PT2060265E - Inibidores peptídicos da via de transdução de sinal da jnk, permeáveis em células - Google Patents
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Description
DESCRIÇÃO "INIBIDORES PEPTÍDICOS DA VIA DE TRANSDUÇÃO DE SINAL DA JNK, PERMEÁVEIS EM CÉLULAS"
CAMPO DA INVENÇÃO
Esta invenção refere-se, de um modo geral, a inibidores de proteína cinases e, mais especificamente, a inibidores da proteína cinase, cinase do terminal amina de c-Jun.
ANTECEDENTES DA INVENÇÃO A cinase do terminal amina de c-Jun (JNK) é um membro do grupo activado pelo stress das proteína cinases activadas pelo mitogénio (MAP). Estas cinases têm sido associadas ao controlo do crescimento e à diferenciação celular e, de um modo mais geral, à resposta de células a estímulos ambientais. A via de transdução de sinal da JNK é activada em resposta a stress ambiental e pelo envolvimento de várias classes de receptores da superfície celular. Estes receptores podem incluir receptores de citocinas, receptores serpentina e receptores de tirosina cinases. Em células de mamífero, a JNK foi associada a processos biológicos, tais como a transformação oncogénica e à mediação de respostas adaptativas a stress ambiental. A JNK tem sido, também, associada à modulação de respostas imunitárias, incluindo maturação e diferenciação de células imunitárias, 1 assim como efectivaçao da morte celular programada, em células identificadas para a destruição pelo sistema imunitário. 0 documento WO 98/44106 divulga a identificação e a caracterização de Islet-Brain I humano e de rato (IB 1), um activador transcricional que está envolvido no controlo dos genes GLUT2 e a insulina por interacção com os elementos reguladores em cis homólogos dos promotores de GLUT2 e a insulina. O ADNc de IB1 de rato codifica uma proteína com 714 aminoácidos e o ADNc IB1 humano uma proteína com 711 aminoácidos. É divulgada a utilização de polipéptidos, ácidos nucleicos, agonistas e antagonistas de IB1 no tratamento ou no diagnóstico de diabetes, doenças neurológicas, tais como demência e/ou parkinsonismo, inibição/promoção da apoptose e cancro. O documento WO 98/49188 descreve a proteína I de interacção com JNK (JIP-I), um inibidor da proteína JNKI e métodos de tratamento de um estado patológico ou de prevenção da ocorrência de um estado patológico num doente pela administração de uma quantidade terapeuticamente eficaz de polipéptidos, péptidos, miméticos de péptidos ou ácidos nucleicos JIP-I.
SUMÁRIO DA INVENÇÃO A presente invenção é parcialmente baseada na identificação de péptidos que são inibidores eficazes de proteínas JNK. Os péptidos, aqui designados como inibidores de péptidos JNK, reduzem os efeitos de proliferação celular da cinase do terminal amina de c-Jun (JNK), a jusante. 2
Consequentemente, a invenção inclui péptidos inibidores da JNK ("péptidos JNKI"), assim como péptidos quiméricos que incluem um péptido inibidor da JNK ligado a um péptido transportador, o qual pode ser utilizado para direccionar um péptido no qual esteja presente para uma localização celular pretendida. A sequência de transporte pode ser utilizada para direccionar o transporte do péptido através da membrana plasmática. Alternativamente ou adicionalmente, o péptido transportador pode ser utilizado para direccionar o péptido para uma localização intracelular pretendida, tal como o núcleo.
Os péptidos inibidores da JNK podem estar presentes como como polímeros de D-aminoácidos. A invenção proporciona ainda péptidos para utilização num método para prevenir ou tratar morte neuronal ou lesões cerebrais num indivíduo. 0 método inclui a administração ao indivíduo de um péptido bioactivo permeável em células que previna danos aos neurónios ou a apoptose neuronal. Um péptido bioactivo permeável em células é, por exemplo, um péptido inibidor de JNK ("JNKI"). De um modo preferido, o péptido bioactivo permeável em células é SEQ ID N°: 3, 4, 6, ou 22. A morte neuronal ou as lesões cerebrais são causadas por isquemia cerebral. Assim, num aspecto, o péptido é administrado antes do indivíduo sofrer um evento isquémico. Num outro aspecto, o péptido é administrado após o indivíduo sofrer um evento isquémico. 0 evento isquémico é, e. g., crónico ou agudo. A morte neuronal ou as lesões cerebrais são causadas por outros mecanismos excitotóxicos. Deste modo, num aspecto, o péptido é administrado antes do indivíduo sofrer um mecanismo 3 excitotóxico. Num outro aspecto, o péptido é administrado após o indivíduo sofrer um mecanismo excitotóxico. 0 mecanismo excitotóxico pode ser, e. g., danos cerebrais hipóxicos/isquémicos, danos cerebrais traumáticos, morte neuronal resultante de episódios epilépticos e vários distúrbios neurodegenerativos, tal como a doença de Alzheimer.
Em alguns aspectos, a administração dos péptidos pode ocorrer por qualquer via de administração seleccionada de: intrauricular, intraperitoneal, nasal, intravenosa, oral e distribuição por emplastro.
De entre as vantagens proporcionadas pela invenção está o facto dos péptidos inibidores da JNK serem pequenos e poderem ser produzidos facilmente, em grandes quantidades e com pureza elevada. Os péptidos inibidores são, também, resistentes à degradação intracelular e são fracamente imunogénicos. Consequentemente, os péptidos estão bem adequados para aplicações in vitro e in vivo, em que é pretendida a inibição da expressão da JNK. A menos que definido de outra forma, todos os termos técnicos e científicos utilizados aqui têm o mesmo significado que o normalmente entendido por um especialista na técnica à qual esta invenção pertence. Embora na realização ou no teste da presente invenção possam ser utilizados métodos e materiais semelhantes ou equivalentes aos aqui descritos, são descritos abaixo métodos e materiais adequados. Além disso, os materiais, métodos e exemplos são apenas ilustrativos e não pretendem ser limitativos. 4
Outras características e vantagens da invenção serão evidentes a partir da descrição detalhada e das reivindicações seguintes.
BREVE DESCRIÇÃO DOS DESENHOS
As FIG. 1A-C são diagramas mostrando alinhamentos das regiões conservadas do domínio JBD nos factores de transcrição indicados. A FIG. 2 é um diagrama mostrando alinhamentos dos péptidos de fusão TAT-IB genéricos. A FIG. 3 é um histograma representando a inibição da morte de células β pelo domínio JBD mínimo do IB1, com 23 aminoácidos de comprimento, em comparação com o domínio JBD completo, com 280 aminoácidos. A FIG. 4 é uma ilustração mostrando os efeitos dos péptidos TAT, TAT-IB1 e TAT-IB2 sobre a fosforilação de JNK recombinantes. 0 painel A mostra a inibição da fosforilação de c-Jun, ATF2 e Elkl por JNK recombinantes, in vitro. O painel B mostra experiências de resposta à dose, semelhantes às do painel A. A FIG. 5 é um histograma representando a inibição da fosforilação de L-TAT-IB por JNK recombinantes. O painel A mostra a inibição da fosforilação de c-Jun, ATF2 e Elkl por JNK recombinantes, por L-TAT-IB, in vitro, na presença de MKK4. O painel B mostra experiências de resposta à dose semelhantes, com MKK7. 5 A FIG. 6 é uma ilustração mostrando a inibição da fosforilação de c-Jun por JNK activadas. A FIG. 7 é um histograma representando a inibição a curto prazo da morte de células β pancreáticas, induzida pela IL-Ιβ, pelos péptidos I-TAT-IB. A FIG. 8 é um histograma representando inibição a curto prazo da morte de células β pancreáticas, induzida pela IL-Ιβ, pelos péptidos D-TAT-IB. A FIG. 9 é um histograma representando inibição a longo prazo da morte de células β pancreáticas, induzida pela IL-Ιβ, pelos péptidos L-TAT-IB1 e D-TAT-IB1. A Fig. 10 é um histograma representando a inibição da morte de células WiDr do cancro do cólon humano, induzida por irradiação, pelos péptidos L-TAT-IB1 e D-TAT-IB1. A Fig. 11 é uma ilustração mostrando a modulação da actividade da cinase JMK pelos péptidos L-TAT, TAT-IB1 e D-TAT-IB1. A Fig. 12 são gráficos representando os efeitos protectores dos péptidos TAT-IB1 em murganhos. O painel A mostra o efeito da irradiação sobre o peso. O painel B mostra o efeito da irradiação sobre os estados de edema e eritema. A Fig. 13 é uma figura representando o efeito protector de D-JNK1 na perda de audição induzida por ruido. O painel A mostra uma representação esquemática da experiência, o painel B mostra 6 um gráfico da perda de audição, os painéis C e D representam, respectivamente, o exame histológico do ouvido contralateral (controlo) e injectado com D-JNK1.
As FIG. 14 A e B são figuras representando o efeito protector de D-JNK1 na perda de audição induzida por antibiótico. A Fig. 15 é um gráfico de barras representando a recuperação aumentada de ilhéus pancreáticos submetidos ao tratamento com D-JNK1 durante o processo de isolamento. A FIG. 16A é uma ilustração mostrando a sensibilidade e a especificidade dos péptidos inibidores da JNK (JNKI) da presente invenção contra a activação e a acção da JNK. A FIG. 16A mostra o efeito inibidor de L-JNKI1 e D-JNKI1 sobre a activação e acção da JNK em ensaios de cinase com, respectivamente, JNKlal recombinante e GST-Jun e substratos GST-Elkl. A FIG. 16B é uma ilustração mostrando a sensibilidade e especificidade dos péptidos inibidores da JNK (JNKI) da presente invenção contra a activação e acção da JNK. A FIG. 16B mostra o efeito inibidor da sequência mínima de JIP-IB1, inibidora da JNK, com 20 aminoácidos (forma L de JBD20) em experiências de resposta à dose, utilizando condições semelhantes às da FIG. 16A e com quantidades decrescentes de L-JBD20· A FIG. 16C é uma ilustração mostrando a sensibilidade e especificidade dos péptidos inibidores da JNK (JNKI) da presente invenção contra a activação e acção da JNK. A FIG. 16C mostra a especificidade dos péptidos JNKI da presente invenção no 7 bloqueio de activação da JNK, utilizando ensaios de cinase com diferentes cinases recombinantes. A Fig. 17A é uma ilustração mostrando a activação da JNK induzida por N-metil-D-aspartato ("NMDA"), em neurónios não tratados (0) e em neurónios expostos a 100 μΜ de NMDA, durante 10 minutos (10') ou durante 30 minutos (30')- A Fig. 17B é uma ilustração que mostra os efeitos dos péptidos JNKI da presente invenção sobre o nível da fosforilação de c-Jun e a quantidade da JNK após exposição a NMDA. Na FIG. 17B, foi aplicada 4 vezes mais proteína nos extractos nucleares (Nucl), do que nos citoplasmáticos (Cyt) e as abreviaturas utilizadas são: C: Controlo; N: NMDA; L: L-JNI1 + NMDA; D: D-JNKI1 + NMDA. A Fig. 17C é um histograma que representa a quantificação da expressão de c-fos por PCR em tempo real, utilizando ARN extraído. A FIG. 17C ilustra a expressão de c-fos em relação à actina. A Fig. 18 são ilustrações e um histograma representando a evolução ao longo do tempo da neurotoxicidade de NMDA e da neuroprotecção por L-JNKI1, D-JNKI1 e dois péptidos de controlo, TAT-vazia (apenas a sequência TAT, sem JBD2o) e L-JNKIl-mut (em que 6 aminoácidos foram transformados em alanina).
As FIG. 18A-18E são uma série de micrografias representando neurónios corados com Hoechst, às 24 horas após o tratamento com NMDA. A FIG. 18F é um histograma representando a morte neuronal às 12 h, 24 h e 48 h após a exposição a NMDA (100 μΜ de NMDA) , como indicado pela actividade de LDH. A Fig. 19 são ilustrações e um histograma representando a isguemia transiente em murganhos. A Fig. 19A mostra o efeito sobre o volume do enfarte de um pré-tratamento, no qual foi administrada uma injecção intracerebroventricular (icv) de D-JNKI1 (15,7 ng em 2 pL de solução de tampão de fosfato (PBS)), a um indivíduo, 1 hora antes da oclusão. A FIG. 19B mostra o efeito sobre o volume do enfarte, quando a injecção icv de D-JKNI1 foi administrada 1 hora antes da oclusão ou 3 horas, 6 horas e 12 horas após a oclusão. A FIG. 20 são ilustrações e um histograma mostrando a protecção por D-JNKI1 contra isquemia focal permanente em ratos jovens (P14) que tinham sido perfundidos 24 horas após a oclusão. A FIG. 20A é uma série de ilustrações que representam exemplos de lesões de um rato de controlo (painel esquerdo) e de um rato tratado com D-JNEI1, 6 horas após a oclusão (painel direito). A FIG. 20B é um histograma representando os volumes de enfarte, expressos como % do volume hemisférico, após a injecção intraperitoneal (i. p.) de D-JNKI1 a -0,5 h antes ou +6 h ou +12 h após a oclusão. 9 A FIG. 20C é uma série de ilustrações representando os resultados de imuno-histoquímica para P-c-Jun, em que c-Jun estava fosforilado em muitos neurónios no córtex peri-enfarte.
DESCRIÇÃO DETALHADA DA INVENÇÃO A presente invenção é baseada, em parte, na identificação de péptidos permeáveis em células que inibem a via sinalizadora activada da cinase do terminal amina de c-Jun (JNK). Estes péptidos são aqui designados como péptidos inibidores da JNK. Adicionalmente, a identificação proporciona métodos e composições farmacêuticas para o tratamento de patofisiologias associadas a sinalização com JNK.
Foram identificados péptidos inibidores da JNK pela inspecção de alinhamentos de sequências entre os Domínios de Ligação a kJNK em várias proteínas de ligação à insulina (IB). Os resultados deste alinhamento são mostrados nas FIG. 1A-1C. A FIG. IA representa a região com homologia mais elevada entre as JBD de IB1, IB2, c-Jun e ATF2. 0 painel B representa o alinhamento da sequência de aminoácidos de JBD de IB1 e IB2. Os resíduos totalmente conservados são indicados por asteriscos, enquanto que os resíduos modificados para Ala no vector GFP-JBD23Mut são indicados por círculos não preenchidos. A FIG. 1C mostra as sequências de aminoácidos de proteínas quiméricas que incluem um domínio peptídico inibidor de JNK e um domínio de transporte. No exemplo mostrado, o domínio de transporte é derivado do polipéptido TAT do vírus da imunodeficiência humana (HIV) e o péptido inibidor da JNK é derivado de um polipéptido IB1. As sequências humana, de murganho e rato, nos Painéis B e C, são idênticas. 10 A comparação entre as sequências dos domínios de ligaçao a JNK de IB1 [SEQ ID N° : 17], IB2 [SEQ ID N° : 18], c-Jun [SEQ ID N° : 19] e ATF2 [SEQ ID N° : 20] revelou uma sequência de 8 aminoácidos parcialmente conservada (FIG. IA) . Uma comparação entre os JBD de IB1 e IB2 revelou, adicionalmente, dois blocos de sete e três aminoácidos que são altamente conservados entre as duas sequências. Estes dois blocos estão contidos dentro de uma sequência peptídica de 23 aminoácidos em IB1 [SEQ ID N° : 1] e de 21 aminoácidos em IB2 [SEQ ID N°: 2]. Na FIG. 1C é mostrada a sequência mínima de JIP-IB1, inibidora da JNK, com 20 aminoácidos (forma L de JBD20 (SEQ ID N°: 21)).
Os péptidos inibidores da JNK da invenção podem ser utilizados em qualuqer situação em que seja pretendida a inibição da actividade de JNK. Isto pode incluir aplicações in vitro, ex vivo e aplicações in vivo. Dado que a JNK e todas as suas isoformas participam no desenvolvimento e no estabelecimento de estados patológicos ou em vias, os péptidos JNK podem ser utilizados para prevenir ou inibir a ocorrência desses estados patológicos. Isto inclui a prevenção e o tratamento de doenças e a prevenção e o tratamento de patologias secundárias às acções terapêuticas. Por exemplo, os péptidos da presente invenção podem ser utilizados para tratar ou prevenir, e. g. , diabetes, radiação ionizante, respostas imunitárias (incluindo doenças autoimunitárias), lesões de isquemia/reperfusão, hipertrofias cardíacas e cardiovasculares e alguns cancros (e. g., transformação Bcr-Abl) .
Os péptidos podem também ser utilizados para inibir a expressão de genes cuja a expressão aumenta na presença de um polipéptido JNK ativo. Estes genes e produtos génicos incluem, 11 e. g., citocinas pró-inflamatórias. Essas citocinas são encontradas em todas as formas de doenças inflamatórias, auto-inflamatórias, imunitárias e autoimunitárias, doenças degenerativas, miopatias, cardiomiopatias e rejeição de enxertos.
Os péptidos inibidores da JNK aqui descritos podem ser também utilizados para tratar ou prevenir os efeitos associados com o stress de tensão de corte celular, como nos estados patológicos induzidos pelo hipertensão arterial, incluindo hipertrofia cardíaca e lesões arterioscleróticas e em ramificações de vasos sanguíneos e semelhantes; radiação ionizante, como utilizada em radioterapia e luz UV; radicais livres; agentes lesivos para o ADN, incluindo fármacoss quimioterapêuticos; transformação oncogénica; danos nas células pancreáticas e neuronais, perda de audição, isquemia e reperfusão; hipóxia; e hipo- e hipertermia.
Os péptidos inibidores da JNK, aqui divulgados, são apresentados na Tabela 1. A tabela apresenta o nome do péptido inibidor da JNK, assim como o seu número identificador da sequência, comprimento e sequência de aminoácido. TABELA 1
NOME DO PÉPTIDO SEQ ID AA Sequência L-IB1 1 23 DTYRPKRPTT LNLFPQVPRS QDT L-IB2 2 21 EEPHKHRPTT LRLTTLGAQD S D-IB1 3 23 TDQSRPVQPF LNLTTPRKPR YTD 12 (continuação)
NOME DO PÉPTIDO SEQ ID AA Sequência D-IB2 4 21 SDQAGLTTLR LTTPRHKHPE E L-IB (genérico) 5 19 XRPTTLXLXX XXXXXQDS/TX D-IB (genérico) 6 19 XS/TDQXXXXXX XLXLTTPRX L-TAT 7 10 GRKKRRQRRR D-TAT 8 10 RRRQRRKKRG L-genérico-TAT 9 17 XXXXRKKRRQ RRRXXXX D-genérico-TAT 10 17 XXXXRRRQRR KKRXXXX L-TAT-IB1 11 35 GRKKRRQRRR PPDTYRPKRP TTLNLFPQVP RSQDT L-TAT-IB2 12 33 GRKKRRQRRR PPEEPHKHRP TTLRLTTLGA QDS L-TAT-IB (genérico) 13 42 XXXXXXXRKK RRQRRRXXXX XXXXRPTTLX LXXXXXXXQD S/TX D-TAT-IB1 14 35 TDQSRPVQPF LNLTTPRKPR YTDPPRRRQR RKKRG D-TAT-IB2 15 33 SDQAGLTTLR LTTPRHKHPE EPPRRRQRRK KRG D-TAT-IB (genérico) 16 42 XT/SDQXXXXXX XLXLTTPRXX XXXXXXRRRQ RRKKRXXXXX XX EBl-longo 17 29 PGTGCGDTYR PKRPTTLNLF PQVPRSQDT IB2-longo 18 27 IPSPSVEEPH KHRPTTLRLT TLGAQDS c-Jun 19 29 GAYGYSNPK! LKQSMTLNLA DPVGNLKPH ATF2 20 29 TNEDHLAVHK HKHBMTLKFG PARNDSVIV L—JBD20 21 20 RPKRPTTLNL FPQVPRSQDT D—JBD2o 22 20 TDQSRPVQPF LNLTTPRKPR L-TAT-JNKI1 (i. e., L-TAT-JBD2o) 23 32 GRKKRRQRRR PPRPKRPTTL NLFPQVPRSQ DT D-TAT-JNKI1 24 32 TDQSRPVQPF LNLTTPRKPR PPRRRQR RKKRG 13 (continuação)
NOME DO PÉPTIDO SEQ ID AA Sequência (í. e., D-TAT-JBD20) L-TAT-JNKI1 (genérico) 25 34 XXXXRKKRRQ RRRXXXXRPT TLXLXXXXXX XQDS/T D-TAT-JNKI1 (genérico) 26 34 S/TDQXXXXXXX LXLTTPRXXX XRRRQRRKKR XXXX L-JBD20-mut 27 20 RPKRPTAANA FPQVPRSQDT D-JBD20-mut 28 20 TDQSRPVAPFANAATPRKPR
PEPTIDOS INIBIDORES DA JNK
Num aspecto, a invenção utiliza péptidos inibidores da JNK No termo "péptido" não está implícito qualquer comprimento em particular. Em alqumas formas de realização, o péptido inibidor da JNK tem menos de 280 aminoácidos de comprimento, e. g., menos ou igual a 150, 100, 75, 50, 35 ou 25 aminoácidos de comprimento. Em várias formas de realização, o péptido inibidor da ligação à JNK inclui a sequência de aminoácidos de uma ou mais das SEQ ID N°: 3, 4, 6 e 22. Numa forma de realização, os péptido péptidos inibidores da JNK ligam-se à JNK. Numa outra forma de realização os péptidos inibem a activação de, pelo menos, um factor de transcrição activado da JNK, e. g. c-Jun, ATF2 ou Elkl.
Os péptidos inibidores da JNK podem ser polímeros de D-aminoácidos. Por exemplo, em várias formas de realização os péptidos são péptidos D retro-inversos. A expressão "isómero 14 retro-inverso" refere-se a um isómero de um péptido linear, no qual a direcção da sequência é invertida, a expressão "isómero D-retro-inverso" refere-se a um isómero de um péptido linear no qual a direcção da sequência é invertida e a quiralidade de cada resíduo de aminoácido é invertida. Ver, e. g.r Jameson et ai., Nature, 368, 744-746 (1994); Brady et al. , Nature, 368, 692-693 (1994). 0 resultado final da combinação de D-enantiómeros e da síntese inversa consiste nas posições dos qrupos carbonilo e amina em cada liqação amida serem permutadas, enquanto que a posição dos qrupos da cadeia lateral em cada carbono alfa é preservada. A menos que indicado, especificamente, de outra forma, é presumido que qualquer sequência determinada de L-aminoácidos da invenção pode ser transformada num péptido D retro-inverso, pela síntese de um reverso da sequência, para a sequência de L-aminoácidos nativa, correspondente.
Por exemplo, um péptido D retro-inverso tem a sequência NH2-TDQSRPVQPFLNLTTPRKPRYTD-cooh [SEQ ID N°: 3] ou NH2-SDQAGLTILRLTTPRHKHPEE-cooh [SEQ ID N° : 4]. Alternativamente, um péptido D retro-inverso inclui a sequência Nh2-TDQSRPVQPFLNLTTPRKPR-cooh [SEQ ID N° : 22]. Foi, inesperadamente, verificado que os péptidos D-retro-inversos têm várias propriedades úteis. Por exemplo, os péptidos D-TAT e D-TAT-IB e D-TAT-JNKI entram nas células tão eficientemente quanto os péptidos L-TAT e L-TAT-IB e D-TAT-JNKI e os péptidos D-TAT e D-TAT-IB e D-TAT-JNKI são mais estáveis do que os L-péptidos correspondentes. Além disso, embora os D-TAT-IB1 sejam -10-20 vezes menos eficiente na inibição da JNK do que L-TAT-IB e L-TAT-JNKI, estes são -50 vezes mais estáveis in vivo. Além disso, os péptidos JNKI D-retro-inversos são resistentes a proteases. Finalmente, como é adicionalmente discutido abaixo, os péptidos D-TAT-IB e D-TAT-JNKI protegem da 15 apoptose as células tratadas com interleucina 1 e submetidas a radiação ionizante e estes péptidos são úteis no tratamento de neurónios, uma vez que a sequência TAT contém seis pares de aminoácidos que tornam a sequência TAT extremamente sensível às proteases neuronais que estão envolvidas no processamento de péptidos no sistema nervoso. Ver e. g.r Steiner et al., J. Biol. Chem. 267:23435 23438 (1992); Bruqidou et al. Biochem. &
Biophys. Res. Comm. 214:685-693 (1995).
Um péptido inibidor da JNK inclui a sequência de aminoácidos NH2-Xn-RPTTLXLXXXXXXXQDS/T-Xn-CooH [SEQ ID N° : 5 e os resíduos 17-42 de L -TAT-IB, SEQ ID N°: 13, como mostrado na FIG. 2]. Como aqui utilizado , Xn pode ter zero resíduos de comprimento ou pode ser uma porção contígua de resíduos de péptido derivados das SEQ ID N°: 1 e 21, de um modo preferido, uma porção com entre 1 a 7 aminoácidos de comprimento ou ter 10, 20, 30 ou mais aminoácidos de comprimento. O resíduo único
representado por S/T pode ser Ser ou Thr na sequência genérica. Numa forma de realização adicional, um péptido inibidor da JNK da invenção pode ser um péptido D retro-inverso, tendo a sequência NH2-Xn-S/TDQXXXXXXXLXLTTPR-Xn-C00H [SEQ ID N°: 6] e OS resíduos 17-42 de L-TAT-IB, SEQ ID N°: 16, como mostrado na FIG. 2] .
Os péptidos inibidores da JNK são obtidos ou produzidos por métodos bem conhecidos na técnica, e. g.f síntese química, métodos de engenharia genética, como discutidos abaixo. Por exemplo, pode ser sintetizado um péptido correspondente a uma porção de um péptido inibidor da JNK, incluindo uma região ou domínio pretendido ou que medeia a actividade pretendida in vitro, pela utilização de um sintetizador de péptidos. 16
Um péptido inibidor da JNK candidato é analisado por análise da hidrof1licidade (ver, e. g.r Hopp e Woods, 1981. Proc Natl Acad Sei USA 78: 3824-3828) que pode ser utilizada para identificar as regiões hidrofóbicas e hidrofilicas dos péptidos, auxiliando, deste modo, na concepção de substratos de manipulação experimental, tais como em experiências de ligação, síntese de anticorpos. Pode ser, também, realizada análise estrutural secundária, para identificar regiões de um péptido inibidor da JNK que assumem motivos estruturais específicos. Ver e. g. , Chou e Fasman, 1974. Biochem 13: 222-223. A manipulação, a tradução, a previsão da estrutura secundária, os perfis hidrofilicidade e hidrofobicidade, a previsão e o delineamento da grelha de leitura aberta e a determinação das homologias de sequência podem ser realizados, utilizando programas informáticos para computador, disponíveis na técnica. Podem ser, também, utilizados outros métodos de análise estrutural, incluindo, e. g., cristalografia de raios X (Ver, e. g. Engstrom, 1974. Biochem Exp Biol 11: 7-13); espectroscopia de massa e cromatografia gasosa (ver. e. g., METHODS IN PROTEIN SCIENCE, 1997. J. Wiley and Sons, Nova Iorque, NI) e modelação computacional (Ver, e. g., Fletterick e Zoller, eds., 1986 . Computer Graphics and Molecular Modeling, Em: CURRENT COMMUNICATIONS IN MOLECULAR BIOLOGY, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbour, NI). São também incluídos na invenção derivados, fragmentos, homólogos, análogos e variantes de péptidos inibidores da JNK.
Os derivados ou os análogos dos péptidos inibidores da JNK incluem moléculas incluindo regiões que são substancialmente homólogas aos péptidos, em várias formas de realização, com, pelo menos, 95%, 98% ou, mesmo, 99% de identidade com uma 17 sequência de aminoácidos de tamanho idêntico ou quando em comparação com uma sequência alinhada, em que o alinhamento é realizado por um programa informático de homologia, conhecido na técnica. Por exemplo, a identidade de sequência pode ser medida, utilizando software de análise de sequências (Sequence Analysis Software Package of the Genetics Computer Group, University of Wisconsin Biotechnology Center. 1710 University Avenue, Madison, Wis. 53705), com os seus parâmetros por omissão.
No caso de sequências polipeptidicas, as quais sejam menos de 100% idênticas a uma sequência de referência, as posições não-idênticas são, de um modo preferido, mas não necessariamente, substituições conservadoras da sequência de referência. As substituições conservadoras incluem, tipicamente, substituições dentro dos grupos seguintes: glicina e alanina; valina, isoleucina e leucina; ácido aspártico e ácido glutâmico; asparagina e glutamina; serina e treonina; lisina e arginina; e fenilalanina e tirosina. Deste modo, são incluídos na invenção péptidos tendo sequências mutadas, de forma a que estas permaneçam homólogas, e. g., em termos de sequência, de função e de carácter antigénico ou de outra função, com uma proteína tendo a sequência parental correspondente. Essas mutações podem ser, por exemplo, mutações envolvendo alterações de aminoácido conservadoras, e. g., alterações entre aminoácidos com propriedades moleculares, de um modo geral, semelhantes. Por exemplo, as permutas dentro do grupo alifático alanina, valina, leucina e isoleucina podem ser consideradas como conservadoras. Por vezes, a substituição da glicina por um destes pode ser, também, considerada conservadora. Outras permutas conservadoras incluem as dentro do grupo alifático do aspartato e glutamato; dentro do grupo amida da asparagina e glutamina; dentro do grupo hidroxilo da serina e treonina; dentro do grupo aromático da 18 fenilalanina, tirosina e triptofano; dentro do grupo básico da lisina, arginina e histidina; e dentro do grupo contendo enxofre metionina e cisteína. Por vezes, a substituição dentro do grupo da metionina e da leucina pode ser, também, considerada como conservadora. Os grupos de substituição conservados preferidos são aspartato-glutamato; asparagina-glutamina; valina-leucina-isoleucina; alanina-valina; fenilalanina-tirosina; e lisina-arginina.
Quando é referido que um polipéptido em particular tem uma identidade percentual específica em relação a um polipéptido de referência com um comprimento definido, a identidade percentual é relativa ao péptido de referência. Deste modo, um péptido que é 50% idêntico a um polipéptido de referência que tem 100 aminoácidos de comprimento, pode ser um polipéptido com 50 aminoácidos, que é completamente idêntico a uma porção com um comprimento de 50 aminoácidos do polipéptido de referência. Este poderá ser, também, um polipéptido com 100 aminoácidos de comprimento, o qual é 50% idêntico ao polipéptido de referência ao longo da totalidade do seu comprimento. Obviamente, outros polipéptidos irão estar de acordo com os mesmos critérios. São também proporcionados pela presente invenção, homólogos de espécie dos péptidos divulgados. ''Variante" refere-se a um polipéptido que difere do polipéptido da presente invenção, mas que conserva as suas propriedades essenciais. De um modo geral, as variantes são, na sua globalidade, muito semelhantes e, em muitas regiões, idênticas ao polipéptido da presente invenção.
Em algumas formas de realização, as sequências alteradas incluem inserções de forma a que a sequência de aminoácidos global seja alongada, enquanto a proteína conserva as 19 as sequências propriedades de transporte. Adicionalmente, alteradas podem incluir eliminações internas aleatórias ou planeadas que encurtam a sequência de aminoácidos global, enquanto que a proteína conserva as propriedades de transporte. Péptidos Quiméricos Incluindo um Domínio Inibidor da JNK e um Domínio de Transporte
Num outro aspecto, a invenção utiliza um péptido quimérico que inclui um primeiro e segundo domínio. 0 primeiro domínio inclui uma sequência de transporte, enquanto que o segundo domínio inclui uma sequência inibidora da JNK, ligada por uma ligação covalente, e. g., uma ligação peptídica, ao primeiro domínio. Os primeiro e segundo domínios podem ocorrer em qualquer ordem no péptido e o péptido pode incluir um ou mais de cada domínio.
Uma sequência de transporte é qualquer sequência de aminoácidos que direcciona um péptido no qual está presente para um destino celular pretendido. Deste modo, a sequência de transporte pode direccionar o péptido através da membrana plasmática, e. g., desde o exterior da célula, através da membrana plasmática e para o interior do citoplasma. Alternativamente ou adicionalmente, a sequência de transporte pode direccionar o péptido para uma localização pretendida dentro da célula, e. g. , núcleo, ribossoma, ER, lisossoma ou peroxissoma.
Em algumas formas de realização, o péptido transportador é derivado de uma sequência de translocação membranar conhecida. Por exemplo, o péptido transportador pode incluir sequências da 20 a proteína TAT do vírus da imunodeficiência humana (HIV) 1. Esta proteína é descrita, e. g., nas Patentes US N° 5804604 e 5674980. O péptido inibidor da JNK está ligado a alguns ou a todos aminoácidos da totalidade dos 86 aminoácidos que constituem a proteína TAT. Por exemplo, pode ser utilizado um fragmento ou uma porção funcionalmente eficaz de uma proteína TAT que tem menos de 86 aminoácidos, a qual apresenta incorporação em células e a qual, opcionalmente, se incorpora no núcleo de célula. Ver e. g., Vives et al., J. Biol . Chem., 272 (25):16010 -17 (1997). Numa forma de realização, o fragmento inclui um péptido contendo os resíduos 48-57 da TAT, e. g. NH2-GRKKRRQRRR-Cooh [SEQ ID N° : 7] ou uma sequência TAT genérica NH2-Xn-RKKRRQRRR-Xn-C00H [SEQ ID N° : 9]. Pode ser definido adicionalmente um péptido TAT, que inclui a região que medeia a entrada e a incorporação nas células, utilizando técnicas conhecidas. Ver, e. g., Franked et al., Proc. Natl. Acad. Sei, USA 86: 7397-7401 (1989). A sequência TAT pode ser ligada à extremidade do terminal N ou ao terminal C da sequência inibidora da JNK. Pode ser adicionada uma charneira de dois resíduos de prolina entre TAT e péptido inibidor da JNK, para criar o péptido de fusão completo. Por exemplo, os péptidos de fusão D retro-inversos podem ser o péptido D-TAT-IBl [SEQ ID N°: 14], o péptido D-TAT-IB2 [SEQ ID N° : 15] ou péptido D-TAT-IB genérico [SEQ ID N° : 16] .
Alternativamente, os péptidos de fusão D retro-inversos podem ser o péptido D-TAT-JNKI [SEQ ID N° : 22] ou péptido D-TAT-JNKI genérico [SEQ ID N°: 26] . O péptido TAT pode ser um péptido D retro-inverso tendo a sequência NH2-Xn-RRRQRRKKR-Xn-CooH [SEQ ID N° : 10]. Nas SEQ ID N° : 5-6, 9-10, 13, 16 e 25-26, o número "X" de resíduos não está limitado ao representado e pode 21 igualar qualquer número de resíduos de aminoácido, incluindo o zero e podem variar, como descrito acima. A sequência de transporte pode ser uma única (i. e., contínua) sequência de aminoácidos, presente na sequência TAT. Alternativamente, esta pode ser duas ou mais sequências de aminoácidos, as quais estão presentes na proteína TAT, mas que na proteína de ocorrência natural estão separadas por outras sequências de aminoácidos. Como aqui utilizado, proteína TAT inclui uma sequência de aminoácidos de ocorrência natural que é a mesma que a da proteína TAT de ocorrência natural ou sua proteína funcional equivalente ou os seus fragmentos funcionalmente equivalentes (péptidos). Essas proteínas equivalentes funcionais ou fragmentos funcionalmente equivalentes possuem actividade de incorporação na célula e no núcleo celular, que é substancialmente semelhante à da proteína TAT de ocorrência natural. A proteína TAT pode ser obtida a partir de fontes de ocorrência natural ou ser produzida, utilizando técnicas de engenharia genética ou síntese química. A sequência de aminoácidos da da proteína TAT de HIV de ocorrência natural pode ser modificada, por exemplo, por adição, eliminação e/ou substituição de, pelo menos, um aminoácido presente na proteína TAT de ocorrência natural, para produzir a proteína TAT modificada (aqui também designada como proteína TAT). Pode ser produzida proteína TAT ou análogos de péptidos TAT modificados, com estabilidade aumentada ou reduzida, utilizando técnicas conhecidas. Em algumas formas de realização, as proteínas ou os péptidos TAT incluem sequências de aminoácidos que são substancialmente semelhantes, embora não idênticas, às das proteínas TAT de ocorrência natural ou às suas porções. Além disso, podem ser adicionados colesterol ou outros 22 derivados lipídicos à proteína TAT, para produzir uma TAT modificada, tendo solubilidade membranar aumentada.
As variantes da proteína TAT podem ser concebidas para modular a localização intracelular do péptido TAT-inibidor da JNK. Quando adicionadas exogenamente, essas variantes são normalmente concebidas de forma a que seja conservada a capacidade da TAT para entrar nas células (i. e., que a incorporação da proteína TAT ou do péptido variante na célula seja, substancialmente, semelhante à da TAT do HIV de ocorrência natural). Por exemplo, a alteração da região básica que se considera importante para a localização nuclear (ver, e. g., Dang e Lee, J. Biol. Chem. 264:18019-18023 (1989); Hauber et al., J. Virol. 63:1181-1187 (1989); Ruben et ai., J. Virol. 63:1-8 (1989)) pode resultar numa localização citoplasmática ou numa localização parcialmente citoplasmática da TAT e, consequentemente, do péptido inibidor da JNK. Alternativamente, pode ser introduzida na TAT uma sequência para a ligação a um componente ou compartimento citoplasmático ou qualquer outro (e. g., retículo endoplasmático, mitocôndria, aparelho de Golgi, vesículas lisossómicas), para manter a TAT e o péptido inibidor da JNK no citoplasma ou em qualquer outro compartimento, para conferir regulação após a incorporação da TAT e do péptido inibidor da JNK.
Outras fontes de péptidos transportadores incluem, e. g., VP22 (descrita, e. g., no documento WO 97/05265; Elliott e 0'Hare, Cell 88: 223-233 (1997)) ou proteínas não-virais (Jackson et al., Proc. Natl. Acad. Sei. USA 89: 10691-10695 (1992) ) . 23 A sequência inibidora da JNK e a sequência de transporte podem ser ligadas por ligação química, de qualquer forma adequada, conhecida na técnica. Muitos métodos de reticulação química conhecidos são não-específicos, i. e.; estes não direccionam o ponto da ligação para qualquer local em particular no polipéptido de transporte ou macromolécula de carregamento. Consequentemente, a utilização de agentes de reticulação não-específicos pode atacar locais funcionais ou bloquear estericamente locais activos, tornando as proteínas conjugadas biologicamente inactivas.
Uma forma de aumentar a especificidade de ligação consiste em realizar, directamente, uma ligação química a um grupo funcional que ocorra apenas uma vez ou poucas vezes num ou em ambos os polipéptidos a serem reticulados. Por exemplo, em muitas proteínas, a cisteína, a qual é o único aminoácido proteico contendo um grupo tiol, ocorre apenas algumas vezes. Também, por exemplo, se um polipéptido não contiver quaisquer resíduos lisina, um reagente de reticulação específico para aminas primárias será selectivo para o terminal amina desse polipéptido. A utilização com sucesso desta abordagem para aumentar especificidade de ligação requer que o polipéptido tenha, adequadamente, os resíduos raros e reactivos em áreas da molécula que possam ser alteradas sem perda da actividade biológica da molécula.
Os resíduos de cisteína podem ser substituídos, quando estes ocorrem em partes de uma sequência polipeptídica em que a sua participação numa reacção de reticulação iria, provavelmente, interferir de outra forma na actividade biológica. Quando um resíduo de cisteína é substituído, é, tipicamente, desejável minimizar as modificações resultantes no 24 enrolamento do polipéptido. As modificações no enrolamento do polipéptido são minimizadas, quando a substituição é quimica e estericamente semelhante à cisteína. Por estas razões, é preferida a serina como uma substituição da cisteína. Como demonstrado nos exemplos abaixo, pode ser introduzido um resíduo de cisteína na sequência de aminoácidos de um polipéptido, para finalidades de reticulação. Quando é introduzido um resíduo de cisteína, é preferida a introdução no terminal amina ou carboxilo ou na sua proximidade. Estão disponíveis métodos convencionais para essas modificações da sequência de aminoácidos, quer o polipéptido de interesse seja produzido por síntese química, quer por expressão de ADN recombinante A liqação dos dois constituintes pode ser realizada através de um agente de liqação ou de conjuqação. Existem vários reagentes de reticulação intermolecular que podem ser utilizados, ver, por exemplo, Means e Feeney, CHEMICAL MODIFICATION OF PROTEINS, Holden-Day, 1974, pp. 39-43. Entre estes reagentes estão, por exemplo, J-succinimidil 3-(2-piridilditio)propionato (SPDP) ou N,N'-bismaleimida (1,3-fenileno) (sendo, ambos, altamente específicos para grupos sulfidrilo e formam ligações irreversíveis); N,N'-etileno-bis-(iodoacetamida) ou outro desses reagentes tendo 6 para 11 pontes de carbono de metileno (as quais são, relativamente, específicas para grupos sulfidrilo); e 1,5-difluoro-2,4-dinitrobenzeno (o qual forma ligações irreversíveis com grupos amina e tirosina). Outros reagentes de reticulação úteis para esta finalidade incluem: ρ,p'-difluoro-m,m'-dinitrodifenilsulfona (a qual forma reticulações irreversíveis com grupos amina e fenólicos); dimetiladipimidato (o qual é específico para grupos amina); cloreto de fenol-1,4-dissulfonilo (o qual reage, principalmente, 25 com grupos amina); hexametilenodiisocianato ou diisotiocianato ou azofenil-p-diisocianato (o qual reage, principalmente, com grupos amina); glutaraldeído (o qual reage com várias cadeias laterais diferentes) e disdiazobenzidina (a qual reage, principalmente, com tirosina e histidina).
Os reagentes de reticulação podem ser homobifuncionais, i. e., tendo dois grupos funcionais que sofrem a mesma reacção. Um reagente de reticulação homobifuncional preferido é o bismaleimido-hexano ("BMH"). 0 BMH contém dois grupos funcionais maleimida, os quais reagem, especificamente, com compostos contendo sulfidrilo, sob condições suaves (pH 6,5-7,7). Os dois grupos maleimida são ligados por uma cadeia de hidrocarbonetos. Consequentemente, o BMH é útil para a reticulação irreversível de polipéptidos que contêm resíduos de cisteína.
Os reagentes de reticulação podem ser, também, heterobifuncionais. Os agentes de reticulação heterobifuncionais têm dois grupos funcionais diferentes, por exemplo, um grupo reactivo com amina e um grupo reactivo com tiol, que irão reticular duas proteínas tendo, respectivamente, aminas e tióis livres. São exemplos de agentes de reticulação heterobifuncionais, succinimidil 4-(N-maleimidometil)ciclo-hexano-l-carboxilolato ("SMCC"), éster m-maleimidobenzoi-N-hidroxisuccinimídico ("MBS") e butirato de succinimida 4-(p-maleimidofenilo) ("SMPB"), um análogo de cadeia extendida do MBS. 0 grupo succinimidilo destes agentes de reticulação reage com uma amina primária e a maleimida reactiva com tiol forma uma ligação covalente com o tiol de um resíduo cisteína.
Os reagentes de reticulação têm, frequentemente, uma baixa solubilidade em água. Pode ser adicionada uma parte hidrofílica, 26 tal como, um grupo sulfonato, ao reagente de reticulação, para melhorar a sua solubilidade em água. Sulfo-MBS e sulfo-SMCC são exemplos de reagentes de reticulação modificados para a solubilidade em água.
Muitos reagentes de reticulação produzem um conjugado que é, essencialmente, não-clivável, sob condições celulares. No entanto, alguns reagentes de reticulação contêm uma ligação covalente, tal como um persulf ureto, que é clivável sob condições celulares. Por exemplo, o reagente de Traut, ditiobis(succinimidilpropionato) ("DSP") e N-succinimidil 3-(2-piridilditio)propionato ("SPDP") são agentes de reticulação cliváveis, bem conhecidos. A utilização de um reagente de reticulação clivável permite à parte de carregamento separar-se do polipéptido de transporte, após a distribuição na célula alvo. A ligação persulfureto, directa, pode ser, também, útil.
Estão comercialmente disponíveis vários reagentes de reticulação, incluindo os discutidos acima. Estão facilmente disponíveis instruções detalhadas para a sua utilização, a partir dos fornecedores comerciais. Uma referência geral em reticulação de proteínas e preparação de conjugados é: Wong, CHEMISTRY OF PROTEIN CONJUGATION AND CROSS-LINKING, CRC Press (1991) . A reticulação química pode incluir a utilização de braços espaçadores. Os braços espaçadores proporcionam flexibilidade intramolecular ou ajustam as distâncias intramoleculares entre as partes conjugadas e, deste modo, podem auxiliar a conservar a actividade biológica. Um braço espaçador pode estar sob a forma de uma parte polipeptídica que inclui aminoácidos espaçadores, 27 e. g. prolina. Alternativamente, um braço espaçador pode ser parte do reagente de reticulação, tal como em "SPDP de cadeia longa" (Pierce Chem. Co., Rockford, IL, N° de cat. 21651 H).
MÉTODOS DE TRATAMENTO OU PREVENÇÃO DE DISTÚRBIOS
DISTÚRBIOS NEURONAIS São também incluídos na invenção péptidos para utilização nos métodos de tratamento ou de prevenção de distúrbios relacionados com a morte de células neuronais administrando a uma célula ou a um indivíduo uma composição de um péptido bioactivo permeável em células em que o péptido previne danos aos neurónios ou a apoptose neuronal. A composição é por exemplo o péptido da SEQ ID N°: 3, 4, 6, 14, 15, 16, 24 ou 26.
De um modo preferido, a composição funciona para inibir a morte de células neuronais induzida por stress excitotóxico ou oxidativo. Uma célula neuronal é qualquer célula derivada do sistema nervoso central ou periférico, por exemplo, neurónio, neurite ou dendrite. A célula é feita contactar in vivo, ex vivo ou in vitro. 0 indivíduo é, e. g., qualquer mamífero, e. g., humano, primata, murganho, rato, cão, gato, vaca, cavalo, porco. A morte da célula neuronal é medida pelos métodos conhecidos na técnica. Por exemplo, a morte celular é determinads microscopicamente ou utilizando um indicador químico, tal como Calcein-am (Molecular Probes). A excitotoxicidade é o mecanismo principal subjacente à morte neuronal no acidente vascular cerebral, danos cerebrais 28 anóxicos e traumáticos são excitotoxicidade. A excitotoxicidade é desencadeada pela ativação excessiva dos receptores ionotrópicos do glutamato, particularmente, o subtipo de receptor N-metil-D-aspartato, originando, desse modo, um influxo rápido de Ca2+ que desencandeia a morte celular. Ver e. g. , Dirnagl et al. , Trends Neurosci. 22:391-97 (1999); Zipfel et al., J. of Neurotrauma 17:857-69 (2000) .
Os métodos são úteis aliviar os sintomas de vários dos distúrbios neuronais. O distúrbio neuronal é agudo ou crónico. Os distúrbios neuronais incluem os associados com um evento excitotóxico, tais como acidente vascular cerebral isquémico, isquemia cerebral, danos cerebrais hipóxicos/isquémicos, danos cerebrais traumáticos, morte neuronal resultante de episódios epilépticos e morte neuronal associada com vários distúrbios neurodegenerativos, tais como a doença de Alzheimer, esclerose lateral amiotrófica (ALS) e doença de Huntington. A morte neuronal na isquemia cerebral está associada com mecanismos excitotóxicos. A isquemia cerebral (e. g., isquemia cerebral global e isquemia cerebral focal) é devida a acidente vascular cerebral, lesões na cabeça ou paragem cardíaca. A isquemia cerebral global resulta de paragem cardíaca ou oclusão bilateral da artéria carótida. A isquemia cerebral focal resulta de uma redução no fluxo sanguíneo cerebral após oclusão da artéria cerebral. A isquemia cerebral focal resulta na morte neuronal necrótica por uma cascata patogénica complexa de eventos que inclue esgotamento de energia, excitotoxicidade e depolarização peri-infarte, assim como um mecanismo mais retardado envolvendo apoptose e inflamação. A isquemia cerebral focal pode ser adicionalmente dividida em isquemia focal trombótica ou embólica. Um acidente vascular cerebral trombótico 29 ocorre quando as artérias cerebrais ficam obstruídas por um coágulo de sangue que é formado dentro do cérebro. Um acidente vascular cerebral embólico é causado também por um artéria obstruída por um coágulo, mas no acidente vascular cerebral embólico, o coágulo é formado num outro local que não o próprio cérebro
Os métodos aqui descritos originam uma redução na gravidade ou o alívio de um ou mais sintomas de um distúrbio neuronal, tal como aqui descritos. Os distúrbios neuronais são diagnosticados e/ou monitorizados, tipicamente por um médico utilizando metodologias convencionais.
Os péptidos JNKI da invenção revelaram, como descrito nos Exemplos, proporcionar níveis elevados de neuroprotecção e além disso, o nível de protecção permanece alto mesmo quando o péptido JNKI é administrado 6-12 horas após o estabelecimento da isquemia. Embora tenha sido demonstrada neuroprotecção a 30-50% com vários compostos administrados até 9 horas após isquemia (ver e. g., Fink et al., J. Cereb. Blood Flow Metab., 18:1071-76 (1998); Williams et al., Neuroreport, 13:821-24 (2002)), os péptidos JNKI da presente invenção revelaram proporcionar protecção quando administrados 12 horas após o evento isquémico, como descrito nos exemplos abaixo. A maioria dos doentes que estão a sofrer ou sofreram, um evento excitotóxico, tal como um acidente vascular cerebral isquémico, procuram auxílio médico nas 3 a 6 horas após o evento excitotóxico. O intervalo de tempo disponível para tratar ou prevenir danos excitotóxicos, tal como os danos que ocorrem num evento isquémico, é importante, dado que a activação dos mecanismos de morte celular pode demorar várias horas após o 30 evento excitotóxico. Consequentemente, o agente terapêutico pode ser administrado ao indivíduo antes sofrer um evento excitotóxico. Alternativamente, o agente terapêutico pode ser administrado após o indivíduo sofrer um evento excitotóxico. 0 indivíduo pode ser, e. g., qualquer mamífero, e. g., humano, primata, murganho, rato, cão, gato, vaca, cavalo, porco.
COMPOSIÇÕES FARMACÊUTICAS
Os agentes terapêuticos incluem, e. g. : qualquer um ou mais dos péptidos inibidores da JNK como aqui descritos e os seus derivados, fragmentos, análogos e homólogos; A expressão "terapeuticamente eficaz" significa que a quantidade do péptido inibidor que é, por exemplo, utilizada, é uma quantidade suficiente para melhorar o distúrbio associado com a JNK,
Tratamento inclui a administração de um reagente que modula a actividade da cinase JNK, como definida acima. 0 termo "modula" inclui a supressão da expressão da JNK quando esta é sobreexpressa. Este inclui, também, a supressão da fosforilação de c-Jun, ATF2 ou NFAT4, utilizando, por exemplo, um péptido de qualquer uma ou mais das SEQ ID N°: 3, 4, 6 e 22 e SEQ ID N° : 14, 15, 16, 24 e 26, como um inibidor competitivo do local de ligação natural de c-Jun, ATF2 e NFAT4, numa célula. Deste modo inclui, também, a supressão dos complexos hetero e homoméricos dos factores de transcrição constituídos por c-Jun, ATF2 ou NFAT4 e os seus parceiros relacionados, tal como, por exemplo, o complexo AP-1 que é constituído por c-Jun, AFT2 e 31 c-fos. Quando um distúrbio proliferativo celular está associado com a sobreexpressão da JNK, podem ser introduzidos esses péptidos inibidores da JNK supressores numa célula. Em alguns casos, "modula" pode incluir o aumento da expressão da JNK, por exemplo, pela utilização de um anticorpo especifico para o péptido IB, que bloqueia a ligação de um péptido IB à JNK, prevenindo, deste modo, a inibição da JNK pelo péptido relacionado com IB. Os péptidos inibidores da JNK, os péptidos de fusão e os ácidos nucleicos da invenção podem ser formulados em composições farmacêuticas. Estas composições podem compreender, além de uma das substâncias acima, um excipiente, veiculo, tampão estabilizador farmaceuticamente aceitável ou outros materiais bem conhecidos dos especialistas na técnica. Esses materiais deverão ser não-tóxicos e não deverão interferir na eficácia do ingrediente activo. A natureza precisa do veículo ou de outro material pode depender da via de administração, e. g. vias oral, intravenosa, cutânea ou subcutânea, nasal, intramuscular, intraperitoneal, intrauricular ou emplastro.
As composições farmacêuticas para administração oral podem estar sob a forma de comprimido, cápsula, pó ou líquido. Um comprimido pode incluir um veículo sólido, tas como gelatina ou um adjuvante. De um modo geral, as composições farmacêuticas líquidas incluem um veículo líquido, tais como água, vaselina, óleos vegetais ou animais, óleo mineral ou óleo sintético. Pode ser incluída uma solução salina fisiológica de dextrose ou outra solução de sacáridos ou glicóis, tais como etilenoglicol, propilenoglicol ou polietilenoglicol.
Para injecção intravenosa, cutânea ou subcutânea, ou injecção no local da lesão, o ingrediente activo estará sob a forma de uma solução aquosa, parentericamente aceitável, a qual 32 é isenta de pirogénios e tem pH, isotonicidade e estabilidade adequados. Os especialistas na técnica têm uma boa capacidade para preparar soluções adequadas, utilizando, por exemplo, veículos isotónicos, tais como Injecção de Cloreto de Sódio, Injecção de Ringer, Injecção de Ringer com Lactato. Se necessário, podem ser incluídos conservantes, estabilizantes, tampões, antioxidantes e/ou outros aditivos.
Se este for um polipéptido, péptido, outro composto farmaceuticamente útil de acordo com a presente invenção, que se destina a ser administrado a um indivíduo, a administração é realizada, de um modo preferido, numa "quantidade profilaticamente eficaz" ou numa "quantidade terapeuticamente eficaz" (de acordo com o caso, embora a profilaxia possa ser considerada terapia), sendo esta suficiente para apresentar um benefício para o indivíduo. A quantidade real administrada e a velocidade e a evolução ao longo do tempo da administração, irá depender da natureza e da gravidade do que está a ser tratado. A prescrição do tratamento, e. g. decisões sobre a dosagem etc., está dentro da responsabilidade dos médicos de clínica geral e de outros médicos e, tipicamente, tem em consideração o distúrbio a ser tratado, o estado do doente individual, o local de distribuição, o método de administração e outros factores conhecidos dos médicos. Em REMINGTON'S PHARMACEUTICAL SCIENCES, 16a edição, Osol, A. (ed), 1980, podem ser encontrados exemplos das técnicas e protocolos referidos acima.
Alternativamente, podem ser utilizadas terapias direccionadas, para distribuir mais especificamente o agente activo a determinados tipos de células, pela utilização de sistemas direccionados, tais como ligandos específicos de anticorpos ou células. O direccionamento pode ser desejável por 33 vários motivos; por exemplo, se o agente for inaceitavelmente tóxico ou se este requerer, de qualquer outra forma, uma dosagem demasiado elevada ou se este não for, de qualquer outra forma, capaz entrar nas células alvo.
Alternativamente, o agente pode ser administrado numa forma de precursor, para a conversão na forma activa por um agente de activação produzido ou direccionado para as células a serem tratadas. Este tipo da abordagem é, por vezes, conhecida como ADEPT envolvendo direccionar o agente de activação para as células, por conjugação com um anticorpo especifico para uma célula.
EXEMPLOS ESPECÍFICOS
Exemplo 1: Identificação de Péptidos Inibidores da JNK
As sequências de aminoácidos importantes para a interacção eficiente com a JNK foram identificadas através de alinhamentos de sequências entre JBD conhecidos. A comparação entre as sequências dos JBD de IB1 [SEQ ID N° : 17], IB2 [SEQ ID N°: 18], c-Jun [SEQ ID N° : 19] e ATF2 [SEQ ID N°: 20] definiu uma sequência de 8 aminoácidos pouco conservada (FIG. IA) . Uma vez que os JBD de IB1 e IB2 são, aproximadamente, 100 vezes tão eficientes quanto c-Jun ou ATF2, na ligação a JNK (Dickens et al. Science 277: 693 (1997), foi considerado que os resíduos conservados entre IB1 e IB2 devem ser importantes para conferir uma ligação máxima. A comparação entre os JBD de 1B1 e IB2 definiu dois blocos de sete e três aminoácidos, que são altamente conservados, entre as duas sequências. Estes dois blocos estão contidos no interior de uma sequência peptídica com 34 23 aminoácidos em IB1 [SEQ ID N°: 1] e 21 aminoácido em IB2 [SEQ ID N° : 2] . Estas sequências são mostradas na FIG. 1B, os tracejados na sequência IB2 indicam um espaço na sequência, de forma a alinhar os resíduos conservados.
Os péptidos inibidores da JNK (JNKI) da presente invenção foram obtidos pela ligação do motivo de ligação à JNK, com 20 aminoácidos, de JIP-1/IB1, aqui referido como JBD2o/· a uma proteína de transporte, tal como, por exemplo, a sequência transportadora HIV_TAT4S_57, com 10 aminoácidos.
Exemplo 2: Preparação de Proteínas de Fusão Inibidoras da
JNK
Foram sintetizadas proteínas de fusão do inibidor da JNK, por ligação covalente da extremidade do terminal C de JBD23 ou da sequência com 21 aminoácidos derivada do JBD de IB2 (JBD21) ou da extremidade do terminal C da sequência de aminoácidos JBD20/ a um péptido transportador do terminal N com 10 aminoácidos de comprimento, derivado de HIV-TAT48_57 (Vives et al. , J. Biol. Chem. 272: 16010 (1997)), através de um espaçador consistindo em dois resíduos de prolina. Este espaçador foi utilizado para permitir a flexibilidade máxima e prevenir modificações estruturais secundárias não pretendidas. Como mostrado na FIG. 1C estas preparações foram designadas, respectivamente, L-TAT [SEQ ID N°: 7], L-TAT-IB1 [SEQ ID N°: 11], L-TAT-IB2 [SEQ ID N° : 12] e L-TAT-JNKI1 [SEQ ID N°: 21]. Foram, também, sintetizados péptidos de fusão com a TAT constituída, unicamente, por péptidos D retro-inversos e foram designados, respectivamente, D-TAT [SEQ ID N°:8], D-TAT-IB1 [SEQ ID N° : 14] e D-TAT-JNKI1 [SEQ ID N° : 22] . Todos os péptidos D e L foram 35 produzidos por síntese F-mock normal e foram, adicionalmente, analisados por Espectrometria de Massa. Estes foram, finalmente, purificados por HPLC. Para determinar os efeitos do espaçador de prolina, foram produzidos dois tipos de péptidos TAT, um com e um sem duas prolinas. A adição das duas prolinas não pareceu modificar a entrada ou localização do péptido TAT no interior das células.
Na FIG. 2 são apresentados péptidos genéricos, apresentando os resíduos de aminoácido conservados. Um "X" indica um qualquer aminoácido. 0 número de X num determinado péptido não está limitado ao representado e pode variar (i. e., X pode representar qualquer número de resíduos de aminoácido, incluindo zero) . Ver acima, para uma descrição mais detalhada das sequências genéricas.
Exemplo 3: Inibição da Morte de Células β por JBD23
Foram, seguidamente, estudados os efeitos da sequência do JBD de IB1, com 23 aminoácidos de comprimento, sobre as actividades biológicas da JNK. A sequência com 23 aminoácidos foi ligada ao terminal N da Proteína Verde Fluorescente (construção GFP-JBD23) e foi avaliado o efeito desta construção sobre a apoptose de células β pancreáticas, induzida pela IL-Ιβ. Ver a FIG. 3. Este modo de apoptose demonstrou, anteriormente, ser bloqueado por transfecção com JBDi_280 , enquanto que os inibidores específicos de ERK1/2 ou p3 8 não protegeram. Ver Ammendrup et al., supra.
Foram sintetizados oligonucleótidos correspondendo à sequência com 23 aminoácidos (JBD23,· FIG 1B) e uma sequência com 36 mutação nas regiões totalmente conservadas (JBD23mUt) e foram inseridos direccionalmente nos locais EcoRI e Sall do vector pEGFP-Nl codificando a Proteína Verde Fluorescente (GFP) (de Clontech). Foram cultivadas células βΤ0-3 produtoras de insulina, em meio RPMI 1640, suplementado com Soro de Vitelo Fetal a 10%, Estreptomicina 100 pg/mL, Penicilina 100 unidades/mL e Glutamina 2 mM. Foram transfectadas células βΤΟ-3 produtoras de insulina com os vectores indicados e foi adicionada IL-1 β (10 ng/mL) ao meio de cultura celular. Foi contado o número de células apoptóticas às 48 horas após a adição de IL-Ιβ, utilizando um microscópio de fluorescência invertido. As células apoptóticas foram discriminadas das células normais pela característica de "formação de bolhas" do citoplasma e foram contadas ao fim de dois dias.
Como indicado na FIG. 3, a GFP é o vector de expressão de Proteína Verde Fluorescente utilizado como um controlo; JBD23 é o vector expressando uma GFP quimérica ligada à sequência com 23 aminoácidos do JBD de IB1; JBD23Mut é o mesmo vector que GFP-JBD23, mas com um JBD com mutações em quatro resíduos conservados, mostrados na FIG 1B; e JBD280 é o vector de GFP ligado ao JBD completo (aminoácidos 1-280). A construção expressando GFP-JBD23 preveniu a apoptose de células β pancreáticas induzida pela IL-Ιβ, tão eficientemente quanto o JBDi_280 completo (FIG. 3, JBD23/IL-1, em comparação com JBD280/IL-1). As sequências com mutações nos resíduos IB1 totalmente conservados, como controlos adicionais, tinham reduzido sigificativamente a capacidade para prevenir a apoptose (FIG. 3, JBD23Mut/IL-l). 37
Exemplo 4: Importação Celular Dos Péptidos TAT-IB1 E TAT-IB2
Foi avaliada a capacidade de entrar nas células das formas L- e D-enantioméricas dos péptidos TAT, TAT-IB1 e TAT-IB2 ("péptidos TAT-IB").
Os péptidos L-TAT, D-TAT, L-TAT-IB1, L-TAT-IB2 e D-TAT-IB1 [respectivamente, as SEQ ID N°: 7, 8, 11, 12 e 14] foram marcados pela adição de um resíduo de glicina conjugado com fluoresceína no terminal N. Foram adicionados péptidos marcados (1 μΜ) a culturas de células βΤ0-3, as quais foram mantidas como descrito no Exemplo 3. Em tempos predeterminados, as células foram lavadas com PBS e fixas durante cinco minutos em metanol-acetona gelada (1:1), antes de serem examinadas sob um microscópio de fluorescência. Foi utilizada BSA marcada com fluoresceína (1 μΜ, 12 moles/mole BSA) como um controlo. Os resultados demonstraram que a totalidade dos péptidos marcados com fluoresceína, acima, entraram eficiente e rapidamente (menos de cinco minutos) nas células, quando adicionados ao meio de cultura. Pelo contrário, a albumina de soro bovino marcada com fluoresceína (1 μΜ de BSA, 12 moles fluoresceína/mole BSA) não entrou nas células.
Um estudo da evolução ao longo do tempo indicou que a intensidade do sinal fluorescente para os péptidos L-enantioméricos diminuiu em 70%, após um período de 24 horas. Às 48 horas estava presente pouco ou nenhum sinal. Pelo contrário, D-TAT e D-TAT-EB1 foram extremamente estáveis dentro das células. Os sinais fluorescentes destes péptidos D retro-inversos estavam ainda muito fortes, após 1 semana e o sinal 38 estava, apenas, ligeiramente diminuído, 2 semanas após o tratamento.
Exemplo 5: Inibição In Vitro Da Fosforilação De c-Jun, ATF2 e Elkl
Foram investigados os efeitos dos péptidos sobre a fosforilação mediada por JNK dos seus factores de transcrição alvo, in vitro. Foram produzidas JNK1, JNK2 e JNK3, recombinantes e não-activadas, utilizando um kit de lisado de reticulócito de coelho TRANSCRIPTION AND TRANSLATION (Promega) e utilizadas em ensaios de cinase em fase sólida, com c-Jun, ATF2 e Elkl, quer, isolados, quer fundidos com glutationa-S-transferase (GST), como substratos. Foram realizados estudos de resposta à dose, em que foram misturados péptidos L-TAT, L-TAT-IB1 ou L-TAT-IB2 (0-25 μΜ) com as cinases recombinantes JNK1, JNK 2 ou JNK3, em tampão de reacção (Tris-acetato 20 mM, EGTA 1 mM, p-nitrofenil-fosfato (pNPP) 10 mM, pirofosfato de sódio 5 mM, p-glicerofosfato 10 mM, ditiotreitol 1 mM), durante 20 minutos. As reacções da cinase foram, então, iniciadas pela adição de MgCl2 10 mM e 5 pCi de 33P-Y-dATP e 1 pg de qualquer um de GST-Jun (aminoácidos 1-89), GST-AFT2 (aminoácidos 1-96) ou GST-ELK1 (aminoácidos 307-428). As proteínas GST de fusão foram adquiridas de Stratagene (La Jolla, CA). Foram, também, adicionados dez pL de esferas de glutationa-agarose à mistura. Os produtos de reacção foram, então, separados por SDS-PAGE num gel de poliacrilamida desnaturante a 10%. Os géis foram secos e foram, subquentemente, expostos a películas de raios X (Kodak). Foi observada a inibição quase completa da fosforilação de c-Jun, ATF2 e Elkl por JNK em doses do péptido TAT-IB tão baixas quanto 2,5 pM. No 39 entanto, uma excepção significativa foi a ausência de inibição da fosforilação JNK3 de Elkl, por TAT-IB. Globalmente, o péptido TAT-IB1 pareceu ligeiramente superior a TAT-IB2, na inibição da fosforilação pela família das JNK dos seus factores de transcrição alvo. (Ver, FIG. 4A).
Foi analisada a capacidade dos péptidos D-TAT, D-TAT-IB1 e L-TAT-IB1 (estudo de dosagem de 0-250 μΜ) para inibirem a fosforilação de GST-Jun (aminoácidos 1-73) por JNK1, JNK2 e JNK3 recombinantes, como descrito acima. Globalmente, o péptido D-TAT-IB1 reduziu a fosforilação de c-Jun mediada por JNK, mas em níveis, aproximadamente, 10-20 vezes menos eficientemente do que L-TAT-IB1. (Ver, FIG. 4B).
Exemplo 6: Inibição da Fosforilação de c-Jun por JNK Activadas
Foram avaliados os efeitos dos péptidos L-TAT, L-TAT-IB1 ou L-TAT-IB2 sobre JNK activadas, por estímulos de stress, utilizando GST-Jun para anular as JNK de células HeLa irradiadas com luz UV ou células PTC tratadas com IL-Ιβ. as células βΤΟ foram cultivadas como descrito acima. As células HeLa foram cultivadas em meio DMEM suplementado com Soro Fetal de Vitelo a 10%, Estreptomicina 100 pg/mL, Penicilina 100 unidades/mL e Glutamina 2 mM. As células PTC foram activadas com IL-Ιβ, como descrito acima, uma hora antes de serem utilizadas na preparação de extracto celular, enquanto que as células HeLa foram activadas por luz UV (20 J/m2) . Foram preparados extractos celulares a partir do controlo, de células HeLa irradiadas com luz UV e de células βΤΟ-3 tratadas com IL-Ιβ, por raspagem das culturas celulares em tampão de lise (Tris-acetato 20 mM, 40 EGTA 1 mM, Triton X-100 a 1%, p-nitrof enil-f osf ato 10 mM, pirofosfato de sódio 5 mM, β-glicerofosfato 10 mM, ditiotrietiol 1 mM) . Os detritos foram removidos por centrifugação, durante cinco minutos, a 15000 rpm, num rotor SS-34 Beckman. Foram incubados cem pg de extractos, durante uma hora, à temperatura ambiente, com uma pg de GST-Jun (aminoácidos 1-89) e 10 pL de esferas de glutationa-agarose (Sigma). Após quatro lavagens com tampão de raspagem, as esferas foram ressuspensas no mesmo tampão suplementado com os péptidos L-TAT, L-TAT-IB1 ou L-TAT-IB2 (25 pM), durante 20 minutos. Foram, então, iniciadas reacções de cinase, pela adição de 10 mM de MgCl2 e 5 pCi de 33P-Y-dATP e incubadas durante 30 minutos a 30 °C. Os produtos de reacção foram, então, separados por SDS-PAGE, em gel de poliacrilamida desnaturante, a 10%. Os géis foram secos e, subsequentemente, expostos a películas de raios X (Kodak). Os péptidos TAT-IB preveniram, eficientemente, a fosforilação de c-Jun por JNK activadas, nestes experiências. (Ver, FIG. 6).
Exemplo 7: Inibição In vivo da Fosforilação de c-Jun por Péptidos TAT-IB
Para determinar se os péptidos permeáveis em células podem bloquear a sinalização JNK in vivo, a requerente utilizou um sistema GAL4 heterólogo. Foram co-transfectadas células HeLa, cultivadas como descrito acima, com o vector repórter 5xGAL-LUC, em conjunto com a construção de expressão GAL-jun (Stratagene), compreendendo o domínio de activação de c-Jun (aminoácidos 1-89) ligado ao domínio GAL4 de ligação ao ADN. A activação da JNK foi realizada pela co-transfecção de vectores expressando as cinases MKK4 e MKK7, directamente a montante (Ver, Whitmarsh et al., Science 285: 1573 (1999)). Resumidamente, foram transfectadas 41 3 χ 105 células com os plasmídeos, em placas de 3,5 cm, utilizando DOTAP (Boehringer Mannheim), seguindo as instruções do fabricante. Para experiências envolvendo GAL-jun, foram transfectadas 20 ng do plasmideo com 1 pg do plasmídeo repórter pFR-Luc (Stratagene) e 0,5 pg de qualquer um dos plasmídeos expressando MKK4 ou MKK7. Três horas após a transfecção, os meios celulares foram substituídos e foram adicionados os péptidos TAT, TAT-IB1 e TAT-IB2 (1 pM). Foram medidas as actividades da luciferase, 16 horas mais tarde, utilizando o "Dual Repórter System" da Promega, após a normalização do conteúdo em proteína. Como mostrado na FIG. 5, adição de ambos os péptidos TAT-IB1 e TAT-IB2 bloqueou activação de c-Jun, após a activação da JNK mediada por MKK4 e MKK7. Dado que as células HeLa expressam ambas as isoformas JNK1 e JNK2, mas não a JNK3, os requerentes transfectaram células com JNK3. Novamente, os dois péptidos TAT-IB inibiram a activação de c-Jun mediada pela JNK 2 .
Exemplo 8: Inibição da Morte de Células β Pancreáticas Induzida pela IL-Ιβ, por Péptidos TAT-IB
Os requerentes investigaram os efeitos dos péptidos L-TAT-IB na promoção de apoptose de células β pancreáticas, desencadeada por IL-1 β. Foram incubadas culturas de células βΤ0-3, durante 30 minutos, com 1 pM de qualquer um dos péptidos L-TAT-IB1 ou L-TAT-IB2, seguida por 10 ng/mL de IL-Ιβ. Foi realizado uma segunda adição de péptido (1 pM) , após 24 horas. As células apoptóticas foram contadas após dois dias de incubação com IL-1 β, utilizando coloração nuclear com Iodeto de Propídio (as células coradas de vermelho são células mortas) e Hoechst 33342 (as células coradas de azul são células com a 42 membrana plasmática intacta) . Como mostrado na FIG. 5, a adição dos péptidos TAT-IB inibiu a apoptose de células βτθ-3, cultivadas na presença de IL-Ιβ, induzida pela IL-1 β, para dois
Foi examinada a inibição a longo prazo de morte celular induzida pela IL-Ιβ, por tratamento de células βΤΟ-3, como descrito acima, excepto por a incubação das células com os péptidos e IL-Ιβ ter sido mantida durante 12 dias. Foram adicionados péptidos adicionais (1 μΜ), em cada dia e foi adicionada IL-Ιβ adicional (10 ng/mL), cada 2 dias. O péptido TAT IB1 confere uma protecção significativa contra a apoptose, nestas condições. No seu conjunto, estas experiências estabelecem que os péptidos TAT-IB são moléculas biologicamente activas, capazes de prevenir os efeitos da sinalização da JNK sobre o destino celular.
Exemplo 9: Síntese de Péptidos Unicamente-D-retro-inversos
Os péptidos da invenção podem ser péptidos de aminoácidos unicamente-D sintetizados em reverso, para prevenir a proteólise natural (i. e., péptidos unicamente-D-retro-inversos). Um péptido unicamente-D retro-inverso da invenção irá proporcionar um péptido com propriedades funcionais semelhantes às do péptido nativo, em que os grupos laterais dos aminoácidos componentes irão corresponder ao alinhamento do péptido nativo, mas que irão conservar um estrutura base resistente a proteases.
Os péptidos retro-inversos da invenção são análogos sintetizados utilizando D-aminoácidos, por ligação dos aminoácidos numa cadeia peptidica, de forma a que a sequência de aminoácidos no análogo peptídico retro-inverso seja, 43 exactamente, oposta à da do péptido seleccionado, a qual serve do modelo. Para ilustrar, se a proteína TAT de ocorrência natural (formada pelos L-aminoácidos) tiver a sequência GRKKRRQRRR [SEQ ID N° : 7], o análogo peptídico retro-inverso deste péptido (formado por D-aminoácidos) terá a sequência RRRQRRKKRG [SEQ ID N°: 8]. São conhecidos na técnica processos para sintetizar uma cadeia de D-aminoácidos, para formar os péptidos retro-inversos. Ver, e. g., Jameson et al., Nature, 368, 744-746 (1994); Brady et al., Nature, 368, 692-693 (1994)); Guichard et al., J. Med. Chem. 39, 2030-2039 (1996). Especificamente, os péptidos retro foram produzidos por síntese de F-mock normal e foram, adicionalmente, analisados por Espectrometria de Massa. Estes foram, finalmente, purificados por HPLC.
Uma vez que um problema inerente aos péptidos nativos é a degradação por proteases naturais e imunogenicidade inerente, os compostos heterobivalentes ou de heteromultivalentes desta invenção serão preparados de forma a incluir o "isómero retro-inverso" do péptido pretendido. A protecção do péptido contra a proteólise natural deve, consequentemente, aumentar a eficácia do composto heterobivalente ou heteromultivalente especifico, prolongando a meia-vida e reduzindo a extensão da resposta imunitária direccionada para destruir activamente os péptidos.
Exemplo 10: Actividade biológica a longo prazo de todos os Péptidos IB unicamente-D-retro-inversos É prevista actividade biológica a longo prazo para o heteroconjugado peptídico contendo D-TAT-IB retro-inverso, quando comparada com o análogo de L-aminoácidos nativo, devido à 44 protecçao do péptido D-TAT-IB da degradação por proteases nativas, como mostrado no Exemplo 5.
Foi analisada a inibição da morte de células β pancreáticas induzida pela IL-Ιβ, pelo péptido D-TAT-IB1. Como mostrado na FIG. 10, foram incubadas células βΤΟ-3, como descrito acima, durante 30 minutos, com uma adição única dos péptidos indicados (1 μΜ) , seguidamente, foi adicionada IL-1 β (10 ng/mL) . Foram, então, contadas as células apoptóticas, após dois dias de incubação com IL-Ιβ, pela utilização de coloração nuclear com Iodeto de Propidio e Hoechst 33342. Foi contado um mínimo de 1000 células para cada experiência. É indicado o Erro Padrão das Médias (SEM), n=5. O péptido D-TAT-IBl diminuiu a apoptose induzida pela IL-1 numa extensão semelhante à dos péptidos L-TAT-IB (comparar a FIG. 5 e a FIG. 10).
Foi, também, analisada a inibição a longo prazo da morte celular induzida pela IL-Ιβ, pelo péptido D-TAT-IBl. Foram incubadas células βΤΟ-3, como acima, durante 30 minutos, com uma adição única dos péptidos indicados (1 μΜ), seguidamente, foi adicionada IL-Ιβ (10 ng/mL), seguida pela adição de citocina, cada dois dias. Foram, então, contadas as células apoptóticas, após 15 dias de incubação com IL-Ιβ, pela utilização de coloração nuclear com Iodeto de Propidio e Hoechst 33342. Verifica-se que uma adição única do péptido L-TAT-IB1 não confere protecção a longo prazo. Foi contado um mínimo de 1000 células para cada experiência. É indicado o Erro Padrão das Médias (SEM), n=5. Os resultados são mostrados na FIG. 9. O D-TAT-IBl foi capaz de conferir protecção a longo prazo (15 dias), mas não L-TAT-IB1. 45
Exemplo 11: Inibição da Morte de Células β Pancreáticas Induzida por Irradiação, por Péptidos TAT-IB A JNK é, também, activada por radiação ionizante. Para determinar se os péptidos TAT-IB irã proporcionar protecção contra danos da JNK induzidos por radiação, foram irradiadas células "WiDr" (30 Gy) na presença ou ausência de péptidos D-TAT, L-TAT-IB1 ou D-TAT-IB1 (1 μΜ adicionado 30 minutos antes da irradiação), como indicado na FIG. 10. As células de controlo (CTRL) não foram irradiadas. As células foram analisadas após 48 horas, utilizando coloração com PI e Hoechst 33342, como descrito acima. N=3, SEM estão indicados. Os péptidos L-TAT-IB1 e D-TAT-IB1 foram ambos capazes de impedir a apoptose induzida pela irradiação, nesta linha celular de cancro do cólon humano.
Exemplo 12: Radioprotecção contra Radiação Ionizante por Péptidos TAT-IB
Foram irradiados murganhos C57 Bl/6 (2 a 3 meses) com um raios R Phillips RT 250, numa proporção de dose de 0,74 Gy/min (17 mA, filtro Cu com 0,5 mM) , para determinar os efeitos radioprotectores dos péptidos TAT-IB. Os animais foram injectados i. p. com qualquer dos péptidos TAT, L-TAT-IB1 e D-TAT-IB1 (30 pL de uma solução de 1 mM) , trinta minutos antes da irradiação. Resumidamente, os murganhos foram irradiados como se segue: os murganhos foram colocados em pequenas caixas de plástico com a cabeça situada fora da caixa. Os animais foram colocados de costas sob o irradiador e o seu pescoço foi fixo num pequeno túnel de plástico, para manter a sua cabeça numa posição correcta. O corpo foi protegido com chumbo. Antes da irradiação os murganhos foram mantidos com ração para murganhos 46 normal, no entanto, após a irradiação, os murganhos foram alimentados com uma comida semi-liquida que foi renovada todos os dias.
Foi, então, classificada a reacção da mucosa do lábio, por 2 observadores independentes, de acordo com o sistema de classificação desenvolvido por Parkins et ai. (Parkins et ai., Radiotherapy & Oncology, 1: 165-173, 1983), em que foi quantificado o estado do eritema, assim como a presença de edema, descamação e exudação. Adicionalmente, os animais foram pesados antes de cada registo do estado de eritema/edema. A Fig. 12A: ilustrou peso dos murganhos após irradiação. Os valores referem-se ao peso inicial dos murganhos que foi estabelecido em 100. CTRL: murganhos de controlo injectados com 30 pL de uma solução salina. N = 2 para cada um dos valores referidos, são indicados os S. D. Os valores de x são dias. FIG. 12B é ilustrativa da classificação do eritema/edema após a irradiação. Foi quantificado o estado de edema e de eritema do lábio ventral, dos mesmos murganhos que na FIG. 12A. N=2 para cada valor referido. Os valores de x são dias.
Os resultados destas experiências indicam que os Péptidos TAT-IB podem proteger contra a perda de peso e eritema/edema associados à radiação ionizante. 47
Exemplo 13: Supressão de Factores de Transcrição da JNK por péptidos L-TAT-IBl
Foram realizados ensaios de retardação em gel com uma sonda (5' -CGC TTG ATG AGT CAG CCG GAA-3') duplamente marcada com um AP-1. Os extractos nucleares celular de HeLa foram ou não tratados durante uma hora com TNF-a 5 ng/mL, como indicado. Foram adicionados os péptidos TAT e L-TAT-IBl, 30 minutos antes do TNF-α. É mostrada, apenas, a parte do gel com o complexo AP-1 ADN específico (como demonstrado por experiências de competição com competidores específicos e não-específicos não marcados). Os péptidos L-TAT-IBl reduzem a formação do complexo de ligação AP-1 ADN, na presença do TNF-α. (Ver, FIG 11) .
Exemplo 14: Protecção contra a perda de audição, induzida por ruido, por D—TAT—IB
Foi injectada uma solução de D-JNKI (luM, 1 uL/h) no ouvido interno direito de uma cobaia, como mostrado na FIG 13, painel A, enquanto que o ouvido esquerdo foi injectado com, apenas, soro fisiológico. A cobaia foi, então, exposta a um traumatismo acústico (120 db, 30 minutos) e foi realizado um registo da sensibilidade auditiva, após três dias (FIG 13, painel B), assim como um exame histológico do ouvido interno (FIG 13, painel C e D) . Como mostrado na FIG 13, as estruturas ciliadas no ouvido tratado com JNKI são completamente protegidas da destruição induzida pelo ruído, como avaliado por exame histológico, ao contrário do ouvido não-tratado, em que a maior parte das estruturas ciliadas desapareceram. Além disso, a sensibilidade do ouvido tratado com D-JNKI ao ruído, parece ter sido conservada (FIG 13, painel B). 48
Exemplo 15: Protecção contra a perda de audição, induzida por antibióticos, por péptidos D-TAT-IB
Foram tratados ouvidos internos de galinhas, com estreptomicina, na presença/ausência de D-JNKI. Foram, então, realizadas experiências de TUNEL para detectar a apoptose (núcleos verdes). Como mostrado na FIG 14, o D-JNKI protege, totalmente, os ouvidos internos, da apoptose induzida pela estreptomicina. Deste modo, o D-JNK-I é útil na prevenção de estados de perda de audição provocados por terapia com antibióticos.
Exemplo 16: Protecção contra a destruição dos ilhéus pancreáticos, induzida por citocinas pró-inflamatórias, por péptidos D-TAT-IB
Foram tratadas células de ilhéus pancreáticos com D-JNKI (1 mM, durante uma hora, antes de serem expostas à interleucina 1B (10 ng/mL) . Como mostrado na FIG 15, os ilhéus tratados com D-JNKI resistem à destruição induzida por IL-1B. Isto indica que o tratamento com D-JNKI auxilia a preservação de ilhéus enxertados.
Exemplo 17: Aumento da recuperação de células de ilhéus pancreáticos, por péptidos D-TAT-IB
Foi adicionado D-JNK-I em conjunto com colagenase, durante o isolamento de células dos ilhéus. Isto resultou numa 49 quantidade aumentada de ilhéu, após 3 dias em cultura, como medido pelo aumento em desidrogenase do lactato. Ver a FIG 15.
Exemplo 18: Métodos gerais utilizados no teste dos efeitos dos péptidos JNKI sobre a activação da JNK e a acção relacionada com JNK
Cultura Neuronal Geral: Foram dissecadas pequenas porções do córtex proveniente de cérebros de filhotes de rato com dois dias de idade e foram incubadas com 200 unidades de papaina, durante 30 minutos, a 34 °C. Seguidamente, os neurónios foram plaqueados numa densidade de, aproximadamente, 1 x 106 células/placa, em placas que tinham sido pró-revestidas com poli-D-lisina 100 pg/mL. As células foram cultivadas utilizando um meio de cultura B27/Neurobasal (Life Technologies), suplementado com glutamina 0,5 M, penicilina 100 U/mL e estreptomicina 100 pg/mL.
Ensaio da citotoxicidade da desidrogenase do lactato (LDH): Foi medida a quantidade de LDH libertada no meio de cultura, utilizando o kit de ensaio de citotoxicidade não-radioactivo Citotox 96 (Promega).
Ensaio da anulação de GST-c-Jun e cinase: Foram preparados extractos celulares por raspagem de células em tampão de lise (Tris-acetato 20 mM, EGTA 1 mM, Triton X-100 a 1%, p-nitrofenil-fosfato 10 mM, pirofosfato de sódio 5 mM, β-glicerofosfato 10 mM, ditiotreitol 1 mM). Foram incubadas 25 pg de amostras, durante 1 hora, à temperatura ambiente, com 1 pg de GST-c-Jun (residuos de aminoácido 1-89) e 10 pL de esferas de glutationa-agarose (Sigma). As esferas foram lavadas quatro 50 vezes e, seguidamente, ressuspensas no tampão de lise descrito acima. Foram, então, realizados ensaios de cinase, in vitro, utilizando JNKlal recombinante e 0,5 pg de um substrato seleccionado do grupo consistindo em proteínas de fusão com GST (e. g., as proteínas de fusão GST-Jun e GST-Elkl), caseína e histona (Sigma). Foram iniciadas reacções com MgCl2 10 mM e ATP 10 μΜ, na presença de 5 pCi de 33P-ATP e foram incubadas durante 30 minutos, a 30 graus Celsius. Os produtos de reacção foram separados por SDS-PAGE e os géis foram secos e foram, seguidamente, expostos a películas de raios X (Kodak).
Transferências de Western: Foram obtidos extractos de proteína totais por raspagem de células em tampão de lise (descrito acima), separando as proteínas num gel de poliacrilamida de SDS a 12%. As proteínas separadas foram, então, transferidas para uma membrana de fluoreto de polivinilideno (PVDF). Os anticorpos utilizados nas transferências de Western aqui descritas foram obtidos de Alexis.
Separação dos núcleos a partir do citoplasma: Foram lisados neurónios durante 15 minutos, em tampão de lise e as amostras foram, seguidamente, centrifugadas a 300 g, durante 10 minutos, a 4 °C, para isolar núcleos para análise de transferência de
Western (ver a FIG. 17B) . Os sedimentos nucleares foram reconstituídos em tampão de lise e foram, depois, sonicados. RT-PCR em Tempo real: Foi realizado RT-PCR em tempo real utilizando iniciadores específicos, num equipamento lightcicler (Roche). Foi utilizada o transcrito de actina de manutenção, para normalizar para a quantidade e a qualidade dos ARN que foram extraídos pelo método de Chomczynski. Ver Chomczynski 51 et al., Anal. Biochem., 162:156-59 (1987). As sequências dos iniciadores utilizados foram as seguintes: c-Fos: Directo:
Inverso:
Actin: Directo:
Inverso: 5'-GCTGACAGATACACTCCAAG-3' 5'-CCTAGATGATGCCGGAAACA-3' 5'-AACGGCTCCGGCATGTGCAA-3' 5'-ATTGTAGAAGGTGTGGTGCCA-5'
Imuno-histoquímica P-c-Jun: P-c-Jun, como aqui utilizado refere-se a formas fosforiladas de c-Jun. A P-c-Jun foi visada por um anticorpo policlonal de coelho (500 x em PBS) (Cell Signaling Technology). O complexo de anticorpo resultante foi visualizado com 3,3-diaminobenzidina como substrato.
Isquemia transiente em murganhos adultos: Foi provocada isquemia, introduzindo um filamento na artéria carótida interna, a partir da artéria carótida comum e fazendo avançar o filamento para o interior do círculo arterial, obstruindo, deste modo, a artéria cerebral média, utilizando murganhos ICR-CD1 do sexo masculino (com, aproximadamente, 6 semanas de idade e pesando na gama de, cerca de, 18 a 37 g) (Harlan, Inc.) . Ver, e. g., Huang et al., Science, 265:1883-85 (1994); Hara et al., Proc. Natl. Acad. Scl. (USA) 94:2007-12 (1997). O fluxo sanguíneo cerebral regional foi medido por fluxometria de Doppler com laser, com uma sonda fixa no crânio ao longo da isquemia e até 10 minutos após a reperfusão. Foi medida a temperatura rectal e mantida a 37 °C. Os animais foram sacrificados 48 horas após a reperfusão. Foram contornadas secções seriadas de criostato com 20 pm de espessura, utilizando um sistema computador-microscópio, equipado com o programa Neurolucida (Microbrightfield, Inc.) e 52 foram calculados os volumes da área isquémica e do total do cérebro (cego), com o programa Neuroexplorer. Foi medida a pressão sanguínea sistólica e diastólica com um cateter arterial em três murganhos adicionais, desde 10 minutos antes da injecção de D-JNKI1, até 30 minutos após esse momento. Estas medições da pressão sanguínea mostraram que as injecções não afectaram a pressão sanguínea (i. e., alteração de menos de 10%). Foram seguidas as orientações do Swiss Federal Veterinary Office em todas as experiências.
Isguemia focal permanente em ratos jovens (P14): Foi obtida a oclusão de artéria cerebral média por electrocoagulação da artéria cerebral média, numa localização fechada em relação à sua origem, na junção com o ramo olfactivo. Os ratos (de Wistar) , os quais pesavam na gama de, cerca de, 27-35 g, foram sacrificados 24 horas após a oclusão da artéria cerebral média. Os ratos foram sacrificados utilizando uma dose excessiva de hidrato de cloral e foram perfundidos através do ventrículo esquerdo, com o fixador de Zamboni. Os cérebros foram pós-fixados durante 2 horas, na mesma solução que a utilizada para a perfusão e, depois, os cérebros foram infiltrados, de um dia para o outro, em sacarose a 30%, para crioprotecção. Foram desenhados os contornos de cada área isquémica (corados) com um sistema computador-microscópio. Foi traçada a área da lesão isquémica e da totalidade do cérebro, a partir de secções seriadas de criostato com 50 pm, coradas com violeta de cresilo, utilizando o programa Neurolucida e foram calculados os volumes de cada um, utilizando o programa Neuroexplorer, como descrito acima.
Estatística: Os dados de ambos os modelos de isquemia (i. e., transiente e permanente) foram transformados 53 logaritmicamente, para satisfazer o critério Gaussiano. Os dados foram analisados com uma ANOVA global (p < 0,0001 para ambos os modelos), seguida por testes t unicaudais não-emparelhados.
Exemplo 19: Sensibilidade e especificidade dos péptidos JNKI contra a acção da JNK
Os péptidos JNKI1 utilizados nestas experiências são direccionados para o bloqueio do acesso da JNK a c-Jun e a outros substratos, através de um mecanismo competitivo directo. Ver, e. g., Bonny et al., Diabetes, 50:77-82 (2001); Barr et al., J. Biol. Chem., 277:10987-97 (2002).
Foi testado o efeito inibidor de L-JNKI1 e D-JNKI1 sobre a activação e a acção da JNK, utilizando os ensaios da cinase, como descrito acima, no Exemplo 18. Os resultados destas experiências são mostrados nas FIG. 16A-16C. O efeito inibidor de L-JNKI 1 e D-JNKI 1 sobre a activação e a acção da JNK é demonstrado pela sua capacidade para impedir a fosforilação in vitro dos alvos conhecidos da JNK, c-Jun e Elkl, utilizando JNKlal. (Ver a FIG. 16A) . Os termos "P-Jun" e "P-Elkl", como aqui utilizados, referem-se, respectivamente, às formas radiomarcadas (i. e., fosforiladas com 33P-ATP) dos substratos GST-Jun e GST-Elkl. A FIG. 16B mostra o efeito inibidor da sequência mínima inibidora da JNK com 20 aminoácido, de JIP-IB1 (forma L de JBD2o (SEQ ID N°: 21)) em experiências de resposta à dose, utilizando condições semelhantes às utilizadas para testar o efeito inibidor de L-JNKI1 e D-JNKI1 e utilizando quantidades decrescente de L-JBD2o · A FIG. 16B ilustra que o péptido L-JBD20 (SEQ ID N°: 21) isolado (i. e., sem a sequência TAT) pode inibir a acção da JNK. JBD20 revelou, também, inibir outros alvos da 54 JNK, incluindo ATF2, IRS-1, MADD, bcl-xl. Em cada um destes
casos, 0 IC50 foi cerca de 1 μΜ (dados não apresentados). A sequência TAT não estava ligada a JBD2o nestas experiências, porque, a uma concentração superior a 50 μΜ, a sequência TAT induz uma precipitação não-especifica das proteínas nos extractos. Abaixo de 50 μΜ, a TAT não influencia as propriedades inibidoras dos péptidos JBD2o.
Foram realizadas experiências in vitro, para determinar a especificidade dos péptidos JNKI no bloqueio da activação da JNK. Foi testado, em particular, o efeito destes péptidos sobre a actividade de 40 cinases diferentes (péptidos 10 μΜ, ATP 10 μΜ) para os seus respectivos substratos. Em http://www.upstate.com/img/pdf/KinaseProfiler.pdf pode ser encontrada a lista completa de substratos utilizados nestas experiências. Como esperado, os péptidos JNKI tiveram um efeito sobre as cinases JNK e MKK4 e MKK7, cuja totalidade contém domínios de ligação a JNK. Os péptidos (as formas D-JNKI1 e L-JNKI1) não conseguiram interferir, absolutamente, com as actividades da totalidade das outras cinases. Experiências adicionais mostraram que 500 μΜ dos péptidos JBD2o não interferiram com a actividade de 6 cinases particulares: ERK2, p38, pKC, p34, caK e pKA (Fig. 16C) . Os substratos destas cinases são ERK2:ERK1; p38:ATF2; p34, pKC, pKA:histona; e caK:caseína. Este nível da especificidade está muito acima dos obtidos com outros pequenos inibidores químicos da cinase do terminal N da Jun, demonstrando, deste modo, a selectividade extremamente elevada dos péptidos JNKI da invenção. Para uma discussão de outros pequenos inibidores químicos da cinase do terminal N da Jun (JNK), ver Bennett et ai., Proc. Natl. Acad Sei. (USA), 98:13681-86 (2001). 55
Exemplo 20: Efeitos dos péptidos JNKI sobre alvos JNK no interior de neurónios corticais tratados com NMDA
Foi realizada uma série de experiências, para analisar os efeitos dos péptidos JNKI da invenção sobre alvos da JNK diferentes no interior dos neurónios. Foi estimada a activação da JNK em neurónios corticais tratados com N-metil-D-aspartato (NMDA) em cultura, pela realização de ensaios de cinase em JNK anulada, utilizando GST-c-Jun, utilizando os métodos descritos acima. (Ver e. g., Ko et al.r J. Neurochem. 71:1390-1395 (1998); Coffey et al. , J. Neurosci. 20:7602-7613 (2000)). Os resultados destas experiências são mostrados nas FIG. 17-18. A Fig. 17A mostra a actividade da JNK em neurónios não tratados ("0"), após 10 minutos de exposição a NMDA 100 μΜ (10') ou após 30 minutos de exposição a NMDA 100 μΜ. As duas pistas à direita da Fig. 17C demonstram que a activação da JNK foi, essencialmente, inalterada por D-JNKI1. O aumento da actividade da JNK pareceu máximo (i. e., 2,2 vezes), após 30 minutos de tratamento com NMDA (FIG. 17A) . Este aumento na actividade da JNK traduziu-se numa fosforilação elevada de c-Jun (FIG. 17B) . A adição dos péptidos L-JNKI1 e D-JNKI1 penetrantes nas células demonstrou prevenir, completamente, o aumento em P-c-Jun, após 5 horas da exposição a 100 μΜ de NMDA, apesar de um nivel normal de activação da JNK. A adição de L-JNKI1 e D—JNKI1 levou nivel de P-c-Jun para baixo, mesmo, do nivel de P-c-Jun no controlo. 56 A transcrição do gene c-fos induzida por NMDA, sob a influência da JNK, através do factor de transcrição Elkl foi, também, completamente impedida pela adição de L-JNKI e D-JNKI1 (FIG. 17C) . Foi quantificada a expressão de c-fos por PCR em tempo real (Lightcycler), utilizando ARN extraído, utilizando os métodos descritos acima no Exemplo 18. Os dados na FIG. 17C são apresentados como a expressão c-fos relativa à actina (n = 4) . Para uma descrição da indução da expressão de c-fos através da fosforilação de TCF/Elk-1 mediada por JNK, ver Cavigelli et al. EMBOJ., 14:5957-5964 (1995). A evolução ao longo do tempo da neurotoxicidade do NMDA e da neuroprotecção por L-JNKI1 e D-JNKI1, assim como por dois péptidos de controlo, TAT-vazia (i. e., a sequência TAT, apenas, sem a sequência JBD20) e L-JNKIlmut (tendo seis aminoácidos mutados em alanina, como descrito em Bonny et al., Diabetes 50:77-82 (2001)). As micrografias da FIG. 18 mostram neurónios corados com Hoechst, às 24 horas após o tratamento. A adição dos péptidos L-JNKI e D-JNKI1 protegeu, completamente, os neurónios contra os efeitos excitotóxicos do NMDA (FIG. 18) ou do cainato (dados não apresentados) enquanto que a adição de péptidos de controlo não teve qualquer efeito neuroprotector. Ambos os péptidos L-JNKI1 e D-JNKI1 demonstraram inibir a morte neuronal, às 12 horas após o tratamento, enquanto que os péptidos TAT-vazios não tiveram qualquer efeito (FIG. 18).
Como verificado na FIG 18, a forma D dos péptidos penetradores na célula da invenção, i. e., D-JNKI1, foi superior na protecção dos neurónios durante períodos de tempo prolondados, i. e., 12 horas, 24 horas e 48 horas após exposição a 100 μΜ de NMDA. Estas micrografias indicam que às 24 horas após o tratamento, D-JNKI1 ainda proporcionava neuroprotecção 57 total, dado que as culturas de controlo e as culturas de tratamento com D-JNKI1 e NMDA eram comparáveis. A forma L da JNKI1 deixou de proteger os neurónios às 24 horas após o tratamento, presumivelmente porque as formas L dos péptidos são, de um modo geral, mais susceptíveis à degradação. Os péptidos TAT-vazios não afectaram a morte celular em quaisquer condições. 0 histograma na FIG. 18 representa o nível de morte neuronal, às 12, 24 e 48 horas após a exposição a 100 μΜ de NMDA, como indicado pela actividade da LDH no meio da placa de Petri. Os valores da absorvência, os quais representam a concentração de LDH, foram convertidos em valores de morte neuronal em %, pela divisão dos valores da absorvência pela absorvência média para a LDH total. A absorvência média para a LDH total foi obtida a partir do meio, mais os neurónios lisados.
Exemplo 21: Distribuição in Vivo de péptidos JNKI permeáveis em células
Para testar a praticabilidade da utilização dos péptidos permeáveis em células em aplicações in vivo, foi avaliada a sua capacidade de penetração no cérebro, utilizando L-JNKI1 marcado com FITC e D-JNKI 1. Para uma discussão da distribuição in vivo de uma proteína biologicamente activa num murganho, ver Schwarze et al., Science, 285:1569-72 (1999). Estas experiências mostraram que L-JNKI1 marcado com FITC e D-JNKI1 foram capazes de atravessarar a barreira hematoencefálica e de penetrar nos neurónios de murganhos e ratos adultos de várias idades. Tanto L-JNKI1 marcado com FTTC como D-JNKI1 foram capazes de penetrar nos neurónios no período de 1 hora após a injecção intraperitoneal (dados não apresentados). 58
Exemplo 22: Neuroprotecção pelos péptidos JNKI contra isguemia cerebral transiente e focal permanente
Num modelo de isquemia ligeira em murganhos, a artéria cerebral média esquerda foi obstruída durante 30 minutos, seguidos por 48 h de reperfusão. O grupo de controlo tratado com veículo recebeu uma injecção de, apenas, tampão fosfato salino (PBS) . No grupo de controlo tratado com veículo, esta oclusão resultou, sistematicamente, num enfarte grave contendo severamente células picnóticas, as quais foram, predominantemente, encontradas no córtex e no estrato em todos os cérebros e, em 7 dos cérebros, estas células foram, também, encontradas no hipocampo. 0 volume de enfarte médio foi de 67,4 mm3 (n = 12), nos indivíduos do grupo de controlo tratados com veículo.
Os indivíduos foram tratados com uma injecção intracerebro-ventricular (icv) de D-JNKI 1 (15,7 ng em 2 pL de PBS), para
avaliar a eficácia e a "janela terapêutica" do tratamento (i. e., o período após os danos, durante o qual o tratamento com os péptidos da invenção permanece eficaz). A FIG. 19A mostra secções coradas com violeta de cresilo que mostram exemplos típicos do enfarte resultante (barra, 1 mm). A FIG. 19B representa volumes de enfarte após a injecção icv de D-JNKI1 em tempos diferentes antes (-1 hora) ou depois (+3,6 ou 12 horas), após a oclusão da artéria cerebral média. Na FIG. 19B, um asterisco (*) indica que o resultado é estatisticamente diferente do controlo (como indicado por um teste de t). O pré-tratamento 1 hora antes da oclusão da artéria cerebral média, com a injecção icv de D-JNKI1, reduziu, 59 significativamente, o volume de enfarte medido 48 horas após a reperfusão, em 88%, para um volume de 7,8 mm3. (FIG. 19A-19B). A administração do péptido D-JNKI1, 3 ou 6 horas após a oclusão da artéria cerebral média, foi ainda significativamente protectora, uma vez que o volume de enfarte médio, para indivíduos injectados 3 horas após oclusão, foi reduzido para 5,8 mm3 (uma redução de 91%, em comparação com animais não tratados) e o volume de enfarte médio, para indivíduos injectados 6 horas após oclusão, foi reduzido para 4, 8 mm3 (uma redução de 93% em comparação com animais não tratados). Pelo contrário, a injecção do péptido D-JNKI1 às 12 horas após a oclusão de artéria cerebral média não foi, significativamente, protectora. A obtenção de isquemia completa, seguida por reperfusão, foi confirmada em todos os animais, pela monitorização do fluxo sanguíneo cerebral regional no território da artéria cerebral média esquerda.
Foram, também, avaliadas as capacidades protectoras de D-JNKI1 contra isquemia focal permanente em ratos jovens (P14). Uma zona isquémica no córtex cerebral de ratos P14, pela realização de uma oclusão permanente da artéria cerebral média, induzindo, deste modo, uma zona de degeneração significativa restringida ao córtex parietotemporal. Dado que os volumes cerebrais nos ratos P14 foram variáveis, as lesões foram expressas como uma percentagem do volume do hemisfério cerebral. D-JNKIl foi injectado intraperitonealmente numa concentração de 11 mg/kg, a qual corresponde a, aproximadamente, 340 pg. Foi administrado D-JNKIl, 30 minutos antes da oclusão da artéria cerebral média ou 6 ou 12 horas após a oclusão. Os ratos foram fixos 24 horas após a oclusão. Em cada um destes pontos temporais (i. e., administração a -30 minutos, +6 h ou +12 h) , D-JNKIl causou reduções significativas e estatisticamente 60 significativas do volume de enfarte, em comparação com animais de controlo (FIG. 20A-20B). A administração de D-JNKI1, 30 minutos antes da oclusão, originou uma redução do volume de enfarte de 68%, enquanto que a administração do péptido às 6 e 12 horas após oclusão originou reduções no volume de enfarte, respectivamente, de 78% e 49%.
Foi realizada análise imuno-histoquímica, para determinar a activação do factor de transcrição c-Jun, um alvo principal da JNK, nos cérebros de filhotes de rato com isquemia permanente. A fosforilação de c-Jun foi evidente em muitos neurónios no córtex peri-enfartado (FIG. 5C, barra = 200 μΜ) . Pelo contrário, em cérebros tratados com o péptido D-JNKI1, o córtex peri-enfartado foi negativo e foram, apenas, detectados alguns neurónios positivos, no limite da região enfartada.
Exemplo 22: Avaliação comportamental de potenciais efeitos laterais de péptidos JNKI
Tipicamente, a elevada toxicidade de outros compostos de neuroprotector limitou, significativamente, a sua utilização clínica. (Ver Gladstone et al., Stroke, 33:2123-36 (2002)). Foi utilizada a capacidade dos murganhos para se manterem num rotarod rotativo horizontal, como critério para efeitos secundários possíveis para doses diferentes de D-JNKI1 e de uma dose terapêutica de MK-801 (1 mg/kg, uma dose terapêutica padrão). Foi avaliada, em particular, a função motora dos murganhos, utilizando o teste do rotarod às 3 h, 24 h, 6 dias e 12 dias após injecções, tanto i. p. (11 e 110 mg/kg), como icv de D-JNKI 1 (2 pL contendo 15,7 ng ou 157 ng de D-JNKI1) . Foi 61 utilizada a injecçao i. p. de MK-801 (1 mg/kg) , como um composto de controlo, durante este processo de avaliação.
Os murganhos foram treinados no dia antes e na manhã do dia da experiência, de modo a reduzir a variabilidade entre indivíduos. As sessões de treino e de teste foram idênticas para os murganhos de controlo e injectados. A função motora de cada murganho foi examinada, imediatamente antes da injecção e a 1, 6 e 12 dias após a injecção. Os murganhos foram colocados no rotarod, o qual foi programado para acelerar uniformemente, de 4 para 40 rpm. Foi registada a latência até às quedas de cada murganho testado. Na Tabela 2 são apresentados os resultados desta avaliação, utilizando os métodos de rotarod como a latência mediana até à queda (medida em segundos).
TABELA 2: EFEITO DO D-JNKIl SOBRE A COORDENAÇÃO MOTORA
Latência Mediana até à queda (visualizações) DOSE -1 h +3 h 1 dia 6 dias 12 dias PBS 2 pL icv 234 202 238 268 246 MK-801 1 mg/kg i. p. 226 incapaz 174 233 292 D-JNKIl 11 mg/kg i. p. 204 221 372 287 418 110 mg/kg i. p. 276 266 447 416 325 15,7 ng icv 210 342 302 345 285 157 ng icv 260 200 253 338 335 2 pL PBS icv 234 202 238 268 246 Como verificado na Tabela 2, a coordenação motora revelou nao ser diminuída com as doses de D-JNKIl em i. p . e icv (i. e., a dose, 2,8 pL/Kg, que conferiu 90% de neuroprotecçao e uma dose 62 10 vezes mais elevada) . Pelo, contrário, MK-801 originou uma diminuição significativa da coordenação motora, dado que os murganhos foram incapazes de permanecer no rotor. (Ver e. g. , a Tabela 2; Dawson et al., Brain Res. 892:344:350 (2001) (descrevendo resultados semelhantes para outros neuroprotectores) e uma dose 10 vezes mais elevada de MK-801 matou todos os murganhos. Os efeitos secundários da dose mais baixa de MK-801 revelaram desaparecer, essencialmente, após 24 horas. Aos 6 e 15 dias após o tratamento com D-JNKI1, não foi verificado qualquer sinal de diminuição motora e as classificações no rotarod foram reproduzivelmente melhores do que nos murganhos de controlo.
EQUIVALENTES A partir da descrição detalhada anterior das formas de realização específicas da invenção, deve ser evidente que foram descritos péptidos bioactivos permeáveis em células únicos. Embora tenham sido aqui divulgadas em detalhe formas de realização particulares, isto foi realizado a título de exemplo, apenas para fins de ilustração e não pretende limitar no que respeita ao âmbito das reivindicações em anexo que se seguem.
LISTAGEM DE SEQUÊNCIAS
<110> Xiagen S.A <120> Inibidores peptídicos da via de transdução de sinal da JNK, permeáveis em células 63 <130> UOO1Ρ005WOEPT1T1 <140> <141> <150> documento US 10/165250 <151> 2002-06-07 <160> 33 <1 7 0> Patentln versão 3.3 <210> 1 <211> 23 <212> PRT <213> Desconhecido <220> <223> Descrição de sequência: péptido L-IB1 inibidor da JNK <400> 1
Asp Thr Tyr Arg Pro Lys Àrg Pro Thr Thr Asn Leu Phe Pro Gin 1 S 10 15
Vai Pro Arcf Ser Gin ftsp Th* 2Q <210> 2 <211> 21 <212> PRT <213> Desconhecido 64 <220> <223> Descrição de sequência: péptido L-IB2 inibidor da JNK <400> 2
Glu Glu Pro His Lys His Arg Pro Thr Thr Leu Arg Leu Thr Thr Leu 1 5 10 15
Gly Ala Gin Asp Ser 20 <210> 3 <211> 23 <212> PRT <213> Desconhecido <220> <223> Descrição de sequência: péptido D-IB1 inibidor da JNK <400> 3
Thr Asp Gin Ser Arg Pro Vai Gin Pro Phe Leu Asn Leu Thr Thr Pro 1 5 10 15
Arg Lys Pro Arg Tyr Thr Asp 20
<210> 4 <211> 21 <212> PRT <213> Desconhecido <22 0> <223> Descrição de sequência: péptido D-IB2 inibidor da JNK 65 <4Ο0> 4
Ser Asp Gin Ala Gly Leu Thr Thr Leu Arg Leu Thr Thr Pro Arg His 1 5 10 Lys His Pro Glu Glu 20 <210> 5 <211> 19 <212> PRT <213> Desconhecido <22 0> <223> Descrição de sequência: pépt (genérico) (XRPTTLXLXXXXXXXQDS/' <220> <221> VARIAÇÃO <222> (1) ..(1) <223> /substituir = "Arg" /substituir = "Asx" /substituir = "Cys" /substituir = "Glx" /substituir = "Gly" /substituir = "His" /substituir = "lie" /substituir = "Leu" /substituir = "Lys" /substituir = "Met" /substituir = "Phe" /substituir = "Pro" /substituir = "Ser" /substituir = "Thr" 15 inibidor da
JNK 66 /substituir = "Trp" /substituir = "Tyr" /substituir = "Vai" /substituir = "Xaa" /substituir = u rr <220> <221> VARIAÇÃO <222> (7) . . (7) <223> /substituir = "Arg" /substituir = "Asx" /substituir = "Cys" /substituir = "Glx" /substituir = "Gly" /substituir = "His" /substituir = "Ile" /substituir = "Leu" /substituir = "Lys" /substituir = "Met" /substituir = "Phe" /substituir = "Pro" /substituir = "Ser" /substituir = "Thr " /substituir = "Trp" /substituir = "Tyr" /substituir = "Vai" /substituir = "Xaa" /substituir = u rr <220> <221> VARIAÇÃO <222> (9)..(15) 67 <223> /substituir = "Arg" /substituir = "Asx" /substituir = "Cys" /substituir = "Glx" /substituir = "Gly" /substituir = "H i s " /substituir = "Ile" /substituir = "Leu" /substituir = "Lys" /substituir = "Met" /substituir = "Phe" /substituir = "Pro" /substituir = "Ser" /substituir = "Thr " /substituir = "Trp" /substituir = "Tyr " /substituir = "Vai" /substituir = "Xaa" /substituir = u rr <220> <221> VARIAÇÃO <222> (18)..(18) <223> /substituir = "Thr" <220> <221> VARIAÇÃO <222> (19)..(19) <223> /substituir = "Arg" /substituir = "Asx" /substituir = "Cys" /substituir = "Glx" 68 /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir <400> 5
Ala Arg Pro Thr Thr 1 5
Asp Ser Ala = "Gly" = " H i s " = " 11 e " = "Leu" = "Lys" = "Met" = "Phe" = "Pro" = "Ser" = "Thr" = "Trp" = "Tyr" = "Vai" = "Xaa"
Leu Ala Leu Ala Ala Ala 10
Ala Ala Ala Ala Gin 15
<210> 6 <211> 19 <212> PRT <213> Desconhecido <220>
JNK <223> Descrição de sequência: péptido D-IB inibidor da (genérico) (XS/TDQXXXXXXXLXLTTPRX) 69 <220>
<221> VARIAÇÃO (1) .. (1) /substituir = "Arg" /substituir = "Asx" /substituir = "Cys" /substituir = "Glx" /substituir = "Gly" /substituir = "H i s " /substituir = "lie" /substituir = "Leu" /substituir = "Lys" /substituir = "Met" /substituir = "Phe" /substituir = "Pro" /substituir = "Ser" /substituir = "Thr" /substituir = "Trp" /substituir = "Tyr" /substituir = "Vai" /substituir = "Xaa" /substituir = u rr <220>
<221> VARIAÇÃO <222> (2)..(2) <223> /substituir = "Thr" <220> <221> VARIAÇÃO <222> (5)..(11) <223> /substituir = "Arg" 70 /substituir = "Asx /substituir = "Cys /substituir = "Glx /substituir = "Gly /substituir = "His /substituir = "Ile /substituir = "Leu /substituir = "Lys /substituir = "Met /substituir = "Phe /substituir = "Pro /substituir = "Ser /substituir = "Thr /substituir = "Trp /substituir = "Tyr /substituir = "Vai /substituir = "Xaa1 /substituir = u rr <220> <221> VARIAÇÃO <222> (13)..(13) <223> /substituir = "Arg‘ /substituir = "Asx' /substituir = "Cys' /substituir = "Glx' /substituir = "Gly' /substituir = "His1 /substituir = "Ile1 /substituir = "Leu1 /substituir = "Lys1 /substituir = "Met' 71 /substituir = "Phe /substituir = "Pro /substituir = "Ser /substituir = "Thr /substituir = "Trp /substituir = "Tyr /substituir = "Vai /substituir = "Xaa /substituir = u rr <220> <221> VARIAÇÃO <222> (19)..(19) <223> /substituir = "Arg /substituir = "Asx /substituir = "Cys /substituir = "Glx· /substituir = "Gly /substituir = "His1 /substituir = "Ile‘ /substituir = "Leu1 /substituir = "Lys‘ /substituir = "Met ‘ /substituir = "Phe1 /substituir = "Pro' /substituir = "Ser' /substituir = "Thr' /substituir = "Trp1 /substituir = "Tyr1 /substituir = "Vai1 /substituir = "Xaa' /substituir = u rr 72 <400> 6
Ala Ser Asp Gin Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Leu Ala Leu Thr Thr 15 10 15
Pro Arg Ala
<210> 7 <211> 10 <212> PRT <213> Desconhecido <220>
<223> Descrição de sequência: péptido contendo a sequência TAT, L-TAT <400> 7
Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gin Arg Arg Arg 15 10
<210> 8 <211> 10 <212> PRT <213> Desconhecido <22 0>
<223> Descrição de sequência: péptido de retro-inverso contendo a sequência TAT D-TAT <400> 8
Arg Arg Arg Gin Arg Arg Lys Lys Arg Gly 15 10 73 17 <210> 9 <211> <212> <213> <220> <223> PRT Desconhecido
Descrição de sequência: péptido contendo a sequência TAT genérica L-genérico-TAT <22 0> <221> <222> <223> VARIAÇAO (D · · (4) /substituir = "Arg" /substituir = "Asx" /substituir = "Cys" /substituir = "Glx" /substituir = "Gly" /substituir = "H i s " /substituir = "Ile" /substituir = "Leu" /substituir = "Lys" /substituir = "Met" /substituir = "Phe" /substituir = "Pro" /substituir = "Ser" /substituir = "Thr" /substituir = "Trp" /substituir = "Tyr " /substituir = "Vai" /substituir = "Xaa" /substituir = u rr 74 <220> <221> VARIAÇÃO <222> (14)..(17) <223> /substituir = "Arg /substituir = "Asx /substituir = "Cys /substituir = "Glx /substituir = "Gly /substituir = "His /substituir = "Ile /substituir = "Leu /substituir = "Lys /substituir = "Met /substituir = "Phe /substituir = "Pro /substituir = "Ser /substituir = "Thr /substituir = "Trp /substituir = "Tyr' /substituir = "Vai1 /substituir = "Xaa1 /substituir = u rr <400> 9
Ala Ala Ala Ala Arg Lys Lys Arg Arg Gin Arg Arg Arg Ala Ala Ala 15 10 15
Ala
<210> 10 <211> 17 <212> PRT 75 <213> Desconhecido <220>
<223> Descrição de sequência: péptido contendo a sequência TAT genérica D-genérico-TAT <22 0>
<221> VARIAÇÃO (D · · (4) /substituir = "Arg" /substituir = "Asx" /substituir = "Cys" /substituir = "Glx" /substituir = "Gly" /substituir = "H i s " /substituir = "Ile" /substituir = "Leu" /substituir = "Lys" /substituir = "Met" /substituir = "Phe" /substituir = "Pro" /substituir = "Ser" /substituir = "Thr " /substituir = "Trp" /substituir = "Tyr " /substituir = "Vai" /substituir = "Xaa" /substituir = u rr <22 0> <221> VARIAÇÃO <222> (14)..(17) 76 <223> /substituir = "Arg /substituir = "Asx /substituir = "Cys /substituir = "Glx /substituir = "Gly /substituir = "His /substituir = "Ile /substituir = "Leu /substituir = "Lys /substituir = "Met /substituir = "Phe /substituir = "Pro /substituir = "Ser /substituir = "Thr' /substituir = "Trp1 /substituir = "Tyr' /substituir = "Vai1 /substituir = "Xaa1 /substituir = u rr <400> 10
Ala Ala Ala Ala Arg Arg Arg Gin Arg Arg Lys Lys Arg Ala Ala Ala 1 5 10 15
Ala
<' 210 > 11 <211> 35 <212> PRT <213> Desconhecido <220> 77 <223> Descrição de sequência: proteína de fusão L-TAT-IB1 inibidora da JNK <40 0> 11
Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gin Arg Arg Arg Pro Pro Asp Thr Tyr Arg 15 10 15
Pro Lys Arg Pro Thr Thr Leu Asn Leu Phe Pro Gin Vai Pro Arg Ser 20 25 30
Gin Asp Thr 35
<210> 12 <211> 33 <212> PRT <213> Desconhecido <22 0>
<223> Descrição de sequência: proteína de fusão L-TAT-IB2 inibidora da JNK <400> 12
Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gin Arg Arg Arg Pro Pro Glu Glu Pro His 1 5 10 15
Lys His Arg Pro Thr Thr Leu Arg Leu Thr Thr Leu Gly Ala Gin Asp 20 25 30
Ser
<210> 13 <211> 42 <212> PRT <213> Desconhecido 78 <220> <223> Descrição de sequência: proteína de fusão L-TAT-IB inibidora da JNK (genérica) (XXXXXXXRKKRRQRRRXXXXXXXXRPTTLXLXXXXXXXQDS/TX) <22 0> <221> VARIAÇÃO <222> (1)..(7) <223> /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir "Arg" "Asx" "Cys" "Glx" "Gly" "H i s " "lie" "Leu" "Lys" "Met" "Phe" "Pro" "Ser" "Thr" "Trp" 'Tyr' "Vai" "Xaa" JJ ry, ff <22 0> <221> VARIAÇÃO <222> (17)..(24) <223> /substituir = "Arg' 79 /substituir = "Asx" /substituir = "Cys" /substituir = "Glx" /substituir = "Gly" /substituir = "His" /substituir = "lie" /substituir = "Leu" /substituir = "Lys" /substituir = "Met" /substituir = "Phe" /substituir = "Pro" /substituir = "Ser" /substituir = "Thr " /substituir = "Trp" /substituir = "Tyr" /substituir = "Vai" /substituir = "Xaa" /substituir = u rr <220> <221> VARIAÇÃO <222> (30)..(30) <223> /substituir = "Arg" /substituir = "Asx" /substituir = "Cys" /substituir = "Glx" /substituir = "Gly" /substituir = "His" /substituir = "Ile" /substituir = "Leu" /substituir = "Lys" /substituir = "Met" 80 /substituir = "Phe /substituir = "Pro /substituir = "Ser /substituir = "Thr /substituir = "Trp /substituir = "Tyr /substituir = "Vai /substituir = "Xaa /substituir = u rr <220> <221> VARIAÇÃO <222> (32)..(38) <223> /substituir = "Arg /substituir = "Asx /substituir = "Cys /substituir = "Glx· /substituir = "Gly /substituir = "His1 /substituir = "lie1 /substituir = "Leu1 /substituir = "Lys* /substituir = "Met ‘ /substituir = "Phe1 /substituir = "Pro' /substituir = "Ser' /substituir = "Thr' /substituir = "Trp1 /substituir = "Tyr1 /substituir = "Vai1 /substituir = "Xaa' /substituir = u rr 81 <220> <221> VARIAÇÃO <222> (41)..(41) <223> /substituir = "Thr" <220> <221> VARIAÇÃO <222> (42)..(42) <223> /substituir = "Arg /substituir = "Asx /substituir = "Cys /substituir = "Glx /substituir = "Gly /substituir = "His /substituir = "lie /substituir = "Leu /substituir = "Lys /substituir = "Met /substituir = "Phe /substituir = "Pro /substituir = "Ser /substituir = "Thr /substituir = "Trp /substituir = "Tyr /substituir = "Vai /substituir = "Xaa /substituir = u rr 82 < 9 Ο Ο > 13
Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Arg Lys Lys Arg Arg Gin Arg Arg Arg 1 5 10 15
Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Arg Pro Thr Thr Leu Ala Leu Ala 20 25 30
Ala Ala Ala Ala Ala Ala Gin Asp Ser Ala 35 40
<210> 14 <211> 35 <212> PRT <213> Desconhecido <22 0> <223> Descrição de sequência: proteína de fusão D-TAT-IB1
inibidora da JNK <400> 14
Thr Asp Gin Ser Arg Pro Vai Gin Pro Phe Leu Asn Leu Thr Thr Pro 15 10 15
Arg Lys Pro Arg Tyr Thr Asp Pro Pro Arg Arg Arg Gin Arg Arg Lys 20 25 30
Lys Arg Gly 35
<210> 15 <211> 33 <212> PRT <213> Desconhecido <220>
<223> Descrição de sequência: proteína de fusão D-TAT-IB2 inibidora da JNK 83 <400> 15
Ser Asp Gin Ala Gly Leu Thr Thr Leu Arg Leu Thr Thr Pro Arg His 15 10 15
Lys His Pro Glu Glu Pro Pro Arg Arg Arg Gin Arg Arg Lys Lys Arg 20 25 30
Gly <210> 16 <211> 42 <212> PRT <213> Desconhecido <220> <223> Descrição de sequência: proteína de fusão D-TAT- inibidora da JNK (genérica) (XT/SDQXXXXXXXLXLTTPRXXXXXXXXRRRQRRKKRXXXXXXX) <22 0> <221> VARIAÇÃO <222> (D · · (D <223> /substituir = "Arg" /substituir = "Asx" /substituir = "Cys" /substituir = "Glx" /substituir = "Gly" /substituir = "His" /substituir = "Ile" /substituir = "Leu" /substituir = "Lys" /substituir = "Met" /substituir = "Phe" 84 /substituir = "Pro" /substituir = "Ser" /substituir = "Thr " /substituir = "Trp" /substituir = "Tyr" /substituir = "Vai" /substituir = "Xaa" /substituir = u rr <220> <221> VARIAÇÃO <222> (2) . . (2) <223> /substituir = "Ser" <220> <221> VARIAÇÃO <222> (5)..(11) <223> /substituir = "Arg" /substituir = "Asx" /substituir = "Cys" /substituir = "Glx" /substituir = "Gly" /substituir = "His" /substituir = "lie" /substituir = "Leu" /substituir = "Lys" /substituir = "Met" /substituir = "Phe" /substituir = "Pro" /substituir = "Ser" /substituir = "Thr" /substituir = "Trp" 85 /substituir /substituir /substituir /substituir <220> <221> VARIAÇÃO <222> (13)..(13) <223> /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir <220> <221> VARIAÇÃO <222> (19)..(26) <223> /substituir "Tyr" "Vai" "Xaa" "Arg" "Asx" "Cys" "Glx" "Gly" "H i s " "lie" "Leu" "Lys" "Met" "Phe" "Pro" "Ser" "Thr" "Trp" "Tyr" "Vai" "Xaa" "Arg" 86 /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = <220>
<221> VARIAÇÃO <222> (36)..(42) <223> /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = "Asx" "Cys" "Glx" "Gly" " H i s " "lie" "Leu" "Lys" "Met." "Phe" "Pro" "Ser" "Thr " "Trp" "Tyr" "Vai" "Xaa" /substituir = "Arg" "Asx" "Cys" "Glx" "Gly" "His" "Ile" "Leu" "Lys" "Met" "Phe" 87 /substituir = "Pro" /substituir = "Ser" /substituir = "Thr" /substituir = "Trp" /substituir = "Tyr" /substituir = "Vai" /substituir = "Xaa" /substituir _ tl ff <400> 16 Ala Thr Asp Gin Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Leu Ala Leu Thr Thr 1 5 10 15 Pro Arg Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Arg Arg Arg Gin Arg Arg 20 25 30 Lys Lys Arg Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala 35 40 <210> 17 <211> 29 <212> PRT <213> Desconhecido <220> <223> Descrição de sequência: : JBD de IB1, IBl-longo <400> 17 Pro Gly Thr Gly Cys Gly Asp Thr Tyr Arg Pro Lys Arg Pro Thr Thr 1 5 10 15 . Leu Asn Leu Phe Pro Gin Vai Pro Arg Ser Gin Asp Thr 20 25 <210> 18 88 <211> 27 <212> PRT <213> Desconhecido <220> <223> Descrição de sequência: JBD de IB2, IB2-longo <400> 18
Ile Pro Ser Pro Ser Vai Glu Glu Pro His Lys His Arg Pro Thr Thr 15 10 15
Leu Arg Leu Thr Thr Leu Gly Ala Gin Asp Ser 20 25 <210> 19 <211> 29 <212> PRT <213> Desconhecido <220> <223> Descrição de sequência: JBD de c-Jun, c-Jun <400> 19
Gly Ala Tyr Gly Tyr Ser Asn Pro Lys Ile Leu Lys Gin Ser Met Thr 15 10 15
Leu Asn Leu Ala Asp Pro Vai Gly Asn Leu Lys Pro His 20 25 <210> 20 <211> 29 <212> PRT <213> Desconhecido 89 <220> <223> Descrição de sequência: JBD de ATF2, ATF2 <400> 20
Thr Asn Glu Asp His Leu Ala Vai His Lys His Lys His Glu Met Thr 15 10 15
Leu Lys Phe Gly Pro Ala Arg Asn Asp Ser Vai Ile Vai 20 25 <210> 21 <211> 20 <212> PRT <213> Desconhecido <220> <223> Descrição de sequência: péptido L-JBD20 inibidor da JNK <400> 21
Arg Pro Lys Arg Pro Thr Thr Leu Asn Leu Phe Pro Gin Vai Pro Arg 1 5 10 15
Ser Gin Asp Thr 20 <210> 22 <211> 20 <212> PRT <213> Desconhecido <220> <223> Descrição de sequência: péptido inibidor da JNK D-JBD20 90 <4Ο0> 22
Thr Asp Gin Ser Arg Pro Vai Gin Pro Phe Leu Asn Leu Thr Thr Pro 15 10 15
Arg Lys Pro Arg 20
<210> 23 <211> 32 <21 PRT <213> Desconhecido <22 0> <223> Descrição de sequência: proteína de fusão L-TAT-JNKIl inibidora da JNK (i. e., L-TAT-JBD20) <400> 23
Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gin Arg Arg Arg Pro Pro Arg Pro Lys Arg 1 5 10 15
Pro Thr Thr Leu Asn Leu Phe Pro Gin Vai Pro Arg Ser Gin Asp Thr 20 25 30
<210> 24 <211> 32 <212> PRT <213> Desconhecido <22 0> <223> Descrição de sequência: proteína de fusão D-TAT-JNKIl inibidora da JNK (i. e., D-TAT-JBD20) 91 <4Ο0> 24
Thr Asp Gin Ser Arg Pro Vai Gin Pro Phe Leu Asn Leu Thr Thr Pro 1 5 10 15
Arg Lys Pro Arg Pro Pro Arg Arg Arg Gin Arg Arg Lys Lys Arg Gly 30 20 25 <210> 25 <211> 34 <212> PRT <213> Desconhecido <22 0> <223> Descrição de sequência: proteína de inibidora da JNK (genérica) (XXXXRKKRRQRRRXXXXRPTTLXLXXXXXXXQDS <220> <221> VARIAÇÃO <222> (D . . (4) <223> /substituir = "Arg" /substituir = "Asx" /substituir = "Cys" /substituir = "Glx" /substituir = "Gly" /substituir = "His" /substituir = "Ile" /substituir = "Leu" /substituir = "Lys" /substituir = "Met" /substituir = "Phe" /substituir = "Pro" 92 /substituir = "Ser" /substituir = "Thr " /substituir = "Trp" /substituir = "Tyr " /substituir = "Vai" /substituir = "Xaa" /substituir = u rr <220> <221> VARIAÇÃO <222> (14)..(17) <223> /substituir = "Arg" /substituir = "Asx" /substituir = "Cys" /substituir = "Glx" /substituir = "Gly" /substituir = "His" /substituir = "lie" /substituir = "Leu" /substituir = "Lys" /substituir = "Met" /substituir = "Phe" /substituir = "Pro" /substituir = "Ser" /substituir = "Thr" /substituir = "Trp" /substituir = "Tyr" /substituir = "Vai" /substituir = "Xaa" /substituir = u rr 93 <220> <220> <221> <222> <221> <222> <223> VARIAÇAO (23)..(23) /substituir = "Arg" /substituir = "Asx" /substituir = "Cys" /substituir = "Glx" /substituir = "Gly" /substituir = "H i s " /substituir = "Ile" /substituir = "Leu" /substituir = "Lys" /substituir = "Met" /substituir = "Phe" /substituir = "Pro" /substituir = "Ser" /substituir = "Thr " /substituir = "Trp" /substituir = "Tyr " /substituir = "Vai" /substituir = "Xaa" /substituir = u rr VARIAÇÃO (25)..(31) /substituir = "Arg" /substituir = "Asx" /substituir = "Cys" /substituir = "Glx" /substituir = "Gly" /substituir = "His" 94 <223> /substituir = "lie /substituir = "Leu /substituir = "Lys /substituir = "Met /substituir = "Phe /substituir = "Pro /substituir = "Ser /substituir = "Thr /substituir = "Trp /substituir = "Tyr /substituir = "Vai /substituir = "Xaa /substituir = u rr <220> <221> VARIAÇÃO <222> (39)..(39) <223> /substituir = "Thr <400> 25
Ala Ala Ala Ala Arg Lys Lys Arg Arg Gin Arg Arg Arg Ala Ala Ala 1 5 10 15
Ala Arg Pro Thr Thr Leu Ala Leu Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Gin 20 25 30
Asp Ser
<210> 26 <211> 34 <212> PRT <213> Desconhecido 95 <220> <223> Descrição de sequência: proteína de fusão D-TAT-JNKI1 inibidora da JNK (genérica) (S/TDQXXXXXXXLXLTTPRXXXXRRRQRRKKRXXXX) <22 0>
<221> VARIAÇÃO <222> (1)..(1) <223> /substituir = "Thr" <22 0> <221> VARIAÇÃO <222> (4)..(10) <223> /substituir = "Arg" /substituir = "Asx" /substituir = "Cys" /substituir = "Glx" /substituir = "Gly" /substituir = "H i s " /substituir = "lie" /substituir = "Leu" /substituir = "Lys" /substituir = "Met" /substituir = "Phe" /substituir = "Pro" /substituir = "Ser" /substituir = "Thr " /substituir = "Trp" /substituir = "Tyr " /substituir = "Vai" /substituir = "Xaa" /substituir = u rr 96 <220> <221> VARIAÇÃO <222> (12)..(12) <223> /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = <220> <221> VARIAÇÃO <222> (18)..(21) <223> /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = /substituir = "Arg" "Asx" "Cys" "Glx" "Gly" " H i s " " 11 e " "Leu" "Lys" "Met" "Phe" "Pro" "Ser" "Thr " "Trp" "Tyr " "Vai" "Xaa" "Arg" "Asx" "Cys" "Glx" "Gly" 97 /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir <220>
<221> VARIAÇÃO <222> (31) . . (39) <223> /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir /substituir " H i s " "lie" "Leu" "Lys" "Met" "Phe" "Pro" "Ser" "Thr" "Trp" "Tyr " "Vai" "Xaa" "Arg" "Asx" "Cys" "Glx" "Gly" "His" "lie" "Leu" "Lys" "Met" "Phe" "Pro" "Ser" "Thr" 98 /substituir = "Trp" /substituir = "Tyr" /substituir = "Vai" /substituir = "Xaa" /substituir = "" <400> 26
Ser Asp Gin Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Leu Ala Leu Thr Thr Pro 15 10 15
Arg Ala Ala Ala Ala Arg Arg Arg Gin Arg Arg Lys Lys Arg Ala Ala 20 25 30
Ala Ala
<210> 27 <211> 20 <212> PRT <213> Desconhecido <220>
<223> Descrição de sequência: péptido L-JBD20-mut inibidor da JNK <400> 27
Arg Pro Lys Arg Pro Thr Ala Ala Asn Ala Phe Pro Gin Vai Pro Arg 15 10 15
Ser Gin Asp Thr 20
<210> 28 <211> 20 <212> PRT 99 <213> Desconhecido <220>
<223> Descrição de sequência: péptido D-JBD20-mut inibidor da JNK <400> 28
Thr Asp Gin Ser Arg Pro Vai Ala Pro Phe Ala Asn Ala Ala Thr Pro 1 5 10 15
Arg Lys Pro Arg 20
<210> 29 <211> 21 <212> ADN <213> Desconhecido <220> <223> Descrição de sequência: sonda AP-1 duplamente marcada (ver a página 48 da descrição) <400> 29 cgcttgatga gtcagccgga a 21 <210> 30 <211> 20 <212> ADN <213> Desconhecido <220> 100 <223> Descrição de sequência: iniciador directo c-Fos para RT-PCR (ver a página 51 da descrição) <400> 30 gctgacagat acactccaag 20
<210> 31 <211> 20 <212> ADN <213> Desconhecido <220> <223> Descrição de sequência: iniciador inverso c-Fos para RT-PCR (ver a página 51 da descrição) <400> 31 eetagatgaí gccggaaaca 20
<210> 32 <211> 20 <212> ADN <213> Desconhecido <220> <223> Descrição de sequência: iniciador directo Actina para RT-PCR (ver a página 51 da descrição) <400> 32 aacggctccg gcatgtgcaa 20 <210> 33 101
<211> 21 <212> ADN <213> Desconhecido <220> <223> Descrição de sequência: iniciador reverso da Actina para RT-PCR (ver a página 51 da descrição) <400> 33 atigtagaag gtgtggtgcc a 21
Lisboa, 20 de Novembro de 2013 102
Claims (3)
- REIVINDICAÇÕES 1. Utilização de qualquer um dos péptidos incluindo qualquer uma das sequências de aminoácidos seleccionadas das SEQ ID N°: 3, 4, 6 e 22 ou sendo qualquer uma das sequências de aminoácidos seleccionadas das SEQ ID N°: 14-16, 24 e 26 ou dos péptidos tendo, pelo menos, uma identidade da sequência de 95% com estes péptidos, na preparação de um medicamento para o tratamento de um distúrbio neuronal associado com um evento excitotóxico devido a danos cerebrais ou a acidente vascular cerebral traumático ou a morte neuronal resultante de episódios epilépticos.
- 2. Utilização de acordo com a reivindicação 1, em que o péptido se destina a ser administradao por qualquer via de administração seleccionada do qrupo consistindo em distribuição intrauricular, intraperitoneal, nasal, intravenosa, oral e por emplastro.
- 3. Utilização de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 ou 2, em que o péptido é seleccionado da sequência de aminoácidos de acordo com a SEQ ID N° : 22 ou 24 e péptidos tendo, pelo menos, uma identidade da sequência de 95% com estes péptidos. Lisboa, 20 de Novembro de 2013 1
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