RU2255975C1 - Рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы - Google Patents

Рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы Download PDF

Info

Publication number
RU2255975C1
RU2255975C1 RU2003136646/13A RU2003136646A RU2255975C1 RU 2255975 C1 RU2255975 C1 RU 2255975C1 RU 2003136646/13 A RU2003136646/13 A RU 2003136646/13A RU 2003136646 A RU2003136646 A RU 2003136646A RU 2255975 C1 RU2255975 C1 RU 2255975C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
oph
organophosphate hydrolase
ptes
plasmid
organophosphate
Prior art date
Application number
RU2003136646/13A
Other languages
English (en)
Inventor
Е.Н. Ефременко (RU)
Е.Н. Ефременко
Ю.А. Вотчицева (RU)
Ю.А. Вотчицева
Т.К. Алиев (RU)
Т.К. Алиев
С.Д. Варфоломеев (RU)
С.Д. Варфоломеев
Original Assignee
Химический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова (Химфак МГУ)
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Химический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова (Химфак МГУ) filed Critical Химический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова (Химфак МГУ)
Priority to RU2003136646/13A priority Critical patent/RU2255975C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2255975C1 publication Critical patent/RU2255975C1/ru

Links

Images

Landscapes

  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

Изобретение относится к генной инженерии и может быть использовано для гидролиза фосфорорганических соединений. Сконструирована рекомбинантная плазмидная ДНК pTES-His-OPH для экспрессии полипептида со свойствами орагнофосфатгидролазы, включающая ClaI/Hind III фрагмент плазмиды pTrcTEGF, фрагмент плазмиды pTES-ОРН, имеющий нуклеотидную последовательность, которая кодирует аминокислотную последовательность зрелой формы органофосфатгидролазы, и нуклеотидную последовательность, кодирующую 6 остатков гистидина, которая располагается на 5-конце нуклеотидной последовательности, кодирующей органофосфатгидролазу. На основе указанной плазмиды получен штамм Escherichia coli ЦКМИБХ-29 - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы. Использование предложенного изобретения позволяет по упрощенной технологии получить полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, который обладает улучшенной каталитической эффективностью действия по отношению к тиосодержащим триэфирам фосфорной кислоты. 2 н.п. ф-лы, 4 ил., 2 табл.

Description

Изобретение относится к биотехнологии, в частности к генетической инженерии, и представляет собой сконструированную in vitro рекомбинантную плазмидную ДНК, содержащую ДНК процессированной формы фермента органофосфатгидролазы (ОРН), участок ДНК, кодирующий синтез аффинной последовательности, состоящей из шести аминокислотных остатков гистидина (6х-His), trc-промотор Escherichia coli и синтетический участок - усилитель трансляции, обуславливающие биосинтез His-OPH, а также штамм Escherichia coli - продуцент этого белка.
Органофосфатгидролаза (ОРН) (арилдиалкилфосфатаза, параоксоназа, фосфотриэстераза, ЕС 3.1.8.1) - фермент, катализирующий гидролиз эфирной связи в триэфирах фосфорной кислоты, содержит по два иона бивалентного металла (Zn2+ или Со2+) на одну субъединицу. Фермент в разной степени способен катализировать гидролиз Р-О, P-F и P-S связей в триэфирах фосфорной кислоты [Ефременко Е.Н., Сергеева B.C. Органофосфатгидролаза - фермент, катализирующий деградацию фосфорсодержащих отравляющих веществ и пестицидов.// Известия АН Сер. Хим., №10, с.1743-1749, (2001)].
Потребность получения ОРН в промышленном масштабе определяется необходимостью его использования в виде каталитически активного элемента биосенсорных устройств, предназначенных для определения фосфорорганических соединений в различных объектах (сельскохозяйственной продукции, продуктах питания, текстиле, речной воде и сточных водах) [Mulchandani P., Chen W., Mulchandani A. Flow injection amperometric enzyme biosensor for direct determination of organophosphate nerve agents.// Environ. Sci. Technol., V.35, p.2562-2565, (2001); Simonian A.L., Efremenko E.N., Wild J.R. Discriminative detection of neurotoxins in multi-component samples.// Anal. Chim. Acta, V.444, p.179-186, (2001)], а также возможностью эффективной биодеградации фосфорорганических нейротоксинов, к числу которых относятся все фосфорорганические пестициды, широко применяемые в сельском хозяйстве, и боевые отравляющие вещества (зарин, зоман и Vx) [Hoskin F.C., Walker J.E., Dettbarn W.D., Wild J.R. Hydrolysis of tetriso by an enzyme derived from Pseudomonas diminuta as a model for the detoxication of O-ethyl S-(2-diisopropylaminoethyl) methylphosphonothiolate (VX).// Biochem. Pharmacol., V.49, p.711-715, (1995); Rastogi V.K., DeFrank J.J., Cheng T.C., Wild J.R. Enzymatic hydrolysis of Russian-VX by organophosphorus hydrolase.// Biochem. Biophys. Res. Commun., V. 241, p.294-296, (1997)], уничтожение которых предусмотрено Международной конвенцией о химическом разоружении [United Nation, Convention on the prohibition of the development, production, stockpiling and use of chemical weapons and on their destruction, corrected version in accordance with Depositary Notification C.N.246.1994. <http://www.opcw.org/html/db/cwc/eng/cwc frameset.html>].
Существующий процесс выделения и очистки ОРН, состоящий из пяти последовательных стадий [Grimsley J.K., Scholtz J.M., Pace C.N., Wild J.R. Organophosphorus hydrolase is a remarkably stable enzyme that unfolds through a homodimeric intermediate.// Biochemistry, V.36, p.14366-14374, (1997)], является трудоемким, длительным и потому нетехнологичным. Создание конструкции, позволяющей экспрессировать генетически модифицированный фермент, содержащий олигогистидиновую последовательность, может позволить выделить высокоочищенный фермент за две стадии при использовании металл-хелатирующей хроматографии. Данный метод очистки белка основан на образовании аффинного комплекса между олигогистидиновой последовательностью белка и металлом, которым модифицирован хроматографический носитель.
Известны попытки коструирования эффективных генно-инженерных продуцентов His-OPH на основе клеток E.coli.
Была создана генетическая конструкция pGFP-OPH [Wu C.F., Cha H.J., Rao G., Valdes J.J., Bentley W.E. A green fluorescent protein fusion strategy for monitoring the expression, cellular location, and separation of biologically active organophosphorus hydrolase.// Appl. Microbiol. Biotechnol., V.54, р.78-83, (2000)], кодирующая синтез гибридного белка со свойствами ОРН, с целью получения экспрессируемого фермента. В качестве вектора была использована коммерческая плазмида pTrcHis (Invitrogen). В состав данного вектора был введен ген, кодирующий синтез зеленого флуоресцентного белка ("green fluorescent protein", GFP), для мониторинга экспрессии ОРН в клетках E.coli BL21. Конечная конструкция кодировала ген гибридного белка, содержащего олигогистидиновую последовательность, GFP, сайт узнавания энтерокиназой (ЕК) и ОРН (His-GFP-EK-OPH). Анализ уровня экспрессии His-OPH осуществляли опосредованно через регистрацию уровня флуоресценции GFP. Выход белка со свойствами ОРН в созданной биологической системе (плазмида pGFP-OPH, штамм E.coli BL21) составил не более 1,4 мг белка из 1 литра культуральной жидкости. Согласно данным, приведенным авторами, максимальный выход биомассы составил около 3 грамм с литра культуральной жидкости, следовательно, выход белка His-GFP-OPH не превышал 0,5 мг из 1 г клеток. Недостатком данной конструкции является не только низкий уровень экспрессии белка, но и довольно сложная процедура его очистки, вследствие того, что необходима обработка выделенного гибридного белка энтерокиназой (в течение 12 ч при 37° С) с целью отделения His-GFP-EK фрагмента белка. Далее необходима дополнительная очистка ОРН от посторонних белков (GFP и ЕК), присутствие которых снижает активность ОРН в 3 раза.
Была предпринята попытка увеличения выхода ОРН путем создания различных гибридных белков, содержащих в своем составе ОРН [Wu C.F., Valdes J.J., Rao G., Bentley W.E. Enhancement of organophosphorus hydrolase yield in Escherichia coli using multiple gene fusions.// Biotechnol Bioeng., V.75, p.100-103, (2001)]. Были созданы генетические конструкции на основе коммерческой плазмиды pTrcHis (Invitrogen), кодирующие синтез различных гибридных белков, содержащих по две копии гена ОРН в одном белке. В качестве штамма-хозяина использовали клетки E.coli BL21. Во всех случаях между геном, кодирующим ОРН, и олигогистидиновой последовательностью находился сайт узнавания энтерокиназой (ЕК). В случае конструкции His-GFP-EK-OPH-EK-OPH, содержащей две копии гена кодирующего ОРН, расположенных после His-GFP, выход ОРН увеличился в два раза и составил около 1 мг белка из 1 г клеток. Данный подход к увеличению выхода ОРН кроме недостатков, присущих предыдущему аналогу, имеет еще один, связанный с высокой массой полученной генетической конструкции (4,8 Md), что приводит к неустойчивому существованию экспрессионной системы. Данные по активности конечного белка авторами не приводятся.
Данное техническое решение, как наиболее близкое к заявляемому по своему назначению, а именно, получению экспрессионной системы, обеспечивающей максимальный выход His-OPH, принято за прототип.
Предлагаемое изобретение решает задачу получения His-OPH путем создания генно-инженерной конструкции и штамма клеток, которые обеспечивают синтез значительных количеств активной растворимой формы ОРН, содержащей олигогистидиновую последовательность, в цитоплазме клеток путем индуцибельного синтеза фермента с помощью индуктора (изопропил-β -D-галактопиранозид, ИПТГ).
Поставленная задача решается путем конструирования рекомбинантной плазмидной ДНК pTES-His-OPH, кодирующей индуцибельный синтез фермента ОРН, содержащего олигогистидиновую последовательность, и штамма Escherichia coli SG13009[pREP4]/pTES-His-ОРН, обеспечивающего синтез этого белка с уровнем экспрессии, позволяющим получать не менее 5 мг очищенного белка из 1 г влажной биомассы за две стадии (ультразвуковое разрушение клеток и металл-хелатирующая хроматография).
Индуцибельный высокий уровень синтеза целевого полипептида обеспечивается наличием в плазмиде pTES-His-OPH trc-промотора Е. coli и синтетического усилителя трансляции гена 10 бактериофага Т7.
Рекомбинантная плазмидная ДНК pTES-His-OPH, кодирующая фермент органофосфатгидролазу, характеризуется следующими признаками:
- имеет молекулярную массу 3,48 Md (5,276 т.п.о.);
- кодирует аминокислотную последовательность фермента органофосфатгидролазы;
- содержит оптимизированную гексагистидиновую последовательность на 5'-конце гена, кодирующего аминокислотную последовательность фермента органофосфатгидролазы;
- состоит из Cla I/Hind III - фрагмента ДНК плазмиды pTrcTEGF (Патент RU 2185438 С2, кл. С 12 N 15/12, 1/21, 2002) длиной 4,232 т.п.о., содержащего trc-промотор Е. coli, синтетический усилитель трансляции TREN гена 10 бактериофага Т7, ген bla β -лактамазы, определяющий устойчивость трансформированных плазмидой pTES-His-OPH клеток к ампициллину и участок ori инициации репликации; а также из ДНК фермента органофосфатгидролазы длиной 1,011 т.п.о., фланкированного сайтами рестрикции Ваm HI и Hind III и оптимизированную гексагистидиновую последовательность;
- содержит: trc-промотор Е. coli, уникальные сайты узнавания рестрикционными эндонуклеазами, имеющими следующие координаты: Nco I - 265, Eco RI - 270, Крn I - 286, Xba I - 340, Cla I - 377, Hind III – 1427.
Особенностью предложенной плазмидной конструкции является наличие trc-промотора Е. coli, контролирующего синтез ДНК фермента ОРН, а для усиления трансляции используется синтетический усилитель трансляции, что в совокупности обеспечивает индуцибельный синтез целевого белка с надежной регуляцией и высоким выходом, достигаемым при малых концентрациях индуктора.
Для получения штамма-продуцента фермента ОРН компетентные клетки Escherichia coli SG13009[pREP4] трансформируют рекомбинантной плазмидой pTES-His-OPH.
Полученный штамм Escherichia coli SG13009[pREP4]/pTES-His-OPH характеризуется следующими признаками:
Морфологические признаки. Клетки мелкие палочковидной формы, грамотрицательные, неспороносные, 1× 3-5 мкм, подвижные.
Культуральные признаки. При росте на агаризованной среде LB (Состав среды LB: триптон - 10,0 г/л; дрожжевой экстракт - 5,0 г/л; NaCl - 5,0 г/л; и 1,7% бактоагара) колонии круглые, гладкие, полупрозрачные, блестящие, серые, край ровный, диаметр колоний 1-3 мм; консистенция пастообразная. Рост в жидкой среде LB (триптон - 10,0 г/л; дрожжевой экстракт - 5,0 г/л; NaCl - 5,0 г/л) характеризуется ровным помутнением с образованием легкого осадка.
Физико-биохимические признаки. Клетки растут при температуре 4-42° С при оптимуме рН 6,8-7,2. В качестве источника азота используют как минеральные соли в аммонийной форме, так и органические соединения в виде пептона, триптона, дрожжевого экстракта, аминокислот. В качестве источника углерода используют аминокислоты, глицерин, углеводы.
Устойчивость к антибиотикам. Клетки проявляют устойчивость к ампициллину (до 200 мкг/мл), обусловленную наличием в плазмиде гена β -лактамазы, а также к канамицину (до 40 мкг/мл).
Штамм Е. coli SG13009[pREP4]/pTES-His-OPH обеспечивает индуцибельный синтез фермента органофосфатгидролазы, содержащего олигогистидиновую последовательность, с высоким содержанием растворимой формы фермента в цитоплазме, что позволяет получать не менее 5 мг очищенного белка из 1 г влажной биомассы за одну стадию. Совокупность перечисленных свойств штамма Е. coli SG13009[pREP4]/pTES-His-OPH делает получение рекомбинантной His-ОРН высокотехнологичным процессом.
Полученный штамм депонирован в коллекции культур микроорганизмов Института биоорганической химии им. М.М.Шемякина -Ю.А. Овчинникова Российской Академии Наук под номером 29.
На фиг.1 представлена физическая карта рекомбинантной плазмиды pTES-His-OPH; на фиг.2 - нуклеотидная последовательность ДНК фермента органофосфатгидролазы с прилегающими регуляторными элементами: trc - промотор (1-30 п.о.), усилитель трансляции TREN (93-188 п.о.), ген, кодирующий гексануклеотидную последовательность (189-221), ген органофосфатгидролазы (222-1232 п.о.); инициирующий и терминирующий кодоны подчеркнуты, в рамки взяты сайты рестриктаз: Eco RI, Cla I и Hind III; на фиг.3 - аминокислотная последовательность фермента органофосфатгидролазы, кодируемого рекомбинантной плазмидой pTES-His-OPH; на фиг.4 - электрофореграмма лизатов клеток штамма-реципиента Е. coli SG13009[pREP4] (дорожка 1), штамма-продуцента Е. coli SG13009[pREP4]/pTES-His-OPH (дорожка 2), белковых стандартов молекулярного веса (дорожка 3) в 12%-ном полиакриламидном геле (стрелкой указан фермент органофосфатгидролаза).
Изобретение иллюстрируется следующими примерами.
Пример 1. Конструирование рекомбинантной плазмиднои ДНК pTES-His-ОРН.
Проводят модификацию гена органофосфатгидролазы путем присоединения на 5'-конце нуклеотидной последовательности, кодирующей 6 остатков гистидина и несколько дополнительных аминокислотных остатков. Такую модификацию осуществляют следующим образом.
Проводят амплификацию гена органофосфатгидролазы с двумя праймерами: праймером For-Bam, имеющим нуклеотидную последовательность CTTCCGGATCCATCGGCACAGGCGATC, и Seq-Rev, имеющим нуклеотидную последовательность GTAACCACTCACACGGCA. Праймер For-Bam позволяет ввести сайт рестрикции эндонуклеазы Ваm HI в начало кодирующей области гена органофосфатгидролазы. Праймер Seq-Rev комплементарен внутренней области гена органофосфатгидролазы. Амплификацию осуществляют следующим образом. К 5 мкл раствора плазмидной ДНК pTES-OPH, состоящей из Cla I/Hind III - фрагмента ДНК плазмиды pTrcTEGF (Патент RU2185438 С2, кл. С 12 N 15/12, 1/21, 2002) длиной 4,232 т.п.о. и ДНК фермента органофосфатгидролазы длиной 1,011 т.п.о. (10 нг/мкл) (выделенной из хромосомной ДНК клеток Pseudomonas diminuta VKM B-1297 полимеразной цепной реакцией с праймерами FOR-Cla с нуклеотидной последовательностью СТТ ССА TCG АТА TGA GAG GAT CGC АТС и REV-Hind с нуклеотидной последовательностью ССА САА AGC TTC ATG ACG CCC GCA AGG ТС), прибавляют по 60 пмоль праймера For-Bam и 60 пмоль праймера Seq-Rev, 8 мкл смеси, содержащей 2,5 мМ каждого из дезоксинуклеозидтрифосфатов, 10 мкл 10-кратного буфера (100 мМ трис-HCl, рН 8,8, 500 мМ КСl, 15 мМ MgCl2), 2 ед. Taq ДНК-полимеразы и воду до общего объема реакционной смеси 100 мкл. Полимеразную цепную реакцию (ПЦР) проводят в следующем режиме: денатурация - 40 сек, 94° С; отжиг - 50 сек, 55° С; достройка - 1 мин, 72° С; количество циклов - 25. В результате амплификации получают ДНК длиной 530 п.н. Реакционную смесь после прохождения ПЦР экстрагируют равным объемом хлороформа, после чего осаждают этиловым спиртом. После центрифугирования и высушивания ДНК растворяют в 20 мкл 10 мМ трис-HCl, 1 мМ ЭДТА, рН 8,0. 5 мкл амплифицированной ДНК обрабатывают 10 ед. рестриктазы Ваm HI и 15 ед. рестриктазы Sal I (Fermentas, Литва) в течение 1 ч при 37° С в 20 мкл буферного раствора, содержащего 33 мМ трис-ацетата (рН 7,9), 10 мМ ацетата магния, 66 мМ ацетата калия, и из полученного гидролизата выделяют переносом из 1,5%-ного агарозного геля на DEAE-мембрану фрагмент ДНК органофосфатгидролазы длиной 218 т.п.о. (Ваm HI - Sal I фрагмент), осаждают этиловым спиртом, высушивают и растворяют в 20 мкл Н2О.
5 мкг плазмидной ДНК pTES-OPH размером 5243 т.п.о. (0,5 мкг/мкл) обрабатывают 10 ед. рестриктазы Сla I, 10 ед. рестриктазы Sal I и 15 ед. рестриктазы Hind III в течение 2 ч при 37° С в 30 мкл буферного раствора, содержащего 33 мМ трис-ацетата (рН 7,9), 10 мМ ацетата магния, 66 мМ ацетата калия, и из полученного гидролизата выделяют переносом из 0,8%-ного агарозного геля на DEAE-мембрану NA-45 3'-концевую часть кДНК органофосфатгидролазы длиной 796 т.п.о. (Sal I - Hind III фрагмент), а также векторную часть плазмидной ДНК длиной 4,232 т.п.о. (Sal I - Hind III фрагмент). Выделенные фрагменты осаждают этиловым спиртом, высушивают и растворяют в 20 мкл Н2О. Олигогистидиновую последовательность присоединяют в составе синтетического олигонуклеотидного дуплекса следующей структуры:
Figure 00000002
Figure 00000003
Данный дуплекс получают следующим образом: по 20 пмоль каждого из олигонуклеотидов (I) и (II) смешивают в водном растворе объемом 20 мкл, содержащем 40 мМ трис-HCl, рН 7,8 и 10 мМ MgCl2, после чего полученную смесь нагревают до 80° С в водяной бане и охлаждают до 20° С в течение 1 часа.
2 мкл раствора олигонуклеотидов после образования дуплекса смешивают с 0,02 мкг Sal I - Hind III фрагмента ДНК фермента органофосфатгидролазы длиной 696 т.п.о., 0,03 мкг Bam HI - SalI фрагмента длиной 418 и 0,05 мкг векторной части плазмидной ДНК pTrcTEGF(b) длиной 4,232 т.п.о. и проводят лигазную реакцию в течение 3 ч при 10° С в 15 мкл раствора, содержащего 40 мМ трис-НСl (рН 7,8), 10 мМ MgCl2, 10 мМ дитиотреитола, 0,5 мМ аденозинтрифосфата и 2 ед. Вейса Т4 ДНК-лигазы. 5 мкл реакционной смеси используют для трансформации 200 мкл компетентных клеток XL-1 Blue. 1/10 клеток, использованных для трансформации, высевают на LB-агар, содержащий 100 мкг/мл ампициллина. Из выросших клонов выделяют плазмидную ДНК, содержащую ДНК фермента органофосфатгидролазы, модифицированной добавлением гексагистидиновой последовательности.
Окончательно структуру рекомбинантной ДНК pTES-His-OPH подтверждают определением нуклеотидной последовательности в области встроенного гена органофосфатгидролазы. Аминокислотная последовательность органофосфатгидролазы, модифицированной добавлением гексагистидиновой последовательности, приведена на Фиг.3.
Пример 2. Получение штамма-продуцента фермента органофосфатгидролазы.
Компетентные клетки Escherichia coli SG13009[pREP4]: NalS StrS rifS, lac- ara- gal- mtl- F- recA+ uvr+ трансформируют рекомбинантной плазмидной ДНК pTES-His-OPH и получают штамм-продуцент фермента His-OPH.
Пример 3. Выделение и очистка рекомбинантного фермента органофосфатгидролазы, содержащей олигогистидиновую последовательность.
Для накопления биомассы клеток используют жидкую питательную среду TYE (триптон - 12,0 г/л, дрожжевой экстракт - 24,0 г/л, глицерин - 4,0 мл/л, КН2РO4 - 6,95 г/л, K2HPO4· 3H2O - 12,54 г/л, рН среды 7,0), в которую добавляют СоСl2· 6Н2О до концентрации 237 мг/л. Перед посевом клеток в среду добавляют раствор ампициллина (концентрация в среде 100 мкг/мл) и канамицина (концентрация в среде 25 мкг/мл).
Для получения инокулята производят посев культуры петлей с чашек Петри в 20 мл среды LB, содержащей ампициллин 100 мкг/мл, канамицин 25 мкг/мл. 16-часовой инокулят вносят в колбу, содержащую 100 мл полноценной питательной среды, культуру выращивают при 30° С и постоянном перемешивании (200 об/мин) до тех пор, пока оптическая плотность при длине волны 540 нм не достигнет 0,6, после чего добавляют ИПТГ до концентрации 0,4 мМ. Клетки культивируют в течение 24 часов. Полученную биомассу отделяют центрифугированием (5000 g, 15 мин), взвешивают и ресуспендируют в 50 мМ фосфатном буфере, рН 8,0, содержащем 300 мМ хлорида натрия (буфер для озвучивания) (массовое соотношение биомасса:буфер - 1:5). Клетки разрушают обработкой ультразвуком (частота 44 кГц) 6 раз по 45 секунд, между обработками биомассу выдерживают в течение 1 мин во льду. Осадок отделяют центрифугированием (15000 g, 30 мин).
К супернатанту добавляют равный объем 50% суспензии Ni-NTA агарозы, предварительно уравновешенной в буфере для озвучивания, и перемешивают в течение 1 ч. Колонку заполняют полученной суспензией, промывают (0,5 мл/мин) элюирующим буфером (50 мМ фосфат натрия (рН 6,0), 300 мМ хлорид натрия, 10% глицерин) и элюируют фермент с колонки градиентным раствором имидазола (от 0 до 0,5 М) в элюирующем буфере. Полученные фракции, содержащие His-OPH, объединяют и подвергают диализу против 20 мМ фосфатно-карбонатного буфера (рН 8,5).
В процессе очистки из 1 г влажной биомассы получают 5 мг высокоочищенного фермента со средней удельной активностью 6870 ед/мг белка. Выход фермента составляет 81,7% от исходного количества His-OPH, синтезированного клетками (табл.1).
Таблица 1.
Баланс процедуры очистки и выделения His-OPH из 1 г биомассы.
Этап очистки Суммарный белок, мг Суммарная активность, ед Удельная активность, ед/мг белка Очистка, раз Выход,
%
Обработка клеток 312 43680 140 1 100
ультразвуком          
Ni-NTA колонка 5,2 35730 6870 60 81,7
Пример 4. Исследование свойств рекомбинантного фермента органофосфатгидролазы, содержащей олигогистидиновую последовательность.
За скоростью исследуемой реакции следят спектрофотометрически по накоплению продукта 4-нитрофенолят аниона (ε =18000 М-1см-1, рН 10,7, λ =405 нм). Для определения каталитической активности His-OPH в водных растворах используют 0,05 М карбонатный буфер (рН 10,5). В качестве субстрата используют 1 мМ водные растворы параоксона, паратиона и метил-паратиона.
Каталитическую реакцию инициируют внесением в кювету с буфером и субстратом раствора His-OPH в 20 мМ фосфатно-карбонатном буфере (рН 8,5). Концентрация фермента в кювете составляет 10-10-10-9 М.
За единицу ферментативной активности принимают такое количество фермента, которое необходимо для того, чтобы гидролизовать 1 мМ субстрата за 1 мин при рН 10,5 и 20° С.
Расчет скоростей ферментативной реакции проводят по начальным линейным участкам кинетических кривых (vo=tgα ). Максимальную скорость ферментативной реакции (Vm) и константу Михаэлиса (Km) определяют с использованием двойных обратных координат 1/vo-1[S] (Лайнуивера-Берка).
Кинетические характеристики рекомбинантной органофосфатгидролазы приведены в табл.2. рН-оптимум действия фермента составляет 10,5.
Таблица 2.
Константы гидролиза ФОС олигогистидинсодержащей органофосфатгидролазой.
Субстрат kcat, с-1 Km, мкМ kcat/Km, M-1c-1
Параоксон 5100± 100 10± 0,5 5,1× 108
Паратион 530± 30 15± 0,5 3,5× 107
Метил-паратион 310± 20 73± 1,0 4,2× 106
Таким образом, заявляемое техническое решение представляет собой плазмиду уникальной конструкции для микробного синтеза полипептида, обладающего свойствами ОРН, и штамм E.coli, обеспечивающий экспрессию данной плазмиды. Данное техническое решение обеспечивает высокий выход растворимого белка His-OPH (не менее 5 мг из 1 г клеток) (Пример 3), который в 5 раз превышает выходы аналогичных гибридных белков, содержащих олигогистидиновую последовательность, в известных экспрессионных системах.
В отличие от известных аналогов, предлагаемое техническое решение позволяет:
- получить полипептид, каталитическая эффективность которого увеличена в 10 раз по ряду основных субстратов по сравнению с нативным ферментом ОРН (Пример 4);
- сократить процесс выделения His-OPH до двух стадий, позволяющих получить более 80% от исходного синтезированного белка в клетках (Пример 3) и получить каталитически активный фермент без необходимости отделения ОРН от посторонних белков-маркеров, в частности, от His-GFP-EK.
Все это позволяет значительно повысить технологичность и экономичность процесса получения высокоактивного рекомбинантного фермента органофосфатгидролазы.
Рекомбинантный фермент может быть использован для приготовления наборов для аналитического определения фосфорорганических соединений, а также для производства препаратов на основе ОРН, предназначенных для деградации фосфорорганических соединений.

Claims (2)

1. Рекомбинантная плазмидная ДНК pTES-His-OPH, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, с молекулярной массой 3,48 Md (5,276 т.п.о.), включающая
СlaI/Hind III фрагмент ДНК плазмиды pTrcTEGF длиной 4,232 т.п.о.,
фрагмент плазмиды pTES-OPH длиной 1,011 т.п.о., имеющий нуклеотидную последовательность, которая кодирует аминокислотную последовательность зрелой формы органофосфатгидролазы, и фланкированный сайтами рестрикции Barn HI и Hind III, и
нуклеотидную последовательность АТGАGАGGАТСGСАТСАССАТСАССАТСАСGGА, располагающуюся на 5'-конце нуклеотидной последовательности, кодирующей аминокислотную последовательность зрелой формы органофосфатгидролазы, а также содержащая уникальные сайты узнавания рестрикционными эндонуклеазами: Nco I - 265, Eco R1 - 270, Kpn I - 286, Xba I - 340, Cla I - 377, Hind III - 1427.
2. Штамм бактерий Escherichia coli ЦКМИБХ-29 - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы.
RU2003136646/13A 2003-12-19 2003-12-19 Рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы RU2255975C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2003136646/13A RU2255975C1 (ru) 2003-12-19 2003-12-19 Рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2003136646/13A RU2255975C1 (ru) 2003-12-19 2003-12-19 Рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2255975C1 true RU2255975C1 (ru) 2005-07-10

Family

ID=35838365

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2003136646/13A RU2255975C1 (ru) 2003-12-19 2003-12-19 Рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2255975C1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2634914C2 (ru) * 2016-12-08 2017-11-08 Елена Николаевна Ефременко Способ биообезвреживания микотоксинов

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2634914C2 (ru) * 2016-12-08 2017-11-08 Елена Николаевна Ефременко Способ биообезвреживания микотоксинов

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Lan et al. Coexpression of two detoxifying pesticide-degrading enzymes in a genetically engineered bacterium
EP0949930B1 (en) Thermostable phosphatases
US8759028B2 (en) Expression cassette, recombinant host cell and process for producing a target protein
CN106957850B (zh) 一株产磷脂酶d的基因工程菌及其构建方法与应用
CN110564708A (zh) 一种重组磷脂酶d及其在合成磷脂酰丝氨酸或其它磷脂中的应用
JP2003506046A (ja) 1−デオキシ−d−キシルロース−5−リン酸レダクトイソメラーゼおよび1−デオキシ−d−キシルロース−5−リン酸シンターゼ活性の決定方法
RU2255975C1 (ru) Рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы
CN102925419B (zh) 一种有机磷农药降解酶突变体及其制备方法
RU2232807C1 (ru) Рекомбинантная плазмидная днк ptrcte-oph и продуцент фермента органофосфатгидролазы
McClain A role for ribonuclease III in synthesis of bacteriophage T4 transfer RNAs
RU2619170C2 (ru) Рекомбинантная плазмидная ДНК pER-APHC3, кодирующая гибридный белок, способный к автокаталитическому расщеплению с образованием APHC3, штамм Escherichia coli C3030/pER-APHC3 продуцент указанных белков и способ получения рекомбинантного APCH3
KR100463966B1 (ko) 시아노카르복실산 에스테르로부터 디카르복실산모노에스테르의 제조
CN112662643A (zh) 一种有机磷酸酐酶及其编码基因和在有机磷农药降解方面的应用
KR101383546B1 (ko) 심해 해저에서 분리된 에스터라제 ktl 4
CN113881728B (zh) 7-氨甲基-7-脱氮鸟嘌呤(PreQ1)的制备方法
CN103013949A (zh) 一种乙酰化羟基酸水解酶及其基因和应用
US6147211A (en) Method for treating cyclic phosphate compound
CN107619832A (zh) 一种氯代硝基苯酚类化合物氧化还原酶基因簇cnpAB及其应用
JP3357405B2 (ja) フラビンヌクレオチド類の製造法
CN105349507A (zh) 一种脂肪酶LIPDa6及其编码基因和应用
KR100838121B1 (ko) 세포간극에 유기인 가수분해효소가 발현 및 분비된 대장균
KR101639031B1 (ko) 캘빈회로 유전자가 도입된 이산화탄소 저감용 재조합 미생물 및 이를 활용한 이산화탄소 저감 방법
JPH02255086A (ja) 新規制限酵素及びその製造法
CN116536383A (zh) 一种构建paps再生循环***及应用的方法
RU2099421C1 (ru) Способ получения рекомбинантного интерлейкина-3 человека, рекомбинантная плазмидная днк p3pteil3, кодирующая рекомбинантный интерлейкин-3 человека, штамм бактерий escherichia coli - продуцент рекомбинантного интерлейкина-3 человека

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20101220

NF4A Reinstatement of patent

Effective date: 20120410

PC43 Official registration of the transfer of the exclusive right without contract for inventions

Effective date: 20140325