RU2008104637A - Модифицированная амилаза из pseudomonas saccharophilia - Google Patents

Модифицированная амилаза из pseudomonas saccharophilia Download PDF

Info

Publication number
RU2008104637A
RU2008104637A RU2008104637/13A RU2008104637A RU2008104637A RU 2008104637 A RU2008104637 A RU 2008104637A RU 2008104637/13 A RU2008104637/13 A RU 2008104637/13A RU 2008104637 A RU2008104637 A RU 2008104637A RU 2008104637 A RU2008104637 A RU 2008104637A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
polypeptide
variant
seq
sequence
amino acid
Prior art date
Application number
RU2008104637/13A
Other languages
English (en)
Inventor
Каспер Туне БЕРГ (DK)
Каспер Туне БЕРГ
Патрик Мария Франсискус ДЕРККС (DK)
Патрик Мария Франсискус ДЕРККС
Кэрол ФЬОРЕСИ (US)
Кэрол ФЬОРЕСИ
Гийсберт ГЕРРИТСЕ (NL)
Гийсберт ГЕРРИТСЕ
Анья Хемминген КЕЛЛЕТ-СМИТ (DK)
Анья Хемминген КЕЛЛЕТ-СМИТ
Карстен Маттиас КРАГХ (DK)
Карстен Маттиас Крагх
Вэй ЛЮ (US)
Вэй Лю
Эндрю ШО (US)
Эндрю ШО
Бо Спанге СЕРЕНСЕН (DK)
Бо Спанге СЕРЕНСЕН
Шарлотт Рефдаль ТОУДАЛЬ (DK)
Шарлотт Рефдаль ТОУДАЛЬ
Original Assignee
Даниско А/С (Dk)
Даниско А/С
Джененкор Интернэшнл, Инк. (Us)
Джененкор Интернэшнл, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Даниско А/С (Dk), Даниско А/С, Джененкор Интернэшнл, Инк. (Us), Джененкор Интернэшнл, Инк. filed Critical Даниско А/С (Dk)
Publication of RU2008104637A publication Critical patent/RU2008104637A/ru

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A21—BAKING; EDIBLE DOUGHS
    • A21D—TREATMENT, e.g. PRESERVATION, OF FLOUR OR DOUGH, e.g. BY ADDITION OF MATERIALS; BAKING; BAKERY PRODUCTS; PRESERVATION THEREOF
    • A21D8/00—Methods for preparing or baking dough
    • A21D8/02—Methods for preparing dough; Treating dough prior to baking
    • A21D8/04—Methods for preparing dough; Treating dough prior to baking treating dough with microorganisms or enzymes
    • A21D8/042—Methods for preparing dough; Treating dough prior to baking treating dough with microorganisms or enzymes with enzymes
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23L—FOODS, FOODSTUFFS, OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT COVERED BY SUBCLASSES A21D OR A23B-A23J; THEIR PREPARATION OR TREATMENT, e.g. COOKING, MODIFICATION OF NUTRITIVE QUALITIES, PHYSICAL TREATMENT; PRESERVATION OF FOODS OR FOODSTUFFS, IN GENERAL
    • A23L33/00—Modifying nutritive qualities of foods; Dietetic products; Preparation or treatment thereof
    • A23L33/10—Modifying nutritive qualities of foods; Dietetic products; Preparation or treatment thereof using additives
    • A23L33/17—Amino acids, peptides or proteins
    • A23L33/18—Peptides; Protein hydrolysates
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405—Glucanases
    • C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/2411—Amylases
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405—Glucanases
    • C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/2411—Amylases
    • C12N9/2414—Alpha-amylase (3.2.1.1.)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405—Glucanases
    • C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/2411—Amylases
    • C12N9/2414—Alpha-amylase (3.2.1.1.)
    • C12N9/2417—Alpha-amylase (3.2.1.1.) from microbiological source
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405—Glucanases
    • C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/2411—Amylases
    • C12N9/2425—Beta-amylase (3.2.1.2)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405—Glucanases
    • C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/2411—Amylases
    • C12N9/2428—Glucan 1,4-alpha-glucosidase (3.2.1.3), i.e. glucoamylase

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Nutrition Science (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Polymers & Plastics (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Bakery Products And Manufacturing Methods Therefor (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • General Preparation And Processing Of Foods (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Fodder In General (AREA)
  • Cereal-Derived Products (AREA)

Abstract

1. Вариант полипептида PS4, который можно получить из исходного полипептида, обладающего амилазной активностью, выбираемый из группы, состоящей из ! (a) полипетида, включающего мутацию аминокислоты в каждом из следующих положений: 33, 34, 121, 134, 141, 146, 157, 161, 178, 179, 223, 229, 272, 303, 307, 309 и 334; ! (b) полипетида, включающего мутацию аминокислоты в каждом из следующих положений: 33, 34, 121, 134, 141, 145, 146, 157, 178, 179, 223, 229, 272, 303, 307 и 334; ! (c) полипетида, включающего мутацию аминокислоты в каждом из следующих положений: 33, 34, 121, 134, 141, 146, 157, 178, 179, 223, 229, 272, 303, 307, 309 и 334; ! (d) полипетида, включающего мутацию аминокислоты в каждом из следующих положений: 3, 33, 34, 70, 121, 134, 141, 146, 157, 178, 179, 223, 229, 272, 303, 307, 309 и 334; ! со ссылкой на нумерацию положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной как SEQ ID NO:1. ! 2. Вариант полипептида PS4 по п.1, в котором каждую из мутаций аминокислот в полипептиде (а) независимо выбирают из группы, состоящей из 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P, предпочтительно N33Y, D34N, G121F, G134R, A141P, Y146G, I157L, S161A, L178F, A179T, G223E, S229P, H272Q, G303E, H307L, A309P и S334P. ! 3. Вариант полипептида PS4 по п.1, включающий последовательность pSac-pMD229 (SEQ ID NO:13). ! 4. Вариант полипептида PS4 по п.1, в котором каждую из мутаций аминокислот в полипептиде (b) независимо выбирают из группы, состоящей из 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 145D, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L и 334P, предпочтительно N33Y, D34N, G121F, G134R, A141P, N145D, Y146G, I157L, L178F, A179T, G223E, S229P, H272Q, G303E, H307L и S334P. ! 5. Вариант полипептида PS4 по п.1, включающий последовательность pSac-pMD248 (SEQ ID NO:15). ! 6. Вариант полипептида PS4 по п.1, в котором каждую из мутаций аминокислот в полипептиде (с) независимо выбирают из группы, состоящей из 33Y, 34N, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309

Claims (62)

1. Вариант полипептида PS4, который можно получить из исходного полипептида, обладающего амилазной активностью, выбираемый из группы, состоящей из
(a) полипетида, включающего мутацию аминокислоты в каждом из следующих положений: 33, 34, 121, 134, 141, 146, 157, 161, 178, 179, 223, 229, 272, 303, 307, 309 и 334;
(b) полипетида, включающего мутацию аминокислоты в каждом из следующих положений: 33, 34, 121, 134, 141, 145, 146, 157, 178, 179, 223, 229, 272, 303, 307 и 334;
(c) полипетида, включающего мутацию аминокислоты в каждом из следующих положений: 33, 34, 121, 134, 141, 146, 157, 178, 179, 223, 229, 272, 303, 307, 309 и 334;
(d) полипетида, включающего мутацию аминокислоты в каждом из следующих положений: 3, 33, 34, 70, 121, 134, 141, 146, 157, 178, 179, 223, 229, 272, 303, 307, 309 и 334;
со ссылкой на нумерацию положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной как SEQ ID NO:1.
2. Вариант полипептида PS4 по п.1, в котором каждую из мутаций аминокислот в полипептиде (а) независимо выбирают из группы, состоящей из 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P, предпочтительно N33Y, D34N, G121F, G134R, A141P, Y146G, I157L, S161A, L178F, A179T, G223E, S229P, H272Q, G303E, H307L, A309P и S334P.
3. Вариант полипептида PS4 по п.1, включающий последовательность pSac-pMD229 (SEQ ID NO:13).
4. Вариант полипептида PS4 по п.1, в котором каждую из мутаций аминокислот в полипептиде (b) независимо выбирают из группы, состоящей из 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 145D, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L и 334P, предпочтительно N33Y, D34N, G121F, G134R, A141P, N145D, Y146G, I157L, L178F, A179T, G223E, S229P, H272Q, G303E, H307L и S334P.
5. Вариант полипептида PS4 по п.1, включающий последовательность pSac-pMD248 (SEQ ID NO:15).
6. Вариант полипептида PS4 по п.1, в котором каждую из мутаций аминокислот в полипептиде (с) независимо выбирают из группы, состоящей из 33Y, 34N, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P, предпочтительно N33Y, D34N, G121D, G134R, A141P, Y146G, I157L, L178F, A179T, G223E, S229P, H272Q, G303E, H307L, A309P и S334P.
7. Вариант полипептида РS4 по п.1, включающий последовательность pSac-pMD253 (SEQ ID NO:17).
8. Вариант полипептида PS4 по п.1, в котором каждую из мутаций аминокислот в полипептиде (d) независимо выбирают из группы, состоящей из 3S, 33Y, 34N, 70D, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P, предпочтительно A3S, N33Y, D34N, G70D, G121D, G134R, A141P, Y146G, I157L, L178F, A179T, G223E, S229P, H272Q, G303E, H307L, A309P и S334P.
9. Вариант полипептида PS4 по п.1, включающий последовательность pSac-pMD271 (SEQ ID NO:19).
10. Вариант полипептида PS4 по п.1, исходный полипептид которого обладает активностью экзоамилазы, предпочтительно немальтогенной экзоамилазы, более предпочтительно глюкан-1,4-альфа-мальтотетрагидролазы (ЕС 3.2.1.60).
11. Вариант полипептида PS4 по п.1, исходный полипептид которого является полипептидом из вида Pseudomonas, предпочтительно Pseudomonas saccharophilia или Pseudomonas stutzeri, либо может быть получен из вида Pseudomonas, предпочтительно Pseudomonas saccharophilia или Pseudomonas stutzeri.
12. Вариант полипептида PS4 по п.1, исходный полипептид которого является немальтогенной экзоамилазой из Pseudomonas saccharophilia, имеющей последовательность, представленную как SEQ ID NO:1 или SEQ ID NO:5.
13. Вариант полипептида PS4 по п.1, который включает мутации аминокислот в каждом из положений, указанных в (а), (b), (c) или (d) п.1, и который имеет аминокислотную последовательность, идентичную, по крайней мере, на 75% SEQ ID NO:1 или SEQ ID NO:5.
14. Вариант полипептида PS4 по п.1, исходный полипептид которого является немальтогенной экзоамилазой из Pseudomonas stutzeri, имеющей последовательность, представленную как SEQ ID NO:7 или SEQ ID NO:11.
15. Вариант полипептида PS4 по п.1, который включает мутации аминокислот в каждом из положений, указанных в (а), (b), (c) или (d) п.1, и который имеет аминокислотную последовательность, идентичную, по крайней мере, на 75% SEQ ID NO:7 или SEQ ID NO:11.
16. Вариант полипептида PS4 по п.1, обладающий большей термостабильностью, чем исходный полипептид или полипептид дикого типа, при проверке в одних и тех же условиях.
17. Вариант полипептида PS4 по любому из предшествующих пунктов, время полужизни (t1/2) которого предпочтительно при 60°С увеличено на 15% или более предпочтительно на 50% или более, наиболее предпочтительно на 100% или более, по сравнению с исходным полипептидом или полипептидом дикого типа.
18. Вариант полипептида PS4 по п.1, обладающий большей экзоспецифичностью, чем исходный полипептид или полипептид дикого типа при проверке в одних и тех же условиях.
19. Вариант полипептида PS4 по п.1, обладающий большей на 10% или более, предпочтительно на 20% или более, предпочтительно на 50% или более, экзоспецифичностью, чем исходный полипептид или полипептид дикого типа.
20. Вариант полипептида PS4 по п.1, при обработке которым пищевого продукта последний имеет любое одно или более, предпочтительно все, из следующих свойств: (а) меньшую твердость; (b) большую эластичность и (c) большую слипаемость, чем пищевой продукт, обработанный исходным полипептидом или полипептидомом дикого типа.
21. Вариант полипептида PS4 по п.20, при обработке которым эластичность или слипаемость пищевого продукта независимо увеличивается на 15% или более, предпочтительно на 50% или более, наиболее предпочтительно на 100% или более, по сравнению с пищевым продуктом, обработанным исходным полипептидом или полипептидом дикого типа.
22. Вариант полипептида PS4 по п.20, при обработке которым как эластичность, так и слипаемость пищевого продукта увеличивается по сравнению с пищевым продуктом, обработанным исходным полипептидом или полипептидом дикого типа.
23. Вариант полипептида PS4 по п.20, при обработке которым твердость пищевого продукта независимого уменьшается на 15% или более, предпочтительно на 50% или более, наиболее предпочтительно на 100% или более, по сравнению с пищевым продуктом, обработанным исходным полипептидом или полипептидом дикого типа.
24. Вариант полипептида PS4 по п.20, при обработке которым твердость пищевого продукта уменьшается по сравнению с пищевым продуктом, обработанным исходным полипептидом или полипептидом дикого типа.
25. Полипептид, включающий фрагмент из, по крайней мере, 20 остатков варианта полипептида PS4 по п.1, который обладает немальтогенной экзоамилазной активностью.
26. Применение полипептида по п.1 в качестве пищевой или кормовой добавки.
27. Способ обработки крахмала, включающий приведение в контакт крахмала с вариантом полипептида по п.1 и предоставление возможности полипептиду образовывать из крахмала один или несколько линейных продуктов.
28. Применение полипептида по п.1 для приготовления пищевого или кормового продукта.
29. Способ приготовления пищевого или кормового продукта, включающий смешивание полипептида по п.1 с пищевым или кормовым ингредиентом.
30. Применение по п.28, в котором пищевым продуктом является тесто или продукт из теста, предпочтительно подвергшийся технологической обработке продукт из теста.
31. Применение по п.26, в котором пищевым продуктом является хлебобулочное изделие.
32. Способ приготовления хлебобулочного изделия, включающий (а) получение крахмальной среды; (b) добавление к крахмальной среде полипептида по п.1 и (с) нагревание крахмальной среды во время или после стадии (b) с получением хлебобулочного изделия.
33. Пищевой продукт, кормовой продукт, продукт из теста или хлебобулочное изделие, полученные или которые можно получить способом по п.29 или 32.
34. Содержащая улучшитель композиция для теста, в которой содержащая улучшитель композиция содержит полипептид по п.1 и, по крайней мере, один дополнительный ингредиент теста или одну тестовую добавку.
35. Композиция, содержащая муку и полипептид по п.1.
36. Применение полипептида по п.1 в продукте из теста для замедления или уменьшения очерствения, предпочтительно вредной ретроградации, продукта из теста.
37. Применение варианта полипептида PS4 по п.1 в продукте из теста для улучшения любого одного или нескольких из следующих свойств продукта из теста: твердости, эластичности или слипаемости.
38. Комбинация варианта полипептида PS4 по п.1 с новамилом или его вариантом, гомологом или мутантами, имеющими мальтогенную альфа-амилазную активность.
39. Применение комбинации по п.38 для применения, указанного в любом из предшествующих пунктов.
40. Пищевой или кормовой продукт, полученный обработкой комбинацией по п.38.
41. Нуклеиновая кислота, способная кодировать полипептид по п.1.
42. Нуклеиновая кислота по п.41, которая кодирует полипептид, включающий мутации аминокислот в каждом из положений, указанных в (а), (b), (c) или (d) п.1, и который имеет последовательность нуклеиновой кислоты, идентичную, по крайней мере, на 75% SEQ ID NO:6 или SEQ ID NO:12.
43. Нуклеиновая кислота, включающая фрагмент из, по крайней мере, 60 остатков нуклеиновой кислоты по п.41, которая способна кодировать полипептид, имеющий немальтогенную экзоамилазную активность.
44. Последовательность нуклеиновой кислоты, которую можно получить из исходной последовательности, причем исходная последовательность способна кодировать амилазу, которая включает замену одного или нескольких остатков, так что нуклеиновая кислота кодирует одну или более из следующих мутаций в указанных положениях: (a) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (b) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 145D, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L и 334P; (c) 33Y, 34N, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (d) 3S, 33Y, 34N, 70D, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; со ссылкой на нумерацию положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной как SEQ ID NO:1.
45. Последовательность нуклеиновой кислоты по п.41, которую получают из исходной последовательности, кодирующей немальтогенную экзоамилазу, заменой одного или нескольких нуклеотидных остатков.
46. Последовательность нуклеиновой кислоты по п.41, которую выбирают из группы, состоящей из pSac-pMD229 (SEQ ID NO:14), pSac-pMD248 (SEQ ID NO:16), pSac-pMD253 (SEQ ID NO:18) и pSac-pMD271 (SEQ ID NO:20).
47. Плазмида, включающая нуклеиновую кислоту PS4 по п.41.
48. Экспрессирующий вектор, который включает нуклеиновую кислоту PS4 по п.41 или способен экспрессировать полипептид по п.1.
49. Клетка-хозяин, включающая плазмиду по п.47 или экспрессирующий вектор по п.48, предпочтительно трансформированная указанной плазмидой или указанным экспрессирующим вектором.
50. Клетка, способная экспрессировать полипептид по п.1.
51. Клетка-хозяин по п.49 или клетка по п.50, которая является клеткой бактерий, грибка или дрожжей.
52. Способ экспрессии варианта полипептида PS4, включающий получение клетки-хозяина по п.49 и экспрессию полипептида клеткой или клеткой-хозяином и, по желанию, очистку полипептида.
53. Способ изменения последовательности полипептида введением замены аминокислоты, выбираемой из группы, состоящей из (a) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (b) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 145D, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L и 334P; (c) 33Y, 34N, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (d) 3S, 33Y, 34N, 70D, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P (со ссылкой на нумерацию положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной как SEQ ID NO:1), в исходный полипептид, обладающий амилазной активностью.
54. Способ изменения последовательности немальтогенной экзоамилазы введением замены, выбираемой из группы, состоящей из (a) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (b) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 145D, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L и 334P; (c) 33Y, 34N, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (d) 3S, 33Y, 34N, 70D, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P, ссылаясь на нумерацию положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной как SEQ ID NO:1.
55. Способ по п.53, в котором последовательность немальтогенной экзоамилазы изменяют с помощью изменения последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей немальтогенную экзоамилазу.
56. Способ получения варианта полипептида PS4, включающий введение замены аминокислоты в исходный полипептид, обладающий амилазной активностью, причем замену аминокислоты выбирают из группы, состоящей из (a) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (b) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 145D, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L и 334P; (c) 33Y, 34N, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (d) 3S, 33Y, 34N, 70D, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P, со ссылкой на нумерацию положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной как SEQ ID NO:1.
57. Способ по п.53, в котором последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую исходный полипептид, изменяют для введения аминокислотной замены.
58. Способ изменения последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей немальтогенную экзоамилазу, причем этот способ включает введение в последовательность кодона, который кодирует аминокислотный остаток, выбираемый из группы, состоящей из (a) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (b) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 145D, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L и 334P; (c) 33Y, 34N, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (d) 3S, 33Y, 34N, 70D, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P, со ссылкой на нумерацию положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной как SEQ ID NO:1.
59. Способ увеличения термостабильности или экзоспецифичности или обоих этих свойств полипептида, причем этот способ включает стадии, указанные в п.53.
60. Способ по п.53, в котором полипептид выделяют или очищают или выделяют и очищают.
61. Полипептид, который можно получить способом по п.53.
62. Полипептид, полученный способом по п.53.
RU2008104637/13A 2005-07-07 2006-07-07 Модифицированная амилаза из pseudomonas saccharophilia RU2008104637A (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US69730205P 2005-07-07 2005-07-07
US60/697,302 2005-07-07

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2008104637A true RU2008104637A (ru) 2009-08-20

Family

ID=37331082

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2008104637/13A RU2008104637A (ru) 2005-07-07 2006-07-07 Модифицированная амилаза из pseudomonas saccharophilia

Country Status (11)

Country Link
US (2) US20070141693A1 (ru)
EP (1) EP1907538A1 (ru)
JP (1) JP2008544751A (ru)
KR (1) KR20080023746A (ru)
CN (1) CN101238210A (ru)
AU (1) AU2006268418A1 (ru)
BR (1) BRPI0612288A2 (ru)
CA (1) CA2614274A1 (ru)
MX (1) MX2008000374A (ru)
RU (1) RU2008104637A (ru)
WO (1) WO2007007053A1 (ru)

Families Citing this family (23)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DK1654355T3 (da) * 2003-06-13 2010-08-09 Danisco Pseudomonas polypeptidvarianter med ikke-maltogen exoamylaseaktivitet og deres anvendelse til fremstilling af fødevarer
AU2004258115A1 (en) * 2003-07-07 2005-01-27 Danisco A/S Thermostable amylase polypeptides, nucleic acids encoding those polypeptides and uses thereof
US8143048B2 (en) * 2003-07-07 2012-03-27 Danisco A/S Exo-specific amylase polypeptides, nucleic acids encoding those polypeptides and uses thereof
EP2295557B1 (en) * 2004-07-07 2017-09-06 DuPont Nutrition Biosciences ApS Exoamylase variants
CA2614274A1 (en) * 2005-07-07 2007-01-18 Danisco A/S Modified amylase from pseudomonas saccharophilia
US8030050B2 (en) * 2005-07-07 2011-10-04 Danisco A/S Modified amylases from Pseudomonas species
NZ573564A (en) * 2006-06-19 2012-01-12 Danisco PS4 variant polypeptide with amylase activity
US7666637B2 (en) * 2006-09-05 2010-02-23 Xuan Nghinh Nguyen Integrated process for separation of lignocellulosic components to fermentable sugars for production of ethanol and chemicals
EP2238244A1 (en) * 2008-01-02 2010-10-13 Danisco A/S Pseudomonas saccharophila g4-amylase variants and uses thereof
JP2010148488A (ja) * 2008-12-26 2010-07-08 Biomaterial In Tokyo Co Ltd カンジダ・グラブラータ（Ｃ．ｇｌａｂｒａｔａ）を用いるエタノール製造方法
EP2417255A2 (en) * 2009-04-10 2012-02-15 Danisco US Inc. Production of maltotetraose syrup using a pseudomonas saccharophila maltotetraohyfrolase variant
DK3473711T3 (da) 2009-05-19 2021-01-04 Dupont Nutrition Biosci Aps Amylasepolypeptider
ES2681692T3 (es) 2010-03-29 2018-09-14 Dupont Nutrition Biosciences Aps Polipéptidos que tienen actividad transgalactosilante
CA2852601C (en) 2011-10-17 2023-05-23 Novozymes A/S Alpha-amylase variants and polynucleotides encoding same
WO2013057143A2 (en) 2011-10-17 2013-04-25 Novozymes A/S Alpha-amylase variants and polynucleotides encoding same
BR122021002223B1 (pt) 2012-06-08 2023-03-28 Dupont Nutrition Biosciences Aps Composição compreendendo polipeptídeo com atividade de transgalactosilação
US9850512B2 (en) 2013-03-15 2017-12-26 The Research Foundation For The State University Of New York Hydrolysis of cellulosic fines in primary clarified sludge of paper mills and the addition of a surfactant to increase the yield
WO2015086027A1 (en) 2013-12-09 2015-06-18 Carlsberg A/S Stable haze for beverages
MX2016007636A (es) 2013-12-11 2016-10-13 Dupont Nutrition Biosci Aps Metodo para preparar un producto lacteo que tiene un contenido estable de galactooligosacarido(s).
US9951363B2 (en) 2014-03-14 2018-04-24 The Research Foundation for the State University of New York College of Environmental Science and Forestry Enzymatic hydrolysis of old corrugated cardboard (OCC) fines from recycled linerboard mill waste rejects
US10842163B2 (en) 2014-11-07 2020-11-24 Dupont Nutrition Biosciences Aps Recombinant host cell expressing beta-galactosidase and/or transgalactosylating activity deficient in mannanase, cellulase and pectinase
FI3607097T3 (fi) 2017-04-07 2023-09-11 Dupont Nutrition Biosci Aps BEETA-GALAKTOSIDAASEJA JA LAKTAASEJA ILMAN p-NITROBENTSYYLIESTERASISIVUAKTIIVISUUTTA TUOTTAVIA BACILLUS-ISÄNTÄSOLUJA
EP4071242A1 (en) * 2021-04-06 2022-10-12 DuPont Nutrition Biosciences ApS Amylase polypeptides with improved properties

Family Cites Families (19)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0063456B1 (en) * 1981-04-13 1984-08-01 Takeda Chemical Industries, Ltd. Pseudo-aminosugars, their production and use
US4683202A (en) * 1985-03-28 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying nucleic acid sequences
JP2660836B2 (ja) * 1987-07-08 1997-10-08 株式会社 林原生物化学研究所 マルトテトラオース生成アミラーゼ活性を有するポリペプチドとその用途
DE4017595A1 (de) * 1990-05-31 1991-12-05 Consortium Elektrochem Ind Maltopentaose produzierende amylasen
JP3533239B2 (ja) * 1994-03-01 2004-05-31 株式会社林原生物化学研究所 マルトヘキサオース・マルトヘプタオース生成アミラーゼとその製造方法並びに用途
US6093562A (en) * 1996-02-05 2000-07-25 Novo Nordisk A/S Amylase variants
AU4483496A (en) * 1995-02-03 1996-08-21 Novo Nordisk A/S A method of designing alpha-amylase mutants with predetermined properties
CN1292028B (zh) * 1998-02-27 2013-08-14 诺维信公司 麦芽α淀粉酶变体
EP1068302B1 (en) * 1998-04-01 2005-06-01 Danisco A/S Non-maltogenic exoamylases and their use in retarding retrogradation of starch
US20030134395A1 (en) * 2001-12-19 2003-07-17 Shetty Jayarama K. Process for hydrolyzing starch without pH adjustment
DK1654355T3 (da) * 2003-06-13 2010-08-09 Danisco Pseudomonas polypeptidvarianter med ikke-maltogen exoamylaseaktivitet og deres anvendelse til fremstilling af fødevarer
US8143048B2 (en) * 2003-07-07 2012-03-27 Danisco A/S Exo-specific amylase polypeptides, nucleic acids encoding those polypeptides and uses thereof
AU2004258115A1 (en) * 2003-07-07 2005-01-27 Danisco A/S Thermostable amylase polypeptides, nucleic acids encoding those polypeptides and uses thereof
US20060073583A1 (en) * 2004-09-22 2006-04-06 Kragh Karsten M Polypeptide
US20060008890A1 (en) * 2004-07-07 2006-01-12 Kragh Karsten M Polypeptide
US20060008888A1 (en) * 2004-07-07 2006-01-12 Kragh Karsten M Polypeptide
US20060018997A1 (en) * 2004-07-07 2006-01-26 Kragh Karsten M Polypeptide
US8030050B2 (en) * 2005-07-07 2011-10-04 Danisco A/S Modified amylases from Pseudomonas species
CA2614274A1 (en) * 2005-07-07 2007-01-18 Danisco A/S Modified amylase from pseudomonas saccharophilia

Also Published As

Publication number Publication date
US20070141693A1 (en) 2007-06-21
MX2008000374A (es) 2008-03-07
JP2008544751A (ja) 2008-12-11
AU2006268418A1 (en) 2007-01-18
US20080292747A1 (en) 2008-11-27
CA2614274A1 (en) 2007-01-18
EP1907538A1 (en) 2008-04-09
KR20080023746A (ko) 2008-03-14
WO2007007053A1 (en) 2007-01-18
CN101238210A (zh) 2008-08-06
BRPI0612288A2 (pt) 2009-01-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2008104637A (ru) Модифицированная амилаза из pseudomonas saccharophilia
RU2009101321A (ru) Полипептид
RU2007104586A (ru) Полипептид
JP5174077B2 (ja) マルトース産生アルファアミラーゼ変異体
Aleshin et al. Crystal structure and evolution of a prokaryotic glucoamylase
JP4550587B2 (ja) 熱安定性α−アミラーゼ
Imamura et al. Crystal structures of 4-α-glucanotransferase from Thermococcus litoralis and its complex with an inhibitor
CN102245764B (zh) 杂合α-淀粉酶
JP2018532413A (ja) タンパク質発現の増強およびその方法
US20240180172A1 (en) Amylase polypeptides with improved properties
de Lemos Esteves et al. Acidophilic adaptation of family 11 endo‐β‐1, 4‐xylanases: Modeling and mutational analysis
US20070190604A1 (en) Novel Gene Products From Bacillus Licheniformis Forming Or Decomposing Polyamino Acids And Improved Biotechnological Production Methods Based Thereon
EP1601765A2 (en) Variants of enzymes of the alpha-amylase family
Wang et al. Low‐molecular‐weight glutenin subunits from the 1U genome of Aegilops umbellulata confer superior dough rheological properties and improve breadmaking quality of bread wheat
CN108795893A (zh) 一种氨基酸脱氢酶突变体及其制备方法和应用
JPH04500609A (ja) 工業的応用条件下で安定性が減少した酵素変異体
CN1174094C (zh) 纤维素分解酶、木聚糖分解酶和β-葡聚糖分解酶的抑制剂
Wong et al. High-Activity Barley\bold\ralpha-Amylase by Directed Evolution
GUO et al. Characterization of HMW prolamines and their coding sequences from Crithopsis delileana
Feng et al. Molecular cloning of a novel chimeric HMW glutenin subunit gene 1Dx5′ from a common wheat line W958
EP0707640A1 (en) (1 $m(7) 3, 1 $m(7) 4)-$g(b)-GLUCANASE OF ENHANCED STABILITY
Wachi et al. A novel RNase G mutant that is defective in degradation of adhE mRNA but proficient in the processing of 16S rRNA precursor
CN111466511B (zh) 含有去环氧基蛋白酶的组合物及脱毒方法
CN1222938A (zh) 经修饰具有改变了的钙离子吉合性质的α－淀粉酶
Cao et al. Identification and characterization of a novel Ag. intermedium HMW-GS gene from T. aestivum-Ag. intermedium addition lines TAI-I series

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20101201