RU2255975C1 - Рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы - Google Patents
Рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы Download PDFInfo
- Publication number
- RU2255975C1 RU2255975C1 RU2003136646/13A RU2003136646A RU2255975C1 RU 2255975 C1 RU2255975 C1 RU 2255975C1 RU 2003136646/13 A RU2003136646/13 A RU 2003136646/13A RU 2003136646 A RU2003136646 A RU 2003136646A RU 2255975 C1 RU2255975 C1 RU 2255975C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- oph
- organophosphate hydrolase
- ptes
- plasmid
- organophosphate
- Prior art date
Links
Images
Landscapes
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Изобретение относится к генной инженерии и может быть использовано для гидролиза фосфорорганических соединений. Сконструирована рекомбинантная плазмидная ДНК pTES-His-OPH для экспрессии полипептида со свойствами орагнофосфатгидролазы, включающая ClaI/Hind III фрагмент плазмиды pTrcTEGF, фрагмент плазмиды pTES-ОРН, имеющий нуклеотидную последовательность, которая кодирует аминокислотную последовательность зрелой формы органофосфатгидролазы, и нуклеотидную последовательность, кодирующую 6 остатков гистидина, которая располагается на 5-конце нуклеотидной последовательности, кодирующей органофосфатгидролазу. На основе указанной плазмиды получен штамм Escherichia coli ЦКМИБХ-29 - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы. Использование предложенного изобретения позволяет по упрощенной технологии получить полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, который обладает улучшенной каталитической эффективностью действия по отношению к тиосодержащим триэфирам фосфорной кислоты. 2 н.п. ф-лы, 4 ил., 2 табл.
Description
Изобретение относится к биотехнологии, в частности к генетической инженерии, и представляет собой сконструированную in vitro рекомбинантную плазмидную ДНК, содержащую ДНК процессированной формы фермента органофосфатгидролазы (ОРН), участок ДНК, кодирующий синтез аффинной последовательности, состоящей из шести аминокислотных остатков гистидина (6х-His), trc-промотор Escherichia coli и синтетический участок - усилитель трансляции, обуславливающие биосинтез His-OPH, а также штамм Escherichia coli - продуцент этого белка.
Органофосфатгидролаза (ОРН) (арилдиалкилфосфатаза, параоксоназа, фосфотриэстераза, ЕС 3.1.8.1) - фермент, катализирующий гидролиз эфирной связи в триэфирах фосфорной кислоты, содержит по два иона бивалентного металла (Zn2+ или Со2+) на одну субъединицу. Фермент в разной степени способен катализировать гидролиз Р-О, P-F и P-S связей в триэфирах фосфорной кислоты [Ефременко Е.Н., Сергеева B.C. Органофосфатгидролаза - фермент, катализирующий деградацию фосфорсодержащих отравляющих веществ и пестицидов.// Известия АН Сер. Хим., №10, с.1743-1749, (2001)].
Потребность получения ОРН в промышленном масштабе определяется необходимостью его использования в виде каталитически активного элемента биосенсорных устройств, предназначенных для определения фосфорорганических соединений в различных объектах (сельскохозяйственной продукции, продуктах питания, текстиле, речной воде и сточных водах) [Mulchandani P., Chen W., Mulchandani A. Flow injection amperometric enzyme biosensor for direct determination of organophosphate nerve agents.// Environ. Sci. Technol., V.35, p.2562-2565, (2001); Simonian A.L., Efremenko E.N., Wild J.R. Discriminative detection of neurotoxins in multi-component samples.// Anal. Chim. Acta, V.444, p.179-186, (2001)], а также возможностью эффективной биодеградации фосфорорганических нейротоксинов, к числу которых относятся все фосфорорганические пестициды, широко применяемые в сельском хозяйстве, и боевые отравляющие вещества (зарин, зоман и Vx) [Hoskin F.C., Walker J.E., Dettbarn W.D., Wild J.R. Hydrolysis of tetriso by an enzyme derived from Pseudomonas diminuta as a model for the detoxication of O-ethyl S-(2-diisopropylaminoethyl) methylphosphonothiolate (VX).// Biochem. Pharmacol., V.49, p.711-715, (1995); Rastogi V.K., DeFrank J.J., Cheng T.C., Wild J.R. Enzymatic hydrolysis of Russian-VX by organophosphorus hydrolase.// Biochem. Biophys. Res. Commun., V. 241, p.294-296, (1997)], уничтожение которых предусмотрено Международной конвенцией о химическом разоружении [United Nation, Convention on the prohibition of the development, production, stockpiling and use of chemical weapons and on their destruction, corrected version in accordance with Depositary Notification C.N.246.1994. <http://www.opcw.org/html/db/cwc/eng/cwc frameset.html>].
Существующий процесс выделения и очистки ОРН, состоящий из пяти последовательных стадий [Grimsley J.K., Scholtz J.M., Pace C.N., Wild J.R. Organophosphorus hydrolase is a remarkably stable enzyme that unfolds through a homodimeric intermediate.// Biochemistry, V.36, p.14366-14374, (1997)], является трудоемким, длительным и потому нетехнологичным. Создание конструкции, позволяющей экспрессировать генетически модифицированный фермент, содержащий олигогистидиновую последовательность, может позволить выделить высокоочищенный фермент за две стадии при использовании металл-хелатирующей хроматографии. Данный метод очистки белка основан на образовании аффинного комплекса между олигогистидиновой последовательностью белка и металлом, которым модифицирован хроматографический носитель.
Известны попытки коструирования эффективных генно-инженерных продуцентов His-OPH на основе клеток E.coli.
Была создана генетическая конструкция pGFP-OPH [Wu C.F., Cha H.J., Rao G., Valdes J.J., Bentley W.E. A green fluorescent protein fusion strategy for monitoring the expression, cellular location, and separation of biologically active organophosphorus hydrolase.// Appl. Microbiol. Biotechnol., V.54, р.78-83, (2000)], кодирующая синтез гибридного белка со свойствами ОРН, с целью получения экспрессируемого фермента. В качестве вектора была использована коммерческая плазмида pTrcHis (Invitrogen). В состав данного вектора был введен ген, кодирующий синтез зеленого флуоресцентного белка ("green fluorescent protein", GFP), для мониторинга экспрессии ОРН в клетках E.coli BL21. Конечная конструкция кодировала ген гибридного белка, содержащего олигогистидиновую последовательность, GFP, сайт узнавания энтерокиназой (ЕК) и ОРН (His-GFP-EK-OPH). Анализ уровня экспрессии His-OPH осуществляли опосредованно через регистрацию уровня флуоресценции GFP. Выход белка со свойствами ОРН в созданной биологической системе (плазмида pGFP-OPH, штамм E.coli BL21) составил не более 1,4 мг белка из 1 литра культуральной жидкости. Согласно данным, приведенным авторами, максимальный выход биомассы составил около 3 грамм с литра культуральной жидкости, следовательно, выход белка His-GFP-OPH не превышал 0,5 мг из 1 г клеток. Недостатком данной конструкции является не только низкий уровень экспрессии белка, но и довольно сложная процедура его очистки, вследствие того, что необходима обработка выделенного гибридного белка энтерокиназой (в течение 12 ч при 37° С) с целью отделения His-GFP-EK фрагмента белка. Далее необходима дополнительная очистка ОРН от посторонних белков (GFP и ЕК), присутствие которых снижает активность ОРН в 3 раза.
Была предпринята попытка увеличения выхода ОРН путем создания различных гибридных белков, содержащих в своем составе ОРН [Wu C.F., Valdes J.J., Rao G., Bentley W.E. Enhancement of organophosphorus hydrolase yield in Escherichia coli using multiple gene fusions.// Biotechnol Bioeng., V.75, p.100-103, (2001)]. Были созданы генетические конструкции на основе коммерческой плазмиды pTrcHis (Invitrogen), кодирующие синтез различных гибридных белков, содержащих по две копии гена ОРН в одном белке. В качестве штамма-хозяина использовали клетки E.coli BL21. Во всех случаях между геном, кодирующим ОРН, и олигогистидиновой последовательностью находился сайт узнавания энтерокиназой (ЕК). В случае конструкции His-GFP-EK-OPH-EK-OPH, содержащей две копии гена кодирующего ОРН, расположенных после His-GFP, выход ОРН увеличился в два раза и составил около 1 мг белка из 1 г клеток. Данный подход к увеличению выхода ОРН кроме недостатков, присущих предыдущему аналогу, имеет еще один, связанный с высокой массой полученной генетической конструкции (4,8 Md), что приводит к неустойчивому существованию экспрессионной системы. Данные по активности конечного белка авторами не приводятся.
Данное техническое решение, как наиболее близкое к заявляемому по своему назначению, а именно, получению экспрессионной системы, обеспечивающей максимальный выход His-OPH, принято за прототип.
Предлагаемое изобретение решает задачу получения His-OPH путем создания генно-инженерной конструкции и штамма клеток, которые обеспечивают синтез значительных количеств активной растворимой формы ОРН, содержащей олигогистидиновую последовательность, в цитоплазме клеток путем индуцибельного синтеза фермента с помощью индуктора (изопропил-β -D-галактопиранозид, ИПТГ).
Поставленная задача решается путем конструирования рекомбинантной плазмидной ДНК pTES-His-OPH, кодирующей индуцибельный синтез фермента ОРН, содержащего олигогистидиновую последовательность, и штамма Escherichia coli SG13009[pREP4]/pTES-His-ОРН, обеспечивающего синтез этого белка с уровнем экспрессии, позволяющим получать не менее 5 мг очищенного белка из 1 г влажной биомассы за две стадии (ультразвуковое разрушение клеток и металл-хелатирующая хроматография).
Индуцибельный высокий уровень синтеза целевого полипептида обеспечивается наличием в плазмиде pTES-His-OPH trc-промотора Е. coli и синтетического усилителя трансляции гена 10 бактериофага Т7.
Рекомбинантная плазмидная ДНК pTES-His-OPH, кодирующая фермент органофосфатгидролазу, характеризуется следующими признаками:
- имеет молекулярную массу 3,48 Md (5,276 т.п.о.);
- кодирует аминокислотную последовательность фермента органофосфатгидролазы;
- содержит оптимизированную гексагистидиновую последовательность на 5'-конце гена, кодирующего аминокислотную последовательность фермента органофосфатгидролазы;
- состоит из Cla I/Hind III - фрагмента ДНК плазмиды pTrcTEGF (Патент RU 2185438 С2, кл. С 12 N 15/12, 1/21, 2002) длиной 4,232 т.п.о., содержащего trc-промотор Е. coli, синтетический усилитель трансляции TREN гена 10 бактериофага Т7, ген bla β -лактамазы, определяющий устойчивость трансформированных плазмидой pTES-His-OPH клеток к ампициллину и участок ori инициации репликации; а также из ДНК фермента органофосфатгидролазы длиной 1,011 т.п.о., фланкированного сайтами рестрикции Ваm HI и Hind III и оптимизированную гексагистидиновую последовательность;
- содержит: trc-промотор Е. coli, уникальные сайты узнавания рестрикционными эндонуклеазами, имеющими следующие координаты: Nco I - 265, Eco RI - 270, Крn I - 286, Xba I - 340, Cla I - 377, Hind III – 1427.
Особенностью предложенной плазмидной конструкции является наличие trc-промотора Е. coli, контролирующего синтез ДНК фермента ОРН, а для усиления трансляции используется синтетический усилитель трансляции, что в совокупности обеспечивает индуцибельный синтез целевого белка с надежной регуляцией и высоким выходом, достигаемым при малых концентрациях индуктора.
Для получения штамма-продуцента фермента ОРН компетентные клетки Escherichia coli SG13009[pREP4] трансформируют рекомбинантной плазмидой pTES-His-OPH.
Полученный штамм Escherichia coli SG13009[pREP4]/pTES-His-OPH характеризуется следующими признаками:
Морфологические признаки. Клетки мелкие палочковидной формы, грамотрицательные, неспороносные, 1× 3-5 мкм, подвижные.
Культуральные признаки. При росте на агаризованной среде LB (Состав среды LB: триптон - 10,0 г/л; дрожжевой экстракт - 5,0 г/л; NaCl - 5,0 г/л; и 1,7% бактоагара) колонии круглые, гладкие, полупрозрачные, блестящие, серые, край ровный, диаметр колоний 1-3 мм; консистенция пастообразная. Рост в жидкой среде LB (триптон - 10,0 г/л; дрожжевой экстракт - 5,0 г/л; NaCl - 5,0 г/л) характеризуется ровным помутнением с образованием легкого осадка.
Физико-биохимические признаки. Клетки растут при температуре 4-42° С при оптимуме рН 6,8-7,2. В качестве источника азота используют как минеральные соли в аммонийной форме, так и органические соединения в виде пептона, триптона, дрожжевого экстракта, аминокислот. В качестве источника углерода используют аминокислоты, глицерин, углеводы.
Устойчивость к антибиотикам. Клетки проявляют устойчивость к ампициллину (до 200 мкг/мл), обусловленную наличием в плазмиде гена β -лактамазы, а также к канамицину (до 40 мкг/мл).
Штамм Е. coli SG13009[pREP4]/pTES-His-OPH обеспечивает индуцибельный синтез фермента органофосфатгидролазы, содержащего олигогистидиновую последовательность, с высоким содержанием растворимой формы фермента в цитоплазме, что позволяет получать не менее 5 мг очищенного белка из 1 г влажной биомассы за одну стадию. Совокупность перечисленных свойств штамма Е. coli SG13009[pREP4]/pTES-His-OPH делает получение рекомбинантной His-ОРН высокотехнологичным процессом.
Полученный штамм депонирован в коллекции культур микроорганизмов Института биоорганической химии им. М.М.Шемякина -Ю.А. Овчинникова Российской Академии Наук под номером 29.
На фиг.1 представлена физическая карта рекомбинантной плазмиды pTES-His-OPH; на фиг.2 - нуклеотидная последовательность ДНК фермента органофосфатгидролазы с прилегающими регуляторными элементами: trc - промотор (1-30 п.о.), усилитель трансляции TREN (93-188 п.о.), ген, кодирующий гексануклеотидную последовательность (189-221), ген органофосфатгидролазы (222-1232 п.о.); инициирующий и терминирующий кодоны подчеркнуты, в рамки взяты сайты рестриктаз: Eco RI, Cla I и Hind III; на фиг.3 - аминокислотная последовательность фермента органофосфатгидролазы, кодируемого рекомбинантной плазмидой pTES-His-OPH; на фиг.4 - электрофореграмма лизатов клеток штамма-реципиента Е. coli SG13009[pREP4] (дорожка 1), штамма-продуцента Е. coli SG13009[pREP4]/pTES-His-OPH (дорожка 2), белковых стандартов молекулярного веса (дорожка 3) в 12%-ном полиакриламидном геле (стрелкой указан фермент органофосфатгидролаза).
Изобретение иллюстрируется следующими примерами.
Пример 1. Конструирование рекомбинантной плазмиднои ДНК pTES-His-ОРН.
Проводят модификацию гена органофосфатгидролазы путем присоединения на 5'-конце нуклеотидной последовательности, кодирующей 6 остатков гистидина и несколько дополнительных аминокислотных остатков. Такую модификацию осуществляют следующим образом.
Проводят амплификацию гена органофосфатгидролазы с двумя праймерами: праймером For-Bam, имеющим нуклеотидную последовательность CTTCCGGATCCATCGGCACAGGCGATC, и Seq-Rev, имеющим нуклеотидную последовательность GTAACCACTCACACGGCA. Праймер For-Bam позволяет ввести сайт рестрикции эндонуклеазы Ваm HI в начало кодирующей области гена органофосфатгидролазы. Праймер Seq-Rev комплементарен внутренней области гена органофосфатгидролазы. Амплификацию осуществляют следующим образом. К 5 мкл раствора плазмидной ДНК pTES-OPH, состоящей из Cla I/Hind III - фрагмента ДНК плазмиды pTrcTEGF (Патент RU2185438 С2, кл. С 12 N 15/12, 1/21, 2002) длиной 4,232 т.п.о. и ДНК фермента органофосфатгидролазы длиной 1,011 т.п.о. (10 нг/мкл) (выделенной из хромосомной ДНК клеток Pseudomonas diminuta VKM B-1297 полимеразной цепной реакцией с праймерами FOR-Cla с нуклеотидной последовательностью СТТ ССА TCG АТА TGA GAG GAT CGC АТС и REV-Hind с нуклеотидной последовательностью ССА САА AGC TTC ATG ACG CCC GCA AGG ТС), прибавляют по 60 пмоль праймера For-Bam и 60 пмоль праймера Seq-Rev, 8 мкл смеси, содержащей 2,5 мМ каждого из дезоксинуклеозидтрифосфатов, 10 мкл 10-кратного буфера (100 мМ трис-HCl, рН 8,8, 500 мМ КСl, 15 мМ MgCl2), 2 ед. Taq ДНК-полимеразы и воду до общего объема реакционной смеси 100 мкл. Полимеразную цепную реакцию (ПЦР) проводят в следующем режиме: денатурация - 40 сек, 94° С; отжиг - 50 сек, 55° С; достройка - 1 мин, 72° С; количество циклов - 25. В результате амплификации получают ДНК длиной 530 п.н. Реакционную смесь после прохождения ПЦР экстрагируют равным объемом хлороформа, после чего осаждают этиловым спиртом. После центрифугирования и высушивания ДНК растворяют в 20 мкл 10 мМ трис-HCl, 1 мМ ЭДТА, рН 8,0. 5 мкл амплифицированной ДНК обрабатывают 10 ед. рестриктазы Ваm HI и 15 ед. рестриктазы Sal I (Fermentas, Литва) в течение 1 ч при 37° С в 20 мкл буферного раствора, содержащего 33 мМ трис-ацетата (рН 7,9), 10 мМ ацетата магния, 66 мМ ацетата калия, и из полученного гидролизата выделяют переносом из 1,5%-ного агарозного геля на DEAE-мембрану фрагмент ДНК органофосфатгидролазы длиной 218 т.п.о. (Ваm HI - Sal I фрагмент), осаждают этиловым спиртом, высушивают и растворяют в 20 мкл Н2О.
5 мкг плазмидной ДНК pTES-OPH размером 5243 т.п.о. (0,5 мкг/мкл) обрабатывают 10 ед. рестриктазы Сla I, 10 ед. рестриктазы Sal I и 15 ед. рестриктазы Hind III в течение 2 ч при 37° С в 30 мкл буферного раствора, содержащего 33 мМ трис-ацетата (рН 7,9), 10 мМ ацетата магния, 66 мМ ацетата калия, и из полученного гидролизата выделяют переносом из 0,8%-ного агарозного геля на DEAE-мембрану NA-45 3'-концевую часть кДНК органофосфатгидролазы длиной 796 т.п.о. (Sal I - Hind III фрагмент), а также векторную часть плазмидной ДНК длиной 4,232 т.п.о. (Sal I - Hind III фрагмент). Выделенные фрагменты осаждают этиловым спиртом, высушивают и растворяют в 20 мкл Н2О. Олигогистидиновую последовательность присоединяют в составе синтетического олигонуклеотидного дуплекса следующей структуры:
Данный дуплекс получают следующим образом: по 20 пмоль каждого из олигонуклеотидов (I) и (II) смешивают в водном растворе объемом 20 мкл, содержащем 40 мМ трис-HCl, рН 7,8 и 10 мМ MgCl2, после чего полученную смесь нагревают до 80° С в водяной бане и охлаждают до 20° С в течение 1 часа.
2 мкл раствора олигонуклеотидов после образования дуплекса смешивают с 0,02 мкг Sal I - Hind III фрагмента ДНК фермента органофосфатгидролазы длиной 696 т.п.о., 0,03 мкг Bam HI - SalI фрагмента длиной 418 и 0,05 мкг векторной части плазмидной ДНК pTrcTEGF(b) длиной 4,232 т.п.о. и проводят лигазную реакцию в течение 3 ч при 10° С в 15 мкл раствора, содержащего 40 мМ трис-НСl (рН 7,8), 10 мМ MgCl2, 10 мМ дитиотреитола, 0,5 мМ аденозинтрифосфата и 2 ед. Вейса Т4 ДНК-лигазы. 5 мкл реакционной смеси используют для трансформации 200 мкл компетентных клеток XL-1 Blue. 1/10 клеток, использованных для трансформации, высевают на LB-агар, содержащий 100 мкг/мл ампициллина. Из выросших клонов выделяют плазмидную ДНК, содержащую ДНК фермента органофосфатгидролазы, модифицированной добавлением гексагистидиновой последовательности.
Окончательно структуру рекомбинантной ДНК pTES-His-OPH подтверждают определением нуклеотидной последовательности в области встроенного гена органофосфатгидролазы. Аминокислотная последовательность органофосфатгидролазы, модифицированной добавлением гексагистидиновой последовательности, приведена на Фиг.3.
Пример 2. Получение штамма-продуцента фермента органофосфатгидролазы.
Компетентные клетки Escherichia coli SG13009[pREP4]: NalS StrS rifS, lac- ara- gal- mtl- F- recA+ uvr+ трансформируют рекомбинантной плазмидной ДНК pTES-His-OPH и получают штамм-продуцент фермента His-OPH.
Пример 3. Выделение и очистка рекомбинантного фермента органофосфатгидролазы, содержащей олигогистидиновую последовательность.
Для накопления биомассы клеток используют жидкую питательную среду TYE (триптон - 12,0 г/л, дрожжевой экстракт - 24,0 г/л, глицерин - 4,0 мл/л, КН2РO4 - 6,95 г/л, K2HPO4· 3H2O - 12,54 г/л, рН среды 7,0), в которую добавляют СоСl2· 6Н2О до концентрации 237 мг/л. Перед посевом клеток в среду добавляют раствор ампициллина (концентрация в среде 100 мкг/мл) и канамицина (концентрация в среде 25 мкг/мл).
Для получения инокулята производят посев культуры петлей с чашек Петри в 20 мл среды LB, содержащей ампициллин 100 мкг/мл, канамицин 25 мкг/мл. 16-часовой инокулят вносят в колбу, содержащую 100 мл полноценной питательной среды, культуру выращивают при 30° С и постоянном перемешивании (200 об/мин) до тех пор, пока оптическая плотность при длине волны 540 нм не достигнет 0,6, после чего добавляют ИПТГ до концентрации 0,4 мМ. Клетки культивируют в течение 24 часов. Полученную биомассу отделяют центрифугированием (5000 g, 15 мин), взвешивают и ресуспендируют в 50 мМ фосфатном буфере, рН 8,0, содержащем 300 мМ хлорида натрия (буфер для озвучивания) (массовое соотношение биомасса:буфер - 1:5). Клетки разрушают обработкой ультразвуком (частота 44 кГц) 6 раз по 45 секунд, между обработками биомассу выдерживают в течение 1 мин во льду. Осадок отделяют центрифугированием (15000 g, 30 мин).
К супернатанту добавляют равный объем 50% суспензии Ni-NTA агарозы, предварительно уравновешенной в буфере для озвучивания, и перемешивают в течение 1 ч. Колонку заполняют полученной суспензией, промывают (0,5 мл/мин) элюирующим буфером (50 мМ фосфат натрия (рН 6,0), 300 мМ хлорид натрия, 10% глицерин) и элюируют фермент с колонки градиентным раствором имидазола (от 0 до 0,5 М) в элюирующем буфере. Полученные фракции, содержащие His-OPH, объединяют и подвергают диализу против 20 мМ фосфатно-карбонатного буфера (рН 8,5).
В процессе очистки из 1 г влажной биомассы получают 5 мг высокоочищенного фермента со средней удельной активностью 6870 ед/мг белка. Выход фермента составляет 81,7% от исходного количества His-OPH, синтезированного клетками (табл.1).
Таблица 1. Баланс процедуры очистки и выделения His-OPH из 1 г биомассы. |
||||||
Этап очистки | Суммарный белок, мг | Суммарная активность, ед | Удельная активность, ед/мг белка | Очистка, раз | Выход, % |
|
Обработка клеток | 312 | 43680 | 140 | 1 | 100 | |
ультразвуком | ||||||
Ni-NTA колонка | 5,2 | 35730 | 6870 | 60 | 81,7 |
Пример 4. Исследование свойств рекомбинантного фермента органофосфатгидролазы, содержащей олигогистидиновую последовательность.
За скоростью исследуемой реакции следят спектрофотометрически по накоплению продукта 4-нитрофенолят аниона (ε =18000 М-1см-1, рН 10,7, λ =405 нм). Для определения каталитической активности His-OPH в водных растворах используют 0,05 М карбонатный буфер (рН 10,5). В качестве субстрата используют 1 мМ водные растворы параоксона, паратиона и метил-паратиона.
Каталитическую реакцию инициируют внесением в кювету с буфером и субстратом раствора His-OPH в 20 мМ фосфатно-карбонатном буфере (рН 8,5). Концентрация фермента в кювете составляет 10-10-10-9 М.
За единицу ферментативной активности принимают такое количество фермента, которое необходимо для того, чтобы гидролизовать 1 мМ субстрата за 1 мин при рН 10,5 и 20° С.
Расчет скоростей ферментативной реакции проводят по начальным линейным участкам кинетических кривых (vo=tgα ). Максимальную скорость ферментативной реакции (Vm) и константу Михаэлиса (Km) определяют с использованием двойных обратных координат 1/vo-1[S] (Лайнуивера-Берка).
Кинетические характеристики рекомбинантной органофосфатгидролазы приведены в табл.2. рН-оптимум действия фермента составляет 10,5.
Таблица 2. Константы гидролиза ФОС олигогистидинсодержащей органофосфатгидролазой. |
|||
Субстрат | kcat, с-1 | Km, мкМ | kcat/Km, M-1c-1 |
Параоксон | 5100± 100 | 10± 0,5 | 5,1× 108 |
Паратион | 530± 30 | 15± 0,5 | 3,5× 107 |
Метил-паратион | 310± 20 | 73± 1,0 | 4,2× 106 |
Таким образом, заявляемое техническое решение представляет собой плазмиду уникальной конструкции для микробного синтеза полипептида, обладающего свойствами ОРН, и штамм E.coli, обеспечивающий экспрессию данной плазмиды. Данное техническое решение обеспечивает высокий выход растворимого белка His-OPH (не менее 5 мг из 1 г клеток) (Пример 3), который в 5 раз превышает выходы аналогичных гибридных белков, содержащих олигогистидиновую последовательность, в известных экспрессионных системах.
В отличие от известных аналогов, предлагаемое техническое решение позволяет:
- получить полипептид, каталитическая эффективность которого увеличена в 10 раз по ряду основных субстратов по сравнению с нативным ферментом ОРН (Пример 4);
- сократить процесс выделения His-OPH до двух стадий, позволяющих получить более 80% от исходного синтезированного белка в клетках (Пример 3) и получить каталитически активный фермент без необходимости отделения ОРН от посторонних белков-маркеров, в частности, от His-GFP-EK.
Все это позволяет значительно повысить технологичность и экономичность процесса получения высокоактивного рекомбинантного фермента органофосфатгидролазы.
Рекомбинантный фермент может быть использован для приготовления наборов для аналитического определения фосфорорганических соединений, а также для производства препаратов на основе ОРН, предназначенных для деградации фосфорорганических соединений.
Claims (2)
1. Рекомбинантная плазмидная ДНК pTES-His-OPH, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, с молекулярной массой 3,48 Md (5,276 т.п.о.), включающая
СlaI/Hind III фрагмент ДНК плазмиды pTrcTEGF длиной 4,232 т.п.о.,
фрагмент плазмиды pTES-OPH длиной 1,011 т.п.о., имеющий нуклеотидную последовательность, которая кодирует аминокислотную последовательность зрелой формы органофосфатгидролазы, и фланкированный сайтами рестрикции Barn HI и Hind III, и
нуклеотидную последовательность АТGАGАGGАТСGСАТСАССАТСАССАТСАСGGА, располагающуюся на 5'-конце нуклеотидной последовательности, кодирующей аминокислотную последовательность зрелой формы органофосфатгидролазы, а также содержащая уникальные сайты узнавания рестрикционными эндонуклеазами: Nco I - 265, Eco R1 - 270, Kpn I - 286, Xba I - 340, Cla I - 377, Hind III - 1427.
2. Штамм бактерий Escherichia coli ЦКМИБХ-29 - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2003136646/13A RU2255975C1 (ru) | 2003-12-19 | 2003-12-19 | Рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2003136646/13A RU2255975C1 (ru) | 2003-12-19 | 2003-12-19 | Рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2255975C1 true RU2255975C1 (ru) | 2005-07-10 |
Family
ID=35838365
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2003136646/13A RU2255975C1 (ru) | 2003-12-19 | 2003-12-19 | Рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2255975C1 (ru) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2634914C2 (ru) * | 2016-12-08 | 2017-11-08 | Елена Николаевна Ефременко | Способ биообезвреживания микотоксинов |
-
2003
- 2003-12-19 RU RU2003136646/13A patent/RU2255975C1/ru active IP Right Revival
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2634914C2 (ru) * | 2016-12-08 | 2017-11-08 | Елена Николаевна Ефременко | Способ биообезвреживания микотоксинов |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Lan et al. | Coexpression of two detoxifying pesticide-degrading enzymes in a genetically engineered bacterium | |
EP0949930B1 (en) | Thermostable phosphatases | |
US8759028B2 (en) | Expression cassette, recombinant host cell and process for producing a target protein | |
CN106957850B (zh) | 一株产磷脂酶d的基因工程菌及其构建方法与应用 | |
CN110564708A (zh) | 一种重组磷脂酶d及其在合成磷脂酰丝氨酸或其它磷脂中的应用 | |
JP2003506046A (ja) | 1−デオキシ−d−キシルロース−5−リン酸レダクトイソメラーゼおよび1−デオキシ−d−キシルロース−5−リン酸シンターゼ活性の決定方法 | |
RU2255975C1 (ru) | Рекомбинантная плазмидная днк ptes-his-oph, кодирующая полипептид со свойствами органофосфатгидролазы, и штамм бактерий e.coli - продуцент полипептида со свойствами органофосфатгидролазы | |
CN102925419B (zh) | 一种有机磷农药降解酶突变体及其制备方法 | |
RU2232807C1 (ru) | Рекомбинантная плазмидная днк ptrcte-oph и продуцент фермента органофосфатгидролазы | |
McClain | A role for ribonuclease III in synthesis of bacteriophage T4 transfer RNAs | |
RU2619170C2 (ru) | Рекомбинантная плазмидная ДНК pER-APHC3, кодирующая гибридный белок, способный к автокаталитическому расщеплению с образованием APHC3, штамм Escherichia coli C3030/pER-APHC3 продуцент указанных белков и способ получения рекомбинантного APCH3 | |
KR100463966B1 (ko) | 시아노카르복실산 에스테르로부터 디카르복실산모노에스테르의 제조 | |
CN112662643A (zh) | 一种有机磷酸酐酶及其编码基因和在有机磷农药降解方面的应用 | |
KR101383546B1 (ko) | 심해 해저에서 분리된 에스터라제 ktl 4 | |
CN113881728B (zh) | 7-氨甲基-7-脱氮鸟嘌呤(PreQ1)的制备方法 | |
CN103013949A (zh) | 一种乙酰化羟基酸水解酶及其基因和应用 | |
US6147211A (en) | Method for treating cyclic phosphate compound | |
CN107619832A (zh) | 一种氯代硝基苯酚类化合物氧化还原酶基因簇cnpAB及其应用 | |
JP3357405B2 (ja) | フラビンヌクレオチド類の製造法 | |
CN105349507A (zh) | 一种脂肪酶LIPDa6及其编码基因和应用 | |
KR100838121B1 (ko) | 세포간극에 유기인 가수분해효소가 발현 및 분비된 대장균 | |
KR101639031B1 (ko) | 캘빈회로 유전자가 도입된 이산화탄소 저감용 재조합 미생물 및 이를 활용한 이산화탄소 저감 방법 | |
JPH02255086A (ja) | 新規制限酵素及びその製造法 | |
CN116536383A (zh) | 一种构建paps再生循环***及应用的方法 | |
RU2099421C1 (ru) | Способ получения рекомбинантного интерлейкина-3 человека, рекомбинантная плазмидная днк p3pteil3, кодирующая рекомбинантный интерлейкин-3 человека, штамм бактерий escherichia coli - продуцент рекомбинантного интерлейкина-3 человека |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20101220 |
|
NF4A | Reinstatement of patent |
Effective date: 20120410 |
|
PC43 | Official registration of the transfer of the exclusive right without contract for inventions |
Effective date: 20140325 |