CN105263915A - 谷氨酰胺酶抑制剂及使用方法 - Google Patents
谷氨酰胺酶抑制剂及使用方法 Download PDFInfo
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Abstract
在此描述了抑制谷氨酰胺酶的化合物以及包含这些化合物的组合物。在此还描述了使用这些抑制谷氨酰胺酶的化合物治疗癌症的方法。
Description
优先权要求
本申请要求自2012年11月21日提交的U.S.S.N.61/729,321的优先权,将其通过引用以其全文结合在此。
发明背景
癌细胞主要依赖于糖酵解来产生用于脂质和核苷酸生物合成的细胞能量和生物化学中间物,而成体组织中的大多数“正常”细胞利用有氧呼吸。癌细胞与正常细胞之间在细胞代谢方面的这一基本差异被称为瓦伯格效应(WarburgEffect)。作为这一差异的结果,经由糖酵解路径产生的丙酮酸被转化成乳酸,而不是被用于产生乙酰-CoA并且最终产生正常柠檬酸循环中所利用的柠檬酸。为了补偿这些能量变化并且维持柠檬酸循环,癌细胞依赖于谷氨酰胺代谢,该代谢是通过升高谷氨酰胺酶活性来实现。这一现象的利用可以通过抑制这一升高的谷氨酰胺酶活性来实现。
发明概述
在此描述了含杂环的化合物,其药学上可接受的盐、溶剂化物及水合物。可以使用这些化合物,例如通过抑制患者体内的谷氨酰胺酶来治疗在此描述的病症。还提供了包含特此在此提供的化合物的组合物(例如,药物组合物)以及这些组合物在治疗与异常谷氨酰胺酶功能或谷氨酰胺酶活性升高相关的疾病和病状(包括例如癌症)的方法中的用途。
在一个实施例中,提供了一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐:
其中
X是化学键、-S-、-S(O)-、-SO2-、-CH=CH-、-NH-或-C(O)-;
每个W、Y和Z独立地是-S-、-CH=、-CH=CH-、-CH=CR1-、-CR1=CR1-、-O-、-N=或-NH-,其条件是(1)对于每个环而言,W、Y和Z中的至少一个不是-CH=并且(2)当W中的一个是-S-并且同一个环上的Y是N时,则同一个环上的Z不是-CH=;
每个R1和R2独立地是C1-6亚烷基-R4、-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-R4、-C(O)-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-O-R4、-N(R3)-C(O)-N(R3)-R4、-O-C(O)-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-C1-6亚烷基-C(O)-R4、-N(R3)-C(O)-C1-6亚烷基-N(R3)-C(O)-R4或-N(R3a)-C(O)-CH2-N(R3)-C(O)-R4;
每个R3独立地是氢、C1-6烷基或芳基;
每个R4独立地是C1-6烷基、C1-6烯基、芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳烷基、杂环基烷基、杂环基、环烷基或环烷基烷基,其中的每个被出现0-3次的R5或两个相邻的R5部分取代,这两个相邻的R5部分与它们附接的原子一起形成一个杂环基、杂芳基、环烷基或芳基;
每个R5独立地是氧代(=O)、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、氰基、卤素、-OH、-SH、-OCF3、-SO2-C1-6烷基、-NO2、-N(R7)-C(O)-C1-6烷基、-N(R6)2、-O-C(O)-C1-6烷基、C3-7环烷基、(C3-7环烷基)烷基、芳基、芳氧基、-C(O)-芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳烷基、杂环基烷基或杂环基,其中每个芳基、杂芳基或杂环基进一步被出现0-3次的R7取代;
每个R6独立地是氢、氟、OH或C1-6烷基;
每个R7独立地是氢、C1-6烷基、-OH、-SH、氰基、卤素、-CF3、-OCF3、-SO2-C1-6烷基、-NO2、-N(R7)-C(O)-C1-6烷基、-N(R6)2或C1-6烷氧基;
m是1、2或3;
n是1、2或3;其条件是当X是键时,则m和n的总和是从3至6并且当X是-S-、-S(O)-、-SO2-、-CH=CH-或-C(O)-时,则m和n的总和是从2至4;
o是1、2或3;并且
p是1、2或3;
其条件是:(1)当X是-S-,m和n都是2,每个R6都是H时,则(i)R1和R2不都是-NHC(O)-R4,其中R4是C1-6烷基、单环的环、单环的芳烷基、单环的杂环基烷基、单环的杂芳烷基并且R4的每个成员都被出现0-3次的R5取代;并且(ii)R1和R2不都是-NHC(O)O-甲基、-NHC(O)O-乙基、-NHC(O)-6-嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮基、-N(乙基)C(O)-苄基或-NHC(O)NH-苯基,其中该-NHC(O)NH-苯基部分的所述苯基任选地被1个或2个选自甲基、硝基和卤素的基团取代;
(2)当X是-S-、m和n都是1,每个R6都是H时,则(i)R1和R2不都是-NH-苯基或-NH-4-甲氧基-苯基或-NHC(O)-苄基;
(3)当X是化学键,m和n的总和是3,每个R6都是H时,则R1和R2不都是-NHC(O)-R4,其中R4是单环的芳基或单环的芳烷基或甲基,并且R4的每个成员都任选地被出现0-3次的R5取代;
(4)当X是化学键,m和n都是2,每个R6都是H时,则R1和R2不都是-NHC(O)-呋喃基、-NHC(O)-苯基、-NHC(O)-o-甲氧基-苯基、-NHC(O)-C1-6烷基、-NH-苄基、-NHC(O)-NH-苯基、-NHC(O)-NH-苄基或-NH-苯基,其中该-NH-苯基部分的所述苯基被出现0-3次的R5取代;
(5)当X是化学键,m和n的总和是5,每个R6都是H时,则R1和R2不都是-NHC(O)-C1-6烷基、-NHC(O)-环己基或-NH-苯基,其中该-NH-苯基部分的所述苯基任选地被甲基取代;并且
(6)当X是化学键,m和n都是3,每个R6都是H时,则R1和R2不都是NH-苯基;
(7)当X是化学键,m和n都是2,并且W、Y或Z中的一个是-CH=CH-或-CH=CR1-时,则R1和R2不都是-NHC(O)C(R*)2-苯基,其中该苯基未被取代或被出现0-3次的R5取代并且R*是H、-OH、-C1-2烷基-OH、-C1-2烷基-OCH3或-CH3;
(8)当X是化学键,m和n都是2,W、Y或Z中的一个是-CH=CH-或-CH=CR1-并且R1和R2中的一个是-NHC(O)CH2-R^,其中R^是氢、-NH2、杂芳基或稠合环,其中该杂芳基未被取代或被出现0-3次的R5;-NHC(O)NH-苄基;或-NHCO2-苄基取代时;则R1和R2中的另一个不是-NHC(O)C(R*)2-苯基,其中该苯基未被取代或被出现0-3次的R5取代,并且R*是H、-OH、-C1-2烷基-OH、-C1-2烷基-OCH3或甲基;
(9)具有式(I)的该化合物不是:
在另一个实施例中,提供了一种组合物,该组合物包含一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐。在一些实施例中,该组合物是一种药物组合物。
在另一个实施例中,在此提供了一种用于治疗或预防如在此所描述(例如治疗)的疾病、病状或病症的方法,该方法包括给予一种在此描述的化合物、其药学上可接受的盐,或者包含一种在此描述的化合物或其药学上可接受的盐的一种药物组合物。
在另一个实施例中,在此提供了一种抑制例如有需要的患者体内的谷氨酰胺酶的方法。在一些实施例中,在此提供了降低受试者,例如有需要的患者体内的谷氨酰胺酶的产物水平。这些方法包括将一种有效量的一种在此描述的化合物或其药学上可接受的盐给予一名位对其有需要的受试者,由此抑制该受试者体内的谷氨酰胺酶水平。
在另一个实施例中,在此提供了一种对罹患或易患与有需要的受试者体内的谷氨酰胺酶异常功能或谷氨酰胺酶活性升高有关的疾病或病症的受试者进行治疗的方法。该方法包括以下步骤:将一种有效量的一种在此描述的化合物给予对其有需要的受试者,由此治疗、预防或改善该受试者中的疾病或病症。在某些实施例中,该化合物是以一种药物组合物的形式提供。在某些实施例中,该方法包括了对将从抑制谷氨酰胺酶或降低谷氨酰胺酶水平获益的受试者进行鉴别或选择。举例来说,可以基于受试者的一个细胞或组织样品中谷氨酰胺酶的活性水平来鉴别该受试者用于与异常谷氨酰胺酶功能或活性有关的癌症的治疗。在另一个实施例中,所选受试者是罹患或易患在此所鉴别的病症或疾病,例如以不需要的细胞生长或增殖为特征的病症(例如癌症或其他赘生性病症)的一名位患者。
在另一个实施例中,在此提供了一种用于治疗受试者中的癌症的方法,该方法包括:任选地,获取一个受试者样品;获取针对该受试者样品的评估或评估该受试者样品,其中该受试者样品的特征在于i)E-钙粘素的表达水平与一种参考标准相比较低与一种参考标准相比较低的E-钙粘素表达水平,ii)波形蛋白的表达水平与一种参考标准相比较高与一种参考标准相比较高的波形蛋白表达水平,或iii)较低或降低的丙酮酸羧化酶表达水平;并且向对其有需要的受试者给予一种治疗有效量的一种在此描述的化合物。在一些实施例中,该受试者样品的特征在于i)E-钙粘素的表达水平与一种参考标准相比降低与一种参考标准相比降低的E-钙粘素表达水平并且ii)波形蛋白的表达水平与一种参考标准相比较高与一种参考标准相比较高的波形蛋白表达水平。在一些实施例中,该受试者样品的特征在于或另外特征在于与一种参考标准相比较低或降低的丙酮酸羧化酶的表达水平与一种参考标准相比较低或降低。
在另一个实施例中,在此提供了一种用于治疗受试者的癌症的方法,该受试者的特征在于i)E-钙粘素的表达水平与一种参考标准相比较低与一种参考标准相比较低的E-钙粘素表达水平,ii)波形蛋白的表达水平与一种参考标准相比较高与一种参考标准相比较高的波形蛋白表达水平,或iii)较低或降低的丙酮酸羧化酶表达水平;该方法包括向对其有需要的受试者给予一种治疗有效量的一种在此描述的化合物。在一些实施例中,该受试者的特征在于i)E-钙粘素的表达水平与一种参考标准相比降低与一种参考标准相比降低的E-钙粘素表达水平并且ii)波形蛋白的表达水平与一种参考标准相比较高与一种参考标准相比较高的波形蛋白表达水平。在一些实施例中,该受试者的特征在于或另外特征在于丙酮酸羧化酶的表达水平与一种参考标准相比较低或降低。
具体实施方式
在以下描述中阐明或在附图中示出的组分的构建以及安排的详情不意欲是限制性的。实施例可以按不同方式实行或进行。同样,在此使用的措辞和术语都是出于说明的目的,并且不应当被视为是限制性的。在此对“包括”、“包含”或“具有”、“含有”、“涉及”以及其变体的使用表示涵盖在其之后所列出的项目和其等效物以及附加项目。
化合物
在此描述了抑制谷氨酰胺酶的化合物和组合物。抑制谷氨酰胺酶的化合物可以用于治疗病症,如赘生性病症(例如癌症)。
在一个实施例中,提供了一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,或者包含一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的一种药物组合物:
其中
X是化学键、-S-、-S(O)-、-SO2-、-CH=CH-、-NH-或-C(O)-;
每个W、Y和Z独立地是-S-、-CH=、-CH=CH-、-CH=CR1-、-CR1=CR1-、-O-、-N=或-NH-,其条件是(1)对于每个环而言,W、Y和Z中的至少一个不是-CH=并且(2)当W中的一个是-S-并且同一个环上的Y是N时,则同一个环上的Z不是-CH=;
每个R1和R2独立地是C1-6亚烷基-R4、-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-R4、-C(O)-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-O-R4、-N(R3)-C(O)-N(R3)-R4、-O-C(O)-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-C1-6亚烷基-C(O)-R4、-N(R3)-C(O)-C1-6亚烷基-N(R3)-C(O)-R4或-N(R3a)-C(O)-CH2-N(R3)-C(O)-R4;
每个R3独立地是氢、C1-6烷基或芳基;
每个R4独立地是C1-6烷基、C1-6烯基、芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳烷基、杂环基烷基、杂环基、环烷基或环烷基烷基,其中的每个被出现0-3次的R5或两个相邻的R5部分取代,这两个相邻的R5部分与它们附接的原子一起形成一个杂环基、杂芳基、环烷基或芳基;
每个R5独立地是氧代(=O)、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、氰基、卤素、-OH、-SH、-OCF3、-SO2-C1-6烷基、-NO2、-N(R7)-C(O)-C1-6烷基、-N(R6)2、-O-C(O)-C1-6烷基、C3-7环烷基、(C3-7环烷基)烷基、芳基、芳氧基、-C(O)-芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳烷基、杂环基烷基或杂环基,其中每个芳基、杂芳基或杂环基进一步被出现0-3次的R7取代;
每个R6独立地是氢、氟、OH或C1-6烷基;
每个R7独立地是氢、C1-6烷基、-OH、-SH、氰基、卤素、-CF3、-OCF3、-SO2-C1-6烷基、-NO2、-N(R7)-C(O)-C1-6烷基、-N(R6)2或C1-6烷氧基;
m是1、2或3;
n是1、2或3;其条件是当X是键时,则m和n的总和是从3至6并且当X是-S-、-S(O)-、-SO2-、-CH=CH-或-C(O)-时,则m和n的总和是从2至4;
o是1、2或3;并且
p是1、2或3;
其条件是:(1)当X是-S-,m和n都是2,每个R6都是H时,则(i)R1和R2不都是-NHC(O)-R4,其中R4是C1-6烷基、单环的环、单环的芳烷基、单环的杂环基烷基、单环的杂芳烷基并且R4的每个成员都被出现0-3次的R5取代;并且(ii)R1和R2不都是-NHC(O)O-甲基、-NHC(O)O-乙基、-NHC(O)-6-嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮基、-N(乙基)C(O)-苄基或-NHC(O)NH-苯基,其中该-NHC(O)NH-苯基部分的所述苯基任选地被1个或2个选自甲基、硝基和卤素的基团取代;
(2)当X是-S-、m和n都是1,每个R6都是H时,则(i)R1和R2不都是-NH-苯基或-NH-4-甲氧基-苯基或-NHC(O)-苄基;
(3)当X是化学键,m和n的总和是3,每个R6都是H时,则R1和R2不都是-NHC(O)-R4,其中R4是单环的芳基或单环的芳烷基或甲基,并且R4的每个成员都任选地被出现0-3次的R5取代;
(4)当X是化学键,m和n都是2,每个R6都是H时,则R1和R2不都是-NHC(O)-呋喃基、-NHC(O)-苯基、-NHC(O)-o-甲氧基-苯基、-NHC(O)-C1-6烷基、-NH-苄基、-NHC(O)-NH-苯基、-NHC(O)-NH-苄基或-NH-苯基,其中该-NH-苯基部分的所述苯基被出现0-3次的R5取代;
(5)当X是化学键,m和n的总和是5,每个R6都是H时,则R1和R2不都是-NHC(O)-C1-6烷基、-NHC(O)-环己基或-NH-苯基,其中该-NH-苯基部分的所述苯基任选地被甲基取代;并且
(6)当X是化学键,m和n都是3,每个R6都是H时,则R1和R2不都是NH-苯基;
(7)当X是化学键,m和n都是2,并且W、Y或Z中的一个是-CH=CH-或-CH=CR1-时,则R1和R2不都是-NHC(O)C(R*)2-苯基,其中该苯基未被取代或被出现0-3次的R5取代并且R*是H、-OH、-C1-2烷基-OH、-C1-2烷基-OCH3或-CH3;
(8)当X是化学键,m和n都是2,W、Y或Z中的一个是-CH=CH-或-CH=CR1-并且R1和R2中的一个是-NHC(O)CH2-R^,其中R^是氢、-NH2、杂芳基或稠合环,其中该杂芳基未被取代或被出现0-3次的R5;-NHC(O)NH-苄基;或-NHCO2-苄基取代时;则R1和R2中的另一个不是-NHC(O)C(R*)2-苯基,其中该苯基未被取代或被出现0-3次的R5取代,并且R*是H、-OH、-C1-2烷基-OH、-C1-2烷基-OCH3或甲基;
(9)具有式(I)的化合物不是:
在一个实施例中,提供了一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,或者包含一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的一种药物组合物:
其中
X是化学键、-S-、-S(O)-、-SO2-、-CH=CH-、-NH-或-C(O)-;
每个W、Y和Z独立地是-S-、-CH=、-CH=CH-、-CH=CR1-、-CR1=CR1-、-O-、-N=或-NH-,其条件是(1)对于每个环而言,W、Y和Z中的至少一个不是-CH=并且(2)当W中的一个是-S-并且同一个环上的Y是N时,则同一个环上的Z不是-CH=;
每个R1和R2独立地是-N(R3)-R4、-C(O)-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-O-R4或-N(R3)-C(O)-N(R3)-R4;
每个R3独立地是氢、C1-6烷基或芳基;
每个R4独立地是C1-6烷基、C1-6烯基、芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳烷基、杂环基烷基、杂环基、环烷基或环烷基烷基,其中的每个被出现0-3次的R5或两个相邻的R5部分取代,这两个相邻的R5部分与它们附接的原子一起形成一个杂环基、杂芳基、环烷基或芳基;
每个R5独立地是氧代(=O)、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、氰基、卤素、-OH、-SH、-OCF3、-SO2-C1-6烷基、-NO2、-N(R7)-C(O)-C1-6烷基、-N(R6)2、-O-C(O)-C1-6烷基、C3-7环烷基、(C3-7环烷基)烷基、芳基、芳氧基、-C(O)-芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳烷基、杂环基烷基或杂环基,其中每个芳基、杂芳基或杂环基进一步被出现0-3次的R7取代;
每个R6独立地是氢、氟、OH或C1-6烷基;
每个R7独立地是氢、C1-6烷基、-OH、-SH、氰基、卤素、-CF3、-OCF3、-SO2-C1-6烷基、-NO2、-N(R7)-C(O)-C1-6烷基、-N(R6)2或C1-6烷氧基;
m是1、2或3;
n是1、2或3;其条件是当X是键时,则m和n的总和是从3至6并且当X是-S-、-S(O)-、-SO2-、-CH=CH-或-C(O)-时,则m和n的总和是从2至4;
o是1、2或3;并且
p是1、2或3;
其条件是:(1)当X是-S-,m和n都是2,每个R6都是H时,则(ii)R1和R2不都是-NHC(O)O-甲基、-NHC(O)O-乙基或-NHC(O)NH-苯基,其中该-NHC(O)NH-苯基部分的所述苯基任选地被1个或2个选自甲基、硝基和卤素的基团取代;
(2)当X是-S-或-S(O)2-,m和n都是1,每个R6都是H时,则R1和R2不都是-NH-苯基或-NH-4-甲氧基-苯基;
(3)当X是化学键,m和n都是2,每个R6都是H时,则R1和R2不都是-NH-苄基、-NHC(O)-NH-苯基、-NHC(O)NH-苄基或-NH-苯基,其中该-NH-苯基部分的所述苯基被出现0-3次的R5取代;
(4)当X是化学键,m和n的总和是5,每个R6都是H时,则R1和R2不都是-NH-苯基,其中该-NH-苯基部分的所述苯基任选地被甲基取代;
(5)当X是化学键,m和n都是3,每个R6都是H时,则R1和R2不都是NH-苯基。
在一个实施例中,提供了一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,或者包含一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的一种药物组合物:
其中
X是化学键、-S-、-S(O)-、-SO2-、-CH=CH-或-C(O)-;
每个W、Y和Z独立地是-S-、-CH=、-O-、-N=或-NH-,其条件是(1)W、Y和Z中的至少一个不是-CH=并且(2)当W中的一个是-S-并且同一个环上的Y是N时,则同一个环上的Z不是-CH=;
每个R1和R2独立地是C1-6亚烷基-R4、-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-R4、-C(O)-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-O-R4、-N(R3)-C(O)-N(R3)-R4、-O-C(O)-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-C1-6亚烷基-C(O)-R4、-N(R3)-C(O)-C1-6亚烷基-N(R3)-C(O)-R4或-N(R3a)-C(O)-CH2-N(R3)-C(O)-R4;
每个R3独立地是氢、C1-6烷基或芳基;
每个R4独立地是C1-6烷基、C1-6烯基、芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳烷基、杂环基烷基、杂环基、环烷基或环烷基烷基,其中的每个被出现0-3次的R5或两个相邻的R5部分取代,这两个相邻的R5部分与它们附接的原子一起形成一个杂环基、杂芳基、环烷基或芳基;
每个R5独立地是氧代(=O)、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、氰基、卤素、-OH、-SH、-OCF3、-SO2-C1-6烷基、-NO2、-N(R7)-C(O)-C1-6烷基、-N(R6)2、-O-C(O)-C1-6烷基、C3-7环烷基、(C3-7环烷基)烷基、芳基、芳氧基、-C(O)-芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳烷基、杂环基烷基或杂环基,其中每个芳基、杂芳基或杂环基进一步被出现0-3次的R7取代;
每个R6独立地是氢、氟、OH或C1-6烷基;
每个R7独立地是氢、C1-6烷基、-OH、-SH、氰基、卤素、-CF3、-OCF3、-SO2-C1-6烷基、-NO2、-N(R7)-C(O)-C1-6烷基、-N(R6)2或C1-6烷氧基;
m是1、2或3;
n是1、2或3;其条件是当X是键时,则m和n的总和是从3至6并且当X是-S-、-S(O)-、-SO2-、-CH=CH-或-C(O)-时,则m和n的总和是从2至4;
o是1、2或3;并且
p是1、2或3;
其条件是:(1)当X是-S-,m和n都是2,每个R6都是H时,则(i)R1和R2不都是-NHC(O)-R4,其中R4是C1-6烷基、单环的芳基、单环的杂芳基、单环的芳烷基、单环的杂芳烷基并且R4的每个成员都被出现0-3次的R5取代;并且(ii)R1和R2不都是-NHC(O)O-甲基、-NHC(O)O-乙基、-NHC(O)-6-嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮基或-NHC(O)NH-苯基,其中该-NHC(O)NH-苯基部分的所述苯基任选地被1个或2个选自甲基、硝基和卤素的基团取代;
(2)当X是-S-、m和n都是1,每个R6都是H时,则(i)R1和R2不都是-NH-苯基或-NH-4-甲氧基-苯基;
(3)当X是化学键,m和n的总和是3,每个R6都是H时,则R1和R2不都是NHC(O)-苯基;
(4)当X是化学键,m和n都是2,每个R6都是H时,则R1和R2不都是-NHC(O)-呋喃基、-NHC(O)-苯基、-NHC(O)-o-甲氧基-苯基、-NHC(O)-C1-6烷基、-NH-苄基或-NH-苯基,其中该-NH-苯基部分的所述苯基被出现0-3次的R5取代;
(5)当X是化学键,m和n的总和是5,每个R6都是H时,则R1和R2不都是-NHC(O)-C1-6烷基、-NHC(O)-环己基或-NH-苯基,其中该-NH-苯基部分的所述苯基任选地被甲基取代;并且
(6)当X是化学键,m和n都是3,每个R6都是H时,则R1和R2不都是NH-苯基。在一个实施例中,提供了一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,或者包含一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的一种药物组合物:
其中
X是-S(O)-、-SO2-、-CH=CH-或-C(O)-;
每个W、Y和Z独立地是-S-、-CH=、-CH=CH-、-CH=CR1-、-CR1=CR1-、-O-、-N=或-NH-,其条件是(1)对于每个环而言,W、Y和Z中的至少一个不是-CH=并且(2)当W中的一个是-S-并且同一个环上的Y是N时,则同一个环上的Z不是-CH=;
每个R1和R2独立地是C1-6亚烷基-R4、-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-R4、-C(O)-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-O-R4、-N(R3)-C(O)-N(R3)-R4、-O-C(O)-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-C1-6亚烷基-C(O)-R4、-N(R3)-C(O)-C1-6亚烷基-N(R3)-C(O)-R4或-N(R3a)-C(O)-CH2-N(R3)-C(O)-R4;
每个R3独立地是氢、C1-6烷基或芳基;
每个R4独立地是C1-6烷基、C1-6烯基、芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳烷基、杂环基烷基、杂环基、环烷基或环烷基烷基,其中的每个被出现0-3次的R5或两个相邻的R5部分取代,这两个相邻的R5部分与它们附接的原子一起形成一个杂环基、杂芳基、环烷基或芳基;
每个R5独立地是氧代(=O)、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、氰基、卤素、-OH、-SH、-OCF3、-SO2-C1-6烷基、-NO2、-N(R7)-C(O)-C1-6烷基、-N(R6)2、-O-C(O)-C1-6烷基、C3-7环烷基、(C3-7环烷基)烷基、芳基、芳氧基、-C(O)-芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳烷基、杂环基烷基或杂环基,其中每个芳基、杂芳基或杂环基进一步被出现0-3次的R7取代;
每个R6独立地是氢、氟、OH或C1-6烷基;
每个R7独立地是氢、C1-6烷基、-OH、-SH、氰基、卤素、-CF3、-OCF3、-SO2-C1-6烷基、-NO2、-N(R7)-C(O)-C1-6烷基、-N(R6)2或C1-6烷氧基;
m是1、2或3;
n是1、2或3;其条件是m和n的总和是从2至4;
o是1、2或3;并且
p是1、2或3;
其条件是具有式(I)的该化合物不是:
在一个实施例中,提供了一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,或者包含一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的一种药物组合物:
其中
X是-S-、-S(O)-、-SO2-、-CH=CH-、-NH-或-C(O)-;
每个W、Y和Z独立地是-S-、-CH=、-CH=CH-、-CH=CR1-、-CR1=CR1-、-O-、-N=或-NH-,其条件是(1)对于每个环而言,W、Y和Z中的至少一个不是-CH=并且(2)当W中的一个是-S-并且同一个环上的Y是N时,则同一个环上的Z不是-CH=并且(3)W、Y和Z中的至少一个是-CH=CH-、-CH=CR1-、-CR1=CR1-;
每个R1和R2独立地是C1-6亚烷基-R4、-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-R4、-C(O)-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-O-R4、-N(R3)-C(O)-N(R3)-R4、-O-C(O)-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-C1-6亚烷基-C(O)-R4、-N(R3)-C(O)-C1-6亚烷基-N(R3)-C(O)-R4或-N(R3a)-C(O)-CH2-N(R3)-C(O)-R4;
每个R3独立地是氢、C1-6烷基或芳基;
每个R4独立地是C1-6烷基、C1-6烯基、芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳烷基、杂环基烷基、杂环基、环烷基或环烷基烷基,其中的每个被出现0-3次的R5或两个相邻的R5部分取代,这两个相邻的R5部分与它们附接的原子一起形成一个杂环基、杂芳基、环烷基或芳基;
每个R5独立地是氧代(=O)、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、氰基、卤素、-OH、-SH、-OCF3、-SO2-C1-6烷基、-NO2、-N(R7)-C(O)-C1-6烷基、-N(R6)2、-O-C(O)-C1-6烷基、C3-7环烷基、(C3-7环烷基)烷基、芳基、芳氧基、-C(O)-芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳烷基、杂环基烷基或杂环基,其中每个芳基、杂芳基或杂环基进一步被出现0-3次的R7取代;
每个R6独立地是氢、氟、OH或C1-6烷基;
每个R7独立地是氢、C1-6烷基、-OH、-SH、氰基、卤素、-CF3、-OCF3、-SO2-C1-6烷基、-NO2、-N(R7)-C(O)-C1-6烷基、-N(R6)2或C1-6烷氧基;
m是1、2或3;
n是1、2或3;其条件是m和n的总和是从2至4;
o是1、2或3;并且
p是1、2或3。
在一个实施例中,提供了一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,或者包含一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐的一种药物组合物:
其中
X是-S(O)-、-SO2-、-CH=CH-或-C(O)-;
每个W、Y和Z独立地是-S-、-CH=、-O-、-N=或-NH-,其条件是(1)对于每个环而言,W、Y和Z中的至少一个不是-CH=并且(2)当W中的一个是-S-并且同一个环上的Y是N时,则同一个环上的Z不是-CH=;
每个R1和R2独立地是C1-6亚烷基-R4、-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-R4、-C(O)-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-O-R4、-N(R3)-C(O)-N(R3)-R4、-O-C(O)-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-C1-6亚烷基-C(O)-R4、-N(R3)-C(O)-C1-6亚烷基-N(R3)-C(O)-R4或-N(R3a)-C(O)-CH2-N(R3)-C(O)-R4;
每个R3独立地是氢、C1-6烷基或芳基;
每个R4独立地是C1-6烷基、C1-6烯基、芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳烷基、杂环基烷基、杂环基、环烷基或环烷基烷基,其中的每个被出现0-3次的R5或两个相邻的R5部分取代,这两个相邻的R5部分与它们附接的原子一起形成一个杂环基、杂芳基、环烷基或芳基;
每个R5独立地是氧代(=O)、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、氰基、卤素、-OH、-SH、-OCF3、-SO2-C1-6烷基、-NO2、-N(R7)-C(O)-C1-6烷基、-N(R6)2、-O-C(O)-C1-6烷基、C3-7环烷基、(C3-7环烷基)烷基、芳基、芳氧基、-C(O)-芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳烷基、杂环基烷基或杂环基,其中每个芳基、杂芳基或杂环基进一步被出现0-3次的R7取代;
每个R6独立地是氢、氟、OH或C1-6烷基;
每个R7独立地是氢、C1-6烷基、-OH、-SH、氰基、卤素、-CF3、-OCF3、-SO2-C1-6烷基、-NO2、-N(R7)-C(O)-C1-6烷基、-N(R6)2或C1-6烷氧基;
m是1、2或3;
n是1、2或3;其条件是m和n的总和是从2至4;
o是1、2或3;并且
p是1、2或3;
其条件是具有式(I)的该化合物不是:
在一些实施例中,X是-S-。在一些实施例中,X是-S(O)-。在一些实施例中,X是-SO2-。在一些实施例中,X是化学键。在一些实施例中,X是-CH=CH-。在一些实施例中,X是-NH-。
在一些实施例中,每个Y是-N=。在一些实施例中,每个Z是-N=。在一些实施例中,每个Z是-O-。在一些实施例中,每个W是-S-。在一些实施例中,每个W是-CH=。在这些实施例的一些方面中,每个W都是-S-,每个Y都是-N=并且每个Z都是-N=。在这些实施例的其他方面中,每个W都是-CH=,每个Z都是-O-并且每个Y都是-N=。在一些实施例中,W、Y和Z中的至少一个是-CH=CH-、-CH=CR1-或-CR1=CR1-。在一些实施例中,每个W都是-CH=CH-。在一些实施例中,一个W是-CH=CH-。在这些实施例的一些方面中,每个W都是-CH=CH-,每个Y都是-N=并且每个Z都是-N=。在这些实施例的一些方面中,一个W是-CH=CH-,并且同一个环上的Y是-N=并且同一个环上的Z是-N=,并且其他W是-S-,同一个环上的Y是-N=并且同一个环上的Z是-N=。
在一些实施例中,每个Y是-N=。在一些实施例中,每个Z是-N=。在一些实施例中,每个Z是-O-。在一些实施例中,每个W是-S-。在一些实施例中,每个W是-CH=。在这些实施例的一些方面中,每个W都是-S-,每个Y都是-N=并且每个Z都是-N=。在这些实施例的其他方面中,每个W都是-CH=,每个Z都是-O-并且每个Y都是-N=。
在一些实施例中,o是1。在一些实施例中,p是1。在一些实施例中,o是1并且p是1。
在一些实施例中,m是1。在一些实施例中,n是1。在一些实施例中,n是1并且m是1。在这些实施例的一些方面中,每个R6都是氢。在这些实施例的一些方面中,每个R6都是-OH。在一些实施例中,R1和R2是相同的。在一些实施例中,R1和R2是不同的。
在一些实施例中,m是1。在一些实施例中,n是1。在一些实施例中,n是1并且m是1。在这些实施例的一些方面中,每个R6都是氢。在一些实施例中,R1和R2是相同的。在一些实施例中,R1和R2是不同的。
在一些实施例中,m是1。在一些实施例中,n是2。在一些实施例中,n是2并且m是1。在这些实施例的一些方面中,每个R6都是氢。在这些实施例的一些方面中,每个R6都是-OH。在一些实施例中,R1和R2是相同的。在一些实施例中,R1和R2是不同的。
在一些实施例中,m是1。在一些实施例中,n是2。在一些实施例中,n是2并且m是1。在这些实施例的一些方面中,每个R6都是氢。在一些实施例中,R1和R2是相同的。在一些实施例中,R1和R2是不同的。
在一些实施例中,m是2。在一些实施例中,n是1。在一些实施例中,n是1并且m是2。在这些实施例的一些方面中,每个R6都是氢。在这些实施例的一些方面中,X是-S-。在一些实施例中,R1和R2是相同的。在一些实施例中,R1和R2是不同的。在这些实施例的一些方面中,m是2,n是1,X是-S-,并且R1和R2是相同的。
在一些实施例中,m是2。在一些实施例中,n是1。在一些实施例中,n是1并且m是2。在这些实施例的一些方面中,每个R6都是氢。在一些实施例中,R1和R2是相同的。在一些实施例中,R1和R2是不同的。
在一些实施例中,m是3。在一些实施例中,n是1。在一些实施例中,n是3并且m是1。在这些实施例的一些方面中,每个R6都是氢。在一些实施例中,同一个碳上的两个R6是C1-6烷基(例如,甲基)并且其余R6都各自是氢。在一些实施例中,R1和R2是相同的。在一些实施例中,R1和R2是不同的。在这些实施例的一些方面中,m是3,n是1,X是-S-,并且R1和R2是相同的。在一些实施例中,m是2。在一些实施例中,n是2。在一些实施例中,n是2并且m是2。在这些实施例的一些方面中,每个R6都是氢。在这些实施例的一些方面中,每个R6都是-OH。在这些实施例的一些方面中,X是-S-。在一些实施例中,R1和R2是相同的。在一些实施例中,R1和R2是不同的。
在一些实施例中,m是2。在一些实施例中,n是2。在一些实施例中,n是2并且m是2。在这些实施例的一些方面中,每个R6都是氢。在一些实施例中,R1和R2是相同的。在一些实施例中,R1和R2是不同的。
在一些实施例中,m是2。在一些实施例中,n是3。在一些实施例中,n是3并且m是2。在这些实施例的一些方面中,每个R6都是氢。在一些实施例中,同一个碳上的两个R6是C1-6烷基(例如,甲基)并且其余R6都各自是氢。在一些实施例中,R1和R2是相同的。在一些实施例中,R1和R2是不同的。
在一些实施例中,m是3。在一些实施例中,n是2。在一些实施例中,n是3并且m是2。在这些实施例的一些方面中,每个R6都是氢。在一些实施例中,同一个碳上的两个R6是C1-6烷基(例如,甲基)并且其余R6都各自是氢。在一些实施例中,R1和R2是相同的。在一些实施例中,R1和R2是不同的。
在一些实施例中,m是3。在一些实施例中,n是3。在一些实施例中,n是3并且m是3。在这些实施例的一些方面中,每个R6都是氢。在一些实施例中,R1和R2是相同的。在一些实施例中,R1和R2是不同的。
在一些实施例中,R1和R2各自是-N(R3)-C(O)-O-R4,其中R3是氢。在这些实施例的一些方面中,每个R4都是被出现0-3次的R5取代的C1-6烷基(例如,异丙基、异丁基或叔丁基)。在这些实施例的一些方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的C1-6烷基(例如,异丙基、异丁基或叔丁基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0-3次的R5取代的芳基(例如,苯基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的芳基(例如,苯基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0-3次的R5取代的C3-7环烷基。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的C3-7环烷基(例如,环己基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0-3次的R5取代的芳烷基。在这些实施例的仍其他方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的芳烷基(例如,苄基)。在这些实施例的一些方面中,R1和R2是相同的。在这些实施例的其他方面中,R1和R2是不同的。
在一些实施例中,R1和R2各自是-N(R3)-C(O)-R4,其中每个R3是氢。在一些实施例中,R1和R2各自是-N(R3)-C(O)-R4,其中每个R3都是C1-6烷基(例如,甲基)。在这些实施例的一些方面中,R1和R2是相同的。在这些实施例的其他方面中,R1和R2是不同的。
在这些实施例的一些方面中,每个R4都是被出现0-3次的R5取代的芳烷基。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的芳烷基(例如,苄基、2-苯基乙基、1-苯基乙基、2-苯基丙基、3-苯基丙基或萘基甲基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现一次的R5取代的芳烷基(例如,苄基、2-苯乙基、1-苯乙基或苯丙基)。在这些实施例的另外的方面中,每个R5都是杂环基(例如,异吲哚啉酮)并且由以下结构表示:
在这些实施例的另外的方面中,每个R5都是C1-6烷氧基(例如,甲氧基)。在这些实施例的其他另外的方面中,每个R5都是-OH。在这些实施例的其他另外的方面中,每个R5都是C1-6烷基(例如,甲基)。在这些实施例的其他另外的方面中,每个R5都是-N(Me)2。在这些实施例的其他另外的方面中,每个R5都是卤素(例如,氯)。在这些实施例的其他另外的方面中,每个R5都是被一个R6取代的C1-6烷氧基(例如,甲氧基),其中R6是芳基(例如,苯基)。
在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现两次的R5取代的芳烷基(例如,苄基)。在这些实施例的另外的方面中,每个R5都是C1-6烷氧基(例如,甲氧基)。在这些实施例的其他另外的方面中,两个R5是卤素(例如,氟)并且另两个R5是卤代烷基(例如,三氟甲基)。在这些实施例的其他另外的方面中,两个R5是C1-6烷基(例如,甲基)并且两个R5是-O-C(O)-C1-6烷基(例如,-OC(O)-CH3),其中的每个都进一步被出现0次的R7取代。在这些实施例的其他另外的方面中,两个相邻的R5部分与它们附接的原子一起形成一个杂环基环,从而产生一个具有以下结构的部分:
在这些实施例的其他另外的方面中,每个R5都是卤素(例如,氟)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现3次的R5取代的芳烷基(例如,2-苯基乙基)。在这些实施例的另外的方面中,每个R5都是C1-6烷氧基(例如,甲氧基)。
在这些实施例的其他方面中,一个R4是被出现0次的R5取代的芳烷基(例如,苄基)并且另一个R4是被出现1次的R5取代的芳烷基(例如,苄基)。在这一实施例的一个另外的方面中,R5是进一步被一个R6取代的C1-6烷氧基(例如,乙氧基),其中R6是-NH2。在这些实施例的其他方面中,一个R4是被出现0次的R5取代的芳烷基(例如,苄基)并且另一个R4是被出现0次的R5取代的C1-6烷基(例如,甲基)。在这些实施例的其他方面中,一个R4是被出现0次的R5取代的C1-6烷基(例如,甲基)并且另一个R4是被出现2次的R5取代的芳烷基(例如,苄基),其中每个R5都是C1-6烷氧基(例如,甲氧基)。
在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0-3次的R5取代的环烷基烷基。在这些实施例的仍其他方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的环烷基烷基(例如,环己基甲基或3-环己基丙基)。在这些实施例的仍其他方面中,每个R4都是被出现0-3次的R5取代的杂芳烷基。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现3次的R5取代的环烷基烷基(例如,环戊基烷基),其中两次出现是氧代并且出现彼此与它们附接的原子一起形成被一个R7取代的芳基环,其中每个R7都是C1-6烷氧基(例如,甲氧基)。在这些实施例的另外的方面中,每个R4都由以下结构表示:
在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的杂芳烷基(例如,2-吡啶基甲基、3-吡啶基甲基、3-吡啶基乙基、3-苯并异噁唑基甲基、3-吲哚基甲基、5-四唑基甲基2-苯硫基甲基或2-苯硫基乙基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现一次的R5取代的杂芳烷基(例如,3-吡啶基甲基、3-吲哚基甲基或5-异噁唑基甲基)。在这些实施例的一些另外的方面中,每个R5都是C1-6烷基(例如,甲基)。在这些实施例的其他另外的方面中,每个R5都是C1-6烷氧基(例如,甲氧基)。在这些实施例的其他另外的方面中,每个R5都是卤素(例如,氯)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现2次的R5取代的杂芳烷基。在这些实施例的一些另外的方面中,每个R5都是C1-6烷基(例如,甲基)并且该杂芳烷基具有以下结构:
在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的C1-6烷基(例如,甲基、异丁基或叔戊基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现一次的R5取代的C1-6烷基(例如,异丙基或正丙基),其中R5是被出现0次的R7取代的芳基(例如,苯基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现一次的R5取代的C1-6烷基(例如,异丙基),其中R5是被出现一次的R7取代的芳氧基(例如,苯氧基),其中R7是卤素(例如,氯)。
在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的C3-7环烷基(例如,环丙基、环丁基、环戊基或环己基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现1次的R5取代的C1-6烷基(例如,甲基或乙基)。在这些实施例的另外的方面中,每个R5都是被出现0次的R7取代的芳氧基(例如,苯氧基)。在这些实施例的其他另外的方面中,每个R5都是被出现一次的R7取代的芳氧基(例如,苯氧基),其中每个R7都是C1-6烷基(例如,甲基或异丙基)。在这些实施例的其他另外的方面中,每个R5都是被出现一次的R7取代的芳氧基(例如,苯氧基),其中每个R7都是C1-6烷氧基(例如,甲氧基)。在这些实施例的其他另外的方面中,每个R5都是被出现两次的R6取代的芳氧基(例如,苯氧基),其中每个R7都是C1-6烷基(例如,甲基)。在这些实施例的其他方面中,一个R4是C1-6烷基(例如,甲基)并且另一个R4是芳烷基(例如,苄基),其中的每个都被出现0次的R5取代。
在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的杂环基烷基(例如,2-四氢吡喃基甲基、N-哌啶基乙基或5-苯并[1,3]间二氧杂环戊烯基甲基)。在这些实施例的一些另外的方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的杂环基烷基并且由以下结构表示:
在这些实施例的一些另外的方面中,每个R4都是被出现3次的R5取代的杂环基烷基(例如,2-四氢呋喃基),其中R5的两次出现是氧代并且其余一次与它们附接的原子一起形成一个芳基部分(例如,苯基)。在这些实施例的一些另外的方面中,每个R4都由以下结构表示:
在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0-3次的R5取代的环烷基(例如,环丙基、环丁基、环戊基或环己基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的环烷基(例如,环丁基、环戊基或环己基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现一次的R5取代的环烷基(例如,环丙基)。在这些实施例的一些另外的方面中,每个R5都是进一步被出现0次的R7取代的芳基(例如,苯基)。
在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0-3次的R5取代的C3-7环烯基(例如,环戊烯基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的C3-7环烯基(例如,环戊烯基)。
在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0-3次的R5取代的芳基(例如,苯基或萘基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的芳基(例如,苯基或萘基)。
在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0-3次的R5取代的杂芳基(例如,6-苯并咪唑基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现一次的R5取代的杂芳基(例如,6-苯并咪唑基)。在这些实施例的一些另外的方面中,每个R5都是C1-6烷基(例如,甲基)。
在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0-3次的R5取代的C2-6烯基(例如,丙烯基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现一次的R5取代的C2-6烯基(例如,丙烯基)。在这些实施例的一些另外的方面中,每个R5都是被出现0次的R7取代的芳基(例如,苯基)。
在一些实施例中,R1和R2各自是-N(R3a)-C(O)-N(R3)-R4,其中每个R3a和R3都是氢。在这些实施例的一些方面中,每个R4都是被出现0-3次的R5取代的芳基。在这些实施例的一些方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的芳基(例如,苯基)。在这些实施例的一些方面中,每个R4都是被出现一次的R5取代的芳基(例如,3-甲苯基或4-甲苯基)。在这些实施例的一些另外的方面中,每个R5都是C1-6烷基(例如,甲基)。在这些实施例的一些方面中,R1和R2是相同的。在这些实施例的其他方面中,R1和R2是不同的。
在一些实施例中,R1和R2各自是-N(R3a)-C(O)-N(R3)-R4,其中每个R3a都是氢并且每个R3都是C1-6烷基(例如,甲基)。在这些实施例的一些方面中,每个R4都是被出现0-3次的R5取代的芳基。在这些实施例的一些方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的芳基(例如,苯基)。
在一些实施例中,R1和R2各自是-N(R3a)-C(O)-C1-6亚烷基-N(R3)-C(O)-R4,其中每个R3a都是氢并且每个R3都是C1-6烷基(例如,甲基)。在这些实施例的一些方面中,R4是C1-6烷氧基(例如,叔丁氧基)。在这些实施例的一些方面中,R1和R2是相同的。在这些实施例的其他方面中,R1和R2是不同的。
在一些实施例中,R1和R2各自是-N(R3a)-C(O)-C1-6亚烷基-N(R3)-C(O)-R4,其中每个R3a都是氢并且每个R3都是氢。在这些实施例的一些方面中,每个R4都是C1-6烷基(例如,甲基)。在这些实施例的一些方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的芳基(例如,苯基)。在这些实施例的一些方面中,R1和R2是相同的。在这些实施例的其他方面中,R1和R2是不同的。
在一些实施例中,R1和R2各自是-N(R3)-C(O)-C1-6亚烷基-C(O)-R4,其中每个R3都是氢。在这些实施例的一些方面中,R1和R2各自是-N(H)-C(O)-CH2CH(CH3)-C(O)-R4或-N(H)-C(O)-CH2CH2CH2-C(O)-R4。在这些实施例的一些方面中,每个R4都是C1-6烷氧基(例如,乙氧基)。在这些实施例的一些方面中,R1和R2各自是-N(H)-C(O)-CH2CH2CH2CH2-C(O)-R4。在这些实施例的一些方面中,每个R4都是C1-6烷基(例如,甲基)。在这些实施例的一些方面中,R1和R2各自是-N(H)-C(O)-CH2CH2-C(O)-R4或-N(H)-C(O)-CH(CH3)CH2-C(O)-R4。在这些实施例的一些方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的芳基(例如,苯基)。在这些实施例的一些方面中,R1和R2是相同的。在这些实施例的其他方面中,R1和R2是不同的。
在一些实施例中,R1和R2各自是-N(R3)-C(O)O-R4,其中每个R3都是氢。在这些实施例的一些方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的芳基(例如,苯基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的环烷基(例如,环己基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的C1-6烷基(例如,异丙基、异丁基或叔丁基)。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是被出现0次的R5取代的芳烷基(例如,苄基)。在这些实施例的一些方面中,R1和R2是相同的。在这些实施例的其他方面中,R1和R2是不同的。
在一些实施例中,R1是-N(R3)-C(O)-R4,其中R3是氢并且R4是被出现一次的R5取代的芳烷基(例如,苯乙基)并且R2是-N(R3)R4,其中R3和R4都是氢。在这些实施例的一些方面中,R5是-OH。
在一些实施例中,具有式(I)的化合物由一种具有式(II)的化合物表示:
其中R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、m、n以及X如在式(I)中所定义。
在一些实施例中,具有式(I)的化合物由一种具有式(IIa)的化合物表示:
其中R1、R2、R3、R4、R5、R6、o、p、m、n以及X如在式(I)中所定义。
在一些实施例中,具有式(I)的化合物由一种具有式(IIb)的化合物表示:
其中R1、R2、R3、R4、R5、R6、o、p、m、n以及X如在式(I)中所定义。
在一些实施例中,具有式(I)的化合物由一种具有式(III)的化合物表示:
其中R4、R6、m、n以及X如在式(I)中所定义。在这些实施例的一些方面中,每个R4都是相同的。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是不同的。
在一些实施例中,具有式(I)的化合物由一种具有式(IIIa)的化合物表示:
其中R4、R6、m、n以及X如在式(I)中所定义。在这些实施例的一些方面中,每个R4都是相同的。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是不同的。
在一些实施例中,具有式(I)的化合物由一种具有式(IIIb)的化合物表示:
其中R4、R6、m、n以及X如在式(I)中所定义。在这些实施例的一些方面中,每个R4都是相同的。在这些实施例的其他方面中,每个R4都是不同的。在某些实施例中,具有式I的示例性化合物包括表1中和实例中所描述的化合物。可以例如通过如实例中所描述的测定来测试在此描述的化合物抑制谷氨酰胺酶的能力。为简单起见,这些化合物的抑制活性是以表1中在实例A或实例B的测定中所测试的IC50值表示。示例性化合物示于下表1中。如所示,“A”是指IC50<100nM的谷氨酰胺酶抑制剂。“B”是指IC50值介于100nM与500nM之间的谷氨酰胺酶抑制剂。“C”是指IC50值介于500nM与1000nM之间的谷氨酰胺酶抑制剂。“D”是指IC50值介于1M与10M之间的谷氨酰胺酶抑制剂。“E”是指不可用的数据。
表1
在此描述的化合物可以使用多种合成技术(如在此提供的实例中所描述的那些)制造。如熟练的业内人士所能理解的,合成在此的具有这些式的化合物的方法对于本领域的普通技术人员将是明显的。另外,不同合成步骤可以按交替顺序或次序进行,以得到所希望的化合物。适用于合成在此描述的化合物的合成化学转化和保护基方法(保护和脱保护)在本领域中是已知的,并且例如包括如以下文献中所描述的那些:R.拉罗克(R.Larock),有机官能团转换大全(ComprehensiveOrganicTransformations),VCH出版社(1989);T.W.格里尼(T.W.Greene)和P.G.M.伍兹(P.G.M.Wuts),有机合成中的保护基(ProtectiveGroupsinOrganicSynthesis),第2版,约翰威立父子公司(JohnWileyandSons)(1991);L.费舍尔(L.Fieser)和M.费舍尔(M.Fieser),费舍尔与费舍尔有机合成试剂(FieserandFieser'sReagentsforOrganicSynthesis),约翰威立父子公司(1994);以及L.帕奎特(L.Paquette)编,有机合成试剂百科全书(EncyclopediaofReagentsforOrganicSynthesis),约翰威立父子公司(1995)及其后续版本。
在此提供的化合物可以包含一个或多个不对称中心,并且因此以外消旋物和外消旋混合物、单一对映异构体、个别非对映异构体以及非对映异构体混合物的形式存在。这些化合物的所有此类异构形式都明确地包括在范围内。除非另外指示,否则当一种化合物是通过一种结构来命名或描绘而未指明立体化学,并且具有一个或多个手性中心时,应理解为表示该化合物的所有可能的立体异构体。特此在此提供的化合物还可以包含可以限制键旋转(例如,由一个环或双键的存在而引起的限制)的键联(例如,碳-碳键)。因此,所有顺/反和E/Z异构体都明确地包括在内。
在此提供的化合物(例如,具有式的I化合物)还可以包含一个或多个同位素取代。例如,H可以呈任何同位素形式,包括1H、2H(D或氘)和3H(T或氚);C可以呈任何同位素形式,包括12C、13C和14C;O可以呈任何同位素形式,包括16O和18O;等等。在此提供的化合物也可以用多种互变异构形式表示,在这些情况下,明确地包括在此所描述的化合物的所有互变异构形式,即使只能表示单一互变异构形式(例如,环***的烷基化可以导致多个位点的烷基化;所有这些反应产物都明确地包括在内)。这些化合物的所有这些异构形式都明确地包括在内。在此描述的化合物的所有结晶形式都明确地包括在内。
在此提供的化合物包括这些化合物本身,以及其盐和其前药(如果合适的话)。举例来说,可以于在此描述的化合物上的阴离子与带正电的取代基(例如氨基)之间形成盐。适合的阴离子包括氯离子、溴离子、碘离子、硫酸根、硝酸根、磷酸根、柠檬酸根、甲烷磺酸根、三氟乙酸根及乙酸根。同样,也可以于在此描述的化合物上的阳离子与带负电的取代基(例如羧酸根)之间形成盐。适合的阳离子包括钠离子、钾离子、镁离子、钙离子,及铵阳离子,如三甲基铵离子。前药的实例包括酯和其他药学上可接受的衍生物,它们在给予一位受试者后能够提供活性化合物。
在此提供的化合物可以通过附加适当官能团以增强所选生物性质(例如,靶向一种特定组织)来进行修饰。此类修饰在本领域中是已知的并且包括了增加进入一个给定的生物区室(例如,血液、淋巴***、中枢神经***)中的生物渗透性、增加口服生物利用度、增加溶解度以允许通过注射给药、改变代谢以及改变***速率的那些。
在一个替代性实施例中,在此描述的化合物可以用作平台或骨架,这些平台或骨架可以被用于组合化学技术中以制备化合物的衍生物和/或化合物库。此类化合物衍生物和化合物库具有生物活性并且适用于鉴别并且设计多种具有特定活性的化合物。适合于利用在此描述的化合物的组合技术在本领域中是已知的,如奥博瑞特D.(Obrecht,D.)和维拉古度J.M.(Villalgrodo,J.M.),小分子量化合物库的固体支撑的组合与平行合成(Solid-SupportedCombinatorialandParallelSynthesisofSmall-Molecular-WeightCompoundLibraries),派格蒙-爱思唯尔科技有限公司(Pergamon-ElsevierScienceLimited)(1998)所举例说明的,并且包括如“拆分与合并(splitandpool)”或“平行”合成技术、固相和溶液相技术,以及编码技术(参看例如,克扎尼克A.W.(Czarnik,A.W.),化学生物学新见(Curr.Opin.Chem.Bio.),(1997)1,60)等那些。因此,一个实施例涉及一种使用在此描述的化合物产生衍生物或化合物库的方法,该方法包括:1)提供一种主体,该主体包括多个孔;2)将一种或多种通过在此描述的方法鉴别的化合物提供于每一个孔中;3)将另外的一种或多种化学品提供于每一个孔中;4)从每一个孔分离出所得到的一种或多种产物。一个替代性实施例涉及一种使用在此描述的化合物产生衍生物或化合物库的方法,该方法包括:1)提供一种或多种连接到固体支撑物的在此描述的化合物;2)用一种或多种另外的化学品处理该一种或多种连接到固体支撑物的通过在此描述的方法鉴别的化合物;3)从该固体支撑物分离出所得到的一种或多种产物。在以上描述的方法中,可以将“标签”或标识符或标记部分连接到在此描述的化合物或其衍生物和/或从在此描述的化合物或其衍生物分离,以促进所希望的产物或其中间物的追踪、鉴别或分离。这些部分在本领域中是已知的。以上提到的方法中所使用的化学品可以包括例如溶剂、试剂、催化剂、保护基及脱保护基试剂等等。此类化学品的实例是在此所提及的不同合成和保护基化学课本和论文中出现的那些。
定义
术语“卤素(halo)”或“卤素(halogen)”是指氟、氯、溴或碘中的任何基团。
术语“烷基”是指可以是包含指定数目的碳原子的直链或支链的烃链。例如,C1-C12烷基表示该基团中可以具有1到12个(包括端值)碳原子。术语“烷基”包括在烃链中包含不饱和度的烯基。术语“卤代烷基”是指其中一个或多个氢原子被卤基置换的烷基,并且包括其中所有的氢已经被卤基置换的烷基部分(例如全氟烷基)。术语“芳基烷基”或“芳烷基”是指其中烷基氢原子被芳基置换的烷基部分。芳烷基包括其中一个以上氢原子已经被芳基置换的基团。“芳基烷基”或“芳烷基”的实例包括苄基、2-苯基乙基、3-苯基丙基、9-芴基、二苯甲基以及三苯甲基。
术语“亚烷基”或“环亚烷基”是指二价烷基或环烷基,例如-CH2-、-CH2CH2-和-CH2CH2CH2-。
术语“烷氧基”是指-O-烷基。术语“卤代烷氧基”是指一个或多个氢原子被卤素置换的烷氧基,并且包括所有的氢已经被卤素置换的烷氧基部分(例如,全氟烷氧基)。
术语“芳基”是指一种单环、双环或三环芳香烃环***,其中能够取代的任何环原子都可以被取代(例如,被一个或多个取代基取代)。芳基部分的实例包括但不限于,苯基、萘基及蒽基。除非另外说明,否则芳基中的任一环原子可以被一个或多个取代基取代。
如在此所采用的术语“环烷基”包括具有3至12个碳的环状、双环、三环或多环的非芳香烃基团。任何可取代的环原子都可以被取代(例如,被一个或多个取代基取代)。术语“环烷基”包括在环中包含不饱和度的环烯基。环烷基可以包含稠合环或螺环。稠合环是共有一个共用碳原子的环。环烷基部分的实例包括(但不限于)环丙基、环己基、甲基环己基、金刚烷基以及降冰片基。
如在此所采用的术语“环烷基烷基”是指被一个环烷基取代的烷基。
术语“杂环基”或“杂环基团”是指3-到14-元非芳香族环结构(例如,3-到14-元环,更优选为3-到7-元环),其环结构包括一个到四个独立地选自O、N及S的杂原子。杂环基或杂环基团可以包含稠合环或螺环。杂环还可以是多环,其中每一个基团具有例如5-7个环成员。术语“杂环基”或“杂环基团”包括了饱和的和部分饱和的杂环基结构。该杂原子可以任选地是杂环基取代基的连接点。
术语“杂芳基”是指具有1-3个环杂原子(如果是单环的)、1-6个环杂原子(如果是双环的)或1-9个环杂原子(如果是三环的)的5-14元(即,5-8元单环的、8-12元双环的或11-14元三环的)芳香族环***,所述环杂原子独立地选自O、N及S(例如,如果是单环、双环或三环的,那么对应地有1-3个、1-6个或1-9个环杂原子N、O或S)。任何可取代的环原子都可以被取代(例如,被一个或多个取代基取代)。
包含一个或多个杂原子以及芳香族与非芳香族环两者(其中从环***到分子其余部分的连接点是通过一个非芳香族环)的双环和三环的环***被认为是杂环基。芳基或杂芳基与环烷基或杂环基稠合并且从环***到分子其余部分的连接点是通过一个芳香族环的双环或三环的环***被认为是芳基或杂芳基。
如在此所使用的术语“杂环烷基”是指被一个杂环基团取代的烷基。
如在此所使用的术语“杂芳烷基(hetaralkyl/heteroaralkyl)”是指被杂芳基取代的烷基。在此提供的化合物的环杂原子包括N-O、S(O)及S(O)2。
芳基、杂芳基、环烷基以及杂环基,无论是单独的还是作为一个基团的一部分(例如,芳烷基的芳基部分),都任选地在一个或多个可取代的原子处被取代基取代,除非另外指明,否则这些取代基独立地选自:卤素、-C≡N、C1-C4烷基、=O、-ORb、-ORb’、-SRb、-SRb’、-(C1-C4烷基)-N(Rb)(Rb)、-(C1-C4烷基)-N(Rb)(Rb’)、-N(Rb)(Rb)、-N(Rb)(Rb’)、-O-(C1-C4烷基)-N(Rb)(Rb)、-O-(C1-C4烷基)-N(Rb)(Rb’)、-(C1-C4烷基)-O-(C1-C4烷基)-N(Rb)(Rb)、-(C1-C4烷基)-O-(C1-C4烷基)-N(Rb)(Rb’)、-C(O)-N(Rb)(Rb)、-(C1-C4烷基)-C(O)-N(Rb)(Rb)、-(C1-C4烷基)-C(O)-N(Rb)(Rb’)、-ORb’、Rb’、-C(O)(C1-C4烷基)、-C(O)Rb’、-C(O)N(Rb’)(Rb)、-N(Rb)C(O)(Rb)、-N(Rb)C(O)(Rb’)、-N(Rb)SO2(Rb)、-SO2N(Rb)(Rb)、-N(Rb)SO2(Rb’)以及-SO2N(Rb)(Rb’),其中任何烷基取代基任选地进一步被-OH、-O-(C1-C4烷基)、卤素、-NH2、-NH(C1-C4烷基)或-N(C1-C4烷基)2中的一个或多个取代;
每个Rb都独立地选自氢和-C1-C4烷基;或
两个Rb与它们键结的氮原子一起形成一个4-至8-元杂环基,该杂环基任选地包含一个选自N、S和O的另外的杂原子;并且
每个Rb’都独立地选自C3-C7碳环基、苯基、杂芳基以及杂环基,其中所述苯基、环烷基、杂芳基或杂环取代基上的一个或多个可取代的位置任选地进一步被-(C1-C4烷基)、-(C1-C4氟烷基)、-OH、-O-(C1-C4烷基)、-O-(C1-C4氟烷基)、卤素、-NH2、-NH(C1-C4烷基)或-N(C1-C4烷基)2中的一个或多个取代。
杂环基,无论是单独的还是作为一个基团的一部分,都任选地在一个或多个任何可取代的氮原子上被氧代(=O)、-C1-C4烷基或氟-取代的C1-C4烷基取代。
术语“被取代”是指一个氢原子被另一个基团置换。
术语“选择性的”意思指针对谷氨酰胺酶的抑制作用比其他目标高出至少2倍、3倍、4倍、5倍、6倍或10倍。
如在此所使用的术语“抑制剂”意思指使谷氨酰胺酶的酶促活性可测量地减慢、停止、降低或失活以降低到低于谷氨酰胺酶正常活性水平的水平的一种药剂。谷氨酰胺酶抑制剂可以是肽或核酸(例如谷氨酸)。一种药剂可以通过直接或间接地测量谷氨酰胺酶在经受该试剂时的活性来进行评估以确定它是否为一种抑制剂。该药剂的活性可以例如针对一种对照物质进行测量。在一些情况下,该药剂的被测量的活性是针对谷氨酰胺酶的抑制作用。
术语“获取(Acquire)”或“获取了(acquiring)”当在此使用时是指通过“直接地获取”或“间接地获取”一个物理实体或一个值来获得对该物理实体或该值(例如数字值)的所有权。“直接地获取”意思指执行一种过程(例如,执行一种合成或分析方法)来获得该物理实体或值。“间接地获取”是指从另一方或来源(例如直接地获取该物理实体或值的一个第三方实验室)接收该物理实体或值。直接地获取一个物理实体包括了执行一种过程,该过程包括一种物理物质(例如,一种起始物质)的物理变化。示例性变化包括了由两种或更多种起始物质制造一个物理实体;对一种物质进行剪切或***;分离或纯化一种物质;将两个或更多个单独的实体组合成一种混合物;执行一种化学反应,该化学反应包括了断裂或形成一个共价或非共价键。直接地获取一个值包括了执行一种包括一种样品或另一种物质的物理变化的过程,例如执行一种包括一种物质(例如一种样品、分析物或试剂)的物理变化的分析过程(在此有时称为“物理分析”),执行一种分析方法,例如包括了以下各项中的一种或多种的一种方法:从另一种物质分离或纯化一种物质,例如一种分析物,或一个片段,或它的其他衍生物;将一种分析物或片段或它的其他衍生物与另一种物质(例如一种缓冲液、溶剂或反应物)组合;或改变一种分析物或一个片段或它的其他衍生物的结构,例如通过在该分析物的第一与第二原子之间断裂或形成一个共价或非共价键;或通过改变一种试剂或一个片段或它的其他衍生物的结构,例如通过在该试剂的第一与第二原子之间断裂或形成一个共价或非共价键。
术语“获取一个样品”当在此使用时是指通过“直接地获取”或“间接地获取”一个样品(例如一个组织样品或核酸样品)来获得该样品的所有权。“直接地获取一个样品”意思指执行一种过程(例如,执行一种物理方法,如一项手术或提取)来获得该样品。“间接地获取一个样品”是指从另一方或来源(例如直接地获取该样品的一个第三方实验室)接收该样品。直接地获取一个样品包括了执行一种过程,该过程包括一种物理物质的物理变化,该物理物质例如为一种起始物质,如一种组织,例如人类患者中的一种组织或预先从患者分离的一种组织。示例性变化包括了由一种起始物质制造一个物理实体;解剖或刮下一种组织;分离或纯化一种物质(例如一个样品组织或一个核酸样品);将两个或更多个单独的实体组合成一种混合物;执行一种化学反应,该化学反应包括了断裂或形成一个共价或非共价键。直接地获取一个样品包括了执行一种过程,该过程包括一种样品或另一种物质的物理变化,例如,如以上所描述的。
如在此所使用,与一种参考标准相比“较低”的E-钙粘素的表达是指与E-钙粘素在上皮细胞中的表达水平相比较低、降低或不存在E-钙粘素的表达水平,如由本领域中已知的方法,例如以下文献中的任一种上所表征的:(约克(Yauch)等人,(2005)临床癌症研究(ClinCancerRes)11:24;撒瓦格纳(Savagner)等人,(2010)肿瘤学年鉴(AnnOncol.)21(增刊7):vii89;泰瑞(Thiery)等人,(2002)自然评述-癌症(NatureReviewsCancer)2(6):442)。
如在此所使用,与一种参考标准相比“较高”的波形蛋白的水平是指与波形蛋白在上皮细胞中的表达水平相比较高或增加的波形蛋白的表达水平,如由本领域中已知的方法,例如以下文献中的任一种上所表征的:(约克等人,(2005)临床癌症研究,11:24;撒瓦格纳等人,(2010)肿瘤学年鉴,21(增刊7):vii89;泰瑞等人,(2002)自然评述-癌症,2(6):442)。
如在此所使用,与一种参考标准相比“较低”或“降低”的丙酮酸羧化酶的表达水平是指与E-钙粘素在上皮细胞中的表达水平相比较低、降低或不存在E-钙粘素的表达水平如由本领域中已知的方法,例如以下文献中的任一种上所表征的:(约克等人,(2005)临床癌症研究,11:24;撒瓦格纳等人,(2010)肿瘤学年鉴,21(增刊7):vii89;泰瑞等人,(2002)自然评述-癌症,2(6):442)。
如在此所使用,“癌症”与“肿瘤”是同义的术语。术语“癌症”或“肿瘤”是指具有致癌细胞的典型特征,如不受控制的增殖、永生、有转移可能、较快的生长和增殖速率以及某些特征性形态特征的细胞的存在。癌细胞经常呈肿瘤的形式,但这些细胞可以单独存在于动物体内,或可以是一种非致瘤性癌细胞,如白血病细胞。这些细胞可以具有间充质细胞的典型特征,如以下文献中的任一种上所表征的:(约克等人,(2005)临床癌症研究,11:24;撒瓦格纳等人,(2010)肿瘤学年鉴,21(增刊7):vii89;泰瑞等人,(2002)自然评述-癌症,2(6):442)。
缩写Me、Et、Ph、Tf、Nf、Ts、Ms对应地表示甲基、乙基、苯基、三氟甲烷磺酰基、九氟丁烷磺酰基、对甲苯磺酰基及甲烷磺酰基。本领域中有普通技能的有机化学家所利用的缩写的更全面的清单见于有机化学杂志(JournalofOrganicChemistry)每一卷的第一期中;此清单典型地呈现在题为标准缩写清单(StandardListofAbbreviations)的表格中。所述清单中所含的缩写以及本领域中有普通技能的有机化学家所利用的所有缩写都通过引用结合在此。
评估化合物的方法
谷氨酰胺酶活性可以通过检测反应产物谷氨酸或氨的产量来监测。在一些实施例中,测量谷氨酸的产量,因为氨是多种生物反应的产物。
谷氨酸产量可以通过本领域中已知的多种标准方法中的任一种来测量,例如化学和色谱检测方法,以及利用NADH和谷氨酸脱氢酶的偶联酶测定。细胞外谷氨酸浓度也可以在体内使用本领域中已知的微透析方法来测量。用于测量谷氨酸的一种适合的方法是一种基于微量滴定的两步骤测定,在该测定中,通过谷氨酸脱氢酶使初始步骤中形成的谷氨酸定量地脱氨基,得到一当量的NADH(古德弗雷(Godfrey)等人,1977;科瓦米(Kvamme)等人,1985),随后可以用分光光度法进行检测。
治疗方法
在一个实施例中,提供了一种用于治疗或预防如在此所描述(例如治疗)的疾病、病状或病症的方法,该方法包括了给予一种化合物、一种化合物的药学上可接受的盐或包含在此描述的化合物(例如,式(I)或表1中的化合物)的药物组合物。
在此描述的化合物和组合物可以被给予例如在体外或离体培养的细胞,或例如在体内给予一名位受试者,以治疗、预防和/或诊断多种病症,包括在以下描述的那些。
如在此所使用,术语“治疗(treat/treatment)”定义为将单独或与一种第二化合物组合的一种化合物施用于或给予受试者,例如患者;或者将该化合物施用于或给予从患有病症(例如,如在此描述的病症)、具有病症的症状或有患病症的倾向的受试者(例如患者)分离的组织或细胞,例如细胞系,以达到治愈、医治、减轻、缓解、改变、矫正、改善、改良或影响该病症、该病症的一种或多种症状或患该病症的倾向(例如,以预防该病症的至少一种症状或延缓该病症的至少一种症状的发作)的目的。
如在此所使用,化合物的可有效治疗一种病症的量或“治疗有效量”是指在向一个受试者给予单剂量或多剂量之后,该化合物超过在不存在这一治疗的情况下所期待的,可有效治疗细胞或治愈、缓和、缓解或改善患有一种病症的受试者的量。
如在此所使用,有效预防病症的化合物的量,或化合物的“预防有效量”是指在给予受试者单次或多次剂量后有效预防或延缓一种病症或该病症的症状的发作或复发的出现的量。
术语“患者”与“受试者”是同义的,并且如在此所使用,是指将成为或已经成为治疗、观察和/或实验的对象的一种动物,典型地为人类(即,任何年龄群的男性或女性,例如儿科患者或成年患者),或其他哺乳动物,如灵长类动物(例如食蟹猴、恒河猴);商业上相关的哺乳动物,如牛、猪、马、绵羊、山羊、猫和/或狗;和/或鸟类,包括商业上相关的鸟类,如鸡、鸭、鹅和/或火鸡。当该术语结合一种化合物或药物的给予来使用时,则该患者已经成为治疗、观察和/或给予该化合物或药物的对象。
癌症
在此描述的方法可以用于任何癌症,例如国立癌症研究所(NationalCancerInstitute)所描述的那些。可以对一种癌症进行评估以确定它是否使用在此描述的方法。示例性癌症可以包括但不限于,肺癌,例如非小细胞肺癌;乳腺癌,例如三阴性乳腺癌;或肝细胞癌、骨肉瘤、脂肪瘤、软骨肉瘤或间皮瘤。在一些实施例中,该癌症选自结肠癌、肾细胞癌、急性骨髓性白血病(AML)、黑色素瘤及多发性骨髓瘤。
该癌症可以是一种原发性肿瘤,即,位于肿瘤生长起始的解剖学部位处。该癌症还可以是转移的,即,除肿瘤生长起始的解剖学部位外,至少出现在一个第二解剖学部位。该癌症可以是一种复发性癌症,即,在治疗后以及在该癌症检测不到的一段时间之后重现的癌症。复发性癌症可以在解剖学上局部地定位于原始肿瘤,例如在解剖学上靠近原始肿瘤;区域性地定位于原始肿瘤,例如在位于原始肿瘤附近的***中;或定位于原始肿瘤的远端,例如在解剖学上位于远离原始肿瘤的区域中。
癌症联合疗法
在一些实施例中,在此描述的化合物是与一种或多种另外的癌症治疗一起给予。示例性癌症治疗包括例如:化学疗法、靶向疗法(如抗体疗法)、免疫疗法及激素疗法。这些治疗中的每一种的实例提供在下文中。
化学疗法
在一些实施例中,在此描述的化合物与一种或多种化疗一起给予。化学疗法是用可以破坏癌细胞的药物进行的癌症治疗。“化学疗法”常常是指总体上影响快速地***的细胞的细胞毒性药物,与靶向疗法形成对比。化学疗法药物以不同的可能方式干扰细胞***,例如干扰DNA的复制或新形成的染色体的分离。化学疗法的大多数形式都靶向所有快速地***的细胞,并且对于癌细胞没有特异性,不过某种程度的特异性可能来自于许多癌细胞不能修复DNA损害,而正常细胞总体上可以。
癌症疗法中使用的化学治疗剂的实例包括例如抗代谢物类(例如,叶酸、嘌呤及嘧啶衍生物)及烷基化剂类(例如,氮芥类、亚硝基脲类、铂、磺酸烷基酯类、肼类、三氮烯类、氮丙啶类、纺锤体毒剂、细胞毒性剂类、拓扑异构酶抑制剂类及其他)。示例性药剂包括阿柔比星、放线菌素、阿利维甲酸(Alitretinon)、六甲密胺、氨基蝶呤、氨基酮戊酸、氨柔比星、安吖啶、阿那格雷、三氧化二砷、天冬酰胺酶、阿曲生坦、贝洛替康、蓓萨罗丁、苯达莫司汀、博来霉素、硼替佐米、白消安、喜树碱、卡培他滨、卡铂、卡波醌、卡莫氟、卡莫司汀、塞来昔布、苯丁酸氮芥、氮芥、顺铂、克拉屈滨、氯法拉滨、克立他酶、环磷酰胺、阿糖胞苷、达卡巴嗪、更生霉素、道诺霉素、地西他滨、秋水仙胺、多烯紫杉醇、多柔比星、乙丙昔罗、伊利司莫、依沙芦星、依诺他滨、表柔比星、雌莫司汀、依托格鲁、依托泊苷、氟尿苷氟达拉滨、氟尿嘧啶(5FU)、福莫司汀、吉西他宾、格立得植入剂、羟基脲(Hydroxycarbamide)、羟基脲(Hydroxyurea)、伊达比星、异环磷酰胺、伊立替康、伊洛福芬、伊沙匹隆、拉洛他赛、亚叶酸、多柔比星脂质体、道诺霉素脂质体、氯尼达明、洛莫司汀、硫蒽酮、甘露舒凡、马索罗酚、美法仑、巯基嘌呤、美司钠、甲氨蝶呤、氨基酮戊酸甲酯、二溴甘露醇、米托胍腙、米托坦、丝裂霉素、米托蒽醌、奈达铂、尼莫司汀、奥利默森、奥马西他辛、脱氢雌马酚、奥沙利铂、太平洋紫杉醇、培门冬酶、培美曲塞、喷司他丁、比柔比星、匹杉琼、普卡霉素、卟吩姆钠、泼尼莫司汀、丙卡巴肼、雷替曲赛、雷诺莫司汀、鲁比替康、沙帕他滨、司莫司汀、塞西马集、赛特铂、链佐星、他拉泊芬、替加氟-尿嘧啶、替莫泊芬、替莫唑胺、替尼泊苷、替司他赛、睾内酯、四硝酸酯、塞替派、噻唑呋林、硫鸟嘌呤、替吡法呢、拓扑替康、曲贝替定、三亚胺醌、三亚乙基密胺、三合铂、维甲酸、曲奥舒凡、曲磷胺、乌拉莫司汀、伐柔比星、维替泊芬n、长春花碱、长春新碱、长春地辛、长春氟宁、长春瑞宾、伏立诺他、左柔比星及在此描述的其他细胞抑制剂或细胞毒性剂。
因为一些药物一起比单独更好地起作用,所以通常同时给予两种或更多种药物。通常,使用两种或更多种化学疗法药剂作为组合化学疗法。在一些实施例中,化学疗法药剂(包括组合化学疗法)可以与在此描述的化合物组合使用。
靶向疗法
在一些实施例中,在此描述的化合物是与一种或多种靶向疗法一起给予。靶向疗法构成了对针对癌细胞的失调蛋白质具有特异性的药剂的使用。小分子靶向疗法药物通常是癌细胞内的突变、过度表达或在其他方面关键的蛋白质的酶域的抑制剂。突出的实例是酪氨酸激酶抑制剂,如阿西替尼、博舒替尼、西地尼布、达沙替尼、尔洛替尼、伊马替尼、吉非替尼、拉帕替尼、来他替尼、尼勒替尼、司马沙尼、索拉非尼、舒尼替尼及凡德他尼,以及周期素依赖性激酶抑制剂,如阿伏昔地和塞立西布(Seliciclib)。单克隆抗体疗法是另一种策略,其中治疗剂是特异性结合到癌细胞表面的蛋白质上的一种抗体。实例包括典型地用于乳腺癌的抗HER2/neu抗体曲妥珠单抗()以及典型地用于多种B细胞恶性病的抗CD20抗体利妥昔单抗和托西莫单抗。其他示例性抗体包括西妥昔单抗、帕尼单抗、曲妥珠单抗、阿来组单抗、贝伐单抗、依决洛单抗及吉妥单抗。示例性融合蛋白包括阿柏西普和地尼白介素。在一些实施例中,靶向疗法可与在此描述的化合物组合使用。
示例性另外的治疗剂还可以包括表皮生长因子受体(EGFR)抑制剂,例如西妥昔单抗、帕尼单抗、吉非替尼、厄洛替尼、尼妥珠单抗、马妥珠单抗、扎芦木单抗或拉帕替尼。针对EGFR抑制剂的抗性可以因细胞转变成间充质表型或间充质表型而发生,并且具有EGFR突变和间充质表型的肿瘤可能对于EGFR抑制剂具有更低敏感性(参看例如,塞奎斯特(Sequist)等人,(2011)科学-转化医学(SciTranslMed.)3:75;布克(Buck)等人,(2007)分子癌症治疗学(MolCancerTher.)6:532;辛普森(Thomson)等人,(2008)临床与实验转移(ClinExpMetastasis)25:843)。
示例性另外的治疗剂还可以包括谷胱甘肽消耗剂,例如L-丁硫氨酸-(S,R)-亚砜亚胺(BSO)。
示例性另外的治疗剂还可以包括磷酸肌醇3-激酶(PI3K)抑制剂,例如哌立福辛、德拉西布(Idelalisib)、BKM120、PX-866、IPI-145、NVP-BEZ235、GDC0941及BAY80-6946。
示例性另外的治疗剂还可以包括热休克蛋白90(HSP90)抑制剂,例如苯醌安莎霉素、根赤壳菌素、17-N-烯丙基氨基-17-脱甲氧基苯醌安莎霉素(17AAG)、格尼替布(ganetespib)、4-(4-(2,3-二氢-1,4-苯并二氧杂环己烯-6-基)-5-甲基-1H-吡唑-3-基)-6-乙基间苯二酚、AUY922(NVP-AUY922)、BIIB021、STA9090、AT13387、NVP-BEP800及SNX-2112(PF-04928473)。
靶向疗法还可以涉及小肽作为“归巢装置”,所述小肽可以结合到细胞表面受体或肿瘤周围的受到感染的胞外基质。如果核素在细胞附近衰变,那么连接到这些肽(例如RGD)的放射性核素最终杀死癌细胞。这种疗法的一个实例包括
免疫疗法
在一些实施例中,在此描述的化合物是与一种或多种免疫疗法一起给予。癌症免疫疗法是指被设计用于诱导患者自身的免疫***对抗肿瘤的一组多样的治疗策略。用于产生针对肿瘤的免疫反应的同期方法包括了用于表浅膀胱癌的囊内BCG免疫疗法,以及使用干扰素和其他细胞因子在肾细胞癌和黑色素瘤患者中诱导免疫反应。
同种异体造血干细胞移植可以视为免疫疗法的一种形式,因为供体的免疫细胞通常将以一种移植物抗肿瘤作用攻击肿瘤。在一些实施例中,免疫疗法药剂可以与在此描述的化合物组合使用。
激素疗法
在一些实施例中,在此描述的化合物是与一种或多种激素疗法一起给予。一些癌症的生长可以通过提供或阻断某些激素来抑制。激素敏感性肿瘤的常见实例包括某些类型的乳癌和***癌。去除或阻断***或睾酮经常是一种重要的附加治疗。在某些癌症中,给予激素激动剂(如孕激素)可以是治疗有益的。在一些实施例中,激素疗法药剂可以与在此描述的化合物组合使用。
养分限制性饮食
在一些实施例中,在此描述的化合物是与一种或多种养分限制性饮食结合给予。由于癌细胞依靠葡萄糖来产生细胞能量,故通过限制碳水化合物和蛋白质来降低葡萄糖血液含量可以抑制一些癌症的生长。在某些癌症中,养分限制性饮食,如热量限制、禁食及生酮饮食,可能在治疗上有益。在一些实施例中,这种养分限制性饮食可以与在此描述的化合物组合使用。
神经元病症
在此描述的化合物或组合物可以用于治疗或预防由神经元组织损伤(例如,暴露于缺血或缺氧事件、外伤或慢性神经退行性病症的神经组织)引起的神经元细胞死亡。“神经元病症”是与谷氨酸兴奋性毒性相关的一种神经疾病或病症,例如由如中风或缺血事件等神经事件引起的脑缺血或缺氧。用该化合物进行的治疗可以是有效提供神经保护作用,例如防止神经元细胞死亡的量。
组合物和给药途径
在此叙述的组合物包括在此叙述的化合物(例如在此描述的化合物),以及另外的治疗剂(如果存在的话),其量有效用于实现疾病或疾病症状(包括在此描述的那些)的调节。
术语“药学上可接受的载体或佐剂”是指可以与特此在此提供的化合物一起给予受试者的一种载体或佐剂,并且该载体或佐剂不会损害其药理学活性并且当以足以递送治疗量的化合物的剂量给予时无毒。
可以用于特此在此提供的药物组合物中的药学上可接受的载体、佐剂或媒剂包括但不限于,离子交换剂;氧化铝;硬脂酸铝;卵磷脂;自乳化药物递送***(SEDDS),如d-α-生育酚聚乙二醇1000琥珀酸酯;用于药物剂型中的表面活性剂,如吐温系列(Tweens)或其他类似的聚合物递送基质;血清蛋白,如人血清白蛋白;缓冲物质,如磷酸盐;甘氨酸、山梨酸、山梨酸钾、饱和植物脂肪酸的偏甘油酯混合物、水、盐或电解质,如硫酸鱼精蛋白、磷酸氢二钠、磷酸氢钾、氯化钠、锌盐、胶状二氧化硅、三硅酸镁;聚乙烯吡咯烷酮、基于纤维素的物质、聚乙二醇、羧甲基纤维素钠、聚丙烯酯、蜡、聚乙烯-聚氧化丙烯嵌段聚合物、聚乙二醇及羊毛脂。环糊精(如α-、β-和γ-环糊精),或化学修饰衍生物(如羟基烷基环糊精,包括2-以及3-羟基丙基-β-环糊精),或其他溶解衍生物也可以有利地用于增强在此描述的式的化合物的递送。
特此在此提供的药物组合物可以经口、肠胃外、通过吸入喷雾、局部地、经直肠、经鼻、经颊、经***或经由植入式储槽给予,优选地通过经口给予或通过注射给予。特此在此提供的药物组合物可以包含任何常规的无毒药学上可接受的载体、佐剂或媒剂。在一些情形中,配制品的pH值可以用药学上可接受的酸、碱或缓冲液进行调整,以增强所配制的化合物或其递送形式的稳定性。如在此所使用的术语肠胃外包括皮下、皮内、静脉内、肌肉内、关节内、动脉内、滑膜内、胸骨内、鞘内、病灶内及颅内注射或输注技术。
药物组合物可以呈无菌可注射制剂的形式,例如呈无菌可注射的水性或油性悬浮液的形式。这种悬浮液可以根据本领域中已知的技术,使用适合的分散或润湿剂(例如像吐温80)及悬浮剂来配制。无菌可注射制剂也可以是在无毒不经肠可接受的稀释剂或溶剂中的无菌可注射溶液或悬浮液,例如呈在1,3-丁二醇中的溶液形式。可以采用的可接受的媒剂和溶剂有甘露醇、水、林格氏溶液(Ringer'ssolution)及等渗氯化钠溶液。另外,常规地采用无菌不挥发性油作为溶剂或悬浮介质。出于这一目的,可以采用任何温和的不挥发性油,包括合成单酸甘油酯或二酸甘油酯。脂肪酸(如油酸)和其甘油酯衍生物如天然药学上可接受的油(如橄榄油或蓖麻油,尤其呈其聚氧乙基化形式)般适用于制备可注射剂。这些油溶液或悬浮液还可以包含长链醇稀释剂或分散剂,或羧甲基纤维素或常用于配制药学上可接受的剂型(如乳液和或悬浮液)的类似分散剂。出于配制的目的,还可以使用常用于制造药学上可接受的固体、液体或其他剂型的其他常用的表面活性剂,如吐温系列或斯盘系列(Spans)和/或其他类似的乳化剂或生物利用度增强剂。
特此在此提供的药物组合物可以呈任何口服可接受的剂型经口给予,该剂型包括但不限于,胶囊、片剂、乳液以及水性悬浮液、分散液及溶液。在供口服使用的片剂的情形中,常用的载体包括乳糖和玉米淀粉。典型地还添加润滑剂,如硬脂酸镁。对于以胶囊形式口服给予,有用的稀释剂包括乳糖和干燥的玉米淀粉。当经口给予水性悬浮液和/或乳液时,可以将活性成分悬浮或溶解于一种组合有乳化剂和/或悬浮剂的油相中。如果希望的话,可以添加某些甜味剂和/或调味剂和/或着色剂。
特此在此提供的药物组合物还可以呈供直肠给药的栓剂形式给予。这些组合物可以通过将特此在此提供的化合物与一种适合的无刺激性赋形剂混合来制备,该赋形剂在室温下为固体,但在直肠温度下为液体,并因此将在直肠中熔融而释放出活性组分。这些材料包括但不限于,可可脂、蜂蜡及聚乙二醇。
当所希望的治疗涉及通过局部施用可容易地接近的区域或器官时,局部给予特此在此提供的药物组合物是适用的。用于局部地施用至皮肤,应该用包含悬浮或溶解于一种载体中的活性组分的适合的软膏来配制该药物组合物。用于局部给予特此在此提供的化合物的载体包括但不限于,矿物油、液体矿脂、白矿脂、丙二醇、聚氧化乙烯聚氧化丙烯化合物、乳化蜡及水。可替代地,可以用包含活性化合物的适合的洗剂或乳膏来配制该药物组合物,该活性化合物用适合的乳化剂悬浮或溶解于载体中。合适的载体包括(但不限于)矿物油、山梨醇酐单硬脂酸酯、聚山梨醇酯60、鲸蜡酯蜡、鲸蜡硬脂醇、2-辛基十二烷醇、苄醇以及水。特此在此提供的药物组合物还可以通过直肠栓剂配制品或以一种适合的灌肠剂配制品局部地施用于下肠道。局部地透皮贴片也包括在内。
特此在此提供的药物组合物可以通过鼻用气雾剂或吸入来给予。这些组合物根据药物配制领域中众所周知的技术制备,并且可以采用苄醇或其他合适的防腐剂、增强生物可用性的吸收促进剂、碳氟化合物和/或本领域中已知的其他增溶剂或分散剂,以在生理食盐水中的溶液形式制备。
当特此在此提供的组合物包含在此描述的多个式的化合物与一种或多种另外的治疗剂或预防剂的组合时,存在的该化合物与该另外的药剂两者的剂量水平应当为单药疗法方案中通常给予的剂量的介于约1%到100%之间,更优选地介于约5%到95%之间。这些另外的药剂可以作为多剂量方案的一部分与特此在此提供的化合物分开地给予。作为替代方案,这些药剂可以作为单一剂型的一部分,与特此在此提供的化合物一起混合于单一组合物中。
在此所述的化合物可以例如通过注射、静脉内、动脉内、皮下、腹腔内、肌内或皮下;或经口、经颊、经鼻、经粘膜、局部、以一种眼用制剂形式或通过吸入,以从每千克体重约0.5到约100mg范围内的剂量,可替代地介于每剂量1mg与1000mg之间的剂量,每4到120小时,或根据特定药物的要求来给予。这些方法在此考虑了给予一个有效量的化合物或化合物组合物来获得所希望的或所陈述的效果。典型地,特此在此提供的药物组合物将每天给予从约1次到约6次,或可替代地,以连续输注来给予。这种给予可以用作慢性或急性疗法。可以与载体材料组合以生产单个剂型的活性成分的量将取决于所治疗的宿主和特定的给药模式而变化。典型的制剂将包含从约5%至约95%的活性化合物(w/w)。可替代地,这些制剂包含从约20%至约80%的活性化合物。
可能需要比上文所述的那些剂量低或高的剂量。用于任何特定患者的具体剂量和治疗方案将取决于多种因素,包括所采用的具体化合物的活性、年龄、体重、一般健康状况、性别、饮食、给药时间、***速率、药物组合、疾病、病状或症状的严重程度和病程、患者对疾病、病状或症状的处置,及治疗医师的判断。
在患者的病状改良后,如果必要,就可以给予特此在此提供的化合物、组合物或组合的维持剂量。随后,根据症状,给药的剂量或频率或两者均可以降低到某一水平,在该水平下,当症状已经缓解到所希望的水平时,所改善的病状得到保持。然而,患者可能需要针对疾病症状的任何复发进行长期的间歇式治疗。
患者选择和监测
在此描述的化合物可以抑制谷氨酰胺酶。因此,可以通过首先评估患者和/或受试者以确定该受试者是否需要抑制谷氨酰胺酶,并且如果该受试者被确定为需要谷氨酰胺酶抑制,那么向该受试者给予在此描述的化合物,来选择患者和/或受试者以使用在此描述的化合物进行治疗。
可以使用本领域中已知的方法,例如通过测量患者体内谷氨酰胺酶的存在和/或活性,将受试者评估为需要谷氨酰胺酶抑制的。在一些实施例中,对癌症中谷氨酰胺酶的活性和/或水平进行评估。
可以例如针对病状和/或不良作用的改良对接收了在此描述的化合物的患者进行监测。患者病状的改良可以例如通过监测癌症(例如肿瘤)的生长、生长的缺乏或消退来进行评估。在一些实施例中,使用放射性测定或溶血参数的评估来对患者进行评估。
可以通过以下方式来选择患者和/或受试者以使用在此描述的化合物进行治疗:任选地获取患者样品;评估该样品以确定该样品是否特征在于i)E-钙粘素的表达水平与一种参考标准相比较低与一种参考标准相比较低的E-钙粘素表达水平,ii)波形蛋白的表达水平与一种参考标准相比较高与一种参考标准相比较高的波形蛋白表达水平,和/或iii)与一种参考标准相比较低或降低的丙酮酸羧化酶的表达水平与一种参考标准相比较低或降低;并且如果确定该患者所具有与一种参考标准相比较低的E-钙粘素表达水平与一种参考标准相比较低,或波形蛋白的表达水平与一种参考标准相比较高与一种参考标准相比较高的波形蛋白表达水平,那么向该患者给予在此描述的化合物。
在一些实施例中,将E-钙粘素的表达水平与一种参考标准相比较,其中该参考标准是上皮细胞中E-钙粘素的表达水平,如以下文献中的任一种上所表征的:(约克等人,(2005)临床癌症研究,11:24;撒瓦格纳等人,(2010)肿瘤学年鉴,21(增刊7):vii89;泰瑞等人,(2002)自然评述-癌症,2(6):442)。在一些实施例中,与该参考标准相比,E-钙粘素的表达水平较低、降低或不存在。在一些实施例中,E-钙粘素的表达水平是通过对编码E-钙粘素的RNA的水平进行评估来测量。在一些实施例中,E-钙粘素的表达水平是通过E-钙粘素的蛋白质表达水平来评估。在一些实施例中,E-钙粘素的表达水平比该参考标准低至少5%、10%、15%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、80%或90%。在一些实施例中,E-钙粘素的表达水平与该参考标准相比在表达方面有至少1.5、2、5、10、15、20、25、50、75、100倍的降低。
在一些实施例中,将波形蛋白的表达水平与一种参考标准相比较,其中该参考标准是波形蛋白在上皮细胞中的表达水平,如以下参考文献中任一种上所表征的:(约克等人,(2005)临床癌症研究,11:24;撒瓦格纳等人,(2010)肿瘤学年鉴,21(增刊7):vii89;泰瑞等人,(2002)自然评述-癌症,2(6):442)。在一些实施例中,波形蛋白的表达水平是通过对编码波形蛋白的RNA的水平进行评估来测量。在一些实施例中,波形蛋白的表达水平是通过波形蛋白的蛋白质表达水平来评估。在一些实施例中,波形蛋白的表达水平比该参考标准高出至少5%、10%、15%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、80%或90%。在一些实施例中,波形蛋白的表达水平与该参考标准相比在表达方面有至少1.5、2、5、10、15、20、25、50、75、100倍的增加。
在一些实施例中,丙酮酸羧化酶的表达水平与一种参考标准相比较低或降低,其中该参考标准是丙酮酸羧化酶在上皮细胞中的表达水平,如以下参考文献中任一种上所表征的:(约克等人,(2005)临床癌症研究,11:24;撒瓦格纳等人,(2010)肿瘤学年鉴,21(增刊7):vii89;泰瑞等人,(2002)自然评述-癌症,2(6):442)。在一些实施例中,丙酮酸羧化酶的表达水平与该参考标准相比较高或增加。在一些实施例中,丙酮酸羧化酶的表达水平是通过对编码丙酮酸羧化酶的RNA的水平进行评估来测量。在一些实施例中,波形蛋白的表达水平是通过丙酮酸羧化酶的蛋白质表达水平来评估。在一些实施例中,丙酮酸羧化酶的表达水平比该参考标准高出至少5%、10%、15%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、80%或90%。在一些实施例中,丙酮酸羧化酶的表达水平与该参考标准相比在表达方面有至少1.5、2、5、10、15、20、25、50、75、100倍的增加。
患者样品
术语“患者样品”、“受试者样品”与“样品”在此可互换地使用。该患者样品可以是一种组织,或体液,或身体产物。组织样品可以包括固定的、石蜡包埋的、新鲜的或冷冻的样品。举例来说,该组织样品可以包括一种活组织检查、脸颊检查拭子。示例性组织包括肺、***、脑、神经组织、肾、卵巢、甲状腺、胰脏、结肠、***、***、皮肤、毛囊及指甲。示例性样品包括了来源于实体肿瘤的样品。示例性体液包括血液、血浆、尿液、淋巴液、泪液、汗液、唾液、***及脑脊髓液。示例性身体产物包括呼出的气体。
该组织、流体或产物可以从患者取出并进行分析。评估可以包括以下各项中的一种或多种:执行该组织、流体或产物的分析;请求该组织、流体或产物的分析;请求从该组织、流体或产物的分析得到的结果;或接收从该组织、流体或产物的分析得到的结果。
可以针对在此描述的基因(例如,E-钙粘素、波形蛋白、丙酮酸羧化酶)的表达水平来对该样品组织、流体或产物进行分析。可以针对在此描述的蛋白质(例如,E-钙粘素、波形蛋白、丙酮酸羧化酶)的表达水平来对该样品组织、流体或产物进行分析。可以针对一个预先选择的信号传导路径或表型路径(例如上皮到间充质转变路径、E-钙粘素路径、波形蛋白路径或丙酮酸羧化酶路径)的一种基因或多种基因的基因表达水平来对该样品组织、流体或产物进行进一步分析。可以针对一个预先选择的信号传导路径或表型路径(例如上皮到间充质转变路径、E-钙粘素路径、波形蛋白路径或丙酮酸羧化酶路径)的一种蛋白质或多种蛋白质的蛋白质表达水平来对该样品组织、流体或产物进行进一步分析。
评估样品的方法
在此描述的基因(例如E-钙粘素、波形蛋白及丙酮酸羧化酶)的表达水平可以使用多种众所周知的用于检测一个转录分子、基因、蛋白质、mRNA、基因组DNA或cDNA的表达的方法中的任一种来进行评价。基因表达可以通过基因转录物(例如mRNA)的测量、通过翻译的蛋白质的量的测量或通过基因产物活性的测量来进行测量或监测;其中任一种都可以使用本领域的技术人员已知的标准技术来测量。这些方法的非限制性实例包括核酸杂交法、核酸反转录法、核酸扩增法、用于蛋白质检测的免疫方法、蛋白质纯化法、蛋白质功能或活性测定。
E-钙粘素
E-钙粘素是位于人染色体16上。E-钙粘素是钙粘素超家族的一种经典的钙粘素。编码的E-钙粘素蛋白是一种钙依赖性细胞-细胞粘附糖蛋白,包含五个细胞外钙粘素重复、一个跨膜区域及一个高度保守的细胞质尾。这一基因中的突变已经与包括胃癌、乳癌、结肠直肠癌、甲状腺癌及卵巢癌在内的癌症的相关。预期E-钙粘素的功能丧失可以通过增加增殖、侵袭和/或转移而有助于癌症进展。这一蛋白质的胞外结构域介导了细菌到哺乳动物细胞的粘附,并且该细胞质结构域是内化所需要求的。鉴别的E-钙粘素转录物变异体是由共同剪接位点处的突变所引起。
波形蛋白
波形蛋白基因是位于人染色体10上并且编码中间纤丝蛋白质家族的一个成员。中间纤丝连同微管和肌动蛋白微丝一起构成了细胞的细胞骨架,该细胞骨架有助于维持细胞形状和细胞质的完整性,并且使细胞骨架的相互作用稳定。波形蛋白还起到介导免疫反应、控制低密度脂蛋白来源的胆固醇从溶酶体运输到酯化位点的作用,并且充当了连接、迁移及细胞信号传导中所涉及的多种关键性蛋白质的组织者。
丙酮酸羧化酶(PC)
PC基因是位于人染色体11上并且编码蛋白质丙酮酸羧化酶,该酶催化丙酮酸羧化成草酰乙酸。该活性酶是安排成四面体的一种同源四聚体,它仅仅位于线粒体基质中。丙酮酸羧化酶涉及于多个细胞过程中,包括糖原异生、脂生成、胰岛素分泌及神经递质谷氨酸的合成。这一基因中的突变已经与丙酮酸羧化酶缺陷相关联。已经鉴别出具有不同5'UTR但编码相同蛋白质的替代性剪接的转录物变异体。
核酸分子
在此描述的方法可以涉及基于对应于在此描述的基因(例如E-钙粘素、波形蛋白、丙酮酸羧化酶)的分离的核酸,例如E-钙粘素的mRNA水平、波形蛋白的mRNA水平、丙酮酸羧化酶的mRNA水平,针对在此描述的基因的表达进行的样品评估。如在此所使用,术语“核酸”或“核酸分子”意在打算包括DNA分子(例如,cDNA或基因组DNA)和RNA分子(例如,mRNA)以及使用核苷酸类似物产生的DNA或RNA的类似物。该核酸分子可以是单链或双链的。
“分离的”核酸分子是与该核酸分子的天然来源中存在的其他核酸分子分开的核酸分子。“分离的”核酸分子可以不含在得到该核酸的生物体的基因组DNA中天然地侧接该核酸(即,位于该核酸的5'和3'端处的序列)的序列(如编码蛋白质的序列)。“分离的”核酸分子,如mRNA,可以实质上不含得到该核酸的细胞或组织来源中的其他细胞材料细胞材料或其他污染性蛋白质。
在此描述的核酸分子可以使用标准分子生物学技术和在本领域的技术人员已知的数据库记录中可得到的序列信息来分离。使用这些核酸序列的全部或一部分,可以使用标准杂交和克隆技术(例如,如萨姆布鲁克(Sambrook)等人编,分子克隆:实验手册(MolecularCloning:ALaboratoryManual),第2版,冷泉港实验室出版社(ColdSpringHarborLaboratoryPress),纽约冷泉港(ColdSpringHarbor,NY),1989中所描述)分离出在此描述的核酸分子。
在此描述的核酸分子可以根据标准PCR扩增技术,使用cDNA、mRNA或基因组DNA作为模板以及适当的寡核苷酸引物进行扩增。由此扩增的核酸分子可以被克隆到一个适当的载体中,并通过DNA序列分析进行表征。此外,对应于一个核酸分子的全部或一部分的寡核苷酸可以通过标准合成技术,例如使用自动化DNA合成仪来制备。
分离的核酸分子可以包含这样一种核酸分子,它具有与对应于在此描述的基因的一种核酸的核苷酸序列,或与编码了对应于在此描述的基因的蛋白质的一种核酸的核苷酸序列互补的核苷酸序列。与一个给定的核苷酸序列互补的核酸分子是与该给定的核苷酸序列充分地互补使得它可以与该给定的核苷酸序列杂交,由此形成一个稳定的双链体的核酸分子。
在此描述的核酸分子可以仅包含一个核酸序列的一部分。这些核酸分子可以例如用作探针或引物。探针/引物可以是一种或多种实质上纯化的寡核苷酸。基于在此描述的核酸分子的序列的探针可以用于检测对应于在此描述的基因的转录物或基因组序列。该探针可以包含包括一个标记基团,例如一种放射性同位素、一种荧光化合物、一种酶或一种酶辅因子。这些探针可以用作一种诊断测试用试剂盒的一部分,该试剂盒如通过对来自患者的细胞样品中编码该蛋白质的核酸分子的水平进行测量,例如检测mRNA水平来鉴别出表达该蛋白质的细胞或组织。
用于检测基因表达的方法
检测和/或定量一种基因转录物(例如mRNA或由其产生的cDNA)的方法可以包括但不限于Southern印迹分析、Northern印迹分析、聚合酶链反应(PCR)分析及探针测定。检测和/或定量一种基因转录物(例如mRNA或由其产生的cDNA)的方法可以包括但不限于基于杂交的方法,例如用对该基因转录物(例如mRNA或由其产生的cDNA)具有特异性的探针进行的杂交。基因转录物(例如mRNA或由其产生的cDNA)的水平可以通过将该样品,或者该mRNA或由其产生的cDNA,或由其扩增的样品施用到一个核酸微阵列或芯片阵列来进行测定。
基因转录物(例如mRNA或由其产生的cDNA)的水平可以通过基于聚合酶链反应(PCR)的方法,例如定量PCR、定量实时PCR、实时PCR、反转录PCR、实时反转录PCR来进行测定。基因转录物(例如mRNA或由其产生的cDNA)的水平可以通过基于测序的方法,例如定量RNA测序来进行测定。
基因转录物(例如mRNA)的水平可以通过本领域中已知的原位或体外方法来确定。对于体外方法,可以利用并非针对mRNA的分离而选择的任何RNA分离技术从一个样品,例如从一个样品的多个细胞纯化出RNA(参看例如,奥苏贝尔(Ausubel)等人编,现代分子生物学实验技术(CurrentProtocolsinMolecularBiology),约翰威立父子公司,纽约(NewYork)1987-1999)。另外地,可以使用本领域的技术人员众所周知的技术,如例如科姆辛斯基(Chomczynski)(1989,美国专利号4,843,155)的单步骤RNA分离工艺容易地对多个组织样品进行加工。对于原位方法,mRNA在检测之前无需从细胞中分离出来。在这类方法中,可以使用已知的组织学方法制备/加工细胞或组织样品。该样品随后可以被固定在一个支撑物上,并且然后与一种探针接触,该探针可以与编码所关注的基因转录物的mRNA杂交。
测定可以基于基因转录物(例如mRNA)的绝对表达水平、归一化的表达水平或相对表达水平。可以通过将基因转录物的表达水平与稳定地表达的另一种基因(例如组成性表达的一种看家基因)的表达水平相比较,对其绝对表达水平进行校正,来将表达水平归一化。用于归一化的适合的基因包括看家基因,如组蛋白H3基因或肌动蛋白基因。这种归一化允许对一个样品与另一个样品,例如从一名患者取得的第一样品与从同一患者(例如从另一个组织或在不同时间点时)取得的第二样品;或在来自不同来源的样品之间,例如来自一位名患者的患者样品与来自另一位名患者的患者样品的表达水平进行比较。
所提供的表达水平可以作为一种相对表达水平。相对表达水平可以通过将该基因转录物(例如mRNA)的绝对表达水平与一种参考标准相比较来测定。该参考标准可以包括在基因型或表型确定的样品中所关注的基因转录物的表达水平。该参考标准可以是在基因型或表型表征为上皮细胞的细胞中所关注的基因转录物(例如,E-钙粘素、波形蛋白、丙酮酸羧化酶)的表达水平。上皮细胞可以如在以下文献中的任一种中表征:(约克等人,(2005)临床癌症研究,11:24;撒瓦格纳等人,(2010)肿瘤学年鉴,21(增刊7):vii89;泰瑞等人,(2002)自然评述-癌症,2(6):442)。
可以至少在两个时间点测量在此描述的基因转录物(例如,E-钙粘素、波形蛋白、丙酮酸羧化酶)的表达水平以确定是否发生了表达水平的变化。举例来说,可以在用在此描述的化合物进行治疗之前和之后,或在用在此描述的化合物进行治疗时在一个或多个时间点测量表达水平。如果发现该表达水平有所降低,例如E-钙粘素的表达与参考标准相比有所降低和/或波形蛋白的表达与参考标准相比有所增加,那么可以向受试者给予用在此描述的化合物进行的治疗。该参考标准可以是在所表征的上皮细胞中所关注的基因转录物的表达水平。上皮细胞可以通过本领域中已知的方法,例如,如在以下文献中的任一种中表征:(约克等人,(2005)临床癌症研究,11:24;撒瓦格纳等人,(2010)肿瘤学年鉴,21(增刊7):vii89;泰瑞等人,(2002)自然评述-癌症,2(6):442)。
蛋白质
在此描述的方法可以涉及基于对应于在此描述的基因(例如E-钙粘素、波形蛋白、丙酮酸羧化酶)的分离的蛋白质,例如E-钙粘素的蛋白质水平、波形蛋白的蛋白质水平、丙酮酸羧化酶的蛋白质水平,针对在此描述的基因的表达进行的样品评估。这也可以包括其生物活性部分、变异体、同功异构型(isoform)或剪接变异体的评估。可以通过一种适当的纯化方案,使用本领域的技术人员已知的标准蛋白质纯化技术,从样品中分离出对应于所关注的蛋白质的天然多肽。
“分离的”或“纯化的”蛋白质或其生物活性部分实质上不含得到该蛋白质的细胞或组织来源中的细胞物质或其他污染性蛋白质。术语“实质上不含细胞物质”包括将蛋白质与分离出其的细胞的细胞组分分开的蛋白质的制备。一种多肽的生物活性部分可以包括有包含与该蛋白质的氨基酸序列足够一致或来源于该蛋白质的氨基酸序列的氨基酸序列的多肽,这些多肽包括比全长蛋白质更少的氨基酸,并且展现出相应全长蛋白质的至少一种活性。典型地,生物活性部分包含了具有相应蛋白质的至少一种活性的一个结构域或基元。
用于检测蛋白质表达的方法
蛋白质或多肽的表达水平可以通过本领域的技术人员众所周知的多种手段中的任一种进行检测并且定量。检测和/或定量在此描述的蛋白质或多肽(例如,E-钙粘素、波形蛋白、丙酮酸羧化酶)的方法可以包括但不限于,生物化学方法,如电泳、毛细管电泳、高效液相色谱法(HPLC)、薄层色谱法(TLC)、高扩散色谱法等等;或不同的免疫测定,如流体或凝胶沉淀反应、免疫扩散(单向或双向)、免疫电泳、放射免疫测定(RIA)、酶联免疫吸附剂测定(ELISA)、免疫荧光测定、Western印迹、免疫组织化学、原位杂交、荧光激活的细胞分选(FACS)等等。熟练的业内人士可以容易地采用已知的蛋白质/抗体检测方法用于确定细胞是否表达在此描述的蛋白质或多肽。
蛋白质或多肽可以使用免疫测定进行检测。如在此所使用,免疫测定包括了利用一种特异性结合于蛋白质或多肽的抗体的测定。免疫测定可以通过检测蛋白质或多肽与抗体的特异性结合来表征,与使用其他物理或化学性质来分离、靶向并定量该多肽相对照。该多肽可以使用多种公认的免疫结合测定中的任一种来检测和/或定量(参看例如,美国专利号4,366,241;4,376,110;4,517,288;及4,837,168)。有关一般免疫测定的评述,也参看浅井(Asai)(1993)细胞生物学方法(MethodsinCellBiology)第37卷:细胞生物学中的抗体(AntibodiesinCellBiology),纽约学术出版有限公司(AcademicPress,Inc.NewYork);斯特兹(Stites)和特尔(Terr)(1991)基础临床免疫学(BasicandClinicalImmunology)第7版。用于检测和/或定量蛋白质或多肽的免疫测定可以采用本领域的技术人员众所周知的多种格式。
能够结合于蛋白质或多肽的抗体,例如对应于在此描述的蛋白质或多肽(例如,E-钙粘素、波形蛋白、丙酮酸羧化酶)的具有可检测的标记(直接或间接地标记的)的抗体,可以用于检测该蛋白质或多肽。抗体可以是多克隆或单克隆的。可以使用完整的抗体,或其片段,例如Fab或F(ab')2。就探针或抗体来说,术语“标记的”打算涵盖通过将一种可检测的物质与该探针或抗体偶联(即,物理地连接)进行的探针或抗体的直接标记,以及通过与直接地标记的另一种试剂反应进行的探针或抗体的间接标记。间接标记的实例包括了使用荧光标记的二次抗体检测一次抗体,以及用生物素对DNA探针进行末端标记以使得它可以用荧光标记的抗生蛋白链菌素进行检测。该抗体还可以是标记的(例如放射性标记的、发色团标记的、荧光团标记的或酶标记的)抗体。使用了一种抗体衍生物,例如与一种底物或与蛋白质-配体对(例如生物素-抗生蛋白链菌素)的蛋白质或配体结合的一种抗体,或一种抗体片段,例如单链抗体、分离的抗体高变结构域等,该抗体衍生物特异性结合于在此描述的蛋白质,例如E-钙粘素、波形蛋白、丙酮酸羧化酶,如通过对应于在此描述的蛋白质或多肽(例如E-钙粘素、波形蛋白、丙酮酸羧化酶)的基因转录物的开放阅读框所编码的蛋白质,或经历了其正常翻译后修饰的全部或一部分的此类蛋白质或多肽。
来自细胞的蛋白质可以使用本领域的技术人员众所周知的技术来进行分离。所采用的蛋白质分离方法可以例如为如哈罗(Harlow)和莱恩(Lane)(哈罗和莱恩,1988,抗体实验手册(Antibodies:ALaboratoryManual),冷泉港实验室出版社,纽约冷泉港)中所描述的那些。
所提供的表达水平可以作为一种相对表达水平。该相对表达水平可以通过将该蛋白质的绝对表达水平与一种参考标准相比较来测定。该参考标准可以包括在基因型或表型确定的样品中所关注的蛋白质的表达水平。该参考标准可以是基因型或表型表征为上皮细胞的一种细胞中所关注的蛋白质(例如,E-钙粘素、波形蛋白、丙酮酸羧化酶)的表达水平。上皮细胞可以通过本领域中已知的方法表征,例如,如以下文献中的任一种中所描述:(约克等人,(2005)临床癌症研究,11:24;撒瓦格纳等人,(2010)肿瘤学年鉴,21(增刊7):vii89;泰瑞等人,(2002)自然评述-癌症,2(6):442)。
在此描述的蛋白质或多肽(例如,E-钙粘素、波形蛋白、丙酮酸羧化酶)的表达水平可以至少在两个时间点测量以确定是否发生了表达水平的变化。举例来说,可以在用在此描述的化合物进行治疗之前和之后,或在用在此描述的化合物进行治疗时在一个或多个时间点测量表达水平。如果发现该表达水平有所降低,例如E-钙粘素的表达与参考标准相比有所降低和/或波形蛋白的表达与参考标准相比有所增加,那么可以向受试者给予用在此描述的化合物进行的治疗。
试剂盒
在此还描述了试剂盒,这些试剂盒包括了用以测定在此描述的基因(例如,E-钙粘素、波形蛋白、丙酮酸羧化酶)的基因表达水平的装置。举例来说,该试剂盒可以包括一种能够与在此描述的一种基因(例如,E-钙粘素、波形蛋白、丙酮酸羧化酶)的基因表达产物相互作用的药剂。该试剂盒可以包括多种能够与在此描述的多种基因(例如,E-钙粘素、波形蛋白、丙酮酸羧化酶)的基因表达产物相互作用的药剂。该药剂可以包括但不限于,一种抗体、多种抗体、一种寡核苷酸或多种寡核苷酸。该基因表达产物可以包括但不限于,转录的分子、RNA分子、多肽、蛋白质、基因组DNA或cDNA。
该试剂盒可以另外任选地包括多种用于执行在此描述的测定的试剂。举例来说,该试剂盒可以包括缓冲剂、溶剂、稳定剂、防腐剂、纯化柱、检测试剂及酶,它们可能是从患者样品分离出核酸,例如通过qRT-PCR扩增样品,并且将样品施用于以上描述的试剂,或者是从受试者样品分离出蛋白质并且将样品施用于以上描述的试剂所必需的;或用于将受试者样品直接地施用于以上描述的药剂的试剂。一个试剂盒还可以包括阳性和阴性对照样品,例如对照核酸样品(例如,来自非癌症受试者的核酸样品,或非肿瘤组织样品,或未接受癌症治疗的受试者,或用于与受试者样品同时进行测试的其他测试样品。试剂盒还可以包括说明材料,该材料可以提供有关收集并加工患者样品,将这些样品施用于基因表达水平的测定以及有关解释测定结果的指导。
所提供的该试剂盒的组分可以呈任何形式,例如液体、干燥的、半干燥的或冻干形式,或呈在冻干条件下储存的形式。典型地,所提供的该试剂盒的组分是呈无菌的形式。当所提供的试剂是呈液体溶液形式时,该液体溶液总体上为一种水溶液,例如一种无菌水溶液。当所提供的试剂是呈干燥形式时,总体上通过添加一种适合的溶剂来实现复水。在该试剂盒中可以任选地提供溶剂,例如无菌缓冲剂。
该试剂盒可以包括一个或多个容器用于呈适用于基因表达水平测定中的浓度的试剂盒组分,或附有有关用于该测定中的稀释的说明书。该试剂盒可以包含用于这些测定组分的单独的容器、分配器或隔室,以及信息材料。举例来说,阳性和阴性对照样品可以被包含在瓶子或小瓶中,临床上可相容的分类符可以被密封在无菌塑料包装中,并且信息材料可以被包含在塑料套管或包中。该试剂盒可以包括多个(例如,一包)个别单个的容器,每一个都包含一种药剂的一个或多个单位形式(例如,用于一次测定)。这些试剂盒的容器可以是气密性的和/或防水的。该容器可以针对用途进行标记。
该试剂盒可以包括有关执行并解释该测定的信息材料。该试剂盒还可以提供有关在何处报告该测定的结果的指导,例如去治疗中心或医疗服务提供者。该试剂盒可以包括用于报告在此描述的基因活性测定结果的形式,以及有关在何处发送这些形式或其他相关的信息的地址和联系信息,或有关在一个在线数据库或一个在线应用(例如,app)中报告结果的URL(统一资源***)地址。在另一个实施例中,该信息材料可以包括有关取决于该测定的结果,患者是否应当接受用抗癌干细胞剂进行的治疗的指导。
这些试剂盒的信息材料不局限于其形式。在许多情形中,所提供的信息材料(例如说明书)是呈印刷品的形式,例如一种印刷文本、图画和/或照片,例如标记或印张。然而,所提供的信息材料还可以呈其他格式,如计算机可读材料、录像或录音。该试剂盒的信息材料可以是联系信息,例如物理地址、电邮地址、网页或电话号码,其中该试剂盒的用户可以获得有关基因活性测定和/或它于在此描述的方法中的应用的实质性信息。所提供的信息材料还可以呈多种格式的任何组合。
受试者样品可以被提供给一名位测定提供者,例如服务提供者(如第三方设施)或医疗服务提供者,它将在一项测定中评估样品并提供读出。举例来说,测定提供者可以从受试者接收样品,如组织样品,或者血浆、血液或血清样品,并使用在此描述的测定对该样品进行评估,并且确定该受试者是接收用如在此描述的抑制剂进行的治疗的候选者。该测定提供者可以告知医疗服务提供者该受试者是用如在此描述的抑制剂进行的治疗的候选者,并且向该候选者给予如在此描述的抑制剂。该测定提供者可以将该评估的结果,以及任选地有关诊断、预后或适当疗法选择中的一种或多种的结论以任何适合的格式,如通过邮件,或电子方式,或通过在线数据库提供给例如医疗服务提供者,或患者,或保险公司。由该测定提供者所收集并提供的信息可以被储存在数据库中。
实例
实例A
在此实例中,通过一种偶联的终点测定来测量谷氨酰胺酶的酶促活性。将谷氨酰胺和磷酸对应地以等于Km和AC50的浓度供应给GAC,并且调整GAC浓度以得到线性反应,持续60分钟。所产生的谷氨酸被动力学过量的谷氨酸脱氢酶转化成2-OG。这个第二步骤是配置用于NAD的2XKm,因为过量的NAD具有抑制性。然而,动力学过量的第三种偶联酶心肌黄酶从NADH回收利用NAD以使NAD的浓度在该测定的时程期间保持恒定。心肌黄酶,也是以动力学过量供应的,它将由GDH产生的NADH重新氧化成NAD,并且伴随着刃天青(rezasurin)还原成高度荧光的试卤灵。在用SDS停止该测定之后,通过Ex544/Em590来测量试卤灵。信号的减少指示了偶联酶***中某种组分的抑制。针对单独的GDH/心肌黄酶对预期的命中(hit)进行复筛以取出命中用于第二测定中的偶联酶***。
1.材料
BSA西格玛(Sigma)#3294(无蛋白酶)
心肌黄酶沃辛顿(Worthington)酶LS004330。以10mg/ml再悬浮于ddH20中并在-80℃下储存。
EDTA西格玛E6758或等效物
谷氨酸脱氢酶西格玛G7882
谷氨酰胺西格玛G3126或等效物
HEPES(pH8.5)西格玛H3375或等效物,用NaOH调到pH8.5
NaCl西格玛S7653或等效物
NAD西格玛N7004;注意:如果在干燥器外储存,则能量将分解成抑制剂。购买数小批并制备储备液,并且在-80℃下储存。
刃天青西格玛199303
十二烷基硫酸钠西格玛L4390或等效物
磷酸钠(pH8.5)由西格玛单碱(S8282)和二碱(S7907)溶液或等效物制备;由该二碱和单碱溶液各自的1M储备液制备的1M储备液最终浓度。
2.缓冲液
2X的缓冲液(300mMNaCl、100mMHEPESpH8.5、0.1%BSA、0.5mMEDTA、100mM磷酸钠pH8.5)
5X的底物混合物(1X的缓冲液最终浓度,含有13mM的谷氨酰胺、100μM的刃天青、50μg/ml的心肌黄酶)
1.2X的酶混合物(1X的缓冲液最终浓度,含有0.875μg/ml的GAC、1.56mM的NAD、6.25个单位/毫升的GDH)
停止混合物(于ddH20中的6%SDS)
反应程序
1.添加1μl含化合物的100%DMSO
2.添加40μl酶混合物并在室温下孵育60分钟
3.添加10μl的底物混合物以开始反应
4.用25μl的6%SDS停止反应并读取Ex544Em590
实例B:
在此实例中,通过一项偶联的终点测定对化合物抑制谷氨酰胺酶HTS方法的偶联酶测定***的潜力进行测试,该***包含谷氨酸脱氢酶和心肌黄酶。将谷氨酸在Km下供应给GDH,接着执行还原脱酰胺以产生2OG。将NAD在2XKm下供应到该***,并且通过心肌黄酶的活性来监测它向NADH的转化。心肌黄酶是以大量动力学过量供应给GDH,它将NADH重新转化成NAD以使NAD水平在反应中保持恒定,而同时将刃天青还原成高度荧光的试卤灵。在用SDS停止该测定之后,通过Ex544/Em590来测量试卤灵。信号的减少指示偶联酶***中某种组分的抑制。
3.材料
BSA西格玛#3294(无蛋白酶)
心肌黄酶沃辛顿酶LS004330。以10mg/ml再悬浮于ddH20中并在-80℃下储存。
EDTA西格玛E6758或等效物
谷氨酸脱氢酶西格玛G7882
谷氨酸西格玛G1251或等效物
HEPES(pH8.5)西格玛H3375或等效物,用NaOH调到pH8.5
NaCl西格玛S7653或等效物
NAD西格玛N7004;注意:如果在干燥器外储存,那么粉末将分解成抑制剂。购买数小批并制备储备液,并且在-80℃下储存。
刃天青西格玛199303
十二烷基硫酸钠西格玛L4390或等效物
4.缓冲液
2X的缓冲液(300mMNaCl、100mMHEPESpH8.5、0.1%BSA、0.5mMEDTA、100mM磷酸盐pH8.5)
2X的底物混合物(1X的缓冲液最终浓度,40μM的刃天青、1.8mM的谷氨酸、20μg/ml的心肌黄酶)
10X的NAD混合物(1X的缓冲液最终浓度,12.5mM的NAD)
2.5X的酶混合物(1X的缓冲液最终浓度,如针对适当线性所测定的GDH酶;例如,如此处描述的0.05个单位/毫升,以得到0.02个单位/毫升的最终浓度)
反应程序
1.添加1μl含化合物的100%DMSO
2.添加20μl酶混合物并在室温下孵育60分钟
3.添加5μl的NAD混合物
4.添加25μl的底物混合物以开始反应
5.用25μl的6%SDS停止反应并读取Ex544Em590
实例1
5,5'-(硫代双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-2-胺)(I-2):
将3,3'-硫代二丙酸(1当量)和氨基硫脲(2当量)的混合物放入POCl3(10倍)中并在90℃下搅拌3h。将反应混合物冷却至室温并倒在冰上。对所得混合物进行过滤,并且随后使用KOH使其达到pH14。将混合物过滤,用水洗涤并干燥,以提供希望的产物I-2,将其按原样用于下一步骤。
用于合成化合物(I-3)的通用程序:
将二胺I-2(1当量)放入DMF中并冷却至0℃。然后添加PYBOP(3当量),随后添加DIPEA(3当量)并搅拌10min。添加对应的酸(3当量)并将反应混合物在室温下搅拌过夜。通过LCMS监测反应的进程。反应完成后,将水添加至反应混合物中并搅拌10min。将混合物通过布氏漏斗过滤,用水洗涤并干燥。将粗产物通过标准方法纯化,以提供希望的产物(I-3)。
通过遵循如针对I-3描述的通用程序合成以下化合物:
N,N'-(5,5'-(硫代双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-环己基乙酰胺)(5):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:0.90-1.30(m,12H),1.55-1.82(m,10H),2.36(t,4H),2.96(t,4H),3.25(t,4H),12.38(brs,2H);质量(M++23):559.30。
实例2
用于氨基甲酸酯(I-5)制备的通用程序
将二胺I-2(1当量)放入DCM中并添加吡啶(2当量),随后添加对应的氯甲酸酯(3当量)并在室温下搅拌过夜。通过LCMS监测反应的进程。反应完成后,将水添加至混合物中并用DCM萃取。将有机层用盐水洗涤,用无水硫酸钠干燥并蒸发至干燥。将粗产物通过标准方法纯化,以提供纯的氨基甲酸酯(I-5)。
通过遵循如针对I-5描述的通用程序合成以下化合物:
二苯基(5,5'-(硫代双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))二氨基甲酸酯(1)
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:2.95(t,4H),3.24(t,4H),7.22-7.32(m,6H),7.40-7.50(m,4H),12.62(s,2H);质量(M++23):551.15。
二环己基(5,5'-(硫代双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))二氨基甲酸酯(8)
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:1.22-1.55(m,12H),1.65-1.78(m,4H),1.82-1.90(m,4H),2.92(t,4H),3.22(t,4H),4.84-4.90(m,2H),11.92(s,2H);质量(M++1):541.15。
实例3
1,1'-(5,5'-(硫代双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(3-甲基-3-苯基脲)(18)
将二胺I-2(1当量)放入THF中,冷却至-50℃并将LiHMDS(2当量)添加至混合物中并搅拌30min。然后,将THF中的甲基(苯基)氨基甲酰氯(4当量)添加至反应混合物中并使其达到室温并搅拌过夜。通过TLC监测反应的进程。反应完成后,将反应混合物用饱和氯化铵溶液淬灭并用乙酸乙酯萃取。将有机层用无水硫酸钠干燥并在减压下蒸发。将粗产物通过标准方法纯化,以提供希望的产物18。
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:2.85(t,4H),3.15(t,4H),3.28(s,6H),7.22-7.30(m,6H),7.34-7.40(m,4H);质量(M++1):555.25。
实例4
5,5'-(硫代双(乙烷-2,1-二基))双(N-苯乙基-1,3,4-噻二唑-2-胺)(9):
在0℃下,将THF中的N,N'-(5,5'-(硫代双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-苯基乙酰胺)3(1当量)添加至LiALH4(2.5当量)在THF中的搅拌悬浮液中并回流4h。通过LCMS监测反应的进程。通过小心地添加饱和NH4Cl溶液,随后添加乙酸乙酯和通过硅藻土垫过滤而获得的材料来淬灭反应。将硅藻土层进一步用乙酸乙酯洗涤。将获得的滤液在减压下蒸发并通过标准方法纯化,以提供9。
1HNMR(400MHz,DMSO-d6+TFA)δ:2.84(q,8H),3.08(t,4H),3.48(q,4H),7.19-7.36(m,10H),7.66(m,2H);质量(M++23):519.15。
实例5
用于合成化合物(I-13)的通用程序:
将对应的硫化物类似物(1当量)放入THF中,在0℃下,滴加THF:H2O(6:1)中的m-CPBA(0.9当量)并在同一温度下搅拌10min。通过TLC监测反应的进程。反应完成后,将反应混合物用水性NaHCO3溶液淬灭并且将溶剂蒸发至干燥。将水添加至残余物中,用乙酸乙酯萃取,用盐水洗涤,用无水硫酸钠干燥并在减压下蒸发。将粗产物通过标准方法纯化,以提供希望的产物(I-13)。
通过遵循如针对I-13描述的通用程序合成以下化合物:
N,N'-(5,5'-(亚磺酰基双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-苯基乙酰胺)(7):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:3.18(t,2H),3.20-3.40(m,6H),3.80(s,4H),7.20-7.38(m,10H),12.62(brs,2H);质量(M++1):541.20。
N,N'-(5,5'-(亚磺酰基双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(吡啶-2-基)乙酰胺)(17):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:3.18(t,4H),3.30-3.42(m,4H),4.00(s4H),7.26(t,2H),7.40(d,2H),7.78(t,2H),8.48-8.52(m,2H);质量(M++1):543.10。
实例6
3,3'-磺酰基二丙酸(I-14):
将3,3'-硫代二丙酸(1当量)放入THF中并且向其中缓慢添加放入水中的过硫酸氢钾(2当量)并在室温下搅拌3h。通过TLC监测反应的进程。反应完成后,将水添加至反应混合物中并用乙酸乙酯萃取。将有机层用无水硫酸钠干燥并蒸发至干燥,以提供粗产物I-14。
5,5'-(磺酰基双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-2-胺)(I-15):
将3,3'-磺酰基二丙酸(1当量)和氨基硫脲(2当量)放入PPA中并回流过夜。然后,将反应混合物冷却至室温。使用水性KOH溶液将反应混合物的pH调到14,搅拌30min并过滤。将获得的材料用二***研磨并干燥,以提供标题化合物I-15。
用于合成化合物(I-16)的通用程序:
将二胺I-16(1当量)放入冷却至0℃的DMF中并添加PYBOP(3当量),随后添加DIPEA(3当量)并搅拌10min。然后,将对应的酸(3当量)添加至反应混合物中并在室温下搅拌过夜。通过LCMS监测反应的进程。反应完成后,将水添加至反应混合物中并搅拌10min。将混合物通过布氏漏斗过滤并干燥。将粗产物通过标准方法纯化,以获得希望的化合物(I-16)。
通过遵循如针对I-16描述的通用程序合成以下化合物:
N,N'-(5,5'-(磺酰基双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-苯基乙酰胺)(4):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:3.45(t,4H),3.70(t,4H),3.80(s,4H),7.20-7.38(m,10H),12.75(s,2H);质量(M++1):557.1。
N,N'-(5,5'-(磺酰基双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(吡啶-2-基)乙酰胺)(13):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:3.45(t,4H),3.68(t,4H),4.00(s,4H),7.25(t,2H),7.40(d,2H),7.78(t,2H),8.50(s,2H)12.75(s,2H);质量(M++1):559.15。
N,N'-(5,5'-(磺酰基双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(吡啶-3-基)乙酰胺)(14):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:3.42(t,4H),3.68(t,4H),3.88(s,4H),7.38(t,2H),7.76(d,2H),8.42-8.55(m,4H),12.78(brs,2H);质量(M++1):559.1。
N,N’-(5,5’-(2,2’-磺酰基双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(3-苯基丙酰胺)(21):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:2.80(t,4H),2.95(t,4H),3.45(t,4H),3.70(t,4H),7.10-7.32(m,10H),12.5(brs,2H);质量(M++1):585.3。
用于氨基甲酸酯(I-17)制备的通用程序
将5,5'-(磺酰基双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-2-胺)(1当量)放入DCM中,并向其中添加吡啶(2当量),随后添加对应的氯甲酸酯(2当量)并在室温下搅拌过夜。通过LCMS监测反应的进程。反应完成后,将水添加至反应混合物中并用DCM萃取。将有机层用盐水洗涤,用无水硫酸钠干燥并蒸发至干燥。将粗产物通过标准方法纯化,以提供希望的化合物(I-17)。
通过遵循如针对I-17描述的通用程序合成以下化合物:
二异丙基(5,5'-(磺酰基双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))二氨基甲酸酯(23):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:1.25(d,12H),3.42(t,4H),3.65(t,4H),4.88-4.98(m,2H),12.00(s,2H);质量(M++1):493.10。
二异丁基(5,5'-(磺酰基双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))二氨基甲酸酯(22):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:0.90(d,12H),1.85-1.98(m,2H),3.42(t,4H),3.65(t,4H),3.98(d,4H),12.10(s,2H);质量(M++1):521.00。
实例7
用于合成化合物(I-19)的通用程序:
将适当的氨基甲酸酯(1当量)放入丙酮中,并且向其中缓慢添加放入水中的过硫酸氢钾(2.5当量)并在室温下搅拌2h。通过TLC监测反应的进程。反应完成后,将丙酮在减压下蒸发。将水添加至反应混合物中并用乙酸乙酯萃取。将合并的有机层用无水硫酸钠干燥并蒸发至干燥。将粗品通过标准方法纯化,以提供希望的产物(I-19)。
通过遵循如针对I-19描述的通用程序合成以下化合物:
二苄基(5,5'-(磺酰基双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))二氨基甲酸酯(19):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:3.45(t,4H),3.70(t,4H),5.24(s,4H),7.34-7.44(m,10H),12.22(s,2H);质量(M++1):589.1。
二-叔丁基(5,5'-(磺酰基双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))二氨基甲酸酯(15):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:1.45(s,18H),3.45(t,4H),3.70(t,4H),11.82(s,2H);质量(M++1):521.15。
实例8
5,5'-(戊烷-1,5-二基)双(1,3,4-噻二唑-2-胺)(I-50):
遵循针对化合物I-2描述的通用程序由庚二酸I-49合成标题化合物。
用于合成化合物(I-51)的通用程序:
将二胺I-50(1当量)放入DMF中并冷却至0℃。然后添加PYBOP(3当量),随后添加DIPEA(3当量)并搅拌10min。添加对应的酸(3当量)并将反应混合物在室温下搅拌过夜。通过LCMS监测反应的进程。反应完成后,将水添加至反应混合物中并搅拌10min。将反应混合物后处理并通过标准方法纯化,以提供希望的产物(I-51)。
通过遵循如针对I-51描述的通用程序合成以下化合物:
N,N'-(5,5'-(戊烷-1,5-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-苯基乙酰胺)(2):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:1.40(t,2H),1.70(t,4H),2.94(t,4H),3.80(s,4H),7.22-7.40(m,10H),12.64(s,2H);质量(M++1):507.25。
N,N'-(5,5'-(戊烷-1,5-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(吡啶-3-基)乙酰胺)(10):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:1.36(t,2H),1.70(m,4H),2.96(t,4H),3.92(s,4H),7.50(t,2H),7.90(d,2H),8.50-8.60(m,4H),12.70(s,2H);质量(M++23):531.25。
N,N'-(5,5'-(戊烷-1,5-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(吡啶-2-基)乙酰胺)(11):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:1.43(t,2H),1.72(m,4H),2.99(t,4H),4.0(s,4H),7.26(t,2H),7.40(d,2H),7.80(t,2H),8.50(d,2H),12.65(s,2H);质量(M++23):531.10。
N,N'-(5,5'-(戊烷-1,5-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(3-苯基丙酰胺)(20):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:1.40(t,2H),1.74(t,4H),2.80(t,4H),2.88-3.0(m,8H),7.15-7.34(m,10H),12.40(brs,2H);质量(M++1):535.05。
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)乙酰胺)(127):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.75(m,4H),3.00(m,4H),3.98(s,4H),7.10-7.13(m,2H),7.60(d,2H),7.76-7.77(m,2H),8.30-8.32(m,2H),11.22(s,2H),11.82(s,2H);质量(M++1):573.2
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(1H-吲唑-3-基)乙酰胺)(126):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:12.88(s,2H),7.74-7.76(d,2H),7.48-7.49(d,2H),7.32-7.35(t,2H),7.07-7.09(t,2H),4.14(s,4H),2.98(s,4H),1.73(s,4H);质量(M+1):573.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-3-基)乙酰胺)(125):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:12.51-12.61(m,2H),11.45-11.48(d,2H),8.68-8.72(d,2H),8.09-8.12(d,2H),7.53-7.56(t,4H),3.91(s,4H),2.98-3.02(t,4H),1.69-1.74(d,4H)。质量(M+1):573.2
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-3-基)乙酰胺)(124):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:12.66(s,2H),11.41(s,2H),8.86(s,2H),8.15-8.16(d,2H),7.35-7.37(t,4H),3.96(s,4H),2.99(s,4H),1.74(s,4H)。质量(M+1):573.2
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(1H-吲哚-4-基)乙酰胺)(123):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.73(m,4H),2.98(m,4H),4.00(s,4H),6.54(s,2H),6.94(d,2H),7.04(t,2H),7.30-7.33(m,4H),11.13(s,2H),12.55(s,2H);质量(M++1):571.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(1-甲基-1H-吲唑-3-基)乙酰胺)(122):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.74(m,4H),3.00(m,4H),4.00(s,6H),4.15(s,4H),7.12(t,2H),7.40(t,2H),7.59(d,2H),7.76(d,2H);质量(M++1):601.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(1-甲基-1H-吲哚-3-基)乙酰胺)(130):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.72(t,4H),2.98(t,4H),3.75(s,6H),3.88(s,4H),7.02(t,2H),7.14(t,2H),7.26(s,2H),7.39(d,2H),7.57(d,2H),12.61(s,2H);质量(M++1):599.3
实例9
乙基5-(5-氨基-1,3,4-噻二唑-2-基)戊酸酯(I-70):
将6-乙氧基-6-氧代己酸(1.0当量)和氨基硫脲(1.0当量)的混合物放入POCl3(3.3当量)中并在80℃下搅拌3h。将反应混合物冷却至室温并倒在冰上。将所得混合物过滤并且然后使用KOH使其达到pH8。将所得材料用水洗涤并干燥,以提供希望的产物(I-70)。将这一材料按原样用于下一步骤。
用于合成化合物(I-71)的通用程序:
然后,向DCM中的乙基5-(5-氨基-1,3,4-噻二唑-2-基)戊酸酯(1当量)和TEA(3当量)的溶液里添加对应的氯化物(1.2当量)并在室温下搅拌过夜。将所得混合物在真空中浓缩,用水淬灭,过滤,用水洗涤并干燥,以提供希望的产物(I-71)。
用于合成化合物(I-72)的通用程序:
然后,向MeOH/THF中的化合物(I-71)(1当量)的溶液里添加LiOH(2当量,4N)并在40℃下搅拌1小时。将所得混合物在真空中浓缩,将pH调到3-4,过滤并干燥,以提供希望的产物(I-72)。
用于合成化合物(I-73)的通用程序:
将化合物(I-72)(1.0当量)和氨基硫脲(1.0当量)的混合物放入POCl3(3.3当量)中并在80℃下搅拌3h。将反应混合物冷却至室温并倒在冰上。将所得混合物过滤并且然后使用KOH使其达到pH8。将所得混合物用水洗涤并干燥,以提供希望的产物(I-73),将其按原样用于下一步骤。
用于合成化合物(I-74)的通用程序:
将化合物(I-73)(1当量)、对应的酸(1.2当量)、HATU(1.5当量)以及DIPEA(2.0当量)的混合物在室温下搅拌过夜。将所得混合物通过标准程序纯化,以提供希望的产物。
通过遵循如针对I-74描述的通用程序合成以下化合物:
N-(5-(4-(5-乙酰胺基-1,3,4-噻二唑-2-基)丁基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-2-甲基-1H-苯并[d]咪唑-5-甲酰胺(128):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.81(s,4H),2.15(s,3H),2.54(s,3H),3.04-3.06(m,4H),7.52-7.61(m,1H),7.90-7.94(t,1H),8.24-8.37(d,1H),12.39(s,1H),;12.56-12.64(d,1H),12.80(s,1H);质量(M++H):457.1
N-(5-(4-(5-乙酰胺基-1,3,4-噻二唑-2-基)丁基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-2-(5-甲氧基-1H-吲哚-3-基)乙酰胺(129):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.74(s,4H),2.15(s,3H),2.98(t,4H),3.74(s,3H),3.84(s,2H),6.71-6.74(m,1H),7.08(d,1H)7.23-7.25(d,2H),10.82(s,1H);质量(M++H):486.1
N-(5-(4-(5-乙酰胺基-1,3,4-噻二唑-2-基)丁基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-2-(3,4-二甲氧基苯基)乙酰胺(118):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.73-1.76(m,4H),2.15(s,3H),3.00(d,4H),3.72(t,8H),6.82-6.94(m,3H),12.39(s,1H),12.60(s,1H);质量(M++H):477.2
N-(5-(4-(5-乙酰胺基-1,3,4-噻二唑-2-基)丁基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-2-苯基乙酰胺(131):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.75(t,4H),2.15(s,3H),3.07(t,4H),3.79(s,2H),7.32-7.33(m,5H),12.5(s,2H);质量(M++H):417.1
实例10
辛二酸(I-59):
将10%钯碳(10%wt)添加至乙醇中的辛-4-炔二酸I-56溶液中。将混合物用氩脱气并且然后在H2气氛下搅拌14h。将混合物通过硅藻土过滤并浓缩,以提供辛二酸。
5,5'-(己烷-1,6-二基)双(1,3,4-噻二唑-2-胺)(I-60):
通过遵循如针对化合物I-2描述的通用程序从辛二酸I-59和氨基硫脲合成标题化合物。
通过遵循如针对I-3描述的通用程序合成化合物I-61。
N,N'-(5,5'-(己烷-1,6-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-苯基乙酰胺)(12):
通过遵循如针对化合物I-61描述的通用程序从5,5'-(己烷-1,6-二基)双(1,3,4-噻二唑-2-胺)I-60合成标题化合物。
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:1.36(t,4H),1.64(t,4H),2.94(t,4H),3.89(s,4H),7.20-7.36(m,10H),12.62(s,2H);质量(M++23):543.10。
N,N'-(5,5'-(己烷-1,6-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(吡啶-2-基)乙酰胺)(16):
通过遵循如针对化合物I-61描述的通用程序从5,5'-(己烷-1,6-二基)双(1,3,4-噻二唑-2-胺)I-60合成标题化合物。
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:1.38(t,4H),1.70(t,4H),2.95(t,4H),4.0(s,4H),7.30(t,2H),7.41(d,2H),7.78(t,2H),8.50(d,2H),12.68(s,2H);质量(M++23):545.20。
实例11
4-((羧基甲基)硫代)丁酸(I-81):
将乙基4-((2-乙氧基-2-氧代乙基)硫代)丁酸酯I-80放入50%水性HCl中并回流1h。通过TLC监测反应的进程。反应完成后,使反应混合物达到室温并在减压下浓缩。将所得材料用二***研磨,过滤并干燥,以提供希望的产物I-81。
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:1.9-2.0(m,2H),2.4-2.5(t,2H),2.8-2.9(t,2H),3.2-3.3(t,2H),11.0(brs,2H)。
5-(3-(((5-氨基-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)硫代)丙基)-1,3,4-噻二唑-2-胺(I-82):
通过遵循如针对I-2描述的通用程序从4-((羧基甲基)硫代)丁酸I-81合成标题化合物。
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:1.9-2.0(m,2H),2.5-2.6(t,2H),2.8-2.9(t,2H),3.9(s,2H),7.0(brs,2H),7.1(brs,2H)。
2-苯基-N-(5-(3-(((5-(2-苯基乙酰胺基)-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)硫代)丙基)-1,3,4-噻二唑-2-基)乙酰胺(6):
通过遵循如针对I-3描述的通用程序从5-(3-(((5-氨基-1,3,4-噻二唑-2-基)甲基)硫代)丙基)-1,3,4-噻二唑-2-胺I-82合成标题化合物。
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:1.95(t,2H),2.58(t,2H),3.0(t,2H),3.80(s,4H),4.12(s,2H),7.20-7.40(m,10H),12.70(d,2H);质量(M++1)524.85
实例12
5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-2-胺)(I-95):
将戊二酸(1当量)和氨基硫脲(2当量)的混合物放入POCl3(10倍)中并在90℃下搅拌3h。将反应混合物冷却至室温并倒在冰上。将所得混合物过滤并且然后使用KOH使其达到pH14。将所得材料过滤,用水洗涤并干燥,以提供希望的产物I-95。将这一材料按原样用于下一步骤。
N,N'-(5,5'-(丙烷-1,3-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(吡啶-3-基)乙酰胺)(26):
将二胺I-95(1当量)放入DMF中并冷却至0℃。然后添加HATU(2.5当量),随后添加DIPEA(3当量)并搅拌10min。添加对应的酸(2.5当量)并将反应混合物在室温下搅拌过夜。通过LCMS监测反应的进程。反应完成后,将水添加至反应混合物中并搅拌10min。将所得混合物通过标准方法纯化,以提供希望的产物(26)。
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:2.094-2.152(m,2H),3.030-3.059(t,4H),3.865(s,4H),7.348-7.736(m,2H),8.468-8.512(m,2H),12.719(brs,2H);质量(M++1):481.2
实例13
5(E)-5,5'-(丁-2-烯-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-2-胺)(I-96):
将(E)-己-3-烯二酸(1当量)和氨基硫脲(2当量)的混合物放入POCl3(10倍)中并在90℃下搅拌3h。将反应混合物冷却至室温并倒在冰上。将所得混合物过滤并且然后使用KOH使其达到pH14。将反应混合物过滤,用水洗涤并干燥,以提供希望的产物I-96。将这一材料按原样用于下一步骤。
(E)-N,N'-(5,5'-(丁-2-烯-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(吡啶-3-基)乙酰胺)(27):
将二胺I-96(1当量)放入DMF中并冷却至0℃。然后添加HATU(2.5当量),随后添加DIPEA(3当量)并搅拌10min。添加对应的酸(2.5当量)并将反应混合物在室温下搅拌过夜。通过LCMS监测反应的进程。反应完成后,将水添加至反应混合物中并搅拌10min。将反应混合物后处理并通过标准方法纯化,以提供希望的产物(27)。
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:3.744-3.753(d,4H),3.855(s,4H),5.851-5.856(t,2H),7.350-7.375(m,2H),7.719-7.734(m,2H),8.473-8.509(m,4H),12.664(brs,2H);质量(M++1):493.1
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(吡啶-3-基)乙酰胺)(28):
将化合物(27)(1当量)放入MeOH中。将体系用氢填充并添加Pd/C(0.1当量),在室温下搅拌过夜。通过LCMS监测反应的进程。反应完成后,将粗产物通过标准方法纯化,以提供希望的产物(28)。
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.70-1.80(m,4H),2.97-3.03(m,4H),3.86(s,4H),7.352-7.736(m,2H),8.474-8.514(m,2H),12.664(brs,2H);质量(M++1):495.2
实例14
5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-2-胺)(I-97):
将己二酸(1当量)和氨基硫脲(2当量)的混合物放入POCl3(10倍)中并在90℃下搅拌3h。将反应混合物冷却至室温并倒在冰上。将所得混合物过滤并且然后使用KOH使其达到pH14。将混合物过滤,用水洗涤并干燥,以提供希望的产物I-97,将其按原样用于下一步骤。
用于合成化合物(1-98)的通用程序:
方法A:将二胺I-97(1当量)放入DMF中并冷却至0℃。然后添加HATU(3当量),随后添加DIPEA(3当量)并搅拌10min。添加对应的酸(3当量)并将反应混合物在室温下搅拌过夜。通过LCMS监测反应的进程。反应完成后,将水添加至反应混合物中并搅拌10min。将混合物后处理并通过标准方法纯化,以提供希望的产物(1-98)。
方法B:将密封小瓶中的DMF中的二胺I-97(1当量)、RCOOR’(4当量)、CH3ONa(4当量)的混合物在100℃下在Biotage史密斯合成仪(BiotageSmithSynthesis)上于微波反应器中辐射1h。通过LCMS监测反应。反应完成后,将粗产物通过标准方法纯化,以提供希望的产物(1-98)。
通过遵循如针对1-98描述的通用程序合成以下化合物:
N,N'-(5,5'-(戊烷-1,5-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-苯基乙酰胺)(37):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.75(t,4H),3.00(t,4H),3.80(s,4H),7.25-7.28(m,2H),7.30-7.34(m,8H),12.64(s,2H);质量(M++1):493.1
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(4-羟基苯基)乙酰胺)(38):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.74(t,4H),2.97(t,4H),3.62(s,4H),6.68(d,4H),7.08(d,4H);质量(M++1):525.2
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(5-氧代-5-苯基戊酰胺)(40):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.77(t,4H),1.92-1.98(m,4H),2.54-2.57(m,4H),3.02(t,4H),3.10(t,4H),7.52(t,4H),7.63(t,2H),7.96(d,4H),12.40(s,2H);质量(M++1):605.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(3-甲基异噁唑-5-基)乙酰胺)(42):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.77(t,4H),2.22(s,6H),3.03(t,4H),4.07(s,4H),6.30(s,2H),12.77(s,2H);质量(M++1):503.2
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(6-甲氧基-3-氧代-2,3-二氢-1H-茚-1-基)乙酰胺)(43):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.78(t,4H),2.37(d,1H),2.40(d,1H),2.69(d,1H),2.72(d,1H),2.82(d,1H),2.86(d,1H),3.03(t,4H),3.12(d,1H),3.15(d,1H),3.74-3.78(m,2H),3.84(s,6H),6.99(d,1H),7.00(d,1H),7.18(d,2H),7.56(s,1H),7.58(s,1H),12.50(s,2H);质量(M++1):661.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(2-羟基苯基)丙酰胺)(45):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.77(t,4H),2.71(t,4H),2.84(t,4H),3.01(t,4H),6.69(t,2H),6.77(d,2H),7.00(t,2H),7.04(d,2H);质量(M++1):553.3
二-叔丁基2,2'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(氮烷二基)双(2-氧代乙烷-2,1-二基)双(甲基氨基甲酸酯)(46):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.29(s,9H),1.41(s,9H),1.78(t,4H),2.86(s,3H),2.88(s,3H),3.03(t,4H),4.09(s,2H),4.12(s,2H),12.51(s,2H);质量(M++1):599.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(吡啶-2-基)乙酰胺)(47):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.76(t,4H),3.00(t,4H),3.99(s,4H),7.27(d,1H),7.28(d,1H),7.38(s,1H),7.40(s,1H),7.76(t,2H),8.48(d,2H);质量(M++1):495.1
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(3-(呋喃-2-基)丙酰胺)(49):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.76(t,4H),2.79(t,4H),2.94(t,4H),3.01(t,4H),6.10(d,2H),6.34(s,2H),7.51(s,2H),12.46(s,2H);质量(M++1):501.2
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(4-(1-氧代异吲哚啉-2-基)苯基)丙酰胺)(50):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.45-1.45(d,6H),1.73(s,4H),2.99(s,4H),4.01-4.02(d,2H)5.00(s,4H),7.42-7.43(d,4H),7.53-7.56(m,2H),7.65-7.68(t,4H),7.86-7.87(d,4H),12.61(s,2H);质量(M++1):783.7
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(萘-1-基)乙酰胺)(51):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.72(t,4H),2.98(t,4H),4.30(s,4H),7.48-7.54(m,8H),7.86(d,2H),7.94(d,2H),8.05(d,2H),12.82(s,2H);质量(M++1):593.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(4-氯苯基)丙酰胺)(52):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.43(s,3H),1.45(s,3H),1.74(t,4H),3.00(t,4H),3.99-4.04(m,2H),7.38-7.42(m,8H),12.64(s,2H);质量(M++1):589.2
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(3-(3-甲氧基苯基)丙酰胺)(53):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.77(t,4H),2.77(t,4H),2.89(t,4H),3.01(t,4H),3.72(s,6H),6.74-6.80(m,6H),7.19(t,2H),12.41(s,2H);质量(M++1):581.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(3-(吡啶-3-基)丙酰胺)(54):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.76(s,4H),2.79-2.82(t,4H),2.93-3.01(m,8H),7.30-7.32(m,2H),7.65-7.66(d,2H),8.40-8.46(t,4H),12.43(s,2H);质量(M++1):523.7
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(苯并[d][1,3]间二氧杂环戊烯-5-基)乙酰胺)(55):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.74(s,4H),3.00(s,4H),3.69(s,4H),5.98(s,4H),6.76-6.89(m,6H),12.58(s,2H);质量(M++1):581.7
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(苯并[d]异噁唑-3-基)乙酰胺)(60):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.75(s,4H),3.01(s,4H),4.34(s,4H),7.39-7.42(t,2H),7.65-7.68(t,2H),7.51-7.76(d,2H),7.87-7.89(d,2H),12.94(d,2H);质量(M++1):575.7
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(5-甲氧基-1H-吲哚-3-基)乙酰胺)(61):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.73-1.75(d,4H),2.97(s,4H),3.72-3.73(d,6H),3.82(d,4H),6.71-6.73(m,2H),7.08(s,2H),7.23-7.24(d,4H),10.80(s,2H),12.66(s,2H);质量(M++1):631.7
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-甲基-4-氧代-4-苯基丁酰胺)(62):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.21(s,3H),1.22(s,3H),1.76(t,4H),3.01(t,4H),3.20-3.24(m,4H),3.52-3.58(m,2H),7.53(t,4H),7.65(t,2H),7.98(d,4H),12.54(s,2H);质量(M++1):605.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(3,4-二甲氧基苯基)乙酰胺)(63):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.74(t,4H),2.98(t,4H),3.69(s,4H),3.72(s,6H),3.74(s,6H),6.82(d,1H),6.83(d,1H),6.88(s,1H),6.90(s,1H),6.93(d,2H),12.59(s,2H);质量(M++1):613.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))二环戊-3-烯甲酰胺(64):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.77(t,4H),2.52-2.57(m,6H),2.61-2.66(m,4H),3.00(t,4H),5.67(s,4H),12.43(s,2H);质量(M++1):445.2
二乙基4,4'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(氮烷二基)双(4-氧代丁酸酯)(66):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.14-1.17(t,6H),1.76(s,4H),2.61-2.64(t,4H),2.71-2.73(t,4H),3.01(s,4H),4.02-4.07(m,4H),12.46(s,2H);质量(M++1):513.7
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(1H-四唑-5-基)乙酰胺)(71):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.77(s,4H),3.02(s,4H),3.97(s,4H);质量(M++1):477.7
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(6-氧代庚酰胺)(72):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.43-1.49(m,4H),1.52-1.57(m,4H),1.76(t,4H),2.07(s,6H),2.45(t,8H),3.01(t,4H),12.36(s,2H);质量(M++1):509.3N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(2-甲氧基苯基)乙酰胺)(132):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.77(s,4H),3.03(s,4H),3.79(s,6H),4.86(s,4H),6.86-7.02(m,8H),12.59(s,2H);质量(M++1):585.7
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(4-(4-甲氧基苯基)丁酰胺)(75):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.76(s,4H)1.84-1.87(t,4H),2.43-2.46(t,4H),2.51-2.54(m,4H),3.00-3.01(d,4H),3.71(s,6H),6.82-6.84(d,4H),7.10-7.11(d,4H),12.35(s,2H);质量(M++1):609.7
二乙基5,5'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(氮烷二基)双(5-氧代戊酸酯)(76):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.16-1.18(d,6H),1.76(s,4H),1.80-1.86(m,4H),2.32-2.35(t,4H),2.48(s,4H),3.01(s,4H),4.02-4.06(m,4H),13.39(s,2H);质量(M++1):541.7
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(6-氯吡啶-3-基)乙酰胺)(78):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.74(s,4H),3.01(s,4H),3.89(s,4H),7.49-7.50(d,2H),7.79-7.81(m,2H),8.34(d,2H),12.70(s,2H);质量(M++1):584.7
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(4-环己基丁酰胺)(80):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:0.8-0.9(d,4H),1.15-1.22(m,12H),1.57-1.65(m,14H),1.76(s,4H),2.40-2.42(d,4H),3.01-3.02(d,4H),12.33(s,2H);质量(M++1):581.7
(3E,3'E)-N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(4-苯基丁-3-烯酰胺)(81):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.76(m,4H),3.01(m,4H),3.42(m,4H),6.37(td,2H),6.55(d,2H),7.24(m,2H),7.32(m,4H),7.42(m,4H),12.51(brs,2H);质量(M++1):545.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(4-苯基丁酰胺)(82):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.77(brs,4H),1.90(m,4H),2.47(t,4H),2.60(t,4H),3.01(brs,4H),7.16-7.29(m,10H),12.35(brs,2H);质量(M++1):549.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(3,4-二氟苯基)乙酰胺)(83):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.74(brs,4H),3.00(brs,4H),3.82(s,4H),7.15(m,2H),7.39(m,4H),12.67(s,2H);质量(M++1):565.2
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))二-1-萘甲酰胺(85):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.89(brs,4H),3.14(brs,4H),7.60(m,6H),7.90(m,2H),8.04(m,2H),8.15(m,2H),8.23(m,2H),13.09(brs,2H);质量(M++1):565.2
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(2-氯苯基)乙酰胺)(86):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.76(brs,4H),3.01(brs,4H),3.99(s,4H),7.33-7.45(m,8H),12.71(brs,2H);质量(M++1):561.2
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(1H-吲哚-3-基)乙酰胺)(87):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.73(s,4H),2.98(s,4H),3.88(s,4H),6.97-7.00(t,2H),7.06-7.09(t,2H),7.28(s,2H),7.35-7.36(d,2H),7.55-7.56(d,2H),10.96(s,2H),12.58(s,2H);质量(M++1):571.7
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-甲基-2-苯基丙酰胺)(88):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.60(s,12H),1.77(brs,4H),3.01(brs,4H),7.25-7.37(m,10H),11.97(brs,2H);质量(M++1):549.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(2,5-二氧代咪唑烷-4-基)乙酰胺)(89):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.76(brs,4H),2.77-2.81(ABq,2H),2.90-2.94(ABq,2H),3.01(brs,4H),4.35(t,2H),7.93(s,2H),10.66(brs,2H),12.53(brs,2H);质量(M++1):537.2
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))二环己烷甲酰胺(90):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.16-1.28(m,6H),1.35-1.42(m,4H),1.64(brd,2H),1.72-1.82(m,12H),2.54(m,2H),3.00(brs,4H),12.30(brs,2H);质量(M++1):477.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(3-(2-氯苯基)丙酰胺)(91):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.76(s,4H),2.76-2.79(t,4H),3.01-3.04(t,8H),7.24-7.29(m,2H),7.34-7.35(m,2H),12.42(s,2H);质量(M++1):589.7
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(3-氧代-1,3-二氢异苯并呋喃-1-基)乙酰胺)(93):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:12.61(s,2H),7.74-7.87(m,4H),7.73-7.74(d,2H),7.61-7.64(t,2H),6.02-6.04(m,2H),3.05(s,4H),2.91-2.96(m,2H),1.79-1.80(d,4H)。质量(M+1):605.2
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))二乙酰胺(94):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.77(t,4H),2.16(s,6H),3.01(t,4H),12.39(s,2H);质量(M++1):341.1
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))二环戊烷甲酰胺(95):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.59(m,4H),1.59-1.72(m,8H),1.76(s,4H),1.85-1.90(m,4H),2.51-2.96(m,2H),3.01(s,4H),12.38(s,2H);质量(M++1):449.7
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(3-(3,4,5-三甲氧基苯基)丙酰胺)(101):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.77(m,4H),2.76(t,4H),2.86(t,4H),3.01(m,4H),3.61(s,6H),3.72(s,12H),6.53(s,4H),12.40(brs,2H);质量(M++1):701.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))二环丁烷甲酰胺(102):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.81-1.94(m,6H),1.96-1.98(t,2H),2.10-2.25(m,6H),3.01(s,4H),3.33-3.40(m,2H),12.26(s,2H);质量(M++1):421.7
N,N'-(2,2'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(氮烷二基)双(2-氧代乙烷-2,1-二基))二苯甲酰胺(103):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:.59(s,2H),8.94-8.96(t,2H),7.88-7.90(t,4H),7.48-7.58(m,6H),4.18-4.19(d,4H),3.03(s,4H),1.77(s,4H)。质量(M+1):579.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(3-(2,3-二甲氧基苯基)丙酰胺)(106):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:12.41(s,2H),6.97-6.98(m,2H),6.89-6.90(m,2H),6.76-6.78(m,2H),3.79(s,6H),3.71(s,6H),3.00-3.01(d,4H),2.87-2.90(t,4H),2.70-2.73(t,4H),1.76(s,4H)。质量(M+1):641.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(4-(二甲基氨基)苯基)乙酰胺)(107):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:12.55(s,2H),7.12-7.13(d,4H),6.66-6.68(d,4H),3.63(s,4H),2.98-2.99(d,2H),2.85(s,12H),1.73(s,4H)。质量(M+1):579.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(3-苯氧基丙酰胺)(111):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:12.57(s,2H),7.26-7.29(m,4H),6.92-6.95(m,6H),4.26-4.28(t,4H),3.01-3.02(d,4H),2.93-2.96(t,4H),1.77(s,4H)。质量(M+1):553.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(4-氧代-4-苯基丁酰胺)(112):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.75(s,4H),2.82-2.85(t,4H),3.00(s,4H),3.39-3.41(t,4H),7.53-7.56(t,4H),7.64(m,2H),7.98-8.00(t,4H),12.50(s,2H);质量(M++1):577.7
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(4-氯苯基)乙酰胺)(113):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.74(s,2H),3.00(s,4H),3.81(s,4H),7.33-7.40(m,8H),12.66(s,2H);质量(M++1):562.7
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(3-甲基丁酰胺)(115):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:0.92(d,12H),1.77(m,4H),2.08(m,4H),2.34(d,4H),3.02(m,4H),12.38(s,2H);质量(M++1):425.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-o-甲苯基乙酰胺)(114):.
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:12.66(s,2H),7.14-7.24(m,8H),3.83(s,4H),2.99-3.00(t,4H),2.25(s,6H),1.74(s,4H)。质量(M+1):521.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(2-甲基-1H-吲哚-3-基)乙酰胺)(116):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:12.59(s,2H),10.87(s,2H),7.46-7.48(d,2H),7.22-7.24(d,2H),6.90-6.99(m,4H),3.82(s,4H),2.97(s,4H),2.37(s,6H),1.72(s,4H)。质量(M+1):599.2
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(4-(苄氧基)苯基)乙酰胺)(117):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:12.64(s,2H),7.31-7.45(m,10H),7.21-7.25(t,2H),6.88-6.99(m,6H),5.08(s,4H),3.75(s,4H),3.00(s,4H),1.75(s,4H)。质量(M+1):705.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(2,4-二甲氧基苯基)乙酰胺)(119):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.75(brs,4H),3.00(brs,4H),3.68(s,4H),3.71(s,6H),3.75(s,6H),6.48(dd,2H),6.54(d,2H),7.10(d,2H),12.49(brs,2H);质量(M++1):613.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-间甲苯基乙酰胺)(120):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:1.74(m,4H),2.29(s,6H),3.00(m,4H),3.74(s,4H),7.06-7.13(m,6H),7.21(m,2H),12.65(brs,2H);质量(M++1):521.3
N,N'-(5,5'-(丁烷-1,4-二基)双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-环己基乙酰胺)(121):
1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ:0.95(m,4H),1.10-1.25(m,6H),1.58-1.65(m,10H),1.76(m,6H),2.33(d,4H),3.00(m,4H),12.36(brs,2H);质量(M++1):505.3
实例15
3,3'-磺酰基二丙酸(I-14):
将3,3'-硫代二丙酸(1当量)和过硫酸氢钾(2.93当量)的混合物放入THF、MeOH、H2O(1:1:1)中并在室温下搅拌8h。使用HCl使反应混合物达到pH5,然后用EtOAc萃取。将有机层在真空中浓缩,以提供希望的产物I-14,将其按原样用于下一步骤。
5,5'-(2,2'-磺酰基双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-2-胺)(I-15):
将3,3'-磺酰基二丙酸(1当量)和氨基硫脲(2当量)的混合物放入POCl3(10倍)中并在90℃下搅拌3h。将反应混合物冷却至室温并倒在冰上。对所得混合物进行过滤,并且随后使用KOH使其达到pH14。将混合物过滤,用水洗涤并干燥,以提供希望的产物I-15,将其按原样用于下一步骤。
用于合成化合物(I-16)的通用程序:
将二胺I-15(1当量)放入DMF中并冷却至0℃。然后添加HATU(3当量),随后添加DIPEA(3当量)并搅拌10min。添加对应的酸(3当量)并将反应混合物在室温下搅拌过夜。通过LCMS监测反应的进程。反应完成后,将水添加至反应混合物中并搅拌10min。将混合物通过布氏漏斗过滤,用水洗涤并干燥。将粗产物通过标准程序纯化,以提供希望的产物I-16。
通过遵循如针对I-16描述的通用程序合成以下化合物:
N,N'-(5,5'-(2,2'-磺酰基双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(3,4-二甲氧基苯基)乙酰胺)(30):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:3.51-3.53(m,4H),3.67-3.74(m,20H),6.83-6.94(m,6H),12.64(brs,2H);质量(M++H):677.2
N,N'-(5,5'-(2,2'-磺酰基双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(4-甲氧基苯基)乙酰胺)(31):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:3.42(m,18H),6.87-6.88(d,4H),7.21-7.23(d,4H);质量(M++H):617.1
N,N'-(5,5'-(2,2'-磺酰基双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-(四氢-2H-吡喃-2-基)乙酰胺)(33):
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:1.36(m,2H),1.46(m,6H),1.60(m,2H),1.76(m,2H),2.60(m,4H),3.29(m,2H),3.46(m,4H),3.71(m,6H),3.82(m,2H),9.29(brs,2H);质量(M++H):573.2
实例16
N,N'-(5,5'-(2,2'-硫代双(乙烷-2,1-二基))双(1,3,4-噻二唑-5,2-二基))双(2-甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-甲酰胺)(34):
将二胺I-2(1当量)放入DMF中并冷却至0℃。然后添加HATU(3当量),随后添加DIPEA(3当量)并搅拌10min。添加对应的酸(3当量)并将反应混合物在室温下搅拌过夜。通过LCMS监测反应的进程。反应完成后,将水添加至反应混合物中并搅拌10min。将混合物通过布氏漏斗过滤,用水洗涤并干燥。将粗产物通过标准方法纯化,以提供希望的产物34。
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:2.51-2.54(d,6H),3.01-3.04(t,4H),3.32-3.34(t,4H),7.52-7.58(d,2H),7.91-7.92(d,2H),8.25-8.37(d,2H),12.56(brs,4H);质量(M++H):605.2
实例17
用于制备化合物I-144a-b的通用程序:
向THF(6ml)中的甲基2-(4-羟基苯基)乙酸酯I-142(2.4mmol)的搅拌溶液里添加三苯基膦(3.6mmol),随后经30分钟的时间,添加适当的Boc-氨基醇I-143a-b(3.6mmol)、3mlTHF中的DEAD(3.6mmol)并且将反应混合物在室温下搅拌3h。反应完成后,将溶剂在减压下除去并用乙酸乙酯萃取。将有机层用盐水洗涤,用无水硫酸钠干燥并在减压下蒸发,以提供粗产物,将其通过标准方法纯化,以提供希望的产物。
I-144a(n=1):1HNMR(400MHz,TFA)δ:1.4(s,9H),3.4(t,2H),3.5(s,2H),3.7(s,3H),4.0(t,2H),5.0(brs,1H),6.8(d,2H),7.2(d,2H)。
用于制备化合物I-145a-b的通用程序:
向THF和水(1:1,20ml)中的甲酯I-144a-b(2.1mmol)的搅拌悬浮液里添加氢氧化锂(4.2mmol)并将反应混合物在室温下搅拌4h。反应完成后,将溶剂在减压下除去并用水性柠檬酸酸化。将溶液萃取进乙酸乙酯中,用盐水洗涤,用无水硫酸钠干燥并在减压下蒸发,以提供粗产物,将其按原样用于下一步骤。
I-145a(n=1):1HNMR(400MHz,TFA)δ:1.4(s,9H),3.4(t,2H),3.5(s,2H),4.0(s,2H),5.0(brs,1H),6.8(d,2H),7.2(d,2H)。
N-(5-(2-((2-(5-氨基-1,3,4-噻二唑-2-基)乙基)磺酰基)乙基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-2-苯基乙酰胺(I-146):
向丙酮和水(2:1,4.5ml)中的N-(5-(2-((2-(5-氨基-1,3,4-噻二唑-2-基)乙基)硫代)乙基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-2-苯基乙酰胺I-139(1.2mmol)的搅拌溶液里添加过硫酸氢钾(1.8mmol)并将反应混合物在室温下搅拌3h。反应完成后,将溶剂在减压下除去并用乙酸乙酯萃取。将有机层用盐水洗涤,用无水硫酸钠干燥并在减压下蒸发,以提供粗产物,将其通过标准方法纯化,以提供希望的产物。
ESMS针对C16H18N6O3S3计算的:438.54,观察到的:438.10(M+)。
用于制备化合物I-147a-b的通用程序:
在0℃下,向在DMF中的N-(5-(2-((2-(5-氨基-1,3,4-噻二唑-2-基)乙基)磺酰基)乙基)-1,3,4-噻二唑-2-基)-2-苯基乙酰胺I-146(1当量)的搅拌溶液里添加适当的胺I-145a-b(1当量)、DIPEA(1.5当量),随后添加HATU(1.5当量)并搅拌10min。将反应混合物在室温下搅拌3h。通过TLC监测反应的进程。反应完成后,将水添加至反应混合物中并搅拌10min。将混合物通过布氏漏斗过滤,用水洗涤并干燥。将粗产物通过标准方法纯化,以提供希望的产物I-147a-b。
I-147a:1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ:1.4(s,9H),3.2-3.4(m,4H),3.4-3.5(m,4H),3.6-3.7(m,6H),3.8(s,2H),3.9(t,2H),7.0(d,2H),7.2(d,2H),7.3-7.4(m,5H)。
用于制备化合物I-148a-b的通用程序:
在0℃下,向在二氯甲烷(15ml)中的里I-147a-b(0.27mmol)的搅拌溶液里添加三氟乙酸(0.6ml)并在室温下搅拌3h。反应完成后,将混合物在减压下浓缩并用氨中和,过滤并用MeOH洗涤并干燥,以提供希望的产物。
2-(4-(2-氨基乙氧基)苯基)-N-(5-(2-((2-(5-(2-苯基乙酰胺基)-1,3,4-噻二唑-2-基)乙基)磺酰基)乙基)-1,3,4-噻二唑-2-基)乙酰胺(29):
1HNMR(400MHz,TFA)δ:3.8(m,2H),3.82-4.0(m,8H),4.1-4.2(m,4H),4.4(m,2H),7.0(d,2H),7.32-7.52(m,8H);质量(M++1):616.3
2-(4-(3-氨基丙氧基)苯基)-N-(5-(2-((2-(5-(2-苯基乙酰胺基)-1,3,4-噻二唑-2-基)乙基)磺酰基)乙基)-1,3,4-噻二唑-2-基)乙酰胺(36):
1HNMR(400MHz,TFA)δ:2.3(s,2H),3.59(s,2H),3.8-3.9(m,8H),3.9-4.0(m,6H),4.23(m,2H),6.9-7.0(m,4H),7.2-7.4(m,5H),11.45(brs,2H);质量(M++1):630.4
已经如此描述了若干实施例的若干方面,应该了解本领域的普通技术人员将容易地想到不同的改变、修改以及改良。这些改变、修改以及改良打算是本披露的一部分,并且打算在本发明的精神和范围内。因此,以上说明和附图只是为了举例。
Claims (19)
1.一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐:
其中
X是化学键、-S-、-S(O)-、-SO2-、-CH=CH-、-NH-或-C(O)-;
每个W、Y和Z独立地是-S-、-CH=、-CH=CH-、-CH=CR1-、-CR1=CR1-、-O-、-N=或-NH-,其条件是(1)对于每个环而言,W、Y和Z中的至少一个不是-CH=并且(2)当W中的一个是-S-并且同一个环上的Y是N时,则同一个环上的Z不是-CH=;
每个R1和R2独立地是C1-6亚烷基-R4、-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-R4、-C(O)-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-O-R4、-N(R3)-C(O)-N(R3)-R4、-O-C(O)-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-C1-6亚烷基-C(O)-R4、-N(R3)-C(O)-C1-6亚烷基-N(R3)-C(O)-R4或-N(R3a)-C(O)-CH2-N(R3)-C(O)-R4;
每个R3独立地是氢、C1-6烷基或芳基;
每个R4独立地是C1-6烷基、C1-6烯基、芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳烷基、杂环基烷基、杂环基、环烷基或环烷基烷基,其中的每个被出现0-3次的R5或两个相邻的R5部分取代,这两个相邻的R5部分与它们附接的原子一起形成一个杂环基、杂芳基、环烷基或芳基;
每个R5独立地是氧代(=O)、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、氰基、卤素、-OH、-SH、-OCF3、-SO2-C1-6烷基、-NO2、-N(R7)-C(O)-C1-6烷基、-N(R6)2、-O-C(O)-C1-6烷基、C3-7环烷基、(C3-7环烷基)烷基、芳基、芳氧基、-C(O)-芳基、杂芳基、芳烷基、杂芳烷基、杂环基烷基或杂环基,其中每个芳基、杂芳基或杂环基进一步被出现0-3次的R7取代;
每个R6独立地是氢、氟、OH或C1-6烷基;
每个R7独立地是氢、C1-6烷基、-OH、-SH、氰基、卤素、-CF3、-OCF3、-SO2-C1-6烷基、-NO2、-N(R7)-C(O)-C1-6烷基、-N(R6)2或C1-6烷氧基;
m是1、2或3;
n是1、2或3;其条件是当X是键时,则m和n的总和是从3至6并且当X是-S-、-S(O)-、-SO2-、-CH=CH-或-C(O)-时,则m和n的总和是从2至4;
o是1、2或3;并且
p是1、2或3;
其条件是:(1)当X是-S-,m和n都是2,每个R6都是H时,则(i)R1和R2不都是-NHC(O)-R4,其中R4是C1-6烷基、单环的环、单环的芳烷基、单环的杂环基烷基、单环的杂芳烷基并且R4的每个成员都被出现0-3次的R5取代;并且(ii)R1和R2不都是-NHC(O)O-甲基、-NHC(O)O-乙基、-NHC(O)-6-嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮基、-N(乙基)C(O)-苄基或-NHC(O)NH-苯基,其中该-NHC(O)NH-苯基部分的所述苯基任选地被1个或2个选自甲基、硝基和卤素的基团取代;
(2)当X是-S-,m和n都是1,每个R6都是H时,则(i)R1和R2不都是-NH-苯基或-NH-4-甲氧基-苯基或-NHC(O)-苄基;
(3)当X是化学键,m和n的总和是3,每个R6都是H时,则R1和R2不都是-NHC(O)-R4,其中R4是单环的芳基或单环的芳烷基或甲基,并且R4的每个成员都任选地被出现0-3次的R5取代;
(4)当X是化学键,m和n都是2,每个R6都是H时,则R1和R2不都是-NHC(O)-呋喃基、-NHC(O)-苯基、-NHC(O)-o-甲氧基-苯基、-NHC(O)-C1-6烷基、-NH-苄基、-NHC(O)-NH-苯基、-NHC(O)-NH-苄基或-NH-苯基,其中该-NH-苯基部分的所述苯基被出现0-3次的R5取代;
(5)当X是化学键,m和n的总和是5,每个R6都是H时,则R1和R2不都是-NHC(O)-C1-6烷基、-NHC(O)-环己基或-NH-苯基,其中该-NH-苯基部分的所述苯基任选地被甲基取代;并且
(6)当X是化学键,m和n都是3,每个R6都是H时,则R1和R2不都是NH-苯基;
(7)当X是化学键,m和n都是2,并且W、Y或Z中的一个是-CH=CH-或-CH=CR1-时,则R1和R2不都是-NHC(O)C(R*)2-苯基,其中该苯基未被取代或被出现0-3次的R5取代并且R*是H、-OH、-C1-2烷基-OH、-C1-2烷基-OCH3或-CH3;
(8)当X是化学键,m和n都是2,W、Y或Z中的一个是-CH=CH-或-CH=CR1-并且R1和R2中的一个是-NHC(O)CH2-R^,其中R^是氢、-NH2、杂芳基或稠合环,其中该杂芳基未被取代或被出现0-3次的R5;-NHC(O)NH-苄基;或-NHCO2-苄基取代时;则R1和R2中的另一个不是-NHC(O)C(R*)2-苯基,其中该苯基未被取代或被出现0-3次的R5取代,并且R*是H、-OH、-C1-2烷基-OH、-C1-2烷基-OCH3或甲基;
(9)该具有式(I)的化合物不是:
2.如权利要求1所述的化合物,其中X是-S-、-S(O)-、-SO2-、化学键、-C(O)-或-CH=CH-。
3.如权利要求1所述的化合物,其中X是-S(O)-、-SO2-、-C(O)-或-CH=CH-。
4.如权利要求1所述的化合物,其中每个R1和R2独立地是-N(R3)-R4、-C(O)-N(R3)-R4、-N(R3)-C(O)-O-R4或-N(R3)-C(O)-N(R3)-R4。
5.如权利要求4所述的化合物,其中X是-S-并且m和n都是2。
6.如权利要求1所述的化合物,其中W、Y和Z中的至少一个是-CH=CH-、-CH=CR1-或-CR1=CR1-。
7.如权利要求1所述的化合物,其中每个W都是-S-,每个Y都是-N=并且每个Z都是-N=。
8.如权利要求1所述的化合物,其中每个W都是-CH=,每个Z都是-O-并且每个Y都是-N=。
9.如权利要求1所述的化合物,其中o是1并且p是1。
10.如权利要求1所述的化合物,其中R1和R2各自是-N(R3)-C(O)-O-R4,其中R3是氢。
11.如权利要求10所述的化合物,其中R1和R2是相同的。
12.如权利要求1所述的化合物,其中该化合物是一种具有式(II)的化合物:
13.如权利要求12所述的化合物,其中R1和R2是相同的。
14.如权利要求1所述的化合物,其中该化合物是一种具有式(III)的化合物:
15.如权利要求1所述的化合物,其中该具有式(I)的化合物选自表1的化合物1-132。
16.一种药物组合物,包含一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐。
17.一种治疗癌症的方法,该方法包括向对其有需要的受试者给予如权利要求1所述的化合物或如权利要求16所述的组合物。
18.如权利要求17所述的方法,其中该癌症选自一种以i)与一种参考标准相比较低的E-钙粘素表达水平,ii)与一种参考标准相比较高的波形蛋白表达水平或iii)较低的或降低的丙酮酸羧化酶表达水平为特征的癌症。
19.如权利要求17所述的方法,其中该癌症是肺癌、非小细胞肺癌、乳腺癌、肝细胞癌、骨肉瘤、脂肪瘤、软骨肉瘤或间皮瘤。
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