KR102050637B1 - Alleles associated with adverse drug reaction and detecting method thereof - Google Patents

Alleles associated with adverse drug reaction and detecting method thereof Download PDF

Info

Publication number
KR102050637B1
KR102050637B1 KR1020170132224A KR20170132224A KR102050637B1 KR 102050637 B1 KR102050637 B1 KR 102050637B1 KR 1020170132224 A KR1020170132224 A KR 1020170132224A KR 20170132224 A KR20170132224 A KR 20170132224A KR 102050637 B1 KR102050637 B1 KR 102050637B1
Authority
KR
South Korea
Prior art keywords
human
seq
detecting
nucleotide sequence
gene consisting
Prior art date
Application number
KR1020170132224A
Other languages
Korean (ko)
Other versions
KR20190041138A (en
Inventor
신재국
김호숙
차은영
정혜은
Original Assignee
인제대학교 산학협력단
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 인제대학교 산학협력단 filed Critical 인제대학교 산학협력단
Priority to KR1020170132224A priority Critical patent/KR102050637B1/en
Publication of KR20190041138A publication Critical patent/KR20190041138A/en
Application granted granted Critical
Publication of KR102050637B1 publication Critical patent/KR102050637B1/en

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156Polymorphic or mutational markers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158Expression markers

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

본 발명은 유전자 CYP2D6, CYP2C19, DRD2, ANNK1 및 GRIK4에 존재하는 변이를 고속으로 검출함으로써 항정신병 약물의 부작용의 발생 위험도를 예측하는 방법에 대한 것으로, 약물 부작용과 관련된 유전자 CYP2D6, CYP2C19, DRD2, ANKK1 및 GRIK4의 특정 대립유전자를 보다 빠르고 저렴하게 확인할 수 있으며, 높은 정확성을 나타내므로, 약물성 과민 반응을 사전에 예방하고 대체 약물투여로 치료의 효과 및 성공률을 높이는데 유용하게 사용될 수 있다.The present invention relates to a method for predicting the risk of developing adverse effects of antipsychotic drugs by rapidly detecting mutations present in the genes CYP2D6, CYP2C19, DRD2, ANNK1 and GRIK4, and relates to genes CYP2D6, CYP2C19, DRD2, ANKK1 associated with drug side effects. And specific alleles of GRIK4 can be identified faster and cheaper, and have high accuracy, and thus can be usefully used to prevent drug hypersensitivity reactions and to increase the effectiveness and success rate of treatment with alternative medications.

Description

약물 부작용과 관련된 대립유전자 및 이의 검출 방법{ALLELES ASSOCIATED WITH ADVERSE DRUG REACTION AND DETECTING METHOD THEREOF}Alleles associated with drug side effects and methods of detection thereof {ALLELES ASSOCIATED WITH ADVERSE DRUG REACTION AND DETECTING METHOD THEREOF}

본 발명은 약물 부작용과 관련된 대립유전자의 용도에 대한 것으로, 구체적으로, 유전자 CYP2D6, CYP2C19, DRD2, ANNK1 및 GRIK4에 존재하는 변이를 고속으로 검출함으로써 항정신병 약물의 부작용의 발생 위험도를 예측하는 방법에 대한 것이다.The present invention relates to the use of alleles associated with drug side effects, and in particular, in a method for predicting the risk of the development of side effects of antipsychotic drugs by detecting the high speed mutations present in genes CYP2D6, CYP2C19, DRD2, ANNK1 and GRIK4. It is about.

인간유전체 지도의 완성과 차세대 염기서열분석 (Next Generation Sequencing, NGS) 등 유전체 기반 기술과, 중개·임상 연구로 이어지는 기초 및 임상 연구 기반 기술의 발전으로, 맞춤의료의 구현이 현실화되고 있다. 특히, 약물유전체연구 (pharmacogenomics)는 각 개인의 유전적/환경적 요인에 근거하여 약물반응을 예측함으로써, 효과적이며 안전한 맞춤약물치료를 가능하게 하는 핵심 연구분야이다 (Shastry BS. Pharmacogenetics and the concept of individualized medicine. Pharmacogenomics J 2006;6(1):16-21).With the development of genome-based technologies such as the completion of human genome maps and next generation sequencing (NGS), as well as basic and clinical research-based technologies leading to intermediary and clinical research, the implementation of personalized medicine is becoming a reality. In particular, pharmacogenomics is a key area of research that enables effective and safe personalized drug therapies by predicting drug responses based on individual genetic and environmental factors (Shastry BS.Pharmacogenetics and the concept of individualized medicine.Pharmacogenomics J 2006; 6 (1): 16-21).

약물유전체연구의 성장으로 다수의 약물유전체바이오마커가 많은 연구를 통해 임상적으로 검증되고 있으며, 미국 또는 유럽의 식약처에서는 “검증된 약물유전체바이오마커 (valid pharmacogenomics biomarker)”내용을 의약품 설명서 (2016년 2월, 136개 약물, 54개의 바이오마커 포함)에 포함시켜 약물반응의 다양성을 설명하거나 치료실패/약물이상반응을 경고하고 있다 (Table of Pharmacogenomic Biomarkers in Drug Labeling. US Food and Drug Administration. Available at http://www.fda.gov/Drugs (last accessed 2 February 2016)). 이 중, 약품설명서에 바이오마커관련 내용을 가장 많이 포함하고 있는 약물이 항암제이며, 두 번째가 항우울제 또는 항조현병제 약물로서, 이들 약물 투여 시 약물유전체바이오마커에 따른 약물요량조절을 권고하고 있다.With the growth of pharmacogenomic research, many pharmacogenomic biomarkers have been clinically validated through a number of studies, and the US and European Food and Drug Administration has described the "valid pharmacogenomics biomarker" in the Pharmaceutical Guide (2016). In February, 136 drugs, including 54 biomarkers, were used to explain the diversity of drug reactions and to warn of treatment failure / drug reactions (Table of Pharmacogenomic Biomarkers in Drug Labeling.US Food and Drug Administration. at http://www.fda.gov/Drugs (last accessed 2 February 2016). Of these, drugs containing the most biomarker-related content in the drug description are anticancer drugs, and second, antidepressants or anti-schizophrenic drugs, and drug administration according to drug genome biomarkers is recommended.

개체간의 유전적 다양성은 약물의 독성 및 효능에 있어서 개체간 차이를 가져온다. 따라서, 약물 개발의 초기 단계에서 이와 같은 약제학적으로 중요한 단백질의 유전적 다양성에 대한 효과를 고려하는 것은 약물 개발의 실패에 대한 위험성을 낮출 수 있는 중요한 요소이다. 이러한 개체간 유전적 다양성을 측정하는 하나의 조사 집단이 되는 것이 "일배체형 (haplotype)"이다. 일배체형이란 하나의 조사 집단 내에 존재하는 각 유전자 서열의 다형성의 조합을 의미하며, 이것은 개별적인 다형성보다 유전적 다양성에 관한 보다 정확하고 신뢰할 수 있는 정보를 제공한다.Genetic diversity between individuals results in differences between individuals in drug toxicity and efficacy. Therefore, considering the effects on the genetic diversity of such pharmaceutically important proteins in the early stages of drug development is an important factor that can reduce the risk of drug development failure. It is the "haplotype" to be one research group that measures the genetic diversity between these individuals. Haplotypes refer to the combination of polymorphisms in each gene sequence present in one population, which provides more accurate and reliable information about genetic diversity than individual polymorphisms.

항우울증 항조현병등 항정신병 약물은 대부분 뇌내의 도파민과 세레토닌의 활성을 억제하는 약물들로 chlorpromazine, perphenazine, loxapine, trifluoperazine , haloperidol, bromperidol, pimozide, sulpiride clozapine, risperidone, olanzapine, quetiapine등이 주로 사용되며 긴장, 과다활동, 투쟁성, 적개심, 거부증, 환각, 급성 망상, 불면, 지나친 금식, 위축및 폐쇄등 다양한 약물 부작용이 발생한다. 이러한 작고 큰 부작용은 환자의 약물 복용을 중단시키는 원인이 되어 지며 이는 약물 치료의 실패로 이르게 된다. Antipsychotic drugs such as antidepressant schizophrenia are mostly drugs that inhibit dopamine and serotonin activity in the brain, such as chlorpromazine, perphenazine, loxapine, trifluoperazine, haloperidol, bromperidol, pimozide, sulpiride clozapine, risperidone, olanzapine, and quetiapine. It is mainly used and causes various side effects such as tension, hyperactivity, struggle, hostility, rejection, hallucinations, acute delusions, insomnia, excessive fasting, atrophy and obstruction. These small and large side effects can cause the patient to stop taking the drug, leading to failure of the medication.

최근 검증된 약물-유전체바이오마커 쌍에 대해 미국 등 외국의 주요 대형병원 (StJude Children's Research Hospital, Mayo Clinic, Vanderbilt University Medical Center 등) 에서는 약물 치료 전에 환자 Preemptive genotype service를 통해, 약물유전체연구와 맞춤치료 진료를 동시에 수행하고 있다. 가장 대표적인 예가 Mayo clinic의 RIGHT (Right Drug, Right Dose, Right Time-Using Genomic Data to Individualize Treatment) 프로그램으로, 유전형결과의 임상적용을 통해 환자의 약물치료결과를 개선하기 위한 최적의 방법을 창출하는 것을 목적으로 한다 (Bielinski SJ, Olson JE, Pathak J, Weinshilboum RM, Wang L, Lyke KJ, et al. Preemptive genotyping for personalized medicine: design of the right drug, right dose, right time-using genomic data to individualize treatment protocol. Mayo Clin Proc 2014;89(1):25-33)). For the recently validated drug-genetic biomarker pair, major foreign hospitals such as the United States (StJude Children's Research Hospital, Mayo Clinic, Vanderbilt University Medical Center, etc.) through drug preemptive genotype service prior to drug treatment, pharmacogenetic research and personalized therapy At the same time treatment is performed. The most representative example is Mayo clinic's RIGHT (Right Drug, Right Dose, Right Time-Using Genomic Data to Individualize Treatment) program, which suggests that clinical application of genotyping results creates an optimal way to improve patient outcomes. (Bielinski SJ, Olson JE, Pathak J, Weinshilboum RM, Wang L, Lyke KJ, et al. Preemptive genotyping for personalized medicine: design of the right drug, right dose, right time-using genomic data to individualize treatment protocol Mayo Clin Proc 2014; 89 (1): 25-33).

인종, 식이, 환경에 따라서 다르게 표현될 수 있으나, 한국에서 항우울제 또는 항조현병제관련 약물유전체바이오마커 기반의 적정 약물 선별 및 약물용량 예측 맞춤치료 연구 및 임상적용사례는 거의 전무하며, 현재 약물 부작용 관련 유전자 분석을 위해 일반적으로 사용되는 방법인 풀 시퀀싱 (full sequencing)은 시간이 많이 소요되어 임상적 치료를 시작하기 전 이용하기에는 시간상으로 적절하지 않으며, RT-PCR (real time PCR) 방법 및 대립 유전자 특이적 (allele specific PCR) 방법 등이 사용되고 있지만 이는 위양성 (false positive) 결과를 도출하는 위험성도 가지고 있는 문제가 있어왔다. Although it can be expressed differently according to race, diet, and environment, there are almost no personal treatment studies and clinical applications based on antidepressant or anti-schizophrenic drug marker biomarker-based customized treatment research and clinical application. Full sequencing, a commonly used method for gene analysis, is time consuming and not suitable for use before beginning clinical treatment. RT-PCR (real time PCR) methods and allele specificity Although allele specific PCR is used, there has been a problem that there is a risk of producing false positive results.

본 발명에서는 한국인을 포함한 아시아인에게서 약물 부작용과 관련된 특정 대립유전자와 이의 존재 여부를 신속하게 결정함으로써 항우울제 또는 항조현병제로 인한 약물 부작용을 예측하는 것을 목적으로 한다.The present invention aims to predict drug side effects caused by antidepressants or anti-schizophrenia drugs by quickly determining the specific alleles associated with drug side effects and their presence in Asians, including Koreans.

상기 목적의 달성을 위해, 본 발명은 약물 부작용 예측 또는 진단을 위한 마커용 조성물을 제공한다.In order to achieve the above object, the present invention provides a composition for a marker for predicting or diagnosing drug side effects.

또한, 본 발명은 약물 부작용 예측 또는 진단용 분석 키트를 제공한다.The present invention also provides an assay kit for predicting or diagnosing drug side effects.

또한, 본 발명은 약물 부작용, 약동학, 약물 치료 효과의 예측을 위한 약물유전형 정보를 제공하는 방법을 제공한다.In addition, the present invention provides a method for providing pharmacogenomic information for the prediction of drug side effects, pharmacokinetics, drug treatment effect.

아울러, 본 발명은 약물 부작용 유발 약물을 동정하는 방법을 제공한다.In addition, the present invention provides a method for identifying drug side effects causing drugs.

본 발명에 따르면, 약물 부작용과 관련된 유전자 CYP2D6, CYP2C19, DRD2, ANKK1 및 GRIK4의 특정 대립유전자의 변이를 보다 빠르고 저렴하게 확인할 수 있으며, 높은 정확성을 나타내므로, 약물성 과민 반응을 사전에 예방하고 대체 약물투여로 치료의 효과 및 성공률을 높이는데 유용하게 사용될 수 있다.According to the present invention, mutations of specific alleles of genes CYP2D6, CYP2C19, DRD2, ANKK1, and GRIK4 associated with drug side effects can be identified faster and cheaper, and exhibit high accuracy, thus preventing and replacing drug hypersensitivity in advance. Drug administration can be useful for increasing the effectiveness and success of treatment.

도 1는 본 발명의 방법에 따른 CYP2D6*2, CYP2D6*4, CYP2D6*5, CYP2D6*10B, CYP2D6*14, CYP2D6*18, CYP2D6*21, CYP2D6*41, CYP2D6*49, CYP2D6*52, CYP2D6*60, CYP2D62D6 중복(duplication) (*1xN, *2xN, *10xN), 즉, CYP2D6 유전자의 1758G>T, 100C>T, 1611T>A, 2573>C 삽입, 2988G>A, 3877G>A, 4125>중복 (GTGCCCACT 삽입), 2850C>T, 1887>TA 삽입, 결실 및 1846G>A을 확인한 도이다.
도 2는 CYP2C19*2(NC_000010.10:g.96541616G>A), CYP2C19*3(NC_000010.10:g.96540410G>A), CYP2C19*17(NC_000010.10:g.96521657C>A), DRD2 rs1799732 (NC_000011.10 g.-50978A>G), DRD2 rs1799978(NC_000011.10 g.-50878insC), DRD2 rs1801028g.(NC_000011.10 11890C>G), ANKK1 rs1800497(NC_000011.10 g.24546C>T) 및 GRIK4 rs1954787(NC_000011.10 g.120792654T>C), 즉, 인간 CYP2C19 유전자의 96541616G>A(*2), 96540410G>A(*3) 및 96521657C>A(*17), 인간 DRD2 유전자의 -50978A>G (rs1799732), -50878>C 삽입 (rs1799978) 및 11890C>G (rs1801028), 인간 ANKK1 유전자의 24546C>T (rs1800497), 및 인간 GRIK4 유전자의 120792654T>C (rs1954787)을 동시에 분석하여 검출한 결과이다.
1 shows CYP2D6 * 2, CYP2D6 * 4, CYP2D6 * 5, CYP2D6 * 10B, CYP2D6 * 14, CYP2D6 * 18, CYP2D6 * 21, CYP2D6 * 41, CYP2D6 * 49, CYP2D6 * 52, and CYP2D6 * 60, CYP2D62D6 duplication (* 1xN, * 2xN, * 10xN), i.e. 1758G> T, 100C> T, 1611T> A, 2573> C insertion, 2988G> A, 3877G> A, 4125 of CYP2D6 gene > Duplicate (GTGCCCACT insertion), 2850C> T, 1887> TA insertion, deletion and 1846G> A.
Figure 2 shows CYP2C19 * 2 (NC_000010.10: g.96541616G> A), CYP2C19 * 3 (NC_000010.10: g.96540410G> A), CYP2C19 * 17 (NC_000010.10: g.96521657C> A), DRD2 rs1799732 (NC_000011.10 g.-50978A> G), DRD2 rs1799978 (NC_000011.10 g.-50878insC), DRD2 rs1801028g. (NC_000011.10 11890C> G), ANKK1 rs1800497 (NC_000011.10 g.24546C> T) and GRIK4 rs1954787 (NC_000011.10 g.120792654T> C), that is, 96541616G> A (* 2), 96540410G> A (* 3) and 96521657C> A (* 17) of human CYP2C19 gene, -50978A> G of human DRD2 gene (rs1799732), -50878> C insertion (rs1799978) and 11890C> G (rs1801028), 24546C> T (rs1800497) of human ANKK1 gene, and 120792654T> C (rs1954787) of human GRIK4 gene were analyzed and detected simultaneously. .

본 발명을 보다 충분히 이해할 수 있도록 하기 위하여 하기의 상세한 설명을 기재한다. 달리 정의하지 않는 한, 본원에서 사용되는 모든 기술적 용어와 과학적 용어는 본 발명이 속하는 분야의 통상의 기술자가 보편적으로 이해하고 있는 것과 동일한 의미를 갖는다.In order that the present invention may be more fully understood, the following detailed description is set forth. Unless defined otherwise, all technical and scientific terms used herein have the same meaning as commonly understood by one of ordinary skill in the art to which this invention belongs.

달리 지시되지 않는 한, 핵산은 좌측에서 우측으로 5'→3' 배향으로 기록된다. 명세서 내에서 열거된 수치 범위는 범위를 정의하는 숫자를 포함하고, 정의된 범위 내의 각각의 정수 또는 임의의 비-정수 분획을 포함한다.Unless otherwise indicated, nucleic acids are recorded in a 5 '→ 3' orientation from left to right. The numerical ranges listed in the specification include numbers defining the ranges and include each integer or any non-integer fraction within the defined ranges.

달리 정의되지 않는 한, 본원에서 사용된 모든 기술적 및 과학적 용어는 본 발명이 속하는 분야의 당업자가 통상적으로 이해하는 것과 동일한 의미를 갖는다. 본원에 기술된 것들과 유사하거나 등가인 임의의 방법 및 재료가 본 발명을 테스트하기 위한 실행에서 사용될 수 있지만, 바람직한 재료 및 방법이 본원에서 기술된다.Unless defined otherwise, all technical and scientific terms used herein have the same meaning as commonly understood by one of ordinary skill in the art to which this invention belongs. Although any methods and materials similar or equivalent to those described herein can be used in the practice for testing the invention, preferred materials and methods are described herein.

본 발명에서 사용되는 용어에 대한 정의는 하기와 같다.Definitions of terms used in the present invention are as follows.

‘유전적 다형성 (genetic polymorphism)'은 인구집단에서 적어도 1% 이상의 빈도로 유전자 변이가 나타나는 경우를 말하며, 이 중 DNA에서 한 개의 뉴클레오티드의 삽입, 소실, 또는 치환이 일어나는 것을 단일염기다형성 (single nucleotide polymorphism, SNP) 이라고 한다.'Genetic polymorphism' refers to the occurrence of genetic variation in the population at least 1% or more, of which single nucleotide insertion, loss, or substitution occurs in DNA. polymorphism, or SNP.

‘다형성'이라는 용어는 군집 내에서 변하는 유전자의 서열에서의 배치를 지칭한다. 다형성은 상이한 "대립유전자"로 구성된다. 이러한 다형성의 배치는 유전자에서의 그의 위치 및 그에서 발견되는 상이한 아미노산 또는 염기에 의해 확인될수 있다. 이러한 아미노산 변이는 2개의 상이한 대립유전자인, 2개의 가능한 변이체 염기, C 및 T의 결과이다. 유전자형은 2개의 다른 별개의 대립유전자로 구성되기 때문에, 여러 가능한 변이체 중 임의의 변이체가 어느 한 개체에서 관찰될 수 있다 (예를 들어, 이 예에서, CC, CT 또는 TT). 개개의 다형성은 또한 당업자에게 공지되어 있고, 예를 들면, NCBI 웹사이트 상에서 이용가능한 뉴클레오티드 염기 변이의 단일 뉴클레오티드 다형성 데이터베이스(Single Nucleotide Polymorphism Database (dbSNP) of Nucleotide Sequence Variation)에서 사용되는 것인, 지정된 독특한 식별자 ("기준 SNP", "refSNP" 또는 "rs#"이다.The term 'polymorphism' refers to the placement in a sequence of genes that change within a community. Polymorphism consists of different "alleles". The placement of such polymorphisms can be identified by their position in the gene and the different amino acids or bases found therein. This amino acid variation is the result of two possible variant bases, C and T, which are two different alleles. Since the genotype consists of two different distinct alleles, any of several possible variants can be observed in either individual (eg, in this example, CC, CT or TT). Individual polymorphisms are also known to those of ordinary skill in the art and are designated, for example, as used in the Single Nucleotide Polymorphism Database (dbSNP) of Nucleotide Sequence Variation of nucleotide base variations available on the NCBI website. Identifier ("reference SNP", "refSNP" or "rs #").

‘유전자형'이라는 용어는 세포 또는 조직 샘플에서 특정 유전자의 특이적 대립유전자를 지칭한다.The term 'genotype' refers to the specific allele of a particular gene in a cell or tissue sample.

‘표현형'은 유전형에 의해서 결정되는 개체의 형태학적, 생리학적, 또는 생화학적 특징을 표현형이라 한다. 유전형이란 표현형과 구별되는 것으로, 개인의 유전자 구성을 뜻하며, 보다 좁은 의미로는 한 유전자 위에 존재하는 대립 유전자들(alleles)을 말한다.Phenotype is the phenotype of the morphological, physiological or biochemical characteristics of an individual, determined by genotype. Genotypes are distinguished from phenotypes and refer to the gene composition of an individual. In a narrower sense, alleles are alleles that exist above a gene.

‘대립 인자' 또는 ‘대립 유전자'란 같은 염색체 위치 (same chromosomallocus)를 점유하는 한 유전자의 둘 또는 그 이상의 선택적인 형태 (alternative forms) 중 하나를 뜻한다.An allele or allele means one of two or more alternative forms of a gene that occupy the same chromosomallocus.

‘대립유전자 빈도'는 대립유전자가 개체 내, 계통 내, 또는 계통의 집단 내에 존재하는 빈도 (비율 또는 백분율)을 지칭한다. 계통 또는 집단 내에서의 대립유전자 빈도를, 계통 또는 집단으로부터의 개체들의 샘플의 대립유전자 빈도를 평균화함으로써 추정할 수 있다.'Allele frequency' refers to the frequency (percent or percentage) in which the allele is present in an individual, within a lineage, or within a population of lines. Allele frequencies within a lineage or population can be estimated by averaging allele frequencies of a sample of individuals from the lineage or population.

‘위험'은 특정 다형성 대립유전자를 보유하지 않은 개체의 구성원에서의 질환 또는 상태의 발생 빈도에 비교하여, 특정 다형성 대립유전자를 보유한 개체에서의 질환 또는 상태의 발생 빈도가 통계적으로 높음을 나타낸다.'Risk' indicates a statistically high incidence of disease or condition in an individual carrying a specific polymorphic allele compared to the frequency of occurrence of the disease or condition in a member of an individual who does not possess a specific polymorphic allele.

‘핵산'은 데옥시리보핵산 (DNA), 및 적절하다면 리보핵산(RNA)과 같은 폴리뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드를 나타낸다. 이 용어는 또한, 동등하게, 뉴클레오티드 유사체 (예, 펩티드 핵산)로부터 제조된 RNA 또는 DNA 중 어느 하나의 유사체, 및, 서술된 구체예에 적용된 대로, 단일 (센스 또는 안티센스) 및 이중나선 폴리뉴클레오티드를 포함한다. 본 발명에서는 ‘핵산'이라는 용어와 ‘뉴클레오티드'가 병용하여 쓰이고 있다.'Nucleic acid' refers to a polynucleotide or oligonucleotide such as deoxyribonucleic acid (DNA), and ribonucleic acid (RNA), where appropriate. The term also equally refers to analogs of either RNA or DNA made from nucleotide analogs (eg, peptide nucleic acids), and single (sense or antisense) and double-stranded polynucleotides, as applied to the embodiments described. Include. In the present invention, the term 'nucleic acid' and 'nucleotide' are used in combination.

‘프라이머'는 상보성 RNA 또는 DNA 표적 폴리뉴클레오티드에 혼성화하고 예를 들어 폴리머라제 연쇄 반응에서 발생하는 뉴클레오티딜트랜스퍼라제의 작용에 의해 모노뉴클레오티드로부터 폴리뉴클레오티드의 단계적 합성을 위한 출발점으로 기능하는 올리고뉴클레오티드 서열을 의미한다.A 'primer' is an oligonucleotide sequence that hybridizes to complementary RNA or DNA target polynucleotides and functions as a starting point for the stepwise synthesis of polynucleotides from mononucleotides, for example by the action of nucleotidyltransferases that occur in polymerase chain reactions. Means.

“기능적 등가물"이라는 용어는 예를 들어, 기준(reference) 서열로부터 하나 또는 그 이상의 치환, 결실 또는 부가, 기준 서열과 실험(subject) 서열 사이의 다양한 기능적 비유사성을 낳지 않는 실제 효과(net effect) 등 변화된 돌연변이 서열의 뉴클레오티드와 핵산서열 모두를 의미한다. 바람직하게는, 뉴클레오티드 서열은 최소한 약 65%의 동일성, 보다 바람직하게는 최소한 약 75%의 동일성, 가장 바람직하게는 약 95%의 동일성을 가진다. 본 발명의 목적을 위해서는, 실질적으로 등가적인 생물학적 활성과 실질적으로 등가적인 합성 특징을 가지는 서열들은 실질적 등가물로 취급된다.The term “functional equivalent” refers to, for example, one or more substitutions, deletions or additions from a reference sequence, a net effect that does not result in various functional dissimilarities between the reference sequence and the subject sequence. Both nucleotide and nucleic acid sequences of the altered mutant sequence, etc. Preferably, the nucleotide sequence has at least about 65% identity, more preferably at least about 75% identity, and most preferably about 95% identity. For the purposes of the present invention, sequences having synthetic characteristics that are substantially equivalent to biological activities that are substantially equivalent are treated as substantially equivalent.

‘대상' 또는 '환자'는 인간, 소, 개, 기니아 피그, 토끼, 닭, 곤충 등을 포함하여 치료가 요구되는 임의의 단일 개체를 의미한다. 또한, 임의의 질병 임상 소견을 보이지 않는 임상 연구 시험에 참여한 임의의 대상 또는 역학 연구에 참여한 대상 또는 대조군으로 사용된 대상이 대상에 포함된다. 본 발명의 일 실시예에서는 인간을 대상으로 하였다."Subject" or "patient" means any single individual in need of treatment, including humans, cattle, dogs, guinea pigs, rabbits, chickens, insects, and the like. Also included are any subjects who participated in clinical research trials showing no disease clinical findings or subjects who participated in epidemiologic studies or who used as controls. In one embodiment of the present invention, humans were targeted.

‘조직 또는 세포 샘플(시료)'은 대상 또는 환자의 조직으로부터 얻은 유사한 세포의 집합체를 의미한다. 조직 또는 세포 샘플의 공급원은 신선한, 동결된 및/또는 보존된 장기 또는 조직 샘플 또는 생검 또는 흡인물로부터의 고형 조직; 혈액 또는 임의의 혈액 구성분; 대상의 임신 또는 발생의 임의의 시점의 세포일 수 있다. 조직 샘플은 또한 1차 또는 배양 세포 또는 세포주일 수 있다.'Tissue or cell sample (sample)' means a collection of similar cells obtained from a tissue of a subject or patient. Sources of tissue or cell samples may include solid tissue from fresh, frozen and / or preserved organ or tissue samples or biopsies or aspirates; Blood or any blood component; Cells at any time of pregnancy or development in the subject. Tissue samples may also be primary or cultured cells or cell lines.

본 발명에서 사용되는 모든 기술용어는, 달리 정의되지 않는 이상, 본 발명의 관련 분야에서 통상의 당업자가 일반적으로 이해하는 바와 같은 의미로 사용된다. 또한 본 명세서에는 바람직한 방법이나 시료가 기재되나, 이와 유사하거나 동등한 것들도 본 발명의 범주에 포함된다. 본 명세서에 참고문헌으로 기재되는 모든 간행물의 내용은 본 발명에 도입된다.All technical terms used in the present invention, unless defined otherwise, are used in the meaning as commonly understood by those skilled in the art in the related field of the present invention. Also described herein are preferred methods or samples, but similar or equivalent ones are within the scope of the present invention. The contents of all publications described herein by reference are incorporated into the present invention.

일 측면에서, 본 발명은 인간 CYP2D6(Cytochrome P450 2D6) 유전자의 1758G>T, 100C>T, 1611T>A, 2573>C 삽입, 2988G>A, 3877G>A, 4125>중복 (GTGCCCACT 삽입), 2850C>T, 1887>TA 삽입, 결실 및 1846G>A, 인간 CYP2C19(Cytochrome P450 2C19) 유전자의 96541616G>A(*2), 96540410G>A(*3) 및 96521657C>A(*17), 인간 DRD2(Dopamine receptor D2) 유전자의 -50978A>G (rs1799732), -50878>C 삽입 (rs1799978) 및 11890C>G (rs1801028), 인간 ANKK1(Ankyrin repeat and kinase domain containing 1) 유전자의 24546C>T (rs1800497), 및 인간 GRIK4(Glutamate Ionotropic Receptor Kainate Type Subunit 4) 유전자의 120792654T>C (rs1954787)로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나의 유전자 변이를 포함하는, 약물 부작용 예측 또는 진단을 위한 마커용 조성물에 관한 것이다.In one aspect, the present invention provides a 1758G> T, 100C> T, 1611T> A, 2573> C insertion, 2988G> A, 3877G> A, 4125> redundancy (GTGCCCACT insertion), 2850C of a human CYP2D6 (Cytochrome P450 2D6) gene. > T, 1887> TA insertion, deletion and 1846G> A, 96541616G> A (* 2), 96540410G> A (* 3) and 96521657C> A (* 17) of human CYP2C19 (Cytochrome P450 2C19) gene, human DRD2 ( -50978A> G (rs1799732), -50878> C insertion (rs1799978) and 11890C> G (rs1801028) of the Dopamine receptor D2) gene, 24546C> T (rs1800497) of the human Ankyrin repeat and kinase domain containing 1 (ANKK1) gene, And it relates to a composition for a marker for predicting or diagnosing drug side effects, comprising any one genetic mutation selected from the group consisting of 120792654T> C (rs1954787) of the human glutamate Ionotropic Receptor Kainate Type Subunit 4 (GRIK4) gene.

일 구현예에서, 상기 CYP2C19, CYP2D6, DRD2, ANKK1 및 GRIK4의 특정 대립유전자는 각각 별도로, 혹은 함께 검출될 수 있다.In one embodiment, the specific alleles of CYP2C19, CYP2D6, DRD2, ANKK1 and GRIK4 can be detected separately or together.

일 구현예에서, 본 발명의 약물 부작용 예측 또는 진단을 위한 마커용 조성물은 서열번호 23 내지 42의 다중 단일염기 프라이머들 중 어느 하나를 포함일 수 있다.In one embodiment, the composition for markers for predicting or diagnosing drug side effects of the present invention may include any one of multiple single base primers of SEQ ID NOs: 23 to 42.

일 구현예에서, 본 발명의 약물 부작용은 항우울제 또는 항조현병제로 인한 약물 부작용일 수 있으며, 상기 약물은 아미트리프틸린, 클로미프라민, 독세핀, 이미프라민, 아목사핀, 노르트립틸린, 시탈로프람, 에스시탈로프람, 플루옥세틴, 플루복사민, 밀나시프란, 파록세틴, 설트랄린, 벤라팍신, 아토목세틴, 부프로피온, 듀록세틴, 미르타자핀, 트라조돈, 셀레길린, 클로르프로마진, 페르페나진, 몰린돈, 할로페리돌, 아리피프라졸, 클로자핀, 올란자핀, 팔리페리돈, 쿠에티아핀, 리스페리돈, 설피리드, 지프라시돈 및 죠테핀으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나일 수 있고, 이로 인한 부작용은 백내장, 점막건조, 동공산대와 모양근 마비, 안내압증가, 고열, 변비, 무력성 장폐색증, 뇨저류, 배뇨지연, 요로 확장, 위약, 기면, 피로, 흥분, 동요, 악몽, 불안, 불면증, 혼돈, 집중곤란, 방향상실, 망상, 환각, 발작, 추체외로 증상, 말초신경통, 어지러움, 이명, 운동실조, 무감각, 쑤심, 이상감각, 조화불능, 운동실조, 불안정, 기절, 부정맥, 고혈압, 혈전증, 울혈성 심질환, 간손상, 황달, 간염, 홍반, 점상출혈, 담마진 , 소양증, 호산성구증가, 부종, 광과민증, 알러지, 식욕감퇴, 구토, 설사, 복부 경련, 성욕감퇴, 발기부전, 유즙분비과다, 미각소실, 빈뇨, 야뇨, 코충혈, 두통, 탈모, 홍조, 식욕증진, 체중증가 또는 감소, 간질성 폐렴, 오한, 발한, 당뇨병, 약물금단증후군, 자살사고 및 심근염으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나일 수 있다.In one embodiment, the drug side effects of the present invention may be drug side effects due to antidepressants or anti-schizophrenia, wherein the drugs are amitriphthyline, clomipramine, doxepin, imipramine, amoxapine, nortriptyline , Citalopram, escitalopram, fluoxetine, fluvoxamine, milnacifran, paroxetine, sulfalin, venlafaxine, atomoxetine, bupropion, duloxetine, mirtazapine, trazodone, selegiline, chlorproline Margin, Perphenazine, Molindon, Haloperidol, Aripiprazole, Clozapine, Olanzapine, Paliperidone, Cutiapine, Risperidone, Sulphide, Ziprasidone and Jotepin, and any one selected from Side effects include cataracts, dry mucous membranes, pupillary band and ciliary palsy, increased intraocular pressure, high fever, constipation, helpless ileus, urinary retention, delayed urination, urinary dilatation, placebo, lethargy, fatigue, excitement, agitation, Dreams, anxiety, insomnia, chaos, difficulty concentrating, disorientation, delusions, hallucinations, seizures, extrapyramidal symptoms, peripheral neuralgia, dizziness, tinnitus, ataxia, numbness, tingling, abnormalities, incompatibility, ataxia, instability, fainting , Arrhythmia, hypertension, thrombosis, congestive heart disease, liver damage, jaundice, hepatitis, erythema, pointed hemorrhage, gallbladder, pruritus, eosinophilia, edema, photosensitivity, allergies, loss of appetite, vomiting, diarrhea, abdominal cramps, sexual loss, Erectile dysfunction, excessive lactation, taste loss, frequent urination, urination, nasal congestion, headache, hair loss, flushing, increased appetite, weight gain or loss, interstitial pneumonia, chills, sweating, diabetes, drug withdrawal syndrome, suicide and myocarditis It may be any one selected from the group consisting of.

본 발명의 CYP2C19, CYP2D6, DRD2, ANKK1 및 GRIK4 유전자는 약물 부작용(Adverse Drug Reaction, ADR)과 관련되어 있으며, 본 발명의 조성물은 특히, CYP2D6*2, CYP2D6*4, CYP2D6*5, CYP2D6*10B, CYP2D6*14, CYP2D6*18, CYP2D6*21, CYP2D6*41, CYP2D6*49, CYP2D6*52, CYP2D6*60, CYP2D62D6 중복(duplication) (*1xN, *2xN, *10xN), CYP2C19*2(NC_000010.10:g.96541616G>A), CYP2C19*3(NC_000010.10:g.96540410G>A), CYP2C19*17(NC_000010.10:g.96521657C>A), DRD2 rs1799732 (NC_000011.10 g.-50978A>G), DRD2 rs1799978(NC_000011.10 g.-50878insC), DRD2 rs1801028g.(NC_000011.10 11890C>G), ANKK1 rs1800497(NC_000011.10 g.24546C>T) 및 GRIK4 rs1954787(NC_000011.10 g.120792654T>C)을 동시에 분석하여 각각의 유전자의 변이, 즉, 인간 CYP2D6 유전자의 1758G>T, 100C>T, 1611T>A, 2573>C 삽입, 2988G>A, 3877G>A, 4125>중복 (GTGCCCACT 삽입), 2850C>T, 1887>TA 삽입, 결실 및 1846G>A, 인간 CYP2C19 유전자의 96541616G>A(*2), 96540410G>A(*3) 및 96521657C>A(*17), 인간 DRD2 유전자의 -50978A>G (rs1799732), -50878>C 삽입 (rs1799978) 및 11890C>G (rs1801028), 인간 ANKK1 유전자의 24546C>T (rs1800497), 및 인간 GRIK4 유전자의 120792654T>C (rs1954787)를 검출할 수 있는 것을 특징으로 한다.The CYP2C19, CYP2D6, DRD2, ANKK1 and GRIK4 genes of the present invention are associated with Adverse Drug Reaction (ADR), and the compositions of the present invention are especially CYP2D6 * 2, CYP2D6 * 4, CYP2D6 * 5, CYP2D6 * 10B , CYP2D6 * 14, CYP2D6 * 18, CYP2D6 * 21, CYP2D6 * 41, CYP2D6 * 49, CYP2D6 * 52, CYP2D6 * 60, CYP2D62D6 Duplication (* 1xN, * 2xN, * 10xN), CYP2C19 * 2 (NC_0000 .10: g.96541616G> A), CYP2C19 * 3 (NC_000010.10: g.96540410G> A), CYP2C19 * 17 (NC_000010.10: g.96521657C> A), DRD2 rs1799732 (NC_000011.10 g.-50978A > G), DRD2 rs1799978 (NC_000011.10 g.-50878insC), DRD2 rs1801028g. (NC_000011.10 11890C> G), ANKK1 rs1800497 (NC_000011.10 g.24546C> T) and GRIK4 rs1954787 (NC_000011.10 g.120792654T > C) simultaneous analysis of each gene mutation, ie 1758G> T, 100C> T, 1611T> A, 2573> C insertion, 2988G> A, 3877G> A, 4125> redundancy (GTGCCCACT insertion) of the human CYP2D6 gene ), 2850C> T, 1887> TA insertion, deletion and 1846G> A, 96541616G> A (* 2), 96540410G> A (* 3) and 96521657C> A (* 17) of human CYP2C19 gene, human DRD2 Detects former -50978A> G (rs1799732), -50878> C insertion (rs1799978) and 11890C> G (rs1801028), 24546C> T of human ANKK1 gene (rs1800497), and 120792654T> C of human GRIK4 gene (rs1954787) It can be characterized by.

구체적으로, CYP2C19은 유전적 다형성에 따라 각각 PM (poor metabolizers), IM (intermediate metabolizers), EM (extensive metabolizers) UM (ultrarapid metaboilzers) 군으로 분류되며, 이러한 표현형에 따라, 아미트리프틸린, 클로미프라민, 독세핀, 이미프라민, 시탈로프람, 에스시탈로프람, 설트랄린 복용시 주의가 필요하다. Specifically, CYP2C19 is classified into a group of poor metabolizers (PM), intermediate metabolizers (IM), and extreme metabolizers (EM) ultrarapid metaboilzers (UM) according to genetic polymorphisms. Caution should be taken when taking pramins, doxepin, imipramine, citalopram, escitalopram, and sulfalin.

또한, CYP2D6는 유전적 다형성에 따라 각각 PM (poor metabolizers), IM (intermediate metabolizers), EM (extensive metabolizers) UM (ultrarapid metaboilzers) 군으로 분류된다. 이러한 표현형 (phenotype)에 따라, 아미트리프틸린, 클로미프라민, 독세핀, 이미프라민, 노르트립틸린, 플루복사민, 파록세틴, 벤라팍신, 아토목세틴, 페르페나진, 할로페리돌, 아리피프라졸, 클로자핀, 리스페리돈 복용시 주의가 필요하다. CYP2D6 유전자의 대립인자는 하기 표 1과 같으며, 각 유전형의 변이를 하기 표 2에 기재하였다 (대한민국등록특허 제10-0973049호 참조). 또한, 유전형에 따른 표현형을 표 3에 기재하였다.In addition, CYP2D6 is classified into a group of poor metabolizers (PM), intermediate metabolizers (IM), and extended metabolizers (EM) ultrarapid metaboilzers (UM), respectively, according to genetic polymorphism. According to this phenotype, amitriphylline, clomipramine, doxepin, imipramine, nortriptyline, fluvoxamine, paroxetine, venlafaxine, atomoxetine, perfenazine, haloperidol, aripiprazole, clozapine Be careful when taking risperidone. Alleles of the CYP2D6 gene are shown in Table 1 below, and the variation of each genotype is shown in Table 2 below (see Republic of Korea Patent No. 10-0973049). In addition, the phenotype according to genotype is listed in Table 3.

Figure 112017100015245-pat00001
Figure 112017100015245-pat00001

*Normal은 정상 수준, Incr는 증가함, Decr는 감소함, None은 활성 없음을 각각 나타낸다. 또한, 괄호안의 표기는 분석에 사용한 표지약물의 약자이다: b, bufuralol; d, debrisoquine; dx, dextromethorphan; s, sparteine.Normal indicates normal levels, Incr increases, Decr decreases, and None indicates no activity. In addition, the notation in parentheses is the abbreviation of the labeling drug used for the analysis: b, bufuralol; d, debrisoquine; dx, dextromethorphan; s, sparteine.

Figure 112017100015245-pat00002
Figure 112017100015245-pat00002

*'1'은 야생형을, '2'는 변이형을 각각 나타낸다.'1' represents wild type and '2' represents variant.

GeneGene Activity ScoreActivity score Allele_1Allele_1 Allele_2Allele_2 phenotype_CPICphenotype_CPIC CYP2D6CYP2D6 44 *1XN, *2XN* 1XN, * 2XN *1XN, *2XN* 1XN, * 2XN UMUM CYP2D6CYP2D6 33 *1XN, *2XN* 1XN, * 2XN *1, *2* 1, * 2 UMUM CYP2D6CYP2D6 2.52.5 *1XN* 1XN *41,*49,*52, *10XN* 41, * 49, * 52, * 10XN UMUM CYP2D6CYP2D6 2.252.25 *1XN, *2XN* 1XN, * 2XN *10* 10 UMUM CYP2D6CYP2D6 22 *1XN, *2XN* 1XN, * 2XN *4, *5, *14, *18, *21, *60* 4, * 5, * 14, * 18, * 21, * 60 NMNM CYP2D6CYP2D6 22 *1, *2* 1, * 2 *1, *2* 1, * 2 NMNM CYP2D6CYP2D6 1.51.5 *1, *2* 1, * 2 *41, *49, *52, *10XN* 41, * 49, * 52, * 10XN NMNM CYP2D6CYP2D6 1.251.25 *1, *2* 1, * 2 *10* 10 NMNM CYP2D6CYP2D6 1One *1, *2* 1, * 2 *4, *5, *14, *18, *21, *60* 4, * 5, * 14, * 18, * 21, * 60 NMNM CYP2D6CYP2D6 1One *41,*49, *52, *10XN* 41, * 49, * 52, * 10XN *41, *49, *52, *10XN* 41, * 49, * 52, * 10XN NMNM CYP2D6CYP2D6 0.750.75 *10* 10 *41, *49, *52, *10XN* 41, * 49, * 52, * 10XN -- CYP2D6CYP2D6 0.50.5 *4, *5, *14, *18, *21, *60* 4, * 5, * 14, * 18, * 21, * 60 *41, *49, *52, *10XN* 41, * 49, * 52, * 10XN IMIM CYP2D6CYP2D6 0.50.5 *10* 10 *10* 10 IMIM CYP2D6CYP2D6 0.250.25 *4, *5, *14, *18, *21, *60* 4, * 5, * 14, * 18, * 21, * 60 *10* 10 -- CYP2D6CYP2D6 00 *4, *5, *14, *18, *21, *60* 4, * 5, * 14, * 18, * 21, * 60 *4, *5, *14, *18, *21, *60* 4, * 5, * 14, * 18, * 21, * 60 PMPM

또한, DRD2의 rs1799732, rs1799978 및 rs1801028은 각 유전형에 따라, 클로르프로마진, 아리피프라졸, 클로자핀, 올란자핀, 리스페리돈, 복용시 주의가 필요하다.In addition, rs1799732, rs1799978 and rs1801028 of DRD2 require caution when taking chlorpromazine, aripiprazole, clozapine, olanzapine, risperidone, depending on each genotype.

또한, ANKK1의 rs1800497에 있어, CT 또는 TT 유전형의 환자는 CC 유전형의 환자와 비교하여, 고프로락틴 혈증 및 체중 증가를 포함한 부작용 위험이 증가 할 수 있으나, 항정신병제 치료중 지연성 운동장애의 위험이 감소할 가능성이 있다고 보고 되며 (클로자핀, 올란자핀, 리스페리돈), TT 유전형 환자는 CC 유전형 환자에 비해 증상이 개선될 가능성이 있다 (아리피프라졸, 리스페리돈).In addition, in rs1800497 of ANKK1, patients with the CT or TT genotype may have an increased risk of side effects, including hyperprolactinemia and weight gain, compared to patients with the CC genotype, but the risk of delayed dyskinesia during antipsychotic treatment. It is reported that this is likely to be reduced (clozapine, olanzapine, risperidone), and TT genotype patients may have improved symptoms compared to CC genotype patients (aripiprazole, risperidone).

아울러, GRIK4의 rs1954787에 있어, TT 또는 TC 유전형을 가진 우울장애 또는 우울증 환자는 CC 유전형 환자에 비해 낮은 항우울제 (아미트리프틸린, 클로미프라민, 독세핀, 이미프라민, 아목사핀, 노르트립틸린, 시탈로프람, 에스시탈로프람, 플루옥세틴, 플루복사민, 밀나시프란, 파록세틴, 설트랄린, 벤라팍신, 아토목세틴, 부프로피온, 듀록세틴, 미르타자핀, 트라조돈, 셀레길린) 치료 반응을 나타낸다.In addition, in rs1954787 of GRIK4, patients with depressive disorders or depressive disorders with TT or TC genotypes have lower antidepressants (amitriptyline, clomipramine, doxepin, imipramine, amoxapine, norip) than patients with CC genotypes. Tilin, citalopram, escitalopram, fluoxetine, fluvoxamine, milnasperan, paroxetine, sulfalin, venlafaxine, atomoxetine, bupropion, duloxetine, mirtazapine, trazodone, selegiline) Indicates a reaction.

본 발명의 인간 CYP2D6 유전자의 1758G>T, 100C>T, 1611T>A, 2573insC, 2988G>A, 3877G>A, 4125>중복 (GTGCCCACT 삽입), 2850C>T, 1887>TA 삽입, 결실 및 1846G>A, 인간 CYP2C19 유전자의 96541616G>A(*2), 96540410G>A(*3) 및 96521657C>A(*17), 인간 DRD2 유전자의 -50978A>G (rs1799732), -50878>C 삽입 (rs1799978) 및 11890C>G (rs1801028), 인간 ANKK1 유전자의 24546C>T (rs1800497), 및 인간 GRIK4 유전자의 120792654T>C (rs1954787)는 아미트리프틸린, 클로미프라민, 독세핀, 이미프라민, 아목사핀, 노르트립틸린, 시탈로프람, 에스시탈로프람, 플루옥세틴, 플루복사민, 밀나시프란, 파록세틴, 설트랄린, 벤라팍신, 아토목세틴, 부프로피온, 듀록세틴, 미르타자핀, 트라조돈, 셀레길린, 클로르프로마진, 페르페나진, 몰린돈, 할로페리돌, 아리피프라졸, 클로자핀, 올란자핀, 팔리페리돈, 쿠에티아핀, 리스페리돈, 설피리드, 지프라시돈 및 죠테핀 등의 약물 관련 부작용과 밀접한 관련을 나타내는 마커로서 기능하기 때문에, 상기 약물들의 부작용 위험을 평가할 수 있는 지표로 사용할 수 있다. 예를 들어, CYP2D6 PM은 아미트리프틸린 복용시 백내장, 점막건조, 동공산대와 모양근 마비, 안내압증가, 고열, 변비, 무력성 장폐색증, 뇨저류, 배뇨지연, 요로 확장, 위약, 기면, 피로, 흥분, 동요, 악몽, 불안, 불면증, 혼돈, 집중곤란, 방향상실, 망상, 환각, 발작, 추체외로 증상, 말초신경통, 어지러움, 이명, 운동실조, 무감각, 쑤심, 이상감각, 조화불능, 운동실조, 불안정, 기절, 부정맥, 고혈압, 혈전증, 울혈성 심질환, 간손상, 황달, 간염, 홍반, 점상출혈, 담마진 , 소양증, 호산성구증가, 부종, 광과민증, 알러지, 식욕감퇴, 구토, 설사, 복부 경련, 성욕감퇴, 발기부전, 유즙분비과다, 미각소실, 빈뇨, 야뇨, 코충혈, 두통, 탈모, 홍조, 식욕증진, 체중증가 또는 감소, 간질성 폐렴, 오한, 발한 등과 같은 약물 부작용이 일어날 수 있다.1758G> T, 100C> T, 1611T> A, 2573insC, 2988G> A, 3877G> A, 4125> Duplicate (GTGCCCACT Insertion), 2850C> T, 1887> TA Insertion, Deletion and 1846G> of the Human CYP2D6 Gene of the Invention A, 96541616G> A (* 2), 96540410G> A (* 3) and 96521657C> A (* 17) of human CYP2C19 gene, -50978A> G (rs1799732), -50878> C insertion of human DRD2 gene (rs1799978) And 11890C> G (rs1801028), 24546C> T of the human ANKK1 gene (rs1800497), and 120792654T> C (rs1954787) of the human GRIK4 gene are amitrifthilin, clomipramine, doxepin, imipramine, amoxapine , Nortriptyline, citalopram, escitalopram, fluoxetine, fluvoxamine, milnasperan, paroxetine, sultraline, venlafaxine, atomoxetine, bupropion, duloxetine, mirtazapine, trazodone, sele Guilin, Chlorpromazine, Perphenazine, Molindon, Haloperidol, Aripiprazole, Clozapine, Olanzapine, Paliperidone, Quetiapine, Risperidone, Sulphide, Ziprasidone and Jaw Because it functions as a marker indicating a closely related to the drug-related side effects such as pins, it may be used as an index for evaluating the risk of side effects of the drug. For example, CYP2D6 PM can cause cataracts, dry mucous membranes, pupillary band and ciliary palsy, increased intraocular pressure, high fever, constipation, lethargic ileus, urinary retention, delayed urination, urinary tract dilatation, placebo, lethargy and fatigue. , Excitement, agitation, nightmares, anxiety, insomnia, chaos, distress, disorientation, delusions, hallucinations, seizures, extrapyramidal symptoms, peripheral neuralgia, dizziness, tinnitus, ataxia, numbness, tingling, abnormalities, incompatibility, exercise Ataxia, instability, fainting, arrhythmia, high blood pressure, thrombosis, congestive heart disease, liver damage, jaundice, hepatitis, erythema, pointed hemorrhage, dimples, pruritus, eosinophilia, edema, photosensitivity, allergy, loss of appetite, vomiting, diarrhea, abdomen Drug side effects such as convulsions, decreased libido, erectile dysfunction, excessive secretion, taste loss, frequent urination, urination, nasal congestion, headache, hair loss, flushing, increased appetite, weight gain or loss, interstitial pneumonia, chills and sweating have.

일 측면에서, 본 발명은 본 발명에 따른 조성물을 포함하는, 약물 부작용 예측 또는 진단용 분석 키트에 관한 것이다.In one aspect, the invention relates to an assay kit for predicting or diagnosing drug side effects, comprising the composition according to the invention.

상기 키트는 CYP2D6*2, CYP2D6*4, CYP2D6*5, CYP2D6*10B, CYP2D6*14, CYP2D6*18, CYP2D6*21, CYP2D6*41, CYP2D6*49, CYP2D6*52, CYP2D6*60, CYP2D62D6 중복(duplication) (*1xN, *2xN, *10xN), CYP2C19*2(NC_000010.10:g.96541616G>A), CYP2C19*3(NC_000010.10:g.96540410G>A), CYP2C19*17(NC_000010.10:g.96521657C>A), DRD2 rs1799732 (NC_000011.10 g.-50978A>G), DRD2 rs1799978(NC_000011.10 g.-50878insC), DRD2 rs1801028g.(NC_000011.10 11890C>G), ANKK1 rs1800497(NC_000011.10 g.24546C>T) 및 GRIK4 rs1954787(NC_000011.10 g.120792654T>C)로 이루어진 군에서 선택되는 하나 이상의 대립유전자 검출을 위한 프로브를 포함한다.The kit is CYP2D6 * 2, CYP2D6 * 4, CYP2D6 * 5, CYP2D6 * 10B, CYP2D6 * 14, CYP2D6 * 18, CYP2D6 * 21, CYP2D6 * 41, CYP2D6 * 49, CYP2D6 * 52, CYP2D6 * 60, CYP2D62 duplication) (* 1xN, * 2xN, * 10xN), CYP2C19 * 2 (NC_000010.10: g.96541616G> A), CYP2C19 * 3 (NC_000010.10: g.96540410G> A), CYP2C19 * 17 (NC_000010.10 : g.96521657C> A), DRD2 rs1799732 (NC_000011.10 g.-50978A> G), DRD2 rs1799978 (NC_000011.10 g.-50878insC), DRD2 rs1801028g. (NC_000011.10 11890C> G), ANKK1 rs1800497 (NC_000011 .10 g.24546C> T) and GRIK4 rs1954787 (NC_000011.10 g.120792654T> C) and comprise a probe for detection of one or more alleles selected from the group.

일 구현예에서, 프로브는 본원에서 다른 물질을 검출하는데 유용한 임의의 물질을 의미한다. 따라서, 프로브는 관심 대상의 대립유전자 내의 특정 영역에 특이적으로 부합화 (hybridize)하는 올리고뉴클레오티드일 수 있다. In one embodiment, probe refers to any substance useful for detecting other substances herein. Thus, the probe may be an oligonucleotide that specifically hybridizes to a specific region within the allele of interest.

상기 키트는 환자로부터 생체 시료를 수집하기 위한 도구 및/또는 시약 뿐 아니라 그 시료로부터 게놈 DNA, cDNA, RNA 또는 단백질을 준비하기 위한 도구 및/또는 시약을 더 포함할 수 있다. 예를 들면, 게놈 DNA의 관련 영역을 증폭하기 위한 PCR 프라이머를 포함할 수 있다. 상기 키트는 약리게놈학적 프로파일링에 유용한 유전 인자의 프로브를 포함할 수 있다. 또한, 이러한 키트의 사용에 있어서, 표지화된 올리고뉴클레오티드를 사용하여 분석 중 용이하게 동정할 수 있다.The kit may further comprise tools and / or reagents for collecting genomic DNA, cDNA, RNA or protein from the sample as well as tools and / or reagents for collecting the biological sample from the patient. For example, it may include PCR primers for amplifying relevant regions of genomic DNA. The kit may comprise probes of genetic factors useful for pharmacogenomic profiling. In addition, in the use of such kits, labeled oligonucleotides can be used to easily identify during analysis.

특히, 본 발명에서는 CYP2C19, CYP2D6, DRD2, ANKK1 및 GRIK4의 특정 유전자 변이, 구체적으로, 인간 CYP2D6 유전자의 1758G>T, 100C>T, 1611T>A, 2573insC, 2988G>A, 3877G>A, 4125>중복 (GTGCCCACT 삽입), 2850C>T, 1887>TA 삽입, 결실 및 1846G>A, 인간 CYP2C19 유전자의 96541616G>A(*2), 96540410G>A(*3) 및 96521657C>A(*17), 인간 DRD2 유전자의 -50978A>G (rs1799732), -50878>C 삽입 (rs1799978) 및 11890C>G (rs1801028), 인간 ANKK1 유전자의 24546C>T (rs1800497), 및 인간 GRIK4 유전자의 120792654T>C (rs1954787)를 검출을 위한 다양한 프로브를 사용하는 것을 특징으로 하며, 각각의 단일 염기 다형성(SNP) 영역 증폭을 위한 프라이머 세트, 예를 들어 서열번호 1 내지 22로 표시되는 프라이머 세트; 및 스냅샷 분석을 위한 다중 단일염기 프라이머, 예를 들어 서열번호 23 내지 42로 표시되는 다중 단일염기 프라이머를 포함하는 것이 바람직하다.In particular, in the present invention, specific gene mutations of CYP2C19, CYP2D6, DRD2, ANKK1 and GRIK4, specifically, 1758G> T, 100C> T, 1611T> A, 2573insC, 2988G> A, 3877G> A, 4125> of the human CYP2D6 gene Duplicate (GTGCCCACT Insertion), 2850C> T, 1887> TA Insertion, Deletion and 1846G> A, 96541616G> A (* 2), 96540410G> A (* 3) and 96521657C> A (* 17) of human CYP2C19 gene -50978A> G (rs1799732), -50878> C insertion (rs1799978) and 11890C> G (rs1801028) of the DRD2 gene, 24546C> T (rs1800497) of the human ANKK1 gene, and 120792654T> C (rs1954787) of the human GRIK4 gene A set of primers for amplifying each single nucleotide polymorphism (SNP) region, for example, a set of primers represented by SEQ ID NOS: 1-22; And multiple single base primers for snapshot analysis, for example, multiple single base primers represented by SEQ ID NOs: 23-42.

상기 키트는 DNA 중합효소 및 dNTP(dGTP, dCTP, dATP 및 dTTP), 형광물질 등의 표지 물질을 추가로 더 함유할 수 있다.The kit may further contain a labeling material such as DNA polymerase and dNTP (dGTP, dCTP, dATP and dTTP), fluorescent material.

일 측면에서, 본 발명은 (a) 인간으로부터 생물학적 시료를 채취하는 단계; (b) 상기 (a) 단계의 채취된 시료로부터 핵산을 추출하는 단계; (c) 상기 (b) 단계의 핵산을 주형으로 하고 인간 CYP2D6 유전자, CYP2C19 유전자, 인간 DRD2 유전자, 인간 ANKK1 유전자 및 인간 GRIK4 유전자로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 또는 이의 단편을 증폭할 수 있는 프라이머로 PCR을 수행하는 단계; 및 (d) 상기 (c) 단계에서 얻은 PCR 산물의 염기서열에서 유전자 변이 존재 유무를 확인하는 단계를 포함하는, 약물유전형에 대한 정보를 제공하는 방법에 관한 것이다.In one aspect, the invention comprises the steps of (a) taking a biological sample from a human; (b) extracting nucleic acids from the sample taken in step (a); (c) a primer capable of amplifying any one or fragments thereof as a template of the nucleic acid of step (b) and selected from the group consisting of human CYP2D6 gene, CYP2C19 gene, human DRD2 gene, human ANKK1 gene, and human GRIK4 gene Performing a PCR; And (d) relates to a method for providing information on the drug genotype comprising the step of confirming the presence or absence of the genetic mutation in the base sequence of the PCR product obtained in step (c).

일 구현예에서, 상기 약물유전형은 약동학, 약물치료효과 및 약물유해반응을 예측하고 이를 고려하여 개인별 맞춤약물치료 요법을 시행하기 위한 정보를 제공할 수 있다.In one embodiment, the pharmacogenetic type may provide information for predicting pharmacokinetics, drug treatment effects and adverse drug reactions and taking personalized drug treatment regimens into consideration.

일 구현예에서, 상기 CYP2C19, CYP2D6, DRD2, ANKK1 및 GRIK4에서 특정 대립유전자가 존재할 때 약물 부작용 위험이 있는 것으로 판단될 수 있다.In one embodiment, it may be determined that there is a risk of drug side effects when certain alleles are present in the CYP2C19, CYP2D6, DRD2, ANKK1 and GRIK4.

일 구현예에서, 상기 (a) 단계의 생물학적 시료가 혈액, 피부 세포, 점막 세포 및 모발로 이루어진 군에서 선택되는 것일 수 있다.In one embodiment, the biological sample of step (a) may be selected from the group consisting of blood, skin cells, mucosal cells and hair.

일 구현예에서, 상기 (c) 단계의 프라이머는 서열번호 1 내지 22으로 이루어진 군에서 선택되는 유전자 변이 포함 영역 증폭을 위한 프라이머 세트일 수 있으며, PCR은 다중 중합효소연쇄반응 (multiplex polymerase chine reaction, multiplex PCR)일 수 있다. 유전자 변이 포함 영역을 PCR 증폭으로부터 얻은 DNA 산물은 예를 들면, 가수분해 프로브(TaqMan, Beacons, Scorpions), 부합화 프로브와 같은 서열 특이적 프로브를 사용하여 검출할 수 있다. 이들 프로브는 예를 들면 CYP2C19*2의 관심 대상의 영역에 결합하도록 설계된다. 상기 PCR 산물은 DNA-결합제에 의해서도 검출될 수 있다.In one embodiment, the primer of step (c) may be a primer set for amplifying a region containing a gene mutation selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1 to 22, PCR is a multiplex polymerase chine reaction (multiplex polymerase chine reaction, multiplex PCR). DNA products obtained from PCR amplification can be detected using sequence specific probes such as, for example, hydrolysis probes (TaqMan, Beacons, Scorpions), matching probes. These probes are designed to bind, for example, to the region of interest of CYP2C19 * 2. The PCR product can also be detected by DNA-binding agents.

일 구현예에서, 유전자 변이는 인간 CYP2D6 유전자의 1758G>T, 100C>T, 1611T>A, 2573insC, 2988G>A, 3877G>A, 4125>중복 (GTGCCCACT 삽입), 2850C>T, 1887>TA 삽입, 결실 및 1846G>A, 인간 CYP2C19 유전자의96541616G>A(*2), 96540410G>A(*3) 및 96521657C>A(*17), 인간 DRD2 유전자의 -50978A>G (rs1799732), -50878>C 삽입 (rs1799978) 및 11890C>G (rs1801028), 인간 ANKK1 유전자의 24546C>T (rs1800497), 및 인간 GRIK4 유전자의 120792654T>C (rs1954787)로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나일 수 있다.In one embodiment, the gene mutation is 1758G> T, 100C> T, 1611T> A, 2573insC, 2988G> A, 3877G> A, 4125> duplicate (GTGCCCACT insertion), 2850C> T, 1887> TA insertion of the human CYP2D6 gene. , Deletion and 1846G> A, 96541616G> A (* 2), 96540410G> A (* 3) and 96521657C> A (* 17) of human CYP2C19 gene, -50978A> G (rs1799732), -50878> of human DRD2 gene C insertion (rs1799978) and 11890C> G (rs1801028), 24546C> T of human ANKK1 gene (rs1800497), and 120792654T> C (rs1954787) of human GRIK4 gene.

일 구현예에서, 상기 (d) 단계의 유전자 변이 존재 유무는 서열번호 23 내지 42의 다중 단일염기 프라이머를 이용한 스냅샷 (SNaPshot) 분석을 통해 확인될 수 있다. 본 발명의 일 실시예에서, 상기 단계 (c)에서 증폭한 유전자 변이 포함 영역의 증폭 산물과 상기 다중 단일염기 프라이머를 이용하여 SNaPshot 분석법으로 유전자 변이 (SNP)를 분석하고, 생성 산물에 대한 단일 염기 다형성(SNP)에 대한 최고점을 분석하여 유전형을 확인하였다.In one embodiment, the presence or absence of the genetic mutation of step (d) can be confirmed by snapshot (SNaPshot) analysis using multiple single-base primer of SEQ ID NO: 23 to 42. In one embodiment of the present invention, by using the amplification product of the region containing the gene mutation amplified in step (c) and the multiple single-base primers to analyze the genetic variation (SNP) by SNaPshot assay, a single base for the product Genotypes were confirmed by analyzing peaks for polymorphism (SNP).

일 구현예에서, 본 발명의 CYP2C19, CYP2D6, DRD2, ANKK1 및 GRIK4의 대립유전자 등의 유전 표지의 존재는 그 내부의 표지 또는 특정 영역의 직접적인 검출에 의해 결정할 수 있다. 예를 들면, Real time PCR 시스템을 이용하여 SNP 분석을 수행하거나, 디데옥시법에 의해 직접적인 핵산의 뉴클레오티드 서열의 결정을 통해 수행할 수 있으며, 또는 SNP 부위의 서열을 포함하는 프로브 또는 그에 상보적인 프로브를 상기 DNA와 혼성화시키고 그로부터 얻어지는 혼성화 정도를 측정함으로써 다형성 부위의 뉴클레오티드 서열을 결정하거나, 대립형질 특이적 프로브 혼성화 방법(allele-specific probe hybridization), 대립형질 특이적 증폭 방법(allelespecific amplification), 서열분석법(sequencing), 5' 뉴클레아제 분해법(5' nuclease digestion), 분자 비콘에세이법(molecular beacon assay), 올리고뉴클레오티드 결합 에세이법(oligonucleotide ligation assay), 크기 분석법(size analysis) 및 단일 가닥 배좌 다형성법(single-stranded conformation polymorphism) 등을 이용하여 수행될 수 있다.In one embodiment, the presence of genetic labels, such as alleles of CYP2C19, CYP2D6, DRD2, ANKK1, and GRIK4 of the present invention, can be determined by direct detection of a label or specific region therein. For example, the SNP analysis may be performed using a real time PCR system, or may be performed by determining the nucleotide sequence of the nucleic acid directly by the dideoxy method, or the probe including the sequence of the SNP region or a complementary probe thereof. The nucleotide sequence of the polymorphic site is determined by hybridizing with the DNA and measuring the degree of hybridization resulting therefrom, or by allele-specific probe hybridization, allelespecific amplification, or sequencing. sequencing, 5 'nuclease digestion, molecular beacon assay, oligonucleotide ligation assay, size analysis and single stranded polymorphism (single-stranded conformation polymorphism) and the like.

일 구현예에서, 약물 부작용(ADR)은 CYP2C19, CYP2D6, DRD2, ANKK1, GRIK4 유전형 및 표현형에 따른 환자 개인별 약물에 대한 부작용의 발병 위험 여부를 통해 판단될 수 있다. In one embodiment, drug side effects (ADR) can be determined based on the risk of developing side effects for individual patient drugs according to CYP2C19, CYP2D6, DRD2, ANKK1, GRIK4 genotypes and phenotypes.

일 구현예에서, 환자의 ADR 발병 확률은 일반집단 (general population)의 발병 확률의 약 1.5배에서 약 10배이며, 확률은 위험 인자의 발생률 (incidence)을 이용하는 등의, 기술분야에 알려진 어떤 방법을 사용하여 결정할 수 있다.In one embodiment, the patient's probability of developing ADR is about 1.5 to about 10 times the probability of developing a general population, and the probability is any method known in the art, such as using incidence of risk factors. Can be determined using.

일 구현예에서, ADR을 예측하기 위한 위험 인자의 “감도 (sensitivity)"는 그 위험 인자를 보유한 ADR 환자의 백분율이다. 예를 들어, 만일 모든 조현병 환자가 대립유전자 A를 가지면, 조현병을 예측하기 위한 그 대립유전자 A의 감도는 100%이다. 만일 40명의 조현병 환자 중 20명이 대립유전자 B를 갖는다면, 그때의 조현병을 예측하기 위한 그 대립유전자 B의 감도는 50%이다.In one embodiment, the “sensitivity” of a risk factor for predicting ADR is the percentage of ADR patients with that risk factor, for example, if all schizophrenic patients have allele A, The sensitivity of the allele A to predict is 100% .If 20 out of 40 schizophrenic patients have allele B, the sensitivity of the allele B to predict the schizophrenia at that time is 50%.

일 구현예에서, 본 발명의 인간 CYP2D6 유전자의 1758G>T, 100C>T, 1611T>A, 2573insC, 2988G>A, 3877G>A, 4125>중복 (GTGCCCACT 삽입), 2850C>T, 1887>TA 삽입, 결실 및 1846G>A, 인간 CYP2C19 유전자의 96541616G>A(*2), 96540410G>A(*3) 및 96521657C>A(*17), 인간 DRD2 유전자의 -50978A>G (rs1799732), -50878>C 삽입 (rs1799978) 및 11890C>G (rs1801028), 인간 ANKK1 유전자의 24546C>T (rs1800497), 및 인간 GRIK4 유전자의 120792654T>C (rs1954787)는 약물 부작용 발병 위험 인자로 사용될 수 있으며, 그 위험 인자의 감도는 적어도 약 50%에서 95%이다.In one embodiment, 1758G> T, 100C> T, 1611T> A, 2573insC, 2988G> A, 3877G> A, 4125> duplicates (GTGCCCACT insertion), 2850C> T, 1887> TA insertions of the human CYP2D6 gene of the invention , Deletion and 1846G> A, 96541616G> A (* 2), 96540410G> A (* 3) and 96521657C> A (* 17) of human CYP2C19 gene, -50978A> G (rs1799732), -50878> of human DRD2 gene C insertion (rs1799978) and 11890C> G (rs1801028), 24546C> T of human ANKK1 gene (rs1800497), and 120792654T> C of human GRIK4 gene (rs1954787) can be used as risk factors for the development of drug side effects, Sensitivity is at least about 50% to 95%.

일 측면에서, 본 발명은 (a) 약물을 시료에 처리하는 단계; (b) 시료로부터 핵산을 추출하는 단계; (c) 상기 (b) 단계의 핵산을 주형으로 하고 인간 CYP2D6 유전자, CYP2C19 유전자, 인간 DRD2 유전자, 인간 ANKK1 유전자 및 인간 GRIK4 유전자로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 또는 이의 단편을 증폭할 수 있는 프라이머로 PCR을 수행하는 단계; (d) 상기 (c) 단계에서 얻은 PCR 산물의 염기서열에서 일염기다형성을 포함한 유전자 변이 여부를 확인하는 단계; 및 (e) 유전자 변이가 존재하면 상기 단계 (a)에서 처리한 약물이 부작용을 유발할 위험이 있는 것으로 판단하는 단계를 포함하는, 약물 부작용 유발 약물을 동정하는 방법에 관한 것이다.In one aspect, the invention comprises the steps of (a) treating a drug to a sample; (b) extracting the nucleic acid from the sample; (c) a primer capable of amplifying any one or fragments thereof as a template of the nucleic acid of step (b) and selected from the group consisting of human CYP2D6 gene, CYP2C19 gene, human DRD2 gene, human ANKK1 gene, and human GRIK4 gene Performing a PCR; (d) confirming the genetic variation including monobasic polymorphism in the nucleotide sequence of the PCR product obtained in step (c); And (e) determining that the drug treated in step (a) is at risk of causing side effects if there is a genetic variation.

특정 대립유전자가 존재할 때 약물 부작용 위험이 있는 것으로 결정하는 단계Determining that there is a risk of drug side effects when certain alleles are present

하기의 실시예를 통하여 본 발명을 보다 상세하게 설명한다. 그러나 하기 실시예는 본 발명의 내용을 구체화하기 위한 것일 뿐 이에 의해 본 발명이 한정되는 것은 아니다.The present invention will be described in more detail with reference to the following examples. However, the following examples are only intended to embody the contents of the present invention, and the present invention is not limited thereto.

실시예 1. 다중 중합효소연쇄반응 (multiplex polymerase chine reaction, multiplex PCR)을 이용한 SNP 포함 PCR 산물 제작Example 1 Preparation of SNP-Containing PCR Product Using Multiplex Polymerase Chine Reaction

CYP2C19, CYP2D6, DRD2, ANKK1, GRIK4 각각의 약물 부작용 관련 SNP를 포함하는 특정 단편을 증폭하기 위하여, ABI 9700 (Applied Biosystems, Foster, USA)를 이용하여, 하기 표 4에 기재된 프라이머 세트로 각각의 PCR 조건으로 중합효소연쇄반응을 수행하였다. 구체적으로, CYP2C19 (CYP2C19*2*3*17)와 GRIK4 (GRIK4 rs1954787)는 의뢰검체 100 ng, 10X d-Taq PCR 버퍼 3㎕, dNTP mixture 3 ㎕, 각각의 프라이머 세트 (10 pmol) 0.4 ㎕씩, d-Taq DNA polymerase (2 U/㎕) 0.2 ㎕, D.W 20.6-X㎕를 포함한 총 30 ㎕의 반응액으로 구성하였다. 중합효소연쇄반응은 94℃에서 5분간 처리한 후에, 94℃에서 30초, 56℃에서 30초, 72℃에서 30분씩 35회 반응시켰고, 최종연장반응은 72℃에서 5분간 시행하였다. 또한, CYP2D6 Duplication은 의뢰검체 100 ng, 110X LA Taq PCR 버퍼 2 ㎕, dNTP mixture 2 ㎕, 25mM MgCl2 2 ㎕, 5X Band doctor 2 ㎕, 서열번호 7에서 8번 프라이머 (10 pmol) 각 0.5 ㎕씩, LATaq DNA polymerase (5 U/ul) 0.2 ㎕, D.W 10.8-X㎕를 포함한 총 20 ㎕의 반응액으로 구성하였다. 94℃에서 5분간 처리한 후에, 98℃에서 20초, 64℃에서 30초, 72℃에서 3분씩 35회 반응시켰고, 최종연장반응은 72℃에서 5분간 시행하였다. DRD2는 의뢰검체 150 ng, 10X d-Taq PCR 버퍼 3 ㎕, dNTP mixture 1 ㎕, 서열번호 11 내지 14의 프라이머 세트 (10 pmol) 1.5 ㎕씩, d-Taq DNA polymerase (2 U/㎕) 0.2 ㎕, D.W 21.2-X㎕를 포함한 총 30 ㎕의 반응액으로 구성하였다. 94℃에서 5분간 처리한 후에, 94℃에서 30초, 59℃에서 30초, 72℃에서 30분씩 35회 반응시켰고, 최종연장반응은 72℃에서 5분간 시행하였다. ANKK1은 의뢰검체 100 ng, 110X LA Taq PCR 버퍼 2 ㎕, dNTP mixture 2 ㎕, 25mM MgCl2 2 ㎕, 5X Band doctor 2 ㎕, 서열번호 15 내지 16의 프라이머 (10 pmol) 각 0.5 ㎕씩, LATaq DNA polymerase (5 U/ul) 0.2 ㎕, D.W 10.8-X㎕를 포함한 총 20 ㎕의 반응액으로 구성하였다. 94℃에서 5분간 처리한 후에, 98℃에서 20초, 64℃에서 30초, 72℃에서 3분씩 35회 반응시켰고, 최종연장반응은 72℃에서 5분간 시행하였다. CYP2D6 midi는 의뢰검체 100 ng, 10X EF Taq PCR 버퍼 2 ㎕, dNTP mixture 2 ㎕, 5X Band doctor 2 ㎕, 서열번호 17 내지 22의 프라이머 (10 pmol) 각 1 ㎕씩, EF Taq DNA polymerase (5 U/㎕) 0.25 ㎕, D.W 9.75-X㎕를 포함한 총 20 ㎕의 반응액으로 구성하였다. 94℃에서 5분간 처리한 후에, 98℃에서 20초, 64℃에서 30초, 72℃에서 3분씩 35회 반응시켰고, 최종연장반응은 72℃에서 5분간 시행하였다.To amplify specific fragments containing SNPs associated with drug side effects of CYP2C19, CYP2D6, DRD2, ANKK1, GRIK4, respectively, using ABI 9700 (Applied Biosystems, Foster, USA), each PCR with the primer set described in Table 4 below. The polymerase chain reaction was carried out under the conditions. Specifically, CYP2C19 (CYP2C19 * 2 * 3 * 17) and GRIK4 (GRIK4 rs1954787) were 100 ng of the sample sample, 3 μl of 10X d-Taq PCR buffer, 3 μl of dNTP mixture, and 0.4 μl of each primer set (10 pmol). A total of 30 µl of the reaction solution was prepared, including 0.2 µl of d-Taq DNA polymerase (2 U / µl) and 20.6-X µl of DW. After the polymerase chain reaction was performed at 94 ° C. for 5 minutes, the reaction was performed 35 times at 30 ° C. for 30 seconds at 94 ° C., 30 seconds at 56 ° C., and 30 minutes at 72 ° C., and the final extension reaction was performed at 72 ° C. for 5 minutes. In addition, CYP2D6 Duplication was performed by 100 ng of the sample sample, 2 μl of 110X LA Taq PCR buffer, 2 μl of dNTP mixture, 2 μl of 25mM MgCl 2, 2 μl of 5X Band doctor, and 0.5 μl of primer (10 pmol) in SEQ ID NO: 7. A total of 20 μl of the reaction solution was prepared, including 0.2 μl of LATaq DNA polymerase (5 U / ul) and DW 10.8-X μl. After 5 minutes at 94 ° C., 20 seconds at 98 ° C., 30 seconds at 64 ° C., and 3 times at 72 ° C. were carried out 35 times, and the final extension reaction was carried out at 72 ° C. for 5 minutes. DRD2 contains 150 ng of sample, 3 μl of 10X d-Taq PCR buffer, 1 μl of dNTP mixture, 1.5 μl of primer set (10 pmol) of SEQ ID NOs. 11 to 14, 0.2 μl of d-Taq DNA polymerase (2 U / μl). The reaction solution was composed of a total of 30 μl of the reaction solution, including DW 21.2-X μl. After treatment at 94 ° C. for 5 minutes, the reaction was carried out 35 times at 30 ° C. for 30 seconds at 59 ° C., 30 seconds at 59 ° C., and at 30 ° C. for 30 minutes. ANKK1 was 100 ng of the sample, 2 μl of 110X LA Taq PCR buffer, 2 μl of dNTP mixture, 2 μl of 25mM MgCl 2, 2 μl of 5X Band doctor, 0.5 μl each of primers (10 pmol) of SEQ ID NOs. 15 to 16, LATaq DNA A total of 20 μl of the reaction solution including 0.2 μl of polymerase (5 U / ul) and 10.8-X μl of DW was used. After 5 minutes at 94 ° C., 20 seconds at 98 ° C., 30 seconds at 64 ° C., and 3 times at 72 ° C. were carried out 35 times, and the final extension reaction was carried out at 72 ° C. for 5 minutes. CYP2D6 midi were 100 ng of sample, 2 μl of 10X EF Taq PCR buffer, 2 μl of dNTP mixture, 2 μl of 5X Band doctor, 1 μl of primer (10 pmol) of SEQ ID NOS: 17-22, EF Taq DNA polymerase (5 U / Μl) consisted of a total of 20 μl of reaction solution including 0.25 μl, DW 9.75-X μl. After 5 minutes at 94 ° C., 20 seconds at 98 ° C., 30 seconds at 64 ° C., and 3 times at 72 ° C. were carried out 35 times, and the final extension reaction was carried out at 72 ° C. for 5 minutes.

GeneGene 다중 중합효소연쇄반응 프라이머명Multiple polymerase chain reaction primer name 서열(5'-3')Sequence (5'-3 ') 서열번호SEQ ID NO: 크기
(bp)
size
(bp)
PCR 조건
(Annealing 온도,
Extension 시간)
PCR conditions
(Annealing temperature,
Extension time)
CYP2C19
*2
CYP2C19
*2
CYP2C19*2FCYP2C19 * 2F AATTACAACCAGAGCTTGGCAATTACAACCAGAGCTTGGC 1One 169169 57℃, 30s57 ℃, 30s
CYP2C19*2RCYP2C19 * 2R TATCACTTTCCATAAAAGCAAG TATCACTTTCCATAAAAGCAAG 22 CYP2C19
*3
CYP2C19
* 3
CYP2C19*3FCYP2C19 * 3F CCAATCATTTAGCTTCACCC CCAATCATTTAGCTTCACCC 33 262262 57℃, 30s57 ℃, 30s
CYP2C19*3R CYP2C19 * 3R ACTTCAGGGCTTGGTCAATA ACTTCAGGGCTTGGTCAATA 44 CYP2C19
*17
CYP2C19
* 17
CYP2C19*17FCYP2C19 * 17F GCCCTTAGCACCAAATTCTCT GCCCTTAGCACCAAATTCTCT 55 483483 57℃, 30s57 ℃, 30s
CYP2C19*17RCYP2C19 * 17R CACCTTTACCATTTAACCCC CACCTTTACCATTTAACCCC 66 CYP2D6
duplication
CYP2D6
duplication
CYP2D6_dup FCYP2D6_dup F CCTCACCACAGGACTGGCCACCCCTCACCACAGGACTGGCCACC 77 32383238 64℃, 3m64 ℃, 3m
CYP2D6_dup RCYP2D6_dup R CACGTGCAGGGCACCTAGATCACGTGCAGGGCACCTAGAT 88 GRIK4 rs1954787GRIK4 rs1954787 GRIK4 rs1954787 FGRIK4 rs1954787 F GATGAAAGGACCGAAGTAGGGATGAAAGGACCGAAGTAGG 99 356356 57℃, 30s57 ℃, 30s GRIK4 rs1954787 RGRIK4 rs1954787 R CTCTTCTTGTCATCCTCCCACTCTTCTTGTCATCCTCCCA 1010 DRD2 PromoterDRD2 Promoter DRD2 Promoter FDRD2 Promoter F TCCATGTCAGGTCAACTCCATCCATGTCAGGTCAACTCCA 1111 375375 59℃, 30s59 ℃, 30s DRD2 Promoter RDRD2 Promoter R CCCCACCAAAGGAGCTGTA CCCCACCAAAGGAGCTGTA 1212 DRD2 rs1801028DRD2 rs1801028 DRD2 rs1801028 FDRD2 rs1801028 F TGGCTTAGAACCACCCAGAGTGGCTTAGAACCACCCAGAG 1313 566566 59℃, 30s59 ℃, 30s DRD2 rs1801028 RDRD2 rs1801028 R GGAGCACCTTCCTGAGTGTCGGAGCACCTTCCTGAGTGTC 1414 ANKK1 rs1800497ANKK1 rs1800497 ANKK1 rs1800497 FANKK1 rs1800497 F CTGATGCCTGGGAACTTGTC CTGATGCCTGGGAACTTGTC 1515 272272 59℃, 30s59 ℃, 30s ANKK1 rs1800497 RANKK1 rs1800497 R GCCCATCTGTAAAGTGAGCAC GCCCATCTGTAAAGTGAGCAC 1616 CYP2D6
midi 1
CYP2D6
midi 1
CYP2D6_2850C/T FCYP2D6_2850C / T F TGGGGCCTGAGACTTGTCCAGGTGGGGCCTGAGACTTGTCCAGG 1717 23792379 64℃, 3m64 ℃, 3m
CYP2D6_6.4kb RCYP2D6_6.4kb R ACTGAGCCCTGGGAGGTAGGTAACTGAGCCCTGGGAGGTAGGTA 1818 CYP2D6
midi 2
CYP2D6
midi 2
CYP2D6_100C/T FCYP2D6_100C / T F CCATTTGGTAGTGAGGCAGGTCCATTTGGTAGTGAGGCAGGT 1919 20622062 64℃, 3m64 ℃, 3m
CYP2D6_1887G/insTA RCYP2D6_1887G / insTA R CCTGCAGAGACTCCTCGGTCTCCTGCAGAGACTCCTCGGTCT 2020 CYP2D6
deletion
CYP2D6
deletion
CYP2D6_del FCYP2D6_del F ACCTCTCTGGGCCCTCAGGGAACCTCTCTGGGCCCTCAGGGA 2121 29262926 64℃, 3m64 ℃, 3m
CYP2D6_del RCYP2D6_del R CAGGCATGAGCTAAGGCACCCAGACCAGGCATGAGCTAAGGCACCCAGAC 2222

중합효소 연쇄반응이 끝난 산물을 아이스 버킷(Ice bucket)에 옮긴 후, 파라필름(parafilm)위에 PCR 산물 2 ㎕, 6X 로딩 버퍼 1 ㎕, 1~2% 아가로오스 겔, 100 bp Mixed DNA ladder 2 ㎕, 0.5X TBE 버퍼를 섞어서 100V, 30분간 전기영동 러닝을 하였다. 이후, 1% 아가로오스 겔을 형광 물질을 함유한 겔 레드(gel red)로 염색하여 DNA 크기를 확인하였다 (도 1). PCR 산물 크기를 확인 후 샘플 내 PCR 반응을 하지 않은 프라이머와 dNTP의 제거를 위해, CYP2C19*2*3*17, GRIK4 rs1954787 PCR 산물 1.6 ul, CYP2D6 Duplication PCR 산물 0.8 ul 및 DRD2 PCR 산물 1.6 ㎕을 ExoSAP-IT (USB corp., Cleveland, USA) 1.8 ㎕와 혼합하였고, CYP2D6 midi PCR 산물 3 ㎕ 및 CYP2D6 deletion PCR 산물3 ㎕을 ExoSAP-IT 3 ㎕과 혼합하여 모두 37℃ 30분, 80℃ 15분간 반응시켜 남아 있는 효소를 비 활성화시켰다. 상기 반응을 통해 제작된 중합효소 연쇄반응 산물을 이후의 SNaPshot 분석을 위한 주형으로 이용하였다.After the polymerase chain reaction product was transferred to an ice bucket, 2 µl of PCR product on parafilm, 1 µl of 6X loading buffer, 1 to 2% agarose gel, and 100 bp Mixed DNA ladder 2 1 μL, 0.5X TBE buffer was mixed and subjected to electrophoresis running at 100V for 30 minutes. Thereafter, 1% agarose gel was stained with gel red containing fluorescent material to confirm DNA size (FIG. 1). ExoSAP CPR2C19 * 2 * 3 * 17, GRIK4 rs1954787 PCR product 1.6 ul, CYP2D6 Duplication PCR product 0.8 ul and DRD2 PCR product 1.6 ul 1.8 μl of IT (USB corp., Cleveland, USA) was mixed, and 3 μl of CYP2D6 midi PCR product and 3 μl of CYP2D6 deletion PCR product were mixed with 3 μl of ExoSAP-IT. To deactivate the remaining enzyme. The polymerase chain reaction product produced through the above reaction was used as a template for subsequent SNaPshot analysis.

실시예 2 :다중 단일염기 프라이머 확장 반응 (multiplex single based primer extension, SNaPshot assay)을 이용한 SNP 존재 유무 확인Example 2 Confirmation of SNP Presence Using Multiplex Single Based Primer Extension (SNaPshot Assay)

2-1. SNP별 프라이머 설계2-1. Primer Design by SNP

다중 단일염기 프라이머 확장반응 (multiplex single based primer extension, SNaPshot assay)을 위한 유형별 프라이머는 표 5와 같다. 프라이머들의 3' 말단은 각 유전자 SNP의 직전 뉴클레오티드와 정렬되도록 설계하였다 (표 5).Type primers for multiplex single based primer extension (SNaPshot assay) are shown in Table 5. The 3 'end of the primers was designed to align with the nucleotide immediately before each gene SNP (Table 5).

서열번호SEQ ID NO: 다중 단일염기 프라이머명Multiple single base primer name 서열(5'-3')Sequence (5'-3 ') 반응 농도 (pmol)Reaction concentration (pmol) 2323 CYP2C19*2 seqF(T20)CYP2C19 * 2 seqF (T20) TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCACTATCATTGATTATTTCCC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCACTATCATTGATTATTTCCC 88 2424 CYP2C19*3 seqR(T28)CYP2C19 * 3 seqR (T28) TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAAAAAACTTGGCCTTACCTGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAAAAAACTTGGCCTTACCTGGAT 22 2525 CYP2C19*17seqF(T0)CYP2C19 * 17seqF (T0) TTTCAAATTTGTGTCTTCTGTTCTCAAAGTTTCAAATTTGTGTCTTCTGTTCTCAAAG 1One 2626 GRIK4 rs1954787 seqF(T32)GRIK4 rs1954787 seqF (T32) TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGCAATTGGAGACTGGTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGCAATTGGAGACTGGTTAT 22 2727 CYP2D6 Duplication seqR(T45)CYP2D6 Duplication seqR (T45) TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCGTCACTGGTCAGGGGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCGTCACTGGTCAGGGGTC 2020 2828 DRD2_ANKK1 rs1800497 seqR(T3)DRD2_ANKK1 rs1800497 seqR (T3) TTTAGCCATCCTCAAAGTGCTGGTCTTTAGCCATCCTCAAAGTGCTGGTC 44 2929 DRD2_rs1799732 seqR(T26)DRD2_rs1799732 seqR (T26) TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTCGGCGATCCCCGGCCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTCGGCGATCCCCGGCCTG 88 3030 DRD2_rs1799978 seqF(T14)DRD2_rs1799978 seqF (T14) TTTTTTTTTTTTTTGACCCAGCCTGCAATCACAGCTTTTTTTTTTTTTTTTGACCCAGCCTGCAATCACAGCTT 88 3131 DRD2_rs1801028 seqF(T34)DRD2_rs1801028 seqF (T34) TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCACCAGCTGACTCTCCCCGACCCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCACCAGCTGACTCTCCCCGACCCGT 44 3232 CYP2D6_1758G/TseqF(T0)CYP2D6_1758G / TseqF (T0) CGCCTTCGCCAACCACTCCCGCCTTCGCCAACCACTCC 2828 3333 CYP2D6_100C/TseqF(T0)CYP2D6_100C / TseqF (T0) CAACGCTGGGCTGCACGCTACCAACGCTGGGCTGCACGCTAC 1515 3434 CYP2D6_1611T/AseqR(T10)CYP2D6_1611T / AseqR (T10) TTTTTTTTTTGGGCCCATAGCGCGCCAGGATTTTTTTTTTGGGCCCATAGCGCGCCAGGA 1One 3535 CYP2D6_2573insCseqF(T16)CYP2D6_2573insCseqF (T16) TTTTTTTTTTTTTTTTTGGGACCCAGCCCAGCCCCCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGACCCAGCCCAGCCCCCCC 33 3636 CYP2D6_2988G/AseqF(T20)CYP2D6_2988G / AseqF (T20) TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTGCAGGGGCCGAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTGCAGGGGCCGAGGGAG 44 3737 CYP2D6_3877G/AseqR(T25)CYP2D6_3877G / AseqR (T25) TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGGCATCCAGGAAGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGGCATCCAGGAAGTGTT 2020 3838 CYP2D6_4125DupseqF(T28)CYP2D6_4125DupseqF (T28) TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGCTTCTCGGTGCCCACTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGCTTCTCGGTGCCCACTG 33 3939 CYP2D6_2850C/TseqR(T35)CYP2D6_2850C / TseqR (T35) TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGGTCAGCCACCACTATGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGGTCAGCCACCACTATGC 2.52.5 4040 CYP2D6_1887insTAseqR(T40)CYP2D6_1887insTAseqR (T40) TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGGGAGGCGATCACGTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGGGAGGCGATCACGTTGCT 88 4141 CYP2D6_deletion_seqR(T45)CYP2D6_deletion_seqR (T45) TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCGTCACTGGTCAGGGGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCGTCACTGGTCAGGGGTC 88 4242 CYP2D6_1846G/AseqF(T50)CYP2D6_1846G / AseqF (T50) TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACCCGCATCTCCCACCCCCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACCCGCATCTCCCACCCCCA 44

2-2. SNaPshot 분석2-2. SNaPshot Analysis

상기 실시예 1에서 제작한 중합효소 연쇄반응 산물을 주형으로 이용하여, 단일염기다형성 부위에 대해 길이를 다르게 설계한 상기 표 5의 프라이머를 이용하여 다중 단일염기 프라이머 확장반응과 SNaPshot 분석을 수행하였다. 구체적으로, 실시예 1의 각각의 반응산물은 SNaPshot Multiplex Ready Reaction Mix 1 ㎕, 1/2 buffer 4 ㎕ 및 SNaPshot 프라이머 혼합액 1 ㎕를 혼합하여, 96 ℃ 10 초 50 ℃ 5 초, 60 ℃ 30초를 40 회 반응시켰다. 그 후, SAP 1 unit (1 ㎕)을 첨가하여 37℃ 60분, 65℃ 15분 반응시켜 남아있는 ddNTP 제거하였다. 이 후 반응 산물 1㎕에 GeneScan-120 LIZ size standard 0.25㎕와 Hi-Di formamide 8.75㎕를 넣어 ABI 3130xl Genetic Analyzer (Applied Biosystems, Foster, USA)를 이용하여 분석하였다.Using the polymerase chain reaction product prepared in Example 1 as a template, multiple single base primer expansion reaction and SNaPshot analysis were performed using the primers of Table 5 designed differently for single base polymorphic sites. Specifically, each reaction product of Example 1 was mixed with 1 μl of SNaPshot Multiplex Ready Reaction Mix, 4 μl of 1/2 buffer and 1 μl of SNaPshot primer mixture, and then, 96 ° C. 10 seconds 50 ° C. 5 seconds and 60 ° C. 30 seconds. The reaction was carried out 40 times. Thereafter, 1 unit (1 μl) of SAP was added thereto, followed by reaction at 37 ° C. for 60 minutes and 65 ° C. for 15 minutes to remove remaining ddNTPs. Thereafter, 0.25 µl of GeneScan-120 LIZ size standard and 8.75 µl of Hi-Di formamide were added to 1 µl of the reaction product, and analyzed using ABI 3130xl Genetic Analyzer (Applied Biosystems, Foster, USA).

2-3. 단일 염기 다형성(SNP) 분석2-3. Single Base Polymorphism (SNP) Analysis

각 단일염기 다형성 위치에 상보적인 형광을 붙인 ddNTP가 각 프라이머 3' 끝에 오도록 조합한 확장반응 산물을 얻은 후, 각 SNP에 대한 각각의 최고점을 분석하였다. 소프트웨어는 GeneMapper v4.0 (Applied Biosystems, Foster, USA)을 이용하였으며 분석결과에 따라 CYP2D6*2, *4, *5, *10B, *14, *18, *21, *41, *49, *52, *60, 2D6 중복 (duplication) (*1xN, *2xN, *10xN), CYP2C19*2(NC_000010.10:g.96541616G>A), *3(NC_000010.10:g.96540410G>A), *17(NC_000010.10:g.96521657C>A), DRD2 rs1799732 (NC_000011.10 g.-50978A>G), rs1799978(NC_000011.10 g.-50878insC), rs1801028g.(NC_000011.10 11890C>G), ANKK1 rs1800497(NC_000011.10 g.24546C>T) 및 GRIK4 rs1954787(NC_000011.10 g.120792654T>C)의 유전형을 확인하였다 (도 2 및 3). 또한, 상기 결과를 표준검사법 (gold standard)으로 얻어진 유전자 서열 정보 (sequencing data)와 비교하였다. Expansion reaction products were obtained in which ddNTPs with complementary fluorescence at each monobasic polymorphic site were at the end of each primer 3 ', and then each peak for each SNP was analyzed. The software used GeneMapper v4.0 (Applied Biosystems, Foster, USA) and according to the analysis results CYP2D6 * 2, * 4, * 5, * 10B, * 14, * 18, * 21, * 41, * 49, * 52, * 60, 2D6 duplication (* 1xN, * 2xN, * 10xN), CYP2C19 * 2 (NC_000010.10: g.96541616G> A), * 3 (NC_000010.10: g.96540410G> A), * 17 (NC_000010.10: g.96521657C> A), DRD2 rs1799732 (NC_000011.10 g.-50978A> G), rs1799978 (NC_000011.10 g.-50878insC), rs1801028g. (NC_000011.10 11890C> G), Genotypes of ANKK1 rs1800497 (NC_000011.10 g.24546C> T) and GRIK4 rs1954787 (NC_000011.10 g.120792654T> C) were confirmed (FIGS. 2 and 3). In addition, the results were compared with the gene sequencing data obtained by the gold standard.

이러한 결과를 통해, CYP2D6*2, *4, *5, *10B, *14, *18, *21, *41, *49, *52, *60, 2D6 중복 (duplication) (*1xN, *2xN, *10xN), CYP2C19*2(NC_000010.10:g.96541616G>A), *3(NC_000010.10:g.96540410G>A), *17(NC_000010.10:g.96521657C>A), DRD2 rs1799732 (NC_000011.10 g.-50978A>G), rs1799978(NC_000011.10 g.-50878insC), rs1801028g.(NC_000011.10 11890C>G), ANKK1 rs1800497(NC_000011.10 g.24546C>T) 및 GRIK4 rs1954787(NC_000011.10 g.120792654T>C)에서 약물 부작용 (ADR) 관련된 유전형 (표 6의 SNP들)을 빠르고 정확하게 확인할 수 있음을 알 수 있었다. Through these results, CYP2D6 * 2, * 4, * 5, * 10B, * 14, * 18, * 21, * 41, * 49, * 52, * 60, 2D6 duplication (* 1xN, * 2xN , * 10xN), CYP2C19 * 2 (NC_000010.10: g.96541616G> A), * 3 (NC_000010.10: g.96540410G> A), * 17 (NC_000010.10: g.96521657C> A), DRD2 rs1799732 (NC_000011.10 g.-50978A> G), rs1799978 (NC_000011.10 g.-50878insC), rs1801028g. (NC_000011.10 11890C> G), ANKK1 rs1800497 (NC_000011.10 g.24546C> T) and GRIK4 rs1954787 (G) NC_000011.10 g.120792654T> C) reveals a rapid and accurate identification of drug side effects (ADR) related genotypes (SNPs in Table 6).

유전자gene SNPSNP CYP2D6CYP2D6 1758G>T1758G> T 100C>T100C> T 1611T>A1611T> A 2573insC2573insC 2988G>A2988G> A 3877G>A3877G> A 4125Dup (insGTGCCCACT)4125Dup (insGTGCCCACT) 2850C>T2850C> T 1887insTA1887insTA deletiondeletion 1846G>A1846G> A CYP2C19CYP2C19 96541616G>A96541616G> A 96540410G>A96540410G> A 96521657C>A96521657C> A DRD2DRD2 -50978A>G-50978A> G -50878insC-50878insC 11890C>G11890C> G ANKK1ANKK1 24546C>T24546C> T GRIK4GRIK4 120792654T>C120792654T> C

따라서, 본 발명을 이용하여 CYP2C19, CYP2D6, DRD2, ANKK1, GRIK4의 특정 대립유전자의 유전형을 고속으로 검출하여 약물 부작용과 관련된 위험도 예측 및 진단 방법에 효과적으로 활용할 수 있을 것이다.Therefore, the genotype of specific alleles of CYP2C19, CYP2D6, DRD2, ANKK1, and GRIK4 can be detected at high speed using the present invention, and thus it can be effectively used for risk prediction and diagnosis methods related to drug side effects.

이제까지 본 발명에 대하여 그 바람직한 실시예들을 중심으로 살펴보았다. 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자는 본 발명이 본 발명의 본질적인 특성에서 벗어나지 않는 범위에서 변형된 형태로 구현될 수 있음을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 개시된 실시예들은 한정적인 관점이 아니라 설명적인 관점에서 고려되어야 한다. 본 발명의 범위는 전술한 설명이 아니라 특허청구범위에 나타나 있으며, 그와 동등한 범위 내에 있는 모든 차이점은 본 발명에 포함된 것으로 해석되어야 할 것이다.So far I looked at the center of the preferred embodiment for the present invention. Those skilled in the art will appreciate that the present invention can be implemented in a modified form without departing from the essential features of the present invention. Therefore, the disclosed embodiments should be considered in descriptive sense only and not for purposes of limitation. The scope of the present invention is shown in the claims rather than the foregoing description, and all differences within the scope will be construed as being included in the present invention.

<110> inje university industry-academic cooperation foundation <120> ALLELES ASSOCIATED WITH ADVERSE DRUG REACTION AND DETECTING METHOD THEREOF <130> P20170096KR-00 <160> 42 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19*2 forward primer <400> 1 aattacaacc agagcttggc 20 <210> 2 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19*2 reverse primer <400> 2 tatcactttc cataaaagca ag 22 <210> 3 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19*3 forward primer <400> 3 ccaatcattt agcttcaccc 20 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19*3 reverse primer <400> 4 acttcagggc ttggtcaata 20 <210> 5 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19*17 forward primer <400> 5 gcccttagca ccaaattctc t 21 <210> 6 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19*17 reverse primer <400> 6 cacctttacc atttaacccc 20 <210> 7 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_dup forward primer <400> 7 cctcaccaca ggactggcca cc 22 <210> 8 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_dup reverse primer <400> 8 cacgtgcagg gcacctagat 20 <210> 9 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> GRIK4 rs1954787 forward primer <400> 9 gatgaaagga ccgaagtagg 20 <210> 10 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> GRIK4 rs1954787 reverse primer <400> 10 ctcttcttgt catcctccca 20 <210> 11 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DRD2 Promoter forward primer <400> 11 tccatgtcag gtcaactcca 20 <210> 12 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DRD2 Promoter reverse primer <400> 12 ccccaccaaa ggagctgta 19 <210> 13 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DRD2 rs1801028 forward primer <400> 13 tggcttagaa ccacccagag 20 <210> 14 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DRD2 rs1801028 reverse primer <400> 14 ggagcacctt cctgagtgtc 20 <210> 15 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ANKK1 rs1800497 forward primer <400> 15 ctgatgcctg ggaacttgtc 20 <210> 16 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ANKK1 rs1800497 reverse primer <400> 16 gcccatctgt aaagtgagca c 21 <210> 17 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_2850C/T primer <400> 17 tggggcctga gacttgtcca gg 22 <210> 18 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_6.4kb primer <400> 18 actgagccct gggaggtagg ta 22 <210> 19 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_100C/T primer <400> 19 ccatttggta gtgaggcagg t 21 <210> 20 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_1887G/insTA primer <400> 20 cctgcagaga ctcctcggtc t 21 <210> 21 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_del forward primer <400> 21 acctctctgg gccctcaggg a 21 <210> 22 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_del reverse primer <400> 22 caggcatgag ctaaggcacc cagac 25 <210> 23 <211> 41 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19*2 seqF(T20) primer <400> 23 tttttttttt tttttttttt cactatcatt gattatttcc c 41 <210> 24 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19*3 seqR(T28) primer <400> 24 tttttttttt tttttttttt ttttttttca aaaaacttgg ccttacctgg at 52 <210> 25 <211> 29 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19*17seqF(T0) primer <400> 25 tttcaaattt gtgtcttctg ttctcaaag 29 <210> 26 <211> 53 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> GRIK4 rs1954787 seqF(T32) primer <400> 26 tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttaagcaatt ggagactggt tat 53 <210> 27 <211> 65 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6 Duplication seqR(T45) primer <400> 27 tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttctcgt cactggtcag 60 gggtc 65 <210> 28 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DRD2_ANKK1 rs1800497 seqR(T3) primer <400> 28 tttagccatc ctcaaagtgc tggtc 25 <210> 29 <211> 47 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DRD2_rs1799732 seqR(T26) primer <400> 29 tttttttttt tttttttttt tttttttcct cggcgatccc cggcctg 47 <210> 30 <211> 37 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DRD2_rs1799978 seqF(T14) primer <400> 30 tttttttttt ttttgaccca gcctgcaatc acagctt 37 <210> 31 <211> 59 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DRD2_rs1801028 seqF(T34) primer <400> 31 tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttcaccag ctgactctcc ccgacccgt 59 <210> 32 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_1758G/TseqF(T0) primer <400> 32 cgccttcgcc aaccactcc 19 <210> 33 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_100C/TseqF(T0) primer <400> 33 caacgctggg ctgcacgcta c 21 <210> 34 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_1611T/AseqR(T10) primer <400> 34 tttttttttt gggcccatag cgcgccagga 30 <210> 35 <211> 38 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_2573insCseqF(T16) primer <400> 35 tttttttttt tttttttggg acccagccca gccccccc 38 <210> 36 <211> 39 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_2988G/AseqF(T20) primer <400> 36 tttttttttt tttttttttt agtgcagggg ccgagggag 39 <210> 37 <211> 45 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_3877G/AseqR(T25) primer <400> 37 tttttttttt tttttttttt tttttctggg catccaggaa gtgtt 45 <210> 38 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_4125DupseqF(T28) primer <400> 38 tttttttttt tttttttttt tttttttttt cagcttctcg gtgcccactg 50 <210> 39 <211> 55 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_2850C/TseqR(T35) primer <400> 39 tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttcaggt cagccaccac tatgc 55 <210> 40 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_1887insTAseqR(T40) primer <400> 40 tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt agggaggcga tcacgttgct 60 60 <210> 41 <211> 65 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_deletion_seqR(T45) primer <400> 41 tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttctcgt cactggtcag 60 gggtc 65 <210> 42 <211> 70 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_1846G/AseqF(T50) primer <400> 42 tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt acccgcatct 60 cccaccccca 70 <110> inje university industry-academic cooperation foundation <120> ALLELES ASSOCIATED WITH ADVERSE DRUG REACTION AND DETECTING          METHOD THEREOF <130> P20170096KR-00 <160> 42 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19 * 2 forward primer <400> 1 aattacaacc agagcttggc 20 <210> 2 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19 * 2 reverse primer <400> 2 tatcactttc cataaaagca ag 22 <210> 3 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19 * 3 forward primer <400> 3 ccaatcattt agcttcaccc 20 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19 * 3 reverse primer <400> 4 acttcagggc ttggtcaata 20 <210> 5 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19 * 17 forward primer <400> 5 gcccttagca ccaaattctc t 21 <210> 6 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19 * 17 reverse primer <400> 6 cacctttacc atttaacccc 20 <210> 7 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_dup forward primer <400> 7 cctcaccaca ggactggcca cc 22 <210> 8 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_dup reverse primer <400> 8 cacgtgcagg gcacctagat 20 <210> 9 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> GRIK4 rs1954787 forward primer <400> 9 gatgaaagga ccgaagtagg 20 <210> 10 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> GRIK4 rs1954787 reverse primer <400> 10 ctcttcttgt catcctccca 20 <210> 11 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DRD2 Promoter forward primer <400> 11 tccatgtcag gtcaactcca 20 <210> 12 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DRD2 Promoter reverse primer <400> 12 ccccaccaaa ggagctgta 19 <210> 13 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DRD2 rs1801028 forward primer <400> 13 tggcttagaa ccacccagag 20 <210> 14 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DRD2 rs1801028 reverse primer <400> 14 ggagcacctt cctgagtgtc 20 <210> 15 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ANKK1 rs1800497 forward primer <400> 15 ctgatgcctg ggaacttgtc 20 <210> 16 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ANKK1 rs1800497 reverse primer <400> 16 gcccatctgt aaagtgagca c 21 <210> 17 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_2850C / T primer <400> 17 tggggcctga gacttgtcca gg 22 <210> 18 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_6.4kb primer <400> 18 actgagccct gggaggtagg ta 22 <210> 19 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_100C / T primer <400> 19 ccatttggta gtgaggcagg t 21 <210> 20 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_1887G / insTA primer <400> 20 cctgcagaga ctcctcggtc t 21 <210> 21 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_del forward primer <400> 21 acctctctgg gccctcaggg a 21 <210> 22 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_del reverse primer <400> 22 caggcatgag ctaaggcacc cagac 25 <210> 23 <211> 41 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19 * 2 seqF (T20) primer <400> 23 tttttttttt tttttttttt cactatcatt gattatttcc c 41 <210> 24 <211> 52 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19 * 3 seqR (T28) primer <400> 24 tttttttttt tttttttttt ttttttttca aaaaacttgg ccttacctgg at 52 <210> 25 <211> 29 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2C19 * 17seqF (T0) primer <400> 25 tttcaaattt gtgtcttctg ttctcaaag 29 <210> 26 <211> 53 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> GRIK4 rs1954787 seqF (T32) primer <400> 26 tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttaagcaatt ggagactggt tat 53 <210> 27 <211> 65 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6 Duplication seqR (T45) primer <400> 27 tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttctcgt cactggtcag 60 gggtc 65 <210> 28 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DRD2_ANKK1 rs1800497 seqR (T3) primer <400> 28 tttagccatc ctcaaagtgc tggtc 25 <210> 29 <211> 47 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DRD2_rs1799732 seqR (T26) primer <400> 29 tttttttttt tttttttttt tttttttcct cggcgatccc cggcctg 47 <210> 30 <211> 37 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DRD2_rs1799978 seqF (T14) primer <400> 30 tttttttttt ttttgaccca gcctgcaatc acagctt 37 <210> 31 <211> 59 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DRD2_rs1801028 seqF (T34) primer <400> 31 tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttcaccag ctgactctcc ccgacccgt 59 <210> 32 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_1758G / TseqF (T0) primer <400> 32 cgccttcgcc aaccactcc 19 <210> 33 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_100C / TseqF (T0) primer <400> 33 caacgctggg ctgcacgcta c 21 <210> 34 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_1611T / AseqR (T10) primer <400> 34 tttttttttt gggcccatag cgcgccagga 30 <210> 35 <211> 38 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_2573insCseqF (T16) primer <400> 35 tttttttttt tttttttggg acccagccca gccccccc 38 <210> 36 <211> 39 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_2988G / AseqF (T20) primer <400> 36 tttttttttt tttttttttt agtgcagggg ccgagggag 39 <210> 37 <211> 45 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_3877G / AseqR (T25) primer <400> 37 tttttttttt tttttttttt tttttctggg catccaggaa gtgtt 45 <210> 38 <211> 50 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_4125DupseqF (T28) primer <400> 38 tttttttttt tttttttttt tttttttttt cagcttctcg gtgcccactg 50 <210> 39 <211> 55 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_2850C / TseqR (T35) primer <400> 39 tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttcaggt cagccaccac tatgc 55 <210> 40 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_1887insTAseqR (T40) primer <400> 40 tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt agggaggcga tcacgttgct 60                                                                           60 <210> 41 <211> 65 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_deletion_seqR (T45) primer <400> 41 tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttctcgt cactggtcag 60 gggtc 65 <210> 42 <211> 70 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CYP2D6_1846G / AseqF (T50) primer <400> 42 tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt acccgcatct 60 cccaccccca 70

Claims (13)

서열번호 23의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2C19(Cytochrome P450 2C19) 유전자의 96541616G>A(*2)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 24의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2C19 유전자의 96540410G>A(*3)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 25의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2C19 유전자의 96521657C>A(*17)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 26의 염기서열로 이루어진 인간 GRIK4(Glutamate Ionotropic Receptor Kainate Type Subunit 4) 유전자의 120792654T>C (rs1954787)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 28의 염기서열로 이루어진 인간 ANKK1(Ankyrin repeat and kinase domain containing 1) 유전자의 24546C>T (rs1800497)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 29의 염기서열로 이루어진 인간 DRD2(Dopamine receptor D2) 유전자의 -50978A>G (rs1799732)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 30의 염기서열로 이루어진 인간 DRD2(Dopamine receptor D2) 유전자의 -50878>C 삽입 (rs1799978)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 31의 염기서열로 이루어진 인간 DRD2 유전자의 11890C>G (rs1801028)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 32의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6(Cytochrome P450 2D6) 유전자의 1758G>T 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 33의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 100C>T 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 34의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 1611T>A 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 35의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 2573>C 삽입을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 36의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 2988G>A 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 37의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 3877G>A 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 38의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 4125>중복 (GTGCCCACT 삽입)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 39의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 2850C>T 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 40의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 1887>TA 삽입을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 및 서열번호 42의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 1846G>A 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머를 포함하는 약물 부작용의 예측 또는 진단용 조성물.Multiple single base primers capable of detecting 96541616G> A (* 2) of human CYP2C19 (Cytochrome P450 2C19) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 23; Multiple single base primers capable of detecting 96540410G> A (* 3) of the human CYP2C19 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 24; Multiple single base primers capable of detecting 96521657C> A (* 17) of a human CYP2C19 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 25; Multiple single base primers capable of detecting 120792654T> C (rs1954787) of the human Glutamate Ionotropic Receptor Kainate Type Subunit 4 (GRIK4) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 26; Multiple single base primers capable of detecting 24546C> T (rs1800497) of the human Ankyrin repeat and kinase domain containing 1 (ANKK1) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 28; Multiple single base primers capable of detecting -50978A> G (rs1799732) of a human Dopamine receptor D2 (DRD2) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 29; Multiple single base primers capable of detecting -50878> C insertion (rs1799978) of human Dopamine receptor D2 (DRD2) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 30; Multiple single base primers capable of detecting 11890C> G (rs1801028) of a human DRD2 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 31; Multiple single base primers capable of detecting 1758G> T of the human CYP2D6 (Cytochrome P450 2D6) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 32; Multiple single base primers capable of detecting 100C> T of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 33; Multiple single base primers capable of detecting 1611T> A of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 34; Multiple single base primers capable of detecting 2573> C insertion of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 35; Multiple single base primers capable of detecting 2988G> A of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 36; Multiple single base primers capable of detecting 3877G> A of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 37; Multiple single base primers capable of detecting 4125> duplication (GTGCCCACT insertion) of the human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 38; Multiple single base primers capable of detecting 2850C> T of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 39; Multiple single base primers capable of detecting 1887> TA insertion of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 40; And multiple monobasic primers capable of detecting 1846G> A of the human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 42. 삭제delete 제 1 항에 있어서,
상기 약물 부작용은 항우울제 또는 항조현병제로 인한 약물 부작용인 것인 조성물.
The method of claim 1,
The drug side effects are drug side effects due to antidepressants or anti-schizophrenia.
제 1 항에 있어서,
상기 약물은 아미트리프틸린, 클로미프라민, 독세핀, 이미프라민, 아목사핀, 노르트립틸린, 시탈로프람, 에스시탈로프람, 플루옥세틴, 플루복사민, 밀나시프란, 파록세틴, 설트랄린, 벤라팍신, 아토목세틴, 부프로피온, 듀록세틴, 미르타자핀, 트라조돈, 셀레길린, 클로르프로마진, 페르페나진, 몰린돈, 할로페리돌, 아리피프라졸, 클로자핀, 올란자핀, 팔리페리돈, 쿠에티아핀, 리스페리돈, 설피리드, 지프라시돈 및 죠테핀로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나인 것인 조성물.
The method of claim 1,
The drug is amitriptyline, clomipramine, doxepin, imipramine, amoxapine, nortriptyline, citalopram, escitalopram, fluoxetine, fluvoxamine, milnacipran, paroxetine, sulfol Traline, venlafaxine, atomoxetine, bupropion, duloxetine, mirtazapine, trazodone, selegiline, chlorpromazine, perphenazine, molindon, haloperidol, aripiprazole, clozapine, olanzapine, paliperidone, quetiapine It is any one selected from the group consisting of risperidone, sulfide, ziprasidone and jotepin.
제 1 항에 따른 조성물을 포함하는 약물 부작용의 예측 또는 진단용 키트.A kit for predicting or diagnosing drug side effects comprising the composition of claim 1. (a) 개체로부터 분리된 생물학적 시료로부터 핵산을 추출하는 단계;
(b) 상기 (a) 단계의 핵산을 주형으로 하여 인간 CYP2D6 유전자, CYP2C19 유전자, 인간 DRD2 유전자, 인간 ANKK1 유전자 및 인간 GRIK4 유전자를 증폭할 수 있는 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하는 단계; 및
(c) 상기 (b) 단계에서 얻은 PCR 산물의 염기서열에서 유전자 변이 존재 유무를 확인하는 단계를 포함하는, 약동학, 약물치료효과, 약물유해반응 예측 및 이를 고려한 개인별 맞춤약물치료 요법 시행을 위한 약물유전형의 정보제공 방법으로서,
상기 (b) 단계의 프라이머는 서열번호 1 및 2의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2C19 유전자의 96541616G>A(*2) 증폭용 프라이머 세트; 서열번호 3 및 4의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2C19 유전자의 96540410G>A(*3) 증폭용 프라이머 세트; 서열번호 5 및 6의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2C19 유전자의 96521657C>A(*17) 증폭용 프라이머 세트; 서열번호 7 및 8의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 4125>중복 (GTGCCCACT 삽입) 증폭용 프라이머 세트; 서열번호 9 및 10의 염기서열로 이루어진 인간 GRIK4 유전자의 120792654T>C (rs1954787) 증폭용 프라이머 세트; 서열번호 11 및 12의 염기서열로 이루어진 인간 DRD2 유전자의 -50978A>G (rs1799732) 및 -50878>C 삽입 (rs1799978) 증폭용 프라이머 세트; 서열번호 13 및 14의 염기서열로 이루어진 인간 DRD2 유전자의 11890C>G (rs1801028) 증폭용 프라이머 세트; 서열번호 15 및 16의 염기서열로 이루어진 인간 ANKK1 유전자의 24546C>T (rs1800497) 증폭용 프라이머 세트; 서열번호 17 및 18의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 1758G>T, 100C>T, 1611T>A, 2573>C 삽입, 2988G>A 및 3877G>A 증폭용 프라이머 세트; 및 서열번호 19 및 20의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 2850C>T, 1887>TA 삽입 및 1846G>A 증폭용 프라이머 세트로 이루어진 것인 약동학, 약물치료효과, 약물유해반응 예측 및 이를 고려한 개인별 맞춤약물치료 요법 시행을 위한 약물유전형의 정보제공 방법.
(a) extracting nucleic acid from a biological sample isolated from the individual;
(b) performing PCR using primers capable of amplifying the human CYP2D6 gene, CYP2C19 gene, human DRD2 gene, human ANKK1 gene, and human GRIK4 gene using the nucleic acid of step (a) as a template; And
(c) pharmacokinetics, drug treatment effects, adverse drug reaction prediction and including the step of confirming the presence or absence of the genetic mutation in the nucleotide sequence of the PCR product obtained in step (b) and the drug for the implementation of personalized drug therapy therapy As a method of providing information of genotypes,
The primer of step (b) is a primer set for 96541616G> A (* 2) amplification of the human CYP2C19 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NO: 1 and 2; A set of primers for amplifying 96540410G> A (* 3) of the human CYP2C19 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 3 and 4; A set of primers for amplifying 96521657C> A (* 17) of the human CYP2C19 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 5 and 6; Primer set for amplification of 4125> duplicate (GTGCCCACT insertion) of the human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 7 and 8; Primer sets for amplification of 120792654T> C (rs1954787) of the human GRIK4 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 9 and 10; Primer sets for amplification of -50978A> G (rs1799732) and -50878> C insertion (rs1799978) of the human DRD2 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 11 and 12; A primer set for 11890C> G (rs1801028) amplification of the human DRD2 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 13 and 14; Primer set for amplification of 24546C> T (rs1800497) of the human ANKK1 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 15 and 16; Primer sets for amplifying 1758G> T, 100C> T, 1611T> A, 2573> C insertion, 2988G> A and 3877G> A of the human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 17 and 18; And a primer set for 2850C> T, 1887> TA insertion, and 1846G> A amplification of the human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 19 and 20. Pharmacogenetic information delivery methods for drug therapy.
제 6 항에 있어서,
상기 (a) 단계의 생물학적 시료는 혈액, 피부 세포, 점막 세포 및 모발로 이루어진 군에서 선택되는 것인 방법.
The method of claim 6,
The biological sample of step (a) is selected from the group consisting of blood, skin cells, mucosal cells and hair.
삭제delete 제 6 항에 있어서,
상기 (c) 단계의 유전자 변이는 인간 CYP2C19 유전자의 96541616G>A(*2), 인간 CYP2C19 유전자의 96540410G>A(*3), 인간 CYP2C19 유전자의 96521657C>A(*17), 인간 GRIK4 유전자의 120792654T>C (rs1954787), 인간 ANKK1 유전자의 24546C>T (rs1800497), 인간 DRD2 유전자의 -50978A>G (rs1799732), 인간 DRD2 유전자의 -50878>C 삽입 (rs1799978), 인간 DRD2 유전자의 11890C>G (rs1801028), 인간 CYP2D6 유전자의 1758G>T, 인간 CYP2D6 유전자의 100C>T, 인간 CYP2D6 유전자의 1611T>A, 인간 CYP2D6 유전자의 2573>C 삽입, 인간 CYP2D6 유전자의 2988G>A, 인간 CYP2D6 유전자의 3877G>A, 인간 CYP2D6 유전자의 4125>중복 (GTGCCCACT 삽입), 인간 CYP2D6 유전자의 2850C>T, 인간 CYP2D6 유전자의 1887>TA 삽입 및 인간 CYP2D6 유전자의 1846G>A 로 이루어진 것인 방법.
The method of claim 6,
Gene mutation of step (c) is 96541616G> A (* 2) of human CYP2C19 gene, 96540410G> A (* 3) of human CYP2C19 gene, 96521657C> A (* 17) of human CYP2C19 gene, 120792654T of human GRIK4 gene > C (rs1954787), 24546C> T of human ANKK1 gene (rs1800497), -50978A> G of human DRD2 gene (rs1799732), -50878> C insertion of human DRD2 gene (rs1799978), 11890C> G of human DRD2 gene ( rs1801028), 1758G> T of human CYP2D6 gene, 100C> T of human CYP2D6 gene, 1611T> A of human CYP2D6 gene, 2573> C insertion of human CYP2D6 gene, 2988G> A of human CYP2D6 gene, 3877G> of human CYP2D6 gene A, 4125> redundancy of the human CYP2D6 gene (GTGCCCACT insertion), 2850C> T of the human CYP2D6 gene, 1887> TA insertion of the human CYP2D6 gene and 1846G> A of the human CYP2D6 gene.
제 6 항에 있어서,
상기 (c) 단계의 유전자 변이 존재 유무는 서열번호 23의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2C19(Cytochrome P450 2C19) 유전자의 96541616G>A(*2)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 24의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2C19 유전자의 96540410G>A(*3)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 25의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2C19 유전자의 96521657C>A(*17)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 26의 염기서열로 이루어진 인간 GRIK4(Glutamate Ionotropic Receptor Kainate Type Subunit 4) 유전자의 120792654T>C (rs1954787)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 28의 염기서열로 이루어진 인간 ANKK1(Ankyrin repeat and kinase domain containing 1) 유전자의 24546C>T (rs1800497)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 29의 염기서열로 이루어진 인간 DRD2(Dopamine receptor D2) 유전자의 -50978A>G (rs1799732)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 30의 염기서열로 이루어진 인간 DRD2(Dopamine receptor D2) 유전자의 -50878>C 삽입 (rs1799978)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 31의 염기서열로 이루어진 인간 DRD2 유전자의 11890C>G (rs1801028)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 32의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6(Cytochrome P450 2D6) 유전자의 1758G>T 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 33의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 100C>T 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 34의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 1611T>A 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 35의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 2573>C 삽입을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 36의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 2988G>A 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 37의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 3877G>A 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 38의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 4125>중복 (GTGCCCACT 삽입)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 39의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 2850C>T 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 40의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 1887>TA 삽입을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 및 서열번호 42의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 1846G>A 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머를 이용하여 스냅샷(SNaPshot) 분석을 통해 확인하는 것인 방법.
The method of claim 6,
The presence or absence of the genetic mutation of step (c) is a multiple single base primer capable of detecting 96541616G> A (* 2) of the human CYP2C19 (Cytochrome P450 2C19) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 23; Multiple single base primers capable of detecting 96540410G> A (* 3) of the human CYP2C19 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 24; Multiple single base primers capable of detecting 96521657C> A (* 17) of a human CYP2C19 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 25; Multiple single base primers capable of detecting 120792654T> C (rs1954787) of the human Glutamate Ionotropic Receptor Kainate Type Subunit 4 (GRIK4) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 26; Multiple single base primers capable of detecting 24546C> T (rs1800497) of the human Ankyrin repeat and kinase domain containing 1 (ANKK1) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 28; Multiple single base primers capable of detecting -50978A> G (rs1799732) of a human Dopamine receptor D2 (DRD2) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 29; Multiple single base primers capable of detecting -50878C insertion (rs1799978) of human Dopamine receptor D2 (DRD2) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 30; Multiple single base primers capable of detecting 11890C> G (rs1801028) of a human DRD2 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 31; Multiple single base primers capable of detecting 1758G> T of the human CYP2D6 (Cytochrome P450 2D6) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 32; Multiple single base primers capable of detecting 100C> T of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 33; Multiple single base primers capable of detecting 1611T> A of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 34; Multiple single base primers capable of detecting 2573> C insertion of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 35; Multiple single base primers capable of detecting 2988G> A of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 36; Multiple single base primers capable of detecting 3877G> A of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 37; Multiple single base primers capable of detecting 4125> duplication (GTGCCCACT insertion) of the human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 38; Multiple single base primers capable of detecting 2850C> T of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 39; Multiple single base primers capable of detecting 1887> TA insertion of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 40; And a single mononucleotide primer capable of detecting 1846G> A of the human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 42 by SNAPPshot analysis.
(a) 약물을 시료에 처리하는 단계;
(b) 시료로부터 핵산을 추출하는 단계;
(c) 상기 (b) 단계의 핵산을 주형으로 하여 인간 CYP2D6 유전자, CYP2C19 유전자, 인간 DRD2 유전자, 인간 ANKK1 유전자 및 인간 GRIK4 유전자를 증폭할 수 있는 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하는 단계;
(d) 상기 (c) 단계에서 얻은 PCR 산물의 염기서열에서 유전자 변이 존재 유무를 확인하는 단계; 및
(e) 유전자 변이가 존재하면 상기 (a) 단계에서 처리한 약물이 부작용을 유발하는 것으로 판단하는 단계를 포함하는 약물 부작용 유발 약물의 동정 방법으로서,
상기 (c) 단계의 프라이머는 서열번호 1 및 2의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2C19 유전자의 96541616G>A(*2) 증폭용 프라이머 세트; 서열번호 3 및 4의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2C19 유전자의 96540410G>A(*3) 증폭용 프라이머 세트; 서열번호 5 및 6의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2C19 유전자의 96521657C>A(*17) 증폭용 프라이머 세트; 서열번호 7 및 8의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 4125>중복 (GTGCCCACT 삽입) 증폭용 프라이머 세트; 서열번호 9 및 10의 염기서열로 이루어진 인간 GRIK4 유전자의 120792654T>C (rs1954787) 증폭용 프라이머 세트; 서열번호 11 및 12의 염기서열로 이루어진 인간 DRD2 유전자의 -50978A>G (rs1799732) 및 -50878>C 삽입 (rs1799978) 증폭용 프라이머 세트; 서열번호 13 및 14의 염기서열로 이루어진 인간 DRD2 유전자의 11890C>G (rs1801028) 증폭용 프라이머 세트; 서열번호 15 및 16의 염기서열로 이루어진 인간 ANKK1 유전자의 24546C>T (rs1800497) 증폭용 프라이머 세트; 서열번호 17 및 18의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 1758G>T, 100C>T, 1611T>A, 2573>C 삽입, 2988G>A 및 3877G>A 증폭용 프라이머 세트; 및 서열번호 19 및 20의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 2850C>T, 1887>TA 삽입 및 1846G>A 증폭용 프라이머 세트로 이루어진 것인 약물 부작용 유발 약물의 동정 방법.
(a) treating the drug with a sample;
(b) extracting the nucleic acid from the sample;
(c) performing PCR using primers capable of amplifying the human CYP2D6 gene, CYP2C19 gene, human DRD2 gene, human ANKK1 gene, and human GRIK4 gene using the nucleic acid of step (b) as a template;
(d) confirming the presence or absence of a genetic variation in the base sequence of the PCR product obtained in step (c); And
(e) a method of identifying drug side effects-inducing drugs comprising the step of determining that the drug treated in step (a) causes side effects when there is a genetic variation,
The primer of step (c) is a primer set for 96541616G> A (* 2) amplification of the human CYP2C19 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 1 and 2; A set of primers for amplifying 96540410G> A (* 3) of the human CYP2C19 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 3 and 4; A set of primers for amplifying 96521657C> A (* 17) of the human CYP2C19 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 5 and 6; Primer set for amplification of 4125> duplicate (GTGCCCACT insertion) of the human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 7 and 8; Primer sets for amplification of 120792654T> C (rs1954787) of the human GRIK4 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 9 and 10; Primer sets for amplification of -50978A> G (rs1799732) and -50878> C insertion (rs1799978) of the human DRD2 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 11 and 12; A primer set for 11890C> G (rs1801028) amplification of the human DRD2 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 13 and 14; Primer set for amplification of 24546C> T (rs1800497) of the human ANKK1 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 15 and 16; Primer sets for amplifying 1758G> T, 100C> T, 1611T> A, 2573> C insertion, 2988G> A and 3877G> A of the human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 17 and 18; And a primer set for 2850C> T, 1887> TA insertion, and 1846G> A amplification of the human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 19 and 20.
삭제delete 제 11 항에 있어서,
상기 (d) 단계의 유전자 변이 존재 유무는 서열번호 23의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2C19(Cytochrome P450 2C19) 유전자의 96541616G>A(*2)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 24의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2C19 유전자의 96540410G>A(*3)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 25의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2C19 유전자의 96521657C>A(*17)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 26의 염기서열로 이루어진 인간 GRIK4(Glutamate Ionotropic Receptor Kainate Type Subunit 4) 유전자의 120792654T>C (rs1954787)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 28의 염기서열로 이루어진 인간 ANKK1(Ankyrin repeat and kinase domain containing 1) 유전자의 24546C>T (rs1800497)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 29의 염기서열로 이루어진 인간 DRD2(Dopamine receptor D2) 유전자의 -50978A>G (rs1799732)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 30의 염기서열로 이루어진 인간 DRD2(Dopamine receptor D2) 유전자의 -50878>C 삽입 (rs1799978)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 31의 염기서열로 이루어진 인간 DRD2 유전자의 11890C>G (rs1801028)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 32의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6(Cytochrome P450 2D6) 유전자의 1758G>T 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 33의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 100C>T 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 34의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 1611T>A 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 35의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 2573>C 삽입을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 36의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 2988G>A 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 37의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 3877G>A 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 38의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 4125>중복 (GTGCCCACT 삽입)을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 39의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 2850C>T 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 서열번호 40의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 1887>TA 삽입을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머; 및 서열번호 42의 염기서열로 이루어진 인간 CYP2D6 유전자의 1846G>A 을 검출할 수 있는 다중 단일염기 프라이머를 이용하여 스냅샷(SNaPshot) 분석을 통해 확인하는 것인 방법.
The method of claim 11,
The presence or absence of the genetic mutation in step (d) is a multiple single base primer capable of detecting 96541616G> A (* 2) of the human CYP2C19 (Cytochrome P450 2C19) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 23; Multiple single base primers capable of detecting 96540410G> A (* 3) of the human CYP2C19 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 24; Multiple single base primers capable of detecting 96521657C> A (* 17) of a human CYP2C19 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 25; Multiple single base primers capable of detecting 120792654T> C (rs1954787) of the human Glutamate Ionotropic Receptor Kainate Type Subunit 4 (GRIK4) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 26; Multiple single base primers capable of detecting 24546C> T (rs1800497) of the human Ankyrin repeat and kinase domain containing 1 (ANKK1) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 28; Multiple single base primers capable of detecting -50978A> G (rs1799732) of a human Dopamine receptor D2 (DRD2) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 29; Multiple single base primers capable of detecting -50878C insertion (rs1799978) of human Dopamine receptor D2 (DRD2) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 30; Multiple single base primers capable of detecting 11890C> G (rs1801028) of a human DRD2 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 31; Multiple single base primers capable of detecting 1758G> T of the human CYP2D6 (Cytochrome P450 2D6) gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 32; Multiple single base primers capable of detecting 100C> T of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 33; Multiple single base primers capable of detecting 1611T> A of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 34; Multiple single base primers capable of detecting 2573> C insertion of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 35; Multiple single base primers capable of detecting 2988G> A of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 36; Multiple single base primers capable of detecting 3877G> A of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 37; Multiple single base primers capable of detecting 4125> duplication (GTGCCCACT insertion) of the human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 38; Multiple single base primers capable of detecting 2850C> T of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 39; Multiple single base primers capable of detecting 1887> TA insertion of human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 40; And a single mononucleotide primer capable of detecting 1846G> A of the human CYP2D6 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 42 by SNAPPshot analysis.
KR1020170132224A 2017-10-12 2017-10-12 Alleles associated with adverse drug reaction and detecting method thereof KR102050637B1 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR1020170132224A KR102050637B1 (en) 2017-10-12 2017-10-12 Alleles associated with adverse drug reaction and detecting method thereof

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR1020170132224A KR102050637B1 (en) 2017-10-12 2017-10-12 Alleles associated with adverse drug reaction and detecting method thereof

Publications (2)

Publication Number Publication Date
KR20190041138A KR20190041138A (en) 2019-04-22
KR102050637B1 true KR102050637B1 (en) 2019-11-29

Family

ID=66283074

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020170132224A KR102050637B1 (en) 2017-10-12 2017-10-12 Alleles associated with adverse drug reaction and detecting method thereof

Country Status (1)

Country Link
KR (1) KR102050637B1 (en)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2022191780A1 (en) * 2021-03-11 2022-09-15 Agency For Science, Technology And Research A method for assessing the potential effect of therapeutics on an individual

Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20200118958A (en) 2019-04-09 2020-10-19 주식회사 엘지화학 Battery Cell Comprising Short Circuit Induction Member and Method of Evaluation for Battery Safety Using Thereof
KR102230252B1 (en) * 2019-08-14 2021-03-19 (주)에스피메드 Multiplex drug gene analysis kit for predicting drug side effects on chronic diseases and cancer related multi-prescription drugs and personalized drug treatment
RU2771180C1 (en) * 2021-07-20 2022-04-28 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр психиатрии и наркологии имени В.П. Сербского" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ "НМИЦ ПН им. В.П. Сербского" Минздрава России) Method for predicting the degree of risk of extrapyramid side effects during the background of haloperidol therapy in patients with schizophrenic spectrum disorders
KR102650359B1 (en) * 2021-08-13 2024-03-25 재단법인 아산사회복지재단 SNP for drug hypersensitivity and diagnosis method using the same
CN113755578A (en) * 2021-09-09 2021-12-07 上海普然生物科技有限公司 Detection kit for ondansetron and tropisetron metabolic markers and detection method and application thereof

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR100973049B1 (en) 2006-09-11 2010-07-29 인제대학교 산학협력단 htSNP FOR DETERMINING A GENOTYPE OF CYTOCHROME P450 2D6 GENE AND GENOTYPING CHIP USING THEREOF
KR101593750B1 (en) * 2013-08-01 2016-03-02 인제대학교 산학협력단 Immortalizatized standard cell lines for genotyping of drug metabolism genes included human cytochrome P450 2D6 gene

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR101540647B1 (en) * 2013-05-16 2015-08-05 대한민국 Simultaneous multiple analysis of korean pharmacogenetic genotype for personalized medicine and methods for predicting drug response using diagnostic results

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR100973049B1 (en) 2006-09-11 2010-07-29 인제대학교 산학협력단 htSNP FOR DETERMINING A GENOTYPE OF CYTOCHROME P450 2D6 GENE AND GENOTYPING CHIP USING THEREOF
KR101593750B1 (en) * 2013-08-01 2016-03-02 인제대학교 산학협력단 Immortalizatized standard cell lines for genotyping of drug metabolism genes included human cytochrome P450 2D6 gene

Non-Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
BMC Medicine (2014) 12:90
Dialogues in Clinical Neuroscience (2016) 18(3):323-337
Schizophrenia Bulletin (2016) 42(6):1418-1437*
The Pharmacogenomics Kournal (2014) 14(6):564-572
공개특허공보 제10-2015-0042882호(2015.04.22.)*

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2022191780A1 (en) * 2021-03-11 2022-09-15 Agency For Science, Technology And Research A method for assessing the potential effect of therapeutics on an individual

Also Published As

Publication number Publication date
KR20190041138A (en) 2019-04-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR102050637B1 (en) Alleles associated with adverse drug reaction and detecting method thereof
CN107419018B (en) Method and kit for detecting gene mutation based on Blocker primer and ARMS primer
KR101583546B1 (en) Method for prediction of reactivity to sorafenib treatment Using gene polymorphism
US20090197276A1 (en) Methods and compositions for predicting compliance with an antidepressant treatment regimen
US20160340725A1 (en) Method to increase sensitivity of next generation sequencing
KR101633783B1 (en) Method of prediction the blood concentration of tacrolimus using SNP in CYP3A5 and CYP3A7 genes
EP2880179B1 (en) Genetic markers for predicting responsiveness to fgf-18 compound
EP2880181B1 (en) Prognosis biomarkers in cartilage disorders
JP5727694B2 (en) Marker for predicting therapeutic effect of hepatitis C, method for predicting therapeutic effect of hepatitis C, and preventive or therapeutic agent for hepatitis C
EP2041304B1 (en) Rgs2 genotypes associated with extrapyramidal symptoms induced by antipsychotic medication
EP1848821B1 (en) Polynucleotide associated with breast cancer comprising single nucleotide polymorphism, microarray and diagnostic kit comprising the same and method for diagnosing breast cancer using the same
KR101725600B1 (en) Methods for providing information for antipsychotic agent therapeutic reaction using genetic polymorphism
KR102219694B1 (en) Method for detecting alleles associated with adverse drug reaction of antipsychotic drug
CN109913481B (en) PIK3CA gene g.179224821G &amp; gtA mutation and application thereof in breast cancer auxiliary diagnosis
TW202146660A (en) Compositions and methods for assessing the efficacy of inhibitors of neurotransmitter transporters
CN108396063B (en) Application of CDH23 gene mutation in molecular diagnosis of pituitary adenoma
JP6644478B2 (en) Method for determining the risk of side effects from thiopurine preparations
CN113166810A (en) SNP marker for diagnosing cerebral aneurysm including single base polymorphism of GBA gene
CN110819713B (en) Application of SNP marker in pancreatic cancer prognosis
US20180023141A1 (en) Method for determining a therapeutic approach for the treatment of age-related macular degeneration (amd)
US20210353709A1 (en) Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin Type 1 (PCSK1) Variants And Uses Thereof
KR102333953B1 (en) Novel genetic markers for the diagnosis of macular degeneration
KR20240058125A (en) Treatment of liver disease using CAMP Responsive Element Binding Protein 3 Like 3 (CREB3L3) inhibitors
JP5070552B2 (en) Test method and test kit for predicting therapeutic effect of chronic hepatitis C
EP4395888A1 (en) Treatment of liver diseases with camp responsive element binding protein 3 like 3 (creb3l3) inhibitors

Legal Events

Date Code Title Description
A201 Request for examination
E902 Notification of reason for refusal
E902 Notification of reason for refusal
E701 Decision to grant or registration of patent right
GRNT Written decision to grant