PT2663556E - Processo de fabrico de inibidores de girase e topoisomerase iv - Google Patents

Description

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DESCRIÇÃO "PROCESSO DE FABRICO DE INIBIDORES DE GIRASE E TOPOISOMERASE IV"

ANTECEDENTES DO PEDIDO DE PATENTE A resistência das bactérias aos antibióticos tem sido há muito reconhecida, e hoje em dia é considerada um grave problema de saúde em todo o mundo. Como um resultado da resistência, algumas infeções bacterianas ou são difíceis de tratar com antibióticos ou mesmo intratáveis. Este problema tornou-se especialmente grave com o desenvolvimento recente de resistência a múltiplas drogas em certas estirpes de bactérias, tais como Streptococcus pneumoniae (SP), Mycobacterium tuberculosis e Enterococcus. 0 aparecimento de enterococcus resistente à vancomicina foi particularmente alarmante porque a vancomicina era antigamente o único antibiótico eficaz para tratar esta infeção, e que tinha sido considerada para muitas infeções como sendo a droga de "último recurso". Enquanto que muitas outras bactérias resistentes aos fármacos não causam doença com risco de vida, como os enterococos, existe o temor que os genes que induzem a resistência podem espalhar-se para os organismos mais mortais, tais como Staphylococcus aureus, onde a resistência à meticilina já é predominante (De Clerq, et al, Current Opinion in Anti-infective Investigational Drugs, 1999, 1, 1; Levy, "The Challenge of Antibiotic Resistance", Scientific American, março, 1998).

Outra preocupação é a rapidez com que a resistência aos antibióticos pode se espalhar. Por exemplo, até à década de 1960, SP era universalmente sensível à 2 penicilina, e, em 1987, apenas 0,02% das estirpes de SP nos E.U.A. eram resistentes. No entanto, em 1995, foi relatado que a resistência à penicilina de SP era de cerca de sete por cento e de até 30% em algumas partes dos E.U.A. (Lewis, FDA Consumer magazine (setembro, 1995); Gershman em The Medicai Repórter, 1997).

Os hospitais, em particular, servem como centros para a formação e transmissão de organismos resistentes aos medicamentos. As infeções que ocorrem em hospitais, conhecidas como infeções nosocomiais, estão a tornar-se um problema cada vez mais grave. Dos dois milhões de americanos infetados em hospitais a cada ano, mais de metade destas infeções resistem a pelo menos um antibiótico. O Centro de Controle de Doenças informou que, em 1992, mais de 13.000 pacientes hospitalares morreram de infeções bacterianas que eram resistentes ao tratamento com antibióticos (Lewis, "The Rise of Antibiotic Resistant Infections", FDA Consumer magazine, setembro, 1995).

Como resultado da necessidade de combater as bactérias resistentes a drogas e ao aumento da falha dos fármacos disponíveis, tem havido um ressurgimento do interesse na descoberta de novos antibióticos. Uma estratégia atrativa para o desenvolvimento de novos antibióticos é de inibir a ADN-girase e/ou topoisomerase IV, as enzimas bacterianas necessárias para a replicação do ADN, e, por conseguinte, necessárias para o crescimento e divisão da célula bacteriana. A atividade da girase e/ou topoisomerase IV também estão associadas a eventos na transcrição, reparação e recombinação de ADN.

A girase é uma das topoisomerases, um grupo de enzimas que catalisam a interconversão de isómeros topológicos de ADN (veja-se genericamente, Kornberg e Baker, ADN 3

Replication, 2d Ed., Capítulo 12, 1992, W. H. Freeman e Co.; Drlica, Molecular Microbiology, 1992, 6, 425; Drlica e Zhao, Microbiology and Molecular Biology Reviews, 1997, 61, pp. 377-392) . A girase em si mesma controla o superenrolamento do ADN e alivia o stress topológico gue ocorre quando as cadeias de ADN de um duplex parental são desenroladas durante o processo de replicação. A girase catalisa também a conversão de ADN duplex circular fechado, relaxado, para uma forma negativamente super-helicoidal que é mais favorável para a recombinação. 0 mecanismo da reação de superenrolamento envolve o envolvimento de girase em torno de uma região do ADN, quebra da cadeia dupla nessa região, passagem de uma segunda região do ADN através do intervalo, e reunião das cadeias quebradas. Tal mecanismo de clivagem é característico de uma topoisomerase de tipo II. A reação de superenrolamento é dirigida por meio da ligação de ATP à girase. 0 ATP é então hidrolisado durante a reação. Esta ligação de ATP e subsequente hidrólise provocam mudanças conformadoras na girase ligada ao ADN que são necessárias para a sua atividade. Também foi descoberto que o nível de superenrolamento do ADN (ou relaxamento) é dependente da proporção de ATP/ADP. Na ausência de ATP, a girase só é capaz de relaxar ADN superenrolado. A girase bacteriana de ADN é um tetrâmero de proteína de 400 kilodalton constituída por duas subunidades A (GyrA) e duas B (GyrB). A ligação e clivagem do ADN está associada com GyrA, enquanto que o ATP é ligado e hidrolisado pela proteína GyrB. A GyrB consiste num domínio amino-terminal que possui a atividade de ATPase, e um domínio carboxi-terminal que interage com a GyrA e o ADN. Em contraste, as topoisomerases do tipo II eucariotas são homodímeros que podem relaxar superespirais negativas e positivas, mas não podem introduzir superespirais negativas. Idealmente, um antibiótico com base na inibição de ADN girase e/ou 4 topoisomerase IV bacteriana seria seletivo para estas enzimas e seria relativamente inativo contra as topoisomerases do tipo II eucariotas. A topoisomerase IV resolve principalmente dimeros de cromossomas ligados na conclusão da replicação do ADN.

Os antibióticos de quinolona amplamente utilizados inibem a girase de ADN (GyrA) e/ou a topoisomerase IV (ParC) bacteriana. Exemplos das quinolonas incluem os compostos iniciais tais como ácido nalidixico e ácido oxolinico, bem como as fluoroquinolonas mais tardias, mais potentes, tais como norfloxacina, ciprofloxacina e trovafloxacina. Estes compostos ligam-se à GyrA e/ou à ParC estabilizam o complexo clivado, inibindo assim a função global da girase, conduzindo à morte celular. As fluoroquinolonas inibem as subunidades catalíticas de girase (GyrA) e/ou Topoisomerase IV (ParC) (ver Drlica e Zhao, Microbiology and Molecular Biology Reviews, 1997, 61, 377-392). No entanto, a resistência a fármacos também tem sido reconhecida como um problema para esta classe de compostos (Relatório da OMS, "Use of Quinolones in Food Animais and Potential Impact on Human Health", 1998). Com as quinolonas, tal como com outras classes de antibióticos, as bactérias expostas aos compostos iniciais muitas vezes desenvolvem rapidamente resistência cruzada a compostos mais potentes na mesma classe.

As subunidades associadas responsáveis por fornecer a energia necessária para o reajuste/reinício catalítico das enzimas através de hidrólise de ATP são GyrB (girase) e ParE (topoisomerase IV), respetivamente (ver, Champoux, J.J., Annu. Rev. Biochem., 2001, 70, pp. 369-413). Os compostos que alvejam estes mesmos sítios de ligação de ATP nas subunidades GyrB e ParE seriam úteis para o tratamento 5 de várias infeções bacterianas (ver, Charifson et ai., J. Med. Chem., 2008, 51, pp. 5243-5263).

Existem menos inibidores conhecidos que se ligam a GyrB. Exemplos incluem as cumarinas, novobiocina e cumermicina Al, ciclotialidina, cinodina, e clerocidina. As cumarinas têm demonstrado capacidade para se ligarem fortemente a GyrB. Por exemplo, a novobiocina cria uma rede de ligações de hidrogénio com a proteína e vários contactos hidrofóbicos. Enquanto a novobiocina e o ATP aparentam ligar-se no sítio de ligação do ATP, há uma sobreposição mínima na orientação limite dos dois compostos. As porções sobrepostas são a unidade de açúcar da novobiocina e a adenina do ATP (Maxwell, Trends in Microbiology, 1997, 5, 102) .

Para as bactérias resistentes à cumarina, o ponto de mutação mais prevalente é na superfície de um resíduo de arginina que se liga ao carbonilo do anel da cumarina (Argl36 em GyrB de E. coli) . Embora as enzimas com esta mutação demonstrem menor superenrolamento e atividade de ATPase, são também menos sensíveis à inibição por fármacos de cumarina (Maxwell, Mol. Microbiol., 1993, 9, 681).

Apesar de serem potentes inibidores de superenrolamento da girase, as cumarinas não têm sido amplamente utilizadas como antibióticos. Geralmente não são adequadas devido à sua baixa permeabilidade em bactérias, toxicidade eucariótica, e baixa solubilidade em água (Maxwell, Trends in Microbiology, 1997, 5, 102) . Seria desejável dispor de um novo, eficaz inibidor de GyrB e ParE que superasse estas desvantagens e, de preferência, não dependesse da ligação a Argl36 para a atividade. Tal inibidor seria um candidato antibiótico atraente, sem um 6 histórico de problemas de resistência que atingem outras classes de antibióticos.

Dado que a resistência bacteriana aos antibióticos se tornou um importante problema de saúde pública, existe uma necessidade continua de desenvolver antibióticos novos e mais potentes. Mais particularmente, há uma necessidade de antibióticos que representem uma nova classe de compostos não utilizados anteriormente para tratar a infeção bacteriana. Os compostos que têm como alvo os locais de ligação de ATP em ambas as subunidades GyrB (girase) e ParE (topoisomerase IV) seriam úteis para o tratamento de várias infeções bacterianas. Tais compostos seriam particularmente úteis no tratamento de infeções nosocomiais em hospitais onde a formação e transmissão de bactérias resistentes se estão a tornar cada vez mais predominantes.

SUMÁRIO DO PEDIDO DE PATENTE

Numa forma de realização, a presente invenção proporciona um método para a preparação de um composto de fórmula (I)

HN r

HN

(D 7 ou de um sal farmaceuticamente aceitável respetivo, em que R é H ou F, e cada um de R3, R4 e R5 é, independentemente, um alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido. 0 método compreende proporcionar um composto de fenilpirimidina de fórmula (II)

(H), em que R é H ou F, e cada um de R3, R4 e R5 é, independentemente, um alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido; e fazer reagir o composto de fenilpirimidina de fórmula (II) com um derivado de ureia de fórmula A ou B:

N H

A

B

Na

QifL que Re e um grupo alquilo opcionalmente substituído, um grupo arilo opcionalmente substituído, um grupo carbocíclico saturado ou insaturado opcionalmente substituído, ou um grupo heterocíclico saturado ou insaturado opcionalmente substituído, para proporcionar um 8 composto de fórmula (I); e, opcionalmente, fazer reagir o composto de fórmula (I) com um ácido adequado para proporcionar um sal farmaceuticamente aceitável do composto de fórmula (I) .

Em alguns aspetos da forma de realização, R6 pode ser metilo, etilo, benzilo, ou p-nitrobenzilo. Num aspeto adicional, a reação pode ser realizada numa mistura de dioxano e um tampão de 75°C a 125°C. Num aspeto adicional, o tampão pode ser um tampão de pH 3,5 e a reação pode ser realizada em refluxo.

Numa segunda forma de realização, a presente invenção proporciona um método para a preparação de um composto de fenilpirimidina de fórmula (II),

0 método compreende proporcionar um derivado de feniltetrahidrofurano de fórmula (IV) ,

em que R é H ou F; e 9 fazer reagir o composto de feniltetrahidrofurano de fórmula (IV) com um derivado de ácido borónico de fórmula (III) 9

em que cada um de R3, R4 e R5 é, independentemente, um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido, e B* é B.

sendo cada um de Ri e R2 independentemente alquilo ou H, ou ORi e 0R2 em conjunto com o átomo de B ao qual estão ligados formando um anel de 5-, 6- ou 7- membros opcionalmente substituído, ou BF3X, sendo X qualquer catião monovalente, na presença de um catalisador de paládio num solvente polar para proporcionar um composto de fenilpirimidina de fórmula (V),

(V), em que R é H ou independentemente, F, e cada um de R3, R4 e R5 é, grupo alquilo opcionalmente um 10 substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido; e tratar o composto de fenilpirimidina de fórmula (V) com um agente redutor adequado para se obter o composto de fenilpirimidina de fórmula (II).

Em alguns aspetos desta forma de realização, B* pode ser

ou

em que cada um dos átomos de carbono do anel pode ser não substituído ou substituído por um ou dois grupos metilo ou etilo. Num aspeto adicional, B* pode ser

Numa terceira forma de realização, a presente invenção proporciona um método para a preparação de um composto de feniltetrahidrofurano de fórmula (IV),

Br

(IV). 0 método compreende proporcionar um composto de fórmula (VI) , (VI), 11

em que R é H ou F; e nitração do composto de fórmula (VI) com um agente de nitração adequado, para se obter o composto de feniltetrahidrofurano de fórmula (IV).

Numa quarta forma de realização, a presente invenção proporciona um método alternativo para a preparação de um composto de feniltetrahidrofurano de fórmula (IV). 0 método compreende proporcionar um composto de fórmula (VI),

(VI), em que R é H ou F; proteger o grupo amino do composto de fórmula (VI) com um grupo protetor amino para se obter um composto amino-protegido; nitrar o composto amino-protegido com um agente de nitração adequado, para se obter um composto nitro amino-protegido; e desproteger o composto nitro amino-protegido para se obter o composto feniltetrahidrofurano de fórmula (IV).

Em alguns aspetos desta forma de realização, a referida provisão de um composto de fenilpirimidina de fórmula (II) pode ainda compreender a redução de um derivado de fenilpirimidina de fórmula (V) , 12

em que R é H ou F, e cada um de R3, R4 e R5 é, independentemente, um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente proteqido, com um agente redutor adequado para proporcionar o composto de fórmula (II). Num aspeto adicional, a nitração do composto de fórmula (VI) pode compreender a reação do composto de fórmula (VI) com NH4N03 na presença de um ácido forte a cerca de 20°C a cerca de 50°C para proporcionar um composto (IV).

Numa quinta forma de realização, a presente invenção proporciona um método para a preparação de um composto de fórmula (VI),

(VI). 0 método compreende proporcionar um composto de fórmula (VII),

HjN O---/ (VII), 13 em que R é H ou F; e fazer reagir o composto de fórmula (VII) com um agente de bromação num solvente aprótico polar, para se obter o composto de fórmula (VI).

Em alguns aspetos desta forma de realização, o composto de fórmula (VII) pode ser enriquecido enantiomericamente.

Numa sexta forma de realização, a presente invenção proporciona um método para a preparação de um composto de fórmula (VII),

0 método compreende proporcionar um composto de nitrobenzeno dihidrofuranilo selecionado a partir do grupo constituído por um composto de fórmula (VlIIa),

R

em que R é H ou F, e um composto de fórmula (VlIIb),

(VITIb), 14 em que R é H ou F; e tratar o composto nitrobenzeno dihidrofuranilo com um agente redutor para se obter o composto de fórmula (VII).

Numa sétima forma de realização, a presente invenção proporciona um método para a preparação de um composto nitrobenzeno dihidrofuranilo de fórmula (VlIIa),

(VlIIb), em que R é H ou F, ou

em que Ré H ou F, compreendendo os passos de: proporcionar um composto de fórmula (IX),

Br N°2 (IX), em que R é H ou F; e tratar o composto de fórmula (IX) com 2,3-dihidrofurano, na presença de um catalisador de paládio para se obter o composto nitrobenzeno dihidrofuranilo. 15 Numa oitava forma de proporciona um composto de realização, fórmula a presente invenção

em que R é H ou F, ou um sal farmaceuticamente aceitável respetivo; preparado de acordo com os métodos do presente pedido de patente. Em algumas formas de realização, o composto de fórmula (I) tem a fórmula

HN )=° > (Ib) em que R é H ou F, ou um sal farmaceuticamente aceitável respetivo. Em outras formas de realização, o composto de fórmula (I) pode ser (R)-l-etil-3-(5-(2-(2-hidroxipropan-2-il)pirimidin-5-il)-7-(tetrahidrofuran-2-il)-1H-benzo[d]imidazol-2-il)ureia, ou um sal farmaceuticamente aceitável respetivo, (R)-l-etil-3-(6-fluoro-5-(2-(2- hidroxipropan-2-il)pirimidin-5-il)-7-(tetrahidrofuran-2-il)-ΙΗ-benzo[d]imidazol-2-il)ureia, ou um sal 16 farmaceuticamente aceitável respetivo, um sal do ácido metanossulfónico de (R) -l-etil-3-(5-(2-(2-hidroxipropan-2-il)pirimidin-5-il)-7-(tetrahidrofuran-2-il)-1H-benzo[d]imidazol-2-il)ureia, ou um sal do ácido metanossulfónico de (R)-l-etil-3-(6-fluoro-5-(2-(2- hidroxipropan-2-il)pirimidin-5-il)-7-(tetrahidrofuran-2-il)-lH-benzo[d]imidazol-2-il)ureia.

Numa nona forma de realização, o presente pedido de patente proporciona adicionalmente um composto de fórmula (II) r3

TO (Π) em que R é H ou F, e cada um de R3, R4 e R5 é, independentemente, um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido. 0 composto de fórmula (II) pode ser preparado por um método que compreende proporcionar um derivado de feniltetrahidrofurano de fórmula (IV)

e fazer reagir o derivado de feniltetrahidrofurano de fórmula (IV) com um derivado de ácido borónico de fórmula (III) 17

(ΤΠ)

V na presença de um catalisador de paládio num solvente polar; em que cada um de R3, FU e R5 é, independentemente, um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido, e B* é B.

sendo cada um de Ri e R2 independentemente alquilo ou H, ou ORi e 0R2 em conjunto com o átomo de B ao qual estão ligados, formando um anel de 5-, 6- ou 7- membros opcionalmente substituído, ou BF3X, sendo X qualquer catião monovalente.

Em alguns aspetos da forma de realização, o método compreende adicionalmente a redução de um derivado de fenilpirimidina de fórmula (V)

(V), em que R é H ou independentemente, F; um e cada um de R: grupo alquilo R4 e R5 é, opcionalmente 3/ 18 substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido, para proporcionar o composto de fórmula (II). a presente invenção

Numa décima forma de realização, proporciona um composto de fórmula (V)

em que R é H ou F; e cada um de R3, R4 e é, independentemente, um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido. 0 composto de fórmula (V) pode ser preparado por um método compreendendo a provisão de um derivado de feniltetrahidrofurano de fórmula (IV)

em que R é H ou F, e fazer reagir o derivado de feniltetrahidrofurano de fórmula (IV) com um derivado de ácido borónico de fórmula (III)

Ra. r3

N^N

B· (ΙΠ) 19 na presença de um catalisador de paládio num solvente polar, em que cada um de R3, R4 e R5 é, independentemente, um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido, e B* é B. R,0' or2i sendo cada um de Ri e R2 independentemente alquilo ou H, ou ORi e 0R2 em conjunto com o átomo de B ao qual estão ligados, formando um anel de 5-, 6- ou 7- membros opcionalmente substituído, ou BF3X, sendo X qualquer catião monovalente, para proporcionar o composto de fórmula (V).

Numa décima primeira forma de realização, a presente invenção proporciona um método para a preparação de um composto de fórmula (I),

>

(O ou de um sal farmaceuticamente aceitável respetivo, em que R é H ou F; e cada um de R3, R4 e R5 é, independentemente, um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido. 0 método compreende 20 proporcionar um composto nitrobenzeno dihidrofuranilo de fórmula

(VHIa),

OU

(VTIIb) em que R é H ou F, e converter o composto de fórmula (VlIIa) ou (VlIIb), ou uma combinação dos mesmos, no composto de fórmula (I) ou num sal farmaceuticamente aceitável respetivo.

Numa décima segunda forma de realização, a presente invenção proporciona um método para a preparação de um composto nitrobenzeno dihidrofuranilo de fórmula (VlIIa) ou (VlIIb). O método compreende a reação de um composto de fórmula (IX),

em que R é H ou F, com 2,3-dihidrofurano, na presença de um catalisador de paládio para se obter o composto nitrobenzeno dihidrofuranilo (VlIIa) ou (VlIIb). 21

Num aspeto desta forma de realização, o método compreende adicionalmente fazer reagir o composto de fórmula (Vllla) ou (VlIIb) com um agente redutor para se obter um composto de fórmula (VII), 21

em que R é H ou F. Num outro aspeto, o método compreende adicionalmente fazer reagir o composto de fórmula (VII) com um agente de bromação num solvente aprótico polar, para se obter o composto de fórmula (VI) . Num aspeto adicional, o método compreende adicionalmente a nitração do composto de fórmula (VI) com um agente de nitração adequado, para se obter o composto feniltetrahidrofurano de fórmula (IV) . Ainda num aspeto adicional, o método compreende adicionalmente fazer reagir o composto feniltetrahidrofurano de fórmula (IV) com um derivado de ácido borónico de fórmula (III)

(III), em que cada um de R3, R4 e R5 é, independentemente, um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido, e B* é ,B.

22 sendo cada um de Ri e R2 independentemente alquilo ou H, ou ORi e 0R2 em conjunto com o átomo de B ao qual estão ligados, formando um anel de 5-, 6- ou 7- membros opcionalmente substituído, ou BF3X, sendo X qualquer catião monovalente, na presença de um catalisador de paládio num solvente polar para proporcionar um composto de fenilpirimidina de fórmula (V) ,

(V), em que R é H ou F, e cada um de R3, R4 e R5 é, independentemente, um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo eventualmente protegido; e tratar o composto fenilpirimidina de fórmula (V) com um agente redutor adequado para se obter o composto de fenilpirimidina de fórmula (II). 0 método pode compreender adicionalmente a reação do composto de fenilpirimidina de fórmula (II) com um derivado de ureia de fórmula geral A ou B:

A H H H

H Na

B 23 em que R6 é um grupo alquilo opcionalmente substituído, grupo arilo opcionalmente substituído, grupo carbocíclico opcionalmente substituído, saturado ou insaturado, ou, grupo heterocíclico saturado ou insaturado opcionalmente substituído; para proporcionar um composto de fórmula (I); e, opcionalmente, fazer reagir o composto de fórmula (I) com um ácido adequado para proporcionar um sal farmaceuticamente aceitável do composto de fórmula (I) .

DESCRIÇÃO BREVE DOS DESENHOS A FIG. 1 é um gráfico elipsoide térmico de duas moléculas independentes de simetria do composto 12. A FIG. 2 é um gráfico elipsoide térmico de duas moléculas independentes de simetria do composto 23.

DESCRIÇÃO DETALHADA 0 presente pedido de patente é dirigido a um método de preparação de compostos, e sais farmaceuticamente aceitáveis respetivos, úteis como inibidores da girase e agentes antibacterianos. Os inibidores de girase do presente pedido de patente são genericamente abrangidos pela U.S. Pat. N°. RE40245 E e podem ser representados pela fórmula (I) ou sais respetivos: (I)

em que R é H ou F; e cada um de R3, R4 e R5 é, independentemente, um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido.

Numa forma de realização particular, os compostos do presente pedido de patente podem ser representados pela fórmula (Ia) ou os sais respetivos:

HN >=° (Ia) em que R é H ou F.

Em certas formas de realização, o composto de fórmula (I) é: 25

Em formas de realização adicionais, o composto de fórmula (I) é

Em fórmula formas de realização (I) é adicionais o composto de 26

OU

Um processo para a preparação do composto de fórmula (I) é apresentado no Esquema 1. 27

Esquema 1

No passo A, um bromonitrobenzeno (IX), em que R é H ou F, é tratado com 2,3-dihidrofurano, na presença de um catalisador de paládio adequado e de uma base adequada. A arilação de Heck do 2,3-dihidrofurano origina uma mistura de nitrobenzeno dihidrofuranilo (VlIIa) e (VlIIb), em que R é H ou F. 28 0 catalisador de paládio utilizado na reação de arilação de Heck pode ser qualquer catalisador de paládio adequado conhecido dos peritos na técnica. Exemplos de catalisadores de paládio adequados para a reação de arilação de Heck entre o bromonitrobenzeno (IX) e o 2,3-dihidrofurano incluem complexos de Pd(II), Pd(I), e Pd(0). Numa forma de realização, o complexo Pd (II) adequado para o presente pedido de patente tem a fórmula genérica PdX2 (fosfina) 2 em que X é um grupo monovalente carregado negativamente tal como um grupo haleto e a fosfina como utilizado aqui refere-se à classe de compostos nos quais um, dois, ou três átomos de hidrogénio do composto do PH3 são substituídos por um número correspondente de grupos tais como fenilo (Ph), ciclohexilo (Cy), terc-butil (tBu), ou isopropilo (iPr). Os exemplos de ligandos de fosfina adequados para os catalisadores de Pd do presente pedido de patente incluem di-terc-butilmetilfosfina, di-terc-butilneopentilfosfina, diciclohexil-(2-metilfenil)fosfina, diciclohexil-(2,4,6-trimetilfenil)fosfina, triciclopentilfosfina, terc-butildifenilfosfina, ciclohexildifenilfosfina, tris(4-clorofenil)fosfina, benzildifenilfosfina, tri(m-tolil)fosfina, tris(4-metoxifenil)fosfina, 1,3-bis(difenilfosfino)propano (dppp), 1,2-bis(difenilfosfino)etano (dppe), 1,4-bis (difenilfosfino)butano (dppb), meso-2,4-bis (difenilfosfino)pentano (mbdpp), e 1,3-bis(diisopropilfosfino)propano (dippp). Numa outra forma de realização, os catalisadores de Pd adequados para a reação de arilação de Heck incluem PdCl2 (PPh3) 2, PdCl2 (PCy3) 2, PdCl2 (PiPr3) 2, PdCl2 (PhCN) 2, Pd (N,N-dimetil β-alaninato) 2, PdCl2{PR2 (Ph-R')}2 em que R é um grupo terc-butilo e R' é um grupo 4-dimetilamino, bis(dibenzilidenoacetona)paládio(II), acetato de paládio (II), PdCl2 (bis-hidrazona), dicloreto de [1,3-bis(2,6-diisopropilfenil)imidazol-2-ilideno](3- 29 cloropiridilo)paládio(II) , dicloreto de di (2- piridil)metanol paládio, 1,1'-bis(di-terc- butilfosfino)ferroceno]dicloropaládio(II), 1,1'- bis(difenilfosfino)ferroceno]dicloropaládio(II) (Pd (dppf) Cl2) , (NHC) Pd (alil) Cl em que NHC é um carbeno N-heterocíclico, tais como N,N’-bis (2,6- diisopropilfenil) imidazol) -2-ilideno, Ν,Ν'-bis (2, 6- diisopropilfenil)4,5-dihidroimidazol)-2-ilideno, N,N'~ bis(2,4,6-trimetilfenil)-imidazol)-2-ilideno, e N,N'~bis terc-butil-imidazol)-2-ilideno. Em algumas formas de realização, um ou mais ligandos de Pd pode ser ligado a um substrato tal como uma partícula. Exemplos de tais catalisadores incluem (Ar' Ph2P) 2PdCl2 em que o grupo Ar' é parte de um polímero de tal modo que o catalisador é um catalisador de paládio polimérico. Numa outra forma de realização, os complexos de Pd(0) úteis no presente pedido de patente incluem Pd(fosfina)4 (por exemplo, Pd(PPh3)4, Pd (PCy3) 4, Pd(PiPr3)4, Pd(tBu3P)2, e tris(dibenzilidenoacetona)dipaládio(0). Ainda noutra forma de realização, os catalisadores de Pd(I) úteis no presente pedido de patente incluem Pd2X2 (fosfina) 2, em que X é um anião monovalente, tal como um haleto. Exemplos de tais catalisadores de Pd(I) incluem Pd2Br2 (tBu3P) 2.

Em certas formas de realização, o catalisador de paládio utilizado na reação de arilação de Heck pode ser qualquer catalisador de paládio quiral adequado conhecido dos peritos na técnica. Exemplos de catalisadores de paládio quirais adequados para a reação de arilação de Heck entre o bromonitrobenzeno (IX) e o 2,3-dihidrofurano incluem complexos de Pd (II) e Pd(0) de 2,2'-bis(difenilfosfino)binafilo (BINAP), outros ligandos de tipo BINAP, JosiPhos, outros ligandos de tipo JosiPhos, PhanePhos, SynPhos, DifluoroPhos, SegPhos, P-Phos, 30

TunePhos, 2,4-bis(difenilfosfino)pentano, e PHOx. As reações de arilação de Heck realizadas utilizando catalisadores de paládio quirais podem proporcionar nitrobenzeno dihidrofuranilo (s) enantiomericamente enriquecido(s) (VlIIa) e/ou (VlIIb), em que R é H ou F. Em algumas formas de realização, o excesso enantiomérico de nitrobenzeno (s) dihidrofuranilo (VlIIa) e/ou (VlIIb) pode estar compreendido entre cerca de 5-100%, cerca de 10-100%, cerca de 20-100%, cerca de 30-100%, cerca de 40-100%, cerca de 50-100%, cerca de 60-100%, cerca de 70-100%, cerca de 80-100%, cerca de 85-100%, cerca de 90-100%, cerca de 91-100%, cerca de 92-100%, cerca de 93-100%, cerca de 94-100%, cerca de 95-100%, cerca de 96-100%, cerca de 97-100%, cerca de 98-100%, cerca de 99-100%, ou cerca de 100%. Assim, qualquer composto quiral derivado a partir do(s) composto (s) enantiomericamente enriquecido(s) de fórmula (VlIIa) e/ou (VlIIb) pode também conter um excesso de um dos dois enantiómeros do composto. A base utilizada na reação de arilação de Heck pode ser qualquer base adequada, conhecida dos peritos na técnica. Exemplos de bases adequadas para a reação de arilação de Heck entre o bromonitrobenzeno (IX) e 2,3-dihidrofurano incluem carbonato de potássio, carbonato de sódio, carbonato de césio, bicarbonato de sódio, fosfato de potássio, terc-butóxido de sódio, terc-butóxido de potássio, trietilamina, diisopropiletilamina, 1,8-bis(dimetilamino)naftaleno, diciclohexilamina, diciclohexilmetilamina, 2,6-lutidina, acetato de sódio, e acetato de potássio. O solvente utilizado para a reação de arilação de Heck pode ser qualquer solvente adequado conhecido dos peritos na técnica. Exemplos de solventes adequados para a reação de arilação de Heck entre o bromonitrobenzeno (IX) e 2,3- 31 dihidrofurano incluem 1,4-dioxano, tetra-hidrofurano, 1,2-dimetoxietano, tolueno, N,N-dimetilformamida, dimetilsulfóxido, acetonitrilo, e N,N-dimetilacetamida. A reação de arilação de Heck pode ser realizada a qualquer temperatura adequada entre 0°C e 200°C. Em algumas formas de realização, a reação pode ser realizada entre 50 e 150°C. Em outras formas de realização, a reação pode ser realizada entre 75 e 125°C. Em formas de realização adicionais, a reação pode ser realizada entre 90 e 110°C.

No passo B, um dos nitrobenzenos dihidrofuranilo (VlIIa) e (VlIIb), ou uma mistura de nitrobenzenos dihidrofuranilo (VlIIa) e (VlIIb) , em que R é H ou F, é tratado com gás hidrogénio na presença de um catalisador de um metal de transição e uma base. A hidrogenação catalítica do substituinte nitro aromático e a ligação dupla do substituinte dihidrofuranilo originam tetrahidrofuranilanilina (VII), em que R é H ou F. O catalisador de metal de transição utilizado na reação de hidrogenação catalítica pode ser qualquer catalisador adequado conhecido dos peritos na técnica. Exemplos de catalisadores de metais de transição adequados para a hidrogenação catalítica de nitrobenzenos dihidrofuranilo (VlIIa) e (VlIIb) incluem paládio sobre carbono, platina sobre carbono, óxido de platina, etc. A base utilizada na reação de hidrogenação catalítica pode ser qualquer base adequada, conhecido dos peritos na técnica. Exemplos de bases adequadas para a hidrogenação catalítica de nitrobenzenos dihidrofuranilo (VlIIa) e (VlIIb) incluem carbonato de potássio, carbonato de sódio, carbonato de césio, bicarbonato de sódio, fosfato de potássio, trietilamina, diisopropiletilamina, e outras 32 bases de amina, tais como piridina, 2,6-lutidina, diciclohexilmetilamina, pirrolidina, e metilpirrolidina. A hidrogenação catalítica pode ser realizada em qualquer solvente adequado conhecido dos peritos na técnica. Exemplos de solventes adequados para a hidrogenação catalítica de nitrobenzenos dihidrofuranilo (VlIIa) e (VlIIb) incluem metanol, etanol, isopropanol, tetrahidrofurano, 1,4-dioxano, 1,2-dimetoxietano, acetato de etilo, hexano, e tolueno, e quaisquer misturas respetivas. A reação de hidrogenação catalítica pode ser realizada a qualquer temperatura adequada entre -50 e 100°C. Em algumas formas de realização, a reação pode ser realizada entre 0 e 50°C. Em outras formas de realização, a reação pode ser realizada entre 10 e 40°C. Em outras formas de realização, a reação pode ser realizada entre 20 e 30°C. A reação de hidrogenação catalítica pode ser realizada a qualquer pressão adequada de gás de hidrogénio entre 15 psi e 100 psi. Em algumas formas de realização, a reação pode ser realizada entre 20 e 55 psi. Em outras formas de realização, a reação pode ser realizada entre 25 e 50 psi. Em formas de realização adicionais, a reação pode ser realizada entre 30 e 45 psi.

No passo C, tetrahidrofuranilanilina (VII), em que R é H ou F, é tratada com um agente de bromação adequado num solvente aprótico polar adequado. A bromação da posição para da tetrahidrofuranilanilina (VII) proporciona bromoanilina (VI), em que R é H ou F. O agente de bromação utilizado na reação de bromação pode ser qualquer agente de bromação adequado conhecido dos 33 peritos na técnica. Exemplos de agentes de bromação adequados para a bromação de tetrahidrofuranilanilina (VII) incluem N-bromossuccinimida, bromo, e bromamina-T. 0 solvente utilizado na reação de bromação pode ser qualquer solvente aprótico polar adequado conhecido dos peritos na técnica. Exemplos de solventes adequados para a bromação de tetrahidrofuranilanilina (VII) incluem acetonitrilo, N,N-dimetilformamida, dimetilsulfóxido, hexametilfosforictriamida (HMPA), e misturas dos solventes precedentes com solventes etéreos, tais como tetrahidrofurano, éter dietilico, 1,4-dioxano, 1,2-dimetoxietano, e éter metil terc-butílico. A reação de bromação pode ser realizada a qualquer temperatura adequada entre -78 e 75°C. Numa forma de realização, a reação é realizada entre -50 e 50°C. Numa outra forma de realização, a reação é realizada entre -35 e 35°C. Ainda noutra forma de realização, a reação é realizada entre -20 e 10°C.

No passo D, o composto de fórmula (VI) é nitrado para produzir o composto de fórmula (IV) . O grupo amino do composto de fórmula (VI), em que R é H ou F, pode ser protegido utilizando qualquer dos grupos protetores variadamente disponíveis. Exemplos de grupos protetores de amina convencionais incluem alcoxicarbonilo (por exemplo, terc-butoxicarbonilo conhecido como BOC), 1,1-dioxobenzo[6]tiofeno-metoxicarbonilo (Bsmoc), alcoxicarbonilo substituído (tais como grupos alcoxicarbonilo halogenados, tais como 2,2,2-tricloroetoxicarbonilo), sulfonilo terc-butílico (BUS), e grupos cicloalcoxicarbonilo, bicicloalcoxicarbonilo, alceniloxicarbonilo, e arilalcoxicarbonilo. Exemplos destes grupos protetores são etoxicarbonilo, 34 ciclopentiloxicarbonilo, ciclohexiloxicarbonilo, 2,2,2-tricloroetoxicarbonilo, aliloxicarbonilo, 1-adamantiloxicarbonilo, t-butiloxicarbonilo, t-amiloxicarbonilo, benziloxicarbonilo (Cbz), p-nitrobenziloxicarbonilo, p-metoxibenziloxicarbonilo, difenilmetoxicarbonilo. Outros grupos protetores de azoto incluem grupos acilo, tais como formilo, acetilo, propionilo, pivaloílo, t-butilacetilo, 2-cloroacetilo, 2-bromoacetilo, trifluoroacetilo, tricloroacetilo, ftalilo, o-nitrofenoxiacetilo, a-clorobutirulo, benzoilo, 4-clorobenzoílo, 4-bromobenzoilo, e 4-nitrobenzoílo. Esquemas adicionais de proteção de amina encontram-se descritos em Green, T.W. e Wuts, P.G.M., Protective Groups in Organic Synthesis, John Wiley & Sons, Inc., pp. 494-653 (1999). 0 composto N-protegido de fórmula (VI) é nitrado utilizando vários agentes de nitração conhecidos dos peritos na técnica. Qualquer reagente que, sob condições apropriadas, possa introduzir um grupo nitro no anel fenilo do composto de fórmula (VI) pode ser utilizado. Exemplos de métodos de nitração podem ser encontrados em March, Advanced Organic Chemistry, John Wiles & Sons, 2001, pp. 696-699, os conteúdos dos quais são aqui incorporados por referência.

Numa forma de realização, o agente de nitração pode ser uma mistura de anidrido trifluoroacético e um sal de nitrato. Nesta forma de realização, uma quantidade em excesso de anidrido trifluoroacético pode ser utilizada para proteger o grupo amino do composto de fórmula (VI). O passo de proteção é seguido da adição de um sal de nitrato para gerar uma mistura de nitração in situ. Por exemplo, nitrato de amónio pode ser adicionado para gerar o agente de nitração ativo. Em algumas formas de realização, o nitrato de amónio pode ser adicionado em pequenas porções a 35 uma temperatura de cerca de 30°C, tomando cuidado para que a temperatura se mantenha entre 30 e 40°C. Alternativamente, um composto N-protegido de fórmula (VI) pode ser reagido com uma mistura de um ácido forte e de um sal de nitrato. Por exemplo, uma mistura de ácido trifluoroacético e NH4N03 pode ser utilizada para nitrar o composto de fórmula (VI) N-protegido.

Outros agentes de nitração incluem outros nitratos inorgânicos, os nitratos orgânicos, nitrato de prata/ óxido de trifenilfosfina/bromo, nosilatos lantanideos, sais de N-nitro-piridínio e quinolinio, e ácido nítrico. É também possível nitrar o composto de fórmula (VI) sem primeiro proteger a anilina. Numa forma de realização particular, o composto de fórmula (VI) pode ser feito reagir com um agente de nitração, a uma temperatura de entre 0°C e 50°C, entre 5°C e 50°C, entre 10°C e 50°C, entre 15°C e 50°C, entre 20°C e 50°C, entre 22°C e 50°C, entre 24°C e 45°C, entre 25°C e 45°C, entre 27°C e 45°C, entre 28°C e 45°C, entre 28°C e 44°C, entre 28°C e 43°C, entre 28°C e 42°C, entre 30°C e 45°C, entre 30°C e 44°C, entre 30°C e 43°C, ou entre 30°C e 42°C. O composto N-protegido nitrado de fórmula (VI) pode ser desprotegido utilizando qualquer método conhecido dos peritos na arte. Por exemplo, um composto protegido de N-trifluorometilcarbonilo de fórmula (VI) pode ser desprotegido por refluxo do composto N-protegido numa solução de um ácido forte, tal como H2S04 ou HC1. Além disso, onde R = H, a desproteção pode ser realizada por refluxo do composto N-protegido na presença de uma base, tal como hidróxido de sódio, carbonato de potássio, ou acetato de sódio. Após a conclusão do passo D, o composto de fórmula (VI) do presente pedido de patente proporciona um composto de fórmula (IV): (IV). 36 Br

No Passo E, o composto de fórmula (IV) é submetido a uma reação de acoplamento de tipo Suzuki com um derivado do ácido borónico de fórmula (III) :

(III) na presença de um catalisador de paládio, em que cada um de r3, R4 e R5 é, independentemente, um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido, e B* é B,

sendo cada um de Ri e R2 independentemente alquilo ou H, ou ORi e 0R2 em conjunto com o átomo de B ao qual estão ligados, formando um anel de 5-, 6-, ou 7- membros opcionalmente substituído; ou BF3X, em que X é qualquer catião monovalente. 0 produto da reação de acoplamento de tipo Suzuki é submetido a hidrogenação catalítica para se obter o composto de fórmula (II), em que R é H ou F, e cada um de R3, R4 e R5 é, independentemente, um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido: 37 R3

(Π).

Tal borónico boronato ésteres o grupo: como aqui utilizado, o refere-se aos ácidos e, aos trifluoroboratos. boronato incluem qualquer termo derivado de ácido borónicos, aos ésteres Os ácidos borónicos e os composto de boro contendo

H O-F?! O-R,

Ri e R2 sendo independentemente alquilo ou H, ou ORi e 0R2 em conjunto com o átomo de B ao qual estão ligados, formando um anel de 5-, 6-, ou 7- membros opcionalmente substituído.

Exemplos de ésteres boronato cíclicos incluem os seguintes anéis formados por ORi, 0R2 e o átomo B do composto de fórmula (III) :

o

o 38 38

ο Β. 5\-tv 0 Composto 7 é um éster boronato específico. Estes exemplos dos derivados de ácido borónico são apenas exemplos de possíveis variações do padrão de substituição de Ri e R2. 0 perito na técnica pode entrever muitas modificações adicionais possíveis e todas essas modificações estão contempladas no presente pedido de patente, desde que as modificações não interfiram com a reação de acoplamento catalisada por paládio entre os compostos das fórmulas (iii) e (iv).

Os trifluoroboratos incluem qualquer composto de boro contendo o grupo -BF3X, em que X é qualquer catião monovalente. Em algumas formas de realização, X pode ser K+, Na+, Li+, Rb+, ou Cs+.

Cada um de R3, R4, e R5 dos compostos de fórmulas (11) e (ΙΙΙ) pode ser, independentemente, um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo em que o grupo hidroxilo pode ser protegido com qualquer um dos grupos protetores conhecidos pelos especialistas na técnica. Numa forma de realização, cada um de R3, R4 e R5 é um grupo alquilo Ci-C6 ou um grupo hidroxilo. Numa forma de realização particular, cada um de R3, R4, e R5 podem ser 39 independentemente metilo, etilo, propilo, isopropilo ou hidroxilo.

Numa forma de realização, o composto de fórmula (III) tem a seguinte estrutura:

Este pedido de patente contempla também a utilização de um pseudo-haleto (por exemplo, triflato) em vez do grupo bromo no composto de fórmula (IV): OTf

(IVa)

Qualquer outro grupo de saida que não interfira com a reação de acoplamento pode também ser utilizado. Outros grupos de saida incluem cloreto, iodeto, tosilato, e mesilato. 0 catalisador de paládio utilizado na reação de acoplamento de tipo Suzuki entre os compostos de fórmulas (III) e (IV) pode ser qualquer catalisador de paládio adequado conhecido dos peritos na técnica. Exemplos de catalisadores de paládio adequados para a reação de 40 acoplamento de tipo Suzuki entre os compostos de fórmulas (III) e (IV) incluem complexos de Pd(II), Pd(I), e Pd(0). Numa forma de realização, o complexo Pd (II) adequado para o presente pedido de patente tem a fórmula genérica PdX2 (fosf ina) 2 em que X é um grupo monovalente carregado negativamente tal como um grupo haleto e a fosfina como utilizado aqui refere-se à classe de compostos nos quais um, dois, ou três átomos de hidrogénio do composto do PH3 são substituídos por um número correspondente de grupos tais como fenilo (Ph), ciclohexilo (Cy), terc-butil (tBu), ou isopropilo (iPr). Os exemplos de ligandos de fosfina adequados para os catalisadores de Pd do presente pedido de patente incluem di-terc-butilmetilfosfina, di-terc-butilneopentilfosfina, diciclohexil-(2-metilfenil)fosfina, diciclohexil-(2,4,6-trimetilfenil)fosfina, triciclopentilfosfina, terc-butildifenilfosfina, ciclohexildifenilfosfina, tris(4-clorofenil)fosfina, benzildifenilfosfina, tri(m-tolil)fosfina, tris(4- metoxifenil)fosfina, 1,3-bis(difenilfosfino)propano (dppp), 1,2-bis(difenilfosfino)etano (dppe), 1,4-bis (difenilfosfino)butano (dppb), meso-2,4-bis (difenilfosfino)pentano (mbdpp), e 1,3- bis(diisopropilfosfino)propano (dippp). Numa outra forma de realização, os catalisadores de Pd adequados para a reação de arilação de Heck incluem PdCl2 (PPh3) 2, PdCl2 (PCy3) 2, PdCl2 (PiPr3) 2, PdCl2 (PhCN) 2, Pd (N,N-dimetil β-alaninato) 2, PdCl2{PR2 (Ph-R')}2 em que R é um grupo terc-butilo e R' é um grupo 4-dimetilamino, bis(dibenzilidenoacetona)paládio(II), acetato de paládio(II), PdCl2 (bis-hidrazona), dicloreto de [1,3-bis(2,6-diisopropilfenil)imidazol-2-ilideno](3-cloropiridilo)paládio(II) , dicloreto de di (2- piridil)metanol paládio, 1,1'-bis(di-terc- butilfosfino)ferroceno]dicloropaládio(II), 1,1'- bis(difenilfosfino)ferroceno]dicloropaládio(II) 41 (Pd (dppf) Cl2) , (NHC) Pd (alil) Cl em que NHC é um carbeno N-heterocíclico, tais como N,N’~bis(2,6- diisopropilfenil)imidazol)-2-ilideno, N,N'~bis(2, 6- diisopropilfenil)4,5-dihidroimidazol)-2-ilideno, N,N’~ bis(2,4,6-trimetilfenil)-imidazol)-2-ilideno, e N,N'~bis terc-butil-imidazol)-2-ilideno. Em algumas formas de realização, um ou mais ligandos de Pd pode ser ligado a um substrato tal como uma partícula. Exemplos de tais catalisadores incluem (Ar'Ph2P) 2PdCl2 em que o grupo Ar' é parte de um polímero de tal modo que o catalisador é um catalisador de paládio polimérico. Numa outra forma de realização, os complexos de Pd(0) úteis no presente pedido de patente incluem Pd(fosfina)4 (por exemplo, Pd(PPh3)4, Pd (PCy3) 4, Pd (PiPr3) 4, Pd(tBu3P)2, e tris(dibenzilidenoacetona)dipaládio(0) . Ainda noutra forma de realização, os catalisadores de Pd(I) úteis no presente pedido de patente incluem Pd2X2 (fosfina) 2, em que X é um anião monovalente, tal como um haleto. Exemplos de tais catalisadores de Pd(I) incluem Pd2Br2 (tBu3P) 2. O produto da reação de acoplamento de Suzuki é submetido a hidrogenação catalítica sob as condições definidas no passo B.

No passo F, o composto de fórmula (II) é tratado com um composto de fórmula A ou B, para se obter o composto de benzimidazole de fórmula (I).

42 42

Na Β r6 pode ser um grupo alquilo, benzilo, ou p-nitrobenzilo opcionalmente substituído. Em formas de realização particulares, R6 é metilo ou etilo.

Numa forma de realização, o composto de fórmula (I) tem a seguinte fórmula:

HN

HN )=0 (Ia). 0 composto de fórmula (Ia) contém um centro quiral em C-2 do anel de tetrahidrofurilo. Como tal, o composto de fórmula (Ia) pode ser uma mistura racémica ou pode conter um excesso de um dos dois enantiómeros do composto.

Uma mistura racémica do composto de fórmula (Ia) pode ser enantiomericamente enriquecida por meio de qualquer método conhecido dos peritos na técnica. Exemplos de métodos de enriquecimento de enantiómeros conhecidos na técnica incluem a conversão dos enantiómeros em diastereómeros e utilizando as diferentes propriedades físicas dos diastereómeros para separar os enantiómeros, enriquecendo-se um enantiómero. Em algumas formas de realização, a mistura racémica (ou uma mistura enriquecida 43 num enantiómero em que é desejável aumentar o excesso enantiomérico) do composto de fórmula (Ia) pode ser enantiomericamente enriquecida utilizando cromatoqrafia em coluna preparativa adequada para isolar um enantiómero puro ou enantiomericamente enriquecido a partir de uma mistura racémica ou a partir de uma mistura enantiomericamente enriquecida, em que é desejável maior enriquecimento enantiomérico. Em formas de realização em que uma mistura enantiomérica é enantiomericamente enriquecida, o excesso enantiomérico de um dos dois enantiómeros pode estar compreendido entre cerca de 5-100%, cerca de 10-100%, cerca de 20-100%, cerca de 30-100%, cerca de 40-100%, cerca de 50-100%, cerca de 60-100%, cerca de 70-100%, cerca de 80-100%, cerca de 85-100%, cerca de 90-100%, cerca de 91-100%, cerca de 92-100%, cerca de 93-100%, cerca de 94-100%, cerca de 95-100%, cerca de 96-100%, cerca de 97-100%, cerca de 98-100%, cerca de 99-100%, ou cerca de 100%.

Os compostos que contêm um ou mais grupos hidroxilo protegidos podem ser preparados utilizando métodos conhecidos dos peritos na técnica. Exemplos de esquemas de proteção hidroxilo estão descritos em Green, T.W. e Wuts, P.G.M., Protective Groups in Organic Synthesis, John Wiley & Sons, Inc., pp. 17-245 (1999). O termo "alquilo" como aqui utilizado refere-se a ambos os radicais de cadeia linear e ramificada com até dez átomos de carbono. Exemplos de grupos alquilo adequados para o presente pedido de patente incluem de grupos alquilo de cadeia linear e ramificada C1-12· Tal como aqui utilizado, o termo "alquilo de cadeia curta" refere-se a uma cadeia alquilo até 4 átomos de carbono. Tal como aqui utilizado, " alquilo de cadeia média" refere-se a uma cadeia de alquilo tendo 5-7 átomos de carbono. Exemplos de grupos alquilo incluem grupos metilo, etilo, propilo, 44 isopropilo, butilo, sec-butilo, terc-butilo, 3-pentilo, hexilo e octilo, os quais podem ser opcionalmente substituídos.

Os grupos arilo adequados para os métodos do presente pedido de patente incluem arilo C6-i4, de preferência arilo C6-io · Os grupos arilo C6-io típicos incluem grupos fenilo, naftilo, fenantrenilo, antracenilo, indenilo, azulenilo, bifenilo, bifenilenilo e fluorenilo. 0 termo "carbociclo" tal como aqui utilizado inclui grupos cicloalquilo e grupos carbocíclicos parcialmente saturados. Exemplos de grupos cicloalquilo são cicloalquilo C3-7. Grupos cicloalquilo típicos incluem ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, ciclohexilo e cicloheptilo. 0 termo "heterociclo" como aqui utilizado refere-se a um sistema em anel monocíclico de 3-7 membros, ou bicíclico de 7-10 membros, saturado ou parcialmente saturado. O sistema de anel de um heterociclo pode ser constituído por átomos de carbono e por um a quatro heteroátomos selecionados a partir do grupo consistindo de O, Ne S, em que os heteroátomos de azoto e enxofre podem ser oxidados, o azoto pode ser quaternizado, e em que o anel heterocíclico pode ser substituído em carbono ou num átomo de azoto se o composto resultante for estável.

Os substituintes opcionais alquilo, arilo, carbociclo saturado ou insaturado e heterociclo saturado ou insaturado incluem um ou mais de halo, haloalquilo C1-6, arilo Ce-io, cicloalquilo C4-7, alquilo C1-6, alcenilo C2-6, alquinilo C2-6/ arilo (Ci-6) alquilo C6-io, alcenilo C6_i0 arilo-C2-6, alquinilo C6-io arilo-C2-6, hidroxialquilo Ci_6, nitro, amino, alquilamino Ci-6, ciano, acilamino Ci-6, hidroxilo, 45 sulfanilo, sulfonilo, sulfóxido, aciloxi Ci-6, alcoxi Ci_6, e carboxilo. A menos que indicado de outra forma, as estruturas aqui ilustradas pretendem também incluir todas as formas estereoquimicas da estrutura; ou seja, as configurações R e S para cada centro assimétrico. Portanto, os isómeros estereoquimicos individuais bem como as misturas enantioméricas e diastereoméricas dos presentes compostos estão dentro do âmbito do pedido de patente. As formas isotopicamente marcadas dos compostos aqui descritos, em que um ou mais átomos são substituídos por um átomo tendo uma massa atómica ou número de massa diferente da massa atómica ou número de massa usualmente encontrados na natureza estão também dentro do âmbito da presente invenção. Exemplos de isótopos que podem ser incorporados nos compostos da invenção incluem isótopos de hidrogénio, carbono, oxigénio e flúor, tais como 2H, 3H, 13C, 14C, 15N, 180, e 170. Tais compostos rotulados por radiação, e de outra forma isotopicamente marcados, são úteis, por exemplo, como ferramentas de pesquisa ou inibidores de girase e/ou da topoisomerase IV com um perfil terapêutico melhorado.

Numa forma de realização, os compostos de fórmula (I) incluem compostos de fórmula (Ib) 46 em que R é Numa fórmula ('. abaixo:

N )=° ) (Ib) H ou F. outra forma de realização, os ) incluem os compostos 12 e 23, compostos de estabelecido

HN ) 12 (R)-l-etil-3-(5-(2-(2-hidroxipropan-2-il)pirimidin-5-il)-7-(tetrahidrofuran-2-il)-lH-benzo[d]imidazol-2-il)ureia, ou um sal farmaceuticamente aceitável respetivo; e 23 >=° Ν > (R) -l-etil-3- (6-fluoro-5-(2-(2-hidroxipropan-2- il)pirimidin-5-il)-7-(tetrahidrofuran-2-il)-1H- benzo[d]imidazol-2-il)ureia, ou um sal farmaceuticamente aceitável respetivo.

Embora eficaz como uma base livre, o composto de fórmula (I) pode ser administrado como sais de adição de ácido farmaceuticamente aceitáveis. Os compostos de fórmula (I) podem ser convertidos nos seus sais de adição de ácido correspondentes, utilizando métodos bem conhecidos dos peritos na técnica. Exemplos de sais de adição de ácido não-tóxicos do composto de fórmula (I) que contém aniões farmaceuticamente aceitáveis incluem sais de acetato, benzenossulfonato (também conhecido como besilato), benzoato, bicarbonato, bitartarato, brometo, edetato de cálcio, camsilato, carbonato, cloreto, citrato, dicloridrato, edetato, edisilato, estolato, fumarato, gluceptato, gluconato, glutamato, glicolilarsaninato, hexilresorcinato, hidrabamina, bromidrato, hidroxinaftoato, iodeto, isetionato, lactato, lactobionato, malato, maleato, mandelato, metanossulfonato (também conhecido como mesilato), metilbrometo, metilnitrato, metilsulfato, mucato, napsilato, nicotinato, nitrato, pamoato (embonato), pantotenato, fosfato, difosfato, poligalacturonato, salicilato, estearato, subacetato, succinato, sulfato, 48 bissulfato, tanato, tartarato, teoclato, p-toluenosulfonato (também conhecido como tosilato), e trietiodeto.

Uma forma de realização deste pedido de patente refere-se a um método de tratamento de uma infeção bacteriana num mamífero em necessidade deste, que compreende a administração ao referido mamífero de uma quantidade terapeuticamente eficaz de um composto tendo a fórmula (I) ou um sal farmaceuticamente aceitável respetivo. A fim de que esta aplicação seja mais completamente compreendida, são apresentados os exemplos seguintes. Estes exemplos são apenas para fins de ilustração e não são para ser interpretados como limitando de qualquer forma o âmbito da aplicação.

EXEMPLOS EXEMPLO 1: ROTA PARA A SÍNTESE DOS COMPOSTOS 11, 12, E 13 0 Esquema 2 proporciona um método para a preparação dos compostos 11, 12 e 13. 49

Esquema 2 49

2

PdfOAch, dppp

30 psi H2, Pd/C -► NEt3, BleOH, ta

NO2 1 1,4-dioxano K2CO3, refluxo

Exemplo 1.a

Preparação de 2-(2-nitrofenil)-2,5-dihidrofurano (3a) e 2-(2-nitrofenil)-2,3-dihidrofurano (3b)

Br

Pd(OAc)2, dppp N02 1,4-dioxano, K2CO3, refluxo 1 2

l-Bromo-2-nitro-benzeno (1) (600 g, 99%, 2,941 mol, Alfa Aesar A11686), 1,3-bis(difenilfosfino)propano (62,50 g, 97%, 147,0 mmol, Alfa Aesar A12931), 1,4-dioxano 50 (2,970 L, Sigma-Aldrich 360481), carbonato de potássio (812,9 g, 5, 882 mol, JT Baker-301201), e 2,3-dihidrofurano (2) (1,041 kg, 99%, 1,124 L, 14,70 mol, Aldrich 200018) foram misturados num vaso de reação. Uma corrente de azoto foi borbulhada através da mistura em agitação durante 4 horas, seguido pela adição de acetato de paládio (II) (16,51 g, 73,52 mmol, Strem 461780) e a continuação da desoxigenação por mais 10 minutos. A mistura de reação foi agitada em refluxo sob azoto durante a noite (RMN de uma aliquota trabalhada mostrou o consumo completo de brometo de arilo) . A mistura de reação foi deixada a arrefecer, diluída com hexano (1 L) , filtrou-se através de um tampão curto de Florisil® (500 g, -200 malha), e eluído com EtOAc. O filtrado foi concentrado sob pressão reduzida (2- (2-nitrofenil)-2,3-dihidrofurano (3b) é volátil sob vácuo elevado e pode ser um pouco instável à temperatura ambiente) originando uma mistura de (3a) e (3b) como um óleo castanho-escuro (654,0 g) . O material em bruto foi armazenado no frigorífico e utilizado subsequentemente sem purificação adicional.

Exemplo l.a.l

Preparação assimétrica do 2-(2-nitrofenil)-2,5- dihidrofurano (3a) e 2-(2-nitrofenil)-2,3-dihidrofurano (3b) íl Ί |Γί Π Ί + + ILJL 1 àv no2 0-/ no2 õ~y no2 0-Jr no2 0· (R)-3a (S)-3a (R)-3b (S)-3b

Pd(OAc>2 (R)-(S)-JosiPhos 1,4-dioxano, K2CO3,105°C no2 (IX) l-bromo-2-nitrobenzeno (50,0 mg, 98%, 0,2426 mmol,

Aldrich 365424), carbonato de potássio (67,1 mg, 0,4852 mmol, JT-Baker 301201), aduto de etanol (R)-(-)-1-[(S)-2- 51 (difenilfosfino)ferrocenil]etildiciclohexilfosfino ((R)-(S)-JosiPhos, 7,8 mg, 0,01213 mmol, Strem 261210), 2,3-di-hidrofurano (1,0 mL, 99%, 13,08 mmol, Aldrich 200018), e 1,4-dioxano (0,98 mL) foram misturados num tubo de reação. Uma corrente de azoto foi borbulhada através da mistura em agitação durante 20 minutos, e, em seguida, foi adicionado acetato de paládio (II) (1,36 mg, 0,006065 mmol, Strem 461780). O tubo foi selado e a mistura de reação agitada a 105°C durante a noite. HPLC da mistura reacional em bruto mostrou o consumo quase completo de brometo de arilo e a formação de uma mistura 1:1 de 2-(2-nitrofenil)-2,5-di-hidrofurano (3a) e 2-(2-nitrofenil)-2,3-dihidrofurano (3b). A mistura de reação foi deixada a arrefecer, diluída com hexano (2 mL) , filtrada, e enxaguada com acetato de etilo. O filtrado foi concentrado num evaporador rotativo para originar um óleo castanho (51 mg) . O material não foi colocado sob alto vácuo, devido à volatilidade e a preocupações de estabilidade. A mistura de reação em bruto foi determinada como sendo uma mistura 1:1 de (3a) e (3b) por análise 1H RMN. O óleo foi purificado por cromatografia em gel de sílica eluindo com 0 a 38% de EtOAc em hexano (ou 0 a 100% de CH2C12 em hexano) para originar amostras puras de (3a) e (3b). Os dados analíticos para estas amostras foram os seguintes: 2-((2-nitrofenil)-2,5-dihidrofurano (3a) foi obtido como um sólido amarelo (97% de pureza por HPLC, 97,0% ee): LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de MeOH / água a partir de 3-5 minutos com modificador de ácido fórmico) M+l: 192, 05 (3, 40 min); HPLC tempo de retenção de 4,2 min (YMC ODS-AQ coluna de 150 x 3,0 mm, eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água, durante 8 minutos com 0,1% de modificador de TFA e caudal 1 mL/min); tempo de retenção de HPLC quiral analítica de 7,4 min (enantiómero principal) e 8,1 min 52 (enantiómero menor), por eluição com 10% de iPrOH / hexano, sobre uma CHIRALCEL® OJ® coluna 4, 6 x 250 mm com caudal de 1 mL/min a 30°C; 3H RMN (300 MHz, CDC13) δ 8,02 (d, J = 8,2 Hz, 1H) , 7,73 (d, J = 7,9 Hz, 1H) , 7,64 (t, J = 7,6 Hz, 1H), 7,45 - 7,38 (m, 1H) , 6,37 -6,30 (m, 1H), 6,11 - 6,06 (m, 1H) , 6, 04 - 5, 98 (m, 1H) , 5, 02 - 4,83 (m, 2H) ppm; 13C RMN (75 MHz, CDC13) δ 146, 97, 139, 11, 133, 95, 129, 58, 128,10, 128, 09,

126, 78, 124,38, 84,28, 76, 42 ppm; 13C DEPT RMN (75 MHz, CDC13) δ 133, 95 (CH) , 129, 58 (CH) , 128,10 (CH) , 128, 09 (CH), 126, 78 (CH) , 124,38 (CH) , 84,28 (CH) , 76, 42 (CH2) ppm. 2-(2-nitrofenil)-2,3-dihidrofurano (3b) foi obtido como um óleo amarelo (79-90% de pureza por HPLC, 44,0% ee): LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de MeOH / água a partir de 3-5 minutos com modificador de ácido fórmico) M+l: 192,05 (3,72 min); HPLC tempo de retenção de 4,8 min (YMC ODS-AQ coluna de 150 x 3,0 mm, eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água, durante 8 minutos com 0,1% de modificador de TFA e caudal 1 mL/min); tempo de retenção de HPLC quiral analítica de 5, 96 min (enantiómero principal) e 6,35 min (enantiómero menor), por eluição com 10% de iPrOH / hexano, sobre uma CHIRALCEL® OJ® coluna 4,6 x 250 mm com caudal 1 ml 3" H- 2 a co o 0 o 3Η RMN (300 MHz, CDC13) δ £ 3,08 (d, J = 8,2 Hz, 1H) ·, 7,73 (d, J = 7,8 Hz, 1H), 7 , 65 (t, J = 7, 6 Hz, 1H) , 7, 48-7 ,39 (m, 1H) , 6, 50 (q, J = 2, 4 Hz , 1H), 6, 10 (dd, J = 10, 9, 7,4 Hz, 1H) , 4, 95 (q, J = 2, , 5 Hz , 1H) , 3,46 - 3, 35 (m, 1H) , 2,50 - 2,39 (m, 1H) ppm; 13C RMN (75 MHz, CDC13) δ 146, 60, 144, 98, 139, 73, 133,93, 128,07, 127,11, 124,85, 99,29, 78,45, 38,29 ppm; 13C DEPT RMN (75 MHz, CDC13) δ 144, 98 (CH) , 133, 93 (CH) , 128,07 (CH), 127,11 (CH) , 124, 85 (CH) , 99,29 (CH), 78,45 (CH), 38,29 (CH2) ppm. 53 3a e 3b foram transportados através do passo de redução para se obter 2-tetrahidrofurano-2-il-anilina (4) , como estabelecido no Exemplo l.b (abaixo). A análise deste material revelou que ambos 3a e 3b foram formados com o mesmo enantiómero principal, com um total ee de 70%. Desconhece-se se a estereoquímica absoluta do enantiómero principal foi de (R) ou (S).

Exemplo 1.b

Preparação de 2-tetra-hidrofuran-2-il-anilina (4)

5% de paládio sobre carbono (16,3 g, 50% de humidade, 3,83 mmol, Aldrich 330116) foi colocado num frasco de Parr sob atmosfera de azoto, seguido por MeOH (100 mL, JT-Baker 909333). A mistura em bruto de 2-(2-nitrofenil)-2,5-dihidrofurano e 2-(2-nitrofenil)-2,3-dihidrofurano (3a & 3b) (163 g) dissolvida em MeOH (389 mL) foi adicionada ao frasco de Parr, seguido por NEt3 (237,6 mL, 1,705 mol, Sigma-Aldrich 471283) . A garrafa foi colocada num agitador de Parr e saturado com H2. H2 30 psi foi adicionado e o frasco foi agitado até o material inicial ter sido completamente consumido (LCMS e RMN revelaram uma reação completa). A mistura de reação foi purgada com azoto, filtrada através de Celite™ e enxaguada com EtOAc. O filtrado foi concentrado num evaporador rotativo originando um óleo castanho. A reação foi repetida mais três vezes na mesma escala e os lotes foram combinados para purificação. O produto em bruto foi destilado sob vácuo (cerca de 15 54 torr) recolhendo o destilado a 108 - 129°C para se obter (4) como um óleo pálido amarelo claro (427,9 g, rendimento médio foi de 84%; 98% de pureza GCMS) . LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico): M+l: 163,95 (1,46 min) . 2Η RMN (300 MHz, CDC13) δ 7,15 - 7,04 (m, 2H) , 6, 77 - 6, 62 (m, 2H) , 4,85 - 4,77 (m, 1H) , 4,18 (s, 2H) , 4,12 - 4,02 (m, 1H) , 3, 94 - 3, 85 (m, 1H) , 2,25 - 1, 95 (m, 4H) ppm.

Exemplo l.c

Preparação de 4-bromo-2-tetra-hidrofuran-2-il-anilina (5)

Br

A uma solução em agitação de 2-tetra-hidrofuran-2-il-anilina (4) (53,45 g, 327,5 mmol) em éter metil-terc-butílico (MTBE, 641,4 mL) e acetonitrilo (213,8 mL), arrefecida até 2°C foi adicionada N-bromossuccinimida (NBS, 58,88 g, 99%, 327,5 mmol, Aldrich B81255) em 4 porções mantendo a temperatura interna abaixo de cerca de 8°C. A mistura de reação foi agitada enquanto se arrefecia com um banho de gelo-água durante 30 minutos (RMN de uma aliquota trabalhada demonstrou o consumo completo do material inicial). Foi adicionado uma solução aquosa de Na2S203 1 N (330 mL) à mistura de reação, removido o banho frio e agitado durante 20 minutos. A mistura foi diluída com EtOAc e as camadas foram separadas. A fase orgânica foi lavada com NaHC03 aquoso saturado (2x), água, salmoura, seco sobre MgS04, filtrado através de um tampão curto de sílica, 55 eluída com EtOAc, e concentrada sob pressão reduzida para originar (5) na forma de um óleo de cor âmbar muito escuro (82,25 g, 77-94% de pureza por HPLC). Utilizado subsequentemente sem mais purificação. LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico): M+l: 242,10 (2,89 min) . 1E RMN (300 MHz, CDC13) δ 7,22 (d, J = 2,3 Hz, 1H) , 7,16 (dd, J = 8,4, 2,3 Hz, 1H) , 6,54 (d, J = 8,4 Hz, 1H ), 4,79 - 4,73 (m, 1H) , 4,15 (s, 2H) , 4,10 - 4,01 (m, 1H) , 3, 93 - 3,85 (m, 1H) , 2,26 - 2,13 (m, 1H) , 2,12 - 1,97 (m, 3H) ppm.

Exemplo l.d

Preparação de N- (4-bromo-2-nitro-6-tetrahidrofuran-2-il-fenil)-2,2,2-trifluoro-acetamida (6)

5 Cp3 6 A anidrido trifluoroacético (455,3 mL, 3,275 mol, Sigma-Aldrich 106232) com agitação a 2°C adicionou-se lentamente 4-bromo-2-tetrahidrofuran-2-il-anilina (5) (79,29 g, 327,5 mmol) como um óleo espesso por meio de um funil de adição, durante 15 minutos (a temperatura de reação subiu até 14°C). O óleo remanescente foi lavado para a mistura reacional com 2-metiltetrahidrofurano anidro (39,6 mL, Sigma-Aldrich 414247). O banho frio foi removido e foi adicionado nitrato de amónio (34,08 g, 425,8 mmol, 56

Aldrich 467758) . A temperatura de reação subiu até 40°C durante cerca de 30 minutos, altura em que um banho de água fria foi utilizado para controlar a exotermia e trazer a reação até à temperatura ambiente. O banho frio foi então removido e a agitação continuou durante mais 40 minutos (HPLC mostrou muito pouco material não-nitrado remanescente). A mistura de reação foi lentamente vertida numa mistura agitada de gelo triturado (800 g) . O precipitado sólido foi recolhido por filtração, lavado com água, NaHC03 aquoso saturado (até pH 8), água novamente, e hexano. O sólido húmido foi seco em primeiro lugar num forno de convecção a 50°C durante várias horas e, em seguida, sob pressão reduzida num forno a 40°C durante a noite originando (6) na forma de um sólido castanho claro (77,86 g, 62% de rendimento; 98% de pureza por HPLC). LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico): M+l: 383, 19 (3,27 min) . ΤΗ RMN (300 MHz, CDC13) δ 9, 81 (s 1H) , 8,08 (d, J = 2,2 Hz, 1H) , 7,73 (d, J = 2 ,2 Hz, 1H) 4,88 (dd, J = 9,0, 6,5 Hz, 1H) , 4, 17 - 4, 08 (m, 1H) , 4, 03 3, 95 (m, 1H), 2,45 - 2,34 (m, 1H) , 2, 17 - 2, 06 (m, 2H) 1,96 - 1,83 (m, 1H) ppm.

Exemplo l.e

Preparação de 4-bromo-2-nitro-6-tetrahidrofuran-2-il-anilina (6a) 57Br

Br NAOH aq 1,4-dioxano refluxo

6 6a N-(4-bromo-2-nitro-6-tetrahidrofuran-2-il-fenil)-2,2,2-trifluoro-acetamida (6) (54,00 g, 140,9 mmol) foi dissolvido em 1,4-dioxano (162 mL) e adicionou-se NaOH aquoso 6 M (70,45 mL, 422,7 mmol, JT-Baker 567202). A mistura de reação foi agitada em refluxo durante 2 dias (HPLC mostrou conversão completa). A mistura foi deixada arrefecer, diluída com MTBE (800 mL) , e lavada com água (2 x 200 mL), solução aquosa saturada de NH4C1, água, e salmoura. A mistura foi seca sobre MgS04, filtrada, e concentrada sob pressão reduzida para originar (6a) como um óleo âmbar escuro (40,96 g, 93% de rendimento; HPLC global 92% mais pureza RMN) . LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de MeOH / água de 3-5 minutos com modificador de ácido fórmico): M+l : 287,28 (3,44 min) . XH RMN (300 MHz, CDC13) δ 8,24 (d, J = = 2,4 Hz, 1H) , 7,41 (d, J = 2,3 Hz, 1H), 6,91 (s, 2H) , 4, 80 (t, J = 7,2 Hz, 1H) , , 4,14 - 4,05 (m, 1H), 3, 98 - 3, 90 (m, 1H) , 2,36 - 2,19 (m , 1H), 2,15 - 2,01 (m, 3H) ppm.

Exemplo l.f

Preparação de 2-[5-(4-amino-3-nitro-5-tetrahidrofuran-2-il-fenil)pirimidin-2-il]propan-2-ol (8) 58 58

Pd(PPh3)4 Na2C03 aq 1,4-díoxano refluxo 4-Bromo-2-nitro-6-tetrahidrofuran-2-il-anilina (6a) (40,40 g, 92%, 129,5 mmol), 1,4-dioxano (260 mL, Sigma-

Aldrich 360481), 2-[5-(4,4,5,5-tetrametil-l,3,2- dioxaborolan-2-il)pirimidin-2-il]propan-2-ol (7) (41,05 g, 155.4 mmol), e solução aquosa de Na2C03 2,7 M (143,9 mL, 388.5 mmol) foram misturados. Uma corrente de azoto foi borbulhada através da mistura em agitação durante 1 hora, seguida pela adição de tetraquis(trifenilfosfina)paládio (0) (7,48 g, 6,47 mmol, Strem 462150). A mistura de reação foi agitada em refluxo durante 2 horas (HPLC mostrou reação completa), deixada a arrefecer, e diluída com EtOAc. A mistura foi lavada com água, solução saturada aquosa de NH4C1 e com salmoura, seca sobre MgS04, e filtrada através de um tampão curto de Florisil®, por eluição com EtOAc. O filtrado foi concentrado sob pressão reduzida originando um óleo castanho-escuro. O óleo foi dissolvido em CH2C12 e eluído através de um tampão curto de gel de sílica com CH2C12 e depois EtOAc. A fração desejada foi concentrada num evaporador rotativo, até se formar um precipitado originando uma suspensão espessa castanha, a qual foi triturada com MTBE. O sólido foi recolhido por filtração, lavado com MTBE, e seco sob vácuo elevado originando (8) como um sólido amarelo (35,14 g, 99+% de pureza por HPLC). LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido 59 fórmico) : M+l: 345, 00 (2,69 min) . 2Η RMN (300 MHz, CDC13) δ 8,88 (s, 2H) , 8,36 (d, J = 2,2 Hz, 1H), 7,56 (d, J = 2,1 Hz, 1H) , 7,09 (s, 2H), 4, 92 (t, J = 7,2 Hz, 1H) , 4,62 (s, 1H) , 4,20 - 4, 11 (m, 1H), 4, 03 - 3,94 (m, 1H), 2,39 - 2,26 (m, 1H) , 2,23 - 2,08 (m, 3H) , 1, 64 (s, 6H) ppm. 0 filtrado foi concentrado e purificado por cromatografia ISCO em gel de sílica eluindo com 0 a 80% de EtOAc / hexano originando uma segunda colheita de produto (8) como um sólido âmbar (4,46 g, 88% de rendimento total; 88% de pureza por HPLC).

Exemplo l.g

Preparação de 2-[5-(3,4-diamino-5-tetrahidrofuran-2-il-fenil)pirimidin-2-il]propan-2-ol (9)

A uma suspensão de 2-[5-(4-amino-3-nitro-5-tetrahidrofuran-2-il-fenil)pirimidin-2-il]propan-2-ol (8) (30,10 g, 87,41 mmol) e THF (90 mL) num frasco de Parr, sob azoto, foi adicionada uma suspensão de 5% de paládio sobre carbono (3,01 g, 50% de humidade, 0,707 mmol, Aldrich 330116) em MeOH (90 mL, JT-Baker 909333), seguido por NEt3 (24,37 mL, 174,8 mmol, Sigma-Aldrich 471283). O recipiente foi colocado num agitador de Parr e saturado com H2. Após a adição de H2 45 psi, o vaso foi agitado até o consumo estar completo (HPLC mostrou conversão completa). A mistura de reação foi purgada com azoto, filtrada através de Celite™ e enxaguada com EtOAc. O filtrado foi novamente filtrado 60 através de um papel de filtro de fibra de vidro de 0,5 micron ensanduichado entre dois papéis P5, e concentrado sob pressão reduzida originando (9) como uma espuma castanho clara (28,96 g, 98% de rendimento; 93% de pureza RMN) . LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico) : M+l: 315, 32 (1,54 min) . 1H RMN (300 MHz, CDC13) δ 8,83 (s, 2H) , 6, 92 (d, J = 1,8 Hz , 1H) , 6,88 (d, J 00 \—1 II Hz, 1H) , 4, 90 (dd, J = 7,9, 6,2 Hz, 1H), 4,72 (s, 1H) , 4,18 (s, 2H) , 4, 17 - 4,08 (m, 1H) , 3, 99 - 3,89 (m, 1H), 3, 46 (s, 2H) , 2,34 - 2, 19 (m, 1H), 2, 17 - 2, 05 (m, 3H), 1,63 ( s, 6H) ppm.

Exemplo 1.h

Preparação de l-etil-3-[5-[2-(1-hidroxi-l-metil- etil) pirimidin-5-il] -7-tetrahidrofuran-2-il-líZ-benzimidazol-2-il]ureia (11)

o s"o

EtHN^N^N^NHEt H_ tampão pH 3,5 dioxano, refluxo A uma solução em agitação de 2-[5-(3,4-diamino-5 tetrahidrofuran-2-il-fenil)pirimidin-2-il]propan-2-ol (9) 61 (32,10 g, 102,1 mmol) em 1,4-dioxano (160,5 mL, Sigma-Aldrich 360481) foi adicionado tampão de pH 3, 5 (240, 8 mL) , preparado por dissolução de NaOAc trihidratado (34,5 g) em H2SO4 aquoso 1 N (240 mL). l-Etil-3-(N-(etilcarbamoil)-C-metilsulfanil-carbonimidoil)ureia (10) (28,46 g, 122,5 mmol, CB Research and Development) foi adicionado à mistura de reação e agitado em refluxo durante a noite (HPLC mostrou 99% de consumo da diamina inicial). A mistura de reação foi arrefecida até à temperatura ambiente e vertida em porções (formação de espuma) para uma solução em agitação de solução aquosa saturada de NaHC03 (480 mL) e água (120 ml) originando pH 8-9. Esta foi agitada durante 30 minutos, o sólido foi recolhido por filtração, lavado copiosamente com água até pH neutro, e, em seguida, com mais moderação com EtOH. O sólido foi seco sob pressão reduzida, originando (11) como um sólido esbranquiçado (34,48 g, 82% de rendimento; 99,4% de pureza por HPLC). LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico): M+l: 411,41 (1,73 min). 2Η RMN (300 MHz, MeOD) δ 9, 02 (s, 2H) , 7,62 (s, 1H) , 7,37 (s, 1H) , 5,31 (s, 1H) r 4,23 (dd, J = 14,5, 7,3 Hz, 1H) , 4, 01 (dd, J = 15, 0, 7, 1 Hz, 1H) , 3,38 - 3,28 (m, 2H) , 2,58 - 2 ,46 (m, 1H), 2,16 - 2,05 (m, 2H), 2,02- 1,88 (m, 1H), 1,63 (s, 6H), 1,22 (t, j = 7,2 Hz, 3H) ppm.

Exemplo l.i

Isolamento cromatográfico quiral de l-etil-3-[5-[2-(1-hidroxi-l-metil-etil)pirimidin-5-il]-7-[(2R)-tetrahidrofuran-2-il]-lH-benzimidazol-2-il]ureia (12)

62HN

crom quiral

HN

HN )=° > 11

HN )=° ) 12

Uma amostra racémica de l-etil-3-[5-[2-(1-hidroxi-l-metil-etil)pirimidin-5-il]-7-tetrahidrofuran-2-il-lH-benzimidazol-2-il]ureia (11) (24,60 g) foi resolvida numa coluna CHIRALPAK® IC® (por Chiral Technologies) eluindo com CH2C12 / MeOH / TEA (60 / 40 / 0,1) a 35°C originando o enantiómero pretendido (12) como um sólido branco (11,35 g, 45% de rendimento; 99+% de pureza por HPLC, 99+% ee). Tempo de retenção em HPLC analítica quiral foi de 6,2 min (CHIRALPAK® IC® coluna 4, 6 x 250 mm, caudal 1 mL/min, 30 °C) . A estrutura e estereoquímica absoluta de 12 foram confirmados por análise de cristal único de difração de raios-x. Os dados de difração de um único cristal foram adquiridos num difratómetro Bruker Apex II equipado com tubo selado Cu fonte K-alfa (radiação Cu Κα, γ = 1,54178 Ã) e um detetor CCD Apex II. Um cristal, com as dimensões de 1/2 x 0,05 x 0,05 mm foi selecionado, limpo usando óleo mineral, montado sobre um MicroMount e centrado num sistema Bruker APEXII. Três lotes de 40 quadros separados no espaço recíproco foram obtidos para fornecer uma matriz de orientação e os parâmetros celulares iniciais. Os 63 parâmetros celulares finais foram obtidos e refinados após a colheita de dados estar concluída com base no conjunto completo de dados. Baseado em ausências sistemáticas e estatísticas de intensidades a estrutura foi resolvida e refinada em grupo espacial acêntrico Ρ2λ.

Um conjunto de dados de difração de espaço recíproco foi obtido com uma resolução de 0,9 Ã utilizando passos de 0,5° utilizando 60 s de exposição para cada quadro.

Os dados foram recolhidos a 100 (2) K. A integração de intensidades e refinamento dos parâmetros celulares foram realizados utilizando o software APEXII. A observação do cristal após a recolha de dados não demonstrou sinais de decomposição. Como mostrado na Fig. 1, há duas moléculas independentes de simetria na estrutura e ambas as moléculas de simetria independente são isómeros R.

Os dados foram recolhidos, refinados e reduzidos utilizando o software Apex II. A estrutura foi resolvida utilizando o programa SHELXS97 (Sheldrick, 1990); e a estrutura refinada utilizando o programa SHELXL97 (Sheldrick, 1997). 0 cristal mostra célula monoclínica com grupo espacial P2i. Os parâmetros de rede são: a = 9, 8423(4) Ã, b = 10,8426 (3) Â, c = 19, 4441 (7) Ã, β = 102,966(3)°. Volume = 2022,09(12) À3.

Exemplo l.j

Preparação do sal de ácido metanossulfónico de l-etil-3-[5-[2-(1-hidroxi-l-metil-etil)pirimidin-5-il]-7-[(2R)-tetrahidrofuran-2-il]-lH-benzimidazol-2-il]ureia (13) 64

> U )=°ΗΝ MeS03H' 13

Uma suspensão em agitação de l-etil-3-[5-[2-(1-hidroxi-l-metil-etil)pirimidin-5-il]-7-[(2R)-tetrahidrofuran-2-il]-lH-benzimidazol-2-il]ureia (12) (9,32 g, 22,71 mmol) em etanol absoluto (93,2 mL) foi arrefecida com um banho de gelo-água. Foi adicionado o ácido metanossulfónico (1,548 mL, 23,85 mmol, Sigma-Aldrich 471356), removida do banho frio e agitada à temperatura ambiente durante 20 minutos. Foi concentrada num evaporador rotativo a 35°C até ser uma suspensão espessa, diluída com

EtOAc, recolheu-se o sólido por filtração, lavado com EtOAc, e seco sob pressão reduzida, originando uma colheita inicial de (13) como um sólido branco (8,10 g) . O filtrado foi concentrado num evaporador rotativo originando uma espuma vítrea amarelado, a qual foi dissolvida em EtOH, concentrada até ser uma suspensão sólida, triturada com EtOAc / Et20, e recolhida por filtração. O sólido foi lavado com EtOAc / Et20, combinado com a primeira colheita, e seco sob pressão reduzida, originando (13) como um sólido branco (9,89 g, 86% de rendimento; 99+% de pureza por HPLC, 99 + % ee) . HPLC analítica quiral mostra um enantiómero com tempo de retenção de 6,3 min, eluindo com CH2C12 / MeOH / 65 TEA (60 / 40 / 0,1) numa coluna CHIRALPAK® IC® 4,6 x 250 mm com caudal 1 mL/min a 30°C. LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico) : M+l: 411,53 (1,74 min) . 2Η RMN (300 MHz, MeOD) δ 9,07 (s, 2H) , 7,79 (s, 1H) , 7,62 (s, 1H) , 5,30 (t, J = 7,3 Hz, 1H) , 4,24 (dd, J = 14,6, 7,3 Hz, 1H) , 4,04 (dd, J = 15,0, 7,6 Hz, 1H) , 3, 40 - 3, 30 (m, 2H) , 2,72 (s, 3H) , 2, 65 - 2,54 (m, 1H) , 2,20 - 2, 07 (m, 2H) , 2,04 - 1,90 (m, 1H) , 1,64 (s, 6H) , 1,23 (t, J = 7,2 Hz, 3H) ppm.

Exemplo 1.1 1-pot desproteção / procedimento Suzuki Preparação de 2 —[5 — (4-amino-3-nitro-5-tetrahidrofuran-2-il-fenil)pirimidin-2-il]propan-2-ol (8)

N-(4-Bromo-2-nitro-6-tetra-hidrofuran-2-il-fenil)-2,2,2-trifluoro-acetamida (6) (19,00 g, 49,59 mmol), 2-[5- (4,4,5,5-tetrametil-l,3,2-dioxaborolan-2-il)pirimidin-2-il]propan-2-ol (7) (14,41 g, 54,55 mmol), carbonato de sódio aquoso 2,7 M (73,48 mL, 198,4 mmol), e 1,4-dioxano (190 mL, Sigma-Aldrich 360481) foram misturados. Uma corrente de azoto foi borbulhada através da mistura em agitação durante 40 minutos, seguido pela adição de aduto de diclorometano dicloropaládio 1,1'- 66

bis(difenilfosfino)ferroceno (2,025 g, 2,480 mmol, Strem 460450) . A mistura de reação foi agitada em refluxo sob N2 durante 7 horas, adicionou-se mais 50 mL de carbonato de sódio aquoso saturado, e submeteu-se a refluxo durante mais 16 horas. A mistura de reação foi deixada arrefecer, em seguida, diluída com EtOAc (500 mL) e água (200 mL) . As camadas foram separadas e a fase aquosa extraída com EtOAc (200 mL) . A fase orgânica combinada foi lavada com água (500 mL) , salmoura (500 mL) , seca sobre Na2S04, filtrada através de um tampão Florisil®, e concentrada num evaporador rotativo para dar em bruto (8) na forma de um óleo cor de laranja. Purificado por cromatografia ISCO de gel de sílica eluindo com 20-90% de EtOAc / hexano para originar (8) como um sólido cor de laranja (15,00 g, 81-88% de pureza). LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico) : M+l: 345, 35 (2, 68 min) . 1H RMN (300 MHz, CDC13) δ 8,88 (s, 2H) , 8,36 (d, J = 2,2 Hz, 1H) , 7,56 (d, J = 2,1 Hz, 1H) , 7,09 (s, 2H) , 4,92 (t, J = 7,2 Hz, 1H) , 4,62 (s, 1H) , 4,20 - 4,11 (m, 1H) , 4,03 - 3,94 (m, 1H) , 2,39 - 2,26 (m, 1H) , 2,23 - 2,08 (m, 3H) , 1,64 (s, 6H) ppm. EXEMPLO 2: ROTA PARA A SÍNTESE DOS COMPOSTOS 22, 23 E 24 O Esquema 3 fornece um método para a preparação dos compostos 22, 23 e 24. 67

Esauema 3

67ÇC-Q NOj 14

20

19 18 17 ¥

45 psi H2l Pd/C, NEt3 MeOH, THF N^-N .OH

N^N

HN 23

_yoH N^N

^0 MeSOjH HN ) u

Exemplo 2.a

Preparação de 2-(2-fluoro-6-nitro-fenil)-2,3-dihidrofurano (15A) e 2-(2-fluoro-6-nitro-fenil)-2,5-dihidrofurano (15B)

2-Bromo-l-fluoro-3-nitro-benzeno (14) (200,3 g, 98%, 892,3 mmol, Bosche F6657), 1,4-dioxano (981,5 mL, Sigma-Aldrich 360481), e 2,3-dihidrofurano (2) (341,1 mL, 99%, 4,462 mol, Aldrich 200018) foram carregados num balão de 68 reação, seguido de N,N-diisopropiletilamina (155,4 mL, 892,3 mmol, Sigma-Aldrich 550043) e dimero de bromo(tri-terc butilfosfina)paládio(I) (6,936 g, 8,923 mmol, Johnson

Matthey C4099). A mistura foi agitada em refluxo durante 2 horas (HPLC mostrou 98% de consumo do brometo de arilo inicial) . A mistura de reação foi deixada a arrefecer; o precipitado foi removido por filtração, enxaguado com EtOAc, e o filtrado concentrado em vácuo até se obter um óleo castanho avermelhado escuro semissólido. O óleo semissólido foi dissolvido em CH2CI2, eluido através de um tampão de sílica com CH2C12, e concentrado em vácuo dando origem a uma mistura de 15A e 15B como um óleo âmbar escuro (291,3 g) . O produto em bruto foi utilizado subsequentemente sem purificação adicional. O produto principal era 2-(2 — fluoro-6-nitro-fenil)-2,3-dihidrofurano (15A) (96%) : LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de

gradiente de CH3CN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico) M+l: 210,23 (3,13 min); 1H RMN (300 MHz, CDCI3) δ 7,54 (dt, J = 8,0, 1,2 Hz, 1H), 7,43 (td, J = 8 ,2, 5,2 Hz, 1H), 7,32 (ddd, J = 9,7, 8,3, 1,3 Hz 1H) , 6, 33 (dd, J = 4,9, 2, 4 Hz, 1H) , 5,80 (t, J = 10,9 Hz 1H) , 5, 06 (q, J = 2,4 Hz, 1H) , 3,18 - 3,07 (m, 1H) , 2,94 2,82 (m, 1H) ppm. O produto menor era 2-(2-fluoro-6-nitro-

fenil)-2,5-dihidrofurano (15B) (4%) : GCMS (Agilent HP-5MS coluna 30 m x 250 ym x 0,25 ym com aquecimento a 60°C durante 2 min a 300°C durante 15 min com um caudal de 1 mL/min) M+l: 210 (11,95 min). 1 H RMN (30 0 MHz, CDC13) δ 7,47 (d, J = 8, 0 H z, 1H), 7,43 - 7, 34 (m, 1H), 7,30 - 7, 23 (m, 1H) , 6,21 - 6, 15 (m, 1H), 6, 11 - 6,06 (m, 1H) , 5,97 - 5, 91 (m, 1H) , 4, 89 - 4,73 (m, 2H) ppm.

Exemplo 2.b

Preparação de 3-fluoro-2-tetrahidrofurano-2-il-anilina (16) 69

5% de paládio sobre carbono (37,3 g, 50% humidade, 8,76 mmol, Aldrich 330116) foi colocado num frasco de Parr sob atmosfera de azoto, seguido por MeOH (70 mL, JT-Baker 909333). A mistura em bruto de 2-(2-fluoro-6-nitro-fenil)-2,3-dihidrofurano e 2-(2-fluoro-6-nitro-fenil)-2,5- dihidrofurano (15A & 15B) (186,6 g, 892,1 mmol) dissolvido em MeOH (117 mL) foi adicionada ao frasco de Parr, seguido de NEt3 (124,3 mL, 892,1 mmol, Sigma-Aldrich 471283). O frasco foi colocado num agitador de Parr e saturado com H2. Após a adição de H2 45 psi, a mistura de reação foi agitada até o consumo do material inicial estar completo (HPLC e LCMS mostraram reação completa). A mistura de reação foi purgada com azoto, filtrada através de Celite™ e enxaguada com EtOAc. O filtrado foi concentrado num evaporador rotativo originando um óleo castanho, que foi dissolvido em Et20 e lavado com água (2x) . A fase de éter foi extraída com solução aquosa de HC1 1 N (5 x 250 mL), que foi lavado com Et20 (3x) e em seguida basificada com NaOH aquoso a 6 N até pH 12-14. A fase aquosa básica foi extraída com diclorometano (CH2C12, 4x) , e o extrato orgânico combinado foi lavado com NH4C1 aquoso saturado, seco sobre MgS04, e filtrado através de um bloco de sílica eluindo com CH2C12 a 25% de EtOAc / hexano. O filtrado desejado foi concentrado sob pressão reduzida originando 16 como um óleo castanho claro (121,8 g, 84% GCMS mais pureza de RMN). GCMS (Agilent HP-5MS coluna 30 m x 250 ym x 0,25 ym com aquecimento a 60°C durante 2 minutos até 300°C durante 15 min com um caudal de 1 mL/min) M+l: 182,0 (11,44 min). LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água ao 70 longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico): M+l: 182,10 (2,61 min) . 2Η RMN (300 MHz, CDC13) δ 6,97 (td, J = 8,1, 6,3 Hz, 1H) , 6, 43 - 6, 35 (m, 2H) , 5,21 - 5,13 (m, 1H) , 4,54 (s, 2H) , 4,16 - 4,07 (m, 1H) , 3,90 - 3,81 (m, 1H) , 2,23 - 2,00 (m, 4H) ppm. Colheitas adicionais foram obtidas como se segue: a fase de éter combinada foi lavada com NaHC03 aquoso saturado, salmoura, seco sobre Na2S04, decantado, e concentrado sob pressão reduzida. O óleo foi destilado sob vácuo (cerca de 15 torr) recolhendo o destilado a 101 - 108°C. A uma solução em agitação do óleo destilado em EtOH (1 volume) a 2°C adicionou-se lentamente HC1 5 Μ (1 eq) em iPrOH. A suspensão resultante foi levada até à temperatura ambiente, diluída com EtOAc (3 volumes, vol/vol), e agitada durante 2 horas. Um sólido branco foi recolhido por filtração, lavado com EtOAc, e seco sob pressão reduzida, obtendo-se uma segunda colheita do produto como o sal de HC1. O licor mãe foi concentrado até uma suspensão, diluído com EtOAc e o sólido foi recolhido por filtração, lavado com EtOAc, e seco sob vácuo originando o sal de HC1 como uma terceira colheita do produto. LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico): M+l: 182, 10 (2,58 min). 2Η RMN (300 MHz, CDC13) δ 10,73 (br.s, 3H) , 7,66 (d, J = 8,1 Hz, 1H) , 7,3 (td, J = 8,2, 5,9 Hz, 1H), 7,13 - 7,05 (m, 1H) , 5,26 (dd, J = 9,0, 6,5 Hz, 1H) , 4,38 - 4,28 (m, 1H) , 4,00 - 3,91 (m, 1H) , 2,59 - 2, 46 (m, 1H) , 2,30 - 1, 95 (m, 3H) ppm. O rendimento global a partir das três colheitas foi de 76%.

Exemplo 2.c

Preparação de 4-bromo-3-fluor-2-tetrahidrofurano-2-il- anilina (17) 71

Br yN. -F íTY MTBE, CH3CN f ΓΤ γγ\ NBS, -15°C 1 nh2 o-V NH2 0— 16 17 A uma solução em agitação de 3-fluoro-2- tetrahidrofurano-2-il-anilina (16) (131,9 g, 92%, 669,7 mmol) em éter metil-terc-butílico (1 , 456 L ) e acetonitrilo (485 mL) arrefecida a - 2 0 °C foi adicionado N- bromossuccinimida (120 ,4 g, 99%, 669,7 mmol, Aldrich B81255) em 3 porções, mantendo uma temperatura de reação abaixo de cerca de 15°C. Após ; a adição completa, a agitação continuou a -15 a -10°C durante 30 minutos. ΤΗ RMN de uma alíquota trabalhada demonstrou o consumo de 96% da anilina inicial. Mais 4,82 g de NBS foram adicionados à mistura de reação e agitou-se a -10°C durante 30 minutos adicionais. Foi adicionado uma solução aquosa de Na2S203 1 N (670 mL) à mistura de reação. 0 banho frio foi removido, a mistura agitada durante 20 minutos, depois diluída com EtOAc. As camadas foram separadas. A fase orgânica foi lavada com NaHC03 aquoso saturado (2x), água, e salmoura, seca sobre Na2S04, decantada, e concentrada sob pressão reduzida, originando um óleo âmbar escuro. O resíduo foi diluído com hexano e eluído através de um tampão curto de sílica com 25% de EtOAc / hexano para 50% EtOAc / hexano. O filtrado desejado foi concentrado sob vácuo originando 17 como um óleo âmbar escuro (182,9 g, 90% de rendimento; 86% de pureza RMN) . LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de AcN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico) : M+l: 260,12 (3, 20 min) . 2Η RMN (300 MHz, CDC13) δ 7,15 (dd, J = 8,6, 7,6 Hz, 1H) , 6,30 (dd, J = 8,7, 1,3 Hz, 1H) , 5,19 - 5,12 (m, 1H) , 4,58 (s, 2H) , 4,16 - 4,07 (m, 1H) , 3,90 - 3,81 (m, 1H) , 2,23 - 1,99 (m, 4H) ppm. 72

Exemplo 2.d

Preparação de N-(4-bromo-3-fluoro-6-nitro-2- tetrahidrofurano-2-il-fenil)-2,2,2-trifluoro-acetamida (18)

18 A anidrido trifluoroacético (565,3 mL, 4,067 mol, Sigma-Aldrich 106232) com agitação a 2°C foi adicionado puro lentamente 4-bromo-3-fluoro-2-tetrahidrofurano-2-il-anilina (17) (123,0 g, 86%, 406,7 mmol) na forma de um óleo espesso por meio de funil de adição durante cerca de 20 minutos (a temperatura de reação subiu até 13°C) . O óleo remanescente foi lavado para a mistura reacional com THF anidro (35 mL) . O banho frio foi removido e a reação foi aquecida até 35°C, seguido da adição em porções de NH4N03 (4,88 g x 20 porções, 1,22 mol, Sigma-Aldrich A7455) ao longo de 2,5 horas mantendo a temperatura da reação entre 30 e 41°C utilizando um banho de gelo-água apenas quando necessário para controlar a exotermia. Depois de completada a adição a mistura de reação foi agitada por mais 10 minutos (HPLC demonstrou reação completa 99%) . Esta foi lentamente vertida em gelo moido (1,23 kg) e agitou-se durante 1 hora para permitir a formação de um precipitado sólido filtrável, que foi recolhido e lavado com água, moderadamente com NaHC03 aquoso saturado, e novamente com água (até pH 7) . O produto foi seco num forno de convecção durante a noite a 40°C e, em seguida, sob pressão reduzida 73 num forno a 50 °C durante a noite originando 18 como um sólido bege (152,5 g, 90% de rendimento; 96% de pureza por HPLC). LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico) : M+l: 401,30 (3, 41 min) . 2Η RMN (300 MHz, CDC13) δ 10,56 (s, 1H) , 8,19 (d, J = 6,6 Hz, 1H) , 5,22 (dd, J = 10,3, 6,4 Hz, 1H) , 4,22 (dd, J = 15,8, 7,2 Hz, 1H) , 3,99 (dd, J = 16,1, 7,5 Hz, 1H) , 2,50 - 2,38 (m, 1H) , 2,22 - 2,11 (m, 2H) , 1,86 - 1,71 (m, 1H) ppm.

Exemplo 2.e

Preparação de 4-bromo-3-fluoro-6-nitro-2-tetrahidrofurano-2-il-anilina (19)

Um balão de reação foi carregado com N-(4-bromo-3-fluoro-6-nitro-2-tetrahidrofurano-2-il-fenil)-2,2,2-trifluoro-acetamida (18) (242,3 g, 604,1 mmol), 1,4-dioxano (1,212 L), e solução aquosa de ácido sulfúrico 2 M (362,4 mL, 724,9 mmol), e agitou-se em refluxo durante 5 dias (HPLC mostrou 98% de conversão). A mistura de reação foi deixada a arrefecer, diluída com EtOAc, neutralizada com NaHC03 aquoso saturado, as camadas separadas, e repetiu-se a extração da fase aquosa com EtOAc (2x). A fase orgânica combinada foi lavada com salmoura (2x), seca sobre MgS04, filtrada e concentrada em vácuo dando origem a 19 como um sólido castanho esverdeado (181,7 g, 94% de 74 rendimento; 95% de pureza por HPLC). O produto foi levado para o passo seguinte sem purificação adicional. LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico): M+l: 305,20 (3, 63 min) . 2Η RMN (300 MHz, CDC13) δ 8,35 (d, J = 7,3 Hz, 1H) , 7,45 (s, 2H) , 5,23 - 5,16 (m, 1H) , 4,23 -4,14 (m, 1H) , 3, 93 - 3, 84 (m, 1H) , 2,31 - 1,96 (m, 4H) ppm.

Exemplo 2.f

Preparação de 2-[5-(4-amino-2-fluoro-5-nitro-3- tetrahidrofuran-2-il-fenil)pirimidin-2-il]propan-2-ol (20)

19 7 20 A uma solução em agitação de 4-bromo-3-fluoro-6-nitro-2-tetrahidrofurano-2-il-anilina (19) (525,0 g, 1,721 mol, Bridge Organics Co.) em 1,4-dioxano (4,20 L, Sigma-Aldrich 360481) foi adicionada uma solução aquosa 1,2 M de NaHC03 (4,302 L, 5,163 mol). Uma corrente de azoto foi borbulhada através da mistura em agitação durante 2 horas, seguido da adição de 2-[5-(4,4,5,5-tetrametil-l,3,2-dioxaborolan-2-il)pirimidin-2-il]propan-2-ol (7) (545,4 g, 2,065 mol, Bridge Organics Co.) e aduto de diclorometano dicloropaládio 1,1'-bis (difenilfosfino)ferroceno (42,16 g, 51,63 mmol, Strem 460450). A mistura de reação foi agitada em refluxo durante a noite, deixada a arrefecer, diluída com EtOAc (8,4 L) , e as camadas foram separadas. A fase orgânica foi lavada com NH4C1 aquoso saturado e depois com 75 salmoura. A fase aquosa foi extraída novamente com EtOAc (4 L) e lavou-se este extrato orgânico com salmoura. A fase orgânica combinada foi seca sobre MgS04, filtrada através de um tampão curto de Florisil®, eluída com EtOAc, e o filtrado concentrado num evaporador rotativo originando um sólido húmido castanho-escuro. Este foi dissolvido em CH2C12, carregado num bloco de gel de sílica, eluído com hexano, em seguida 25% de EtOAc / hexano, e, em seguida, 50% de EtOAc / hexano. O filtrado desejado foi concentrado num evaporador rotativo até ser uma suspensão espessa, e o sólido foi recolhido por filtração, triturado com MTBE, e seco sob vácuo originando 20 como um sólido amarelo brilhante (55,8% de rendimento, 90-97% de pureza por HPLC). O filtrado foi concentrado e a purificação acima foi repetida dando uma segunda colheita de 20 como um sólido amarelo brilhante (19,7% de rendimento). O filtrado foi novamente concentrado originando um óleo castanho-escuro e este foi carregado numa coluna de sílica com tolueno e CH2C12 mínimo. Foi eluído com EtOAc / hexano (0% a 50%) . As frações desejadas foram concentradas até serem suspensões e diluídas com MTBE / hexano. O sólido foi recolhido por filtração e lavado com MTBE mínimo originando uma terceira colheita de 20 como um sólido amarelo brilhante (4,9% de rendimento), com um rendimento global de 80% a partir das

três colheitas. LCMS (coluna Cl 8 eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico): M+l : 363,48 (2, 95 min) . RMN (30 0 MHz, CDC13) δ 8,84 (d, J = 1,6 Hz, 2H), 8,27 (d , J = 8,0 Hz, 1H) , 7,62 (s, 2H) , 5,31 - 5,24 (m, 1H) , 4,63 (s, 1H), 4,27 - 4,18 (m, 1H), 3, 97 - 3, 87 (m, 1H) , 2,33 - 2,05 (m, 4H), 1,64 (s, 6H) ppm.

Exemplo 2.g 76

Preparação de 2-[5-(4,5-diamino-2-fluoro-3-tetrahidrofuran-2-il-fenil)pirimidin-2-il]propan-2-ol (21)

5% de paládio sobre carbono (14,21 g, 50% de humidade, 3,339 mmol, Aldrich 330116) foi colocado num frasco de Parr sob atmosfera de azoto, seguido de MeOH (242 mL, JT-Baker 909333) e NEt3 (46,54 mL, 333,9 mmol, Sigma-Aldrich 471283) . 2-[5-(4-Amino-2-fluoro-5-nitro-3-tetrahidrofuran- 2-il-fenil)pirimidin-2-il]propan-2-ol (20) (121,0 g, 333,9 mmol) foi dissolvido em THF quente (360 mL) , deixado a arrefecer, adicionado à mistura de reação, e enxaguada a quantidade residual de 20 com uma outra porção de THF (124 mL). O frasco foi colocado num agitador de Parr e saturado com H2. Após a adição de H2 45 psi, o frasco foi agitado até o consumo de 20 estar completo (HPLC e LCMS demonstraram reação completa). A mistura de reação foi purgada com azoto, filtrada através de Celite™ e enxaguada com EtOAc. Esta foi novamente filtrada através de papel (microfibra de vidro) e o filtrado concentrado em vácuo. A reação foi repetida mais três vezes na mesma escala e os lotes foram combinados originando 21 como um sólido castanho (447 g, 99% de rendimento; 93% de pureza por HPLC) . LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico) : M+l: 333,46 (1,79 min) . 2Η RMN (300 MHz, CDC13) δ 8,81 (d, J = 1,4 Hz, 2H), 6,69 (d, J = 7,3 Hz, 1H), 5,27 -5,20 (m, 1H) , 4,73 (s, 1H) , 4,70 (s, 2H) , 4,23 - 4,14 (m, 77 1Η) , 3, 94 - 3,86 (m, 1H) , 3,22 (s, 2H) , 2,32 - 2,22 (m, 1H) , 2,18 - 1,99 (m, 3H) , 1,63 (s, 6H) ppm.

Exemplo 2.h

Preparação de l-etil-3-[6-fluoro-5-[2-(1-hidroxi-l-metil-etil) pirimidin-5-il ] -7-tetrahidrofuran-2-il-li7-benzimidazol-2-il]ureia (22)

A uma suspensão em agitação de 2-[5-(4,5-diamino-2-fluoro-3-tetrahidrofuran-2-il-fenil)pirimidin-2-il]propan-2-ol (21) (111,3 g, 334,9 mmol) e 1,4-dioxano (556,5 mL,

Sigma-Aldrich 360481) foi adicionado l-etil-3-(N-(etilcarbamoil)-C-metilsulfanil-carbonimidoil)ureia (10) (93,36 g, 401,9 mmol, CB Research and Development) seguido de um tampão de pH 3,5 (1,113 L) , preparado por dissolução de NaOAc trihidratado (158,1 g) em H2S04 aquoso 1 N (1,100 L) . A mistura de reação foi agitada em refluxo durante a noite (HPLC mostrou conversão completa), arrefecida até à temperatura ambiente, e vertida em porções (para minimizar a formação de espuma) dentro de uma solução agitada de NaHC03 aquoso saturado (2,23 L) para dar pH 8-9. A mistura 78 resultante foi agitada durante 30 minutos, o sólido foi recolhido por filtração, lavado copiosamente com água até pH neutro, e, em seguida, com mais moderação com EtOH. O sólido foi seco sob pressão reduzida originando 22 como um sólido amarelado esbranquiçado (135,2 g, 94% de rendimento; 99% de pureza por HPLC) . LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico) : M+l: 429,58 (2, 03 min) . 2Η RMN (300 MHz, MeOD) CO l/O . 95 (d , J = 1,6 Hz, 2H), 7,45 (d, = 6, 5 Hz, 1H) , 5, 38 (br. s, 1H) , 4, ,27 (dd, J = 14,9, 7 , 1 Hz 1H) , 4,01 (dd, J = 15,1, . 7, ,0 Hz, 1H), 3,37 - 3,29 (m , 2H) 2,55 (br. s, 1H), 2 ,19 - 2, . 07 (m, 2H) , 2,02 - 1,82 (br. s 1H) , 1, 63 (s, 6H) f 1,21 (t, J = 7, ,2 Hz, 3H) ppm.

Exemplo 2.i

Isolamento cromatográfico quiral de l-etil-3-[6-fluoro-5-[2-(1-hidroxi-l-metil-etil)pirimidin-5-il]-7-[(2R)-tetrahidrofuran-2-il]-lH-benzimidazol-2-il]ureia (23)

Uma amostra racémica de l-etil-3-[6-fluoro-5-[2-(1-hidroxi-l-metil-etil)pirimidin-5-il]-7-tetrahidrofuran-2-il-lH-benzimidazol-2-il]ureia (22) (133,60 g) foi resolvida 79 numa coluna CHIRALPAK® IC® (por Chiral Technologies) eluindo com CH2C12 / MeOH / TEA (60 /40 / 0, 1) a 25°C originando o enantiómero pretendido 23 como um sólido esbranquiçado (66,8 g, 45% de rendimento; 99,8% de pureza por HPLC, 99 + % ee) . Tempo de retenção em HPLC analítica quiral foi de 7,7 min (CHIRALPAK® IC® coluna 4, 6 x 250 mm, caudal 1 mL/min, 30°C). O sólido foi suspenso em de EtOH / Et20 2:1 (5 volumes), agitado durante 10 minutos, recolhido por filtração, lavado EtOH / Et20 2:1, e seco sob pressão reduzida, originando um sólido branco (60,6 g). A estrutura e estereoquímica absoluta de 23 foram confirmadas por análise de cristal único de difração de raios-x. Os dados de difração de um único cristal foram adquiridos num difratómetro Bruker Apex II equipado com tubo selado Cu fonte K-alfa (radiação Ka Cu, γ = 1,54178 Ã) e um detetor Apex II CCD. Um cristal, com as dimensões de 0,15 x 0,15 x 0,10 mm foi selecionado, limpo usando óleo mineral, montado sobre um MicroMount e centrado num sistema Bruker APEXII. Três lotes de 40 quadros separados no espaço recíproco foram obtidos para fornecer uma matriz de orientação e os parâmetros celulares iniciais. Os parâmetros celulares finais foram obtidos e refinados após a colheita de dados ter sido concluída com base no conjunto completo de dados. Baseado em ausências sistemáticas e estatísticas de intensidades a estrutura foi resolvida e refinado em grupo espacial acêntrico Ρ2λ.

Um conjunto de dados de difração de espaço recíproco foi obtido com uma resolução de 0,85 Ã utilizando passos de 0,5° utilizando 30 s de exposição para cada quadro. Os dados foram recolhidos a 100 (2) K. A integração de intensidades e o refinamento dos parâmetros celulares foram realizados utilizando o software APEXII. A observação do cristal após a recolha de dados não demonstrou sinais de 80 decomposição. Como mostrado na Fig. 2, há duas moléculas independentes de simetria na estrutura e ambas as moléculas de simetria independente são isómeros R.

Os dados foram recolhidos, refinados e reduzidos utilizando o software Apex II. A estrutura foi resolvida utilizando o programa SHELXS97 (Sheldrick, 1990); e a estrutura refinada utilizando o programa SHELXL97 (Sheldrick, 1997). O cristal mostra célula monoclínica com grupo espacial P2i. Os parâmetros de rede são: a = 9,9016(2) Ã, b = 10,9184(2) Ã, c = 19, 2975(4) Â, β = 102,826(1)°. Volume = 2034, 19(7) À3.

Exemplo 2.j

Preparação do sal de ácido metanossulfónico l-etil-3-[6-fluoro-5-[2-(1-hidroxi-l-metil-etil)pirimidin-5 — i1]-7-[(2R)-tetrahidrofuran-2-il]-lH-benzimidazol-2-iljureia (24)

Hl Hl

24 A uma suspensão em agitação de l-etil-3-[6-fluoro-5-[2-(1-hidroxi-l-metil-etil)pirimidin-5-il]-7-[(2R)- 81

tetrahidrofuran-2-il]-lH-benzimidazol-2-il]ureia (23) (15,05 g, 35,13 mmol) em diclorometano (60 mL, J.T. Baker 931533) e etanol absoluto (15 mL, Pharmco-AAPER 111000200) foi adicionado ácido metanossulfónico (2,392 mL, 36,89 mmol, Sigma-Aldrich 471356). Agitou-se à temperatura ambiente até se observar uma solução límpida. Foi adicionado heptano (300 mL) lentamente ao longo de cerca de 1 hora e recolheu-se o precipitado sólido por filtração (através de um filtro de papel Whatman # 3 qualitativo no topo de um papel de microfibra de vidro Whatman GF/F). Secou-se sob pressão reduzida num forno de vácuo (desidratado com sulfato de cálcio e hidróxido de potássio) durante a noite a 40°C originando 24 como um sólido branco (13,46 g, 99+% de pureza por HPLC, 99+% ee). HPLC analítica quiral mostra um enantiómero com tempo de retenção de 8,6 min, eluindo com CH2C12 / MeOH / TEA (60 / 40 / 0,1) numa coluna CHIRALPAK® IC® 4,6 x 250 mm com caudal de 1 mL/min a 30 °C. Uma segunda colheita de produto sólido branco 24 (4,36 g, 98% de pureza por HPLC, 99+% ee) foi obtida a partir do filtrado. LCMS (coluna C18 eluindo com 10-90% de gradiente de CH3CN / água ao longo de 5 minutos com modificador de ácido fórmico): M+l: 429,58 (2,03 min). XH RMN (300 MHz, MeOD) δ 9,00 (d , J = 1,6 Hz, 2H) , 7, 67 (d, J = 6, 1 Hz , 1H) , 5,39 (t, J = 7,7 Hz, 1H) , 4, 30 (dd, J = 14 , 9 , 6,9 Hz, 1H), 4 , 03 (dd, J = 14,8, 7,7 Hz, 1H) , 3 ,40 - 3, 31 (m, 2H) , 2,72 (s, 3H), 2,70 - 2, 60 (m, 1H) . , 2, ,21 - 2, 08 (m, 2H) , 1, 98 - 1,84 (m, 1H), 1,65 (s, 6H) , 1, 22 (t, J = 7, 2 Hz, 3H) ppm.

Claims (5)

1 REIVINDICAÇÕES 1. Um método para preparar um composto de fórmula (I) HN

HN

0) ou um sal farmaceuticamente aceitável respetivo, em que R é H ou F; e cada um de R3, R4, e R5 é independentemente um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido; compreendendo a provisão de um composto de fenilpirimidina de fórmula (II)

2 em que R é H ou F; e cada um de R3, e R5 é independentemente um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido; e fazer reagir o composto de fenilpirimidina de fórmula (II) com um derivado de ureia de fórmula A ou B: /R6 O s o

Na em que R6 é um alquilo opcionalmente substituído, um arilo opcionalmente substituído, um carbociclo saturado ou insaturado opcionalmente substituído, ou um heterociclo saturado ou insaturado opcionalmente substituído; para proporcionar um composto de fórmula (I) ; e reagir opcionalmente o composto de fórmula (I) com um ácido adequado para proporcionar um sal farmaceuticamente aceitável do composto de fórmula (I). 2. 0 método da reivindicação 1, em que R6 é metilo, etilo, benzilo, ou p-nitrobenzilo. 3. 0 método de qualquer uma das reivindicações 1 ou 2, em que a referida reação é realizada numa mistura de dioxano e um tampão de pH 3,5 de 75°C até 125°C, preferencialmente em refluxo. 3 4. 0 método de qualquer uma das reivindicações 1 a 3, em que a referida provisão de um composto de fenilpirimidina de fórmula (II) compreende proporcionar um derivado de feniltetrahidrofurano de fórmula (IV)

em que R é H ou F; e reagir o composto de feniltetrahidrofurano de fórmula (IV) com um derivado de ácido borónico de fórmula (III)

B* (III), em que cada um de R3, R4, e R5 é independentemente um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido, e B* é R,0 0R2 t sendo cada um de Ri e R2 independentemente alquilo ou H, ou ORi e 0R2 em conjunto com o átomo de B ao qual estão ligados formando um anel de 5-, 6- ou 7-membros opcionalmente substituído, ou BF3X, sendo X 4 qualquer catião monovalente, na presença de um catalisador de paládio num solvente polar para proporcionar um composto de fenilpirimidina de fórmula (V) ,

em que R é H ou F, e cada um de R3/ R4 e R5 é, independentemente, um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido; e tratar o composto de fenilpirimidina de fórmula (V) com um agente redutor adequado para se obter o composto de fórmula (II). 5. 0 método da reivindicação 4, em que B* é selecionado do grupo constituído por

em que cada um dos átomos de carbono do anel pode ou não ser substituído com um ou dois grupos metilo ou etilo, de preferência 5 Β

6. Ο método de qualquer uma das reivindicações 4 ou 5, em que a referida provisão de um composto de feniltetrahidrofurano de fórmula (IV) compreende proporcionar um composto de fórmula (VI) Br

em que R é H ou F; e a nitração do composto de fórmula (VI) com um agente de nitração adequado para se obter o composto de feniltetrahidrofurano de fórmula (IV). 7. 0 método de qualquer uma das reivindicações 4 ou 5, em que a referida provisão de um composto de feniltetrahidrofurano de fórmula (IV) compreende proporcionar um composto de fórmula (VI) Br

em que R é H ou F; (VI), 6 proteger o grupo amino do composto de fórmula (VI) com um grupo protetor de amino para se obter um composto amino-protegido; a nitração do composto amino-protegido com um agente de nitração adequado para se obter um composto nitro amino-protegido; e desproteger o composto nitro amino-protegido para se obter o composto feniltetrahidrofurano de fórmula (IV) . 8. 0 método de qualquer uma das reivindicações 1 a 3, em que a referida provisão de um composto de fenilpirimidina de fórmula (II) compreende adicionalmente a redução de um derivado de fenilpirimidina de fórmula (V)

em que R é H ou F, e cada um de R3/ R4 e R5 é, independentemente, um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido, com um agente redutor adequado para proporcionar o composto de fórmula (II). 9. 0 método da reivindicação 7, em que a referida nitração do composto de fórmula (VI) 7 compreende reagir o composto de fórmula (VI) com NH4NO3 na presença de um ácido forte a cerca de 20°C até cerca de 50°C para proporcionar um composto (IV).

10. O método da reivindicação 7, em que a referida provisão de um composto de fórmula (VI) compreende proporcionar um composto de fórmula (VII),

em que R é H ou F; e reagir o composto de fórmula (VII) com um agente de bromação num solvente polar aprótico para se obter o composto de fórmula (VI).

11. O método da reivindicação 10, em que o composto de fórmula (VII) é enriquecido enantiomericamente.

12. O método de qualquer uma das reivindicações 10 ou 11, em que a referida provisão de um composto de fórmula (VII) compreende: proporcionar um composto nitrobenzeno dihidrofuranilo selecionado a partir do grupo constituído por um composto de fórmula (VlIIa),

em que R é H ou F, e um composto de fórmula (VlIIb),

em que R é H ou F; e tratar o composto nitrobenzeno dihidrofuranilo com um agente de redução para se obter o composto de fórmula (VII). 13. 0 método da reivindicação 12, em que a referida provisão de um composto nitrobenzeno dihidrofuranilo compreende: proporcionar um composto de fórmula (IX),

em que R é H ou F; e tratar o composto de fórmula (IX) com 2,3-dihidrofurano na presença de um catalisador de paládio para se obter o composto nitrobenzeno dihidrofuranilo. Um composto de fórmula (II) 14 . 9 r3

(") (II) em que R é H ou F, e cada um de R3, R4 e R5 é, independentemente, um grupo alquilo opcionalmente substituído ou um grupo hidroxilo opcionalmente protegido.

15. Um composto de fórmula (V)

R3, R4 e R5 é, opcionalmente opcionalmente em que R é H ou F, e cada um de independentemente, um grupo alquilo substituído ou um grupo hidroxilo protegido.