CN103555751A - 一种基于双阻遏策略增强大肠杆菌t7表达***稳定性的方法 - Google Patents
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Abstract
一种基于双阻遏策略增强大肠杆菌T7表达***稳定性的方法,属于大肠杆菌表达调控领域。本发明利用基因工程技术,以细菌来源的普鲁兰酶为表达蛋白,构建了表达普鲁兰酶的重组大肠杆菌。通过使用含有lac操纵子和阻遏物基因lacI的pET表达载体pET-22b(+)和pET-28a(+),构建了重组菌E.coli BL21/pET-22b(+)-pul和E.coli BL21/pET-28a(+)-PelB-pul,利用lac操纵子严谨的双阻遏调控策略,基本消除了毒性外源蛋白的本底表达,提高了冷冻甘油菌种的表达稳定性和乳糖自诱导后的目标蛋白表达量,增强了大肠杆菌表达***稳定性。本发明解决了大肠杆菌T7表达***中常见的***稳定性问题,开发了增强大肠杆菌T7表达***稳定性的方法。
Description
技术领域
一种基于双阻遏策略增强大肠杆菌T7表达***稳定性的方法,属于大肠杆菌表达调控领域。
背景技术
重组技术已广泛用于目标蛋白的高水平表达。 在多种可用于异源蛋白表达的***中,大肠杆菌***始终是最常用的表达宿主。与其他表达宿主相比,大肠杆菌具有众多优势,如遗传背景清楚、生长迅速、可在价格低廉的培养基中达到高密度和拥有过量表达目标蛋白的能力。基于T7 RNA聚合酶的T7***表达的目标蛋白量可高达细胞总蛋白量的50%,因此显示了与其他大肠杆菌***的优势。
T7 RNA聚合酶合成mRNA的速度是大肠杆菌自身RNA聚合酶的5倍,其高活力赋予了T7***强大的合成重组蛋白的能力。但T7 RNA聚合酶的高活力已被证明了对表达***存在一些负面作用,主要表现为:虽然T7 RNA聚合酶的编码基因,位于大肠杆菌宿主BL21(DE3)染色体上的T7基因受到lacUV5启动子和lac操纵子序列的调控,只有极少量的T7 RNA聚合酶“渗漏”表达,但由于T7 RNA聚合酶活力过高,即使没有诱导物存在,目标基因的转录也能被引发,产生本底表达。如果目标蛋白对大肠杆菌细胞有毒性,这种本底表达将会影响表达***的稳定性和目标蛋白的正常表达,甚至表达菌株可能不稳定或积累有害突变。
已有一些研究致力于减少大肠杆菌T7表达***的本底表达。一种减少本底表达的方法是使用含有与pET载体兼容的pLysS或pLysE质粒的宿主菌。这两种载体表达的T7溶菌酶,是T7 RNA聚合酶的天然抑制剂,能与T7 RNA聚合酶结合并抑制后者的活性。然而,虽然BL21(DE3) pLysS菌株的本底表达水平几乎只有BL21(DE3)菌株的十分之一,但前者的本底表达依然存在,并且依然可能引起***不稳定的问题。而且,T7溶菌酶是一种双功能的蛋白,它对大肠杆菌细胞壁具有破坏作用,因此含有pLysS或pLysE质粒的菌株生长较慢。另外诱导后,T7溶菌酶将减弱表达,使目标蛋白表达量很低。向培养基中添加0.5-1%葡萄糖,产生的代谢阻遏效应也能够降低T7 RNA聚合酶的本底表达。
以上的方法都是直接针对T7 RNA聚合酶的本底表达而设计的,目标都是减少T7 RNA聚合酶的本底表达。本发明开发出一种不直接减弱T7 RNA聚合酶的本底表达,但可以阻止T7 RNA聚合酶引发表达质粒上外源基因转录的方法。在pET载体的T7启动子下游***lac操纵子,形成T7-lac启动子,能有效地降低目标蛋白的本底表达。T7-lac启动子可提供一个lac阻遏物的结合位点,当体系中不存在诱导物时,lac阻遏物可紧紧地结合于T7-lac启动子的lac操纵子序列上,阻止由本底表达产生的T7 RNA聚合酶通过,干扰了mRNA链的延伸,从而减少外源基因在未诱导状态下的本底转录。如果***中存在足够量的lac阻遏物以占据细胞中所有的lac操纵子位点,未诱导细胞中目标蛋白的本底表达将几乎被完全地消除,表达***也将获得稳定。
发明内容
(一)要解决的技术问题
本发明的目的是提供增强大肠杆菌T7表达***稳定性的方法。本发明以细菌来源的普鲁兰酶为表达蛋白,使用了含有lac操纵子和阻遏物基因lacI的pET表达载体,利用lac操纵子严谨的双阻遏调控策略,基本消除了毒性报道蛋白的本底表达,提高了大肠杆菌表达***稳定性,从而开发了增强大肠杆菌T7表达***稳定性的方法。
(二)技术方案
一种基于双阻遏策略增强大肠杆菌T7表达***稳定性的方法,首先构建了表达长野芽胞杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC M 2012388普鲁兰酶的重组大肠杆菌E.coli BL21(DE3)/ pET-20b(+)-pul,该重组菌携带的表达载体pET-20b(+)不含有lac操纵子和阻遏物基因lacI。在诱导表达过程中发现报道蛋白存在本底表达,并且重组菌的冷冻甘油管在冻存过程中表达水平不断下降,表明表达***存在不稳定的现象。因此使用含有lac操纵子和阻遏物基因lacI的载体pET-22b(+)及pET-28a(+),利用lac操纵子严谨的双阻遏调控策略,构建了重组菌E.coliBL21/ pET-22b(+)-pul和E.coliBL21/pET-28a(+)-PelB- pul。比较了三株重组大肠杆菌的本底表达水平、冷冻甘油管表达量稳定性和乳糖自诱导后的目标蛋白表达量。
(1)普鲁兰酶基因的获得
长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC M 2012388培养基:CaCl2 0.25 g/L,MgSO4·7H2O 0.5 g/L,(NH4)2SO4 0.2 g/L,酵母提取物 2 g/L,无水葡萄糖 5 g/L,KH2PO4 3 g/L,无机盐溶液1 mL/L,pH 5.0,双蒸水配制。
无机盐溶液:ZnSO4·7H2O 0.1 g/L,MnCl2·H2O 0.03 g/L,H3BO3 0.3 g/L,CoCl2·6H2O 0.2 g/L,CuCl2·2H2O 0.01 g/L,NiCl2·6H2O 0.02 g/L,Na2MoO4·2H2O 0.03 g/L,双蒸水配制。
将长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC M 2012388菌种接种于含有25 mL培养基的250 mL摇瓶中,于37℃、200 rpm振荡培养72 小时。培养结束后,将菌体离心并用生理盐水洗涤两次,收集细胞利用基因组DNA提取试剂盒Genomic DNA Extraction Miniprep System(VIOGENE公司)提取基因组。
引物1:5’- gaacaGGATCCagatgggaacaccacaaaC -3’,
引物2:5’- attccctcgagtttaccatcagatgggct -3’。
引物1含有BamHI限制性酶切位点,引物2含有XhoI限制性酶切位点。
PCR反应体系:ddH2O 37 μL,10×Reaction Buffer 5 μL,dNTP(25 mmol/L)0.5 μL,引物1(50 pmol/μL)1 μL,引物2(50 pmol/μL) 1 μL,基因组DNA 5 μL,Taq DNA polymerase(5 U/μL)0.5 μL。
以长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC M 2012388基因组为模板,采用PCR方法扩增普鲁兰酶基因。PCR反应过程:95℃预变性5 min;95℃ 1 min、60℃ 0.5 min、72℃ 2 min,进行30个循环;72℃延伸10 min。
利用3S Spin Agarose Gel DNA Purification Kit(上海申能***生物科技有限公司)纯化DNA片断。
DNA溶液中加入1/10体积的乙酸钠溶液(3 mol/L,pH 5.2)和2倍体积无水乙醇,-20℃沉淀1小时。12000 rpm于4℃离心30 min。加入75%乙醇500 μL洗涤,12000 rpm于4℃离心30 min,无菌操作台吹干后溶于适量TE缓冲液中,立即使用或-20℃保存。
(2)含有普鲁兰酶基因的重组大肠杆菌的构建
a、pET-20b(+)-pul的构建
利用质粒提取试剂盒Mini-Plasmid Rapid Isolation Kit(北京博大泰克生物基因技术有限公司)提取质粒pET20b(+)。
按照水、缓冲液、PCR产物或质粒DNA、酶的顺序加到Eppendorf管中,盖好管盖,振荡使液体充分混匀,置于离心机内离心2秒钟使液体集中于管底,37℃水浴3小时,在管中加入1/10体积的Loading Buffer或将管置于65℃保温10分钟,终止酶切反应。酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳分析并切胶回收目的片段,浓缩。
反应体系组成:10×H Buffer 4 μL,DNA 10 μL,BamHI 2 μL,XhoI 2 μL,ddH2O将体系补足40 μL。
目的基因与质粒pET20b(+)的连接
将普鲁兰酶基因与质粒pET20b(+)连接,反应体系组成如下:质粒pET-20b(+) 0.8 μL,普鲁兰酶基因4.2 μL,Ligation Solution 5 μL。混合连接液,将其置于16℃培养箱中连接反应12小时。
重组质粒转化大肠杆菌
在100 μL大肠杆菌E. coli BL21(DE3)感受态细胞悬液中加入10 μL连接产物,轻轻混匀,冰浴中静置30分钟。转入42℃水浴中,热击90秒。快速转移至冰浴中,冷却2分钟。加入700 μL的LB液体培养基,37℃、100 rpm摇床温育培养1小时。培养后菌液3000 rpm离心2分钟,弃上清600 μL,剩余菌液混匀后涂布到含有50 μg/mL 氨苄抗生素的LB平板上,37℃倒置培养。获得含有目的普鲁兰酶基因的重组大肠杆菌E. coli BL21 (DE3)/pET-20b(+)-pul。
b、pET-22b(+)-pul和pET-28a(+)-PelB- pul的构建
将重组质粒pET-20b(+)-pul和表达载体pET-28a(+)、pET-22b(+)分别用限制性内切酶XbaI和XhoI分步单酶切。按照水、缓冲液、质粒、酶的顺序加到Eppendorf管中,盖好管盖,振荡使液体充分混匀,置于离心机内离心2秒使液体集中于管底,37℃水浴3小时,在管中加入1/10体积的Loading Buffer或将管置于65℃保温10分钟,终止酶切反应。酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳分析并切胶回收目的片段,浓缩。反应体系组成:10×H Buffer 4 μL,DNA 10 μL,XbaI 2 μL,XhoI 2 μL,ddH2O将体系补足40 μL。
将胶回收线性化的目标片段分别与pET-28a(+)及pET-22b(+)载体连接,反应体系组成如下:质粒载体1 μL,目标片段4 μL,Ligation Solution 5 μL。混合连接液,将其置于16℃培养箱中连接反应12小时。
重组质粒转化大肠杆菌
在100 μL大肠杆菌E. coli BL21(DE3)感受态细胞悬液中加入10 μL连接产物,轻轻混匀,冰浴中静置30分钟。转入42℃水浴中,热击90秒。快速转移至冰浴中,冷却2分钟。加入700 μL的LB液体培养基,37℃、100 rpm摇床温育培养1小时。培养后菌液3000 rpm离心2分钟,弃上清600 μL,剩余菌液混匀后涂布到含有50 μg/mL 卡那霉素的LB平板上,37℃倒置培养。获得含有目的普鲁兰酶基因的重组大肠杆菌E. coli BL21(DE3)/pET-28a(+)-PelB-pul及E. coli BL21 (DE3)/pET-22b(+)-pul。
双阻遏效应基本上消除了重组大肠杆菌的本底表达现象,重组大肠杆菌冷冻甘油管的表达显示双阻遏效应可维持表达***的稳定性,及重组大肠杆菌自诱导表达的稳定性得到提高。
(3)、重组大肠杆菌的本底表达比较
LB培养基:胰蛋白胨10 g/L,酵母提取物5 g/L,NaCl 10 g/L,pH7.0,双蒸水配制。需要时使用前加入氨苄青霉素(100μg/mL)或卡那霉素(50 μg/mL),固体培养基添加15 g/L琼脂粉。
挑取新转化的重组大肠杆菌单菌落接种于3 mL含相应抗生素的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养过夜。取0.5 mL培养液转接于50 mL含相应抗生素的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养至OD600约为1.2。培养液转入20℃中继续培养12小时。培养结束后,将发酵液于10000 rpm离心10分钟,菌体沉淀超声破碎,破碎液于12000 rpm离心20分钟,取上清液用于胞内普鲁兰酶酶活测定。
经酶活检测,E. coli BL21(DE3)/pET-20b(+)-pul的胞内组分酶活约为1.9 U/mL,而E. coli BL21(DE3)/pET28a(+)-PelB-pul及E. coli BL21(DE3) /pET-22b(+)-pul的胞内组分则没有测到酶活,表明由于表达载体pET-22b(+)和pET-28a(+)中的lac操纵子和阻遏物基因lacI的存在,阻遏物可同时结合于大肠杆菌染色体上T7基因上游的lac操纵子和表达载体的lac操纵子上,这种双阻遏效应基本上消除了本底表达现象。
普鲁兰酶测定方法
取100 μL用100 mM、pH 5.0的醋酸缓冲液适当稀释的酶液与等体积的溶于100 mM、pH 5.0醋酸缓冲液中的10 g/L 普鲁兰相混合于50 ℃水浴中保温30分钟。加入DNS试剂300 μL摇匀,置于沸水中煮沸15分钟,取出以流动水迅速冷却后,于540 nm波长处,以0.5 cm比色杯,测定反应液的吸光度值。
酶活单位定义:在上述指定的条件下,每分钟催化分解普鲁兰多糖生成相当于1 μmol葡萄糖的还原糖所需的酶为1个酶活单位(U)。
(4)、重组大肠杆菌冷冻甘油管的表达稳定性比较
三种重组表达质粒转化E.coli BL21(DE3)感受态细胞,转化子长出后立刻接种于3 mL含相应抗生素的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养过夜。取0.5 mL培养液转接于50 mL含相应抗生素的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养至OD600约为1.2。培养液转入20℃中继续培养12小时。培养结束后,将发酵液于10000 rpm离心10分钟,上清留样为胞外组分。菌体沉淀超声破碎,破碎液于12000 rpm离心20分钟,取上清液为胞内组分。测定胞内外酶活结果为第一批的IPTG诱导表达结果。剩余试管种子液用于保存冷冻甘油管,于-70℃中冷冻保存。分别在冻存2天及4天后取出用于第二、第三批诱导表达。测定比较各工程菌的胞内外总酶活。
比较不同发酵批次的酶活结果发现,随着在-70℃中冻存天数的增加,E. coli BL21(DE3)/pET-20b(+)-pul的产酶能力不断下降。菌种在-70℃中冻存4天,在LB培养基中发酵后胞内酶活下降到新转化菌种发酵酶活的38%,说明该工程菌在冻存状态下性能不稳定,目标蛋白的表达能力会迅速下降。而E. coli BL21(DE3)/pET-22b(+)-pul和E. coli BL21(DE3)/pET-28a(+)-PelB- pul的酶活水平则一直约为15 U/mL,即一直保持着最初的产酶能力,说明载体中lac操纵子产生的双阻遏效应可维持表达***的稳定性,使这两株工程菌在冻存状态下可保持正常的产酶性能。
(5)、重组大肠杆菌自诱导表达的比较
自诱导培养基(g/L):β-乳糖 1~50,无水葡萄糖0.5,甘油5,KH2PO4 6.8,MgSO4 0.24,胰蛋白胨10,酵母提取物5,Na2HPO4 7.1,Na2SO4 0.71,NH4Cl 2.67,痕量元素溶液 400 μL/L,pH 7.5~8.0,双蒸水配制。
痕量元素溶液(g/L):FeCl3 8.125,CaCl2 2.22,MnCl2 2.52,ZnSO4 1.61,CoCl2 0.26,CuCl2 0.27,NiCl2 0.26,Na2MoO4 0.41,Na2SeO3 0.346,H3BO3 0.124,HCl 2.19,双蒸水配制。
三种重组表达质粒转化E.coli BL21感受态细胞,转化子长出后立刻接种于3 mL含相应抗生素的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养过夜。取2mL培养液接种于50mL含相应抗生素的自诱导培养基中,37℃、200rpm下培养2小时后转入20℃中继续培养70小时。分别测定胞内外酶活水平。
发酵结束后,E. coli BL21(DE3)/pET-20b(+)-pul的胞内外总酶活为23 U/mL, 而E. coli BL21(DE3)/pET-22b(+)-pul及E. coli BL21(DE3)/ pET-28a(+)-PelB-pul的总酶活均为550 U/mL,表明由于载体中lac操纵子的双阻遏效应消除了目标蛋白的本底表达,表达***的稳定性得到提高,使菌种在发酵过程中也能保持目标蛋白的表达能力,不会发生退化。
(三)有益效果
成功克隆了长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC NO:M 2012388普鲁兰酶编码基因,该基因全长2781 bp,编码926个氨基酸残基,其基因的核苷酸序列为:SEQ ID NO:1,其氨基酸组成为SEQ ID NO:2。利用不含有lac操纵子和阻遏物基因lacI的载体pET-20b(+)构建了含有普鲁兰酶基因的重组大肠杆菌E. coli BL21 (DE3)/pET-20b(+)-pul,利用含有lac操纵子和阻遏物基因lacI的载体pET-28a(+)和pET-22b(+)分别构建了含有普鲁兰酶基因的重组大肠杆菌E. coli BL21(DE3)/pET-28a(+)-PelB-pul和E. coli BL21 (DE3)/pET-22b(+)-pul。
使用不含lac操纵子和阻遏物基因的pET载体***E. coli BL21(DE3)/pET-20b(+)-pul表达毒性报道蛋白时,发现存在明显的本底表达和随之引起的表达***不稳定的现象。表达***的不稳定引起了重组菌冷冻甘油管的表达水平下降和在自诱导培养基中表达量偏低的问题。通过使用含有lac操纵子和阻遏物基因的pET载体***E. coli BL21(DE3)/pET-22b(+)-pul和E. coli BL21(DE3)/pET-28a(+)-PelB-pul,毒性报道蛋白的本底表达基本被消除,重组菌冷冻甘油管的蛋白表达能力得到稳定,在自诱导培养基中的蛋白表达量大幅提高。表明lac操纵子严谨的双阻遏调控策略,增强了大肠杆菌表达***的稳定性。这些工作为增强重组大肠杆菌的***稳定性提供了有效策略,对高效表达目标蛋白具有重要意义。
该长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC M 2012388;保藏单位:中国典型培养物保藏中心,简写CCTCC,地址:中国武汉武汉大学,保藏编号CCTCC NO:M 2012388,保藏日期为2012年9月28日。在以前专利申请中已用过,“一种基因重组大肠杆菌及其高效生产普鲁兰酶的方法”,申请号201210481749.3,申请日2012年11月24日。
具体实施方式
实施例1
LB培养基:胰蛋白胨10 g/L,酵母提取物5 g/L,NaCl 10 g/L,pH7.0,双蒸水配制。需要时使用前加入氨苄青霉素(100μg/mL)或卡那霉素(50 μg/mL),固体培养基添加15 g/L琼脂粉。
挑取新转化的E. coli BL21(DE3)/pET-20b(+)-pul单菌落接种于3 mL含卡那霉素(50 μg/mL)的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养过夜。取0.5 mL培养液转接于50 mL含相应抗生素的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养至OD600约为1.2。培养液转入20℃中继续培养12小时。培养结束后,将发酵液于10000 rpm离心10分钟,菌体沉淀超声破碎,破碎液于12000 rpm离心20分钟,取上清液为胞内组分,普鲁兰酶酶活为1.9 U/mL。而E. coli BL21(DE3)/pET28a(+)-PelB-pul及E. coli BL21(DE3) /pET-22b(+)-pul的胞内组分则没有测到酶活。
实施例2
LB培养基:胰蛋白胨10 g/L,酵母提取物5 g/L,NaCl 10 g/L,pH7.0,双蒸水配制。需要时使用前加入氨苄青霉素(100μg/mL)或卡那霉素(50 μg/mL),固体培养基添加15 g/L琼脂粉。
重组质粒pET-20b(+)-pul转化E.coli BL21感受态细胞,转化子长出后立刻接种于3 mL含相应抗生素的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养过夜。取0.5 mL培养液转接于50 mL含相应抗生素的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养至OD600约为1.2。培养液转入20℃中继续培养12小时。培养结束后,将发酵液于10000 rpm离心10分钟,上清留样为胞外组分。菌体沉淀超声破碎,破碎液于12000 rpm离心20分钟,取上清液为胞内组分。胞内外总酶活为15 U/mL,作为第一批的IPTG诱导表达结果。剩余试管种子液用于保存冷冻甘油管,于-70℃中冷冻保存。分别在冻存2天和4天后取出用于第二、第三批诱导表达,酶活结果分别为8.6 U/mL和5.1 U/mL。而E. coli BL21(DE3)/pET-22b(+)-pul和E. coli BL21(DE3)/pET-28a(+)-PelB- pul的酶活水平则一直约为15 U/mL。
实施例3
自诱导培养基(g/L):β-乳糖 1~50,无水葡萄糖0.5,甘油5,KH2PO4 6.8,MgSO4 0.24,胰蛋白胨10,酵母提取物5,Na2HPO4 7.1,Na2SO4 0.71,NH4Cl 2.67,痕量元素溶液 400 μL/L,pH 7.5~8.0,双蒸水配制。
痕量元素溶液(g/L):FeCl3 8.125,CaCl2 2.22,MnCl2 2.52,ZnSO4 1.61,CoCl2 0.26,CuCl2 0.27,NiCl2 0.26,Na2MoO4 0.41,Na2SeO3 0.346,H3BO3 0.124,HCl 2.19,双蒸水配制。
重组质粒pET-22b(+)-pul转化E.coli BL21感受态细胞,转化子长出后立刻接种于3 mL含相应抗生素的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养过夜。取2mL培养液接种于50mL含相应抗生素的自诱导培养基中,37℃、200rpm下培养2小时后转入20℃中继续培养70小时。测得胞内外总酶活为23 U/mL 。而E. coli BL21(DE3)/pET-22b(+)-pul及E. coli BL21(DE3)/ pET-28a(+)-PelB-pul的总酶活均为550 U/mL。
<210> SEQ ID NO: 1
<211> 2781
<212> DNA
<213> 长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC NO:M 2012388
<214>
gatgggaaca ccacaaacat cgtagtccat tattttcgtc ctagtgggga ttatacggat 60
tggaatcttt ggatgtggcc ggagaacggt gatggggctg agtatgattt taatcaaccg 120
actgattctt atggggaggt tgcaagtgtg gacattcctg gaaacccaag tcaagtaggg 180
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ttaagcaaag ggcatgagat ttggctcgtc caaggaaaca gccagatttt ctatagtgaa 300
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ggaactaaag gccctgacaa tgtaaagaca ggggtagatt ccttaaaaca acttgggatt 1440
actcatgttc agcttcagcc tgttttcgca tttaatagtg tcaatgaaaa cgatccaact 1500
caatataatt ggggttatga ccctcgcaac tacaatgttc ctgagggaca atatgctact 1560
aatgcaaacg gaacaactcg gattaaagag tttaaggaaa tggttctttc actccatcag 1620
gaccacattg gggttaatat ggatgttgtt tataatcata cctttgccac gcaaatctct 1680
gacttcgata agattgtacc agaatattac taccgcacgg atgatgctgg taactacact 1740
aacggctcag gtactggaaa cgaaatcgca gccgaaagac caatggttca aaaatttatt 1800
atcgattcac ttaagttttg ggtcaatgag taccacgttg acggtttccg ttttgactta 1860
atggcgttgc ttggaaaaga tacaatgtct aaagctgcca cgcagcttca tgccattgat 1920
ccaggaattg ctctctacgg tgagccatgg acaggaggaa catccgcgct gccagccgat 1980
cagcttttaa caaaaggagc tcaaaaaggc atgggagtgg ctgtatttaa tgacaatctg 2040
cgaaacggtt tggacggcag tgtctttgat tcatctgctc aaggttttgc gacaggtgct 2100
actggtttaa cggatgctat taaaaatgga gttgaaggaa gtattaatga cttcaccgct 2160
tcaccaggcg agacgatcaa ctatgtcaca agtcatgata actataccct ttgggacaag 2220
attgcccaaa gcaatccaaa cgattctgaa gcggatcgaa ttaaaatgga tgagctcgct 2280
caagcgatcg tcatgacctc acaaggcatt cctttcatgc agggcgggga agaaatgctt 2340
cgtacgaaag gcggcaacga caatagctat aatgctggtg atgtagtgaa cgagtttgat 2400
tggagcagaa aagctcaata tccagatgtt ttcaattatt atagcgggct gattcatctt 2460
cgtcttgatc acccagcctt ccgcatgacg acagctaatg aaatcaatag ccacctccaa 2520
ttcctaaata gcccagagaa cacagtggcc tatgaattat ctgatcatgc aaataaagat 2580
acatggggta atattgtggt tatttataat ccaaataaaa cggcagaaac cattaatttg 2640
ccaagcggga aatgggaaat caatgcgacg agcggtaagg tgggagaatc cacacttggt 2700
caagcagagg gcagtgttca agttccaggc atatctatga tgattcttca tcaagaagta 2760
agcccatctg atggtaaata g 2781
<210> SEQ ID NO: 2
<211> 926
<212> PRT
<213> 长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC NO:M 2012388
<400>1
Asp Gly Asn Thr Thr Asn Ile Val Val His Tyr Phe Arg Pro Ser
1 5 10 15
Gly Asp Tyr Thr Asp Trp Asn Leu Trp Met Trp Pro Glu Asn Gly
20 25 30
Asp Gly Ala Glu Tyr Asp Phe Asn Gln Pro Thr Asp Ser Tyr Gly
35 40 45
Glu Val Ala Ser Val Asp Ile Pro Gly Asn Pro Ser Gln Val Gly
50 55 60
Ile Ile Val Arg Lys Gly Asn Trp Asp Ala Lys Asp Ile Asp Ser
65 70 75
Asp Arg Tyr Ile Asp Leu Ser Lys Gly His Glu Ile Trp Leu Val
80 85 90
Gln Gly Asn Ser Gln Ile Phe Tyr Ser Glu Lys Asp Ala Glu Ala
95 100 105
Ala Ala Gln Pro Ala Val Ser Asn Ala Tyr Leu Asp Ala Ser Asn
110 115 120
Gln Val Leu Val Lys Leu Ser Gln Pro Phe Thr Leu Gly Glu Gly
125 130 135
Ser Ser Gly Phe Thr Val His Asp Asp Thr Ala Asn Lys Asp Ile
140 145 150
Pro Val Thr Ser Val Ser Asp Ala Asn Gln Val Thr Ala Val Leu
155 160 165
Ala Gly Thr Phe Gln His Ile Phe Gly Gly Ser Asp Trp Ala Pro
170 175 180
Asp Asn His Asn Thr Leu Leu Lys Lys Val Asn Ser Asn Leu Tyr
185 190 195
Gln Phe Ser Gly Asn Leu Pro Glu Gly Asn Tyr Gln Tyr Lys Val
200 205 210
Ala Leu Asn Asp Ser Trp Asn Asn Pro Ser Tyr Pro Ser Asp Asn
215 220 225
Ile Asn Leu Thr Val Pro Ala Gly Gly Ala His Val Thr Phe Ser
230 235 240
Tyr Ile Pro Ser Thr His Ala Val Tyr Asp Thr Ile Asn Asn Pro
245 250 255
Asn Ala Asp Leu Gln Val Asp Ser Ser Gly Val Lys Thr Asp Leu
260 265 270
Val Ala Val Thr Leu Gly Glu Asn Pro Asp Val Ser His Thr Leu
275 280 285
Ser Ile Gln Thr Glu Asp Tyr Gln Ala Gly Gln Val Ile Pro Arg
290 295 300
Lys Val Leu Asp Ser Ser Gln Tyr Tyr Tyr Ser Gly Asp Asp Leu
305 310 315
Gly Asn Thr Tyr Thr Lys Asn Ala Thr Thr Phe Lys Val Trp Ala
320 325 330
Pro Thr Ser Thr Gln Val Asn Val Leu Leu Tyr Asn Ser Ala Thr
335 340 345
Gly Ala Val Thr Lys Thr Val Pro Met Thr Ala Ser Gly His Gly
350 355 360
Val Trp Glu Ala Thr Val Asn Gln Asp Leu Glu Asn Trp Tyr Tyr
365 370 375
Met Tyr Glu Val Thr Gly Gln Gly Ser Thr Arg Thr Ala Val Asp
380 385 390
Pro Tyr Ala Thr Ala Ile Ala Pro Asn Gly Thr Arg Gly Met Ile
395 400 405
Val Asp Leu Ala Lys Thr Asp Pro Ala Gly Trp Glu Ser Asp Lys
410 415 420
His Ile Thr Pro Lys Asn Ile Glu Asp Glu Val Ile Tyr Glu Met
425 430 435
Asp Val Arg Asp Phe Ser Ile Asp Ser Asn Ser Gly Met Lys Asn
440 445 450
Lys Gly Lys Tyr Leu Ala Leu Thr Glu Lys Gly Thr Lys Gly Pro
455 460 465
Asp Asn Val Lys Thr Gly Val Asp Ser Leu Lys Gln Leu Gly Ile
470 475 480
Thr His Val Gln Leu Gln Pro Val Phe Ala Phe Asn Ser Val Asn
485 490 495
Glu Asn Asp Pro Thr Gln Tyr Asn Trp Gly Tyr Asp Pro Arg Asn
500 505 510
Tyr Asn Val Pro Glu Gly Gln Tyr Ala Thr Asn Ala Asn Gly Thr
515 520 525
Thr Arg Ile Lys Glu Phe Lys Glu Met Val Leu Ser Leu His Gln
530 535 540
Asp His Ile Gly Val Asn Met Asp Val Val Tyr Asn His Thr Phe
545 550 555
Ala Thr Gln Ile Ser Asp Phe Asp Lys Ile Val Pro Glu Tyr Tyr
560 565 570
Tyr Arg Thr Asp Asp Ala Gly Asn Tyr Thr Asn Gly Ser Gly Thr
575 580 585
Gly Asn Glu Ile Ala Ala Glu Arg Pro Met Val Gln Lys Phe Ile
590 595 600
Ile Asp Ser Leu Lys Phe Trp Val Asn Glu Tyr His Val Asp Gly
605 610 615
Phe Arg Phe Asp Leu Met Ala Leu Leu Gly Lys Asp Thr Met Ser
620 625 630
Lys Ala Ala Thr Gln Leu His Ala Ile Asp Pro Gly Ile Ala Leu
635 640 645
Tyr Gly Glu Pro Trp Thr Gly Gly Thr Ser Ala Leu Pro Ala Asp
650 655 660
Gln Leu Leu Thr Lys Gly Ala Gln Lys Gly Met Gly Val Ala Val
665 670 675
Phe Asn Asp Asn Leu Arg Asn Gly Leu Asp Gly Ser Val Phe Asp
680 685 690
Ser Ser Ala Gln Gly Phe Ala Thr Gly Ala Thr Gly Leu Thr Asp
695 700 705
Ala Ile Lys Asn Gly Val Glu Gly Ser Ile Asn Asp Phe Thr Ala
710 715 720
Ser Pro Gly Glu Thr Ile Asn Tyr Val Thr Ser His Asp Asn Tyr
725 730 735
Thr Leu Trp Asp Lys Ile Ala Gln Ser Asn Pro Asn Asp Ser Glu
740 745 750
Ala Asp Arg Ile Lys Met Asp Glu Leu Ala Gln Ala Ile Val Met
755 760 765
Thr Ser Gln Gly Ile Pro Phe Met Gln Gly Gly Glu Glu Met Leu
770 775 780
Arg Thr Lys Gly Gly Asn Asp Asn Ser Tyr Asn Ala Gly Asp Val
785 790 795
Val Asn Glu Phe Asp Trp Ser Arg Lys Ala Gln Tyr Pro Asp Val
800 805 810
Phe Asn Tyr Tyr Ser Gly Leu Ile His Leu Arg Leu Asp His Pro
815 820 825
Ala Phe Arg Met Thr Thr Ala Asn Glu Ile Asn Ser His Leu Gln
830 835 840
Phe Leu Asn Ser Pro Glu Asn Thr Val Ala Tyr Glu Leu Ser Asp
845 850 855
His Ala Asn Lys Asp Thr Trp Gly Asn Ile Val Val Ile Tyr Asn
860 865 870
Pro Asn Lys Thr Ala Glu Thr Ile Asn Leu Pro Ser Gly Lys Trp
875 880 885
Glu Ile Asn Ala Thr Ser Gly Lys Val Gly Glu Ser Thr Leu Gly
890 895 900
Gln Ala Glu Gly Ser Val Gln Val Pro Gly Ile Ser Met Met Ile
905 910 915
Leu His Gln Glu Val Ser Pro Ser Asp Gly Lys ***
920 925 926
Claims (4)
1.一种基于双阻遏策略增强大肠杆菌T7表达***稳定性的方法,其特征在于:以来源于长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC M 2012388的普鲁兰酶为表达蛋白,使用含有lac操纵子和阻遏物基因lacI的pET表达载体pET-22b(+)及pET-28a(+),利用lac操纵子严谨的双阻遏调控策略,构建了重组菌E.coliBL21/pET-22b(+)-pul及E.coliBL21/pET-28a(+)-PelB- pul,作为对照,构建了不含有lac操纵子和阻遏物基因lacI的表达***E.coli BL21(DE3)/ pET-20b(+)-pul;步骤为:
(1)普鲁兰酶基因的获得
长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC M 2012388培养基:CaCl2 0.25 g/L,MgSO4·7H2O 0.5 g/L,(NH4)2SO4 0.2 g/L,酵母提取物 2 g/L,无水葡萄糖 5 g/L,KH2PO4 3 g/L,无机盐溶液1 mL/L,pH 5.0,双蒸水配制;
无机盐溶液:ZnSO4·7H2O 0.1 g/L,MnCl2·H2O 0.03 g/L,H3BO3 0.3 g/L,CoCl2·6H2O 0.2 g/L,CuCl2·2H2O 0.01 g/L,NiCl2·6H2O 0.02 g/L,Na2MoO4·2H2O 0.03 g/L,双蒸水配制;
将长野芽孢杆菌(Bacillus naganoensis)CCTCC M 2012388菌种接种于含有25 mL培养基的250 mL摇瓶中,于37℃、200 rpm振荡培养72 小时,培养结束后,将菌体离心并用生理盐水洗涤两次,收集细胞利用VIOGENE公司的基因组DNA提取试剂盒Genomic DNA Extraction Miniprep System提取基因组;
引物1:5’- gaa caG GAT CCa gat ggg aac acc aca aaC -3’,
引物2:5’- att ccc tcg agt tta cca tca gat ggg ct -3’;
引物1含有BamHI限制性酶切位点,引物2含有XhoI限制性酶切位点;
PCR反应体系:ddH2O 37 μL,10×Reaction Buffer 5 μL,25 mmol/L 的dNTP 0.5 μL,50 pmol/μL的引物1 1 μL,50 pmol/μL的引物2 1 μL,基因组DNA 5 μL,5 U/μL的 Taq DNA polymerase 0.5 μL;
以长野芽孢杆菌CCTCC M 2012388基因组为模板,采用PCR方法扩增普鲁兰酶基因,PCR反应过程:95℃预变性5 min;95℃ 1 min、60℃ 0.5 min、72℃ 2 min,进行30个循环;72℃延伸10 min;
利用上海申能***生物科技有限公司的3S Spin Agarose Gel DNA Purification Kit纯化DNA片断;
DNA溶液中加入1/10体积的pH 5.2、3 mol/L的乙酸钠溶液和2倍体积无水乙醇,-20℃沉淀1小时,12000 rpm于4℃离心30 min,加入75%乙醇500 μL洗涤,12000 rpm于4℃离心30 min,无菌操作台吹干后溶于适量TE缓冲液中,立即使用或-20℃保存;
(2)含有普鲁兰酶基因的重组大肠杆菌的构建
a、pET-20b(+)-pul的构建
利用北京博大泰克生物基因技术有限公司的质粒提取试剂盒Mini-Plasmid Rapid Isolation Kit提取质粒pET-20b(+);
按照水、缓冲液、PCR产物或质粒DNA、酶的顺序加到Eppendorf管中,盖好管盖,振荡使液体充分混匀,置于离心机内离心2秒钟使液体集中于管底,37℃水浴3小时,在管中加入1/10体积的Loading Buffer或将管置于65℃保温10分钟,终止酶切反应,酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳分析并切胶回收目的片段,浓缩;
反应体系组成:10×H Buffer 4 μL,DNA 10 μL,BamHI 2 μL,XhoI 2 μL,ddH2O将体系补足40 μL;
目的基因与质粒pET-20b(+)的连接
将普鲁兰酶基因与质粒pET-20b(+)连接,反应体系组成如下:质粒pET-20b(+) 0.8 μL,普鲁兰酶基因4.2 μL,Ligation Solution 5 μL;混合连接液,将其置于16℃培养箱中连接反应12小时;
重组质粒转化大肠杆菌
在100 μL大肠杆菌E. coli BL21(DE3)感受态细胞悬液中加入10 μL连接产物,轻轻混匀,冰浴中静置30分钟,转入42℃水浴中,热击90秒,快速转移至冰浴中,冷却2分钟,加入700 μL的LB液体培养基,37℃、100 rpm摇床温育培养1小时,培养后菌液3000 rpm离心2分钟,弃上清600 μL,剩余菌液混匀后涂布到含有50 μg/mL 氨苄抗生素的LB平板上,37℃倒置培养,获得含有目的普鲁兰酶基因的重组大肠杆菌E. coli BL21 (DE3)/pET-20b(+)-pul;
b、pET-22b(+)-pul和pET-28a(+)-PelB- pul的构建
将重组质粒pET-20b(+)-pul和表达载体pET-28a(+)、pET-22b(+)分别用限制性内切酶XbaI和XhoI分步单酶切,按照水、缓冲液、质粒、酶的顺序加到Eppendorf管中,盖好管盖,振荡使液体充分混匀,置于离心机内离心2秒使液体集中于管底,37℃水浴3小时,在管中加入1/10体积的Loading Buffer或将管置于65℃保温10分钟,终止酶切反应,酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳分析并切胶回收目的片段,浓缩;反应体系组成:10×H Buffer 4 μL,DNA 10 μL,XbaI 2 μL,XhoI 2 μL,ddH2O将体系补足40 μL;
将胶回收线性化的目标片段分别与pET-28a(+)及pET-22b(+)载体连接,反应体系组成如下:质粒载体1 μL,目标片段4 μL,Ligation Solution 5 μL,混合连接液,将其置于16℃培养箱中连接反应12小时;
重组质粒转化大肠杆菌
在100 μL大肠杆菌E. coli BL21(DE3)感受态细胞悬液中加入10 μL连接产物,轻轻混匀,冰浴中静置30分钟,转入42℃水浴中,热击90秒:快速转移至冰浴中,冷却2分钟;加入700 μL的LB液体培养基,37℃、100 rpm摇床温育培养1小时,培养后菌液3000 rpm离心2分钟,弃上清600 μL,剩余菌液混匀后涂布到含有50 μg/mL 卡那霉素的LB平板上,37℃倒置培养,获得含有目的普鲁兰酶基因的重组大肠杆菌E. coli BL21(DE3)/pET-28a(+)-PelB-pul及E. coli BL21 (DE3)/pET-22b(+)-pul;
双阻遏效应基本上消除了重组大肠杆菌的本底表达现象,重组大肠杆菌冷冻甘油管的表达显示双阻遏效应可维持表达***的稳定性,及重组大肠杆菌自诱导表达的稳定性得到提高。
2.根据权利要求1所述基于双阻遏策略增强大肠杆菌T7表达***稳定性的方法,其特征在于:重组大肠杆菌的本底表达比较;
挑取新转化的重组大肠杆菌单菌落接种于3 mL含相应抗生素的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养过夜;取0.5 mL培养液转接于50 mL含相应抗生素的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养至OD600为1.2;培养液转入20℃中继续培养12小时,培养结束后,将发酵液于10000 rpm离心10分钟,菌体沉淀超声破碎,破碎液于12000 rpm离心20分钟,取上清液用于胞内普鲁兰酶酶活测定;
经酶活检测,E. coli BL21(DE3)/pET-20b(+)-pul的胞内组分酶活为1.9 U/mL,而E. coli BL21(DE3)/pET-28a(+)-PelB-pul及E. coli BL21(DE3)/ pET-22b(+)-pul的胞内组分则没有测到酶活,表明由于表达载体pET-22b(+)及pET-28a(+)中的lac操纵子和阻遏物基因lacI的存在,阻遏物可同时结合于大肠杆菌染色体上T7基因上游的lac操纵子和表达载体的lac操纵子上,这种双阻遏效应基本上消除了本底表达现象。
3.根据权利要求1所述基于双阻遏策略增强大肠杆菌T7表达***稳定性的方法,其特征在于:重组大肠杆菌冷冻甘油管的表达稳定性比较;
三种重组表达质粒转化E.coli BL21(DE3)感受态细胞,转化子长出后立刻接种于3 mL含相应抗生素的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养过夜;取0.5 mL培养液转接于50 mL含相应抗生素的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养至OD600约为1.2;培养液转入20℃中继续培养12小时;培养结束后,将发酵液于10000 rpm离心10分钟,上清留样为胞外组分;菌体沉淀超声破碎,破碎液于12000 rpm离心20分钟,取上清液为胞内组分;测定胞内外酶活结果为第一批的IPTG诱导表达结果,剩余试管种子液用于保存冷冻甘油管,于-70℃中冷冻保存,分别在冻存2天及4天后取出用于第二、第三批诱导表达,测定比较各工程菌的胞内外总酶活;
比较不同发酵批次的酶活结果发现,随着在-70℃中冻存天数的增加,E. coli BL21(DE3)/pET-20b(+)-pul的产酶能力不断下降,菌种在-70℃中冻存4天,在LB培养基中发酵后胞内酶活下降到新转化菌种发酵酶活的38%,说明该工程菌在冻存状态下性能不稳定,目标蛋白的表达能力会迅速下降;而E. coli BL21(DE3)/pET-22b(+)-pul及E. coli BL21(DE3)/pET-28a(+)-PelB- pul的酶活水平则一直为15 U/mL,即一直保持着最初的产酶能力,说明载体中lac操纵子产生的双阻遏效应可维持表达***的稳定性,使这两株工程菌在冻存状态下可保持正常的产酶性能。
4.根据权利要求1所述基于双阻遏策略增强大肠杆菌T7表达***稳定性的方法,其特征在于:重组大肠杆菌自诱导表达的比较;
自诱导培养基g/L:β-乳糖 1~50,无水葡萄糖0.5,甘油5,KH2PO4 6.8,MgSO4 0.24,胰蛋白胨10,酵母提取物5,Na2HPO4 7.1,Na2SO4 0.71,NH4Cl 2.67,痕量元素溶液 400 μL/L,pH 7.5~8.0,双蒸水配制;
痕量元素溶液g/L:FeCl3 8.125,CaCl2 2.22,MnCl2 2.52,ZnSO4 1.61,CoCl2 0.26,CuCl2 0.27,NiCl2 0.26,Na2MoO4 0.41,Na2SeO3 0.346,H3BO3 0.124,HCl 2.19,双蒸水配制;
三种重组表达质粒转化E.coli BL21感受态细胞,转化子长出后立刻接种于3 mL含相应抗生素的LB液体培养基中,于37℃、200 rpm振荡培养过夜;取2mL培养液接种于50mL含相应抗生素的自诱导培养基中,37℃、200rpm下培养2小时后转入20℃中继续培养70小时,分别测定胞内外酶活水平;
发酵结束后,E. coli BL21(DE3)/pET-20b(+)-pul的胞内外总酶活为23 U/mL,而E. coli BL21(DE3)/pET-22b(+)-pul及E. coli BL21(DE3)/ pET-28a(+)-PelB-pul的总酶活均为550 U/mL,表明由于载体中lac操纵子的双阻遏效应消除了目标蛋白的本底表达,表达***的稳定性得到提高,使菌种在发酵过程中也能保持目标蛋白的表达能力,不会发生退化。
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