CN101298613A - 转化生长因子α-HII - Google Patents

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Abstract

本发明公开了转化生长因子α-HII多肽和编码这种多肽的多核苷酸。本发明也提供了通过重组技术产生这种多肽的方法和这种多肽在治疗方面的用途,这些治疗包括刺激创伤愈合、治疗神经紊乱、治疗视觉障碍、治疗肾和肝脏机能障碍和刺激胚胎发生及血管形成。本发明也公开了针对这种多肽的拮抗剂和其作为治疗剂在治疗瘤形成疾病上的用途。本发明还公开了检测本发明多肽的改变的水平和编码本发明多肽之核酸序列中的突变的诊断测定方法。

Description

转化生长因子α-HII
本申请是申请日为1995年5月19日、申请号为95197808.X、发明名称为“转化生长因子α-HII”的中国专利申请的分案申请。
本发明涉及最新鉴别的多核苷酸、由这些多核苷酸编码的多肽、这些多核苷酸和多肽的用途以及这种多核苷酸和多肽的产生方法。本发明的多肽已被推定性地鉴定为转化生长因子α同系物。更具体地说,本发明的多肽已被推定性地鉴定为转化生长因子α-HII,下文有时称为“’TGFα-HII”。本发明也涉及抑制这些多肽的作用的方法。
细胞生长和分化似乎是由多种刺激、抑制和协同因子及激素起始、促进、保持和调节的。细胞自动调节机制的变化和/或者障碍似乎是生长相关之疾病(包括瘤形成)的根本原因。生长模式(modular)因子和各种病理和生理过程有关,这些过程包括:信号转导、细胞通讯、生长和发育、胚胎发生、免疫应答、造血细胞的存活和分化、炎症、组织修复和改造、动脉粥样硬化和癌变。表皮生长因子(EGF)、转化生长因子α(TGFα)、β-动物纤维素、双调蛋白和牛痘生长因子等都是各种细胞在正常生理条件或对外源刺激进行应答的情况下产生的生长和分化调节蛋白,并且这些因子也是EGF家族的成员。
这些肽生长因子通过自分泌和旁分泌机制影响创伤细胞。它们也对很多组织(如皮肤、角膜和胃肠道)的正常创伤愈合起重要作用,并且所有这些因子实质上共有氨基酸序列的同源性,这种同源性包括三个链内二硫键的保守替换。此外,此家族的所有因子都和分子量为170,000的跨膜糖蛋白受体结合,并且激活受体细胞质区的酪氨酸激酶活性(Buhrow,S.A.等,生物化学杂志258:7824-7826(1983))。
这种受体由许多典型的细胞表达,这些细胞包括皮肤角质化细胞、血管内皮细胞和GI道的上皮细胞。这些肽生长因子由几种和创伤愈合有关的细胞合成,这些细胞包括血小板、角质化细胞和激活的巨噬细胞。这些生长因子既与某些细胞的生长及分化的刺激作用(例如,瘤形成)有关,也和其它类型细胞的抑制作用有关。
β-动物纤维素是32-kDa糖蛋白,这种糖蛋白可能是由一个更大的跨膜前体经蛋白水解断裂加工而成的。β-动物纤维素的羧基末端区和大鼠生长因子α的羧基末端区具有50%的序列相似性。β-动物纤维素是视网膜色素上皮细胞和血管平滑肌细胞中有力的促细胞***剂。
双调蛋白是一种双向功能的细胞生长调节因子,其对致瘤细胞的DNA合成显示出有力的抑制活性,却促进某些正常细胞的生长。已经指出双调蛋白具有包括治疗创伤和癌症在内的各种广泛用途。例如,双调蛋白在体外对几种上皮来源的人类癌细胞系具有有力的抗增殖作用。如美国专利申请5,115,096所示,双调蛋白也诱导人类***成纤维细胞的增殖。
TGFα具有多向性生物作用。TGFα某些成员的产生是通过许多产生瘤的转化成纤维细胞合成的(Ciardiallo等,细胞生物化学杂志42:45-57(1990)),以及通过多种肿瘤(包括肾癌、乳腺癌和鳞状癌、黑素瘤和成胶质细胞瘤)合成(Derynck,R.等,癌研究47:707-712(1987))。通过分析转基因小鼠(其中,肿瘤细胞表达高水平的TGFα),有直接的证据表明TGFα的表达可能是正常细胞转化成其致瘤相应物的促进因子。TGFα的转基因动物表现出各种致瘤性损伤,致瘤性损伤取决于小鼠株系及调节TGFα表达之启动子的选择(Sandgren,等,细胞,61:1121-1135(1990))。
TGFα也在正常的胚胎发育和成年人的生理过程中具有作用(Derynck,R.癌研究进展,58:27-5(1992))。TGFα在许多组织(包括皮肤、脑、胃肠粘膜和激活的巨噬细胞)中表达。因此,TGFα是控制上皮细胞生长的重要因子并且对创伤愈合具有作用(Schreiber等,科学,232:1250-1253(1986))。
本发明的多肽已经被推定性地鉴定为转化生长因子TGFα-HII。由于氨基酸序列和人类TGFα同源,所以作出了这种鉴定。
按照本发明的一个方面,本发明提供了新的成熟多肽以及其生物学活性的并且在诊断上或治疗上有用的片段、类似物和衍生物。本发明的多肽是人源的。
按照本发明的另一个方面,本发明提供了编码本发明的多肽的分离的核酸分子,包括mRNA、DNA、cDNA、基因组DNA以及其类似物和其生物学活性的并且在诊断上或治疗上有用的片段和衍生物。
按照本发明的另一个方面,本发明提供了通过重组技术生产这种多肽的方法,该方法包括培养含有编码本发明多肽之核酸序列的重组原核和/或真核宿主细胞。
按照本发明的另一个方面,本发明提供了将这些多肽或编码这些多肽的多核苷酸用于治疗的方法,所述治疗方法例如,刺激创伤愈合以便在创伤和AIDS痴呆后恢复正常的神经功能、治疗视觉障碍、靶向某些细胞、治疗肾和肝脏紊乱和促进毛发发囊发育、刺激血管形成以便治疗烧伤、溃疡和角膜切口以及刺激胚胎发生。
按照本发明的另一个方面,本发明提供了核酸探针,这种核酸探针包含长度足以特异性地与本发明的核酸序列杂交的核酸分子。
按照本发明的另一个方面,本发明提供这些多肽的抗体。
按照本发明的另一个方面,提供了本发明多肽的***。
按照本发明的另一个方面,本发明提供了所说的多肽的拮抗剂,其可用于抑制这些多肽的作用,例如,治疗角膜炎症,瘤形成(例如,肿瘤、癌症及牛皮癣)。
按照本发明的另一个方面,本发明提供了检测与本发明多肽过量表达及编码这种多肽之核酸序列中的突变有关的疾病的诊断测定方法。
按照本发明的另一个方面,本发明提供了将这些多肽,或编码这些多肽的多核苷酸体外用于与科学研究、DNA合成及DNA载体的人工合成有关之目的的方法。
从本文的教导中,本领域技术人员会清楚本发明的这些和其它方面。
下列附图用来说明本发明的实施方案,而无意于用来限制本发明权利要求所包括的范围。
图1描述了相应于TGFα-HII推导的氨基酸序列的cDNA序列。使用了氨基酸标准单字母缩写。推定的信号序列有下划线。
图2是人β-动物纤维素、人TGFα和人TGFα-HII(第三排)之间的比较氨基酸序列同源性的图解。*表示在本发明多肽中显示出保守性的EGF基序。下划线表示人TGFα的成熟序列。
按照本发明的一个方面,本发明提供了一种分离的核酸(多核苷酸),这种核酸编码具有图1的推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:2)的成熟多肽或编码由1995年5月15日以保藏号ATCC No.97160保藏的cDNA克隆编码的成熟多肽。
可以从人脑或早期脑组织中得到编码本发明多肽的多核苷酸。本发明的多核苷酸在两周龄胚胎的cDNA文库中发现。其在结构上和EGF家族相关。其包含一个编码374个氨基酸残基之蛋白质的开放读框,其中大约45个氨基酸残基是推定的前导序列。所述蛋白质和人TGFα显示出最高程度的同源性,在一段263个氨基酸序列上具有26%的相同性和46%的相似性。TGFα-HII含有在所有的EGF家族成员中发现的全部6个保守半胱氨酸残基。
如SEQ ID NO:2所示的本发明的全长多肽具有推定的信号序列,这种信号序列包含SEQ ID NO:2的1位氨基酸至45位氨基酸,帮助此肽从细胞分泌。此肽被进一步加工,加工中SEQ ID NO:2的46位氨基酸至214位氨基酸从所述肽上裂解下来,因为这一段氨基酸序列是推定的前体序列。并且,264位氨基酸至344位氨基酸代表推定的转膜部分,其被认为对指导所述肽到特定的靶位点以显示下文描述的生物学功能是必需的。转膜部分也可以从肽中切除,这样,本发明多肽推定的可溶部分包含SEQ ID NO:2的214位氨基酸至264位氨基酸。
本发明的多核苷酸可以是RNA形式或是DNA形式,其中DNA包括cDNA、基因组DNA和合成DNA。这种DNA可以是双链或单链,如果是单链,其可以是编码链或非编码(反义)链。这种编码成熟多肽的编码序列可以和图1(SEQ ID NO:1)所示的编码序列或保藏的克隆的编码序列相同;由于遗传密码的丰余性或简并性,这种编码序列也可以是一种不同的编码序列,其能和图1的DNA(SEQ ID NO:1)或保藏的cDNA编码相同的成熟多肽。
编码图1的成熟多肽(SEQ ID NO:2)或编码由保藏的cDNA编码的成熟多肽的多核苷酸可以包括:仅仅是编码成熟多肽的编码序列;编码成熟多肽的编码序列和附加的编码序列,如前导或分泌序列或蛋白原(proprotein)序列;编码成熟多肽的编码序列(和任选的附加的编码序列)和非编码序列,如内含子或成熟多肽编码序列的5′和/或3′非编码序列。
这样,“编码多肽的多核苷酸”这一术语包括只含有多肽编码序列的多核苷酸以及还含有附加的编码和/或非编码序列的多核苷酸。
本发明还涉及上文描述的多核苷酸变体,这种变体编码具有图1的推定的氨基酸序列(SEQ ID NO:2)的多肽或由保藏的cDNA克隆编码的多肽的片段、类似物和衍生物。这种多核苷酸变体可以是天然产生的多核苷酸等位变体或是非天然产生的多核苷酸变体。
这样,本发明包括编码如图1所示的相同成熟多肽(SEQ ID NO:2)或由保藏的cDNA克隆编码的相同成熟多肽的多核苷酸,以及编码如图1(SEQ ID NO:2)所示的成熟多肽或由保藏的cDNA克隆编码的成熟多肽的片段、衍生物和类似物的多核苷酸变体。这些核苷酸变体包括缺失变体、取代变体、添加或***变体。
正如上文所表明的,所述多核苷酸可以具有一种编码序列,该序列是图1中所示的编码序列(SEQ ID NO:1)或保藏的克隆的编码序列的天然产生的等位变体。本领域已知等位变体是多核苷酸序列的另一种形式,其可以具有一个或多个核苷酸的取代、缺失或添加,而实质上不改变所编码的多肽的功能。
本发明也包括这样的多核苷酸,其中所说的成熟多肽的编码序列可以在相同的阅读框架中与帮助宿主细胞表达和分泌多肽的多核苷酸序列融合,所述的多核苷酸序列如作为分泌序列在控制多肽从细胞转运中起作用的前导序列。具有前导序列的多肽是前蛋白(preprotein),并且可以具有由宿主细胞切割形成成熟形式的多肽的前导序列。这种多核苷酸也编码蛋白原(proprotein),这种蛋白原是添加有附加的5’氨基酸残基的成熟蛋白。具有原序列(prosequence)的成熟蛋白是蛋白原,是一种无活性的蛋白形式。一旦切除原序列,留下的是有活性的成熟蛋白。
这样,例如本发明的多核苷酸可以编码一种成熟蛋白或编码具有原序列的蛋白质或编码既有原序列又有前序列(presequence)(前导序列)的蛋白质。
本发明的多核苷酸也可以具有在读框中与标记序列融合的编码序列,所述的标记序列使得可以纯化本发明的多核苷酸。在细菌宿主的情况下,所述的标记序列可以是由pQE-9载体提供的六组氨酸标记,其用来纯化融合有标记的成熟多肽,或者例如当使用哺乳动物细胞(如COS-7细胞)时,标记序列可以是血细胞凝集素(HA)标记。所说的HA标记相应于来源于流感血细胞凝集素蛋白质的一种表位(Wilson,I.,等,细胞,37:767(1984))。
术语“基因”是指和产生多肽链有关的DNA区段;其包括编码区前面的区域和随后的区域(前导区和尾随序列)以及在各个编码区段(外显子)之间的间插序列(内含子)。
全长TGFα-HII基因的片段可以用作cDNA文库的杂交探针,用来分离全长基因和与此基因有高度的序列类似性或类似生物活性的其它基因。这种类型的探针优选地是具有至少30个碱基,并且可以含有,例如50个或更多的碱基。所说的探针也可以用于鉴别相应于全长转录物的cDNA克隆和基因组克隆或含有包含调节和启动子区、外显子和内含子的完整TGFα-HII基因的克隆。筛选的实例包括通过利用已知DNA序列合成寡核苷酸探针来分离基因的编码区。具有互补于本发明的基因序列之序列的标记可以用来筛选人类cDNA、基因组DNA或mRNA文库,以确定探针和哪些文库成员杂交。
本发明还涉及与以上所描述的序列杂交的多核苷酸(条件是两个序列之间具有至少70%,优选地具有至少90%,更优选地具有至少95%的相同性)。本发明特别涉及在严格条件下与以上所述的多核苷酸杂交的多核苷酸。如本文所使用的,术语“严格条件”指仅在序列间具有至少95%,优选地具有至少97%的相同性时杂交才可以发生。在一个优选的实施方案中,与以上所述的多核苷酸杂交的多核苷酸编码这样一种多肽,其实质上保持与由图1的cDNA(SEQ ID NO:1)或保藏的cDNA(s)编码的成熟多肽相同的生物学功能或活性。
此外,所述多核苷酸可以具有至少20个碱基,优选地是至少30个碱基,更优选地是至少50个碱基,其与本发明的多核苷酸杂交,并且具有如上文所述的相同性,可以保留或不保留活性。例如,这种多核苷酸可以用作SEQ ID NO:1多核苷酸的探针,例如用于回收多核苷酸或者作为诊断探针或作为PCR引物。
这样,本发明涉及与编码SEQ ID NO:2多肽之多核苷酸具有至少70%相同性,优选地至少90%相同性并且更优选地至少95%相同性的多核苷酸及其片段(这种片段具有至少30个碱基,优选地至少50个碱基)和这些多核苷酸编码的多肽。
本文所提及的保藏物将按照用于专利程序的国际承认的微生物保藏布达佩斯条约的规定保持。这些保持物仅仅是为了给本领域技术人员提供方便,并不是35U.S.C 112条所需的保藏。包含在所述的保藏材料中的多核苷酸序列和由其编码的氨基酸序列本文一并参考,并且用于解决本文序列描述上的任何矛盾。对保藏材料的任何制造、使用或者销售需要经过许可,在此未给予任何这样的许可。
本发明还涉及具有图1的推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:2)的多肽或具有由保藏的cDNA编码的氨基酸序列的多肽,以及这种多肽的片段、类似物和衍生物。
术语“片段”、“衍生物”和“类似物”,当有关图1的多肽(SEQ ID NO:2)或由保藏的cDNA编码的多肽时,指基本上保持与这样的多肽相同的生物功能或活性的多肽。这样,类似物包括蛋白原,这种类似物可以由蛋白原部分切除进而产生活性的成熟多肽。
本发明的多肽可以是重组多肽,天然多肽或合成多肽,优选地是重组多肽。
所说的图1的多肽(SEQ ID NO:2)或由保藏的cDNA编码的多肽的片段、衍生物或类似物可以是:(i)这样一种,其中一个或多个氨基酸残基被保守或非保守氨基酸残基取代(优选地是保守氨基酸残基取代)并且取代的氨基酸残基可以是也可以不是由遗传密码子编码的氨基酸残基,或者(ii)这样一种,其中一个或多个氨基酸残基包含取代基,或者(iii)这样一种,其中成熟多肽与另一种化合物融合,所述化合物如增加多肽半寿期的化合物(例如聚乙二醇),或者(iv)这样一种,其中附加氨基酸与成熟多肽融合,例如前导或分泌序列或用来纯化成熟多肽的序列或原序列。通过本文的阐述,可以认为这样的片段、衍生物以及类似物在本领域技术人员的知识范围之内。
本发明优选地是提供分离形式的多肽和多核苷酸,并且优选地是将所述多肽和多核苷酸纯化成同质性的。
术语“分离的”意指所述的物质脱离了其原始环境(例如,天然环境,如果其是天然产生的)。例如,一种存在于活的动物中的天然产生的多核苷酸或多肽不是分离的,但是与天然***中某些或全部共存的物质分开的相同的多核苷酸或多肽是分离的。这样的多核苷酸可以是载体的一部分,和/或这样的多核苷酸或多肽可以是组合物的一部分,其仍然是分离的,这是因为这种载体或者组合物不是其天然环境的一部分。
本发明的多肽包括SEQ ID NO:2的多肽(特别是成熟多肽)以及和SEQ ID NO:2的多肽具有至少70%的相似性(最好是70%的相同性),更优选地是90%的相似性(最好是90%的相同性),最优选地是95%的相似性(最好是90%相同性)的多肽,也包括这些多肽的部分,这种多肽的部分通常包含至少30个氨基酸,并且优选地是至少50个氨基酸。
如本领域所熟知的,两个多肽之间的“相似性”是通过比较一个多肽和另一个多肽的氨基酸序列和其保守氨基酸取代来确定的。
本发明多肽的片段或部分通过肽合成可以用于产生相应的全长多肽;因此,此片段可以用作产生全长多肽的中间体。本发明多核苷酸的片段或部分可以用于合成本发明的全长多核苷酸。
本发明也涉及包含本发明的多核苷酸的载体和用本发明的载体经基因工程产生的宿主细胞,以及经重组技术生产本发明的多肽的方法。
宿主细胞是用本发明的载体经基因工程操作(转导、转化或转染)产生的,所说的载体可以是克隆载体或表达载体。该载体可以是例如,质粒、病毒颗粒和噬菌体等形式。工程化宿主细胞可以在改良的适于激活启动子、选择转化体或扩增本发明的基因的常规营养培养基中培养。培养条件,例如温度和pH值等,是以前用于表达选择的宿主细胞的那些,对普通技术人员是显而易见的。
本发明的多核苷酸可以用来经重组技术生产多肽。这样,例如,多核苷酸可以包含在各种用于表达多肽的表达载体的任何一种中。这样的载体包括染色体、非染色体和合成DNA序列,例如SV 40衍生物;细菌质粒;噬菌体DNA;杆状病毒;酵母质粒;从质粒和噬菌体DNA、病毒DNA(如牛痘、腺病毒、家禽痘病毒、和假狂犬病病毒)组合衍生的载体。然而,任何其它载体也可以使用,只要其在宿主中可复制和稳定。
可以用多种方法将合适的DNA序列***到载体中。一般来说,用本领域已知的方法将DNA序列***到适当的限制性核酸内切酶位点。这样的方法和其它方法被认为在本领域技术人员的知识范围内。
在表达载体中的所说的DNA序列是可操作地连接到适当的指导mRNA合成表达控制序列(启动子)上的。这样的启动子的代表性例子可以提到的是:LTR或SV 40启动子,大肠杆菌的lac或trp、噬菌体λPL启动子,和已知在原核或真核细胞或它们的病毒中控制基因表达的其它启动子。所说的表达载体也包含用于翻译起始和转录终止的核糖体结合位点。该载体也可以包含供扩增表达的合适的序列。
此外,表达载体优选地包含一个或多个选择性标记基因,以提供用于选择转化的宿主细胞的表型特征,例如真核细胞培养物的二氢叶酸还原酶或新霉素抗性,或例如大肠杆菌中的四环素和氨苄青霉素抗性。
包含以上所述的适当的DNA序列以及适当的启动子或者控制序列的载体可以用于转化适当的宿主,以使其能够表达蛋白质。
作为合适宿主的代表性例子,这里可以提到的是:细菌细胞,如大肠杆菌、链霉菌、鼠伤寒沙门氏菌;真菌细胞,如酵母;昆虫细胞如果蝇S2和Spodoptera Sf9;动物细胞如CHO、COS或Bowes黑素瘤;腺病毒;植物细胞等。通过本文的阐述,对适当的宿主的选择在本领域技术人员的知识范围之内。
更具体地说,本发明也包括重组构建体,该构建体包含以上广泛描述的一种或多种序列。该构建体包含载体,如质粒或病毒的载体,该载体已正向或反向***了本发明的序列。在这一实施方案的更为理想的情况下,构建体还包含可操作连接到所述序列上的调节序列,包括,例如,启动子。大量适合的载体和启动子是本领域技术人员已知的,并且是通过商业途径可获得的。以举例的方式给出下列载体:细菌:pQE70、pQE60、pQE-9(Qiagen)、pBS、pD10、phagescript、psiX174、pbluescript SK、pbsks、pNH8A、pNH16a、pNH18A、pNH46A(Stratagene)、ptrc99a、pKK223-3、pKK233-3、pDR540、pRIT5(Pharmaca);真核:pWLNEO、pSV2CAT、pOG44、pXT1、pSG(Stratagene)、pSVK3、pBPV、pMSG、pSVL(Parmacia)。然而,任何其它质粒或载体都可以使用,只要它们在宿主中可复制和稳定。
可以用CAT(氯霉素转移酶)载体或其它带有选择性标记的载体从任何所需的基因选择启动子区。两种合适的载体是pKK232-8和pCM7。特别提到的细菌启动子包括lacI、lacZ、T3、T7、gpt、λPR、PL、和trp。真核生物启动子包括CMV立即早期、HSV胸苷激酶、早期和晚期SV40、得自逆转录病毒的LTRs和小鼠金属硫蛋白-I。对适当的载体与启动子的选择在本领域普通技术人员的水平之内。
在另一个实施方案中,本发明涉及包含以上所述构建体的宿主细胞。所说的宿主细胞可以是高等真核细胞(如哺乳动物细胞),或低等真核细胞(如酵母细胞),或者宿主细胞可以是原核细胞(如细菌细胞)。可以由磷酸钙转染、DEAE-葡聚糖介导的转染,或电穿孔有效地将构建体引入到宿主细胞中(Davis,L.,Dibner,M.,Battey,I.,分子生物学中的基本方法,(1986))。
宿主细胞中的构建体可以用来以常规方式生产由重组序列编码的基因产物。此外,本发明的多肽可以由常规肽合成器合成产生。
成熟蛋白质可以在哺乳动物细胞、酵母、细菌或其它细胞中在适当的启动子控制下表达。采用来源于本发明的DNA构建体的RNA,无细胞翻译***也可以用来生产这种蛋白质。Sambrook等,分子克隆:实验室手册,再版,冷泉港,N.Y.,(1989)(本文一并参考)描述了与原核和真核宿主一起使用的合适的克隆和表达载体。
编码本发明的多肽的DNA在高等真核生物的转录被***到载体中的增强子序列增强。增强子是DNA的顺式作用元件,通常约10至300bp,作用在启动子上增加其转录。例子包括复制起点晚期侧100至270bp上的SV 40增强子、细胞肥大病毒早期启动子增强子、复制起点晚期侧上的多形瘤增强子以及腺病毒增强子。
一般来说,重组表达载体包括复制起点和允许宿主细胞转化的选择性标记(例如,大肠杆菌的氨苄青霉素抗性基因和啤酒糖酵母TRP1基因)以及源于高表达基因的指导下游结构序列转录的启动子。这样的启动子可以是来自编码糖酵解酶(例如3-磷酸甘油酸激酶(PGK))、α-因子、酸性磷酸酶或热休克蛋白质等的操纵子。异源结构序列以合适的方式(phase)与翻译起始和终止序列装配,优选地,与能够指导翻译的蛋白质分泌进周质空间或细胞外培养基的前导序列装配。异源序列可以也可以不编码融合蛋白,这种蛋白质包括赋予所需特征的N-末端鉴别肽,所需特征例如,表达的重组产物稳定或简化纯化步骤。
通过将编码所需蛋白质的结构DNA序列及合适的翻译起始和终止信号以可操作阅读方式(reading phase)与具有功能性启动子一起***来构建用于细菌的有用的表达载体。所说载体包含一个或多个表型选择性标记和复制起点,以在宿主来保证保持载体和需要时提供扩增。适合转化的原核宿主包括大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、鼠伤寒沙门氏菌、假单胞菌属、链霉菌属和葡萄球菌属的各种(虽然其它的也可以选择来使用)。
作为一个代表性的但不是限制性的例子,用于细菌的有用的表达载体可以包含源于市售质粒(包含众所周知的克隆载体pBR322(ATCC37017)的遗传元件)的选择性标记和细菌复制起点。这样的市售载体包括,例如,pKK223-3(Pharmacia Fine化学品公司,Uppsala,瑞典)和GEM1(Promega Biotec,Madison,WI,美国)。这些pBR322“骨架”片段与适当的启动子和待表达的结构序列组合。
在合适的宿主菌株转化和宿主菌株生长至适当的细胞密度之后,用合适的方法(例如温度变换或化学诱导)诱导选择的启动子,将细胞培养另外一段时间。
典型地经离心收获细胞,经物理或化学方法破碎细胞,保持所形成的粗产物用于进一步的纯化。
可以经任何常规的方法破碎用于表达蛋白质的微生物细胞,所述方法包括冻融循环、超声处理、机械破碎或使用细胞裂解剂,这些方法是本领域技术人员熟知的。
各种哺乳动物细胞培养***也可以用于表达重组蛋白质。哺乳动物表达***的例子包括由Gluzman(细胞,23:175(1981))描述的猴肾成纤维细胞COS-7细胞系和其它能够表达相容载体的细胞系,例如,C127,3T3,CHO,HeLa和BHK细胞系。哺乳动物表达载体包含复制起点、适合的启动子和增强子,也可以包含任何必需的核糖体结合位点、聚腺苷酸化位点、剪接供体和受***点、转录终止序列和5’侧翼非转录序列。得自SV40剪接和聚腺苷酸化位点的DNA序列可以用来提供所需的非转录遗传元件。
所说的多肽可以用多种方法从重组细胞培养物回收和纯化,所述方法包括硫酸铵或乙醇沉淀、酸抽取、阴离子或阳离子交换层析、磷纤维素层析、疏水相互作用层析、亲和性层析、羟基磷灰石层析和植物凝集素层析。需要时在完成成熟蛋白质的构型中可以使用蛋白质再折叠步骤。最后,可以使用高效液相层析(HPLC)作为最后的纯化步骤。
本发明的多肽可以是天然纯化的产物,或化学合成方法的产物,或经重组技术从原核或真核宿主(例如细菌、酵母、高等植物、培养的昆虫和哺乳动物细胞)产生的。依据重组产生方法中使用的宿主,本发明的多肽可以是糖基化的或可以是非糖基化的。本发明的多肽也可以包括起始甲硫氨酸残基。
本发明的多核苷酸和多肽可以用作人类疾病的治疗和诊断的研究试剂和材料。
本发明的多肽可以用于确定受体的特征。目前,EGF家族的受体包括4个EGF受体,称为EGFR1、EGFR2、EGFR3、EGFR4。EGFR2也可以称为ERB-2,此分子在各种诊断和治疗适应症方面是有用的(Prigent,S.A.,和Lemoine,N.R.,生长因子研究进展,4:1-24(1992))。TGFα-HII多肽可能是一种或几种这些受体以及鉴定的新EGF类型受体的配体。TGFα-HII的使用有助于这些受体的鉴定、定性和克隆。例如,EGF受体基因代表禽成红细胞增多病病毒的v-erb-B癌基因的细胞同系物。EGF受体的过量表达或该蛋白质激酶调节片段的缺失可以导致细胞的致瘤转化(Manjusri,D.等,人类细胞因子,364和381(1991))。
本发明的多肽也可以用于因创伤或者其它破坏性病理(如AIDS痴呆、衰老的痴呆等等)降低的神经功能的恢复或提高。已经发现TGFα和其同系物是大部分脑中的EGF/TGFα受体的最丰富的配体(Kaser等,脑研究和分子脑研究:16:316-322,(1992))。与EGF(其只存在于较小的分散的区域中)相比,TGFα在脑的各种区域中似乎有广泛的分布,表明TGFα可能在脑组织中具有生理作用。脑中这些TGFα的众多受***点说明TGF在促进正常脑细胞分化和发挥功能方面具有重要作用。因此,在神经功能降低的情况下,施用本发明的多肽可以刺激脑并提高适当的生理功能。
TGFα-HII和其可溶形式也可以用于治疗视觉障碍,例如,角膜炎症。各种实验表明TGFα-HII基因家族的成员和这种病理有关。最近的论文概括了一些和这些生长因子在眼疾病中所起的作用相关的数据(Mann等,细胞73:249-261(1993))。最近的实验显示缺乏TGFα基因的小鼠由于白细胞和其它细胞对眼固有质的浸润显示出角膜炎症。
此外,TGFα生长因子对其靶细胞的特异性可以用作破坏靶细胞的机制。例如,可以通过各种方法将TGFα-HII或者可溶形式与毒素分子(例如灭活靶细胞的放射药物)偶联。这些生长因子-毒素融合物杀死靶细胞(和在某些情况下通过各种“旁观者”效应杀死邻区细胞)。Mesri等(生物化学杂志268:4853-62(1993))发表了这种毒素融合基因的最新例子。可以将TGFα-HII和相关的分子在脂质体中形成胶囊并将其和识别并结合肿瘤或细胞特异性抗原的抗体结合,从而提供“导向”细胞的方法。
因为EGF家族成员在转化的细胞中显示出抗增殖作用,所以TGFα-HII可以以同样的方式用作抗致瘤的化合物。对于体内使用,本发明多肽可以以各种方式施用,这些方式包括但不限于:注射、输注、局部地、肠胃外等等。可以以任何生理上可接受的载体进行施用,这些载体包括:磷酸缓冲盐水、盐水、无菌水等等。
因为已经发现在肾中有这些生长因子的表达,所以TGFα-HII也可以用于治疗某些肾功能障碍。这样,这些因子对此器官正常生理的维持是必需的。
因为TGFα和其同系物及肝细胞生长因子在部分肝切除和急性肝细胞坏死之后,触发肝细胞的再生,所以所说的治疗也和肝脏的再生或肝脏机能障碍有关(Masuhara,M.等,肝脏学16:1241-1249(1992))。
与TGFα-HII有关的有重要意义的治疗涉及创伤愈合。本发明的组合物可以用于治疗实质上包括所有的皮创伤、角膜创伤和身体上皮排列穴器官伤害在内的各种创伤。适于治疗的创伤包括由外伤(如烧伤、擦伤、刀伤)以及外科手术(如外科切口和皮肤移植)导致的创伤。适于用本发明的多肽治疗的其它病症包括慢性疾病(如慢性溃疡,糖尿病溃疡)和其它不愈合(营养)病症。
TGFα-HII或其可溶片段可以掺人到生理上可接受的载体中以便用于感染的区域。所说的载体的特性变化很大,这种变化依赖于预期施用的位点。对于在皮肤上施用,乳油和软膏基质通常是优选的;合适的基质包括:羊毛脂、Silvadene(Marion)(特别是对于治疗烧伤)、Aquaphor(Duke实验室,South Norwalk,Conn.)等等。如果需要,将包含TGFα-HII的组合物掺入绷带和其它的创伤包扎物中以便使伤口持续地暴露在所说的肽下。气溶胶的应用也找到了用途。
TGFα-HII在治疗组合物中的浓度不是关键的但其应该足以诱导上皮细胞增殖。可以局部地对感染区施用所说的组合物,一般作为滴眼剂施用到眼部或者作为乳油、软膏或者洗剂施用到皮肤上。对于眼部,需要经常治疗,通常以4小时或更少的间隔施用。在皮肤上,在愈合的过程中需要在感染区持续保持治疗组合物,每天施用治疗组合物2至4次或更多次。
本发明多肽的使用量随施用方式,其它活性化合物等的使用量而变化,通常在1μg-100μg的范围内。本发明多肽可以和生理上可接受的载体(如盐水、磷酸缓冲盐水等等)一起使用。所述化合物的使用量根据体外细胞的反应和实验动物对实验多肽或含有实验多肽的制剂的反应由经验确定。
TGFα-HII或其可溶片段可以用于血管形成、骨吸收、免疫应答和突触及神经元效应器功能的调节。TGFα-HII也可以用于花生四烯酸级联的调节。
TGFα-HII或其可溶片段也可以用于与终末分化相关的应用中。许多TGFα因子和它们的同系物在它们的靶细胞中诱导终末分化。可以通过施用所说的因子并诱导靶细胞死亡在体内利用这种特性。这种用药方式是考虑到和医学上不希望的细胞类型(如癌症和其它增殖障碍(如炎症、牛皮癣等等))的过度增殖有关的紊乱。除了体内施用,也有许多允许体外施用的情况。例如,可以通过用所说的生长因子和/或其衍生物体外治疗所说的细胞以从骨髓中清除不需要的细胞群。
所说的应用也涉及脱毛、毛发损失和其它影响毛发发囊发育的皮肤病症。若干证据表明这些情况和TGFα生长因子有关。经基因工程操作含有TGFα基因中无效突变的“剔除(knockout)”小鼠显示出和毛发合成的数量及质量有关的异常。此外,小鼠中的遗传图谱研究已经表明一些影响毛发生长的突变位于TGFα基因基因座上(Mann等,细胞73:249-261(1993))。TGFα-HII或其衍生物的局部或者全身应用可以用于治疗脱发及毛发损失的病症,这些权利要求在本发明的范围之内。
通过全身临床施用TGFα-HII生长因子,某些疾病的病理情况已部分地或完全地改善。所说的施用可以以基因治疗的形式进行,或通过施用由TGFα-HII DNA重组构建体或肽化学合成法合成的肽或蛋白质来完成(Woo等,蛋白质工程3:29-37(1989))。
本发明提供了筛选化合物以鉴定本发明多肽的***或者拮抗剂化合物的方法。例子是将表达TGFα-HII受体的哺乳动物细胞或膜制剂和潜在的化合物一起培养,检测所说的化合物由该受体产生第二信号的能力以确定其是否是有效的***。第二信使***包括但不限于:cAMP鸟苷酸环化酶、离子通道或磷酸肌醇水解作用。有效的拮抗剂由上文描述的方法确定,其中检测到的拮抗剂化合物和所说的受体结合但不能引起第二信使反应,进而阻断TGFα-HII与受体结合。
另一种鉴定对本发明多肽之受体特异性的潜在的拮抗剂的方法是竞争测定法,这种方法包括分离过量表达本发明多肽之受体的原生质膜,例如,人类A431癌细胞。将在介质(体积大约是10μl)中系列稀释的含有10nM125I-TGFα-HII的实验样品加入到含有潜在的拮抗剂化合物的5微克原生质膜中,并在4℃下培养4小时。将反应混合物稀释并立即通过微孔滤器,然后迅速洗涤滤器。并在γ计数器中测量结合的放射性。然后测量结合的TGFα-HII的量。在不存在所说的化合物的情况下进行对照分析以确定拮抗剂是否能降低结合的TGFα-HII的量。
潜在的拮抗剂化合物包括抗体或某种情况下和所说的多肽结合的寡肽。另外,潜在的拮抗剂可以是一种与受体结合的密切相关的蛋白质,这种蛋白质是所说的多肽的失活形式,进而阻止了本发明多肽的活性。
另一种潜在的拮抗剂化合物是采用反义技术制备的反义构建体。反义技术可以通过三螺旋形成或反义DNA或者RNA来控制基因的表达,这两种方法都基于多核苷酸和DNA或者RNA的结合。例如,编码本发明的成熟多肽的多核苷酸序列的5’编码部分可以用来设计长度约10至40个碱基对的反义RNA寡核苷酸。一种DNA寡核苷酸被设计成与转录所涉及的基因区互补(三螺旋-参见Lee等,核酸研究,6:3073(1979);Cooney等,科学,241:456,(1988);和Dervan等,科学,251:1360(1991)),进而阻止本发明多肽的转录和产生。反义RNA寡核苷酸在体内和mRNA杂交,并阻断mRNA分子翻译成为本发明的多肽(反义-Okano,J.Neurochem.,56:560(1991);寡脱氧核苷酸作为基因表达的反义抑制剂(CRC出版社,BocaRaton,FL(1988))。以上描述的寡核苷酸可以传送到细胞中,以便可以体内表达反义RNA和DNA,抑制本发明多肽的产生。
拮抗剂化合物包括小分子,这些小分子和本发明的多肽结合并阻断其在受***点的作用,这样,就阻断了正常的生物学活性。小分子也可以和所说的多肽的受体结合,结果阻止了多肽和受体的结合。小分子的例子包括但不限于小肽或类肽分子。
拮抗剂可以用来治疗瘤形成,例如,癌和肿瘤。已知对小鼠中肿瘤细胞分泌或产生EGF家族成员的抑制作用可使肿瘤衰退。
本发明多肽的拮抗剂也可以治疗性地用于治疗某些皮肤病症,例如,牛皮癣。已经发现所说的生长因子家族成员提高的表达水平在取自疾病(如牛皮癣损伤)的皮肤活组织检查中将再提高(Cook,et al.,癌研究,52:3224-3227(1992))。所说的拮抗剂和药学可接受的载体(如下文描述的)一起用于组合物中。
本发明的多肽和***或拮抗剂可以与合适的药物载体组合使用。这样的组合物包含治疗有效量的所说多肽和药学上可接受的载体或者赋形剂。这样的载体包括但不限于盐水、缓冲盐水、右旋糖、水、甘油、乙醇和它们的组合物。其配方应该适宜于施用的方式。
本发明也提供了药物包或试剂盒,它们包含一个或多个填装有本发明的药物组合物的一种或多种成份的容器。这种容器中可以附有管理药物和生物制品制造、使用或销售的政府机构规定形式的告示,这一告示反映了制造、使用或销售人类使用品得到政府机构的同意。此外,本发明的多肽或组合物可以与其它治疗化合物结合使用。
所述药物组合物可以以方便的方式施用,所述方式例如口服、局部、静脉内、腹膜内、肌内、皮下、鼻内或真皮内途径施用。所说的药物组合物以治疗和/或预防特定疾病的有效量施用。一般来说,它们以至少大约10微克/千克体重的量施用,在大多数情况下,它们以不超过每天大约8毫克/千克体重的量施用。在大多数情况之下,考虑用药途径和病症等因素,剂量从每日大约10微克/千克到1毫克/千克体重。
多肽和多肽形式的***和拮抗剂,可以依据本发明通过体内表达这样的多肽来利用,这常被称作“基因治疗”。
这样,例如,可以体外对患者细胞用编码多肽的多核苷酸(DNA或者RNA)进行基因工程操作,用工程细胞向被治疗的患者提供所说的多肽。这样的方法是本领域众所周知的,并且由本文的描述也显而易见。例如,可以用包含编码本发明的多肽的RNA的逆转录病毒颗粒对细胞进行基因工程操作。
同样地,可以通过例如本领域已知的方法体内对细胞进行基因工程操作,以便体内表达多肽。例如,将包装(packaging)细胞用含有编码本发明多肽的RNA的反转录病毒质粒载体转导,以便包装细胞能产生含有兴趣基因的传染性病毒颗粒。可以将这种生产细胞施用给患者以便体内将细胞基因工程化并体内表达所说的多肽。经本发明的描述,通过这种方式施用本发明多肽的这些或其它方法对本领域技术人员是清楚的。
可以衍生上文描述的反转录病毒质粒载体的反转录病毒包括但不限于:莫洛尼氏鼠白血病病毒、脾坏死病毒、反转录病毒如劳氏肉瘤病毒、Harvey肉瘤病毒、禽类白血病病毒、长臂猿猩猩白血病病毒、人类免疫缺陷病毒、腺病毒、骨髓增殖肉瘤病毒、和***肿瘤病毒。在一个实施方案中,反转录病毒质粒载体来自莫洛尼氏鼠白血病病毒。
所述载体包含一个或多个启动子。可以使用的合适的启动子包括但不限于:反转录病毒LTR;SV 40启动子;和人类巨细胞病毒(CMV)启动子(Miller,等,生物技术,Vol.7,No.9,980-990(1989)描述);或者其它任何启动子(例如真核细胞启动子,如包括但不限于组蛋白、pol III和β-肌动蛋白启动子)。使用的其它病毒启动子包括但不限于:腺病毒启动子、胸苷激酶(TK)启动子和B19细小病毒启动子。通过本文的描述,合适的启动子的选择在本领域技术人员的知识范围内。
编码本发明多肽的核酸序列在合适的启动子控制下。可以使用的合适的启动子包括,但不限于:腺病毒启动子(如腺病毒主要晚期启动子);或者异源启动子(如巨细胞病毒(CMV)启动子);呼吸合胞体病毒(RSV)启动子;可诱导的启动子(如MMT启动子、金属硫蛋白启动子);热休克启动子;清蛋白启动子;ApoAI启动子;人类珠蛋白启动子;病毒胸苷激酶启动子(如单纯疱疹胸苷激酶启动子);反转录病毒LTRs(包括上文描述的修饰的反转录病毒LTRs);β-肌动蛋白启动子;和人类生长激素启动子。所说的启动子也可以是控制编码所述多肽之基因的天然启动子。
使用反转录病毒质粒载体转导包装细胞系以便形成生产细胞系。可以被转染的包装细胞的例子包括但不限于:PE501、PA317、ψ-2、ψ-AM、PA12、T19-14X、VT-19-17-H2、ψCRE、ψCRIP、GP+E-86、GP+envAml2和DAN细胞系(Miller、人类基因治疗,Vol.1,pgs.5-14(1990)描述的,其全部内容本文一并参考)。可以通过本领域任何已知的方法用所述载体转导包装细胞。这些方法包括但不限于:电穿孔、使用脂质体和CaPO4沉淀。另外,反转录病毒质粒载体可以包在脂质体中,或者和脂类偶联,然后施用到宿主中。
生产细胞系产生感染性的反转录病毒载体颗粒,这种颗粒包含编码所述多肽的核酸序列。然后可以使用这些反转录病毒载体颗粒体内或者体外转导真核细胞。转导的真核细胞将表达编码所述多肽的核酸序列。可被转导的真核细胞包括但不限于:胚胎干细胞、胚胎癌细胞、以及造血干细胞、肝细胞、成纤维细胞、成肌细胞、角质化细胞、内皮细胞和支气管上皮细胞。
本发明也涉及本发明的基因作为诊断剂的用途。本发明的基因的突变形式的检测使得可以诊断源于本发明的多肽表达不足(underexpression)的疾病或疾病的易感性,例如,不适当(improper)的伤口愈合、不适当的神经功能、视觉障碍、肾和肝功能障碍、毛发发囊发育、血管形成和胚胎形成。
可以用各种技术在DNA水平上检测具有本发明的人基因突变的个体。可以从患者的细胞(如血液,尿,唾液,组织活组织检查和尸体解剖材料)获得用于诊断的核酸。基因组DNA可以直接用于检测,或者在分析前用PCR酶促扩增(Saiki等,自然,324:163-166(1986))。RNA或者cDNA也可以用于相同的目的。作为一个例子,可以用与编码本发明多肽的核酸互补的PCR引物鉴别和分析其突变。例如,可以通过与正常遗传型比较的扩增产物大小上的改变来检测缺失或者***。点突变可以经扩增的DNA与放射性标记的RNA或者放射性标记的反义DNA序列杂交鉴别。经核糖核酸酶A消化,或者从熔点温度的不同辨别完全配对的序列和错配双链体。
通过直接的DNA测序方法揭示参照基因和具有突变的基因间的序列差异。此外,克隆的DNA区段(segment)可以用作探针以检测特异性DNA区段。当和PCR结合时,这种方法的敏感性大大提高。例如,将测序引物和双链的PCR产物或由改良的PCR方法产生的单链模板分子一起使用。通过常规的放射标记核苷酸方法或具有荧光标记的自动测序方法确定序列。
基于DNA序列差异的遗传试验可以通过检测在有或没有变性剂时凝胶上DNA片段电泳迁移率的改变完成。小的序列缺失和***可以由高分辨率凝胶电泳显示出。不同序列的DNA片段可以在变性甲酰胺梯度凝胶上区别,其中不同DNA片段的迁移按照其特定的熔点或部分融化温度而停滞在凝胶的不同位置(参见,例如,Myers等,科学,230:1242(1985))。
也可以由核酸酶保护测定法揭示特定位置上的序列变化,所述测定法如核糖核酸酶保护和S1保护以及化学裂解方法(例如,Cotton等,PNAS,美国,85:4397-4401(1985))。
这样,可以由以下方法检测特定DNA序列,所述方法例如杂交、核糖核酸酶保护、化学裂解、直接DNA测序、或使用限制酶(例如,限制片段长度多态性(RFLP))和基因组DNA的Southern印迹法。
除很多常规凝胶电泳和DNA测序法之外,也可用原位分析检测突变。
因为相对于正常组织样品所说的多肽的过量表达可以检测某些疾病(例如,瘤形成、皮肤机能障碍、视觉障碍和炎症)的存在,所以,本发明也涉及用于检测各种组织中本发明的多肽之改变的水平的诊断分析方法。用于检测得自宿主的样品中本发明多肽水平的分析方法对本领域的技术人员是公知的,所说的方法包括:放射免疫测定、竞争结合测定、Western印迹分析,优选地是ELISA测定。ELISA测定最初包括制备本发明多肽之抗原的特异性抗体,优选地是单克隆抗体。此外,制备单克隆抗体的报道抗体。将可检测的试剂和报道抗体结合,所说的试剂如放射性、荧光或者在这一实例中是辣根过氧化物酶。由宿主获得样品,并将其在与样品中蛋白质结合的固体支持物(如聚苯乙烯皿)中温育。通过和非特异性蛋白质(如牛血清清蛋白)一起温育,将覆盖皿中任何自由的蛋白质结合位点。接下来将单克隆抗体在皿中温育,在此期间单克隆抗体和结合到聚苯乙烯皿上的本发明任何多肽结合。用缓冲液将所有未结合的单克隆抗体洗掉。此时,将和辣根过氧化物酶连接的报道抗体放入皿中,结果导致报道抗体和任何结合到本发明多肽上的单克隆抗体结合。然后将未结合的单克隆抗体洗掉。接着向皿中加入过氧化物酶底物,和标准曲线比较,在给定时间内产生的颜色的量即是给定体积的患者样品中存在的蛋白质的量。
也可以使用竞争测定确定宿主样品中本发明多肽的水平。这种测定方法包括分离过量表达本发明多肽受体的原生质膜。然后将含有已经标记的本发明多肽的实验样品加入到原生质膜中,并将其温育一段时间。将可能含有本发明多肽的宿主样品加入到反应混合物中。然后使反应混合物通过被迅速洗涤的滤器,并测定结合的放射性以确定所说的受体的竞争量,从而确定样品中本发明多肽的量。
因为很多类型的癌细胞在瘤形成或者增生的过程中正调节(upregulate)TGFα家族的各种成员,所以可以将TGFα-HII的特异性抗体用于癌症的诊断和治疗中。这些抗体和TGFα-HII结合并失活TGFα-HII。TGFα-HII(和/或其家族成员)的单克隆抗体在临床上用于某些机能障碍的诊断和治疗,所说的机能障碍包括(但不限于)增生的和致瘤性的生长异常。致瘤性组织对生长因子的表达的正调形成了检测感染患者血液中生长因子增加的各种血清测定的基础。一般,这种测定不仅用于诊断性确诊(setting),也用于预后性确诊(以便在外科手术和化疗之后检测潜隐的肿瘤细胞的存在)。
此外,在受体结合测定中可以利用标记的TGFα-HII或利用TGFα-HII受体本身的抗体检测表达TGFα-HII受体的恶性细胞。依据TGFα-HII受体的存在和密度区别细胞,进而提供预测所说的细胞对TGFα-HII的生物学活性之敏感性的方法。
本发明的序列对染色体鉴定也是有价值的。该序列特异地靶向位于单个的人染色体上的特定位置并能与之杂交。此外,现在需要鉴定染色体上的特定位点。目前,仅有少数几种以实际的序列数据(重复多态性)为基础的染色体标记试剂可以用于标记染色体的位置。本发明的DNA染色体作图是将这些序列和疾病相关基因相关联的重要的第一步。
简而言之,通过从cDNA制备PCR引物(优选10-25bp)便可以把序列定位到染色体上。采用3’未翻译区域的计算机分析可以快速地选择引物,其中引物不应跨越超过基因组DNA上的一个外显子,否则使得扩增方法复杂化。然后采用这些引物用于PCR筛选含有单个的人染色体的体细胞杂交体。只有那些含有与该引物对应的人基因的杂交体才会生产扩增片段。
体细胞杂交体的PCR作图是将一个特定的DNA定位于特定的染色体上的快速程序。根据本发明采用同样的寡核苷酸引物,用来自于特定染色体或者大基因组克隆集合体的一组片段、按照类似方式可以实现亚定位(sublocalization)。可以类似地用于对染色体作图的其它的作图策略包括原位杂交,用标记的经流式分选的染色体进行预筛选以及通过杂交进行预选,从而构建出染色体特异性的cDNA文库。
cDNA克隆与中期染色体涂片的荧光原位杂交(FISH)可以用来实现一步法准确染色体定位。该技术可以采用50或60个碱基长短的cDNA。关于该技术的综述参阅Verma等,人类染色体:基本技术手册,Pergamon出版社,纽约(1988)。
一旦序列已定位到一个准确的染色***置,则染色体上该序列的物理位置可与遗传图谱数据相关联。这些数据例如可在V.McKusick,人类的孟德尔遗传中找到(可以通过Johns Hopkins大学Welch医学文库联机得到)。然后通过连锁分析(物理相邻基因的共遗传性)来鉴定基因与已定位到相同染色体区域上的疾病之间的关系。
接下来需要测定在受影响的和未受影响的个体之间cDNA或基因组序列中的差异。如果突变是在一些或所有的受影响个体中观察到的、但是又没有在任何一个正常个体中被观察到的话,那么该突变可能是疾病的病因。
根据物理作图和遗传作图技术目前的分辨率,一个被准确定位到与疾病有关的染色体区域的cDNA可以是50-500个潜在的致病(causative)基因中的一种(其中假定有1兆碱基的作图分辨率且每20kb为一个基因)。
所述的多肽、其片段或衍生物或类似物、或者表达上述物质的细胞可以用作生产其抗体的免疫原。这些抗体可以是例如多克隆抗体或者单克隆抗体。本发明也包括嵌合,单链和人源化的抗体,以及Fab片段或Fab表达文库的产物。本领域已知的多种方法可以用于生产这些抗体和片段。
针对相应于本发明的序列的多肽而产生的抗体可以通过将该多肽直接注射入动物体内或者通过将该多肽向动物给药来得到,其中的动物优选非人类。然后,如此得到的抗体会结合到该多肽上。通过这种方式,即使是仅仅编码该多肽的一个片段的序列也可用于产生能结合整个天然多肽的抗体。然后,该抗体可以用于从表达该多肽的组织中分离这种多肽。
为了制备单克隆抗体,可以采用任何一种通过连续的细胞系培养生产抗体的技术。例子包括杂交瘤技术(Kohler与Milstein,1975,自然,256:495-497),三体杂交瘤技术,人B细胞杂交瘤技术(Kozbor等,1983,今日免疫学,4:72)以及生产人单克隆抗体的EBV-杂交瘤技术(Cole,等,1985,单克隆抗体与癌症治疗,Alan R.Liss,Inc.,pp.77-96)。
可以将用于生产单链抗体的技术(美国专利4,946,778)进行修改从而生产针对本发明免疫原性多肽产物的单链抗体。也可以使用转基因小鼠来表达针对本发明免疫原性多肽产物的人源化抗体。
本发明将参照下面的实施例进一步加以说明;但是,应当了解本发明并不局限于这些实施例。除非另作声明的以外,所有的份或量均为重量。
为了利于理解以下的实施例,现叙述一些经常出现的方法和/或术语。
“质粒”通过一个在前的小写p和/或跟随几个大写字母和/或数字加以命名。本文中的起始质粒或者可以通过商业途径得到或在不受限制的基础上公众可得到,或者可以根据已公开的方法从可得到的质粒中构建出来。此外,对于与那些所述等价的质粒是本领域已知的并且对本领域普通技术人员是显而易见的。
DNA的“消化”是指用一种仅对DNA上的某些序列起作用的限制性酶催化裂解DNA。本文所采用的多种限制性酶可以通过商业途径得到,并且其反应条件、辅因子和其它使用要求对本领域普通技术人员是已知的。为了分析目的,通常把1μg的质粒或DNA片段与溶于约20μl缓冲溶液的约2单位的酶一起使用。为了分离用于质粒构建的DNA片段,通常在一个更大的体积内用20至250单位的酶消化5至50μg的DNA。针对具体的限制性酶而言,合适的缓冲溶液和底物的量是由生产者规定的。通常采用在37℃下约1小时的温育时间,但是该时间可以根据产品供应者的指示而变化。在消化后,反应混合物直接在聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳以分离出所需的片段。
采用由Goeddel,D.等,核酸研究,8:4057(1980)所述的8%聚丙烯酰胺凝胶进行裂解片段的大小分离。
“寡核苷酸”或指一种单链多脱氧核苷酸,或指可以通过化学合成的两条互补的多脱氧核苷酸链。这些合成的寡核苷酸不具有5’磷酸,因此如果不在一种激酶存在下以ATP添加一个磷酸时,该寡核苷酸将不会连接到另一个寡核苷酸上。合成的寡核苷酸将连接到未被去磷酸化的片段上。
“连接”是指在两个双链核酸片段之间形成磷酸二酯键的过程(Maniatis,T.,等,出处同上,p.146)。除非另行提供的以外,采用已知的缓冲液和条件、每0.5μg约等摩尔量的待连接DNA片段10单位T4 DNA连接酶(“连接酶”)来实现连接。
除非另有说明,按Graham,F.和Van der Eb,A.,病毒学,52:456-457(1973)所述的方法进行转化。
实施例1
细菌表达和纯化TGFα-HII可溶形式
利用PCR寡核苷酸引物起始扩增编码TGFα-HII的DNA序列(ATCC#97160),所说的引物相当于加工过的TGFα-HII蛋白质的5’序列(减去信号肽序列)和TGFα-HII基因3’的载体序列。将相应于TGFα-HII的附加核苷酸分别加入到5’和3’序列中。所说的5’寡核苷酸引物具有序列5’CCCGGATCCGCACGAGACATACCTTGTCCG3’(SEQ ID NO:3),此引物含有BamHI限制性内切酶位点(粗体),后接由加工的蛋白质密码子的假定的末端氨基酸开始的TGFα-HII编码序列的21个核苷酸。所说的3’序列5’GGGAAGCTTTTAATACTGAAATCGTACAGGAC 3’(SEQ ID NO:4)包含和Hind III位点互补的序列,并接着TGFα-HII的23个核苷酸。所说的限制性内切酶位点相应于细菌表达载体pQE-9的限制性内切酶位点(Qiagen,Chatsworth公司,CA,91311)。pQE-9编码抗生素抗性(Ampr)、细菌复制起点(ori)、IPTG可调节启动子操纵子(P/O)、核糖体结合位点(RBS)、6-组氨酸标记和限制性内切酶位点。然后用BamHI和HindIII消化pQE-9。将扩增的序列连接到pQE-9中并将其***到带有编码组氨酸标记和RBS之序列的框架中。然后通过Sambrook等(分子克隆:实验手册,冷泉港实验室出版社,(1989))描述的方法,用连接混合物转化大肠杆菌菌株M15/rep 4(Qiagen,公司)。M15/rep4包含质粒pREP4的多拷贝,这种质粒表达lacI阻遏物同时赋予卡那霉素抗性(Kanr)。通过转化体在LB平板上的生长能力鉴定转化体,并筛选出氨苄青霉素/卡那霉素抗性菌落。通过限制分析分离并确认质粒DNA。将含有所需构建体的菌落在补充了Amp(100μg/ml)和Kan(25μg/ml)的LB液体培养基中过夜(O/N)培养。将O/N培养物以1∶100至1∶250的比率用于接种大体积培养物。细胞生长至0.4和0.6之间的光密度600(O.D.600)时,加入IPTG(异丙基-B-D-硫代半乳糖吡喃糖苷)至最终浓度为1mM。IPTG通过失活lacI阻遏物,清除P/O,引起基因表达的增加。将细胞再培养3至4小时。通过离心收获细胞。将细胞沉淀溶解在6M盐酸胍离液剂中。澄清后,在允许含有6-组氨酸标记的蛋白质紧密结合的条件下,在镍-螯合物柱中通过层析从溶液中纯化溶解的TGFα-HII(Hochuli,E.等,层析法杂志411:177-184(1984))。将TGFα-HII(85%纯度)以6M胍HCl(pH值5.0)从柱中洗脱下来,为了复性,调至3M盐酸胍、100mM磷酸钠、10M谷胱甘肽(还原型的)、2M谷胱甘肽(氧化型的)。在溶液中温育12小时后,将蛋白质对10M磷酸钠透析。
实施例2
利用杆状病毒表达***克隆和表达TGFα-HII
利用PCR寡核苷酸引物扩增编码全长TGFα-HII蛋白质的DNA序列(ATCC#97160),所说引物相应于该基因的5’和3’序列:
使用了三套引物:
第一套引物是:5’CGCGGATCCGCCATCATGGTGCTGTGGGAGTCC 3’(SEQ ID NO:5)和5’GCGTCTAGACTAGTATAGAACACTGTAGTCC 3’(SEQ ID NO:6),此构建体在SEQ ID NO:1的321位核苷酸开始,在其1248位核苷酸终止,并包括推定的前导序列;
第二套引物是:5’CGCGGATCCGCCATCATGCTACTCATCGTAGCC 3’(SEQ ID NO:7)和5’GCGTCTAGACTAGTATAGAACACTGTAGTCC 3’(SEQ ID NO:8),此构建体在SEQ ID NO:1的402位核苷酸开始,在其1248位核苷酸终止,并且不包括推定的前导序列;
第三套引物是:5’CGCGGATCCAGAACACCACATACCTTGTCCG 3’(SEQ ID NO:9)和5’GCGTCTAGACTAGTATAGAACACTGTAGTCC 3’(SEQ ID NO:10),此构建体在SEQ ID NO:1的1100位核苷酸开始,在其1248位核苷酸终止,是所说多肽推定的可溶部分。所有三个5’引物都具有BamHI限制性内切酶位点(粗体),后接代表真核细胞有效翻译起始信号的核苷酸(Kozak,M.,分子生物学杂志,196:947-950(1987))(翻译起始密码子“ATG”下划线)。对于这三套引物,在pA2GP载体中建造了杆状病毒信号肽序列。
所说的3’引物序列包含限制性核酸内切酶XbaI的切割位点,并具有和TGFα-HII基因的3’TGFα区互补的核苷酸。用市售试剂盒(“Geneclean,”生物101公司,La Jolla,Ca.)从1%琼脂糖凝胶分离扩增的序列。将所说的片段用核酸内切酶BamHI和XbaI消化,并在1%琼脂糖凝胶上再次纯化。此片段指定为F2。
载体pA2用于前两套引物,而pA2GP用于第三套引物。用载体pA2(由pVL941载体修饰而成,见下文讨论)由杆状病毒表达***表达TGFα-HII蛋白质(综述参见:Summer,M.D.和Smith,G.E.1987,杆状病毒载体和昆虫细胞培养过程的方法手册,得克萨斯农业的试验站公报1555)。这种表达载体包含苜蓿银纹夜蛾多核型多角病毒(AcMNPV)强多角体蛋白启动子,其后面是限制性核酸内切酶的识别位点。猴病毒(SV)40的聚腺苷酸化位点用于有效的聚腺苷酸化。为了容易地选择重组病毒,把大肠杆菌的β-半乳糖苷酶基因以与多角体蛋白启动子同样的方向***,其后是多角体蛋白基因的聚腺苷酸化信号。多角体蛋白序列的两侧是用于细胞介导的共转染的野生型病毒DNA的同源重组的病毒序列。可以用很多其它的杆状病毒载体代替pRG1,所说的载体如pAc373、pVL941和pAcIM1(Luckow,V.A.和Summer,M.D.,病毒学,170:31-39)。
用限制酶SmaI和XbaI消化所说的质粒,然后由本领域已知的方法利用小牛肠磷酸酶使质粒去磷酸化。然后用市售试剂盒(“Geneclean”,BIO 101公司,La Jolla,Ca.)从1%琼脂糖凝胶分离DNA。这种载体DNA指定为V2。
用T4DNA连接酶连接F2片段和所说的去磷酸化质粒V2。然后转化大肠杆菌HB101细胞(Stratagene克隆***,11011North TorreyPines Road La Jolla,Ca.92037)并利用酶BamHI和XbaI鉴别含有所说带TGFα-HII基因的质粒(pBac TGFα-HII)的细菌。通过DNA测序确认克隆片段的序列。
用脂转染法(Felgner等,美国科学院学报,84:7413-7417(1987))将5μg质粒pBacTGFα-HII与1.0μg市售的线性杆状病毒(“BaculoGoldTM杆状病毒DNA”,Pharmingen,San Diego,CA.)共转染。
将1μg BaculoGolTM病毒DNA和5μg质粒pBacTGFα-HII在含有50微升无血清Grace’s培养基(Life Technologies公司,Gaithersburg,MD)的微滴板的无菌孔中混合。在添加10微升脂转染试剂和90微升Grace’s的培养基后,混合并于室温下培养15分钟。然后将转染混合物逐滴添加到Sf9昆虫细胞(ATCC CRL1711)中,所说细胞接种在具有1ml无血清Grace’s培养基的35mm组织培养平板上。来回摇动平板以混合新添加的溶液。然后将平板在27℃下培养5小时。5小时后,从平板除去转染溶液,添加1微升补充有10%胎牛血清的Grace’s昆虫培养基。把平板放回到温箱,在27℃下连续培养4天。
4天后,收集上清液,用类似Summers和Smith(同上)所述的方法进行噬斑测定。一点改变是使用具有“Blue Gal”的琼脂糖凝胶(LifeTechnologies公司,Gaithersburg),其使得易于分离染蓝的噬斑。(“噬斑测定”的详尽的描述也可以在Life Technologies公司(Gaithersburg)发布的昆虫细胞培养和杆状病毒学用户指南9-10页中找到)。
四天后,将系列稀释的病毒添加到细胞中,用Eppendorf吸管尖端挑取染蓝的噬斑。然后将包含重组病毒的琼脂悬浮于包含200微升Grace’s培养基的Eppendcrf管中。经简短离心除去琼脂,将包含重组杆状病毒的上清液用于感染接种到35毫米培养皿中的Sf9细胞。4天后,收获这些培养皿中的上清液,于4℃贮存。
使Sf9细胞在补充有10%热灭活FBS的Grace’培养基中生长。在感染复数(MOI)2下用重组杆状病毒V-TGFα-HII感染细胞。6小时后,除去培养基,用SF900II培养基(减去甲硫氨酸和半胱氨酸)(LifeTechnologies公司,Gaithersburg)替代。42小时后,添加5μCi35S甲硫氨酸和5μCi35S半胱氨酸(Amersham)。在经离心收获之前,将细胞进一步培养16小时,标记蛋白质经SDS-PAGE和放射自显影显示出。
实施例3
在COS细胞中的表达重组TGFα-HII
表达质粒TGFα-HII HA来源于载体pcDNA3/Amp(Invitrogen),其包含:1)SV 40复制起点,2)氨苄青霉素抗性基因,3)大肠杆菌的复制起点,4)CMV启动子,其后为多接头区、SV 40内含子和聚腺苷酸化位点。将编码完整的TGFα-HII前体的DNA片段和在读框中融合进3’末端的HA标记克隆到所说的载体的多接头区,因此,重组蛋白质的表达在CMV启动子控制之下。HA标记相应于来自流感血细胞凝集素蛋白质的表位,这一点以前已经描述过(I.Wilson,H.Niman,R.Heighten,A Cherenson,M.Connolly,and R.Lerner,1984,细胞37:767,(1984))。HA和靶蛋白的融合,使得用识别HA表位的抗体很容易检测重组蛋白质。
质粒构建策略描述如下:
用两种引物在克隆的原始的EST上通过PCR方法构建编码TGFα-HII的DNA序列(ATCC#97160),所说的引物是:5’引物5’CGCGGATCCGCCATCATGGTGCTGTGGGAGTCC 3’(SEQ ID NO:11),包含BamHI位点(粗体),之后是由起始密码子开始的TGFα-HII编码序列的18个核苷酸;3’引物5’GCGCTCGAGGTATAGAACACTGTAGTCC 3’(SEQ ID NO:12),包含XhoI位点、TGFα区的最后19个核苷酸和XhoI位点的互补序列。pcDNA3/Amp载体包含BamHI/XhoI克隆位点,此位点携带与3’HA标记在一个读框内的PCR***片段,后接终止密码子。因此,PCR产物包含BamHI位点,936个碱基对编码序列和XhoI位点。用BamHI和XhoI限制性内切酶消化和连接PCR扩增的DNA片段和载体pcDNA3/Amp。将连接混合物转化到大肠杆菌菌株SURE中(可从Stratagene克隆***,La Jolla,CA 92037得到),将转化的菌株接种在氨苄青霉素培养基平板上,并筛选抗性克隆。从转化体中分离质粒DNA,并用限制分析检测是否存在正确的片段。为了表达重组体TGFα-HII,通过DEAE-DEXTRAN方法用表达载体转染COS细胞(J.Sambrook,E.Fritsch,T.Maniatis,分子克隆:实验手册,冷泉港实验室出版,(1989))。通过放射标记和免疫沉淀法检测TGFα-HII HA蛋白质的表达(E.Harlow,D.Lane,抗体:实验手册,冷泉港实验室出版,(1988))。将细胞在转染后两天用15S-半胱氨酸标记8小时。然后收集培养物并用去垢剂裂解细胞(RIPA缓冲液(150mM NaCl,1%NP-40,0.1%SDS,1%NP-40,0.5%DOC,50mM Tris,pH 7.5)(Wilson,I.等,Id.37:767(1984))。用HA特异性单克隆抗体沉淀细胞裂解物和培养物。在15%SDS-PAGE凝胶上分析蛋白质沉淀。
实施例4
经由基因治疗的表达
成纤维细胞是通过皮肤活组织检查从一个研究对象中得到的。将得到的组织放置在组织培养基上并且分割成小块。将小组织块放置在组织培养瓶的湿表面上,其中每瓶中放置约10块组织。将瓶颠倒放置,盖紧并于室温下过夜。在室温下放置24小时后反转瓶,组织块仍固定在瓶底部,加入新鲜培养基(例如含有10%FBS,青霉素和链霉素的Ham’s F12培养基),然后于37℃下温育大约1周。这时加入新鲜培养基,随后每隔几天更换一次培养基。再培养2周后,出现了一单层成纤维细胞。将单层细胞经胰蛋白酶消化并放入更大的瓶中。
用EcoRI和Hind III消化旁侧有Moloney鼠肉瘤病毒长末端重复的pMV-7(Kirschmeier,P.T.等,DNA,7:219-25(1988)),接下来用小牛肠磷酸酶进行处理。线性载体在琼脂糖凝胶上分级分离并使用玻璃珠加以纯化。
采用分别与5’和3’末端序列对应的PCR引物扩增编码本发明多肽的cDNA。5’引物包含一个EcoRI位点,3’引物含有一个Hind III位点。在T4 DNA连接酶存在下,将等量的Moloney鼠肉瘤病毒的线性化骨架与扩增的EcoRI和Hind III片段加在一起,在适于两个片段连接的条件下保持所得到的混合物。将该连接混合物用于转化细菌HB101,然后为了证实该载体具有***正确的感兴趣基因而将细菌涂布在含有卡那霉素的琼脂平板上。
将兼嗜性(amphotropic)pA317或GP+am12包装细胞在含有10%小牛血清(CS)、青霉素和链霉素的Dulbecco’s改良Eagles培养基(DMEM)的组织培养板上进行培养,直至达到铺满密度。然后将含有所述基因的载体加入培养基中并用该载体转导包装细胞。包装细胞随即生产含有该基因的具有感染性的病毒颗粒(现在包装细胞被称作生产细胞)。
向转导的生产细胞中加入新鲜的培养基,接下来从一个铺满生产细胞的10cm平板中收集培养基。含有感染性病毒颗粒的培养基经微孔过滤器过滤以除去脱附(detached)的生产细胞,然后利用该培养基去感染成纤维细胞。从成纤维细胞的亚铺满平板中除去培养基并迅速地代之以来自于生产细胞的培养基。除去该培养基并代之以新鲜的培养基。如果病毒的滴度很高,那么实质上所有的成纤维细胞均被感染并且无需选择。如果滴度非常低,那么就需要采用具有如neohis这样的可选择性标记的逆转录病毒。
然后将工程化的成纤维细胞注射入宿主,它或单独注射或在一个cytodex 3微载体珠上已生长至铺满之后再注射。此时成纤维细胞产生蛋白质产物。
根据以上的教导,本发明的许多改进和变化都是可能的,因此在附加的权利要求的范围内可以另外的方式实施本发明。
序列表
(1)一般信息:
(i)申请人:WEI等
(ii)发明名称:转化生长因子α-HII
(iii)序列数:12
(iv)通讯地址:
(A)收信人:CARELLA,BYRNE,BAIN,GILFILLAN,
           CECCHI,STEWART和OLSTEIN
(B)街道:6BECKER FARM ROAD
(C)城市:ROSELAND
(D)州:新泽西州
(E)国家:美国
(F)邮码:07068
(v)计算机可读形式:
(A)介质类型:3.5英寸磁盘
(B)计算机:IBM PS/2
(c)操作***:MS-DOS
(D)软件:WORD PERFECT 5.1
(vi)当前申请数据:
(A)申请号:
(B)申请日:
(C)分类号:
(vii)在先申请数据
(A)申请号:没有
(B)申请日:没有
(viii)律师/代理人信息:
(A)姓名:FERRARO,GREGORY D.
(B)登记号:36,134
(c)案号/文档号:325800-351
(ix)电信信息:
(A)电话:201-994-1700
(B)传真:201-994-1744
(2)SEQ ID NO:1的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:1659个碱基对
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:cDNA
(xi)序列描述:SEQ ID NO:1
CACTCGTCTG CCCCTGGACT CCCGTCTCCT CCTGTCCTCC GGCTTCCCAG AGCTCCCTCC 60
TTATGGCAGC AGCTTCCCGC GTCTCCGGCG CAGTTCTCAG CGGACGACCC TCTCGCTCCG 120
GGGCTGAGCC CAGTCCCTGG ATGTTGCTGA AACTCTCGAG ATCATGCGCG GGTTTGGCTG 180
CTGCTTCCCC GCCGGGTGCC ACTGCCACCG CCGCCGCCTC TGCTGCCGCC GTCCGCGGGA 240
TGCTCAGTAG CCCGCTGCCC GGCCCCCGCG ATCCTGTGTT CCTCGGAAGC CGTTTGCTGC 300
TGCAGAGTTG CACGAACTAG TCATGGTGCT GTGGGAGTCC CCGCGGCAGT GCAGCAGCTG 360
GACACTTTGC GAGGGCTTTT GCTGGCTGCT GCTGCTGCCC GTCATGCTAC TCATCGTAGC 420
CCGCCCGGTG AAGCTCGCTG CTTTCCCTAC CTCCTTAAGT GACTGCCAAA CGCCCACCGG 480
CTGGAATTGC TCTGGTTATG ATGACAGAGA AAATGATCTC TTCCTCTGTG ACACCAACAC 540
CTGTAAATTT GATGGGGAAT GTTTAAGAAT TGGAGACACT GTGACTTGCG TCTGTCAGTT 600
CAAGTGCAAC AATGACTATG TGCCTGTGTG TGGCTCCAAT GGGGAGAGCT ACCAGAATGA 660
GTGTTACCTG CGACAGGCTG CATGCAAACA GCAGAGTGAG ATACTTGTGG TGTCAGAAGG 720
ATCATGTGCC ACAGATGCAG GATCAGGATC TGGAGATGGA GTCCATGAAG GCTCTGGAGA 780
AACTAGTCAA AAGGAGACAT CCACCTGTGA TATTTGCCAG TTTGGTGCAG AATGTGACGA 840
AGATGCCGAG GATGTCTGGT GTGTGTGTAA TATTGACTGT TCTCAAACCA ACTTCAATCC 900
CCTCTGCGCT TCTGATGGGA AATCTTATGA TAATGCATGC CAAATCAAAG AAGCATCGTG 960
TCAGAAACAG GAGAAAATTG AAGTCATGTC TTTGGGTCGA TGTCAAGATA ACACAACTAC 1020
AACTACTAAG TCTGAAGATG GGCATTATGC AAGAACAGAT TATGCAGAGA ATGCTAACAA 1080
ATTAGAAGAA AGTGCCAGAG AACACCACAT ACCTTGTCCG GAACATTACA ATGGCTTCTG 1140
CATGCATGGG AAGTGTGAGC ATTCTATCAA TATGCAGGAG CCATCTTGCA GGTGTGATGC 1200
TGGTTATACT GGACAACACT GTGAAAAAAA GGACTACAGT GTTCTATACG TTGTTCCCGG 1260
TCCTGTACGA TTTCAGTATG TCTTAATCGC AGCTGTGATT GGAACAATTC AGATTGCTGT 1320
CATCTGTGTG GTGGTCCTCT GCATCACAAG GAAATGCCCC AGAAGCAACA GAATTCACAG 1380
ACAGAAGCAA AATACAGGGC ACTACAGTTC GGACAATACA ACAAGAGCGT CCACGAGGTT 1440
AATCTAAAGG GAGCATGTTT CACAGTGGCT GGACTACCGA GAGCTTGGAC TACACAATAC 1500
AGTATTATAG ACAAAAGAAT AAGACAAGAG ATCTACACAT GTTGCCTTGC ATTTGTGGTA 1560
ATCTACACCA ATGAAAGCAT GTACTACAGC TATATTTGAT TATGTATGGA TATATTTGAA 1620
ATAGTATACA TTGTCTTGAT GTTTTTTCTG TAATGTAAAT AAACTATTTA TATCACACAA 1680
AAAAAAAAAA AAAAA                                                  1695
(2)SEQ ID NO:2的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:374个氨基酸
(B)类型:氨基酸
(C)链型:
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:蛋白质
(xi)序列描述:SEQ ID NO:2
Met Val Leu Trp Glu Ser Pro Arg Gln Cys Ser Ser Trp Thr Leu
-45                 -40                 -35
Cys Glu Gly Phe Cys Trp Leu Leu Leu Leu Pro Val Met Leu Leu
-30                 -25                 -20
Ile Val Ala Arg Pro Val Lys Leu Ala Ala Phe Pro Thr Ser Leu
-15                 -10                 -5
Ser Asp Cys Gln Thr Pro Thr Gly Trp Asn Cys Ser Gly Tyr Asp
  1              5                   10                  15
Asp Arg Glu Asn Asp Leu Phe Leu Cys Asp Thr Asn Thr Cys Lys
                 20                  25                  30
Phe Asp Gly Glu Cys Leu Arg Ile Gly Asp Thr Val Thr Cys Val
                 35                  40                  45
Cys Gln Phe Lys Cys Asn Asn Asp Tyr Val Pro Val Cys Gly Ser
                 50                  55                  60
Asn Gly Glu Ser Tyr Gln Asn Glu Cys Tyr Leu Arg Gln Ala Ala
                 65                  70                  75
Cys Lys Gln Gln Ser Glu Ile Leu Val Val Ser Glu Gly Ser Cys
                 80                  85                  90
Ala Thr Asp Ala Gly Ser Gly Ser Gly Asp Gly Val His Glu Gly
                 95                 100                 105
Ser Gly Glu Thr Ser Gln Lys Glu Thr Ser Thr Cys Asp Ile Cys
                110                 115                 120
Gln Phe Gly Ala Glu Cys Asp Glu Asp Ala Glu Asp Val Trp Cys
                125                 130                 135
Val Cys Asn Ile Asp Cys Ser Gln Thr Asn Phe Asn Pro Leu Cys
                140                 145                 150
Ala Ser Asp Gly Lys Ser Tyr Asp Asn Ala Cys Gln Ile Lys Glu
                155                 160                 165
Ala Ser Cys Gln Lys Gln Glu Lys Ile Glu Val Met Ser Leu Gly
                170                 175                 180
Arg Cys Gln Asp Asn Thr Thr Thr Thr Thr Lys Ser Glu Asp Gly
                185                 190                 195
His Tyr Ala Arg Thr Asp Tyr Ala Glu Asn Ala Asn Lys Leu Glu
                200                 205                 210
Glu Ser Ala Arg Glu His His Ile Pro Cys Pro Glu His Tyr Asn
                215                 220                 225
Gly Phe Cys Met His Gly Lys Cys Glu His Ser Ile Asn Met Gln
                230                 235                 240
Glu Pro Ser Cys Arg Cys Asp Ala Gly Tyr Thr Gly Gln His Cys
                245                 250                 255
Glu Lys Lys Asp Tyr Ser Val Leu Tyr Val Val Pro Gly Pro Val
                260                 265                 270
Arg Phe Gln Tyr Val Leu Ile Ala Ala Val Ile Gly Thr Ile Gln
                275                 280                 285
Ile Ala Val Ile Cys Val Val Val Leu Cys Ile Thr Arg Lys Cys
                290                 295                 300
Pro Arg Ser Asn Arg Ile His Arg Gln Lys Gln Asn Thr Gly His
                305                 310                 315
Tyr Ser Ser Asp Asn Thr Thr Arg Ala Ser Thr Arg Leu Ile
                320                 325
(2)SEQ ID NO:3的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:30个碱基对
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:寡核苷酸
(xi)序列描述:SEQ ID NO:3
CCCGGATCCG CACGAGACAT ACCTTGTCCG                       30
(2)SEQ ID NO:4的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:32个碱基对
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:寡核苷酸
(xi)序列描述:SEQ ID NO:4
GGGAAGCTTT TAATACTGAA ATCGTACAGG AC                    32
(2)SEQ ID NO:5的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:33个碱基对
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:寡核苷酸
(xi)序列描述:SEQ ID NO:5
CGCGGATCCG CCATCATGGT GCTGTGGGAG TCC                   33
(2)SEQ ID NO:6的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:31个碱基对
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:寡核苷酸
(xi)序列描述:SEQ ID NO:6
GCGTCTAGAC TAGTATAGAA CACTGTAGTC C                     31
(2)SEQ ID NO:7的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:33个碱基对
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:寡核苷酸
(xi)序列描述:SEQ ID NO:7
CGCGGATCCG CCATCATGCT ACTCATCGTA GCC                   33
(2)SEQ ID NO:8的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:31个碱基对
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:寡核苷酸
(xi)序列描述:SEQ ID NO:8
GCGTCTAGAC TAGTATAGAA CACTGTAGTC C                     31
(2)SEQ ID NO:9的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:31个碱基对
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:寡核苷酸
(xi)序列描述:SEQ ID NO:9
CGCGGATCCA GAACACCACA TACCTTGTCC G                     31
(2)SEQ ID NO:10的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:31个碱基对
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:寡核苷酸
(xi)序列描述:SEQ ID NO:10
GCGTCTAGAC TAGTATAGAA CACTGTAGTC C                     31
(2)SEQ ID NO:11的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:33个碱基对
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:寡核苷酸
(xi)序列描述:SEQ ID NO:11
CGCGGATCCG CCATCATGGT GCTGTGGGAG TCC                   33
(2)SEQ ID NO:12的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:28个碱基对
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:寡核苷酸
(xi)序列描述:SEQ ID NO:12
GCGCTCGAGG TATAGAACAC TGTAGTCC                         28

Claims (30)

1.一种分离的多核苷酸,其包含选自如下一组的成员:
(a)一种多核苷酸,这种多核苷酸编码如SEQ ID NO:2所示的多肽;
(b)一种多核苷酸,这种多核苷酸编码包含SEQ ID NO:2的1至329位氨基酸之多肽;
(c)一种多核苷酸,这种多核苷酸编码包含SEQ ID NO:2的1至264位氨基酸之多肽;
(d)一种多核苷酸,这种多核苷酸编码包含SEQ ID NO:2的215至329位氨基酸之多肽;
(e)一种多核苷酸,这种多核苷酸编码包含SEQ ID NO:2的215至264位氨基酸之多肽;
(f)一种多核苷酸,这种多核苷酸能够和(a),(b),(c),(d)或(e)的多核苷酸杂交,并且和它们具有至少70%的相同性。
(h)一种(a),(b),(c),(d),(e)或者(f)的多核苷酸的多核苷酸片段。
2.权利要求1的多核苷酸,其中所说的多核苷酸是DNA。
3.权利要求1的多核苷酸,其中所说的多核苷酸是RNA。
4.权利要求1的多核苷酸,其中所说的多核苷酸是基因组DNA。
5.权利要求2的多核苷酸,这种多核苷酸编码如SEQ ID NO:2所示的多肽。
6.权利要求2的多核苷酸,这种多核苷酸编码包含如SEQ IDNO:2所示的1至329位氨基酸的多肽。
7.权利要求2的多核苷酸,这种多核苷酸编码包含如SEQ IDNO:2所示的1至264位氨基酸的多肽。
8.权利要求2的多核苷酸,这种多核苷酸编码包含如SEQ IDNO:2所示的215至329位氨基酸的多肽。
9.权利要求2的多核苷酸,这种多核苷酸编码包含如SEQ IDNO:2所示的215至264位氨基酸的多肽。
10.一种分离的多核苷酸,其包含选自如下一组的成员:
(a)一种多核苷酸,这种多核苷酸编码一种成熟多肽,这种多肽具有由包含在ATCC保藏号97160中的DNA表达的氨基酸序列;
(b)一种多核苷酸,这种多核苷酸能够和(a)的多核苷酸杂交,并且和其具有至少70%的相同性。
(c)一种(a)或者(b)的多核苷酸的多核苷酸片段。
11.权利要求1的多核苷酸,这种多核苷酸具有如SEQ ID NO:1所示的序列。
12.权利要求1的多核苷酸,这种多核苷酸包含如SEQ ID NO:1所示的321位核苷酸至1248位核苷酸。
13.权利要求1的多核苷酸,这种多核苷酸包含如SEQ ID NO:1所示的402位核苷酸至1248位核苷酸。
14.权利要求1的多核苷酸,这种多核苷酸包含如SEQ ID NO:1所示的1100位核苷酸至1248位核苷酸。
15.一种载体,这种载体包含权利要求2的DNA。
16.一种由权利要求15的载体转化或者转染过的宿主细胞。
17.一种生产多肽的方法,这种方法包括在权利要求16的宿主细胞中表达由所说的DNA编码的多肽。
18.一种产生能够表达多肽之细胞的方法,这种方法包括用权利要求15的载体对细胞进行基因工程操作。
19.一种多肽,这种多肽包含选自如下一组的成员:
(a)一种具有SEQ ID NO:2的推导的氨基酸序列的多肽;
(b)一种包含如SEQ ID NO:2所示的1至329位氨基酸的多肽;
(c)一种包含如SEQ ID NO:2所示的215至329位氨基酸的多肽;
(d)一种包含如SEQ ID NO:2所示的215至264位氨基酸的多肽;
(e)一种包含如SEQ ID NO:2所示的1至264位氨基酸的多肽;
(f)(a),(b),(c),(d)或者(e)之多肽的片段、类似物以及衍生物;和
(g)一种由ATCC保藏号97160的cDNA编码的多肽,和其片段、类似物以及衍生物。
20.权利要求19的多肽,这种多肽包含SEQ ID NO:2的215位氨基酸至264位氨基酸。
21.一种权利要求19之多肽的抗体。
22.一种化合物,这种化合物抑制权利要求19之多肽的激活。
23.一种化合物,这种化合物激活权利要求19之多肽。
24.一种治疗需要TGFα-HII之患者的方法,这种方法包括:对患者施用治疗有效量的权利要求19的多肽。
25.一种治疗需要抑制TGFα-HII之患者的方法,这种方法包括:对患者施用治疗有效量的权利要求22的化合物。
26.权利要求24的方法,其中所说的治疗有效量的多肽是通过对患者提供编码所说多肽的DNA,并在体内表达所说的多肽来施用的。
27.一种鉴定作为权利要求19的多肽的***有活性的化合物的方法,这种方法包括:
将包含表达TGFα-HII受体之细胞类型的反应混合物和待筛选的化合物接触;和
确定此化合物是否从所说的受体产生信号,以便鉴定此化合物是否是有效的***。
28.一种鉴定作为权利要求19的多肽的拮抗剂有活性的化合物的方法,这种方法包括:
将包含表达TGFα-HII受体之细胞类型的反应混合物和待筛选的化合物接触;和
在和所说的化合物结合后,确定不存在由所说的受体产生的信号,以便鉴定此化合物是否是有效的拮抗剂。
29.一种诊断疾病或者对疾病的易感性的方法,这种方法包括:
测定权利要求1的多核苷酸中的突变。
30.一种诊断方法,这种方法包括:
分析来源于宿主细胞的样品中是否存在权利要求19的多肽。
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