,其中X1和X2不同时为N;
L是O、S、NR或键;
R是H或C1-C6-烷基;
R1选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C3-C6-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基)和-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基),其中
R1中的任何烷基是直链的或支链的,
R1任选地被1-6个卤代取代;并且
当X1是N,X2是CR6,L是NR或S,R是H,并且R1是C1-C6-烷基时,则R1被1-6个卤代取代;
或者,当L是NR时,则R和R1可以与L组合在一起形成任选地被一个或多个RA取代的3至6元杂环烷基(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S);
R2和R3独立地选自由以下各项组成的组:C6-C10-芳基、C3-C6-碳环基、5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S)和3至14元杂环烷基(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S),
其中R2和R3独立地和任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:RA、ORA、卤代、-N=N-RA、-NRARB、-(C1-C6-烷基)NRARB、-C(O)ORA、-C(O)NRARB、-OC(O)RA、和-CN;
R4选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、氧代、–CN和-NRCRD
R5选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、–CN和-NRCRD
R6选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基(任选地被一个或多个卤代、-O(C1-C6-烷基)(任选地被一个或多个卤代取代)、-OH、卤代、-CN、-(C1-C6-烷基)NRARB和-NRARB
RA和RB独立地选自由以下各项组成的组:H、-CN、-羟基、氧代、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、-NH2、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、-S(O)0-2-(C6-C10-芳基)、-C(O)(C1-C6-烷基)、-C(O)(C3-C14-碳环基)、-C3-C14-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C14-碳环基)、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S)和5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S);
其中RA和RB的每个烷基、烷氧基、烯基、炔基、芳基、碳环基、杂环烷基和杂芳基部分任选地被一个或多个取代基取代,所述取代基选自由以下各项组成的组:氘、羟基、卤代、-NR'2(其中每个R'独立地选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S)和5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S))、-NHC(O)(OC1-C6-烷基)、-NO2
-CN、氧代、-C(O)OH、-C(O)O(C1-C6-烷基)、-C1-C6-烷基(C1-C6-烷氧基)、-C(O)NH2、C1-C6-烷基-C(O)C1-C6-烷基、-OC1-C6-烷基、-Si(C1-C6-烷基)3、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、C6-C10-芳基、-(C1-C6-烷基)(C6-C10-芳基)、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环)(其中1-4个杂环成员独立地选自N、O和S)和-O(C6-C14-芳基),
其中每个烷基、烯基、芳基和杂环烷基任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:羟基、-OC1-C6-烷基、卤代、-NH2、-(C1-C6-烷基)NH2、-C(O)OH、CN和氧代;
RC和RD各自独立地选自H和C1-C6-烷基;
或其药学上可接受的盐。
2.一种根据式II的化合物:
Figure FDA0003224737390000021
其中
X1是N,并且X2是CR6,或者X1是CR5,并且X2是CR6,X1和X2均为N,或者X1是CR5,并且X2是CR6
L是O、S、NR或键;
R是H或C1-C6-烷基;
R1选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C3-C6-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基)和-(C1-C6-烷基)(C3-C6-碳环基),其中
R1中的任何烷基是直链的或支链的,
R1任选地被1-6个卤代取代;
或者,当L是NR时,则R和R1可以与L组合在一起形成任选地被一个或多个RA取代的3至6元杂环烷基(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S);
R2和R3独立地选自由以下各项组成的组:C6-C10-芳基、C3-C6-碳环基、5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S)和3至14元杂环烷基(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S),
其中R2和R3独立地和任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:RA、ORA、卤代、-N=N-RA、-NRARB、-(C1-C6-烷基)NRARB、-C(O)ORA、-C(O)NRARB、-OC(O)RA、和-CN;
R4选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、氧代、–CN和-NRCRD
R5选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基、C1-C6-烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、卤代、–CN和-NRCRD
R6选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基(任选地被一个或多个卤代、-O(C1-C6-烷基)(任选地被一个或多个卤代取代)、-OH、卤代、-CN、-(C1-C6-烷基)NRARB和-NRARB
RA和RB独立地选自由以下各项组成的组:H、-CN、-羟基、氧代、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、-NH2、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、-S(O)0-2-(C6-C10-芳基)、-C(O)(C1-C6-烷基)、-C(O)(C3-C14-碳环基)、-C3-C14-碳环基、-(C1-C6-烷基)(C3-C14-碳环基)、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个杂环烷基成员独立地选自N、O和S)和5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S);
其中RA和RB的每个烷基、烷氧基、烯基、炔基、芳基、碳环基、杂环烷基和杂芳基部分任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:羟基、卤代、-NR'2(其中每个R'独立地选自由以下各项组成的组:C1-C6-烷基、C2-C6-烯基、C2-C6-炔基、C6-C10-芳基、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环烷基)(其中1-4个环成员独立地选自N、O和S)和5至10元杂芳基(其中1-4个杂芳基成员独立地选自N、O和S)、-NHC(O)(OC1-C6-烷基)、-NO2、-CN、氧代、-C(O)OH、-C(O)O(C1-C6-烷基)、-C1-C6-烷基(C1-C6-烷氧基)、-C(O)NH2、C1-C6-烷基、-C(O)C1-C6-烷基、-OC1-C6-烷基、-Si(C1-C6-烷基)3、-S(O)0-2-(C1-C6-烷基)、C6-C10-芳基、-(C1-C6-烷基)(C6-C10-芳基)、3至14元杂环烷基和-(C1-C6-烷基)-(3至14元杂环)(其中1-4个杂环成员独立地选自N、O和S)和-O(C6-C14-芳基),
其中RA和RB中的每个烷基、烯基、芳基和杂环烷基任选地被一个或多个选自由以下各项组成的组的取代基取代:羟基、-OC1-C6-烷基、卤代、-NH2、-(C1-C6-烷基)NH2、-C(O)OH、CN和氧代,
RC和RD各自独立地选自H和C1-C6-烷基;
或其药学上可接受的盐。
3.根据权利要求1所述的化合物,其中X1是N,并且X2是CR6
4.根据权利要求1所述的化合物,其中X1是CR5,并且X2是CR6
5.根据权利要求1所述的化合物,其中X1是CR5,并且X2是N。
6.根据权利要求2所述的化合物,其中X1是CR5,并且X2是CR6
7.根据权利要求2所述的化合物,其中X1是N,并且X2是CR6
8.根据权利要求2所述的化合物,其中X1和X2均为N。
9.根据权利要求2所述的化合物,其中X1是CR5,并且X2是CR6
10.根据权利要求1至9中任一项所述的化合物,其中R4和R5(当存在时)中的每个独立地选自H和C1-C6-烷基,并且R6(当存在时)选自由以下各项组成的组:H、C1-C6-烷基(任选地被一个或多个卤代取代)、C1-C6-烷氧基、-(C1-C6-烷基)NRARB和-NRARB(其中RA和RB独立地选自H和C1-C6-烷基)。
11.根据权利要求1至9中任一项所述的化合物,其中R4、R5和R6(当存在时)中的至少一个是H。
12.根据权利要求1至11中任一项所述的化合物,其中R4是H。
13.根据权利要求1至11中任一项所述的化合物,其中R5是H。
14.根据权利要求1至11中任一项所述的化合物,其中R6是H。
15.根据权利要求1至14中任一项所述的化合物,其中R4和R5和R6(当存在时)中的每个是H。
16.根据权利要求1至15中任一项所述的化合物,其中R2是任选地取代的C6-C10-芳基或任选地取代的5至10元杂芳基。
17.根据权利要求16所述的化合物,其中R2是任选地取代的C6-C10-芳基。
18.根据权利要求17所述的化合物,其中R2是任选地取代的苯基。
19.根据权利要求16所述的化合物,其中R2是任选地取代的5至10元杂芳基,并且其中1个环成员是N。
20.根据权利要求19所述的化合物,其中R2是任选地取代的吡啶基。
21.根据权利要求1至20中任一项所述的化合物,其中R3是任选地取代的3至14元杂环烷基或任选地取代的5至10元杂芳基。
22.根据权利要求21所述的化合物,其中R3选自由以下各项组成的组:苯并噻唑基、苯并异噻唑基、苯并噁唑基、吡啶基、吡啶酮基、哒嗪基、苯并咪唑基、苯并***基、吲唑基、喹喔啉基、喹啉基、喹唑啉基、咪唑并吡啶基、吡唑并吡啶基、***并吡啶基、噌啉基、异噁唑基、吡唑基、苯并呋喃基、二氢苯并呋喃基、二氢苯并二噁英基和四氢苯并二噁英基,它们中的任一个都可以任选地被取代。
23.根据权利要求1至20中任一项所述的化合物,其中R3是任选地取代的C6-C10-芳基。
24.根据权利要求23所述的化合物,其中R3是任选地取代的苯基。
25.根据权利要求1至15中任一项所述的化合物,其中R2是任选地取代的苯基,并且R3是任选地取代的3至14元杂环烷基或任选地取代的5至10元杂芳基。
26.根据权利要求1至25中任一项所述的化合物,其中L是O或NR。
27.根据权利要求26所述的化合物,其中R1是任选地取代的C1-C6-烷基或任选地取代的C3-C6-碳环基。
28.根据权利要求26或27所述的化合物,其中R1是任选地被1-3个F取代的C1–C3-烷基。
29.根据权利要求1至9中任一项所述的化合物,其中
L是O或NR,并且R是H;
R1是任选地被1-3个F取代的C1-C3-烷基;
R2是任选地取代的3至14元杂环烷基或任选地取代的5至10元杂芳基(其中1个杂环烷基或杂芳基成员是N)或任选地取代的C6-C10-芳基;
R3是任选地取代的3至14元杂环烷基或任选地取代的5至10元杂芳基,其中1至3个杂环烷基或杂芳基成员独立地选自N、O和S,或任选地取代的C6-C10-芳基;并
R4、R5和R6(当存在时)中的每个都是H。
30.根据权利要求29所述的化合物,其中L是NR。
31.根据权利要求29或30所述的化合物,其中
R2是任选地取代的苯基;并且
R3是任选地取代的5至10元杂芳基,其中1至3个杂芳基成员独立地选自N、O和S。
32.根据权利要求29或30所述的化合物,其中
R2是任选地取代的5至10元杂芳基,其中1至3个杂芳基成员独立地选自N、O和S;并且
R3是任选地取代的苯基。
33.根据权利要求31所述的化合物,其中R3选自由以下各项组成的组:任选地取代的苯并噻唑基、苯并异噻唑基、苯并噁唑基、吡啶基、吡啶酮基、哒嗪基、苯并咪唑基、苯并***基、吲唑基、喹喔啉基、喹啉基、喹唑啉基、咪唑并吡啶基、吡唑并吡啶基、***并吡啶基、噌啉基、异噁唑基、吡唑基、苯并呋喃基、二氢苯并呋喃基、二氢苯并二噁英基和四氢苯并二噁英基,它们中的任一个都可以任选地被取代。
34.根据权利要求29或30所述的化合物,其中R2和R3独立地是任选地取代的苯基。
35.根据权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物选自下表:
Figure FDA0003224737390000061
Figure FDA0003224737390000071
Figure FDA0003224737390000081
Figure FDA0003224737390000091
Figure FDA0003224737390000101
Figure FDA0003224737390000111
Figure FDA0003224737390000121
Figure FDA0003224737390000131
Figure FDA0003224737390000141
Figure FDA0003224737390000151
Figure FDA0003224737390000161
Figure FDA0003224737390000171
Figure FDA0003224737390000181
Figure FDA0003224737390000191
Figure FDA0003224737390000201
Figure FDA0003224737390000211
Figure FDA0003224737390000221
36.根据权利要求2所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物选自下表:
Figure FDA0003224737390000231
37.根据权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物选自下表:
Figure FDA0003224737390000232
Figure FDA0003224737390000241
Figure FDA0003224737390000251
Figure FDA0003224737390000261
Figure FDA0003224737390000271
38.根据权利要求5所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物选自下表:
Figure FDA0003224737390000272
39.一种药物组合物,所述药物组合物包含治疗有效量的根据权利要求1至37中任一项所述的化合物,或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的载剂。
40.一种用于治疗患有癌症的受试者的癌症的方法,所述方法包括向所述受试者施用有效量的根据权利要求1至37中任一项所述的MAT2A抑制剂化合物或其药学上可接受的盐。
41.根据权利要求39所述的方法,其中所述癌症是MTAP缺失的癌症。
42.根据权利要求39或40所述的方法,其中所述癌症选自由以下各项组成的组:间皮瘤、神经母细胞瘤、直肠癌、结肠癌、家族性腺瘤性息肉病性癌和遗传性非息肉病性结肠直肠癌、食道癌、唇癌、喉癌、下咽癌、舌癌、唾液腺癌、胃癌、腺癌、甲状腺髓样癌、甲状腺***样癌、肾癌、肾薄壁组织癌、卵巢癌、***、子宫体癌、子宫内膜癌、绒毛膜癌、胰腺癌、***癌、膀胱癌、睾丸癌、乳腺癌、泌尿系癌、黑素瘤、脑肿瘤、淋巴瘤、头颈癌、急性淋巴性白血病(ALL)、慢性淋巴性白血病(CLL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性骨髓性白血病(CML)、肝细胞癌、胆囊癌、支气管癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、多发性骨髓瘤、基底细胞瘤、畸胎瘤、视网膜母细胞瘤、脉络膜黑素瘤、***瘤、横纹肌肉瘤、骨肉瘤、软骨肉瘤、肌肉瘤、脂肪肉瘤、纤维肉瘤、尤文氏肉瘤和浆细胞瘤。
43.根据权利要求39或40所述的方法,其中所述癌症选自由以下各项组成的组:B细胞急性淋巴细胞性白血病(B-ALL)、间皮瘤、淋巴瘤、胰腺癌、肺癌、胃癌、食管癌、膀胱癌、脑癌、头颈癌、黑素瘤和乳腺癌。
44.根据权利要求42所述的方法,其中所述癌症是肺癌,所述肺癌选自由以下各项组成的组:非小细胞肺癌、小细胞肺癌、肺腺癌和肺鳞状细胞癌。
45.根据权利要求42所述的方法,其中所述癌症是脑肿瘤,所述脑肿瘤选自由以下各项组成的组:胶质瘤、胶质母细胞瘤、星形细胞瘤、脑膜瘤、成神经管细胞瘤、外周神经外胚层肿瘤和颅咽管瘤。
46.根据权利要求42所述的方法,其中所述癌症是三阴性乳腺癌(TNBC)。
47.根据权利要求42所述的方法,其中所述癌症是淋巴瘤,所述淋巴瘤选自由以下各项组成的组:套细胞淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤和成人T细胞白血病/淋巴瘤。
48.一种用于治疗患有癌症的受试者的癌症的方法,其中与其中MTAP基因或蛋白质存在和/或完全发挥功能的癌症相比,所述癌症的特征在于甲硫腺苷磷酸化酶(MTAP)基因表达的降低或缺失、MTAP基因的缺失或MTAP蛋白的功能降低,所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的根据权利要求1至37中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐。
49.根据权利要求1至37中任一项的所述化合物,或其药学上可接受的盐,用于治疗患有癌症的受试者的癌症。
50.根据权利要求48所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述癌症是MTAP缺失的癌症。
51.根据权利要求48或49所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述癌症选自由以下各项组成的组:间皮瘤、神经母细胞瘤、直肠癌、结肠癌、家族性腺瘤性息肉病性癌和遗传性非息肉病性结肠直肠癌、食道癌、唇癌、喉癌、下咽癌、舌癌、唾液腺癌、胃癌、腺癌、甲状腺髓样癌、甲状腺***样癌、肾癌、肾薄壁组织癌、卵巢癌、***、子宫体癌、子宫内膜癌、绒毛膜癌、胰腺癌、***癌、膀胱癌、睾丸癌、乳腺癌、泌尿系癌、黑素瘤、脑肿瘤、淋巴瘤、头颈癌、急性淋巴性白血病(ALL)、慢性淋巴性白血病(CLL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性骨髓性白血病(CML)、肝细胞癌、胆囊癌、支气管癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、多发性骨髓瘤、基底细胞瘤、畸胎瘤、视网膜母细胞瘤、脉络膜黑素瘤、***瘤、横纹肌肉瘤、骨肉瘤、软骨肉瘤、肌肉瘤、脂肪肉瘤、纤维肉瘤、尤文氏肉瘤和浆细胞瘤。
52.根据权利要求48或49所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述癌症选自由以下各项组成的组:B细胞急性淋巴细胞性白血病(B-ALL)、间皮瘤、淋巴瘤、胰腺癌、肺癌、胃癌、食管癌、膀胱癌、脑癌、头颈癌、黑素瘤和乳腺癌。
53.根据权利要求51所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述癌症是肺癌,所述肺癌选自由以下各项组成的组:非小细胞肺癌、小细胞肺癌、肺腺癌和肺鳞状细胞癌。
54.根据权利要求51所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述癌症是三阴性乳腺癌(TNBC)。
55.根据权利要求51所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述癌症是脑肿瘤,所述脑肿瘤选自由以下各项组成的组:胶质瘤、胶质母细胞瘤、星形细胞瘤、脑膜瘤、成神经管细胞瘤、外周神经外胚层肿瘤和颅咽管瘤。
56.根据权利要求51所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述癌症是淋巴瘤,所述淋巴瘤选自由以下各项组成的组:套细胞淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)和成人T细胞白血病/淋巴瘤。
57.根据权利要求1至37中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐用于制备治疗癌症的药物的用途。
58.根据权利要求56所述或其药学上可接受的盐的用途,其中所述癌症是MTAP缺失的癌症。
59.根据权利要求56或57所述或其药学上可接受的盐的用途,其中所述癌症选自由以下各项组成的组:间皮瘤、神经母细胞瘤、直肠癌、结肠癌、家族性腺瘤性息肉病性癌和遗传性非息肉病性结肠直肠癌、食道癌、唇癌、喉癌、下咽癌、舌癌、唾液腺癌、胃癌、腺癌、甲状腺髓样癌、甲状腺***样癌、肾癌、肾薄壁组织癌、卵巢癌、***、子宫体癌、子宫内膜癌、绒毛膜癌、胰腺癌、***癌、膀胱癌、睾丸癌、乳腺癌、泌尿系癌、黑素瘤、脑肿瘤、淋巴瘤、头颈癌、急性淋巴性白血病(ALL)、慢性淋巴性白血病(CLL)、急性骨髓性白血病(AML)、慢性骨髓性白血病(CML)、肝细胞癌、胆囊癌、支气管癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、多发性骨髓瘤、基底细胞瘤、畸胎瘤、视网膜母细胞瘤、脉络膜黑素瘤、***瘤、横纹肌肉瘤、骨肉瘤、软骨肉瘤、肌肉瘤、脂肪肉瘤、纤维肉瘤、尤文氏肉瘤和浆细胞瘤。
60.根据权利要求56或57所述或其药学上可接受的盐的用途,其中所述癌症选自由以下各项组成的组:B细胞急性淋巴细胞性白血病(B-ALL)、间皮瘤、淋巴瘤、胰腺癌、肺癌、胃癌、食管癌、膀胱癌、脑癌、头颈癌、黑素瘤和乳腺癌。
61.根据权利要求59所述或其药学上可接受的盐的用途,其中所述癌症是肺癌,所述肺癌选自由以下各项组成的组:非小细胞肺癌、小细胞肺癌、肺腺癌和肺鳞状细胞癌。
62.根据权利要求59所述或其药学上可接受的盐的用途,其中所述癌症是三阴性乳腺癌(TNBC)。
63.根据权利要求59所述或其药学上可接受的盐的用途,其中所述癌症是脑肿瘤,所述脑肿瘤选自由以下各项组成的组:胶质瘤、胶质母细胞瘤、星形细胞瘤、脑膜瘤、成神经管细胞瘤、外周神经外胚层肿瘤和颅咽管瘤。
64.根据权利要求59所述或其药学上可接受的盐的用途,其中所述癌症是淋巴瘤,所述淋巴瘤选自由以下各项组成的组:套细胞淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)和成人T细胞白血病/淋巴瘤。
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