Claims (38)
1. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты из Corynebacterium glutamicum, кодирующая белок системы фосфоенолпируват-сахар-фосфотрансферазы, или ее часть, при условии, что эта молекула нуклеиновой кислоты не состоит ни из одного из F-обозначенных генов, представленных в табл.1.1. An isolated nucleic acid molecule from Corynebacterium glutamicum encoding a protein of the phosphoenolpyruvate-sugar-phosphotransferase system, or part thereof, provided that this nucleic acid molecule does not consist of any of the F-designated genes shown in Table 1.
2. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты по п.1, где указанный белок системы фосфоенолпируват-сахар-фосфотрансферазы выбран из группы, состоящей из белков, участвующих в транспорте глюкозы, сахарозы, маннозы, фруктозы, маннита, рафинозы, рибулозы, рибозы, лактозы, мальтозы, сорбозы, сорбита, ксилозы и галактозы.2. The isolated nucleic acid molecule according to claim 1, wherein said protein of the phosphoenolpyruvate-sugar-phosphotransferase system is selected from the group consisting of proteins involved in the transport of glucose, sucrose, mannose, fructose, mannitol, raffinose, ribulose, ribose, lactose, maltose , sorbose, sorbitol, xylose and galactose.
3. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты Corynebacterium glutamicum, выбранная из группы, состоящей из последовательностей, представленных в виде имеющих нечетные номера SEQ ID NO: Списка последовательностей, или ее часть, при условии, что эта молекула нуклеиновой кислоты не состоит ни из одного из F-обозначенных генов, представленных в табл.1.3. An isolated Corynebacterium glutamicum nucleic acid molecule selected from the group consisting of sequences presented as odd-numbered SEQ ID NO: Sequence Listing, or part thereof, provided that this nucleic acid molecule does not consist of any of F- designated genes are presented in table 1.
4. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из последовательностей, представленных в виде, имеющих четные номера SEQ ID NO: Списка последовательностей, при условии, что эта молекула нуклеиновой кислоты не состоит ни из одного из F-обозначенных генов, представленных в табл.1.4. An isolated nucleic acid molecule that encodes a polypeptide sequence selected from the group consisting of sequences shown as even numbers SEQ ID NO: Sequence List, provided that the nucleic acid molecule does not consist of any of F- designated genes are presented in table 1.
5. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, которая кодирует природный аллельный вариант полипептида, выбранного из группы аминокислотных последовательностей, состоящей из последовательностей, представленных в виде имеющих четные номера SEQ ID NO: Списка последовательностей, при условии, что эта молекула нуклеиновой кислоты не состоит ни из одного из F-обозначенных генов, представленных в табл.1.5. An isolated nucleic acid molecule that encodes a naturally occurring allelic variant of a polypeptide selected from the group of amino acid sequences consisting of sequences represented as even-numbered SEQ ID NO: Sequence List, provided that the nucleic acid molecule does not consist of any of the F-designated genes shown in table 1.
6. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая нуклеотидную последовательность, которая, по меньшей мере, на 50% гомологична нуклеотидной последовательности, выбранной из группы, состоящей из последовательностей, представленных в виде имеющих нечетные номера SEQ ID NO: Списка последовательностей, или ее часть, при условии, что эта молекула нуклеиновой кислоты не состоит ни из одного из F-обозначенных генов, представленных в табл.1.6. An isolated nucleic acid molecule containing a nucleotide sequence that is at least 50% homologous to a nucleotide sequence selected from the group consisting of sequences presented as odd-numbered SEQ ID NO: Sequence Listing, or part thereof, when provided that this nucleic acid molecule does not consist of any of the F-designated genes shown in table 1.
7. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая фрагмент из, по меньшей мере, 15 нуклеотидов нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из последовательностей, представленных в виде имеющей нечетные номера SEQ ID NO: Списка последовательностей, при условии, что эта молекула нуклеиновой кислоты не состоит ни из одного из F-обозначенных генов, представленных в табл.1.7. An isolated nucleic acid molecule containing a fragment of at least 15 nucleotides of a nucleic acid containing a nucleotide sequence selected from the group consisting of sequences presented as having odd numbers SEQ ID NO: Sequence List, provided that this the nucleic acid molecule does not consist of any of the F-designated genes shown in Table 1.
8. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, которая гибридизуется с молекулой нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-7 в жестких условиях.8. The selected nucleic acid molecule that hybridizes with the nucleic acid molecule according to any one of claims 1 to 7 under stringent conditions.
9. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-8 или ее часть и нуклеотидную последовательность, кодирующую гетерологичный полипептид.9. An isolated nucleic acid molecule containing the nucleic acid molecule according to any one of claims 1 to 8 or a part thereof and a nucleotide sequence encoding a heterologous polypeptide.
10. Вектор, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пунктов 1-9.10. A vector containing a nucleic acid molecule according to any one of paragraphs 1-9.
11. Вектор по п.10, который является экспрессирующим вектором.11. The vector of claim 10, which is an expression vector.
12. Клетка-хозяин, трансфицированная экспрессирующим вектором по п.11.12. A host cell transfected with an expression vector according to claim 11.
13. Клетка-хозяин по п.12, где указанная клетка является микроорганизмом.13. The host cell of claim 12, wherein said cell is a microorganism.
14. Клетка-хозяин по п.13, где указанная клетка принадлежит к роду Corynebacterium или Brevibacterium.14. The host cell according to item 13, where the specified cell belongs to the genus Corynebacterium or Brevibacterium.
15. Клетка-хозяин по п.12, где экспрессия указанной молекулы нуклеиновой кислоты приводит к модуляции продуцирования химического продукта тонкого органического синтеза из указанной клетки.15. The host cell of claim 12, wherein the expression of said nucleic acid molecule modulates the production of a fine organic chemical product from said cell.
16. Клетка-хозяин по п.15, где указанный химический продукт тонкого органического синтеза выбран из группы, состоящей из органических кислот, белковых аминокислот, небелковых аминокислот, пуриновых и пиримидиновых оснований, нуклеозидов, нуклеотидов, липидов, насыщенных и ненасыщенных жирных кислот, двухатомных спиртов, углеводов, ароматических соединений, витаминов, кофакторов, поликетидов и ферментов.16. The host cell according to clause 15, where the specified chemical product of fine organic synthesis is selected from the group consisting of organic acids, protein amino acids, non-protein amino acids, purine and pyrimidine bases, nucleosides, nucleotides, lipids, saturated and unsaturated fatty acids, diatomic alcohols, carbohydrates, aromatic compounds, vitamins, cofactors, polyketides and enzymes.
17. Способ получения полипептида, предусматривающий культивирование клетки-хозяина по п.12 в подходящей культуральной среде для получения посредством этого данного полипептида.17. A method for producing a polypeptide comprising culturing a host cell according to claim 12 in a suitable culture medium to thereby produce a given polypeptide.
18. Выделенный полипептид системы фосфоенолпируват-сахар-фосфотрансферазы из Corynebacterium glutamicum или его часть.18. An isolated polypeptide of the phosphoenolpyruvate-sugar-phosphotransferase system from Corynebacterium glutamicum or part thereof.
19. Белок по п.18, где указанный белок системы фосфоенолпируват-сахар-фосфотрансферазы выбран из группы, состоящей из белков, участвующих в транспорте глюкозы, сахарозы, маннозы, фруктозы, маннита, рафинозы, рибулозы, рибозы, лактозы, мальтозы, сорбозы и галактозы.19. The protein of claim 18, wherein said protein of the phosphoenolpyruvate-sugar-phosphotransferase system is selected from the group consisting of proteins involved in the transport of glucose, sucrose, mannose, fructose, mannitol, raffinose, ribulose, ribose, lactose, maltose, sorbose and galactoses.
20. Выделенный полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из последовательностей, представленных в виде имеющих четные номера SEQ ID NO: Списка последовательностей, при условии, что эта аминокислотная последовательность не кодируется никаким из F-обозначенных генов, представленных в табл.1.20. The selected polypeptide containing the amino acid sequence selected from the group consisting of sequences presented as even-numbered SEQ ID NO: Sequence List, provided that this amino acid sequence is not encoded by any of the F-designated genes shown in table. 1.
21. Выделенный полипептид, содержащий природный аллельный вариант полипептида, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из последовательностей, представленных в виде имеющих четные номера SEQ ID NO: Списка последовательностей, или его часть, при условии, что эта аминокислотная последовательность не кодируется никаким из F-обозначенных генов, представленных в табл.1.21. The selected polypeptide containing a natural allelic version of the polypeptide containing an amino acid sequence selected from the group consisting of sequences presented as even numbers SEQ ID NO: List of sequences, or part thereof, provided that this amino acid sequence is not encoded by any of the F-designated genes shown in table 1.
22. Выделенный полипептид по любому из пп.18-21, дополнительно содержащий гетерологичные аминокислотные последовательности.22. An isolated polypeptide according to any one of claims 18 to 21, further comprising heterologous amino acid sequences.
23. Выделенный полипептид, который кодируется молекулой нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, которая является, по меньшей мере, на 50% гомологичной нуклеиновой кислоте, выбранной из группы, состоящей из последовательностей, представленных в виде имеющих нечетные номера SEQ ID NO: Списка последовательностей, при условии, что эта молекула нуклеиновой кислоты не содержит никакой из F-обозначенных молекул нуклеиновых кислот, представленных в табл.1.23. An isolated polypeptide that is encoded by a nucleic acid molecule containing a nucleotide sequence that is at least 50% homologous to a nucleic acid selected from the group consisting of sequences presented as odd-numbered SEQ ID NO: Sequence Listing, provided that this nucleic acid molecule does not contain any of the F-designated nucleic acid molecules shown in table 1.
24. Выделенный полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, которая является, по меньшей мере, на 50% гомологичной аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из последовательностей, представленных в виде имеющих четные номера SEQ ID NO: Списка последовательностей, при условии, что эта аминокислотная последовательность не кодируется никаким из F-обозначенных генов, представленных в табл.1.24. An isolated polypeptide containing an amino acid sequence that is at least 50% homologous to an amino acid sequence selected from the group consisting of sequences presented as even numbers SEQ ID NO: Sequence List, provided that this amino acid the sequence is not encoded by any of the F-designated genes shown in Table 1.
25. Способ получения химического продукта тонкого органического синтеза, предусматривающий культивирование клетки, содержащей вектор по п.12, так что продуцируется химический продукт тонкого органического синтеза.25. A method of obtaining a chemical product of fine organic synthesis, comprising cultivating a cell containing the vector according to item 12, so that a chemical product of fine organic synthesis is produced.
26. Способ по п.25, где указанный способ дополнительно предусматривает стадию извлечения химического продукта тонкого органического синтеза из указанной культуры.26. The method according A.25, where the specified method further comprises the step of extracting a chemical product of fine organic synthesis from the specified culture.
27. Способ по п.25, где указанный способ дополнительно предусматривает стадию трансфекции указанной клетки вектором по п.11 для получения клетки, содержащей указанный вектор.27. The method of claim 25, wherein said method further comprises the step of transfecting said cell with the vector of claim 11 to produce a cell containing said vector.
28. Способ по п.25, где указанная клетка принадлежит к роду Corynebacterium или Brevibacterium.28. The method according A.25, where the specified cell belongs to the genus Corynebacterium or Brevibacterium.
29. Способ по п.25, где указанная клетка выбрана из группы, состоящей из: Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium herculis, Corynebacterium lilium, Corynebacterium acetoacidophilum, Corynebacterium acetoglutamicum, Corynebacterium acetophilum, Corynebacterium ammoniagenes, Corynebacterium fujiokense, Corynebacterium nitrilophilus, Brevibacterium ammoniagenes, Brevibacterium butanicum, Brevibacterium divaricatum, Brevibacterium flavum, Brevibacterium healii, Brevibacterium ketoglutamicum, Brevibacterium ketosoreductum, Brevibacterium lactofermentum, Brevibacterium linens, Brevibacterium paraffinolyticum и их штаммов, представленных в табл.3.29. The method of claim 25, wherein said cell is selected from the group consisting of: Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium herculis, Corynebacterium lilium, Corynebacterium acetoacidophilum, Corynebacterium acetoglutamicum, Corynebacterium acetophilum, Corynebacterium ammoniagenes, Corynebacterium fujiokense, Corynebacterium nitrilophilus, Brevibacterium ammoniagenes, Brevibacterium butanicum , Brevibacterium divaricatum, Brevibacterium flavum, Brevibacterium healii, Brevibacterium ketoglutamicum, Brevibacterium ketosoreductum, Brevibacterium lactofermentum, Brevibacterium linens, Brevibacterium paraffinolyticum and their strains. 3.
30. Способ по п.25, где экспрессия молекулы нуклеиновой кислоты из указанного вектора приводит к модуляции продуцирования указанного химического продукта тонкого органического синтеза.30. The method according A.25, where the expression of a nucleic acid molecule from the specified vector leads to modulation of the production of the specified chemical product of fine organic synthesis.
31. Способ по п.25, где указанный химический продукт тонкого органического синтеза выбран из группы, состоящей из органических кислот, белковых аминокислот, небелковых аминокислот, пуриновых и пиримидиновых оснований, нуклеозидов, нуклеотидов, липидов, насыщенных и ненасыщенных жирных кислот, двухатомных спиртов, углеводов, ароматических соединений, витаминов, кофакторов, поликетидов и ферментов.31. The method according A.25, where the specified chemical product of fine organic synthesis is selected from the group consisting of organic acids, protein amino acids, non-protein amino acids, purine and pyrimidine bases, nucleosides, nucleotides, lipids, saturated and unsaturated fatty acids, dihydric alcohols, carbohydrates, aromatic compounds, vitamins, cofactors, polyketides and enzymes.
32. Способ по п.25, где указанный химический продукт является аминокислотой.32. The method according A.25, where the specified chemical product is an amino acid.
33. Способ по п.32, где указанная аминокислота выбрана из группы, состоящей из лизина, глутамата, глутамина, аланина, аспартата, глицина, серина, треонина, метионина, цистеина, валина, лейцина, изолейцина, аргинина, пролина, гистидина, тирозина, фенилаланина и триптофана.33. The method of claim 32, wherein said amino acid is selected from the group consisting of lysine, glutamate, glutamine, alanine, aspartate, glycine, serine, threonine, methionine, cysteine, valine, leucine, isoleucine, arginine, proline, histidine, tyrosine , phenylalanine and tryptophan.
34. Способ получения химического продукта тонкого органического синтеза, предусматривающий культивирование клетки, геномная ДНК которой была изменена включением молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-9.34. A method of obtaining a chemical product of fine organic synthesis, comprising cultivating a cell whose genomic DNA has been altered by incorporating a nucleic acid molecule according to any one of claims 1 to 9.
35. Способ диагностики присутствия или активности Corynebacterium diphtheriae в субъекте, предусматривающий детектирование присутствия одной или нескольких SEQ ID NO:1 - SEQ ID NO:34 Списка последовательностей в этом субъекте, при условии, что эти последовательности не являются ни одной из F-обозначенных последовательностей, представленных в табл.1, и не кодируются ни одной из F-обозначенных последовательностей, представленных в табл.1, и диагностирование посредством этого присутствия или активности Corynebacterium diphtheriae в данном субъекте.35. A method for diagnosing the presence or activity of Corynebacterium diphtheriae in a subject, comprising detecting the presence of one or more of SEQ ID NO: 1 - SEQ ID NO: 34 a List of sequences in this subject, provided that these sequences are not one of the F-designated sequences are presented in table 1, and not encoded by any of the F-designated sequences shown in table 1, and diagnosis through this presence or activity of Corynebacterium diphtheriae in this subject.
36. Клетка-хозяин, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из молекул нуклеиновых кислот, представленных в виде имеющих нечетные номера SEQ ID NO: Списка последовательностей, где эта молекула нуклеиновой кислоты является разрушенной.36. A host cell containing a nucleic acid molecule selected from the group consisting of nucleic acid molecules represented as odd-numbered SEQ ID NO: Sequence listing where this nucleic acid molecule is disrupted.
37. Клетка-хозяин, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из молекул нуклеиновых кислот, представленных в виде имеющих нечетные номера SEQ ID NO: Списка последовательностей, где эта молекула нуклеиновой кислоты содержит одну или несколько модификаций нуклеиновой кислоты относительно последовательности, представленной в виде имеющих нечетные номера SEQ ID NO: Списка последовательностей.37. A host cell containing a nucleic acid molecule selected from the group consisting of nucleic acid molecules represented as odd-numbered SEQ ID NO: Sequence Listing where this nucleic acid molecule contains one or more nucleic acid modifications relative to the sequence represented by as odd-numbered SEQ ID NO: Sequence List.
38. Клетка-хозяин, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из молекул нуклеиновых кислот, представленных в виде имеющих нечетные номера SEQ ID NO: Списка последовательностей, где регуляторная область этой молекулы нуклеиновой кислоты модифицирована относительно регуляторной области этой молекулы дикого типа.38. A host cell containing a nucleic acid molecule selected from the group consisting of nucleic acid molecules represented as odd numbers SEQ ID NO: A sequence listing where the regulatory region of this nucleic acid molecule is modified relative to the regulatory region of this wild-type molecule.