WO2022025709A1 - 2,3,5-치환된 싸이오펜 화합물의 위장관기질종양 예방, 개선 또는 치료 용도 - Google Patents

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stromal tumor
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present
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심태보
최승혜
조한나
김남경
허우영
송치만
남기엽
윤정혁
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(주)파로스아이바이오
한국과학기술연구원
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Definitions

  • the present invention relates to the use of a 2,3,5-substituted thiophene compound for the prevention, improvement or treatment of gastrointestinal stromal tumors.
  • Gastrointestinal stromal tumor is the most common sarcoma occurring in the gastrointestinal tract, mesentery, or reticulum, accounting for 5% of all sarcomas. In general, only complete resection can achieve a cure for gastrointestinal stromal tumor, but recurrence to the liver or peritoneum is common even after surgery. Its prognosis was very poor. A phenomenal effect could be achieved by using imatinib (imatinib, Glivec , Novartis), a so-called targeted anticancer drug that can block specific cell signaling systems related to the development of gastrointestinal stromal tumors.
  • imatinib imatinib, Glivec , Novartis
  • Gleevec exhibits very mild side effects compared to previous cytotoxic anticancer drugs, it showed excellent effects not only in prolonging the survival period but also in quality of life. As an adjuvant treatment after treatment and surgery, research on the effect of Gleevec is ongoing.
  • Gastrointestinal stromal tumor originates from Cajal stromal cells or its progenitor cells, and is a mesenchymal tumor of the gastrointestinal tract induced by KIT mutations (D816, N822K). Most cases (90-95%) are positive for c-kit protein and have characteristic spindle, epithelial or mixed histological findings (Corless CL, Fletcher JA, Heinrich MC. Biology of gastro-intestinal stromal tumors. J Clin Oncol) 2004;22:3813-3825.). Mutations in the KIT or PDGFR ⁇ gene are found in 85-90% of gastrointestinal stromal tumors, of which the KIT gene mutation is the most common with a frequency of 75-80%.
  • mutations in exon 11 account for about 70%, exon 9 mutations in about 15%, and mutations in exons 13 and 17 less than 5% are rare.
  • Mutations in the PDGFR ⁇ gene are observed in about 1/3 (about 7%) of gastrointestinal stromal tumors without KIT mutations (Yarden Y, Kuang WJ, Yang-Feng T, et al. Human proto-oncogene c-kit: a new cell surface receptor tyrosine kinase for an unidentified ligand. EMBO J 1987;6:3341-3351.).
  • KIT receptor protein is activated by itself even in the absence of ligand stimulation due to KIT gene mutations (D816, N822K), and cell division is continuously promoted to generate tumors.
  • Gastrointestinal stromal tumors are known to have a similar incidence worldwide regardless of race. Gastrointestinal stromal tumor is a relatively rare tumor, with an annual incidence of 10-20 per million people, and it is known that about 20-30% of all gastrointestinal stromal tumors show a clinically malignant course (Miettinen M, Lasota J. Gastrointestinal stromal tumors: definition, clinical, histological, immunohistochemical, and molecular genetic features and differential diagnosis. Virchows Arch 2001;438:1-12.). Considering that the population of Korea is about 50 million, 500-1,000 new cases of gastrointestinal stromal tumor occur annually, and it is estimated that the number of patients with a malignant course will be about 100-300 annually. It occurs slightly more in men than in women, and it occurs most often in people aged 55-65, but it also occurs in people in their 20s and 30s and in children.
  • the present inventors completed the present invention by conducting research to develop a novel material that can be used for the treatment of gastrointestinal stromal tumor.
  • One object of the present invention is to provide a pharmaceutical composition for preventing or treating gastrointestinal stromal tumor, comprising a compound represented by the following formula (1) or a pharmaceutically acceptable salt thereof:
  • Another object of the present invention is to provide a food composition for preventing or improving gastrointestinal stromal tumor comprising a compound represented by the following formula (1) or an acceptable salt thereof:
  • Another object of the present invention is to provide a method for treating gastrointestinal stromal tumor comprising administering to a patient with a gastrointestinal stromal tumor a pharmaceutical composition comprising a compound represented by the following formula (1) or a pharmaceutically acceptable salt thereof as an active ingredient to do:
  • Another object of the present invention is to provide the use of a compound represented by the following formula (1) or a pharmaceutically acceptable salt thereof for preventing or treating gastrointestinal stromal tumor:
  • One aspect of the present invention provides a pharmaceutical composition for preventing or treating gastrointestinal stromal tumor comprising a compound represented by the following formula (1) or a pharmaceutically acceptable salt thereof:
  • the gastrointestinal stromal tumor may be generated by substituting valine for aspartic acid, amino acid 816 constituting the c-kit protein.
  • Another aspect of the present invention provides a food composition for preventing or improving gastrointestinal stromal tumor comprising a compound represented by the following formula (1) or an acceptable salt thereof:
  • Another aspect of the present invention is a method of treating a gastrointestinal stromal tumor comprising administering to a patient with a gastrointestinal stromal tumor a pharmaceutical composition comprising a compound represented by the following formula (1) or a pharmaceutically acceptable salt thereof as an active ingredient to provide:
  • Another aspect of the present invention provides the use of a compound represented by the following formula (1) or a pharmaceutically acceptable salt thereof for preventing or treating gastrointestinal stromal tumor:
  • Another aspect of the present invention provides the use of a compound represented by the following formula (1) or a pharmaceutically acceptable salt thereof for preparing a pharmaceutical composition for preventing or treating gastrointestinal stromal tumor:
  • composition containing the 2,3,5-substituted thiophene compound according to an embodiment of the present invention has an excellent rate of inhibition of gastrointestinal stromal tumor growth, it can be usefully utilized for the prevention, improvement or treatment of gastrointestinal stromal tumor.
  • FIG. 1 is a diagram showing a mutation in which the 816th amino acid of the c-kit protein amino acid sequence is substituted with aspartic acid (D) to valine (V).
  • FIG. 2 is a c-kit D816V Ba / F3 cell line according to the treatment concentration of (A) PHI-101, (B) sunitinib and (C) dasatinib according to an embodiment of the present invention; This is a picture showing my ability to inhibit signal transduction.
  • FIG. 4 is a cell of c-kit D816V Ba/F3 cell line treated with (A) negative control, DMSO (dimethyl sulfoxid), (B) sunitinib, and (C) PHI-101 according to an embodiment of the present invention. It is a graph showing the results of cycle FACS analysis.
  • FIG. 5 is each of the c-kit D816V Ba/F3 cell lines treated with (A) negative controls DMSO (dimethyl sulfoxid), (B) sunitinib, and (C) PHI-101 according to an embodiment of the present invention. It is a graph showing the population by cell cycle.
  • A negative controls DMSO (dimethyl sulfoxid), (B) sunitinib, and (C) PHI-101 according to an embodiment of the present invention. It is a graph showing the population by cell cycle.
  • FIG. 6 is a photograph showing the signaling inhibition ability in the GIST-T1 cell line according to the treatment concentration of PHI-101, imatinib (Imatinib) and sunitinib according to an embodiment of the present invention.
  • FIG. 7 is a photograph showing the results of confirming the apoptosis effect of the GIST-T1 cell line according to the treatment concentrations of PHI-101, imatinib, and sunitinib according to an embodiment of the present invention by a Western blot analysis method.
  • FIG. 8 is a graph and table showing the survival period extension effect of oral administration of PHI-101, imatinib and sunitinib according to an embodiment of the present invention in a c-kit D816V Ba/F3 cell line xenograft mouse model.
  • One aspect of the present invention provides a pharmaceutical composition for preventing or treating gastrointestinal stromal tumor comprising a compound represented by the following formula (1) or a pharmaceutically acceptable salt thereof:
  • the compound represented by Formula 1, included as an active ingredient in the pharmaceutical composition of the present invention is (S)-5-((3-fluorophenyl)ethynyl)-N-(piperidin-3-yl)- 3-ureido thiophene-2-carboxamide ((S)-5-((3-fluorophenyl)ethynyl)-N-(piperidin-3-yl)-3-ureido thiophene-2-carboxamide).
  • PHI-101 a compound represented by Formula 1 of the present invention, inhibits the proliferation of GIST-T1, a human GIST cell line. Since PHI-101 exhibits an IC 50 value of 36 nM in GIST-T1 cells, it may exhibit excellent gastrointestinal stromal tumor suppression activity.
  • composition according to one embodiment of the present invention may be administered together with one or more anticancer agents.
  • composition according to one embodiment of the present invention may be used alone or in combination with methods using surgery, hormone therapy, drug therapy, radiation therapy and/or biological response modifiers for the treatment of gastrointestinal stromal tumor. .
  • the pharmaceutical composition of the present invention may include a pharmaceutically acceptable carrier.
  • Pharmaceutically acceptable carriers included in the pharmaceutical composition of the present invention are commonly used in the manufacture of drugs, and include lactose, dextrose, sucrose, sorbitol, mannitol, starch, acacia gum, calcium phosphate, alginate, gelatin. , calcium silicate, microcrystalline cellulose, polyvinylpyrrolidone, cellulose, water, syrup, methyl cellulose, methylhydroxybenzoate, propylhydroxybenzoate, talc, magnesium stearate and mineral oil, etc. It is not limited.
  • the pharmaceutical composition of the present invention may further include a lubricant, a wetting agent, a sweetening agent, a flavoring agent, an emulsifying agent, a suspending agent, a preservative, and the like, in addition to the above components.
  • a lubricant e.g., a lubricant, a wetting agent, a sweetening agent, a flavoring agent, an emulsifying agent, a suspending agent, a preservative, and the like, in addition to the above components.
  • Suitable pharmaceutically acceptable carriers and agents are described in detail in Remington: the science and practice of pharmacy 22nd edition (2013).
  • the pharmaceutical composition of the present invention may contain various bases and/or additives necessary and appropriate for the formulation of the dosage form, and nonionic surfactants, silicone polymers, extenders, fragrances, and preservatives within a range that does not impair the effect , disinfectant, oxidative stabilizer, organic solvent, ionic or nonionic thickener, emollient, antioxidant, free radical scavenger, opacifier, stabilizer, emollient, silicone, ⁇ -hydroxy acid, defoamer, humectant , vitamins, insect repellents, fragrances, preservatives, surfactants, anti-inflammatory agents, substance P antagonists, fillers, polymers, propellants, basifying or acidifying agents, or coloring agents.
  • a suitable dosage of the pharmaceutical composition of the present invention is variously prescribed depending on factors such as formulation method, administration method, age, weight, sex, pathological condition, food, administration time, administration route, excretion rate, and reaction sensitivity of the patient.
  • the dosage of the pharmaceutical composition of the present invention may be 0.001 to 1000 mg/kg based on an adult.
  • the pharmaceutical composition of the present invention may be administered orally or parenterally.
  • the pharmaceutical composition of the present invention may be administered in various formulations upon oral administration, and may be administered in the form of tablets, pills, hard/soft capsules, solutions, suspensions, emulsions, syrups, granules, elixirs, troches, etc. and may further include various excipients, for example, wetting agents, sweetening agents, fragrances, preservatives, and the like.
  • the composition of the present invention when formulated as an oral dosage form, it may further include appropriate carriers, excipients and diluents commonly used in the preparation thereof.
  • the carrier, excipient and diluent include, for example, lactose, dextrose, sucrose, sorbitol, mannitol, xylitol, erythritol, maltitol, starch, acacia gum, alginate, gelatin, calcium phosphate, calcium silicate, cellulose, methyl cellulose, Microcrystalline cellulose, polyvinyl pyrrolidone, water, methylhydroxybenzoate, propylhydroxybenzoate, talc, magnesium stearate and/or mineral oil may be used, but are not limited thereto.
  • it may be prepared by including diluents or excipients such as fillers, extenders, binders, wetting agents, disintegrants, surfactants, etc. generally used for formulation, and may further include a lubricant such as magnesium stearate or talc in addition to the excipients. .
  • the pharmaceutical composition of the present invention may be administered parenterally, for example, may be administered through methods such as subcutaneous injection, intravenous injection or intramuscular injection, but is not limited thereto.
  • Formulation into a dosage form for parenteral administration may be, for example, preparing a solution or suspension by mixing the pharmaceutical composition of the present invention with water together with a stabilizer or buffer, and preparing it as an ampoule or vial unit dosage form.
  • the composition is sterilized and may further include adjuvants such as preservatives, stabilizers, wetting agents or emulsification accelerators, salts and buffers for regulating osmotic pressure, and other therapeutically useful substances, and is formulated by a conventional method.
  • adjuvants such as preservatives, stabilizers, wetting agents or emulsification accelerators, salts and buffers for regulating osmotic pressure, and other therapeutically useful substances.
  • the gastrointestinal stromal tumor may be generated by substituting valine for aspartic acid, amino acid 816 constituting the c-kit protein.
  • gastrointestinal stromal tumors 85 to 90% of gastrointestinal stromal tumors are caused by mutations in the KIT or PDGFR ⁇ gene, and among them, mutations in the KIT gene are the most common with a frequency of 75 to 80%. Since the compound represented by Formula 1 has excellent inhibitory activity against gastrointestinal stromal tumors having a mutation of aspartic acid, which is amino acid 816 constituting the c-kit protein, specifically, a mutation in which aspartic acid is substituted with valine, the gastrointestinal tract having such a mutation It can be usefully used for the prevention or treatment of stromal tumors.
  • aspartic acid which is amino acid 816 constituting the c-kit protein
  • Another aspect of the present invention provides a method for treating gastrointestinal stromal tumor comprising administering to a patient with a gastrointestinal stromal tumor a composition comprising the compound represented by Formula 1 or a pharmaceutically acceptable salt thereof as an active ingredient.
  • the pharmaceutical composition according to one embodiment of the present invention contains the compound represented by Formula 1 as an active ingredient, and in particular, has excellent anticancer properties for gastrointestinal stromal tumors having a mutation of aspartic acid, amino acid 816 constituting the c-kit protein. show the effect. Therefore, prior to administering the pharmaceutical composition of the present invention, a companion diagnosis step of selecting a patient group showing an effect on the compound represented by Formula 1 may be further included, which is a gastrointestinal stromal tumor known in the art. It can be performed by the diagnostic method of
  • the term "accompanying diagnosis” refers to a diagnosis for predicting a patient's response to a specific drug treatment in advance.
  • Another aspect of the present invention provides a food composition for preventing or improving gastrointestinal stromal tumor comprising a compound represented by the following formula (1) or an acceptable salt thereof:
  • the food composition of the present invention can be prepared by adding raw materials and ingredients commonly added in the art, and in addition to containing the compound represented by Chemical Formula 1 as an active ingredient, various flavoring agents or natural ingredients like conventional food compositions It may contain carbohydrates and the like as additional ingredients.
  • natural carbohydrates include monosaccharides (eg, glucose, fructose, etc.), disaccharides (eg, maltose, sucrose, etc.), and polysaccharides (eg, , dextrin, cyclodextrin, etc.) and sugar alcohols such as xylitol, sorbitol, and erythritol.
  • the flavoring agent may include a natural flavoring agent (taumatine), a stevia extract (eg, rebaudioside A, glycyrrhizin, etc.) and/or a synthetic flavoring agent (saccharin, aspartame, etc.).
  • the food composition of the present invention may be formulated as a food composition by including one or more pharmaceutically acceptable or pharmaceutically acceptable carriers in addition to the active ingredients described above.
  • Formulations of the food composition may be tablets, capsules, powders, granules, liquids, pills, solutions, syrups, juices, suspensions, emulsions, or drops.
  • the active ingredient may be combined with an orally, non-toxic, pharmaceutically acceptable inert carrier such as ethanol, glycerol, water, and the like.
  • the food composition of the present invention comprises a vitamin mixture comprising vitamin A acetate, vitamin E, vitamin B1, vitamin B2, vitamin B6, vitamin B12, vitamin C, biotin, nicotinic acid amide, folic acid, calcium pantothenate, and ferrous sulfate, zinc oxide , magnesium carbonate, potassium phosphate monobasic, potassium phosphate dibasic, potassium citrate, calcium carbonate and magnesium chloride, and the like, may include one or more minerals that can be added conventionally in the art.
  • suitable binders include starch, gelatin, natural sugars such as glucose or beta-lactose, corn sweeteners, natural and synthetic gums such as acacia, tracacanth or sodium oleate, sodium stearate, magnesium stearate, sodium benzoate, sodium acetate, sodium chloride and the like.
  • the disintegrant may include starch, methyl cellulose, agar, bentonite, xanthan gum, and the like.
  • These components may be used independently or in combination, and the proportion of these additives may be selected from 0 to about 20 parts by weight per 100 parts by weight of the food composition of the present invention, but is not limited thereto.
  • various foods can be prepared by applying the manufacturing method of various formulations known to those skilled in the art to the food composition of the present invention.
  • the food composition of the present invention may be prepared in a conventional health functional food formulation such as beverage, pill, powder, etc., but is not limited thereto.
  • the food composition of the present invention is particularly excellent in inhibiting proliferation of gastrointestinal stromal tumor cell lines, it can be usefully utilized for the prevention or improvement of gastrointestinal stromal tumors.
  • Another aspect of the present invention is a method of treating a gastrointestinal stromal tumor comprising administering to a patient with a gastrointestinal stromal tumor a pharmaceutical composition comprising a compound represented by the following formula (1) or a pharmaceutically acceptable salt thereof as an active ingredient to provide:
  • Another aspect of the present invention provides the use of a compound represented by the following formula (1) or a pharmaceutically acceptable salt thereof for preventing or treating gastrointestinal stromal tumor:
  • Another aspect of the present invention provides the use of a compound represented by the following formula (1) or a pharmaceutically acceptable salt thereof for preparing a pharmaceutical composition for preventing or treating gastrointestinal stromal tumor:
  • the inhibitory activity of the compound represented by Formula 1 (hereinafter referred to as 'PHI-101') against the c-kit mutant cell line was measured.
  • the c-kit D816V mutant (FIG. 1) Ba/F3 cell line was adjusted to 10,000 cells/100 ⁇ l and put into a 96-well plate by 100 ⁇ l. After 4 hours, 100 ⁇ l of the Ba/F3 cell line was treated with 0.5 ⁇ l each of a control compound diluted by 10 points, 1/3 serial dilution, and PHI-101 to a final concentration of 50 ⁇ M, 5 % CO 2 Incubated for 72 hours at 37 °C condition. As control compounds, c-kit inhibitors Imatinib and Sunitinib were used. After incubation, the number of cells was measured using a Celltiter glo assay kit (Promega), and 50% growth inhibition values (GI 50 , ⁇ M) of the control compound and PHI-101 were measured.
  • a control compound diluted by 10 points, 1/3 serial dilution, and PHI-101
  • the c-kit phosphorylation and down-signaling inhibition (p-STAT3, p-ERK1/2) of the control compound and PHI-101 were measured.
  • the control compound sunitinib and Dasatinib was used.
  • the c-kit D816V mutant Ba/F3 cell line was aliquoted at a concentration of 1 ⁇ 10 6 cells/ml, and the control compound and PHI-101 were treated at concentrations of 0.1, 1, and 10 ⁇ M, respectively, and then cultured for 2 hours. Then, lysate the cells with lysis buffer (50 mM Tris-HCl pH7.5, 1% NP40, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl, 5 mM, Na 3 VO 4 and 2.5 mM NaF, and protease inhibitor cocktail). seafood was obtained.
  • lysis buffer 50 mM Tris-HCl pH7.5, 1% NP40, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl, 5 mM, Na 3 VO 4 and 2.5 mM NaF, and protease inhibitor cocktail. seafood was obtained.
  • the membrane was washed 3 times for 5 minutes with TBST (Tris-buffered saline, 0.1% Tween 20), and then diluted at a ratio of 1:10000 using HRP-binding anti-rabbit as a secondary antibody, and then at room temperature for 1 hour. After incubation, the cells were washed 3 times for 5 minutes with TBST, treated with a chemiluminescent substrate reagent, and the protein expression level was confirmed by detecting luminescence with a film in the dark.
  • TBST Tris-buffered saline, 0.1% Tween 20
  • c-kit D816V mutant Ba/F3 cell line was divided into 1 ⁇ 10 6 /ml concentration, PHI-101 was treated at 0.1, 1, 10 ⁇ M concentration, and sunitinib was treated as a control compound at 1, 10 ⁇ M concentration for 24 hours. . Then, the medium was removed and washed once with 1 ml PBS. The PBS was removed by centrifugation at 1000 rpm for 5 minutes. Cells were released with 100 ⁇ l of PBS containing Ca 2+ , Mg 2+ , and 5 ⁇ l Annexin V was added and reacted for 20 minutes.
  • the SubG1/GO-1 population was analyzed through cell cycle FACS analysis.
  • the c-kit D816V mutant Ba/F3 cell line was divided into 1 ⁇ 10 6 /ml concentration, and PHI-101 and a control compound, sunitinib, were treated at a concentration of 1 ⁇ M for 24 hours. After that, the medium was removed, and the c-kit D816V mutant Ba/F3 cell line was put in 70% ethanol and fixed at 4° C. for 24 hours, and then 40 ⁇ g/ml PI (propidium iodide) and 100 ⁇ g/ml RNase were mixed. Total DNA was stained by reaction in PBS buffer for 30 minutes. Cell cycle analysis of the stained cells was performed using a flow cytometer (FACS-C6, BD). The proportion of cells in the G0/G1 phase, S phase, and G2/M phase was measured, and based on this, the SubG1/GO-1 population was confirmed.
  • FACS-C6, BD flow cytometer
  • the inhibitory activity of PHI-101 against gastrointestinal stromal tumor (GIST) cell lines was measured.
  • the GIST-T1 cell line was adjusted to 5,000 cells/100 ⁇ l and put into a 96-well plate by 100 ⁇ l. After stabilization for 24 hours, 100 ⁇ l of the GIST-T1 cell line was treated with 0.5 ⁇ l each of the control compound and PHI-101, which were serially diluted by 10 points and 1/3, so that the final concentration reached a maximum of 50 ⁇ M, Incubated for 72 hours at 37 °C conditions of 5% CO 2 .
  • control compounds c-kit inhibitors imatinib, dasatinib, sunitinib and ponatinib were used. After incubation, the number of cells was measured using a Celltiter glo assay kit (Promega), and 50% growth inhibition values (GI 50 , ⁇ M) of the control compound and PHI-101 were measured.
  • the c-kit phosphorylation and down-signaling inhibition (p-AKT, p-ERK1/2, p-S6) of the control compound and PHI-101 were measured, and the control compounds were imatinib and sunitinib. was used.
  • the GIST-T1 cell line was treated with a control compound at a concentration of 1 ⁇ M and PHI-101 at a concentration of 0.01, 0.1, and 1 ⁇ M, and pc-kit Tyrosine 703 (Y703), p-AKT Threonine 308 (T308), as primary antibodies, Example 1-2, except that p-AKT Serine 473 (S473) Tyrosine 705 (Y705), p-ERK1/2 and p-S6 Serine 235/Serine 236 (S235/S236) were diluted at 1:3000 The ability to inhibit c-kit phosphorylation and sub-signal transduction was confirmed in the same manner as described above.
  • Gastrointestinal stromal tumor cell lines were treated with PHI-101 to analyze the level of cleaved PARP, an apoptosis marker, and as control compounds, imatinib and sunitinib were used.
  • the GIST-T1 cell line was treated with a control compound at a concentration of 1 ⁇ M and PHI-101 at a concentration of 0.01, 0.1, and 1 ⁇ M for 24 hours, and cleaved PARP as the primary antibody was diluted at 1:3000, except that it was used.
  • the apoptosis effect of PHI-101 on the GIST-T1 cell line was analyzed in the same manner as in 1-2.
  • mice were prepared as 6-8 week old NOD SCID female mice (18-22 g) (GemPharmatech Co., Ltd). Mice were acclimatized for 7 days before use in the experiment, and mice with abnormal health were excluded from the experiment. Mice were bred with a light-dark cycle of 12 hours in a cage (300 ⁇ 180 ⁇ 150mm) of 22 ⁇ 3° C. maintained at a relative humidity of 40% to 70%. Mice were allowed to freely ingest sterile dry granular food (Beijing Keaoxieli Feed Co., Ltd., Beijing, China) and water for the entire duration of the experiment except for the period specified in the protocol.
  • c-kit D816V mutant Ba/F3 cells cultured in suspension in a 75T flask 50 ml of c-kit D816V mutant Ba/F3 cells cultured in suspension in a 75T flask were placed in a cone tube, centrifuged at 800 rpm for 2 minutes, and 2 minutes at 800 rpm with DPBS (Dulbecco's Phosphate-Buffered Saline, welgene) After washing by centrifugation for a minute, it was suspended in RPMI1640 (welgene) without antibiotics and fetal bovine serum (FBS). Then, it was stained with tryphan blue, and the number of cells was measured with a hematocytometer.
  • DPBS Dynabecco's Phosphate-Buffered Saline, welgene
  • the cell concentration was adjusted so that the number of viable cells was 1 ⁇ 10 7 cells/ml, and 100 ⁇ l of each was dispensed into an insulin syringe.
  • the c-kit D816V Ba/F3 cell line was administered by tail vein administration.
  • a xenograft mouse model was constructed.
  • mice 3 days after transplantation of the c-kit D816V mutant Ba/F3 cell line, 6 mice were assigned to each group, and daily imatinib 90 mg/kg, sunitinib 20, 40 mg/kg, PHI-101 doses of 7, 20, 40, and 80 mg/kg were orally administered to mice, respectively.
  • imatinib 90 mg/kg, sunitinib 20, 40 mg/kg, PHI-101 doses of 7, 20, 40, and 80 mg/kg were orally administered to mice, respectively.
  • each compound was dissolved in 5% 1-methyl-2-pyrrolidone, and then thoroughly mixed in 15% Kolliphor, 30% PEG E400 HS15 and 50% 0.05M citric acid.
  • the mouse weight is measured at intervals of 3 days after the start of oral administration of the drug to determine whether the body weight has changed. Confirmed.
  • the condition of the mouse was checked and the dead subject was recorded. For each data, one-way ANOVA was used to test the significance of each group, and for the mouse life-span, a graph was derived using Kaplan Meier survival analysis, and the median survival time ) was found.
  • PHI-101 had an effect of extending the survival period by 3 days compared to the vehicle administration group even at a low dose of 7 mg/kg, and in the 80 mg/kg administration group, the vehicle administration group It was confirmed that the survival period was extended by 2 times (FIG. 8).

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Abstract

본 발명은 2,3,5-치환된 싸이오펜 화합물의 위장관기질종양 예방, 개선 또는 치료 용도에 관한 것으로, 위장관기질종양 증식 억제율이 우수하므로, 위장관기질종양의 예방, 개선 또는 치료에 유용하게 활용될 수 있다.

Description

2,3,5-치환된 싸이오펜 화합물의 위장관기질종양 예방, 개선 또는 치료 용도
본 발명은 2,3,5-치환된 싸이오펜 화합물의 위장관기질종양 예방, 개선 또는 치료 용도에 관한 것이다.
위장관기질종양(gastrointestinal stromal tumor, GIST)은 위장관, 창자간막 또는 그물막에서 발생하는 육종 중 가장 흔하며, 모든육종의 5%를 차지한다. 일반적으로 완전 절제에 의해서만이 위장관기질종양의 완치를 달성할 수 있으나, 수술 이후에도 간이나 복막으로의 재발이 흔하며, 절제가 불가능하거나 재발한 경우 고식적인 세포 독성 항암치료 및 방사선 치료에 반응하지 않으므로, 그 예후가 무척 불량하였다. 위장관기질종양의 발생과 관련된 특정세포 신호전달 체계가 밝혀지고 이를 차단할 수 있는 소위 표적항암제인 이마티닙(imatinib, Glivec　, Novartis)을 사용하여 경이적인 효과를 달성할 수 있었다. 글리벡은 이전의 세포독성항암제에 비해 매우 경미한 부작용을 나타내므로, 생존기간 연장뿐만 아니라 삶의 질에서도 우수한 효과를 보여 주었으며, 이러한 결과를 바탕으로 전이성 종양의 1차 치료로서 사용을 넘어, 수술 전 선행치료, 수술 후 보조 치료로서, 글리벡의 효과에 대한 연구가 진행중이다.
위장관기질종양은 Cajal 기질세포 혹은 그 전구세포로부터 기원하며, KIT 돌연변이(D816, N822K)에 의해 유도되는 위장관의 간엽조직기원(mesenchymal)의 종양이다. 대부분의 경우(90-95%) c-kit 단백 양성이며 특징적인 방추형, 상피양 혹은 혼합형의 조직학적 소견을 갖는다(Corless CL, Fletcher JA, Heinrich MC. Biology of gastro-intestinal stromal tumors. J Clin Oncol 2004;22:3813-3825.). 위장관기질종양의 85-90%에서 KIT 또는 PDGFRα 유전자의 돌연변이가 발견되는데, 이 중 KIT 유전자의 돌연변이가 75-80%의 빈도로 가장 흔하다. 특히 KIT 유전자의 돌연변이 중 엑손 11의 돌연변이는 약 70%를 차지하고, 엑손 9는 약 15%, 엑손 13과 17의 돌연변이는 5% 미만으로 드물다. PDGFRα 유전자의 돌연변이는 KIT 돌연변이가 없는 위장관기질종양의 약 1/3(7% 내외)에서 관찰된다(Yarden Y, Kuang WJ, Yang-Feng T, et al. Human proto-oncogene c-kit: a new cell surface receptor tyrosine kinase for an unidentified ligand. EMBO J 1987;6:3341-3351.). 위장관기질종양에서는 KIT 유전자 돌연변이(D816, N822K)에 의해 리간드의 자극이 없는 경우에도 KIT 수용체 단백이 스스로 활성화되고, 계속 세포분열이 촉진되어 종양이 발생한다.
위장관기질종양은 세계적으로 인종에 관계없이 발생 빈도가 유사한 것으로 알려져 있다. 위장관기질종양은 비교적 드문 종양으로 연간 인구 100만 명 당 10-20명이 발생하며, 전체 위장관기질종양의 약 20-30%가 임상적으로 악성의 경과를 보이는 것으로 알려져 있다(Miettinen M, Lasota J. Gastrointestinal stromal tumors: definition, clinical, histological, immunohistochemical, and molecular genetic features and differential diagnosis. Virchows Arch 2001;438:1-12.). 우리나라 인구가 약 5,000만 명임을 고려하면 연간 500-1,000명의 위장관기질종양 환자가 새롭게 발생하며, 악성 경과를 갖는 환자는 연간 약 100-300명이 될 것으로 추산된다. 여자보다 남자에서 조금 더 많이 발생하며 55-65세에서 가장 많이 발생하나 20-30대 및 소아 연령에서도 발생하고 있다.
이에, 본 발명자들은 위장관기질종양의 치료에 사용될 수 있는 신규 물질을 개발하기 위한 연구를 수행하여 본 발명을 완성하였다.
본 발명의 하나의 목적은 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 약학적으로 허용 가능한 염을 포함하는 위장관기질종양 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공하는 것이다:
[화학식 1]
Figure PCTKR2021009987-appb-I000001
.
본 발명의 다른 목적은 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 허용 가능한 염을 포함하는 위장관기질종양 예방 또는 개선용 식품 조성물을 제공하는 것이다:
[화학식 1]
Figure PCTKR2021009987-appb-I000002
.
본 발명의 다른 목적은 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 약학적으로 허용 가능한 염을 유효성분으로 포함하는 약학적 조성물을 위장관기질종양 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 위장관기질종양의 치료 방법을 제공하는 것이다:
[화학식 1]
Figure PCTKR2021009987-appb-I000003
.
본 발명의 다른 목적은 위장관기질종양 예방 또는 치료하기 위한 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 약학적으로 허용 가능한 염의 용도를 제공하는 것이다:
[화학식 1]
Figure PCTKR2021009987-appb-I000004
.
본 발명의 일 양상은 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 약학적으로 허용 가능한 염을 포함하는 위장관기질종양 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다:
[화학식 1]
Figure PCTKR2021009987-appb-I000005
.
본 발명의 일 구체예로, 상기 위장관기질종양은 c-kit 단백질을 구성하는 816번 아미노산인 아스파르트산(Aspartic acid)이 발린(Valine)으로 치환되어 발생하는 것일 수 있다.
본 발명의 다른 일 양상은 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 허용 가능한 염을 포함하는 위장관기질종양 예방 또는 개선용 식품 조성물을 제공한다:
[화학식 1]
Figure PCTKR2021009987-appb-I000006
.
본 발명의 다른 일 양상은 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 약학적으로 허용 가능한 염을 유효성분으로 포함하는 약학적 조성물을 위장관기질종양 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 위장관기질종양의 치료 방법을 제공한다:
[화학식 1]
Figure PCTKR2021009987-appb-I000007
.
본 발명의 다른 일 양상은 위장관기질종양 예방 또는 치료하기 위한 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 약학적으로 허용 가능한 염의 용도를 제공한다:
[화학식 1]
Figure PCTKR2021009987-appb-I000008
.
본 발명의 다른 일 양상은 위장관기질종양 예방 또는 치료하기 위한 약학적 조성물 제조를 위한 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 약학적으로 허용 가능한 염의 용도를 제공한다:
[화학식 1]
Figure PCTKR2021009987-appb-I000009
.
본 발명의 일 구체예에 따른 2,3,5-치환된 싸이오펜 화합물을 포함하는 조성물은 위장관기질종양 증식 억제율이 우수하므로, 위장관기질종양의 예방, 개선 또는 치료에 유용하게 활용될 수 있다.
도 1은 c-kit 단백질 아미노산 서열 중 816번째 아미노산이 아스파르트산(D)에서 발린(V)으로 치환된 돌연변이를 나타낸 그림이다.
도 2는 (A) 본 발명의 일 구체예에 따른 PHI-101, (B) 서니티닙(Sunitinib) 및 (C) 다사티닙(Dasatinib)의 처리 농도에 따른 c-kit D816V Ba/F3 세포주 내 신호전달 저해능을 나타낸 사진이다.
도 3은 (A) 음성대조군인 DMSO(dimethyl sulfoxid), (B)(C) 서니티닙 및 (D)(E)(F) 본 발명의 일 구체예에 따른 PHI-101의 처리 농도에 따른 c-kit D816V Ba/F3 세포주의 Annexin V-PI FACS 분석 결과를 나타낸 그래프이다.
도 4는 (A) 음성대조군인 DMSO(dimethyl sulfoxid), (B) 서니티닙 및 (C) 본 발명의 일 구체예에 따른 PHI-101의 처리에 따른 c-kit D816V Ba/F3 세포주의 cell cycle FACS 분석 결과를 나타낸 그래프이다.
도 5는 (A) 음성대조군인 DMSO(dimethyl sulfoxid), (B) 서니티닙 및 (C) 본 발명의 일 구체예에 따른 PHI-101의 처리에 따른 c-kit D816V Ba/F3 세포주의 각 세포주기별 population을 나타낸 그래프이다.
도 6은 본 발명의 일 구체예에 따른 PHI-101, 이마티닙(Imatinib) 및 서니티닙의 처리 농도에 따른 GIST-T1 세포주 내 신호전달 저해능을 나타낸 사진이다.
도 7은 본 발명의 일 구체예에 따른 PHI-101, 이마티닙 및 서니티닙의 처리 농도에 따른 GIST-T1 세포주의 세포사멸 효과를 웨스턴블롯 분석 방법으로 확인한 결과를 나타낸 사진이다.
도 8은 c-kit D816V Ba/F3 세포주 이종이식 마우스 모델에서, 본 발명의 일 구체예에 따른 PHI-101, 이마티닙 및 서니티닙의 경구투여에 따른 생존기간 연장효과를 나타낸 그래프 및 표이다.
본 발명의 일 양상은 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 약학적으로 허용 가능한 염을 포함하는 위장관기질종양 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다:
[화학식 1]
Figure PCTKR2021009987-appb-I000010
.
본 발명의 약학적 조성물에 유효성분으로 포함되는, 화학식 1로 표시되는 화합물은 (S)-5-((3-플루오로페닐)에티닐)-N-(피페리딘-3-일)-3-유레이도 싸이오펜-2-카복스아마이드((S)-5-((3-fluorophenyl)ethynyl)-N-(piperidin-3-yl)-3-ureido thiophene-2-carboxamide)이다.
본 발명의 화학식 1로 표시되는 화합물인 PHI-101은 인간 GIST 세포주인 GIST-T1의 증식을 억제한다. PHI-101은 GIST-T1 세포에서 36nM의 IC50 값을 나타내므로, 우수한 위장관기질종양 억제 활성을 나타낼 수 있다.
본 발명의 일 구체예에 따른 약학적 조성물은 하나 이상의 항암제와 함께 투여될 수 있다.
본 발명의 일 구체예에 따른 약학적 조성물은 위장관기질종양의 치료를 위하여 단독으로, 또는 수술, 호르몬 치료, 약물 치료, 방사선 치료 및/또는 생물학적 반응 조절제를 사용하는 방법들과 병용하여 사용될 수 있다.
본 발명의 약학적 조성물은 약학적으로 허용되는 담체를 포함할 수 있다. 본 발명의 약학적 조성물에 포함되는 약학적으로 허용되는 담체는 약제의 제조에 통상적으로 이용되는 것으로써, 락토오스, 덱스트로스, 수크로오스, 솔비톨, 만니톨, 전분, 아카시아 고무, 인산칼슘, 알기네이트, 젤라틴, 규산칼슘, 미세결정성 셀룰로오스, 폴리비닐피롤리돈, 셀룰로오스, 물, 시럽, 메틸 셀룰로오스, 메틸히드록시벤조에이트, 프로필히드록시벤조에이트, 활석, 스테아르산 마그네슘 및 미네랄 오일 등을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다. 본 발명의 약학적 조성물은 상기 성분들 이외에 윤활제, 습윤제, 감미제, 향미제, 유화제, 현탁제, 보존제 등을 추가로 포함할 수 있다. 적합한 약학적으로 허용되는 담체 및 제제는 Remington: the science and practice of pharmacy 22nd edition (2013)에 상세히 기재되어 있다.
본 발명의 약학적 조성물은 그 제형의 제제화에 필요하고 적절한 각종 기제 및/또는 첨가물을 포함할 수 있으며, 그 효과를 떨어트리지 않는 범위 내에서 비이온 계면활성제, 실리콘 폴리머, 체질안료, 향료, 방부제, 살균제, 산화 안정화제, 유기 용매, 이온성 또는 비이온성 증점제, 유연화제, 산화방지제, 자유 라디칼 파괴제, 불투명화제, 안정화제, 에몰리언트(emollient), 실리콘, α-히드록시산, 소포제, 보습제, 비타민, 곤충 기피제, 향료, 보존제, 계면활성제, 소염제, 물질 P 길항제, 충전제, 중합체, 추진제, 염기성화 또는 산성화제, 또는 착색제 등 공지의 화합물을 더 포함하여 제조될 수 있다.
본 발명의 약학적 조성물의 적합한 투여량은 제제화 방법, 투여 방식, 환자의 연령, 체중, 성, 병적 상태, 음식, 투여 시간, 투여 경로, 배설 속도 및 반응 감응성과 같은 요인들에 의해 다양하게 처방될 수 있다. 본 발명의 약학적 조성물의 투여량은 성인 기준으로 0.001~1000㎎/㎏일 수 있다.
본 발명의 약학적 조성물은 경구 또는 비경구 투여할 수 있다.
본 발명의 약학적 조성물은 경구 투여시 다양한 제형으로 투여될 수 있는데, 정제, 환제, 경/연질 캅셀제, 액제, 현탁제, 유화제, 시럽제, 과립제, 엘릭시르제, 트로키제 등의 형태로 투여될 수 있으며, 여러 가지 부형제, 예를 들면 습윤제, 감미제, 방향제, 보존제 등을 더 포함할 수 있다. 구체적으로, 본 발명의 조성물을 경구투여 제형으로 제형화할 경우, 이의 제조에 통상적으로 사용하는 적절한 담체, 부형제 및 희석제를 더 포함할 수 있다. 상기 담체, 부형제 및 희석제로는 예를 들어, 락토오스, 덱스트로스, 수크로오스, 솔비톨, 만니톨, 자일리톨, 에리스리톨, 말티톨, 전분, 아카시아 고무, 알기네이트, 젤라틴, 인산칼슘, 규산칼슘, 셀룰로오스, 메틸 셀룰로오스, 미정질 셀룰로오스, 폴리비닐 피롤리돈, 물, 메틸히드록시벤조에이트, 프로필히드록시벤조에이트, 탈크, 마그네슘 스테아레이트 및/또는 광물유가 사용될 수 있으나 이에 한정되지 않는다. 또한, 제제화에 일반적으로 사용되는 충진제, 증량제, 결합제, 습윤제, 붕해제, 계면활성제 등의 희석제 또는 부형제를 포함하여 조제될 수 있으며, 상기 부형제 이외에 마그네슘 스테아레이트 또는 탈크 같은 윤활제를 더 포함할 수 있다.
본 발명의 약학적 조성물은 비경구 투여될 수 있으며, 예를 들어, 피하주사, 정맥주사 또는 근육 내 주사 등의 방법을 통하여 투여되는 것일 수 있으나, 이에 한정되지 않는다.
비경구 투여용 제형으로의 제제화는, 예를 들어, 본 발명의 약학적 조성물을 안정제 또는 완충제와 함께 물에 혼합하여 용액 또는 현탁액으로 제조하고, 이를 앰플 또는 바이알 단위 투여형으로 제조하는 것일 수 있다. 또한, 상기 조성물은 멸균되고, 방부제, 안정화제, 수화제 또는 유화 촉진제, 삼투압 조절을 위한 염 및 완충제 등의 보조제, 및 기타 치료적으로 유용한 물질을 추가로 포함할 수 있으며, 통상적인 방법에 의해 제제화될 수 있다.
본 발명의 일 구체예에 따르면, 상기 위장관기질종양은 c-kit 단백질을 구성하는 816번 아미노산인 아스파르트산(Aspartic acid)이 발린(Valine)으로 치환되어 발생한 것일 수 있다.
85 내지 90%의 위장관기질종양은 KIT 또는 PDGFRα 유전자의 돌연변이에 의한 것으로, 이 중 KIT 유전자의 돌연변이가 75 내지 80%의 빈도로 가장 흔하다. 화학식 1로 표시되는 화합물은 c-kit 단백질을 구성하는 816번 아미노산인 아스파르트산의 돌연변이, 구체적으로 아스파르트산이 발린으로 치환된 돌연변이를 갖는 위장관기질종양의 억제 활성이 우수하므로, 이와 같은 돌연변이를 갖는 위장관기질종양의 예방 또는 치료에 유용하게 활용될 수 있다.
본 발명의 다른 양상은 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 약학적으로 허용 가능한 염을 유효성분으로 포함하는 조성물을 위장관기질종양 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 위장관기질종양의 치료 방법을 제공한다.
본 발명의 일 구체예에 따른 약학적 조성물은 화학식 1로 표시되는 화합물을 유효성분으로 포함하며, 특히, c-kit 단백질을 구성하는 816번 아미노산인 아스파르트산의 돌연변이를 갖는 위장관기질종양에 우수한 항암효과를 나타낸다. 따라서, 본 발명의 약학적 조성물을 투여 하기 전, 화학식 1로 표시되는 화합물에 효과를 보이는 환자군을 선별하는 동반진단(Companion Diagnosis) 단계를 더 포함할 수 있으며, 이는 당업계에 공지된 위장관기질종양의 진단 방법에 의해 수행될 수 있다.
본 발명에서 사용되는 용어, "동반진단"은 환자의 특정 약물 치료에 대한 반응성을 미리 예측하기 위한 진단을 말한다.
본 발명의 또 다른 양상은 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 허용 가능한 염을 포함하는 위장관기질종양 예방 또는 개선용 식품 조성물을 제공한다:
[화학식 1]
Figure PCTKR2021009987-appb-I000011
.
본 발명의 식품 조성물은 당업계에서 통상적으로 첨가하는 원료 및 성분을 첨가하여 제조할 수 있으며, 유효성분인 화학식 1로 표시되는 화합물을 함유하는 것 외에 통상의 식품 조성물과 같이 여러 가지 향미제 또는 천연 탄수화물 등을 추가성분으로 함유할 수 있다.
본 발명의 일 구체예에 따르면, 천연 탄수화물은 모노사카라이드(예를 들어, 포도당, 과당 등), 디사카라이드(예를 들어, 말토스, 슈크로스 등), 및 폴리사카라이드(예를 들어, 덱스트린, 시클로덱스트린 등)와 같은 통상적인 당, 및 자일리톨, 소르비톨, 에리트리톨 등의 당알코올일 수 있다. 상기 향미제는 천연 향미제(타우마틴), 스테비아 추출물(예를 들어, 레바우디오시드 A, 글리시르히진 등) 및/또는 합성 향미제(사카린, 아스파르탐 등)를 포함할 수 있다.
본 발명의 식품 조성물은 상기 기재한 유효성분 이외에 추가로 식품학적으로 허용 가능하거나 약학적으로 허용 가능한 담체를 1종 이상 포함하여 식품 조성물로 제제화될 수 있다. 상기 식품 조성물의 제제 형태는 정제, 캡슐제, 분말, 과립, 액상, 환, 액제, 시럽, 즙, 현탁제, 유제, 또는 점적제 등일 수 있다. 예를 들어, 정제 또는 캡슐제의 형태로의 제제화를 위해, 유효 성분은 에탄올, 글리세롤, 물 등과 같은 경구, 무독성의 약제학적으로 허용 가능한 불활성 담체와 결합될 수 있다.
본 발명의 식품 조성물은 비타민 A 아세테이트, 비타민 E, 비타민 B1, 비타민 B2, 비타민 B6, 비타민 B12, 비타민 C, 비오틴, 니코틴산 아마이드, 엽산, 판토텐산 칼슘으로 이루어진 비타민 혼합물, 및 황산 제1철, 산화아연, 탄산마그네슘, 제1 인산칼륨, 제2 인산칼륨, 구연산칼륨, 탄산칼슘 및 염화마그네슘 등 당 업계에서 통상적으로 첨가할 수 있는 하나 이상의 무기질을 포함할 수 있다.
필요한 경우, 적합한 결합제, 윤활제, 붕해제 및 발색제 또한 혼합물로 포함될 수 있다. 적합한 결합제는 녹말, 젤라틴, 글루코스 또는 베타-락토오스와 같은 천연 당, 옥수수 감미제, 아카시아, 트래커캔스 또는 소듐올레이트와 같은 천연 및 합성검, 소듐 스테아레이트, 마그네슘 스테아레이트, 소듐 벤조에이트, 소듐 아세테이트, 소듐 클로라이드 등을 포함할 수 있다. 붕해제는 녹말, 메틸 셀룰로오스, 아가, 벤토니트, 잔탄검 등을 포함할 수 있다.
이러한 성분은 독립적으로 또는 조합하여 사용될 수 있으며, 이러한 첨가제의 비율은 본 발명의 식품 조성물 100 중량부 당 0 내지 약 20 중량부의 범위에서 선택될 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.
한편, 본 발명의 식품 조성물에 통상의 기술자에게 알려져 있는 다양한 제형의 제조방법을 적용하여 다양한 식품을 제조할 수 있다. 예를 들어, 본 발명의 식품 조성물은 음료나 환, 분말 등과 같은 통상의 건강기능식품 제형으로 제조될 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명의 식품 조성물은 위장관기질종양 세포주의 증식 억제 능력이 특히 우수하므로, 위장관기질종양의 예방 또는 개선에 유용하게 활용될 수 있다.
본 발명의 다른 일 양상은 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 약학적으로 허용 가능한 염을 유효성분으로 포함하는 약학적 조성물을 위장관기질종양 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 위장관기질종양의 치료 방법을 제공한다:
[화학식 1]
Figure PCTKR2021009987-appb-I000012
.
본 발명의 다른 일 양상은 위장관기질종양 예방 또는 치료하기 위한 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 약학적으로 허용 가능한 염의 용도를 제공한다:
[화학식 1]
Figure PCTKR2021009987-appb-I000013
.
본 발명의 다른 일 양상은 위장관기질종양 예방 또는 치료하기 위한 약학적 조성물 제조를 위한 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 약학적으로 허용 가능한 염의 용도를 제공한다:
[화학식 1]
Figure PCTKR2021009987-appb-I000014
.
이하 본 발명을 하나 이상의 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나, 이들 실시예는 본 발명을 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예 1. c-kit 돌연변이 세포주에 대한 PHI-101의 억제 활성 확인
1-1. c-kit 돌연변이 세포주의 성장 저해능 확인
화학식 1로 표시되는 화합물(이하, 'PHI-101'이라 함)의 c-kit 돌연변이 세포주에 대한 억제 활성을 측정하였다.
[화학식1]
Figure PCTKR2021009987-appb-I000015
.
구체적으로, c-kit D816V 돌연변이(도 1) Ba/F3 세포주를 10,000cells/100㎕로 맞추어 96 웰 플레이트에 100㎕씩 넣어주었다. 4시간 후, Ba/F3 세포주 100㎕에, 10 point, 1/3씩 연속 희석(serial dilution)한 대조 화합물 및 PHI-101을 각각 0.5㎕씩 처리하여 최종 농도가 최고 50μM이 되도록 처리하고, 5% CO2의 37℃조건에서 72시간 동안 배양하였다. 대조 화합물로는 c-kit 억제제인 이마티닙(Imatinib) 및 서니티닙(Sunitinib)을 사용하였다. 배양 후, Celltiter glo assay 키트(Promega)를 사용하여 세포수를 측정하여, 대조 화합물 및 PHI-101의 50% 성장 억제 값(GI50, μM)을 측정하였다.
그 결과, PHI-101은 대조 화합물 대비 c-kit D816V Ba/F3 돌연변이 세포주에 대한 높은 저해능을 나타내는 것으로 확인되었으며, parental Ba/F3 세포주 대비 보다 높은 선택성을 나타내는 것으로 확인되었다(표 1).
구분 GI50(μM)
PHI-101 Imatinib Sunitinib
cKIT D816V Ba/F3 0.912 11.48 2.647
Parental Ba/F3 5.010 12.73 13.32
1-2. c-kit 인산화 및 하위신호 전달 저해능 확인
c-kit D816V 돌연변이 Ba/F3 세포주에서, 대조 화합물 및 PHI-101의 c-kit 인산화 및 하위신호 전달 저해능(p-STAT3, p-ERK1/2)을 측정하였으며, 대조 화합물로는 서니티닙 및 다사티닙을 사용하였다.
구체적으로, c-kit D816V 돌연변이 Ba/F3 세포주를 1Х106cells/㎖ 농도로 분주하고, 대조 화합물 및 PHI-101를 각각 0.1, 1 및 10μM 농도로 처리한 다음, 2시간 동안 배양하였다. 그 후, 용해 버퍼(50mM Tris-HCl pH7.5, 1% NP40, 1mM EDTA, 150mM NaCl, 5mM, Na3VO4 및 2.5mM NaF, 및 프로테아제 저해제 혼합물(protease inhibitor cocktail))를 사용하여 세포 용해물을 수득하였다. 동일한 양의 세포 용해물을 8% SDS-PAGE gel를 이용하여 100V 에서 1시간 30분 동안 전기영동하고, 분리된 단백질을 니트로셀룰로오스 멤브레인에 전기적으로 이동시켰다. 멤브레인을 5% 탈지유로 실온에서 30분 동안 블로킹한 후, 1차 항체 p-c-kit Tyrosine 719(Y719), p-STAT3 Tyrosine 705(Y705) 및 p-ERK1/2 Threonine 202/Tyrosine 204(T202/Y204)를 1:5000으로 희석하여 멤브레인과 4℃에서 16 내지 20시간 동안 반응시켰다. 발현의 정도를 비교하기 위한 대조군으로, 항-β액틴(actin)을 1:10000의 비율로 희석하여 1차 항체로 사용하였다. 이 후, 멤브레인을 TBST(Tris-buffered saline, 0.1% Tween 20)로 5분간 3회씩 세척한 후, HRP-결합 항-rabbit을 2차 항체로 하여 1:10000의 비율로 희석하여 실온에서 1시간 배양한 후 TBST로 5분간 3회씩 세척하고 화학발광기질 시약을 처리하였으며, 암실에서 필름으로 발광(luminescence)을 검출하여 단백질 발현 정도를 확인하였다.
그 결과, PHI-101은 대조 화합물에 비해 p-c-kit(Y719) 인산화에 대한 높은 저해능을 나타내고, 대조 화합물과 유사한 하위 신호전달(p-STAT3, p-ERK1/2) 저해능을 나타내는 것으로 확인되었다(도 2).
1-3. 세포사멸 효과 확인
c-kit D816V 돌연변이 Ba/F3 세포주에 PHI-101을 처리한 후, 세포사멸(apoptosis) 효과를 분석하였다.
구체적으로, c-kit D816V 돌연변이 Ba/F3 세포주를 1Х106/㎖ 농도로 나누고, PHI-101을 0.1, 1, 10μM 농도로, 대조 화합물로는 서니티닙을 1, 10μM 농도로 24시간 처리하였다. 그 후, 배지를 제거하고 1㎖ PBS로 1회 세척하였다. 1000rpm으로 5분 동안 원심분리하여 PBS를 제거하였다. Ca2+, Mg2+ 를 포함하고 있는 PBS 100㎕로 세포를 풀어주고, 5㎕ Annexin V를 넣어 20분동안 반응시켰다. 반응이 끝나면 400㎕의 Ca2+, Mg2+ 를 포함하고 있는 PBS를 추가하고, 5㎕ PI(Propodium iodide)를 넣은 후, 유세포분석기(FACS-C6, BD)를 사용하여 FACS(fluorescence activated cell sorter) 분석법으로 세포사(apoptotic cell death) 정도를 조사하였다.
그 결과, PHI-101은 0.1μM 농도에서도 세포사멸을 강하게 유도하였고, 농도 의존적으로 세포사가 증가하는 것으로 확인되었다(도 3).
1-4. 세포주기 진행 억제 효과 확인
c-kit D816V 돌연변이 Ba/F3 세포주에 PHI-101 1μM을 처리한 후, cell cycle FACS 분석을 통해 SubG1/GO-1 population을 분석하였다.
구체적으로, c-kit D816V 돌연변이 Ba/F3 세포주 1Х106/㎖ 농도로 나누고, PHI-101 및 대조 화합물인 서니티닙을 1μM 농도로 24시간 처리하였다. 그 후, 배지를 제거하고, c-kit D816V 돌연변이 Ba/F3 세포주를 70% 에탄올에 넣어 4℃에서 24시간 고정한 다음, 40㎍/㎖ PI(propidium iodide) 및 100㎍/㎖의 RNase가 혼합된 PBS 완충용액에서 30분간 반응시켜 total DNA를 모두 염색하였다. 염색된 세포의 세포주기 분석은 유세포분석기(FACS-C6, BD)를 이용하여 수행되었다. G0/G1기, S기, 및 G2/M기에 있는 세포의 비율(proportion)을 측정하였고, 이를 바탕으로, SubG1/GO-1 population을 확인하였다.
그 결과, PHI-101의 처리에 의하여 SubG1/GO-1 population이 증가하여 c-kit D816V 돌연변이 Ba/F3 세포주의 세포주기 진행이 억제되는 것으로 확인되었다(도 4 및 도 5).
실시예 2. 위장관기질종양 세포주에 대한 PHI-101의 억제 활성 확인
2-1. 위장관기질종양 세포주의 성장 저해능 측정
위장관기질종양(gastrointestinal stromal tumor, GIST) 세포주에 대한 PHI-101의 억제 활성을 측정하였다.
구체적으로, GIST-T1 세포주를 5,000cells/100㎕로 맞추어 96 웰 플레이트에 100㎕씩 넣어주었다. 24시간 안정화 후, GIST-T1세포주 100㎕에, 10 point, 1/3씩 연속 희석(serial dilution)한 대조 화합물 및 PHI-101을 각각 0.5㎕씩 처리하여 최종 농도가 최고 50μM이 되도록 처리하고, 5% CO2의 37℃조건에서 72시간 동안 배양하였다. 대조 화합물로는 c-kit 억제제인 이마티닙, 다사티닙(Dasatinib), 서니티닙 및 포나티닙(Ponatinib)을 사용하였다. 배양 후, Celltiter glo assay 키트(Promega)를 사용하여 세포수를 측정하여, 대조 화합물 및 PHI-101의 50% 성장 억제 값(GI50, μM)을 측정하였다.
그 결과, PHI-101은 대조 화합물과 유사한 수준의 GIST-T1 세포주 저해능을 나타내는 것으로 확인되었다(표 2).
구분 GI50(μM)
PHI-101 Imatinib Dasatinib Sunitinib Ponatinib
GIST-T1 0.036 0.064 0.073 0.026 -
2-2. c-kit 인산화 및 하위신호 전달 저해능 확인
위장관기질종양 세포주에서, 대조 화합물 및 PHI-101의 c-kit 인산화 및 하위신호 전달 저해능(p-AKT, p-ERK1/2, p-S6)을 측정하였으며, 대조 화합물로는 이마티닙 및 서니티닙을 사용하였다.
구체적으로, GIST-T1 세포주에 1μM 농도의 대조 화합물 및 0.01, 0.1, 1μM 농도의 PHI-101을 처리하고, 1차 항체로 p-c-kit Tyrosine 703(Y703), p-AKT Threonine 308(T308), p-AKT Serine 473(S473) Tyrosine 705(Y705), p-ERK1/2 및 p-S6 Serine 235/Serine 236(S235/S236)를 1:3000으로 희석하여 사용한 것을 제외하면, 실시예 1-2와 동일한 방법으로 c-kit 인산화와 하위신호 전달 저해능을 확인하였다.
그 결과, PHI-101은 농도 의존적으로 c-kit 및 하위신호 인산화를 감소시켰으며, 대조 화합물과 유사한 하위신호 저해능을 나타내는 것으로 확인되었다(도 6).
2-3. 세포사멸 효과 확인
위장관기질종양 세포주에 PHI-101을 처리하여 세포사멸 마커인 cleaved PARP의 수준을 분석하였으며, 대조 화합물로는 이마티닙 및 서니티닙을 사용하였다.
구체적으로, GIST-T1 세포주에 1μM 농도의 대조 화합물 및 0.01, 0.1, 1μM 농도의 PHI-101을 24시간 처리하고, 1차 항체로 cleaved PARP를 1:3000으로 희석하여 사용한 것을 제외하면, 실시예 1-2와 동일한 방법으로 분석하여 GIST-T1 세포주에 대한 PHI-101의 세포사멸 효과를 분석하였다.
그 결과, GIST-T1 세포주에서 cleaved PARP 수준이 PHI-101의 농도 의존적으로 증가하는 것으로 확인되어, 위장관기질종양 세포주에 대한 PHI-101의 세포사멸 효과를 확인하였다(도 7).
실시예 3. c-kit D816V Ba/F3 세포주 이종이식 마우스 모델에서 PHI-101의 생존기간 연장 효능 확인
3-1. c-kit D816V Ba/F3 세포주 이종이식 마우스 모델 확립
마우스는 6 내지 8주령의 NOD SCID 암컷 마우스(18 내지 22g)(GemPharmatech Co.,Ltd)로 준비하였다. 마우스를 실험에 사용하기 전 7일 동안 순화시켰으며, 건강에 이상이 있는 마우스는 실험에서 제외하였다. 40% 내지 70%의 상대 습도로 유지되는 22±3℃의 사육장(300Х180Х150mm)에서 12시간의 명암 주기로 마우스를 사육하였다. 프로토콜로 명시된 기간을 제외한 전체 실험 기간 동안 멸균된 건조 과립 식품(Beijing Keaoxieli Feed Co., Ltd., Beijing, China) 및 물을 마우스가 자유롭게 섭취할 수 있도록 하였다.
75T 플라스크에서 부유형태로 배양된 c-kit D816V 돌연변이 Ba/F3 세포 50㎖를 원추관(cornical tube)에 담아 800rpm으로 2분간 원심분리하고, DPBS(Dulbecco's Phosphate-Buffered Saline, welgene)로 800rpm에서 2분간 원심분리하여 세척한 다음, 항생제 및 FBS(fetal bovine serum)가 없는 RPMI1640(welgene)에 현탁시켰다. 그 후, 트리판 블루(Tryphan blue)로 염색하고, 혈구계산판(hematocytometer)으로 세포수를 측정하였다. 생존 세포의 수가 1Х107cells/㎖이 되도록 세포 농도를 조절하여 100㎕씩 인슐린 주사기(insulin syringe)에 분주하고, restrainer를 이용하여 마우스를 보정한 뒤 꼬리정맥투여하여 c-kit D816V Ba/F3 세포주 이종이식 마우스 모델을 제작하였다.
c-kit D816V 돌연변이 Ba/F3 세포주를 이식하고 3일 후, 마우스를 각 그룹별로 6마리씩 할당하였고, 마우스가 사망할 때까지 동안 매일 이마티닙 90㎎/㎏, 서니티닙 20, 40㎎/㎏, PHI-101 7, 20, 40, 80㎎/㎏ 용량을 각각 마우스에 경구투여하였다. 경구투여시 각 화합물은 5% 1-메틸-2-피롤리돈에 녹인 뒤 15% Kolliphor, 30% PEG E400 HS15 및 50% 0.05M 시트르산에 완전히 혼합하여 사용하였다.
3-2. 마우스의 생존기간 연장 확인
c-kit D816V Ba/F3 세포주 이종이식 마우스 모델에서, PHI-101 투여에 의해 마우스의 생존기간이 연장되는지 확인하였다.
구체적으로, 매일 실시예 3-1의 마우스 모델의 피부상태, 출혈 및 변의 상태 등을 확인하여 이상유무를 모니터링하면서, 약물의 경구투여 시작 후 3일 간격으로 마우스 체중을 측정하여 체중의 변화유무를 확인하였다. 또한, 매일 경구투여를 진행하면서 마우스의 상태를 확인하여 사망개체를 기록하였다. 각 데이터에 대해서는 One-way ANOVA를 이용하여 각 군의 유의성 테스트를 진행하였으며, 마우스의 생존기간(life-span)에 대하여 Kaplan Meier survival analysis를 이용하여 그래프를 도출하고, 평균 생존 기간(median survival time)을 구하였다.
그 결과, 생존기간 연장 효과가 없는 대조 화합물과는 달리, PHI-101은 7㎎/㎏의 저용량에서도 비히클(vehicle) 투여군 대비 3일의 생존기간 연장 효과가 있었으며, 80㎎/㎏ 투여군에서는 비히클 투여군 대비 생존기간이 2배 연장된 것으로 확인되었다(도 8).
이제까지 본 발명에 대하여 그 실시예들을 중심으로 살펴보았다. 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자는 본 발명이 본 발명의 본질적인 특성에서 벗어나지 않는 범위에서 변형된 형태로 구현될 수 있음을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 개시된 실시예들은 한정적인 관점이 아니라 설명적인 관점에서 고려되어야 한다. 본 발명의 범위는 전술한 설명이 아니라 청구범위에 나타나 있으며, 그와 동등한 범위 내에 있는 모든 차이점은 본 발명에 포함된 것으로 해석되어야 할 것이다.

Claims (6)

  1. 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 약학적으로 허용 가능한 염을 포함하는 위장관기질종양 예방 또는 치료용 약학적 조성물:
    [화학식 1]
    Figure PCTKR2021009987-appb-I000016
    .
  2. 제 1 항에 있어서, 상기 위장관기질종양은 c-kit 단백질을 구성하는 816번 아미노산인 아스파르트산(Aspartic acid)이 발린(Valine)으로 치환되어 발생하는 것인 위장관기질종양 예방 또는 치료용 약학적 조성물.
  3. 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 허용 가능한 염을 포함하는 위장관기질종양 예방 또는 개선용 식품 조성물:
    [화학식 1]
    Figure PCTKR2021009987-appb-I000017
    .
  4. 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 약학적으로 허용 가능한 염을 유효성분으로 포함하는 약학적 조성물을 위장관기질종양 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 위장관기질종양의 치료 방법:
    [화학식 1]
    Figure PCTKR2021009987-appb-I000018
    .
  5. 위장관기질종양 예방 또는 치료하기 위한 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 약학적으로 허용 가능한 염의 용도:
    [화학식 1]
    Figure PCTKR2021009987-appb-I000019
    .
  6. 위장관기질종양 예방 또는 치료하기 위한 약학적 조성물 제조를 위한 하기 화학식 1로 표시되는 화합물 또는 그의 약학적으로 허용 가능한 염의 용도:
    [화학식 1]
    Figure PCTKR2021009987-appb-I000020
    .
PCT/KR2021/009987 2020-07-31 2021-07-30 2,3,5-치환된 싸이오펜 화합물의 위장관기질종양 예방, 개선 또는 치료 용도 WO2022025709A1 (ko)

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