KR20230028619A - 아토피성 피부염 진단용 바이오마커 및 이의 용도 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 아토피성 피부염 진단용 바이오마커 및 이의 용도에 관한 것으로, 본 발명에 따른 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, TIGAR, SCIN, 또는 BOC는 TWAS 또는 전사체 메타분석을 이용하여 도출된 유전자로서, 아토피성 피부염에서 차등 발현되는 것을 확인하였다. 이에, LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, TIGAR, SCIN, 또는 BOC를 아토피성 피부염 진단용 바이오마커로 이용하여, 이들의 발현 패턴을 확인함으로써 아토피성 피부염 진단, 발병 위험도 예측, 또는 아토피성 피부염 치료용 후보물질을 스크리닝 하는 데에 유용하게 활용할 수 있을 것으로 기대된다.
Description
본 발명은 아토피성 피부염 진단용 바이오마커 및 이의 용도에 관한 것으로서, 아토피성 피부염 진단용 바이오마커, 이를 이용한 아토피성 피부염 진단 방법, 및 아토피성 피부염 치료용 후보물질의 스크리닝 방법을 제공하는 것이다.
아토피성 피부염(atopic dermatitis: AD)은 정상인에게는 해가 되지 않은 유발인자들에 피부가 과민반응상태를 보임으로써 만성적으로 피부에 염증이 생기는 만성 염증성 피부질환으로, 세균, 바이러스, 곰팡이 등에 의한 감염, 꽃가루 등과 같은 특정 물질, 음식물, 인공적 화합물질 등에 의하여 면역체계가 과민반응 하여 발생하는 것으로 알려져 있으나, 정확한 원인은 확실하게 밝혀진 바 없다. 아토피성 피부염의 전 세계 유병률은 10~20 % 정도로 보고되어 있으며, 필라그린(fillagrin, FLG)과 같은 유전자가 위험인자로 작용함이 알려져 있다. 아토피성 피부염은 그 자체로는 크게 위험하지 않을 수 있으나, 지속적인 재발 위험성, 피부 표면의 염증으로 인한 심리적 위축, 장기적인 스테로이드성 약물 사용으로 인한 부작용 등으로 인해 삶의 질을 크게 해칠 수 있다. 이에, 아토피성 피부염의 예방 또는 치료를 위해, 아토피성 피부염의 발병 위험도를 미리 예측하고 조기 진단하는 방법에 대한 연구가 필요한 실정이다.
기존 진단 마커 관련 연구들은 전장 유전체 연관분석(genome-wide association study, GWAS)을 통해 통계적으로 유의하게 작용하는 SNP를 찾은 뒤 해당 SNP의 ±1Mb 위치에 있는 유전자를 원인 유전자로 지정하는 방식으로 주로 이루어졌다. 하지만 이 방법은 정교한 매핑 방법이 아니기에 정확한 유전적 조절 관계를 설명하기 어려웠다. 반면 전장 전사체 연관 분석(transcriptomic-wide association study, TWAS)은 각 조직 별 전사체 발현 데이터와 LD block을 적용하여 보다 정확하고 향상된 통계학적 검정력을 바탕으로 유전적 변이에 의해 영향을 받아 질병을 일으킬 수 있는 원인 유전자를 특정할 수 있다.
또한, 메타분석은 기존의 여러 연구 결과를 통합하여 다시 분석을 진행하는 접근법으로서, 이를 이용하면 샘플수가 늘어남에 따라 통계적 검정력이 향상되어 기존의 개별 연구에서는 도출되지 않았던 새로운 결과가 나오기도 하며, 여러 연구를 통합한 만큼 더욱 표본집단에 가까운 결과를 얻어낼 수 있다. 생물학 전사체 데이터에 대한 메타 분석에서는 각각의 개별적 연구 사이에 존재하는 생물학 외적인 교란효과를 제거하는 방법을 이용하여 여러 데이터를 통합 분석하는 방식이 이루어지고 있다.
한편, 상관표시 맵(Connectivity map, CMAP)은 사용자가 입력한 유전자 발현 정보를 받아 해당 신호를 뒤집거나 모방할 수 있는 약물 혹은 저분자 화학물질을 제시해주는 도구이다. CMAP에는 여러 세포주에 1000여 종의 약물을 처리하였을 때 일어나는 전사체 범위의 변화가 저장되어 있어, 이를 Kolmogorov-Smirnov statistics(KS statistics)를 이용하여 사용자가 입력한 정보와 비교하여 결과를 도출한다. 기존의 여러 선행연구들에서 해당 도구를 사용하여 성공적으로 특정 질병에 대해 신약 재창출 접근법을 이용한 새로운 약물 후보를 도출하는 데에 성공하였다.
이에, 본 발명자들은 TWAS 및 전사체 메타분석 기법을 이용하여 아토피성 피부염의 병증에 영향을 주는 유전자의 발현 수준 패턴을 분석함으로써 아토피성 피부염 진단용 바이오마커를 발굴하고, 해당 패턴을 활용하여 신약 재창출 기법을 통해 아토피성 피부염에 대한 약물 후보군을 스크리닝 하였다.
Gusev, A., et al., Nat Genet, 2016 Mar; 48(3): 245-52.
본 발명자들은 TWAS 및 전사체 메타분석 기법을 이용하여 아토피성 피부염의 병증과 상관관계가 있는 유전자들을 확인하였으며, 상기 유전자들의 발현을 통해 아토피성 피부염에 대한 약물 후보물질을 발굴하였는 바, 이에 기초하여 본 발명을 완성하였다.
이에, 본 발명의 목적은 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자를 유효성분으로 포함하는, 아토피성 피부염 진단용 바이오마커 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질을 검출하는 물질을 유효성분으로 포함하는, 아토피성 피부염 진단용 조성물 또는 키트를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 피검체로부터 채취한 시료에서 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 단계를 포함하는, 아토피성 피부염 진단 또는 발병 위험도 예측을 위한 정보제공방법을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 (a) 피검체로부터 채취한 시료에 후보물질을 처리하는 단계;
(b) 상기 후보물질을 처리한 시료에서 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 단계; 및
(c) 상기 LINGO4, C1orf162, NOCT, 및 TIGAR로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 후보물질 처리 전에 비해 감소된 경우, 또는 상기 RFX5, P4HA2, RBM17, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 후보물질 처리 전에 비해 증가된 경우, 상기 후보물질을 아토피성 피부염 치료용 후보물질로 선택하는 단계를 포함하는, 아토피성 피부염 치료용 후보물질 스크리닝 방법을 제공하는 것이다.
그러나, 본 발명이 이루고자 하는 기술적 과제는 이상에서 언급한 과제에 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 과제들은 아래의 기재로부터 본 발명이 속하는 기술 분야의 통상의 지식을 가진 자에게 명확하게 이해될 수 있을 것이다.
상기와 같은 목적을 달성하기 위해 본 발명은 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자를 유효성분으로 포함하는, 아토피성 피부염 진단용 바이오마커 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명은 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질을 검출하는 물질을 유효성분으로 포함하는, 아토피성 피부염 진단용 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 조성물을 포함하는, 아토피성 피부염 진단용 키트를 제공한다.
본 발명의 일 구현예로서, 상기 물질은 프라이머, 프로브, 압타머, 및 항체로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
또한, 본 발명은 피검체로부터 채취한 시료에서 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 단계를 포함하는, 아토피성 피부염 진단을 위한 정보제공방법을 제공한다.
본 발명의 일 구현예로서, 상기 LINGO4, C1orf162, NOCT, 및 TIGAR로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 증가된 경우; 또는
상기 RFX5, P4HA2, RBM17, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 감소된 경우, 아토피성 피부염으로 판정하는 단계를 더 포함할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
또한, 본 발명은 피검체로부터 채취한 시료에서 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 단계를 포함하는, 아토피성 피부염의 발병 위험도 예측을 위한 정보제공방법을 제공한다.
본 발명의 일 구현예로서, 상기 LINGO4, C1orf162, NOCT, 및 TIGAR로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 증가된 경우; 또는
상기 RFX5, P4HA2, RBM17, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 감소된 경우, 아토피성 피부염에 걸릴 위험이 높은 것으로 판정하는 단계를 더 포함할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
또한, 본 발명은 (a) 피검체로부터 채취한 시료에 후보물질을 처리하는 단계;
(b) 상기 후보물질을 처리한 시료에서 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 단계; 및
(c) 상기 LINGO4, C1orf162, NOCT, 및 TIGAR로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 후보물질 처리 전에 비해 감소된 경우, 또는 상기 RFX5, P4HA2, RBM17, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 후보물질 처리 전에 비해 증가된 경우, 상기 후보물질을 아토피성 피부염 치료용 후보물질로 선택하는 단계를 포함하는, 아토피성 피부염 치료용 후보물질 스크리닝 방법을 제공한다.
본 발명의 일 구현예로서, 상기 아토피성 피부염 치료용 후보물질은 2-데옥시-D-글루코스(2-deoxy-D-glucose), 파라로사닐린(pararosaniline), 칸타리딘(cantharidin), MG-132, 및 1,4-크리센퀴논(1,4-chrysenequinone)로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명의 다른 구현예로서, 상기 시료는 피부 조직, 비장 조직, 갑상선 조직, 전혈, 림프구, 및 섬유아세포로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
또한, 본 발명은 피검체로부터 채취한 시료에서 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 단계를 포함하는, 아토피성 피부염 진단 또는 발병 위험도 예측 방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질을 검출하는 물질을 유효성분으로 포함하는 조성물의 아토피성 피부염 진단 또는 발병 위험도 예측 용도를 제공한다.
또한, 본 발명은 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질을 검출하는 물질의 아토피성 피부염 진단 또는 발병 위험도 예측용 제제의 제조를 위한 용도를 제공한다.
본 발명에 따른 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 또는 BOC는 TWAS 또는 전사체 메타분석을 이용하여 도출된 유전자로서, 아토피성 피부염에서 차등 발현되는 것을 확인하였다. 이에, LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 또는 BOC를 아토피성 피부염 진단용 바이오마커로 이용하여, 이들의 발현 패턴을 확인함으로써 아토피성 피부염 진단, 발병 위험도 예측, 또는 아토피성 피부염 치료용 후보물질을 스크리닝 하는 데에 유용하게 활용할 수 있을 것으로 기대된다.
도 1a는 본 발명의 일 구현예에 따른 TWAS 분석 결과를 맨하탄 플롯으로 나타낸 도면이다.
도 1b는 본 발명의 일 구현예에 따른 TWAS-GSEA를 이용하여 진행한 생물학적 기작 농축 분석 결과를 히트맵으로 나타낸 도면이다.
도 2a 내지 2c는 본 발명의 일 구현예에 따른 전사체 메타분석 결과를 나타낸 것으로, 도 2a는 차원축소 결과, 도 2b는 단일 연구와 메타 분석 결과의 비교를 나타낸 벤 다이어그램, 도 2c는 DEG들의 전반적인 발현값을 히트맵으로 나타낸 도면이다.
도 3a 내지 3c는 본 발명의 일 구현예에 따른 TWAS 분석 결과 도출된 유의미한 신호와 전사체 메타분석 결과 도출된 DEG를 이용하여 구축한 PPI-네트워크의 서브네트워크 분석 결과를 나타낸 도면이다.
도 4a는 본 발명의 일 구현예에 따른 TWAS 신호와 메타분석 결과 도출된 DEG를 이용하여 분석한 약물의 농축 스코어 간의 상관관계를 시각화한 산점도를 나타낸 도면이다.
도 4b는 본 발명의 일 구현예에 따른 약물들에 대한 제품 스코어의 계산 결과를 나타낸 산점도를 나타낸 도면이다.
도 4c는 본 발명의 일 구현예에 따른 5개의 아토피성 피부염 약물 후보군과 4개의 기존 아토피성 피부염 약물간의 구조적 유사성을 분석한 결과를 나타낸 도면이다.
도 4d는 본 발명의 일 구현예에 따른 MG-132를 제외한 4개의 아토피성 피부염 약물 후보군과 기존 아토피성 피부염 약물간의 기능적 유사도를 분석한 결과를 나타낸 도면이다.
도 1b는 본 발명의 일 구현예에 따른 TWAS-GSEA를 이용하여 진행한 생물학적 기작 농축 분석 결과를 히트맵으로 나타낸 도면이다.
도 2a 내지 2c는 본 발명의 일 구현예에 따른 전사체 메타분석 결과를 나타낸 것으로, 도 2a는 차원축소 결과, 도 2b는 단일 연구와 메타 분석 결과의 비교를 나타낸 벤 다이어그램, 도 2c는 DEG들의 전반적인 발현값을 히트맵으로 나타낸 도면이다.
도 3a 내지 3c는 본 발명의 일 구현예에 따른 TWAS 분석 결과 도출된 유의미한 신호와 전사체 메타분석 결과 도출된 DEG를 이용하여 구축한 PPI-네트워크의 서브네트워크 분석 결과를 나타낸 도면이다.
도 4a는 본 발명의 일 구현예에 따른 TWAS 신호와 메타분석 결과 도출된 DEG를 이용하여 분석한 약물의 농축 스코어 간의 상관관계를 시각화한 산점도를 나타낸 도면이다.
도 4b는 본 발명의 일 구현예에 따른 약물들에 대한 제품 스코어의 계산 결과를 나타낸 산점도를 나타낸 도면이다.
도 4c는 본 발명의 일 구현예에 따른 5개의 아토피성 피부염 약물 후보군과 4개의 기존 아토피성 피부염 약물간의 구조적 유사성을 분석한 결과를 나타낸 도면이다.
도 4d는 본 발명의 일 구현예에 따른 MG-132를 제외한 4개의 아토피성 피부염 약물 후보군과 기존 아토피성 피부염 약물간의 기능적 유사도를 분석한 결과를 나타낸 도면이다.
본 발명의 일 실험예에서는 전장 전사체 연관분석(TWAS)을 통하여 아토피성 피부염과 유의미한 연관성을 나타내는 LINGO4, RFX4, P4HA2, 및 RBM17 유전자를 도출하였으며, 아토피성 피부염에서 LINGO4는 증가, RFX5, P4HA2, 및 RBM17은 감소되어 있는 것을 확인하였다(실험예 1 참조).
본 발명의 다른 실험예에서는 전사체 메타분석을 통하여 아토피성 피부염과 유의미한 연관성을 나타내는 C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC 유전자를 도출하였으며, 아토피성 피부염에서 C1orf162, NOCT, 및 TIGAR는 증가, SCIN 및 BOC는 감소되어 있는 것을 확인하였다(실험예 2 참조).
본 발명의 또 다른 실험예에서는 유의미하게 도출된 TWAS 신호와 전사체 메타분석 결과 도출된 차별 발현 유전자(DEG)를 이용하여 구축한 단백질-단백질 상호작용(PPI) 네트워크의 서브네트워크를 통해 두 분석에서 도출된 유전자들 간의 연결성을 확인하였다(실험예 3 참조).
본 발명의 또 다른 실험예에서는 TWAS 및 전사체 메타분석 결과를 통합하고 상관표시 맵(CMAP)을 이용하여 아토피성 피부염과 관련된 유전자의 발현 패턴을 변화시킬 수 있는 약물을 스크리닝하였으며, 그 결과 2-데옥시-D-글루코스, 파라로사닐린, 칸타리딘, MG-132, 및 1,4-크리센퀴논을 아토피성 피부염의 잠재적 치료 후보물질로 선정하였다(실험예 4 참조).
이에, 본 발명은 LINGO4(leucine rich repeat and Ig domain containing 4), RFX5(regulatory factor X5), P4HA2(prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 2), RBM17(RNA binding motif protein 17), C1orf162(chromosome 1 open reading frame 162), NOCT(nocturnin), TIGAR(TP53 induced glycolysis regulatory phosphatase), SCIN(scinderin), 및 BOC(BOC cell adhesion associated, oncogene regulated)로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자를 유효성분으로 포함하는, 아토피성 피부염 진단용 바이오마커 조성물을 제공한다.
본 발명에 있어서, “아토피성 피부염”이란 주로 유아기 혹은 소아기에 시작되는 만성적이고 재발성의 염증성 피부질환으로 소양증(가려움증)과 피부건조증 및 특징적인 습진을 동반한다. 유아기에는 얼굴과 팔다리의 펼쳐진 쪽 부분에 습진으로 시작되지만, 성장하면서 특징적으로 팔이 굽혀지는 부분과 무릎 뒤의 굽혀지는 부위에 습진의 형태로 나타나며, 많은 경우에 성장하면서 자연히 호전되는 경향을 보인다. 어른의 경우 접히는 부위 피부가 두꺼워지는 태선화(lichenification)가 나타나고, 유소아기에 비해 얼굴에 습진이 생기는 경우가 많다.
본 발명에 있어서, “바이오마커”란 정상이나 병적인 상태를 구분할 수 있거나 치료반응을 예측할 수 있고 객관적으로 측정이 가능한 표지자로서, “아토피성 피부염 진단용 바이오마커”란 생물학적 시료에서 아토피성 피부염 여부를 구분하여 진단할 수 있는 단백질, DNA, RNA, 대사 물질 등을 의미한다. 본 발명에 따른 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 또는 BOC 유전자는 아토피성 피부염에서 발현이 유의적으로 증가 또는 감소하였는 바, 아토피성 피부염 진단용 바이오마커로 이용될 수 있다.
본 발명에 있어서, LINGO4(Gene ID: 339398) 유전자는 NCBI Reference Sequence: NM_001004432.4의 염기서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에 있어서, RFX5(Gene ID: 5993) 유전자는 NCBI Reference Sequence: NM_001025603.2의 염기서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에 있어서, P4HA2(Gene ID: 8974) 유전자는 NCBI Reference Sequence: NM_001017974.2의 염기서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에 있어서, RBM17(Gene ID: 84991) 유전자는 NCBI Reference Sequence: NM_032905.5의 염기서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에 있어서, C1orf162(Gene ID: 128346) 유전자는 NCBI Reference Sequence: NM_001300834.2의 염기서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에 있어서, NOCT(Gene ID: 25819) 유전자는 NCBI Reference Sequence: NM_012118.4의 염기서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에 있어서, TIGAR(Gene ID: 57103) 유전자는 NCBI Reference Sequence: NM_020375.3의 염기서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에 있어서, SCIN(Gene ID: 85477) 유전자는 NCBI Reference Sequence: NM_001112706.3의 염기서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에 있어서, BOC(Gene ID: 91653) 유전자는 NCBI Reference Sequence: NM_001378074.1의 염기서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명의 다른 양태로서, 본 발명은 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질을 검출하는 물질을 유효성분으로 포함하는, 아토피성 피부염 진단용 조성물을 제공한다.
상기 단백질은 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자에 의해 암호화되는 것일 수 있다.
본 발명에 있어서, “진단”은 병리 상태의 존재 또는 특징을 확인하는 것을 의미한다. 본 발명의 목적상, 진단은 아토피성 피부염 여부를 확인하는 것이다.
본 발명에 있어서, “검출”이란 목적하는 물질의 존재(발현) 여부를 측정 및 확인하는 것, 또는 목적하는 물질의 존재 수준(발현 수준)의 변화를 측정 및 확인하는 것을 모두 포함하는 의미이다. 같은 맥락에서, 본 발명에서 상기 유전자, 이의 mRNA, 또는 단백질의 발현수준을 측정하는 것은 발현 여부를 측정하는 것(즉, 발현 유무를 측정하는 것), 또는 질적, 양적 변화 수준을 측정하는 것을 의미한다. 상기 측정은 정성적인 방법(분석)과 정량적인 방법을 모두 포함하여 제한 없이 수행될 수 있다. 상기 유전자, 이의 mRNA, 또는 단백질의 존재 여부 측정에 있어서 정성적 방법과 정량적 방법의 종류는 당업계에 잘 알려져 있으며, 본 명세서에서 기술한 실험법들이 이에 포함된다.
본 발명에 있어서, 상기 물질은 상기 유전자, 이의 mRNA, 또는 단백질에 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브, 압타머, 및 항체로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에 있어서, “프라이머(primer)”란 DNA 합성의 개시점(starting point)으로 작용하는 짧은 단일가닥 올리고뉴클레오티드(single strand oligonucleotide)이다. 프라이머는 적합한 완충액(buffer)와 온도 조건에서 주형(template)인 폴리뉴클레오티드에 특이적으로 결합하고, DNA 중합효소가 프라이머에 주형 DNA에 상보적인 염기를 갖는 뉴클레오사이드 트리포스페이트를 추가하여 연결함으로써 DNA가 합성된다. 프라이머는 일반적으로 15 내지 30개의 염기서열로 이루어져 있으며, 염기 구성과 길이에 따라 주형 가닥에 결합하는 온도(melting temperature, Tm)가 달라진다. 프라이머의 서열은 주형의 일부 염기 서열과 완전하게 상보적인 서열을 가질 필요는 없으며, DNA 합성을 통해 mRNA 또는 cDNA의 특정 구간을 증폭하여 mRNA의 양을 측정하려는 목적에 맞는 길이와 상보성을 갖는 것이면 충분하다. 따라서 본 발명에서 상기 유전자 또는 이의 mRNA의 cDNA 또는 genomic DNA의 염기서열을 참조하여 프라이머 쌍을 용이하게 디자인할 수 있다. 상기 증폭 반응을 위한 프라이머는 증폭하고자 하는 mRNA의 특정 구간의 양쪽 끝부분의 주형(또는 센스, sense)과 반대편(안티센스, antisense)에 각각 상보적으로 결합하는 한 세트(쌍)으로 구성된다.
본 발명에 있어서, “프로브(probe)”는 특정 유전자의 mRNA나 cDNA(complementary DNA), DNA 등에 특이적으로 결합할 수 있는 짧게는 수개 내지 길게는 수백 개의 염기(base pair) 길이의 RNA 또는 DNA 등 폴리뉴클레오티드의 단편을 의미하며, 표지(labeling)되어 있어서 결합하는 대상 mRNA나 cDNA의 존재 유무, 발현양 등을 확인할 수 있다. 프로브의 선택 및 혼성화 조건은 당업계에 공지된 기술에 따라 적절하게 선택할 수 있다. 상기 프로브는 대립형질(또는 대립유전자, allele)을 검출하기 위한 진단 방법 등에 사용될 수 있다. 상기 진단 방법에는 서던 블롯 등과 같은 핵산의 혼성화에 근거한 검출 방법들이 포함되며, DNA 칩을 이용한 방법에서 DNA 칩의 기판에 미리 결합된 형태로 제공될 수도 있다.
본 발명에서, 프라이머 또는 프로브는 포스포아미다이트(phosphoramidite) 고체지지체 합성법이나 기타 널리 공지된 방법을 이용하여 화학적으로 합성할 수 있다. 또한 프라이머 또는 프로브는 검출하고자 하는 표적이 되는 폴리뉴클레오티드와의 혼성화를 방해하지 않는 범위에서 당해 기술분야에 공지된 방법에 따라 다양하게 변형시킬 수 있다. 이러한 변형의 예로는 메틸화, 캡화, 천연 뉴클레오티드 하나 이상의 동족체로의 치환 및 뉴클레오티드 간의 변형, 예를 들면 하전되지 않은 연결체(예: 메틸 포스포네이트, 포스포트리에스테르, 포스포로아미데이트, 카바메이트 등) 또는 하전된 연결체(예: 포스포로티오에이트, 포스포로디티오에이트 등), 그리고 형광 또는 효소를 이용한 표지물질(labeling material)의 결합 등이 있다.
본 발명에 있어서, 상기 프라이머 또는 프로브는 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자 또는 이의 mRNA를 검출할 수 있는 것이라면 특정 서열로 한정되지 않는다.
본 발명에 있어서, "압타머(aptamer)"란 그 자체로 안정된 삼차구조를 가지면서 표적분자에 높은 친화성과 특이성으로 결합할 수 있는 특징을 가진 단일가닥 핵산(DNA, RNA 또는 변형핵산)을 의미하며, SELEX(Systematic Evolution of Ligands of Exponential enrichment)라는 방법으로 원하는 다양한 목적 물질(단백질, 당, 염색물질, DNA, 금속이온, 세포 등)에 대한 압타머를 개발할 수 있다.
본 발명에 있어서, “항체(antibody)”란 항원성 부위에 대해서 지시되어 특이적으로 결합하는 단백질 분자를 의미한다. 항체는 당업계에서 통상적으로 실시되는 방법들, 예를 들어, 융합 방법, 재조합 DNA 방법, 또는 파아지 항체 라이브러리 방법 등에 의해 제조될 수 있다. 일부 실시형태에서, 항체 또는 항체의 단편은 인간, 마우스, 래트, 햄스터, 토끼, 또는 낙타 등을 포함한, 상이한 유기체에서 유래될 수 있으며, 예컨대 단클론 또는 다클론 항체, 면역학적으로 활성인 단편, 항체 중쇄, 인간화 항체, 항체 경쇄, 유전자 조작된 단일쇄 Fν 분자, 또는 키메릭 항체 등일 수 있다. 본 발명에 있어서, 상기 항체는 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자에 의해 암호화되는 단백질을 검출할 수 있는 것이라면 특정 항체의 종류로 한정되지 않는다.
본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 상기 아토피성 피부염 진단용 조성물을 포함하는, 아토피성 피부염 진단용 키트를 제공한다.
본 발명에 있어서, “키트”는 상기 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 이의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 물질을 포함함으로써, 아토피성 피부염을 진단할 수 있도록 하는 도구를 의미한다. 본 발명의 키트에는 상기 유전자, mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 물질 외에도 이들의 검출 방법에 통상적으로 필요한 다른 구성성분, 조성물, 용액, 장치 등이 포함될 수 있다. 이때, 상기 유전자, mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 물질은 1회 이상 횟수에 제한 없이 작용시킬 수 있으며, 각 물질을 적용하는 선후에는 제한이 없고, 각 물질의 적용은 동시에 진행될 수도 있고 미시에 진행될 수도 있다.
본 발명에 있어서, 상기 키트는 컨테이너; 지시서; 및 상기 유전자, mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 물질을 포함할 수 있다. 상기 컨테이너는 상기 물질을 포장하는 역할을 할 수 있고, 보관 및 고정하는 역할을 할 수도 있다. 상기 컨테이너의 재질은 예컨대, 플라스틱, 유리병 등일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 피검체로부터 채취한 시료에서 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 단계를 포함하는, 아토피성 피부염 진단을 위한 정보제공방법을 제공한다.
본 발명에 있어서, 상기 LINGO4, C1orf162, NOCT, 및 TIGAR로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 증가된 경우; 또는
상기 RFX5, P4HA2, RBM17, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 감소된 경우, 아토피성 피부염으로 판정하는 단계를 더 포함할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 피검체로부터 채취한 시료에서 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 단계를 포함하는, 아토피성 피부염의 발병 위험도 예측을 위한 정보제공방법을 제공한다.
본 발명에 있어서, 상기 LINGO4, C1orf162, NOCT, 및 TIGAR로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 증가된 경우; 또는
상기 RFX5, P4HA2, RBM17, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 감소된 경우, 아토피성 피부염에 걸릴 위험이 높은 것으로 판정하는 단계를 더 포함할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에 있어서, “발현”은 폴리펩티드(polypeptide)가 구조 유전자로부터 생산되는 과정을 지칭한다. 상기 과정은 유전자의 mRNA로의 전사, 및 이러한 mRNA의 폴리펩티드(들)로의 해독을 포함한다.
본 발명에 있어서, 상기 유전자 또는 이의 mRNA 발현 수준을 검출하기 위한 방법으로는, 당업계에 공지된 방법을 이용할 수 있으며, 예컨대 중합효소연쇄반응(polymerase chain reaction, PCR), 역전사 중합효소연쇄반응(reverse transcription polymerase chain reaction, RT-PCR), 경쟁적 역전사 중합효소반응(Competitive RT-PCR), 실시간 중합효소연쇄반응(Real-time PCR, quantitative PCR, quantitative real-time PCR), RNase 보호 분석법(RPA; RNase protection assay), 서던 블롯팅(southern blotting), 노던 블롯팅(Northern blotting), 및 DNA 칩으로 이루어진 군으로부터 선택되는 방법을 이용할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에 있어서, 상기 단백질의 발현 수준을 검출하기 위한 방법으로는, 당업계에 공지된 방법을 이용할 수 있으며, 예컨대 웨스턴블롯팅, 엘라이자(enzyme linked immunosorbent assay, ELISA), 방사선면역분석(RIA: Radioimmunoassay), 방사 면역 확산법(radioimmunodiffusion), 오우크테로니(Ouchterlony) 면역확산법, 로케트(rocket) 면역전기영동, 조직면역 염색, 면역침전 분석법(Immunoprecipitation Assay), 보체 고정 분석법(Complement Fixation Assay), 유세포분석(Fluorescence Activated Cell Sorter, FACS), 및 단백질 칩(protein chip)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 방법을 이용할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에 있어서, “피검체”는 아토피성 피부염의 진단 또는 발병 위험도를 예측하기 위한 대상을 의미하고, 보다 구체적으로는 인간 또는 비-인간인 영장류, 생쥐 (mouse), 쥐 (rat), 개, 고양이, 말, 및 소 등의 포유류를 의미한다.
본 발명에 있어서, “시료”는 아토피성 피부염을 진단하거나 발병 위험도를 예측하고자 하는 피검체로부터 채취된 것이라면 제한 없이 사용할 수 있으며, 예를 들어 생검 등으로 얻어진 세포나 조직, 혈액, 전혈, 혈청, 혈장, 타액, 뇌척수액, 각종 분비물, 소변, 대변 등일 수 있다. 본 발명에 있어서, 상기 시료는 피부 조직, 비장 조직, 갑상선 조직, 전혈, 림프구, 및 섬유아세포로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상일 수 있으며, 본 발명의 일 실시예 또는 실험예에 따르면 치골상 피부(suprapubic skin), 하지 피부(lower leg skin), 비장 조직, 갑상선 조직, 전혈, NTR(Netherlands Twin Register) 혈액, YFS(Young Finns Study) 혈액, EBV(Epstein-Barr) 형질전환된 림프구, 또는 섬유아세포일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. 상기 시료는 검출에 사용하기 전에 전처리할 수 있다. 예를 들어, 균질화(homogenization), 여과, 증류, 추출, 농축, 방해 성분의 불활성화, 시약의 첨가 등을 포함할 수 있다.
본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 (a) 피검체로부터 채취한 시료에 후보물질을 처리하는 단계;
(b) 상기 후보물질을 처리한 시료에서 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 단계; 및
(c) 상기 LINGO4, C1orf162, NOCT, 및 TIGAR로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 후보물질 처리 전에 비해 감소된 경우, 또는 상기 RFX5, P4HA2, RBM17, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 후보물질 처리 전에 비해 증가된 경우, 상기 후보물질을 아토피성 피부염 치료용 후보물질로 선택하는 단계를 포함하는, 아토피성 피부염 치료용 후보물질 스크리닝 방법을 제공한다.
본 발명에 있어서, “후보물질”은 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 증감을 측정하기 위하여 스크리닝에서 사용되는 미지의 물질을 의미하며, 뉴클레오티드, DNA, RNA, 아미노산, 앱타머, 단백질, 줄기세포, 줄기세포 배양액, 화합물, 미생물 배양액 또는 추출물, 천연물, 및 천연추출물로 이루어진 군으로부터 선택되는 것일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에 있어서, 상기 아토피성 피부염 치료용 후보물질은 2-데옥시-D-글루코스(2-deoxy-D-glucose), 파라로사닐린(pararosaniline), 칸타리딘(cantharidin), MG-132, 및 1,4-크리센퀴논(1,4-chrysenequinone)로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 피검체로부터 채취한 시료에서 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 단계를 포함하는, 아토피성 피부염 진단 또는 발병 위험도 예측 방법을 제공한다.
본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질을 검출하는 물질을 유효성분으로 포함하는 조성물의 아토피성 피부염 진단 또는 발병 위험도 예측 용도를 제공한다.
본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질을 검출하는 물질의 아토피성 피부염 진단 또는 발병 위험도 예측용 제제의 제조를 위한 용도를 제공한다.
본 발명에 있어서, “포함하는” 이라는 용어가 사용될 때, 이는 특별히 반대되는 기재가 없는 한 다른 구성 요소를 제외하는 것이 아니라 다른 구성 요소를 더 포함할 수 있는 것을 의미한다. 본 발명 전체에서 사용되는 정도의 용어 “~(하는) 단계” 또는 “~의 단계”는 “~ 를 위한 단계”를 의미하지 않는다.
이하, 본 발명의 이해를 돕기 위하여 바람직한 실시예 및 실험예를 제시한다. 그러나 하기의 실시예 및 실험예는 본 발명을 보다 쉽게 이해하기 위하여 제공되는 것일 뿐, 하기 실시예 및 실험예에 의해 본 발명의 내용이 한정되는 것은 아니다.
[실시예]
실시예 1. 전장 유전체 연관 분석(GWAS) 요약 통계
연구에 사용된 전장 유전체 연관 분석(genome-wide association study, GWAS) 요약 통계(summary statistics)는 GWAS Atlas(https://atlas.ctglab.nl/)에서 다운로드 받았다. 해당 데이터의 Atlas Id는 3606로, 총 289307 명의 정보가 들어 있는 데이터로서 그 중 환자군은 9831명, 대조군은 279476명이 포함되어 있다.
실시예 2. 전장 전사체 연관 분석(TWAS)
전장 전사체 연관 분석(transcriptomic-wide association study, TWAS)은 FUSION 소프트웨어를 이용하여 진행되었다. 분석에 사용된 래퍼런스 LD 구조는 1000 Genome project의 것을 사용하였으며 GWAS 데이터의 전처리는 LDSC 소프트웨어를 사용하여 LD-score 형태로 변환하였다. 전사체 발현 데이터의 래퍼런스로는 두 개의 혈액 데이터(Netherlands Twin Register: NTR, Young Finns Study: YFS)와 GTEx 데이터를 사용하였으며, 그 중 아토피성 피부염과의 연관성이 밝혀진 총 7 개의 조직(형질전환된 섬유아세포(전층(full thickness) 피부 샘플로부터 배양한 1차 세포주(primary cell line)), 치골상 피부(suprapubic skin), 하지 피부(lower leg skin), 비장, EBV(Epstein-Barr) 형질전환된 림프구, 갑상선, 전혈)에 대한 패널을 사용하였다(Nat Genet. 2013 Jun; 45(6):580-5). 상기 모든 데이터, 각 SNP 및 유전자에 주어진 가중치(weight) 데이터는 FUSION 홈페이지(http://gusevlab.org/projects/fusion/)에서 다운로드 하였다. 또한 TWAS 결과의 신뢰성을 높이기 위해 100,000 회의 순열검정(permutation test)을 진행하였다.
실시예 3. 전장 전사체 연관 분석 결과의 추가 분석
TWAS에서 도출된 결과의 신빙성을 확보하고 도출된 유전자들의 기능을 탐구하기 위하여 추가적인 분석을 수행하였다. 먼저, FUSION 소프트웨어에 내장된 조건부-결합(conditional-joint) 분석을 이용하여 특정 유전자와 표현형의 연관성이 유전자의 발현 값과 독립적으로 연관지어 지는지, 혹은 해당 유전자와 연관된 SNP의 효과와 함께 연관성을 보이는지 조사하였다. 다음으로 fine-mapping을 수행하는 FOCUS를 이용하여 해당 유전자가 특정 표현형에 대한 원인 유전자로 특정 지어질 수 있는가에 대한 검정을 수행하였다. 추가적으로 TWAS 분석 결과가 생물학적 기작에 미치는 영향을 유전자 세트 범위에서 알아보기 위해 TWAS-GSEA 소프트웨어를 이용하여 유전자 세트 농축 분석(gene set enrichment analysis, GSEA)을 수행하였다. 분석을 위하여 각 TWAS 신호에 대해 TWAS Z값을 가중치(weight)로 사용하여 상기에서 언급한 두 개의 혈액 데이터(NTR, YFS) 및 7가지의 조직 별로 분석을 진행하였다.
실시예 4. 전사체 데이터 메타분석
전사체 데이터 메타분석을 위한 데이터로는 공용 데이터베이스인 NCBI GEO와 EBI ArrayExpress에서 raw data를 다운로드 받아 사용하였다. 모든 데이터는 아토피성 피부염 환자와 정상 대조군을 포함하는 피부 조직에서 유래한 데이터로 선별하였다. 본 발명에서 통합된 데이터는 1개의 RNA-seq 데이터(GSE121212), 및 4개의 마이크로어레이 데이터(GSE16161, GSE5667, GSE120721, E-MTAB-8149)였으며, 모든 데이터를 통합한 뒤의 샘플 수는 환자군 140명, 대조군 93명으로 총 233명의 샘플로 이루어져 있었다. 데이터 전처리는 R 패키지인 oligo와 edgeR, DESeq2를 사용하여 진행하였으며, 아토피성 피부염 환자나 정상 대조군 어디에도 속하지 않은 데이터는 표준화 작업 전에 제외하였다. 데이터의 통합 및 교란효과 제거는 R 패키지인 SVA의 ComBat 함수를 이용하여 진행하였으며, 기존의 연구결과를 참고하여 RNA-seq 데이터는 log2(cpm + 0.25)로 변환하여 통합하였다(Johnson, W.E., C. Li, and A. Rabinovic, 2007. 8(1): p. 118-27; Mooney, M., et al., PLoS One, 2013. 8(4): p. e61088.) 전사체 데이터에서의 차별 발현 유전자(differentially expressed genes: DEGs)를 구하는 데에는 limma R 패키지를 사용하였다.
실시예 5. 네트워크 분석
단백질-단백질 상호작용 네트워크(protein-protein interaction network, PPI network)의 구축에는 TWAS 분석 결과 유의미하게 도출된 유전자와 전사체 메타분석 결과 도출된 DEGs를 합하여 사용하였다. STRING 데이터베이스를 기반으로 각 유전자 간의 기능적 상호관계 네트워크를 구축하였으며 Cytoscape(version 3.8.2)을 이용하여 시각화하고 MCODE와 NetworkAnalyzer를 이용하여 하위 네트워크 분석을 진행하였다.
실시예 6. 신약 재창출 후보 약물 도출
신약 재창출 후보 약물 도출을 위해 상관표시 맵(Connectivity map, CMAP)을 사용하였다. CMAP 데이터베이스에 저장된 약물을 대상으로 TWAS 결과 유의미하게 도출된 유전자들과 전사체 메타분석 결과 도출된 DEGs를 별도로 입력하여 발현 패턴을 뒤집을 수 있는 정도에 대한 결과를 얻었다. 그 후 각각의 결과에서 공통적으로 유의미하게 나타난 약물들을 골라 피어슨 상관계수를 계산하여 두 결과가 유의미하게 일관성이 있음을 확인하였다. 그 후 공통적으로 도출된 약물들의 농축 스코어(enrichment score)를 이용하여 이전 연구를 참조하여 제품 스코어(product score)를 계산 후, product score > 0.6인 약물들을 후보 약물로 도출하였다(Liu, J., et al., Cell, 2015. 161(5): p. 999-1011).
실시예 7. 아토피성 피부염에 사용 중인 약물과의 유사성 분석
신약 재창출 기법을 적용하여 도출한 후보군들에 대하여 기존 아토피성 피부염에 사용되고 있는 약물인 타크로리무스(tacrolimus), 디펜히드라민(diphenhydramine), 히드록시진(hydroxazine), 세팔렉신(cephalexin)과의 구조적, 기능적 유사도를 분석하였다. 먼저 5개 후보물질 및 비교 약물에 관한 화학구조 정보를 DrugBank와 PubChem에서 확보하였으며 rcdk 와 Rcpi R 패키지를 이용하여 전처리하였다. 그런 다음 ECFP4 형식으로 전처리를 거친 구조 데이터를 이용하여 후보물질과 기존 약물들 간의 코사인 유사도(cosine similarity)를 계산하였다. MOA(modes of action)에 대한 유사도 분석은 MANTRA 2.0 데이터베이스를 이용하여 진행하였다. 분석에 사용한 파라미터는 maximum number of neighborhood를 10으로 설정한 것 외에는 기본 설정을 따랐으며 분석 결과는 Cytoscape(version 3.8.2)를 이용하여 시각화하였다.
[실험예]
실험예 1. TWAS 분석 및 원인 유전자, 좌위 도출 및 패스웨이 분석
TWAS 분석 결과, 총 52860개의 유전자에 대한 신호를 얻을 수 있었으며, 그 중 본페로니 교정(Bonferroni correction) (P 값 < 0.05 / 52860) 이후 유의미하게 나온 신호는 총 9개의 염색체에서 32개의 eQTL 좌위에 대해 25개의 유전자의 연관성이 보여졌으며, 상기 유의미하게 도출된 25개의 유전자 목록을 하기 표 1에 나타내었다(표 1에서 * 표시는 이전의 GWAS 연구에서 밝혀지지 않았던 새로운 유전자 마커임).
| Chromosome | Gene | Panel | eQTL.ID | TWAS.Z | TWAS.P | Permutation.P |
| 1 | CRNN | Skin - not sun exposed (suprapubic) | rs4845763 | 4.9853 | 6.19E-07 | 0.1875 |
| FLG | Cells - Transformed fibroblasts | rs1552991 | -6.244 | 4.27E-10 | 0.0498 | |
| Skin - sun exposed (lower leg) | rs11204948 | -7.4583 | 8.77E-14 | 0.0325 | ||
| Thyroid | rs4845737 | -7.1502 | 8.67E-13 | 0.0194 | ||
| FLG-AS1 | Skin - not sun exposed (suprapubic) | rs1552991 | -6.6973 | 2.12E-11 | 0.0328 | |
| Cells - Transformed fibroblasts | rs1552991 | -6.5511 | 5.71E-11 | 0.0188 | ||
| Skin - sun exposed (lower leg) | rs4845743 | -5.9174 | 3.27E-09 | 0.0335 | ||
| Spleen | rs4845737 | -5.5863 | 2.32E-08 | 0.0822 | ||
| Thyroid | -6.4987 | 8.10E-11 | 0.0353 | |||
| IL6R | Whole Blood | rs4845618 | -4.9217 | 8.58E-07 | 0.0152 | |
| YFS Blood | rs4845623 | -5.2654 | 1.40E-07 | 0.0108 | ||
| LINGO4 * | Skin - not sun exposed (suprapubic) | rs12128071 | 5.6211 | 1.90E-08 | 0.0307 | |
| RFX5 * | Thyroid | rs6684085 | -4.9048 | 9.35E-07 | 0.2308 | |
| 2 | AC007278.2 | Whole Blood | rs1420106 | -6.14 | 8.50E-10 | 0.0004 |
| AC007248.7 | Whole Blood | rs13015714 | 5.31 | 1.09E-07 | 0.0011 | |
| IL1RL1 | NTR Blood | rs7559479 | -5.7959 | 6.80E-09 | 0.0123 | |
| IL18RAP | Whole Blood | rs3755267 | -5.99 | 2.09E-09 | 0.0015 | |
| YFS Blood | rs3755266 | -5.0088 | 5.48E-07 | 0.0085 | ||
| 5 | KIF3A | Skin - sun exposed (lower leg) | rs3213639 | -5.1391 | 2.76E-07 | 0.1111 |
| P4HA2 * | Cells - Transformed fibroblasts | rs4705928 | -5.085 | 3.68E-07 | 0.4444 | |
| 10 | RBM17 * | Skin - sun exposed (lower leg) | rs8463 | -5.6682 | 1.44E-08 | 0.005 |
| 11 | OVOL1 | Cells - EBV-transformed lymphocytes | rs10791824 | -5.6193 | 1.92E-08 | 0.001 |
| 14 | FAM177A1 | Skin - not sun exposed (suprapubic) | rs11156875 | 5.0543 | 4.32E-07 | 0.0157 |
| PPP2R3C | NTR Blood | rs8014377 | -5.3214 | 1.03E-07 | 0.0066 | |
| RP11-85K15.2 | Whole Blood | rs13379372 | 5.3018 | 1.15E-07 | 0.0239 | |
| 16 | CLEC16A | Thyroid | rs2286975 | 5.0211 | 5.14E-07 | 0.0478 |
| 17 | FAM134C | Skin - not sun exposed (suprapubic) | rs2293158 | -4.9214 | 8.59E-07 | 0.0026 |
| 20 | ARFRP1 | Cells - Transformed fibroblasts | rs4809330 | 6.8397 | 7.93E-12 | 0.0019 |
| Thyroid | rs2315008 | 5.8079 | 6.33E-09 | 0.0082 | ||
| Whole Blood | rs6062504 | -5.5349 | 3.11E-08 | 0.0062 | ||
| LIME1 | Skin - sun exposed (lower leg) | rs6011040 | -5.2138 | 1.85E-07 | 0.1304 | |
| Whole Blood | rs4809330 | -5.3781 | 7.53E-08 | 0.0227 | ||
| YFS Blood | rs6011058 | -6.1045 | 1.03E-09 | 0.0064 | ||
| SLC2A4RG | Thyroid | rs1151622 | 6.0395 | 1.55E-09 | 0.0197 | |
| STMN3 | Skin - sun exposed (lower leg) | rs2315008 | -5.5004 | 3.79E-08 | 0.0102 | |
| Whole Blood | rs6011040 | 5.43 | 5.64E-08 | 0.0093 | ||
| ZBTB46 | Thyroid | rs2315654 | 6.9417 | 3.87E-12 | 0.0015 | |
| ZGPAT | Cells - Transformed fibroblasts | rs1058319 | 5.3406 | 9.26E-08 | 0.0086 |
도 1a에서는 맨하탄 플롯(Manhattan plot)을 통해 본페로니 교정(Bonferroni correction) 이후 유의미하게 검출된 유전자들을 노란색 점으로 표시하였다.
유의미하게 도출된 유전자 중, 기존에 잘 알려져 있던 FLG, OVOL1, IL6R 등이 포함되어 있었으며, 이전에 알려지지 않았던 LINGO4, RFX5, P4HA2, 및 RBM17과 아토피성 피부염과의 연관성이 새롭게 발견되었다. 구체적으로, 아토피성 피부염에서 LINGO4는 증가, RFX5, P4HA2, 및 RBM17은 감소되어 있는 것을 알 수 있었다.
다음으로 상기 새롭게 발견된 유전자들이 독립적으로 아토피성 피부염과의 연관성을 가지는 지 여부를 확인하기 위해 조건부-결합 분석을 수행하였다. 그 결과, 하기 표 2에 나타낸 바와 같이 LINGO4, RBM17, 및 RFX5 유전자가 독립적으로 연관성을 가지는 것을 알 수 있었다.
| Gene | TWAS.Z | TWAS.P | JOINT.Z | JOINT.P | Tissue |
| LINGO4 | 5.6 | 1.90E-08 | 5.6 | 1.90E-08 | Skin - not sun exposed (suprapubic) |
| RFX5 | -4.9 | 9.40E-07 | -4.9 | 9.40E-07 | Thyroid |
| RBM17 | -5.7 | 1.40E-08 | -5.7 | 1.40E-08 | Skin - sun exposed (lower leg) |
또한, 하기 표 3에 나타낸 바와 같이 그 중 LINGO4 및 RBM17은 FOCUS를 이용한 fine mapping에서도 아토피성 피부염의 원인 유전자로 작용할 가능성을 보였다.
| Gene | Tissue | Chromosome | Model | Cross-validation P-value | PIP | Region |
| LINGO4 | Skin - sun exposed (lower leg) | 1 | enet | 0 | 0.163 | 1:148512062- 1:151538786 |
| Skin - not sun exposed (suprapubic) | lasso | 0 | 1 | 1:151539165- 1:153180729 |
||
| RBM17 | Skin - sun exposed (lower leg) | 10 | lasso | 0.0399 | 0.695 | 10:5983762- 10:7171183 |
TWAS 분석 결과 도출된 유전자들을 이용하여 TWAS-GSEA 분석을 진행한 결과, 도 1b에 나타낸 바와 같이 림프구 패널에서는 P.CORR가 0.05 미만에서 총 32 개의 패스웨이가 유의미하게 나타났다. 이때, 상기 P.CORR은 교정된(corrected) p value를 의미하며, 도출된 p value에 대해 다중 테스트 교정(multiple testing correction)을 진행한 값을 의미한다. 교정 방법으로는 FDR을 사용하였다.
또한 NTR 혈액 패널에서는 7개, 피부조직에서는 15개, 전혈 및 YFS 혈액에서는 13개의 패스웨이가 유의미하게 나타났다. 도 1b의 히트맵 결과에서 푸른색이 진할수록 해당 기작에 포함된 유전자의 수가 많음을 뜻하며, * 표시는 보정된 P 값이 유의미하게 나타난 기작을 나타낸다.
TWAS-GSEA를 이용한 분석 결과 전반적으로 혈액 관련 패널에서는 사이토카인 생성 및 헷지호그 신호 경로(hedgehog signaling pathway)와 관여된 기작들이 농축되어 있었으며, 피부 패널에서는 아토피성 피부염의 특징적인 기작들인 각질화된 외피(cornified envelope) 및 펩타이드 교차 결합(peptide corss-linking)이 농축되어 있는 것을 확인하였다.
실험예 2. 아토피성 피부염 데이터를 이용한 전사체 메타분석
공용 데이터베이스 상의 아토피성 피부염 전사체 데이터를 수집하여 총 5개의 단일 연구 데이터 셋을 확보하였으며, 하기 표 4에 전사체 메타분석에 사용된 데이터 목록을 나타내었다.
교란효과를 제거한 후 샘플들의 발현량 분포가 RNA-seq, 마이크로어레이와 같이 실험 방법에 따라 달라진 것이 아님을 확인하기 위해 차원축소 분석을 수행하였으며, 그 결과 도 2a에 나타낸 바와 같이 PCA(principal component analysis)를 통해 이들이 질병 유무에 따라 더욱 큰 공분산을 지님을 확인하였다. 도 2a에서 붉은색은 아토피성 피부염 환자, 녹색은 정상인을 나타내며, 마름모꼴은 마이크로어레이 데이터, 원은 RNA-seq 데이터를 나타낸다.
통계적 검정력 증가의 효과를 확인하기 위하여 단일 연구의 DEG와 메타 분석 결과 DEG를 벤 다이어그램을 통해 비교하였을 때, 도 2b에 나타낸 바와 같이 226개의 유전자는 반복해서 도출되었으며 추가적으로 42개의 유전자는 메타분석에서만 도출되었음을 확인하였다. 또한, 전사체 메타분석을 통해 총 268개의 DEG를 얻었으며 이 DEG들의 전반적인 발현값을 히트맵으로 시각화한 결과, 도 2c에 나타낸 바와 같이 268개 중 196개는 과발현되었고, 72개는 저발현된 DEG였음을 확인하였으며, 이들의 발현은 정상군과 환자군 사이에서 비교적 분명한 차이를 보이고 있었음을 알 수 있었다. 특히, 메타분석을 통해 도출된 유전자 중 C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC는 이전의 연구들에서 언급되지 않은 새로운 유전자 마커로 발견되었으며, 이들을 하기 표 5에 나타내었다. 구체적으로, 아토피성 피부염에서 C1orf162, NOCT, 및 TIGAR는 증가, SCIN 및 BOC는 감소되어 있는 것을 알 수 있었다.
| Gene | Entrez ID | logFC | P | FDR |
| C1orf162 | 128346 | 1.011 | 3.94E-53 | 8.68E-52 |
| NOCT | 25819 | 1.0662 | 1.60E-81 | 2.87E-79 |
| TIGAR | 57103 | 1.1068 | 1.67E-70 | 1.17E-68 |
| SCIN | 85477 | -1.2283 | 5.28E-85 | 1.37E-82 |
| BOC | 91653 | -1.0288 | 2.01E-106 | 2.19E-103 |
실험예 3. 네트워크 분석을 통한 전사체 메타분석 결과와의 통합
도출된 268개의 DEG들과 함께 상기 실험예 1에서 TWAS 결과 도출되었던 25개의 유전자를 합하여 두 분석에서 도출된 유전자들 간의 연결성을 알아보기 위해 네트워크 분석을 진행하였다.
전체 네트워크를 구축한 뒤 서브네트워크 분석을 진행한 결과 총 12개의 클러스터로 이루어져 있는 것을 확인할 수 있었으며 해당 클러스터들의 rank score는 2.333에서 12.383점으로 나타났고, rank score의 중위 값은 4.75였다. 이 중 상위 25 %의 rank score를 기록한 3 개의 클러스터를 아토피성 피부염의 주요 발현 패턴을 표현하는 클러스터로 가정하였다. 첫 번째 클러스터는 도 3a에 나타낸 바와 같이, rank score 12.383점을 기록하였으며 3개의 TWAS 유전자, 44개의 메타분석 DEG, 및 STRING 데이터베이스에 의해 추가된 1개의 유전자로 구성되어 있었다. 두 번째 클러스터는 도 3b에 나타낸 바와 같이, 메타분석 결과 나온 DEG로만 이루어져 있었으며, 11.355의 rank score를 기록하였고 총 30개의 과발현 유전자와 2개의 저발현 유전자로 구성되어 있었다. 세 번째 클러스터는 도 3c에 나타낸 바와 같이, 116개로 가장 많은 수의 유전자로 구성되어 있었으며, 7개의 TWAS 유전자, 그리고 107개의 메타분석 DEG로 이루어져 있었다.
도 3a 내지 3c에서 각 노드의 크기는 유전자의 상호작용 개수를 의미한다. 노드의 색은 저발현된 유전자일수록 푸른색, 과발현된 유전자일수록 붉은색을 띈다. 각 유전자가 도출된 분석법의 종류에 따라 TWAS는 사각형, 메타분석은 원, STRING 데이터베이스는 삼각형의 모양을 띄며, TWAS와 메타분석에서 공통적으로 도출된 유전자는 붉은색 별로 표시하였다.
실험예 4. TWAS와 전사체 메타분석 결과를 통합한 후보약물 도출
CMAP를 이용하여 TWAS 신호와 전사체 메타분석 DEG를 분석한 결과, P값이 0.01 이하에서 각각 225개, 589개의 약물이 아토피성 피부염의 유전자 발현 양상을 뒤집을 수 있을 것으로 예상되었다. 그 중 118개의 약물은 TWAS와 전사체 메타분석 모두에서 유의미하게 나타났다.
두 데이터로부터 유래한 결과가 일관성을 보임을 검증하고자 두 결과의 농축 스코어(enrichment score)를 이용하여 피어슨 상관계수를 구하여 상관성을 확인하였다. 그 결과, 도 4a에 나타낸 바와 같이 두 농축 스코어의 상관계수는 0.564로 평범한 수준의 양의 상관관계를 띄고 있음을 확인할 수 있었으며, 상관계수의 P값은 0에 수렴하여 매우 유의미함을 나타내었다.
또한, 각 약물들에 대해 TWAS, 메타분석 유전자로 계산한 농축 스코어를 곱하는 방식으로 제품 스코어(product score)를 계산하였다. 그 결과, 도 4b에 나타낸 바와 같이 제품 스코어가 0.6 이상의 값을 보인 2-데옥시-D-글루코스(2-deoxy-D-glucose), 파라로사닐린(pararosaniline), 칸타리딘(cantharidin), MG-132, 및 1,4-크리센퀴논(1,4-chrysenequinone)의 5가지 약물을 아토피성 피부염의 잠재적 치료 후보물질로 선정하였다. 도 4a 및 4b에서 제품 스코어 > 0.6인 약물들은 붉은색 점으로 표시되었다.
추가적으로 기존 아토피성 피부염의 치료에 쓰이고 있는 4가지 약물(세팔렉신, 디펜히드라민, 히드록시진, 타크로리무스)과 상기 도출한 5개 약물 후보군 간의 구조적, 기능적 유사도 분석을 진행하였다. 먼저 구조적 유사도 분석을 진행한 결과, 도 4c에 나타낸 바와 같이 5개의 약물 후보군 중 2-데옥시-D-글루코스 및 칸타리딘은 0.5 이상의 코사인 유사도 지수(index)를 보이며 비교적 기존 약물들과 구조적인 유사성을 보였다. 도 4c에서 붉은색이 짙을수록 코사인 계수(cosine coefficient)가 높아 두 약물 간의 유사도가 높은 것을 의미한다.
다음으로 MANTRA 2.0 데이터베이스를 이용하여 네트워크 기반의 MOA 분석을 진행하였다. 5가지의 약물 후보군 중 MG-132의 경우 MOA 시그니쳐가 MANTRA 2.0 데이터베이스에 존재하지 않아 MOA 분석을 진행하지 못하였으며, 이에 나머지 4가지 약물에 대한 분석을 진행한 결과, 도 4d에 나타낸 바와 같이 4개의 약물 후보군 모두 최소한 하나 이상의 기존 약물과 기능적인 유사성을 보이는 것을 확인하였다. 도 4d에서 붉은색 점은 상기에서 도출된 약물 후보군이며 푸른색 점은 기존 아토피성 피부염의 치료에 쓰이는 약물이다. 각 정점 간의 엣지가 존재할 경우 두 약물 간의 기능적 유사도가 존재함을 의미한다.
전술한 본 발명의 설명은 예시를 위한 것이며, 본 발명이 속하는 기술분야의 통상의 지식을 가진 자는 본 발명의 기술적 사상이나 필수적인 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 쉽게 변형이 가능하다는 것을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 이상에서 기술한 실시예 및 실험예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적이 아닌 것으로 이해해야 한다.
Claims (13)
- LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자를 유효성분으로 포함하는, 아토피성 피부염 진단용 바이오마커 조성물.
- LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질을 검출하는 물질을 유효성분으로 포함하는, 아토피성 피부염 진단용 조성물.
- 제2항에 있어서,
상기 물질은 프라이머, 프로브, 압타머, 및 항체로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 아토피성 피부염 진단용 조성물.
- 제2항의 조성물을 포함하는, 아토피성 피부염 진단용 키트.
- 피검체로부터 채취한 시료에서 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 단계를 포함하는, 아토피성 피부염 진단을 위한 정보제공방법.
- 제5항에 있어서,
상기 LINGO4, C1orf162, NOCT, 및 TIGAR로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 증가된 경우; 또는
상기 RFX5, P4HA2, RBM17, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 감소된 경우, 아토피성 피부염으로 판정하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는, 아토피성 피부염 진단을 위한 정보제공방법.
- 제5항에 있어서,
상기 시료는 피부 조직, 비장 조직, 갑상선 조직, 전혈, 림프구, 및 섬유아세포로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 아토피성 피부염 진단을 위한 정보제공방법.
- 피검체로부터 채취한 시료에서 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 단계를 포함하는, 아토피성 피부염의 발병 위험도 예측을 위한 정보제공방법.
- 제8항에 있어서,
상기 LINGO4, C1orf162, NOCT, 및 TIGAR로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 증가된 경우; 또는
상기 RFX5, P4HA2, RBM17, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 감소된 경우, 아토피성 피부염에 걸릴 위험이 높은 것으로 판정하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는, 아토피성 피부염의 발병 위험도 예측을 위한 정보제공방법.
- 제8항에 있어서,
상기 시료는 피부 조직, 비장 조직, 갑상선 조직, 전혈, 림프구, 및 섬유아세포로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 아토피성 피부염의 발병 위험도 예측을 위한 정보제공방법.
- (a) 피검체로부터 채취한 시료에 후보물질을 처리하는 단계;
(b) 상기 후보물질을 처리한 시료에서 LINGO4, RFX5, P4HA2, RBM17, C1orf162, NOCT, TIGAR, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준을 검출하는 단계; 및
(c) 상기 LINGO4, C1orf162, NOCT, 및 TIGAR로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 후보물질 처리 전에 비해 감소된 경우, 또는 상기 RFX5, P4HA2, RBM17, SCIN, 및 BOC로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 유전자, 상기 유전자의 mRNA, 또는 단백질의 발현 수준이 후보물질 처리 전에 비해 증가된 경우, 상기 후보물질을 아토피성 피부염 치료용 후보물질로 선택하는 단계를 포함하는, 아토피성 피부염 치료용 후보물질 스크리닝 방법.
- 제11항에 있어서,
상기 시료는 피부 조직, 비장 조직, 갑상선 조직, 전혈, 림프구, 및 섬유아세포로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 아토피성 피부염 치료용 후보물질 스크리닝 방법.
- 제11항에 있어서,
상기 아토피성 피부염 치료용 후보물질은 2-데옥시-D-글루코스(2-deoxy-D-glucose), 파라로사닐린(pararosaniline), 칸타리딘(cantharidin), MG-132, 및 1,4-크리센퀴논(1,4-chrysenequinone)로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 아토피성 피부염 치료용 후보물질 스크리닝 방법.
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| KR20230028619A true KR20230028619A (ko) | 2023-03-02 |
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-
2021
- 2021-08-19 KR KR1020210109346A patent/KR20230028619A/ko not_active Application Discontinuation
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| Gusev, A., et al., Nat Genet, 2016 Mar; 48(3): 245-52. |
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