BE1025623B1 - Dispositif de lecture optique à la carte d’un support solide amovible pour la détection et/ou la quantification d’analytes présents dans un échantillon - Google Patents
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Abstract
Dispositif (1) de lecture optique d’un support (2) amovible pour la détection et/ou la quantification d’analytes présents dans un échantillon comprenant des moyens de communications (8) pour obtenir une information relative à un support (2) ; des moyens de sélection (27) pour sélectionner à partir d’une liste d’analytes prédéfinis, une sélection d’analytes à détecter et/ou à quantifier ; une unité optique (7), pour analyser ledit support (2) sur la base de paramètres d’analyse compris dans ladite information relative à un support (2) ; des moyens de traitement d’image (12) ; des moyens de détermination (13) pour déterminer des informations d’analyte sur la base de l’information relative au support (2) et des données des moyens de traitement d’image (12) ; et des moyens de transmission pour transmettre les informations d’analyte.
Description
Domaine technique [0001] Selon un premier aspect, l'invention se rapporte à un dispositif de lecture optique d’un support solide pour la détection et/ou la quantification d’analytes présents dans un échantillon. Selon un deuxième aspect, l’invention se rapporte à un ensemble de diagnostic comprenant un dispositif de lecture optique selon le premier aspect et un moyen de diagnostic.
Etat de la technique [0002] La surveillance et le contrôle des produits alimentaires imposent d’effectuer des tests le plus en amont possible de leur fabrication. Idéalement ces tests doivent être réalisés sur le lieu de production des matières premières 15 ou sur leur lieu de transformation. Ces tests de dépistages ou tests de screening sont particulièrement conçus pour détecter la présence de certains analytes de type bactérien, antibactérien ou antibiotique dans des échantillons. La multiplication des normes sanitaires et la volonté d’une meilleure traçabilité des produits alimentaires imposent une multiplication des analytes à tester ainsi 20 que de connaître le plus précisément possible leurs classes et leurs quantités.
[0003] Une façon de détecter des analytes d’un échantillon consiste à utiliser un mélange réactionnel comprenant des molécules biologiques de reconnaissance par exemple capables chacune de reconnaître un anaiyte déterminé présent dans ledit échantillon. La détection d’analytes peut alors être 25 réalisée avec une tigette (support immunochromatographlque) que l’on plonge dans une fiole contenant le mélange réactionnel. La tigette comprend en général plusieurs zones souvent appelées ligne ou point de détection correspondant à différents analytes à détecter ou à quantifier. Le diagnostic est finalement réalisé par exemple par une visualisation directe de chacun des 30 lignes de la tigette, ou à l’aide d’un lecteur permettant d’analyser les signaux émis par les différents lignes ou points de détection.
BE2017/5707 [0004] Un analyte à détecter est donc souvent mis en évidence par une ligne ou points sur la tigette. Le changement de couleur ou d’intensité lumineuse du signal réfléchi par la ligne ou le point en lien avec fanalyte à détecter est la méthode la plus répandue (réflectométrie). Des molécules 5 couplées à un fluorophore (ou à une molécule active pouvant générer/modifîer un substrat fluorescent ou chromogène) ayant une fonction de marquage peuvent être utilisées pour notamment permettre d’obtenir des seuils de détection plus bas et permettant de rendre ie signal non-interprétable de manière directe par l’œil humain dans le but de contourner les risques de 10 subjectivité (ou d’erreur) d'un individu à un autre ainsi qu’un risque de falsification. L’utilisation de fluorophores nécessite notamment une inspection de la fluorescence émise par tes différents lignes ou points positionnés sur une tigette.
[GOOS] Il est déjà connu de l’état de la technique des lecteurs optiques 15 pour réaliser un diagnostic concernant la présence et ou la quantité d’anaiytes présents sur une tigette de test préalablement trempée dans un fluide à tester. Cependant, les lecteurs optiques actuels ne permettent pas la lecture optique d’une sélection de régions d’intérêt choisie à partir d’un grand nombre de régions d’intérêt correspondant à des analytes définis présents sur une tigette.
Les dispositifs de lecture optique actuels, afin de permettre une sélection d’analyte à partir d’un grand nombre d'intérêt nécessitent que soit mis à disposition une pluralité de bandelettes permettant le test de ladite sélection de régions d’intérêt choisie correspondant à des analytes à tester. Tout cela nécessite une manipulation importante des bandelettes à tester, coûteuse en 2S temps et en gestion des stocks.
Résumé de Pinvenfion [0008] Selon un premier aspect, un des buts de la présente invention est de fournir un dispositif de lecture optique d’un support solide amovible pour la 30 détection et/ou la quantification d’anaiytes présents dans un échantillon et.
permettant la sélection des analytes à tester sans nécessiter l’utilisation de plusieurs support solides amovibles. Un des bute de ia présente invention est de permettre une sélection d’anaiytes parmi une liste préétablie pour laquelle
BE2017/5707 un opérateur souhaite tester la présence ou obtenir une quantification desdits analytes.
[0GÛ7] A cet effet, les inventeurs proposent un dispositif de lecture optique d'un support solide amovible pour la détection et/ou la quantification d’analytes présents dans un échantillon et comprenant :
- un emplacement pour recevoir ledit support solide :
·· une unité optique pour analyser ledit support solide et comprenant :
o une première source lumineuse pour émettre selon une intensité d’émission et dans une mière plage de longueur 10 d’onde un premier faisceau lumineux vers ledit emplacement (20);
o un système d’imagerie comprenant un détecteur optique pour fournir une image d'une zone de visualisation, ladite zone de visualisation comprenant au moins une portion dudit 15 emplacement ;
o un filtre pour filtrer une plage de longueur d’onde définie, et positionné entre l’emplacement et ledit système d’imagerie ;
- des moyens de communications pour obtenir une information relative à un support solide ;
- des moyens de sélection pour :
o sélectionner à partir d’une liste d’analytes prédéfinis, une sélection d’analytes à détecter et/ou à quantifier ;
des moyens de traitement d’image de ladite image pour :
o déterminer, à partir de l’information relative audit support solide à lire, un nombre fini de sous-ensembles de ladite image, chaque sous-ensemble correspondant à un analyte ;
o fournir des données relatives à des intensités lumineuses issues desdits sous-ensembles ;
- des moyens de détermination pour :
o calculer, pour chaque sous-ensemble correspondant à un analyte sélectionné dans ladite sélection d'analytes une intensité de sous-ensemble ;
BE2017/5707 o déterminer sur la base de ladite intensité de sous-ensemble des informations d’analyte pour chaque sous-ensembte correspondant à un analyte sélectionné dans ladite sélection d’analytes ;
des moyens de transmission configurés pour transmettre ladite information d’analyte pour chaque sous-ensemble correspondant à un analyte sélectionné dans ladite sélection d'analytes.
[0008] Le dispositif selon l’invention permet te lecture des zones à tester, en particulier avec une mesure instantanée de fluorescence ou de façon 10 préférée avec une mesure de la lumière réfléchie des zones à tester. Afin de permettre une sélection des analytes à tester correspondant à des zones d’intérêts sur une tigette, le dispositif propose grâce à l’accès à une méthode contenant des informations relatives à une tigette, une sélection à partir d'une liste d’analytes à tester. Il est en effet Intéressant d'effectuer une sélection des 15 analytes à tester avant d’en obtenir les résultats afin de bien cibler tes analytes dont il est nécessaire de connaître les résultats d’un test afin de ne pas exposer un utilisateur à une trop grande quantité de résultats. Donner accès à une trop grande quantité de résultats â un utilisateur n’en ayant pas nécessairement le besoin l’expose au risque d’une perte d’objectivité par rapport à son intention 2 0 d’analyse initiale. Il est également intéressant d’un point de vue économique pour l’utilisateur qu’il paie uniquement pour les résultats dont H a réellement besoin. Pour le producteur et ou te distributeur, il est intéressant de disposer d’un procédé industriel unique permettant une simplification du procédé de fabrication ainsi qu'une simplification de ia gestion des stocks. Ainsi, le dispositif 25 de l’invention, grâce à des moyens de sélection, permet un choix des analytes à tester par l’utilisateur avant d’effectuer la lecture de la tigette. Les moyens de sélection, en communication avec les moyens de traitement d’image permettent aux moyens de traitement d’image, une détermination des informations des analytes sélectionnés uniquement.
[0009] L’avantage du dispositif de l’invention est de permettre une lecture optique basée sur la fluorescence de zones comprenant des informations relatives aux analytes à tester. De préférence, le signal interprété par tes moyens de détermination peut avoir une intensité absolue (unité arbitraire) ou
BE2017/5707 avoir une intensité relative par rapport à une intensité émise par un point de référence ou par un point de contrôle Interne émettant une intensité de référence. De pies, ce lecteur optique permet une sélection des anaiytes à tester â partir d’une seule tigette, c’est-à-dire ne nécessitant pas ie 5 positionnement d’une ou plusieurs tigettes différentes dans une cassette, la cassette étant ensuite insérée dans le lecteur. Plusieurs tigettes pouvant également être insérées directement dans un lecteur optique. Par ailleurs, ce lecteur optique permet par exemple une communication par câble ou sans-fil des résultats concernant les analytes à tester.
[0010] Un avantage d’utiliser le lecteur optique de l’invention pour réaliser un diagnostic concernant une sélection d’analytes d’intérêt est qu’il ne nécessite ni une première sélection des bandelettes à tester, ni la mise en contact de chacune de ces bandelettes avec le produit à tester puis leur positionnement dans le lecteur optique. De le lecteur optique de l'invention pour 15 permettre une sélection des analytes d’intérêt ne nécessite pas que soit rnis à disposition une pluralité de bandelettes permettant le test de ladite sélection d'analytes à tester. Tout cela permet d'éviter une manipulation importante des bandelettes à tester, coûteuse en temps et en gestion des stocks, Cela permet également une analyse plus simple, plus rapide et plus ciblée des anaiytes à 20 tester, en disposant uniquement des résultats sélectionnés à l’issue de la lecture de la bandelette par le lecteur optique de l’invention.
[0011] Par exemple, les moyens de sélection, en communication avec les moyens de détermination et avec les moyens de transmission, permettent, la transmission des résultats concernant les anaiytes sélectionnés et ia 25 transmission des résultats des anaiytes non sélectionnés vers des moyens de cryptage. Les moyens de cryptages permettant alors un cryptage des données relatives aux anaiytes non enregistrés et l'enregistrement de ces données cryptées. L’avantage de l’enregistrement des données cryptées comprenant les résultats des anaiytes non-sélectionnés permet de pouvoir disposer des 30 résultats concernant les anaiytes non-sélectionnés mais d’en limiter l'accès aux personnes disposant de moyens de décryptages aptes à décrypter les données cryptées par les moyens de cryptages. Par exemple, les données cryptées
BE2017/5707 comprennent l’image acquise par le détecteur optique ainsi qu'une méthode ou une information relative à la tigette testées.
[0012] Les analytes pouvant être détectés et ou quantifiés sont par exempte des contaminants chimiques, des protéines ou des pathogènes. Les 5 échantillons pouvant faire l’objet d’une détection et ou d’une quantification par le dispositif selon l’invention sont par exemple des échantillons de lait, de sang, de sérum, de salive, d’eau, d’urine, de céréales, de viande, de sécrétions lacrymales...
[Ö013] De préférence, le dispositif selon »'invention permet la lecture 10 d'emplacements (de récupération) ou de dots fixés sur un support solide (ou système récupérateur) selon un arrangement, préférentiellement matriciel en deux dimensions sous la forme de points présentant chacun un diamètre compris entre 20 μm et 2 mm, de préférence compris entre 100 μm et 500 μm. et encore plus préférentiellement compris entre 250 μm et 400 μm. Le dispositif 15 selon l'invention permet la benne différenciation d’emplacements de récupération sous forme de points présentant chacun un diamètre et un espacement compris entre 20 μm et 2 mm, de préférence compris entre 100 μm et 500 μm et encore plus préférentiellement compris entre 250 μm et 400 μm, permettant ainsi de fixer au moins 5 emplacements, de préférence au 20 moins 10, et encore plus préférentiellement au moins 15 emplacements de récupération en simpiicat, en duplicat, en triplicat ou plus pour la détection et/ou la quantification d’au moins 5, de préférence au moins 10, préférentiellement au moins 15 analytes de classes différentes, appartenant ou non à des familles d'anaiytes distinctes, ainsi qu'au moins un emplacement de récupération 22 déposé en simpiicat, en duplicat, en triplicat ou plus destiné au contrôle positif du seuil de détection permettant de valider le test et/ou à la calibration pour la détection et/ou la quantification, et ce sur un système récupérateur ayant uns taille raisonnable et dfô l’ordre du centimètre carré, pour la réalisation de la détection et/ou la quantification desdits au moins 15 analytes par le dispositif de 30 lecture optique de l’invention.
[Ü014] De façon préférée, le dispositif d’identification est positionné au niveau dudit emplacement pour Identifier un support solide à lire positionné dans ledit emplacement. Les moyens de communications sont également des
BE2017/5707 moyens de lecture, par exemple pour lire des données sur un support solide de données amovible. Par exemple, les moyens de communications permettent une connexion à un réseau de type internet par des câbles ou par des moyens sans fil de type wifi, Bluetooth, 4/5G ou de communication en champ proche.
Un support solide selon l’invention est par exemple une tigette.
[0015] Limage comprend des sous-ensembie, des portions, des régions d’intérêt., des zones d’intérêt ou encore des parties d’images. Préférentiellement, les sous-ensembie d'une image comprennent une pluralité de pixels. De préférence, chaque sous-ensembie comprend au moins 20 pixels, 10 de préférence plus de 50 pixels et de manière encore plus préférée plus de 250 pixels.
[0016] De préférence la première source lumineuse permet une lecture des réglons d’intérêt en fluorescence, c’est-à-dire avec une plage de longueur d’onde qui coïncide avec le spectre d’absorption d'éléments fluorescent tels que 15 des molécules de marquage. Les molécules de marquage réémettent alors l’énergie lumineuse absorbée dans une plage de longueur différente de la plage de la première source lumineuse. L'unité optique permet alors l’acquisition du signal de fluorescence émis par les molécules de marquage fluorescentes. Un filtre passe-bande positionné entre le détecteur optique et les molécules de 20 marquage fluorescentes permet de stopper la lumière émise par la source lumineuse permettant l’excitation des molécules de marquage fluorescentes tout en laissant passer la lumière émise par les molécules de marquage fluorescentes.
[0017] De préférence, les moyens de transmission sont configurés pour 25 transmettre ou communiquer l’information d’analyte pour chaque sousensembie vers une mémoire. De préférence, les moyens de transmission permettent de transmettre une information d’analyte vers un dispositif d’affichage compris dans le dispositif de lecture optique selon Unvention.
[0018] Un avantage du dispositif selon l’invention est de pouvoir recevoir 3 G un support solide comme par exemple une tigette de type immunoobromatographique (avec ou sans cassette) ou une puce microfluidique.
BE2017/5707 [Ö019] Par exempte, un kit comprend le dispositif de l’invention et un incubateur, afin de permettre l’incubation du mélange réactionnel contenu dans une fiole ainsi que pendant le trempage du support solide amovible. L’incubateur permet le maintien en position et en température du mélange 5 réactionnel à une température de préférence entre 25’C et 35C et encore plus préférentiellement à 30°C. L'incubateur est à utiliser avant le positionnement du support solide amovible dans emplacement du dispositif.
[0920] Un des buts d'un mode de réalisation préféré de ia présente invention est de permettre un coût de revient à l'utilisateur du dispositif de 10 l’invention qui soit directement lié à une sélection par l’utilisateur d’analytes à tester. Un des buts de la présente invention est de permettre au fournisseur du dispositif de lecture optique, une facturation sur ia base d’une sélection par l’utilisa leur d'analytes à tester.
[0021] De préférence, le dispositif comprend en outre :
- un compteur de crédit, ledit compteur de crédit étant Increments lors de la sélection de chaque analyte à détecter et/ou à quantifier.
[0022] Par exemple, le compteur de crédit permet une incrémentation positive ou négative. Par exempte te compteur de crédit est rechargeable et permet de bloquer les moyens de traitement d’image et ou les moyens de 20 détermination et ou les moyens de transmission des données relative à la tigette à mesurer lorsque le solde de crédit est égal à zéro ou que te solde de crédit n’est pas suffisant pour réaliser l’analyse de tous les analytes sélectionnés par tes moyens de sélection. Un avantage du compteur de crédit est qu’il peut être rechargé à partir des moyens de communications. Par 2 5 exemple une consigne pour incrémenter te crédit de façon positive est contenue sur une clé usb amovible ou directement transférée en webservice via une plateforme internet utilisée pour la gestion des dispositifs optiques à distance. Par exemple une consigne pour une incrémentation positive de crédit est accessible aux moyens d’une connexion sans fil. Par exemple le compteur de 30 crédit est un compteur d’unité ou ‘unit’. Par exemple, tes crédits (ou unités d’utilisation) ’’virtuelles’’ sont décomptés au regard du nombre d’analyse (tigettes) et du nombre de channel (point ou dot.) sélectionné. Les crédits peuvent être rechargés après un payement.
BE2017/5707 [0023] De préférence, te dispositif comprend en outre :
- des moyens de cryptage et d’enregistrement pour enregistrer l’image sur la base d’un cryptage défini.
[0024] Par exemple, tes moyens de sélection, en communication avec les moyens de détermination et avec les moyens de transmission, permettent la transmission des résultats concernant ies analytes sélectionnés. L'image ayant permis ia détermination des résultats concernant les analytes est par exemple transmise vers des moyens de cryptage. Les moyens de cryptages permettant alors un cryptage des données relatives aux analytes enregistrés et non ïû enregistrés et l’enregistrement de ces données cryptées, L'avantage de l'enregistrement des données cryptées comprenant les résultats des analytes non-sélectionnés permet de pouvoir disposer des résultats concernant Iss analytes non-sélectionnés mais d’en limiter l’accès aux personnes disposant de moyens de décryptages aptes à décrypter les données cryptées par tes moyens 15 de cryptages. Par exemple, les données cryptées comprennent, l’image acquise par le détecteur optique ainsi qu’une méthode ou une information relative à la tigette testées. Pour obtenir des résultats des « channels (points) nonsélectionnés », il faut activer ies « channels (points)» en question et faire une « réannalyse d’image existante » pour dévoiler les résultats des points non20 sélectionnés initialement. Un avantage de disposer de l’image acquise par l'unité optique ainsi que d’une information relative à la tigette testée est de pouvoir réaliser une rè~analyse du support solide à n’importe quel moment après la première analyse selon l’invention. Il est ainsi possible de s’assurer de la bonne analyse de l’image par tes moyens de traitement d’image, d’analyser 25 des sous-ensembles n’ayant pas été sélectionnés par les moyens de sélection ou encore d’effectuer analyse quantitative lorsqu’une première analyse qualitative avait été effectuée. Cet avantage d’enregistrer l’image, de préférence sous forme cryptée, permet de s’assurer qu’elle ne peut être lue que par une personne ayant les droits d'y accéder. Lors d’une ré-analyse, dans 1e 30 cas où de l’analyse d’analytes non précédemment détecté ou quantifier, une incrémentation d’un compteur de crédit est de préférence possible.
[O025] De préférence, le dispositif comprend en outre :
- un dispositif d’identification pour identifier un support, solide à lire ;
BE2017/5707 et en ce que les moyens de communication sont configurés pour obtenir une information relative audit support solide identifié par ledit dispositif d’identification.
[0026] Un avantage que ie lecteur optique de l’invention comprenne un dispositif d’identification pour identifier un support solide à lire est de permettre un choix automatique de la méthode à appliquer au support solide â lire. Cela permet un gain de temps et permet d’éviter les risques d'erreur par rapport à un choix manuel de la méthode, Une méthode de lecture comprend des informations propre au support solide à lire et permettant notamment le bon i û fonctionnement de l'unité optique, des moyens de traitement d'image et de détermination afin de pouvoir obtenir une information fiable relative à au moins un anaiyte.
[002T] De préférence, la liste d’analytes prédéfinis est comprise dans l'information relative à un support solide.
[0028] L’avantage d’avoir une liste d’anaiyte prédéfinis dans l’information relative à un support solide est de disposer d’une liste comprenant seulement les analytes que le support solide amovible est capable de déterminer. Cela permet de réaliser une sélection uniquement à partir des analytes pour lesquels il est possible d’obtenir un résultat et non à partir d’une liste exhaustive 20 d’analytes.
[0029] De préférence, les moyens de traitement d’image sont en outre configurés pour :
o détecter des zones de références de ladite Image, o positionner dans ladite image chaque sous-ensemble à une position déterminée à partir desdites zones de référence.
[0030] De préférence, les moyens de détermination sont configurés pour :
o déterminer sur la base de ladite intensité de sous-ensembfo et sur la base de l’information relative audit support solide à lire, 30 lesdites informations d’anaiyte pour chaque sous-ensemble correspondant à un anaiyte sélectionné dans ladite sélection d’analytes,
BE2017/5707 [0031] De préférence, un des avantages du mode de réalisation préféré de invention est de fournir un dispositif de lecture optique d’un support solide amovible pour la détection et/ou ia quantification d’anaiytes présents dans un échantillon avec un choix automatique de la méthode â appliquer à l’échantillon 5 à partir d’une base de données de méthodes. Le présent mode de réalisation de l’invention permet en outre une correction automatique liée à la variation de lots du support solide amovible pour chaque dots permettant la détection ou la quantification d’anaiytes.
[Ö032] Le dispositif de lecture optique selon ce mode de réalisation 10 préféré de l’invention permet une lecture optique d’une tigette pour l’analyse d’un échantillon avec un choix de méthode de lecture automatisé. La méthode de lecture comprenant de préférence des données relatives a : une- version de méthode, un numéro de lot, une date limite d’utilisation d’un lot, le type de source lumineuse utilisée, le type de zone d’intérêt (ligne ou point), méthode 15 pour analyse quantitative (binaire) ou quantitative, des paramètres d’acquisition d’image (temps d’exposition, gain,...), les positions par rapport à des points de référence (par exemple selon des coordonnées cartésiennes), un nombre de zones d’intérêt, un nombre de réplica par analyte, l’organisation matricielle des zones d’intérêt sur ie support solide mobile, la dimensions des zones d’intérêt 20 (par exemple, un rayon), une dimension relative à une zone autour d’une zone d’intérêt à considérer pour la prise en compte du background, des paramètres de calibration du type interpolation de données ou permettant une analyse quantitative d’un échantillon et enfin la désignation des zones d’intérêt en fonction de l'analyte qu’elles permettent de détecter et/ou de quantifier.
[0033] La choix automatique de la méthode de lecture est réalisé par le lecteur optique de l’invention grâce au dispositif d'identification pour identifier un support solide à lire. Par exemple, le dispositif d’identification est un lecteur de code barre, de QR code, de datamatrix ou similaire permettant à partir d’un code inscrit sur un support solide, de disposer d’informations relative au support 30 solide. De préférence, à partir d’une information relative au support solide contenu par un marquage présent sur un support solide, le lecteur optique de l’invention permet grâce aux moyens de communication de consulter une base de données de méthode afin d'accéder à la méthode correspondant au support
BE2017/5707 solide présent dans le lecteur. Par exemple le dispositif d’identification est lecteur de données en champ proche et le type de marquage présent sur un support solide est une puce RFID. Par exemple les moyens de communication permettent d'accéder à une base de données de méthode sous format Imprimé, s Par exemple la base donnée est répartie sur plusieurs feuillets, la méthode correspondant au support solide étant acquise par la lecture du feuillet correspondant à la méthode voulue. Par exemple les moyens d’affichage du lecteur optique Indiquent le feuillet comprenant ia méthode voulue. Par exempte les moyens de communications permettent une confirmation que la méthode 10 lue est bien ia méthode correspondant à un support solide à lire, [G034] Le dispositif de lecture optique selon ce mode de réalisation de l’invention permet à partir d’une image fournit par le détecteur optique, une détermination d’un nombre) de sous-ensembles à analyser à partir des informations contenues dans la méthode choisie grâce au dispositif 15 d’identification. Cela permet une meilleure localisation des zones d’intérêts sur le support solide à lire. Lorsque les sous-ensembles sont positionnés au niveau des zones d’intérêt de la tigette, les moyens de détermination permettent une détermination d’une information d'analyte pour chaque sous-ensembie. Par exemple une information d'analyte pour une zone d’intérêt est modifiée par les 20 moyens de détermination sur la base d’informations d'analytes contenues dans la méthode. Par exemple, oes informations d’analytes sont une courbe de calibration permettent de déterminer une information quantitative d’un analyte. Par exemple, des informations d’analytes sont une intensité seuil pour une zone d’intérêt et donc pour un analyte, intensité seuil à partir de laquelle un analyte 2 5 est considéré présent ou non présent dans l’échantillon testé. Par exemple, une valeur d’intensité seuil peut varier d'un lot de support solide mobile à un autre ce qui nécessite un accès automatique à une méthode pour assurer un résultat d’analyse fiable et avec un seuil de détection correspondant aux normes en vigueur.
[0035] De préférence les tlgettes à mesurer sont dotées d’un identifiant unique (à partir duquel la méthode de lecture peut être automatiquement désignée) qui permet de prévenir un utilisateur de ia réutilisation d’une tigette déjà utilisée. En effet, il existe un risque de réutilisation d’une tigette ayant déjà
BE2017/5707 été utilisé pour l’analyse d’un premier échantillon et ne pouvant être réutilisée pour une analyse d’un deuxième échantillon. Ainsi le dispositif de l’invention, permet de vérifier dans une base de données de support solide mobile, via les moyens de communication, si ie support solide mobile inséré dans le lecteur 5 optique n’a pas encore été utilisé. Si il s’agit de la première utilisation du support solide mobile, la lecture optique peut commencer, si ii s’agit d’une deuxième utilisation (ou plus) la lecture optique ne démarre pas et l’utilisateur est averti que le support solide mobile n'est pas valable pour réaliser une analyse d’un échantillon choisi.
[0036] Un avantage du lecteur optique de ce mode de réalisation de l’invention est de permettre la détermination d’une méthode à partir d’un marquage de type code barre ou RFID présent sur un support solide mobile à lire afin de transférer automatiquement des informations relatives au support solide mobile à lire, telles que des paramètres de calibration propres à chaque 15 support solide (ou lot de support solide).
[0037] Un avantage d’utiliser un marquage de type code barre ou RFID présent sur ou dans la tigette à tester permettant de coder une information relative à la tigette est de permettre une lecture rapide d’un identifiant unique à partir duquel, ie choix de la méthode peut se faire de manière automatique en 20 accédant â une base de données de méthodes. Il est plus avantageux de procéder de la sorte plutôt que de stocker une méthode dans un marquage de type code bar ou RFID car la quantité d’information contenue dans de tels marquage est très limitée. Cette limitation de la quantité d’information pouvant être contenue dans ce type de marquage ne permet pas de fournir des 25 informations relatives à un grand nombre de dots ou de lignes d’analytes à lire.
Cet avantage de ce mode de réalisation de l’invention, de pouvoir accéder à une méthode ne limitant ie nombre d’analyte pouvant être testé par un support solide permet l’utilisation de tigettes sur lesquelles sont présents un grand nombre de points ou de lignes correspondant à un grand nombre d’analytes à tester et disposant d’une information détaillée pour chacun des anaiytes à tester. De plus, la présence d’informations relatives à des anaiytes à tester présent dans une base de données de méthode plutôt que dans le marquage permet l’inscription du marquage lors de la fabrication des supports solides, les
BE2017/5707 informations de méthode relatives à chaque analyte et à chaque support solide pouvant être établis suite à la production du lot de support solide. Une modification de la méthode étant également envisageable si par exemple un suivi qualité venait à révéler une anomalie ne permettant pas une lecture 5 correcte d’un résultat d’analyte. Dans le cas où le marquage présent sur le support solide devrait être imprimé directement sur le support solide, cela devrait se faire en différé des zones d’intérêt du support solide ou bien devrait ne pas contenir d’informations relative à la spécificité du lot en cours de production.
£0038] De préférence, l'unité optique comprend en outre :
o un capteur d’intensité lumineuse pour mesurer l’intensité d’émission émise par ladite première source lumineuse ;
o un moyen de rétrocontrôle pour moduler ladite intensité d'émission de ladite première source lumineuse en fonction de 15 l’intensité d’émission mesurée par ledit capteur d'intensité lumineuse de sorte que ladite première source lumineuse émette une intensité cible.
[0039] Un avantage de ce mode de réalisation préféré de la présente invention est de fournir un dispositif de lecture optique d’un support solide 20 amovible pour la détection et/ou la quantification d'analytes présents dans un échantillon et permettant une lecture simultanée d’un grand nombre de zones à tester (ou dots). Un autre avantage de ce mode de réalisation préféré de la présente invention est qu'il permet de délivrer un résultat qualitatif et éventuellement quantitatif de chacune des zones â tester.
5 [0940] Lorsqu'une technique de fluorescence ou une technique en lumière réfléchie est utilisée pour lire les zones à tester (ou points), un moyen de rétrocontrôle est par exemple utilisé et permet de garantir une intensité lumineuse d’excitation toujours égale, ce qui permet une mesure instantanée de fluorescence ou de réflexion fiable, quelle que soit la température, la source 30 d'énergie utilisée ou encore la durée d’utilisation et le vieillissement de la source lumineuse. L’utilisation du moyen de rétrocontrôle permet de garantir une source d’énergie lumineuse ayant une intensité constante dans le temps et prédéfinie. Une source d’énergie lumineuse ayant une intensité prédéfinie
BE2017/5707 permet notamment de garantir des résultats quantitatifs fiables. Le moyen de rétrocontrôle est de préférence un moyen de rétrocontrôle électronique.
[0G41] Les moyens de rétrocontrôle permettent de définir par exemple une intensité d’émission cible d'une source lumineuse. Un capteur d’intensité 5 permet de mesurer une intensité d’émission de la source lumineuse et de renvoyer l’intensité mesurée de la source d’émission aux moyens de rétrocontrôle. Les moyens de rétrocontrôle permettent par exemple de définir la tension d alimentation ou l’intensité du courant fourni à la source lumineuse.
Lorsque l’intensité lumineuse de ia source lumineuse renvoyée par le capteur 10 d’intensité aux moyens de rétrocontrôle est trop faible par rapport à l’intensité cible, les moyens de rétrocontrôle permettent une augmentation de la tension ou du courant alimentant, la source lumineuse. Au contraire, lorsque l'intensité lumineuse de 1a source lumineuse est trop élevée par rapport à l’intensité cible, les moyens de rétrocontrôle réduisent ia tension ou le courant alimentant ia 15 source lumineuse. Les moyens de rétrocontrôle permettent une régulation de l’intensité lumineuse émise afin que la source lumineuse opère à une intensité lumineuse cible, stable dans le temps. Par exemple, l’intensité lumineuse cible est définie lors d’une calibration Initiale et enregistrée dans une mémoire du dispositif. Cette régulation de l’intensité lumineuse permet d’assurer une lecture 2 0 du support solide avec une même intensité cible contrôlée afin que cette intensité lumineuse ne soit pas Influencée par des variations de température ou d’un vieillissement de la source lumineuse. Les moyens de rétrocontrôle permettent ia régulation de l’intensité lumineuse pour assurer une intensité cible d’une source lumineuse pour une mesure en fluorescence et ou en lumière 2 5 réfléchie. Un avantage de ce dispositif de rétrocontrôle est d'assurer une intensité lumineuse contrôlé afin de pouvoir réaliser une lecture d’un support solide amovible avec une technique de fluorescence en continu et de pouvoir lire un signal de manière qualitatif et/ou quantitatif. Un autre avantage de pouvoir réaliser une lumière avec une intensité de lumière cible est de pouvoir 30 assurer une meilleure consistance et comparaison des résultats d'un appareil à un autre. Par exmeple, il est possible de pouvoir définir des facteurs de correction pour chaque lot de support solide amovible applicables sur n'importe quel dispositif de lecture optique de l'invention.
BE2017/5707 [0042] De préférence, l’intensité cible est définie sur la base de l'information relative audit support solide à lire.
[0043] Un avantage que l’intensité cibie destinée aux moyens de rétrocontrôle soit spécifiée dans l'information relative au support solide à lire est 5 que cette intensité peut être modifiée en fonction du support solide à lire et de la spécificité de celui-ci. Cela permet une plus grande flexibilité des supports solides pouvant être lus par le lecteur optique de l'invention. Il est par exemple envisageable de combiner une intensité cible avec une méthode relative à une tigette ou un lot de tigettes. Une telle méthode comprendrait en plus d’une 10 intensité cible, un gain, un temps exposition, des signaux minimum de (in)validité des CTRL, des ratio cut-off (seuil de décision PO-S/NEG spécifique en fonction du lot et du point sur la tigette.
[0044] De préférence, le détecteur optique est un détecteur optique à deux dimensions pour fournir une image à deux dimensions de ladite zone de 15 visualisation et en ce que lesdits moyens de traitement d’image sont configurés pour traiter ladite image à deux dimensions.
[0045] De préférence, le détecteur optique est un détecte,r optique à deux dimensions pour fournir une image à deux dimensions de ladite zone de visualisation et en ce que lesdits moyens de traitement d’image sont en outre 20 configurés pour :
o détecter des zones de références de l'image à deux dimensions, o déterminer le nombre fini de sous-ensembles de l’image à deux dimensions, à partir de l'information relative au support solide à lire, o positionner dans l’image à deux dimensions chaque sousensemble à une position déterminée à partir des zones de référence.
[0046] Un avantage du dispositif de ce mode de réalisation préféré de l'invention est de fournir un dispositif de lecture optique d’un support solide 30 amovible pour la détection et/ou la quantification d’anaiytes présents dans un échantillon et permettant une lecture simultanée d’un grand nombre de zones à tester (ou dots). De plus, celui-ci permet de délivrer un résultat qualitatif et éventuellement quantitatif de chacune des zones à tester.
BE2017/5707 [0047] Un autre avantage de c© mode de réalisation préféré du dispositif d© lecture optique de l’invention est de permettre la lecture optique d'un grand nombre de régions d’intérêt présents sur une seule et même tigette. En effet, le dispositif de lecture optique de l’invention permet la lecture optique d’un grand nombre de régions d’intérêt présents sur une seule tigette et dispose de moyens pour analyser un grand nombre de régions d’intérêt sur une tigette de manière précise. Dans le cas du dispositif optique de l’invention, ia lecture d'un grand nombre de régions d’intérêt ne nécessite pas de prévoir des emplacements pour plusieurs tigettes. L’emploi de plusieurs tigettes dans un même lecteur optique pour une lecture simultanée de plusieurs tigettes afin de couvrir un grand nombre de régions d’intérêt avec un même capteur optique étant source de mauvais placement et de décalage des régions d’intérêt d'une mesure à une autre et ce pour chacune des tigettes introduites dans le lecteur optique, [0048] L’image à deux dimensions comprend des sous-ensembie, des portions, des régions d’intérêt, des zones d’intérêt ou encore des parties d’images. Préférentiellement, les sous-ensembie d’une image à deux dimensions comprennent une pluralité de pixels. De préférence, chaque sousensembie comprend au moins 20 pixels, de préférence plus de 50 pixels et de manière encore plus préférée plus de 250 pixels.
[0049] De préférence, l’information d’analyte est déterminée sur la base d’au moins deux intensités de sous-ensembie Issues d’au moins deux sous-ensembie. Par exemple, l’information d’analyte est une moyenne d'au moins deux intensités de sous-ensembles issues d’au moins deux sousensembles.
[0050] Un avantage de réaliser une moyenne est de permettre de lisser d’éventuelles perturbations dans la lecture du support solide amovible. Do manière encore plus préférée, une moyenne est réalisée sur ia base de trois intensités de sous-ensembles issues d’au moins trois sous-ensembles.
[0051] De préférence, ledit nombre fini de sous-ensembles est supérieur ou égal à cinq sous-ensembles, de préférence, à plus de dix sous-ensembles et de manière encore plus préférée à plus de quinze sous-ensembles.
BE2017/5707 [0052] Un avantage de pouvoir lire plus de cinq sous-ensembles, de préférence plus de dix sous-ensembles et de façon encore plus préférée plus de quinze sous-ensembles est de pouvoir réaliser un diagnostic d’un échantillon à tester en une seule lecture d’une seule et même support solide amovible.
[0053] De préférence, les sous-ensembles ont une forme arrondie et de préférence ont une forme de disque.
[0054] Un avantage d'avoir des sous-ensembie de forme arrondie ou de disque est qu'ils permettent de collecter une intensité de point d'intérêt ayant une forme de disque plus importante.
1.0 [0055] De préférence, l'image à deux dimensions comprend des zones contrastées par rapport à une zone de fond, et en ce que, les moyens de traitement d’image de l’image â deux dimensions permettent en outre de :
- recadrer l’image à deux dimensions en une image recadrée, l’image recadrée montrant une portion plus importante ou égale de l'emplacement pour recevoir un support solide que dans l’image à deux dimensions ;
- attribuer une surface définie pour chaque position à deux dimensions de sous-ensembie dans l’image recadrée ;
effectuer une optimisation locale de position de chaque sous-ensembie de sorte que la surface définie de chaque sous-ensembie est positionnée de sorte à renvoyer une intensité lumineuse maximale de chacune des zones contrastées.
[0055] Par exemple, l’intensité lumineuse maximale de chacune des 2 5 zones contrastées est déterminée pour une taille de sous ensemble donnée.
[0057] De préférence la surface définie pour chaque position à deux dimensions de sous-ensembie dans l’image recadrée est arrondie, de préférence circulaire, de préférence un disque.
[0058] De préférence, l’information relative à un support solide à lire 30 comprend une information correspondant à chacun des sous-ensembles.
[0059] Un avantage de disposer d’une information relative à un support solide amovible comprenant une information relative à chacun des sousensembies est qu’il est possible d’indiquer dans l'information relative au support
BE2017/5707 solide, des caractéristiques essentielles comme les analytes correspondant à chacun des sous-ensembles ainsi que par exemple des courbes de calibration permettant une mesure qualitative et quantitative.
[0060] De préférence, l’information d’anaiyte est une information de type 5 binaire.
[0061] Une information d’anaiyte de type binaire est une information d’anaiyte qualitative. Par exemple l’information d’anaiyte permet d’indiquer une présence positive ou une présence négative d’un anaiyte. Par exemple, le système de détermination, sur la base d’une intensité pivot ou intensité seuil ou 10 ratio définie par l’information relative au support, permet d’assigner une valeur binaire à une intensité de sous-ensemble. Les moyens de détermination indiquent par exemple pour une intensité de sous-ensemble supérieure à une intensité de sous-ensemble seuil, une présence d’anaiyte négative. Les moyens de détermination indiquent par exemple pour une intensité de sous-ensemble 15 inférieure à une intensité de sous-ensemble seuil, une présence d’anaiyte positive. Par exemple, une information d’anaiyte est comprise dans la mémoire du dispositif de l’invention et ne nécessite pas d’extraire cette information d’anaiyte à partir d’une information relative au support. De préférence, une intensité seuil est définie par rutiiisateur en fonction de règlementations propres 20 à un territoire.
[0062] De préférence, l’information d’anaiyte est une information proportionnelle à l’intensité lumineuse mesurée.
[0003] Un avantage d’une Information d’anaiyte proportionnelle à l’intensité lumineuse mesurée est de pouvoir réaliser une analyse quantitative 2 5 d’analytes dans un échantillon. De préférence, l’information d’anaiyte est calibrée avec une courbe de calibration qui dépend du lot de fabrication du support solide amovible et du point d’intérêt correspondant à l’anaiyte choisi.
[0064] De préférence, le dispositif est compact et hermétique.
[0065] Un avantage d'avoir un dispositif compact et hermétique est de 30 pouvoir utiliser le dispositif de façon portative. Un autre avantage est de pouvoir utiliser le dispositif dans des conditions extérieures ou dans des conditions liées au lieu de production d’un lot dont provient l’échantillon â tester.
[0066] De préférence, le dispositif comprend en outre :
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- une surface externe ;
- des moyens de refroidissement pour transférer une quantité de chaleur de l’intérieur dudit dispositif vers ladite surface externe.
[0087] De préférence la surface externe crée une étanchéité à l’eau et à la poussière. Un avantage des moyens de refroidissement qui permettent un transfert de chaleur de l'intérieur du dispositif vers sa surface externe est de permettre le transfert de chaleur sans pour autant nuire à l'étanchéité ou â l’hermétisme selon un indice de protection IP54 selon la norme de CEI 60529 consultée en septembre 2017.
[8088] De préférence, les moyens de refroidissement comprennent un caloduc.
[0069] Un avantage du caloduc est qu’il permet le transport: d’une grande quantité de chaleur sur une distance relativement grande. De fait le caloduc est particulièrement bien adapté pour le dispositif de l’invention car H d’acheminer ia chaleur produite à tout endroit à l’intérieur du dispositif vers l’extérieur du dispositif tout en conservant une bonne étanchéité.
[0070] De préférence, le dispositif de l’invention comprend en outre une deuxième source lumineuse pour émettre un deuxième faisceau lumineux dans une deuxième plage de longueur d'onde.
[0871] Un avantage de disposer d'une deuxième source lumineuse est de pouvoir disposer d’un lecteur optique pour la lecture de régions d’intérêt avec une plage de longueur d'onde différente de la première plage de longueur d’onde émise par la première source lumineuse. De préférence, la deuxième source lumineuse permet une lecture en lumière réfléchie. La deuxième source lumineuse éclaire les régions d’intérêt d’une tigette positionnée dans l’emplacement du lecteur. Des molécules de marquages présentent ou non au niveau des régions d’intérêt, permettent ou non une absorption, ou une moindre réflexion de la région d'intérêt éclairée par ladite deuxieme source lumineuse. L’unité optique permet alors une acquisition de la lumière réfléchie par la tigette dans la zone de visualisation. En fonction de la présence ou non des molécules de marquages, il en résulte des régions d’intérêt plus ou moins sombres par rapport à la zone de fond de la tigette.
BE2017/5707 [0072] Par exempte, des moiécutes de marquage fluorescentes et ou modifiant la réflexion peuvent être utilisées, ce qui nécessite une lecture en fluorescence et une lecture en lumière réfléchie. Les deux lectures sont par exemple exécutées l’une après l'autre dans un ordre prédéfini ou non prédéfini.
[0073] Un filtre passe bande est par exemple utilisé afin de, lors d'une mesure en lumière réfléchie, laisser passer vers l’unité de détection optique une plage de longueur d’onde susceptible d’être absorbée ou non par les molecules de marquage modifiant la réflexion. En effet, cela permet d’augmenter le contraste en supprimant le bruit de fond dû aux longueurs d'onde émise par la 10 source lumineuse mais non absorbées par les moiécutes de marquage. Le filtre passe bande est de préférence positionné entre la source lumineuse et les molécules de marquage ou entre les molecules de marquage et le détecteur optique.
[0074] De préférence, la première plage de longueur d'onde est distincte 15 de ladite deuxième plage de longueur d’onde.
[0075] L’avantage de disposer de deux sources lumineuses émettant dans des plages de longueur d’onde distinctes permet une lecture d’un plus grand choix de molécules de marquages. Par exemple cela permet la lecture de molécules de marquage pouvant renvoyer un signal par fluorescence et de 20 molécules de marquages pouvant modifier la réflexion de la lumière sur le support solide amovible.
[0076] De préférence, le filtre est un filtre passe double bande pour laisser passer deux plages de longueur d’onde définies dont une des deux plages est la première plage de longueur d’onde ou la deuxième plage de 2? longueur d’onde, ne nécessitant donc aucun changement physique de filtre passe bande lors des analyses.
[0677] Par exemple, un avantage d’utiliser un filtre passe double bande positionné entre tes molécules de marquage et le détecteur optique permet la détection de molecules de marquage différentes ou permettant une lecture 30 dans des plages de longueur d'onde distinctes. De préférence le filtre passe double bande est utilisé en présence de deux sources lumineuses différentes émettant dans des plages de longueur d’onde différentes. De préférence, un
BE2017/5707 filtre passe double bande est utilisé dans le cas d’un lecteur optique permettant une lecture des melécules de marquage en réflexion et en fluorescence.
[0078] De préférence, te dispositif d’identification du support solide est un lecteur de data matrix, de code barre, ou de QR code.
[0079] Selon un deuxième aspect, un des buts de l'invention est de fournir un ensemble de diagnostic permettant un diagnostic pratique, économique, efficace et optimisé par rapport aux ensembles de diagnostic actuels, et ce en permettant ia détection et/ou la quantification non seulement d'un nombre plus élevé de classes d’anaiytes appartenant à une famille 10 d’anaiytes (par exemple tes antibiotiques), mais également d’un nombre plus élevé de classes d'anaiytes appartenant à plusieurs familles d’anaiytes (par exemple les résidus médicamenteux, tes toxines ou encore les métaux lourds). Plus particulièrement, un ensemble de diagnostic selon le deuxième aspect de l’invention permet la détection et/ou la quantification d’au moins cinq classes 15 différentes d’anaiytes, de préférence d’au moins dix classes différentes d'anaiytes, encore plus préférentiellement d’au moins quinze classes différentes d’anaiytes présents dans un échantillon et appartenant à au moins deux familles d'anaiytes distinctes, et ce en moins de quinze minutes.
[0080] A cet effet, les inventeurs proposent un ensemble de diagnostic pour la lecture optique d'un système récupérateur comprenant :
le dispositif selon le premier aspect de l’invention ;
- un moyen de diagnostic pour la détection et/ou ia quantification respective, simultanée et spécifique d’une pluralité d’anaiytes présents dans un échantillon comprenant au moins un mélange réactionnel et au 25 moins un système récupérateur, ledit au moins un système récupérateur étant sous la forme d’un support solide auquel se trouvent fixés en des emplacements de récupération distincts et connus dans l’espace, des ligands compétiteurs et/ou des molécules biologiques de reconnaissance, de manière à identifier par la localisation desdits 30 emplacements de récupération sur ledit support, lesdits analytes présents dans ledit échantillon, ledit moyen de diagnostic étant caractérisé en ce que ledit système récupérateur comprend des emplacements de récupération qui sont
BE2017/5707 disposés selon un arrangement matriciel en deux dimensions qui est défini selon un système de coordonnées connues et spécifiques desdits ligands compétiteurs et/ou desdites molécules biologiques de reconnaissance fixés audits emplacements de récupération dudit 5 système récupérateur, [0081 ] Les variantes et avantages mentionnés pour le premier aspect de l’invention s’appliquent à l'ensemble de diagnostic suivant le deuxième aspect, mutadis mutandis.
[0082] En effet, ii a été démontré de manière surprenante qu’un 10 ensemble de diagnostic comprenant un moyen de diagnostic qui comprend un système de récupération présentant des emplacements de récupération qui sont disposés selon un arrangement matriciel en deux dimensions qui est défini selon un système de coordonnées connues et spécifiques permet de détecter et/ou de quantifier au moins cinq classes différentes d'analytes, de préférence 15 au moins dix classes différentes d’analytes, de préférence au moins quinze classes différentes d’analytes présents dans un échantillon et appartenant à au moins deux familles d’analytes distinctes, et ce en moins de quinze minutes. Un ensemble de diagnostic avec un moyen de diagnostic est par conséquent, plus pratique, plus économique et plus efficace que les moyens de diagnostic 20 connus actuellement qui se limitent généralement à moins de cinq classes différentes d’analytes, typiquement seulement à deux ou trois classes différentes d’analytes, ces classes appartenant à une même famille d’analytes (par exemple les antibiotiques), [0083] De préférence, lesdlts emplacements de récupération sont 25 disposés selon un arrangement matriciel en deux dimensions sous la forme de points présentant chacun un diamètre compris entre 20 μm à 2 mm, de préférence compris entre 100 à 500 μm et encore plus préférentiellement compris entre 250 μm et 400 μm.
[0084] Il a été démontré que des emplacements de récupération sous 30 forme de points présentant chacun un diamètre compris entre 20 μm et 2 mm, de préférence compris entre 100 μm et 500 μm, préférentiellement entre 250 μm et 400 μm, permettaient de fixer au moins cinq, de préférence au moins dix, plus préférentiellement au moins quinze emplacements de récupération en
BE2017/5707 simplicat, en dupiicat ou en triplicat. pour la détection el/ou la quantification d'au moins cinq, de préférence au moins dix, plus préférentiellement d’au -noms quinze analytes de classes différentes, appartenant ou non à des familles d’anaiytes distinctes, ainsi qu’au moins un emplacement de récupération 5 déposé en simplicat, en dupiicat ou en triplicat destiné au contrôle positif du seuil de détection permettant de valider le test et/ou à la calibration pour la détection et/ou la quantification, et ce sur un système récupérateur ayant une taille raisonnable et de l’ordre du centimètre- carré, pour la réalisation de la détection et/ou la quantification d’au moins treize anaiyt.es par le dispositif de 10 lecture optique.
[0085] De préférence, ledit système de coordonnées présente une première coordonnée définie sur un axe longitudinal d’une longueur dudit système récupérateur et une deuxième coordonnées définie sur un axe longitudinal d’une largeur dudit système récupérateur.
[0088] De préférence, ledit système récupérateur comprend au moins cinq, de préférence au moins dix, et plus préférentiellement au moins quinze emplacements de récupération distincts destinés à la détection et/ou la quantification respective, simultanée et spécifique d’au moins cinq, de préférence d’au moins dix, plus préférentiellement d’au moins quinze analytes 20 de classes distinctes présents dans un échantillon et appartenant eu non à des familles d’anaiytes différentes, et au moins un emplacement de récupération destiné à un contrôle et/ou un calibrateur.
Brève description des figures [0087] Ces aspects ainsi que d’autres aspects de l’invention seront 25 clarifiés dans la description détaillée de modes de réalisation particuliers de l’invention, référence étant faite aux dessins des figures, dans lesquelles:
- les Fig.la, Fig. 1b, Fig. 1c et Fig. 1d montrent des modes de réalisations schématiques du dispositif selon l’invention :
- les Fig.2a et Fig. 2b montrent un mode de réalisation schématique du dispositif selon l’invention :
- les Fig.3a et Fig.Sb montrent un exemple d’image selon l’invention ;
- la Fig.4 montre une vue en 3D d’un mode de réalisation selon l’invention.
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Les dessins des figures ne sont pas à l’échelle. Généralement, des éléments semblables sont dénotés par des références semblables dans les figures. La présence de numéros de référence aux dessins ne peut être considérée comme limitative, y compris lorsque ces numéros sont indiqués dans les 5 revendications.
Description détaillée de certains modes de réalisation de l’invention [0088] Les Figures 1a à 1d montrent un exemple de mode de réalisation du dispositif 1 selon l’invention. Un support solide 2 amovible pour la détection et/ou la quantification d’analytes présents dans un échantillon est inséré dans le 1 ù dispositif 1 et est reçu par un emplacement 20. L’emplacement 20 permet de recevoir le support solide 2 pour que le positionnement du support solide 2 soit le plus reproductible possible d’un support solide 2 à un autre par rapport à l’unité optique 7. De préférence, l’emplacement 20 est une partie amovible du dispositif 1 qui est par exemple soutenu par un dispositif de tiroir. Pour réaliser 15 la lecture optique d'un support solide 2, l’emplacement 20 est par exemple retiré du dispositif afin de pouvoir y positionner le support solide 2 à lire optiquement. Lorsque le support solide 2 à lire est positionné dans l’emplacement 20, ceux-ci sont de préférence ramenés à l’intérieur du dispositif 1 pour y effectuer la lecture optique. L'emplacement 20 permet un 20 positionnement rapide et fiable du support solide 2. Le support solide 2 lorsqu’il est présent dans le dispositif 1 tel qu’illustré en figure 1 est éclairé par une source lumineuse 3. 4. Un signal lumineux renvoyé par le support solide 2 vers un système d’imagerie 60 est détecté par le détecteur optique 6 pour fournir une image 40 du support solide 2.
[ÖÜ89] Une source lumineuse 3, 4 a par exemple les spécifications suivantes :
- la première source lumineuse 3 : diode électroluminescente ayant une longueur d’onde dominante : 590 nm, largeur de bande d’émission (FWHM) : 18 nm, puissance d'émission minimale / typique : 160 mW / 30 170 mW. De préférence la première source lumineuse 3 comprend au moins une diode électroluminescente, de préférence au moins trois diodes et de façon encore plus préférée six diodes électroluminescentes
BE2017/5707 afin d’assurer une intensité lumineuse suffisante d’éclairage de ia région d’intérêt (zone de visualisation) du support solide 2, l’utilisation d’au moins deux diodes permet une meilleure uniformité d’éclairage de ia région d’intérêt du support solide ;
- la deuxième source lumineuse 4 : diode électroluminescente ayant une longueur d'onde dominante i 525nm.
Le système d’imagerie 60 comprend un détecteur optique 6, une optique pour focaliser le signal lumineux renvoyé par le support solide 2 sur le détecteur optique 6. De préférence le détecteur optique 6 est un détecteur de type j CMOS. Dans un autre mode de réalisation, le détecteur 6 est un détecteur de type CCD. Par exemple îe détecteur optique est un réseau de photo détecteurs. Une optique de focalisation est par exemple une lentille convergente, par exemple une lentille convergente ayant une longueur focale comprise entre 15 mm et 20 mm.
[0Ô9Ô] Le lecteur optique 1 de l’invention comprend également un filtre W positionné sur le chemin optique du signai lumineux renvoyé par le support solide 2 et situé en amont du détecteur optique 6. De préférence le filtre 10 est un filtre passe bande qui permet de laisser passer une bande de longueur d’onde du signal lumineux renvoyé par le support solide 2 lors de sen 2 0 illumination par une source lumineuse 3, 4. La bande de longueur d'onde transmise par le filtre permet la détection et/ou la quantification d’analytes présents dans un échantillon.
Préférentiellement, le filtre 10 est un filtre passe double bande, c’est-à-dire transparent à deux bandes de longueurs d'ondes distinctes. Par exemple, le Il filtre 10 passe double bande a une première plage de transmission centrée sur
527 nm et avec une bande de transmission nominale à mi-hauteur (FWHM) de
54,1 nm. La première plage de transmission a une transmission supérieure à 90 % dans la plage de longueur d’onde 506 - 548 nm. Une deuxième plage de transmission centrée sur 645 nm et avec une bande de transmission nominale 30 à mi-hauteur (FWHM) de 61 nm. La deuxième plage de transmission a une transmission supérieure à 90 % dans la plage de longueur d’onde 620,5 -
669,5 nm. Chacune des bandes de transmission du filtre passe double bande permet la détection et/ou la quantification d'analytes présents dans un
BE2017/5707 échantillon. Par exemple, Ie support solide comprend des molécules de marquages fluorescentes qui nécessitent un filtre peur être détectées et/ou quantifiées. Le filtre 10 permet de bien différencier dans la lumière qui est renvoyée par le support solide 2 au détecteur optique à deux dimensions 6, la 5 composante réfléchie et la composante issue de la fluorescence desdits composés. De préférence pour une lecture optique d'un support solide 2 en fluorescence (photoluminescence), seule la plage de longueur d'onde émise par les molécules fluorescentes en rapport avec l’analyte à détecter doit être transmise au détecteur optique 6. En effet la transmission des longueurs 10 d ondes en lien avec la source lumineuse 3, 4 d’excitation ne permet pas d'obtenir un bon rapport signal/bruit L’élimination de la plage de longueur d’onde d’un faisceau lumineux 30, 40 au niveau du détecteur 60 est donc préférable lors d'une mesure en f.uorescence.
[0091] L’image 40 acquise par le détecteur optique 6 est ensuite 15 acheminée vers les moyens de traitement d’image 12 afin d'y être analysé. Les moyens de détermination 13 permettent un traitement des données générées par les moyens de traitement d’image 12 afin de fournir une ou des informations concernant un ou des analytes présents dans un échantillon. Par exemple si un analyte esf présent ou absent d’un échantillon. Ces informations concernant 20 des analytes sont transmises à un utilisateur par le biais des moyens de transmission 19. Des moyens de sélection 27 permettant à un utilisateur une sélection des analytes dont ii souhaite déterminer la présence (dans des proportions excédant les normes en vigueur dans le domaine d’application des supports solides 2) ou la quantité dans un échantillon. Il peut exister plusieurs 25 modes afin d’effectuer une sélection des analytes à déterminer. Par exemple un administrateur du lecteur optique 1 de l’invention peut effectuer une sélection type qui sera utilisée lors de chacune des lectures de support solide 2. Par exemple la sélection peut être effectuée à la carte, c’est-à-dire qu’avant le début de chaque lecture de support solide 2, utilisateur sélectionne les 3ù analytes dont il souhaite connaître la presence et ou la quantité dans l'échantillon qu’il souhaite tester. De préférence les moyens de communication 8 envoient aux moyens de sélection 27, des informations concernant les analytes qu’il est possible de détecter avec Ie support solide 2 inséré dans le
BE2017/5707 lecteur optique 1. Ainsi l’utilisateur peut effectuer un choix, uniquement à partir des enelytes qu’il est possible d’analyser aveu le support solide 2 inséré dans le lecteur 1 et non à partir d’une liste générique d’analyte dont l'utilisateur ne sait pas s’il serait possible d’en obtenir un quelconque résultat. Lorsque ia sélection 5 de l'utilisateur est effectuée, cette sélection est communiquée par les moyens de sélection 27 aux moyens de détermination 13. Les moyens de détermination 13 déterminent alors pour chaque analyte sélectionné, une intensité de sousensembie ou de point d’intérêt 41 correspondant aux analytes sélectionnés. À partir de nette intensité de sous-sensembie et grâce aux données 10 communiquées par les moyens de communication 8 concernant une valeur seuil ou une courbe de calibration pour chacun des point d’intérêt 41, les moyens de détermination 13 envoient aux moyens de transmission 19, des résultats concernant la détection et ou la quantification des analytes sélectionnés lorsqu’une sélection a été réalisée ou de tous les analytes dont le 15 support solide 2 permet ia détection ou la quantification iorsqu’aucune sélection n’a été réalisée. Une valeur pivot est par exemple une valeur spécifiée par une norme désignant une quantité à partir de laquelle il est possible de juger si un analyte est présent dans des quantités acceptables par la norme ou non acceptable.
G [6092] Les figures 1b et 1d montrent également un moyen de rétrocontrôle 11, relié à un détecteur d'intensité lumineuse 5. par exemple une photodiode sensible dans la plage de longueur d’onde émise par une source lumineuse 3. Ce moyen de rétrocontrôle 11 permet de fournir à la source lumineuse 3 un signal électrique afin que l'emplacement 20 pour recevoir le
5 support solide 2 soit éclairer avec une intensité cible choisie et par exemple constante quelles que soient les conditions extérieures au dispositif 1 de l’invention. Par exemple le moyen de rétrocontrôle 11 permet une régulation do l’intensité lumineuse.
[0693] Des moyens de communication 8 reliés aux moyens de traitement
G d'image 12 et aux moyens de détermination 13. Les moyens de communication permettent l’accès â une base de données de méthode pouvant être informatisée et stockée sur un serveur, stockée dans une mémoire interne ou externe au lecteur optique de Γ invention, par exemple une clé usb, un CD, une
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mémoire non-volatile. La base de données peut également être non informatisé et présentée sous forme papier et lisible par le lecteur optique sous forme d’un code barre, datamatrix, QR code. Par exempte le lecteur optique 25 de l'invention peut lire les données de la base de données non-informatisée grâce à un lecteur optique externe au dispositif. Par exemple ie dispositif d’identification 25 décrit en Fig. 1c et Fig. 1d permet la lecture des données de ia base de données non-informatisée. À partir des données obtenues de la base de données (informatisée ou non-informatisée), tes moyens de communications 8 peuvent transmettre aux moyens de inclement d’image 12 des données relative â remplacement des points ou des lignes d’intérêt. De préférence, te position des points ou des lignes d’intérêt est données par rapport â des points ou zones de références. Par exemple les moyens de communication 8 peuvent envoyer à l’unité optique 7 des informations relatives au type de source lumineuse 3, 4, à l’intensité de la source lumineuse requise, au temps d’exposition pour l’acquisition d’une image permettant la détection et ou la quantification d’analytes présent dans un échantillon.
[0094] Les moyens de communication 8 sont également configurés pour transmettre des données issues de la base de données vers les moyens de détermination 13. Ces données permettent notamment de donner une correspondance entre les points 41 ou les lignes d’intérêt identifiées et d'extraire par les moyens de traitement d’image 12, des informations concernant un anaiyte à déterminer ou à quantifier. Par exemple, les moyens de traitement d'image 12 attribuent à chaque point 41 ou ligne présent sur ie support solide 2 une position, par exemple des coordonnées dans un repère cartésien par rapport à des points ou zones de référence 45. Les moyens de détermination 13 permettent alors pour chacun des points 41 ou lignes présents ou sensé être présents de leur attribuer un nom d’anaiyte. Les données issues des moyens de communication 8 et transmises aux moyens de détermination 13 comprennent également des information relative à des valeurs seuils, par exempte spécifiée par une ou des normes, à partir desquelles un anaiyte est considéré comme présent en trop grande quantité ou présent dans des proportions acceptable ou inversement. Ces données comprennent par exemple des courbes de calibration permettant une analyse quantitative d'un
BE2017/5707 analyte. De préférence, pour chaque point 41 ou ligne d’intérêt, il existe une courbe de calibration permettant de donner une concentration de l’analyte dans l’échantillon et correspondant à un point d’intérêt 41.
[0095] Les informations relatives à un support solide sont par exemple transmises aux moyens de traitement d’image 12 afin que ceux-ci disposent d’informations relatives à un nombre de point d’intérêt ou à un positionnement préféré de ces points d’intérêt ou encore â des corrections permettant une comparaison des différents lots entre eux afin d’effectuer une mesure quantitative des analytes présents dans un échantillon. Les moyens de 10 transmission 19 sont de préférence connectés aux moyens de communication
8.
[0006] La Fig. 1b montre un mode de réalisation selon l’invention basé sur la Fig. la et comprenant en outre des moyens de rétrocontrôle 11 permettant d'assurer une illumination du support solide 2 contrôlée. La 15 photodiode 5 est positionnée de sorte qu’elle reçoive un flux lumineux généré par la source lumineuse 3, 4 représentatif de la l'intensité lumineuse dirigée vers remplacement 20 et ou le support solide 2.
[0097] La Fig. 1c montre un mode de réalisation selon l’invention comprenant un dispositif d’identification 25 permettant la lecture d’un identifiant 2 0 présent sur le support solide 2. Un Identifiant est par exemple un code barre, un data matrix ou un QR code, dans ce cas le dispositif d’identification 25 est lecteur de code optique connu de l’homme du métier. Un identifiant est par exemple une puce RFID, dans ce cas le dispositif d'identification 25 est un lecteur en champ proche connu de l’homme du métier. Le dispositif 25 d’identification 25 lorsqu’il a acquis une information à partir de l’identifiant présent sur le support solide 2, envoi vers les moyens de communication 8 l’information relative au support solide inséré dans le lecteur optique 1. À partir de cette information, les moyens de communication peuvent acquérir à partir d'une base de données, des informations spécifique au support solide 2 inséré 30 ou au lot auquel le support solide 2 inséré appartient, En l’absence d’un dispositif d’identification 25, il est possible d’indiquer manuellement aux moyens de communication un identifiant relatif au support solide 2 inséré, par exemple
BE2017/5707 avec un davier connecté au lecteur optique 1 ou avec l’écran tactile qui équipe le lecteur optique 1.
[0098] En Fig. 1d, le lecteur optique intègre un dispositif d’identification 25, des moyens de sélection 27, des moyens de communication 8 et un 5 dispositif d'identification 25 du support solide 2 combinant les mêmes avantages et fonctions tel que décrit dans tes Fig. 1a â Fig 1 ,c.
[0809] Il est également possible de positionner dans les modes de réalisations présentés dans les Figs. 1a à 1 d, une deuxième source lumineuse 4 telle que représentée en Fig. 2a et Fig. 2b. Dans le cas de la présence de 10 moyens de rétrocontrôle 11, la deuxième source lumineuse 4 est reliée à ces moyens de rétrocontrôle 11 afin que l’intensité de ia deuxième source lumineuse 4 puisse être contrôlée telle que décrit pour l’intensité de la première source lumineuse 3.
[0100] Le lecteur optique 1 selon l’invention dispose de préférence d’une 15 première 3 et d’une deuxième 4 source lumineuse tel qu'illustré en Fig. 2a et
Fig. 2b. De préférence, la première source lumineuse 3 est destinée à effectuer une lecture/mesure en fluorescence du support solide 2. De préférence, la deuxième source lumineuse 4 est destinée à effectuer une lecture/mesure en réflexion du support solide 2 pour la détection et/ou la quantification d’analytes. 2Q La présence du filtre 10 passe double bande permet d’utiliser le même détecteur optique 6 pour une mesure en fluorescence ou pour une mesure en réflexion. De préférence les première 3 et deuxième 4 sources lumineuses sont utilisées l’une après l’autre pour la mesure d’un même support solide 2 dans un ordre variable. De manière plus préférée une seule source lumineuse est /o utilisée pour la détection et ou la quantification d’analytes présents dans un échantillon par la lecture optique d’un support solide 2.
[0101] Une image 40 acquise par le détecteur 6 est alors envoyée vers les moyens de traitement d'image 12. Les moyens de traitement d’image 12 permettent les étapes de traitement d’image détaillées ci-après. De préférence 30 ces étapes sont utilisées en fonction d’une méthode choisie manuellement par un opérateur ou automatiquement par une reconnaissance de la tigette à mesurer par le lecteur optique et en particulier par un dispositif d’identification.
BE2017/5707 [0182] Prétraitement ~ Recadrage de l’image [0103] L’étape de recadrage de l’image 40 en une image recadrée 42 permet de sélectionner au sein de l’image originale 40 une région d'intérêt rectangulaire comprenant des zones de la tigette à analyser plus spécifique et 5 comprenant moins de zones de fond ou de zones sans rapport avec le support solide 2 â lire. Les zones de l’image 4Û inutiles â l’analyse future sont ainsi éliminées de l’image recadrée 42. Le reoadrage de l’image 40 est une étape facultative.
[0104] La région d’intérêt de l’image recadrée 42 est définie â partir de 10 l’image 40 (définie par des pixels selon des coordonnées cartésiennes) par des coordonnées x et y en pixels de l’extrémité haute gauche de la région rectangulaire d’intérêt, sa largeur en pixels et sa hauteur en pixels.
[0105] Prétraitement « Correction d’uniformité [0106] Le but est du prétraitement de l’image 40 ou de l’image recadrée 15 42 et plus particulièrement de ia correction d’uniformité est de corriger la non uniformité de l’éclairage au sein de la région d’intérêt pour qu’elle n’impacte pas les analyses futures du support solidee 2. Cette correction d’uniformité peut être activée ou non par les moyens de traitement d’image 2. La correction de l'uniformité de l’éclairage est par exemple réalisé à partir d'un fichier 2 0 comprenant une image modèle (ou de calibration), par exemple d’un support solide n’ayant pas encore été soumis à l’échantillon à caractérisé ou d'un support solide ne comprenant pas de point ou de bande supportant des molécules de marquages. Cette image modèle est par exemple enregistrée dans une mémoire du lecteur optique 1 accessible par les moyens de 25 traitement d’image 2.
[0107] En l’absence d’une Image modèle, une auto-caiibration est effectuée. L’auto-calibration consiste à créer une image (un modèle) synthétique pour la correction d’uniformité, utilisée en lieu et place de l’image modèle et ce, en appliquant à la région d’intérêt originale deux filtres médians 30 consécutifs. Ces filtres, en remplaçant la valeur de chaque pixel de l’image par la valeur médiane des pixels se situant dans un voisinage de taille définie, permettent d’obtenir une version fioutée, moins bruilée de l’image 40 (élimination des valeurs aberrantes) tout en respectant le contraste de l’image.
BE2017/5707 [0108] Détection mittete des points [01 OB] Cette étape vise à détecter la position des dots présents sur la tigette. Pour ce faire, une fenêtre carrée de détection (de côté égal à deux fors le rayon d'un point) balaye dans un premier temps l’entièreté de l’image 5 analysée 40, 42 à la recherche de zones correspondant potentiellement à des points à savoir les zones les plus brillantes dans l’image entourées de zones sombres (zones contrastées par rapport à une zone de fond), [0110] À chaque position de la fenêtre, la moyenne des valeurs des pixels au sein d’un cercle de rayon défini au centre de la fenêtre, est calculée, 1 0 Celle-ci est ensuite comparée à la moyenne des pixels compris dans un anneau extérieur, entourant le cercle de rayon. Si ia différence entre les deux moyennes est supérieure à un certain seuil (fixé empiriquement), te centre de la fenêtre de balayage est considéré comme appartenant ä une zone correspondant potentiellement à un dot. En balayant l’entièreté de l’image, un 15 masque binaire spécifiant les zones potentielles de dots est ainsi créé.
[0111] Dans un deuxième temps, les cercles sont détectes au sein de l’image binaire obtenue lors de la première) phase de détection. Parmi tes cercles détectés, on retrouve notamment les points de la grille mais également de « faux points » dus notamment à l’apparition des bords du support solide 2 20 au sein de ia ROI définie par l’utilisateur. Pour éliminer les faux points au sein du masque binaire et ne garder que les cercles correspondant aux points de te grille, remplacement théorique de la grille au sein de l’image 40 ,42 est utilisé.
[0112] L'emplacement théorique de la grille est déterminé sur base des coordonnées « xi », « y1 » (en haut à gauche) et « xn », « ym » (en bas à 25 droite) qui définissent la position des points extrêmes de la grille en haut à gauche et en bas à droite. Étant donné la différence entre la position réelle de la grille de points et la position théorique spécifiée par la méthode de lecture ou par les moyens de traitement d’image 12, les coordonnées théoriques selon l’axe y « yl » et « ym » sont corrigées sur base de la détection automatique du 30 support solide 2 au sein de la ROI large définie par l’opérateur. Cette détection est permise grâce à la connaissance de la hauteur du support solide spécifiée par la méthode de lecture ou par les moyens de traitement d'image 12.
BE2017/5707 [0113] L’emplacement théorique de la grille révisé sert alors à définir une sous-région d’intérêt complètement incluse au sein du support solide, au sein duquel les cercles détectés sont conservés (car considérés comme appartenant à la grille de points) et en dehors de laquelle tes cercles détectés sont 5 considérés comme de fausses détections de points et sont dès lors éliminés. Après l’élimination des mauvaises détections, un masque binaire spécifiant les positions initialement estimées des points de te grille est obtenu.
[0114] Fitting grille sur dots visibles [0115] Cette étape vise à faire correspondre un motif de grille initial de dots sur tes dots détectés au sein de ia région d’intérêt afin d'optimiser postérieurement les positions estimées des dots et de permettre leur mesure. Un rectangle entourant l’ensemble des dots détectés initialement (et non éliminés) est dans un premier temps calculé.
[Ö116] Le coin haut gauche ou le coin en haut à gauche « x1 », « y1 » du rectangle obtenu permet de déterminer l’emplacement observé en pratique (et non plus théorique) du premier point de te grille initiale (en haut à gauche). Avec l’aide de paramétres spécifiant respectivement le nombre de dots présents sur la tigette en X et en Y, le rectangle défini permet également de déterminer l’angle que forme la grille de points avec l’horizontale mais aussi de calculer l’espace entre points observé en pratique selon X et Y. En effet, l’espace entre points selon x(y) est déterminé comme le rapport entre la hauteur (largeur) du rectangle calculé et des paramétres spécifiant respectivement le nombre de dots présents sur te support solide 2 en X et en Y. Cet espace entre dots « pratique » est moyenne avec l’espace inter points 2û théorique (déterminé quant à lui sur base des paramètres « x1 », « y1 », « xn », « ym » et des valeurs des paramètres spécifiant respectivement le nombre de dots présents sur la tigette en X et en Y. Celte moyenne est réalisée dans le but de contrer l’effet d’un élargissement potentiel excessif de l’espace inter points « pratique », élargissement observé lorsqu’un point n’est pas exemple plus aligné par rapports aux points situés sur une même ligne.
[0117] Un motif de grille initial peut être défini à partir d’un coin haut gauche de ia grille, l'angle que forme cette dernière avec l'horizontale, l’espacement entre points et le nombre de points connus spécifié par une
BE2017/5707 méthode propre à chaque support solide 2. La recherche des correspondances entre les points détectés et les points du motif de grille initiai est ensuite initiée par les moyens de traitement d’image 12. Les correspondances trouvées servent alors au calcul d’une transformation géométrique (homographie) qui est appliquée à la grille théorique pour que celle-ci s’adapte d'avantage aux points du support solide 2 et ce afin d’obtenir une grille théonque. La grille théorique s’adapte déjà à la plupart des points visibles mais certains doivent encore être optimisés tels que des points qui ne seraient pas bien alignés par rapport aux autres.
[0113] Optimisation locale des dots [0119] Pour que chaque dot soit centré sur un point de mesure, une optimisation locale de la position de chaque point de la grille théorique est réalisée. Ceci permet d’obtenir une mesure fiable de points mal alignés par rapport aux autres. Les points mal alignés sont par exemple dus à un mauvais alignement des moyens de production des points sur le support solidee 2. Le nombre d’itérations de l'optimisation locale de position est défini par un paramètre de nombre d’itérations d’optimisation locale de position. Si cs dernier est nul, aucune optimisation n’est réalisée.
[0120] Pour chaque point théorique, une fenêtre d’analyse (de côté égal à deux fois le rayon externe de l’anneau de mesure du fond (background) d’un dot en pixels balaye une zone d’intérêt définie autour du point. À chaque position de ia fenêtre, une mesure du ratio signal/background est calculée. Celle-ci est définie comme la différence entre la moyenne des valeurs des pixels au sein d’un cercle de rayon en pixels de la zone de signal contenant le point défini au centre de ia fenêtre, et la moyenne des pixels compris dans un anneau extérieur, entourant le cercle de rayon en pixels de ia zone de signal contenant le point. Les paramètres de rayon interne de l'anneau de mesure du fond (background) d’un point en pixels et de rayon externe de l’anneau de mesure du background (fond) d’un point en pixels représentent respectivement le rayon interne et le rayon externe de cet anneau de mesure du background (fond). La position du dut est modifiée de telle sorte à correspondre à la position de ia fenêtre d’analyse présentant le meilleur ratio signal/background.
BE2017/5707 [0121] Mesure des dots [0122] À chaque point de mesure, une mesure du signai utile est réalisée à savoir l’intensité moyenne des pixels au sein d’un cercle de rayon égal au paramètre de rayon de mesure en pixels de la zone de signal contenant le point à mesurer. La mesure de l'intensité du background est également mesurée en considérant l’intensité moyenne des pixels de l'image au sein d’un anneau extérieur au point de rayon interne de l’anneau de mesure du background en pixels et de rayon externe de l’anneau de mesure du background en pixels. [0123] Les mesures brutes des points sont obtenues en faisant la différence entre la mesure du signal et du background et en multipliant cette différence par le nombre de pixels au sein du cercle de rayon de la zone de signal contenant le point en pixel.
[0124] Les Fig. 2a et Fig. 2b montrent par exemple un mode de réalisation préféré de l’invention comprenant un habillage étanche 16 ayant un indice de protection IP54 selon la norme CEI 60529 consulté en septembre 2017. L’habillage est notamment étanche à l’eau et à la poussière. La partie de réception du support solide 2 et comprenant l’emplacement 20 est notamment rendu étanche des parties optiques et électronique au moyen d’une vitre de protection. Cette vitre de protection est par exemple représentée en Fig. 1a à
Fig. 1d et Fig. 2a à Fig. 2b de sorte à décrire un angle non droit entre sa surface et un faisceau lumineux en provenance du support solide 2 en direction du détecteur optique 6, afin de limiter la réflexion de faisceaux lumineux émis par le support solide 2. Afin de limiter réchauffement dans l’enceinte du dispositif de lecture 1, des moyens de refroidissement 15 permettent un
5 transfert de chaleur généré par les composant électroniques et optiques vers l'extérieur de l'enceinte étanche 16. Les moyens de refroidissement permettent une collection de la chaleur auprès des composants les plus émetteurs de chaleur tels que des microprocesseurs et assure le transfert de celte chaleur vers l’extérieur de l'enceinte étanche. De préférence la chaleur est ensuite dissipée vers l’extérieur de façon passive à l’aide d’un radiateur en métal. De préférence le transfert entre les composants émetteurs de chaleur et le radiateur sllué à l’extérieur de l’enceinte étanche est réalisé par un caloduc.
BE2017/5707 [0125] Des moyens de communication 8 sont de préférence indus dans te lecteur optique 1 selon l’invention afin de pouvoir acquérir une méthode adaptée à la lecture d’un support solide. Les moyens de communication 8 permettent également la communication des résultats issus des moyens de transmission. Les résultats peuvent être communiqués de façon qualitative ou quantitative vers un dispositif d’affichage, d’impression, de messagerie électronique, ou d’enregistrement analogique ou digital. Les moyens de communication 8 permettent par exemple d'accéder à une méthode spécifique à chaque lot de support solide 2. Une base de donnée de méthode est par exemple accessible via un réseau de type internet ou local, à partir d’une mémoire- do type non-volatile, à partir d'éléments imprimés de type code barre, QR code ou data-matrix. Les éléments imprimés sont par exemple lus par des moyens de lecture optique adaptés et connus de l’homme du métier.
[0126] Les Figs. 3a et 3b montrent une image 40 acquise par le détecteur optique sur laquelle figure des points de référence 45 et des point d’intérêt 41.
Les points d’intérêt correspondent aux emplacements sur lesquels les molécules de marquages se sont immobilisées. Chaque point correspond à un analyte à mesurer prédéterminé. Par exemple les points d’intérêt sont alignés lors de l’acquisition de l’image, par exemple ils sont alignés selon une même direction, par exemple lis sont répartis dans un espace à deux dimensions. Une image 40 peut être recadrée par ies moyens de traitement d’image en une image recadrée 42 telle que représentée en Fig. 3a ou 3b.
[0127] La Figure 4 montre une vue en trois dimension d’un exemple de réalisation du dispositif de lecture 1 de l’invention. Le dispositif 1 est doté d'une surface externe 16 de laquelle dépasse un dispositif de refroidissement 15 situé sur l’arrière du dispositif 1. Un emplacement 20 prenant la forme d’un tiroir permet le positionnement d’un support solide mobile 2 dans le dispositif 1. Le dispositif est équipé de moyen d’affichage permettant par exemple ia saisie de données grâce à un écran de type tactile. Un moyen de préhension est intégré dans le dispositif afin de garantir une mobilité optimale. Des moyens de connections sans-fil permettent au dispositif 1 une intégration dans tout environnement de travail et dispose de batteries afin de bénéficier d’une
BE2017/5707 autonomie suffisante pour réaliser un nombre suffisant de lecture d’échantillon sur une journée de travail par exemple.
[0128] En résumé, l’invention peut également être décrite comme suit.
Dispositif 1 de lecture optique d’un support 2 amovible pour la détection et/ou la quantification d’analytes présents dans un échantillon comprenant des moyens de communications 8 pour obtenir une information relative à un support 2 ; des moyens de sélection 27 pour sélectionner à partir d’une liste d’analytes prédéfinis, une sélection d’analytes à détecter et/ou à quantifier ; une unité optique 7, pour analyser ledit support 2 sur la base de paramètres d’analyse 10 compris dans ladite information relative à un support 2 ; des moyens de traitement d’image 12 ; des moyens de détermination 13 pour déterminer des informations d’analyte sur la base de l’information relative au support 2 et des données des moyens de traitement d’image 12 ; et des moyens de transmission pour transmettre les informations d’analyte.
Claims (27)
- Revendications1. Dispositif (1) de lecture optique d’un support solide (2) amovible pour la détection et/ou la quantification d’analytes présents dans un échantillon et comprenant :- un emplacement (20) pour recevoir ledit support solide (2) ;- une unité optique (7) pour analyser ledit support solide (2) et comprenant :o une première source lumineuse (3) pour émettre selon une intensité d’émission et dans une première plage de longueur d’onde un premier faisceau lumineux vers ledit emplacement (20);o un système d'imagerie (60) comprenant un détecteur optique (6) pour fournir une image (40) d’une zone de visualisation, ladite zone de visualisation comprenant au moins une portion dudit emplacement (20) ;o un filtre (10) pour filtrer une plage de longueur d’onde définie, et positionné entre l’emplacement (20) et ledit système d'imagerie (60) ;- des moyens de communications (8) pour obtenir une information relative à un support solide (2) ;des moyens de sélection (27) pour :o sélectionner à partir d’une liste d’analytes prédéfinis, une sélection d’analytes â détecter et/ou à quantifier ;- des moyens de traitement d’image (12) de ladite image (40) pour :o déterminer, â partir de l’information relative audit support solide (2) à lire, un nombre fini de sous-ensembles (41) de ladite image (40), chaque sous-ensemble (41) correspondant à un anaiyte ;g fournir des données relatives à des intensités lumineuses issues desdits sous-ensembles (41 ) ;- des moyens de détermination (13) pour ;BE2017/5707 o calculer, pour chaque sous-ensembte (41 ) correspondant à un analyte sélectionné dans ladite sélection d’analytes une intensité de sous-ensemble ;o déterminer sur la base de ladite intensité de sous-ensemble 5 des informations d’analyte pour chaque sous-ensemble (41) correspondant à un analyte sélectionné dans ladite sélection d’analytes ;- des moyens de transmission (19) configurés pour transmettre ladite information d’analyte pour chaque sous-ensemble (41 ) correspondant à un 10 analyte sélectionné dans ladite sélection d'analytes.
- 2, Dispositif (1) selon la revendication précédente caractérisé en ce qu’il comprend en outre :- un compteur de crédit (18), ledit compteur de crédit (18) étant 15 incréments lors de la sélection de chaque analyte à détecter et/ou à quantifier par les moyens de sélection (27).
- 3, Dispositif (1) selon l’une quelconque des revendications précédentes caractérisé en ce qu’il comprend en autre :20 des moyens de cryptage et d’enregistrement (14) pour enregistrer ladite image (40) sur la base d’un cryptage défini.
- 4. Dispositif (1) selon l’une quelconque des revendications précédentes caractérisé en ce qu'il comprend en outre :25 un dispositif d’identification (25) pour identifier un support solide (2) à lire ;et en ce que les moyens de communication (8) sont configurés pour obtenir une information relative audit support solide (2) identifié par ledit dispositif d’identification (25),
- 5. Dispositif (1) selon la revendication précédente caractérisé en ce que ladite liste d’analytes prédéfinis est comprise dans ladite information relative à un support solide (2).BE2017/5707
- 6. Dispositif (1) selon l’une quelconque des revendications précédentes caractérisé en ce que lesdits moyens de traitement d’image (12) sont en outre configurés pour :5 o détecter des zones de références (45) de ladite image (40), o positionner dans ladite image (40) chaque sous-ensemble (41 ) à une position déterminée à partir desdites zones de référence (45)..1.0
- 7. Dispositif (1) selon l’une quelconque des revendications précédentes lorsqu’il dépend de la revendication 4 caractérisé en ce que les moyens de détermination (13) sont configurés pour :o déterminer sur la base de ladite intensité de sous-ensemble et sur la base de l’information relative audit support solide (2) à 15 lire, lesdltes informations d’analyte pour chaque sousensemble (41) correspondant à un analyte sélectionné dans ladite sélection d’anaiytes,
- 8. Dispositif (1) selon l'une quelconque des revendications précédentes caractérisé en ce que ladite unité optique (7) comprend en outre :o un capteur d’intensité lumineuse (5) pour mesurer l’intensité d’émission émise par ladite première source lumineuse (3) ;o un moyen de rétrocontrôle (11) pour moduler ladite intensité d’émission de ladite première source lumineuse (3) en fonction / 5 de l’intensité d’émission mesurée par ledit capteur d’intensité lumineuse (5) de sorte que ladite première source lumineuse (3) émette une intensité cible.
- 9. Dispositif (1) selon l’une quelconque des revendications précédentes30 caractérisé en ce que ledit détecteur optique (6) est un détecteur optique à deux dimensions pour fournir une image (40) à deux dimensions de ladite zone de visualisation et en ce que lesdits moyens de- traitement d’image (12) sont configurés pour traiter ladite image (40) à deux dimensions.BE2017/5707
- 10. Dispositif (1) selon l’une quelconque des revendications précédentes caractérisé en ce que iadite information d’anaiyte est déterminée sur L base d’au moins deux intensités de sous-ensemble issues d’au moins deux 5 sous-ensemble (41 ).
- 11. Dispositif (1) selon l’une quelconque des revendications précédentes ca;sctérisé en ce que ledit nombre fini de sous-ensembles (41) est supérieur ou égal à six sous-ensembles (41), de préférence, à plus de dix sous-ensembles (41) et de manière encore plus préférée à plus de quinze sous-ensembles (41).
- 12.
- 13.Dispositif (1) selon l'une quelconque des revendications précédentes caractérisé en ce que lesdits sous-ensembles (41 ) ont une forme arrondie et de préférence ont une forme de disque.Dispositif (1) selon l’une quelconque des revendications précédentes lorsqu'il dépend de la revendication 9 caractérisé en ce que ladite image à deux dimensions (40) comprend des zones contrastées par rapport à une zone de fond, et en ce que, les moyens de traitement d’image (12) de l’image é deux dimensions (40) permettent en outre de :- recadrer iadite image à deux dimensions (40) en une image recadrée (42), ladite image recadrée (42) montrant une portion plus importante dudit emplacement (20) pour recevoir un support solide (2) que dans ladite image à deux dimensions (40) :attribuer une surface définie pour chaque position à deux dimensions de sous-ensemble (41 ) dans ladite image recadrée (42) :effectuer une optimisation locale de position de chaque sousensemble (41) de sorte que ladite surface définie de chaque sousensemble (41) est positionnée de sorte à renvoyer une intensité lumineuse maximale de chacune desdites zones contrastées.Dispositif (1) selon l’une quelconque des revendications précédentes lorsqu’elle dépend de ia revendication 4 caractérisé en ce que ladite
- 14..5 •43 information relative à un support solide (2) à lire comprend une information correspondant à chacun desdits sous-ensembles (41 ).
- 15. Dispositif (1) selon l’une quelconque des revendications précédentes5- caractérisé en ce que ladite information d’analyte est une information de type binaire.
- 16. Dispositif (1) selon l’une quelconque des revendications 1 à 14 caractérisé en ce que ladite information d’analyte est une information proportionnelle à lü ladite intensité lumineuse mesurée.
- 17. Dispositif (1) selon l’une quelconque des revendications précédentes caractérisé en ce qu’il est compact et hermétique.15
- 18. Dispositif (1) selon l'une quelconque des revendications précédentes caractérisé en ce qu’il comprend en outre :- une surface externe (16) ;- des moyens de refroidissement (15) pour transférer une quantité de chaleur de l’intérieur dudit dispositif (1) vers ladite surface externe20.............. (ie). ........; t : ƒ lllll
- 19. Dispositif (1) selon la revendication précédente caractérisé en ce que les moyens de refroidissement comprennent un caloduc.25
- 20. Dispositif (1) selon l’une quelconque des revendications précédentes caractérisé en ce qu’il comprend en outre une deuxième source lumineuse (4) configurée pour émettre un deuxième faisceau lumineux (40) dans une deuxième plage de longueur d’onde.30
- 21. Dispositif (1) selon l'une quelconque des revendications précédentes caractérisé en ce que ladite première plage de longueur est distincte de ladite deuxième plage de longueur d’onde.
- 22. Dispositif (1) selon l’une quelconque des revendications précédentes35 caractérisé en ce que ledit filtre (10) est un filtre passe double bande pourBE2017/5707BE2017/5707 laisser passer deux plages de longueur d’onde définies dont une des deux plages est ladite première plage de longueur d’onde ou ladite deuxième plage de longueur d’onde.5
- 23. Dispositif (1) selon l’une quelconque des revendications précédentes caractérisé en ce que ledit dispositif d’identification (25) du support solide (2) est un lecteur de data matrix, de code barre, ou de QR code.
- 24. Ensemble de diagnostic pour la lecture optique d’un système récupérateur 10 comprenant :- ledit dispositif (1) selon l’une quelconque des revendications précédentes ;- un moyen de diagnostic pour la détection et/ou la quantification respective, simultanée et spécifique d'une pluralité d’analytes présents15 dans un échantillon (E) comprenant au moins un mélange réactionnel et au moins un système récupérateur (2), ledit au moins un système récupérateur (2) étant sous la forme d’un support solide (2) auquel se trouvent fixés en des emplacements de récupération distincts et connus dans l'espace, des ligands compétiteurs et/ou des molécules biologiques : û de reconnaissance, de manière à identifier par ia localisation desdits emplacements de récupération sur ledit support, lesdits analytes présents dans ledit échantillon, ledit moyen de diagnostic étant caractérisé en ce que ledit système récupérateur (2) comprend des emplacements de récupération qui sont 35 disposés selon un arrangement matriciel en deux dimensions qui est défini selon un système de coordonnées connues et spécifiques desdits ligands compétiteurs et/ou desdites molécules biologiques de reconnaissance fixés audits emplacements de récupération dudit système récupérateur (2).
- 25. Ensemble de diagnostic selon la revendication précédente caractérisé en ce que lesdits emplacements de récupération sont disposés selon un arrangement matriciel en deux dimensions sous la forme de pointsBE2017/5707 présentant chacun un diamètre compris entre 20 μm à 2 mm, de préférence compris entre 100 à 500 μm et encore plus préférentiellement compris entre 250 μm et 400 μm.5
- 26. Ensemble de diagnostic selon l’une quelconque des deux revendications précédentes, caractérisé en ce que ledit système de coordonnées présente une première coordonnée définie sur un axe longitudinal d'une longueur dudit système récupérateur et une deuxième coordonnées définie sur un axe longitudinal d’une largeur dudit système récupérateur.
- 27. Ensemble de diagnostic selon l’une quelconque des trois revendications précédentes caractérisé en ce que ledit système récupérateur (2) comprend au moins cinq, de préférence au moins dix, et plus préférentiellement au moins quinze emplacements de récupération distincts destinés à la 15 détection et/ou la quantification respective, simultanée et spécifique d’au moins cinq, de préférence d’au moins dix, plus préférentiellement d'au moins quinze anaiytes de classes distinctes présents dans un échantillon et appartenant ou non à des familles d’analytes différentes, et au moins un emplacement de récupération destiné à un contrôle et/ou un calibrateur.
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