KR20180075787A - Pectinase cel35-KG100 gene from rumen microorganism of black goat and uses thereof - Google Patents

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Abstract

The present invention relates to a pectinase cel35-KG100 gene derived from a black goat rumen microorganism and uses thereof. More specifically, the present invention provides a novel pectinase cel35-KG100 gene selected from the black goat rumen microorganism and a protein product thereof, and relates to a feed additive, a detergent composition and a method for manufacturing biofuel using the same. The method comprises a step of hydrolyzing biomass materials with addition of the pectinase proteins.

Description

흑염소 반추위 미생물 유래의 펙틴 분해효소 cel35-KG100 유전자 및 이의 용도{Pectinase cel35-KG100 gene from rumen microorganism of black goat and uses thereof}The pectinolytic enzyme cel35-KG100 gene derived from a black goat rumen microorganism and its use {Pectinase cel35-KG100 gene from rumen microorganism of black goat and uses thereof}

본 발명은 흑염소 반추위 미생물 유래의 펙틴 분해효소 cel35-KG100 유전자 및 이의 용도에 관한 것으로, 보다 구체적으로 흑염소 반추위 미생물로부터 선별한 신규한 펙틴 분해효소 cel35-KG100 유전자 및 이의 단백질 산물을 제공하고, 이를 이용하여 사료첨가제, 세제 조성물 및 바이오연료를 제조하는 방법에 관한 것이다.The present invention relates to a pectinolytic enzyme cel35-KG100 gene derived from a black goat rumen microorganism and its use, more specifically, to provide a novel pectinolytic enzyme cel35-KG100 gene selected from a black goat rumen microorganism and a protein product thereof, To feed additives, detergent compositions, and methods of making biofuels.

식물 세포벽의 주요 구성 성분은 셀룰로오스(celluloase), 헤미-셀룰로오스(hemi-cellulose), 펙틴(pectin)이며, 이들은 초식동물의 반추위에서 복잡하고도 효과적인 과정을 통해 미생물에 의해 분해 및 흡수된다. The main constituents of plant cell walls are celluloase, hemi-cellulose, and pectin, which are degraded and absorbed by microorganisms through complex and effective processes in herbivore rumen.

반추위의 미생물은 극도의 혐기성으로, 곰팡이, 프로토조아 및 박테리아를 포함하며, 섬유소의 분해는 주로 박테리아와 곰팡이가 담당하는 것으로 알려져 있다. Rumen microorganisms are extreme anaerobes, including fungi, protozoa and bacteria, and the breakdown of fibrin is mainly responsible for bacteria and fungi.

하지만 이들 미생물은 대부분 배양이 어려워 잘 알려져 있지 않은 상태이다. 현재까지 알려진 바로, 반추위 미생물 중에서 식물 세포벽을 소화하는데 주요하게 관여하는 박테리아로는 파이브로박터 숙시노게네스(Fibrobacter succinogenes), 루미노코커스 플라베파시엔스(Ruminococcus flavefaciens), 루미노코쿠살버스(Ruminococcusalbus), 부티리비브릭 피브리솔벤스(Butyrivibrio fibrisolvens), 유박테리움 셀룰로솔벤스(Eubacterium cellulosolvens), 프레보텔라(Prevotella), 그리고 일부 클로스트리디움(Clostridium) 속에 속하는 박테리아가 밝혀져 있다. 현재까지 대부분의 반추동물의 섬유소분해효소 유전자를 발굴하기 위하여 소와 토끼, 캥거루의 소화기관의 총 미생물 DNA, 혹은 메타게놈(metagenome; 환경미생물의 총 DNA를 일컬음)에 대한 연구가 진행되었으며, 이를 통해 다수의 글루카나아제(glucanase), 및 셀룰로솜 복합체(cellulosome complex)들이 밝혀진 바 있다. However, most of these microorganisms are not well known because they are difficult to cultivate. Among the rumen microorganisms known to date, the bacteria mainly involved in digesting plant cell walls include Fibrobacter succinogenes , Ruminococcus flavefaciens , Ruminococcusalbus), has been shown that bacteria belonging to the genus -butyrolactone Libby P brick debris brush Bence (Butyrivibrio fibrisolvens), oil cake Te as Solarium cellulite brush Bence (Eubacterium cellulosolvens), pre-correction telra (Prevotella), and some of Clostridium (Clostridium). To date, most microbial DNA in the digestive organs of cows, rabbits, and kangaroos, or the metagenome (referred to as the total DNA of environmental microorganisms) has been studied to identify the most abundant enzymes in the rumen, A number of glucanases and cellulosome complexes have been identified through this process.

하지만, 상기 대부분은 연질의 식물 섬유소원을 먹이로 진화한 경우이다. 산업적으로는 섬유소분해효소 중 보다 경질의 섬유소원에 대한 분해능력이 요구된다. However, most of the above cases have evolved from soft fungal fibrinogen to food. In industry, degradation ability of fibrinolytic enzyme to harder fibrin source is required.

흑염소는 나뭇가지 및 껍질, 그리고 초목과 같이 보다 조악한 섬유소원의 사료를 잘 소화하도록 진화하였다. 이는 흑염소의 반추위 미생물군이 다른 초식동물과 다르게 공생되어 진화되었다는 것을 의미한다. 난배양성 미생물군에 대한 유전자 탐색을 위하여 포스미드(fosmid), 코스미드(cosmid) 및 BAC(bacterial artificial chromosome) 유전자은행을 이용하여 신규 물질을 탐색하는 기술이 널리 사용되고 있다. 이러한 방법으로 현재까지 많은 섬유소분해효소 유전자가 밝혀진 바 있다.Black goats evolved to digest feeds of the less coarse fibrinogen, such as twigs, bark, and vegetation. This means that the ruminal microbial population of the black goat evolved differently from other herbivores. Techniques for searching for novel substances using fosmid, cosmid, and bacterial artificial chromosome (GAC) gene banks have been widely used for gene search for promiscuous microorganisms. In this way, a number of fibrinolytic enzyme genes have been found to date.

한국공개특허공보 제2011-0119961호Korean Patent Publication No. 2011-0119961 한국공개특허공보 제2007-0116881호Korean Patent Publication No. 2007-0116881

이와 같은 기술적 배경하에서 본 발명자들은 예의 노력한 결과 본 발명을 완성하기에 이르렀다.Under these technical backgrounds, the present inventors have made intensive efforts to accomplish the present invention.

결국, 본 발명의 목적은 흑염소 반추위 미생물 유래의 펙틴 분해효소 cel35-KG100 및 이의 용도를 제공하는 데 있다.Finally, it is an object of the present invention to provide a pectin degrading enzyme cel35-KG100 derived from a black goat rumen microorganism and its use.

본 발명의 다른 목적 및 이점은 하기의 발명의 상세한 설명, 청구범위 및 도면에 의해 더욱 명확하게 된다.Other objects and advantages of the present invention will become more apparent from the following detailed description of the invention, claims and drawings.

본 발명의 일 측면에 따르면, 서열번호 1로 표시되는 염기서열로 이루어진, 흑염소 반추위 미생물 유래의 펙틴 분해효소 cel35-KG100 유전자가 제공될 수 있다.According to one aspect of the present invention, there can be provided a pectinolytic enzyme cel35-KG100 gene derived from a black goat rumen microorganism, which comprises the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 1.

본 발명의 다른 측면에 따르면, 상기 유전자로부터 인코딩되며, 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, 흑염소 반추위 미생물 유래의 GH35 도메인 계열인 펙틴 분해효소 단백질이 제공될 수 있다.According to another aspect of the present invention, there can be provided a pectin degrading enzyme protein encoded by the gene and consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, which is a GH35 domain sequence derived from a black goat rumen microorganism.

본 발명의 또 다른 측면에 따르면, 상기 유전자를 포함하는 재조합 벡터가 제공될 수 있다.According to another aspect of the present invention, a recombinant vector containing the gene may be provided.

본 발명의 또 다른 측면에 따르면, 상기 재조합 벡터로 형질전환된 숙주세포가 제공될 수 있다.According to another aspect of the present invention, a host cell transformed with the recombinant vector may be provided.

본 발명의 또 다른 측면에 따르면, 상기 펙틴 분해효소 단백질을 포함하는 섬유소 분해 증진용 사료첨가제가 제공될 수 있다.According to another aspect of the present invention, there is provided a feed additive for promoting fibrin degradation comprising the pectin degrading enzyme protein.

본 발명의 또 다른 측면에 따르면, 상기 펙틴 분해효소 단백질을 포함하는 세제 조성물이 제공될 수 있다.According to another aspect of the present invention, a detergent composition comprising the pectinolytic enzyme protein may be provided.

본 발명의 또 다른 측면에 따르면, 바이오매스 물질에 상기 펙틴 분해효소 단백질을 첨가하여 가수분해시키는 단계를 포함하는 바이오연료의 제조방법이 제공될 수 있다.According to another aspect of the present invention, there is provided a method for producing a biofuel comprising the step of hydrolyzing a biomass material by adding the pectin degrading enzyme protein.

본 발명은 신규한 흑염소 반추위 미생물 유래의 섬유소분해효소 제공하며, 이를 통해 보다 경질의 섬유소원을 분해할 수 있다. 본 발명을 활용하여 사료 곡물 가격 상승에 대비한 저가의 사료 첨가제를 개발할 수 있고, 지구상에서 가장 풍부한 자원인 섬유소를 이용한 바이오연료를 개발할 수 있으며, 세제 및 식품가공 공정 등 다양한 방면에 적용할 수 있다. The present invention provides a novel fibrinolytic enzyme derived from a black goat rumen microorganism, which can decompose a harder fibrin source. By utilizing the present invention, it is possible to develop a low-cost feed additive against the rise in feed grain price, develop biofuels using the most abundant resource on the earth, and can be applied to various aspects such as detergent and food processing .

도 1은 본 발명의 일 실시예에 따른 포스미드(Fosmid) 유전자 은행 구축을 위한 메타게놈 DNA 부분절단 조건 확립 및 삽입 DNA 절단 결과를 나타낸다.
도 2는 본 발명의 일 실시예에 따른 Ad 분획과 Lq 분획에 대한 포스미드 유전자은행 평균 삽입 크기 확인 결과를 나타낸다.
도 3은 본 발명의 일 실시예에 따른 펙틴 기질이 포함된 아가 플레이트 상에 접종 후, 루골(lugol) 용액 염색에 따른 투명환이 생긴 클론 선발 결과를 나타낸다.
도 4는 본 발명의 일 실시예에 따른 펙틴 분해효소 cel35-KG100의 뉴클레오티드 검색(nucleotide blast) 결과를 나타낸다.
도 5는 본 발명의 일 실시예에 따른 펙틴 분해효소 cel35-KG100 단백질 검색(protein blast)에 따른 주요 도메인 확인 결과를 나타낸다.
도 6은 본 발명의 일 실시예에 따른 펙틴 분해효소 cel35-KG100 단백질 검색(protein blast) 결과에 따른 주요 유사 단백질을 나타낸다.
도 7은 본 발명의 일 실시예에 따른 펙틴 분해효소 cel35-KG100 단백질 검색(protein blast) 결과 중 최상위 상동 단백질과 다른 섬유소분해효소 단백질과의 유사성 검토(phylogenetic tree) 및 상동성과 추정값을 나타낸다.FIG. 1 shows the results of metagenome DNA fragment cleavage conditions and insertion DNA cleavage for constructing a Fosmid gene bank according to an embodiment of the present invention.
FIG. 2 shows the results of confirming the mean insertion size of the phosphide gene bank in the Ad fraction and the Lq fraction according to an embodiment of the present invention.
FIG. 3 shows clone selection results in which a transparent ring is formed by staining of a lugol solution after inoculation onto agar plates containing a pectin substrate according to an embodiment of the present invention.
Figure 4 shows nucleotide blast results of the pectinolytic enzyme cel35-KG100 according to an embodiment of the present invention.
FIG. 5 shows major domain identification results according to protein pellet digestion enzyme cel35-KG100 protein blast according to an embodiment of the present invention.
FIG. 6 shows a major analogous protein according to the result of protein blast of pectinolytic enzyme cel35-KG100 according to an embodiment of the present invention.
FIG. 7 shows the phylogenetic tree and homology of the highest homologous protein among the results of the pectin-degrading enzyme cel35-KG100 protein blast according to an embodiment of the present invention.

이하, 본 발명을 보다 상세하게 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail.

본 발명에서 사용되는 용어, '바이오매스(biomass)'란, 태양광을 사용하여 이산화탄소를 고정하는 탄소동화과정을 하는 식물체와 이를 먹고 살아가는 동물체를 포함하는 생물유기체 전반을 일컫는다. 상기 바이오매스로부터 생산되는 알콜, 디젤, 수소와 같은 각종 연료는 바이오연료(biofuel)라 불리우며 이러한 바이오매스, 특히 섬유소와 같은 식물계 바이오매스는 석유로부터 얻어지는 화학물질들을 대체할 수 있는 물질로 제안되고 있다. 식물계 바이오매스는 각종 화학제품을 생산하는데 있어 석유를 원료로 하는 것보다 에너지 수지면에서 유리하다.The term " biomass " used in the present invention refers to a whole of a biological organism including a plant carrying out a carbon assimilation process for fixing carbon dioxide using sunlight and a living animal eating it. Various fuels such as alcohol, diesel, and hydrogen produced from the biomass are called biofuel, and biomass such as biomass such as cellulose is proposed as a substitute for chemical substances obtained from petroleum . Plant-based biomass is more advantageous in terms of energy balance than petroleum as raw material in producing various chemical products.

그 이유는 식물계 바이오매스의 경우는 산소를 포함하는 다양한 기능기가 포함되어 있어 기능기가 첨부된 각종 화학제품들을 생산하는 경우 더 낮은 활성화 에너지로 전환이 가능하기 때문이다.The reason for this is that, in the case of the plant-based biomass, various functional groups including oxygen are included, so that it is possible to convert to a lower activation energy when various chemical products with functional groups are produced.

본 발명에서 사용되는 용어, '바이오연료(biofuel)'란, 연료로 살아있는 유기체뿐 아니라 동물의 배설물 등 대사활동에서 나오는 부산물을 모두 포함하며, 화석연료와는 다른 신재생에너지로 바이오에탄올과 바이오디젤 등이 포함된다.The term 'biofuel' used in the present invention includes all the byproducts derived from metabolism activities such as feces and living organisms as well as fossil fuels. It is a renewable energy different from fossil fuels, and bioethanol and biodiesel And the like.

본 발명은 흑염소 반추위 미생물의 섬유소분해 능력에 초점을 두고, 흑염소 반추위 미생물 메타게놈에 대하여 포스미드(fosmid) 유전자은행을 구축하고, 이로부터 갈락튜론산이 주성분인 펙틴을 기질로 하여 이에 대한 분해 활성을 갖는 포스미드(fosmid) 클론을 선발하고, 그 클론의 플라스미드 DNA를 해독함으로써 유전정보를 확보하였다. 활성을 갖는 포스미드 클론의 플라스미드 DNA는 Qiagen Midi Prep Kit을 사용하여 추출하였으며, 추출된 DNA는 평균 400bp 길이로 100배수의 샷건 시퀀싱(shotgun sequencing) 데이터를 생산하였다. 생산된 데이터는 fasta 형식으로 전환하여 Newbler de novo assembler를 사용하여 조합하여 염기서열 정보를 확보하였다. 확보된 활성 포스미드(fosmid) 플라스미드 DNA 서열정보는 Metagenemark 프로그램을 사용하여 유전자를 찾아내고, 밝혀진 유전자들에 대하여 NCBI blastp 검색을 통해 주요 도메인과 유사 유전자를 검색하여 펙틴 분해효소 관련 유전자를 발굴하였다. The present invention focuses on fibrin degrading ability of a black goat rumen microorganism and constructs a fosmid gene bank against the black goat rumen microorganism metagenome and uses the pectin as a main component of galacturonic acid as a substrate, , And genomic information was obtained by decoding the plasmid DNA of the clone. The plasmid DNA of the active phosmid clone was extracted using the Qiagen Midi Prep Kit, and the extracted DNA produced 100 times more shotgun sequencing data with an average length of 400 bp. The data were converted to fasta format and combined with Newbler de novo assembler to obtain sequence information. The obtained active fosmid plasmid DNA sequence information was obtained by using the Metagenemark program, and the major domains and similar genes were searched for NCBI blastp for the identified genes to discover pectinase related genes.

본 발명은 흑염소 반추위 미생물 메타게놈에서 발굴한 최초의 펙틴 분해효소 유전자로서 Prevotella ruminicola 23의 펙틴 분해효소 유전자와 단백질 수준에서 97%의 상동성으로 유사하지만, 단지 GH35 유전자로만 명명되어 있으므로, 본 발명을 통해 그 기능을 증명한 것이다.The present invention is the first pectinolytic enzyme gene found in the black goat rumen microorganism metagenome, which is similar in homology to the pectinase gene of Prevotella ruminicola 23 at the protein level, but is designated only as the GH35 gene. Which proves its function.

본 발명의 일 측면에 따르면, 서열번호 1로 표시되는 염기서열로 이루어진, 흑염소 반추위 미생물 유래의 펙틴 분해효소 cel35-KG100 유전자가 제공될 수 있다.According to one aspect of the present invention, there can be provided a pectinolytic enzyme cel35-KG100 gene derived from a black goat rumen microorganism, which comprises the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 1.

본 발명에 따른 펙틴 분해효소 cel35-KG100 유전자는 펙틴 분해효소 단백질을 코딩하는 DNA 또는 RNA 일 수 있다. DNA는 cDNA, 게놈 DNA 또는 인위적인 합성 DNA를 포함한다. DNA는 단일 가닥 또는 이중 가닥일 수 있다. DNA는 코딩(coding) 가닥 또는 넌코딩(non-coding) 가닥일 수 있다.The pectin-degrading enzyme cel35-KG100 gene according to the present invention may be DNA or RNA encoding a pectin-degrading enzyme protein. DNA includes cDNA, genomic DNA, or artificial synthetic DNA. The DNA may be single stranded or double stranded. The DNA may be a coding strand or a non-coding strand.

바람직하게는, 본 발명에 따른 펙틴 분해효소 cel35-KG100 유전자는 서열번호 1로 표시되는 염기서열을 포함할 수 있다. 또한, 상기 염기서열의 변이체가 본 발명의 범위 내에 포함된다. 보다 구체적으로, 상기 유전자는 서열번호 1의 염기서열로부터 70% 이상, 바람직하게는 80% 이상, 더욱 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 가지는 염기서열을 포함할 수 있다.Preferably, the pectinolytic enzyme cel35-KG100 gene according to the present invention may include the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 1. Variants of the above base sequences are also included within the scope of the present invention. More specifically, the gene comprises a nucleotide sequence having a sequence homology of 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 90% or more, and most preferably 95% or more, from the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 .

폴리뉴클레오티드에 대한 '서열 상동성의 %'는 두 개의 최적으로 배열된 서열과 비교 영역을 비교함으로써 확인되며, 비교 영역에서의 폴리뉴클레오티드 서열의 일부는 두 서열의 최적 배열에 대한 참고 서열(추가 또는 삭제를 포함하지 않음)에 비해 추가 또는 삭제(즉, 갭)를 포함할 수 있다.The 'percentage of sequence homology to polynucleotides' is identified by comparing the comparison region with two optimally aligned sequences, and a portion of the polynucleotide sequence in the comparison region is the reference sequence for the optimal alignment of the two sequences (addition or deletion) (I. E., A gap) relative to the < / RTI >

본 발명의 실시예에 따라, 펙틴 분해효소 cel35-KG100는 바람직하게는 흑염소 반추위 미생물 유래일 수 있다. 다만, 반드시 이에 제한될 것은 아니며, 본 발명의 실시예는 펙틴 분해효소 cel35-KG100와 높은 상동성(예를 들어, 70% 이상, 바람직하게는 80% 이상, 더욱 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성)을 갖고, 흑염소가 아닌 다른 생물의 반추위 미생물로부터 유래한 유전자를 포함할 수 있다. 서열정렬 방법 및 서열 상동성을 결정하기 위한 수단(예를 들어, BLAST 등)은 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 주지되어 있다.According to an embodiment of the present invention, the pectinolytic enzyme cel35-KG100 can be preferably derived from a black goat rumen microorganism. However, the present invention is not necessarily limited thereto. Examples of the present invention may be used in combination with pectinolytic enzyme cel35-KG100 (for example, 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 90% Preferably 95% or more sequence homology) and may comprise a gene derived from a rumen microorganism of another organism other than a black goat. Methods for sequencing and means for determining sequence homology (e.g., BLAST, etc.) are well known to those skilled in the art.

본 발명의 다른 측면에 따르면, 상기 유전자로부터 인코딩되며, 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, 흑염소 반추위 미생물 유래의 GH35 도메인 계열인 펙틴 분해효소 단백질이 제공될 수 있다.According to another aspect of the present invention, there can be provided a pectin degrading enzyme protein encoded by the gene and consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, which is a GH35 domain sequence derived from a black goat rumen microorganism.

본 발명에 따른 펙틴 분해효소 단백질의 범위는 흑염소 반추위 미생물로부터 분리된 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 GH35 도메인 계열 단백질 및 상기 단백질의 기능적 동등물을 포함한다.The range of the pectinase protein according to the present invention includes the GH35 domain protein consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 isolated from the black goat rumen microorganism and the functional equivalent of the protein.

상기 '기능적 동등물'이란 용어는, 아미노산의 부가, 치환 또는 결실의 결과, 상기 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열과 적어도 70% 이상, 바람직하게는 80% 이상, 더욱 바람직하게는 90% 이상, 가장 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것으로, 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 단백질과 실질적으로 동질의 생리활성을 나타내는 단백질을 말한다. 상기 '실질적으로 동질의 생리활성'이란 용어는, 동일한 펙틴 분해효소 활성을 의미한다.The term "functional equivalent" means that at least 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 90% or more, or more preferably 90% or more, of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 as a result of addition, 2, and most preferably at least 95%, of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2, and has substantially the same physiological activity as the protein consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2. The term " substantially homogenous physiological activity " means the same pectinase activity.

본 발명은 또한 펙틴 분해효소 단백질의 단편, 유도체 및 유사체(analogues)를 포함한다. 상기 '단편', '유도체' 및 '유사체'란 용어는 본 발명에 따른 펙틴 분해효소 단백질과 실질적으로 같은 생물학적 기능 또는 활성을 보유하는 폴리펩티드를 의미한다.The present invention also includes fragments, derivatives and analogues of pectinolytic enzyme proteins. The terms "fragment", "derivative" and "analog" refer to a polypeptide having substantially the same biological function or activity as the pectinase protein according to the present invention.

본 발명에 따른 펙틴 분해효소 단백질의 단편, 유도체 및 유사체는 (i) 하나 이상의 보존적(conservative) 또는 비보존적 아미노산 잔기(바람직하게는 보존적 아미노산 잔기)가 치환된 폴리펩티드(상기 치환된 아미노산 잔기는 유전암호에 의해 암호화될 수도, 되지 않을 수도 있다) 또는 (ii) 하나 이상의 아미노산 잔기에서 치환기(들)를 가지는 폴리펩티드, 또는 (iii) 또 다른 화합물(폴리펩티드의 반감기를 연장할 수 있는 화합물, 예를 들면 폴리에틸렌 글리콜)과 결합된 성숙 폴리펩티드로부터 유래된 폴리펩티드, 또는 (iv) 부가적인 아미노산 서열(예를 들면, 선도 서열, 분비 서열, 상기 폴리펩티드를 정제하는데 사용된 서열, 프로테이노젠(proteinogen) 서열 또는 융합 단백질)과 결합된 상기 폴리펩티드로부터 유래된 폴리펩티드일 수 있다. 본 발명에 따라 정의된 상기 단편, 유도체 및 유사체는 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 주지되어 있다.Fragments, derivatives and analogs of the pectin degrading enzyme proteins according to the present invention may be obtained by (i) replacing one or more conservative or non-conservative amino acid residues (preferably conservative amino acid residues) with a substituted polypeptide (Ii) a polypeptide having a substituent (s) at one or more amino acid residues, or (iii) another compound (a compound capable of extending the half-life of the polypeptide, e.g., (Iii) a polypeptide derived from a mature polypeptide conjugated to a poly (ethylene glycol), or (iv) a polypeptide derived from a polypeptide having additional amino acid sequence (e.g., a sequence, sequence, sequence used to purify the polypeptide, ≪ RTI ID = 0.0 > a < / RTI > sequence or fusion protein). The fragments, derivatives and analogs defined in accordance with the present invention are well known to those skilled in the art.

서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열, 즉 성숙(mature) 폴리펩티드를 암호화하는 폴리뉴클레오티드는 오직 성숙 폴리펩티드만을 암호화하는 코딩 서열; 성숙 폴리펩티드 및 다양한 부가적인 코딩 서열을 암호화하는 서열; 성숙 폴리펩티드(및 임의의 부가적인 코딩 서열) 및 넌코딩 서열을 암호화하는 서열을 포함한다.The amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, that is, the polynucleotide encoding the mature polypeptide, is a coding sequence that encodes only the mature polypeptide; Sequences encoding mature polypeptides and various additional coding sequences; Mature polypeptides (and any additional coding sequences) and sequences coding for noncoding sequences.

상기 '폴리펩티드를 암호화하는 폴리뉴클레오티드'란 용어는 폴리펩티드를 암호화하는 폴리뉴클레오티드, 또는 부가적인 코딩 및/또는 넌코딩 서열을 더 포함하는 폴리뉴클레오티드를 말한다.The term " polynucleotide encoding the polypeptide " refers to a polynucleotide encoding a polypeptide, or a polynucleotide further comprising additional coding and / or noncoding sequences.

또한, 본 발명은 상기에 기재된 것과 동일한 아미노산 서열, 또는 이의 단편, 유사체 및 유도체를 포함하는 폴리펩티드를 암호화하는 상기 폴리뉴클레오티드의 변이체에 관한 것이다. 폴리뉴클레오티드 변이체는 자연적으로 발생하는 대립유전자 변이체 또는 비자연적으로 발생하는 변이체일 수 있다. 상기 뉴클레오티드 변이체는 치환변이체, 결실 변이체, 및 삽입 변이체를 포함한다.The present invention also relates to variants of said polynucleotides encoding polypeptides comprising the same amino acid sequence as described above, or fragments, analogs and derivatives thereof. Polynucleotide variants can be naturally occurring allelic variants or non-naturally occurring variants. The nucleotide mutant includes a substitution mutant, a deletion mutant, and an insertion mutant.

본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 주지된 바와 같이, 대립유전자 변이체는 폴리뉴클레오티드의 대안(alternative)이며, 이는 하나 이상의 치환, 결실 또는 삽입된 뉴클레오티드를 포함할 수 있으며, 변이체에 의해 암호화된 폴리펩티드에서 실질적인 기능 변화를 초래하지는 않는다.As is known to those of ordinary skill in the art, an allelic variant is an alternative to a polynucleotide, which may comprise one or more substituted, deleted or inserted nucleotides, Lt; RTI ID = 0.0 > polypeptide < / RTI >

본 발명의 또 다른 측면에 따르면, 상기 유전자를 포함하는 재조합 벡터가 제공될 수 있다.According to another aspect of the present invention, a recombinant vector containing the gene may be provided.

본 발명에 따른 벡터는 전형적으로 클로닝 또는 발현을 위한 벡터로서 구축될 수 있다. 또한, 본 발명에 따른 벡터는 원핵 세포 또는 진핵 세포를 숙주로 하여 구축될 수 있다. 예를 들어, 본 발명에 따른 벡터가 발현 벡터이고, 원핵 세포를 숙주로 하는 경우에는, 전사를 진행시킬 수 있는 강력한 프로모터 (예컨대, pL프로모터, trp프로모터, lac 프로모터, T7 프로모터, tac 프로모터 등), 해독의 개시를 위한 리보좀 결합 자리 및 전사/해독종결 서열을 포함하는 것이 일반적이다. 숙주 세포로서 대장균(E. coli)이 이용되는 경우, 대장균 트립토판 생합성 경로의 프로모터 및 오퍼레이터 부위, 그리고 파아지의 좌향 프로모터 (pL프로모터)가 조절 부위로서 이용될 수 있다.The vector according to the invention can typically be constructed as a vector for cloning or expression. In addition, the vector according to the present invention can be constructed by using prokaryotic cells or eukaryotic cells as hosts. For example, when the vector according to the present invention is an expression vector and a prokaryotic cell is used as a host, a strong promoter (for example, pL promoter, trp promoter, lac promoter, T7 promoter, tac promoter, etc.) , Ribosome binding sites for initiation of detoxification, and transcription / translation termination sequences. When E. coli is used as a host cell, the promoter and operator site of the E. coli tryptophan biosynthesis pathway, and the leftward promoter of the phage (pL promoter) can be used as a regulatory region.

여기서, 본 발명에 이용될 수 있는 벡터는 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상적으로 사용되는 플라스미드(예: pSC101, ColE1, pBR322, pUC8/9, pHC79, pGEX, pQE80L 시리즈, pET 시리즈 및 pUC19 등), 파지 (예: gt4B, -Charon, z1 및 M13 등) 또는 바이러스 (예: SV40 등)를 조작하여 제작될 수 있다.Herein, the vectors that can be used in the present invention include plasmids (e.g., pSC101, ColE1, pBR322, pUC8 / 9, pHC79, pGEX, pQE80L series, pET series and pUC19, etc.) commonly used in the technical field to which the present invention belongs, (E.g., gt4B, -Charon, z1, and M13) or viruses (e.g., SV40, etc.).

또한, 본 발명에 따른 벡터가 발현 벡터이고, 진핵 세포를 숙주로 하는 경우, 포유동물 세포의 게놈으로부터 유래된 프로모터(예: 메탈로티오닌 프로모터) 또는 포유동물 바이러스로부터 유래된 프로모터(예: 아데노바이러스 후기 프로모터, 백시니아 바이러스 7.5K 프로모터, SV40 프로모터, 사이토메갈로바이러스 프로모터 및 HSV의 tk프로모터)가 이용될 수 있으며, 전사 종결 서열로서 일반적으로 폴리아데닐화 서열을 갖는다.In addition, when the vector according to the present invention is an expression vector and the eukaryotic cell is a host, a promoter derived from the genome of a mammalian cell (e.g., a metallothionine promoter) or a mammalian virus (e.g., Adeno Virus late promoter, vaccinia virus 7.5K promoter, SV40 promoter, cytomegalovirus promoter, and tk promoter of HSV) can be used, and generally have a polyadenylation sequence as a transcription termination sequence.

본 발명에 따른 벡터는 선택표지(marker)로서, 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상적으로 이용되는 항생제 내성 유전자, 예를 들어 암피실린, 겐타마이신, 카베니실린, 클로람페니콜, 스트렙토마이신, 카나마이신, 게네티신, 네오마이신 및 테트라사이클린에 대한 내성 유전자를 더 포함할 수 있다.The vectors according to the present invention may be used as selectable markers and include antibiotic resistance genes commonly used in the art to which the present invention belongs, for example, ampicillin, gentamycin, carbenicillin, chloramphenicol, streptomycin, kanamycin, , ≪ / RTI > neomycin, and tetracycline.

본 발명의 또 다른 측면에 따르면, 상기 재조합 벡터로 형질전환된 숙주세포가 제공될 수 있다.According to another aspect of the present invention, a host cell transformed with the recombinant vector may be provided.

본 발명에 따른 벡터를 원핵세포에 안정적으로 형질전환시킨 후 발현시키기 위한 숙주세포는 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상적으로 이용되는 숙주세포, 예를 들어, E. coli JM109, E. coli BL21, E. coli RR1, E. coli LE392, E. coli B, E. coli X 1776, E. coli W3110, 바실러스 서브틸리스, 바실러스 츄린겐시스와 같은 바실러스 속 균주, 또는 살모넬라 티피무리움, 세라티아 마르세슨스 및 다양한 슈도모나스 종과 같은 장내균과 균주등을 이용할 수 있다.The host cell for stably transforming the vector according to the present invention into a prokaryotic cell and expressing the vector may be a host cell commonly used in the technical field of the present invention, for example, E. coli JM109 , E. coli BL21 , E. coli RR1 , E. coli LE392 , E. coli B , E. coli X 1776 , E. coli W3110, Bacillus subtilis, and Bacillus thuringiensis, or enterobacteria and strains such as Salmonella typhimurium, Serratia marcesensus and various Pseudomonas spp. Can be used.

또한, 본 발명에 따른 벡터를 진핵 세포에 형질전환시키는 경우, 숙주세포로서, 효모(Saccharomyce cerevisiae), 곤충세포, 사람세포 (예컨대, CHO 세포주 (Chinese hamster ovary), W138, BHK, COS-7, 293, HepG2, 3T3, RIN 및 MDCK 세포주) 및 식물세포 등을 이용할 수 있다.When the vector according to the present invention is transformed into eukaryotic cells, yeast ( Saccharomyce cerevisiae ), insect cells, human cells (for example, Chinese hamster ovary, W138, BHK, COS-7, 293, HepG2, 3T3, RIN and MDCK cell lines) and plant cells.

본 발명에 따른 벡터를 숙주세포 내로 운반하는 방법은, 숙주 세포가 원핵 세포인 경우, CaCl2 방법, 하나한 방법 (Hanahan, D., J. Mol. Biol., 166:557-580(1983)) 및 전기천공 방법 등에 의해 실시될 수 있다. 또한, 숙주세포가 진핵세포인 경우, 미세주입법, 칼슘포스페이트 침전법, 전기천공법, 리포좀-매개 형질감염법, DEAE-덱스트란 처리법, 및 유전자 밤바드먼트 등에 의해 벡터를 숙주세포 내로 주입할 수 있다.The method of delivering a vector according to the present invention into a host cell can be carried out by a CaCl 2 method or a single method (Hanahan, D., J. MoI. Biol., 166: 557-580 (1983) ) And electric drilling method. When the host cell is a eukaryotic cell, the vector can be injected into the host cell by microinjection, calcium phosphate precipitation, electroporation, liposome-mediated transfection, DEAE-dextran treatment, gene bombardment, have.

본 발명의 또 다른 측면에 따르면, 상기 펙틴 분해효소 단백질을 포함하는 섬유소 분해 증진용 사료첨가제가 제공될 수 있다.According to another aspect of the present invention, there is provided a feed additive for promoting fibrin degradation comprising the pectin degrading enzyme protein.

본 발명에 따른 사료 첨가제는 구연산, 후말산, 아디픽산, 젖산 및 사과산 등과 같은 유기산; 인산나트륨, 인산칼륨, 산성피로인산염, 폴리인산염(중합인산염)등과 같은 인산염; 폴리페놀, 카테킨(catechin), 알파-토코페롤, 로즈메리 추출물(rosemary extract), 비타민 C, 녹차 추출물, 감초 추출물, 키토산, 탄닌산, 피틴산 등과 같은 천연 항산화제;로부터 선택되는 하나 이상을 더 포함할 수 있다.Feed additives according to the present invention include organic acids such as citric acid, fumaric acid, adipic acid, lactic acid and malic acid; Phosphates such as sodium phosphate, potassium phosphate, acid pyrophosphate, polyphosphate (polymerized phosphate) and the like; Natural antioxidants such as polyphenol, catechin, alpha-tocopherol, rosemary extract, vitamin C, green tea extract, licorice extract, chitosan, tannic acid, phytic acid and the like have.

본 발명에 따른 사료 첨가제는 아미노산, 무기염류, 비타민, 항생물질, 항균물질, 항산화, 항곰팡이 효소 및 다른 생균 형태의 미생물 제제 등과 같은 보조제 성분; 곡물, 예를 들어, 분쇄 또는 파쇄된 밀, 귀리, 보리, 옥수수 및 쌀; 식물성 단백질 사료, 예를 들어, 평지, 콩 및 해바라기를 주성분으로 하는 것; 동물성 단백질 사료, 예를 들어, 혈분, 육분, 골분 및 생선분; 당분 및 유제품, 예를 들어, 각종 분유 및 유장 분말로 이루어지는 건조성분; 지질, 예를 들어, 가열에 의해 임의로 액화시킨 동물성 지방 및 식물성 지방 등과 같은 주성분; 영양보충제, 소화 및 흡수향상제, 성장촉진제, 질병예방제 등과 같은 첨가제;로부터 선택되는 하나 이상을 더 포함할 수 있다.The feed additive according to the present invention may include adjuvant components such as amino acids, inorganic salts, vitamins, antibiotics, antimicrobials, antioxidants, antifungal enzymes and other microbial agents in the form of live cells; Grain, for example, ground or crushed wheat, oats, barley, corn and rice; Vegetable protein feedstuffs, for example, based on rapeseed, soybeans and sunflower; Animal protein feeds such as blood, meat, bone meal and fish meal; A dry component consisting of sugar and dairy products, for example various powdered milk and whey powders; Lipids such as animal fat and vegetable fat optionally liquefied by heating; Nutritional supplements, digestion and absorption enhancers, growth promoters, disease prevention agents, and the like.

본 발명에 따른 사료 첨가제는 건조 또는 액체 상태의 제제 형태일 수 있으며, 사료 첨가용 부형제를 포함할 수 있다. 상기 사료 첨가용 부형제로는 예를 들어, 제올라이트, 옥분 또는 미강 등이 있으며, 반드시 상기의 예시에 한정되지 않는다.The feed additive according to the present invention may be in the form of a dry or liquid preparation, and may contain an excipient for feed addition. Examples of the excipient for adding the feed include zeolite, corn or rice bran, and the present invention is not limited to the above examples.

본 발명에 따른 사료 첨가제는 효소 제제, 예를 들어, 리파아제(lipase)와 같은 지방 분해효소, 피틴산(phytic acid)을 분해하여 인산염과 이노시톨인산염을 만드는 파이타제(phytase), 녹말과 글리코겐 등에 포함되어 있는 알파-1,4-글리코시드 결합(α-1,4-glycoside bond)을 가수분해하는 효소인 아밀라제, 유기인산에스테르를 가수분해하는 효소인 포스파타제(phosphatase), 말토오스를 두 분자의 글루코스로 가수분해하는 말타제 및 사카로스를 가수분해하여 글루코스-프룩토스 혼합물을 만드는 전환효소 등으로부터 선택되는 하나 이상을 더 포함할 수 있다.The feed additive according to the present invention may be used as an enzyme preparation, for example, a lipase such as lipase, a phytase which decomposes phytic acid to form phosphate and inositol phosphate, starch and glycogen Amylase, which is an enzyme that hydrolyzes the α-1,4-glycoside bond, phosphatase, which is an enzyme that hydrolyzes the organic phosphate ester, and maltose, And a conversion enzyme which hydrolyzes maltase and saccharose to produce a glucose-fructose mixture, and the like.

본 발명에 따른 사료 첨가제는 동물에게 단독으로 투여되거나 식용 담체 중에서 다른 사료 첨가제와 조합되어 투여될 수 있다. 또한, 상기 사료 첨가제는 탑 드레싱으로서 또는 이들을 가축 사료에 직접 혼합하거나 또는 사료와 별도로, 별도의 경구 제형으로, 또는 다른 성분과 조합하여 쉽게 투여할 수 있다.The feed additive according to the present invention may be administered to animals alone or in combination with other feed additives in edible carriers. The feed additives can also be administered as top dressing or they can be mixed directly with the livestock feed or separately from the feed, in separate oral formulations, or in combination with other ingredients.

본 발명이 속하는 기술분야에서 통상적으로 알려진 바와 같이 단독 일일 섭취량 또는 분할 일일 섭취량을 사용할 수 있다.A single daily intake or divided daily intake can be used as is commonly known in the art.

본 발명에 따른 사료 첨가제가 사용될 수 있는 동물은 예를 들어 식용우, 젖소, 송아지, 돼지, 돼지새끼, 양, 염소, 말, 토끼, 개, 고양이 등과 같은 가축, 병아리, 알닭, 가정용 닭, 수탉, 오리, 거위, 칠면조, 메추라기, 작은새 등과 같은 가금류를 포함하며, 반드시 상기의 예시에 한정되지 않는다.The animal in which the feed additive according to the present invention can be used can be, for example, an animal such as a cow, a cow, a calf, a pig, a pig, a sheep, a goat, a horse, a rabbit, a dog, , Poultry such as ducks, geese, turkeys, quails, small birds, and the like, and are not necessarily limited to the above examples.

본 발명에 따른 사료 첨가제에 포함되는 본 발명에 따른 펙틴 분해효소의 양은 특별히 한정되지 않으나, 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상적으로 알려진 바와 같이 가축의 소화관에서 장기간 생존하면서 섬유질계 및 반섬유질계 물질을 분해하기에 적합한 양으로 포함된다.The amount of the pectin-degrading enzyme according to the present invention contained in the feed additive according to the present invention is not particularly limited. However, as is commonly known in the technical field of the present invention, And is included in an amount suitable for decomposition.

본 발명의 또 다른 측면에 따르면, 상기 펙틴 분해효소 단백질을 포함하는 세제 조성물이 제공될 수 있다.According to another aspect of the present invention, a detergent composition comprising the pectinolytic enzyme protein may be provided.

본 발명에 따른 세제 조성물은 1부 및 2부 수성 세제 조성물, 비수성 액체 세제 조성물, 성형 고체(cast solid), 과립 형태, 입자 형태, 압축 정제, 겔, 페이스트 또는 슬러리 형태일 수 있다. 상기 세제 조성물을 사용하여 음식물의 찌든 때, 음식물 잔류막 및 기타 소량의 식품 조성물을 신속하게 제거할 수 있다.The detergent composition according to the present invention may be in the form of a part and a part of an aqueous detergent composition, a non-aqueous liquid detergent composition, a cast solid, a granular form, a granular form, a compressed tablet, a gel, a paste or a slurry. The detergent composition can be used to quickly remove food stains, food residue films, and other small amounts of food compositions.

본 발명에 따른 세제 조성물은 전분 다당류의 촉매-매개 가수분해를 통한 말라붙은 얼룩 제거에 효과적일 수 있다.The detergent compositions according to the present invention may be effective in removing dried stains through the catalytic-mediated hydrolysis of starch polysaccharides.

본 발명에 따른 세제 조성물은 단단한 표면을 세정하는 세제 조성물, 직물을 세정하는 세제 조성물, 설거지용 세제 조성물, 구강 세정용 세제 조성물, 의치 세정용 세제 또는 콘택트 렌즈 세정 용액과 같은 형태로 제공될 수 있다.The detergent composition according to the present invention may be provided in the form of a detergent composition for cleaning hard surfaces, a detergent composition for cleaning fabrics, a detergent composition for washing dishes, a detergent composition for oral cleaning, a detergent for cleaning denture or a contact lens cleaning solution .

본 발명의 또 다른 측면에 따르면, 바이오매스 물질에 상기 펙틴 분해효소 단백질을 첨가하여 가수분해시키는 단계를 포함하는 바이오연료의 제조방법이 제공될 수 있다.According to another aspect of the present invention, there is provided a method for producing a biofuel comprising the step of hydrolyzing a biomass material by adding the pectin degrading enzyme protein.

본 발명에 따른 바이오매스 물질은 고분자량의 탄수화물을 포함하는 바이오매스 물질이며, 본 발명에 따른 바이오연료의 제조방법은 고분자량의 탄수화물을 포함하는 바이오매스 물질을 전처리하는 단계; 전처리한 바이오매스를 효소로 가수분해시키는 단계; 및 가수분해된 바이오매스 물질을 발효시키는 단계;로 이루어지며, 상기 바이오연료의 제조방법은 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상적으로 알려진 바이오연료(Biofuel)의 제조방법을 통해 수행될 수 있다.The biomass material according to the present invention is a biomass material containing a high molecular weight carbohydrate. The method for preparing a biofuel according to the present invention comprises: pre-treating a biomass material containing a high molecular weight carbohydrate; Hydrolyzing the pretreated biomass with an enzyme; And a step of fermenting the hydrolyzed biomass material. The method of manufacturing the biofuel may be performed by a method of manufacturing a biofuel commonly known in the art.

본 발명에 따른 바이오연료의 제조방법에 있어서, 상기 바이오매스는 전분질계(곡물, 감자류 등), 셀룰로오스계(초본, 임목, 왕겨 등), 당질계(사탕수수, 사탕무 등) 또는 단백질계(가축분뇨, 사체, 미생물 균체 및 이들로부터 유래하는 종이와 음식물찌꺼기 등 유기성 자원)등의 고분자량의 탄수화물일 수 있으며, 반드시 상기의 예시에 한정되지 않는다.In the method for producing a biofuel according to the present invention, the biomass may be selected from the group consisting of starchy (cereals, potatoes), cellulose (herb, wood, chaff) Organic material such as manure, carcass, microbial cells and paper and food waste derived therefrom), and the like, and the present invention is not limited to the above examples.

이하, 실시예를 통해 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐 본 발명의 내용이 하기의 실시예에 한정되지 않는다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail by way of examples. However, the following examples are illustrative of the present invention and the contents of the present invention are not limited to the following examples.

실시예Example

실시예Example 1: 흑염소 반추위 미생물 분리 및 DNA 추출 1: Isolation of black goat rumen microorganism and DNA extraction

수컷 2마리와 암컷 1마리 흑염소에 대하여 1개월간 볏짚 사료와 미네랄 보충제만으로 사육한 후, 도축을 실시하였고 이로부터 4개의 위 중에서 첫 번째 위인 반추위를 취하여 그 내용물을 확보하였다. 확보된 내용물은 먼저 거즈를 이용하여 위액상(Lq; liquid phase)과 사료 소화상(Ad; adherent phase)로 구분하여 시료를 준비하였다. 사료 소화상 Ad는 거즈로 거른 후의 찌꺼기를 다시 0.15%(volume/volume) Tween-80, PBS 용액에 현탁하여 볏짚 소화물에 부착된 미생물을 회수한 것이다. 이들에 대해 각각 5g의 침전 시료를 마련하고 이를 CTAB(hexadecylmethylammonium bromide)와 SDS (sodium dodecyl sulfate)를 이용하여 총 DNA를 추출하였다. Two males and one female black goat were raised for only one month with rice straw and mineral supplements, and then slaughtered. The rumen was obtained from the four rumen, and the contents were obtained. The obtained contents were first separated into a liquid phase (Lq) and an adherent phase (Ad) by using gauze. Feed scoop Ad was obtained by suspending the residue after filtering with gauze in 0.15% (volume / volume) Tween-80, PBS solution, and recovering the microorganisms attached to rice straw. A total of 5 g of the precipitated sample was prepared and extracted with CTAB (hexadecylmethylammonium bromide) and SDS (sodium dodecyl sulfate).

실시예Example 2: 흑염소 반추위 미생물  2: Black goat rumen microorganism 포스미드Fosmid (( fosmidfosmid ) 유전자은행 구축) Construction of gene bank

Ad와 Lq에서 추출된 DNA에 대하여 포스미드(fosmid) 유전자은행을 구축하기 위한 적절한 크기로 임의 부분절단 조건을 위해 여러 HindIII 제한효소의 양을 조절한 결과, Ad는 HindIII 5units 그리고 Lq는 2.5units를 사용하도록 결정하였다(도 1). For the DNA extracted from Ad and Lq, the amount of HindIII restriction enzyme was adjusted to the appropriate size for arbitrary fragmentation conditions to construct a fosmid gene bank. As a result, Ad was HindIII 5 units and Lq was 2.5 units (Fig. 1).

부분절단된 DNA 절편들은 Pulse-Field Gel 전기영동 방법을 사용하여 10kb 에서 50kb 사이의 영역을 오려내어 이로부터 다시 인서트 DNA 단편을 수득하였다. 수득된 DNA는 말단 평활화 반응을 수행하고 이를 pCC1FOS 벡터에 리게이션(ligation) 반응으로 연결하였다. 리게이션(Ligation) 연결 반응 후, 이를 DH5alpha 대장균에 전기적 충격법으로 형질전환하여 유전자은행을 구축하였다. The partially cleaved DNA fragments were clipped from 10 kb to 50 kb using a Pulse-Field Gel electrophoresis method, from which the insert DNA fragments were again obtained. The obtained DNA was subjected to terminal smoothing reaction and ligated to a pCC1FOS vector by a ligation reaction. Ligation After the ligation reaction, it was transformed into DH5alpha E. coli by electric shock method to construct a gene bank.

구축된 포스미드(fosmid) 유전자은행에 대하여 평균 삽입크기를 확인하기 위하여 NotI 효소 처리를 하여 이를 전기영동으로 확인한 결과, Ad의 경우 30 kb, Lq의 경우는 31kb로 판명되었다(도 2). 이들에 대해서 각각 384 well plate 총 150 plates에 냉동보존 가능 배지에 접종하여 초저온냉동고(-70℃)에 보관하였다. In order to confirm the average insertion size of the constructed fosmid gene bank, NotI enzyme treatment was performed and it was confirmed by electrophoresis that 30 kb for Ad and 31 kb for Lq (FIG. 2). For each of these, 150 plates of 384 well plates were inoculated on cryopreservation media and stored in a cryogenic freezer (-70 ° C).

실시예Example 3: 펙틴 분해 활성을 지닌  3: with pectin-degrading activity 포스미드Fosmid (( fosmindfosmind ) 클론 선발 ) Clone starter

Ad와 Lq의 포스미드 클론 전부인 115,200개 클론에 대하여 INTEGRA사의 VIAFLO 384 기기를 사용하여, 384 클론 단위로 1% 펙틴(pectin from citrus peel) 기질이 포함된 LB-chloramphenicol 아가 플레이트에 0.5 ㎕씩 접종을 하고, 37℃에서 48시간 배양하였다. 배양된 아가 플레이트에서 루골(lugol) 용액 20ml를 부어 30분간 염색한 후, 클론 주위에 투명환을 나타내는 클론을 육안으로 확인하여 선발하였다(도 3). A total of 115,200 clones of Ad and Lq phosphide clones were inoculated with 0.5 μl of LB-chloramphenicol agar plates containing 1% pectin from citrus peel substrate in 384 clone units, using a VIAFLO 384 instrument from INTEGRA. And cultured at 37 ° C for 48 hours. 20 ml of lugol solution was poured in the cultured agar plate and stained for 30 minutes, and a clone showing a transparent ring around the clone was visually confirmed (FIG. 3).

실시예Example 4: 펙틴 분해 활성  4: Pectin degrading activity 포스미드Fosmid 클론에 대한 염기서열 해독 Sequence decode for clones

실시예 3에서 확인된 포스미드 클론 AD136K11에 대하여 포스미드 플라스미드 추출을 Qiagen plasmid midi prep kit을 사용하여 수행하였으며, 추출된 플라스미드 DNA는 파이로-시퀀싱(pyro-sequencing) 방식인 GS-Junior 플랫폼을 사용하여 평균 400bp 길이로 100배수의 샷건 시퀀싱(shotgun sequencing) 데이터를 생산하였다. 생산된 데이터는 fasta 형식으로 전환하여 Newbler 2.5 de novo assembler 프로그램을 사용하여 어셈블리(assembly)를 진행하였다. 총 2개의 컨티그 서열이 만들어졌으며, 각 12,627bp, 9,645bp의 길이로, 총 22,272bp의 메타게놈 서열 정보를 확보할 수 있었다.For the plasmid clone AD136K11 identified in Example 3, a phosphide plasmid extraction was performed using a Qiagen plasmid midi prep kit, and the extracted plasmid DNA was subjected to pyro-sequencing using a GS-Junior platform To produce shotgun sequencing data with an average of 400 bp and a multiple of 100 times. The resulting data was converted to fasta format and assembled using the Newbler 2.5 de novo assembler program. A total of two consensus sequences were constructed, each of which was 12,627bp and 9,645bp in length, and a total of 22,272bp of metagenomic sequence information was obtained.

- 서열 발견 장소: 농촌진흥청 국립축산과학원- Sequence Locations: National Livestock Research Institute, RDA

서열 유래 흑염소: 농촌진흥청 국립축산과학원 가축유전자원시험장 출생 흑염소 3두(수컷 2두, 암컷 1두)에 대하여 동물유전체과에서 관리이전 후 볏짚사료와 미네랄 보충제로만 한 달간 급여한 후 도축하여 얻은 반추위 미생물 시료 Black goat derived from sequence: Rat three days after birth of two black goats (two males and one female) born in the livestock genetic resource laboratory in the National Livestock Research Institute, RDA. After ruminant diets and mineral supplements, sample

- 포스미드 유전자은행 벡터: pCC1Fos-Phosphamide gene bank vector: pCC1Fos

- 유전자 유래 포스미드 클론 명칭: AD136K11- Genome derived phosphide clone Name: AD136K11

- 유전자의 DNA 염기서열(서열번호 1) 길이: 2,346 bp - DNA sequence of the gene (SEQ ID NO: 1) Length: 2,346 bp

- 유전자의 아미노산 서열(서열번호 2) 길이: 781 amino acids- amino acid sequence of the gene (SEQ ID NO: 2) length: 781 amino acids

- 유전자의 DNA 및 단백질 서열: 하기 표 1 , 표 2 및 서열목록 첨부DNA and protein sequences of the genes: Table 1, Table 2 and Sequence Listing

Figure pat00001
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Figure pat00002
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실시예Example 5: 유전자 탐색 및 유사성 조사 5: Genetic search and similarity survey

확보된 포스미드 클론의 삽입 DNA 염기서열 정보에 대해서는 MetaGeneMark 프로그램을 이용하여 유전자 영역을 탐색하였다. 탐색된 유전자 정보에 대해서는 일차적으로 NCBI의 단백질 검색(protein blast)을 통해 각 유전자의 유사 서열 정보를 얻었으며, 이 과정에서 주요 도메인 검색 결과와 유사 단백질을 참조하여 신규 펙틴 분해효소 유전자를 발굴하였다. For the inserted DNA sequence information of the acquired phosphodiester clones, the gene region was searched using the MetaGeneMark program. Regarding the detected gene information, similar sequence information of each gene was obtained primarily through protein blast of NCBI. In this process, a novel pectinase gene was extracted by referring to the main domain search result and similar protein.

본 발명에 의한 펙틴 분해효소 Cel35-KG100은 2016년 11월 현재 nucleotide blast 결과(도 4), 전체 2,346bp 크기의 유전자에 대해 Prevotella ruminicola 23 complete genome에서 1,869,352bp ~ 1,871,694bp 영역에 대해 95%의 상동성을 갖는 것으로 확인되었다. 또한 단백질 검색(protein blast) 결과, 글리코실 히드롤라아제 35 도메인(glycosyl hydrolase 35 domain, GH1; PF01301)을 가지고 있는 것이 확인되었으며, 베타 갈락토시다아제 도메인인 PLN03059과 GanA도 포함하고 있다(도 5). 유사한 단백질을 탐색한 결과, Prevotella sp. RM4의 글리코실 히드롤라아제 패밀리 35(glycosyl hydrolase family 35) 단백질과 전체 99% 영역에서 97%의 상동성을 갖는 것으로(도 6). 그리고 다른 종류의 유사 상동성 단백질 서열과 비교해 본 결과, ce135-KG100 유전자의 산물은 베타 갈락토시다아제 도메인2를 갖는 펙틴 분해효소라고 할 수 있다(도 7). 결론적으로 흑염소 반추위 미생물로부터 최초로 밝혀낸 Prevotella ruminicola의 GH35 유전자와 97%로 유사한 펙틴분해효소 활성을 갖는 유전자를 발명한 것이다. The pectinolytic enzyme Cel35-KG100 according to the present invention is a nucleotide blast result as of November 2016 (Fig. 4), and a total 2,346 bp gene is expressed by Prevotella It was found that the ruminicola 23 complete genome had 95% homology to the 1,869,352 bp to 1,871,694 bp region. In addition, as a result of protein blinding, it was confirmed to have a glycosyl hydrolase 35 domain (GH1; PF01301), and also contained beta-galactosidase domain, PLN03059 and GanA ). As a result of searching for similar proteins, Prevotella sp . And has 97% homology in the entire 99% region with the glycosyl hydrolase family 35 protein of RM4 (FIG. 6). As a result of comparison with other homologous homologous protein sequences, the product of the ce135-KG100 gene can be said to be a pectinolytic enzyme having beta-galactosidase domain 2 (FIG. 7). In conclusion, we have invented a gene with pectinolytic activity similar to 97% of the GH35 gene of Prevotella ruminicola, which was first discovered from a black goat rumen microorganism.

본 발명에 따른 GH35 도메인을 포함하고 있는 섬유소분해효소 펙틴 분해효소의 일종인 cel35-KG100 유전자의 산물은 사료 첨가제로서 이용될 수 있을 뿐만 아니라, 세제, 식품가공 및 바이오연료 생산에도 이용되어 산업적으로 매우 유용하게 이용될 수 있다.The product of the cel35-KG100 gene, which is a kind of fibrinolytic enzyme pectin-degrading enzyme containing the GH35 domain according to the present invention, can be used not only as a feed additive but also as a detergent, a food processing and a biofuel, Can be usefully used.

이상으로 본 발명 내용의 특정한 부분을 상세히 기술하였는 바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서, 이러한 구체적 기술은 단지 바람직한 실시 양태일 뿐이며, 이에 의해 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백할 것이다. 따라서 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항 들과 그것들의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.While the present invention has been particularly shown and described with reference to specific embodiments thereof, those skilled in the art will appreciate that such specific embodiments are merely preferred embodiments and that the scope of the present invention is not limited thereby. something to do. It is therefore intended that the scope of the invention be defined by the claims appended hereto and their equivalents.

<110> RURAL DEVELOPMENT ADMINISTRATION <120> Pectinase cel35-KG100 gene from rumen microorganism of black goat and uses thereof <130> NPF30582 <160> 2 <170> PatentIn version 3.2 <210> 1 <211> 2346 <212> DNA <213> Capra hircus <400> 1 atgaaacgac agatatttgt gatgttagcg ttggggttct gtgccgcggt acaggcacag 60 caggtgtacc agcttaacga gccagcacag cccaaacaga tacgtagcaa ccacctgcgc 120 atgggtggcg taaacccgca gggcgagcgt atcgatgtaa ataatttcta tatgtcgatg 180 gcaggcaagc ctgttatccc agtgatgggc gagttccact acagtcgcta cccggccgag 240 cagtgggagg aggagatctt gaagatgaag gcgggtggtg taactgttat ccctacctat 300 gtgttctgga gcctgcacga ggaggttgag ggccagttcc gttgggacgg tcagcgcaat 360 ctgcgtcgtt tcattgagct ttgtaaaaag cacgatatgc aggtgattgt gcgtatcggt 420 ccgttctgcc atggcgagat tcgtagtggc ggtttccccg attggctgtt tgccaaacct 480 cttgaggtgc gtagtaacga tcccgaatac ctgaaaatcg ttaagcgact ctataccgag 540 attggcaagc agttgcaagg cctgtattac aaggatggcg gcccgattat cggctgtcag 600 gttgagaacg aaatgcagca ttcggctgcc ccttgggcca ttacctatgc cggcgaaccc 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Asp Asn Thr     210 215 220 Ala Ala Ser Tyr Asn Ala Gly Glu Ala Met Ile Gly Val Gly Asn Gln 225 230 235 240 Ala Arg Lys Ala Thr Gly Ala Glu Met Gly Asn Leu His Met Gln Leu                 245 250 255 Leu Lys Lys Met Ala Val Glu Ala Gly Ile Asp Val Pro Phe Tyr Thr             260 265 270 Ala Thr Gly Trp Gly Asn Ala Ala Val Ile Glu Gly Glu Ala Ile Pro         275 280 285 Val Thr Ala Ala Tyr Thr Tyr Pro Phe Trp Ala Lys Pro His Met Ser     290 295 300 Lys Phe Leu Met Phe Lys Asp Leu Thr Lys Glu Ala Asp Tyr Ala Pro 305 310 315 320 Thr Arg Tyr Asn Pro Ala Asp Tyr Pro Ser Phe Cys Ala Glu Met Gly                 325 330 335 Ala Gly Ile Gln Met Ile Tyr Gly Ala Arg Pro Ile Val Thr Ala Gln             340 345 350 Ala Ala Glu Gly Leu Met Val Arg Thr Leu Gly Ser Gly Ser Asn Gly         355 360 365 Ile Gly Tyr Tyr Met Tyr His Gly Gly Ser Thr Pro Lys Gln Ile Gly     370 375 380 Gly Val Gly Ser Phe Asn Asp Glu Pro Met Gly Met Pro Lys Ile Ser 385 390 395 400 Tyr Asp Phe Gln Ala Pro Ile Gly Glu Phe Gly Leu Glu Gly Lys Met                 405 410 415 Tyr Arg Asn Leu Arg Leu Leu His Thr Phe Leu Ala Asp Phe Gly Asp             420 425 430 Val Leu Ala Pro Met Glu Pro Val Leu Pro Ala Asp Trp Gln Gln Met         435 440 445 Thr Pro Asp Asn Arg Asp His Leu Arg Tyr Ala Ala Arg Ile Lys Asp     450 455 460 Gly Ser Gly Phe Leu Phe Met Val Asn Phe Gln Asp His Asp Thr Leu 465 470 475 480 Arg His Asp Gln Thr Asn Leu Gln Val Arg Leu Asn Met Lys His Glu                 485 490 495 Thr Leu Asn Ile Pro Ala Gln Gly Gly Phe Thr Leu Gly Lys Asp Gln             500 505 510 Ser Val Ile Leu Pro Phe Asn Leu Asp Met Asp Gly Ala Leu Leu Lys         515 520 525 Tyr Ala Thr Ala Gln Leu Leu Thr Lys Leu Lys Asp Gly Asp Ala Glu     530 535 540 His Tyr Phe Phe Phe Ala Pro Asp Gly Met Ala Thr Glu Tyr Leu Phe 545 550 555 560 Asp Ala Thr Thr Val Lys Gly Lys His Phe Phe Lys Pro Val Ala Gly                 565 570 575 Phe Lys Ser Ser Phe Ala Leu Lys Thr Ala Ser Gly Arg Thr Ile Lys             580 585 590 Val Thr Thr Leu Thr Arg Gln Gln Ala Leu Asn Ala Leu Lys Val Asn         595 600 605 Gly Lys Leu Leu Ile Thr Asp Ala Thr Val Leu Pro Ala Ala Asn Gly     610 615 620 Ala Thr Leu Ser Leu Gly Asn His Gln Val Asn Tyr Val Val Tyr 625 630 635 640 Pro Ser Lys Gln Gly Phe Lys Ala Gln Thr Ala Ser Val Ala Pro Val                 645 650 655 Thr Pro Gln Phe Glu Val Lys Lys Ala Gly Pro Arg Arg Met Ser Val             660 665 670 Lys Leu Ser Thr Val Asn Cys Gln Leu Ser Thr Ile Gln Glu Leu Phe         675 680 685 Leu Arg Val Asn Tyr Val Gly Asp Val Ala Met Ala Phe Met Lys Gly     690 695 700 Gln Leu Val Gln Asp Glu Phe Tyr His Gly Glu Pro Trp Thr Ile Gly 705 710 715 720 Leu Lys Arg Tyr Ala Asp Asp Leu Lys Thr Asp Pro Leu Thr Phe Tyr                 725 730 735 Phe Arg Pro Leu Arg Ala Asn Ala Pro Phe Leu Gly Asp Leu Pro Lys             740 745 750 Gln Ala Val Pro Asn Phe Ala Asn Gly Pro Val Val Glu Ile Lys Asn         755 760 765 Val Glu Val Ile Pro Glu Tyr Lys Phe Asn Ile Lys Leu     770 775 780

Claims (7)

서열번호 1로 표시되는 염기서열로 이루어진, 흑염소 반추위 미생물 유래의 펙틴 분해효소 cel35-KG100 유전자.A pectin degrading enzyme cel35-KG100 gene derived from a black goat rumen microorganism and consisting of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 1. 제1항에 따른 유전자로부터 인코딩되며, 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, 흑염소 반추위 미생물 유래의 글라이코시드 하이드롤라아제(GH)35 도메인 계열인 펙틴 분해효소 단백질.2. A pectin degrading enzyme protein encoded by the gene according to claim 1 and consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2, which is a glycocide hydrolase (GH) 35 domain sequence derived from a black goat rumen microorganism. 제1항에 따른 유전자를 포함하는 재조합 벡터.A recombinant vector comprising the gene according to claim 1. 제3항에 따른 재조합 벡터로 형질전환된 숙주세포.A host cell transformed with the recombinant vector according to claim 3. 제2항에 따른 펙틴 분해효소 단백질을 포함하는 섬유소 분해 증진용 사료 첨가제.A feed additive for promoting fibrin degradation comprising the pectinolytic enzyme protein according to claim 2. 제2항에 따른 펙틴 분해효소 단백질을 포함하는 세제 조성물.A detergent composition comprising the pectin degrading enzyme protein according to claim 2. 바이오매스 물질에 제2항에 따른 펙틴 분해효소 단백질을 첨가하여 가수분해시키는 단계를 포함하는 바이오연료의 제조방법.A method for producing a biofuel comprising the step of hydrolyzing a biomass material by adding the pectin degrading enzyme protein according to claim 2.
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