TW402639B - Protein production and protein delivery - Google Patents

Protein production and protein delivery Download PDF

Info

Publication number
TW402639B
TW402639B TW082110126A TW82110126A TW402639B TW 402639 B TW402639 B TW 402639B TW 082110126 A TW082110126 A TW 082110126A TW 82110126 A TW82110126 A TW 82110126A TW 402639 B TW402639 B TW 402639B
Authority
TW
Taiwan
Prior art keywords
cells
sequence
gene
cell
exon
Prior art date
Application number
TW082110126A
Other languages
English (en)
Inventor
Douglas Treco
Michael W Heartlein
Richard F Selden
Original Assignee
Transkaryotic Therapies Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Transkaryotic Therapies Inc filed Critical Transkaryotic Therapies Inc
Application granted granted Critical
Publication of TW402639B publication Critical patent/TW402639B/zh

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/475Growth factors; Growth regulators
    • C07K14/505Erythropoietin [EPO]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/575Hormones
    • C07K14/61Growth hormone [GH], i.e. somatotropin
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C12N15/902Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
    • C12N15/907Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination in mammalian cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/036Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif targeting to the medium outside of the cell, e.g. type III secretion
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/70Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction
    • C07K2319/74Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor
    • C07K2319/75Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor containing a fusion for activation of a cell surface receptor, e.g. thrombopoeitin, NPY and other peptide hormones

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)

Description

4Q細8 B7 五、發明說明(I?) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 一新穎蛋白質或新穎核酸)cDNA獲得之來源可為自然 發生或使用遣傳工程技術或人工合成方法可產生者。轉染 進入初級细胞或二級細胞的DNA可編碼一或多種治療性 產物。轉染進入初級细胞或二級细胞後,外源性DNA穩 定嵌入接受者姻胞基因體中(與出現在所使用之DNA構 築體之額外序列一起),表現或行使其他功能。或者,外 源性DNA游離性存在於受轉染初級綑胞或二級细胞中。 編碼欲得產物之DNA可於一可誘發啟動子之控制下 進入細胞,使得细胞生產或進入個體後不表現產物但可予 K誘發(即,產量之誘發係於受轉染綑胞產生後但於植入 前後均可)。編碼欲得產犓之DNA當然亦可用進入後立 即表現之方式進入綑胞(即,不需誘發)。 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製
如在此所教導的,基因尋標法可K被用於K一分離自 一不同基因的調節序列或一經由遺傳工程的方法製造之新 穎調節序列去取代一基因已存在的調節序列。這種調節序 列可Μ被包含於啟動子,促進子,骨架連接區域(scaff old-attachment region), 負性調 節元件 ,轉錄起始位置 ,調節 性蛋白質結合位置或已述序列之組合。(或者,影響所產生 的RN A或蛋白質之结構或穩定性的序列可K被取代,移除, 加入或另外經由尋標法邡Μ修正,這些序列包括多腺核苷化 訊號,mRNΑ穩定元件,剪接位置,促進或修正該蛋白質蓮輸 或分泌特性之引導序列。或其它改變或改善蛋白質或RNA分 子之功能或穩定性的序列)。根據本發明的方法,外源性D -20 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) 五、發明說明(/) 發明背景 目前對於經由施用治療性蛋白質來治療疾病的研究包 括供傳統性醫藥傳送(例如,靜脈内,皮下,或肌肉内注 射)之治療性蛋白質之體外生產,及較近期地,基因治療 0 具治療性意義的蛋白質通常經由置入編碼具治療性意 義的蛋白質之外源性DNA到合適的细胞內加以生產。目 前對於基因治療方面可行之研究利用到感染性的載體,例 如反轉錄病毒載體,其中包含欲表現的遣傳物質。這樣的 研究本身具有限制,例如在載體生產時產生可複製病毒之 潛在可能性,治療性病毒與内源性病毒之間發生重组,潛 在性生成具新穎细胞特異性,宿主範圍之感染性因子,或 增加毒性及细胞殺傷力;獨立嵌人大量细胞中,增加腫瘤 產生性***事件之危險性;在反轉錄病毒中限制選殖能力 (其限制治療應用性)並於ri期在體内表現目的產物。一 較好的研究係提供基因產物,特別是在避免關於目前可用 方法之風險及提供長期生產這一點上具有價值。 發萌概述 本發明相關於供體外治療性蛋白類的生產及供經由基 因治療之治療性蛋白類的生產及傳送的改良方法。本方法 敘述一種活化内源性细胞基因表現的研究方式,並進而使 得被活化之内源性细胞基因進行增幅,其不需要編碼具治 療目的之蛋白質之外源性DMA進行體外的操作或轉染。 —4 — 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) ---------------- (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂· 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 ;線參----usp II I -- I---------- 年、 6 β 月 & ο
9 3 A7 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 -- Tffi 7U _B7_五、發明說明(4〇 ) η位於EPO第2 — 5涸exon的上游。轉錄,剪接及 轉譯的產物為hE PO訊號胜肽第1 — 4個胺基酸被hG Η第1 - 3個胺基酸殘基所取代之蛋白質。該兩個具體事 實不同點在於外來調節性序列***之相對位置及產生最終 加工之轉錄本(transcript)所需要的特殊剪接形式。 質體ρΧΕΡΟ—10用於藉由基因尋標於人類第7 對染色體上内源性hEPO基因KhGH第1個exon 取代hEPO第1個exon。質體ρΧΕΡΟ - 10構 築如下。首先,中間質體ρ Τ 1 63藉由將6仟鹽基對Η indl-BamHI片段(見實施例If)在Hind 皿一BomHI 切割之 pBl uescr i pt ISK + (Stratagene,LaJol la,CA)內插 入hEPO譯碼區 域之上游。該連接後的產物KXho I及H i ndiil切割並連接至來自pMC 1 neoPo 1 y A 〔Thomas ,K*R* 及 Capecchi ,M * R * C e 1 1 51:503-512 (1 9 8 7), 可用來自 Stratagene,Laj o 1 1 aCA 者 〕之1 ♦ 1仟鹽基對Hindi— Xhol片段上。在聚 合酶鐽反應中使用寡核苷酸1 3 · 1 — 1 3 · 4而產生一 融合片段,其中老鼠meta 1 i othi one i nl (mMT — i)啟動子一hGH第1個exon序列融合 於hEPO 第1個exon序列。首先,寡核苷酸13 * 1及13 * 2被用來自pXGH5 (圖1)增幅約0 * -63- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 舖2g38 五、發明說明(>) 本發明相關於受轉染之细胞,包括受轉染之初級细胞 及受轉染之二級细胞(即,非不死化细胞)及受轉染之不 死化细胞,其有利於生產蛋白質,特別是治療性蛋白質的 製造,相闢於製造這些细胞的方法,使用這些细胞供體外 蛋白質的製造及相關於基因治療的方法。本發明之细胞為 脊椎動物來源,特別是哺乳動物來源及甚至較特別的是人 類來源。藉由本發明方法所產生的细胞包含編碼一治療性 產物的外源性DNA,或外源性DNA本身為一治療性產 物及/或造成該受轉染细胞K較高程度表現基因或使該受 轉染细胞具有與相關未受轉染细胞不同之調節或誘發型式 之外源性D N A。 本發明亦相關於轉染初級细胞Λ二級细胞及不死化细 胞Κ使其包括外源性遺傳物質的方法,相關於產生選殖细 胞株或異源性细胞株的方法及使用該受轉染初级细胞,二 级细胞及不死化细胞來免疫動物,或在免疫動物身上產生 抗體的方法。 本發明特別相關於一種在脊椎動物來源,特別是在哺 乳動物來源的细胞中進行之基因尋標或相似性重組的方法 。也就是說,其相關於將DNA經由相似性重組置入脊椎 動物來源之初級细胞,二級细胞或不死化细胞,使得該D ΝΑ被置入初級细胞,二級细胞或不死化细胞之基因體D Ν Α上的預選位置。該所使用的尋標序列係藉由外源性D N A欲嵌入的位置加K決定(選擇之參考)。本發明進而 -5- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) ----訂---------線一 8V.月08曰 修正補充 403638 A7 B7 五、發明說明(α) E P 0啟動子及上游序列進行對應性重組的綑胞包含一種 多形性基因,其中mMT— I啟動子及非轉錄性序列,h GH5’未轉譯序列及hGH 第1個exon,及一包 含hEPO 第1個intron前10個鹽基對之10 鹽基對長連接子於相對於h E P0密碼區域一 62 0位置 的Hindi!處***(見圖6)。位於正常沈默之hEP 0啟動子上游之mMT-I啟動子將於初級或二級皮虜纖 維母細胞中,指揮具(5*至S')非轉譯性metal 1 oth i one i n 及 hGH 序列,hGH 第 1 個 ex on同於hEPO 第1個intron前10個鹽基對 的1 0鹽基DNA,及正常性hEPO啟動子及hEPO 第1個exon (相對於EP ◦密碼區域一620至+1 3)之訊號的製造。來自hEPO 第1個intron 之10鹽基對連接子序列作為剪接主動位置將hGH 第 1個exon與位於hEPO 第2個exon上游之下 一個下游剪接被位置融合。該轉録本之處理將因而剪出h ΕΡ0啟動子,第1個exon,及第1個i nt ron 序列。MhGH exonl取代hEPO 第1個ex ο η產生h E P0訊號胜肽前4個胺基酸KhGH第1 一 3個胺基酸取代之蛋白質,並製造一具功能之多形性訊號 胜肽,其藉由後轉譯處理成熟蛋白質上移除並自表現细胞 分泌。 可使用習知方法構築一条列相關於pXE P0 — 1 0 -69- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) -ο裝 ——訂--------- 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 五、發明說明(3) 相關於有本發明產生之相似性重組之初級细胞,二級细胞 或不死化细胞,被稱為相似重組性(HR)初級细胞,二 級细胞或不死化细胞,及相關於H R初級细胞,二级细胞 或不死化细胞的用途。 本發明亦相關於一種活化(即,開啟)一出現於脊椎 動物來源之初級细胞,二級i胞或不死化细胞中的基因, .:; 該基因在细胞中正常是不表4的或當细胞得到時並不K生 理上有意義的程度加K表現。根據本發明的方法,相似性 重組被用於K一造成該受轉染细胞K較高程度表現基因或 使該受轉染细胞具有與相關未受轉染细胞不同之調節或誘 發型式之外源性DNA,取代或破壞當细胞得到時與其中 基因正常性連结的調節區域。本發朋因而相關於一種經由 開啟或活化一內源性基因的方法,該內源性基因與受轉染 之初級细胞,二級细胞或不死化细胞中編碼一希望之產物 0 在一個具體事實中,該活化基因可Μ進而經由含有一 可篩選標記而被增幅,該可篩選標記具有的特性為含有該 可篩選標記基因之增幅拷貝的细胞可Κ經由在合適的篩選 劑存在下培養细胞而加Μ篩選出。該鄰近或連接於被增幅 之可篩選標記基因之内源性基因在含有被增幅之可篩選標 記基因的细胞中亦可被增幅。包含許多份拷貝之被活化内 源性基因的细胞有利於供體外蛋白質的生產及基因治療。 如在本發明所揭示之基因尋標及增幅特別有利於開啟 -6 - 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 ---------1!!1!!------------ 89 6 GSjfi 4的63 年補充 五、發明說明) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 及ρΧΕΡΟ — 1 1的構築體。在這些構築體中,mMT 一 I啟動子及hGH序列的相對位置,及mMT — I/h G Η序列***h E P 0上游序列的位置皆為多變的Μ創造 有助於基因尋標之多形性轉錄,使得融合之轉錄本表現更 有效率,或具其他希望的特性。此種構築體將得到相同的 結果,因此該hGH/hEPO融合基因藉由基因尋標而 在正常h E P 0基因上受到一外源性啟動子的控制。 例如在hEPO基因上游之6仟鹽基對H i nd I I I 一 BamH I片段(見實施例If)據有許多限制酶鑑 識序列而可Μ作為n e 〇基因及mMT— I啟動子/hG Η融合片段的嵌入位置。一個這樣的位置,位於該H i η d I I I位置上游約1 * 3仟鹽基對之Bg 1 I I位置, 在此區域為獨特的,且可作為一或多個可篩選標記及一衍 生自另一個基因的調節性序列***的用途,該調節性序列 可以作為在初級人類细胞、二級人類细胞或不死化人類细 胞中活化EPO表現之用途。 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 首先,中間型質體pT164係經由將在hEPO編 碼區域上游6Kb之Hindi I I — BamHI片段( 實施例If)嵌入MHindl I I— BamHI切割之 pBluescriptIISK + (Stratase n e > L a J ο 1 1 a,CA)中構築而成。質體pMC IneoPolyA〔Thomas,K.R ♦及 Cap ccchi,M,R.Cel i5i :503-512 ( -70- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公复) A7 B7 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 五、發明說明(4) 會形成相當大的轉錄單位且因此難Μ分離及表現之基因的 表現,或開啟整個蛋白質的煽碼區域上未可知或尚未選殖 之基因。本發明亦敘述一種相似性重組用於轉變一基因成 為cDNA拷貝,去除ί nt ron,供轉移人酵母菌或 细菌中進行體外蛋白質的生產的方法。 本發明受轉染的细胞有利於在人類及動物上的許多應 用。在一具體事實中,該细胞可被植入一人類或一動物身 上K供在人類或動物身上進行蛋白質的傳送。例如,人類 生長激素(hGH),人類_P0 ( h E P 0 ),人類胰 ' I 島素調理素及其他蛋白質可系統性或局部性在人類身上 被傳送而提供治療的肋益。包含表現一治療性產物之受轉 染细胞且治療性產物可Μ自由進出之屏障設計可K用來將 细胞駐留體内一固定的位置,或保護並分雛细胞,免於宿 主兔疫系統的攻擊。屏障設計特別有利於並使得受轉染不 死化细胞,來自其他生物種類的受轉染细胞(異種性受轉 染细胞,’xenogenic),或來自一非組绷抗原相 容性配合之提供者(受轉染異體性细胞,a 1 i o gen i c ),可K被植入K供人類或動物的治療或供農菓用途 (例如,肉類及日常產品)。屏障設計亦允許經由接近细 胞之方便的短期(即*暫時性)治療,並當治療計畫因任 何理由停止時可K移出。受轉染之異種性及異體性细胞可 作為短期基因治療的用途,使得該细胞所產生的基因產物 在體内被傳送直到該细胞受到宿主.免疫系統的排斥為止。 -7- (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) !!”--------------«衣 訂---------線P---- β. 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐〉
402633 A7 B7 五、發明說明(刀) 一訊息的產生:(5 '到3 Λ )非轉譯性m e t a 1 1 〇 th i one i n 及 hGH 序列,hGH 第 1 個 exon ’與hEPO第1個i ntr〇n前10個鹽基對相同之 1 〇鹽基對之DNA,及hEPO上游區域及hEPO第 1個ex〇n (相對於ΕΡ0編碼序列,自約一1920 到+13)。來自hEPO第1個intron之10鹽 基對連接子序列作為一剪接提供位置Μ便將h G Η第1個 e X ο η融合到下游的剪接接受位置,其為於h Ε Ρ0第 2個e X 〇 n的正上游位置。所得到的轉錄本的加工將因 此剪接出hEPO上游序列,啟動子區域,第1個exo η,及第1個i nt ron序列。當使用ρΧΕΡΟ— 1 〇,一 1 1及一1 2時,該訊息之轉錄後加工可Κ經由利 用體外突變產生法Κ除去剪接接受位置加Κ改善,該剪接 接受位置位於介於mMT- I啟動子及hEPO第1個e X ο η之間的h Ε P0上游序列中,其本來會減少製造希 望的訊息所需要之生產行剪接事件的發生程度。Kh GH 第1個exon取代hEPO第1個exon導致一蛋白 質中h Ε P0訊息胜肽中前4個胺基酸被hGH之第1個 到第3個胺基酸所取代,製造出一功能性,融合之訊息胜 肽’其藉由轉譯後加工自成熟蛋白質上去除且由表現细胞 中分泌出來。 實施例3 * 上游序列之被尋標修正及該被尋標基因 的增幅 -74- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) -C3裝--------訂---------· 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 mum A7 B7 五、發明說明(ζ") 〆 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 本發明之受轉染细胞亦有利於提升抗體的產生或供免 疫人類或動物K對抗致病因子。經植入的受轉染细胞可以 用來傳送免疫性抗原,引起對宿主细胞及體疲免疫反應的 剌激。這些免疫反應可K被設計成保護宿主免於未來的感 染性因子的感染(即,疫苗用途),刺激或調節直接對抗 一正發生之感染的疾病作戰能力,或產生抗體直接對抗在 體内經由受轉细胞所產生的抗原,該受轉染细胞有利於治 療性或診斷性目的。可移除之屏障設計可K作為允許一終 止抗原的曝露之簡單設計。或者,最終會被排斥的细胞( 異種性或異體性受轉染细胞)可K作為限制抗原的曝露, 因為抗原的生產會因為细胞4排斥而停止。 經.> 智慧財產局員工消費合作社印製 本發明的方法可K用於_產會產生廣泛範圔之治療上 有用的產物之初級细胞,二?i细胞或不死化细胞,這些產 物包括(但不限於):一激素,细胞激素,抗原,抗體, 酵素,凝血因子,輸送蛋白質,受體,調節性蛋白質,结 構性蛋白質*反義RNA。另外,本發明的方法可K用於 產生细胞,該细胞會生產有利於一治療性產物的體外生產 及基因治療之非自然發生之RNA醑,蛋白質,或核酸。 画示簡述 圖1為質體PXGH5之概要圖示,其包括在老鼠m e t a 1 1 ot h i one i n啟動子的控制下之人類生 長激素(hGH)基因。 圖2為質體p c DN E 0之概要圖示,其包括嵌入質 一 8 一 度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 1 I 年^修正1補充 赠639五、發明說明(剜) e X ο π5序列,酵母菌轉錄終只序列,酵母菌質體複製 序列,LTR,gpt基因,hGH3<非轉錄序列。 來自TC1及TC2的線狀片段順序行嵌入hGH基 因兩側的相對位置。當Μ輔肋性反轉錄病毒重複感染(s uper infect ion)這些細胞後,LTR經由 此區域所指揮的轉錄作用將導致一 RNA在兩端具有L T R。此RNA的剪接將產生一種其中正常hGH i n t ron被移除的分子。該被加工的轉錄本之反轉錄作用將 造成經加工之h GH融合基因之雙股DNA拷貝的累積。 由該雙重尋標的反轉錄病毒性感染之綑胞中分雛出DNA ,並K一在該轉錄單位之L T R中切割一次之酵素加K切 割。該被切割的物質在促進環化反應的條件下進行黏接, 被送入酵母菌细胞中,且該细胞接著被曝露於針對URA 3基因所進行的篩選之下。只有採取URA3基因的细胞 (URA3連接於被TC1及TC2所送人的序列及該經 加工之hGH基因)能夠生長。這些细胞包含一將在半乳 糖的誘發下表現h GH蛋白質且在细胞中經由被融合之酵 母菌引導胜肽序列分泌出該hGH蛋白質的質體,酵母菌 引導胜肽序列在分泌時會被切除而產生一成熟,具生物活 性之h G Η分子。 在綑菌綑胞中的表現係伴隨著簡單地在T C 1及T C 2中,將來自UBR322之安比西林(amp i c i 1 i in) _抗藥性基因取代酵母菌URA3基因,將ta 一 8 4 _ 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) α 裝 tr---------龜
402Q3B 五、發明說明(fc) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 體pcD之BamHI位置之來自質體pSV2neo之 neo編碼區域(BamHI— Bsl I I片段);來自 PBR322 之 Amp — R 及 pBR3220r i 序列; 及po l yA,1 6S剪接交會位置及來自SV40之早 期啟動子區域。 圖3為質體dXEPO 1之概要圖示。該實體黒弧表 示pUC 1 2骨幹且該箭頭表示安比西林(amp i c i i 1 i η)抗藥性基因的轉錄方向。該斜線弧表示老鼠m eta 1 1 oth i one i η 啟動子(pmMTl)。 該空心且為黑方魄所中斷的弧表示人類紅血球生成素E P 0基因(黑色方塊顯示exon且該箭頭指示hEPO轉 錄的方向)。限制核酸酹辨識處的相對位置亦加K標明。 圖4為質體pE3neoEP ◦之概要圖示。人類紅 血球生成素基因的相對位置及n e 〇和amp抗藥性基因 被標示出。箭頭指出不同基因的轉錄方商。pmMT 1表 示老鼠me t a 1 1 o t h i丨one i η啟動子(驅動h EPO的表現)且pTK表g疱疹簡單病毒胸腺核苷激酸 i 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 啟動子(驅動neo的表現P。圖譜中的點狀區域標示人 類Η P R T序列的位置。限制核酸酶辨識處的相對位置亦 加Κ標明。 圖5為轉錄性活化h e d 〇基因之策略的概要圖示; 细線表示hE P0序列;粗線為老鼠me t a 1 1 o t h i one i η I啟動子;點狀方塊為hGH之5'非轉譯 -9- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製
402G3B 五、發明說明(7) 區域;實心方塊為hGH第1個exon ;開口性方塊為 hEPO編碼序列;HI I ί ,HindI I I位置。 丨:, 圖6為轉錄性活化h e | 〇基因之策略的概要圖示; 细線表示hEPO序列;粗緣為老鼠metal loth i one i η I啟動子;點狀方塊為hGH之5'非轉 譯區域;實心方塊為hGH第1個exon;斜線方塊為 1 0鹽基對來自hEPO第1個i nt r on的連接子; 開口性方塊為hEPO編碼序列;HI I I ,Hi ndl I I位置;交叉線方塊為hEPO之5'非轉譯區域;且 開口性方塊為hEPO編碼序列;HI I I ,HindI I I位置。 圖7為一紅血球生成素在一被尋標之人類细胞株中表 現並進行逐步在0 * 02,0 ♦ 05,0 * 1 ,0 . 2及 中進行篩選的圖示。 圖8為質體PREP04之概要圖示。 發明詳述 發明總覽 本發明及其中K參考方式加入的方法相關於脊椎動物 來源,特別是哺乳動物來源之受轉染初級及二級细胞,其 Μ外源性遣傳物質(DNA或RNA)進行轉染,並編碼 一臨床上有用產物,相闞於轉染初级及二級细胞而使其具 外源性遣傳物質之方法,相關於產生可表現外源性遺傳物 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寓本I)
402838 A7 B7 五、發明說明(g) 質之選殖株细胞或是異源性细胞株的方法,相醖於經由本 發明受轉染细胞之利用提供生理上有用份量之產物給一需 要之個體之方法,相關於免疫動物來對抗可表現與該受轉 染细胞表現之產物有抗原相關性之表位(ep i tope s)的致病性病毒或微生物之方法,及栢關於產生抗體直 接對抗受轉染初級、二级或不死化细胞之產物的方法。臨 床上有用的產物可K經由自受轉染细胞的純化而於體外產 生,也可K經由植入一非人類或人類(基因治療)而於體 內製造。不論在體内或體外生產,臨床上有用的產物可以 包括激素類,细胞激素類*抗原類,抗體類,酵素類,凝 血因子類,蓮輸蛋白質類,受體類,調節性蛋白質類,结 構性蛋白質,轉錄因子類,及反義R N A。另外,本發明 的方法可以用於產生可生產非自然發生之RNA醯類,蛋 白質類,或核酸類之细胞。 在一個具體事實中,本發明相關於一種脊椎動物细胞 ,特別是哺乳動物來源之基因或DNA尋標(t a r g e t i ng)的方法。也就是說,其相關於將DNA經由相 似性重組(homologous recomb i na nt i on)置入脊椎動物來源之初級细胞,二級细胞或 不死化细胞,使得該DNA被置入初級细胞,二級细胞或 不死化细胞之基因體DNA上的預選位置。該所使用的尋 標序列係藉由外源性DN A欲嵌入的位置加K決定(選擇 之參考)。本發明進而相關於有本發明產生之相似性重組 -11- 本紙張尺度適用令國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) -------—訂---------線' 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 402§SS A7 B7 五、發明說明() 之初級细胞,二趿细胞或不死化细胞,被稱為相似重組性 (HR)初級细胞,二級细胞或不死化细胞,及相關於Η R初級细胞,二級ffl胞或不死化细胞的用途。 本發明亦相闞於在脊椎動物來源之初級细胞,二级细 胞或不死化細胞中基因開啟或活化的方法,該基因正常時 未於细胞中表現或表現未達明顯之程度。對應性重組法或 尋標法係用來K一引起基因表現程度較相關未受轉染细胞 者為高之調節序列取代或破壞正常相關於該基因之調節區 域。本發明因而相闢於一種經由開啟或活化一内源性基因 的方法,該内源性基因與受轉染之初級细胞,二级细胞或 不死化细胞中編碼一希望之產物。 在一些具體事實中,外源性DNA經過與受轉染(接 受者)細胞之基因體DNA進行之相似性重組可K根據本 發明加K實施。在一個具體事實中,外源性DNA的置入 造成一正常下不表現的或表現程度太低而對體外蛋白質傳 送或基因治療無甚益處之基因的活化。在第二個具體事簧 中,編碼一具治療性用途的產物之序列經由相似性重組在 接受者细胞之基因體上的預選位置嵌入接受者细胞的基因 體中,使得嵌入位置為精確可知且該位置可K針對其被偏 好的特性加K選擇(例如,允許外源性DNA之高程度表 現的位置)。 在第三涸具體事實中,本發明敘述一種活化(即,開 啟)及增幅一在一受轉染初級细胞、二級细胞或不死化细 -12- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公楚) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) -I------訂·!•線〆 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 A7 B7 五、發明說明(丨ο )
胞中編碼一希望產物之内源性基因。也就是說,其相關於 一種經由與基因體D N A之間之相似性重組方法,該方法 置入非正常功能性連接於内源性基因之DNA序列及(1 )當其在内源性基因位置或鄰近内源性基因位置嵌入宿主 基因體,其可K改變(例如,活化)內源性基因的表現, 且進而(2)允許篩選出其中被活化內源性基因經過增幅 之细胞。在本發明中有利的可增幅序列包括,但不限於: 編碼可篩選標記二氫葉酸還原酶、腺核苷去胺II及CAD 基因(編碼三功能性蛋白質:磷酸胺基甲酯製造酶,天門 冬胺酸轉胺基甲醯酶,及二氫乳清酸酶)的序列。亦可使 用這些序列及其他可增幅序列的修正者。根據本發明的方 法,該編碼一可篩選標記之可增幅序列及改變該内源性基 因之表現調節之DNA序列,與在细胞基因體上一預選位 置之基因體DNA序列相似之DNA序列聯合被置入初級 细胞、二級细胞或不死化细胞。此位置通常在編碼一治療 性產物的基因上游或之中,或在影響希望基因之功能的位 置。改變内源性基因表現的DNA序列,編碼一可篩選標 記之可增幅序列,及與基因體DNA預選位置相似之序列 ,可Μ用一單一 DNA構築體,或Μ分開而在一受轉染细 胞之基因體上物理性連接的序列形式被置入初級细胞、二 级细胞或不死化细胞。進而,該DNA可Κ單股,雙股D ΝΑ,在一或兩個末端具有或不具有軍股區域的形式置入 ,或該DNA可Μ環狀DNA形式嵌入。當外源性DNA 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) ,— I I丨I _丨訂·丨丨— — 線' 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 A7 ___B7_ 五、發明說明(丨丨) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 被置人细胞後,該细胞在適合相似性重組發生於基因體D N A及被置入DN A之部份之間的條件下被培育。介於基 因體DN A及被置入DNA之間的相似性重組導致一相似 性重組初級细胞、二级细胞或不死化细胞,其中改變一内 源性基因表現的序列,及編碼一可篩選標記之可增幅序列 ,係合作性連接於一編碼治療性產物的内源性基因。在篩 選出編碼一可篩選標記之可增幅DNA之增幅的條件下培 養得到的相似性重組细胞,傳到一包含一被增幅之可篩選 標記及一同時被增幅且其表現已被改變之内源性基因的细 胞。藉此方法產生的细胞可Μ在合適該治療性產物的條件 下加以培養,籍此在體外產生治療性產物,或該细胞可Μ 作為一治療性蛋白質體内傳送的用途(即,基因治療)。 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 額外的具體事茛為具有可行性的。該尋標事件可為一 調節性序列單純之嵌入,將該内源性基因製於一新的調節 序列的控制下(例如,經由一啟動子或一促進子*或兩者 同時嵌入一內源性基因的上游)。該尋標事件可為一單純 之調節元件的刪除,如一組織特異性負性調節序列的刪除 。該尋標事件可Κ取代一已存在之元件;例如一組纖特異 性促進子可Μ被一較其自然發生之元件具更廣或不同的细 胞型特異性的促進子加Μ取代,或表現不同於相關之未轉 染細胞之調節或誘發型式。在此具體事實中該自然發生的 序列被刪除且新的序列被加入。在所有的情形中’尋標事 件的確認可Μ藉肋於使用與尋標D Ν Α物理性聯结之一或 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 x 297公釐) A7 '^___^-----;—— 五、發明說明(丨>) 多個可篩選標記基因,使得其中外源性DNA已嵌入宿主 细胞基因體中的细胞被篩選出。尋標事件的確認亦可K藉 助於使用一個或多個表現負性篩選特性之一個或多個篩選 基因,使得負性篩選的標記連接於該外源D N A,但是必 須規劃使得負性篩選的標記位於尋標序列的兩端,且因而 —與宿主细胞基因體中序列發生之正確相似性重組事件不 會引起負性篩選標記的穩定嵌入 有利於此目標之標記類 包括簡單疱疹病毒胸腺核苷激醑(TK)基因或细菌性黃 嘌呤一鳥糞嘌呤磷酸核糖基轉移酶。 本發明亦相關於使用相似性重組將一基因轉變成一c DNA拷貝(一去除intron的基因拷貝)。該cD N A拷貝可以被轉移到酵母菌或细菌以供體外蛋白質的產 生,或該c DNA拷貝可Μ被嵌入一哺乳细胞K供蛋白質 的生產。若該cDNA打算轉移到微生物细胞中,包含尋 標序列之兩個DNA構築體經由相似性重組被嵌入,一個 構築體位於編碼一治療性產物之人類基因的上游而另一個 構築體位於該基因的下游。在上游嵌入的序列,包括與在 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 胺.,記可 入 個列標及 r 嵌 一 序之;〇> 係 第 A 選件 d 列 之 N 篩元 a 序 質 D 供性 e 的 白的中節 1 人 蛋似物調肽嵌 性相生之胜游 療列微用導上 治序在功引在 之的一 有一 。 工置碼具碼 A 加位編中編 N 經游;胞之 D , 上 R 细泌之 熟其 T 物分 } 成或 L 生胞 e 1 的之為细 d 碼 A 毒在物 i 編 N 病一生 t 上 D 錄;微 P 體之轉列自 e 因酸反序進 P 基基一之促 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) W63S A7
五、發明說明(β ) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 編碼一成熟,經加工之治療性蛋白質之第一涸胺基酸的基 因體DNA的鄰近上游區。在下游嵌人的序列包括與在基 因體上編碼一成熟,經加工之治療性蛋白質之最後一個胺 基酸之DMA的或其下游位置的序列栢似的DMA序列; 一微生物性轉錄終止序列;能夠在微生物细胞中指導DN A禝製之序列;及一反轉錄病毒L T R。在下游嵌入的序 列係嵌人編碼一成熟,經加工之治療性蛋白質之終止密碼 子(codon) DMA的鄰近下游區。當兩種外源性D NA分別被置入细胞後,該细胞在適合相似性重組發生於 基因體DNA及被置入DNA之間的條件下被培育,藉此 產生相似性重組细胞。選擇性地,構築體的其中之一或兩 者可K編碼一或多個供正性篩選或負性篩選含有該DNA 構築體的细胞的標記,且一當構築體的其中之一或兩者已 嵌入细胞候可Μ添加一篩選步驟到本方法之中。或者,編 碼在微生物细胞中供篩選之標記的序列及能夠指揮DNA 在微生物细胞中複製的序列可以兩者同時存在於尋標質體 的上游或下游*或在微生物细胞中供篩選的標記可Κ出現 在尋標構築體的下游,且能夠在微生物细胞中指揮DNA 複製的序列可以出現在尋標構築體的上游。該相似性重組 细胞隨即在適合L T R指揮的轉錄,加工處理及適合反轉 錄編碼治療性蛋白質之基因之R Ν Α產物的條件下進行培 養。反轉錄做用的產物為一 DNA構築體,該構築體包含 一編碼治療性蛋白質之無i n t r ο η的DNA拷貝,其 -16- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) 玉、發明說明(\+) 合作性地與包含兩個上述外源性DNA構築體連接。經由 本發明方法所生產之該無i n t r on的DNA構築體隨 即被嵌入一微生物细胞中,該微生物隨即與適合該治療性 蛋白質之表現及分泌的條件下進行培養。 受轉染细胞 在此使用之名詞初级细胞包括出現在分離自脊椎動物 組織來源之细胞懸浮液之细胞(於其貼附之前,即黏附於 一組織培養基質如盤或瓶),及衍生自組識之外植體,前 二種细胞均第一次貼附,且细胞懸浮疲衍生自這些貼附细 胞。名詞二級细胞或细胞株指稱在培養時所有後續步驟中 的细胞。也就是說,第一次一貼附之初级细胞自培養基質 上移除並再貼附(繼代),其在此稱為二级细胞,如同所 有在後續繼代中的细胞。二級细胞為已經過一或多次繼代 之二級细胞所組成之细胞株。組成一细胞株之二級细胞·· 1)已經過一或多次繼代;2)在培養時表現之平均族群 加倍時間為定數;3 )表現接觸性抑制,附著依賴性生長 之特性(附著依賴性不適用於分佈於懸浮液培養之细胞) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 ;及4 )非不死化。 經由主題方法所轉染的细胞可分成四種型態或範圍: 1)當得到時不製造或包含治療性產物的细胞,2)製造 或包含治療性產物但其份量小於正常值(其份量少於生理 上正常較低量)或為有缺陷的形式的细胞,3)可K在生 理上正常程度製造治療性產物,但是打算調整或增進其內 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 mm A7 B7 五、發明說明(丨〇 容及產量的細胞,及4)其中希望改變編碼一治療性產物 之基因的調節或誘發型態。 藉 由本發明方法轉 染 之初 級 细胞或二 級细 胞 可 由 不 同 組 纖 中 得到且 包括所有 可 K人 工 培養之细 胞種 類 0 例 如 , 可 藉 本 方法轉 染之初级 细 胞及 二 級细胞包 括纖 維 母 细 胞 9 角 質 细 胞,’上 皮细胞( 例 ,乳 房 上皮细胞 ,小 腸 上 皮 细 胞 ) 9 內 皮细胞 ,膠细胞 9 神經 细 胞,血疲 組成 份 子 ( 例 9 淋 巴 球 ,骨髓 细胞), 肌 肉细 胞 及這些體 细胞 種 類 前 驅 细 Cffy* Μ 0 初级細 胞適合由 將 施用 該 受轉染初 级细 胞 或 二 級 细 胞 之 個 體上取 得。然而 9 初級 细 胞可由供 給者 ( 非 接 受 者 ) 取 得 ,供給 者為同種 或 不简 種 (例,老 鼠, 大 鼠 9 兔 子 9 m 9 狗,豬 ,牛,鳥 9 綿羊 9 山羊,馬 )0 受 轉染初 級细胞及 二 级细 胞 已予Κ製 造, 不 論 是 否 經 表 現 型 篩選, 其顯示可 表 現編 碼 一治療性 產物 9 包 括 » 例 如 9 h G Η, E P 0及 胰 島素 調 理素之外 源性 D N A 0 不 死化细 胞亦可經 由 本方 法 加Μ轉染 ,且 作 為 蛋 白 質 生 產 或 基因治 療的用途 〇 經由 本 發明的方 法有 利 於 蛋 白 質 的 生 產 及基因 治療的不 死 化人 類 细胞株的 實施 例 包 括 , 但 不 限 於 :Η Τ 10 8 0 He L a,M C F - 7 胸 癌 细 胞 9 K — 5 6 2 白血症细 胞 ,K B 上皮腫瘤 细胞 9 2 7 8 0 A D 卵 巢上皮 腫瘤细胞 9 R a j i (AT C C C C L 8 6 ) 细胞, J u r k a t ( A T C C T I B 1 5 2 ) 细 胞 ,N a m a 1 w a (A Τ C C C R L 1 4 3 2 - 18 _ (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) 40263S Δ7 Α7 _Β7__ 五、發明說明(山) )細胞,HL — 60(ATCC C C L 240)细胞 ,Daudi (ATCC C C L 213)细胞,RP MI8226 (ATCC CCL 155)细胞及 M0 LT-4 (ATCC CRL 1582)细胞。來自其 他生物種類的细胞(例如,中國倉鼠卵巢(CHO)细胞 或老鼠L细胞)可作為體外蛋白質的生產或基因治療的用 途。另外,表現在體外基因增幅的特性之初級或二級人類 细胞,Μ及來自其它生物種類的初級细胞或二級细胞可作 為體外蛋白質的生產或基因治療的用途。
外源性D N A 外源性DNAK本方法嵌入初級细胞,二級细胞或不 死化细胞之外源性DNA:1)編碼一轉譯或轉錄產物之 DNA,而其在细胞中的表現為需要的,或編碼一轉譯或 轉錄產物之部份的DNA,例如有利於治療一存在狀況或 預防其發生之蛋白質或RNA產物(例如hGH,ΕΡ0 或胰島素調理素);或2) DNA不編碼一基因產物但其 本身為有用的,如有利於治療一存在狀況或防其發生之轉 錄調節序列或DNA。 · 轉染初级细胞或二级细胞之DNA可編碼整個欲得產 物,或可編碼,例如,該產物之活性或功能性部分。產物 可為,例如,一激素,细胞素,抗原,抗體,酵素,凝血 因子,輸送蛋白質,受體,調節性蛋白質,结構性蛋白質 ,反義RNA,RNA酶或一非自然性蛋白質或核酸(即 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂-------------線輪- 經濟部智慧財產局員工消費合作杜印製 4Q細8 B7 五、發明說明(I?) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 一新穎蛋白質或新穎核酸)cDNA獲得之來源可為自然 發生或使用遣傳工程技術或人工合成方法可產生者。轉染 進入初級细胞或二級細胞的DNA可編碼一或多種治療性 產物。轉染進入初級细胞或二級细胞後,外源性DNA穩 定嵌入接受者姻胞基因體中(與出現在所使用之DNA構 築體之額外序列一起),表現或行使其他功能。或者,外 源性DNA游離性存在於受轉染初級綑胞或二級细胞中。 編碼欲得產物之DNA可於一可誘發啟動子之控制下 進入細胞,使得细胞生產或進入個體後不表現產物但可予 K誘發(即,產量之誘發係於受轉染綑胞產生後但於植入 前後均可)。編碼欲得產犓之DNA當然亦可用進入後立 即表現之方式進入綑胞(即,不需誘發)。 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製
如在此所教導的,基因尋標法可K被用於K一分離自 一不同基因的調節序列或一經由遺傳工程的方法製造之新 穎調節序列去取代一基因已存在的調節序列。這種調節序 列可Μ被包含於啟動子,促進子,骨架連接區域(scaff old-attachment region), 負性調 節元件 ,轉錄起始位置 ,調節 性蛋白質結合位置或已述序列之組合。(或者,影響所產生 的RN A或蛋白質之结構或穩定性的序列可K被取代,移除, 加入或另外經由尋標法邡Μ修正,這些序列包括多腺核苷化 訊號,mRNΑ穩定元件,剪接位置,促進或修正該蛋白質蓮輸 或分泌特性之引導序列。或其它改變或改善蛋白質或RNA分 子之功能或穩定性的序列)。根據本發明的方法,外源性D -20 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 A7 B7 五、發明說明(J) N A的置入導致控制内源性基因表現的内源性序列被破壞 ,其係經由取代全部或部份内源性(基因體)序列或另外 破壞内源性序列之的功能。在這種情形中使用尋標法去取 代的地方,一編碼功能區域,融合性,多功能性蛋白質的 蛋白質可因此產生,其由兩個或多個蛋白質结合结構上, 酵素性,或结合子(1 i gand)或受體结合的特性至 單一多肽上。 可篩選標記 許多可篩選標記可嵌入初級或二級細胞中。例如,使 用一種可賦予可篩選表現列如抗藥性,營養自營性,抗细 胞毒劑或一種表面蛋白質之表現之可篩選標記。可使甩之 可.筛選標記基因包括neo,gp:t * dhfr,ada ,pac ,hyg及h i sd。被賦予K可筛選表現型使 接受者初級或二級細胞之確認及分離具可行性。編碼可篩 選標記(例如ada ,dhfr及多功能性CAD基因, 其編碼磷酸胺基甲酯製造酶,天門冬胺酸轉胺基甲醯酶, 及二氫乳清酸酶)之可增幅的基因具有額外的特徵,即他 們使含有嵌入基因體之可篩選標記之被增幅拷貝的细胞得 K被篩選。此特性提供一個機構去明顯增加希望被增幅之 一鄰近基因或連结基因的拷貝數目。 可篩選標記可分成兩個領域:正性可篩選性或負性可 篩選性。在正性篩選中,表現正性可篩選標記之细胞能於 篩選藥劑處理下生存(例如neo ,gpt ,dhf r , 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 χ 297公楚) 赞· ---- (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂---------線; A7 B7 五、發明說明(丨q ) ada,pac ,hyg ,mdr 1 及 h i sD)。在負 性選擇中,表現負性可篩選標記之细胞在篩選藥劑存在下 會被破壞(如,tk,gut) ° D N A構築體 包含外源性DNA及,選擇性地,含編碼可篩選標記 密碼之DN A,及在接受者初级或二級细胞中表現外源性 DNA所必須之額外序列之DNA構築體,被用來轉染可 表現該產物之初級或二级细胞。該DNA構築體亦可包含 與宿主细胞DNA進行對應性重組之尋標序列。包含不轉 譯基因產物之外源性DNA序列之構築體(其本身為治療 柱產物)且選擇性地包含編碼可篩選標記之DNA,可用 來轉染初級细胞,二鈒细胞或不死化细胞。該DNA構築 體可K經由不同的方法嵌入细胞,包括電擊轉染法(e i ectroporat ion),微细注射法(mi cr o inject ion),碟酸 15 沉殺法(ca 1 c.i u m phosphate prec i p i tat i on ),.及微脂體一多膜法(1 ί pos ome — po 1 yb rene)或DEAE右旋物一媒介轉染法(DEAE dextran—mediated. transfec t i ο n )。或者,感染性載體,如反轉錄病毒,疱疹病 毒,腺病毒,腺病毒相關病毒,腮腺炎病毒及小兒麻揮病 毒載體,可作為DNA嵌入之使用。
在一個具體事實中,DNA構築體包含外源性DNA -2 2- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) ---in--訂---------線| 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 術 63a A7 B7 五、發明說明(>0 ) 及一或多個分開之尋標序列,通常位於外源DMA的兩端 0尋標序列為通常在初級或二級细胞基因體出現之DNA 序列〔例,一必要基因,一非必要基因或無密碼之D N A ’或經先前修正而存在於基因體中的序列]。此構築體有 利於(在一接受者细胞基因體上的預選位置)嵌入編碼治 療性產物之外源性DNA,如一激素,一细胞素,一抗原 ,一抗體,一酵素,一凝血因子,一運輸性蛋白質,一受 體,一調節性蛋白質,一结構性蛋白質,一反義RNA醯 或一非自然性蛋白質或核酸。特別是,外源性DNA可編 碼下列基因:凝血因子VU、凝血因子IX,紅血球生成 素,α_1 -抗胰蛋白酶,降血鈣素,糖腦苷酶,生長激 素,低密度脂蛋白受體(LDL),,衍脂蛋白Ε ,IL — 2受體及其拮抗者,胰島素,球蛋白,免疫球蛋白,分解 性抗體,白血球間質素,類胰島素生長因子,過氧化物岐 化酹(d i s m u t a s e ),免疫反應修正劑,副甲狀 腺素,干擾素,神經生長因子,組绷血纖維蛋白溶酿原活 化劑,株落剌激因子,及具有改良或新穎生物特性或在體 內具有更希望之半生期或轉換時間之上逑蛋白質。此構築 體亦有利於(在一接受者细胞基因體上的預選位置)嵌入 本身為治療產物之外源性DNA,如足K在受轉染初級或 二級细胞中隔離一蛋白質或核酸之DNA序列,與细胞調 節性蛋白質结合之DNA序列,改變二級或三級染色體结 構之DNA序列或在初級或二級细胞之基因體中轉錄性調 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) !!!1 訂- -------- 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 A7 B7 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 五、發明說明〇l) 節單位。 外源性DNA,尋標序列及可篩選標記可用單一 DN A構築體或分開之構築體進入细胞。DNA構築體之全畏 依元件數目(外源性DNA,尋標序列,可篩選標記基因 )及其全長而有所不同。整個構築體長度通常至少20個 核苷酸。在一構築體中外源DNA與基因體DNA有足夠 的相似性進行對應性重組,則此構築體包含單一元件,外 源性DNA。在此具體事實中,外源性DNA,由於其相 似性,亦可目標性嵌入基因體DNA且不需要額外之尋標 序列。此種構築體有利於剔除,取代或修補一存在之D N A序列,如完蝥之基因,一部分基因,一調節性元素或其 部分,或放置功能相似調節性及结構性序列於被移去的D N A區域。當外源D NA包含有利於被連结序列之篩選或 增幅的標記時亦為有利的。 在第二個具體事實中,DNA構築體包含外源性DN A,尋標DNA序列及具至少一種可篩選標記密碼之DN A。在此第四個具體事實中,構築體元件之順序可為尋標 序列一外源性DNA—編碼一可篩選標記之DNA—尋標 序列。在此具體事實中,一個或更多可篩選標記可為此構 築體所包含,其使得基於可篩選表現型之選擇具可行性。 構築體穩定嵌入之细胞K篩選劑處理將生存下來;稱定轉 染之细胞有一部分為HR细胞,其可藉不同的方法予K確 認,包括PCR,Sout hern氐雜交法及表現型篩 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) ·%! -----訂---- 線· 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 可篩在標二啟化 D 性被。尋第適活。性 正 Κ 幅,碼合可列源 1 得增如編一 一序外 括胞時例 I 在有 Α 制 包细同,A於僅 N 控 體的列為 N 闞或 D 來 築貝序序 D 相因標子 構拷 A 順的 I 基尋動 A幅N的記} 性 I 啟 N 增 D 間標地源列發 D 經的之選性外序誘 該之側物篩擇的 A 可 , 記兩成可選現 N 一 中標成組性 t 表 D 含 實該造體正 A 以之包 事有幅築幅 N 加子體 體含增構增 D 欲動築 具許的,可的 一啟構 個允記中 一 記下的A 四M標實碼標制因N 第記種事編選控基 D 在標這體 I 篩的性 一 選。具列可子源 篩選此序個勤内 40S63S Α7 Β7 玉、發明説明(>>) 選。 在第三個具體事簧中,在DNA構築體中之元件順序 為:尋標序列-第1個可篩選標記-尋標序列一第2個可 篩選標記。在此具體事實中第2個可篩選標記顯示負性鋪 選之特性。即’第2涸可鋪選標記之基因產物藉由在合適 而包含殺死表現第2個可篩選標記细胞之藥劑(典型地為 一藥物或代謝類Μ物)之培養基上生長而予K逆選擇。在 第1個可篩選標記兩側之尋標序列與宿主细胞基因體中類 似序列間之重組造成可篩選標記1之尋標嵌人,其中第2 個可篩選標記並未嵌入。此重組事件產生之细胞為Μ第1 個可篩選標記穩定轉染但非Κ可篩選標記2穩定轉染,且 該细胞藉由在含有篩選第1個可篩選標記之篩選劑及逆篩 選第2個可篩選標記之篩選劑之培養基上生長而予Κ篩選 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公爱) — — — — — 111 — — — — — — — — — I— ·11111111 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) A7 B7 五、發明說明(>}) N A之表現,使可誘發之表現具可行性。選擇性地,該D N A構_體可包含一複製之细菌性起源及细菌性抗藥性標 記,其允許在细菌中大量繁殖質體。一 DNA構築體包含 攜帶可篩選標記密碼之DN A及額外序列,如啟動子,多 腺核苷化位置及剪接會合處,可甩來受轉染初級或二級细 胞一種可篩選表現型(例,質體p c DNEO,其流程表 規於匾2)。使用此法,此種DMA構築體可K和一尋標 DN A序列同時轉染初级或二级细胞。 在所有DNA構築體的實施例中,外源性DNA具一 或多種產物之密碼,其可為或每一個可為一或多種治療產 物,因此使得傳送多種產物具可行性。 受轉染细胞的用途 使用在此所述之本發明的方法及D N A構築體所產生 的细胞可以作為廣泛目的的使用。產生的脊椎動物來源之 初鈒细胞、二級细胞或不死化细胞,其中1)在一接受者 细胞中已出現的DNA被修復,改變,刪除,或取代;2 )編碼一治療性產物之一基因或DNA序列(或編碼其他 希望的產物)或本身為一治療性產物而在一預選位置嵌入 一接受者细胞的基因體之中(即,基因尋標);3)在初 级接受者綑胞、二級接受者细胞或不死化接受者细胞中出 現的調節序列已被修復,改變,刪除,或取代;或4 ) 一 整體基因或部份基因已被修復,改變,刪除,或取代。相 Μ性重組作用亦可被用於產生普遍性的提供者细胞,其中 -26- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) -I I amt I n i^OJ· ( n n n 線一 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 4QZ&U_^_ 五、發明說明(>\|) 涉及組織抗原相容性之细胞表面標記已被修復,改變,刪 @·或取代,或其中該標記的表現被改變,修復或降低。 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 本發明的细胞有利於治療性產物於體外的生產*該治 療性產物可Μ經由傳統豁藥途徑去純化及傳送。例如,初 級人類细胞、二級人類细胞或不死化人類细胞可Μ含一調 節性區域之外源性D Ν Α加Κ轉染,該外源性D Ν Α經過 與基因體DNA序列發生相似性重組,得到Μ—允許該目 標基因有新穎的表現及/或調節之調節性序列取代一內源 性目標基因的調節序列,且最後經由該受轉染细胞產生治 療上有用之產物。若在該尋標DNA中包含一合適的可選 擇標記基因,則該被活化之內源性基因可進而被增幅。不 論增幅作用是否發生,這些细胞可以進行大規模的培養Κ 收穫细胞內及细胞外的蛋白質產物。 經濟部智慧財產局員χ%費合作社印製 本發明之受轉染细胞為有用的,如受轉染初級细胞之 族群,受轉染選殖细胞株,受轉染異源性细胞株,及如至 少Κ前述三種细胞之一為代表性细胞之混合细胞,如一用 來治療一具不正常或不欲之情形且對一治療性產物之傳送 有回應情況之個體之傳送系統,其為:1) 一治療性蛋白 質(例,一種蛋白質相關於個體生理需要而缺乏或減產, 在個體中之利用有缺陷,無效率或不適當;一種蛋白質具 新穎功能,如酵素性或運輸性功能)或2) —種治療性核 酸(例,结合於或隔離一種調節性蛋白質之DNA,抑制 基因表現或具本質上酵素活性之RNA)。在本發明提供 -27- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4視格(21Q χ 297公髮) 五、發明說明(vp 一治療性蛋白或核酸的方法中’受轉染初級細胞’選殖细 胞株或異源性细胞株* Μ足夠量或藉合適之途徑施用於一 不正常或不欲之情況而待治療之個體’而Μ生理上適合之 程度表現該外源性DN Α或使其可作用。一生理上適合之 程度為近乎該產物在身體生產之份量或造成不正常或不欲 情況之改善。在本方法中施用之细胞為K攜帶一治療性產 物密碼之外源性DNA轉染之细胞,外源性DNA本身為 治療性產物或者外源性DNA,如調節性序列,其經由對 應性重組進入基因體DNA之預定位置並產生作用引起接 受者细胞產生平常在细胞中不表現之產物或生產較相關未 轉染细胞表現程度為高之產物。在一具體事實中送入一調 節性序列(例* 一啟動子),其取代或破壞正常與一基因 相連之調節性序列,並使該基因之表現較相關未轉染细胞 為高,或者使得調節或誘發的型態與相關之未轉染细胞不 同。 經由在此所敘述的方法所製造之產生一治療性蛋白質 的细胞,該產生的细胞可K用於基因治療,該细胞的產生 經由:1)治療性蛋白質之隨機嵌人,2)進行相似性重 組K將該治療性蛋白質尋標進入细胞的基因體,3)進行 相似性重組Μ活化或開啟一治療利益之基因,或4 )與前 述三個方法之一配合之基因增幅。根據本發明在此所敘述 者,不死化細胞被包含於許多半通透性屏障設計之一内。 該設計的通透特性為细胞在植入一動物時該细胞不能離開 本纸張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂·--------線ί. 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 A7 B7 、發明說明) 該設計,但是治療性產物則可K自由的通透且可Μ離開該 屏障設計並進入圍繞移植體的局部空間或進入系統性循環 之中。一些過濾膜可以針對此目的加Μ利用,其包括但不 限制於:纖維素,乙酸纖維素酯,硝基纖維素,聚碾,二 氟聚亞乙烯,氯聚乙烯聚合物及氯聚乙烯聚合物之衍生性 聚合物。或者,屏障設計可Μ被用於使得來自其他生物種 類的初级细胞、二級细胞或不死化细胞可Μ作為人類基因 治療的用途。來自其他生物種類的细胞的用途偏好在非人 類细胞對蛋白質生產的目的是有利的時候或在非人類细胞 蛋白質為治療上有用的時候,例如衍生自鮭魚的细胞可做 為鮭魚條血鈣素(ca l c i t on i η)生產的用途, 且衍生自豬的细胞可作為豬胰島素生產的用途。 來目非人類之生物種類的细胞亦可作為體外蛋白質的 生產。這些细胞可Μ為經由在此敘述的方法而產生一治療 性蛋白質之初級细胞、二級细胞或不死化细胞,該细胞得 產生是經由:1)洎療性蛋白質之隨機嵌入,2)發生栢 似性重組作用將該治療性蛋白質尋標嵌入一细胞的基因體 中,3)發生相似性重組作用而活化開啟一具有治療性目 的之基因,或4)進行與前述三個方法之一结合之基因增 幅作用。來自其他生物種類的细胞的用途偏好在非人類细 胞對蛋白質生產的目的是有利的時候(例如CHO细胞) 或在非人類细胞蛋白質為治療上或商業上有用的時候*例 如衍生自鮭魚的细胞可作為鮭魚降血鈣素(ca 1 c i t _v -2 9- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先間讀背面之注意事項再填寫本頁) 夢--------tr--------4 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 Α7 Β7 五、發明說明(>7) ο n i π )生產的用途,且衍生自豬的细胞可作為豬胰島 紫生產的用途,及衍生自牛的细胞可以作為牛生長激素生 產的用途。 本發明受轉染的細胞有利於在人類及動物上的許多應 用。在一具體事實中,該细胞可被植入一人類或一動物身 上K供在人類或動物身上進行蛋白質的傳送。例如,人類 生長激素(hGH),人類EPO ( h E P 0 ),或人類 胰島素調理素可K系統性或局部性在人類身上被傳送而提 供治療的肋益。包含表現一治療性產物之受轉染细胞且治 療性產物可Μ自由進出之屏障設計可K用來將细胞駐留體 内一固定的位置,或保護並分離细胞,免於宿主兔疫系統 的攻擊。屏障設計特別有利於並使得受轉染不死化细胞, 來自其他生物種類的受轉染细胞(異種性受轉染细胞), 或來自一非組纖抗原相容性配合之提供者(受轉染異體性 细胞),可Μ被植入Μ供人類或動物的治療或供農業用途 (例如,肉類及日常產品)。屏障設計亦允許經由接近细 胞之方便的短期(即,暫時性)治療,並當治療計畫因任 何理由停止時可Μ移出。 本發明之受轉染细胞亦有利於提升抗體的產生或供免 疫人類或動物Κ對抗致病因子。經植入的受轉染细胞可Μ 用來傳送免疫性抗原,引起對宿主细胞及體液免疫反應的 剌激。這些免疫反應可Κ被設計成保護宿主兔於未來的感 染性因子的感染(即,疫苗用途),剌激或調節直接對抗 -30 - 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210 X 297公釐) -----------——------訂--------- (請先閲讀背面之注音?事項再填寫本頁) 4齡63§ A7 B7 五、發明說明(>|) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 一正發生之感染的疾病作戰能力,或產生抗體直接對抗在 體内經由受轉细胞所產生的抗原,該受轉染细胞有利於治 療性或診斷性目的。可移除之屏障設計可以作為允許一終 止抗原的曝露之簡單設計。或者,最終會被排斥的细胞( 異種性或異體性受轉染细胞)可κ作為限制抗原的曝露, 因為抗原的生產會因為细胞被排斥而停止。 實施例之解釋 如在此所敘述者,申請人已示範該DNA可K被送入 初級脊椎動物细胞、二级脊椎動物细胞或不死化脊稚動物 细胞且可經由相似性重組作用嵌入受轉染初级细胞、二級 细‘胞或不死化细胞。也就是說,他們已在初级晡乳動物妞 胞、二級哺乳動物细胞或不死化哺乳動物細胞中展示基因 尋槱法。他們進一步展示該外源性D N A在相似性重組( HR)细胞中表現出希望的功能,且該正確被尋標的细胞 可以基於適當被尋標嵌入的DN A所給予可偵測的表現型 加Μ驗證。 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 另外,本發明相闢於一種使用受轉染初級细胞、二級. 细胞或不死化细胞製造蛋白質的方法。本方法涉及以編碼 一治療性產物之外源性D Ν Α或以足以尋標且活化編碼一 治療性產物之内源性基因去轉染初級细胞、二級细胞或不 死化细胞。例如,實施例1 g ,1 j ,2,3及4敘述經 由一被挑選之内源性基因的尋標及活化產生蛋白質。 申請人們亦敘述D N A構築體及供經由基因尋標法加 -3 1 - 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公爱) 4§g63S A7 B7 五、發明說明(1) Μ活化之内源性细胞基因之增幅的方法(實施例1 f — 1 k及實施例3)且進而敘述一基因可經由基因尋標法*** 入一初級綑胞、二级细胞或不死化细胞之基因體上一預選 位置(簧施例ld)° 申請人敘述一有利於在人類基因體上尋標至一特別基 因位置(HPRT基因位置)的質體構築及基於藥物柢抗 性表現型的篩選(實施例1 a )。該質體被命名為p E 3 Neo,且其在细胞基因體上HPRT位置的嵌入所產生 的细胞具有一 hprt ,6 — TG抗藥性表現型且亦為G 4 1 8抗藥性。如其中所敘述的,他們已顯示p E3Ne 〇在基因尋標嵌入一被建立之人類纖維母细胞後可適當地 表現功能(實施例lb),其顗示係經由驗證該DNA被 送入被見建立之细胞中HP RT基因的第3個e X ο η位 置。 另外,申請人們展示使用pE3Neo在初級人類皮 虜纖維母细胞、二级人類皮慮纖維母細胞或不死化人類皮 慮纖雄母细胞中進行的基因尋標法(實施例lc)。本申. 請案進而展示DNA末端的修正可K幫肋DNA尋標進入 基因體DNA中(實施例lc及le)。 簧施例1 f 一 1 h及實施例2示範說明的具體事實為_ 在人類E P 0基因的上游之正常調酣序列被改變,使得在 未受轉染的初級人類皮朦纖維母细胞株或二級人類皮瓛缴 維母綑胞株中不會K可偵測出的量表現的E P 0基因可以 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) —----訂----- 線!: 經濟部智慧財產局員工消費合作杜印製 A7 B7 4❹魏39 五、發明說明U〇) 開始表現。在一具體事實中,尋標的產物留下正常而完整 的EPO基因,但是在在老鼠metal lothion e i η啟動子的控制下。實施例1 i及1 j展示相似尋標 構築體作為在初級人類皮慮纖維母细胞或二級人類皮慮纖 維母细胞中活化内源性生長激素基因的用途。在其他敘述 在人類纖維母細胞中活化E P0的表現的具體事實中,尋 標事件的產物為融合性轉錄單位,其中人類生長激素基因 第1個exon位於EPO第2—5個exon的上游。 轉錄產物(由老鼠met a 1 1 oth丨one ί η啟動 子加Κ控制),經過剪接,並轉譯後的蛋白質為其中hE P0訊號胜肱之第1— 4個胺基酸被hGH之第1 一 3個 胺基酸殘基加K取代。該蛋白質的融合區域,即該訊號胜 肽,在有细胞分泌出Μ前就被去除。實施例5敘述尋標構 築體及產生可將一基因(具有intron)轉變成一可 表現之該基因cDNA拷貝(沒有intron)的细胞 之方法,並於微生物(例如,酵母菌或细菌)细胞中回收 該可表規的c DNA分子。實施例6敘述一尋標載體的構 築,其命名為p REP04而可供雙重篩選及其中d h f r基因被複製之细胞的篩選。當内源性hEP〇基因經由 相似性重組作用被活化後,質體p R E P04B被用於Η Τ 1 0 8 0细胞(一種不死化人類细胞株)中增幅人類Ε Ρ 〇 (hEPO)基因位置。如其中所敘逑的’在含·有甲 胺基蝶呤(methotrexate)的培泰基中逐步 -33- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂---------線© 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 mm A7 B7 五、發明說明(y) 的篩選導致在能夠抵抗0 · 4«M甲胺基蝶呤(me t h o t r exa t e)的细胞中hEPO的產量增加70倍 Ο 這些實施例提供經由基因尋標法活化或活化且增幅内 源性基因的方法,其不需要操作或標的基因蛋白質編碼區 域之其他用途。經由這些方法,正常下不活化的基因可K 在细胞中被活化,這些细胞具有偏好體外蛋白質(例如, 醫藥品)製造或體内傳送方法(例如,基因治療)的特性 。圖5及6示範說明兩種轉錄性活化hE P0基因的策略 0 使用在此說明的方法及DNA構築體或質體,或使用 其對於一嫻於此技藝者而言係甚為明顯的修正,編碼一治 療性產物(例如,蛋白質,RNA酶,核酸)之外源DN A可Μ***人脊椎動物(例如,哺乳動物,包括人類及非 人類)初级细胞或二级细胞之基因體上的預選位置。 本發明將Κ下列實施例加以示範說明,然並不打算給 予任何的限制。 實施例 簧施例1 以基因尋標方式產生之受轉细胞株之生產 基因尋標發生於受轉染DNA經對應性簠組而嵌人或 部分取代基因體DNA序列。然而此事件可發生於任何轉 染實驗期間,其通常被一發生率大量超出之事件所掩蓋, 即質體DNA藉由非對應性,或無法解釋,重組之方式嵌 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂----- 經濟部智慧財產局員工消費合作杜印製 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 A7 ______B7____ 五、發明說明(wo 入0 a ·—有利於篩選在人類细胞中基因尋標事件之構築 體之產生 一種篩選標的化事件的研究是由基篩選出因受轉染D N A之嵌入而造成基因功能之喪失。人類Η P R T基因具 次黃嘌呤-磷酸核糖基轉移酿之密碼。hp r t細胞可藉 其生長於含核苷酸類似物6 —硫代鳥糞嘿'呤(6 — TG) 之培養基中進行篩選:具野生型(HPRT+)對偶基因 之細胞被6 — TG所殺,然而具突變型(hpi't-)對 偶基因之细胞可生存。發生標的化事件而破壞HP RT基 因功能的细胞因而在6 — T G培養基中可加K篩選。 為了構築用於尋標HPRT基因之質體,由HPRT 序列 1 1 ,960— 18,869 位置(Geneban k 稱其為 HUMHPRTB;Edwards,A等 人,Genomics 6*593 — 608 (1990 ))延伸而來的6 · 9仟鹽基對Η ί n d II位置。得到的 次選殖株於HP RT基因片段上第3個e χ ο η中之唯一 Xho位置切割且嵌入含衍自pMCINeo (stra tage.ne)之neo基因之1 ♦ 1仟鹽基對Sa 1 — XhoI片段,破壞了第3個exon之密碼區域。選擇 n e 〇轉錄方向而與HP RT轉錄方向相反者並命名為p E3Neo 〇Kneo破壞之方式取代正常HPRT第3 個exon將導致一 hpr t —,6 — TG抗藥性表現型 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 χ 297公釐) ----:--------β--------訂---------線β (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)
五、發明説明(3)) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 402638 A7 。該細胞亦將為抗G 4 1 8者。 b *於一已建立之人類纖維母如胞株內進行基因尋標 基因尋摞先前曾被報告用於不死化組纖培養细胞株。 為了作為尋之正性控制組及合適地建立在基因尋標時p E 3Ne〇的功能,人類纖維瘤细胞株HT1080 ( A τ C C CCK 121) MPESNeo進行電擊轉染。 作為在不死化细胞糸中尋標的示範,且在基因尋標時合適 地建立pE3Neo的功能,人類细胞系HT1080 ( A T C C CCL 121)經由電擊轉染方式MPE3 N e 〇加K轉染。 hT T 1 080细胞在電擊轉染前維持添加HAT (次 黃喋呤/胺基蝶翅素/黃嘌呤)及.15%牛血清(HyC 1 one)之DM EM中。電擊轉染前兩天,這些细胞轉 移至相同但不含胺基蝶翅素的培養基中。活躍增殖期细胞 以胰蛋白酶處理並K含1 5%牛血清之DMEM中稀釋, 離心,最後K每毫升1 3 * 3佰萬细胞之濃度再懸浮於p B S (磷酸鹽緩衝之食鹽水)cpE3NeoKHind I切割,由pUC 12骨幹分離8仟鹽基對HPRT — η e 〇片段,Μ酚窣取及酒精沈澱予Κ純化,並Κ600微 克/毫升濃度再重建。其中50微升(30微克)加入電 擊轉染小管(〇 ♦ 4厘米電極溝;B i 〇 — Rad La borator i es)並加入750微升之细胞懸浮液 1仟萬個細胞)。電擊轉染條件為450伏特。250微 -36- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)
iQmm a7 _B7 五、發明說明o1!) 法 拉 第 ( Β i 〇 — R a d G e η e Ρ U 1 S e Γ : B 1 〇 — R a d L a b 〇 Γ a t ο Γ i e S ) 0 小 管 中 疲 體 刻 加 入 含 1 4 % 牛 血 清 之 D Μ Ε Μ 中 得 到 每 2 5 毫 升 培 養 基 1 佰 萬 個 细 胞 之 懸 浮 疲 0 2 5 毫 升 之 處 理 過 的 细 胞 懸 疲 覆 於 1 5 2 米 直 徑 組 織 培 養 Μ 並 於 3 7 °c 9 5 % C 0 2 中 培 養 0 〇 4 小 時 後 j 直 接 加 入 G 4 1 8 溶 液 至 器 皿 中 使 ΞΙ 取 終 濃 度 為 8 〇 0 微 克 / 毫 升 G 4 1 8 0 五 天 後 培 養 基 更 換 為 D Μ E Μ / 1 5 % 牛 血 清 / 8 0 0 微 克 / 毫 升 G 4 1 8 0 電 擊 轉 染 後 9 天 , 培 養 基 更 換 為 D Μ E Μ / 1 5 % 牛 血 清 / 8 0 0 微 克 / 毫 升 G 4 1 8 及 1 0 U Μ 6 — 硫 代 鳥 糞 嘌 呤 0 雙 重 篩 選 開 始 後 1 4 — 1 6 天 選 殖 棒 挑 出 抗 G 4 1 8 及 6 — Τ G 之 株 落 0 五 個 代 表 性 尋 標 實 駿 於 Η Τ 1 0 8 0 中 的 结 果 示 於 表 表 1 轉染 經處理细胞數 G418及6—TG株落數 ------------©衣---------訂---------線 ry (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 1 1 X 1 0 7 3 2 2 1 X 1 0 7 2 8 3 1 X 1 〇 7 2 4 4 1 X 1 0 7 3 2 5 1 X 1 0 7 6 6 . 就第5 個 轉 染 實驗而言, 1用於決定全部 -37- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) €〇v638 a7 ___ B7_________ 五、發明說明o孓) 數之控制組培養皿顯示由開始之1 x 1 o7受處理.细胞可 產生33,710個G4 18株落。因此,目標化或未目 標化事件之比率為66/33,700,或1比5 10 ° 在總共5個實驗中,目標化事件之出現頻率為3人6 X 1 0s ,或受處理细胞之0 . 00036%。 限制醌與使用來自n e 〇及HP RT基因之探子的S o u t h e r η氐雜交實驗確定n e 〇基因位於η P R T 第3個exon之預期位置上。 c♦在初級與二级人類皮虜娥維母细胞中進行基因尋 標 DE3Ne〇KH i ndEI 切割,由 PVC12 骨幹 上分離8仟鹽基對HPRT_n e.o片段,以酚萃取及乙 醇沈澱加以純化。DNAK2毫克/毫升再懸浮。3佰萬 個二级人類***纖維母细胞於0 . 5毫升體積中K1 00 微克Hindi切割之pE3Neo (50微升)進行電 擊轉染(250伏特及960微法拉苐)。進行分開之3 個轉染實驗,共處理9佰萬個细胞。细胞進行處理並篩選 具s4 1 8抗藥性者。作為G4 1 8篩選之每個150毫 米培養皿覆蓋500,000個细胞。篩選後1 〇天,培 養基更換為含400微克/毫升G4 1 8及1 0wM6_ T G之人類纖維母綑胞培養。K兩種藥聯合篩選多持續i 0天。培養皿Μ鏡檢方式掃瞄Μ定出抗兩種藥物之人類纖 維母綑胞株落。G4 1 8及6 — TG株落每9佰萬涸受處 -38- 本纸張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) "~~~ (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) Q衣 訂---------線©_ 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 A7 A7
經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 全基 \ 限此類殖 丨鹽 1 之在人選 因 5 中標用常標 基 7 其尋使正尋 τ 1 , 上 ,在被 R 用 ,-,T 此 用 ί Ρ 使激 R 因作率 Η 用剌 Ρ 。 標頻 入作倍 Η } 尋標 嵌標 ο 於落,尋 用尋 1 斷株體體 作。約診化築蝥 標}丨為標構且 尋落激作目 Α 到 經株刺現個 N 察 因標之表 9 D 觀 基尋大落到性被 〇 被最株離組於 e 個到 8 分重易 n4受 1 部及中 實 2 時 4 全件胞 證出出 G f 條细 析離突 段之母 分分之 ο 片述維 交部對 8 制敘纖 五、發明說明) 理細胞中有4個°所有细胞之0 * 0 0 0 1 % (或佰s中 有1個)可形成株落。用於決定G4 18株落全部數量之 控制組培養皿顯示由開始之9 x 1 0 6個受處理細胞中可 &生2,850個G418株落。因此被尋標與未被尋標 事拌之比率為4 / 2 ’ 8 5 0 ’或1比7 1 2 °限制酶及 使用來自n e 〇及HP RT基因之引子的So u t h e r nE£雜交試驗確定neo基因位於HPRT 第3個ex ο η之預期位置並顯示尋標已於此4個選殖细胞株中發生 。抗兩種藥物之株落亦可藉轉染初級细胞(1/3 · 0Χ 107)而予Μ分離。 數個pE3^ίeo尋標化實驗之结果總结於表2。H 'i n d HI切割過的P E 3Ne 〇可直接轉染或於轉染前Κ 外核酸酶Μ處理產生5'單股突出(見霣施例lc)。具 單股由1 7 5至9 3 0鹽基對之DNA製備物長度予K測 試。僅使用Hindi切割之pE3Neo時,1/79 9 G418抗性株落Μ限制酶及Southern氐雜 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)
A7 B7 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 五、發明說明(< ) 株數除K楗定受轉染抗G 4 1 8株落之總!數)可用如S Sfe 例1e中所述之方法,Μ含單股突出尾端之尋標構築體轉 染而予Κ刺激0 表2 尋標至 人類纖維母细胞中Η P R Τ基因位置 pE3neo處理 實驗次數 每G418菌落中被尋標之數 被尋標克隆的總數 Hind HI切割 6 1/799 24 Π5鹽基對突岀 1 1/ 80 9 350鹽基對突出 3 1/117 20 930鹽基對突出 1 1/144 1 d ,產生一構築體供一治療性基因標的性嵌入人類基 因體中及其於基因尋標上之用途 -種p E 3N e 〇變異體*其冲一治療性基因嵌入Η P RT密碼區域中鄰近或緊接n e 〇基因的位置,可作為 將一治療所需的基因尋標而進入接受者初級或二级细胞基 因體中特殊之位置上。此種p E 3N e 〇變異體可予K構 築供將hGH基因尋標而進入HPRT基因上。
dXGH5MEc 〇R I切割並分離出h‘GH基因及 與其連接的老鼠meta 1 1 oth i one i'n (mM T)啟動子。EcoRI突出K來自大腸桿菌(E ♦ co i i) DNA聚合酶之k 1 enow片段補齊。分別地 ’ pE3ne〇KXho I切割,其在neo片段及HP R T exon之交會處切割(嵌入第3個exon之3 ’端交會處。該綫形質體之Xh ο I突出端K衍自大腸桿 -40- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先間讀背面之注意事項再填寫本頁) p: 訂---------線-. A7 B7 五、發明說明(#) 菌(E.col i) DNA聚合酶之klen〇w片段 補齊,且得到之片段連接至4 ♦ 1仟鹽基對平頭hGH — mMT片段。由連接混合物而來的细菌株落κ限制酶分析 找尋hGH— mMT片段單一嵌入,並選擇hGH基因與 n e 〇基因轉錄的方尚相同者並命名為p e 3N e o/h GH。pESNeo/hGHMH i ndB[切割,釋出含 HPRT ; neo 及 mMT — hGH 序列之 12 . 1 仟鹽 基對H段。切割過的DNA依實施例1 8 c中所述予M處 理並轉染進入初級或二级人類纖維母细胞。G4 1 8 6 -TG株落如實施例1c中所述對mMT—hGH及ne 〇序列之標的性嵌入Η P R T基因進行篩選及分析。個別 株落使用商業化可用之免疫試驗(i c h 〇 i s In st i tute)對hGH表現進行試驗。 二級人類纖維母:細胞Kp E 3N e ο/hGH轉染抗 硫代鳥糞嘌呤的選殖株對穩定表現hGH作分析,Μ限制 酶及Sou t hernK雜交反應。在經分析之1 3個Τ G株落中有8個株落證實h G Η基因已嵌入至内生性Η P RT基因。所有8個株落皆穩定表現明顯量之hGH,具 22 * 7微克/1 06個细胞/24小時之平均表現程度 。或者,質體pE3neoEP0,見圖4,可K作為將 E P 0尋標嵌人類Η P R T基因位置的用途。利用相似性 重組作用將一具有治療目的之基因尋標進入一细胞基因體 D Ν Α的特異性位置的用途可以加Κ擴及且更有利於經由 -41- · 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公髮) (請先閱讀背面之注音?事項再填寫本頁) --------訂---------/ 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 €026Μ Α7 Β7 生 產治 療 性 百 的 (例 此 種甩 途 包 含 基 因被 於 一合 適 的 藥 物 篩選 e 〇 / h G Η / 簧施 h G Η 中 緊 鄰 h G Η a da 3 或 C A D基 或 不死 化 细 胞 Κ 此質 確 認。 這 细 胞 可Μ 增 幅基 因 的 藥 物 (針 呤 (m e t h 〇 t r D 基因 , 篩 選 性 藥劑 門 冬酸 鹽 ( P A L A 腺 嘌呤 核 苷 酸 ( 如腺 治 療性 利 益 的 基 因之 基 因同 時 增 幅 0 因此 進 行之 遺 傳 工 程 可K 預 選位 置 中 尋 標 構築 拷 貝停 留 於 被 增 幅的 N A末 端 Xb 進 尋標 示 3突 出 端 牽 涉 大腸 酒 酵母 菌 ( S ♦ C U S 1 a e V i s V U S 1 a e v i 一 42 _ (請先間讀背面之注意事項再填寫本頁) -I I n n It In 一一»J n HI ϋ 111 ϋ I * 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 五、發明說明(y)) 一基因之***而 療)之產品,經 K藉由將细胞曝 例如,p E 3 η ρ Ε 3 n e 〇 / ***d h f r, 细胞、二級细胞 的尋標事件加K 適合篩選含有經 藥劑為甲胺基蝶 對多功能性C A 醯基)一 L —天 篩選性藥劑為一 在此方式中該具 篩選增幅拷貝之 性用途的基因所 加K控制,在該 位置中被增幅的 e *修正D 一些證據顯 ),噬菌體,啤 )及 X e η ο u 徑。在X e η ο 如,醫藥品,基因治 增幅之拷貝的细胞可 組合中來予Κ篩選。 例1 d )可Κ經由在 或n e 〇基因的位置 因而加以修正。初級 體加K轉染並對正確 進一步K增加濃度之 對dhfr,篩選性 e X a t e )),針 為 N — (亞瞵酸乙 ),及針對a d a ; 苷酸))進行處理。 嵌入部份將隨著用於 使细胞產生針對治療 簡易地經由預選位置 體被嵌入且在該預選 细胞中。 作用 稈菌(E · c ο 1 .ί erevesiae 之一些對應性重組途 s的卵中,具長度數 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 A7 __B7__ -------- 玉、發明說明(和) 佰個鹽基對之3’突出端的分子經微细注人後與其他類似 分子進行之重組比使用由限制酶切割產生具非常短之突出 (4個鹽基對)的分子要快得多。在酵母菌中,數佰鹽基 對畏之3'突出端的產生顯然為減數***重組之速限步驟 。尚無報告有證據涉及3'突出端在人類细胞中重組’且 無案例具任何修正過的DNA基質顯示增進尋標作用(對 應性重組之一種)於任何物種内之跡象。在人類细胞中’ 3’突出端對尋標作用的影響尚無試驗。在下列實施例描 述之實驗建議5’突出端對初級及二级人類纖雄母细胞中 尋標作用最為有效。 藉由修正轉染DNA分子之未端而增進尋標作用的報 告尚沒有出現。本實施例可用於示範將綫形DNA分子末 端由雙股形式轉換成一單股形式,可剌激在初級及二級人 類纖維母细胞基因體内的尋標作用。 1 1 0 0微克之質體p E 3 N e 〇 (實施例1 A ) K H i n d I切割。該DNA可直接於酚萃取及乙醇沈澱後 使用,或者藉凝膠電泳由P UC 1 2載體序列分離僅含Η PRT及neo基因之8仟鹽基對H i ndl片段。以Ε X o IB分解H in d SI切割之DNA造成在兩端延伸之外 核苷分解性切割,開始於自由之3’端,且留下5’突出 端。外核苷分解性作用之程度,即所得到之5’突出之長 度,可用不同之Εχ ο III分解時間予K控制。執行H i η d切割之pE3Ne ο 1 00微克之Exo HI分解係依提 本纸張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂-------------I——— — — — —---------- 嫩_ A7 _ B7 五、發明說明(φ|) 洪者的建議條件,分別作用3 〇秒,1分鐘,1 ♦ 5分簿 ’ 2分鐘’ 2,5分鐘,3分鐘,3 . 5分鐘,4分鐘, 4 * 5分鐘,及5分鐘。為瞭解分解之程度於每個時間取 出少量約1微克之Εχ ο Μ處理過的DNA,在提供者建 議的條件下用m u n g豆核酸酶處理,且該D N A Κ凝膠 電泳分開。測量未處理,H i n d BI切割之p E 3 N e 〇 及KE x 〇 M &mu n g豆核酸醱處理之相同分子間大小 的差異。大小差別除Μ 2得到該分子兩個5 ’突出端的平 均長度。使用上述之時間距於30t:分解,產生之5’突 出應由100至1 ,〇〇〇鹽基長。
由每輝時間距而得到之6 0徽克Ε X ο JI處理之DN Α (全部KHindSI切割之pE:3Neo)被純化後電 擊轉染進入初級或二級人類纖維母细胞,K實施例1 c中 所述的條件。藉由每種E X o ffi處理之製物備物所增進尋 標作用的程度MG4 18 6 — TG株落數定量並與KH i ndffi切割但未MExoffi處理之pE3Neo進行尋 標得到的數目比較。 3’突出端的效果亦可使用類似的系統予以定量。在 此情形中H i ndM切割之pESNeoK噬菌體T7第 6基因外核酸酶(United States B i 〇 c h e m i c a 1 s )於提供者建議之不同時間距下處理 。分解程度(每端3'突出之平均長度)之決定及電擊轉 染的條件如上對經E X ο Μ處理之DNA的敘述。藉由每 -44- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注音?事項再填寫本頁> — --------訂---------線\ 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 A7 B7 五、發明說明(ψ>) 種Τ 7第6基因外核酶處理之製備物而增進尋標作用的程 度由G418 6 — TG株落數予Κ定量並與以Hind I切割但未MT 7第6基因外核酶處理之p E 3N e 〇進 行尋標得到的數目比較。 其他產生5’及3’突出端之方法亦具可行性,例如 ,將兩個彼此部分重複的綫狀分子變性再聯合將可產生分 子混合物,每個分子具3'突出或5’突出於兩端上,及 無法與原始綫將分子分辨之再聯合片段。突出長度藉由非 正常介於兩個DNA片段間之DNA畏度予K決定。 f ·構築供初級及二級人類纖維母细胞中將人類血紅 素生成素基因置於老鼠me t.a 1 1 o t h i one i η 啟動子之控制下之用的尋標載體 下列可用於示範一本發明之具體實施例,其中人類紅 血球生成素(ΕΡΟ)基因上游之正常正性及負性調節序 列被更ife Κ允許人類紅血球生成素在初級或二級人類纖維 母细胞株中表現,其原來並不Μ明顯量表現E P0。 於人類Ε Ρ0密碼區域上游存在之特異性區域可藉Ρ C R增幅。有利於此目的之三組引子係分析已發表人類Ε Ρ 〇 〔Genebank 記作 HUMERPA ; L i η , F· — Κ,等人,Proc,Natl *Acad*Sci. ♦,USA82:7580-7 5 84 (1985)〕後 加M設計的。這些引子對可增幅609,60 3或590 鹽基對之Μ段。 -4 5 - 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS),A4規格(210 X 297公釐) (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁)
II 線· 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 A7 B7
40E63;S 五、發明說明) 表3 引子 H U Μ E R P A 序列 片段大小 順序
F1 2420 5, AGCTTCT GCTTCCAGAC (S E Q ID NO 1 ) R2 8 1 0 -> 5 9 5 5'GGGGTCC 609 鹽基對 CTCAGCGAC (S E Q ID NO 2 )
F2 8^ 2 4 5'TGGGCTT CCAGACCCAG (S E Q I D N 0 3 ) R2 610 今 595 5'GGGGTCC 6 0 3 鹽對基
CTCAGCGAC
F 3 2 1~> 4 0 5, CCAGCTA
CTTTGCGGA A C T C (S E Q ID NO 4 ) R2 610->595 5'GGGGTCC 59 ◦鹽基對
CTCAGCGAC 該3個片段本質上為重複的且在本實驗中互換使用。 6 9 0鹽基對的片段由相對於起始位置一 6 2 3延伸至一 -46- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4.規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) τ I 0 tmm§ n n n n n VI 》 Μ i n m 1 VN)/' 線^^· 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 五 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 402638 a7 _B7_______ 發明說明(υ4)
i4 (HUMERPA核發位置2至61〇) ’兩端與C 1社I連接子連接。得到的C 1 a I連接片段M C i a I 切割並嵌入pBlueScript2SK/+ (Str atagene),方向為HUMERP A核苷位置6 1 0鄰近質體多連接子中S a i I位罝。該質體,P 5 , E P Ο,可分別地在E P 〇上游M段(各別在H U M E R P A核苷位置150及4〇5)之唯一 FspI或Df i I 位置上切割並連接至me t a 1 1 o th i one l n啟 動子。典型上,來自mMT — I基因〔不含任何mMT密 碼序列;Ηειΐηθΐ',ϋ*Η.及 Wal I insM., J'Mol *Appl - Gen - 1 :273-288 ( 1 9 8 2);該片段亦可使用由來:自Genbank,即 MUSMTI,MUSMTIP,MUSMTIPRM, 可用於mMT序列之分析所設計之P C R引子K已知方法 由老鼠基因體DNA分離〕之1 * 8仟鹽基對EcoRI 一 Bg 1 IH段用已知方法製成平頭且與Sf i I切割( 亦製成平頭)或FspI切割之p5’ EP0連接。分析 得到擇殖株的方向性且使用mMT前方B a g I位置位於 質體多連接子中Sa i I位置近端者在初級及二級人類纖 雄母细胞中進行尋標。在最終產物中該方向指揮mMT轉 錄HUMERPA核苷酸位置6 1 0。該得到的質體 MT***FspI及Sfil位置者分別命名為P5, E PO-mHTF 及 p5’ EPO-mMTS。 -47- 本纸張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 x 297公釐〉 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) ---------訂--------- 402638 A7 B7 五、發明說明(必) 當需要修正,刪除及/或取代位於原始標的基因上游 的負性調節性序列或增強子時額外的上游序列為有用的。 洌如E P 0,於肝K外及直腸外組繩中抑制E P 0表現之 一負性調節元素序列〔Semenza.,G· * L ♦等人, xVl〇l - Cel 1 - Biol · 10: 930-938 ( 1 990)〕可被刪除。在6仟鹽基對片 段中進行一系 列之刪除。該刪除區域可用具廣泛宿主-细胞活性之增強 子〔例,由巨細胞病毒(CMV)而來之增強子]加Μ取 代。 選擇在ρΒ 1 ue s c r i p t ISK / +載體中6 09鹽基對5’ EP0片段之方向,因為HUMEPRA 序列K一 BamHI (遠端)及Hindi位置(近端) 置於其5'端。因此,一正常位於609鹽基對片段上游 之6仟鹽基對BamHI-HindM片段〔Semen za,G*L.等人,Mol *Cel 1 *Biol * 1 0 : 930-938 (1 9 9 0)〕藉已 知方法由基因 體DNA分離。例如,一個噬菌體,巨質體,或酵母菌人 工染色體基因庫可用6 0 9鹽基對P C R增幅出的片段作 為探針進行篩選。標的選殖株將具有6仟鹽基對B a m Η
1 — Η ί n d Μ片段且其可藉由已知方法比較其限制圖譜 與人類Ε Ρ 0基因附近之限制圖譜而予以確認。或者,使 用6 0 9鹽基對片段作為探針構築Ε Ρ0基因上游人類基 因體之限制醑圖譜,可確認酵素產生一源自HUME P R -48- 本纸張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公& ) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製
402639 A7 B7 ___ 五、發明說明(4k) A順序2及6〇9間並延伸超過上游8&111141位置;該 片段可由經合適切割的人類基因體D N A進行電泳而分離 並連接於一细菌性或酵母菌選殖載體上。正確的選殖株將 與609鹽基對5’ EPO探針雜交並包含一6仟鹽基對 BamH I — Η i nd Μ片段。分離之6仟鹽基對片段K 適當方向*** p5’ EP0,p5’ EPO— mMTF, 或p5’ EPO— m MTS (如此一來Hindi位置接 近HUMEPRA核苷酸位置2)。額外之上游序列可用 已知方法分離’使用染色體步査技術(c h r omo s 〇 me walking techniques)或藉由 可與609鹽基對5’ EPO探針雜交之酵母菌人工染色 體之分離。 上述之選殖技巧使得E P ◦上游序列可在體外修正供 後績初级及二級人類母细胞尋標性轉染。這些技巧敘述m Μ T啟動子簡易的***,及刪除負性調節區域,及刪除負 性調節區域並Κ具廣泛宿主一细胞活性之增強子加Μ取代 Ο g·尋標至人類ΕΡ0基因兩側序列並藉篩選分離被 尋標之初級,二級及長生之人類纖雄母:细胞 為了尋標,質體Μ限制酶切割使***之發生遠離質體 骨幹。Kp5’ EP0— mMTS 而言,H i ndffi 及 S a .1 i之切割釋出2 ♦ 4仟鹽基對的尋標片段DNA,其 包含1·8仟鹽基對mMT啟動子及分別於5’及3’端 -49- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) ----------訂---------線 ' 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 仙 2638 A7 — B7 五、發明說明(θ) 胃4 0 5鹽基對及204鹽基對,係為了將此構築體尋標 基因之調節區域上。該DNA或軍獨此2 * 4對尋標片段藉酚萃洗及乙醇沈澱予K純化並Μ實 W 1 8 e中所述條件轉染進入初級或二級人類纖維母细 ffi e €胃染细胞覆蓋於在人類纖雄母细胞培養基中的1 5 0毫#培養皿上。48小時後該细胞K10,〇〇〇細胞 /平$公分之密度覆於24孔盤内〔約每孔20,〇〇〇 MffiiS,’若尋標發生率為每i〇S個可選殖细胞(實施例 1 c ) ’則需要測試約5 0個孔Μ分離軍一表現株]。這 些於被轉染後DNA尋標而進入Ε Ρ 0上游對應性區域的 细胞將於m Μ Τ啟勤子的控制下表現Ε Ρ 0。1 0天後, 整個孔内上清疲使用一商業化可用兔疫試驗套件(Am g en)對ΕΡ0表現作測試。由表現ΕΡ0的孔而來之選 殖株係使用已知方法分離,典型地藉由分配到個別孔内或 盤內之異源性族群细胞每一部分的試驗,試驗這些正反應 细胞,並依需要重複,最後,藉由篩選每一孔種植一细胞 之9 6孔微效價盤分離出被尋標的株落。來自整個盤之溶 解物中之DNA亦可使用一mMT特異性引子配合位於Η U Μ E R Ρ Α核苷酸位置1上游之一引子藉P.C R對一片 段之增幅加K分析。這對引子應增幅出一段精確符合基於 該D N A序列所預测之大小的D N A片段。正性反應盤K 胰蛋白酶處理並以連續較低之稀釋度再覆於盤上,並依需 要重複DMA製備及PC R步驟K分離被尋標的细胞。 -50- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(21〇X 297公爱) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂---------線. 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 40S63S A7 B7 五、發明說明(4) 在此敘述之尋標程序亦可用來在不死化人類细胞(例 如,HT1080 纖維 S细胞,HeLa,MCF — 7, 乳癌,细胞,K — 562白血癌细胞,KB癌细胞或27 80AD卵瘤细胞)活化hGH的表琨Μ達為了傳統藥物 傳送而製造h G Η之目的。 在此所敘述的尋標計劃亦可以用於在不死化人類细胞 (例如,ΗΤ1080 ( A T C C CCL 121)纖 維母细胞,HeLa(ATCC CCL 2)细胞,Μ CF-7 (ATCC HTB 22)乳癌细胞,K_5 6 2 ( A T C C CCL 243)白血癌细胞,KB ( ATCC CCL 17)上皮腫瘤妞胞2780 AD ( Van der Bliek,A'*M·等人,Cane e r Res - 48:5927-5932 (1 9 8 8) )卵巢腫瘤細胞)中活化hGH的表現,以作為供翳藥傳 送之hGH生產的目的。 h ·尋標至人類ΕΡ0基因兩側序列並藉由一正性或 一聯合正性/負性篩選条統分離被尋標之初級,二級及不 死化人類纖維母细胞 構築p5’ EP0-mMTF,p5’ EPO—mM TS或其具有額外上游之6仟鹽基對BamHI — Η丨η d ffi片段之衍生物的策略可接著進行***n e 〇基因於m Μ T啟動子附近之步驟。另外,一負性篩選標記,例如s p t 〔來自pMS_G (pharmac i a)或另外合適 -5 1- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 χ 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂---------線©. 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 mmm ^ B7 五、發明說明(1) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)
的來源〕,可於pBI uescr i ptESK/ +多連 接子中***HUME PRA序列的附近。在前一種情形, G418藉由株落群中製備之DNA進行PCR增幅或限 制酶及S o u t h e r η氏雜交分析予Μ分離及篩選而證 實被尋標的株落。在後一種情形,G4 1 8株落置於含6 -硫代黃嘿呤之培養基中以篩選掉pGT基因嵌入者〔Β esnard,C* 等人,Mol *Cel 1 ·Βίο1 .7:4139—4141 (1987)]。另外,HS V — TK基因可置於如pGT之***者之相反一端,使得 藉由在含40 0微克/毫升G418,100//M6 —硫 代黃嘿呤,及25毫克/毫升gancyc lov i r之 人類纖維母细胞培養基中培養细胞可蹄選出n e o及篩選 掉g P t及ΤΚ。該雙重負性篩選應可提供對真簧被尋標 事件一幾乎絕對的篩選且S 〇 u t h e r η氐移漬分析提 供一最後的確認。 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 此處敘逑之尋標程序亦可用於不死化人類细胞(例, ΗΤ 1 080纖維母细胞,HeLa,MCF — 7乳癌细 胞,K—562白血癌细胞,KB腫瘤细胞或2780A D卵癌綑胞)中活化h E P0的表現K達為了傳統藥物傳 送而製造hEPO的目的。 在此所敘述的尋標計劃亦可Μ用於在不死化人類细胞 (例如,ΗΤ1080 (ATCC CCL 121)纖 維母细胞,HeLa(ATCC CCL 2)细胞,Μ -52- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) 402639 A7 B7 五、發明說明(w) c F - 7 ( A T C C HTB 22)乳癌细胞,K — 5 6 2 ( A T C C C C L 2 4 3)白血癌细胞,KB ( A T C C C C L 17)上皮腫瘤细胞2780AD(
Van d e r Bliek,A*M‘ 等人,Cane e r Res *48:5927-5932 (1988) )卵巢腫瘤细胞)中活化hGH的表現*M作為供醫藥傳 送之h G Η生產的目的。 i *構築可將人類生長激素基因置於在初級人類纖雄 母細胞中老鼠me t a 1 1 o t h i one i η啟動子之 控制下的尋標質體 下列實施例用來示範本發明之一具體事實,其中人類 生長激素基因被更改Μ在初级或二#人類纖維母细胞中表 現人類生長激素。 與那些在實施例1f中所述為了尋標至ΕΡΟ基因調 性區域的分子相似的尋標分子係使用源自人類生長激素N 基因之5 ’端之被選殖D N A片段而產生。一約1 * 8仟 鹽基對片段分佈於HUMGHC SA (輸入G e n e b a nk)核苷酸位置3787-5432 (此有兩個Eco NI位置而產生大小方便於選殖或涉及此片段之次選殖之 診斷性切割的片段)藉由分析此區域序列而設計P C R引 子予K增幅。該區域由hGH基因N 第1個intro η延伸至轉譯開始位置5〃上游約1 * 4仟鹽基對處。ρ U C 1 2 Μ E c 〇 R I 及 B a m Η I 切割,K k 1 e η 〇 -53- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製
經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 A7 __B7 _ 五、發明說明(d)
W處理產生平頭,並於稀釋的條件下再形成環,導致已失 去E c 〇R I及BamH I位置之質體。該質體命名為P UC 1 2XE B。H i n.d I連接子被連接於增幅出的h G Η片段上且得到的片段Μ H i n d SI切割再連接於H i n d M切割之P U C 1 2 X E B上。得到的質體P U C 1 2 XEB — .5’ hGH,KEcoRI 及 BamHI 切 割後移除緊接hGH轉錄起始位置上游之0.5仟鹽基對 K段。該切割過之Η段連接於來自mMT—I基因〔不包 含任何mMT_密碼區域;Hamer,D · Η ♦及Wa 1 iing,M*J.Mol. A p p 1 · G e n * 1 J 2 7 3 - 2 8 8 (1 9 8 2);該片段亦可使用來自Ge nbankmMUSMTI,M:USMTIP,MUS MT I PRM,可用於mMT序列之分析中所設計之PC R引子由老鼠基因體D N A中藉已知方法分離〕之1 · 8 仟鹽基對EcoRI— BslI片段。質體p5’ h G Η —m ιΜ Τ具兩側皆是上游h G Η序列之m Μ Τ啟動子。 上述選殖技巧使得h G Η上游序列在試管中被修正Μ 接著進行初級或二級人類纖維母细胞之被尋標轉染。該策 略敘述rnMT啟動子之簡軍***。其他策略亦可考慮,例 如,在***之mMT序列上游***具廣泛宿主—细胞特異 性之一增強子。 j *尋標至人類hGH基因兩側之序列且藉由篩選而 分離被尋標之初級,二級及不死化人類纖維母细胞 -54- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)
A7 B7 玉、發明說明(ρ) 3 7尋標,質體以限制酶切割使***之發生遠離質體 。在p5’ hGH — mMT的情形下,Η i ndll[之切割 釋出一2 ‘ ◦仟鹽基對之尋標片段,其包括1 . 8仟鹽基 對之m Μ T啟勤子而在5 ’及3 ’兩側具D N A以便將此 構築體尋標於h G Η基因之調節區域上。該D NA或僅2 • 9fFi(基對尋標片段藉由酚萃洗及乙醇沈澱予以純化並 於實^例6中所述條件轉染進人初级或二級人類纖雄母细 胞0旋轉染细胞覆於具人類纖維母细胞培養基之1 5 0毫 米培養皿中。48小時後细胞以10,000個细胞/平 方公分之密度〔每孔約2 0,0 0 0個细胞;若尋標發生 率為每10®個可選殖细胞有1個(實施例lc),則需 要測試5 0個孔左右才能分離到單一表現株落〕覆於24 孔盤上。被轉染用的DNA尋標而進人hGH之上游對應 性區域的细胞將在m Μ T啟動子的控制下表現h G Η。1 0天後,所有孔內上清疲使用商業化可用之免疫試驗套件 (N i cho i s)對hGH加以測試。由顯示製造hG Η的孔而來的细胞使用習用方法分離,興型上藉由測試分 佈於個別孔或盤内之異源性族群细胞之每一部分,測試陽 性反應的孔,並依需要重複,最後藉由篩選每孔種一细胞 之9 6孔微效價盤而分離被尋標的株落。來自全部盤溶解 物之D Ν Α亦可使用一 m Μ Τ特異性引子配合一位於H L MGHCSA核苷酸位置5 ,432下游引子KPCR對 —片段之增幅加Κ分析。該對引子應增幅出一大小精確符 -55- 參紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210x 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製
A7 402639_B7 五、發明說明u)) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 合基於該DNA序列之預期的DNA片段。陽性反應盤K 胰蛋白醯處理並Μ連績較低稀釋度再覆於盤中,且依需要 重複D Ν Α的製備及P C R步驟Μ分離被尋標的细胞。在 肋所述之尋標程序亦可用於不死化人類细胞(例如,Η Τ 1 080纖維母细胞,He 1 a ,MCF— 7乳癌细胞, K 一 562白迦癌细胞,KB癌细胞或2780AD卵癌 细胞)活化h G Η的表現Μ達為了傳統藥物傳送而製造h G Η的目的。 在此所敘述的尋標計劃亦可Μ用於在不死化人類细胞 (例如,HT1080(ATCC C C L 121)纖 維母綑胞,HeLa (ATCC CCL 2)细胞,Μ CF-7 (ATCC ΗΤΒ 2.2)乳癌细胞,Κ 一 5 6 2 ( A T C C CCL 2 4 3)白血癌ffl胞,KB ( ATCC CCL 17)上皮腫瘤细胞2780AD ( Van d e r B1 iek’A.M·等人,Cane e r Res .48:5927-5932 (1 9 8 8) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 )卵巢腫瘤细胞)中活化hGH的表現,K作為供翳藥傳 送之h G Η生產的目的。 k *尋標至人類h G Η兩側序列並藉由一正性或一聯 合的正性/負性篩選条統分離被尋標的初級,二級及不死 化人類纖維母细胞 " 構築p5’ hGH—mMT之策略可緊接著進行插人 n e ◦基因於m Μ T啟動子附近之額外步驟。另外,可將 -56- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) •402638 A7 B7 -__—-- ^ :— 玉、發明說明(外) —負性篩選標記’例如gpt 〔來自PMSG (Phar maC i a)或另外合適的來源]於PUC12多連接子 處***HUMGHCSA附近。在前一種情形’ G4 1 8 2株落藉由來自混合株落製滝的D N A進行P C R增幅或 限制酶及S o u t h e r η氐雜交分析加以篩選及分離而 確認被尋標的株落。在後一種情況’ G4 1 8 株落被置 人含硫代黃嘌呤的培養基中以篩選掉sp t基因嵌入者〔 jgesnard’C.等人,Mol *Cel.l · Β ί ο 1.7:4139—4141 (1987)]。另外,Η ,SV—ΤΚ基因可置於如spt之插人者之相反一端,使 得藉由於含400微克/毫升G418, 100wM6— 硫代黃嗓呤,及25微克/毫升g.aniyc 1 oui r 之人類纖雄母细胞培養基中培養细胞可篩選出n e 〇且篩 選掉g P t及Τ Κ。此雙重負性篩選可提供對於真實被標 定事件一近乎絕對的篩選。S 〇 u t h e r η氏雜交分析 則具確認性。 在此敘述之尋標程序亦可於不死化人類细胞中(例如 (請先閱讀背面之注音?事項再填寫本頁) --------訂---------線£1:,.=、. 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 抱 抱 nnn QHU 细細 母癌 維血 纖白 ο 2 8 6 ο 5 1 Κ Η ,
胞癌 细卵 癌 D 乳 A 7 ο I 8 F 7 C 2 Μ 或 , 胞 a 细 1 癌 B K e Η Η G h 造 製 送 傳 物 藥 統 傳 供 達M 現 表 的 Η G h ib活 。 勺 \ly Ad 胞目 细之 胞纖 细 } 類 1 λ 2 化 1 死 不 L 在 C 於 C 用 MC 可 C 亦 Τ 劃 A 計 { 標 ο 尋 8 的 ο 述 1 敘T 所H 此, 在如 例 本纸張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) A7 B7 五、發明說明(c)
維母细胞,H e c F - 7 ( A T 6 2 ( A T c c A Γ C C C c v a n d e r e r R e s . )卵巢腫瘤细胞 送之h G H生產 在實施例1 h,1 j 及 1 k 增幅之可篩選標 ),該可篩選標 增幅之可篩選標 能夠表現編碼一 蛋白質(例如, 基因治療的用途 L a ( A Τ C C C C C Η Τ B 2 2 C C L 2 4 3 ) L 1 ) 上 皮 腫 瘤 Β 1 Ϊ 0 k j A ♦ 4 8 « 5 9 2 7 — 5 ) 中 活 化 h G Η 的 表 的 巨 的 0 f 及 1 ί 中 提 及 9 以 中 使 用 的 尋 標 構 築 體 記 ( 例 如 9 a d a 9 記 有 利 於 篩 選 其 中 被 記 均 被 增 幅 的 细 胞 C 治 療 性 產 物 的 内 源 性 h G Η 及 h E P 0 ) Ο C L 2 )细胞,Μ )乳癌细胞,Κ — 5 白血癌细胞,Κ Β ( 细胞2780AD ( Μ ·等人,C a n c 9 3 2 (1 9 8 8) 現,Μ作為供醫藥傳 及在實施例1 g,1 可K被修正為含有可 dhfr,或 CAD 活化内源性基因及可 這種细胞,其表現或 基因,可K作為製造 K供傳統醫藥傳送或 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 基 酶以懸·, 記 白加再 s 1 標 蛋菠胞 EC 選 胰淨细 p K 篩 以懸將 E 可 予胞並 Η Μ 一 胞细疲m 及 细量清 Μ 5 Α染母少上 £, N 轉維取出 ο 1 D 之纖。抽 2 C 性行之刷。i a 源進段冲心液 N 外胞階基離衝 K 细止養行鍰 Μ 法母靜培進移 Ε 染維期 Μ 胞轉 7 轉纖早面细擊 3 擊级或表之電 1 電二長膠餘之 , 藉及生塑剩升 3 ♦ 級速由且毫 . 1 .勘法及 -5 7 對 理算於 Η 因 處計浮 Ρ 1本紙張尺度賴+酬家料(CNS)A4規格(210 x 297公釐) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 403638 A7 __________ B7___ 五、發明說明(士) 0 * 7 m Μ N a 2 Η Ρ Ο 4 ,6mM右旋糖)。該细胞 再次離心’抽離上清液,並再將细胞懸浮於含1毫克/毫 升乙驢化牛血清白蛋白之電擊轉移媛衝液中。最終细胞濃 度約3 X 1 〇6细胞/毫升。電擊轉染應於懸浮後立即進 行。 超螺旋之質體DNA加入具0 ♦ 4厘米電極溝(B i 〇 — Ra d)之滅菌管。最終DNA濃度通常至少為1 2 0微克/毫升。〇 . 5毫升之细胞懸浮疲隨即加入該管中 (約含1 ♦ 5X 1 〇6個细胞),並媛慢混合细胞懸浮疲 及DNA溶液。電擊轉染以(}ene_Pu.l ser儀器 (Bi 0~Rad)進行。電容及電壓分別設定為960 微法拉第及250 — 300伏特。當電壓增加,细胞存活 降低’但存活细胞中穩定將送入DNA嵌入其基因體之比 率大為増加。根據這些既得參數,可観察到約丨4 一 20 毫秒之電擊時間。 受電擊轉染之细胞置於室溫下約5分鐘,且管中液體 小心地以無菌輸送管移出。該细胞直接加人預溫之培養基 10毫升(如上逑具15%牛血清)於一10米盤中並如 上述培養。次日,吸取培養基並換上1 〇毫升新鲜培養基 且再培養1 6 — 2 4小時。在次日進行细胞次培養从決定 選殖效率及篩選抗G4 1 8之次殖株。细胞以胰蛋白酶處 理’計算並貼附;典型上來說,纖維母细胞以1 〇 3细胞 /1 〇厘米盤濃度貼附來決定選殖效率且以1 — 2X 1 0 -59- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)
經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 _ 她639_B7__ 五、發明說明(<?) *個细胞/ 1 0厘米盤濃度進行G 4 1 8篩選。 人類纖維母细胞在具3 0 0 — 4 0 0微克/毫升G4 18 (Genet i c i η,雙硫酸鹽而具約50%有效 成分;Gibco)之纖雑母细胞培養基中(具15%牛 血清)對1 8抗藥性進行篩選。選殖效率之決定則不 加入G 4 1 8。貼附细胞培養1 2 — 1 4天,其後株落K 福馬林固定,用结晶紫染色並加K計數(對於作選殖效率 實驗之培養盤)或使用選殖棒予Μ分離(對於作G 4 1 8 篩選之培養盤)。兔子纖維母细胞之電擊轉染及篩選基本 上如同人類纖維母细胞,除了使用之條件Κ外。兔子纖維 母细胞在含1克/毫升G418漶度之培養基中篩選抗藥 性株落。 纖維母细胞由新鮮切除之人類***中分離。细胞5 0 ,000個细胞/平方公分種於加入1 0 %牛血清之DM EM中。當细胞聚集時K胰蛋白醑處理得到纖維母细胞並 予K電擊轉染。電擊轉染條件藉K質體p c DN E 0之轉 染予Μ評估。一代表搜轉染簧驗使用近乎完善之條件(6 0毫克質體p c DNE0於250伏特電擊電壓及960 微法泣第電容之下)產生每588個受處理细掘中有一個 G 4 1 8株落(所有處理细胞之〇*17%),或每7 1 個可選殖株中有1個G 4 1 8株落_( 1 ♦ 4 % )。 當分別進行9個於幾乎完善之條件下(6 0微克質體 p c DN Ε 0於3 0 0伏特電壓及9 6 0微法拉第電容下 -60- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) #衣--------訂---------線. 402638 A7 B7 五、發明說明(0) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) )之電擊轉染實驗’平均觀察到每1 ,8 9 9個被處理之 细胞就有1個G41 8株落(〇 . 05%),而在1/8 8 2至1/7500之範圍内。相對地每38個可選殖细 胞中平均有1個0418株落(2‘6%) 〇 較低繼代之初級人類纖維母细胞藉由K質體p c DN E0 及 i>XGH5 之共轉染(co — transfect i on)轉變成hGH表現细胞。典型地,60微克之等 莫耳兩質體之混合物在近乎完善之條件下(電擊電壓3 ◦ 0伏特且電容960微法拉第)予以轉染。該實驗結果每 14,705個受處理细胞產生1個G4 1 8株落。 這些细胞及其他Μ相同轉染條件分離之细胞的h G Η 表規資料總结於下。最後,全部G:4 1 8株落之98%可 生大量培養細胞。 經分析之G418-r株落數目 154 G418/表現hGΗ之株落數目 65 平均hGH表現程度 2*3微克hGH/ 1 0 6個细胞/ 2 4小時 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 最大hGH表現程度 23·0微克hGH/ 1 0 6涸细胞/ 2 4小時 穩定之受轉染细胞亦藉由M p XG Η 3 0 1轉染初級 或二級人類纖維母细胞而業已產生,PXGH301為η e 〇及hGH基因同時出現於一個質體分子之DNA構築 -6 1- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) 402638 A7 B7 五、發明說明) 。p X G Η 3 0 1 .經由一兩個步驟姐成的過程an Μ ®° 自 PBR322 (在 PBR32 2 中的位置 23 — 651 )分離Sa I I — C 1 a 1片段並嵌人MSa 1 i _C 1 a ί切割之pcDNEO ’因而將一 BamH I位置送入 p c DN E 0之S V4 0早期啟動子區域的上游。該質體 ,pBNEO,KBamHI 進行切割且一 2,1Kb 包 含在SV40早期啟動子控制下的n e 〇基因之片段被分 離,並***MBamH I進行切割之pXGH5。一具有 該2·1仟鹽基對BamHI片段之單一嵌入之質體被分 離得到,其中n e 〇及hGH彼此K同樣的方向進行轉錄 。該質體被命名為PXGH301·例如,K60微克p XGH30 1於300伏特及96Ό微法拉第下轉染1 * 5 X 1 06個細胞。G4 1 8抗藥性株落由受轉染二級纖 維母细胞分離之頻率為每1 * 5X 1 06個细胞產生65 2涸G4 18抗藥性株落(每2 2 9 9個受處理细胞中有 1個)。該株落群中約5 9 %表現h G Η。 實施例2 構築導致人類生長激素與紅血球生成素序 列融合之多形性轉錄單位之尋標質體 下述可作為本發明兩個具體事實之示範說明,其中人 類Ε Ρ 0基因上游正常調節性#列被更改使得在未體轉染 狀態不能Κ可偵测量表現Ε Ρ0之初級或二級纖維母细胞 - ....«TV, 株可表現hEPO。在這些具體事實中,尋標作用之產物 為多形性轉錄單位,其中人類生長激素基因第1個e X 〇 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) --------訂---------線 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 年、 6 β 月 & ο
9 3 A7 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 -- Tffi 7U _B7_五、發明說明(4〇 ) η位於EPO第2 — 5涸exon的上游。轉錄,剪接及 轉譯的產物為hE PO訊號胜肽第1 — 4個胺基酸被hG Η第1 - 3個胺基酸殘基所取代之蛋白質。該兩個具體事 實不同點在於外來調節性序列***之相對位置及產生最終 加工之轉錄本(transcript)所需要的特殊剪接形式。 質體ρΧΕΡΟ—10用於藉由基因尋標於人類第7 對染色體上内源性hEPO基因KhGH第1個exon 取代hEPO第1個exon。質體ρΧΕΡΟ - 10構 築如下。首先,中間質體ρ Τ 1 63藉由將6仟鹽基對Η indl-BamHI片段(見實施例If)在Hind 皿一BomHI 切割之 pBl uescr i pt ISK + (Stratagene,LaJol la,CA)內插 入hEPO譯碼區 域之上游。該連接後的產物KXho I及H i ndiil切割並連接至來自pMC 1 neoPo 1 y A 〔Thomas ,K*R* 及 Capecchi ,M * R * C e 1 1 51:503-512 (1 9 8 7), 可用來自 Stratagene,Laj o 1 1 aCA 者 〕之1 ♦ 1仟鹽基對Hindi— Xhol片段上。在聚 合酶鐽反應中使用寡核苷酸1 3 · 1 — 1 3 · 4而產生一 融合片段,其中老鼠meta 1 i othi one i nl (mMT — i)啟動子一hGH第1個exon序列融合 於hEPO 第1個exon序列。首先,寡核苷酸13 * 1及13 * 2被用來自pXGH5 (圖1)增幅約0 * -63- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) A7 B7 _ 五、發明說明(Μ) 7 3仟鹽基對mMT—I啟動子一hGH第l個exon 片段。再來,使用寡核苷酸1 3 ,3 — 1 3,4增幅約0 ’ 5 7仟鹽基對主要包含來自人類基因體〇1^及之}1£卩 0 第1個i n t r ο η片段。最後,混合此兩種被增幅 的片段並進而Μ寡核苷酸1 3 * 1及1 3 · 4複製產生最 終之融合片段(第3個融合片段),其mMT—I之5’ 端具Sa 1 I位置且hEPO第1個i ntron序列之 3’端具Xho I位置。融合片段MXho I及Sa i I 切割並連接至X h ο I切割之p T 1 6 3。該連接後之混 合物被轉形進入大腸稈菌(E · c 〇 I i )且一選殖株被 確認含有單一***之第3個融合片段,其中XhoI位置 在hEPO第1個intron序列之3’端再產生,且 其被命名為pXEPO—10。
13,1 5' AAAAGTCGAC GGTACC
Sail Κ ρ η I
TTGG TTTTTAAAAC CAGCCTGGAG (S E Q ID NO 5 )
13*2 5' CCTAGCGGCA ATGGCTA
CAG GTGAGTACTC GCGGGCTGGG C G (S E Q ID NO 6 )
13·3 5' CGCCCAGC C C G C G A G T A
CTC ACCTGTAGCC ATTGCCGCTA G G (S E Q I D N 0 7 ) -64- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂---------線'" 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 A7
經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 五、發明說明((^)
13,4 5' TTTTCTCGAG CTAGAAC A G A TAGCCAGGCT GAGAG (S E Q ID N 0 8 ) 寡核苷酸1 3 * 1中非粗體字區域與mMT_ 1啟動 子相同,具有自然之κ p n I位置於其5,端。粗體字區 域表現一 Sa i I位置尾端而將5’端轉變成一 Sa 1 I 位置。寡核苷酸1 3 * 2及1 3 * 3之粗體字區域表hG Η序列,但非粗體字區域為來自hE P〇基因之第1個i n t r on序列。寡核苷酸1 3 * 4之非粗體字區域與h E P 0第1個Γ n t r ο η最後2 5個鹽基相同。粗體字 區域包括一Xho I位置尾端而將被增幅片段之3’端轉 變成一Xhol位置。 質體ρΧΕΡΟ — 1 1藉由基因尋標將mMT — I啟 動子及h E P 0構造基因及啟動子區域上游h G Η之第1 個e X ο η置於人類第7對染色體上内源性hE Ρ0位置 。質體pXEPO-11之構築如下。寡核苷酸13.1 及1 3 . 5— 1 3 * 7被用於聚合醯鍵反應K產生一融合 片段,其中老鼠 meta.llo_thionein I ( mMT— ί)啟動子一hGH 第1個ex ο η序列與栢 :r· 對於hE P0譯碼區域自一 1至一6 30之hE PO’序列 融合。苜先,寡核苷酸1 3 ♦ 1及1 3 ♦ 5被用來自p X GH5 (圖1)增幅約〇 . 73仟鹽基對mMT — I啟動 -65- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 x 297公釐) (請先間讀背面之注意事項再填寫本頁)
經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 402638 A7 B7 五、發明說明α)) 子一hGH 第1個exon片段。再者,寡核苷酸13 .6及1 3 ♦ 7被用來自人類基因體DNA增幅約0 · 6 2仟鹽基對主要包括相對於h E PO譯碼區域—1至一 6 2 0之hEPO序列。寡核苷酸13,5及13 · S在h GH第1個i nt r on — hEP〇啟動子區域包含1 〇 鹽基對之連接序列,其對應於自然hEPO第1個i n t r ο η剪接供應處。最後,混合這兩個被增幅的片段並進 而Κ寡核苷酸1 3 * 1及1 3 ♦ 7增幅而產生最終融合片 段(融合片段6),其於mMT— 15^端具Sal I位 置且於ιταΜΤ — I啟動子區域之3’端具一 Xho I位置 。融合片段MXhoI及SaII割並連接至XhoI切 割之p T 1 63。該連接反應混合物轉形送入大腸桿菌( E . c ο 1 i)且一選殖株被確認含有單一***的融合片 段6,其中Xhol位置在hEPO啟動子序列3'端再 生,並將其命名為ρΧΕΡΟ—11。
13*5 5' CCTAGCGGCA A T G G C T A
CAG GTGAGTACTC AAGCTTCTGG
H i n d I I I
GCTTCCAGAC CCAG ( S E Q ID NO 9) 13*6 5' CTGGGTCTGG AAGCCCA
GAA GCTTGAGTAC TCACCTGTAG
H i n d I I I CCATTGCCGC T A G G ( S E Q ID NO 10) -6 8 - 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先間讀背面之注意事項再填寫本頁) ----I---訂------一 A7 B7 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 五、發明說明) 1 3 ' 7 5' TTTTCTCGAG CTCCGCG X h ο Ϊ CCT GGCCGGGGTC C C T C (S E Q ID NO 1 1 ) 寡核苷酸1 3 · 5及1 3 * 6之粗體字部分表hGH 序列。斜體字區域對應於hEPO 第1個i nt ron 前1 0個鹽基對。剰下的序列對應於相對於h E P 0譯碼 區域由—620至—597之hEPO序列。寡核苷酸1 3 · 7之非粗體字區域與相對於hEPO譯碼區域一 1至 一24之鹽基對相同。包括XhoI位置尾端之粗體字區 域將被增幅片段之3,端變成Xhol位置。 質體pXEPO-lOKBamHI及XhoI切割 釋出兩側皆有hEP 0序列之mMT — I/hGH融合序 列約7 * 3仟鹽基對,可作為基因尋標的用途。該片段( 尋標第1個尋標片段)不包含h E P 0譯碼區域,僅具h ΕΡ0密碼區域及hEP0_第1個i nt r on序列上 游約一6 2 0至一6 6 2 0之間的序列指揮尋標至人類e P 0基因上。第1個尋標片段使用類Μ實施例1 c中所述 的條件轉染初级或二級人類纖維母细胞。G A 1 8 株落 挑至96孔盤之個別孔中並ME LISA試驗(R&D系 統,Mi nneapo 1 i s ,.MN)筛選 EP0 的表現 。轉染DN A隨意嵌人人類基因體的细胞不能產生EP 〇 。轉染DNA與內源性hEPO第1個i n t r οη及h -67- (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 身------ 訂----- 線〆 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 x 297公釐) A7 B7 五、發明說明(ο Ε Ρ 0上游序列已進行對應性重組的细胞包含一多形性基 因,其中mMT- I啟動子及非轉錄的序列及hGH 第 1個e X ο n取代正常性h Ε P0游啟動子及h Ε P0 第1個ex〇n (見圖5)。在第1個尋標片段中非hE P0序列加入hEPO第1個i ntron下游之hEP 0序列。KmMT— I啟動子對正常性h E P0調節性區 域進行取代將於非正常性表現Ε P 0之孅維母细胞中活化 EPO基因。以hGH 第1個exon取代hEPO第 1個ex o n產生MhGH第1 — 3個胺基酸取代hE P 0訊號胜肽前4個胺基酸的蛋白質,並產生一具功能之多 形性訊號胜肽,其藉由後轉譯處理自成熟蛋白質上去除並 由表現细胞排出。 質體ρΧΕΡΟ — 1 1可藉由KBamHI及Xho I切割釋出7 · 4仟鹽基對包括兩側皆有h Ε P0序列之 m Μ T - I / h G Η融合序列而作為基因尋標的用途。該 片段(第2涸尋標Η段)不含hEPO密碼區域,僅具位 於h Ε P 0密碼區域的上游一 1及約一 6 6 2 ◦間的序列 指揮尋標而進入人類EPO基因。第2個尋標片段使用類 似實施例1 g中所述條件轉染初级或二级人類皮慮纖維母 细胞。G 4 1 8抗藥性株落被挑至9 6孔盤的個別孔中並 MELISA 試驗(R&D 糸統·,Minneapo.t i s ,MN)篩選EPO的表現。轉染DMA隨意嵌入人類 基因體之細胞不能產生Ε P0。轉染DNA已與内源性h -68- 本纸張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) --------訂----- 線' 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 8V.月08曰 修正補充 403638 A7 B7 五、發明說明(α) E P 0啟動子及上游序列進行對應性重組的綑胞包含一種 多形性基因,其中mMT— I啟動子及非轉錄性序列,h GH5’未轉譯序列及hGH 第1個exon,及一包 含hEPO 第1個intron前10個鹽基對之10 鹽基對長連接子於相對於h E P0密碼區域一 62 0位置 的Hindi!處***(見圖6)。位於正常沈默之hEP 0啟動子上游之mMT-I啟動子將於初級或二級皮虜纖 維母細胞中,指揮具(5*至S')非轉譯性metal 1 oth i one i n 及 hGH 序列,hGH 第 1 個 ex on同於hEPO 第1個intron前10個鹽基對 的1 0鹽基DNA,及正常性hEPO啟動子及hEPO 第1個exon (相對於EP ◦密碼區域一620至+1 3)之訊號的製造。來自hEPO 第1個intron 之10鹽基對連接子序列作為剪接主動位置將hGH 第 1個exon與位於hEPO 第2個exon上游之下 一個下游剪接被位置融合。該轉録本之處理將因而剪出h ΕΡ0啟動子,第1個exon,及第1個i nt ron 序列。MhGH exonl取代hEPO 第1個ex ο η產生h E P0訊號胜肽前4個胺基酸KhGH第1 一 3個胺基酸取代之蛋白質,並製造一具功能之多形性訊號 胜肽,其藉由後轉譯處理成熟蛋白質上移除並自表現细胞 分泌。 可使用習知方法構築一条列相關於pXE P0 — 1 0 -69- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) -ο裝 ——訂--------- 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 89 6 GSjfi 4的63 年補充 五、發明說明) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 及ρΧΕΡΟ — 1 1的構築體。在這些構築體中,mMT 一 I啟動子及hGH序列的相對位置,及mMT — I/h G Η序列***h E P 0上游序列的位置皆為多變的Μ創造 有助於基因尋標之多形性轉錄,使得融合之轉錄本表現更 有效率,或具其他希望的特性。此種構築體將得到相同的 結果,因此該hGH/hEPO融合基因藉由基因尋標而 在正常h E P 0基因上受到一外源性啟動子的控制。 例如在hEPO基因上游之6仟鹽基對H i nd I I I 一 BamH I片段(見實施例If)據有許多限制酶鑑 識序列而可Μ作為n e 〇基因及mMT— I啟動子/hG Η融合片段的嵌入位置。一個這樣的位置,位於該H i η d I I I位置上游約1 * 3仟鹽基對之Bg 1 I I位置, 在此區域為獨特的,且可作為一或多個可篩選標記及一衍 生自另一個基因的調節性序列***的用途,該調節性序列 可以作為在初級人類细胞、二級人類细胞或不死化人類细 胞中活化EPO表現之用途。 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 首先,中間型質體pT164係經由將在hEPO編 碼區域上游6Kb之Hindi I I — BamHI片段( 實施例If)嵌入MHindl I I— BamHI切割之 pBluescriptIISK + (Stratase n e > L a J ο 1 1 a,CA)中構築而成。質體pMC IneoPolyA〔Thomas,K.R ♦及 Cap ccchi,M,R.Cel i5i :503-512 ( -70- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公复) 402638 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 五、發明說明(β) 1 3 8 7);商業化產品來自S t r a t a g e n e ,L aJo i 1 a ,CA] KBamHI 及 Xho I 進行切割 ’再M大腸桿菌(E . c o i i ) D N A聚合醒之K 1 e η o w片段處理而製成鈍端,並純化得到的i . 1仟鹽基 對Μ段。p T 1 6 4以B s 1 I I進行切割並K大腸稈菌 (Ε * c 〇 1 i ) D ΝΑ聚合酶之K1 enow片段處理 而製成鈍端。前面兩個鈍端的片段被連接在一起並使其轉 形進入勝任大腸桿菌(E . co 1 i)。具有該1 · 1K b n e 〇片段單一嵌入的選殖株被分離出,並經由限制 酶分析法加K分析,以確認其中由於鈍端Xh ο I及B g i I I位置的融合而重建之Bg 1 I I位置係距雛出現在 質體PT164上獨特之Hi nd:I I I位置1 · 3仟鹽 基對處。該得到的質體,PT165,可K在neo轉錄 單位的5 '端側逄之獨特B s 1 I I處進行切割。 寡核苷13·8及13♦9在聚合酶鏈反應中被使用 來產生一片段,其中老鼠meta 1 1 oth i o_ne i η I (mMT— I)啟動子一hGH第一個exon序列 被額外地與一包含剪接提供位置的1〇鹽基對片段加K融 合。被選擇的剪接提供位置與自然h E P 0第1個i n t r ο η中的剪接提供位置相關,雖然可Μ使用其他很多的 剪接提供位置或共同性剪接提供位置。這些寡核苷(1 3 • 8及13 ‘ 9)可Κ被用於自PXGH5增幅約0 · 7 3仟鹽基對之mMT — I啟動子一 hGH第一個e X ο η -71- (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) £) 衣 訂---------線〆 -V . 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS〉A4規格(210 χ 297公釐) A7 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 40^639 _B7__ 五、發明說明((/]) 片段(圖1 )。該被增幅的片段(片段7 )以B g 1 I I 進行切割並與Μ B g 1 I I切割之p T 1 6 5連接。此連 接混合物K轉形法送入大腸桿菌(E * c ο 1 i ),且一 包含單一嵌入之片段7的選殖株被確任並命名為ΡΧΕΡ 0 — 1 2 ,該片段中在m Μ Τ — I啟動子中的Κ ρ η I位 置與neo基因的5'末端相鄰,且該mMT_I啟動子 的方向使得轉錄係朝向獨特的H i n d I I I位置。
1 3 · 8 5 , AAAAAGATCT GGTACCT
B g 1 I I Κ ρ η I TGG TTTTTAAAAC CAGCCTGGAG (S E Q ID NO 1 2 ) 其中寡核苷1 3 * 8之非粗體字區域與mMT - I啟 動子相同,在其5'方向具有自然的Κρ η I位置。粗體 字型表示一 B.g丨I I位置尾端,可將5'端轉便成一 B s 1 I I位置。
13-9 5 / TTTTAGATCT GAGTACT
B g 1 I I C A C CTGTAGCCAT TGCCGCTAGG (S E Q ID NO 1 3 ) 寡核苷1 3 · 9之粗體字區域表示hGH序列。該斜 體字區域相關於hEP ◦第1個i n t r on中前1 0個 鹽基對。劃上底線之B g I I I位置係為了質體構築的目 的而加入。 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)
402639 A7 B7 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 五、發明說明(p) 質體 pXEPO-12 經由 KBamHI 及 Hind I I I進行切割釋出7 ‘ 9仟鹽基對的片段可K作為尋標 的用途,該片段包含n e 〇基因及兩側為hE P0序列之 mMT — I/hGH融合物。此片段(第3個尋標片段) 不包含h E P 0編碼區域序列,僅有在h E P ◦編碼區域 上游約—6 2 0到約一6 6 2 0之間的序列,該序列可引 導在人類E P 0基因位置上游進行尋標作用。第3個尋標 片段使用類似於實施例1 b及1 c中所敘述的條件,被轉 染送入初級人類皮虜纖維母细胞、二級人類皮虜纖維母细 胞或不死化人類皮慮纖雄母细胞。對G 4 1 8有抗藥性的 選殖株被挑到9 6孔盤的個別孔中,並經由一 E L I S A 試驗(R& DSystems ,Minneapo 1 i s ,MN)篩選EPO的表現。其中受轉染的DNA隨機嵌 入人類基因體的细胞不會產生E P0。其中受轉染的DN A在內源性h E P 0啟動子及上游序列之間已進行栢似性 重組的细胞包含一融合基因,在該融合基因中,mMT — I啟動子及非轉錄序列,h G Η 5 '端非轉譯序列,及h GHexon 1 ,及包含 hEPO 第 1 個 i nt r on 前 1 0個鹽基對之1 0個鹽基對之連接子被嵌入相對於h E P〇編碼區域約一 1 9 2 0之位置的B g 1 I I鑑識位置 。mMT — I啟動子在正常之下不表現的hEPO啟動子 上游的位置,將在初級人類缴維母细胞、二级人類纖維母 細胞或不死化人類纖維母:細胞中(或其他人類细胞)指導 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) ----
訂---II 線, 本纸張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210 X 297公釐)
402633 A7 B7 五、發明說明(刀) 一訊息的產生:(5 '到3 Λ )非轉譯性m e t a 1 1 〇 th i one i n 及 hGH 序列,hGH 第 1 個 exon ’與hEPO第1個i ntr〇n前10個鹽基對相同之 1 〇鹽基對之DNA,及hEPO上游區域及hEPO第 1個ex〇n (相對於ΕΡ0編碼序列,自約一1920 到+13)。來自hEPO第1個intron之10鹽 基對連接子序列作為一剪接提供位置Μ便將h G Η第1個 e X ο η融合到下游的剪接接受位置,其為於h Ε Ρ0第 2個e X 〇 n的正上游位置。所得到的轉錄本的加工將因 此剪接出hEPO上游序列,啟動子區域,第1個exo η,及第1個i nt ron序列。當使用ρΧΕΡΟ— 1 〇,一 1 1及一1 2時,該訊息之轉錄後加工可Κ經由利 用體外突變產生法Κ除去剪接接受位置加Κ改善,該剪接 接受位置位於介於mMT- I啟動子及hEPO第1個e X ο η之間的h Ε P0上游序列中,其本來會減少製造希 望的訊息所需要之生產行剪接事件的發生程度。Kh GH 第1個exon取代hEPO第1個exon導致一蛋白 質中h Ε P0訊息胜肽中前4個胺基酸被hGH之第1個 到第3個胺基酸所取代,製造出一功能性,融合之訊息胜 肽’其藉由轉譯後加工自成熟蛋白質上去除且由表現细胞 中分泌出來。 實施例3 * 上游序列之被尋標修正及該被尋標基因 的增幅 -74- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) -C3裝--------訂---------· 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 402639 五、發明說明(;?>) 假如尋標質體包含一可K經由基因增幅的表現型對於 一高濃度妞胞毒性劑具有抵抗性的標記基因,其中E P 0 基因已經由前述方法加Μ活的人類细胞可K被誘發去增幅 n e o/mMT — 1/ΕΡ0轉錄單位。可篩選的標記基 因,例如二氫葉酸癦原醌(dhfr ,篩選性藥劑為甲胺 基碟呤(me t_ho t r exa t e) )_,多功能性CA D基因〔編碼瞵酸胺基甲酯製造酶,天門冬胺酸轉胺基甲 醯酶,及二氫乳清酸騮;篩選性藥劑為N - (亞磷酸乙醯 基)一L 一天門冬酸鹽(PALA)〕,及腺核苷去胺釀 (a d a ;篩選搜藥劑為一腺嘌呤核苷酸),在眾多基因 中特別被報導可K在不死化人類细胞株中進行增幅(W r ight ,J *Α·等人 Pr〇c:*Nat 1 * A c a d ♦Sci * U S A 8 7 : 1791-1795 (199 0 ))。在這些研究中*基因増幅已被報告可以在許多不 死化人類细胞株中發生。HT 1 08 0,HeLa ,MC F — 7乳癌细胞,K — 5 6 2白血癌细胞,KB上皮種瘤 细胞,或2 7 8 0 A D卵巢上皮腫瘤綑胞在合適的篩選條 件下都表現増幅的現象。 質體pXEP0~10及pXEP〇一1 1可K經由 將一正常性或突變性d h f r基因***這些質體的獨特唯 一之H i n d I I I為置而加K修正。K合適的D N A轉 染Η T 1 080细胞後,針對G4 18 -抗藥性(由n e 〇基因所賦予)的细胞進行篩選,並加Κ檢驗,這呰细胞 -75- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂---------線^ 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 402639 A7 Β7 五、發明說明) 中的h E P〇基因已經由n e 〇 ,d h f r及m Μ T — 1 序列尋標進入h E P 0基因上游正確的位置而加以活化’ 這些细胞可K曝露在甲胺基蝶呤(me t ho t 1' exa t e )中進行逐步篩選M針對.d h f r的增幅及其連接之 neo ,mMT— 1 ’及 hEP〇序列進 ίτ 确選(Kan fman,R'J ’Technique 2 : 2 2 1 - 236 (1990))。在一逐步篩選的計劃中’细胞手 先曝露於低濃度的MTX (0·01Z到0·08wM) 中,接著連鑕曝露於漸增的Μ T X濃度,直到使用達2 5 0 w Μ Μ Τ X或更高的濃度為止。0 · 〇 4到0 · 〇 8 w Μ Μ ΤΧ之線性漸增步驟及連續ΜΤΧ濃度兩倍增加將有 效地針對被增幅的受轉染细胞株進行篩選,雖然一相對增 加較少的改變亦為有效的。增幅作用經由d h f r基因拷 貝數目的增加加K追蹤並經由體外h E P 0的測量加K確 認。藉由此策略,後績h Ε Ρ0的過度表現是可Κ經由在 完全於h E P 0編碼區域之外的序列被尋標修正予Μ達成 的° 與這些所敘述(實施例1 i及1 k )用於在人類細胞 中活化hG H的表現者類Μ的構築體,亦可被進一步修正 Μ包含d h f r基因,其目的為得到經由在非編碼序列進 行之基因尋標法及後續之增幅會過度表現h G Η基因的细 胞。 實施洌4. 人類ΕΡ0基因位置在一不死化人類孅 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事頊再填寫本頁) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製
A7 402639 B7____ 五、發明說明(外) 維细胞株中的尋標及活化 該尋標質體p X E P 0 — 1 3係被製成用於試驗内源 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 性h E PO基因可Μ在一·人類纖維细胞中被活化之假說。 首先’質體ρ Τ 2 2 * 1被構築,其包含融合到老鼠m e t a 1 lothionein— Ipromoter ( m MT — I)之hEPO基因之第一個密碼子上游之基因體 hEP ◦序列之63鹽基對。寡核苷22 . 1到22 .4 被用於PCR中K融合mMT—I及hEPO序列。這些 引子的特性如下·· : 2 2 ‘ 1為一 2 1鹽基之寡核而類似 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 於mMT - I Κρη I位置的上游之mMT- I啟動子開 始28個鹽基對的片段;22 * 2及22,3為58核苷 之互補性引子,其定義h E P0與mMT — I序列之融合 物,使得該融合物包含h E P0基因之地一個密碼子上游 的h E P0序列開始之3 5個鹽基對之中的2 8個鹽基對 ,且mMT— I序列開始於寡核苷2 2,2的第29個鹽 基’包括mMT-Ι之自然Bg1 ί I位置並延伸30個 鹽基對到mMT— I序列之中;22 * 4為2 1核苷之長 度並類似於h E.P0基因第一涸密碼子下游之h E P0序 列開始7 2 5鹽基對。這些引子被用於增幅一 1、4仟鹽 基對DNA片段,該片段包含上述之mMT — I與hEP 0序列的融合物。得到的Η段Μ Κ ρ η I進行切割(該P C R片段包含兩個Κ ρ η I位置:一位於m Μ Τ — I啟動 子區域之獨特自然Κρη I位置及位於hEPO序列中之 本纸張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(2〗0 X 297公釐) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 mum a7 _B7_ 五、發明說明(厂)
獨特自然之Κ Ρ η I位置),並加Κ純化。該質體ρ X Ε Ρ Ο I (圖3 )亦Μ Κ ρ η I進行切割,釋出一 1 ,4仟 鹽基對片段及a6 ‘ 4仟鹽基對片段。該6 * 4仟鹽基對 片段被純化之並被連接到1 · 4仟鹽基對Κ ρ η I P C R 融合物片段。該得到的構築體被稱為ρ Τ 2 2 * 1 。第二
個中間物,ρ Τ 2 2 * 2 ,係經由將h Ε Ρ 0结構基因( 見簧施例1 f )上游約6仟鹽基對之H i n d I I I — B a m Η I H段連接到Κ B a m Η I及H i n d I I I進行 切害!j 之 pBSIISK + (Stratagene > La Jo I i a ,CA)而加K構築。第三個中間體,pT2 2 · 3,係經由首先自含有新徽素磷酸轉移酶基因(ne 0 m y c in phosphotransferase gene)之 pMCINEOpolyA (St rat agene, ,LaJolla,CA)切出一 1*1 仟 鹽基對XhoI/BamHI片段。該片段隨即MDNA 聚合酶 I (New England Bio labs) 之K 1 e η o w片段處理而製成鈍端。該片段隨即被連接 到Ρ B S I I S K + ( K聚合醌I處理而製成相似的鈍端 )之H i nc I ί位置K產生pT22 * 3。第四個中間 物,ρ T 2 2 · 4,其製造係經由純化一 1 · 1仟鹽基對
Xho I/Hi ndl I I片段,其包括來自pT22 , 3的n e 〇基因且將此片段連接到Μ X h ο I及H i n d 1 I I進行切割之ρΤ22 · 2。ρΤ22 . 4因此包含 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)
經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 A7 B7 五、發明說明(外) 鄰近hEPO片段上游BamHI — Hindi I I之Η i ndl I I 端之 neo 基因。最後,dXEPO—13 係經由自pT22·1首先切出一2·0仟鹽基對Eco R ί/Acc I片段而加K產生ύ該片段之EcoRI位 置定義mMT — I啟動子的5'端序列,然而該片段之A cc I位置在hEP〇第5個exon。因此,theA c c I/E c o R I Η段包含幾乎完整的hEPO表現軍 位,僅失去一部份的第5個e X ο η及自然之多腺核苷化 位置。此2 * 0仟鹽基對E c 〇 R I / A c c I片段被纯 化,以大腸桿菌(E ♦ co丨i) DMA聚合酶之Ki e n ow片段處理而製成鈍端,並達接到KXh ο I進行 切割之鈍端之PT22+4。 HT 1 080细胞經由KPvu I— BamHI進行 切割之p X E P 0 — 1 3加Μ轉染。K此方式切割之p X Ε Ρ 0 — 1 3產生三個片段;一 1仟鹽基對載體片段,其 包括一部份之amp基因,一 1 · 7仟鹽基對片段之其他 載體序列及一約1 0仟鹽基對之片段,其包含h Ε P 0, n e o a n d m Μ T — I序列。此約1 0仟鹽基對之B a m Η I / P v u I片段在B a in Η I位製包含下列序列: 一約6 * 0仟鹽基對之上游hEPO基因體序列,1 * 1 仟鹽基對neo轉錄單位,0 ♦ 7仟鹽基對mMT — I啟 動子及2 · 0仟鹽基對之片段,其包含hEPO編碼區域 序列而在第5個e X ο η中截斷。以此方式切割之4 5 u -79- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先間讀背面之注意事項再填寫本頁)
2 nL Γ I n J,J· t· §· ·1 a— n n I 線一 402639 B7 五、發明說明(乃) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 g p EXPO — 1 3被用於1千2百萬细胞的電擊轉染中 (電擊轉染的條件敘述於實施例1 b )。該電擊轉染法總 共重複八次,使得總共有9千6百萬個细胞接受電擊轉染 作用。细胞與培養基混合得到每毫升1百萬個细胞之密度 且取其中1毫升分散於共96個150mm組織培養盤中 (Fa i con),每個包含至少35毫升之DMEM/ 1 5 %牛血清。隔天,抽出培養基並Μ新鮮含有〇 ♦ 8毫 克/毫升G418 (Gibco)的培養基替換。培養1 0天後,每一盤的培養基進行取樣針對hEPO作EL I SA分析(R&D系統)。96個盤中的6個包含至少1 0厘單位/毫升hE P0。這些盤的其中之一,編號第1 8號,被選擇來純化表現hEPO的選殖株。96個1 5 〇mm培養盤中每一個包含約60 ◦個G4 1 8抗藥性株 落(估計在全部96個盤中共有57,600個41 8抗 藥性株落)。在第18號盤中約600個株落以胰蛋白酶 處理脫落並以50细胞/毫升濃度附著於364孔盤中( S t e r ί 1 ί η )。培養一個星期以後,單一株落在每 一個3 64孔盤的大孔中約可観察到10個(這些盤在2 4個大孔中都有1 6個小孔)。每個孔在這次都進行h Ε P 0表現的篩檢。這些大孔中的兩個所含的培養基中至少 有2 0厘單位/毫升h Ε P 0。編號A 2的孔中發現分佈 在1 6個小孔中含有1 5個株落。每個這些小孔中的细胞 以胰蛋白醒處理脫落並轉移到一 9 6孔盤中1 6個獨立的 -8 0 * 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 Α7 Β7 五、發明說明(对)
孔中。進行培養後7天每個這些孔中的培養基進行取樣針 對hE P0作E L I SA分析。僅有一個孔’編號第1 〇 號,含由h E P 0。這個细胞株被命名為Η T 1 6 5 - :L 8A2— 10且被培養複製K供定量hEPO分析,RN A分離及DNA分離。hEPO生產量的定量測量得到一 測量值2,50 0毫單位/百萬细胞/24小時。
一 0,2仟鹽基對DNA探子自hEPCJ第5個ex ο η的A c c I位置延伸到3 '非轉譯區域之B g 1 I I 位置,且被用於探尋分離自HT 1 65— 1 8A2 - 1〇 细胞的RNA。該尋標構築體,pXEPO-13,在h £?0第5個6父〇11的六(3(11位置截斷,並不包含這 些Accl/BglII序列且,因此,針對在hEPO 基因位置上的尋標具有診斷性。只有與自然hEP◦序列 已經Μ相似性的方式發生重組作用之细胞才會產生含有與 Acc I/Bg 1 I I序列相似序列之hEPOmRNA CHT165-18A2-10被發現可K表現預期大小 的一 mRNA,其可Μ在北方墨漬结果中與32 — P標定 之Acc I/Bg丨I I hEPO探子發生雜交反應。限 制酶及Sout hernS墨漬分析確認neo基因及m MT— I啟動子被尋標而進人HT 1 65 — 1 8A2— 1 0细胞中兩個h E P0對偶基因中的一個。 這些结果顯示相似性重組作用可Μ用於尋標一調節區 域至一正常下在人類纖維母细胞中為不表現的基因中,使 -81-. 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) -------------------丨訂------—1 (請先閲讀背面之注音?事項再填寫本頁) 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 402638 = 五、發明說明(1) 得該基因被功能性地活化。
2 2 · 1 5 / CACCTAAAATGATCTCTC T G G ( S E Q ID N 0 14)
2 2-2 5, CGCGCCGGGTGACCACAC
CGGGGGCCCTAGATCTGGTGAAGCT GGAGCTACGGAGTAA (SEQ ID NO 1 5 )
22.3 TTACTCCGTAGCTCCAGC
TTCACCAGATCTAGGGCCCCCGGTG TGGTCACCCGGCGCG (SEQ ID NO 1 6 )
2 2-4 GTCTCAGC'GTGATATTCT C G G (SEQ ID NO 17) 實施例5 無intron基因之產生 基因尋標法亦可被用於產生一經加工的基因,其中i n t r 〇 n被去除,Μ供轉移到细菌或酵母菌中表現基因 及體外蛋白質的產生。例如,h G Η可Κ經由下列的研究 在酵母菌细胞中加以表現。 兩個分開的尋標構築體被加Κ製造。尋標構築體1 ( TC 1)包括一反轉錄病毒之LTR序列,例如來自Mo 1 〇 n e y Murine L e u k e m i a V ί r us (MoMLV)的LTR,一供在人類细胞中的蹄選 標記(例如,來自Τ η 5的n e 〇基因),一供在酵母菌 -82- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)
— — — — — — --- -----I .^^fr · A7 B7 五、發明說明(扔) 中的鋪選標記(例如,酵母菌U R A 3基因),一能搆指 揮基因在酵母菌中表規的調節性區域(例如,G A L 4啟 動子),及選擇性地,一當與h G Η基因融合時將允許h G Η由酵母菌细胞中分泌出去的序列(引導序列)。該載 體亦可以包含一允許反轉錄病毒在人類细胞中包裝(P a ckag ing)的DNA序列。該構築體被如ft統合, 使得上述序列被h G Η基因體序列包夾兩側,該h G Η基 因經由與h G Η基因Ν端序列發生之相似性重組將外源性 序列嵌入緊鄰hGH基因Ν端序列第一個密碼子(相關於 在成熟,經加工之蛋白質的第一個胺基酸位置)上游的T C 1 。在嵌入後D N A序列的順序為:h G Η上游及調節 性序列,neo基因,LTR,LTRA3基因,GAL4 啟勤子,酵母菌引導序列,包括成熟蛋白質第一個胺基酸 及其下游之hGH序列。尋標構築體2 (TC2)包括足 Μ供質體在酵母菌中複製的序列(例如,2 —微米環(2 — mi cron <311'(316)或八1^5序列),一酵 母菌轉錄終止序列,一病毒之L T R,及一供在人類细胞 中篩選的標記基因(例如,綑菌性g P t基因)。該構築 , 體被如此統合使得上述序列被h G Η基因體序列包夾兩側 ,該hGH基因經由與hGH基因Ν端序列發生之相似性 重組將外源性序列嵌入緊鄰h G Η基因N端序列終止密碼 子(相HI於在成熟,經加工之蛋白質的第一個.胺基酸位置 )下游的T C 2。在嵌人後D N A序列的順序為:h G Η 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS〉A4規格(210 χ 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)
訂----^------ 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 1 I 年^修正1補充 赠639五、發明說明(剜) e X ο π5序列,酵母菌轉錄終只序列,酵母菌質體複製 序列,LTR,gpt基因,hGH3<非轉錄序列。 來自TC1及TC2的線狀片段順序行嵌入hGH基 因兩側的相對位置。當Μ輔肋性反轉錄病毒重複感染(s uper infect ion)這些細胞後,LTR經由 此區域所指揮的轉錄作用將導致一 RNA在兩端具有L T R。此RNA的剪接將產生一種其中正常hGH i n t ron被移除的分子。該被加工的轉錄本之反轉錄作用將 造成經加工之h GH融合基因之雙股DNA拷貝的累積。 由該雙重尋標的反轉錄病毒性感染之綑胞中分雛出DNA ,並K一在該轉錄單位之L T R中切割一次之酵素加K切 割。該被切割的物質在促進環化反應的條件下進行黏接, 被送入酵母菌细胞中,且該细胞接著被曝露於針對URA 3基因所進行的篩選之下。只有採取URA3基因的细胞 (URA3連接於被TC1及TC2所送人的序列及該經 加工之hGH基因)能夠生長。這些细胞包含一將在半乳 糖的誘發下表現h GH蛋白質且在细胞中經由被融合之酵 母菌引導胜肽序列分泌出該hGH蛋白質的質體,酵母菌 引導胜肽序列在分泌時會被切除而產生一成熟,具生物活 性之h G Η分子。 在綑菌綑胞中的表現係伴隨著簡單地在T C 1及T C 2中,將來自UBR322之安比西林(amp i c i 1 i in) _抗藥性基因取代酵母菌URA3基因,將ta 一 8 4 _ 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) α 裝 tr---------龜 402639 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 Α7 Β7 五、發明說明(^^·)
c 啟動子’(deBoer 等人,Proc * Nat 1 · A cad*Sci *80:21-25 (1983))取代 酵母菌G A L 4啟動子,將一细菌性引導序列取代酵母菌 引導序列,將p B R 3 2 2複製來源取代2 —微米環(2 -micron circle)或ARS序列,且將一 细菌性轉錄终止序列(例如,t r pA轉錄終止者;Ch r·ίstie,G*E♦等人,Proc,Natl * A c a d * S c i *78:4180-4184 (1 9 8 1 ))取代酵母菌轉錄終止序列。類似的是,hEPO可M 在酵母菌中及细菌中表現,其經由簡單地將hGH尋標序 列K h E P 0尋標序列加K取代,使得酵母菌或细葡性引 導序列位於緊鄰hEPO第1個密碼子(相關於成熟經加 工之蛋白質中第一個胺基酸位置)上游的位置。 實施例6· ΕΡ0基因在一不死化人類细胞株中的 活化及增幅 將一 dhf r表現軍位嵌入ρΧΕΡΟ— 1 3中的唯 一 H i nd I I I位置(見實施例4)得到一新穎的尋標 載體,其能夠進行雙重篩選並篩選出其中d h f r基因被 增幅的细胞。在pXEP0—1 3中唯一的H i nd I I [位置定義n e o基因與自然在人類E P0基因上游的序 列之間的聯會處將一 d h f r基因置於此位置提供一具有 n e 〇基因及被衍生自自然E P0基因位置的DNA序列 所包圍之dhfr基因的構築體。如ρΧΕΡΟ— 13, -8 5 - 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) -----------裝--------訂--------- (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) A7 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 402639 _______B7 __ 五、發明說明(〇) 有利於經由相似性重組尋標至E P 0基因位置。如此之構 築體稱為d R E P 0 4,其被表現於圖8。該質體包含人 類E PO基因第1 一 4個exon s及部份之第5個ex on ’Μ及位於hEPO編碼區域上游之H i nd I I I —BamHl 片段。PSVe ,pTK 及 pmMT-I 相 關於來自S V 4 0早期區域,疱疹簡單病毒(H e r p e s Simplex Virus,HSV)胸腺核苦激 酶(TK)基因及老鼠 metal 1 o t h i ο n e i η _I基因。其製造如下.‘以Hindi I I切割之pXE P〇- 1 3被純化並以DNA聚合酶之K 1 enow片段 處理而製成鈍端•。為了得到dhfr表現單位,質體構 築體PF3CIS9080 (Eaton等人,Bioc h e m i s t r y 2 5: 8343-8347 (198 6) ) KEcoRi及Sal I進行切割。一含有d h f r表現覃位之2仟鹽基對片段由此切割中邡K純化並K D ΝΑ聚合籬之K 1 enow片段處理而製成鈍端。此含有 d h f r之片段隨即被連接到p X E P 0 — 1 3鈍頭的Η i n d ί I I位置。此連接反應之少量反應物以轉彫方式 送入大腸桿菌(Ε ♦ c ο 1 i )中並塗覆於安比西林(a m p i c i 1丨i η )篩選培養皿上。接著在3 7 °C培養 一整夜,觀察到個別的细菌菌落,挑選之並培養之。由者 些培養物中進行少量質體的製備且該得到的g D N A隨即 K 酵素 B g 1 I i + H i n d I I I ,及 S f ί I 進行限 -88- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 χ 297公釐)_ (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)
___^---:——:—— 五、發明說明(r/) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 制酶切割K決定***人d h f r片段的方向性。來自這些 製備物之一的質體DN A被發現包含該2 K b之***d h f r片段。在此質體中該011 f Γδ因的轉錄方向被發現 與鄰近的n e 〇基因相反°該構築體被命名為p RE Ρ0 4 ° 在内源性h E P 0基因經由相似性重組活化後,質體 p RE p〇4被用於在细胞中增幅h E P0基因位置。K 此構築體進行之基因活化使得可以·針對增加之D H F R表 現經由藥物甲睽基蝶呤(me t ho t r exa t e ,,Μ T X )的使用而加M篩選。典型地’增加之D H F R表現 應經由藉DNAif幅增加拷貝i[目而發生°淨结果為被活 化之EPO基因與dhfr基因同,時增幅。該活化之EP 0基因位置之同時增幅應咳導製E P 0表現量的增加。 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 尋標性試驗在HT1080细胞中KpREP04進 行。hEPO表現细胞系HTREP0 — 52因而被分離 出此綑胞系針對E P0的產量進行定量及經由S o u t h e r η氐墨潰法及北方墨潰法的分析。有兩個细胞株被發 琨只有翬一拷貝之f _dhf r / neo/mMT—1序列 加M尋標進入。在0*8毫克/毫升0418的條件下得 到的表現程度為1 3 0 0厘單位/百萬细胞/天。因為被 尋標之E P0基因位置包括一 d h f r表現單位,其有可 能Μ抗葉酸藥物,Μ T X,去篩選D H F R之增強性表現 。這些细胞株因次進行在0 ‘ 02,0 · 05,0 ♦ 1 , -87- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐) 402^39 a? B7 五、發明說明(si) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 〇. 2及〇 * 4/iMMTX中進行勺 株之大量培養的最初篩選结果險示於表4及圖7。 表4 m U / 百萬细胞/ 细 胞 系 Μ Τ X ( u Μ ) 2 I 4 h 5 2 C 2 0 — 5 — 0 0 1 3 68 5 2 C 2 0 — 5 — ♦ 0 1 0 . 0 1 1 7 4 4 5 2 C 2 0 — 5 — * 0 2 0 ' '0 2 11 6 4 3 5 2 C 2 0 — 5 — 0 • 0 5 0 ‘05 2 4 4 4 9 5 2 — 3 — 5 — 〇 t 1 0 0 - 1 3 7 0 19 5 2 — 3 — 2 — 0 ♦ 2 0 0 2 6 7 8 6 7 5 2 — 3 — 2 — 0 ♦ 4 B 0 < 4 9 9 9 19 K 昇 高 之 Μ Τ X 濃 度進 行之 篩選在 细 胞系Η [T R E P 0 — 5 2 中 成 功 找 到 增 強之 Ε Ρ 0表琨 9 其在可抵抗0 ♦ 4 U Μ Μ Τ X 的 细 胞 系 中觀 察到 Ε P 0 產 量7 0 •倍的增 強 對 於 Ε Ρ 0 基 因 位 置 之 增幅 可Κ 經由在 Μ Τ X抗藥性细 胞 糸 中 進 行 S 〇 U t h e r η 氐墨 漬法分 析 而完全予Μ確 認 0 其 相 對 於 親 代 ( 未 尋 標) h E P 0對 偶 基因, 顯示被 活 化 h Ε Ρ 0 基 因 位 置 之 拷貝 數目 約增強 1 0倍。 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 -88- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210 X 297公釐)

Claims (1)

  1. A8 申請專利範圍 1.—種改變細胞內一被尋標基因表現之方法,該方法係 包含下列步驟: (a) 提供一細胞,其基因組包含: ⑴具有內源性調節區域之被尋標基因; (ii) —標的位置; (b) 提供一 DNA構築體,其包含: ⑴一同源於標的位置之尋標序列; (Π)—外源性調節序列;. (iii) 一表現體(exon); (iv) —個編碼可增幅標記之序列,其使得可選擇含有多 拷貝數目之編碼該可增幅標記的序列之細胞;及 (v) 該表現體(exon)的3’端之一不成對剪切提供者位 置, (c) 以DNA構築體轉染該細胞,藉此產生一轉染細胞; 經濟部智1財產局員工消費合作社印製 (d) 將該轉染細胞保持於適合進行同源性重組作用的環 境之下,藉此產生一同源性重組細胞,該同源性重組細胞之 基因組包括除了被尋標基因之所有表現體外,還含有外源性 調節序列,該構築體衍生之表現體(exon)、以及該構築體衍 生之剪切提供者位置, (e) 在可選擇含有多拷貝數目之編碼該可增幅標記的序 列之細胞的條件下,培養該同源性重組細胞;及‘ (f) 將該同源性重組細胞保持在適當於外源性調節序列 的轉錄控制的狀況之下,以便產生該構築體衍生之表現體 (exon)的轉錄本(transcript)、該被尋標基因、以及任何位於 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS ) A4規格(210 X 297公釐)
    A8 申請專利範圍 1.—種改變細胞內一被尋標基因表現之方法,該方法係 包含下列步驟: (a) 提供一細胞,其基因組包含: ⑴具有內源性調節區域之被尋標基因; (ii) —標的位置; (b) 提供一 DNA構築體,其包含: ⑴一同源於標的位置之尋標序列; (Π)—外源性調節序列;. (iii) 一表現體(exon); (iv) —個編碼可增幅標記之序列,其使得可選擇含有多 拷貝數目之編碼該可增幅標記的序列之細胞;及 (v) 該表現體(exon)的3’端之一不成對剪切提供者位 置, (c) 以DNA構築體轉染該細胞,藉此產生一轉染細胞; 經濟部智1財產局員工消費合作社印製 (d) 將該轉染細胞保持於適合進行同源性重組作用的環 境之下,藉此產生一同源性重組細胞,該同源性重組細胞之 基因組包括除了被尋標基因之所有表現體外,還含有外源性 調節序列,該構築體衍生之表現體(exon)、以及該構築體衍 生之剪切提供者位置, (e) 在可選擇含有多拷貝數目之編碼該可增幅標記的序 列之細胞的條件下,培養該同源性重組細胞;及‘ (f) 將該同源性重組細胞保持在適當於外源性調節序列 的轉錄控制的狀況之下,以便產生該構築體衍生之表現體 (exon)的轉錄本(transcript)、該被尋標基因、以及任何位於 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS ) A4規格(210 X 297公釐) A8 402639 B8s D8 六、申請專利範圍 該構築體衍生之表現體(exon)以及該被尋標基因間的序 列,其中對應於構築體衍生之剪切提供者位置之轉錄本 RNA會引導剪切作用於相當於標的基因內位置之轉錄本上 的剪切接受者位置。 2. 如申請專利範圍第1項之方法,其中該可增幅標記係 選自二氫葉酸還原酶,腺核苷去胺酶及三官能性酶胺甲醯基 磷酸合成酶-天門冬胺酸轉氨甲醯酶-二氫乳淸酸酶(CAD) 所組成之族群中。 3. 如申請專利範圍第1項之方法,其中該細胞之來源爲 人類。 4. 如审請專利範圍第1項之方法,其中該細胞之來源爲 初級或二級細胞。 5. 如申請專利範圍第1項之方法,其中該細胞爲π死化‘ 細胞。 6. 如申請專利範圍第1項之方法,其中該細胞爲不死化 人類細胞。 7. 如申請專利範圍第1項之方法’其中該細胞係選自下 列組成之一 :ΗΤ1080細胞、HeLa細胞、MCF-7乳癌細胞、 K-562白血病細胞、KB腫瘤細胞、2780AD卵巢腫瘤細胞、 Raji 細胞、Jurkat 細胞、Namalwa 細胞、HL-60 細胞、Daudi 細胞、RPMI8226細胞以及MOLT-4細胞,中ΐΐ大鼠卵巢 (CHO)細胞及鼠L細胞。 8. 如申請專利範圍第1項之方法’其中該轉錄本之剪切 接受者位置,係相對應於該被尋標基因的第二表現體(exon) _2___ 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS ) A4規格(2〖〇Χ297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再_本頁) -裝' 泉 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 403639 Β8 D8 六、申請專利範圍 之剪切接受者位置。 9.如申請專利範圍第1項之方法,其中該構築體衍生之 表現體(exon)係包含一 CAP位置。 1〇_如申請專利範圍第9項之方法,其中該構築體衍生 之表現體(exon)係包含核苷酸序列ATG。 Π.如申請專利範圍第1項之方法,其中在同源性重組 細胞中,b(ii)-(v)係位於該被尋標基因的內源性調節區域的 上游。 12. 如申請專利範圍第1項之方法,其中該DNA構築體 進一步包含一第二尋標序列,其係與被尋標基因的內源性調 節序列上游之序列同源。 13. 如申請專利範圍第1項之方法,其中該被尋標基因 係編碼一治療性蛋白質。 14. 如申請專利範圍第1項之方法,其中該被尋標基因 係編碼一激素、細胞激素、抗原、抗體、酵素、凝血因子、 運輸蛋白質、受體、調節性蛋白質、結構性蛋白、或轉錄因 子。. 15. 如申請專利範圍第1項之方法’其中該被尋標基因 所編碼之蛋白質係選自下列組成之一者:降血躬素、胰島 素、胰島素調節素、類胰島素的生長因子類、副甲狀腺激素、 神經生長因子、白血球間質素、免疫球蛋白、催也性抗體、 過氧化物歧異酶、組織凝血酶原活化劑、血液凝集因子 VIII、脫輔基脂蛋白E、脫輔基脂蛋白A-1、血球蛋白、低 密度脂蛋白受體、IL-2受體、IL-2受體掊抗劑、alpha-1抗 本紙張尺度適用中國國) 2Η)Χ297公釐) (請先閱讀背面之注意事項再^^本頁) -裝· 訂 經滴部智慧財產局員工消費合作社印製 A8 Βδ C8 D8 4036¾9 申請專利範圍 胰蛋白酶、以及免疫反應修飾劑。 16. 如申請專利範圍第1項之方法,其中該被尋標基因 係編碼生長激素。 17. 如申請專利範圍第1項之方法’其中該被尋標基因 係編碼一干擾素。 18. 如申請專利範圍第1項之方法,其中該被尋標基因 係編碼血液凝集因子IX。 19. 如申請專利範圍第1項之方法’其中該被尋標基因 係編碼葡萄糖腦苷脂酶。 20. 如申請專利範圍第1項之方法,其中該被尋標基因 係編碼一集落生成刺激因子。 21. 如申請專利範圍第1項之方法,其中該被尋標基因 係編碼紅血球生成素。 22. 如申請專利範圍第21項之方法,其中該構築體衍生 之表現體(exon)係包含一編碼序列,其與紅血球生成素的第 —表現體(exon)的編碼序列相同。 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 23. 如申請專利範圍第21項之方法’其中該構築體衍生 之表現體(exon)係包含一編碼序列,其與紅血球生成素的第 一表現體(exon)的編碼序列不同。 24. 如申請專利範圍第21項之方法,其中該構築體衍生 之表現體(exon)係包含一編碼序列,其與人類生萇激素的第 一表現體(exon)的編碼序列相同。 25. 如申請專利範圍第1項之方法’其中該外源性調節 序列爲一啓動子、促進子、骨架連接區域(scaffold-attachment 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS ) A4規格(210X297公釐) _i〇S639 __ 六、申請專利範圍 region)、或者一轉錄因子結合位置。 26. 如申請專利範圍第25項之方法,其中該DNA構築 體進一步包含一第二調節序列。 27. 如申請專利範圍第25項之方法,其中該外源性調節 序列爲一SV-40基因之調節序列、細胞巨大病毒基因之調 節序列、一老鼠金屬硫肽-I基因之調節序列。 28. 如申請專利範圍第1項之方法,其進一步包含下列 步驟: (g) 將該同源性重組細胞保持在適當於該轉錄本剪切以 及轉譯的條件之下;以及 (h) 確認該轉錄本的轉譯產物已被產生。 29. 如申請專利範圍第28項之方法,其中該被尋標基因 係編碼紅血球生成素。 經濟部智慧財產局員工消費合作社印製 一適 I張 紙 準 標 家 釐 公 7 9 2
TW082110126A 1992-12-03 1993-11-30 Protein production and protein delivery TW402639B (en)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US98558692A 1992-12-03 1992-12-03

Publications (1)

Publication Number Publication Date
TW402639B true TW402639B (en) 2000-08-21

Family

ID=25531613

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
TW082110126A TW402639B (en) 1992-12-03 1993-11-30 Protein production and protein delivery

Country Status (15)

Country Link
EP (1) EP0672160B8 (zh)
JP (2) JPH08503856A (zh)
KR (1) KR100364916B1 (zh)
AT (1) ATE477327T1 (zh)
AU (1) AU689455B2 (zh)
CA (1) CA2151032A1 (zh)
DE (1) DE69334340D1 (zh)
DK (1) DK0672160T3 (zh)
IL (1) IL107822A (zh)
MX (1) MX9307623A (zh)
MY (1) MY140230A (zh)
NZ (3) NZ259165A (zh)
SG (1) SG46476A1 (zh)
TW (1) TW402639B (zh)
WO (1) WO1994012650A2 (zh)

Families Citing this family (171)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6270989B1 (en) 1991-11-05 2001-08-07 Transkaryotic Therapies, Inc. Protein production and delivery
US5641670A (en) * 1991-11-05 1997-06-24 Transkaryotic Therapies, Inc. Protein production and protein delivery
US5968502A (en) * 1991-11-05 1999-10-19 Transkaryotic Therapies, Inc. Protein production and protein delivery
US5792751A (en) * 1992-04-13 1998-08-11 Baylor College Of Medicine Tranformation of cells associated with fluid spaces
CA2177959C (en) * 1993-12-23 2007-02-13 Gregory Franklin Hollis Homologous recombination antibody expression system for murine cells
US6130071A (en) * 1997-02-05 2000-10-10 Helsinki University Licensing, Ltd. Vascular endothelial growth factor C (VEGF-C) ΔCys156 protein and gene, and uses thereof
US6645933B1 (en) 1995-08-01 2003-11-11 Helsinki University Licensing Ltd. Oy Receptor ligand VEGF-C
US6818220B1 (en) 1994-11-14 2004-11-16 Licentia Ltd. Vascular endothelial growth factor C (VEGF-C) protein and gene mutants thereof, and uses thereof
US6498015B1 (en) 1995-06-07 2002-12-24 Icos Corporation Methods of identifying agents that modulate the binding between MDC and an MDC receptor
US7018627B1 (en) 1995-06-07 2006-03-28 Icos Corporation Macrophage derived chemokine (MDC), MDC analogs, MDC inhibitor substances, and uses thereof
US6737513B1 (en) 1996-06-07 2004-05-18 Icos Corporation Macrophage derived chemokine (MDC) and chemokine analogs and assay to identify modulators of MDC activity, and therapeutic uses for same
US6361946B1 (en) 1997-02-05 2002-03-26 Licentia Ltd Vascular endothelial growth factor C (VEGF-C) protein and gene, mutants thereof, and uses thereof
US7423125B2 (en) 1995-08-01 2008-09-09 Vegenics Limited Antibodies to VEGF-C
US6419920B1 (en) 1995-10-25 2002-07-16 Trans Karyotic Therapies, Inc. Hybrid matrix implants and explants
US5965125A (en) 1995-10-25 1999-10-12 Transkaryotic Therapies, Inc. Hybrid matrix implants and explants
US7888466B2 (en) 1996-01-11 2011-02-15 Human Genome Sciences, Inc. Human G-protein chemokine receptor HSATU68
US5989914A (en) * 1996-06-03 1999-11-23 Universite Laval Integration cassette for improvement of transgenesis in eukaryotes
ATE552341T1 (de) 1996-10-01 2012-04-15 Geron Corp Katalytische untereinheit der menschlichen telomerase
JP4771563B2 (ja) 1996-12-06 2011-09-14 アムジエン・インコーポレーテツド Il−1媒介疾患を処置するためにil−1インヒビターを使用する組合せ療法
US7125714B2 (en) 1997-02-05 2006-10-24 Licentia Ltd. Progenitor cell materials and methods
WO1998049350A1 (en) * 1997-04-30 1998-11-05 Regents Of The University Of Minnesota In vivo use of recombinagenic oligonucleobases to correct genetic lesions in hepatocytes
US5888809A (en) * 1997-05-01 1999-03-30 Icos Corporation Hamster EF-1α transcriptional regulatory DNA
US6172211B1 (en) 1997-07-11 2001-01-09 Boehringer Ingelheim International Gmbh Nucleic acid encoding tag7 polypeptide
DE59813913D1 (de) * 1997-07-23 2007-04-05 Roche Diagnostics Gmbh Identifizierung humaner zellinien zur produktion humaner proteine durch endogene genaktivierung
KR100622203B1 (ko) 1997-07-23 2006-09-07 로셰 디아그노스틱스 게엠베하 내인성 유전자 활성화에 의해 사람 단백질을 생성시키는 사람 세포주를 확인하는 방법
JP2001511341A (ja) * 1997-07-23 2001-08-14 ロシュ ダイアグノスティックス ゲーエムベーハー ヒト細胞におけるヒト変異型タンパク質の相同的組換えによる生産
AU776280B2 (en) * 1997-07-23 2004-09-02 Roche Diagnostics Gmbh Production of erythropoietin by endogenous gene activation
EP0986644B1 (de) * 1997-07-23 2006-10-04 Boehringer Mannheim GmbH Herstellung von erythropoietin durch endogene genaktivierung mit viralen promotoren
US6548296B1 (en) 1997-07-23 2003-04-15 Roche Diagnostics Gmbh Methods for identifying human cell lines useful for endogenous gene activation, isolated human lines identified thereby, and uses thereof
PT986644E (pt) 1997-07-23 2007-01-31 Roche Diagnostics Gmbh Preparação de eritropoietina por activação genética endógena com promotores virais
US6897066B1 (en) 1997-09-26 2005-05-24 Athersys, Inc. Compositions and methods for non-targeted activation of endogenous genes
US7316923B1 (en) 1997-09-26 2008-01-08 Athersys, Inc. Compositions and methods for non-targeted activation of endogenous genes
US5932465A (en) * 1997-10-16 1999-08-03 Icos Corporation Phosphodiesterase 8A
KR20010031713A (ko) 1997-11-03 2001-04-16 벤슨 로버트 에이치. 맥관형성 및 종양 성장 억제제인 맥관 내피 세포 성장억제제
AU757930B2 (en) * 1997-12-01 2003-03-13 Roche Diagnostics Gmbh Optimization of cells for endogenous gene activation
WO1999028346A1 (de) 1997-12-03 1999-06-10 Roche Diagnostics Gmbh Erythropoietin mit hoher spezifischer aktivität
ATE331791T1 (de) 1998-02-23 2006-07-15 Icos Corp Phosphodiesterase 10
WO1999044625A1 (en) 1998-03-03 1999-09-10 John Hopkins University Smallpox inhibitor of complement enzymes (spice) protein and methods of inhibiting complement activation
US6479256B1 (en) 1998-03-04 2002-11-12 Icos Corporation Lectomedin materials and methods
US6200951B1 (en) 1998-03-12 2001-03-13 Icos Corporation Chitinase chitin-binding fragments
EP1093457B8 (en) 1998-03-19 2011-02-02 Human Genome Sciences, Inc. Cytokine receptor common gamma chain like
US6541623B1 (en) 1998-04-03 2003-04-01 Hyseq, Inc. Interleukin—1 receptor antagonist and uses thereof
US6426191B1 (en) 1998-04-03 2002-07-30 Hyseq, Inc. Assays involving an IL-1 receptor antagonist
US6294655B1 (en) 1998-04-03 2001-09-25 Hyseq, Inc. Anti-interleukin-1 receptor antagonist antibodies and uses thereof
US6337072B1 (en) 1998-04-03 2002-01-08 Hyseq, Inc. Interleukin-1 receptor antagonist and recombinant production thereof
US6071691A (en) * 1998-04-27 2000-06-06 Oregon Health Science University Materials and methods for modulating differentiation
US6492138B1 (en) 1998-05-21 2002-12-10 Amgen Canada Inc. Polynucleotides encoding a novel SHC-binding protein
US6387645B1 (en) 1998-07-16 2002-05-14 Hyseq, Inc. Methods and materials relating to novel CD39-like polypeptides
US6447771B1 (en) 1999-03-19 2002-09-10 Hyseq, Inc. Methods and materials relating to novel CD39-like polypeptides
US6476211B1 (en) 1998-07-16 2002-11-05 Hyseq, Inc. Methods and materials relating to CD39-like polypeptides
JP2002520040A (ja) 1998-07-16 2002-07-09 ハイセック,インコーポレーテッド 新規cd39様ポリペプチドに関する方法および材料
DE19857609A1 (de) 1998-12-14 2000-06-15 Hannelore Ehrenreich Verwendung von Erythropoietin zur Behandlung von cerebralen Ischämien des Menschen
WO2000038536A2 (en) 1998-12-23 2000-07-06 Mount Sinai School Of Medicine Of New York University Inhibitors of the bitter taste response
US6780977B1 (en) 1999-01-29 2004-08-24 Nuvelo, Inc. Methods and compositions relating to CD39-like polypeptides and nucleic acids
US6899875B1 (en) 1999-01-29 2005-05-31 Nuvelo, Inc. Methods and compositions relating to CD39-like polypeptides and nucleic acids
US6350447B1 (en) 1999-01-29 2002-02-26 Hyseq, Inc. Methods and compositions relating to CD39-like polypeptides and nucleic acids
WO2000049162A2 (en) * 1999-02-19 2000-08-24 Athersys, Inc. Compositions and methods for non-targeted activation of endogenous genes
WO2000050620A2 (en) 1999-02-26 2000-08-31 Human Genome Sciences, Inc. Human endokine alpha and methods of use
US6335013B1 (en) 1999-03-19 2002-01-01 Hyseq, Inc. Methods and materials relating to CD39-like polypeptides
AU779689B2 (en) 1999-06-16 2005-02-03 Icos Corporation Human poly(ADP-ribose) polymerase 2 materials and methods
US6632665B1 (en) 1999-08-09 2003-10-14 Wake Forest University Human gene encoding 3′-5′ exonuclease
ES2316354T3 (es) 1999-09-29 2009-04-16 The General Hospital Corporation Derivados polipeptidos de la hormona paratiroidea (pth).
US6344549B1 (en) 1999-10-14 2002-02-05 Icos Corporation ATR-2 cell cycle checkpoint
WO2001031005A2 (en) 1999-10-22 2001-05-03 Pharmacia & Upjohn Company Drosophila g protein coupled receptors, nucleic acids, and methods related to the same
US7314716B2 (en) 1999-11-19 2008-01-01 Mount Sinai School Of Medicine Gustducin γ subunit materials and methods
AU1647501A (en) 1999-12-10 2001-06-18 Cytos Biotechnology Ag Replicon based activation of endogenous genes
US6465620B1 (en) 2000-01-21 2002-10-15 Hyseq, Inc. Methods and materials relating to novel von Willebrand/Thrombospondin-like polypeptides and polynucleotides
US6586390B1 (en) 2000-01-21 2003-07-01 Hyseq, Inc. Methods and materials relating to novel prothrombinase-like polypeptides and polynucleotides
US6635742B1 (en) 2000-01-25 2003-10-21 Nuvelo, Inc. Antibodies specific for semaphorin-like polypeptides
US20030084471A1 (en) 2000-03-16 2003-05-01 David Beach Methods and compositions for RNA interference
EP1728862A1 (en) 2000-03-16 2006-12-06 Genetica, Inc. Methods and compositions for RNA interference
AU2001259063A1 (en) 2000-04-12 2001-10-30 Human Genome Sciences, Inc. Albumin fusion proteins
US6734005B2 (en) 2000-05-22 2004-05-11 Pharmacia & Upjohn Company Matrix metalloproteinases
US7259146B2 (en) 2000-05-26 2007-08-21 Ortho-Mcneil Pharmaceutical, Inc. Neuroprotective peptides
AU2001282856A1 (en) 2000-06-15 2001-12-24 Human Genome Sciences, Inc. Human tumor necrosis factor delta and epsilon
WO2002002639A2 (en) 2000-07-05 2002-01-10 Pharmacia & Upjohn Company Human ion channels
GB0018876D0 (en) 2000-08-01 2000-09-20 Applied Research Systems Method of producing polypeptides
IL154596A0 (en) 2000-08-25 2003-09-17 Basf Plant Science Gmbh Plant polynucleotides encoding novel prenyl proteases
US6787684B2 (en) 2000-10-16 2004-09-07 E. & J. Gallo Winery Lipoxygenase genes from Vitis vinifera
WO2002049673A2 (en) 2000-12-20 2002-06-27 F. Hoffmann-La Roche Ag Conjugates of erythropoietin (pep) with polyethylene glycol (peg)
PT1471871E (pt) 2001-02-02 2007-06-05 Ortho Mcneil Pharm Inc Tratamento de disfunção neurológica compreendendo sulfamatos de frutopiranose e eritropoietina
AU2002250032B2 (en) 2001-02-09 2008-06-05 Human Genome Sciences, Inc. Human G-protein chemokine receptor (CCR5) HDGNR10
DK1385864T3 (da) 2001-04-13 2010-08-16 Human Genome Sciences Inc Anti-VEGF-2-antistoffer
US7803982B2 (en) 2001-04-20 2010-09-28 The Mount Sinai School Of Medicine Of New York University T1R3 transgenic animals, cells and related methods
US6818613B2 (en) 2001-11-07 2004-11-16 Ortho-Mcneil Pharmaceutical, Inc. Aqueous sustained-release formulations of proteins
NZ532988A (en) 2001-11-28 2008-04-30 Ortho Mcneil Pharm Inc Erythropoietin dosing regimen for treating anemia
EP1463751B1 (en) 2001-12-21 2013-05-22 Human Genome Sciences, Inc. Albumin fusion proteins
US20080194481A1 (en) 2001-12-21 2008-08-14 Human Genome Sciences, Inc. Albumin Fusion Proteins
GB0200977D0 (en) * 2002-01-17 2002-03-06 Lonza Biologics Plc Glutamine-auxotrophic human cells capable of producing proteins and capable of growing in a glutamine-free medium
WO2003054172A2 (en) 2002-01-17 2003-07-03 Lonza Biologics Plc. Glutamine-auxothrophic human cells capable of producing proteins and capable of growing in a glutamine-free medium
EP1471928A1 (en) 2002-02-07 2004-11-03 Delta Biotechnology Limited Hiv inhibiting proteins
US7129267B2 (en) 2002-03-11 2006-10-31 Janssen Pharmaceutica N.V. Methods for SHP1 mediated neuroprotection
US7563882B2 (en) 2002-06-10 2009-07-21 University Of Rochester Polynucleotides encoding antibodies that bind to the C35 polypeptide
AU2003254016A1 (en) 2002-07-19 2004-02-09 Catholic Healthcare West Methods and compositions relating to chimeric nicotinic receptor subunits
US7459435B2 (en) 2002-08-29 2008-12-02 Hoffmann-La Roche Inc. Treatment of disturbances of iron distribution
US7459436B2 (en) 2002-11-22 2008-12-02 Hoffmann-La Roche Inc. Treatment of disturbances of iron distribution
CA2513251C (en) 2003-01-14 2013-03-19 Dana-Farber Cancer Institute Cancer therapy sensitizer
US8021833B2 (en) 2003-02-12 2011-09-20 Functional Genetics, Inc. Method for reducing HIV viral budding by administering a VPS28-specfic antibody that disrupts Gag-TSG101-VPS28 binding interactions
EP1639005B1 (en) 2003-06-27 2017-05-03 Monell Chemical Senses Center Taste receptors of the t1r family from domestic cat
US7541158B2 (en) 2004-04-14 2009-06-02 Monell Chemical Senses Center Taste receptors of the T1R family from domestic dog
BRPI0508928B1 (pt) 2004-04-23 2015-10-06 Pah P & U Llc Processo de falicitação da infecção de uma célula de vertebrado por PRRSV e para medir a propensão de uma linhagem de células teste à referida infecção
US7597884B2 (en) 2004-08-09 2009-10-06 Alios Biopharma, Inc. Hyperglycosylated polypeptide variants and methods of use
EP2298897B1 (en) 2004-09-02 2013-08-14 Yale University Regulation of oncogenes by microRNAs
WO2006066064A2 (en) 2004-12-13 2006-06-22 Monell Chemical Senses Center A voltage-gated, ph-sensitive anion channel and its novel splice variant involved in taste sensation
US8354384B2 (en) 2005-06-23 2013-01-15 Yale University Anti-aging micrornas
CA2626082C (en) 2005-10-13 2017-04-11 Human Genome Sciences, Inc. Methods and compositions for use in treatment of patients with autoantibody positive disease
AU2006311827A1 (en) 2005-11-03 2007-05-18 Redpoint Bio Corporation High throughput screening assay for the TRPM5 ion channel
DE102006004008A1 (de) 2006-01-27 2007-08-02 Hannelore Prof. Dr. Dr. Ehrenreich Verfahren zur Behandlung und/oder Prophylaxe von Multipler Sklerose, sowie Verwendung von Erythropoietin zur Herstellung eines Arzneimittels zur intermittierenden Behandlung und/oder intermittierenden Prophylaxe von Multipler Sklerose
CN101062407A (zh) 2006-04-29 2007-10-31 中国科学院上海生命科学研究院 ***在预防或治疗视网膜损伤中的用途
US7572618B2 (en) 2006-06-30 2009-08-11 Bristol-Myers Squibb Company Polynucleotides encoding novel PCSK9 variants
WO2008013861A2 (en) 2006-07-27 2008-01-31 Redpoint Bio Corporation Screening assay for inhibitors of trpa1 activation by a lower alkyl phenol
JP5256199B2 (ja) 2006-08-07 2013-08-07 テヴァ バイオファーマシューティカルズ ユーエスエー,インコーポレーティッド アルブミン−インスリン融合タンパク質
EP1900749A1 (en) 2006-09-12 2008-03-19 Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale (Inserm) Nucleic acids for expressing a polynucleotide of interest in mammalian cancer cells
WO2008114673A1 (ja) 2007-03-15 2008-09-25 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha ポリペプチドの製造方法
AU2008251467B2 (en) 2007-05-11 2014-07-31 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Methods of treatment of skin ulcers
KR101690390B1 (ko) 2007-05-11 2016-12-27 토마스 제퍼슨 유니버시티 신경변성 질환 및 장애의 치료 및 예방 방법
ES2466916T3 (es) 2007-06-27 2014-06-11 Admune Therapeutics Llc Complejos de IL-15 e IL-15R alfa y usos de los mismos
AR067537A1 (es) 2007-07-17 2009-10-14 Hoffmann La Roche Purificacion de polipeptidos pegilados
AR067536A1 (es) 2007-07-17 2009-10-14 Hoffmann La Roche Metodo para obtener una eritropoyetina mono-pegilada en una forma sustancialmente homogenea
WO2009010107A1 (en) 2007-07-19 2009-01-22 Hannelore Ehrenreich Use of epo receptor activation or stimulation for the improvement of the edss score in patients with multiple sclerosis
CA2694476C (en) 2007-07-27 2017-06-27 Universiteit Gent Permissive cells and uses thereof
MX353986B (es) 2007-08-01 2017-11-06 Massachusetts Gen Hospital Metodos de analisis y seleccion usando receptores acoplados a proteina g y composiciones relacionadas.
CN101809161B (zh) 2007-08-07 2014-03-12 中外制药株式会社 异种蛋白的制备方法
JP5337043B2 (ja) 2007-10-15 2013-11-06 中外製薬株式会社 異種タンパク質を高生産する細胞の作製方法
CN101821403B (zh) 2007-10-24 2014-01-01 中外制药株式会社 用于异种蛋白制备的细胞及使用所述细胞的制备方法
SG188143A1 (en) 2008-02-08 2013-03-28 Ambrx Inc Modified leptin polypeptides and their uses
GB0803076D0 (en) 2008-02-20 2008-03-26 Univ Ghent Mucosal Membrane Receptor and uses thereof
PL2342223T3 (pl) 2008-09-26 2017-09-29 Ambrx, Inc. Zmodyfikowane polipeptydy zwierzęcej erytropoetyny i ich zastosowania
US8110185B2 (en) 2008-10-03 2012-02-07 St. Michael's Hospital Method for preventing and treating cardiovascular diseases with BRCA1
US20120015841A1 (en) 2009-02-02 2012-01-19 Chromocell Corporation Novel cell lines and methods
JP5715050B2 (ja) 2009-04-22 2015-05-07 中外製薬株式会社 異種タンパク質を高生産する細胞の作製方法
EP2460006A2 (en) 2009-07-31 2012-06-06 Chromocell Corporation Methods and compositions for identifying and validating modulators of cell fate
US20120131701A1 (en) 2009-08-05 2012-05-24 Chromocell Corporation Improved plants, microbes, and organisms
US8840889B2 (en) 2009-08-13 2014-09-23 The Johns Hopkins University Methods of modulating immune function
US8883739B2 (en) 2010-01-19 2014-11-11 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Osteocalcin as a treatment for male reproductive disorders
MX358161B (es) 2010-05-13 2018-08-06 The General Hospital Corp Star Analogos de hormona paratiroidea y usos para los mismos.
SI2616101T1 (sl) 2010-09-14 2014-10-30 F. Hoffmann-La Roche Ag Postopek za čiščenje pegiliranega eritropoetina
JP5918697B2 (ja) 2010-10-15 2016-05-18 Jcrファーマ株式会社 糖鎖の非還元末端がマンノース残基である糖蛋白質の製造方法
WO2012101671A1 (en) 2011-01-25 2012-08-02 Jcr Pharmaceuticals Co., Ltd. Method for production of human recombinant iduronate 2-sulfatase
CN103443123B (zh) 2011-02-07 2020-05-29 塞勒尼斯医疗控股公司 脂蛋白复合物及其制备和用途
ES2676878T3 (es) 2011-03-03 2018-07-25 Zymeworks Inc. Diseño de armazón de heteromultímero multivalente y constructos
TWI674272B (zh) 2011-04-01 2019-10-11 中外製藥股份有限公司 具有apes活性的核酸分子
WO2013003697A1 (en) 2011-06-30 2013-01-03 Trustees Of Boston University Method for controlling tumor growth, angiogenesis and metastasis using immunoglobulin containing and proline rich receptor-1 (igpr-1)
WO2013009971A1 (en) 2011-07-12 2013-01-17 E. I. Du Pont De Nemours And Company Detection and screening method and materials useful in performance thereof
WO2013020044A1 (en) 2011-08-03 2013-02-07 The Charlotte-Mecklenburg Hospital Authority D/B/A Carolinas Medical Center Treatment of fibrosis using microrna-19b
WO2014012082A2 (en) 2012-07-13 2014-01-16 Zymeworks Inc. Multivalent heteromultimer scaffold design an constructs
WO2014016873A1 (en) 2012-07-26 2014-01-30 Jcr Pharmaceuticals Co., Ltd. Method for production of recombinant human alpha-galactosidase a
SG11201502801RA (en) 2012-10-10 2015-06-29 Chugai Pharmaceutical Co Ltd Method for establishing modified host cell
EP2911684B1 (en) 2012-10-24 2019-06-19 Novartis Ag Il-15r alpha forms, cells expressing il-15r alpha forms, and therapeutic uses of il-15r alpha and il-15/il-15r alpha complexes
WO2014152497A2 (en) 2013-03-15 2014-09-25 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Osteocalcin as a treatment for cognitive disorders
EP2970420A4 (en) 2013-03-15 2016-08-17 Apotex Inc STABILITY OF THE ENHANCED LIQUID FORMULATION OF ERYTHROPOIETIN ALPHA VIA A PURIFICATION TREATMENT
AU2014262566A1 (en) 2013-05-08 2015-11-12 Zymeworks Inc. Bispecific HER2 and HER3 antigen binding constructs
ES2811974T3 (es) 2014-07-29 2021-03-15 Novartis Ag Regímenes de aumento escalonado de la dosis del heterodímero de il-15 e il-15ralfa para tratar afecciones
KR102617137B1 (ko) 2014-09-15 2023-12-27 칠드런'즈 메디컬 센터 코포레이션 히스톤 h3-리신 트리메틸화를 제거함으로써 체세포 핵 이식(scnt) 효율을 증가시키는 방법 및 조성물
JP2017531632A (ja) 2014-09-29 2017-10-26 アレクシオン ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド ムコ多糖症iiib型(mpsiiib)を治療する方法
EP3226889A4 (en) 2014-11-19 2018-11-21 The Trustees of Columbia University in the City of New York Osteocalcin as a treatment for frailty associated with aging
CA2874083C (en) 2014-12-05 2024-01-02 Universite Laval Tdp-43-binding polypeptides useful for the treatment of neurodegenerative diseases
WO2016116966A1 (en) 2015-01-22 2016-07-28 Jcr Pharmaceuticals Co., Ltd. Method for purification of recombinant human alpha-galactosidase a from material containing contaminant host cell proteins
ES2841648T3 (es) 2016-07-15 2021-07-08 Hoffmann La Roche Procedimiento para purificar eritropoyetina PEGilada
US20200237874A1 (en) 2017-01-20 2020-07-30 Novartis Ag Combination therapy for the treatment of cancer
CN110177568A (zh) 2017-01-20 2019-08-27 诺华股份有限公司 用于治疗癌症的组合疗法
EP3731871B1 (en) 2017-12-29 2023-10-04 F. Hoffmann-La Roche AG Process for providing pegylated protein composition
KR102497097B1 (ko) 2017-12-29 2023-02-06 에프. 호프만-라 로슈 아게 페길화 단백질 조성물의 제공 방법
CN111801120A (zh) 2017-12-29 2020-10-20 豪夫迈·罗氏有限公司 用于提供聚乙二醇化蛋白质组合物的方法
EP3830261A1 (en) * 2018-08-02 2021-06-09 Novozymes A/S Preparation of combinatorial libraries of dna constructs using introns
US20210244821A1 (en) 2020-02-05 2021-08-12 Novartis Ag Cho cell expressed het il-15
WO2022159414A1 (en) 2021-01-22 2022-07-28 University Of Rochester Erythropoietin for gastroinfestinal dysfunction
WO2023237927A2 (en) 2022-06-10 2023-12-14 Abionyx Pharma Sa Methods for treating hyperinflammatory conditions using lipid binding protein -based complexes
WO2023237935A2 (en) 2022-06-10 2023-12-14 Abionyx Pharma Sa Methods for treating acute conditions using lipid binding protein-based complexes
WO2024091824A1 (en) 2022-10-26 2024-05-02 Ada Forsyth Institute, Inc. Differentiation and reprogramming of chondrocyte
WO2024129459A1 (en) 2022-12-16 2024-06-20 University Of Rochester Repairmen! of barrier dysfunction in esophagus

Family Cites Families (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU572108B2 (en) * 1983-01-19 1988-05-05 Genentech Inc. Human tpa production using vectors coding for dhfr protein
US4822736A (en) * 1984-07-05 1989-04-18 Baylor College Of Medicine Amplification of adenosine deaminase genes in mammalian cells using adenosine, alanosine, uridine, and deoxycoformycin
US5043270A (en) * 1989-03-31 1991-08-27 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Intronic overexpression vectors
AU636630B2 (en) * 1989-06-23 1993-05-06 United States of America, as represented by the Secretary, U.S. Department of Commerce, The Efficient method for identifiable expression of non-selectable genes
DE779362T1 (de) 1989-12-22 2001-04-05 Applied Research Systems DNS-Konstrukten zur Aktivierung und Veränderung der Expression von endogenen Genen
DE69131015T2 (de) * 1990-12-07 1999-11-18 Univ Florida Rekombinante zellen, die stark chromosomal-integrierte heterologe gene exprimieren
EP0539573A4 (en) * 1991-05-15 1993-12-29 Cell Genesys, Inc. Genomic modifications with homologous dna targeting
PT101031B (pt) 1991-11-05 2002-07-31 Transkaryotic Therapies Inc Processo para o fornecimento de proteinas por terapia genetica

Also Published As

Publication number Publication date
DE69334340D1 (de) 2010-09-23
NZ329348A (en) 1999-10-28
WO1994012650A2 (en) 1994-06-09
KR100364916B1 (ko) 2003-03-31
NZ259165A (en) 1998-01-26
MY140230A (en) 2009-12-31
KR950704502A (ko) 1995-11-20
IL107822A0 (en) 1994-04-12
EP0672160B1 (en) 2010-08-11
IL107822A (en) 2007-05-15
DK0672160T3 (da) 2010-11-29
EP0672160B8 (en) 2010-09-22
MX9307623A (es) 1994-06-30
WO1994012650A3 (en) 1994-08-04
ATE477327T1 (de) 2010-08-15
AU689455B2 (en) 1998-04-02
JP2005027673A (ja) 2005-02-03
CA2151032A1 (en) 1994-06-09
SG46476A1 (en) 1998-02-20
NZ336200A (en) 2000-12-22
AU5736294A (en) 1994-06-22
JPH08503856A (ja) 1996-04-30
EP0672160A1 (en) 1995-09-20

Similar Documents

Publication Publication Date Title
TW402639B (en) Protein production and protein delivery
EP0649464B1 (en) Transfection of vertebrate cells e.g. by homologous recombination
US6565844B1 (en) Protein production and protein delivery
US6187305B1 (en) Targeted introduction of DNA into primary or secondary cells and their use for gene therapy and protein production
US6048729A (en) In vivo protein production and delivery system for gene therapy
US6670178B1 (en) In Vivo production and delivery of insulinotropin for gene therapy
UA34493C2 (uk) Спосіб одержання гомологічно рекомбінантної клітини (варіанти), плазміда для використання у способі (варіанти), штам гомологічно рекомбінантних клітин фібросаркоми людини (варіанти), спосіб одержання еритропоетину людини (варіанти)
US6054288A (en) In vivo protein production and delivery system for gene therapy
US6531124B1 (en) In vivo production and delivery of insulinotropin for gene therapy
AU710255B2 (en) Transfection of vertebrate cells e.g. by homologous recombination
AU753372B2 (en) Transfection of vertebrate cells e.g. by homologous recombination
NZ270805A (en) Transfected primary and secondary cells of vertebrate origin and their use in gene therapy

Legal Events

Date Code Title Description
GD4A Issue of patent certificate for granted invention patent
MK4A Expiration of patent term of an invention patent