JP2006271389A5

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Publication number: JP2006271389A5
Application number: JP2006132306A
Authority: JP
Filing date: 2006-05-11
Publication date: 2007-06-14

Claims

配列番号（SEQ ID NO)：７７に示されたヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子またはその相補体。 SEQ ID NO (SEQ ID NO): 77 comprises a nucleotide sequence shown in, isolated nucleic acid molecule or its complement.

配列番号（SEQ ID NO)：７８に示されたアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする単離された核酸分子またはその相補体。 SEQ ID NO (SEQ ID NO): A shown in 78 amino acid sequence of the isolated nucleic acid molecule or a complement thereof encoding including Mupo Ripepuchido.

配列番号（SEQ ID NO)：７８に示されたアミノ酸配列を含む、ポリペプチドの自然に発生する対立性変異体をコードする単離された核酸分子またはその相補体。 SEQ ID NO (SEQ ID NO): 78 including amino acid sequence shown in, encoding allelic variants that occur naturally in polypeptides isolated nucleic acid molecule or its complement.

配列番号（SEQ ID NO)：７７に示されたヌクレオチド配列全体に対し、少なくとも５０％の相同性を持つヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子またはその相補体。 SEQ ID NO (SEQ ID NO): 77 against the nucleotide sequence entire shown in, comprising a nucleotide sequence having at least 50% homology, the isolated nucleic acid molecule or its complement.

配列番号（SEQ ID NO) ：７７に示されたヌクレオチド配列の、少なくとも１５個の連続するヌクレオチドの核酸フラグメントを含む、単離された核酸分子またはその相補体。 SEQ ID NO (SEQ ID NO): the indicated nucleotide sequence to 77, comprising the nucleic acid fragment of at least 15 contiguous nucleotides, isolated nucleic acid molecule or its complement.

配列番号（SEQ ID NO)：７８に示されたアミノ酸配列全体に対し、少なくとも５０％の相同性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする単離された核酸分子またはその相補体。SEQ ID NO: 78: isolated nucleic acid molecule encoding a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 50% homology to the entire amino acid sequence set forth in 78 or its complement.

請求項１から６のいずれかに記載の核酸分子、および異種ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸。 An isolated nucleic acid comprising a nucleic acid molecule according to any of claims 1 to 6 and a nucleotide sequence encoding a heterologous polypeptide.

請求項１から７のいずれかに記載の核酸分子を含むベクター。 Vector comprising a nucleic acid molecule according to any one of claims 1 to 7.

発現ベクターである、請求項８に記載のベクター。 The vector according to claim 8 , which is an expression vector.

請求項９に記載の発現ベクターによりトランスフェクションされた単離された宿主細胞。 An isolated host cell transfected with the expression vector of claim 9 .

前記細胞が微生物に由来する請求項１０に記載の宿主細胞。 The host cell according to claim 10 , wherein the cell is derived from a microorganism.

前記細胞が、コリネバクテリウム属またはブレビバクテリウム属に属する請求項１１に記載の宿主細胞。 The host cell according to claim 11 , wherein the cell belongs to the genus Corynebacterium or Brevibacterium.

前記核酸分子の発現の結果、前記細胞からのファインケミカルの製造が調節される請求項１０に記載の宿主細胞。 11. A host cell according to claim 10 , wherein the production of fine chemicals from the cell is regulated as a result of the expression of the nucleic acid molecule.

ファインケミカルが、有機酸、タンパク質原アミノ酸および非タンパク質原アミノ酸、プリンおよびピリミジン塩基、ヌクレオシド、ヌクレオチド、脂質、飽和および不飽和の脂肪酸、ジオール、炭水化物、芳香族化合物、ビタミン、補助因子、ポリケチド、および酵素からなる群より選択される請求項１３に記載の宿主細胞。 Fine chemicals are organic acids, pro- and non-prote amino acids, purines and pyrimidine bases, nucleosides, nucleotides, lipids, saturated and unsaturated fatty acids, diols, carbohydrates, aromatics, vitamins, cofactors, polyketides, and enzymes 14. A host cell according to claim 13 selected from the group consisting of:

適当な培地中で請求項１０に記載の宿主細胞を培養し、これによりポリペプチドを製造することを含む、ポリペプチドの製造方法。 A method for producing a polypeptide, comprising culturing the host cell according to claim 10 in an appropriate medium, thereby producing the polypeptide.

配列番号（SEQ ID NO)：７８に示されたアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。 SEQ ID NO (SEQ ID NO): 78 including amino acid sequences shown in, isolated polypeptide.

配列番号（SEQ ID NO) ：７８に示されたアミノ酸配列を含むポリペプチドの、自然に発生する対立性変異体を含む単離されたポリペプチド。 SEQ ID NO (SEQ ID NO): polypeptide comprising the amino acid sequence shown in 78, an isolated polypeptide comprising an allelic variant which occurs naturally.

配列番号（SEQ ID NO）：７７に示されたヌクレオチド配列全体に対し、少なくとも５０％の相同性を持つヌクレオチド配列を含む核酸分子によりコードされた単離されたポリペプチド。 SEQ ID NO (SEQ ID NO): the entire nucleotide sequence to that shown in 77, the encoded isolated polypeptide by a nucleic acid molecule comprising a nucleotide sequence having at least 50% homology.

配列番号（SEQ ID NO) ：７８に示されたアミノ酸配列全体に対し、少なくとも５０％の相同性を持つアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチド。 SEQ ID NO (SEQ ID NO): with respect to the total amino acid sequence shown in 78, an isolated polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 50% homology.

配列番号（SEQ ID NO) ：７８に示された配列のいずれかのアミノ酸配列を含むポリペプチドフラグメントを含む単離されたポリペプチドであって、ポリペプチドフラグメントが前記アミノ酸配列（SEQ ID NO) ：７８を含むポリペプチドの生物学的活性を維持している単離されたポリペプチド。 SEQ ID NO (SEQ ID NO): An isolated polypeptide comprising a polypeptide fragment comprising the amino acid sequence of 78 to the indicated sequence, polypeptide fragment the amino acid sequence (SEQ ID NO) : An isolated polypeptide that retains the biological activity of the polypeptide comprising 78 .

配列番号（SEQ ID NO) ：７７に示されたいずれかのヌクレオチド配列を含む核酸分子によってコードされている単離されたポリペプチド。 SEQ ID NO (SEQ ID NO): isolated polypeptide encoded by a nucleic acid molecule comprising any of the nucleotide sequences shown in 77.

異種アミノ酸配列を更に含む請求項１６〜２１のいずれかに記載の単離されたポリペプチド。 The isolated polypeptide according to any one of claims 16 to 21 , further comprising a heterologous amino acid sequence.

請求項１０に記載の細胞を培養する工程を含み、ファインケミカルが製造されるファインケミカルの製造方法。 A method for producing a fine chemical, comprising the step of culturing the cell according to claim 10 , wherein the fine chemical is produced.

培養により得られた産物からファインケミカルを回収する工程を含む、請求項２３に記載の製造方法。 The manufacturing method of Claim 23 including the process of collect | recovering fine chemicals from the product obtained by culture | cultivation.

前記細胞が、コリネバクテリウム属またはブレビバクテリウム属に属する請求項２３に記載の宿主細胞。 24. The host cell according to claim 23 , wherein the cell belongs to the genus Corynebacterium or Brevibacterium.

前記細胞が、コリネバクテリウム−グルタミカム, コリネバクテリウム−ヘルキュリス、コリネバクテリウム−リリウム、コリネバクテリウム−アセトアシドフィリウム、コリネバクテリウム−アセトグルタミカム、コリネバクテリウム−アセトフィリウム、コリネバクテリウム−アンモニアゲン、コリネバクテリウム−フジオケンス、コリネバクテリウム−ニトリロフィリウス、ブレビバクテリウム−アンモニアゲン、ブレビバクテリウム−ブタニカム、ブレビバクテリウム−ジバリカツム、ブレビバクテリウム−フラビン、ブレビバクテリウム−ヘアリ、ブレビバクテリウム−ケトグルタミカム、ブレビバクテリウム−ケトソレダクタム、ブレビバクテリウム−ラクトフェルメンツム、ブレビバクテリウム−リネンス、ブレビバクテリウム−パラフィノリティカム、および表３に記載の株からなる群より選択される、請求項２３に記載の方法。 The cells are Corynebacterium-glutamicum, Corynebacterium-herculis, Corynebacterium-lilium, Corynebacterium-acetoacidophilium, Corynebacterium-acetoglutamicum, Corynebacterium-acetophyllium, Corynebacterium -Ammogen, Corynebacterium-Fujikens, Corynebacterium-nitrilophyllius, Brevibacterium-Ammogen, Brevibacterium-Butanicum, Brevibacterium-Divaricat, Brevibacterium-flavin, Brevibacterium-Hari, Brevibacterium Bacteria-ketoglutamicum, Brevibacterium-ketosoleductum, Brevibacterium-lactofermentum, Brevibacterium-linens, Brevibacterium Beam - para Fino utility cams, and are selected from the group consisting of strains described in Table 3, The method of claim 23.

前記ベクターによる核酸分子の発現の結果、前記ファインケミカルの製造が調節される請求項２３に記載の方法。 24. The method of claim 23 , wherein production of the fine chemical is regulated as a result of expression of the nucleic acid molecule by the vector.

前記ファインケミカルが、有機酸、タンパク質原アミノ酸および非タンパク質原アミノ酸、プリンおよびピリミジン塩基、ヌクレオシド、ヌクレオチド、脂質、飽和および不飽和の脂肪酸、ジオール、炭水化物、芳香族化合物、ビタミン、補助因子、ポリケチド、および酵素からなる群より選択される、請求項２３に記載の方法。 The fine chemical comprises organic acids, pro- and non-proteic amino acids, purines and pyrimidine bases, nucleosides, nucleotides, lipids, saturated and unsaturated fatty acids, diols, carbohydrates, aromatics, vitamins, cofactors, polyketides, and 24. The method of claim 23 , selected from the group consisting of enzymes.

ファインケミカルがアミノ酸である、請求項２３に記載の方法。 24. The method of claim 23 , wherein the fine chemical is an amino acid.

アミノ酸が、リジン、グルタマート、グルタミン、アラニン、アスパルタート、グリシン、セリン、トレオニン、メチオニン、システイン、バリン、ロイシン、イソロイシン、アルギニン、プロリン、ヒスチジン、チロシン、フェニルアラニン、およびトリプトファンから成る群より選択される、請求項２９に記載の方法。 The amino acid is selected from the group consisting of lysine, glutamate, glutamine, alanine, aspartate, glycine, serine, threonine, methionine, cysteine, valine, leucine, isoleucine, arginine, proline, histidine, tyrosine, phenylalanine, and tryptophan; 30. The method of claim 29 .

請求項１から６のいずれかに記載の核酸分子の導入によってゲノムＤＮＡが変異した細胞を培養する工程を含むファインケミカルの製造方法。 A method for producing fine chemicals, comprising a step of culturing cells in which genomic DNA has been mutated by introduction of the nucleic acid molecule according to any one of claims 1 to 6.

請求項１〜６に記載の核酸分子の少なくとも1つ又は請求項１６〜２１に記載のポリペプチド分子の少なくとも1つの存在を検知する工程を含み、これによりコリネバクテリウム−ジフテリアの存在または活性を診断する、コリネバクテリウム−ジフテリアの存在または活性を検知する方法。 The presence of diphtheria - claims 1-6 comprising at least one or the step of detecting the presence of at least one of the polypeptide molecule of claim 16 to 21 nucleic acid molecule according to, by the this Riko linen Agrobacterium or diagnosing activity, co linen Agrobacterium - method of detecting the presence or activity of diphtheria.

配列番号（SEQ ID NO)：７７に示された核酸分子を含み、核酸分子が混乱している宿主細胞。 SEQ ID NO (SEQ ID NO): 77 includes a nucleic acid molecule shown in a host cell a nucleic acid molecule is confused.

配列番号（SEQ ID NO)：７７に示された核酸分子を含み、前記核酸分子が配列番号（SEQ ID NO)：７７の配列に対して1個以上の核酸の修飾を含む宿主細胞。 SEQ ID NO (SEQ ID NO): 77 contains a nucleic acid molecule shown in, the nucleic acid molecule SEQ ID NO (SEQ ID NO): 77 host cells containing modifications of one or more nucleic acid to the sequence of .

配列番号（SEQ ID NO)：７７に示された核酸分子を含み、前記核酸分子の調節領域が、分子の野生型の調節領域に対して修飾されている宿主細胞。 SEQ ID NO (SEQ ID NO): 77 includes a nucleic acid molecule shown in a host cell a regulatory region of the nucleic acid molecule is modified relative to the regulatory region of the wild-type molecule.