CN102165075A - 用于检测和治疗结肠直肠癌的组合物 - Google Patents

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Abstract

本发明提供了鉴定由细胞在第一环境状况下表达但在第二环境状况下不表达的蛋白和多肽及其同源多核苷酸的方法。本发明还提供了用于治疗和检测癌症包括结肠直肠癌的组合物。

Description

用于检测和治疗结肠直肠癌的组合物
优先权
本申请要求2008年7月18日提交的美国系列号61/081,926的优先权,其全部内容通过引用并入本文。
政府权益
本发明部分地得到NIH/NCI/SBIR基金号1R43CA124006-01A1的支持。美国政府享有本申请的某些权利。
背景技术
鉴定当细胞经历从一种状态或状况改变为另一种状态或状况时所产生的蛋白、多肽和其它细胞组分可能具有重要意义,因为此类分子可能作为所述变化正在发生或已经发生的指示。在第一状况是健康而第二状况是疾病状态的情况下,鉴定此类“变化介导的”蛋白、多肽或其它细胞组分将为新的诊断剂的开发提供良好的靶标,也可以为多种类型的抗生素疗法(例如疫苗)提供靶标以辅助疾病的治疗。
在一些情况下,变化介导的分子可能从疾病组织脱落并进入相对容易回收的体液中。鉴定从疾病(例如癌性)组织脱落进入体液的细胞组分的存在可能具有重要意义,因为此类脱落的蛋白极有可能作为活性疾病的特异病征性的(pathogenomonic)理想诊断靶标的候选。例如,在癌细胞例如结肠直肠癌细胞中差别化表达的多肽,以及在癌细胞中特异性表达并且从癌细胞脱落进入体液的多肽可用于提供癌症的精确和准确的诊断,用于筛选抗癌化合物,用于开发治疗性组合物,以及用于其它用途。
发明内容
本发明的一个实施方式提供了检测受试者中的癌症或患上癌症的倾向性的方法。所述方法包括,测定来自受试者的生物样品中的选自下列的与癌症相关的多核苷酸、蛋白或多肽的表达水平:肌联蛋白(Titin);HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白(zonadhesin)前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素(GALECTIN)-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;成髓细胞素(myeloblastin)前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Igκ链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7(isoform 1 of splicing factor,arginine/serine-rich 7);mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白(calponin)-2;盲肌样蛋白(muscleblind-like protein)3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/H RNP C2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1 L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白(Nucleobindin)1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(Tripartite motif-containing 28)(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白(transgelin));基膜聚糖(Lumican)前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(axonemal)(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白(endoplasmin);核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(adducin)(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶(Aldehyde Dehydrogenase)9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1,或其任意组合(“本发明的多肽”)。与对照样品相比,生物样品例如体液中的与癌症相关的多核苷酸的表达水平的升高指示该受试者患有癌症或具有患上癌症的倾向性。所述蛋白或多肽可以包含如SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。所述癌症可以是结肠直肠癌。所述方法可以进一步包括,测定一种或多种、或者两种或更多种与癌症相关的蛋白或多肽的表达水平。可以通过选自下列的方法测定与癌症相关的蛋白或多肽的表达水平:(a)检测所述蛋白或多肽的存在;(b)检测与癌症相关的多核苷酸编码的蛋白或多肽的生物活性;和(c)检测与癌症相关的多核苷酸的mRNA。所述生物样品可以包括细胞、细胞提取物、组织、体液和基本上不含细胞的体液(例如少于大约1%、5%或10%的细胞),例如血清、尿、眼泪、乳汁、***、***液、肺灌洗液和唾液。与癌症相关的蛋白或多肽的水平可以这样测定:使用结合蛋白或多肽的表位的抗体(特异于变化介导的蛋白或多肽)或通过本领域已知的其它方法检测生物样品中与癌症相关的蛋白或多肽的水平。
本发明的另一个实施方式提供了特异性结合本发明的蛋白或多肽或其任意组合的分离的抗体或其抗原结合片段。本发明的蛋白或多肽可以包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。所述抗体可以是单克隆抗体、多克隆抗体、单链抗体、单特异性单链抗体、双特异性单链抗体、二价单链抗体、四价单链抗体、嵌合抗体、抗体的抗原结合片段、或人源化抗体。
本发明的另一个实施方式提供了筛选抗癌化合物的方法。所述方法包括,将存在测试化合物的情况下第一生物样品中的变化介导的蛋白或多肽表达产物的水平与不存在该测试化合物的情况下第二生物样品中的变化介导的蛋白或多肽表达产物的水平进行比较。所述变化介导的表达产物包括本发明的蛋白或多肽,或编码本发明的多肽的mRNA,或其任意组合。使第一生物样品中表达产物的水平相对于第二生物样品降低的测试化合物被鉴定为抗癌剂。所述蛋白或多肽可以包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
本发明的另一个实施方式提供了筛选用于治疗或预防癌症的化合物的方法。所述方法包括(a)将候选化合物与表达本发明的蛋白或多肽或其任意组合的细胞接触;和(b)选择降低所述蛋白或多肽的表达水平的化合物。所述蛋白或多肽可以包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
本发明的另一个实施方式提供了用于检测哺乳动物中的癌症的试剂盒。所述试剂盒包含(a)抗体或其抗原结合片段,其中所述抗体或其抗原结合片段特异性结合本发明的蛋白或多肽的表位;和(b)用于检测所述抗体和所述蛋白或多肽之间的结合反应的一种或多种试剂。所述蛋白或多肽可以包含SEQID NO:1-157所示的氨基酸序列或其任意组合。
本发明的另一个实施方式提供了用于检测生物样品中的癌细胞的试剂盒,其包含至少一种多核苷酸引物或探针,其中所述多核苷酸引物或探针对于编码本发明的蛋白或多肽的多核苷酸是特异性的。所述蛋白或多肽可以包含SEQID NO:1-157所示的氨基酸序列或其任意组合。所述试剂盒可以包含至少两种特异于编码本发明的蛋白或多肽的多核苷酸的多核苷酸引物。
本发明的另一个实施方式提供了融合蛋白,其包含至少两种本发明的蛋白或多肽,或其任意组合。至少两种蛋白或多肽可以选自SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
本发明的另一个实施方式提供了组合物,其包含第一组分和第二组分,所述第一组分选自生理上可接受的载体和免疫刺激剂;所述第二组分选自本发明的蛋白或多肽或其任意组合、编码本发明的蛋白或多肽的多核苷酸或其任意组合、本发明的抗体或其任意组合、和本发明的融合蛋白或其任意组合。所述蛋白或多肽可以包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列或其任意组合。
本发明的另一个实施方式提供了结肠直肠癌参考表达谱,其包括两种或更多种如SEQ ID NO:1-157所示的本发明的蛋白或多肽或其任意组合的蛋白或多肽表达样式。
本发明的另一个实施方式提供了结肠直肠癌参考表达谱,其包括编码本发明的蛋白或多肽或其任意组合的两种或更多种多核苷酸的多核苷酸表达样式。本发明的多肽可以包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
本发明的另一个实施方式提供了包含两种或更多种多核苷酸的阵列,所述多核苷酸与编码本发明的蛋白或多肽或本发明的两种或更多种多肽或其任意组合的两种或更多种多核苷酸特异性杂交。本发明的多肽可以包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
本发明的另一个实施方式提供了用于治疗癌症的组合物。所述组合物包含药学上有效量的特异性结合本发明的蛋白或多肽或其任意组合的抗体或其抗原结合片段。本发明的蛋白或多肽可以包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
本发明的另一个实施方式提供了用于治疗癌症的组合物。所述组合物包含药学上有效量的本发明的多肽或编码本发明的多肽的多核苷酸。本发明的多肽可以包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
本发明的另一个实施方式提供了治疗受试者中的癌症或刺激受试者中的免疫应答例如抗肿瘤免疫应答或任何其它类型的免疫应答的方法。所述方法包括(a)向所述受试者给予药学上有效量的本发明的蛋白或多肽;(b)向所述受试者给予药学上有效量的编码本发明的多肽的多核苷酸或其片段;或(c)向所述受试者给予药学上有效量的特异性结合本发明的蛋白或多肽的抗体或其抗原结合片段。本发明的蛋白或多肽可以包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。所述癌症可以是结肠直肠癌。
本发明的另一个实施方式提供了分离由第一宿主在第一环境状况下表达但不在第二环境状况下表达的变化介导的蛋白或多肽及其同源(cognate)基因或多核苷酸的方法。所述方法包括以下步骤:
(a)在第一环境状况下从第一宿主获得细胞、组织或体液样品,并任选地将其储存在一定条件下(例如冷冻)以保持所述样品中的蛋白、多肽和其它潜在感兴趣的成分(即变化介导的);
(b)使用(a)中的样品并任选使用强佐剂免疫动物,所述动物任选是在***发生上距离所述第一宿主远的动物,以引发强烈的、广泛的抗体应答,从而得到免疫的动物;
(c)从所述免疫的动物中收集抗体,并任选地纯化所述抗体;
(d)使用来自第二环境状况下的第二宿主(任选是与(a)中所用的相同物种或相同个体的宿主)的组织、匀浆的组织、细胞、细胞提取物或体液样品吸附所述抗体;
(e)分离未吸附的抗体;和
(f)使用未吸附的抗体分离在所述第一环境状况下存在于第一宿主的细胞、组织或体液样品中但在所述第二环境状况下不存在于所述宿主的细胞、组织或体液中的蛋白、多肽或其它成分(例如脂类、碳水化合物或糖蛋白);和任选地
(g)鉴定所分离的蛋白、多肽或其它成分。
所述第一环境状况可以是疾病、癌症或自身免疫疾病。所述第二环境状况可以是正常状况、健康状况、非疾病状况或不同于所述第一环境状况的环境状况。细胞和组织可以来自宿主的任意部分。在宿主是动物的情况下,体液可以是尿、眼泪、血浆、乳汁、灌洗液、***液、***、唾液、血清、痰和胸腔积液。来自植物的体液可以从韧皮部或木质部(xylum)提取。体液可以基本上不含细胞。当所述第一宿主是动物时,所述免疫的动物可以是与所述第一宿主动物相同的物种,或者是与所述第一宿主动物不同类型的动物。所述方法还可以包括从在第一状况下取自宿主的细胞或组织的匀浆物或提取物直接分离感兴趣的蛋白、肽或其它成分。或者可以使用未吸附的抗体从文库捕获蛋白或肽,所述文库是使用在第一环境状况下从宿主获取的DNA或mRNA构建的,其中所述文库是表达文库或展示文库。“探测文库”可以包括:
(a)将未吸附的抗体固定在固体载体(support)上;
(b)加入来自第一状况下的第一宿主的细胞或组织匀浆物或体液,或从第一环境状况下的宿主的DNA或RNA制备的基因组表达文库或表面展示文库的表达的蛋白;
(c)从固体载体上洗掉未结合的蛋白或噬菌体文库的成员;
(d)回收与固体载体结合的蛋白和多肽或表面展示文库的成员;和
(e)鉴定特异性捕获的蛋白和多肽,或者,在表面展示文库探测的情况下,鉴定负责表达由(一种或多种)抗体捕获的同源蛋白或多肽的基因或多核苷酸。
可以在加入匀浆物、体液或文库之前,使用封闭剂封闭所述固体载体,以减少非特异性结合。所述固体载体可以选自硝酸纤维素、尼龙、聚苯乙烯、聚氯乙烯、乳胶、纤维玻璃、玻璃、微球体、脂质体、琼脂糖、交联葡聚糖凝胶(sephadex)和磁性颗粒。抗体可以源自选自下列的免疫的动物:人、狒狒、黑猩猩、猕猴、牛、绵羊、猪、马、山羊、狗、猫、兔、豚鼠、大鼠、小鼠、鸡、鸭和鱼。在第一环境状况下从宿主获取细胞、组织和体液样品之后可以立即将其冷冻。在第二环境状况下从第二宿主获取细胞、组织和体液样品之后可以立即将其冷冻,以使需要吸附的分子的降解最小化并除去非变化介导的成分。可以使用本领域已知的常规方法例如质谱法联合分离方法(例如GeLC-MS/MS)来进行捕获的蛋白、多肽或其它成分(例如脂类、碳水化合物或糖蛋白)的鉴定。
还提供了确认和验证由宿主响应于疾病或变化介导的状况而表达的分离的蛋白/多肽的特异性表达性质的方法。所述方法包括:
(a)纯化天然或重组蛋白或多肽;
(b)制备针对所述多肽的非交叉反应性(例如单克隆)抗体;
(c)使用(b)的抗体在第一和第二环境状况下探测宿主的细胞、细胞提取物、体液或组织;和
(d)证明所述(一种或多种)抗体与来自第一环境状况而非第二环境状况的样品的相对反应活性。
其中,如果所述抗体特异性结合从所述第一状况而非第二状况的宿主获取的细胞、细胞提取物、体液或组织,则鉴定的蛋白或多肽及其同源多核苷酸被确认为在所述第一环境状况下表达而不在所述第二环境状况下表达的变化介导的分子。
附图说明
图1显示了通过斑点免疫印迹测定法评估使用IV期人结肠癌组织的匀浆物在鸡中产生的多克隆卵抗体(YPAb)与诊断患有IV期结肠癌的患者的汇集的血清之间的反应活性。将来自IV期结肠癌患者的斑点化汇集血清的差别化反应活性与来自年龄、性别和种族匹配的健康患者的对照血清(斑点4)、BSA(斑点3)和健康组织的匀浆物(斑点1)的斑点进行比较。IV期结肠癌组织的匀浆物作为阳性对照(斑点2)。
发明详述
除非文中另有明确指明,否则如本说明书和随附的权利要求中所使用的单数形式“一”和“该”包括复数指称。
在癌细胞中差别化调节的蛋白的鉴定
基于蛋白质组学的变化介导的抗原技术(PCMAT)是用于鉴定当细胞经历变化(例如,从正常的健康细胞变为病态细胞)或暴露于环境状况中的变化(例如植物细胞从潮湿变为干旱条件)时特异性表达的蛋白和多肽及其同源基因或多核苷酸的方法。PCMAT可用于鉴定当细胞变为病态或癌性时,在细胞中被上调的或特异性表达的蛋白和多肽及其同源基因或多核苷酸。
“特异性表达”意思是指,蛋白或多肽在第一环境状况下的表达程度高于或低于在第二环境状况下的表达。例如,蛋白或多肽可能在第一环境状况下表达,但是在第二环境状况下不表达。或者,蛋白或多肽可能在第一环境状况下的表达比在第二环境状况下的表达程度高例如10%、20%、50%、100%、200%或更高。
第一环境状况包括但不限于,疾病状况(诸如,例如,病毒疾病、细菌疾病、真菌疾病、由朊病毒引起的疾病、由原生动物引起的疾病、寄生虫疾病、癌症、自身免疫疾病(例如关节炎、慢性炎性肠疾病或糖尿病)、热、冷、暴露于毒性化学物质、暴露于药物、暴露于化疗药物或方案、暴露于压力、暴露于毒性金属、暴露于辐射、暴露于毒素、暴露于抗生素、暴露于意在杀死或延缓微生物生长的化学物质例如杀菌剂、杀病毒剂和细菌抑制剂或病毒抑制剂,低氧条件、高氧条件、低pH条件、高pH条件、暴露于铁、暴露于低水平的营养物,以及暴露于高水平的营养物。
第二环境状况可以是例如正常状况、健康状况、非疾病状况,和/或不存在所述的第一环境状况。在本发明的一个实施方式中,第一环境状况可以是疾病的一个阶段或时期(例如,早期、中期、晚期、慢性、治疗的、未治疗的、治疗一定的时间、缓解期),第二环境状况可以是疾病的第二不同阶段(例如,早期、中期、晚期、慢性、治疗的、未治疗的、治疗一定的时间、缓解期)。
本发明的一个实施方式提供了分离在第一环境状况(例如疾病状况)下表达而在第二环境状况(例如健康或非疾病状况)下不表达的蛋白、多肽或细胞的其它成分(例如脂类、碳水化合物或糖蛋白)的方法。一般而言,该方法包括:从第一状况(例如疾病状况)下的宿主获取第一样品,并使用所述的宿主样品免疫第二动物。收集来自经免疫的动物的抗体,并使用从第二环境状况(例如健康状况)下的第二宿主收集的宿主样品吸附所述抗体。所述第二宿主可以是处于第二状况(例如,来自第一宿主的健康组织或细胞)下的与第一宿主相同的个体,或者是与第一宿主的物种相同或不同的不同宿主。收集未吸附的抗体并用于收集差别化表达的蛋白、多肽或其它成分,所述差别化表达的蛋白、多肽或其它成分直接来自第一宿主的疾病组织或体液,或者来自宿主的DNA或RNA或类似DNA或RNA的表达或展示文库。
暴露于第一环境状况的宿主可以是任何类型的生物,例如,哺乳动物,例如人、狒狒、黑猩猩、猕猴、牛、绵羊、猪、马、山羊、狗、猫、兔、豚鼠、大鼠或小鼠。动物还可以是,例如鸡、鸭、昆虫或鱼。宿主还可以是植物界或微生物界的成员。
在宿主来自动物界的情况下,从第一环境状况下的宿主收集的样品可以是例如,细胞、细胞提取物、组织、体液、基本上不含细胞的体液(例如少于大约1%、5%或10%的细胞)、血清、尿、眼泪、乳汁、***、***液、肺灌洗液、唾液、粘膜细胞、肿瘤细胞、癌细胞、活组织检查样品、灌洗样品、痰、血浆、血液、粪便样品、***样品、骨髓、结肠组织、直肠组织或胸腔积液样品。当宿主是植物时,所述样品可以来自例如细胞、组织、细胞提取物、从韧皮部提取的体液、从木质部提取的体液。当宿主是微生物、细菌、病毒或朊病毒时,所述样品可以是细胞或细胞提取物,或被微生物感染的宿主或其中定殖了微生物的宿主的细胞或组织。
可以收集并立即处理来自第一环境状况的动物宿主的样品以进行免疫,或者快速冷冻以用于后续处理,以尽可能完整地保留获取样品的时刻存在于该宿主动物样品中的所有潜在表位。在不同的时间间隔收集的、或来自不同的取样地点、或来自暴露于相同的第一环境状况或相似的环境状况的不同动物的单一样品或汇集样品可以用于免疫动物以获得抗体应答。
收集来自经免疫的动物的抗体。免疫的动物可以是任何类型的能够引发体液免疫应答的动物,例如哺乳动物,例如人、狒狒、黑猩猩、猕猴、牛、绵羊、猪、马、山羊、狗、猫、兔、豚鼠、大鼠或小鼠。动物还可以是,例如鸡、鸭、昆虫或鱼。在一个实施方式中,免疫的动物与所述第一宿主动物是相同的物种。在另一个实施方式中,免疫的动物与所述第一宿主动物是不同的物种。在另一个实施方式中,免疫的动物与所述第一宿主动物是不同的物种,其中所述免疫的动物与所述第一宿主动物相关性远(例如,所述第一宿主动物是人,所述免疫的动物是鸡)。
在使用体液作为免疫原的情况下,体液样品无需来自第一环境状况的位点。也就是说,无需从疾病组织或癌性损害的直接位点收集体液,而是可以是例如从离开疾病组织或癌性损害的位点采集的血清。
使用抗原样品免疫动物以产生抗体是本领域熟知的。参见,例如Antibody Techniques,Malik & Lillehoj,eds.,Academic Press(1994);Antibodies:A Laboratory Manual,Harlow & Lane,eds.,Cold Spring Harbor Laboratories(1988)。可以在给予至动物之前将样品匀浆化。可以通过例如肌肉内、腹膜内、皮下、真皮内、静脉内或经鼻/吸入或其组合方式给药。
向动物给予样品可以与佐剂联合。或者,可以单独向动物给予佐剂。佐剂可以增强针对抗原的免疫应答。佐剂可以是例如氟氏完全佐剂(CFA)、氟氏不完全佐剂(IFA)、montanide ISA(不完全Seppic佐剂)、Ribi佐剂***(RAS)、TiterMax
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Syntex佐剂制剂(SAF)、铝盐佐剂、硝酸纤维素吸附的抗原、封装的或截留的抗原、免疫刺激复合物(ISCOM),例如Quil A或QS-21,以及Gerbu
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佐剂。本领域技术人员可以为特定样品选择合适的佐剂。
可以在例如免疫之后2周、1个月、2个月或3个月向动物给予来自第一环境状况的宿主样品的加强给药。
在动物内发生免疫应答之后,从免疫的动物收集抗体样品。所述样品可以包括例如经免疫的动物的血清。动物的血清将包含抗体,包括对于在第一环境状况(例如疾病状况)下由宿主动物表达的抗原具有特异性的抗体。可以使用从单一免疫动物收集的抗体,或者可以使用从两只或更多只动物汇集的抗体。例如,可以汇集来自大约2、5、25、100、500或1,000只动物的抗体。
从抗体样品中除掉那些与产生于第二环境状况例如健康或非疾病状况的抗原结合的抗体。结果为“非吸附的抗体”样品。从经免疫的动物收集抗体,并使用与用于产生抗体的动物宿主样品相当的动物宿主样品(不同之处在于该样品获自第二环境状况(例如健康、正常或不同于第一环境状况的状况)下的宿主动物)吸附所述抗体。所述动物宿主样品(即,从处于第二环境状况下的宿主动物收集的宿主样品)可以是例如,细胞、细胞提取物、组织、体液、基本上不含细胞的体液(例如少于大约1%、5%或10%的细胞)、血清、尿、眼泪、乳汁、***、***液、肺灌洗液、唾液、粘膜细胞、肿瘤细胞、癌细胞、活组织检查样品、灌洗样品、痰、血浆、血液、粪便样品、***样品、骨髓、结肠组织、直肠组织、胸腔积液样品、微生物或植物细胞、组织或细胞提取物。吸附会除掉那些与由第二环境状况(例如无疾病状况)下的宿主产生的蛋白和其它细胞成分反应的抗体。回收那些与由第一环境状况下的动物宿主表达的抗原反应的未吸附的抗体,并用于捕获由第一环境状况下的宿主特异性表达的蛋白、多肽和其它成分。蛋白和多肽的来源可以是来自第一环境状况的动物的组织的提取物或体液。或者,宿主的DNA或RNA的表达或展示文库可以用作蛋白来源。洗脱由吸附的抗体特异性捕获的蛋白,浓缩,并通过本领域技术人员已知的蛋白质组学方法(例如GeLC-MS/MS)进行鉴定。在使用表面展示文库的情况下,对编码展示的蛋白的克隆的遗传片段进行测序,并推导由该片段表达的蛋白。
吸附步骤可以这样进行:例如,将抗体样品与固定于固体载体例如硝酸纤维素膜或胶乳珠上的来自第二环境状况的宿主样品接触。参见,Brady & Daphtary,J.Infect.Dis.158:965-972(1988)。任选地,可以在使用之前将来自第二环境状况的宿主样品变性(例如通过加热),以暴露另外的免疫活性表位。可以使用相同或不同的吸附方法进行两次或更多次连续吸附。
抗体样品(其对应的抗原来自于第二环境状况下的宿主)中的全部或基本上全部抗体将与这些抗原结合以形成免疫复合物。但是,针对那些在第一环境状况下特异性表达的抗原的抗体不会形成复合物,因为它们的对应抗原不存在于第二环境状况下的宿主样品中。未形成复合物的抗体包括未吸附的抗体样品。
多肽可以表达自本发明的多核苷酸。然后,所述多肽可用于产生特异性结合存在于本发明的多肽中的免疫表位的抗体。本发明的抗体是特异性结合本发明的多肽或其片段的抗体分子。本发明的抗体可以是多克隆抗体、单克隆抗体、单链抗体(scFv),或抗体的抗原结合片段。
可以通过任何本领域已知的方法,通过直接探测取自例如疾病位点或体液样品的生物样品,直接验证在第一环境状况下诱导产生的抗体确实是由动物宿主响应于第一环境状况而表达的。例如,可以产生针对变化介导的蛋白的单克隆抗体,并测定其对于已知或可能存在于测试样品中的其它蛋白或多肽的特异性和交叉反应活性。可以通过多种方法标记对于变化介导的蛋白或多肽上的表位显示出正确的特异性的单克隆抗体,并测试其与合适的生物样品(包括来自第一和第二两种环境状况的宿主的组织或体液)的反应活性。标记的抗体将与第一状况下的宿主(例如患病的)的生物样品反应,但不与第二状况下的宿主(例如健康的或非患病的)的生物样品反应。这些结果提供了直接证据证明:宿主在第一环境状况下特异性表达目标抗原,并且由此鉴定的变化介导的蛋白或多肽具有用于疾病状况的诊断、预防和治疗的潜力。
在疾病进程整个过程中的定期间隔获取的样品将确保蛋白和其它可被瞬时表达的潜在的重要细胞成分的存在。获取的样品越多,得到特异性表达的成分的完整阵列的可能性越大。可以将在疾病或第一状况的不同时间阶段获得的样品合并以用于免疫。或者,它们可以分别用于免疫动物以确定在疾病过程中特定蛋白或其它细胞成分被表达的正确时间。
例如,比较在第一环境状况下在疾病的不同阶段表达的动物宿主的蛋白和多肽可以包括:使用包含第一环境状况下的一个或多个动物宿主样品的第一样品免疫动物,其中所述一个或多个宿主样品的每一个大约处于疾病进程或治疗期(例如早期、中期、晚期、慢性、治疗的、未治疗的、治疗一定的时间、缓解期)的相同阶段。可以通过例如医学专业人士确定第一状况的阶段或治疗期。收集来自经免疫的动物的抗体,并使用第二环境状况(例如健康的或正常的状况)下的宿主样品吸附所述抗体。收集未吸附的抗体并按照如上描述用于鉴定在疾病的整个时间过程(有无消退、有无治疗)中表达的变化介导的蛋白和多肽。
使用包含第一环境状况下的一个或多个宿主样品的第二宿主样品免疫动物,其中所述宿主样品的每一个大约处于疾病进程的相同阶段或相同的治疗期,其中所述阶段或时期不同于上文所述阶段或时期。收集来自经免疫的动物的抗体,并使用第二环境状况下的宿主样品吸附所述抗体。收集未吸附的抗体并按照如上描述用于鉴定在疾病的特定阶段特异性表达的变化介导的蛋白和多肽,或那些响应于消退或治疗而特异性表达的变化介导的蛋白和多肽。
PCMAT技术在结肠直肠癌中的应用
PCMAT和PCMAT的变化形式在本文中用于鉴定当健康的结肠直肠细胞变成癌性结肠直肠细胞时表达的多核苷酸。腺癌组织获自Asterand XpressBank(Detroit,MI)。收集样品并迅速冷冻以使那些在收集时存在的任何潜在抗原保持完整。通过临床和组织病理学检查进行疾病组织的鉴定和分期。通过RNA谱确认组织样品的完整性。基于以下标准,从大约200个可获得的组织样品的潜在列表中选择4个样品:主要诊断为腺癌;基于AJCC/UICC分类方案,显示是1、2、3和4期;RNA谱指示在收集和迅速冷冻之后的时期造成的组织降解极少;疾病组织来自大肠;可以获得配对的(同源的)、健康的组织(通过临床和组织病理学检查确认);并且样品中有男有女。
独立处理4个癌性组织样品(1、2、3和4期)的每一个,并进行PCMAT,其鉴定在腺癌样品中特异性表达的蛋白和多肽(相对于在健康肠组织中表达的蛋白)。
简而言之,将腺癌样品在PBS中匀浆,将来自每个癌症时期的样品单独用于免疫合适的动物。该步骤中选择的是鸡(因为鸡与人在***发生上距离远),以便优化免疫应答的强度和广度。为此还使用了强佐剂(弗氏完全佐剂)。结肠直肠癌阶段特异性多克隆免疫球蛋白(PAb)获自经免疫的动物的蛋黄。为了选择性富集针对结肠癌组织所特有的蛋白抗原的免疫球蛋白,并同时除掉针对由包含健康和癌组织二者的细胞表达的蛋白抗原的免疫球蛋白,制备健康、自体同源的肠组织的匀浆物,制备方法如同疾病组织一样。使用UltraBind亲和膜与共价偶联的来自健康组织的蛋白进行吸附,从免疫球蛋白中除掉与健康肠组织表达的蛋白反应的抗体。重复该程序直至在吸附的免疫球蛋白与配对的健康组织匀浆物之间的ELISA或western印迹中基本观察不到反应活性。将除掉了与由健康组织组成型表达的蛋白抗原有反应活性的抗体的免疫球蛋白进行另一轮与大肠杆菌宿主菌株/pET30(在诱导剂(1mM IPTG)存在下生长)的完整细胞和裂解物的吸附,以除掉任何与cDNA文库中的污染物有反应活性或交叉反应的抗体。
使用两种不同来源,使用在吸附步骤之后保留的未吸附抗体捕获变化介导的蛋白。第一来源是用于免疫动物的疾病组织(1、2、3和4期)的匀浆物。第二来源是校正的cDNA文库NCI_CGAP_Co14,其获自I.M.A.G.E.联盟。该文库据报道为使用通过逆转录分离自中度分化的结肠腺癌的mRNA产生的cDNA并克隆进入穿梭载体pCMV-SPORT6而构建的。
根据生产商的说明书(Dynal Biotech),使吸附的免疫球蛋白制备物共价结合至M-280甲苯磺酰基-激活的Dynabead,以产生“负载的”磁性珠子。对于免疫捕获,将5ml之前制备的疾病组织匀浆物或cDNA表达文库组分(其中含有重组蛋白,浓度为1mg/ml)与0.5ml负载的珠子在4℃温育2小时并倾斜旋转。免疫捕获之后,以10倍珠子体积的洗涤缓冲液(PBS-0.2%NOG)洗涤负载的珠子。
以1M的乙酸洗脱特异性结合的蛋白3次。收集所有的洗涤和洗脱组分以进行分析。洗脱之后,立即通过加入10倍体积的0.2M Na2PO4(pH 7.4)将特异性结合的蛋白中和,并在存在0.02%叠氮化钠的情况下储存于4℃,直至使用。阴性对照由相同体积的负载了预免疫的免疫球蛋白的珠子组成,按照如上所述进行处理以捕获非特异性结合的蛋白。来自经来自cDNA文库的可溶性裂解物以及肿瘤的匀浆物处理的负载的柱子的洗脱物清晰地证明了蛋白的存在,所述蛋白不存在于阴性对照中。
在弗罗里达大学的跨学科生物技术研究中心(ICBR)通过GeLC-MS/MS鉴定负载了吸附的免疫球蛋白的柱子上特异性结合的蛋白。将从上述负载的柱子上洗脱的特异性结合的重组蛋白进行浓缩,在1D SDS-PAGE上分离,并通过胰蛋白酶进行凝胶内消化,然后进行串联MS/MS。将1D-泳道的组分还原、烷基化,并以胰蛋白酶(Promega)消化。使用C18Pep Map HPLC柱分离酶消化的样品,使用甲酸梯度洗脱。在混成四极杆-TOF质谱仪(QSTAR,Applied Biosystems,Framingham,MA)上进行GeLC-MS/MS分析。使用Mascot 2.0.01版(Matrix Science,London,UK)和Scaffold(version Scaffold-01-06-03,Proteome Software Inc.,Portland,OR)分析所有的MS/MS样品。通过查询人类基因组序列数据库通过生物信息学分析所鉴定的变化介导的抗原。
鉴定了在I期癌性细胞中上调的蛋白及其同源多核苷酸。鉴定的多肽和蛋白如下:肌联蛋白(也称为TTN横纹肌肉瘤抗原MU-RMS 40)(例如,GenBank登录号Q8WZ42-2(SEQ ID NO:1));HBA1(例如,GenBank登录号P69905(SEQ ID NO:2));***1受体(IGF1R)(例如,GenBank登录号P08069(SEQ ID NO:3));带粘蛋白前体的同种型3(例如,GenBank登录号Q9Y493-1(SEQ ID NO:4));潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4)(例如,UniProt登录号A6NCG8(SEQ ID NO:5));ASXL1(另外的性梳子样1)(例如,GenBank登录号Q8IXJ9-1(SEQ ID NO:6));β珠蛋白(HBB)(例如,GenBank登录号P68871(SEQ ID NO:7));BMP15-骨形态发生蛋白(例如,GenBank登录号NM_005448.1(另参见,UniProt登录号O95972)(SEQ ID NO:8));TRIM49(也称作RNF18;含有三部分基序的49)(例如,GenBank登录号Q9NS80(SEQ ID NO:9));DNAJ同源物亚家族B成员11前体(例如,GenBank登录号Q9UBS4(SEQ ID NO:10));未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027(也称作MDS027 hHBrk1 HSPC300)(例如,GenBank登录号Q9NZ47(SEQ ID NO:11));未表征的蛋白ALB(例如,UniProt登录号A6NBZ8(SEQ ID NO:12));含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3(例如,GenBank登录号Q8TER0-4(SEQ ID NO:13));外周蛋白的同种型2(例如,GenBank登录号P41219-2(SEQ ID NO:14));线粒体28S核糖体蛋白S22(例如,GenBank登录号P82650(SEQ ID NO:15));翻译起始因子EIF-2B亚基ε(例如,GenBank登录号Q13144(SEQ ID NO:16));***17-β-脱氢酶1(例如,GenBank登录号P14061(SEQ ID NO:17));XRCC6BP1(例如,GenBank登录号Q8N4L5(SEQ ID NO:18));脑特异性血管生成抑制剂1前体(例如,GenBank登录号O14514(SEQ ID NO:19));含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2(例如,GenBank登录号Q9HBD1-2(SEQ ID NO:20));血红蛋白亚基β(例如,GenBank登录号P68871(SEQ ID NO:21));远上游元件结合蛋白1的同种型1(例如,GenBank登录号Q96AE4-1(SEQ ID NO:22));半乳糖凝集素-3(例如,GenBank登录号P17931(SEQ ID NO:23));溶菌酶C前体(例如,GenBank登录号P61626(SEQ ID NO:24));肌动蛋白,α骨骼肌的(例如,GenBank登录号P68133(SEQ ID NO:25));丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2(例如,GenBank登录号P14618-1(SEQ ID NO:26));AGR2(例如,GenBank登录号O95994(SEQ ID NO:27));中性粒细胞防御素1前体(例如,GenBank登录号P59665(SEQ ID NO:28));成髓细胞素前体(例如,GenBank登录号P24158(SEQ ID NO:29));未表征的蛋白PSME2(例如,GenBank登录号Q9UL46(SEQ ID NO:30));微管蛋白β-2C链(例如,UniProt登录号P68371(SEQ ID NO:31));硫代硫酸盐转硫酶(例如,GenBank登录号Q16762(SEQ ID NO:32));热休克70kDa蛋白1(例如,GenBank登录号P08107(SEQ ID NO:33));Igκ链V-Ⅲ区sie(例如,GenBank登录号P01620(SEQ ID NO:34));巨噬细胞迁移抑制因子(例如,GenBank登录号P14174(SEQ ID NO:35));ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的(例如,GenBank登录号O75947-1(SEQ ID NO:36));未表征的蛋白ENSP00000374051(例如,GenBank登录号A6NGM3(SEQ ID NO:37));细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP](例如,UniProt登录号O75874(SEQ ID NO:38));血红蛋白亚基δ(例如,GenBank登录号P02042(SEQ ID NO:39));剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7(例如,GenBank登录号Q16629-1(SEQ ID NO:40));mRNA加帽酶的同种型1(例如,GenBank登录号O60942-1(SEQ ID NO:41));LON蛋白酶同源物,线粒体前体(例如,GenBank登录号P36776(SEQ ID NO:42));信号识别颗粒54kDa蛋白(例如,GenBank登录号P61011(SEQ ID NO:43));半乳糖凝集素-9的长同种型(例如,GenBank登录号O00182-1(SEQ ID NO:44));整联蛋白连接的蛋白激酶(例如,GenBank登录号Q13418(SEQ ID NO:45));双功能氨酰-tRNA合成酶(例如,GenBank登录号P07814(SEQ ID NO:46));锌指蛋白207的同种型1(例如,GenBank登录号O43670-1(SEQ ID NO:47));无机焦磷酸酶(例如,GenBank登录号Q15181(SEQ ID NO:48));调宁蛋白(calponin)-2(例如,GenBank登录号Q99439(SEQ ID NO:49));盲肌样蛋白3的同种型1(例如,GenBank登录号Q9NUK0-1(SEQ ID NO:50));组织蛋白酶G前体(例如,GenBank登录号P08311(SEQ ID NO:51));含有锌指和BTB结构域的蛋白34(例如,GenBank登录号Q8NCN2(SEQ ID NO:52));腺嘌呤磷酸核糖转移酶(例如,GenBank登录号P07741(SEQ ID NO:53));40S核糖体蛋白S9(例如,GenBank登录号P46781(SEQ ID NO:54));TALIN-1(例如,GenBank登录号Q9Y490(SEQ ID NO:55));含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59(例如,GenBank登录号Q96AG4(SEQ ID NO:56));ATP合酶亚基α,线粒体前体(例如,GenBank登录号P25705(SEQ ID NO:57));蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7(例如,GenBank登录号O94979-7(SEQ ID NO:58));二羟基丙酮激酶(例如,GenBank登录号Q3LXA3(SEQ ID NO:59));类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)同种型4的蛋白(例如,ENSEMBL登录号ENST0000342709(另参见,GenBank登录号NM_004500.3和UNIPARC登录号IPI00868835)(SEQ ID NO:60));18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554(SEQ ID NO:61));寒冷凝集素FS-1 L-链(例如,GenBank登录号A2NB45(SEQ ID NO:62));异质核核糖核蛋白d0的同种型1(例如,UniProt登录号Q14103-1(SEQ ID NO:63));DAZAP1/MEF2D融合蛋白(例如,GenBank登录号Q5IRN2(SEQ ID NO:64))。
也鉴定了在II期癌性细胞中上调的蛋白及其同源多核苷酸。所述多核苷酸编码以下多肽:POTE2(也称作ANKRD26样家族C,成员1A)(例如,GenBank登录号NP_001077007(SEQ ID NO:65));角蛋白18(KRT18)(例如,GenBank登录号NP_000215(SEQ ID NO:66));蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1(也称作蛋白酶体macropain,激活子亚基4)(例如,GenBank登录号NP_055429(SEQ ID NO:67));丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33)(例如,GenBank登录号NP_004626(SEQ ID NO:68));补体组分1,s亚组分(C1S)(例如,GenBank登录号NP_001725(SEQ ID NO:69));溶菌酶C前体(LYZ)(例如,GenBank登录号NP_000230(SEQ ID NO:70));角蛋白型细胞骨架20(KRT20)(例如,GenBank登录号NP_061883(SEQ ID NO:71));RNASE3(也称作ECP RNS3,核糖体酶,RNase A家族3)(例如,GenBank登录号NP_002926(SEQ ID NO:72));醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1)(例如,GenBank登录号NP_000683(SEQ ID NO:73));CDNAFLJ25506 fis,克隆CBR05185(例如,GenBank登录号Q8N7I6(SEQ ID NO:74));fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B(例如,GenBank登录号P23142-2(SEQ ID NO:75));核结合蛋白1(NUCB1)(例如,GenBank登录号NP_006175(SEQ ID NO:76));组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA)(例如,GenBank登录号NP_001019770(SEQ ID NO:77));含有三部分基序的28(TRIM28)(例如,GenBank登录号NP_005753(SEQ ID NO:78));过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI)(例如,GenBank登录号NP_006108(SEQ ID NO:79));肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB)(例如,GenBank登录号NP_000933(SEQ ID NO:80));与40S核糖体蛋白S17类似的(例如,GenBank登录号IP00743305(SEQ ID NO:81));真核翻译延伸因子1γ(EEF1G)(例如,GenBank登录号IPI00747497(SEQ ID NO:82));角蛋白8(KRT8)(例如,GenBank登录号NP_002264(SEQ ID NO:83));Fibulin 2(FBLN2)(例如,GenBank登录号NP_001989(SEQ ID NO:84));VIM(例如,GenBank登录号NP_003371(SEQ ID NO:85));纤维蛋白原α链(FGA)(例如,GenBank登录号NP_000499(SEQ ID NO:86));膜联蛋白A2(ANXA2)(例如,GenBank登录号NP_001002858(SEQ ID NO:87));H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ)(例如,GenBank登录号NP_808760(SEQ ID NO:88));肌动蛋白α,心肌1(ACTC1)(例如,GenBank登录号NP_005150(SEQ ID NO:89));角蛋白19(KRT19)(例如,GenBank登录号NP_002267(SEQ ID NO:90));免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白)(例如,GenBank登录号Q6PIQ7(SEQ ID NO:91));免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM)(例如,GenBank登录号Q8WUK1(SEQ ID NO:92));含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1)(例如,GenBank登录号Q12805-3(SEQ ID NO:93));含有三部分基序的蛋白34(例如,GenBank登录号NP_067629(SEQ ID NO:94));AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3(例如,GenBank登录号NP_542117(SEQ ID NO:95));Proflin-1(例如,GenBank登录号NP_005013(SEQ ID NO:96));组蛋白H4(例如,GenBank登录号NP_001029249(SEQ ID NO:97));血红蛋白亚基α(例如,GenBank登录号NP_000549(SEQ ID NO:98));转凝蛋白(也称作TAGLN)(例如,GenBank登录号NP_001001522(SEQID NO:99));基膜聚糖前体例如,GenBank登录号NP_002336(SEQ ID NO:100));血红蛋白β(也称作HBD CD113t)(例如,GenBank登录号NP_000509(SEQ ID NO:101));纤维蛋白原β链前体(例如,GenBank登录号NP_005132(SEQ ID NO:102));免疫球蛋白κ恒定(IGKC)(例如,GenBank登录号Q6GMX8(SEQ ID NO:103));未表征的蛋白ALB(也称作白蛋白)(例如,GenBank登录号Q56G89(SEQ ID NO:104))。
在另一个实施例中,使用PCMAT鉴定在疾病状态即IV期结肠直肠癌期间脱落进入体液的蛋白。见实施例1。该研究使用在鸡中针对IV期人结肠癌组织的佐剂化匀浆物产生的YPAb(多克隆IgY抗体)。使用来自健康受试者的血清(结合在固体载体上)吸附从IV期肿瘤组织引发的YPAb。使用western和斑点印迹法确认不存在与健康血清中存在的抗原反应的其余抗体之后,使剩余的未吸附的抗体结合至固体载体树脂,以产生如上文所述的负载的柱子。使来自IV期结肠直肠癌患者的血清通过该柱子,通过洗涤除掉非特异性反应的蛋白和肽。使用乙酸回收特异性结合的蛋白,如上文所述通过GeLC-MS/MS鉴定。按照相同的方式使用II期肿瘤组织以鉴定SEQ ID NO:108-157如下:细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β)(例如,GenBank登录号NP_001092(SEQ ID NO:108));血红蛋白β(例如,GenBank登录号O95408(SEQ ID NO:109));血红蛋白亚基α(例如,GenBank登录号P69905(SEQ ID NO:110));POTE-2α肌动蛋白(例如,GenBank登录号A5A3E0(SEQ ID NO:111));SLC4A10(例如,GenBank登录号Q6U841(SEQ ID NO:112));核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7)(例如,GenBank登录号O75817(SEQ ID NO:113));核RNA输出因子1(NXF1)(例如,GenBank登录号Q59E96(SEQ ID NO:114));具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA(例如,GenBank登录号Q05DB3(SEQ ID NO:115));未表征的蛋白C13ORF27(例如,GenBank登录号Q5JUR7(SEQ ID NO:116));含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3(例如,GenBank登录号Q8TER0(SEQ ID NO:117));动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10)(例如,GenBank登录号Q8IVF4(SEQ ID NO:118));间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43)(例如,GenBank登录号P17302(SEQ ID NO:119));驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1(例如,GenBank登录号Q5SZU8(SEQ ID NO:120));GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶(例如,GenBank登录号P04406(SEQ ID NO:121));未表征的蛋白ALB(例如,GenBank登录号P02768(SEQ ID NO:122));半乳糖凝集素-3,LGALS3(例如,GenBank登录号NP_002297(SEQ ID NO:123));与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的(例如,GenBank登录号O15069(SEQ ID NO:124));线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1(例如,GenBank登录号NP_000010(SEQ ID NO:125));KH型剪接调控蛋白,FUBP2(例如,GenBank登录号NP_003676(SEQ ID NO:126));Profilin 1(PFN1)(例如,GenBank登录号NP_005013(SEQ ID NO:127));细胞内氯通道蛋白1,CLIC1(例如,GenBank登录号NP_001279(SEQ ID NO:128));锌指蛋白831(例如,GenBank登录号NP_848552(SEQ IDNO:129));内质蛋白(例如,GenBank登录号NP_003290(SEQ ID NO:130));核糖体蛋白S10(RPS10)(例如,GenBank登录号P46783(SEQ ID NO:131));剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3(例如,GenBank登录号NP_003008(SEQ ID NO:132));ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌)(例如,GenBank登录号P62736(SEQ ID NO:133));钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A(例如,GenBank登录号NP_055006SEQ ID NO:134));半乳糖凝集素-9的长同种型(例如,GenBank登录号NP_033665SEQ ID NO:135));T-复合蛋白1亚基ε,CCT5(例如,GenBank登录号NP_036205(SEQ ID NO:136));肺特异性的α-烯醇酶(例如,GenBank登录号CAA47179(SEQ ID NO:137));原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS(例如,GenBank登录号NP_005363(SEQ ID NO:138));β-内收蛋白(ADD2)的同种型1(例如,GenBank登录号NP_001608(SEQ ID NO:139));载脂蛋白E(APOE)(例如,GenBank登录号NP_000032SEQ ID NO:140));泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白)(例如,GenBank登录号NP_064516(SEQ ID NO:141));Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物)(例如,GenBank登录号NP_003336(SEQ ID NO:142));肌球蛋白-15(MYH15)(例如,GenBank登录号NP_055796(SEQ ID NO:143));FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK)(例如,GenBank登录号NP_057392(SEQ ID NO:144));Intelectin-1(ITLN1)(例如,GenBank登录号NP_060095(SEQ ID NO:145));载脂蛋白A-IV(APOA4)(例如,GenBank登录号Q13784(SEQ ID NO:146));线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1)(例如,GenBank登录号P08559(SEQ ID NO:147));含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59)(例如,GenBank登录号NP_060979(SEQ ID NO:148));60S核糖体蛋白L37A(RPL37A)(例如,GenBank登录号NP_000989(SEQ ID NO:149));尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1)(例如,GenBank登录号Q53HM1(SEQ ID NO:150));醛脱氢酶9A1(ALDH9A1)(例如,GenBank登录号NP_000687(SEQ ID NO:151));细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1)(例如,GenBank登录号Q16881(SEQ ID NO:152));核受体亚家族2组E成员1(NR2E1)(例如,GenBank登录号NP_003260(SEQ ID NO:153));阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3)(例如,GenBank登录号NP_821138(SEQ ID NO:154));含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1)例如,GenBank登录号NP_006849(SEQ ID NO:155));蛋白FAM154A(FAM154A)(例如,GenBank登录号NP_714918(SEQ ID NO:156));转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1(例如,GenBank登录号NP_002495(SEQ ID NO:157))。
鉴定了在IV期癌性细胞中上调的脱落的变化介导的蛋白及其同源多核苷酸。所述多核苷酸编码SEQ ID NO:105-107所示的多肽ApoA1(例如,GenBank登录号P02647(SEQ ID NO:105));C4A(例如,GenBank登录号P0C0L4(SEQ ID NO:106));和C3 187kDa蛋白(例如,GenBank登录号P01024(SEQ ID NO:107))。
一般而言,PCMAT具有多个杰出的优点,包括其速度(可以在6个月以内完成项目的整个生物标志物发现部分)、成本划算,以及,最重要的,其灵敏性。一般而言,鸡被用作良好的宿主,其中产生高效价的、广谱反应性的抗体:它们也能非常好地耐受非常强的佐剂,它们在***发生上与人距离远,这使其在癌症研究中更容易针对人类免疫原作出响应;它们具有非常大的免疫组库(immune repertoire),并且从它们的卵中可以容易地获取数量巨大的纯化的IgY(基本上与IgG相同)。强佐剂的使用辅助确保即使是低丰度的蛋白也会引发抗体应答,并且将被回收。促进PCMAT的灵敏性的另一个方面是负载的柱子的大小和可以通过它的体液的数量可以很大(substantial)。这再次促成了发现低丰度蛋白的可能性。最后,减除步骤(其中来自健康受试者的体液用于除掉与背景蛋白反应的抗体)产生显著升高的信噪比。对如PCMAT所提供的灵敏性的需求无论怎么说都不会被夸大。脱落进入体液的癌性蛋白极有可能是相对低丰度的,因此会被目前使用的策略忽略掉。使用PCMAT发现癌性的脱落蛋白提供了鉴定用于开发癌症诊断剂的新靶标的独特机会。
所有这些多肽在本文中被称作“本发明的多肽”或“与癌症相关的抗原或多肽”。编码本发明的多肽的多核苷酸在本文中被称作“本发明的多核苷酸”或“与癌症相关的多核苷酸”。
多肽
多肽是通过酰胺键共价连接的三个或更多个氨基酸的聚合物。多肽可以进行翻译后修饰。纯化的多肽是基本上不含细胞物质、其它类型的多肽、用于合成该多肽的化学前体、化学品、或其组合的多肽制剂。基本上不含细胞物质、培养基、用于合成多肽的化学前体和/或化学品的多肽制剂含有小于大约30%、20%、10%、5%、1%或更少的其它多肽、培养基、用于合成的化学前体和/或其它化学品。因此,纯化的多肽是大约70%、80%、90%、99%或更纯。
本发明的多肽可以包含至少1、2、3、4、5、10、25、100、500、1,000或更多个非天然存在的氨基酸,其紧临多肽的氨基和羧基末端之一或二者。
本发明的多肽可以是全长多肽或蛋白或多肽或蛋白的片段。例如,本发明的多肽的片段可以包含本发明的多肽的大约5、10、15、20、30、40、50、60、70、80、90、100、250、500、750、1,000、2,000、3,000、4,000、5,000或更多个连续氨基酸,或5至5,000之间的任意数值或范围。本发明的多肽的实例包括SEQ ID NO:1-157所示的那些。变体多肽与SEQ ID NO:1-157所示的多肽序列具有至少大约80%,或大约85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性。变体多肽具有一个或多个保守性氨基酸变异或其它小修饰,并且保留生物活性,即,其是生物学功能等同物。与对应的野生型多肽相比,生物活性等同物具有基本上等同的功能。
序列同一性百分率在本领域具有已知含义,有多种方法可以测定两个多肽或多核苷酸序列之间的同一性。参见,例如Lesk,Ed.,Computational Molecular Biology,Oxford University Press,New York,(1988);Smith,Ed.,Biocomputing:Informatics And Genome Projects,Academic Press,New York,(1993);Griffin & Griffin,Eds.,Computer Analysis Of Sequence Data,Part I,Humana Press,New Jersey,(1994);von Heinje,Sequence Analysis In Molecular Biology,Academic Press,(1987);和Gribskov & Devereux,Eds.,Sequence Analysis Primer,M Stockton Press,New York,(1991)。用于比对多核苷酸或多肽的方法编撰于计算机程序中,包括GCG程序包(Devereux等人.,Nuc.Acids Res.12:387(1984))、BLASTP、BLASTN、FASTA(Atschul等人.,J. Molec.Biol.215:403(1990)),和Bestfit程序(Wisconsin Sequence Analysis Package,Version 8 for Unix,Genetics Computer Group,University Research Park,575 Science Drive,Madison,WI 53711),其使用Smith和Waterman(Adv.App.Math.,2:482-489(1981))的局部同源性算法。例如,可以使用计算机程序ALIGN,其应用FASTA算法,具有仿射空隙搜索(affine gap search),其中空隙开放罚分为-12,空隙延伸罚分为-2。
当使用任何序列比对程序来确定特定序列是否与参考序列具有例如大约95%的同一性时,将参数设定为:在参考多核苷酸的全长上计算同一性百分率,并且允许参考多核苷酸中总核苷酸数目的至多5%的同一性中的空隙。
变体一般可以这样鉴定:修饰本发明的一种多肽序列,并评估经修饰的多肽的性质以确定其是否为生物学上等同的。如果在测定(例如免疫组化测定、酶联免疫吸附测定(ELISA)、放射免疫测定(RIA)、免疫酶测定或western印迹测定)中,变体的反应基本上与本发明的多肽相同,例如具有原始多肽的90%-110%的活性,则该变体是生物学上等同的。在一个实施方式中,所述测定是竞争性测定,其中生物学上等同的多肽能够将本发明的多肽与相应的有反应活性的抗原或抗体的结合减少大约80%、95%、99%或100%。特异性结合相应的野生型多肽的抗体也特异性结合变体多肽。本发明的变体多肽可以包括大约1、2、3、4、5、10、20、30、40、50、60、70、80、100、200或更多个保守性氨基酸替换或大约1至大约200之间的任意数值或范围的替换。
保守性替换是指这样的替换,其中一个氨基酸被替换为另一个具有相似性质的氨基酸,以致于肽化学领域的技术人员将会预期多肽的二级结构和亲水疏水性(hydropathic nature)基本上不会改变。保守性替换包括氨基酸组内的交换,例如脂肪族或疏水性氨基酸Ala、Val、Leu和Ile的替换;带羟基的残基Ser和Thr的替换;酸性残基Asp和Glu的替换;酰胺残基Asn和Gln的替换;碱性残基Lys、Arg和His的替换;芳香族残基Phe、Tyr和Trp的替换;以及小氨基酸Ala、Ser、Thr、Met和Gly的替换。
本发明的多肽还可以包含信号(或前导)序列,其共翻译地或翻译后地指导蛋白的转移。多肽还可以包含连接子或其它序列,以简化多肽的合成、纯化或鉴定(例如多聚组氨酸),或为了增强多肽与固体载体的结合。本发明的多肽还可以包含信号(或前导)序列,其共翻译地或翻译后地指导蛋白的转移。多肽还可以包含连接子或其它序列,以简化多肽的合成、纯化或鉴定(例如多聚组氨酸),或为了增强多肽与固体载体的结合。例如,多肽可以缀合至免疫球蛋白的Fc区或牛血清白蛋白。
多肽可以共价或非共价地连接至在天然状态下通常不与所述多肽结合的氨基酸序列。多肽还可以共价或非共价地连接至氨基酸之外的化合物或分子。例如,多肽可以连接至指示剂、氨基酸间隔子、氨基酸连接子、信号序列、终止转移序列、跨膜结构域、蛋白纯化配体,或其组合。在本发明的一个实施方式中,蛋白纯化配体可以是一个或多个氨基酸残基,例如,本发明的多肽的氨基末端或羧基末端。氨基酸间隔子是在天然状态下通常不与本发明的多肽结合的氨基酸序列。氨基酸间隔子可以包含大约1、5、10、20、100、500、1,000或更多个氨基酸。
如果需要,多肽可以是融合蛋白,其还可以包含其它氨基酸序列,例如氨基酸连接子、氨基酸间隔子、信号序列、TMR终止转移序列、跨膜结构域、以及用于蛋白纯化的配体,例如谷胱甘肽-S-转移酶、组氨酸标签和葡萄球菌蛋白A,或其组合。融合蛋白中可以存在一种以上的本发明的多肽。本发明的多肽的片段可以存在于本发明的融合蛋白中。本发明的融合蛋白可以包括SEQ ID NO:1-157中的一个或多个,其片段,或其组合。
本发明的多肽可以是多聚体形式。即,多肽可以包含SEQ ID NO:1-157的一个或多个拷贝,或其组合。多聚体多肽可以是多抗原肽(MAP)。参见,例如,Tam,J.Immunol.Methods,196:17-32(1996)。
本发明的多肽可以包含被抗体识别的抗原。所述抗原可以包含一个或多个表位(即抗原决定簇)。表位可以是线性表位、连续表位或构象表位。可以通过数种方法鉴定本发明的多肽内的表位。参见,例如美国专利号4,554,101;Jameson & Wolf,CABIOS 4:181-186(1988)。例如,可以分离并筛选本发明的多肽。可以通过蛋白水解切割制备一系列短肽,其联合在一起跨越整个多肽序列。从例如100聚体的多肽片段开始,可以在ELISA中测定每个片段中被识别的表位的存在。例如,在ELISA测定中,将多肽例如100聚体的多肽片段附着至固体载体,例如塑料多孔板的孔。标记抗体群体,加入至固体载体中,并使其在封闭了非特异性吸附的条件下与未标记的抗原结合,洗掉任何未结合的抗体和其它蛋白。通过例如将无颜色的底物转化为有颜色的反应产物的反应来检测抗体结合情况。然后可以从所鉴定的100聚体中逐渐测定更小的和重叠的片段,以定位目标表位。
可以重组地产生本发明的多肽。可以使用本领域熟知的技术,将编码本发明的多肽的多核苷酸导入可以在合适的表达宿主细胞***中表达的重组表达载体。本领域有多种细菌、酵母、植物、哺乳动物和昆虫表达***,可以使用任意此类表达***。任选地,可以在无细胞翻译***中翻译编码多肽的多核苷酸。还可以化学合成或从癌性细胞中获得多肽。
本发明的免疫原性多肽可以包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。免疫原性多肽可以引发识别具有SEQ ID NO:1-157的多肽的表位的抗体或其它免疫应答(例如免疫***的T-细胞应答)。本发明的免疫原性多肽还可以是具有SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列的多肽的片段。本发明的免疫原性多肽片段的长度可以是大约5、10、15、20、30、40、50、60、70、80、90、100、250、500、750、1,000、2,000、3,000、4,000、5,000或更多个氨基酸,或大约5至大约5,000之间的任意数值或范围。
多核苷酸
本发明的多核苷酸包含小于整个基因组,可以是单链或双链的核酸。多核苷酸可以是RNA、mRNA、DNA、cDNA、基因组DNA、化学合成的RNA或DNA或其组合。多核苷酸可以是纯化的,不含其它成分,例如蛋白、脂类和其它多核苷酸。例如,多核苷酸可以是50%、75%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%纯化的。本发明的多核苷酸编码如上文所述的多肽。在本发明的一个实施方式中,多核苷酸编码本发明的多肽和SEQ ID NO:1-157所示的多肽,其互补物,或其组合。本发明的多核苷酸可以包含其它核苷酸序列,例如编码连接子、信号序列、TMR终止转移序列、跨膜结构域、或用于蛋白纯化的配体例如谷胱甘肽-S-转移酶、组氨酸标签和葡萄球菌蛋白A的序列。
本发明的多核苷酸可以是分离的。分离的多核苷酸是指这样的多核苷酸,其不与5’和3’侧翼基因组序列(天然状态下与之结合)之一或二者紧临。分离的多核苷酸可以是例如,任意长度的重组DNA分子,只要在天然存在的基因组中天然发现的紧临重组DNA分子侧翼的核酸序列被除掉或不存在。分离的多核苷酸还包括非天然存在的核酸分子。存在于例如cDNA或基因组文库或含有基因组DNA限制性消化物的凝胶切片内的数百至数百万的其它核酸分子中的核酸分子不被认为是分离的或纯化的多核苷酸。
本发明的多核苷酸还可以包括编码免疫原性多肽的片段。本发明的多核苷酸可以编码全长多肽或蛋白、多肽片段、变体或融合多肽。
编码本发明的多肽的简并核苷酸序列,以及与本发明的多核苷酸序列具有至少大约80%、或大约85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或更高同一性的同源核苷酸序列及其互补物也是本发明的多核苷酸。可以按照“多肽”部分的描述计算序列同一性百分率。简并核苷酸序列是编码本发明的多肽或其片段的多核苷酸,但由于遗传密码的简并性而与野生型多核苷酸序列的核酸序列不同。编码本发明的生物功能多肽的互补性DNA(cDNA)分子、物种同源物和多核苷酸变体也是本发明的多核苷酸。本发明的多核苷酸可以分离自存在于例如来自个体患者的生物样品,例如血液、血清、唾液、或组织中的核酸序列。多核苷酸还可以在实验室中合成,例如使用自动化合成器。可以使用扩增方法例如PCR从基因组DNA或编码多肽的cDNA扩增多核苷酸。
本发明的多核苷酸可以包括天然存在的多肽的编码序列或者可以编码天然不存在的改变的序列。如果需要,可以将多核苷酸克隆进入包含表达控制元件的表达载体,所述控制元件包括例如,复制起始子、启动子、增强子、或驱动本发明的多核苷酸在宿主细胞中表达的其它调控元件。表达载体可以是例如质粒,例如pBR322、pUC或ColE1,或腺病毒载体,例如腺病毒2型载体或5型载体。任选地,可以使用其它载体,包括但不限于,Sindbis病毒、SV40、甲病毒载体、痘病毒载体和巨细胞病毒和逆转录病毒载体,例如鼠肉瘤病毒、小鼠乳腺肿瘤病毒、莫洛尼氏鼠白血病病毒和Rous肉瘤病毒。也可以使用微染色体,例如MC和MC1,细菌噬菌体、噬菌粒、酵母人工染色体、细菌人工染色体、病毒颗粒、病毒样颗粒、粘粒(其中***了噬菌体λcos位点的质粒)和复制子(能够在细胞中在其自身控制下复制的遗传元件)。
制备与表达控制序列可操作地连接的多核苷酸并使其在宿主细胞中表达的方法是本领域熟知的。参见,例如美国专利号4,366,246。当置于紧临或靠近一个或多个指导多核苷酸转录和/或翻译的表达控制元件时,本发明的多核苷酸是可操作地连接的。
本发明的多核苷酸可以用作例如探针或引物,例如PCR引物,以检测样品例如生物样品中多核苷酸的存在。此类探针和引物与本发明的多核苷酸特异性结合的能力使其能够用于检测给定样品中互补序列的存在。本发明的多核苷酸探针和引物可以杂交至样品例如生物样品(包括唾液、痰、血液、尿、粪便、胸腔积液、羊水、伤口流出物或组织)中的互补序列。来自样品的多核苷酸可以,例如,进行凝胶电泳或其它基于大小的分离技术,或者可以不进行基于大小的分离而被固定。可以标记多核苷酸探针或引物。用于标记探针和引物的适当的标记物和方法是本领域已知的,包括例如,通过切割翻译或通过激酶掺入的放射活性标记物、生物素标记物、荧光标记物、化学发光标记物、生物发光标记物、金属螯合剂标记物和酶标记物。在合适的严格性的杂交条件下使来自样品的多核苷酸与探针或引物接触。
取决于应用情况,可以使用不同的杂交条件以达到探针或引物针对靶序列的不同程度的选择性。对于需要高选择性的应用,可以使用相对严格的条件,例如低盐和/或高温度的条件,例如大约0.02M至大约0.15M盐的盐浓度,或大约0.02M至大约0.15M盐之间的任何数值或范围,温度为大约50℃至大约70℃,或大约50℃至大约70℃之间的任意数值或范围。对于需要低选择性的应用,可以使用较低严格性的杂交条件,例如大约0.14M至大约0.9M盐的盐浓度,或大约0.14M至大约0.9M盐之间的任何数值或范围,温度为大约20℃至大约55℃,或大约20℃至大约55℃之间的任意数值或范围。包含探针或引物和来自测试样品的互补性多核苷酸的杂交复合物的存在可以指示样品中癌症的存在。
抗体
本发明的抗体是特异性且稳定地结合本发明的多肽或其片段的抗体分子。本发明的抗体可以是多克隆抗体、单克隆抗体、单链抗体(scFv)、单特异性单链抗体、双特异性单链抗体、二价单链抗体、四价单链抗体、嵌合抗体、人源化抗体或抗体的抗原结合片段。抗体的抗原结合片段是完整抗体的一部分,其包含完整抗体的抗原结合位点或可变区,其中所述部分不含完整抗体的Fc区的重链恒定结构域。抗原结合抗体片段的实例包括Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab’)2和Fv片段。
分离的抗体实质上是从其天然环境分离的。例如,分离的抗体实质上是从其所源自的生物来源分离的。纯化的抗体基本上不含在天然环境中与该抗体结合的其它物质。例如,纯化的抗体基本上不含有来自其所源自的细胞或组织的细胞物质或其它蛋白或抗体。该术语指这样的制备物,其中分离的抗体是至少大约70%至80%(w/w)纯的,更优选为,至少大约80%至90%(w/w)纯的,更优选为,大约90%至95%(w/w)纯的,最优选为,至少大约95%、96%、97%、98%、99%或100%(w/w)纯的。
本发明的抗体可以是任意抗体类别和任意亚型,包括例如,IgG(IgG1、IgG2、IgG4)、IgM、IgA、IgD、IgE和IgY。抗体或其抗原结合片段与本发明的多肽的表位结合。可以在体内在合适的实验动物中制备抗体,或者在体外使用重组DNA技术制备。制备并表征抗体的方法是本领域熟知的。参见,例如,Dean,Methods Mol.Biol.80:23-37(1998);Dean,Methods Mol.Biol.32:361-79(1994);Baileg,Methods Mol.Biol.32:381-88(1994);Gullick,Methods Mol.Biol.32:389-99(1994);Drenckhahn等人.Methods Cell.Biol.37:7-56(1993);Morrison,Ann.Rev.Immunol.10:239-65(1992);Wright等人,Crit.Rev.Immunol.12:125-68(1992)。例如,可以通过将本发明的多肽给予至动物例如人或其它灵长类、小鼠、大鼠、兔子、豚鼠、山羊、猪、狗、牛、绵羊、驴、鸡或马来制备多克隆抗体。收集来自经免疫的动物的血清,并通过例如硫酸铵沉淀、然后通过色谱法例如亲和色谱从血浆中纯化抗体。用于制备和处理多克隆抗体的技术是本领域已知的。
“特异性结合”或“特异于”意思是第一抗原例如本发明的多肽识别并以大于其它非特异性分子的亲和力结合本发明的抗体。非特异性分子是与第一抗原无共同表位的抗原。在这种情况下,本发明的多肽一般不是用于非特异性对照分子的理想选择。例如,针对第一抗原(例如多肽)产生的抗体,所述抗体与所述第一抗原的结合效率高于所述抗体与非特异性抗原的结合,则所述抗体可以被描述为特异性结合所述第一抗原。在优选的实施方式中,当抗体或其抗原结合部分以107l/mol或更高的结合亲和Ka结合本发明的多肽,例如SEQ ID NO:1-157或其片段时,其为特异性结合。可以使用本领域熟知的方法,通过例如酶联免疫吸附测定(ELISA)、放射免疫测定(RIA)或western印迹测定法检测特异性结合。
另外,也可以容易地制备针对存在于本发明的多肽上的表位的单克隆抗体。例如,可以使来自哺乳动物(例如小鼠,其经过本发明的多肽免疫)的正常B细胞与例如HAT敏感性小鼠骨髓瘤细胞融合以产生杂交瘤。可以使用RIA或ELISA鉴定产生抗体的杂交瘤,并通过克隆进入半固体琼脂或通过有限稀释法来分离。通过另一轮筛选分离产生多肽特异性抗体的克隆。可以使用标准技术就特异性来筛选单克隆抗体,例如通过使本发明的多肽与微量滴定板结合并通过ELISA测定法测定单克隆抗体的结合。用于产生和处理单克隆抗体的技术是本领域已知的。参见,例如Kohler & Milstein,Nature,256:495(1975)。可以直接制备单克隆抗体的特定同种型,例如,通过从最初的融合体中选择;或者,通过使用近亲选择技术以分离类转换变体,从而从分泌不同同种型的单克隆抗体的亲本杂交瘤间接制备。参见,Steplewski等人,P.N.A.S.U.S.A.82:8653 1985;Spria et al.,J.Immunolog.Meth.74:307,1984。本发明的单克隆抗体还可以是重组单克隆抗体。参见,例如美国专利号4,474,893;美国专利号4,816,567。本发明的抗体还可以是化学构建的。参见,例如美国专利号4,676,980。
本发明的抗体可以是嵌合的(参见,例如美国专利号5,482,856)、人源化的(参见,例如Jones等人.,Nature 321:522(1986);Reichmann等人.,Nature 332:323(1988);Presta,Curr.Op.Struct.Biol.2:593(1992)),或人抗体。可以通过例如直接永生化、噬菌体展示、转基因小鼠、或Trimera技术制备人抗体,参见,例如Reisener等人.,Trends Biotechnol.16:242-246(1998)。
特异性结合抗原(例如本发明的多肽)的抗体对于检测样品例如来自怀疑患有癌症的动物例如人的血清、血液、尿、组织或唾液样品中与癌症相关的抗原的存在是特别有用的。用于与癌症相关的抗原的免疫测定可以利用一种抗体或数种抗体。用于与癌症相关的抗原的免疫测定可以使用例如,针对本发明的多肽的一个表位的单克隆抗体,针对本发明的一种多肽的表位的单克隆抗体、针对本发明的不同多肽的表位的单克隆抗体、针对本发明的多肽的相同抗原的多克隆抗体、针对不同抗原的多克隆抗体的组合,或单克隆与多克隆抗体的组合。免疫测定程序可以基于例如,竞争性、直接反应、或夹心式测定,使用例如标记的抗体。本发明的抗体可以通过本领域已知的任意类型的标记物标记,包括,例如荧光、化学发光、放射活性、酶、胶体金属、放射性同位素和生物发光标记物。
本发明的抗体包括抗体及其抗原结合片段,其(a)与参考抗体竞争与本发明的多肽例如SEQ ID NO:1-157或其抗原结合片段的结合;(b)与参考抗体结合本发明的多肽例如SEQ ID NO:1-157或其抗原结合片段的相同的表位;(c)与参考抗体以基本上相同的Kd结合本发明的多肽例如SEQ ID NO:1-157或其抗原结合片段;和/或(d)与参考抗体以基本上相同的解离速率结合本发明的多肽例如SEQ ID NO:1-157或其片段,其中所述参考抗体是以107l/mol或更高的结合亲和力特异性结合本发明的多肽例如SEQ ID NO:1-157或其抗原结合片段的抗体或其抗原结合片段。
本发明的抗体或其抗原结合片段可以结合至载体,并用于检测与癌症相关的抗原的存在。所述载体包括,例如,玻璃、聚苯乙烯、聚丙烯、聚乙烯、葡聚糖、尼龙、淀粉酶、天然和修饰的纤维素、聚丙烯酰胺、琼脂糖和磁铁矿。
本发明的抗体还可以用于通过免疫亲和柱分离与癌症相关的抗原。抗体可以通过例如吸附或通过共价键结合至固体载体,从而抗体保留其免疫选择活性。任选地,可以包括间隔基团,从而抗体的抗原结合位点保持可以靠近。然后固定的抗体可以用于结合来自样品例如生物样品(包括唾液、血清、痰、血液、尿、粪便、胸腔积液、羊水、伤口流出物或组织)的与癌症相关的抗原。通过例如pH的变化从柱基质中回收结合的与癌症相关的抗原。
本发明的抗体还可以用于免疫定位研究以分析本发明的多肽在多个细胞事件或生理状况过程中的存在和分布情况。抗体还可用于鉴定参与被动免疫的分子,并用于鉴定参与非蛋白抗原的生物合成的分子。此类分子的鉴定对于疫苗开发是有用的。本发明的抗体,包括例如单克隆抗体和单链抗体,可用于监视癌症的改善进程。本发明的IV期多核苷酸(即编码SEQ ID NO:65-107的多核苷酸)在该方法中是特别有用的,但是,I期(即编码SEQ ID NO:1-64的多核苷酸)和II期(即编码SEQ ID NO:108-157的多核苷酸)也可用于该方法。通过测定针对来自动物的测试样品中的与癌症相关的抗原的抗体的增加或减少,可以测定旨在缓解癌症的特定治疗方案是否有效。可以使用例如直接结合测定法例如RIA、ELISA或western印迹测定法来检测和/或定量抗体。
检测癌症的方法
本文提供了检测受试者中的癌症、患上癌症的倾向性或患上癌症的易感性的方法。对癌症的倾向性意思是受试者对癌症例如结肠直肠癌易感,或者比正常个体或正常个体的群体患上癌症的可能性更大。受试者可以是哺乳动物例如人、非人灵长类、小鼠、大鼠、狗、猫、绵羊、猪、马或牛。鉴定了在结肠癌组织中特异性表达的107种多肽(即,所述多肽在癌性组织中表达,但是在健康组织中不表达或以低水平表达)。这些多肽是与癌症相关的多肽并且由与癌症相关的多核苷酸编码。I期多肽和多核苷酸对于早期诊断是特别有用的。可以测定来自受试者的生物样品中的编码本发明的多肽的一种或多种与癌症相关的多核苷酸的表达水平,其中,所述与癌症相关的多核苷酸的表达水平相对于多核苷酸的正常对照表达水平的升高指示该受试者患有癌症或具有患上癌症的风险。与正常对照表达水平的比较不是必需的,因为本发明的多核苷酸在健康细胞和组织中不表达或者以低水平表达。
一般而言,PCMAT可用于多种癌症。癌症可以是结肠癌(也称作,并且在本文中也被称为结肠直肠癌或大肠癌)、腺癌、癌(carcinoma)、肉瘤、淋巴瘤、白血病、***癌、胃癌、肺癌、膀胱癌、黑素瘤、胰腺癌、乳腺癌、子宫内膜癌、卵巢癌、***癌、皮肤癌、骨肉瘤、脑肿瘤、胃肠癌、食道癌、胆管癌、眼癌、胆囊癌、神经胶质瘤、头颈癌、肝癌、肾癌、喉癌、唇癌及口癌、间皮瘤、小肠癌、睾丸癌、甲状腺癌、尿道癌、子宫癌、***癌、外阴癌、***癌、或其任意组合或子集。生物样品可以是例如,粘膜细胞、肿瘤细胞、癌细胞、活组织检查样品、灌洗样品、痰样品、血清样品、胃分泌样品、血浆样品、血液样品、粪便样品、***样品、骨髓样品、尿样品、组织样品、结肠直肠组织样品、胸腔积液样品、细胞、细胞提取物、体液、基本上不含细胞的体液(例如,少于大约1%、5%或10%的细胞)、眼泪、乳汁、***、***液、肺灌洗液或唾液。
可以通过检测与癌症相关的多核苷酸编码的多肽来测定与癌症相关的蛋白或多肽的表达水平。可以使用免疫测定法例如ELISA、免疫组化测定法、免疫细胞化学测定法以及抗体标记的细胞的流式细胞术测定法来测定多肽的表达水平。可以通过例如使用特异性结合多肽的抗体来测定多肽的表达水平。还可以通过测定与癌症相关的多核苷酸编码的多肽的生物活性来测定与癌症相关的蛋白和多肽的表达水平。检测多肽的生物活性的方法是本领域熟知的。
可以通过测定与癌症相关的多核苷酸的mRNA的表达水平来测定本发明的多核苷酸(即“与癌症相关的多核苷酸”)的表达水平。可以通过测定与癌症相关的多核苷酸探针与源自患者的生物样品的多核苷酸转录物的杂交来测定与癌症相关的多核苷酸的表达水平。可以使用例如多核苷酸阵列来测定杂交。例如,用于检测对应于本发明的与癌症相关的多核苷酸的RNA序列的探针可用于例如northern印迹杂交测定中。或者,本发明的多核苷酸可用于构建在例如基于扩增的检测方法中特异性扩增多核苷酸序列的引物,所述方法例如基于逆转录的聚合酶链式反应(RT-PCR)、聚合酶链式反应扩增(PCR)、连接酶链式反应扩增(LCR)、链置换扩增(SDA)和基于核酸序列的扩增(NASBA)。
可以将测试样品中的一种或多种本发明的与癌症相关的多核苷酸的表达水平与对照样品中的与癌症相关的多核苷酸的表达水平进行比较。所述对照样品可以是例如癌样品或非癌样品(例如健康组织,例如健康的结肠直肠组织)。
当所述对照样品是非癌的时,测试样品与对照样品中的相似的蛋白或多核苷酸表达水平指示该测试样品是非癌的。测试样品可以与多个对照样品进行比较。因此,测试样品可以与含有例如癌性细胞的第二对照样品进行比较,以及与含有例如非癌性细胞的第二对照进行比较。
本发明的蛋白、多肽和多核苷酸可用于在来自特定受试者的测试样品中测定假设的治疗性或预防性抗癌剂,例如抗结肠直肠癌试剂,以确定该试剂是否是适合于该特定受试者的抗癌剂。为了鉴定某抗癌剂适合于某特定受试者,从该受试者获得测试样品,例如癌性细胞或肿瘤样品,并将其暴露于抗癌剂。测定一种或多种本发明的多核苷酸的表达。可以测定测试样品的与癌症相关的多核苷酸的表达样式并与一种或多种对照谱例如结肠直肠癌参考表达谱或非结肠直肠癌参考表达谱相比较。优选地,在离体条件下将细胞群体与试剂或抗癌剂的活性形式接触。
然后,将测试样品中与癌症相关的多肽或多核苷酸的表达与对照样品中与癌症相关的多肽或多核苷酸的表达进行比较。对照样品可以是细胞,其癌症状态是已知的。如果对照样品是非癌的,则测试样品与对照样品之间的相似的基因表达谱指示该抗癌剂适合于治疗该受试者中的癌症。测试样品与对照样品之间的多肽或多核苷酸表达上的表达差异指示该抗癌剂不适合于治疗该受试者中的癌症。测试样品中一种或多种与癌症相关的多肽或多核苷酸的表达相对于来自癌性组织的对照样品的降低指示该试剂是治疗性的。
本发明的多肽或多核苷酸还可用于鉴定用于治疗癌症例如结肠直肠癌的候选治疗剂。筛选候选治疗剂以确定其是否将特异于癌症状态例如结肠直肠癌状态的与癌症相关的多肽或多核苷酸的表达谱转变为指示非癌状态的样式。
将癌样品暴露于测试试剂或测试试剂的组合(依次或同时),并测定样品中一种或多种与癌症相关的多肽或多核苷酸的表达。将测试样品中的与癌症相关的多肽或多核苷酸的表达与未暴露于测试试剂的对照样品中的与癌症相关的多肽或多核苷酸的表达水平进行比较。治疗性测试试剂将降低在癌细胞中被上调的与癌症相关的多肽或多核苷酸的表达。
对照样品可以是癌性细胞,例如癌性结肠直肠癌细胞。相对于不存在测试试剂的情况下对照样品的表达谱而言,在存在测试试剂的情况下与癌症相关的多肽或多核苷酸的表达的降低指示该测试试剂是治疗癌症例如结肠直肠癌的候选治疗剂。
还提供了通过将测试样品中的一种或多种本发明的多肽或多核苷酸的表达与来源于疾病阶段范围内的患者的对照样品中的多肽或多核苷酸的表达相比较来测定患有癌症例如结肠直肠癌的受试者的预后的方法。通过比较测试样品与对照样品中一种或多种本发明的多肽或多核苷酸的多肽或多核苷酸表达,或者通过比较来源于受试者的多肽或多核苷酸随时间的表达样式,可以测定受试者的预后。一种或多种IV期多肽或多核苷酸(即多肽或编码SEQ ID NO:65-107的多核苷酸)的表达将指示较差的预后。排除掉一种或多种IV期多核苷酸的表达,一种或多种I期多肽或多核苷酸(即多肽或编码SEQ ID NO:1-64的多核苷酸)的表达将指示较好的预后。
对照样品可以是健康样品或癌性样品,例如结肠直肠癌样品。或者,对照样品可以是癌表达谱,例如结肠直肠癌表达谱。当对照样品是癌性的时,一种或多种本发明的多肽的表达的升高指示较为不利的预后。本发明的多肽或多肽表达的降低指示对于受试者较为有利的预后。或者,当对照样品是健康样品时,一种或多种本发明的多肽或多肽的表达的升高指示受试者的较为不利的预后,而降低的或相似的表达指示较为有利的预后。
本发明还提供了结肠直肠癌参考表达谱,其包含两种或更多种本发明的多肽或多核苷酸任选地随着疾病进程的多肽或多核苷酸表达样式。该表达谱作为结肠直肠癌诊断或作为患上疾病的倾向性的对照,监测治疗进程并测定患有疾病的受试者的预后。
本发明还提供了用于预测癌症的高度或低度转移性扩散的倾向性的方法。可以检测和/或定量癌样品中的多肽或多核苷酸表达产物的存在和/或水平,并与肿瘤转移的倾向性关联。一种或多种IV期多肽或多核苷酸(即多肽或编码SEQ ID NO:65-107的多核苷酸)的表达将指示癌症的较高程度的转移性扩散。排除掉一种或多种IV期多核苷酸的表达,一种或多种I期多核苷酸(即多肽或编码SEQ ID NO:1-64的多核苷酸)的表达将指示癌症的较低程度的转移性扩散。
本发明的多肽和多核苷酸还可用于监视癌症例如结肠直肠癌的治疗进程。获得来自于正经历癌症例如结肠直肠癌治疗进程的受试者的测试样品。可以在治疗之前、之中或之后的不同时间点从该受试者获得测试样品。测定所述测试样品中的一种或多种本发明的多肽或多核苷酸的表达,并与包含具有已知癌症状态的细胞的对照样品进行比较。优选地,对照样品未曾进行治疗。本发明的IV期多肽或多核苷酸(即SEQ ID NO:65-107的多肽或编码SEQ ID NO:65-107的多核苷酸)在该方法中是特别有用的,但是I期(即SEQ ID NO:1-64的多肽或编码SEQ ID NO:1-64的多核苷酸)和II期(即SEQ ID NO:108-157的多肽或编码SEQ ID NO:108-157的多核苷酸)也可用于该方法。
当对照样品包含非癌细胞时,测试样品与对照样品之间的本发明的多肽或多核苷酸的表达的相似性指示治疗是有效的。但是,与对照样品相比,测试样品中的本发明的多肽或多核苷酸的表达的升高指示治疗是无效的。
有效意味着处理引起受试者中的癌症例如结肠直肠癌的大小、普遍性或转移潜力的降低。当以预防性的方式进行处理时,有效意味着延缓、减慢或阻止癌症例如结肠直肠癌的形成。可以联合用于诊断或治疗癌症例如结肠直肠癌的任意已知方法来测定有效性。
当对照样品是癌性的时,例如对照样品包含在诊断时但是开始治疗之前从受试者获取的癌细胞,则测试样品与对照样品之间的表达样式的相似性指示该处理是无效的。测试样品与对照样品之间多肽或多核苷酸的表达的差异(即,测试样品中表达的降低)指示该处理是有效的。当对照样品包含非癌细胞时,与对照样品相比,测试样品中一种或多种本发明的多肽或多核苷酸的表达的降低指示该处理是有效的。
治疗癌症的方法
本发明提供了治疗受试者中的癌症例如结肠直肠癌或在受试者中刺激免疫应答的方法,其包括,例如,(a)向受试者给予药学上有效量的本发明的多肽;(b)向受试者给予药学上有效量的编码本发明的多肽的多核苷酸;或(c)向受试者给予药学上有效量的特异性结合本发明的多肽的抗体或其抗原结合片段。
本发明还提供了在受试者中诱导抗肿瘤免疫力的方法,其包括,例如,将本发明的多肽与抗原呈递细胞接触,或者将编码多肽的多核苷酸或包含多核苷酸的载体导入抗原呈递细胞,然后将所述抗原呈递细胞给予受试者。
可以预防性地或治疗性地向受试者给予治疗剂,所述受试者具有患上与差别化表达的本发明的多核苷酸相关的病症的风险(或对该病症易感)或患有所述病症。可以降低一种或多种本发明的多核苷酸的表达产物的表达、功能或表达与功能,以预防性地或治疗性地处理受试者。可以通过向受试者给予多核苷酸例如抑制或降低本发明的多核苷酸的表达的反义分子或siRNA分子来抑制或降低表达。
对应于本发明的多核苷酸的反义分子和siRNA分子对于癌症例如结肠直肠癌的治疗是有用的。反义分子和siRNA分子可以与靶序列完全互补,或者可以具有一个或多个核苷酸的错配,只要所述反义分子和siRNA分子能够与靶序列特异性杂交。例如,反义分子或siRNA分子包括在跨越至少15个连续核苷酸上与本发明的多核苷酸或其互补物具有至少80%或更高的、更优选90%或更高、更优选95%或更高的同源性的多核苷酸。可以使用本领域已知的算法来测定同源性。
可以通过标准载体和/或基因递送***将反义分子、siRNA分子和本发明的多核苷酸递送至受试者。合适的基因递送***包括脂质体、受体介导的递送***、切割的DNA和病毒载体,例如疱疹病毒、逆转录病毒、腺病毒和腺相关病毒等。
反义分子或siRNA分子抑制本发明的多核苷酸的表达,因此可用于阻抑本发明的多肽的生物活性。因此,包含靶向本发明的多核苷酸的反义分子或siRNA分子的组合物可用于治疗癌症,例如结肠直肠癌。
在本发明的另一个实施方式中,可以通过给予结合表达产物或抑制其功能的化合物来抑制一种或多种本发明的多核苷酸的表达产物的功能。所述化合物可以是例如,特异性结合本发明的多核苷酸的表达产物的抗体。
可以利用的治疗性化合物包括例如(i)SEQ ID NO:1-157的多肽或其片段;(ii)特异性结合SEQ ID NO:1-157的抗体或其特异性结合片段;(iii)编码SEQ ID NO:1-157的多核苷酸或其片段;(iv)特异于编码SEQ ID NO:1-157的多核苷酸(或其互补物)或其片段的反义分子;(v)特异于编码SEQ ID NO:1-157的多核苷酸(或其互补物)或其片段的siRNA分子;和(vi)调节剂(即,改变本发明的多肽与其结合伴侣之间的相互作用的抑制剂、激动剂和拮抗剂)。
可以在疾病或病症的特征性症状发作之前给予预防性的药物组合物,以便阻止疾病或病症,或延迟其进展。
本发明还涉及治疗或预防受试者中的癌症例如结肠直肠癌的方法,包括向所述受试者给予免疫组合物(即,能够在受试者中诱导抗体和其它免疫应答的组合物),所述组合物包含由本发明的多核苷酸编码的多肽或所述多肽的免疫学活性片段,或编码所述多肽或其片段的多核苷酸。给予多肽可以在受试者中诱导抗肿瘤免疫力。在一个实施方式中,可以以结合T细胞受体(TCR)的形式或由抗原呈递细胞(APC)例如巨噬细胞、树突细胞(DC)或B-细胞呈递的形式来给予本发明的多肽或其片段。
在本发明中,针对癌症例如结肠直肠癌的免疫组合物在接种到受试者之后可发挥作用以诱导抗肿瘤免疫力。本发明的多肽可以诱导强烈的和特异性的针对癌症例如结肠直肠癌的免疫应答。一般而言,抗肿瘤免疫力包括免疫应答,例如诱导针对肿瘤的细胞毒性淋巴细胞,诱导识别肿瘤的抗体,和诱导抗肿瘤细胞因子的产生。
通过给予本发明的免疫组合物来诱导抗肿瘤免疫力,抗肿瘤免疫力的诱导能够治疗和预防癌症例如结肠直肠癌。
具有免疫学活性的本发明的多肽或编码多肽的载体可以与佐剂联合。当与具有免疫学活性的多肽一起(或连续)给药时,佐剂能够增强针对多肽的免疫应答。免疫组合物的给药方式为全身性或局部。可以通过单次给药进行免疫组合物的给药,或通过多次给药来加强。
在另一个方面,本发明包括药物组合物或治疗性组合物,其包含一种或多种本文描述的治疗性化合物。药物制剂可以包括适合于口服、直肠、鼻、局部(包括口腔和舌下)、***或非肠道(包括肌肉内、腹膜内、肿瘤内、皮下和静脉内)给药,或通过吸入或吹入法给药。如果合适,制剂可以方便地配制为离散的剂量单元,并且可以通过制药领域熟知的任何方法来制备。所有此类制药方法包括使活性化合物与液体载体或精细粉碎的固体载体或二者(视需要)接触的步骤,然后,如果需要,将产物塑形为需要的制剂。
适合于口服给药的药物制剂可以方便地配制为离散单元,例如胶囊、扁胶囊或药片,每个含有预定数量的活性成分;作为粉末或颗粒;或作为溶液、悬浮液或作为乳液。药片或胶囊任选可以配制为提供其中的活性成分的缓释或控释。活性成分也可以配制为大丸药糖剂或糊剂,并且是纯的形式,即不含载体。口服液体制剂可以是以下形式,例如,水性或油性悬浮液、溶液、乳液、糖浆或西也剂,或者可以配制为干燥产品,在使用前以水或其它合适介质复原。此类液体制剂可以包含常规添加剂,例如悬浮剂、乳化剂、非水性介质(其可以包括食用油)或防腐剂。
用于非肠道给药的制剂包括水性和非水性无菌注射溶液,其可以包含抗氧化剂、缓冲液、抑菌剂和使该制剂与想要给药的受体的血液等渗的溶质;以及水性和非水性无菌悬浮液,其可以包含悬浮剂和增稠剂。制剂可以配制为单元剂量或多剂容器,例如密封的安瓿和小瓶,并且可以储存在冷冻干燥(冻干)的条件下,只需要在临使用前添加无菌液体载体,例如,盐水、用于注射的水。或者,制剂可以配制为用于持续输注。可以从上文所述种类的无菌粉末、颗粒和药片制备即用型注射溶液和悬浮液。
用于直肠给药的制剂可以配制为栓剂,其具有常规的载体,例如可可油或聚乙二醇。用于口例如口腔或舌下局部给药的制剂包括锭剂(lozenge),其包含处于有益的基底例如蔗糖和***树胶或黄芪胶中的活性成分;以及锭剂(pastille),其包含处于基底例如明胶和甘油或蔗糖和***树胶中的活性成分。对于鼻内给药,本发明的化合物可以用作液体喷雾剂或可分散的粉末或是滴液的形式。滴液可以使用水性或非水性基底来配制,所述基底还包含一种或多种分散剂、增溶剂或悬浮剂。从加压瓶中方便地递送液体喷雾剂。
对于通过吸入给药,从吹药器、喷雾器、加压瓶或其它方便的递送气雾喷雾剂的方式方便地递送化合物。加压瓶可以包含合适的推进剂,例如二氯二氟甲烷、三氯氟甲烷、二氯四氟乙烷、二氧化碳或其它合适的气体。在加压气雾剂的情况下,可以通过提供阀来确定剂量单元,以递送计量的数量。
或者,对于通过吸入或吹入法给药,化合物可以是干燥粉末组合物的形式,例如化合物与合适的粉末基底例如乳糖或淀粉的粉末混合物。粉末组合物可以配制为单元剂量形式,例如胶囊、药筒、明胶或罩板包装,从中可以通过吸入器或吹入器的辅助施用粉末。
如果需要,可以应用适于提供活性成分的延释的上述制剂。药物组合物还可以包含其它活性成分,例如抗微生物剂、免疫抑制剂或防腐剂。
对于上述每种状况,可以经口服或通过注射来给予组合物,其剂量为大约0.1至大约250mg/kg/天。用于成年人的剂量范围一般是大约5mg至大约17.5g/天,优选大约5mg至大约10g/天,最优选大约100mg至大约3g/天。以离散单元提供的药品或其它单元剂量的呈现形式可以方便地包含在此等剂量有效的数量,或作为多个相同的例如含有大约5mg至大约500mg,通常是大约100mg至大约500mg的单元。所用的剂量将取决于多个因素,包括受试者的年龄和性别,待治疗的具体病症及其严重性。给药途径同样也可以取决于病况及其严重性。
筛选抗癌化合物的方法
本发明提供了筛选抗癌化合物例如抗结肠直肠癌化合物的方法。例如,可以通过将存在测试化合物的情况下第一生物样品(例如癌样品)中的多肽或多核苷酸表达产物的水平与不存在所述测试化合物的情况下第二生物样品(例如癌样品)中的多肽或多核苷酸表达产物的水平进行比较,来鉴定抗癌化合物;其中所述多肽或多核苷酸表达产物包括例如选自SEQ ID NO:1-157的多肽或编码所述多肽的mRNA。使第一生物样品中的多肽或多核苷酸表达产物的水平相对于第二生物样品降低的测试化合物被鉴定为抗癌剂。在本发明的一个实施方式中,测试化合物使第一生物样品中的多肽或多核苷酸表达产物的水平相对于第二生物样品中的表达产物的水平降低至少大约10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%(或大约10%至大约90%之间的任意数值或范围)。
在本发明的一个实施方式中,筛选抗癌化合物例如抗结肠直肠癌化合物,可以包括:将存在测试化合物的情况下第一生物样品中的本发明的多肽的生物活性的水平与不存在所述测试化合物的情况下第二生物样品中的生物活性的水平进行比较;其中使第一生物样品中的生物活性的水平相对于第二生物样品降低的测试化合物被鉴定为抗癌剂。
在本发明的一个实施方式中,筛选抗癌化合物例如抗结肠直肠癌化合物,可以包括:a)将测试化合物与本发明的多肽接触;b)检测所述多肽与所述测试化合物之间的结合活性;和c)选择与所述多肽结合的化合物。
在本发明的一个实施方式中,筛选抗癌化合物例如抗结肠直肠癌化合物,可以包括:a)将候选化合物与表达一种或多种本发明的多肽的测试细胞接触;和b)选择降低所述一种或多种本发明的多肽的表达水平的化合物。所述测试细胞可以包括结肠直肠癌细胞。
在本发明的一个实施方式中,筛选抗癌化合物例如抗结肠直肠癌化合物,可以包括:a)将候选化合物与其中导入了载体的细胞接触,所述载体包含一种或多种标志物基因的转录调节区和报告基因,所述报告基因在所述转录调节区的控制下表达,其中所述一种或多种标志物基因选自编码SEQ ID NO:1-157的多核苷酸;b)测定所述报告基因的活性;和c)选择使报告基因的表达水平相对于对照降低的化合物。
本发明提供了用于例如诊断方法的试剂盒。所述试剂盒的成分可以包括例如化合物、试剂、容器和/或设备。例如,试剂盒内的一个容器可以包含特异性结合本发明的多肽的单克隆抗体或其抗原结合片段。所述抗体或其抗原结合片段可以例如附着至载体材料。一个或多个另外的容器可以包含用于测定中的元件,例如试剂或缓冲液。试剂盒还可以或者可替代地包含检测试剂,其含有适合于直接或间接检测特异性抗体结合的报告基团。
或者,试剂盒可用于检测例如生物样品中的编码本发明的多肽的mRNA的水平。此类试剂盒可以包含至少一种、两种或更多种与编码本发明的多肽的多核苷酸(或其互补物)杂交的多核苷酸探针或引物。此类多核苷酸可用于例如扩增测定(例如RT-PCR)或杂交测定中。可以存在于此类试剂盒中的其它成分包括第二多核苷酸和/或诊断试剂或容器,以促进编码本发明的多肽的多核苷酸的检测。
可以在不存在那些未在本文中特异性公开的任何元件、限制的情况下适宜地实施由本文诠释性地描述的发明。因此,例如,在本文的各个情况下,术语“包含”、“基本上由……组成”和“由……组成”中的任一个术语可以替换为其它两个术语中的任一个,而不改变这些术语的通常含义。所用的术语和表述用作描述性术语而非限制性术语,并且此类术语和表述的使用不是旨在排除任何所显示和所描述的特征的任意等同物或其部分,相反应认识到,在要求保护的本发明的范围内可以有多种修饰。因此,应该理解,虽然通过优选的实施方式具体公开了本发明,但是本领域技术人员可以采纳本文公开的任选的特征、概念的修饰和变体,并且此类修饰和变体被认为是落在由说明书和随附的权利要求定义的本发明的范围之内。
此外,当以马库什组或其它替代性组的形式来描述本发明的特征或方面时,本领域技术人员将认识到,同样也以马库什组或其它组的任意单个成员或成员的子集来描述本发明。
本公开物中引用的所有参考文献通过引用整体并入本文。此外,本文列举的所有的GenBank、ENSEMBL、UNIPARC和UniProt的登录号(以及与其相关的数据)的内容(在本发明的申请日之时)皆通过引用整体并入本文。肌联蛋白(也称为TTN横纹肌肉瘤抗原MU-RMS 40)(例如,GenBank登录号Q8WZ42-2(SEQ ID NO:1));
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27721 dggskitgyi verrdlpdgr wtkasftnvt etqfiisglt qnsqyefrvf arnavgsisn
27781 psevvgpitc idsyggpvid lpleytevvk yragtsvklr agisgkpapt iewykddkel
27841 qtnalvcven ttdlasilik dadrlnsgcy elklrnamgs asatirvqil dkpgppggpi
27901 efktvtaeki tllwrppadd ggakithyiv ekretsrvvw smvsehleec iitttkiikg
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28021 gsdisgyfle krdkkslgwf kvlketirdt rqkvtglten sdyqyrvcav naagqgpfse
28081 psefykaadp idppgppaki riadstkssi tlgwskpvyd ggsavtgyvv eirqgeeeew
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29221 kadlgdwhkv naeacvktry tvtdlqagee ykfrvsaing agkgdscevt gtikavdrlt
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29701 tnyivekres gttawqlvns svkrtqikvt hltkymeysf rvssenrfgv skplesapii
29761 aehpfvppsa ptrpevyhvs anamsirwee pyhdggskii gywvekkern tilwvkenkv
29821 pclecnykvt glvegleyqf rtyalnaagv skaseasrpi maqnpvdapg rpevtdvtrs
29881 tvsliwsapa ydggskvvgy iierkpvsev gdgrwlkcny tivsdnfftv talsegdtye
29941 frvlaknaag viskgsestg pvtcrdeyap pkaeldarlh gdlvtirags dlvldaavgg
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30901 radrwvrvnk vpvtmtryrs tgltegleye hrvtainarg sgkpsrpskp ivamdpiapp
30961 gkpqnprvtd ttrtsvslaw svpedeggsk vtgyliemqk vdqhewtkcn ttptkireyt
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34081 tceisgepsp eiewfknnlp isissnvsis rsrnvyslei rnasvsdsgk ytikaknfrg
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34261 lpsdisideg kvltvacaft geptpevtws cggrkihsqe qgrfhientd dlttliimdv
34321 qkqdgglytl slgnefgsds atvnihirsi
HBA1(例如,GenBank登录号P69905(SEQ ID NO:2))
1   mvlspadktn vkaawgkvga hageygaeal ermflsfptt ktyfphfdls hgsaqvkghg
61  kkvadaltna vahvddmpna lsalsdlhah klrvdpvnfk llshcllvtl aahlpaeftp
121 avhasldkfl asvstvltsk yr
***1受体(IGF1R)(例如,GenBank登录号P08069(SEQ ID NO:3)):
1    mksgsgggsp tslwgllfls aalslwptsg eicgpgidir ndyqqlkrle nctviegylh
61   illiskaedy rsyrfpkltv iteylllfrv agleslgdlf pnltvirgwk lfynyalvif
121  emtnlkdigl ynlrnitrga irieknadlc ylstvdwsli ldavsnnyiv gnkppkecgd
181  lcpgtmeekp mcekttinne ynyrcwttnr cqkmcpstcg kractennec chpeclgscs
241  apdndtacva crhyyyagvc vpacppntyr fegwrcvdrd fcanilsaes sdsegfvihd
301  gecmqecpsg firngsqsmy cipcegpcpk vceeekktkt idsvtsaqml qgctifkgnl
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781  rvdnkertvi snlrpftlyr idihscnhea eklgcsasnf vfartmpaeg addipgpvtw
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1321 sghkaengpg pgvlvlrasf derqpyahmn ggrkneralp lpqsstc
带粘蛋白前体的同种型3(例如,GenBank登录号Q9Y493-1(SEQ ID NO:4)):
1    mvppvwtlll lvgaalfrke kppdqklvvr ssrdnyvltq cdfeddakpl cdwsqvsadd
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121  hhmfglswga qlrllllsge egrrpdvlwk hwntqrpswm lttvtvpagf tlptrlmfeg
181  trgstayldi aldalsirrg scnrvcmmqt csfdipndlc dwtwiptasg akwtqkkgss
241  gkpgvgpdgd fsspgsgcym lldpknarpg qkavllspvs lssgclsfsf hyilrgqspg
301  aalhiyasvl gsirkhtlfs gqpgpnwqav svnytavgri qfavvgvfgk tpepavavda
361  tsiapcgegf pqcdfednah pfcdwvqtsg dgghwalghk ngpvhgmgpa ggfpnagghy
421  iyleadefsh agqsvrlvsr pfcapgdicv efayhmyglg egtmlelllg spagsppipl
481  wkrvgsqrpy wqntsvtvps ghqqpmqlif kgiqgsntas vvamgfilin pgtcpvkvlp
541  elppvspvss tgpsettglt enptistkkp tvsiekpsvt tekptvpkek ptiptekpti
601  stekptipse kpnmpsekpt ipsekptilt ekptipsekp tipsekptis tekptvptee
661  pttpteettt smeepvipte kpsiptekps iptekptism eetiistekp tispekptip
721  tekptiptek stispekptt ptekptipte kptispekpt tptekptisp ekltiptekp
781  tiptekptip tekptistee pttpteetti stekpsipme kptlpteett tsveettist
841  ekltipmekp tistekptip tekptispek ltipteklti ptekptipie ettisteklt
901  iptekptisp ekptistekp tiptekptip teettistek ltiptekpti spekltipte
961  kptistekpt iptekltipt ekptiptekp tiptekltal rpphpsptat glaalvmsph
1021 apstpmtsvi lgttttsrss tercppnary escacpasck sprpscgplc regcvcnpgf
1081 lfsdnhciqa sscncfynnd yyepgaewfs pnctehcrcw pgsrvecqis qcgthtvcql
1141 kngqygchpy agtatclvyg dphyvtfdgr hfgfmgkcty ilaqpcgnst dpffrvtakn
1201 eeqgqegvsc lskvyvtlpe stvtllkgrr tlvggqqvtl paipskgvfl gasgrfvelq
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1681 gnynnnsldd nlrpdrklag dsmqlgaawk lpessepgcf lvggkpsscq ensmadawnk
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1801 awrnrtfcpm rcppgssysp csspcpdtcs sinnprdcpk alpcaescec qkghilsgts
1861 cvplgqcgct dpagsyhpvg erwytentct rlctcsvhnn itcfqstckp nqicwaldgl
1921 lhcrasgvgv cqlpgeshyv sfdgsnhsip dactlvlvkv chpamalplf kisakhekee
1981 ggteafrlhe vyidiydaqv tlqkghrvli nskqvtlpai sqipgvsvks ssiytivnik
2041 igvqvkfdgn hlleieiptt yygkvcgmcg nfndeeedel mmpsdevans dsefvnswkd
2101 kdidpscqsl pvdeqqipae qqenpsgncr aadlrrarek ceaalrapvw aqcasridlt
2161 pflvdcantl cefgglyqal cqalqafgat cqsqglkppl wrnssfcple cpayssytnc
2221 lpscspscwd ldgrcegakv psacaegcic qpgyvlsedk cvprsqcgck dahggsiplg
2281 kswvssgcte kcvctggaiq cgdfrcpsgs hcqltsdnsn sncvsdkseq csvygdpryl
2341 tfdgfsyrlq grmtyvlikt vdvlpegvep llvegrnkmd pprssiflqe vittvygykv
2401 qlqaglelvv nnqkmavpyr pnehlrvtlr gqrlylvtdf elvvsfggrk navislpsmy
2461 eglvsglcgn ydknrkndmm lpsgaltqnl ntfgnswevk tedallrfpr aipaeeegqg
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2641 lqwhpeppla dcgctsngiy yqlgssflte dcsqrctcas srillcepfs cragevctlg
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潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4)(例如,UniProt登录号A6NCG8(SEQ ID NO:5)):
mplanhrdde hgvasmvsvh vehpqeasvv vhqvervsgp weeadaeava   50
raeaaaraea aapytvlaqs apredgysda sgfgycfrel rggecasplp  100
glrtqevccr gaglawgvhd cqlcserlgn servsapdgp cptgfervng  150
scedvdecat ggrcqhgeca ntrggytcvc pdgflldssr sscisqhvis  200
eakgpcfrvl rdggcslpil rnitkqiccc srvgkawgrg cqlcppfgse  250
gfreicpagp gyhysasdlr yntrplgqep prvslsqprt lpatsrpsag  300
flpthrlepr peprpdprpg pelplpsipa wtgpeipesg pssgmcqrnp  350
qvcgpgrcis rpsgytcacd sgfrlspqgt rcidvdecrr vpppcapgrc  400
enspgsfrcv cgpgfragpr aaecldvdec hrvpppcdlg rcentpgsfl  450
cvcpagyqaa phgascqdvd ectqspglcg rgacknlpgs frcvcpagfr  500
gsaceedvde caqepppcgp grcdntagsf hcacpagfrs rgpgapcqdv  550
decarspppc tygrcenteg sfqcvcpmgf qpntagsece dvdecenhla  600
cpgqecvnsp gsfqcrtcps ghhlhrgrct dvdecssgap pcgphghctn  650
tegsfrcsca pgyrapsgrp gpcadvnecl egdfcfphge clntdgsfac  700
tcapgyrpgp rgascldvde cseedlcqsg ictntdgsfe cicppghrag  750
pdlascldvd ecrergpalc gsqrcenspg syrcvrdcdp gyhagpegtc  800
ddvdecqeyg peicgaqrce ntpgsyrctp acdpgyqptp gggcqdvdec  850
rnrsfcgaha vcqnlpgsfq clcdqyegar dgrhcvdvne cetlqgvcga  900
alcenvegsf lcvcpnspee fdpmtgrcvp prtsagtfpg sqpqapaspv  950
lparpppppl prrpstprqg pvgsgrrecy fdtaapdacd nilarnvtwq  1000
eccctvgegw gsgcriqqcp gtetaeyqsl cphgrgylap sgdlslrrdv  1050
decqlfrdqv cksgvcvnta pgyscycsng yyyhtqrlec idndecadee  1100
paceggrcvn tvgsyhctce pplvldgsqr rcvsnesqsl ddnlgvcwqe  1150
vgadlvcshp rldrqatyte ccclygeawg mdcalcpaqd sddfealcnv  1200
lrppaysppr pggfglpyey gpdlgppyqg lpygpelypp palpydpypp  1250
ppgpfarrea pygaprfdmp dfeddggpyg eseapappgp gtrwpyrsrd  1300
trrsfpepee ppeggsyags laepyeelea eecgildgct ngrcvrvpeg  1350
ftcrcfdgyr ldmtrmacvd inecdeaeaa splcvnarcl ntdgsfrcic  1400
rpgfapthqp hhcaparpra                                   1420
ASXL1(另外的性梳子样1)(例如,GenBank登录号Q8IXJ9-1(SEQ ID NO:6)):
1    mkdkqkkkke rtwaeaarlv lenysdapmt pkqilqviea eglkemrsgt splaclnaml
61   hsnsrggegl fyklpgrisl ftlkkdalqw srhpatvege epedtadves cgsneastvs
121  gendvsldet ssnascstes qsrplsnprd syrassqank qkkktgvmlp rvvltplkvn
181  gahvesasgf sgchadgesg spsssssgsl algsaairgq aevtqdpapl lrgfrkpatg
241  qmkrnrgeei dfetpgsilv ntnlralins rtfhalpshf qqqllfllpe vdrqvgtdgl
301  lrlsssalnn effthaaqsw rerladgeft hemqvrirqe mekekkveqw kekffedyyg
361  qklgltkees lqqnvgqeea eiksglcvpg esvriqrgpa trqrdghfkk rsrpdlrtra
421  rrnlykkqes eqagvakdak svasdvplyk dgeaktdpag lssphlpgts saapdlegpe
481  fpvesvasri qaepdnlara saspdripsl pqetvdqepk dqkrksfeqa asasfpekkp
541  rledrqsfrn tiesvhtekp qptkeepkvp piriqlsrik ppwvvkgqpt yqicpriipt
601  tesscrgwtg artladikar alqvrgargh hchreaatta igggggpggg gggatdeggg
661  rgsssgdgge acghpeprgg pstpgkctsd lqrtqllppy plngehtqag tamsrarred
721  lpslrkeesc llqratvglt dglgdasqlp vaptgdqpcq alpllssqts vaerlveqpq
781  lhpdvrtece sgttswesdd eeqgptvpad ngpipslvgd dtlekgtgqa ldshptmkdp
841  vnvtpsstpe ssptdclqnr afddelglgg scppmresdt rqenlktkal vsnsslhwip
901  ipsndevvkq pkpesrehip svepqvgeew ekaaptppal pgdltaeegl dpldsltslw
961  tvpsrggsds ngsycqqvdi eklkingdse alsphgestd tasdfeghlt edsseadtre
1021 aavtkgssvd kdekpnwnqs aplskvngdm rlvtrtdgmv apqswvsrvc avrqkipdsl
1081 llasteyqpr avclsmpgss veatnplvmq llqgslplek vlppahddsm sespqvpltk
1141 dqshgslrmg slhglgknsg mvdgsspssl ralkepllpd scetgtglar ieatqapgap
1201 qknckavpsf dslhpvtnpi tssrkleemd skeqfssfsc edqkevrams qdsnsnaapg
1261 kspgdlttsr tprfsspnvi sfgpeqtgra lgdqsnvtgq gkklfgsgnv aatlqrprpa
1321 dpmplpaeip pvfpsgklgp stnsmsggvq tpredwapkp hafvgsvkne ktfvggplka
1381 naenrkatgh splelvghle gmpfvmdlpf wklprepgkg lseplepssl psqlsikqaf
1441 ygklsklqls stsfnyssss ptfpkglags vvqlshkanf gashsaslsl qmftdsstve
1501 sislqcacsl kamimcqgcg afchddcigp sklcvlclvv r
β珠蛋白(HBB)(例如,GenBank登录号P68871(SEQ ID NO:7)):
1   mvhltpeeks avtalwgkvn vdevggealg rllvvypwtq rffesfgdls tpdavmgnpk
61  vkahgkkvlg afsdglahld nlkgtfatls elhcdklhvd penfrllgnv lvcvlahhfg
121 keftppvqaa yqkvvagvan alahkyh
BMP15-骨形态发生蛋白(例如,GenBank登录号NM_005448.1(另参见,UniProt登录号O95972)(SEQ ID NO:8)):
1   mvllsilril flcelvlfme hraqmaeggq ssiallaeap tlplieelle espgeqprkp
61  rllghslrym lelyrrsads hghprenrti gatmvrlvkp ltnvarphrg twhiqilgfp
121 lrpnrglyql vratvvyrhh lqltrfnlsc hvepwvqknp tnhfpssegd sskpslmsna
181 wkemditqlv qqrfwnnkgh rilrlrfmcq qqkdsgglel whgtssldia flllyfndth
241 ksirkakflp rgmeefmere sllrrtrqad gisaevtass skhsgpennq cslhpfqisf
301 rqlgwdhwii appfytpnyc kgtclrvlrd glnspnhaii qnlinqlvdq svprpscvpy
361 kyvpisvlmi eangsilyke yegmiaesct cr
TRIM49(也称作RNF18;含有三部分基序的49)(例如,GenBank登录号Q9NS80(SEQ ID NO:9)):
1   mnsgilqvfq gelicplcmn yfidpvtidc ghsfcrpcfy lnwqdipflv qcsectkste
61  qinlktnihl kkmaslarkv slwlflssee qmcgthretk kifcevdrsl lcllcsssqe
121 hryhrhrpie waaeehrekl lqkmqslwek acenhrnlnv ettrtrcwkd yvnlrleair
181 aeyqkmpafh heeekhnlem lkkkgkeifh rlhlskakma hrmeilrgmy eelnemchkp
241 dvellqafgd ilhrsesvll hmpqplnpel sagpitglrd rlnqfrvhit lhheeanndi
301 flyeilrsmc igcdhqdvpy ftatprsfla wgvqtftsgk yywevhvgds wnwafgvcnm
361 yrkeknqnek idgkaglfll gcvkndiqcs lfttsplmlq yipkptsrvg lfldceaktv
421 sfvdvnqssl iytipncsfs pplrpifcci hf
DNAJ同源物亚家族B成员11前体(例如,GenBank登录号Q9UBS4(SEQ ID NO:10)):
1   mapqnlstfc llllyligav iagrdfykil gvprsasikd ikkayrklal qlhpdrnpdd
61  pqaqekfqdl gaayevlsds ekrkqydtyg eeglkdghqs shgdifshff gdfgfmfggt
121 prqqdrnipr gsdiivdlev tleevyagnf vevvrnkpva rqapgkrkcn crqemrttql
181 gpgrfqmtqe vvcdecpnvk lvneertlev eiepgvrdgm eypfigegep hvdgepgdlr
241 frikvvkhpi ferrgddlyt nvtislvesl vgfemdithl dghkvhisrd kitrpgaklw
301 kkgeglpnfd nnnikgslii tfdvdfpkeq lteearegik qllkqgsvqk vynglqgy
未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027(也称作MDS027 hHBrk1 HSPC300)(例如,GenBank登录号Q9NZ47(SEQ ID NO:11)):
1  mrgidtpsdr kkslkmslqa kwgpgldlsk strnwwvsnn ilwqphcqgm svltrtaphf
61 ppkvgrrqrl fteavqrq
未表征的蛋白ALB(例如,UniProt登录号A6NBZ8(SEQ ID NO:12)):
mkwvtfisll flfssaysrg vfrrdahkse vahrfkdlge enfkalvlia 50
faqylqqcpf edhvklvnev tefaktcvad esaencdksl htlfgdklct 100
vatlretyge madccakqep ernecflqhk ddnpnlprlv rpevdvmcta 150
fhdneetflk kylyeiarrh pyfyapellf fakrykaaft eccqaadkaa 200
cllpkldelr degkassakq rlkcaslqkf gerafkawav arlsqrfpka 250
efaevsklvt dltkvhtecc hgdllecadd radlakyice nqdsissklk 300
eccekpllek shciaevend empadlpsla adfveskdvc knyaeakdvf 350
lgmflyeyar rhpdysvvll lrlaktyett lekccaaadp hecyakvfde 400
fkplveepqn likqncelfe qlgeykfqna llvrytkkvp qvstptlvev 450
srnlgkvgsk cckhpeakrm pcaedylsvv lnqlcvlhek tpvsdrvtkc 500
cteslvnrrp cfsalevdet yvpkefnaet ftfhadictl sekerqikkq 550
talvelvkhk pkatkeqlka vmddfaafve kcckaddket cfaeegqktc 600
cckssclrli tshlkasqpt mrirerk                          627
含有su shi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2(例如,GenBank登录号Q8TER0-4(SEQ ID NO:13)):
1   mrhgvawall vaaalglgar gvrgavalad fypfgaergd avtpkqddgg sglrplsvpf
61  pffgaehsgl yvnnngiisf lkevsqftpv afpiakdrcv vaafwadvdn rragdvyyre
121 atdpamlrra tedvrhyfpe lldfnatwvf vatwyrvtff ggsssspvnt fqtvlitdgk
181 lsftifnyes ivwttgthas sggnatglgg iaaqagfnag dgqryfsipg srtadmaeve
241 tttnvgvpgr wafriddaqv rvggcghtts vclalrpcln ggkciddcvt gnpsytcscl
301 sgftgrrchl dvnecasqpc qnggtcthgi nsfrcqcpag fggptcetaq spcdtkecqh
361  ggqcqvengs avcvcqagyt gaacemdvdd cspdpclngg scvdlvgnyt clcaepfkgl
421  rcetgdhpvp daclsapchn ggtcvdadqg yvcecpegfm gldcrervpd dcecrnggrc
481  lganttlcqc plgffgllce feitampcnm ntqcpdggyc mehggsylcv chtdhnashs
541  lpspcdsdpc fnggscdahd dsytcecprg fhgkhcekar phlcssgpcr nggtckeagg
601  eyhcscpyrf tgrhceigkp dscasgpchn ggtcfhyigk ykcdcppgfs grhceiapsp
661  cfrspcvngg tcedrdtdff chcqagymgr rcqaevdcgp peevkhatlr fngtrlgava
721  lyacdrgysl sapsrirvcq phgvwseppq cleidecrsq pclhggscqd rvagylclcs
781  tgyegahcel erdecrahpc rnggscrnlp gayvcrcpag fvgvhcetev dacdsspcqh
841  ggrcesggga ylcvcpesff gyhcetvsdp cfsspcggrg yclasngshs ctckvgytge
901  dcakelfppt alkmervees gvsiswnppn gpaarqmldg yavtyvssdg syrrtdfvdr
961  trsshqlqal aagraynisv fsvkrnsnnk ndisrpavll artrprpveg fevtnvtast
1021 isvqwalhri rhatvsgvrv sirhpealrd qatdvdrsvd rftfrallpg krytiqlttl
1081 sglrgeehpt eslatapthv wtrplppanl taarvtatsa hvvwdaptpg slleayvinv
1141 ttsqstksry vpngklasyt vrdllpgrry qlsviavqst elgpqhsepa hlyiitsprd
1201 gadrrwhqgg hhprvlknrp pparlpelrl lndhsapetp tqpprfselv dgrgrvsarf
1261 ggspskaatv rsqptasaql enmeeapkrv slalqlpehg skdignvpgn csenpcqngg
1321 tcvpgadahs cdcgpgfkgr rcelacikvs rpctrlfset kafpvweggv chhvykrvyr
1381 vhqdicfkes cestslkktp nrkqsksqtl eks
外周蛋白的同种型2(例如,GenBank登录号P41219-2(SEQ ID NO:14)):
1   mshhpsglra gfsstsyrrt fgpppslspg afsyssssrf sssrllgsas psssvrlgsf
61  rspragagal lrlpserldf smaealnqef latrsnekqe lqelndrfan fiekvrfleq
121 qnaalrgels qargqepara dqlcqqelre lrrelellgr erdrvqverd glaedlaalk
181 qrleeetrkr edaehnlvlf rkdvddatls rlelerkies lmdeieflkk lheeelrdlq
241 vsvesqqvqq veveatvkpe ltaalrdira qyesiaaknl qeaeewyksk yadlsdaanr
301 nhealrqakq emnesrrqiq sltcevdglr gtneallrql releeqfale aggyqagaar
361 leeelrqlke emarhlreyq ellnvkmald ieiatyrkll egeesrisvp vhsfaslnik
421 ttvpeveppq dshsrktvli ktietrngev vtesqkeqrs eldkssahsy
线粒体28S核糖体蛋白S22(例如,GenBank登录号P82650(SEQ ID NO:15)):
1   maplgttvll wsllrsspgv ervcfrariq pwhggllqpl pcsfemglpr rrfsseaaes
61  gspetkkptf mdeevqsilt kmtglnlqkt fkpaiqelkp ptyklmtqaq leeatrqave
121 aakvrlkmpp vleervpind vlaedkileg tettkyvftd isysiphrer fivvrepsgt
181 lrkasweerd rmiqvyfpke grkiltpiif keenlrtmys qdrhvdvlnl cfaqfepdst
241 eyikvhhkty edidkrgkyd llrstryfgg mvwyfvnnkk idgllidqiq rdliddatnl
301 vqlyhvlhpd gqsaqgakdq aaeginlikv fakteaqkga yieltlqtyq ealsrhsaas
翻译起始因子EIF-2B亚基ε(例如,GenBank登录号Q13144(SEQ ID NO:16)):
1   maapvvappg vvvsrankrs gagpggsggg gargaeeepp pplqavlvad sfdrrffpis
61  kdqprvllpl anvalidytl efltatgvqe tfvfccwkaa qikehllksk wcrptslnvv
121 riitselyrs lgdvlrdvda kalvrsdfll vygdvisnin itraleehrl rrkleknvsv
181 mtmifkessp shptrchedn vvvavdsttn rvlhfqktqg lrrfafplsl fqgssdgvev
241 rydlldchis icspqvaqlf tdnfdyqtrd dfvrgllvne eilgnqihmh vtakeygarv
301 snlhmysavc advirrwvyp ltpeanftds ttqscthsrh niyrgpevsl ghgsileenv
361 llgsgtvigs ncfitnsvig pgchigdnvv ldqtylwqgv rvaagaqihq sllcdnaevk
421 ervtlkprsv ltsqvvvgpn itlpegsvis lhppdaeede ddgefsddsg adqekdkvkm
481 kgynpaevga agkgylwkaa gmnmeeeeel qqnlwglkin meeesesese qsmdseepds
541 rggspqmddi kvfqnevlgt lqrgkeenis cdnlvleins lkyaynislk evmqvlshvv
601 lefplqqmds pldssrycal llpllkawsp vfrnyikraa dhlealaaie dfflehealg
661 ismakvlmaf yqleilaeet ilswfsqrdt tdkgqqlrkn qqlqrfiqwl keaeeessed
721 d
***17-β-脱氢酶1(例如,GenBank登录号P14061(SEQ ID NO:17)):
1   martvvlitg cssgiglhla vrlasdpsqs fkvyatlrdl ktqgrlweaa ralacppgsl
61  etlqldvrds ksvaaarerv tegrvdvlvc naglgllgpl ealgedavas vldvnvvgtv
121 rmlqaflpdm krrgsgrvlv tgsvgglmgl pfndvycask faleglcesl avlllpfgvh
181 lsliecgpvh tafmekvlgs peevldrtdi htfhrfyqyl ahskqvfrea aqnpeevaev
241 fltalrapkp tlryftterf lpllrmrldd psgsnyvtam hrevfgdvpa kaeagaeagg
301 gagpgaedea grsavgdpel gdppaapq
XRCC6BP1(例如,GenBank登录号Q8N4L5(SEQ ID NO:18)):
1  magapderrr gpaageqlqq qhvscqvfpe rlaqgnpqqg ffssfftcnq kcqlrllktl
61 etsrshdlea vvpqngsetg warkglgntw pgasgsaqsl drlgimgagl ga
脑特异性血管生成抑制剂1前体(例如,GenBank登录号O14514(SEQ ID NO:19)):
1    mrgqaaapgp vwilapllll llllgrrara aagadagpgp epcatlvqgk ffgyfsaaav
61   fpanasrcsw tlrnpdprry tlymkvakap vpcsgpgrvr tyqfdsfles trtylgvesf
121  devlrlcdps aplaflqask qflqmrrqqp pqhdglrpra gppgptddfs veylvvgnrn
181  psraacqmlc rwldaclags rsshpcgimq tpcaclggea ggpaagplap rgdvclrdav
241  aggpenclts ltqdrgghga tggwklwslw gectrdcggg lqtrtrtclp apgvegggce
301  gvleegrqcn reacgpagrt ssrsqslrst darrreelgd elqqfgfpap qtgdpaaeew
361  spwsvcsstc gegwqtrtrf cvsssystqc sgplreqrlc nnsavcpvhg awdewspwsl
421  csstcgrgfr drtrtcrppq fggnpcegpe kqtkfcnial cpgravdgnw newsswsacs
481  ascsqgrqqr trecngpsyg gaecqghwve trdcflqqcp vdgkwqawas wgscsvtcga
541  gsqrrervcs gpffggaacq gpqdeyrqcg tqrcpephei cdednfgavi wketpageva
601  avrcprnatg lilrrcelde egiayweppt yircvsidyr niqmmtrehl akaqrglpge
661  gvseviqtlv eisqdgtsys gdllstidvl rnmteifrra yysptpgdvq nfvqilsnll
721  aeenrdkwee aqlagpnake lfrlvedfvd vigfrmkdlr dayqvtdnlv lsihklpasg
781  atdisfpmkg wratgdwakv pedrvtvsks vfstgltead easvfvvgtv lyrnlgsfla
841  lqrnttvlns kvisvtvkpp prslrtplei efahmyngtt nqtcilwdet dvpsssappq
901  lgpwswrgcr tvpldalrtr clcdrlstfa ilaqlsadan mekatlpsvt livgcgvssl
961  tllmlviiyv svwryirser svilinfcls iissnalili gqtqtrnkvm ctlvaaflhf
1021 fflssfcwvl teawqsymav tghlrnrlir krflclgwgl palvvaisvg ftkakgystm
1081 nycwlslegg llyafvgpaa avvlvnmvig ilvfnklvsk dgitdkklke ragaslwssc
1141 vvlpllaltw msavlavtdr rsalfqilfa vfdslegfvi vmvhcilrre vqdavkcrvv
1201 drqeegngds ggsfqnghaq lmtdfekdvd lacrsvlnkd iaacrtatit gtlkrpslpe
1261 eeklklahak gpptnfnslp anvsklhlhg sprypggplp dfpnhsltlk rdkapkssfv
1321 gdgdifkkld selsraqeka ldtsyvilpt atatlrpkpk eepkysihid qmpqtrlihl
1381 stapeaslpa rsppsrqpps ggppeappaq pppppppppp ppqqplpppp nlepappslg
1441 dpgepaahpg pstgpstkne nvatlsvssl errksryael dfekimhtrk rhqdmfqdln
1501 rklqhaaekd kevlgpdskp ekqqtpnkrp weslrkahgt ptwvkkelep lqpsplelrs
1561 vewersgati plvgqdiidl qtev
含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2(例如,GenBank登录号Q9HBD1-2(SEQ ID NO:20)):
1   mpvqaaqwte flscpicyne fdenvhkpis lgcshtvckt clnklhrkac pfdqtaintd
61  idvlpvnfal lqlvgaqvpd hqsiklsnlg enkhyevakk cvedlalylk plsggkgvas
121 lnqsalsrpm qrklvtlvnc qlveeegrvr amraarslge rtvtelilqh qnpqqlsanl
181 waavrargcq flgpamqeea lklvllaled gsalsrkvlv lfvvqrlepr fpqasktsig
241 hvvqllyras cfkvtkrded sslmqlkeef rsyealrreh daqivhiame aglrispeqw
301 ssllygdlah kshmqsiidk lqspesfaks vqeltivlqr tgdpanlnrl rphlellani
361 dpnpdavspt weqlenamva vktvvhglvd fiqnysrkgh etpqpqpnsk yktsmcrdlr
421 qqggcprgtn ctfahsqeel ekyrlrnkki natvrtfpll nkvgvnntvt ttagnvisvi
481 gstettgkiv pstngisnae nsvsqlisrs tdstlralet vkkvgkvgan gqnaagpsad
541 svtenkigsp pktpvsnvaa tsagpsnvgt elnsvpqkss pfltrvpvyp phseniqyfq
601 dprtqipfev pqypqtgyyp ppptvpagva pcvprfvrsn nvpesslppa smpyadhyst
661  fsprdrmnss pyqppppqpy gpvppvpsgm yapvydsrri wrppmyqrdd iirsnslppm
721  dvmhssvyqt slrerynsld gyysvacqpp seprttvplp repcghlkts ceeqirrkpd
781  qwaqyhtqka plvsstlpva tqsptppspl fsvdfradfs esvsgtkfee dhlshyspws
841  cgtigscina idsepkdvia nsnavlmdld sgdvkrrvhl fetqrrtkee dpiipfsdgp
901  iiskwgaisr ssrtgyhttd pvqatasqgs atkpisvsdy vpyvnavdsr wssygneats
961  sahyverdrf ivtdlsghrk hsstgdllsl elqqaksnsl llqreanala mqqkwnslde
1021 grhltlnlls keielrngel qsdytedatd tkpdrdiele lsaldtdepd gqsepieeil
1081 diqlgissqn dqllngmave nghpvqqhqk eppkqkkqsl gedhvileeq ktilpvtscf
1141 sqplpvsisn asclpittsv sagnlilkth vmsedkndfl kpvangkmvn s
血红蛋白亚基β(例如,GenBank登录号P68871(SEQ ID NO:21)):
1   mvhltpeeks avtalwgkvn vdevggealg rllvvypwtq rffesfgdls tpdavmgnpk
61  vkahgkkvlg afsdglahld nlkgtfatls elhcdklhvd penfrllgnv lvcvlahhfg
121 keftppvqaa yqkvvagvan alahkyh
远上游元件结合蛋白1的同种型1(例如,GenBank登录号Q96AE4-1(SEQ ID NO:22)):
1   madystvppp ssgsaggggg ggggggvnda fkdalqrarq iaakiggdag tslnsndygy
61  ggqkrpledg dqpdakkvap qndsfgtqlp pmhqqqsrsv mteeykvpdg mvgfiigrgg
121 eqisriqqes gckiqiapds gglperscml tgtpesvqsa krlldqivek grpapgfhhg
181 dgpgnavqei mipaskaglv igkggetikq lqeragvkmv miqdgpqntg adkplritgd
241 pykvqqakem vlelirdqgg frevrneygs riggnegidv piprfavgiv igrngemikk
301 iqndagvriq fkpddgttpe riaqitgppd rcqhaaeiit dllrsvqagn pggpgpggrg
361 rgrgqgnwnm gppgglqefn fivptgktgl iigkggetik sisqqsgari elqrnpppna
421 dpnmklftir gtpqqidyar qlieekiggp vnplgppvph gphgvpgphg ppgppgpgtp
481 mgpynpapyn pgppgpaphg ppapyapqgw gnayphwqqq appdpakagt dpnsaawaay
541 yahyyqqqaq pppaapagap tttqtngqgd qqnpapagqv dytkaweeyy kkmgqavpap
601 tgappggqpd ysaawaeyyr qqaayyaqts pqgmpqhppa pqgq
半乳糖凝集素-3(例如,GenBank登录号P17931(SEQ ID NO:23)):
1   madnfslhda lsgsgnpnpq gwpgawgnqp agaggypgas ypgaypgqap pgaypgqapp
61  gayhgapgay pgapapgvyp gppsgpgayp ssgqpsapga ypatgpygap agplivpynl
121 plpggvvprm litilgtvkp nanrialdfq rgndvafhfn prfnennrrv ivcntkldnn
181 wgreerqsvf pfesgkpfki qvlvepdhfk vavndahllq ynhrvkklne isklgisgdi
241 dltsasytmi
溶菌酶C前体(例如,GenBank登录号P61626(SEQ ID NO:24)):
1   mkalivlglv llsvtvqgkv fercelartl krlgmdgyrg islanwmcla kwesgyntra
61  tnynagdrst dygifqinsr ywcndgktpg avnachlscs allqdniada vacakrvvrd
121 pqgirawvaw rnrcqnrdvr qyvqgcgv
肌动蛋白,α骨骼肌的(例如,GenBank登录号P68133(SEQ ID NO:25)):
1   mcdedettal vcdngsglvk agfagddapr avfpsivgrp rhqgvmvgmg qkdsyvgdea
61  qskrgiltlk ypiehgiitn wddmekiwhh tfynelrvap eehptlltea plnpkanrek
121 mtqimfetfn vpamyvaiqa vlslyasgrt tgivldsgdg vthnvpiyeg yalphaimrl
181 dlagrdltdy lmkiltergy sfvttaerei vrdikeklcy valdfenema taasssslek
241 syelpdgqvi tignerfrcp etlfqpsfig mesagihett ynsimkcdid irkdlyannv
301 msggttmypg iadrmqkeit alapstmkik iiapperkys vwiggsilas lstfqqmwit
361 kqeydeagps ivhrkcf
丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2(例如,GenBank登录号P14618-1(SEQ ID NO:26)):
1   mskphseagt afiqtqqlha amadtflehm crldidsppi tarntgiict igpasrsvet
61  lkemiksgmn varlnfshgt heyhaetikn vrtatesfas dpilyrpvav aldtkgpeir
121 tglikgsgta evelkkgatl kitldnayme kcdenilwld yknickvvev gskiyvddgl
181 islqvkqkga dflvteveng gslgskkgvn lpgaavdlpa vsekdiqdlk fgveqdvdmv
241 fasfirkasd vhevrkvlge kgknikiisk ienhegvrrf deileasdgi mvargdlgie
301 ipaekvflaq kmmigrcnra gkpvicatqm lesmikkprp traegsdvan avldgadcim
361 lsgetakgdy pleavrmqhl iareaeaaiy hlqlfeelrr lapitsdpte atavgaveas
421 fkccsgaiiv ltksgrsahq varyrprapi iavtrnpqta rqahlyrgif pvlckdpvqe
481 awaedvdlrv nfamnvgkar gffkkgdvvi vltgwrpgsg ftntmrvvpv p
AGR2(例如,GenBank登录号O95994(SEQ ID NO:27)):
1   mekipvsafl llvalsytla rdttvkpgak kdtkdsrpkl pqtlsrgwgd qliwtqtyee
61  alyksktsnk plmiihhlde cphsqalkkv faenkeiqkl aeqfvllnlv yettdkhlsp
121 dgqyvprimf vdpsltvrad itgrysnrly ayepadtall ldnmkkalkl lktel
中性粒细胞防御素1前体(例如,GenBank登录号P59665(SEQ ID NO:28)):
1  mrtlailaai llvalqaqae plqaradeva aapeqiaadi pevvvslawd eslapkhpgs
61 rknmacycri paciagerry gtciyqgrlw afcc
成髓细胞素前体(例如,GenBank登录号P24158(SEQ ID NO:29)):
1   mahrppspal asvllallls gaaraaeivg gheaqphsrp ymaslqmrgn pgshfcggtl
61  ihpsfvltaa hclrdipqrl vnvvlgahnv rtqeptqqhf svaqvflnny daenklndvl
121 liqlsspanl sasvatvqlp qqdqpvphgt qclamgwgrv gahdppaqvl qelnvtvvtf
181 fcrphnictf vprrkagicf gdsggplicd giiqgidsfv iwgcatrlfp dfftrvalyv
241 dwirstlrrv eakgrp
未表征的蛋白PSME2(例如,GenBank登录号Q9UL46(SEQ ID NO:30)):
makpcgvrls gearkqvevf rqnlfqeaee flyrflpqki iylnqllqed  50
slnvadltsl rapldipipd pppkddemet dkqekkevpk cgflpgnekv 100
lsllalvkpe vwtlkekcil vitwiqhlip kiedgndfgv aiqekvlerv 150
navktkveaf qttiskyfse rgdavakask ethvmdyral vherdeaayg 200
elramvldlr afyaelyhii ssnlekivnp kgeekpsmy             239
微管蛋白β-2C链(例如,UniProt登录号P68371(SEQ ID NO:31)):
1   mreivhlqag qcgnqigakf wevisdehgi dptgtyhgds dlqlerinvy yneatggkyv
61  pravlvdlep gtmdsvrsgp fgqifrpdnf vfgqsgagnn wakghytega elvdsvldvv
121 rkeaescdcl qgfqlthslg ggtgsgmgtl liskireeyp drimntfsvv pspkvsdtvv
181 epynatlsvh qlventdety cidnealydi cfrtlklttp tygdlnhlvs atmsgvttcl
241 rfpgqlnadl rklavnmvpf prlhffmpgf apltsrgsqq yraltvpelt qqmfdaknmm
301 aacdprhgry ltvaavfrgr msmkevdeqm lnvqnknssy fvewipnnvk tavcdipprg
361 lkmsatfign staiqelfkr iseqftamfr rkaflhwytg egmdemefte aesnmndlvs
421 eyqqyqdata eeegefeeea eeeva
硫代硫酸盐转硫酶(例如,GenBank登录号Q16762(SEQ ID NO:32)):
1   mvhqvlyral vstkwlaesi rtgklgpglr vldaswyspg trearkeyle rhvpgasffd
61  ieecrdtasp yemmlpseag faeyvgrlgi snhthvvvyd gehlgsfyap rvwwmfrvfg
121 hrtvsvlngg frnwlkeghp vtsepsrpep avfkatldrs llktyeqvle nleskrfqlv
181 dsrsqgrflg tepepdavgl dsghirgavn mpfmdflted gfekgpeelr alfqtkkvdl
241 sqpliatcrk gvtachvala aylcgkpdva vydgswsewf rrappesrvs qgkseka
热休克70kDa蛋白1(例如,GenBank登录号P08107(SEQ ID NO:33)):
1   makaaaigid lgttyscvgv fqhgkveiia ndqgnrttps yvaftdterl igdaaknqva
61  lnpqntvfda krligrkfgd pvvqsdmkhw pfqvindgdk pkvqvsykge tkafypeeis
121 smvltkmkei aeaylgypvt navitvpayf ndsqrqatkd agviaglnvl riineptaaa
181 iaygldrtgk gernvlifdl gggtfdvsil tiddgifevk atagdthlgg edfdnrlvnh
241 fveefkrkhk kdisqnkrav rrlrtacera krtlssstqa sleidslfeg idfytsitra
301 rfeelcsdlf rstlepveka lrdakldkaq ihdlvlvggs tripkvqkll qdffngrdln
361 ksinpdeava ygaavqaail mgdksenvqd lllldvapls lgletaggvm talikrnsti
421 ptkqtqiftt ysdnqpgvli qvyegeramt kdnnllgrfe lsgippaprg vpqievtfdi
481 dangilnvta tdkstgkank ititndkgrl skeeiermvq eaekykaede vqrervsakn
541 alesyafnmk savedeglkg kiseadkkkv ldkcqevisw ldantlaekd efehkrkele
601 qvcnpiisgl yqgaggpgpg gfgaqgpkgg sgsgptieev d
Igκ链V-Ⅲ区sie(例如,GenBank登录号P01620(SEQ ID NO:34)):
1  eivltqspgt lslspgerat lscrasqsvs nsylawyqqk pgqaprlliy gassratgip
61 drfsgsgsgt dftltisrle pddfavyycq qygsspqtfg qgskveikr
巨噬细胞迁移抑制因子(例如,GenBank登录号P14174(SEQ ID NO:35)):
1  mpmfivntnv prasvpdgfl seltqqlaqa tgkppqyiav hvvpdqlmaf ggssepcalc
61 slhsigkigg aqnrsyskll cgllaerlri spdrvyinyy dmnaanvgwn nstfa
ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的(例如,GenBank登录号O75947-1(SEQ ID NO:36)):
1   magrklalkt idwvafaeii pqnqkaiass lkswnetlts rlaalpenpp aidwayykan
61  vakaglvddf ekkfnalkvp vpedkytaqv daeekedvks caewvslska riveyekeme
121 kmknlipfdq mtiedlneaf petkldkkky pywphqpien l
未表征的蛋白ENSP00000374051(例如,GenBank登录号A6NGM3(SEQ ID NO:37)):
mvvdknkrlt kggkkgakkk vvdpfskkdw ydvnapamfn irnigktlvt 50
rtqgtkiasd grvfevslad lqndevafrk fklitedvqg kncltnfhgv 100
dltsdkmcsm vkkwqtmiea hvdvkttdgy llrlfcvgft kkrnnqirkt 150
syaqhqqvlt sqirkkmmei mtrevqtndl kevvnklipd sigkdvekac 200
qsiyplhdvf vrkvkmlkkp kfelgklmel hgegcssgka tgdetgvkve 250
radgyelpvq esv                                         263
细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP](例如,UniProt登录号O75874(SEQ ID NO:38)):
1   mskkisggsv vemqgdemtr iiwelikekl ifpyveldlh sydlgienrd atndqvtkda
61  aeaikkhnvg vkcatitpde krveefklkq mwkspngtir nilggtvfre aiickniprl
121 vsgwvkpiii grhaygdqyr atdfvvpgpg kveitytpsd gtqkvtylvh nfeegggvam
181 gmynqdksie dfahssfqma lskgwplyls tkntilkkyd grfkdifqei ydkqyksqfe
241 aqkiwyehrl iddmvaqamk seggfiwack nydgdvqsds vaqgygslgm mtsvlvcpdg
301 ktveaeaahg tvtrhyrmyq kgqetstnpi asifawtrgl ahrakldnnk elaffanale
361 evsietieag fmtkdlaaci kglpnvqrsd ylntfefmdk lgenlkikla qakl
血红蛋白亚基δ(例如,GenBank登录号P02042(SEQ ID NO:39)):
1   mvhltpeekt avnalwgkvn vdavggealg rllvvypwtq rffesfgdls spdavmgnpk
61  vkahgkkvlg afsdglahld nlkgtfsqls elhcdklhvd penfrllgnv lvcvlarnfg
121 keftpqmqaa yqkvvagvan alahkyh
剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7(例如,GenBank登录号Q16629-1(SEQ ID NO:40)):
1   msrygrygge tkvyvgnlgt gagkgelera fsyygplrtv wiarnppgfa fvefedprda
61  edavrgldgk vicgsrvrve lstgmprrsr fdrpparrpf dpndrcyecg ekghyaydch
121 rysrrrrsrs rsrshsrsrg rrysrsrsrs rgrrsrsasp rrsrsislrr srsaslrrsr
181 sgsikgsryf qspsrsrsrs rsisrprssr sksrspspkr srspsgsprr saspermd
mRNA加帽酶的同种型1(例如,GenBank登录号O60942-1(SEQ ID NO:41)):
1   mahnkipprw lncprrgqpv agrflplktm lgprydsqva eenrfhpsml snylkslkvk
61  mgllvdltnt srfydrndie kegikyiklq ckghgecptt entetfirlc erfnernppe
121 ligvhcthgf nrtgflicaf lvekmdwsie aavatfaqar ppgiykgdyl kelfrrygdi
181 eeappppllp dwcfeddede dededgkkes epgssasfgk rrkerlklga iflegvtvkg
241 vtqvttqpkl gevqqkchqf cgwegsgfpg aqpvsmdkqn iklldlkpyk vswkadgtry
301 mmlidgtnev fmidrdnsvf hvsnlefpfr kdlrmhlsnt lldgemiidr vngqavpryl
361 iydiikfnsq pvgdcdfnvr lqciereiis prhekmktgl idktqepfsv rnkpffdict
421 srkllegnfa kevshemdgl ifqptgkykp grcddilkwk ppslnsvdfr lkitrmggeg
481 llpqnvglly vggyerpfaq ikvtkelkqy dnkiieckfe nnswvfmrqr tdksfpnayn
541 tamavcnsis npvtkemlfe fidrctaasq gqkrkhhldp dtelmppppp krprplt
LON蛋白酶同源物,线粒体前体(例如,GenBank登录号P36776(SEQ ID NO:42)):
1   maastgyvrl wgaarcwvlr rpmlaaaggr vptaagawll rgqrtcdasp pwalwgrgpa
61  iggqwrgfwe assrgggafs ggedasegga eegaggaggs agagegpvit altpmtipdv
121 fphlpliait rnpvfprfik iievknkklv ellrrkvrla qpyvgvflkr ddsnesdvve
181 sldeiyhtgt faqihemqdl gdklrmivmg hrrvhisrql evepeepeae nkhkprrksk
241 rgkkeaedel sarhpaelam eptpelpaev lmvevenvvh edfqvteevk altaeivkti
301 rdiialnply resvlqmmqa gqrvvdnpiy lsdmgaaltg aeshelqdvl eetnipkrly
361 kalsllkkef elsklqqrlg reveekikqt hrkyllqeql kiikkelgle kddkdaieek
421 frerlkelvv pkhvmdvvde elsklglldn hssefnvtrn yldwltsipw gkysnenldl
481 araqavleed hygmedvkkr ilefiavsql rgstqgkilc fygppgvgkt siarsiaral
541 nreyfrfsvg gmtdvaeikg hrrtyvgamp gkiiqclkkt ktenplilid evdkigrgyq
601 gdpssallel ldpeqnanfl dhyldvpvdl skvlfictan vtdtipeplr drmeminvsg
661 yvaqeklaia erylvpqara lcgldeskak lssdvltlli kqycresgvr nlqkqvekvl
721 rksaykivsg eaesvevtpe nlqdfvgkpv ftvermydvt ppgvvmglaw tamggstlfv
781 etslrrpqdk dakgdkdgsl evtgqlgevm kesariaytf araflmqhap andylvtshi
841 hlhvpegatp kdgpsagcti vtallslamg rpvrqnlamt gevsltgkil pvggikekti
901 aakragvtci vlpaenkkdf ydlaafiteg levhfvehyr eifdiafpde qaealaver
信号识别颗粒54kDa蛋白(例如,GenBank登录号P61011(SEQ ID NO:43)):
1   mvladlgrki tsalrslsna tiineevlna mlkevctall eadvniklvk qlrenvksai
61  dleemasgln krkmiqhavf kelvklvdpg vkawtptkgk qnvimfvglq gsgktttcsk
121 layyyqrkgw ktclicadtf ragafdqlkq natkaripfy gsytemdpvi iasegvekfk
181 nenfeiiivd tsgrhkqeds lfeemlqvan aiqpdnivyv mdasigqace aqakafkdkv
241 dvasvivtkl dghakgggal savaatkspi ifigtgehid dfepfktqpf iskllgmgdi
301 eglidkvnel klddnealie klkhgqftlr dmyeqfqnim kmgpfsqilg mipgfgtdfm
361 skgneqesma rlkklmtimd smndqeldst dgakvfskqp griqrvargs gvstrdvqel
421 ltqytkfaqm vkkmggikgl fkggdmsknv sqsqmaklnq qmakmmdprv lhhmggmagl
481 qsmmrqfqqg aagnmkgmmg fnnm
半乳糖凝集素-9的长同种型(例如,GenBank登录号O00182-1(SEQ ID NO:44)):
1   mafsgsqapy lspavpfsgt iqgglqdglq itvngtvlss sgtrfavnfq tgfsgndiaf
61  hfnprfedgg yvvcntrqng swgpeerkth mpfqkgmpfd lcflvqssdf kvmvngilfv
121 qyfhrvpfhr vdtisvngsv qlsyisfqnp rtvpvqpafs tvpfsqpvcf pprprgrrqk
181 ppgvwpanpa pitqtvihtv qsapgqmfst paippmmyph paypmpfitt ilgglypsks
241 illsgtvlps aqrfhinlcs gnhiafhlnp rfdenavvrn tqidnswgse erslprkmpf
301 vrgqsfsvwi lceahclkva vdgqhlfeyy hrlrnlptin rlevggdiql thvqt
整联蛋白连接的蛋白激酶(例如,GenBank登录号Q13418(SEQ ID NO:45)):
1   mddiftqcre gnavavrlwl dntendlnqg ddhgfsplhw acregrsavv emlimrgari
61  nvmnrgddtp lhlaashghr divqkllqyk adinavnehg nvplhyacfw gqdqvaedlv
121 angalvsicn kygempvdka kaplrellre raekmgqnln ripykdtfwk gttrtrprng
181 tlnkhsgidf kqlnfltkln enhsgelwkg rwqgndivvk vlkvrdwstr ksrdfneecp
241 rlrifshpnv lpvlgacqsp paphptlith wmpygslynv lhegtnfvvd qsqavkfald
301 margmaflht lepliprhal nsrsvmided mtarismadv kfsfqcpgrm yapawvapea
361 lqkkpedtnr rsadmwsfav llwelvtrev pfadlsnmei gmkvaleglr ptippgisph
421 vcklmkicmn edpakrpkfd mivpilekmq dk
双功能氨酰-tRNA合成酶(例如,GenBank登录号P07814(SEQ ID NO:46)):
1    matlsltvns gdpplgalla vehvkddvsi sveegkenil hvsenviftd vnsilrylar
61   vattaglygs nlmehteidh wlefsatkls scdsftstin elnhclslrt ylvgnslsla
121  dlcvwatlkg naawqeqlkq kkapvhvkrw fgfleaqqaf qsvgtkwdvs ttkarvapek
181  kqdvgkfvel pgaemgkvtv rfppeasgyl highakaall nqhyqvnfkg klimrfddtn
241  pekekedfek viledvamlh ikpdqftyts dhfetimkya ekliqegkay vddtpaeqmk
301  aereqriesk hrknpieknl qmweemkkgs qfghscclra kidmssnngc mrdptlyrck
361  iqphprtgnk ynvyptydfa cpivdsiegv thalrtteyh drdeqfywii ealgirkpyi
421  weysrlnlnn tvlskrkltw fvneglvdgw ddprfptvrg vlrrgmtveg lkqfiaaqgs
481  srsvvnmewd kiwafnkkvi dpvapryval lkkevipvnv peaqeemkev akhpknpevg
541  lkpvwyspkv fiegadaetf segemvtfin wgnlnitkih knadgkiisl dakfnlenkd
601  ykkttkvtwl aetthalpip vicvtyehli tkpvlgkded fkqyvnknsk heelmlgdpc
661  lkdlkkgdii qlqrrgffic dqpyepvspy sckeapcvli yipdghtkem ptsgskektk
721  veatknetsa pfkerptpsl nnncttseds lvlynrvavq gdvvrelkak kapkedvdaa
781  vkqllslkae ykektgqeyk pgnppaeigq nissnssasi leskslydev aaqgevvrkl
841  kaekspkaki neavecllsl kaqykektgk eyipgqppls qssdssptrn sepagletpe
901  akvlfdkvas qgevvrklkt ekapkdqvdi avqellqlka qyksligvey kpvsatgaed
961  kdkkkkeken ksekqnkpqk qndgqrkdps knqggglsss gagegqgpkk qtrlgleakk
1021 eenladwysq vitksemiey hdisgcyilr pwayaiweai kdffdaeikk lgvencyfpm
1081 fvsqsaleke kthvadfape vawvtrsgkt elaepiairp tsetvmypay akwvqshrdl
1141 piklnqwcnv vrwefkhpqp flrtreflwq eghsafatme eaaeevlqil dlyaqvyeel
1201 laipvvkgrk tekekfaggd ytttieafis asgraiqggt shhlgqnfsk mfeivfedpk
1261 ipgekqfayq nswglttrti gvmtmvhgdn mglvlpprva cvqvviipcg itnalseedk
1321 ealiakcndy rrrllsvnir vradlrdnys pgwkfnhwel kgvpirlevg prdmkscqfv
1381 avrrdtgekl tvaeneaetk lqailediqv tlftrasedl kthmvvantm edfqkildsg
1441 kivqipfcge idcedwikkt tardqdlepg apsmgakslc ipfkplcelq pgakcvcgkn
1501 pakyytlfgr sy
锌指蛋白207的同种型1(例如,GenBank登录号O43670-1(SEQ ID NO:47)):
1   mgrkkkkqlk pwcwycnrdf ddekiliqhq kakhfkchic hkklytgpgl aihcmqvhke
61  tidavpnaip grtdieleiy gmegipekdm derrrlleqk tqesqkkkqq ddsdeydddd
121 saastsfqpq pvqpqqgyip pmaqpglppv pgapgmppgi pplmpgvppl mpgmppvmpg
181 mppgmmpmgg mmppgpgipp lmpgmppgmp ppvprpgipp mtqaqavsap gilnrppapt
241 atvpapqppv tkplfpsagq mgtpvtssst assnseslsa sskalfpsta qaqaavqgpv
301 gtdfkplnst pattteppkp tfpaytqsta sttsttnsta akpaasitsk patltttsat
361 sklihpdedi sleerraqlp kyqrnlprpg qapignppvg piggmmppqp gipqqqgmrp
421 pmpphgqygg hhqgmpgylp gamppygqgp pmvppyqggp prppmgmrpp vmsqggry
无机焦磷酸酶(例如,GenBank登录号Q15181(SEQ ID NO:48)):
1   msgfsteera apfsleyrvf lknekgqyis pfhdipiyad kdvfhmvvev prwsnakmei
61  atkdplnpik qdvkkgklry vanlfpykgy iwnygaipqt wedpghndkh tgccgdndpi
121 dvceigskvc argeiigvkv lgilamideg etdwkviain vddpdaanyn dindvkrlkp
181 gyleatvdwf rrykvpdgkp enefafnaef kdkdfaidii ksthdhwkal vtkktngkgi
241 scmnttlses pfkcdpdaar aivdalpppc esactvptdv dkwfhhqkn
调宁蛋白(calponin)-2(例如,GenBank登录号Q99439(SEQ ID NO:49)):
1   msstqfnkgp syglsaevkn rllskydpqk eaelrtwieg ltglsigpdf qkglkdgtil
61  ctlmnklqpg svpkinrsmq nwhqlenlsn fikamvsygm npvdlfeand lfesgnmtqv
121 qvsllalagk aktkglqsgv digvkysekq ernfddatmk agqcviglqm gtnkcasqsg
181 mtaygtrrhl ydpknhilpp mdhstislqm gtnkcasqvg mtapgtrrhi ydtklgtdkc
241 dnssmslqmg ytqganqsgq vfglgrqiyd pkycpqgtva dgapsgtgdc pdpgevpeyp
301 pyyqeeagy
盲肌样蛋白3的同种型1(例如,GenBank登录号Q9NUK0-1(SEQ ID NO:50)):
1   mtavnvalir dtkwltlevc refqrgtcsr adadckfahp prvchvengr vvacfdslkg
61  rctrenckyl hppphlktql eingrnnliq qktaaamfaq qmqlmlqnaq msslgsfpmt
121 psipanppma fnpyiphpgm glvpaelvpn tpvlipgnpp lampgavgpk lmrsdklevc
181 refqrgnctr gendcryahp tdasmieasd ntvticmdyi kgrcsrekck yfhppahlqa
241 rlkaahhqmn hsaasamalq pgtlqlipkr salekpngat pvfnptvfhc qqaltnlqlp
301 qpafipagpi lcmapasniv pmmhgatptt vsaattpats vpfaapttgn qlkf
组织蛋白酶G前体(例如,GenBank登录号P08311(SEQ ID NO:51)):
1   mqplllllaf llptgaeage iiggresrph srpymaylqi qspagqsrcg gflvredfvl
61  taahcwgsni nvtlgahniq rrentqqhit arrairhpqy nqrtiqndim llqlsrrvrr
121 nrnvnpvalp raqeglrpgt lctvagwgrv smrrgtdtlr evqlrvqrdr qclrifgsyd
181 prrqicvgdr rerkaafkgd sggpllcnnv ahgivsygks sgvppevftr vssflpwirt
241 tmrsfklldq metpl
含有锌指和BTB结构域的蛋白34(例如,GenBank登录号Q8NCN2(SEQ ID NO:52)):
1   msvemdsssf iqfdvpeyss tvlsqlnelr lqgklcdiiv hiqgqpfrah kavlaasspy
61  frdhsalstm sglsisvikn pnvfeqllsf cytgrmslql kdvvsfltaa sflqmqcvid
121 kctqilesih skisvgdvds vtvgaeenpe srngvkdssf fanpveispp ycsqgrqpta
181 ssdlrmettp skalrsrlqe eghsdrgssg svseyeiqie gdheqgdllv resqitevkv
241 kmeksdrpsc sdssslgddg yhtemvdgeq vvavnvgsyg svlqhaysys qaasqptnvs
301 eafgslsnss psrsmlscfr ggrarqkral svh1hsdlqg lvqgsdseam mnnpgyessp
361 rersarghwy pynerliciy cgksfnqkgs ldrhmrlhmg itpfvckfcg kkytrkdqle
421 yhirghtddk pfrceicgkc fpfqgtlnqh lrknhpgvae vrsriesper tdvyveqkle
481 ndasasemgl dsrmeihtvs dapd
腺嘌呤磷酸核糖转移酶(例如,GenBank登录号P07741(SEQ ID NO:53)):
1  madselqlve qrirsfpdfp tpgvvfrdis pvlkdpasfr aaigllarhl kathggridy
61 iagldsrgfl fgpslaqelg lgcvlirkrg klpgptlwas ysleygkael eiqkdalepg
121 qrvvvvddll atggtmnaac ellgrlqaev lecvslvelt slkgreklap vpffsllqye
40S核糖体蛋白S9(例如,GenBank登录号P46781(SEQ ID NO:54)):
1   mpvarswvcr ktyvtprrpf eksrldqelk ligeyglrnk revwrvkftl akirkaarel
61  ltldekdprr lfegnallrr lvrigvldeg kmkldyilgl kiedflerrl qtqvfklgla
121 ksihharvli rqrhirvrkq vvnipsfivr ldsqkhidfs lrspygggrp grvkrknakk
181 gqggagagdd eeed
TALIN-1(例如,GenBank登录号Q9Y490(SEQ ID NO:55)):
1    mvalslkisi gnvvktmqfe pstmvydacr iireripeap agppsdfglf lsdddpkkgi
61   wleagkaldy ymlrngdtme yrkkqrplki rmldgtvkti mvddsktvtd mlmticarig
121  itnhdeyslv relmeekkee itgtlrkdkt llrdekkmek lkqklhtdde lnwldhgrtl
181  reqgveehet lllrrkffys dqnvdsrdpv qlnllyvqar ddilngshpv sfdkacefag
241  fqcqiqfgph neqkhkagfl dlkdflpkey vkqkgerkif qahkncgqms eieakvryvk
301  larslktygv sfflvkekmk gknklvprll gitkecvmrv dektkeviqe wnltnikrwa
361  aspksftldf gdyqdgyysv qttegeqiaq liagyidiil kkkkskdhfg legdeestml
421  edsvspkkst vlqqqynrvg kvehgsvalp aimrsgasgp enfqvgsmpp aqqqitsgqm
481  hrghmpplts aqqaltgtin ssmqavqaaq atlddfdtlp plgqdaaska wrknkmdesk
541  heihsqvdai tagtasvvnl tagdpaetdy tavgcavtti ssnltemsrg vkllaalled
601  eggsgrpllq aakglagavs ellrsaqpas aeprqnllqa agnvgqasge llqqigesdt
661  dphfqdalmq lakavasaaa alvlkaksva qrtedsglqt qviaaatqca lstsqlvact
721  kvvaptissp vcqeqlveag rlvakavegc vsasqaated gqllrgvgaa atavtqalne
781  llqhvkahat gagpagrydq atdtiltvte nifssmgdag emvrqarila qatsdlvnai
841  kadaegesdl ensrkllsaa kiladatakm veaakgaaah pdseeqqqrl reaaeglrma
901  tnaaaqnaik kklvqrleha akqaaasatq tiaaaqhaas tpkasagpqp llvqsckava
961  eqipllvqgv rgsqaqpdsp saqlaliaas qsflqpggkm vaaakasvpt iqdqasamql
1021 sqcaknlgta laelrtaaqk aqeacgplem dsalsvvqnl ekdlqevkaa ardgklkplp
1081 getmekctqd lgnstkavss aiaqllgeva qgnenyagia ardvagglrs laqaargvaa
1141 ltsdpavqai vldtasdvld kasslieeak kaaghpgdpe sqqrlaqvak avtqalnrcv
1201 sclpgqrdvd nalravgdas krllsdslpp stgtfqeaqs rlneaaagln qaatelvqas
1261 rgtpqdlara sgrfgqdfst fleagvemag qapsqedraq vvsnlkgism sssklllaak
1321 alstdpaapn lksqlaaaar avtdsinqli tmctqqapgq kecdnalrel etvrellenp
1381 vqpindmsyf gcldsvmens kvlgeamtgi sqnakngnlp efgdaistas kalcgfteaa
1441 aqaaylvgvs dpnsqagqqg lveptqfara nqaiqmacqs lgepgctqaq vlsaativak
1501 htsalcnscr lasarttnpt akrqfvqsak evanstanlv ktikaldgaf teenraqcra
1561 ataplleavd nlsafasnpe fssipaqisp egraamepiv isaktmlesa ggliqtaral
1621 avnprdppsw svlaghsrtv sdsikklits mrdkapgqle cetaiaalns clrdldqasl
1681 aavsqqlapr egisqealht qmltavqeis hlieplanaa raeasqlghk vsqmaqyfep
1741 ltlaavgaas ktlshpqqma lldqtktlae salqllytak eaggnpkqaa htqealeeav
1801 qmmteavedl tttlneaasa agvvggmvds itqainqlde gpmgepegsf vdyqttmvrt
1861 akaiavtvqe mvtksntspe elgplanqlt sdygrlasea kpaavaaene eigshikhrv
1921 qelghgcaal vtkagalqcs psdaytkkel iecarrvsek vshvlaalqa gnrgtqacit
1981 aasavsgiia dldttimfat agtlnregte tfadhregil ktakvlvedt kvlvqnaags
2041 qeklaqaaqs svatitrlad vvklgaaslg aedpetqvvl inavkdvaka lgdlisatka
2101 aagkvgddpa vwqlknsakv mvtnvtsllk tvkavedeat kgtraleatt ehirqelavf
2161 cspeppakts tpedfirmtk gitmatakav aagnscrqed viatanlsrr aiadmlrack
2221 eaayhpevap dvrlralhyg recangylel ldhvlltlqk pspelkqqlt ghskrvagsv
2281 teliqaaeam kgtewvdped ptviaenell gaaaaieaaa kkleqlkpra kpkeadesln
2341 feeqileaak siaaatsalv kaasaaqrel vaqgkvgaip analddgqws qglisaarmv
2401 aaatnnlcea anaavqghas qeklissakq vaastaqllv ackvkadqds eamkrlqaag
2461 navkrasdnl vkaaqkaaaf eeqenetvvv kekmvggiaq iiaaqeemlr kereleeark
2521 klaqirqqqy kflpselrde h
含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59(例如,GenBank登录号Q96AG4(SEQ ID NO:56)):
1   mtkagskggn lrdkldgnel dlslsdlnev pvkelaalpk atildlscnk lttlpsdfcg
61  lthlvkldls knklqqlpad fgrlvnlqhl dllnnklvtl pvsfaqlknl kwldlkdnpl
121 dpvlakvagd cldekqckqc ankvlqhmka vqadqererq rrlevereae kkreakqrak
181 eaqerelrkr ekaeekerrr keydalkaak reqekkpkke anqapksksg srprkppprk
241 htrswavlkl llllllfgva gglvacrvte lqqqplctsv ntiydnavqg lrrheilqwv
301 lqtdsqq
ATP合酶亚基α,线粒体前体(例如,GenBank登录号P25705(SEQ ID NO:57)):
1   mlsvrvaaav vralprragl vsrnalgssf iaarnfhasn thlqktgtae mssileeril
61  gadtsvdlee tgrvlsigdg iarvhglrnv qaeemvefss glkgmslnle pdnvgvvvfg
121 ndklikegdi vkrtgaivdv pvgeellgrv vdalgnaidg kgpigsktrr rvglkapgii
181 prisvrepmq tgikavdslv pigrgqreli igdrqtgkts iaidtiinqk rfndgsdekk
241 klyciyvaig qkrstvaqlv krltdadamk ytivvsatas daaplqylap ysgcsmgeyf
301 rdngkhalii yddlskqava yrqmslllrr ppgreaypgd vfylhsrlle raakmndafg
361 ggsltalpvi etqagdvsay iptnvisitd gqifletelf ykgirpainv glsvsrvgsa
421 aqtramkqva gtmklelaqy revaafaqfg sdldaatqql lsrgvrltel lkqgqyspma
481 ieeqvaviya gvrgyldkle pskitkfena flshvvsqhq allgtiradg kiseqsdakl
541 keivtnflag fea
蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7(例如,GenBank登录号O94979-7(SEQ ID NO:58)):
1    mklkevdrta mqawspaqnh piylatgtsa qqldatfstn asleifeldl sdpsldmksc
61   atfssshryh kliwgpykmd skgdvsgvli aggengniil ydpskiiagd kevviaqndk
121  htgpvraldv nifqtnlvas ganeseiyiw dlnnfatpmt pgaktqpped isciawnrqv
181  qhilasasps gratvwdlrk nepiikvsdh snrmhcsgla whpdvatqmv laseddrlpv
241  iqmwdlrfas splrvlenha rgilaiawsm adpelllscg kdakilcsnp ntgevlyelp
301  tntqwcfdiq wcprnpavls aasfdgrisv ysimggstdg lrqkqvdkls ssfgnldpfg
361  tgqplpplqi pqqtaqhsiv lplkkppkwi rrpvgasfsf ggklvtfenv rmpshqgaeq
421  qqqqhhvfis qvvtekefls rsdqlqqavq sqgfinycqk kidasqtefe knvwsflkvn
481  feddsrgkyl ellgyrkedl gkkialalnk vdganvalkd sdqvaqsdge espaaeeqll
541  gehikeekee seflpssggt fnisvsgdid glitqalltg nfesavdlcl hdnrmadaii
601  laiaggqell artqkkyfak sqskitrlit avvmknwkei vescdlknwr ealaavltya
661  kpdefsalcd llgtrleneg dsllqtqacl cyicagnvek lvacwtkaqd gshplslqdl
721  iekvvilrka vqltqamdts tvgvllaakm sqyanllaaq gsiaaalafl pdntnqpnim
781  qlrdrlcraq gepvaghesp kipyekqqlp kgrpgpvagh hqmprvqtqq yyphgenppp
841  pgfimhgnvn pnaagqlpts pghmhtqvpp ypqpqpyqpa qpypfgtggs amyrpqqpva
901  pptsnaypnt pyissassyt gqsqlyaaqh qassptsspa tsfppppssg asfqhggpga
961  ppsssayalp pgttgtlpaa selpasqrtg pqngwndppa lnrvpkkkkm penfmppvpi
1021 tspimnplgd pqsqmlqqqp sapvplssqs sfpqphlpgg qpfhgvqqpl gqtgmppsfs
1081 kpniegapga pigntfqhvq slptkkitkk pipdehlilk ttfedliqrc lssatdpqtk
1141 rklddaskrl eflydklreq tlsptitsgl hniarsietr nysegltmht hivstsnfse
1201 tsafmpvlkv vltqanklgv
二羟基丙酮激酶(例如,GenBank登录号Q3LXA3(SEQ ID NO:59)):
1   mtskklvnsv agcaddalag lvacnpnlql lqghrvalrs dldslkgrva llsgggsghe
61  pahagfigkg mltgviagav ftspavgsil aairavaqag tvgtllivkn ytgdrlnfgl
121 areqaraegi pvemvvigdd saftvlkkag rrglcgtvli hkvagalaea gvgleeiakq
181 vnvvtkamgt lgvslsscsv pgskptfels adevelglgi hgeagvrrik matadeivkl
241 mldhmtnttn ashvpvqpgs svvmmvnnlg glsflelgii adatvrsleg rgvkiaralv
301 gtfmsalemp gisltlllvd epllklidae ttaaawpnva avsitgrkrs rvapaepqea
361 pdstaaggsa skrmalvler vcstllglee hlnaldraag dgdcgtthsr aaraiqewlk
421 egpppaspaq llsklsvlll ekmggssgal yglfltaaaq plkaktslpa wsaamdagle
481 amqkygkaap gdrtmldslw aagqelqawk spgadllqvl tkavksaeaa aeatknmeag
541 agrasyissa rleqpdpgav aaaailrail evlqs
类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)同种型4的蛋白(例如,ENSEMBL登录号ENST0000342709(另参见,GenBank登录号NM_004500.3和UNIPARC登录号IPI00868835)(SEQ ID NO:60)):
masnvtnktdprsmnsrvfignlntlvvkksdveaifskygkivgcsvhkgfaffqyvnernaraavagedgrmiagqv
ldinlaaepkvnrgkagvkrsaaemygssfdldcdfqrdyydrmysyparvpppppiaraaikreltqikqkvdsflen
lekiekeqskqavemnnvkseeeqssssvkkdetnvkmeseggaddsaeegdllddddnedggmtsws
18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554(SEQ ID NO:61)):
marsrtsssp aisqetevgg grkaiiifvp vpqlksfqki qvrlvrelek kfsgkhvvfi
aqrrilpkpt qksrtknkqk cprsrtltav hdafledlvf pseivgkrip vkldssrlik
vhldkaqqnn vehkvetfsg vykkltgkdv nfefpefql
寒冷凝集素FS-1L-链(例如,GenBank登录号A2NB45(SEQ ID NO:62)):
divmtqspls lpvtpgepas iscrssqsll hsngfnylhw ylqkpgqspr 50
lliylgsnra sgvpdrfsgs gsgtdftlki srveaddvgi yycmqalqsp 100
ytfgqgtkle ikr                                         113
异质核核糖核蛋白d0的同种型1(例如,UniProt登录号Q14103-1(SEQ ID NO:63)):
1   mseeqfggdg aaaaataavg gsageqegam vaatqgaaaa agsgagtggg tasggteggs
61  aesegakida skneedeghs nssprhseaa taqreewkmf igglswdttk kdlkdyfskf
121 gevvdctlkl dpitgrsrgf gfvlfkeses vdkvmdqkeh klngkvidpk rakamktkep
181 vkkifvggls pdtpeekire yfggfgeves ielpmdnktn krrgfcfitf keeepvkkim
241 ekkyhnvgls kceikvamsk eqyqqqqqwg srggfagrar grgggpsqnw nqgysnywnq
301 gygnygynsq gyggyggydy tgynnyygyg dysnqqsgyg kvsrrgghqn sykpy
DAZAP1/MEF2D融合蛋白(例如,GenBank登录号Q5IRN2(SEQ ID NO:64)):
1   mnnsgadeig klfvggldws ttqetlrsyf sqygevvdcv imkdkttnqs rgfgfvkfkd
61  pncvgtvlas rphtldgrni dpkpctprgm qpertrpkeg wqkgprsdns ksnkifvggi
121 phncgetelr eyfkkfgvvt evvmiydaek qrprgngyvs araspgllpv angnslnkvi
181 paksppppth stqlgapsrk pdlrvitsqa gkglmhhlte dhldlnnaqr lgvsqsthsl
241 ttpvvsvatp sllsqglpfs smptayntdy qltsaelssl pafsspggls lgnvtawqqp
301 qqpqqpqqpq ppqqqppqpq qpqpqqpqqp qqppqqqshl vpvslsnlip gsplphvgaa
361 ltvtthphis iksepvspsr erspappppa vfpaarpepg dglsspaggs yetgdrddgr
421 gdfgptlgll rpapepeaeg savkrmrldt wtlk
POTE2(也称作ANKRD26样家族C,成员1A)(例如,GenBank登录号NP_001077007(SEQ ID NO:65)):
1   mvvevdsmpa assvkkpfgl rskmgkwccr cfpcyresgk snvgtsgdhd dsamktlrsk
61  mgkwchhcfp ccrgsgksnv gasgdhddsa mktlrnkmgk wcchcfpccr gsgkskvgaw
121 gdyddsafme pryhvrgedl dklhraawwg kvprkdlivm lrdtdvnkkd kqkrtalhla
181 sangnsevvk llldrrcqln vldnkkrtal ikavqcqede calmllehgt dpnipdeygn
241 ttlhyaiyne dklmakalll ygadiesknk hgltplllgv heqkqqvvkf likkkanlna
301 ldrygrtali lavccgsasi vsllleqnid vssqdlsgqt areyavsshh hvicqllsdy
361 kekqmlkiss ensnpeqelk ltseeesqrf kgsensqpek msqeleinkd gdreveeemk
421 khesnnvgll enltngvtag ngdnglipqr ksrtpenqqf pdneseeyhr icellsdyke
481 kqmpkyssen snpeqdlklt seeesqrlkg sengqpekrs qepeinkdgd relenfmaie
541 emkkhgsthv gfpenltnga tagngddgli pprksrtpes qqfpdtenee yhsdeqndtq
601 kqfceeqntg ilhdeilihe ekqievvekm nselslsckk ekdvlhenst lreeiamlrl
661 eldtmkhqsq lrekkyledi esvkkkndnl lkalqlnelt mdddtavlvi dngsgmckag
721 fagddaprav fpsivgrprq qgmmggmhqk esyvgkeaqs krgiltlkyp mehgiitnwd
781 dmekiwhhtf ynelrvapee hpillteapl npkanrekmt qimfetfntp amyvaiqavp
841 slytsgrttg ivmdsgdgvt htvpiyegna lphatlrldl agrelpdylm kiltergyrf
901  ttmaereivr dikeklcyva ldfeqemata assssleksy elpdgqviti gnerfrcpea
961  lfqpcflgme scgihettfn simksdvdir kdlytntvls ggttmypgma hrmqkeiaal
1021 apsmmkirii appkrkysvw vggsilasls tfqqmwiskq eydesgpsiv hrkcf
角蛋白18(KRT18)(例如,GenBank登录号NP_000215(SEQ ID NO:66)):
1   msfttrstfs tnyrslgsvq apsygarpvs saasvyagag gsgsrisvsr stsfrggmgs
61  gglatgiagg lagmggiqne ketmqslndr lasyldrvrs letenrrles kirehlekkg
121 pqvrdwshyf kiiedlraqi fantvdnari vlqidnarla addfrvkyet elamrqsven
181 dihglrkvid dtnitrlqle teiealkeel lfmkknheee vkglqaqias sgltvevdap
241 ksqdlakima diraqydela rknreeldky wsqqieestt vvttqsaevg aaettltelr
301 rtvqsleidl dsmrnlkasl enslrevear yalqmeqlng illhlesela qtraegqrqa
361 qeyeallnik vkleaeiaty rrlledgedf nlgdaldssn smqtiqkttt rrivdgkvvs
421 etndtkvlrh
蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1(也称作蛋白酶体macropain,激活子亚基4)(例如,GenBank登录号NP_055429(SEQ ID NO:67)):
1    mepaeragvg eppepggrpe pgprgfvpqk eivynkllpy aerldaesdl qlaqikcnlg
61   ravqlqelwp gglfwtrkls tyirlygrkf skedhvlfik llyelvsipk leismmqgfa
121  rllinllkkk ellsradlel pwrplydmve rilysktehl glnwfpnsve nilktlvksc
181  rpyfpadata emleewrplm cpfdvtmqka ityfeiflpt slppelhhkg fklwfdelig
241  lwvsvqnlpq wegqlvnlfa rlatdnigyi dwdpyvpkif trilrslnlp vgssqvlvpr
301  fltnaydigh aviwitammg gpsklvqkhl aglfnsitsf yhpsnngrwl nklmkllqrl
361  pnsvvrrlhr erykkpswlt pvpdshkltd qdvtdfvqci iqpvllamfs ktgsleaaqa
421  lqnlalmrpe lvippvlert ypaletltep hqltatlscv igvarslvsg grwfpegpth
481  mlpllmralp gvdpndfskc mitfqfiatf stlvplvdcs svlqerndlt everelcsat
541  aefedfvlqf mdrcfglies stleqtreet etekmthles lvelglsstf stiltqcske
601  ifmvalqkvf nfstshifet rvagrmvadm craavkccpe eslklfvphc csvitqltmn
661  ddvlndeeld kellwnlqll seitrvdgrk lllyreqlvk ilqrtlhltc kqgytlscnl
721  lhhllrsttl iypteycsvp ggfdkppsey fpikdwgkpg dlwnlgiqwh vpsseevsfa
781  fylldsflqp elvklqhcgd gklemsrddi lqsltivhnc ligsgnllpp lkgepvtnlv
841  psmvsleetk lytgleydls renhreviat virkllnhil dnseddtksl fliikiigdl
901  lqfqgshkhe fdsrwksfnl vkksmenrlh gkkqhirall idrvmlqhel rtltvegcey
961  kkihqdmird llrlstssys qvrnkaqqtf faalgaynfc crdiiplvle flrpdrqgvt
1021 qqqfkgalyc llgnhsgvcl anlhdwdciv qtwpaivssg lsqamslekp sivrlfddla
1081 ekihrqyeti gldftipksc veiaellqqs knpsinqill spekikegik rqqeknadal
1141 rnyenlvdtl ldgveqrnlp wkfehigigl lslllrddrv lplrairffv enlnhdaivv
1201 rkmaisavag ilkqlkrthk kltinpceis gcpkptqiia gdrpdnhwlh ydsktiprtk
1261 kewesscfve kthwgyytwp knmvvyagve eqpklgrsre dmteaeqiif dhfsdpkfve
1321 qlitflsled rkgkdkfnpr rfclfkgifr nfddaflpvl kphlehlvad shestqrcva
1381 eiiaglirgs khwtfekvek lwellcpllr talsnitvet yndwgaciat scesrdprkl
1441 hwlfellles plsgeggsfv dacrlyvlqg glaqqewrvp ellhrllkyl epkltqvykn
1501 vrerigsvlt yifmidvslp nttptisphv peftarilek lkplmdvdee iqnhvmeeng
1561 igeedertqg ikllktilkw lmasagrsfs tavteqlqll plffkiapve ndnsydelkr
1621 daklclslms qgllyphqvp lvlqvlkqta rssswharyt vltylqtmvf ynlfiflnne
1681 davkdirwlv islledeqle vremaattls gllqcnfltm dspmqihfeq lcktklpkkr
1741 krdpgsvgdt ipsaelvkrh agvlglgacv lsspydvptw mpqllmnlsa hlndpqpiem
1801 tvkktlsnfr rthhdnwqeh kqqftddqll vltdllvspc yya
丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33)(例如,GenBank登录号NP_004626(SEQ ID NO:68)):
1   mdgetaeeqg gpvpppvapg gpglggapgg rrepkkyavt ddyqlskqvl glgvngkvle
61  cfhrrtgqkc alkllydspk arqevdhhwq asggphivci ldvyenmhhg krclliimec
121 meggelfsri qergdqafte reaaeimrdi gtaiqflhsh niahrdvkpe nllytskekd
181 avlkltdfgf akettqnalq tpcytpyyva pevlgpekyd kscdmwslgv imyillcgfp
241 pfysntgqai spgmkrrirl gqygfpnpew sevsedakql irlllktdpt erltitqfmn
301 hpwinqsmvv pqtplhtarv lqedkdhwde vkeemtsala tmrvdydqvk ikdlktsnnr
361 llnkrrkkqa gsssasqgcn nq
补体组分1,s亚组分(C1S)(例如,GenBank登录号NP_001725(SEQ ID NO:69)):
1   mwcivlfsll awvyaeptmy geilspnypq aypseveksw dievpegygi hlyfthldie
61  lsencaydsv qiisgdteeg rlcgqrssnn phspiveefq vpynklqvif ksdfsneerf
121 tgfaayyvat dinectdfvd vpcshfcnnf iggyfcscpp eyflhddmkn cgvncsgdvf
181 taligeiasp nypkpypens rceyqirlek gfqvvvtlrr edfdveaads agncldslvf
241 vagdrqfgpy cghgfpgpln ietksnaldi ifqtdltgqk kgwklryhgd pmpcpkedtp
301 nsvwepakak yvfrdvvqit cldgfevveg rvgatsfyst cqsngkwsns klkcqpvdcg
361 ipesiengkv edpestlfgs virytceepy yymengggge yhcagngswv nevlgpelpk
421 cvpvcgvpre pfeekqriig gsdadiknfp wqvffdnpwa ggalineywv ltaahvvegn
481 reptmyvgst svqtsrlaks kmltpehvfi hpgwkllevp egrtnfdndi alvrlkdpvk
541 mgptvspicl pgtssdynlm dgdlglisgw grtekrdrav rlkaarlpva plrkckevkv
601 ekptadaeay vftpnmicag gekgmdsckg dsggafavqd pndktkfyaa glvswgpqcg
661 tyglytrvkn yvdwimktmq enstpred
溶菌酶C前体(LYZ)(例如,GenBank登录号NP_000230(SEQ ID NO:70)):
1   mkalivlglv llsvtvqgkv fercelartl krlgmdgyrg islanwmcla kwesgyntra
61  tnynagdrst dygifqinsr ywcndgktpg avnachlscs allqdniada vacakrvvrd
121 pqgirawvaw rnrcqnrdvr qyvqgcgv
角蛋白型细胞骨架20(KRT20)(例如,GenBank登录号NP_061883(SEQ ID NO:71)):
1   mdfsrrsfhr slssslqapv vstvgmqrlg ttpsvyggag grgirisnsr htvnygsdlt
61  gggdlfvgne kmamqnlndr lasylekvrt leqsnsklev qikqwyetna pragrdysay
121 yrqieelrsq ikdaqlqnar cvlqidnakl aaedfrlkye tergirltve adlqglnkvf
181 ddltlhktdl eiqieelnkd lallkkehqe evdglhkhlg ntvnvevdaa pglnlgvimn
241 emrqkyevma qknlqeakeq ferqtavlqq qvtvnteelk gtevqltelr rtsqsleiel
301 qshlsmkesl ehtleetkar yssqlanlqs llssleaqlm qirsnmerqn neyhilldik
361 trleqeiaty rrllegedvk tteyqlstle erdikktrki ktvvqevvdg kvvssevkev
421 eeni
RNASE3(也称作ECP RNS3,核糖体酶,RNase A家族3)(例如,GenBank登录号NP_002926(SEQ ID NO:72)):
1   mvpklftsqi clllllglmg vegslharpp qftraqwfai qhislnpprc tiamrainny
61  rwrcknqntf lrttfanvvn vcgnqsircp hnrtlnnchr srfrvpllhc dlinpgaqni
121 snctyadrpg rrfyvvacdn rdprdspryp vvpvhldtti
醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1)(例如,GenBank登录号NP_000683(SEQ ID NO:73)):
1   mlrflaprll slqgrtarys saaalpspil npdipynqlf innewqdavs kktfptvnpt
61  tgevighvae gdradvdrav kaareafrlg spwrrmdase rgrllnrlad lverdrvyla
121 sletldngkp fqesyaldld evikvyryfa gwadkwhgkt ipmdgqhfcf trhepvgvcg
181 qiipwnfplv mqgwklapal atgntvvmkv aeqtplsaly laslikeagf ppgvvniitg
241 ygptagaaia qhvdvdkvaf tgstevghli qkaagdsnlk rvtlelggks psivladadm
301 ehaveqchea lffnmgqccc agsrtfvees iyneflertv ekakqrkvgn pfeldtqqgp
361 qvdkeqferv lgyiqlgqke gakllcgger fgergffikp tvfggvqddm riakeeifgp
421 vqplfkfkki eevverannt ryglaaavft rdldkamyft qalqagtvwv ntynivtcht
481 pfggfkesgn grelgedglk aytevktvti kvpqkns
CDNA FLJ25506 fis,克隆CBR05185(例如,GenBank登录号Q8N7I6(SEQ ID NO:74)):
1   mwicpggggg gggggggggg dredarpapl ccgrcwrsgc aarpprmvsi glrgavrgar
61  gchlgrpfsp svllcvgrpg saagaerghs lgsrefghrr gplpwcpanr rgspptagvp
121 rqppgfpaap aprgpgpltr llgrreagsk sqkllfrsar vqgggqfcps gsaflgvere
181 ptaglggaer rnarfwrger gqgrqakrpa psqpasplpg ggtwagcvgl vwmgtgfcga
241 pef
fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B(例如,GenBank登录号P23142-2(SEQ ID NO:75)):
1   meraapsrrv plpllllggl allaagvdad vlleaccadg hrmathqkdc slpyateske
61  crmvqeqcch sqleelhcat gislaneqdr catphgdnas leatfvkrcc hccllgraaq
121 aqgqsceysl mvgyqcgqvf raccvksqet gdldvgglqe tdkiieveee qedpylndrc
181 rgggpckqqc rdtgdevvcs cfvgyqllsd gvscedvnec itgshscrlg escintvgsf
241 rcqrdsscgt gyeltednsc kdidecesgi hnclpdficq ntlgsfrcrp klqcksgfiq
301 dalgncidin eclsisapcp ightcinteg sytcqknvpn cgrgyhlnee gtrcvdvdec
361 appaepcgkg hrcvnspgsf rcecktgyyf dgisrmcvdv necqrypgrl cghkcentlg
421 sylcscsvgf rlsvdgrsce dinecssspc sqecanvygs yqcycrrgyq lsdvdgvtce
481 didecalptg ghicsyrcin ipgsfqcscp ssgyrlapng rncqdidecv tgihncsine
541 tcfniqggfr clafecpeny rrsaatlqqe ktdtvrciks crpndvtcvf dpvhtishtv
601 islptfreft rpeeiiflra itpphpasqa niifditegn lrdsfdiikr ymdgmtvgvv
661 rqvrpivgpf havlklemny vvggvvshrn vvnvrifvse ywf
核结合蛋白1(NUCB1)(例如,GenBank登录号NP_006175(SEQ ID NO:76)):
1   mppsgprgtl lllpllllll lravlavple rgapnkeetp atespdtgly yhrylqevid
61  vletdghfre klqaanaedi ksgklsreld fvshhvrtkl delkrqevsr lrmllkakmd
121 aeqdpnvqvd hlnllkqfeh ldpqnqhtfe ardlelliqt atrdlaqyda ahheefkrye
181 mlkeherrry leslgeeqrk eaerkleeqq rrhrehpkvn vpgsqaqlke vweeldgldp
241 nrfnpktffi lhdinsdgvl deqelealft kelekvydpk needdmreme eerlrmrehv
301 mknvdtnqdr lvtleeflas tqrkefgdtg egwetvemhp ayteeelrrf eeelaareae
361 lnakaqrlsq etealgrsqg rleaqkrelq qavlhmeqrk qqqqqqqghk apaahpegql
421 kfhpdtddvp vpapagdqke vdtsekklle rlpevevpqh l
组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA)(例如,GenBank登录号NP_001019770(SEQ ID NO:77)):
1   mpdpaksapa pkkgskkavt kvqkkdgkkr krsrkesysv yvykvlkqvh pdtgisskam
61  gimnsfvndi feriageasr lahynkrsti tsreiqtavr lllpgelakh avsegtkavt
121 kytssk
含有三部分基序的28(TRIM28)(例如,GenBank登录号NP_005753(SEQ ID NO:78)):
1   maasaaaasa aaasaasgsp gpgegsagge krstapsaaa sasasaaass pagggaeale
61  llehcgvcre rlrpereprl lpclhsacsa clgpaapaaa nssgdggaag dgtvvdcpvc
121 kqqcfskdiv enyfmrdsgs kaatdaqdan qcctscedna patsycvecs eplcetcvea
181 hqrvkytkdh tvrstgpaks rdgertvycn vhkheplvlf cescdtltcr dcqlnahkdh
241 qyqfledavr nqrkllaslv krlgdkhatl qkstkevrss irqvsdvqkr vqvdvkmail
301 qimkelnkrg rvlvndaqkv tegqqerler qhwtmtkiqk hqehilrfas walesdnnta
361 lllskkliyf qlhralkmiv dpvephgemk fqwdlnawtk saeafgkiva erpgtnstgp
421 apmapprapg plskqgsgss qpmevqegyg fgsgddpyss aephvsgvkr srsgegevsg
481 lmrkvprvsl erldldltad sqppvfkvfp gsttedynli viergaaaaa tgqpgtapag
541 tpgapplagm aivkeeetea aigapptate gpetkpvlma laegpgaegp rlaspsgsts
601 sglevvapeg tsapgggpgt lddsaticrv cqkpgdlvmc nqcefcfhld chlpalqdvp
661 geewscslch vlpdlkeedg slsldgadst gvvaklspan qrkcervlla lfchepcrpl
721 hqlatdstfs ldqpggtldl tlirarlqek lsppysspqe faqdvgrmfk qfnkltedka
781 dvqsiiglqr ffetrmneaf gdtkfsavlv epppmslpga glssqelsgg pgdgp
过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI)(例如,GenBank登录号NP_006108(SEQ ID NO:79)):
1   mnrtamrasq kdfensmnqv kllkkdpgne vklklyalyk qategpcnmp kpgvfdlink
61  akwdawnalg slpkeaarqn yvdlvsslsp slesssqvep gtdrkstgfe tlvvtsedgi
121 tkimfnrpkk knaintemyh eimralkaas kddsiitvlt gngdyyssgn dltnftdipp
181 ggveekaknn avllrefvgc fidfpkplia vvngpavgis vtllglfdav yasdratfht
241 pfshlgqspe gcssytfpki mspakateml ifgkkltage acaqglvtev fpdstfqkev
301 wtrlkafakl ppnalriske virkrerekl havnaeecnv lqgrwlsdec tnavvnflsr
361 kskl
肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB)(例如,GenBank登录号NP_000933(SEQ ID NO:80)):
1   mlrlsernmk vllaaaliag svfflllpgp saadekkkgp kvtvkvyfdl rigdedvgrv
61  ifglfgktvp ktvdnfvala tgekgfgykn skfhrvikdf miqggdftrg dgtggksiyg
121 erfpdenfkl khygpgwvsm anagkdtngs qffittvkta wldgkhvvfg kvlegmevvr
181 kvestktdsr dkplkdviia dcgkievekp faiake
与40S核糖体蛋白S17类似的(例如,GenBank登录号IP00743305(SEQ ID NO:81)):
mgrvrtktvkkaarviiekyytrlgndfhtnkrvceeiaiipskklrnkipeilgtdrrtsdwrgdqlscipvpfpnstm
elakglqdnsrscvhssktccryhtvgppqlakigstgqvdqsgrprppnradlamepshaekdnhsalstpeagqsthg
真核翻译延伸因子1γ(EEF1G)(例如,GenBank登录号IPI00747497(SEQ ID NO:82)):
avgtlytypenwrafkaliaaqysgaqvrvlsapphfhfgqtnrtpeflrkfpagkvpaf
egddgfcvfesnaiayyvsneelrgstpeaaaqvvqwvsfadsdivppastwvfptlgim
hhnkqatenakeevrrilglldaylktrtflvgervtladitvvctllwlykqvlepsfr
qafpntnrwfltcinqpqfravlgevklcekmaqfdakkfaetqpkkdtprkekgsreek
qkpqaerkeekkaaapapeeemdeceqalaaepkakdpfahlpkstfvldefkrkysned
tlsvalpyfwehfdkdgwslwyseyrfpeeltqtfmscnlitgmfqrldklrknafasvi
lfgtnnsssisgvwvfrgqelafplspdwqvdyesytwrkldpgseetqtlvreyfsweg
afqhvgkafnqgkifk
角蛋白8(KRT8)(例如,GenBank登录号NP_002264(SEQ ID NO:83)):
1   msirvtqksy kvstsgpraf ssrsytsgpg srissssfsr vgssnfrggl gggyggasgm
61  ggitavtvnq sllsplvlev dpniqavrtq ekeqiktlnn kfasfidkvr fleqqnkmle
121 tkwsllqqqk tarsnmdnmf esyinnlrrq letlgqeklk leaelgnmqg lvedfknkye
181 deinkrteme nefvlikkdv deaymnkvel esrlegltde inflrqlyee eirelqsqis
241 dtsvvlsmdn srsldmdsii aevkaqyedi anrsraeaes myqikyeelq slagkhgddl
301 rrtkteisem nrnisrlqae ieglkgqras leaaiadaeq rgelaikdan aklseleaal
361 qrakqdmarq lreyqelmnv klaldieiat yrkllegees rlesgmqnms ihtkttsgya
421 gglssayggl tspglsyslg ssfgsgagss sfsrtsssra vvvkkietrd gklvsessdv
481 lpk
Fibulin 2(FBLN2)(例如,GenBank登录号NP_001989(SEQ ID NO:84)):
1   mvllwepaga wlalglalal gpsvaaaapr qdctgvecpp lencieeale pgaccatcvq
61  qgcacegyqy ydclqggfvr grvpagqsyf vdfgstecsc ppgggkiscq fmlcpelppn
121 cieavvvads cpqcgqvgcv haghkyaagh tvhlppcrac hcpdaggeli cyqlpgchgn
181 fsdaeegdpe rhyedpysyd qevaeveaat alggevqaga vqagaggppa algggsqpls
241 tiqappwpav lprptaaaal gppapvqaka rrvtedseee eeeeeereem avteqlaagg
301 hrgldglptt apagpslpiq eeraeagara eagarpeenl ildaqatsrs tgpegvthap
361 slgkaalvpt qavpgsprdp vkpsphnils tslpdaawip ptrevprkpq vlphshveed
421 tdpnsvhsip rsspegstkd lietccaagq qwaidndecl eipesgtedn vcrtaqrhcc
481  vsylqekscm agvlgakege tcgaedndsc gislykqccd ccglglrvra egqscesnpn
541  lgypcnhvml sccegeepli vpevrrppep aaaprrvsea emagrealsl gteaelpnsl
601  pgddqdecll lpgelcqhlc intvgsyhca cfpgfslqdd grtcrpeghp pqpeapqepa
661  lksefsqvas ntiplplpqp ntckdngpck qvcstvggsa icscfpgyai madgvscedi
721  necvtdlhtc srgehcvntl gsfhcykalt cepgyalkdg ecedvdecam gthtcqpgfl
781  cqntkgsfyc qarqrcmdgf lqdpegncvd inectslsep crpgfscint vgsytcqrnp
841  licargyhas ddgtkcvdvn ecetgvhrcg egqvchnlpg syrcdckagf qrdafgrgci
901  dvnecwaspg rlcqhtcent lgsyrcscas gfllaadgkr cedvneceaq rcsqecaniy
961  gsyqcycrqg yqlaedghtc tdidecaqga gilctfrcln vpgsyqcacp eqgytmtang
1021 rsckdvdeca lgthncseae tchniqgsfr clrfecppny vqvsktkcer ttchdflecq
1081 nsparithyq lnfqtgllvp ahifrigpap aftgdtialn iikgneegyf gtrrlnaytg
1141 vvylqravle prdfaldvem klwrqgsvtt flakmhifft tfal
VIM(例如,GenBank登录号NP_003371(SEQ ID NO:85)):
1   mstrsvssss yrrmfggpgt asrpsssrsy vttstrtysl gsalrpstsr slyasspggv
61  yatrssavrl rssvpgvrll qdsvdfslad aintefkntr tnekvelqel ndrfanyidk
121 vrfleqqnki llaeleqlkg qgksrlgdly eeemrelrrq vdqltndkar veverdnlae
181 dimrlreklq eemlqreeae ntlqsfrqdv dnaslarldl erkveslqee iaflkklhee
241 eiqelqaqiq eqhvqidvdv skpdltaalr dvrqqyesva aknlqeaeew ykskfadlse
301 aanrnndalr qakqesteyr rqvqsltcev dalkgtnesl erqmremeen faveaanyqd
361 tigrlqdeiq nmkeemarhl reyqdllnvk maldieiaty rkllegeesr islplpnfss
421 lnlretnlds lplvdthskr tlliktvetr dgqvinetsq hhddle
纤维蛋白原α链(FGA)(例如,GenBank登录号NP_000499(SEQ ID NO:86)):
1   mfsmrivclv lsvvgtawta dsgegdflae gggvrgprvv erhqsackds dwpfcsdedw
61  nykcpsgcrm kglidevnqd ftnrinklkn slfeyqknnk dshslttnim eilrgdfssa
121 nnrdntynrv sedlrsriev lkrkviekvq hiqllqknvr aqlvdmkrle vdidikirsc
181 rgscsralar evdlkdyedq qkqleqviak dllpsrdrqh lplikmkpvp dlvpgnfksq
241 lqkvppewka ltdmpqmrme lerpggneit rggstsygtg setesprnps sagswnsgss
301 gpgstgnrnp gssgtggtat wkpgssgpgs tgswnsgssg tgstgnqnpg sprpgstgtw
361 npgssergsa ghwtsessvs gstgqwhses gsfrpdspgs gnarpnnpdw gtfeevsgnv
421 spgtrreyht eklvtskgdk elrtgkekvt sgsttttrrs csktvtktvi gpdghkevtk
481 evvtsedgsd cpeamdlgtl sgigtldgfr hrhpdeaaff dtastgktfp gffspmlgef
541 vsetesrgse sgiftntkes sshhpgiaef psrgksssys kqftsstsyn rgdstfesks
601 ykmadeagse adhegthstk rghaksrpvr dcddvlqthp sgtqsgifni klpgsskifs
661 vycdqetslg gwlliqqrmd gslnfnrtwq dykrgfgsln degegefwlg ndylhlltqr
721 gsvlrveled wagneayaey hfrvgseaeg yalqvssyeg tagdaliegs veegaeytsh
781 nnmqfstfdr dadqweenca evygggwwyn ncqaanlngi yypggsydpr nnspyeieng
841 vvwvsfrgad yslravrmki rplvtq
膜联蛋白A2(ANXA2)(例如,GenBank登录号NP_001002858(SEQ ID NO:87)):
1   mgrqlagcgd agkkasfkms tvheilckls legdhstpps aygsvkaytn fdaerdalni
61  etaiktkgvd evtivniltn rsnaqrqdia fayqrrtkke lasalksals ghletvilgl
121 lktpaqydas elkasmkglg tdedslieii csrtnqelqe inrvykemyk tdlekdiisd
181 tsgdfrklmv alakgrraed gsvidyelid qdardlydag vkrkgtdvpk wisimtersv
241 phlqkvfdry ksyspydmle sirkevkgdl enaflnlvqc iqnkplyfad rlydsmkgkg
301 trdkvlirim vsrsevdmlk irsefkrkyg kslyyyiqqd tkgdyqkall ylcggdd
H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ)(例如,GenBank登录号NP_808760(SEQ ID NO:88)):
1   msgrgkqggk vrakaksrss raglqfpvgr vhrllrkgny aervgagapv ylaavleylt
61  aeilelagna ardnkktrii prhlqlairn deelnkllgk vtiaqggvlp niqavllpkk
121 tesqktksk
肌动蛋白α,心肌1(ACTC1)(例如,GenBank登录号NP_005150(SEQ ID NO:89)):
1   mcddeettal vcdngsglvk agfagddapr avfpsivgrp rhqgvmvgmg qkdsyvgdea
61  qskrgiltlk ypiehgiitn wddmekiwhh tfynelrvap eehptlltea plnpkanrek
121 mtqimfetfn vpamyvaiqa vlslyasgrt tgivldsgdg vthnvpiyeg yalphaimrl
181 dlagrdltdy lmkiltergy sfvttaerei vrdikeklcy valdfenema taasssslek
241 syelpdgqvi tignerfrcp etlfqpsfig mesagihett ynsimkcdid irkdlyannv
301 lsggttmypg iadrmqkeit alapstmkik iiapperkys vwiggsilas lstfqqmwis
361 kqeydeagps ivhrkcf
角蛋白19(KRT19)(例如,GenBank登录号NP_002267(SEQ ID NO:90)):
1   mtsysyrqss atssfgglgg gsvrfgpgva frapsihggs ggrgvsvssa rfvsssssga
61  ygggyggvlt asdgllagne kltmqnlndr lasyldkvra leaangelev kirdwyqkqg
121 pgpsrdyshy yttiqdlrdk ilgatiensr ivlqidnarl aaddfrtkfe teqalrmsve
181 adinglrrvl deltlartdl emqieglkee laylkknhee eistlrgqvg gqvsvevdsa
241 pgtdlakils dmrsqyevma eqnrkdaeaw ftsrteelnr evaghteqlq msrsevtdlr
301 rtlqgleiel qsqlsmkaal edtlaetear fgaqlahiqa lisgieaqlg dvradserqn
361 qeyqrlmdik srleqeiaty rsllegqedh ynnlsaskvl
免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白)(例如,GenBank登录号Q6PIQ7(SEQ ID NO:91)):
1   mawallllsl ltqgtgswaq saltqprsvs gspgqsvtip ctgtssdvgn ynyvswyrqh
61  pgkapklmiy dvnkrpsgvp drfsgsksgn tasltisglq aedeadyycc syagtytfgv
121 fgggtkltvl gqpkaapsvt lfppsseelq ankatlvcli sdfypgavtv awkadsspvk
181 agvetttpsk qsnnkyaass ylsltpeqwk shksyscqvt hegstvektv aptecs
免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM)(例如,GenBank登录号Q8WUK1(SEQ ID NO:92)):
1   mefglswvfl vallrgvqcq vqlvesgggv vqpgrslrls caasgftfss ygmhwvrqap
61  gkglewvavi sydgsnkyya dsvkgrftis rdnskntlyl qmnslraedt avyycakdws
121 egvetfdiwg qgtmvtvssg sasaptlfpl vscenspsdt ssvavgclaq dflpdsitfs
181 wkyknnsdis strgfpsvlr ggkyaatsqv llpskdvmqg tdehvvckvq hpngnkeknv
241 plpviaelpp kvsvfvpprd gffgnprksk licqatgfsp rqiqvswlre gkqvgsgvtt
301 dqvqaeakes gpttykvtst ltikesdwls qsmftcrvdh rgltfqqnas smcvpdqdta
361 irvfaippsf asifltkstk ltclvtdltt ydsvtiswtr qngeavktht niseshpnat
421 fsavgeasic eddwnsgerf tctvthtdlp splkqtisrp kgvalhrpdv yllppareql
481 nlresatitc lvtgfspadv fvqwmqrgqp lspekyvtsa pmpepqapgr yfahsiltvs
541 eeewntgety tcvvahealp nrvtertvdk stegevsade egfenlwata stfivlflls
601 lfysttvtlf kvk
含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1)(例如,GenBank登录号Q12805-3(SEQ ID NO:93)):
1   mlkalfltml tlalvksqdt eetitytqct dgyewdpvrq qckdidecdi vpdackggmk
61  cvnhyggylc lpktaqiivn neqpqqetqp aegtsgattg vvaassmats gvlpgggfva
121 saaavagpem qtgrnnfvir rnpadpqrip snpshriqca agyeqsehnv cqdidectag
181 thncradqvc inlrgsfacq cppgyqkrge qcvdidecti ppychqrcvn tpgsfycqcs
241 pgfqlaanny tcvdinecda snqcaqqcyn ilgsficqcn qgyelssdrl ncedidecrt
301 ssylcqyqcv nepgkfscmc pqgyqvvrsr tcqdinecet tnecredemc wnyhggfrcy
361 prnpcqdpyi ltpenrcvcp vsnamcrelp qsivykymsi rsdrsvpsdi fqiqattiya
421 ntintfriks gnengefylr qtspvsamlv lvkslsgpre hivdlemltv ssigtfrtss
481 vlrltiivgp fsf
含有三部分基序的蛋白34(例如,GenBank登录号NP_067629(SEQ ID NO:94)):
1   maskillnvq eevtcpicle llteplsldc ghslcracit vsnkeavtsm ggksscpvcg
61  isysfehlqa nqhlaniver lkevklspdn gkkrdlcdhh geklllfcke drkvicwlce
121 rsqehrghht vlteevfkec qeklqavlkr lkkeeeeaek leadireekt swkyqvqter
181 qriqtefdql rsilnneeqr elqrleeeek ktldkfaeae delvqqkqlv relisdvecr
241 sqwstmellq dmsgimkwse iwrlkkpkmv skklktvfha pdlsrmlqmf reltavrcyw
301 vdvtlnsvnl nlnlvlsedq rqvisvpiwp fqcynygvlg sqyfssgkhy wevdvskkta
361 wilgvycrty srhmkyvvrr canrqnlytk yrplfgywvi glqnkckygv feeslssdpe
421 vltlsmavpp crvgvfldye agivsffnvt shgsliykfs kccfsqpvyp yfnpwncpap
481 mtlcppss
AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3(例如,GenBank登录号NP_542117(SEQ ID NO:95)):
1    malrpgagsg gggaagagag saggggfmfp vaggirppqa glmpmqqqgf pmvsvmqpnm
61   qgimgmnyss qmsqgpiamq agipmgpmpa agmpylgqap flgmrppgpq ytpdmqkqfa
121  eeqqkrfeqq qklleeerkr rqfeeqkqkl rllssvkpkt geksrddale aikgnldgfs
181  rdakmhptpa shpkkpgpsl eekflvscdi stsgqeqikl ntsevghkal gpgsskkyps
241  lmasngvavd gcvsgtttae aentsdqnls ieesgvgvfp sqdpaqprmp pwiyneslvp
301  daykkilett mtptgidtak lypilmssgl pretlgqiwa lanrttpgkl tkeelytvla
361  miavtqrgvp amspdalnqf paapiptlsg fsmtlptpvs qptvipsgpa gsmplslgqp
421  vmginlvgpv ggaaaqassg fiptypanqv vkpeeddfqd fqdasksgsl ddsfsdfqel
481  passktsnsq hgnsapsllm plpgtkalps mdkyavfkgi aadkssentv ppgdpgdkys
541  afreleqtae nkplgesfae frsagtddgf tdfktadsvs plepptkdkt fppsfpsgti
601  qqkqqtqvkn plnladldmf ssvncssekp lsfsavfsts ksvstpqstg saatmtalaa
661  tktssladdf gefslfgeys glapvgeqdd fadfmafsns sisseqkpdd kydalkeeas
721  pvpltsnvgs tvkggqnsta astkydvfrq lslegsglgv edlkdntpsg ksdddfadfh
781  sskfssinsd kslgekavaf rhtkedsasv ksldlpsigg ssvgkedsed alsvqfdmkl
841  advggdlkhv msdssldlpt vsgqhppaad iedlkyaafg syssnfavst ltsydwsdrd
901  datqgrklsp fvlsagsgsp satsilqkke tsfgssenit mtslskvttf vsedalpett
961  fpalasfkdt ipqtseqkey enrdykdftk qdlptaersq eatcpspass gasqetpnec
1021 sddfgefqse kpkiskfdfl vatsqskmks seemiksela tfdlsvqgsh krslslgdke
1081 isrsspspal eqpfrdrsnt lnekpalpvi rdkykdltge veeneryaye wqrclgsaln
1141 vikkandtln gissssvcte viqsaqgmey llgvvevyrv tkrvelgika tavcseklqq
1201 llkdidkvwn nligfmslat ltpdensldf sscmlrpgik naqelacgvc llnvdsrsra
1261 fnsetdsfkl aygghqyhas canfwincve pkppglvlpd ll
Proflin-1(例如,GenBank登录号NP_005013(SEQ ID NO:96)):
1   magwnayidn lmadgtcqda aivgykdsps vwaavpgktf vnitpaevgv lvgkdrssfy
61  vngltlggqk csvirdsllq dgefsmdlrt kstggaptfn vtvtktdktl vllmgkegvh
121 gglinkkcye mashlrrsqy
组蛋白H4(例如,GenBank登录号NP_001029249(SEQ ID NO:97)):
1  msgrgkggkg lgkggakrhr kvlrdniqgi tkpairrlar rggvkrisgl iyeetrgvlk
61 vflenvirda vtytehakrk tvtamdvvya lkrqgrtlyg fgg
血红蛋白亚基α(例如,GenBank登录号NP_000549(SEQ ID NO:98)):
1   mvlspadktn vkaawgkvga hageygaeal ermflsfptt ktyfphfdls hgsaqvkghg
61  kkvadaltna vahvddmpna lsalsdlhah klrvdpvnfk llshcllvtl aahlpaeftp
121 avhasldkfl asvstvltsk yr
转凝蛋白(也称作TAGLN)(例如,GenBank登录号NP_001001522(SEQ ID NO:99)):
1   mankgpsygm srevqskiek kydeeleerl vewiivqcgp dvgrpdrgrl gfqvwlkngv
61  ilsklvnsly pdgskpvkvp enppsmvfkq meqvaqflka aedygviktd mfqtvdlfeg
121 kdmaavqrtl malgslavtk ndghyrgdpn wfmkkaqehk reftesqlqe gkhviglqmg
181 snrgasqagm tgygrprqii s
基膜聚糖前体例如,GenBank登录号NP_002336(SEQ ID NO:100)):
1   mslsaftlfl aliggtsgqy ydydfplsiy gqsspncape cncpesypsa mycdelklks
61  vpmvppgiky lylrnnqidh idekafenvt dlqwlildhn llenskikgr vfsklkqlkk
121 lhinhnnlte svgplpksle dlqlthnkit klgsfeglvn ltfihlqhnr lkedavsaaf
181 kglksleyld lsfnqiarlp sglpvslltl yldnnkisni pdeyfkrfna lqylrlshne
241 ladsgipgns fnvsslveld lsynklknip tvnenlenyy levnqlekfd iksfckilgp
301 lsyskikhlr ldgnrisets lppdmyeclr vanevtln
血红蛋白β(也称作HBD CD113t)(例如,GenBank登录号NP_000509(SEQ ID NO:101)):
1   mvhltpeeks avtalwgkvn vdevggealg rllvvypwtq rffesfgdls tpdavmgnpk
61  vkahgkkvlg afsdglahld nlkgtfatls elhcdklhvd penfrllgnv lvcvlahhfg
121 keftppvqaa yqkvvagvan alahkyh
纤维蛋白原β链前体(例如,GenBank登录号NP_005132(SEQ ID NO:102)):
1   mkrmvswsfh klktmkhlll lllcvflvks qgvndneegf fsarghrpld kkreeapslr
61  papppisggg yrarpakaaa tqkkverkap daggclhadp dlgvlcptgc qlqeallqqe
121 rpirnsvdel nnnveavsqt ssssfqymyl lkdlwqkrqk qvkdnenvvn eysselekhq
181 lyidetvnsn iptnlrvlrs ilenlrskiq klesdvsaqm eycrtpctvs cnipvvsgke
241 ceeiirkgge tsemyliqpd ssvkpyrvyc dmntenggwt viqnrqdgsv dfgrkwdpyk
301 qgfgnvatnt dgknycglpg eywlgndkis qltrmgptel liemedwkgd kvkahyggft
361 vqneankyqi svnkyrgtag nalmdgasql mgenrtmtih ngmffstydr dndgwltsdp
421 rkqcskedgg gwwynrchaa npngryywgg qytwdmakhg tddgvvwmnw kgswysmrkm
481 smkirpffpq q
免疫球蛋白κ恒定(IGKC)(例如,GenBank登录号Q6GMX8(SEQ ID NO:103)):
1   mdmrvpaqll gllllwfpgs rcdiqmtqsp ssvsasvgdr vtitcrasqg isswlawyqq
61  kpgkapklli yaasslqsgv psrfsgsgsg tdftltissl qpedfatyyc qqahsfpftf
121 gpgtkvdikr tvaapsvfif ppsdeqlksg tasvvcllnn fypreakvqw kvdnalqsgn
181 sqesvteqds kdstyslsst ltlskadyek hkvyacevth qglsspvtks fnrgec
未表征的蛋白ALB(也称作白蛋白)(例如,GenBank登录号Q56G89(SEQ ID NO:104)):
1   mkwvtfisll flfssaysrg vfrrdahkse vahrfkdlge enfkalvlia faqylqqcpf
61  edhvklvnev tefaktcvad esaencdksl htlfgdklct vatlretyge madccakqep
121 ernecflqhk ddnpnlprlv rpevdvmcta fhdneetflk kylyeiarrh pyfyapellf
181 fakrykaaft eccqaadkaa cllpkldelr degkassakq glkcaslqkf gerafkawav
241 arlsqrfpka efaevsklvt dltkvhtecc hgdllecadd radlakyice nqdsissklk
301 eccekpllek shciaevend empadlpsla adfvgskdvc knyaeakdvf lgmflyeyar
361 rhpdysvvll lrlaktyett lekccaaadp hecyakvfde fkplveepqn likqncelfe
421 qlgeykfqna llvrytkkvp qvstptlvev srnlgkvgsk cckhpeakrm pcaedclsvf
481 lnqlcvlhek tpvsdrvtkc cteslvngrp cfsalevdet yvpkefnaet ftfhadictl
541 sekerqikkq talvelvkhk pkatkeqlka vmddfaafve kcckaddket cfaeegkklv
601 aasqaalgl
ApoA1(例如,GenBank登录号P02647(SEQ ID NO:105):
MKAAVLTLAV LFLTGSQARH FWQQDEPPQS PWDRVKDLAT VYVDVLKDSG RDYVSQFEGS
ALGKQLNLKL LDNWDSVTST FSKLREQLGP VTQEFWDNLE KETEGLRQEM SKDLEEVKAK
VQPYLDDFQK KWQEEMELYR QKVEPLRAEL QEGARQKLHE LQEKLSPLGE EMRDRARAHV
DALRTHLAPY SDELRQRLAA RLEALKENGG ARLAEYHAKA TEHLSTLSEK AKPALEDLRQ
GLLPVLESFK VSFLSALEEY TKKLNTQ
C4A(例如,GenBank登录号P0C0L4(SEQ ID NO:106):
MRLLWGLIWA SSFFTLSLQK PRLLLFSPSV VHLGVPLSVG VQLQDVPRGQ VVKGSVFLRN
PSRNNVPCSP KVDFTLSSER DFALLSLQVP LKDAKSCGLH QLLRGPEVQL VAHSPWLKDS
LSRTTNIQGI NLLFSSRRGH LFLQTDQPIY NPGQRVRYRV FALDQKMRPS TDTITVMVEN
SHGLRVRKKE VYMPSSIFQD DFVIPDISEP GTWKISARFS DGLESNSSTQ FEVKKYVLPN
FEVKITPGKP YILTVPGHLD EMQLDIQARY IYGKPVQGVA YVRFGLLDED GKKTFFRGLE
SQTKLVNGQS HISLSKAEFQ DALEKLNMGI TDLQGLRLYV AAAIIESPGG EMEEAELTSW
YFVSSPFSLD LSKTKRHLVP GAPFLLQALV REMSGSPASG IPVKVSATVS SPGSVPEVQD
IQQNTDGSGQ VSIPIIIPQT ISELQLSVSA GSPHPAIARL TVAAPPSGGP GFLSIERPDS
RPPRVGDTLN LNLRAVGSGA TFSHYYYMIL SRGQIVFMNR EPKRTLTSVS VFVDHHLAPS
FYFVAFYYHG DHPVANSLRV DVQAGACEGK LELSVDGAKQ YRNGESVKLH LETDSLALVA
LGALDTALYA AGSKSHKPLN MGKVFEAMNS YDLGCGPGGG DSALQVFQAA GLAFSDGDQW
TLSRKRLSCP KEKTTRKKRN VNFQKAINEK LGQYASPTAK RCCQDGVTRL PMMRSCEQRA
ARVQQPDCRE PFLSCCQFAE SLRKKSRDKG QAGLQRALEI LQEEDLIDED DIPVRSFFPE
NWLWRVETVD RFQILTLWLP DSLTTWEIHG LSLSKTKGLC VATPVQLRVF REFHLHLRLP
MSVRRFEQLE LRPVLYNYLD KNLTVSVHVS PVEGLCLAGG GGLAQQVLVP AGSARPVAFS
VVPTAAAAVS LKVVARGSFE FPVGDAVSKV LQIEKEGAIH REELVYELNP LDHRGRTLEI
PGNSDPNMIP DGDFNSYVRV TASDPLDTLG SEGALSPGGV ASLLRLPRGC GEQTMIYLAP
TLAASRYLDK TEQWSTLPPE TKDHAVDLIQ KGYMRIQQFR KADGSYAAWL SRDSSTWLTA
FVLKVLSLAQ EQVGGSPEKL QETSNWLLSQ QQADGSFQDP CPVLDRSMQG GLVGNDETVA
LTAFVTIALH HGLAVFQDEG AEPLKQRVEA SISKANSFLG EKASAGLLGA HAAAITAYAL
SLTKAPVDLL GVAHNNLMAM AQETGDNLYW GSVTGSQSNA VSPTPAPRNP SDPMPQAPAL
WIETTAYALL HLLLHEGKAE MADQASAWLT RQGSFQGGFR STQDTVIALD ALSAYWIASH
TTEERGLNVT LSSTGRNGFK SHALQLNNRQ IRGLEEELQF SLGSKINVKV GGNSKGTLKV
LRTYNVLDMK NTTCQDLQIE VTVKGHVEYT MEANEDYEDY EYDELPAKDD PDAPLQPVTP
LQLFEGRRNR RRREAPKVVE EQESRVHYTV CIWRNGKVGL SGMAIADVTL LSGFHALRAD
LEKLTSLSDR YVSHFETEGP HVLLYFDSVP TSRECVGFEA VQEVPVGLVQ PASATLYDYY
NPERRCSVFY GAPSKSRLLA TLCSAEVCQC AEGKCPRQRR ALERGLQDED GYRMKFACYY
PRVEYGFQVK VLREDSRAAF RLFETKITQV LHFTKDVKAA ANQMRNFLVR ASCRLRLEPG
KEYLIMGLDG ATYDLEGHPQ YLLDSNSWIE EMPSERLCRS TRQRAACAQL NDFLQEYGTQ
GCQV
C3187kDa蛋白(例如,GenBank登录号P01024(SEQ ID NO:107)):
MGPTSGPSLL LLLLTHLPLA LGSPMYSIIT PNILRLESEE TMVLEAHDAQ GDVPVTVTVH
DFPGKKLVLS SEKTVLTPAT NHMGNVTFTI PANREFKSEK GRNKFVTVQA TFGTQVVEKV
VLVSLQSGYL FIQTDKTIYT PGSTVLYRIF TVNHKLLPVG RTVMVNIENP EGIPVKQDSL
SSQNQLGVLP LSWDIPELVN MGQWKIRAYY ENSPQQVFST EFEVKEYVLP SFEVIVEPTE
KFYYIYNEKG LEVTITARFL YGKKVEGTAF VIFGIQDGEQ RISLPESLKR IPIEDGSGEV
VLSRKVLLDG VQNPRAEDLV GKSLYVSATV ILHSGSDMVQ AERSGIPIVT SPYQIHFTKT
PKYFKPGMPF DLMVFVTNPD GSPAYRVPVA VQGEDTVQSL TQGDGVAKLS INTHPSQKPL
SITVRTKKQE LSEAEQATRT MQALPYSTVG NSNNYLHLSV LRTELRPGET LNVNFLLRMD
RAHEAKIRYY TYLIMNKGRL LKAGRQVREP GQDLVVLPLS ITTDFIPSFR LVAYYTLIGA
SGQREVVADS VWVDVKDSCV GSLVVKSGQS EDRQPVPGQQ MTLKIEGDHG ARVVLVAVDK
GVFVLNKKNK LTQSKIWDVV EKADIGCTPG SGKDYAGVFS DAGLTFTSSS GQQTAQRAEL
QCPQPAARRR RSVQLTEKRM DKVGKYPKEL RKCCEDGMRE NPMRFSCQRR TRFISLGEAC
KKVFLDCCNY ITELRRQHAR ASHLGLARSN LDEDIIAEEN IVSRSEFPES WLWNVEDLKE
PPKNGISTKL MNIFLKDSIT TWEILAVSMS DKKGICVADP FEVTVMQDFF IDLRLPYSVV
RNEQVEIRAV LYNYRQNQEL KVRVELLHNP AFCSLATTKR RHQQTVTIPP KSSLSVPYVI
VPLKTGLQEV EVKAAVYHHF ISDGVRKSLK VVPEGIRMNK TVAVRTLDPE RLGREGVQKE
DIPPADLSDQ VPDTESETRI LLQGTPVAQM TEDAVDAERL KHLIVTPSGC GEQNMIGMTP
TVIAVHYLDE TEQWEKFGLE KRQGALELIK KGYTQQLAFR QPSSAFAAFV KRAPSTWLTA
YVVKVFSLAV NLIAIDSQVL CGAVKWLILE KQKPDGVFQE DAPVIHQEMI GGLRNNNEKD
MALTAFVLIS LQEAKDICEE QVNSLPGSIT KAGDFLEANY MNLQRSYTVA IAGYALAQMG
RLKGPLLNKF LTTAKDKNRW EDPGKQLYNV EATSYALLAL LQLKDFDFVP PVVRWLNEQR
YYGGGYGSTQ ATFMVFQALA QYQKDAPDHQ ELNLDVSLQL PSRSSKITHR IHWESASLLR
SEETKENEGF TVTAEGKGQG TLSVVTMYHA KAKDQLTCNK FDLKVTIKPA PETEKRPQDA
KNTMILEICT RYRGDQDATM SILDISMMTG FAPDTDDLKQ LANGVDRYIS KYELDKAFSD
RNTLIIYLDK VSHSEDDCLA FKVHQYFNVE LIQPGAVKVY AYYNLEESCT RFYHPEKEDG
KLNKLCRDEL CRCAEENCFI QKSDDKVTLE ERLDKACEPG VDYVYKTRLV KVQLSNDFDE
YIMAIEQTIK SGSDEVQVGQ QRTFISPIKC REALKLEEKK HYLMWGLSSD FWGEKPNLSY
IIGKDTWVEH WPEEDECQDE ENQKQCQDLG AFTESMVVFG CPN
细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β)(例如,GenBank登录号NP_001092(SEQ ID NO:108)):
>refseqp|NP_001092|NP_001092beta actin[智人]
MDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQS
KRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMT
QIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDL
AGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSY
ELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLS
GGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQ
EYDESGPSIVHRKCF
血红蛋白β(例如,GenBank登录号O95408(SEQ ID NO:109)):
>uniprot|O95408|O95408_人β球蛋白;
MVHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVIYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMG
血红蛋白亚基α(例如,GenBank登录号P69905(SEQ ID NO:110)):
>uniprot|P69905|HBA_人血红蛋白亚基α;
MVLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHG
KKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTP
AVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
POTE-2α肌动蛋白(例如,GenBank登录号A5A3E0(SEQ ID NO:111)):
>uniprot|A5A3E0|POTEF_人POTE锚定蛋白结构域家族成员F;
MVVEVDSMPAASSVKKPFGLRSKMGKWCCRCFPCCRESGKSNVGTSGDHDDSAMKTLRSK
MGKWCRHCFPCCRGSGKSNVGASGDHDDSAMKTLRNKMGKWCCHCFPCCRGSSKSKVGAW
GDYDDSAFMEPRYHVRGEDLDKLHRAAWWGKVPRKDLIVMLRDTDVNKQDKQKRTALHLA
SANGNSEVVKLLLDRRCQLNVLDNKKRTALIKAVQCQEDECALMLLEHGTDPNIPDEYGN
TTLHYAIYNEDKLMAKALLLYGADIESKNKHGLTPLLLGVHEQKQQVVKFLIKKKANLNA
LDRYGRTALILAVCCGSASIVSLLLEQNIDVSSQDLSGQTAREYAVSSHHHVICQLLSDY
KEKQMLKISSENSNPEQDLKLTSEEESQRFKGSENSQPEKMSQEPEINKDGDREVEEEMK
KHESNNVGLLENLTNGVTAGNGDNGLIPQRKSRTPENQQFPDNESEEYHRICELLSDYKE
KQMPKYSSENSNPEQDLKLTSEEESQRLKGSENGQPEKRSQEPEINKDGDRELENFMAIE
EMKKHRSTHVGFPENLTNGATAGNGDDGLIPPRKSRTPESQQFPDTENEEYHSDEQNDTQ
KQFCEEQNTGILHDEILIHEEKQIEVVEKMNSELSLSCKKEKDILHENSTLREEIAMLRL
ELDTMKHQSQLREKKYLEDIESVKKRNDNLLKALQLNELTMDDDTAVLVIDNGSGMCKAG
FAGDDAPRAVFPSIVGRPRQQGMMGGMHQKESYVGKEAQSKRGILTLKYPMEHGIITNWD
DMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEATLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVL
SLYTSGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGNALPHATLRLDLAGRELPDYLMKILTEHGYRF
TTMAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATVASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEA
LFQPCFLGMESCGIHETTFNSIMKSDVDIRKDLYTNTVLSGGTTMYPGMAHRMQKEIAAL
APSMMKIRIIAPPKRKYSVWVGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCL
SLC4A10(例如,GenBank登录号Q6U841(SEQ ID NO:112)):
>uniprot|Q6U841|S4A10_人钠驱动的氯化物碳酸氢盐交换器;
MEIKDQGAQMEPLLPTRNDEEAVVDRGGTRSILKTHFEKEDLEGHRTLFIGVHVPLGGRK
SHRRHRHRGHKHRKRDRERDSGLEDGRESPSFDTPSQRVQFILGTEDDDEEHIPHDLFTE
LDEICWREGEDAEWRETARWLKFEEDVEDGGERWSKPYVATLSLHSLFELRSCILNGTVL
LDMHANTLEEIADMVLDQQVSSGQLNEDVRHRVHEALMKQHHHQNQKKLTNRIPIVRSFA
DIGKKQSEPNSMDKNAGQVVSPQSAPACVENKNDVSRENSTVDFSKGLGGQQKGHTSPCG
MKQRHEKGPPHQQEREVDLHFMKKIPPGAEASNILVGELEFLDRTVVAFVRLSPAVLLQG
LAEVPIPTRFLFILLGPLGKGQQYHEIGRSIATLMTDEVFHDVAYKAKDRNDLVSGIDEF
LDQVTVLPPGEWDPSIRIEPPKNVPSQEKRKIPAVPNGTAAHGEAEPHGGHSGPELQRTG
RIFGGLILDIKRKAPYFWSDFRDAFSLQCLASFLFLYCACMSPVITFGGLLGEATEGRIS
AIESLFGASMTGIAYSLFGGQPLTILGSTGPVLVFEKILFKFCKEYGLSYLSLRASIGLW
TATLCIILVATDASSLVCYITRFTEEAFASLICIIFIYEALEKLFELSEAYPINMHNDLE
LLTQYSCNCVEPHNPSNGTLKEWRESNISASDIIWENLTVSECKSLHGEYVGRACGHDHP
YVPDVLFWSVILFFSTVTLSATLKQFKTSRYFPTKVRSIVSDFAVFLTILCMVLIDYAIG
IPSPKLQVPSVFKPTRDDRGWFVTPLGPNPWWTVIAAIIPALLCTILIFMDQQITAVIIN
RKEHKLKKGCGYHLDLLMVAVMLGVCSIMGLPWFVAATVLSITHVNSLKLESECSAPGEQ
PKFLGIREQRVTGLMIFILMGSSVFMTSILKFIPMPVLYGVFLYMGASSLKGIQFFDRIK
LFWMPAKHQPDFIYLRHVPLRKVHLFTIIQMSCLGLLWIIKVSRAAIVFPMMVLALVFVR
KLMDLLFTKRELSWLDDLMPESKKKKLEDAEKEEEQSMLAMEDEGTVQLPLEGHYRDDPS
VINISDEMSKTALWRNLLITADNSKDKESSFPSKSSPS
核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7)(例如,GenBank登录号O75817(SEQ ID NO:113))
>uniprot|O75817|POP7_人核糖核酸酶P蛋白亚基p20;
MAENREPRGAVEAELDPVEYTLRKRLPSRLPRRPNDIYVNMKTDFKAQLARCQKLLDGGA
RGQNACSEIYIHGLGLAINRAINIALQLQAGSFGSLQVAANTSTVELVDELEPETDTREP
LTRIRNNSAIHIRVFRVTPK
核RNA输出因子1(NXF1)(例如,GenBank登录号Q59E96(SEQ ID NO:114)):
>uniprot|Q59E96|Q59E96_人核RNA输出因子1变体;
RPAPEPALDLRCGMADEGKSYSEHDDERVNFPQRKKKGRGPFRWKYGEGNRRSGRGGSGI
RSSRLEEDDGDVAMSDAQDGPRVRYNPYTTRPNRRGDTWHDRDRIHVTVRRDRAPPERGG
AGTSQDGTSKNWFKITIPYGRKYDKAWLLSMIQSKCSVPFTPIEFHYENTRAQFFVEDAS
TASALKAVNYKILDRENRRISIIINSSAPPHTILNELKPEQVEQLKLIMSKRYDGSQQAL
DLKGLRSDPDLVAQNIDVVLNRRSCMAATLRIIEENIPELLSLNLSNNRLYRLDDMSSIV
QKAPNLKILNLSGNELKSERELDKIKGLKLEELWLDGNSLCDTFRDQSTYIRSVVACVSP
PGDLHPLGG
具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA(例如,
GenBank登录号Q05DB3(SEQ ID NO:115)):
>uniprot|Q05DB3|Q05DB3_人UACA蛋白;
MMNCWFSCTPKNRHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVTSILAKKGVNPGKLDVEGRSVFH
VVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKLLQYNCPTEHADLQ
GRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMSRPTICQLLIDRGADV
NSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADISLLDALGHDSSYYARIGDNLDILTLLK
TASENTNKGRELWKKGPSLQQRNLTHMQDEVNVKSHQREHQNIQDLEIENEDLKERLRKI
QQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEKQHEESLRTIEALKNRF
KYFESDHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYMADSQCTSPGIPAHMQSRSMLRPLELSLPSQ
TSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVAECKALALECERVKEDSDEQIK
QLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAASGNHRLTEELKDQLKDLKVKY
EGASAEVGKLRNQIKQNEMIVEEFKRDEGKLIEENKRLQKELSMCEMEREKKGRKVTEME
GQAKELSAKLALSIPAEKFENMKSSLSNEVNEKAKKKK
未表征的蛋白C13ORF27(例如,GenBank登录号Q5JUR7(SEQ ID NO:116)):
>uniprot|Q5JUR7|CM027_人未表征的蛋白C13orf27;
MSHTEVKLKIPFGNKLLDAVCLVPNKSLTYGIILTHGASGDMNLPHLMSLASHLASHGFF
CLRFTCKGLNIVHRIKAYKSVLNYLKTSGEYKLAGVFLGGRSMGSRAAASVMCHIEPDDG
DDFVRGLICISYPLHHPKQQHKLRDEDLFRLKEPVLFVSGSADEMCEKNLLEKVAQKMQA
PHKIHWIEKANHSMAVKGRSTNDVFKEINTQILFWIQEITEMDKKCH
含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3(例如,GenBank登录号Q8TER0(SEQ ID NO:117)):
>SWissprot|Q8TER0|SNED1_人含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1;
MRHGVAWALLVAAALGLGARGVRGAVALADFYPFGAERGDAVTPKQDDGGSGLRPLSVPF
PFFGAEHSGLYVNNNGIISFLKEVSQFTPVAFPIAKDRCVVAAFWADVDNRRAGDVYYRE
ATDPAMLRRATEDVRHYFPELLDFNATWVFVATWYRVTFFGGSSSSPVNTFQTVLITDGK
LSFTIFNYESIVWTTGTHASSGGNATGLGGIAAQAGFNAGDGQRYFSIPGSRTADMAEVE
TTTNVGVPGRWAFRIDDAQVRVGGCGHTTSVCLALRPCLNGGKCIDDCVTGNPSYTCSCL
SGFTGRRCHLDVNECASQPCQNGGTCTHGINSFRCQCPAGFGGPTCETAQSPCDTKECQH
GGQCQVENGSAVCVCQAGYTGAACEMDVDDCSPDPCLNGGSCVDLVGNYTCLCAEPFKGL
RCETGDHPVPDACLSAPCHNGGTCVDADQGYVCECPEGFMGLDCRERVPDDCECRNGGRC
LGANTTLCQCPLGFFGLLCEFEITAMPCNMNTQCPDGGYCMEHGGSYLCVCHTDHNASHS
LPSPCDSDPCFNGGSCDAHDDSYTCECPRGFHGKHCEKARPHLCSSGPCRNGGTCKEAGG
EYHCSCPYRFTGRHCEIGKPDSCASGPCHNGGTCFHYIGKYKCDCPPGFSGRHCEIAPSP
CFRSPCVNGGTCEDRDTDFFCHCQAGYMGRRCQAEVDCGPPEEVKHATLRFNGTRLGAVA
LYACDRGYSLSAPSRIRVCQPHGVWSEPPQCLEIDECRSQPCLHGGSCQDRVAGYLCLCS
TGYEGAHCELERDECRAHPCRNGGSCRNLPGAYVCRCPAGFVGVHCETEVDACDSSPCQH
GGRCESGGGAYLCVCPESFFGYHCETVSDPCFSSPCGGRGYCLASNGSHSCTCKVGYTGE
DCAKELFPPTALKMERVEESGVSISWNPPNGPAARQMLDGYAVTYVSSDGSYRRTDFVDR
TRSSHQLQALAAGRAYNISVFSVKRNSNNKNDISRPAVLLARTRPRPVEGFEVTNVTAST
ISVQWALHRIRHATVSGVRVSIRHPEALRDQATDVDRSVDRFTFRALLPGKRYTIQLTTL
SGLRGEEHPTESLATAPTHVWTRPLPPANLTAARVTATSAHVVWDAPTPGSLLEAYVINV
TTSQSTKSRYVPNGKLASYTVRDLLPGRRYQLSVIAVQSTELGPQHSEPAHLYIITSPRD
GADRRWHQGGHHPRVLKNRPPPARLPELRLLNDHSAPETPTQPPRFSELVDGRGRVSARF
GGSPSKAATVRSQPTASAQLENMEEAPKRVSLALQLPEHGSKDIGNVPGNCSENPCQNGG
TCVPGADAHSCDCGPGFKGRRCELACIKVSRPCTRLFSETKAFPVWEGGVCHHVYKRVYR
VHQDICFKESCESTSLKKTPNRKQSKSQTLEKS
动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10)(例如,GenBank登录号Q8IVF4(SEQ ID NO:118)):
>uniprot|Q8IVF4|DYH10_人动力蛋白重链10,纤毛轴的;
MVPEEVEVEIDEIPVLSEEGEEEEETYSQKVESVDKVRAKRVSLRTESLGQPLNREDEEM
DKEISEKLPSKRTAKHIMEKMHLHMLCTPLPEEFLDQNVVFFLRNTKEAISEATDMKEAM
EIMPETLEYGIINANVLHFLKNIICQVFLPALSFNQHRTSTTVGVTSGEVSNSSEHESDL
PPMPGEAVEYHSIQLIRDEFLMNVQKFASNIQRTMQQLEGEIKLEMPIISVEGEVSDLAA
DPETVDILEQCVINWLNQISTAVEAQLKKTPQGKGPLAEIEFWRERNATLSALHEQTKLP
IVRKVLDVIKESDSMLVANLQPVFTELFKFHTEASDNVRFLSTVERYFKNITHGSGFHVV
LDTIPAMMSALRMVWIISRHYNKDERMIPLMERIAWEIAERVCRVVNLRTLFKENRASAQ
SKTLEARNTLRLWKKAYFDTRAKIEASGREDRWEFDRKRLFERTDYMATICQDLSDVLQV
LEEFYNIFGPELKAVTGDPKRIDDVLCRVDGLVTPMENLTFDPFSIKSSQFWKYVMDEFK
IEVLIDIINKIFVQNLENPPLYKNHPPVAGAIYWERSLFFRIKHTILRFQEVQEILDSDR
GQEVKQKYLEVGRTMKEYEDRKYEQWMEVTEQVLPALMKKSLLTKSSIATEEPSTLERGA
VFAINFSPALREIINETKYLEQLGFTVPELARNVALQEDKFLRYTAGIQRMLDHYHMLIG
TLNDAESVLLKDHSQELLRVFRSGYKRLNWNSLGIGDYITGCKQAIGKFESLVHQIHKNA
DDISSRLTLIEAINLFKYPAAKSEEELPGVKEFFEHIERERASDVDHMVRWYLAIGPLLT
KVEGLVVHTNTGKAPKLASYYKYWEKKIYEVLTKLILKNLQSFNSLILGNVPLFHTETIL
TAPEIILHPNTNEIDKMCFHCVRNCVEITKHFVRWMNGSCIECPPQKGEEEEVVIINFYN
DISLNPQIIEQAVMIPQNVHRILINLMKYLQKWKRYRPLWKLDKAIVMEKFAAKKPPCVA
YDEKLQFYSKIAYEVMRHPLIKDEHCIRLQLRHLANTVQENAKSWVISLGKLLNESAKEE
LYNLHEEMEHLAKNLRKIPNTLEDLKFVLATIAEIRSKSLVMELRYRDVQERYRTMAMYN
LFPPDAEKELVDKIESIWSNLFNDSVNVEHALGDIKRTFTELTRGEIMNYRVQIEEFAKR
FYSEGPGSVGDDLDKGVELLGVYERELARHEKSRQELANAEKLFDLPITMYPELLKVQKE
MSGLRMIYELYEGLKVAKEEWSQTLWINLNVQILQEGIEGFLRALRKLPRPVRGLSVTYY
LEAKMKAFKDSIPLLLDLKNEALRDRHWKELMEKTSVFFEMTETFTLENMFAMELHKHTD
VLNEIVTAAIKEVAIEKAVKEILDTWENMKFTVVKYCKGTQERGYILGSVDEIIQSLDDN
TFNLQSISGSRFVGPFLQTVHKWEKTLSLIGEVIEIWMLVQRKWMYLESIFIGGDIRSQL
PEEAKKFDNIDKVFKRIMGETLKDPVIKRCCEAPNRLSDLQNVSEGLEKCQKSLNDYLDS
KRNAFPRFFFISDDELLSILGSSDPLCVQEHMIKMYDNIASLRFNDGDSGEKLVSAMISA
EGEVMEFRKIVRAEGRVEDWMTAVLNEMRRTNRLITKEAIFRYCEDRSRVDWMLLYQGMV
VLAASQVWWTWEVEDVFHKAQKGEKQAMKNYGRKMHRQIDELVTRITMPLSKNDRKKYNT
VLIIDVHARDIVDSFIRGSILEAREFDWESQLRFYWDREPDELNIRQCTGTFGYGYEYMG
LNGRLVITPLTDRIYLTLTQALSMYLGGAPAGPAGTGKTETTKDLAKALGLLCVVTNCGE
GMDYRAVGKIFSGLAQCGAWGCFDEFNRIDASVLSVISSQIQTIRNALIHQLTTFQFEGQ
EISLDSRMGIFITMNPGYAGRTELPESVKALFRPVVVIVPDLQQICEIMLFSEGFLEAKT
LAKKMTVLYKLAREQLSKQYHYDFGLRALKSVLVMAGELKRGSSDLREDVVLMRALRDMN
LPKFVFEDVPLFLGLISDLFPGLDCPRVRYPDFNDAVEQVLEENGYAVLPIQVDKVVQMF
ETMLTRHTTMVVGPTRGGKSVVINTLCQAQTKLGLTTKLYILNPKAVSVIELYGILDPTT
RDWTDGVLSNIFREINKPTDKKERKYILFDGDVDALWVENMNSVMDDNRLLTLANGERIR
LQAHCALLFEVGDLQYASPATVSRCGMVYVDPKNLKYRPYWKKWVNQIPNKVEQYNLNSL
FEKYVPYLMDVIVEGIVDGRQAEKLKTIVPQTDLNMVTQLAKMLDALLEGEIEDLDLLEC
YFLEALYCSLGASLLEDGRMKFDEYIKRLASLSTVDTEGVWANPGELPGQLPTLYDFHFD
NKRNQWVPWSKLVPEYIHAPERKFINILVHTVDTTRTTWILEQMVKIKQPVIFVGESGTS
KTATTQNFLKNLSEETNIVLMVNFSSRTTSMDIQRNLEANVEKRTKDTYGPPMGKRLLVF
MDDMNMPRVDEYGTQQPIALLKLLLEKGYLYDRGKELNCKSIRDLGFIAAMGKAGGGRNE
VDPRFISLFSVFNVPFPSEESLHLIYSSILKGHTSTFHESIVAVSGKLTFCTLALYKNIV
QDLPPTPSKFHYIFNLRDLSRVFNGLVLTNPERFQTVAQMVRVWRNECLRVFHDRLISET
DKQLVQQHIGSLVVEHFKDDVEVVMRDPILFGDFQMALHEGEPRIYEDIQDYEAAKALFQ
EILEEYNESNTKMNLVLFDDALEHLTRVHRIIRMDRGHALLVGVGGSGKQSLSRLAAFTA
SCEVFEILLSRGYSENSFREDLKSLYLKLGIENKAMIFLFTDAHVAEEGFLELINNMLTS
GIVPALFSEEEKESILSQIGQEALKQGMGPAKESVWQYFVNKSANNLHIVLGMSPVGDTL
RTWCRNFPGMVNNTGIDWFMPWPPQALHAVAKSFLGYNPMIPAENIENVVKHVVLVHQSV
DHYSQQFLQKLRRSNYVTPKNYLDFINTYSKLLDEKTQCNIAQCKRLDGGLDKLKEATIQ
LDELNQKLAEQKIVLAEKSAACEALLEEIAVNTAVAEEKKKLAEEKAMEIEEQNKVIAME
KAEAETTLAEVMPILEAAKLELQKLDKSDVTEIRSFAKPPKQVQTVCECILIMKGYKELN
WKTAKGVMSDPNFLRSLMEIDFDSITQSQVKNIKGLLKTLNTTTEEMEAVSKAGLGMLKF
VEAVMGYCDVFREIKPKREKVARLERNFYLTKRELERIQNELAAIQKELETLGAKYEAAI
LEKQKLQEEAEIMERRLIAADKLISGLGSENIRWLNDLDELMHRRVKLLGDCLLCAAFLS
YEGAFTWEFRDEMVNRIWQNDILEREIPLSQPFRLESLLTDDVEISRWGSQGLPPDELSV
QNGILTTRASRFPLCIDPQQQALNWIKRKEEKNNLRVASFNDPDFLKQLEMSIKYGTPFL
FRDVDEYIDPVIDNVLEKNIKVSQGRQFIILGDKEVDYDSNFRLYLNTKLANPRYSPSVF
GKAMVINYTVTLKGLEDQLLSVLVAYERRELEEQREHLIQETSENKNLLKDLEDSLLREL
ATSTGNMLDNVDLVHTLEETKSKATEVSEKLKLAEKTALDIDRLRDGYRPAARRGAILFF
VLSEMALVNSMYQYSLIAFLEVFRLSLKKSLPDSILMKRLRNIMDTLTFSIYNHGCTGLF
ERHKLLFSFNMTIKIEQAEGRVPQEELDFFLKGNISLEKSKRKKPCAWLSDQGWEDIILL
SEMFSDNFGQLPDDVENNQTVWQEWYDLDSLEQFPVPLGYDNNITPFQKLLILRCFRVDR
VYRAVTDYVTVTMGEKYVQPPMISFEAIFEQSTPHSPIVFILSPGSDPATDLMKLAERSG
FGGNRLKFLAMGQGQEKVALQLLETAVARGQWLMLQNCHLLVKWLKDLEKSLERITKPHP
DFRLWLTTDPTKGFPIGILQKSLKVVTEPPNGLKLNMRATYFKISHEMLDQCPHPAFKPL
VYVLAFFHAVVQERRKFGKIGWNVYYDFNESDFQVCMEILNTYLTKAFQQRDPRIPWGSL
KYLIGEVMYGGRAIDSFDRRILTIYMDEYLGDFIFDTFQPFHFFRNKEVDYKIPVGDEKE
KFVEAIEALPLANTPEVFGLHPNAEIGYYTQAARDMWAHLLELQPQTGESSSGISRDDYI
GQVAKEIENKMPKVFDLDQVRKRLGTGLSPTSVVLLQELERFNKLVVRMTKSLAELQRAL
AGEVGMSNELDDVARSLFIGHIPNIWRRLAPDTLKSLGNWMVYFLRRFSQYMLWVTESEP
SVMWLSGLHIPESYLTALVQATCRKNGWPLDRSTLFTQVTKFQDADEVNERAGQGCFVSG
LYLEGADWDIEKGCLIKSKPKVLVVDLPILKIIPIEAHRLKLQNTFRTPVYTTSMRRNAM
GVGLVFEADLFTTRHISHWVLQGVCLTLNSD
间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43)(例如,GenBank登录号P17302(SEQ ID NO:119)):
>uniprot|P17302|CXA1_人间隙连接α-1蛋白;
MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG
CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLNKKEEELKVAQTDG
VNVDMHLKQIEIKKFKYGIEEHGKVKMRGGLLRTYIISILFKSIFEVAFLLIQWYIYGFS
LSAVYTCKRDPCPHQVDCFLSRPTEKTIFIIFMLVVSLVSLALNIIELFYVFFKGVKDRV
KGKSDPYHATSGALSPAKDCGSQKYAYFNGCSSPTAPLSPMSPPGYKLVTGDRNNSSCRN
YNKQASEQNWANYSAEQNRMGQAGSTISNSHAQPFDFPDDNQNSKKLAAGHELQPLAIVD
QRPSSRASSRASSRPRPDDLEI
驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1(例如,GenBank登录号Q5SZU8(SEQ ID NO:120)):
>uniprot|Q5SZU8|Q5SZU8_人驱动蛋白家族成员25;
CRAVGSASKLMELVHGGLQLRAKHPTLVHADSSRSHLIITVTLTTASCSDSTADQACSAT
LPREQTEAGRAGRSRRASQGALAPQLVPGNPAGHAEQVQARLQLVDSAGSECVGGDAKLL
VILCISPSQRHLAQTLQGLGFGIRARQVQRGPARKKPPSSQTEGKRRPD
GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶(例如,GenBank登录号P04406(SEQ ID NO:121)):
>uniprot|P04406|G3P_人甘油醛-3-磷酸脱氢酶;
MGKVKVGVNGFGRIGRLVTRAAFNSGKVDIVAINDPFIDLNYMVYMFQYDSTHGKFHGTV
KAENGKLVINGNPITIFQERDPSKIKWGDAGAEYVVESTGVFTTMEKAGAHLQGGAKRVI
ISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIISNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHA
ITATQKTVDGPSGKLWRDGRGALQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTANV
SVVDLTCRLEKPAKYDDIKKVVKQASEGPLKGILGYTEHQVVSSDFNSDTHSSTFDAGAG
IALNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMAHMASKE
未表征的蛋白ALB(例如,GenBank登录号P02768(SEQ ID NO:122)):
>uniprot|P02768|ALBU_人血清白蛋白;
MKWVTFISLLFLFSSAYSRGVFRRDAHKSEVAHRFKDLGEENFKALVLIAFAQYLQQCPF
EDHVKLVNEVTEFAKTCVADESAENCDKSLHTLFGDKLCTVATLRETYGEMADCCAKQEP
ERNECFLQHKDDNPNLPRLVRPEVDVMCTAFHDNEETFLKKYLYEIARRHPYFYAPELLF
FAKRYKAAFTECCQAADKAACLLPKLDELRDEGKASSAKQRLKCASLQKFGERAFKAWAV
ARLSQRFPKAEFAEVSKLVTDLTKVHTECCHGDLLECADDRADLAKYICENQDSISSKLK
ECCEKPLLEKSHCIAEVENDEMPADLPSLAADFVESKDVCKNYAEAKDVFLGMFLYEYAR
RHPDYSVVLLLRLAKTYETTLEKCCAAADPHECYAKVFDEFKPLVEEPQNLIKQNCELFE
QLGEYKFQNALLVRYTKKVPQVSTPTLVEVSRNLGKVGSKCCKHPEAKRMPCAEDYLSVV
LNQLCVLHEKTPVSDRVTKCCTESLVNRRPCFSALEVDETYVPKEFNAETFTFHADICTL
SEKERQIKKQTALVELVKHKPKATKEQLKAVMDDFAAFVEKCCKADDKETCFAEEGKKLV
AASQAALGL
半乳糖凝集素-3,LGALS3(例如,GenBank登录号NP_002297(SEQ ID NO:123)):
>refseqp|NP_002297|NP_002297半乳糖凝集素3[智人]
MADNFSLHDALSGSGNPNPQGWPGAWGNQPAGAGGYPGASYPGAYPGQAPPGAYPGQAPP
GAYPGAPGAYPGAPAPGVYPGPPSGPGAYPSSGQPSATGAYPATGPYGAPAGPLIVPYNL
PLPGGVVPRMLITILGTVKPNANRIALDFQRGNDVAFHFNPRFNENNRRVIVCNTKLDNN
WGREERQSVFPFESGKPFKIQVLVEPDHFKVAVNDAHLLQYNHRVKKLNEISKLGISGDI
DLTSASYTMI
与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的(例如,GenBank登录号O15069(SEQ ID NO:124)):
>uniprot|O15069|NACAD_ 人含有NAC-α结构域的蛋白1;
MPGEAARAELLLPEADRPGPRTDLSCDAAAATTILGGDRREPCALTPGPSHLALTFLPSK
PGARPQPEGASWDAGPGGAPSAWADPGEGGPSPMLLPEGLSSQALSTEAPLPATLEPRIV
MGEETCQALLSPRAARTALRDQEGGHASPDPPPELCSQGDLSVPSPPPDPDSFFTPPSTP
TKTTYALLPACGPHGDARDSEAELRDELLDSPPASPSGSYITADGDSWASSPSCSLSLLA
PAEGLDFPSGWGLSPQGSMVDERELHPAGTPEPPSSESSLSADSSSSWGQEGHFFDLDFL
ANDPMIPAALLPFQGSLIFQVEAVEVTPLSPEEEEEEAVADPDPGGDLAGEGEEDSTSAS
FLQSLSDLSITEGMDEAFAFRDDTSAASSDSDSASYAEADDERLYSGEPHAQATLLQDSV
QKTEEESGGGAKGLQAQDGTVSWAVEAAPQTSDRGAYLSQRQELISEVTEEGLALGQEST
ATVTPHTLQVAPGLQVEVATRVTPQAGEEETDSTAGQESAAMAMPQPSQEGISEILGQES
VTAEKLPTPQEETSLTLCPDSPQNLKEEGGLDLPSGRKPVAAATIVPRQAKEDLTLPQDS
AMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATIVSQQAEEGLTLPQDSVMTPPLPLQDTELSSAPKPV
AAATLVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATLVSQQAEEGLTLPQDS
AMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATLVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPV
AAATIVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATIVSQQAEEGLTLPQDS
AMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATPVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPV
AAATPVSQQAEEGLTLPQDSAMTAPLPLQDTGPTSGPEPLAVATPQTLQAEAGCAPGTEP
VATMAQQEVGEALGPRPAPEEKNAALPTVPEPAALDQVQQDDPQPAAEAGTPWAAQEDAD
STLGMEALSLPEPASGAGEEIAEALSRPGREACLEARAHTGDGAKPDSPQKETLEVENQQ
EGGLKLLAQEHGPRSALGGAREVPDAPPAACPEVSQARLLSPAREERGLSGKSTPEPTLP
SAVATEASLDSCPESSVGAVSSLDRGCPDAPAPTSAPTSQQPEPVLGLGSVEQPHEVPSV
LGTPLLQPPENLAKGQPSTPVDRPLGPDPSAPGTLAGAALPPLEPPAPCLCQDPQEDSVE
DEEPPGSLGLPPPQAGVQPAAAAVSGTTQPLGTGPRVSLSPHSPLLSPKVASMDAKDLAL
QILPPCQVPPPSGPQSPAGPQGLSAPEQQEDEDSLEEDSPRALGSGQHSDSHGESSAELD
EQDILAPQTVQCPAQAPAGGSEETIAKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQIQGVTRITIQKS
KNILFVIAKPDVFKSPASDTYVVFGEAKIEDLSQQVHKAAAEKFKVPSEPSALVPESAPR
PRVRLECKEEEEEEEEEVDEAGLELRDIELVMAQANVSRAKAVRALRDNHSDIVNAIMEL
TM
线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1(例如,GenBank登录号NP_000010(SEQ ID NO:125)):
>refseqp|NP_000010|NP_000010乙酰辅酶A乙酰转移酶1前体[智人]
MAVLAALLRSGARSRSPLLRRLVQEIRYVERSYVSKPTLKEVVIVSATRTPIGSFLGSLS
LLPATKLGSIAIQGAIEKAGIPKEEVKEAYMGNVLQGGEGQAPTRQAVLGAGLPISTPCT
TINKVCASGMKAIMMASQSLMCGHQDVMVAGGMESMSNVPYVMNRGSTPYGGVKLEDLIV
KDGLTDVYNKIHMGSCAENTAKKLNIARNEQDAYAINSYTRSKAAWEAGKFGNEVIPVTV
TVKGQPDVVVKEDEEYKRVDFSKVPKLKTVFQKENGTVTAANASTLNDGAAALVLMTADA
AKRLNVTPLARIVAFADAAVEPIDFPIAPVYAASMVLKDVGLKKEDIAMWEVNEAFSLVV
LANIKMLEIDPQKVNINGGAVSLGHPIGMSGARIVGHLTHALKQGEYGLASICNGGGGAS
AMLIQKL
KH型剪接调控蛋白,FUBP2(例如,GenBank登录号NP_003676(SEQ ID NO:126)):
>refseqp|NP_003676|NP_003676KH-型剪接调节蛋白(FUSE结合蛋白2)[智人]
MSDYSTGGPPPGPPPPAGGGGGAGGAGGGPPPGPPGAGDRGGGGPGGGGPGGGSAGGPSQ
PPGGGGPGIRKDAFADAVQRARQIAAKIGGDAATTVNNSTPDFGFGGQKRQLEDGDQPES
KKLASQGDSISSQLGPIHPPPRTSMTEEYRVPDGMVGLIIGRGGEQINKIQQDSGCKVQI
SPDSGGLPERSVSLTGAPESVQKAKMMLDDIVSRGRGGPPGQFHDNANGGQNGTVQEIMI
PAGKAGLVIGKGGETIKQLQERAGVKMILIQDGSQNTNVDKPLRIIGDPYKVQQACEMVM
DILRERDQGGFGDRNEYGSRIGGGIDVPVPRHSVGVVIGRSGEMIKKIQNDAGVRIQFKQ
DDGTGPEKIAHIMGPPDRCEHAARIINDLLQSLRSGPPGPPGGPGMPPGGRGRGRGQGNW
GPPGGEMTFSIPTHKCGLVIGRGGENVKAINQQTGAFVEISRQLPPNGDPNFKLFIIRGS
PQQIDHAKQLIEEKIEGPLCPVGPGPGGPGPAGPMGPFNPGPFNQGPPGAPPHAGGPPPH
QYPPQGWGNTYPQWQPPAPHDPSKAAAAAADPNAAWAAYYSHYYQQPPGPVPGPAPAPAA
PPAQGEPPQPPPTGQSDYTKAWEEYYKKIGQQPQQPGAPPQQDYTKAWEEYYKKQAQVAT
GGGPGAPPGSQPDYSAAWAEYYRQQAAYYGQTPGPGGPQPPPTQQGQQQAQ
Profilin 1(PFN1)(例如,GenBank登录号NP_005013(SEQ ID NO:127)):
>refseqp|NP_005013|NP_005013 profilin 1[智人]
MAGWNAYIDNLMADGTCQDAAIVGYKDSPSVWAAVPGKTFVNITPAEVGVLVGKDRSSFY
VNGLTLGGQKCSVIRDSLLQDGEFSMDLRTKSTGGAPTFNVTVTKTDKTLVLLMGKEGVH
GGLINKKCYEMASHLRRSQY
细胞内氯通道蛋白1,CLIC1(例如,GenBank登录号NP_001279(SEQ ID NO:128)):
>refseqp|NP_001279|NP_001279细胞内氯通道蛋白1[智人]
MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCP
GGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAALNPESNTAGLDIFAKFSAYIKN
SNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLTSPLPEEVDETSAEDEGVSQRKFLDGNELTLADCNL
LPKLHIVQVVCKKYRGFTIPEAFRGVHRYLSNAYAREEFASTCPDDEEIELAYEQVAKAL
K
锌指蛋白831(例如,GenBank登录号NP_848552(SEQ ID NO:129)):
>refseqp|NP_848552|NP_848552锌指蛋白831[智人]
MEVPEPTCPAPPARDQPAPTPGPPGAPGGQASPHLTLGPVLLPPEQGLAPPTVFLKALPI
PLYHTVPPGGLQPRAPLVTGSLDGGNVPFILSPVLQPEGPGPTQVGKPAAPTLTVNIVGT
LPVLSPGLGPTLGSPGKVRNAGKYLCPHCGRDCLKPSVLEKHIRSHTGERPFPCATCGIA
FKTQSNLYKHRRTQTHLNNSRLSSESEGAGGGLLEEGDKAGEPPRPEGRGESRCQGMHEG
ASERPLSPGAHVPLLAKNLDVRTEAAPCPGSAFADREAPWDSAPMASPGLPAASTQPWRK
LPEQKSPTAGKPCALQRQQATAAEKPWDAKAPEGRLRKCESTDSGYLSRSDSAEQPHAPC
SPLHSLSEHSAESEGEGGPGPGPGVAGAEPGAREAGLELEKKRLEERIAQLISHNQAVVD
DAQLDNVRPRKTGLSKQGSIDLPTPYTYKDSFHFDIRALEPGRRRAPGPVRSTWTPPDKS
RPLFFHSVPTQLSTTVECVPVTRSNSLPFVEGSRTWLEPREPRDPWSRTQKPLSPRPGPA
RLGCRSGLSSTDVPSGHPRALVRQAAVEDLPGTPIGDALVPAEDTDAKRTAAREAMAGKG
RAGGRKCGQRRLKMFSQEKWQVYGDETFKRIYQKMKASPHGGKKAREVGMGSGAELGFPL
QKEAAGSSGTVPTQDRRTPVHEDISAGATPEPWGNPPALEASLVTEPTKHGETVARRGDS
DRPRVEEAVSSPALGGRDSPCSGSRSPLVSPNGRLELGWQMPPAPGPLKGGDVEAPRPVW
PDPKLEGGARGVGDVQETCLWAQTVLRWPSRGSGEDKLPSERKKLKVEDLHSWKQPEPVS
AETPGGPTQPASLSSQKQDADPGEVPGGSKESARQVGEPLESSGASLAAASVALKRVGPR
DKATPLHPAAPAPAEHPSLATPPQAPRVLSALADNAFSPKYLLRLPQAETPLPLPIPWGP
RHSQDSLCSSGWPEERASFVGSGLGTPLSPSPASGPSPGEADSILEDPSCSRPQDGRKGA
QLGGDKGDRMATSRPAARELPISAPGAPREATSSPPTPTCEAHLVQDMEGDSHRIHRLCM
GSTLARARLSGDVLNPWVPNWELGEPPGNAPEDPSSGPLVGPDPCSPLQPGSFLTALTRP
QGVPPGWPELALSSHSGTSRSHSTRSPHSTQNPFPSLKAEPRLTWCCLSRSVPLPAEQKA
KAASVYLAVHFPGSSLRDEGPNGPPGSNGGWTWTSPGEGGPAQMSKFSYPTVPGVMPQHQ
VSEPEWKKGLPWRAKMSRGNSKQRKLKINPKRYKGNFLQSCVQLRASRLRTPTWVRRRSR
HPPALEGLKPCRTPGQTSSEIAGLNLQEEPSCATSESPPCCGKEEKKEGDCRQTLGTLSL
GTSSRIVREMDKRTVKDISPSAGEHGDCTTHSTAATSGLSLQSDTCLAVVNDVPLPPGKG
LDLGLLETQLLASQDSVSTDPKPYIFSDAQRPSSFGSKGTFPHHDIATSVAAVCISLPVR
TDHIAQEIHSAESRDHSQTAGRTLTSSSPDSKVTEEGRAQTLLPGRPSSGQRISDSVPLE
STEKTHLEIPASGPSSASSHHKEGRHKTFFPSRGQYGCGEMTVPCPSLGSDGRKRQVSGL
ITRKDSVVPSKPEQPIEIPEAPSKSLKKRSLEGMRKQTRVEFSDTSSDDEDRLVIEI
内质蛋白(例如,GenBank登录号NP_003290(SEQ ID NO:130)):
>refseqp|NP_003290|NP_003290热休克蛋白90kDaβ,成员1[智人]
MRALWVLGLCCVLLTFGSVRADDEVDVDGTVEEDLGKSREGSRTDDEVVQREEEAIQLDG
LNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISL
TDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGVGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTE
AQEDGQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSVIADPRGNT
LGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPMEEEEAAK
EEKEESDDEAAVEEEEEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYK
SFSKESDDPMAYIHFTAEGEVTFKSILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITD
DFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKY
NDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYF
MAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDE
SEKTKESREAVEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMER
IMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFET
ATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDEDE
EMDVGTDEEEETAKESTAEKDEL
核糖体蛋白S10(RPS10)(例如,GenBank登录号P46783(SEQ ID NO:131)):
>uniprot|P46783|RS10_人40S核糖体蛋白S10;
MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKE
QFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETGRPRPKGLEGERPARLTRG
EADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ
剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3(例如,GenBank登录号NP_003008(SEQ ID NO:132)):
>refseqp|NP_003008|NP_003008剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3[智人]
MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAA
DAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRSPRRRS
FSRSRSRSLSRDRRRERSLSRERNHKPSRSFSRSRSRSRSNERK
ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌)(例如,GenBank登录号P62736(SEQ ID NO:133)):
>uniprot|P62736|ACTA_人肌动蛋白,主动脉平滑肌的;
MCEEEDSTALVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEA
QSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHSFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREK
MTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRL
DLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEK
SYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNV
LSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWIS
KQEYDEAGPSIVHRKCF
钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A(例如,GenBank登录号NP_055006 SEQ ID NO:134)):
>refseqp|NP_055006|NP_055006钠通道,电压门控的,VIII型,α[智人]
MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE
AGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNL
IRRIAIKILIHSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIAR
GFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYITEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWPINFNESYLENGTKGF
DWEEYINNKTNFYTVPGMLEPLLCGNSSDAGQCPEGYQCMKAGRNPNYGYTSFDTFSWAF
LALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFVGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQA
TLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSAGTVSEDAIEEEGEEGGGSPRSSSEI
SKLSSKSAKERRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSESEDGMRRKAFRLPDNRIGRKF
SIMNQSLLSIPGSPFLSRHNSKSSIFSFRGPGRFRDPGSENEFADDEHSTVEESEGRRDS
LFIPIRARERRSSYSGYSGYSQGSRSSRIFPSLRRSVKRNSTVDCNGVVSLIGGPGSHIG
GRLLPEATTEVEIKKKGPGSLLVSMDQLASYGRKDRINSIMSVVTNTLVEELEESQRKCP
PCWYKFANTFLIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHHPMTPQ
FEHVLAVGNLVFTGIFTAEMFLKLIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLMELSLADVEGL
SVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKS
YKECVCKINQDCELPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVFMMV
MVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDDDGEMNNLQISVIRIKKGVAWTKLKVHAFMQ
AHFKQREADEVKPLDELYEKKANCIANHTGADIHRNGDFQKNGNGTTSGIGSSVEKYIID
EDHMSFINNPNLTVRVPIAVGESDFENLNTEDVSSESDPEGSKDKLDDTSSSEGSTIDIK
PEVEEVPVEQPEEYLDPDACFTEGCVQRFKCCQVNIEEGLGKSWWILRKTCFLIVEHNWF
ETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRTILEYADKVFTYIFILEMLLKWTAYGFVKFF
TNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNAL
VGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKYHYCFNETSEIRFEIEDVNNKTECEKLM
EGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRKPDEQPKYEDNIYM
YIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKP
QKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMMLICLNMVTMMVETDTQSKQMENILYWINLV
FVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIR
LARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEA
GIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILNRPPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPS
VGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDAT
QFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIELIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGDSG
ELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICKKT
TSNKLENGGTHREKKESTPSTASLPSYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC
半乳糖凝集素-9的长同种型(例如,GenBank登录号NP_033665SEQ ID NO:135)):
>refseqp|NP_033665|NP_033665半乳糖凝集素-9的长同种型[智人]
MAFSGSQAPYLSPAVPFSGTIQGGLQDGLQITVNGTVLSSSGTRFAVNFQTGFSGNDIAF
HFNPRFEDGGYVVCNTRQNGSWGPEERKTHMPFQKGMPFDLCFLVQSSDFKVMVNGILFV
QYFHRVPFHRVDTISVNGSVQLSYISFQNPRTVPVQPAFSTVPFSQPVCFPPRPRGRRQK
PPGVWPANPAPITQTVIHTVQSAPGQMFSTPAIPPMMYPHPAYPMPFITTILGGLYPSKS
ILLSGTVLPSAQRFHINLCSGNHIAFHLNPRFDENAVVRNTQIDNSWGSEERSLPRKMPF
VRGQSFSVWILCEAHCLKVAVDGQHLFEYYHRLRNLPTINRLEVGGDIQLTHVQT
T-复合蛋白1亚基ε,CCT5(例如,GenBank登录号NP_036205(SEQ ID NO:136)):
>refseqp|NP_036205|NP_036205含有伴侣蛋白的TCP1,亚基5(ε)[智人]
MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKM
MVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEA
EQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNS
CHRQMAEIAVNAVLTVADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMP
KKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLA
ICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQ
EISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVY
GGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRAR
QVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESE
E
肺特异性的α-烯醇酶(例如,GenBank登录号CAA47179(SEQ ID NO:137)):
MSILKIIHARDIFESRGNPTVEVDLYTNKGGLFGRAAVPSGASTG
IYEALLELRDNDKTRYMGGKGVSKAVEHIINKTIAPALISKNVNVVEQDKIDNLMLDMD
GSENKSKFGANAILGVSLAVCSNAGATAEKGVPLYRHIADLAGNNPEVILPVPAFNVIN
GGSHAGNKLAMQEFMIPPCGADRFNDAIRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGF
APNILENKEALELLKTAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFYRDGKYDLDFNSPDDPSRYIS
PDQLADLYKGFVLGHAVKNYPVGVSIEDPPFDQDDWGAWKKLFTGSLVGIQVVGDDLTV
TKPEARIAKAVEEVKACNCLLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSNGWGVMPVSHRLSGET
EDTFMADLVVGLCTGQIKTGPTCRSERLAKYNQLLRIEEAEAGSKARFAGRNFRNPRIN
原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS(例如,GenBank登录号NP_005363(SEQ ID NO:138)):
>refseqp|NP_005363|NP_005363v-mos莫洛尼氏小鼠肉瘤病毒癌基因同源物[智人]
MPSPLALRPYLRSEFSPSVDARPCSSPSELPAKLLLGATLPRAPRLPRRLAWCSIDWEQV
CLLQRLGAGGFGSVYKATYRGVPVAIKQVNKCTKNRLASRRSFWAELNVARLRHDNIVRV
VAASTRTPAGSNSLGTIIMEFGGNVTLHQVIYGAAGHPEGDAGEPHCRTGGQLSLGKCLK
YSLDVVNGLLFLHSQSIVHLDLKPANILISEQDVCKISDFGCSEKLEDLLCFQTPSYPLG
GTYTHRAPELLKGEGVTPKADIYSFAITLWQMTTKQAPYSGERQHILYAVVAYDLRPSLS
AAVFEDSLPGQRLGDVIQRCWRPSAAQRPSARLLLVDLTSLKAELG
β-内收蛋白(ADD2)的同种型1(例如,GenBank登录号NP_001608(SEQ ID NO:139)):
>refseqp|NP_001608|NP_001608内收蛋白2同种型a[智人]
MSEETVPEAASPPPPQGQPYFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTMILQS
PSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNVSMMTPINDLHT
ADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVSCSEV
TASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHLHTPATAAVSAMK
WGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALGDTVE
EAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKHRPHEVGSVQWAGSTFGPMQKSRL
GEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPFVQEKTKHKSEVEIPATVTAFVFEEDGAPVPALR
QHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMKADEVEKSSSGMPIRIE
NPNQFVPLYTDPQEVLEMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSPSTESQLMSK
GDEDTKDDSEETVPNPFSQLTDQELEEYKKEVERKKLELDGEKETAPEEPGSPAKSAPAS
PVQSPAKEAETKSPLVSPSKSLEEGTKKTETSKAATTEPETTQPEGVVVNGREEEQTAEE
ILSKGLSQMTTSADTDVDTSKDKTESVTSGPMSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKSKK
KEKVES
载脂蛋白E(APOE)(例如,GenBank登录号NP_000032SEQ ID NO:140)):
>refseqp|NP_000032|NP_000032载脂蛋白E前体[智人]
MKVLWAALLVTFLAGCQAKVEQAVETEPEPELRQQTEWQSGQRWELALGRFWDYLRWVQT
LSEQVQEELLSSQVTQELRALMDETMKELKAYKSELEEQLTPVAEETRARLSKELQAAQA
RLGADMEDVCGRLVQYRGEVQAMLGQSTEELRVRLASHLRKLRKRLLRDADDLQKRLAVY
QAGAREGAERGLSAIRERLGPLVEQGRVRAATVGSLAGQPLQERAQAWGERLRARMEEMG
SRTRDRLDEVKEQVAEVRAKLEEQAQQIRLQAEAFQARLKSWFEPLVEDMQRQWAGLVEK
VQAAVGTSAAPVPSDNH
泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白)(例如,GenBank登录号NP_064516(SEQ ID NO:141)):
>refseqp|NP_064516|NP_064516ataxin-1泛素样相互作用蛋白[智人]
MAEPSGAETRPPIRVTVKTPKDKEEIVICDRASVKEFKEEISRRFKAQQDQLVLIFAGKI
LKDGDTLNQHGIKDGLTVHLVIKTPQKAQDPAAATASSPSTPDPASAPSTTPASPATPAQ
PSTSGSASSDAGSGSRRSSGGGPSPGAGEGSPSATASILSGFGGILGLGSLGLGSANFME
LQQQMQRQLMSNPEMLSQIMENPLVQDMMSNPDLMRHMIMANPQMQQLMERNPEISHMLN
NPELMRQTMELARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMFSAAREQ
FGNNPFSSLAGNSDSSSSQPLRTENREPLPNPWSPSPPTSQAPGSGGEGTGGSGTSQVHP
TVSNPFGINAASLGSGMFNSPEMQALLQQISENPQLMQNVISAPYMRSMMQTLAQNPDFA
AQMMVNVPLFAGNPQLQEQLRLQLPVFLQQMQNPESLSILTNPRAMQALLQIQQGLQTLQ
TEAPGLVPSLGSFGISRTPAPSAGSNAGSTPEAPTSSPATPATSSPTGASSAQQQLMQQM
IQLLAGSGNSQVQTPEVRFQQQLEQLNSMGFINREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQL
S
Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物)(例如,GenBank登录号NP_003336(SEQ ID NO:142)):
>refseqp|NP_003336|NP_003336泛素-缀合酶E2I[智人]
MSGIALSRLAQERKAWRKDHPFGFVAVPTKNPDGTMNLMNWECAIPGKKGTPWEGGLFKL
RMLFKDDYPSSPPKCKFEPPLFHPNVYPSGTVCLSILEEDKDWRPAITIKQILLGIQELL
NEPNIQDPAQAEAYTIYCQNRVEYEKRVRAQAKKFAPS
肌球蛋白-15(MYH15)(例如,GenBank登录号NP_055796(SEQ ID NO:143)):
>refseqp|NP_055796|NP_055796肌球蛋白,重多肽15[智人]
MVESCLLTFRAFFWWIALIKMDLSDLGEAAAFLRRSEAELLLLQATALDGKKKCWIPDGE
NAYIEAEVKGSEDDGTVIVETADGESLSIKEDKIQQMNPPEFEMIEDMAMLTHLNEASVL
HTLKRRYGQWMIYTYSGLFCVTINPYKWLPVYQKEVMAAYKGKRRSEAPPHIFAVANNAF
QDMLHNRENQSILFTGESGAGKTVNSKHIIQYFATIAAMIESRKKQGALEDQIMQANTIL
EAFGNAKTLRNDNSSRFGKFIRMHFGARGMLSSVDIDIYLLEKSRVIFQQAGERNYHIFY
QILSGQKELHDLLLVSANPSDFHFCSCGAVTVESLDDAEELLATEQAMDILGFLPDEKYG
CYKLTGAIMHFGNMKFKQKPREEQLEADGTENADKAAFLMGINSSELVKCLIHPRIKVGN
EYVTRGQTIEQVTCAVGALSKSMYERMFKWLVARINRALDAKLSRQFFIGILDITGFEIL
EYNSLEQLCINFTNEKLQQFFNWHMFVLEQEEYKKESIEWVSIGFGLDLQACIDLIEKPM
GILSILEEECMFPKATDLTFKTKLFDNHFGKSVHLQKPKPDKKKFEAHFELVHYAGVVPY
NISGWLEKNKDLLNETVVAVFQKSSNRLLASLFENYMSTDSAIPFGEKKRKKGASFQTVA
SLHKENLNKLMTNLKSTAPHFVRCINPNVNKIPGILDPYLVLQQLRCNGVLEGTRICREG
FPNRLQYADFKQRYCILNPRTFPKSKFVSSRKAAEELLGSLEIDHTQYRFGITKVFFKAG
FLGQLEAIRDERLSKVFTLFQARAQGKLMRIKFQKILEERDALILIQWNIRAFMAVKNWP
WMRLFFKIKPLVKSSEVGEEVAGLKEECAQLQKALEKSEFQREELKAKQVSLTQEKNDLI
LQLQAEQETLANVEEQCEWLIKSKIQLEARVKELSERVEEEEEINSELTARGRKLEDECF
ELKKEIDDLETMLVKSEKEKRTTEHKVKNLTEEVEFLNEDISKLNRAAKVVQEAHQQTLD
DLHMEEEKLSSLSKANLKLEQQVDELEGALEQERKARMNCERELHKLEGNLKLNRESMEN
LESSQRHLAEELRKKELELSQMNSKVENEKGLVAQLQKTVKELQTQIKDLKEKLEAERTT
RAKMERERADLTQDLADLNERLEEVGGSSLAQLEITKKQETKFQKLHRDMEEATLHFETT
SASLKKRHADSLAELEGQVENLQQVKQKLEKDKSDLQLEVDDLLTRVEQMTRAKANAEKL
CTLYEERLHEATAKLDKVTQLANDLAAQKTKLWSESGEFLRRLEEKEALINQLSREKSNF
TRQIEDLRGQLEKETKSQSALAHALQKAQRDCDLLREQYEEEQEVKAELHRTLSKVNAEM
VQWRMKYENNVIQRTEDLEDAKKELAIRLQEAAEAMGVANARNASLERARHQLQLELGDA
LSDLGKVRSAAARLDQKQLQSGKALADWKQKHEESQALLDASQKEVQALSTELLKLKNTY
EESIVGQETLRRENKNLQEEISNLTNQVREGTKNLTEMEKVKKLIEEEKTEVQVTLEETE
GALERNESKILHFQLELLEAKAELERKLSEKDEEIENFRRKQQCTIDSLQSSLDSEAKSR
IEVTRLKKKMEEDLNEMELQLSCANRQVSEATKSLGQLQIQIKDLQMQLDDSTQLNSDLK
EQVAVAERRNSLLQSELEDLRSLQEQTERGRRLSEEELLEATERINLFYTQNTSLLSQKK
KLEADVARMQKEAEEVVQECQNAEEKAKKAAIEAANLSEELKKKQDTIAHLERTRENMEQ
TITDLQKRLAEAEQMALMGSRKQIQKLESRVRELEGELEGEIRRSAEAQRGARRLERCIK
ELTYQAEEDKKNLSRMQTQMDKLQLKVQNYKQQVEVAETQANQYLSKYKKQQHELNEVKE
RAEVAESQVNKLKIKAREFGKKVQEE
FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK)(例如,GenBank登录号NP_057392(SEQ ID NO:144)):
refseqp|NP_057392|NP_057392UMP-CMP激酶1同种型a[智人]
MLSRCRSGLLHVLGLSFLLQTRRPILLCSPRLMKPLVVFVLGGPGAGKGTQCARIVEKYG
YTHLSAGELLRDERKNPDSQYGELIEKYIKEGKIVPVEITISLLKREMDQTMAANAQKNK
FLIDGFPRNQDNLQGWNKTMDGKADVSFVLFFDCNNEICIERCLERGKSSGRSDDNRESL
EKRIQTYLQSTKPIIDLYEEMGKVKKIDASKSVDEVFDEVVQIFDKEG
Intelectin-1(ITLN1)(例如,GenBank登录号NP_060095(SEQ ID NO:145)):
>refseqp|NP_060095|NP_060095intelectin [智人]
MNQLSFLLFLIATTRGWSTDEANTYFKEWTCSSSPSLPRSCKEIKDECPSAFDGLYFLRT
ENGVIYQTFCDMTSGGGGWTLVASVHENDMRGKCTVGDRWSSQQGSKAVYPEGDGNWANY
NTFGSAEAATSDDYKNPGYYDIQAKDLGIWHVPNKSPMQHWRNSSLLRYRTDTGFLQTLG
HNLFGIYQKYPVKYGEGKCWTDNGPVIPVVYDFGDAQKTASYYSPYGQREFTAGFVQFRV
FNNERAANALCAGMRVTGCNTEHHCIGGGGYFPEASPQQCGDFSGFDWSGYGTHVGYSSS
REITEAAVLLFYR
载脂蛋白A-IV(APOA4)(例如,GenBank登录号Q13784(SEQ ID NO:146)):
>uniprot|Q13784|Q13784_人APOA4蛋白;
LEPYADQLRTQVNTQAEQLRRQLDPLAQRMERVLRENADSLQASLRPHADELKAKIDQNV
EELKGRLTPYADEFKVKIDQTVEELRRSLAPYAQDTQEKLNHQLEGLTFQMKKNAEELKA
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NKALVQQMEQLRQKLGPHAGDVEGHLSFLEKDLRDKVNSFFSTFKEKESQDKTLSLPELE
QQQE
线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1)(例如,GenBank登录号P08559(SEQ ID NO:147)):
>uniprot|P08559|ODPA_人丙酮酸脱氢酶E1成分亚基α,体细胞形式,线粒体的;
MRKMLAAVSRVLSGASQKPASRVLVASRNFANDATFEIKKCDLHRLEEGPPVTTVLTRED
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LEELGYHIYSSDPPFEVRGANQWIKFKSVS
含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59)(例如,GenBank登录号NP_060979(SEQ ID NO:148)):
>refseqp|NP_060979|NP_060979富含亮氨酸重复序列的59[智人]
MTKAGSKGGNLRDKLDGNELDLSLSDLNEVPVKELAALPKATILDLSCNKLTTLPSDFCG
LTHLVKLDLSKNKLQQLPADFGRLVNLQHLDLLNNKLVTLPVSFAQLKNLKWLDLKDNPL
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LQTDSQQ
60S核糖体蛋白L37A(RPL37A)(例如,GenBank登录号NP_000989(SEQ ID NO:149)):
>refseqp|NP_000989|NP_000989ribosomal核糖体蛋白L37a[智人]
MAKRTKKVGIVGKYGTRYGASLRKMVKKIEISQHAKYTCSFCGKTKMKRRAVGIWHCGSC
MKTVAGGAWTYNTTSAVTVKSAIRRLKELKDQ
尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1)(例如,GenBank登录号Q53HM1(SEQ ID NO:150)):
>uniprot|Q53HM1|Q53HM1_人尿苷激酶;
MAAPPARADADPSPTSPPTARDTPGRQAEKSETACEDRSNAESLDRLLPPVGTGRSPRKR
TTSQCKSEPPLLRTSKRTIYTAGRPPWYNEHGTQSKEAFAIGLGGGSASGKTTVARMIIE
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LLSLLMAEMGVHSVAYAFPRVRIITTAVDKRVNDLFRIIPGIGNFGDRYFGTDAVPDGSD
EEEVAYTG
醛脱氢酶9A1(ALDH9A1)(例如,GenBank登录号NP_000687(SEQ ID NO:151)):
>refseqp|NP_000687|NP_000687醛脱氢酶9A1[智人]
MFLRAGLAALSPLLRSLRPSPVAAMSTGTFVVSQPLNYRGGARVEPADASGTEKAFEPAT
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细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1)(例如,GenBank登录号Q16881(SEQ ID NO:152)):
>uniprot|Q16881|TRXR1_人细胞质的硫氧还蛋白还原酶;
MGCAEGKAVAAAAPTELQTKGKNGDGRRRSAKDHHPGKTLPENPAGFTSTATADSRALLQ
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GFAAALKCGLTKKQLDSTIGIHPVCAEVFTTLSVTKRSGASILQAGCUG
核受体亚家族2组E成员1(NR2E1)(例如,GenBank登录号NP_003260(SEQ ID NO:153)):
>refseqp|NP_003260|NP_003260核受体亚家族2组E成员1[智人]
MSKPAGSTSRILDIPCKVCGDRSSGKHYGVYACDGCSGFFKRSIRRNRTYVCKSGNQGGC
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SGSELRSFRNAAAIAALQDEAQLTLNSYIHTRYPTQPCRFGKLLLLLPALRSISPSTIEE
VFFKKTIGNVPITRLLSDMYKSSDI
阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3)(例如,GenBank登录号NP_821138(SEQ ID NO:154)):
>refseqp|NP_821138|NP_821138阳离子通道,***相关蛋白3[智人]
MSQHRHQRHSRVISSSPVDTTSVGFCPTFKKFKRNDDECRAFVKRVIMSRFFKIIMISTV
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TTVHKLQELYYEIVHVLSLMLEDLPQEKPQSLEKVDEK
含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1)例如,GenBank登录号NP_006849(SEQ ID NO:155)):
>refseqp|NP_006849|NP_006849白介素1受体样1配体前体[智人]
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RDRNLQEGNLERVNFWSAVNVAVLLLVAVLQVCTLKRFFQDKRPVPT
蛋白FAM154A(FAM154A)(例如,GenBank登录号NP_714918(SEQ ID NO:156)):
>refseqp|NP_714918|NP_714918假设的蛋白LOC158297[智人]
MKTKCICELCSCGRHHCPHLPTKIYDETEKPCLLSEYTENYPFYHSYLPRESFKPRREYQ
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LASYPEPPGYTFEEVDALGHRIYKPVSQAGSQQSSHLSVDDSENPNQRELEVLA
转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1(例如,GenBank登录号NP_002495(SEQ ID NO:157)):
>refseqp|NP_002495|NP_002495核转录因子,结合X盒的1的同种型1[智人]
MAEAPPVSGTFKFNTDAAEFIPQEKKNSGLNCGTQRRLDSNRIGRRNYSSPPPCHLSRQV
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QARPPPPIPHHRHQSDKNPGSSNLQKITKEPIIDYFDVQD
可以在不存在那些未在本文中特异性公开的任何元件、限制的情况下适宜地实施由本文诠释性地描述的发明。因此,例如,在本文的各个情况下,术语“包含”、“基本上由……组成”和“由……组成”中的任一个术语可以替换为其它两个术语中的任一个,但仍保留它们的通常含义。所用的术语和表述用作描述性术语而非限制性术语,并且此类术语和表述的使用不是旨在排除任何所显示和所描述的特征的任意等同物或其部分,相反应认识到,在要求保护的本发明的范围内可以有多种修饰。因此,应该理解,虽然通过实施方式具体公开了本发明,但是本领域技术人员可以采纳本文公开的任选的特征、概念的修饰和变体,并且此类修饰和变体被认为是落在由说明书和随附的权利要求定义的本发明的范围之内。
此外,当以马库什组或其它替代性组的形式来描述本发明的特征或方面时,本领域技术人员将认识到,同样也以马库什组或其它组的任意单个成员或成员的子集来描述本发明。
实施例
实施例1
配对的自体同源结肠腺癌和健康组织样本
从Asterand XpressBank(Detroit,MI)获取I-IV期结肠腺癌和来自邻近肿瘤的大肠区域的自体同源健康组织。收集并迅速冷冻由Asterand提供的样品,以使那些在收集时存在的任何潜在抗原保持完整。通过RNA谱确认组织的极少降解。将组织储存于-80℃备用。
制备用于在鸡中产生多克隆抗体(YPAbs)的组织和样品
将大约50mg冷冻的I-IV期结肠癌组织样本分别削刮、在冰上解冻并匀浆。将样品的蛋白浓度调整为1mg/ml,与弗氏完全佐剂混合,并用于免疫和加强2只鸡/样品。使用western印迹方法,测定最后一次加强免疫之后3周从卵中获取的I-IV期结肠癌特异性免疫YPAbs针对相应的时期特异性肿瘤组织匀浆物的反应活性(数据未显示)。从6枚卵/鸡纯化强烈和广谱的有反应活性的YPAbs,等份分装并储存于4℃备用。仅显示了对于IV期结肠癌组织的结果。
IV期YPAbs与被诊断为患有IV期结肠癌的患者的汇集血清的反应活性的 测定
使用斑点免疫印迹测定法测定反应活性。图1中显示的结果表明,当与来自年龄、性别和种族匹配的健康患者的对照血清(斑点4)、BSA(斑点3)和健康组织的匀浆物(斑点1)的斑点比较时,来自IV期结肠癌患者的斑点化汇集血清的差别化反应活性。IV期癌组织的匀浆物作为阳性对照(斑点2)。
减除与健康组织表达的蛋白有反应的抗体
使用获自自体同源宿主的健康肠组织的匀浆物反复吸附来自4个时期中的每一个的结肠癌的肿瘤组织的匀浆物诱发的高效价、广谱反应活性的YPAb。匀浆物中的蛋白结合至固体载体,在4℃将YPAb温育过夜并轻轻摇动。回收未结合的抗体,再重复该吸附过程两次,直至ELISA和western印迹显示与健康组织中存在的蛋白基本上不再有反应活性。回收剩余的抗体并进行纯化以用于以下的步骤。或者,在一项研究中,使用来自健康受试者的血清减除针对IV期肿瘤组织产生的抗体。通过将血清成分结合至固体载体并按照上文所述处理抗体制备物,从而实现减除。
变化介导的抗原捕获和蛋白鉴定
回收、纯化未吸附的抗体,并根据生产商(Dynal Biotech)的说明书,共价结合至M-280甲苯磺酰基-激活的Dynabead,以产生“负载的”磁性珠子。对于免疫捕获,将分期的肿瘤的匀浆物(1mg/ml)与其合适的分期的负载的珠子匹配。将5ml匀浆物与0.5ml负载的珠子在4℃温育1小时并倾斜旋转。免疫捕获之后,以10倍珠子体积的洗涤缓冲液(PBS-0.2%NOG)洗涤负载的珠子。以1M的乙酸洗脱特异性结合的蛋白。鉴定了多种脱落的蛋白(见SEQ ID NO:1-157)。阴性对照由相同体积的未负载的珠子的洗脱物组成,用于免疫捕获来自匀浆物的蛋白。在1D SDS-PAGE上分离与负载的珠子和对照特异性结合的蛋白,以考马斯兰染色,并切成区段。使用胰蛋白酶在凝胶内消化每个凝胶切片中包含的蛋白条带,从凝胶切片中洗脱,并在弗罗里达大学的跨学科生物技术研究中心(ICBR)通过GeLC-MS/MS和Mascot数据库搜索(IPI人类蛋白质数据库)进行鉴定。
使用类似的形式来挑拣IV期癌症患者血清中的脱落的变化介导的蛋白。汇集1毫升来自5位患者的血清(共5ml)并与0.5ml负载的珠子在4℃温育1小时并倾斜旋转。免疫捕获之后,以10倍珠子体积的洗涤缓冲液(PBS-0.2%NOG)洗涤负载的珠子。以1M的乙酸洗脱特异性结合的蛋白。鉴定了3种脱落的蛋白,其详细信息显示于表1。
表1.在IV期结肠癌患者的汇集血清中通过PCMAT鉴定的脱落的蛋白
Figure BPA00001331130100881

Claims (50)

1.检测受试者中的癌症或患上癌症的倾向性的方法,所述方法包括,测定来自受试者的生物样品中的选自下列的与癌症相关的蛋白、多肽或多核苷酸的表达水平:成髓细胞素前体(例如SEQ ID NO:29);肌联蛋白;HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Igκ链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7;mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白-2;盲肌样蛋白3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNPC1/HNRNP C2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1 L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白);基膜聚糖前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白;核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1,或其任意组合;其中与对照样品相比,所述生物样品中的与癌症相关的蛋白、多肽或多核苷酸的表达水平的升高指示该受试者患有癌症或具有患上癌症的倾向性。
2.权利要求1的方法,其中所述蛋白或多肽包含如SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
3.权利要求1的方法,其中所述癌症是结肠直肠癌。
4.权利要求1的方法,其中所述方法进一步包括,测定两种或更多种与癌症相关的蛋白、多肽或多核苷酸的表达水平。
5.权利要求1的方法,其中通过选自下列的方法测定与癌症相关的多核苷酸、多肽或蛋白的表达水平:(a)检测所述多肽、蛋白或多核苷酸的存在;(b)检测与癌症相关的多核苷酸的mRNA;和(c)检测与癌症相关的多核苷酸编码的蛋白或多肽的生物活性。
6.权利要求1的方法,其中所述生物样品包括细胞、细胞提取物、组织、体液、基本上不含细胞的体液、血清、尿、眼泪、乳汁、***、***液、肺灌洗液、唾液、粘膜细胞、肿瘤细胞、癌细胞、活组织检查样品、灌洗样品、痰样品、血清样品、血浆样品、血液样品、粪便样品、***样品、骨髓样品、尿样品、组织样品、结肠直肠组织样品或胸腔积液样品。
7.权利要求5的方法,其中所述与癌症相关的蛋白或多肽的表达水平这样测定:使用特异性结合多肽的抗体检测样品中的多肽表达的水平。
8.特异性结合选自下列的蛋白或多肽的分离的抗体或其抗原结合片段:肌联蛋白;HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;成髓细胞素前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Igκ链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7;mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白-2;盲肌样蛋白3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1 L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白;基膜聚糖前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白;核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1,或其任意组合。
9.权利要求8的分离的抗体,其中所述蛋白或多肽包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
10.权利要求8的分离的抗体,其中所述抗体是单克隆抗体、多克隆抗体、单链抗体、单特异性单链抗体、双特异性单链抗体、二价单链抗体、四价单链抗体、嵌合抗体、抗体的抗原结合片段、或人源化抗体。
11.筛选抗癌化合物的方法,所述方法包括,将存在测试化合物的情况下第一生物样品中的变化介导的蛋白或多肽表达产物的水平与不存在该测试化合物的情况下第二生物样品中的变化介导的蛋白或多肽表达产物的水平进行比较;其中所述变化介导的蛋白或多肽表达产物包括选自下列的多肽:肌联蛋白;HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;成髓细胞素前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Ig κ链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7;mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白-2;盲肌样蛋白3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1 L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白;基膜聚糖前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白;核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1,或其任意组合;或编码多肽的mRNA或其任意组合,并且其中使第一生物样品中的变化介导的蛋白或多肽表达产物的水平相对于第二生物样品降低的测试化合物被鉴定为抗癌剂。
12.权利要求11的方法,其中所述变化介导的蛋白或多肽表达产物包括SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
13.筛选治疗或预防癌症的化合物的方法,所述方法包括:(a)将候选化合物与表达选自下列的蛋白或多肽的细胞接触:肌联蛋白;HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;成髓细胞素前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Ig κ链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7;mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白-2;盲肌样蛋白3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1 L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白;基膜聚糖前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白;核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1,或其任意组合;和(b)选择降低所述蛋白或多肽的表达水平的化合物。
14.权利要求13的方法,其中所述蛋白或多肽包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
15.用于检测哺乳动物中的癌症的试剂盒,所述试剂盒包含(a)抗体或其抗原结合片段,其中所述抗体或其抗原结合片段特异性结合选自下列的蛋白或多肽的表位:肌联蛋白;HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;成髓细胞素前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Igκ链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7;mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白-2;盲肌样蛋白3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白;基膜聚糖前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白;核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH 15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1,或其任意组合;和(b)用于检测所述抗体与所述多肽之间的结合反应的一种或多种试剂。
16.权利要求15的试剂盒,其中所述蛋白或多肽包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
17.用于检测生物样品中的癌细胞的试剂盒,其包含至少一种多核苷酸引物或探针,其中所述多核苷酸引物或探针对于编码选自下列的蛋白或多肽的多核苷酸是特异性的:肌联蛋白;HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;成髓细胞素前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Igκ链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7;mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白-2;盲肌样蛋白3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白;基膜聚糖前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白;核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1;或其互补物,或其任意组合。
18.权利要求17的试剂盒,其中所述蛋白或多肽包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
19.权利要求17的用于检测癌细胞的试剂盒,其中所述试剂盒包含特异于编码选自下列的蛋白或多肽的多核苷酸的至少两种多核苷酸引物:肌联蛋白;HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;成髓细胞素前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Igκ链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7;mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白-2;盲肌样蛋白3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1 L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白;基膜聚糖前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白;核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1;或其互补物或其任意组合。
20.融合蛋白,其包含至少两种选自下列的蛋白或多肽:肌联蛋白;HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;成髓细胞素前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Igκ链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7;mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白-2;盲肌样蛋白3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1 L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白;基膜聚糖前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白;核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1,或其任意组合。
21.权利要求20的融合蛋白,其中所述至少两种蛋白或多肽选自SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
22.组合物,其包含第一组分和第二组分,所述第一组分选自生理上可接受的载体和免疫刺激剂,所述第二组分选自:(a)选自下列的蛋白或多肽:肌联蛋白;HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;成髓细胞素前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Igκ链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7;mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白-2;盲肌样蛋白3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白;基膜聚糖前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白;核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1;(b)编码(a)的蛋白或多肽的多核苷酸;(c)根据权利要求8的抗体;和(d)根据权利要求20的融合蛋白,或它们的任意组合。
23.权利要求22的组合物,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
24.结肠直肠癌参考表达谱,其包括两种或更多种选自下列的蛋白或多肽的蛋白或多肽表达样式:肌联蛋白;HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;成髓细胞素前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Ig链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7;mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白-2;盲肌样蛋白3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNPC2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1 L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNAFLJ25506 fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白;基膜聚糖前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白;核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1,或其任意组合。
25.结肠直肠癌参考表达谱,其包括编码选自下列的蛋白或多肽的两种或更多种多核苷酸的多核苷酸表达样式:肌联蛋白;HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;成髓细胞素前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Igκ链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7;mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白-2;盲肌样蛋白3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNPC2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1 L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNAFLJ25506fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白;基膜聚糖前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白;核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NEX1)的同种型1,或其任意组合。
26.权利要求24或25的结肠直肠癌参考表达谱,其中所述蛋白或多肽包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
27.包含两种或更多种多核苷酸的阵列,所述多核苷酸与编码选自下列的多肽的两种或更多种多核苷酸特异性杂交:肌联蛋白;HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;成髓细胞素前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Ig κ链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7;mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白-2;盲肌样蛋白3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白;基膜聚糖前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白;核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1,或其任意组合;或者所述多核苷酸与编码选自下列的两种或更多种蛋白或多肽的两种或更多种多核苷酸特异性杂交:肌联蛋白;HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;成髓细胞素前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Ig κ链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7;mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白-2;盲肌样蛋白3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1 L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白;基膜聚糖前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白;核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1,或其任意组合。
28.权利要求27的阵列,其中所述蛋白或多肽包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
29.用于治疗癌症的组合物,所述组合物包含药学上有效量的特异性结合选自下列的蛋白或多肽的抗体或其抗原结合片段:肌联蛋白;HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;成髓细胞素前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Igκ链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7;mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白-2;盲肌样蛋白3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1 L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白;基膜聚糖前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白;核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1,或其任意组合。
30.权利要求29的组合物,其中所述蛋白或多肽包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
31.用于治疗癌症的组合物,所述组合物包含药学上有效量的选自下列的蛋白或多肽:肌联蛋白;HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;成髓细胞素前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Igκ链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7;mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白-2;盲肌样蛋白3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白;基膜聚糖前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白;核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1;或编码所述多肽的多核苷酸;或其任意组合。
32.权利要求31的组合物,其中所述蛋白或多肽包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
33.治疗受试者中的癌症或刺激受试者中的免疫应答的方法,所述方法包括(a)向所述受试者给予药学上有效量的选自下列的蛋白或多肽:肌联蛋白;HBA1;***1受体(IGF1R);带粘蛋白前体的同种型3;潜在转化生长因子β结合蛋白4(LTBP4);ASXL1(另外的性梳子样1);β珠蛋白(HBB);BMP15-骨形态发生蛋白;TRIM49;DNAJ同源物亚家族B成员11前体;未表征的造血干/祖细胞蛋白MDS027;未表征的蛋白ALB;含有sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;外周蛋白的同种型2;线粒体28S核糖体蛋白S22;翻译起始因子EIF-2B亚基ε;***17-β-脱氢酶1;XRCC6BP1;脑特异性血管生成抑制剂1前体;含有无名指和CCCH-型锌指结构域的蛋白2的同种型2;血红蛋白亚基β;远上游元件结合蛋白1的同种型1;半乳糖凝集素-3;溶菌酶C前体;肌动蛋白,α骨骼肌的;丙酮酸激酶同工酶M1/M2的同种型M2;AGR2;中性粒细胞防御素1前体;成髓细胞素前体;未表征的蛋白PSME2;微管蛋白β-2C链;硫代硫酸盐转硫酶;热休克70kDa蛋白1;Igκ链V-Ⅲ区sie;巨噬细胞迁移抑制因子;ATP合酶亚基D的同种型1,线粒体的;未表征的蛋白ENSP00000374051;细胞质的异柠檬酸脱氢酶[NADP];血红蛋白亚基δ;剪接因子的同种型1,富含精氨酸/丝氨酸的7;mRNA加帽酶的同种型1;LON蛋白酶同源物,线粒体前体;信号识别颗粒54kDa蛋白;半乳糖凝集素-9的长同种型;整联蛋白连接的蛋白激酶;双功能氨酰-tRNA合成酶;锌指蛋白207的同种型1;无机焦磷酸酶;调宁蛋白-2;盲肌样蛋白3的同种型1;组织蛋白酶G前体;含有锌指和BTB结构域的蛋白34;腺嘌呤磷酸核糖转移酶;40S核糖体蛋白S9;TALIN-1;含有富含亮氨酸的重复序列的蛋白59;ATP合酶亚基α,线粒体前体;蛋白转运蛋白SEC31A的同种型7;二羟基丙酮激酶;类似于异质核核糖核蛋白C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)同种型4的蛋白;18kDa的蛋白(例如,UNIPARC登录号IPI00796554);寒冷凝集素FS-1 L-链;异质核核糖核蛋白d0的同种型1;DAZAP1/MEF2D融合蛋白;POTE2;角蛋白18(KRT18);蛋白酶体激活子复合体亚基的PSME4同种型1;丝裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶(MAPKAPK33);补体组分1,s亚组分(C1S);溶菌酶C前体(LYZ);角蛋白型细胞骨架20(KRT20);RNASE3;醛脱氢酶X,线粒体前体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,克隆CBR05185;fibulin-1前体(FBLN1)的同种型B;核结合蛋白1(NUCB1);组蛋白簇2,H2ba(HIST2H2BA);含有三部分基序的28(TRIM28);过氧化物酶体D3,D2-烯脂酰辅酶A异构酶(PECI);肽酰脯氨酰异构酶B(PPIB);与40S核糖体蛋白S17类似的;真核翻译延伸因子1γ(EEF1G);角蛋白8(KRT8);Fibulin 2(FBLN2);VIM;纤维蛋白原α链(FGA);膜联蛋白A2(ANXA2);H2A组蛋白家族,成员J(H2AFJ);肌动蛋白α,心肌1(ACTC1);角蛋白19(KRT19);免疫球蛋白λ基因座(IGL@蛋白);免疫球蛋白重链恒定μ(IGHM);含有EGF的fibulin样细胞外基质蛋白1(EFEMP1);含有三部分基序的蛋白34;AP1-亚基γ结合蛋白1的同种型3;Proflin-1;组蛋白H4;血红蛋白亚基α;转凝蛋白;基膜聚糖前体;血红蛋白β;纤维蛋白原β链前体;免疫球蛋白κ恒定(IGKC);未表征的蛋白ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDa蛋白;细胞质的肌动蛋白1(肌动蛋白β);血红蛋白β;血红蛋白亚基α;POTE-2α肌动蛋白;SLC4A10;核糖核酸酶P蛋白亚基P20(POP7);核RNA输出因子1(NXF1);具有卷曲螺旋结构域和锚定蛋白重复序列的UVEAL自身抗原,UACA;未表征的蛋白C13ORF27;含有Sushi、巢蛋白和EGF样结构域的蛋白1前体的同种型3;动力蛋白重链10的同种型1,纤毛轴的(DNAH10);间隙连接α-1蛋白(GJA1/Connexion 43);驱动蛋白样蛋白KIF25(KIF25)的同种型1;GAPDH-甘油醛-3-磷酸脱氢酶;未表征的蛋白ALB;半乳糖凝集素-3,LGALS3;与含有NAC-α结构域的蛋白1(NACADA)类似的;线粒体的乙酰辅酶A乙酰转移酶,ACAT1;KH型剪接调控蛋白,FUBP2;Profilin 1(PFN1);细胞内氯通道蛋白1,CLIC1;锌指蛋白831;内质蛋白;核糖体蛋白S10(RPS10);剪接因子,富含精氨酸/丝氨酸的3;ACTA2蛋白(α肌动蛋白,平滑肌);钠通道蛋白8型亚基α的同种型1,SCN8A;半乳糖凝集素-9的长同种型;T-复合蛋白1亚基ε,CCT5;肺特异性的α-烯醇酶;原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶MOS;β-内收蛋白(ADD2)的同种型1;载脂蛋白E(APOE);泛素-4(UBQLN4)(ataxin-1泛素样相互作用蛋白);Sumo-缀合酶UB21(酵母中的UBC9同源物);肌球蛋白-15(MYH15);FLJ93091,智人UMP-CMP激酶(UMP-CMPK);Intelectin-1(ITLN1);载脂蛋白A-IV(APOA4);线粒体的丙酮酸脱氢酶(硫辛酰胺)α1(PDHA1);含有富含亮氨酸重复序列的蛋白59(LRRC59);60S核糖体蛋白L37A(RPL37A);尿苷-胞苷激酶1-样1(UCKL1);醛脱氢酶9A1(ALDH9A1);细胞质的硫氧还蛋白还原酶1的同种型3(TXNRD1);核受体亚家族2组E成员1(NR2E1);阳离子通道***相关蛋白3(CATSPER3);含有跨膜EMP24结构域的蛋白1(TMED1);蛋白FAM154A(FAM154A)和转录阻遏子NF-X1(NFX1)的同种型1;或其片段或其任意组合;(b)向所述受试者给予药学上有效量的编码所述蛋白或多肽或其任意组合的多核苷酸或其片段;或(c)向所述受试者给予药学上有效量的特异性结合所述蛋白或多肽的抗体或其抗原结合片段。
34.权利要求33的方法,其中所述蛋白或多肽包含SEQ ID NO:1-157所示的氨基酸序列。
35.权利要求33的方法,其中所述癌症是结肠直肠癌。
36.权利要求33的方法,其中所述免疫力是抗肿瘤免疫力。
37.分离由宿主在第一环境状况下表达但不在第二环境状况下表达的变化介导的蛋白或多肽及其同源基因或多核苷酸的方法,所述方法包括以下步骤:
(a)在第一环境状况下从第一宿主获得细胞、组织或体液样品;
(b)使用(a)中的样品免疫动物;
(c)从经免疫的动物中收集抗体;
(d)使用来自第二环境状况下的第二宿主动物的组织的匀浆物或体液吸附所述抗体;
(e)分离未吸附的抗体;和
(f)使用未吸附的抗体分离由第一宿主在所述第一环境状况下表达但在所述第二环境状况下不表达的变化介导的蛋白或多肽或其同源基因或多核苷酸。
38.权利要求37的方法,其中所述第一环境状况是疾病、癌症或自身免疫疾病。
39.权利要求37的方法,其中所述第二环境状况是正常状况、健康状况、非疾病状况或不同于所述第一环境状况的环境状况。
40.权利要求37的方法,其中所述体液是尿、眼泪、血浆、乳汁、灌洗液、***液、***、唾液、血清、痰和胸腔积液、细胞提取物、韧皮部提取物或木质部提取物。
41.权利要求37的方法,其中所述体液基本上不含细胞。
42.权利要求37的方法,其中使用获自不同于第一宿主的第二宿主的组织或体液吸附针对来自第一宿主的细胞、细胞提取物、组织或体液而产生的抗体。
43.权利要求37的方法,其中使用获自不同于第一宿主但与其是同一物种的第二宿主的细胞、细胞提取物、组织或体液吸附针对来自第一宿主的细胞、细胞提取物、组织或体液而产生的抗体。
44.权利要求37的方法,其中所述经免疫的动物选自:人、狒狒、黑猩猩、猕猴、牛、绵羊、猪、马、山羊、狗、猫、兔、豚鼠、大鼠、小鼠、鸡、鸭和鱼。
45.权利要求37的方法,其中在第一环境状况下从第一宿主获取细胞、组织或体液样品之后立即将其冷冻。
46.一种方法,该方法确认权利要求36的分离的蛋白、多肽或多核苷酸是由第一宿主响应于第一环境状况而表达的,所述方法包括:
(a)从权利要求36的分离的多核苷酸表达并纯化多肽,或分离权利要求36的蛋白或多肽;
(b)制备针对所述蛋白或多肽的抗体;和
(c)使用(b)的抗体在第一环境状况下探测第一宿主或另一宿主的细胞、细胞提取物、体液或组织,
其中,如果所述抗体特异性结合所述细胞、细胞提取物、体液或组织,则鉴定的多核苷酸、蛋白或多肽被确认为由第一宿主响应于第一环境状况而表达。
47.权利要求37的方法,其中经免疫的动物在***发生上与第一宿主距离远。
48.权利要求37的方法,其中在免疫动物之前向(a)的样品中添加佐剂。
49.权利要求37的方法,其中通过如下分离变化介导的蛋白或多肽:将(e)的未吸附的抗体固定在固体载体上,添加第一环境状况下的第一宿主的细胞、细胞提取物、组织或体液,并回收结合至所述固体载体的蛋白或多肽。
50.权利要求49的方法,其中通过质谱法鉴定结合至固体载体的蛋白或多肽。
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