RU99127287A - METHODS AND COMPOSITIONS FOR IDENTIFICATION OF PIGS GENETICALLY RESISTANT TO DISEASES ASSOCIATED WITH F18E. Coli - Google Patents

METHODS AND COMPOSITIONS FOR IDENTIFICATION OF PIGS GENETICALLY RESISTANT TO DISEASES ASSOCIATED WITH F18E. Coli

Info

Publication number
RU99127287A
RU99127287A RU99127287/13A RU99127287A RU99127287A RU 99127287 A RU99127287 A RU 99127287A RU 99127287/13 A RU99127287/13 A RU 99127287/13A RU 99127287 A RU99127287 A RU 99127287A RU 99127287 A RU99127287 A RU 99127287A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
pigs
coli
alpha
resistant
dna molecule
Prior art date
Application number
RU99127287/13A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2204609C2 (en
Inventor
Брэд Т. БОСВОРТ
Петер ВеГЕЛИ
Original Assignee
Биотехнолоджи Резерч Энд Девелопмент Корпорэйшн
Ю.С. Департмент оф Агрикалче
Швисс Федерэл Инститьют Оф Технолоджи Цюрих
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Биотехнолоджи Резерч Энд Девелопмент Корпорэйшн, Ю.С. Департмент оф Агрикалче, Швисс Федерэл Инститьют Оф Технолоджи Цюрих filed Critical Биотехнолоджи Резерч Энд Девелопмент Корпорэйшн
Publication of RU99127287A publication Critical patent/RU99127287A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2204609C2 publication Critical patent/RU2204609C2/en

Links

Claims (18)

1. Способ идентификации свиней, которые являются резистентными к кишечной колонизации E. coli, где указанный способ предусматривает обнаружение присутствия генетического полиморфизма, ассоциированного с резистентностью к бактериальной колонизации, в биологическом образце, взятом от свиней, и установление того факта, что данная свинья является резистентной в том случае, если эта свинья является гомозиготной по этому полиморфизму.1. A method for identifying pigs that are resistant to intestinal colonization of E. coli, wherein said method comprises detecting the presence of genetic polymorphism associated with resistance to bacterial colonization in a biological sample taken from pigs, and establishing that the pig is resistant in the event that this pig is homozygous for this polymorphism. 2. Способ идентификации свиней, резистентных к кишечным заболеваниям, ассоциированным с E. coli, где указанный способ предусматривает определение того факта, является ли азотистым основанием в положении 307 гена альфа-(1,2)-фукозилтрансферазы 1 в биологическом образце, взятом у свиньи, лишь аденин, и идентификация свиней, как резистентных, если в положении 307 азотистым основанием является лишь аденин. 2. A method for identifying pigs resistant to intestinal diseases associated with E. coli, wherein the method comprises determining whether the nitrogen base at position 307 of the alpha (1,2) -fucosyl transferase 1 gene is in a biological sample from a pig , only adenine, and identification of pigs as resistant, if at position 307 only adenine is the nitrogenous base. 3. Способ разведения свиней, резистентных к заболеваниям, ассоциированным с E. coli, где указанный способ предусматривает отбор для разведения таких свиней, которые обнаруживают генетический полиморфизм по гену альфа-(1,2)-фукозилтрансферазы 1, что позволяет идентифицировать их как свиней, резистентных к кишечным заболеваниям, ассоциированным с E. coli, и разведение отобранных свиней. 3. A method for breeding pigs resistant to diseases associated with E. coli, wherein said method comprises selecting for breeding pigs that exhibit genetic polymorphism for the alpha (1,2) -fucosyl transferase 1 gene, which makes it possible to identify them as pigs, resistant to intestinal diseases associated with E. coli, and breeding of selected pigs. 4. Способ по п. 1, 2 или 3, где E. coli является штамм F18. 4. The method according to p. 1, 2 or 3, where E. coli is strain F18. 5. Выделенная ДНК-молекула, которая является полиморфной по свиному гену альфа-(1,2)-фукозилтрансферазы 1. 5. An isolated DNA molecule that is polymorphic for the porcine gene of alpha- (1,2) -fucosyltransferase 1. 6. Выделенная ДНК-молекула, имеющая нуклеотидную последовательность, представленную на Фиг. 1. 6. An isolated DNA molecule having the nucleotide sequence shown in FIG. 1. 7. Выделенная ДНК-молекула по п. 6, где в положении 307 вместо гуанина присутствует аденин. 7. The isolated DNA molecule according to claim 6, wherein at position 307 adenine is present instead of guanine. 8. Выделенная ДНК-молекула, которая является комплементарной нуклеотидной последовательности по п. 6. 8. The selected DNA molecule, which is a complementary nucleotide sequence according to claim 6. 9. Выделенная ДНК-молекула по п. 6, где в нуклеотидном положении 887 гуанин заменен аденином. 9. The isolated DNA molecule according to claim 6, where in the nucleotide position of 887 guanine is replaced by adenine. 10. Выделенная ДНК-молекула по п. 6, где в нуклеотидном положении 229 присутствует треонин. 10. The isolated DNA molecule according to claim 6, wherein threonine is present at nucleotide position 229. 11. Полипептид, кодируемый ДНК-молекулой по п. 5 или 6, где указанная молекула имеет альфа-(1,2)-фукозилтрансферазную активность. 11. The polypeptide encoded by the DNA molecule according to claim 5 or 6, where the specified molecule has alpha- (1,2) -fucosyltransferase activity. 12. Часть выделенной ДНК-молекулы по п. 5 или 6, где указанная часть включает в себя нуклеотидную последовательность, которая позволяет идентифицировать свиней, резистентных к E. coli, от свиней, восприимчивых к E. coli. 12. A portion of the isolated DNA molecule according to claim 5 or 6, wherein said portion includes a nucleotide sequence that allows identification of E. coli resistant pigs from E. coli susceptible pigs. 13. Молекулярный анализ для обнаружения рецепторов F18 E. coli у свиней, где указанный анализ предусматривает выделение ДНК из ядросодержащих клеток свиней; амплификацию указанной ДНК посредством полимеразной цепной реакции с использованием олигонуклеотидов в качестве праймеров, которые являются комплементарными ДНК-последовательности гена альфа-(1,2)-фукозилтрансферазы 1; осуществление разрезания, по крайней мере, одним рестриктирующим ферментом; разделение полученных фрагментов с помощью гель-электрофореза; определение соответствующего числа и длин фрагментов на геле; и определение, исходя из числа и длин фрагментов F18, какие именно присутствуют рецепторы. 13. Molecular analysis to detect E. coli F18 receptors in pigs, wherein said analysis provides for the isolation of DNA from porcine nucleated cells; amplification of said DNA by polymerase chain reaction using oligonucleotides as primers that are complementary to the DNA sequence of the alpha (1,2) -fucosyltransferase gene 1; performing cutting with at least one restriction enzyme; separation of the obtained fragments using gel electrophoresis; determination of the corresponding number and lengths of fragments on the gel; and determining, based on the number and lengths of F18 fragments, which particular receptors are present. 14. Молекулярный анализ по п. 13, где рестриктирующим ферментом является Cfol. 14. The molecular analysis of claim 13, wherein the restriction enzyme is Cfol. 15. Набор для. обнаружения рецепторов F18 E. coli, где указанный набор включает в себя олигонуклеотиды, которые находятся в отдельных контейнерах, и которые являются комплементарными ДНК-последовательности с полиморфизмом по гену 1 альфа-(1,2)-фукозилтрансферазы свиньи. 15. Set for. detecting E. coli F18 receptors, wherein said kit includes oligonucleotides that are in separate containers and that are complementary to a DNA sequence with polymorphism of the porcine alpha (1,2) -fucosyl transferase gene 1. 16. Свиной полипептид, имеющий альфа-(1,2)-фукозилтрансферазную активность и аминокислотную замену в положении 103. 16. A porcine polypeptide having alpha (1,2) -fucosyltransferase activity and an amino acid substitution at position 103. 17. Полипептид по п. 16, кроме того, отличающийся тем, что он имеет аминокислотную замену в положении 286. 17. The polypeptide according to p. 16, in addition, characterized in that it has an amino acid substitution at position 286. 18. Использование полиморфизма по альфа-(1,2)-фукозилтрансферазе свиньи в целях разработки лекарственных средств для лечения свиней с Е. соli-ассоциированным заболеванием. 18. The use of pig alpha-(1,2) -fucosyltransferase polymorphism for the development of drugs for the treatment of pigs with E. coli-associated disease.
RU99127287/13A 1997-05-20 1998-05-20 Method of identification of pigs resistant to intestinal diseases associated with escherichia coli, method for breeding pigs resistant to intestinal diseases associated with escherichia coli, isolated dna molecule (variants), molecular analysis for detection of escherichia coli f18 receptors in pigs and set for detection of escherichia coli f18 receptors RU2204609C2 (en)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US4718197P 1997-05-20 1997-05-20
US60/047,181 1997-05-20

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU99127287A true RU99127287A (en) 2002-08-10
RU2204609C2 RU2204609C2 (en) 2003-05-20

Family

ID=21947500

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU99127287/13A RU2204609C2 (en) 1997-05-20 1998-05-20 Method of identification of pigs resistant to intestinal diseases associated with escherichia coli, method for breeding pigs resistant to intestinal diseases associated with escherichia coli, isolated dna molecule (variants), molecular analysis for detection of escherichia coli f18 receptors in pigs and set for detection of escherichia coli f18 receptors

Country Status (21)

Country Link
US (3) US6596923B1 (en)
EP (1) EP0985052B1 (en)
JP (2) JP3637420B2 (en)
CN (1) CN1314953A (en)
AT (2) ATE246731T1 (en)
AU (2) AU7580798A (en)
BR (1) BR9809137A (en)
CA (1) CA2290768C (en)
CZ (1) CZ298021B6 (en)
DE (3) DE69832306T2 (en)
DK (2) DK0985052T3 (en)
ES (2) ES2203958T3 (en)
HK (1) HK1040097A1 (en)
HU (1) HUP0103587A3 (en)
MX (1) MXPA99011988A (en)
NO (1) NO996373L (en)
NZ (1) NZ501886A (en)
PL (1) PL195890B1 (en)
PT (1) PT985052E (en)
RU (1) RU2204609C2 (en)
WO (2) WO1998053101A2 (en)

Families Citing this family (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6355859B1 (en) * 1997-05-20 2002-03-12 Biotechnology Research And Development Corporation Interactions between genotype and diet in swine that prevent E. coli associated intestinal disease
WO1998053101A2 (en) * 1997-05-20 1998-11-26 Biotechnology Research & Development Corporation Methods and composition to identify swine genetically resistant to f18 e. coli associated diseases
HU221664B1 (en) * 1999-03-31 2002-12-28 MTA Állatorvostudományi Kutatóintézete Strain suitable for preparing live oral escherichia coli vaccine for preventing postweaning diarrhoea of pigs, and method for producing that strain
GB0118549D0 (en) * 2001-07-30 2001-09-19 Pig Improvement Uk Ltd Methods
JP2006506991A (en) 2002-11-25 2006-03-02 デン・コンゲリエ・ヴェテリネー−オ・ランボホイスコレ Pig polymorphism and methods for its detection
ZA200506094B (en) 2002-12-31 2006-11-29 Mmi Genomics Inc Compositions, methods and systems for inferring bovine traits
CN104982387B (en) * 2015-05-25 2018-01-23 广东温氏食品集团股份有限公司 A kind of molecular marker-assisted selection method of MUC13 and FUT1 genes
DK3344282T3 (en) * 2015-09-02 2020-12-14 Dupont Nutrition Biosci Aps GLYCOSIDE HYDROLASES AND THEIR USE TO PREVENT AND / OR TREAT A PATHOGENIC INFECTION IN AN ANIMAL
CN106480174B (en) * 2016-09-14 2019-04-16 扬州大学 It is a kind of for the genetic molecule labeling method of pig disease resistant breeding and application
CN108384865A (en) * 2018-02-07 2018-08-10 扬州大学 Application of the Alpha fimbriae genes in grice diarrhoea enteropathogenic E. Coli monitors, differentiates

Family Cites Families (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DK41885A (en) 1985-01-31 1986-11-13 Slagteriernes Forskningsinst 987P-FIMBRIE-PRODUCING MICROORGANISM, VACCINE FOR IMMUNIZATION OF PIGS, AND PROCEDURE FOR PREPARING THE VACCINE
DE69108568T3 (en) 1990-12-21 2004-03-04 The University Of Toronto Innovations Foundation, Toronto DIAGNOSIS FOR Vicious HYPERTHERMIA IN PIG.
US5474796A (en) * 1991-09-04 1995-12-12 Protogene Laboratories, Inc. Method and apparatus for conducting an array of chemical reactions on a support surface
US5552144A (en) 1992-01-22 1996-09-03 Microcarb, Inc. Immunogenic shiga-like toxin II variant mutants
AU5715194A (en) 1992-12-04 1994-07-04 N.V. Innogenetics S.A. New polypeptides, nucleic acid sequences encoding them, and their use to prevent the adhesion of f107-fimbriated bacteria
US5625124A (en) * 1994-07-11 1997-04-29 Washington University Animal model for helicobacter pylori infection
WO1996028967A1 (en) 1995-03-17 1996-09-26 Chihiro Koike Transgenic non-primatal mammals wherein serotypes of higher primates have been expressed by foreign gene transfer and method of creating the same
US6355859B1 (en) * 1997-05-20 2002-03-12 Biotechnology Research And Development Corporation Interactions between genotype and diet in swine that prevent E. coli associated intestinal disease
WO1998053101A2 (en) * 1997-05-20 1998-11-26 Biotechnology Research & Development Corporation Methods and composition to identify swine genetically resistant to f18 e. coli associated diseases
JP2002540050A (en) * 1999-03-19 2002-11-26 ストーンクラフト,エルエルシー Polymer cement composite material and method for producing the same

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR101823368B1 (en) SNP marker regulating polyunsaturated fatty acid level in the pork and uses thereof
US6238866B1 (en) Detector for nucleic acid typing and methods of using the same
US5856104A (en) Polymorphisms in the glucose-6 phosphate dehydrogenase locus
US5234810A (en) Diagnostic assays for genetic mutations associated with bovine leukocyte adhesion deficiency
RU99127287A (en) METHODS AND COMPOSITIONS FOR IDENTIFICATION OF PIGS GENETICALLY RESISTANT TO DISEASES ASSOCIATED WITH F18E. Coli
JP2002512511A (en) Gene compositions and methods
US7056705B2 (en) Multiplex PCR primer set for human glucokinase gene amplification
US20090143245A1 (en) Microarrays for genotyping and methods of use
JP2022002539A (en) Major histocompatibility complex single nucleotide polymorphisms
KR102194878B1 (en) Composition for early predicting or diagnosing mental stability in dog
DE985052T1 (en) METHOD AND COMPOSITIONS FOR IDENTIFYING GENETICALLY RESISTANT PIGS AGAINST F18 E. COLI-ASSOCIATED DISEASES
KR101823374B1 (en) SNP Markers for Identification of Chookjin Duroc Porcine and Method for Identifying Chookjin Duroc Porcine using the same
EP1536003A1 (en) Method of detecting gene polymorphism
JP2007330260A (en) Microsatellite sequences for canine genotyping
KR102001528B1 (en) Gene marker for discrimination of Korean Native pig and use thereof
KR102185440B1 (en) Composition for early predicting or diagnosing hypercholesterolemia in dog
US20040121344A1 (en) Method of detecting nucleotide polymorphism
KR20120127178A (en) SNP markers and methods for assessing porcine meat
RU2639510C2 (en) Method of diagnostics of smc2 polymorphism, associated with hh3 fertility haplotype of cattle stock
WO1998058529A2 (en) Genetic compositions and methods
TWI707864B (en) Oligonucleotide microarray for detection of canine mdr1 gene mutations and determination method thereof and method for determination of the risk of chemotherapy side effects to a subject
KR102475364B1 (en) SNP marker for prediction of dog's environmental adaptability and prediction method using the same
KR102336624B1 (en) Marker for predicting collagen content in pork and use thereof
KR102475362B1 (en) SNP marker for prediction of dog's activity and prediction method using the same
WO2002024905A1 (en) Method of judging gene mutation