TW200523545A - Optical bio-discs including spiral fluidic circuits for performing assays - Google Patents

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TW200523545A
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cut
cutting
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Norbert Staimer
Yih-Far Chen
James Rodney Norton
Jay Oliver C Jison
Johnny Chen Mounphoxay
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Nagaoka Kk
Burstein Technologies Inc
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Description

200523545 玖、發明說明： 【發明所屬之技術領域】 本發明-般係關於生物化學檢驗。更明確地說，本發 之具體實施例係關於用於含有具有螺旋流體管路以及: 偵測系統的光學生物碟片之檢驗的方法及設備。 存 【先前技術】 血液或其他體液中的分析物之侦測及量化對於疾病的故 斷、病因的說明、以及用以監視對藥物治療的回應而言: 可能是重要的。傳統上，由經專門訓練的技術員採用複雜 设備在貫驗室執行診斷分析。執行該等分析通常消耗時間 亚且成本較南。因此，極需要較快地並更接近於終端使用 者，進行所有類型的診斷分析及法醫分析。理想上，臨庆 西生患者、調查者、軍方、其他衛生保健人士以及消費 者應能自己測試其身體中某些風險因素或疾病指示劑之存 X此’現場或在1場上某些生物材料的 二二前，存在許多醫學卿基的裝置，其具有附著 :二的市售或處於開發中的核酸及/或蛋白質。該等晶片 的個人或實體使用。戈“之很專業技術及昂貴裝備 在該技術中吾人熟知亦稱為生物小型碟片(Bi—ct isc , BCD)、生物光學碟 片的光學生物碑片… 斤碟片或小型生物碟 析。特定古：碟片係用以執行各種類型的生物化學分 源：此先學碟片利用-光學儲存裝置之雷射來 μ 、一、片本身之操作表面上或附近的生物化學反 92831 .doc 200523545 應。该等反應可能會出現在通當 祕“ 通吊具有小於微米的—或多 維尺度之碟片内較小通道或室中， 夕 者了以為出現在碟片 之粗糙表面上的反應。無論哪種系 '、 ϋ 要多及廍都 位來同時偵測不同反應，或因 ^ 靖决之目的而重複相同 反應。 【發明内容】 本發明係關於對一光學生物碟片執行檢驗’其包括遺傳 材料的製備及侧、免疫化學分析、以及比色分析。本發 明亦係關於對光學生物碟片的色譜分析，其包括(例如)親^ 力、尺寸排斥、反相位以及離子交換色譜。離子交換色譜 可包括陰離子錢、陽離子交換、陽離子交換鏈接免疫分 析（cation exchange lmked immunoassays ; CELIA)以及陰離 子交換鏈接免疫分析。可採用一光學分析碟片或光學生物 碟片，結合比色及/或螢光偵測及定量來執行該等色譜分 析。本發明包括用於製備分析的方法、用於沈積分析所需 試劑的方法、用於執行分析的碟片以及偵測系統。 般使用南壓力液體色譜（High pressure liquid
Chr〇matography ; HPLC)及其他類型的色譜，以分離具有不 同物理特性的重要物質或分析物，並採用UV/VIS、IR、發 光或勞光偵測對該等分析物進行定量。色譜儀器一般需要 成本較南的裝備及維護以及經專門訓練人士來實行複雜耗 時的測試。本發明之一目的係使一簡單色譜系統可用於測 试分析物、可以為可攜式以及可由終端使用者使用。 本發明包括用於採用比色或螢光計偵測來隔離並量化光 92831.doc 200523545 二生物碟片上—生物樣本中—重要分析物的濃度之方法。 分析物可包括（例如）血紅素、糖化及非糖化血紅素以及其他 :構重整之蛋白質。可以在分析之前將分析所需的所有試 別固疋在光學碟片上。聽行—分析，將—樣本（最好為血 清’但是亦可使用其他類型的體液）經由_注射或入口淳載 入一通道或流體管路。在載人樣本之後，密封人口璋、旋 轉碟片:並移動樣本經由一或多個微色譜或生物基質，該 移動係猎由包括含有（例如）尺寸排斥及離子交換基質的不 同分離媒介之離法。 *力木用树月日或珠、凝膠或隔膜形成 …-旦採用色譜方法分離重要分析物，接著將包含重 要分析物的分析物溶液引入一分析室。分析室可包含们列 试劑，其包括但不限於黏著於一捕獲區域之表面上的捕獲 媒介以及與一或多個報告項結合的信號抗體’兩者均呈有 對相同重要分析物之不同抗原決定基的親合力。報告項可 包括但不限於螢光團、發光團、微球體、酶以及奈米球體。 在-預定溫度及時間使分析物在分析室中孵化，以允許分 析物充分地黏著於捕獲媒介上並允許信號抗體黏著於分： 物上m之後’沖洗分析室以移除未黏著信號抗體及分 析物右刀析中所使用的報告項為非酶可偵測報告項(例如 珠），則接著可採用-光學碟片讀取器對分析室中報告項珠 之呈現及數量進行分析。否則，若使用一酶報告項，則將 -酶受質加入分析室。允許酶催化產生一可谓測信號(例如 顏色或螢光）之-酶受質反應。光學碟片讀取器接著量化所 顯影的顏色或螢光之強度。在一具體實施例中，資料收集 92831.doc 200523545 近3分鐘之後，將分析的結果顯示在—電腦監視器 一"，可有利地使用分析物本身的固有酶活性以產生 可：測心唬。此類分析物之—非限制性範例為具有一固 =化酶活性的血紅素。因此，此方法可以不需要捕獲 〜“《而允絲用-單步驟分析方法而無需沖洗 八 在此方法中，將樣本載入碟片並使其經由基質流入 ::%以上所說明。在此方法中，分析室將僅包含適 田又貝例如可結合血紅素分析物使用一過氧化酶受質， 士 ABTS(2,2 -連氮基二[3-乙烧基苯嗟唾琳]石黃酸）。一旦產生 信號i則採用如以上說明的光學碟片讀取器調查分析室， 以决疋呈現在樣本中的分析物之呈現及數量。 應主思於37攝氏度的情況下在臨床實驗室實行某些診斷 比色分析，以方便並加速顏色顯影。然而，可於任一溫度
It況下貫行比色分析，而且在某些具體實施例中於光學碟 片上執行比色刀析，並將該等分析最佳化為於大氣溫度情 況下運行。最佳化包括酶來源、酶濃度的選擇，以及樣本 的製備。 在一具體貫施例中，可選擇各種產色以用於一比色分 析，其中可在一特定波長情況下藉由一光學讀取器偵測各 產色。例如CD-R型碟片讀取器可偵測紅外線（75〇 nm至 8 00 nm)區域中的產色。可用於本發明之其他類型的光學碟 片系統包括DVD、DVD-R、螢光、磷光以及任一其他類似 光學碟片讀取器。光密度量測之幅度取決於光學路徑長 度、產生之分子消光係數以及重要分析物之濃度（比爾 92831.doc -9- 200523545 (Beer)定律）。為最佳化光學碟片上比色分析的敏感度，已 識別並評估在重要波長情況下具有高分子消光係數的數個 產色。 適合於CD-R型光學碟片上的比色分析之產色包括但不 限於N，N’-Bis(2-羥-3-硫丙基）聯甲苯胺、二鈉鹽（SAT_3)、 N-(羧曱基氨羰基）-4,4，-bls(二曱氨基）_二苯胺鈉鹽 (DA-64)、2,2’-連氮基-雙二噻唑·磺酸（ABTS)、Trinda 試 劑N-乙烷基-N-(2-羥-3-硫丙基）3-甲基苯胺、鈉鹽、具有耦 合試劑3-(N-甲基-N-苯胺對氨基苯磺酸的二水合物 (TOOS)以及鈉鹽（NCP-11)。 伋艨本發明
’徒供用於量化生物碟片上生物; 本中一重要分析物的濃度之債測方法。偵測包括採用 二驅動，朝捕獲現場或區域、分析室或生物基質材料引: %磁此里《光束’亚且分析所返回或透射的電磁能量。 在本發明之比色分析方面，可採用至少二種方法藉由； 學碟片讀取器來量化光穷庚戀
尤么度、交化。該等方法包括量測反j 或透射光之變化。碟片可以稱為反射、透射或反射與❿ 之某一組合。在一反射碟片中，-入射光束係聚焦至碟, 上（通常在其中對資訊進行編碼的—反射面上）、反射並⑸ 光學元件返回至與光源相同 々曰U的碟片之一側上一偵測器。 一透射碟片中，光穿過碟片卩 ^ 之另-側y在—碟片之一透射部分，苹光= 得以反射並偵測為反射光。 八、可 ^ ^ , 尤將不同偵測系統用於不同類 的生物碟片(頂部對底部伯測器）。 _ 9283i.doc -10- 200523545 可廉價地、無需專門技術及昂貴裝備來設計本發明之具 體實施例中的設備及方法，以由一終端使用者使用。系統 可製作為可攜式，因而可用於其中一般無傳統診斷裝備可 用的退端位置。 或者’可實行螢光分析以量化光學碟片上一生物樣本中 重要刀析物的7辰度。在此情況下，碟片驅動器中的能源最 好具有一波長可控制光源，以及係特定針對或可製作特定 針對一特定波長的一偵測器。在另一替代具體實施例中， 可將一碟片驅動器製作具有一特定光源及偵測器以產生一 專用裝置，在此情況下該光源可僅需微調。 針對與各種生理紊亂、生物研究、蛋白質、環境研究、 農業以及食品行業相關的物質之數量及品質決定的生物流 體之分析，依賴於其中免疫分析起到主要作用的特定黏著 分析。實務上在任一環境中幾乎無數分析物的數量決定之 顯出特徵及敏感性，以及最小型化及適合於自動化的能力 使其成為常規分析的理想工具。 抗體黏著技術係基於一黏著抗體、受體或其他黏著蛋白 貝與一抗原或一特疋配合體分子的互動，以及一抗體抗原 或受體配合體的複合物之形成。藉由改變某些狀況，可將 -黏者分析設計成決定-分析物、配合體或目標黏著試劑 或-重要抗體。該等步驟為類似步驟，但是分析組態提供 關於抗原或重要抗體的結果。 ^ 捕獲探針黏著及樣本應用 當將一樣本注入一光學生物碟片上一微通道、流體管路 9283l.doc -11 . 200523545 或液流通道時，包括（例如）目標抗原或抗體的目標媒介或八 析物’黏著於已黏著在-固體支撐（例如—碟片基板或= 物基貝）上一捕獲或目標區域中的一捕獲探針。捕獲探針可 以為由目標抗體所認識的一抗原’或者具有對於目桿抗Z 或配合體的特定親合力之一抗體或受體。隨黏著步：二 由-沖洗步驟移除未黏著目標媒介。應瞭解可將 : 熟知的各種技術、程序及化學品用以將捕獲探針黏著於— 固體支撐上，包括（例如）引導共價黏著探針至一金屬或活性 表面上、被動吸附、以及經由交聯試劑。 除用以附著捕獲探針的表面化學品以外，可將阻塞媒介 用以阻塞其巾捕獲探針未得到黏著的捕獲或目標I域及液 流通道内的區域（非捕獲區域），以防止將目標或分析物、信 號探針以及報告項非特定地黏著於該等區域。阻塞媒介包 括但不限於蛋白質（例如BSA)、凝膠、糖（例如蔑糖）、清潔 d (例如tween-20)、遺傳材料（例如剪切鮭魚***βΝΑ)以及 聚乙稀·醇。 信號產生 乜旎係產生於附著於信號或報告項媒介或具有對於一目 祆2介或分析物的特定親合力之探針的標籤或標記。信號 '、f或探針可包括（例如）標以微球體、亞微米奈米球體或酶 ^信號抗體或信號抗原。微球體或奈米球體可以為螢光標 二，（螢Α體）、鱗光、發光或化學發光。微球體或奈米球體 亦可具有不同化學功能性，包括（例如）緩基、氨基、駿以及 肼功能基。該等功能基可方便信號媒介的黏著。酶可方便 92831.doc -12- 200523545 一化學反應，其在呈現一適合受質的情況下產生螢光、顏 色或一可偵測信號。例如，在呈現過氧化氫的情況下可將 共軛山葵過氧化酶（HRP ;由伊利諾斯州羅克福德pierce公 司提供）用於雙質3,3,5,5-四甲基對二氨基聯苯（Tmb ; CalMochem公司目錄號 61354δ，CAS_54827_17-7)，以產生 不可洛解的沈殿物。山葵過氧化酶亦可用於CN/DAB(4- 氣奈酚/3,3’-二氨基對氨基聯苯、四氫氯化物）、4_(：叫4_氯 小奈酚）、AEC(3 —氨基-9-乙烷σ弄唑）以及DAB(3,3-二氨基 對氨基聯苯、四氫氯化物）以形成不可溶解的沈澱物。同 樣，在本發明之實務中亦可將鹼性磷酸酶（Ap)用於溴氣磷 酉欠鹽叉質。熟習此項技術者將明白其他適合的酶/受質組 合0 偵測 可採用開發用於本發明的光學生物碟片讀取器來讀取來 自微球體或酶反應的信號。可將具有一反射蓋的一碟片上 一底部偵測器，或具有一透射碟片的一頂部偵測器用作本 文t兄明的分析所需的光學生物讀取器以及碟片系統及方 法。 碟片實施方案 在有利具體貫施例中，可在一分析碟片、修改光學碟 片或生物碟片上實施分析。生物碟片可以包括其中嵌入一 或多個目標或捕獲區域及/或生物基質的一液流通道或流 體管路、與該液流通道進行流體通信的一返回通道、與該 液流通道進行流體通信的一混合室，以及在某些具體實施 92831.doc -13 - 200523545 例中與液流通道進行流體通信的一廢液儲箱。 可在包括一資訊編碼格式（例如CD、CD-R或DVD或其_ 修改版)的-光學碟片上實施生物碟片。生物碟片可包括用 於執行、控制及後處理測試或分析的編碼資訊。例如，可 引導此類編碼資訊以控制碟片的旋轉速度、醇化時間、r 二匕溫度及/或特定分析步驟。取決於測試、分析或調查： 定，旋轉速度可隨加速度、怪定速度以及減速度的干預 連續會話而變化。可密切控制關於旋轉之速度及時間的該 等會話以提供（例如）流體的混合、擾拌或分離，以及與媒 ” H DNA、rNA、抗原、抗體、配合體及受體的懸 浮。 ^ 驅動器實施方案 可使用-生物碟片驅動器裝配件或讀取器以旋轉碟片， 讀取並處理儲存在碟片中的任一編碼資訊，並且分析生物 碟片之液流通道中的樣本。生物碟片驅動器因此具有用於 旋轉生物碟片的一馬達'用於控制碟片之旋轉速度的一控 制器、用於處理來自碟片之返回信號的處理器、以及用於 :分析處理信號的一分析器。驅動器可包括特定開發用於執 行本文揭示的分析之軟體。 控制馬達的旋轉速度以達到碟片之所需旋轉。亦可利用 生物碟片驅動器裝配件’以在由驅動器之讀取光束詢問並 由分析器分析液流通道及目標或捕獲區域中的測試材料之 將資訊寫入生物碟片。生物碟片可包括編碼資 況，其用於控制碟片的旋轉速度，用於提供對於要進行的 92831.doc -14- 200523545 測試類型而言具有特定性的處理資訊，並且用於顯示結果 於與依據有關分析方法的生物驅動器相關之一顯示器監 器上。 | 在-具體實施例中’一光學生物碟片包括具有一内周長 及外周長的-基板，與該基板相關並包括沿資訊磁軌定 位的編碼資訊之操作層；以及包括調查特徵的一分析區 域。分析區域係固定在内周長與外周長之間並且係沿資气 磁執而引I’以便當電磁能量之一入射光束沿該等磁執追 縱時’分析區域内的調查特徵因而得以圓周式詢問。在另 一具體實施例中’分析區域内的調查特徵係依據一螺旋路 徑’或-般依據變化角度座標之一路徑而得以詢問。 在-具體實施例中，基板包括一連串的實質上圓形資訊 磁執，其增加與從内周長延伸至外周長的半徑成—函數關 係的周長’分析區域係在—預選數量的圓形資訊磁軌之間 圓周式伸長，而調查特徵係實質上沿-預選内周長與外周 長之間的圓形資訊磁執而得以詢問。 在一具體實施例中’分析區域包括一流體室。可將生物 碟片的旋轉用以分配調查特徵於沿分析區域的—“上一 致分配區域中，及/或於沿分析區域的一實質上二「 域中。 …均勾分配區 在另-具體實施例中’生物碟片包括具有 外周長的-基板’以及包括調查特徵的一分: 析區域《定在該基板之該内周長與該外周長^ Z 依據-變化角度座標並最好 豕I貝上111周或螺旋路徑 9283l.doc -15 - 200523545 心ιγ 在一具體實施例中，碟片包括—操 並包括實質上、VL次1^ 9 ，其與基板相關 只貝上/口貝吼磁軌定位的編碼資訊。 在另-具體實施例中，基板包括—實質 加與從内周長延伸至外周長的半、、®形輪廓並增 一 i車电：欠M i Κ 成—函數關係的周長之 連串貝汛磁執，分析區域係實質次 當能量之一入射来类、、/ 口貝矾磁執引導以便 、光束/口負汛磁軌追縱時，八、 查特徵因而得以圓周式詢問。或者 =析區域内的調 ^ 刀析區域可在一預選 數罝的圓形資訊磁執之間圓周式預& 上沿一預選内周|盥外网且 而调查特徵係實質 問。周長與外周長之間的圓形資訊磁執得以詢 實施例中，分析區域包括複數個反應部位及/ =據：角度座標所配置的複數個捕獲、分析或目標 £域。光學分析生物碟片亦可包括 匕符U疋在基板之内周長與 外周長之間的複數個分析區域，該等區域之至少之一者依 據一變化角度座標而延伸。 在另-具體實施例中，碟片包括多層分析區域4中各 分析區域依據一實質上圓周路徑而延伸，並且將各層配置 至一個別徑向座標中的生物碟片上。 在-進-步的較佳具體實施例中，分析區域包括依據一 變化角度座標而延伸的一或多個流體室，該(等)流體室具有 依據-變化角度座標而延伸的一中心部分，以及依據一徑 向延伸的橫向臂部分。在一具體實施例中，室中心部分具 有-角度延伸〜，其與包括在室臂部分之間的一角度θ所成 92831.doc •16- 200523545 的一比率心Μ等於或大於〇.25。此類具體實施例可提供包括 相應/σ貫貝上圓周路徑而延伸的至少一包含液體通道之 分析區域，並且通道的彎曲半徑與包含在通道内液柱的長 度b，係成等於或大於〇 5(並且最好等於或大於丨）的一比 rc/b 〇 … 在另 一體實施例中，光學分析碟片可包括二入口埠， 其係，位於針對分析區域的生物碟片本身之一下徑向座標 中。取好將此類埠分別定位於流體室之一個別橫向臂部分 的一端部。此外，碟片可包括多層分析流體通道，最終包 括不同分析、血型、酸性細胞的濃度以及類似物。亦可將 一組流體通道配置在實質上相同的徑向座標中。此外，流 體通道可具有相同或不同尺寸。 碟片可以為-反射型或透射型光學生物碟片。如先前呈 體實施例所說明，可將生物碟片的旋轉用以分配調查特徵 於^刀析區域的-實f上—致及/或均勾分配區域中。 在另-具體實施例中’光學分析生物碟片可包括具有_ 内周長及一外周异的_其士 ^ ' 土板，以及包括調查特徵並且係固 疋在該基板之該内周長與該外 八+ 贲之間的一分析區域。分 斤&域匕括至少一包含液體 路徑延伸的、 其具有沿一實質上圓周 、^ ^ '刀。通道圓周部分的f曲半徑rc與包含 在：道/的液柱之長度b最好成等於或大於。·5的一比率 ::呈广具體實施例中’比率…等於或大於1。而且在 匕一體貫施例中，碟片可以為一 碟片。 汉射型或透射型光學生物 92831.doc 200523545 特體實施例中’用於一光學分析生物碟片内調杳 問的方法’提供依據-變化角度座標，並可能： 據螺方疋或一實質上圓周路徑的調查特徵之詢& 步驟亦可為如&，以致當電磁能量之一入射光束沿二 訊磁軌追縱時，分析區域㈣詢問特徵因而得關周： 問。詢問步驟可提供依據-實質上固定徑向座標中 角度座標，或者依據一變化角度及徑向座標的調查特徵之 詢問。詢問步驟可提供依據—變化角度座標所配置的複數 個類似或不同反應部位、捕獲區域或目標區域中的調 徵之詢問。 、 依據本文揭示的本發明之以上說明的方法及設備可具有 -或多個優點，其包括但不限於簡單及快速的碟片上處理 而無需一富有經驗的技術員來管理測試、較小的樣本容 ΐ、使用廉價的材料、使用熟知的光學碟片格式及驅動器 製造。結合附圖及技術範例，藉由參考以下詳細說明將更 好地瞭解該等及其他特徵及優點。 【實施方式】 名稱為「碟片實驗室」、發佈於2〇〇〇年2月29日的美國專 利第6,030,581號（581專利），一般揭示一種包括一光學碟 片、適合於由一光學讀取器讀取的設備，其具有一扇區， 該扇區具有一實質上自包含分析系統，可用以本地化並偵 測一樣本中的一疑似分析物。名稱為「使用磁性分離之數 量細胞分析方法」、發佈於1 999年11月30日的美國專利第 5,993,665號「665專利），揭示一流體媒介中生物試樣的分 9283l.doc -18 - 200523545 析，其中藉由與鐵磁膠體的免疫特定黏著磁性地致使試樣 具有回應性。 圖1為用以進行生物化學分析，特定而言係用以進行細胞 计數及差動細胞計數的一光學生物碟片丨丨〇之一透視圖。本 光學生物碟片110係顯示為與一光學碟片驅動器丨12以及一 顯不器監視器114結合。關於此類型的碟片驅動器及碟片分 析系統之進一步細節係揭示在美國專利申請案第 1〇/〇〇8，156號中，其名稱為「用於生物碟片之碟片驅動器系 統及方法」，申請日期為別⑴年丨丨月9日；以及美國專利申 請案第謂43,688號，其名稱為「含有用於生物及醫學成像 的有關方法之光學碟片分析系統」，申請曰期為2〇〇2年工月 10曰。 圖2為光學生物碟片丨1〇之一具體實施例的主要結構元件 之一分解透視圖。圖2為可依據本文說明的系統及方法而得 以使用的一反射區域光學生物碟片（以下稱「反射碟片」 之一範例。主要結構元件包括一蓋部分116、一黏性部件或 通道層118、以及一基板12〇。蓋部分116包括一或多個入口 淳m以及-或多個出口璋124。蓋部分116可採用聚碳酸醋 形成，並可在其底部（從圖2之透視圖所觀察到）上塗佈一反 射面M6(如圖4所示）。在較佳具體實施例中，觸發器標諸或 記號126係包括在一反射層142之表面上（如目4所示）。觸發 器記號126可包括所有三層生物碟片中的一清晰視窗、一不 透明區域、或-反射或半反射區域，胃區域係採用傳送資 料至-處理器166的資訊加以編碼，如圖1〇所示；該處理器 92831.doc -19- 200523545 繼而與一詢問或入射光束152之運算函數互動，如圖6及1〇 所示。 圖2所示的第二元件為一黏性部件或通道層丨丨8，其具有 形成於其中的流體管路128或U通道。形成流體管路128係藉 由衝壓或切割隔膜以移除塑膠膜並形成所指示的形狀。各 流體官路128包括一液流通道或分析區域丨3()以及一返回通 道132。圖2所解說的某些流體管路128包括一混合室134。 該圖解說二不同類型的混合室134。第一類型為一對稱混合 至1 36，其係關於液流通道丨3〇而對稱式形成。第二類型為 一偏移混合室138。偏移混合室138係形成於液流通道13() 之一側上，如圖所指示。 圖2所解說的第三元件為包括目標或捕獲區域14〇的一基 板1 20基板1係最好由聚碳酸酯製作，並具有沈積於其 頂部上的上述反射層142(如圖4所示）。形成目標區域14〇係 藉由移除具有所指示形狀或任一所需形狀的反射層142。或 者，形成目標區域140可藉由一遮罩技術，其包括在施加反 射層142之丽遮罩目標區域14〇之區域。反射層142可採用一 金屬（例如鋁或金）形成。 圖3為圖2所解說的光學生物碟片11〇之一俯視平面圖，在 蓋部分116上的反射層146係顯示為透明以顯露位於碟片内 的流體管路128、目標區域140、以及觸發器記號⑶。 圖4為依據可用於本發明的一具體實施例之反射區域型 光學生物碟片110的一放大透視圖。此圖包括其各種層之一 部分，其係、切掉以解說各主要層、基板、塗層或隔膜之一 92831.doc -20- 200523545 部分斷面圖。圖4顯示採用反射層142加以塗佈的基板12〇。 將一作用層144施加於反射層142上。在一具體實施例中， 作用層144可採用聚苯乙烯形成。或者，可使用聚碳酸醋、 金、活性玻璃、改質玻璃、或改質聚苯乙烯，例如聚苯乙 烯共馬來酐。此外，可使用水凝膠。或者，如此具體實施 例所解說，將塑膠黏性部件118施加於作用層144上。塑膠 黏性部件11 8之曝露區段解說建立流體管路128的切割或衝 壓U形形式。本生物碟片之此反射區域具體實施例中的最終 主要結構層為蓋部分11 6。蓋部分11 6包括其底部上的反射 面146。反射面146可採用一金屬（例如链或金）製作。 現在參考圖5，其顯示一透射型光學生物碟片11〇的主要 結構元件之一分解透視圖。透射型光學生物碟片11〇的主要 結構元件同樣包括一蓋部分丨丨6、黏性或通道部件丨丨8、以 及基板層120。蓋部分Π6包括一或多個入口埠122以及一 或多個出口埠124。蓋部分116可採用一聚碳酸酯層形成。 可選觸發器記號126可包括在一較薄半反射層143之表面 上，如圖6及9所最佳解說。觸發器記號126可包括所有三層 生物碟片中的一清晰視窗、一不透明區域、或一反射或半 反射區域，該區域係採用傳送資料至一處理器166的資訊加 以編碼，如圖1〇所示；該處理器繼而與一詢問光束M2之運 算函數互動，如圖6及10所示。 圖5所示的第二元件為一黏性部件或通道層ιΐ8，其具有 形成於其中的流體管路128或U通道。形成流體管路128係藉 由衝壓或切割隔膜以移除塑膠膜並形成所指示的形狀。各 92831.doc -21 - 200523545 流體管路128包括液流通道130以及返回通道ι32。圖5所解 况的某些流體管路128包括一混合室134。該圖解說二不同 類型的混合室134。第一類型為一對稱混合室136，其係關 於於液流通道130而對稱式形成。第二類型為一偏移混2 = 138。偏移混合室138係形成於液流通道13〇之一側上，如囷 所指示。 圖5所解說的第三元件為可包括目標或捕獲區域14〇的基 板120。在一具體實施例中，基板12〇係由聚碳酸酯製作， 並具有沈積於其頂部上的上述較薄半反射層143，如圖石所 示。與圖5及6所解說的碟片110之基板12〇相關的半反射層 143，在很大程度上薄於圖2、3及4所解說的反射碟片"ο之 基板120上的反射層142。較薄半反射層143允許詢問光束 152經由透射碟片之結構層進行某透射，如圖6及丨2所示。 較薄半反射層143可採用一金屬（例如鋁或金）形成。 圖6為圖5所解說的光學生物碟片11〇之透射具體實施例 的基板120及半反射層143之一放大透視圖。較薄半反射層 143可採用一金屬（例如鋁或金）製作。在較佳具體實施例 中，圖5及6所解說的透射碟片之較薄半反射層143接近ι〇〇 至300A厚而且不超過400A。此較薄半反射層143允許入射 或詢問光束152之一部分透過，並穿過半反射層143 ’以由 一頂部偵測器158加以偵測，如圖丨〇及丨2所示；同時某些光 係沿入射路徑而得以反射或返回。如以下所指示，表丨揭示 一金膜相對於該金膜之厚度的反射及透射特徵。金膜層在 大於800 A的尽度情況下具有完全反射性。而透過金膜的光 92831.doc 200523545 之臨界密度接近400A。 除表1以外’圖7提供基於金膜厚度的較薄半反射層143 之反射性質與透射性質的相反關係之一圖解表示。用於圖7 所解說的曲線圖之反射及透射數值為絕對值。 表1 金膜反射及透射（絕對值） 厚度（埃） 厚度（nm) 反射係數 透射係數 0 0 0.0505 0.9495 50 5 0.1683 0.7709 100 10 0.3981 0.5169 150 15 0.5873 0.3264 200 20 0.7142 0.2057 250 25 0.7959 0.1314 300 30 0.8488 0.085 1 350 35 0.8836 0.0557 400 40 0.9067 0.0368 450 45 0.9222 0.0244 500 50 0.9328_ 0.0163 550 55 0.9399__ 0.0109 600 60 0.9448__ 0.0073 650 65 0.9482__ 0.0049 700 70 〇.95〇5__ 0.0033 750 75 〇.951〇__ 0.0022 800 80 〇.953j__ 0.0015 接著參考圖8，其顯示圖5及6所解說的透射型光學生物碟 片110之一俯視平面圖，透明蓋部分1丨6顯露位於碟片内的 流體通道、觸發器記號126、以及目標匾威14〇。 92831.doc 200523545 圖9為依據透射碟片具體實施例的光學生物碟片丨丨〇之一 放大透視圖。碟片UG係解說為具有其各種層之—部分，其 知切割以顯不各主要層、基板、塗層或隔膜之一部分斷面 圖。圖9解說—透射碟片格式，其具有—清晰蓋部分⑴、 基板120上的較薄半反射層143、以及觸發器記號以。在此 具體實施例中’觸發器記號126包括置於蓋之頂部部分上的 不透=材料。或者，形成觸發器記號126可藉由钱刻在碟片 之較薄反射層143上的清晰、非反射視窗，或吸收或並不反 射來自一觸發器伯測器160的信號之任-記號，如圖10所 不。圖9亦顯示目標區域14〇，形成該目標區域係藉由採用 所指示形狀或採用任一所需形狀對指定區域作記號。用以 指示目標區域i 4 0的記號可作在基板丄2 〇之較薄半反射層 143上，或作在基板12〇之底部部分上（在碟片下面）。或者， 形成目標區域140可藉由一遮罩技術，其包括遮罩除目標區 域140以外的整個較薄半反射層143。在此具體實施例^， 建立目標區域14〇可藉由以絲網印刷方式將油墨印至較薄 半反射層143上。在圖5、8及9所解說的透射碟片格式 定義目標區域140可替代地藉由編碼在碟片中的位址資 訊。在此具體實施例t，目標區域刚並不包括—實體可辨 別邊緣邊界。 繼續參考圖9，其解說將一作用層144施加於較薄半反射 層143上。在較佳具體實施例中，作用層144為_ 至2〇〇 厚的2%聚笨乙烯層。或者，可使用聚碳酸酯、金、活性玻 璃、改質玻璃、或改質聚苯乙稀，例如聚苯乙稀共馬來肝。 92831.doc -24- 200523545 此外’可使用水凝膠。如此具體實施例所解說，將塑膠黏 性部件118施加於作用層144上。塑膠黏性部件丨18之曝露區 段解说建立流體管路12 8的切割或衝壓u形形式。 本生物碟片11 0之此透射具體貫施例中的最終主要*士構 層為清晰、非反射蓋部分11 6 ’其包括入口埠12 2及出口璋 124 ° 現在參照圖10,其解說表示光學組件148、產生入射或詢 問光束152的一光源150、一返回光束154、以及一透射光束 156的透視及方塊圖。在圖4所解說的反射生物碟片之情況 下，返回光束154係從光學生物碟片ι10的蓋部分116之反射 面146反射。在本光學生物碟片11〇之此反射具體實施例 中，藉由一底部偵測器157偵測及分析返回光束154中是否 呈現信號元件。另一方面在透射生物碟片格式中，透射光 束156係藉由上述頂部偵測器158加以偵測，並且亦分析是 否呈現ia號元件。在透射具體實施例中，可將一光偵測器 用作頂部偵測器158。 圖10亦顧示一硬體觸發器機制，其包括碟片上的觸發器 記號126以及上述觸發器偵測器丨6〇。將硬體觸發機制用於 反射生物碟片（圖4)以及透射生物碟片（圖9)。僅當詢問光束 152係在一個別目標區域14()中（例如在一預定反應部位） 時，觸發機制才允許處理器166收集資料。此外，在透射生 物碟片系統中，亦可使用一軟體觸發器。軟體觸發器使用 底部偵測器來發信給處理器166，以便詢問光束152 一撞擊 一個別目標區域140之邊緣，即收集資料。圖1 〇進一步解說 92831.doc •25 - 200523545 一驅動器馬達162及用以控制光學生物碟片u〇的旋轉之一 控制器164。圖1〇亦顯示處理器166及分析器168，其係實施 於替代具體實施例中，以處理與透射光學生物碟片相關的 · 返回光束154及透射光束156。 - 如圖11所示，揭示光學生物碟片11〇之反射碟片具體實施 例的一部分斷面圖。圖11解說基板120以及反射層142。如 以上所指示，反射層142可採用一材料（例如鋁、金或其他 適合的反射材料）製作。在此具體實施例中，基板12〇之頂 部表面為平滑式。圖11亦顯示施加於反射層142上的作用層 ® 144。亦如圖11所示，形成目標區域14〇係藉由移除一所需 位置處的反射層142之一區域或部分，或者藉由在施加反射 層142之前遮罩該所需區域。如圖η所進一步解說，將塑膠 黏性部件118施加於作用層144上。圖u亦顯示蓋部分U6及 與其相關的反射面146。因此當將蓋部分丨16施加於包括所 需切割形狀的塑膠黏性部件118上時，因而形成液流通道 1 3 0。如圖11所示的箭頭所指示，入射光束} 5 2之路徑係最 _ 初從碟片110下面導向基板12〇。入射光束接著聚焦於接近 於反射層142的一點。因為此聚焦發生在其中缺少反射層 142之一部分的目標區域14〇中，所以入射光束繼續沿一路 徑穿過作用層144並進入液流通道13〇。入射光束152接著繼 續向上穿過液流通道以最終入射在反射面146上。此時，入、 射光束152係沿入射路徑而得以返回或往回反射，從而形成 返回光束154。 · 圖12為生物碟片11〇之透射具體實施例的一部分斷面 92831.doc -26- 200523545
圖。圖12解說一透射碟片格式，其具有清晰蓋部分ιΐ6以及 基板120上的較薄半反射層143。圖12亦顯示施加於較薄半 反射層143上的作用層144。在較佳具體實施例中，透射碟 片具有採用-金屬製作的較薄半反射層143，該金屬如鋁或 金，其接近100至300埃厚而且不超過4〇〇埃。此較薄半反射 層143允許來自光源150(圖1〇)的入射或詢問光束152之一部 分透過，亚向上穿過碟片以由頂部偵測器丨5 8加以偵測，同 時某些光係沿與人射光束相同的路徑但是以相反的方向而 往回反射。在此具體實施例中，返回或反射光束154係從半 反射層⑷反射。因此採用此方式，返回光束154並不進入 液流通道130。可將反射光或返回光束154用以追蹤形成於 半反射層143中或上的預記錄資訊磁軌上的入射光束152, 如結合圖U及14所更詳細地說明。在圖12所解說的碟片呈 體實施例中，可能會或可能不會呈現一實體定義目標區域 140。建立目標區域14G可藉直接作記號於基㈣吐的較薄 半反射層14 3上。形成該等記號可採用絲網印刷或任一等效 方法。在其中並未將實體標記用以定義一目標區域的替代 具體實施例中（例如當利用編碼軟體定址時），可有效地將液 流通道U0用作其中進行一調查特徵之檢查的一限定目標 區域。 圖13為橫跨生物碟片 110之反射碟片具體實施例的磁執 所取的一斷面圖 所取。圖13包括基板12〇以及反射層 中，基板120包括一連串的溝槽17〇。 此圖係沿碟片之一半徑及液流通道縱向 M2。在此具體實施例 溝槽170係以一螺旋的 92831 .doc -27- 200523545 形式從碟片的中心附近朝外緣延伸。實施溝槽17〇以便詢問 光束1 52可沿碟片上的螺旋溝槽} 7〇而追蹤。此類型的溝槽 1 70係熟知為「擺動溝槽」。具有波動或波狀側壁的一底部 邛为形成溝槽170，而一提升或提高部分分離螺旋中的鄰近 溝槽170。施加於在此具體實施例中的溝槽17〇上之反射層 142具有如圖所解說的保形性質。圖13亦顯示施加於反射層 142上的作用層144。如圖13所示，形成目標區域14〇係藉由 移除一所需位置處的反射層142之一區域或部分，或者藉由 在施加反射層142之前遮罩該所需區域。如圖13所進一步解 忒，將塑膠黏性部件11 8施加於作用層i 44上。圖丨3亦顯示 蓋部分116及與其相關的反射面146。因此當將蓋部分} 16施 加於包括所需切割形狀的塑膠黏性部件1丨8上時，因而形成 液流通道130。 圖14為橫跨（例如）圖12說明的生物碟片11〇之透射碟片具 體貝施例的磁執所取的一斷面圖。此圖係沿碟片之一半徑 及液流通道縱向所取。圖14解說基板12〇以及較薄半反射層 143。此較薄半反射層143允許來自光源15〇的入射或詢問光 束152透過，並穿過碟片以由頂部偵測器158加以偵測，同 時某些光係以返回光束154的形式加以往回反射。決定較薄 半反射層143之厚度係藉由碟片讀取器維持其追蹤能力所 需要的反射光之最少數量。如圖13所論述的一樣，此具體 κ施例中的基板1 20包括連串的溝槽1 7〇。此具體實施例中 的溝槽170係以一螺旋的形式從碟片的中心附近朝外緣延 伸。實施溝槽170以便詢問光束152可沿螺旋追蹤。圖丨斗亦 92831.doc 200523545 顯示施加於較薄半反射層143上的作用層144。如圖14所進 一步解說，將塑膠黏性部件或通道層118施加於作用層144 上。圖14亦顯示無一反射面146的蓋部分11 6。因此當將蓋 部分施加於包括所需切割形狀的塑膠黏性部件11 8上時，因 而形成液流通道1 3 0，並且允許入射光束1 5 2之一部分實質 上不經反射即穿過該通道。 圖15為類似於圖11的一圖，其顯示反射碟片的整個厚度 及該碟片的最初折射特性。圖1 6為類似於圖12的一圖，其 顯示透射碟片的整個厚度及該碟片的最初折射特性。在圖 15及16中並未看見溝槽17 〇，因為區段係沿溝槽17 〇切割。 圖15及16顯示其位置垂直於該等具體實施例中的溝槽17〇 之較乍液流通道1 3 0之呈現。圖1 3、14、15及16顯示個別反 射及透射碟片之整個厚度。在該等圖中，入射光束丨52係解 說為最初與具有改變如圖所解說的入射光束之路徑的折射 特性之基板120互動，以使光束152聚焦在反射層142或較薄 半反射層143上。 計數方法及相關軟體 經由解說性背景，本文進一步詳細地論述採用光學碟片 貧料的白血球計數之許多方法及相關演算法。該等方法及 相關演算法並不限於計數白血球，而係可輕易地應用於進 行任一類型的顆粒物質的計數，該物質包括但不限於紅血 球' 白血球、珠、以及產生可由—光學讀取器加以请測的 類似光學簽名之任何其他生物及非生物物體。 基於解說之目的，以下參考圖17至21說明的、與本發明 92831.doc -29- 200523545 有相關的方法及演算法之說明係關於細胞計數。在進行某 些修改的情況下，可將該等方法及演算法應用於計數：他 類型的物體。本文一般說明細胞計數方法及演算法的資料 評估方面，以提供本發明之方法及設備的相關背景。在以 下論述中，揭示具有一簡短解釋的方法及演算法之基本方 案。如圖ίο所解說，以已藉由與測試樣本的互動而加以修 改或調變的電磁ϋ射之-光束的形式，從光學生物碟片㈣ 取回關於生物測試樣本之屬性的資訊。在結合圖2、3、4、 11、13及15所論述的反射光學生物碟片的情況下，返回光 束154承載關於生物樣本的資訊。如以上所論述，僅當入射 :束係在液流通道130或目標區域14〇内並因而與樣本接觸 時’關於生物樣本的此類資訊才係本包含在返回光束 中。在生物碟片H0之反射具體實施例中，返回光束154亦 可承載編碼在反射層142中或上或另外編碼在圖 解說的擺動㈣m巾的資訊。如熟f此項技術者所明白，
僅當對應人射光束與反射層142接觸時，預記錄資訊才係$ 含在具有目標區域的反射碟片之返回光束154中。當入射另 束152係在其中承載資訊的反射層142已得到移除或缺少^ 區域中時’此類資訊並不包含在返回光束154中。在結合廣 5 6 8、9、12、14及16所論述的透射光學生物碟片的惰 況下，透射光束丨56承載關於生物樣本的資訊。 繼續參考圖1〇,無論從反射碟片之返回光束154或從透制 碟片之透射光束156獲得的關於生物測試樣本的資訊，皆係 引導至用於信號處理的處理器166。此處理包括將由議 92831.doc -30- 200523545 =二=射碟片)或頂部偵測器15δ(透射碟片)所制的 類比4唬轉換為一離散數位形式。 =著參考圖17，信號轉換包括在固定時間間隔犯對類比 〇進行取#，並且將該信號之對應瞬時類比幅度214 編碼為-離散二進制整數216。取樣係在某開始時間川開 。在某、。束¥間220停止。與任一類比至數位轉換處理相 關的一共同數值為取樣頻率及位元深度。亦稱為取樣速率 的取樣頻率為每單位時間所取的樣本之數量。-較高取樣 頻率產生連績樣本之間的—較小時間間隔M2，其導致與原 =類比信號210相比的數位信號222之—較高保真度。位元 深度為各樣本點中用以對類比信號21G之取樣幅度214進行 編碼的位元之數量。位元深度越大，則二進制整數216將越 接近於原始類比幅度214。在本具體實施例t，取樣速率為 8 MHz，母樣本具有12位元的—位元深度，從而允許一整數 樣本範圍為0至彻⑽至叫）），其中n為位元深度。此組 合可變化以應付其他具體實施例所需要的特定精度。經由 範例而非限制’可能會需要增加包括用於計數一般小於細 胞的珠之方法的具體實施例中之取樣頻率。接著將取樣資 料傳送至處理器1 66以進行類比至數位轉換。 在類比至數位轉換期間，將沿雷射路徑的各連續樣本點 224連續地儲存於碟片上或記憶體中作為一一維陣列。 各連續磁執貢獻一獨立一維陣列，其產生類似於一影像的 一二維陣列228(圖20A)。 圖18為一光學生物碟片11〇之一透視圖，所指示的區段之 92831.doc -31 - 200523545 一放大詳圖顯示一捕獲的白血球230,該白血球係相對於該 光本生物碟片的磁執2 3 2而加以固定。本文僅因解說性目的 而使用白血球230。如以上所指示，本文可利用其他物體或 α周查特被，例如珠或黏著物質。如圖所示，入射光束1 $ 2 與白血球230的互動產生一包含信號的光束，其係以反射碟 片之一返回光束154或透射碟片之一透射光束156的形式， 該光束係由偵測器15 7或1 5 8加以偵測。 圖19Α為相對於圖is所示的光學生物碟片u〇之磁執232 而加以固定的一白血球230之另一曲線表示。如圖1 g及1 9A 所示’白血球230覆蓋接近四磁軌A、B、C及D。圖19B顯 示從圖18及19A之白血球210導出的一連串簽名執跡。如圖 19B所指示，偵測系統提供對應於磁執a、b、C及D的四類 比k號A、B、C及D。如圖19B所進一步顯示，各類比信號 A、B、C及D承載關於白血球230的特定資訊。因此如圖所 解說，在一白血球230上的一掃描產生可得以偵測及處理的 入射光束之明顯擾動。接著將類比簽名執跡（信號）21〇引導 至處理器166，以轉換成如圖20A及20C所示的一類比數位 信號222，如以下所進一步詳細論述。 圖20為解說圖2〇A、20B、20C及20D之間的關係之一曲線 表示。圖20A、20B、20C及20D為圖示曲線表示，其表示將 圖1 9B的簽名執跡轉換為數位信號222，該等信號係儲存為 一維陣列226並組合為用於資料輸入244的一二維陣列228。 現在特定參考圖20A，其顯示來自圖18及19A所示的光學 生物碟片之磁軌A及B的取樣類比信號210。處理器166接著 92831.doc -32- 200523545 將類比信號210之對應瞬時類比幅度214編碼為一離散二進 制整數216(參見圖17)。所得到的連串資料點為類樣 類比信號2 1 0的數位信號222。 接著參考圖20B ’將來自磁軌…的數位信號222(圖 20A)儲存為一獨立一維記憶體陣列226。各連續磁軌貢獻一 對應-維陣列，當將該陣列與先前一維陣列組合時，、其產 生類似於-影像的-二維陣列228。接著將數位資料儲存在 記憶體甲或碟片上，作為樣本點224(圖17)之一二維陣列 228 ’該等樣本點表示樣本區域中一特定點處的返回光束 154或透射光束156(圖18)之相對強度。接著以圖細所表示 的-原播案或影像檔案謂的形式，將二維陣列儲存在記憶 體中或碟片上。接著將館存在影像標案中的資料（24〇)取回 242以將其儲存於記憶體中，並用作至圖_示的分析器 1 6 8之負料輸入2 4 4。 圖20C顯示來自圖18及19八所示的光學生物碟片之磁執c 及D的取樣類比信號21〇。處理器166接著將類比信號21〇之 對應瞬時類比幅度214編碼為—離散二進制整數216(圖 ⑺。所得到的連串資料點為類似於取樣類比信號21〇的數 位信號222。 見在 > 考圖20D ’將來自磁轨c及D的數位信號222儲存為 一獨立一維記憶體陣列226。各連續磁執貢獻_對應一維陣 列，當將該陣列與先前一維陣列組合時，其產生類似於一 影像的維陣列228。如以上所說明，接著將數位資料儲 存在記憶體中或碟片上，作為樣本點以（圖17)之一二維陣 92831.doc -33 - 200523545 列228’該等樣本點表示樣本區域中一特定點處的返回光束 154或透射光束156(圖18)之相對強度。接著以一原檔案或与 像檔案240的形式，將二維陣列儲存在記憶體中或碟片5上^ 如圖20B所示。如以上所指示，接著將儲存在影像檔案中的 資料240取回242以將其儲存至記憶體中，並用作至圖所 示的分析器168之資料輸入244。 將計算及處理演算法儲存在分析器168(圖1〇)_，並應用 於輸入貧料244以產生有用輸出結果262(圖21)，該等結果可 顯示在顯示器監視器114(圖1〇)上。 現在參考圖21，其顯示依據與本發明有關的處理方法及 計算演算法進行資料評估的主要步驟之一邏輯流程圖\本 處理方法之一第一主要步驟包括接收輸入資料244。如以上 所說明，資料評估開始於範圍〇至4〇96内的整數之一陣列。 下一主要步驟246係選擇一碟片區域進行計數。一旦定義 此區域，則一目的變為對包含在定義區域中的所有白血球 進行實際計數。步驟246的實施方案取決於碟片的組態及使 用者的選擇。經由範例而非限制，在使用具有例如圖2及5 所示的目標區域140之視窗的碟片之本發明的具體實施例 中，軟體涊識該等視窗並修剪其一區段以進行分析及計 數。在例如圖2所解說的一較佳具體實施例中，目標區域或 視窗具有1 x2 mm矩形的形狀，該等矩形在其各端部具有一 半圓形區段。在此具體實施例中，軟體修剪一個別視窗内 一標準矩形區域1 x2 mm。在此具體實施例之一方面，讀取 器可採用數個連續樣本數值以比較數個不同視窗中細胞的 9283丨.d〇c -34- 200523545 數量。 在採用-無視窗之透射碟片#本發明之具體實施例中， 如圖5、6、8及9所示，可採用二不同方式之一者執行步驟 246。選擇標準矩形的位置，該選擇係藉由相對於具有固定 座標的一點而固定矩形的中心，或藉由發現可以為一黑暗 染料點的參考記號。在其中使用一參考記號的情況下，將 具有-所需對比度的一染料針對二藥細胞而沈積於碟片上 一特定位置處。接著引導光學碟片讀取器跳至細胞簇之一 者的中心，並且接著使標準矩形圍繞所選簇而居中。 至於關於步驟246的上述使用者選擇，使用者可規定一所 需樣本區域形狀（例如一矩形區域）以進行細胞計數，該計數 係藉由與滑鼠選擇或其他直接互動。在本軟體具體實施例 中，此包括採用滑鼠來點擊並拖動一矩形，其係在顯示在 風視器114上的光學生物碟片導出影像之所需部分上。不管 评估區域選擇方法，評估一個別矩形區域以在下一步驟248 中進行計數。 圖21中的第三主要步驟為步驟248，其係關於背景照明均 勾化。此處理校正某些硬體組態中引起的可能背景均勻度 波動。背景照明均勻化抵銷各樣本點的強度位準，以便總 背景或並非細胞的影像之部分接近具有一任意背景數值 Vbackground的一平面。雖然可採用許多方式（例如取標準 矩形樣本區域的平均數值）來決定Vbackground，但是在本 具體實施例中將該數值設定為2〇〇〇。所選矩形樣本區域之 各點P處的數值V，係採用數字（Vbackgr〇und + (V-P之鄰近點 92831.doc -35- 200523545 的平均數值））加以取代並若有必要則加以刪節，以適合實際 可此數值範圍’其在本發明之一較佳具體實施例中為〇至 4095。將鄰近點的尺度選擇為充分大於一細胞的尺寸並充 分小於標準矩形的尺寸。 圖21之流程圖中的下一步驟為一標準化步驟25〇。在進行 標準化步驟250時，對標準矩形樣本區域中的資料執行一線 性轉換以便平均數值變為2000，其具有600的一標準偏差。 若有必要，則刪節數值以適合範圍〇至4〇96。此步驟25〇以 及月景照明均勻化步驟248使軟體對硬體修改及調節較不 敏感。經由範例而非限制，例如頂部偵測器158(圖18)之偵 測官路中的信號增益可以變化而不會明顯影響所得到的細 胞計數。 如圖2 1所不，接著執行一過濾步驟252。對於標準矩形中 的各點P，計算p之鄰近點中的點之數量，其尺度小於步驟 248所指示的尺度，數值充分不同於Vbackgr〇und。所計算 的點應接近影像中一細胞的尺寸。若此數字足夠大，貝p 處的數值保持原樣；否則將其指定為¥1^仏訂〇1111(1。執行此 過濾操作以移除雜訊，並且在最佳情況下僅細胞保持在影 像中’而背景為均等Vbackground。 ' …丁人么从才的一可選步 254。例如刮痕、氣泡、髒物以及其他類似不規則之缺陷 通過遽波步驟252。該等缺陷可直接或藉由影響影像桎^ 中的總分配而引起細胞計數錯誤。通常古 々 中叨S ，该等缺陷ί 尺寸充分大於細胞並可在步驟2 5 4中如下力Ί软 τ又广加以移除。首先 92831.doc -36- 200523545 形成具有與所選區域相同的尺度之一二進制影像。若原始 影像之對應點處的數值等於Vbackgr〇und，則將二進制影像 中的A定義為白色，否則將其定義為黑色。其次，擷 ' <、、、赤占 之連接成分。接著應用後來的腐蝕及擴充來正規化成分 圖。取終，移除大於一定義臨界值的成分。在此可選步驟 之一具體實施例中，藉由指定具有數值Vbackgr〇und的原始 影像中的對應樣本點，從原始影像中移除成分。決定哪些 成分組成可計數物體以及哪些成分要加以移除的臨界值為 使用者疋義數值。此臨界值亦可變化，取決於所計管的 調查特徵，即白血球、紅血球或其他生物物質。在可選步 驟254之後，最好重複步驟248、250以及252。 圖21中的下一主要處理步驟為步驟256，其係關於藉由光 亮中心計數細胞。計數步驟256係由數個子步驟組成。該等 子步驟之第一者包括執行一纏繞。在此纏繞子步驟中，形 成稱為一纏繞圖像的一辅助陣列。點P處的纏繞圖像之數值 為P之圓形鄰近點中的濾波之後一圖像的整合之結果。更準 確地說，對於一特定具體實施例而言，所整合的函數為當v 大於2000時等於v-2 000的函數，以及當v小於或等於時 等於0的函數。計數步驟256中執行的下一子步驟為，發現 約一細胞尺寸的一半徑之鄰近半徑的纏繞圖像之本地最大 值。接著’複製本地最大值，而避免一相互封閉鄰近半巧 中的相同數值。在計數步驟256之最後子步驟中，判定剩餘 本地最大值以對細胞做記號。 在某些硬體組態中，某些細胞可顯現而無光亮中心。在 92831.doc -37- 200523545 以下二可選步驟258 該等實例中，僅一黑暗邊緣可見並且 及260有用。 步驟258係關於從圖像移除發現的細胞。在步驟w中， 圍繞各發現細胞之中心的圓形區域係採用數值2〇〇〇加以填 充，以便具有光亮中心、及黑暗邊緣的細胞將不會得以發現 兩次。 步驟2 6 0係關於藉由黑暗邊緣計數額外細胞。步驟2 $ 8之 後對影像進行二轉換。在此常規之第—子步驟（即子步驟 U))中，各點處的數值v係採用（2〇〇〇_v)加以取代，並且若結 果為負數，則採用零加以取代。在子步驟中，接著採用 具有内半徑Ri及外半徑R2的-環I繞所得到的圖像。^及 R2分別為一細胞之最小及最大期望半徑，後來在子步驟⑷ 中向左、向右、向上及向下偏移環。在子步驟⑷中，匯總 四偏移之結果。在此轉換之後，一黑暗邊緣細胞之影像看 起來像1花瓣花。最後’在子步驟⑷中，採賴似於計 數步驟256所用的-方式來發現子步驟⑷中獲得的最大函 數。判定該等函數以對步驟256中所省略的細胞做記號。 在汁數步驟256之後，或在視需要而使用計數步驟之 後，圖21所解說的最後主要步驟為一結果輸出步驟。在 標準矩形中發現的細胞之數量係顯示在圖丨及5的監視器 114上，並且各識別細胞係採用顯示光學生物碟片導出影像 中的一十字架做記號。 碟片上生物及化學分析 以下論述係關於可用於本發明的生物及化學應用。在序 92831.doc -38- 200523545 列應用中’藉由偵測哪些探針具有黏著於其上的dna樣 本，可決定DNA樣本内一序列的核苷基體。在診斷應用中， 依靠一預定組探針篩選來自一個人的一基因組樣本，以決 定該個人是否具有一疾病或一疾病之一遺傳處理。
本發明將微流體技術與一光學生物碟片上的基因組及蛋 白質結合，以偵測一測試樣本中的調查特徵。參考圖22a、 22B、22C及22D，一水測試樣本352係置於一光學生物碟片 350上或内，並且係經由微通道354橫跨一特定製備表面 而加以驅動以實行所需測試。毛細行動、.採用一外部施加 器所施加的塵力、及/或離心力（即從旋轉之中心或曲線或轴 線引導開的曲線運動中一主體上的力）作用於測試樣本，以 達到與捕獲探針358的接觸。核酸探針技術可應用於遺傳變 異及有關機制㈣測、癌症_選、決定藥品毒性位準、遺 傳紊亂之_、傳染疾病之_、以及遺傳指紋識別。
此外，本發明適用於—混合相位系統以執行雜交分析。 參考圖23A、23B、23C及23D ,—混合相位分析包括對—固 相（例如-較薄尼龍或硝化纖維隔膜362)執行雜交。例如， 分析通常包括將-硝化纖維薄層362旋塗至—生物碟片遍 之基板364上，該塗佈係藉由採用一吸液管366或類似裝置 以向隔膜載入一樣本368，使DNA改變性質或建立單一股分 子：’將DNA或RNA固定至隔膜上’以及採用異種核酸: 或蛋白質372充滿剩餘隔膜附著部位，以防止分析物及報 = 員以-非特定方式黏著於隔膜上。所有該等步驟均必須 在執行實際雜交之前加以實行。接著執行後來步驟以達到 92831.doc -39- 200523545 雜父並將報告項珠疋位於捕獲區域或目標區域。接著利用 入射光束來偵測報告項，如參考圖22所論述。 光學生物碟片可用於實驗分析以及遺傳及蛋白質領域中 的分析，其係用於各種應用，例如藥理基因、基因表現 化合物篩選毒物學、法院調查、單一核苷多形性 Nucleotide Polymorphism ; SNP)分析、短串連重複序列 (Short Tandem Repeats ; STR)、以及臨床 /分子診斷。 報告項 許多化學、生物化學及生物分析依賴於在所測試的特定 樣本之光學特性方面引起一變化。此類變化可出現在偵測 調查特徵本身（例如血細胞）之後，或可在偵測_報告項之 後。在其中調查特徵太小以致無法由光學碟片驅動器之讀 取光束加以偵測的情況下，報告項具有調查特片之一選擇 性親合力（即與測試樣本内調查特徵的不同化學構造之原 子或化合物反應或組合的一趨勢）以方便偵測。報告項將反 應、組合或黏著於調查特徵，從而引起調查特徵之一可積 測顏色、化學發光、發光或其他可識別標記。 發光係形式上劃分為一類別’即螢光及碟光，取決於激 發狀悲之性質。一發光分子能採用一波長吸收光子能量， 並後來採用另一波長發射能量。發光係由撞擊在一分子上 或激發'^分子之電子的入射輪射引起。電子吸收入射輻 射並從一較低量子能階提高至一較高量子能階。隨著電子 返回至較低基態能階，將過多的能量釋放為光之光子。因 為各報告項具有其自己的發光特徵，所以分別採用一不同 92831.doc -40- 200523545 報告項加以標籤的-個以上的標記分子，可同時用以偵測 相同測試樣本内的二或多個調查特徵。 除發光以外，例如採用酶鏈接免疫吸收劑分析（enzyme_ Hnked immunosorbent assay; EUSA)的染色及金標記之技 術’可用以改變生物抗原材料之光學特性。例如，為測試 可指示一病毒感染的一血樣本中一抗體的呈現，可實行一 ELISA，若呈現抗體，則該分析產生一可見顏色沈積。參 考圖 24A、24B、24C、24D、24E及 24F，- EUSA使用-表 面彻’其係採用對於要測試的抗體384而言具有特定性的 -抗原382加以塗佈。在將表面曝露於血樣本386之後，樣 本中的抗體即黏著於抗原上。後來採用特定酶共扼抗體谓 對表面進行的染色以及酶與一受質的反應產生一沈澱物 390,其與抗原黏著的位準關聯，因而使樣本中抗體的呈現 可由光學碟片驅動器加以識別。接著由人射光束積測此沈 殿物。 參考圖25，以珠為基礎的分析使用球形微粒或珠4〇〇以改 變生物抗原材料402之光學特性。採用具有一測試樣本中調 查特徵之一特定親合力的一化學層4〇4塗佈珠4〇〇。參考圖 26A、26B、26C及26D，當將—測㈣本載人包含報告項珠 400(圖25)的-光學碟片41〇中或上時，#呈現調查特徵 412 ’則5亥特徵黏著於報告項4〇〇上。調查特徵4 1 2進一步黏 著於光學碟片410之表面416上的特定捕獲媒介414上。採用 此方式，若調查特徵呈現在生物溶液中，則其變為一黏著 媒介以將珠報告項400黏著於生物碟片41〇之表面416上的 92831.doc -41 - 200523545 ?又媒’丨4 14上。當生物碟片係在光學碟片驅動器中旋轉 才所侍到的離主力傳送未黏著珠報告項4丨8至碟片之一外 ^周邊’❿已黏著珠報告項保持分配於採用捕獲媒介塗佈 的碟片之區域上。已黏著珠可採用一光學碟片讀取器加以 積則及里化。有關雙珠分析係進一步揭示在美國專利申請 案第09/997,7415虎中’其名稱為「含有光學生物碟片的雙珠 分析及其有關方法」，申請曰期為2001年u月27曰。 &可用於本發明的報告項包括但不限於合成或生物產生核 酉夂序列、合成或生物產生配合體黏著氨基酸序列、酶反應 之產以及由例如乳膠、聚苯乙烯製作的塑膠微球體或 珠' 或具有生物分子之塗層的膠狀金粒，該等分子具有對 於一給定材料（例如一 DNA股中一生物素分子）的一親合 力。適當的塗層包括採用（例如）鏈黴抗生物素蛋白或中性抗 生物素蛋白。在尺寸上對該等珠加以選擇，以便光學碟片 驅動器之讀取或詢問光束可「看見」&偵測由粒子引起的 表面反射率之一變化。 在”本t明相關的某引起具體實施例中，報告項珠係經 由DNA雜父黏著於碟片表面上。參考圖27及28，將一捕獲 &針432附著於碟片表面43〇上’而_信號探針^係附著於 報告項珠_(圖25)上。在_雜交分析的情況下，兩探針皆 係對目標序列436的補充。在呈現目標序列—的情況下， 捕獲及信號探針皆與目標雜交。採用此方式，將珠附著 於碟片表面430上。在一後來離心(或沖洗)步驟中，移除所 以未黏著珠。或者’目標本身係直接與珠黏著或鏈接而無 92831.doc -42- 200523545 需一額外發信探針之呈現。 參考圖29，在一免疫分析的情況下，碟片表面44〇係採用 一受體442(例如抗體）加以塗佈，該受體特定黏著於重要分 析物444(如調查特徵）上。可在碟片之分析區域中分離要分 析的各特定分析物之捕獲區域446。若一分析物444(抗原咬 抗體）係由呈現在捕獲區域446上的受體442(分別為抗原或 抗體）捕獲，則可將特定用於分析物之一信號產生組合用以 量化分析物的呈現。 或者’若由一光學碟片驅動之入射光束摘測具有足夠尺 寸的一調查特徵，則該特徵可能不需要一報告項。某些化 學反應及從其得到的產品及副產品（即沈澱物）引起所測試 的生物樣本之光學特性的一充分變化。此類變化可出現在 偵測調查特徵本身之後，例如在當將本發明用以建立一顯 微鏡結構之一影像時的情況下。光學碟片驅動器偵測生物 碟片之表面的光學特性之變化，並根據該等變化建立影像。 在本發明之一特定具體實施例中，一光學碟片系統（例如 圖10)包括一信號處理系統，及一光學碟片驅動器的一光偵 測器電路（例如圖12之158)，該驅動器係配置成採用一光學 碟片裝配件（例如圖1〇之碟片11〇)產生至少一資訊承載信號 (例如HF、TE或FE信號）。信號處理系統係與光偵測器^ 轉合’以從用以操作光學碟片系統的操作標記，及指示與 光學碟片裝配件相關的一調查特徵之一呈現的標記資料 (例如圖19B中的跡線），獲得至少一資訊承載信號。 在本發明之一變化中，光學碟片系統之信號處理系統包 92831.doc 200523545 括一 PC及用以提供一數位化信號給該pc的—類比數位轉 換。類比至數位轉換器係耦合在至少一資訊承載信號與 PC之間。PC包括一程式模組，其用以偵測並特徵化數位化 h唬中的峰值（例如參見圖丨9b中的跡線）。PC最好進一步包 · 括另一程式模組，其用以偵測並計數數位化信號中的雙峰 值（例如參見圖1 9B中的跡線）。 在本發明之另一變化中，光學碟片系統之信號處理系統 包括一 PC、用以提供一數位化信號給該pc的一類比數位轉 換益、以及权合在-類比至數位轉換器與—PC之間的—分# 析器。類比至數位轉換器係耦合在至少一資訊承載信號與 PC之間。分析器包括用以偵測並特徵化數缸化信號中的峰 值之邏輯。分析器最好進一步包括用以積測並計數數位化 信號中的雙峰值之邏輯。 ’光學碟片系統之信號處理系統
包括一 PC及用以提供一 在本發明之另一變化令， 包括一 PC及用以提供一數, 轉換杰。類比至數位轉換器 與PC之間。信號處理系統發 b中，光學碟片系統之信號處理系統 一數位化信號給該PC的一類比數位 9283 丨.doc -44 - 200523545 轉換杰。類比至數位轉換器係耦合在至少一資訊承載信號 與pc之間。信號處理系統進一步包括一外部緩衝器放大 杰，其係耦合在至少一資訊承載信號與類比至數位轉換器 之間。 在本發明之一進一步的變化中，光學碟片系統之信號處 理系統包括一 PC及用以提供一數位化信號給該Pc的一類 比數位轉換器。類比至數位轉換器係耦合在至少一資訊承 載信號與PC之間。信號處理系統進一步包括耦合在類比至 數位轉換杰之間的一觸發器偵測電路。觸發器偵測器電路 用來偵測一特定時間，其係關於當標記資料係呈現在至少 一貧訊承載信號中時的一時間。 在-替代具體實施例中，信號處理系統包括一可程式化 ，位信號處理器’其可選擇性地加以配置以⑴在—第一組 心中攸至少一貧訊承載信號擷取操作資訊，或（2)在一第二 〜中操作為一類比至數位轉換器以提供標記資料。 广-替代具體實施例中，光學碟片系統之信號處理系 Μ括-PC、與至少_資訊承載信號耗合的—可程式化數 L 處理A 1及耗合在該可程式化數位信號處理器與 該PC之間的一分析器。 絲 替代具體實施例中，光學碟片系統之信號處 、洗包括一觸發器偵測 .^ 电峪具偵測一時間周期，在該 期間與光學碑H $ ,+ 片為件相關的調查特徵係由光偵測器 加以掃描。 光學碟片系統之信號
在一進一步的替代具體實施例中 92831 .doc -45- 200523545 处里***包括一觸發器偵測電路，其偵測一特定時間，該 時間係關於當標記資料係呈現在至少一資訊承載信號中時 、、1 ^彳示5己資料係呈現在至少一資訊承載信號中時 的^間會周期性地出現。特定時間為每次標記資料在至少 貝Λ承載信號中開始呈現或結束（1)之前的一預定時間， () Τ間畜中的一時間，或（3)在該時間之後的一預定時 間。 ^ 替代具體實施例中，光學碟片系統之信號處理系 充匕括立PC以及耦合在該PC與至少一資訊承載信號之間 :聲3處理杈組。聲音處理模組最好為與光學碟片驅動 為無關的一外部模組、為光學碟片驅動器之一部分的一驅 動器模組、或為光學碟片驅動器之一部分的一修改驅動器 一：此ϋ體實施例之一變化中，pc包括與聲音模組耦 5的 處理器，以及一 m a . ^ . 、、’'且，，、係儲存在一記憶體中 以控制该處理器從聲音資料中擷取標記資料。 在一進一步的替代具體實施 測器電路包括用以產生一類師二，碟片系統之光伯 號的電路。類比信號包括來自丄 -^承載k 號、-追縱錯誤信號、一聚 I: 設定、-推挽追縱信號、一⑶追縱信°説二自動增益控制 一聚焦信號、一 i ^ JL CD-R追蹤信號、 差動相位偵測器信號、—帝 信號、或一聲音信號。 田射功率監視器 在另一具體實施例中，光學碟片系 ’ 月裝配件（例如圖1 〇之u 〇)。光學碟租〃包括光學碟 ”凌配件具有置放於第 9283I.doc -46- 200523545 -碟片扇區中裝配件上的相關調查特徵，並具有編碼在— 剩餘碟扇區中裝配件上、肖以操作光學碟片驅動器之扶
作資訊。 A 在一變化中，光學碟片裝配件包括一觸發器記號（例如圖 10之126)，其係置放在光學碟片裝配件上相對於第一碟片 扇區的—預定位置。信號處理系統進—步包括偵測觸發器 :己號的一觸發|§谓測器電路（例如圖1〇之158)。觸發器谓測 电路取好周期性地❹】觸發器記號，並且當由光偵測器根 據相對於第-碟片扇區的觸發器記號之預^位置讀取相關 =查特徵時’⑴在該時間之前的—默時間，⑺在該時間 的守間或（3)在該時間之後的一預定時間偵測觸發 在艾化中，光學碟片裝配件之相關調查特徵包括具有 一生物分子塗層的塑膠微球體、具有一生物分子塗層的膠 狀金珠、矽珠、玻璃珠、磁珠、或螢光珠。
在本發明之另一具體實施例中，提供一種方法，其包 以下步驟：沈積-測試樣本、旋轉光學碟片、；丨導一入 :束、偵測一返回光束、以及處理偵測的返回光束。沈 :測：樣本之步驟包括沈積樣本於一光學碟片裝配件上 置旋轉光學碟片之步驟包括在一光學碟片驅 器中旋轉裝配件。引導—入射氺击—> 卩丨泽入射先束之步驟包括將該光束 導至光學碟片裝配件上。 y 11導返回光束之步驟包括引 形成為與測試樣本動 助的入射先束之一結果的該返回 束。處理偵測的返回井圭 尤果之步驟處理偵測的返回光束， 92831 .doc -47- 200523545 》又付關於與測試樣本相關之_調查特徵的資訊。 在此具體實施例之一變化 成複數個_比㈣返^束之步驟形 複數個類比信號之一第一子集以產生一匯：：總 數個類比信穿之^ …，：弟一子集或—第二子集以產生-追縱錯 口&传用以採用該追縱錯誤信號操作-光學碟片驅 動為的資訊’以及將該匯總信號轉換為一數位化信號。 :本發明之另一具體實施例中，本發明為包括以下步驟 一一方法：獲得複數個類比信號、匯總-第一子集、植人 -第二子集、獲得資訊、以及將匯總信號轉換為一數位： 獲得複數個類比信號之步驟採用複數個光债測器從 一先學碟片裝配件獲得類比信號。匯總一第一子集之步驟 ㈣復數個類比信號之一第—子集以產生一匯總信號。組 合一弟二子集之步驟組合複數個類比信號之一第二子集以 m蹤錯誤m得資訊之步驟獲得用以採用追蹤 錯誤信號操作一光學碟片驅動器的資訊。 驟產生匯總信號，其 位置處的一調查特徵 在一變化中，獲得且匯總信號之步 包括指示定位於光學碟片裝配件之一 之擾動。 在另一變化中’該方法進一步包 /匕括根據數位化信號使調 查特徵特徵化之一步驟。 在該方法之另一變化中，轉換之+跑^ 科供又*步驟包括配置一光學碟 片驅動為晶片組之一部分，以操作為_ 器。配置之步驟最好包括程式化光學碟片 類比至數位轉換 驅動為晶片組内 92831.doc -48 - 200523545 一數位信號處理晶片，以操作為—類比至數位轉換器。數 位信號處理晶片最好包括一標準化功能、一類比至數位轉 換器功能：一解調變/解碼功能、以及一輸出介面功能。配 v驟最好進—步包括藉由建立從類比至數位轉換器功 此至輸出介面功能之_路徑，經由解調變/解碼功能而傳送 匯總彳§號。配置之步驟界^ ^ ' 之^私取好進一步包括停用解調變/解碼功 能。 在該方法之另一變化中，轉換之步驟包括配置一數位信 5虎處理晶片，其&枯—L® ^ η 1 、匕括払準化功旎、一類比至數位轉換器 功能一解調變/解碼功能、以及—輸出介面功能；而配置 '步驟包括建立從該類比至數位轉換器功能至該輸出介面 。力月b的路也’以便並非由該解調變/解碼功能處理匯總信 5虎。配置之步驟最好包括停用解調變/解碼功能。 在本發明之另—具體實施例中，一方法包括以下步驟： 調適-信號處理系統之一部分、獲得複數個類比信號、轉 換類比信號、以及根據-數位化信號使調查特徵特徵化。 調適一信號處理系統之一部分的步驟包括調適該部分以操 作為-類比至數位轉換器。獲得複數個類比信號之步驟採 用一光學碟片驅動器之一光债測器電路獲得類比信號。複 數個類比信號包括指示一光學碟片裝配件上之調杳特徵的 =轉Γ比信號之步驟採用信號處理系統將類比信號 ^換為一數位化信號。調適之步驟最好包括程式化信號處 Γ糸統内一數位信號處理晶片’以操作為類比至數位轉換 器0 92831.doc -49- 200523545 在本發明之另一替代具體實施例中，一方法包括接收及 轉換之步驟。接收之步驟包括接收信號處理電路之一對應 輸入處各至；一類比彳§號。藉由偵測從一光學碟片裝配件 之一表面返回的光之至少一對應光偵測器元件，已提供至 '颏比化號。轉換之步驟包括將各至少一類比信號轉換 為一對應數位化信號。各數位化信號係實質上上與藉由至 少一光偵測器元件之一對應者偵測的返回光之一強度成比 例。 在此具體實施例之一變化中，轉換之步驟包括操作信號 處理電路以旁通一第一數位化信號之任一解調變。轉換之 步驟最好進一步包括操作信號處理電路以旁通第一數位化 信號之任一解碼，並操作信號處理電路以旁通第一數位化 信號中任一錯誤檢查。 在此具體實施例之另一變化中，轉換之步驟包括操作信 號處理電路以旁通一第一數位化信號之任一解碼。 在此具體實施例之另一變化中，轉換之步驟包括操作信 號處理電路以旁通一第一數位化信號之任一錯誤檢查。 在此具體實施例之另一變化中，該方法進一步包括組合 至少一類比信號之至少二者的一步驟。組合之步驟最好為 選自由加、減、除、乘、及其一組合所組成的群組。組合 之步驟最好係在轉換之步驟之前加以執行。或者，組合之 步驟可在轉換之步驟之後加以執行。 在一進一步的變化中，該方法進一步包括在轉換之步驟 之後供應信號處理電路之一輸出介面處的至少一數位化信 9283 丨.doc -50- 200523545 號之一第一數位化信f卢，而七士 ^而無為實質上修改轉換與供應之 步驟之間的該第一數位化卢 ^就。信號處理電路最好包括一 數位^號處理器。信號處 心王电路最好係由一數位信號處理 器組成。 用於本發明之方法的姑4 '斗可理想地適合於一工具之製 備。此類工具可包括一藝轉 ’、 、 、 戟體°卩件，其係劃分為以封閉限制 的方式接收一光學生物磾片· ”片’以及一或多個容器，例如小 瓶子、管線及類似物，各衮哭 一 合谷杰包括要用於該方法的一獨立 元件。例如，容器之一去 如 考了包括一報告項及/或特定蛋白質 黏著試劑（例如抗體）0另一交 =可匕括此項技術中熟知的或 未來開發的隔離核酸、抗體、蛋白質、及/或本文說明的試 劑。要素可以按需要而呈現為液體或冷凍形式。用於本發 月之刀析工具的抗體可以為單源或多源抗體。例如，—抗 體亦可提供附於生物碟片之基板上的報告項。此外，報告 項可進一步與用於未來進行的分析之一指示項（例如—輻 射性標記或-酶）組合。-典型卫具亦包括用於本文說明的 方法之任一者或全部的一組指令。 在此具體實施例之一變化中，載體可進一步劃分為包括 δ有軟體的一設定光學碟片，用以配置用於生物碟片的〜 毛腦。視需要而定，工具可與一修改光學碟片驅動器封袭。 例如，可因教育目的而出售工具，作為共同顯微鏡的—替 代物。 具有等半徑分析區域的生物碟片 現在參考圖3〇至35說明依據本發明之生物碟片的替代具 92831 .doc -51 - 200523545 體實施例。已來者圖彳$ "圖至2 1解說該等後者具體實施例之碟片 的各種特徵，因此以下肢 上、 ^ 夺不再說明此類共同特徵。因此基 於間早之目的’作為图ία 為S 30至35的一般規則，僅表示使生物 碟片UG不同於^至^之碟片的特徵。 此外以下本發明之生物碟片11Q的說明可輕易地應用於 以亡結合圖2至9說明的透射型及反射型光學生物碟片。 一參考圖30，其顯示依據本發明之光學生物碟片的一具體 實施例之主要結構元件的一分解透視圖，在此情況下本發 明係全部由110指示。 下圖，即圖31為生物碟片11〇之一俯視圖，其中該碟片 之一蓋部分116係表示為透明以便顯露碟片11〇本身的内部 組件。 參考圖30及3卜光學生物碟片11〇包括已參考前述圖所介 紹的主要結構元件（即上述蓋部分116)、一黏性部件或通道 層118以及一基板120。 蓋部分116包括一或多個入口埠122。完全經由範例並基 於簡單之目的’圖30及31僅顯示二入口槔122。 黏性部件或通道層11 8具有形成於其中的流體室5〇2，在 该流體室中可進行調查特徵之檢查，並且以下將更詳細地 5尤明遠流體室。始終經由範例並基於簡單之目的，圖3 〇及 3 1僅顯示一流體室5 0 2。 基板120疋義一圓形内部周長503及與生物碟片11〇之内 周長503同心的一圓形外部周長504。 基板1 2 0包括一或多個反應部位5 0 5。完全經由範例並僅 92831.doc -52- 200523545 基於解說目的，圖30及31顯示僅向杠g從六 ⑹不1皇巴栝反應部位505之一單 組或陣列的一碟片。 捕 熟習此項技術者將瞭解反應部位505_般可以為目標或 獲區域。如參考圖丨至16已解說，形成此類目標區域可藉 由實體移除一所需位置處的碟片之 反射或半反射層的一 區域或部分，或者藉由在施加該反射或半反射層之前遮罩 該所需區域。或者如以上已解說，在透射型碟片中藉由 油墨絲網印刷至較薄半反射層上可建立目標區$，或藉由 碟片110上編碼的位址資訊來定義該等目標區域。 生物碟片110亦在基板120上提供一連串資訊磁執，其類 似於已參考圖1至2 1之具體實施例所說明的磁執17〇而且因 此並未表示在圖3〇及31中。 一般而言，資訊磁執為實質上圓形輪廓並且圓周會增 加，以與通常依據一螺旋輪廓從碟片11〇之内部周長5〇3延 伸至外部周長504的半徑成一函數關係。 此外，生物碟片110可提供與基板12〇相關的一操作層， 該層包括實質上沿一或多個資訊磁軌所定位的編碼資訊， 例如類似於參考圖1至16介紹的反射層142之一層。 現在參考圖30及31提供流體室502之一更詳細的說明。 首先應瞭解生物碟片110對應於流體室5〇2提供包括調查 特徵的、全部由506指示的一分析區域。 由本么月疋址的分析區域可包括任一類型的反應部位、 點陣列、捕獲部位或區域、目標區域、檢視視窗及類似物， 並且般而言該區域可以無論哪種類型、性質及結構之任 92831.doc -53- 200523545 一目標分析區域。 依據本發明之一般原理，分析區域506及因此包括流體室 二2具有參考圖i至16說明的具體實施例之組態的一替代組 恶。此替代組態係如此以便當電磁能量之—入射光束沿資 Λ磁軌追縱時，分析區域内的任—調查特徵因而隨—變 化角度座標得以詢問，而非該光束像在圖丨至以之具體實施 例中-樣沿-單一半徑（即以—@定角度座標）追蹤。 可輕易地瞭解並如圖31所示，藉由「角度座標」，因此希 望其為碟片11G之-平面圖中^義的平面角度“，其係在一 碟片參考徑向軸\與對應於一元件（例如一調查特徵）之實際 徑向位置的碟片徑向如之間’其中參考系統之中心係當： 設定在碟片1Η)本身之中心。同樣，藉由「徑向座標」，因 此希望其為一元件之實際位置，例如沿對應徑向軸Γ的一調 查特徵。 依據一較佳具體實施例，分析區域5〇6係實質上沿資訊磁 執引導。 在圖30及31所示的特定具體實施例中，流體室5〇2為一流 體管路或通道，其具有-中心部分52卜該部分依據與碟片 内部及外部周長503及504同心的一實質上圓周輪庵而延 伸，並具有二橫向臂部分523及524，其沿一實質上徑向延 伸0 反應部位505因此係沿流體通道中心部分521之圓周延伸 部分（即沿一圓娘）分配。因此，依據本發明，反應部位505 並非像在先前具體實施例中一樣沿一單一半徑（即在一單 92831.doc -54- 200523545 又座帖中）配置，而係在一變化角度座標中以固定半徑 加以配置。 二 士因此’當電磁能量之一入射光束沿碟片資訊磁執追蹤 時’分析區域506内的調查特徵因而依據一實質上圓周路徑 得以詢問。 以下此圓周配置將稱為「等半徑（eRad)」，而提供該等半 L的碟片稱為Γ eRad碟片」。因此基於方便之目的，本文可 交換利用術語「等半徑（equi_radlab e-radiab e-rad、eRad)」 或「0周」。 使用eRad碟片11 〇所出現的一問題為將入口埠122固定在 碟片本身上。如圖31所示，可使入口埠122處於對應通道5〇2 之圓周部分521的一不同徑向位置。然而，通道中心部分52工 取好係處於入口埠122之一較高徑向座標，以便防止向心力 引起最終包含在通道中的一液體從入口埠122中逃離。 依據一不同具體實施例，若入口埠得以密封（即保證不會 冷漏）’則亦可使通道中心部分處於低於入口埠的徑向座 標。 圖32A為本發明之併入等半徑（e-rad*eRad)或圓周通道 的反射生物碟片之一分解透視圖。此一般結構對應於圖2 所示的徑向通道碟片。圖32A所示的生物碟片u〇ie-rad實 施方案同樣包括蓋部分116、通道層118、以及基板120。通 道層118包括等半徑流體通道502,而基板12〇包括反應部位 或目標區域5 0 5之對應陣列。 圖32B為圖32A所示的碟片之一俯視平面圖。圖32B進一 9283l.doc -55- 200523545 步顯示具有一透明蓋部分的eRad碟片之一具體實施例的一 俯視平面圖，該碟片具有二層圓周流體通道，其具有Ab〇 血型化學品及二血型（A+及AB + )。如圖32B所示，亦可在本 發明之碟片的製造級提供一推理、最終在不同徑向座標中 的複數個入口埠，以便較大範圍的等半徑、螺旋、或徑向 反應部位及/或通道可在一碟片上。該等通道可用於不同測 試組，或用於單一測試組之多個樣本。 圖32C為圖32A所解說的碟片之一透視圖，切割區段顯示 寺半徑反射碟片之不同層。此圖類似於圖4所示的反射碟片 110。圖32C所示的反射生物碟片no之e-rad實施方案同樣包 括反射層142、施加於反射層142上的作用層144、以及蓋部 分116上的反射層146。 圖33A為本發明之利用同半徑通道的一透射生物碟片之 一分解透視圖。此一般結構對應於圖5所示的徑向通道碟 片。圖33 A所示的生物碟片11〇之透射e_rad實施方案同樣包 括蓋部分116、通道層118、以及基板120。通道層118包括 等半徑流體通道502，而基板120包括反應部位505之對應陣 列。 圖33B為圖33A所示的透射e-rad碟片之一俯視平面圖。圖 3 3B進一步顯示二層圓周流體通道，其具有ab〇化學品及二 么型（A+及AB + )。如先前所論述，在分析區域5〇6中執行分 析。 圖33C為圖33 A所解說的碟片之一透視圖，切割區段顯示 e-rad透射生物碟片之此具體實施例的不同層。此圖類似於 9283l.doc -56- 200523545 圖9所示的透射碟片110。圖31C所示的透射生物碟片11〇之 e-fad實施方案同樣包括較薄半反射層M3、施加於半反射層 143上的作用層丨44。 圖34顯示具有一透明蓋部分的咖碟片之一具體實施例 的一俯視平面圖，該碟片具有二層圓周流體通道，其具有 二不同分析，即CD4/CD8化學品與AB〇/RH化學品。碟片/ n 〇 係解說在一生物安全寳石箱1 1 7中。 圖35顯示具有一透明蓋部分的CD4/CD8 eRad.片之一 具體實施例的一俯視平面圖，該碟片具有六圓周流體通道 或配置在實質上相同徑向上的Erad通道。圖35之碟片工亦 係解說在生物安全寶石箱1 1 7中。 本舍明亦k供結合圖1及1 0說明的類型之一光學分析碟 片驅動器系統，包括調查特徵之詢問構件（特定言之為光 源）、光學偵測器，以及以上已結合圖10說明的相關光學組 件。 依據本發明，詢問構件適合於最好依據一變化角度座標 圓周式或螺旋式詢問碟片分析區域内的調查特徵。 碟片及系統之配置係最好如此以便碟片本身之旋轉以沿 分析室的一實質上一致分配形式來分配調查特徵。 碟片之旋轉更佳地以沿分析室的一實質上均勻分配形式 來分配調查特徵之濃度。 本發明亦提供採用迄今說明的一生物碟片及一光學碟片 驅動系統之一分析方法，該方法提供碟片調查特徵之一詢 問步驟’以便當電磁能量之一入射光束沿碟片資訊磁執追 92831.doc -57- 200523545 縱時’分析區域内的任一調查特徵因而依據一變化角度座 標（特定言之係依據一圓周或螺旋路徑）而得以詢問。 採用光學生物碟片偵測企紅素及糖化血紅素 糖化血紅素分析係用於糖尿病患者之長期碳水化合物控 ^ ^葡萄糖在Hb A1 c之形成所導致的0鏈上採用n末端綠 胺酸黏著於血紅素（Hb)時，即形成糖化血紅素。以抗體為 基礎的分析已用以直接伯測Hb之非酶糖化。然而，產生動 物中的特定HbAlc抗體非常困難，因為糖化血紅素分子之 糖部分並未得以曝露並且將導致特定免疫反應。均勻離子 父換色瑨與血紅素之一特定等級免疫分析的一組合可迅速 地分析糖化血紅素，而無需用於HbAlc的一特定探針。以 下說明對光學生物碟片實施的糖化血紅素分析之不同方 法。 光學生物碟片之陽離子交換鏈接免疫分析（celia) 離子交換樹脂 藉由將結合珠蛋白（用於血紅素種類的一般捕獲媒介）直 接固疋至光學生物碟片基板110之金表面或反射層143上， 進行血紅素之一多層免疫分析。山葵過氧化酶（Horseradish peroxidase ; HRP)標記山羊反人體血紅素抗體係用作酶共軛 信號抗體。ABTS[2,2’-連氮基-二-(3-乙烷-苯噻唑啉磺酸μ 係用作酶受質。取得分析室之光學生物碟片影像，並且產 生四參數適合標準曲線，如圖3 6及3 7所示。結果指示光學 生物碟片分析對於血紅素比較敏感，並能偵測糖化及非糖 化血紅素種類至相同程度。 92831.doc -58- 200523545 —弱陽離子交換樹脂（例如m甲基交聯葡聚糖珠）可用以將 一測試樣本中的非糖化血红素種類與糖化血紅素種類分 離。圖38解說本發明之光學生物碟片的一具體實施例，盆 中弱陽離子交換珠6()3係整合為流體管路128，以在光學生 物碟片110中形成一微色譜基質6〇4，從而隔離包括(例如) :、素的所分析物。採用此方法，冑包含糖化及非 糖化血、’工素形式的一血紅素樣本(例如血溶解產物)載入入 口埠122。接著旋轉碟片11〇，從而移動樣本經由陽離子交 換微色譜基質6G4。非糖化血紅素黏著於珠咖上，而且僅 糖化血紅素離開基質604並移經一過濾器614而且進入一分 析區域602，其中分析物得以量化，如以上所說明。或者， 非糖化血紅素可採用陰離子珠加以隔離。在此替代具體實 施例中，糖化血紅素黏著於陰離子珠，而非糖化血紅素穿 過微色瑨基質604並得以量化。總血色係亦需要連同糖化或 非糖化血紅素一起加以量化，以決定糖化血紅素之百分 比。總血紅素可直接採用直接載入分析區域6〇2的樣本加以 量化，或者中性珠亦可用於微色譜基質6〇4中，其中兩種血 紅素形式皆可自由地穿過，從而允許對總血紅素進行量化。 可使用螢光標記而非HRP標記反人體血紅素信號抗體， 並且可採用一螢光光學生物碟片驅動器來量化分析。或 者捕獲及k號媒介可以為結合珠蛋白，而非抗體。在此 情況下，分析將由以下組成：固定在一分析室内一捕獲或 目標區域中的一結合珠蛋白捕獲媒介，及一 HRP或螢光標 記結合珠蛋白信號媒介。亦可應用此項技術中熟知的其他 92831.doc -59- 200523545 了偵測標記。血红夸的後 与 過氧化酶W ㈣活性亦可❹採用適當 珠蛋白_二八地“§ 5虎，並僅需要(未標記的)結合 =蛋白捕獲媒介(或其他用於血紅素的捕獲蛋白質)以捕獲 刀析物，如以上所說明。 、 離=奐基…裝至流體通道中並與分析室-分 ::猎由知用與分析室602不同的一通道及/或分 :::度。：如’可將40至120微米陽離子交換珠用以形成 一父換基質。因此可以使用碟片上具有厚度〉⑽微米的 -通道或分析室（「離子交換區域」），其係與具有厚度<4〇 微米的-第二通道或室（分析室）連接。分析室的較薄厚度防 止珠進入分析室。此外，具有一毛細間系統的一微流體通 道設計可帛於本發明之料交換鏈接免疫分析具體實施 例。 離子交換隔膜 1)橫向液流隔膜 圖39及40顯示二具體實施例光學生物碟片11〇，其可用於 本發明之隔膜色譜分析，其中具有與（例如）糖化或非糖化血 紅素有關的化學改質隔膜616可用作本發明之基質材料。在 此情況下，可採用（例如）羧基曱基（一弱陽離子）隔膜形成橫 向液流隔膜616,以黏著非糖化血紅素。以下結合圖39及4〇 說明的本發明之生物碟片110,可輕易地應用於以上結合圖 2至9說明的透射型及反射型光學生物碟片。 在本發明之多層分析格式方法中，可以為一抗體或結合 珠蛋白或另一血紅素捕獲蛋白之捕獲媒介，可採用報告項 9283l.doc -60- 200523545 粒子（乳膠珠、金珠、端. 珠或其他珠）加以標記。樣本應用及 碟片旋轉步驟之後，非# 非糖化血紅素黏著於陽離子交換基質 並且糖化血紅素將移動$牲— 一 ^ 至特疋刀析至以及移動至目標或捕 獲區域。接著㈣光學生物w讀取Μ析目觀域之報 口項粒子的呈現及數量。為量測非糖化血紅素，可採用— 弱陰離子交換隔膜形成離子交換基質。 2)經由隔膜的液流（隔膜吸收器） 亦可將用於現成過濾器的離子交換隔膜吸收器（Sart〇rius、 Goettengen、Germany)用以形成基質。此外，亦可將以離心 機為基礎的離子交換隔膜旋轉柱（例如 (Vivascience、Hannover、Germany))嵌入一光學生物碟片， 如以下結合圖41及43所解說及說明；並用以採用後來以免 疫分析為基礎的光學生物碟片偵測來分離不同異構重整蛋 白（包括各種血紅素種類）。 參考圖39A，其顯示生物碟片11〇之不同層，用於橫向液 流及經由本發明之以隔膜為基礎的分析之液流。在此具體 實施例中，可組裝數層以形成螺旋流體管路丨28，如圖4〇b 所最佳解說。該等層可包括一頂部覆蓋碟片或蓋部分丨16 (解說在圖3 9B中）、一上通道層608、一下通道層612、位於 上層608與下層612之間的一中間隔膜或色譜層610、以及一 底部基板層120。基板層120可以為透射或反射型基板120， 如以上所論述。頂部蓋部分116包括一或多個入口埠12 2以 及一或多個出口璋124，如圖2、5、32A及33A所示。色譜 層610包括形成於其中的穿過埠606。可將化學改質隔膜616 9283l.doc -61 - 200523545 置於穿過埠606上。上通道層608及下通道層612具有形成於 其中的流體管路128，以便當將碟片11〇組裝成具有置於上 通道層608與下通道層612之間的色譜層610，並因此將底部 基板層1 2 0及頂部蓋部分11 6與碟片焊接時，形成一螺旋流 體色譜管路。 現在筝考圖39B ,其描述以上結合圖39A所說明的生物碟 片110之一分解圖，其顯示生物碟片之各層，該碟片包括頂 部蓋部分116、上通道層608、色譜層61〇、下通道層612、 以及底部基板層120。 接著參考圖39C，其解說圖39A至39B所說明的一完全組 裝生物碟片之一部分斷面圖，其顯示經由流體管路丨28的流 體液流之方向（箭頭）。經由蓋部分116之入口埠122將樣本引 入碟片110。固疋上通道層608、色譜層610、以及下通道層 612，以便隨著流體或樣本移經流體管路128時，引導流體 經由一連串化學改質隔膜6丨6，如圖所解說。將化學改質隔 膜616置於包括入口通道626及出口通道628的穿過埠上。化 學改質隔膜616可包括（例如）以上說明的離子交換及橫向液 流隔膜。 採用一多孔隔膜的生物分離在分子生物分析中致關重 要。本中請案證實將多孔材料（例如多孔隔膜或色譜隔膜） 整合至光學生物碟片110中的流體通道配置。 生物碟片110最好係由數層聚碳酸酯碟片及圖案化黏結 劑製作’以形成如圖39及4〇所解說的一螺旋流體管路。藉 由將多孔隔膜整合至如圖39及4()所解說的流體管路中，當 92831.doc 200523545 由離心力及/或其他類型的力驅動分析物時，施加的分析物 將流經多孔材料。 繼續參考圖39C，其顯示用於生物化學分析的一碟片之各 層的一圖案。本發明之光學生物碟片11〇可包括以下層·· 1) 基板層120為具有信號磁執的一透鏡碟片。基板層可以 為（例如）一CD、CD-R、DVD或DVD_R型碟片。基板12〇可 以包括一反射層142,其可以為透射或部分反射式，如以上 、、’口 a圖2至9所說明。因此，該基板可用以追縱碟片旋轉並 提供足夠光學信號以進行彳貞測。 2) 下通道層612可以採用一黏結劑形成，而流體通道128 即形成於該下通道層中。 3) 色譜層610為一碟片層，其具有所設計的穿過層6〇6以 便可將一色譜隔膜材料616整合至光學生物碟片11〇中。最 好將色譜隔膜616置於穿過埠606中或上。隔膜及色譜層厚 度最好相同。若隔膜層的厚度不同於色譜層的厚度，則可 藉由應用多層來調整各層的厚度。 4) 上通道層608可以採用一黏結劑形成，而流體通道即形 成於5亥上通道層中。圖案化流體通道僅在色譜層之穿過埠 606處與下通道層612之流體通道重疊，如圖所示。因此， 分析物將藉由僅垂直流經隔膜來穿過該等流體路徑，如圖 39C所最佳解說。 5) 頂端蓋部分116為一覆蓋碟片。使流體通道128容納測 4樣本，尤其係當分析需要一較大分析物容量時。 6) 本發明之光學生物碟片可視需要而包括蓋部分116上 92831 .doc -63 - 200523545 的一密封層（圖中未顯示）。該密封層覆蓋出口璋i24及入口 璋122’並防止流體管路128之污染物，而且當將測試樣本 載入生物碟片時防止該樣本蒸發。 般而§，分離概念係基於使色譜隔膜材料616配置在二 層流體路徑内’如圖39C所示。此外’達到生物分離可藉: 適當地配置流體路徑以允許分析物流經—連串色 616 〇 、 一圖39C顯示整合配置之一區段，並且此設計模組可藉由考 量以下因素而按比例增加或減小：隔膜尺寸及厚度、所需 隔膜之數量、以及需要的流體空間。 而 藉由串聯延伸此模組，分析物可流經二層以上的隔膜（如 圖39A至39C所示）。本發明可用於（例如）採用如以上論述的 一陽離子交換隔膜進行血紅素分^本發明亦可用於各種 生物分離及分析物捕獲應用，其不同於僅藉由多孔膠料的 分離。 / 現在參考圖40A，其顯示用於本發明之各種分析的生物碟 片110之-替代具體實施例的不同層。在此具體實施例I 可組裝六層以形成-螺旋流體管路’其具有藉由入口通道 626及出口通道628連接的上液流室62〇及下穿過室a〗，如 圖39C所最佳顯示。該等層可包括—頂部覆蓋碟片或蓋部分 116、一第一通道層632、一第二通道層634、—第三通道声 636、一第四通道層638、以及一底部基板層12〇。基板層 可以為透射或反射型基板120,如以上所論述。頂部蓋部分 U 6包括-或多個入口槔i 2 2以及—或多個出口埠叉2 4。在2 92831.doc -64- 200523545 4〇A之具體實施例中，第一通道層632具有切割分部，其包 括一延伸弓形切割640、短弓形切割644、一入口通道切割 642、一徑向切割658、以及一圓周切割652。第二通道層Μ# 具有切割部分，其包括一延伸弓形切割64〇、一圓周切割 652、一入口通道切割642、具有一圓形切割646的—徑向切 割658、以及包括其各端一中心切割部分65〇及圓形切割 的啞鈴形區段648 ,如圖所解說。同樣，第三通道層636包 括類似於第二通迢層634而無入口通道切割之切割部分，如 圖40A所顯。下一層為第四通道層638，其具有類似於第一 通道層632而無徑向切割分部之切割部分。來自第二、第二 及第四通道層的切割部分係相互配準中，以便當如圖4〇B 所示組裝碟片時，將一螺旋管路形成為包括入口埠、一混 合室134、上液流室620、下穿過室622、入口通道626、出 口通道628、以及一圓周分析室618。可將化學改質隔膜616 置於入口通道626及出口通道628上，如圖39C所最佳解說。 在另一替代具體實施例中，可組裝三層而非六層以形成 螺旋流體管路，其具有藉由入口通道626及出口通道628連 接的上液流室620及下穿過室622。該等層可包括一頂部覆 盍碟片或盍部分116、一室層、以及一底部基板層120。基 板層120可以為透射或反射型基板120，如以上所論述。頂 部蓋部分116包括一或多個入口埠122以及一或多個出口埠 124，如圖2、5、32A及33A所示。在本發明之光學生物碟 片的此具體實施例中，頂部蓋部分1丨6可包括形成於其中的 上液流室620。而將下穿過室形成於該室層中。可類似於形 9283l.doc -65- 200523545 成層638來形成中間室層，圖4〇A所示。可將化學改質隔膜 6 16置於入口通道626及出口通道628上。 繼績參考圖40B，其顯示圖40A所示的光學生物碟片之一 俯視圖的一圖示表示。所示的碟片之各組件包括入口埠 122、混合室134、上液流室62〇、下穿過室622、置於入口 通迢626及出口通道628上的化學改質隔膜616、圓周分析室 618、以及出口埠124。 現在參考圖41A、41B及41C，其解說製造用於色譜分析 的光學生物碟片之一方法。製造生物碟片的第一步驟為組 裝第二、第三及第四通道層以及基板12〇，如圖4〇a所解說。 採用對準孔624對準不同層以將各切割部分相互配準。接著 將化學改質隔膜616置於圓形切割部分内，如圖41β所示。 一旦隔膜處於適當位置，則組裝剩餘頂部層（蓋部分丨16及 第一通道層632)並將其置於預組裝底部層上，如圖斗丨匸所 示，從而完成本發明之光學生物碟片的組裝，如圖4〇β所描 述。 接著參考圖42A及42B，其解說使用如結合圖41 a至41C 說明所製㈣光學生物碟片《一方法；、經由至㉟合室i34 的入口埠將樣本載入碟片（箭頭載入樣本之後，將碟片 置於光學碟片驅動器112中。接著將採用光學碟片驅動器 112及適當軟體，以—預定速度及時間旋轉碟片110以控制 碟片旋轉速度、加速度以及時間。隨著碟片旋轉，樣本藉 由離心力而經由人口通道626及出口通道628移經上液流室 〇及下穿過至622。因為入口通道及出口通道包含化學改 92831.doc -66- 200523545 質隔膜6 1 6，所以接著在隔膜中插依 ^ ^ ^ 獲特定分析物，而其他分 析物移經分析室6 1 8。接著採用俨 们η.…. 則口琥媒介、捕獲媒介、酶、 及/或文質來分析並量化分析室中 J刀斫物，以產生可由氺 學碟片驅動器112偵測的一信號。 」由九 呈古似认* u , J才木用適當信號抗體或 /、有附於其上的一可偵測信號媒 ^ 丨又扶針或可產生一可偵 測信號的-酶，來偵測並量化黏著於 、 _ ^ , . t 、隔膜上的分析物。以 下乾例1說明關於採用本發明之 一步細節。 千生物碟片的分析之進 參考圖43A及43B ,其顯示製作用 於免疫化學及遺傳分析 的先學生物碟片之一方法的步 ^ ^ , 乂驟（取決於所用的捕獲媒介 或铋針的類型）。處理申的第一步 少知马將捕獲棟針之一溶液 施加於生物基質654上。隨 m 丨通此步驟的係藉由烘乾生物基質 654上的捕獲探針溶液 、 , 肘補獲奴針黏著於生物基質654 上。捕獲媒介或探針可以為一抗 彳几原抗體、配合體、受體、 ^ “、dna、rna、可黏著於目標或分析物上的任— 分子、或其中分析物特定黏著於其上的任一分子。接著將 具有黏著於其上的捕獲探針之個別生物基質654置於 所解說的一部分组炎头 4生物碟片上。以上結合圖41A已說明此 部分組裝生物磾Η夕4 μ 兄月此 物磲片之組件及裝配件。生物基質墊 位置之後，接荽# 4^田 者苑加第一通道層632及頂部覆蓋碟片U6， 如圖41 Β所示，以6 士 另 70成免疫化學或遺傳分析之生物碟片的組 裝。 下一組圖，即HI /1/1 a ^ 圖44A、44B、44C及44D顯示使用如結人圖 43A及43B說明戶斤制 ° 裂作的光學生物碟片之一方法的步驟。圖 92831.doc -67- 200523545 44A解s兄彳木用一吸液管366將一樣本載入混合室I%。一旦載 入樣本，則將碟片110載入碟片驅動器112並以一預定速度 及持續時間旋轉該碟片，以允許樣本以一速率移經流體管 路’戎速率允許呈現在樣本中的分析物具有充足的時間來 與生物基質塾654中其個別捕獲媒介黏著。各生物基質塾 654可包s不同類型的捕獲媒介以捕獲樣本中的不同分析 物。接.著從驅動器112中移除碟片11〇，並將具有或沒有附 於其上的報告項之信號媒介載入混合室134中（圖44B)。該 等‘唬媒’丨右呈現在生物基質墊654中，則黏著於捕獲的分 析物上L號媒介可包括抗原 '抗體、配合體、受體 '黏 著媒介、DNA、RNA、可黏著於目標或分析物上的任一分 子、或其中分析物特定點著於其上的任一分子。而報告項 可包括可由光學碟片驅動器112制的任—分子或材料，或 在呈現分析物或—受質的情況下產生—可Ϊ貞測信號的分 子。報告項可以為（例如）奈米球體、微球體、勞光粒子、化 學發光粒子、鱗光粒子、酶、以及酶受質。分析中的下— 步驟為沖洗定位在入口通道㈣及出口通道628中生物基質 她内的分析區域。執行沖洗係藉由利用向…載入沖 =衝溶液並旋轉碟片11〇，採用沖洗緩衝溶液來沖洗生物 基貝（圖，。可重複此沖洗步驟數次，取決於分析。亦可 先步驟加入以上說明的令間步驟之任-者卜接著將 ，片載入光學碟片驅動器112令，如圖彻所示。分析中的 最終步驟為，藉由引導來自光 ' 干碟片動器112的電磁輻射 μ’經由包含生物基質塾的入口通道及出口通道來 92831 .doc -68 - 200523545 分析生物基質墊，以決定是否有任何報告項呈現在生物基 質墊中，並決定呈現在各生物基質墊654中的報告項之數 量，從而允許量化重要分析物。螺旋流體管路組態允許同 時偵測並量化一樣本内的多個分析物，因為不同捕獲媒介 及信號媒介可用於或置於生物基質墊654中。 以下提供在光學生物碟片上實施的隔膜之更特定的論 述。 範例 範例1 碟片中血紅素分離 將弱陽離子交換隔膜（Vivascience、Hann〇ver、⑽y 產生的Vlvapure)嵌入光學生物碟片中，如以上結合圖41A 至41C所說明。藉由重新建立包含具有lml脫離子水的正常 及提高糖化血紅素之冷凍血紅素標準，製備血紅素標準溶 液（Eagle移斷、〇e s〇t〇、τχ)。正常標準包含7%的糖化血 、、工素，而提円標準包含14%的糖化血紅素。將6·9微升整分 的各標準溶液與1加、ρΗ值為6 9的5〇 mm M〇ps[3·嗎 啉）丙烷〜馱]緩衝溶液混合。將25〇微升的各糖化血 、、素“準^* a物載入不同生物碟片_而無需預均衡（2碟片 用於正㊉^示準及2碟片用於提高標準）。接著以1000 rpm的 轉速凝轉碟片4分鐘。從出口埠收集此實驗_所用的各生物 碟片之圓周分析室中50微升的各濾液。接著將整分的濾液 置於微里滴疋板中，並採用41 5 nm以分光光度量測方法 分析該濾液兩次。亦可分析總血紅素的數量，該分析係藉 92831 .doc 200523545 由取50 ul整为的未過濾MOPS/糖化血紅素標準混合物，並 採用415 nm以分光光度量測方法分析各混合物。圖45顯示 此實驗的結果，其指示樣本中的非糖化血紅素之成功遽出 僅留下用於分析的糖化血紅素。圖45進一步證實由從正常 標準（7%)及提高標準（14%)十收集的資料之比率所指示的 分析之線性。 結論摘要 雖已、纟σ合某些較佳具體實施例詳細地說明本發明，但 是應瞭解本發明並不限於該等精確的具體實施例。相反， 考慮到說明用以實施本發明之目前最佳模式的本光學生物 系統揭示此項技術者將可進行許多修改及變更而 不脫離本發明之範疇及精神。因此本發明之範疇係由以下 申請專例範圍而非上述說明加以指示。申請專利範圍之等 效物的含義及範圍内的所有變化、修改以及變更係視為在 其範疇内。
此外’熟習此項技術者將僅採用常規實驗而認識到或能 確定本文說明的本發明之特定具體實施例的許多等效物。 亦希望此類等效物係包括在以下申請專利範圍中。 【圖式簡單說明】 從附圖所顯示的本發明之 4 J + k Θ之以上較佳具體實施例的說明 將明白本發明之進一步目的 /日的以及促成本發明之目的的另 特徵及自其所產生的優點軟八 一 /生王旧儍點整伤圖式中的相同參考數字 示相同組件，其中·· 圖1為一生物碟片系統之一圖示表示； 92831.doc -70- 200523545 圖2為一反射生物碟片之一分解透視圖； 圖3為圖2所示的碟片之一俯視平面圖； 圖4為圖3所解說的碟片之一透視圖，切割區段顯示碟片 之不同層； 圖5為一透射生物碟片之一分解透視圖； 圖6為表示圖5所示的碟片之一透視圖，切割區段解說碟 片之一半反射層的功能方面； 圖7為顯示一較薄金膜的厚度與透射之間的關係之一曲 線表示； 圖8為圖5所示的碟片之一俯視平面圖； 圖9為圖8所解說的碟片之一透視圖，切割區段顯示包括 圖6所示的半反射層類型之碟片的不同層； 圖10為更洋細地解說圖丨之系統的一透視及方塊圖表示； 圖11為垂直於圖2、3及4解說的反射光學生物碟片之一半 徑所取的一部分斷面圖，其顯示形成於其中的一液流通道； 圖12為垂直於圖5、8及9解說的透射光學生物碟片之一半 徑所取的一部分斷面圖，其顯示形成於其中的一液流通道 及一頂部偵測器； 圖13為圖2、3及4所示的反射光學生物碟片之一部分縱向 斷面圖，其解說形成於其中的一擺動槽； 圖14為圖5、8及9所解說的透射光學生物碟片之一部分縱 向斷面圖，其顯示形成於其中的一擺動槽及一頂部偵測器； 圖15為類似於圖11的一圖，其顯示反射碟片的整個厚度 及該碟片的最初折射特性； 92831.doc -71 - 200523545 圖16為類似於圖12的一圖’其顯示透射碟片的整個厚度 及σ亥碟片的最初折射特性； 口圖17為樣本類比信號至儲存為一維陣列的一對應數位信 號之轉換的一圖示曲線表示； 圖U為-光學碟片之一透視圖，一指示區段之一放大詳 圖Ή相對於生物碟片的磁軌而加以固定的—捕獲白血 球’该碟片在與一入射光束互動之後產生一包含信號的光 束； 圖19Α為相對於一光學生物碟片$磁軌而加以固定的一 白血球之一曲線表示； 圖19Β為從圖19Α之白血球導出的一連串簽名執跡； 圖20Α ' 20B、20C及2〇D一起形成一圖示曲線表示，其表 示將圖19B的簽名軌跡轉換為數位信號，該等信號係儲存為 一維陣列並組合為用於資料輸入的一二維陣列； 圖21為-邏輯流程圖，其描延依據本文說明的處理方法 及計算演算法之資料評估的主要步驟； 圖22A、22B、22C及22D為一光學生物碟片之斷面側視 圖，其顯示偵測一測試樣本中的調查特徵之一方法； 圖23A、23B、23C及23D為用於一混合相位陣列中以偵測 -測試樣本中的調查特徵之一光學生物碟片的斷面側視 圖； 圖24A、24B、24C、24D、24E及24F為一光學生物碟片 之斷面側視圖，其顯示採用EUSA.測—測試樣本中的調 查特徵之一方法； 92831.doc -72- 200523545 圖25為-生物碟片之表面的一詳細部分斷面圖 具有黏著於該表面的抗原之特定親合力之報告項珠厂 圖26A、26B、26C及26D為-光學生物碟片之斷面側視 圖，其顯示使用報告項珠以偵測―测試樣本中的調查特徵 之一方法； 一 圖27為一生物碟片之表面的一詳細部分斷面圖，其顯示 使用報告項珠、捕獲探針以及信號探針則貞測—測試樣本 中的調查特徵； 圖28為類似於圖27的一圖，其顯示將調查特徵與捕獲及 信號探針雜交； 圖29為一生物碟片之—斷面側視圖，其顯示使用抗體塗 佈捕獲區域以偵測一測試樣本中的重要分析物； 圖3 0為依據本發明池 知5之生物碟片的一具體實施例之一分解 透視圖； 圖31為圖30之碟片的一俯視平面圖； 圖3 2 A為本發明之併人、上 併入同+徑通道的一反射生物碟片之 一分解透視圖； 圖32Β為圖32Α所示的碟片之一俯視平面圖； 圖32C為圖32Β所解說的碟片之一透視圖，切割區段顯示 等半徑反射碟片之不同層； 圖33Α為本發明之利用同半徑通道的一透射生物碟片之 一分解透視圖； 圖33Β為圖33Α所示的碟片之___視平面圖； 圖33C為圖33B所解說的碟片之一透視圖，切割區段顯示 92831.doc -73- 200523545 等半徑透射生物碟片之此具體實施例的不同層； 圖34及35分別為本發明之生物碟片的一個別額外具體實 施例的俯視圖，其係分別顯示在一生物安全寳石箱中，· 圖36為從一透射光學生物碟片中導出的影像之_圖示表 不，其顯示從血紅素之各種濃度中導出的信號之差別； 圖37為採用本發明之光學生物碟片系統產生的一劑量回 應曲線之一曲線表示； 圖38為在一流體管路中具有一微色譜基質之光學生物碟 片的另一具體實施例之一俯視平面圖； 圖3 9A為本發明之一色譜光學生物碟片之各層的俯視平 面圖； 圖39B為圖39A之色譜光學生物碟片的一分解透視圖； 圖3 9C為垂直於顯示形成於圖3 9]B所解說的光學生物碟 片之一半徑所取的一部分斷面圖，其顯示樣本在流體管路 内流動的方向； 圖40A為色譜光學生物碟片之一替代具體實施例的一分 解透視圖； 圖40B為圖40 A之光學生物碟片的一俯視平面圖； 圖41A、41B及41C顯示用以製造用於色譜分析的光學生 物碟片之步驟； 圖42A及42B顯示使用依據結合圖41人至41C說明的步驟 所製作的光學生物碟片之一方法的步驟； 圖43 A及43B顯示製作用於免疫化學及遺傳分析的光學 生物碟片之一方法的步驟； 92831 .doc -74- 200523545 而製作的光學生物碟片之—、’用如圖43A及所解况 m ^ $的步驟· 素分杆 圖為採用光學生物碟片進行〜 ， 所導致的結 果之—條線圖表示。 仃—血紅 【圖式代表符號說明】 110 光學生物碟片 112 碟片驅動器 114 顯示器監視器 116 蓋部分 117 生物安全寳石 118 通道層 120 基板 122 入口埠 124 出口埠 126 觸發器記號 128 流體管路 130 液流通道 132 返回通道 134 混合室 136 對稱混合室 138 偏移混合室 140 目標區域 142 反射層 143 半反射層 92831 -doc -75- 200523545 144 作用層 146 反射面 148 光學組件 150 光源 152 詢問光束/入射光束 154 返回光束 156 透射光束 157 底部偵測器 158 頂部偵測器 160 觸發器偵測器 162 驅動器馬達 164 控制器 166 處理器 168 分析器 170 溝槽 210 類比信號/白血球 212 時間間隔 214 類比幅度 216 離散二進制整數 218 開始時間 220 結束時間 222 數位信號 224 樣本點 226 一維陣列 92831.doc -76- 200523545 228 二維陣列 230 白血球 232 磁軌 240 影像檔案 244 輸入資料 350 光學生物碟片 352 水測試樣本 354 微通道 358 捕獲探針 360 生物碟片 362 隔層 364 基板 366 吸液管 368 樣本 370 股分子 372 異種核酸及/或蛋白質 380 表面 382 抗原 386 血樣本 388 抗體 390 沈積物 400 珠 402 生物抗原材料 410 光學碟片 92831.doc -77- 200523545 412 調查特徵 414 捕獲媒介 416 表面 418 報告項 430 碟片表面 432 捕獲探針 436 目標序列 440 碟片表面 442 受體 444 分析物 446 捕獲區域 502 流體室 503 内部周長 504 外部周長 505 反應部位 506 分析區域 521 中心部分 523 橫向臂部分 524 橫向臂部分 602 分析區域 603 弱陽離子交換珠 604 微色譜基質 606 穿過埠 608 上通道層 92831 .doc -78- 200523545 610 中間隔膜或色譜層 612 下通道層 614 過濾·器 616 化學改質隔膜 618 圓周分析室 620 上液流室 622 下穿過室 624 對準孔 626 入口通道 628 出口通道 632 第一通道層 634 第二通道層 636 第三通道層 638 第四通道層 640 延伸弓形切割 642 入口通道切割 644 短弓形切割 646 圓形切割 648 啞鈐形區段 650 中心切割部分 652 圓周切割 654 生物基質 658 徑向切割 A 磁執/類比信號
92831.doc -79- 200523545 B 磁軌/類 比 信 號 C 磁執/類 比 信 號 D 磁軌/類 比 信 號 B 長度 rc 彎曲半徑 92831.doc - 80 -

Claims (1)

  1. 200523545 拾、申請專利範圍： 1· 一種光學生物碟片，其包括： 一蓋部分，其具有形成於其中的入口瑋及出口埠； 一第一通道層，其具有切割部分； 一第二通道層，其具有切割部分； 一第三通道層，其具有切割部分； 一第四通道層，其具有切割部分；以及 貝貝上圓形基板’其具有一中心及一外緣。 2.如申請專利範圍第1項之光學生物碟片，其中該第一通道 層中的邊專切割分部包括一延伸弓形切割、短弓形切 割、一入口通道切割、一徑向切割、以及一圓周切割之 至少一者。 3·如申請專利範圍第1項之光學生物碟片，其中該第二通道 層中的該等切割分部包括一延伸弓形切割、0亞鈴形切 割、一入口通道切割、具有一圓形切割的一徑向切割、 以及一圓周切割之至少一者。 4.如申請專利範圍第1項之光學生物碟片，其中該第三通道 層中的該等切割分部包括一延伸弓形切割、啞鈴形切 割、具有一圓形切割的一徑向切割、以及一圓周切割之 至少一者。 5·如申請專利範圍第1項之光學生物碟片，其中該第四通道 層中的該等切割分部包括一延伸弓形切割、短弓形切 割、一入口通道切割、以及一圓周切割之至少一者。 6.如申請專利範圍第丨項之任一項之光學生物碟片，其中該 92831.doc 200523545 等切割部分係相互配準以便當組裝該生物碟片時，將一 螺旋流體管路形成為具有進行流體通信的一入口埠、一 匕5至 上液流室、下穿過至、入口通道、出口通道、 一圓周分析室、以及出口埠。 7· 8. 9. 如申請專利範圍第1項之光學生物碟片，其進一步包括置 於該等入口通道及出口通道之一或多個甲的一化學改質 隔膜。 如申請專利範圍第丨項之光學生物碟片，其進一步包括置 於該等入口通道及出口通道之一或多個中的生物基質。 一種製作一色譜光學生物碟片的方法，該方法包括以下 步驟： 提供一基板，其具有一中心及一外緣； 提供一蓋部分，其具有形成於其中的一入口埠及一出 口埠； 提供一具有切割部分之第一通道層； 提供一具有切割部分之第二通道層； 提供一具有切割部分之第三通道層； 提供一具有切割部分之第四通道層；以及 以便該等切割部分 組裝該光學生物碟片 流體管路。 10. 11. 專切割分部包括-延伸弓形切割、短弓形切判、— 通道切割、—徑向切割、以及-圓周切割之至小—士 如申請專利範圍第9項之方法，其中該第二通道層中: 92831.doc 200523545 一入口 一圓周 等切割分部包括一延伸弓形切割、啞鈴形切割、 通道切割、具有一圓形切割的一徑向切割、以及 切割之至少一者。 12. 13. 14. 15. 16. 17. 18. 19. =申請專利範圍第9項之方法，其中該第三通道層令的該 f切割分部包括一延伸弓形切割、啞鈐形切割、具有一 圓幵d刀害ij的一徑向切害j、以及一圓周切割之至少一者。 :申請專利範圍第9項之方法，丨中該第四通道層中的該 等切割分部包括一延伸弓形切割、短弓形切割、一入： 通道切割、以及一圓周切割之至少一者。 如申請專利範圍第9項之任一項之方法，纟中該等切割部 :係相互配準以便當組裝該生物碟片時，將一螺旋流體 官路形成為具有進行流體通信的一入口埠、一混合室、 上液流室、下穿過室、人口通道、出口通道、―圓^分 析室、以及出口埠。 其進一步包括將一生物 驟。 其進一步包括將一化學 步驟。 如申凊專利範圍第14項之方法， 基質塾置於該等下穿過室上之步 如申請專利範圍第14項之方法， 改質隔膜置於該等下穿過室上之 如申請專利範圍第9項之方法，其進—步包括對與該基相 :關的-資訊層進行資訊編碼之步驟，該編碼資訊可连 一碟片驅動器裝配件讀取以控制該碟片之旋轉。 如申請專利範圍第9項之方法’其進—步包括將_或多帝 捕獲媒介附著於該光學生物碟片上之步驟。 如申請專利範圍第18項之方法，纟中該等—或多謂 92831.doc 200523545 媒介係選自包括以下各項的群組：抗原、抗體、配合體、 受體、黏著媒介、DNA、RNA、可黏著於該目標或分析 物上的任—分子、以及其中該分析物特定黏著於其上的 任一分子〇 20. —種使用一光學生物碟片的方法，該方法包括： 經由一入口埠將一測試樣本沈積至該碟片上； 以-預定速度及時間旋轉該碟片以允許該測試樣本移 經-生物基質墊’以便呈現在該樣本中的分析物黏著於 該生物基質墊中的捕獲媒介上； 繼續該旋轉步驟以移動該測試樣本穿過該光學生物碟 片之一螺旋流體管路，並移入一分析室· 經由該入口埠將具有黏著於其上的一或多個報告項之 信號媒介沈積於該生物碟片上； 方疋轉5亥碟片以允許該等信號媒介移經該生物基質势， 以便遠等信號媒介黏著於任一已黏著於該生物基質墊中 的该等捕獲媒介上之分析物上；以及 採用電磁輻射之一光束掃描該等入口通道及出口通道 中的該等生物基質墊，以決定已黏著於該等生物基質墊 内該等分析物上的信號媒介之存在及數量。 21·如申請專利範圍第20項之方法，其進一步包括根據已黏 著的信號媒介之該數量，來計算該樣本中呈現的分析物 之該數量的步驟。 22·如申請專利範圍第2〇項之方法，其_該等信號媒介係選 自包括以下各項的群組··抗原、抗體、配合體、受體、 92831.doc 200523545 黏耆媒介、DNA、rNA、.可黏著於該目標或分析物上的 任一分子、以及其中該分析物特定黏著於其上的任一分 〇 23. 24. 如申請專利範圍第20項之方法，其中該等一或多個報告 項係選自包括以下各項的群組：可由一光學碟片驅動器 偵測的任一分子或材料、以及在呈現該分析物或一受質 的情況下產生一可偵測信號之任一分子。 如申請專利範圍第20項之方法，其中該等一或多個報告 項係選自包括以下的群組：奈米球體、微球體、勞光粒 子、化學發光粒子、磷光粒子、酶、以及酶受質。 9283l.doc
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