TH128856B - "ระบบอัตโนมัติสำหรับวิเคราะห์การแปรผันของลำดับเบสของดีเอ็นเอที่ได้จากเครื่อง อ่านลำดับเบสที่ใช้เทคโนโลยีเทอมิเนเตอร์ไซเคิลซีเคว้นซิ่ง" - Google Patents

"ระบบอัตโนมัติสำหรับวิเคราะห์การแปรผันของลำดับเบสของดีเอ็นเอที่ได้จากเครื่อง อ่านลำดับเบสที่ใช้เทคโนโลยีเทอมิเนเตอร์ไซเคิลซีเคว้นซิ่ง"

Info

Publication number
TH128856B
TH128856B TH1201004892A TH1201004892A TH128856B TH 128856 B TH128856 B TH 128856B TH 1201004892 A TH1201004892 A TH 1201004892A TH 1201004892 A TH1201004892 A TH 1201004892A TH 128856 B TH128856 B TH 128856B
Authority
TH
Thailand
Prior art keywords
sequencing
dna
terminator cycle
technology
sequence
Prior art date
Application number
TH1201004892A
Other languages
English (en)
Other versions
TH128856A (th
TH74416B (th
Inventor
นาย ศุภศักดิ์ กุลวงศ์อนันชัย นาย กฤษดากร ไชยชุมภู นาง วรรณวิสาข์ เจริญฉิม นางสาว อลิษา วิลันโท นาย ศิษเฎศ ทองสิมา นาย อนันต์ชัย อัศวเมฆิน
Original Assignee
สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
Filing date
Publication date
Application filed by สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ filed Critical สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
Publication of TH128856B publication Critical patent/TH128856B/th
Publication of TH128856A publication Critical patent/TH128856A/th
Publication of TH74416B publication Critical patent/TH74416B/th

Links

Abstract

การประดิษฐ์นี้ได้พัฒนาระบบอัตโนมัติสำหรับวิเคราะห์การแปรผันของลำดับเบสของ ดีเอ็นเอที่ได้จากเครื่องอ่านลำดับเบสที่ใช้เทคโนโลยีเทอมิเนเตอร์ไซเคิลซีเคว้นซิ่ง เพื่อแก้ไข ข้อจำกัดเดิม ได้แก่ การเพิ่มความสามารถในการวิเคราะห์การแปรผันของลำดับเบสของดีเอ็นเอ ได้ครอบคลุมทุกรูปแบบ และการวิเคราะห์การแปรผันของลำดับเบาของดีเอ็นเอที่ได้จากเครื่อง อ่านลำดับเบสได้อย่างอัตโนมัติ รวดเร็ว และมีความถูกต้องแม่นยำ เนื่องจากระบบตามการ ประดิษฐ์นี้ ประกอบด้วย เครื่องอ่านลำดับเบสที่ใช้เทคโนโลยีเทอมิเนเตอร์ไซเคิลซีเคว้นซิ่ง เครื่องประดิษฐ์การแปรผันของลำดับเบสของดีเอ็นเอที่อย่างน้อยที่สุดประกอบด้วยหน่วย ประมวลผลกลาง หน่วยความจำ RAM ฮาร์ดดิสก์ พอร์ตอินพุด และจอแสดงผล และอุปกรณ์ เชื่อมต่อระหว่างเครื่องอ่านลำดับเบสที่ใช้เทคโนโลยีเทอมิเนเตอร์ไซเคิลซีเคว้นซิ่ง ดังกล่าวกับ พอร์ตอินพุดของเครื่องวิเคราะห์การแปรผันของลำดับเบสของดีเอ็นเอ โดยมีลักษณะเฉพาะ คือ เครื่องวิเคราะห์การแปรผันของลำดับเบสของดีเอ็นเอทำงานตามขั้นตอนดังนั้น (1) ขั้นตอนการ จัดเตรียมข้อมูลลำดับเบส ด้วยการแปล จำแนกและปรับแต่งสัญญาณลำดับเบสของดีเอ็นเอที่ได้ จากเครื่องอ่านลำดับเบสที่ใช้เทคโนโลยีเทอมิเนเตอร์ไซเคิลซีเคว้นซิ่งโดยใช้กระบวนการโอโต เมตโลเคิลฮิวรีสติก (Automate / local heuristic) และการเข้ารหัสซีดเมอร์ (seed mer) แบบ เลื่อนที่ละ 1 เบส (2) ขั้นตอนการเรียงลำดับสายดีเอ็นอตัวอย่างบนสายดีเอ็นเออ้างอิงด้วย วิธีการค้นหาตำแหน่งจากตารางดัชนี (look up index) ประกอบกับการใช้ค่าโหมดอะไลน์เม็นท์ (MODE alignment) เพื่อระบุตำแหน่งการเรียงตัวและนำไปสู่การวิเคราะห์การแปรผันของลำดับ ของลำดับเบสของดีเอ็นเอ ซึ่งข้อมุลที่ได้จากการวิเคราะห์ด้วยระบบตามการประดิษฐ์นี้จะมี คุณภาพสูงและเอื้อต่อการนำไปใช้ประโยชน์ทั้งในแง่การวินิจฉัยและการศึกษาวิจัยต่อได้อย่าง ถูกต้องและชัดเจน

Claims (1)

1. ระบบอัตโนมัติสำหรับวิเคราะห์การแปรผันของลำดับเบสของดีเอ็นเอที่ได้จากเครื่องอ่าน ลำดับเบสที่ใช้เทคโนโลยีเทอมิเนเตอร์ไซเคิลซีเคว้นซิ่ง ประกอบด้วย (สูตร) เครื่องอ่านลำดับเบสที่ใช้เทคโนโลยีเทอมิเนเตอร์ไซเคิลซีเคว้นซิ่ง สำหรับอ่านข้อมูล ลำดับเบสของดีเอ็นเอตัวอย่างที่ต้องการวิเคราะห์ (สูตร) เครื่องวิเคราะห์การผันแปรของลำดับเบสของดีเอ็นเอที่อย่างน้อยที่สุดประกอบด้วยหน่วย ประมวลผลกลาง หน่วยความจำ RAM ฮาร์ดดิสก์ พอร์ตอินพุต และจอแสดงผล (สูตร) อุปกรณ
TH1201004892A 2012-09-21 ระบบอัตโนมัติสำหรับวิเคราะห์การแปรผันของลำดับเบสของดีเอ็นเอที่ได้จากเครื่องอ่านลำดับเบสที่ใช้เทคโนโลยีเทอมิเนเตอร์ไซเคิลซีเคว้นซิ่ง TH74416B (th)

Publications (3)

Publication Number Publication Date
TH128856B true TH128856B (th) 2013-11-07
TH128856A TH128856A (th) 2013-11-07
TH74416B TH74416B (th) 2020-02-14

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Zangar et al. ELISA microarray technology as a high-throughput system for cancer biomarker validation
CN101836114B (zh) 免疫测定分析方法
CN103267843A (zh) 胶体金试纸卡、相应的胶体金分析仪及测试方法
DK1949849T3 (da) Vurderingsfremgangsmåde til behandling af et glucosekoncentrationssignal
DK1388734T3 (da) Metode til opløsningsbaseret diagnose
CN107862350B (zh) 试纸检测方法、装置、***及程序产品
RU2010108229A (ru) Система и способ для автоматической калибровки
CN103439266A (zh) 一种珠宝玉石及岩石矿物的鉴定分析***
KR20110024747A (ko) 카메라를 이용한 검체 정량 측정 기기, 방법 및 시스템
CN109886928A (zh) 一种目标细胞标记方法、装置、存储介质及终端设备
CN104903899A (zh) 用于数字pcr数据的视像工具
CN104838383A (zh) 基于患者的结果显示器
EP3907697A1 (en) Method and apparatus for acquiring information
IN2015DN01491A (th)
EA200801809A1 (ru) Комбинация считывателя и термостата
WO2021135365A1 (zh) 测试结果确定方法及装置
Kearse et al. The Geneious 6.0. 3 read mapper
US20220270228A1 (en) Method and apparatus for obtaining information
TW201514861A (zh) 檢測卡匣讀取裝置及其讀取方法
CN113138916B (zh) 基于标注样本的图片结构化算法的自动测试方法及***
CN116434837B (zh) 一种基于ngs的染色体平衡易位检测分析***
WO2021135366A1 (zh) 样本测试项的排布方法及装置
CN201936003U (zh) 电阻测试仪的校准测试***
TH128856B (th) "ระบบอัตโนมัติสำหรับวิเคราะห์การแปรผันของลำดับเบสของดีเอ็นเอที่ได้จากเครื่อง อ่านลำดับเบสที่ใช้เทคโนโลยีเทอมิเนเตอร์ไซเคิลซีเคว้นซิ่ง"
CN115376612A (zh) 一种数据评测方法、装置、电子设备及存储介质