KR101253261B1 - siRNA 의 전달을 위한 재조합 단백질 및 이를 포함하는 조성물 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 siRNA의 효율적인 세포 및 생체 내 전달이 가능하도록 하는 siRNA 전달용 재조합 단백질에 관한 것이다. 보다 구체적으로, 본 발명은 HBV(Hepatitis B virus) 바이러스의 캡시드 단백질 내부의 빈 공간에 siRNA 결합 단백질이 위치한 재조합 단백질에 관한 것으로서, 다양한 목적의 siRNA 가 상기 siRNA 결합 단백질에 결합하여 캡시드 내부 공간에 봉입됨으로써 각종 분해효소와 같은 외부 공격으로부터 안정성을 확보할 수 있으며 세포 투과 후 siRNA 의 세포질 방출에 의하여 siRNA를 효과적으로 세포 및 생체 조직에 전달할 수 있다.
Description
본 발명은 siRNA의 효율적인 세포 및 생체 내 전달이 가능하도록 하는 siRNA 전달용 재조합 단백질에 관한 것이다. 보다 구체적으로, 본 발명은 HBV(Hepatitis B virus) 바이러스의 캡시드 단백질 내부의 빈 공간에 siRNA 결합 단백질이 위치한 재조합 단백질에 관한 것으로서, 다양한 목적의 siRNA 가 상기 siRNA 결합 단백질에 결합하여 캡시드 내부 공간에 봉입됨으로써 각종 분해효소와 같은 외부 공격으로부터 안정성을 확보할 수 있으며 세포 투과 후 siRNA 의 세포질 방출에 의하여 siRNA를 효과적으로 세포 및 생체 조직에 전달할 수 있다.
RNAi(RNA interference)는 표적 유전자의 mRNA와 상동인 서열을 가지는 센스 RNA와 이것과 상보적인 서열을 가지는 안티센스 RNA로 구성되는 이중사슬 RNA(double strand RNA)를 세포 등에 도입하여 선택적으로 표적 유전자의 mRNA의 분해를 유도하거나 표적 유전자의 발현을 억제할 수 있는 현상을 말한다. RNAi 는 처음에 선충에서 발견되었지만, 현재는 효모, 곤충, 식물, 인간 등 각종 동식물에서 매우 잘 보존이 되어 있는 생명현상으로 관찰되고 있다.
siRNA(small interference RNA)는 RNAi를 유도하는 물질로서, 약 20 내지 30개의 뉴클레오타이드로 구성된 짧은 RNA 이중나선 가닥을 말한다. siRNA를 세포 내로 주입시켜 이 siRNA와 염기서열이 상보적인 mRNA를 표적으로 삼아 유전자 발현을 억제하게 된다. 따라서, siRNA는 질병에 대한 치료 효과를 가지며, 쉬운 제조법 및 높은 표적 선택성 등으로 인해 표적이 되는 생명 프로세스를 조절할 수 있는 효과적인 수단으로 각광을 받고 있다.
현재 siRNA를 이용하여 치료할 수 있는 질환으로, 암, 바이러스 감염 질환, 자가면역 질환, 신경퇴행성 질환 등이 연구되고 있으며, 임상적 시도로서 노인성 황반변성 (베바시라닙; Opko Health, Inc., Miami, FL, USA; 임상 3상), 호흡기 신시치아 바이러스 감염증 (ALN-RSV01; Alnylam, Cambridge, MA, USA; 임상 2상)에 대한 치료제로서의 가능성이 보고되었다 (Melnikova I. Nat Rev Drug Discov 2007, 6, 863-864). 또한 트랜스페린을 표적으로 하는 사이클로덱스트린 기반의 나노입자 중합체 (CALAA-01; Calando Pharmaceuticals, Pasadena, CA, USA; 임상 1상)를 이용하여 인간 암 치료에서 siRNA의 전달 시스템이 가능함이 보고되었다 (Oh YK. et al., Adv Drug Deliver Rev 2009, 61, 850-862).
그러나, siRNA는 안정성이 낮아 생체 내에서 단시간에 분해되며, siRNA의 음이온성으로 인하여 같은 음전하를 띄는 세포막을 쉽게 투과하기 힘들어 세포 내로의 전달성이 떨어진다는 문제가 있어, 이들의 세포 내 전달을 용이하게 하는 효과적인 전달체 제조 기술이 요구되고 있다. 이와 같이 siRNA 를 세포 내로 효율적으로 전달하기 위해서는, 분해효소 저항성을 가지며 장시간 생체 내에서 순환하며 임상적으로 가능한 주입경로를 통해 표적 세포에 도달할 수 있고 세포투과 후에는 효과적인 세포질 방출이 가능한 효과적인 새로운 전달 시스템이 필요하다.
기존의 siRNA 전달체로, siRNA 를 발현하는 재조합 플라스미드 또는 바이러스 벡터가 사용되거나, 리포펙틴, 리포펙타민, 셀펙틴, 양이온성 인지질 나노입자, 양이온성 고분자, 또는 리포좀에 기반한 전달체가 주로 사용되었다. 그러나, 바이러스성 전달체의 경우 전달하려는 유전자의 크기에 제한을 받게 되고 바이러스 벡터의 표면 단백질의 면역원성으로 인한 면역 부작용을 일으켜 체내 안정성이 보장되지 못하는 문제가 지적되었다. 또한, 양이온성 분자 또는 합성 고분자를 이용한 전달체의 경우 세포 내로의 수송 효율이 낮으며 세포 내로의 유전자 전달과정에서 유발될 수 있는 세포 독성에 대한 문제가 있다.
이에, 본 발명자는 기존의 siRNA 전달체가 가지는 문제점을 개선하여 안정성 및 세포 투과성이 향상된 새로운 siRNA 전달체를 개발하고자 노력한 결과, 바이러스 캡시드 단백질을 이용하여 캡시드 파티클 내부에 siRNA 를 봉입함으로써 외부 분해 효소의 공격을 차단하여 안정성을 높이고 엔도솜 방출 기전(endosomal escape)을 통하여 siRNA 을 세포질로 전달할 수 있는 재조합 단백질 전달체를 구상하게 되었다. 나아가, 본 발명자들은 자가조립이 가능한 HBV의 캡시드 단백질을 이용하여 구형 파티클 내에 siRNA 를 봉입할 수 있는 구조의 재조합 단백질 전달체를 제조하였고, siRNA와의 결합력, 세포투과 활성 및 생체 안정성 실험을 통해 상기 재조합 단백질이 가지는 전달체로서의 우수한 효과를 검증함으로써 본 발명을 완성하였다.
본 발명의 하나의 목적은 HBV(Hepatitis B virus)의 캡시드 단백질 및 siRNA 결합 단백질을 포함하는 siRNA 전달용 재조합 단백질을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 하나의 목적은 상기 재조합 단백질 및 siRNA 를 포함하는 siRNA 전달용 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 하나의 목적은 상기 재조합 단백질 및 siRNA 를 포함하는 siRNA 관련 질환의 치료용 조성물을 제공하는 것이다.
상기와 같은 과제를 해결하기 위한 하나의 양태로서, 본 발명은 HBV(Hepatitis B virus)의 캡시드 단백질 및 siRNA 결합 단백질을 포함하는 siRNA 전달용 재조합 단백질에 관한 것이다.
상기 siRNA 전달용 재조합 단백질은 HBV 캡시드 단백질이 형성하는 구형의 바이러스 파티클의 내부에 siRNA 결합 단백질이 위치하게 되어, 결과적으로 siRNA 를 바이러스 파티클 내부로 봉입할 수 있음을 특징으로 한다.
본 발명에서 용어,"HBV 캡시드 단백질" 은 대장균과 같은 박테리아에서 발현시켰을 경우 자가조립을 통해 구형의 바이러스 파티클을 형성하는 단백질을 말한다. 자연계에서 HBV 캡시드 단백질은 HBV 에서 외부 껍질(shell)을 형성하는 단백질로서, 하나의 바이러스 파티클을 형성하는 캡시드 단백질은 240개의 서브유닛 단백질로 구성되며, 서브유닛 단백질 두 개가 모여서 하나의 다이머 클러스터(dimer cluster)를 형성하여 파티클의 외부에 뾰족한 스파이크(spike)를 노출시키는 구조를 가지므로, 하나의 바이러스 파티클에는 120개의 스파이크가 존재하게 된다. 구형의 바이러스 파티클은 그 외경이 약 36 nm로 알려져 있다.
본 발명에서 용어, "재조합 바이러스 파티클" 또는 "재조합 파티클" 이란 본 발명의 재조합 단백질에 포함된 캡시드 단백질의 자가 조립 성질에 의하여 형성된 것으로, siRNA를 세포 내로 전달할 수 있는 전달체를 의미하며, 이에 한정되지 않지만 평균지름이 30 내지 500 nm, 바람직하게는 30 내지 100 nm 인 나노 파티클일 수 있다. 상기 용어는 본 발명에서 재조합 단백질의 siRNA 전달을 표현하기 위하여 광의로 사용된 것으로, 본 명세서 내에서 siRNA 전달용 재조합 단백질을 의미하는 것으로 사용되기도 한다.
본 발명에서 HBV 캡시드 단백질은 유전자 재조합 방법을 이용하여 표면에 다양한 표적지향성 펩타이드를 도입하여 표적 세포로의 전달성을 향상시킬 수 있고, 한편으론 캡시드 단백질이 형성하는 구형의 바이러스 파티클 안쪽 공간에 siRNA 를 봉입함으로써 외부 공격으로부터 siRNA 를 보호하여 생체 내 안정성을 높일 수 있어, 효과적인 siRNA 전달체로 이용할 수 있다는 장점이 있다.
바람직하게, 본 발명의 HBV 캡시드 단백질은 GenBank 등재번호가 CAA26537.1 또는 서열번호 1의 아미노산 서열을 가지는 서브유닛 단백질을 포함하는 것일 수 있으며, 구형의 바이러스 파티클을 형성할 수 있는 한, 상기 서열의 일부를 치환, 삽입 또는 결실한 변형체도 본 발명의 범주에 포함된다. 본 발명의 캡시드 단백질은 자가조립에 의하여 240개의 서브유닛 단백질들이 외부 직경이 수십 nm에 이르는 속이 비어있는 구형태의 파티클을 형성하게 된다.
예를 들어, 본 발명의 HBV 캡시드 단백질은 서열번호 1의 아미노산 서열 중 C-말단을 결실시킨 서브유닛 단백질, 바람직하게는 서열번호 1의 아미노산 서열 중 1 내지 149번째 아미노산 서열을 가지는 서브유닛 단백질을 포함할 수 있다. 또한, 표적지향성 펩타이드가 도입된 서브유닛 단백질을 포함할 수 있으며, 바람직하게는 서열번호 1의 아미노산 서열 중 표적지향성 펩타이드가 삽입된 서브유닛 단백질, 보다 바람직하게는 상기 서열의 79번째(Pro) 및 89번째(Arg) 아미노산 사이에 RGD 펩타이드가 삽입된 서브유닛 단백질을 포함할 수 있다. 예컨대, 상기 서열의 80번째 및 81번째 아미노산 자리에 RGD 펩타이드가 삽입된 단백질을 사용할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
이와 같이, 본 발명의 재조합 단백질의 표면에는 다양한 표적지향성 펩타이드가 도입되어 표적 세포로의 전달성을 향상시킬 수 있다. 본 발명에서 용어, "표적지향성 펩타이드" 란 본 발명의 siRNA 재조합 단백질의 표면에 도입되어 표적 세포로의 전달을 지시하는 펩타이드를 말한다. 바람직하게, 상기 표적지향성 펩타이드는 HBV 캡시드 단백질을 이루는 아미노산 서열 중에 삽입되어, 자가조립에 의한 구형 바이러스 파티클이 형성될 때 파티클의 외부에 위치하여 표적 세포로의 전달을 지시할 수 있다.
바람직하게, 표적지향성 펩타이드는 RGD(Arg-Gly-Asp) 펩타이드를 포함할 수 있다. RGD 펩타이드는 바이러스 파티클 외부에 노출되어, 암세포에 특이적으로 과발현되어 있는 인테그린 단백질에 결합함으로써 암세포 특이적인 세포 타겟팅을 나타낼 수 있다. 상기 RGD 펩타이드는 바람직하게 3개 이상 30개 이하의 아미노산 잔기로 구성된 것일 수 있으며, 예컨대 서열번호 3(CDCRGDCFC)의 RGD 펩타이드를 사용할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 용어, "siRNA 결합 단백질"은 siRNA 와 결합함으로써 siRNA 를 파티클 내부에 붙잡아 둘 수 있는 단백질을 말하며, 바람직하게는 CIRV(Carnation Italian ringspot virus) 유래의 p19 단백질을 사용할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. p19 단백질은 20 내지 23 뉴클레오타이드 길이의 이중가닥 RNA 와 높은 친화력으로 결합할 수 있으나, 단일가닥 RNA, 이중가닥 DNA 및 리보솜 RNA 와는 결합하지 않는 특이성을 가지므로, 본 발명의 siRNA 결합 단백질로 적합하다.
siRNA 결합 단백질은 캡시드 단백직의 C-말단에 융합되어 바이러스 파티클 내부 공간에 위치하게 되며, 결과적으로 이에 결합된 siRNA 를 파티클 내부에 봉입할 수 있게 되어 외부 분해효소 등의 공격으로부터 siRNA 를 보호할 수 있게 한다. 일 구체예로서, 본 발명의 siRNA 결합 단백질은 GenBank CAA59481.1 또는 서열번호 2의 아미노산 서열을 가지는 p19 단백질을 사용할 수 있으며, 바람직하게는 서열번호 2의 아미노산 서열 중 3 내지 172번째 아미노산 서열을 가지는 단백질을 사용할 수 있다.
본 발명에서 HBV 캡시드 단백질과 siRNA 결합 단백질은 링커 펩타이드를 통하여 연결될 수 있다. 본 발명에서 용어, "링커 펩타이드" 란 HBV 캡시드 단백질과 siRNA 결합 단백질은 연결하는 펩타이드로서, 캡시드 단백질의 자가조립 성질을 방해하지 않고 siRNA 결합 단백질의 다이머 형성을 방해하지 않으면서, siRNA 결합 단백질이 바이러스 파티클 내부에 위치하도록 하는 펩타이드를 말한다. 상기 기능을 수행하는 펩타이드라면 특정 아미노산 서열에 국한되지 않으나, 링커 펩타이드는 p19 단백질이 캡시드 단백질에 융합된 뒤에도 구형 파티클 형성이 가능하도록 충분한 길이를 유지하는 것이 바람직하며, 보다 바람직하게는 31개 이상 300개 미만의 펩타이드로 구성될 수 있다. 바람직한 일양태로서, 상기 링커 펩타이드는 31개의 아미노산으로 구성된 서열번호 4로 나타내는 펩타이드(GSSGGSGSSGGSGGGDEADGSRGSQKAGVDE)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
바람직한 일 양태로서, 본 발명의 siRNA 전달용 재조합 단백질은 하기 구조를 포함하는 재조합 단백질이다:
A-B-C
상기에서, A 는 표적지향성 펩타이드가 표면에 도입된 HBV 캡시드의 서브유닛 단백질이며;
B 는 링커 펩타이드이며; 및
C 는 HBV 캡시드 단백질의 내부에 위치하게 되는 siRNA 결합 단백질이다.
또 다른 일 양태로서, 본 발명의 siRNA 전달용 재조합 단백질은 하기 구조를 포함하는 재조합 단백질이다:
A-B-C
상기에서, A 는 RGD(Arg-Gly-Asp)가 표면에 도입된 HBV 캡시드의 서브유닛 단백질이며;
B 는 링커 펩타이드이며; 및
C 는 HBV 캡시드 단백질의 내부에 위치하게 되는 p19 단백질이다.
또 다른 일 양태로서, 본 발명의 siRNA 전달용 재조합 단백질은 하기 구조를 포함하는 재조합 단백질이다:
A-B-C
상기에서, A 는 서열번호 1 의 아미노산 서열 중 1 내지 149번째 아미노산 서열을 가지며 80번째 및 81번째 아미노산 자리에 RGD 펩타이드가 삽입되어 있는, HBV 캡시드의 서브유닛 단백질이며;
B 는 서열번호 4의 아미노산 서열을 가지는 링커 펩타이드이며; 및
C 는 서열번호 2 의 아미노산 서열 중 3 내지 172번째 아미노산 서열을 가지며, HBV 캡시드 단백질의 내부에 위치하게 되는 p19 단백질이다.
바람직하게, 상기 A-B-C 의 구조를 가지는 재조합 단백질은 서열번호 3의 아미노산 서열로 나타낼 수 있으며, 이 때 전체 서열에 포함된 각 아미노산 서열이 나타내는 바를 도 1에 나타내었다.
본 발명의 구체적인 실시예에서는, 도 1에 나타난 바와 같이, 서열번호 1 의 아미노산 서열 중 1 내지 149번째 아미노산 서열을 가지며 80번째 및 81번째 아미노산 자리에 서열번호 4의 RGD 펩타이드가 삽입되어 있는 HBV 캡시드 서브유닛 단백질, 및 서열번호 2 의 아미노산 서열 중 3 내지 172번째 아미노산 서열을 가지는 p19 단백질이, 서열번호 4의 링커 펩타이드로 연결된 재조합 단백질을 디자인하였고, 3차원 시뮬레이션을 통해 상기 디자인된 재조합 단백질이 hole 을 통하여 내부에 siRNA 가 자유롭게 통과할 수 있음을 확인하였다. 또한, 실제로 상기 디자인된 재조합 단백질을 제조하였다(실시예 1 참조).
본 발명자들은 이와 같이 제조한 재조합 단백질이 자기조립을 통하여 구형 파티클을 형성하며, 파티클 내부에 siRNA 를 봉입할 수 있음을 크기 배제 크로마토그래피 및 형광 분석을 이용하여 확인하였고(도 4 참조), 정량분석을 통하여 하나의 재조합 파티클 당 120개의 RNA를 봉입할 수 있음을 확인하였다(도 5 참조). 또한, 전자 현미경 관찰을 통하여 본 발명에 따라 제조한 재조합 단백질이 HBV 와 동일하게 약 36 nm의 외경을 가진 구형 파티클을 형성함을 확인하였다(도 6 참조).
또한, 본 발명의 재조합 단백질은 MTT 분석 결과 1 μM 까지 우수한 생체적합성이 있음을 확인하였으며(도 7 참조), 산성 조건에서 siRNA 가 재조합 단백질로부터 해리되므로 엔도솜에서 세포질로의 방출 기전(endosomal escape)을 통하여 효과적으로 siRNA 를 세포질로 전달할 수 있음을 확인하였다(도 8 참조). 상기 siRNA 는 재조합 단백질이 형성하는 파티클의 내부에 봉입됨으로 각종 리보뉴클레아제에 의한 외부 공격으로부터 안정성을 유지하고(도 9 참조), 재조합 단백질 표면에 도입된 표적지향성 펩타이드에 의하여 선택적인 세포 투과성을 나타내며(도 10 참조), 세포질로 전달되어 표적 유전자의 사일런싱을 일으키므로(도 11 내지 도 13 참조), siRNA 전달체로 유용하게 사용될 수 있다.
따라서, 또 하나의 양태로서, 본 발명은 상기 재조합 단백질 및 siRNA 를 포함하는 siRNA 전달용 조성물에 관한 것이다.
본 발명에서 siRNA 는 본 발명의 재조합 단백질을 구성하는 siRNA 결합 단백질에 결합하므로, 재조합 바이러스 파티클의 내부에 봉입됨을 특징으로 한다. 이와 같이 바이러스 파티클 내부에 봉입된 siRNA 는 외부와 물리적으로 차단되므로 뉴클레아제(nuclease)와 같은 분해효소로부터 자유로워 안정성이 우수하며, 바이러스 파티클 외부에 노출된 표적지향성 펩타이드에 의해 효과적으로 표적 세포에 결합한 후 엔도시토시스(endocytosis)에 의하여 세포 내로 투과될 수 있다. 세포 내 투과 후, siRNA 결합단백질과 결합되어 있는 siRNA는 세포 내 엔도의 산성 조건에서 siRNA 결합단백질과 해리되어 엔도솜으로부터 세포질로 방출(endosomal escape)됨으로써 효과적으로 mRNA 의 발현을 억제할 수 있다. 따라서, 질환 유전자를 포함하는 타겟 유전자 발현을 억제하고 질병치료가 가능하게 할 수 있다.
따라서, 또 하나의 양태로서, 본 발명은 상기 siRNA 전달용 조성물을 포함하는 siRNA 관련 질환의 치료용 조성물에 관한 것이다.
siRNA 는 질환 관련 유전자의 mRNA 의 발현을 억제함으로써 질환 치료 효과를 유도할 수 있는 것이라면 제한없이 사용할 수 있으며, 바람직하게는 20 내지 30 개의 뉴클레오타이드로 이루어진 것을 포함한다.
상기 siRNA 관련 질환은 이에 한정되지는 않지만, siRNA 로 치료할 수 있음이 알려진 질환들을 포함할 수 있으며, 바람직하게는 암, 노인성 황반변성, 바이러스 감염 질환, 자가면역 질환 및 신경퇴행성 질환으로 이루어진 군에서 선택되는 질환을 포함할 수 있다. 상기 암은 유방암, 폐암, 두경부암, 뇌암, 복부암, 결장암, 식도암, 위암, 위장암, 간암, 설암, 신경아세포종, 골육종, 난소암, 췌장암, 전립선암, 빌립스 종양, 망막아세포종, 다발성 골수종, 피부암, 림프종 및 혈액암 등을 포함하나 이에 제한되지 않는다.
상기 치료용 조성물 내의 유효성분으로서의 상기 재조합 단백질의 함량은 사용 형태 및 목적, 환자 상태 등에 의하여 적절하게 조절할 수 있다. 또한, 상기 치료용 조성물은 사람을 포함하는 포유동물에 다양한 경로로 투여될 수 있다. 투여 방식은 통상적으로 사용되는 모든 방식일 수 있으며, 예컨대, 경구, 직장 또는 정맥, 근육, 피하, 자궁 내 경막 또는 뇌혈관 내 (intracerebroventricular) 주사에 의해 투여될 수 있다. 본 발명의 약학적 조성물은 각각 통상의 방법에 따라 산제, 과립제, 정제, 캡슐제, 현탁액, 에멀젼, 시럽, 에어로졸 등의 경구형 제형, 경피제, 좌제 및 멸균 주사용액의 형태의 비경구 제형 등으로 제형화하여 사용할 수 있다.
본 발명의 재조합 단백질 또는 상기 재조합 단백질이 형성하는 재조합 바이러스 파티클은 siRNA를 세포 및 생체 조직으로 선택적으로 전달할 수 있으며 생체 내 안정성을 혁신적으로 향상시킬 수 있으므로 siRNA 치료제, 세포기반 약물 스크리닝 조성물 및 연구용 siRNA 전달체로 효과적으로 이용될 수 있다.
도 1은 본 발명 실시예 1에서 제조한 siRNA 전달용 재조합 단백질이 포함하는 서브유닛의 아미노산 서열을 나타낸 것이다. 구체적으로, HBV 바이러스의 캡시드 단백질 (점선 박스), RGD 펩타이드 (빨간색 박스), 캡시드 단백질과 p19 단백질을 연결하는 링커 펩타이드 (파란색 밑줄) 및 p19 단백질 (대시 박스) 의 아미노산 서열을 나타낸다.
도 2는 캡시드 단백질, RGD 펩타이드 및 p19 단백질이 융합되어 있는 본 발명 재조합 파티클의 3차원 구조를 나타낸 모식도이다.
도 3은 본 발명의 재조합 파티클의 표면에 존재하는 구멍(hole)을 통하여 siRNA 분자가 자유로이 통과할 수 있음을 보여주는 시뮬레이션 결과이다.
도 4는 본 발명의 재조합 바이러스 파티클 내부에 siRNA가 봉입되었는지를 확인하기 위한 크기 배제 크로마토그래피(SEC) 결과 및 상기 SEC 프로파일의 피크에서 수집된 샘플을 형광분광기를 이용하여 분석한 결과(박스 그림)을 나타낸다.
도 5는 본 발명 재조합 파티클의 농도에 따라 결합하는 siRNA의 양을 정량분석한 전기영동한 결과를 나타낸다 (CN: 재조합 파티클, siRNA+CN: 재조합 파티클에 siRNA 를 주입한 경우).
도 6은 전자현미경 분석 결과 HBV 캡시드 단백질(1-149 아미노산)이 약 36 nm 외경을 가진 구형의 파티클을 형성하는 것(A 그림) 및 siRNA와 결합한 재조합 파티클도 마찬가지로 같은 크기의 구형 파티클을 형성하는 것(B 그림)을 나타낸다.
도 7은 MTT 분석를 통하여 본 발명 재조합 파티클의 농도에 따른 세포 독성 및 생체적합성을 시험한 결과를 나타낸다.
도 8은 재조합 파티클에 결합되어 있는 siRNA가 pH가 감소할수록 해리되는 것을 보여주는 전기영동 결과이다.
도 9는 10% FBS (fatal bovine serum) 조건 하에서 naked siRNA와 재조합 파티클에 결합되어 있는 siRNA의 안정성을 비교한 결과이다 (siRNA+CN: 재조합 파티클에 siRNA 를 주입한 경우).
도 10은 재조합 파티클 외부에 노출된 RGD 펩타이드에 의하여 재조합 파티클이 암세포에 결합한 후 엔도시토시스(endocytosis)에 의하여 세포 투과되는 것을 보여주는 형광현미경 분석 결과(그림 A) 및 정량분석 결과(그림 B)를 나타낸다 (CN: 본 발명의 재조합 파티클를 처리한 경우, RGD100-fold 또는 RGD100/CN: RGD 펩타이드를 100배 선처리한 후 재조합 파티클을 처리한 경우, RGD200-fold 또는 RGD200/CN: RGD 펩타이드를 200배 선처리한 후 재조합 파티클을 처리한 경우, RGD300-fold 또는 RGD300/CN: RGD 펩타이드를 300배 선처리한 후 재조합 파티클을 처리한 경우).
도 11은 재조합 파티클에 봉입된 siRNA에 의해서 RFP 유전자가 세포에서 발현이 억제됨을 보여주는 형광현미경 분석 결과(그림 A) 및 정량분석 결과(그림 B)를 나타낸다 (Control: RFG 유전자가 발현되는 B16F10 세포, siRNA-CN: 재조합 파티클을 이용하여 siRNA를 세포에 주입한 경우, sc siRNA-CN: RFP 유전자에 매칭하지 않는 scramble siRNA를 재조합 파티클에 봉입하여 세포에 주입한 경우, siRNA/LF: 기존 siRNA 전달체인 리포펙타민을 사용한 경우).
도 12는 도 11에서 발현되는 RFP의 형광세기를 정량화한 결과를 나타낸다. (Control: RFG 유전자가 발현되는 B16F10 세포, siRNA-CN: 재조합 파티클을 이용하여 siRNA를 세포에 주입한 경우, sc siRNA-CN: RFP 유전자에 매칭하지 않는 scramble siRNA를 재조합 파티클에 봉입하여 세포에 주입한 경우, siRNA/LF: 기존 siRNA 전달체인 리포펙타민을 사용한 경우).
도 13은 도 11에서 RFP 유전자의 mRNA가 siRNA에 의하여 분해되었음을 RT-PCR을 통하여 확인한 전기영동 결과(그림 A) 및 정량분석 결과(그림 B)를 나타낸다 (Control: RFG 유전자가 발현되는 B16F10 세포, siRNA-CN: 재조합 파티클을 이용하여 siRNA를 세포에 주입한 경우, sc siRNA-CN: RFP 유전자에 매칭하지 않는 scramble siRNA를 재조합 파티클에 봉입하여 세포에 주입한 경우, siRNA/LF: 기존 siRNA 전달체인 리포펙타민을 사용한 경우).
도 2는 캡시드 단백질, RGD 펩타이드 및 p19 단백질이 융합되어 있는 본 발명 재조합 파티클의 3차원 구조를 나타낸 모식도이다.
도 3은 본 발명의 재조합 파티클의 표면에 존재하는 구멍(hole)을 통하여 siRNA 분자가 자유로이 통과할 수 있음을 보여주는 시뮬레이션 결과이다.
도 4는 본 발명의 재조합 바이러스 파티클 내부에 siRNA가 봉입되었는지를 확인하기 위한 크기 배제 크로마토그래피(SEC) 결과 및 상기 SEC 프로파일의 피크에서 수집된 샘플을 형광분광기를 이용하여 분석한 결과(박스 그림)을 나타낸다.
도 5는 본 발명 재조합 파티클의 농도에 따라 결합하는 siRNA의 양을 정량분석한 전기영동한 결과를 나타낸다 (CN: 재조합 파티클, siRNA+CN: 재조합 파티클에 siRNA 를 주입한 경우).
도 6은 전자현미경 분석 결과 HBV 캡시드 단백질(1-149 아미노산)이 약 36 nm 외경을 가진 구형의 파티클을 형성하는 것(A 그림) 및 siRNA와 결합한 재조합 파티클도 마찬가지로 같은 크기의 구형 파티클을 형성하는 것(B 그림)을 나타낸다.
도 7은 MTT 분석를 통하여 본 발명 재조합 파티클의 농도에 따른 세포 독성 및 생체적합성을 시험한 결과를 나타낸다.
도 8은 재조합 파티클에 결합되어 있는 siRNA가 pH가 감소할수록 해리되는 것을 보여주는 전기영동 결과이다.
도 9는 10% FBS (fatal bovine serum) 조건 하에서 naked siRNA와 재조합 파티클에 결합되어 있는 siRNA의 안정성을 비교한 결과이다 (siRNA+CN: 재조합 파티클에 siRNA 를 주입한 경우).
도 10은 재조합 파티클 외부에 노출된 RGD 펩타이드에 의하여 재조합 파티클이 암세포에 결합한 후 엔도시토시스(endocytosis)에 의하여 세포 투과되는 것을 보여주는 형광현미경 분석 결과(그림 A) 및 정량분석 결과(그림 B)를 나타낸다 (CN: 본 발명의 재조합 파티클를 처리한 경우, RGD100-fold 또는 RGD100/CN: RGD 펩타이드를 100배 선처리한 후 재조합 파티클을 처리한 경우, RGD200-fold 또는 RGD200/CN: RGD 펩타이드를 200배 선처리한 후 재조합 파티클을 처리한 경우, RGD300-fold 또는 RGD300/CN: RGD 펩타이드를 300배 선처리한 후 재조합 파티클을 처리한 경우).
도 11은 재조합 파티클에 봉입된 siRNA에 의해서 RFP 유전자가 세포에서 발현이 억제됨을 보여주는 형광현미경 분석 결과(그림 A) 및 정량분석 결과(그림 B)를 나타낸다 (Control: RFG 유전자가 발현되는 B16F10 세포, siRNA-CN: 재조합 파티클을 이용하여 siRNA를 세포에 주입한 경우, sc siRNA-CN: RFP 유전자에 매칭하지 않는 scramble siRNA를 재조합 파티클에 봉입하여 세포에 주입한 경우, siRNA/LF: 기존 siRNA 전달체인 리포펙타민을 사용한 경우).
도 12는 도 11에서 발현되는 RFP의 형광세기를 정량화한 결과를 나타낸다. (Control: RFG 유전자가 발현되는 B16F10 세포, siRNA-CN: 재조합 파티클을 이용하여 siRNA를 세포에 주입한 경우, sc siRNA-CN: RFP 유전자에 매칭하지 않는 scramble siRNA를 재조합 파티클에 봉입하여 세포에 주입한 경우, siRNA/LF: 기존 siRNA 전달체인 리포펙타민을 사용한 경우).
도 13은 도 11에서 RFP 유전자의 mRNA가 siRNA에 의하여 분해되었음을 RT-PCR을 통하여 확인한 전기영동 결과(그림 A) 및 정량분석 결과(그림 B)를 나타낸다 (Control: RFG 유전자가 발현되는 B16F10 세포, siRNA-CN: 재조합 파티클을 이용하여 siRNA를 세포에 주입한 경우, sc siRNA-CN: RFP 유전자에 매칭하지 않는 scramble siRNA를 재조합 파티클에 봉입하여 세포에 주입한 경우, siRNA/LF: 기존 siRNA 전달체인 리포펙타민을 사용한 경우).
이하, 본 발명을 실시예에 의해 상세히 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐 본 발명의 내용이 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예
1.
siRNA
전달용 재조합 단백질의 제조
1-1. 본 발명의 재조합 단백질의 디자인
본 발명자들은 구형 파티클을 형성하는 siRNA 전달용 재조합 단백질을 디자인하고, 3차원 구조분석 시뮬레이션을 실시하였다.
우선, 본 발명의 재조합 단백질을 구성하는 서브유닛으로서 도 1의 아미노산 서열을 결정하였다. 도 1에 나타난 바와 같이, HBV 캡시드 단백질의 서브유닛(서열번호 1 또는 GenBank CAA26537.1)을 구성하는 전체 185개 아미노산 중에서 C-말단이 제거된 아미노산 서열(1-149)에서, Ala80 및 Ser81을 제거하고 그 자리에 RGD 펩타이드(서열번호 3: CDCRGDCFC)를 삽입하였다. 또한, 링커 펩타이드로 31개 아미노산(서열번호 4: GSSGGSGSSGGSGGGDEADGSRGSQKAGVDE) 을 사용하여 캡시드 단백질 및 p19 단백질을 연결하도록 하였다. p19 단백질은 CIRV (Carnation Italian ringspot virus)에서 유래한 p19 siRNA 결합 단백질 (서열번호 2 또는 GenBank CAA59481.1)을 구성하는 아미노산 중에서 3 내지 172번째 아미노산을 포함하도록 디자인하였다.
이와 같이 디자인된 재조합 단백질은 도 2에 나타난 바와 같은 3차원 구조를 가지게 된다. 본 발명의 재조합 단백질은 240개의 서브유닛 단백질로 구성되어 하나의 구형 파티클을 형성하게 되는데, 이 때 서브유닛 단백질 두 개가 모여서 하나의 다이머 클러스터(dimer cluster)를 형성하여 파티클의 외부에 뾰족한 스파이크(spike) 구조를 노출시키는 구조를 가지며, RGD 펩타이드가 스파이크(spike)에 위치하게 되므로 하나의 파티클당 240개의 RGD 펩타이드가 노출될 수 있다. 또한, 캡시드 단백질의 C-말단에 융합되어 있는 p19 단백질이 siRNA 와 결합하게 되므로 결과적으로 siRNA는 재조합 파티클의 내부에 위치하게 되며 하나의 재조합 파티클은 120개의 siRNA를 포함할 수 있다.
본 발명자들은 Pymol (version 1.4.1, DeLano Scientific LLC) 3차원 구조분석 프로그램을 이용한 구조생물학적 시뮬레이션을 통하여, 상기와 같이 디자인된 바이러스 파티클 표면의 구멍(hole)을 통하여 siRNA의 자유로운 통과가 가능함을 확인하였다 (도 3). 재조합 파티클의 표면은 3개의 다이머 클러스터(dimer cluster)가 모여서 하나의 구멍(hole)을 형성함으로써 하나의 재조합 파티클당 40개의 hole을 갖게 되며, 이중 가닥 siRNA가 이루는 helix의 단면 반지름은 1 nm인데 비해 hole의 반경은 1.2 nm이상이며 hole을 구성하는 아미노산의 유연성(flexibility)으로 인해 siRNA의 자유로운 통과를 가능하게 한다.
1-2. 대장균을 이용한 재조합 단백질의 대량 생산 및 정제
상기 실시예 1-1에서 디자인된 재조합 단백질을 제조하기 위하여, 먼저 HBV 캡시드 단백질을 코딩하는 유전자를 정방향 프라이머 5'-ATGGACATTGACCCGTATAAA-3' (서열번호 6) 및 역방향 프라이머 5'-AACAACAGTAGTTTCCGG-3' (서열번호 7)을 이용하여 PCR 증폭하였고, p19 단백질을 코딩하는 유전자를 정방향 프라이머 5'-CGAGCTATACAAGGAAACGAC-3' (서열번호 8) 및 역방향 프라이머 5'-CTGAGCTCCTCGCTTTCTTTCTTGAAGGT-3' (서열번호 9)를 이용하여 PCR 증폭하였다. 상기 PCR 증폭은 각각 변성 단계 95℃/30초, 어닐링 단계 60℃ 및 신장 단계 72℃/ 2분의 조건으로 30 사이클 실시하였다. 상업적으로 합성된 링커 펩타이드에 해당하는 프라이머인 정방향 프라이머 5'-ACTACTGTTGTTGGTTCAAGCGGCGGTTCCGGTTCAAGTGGCGGATCCGGAGGCGGTGATGAAGCTGACGGCTCCCGTGGTTCACAAAAAGCTGGTGTCGACGAA-3' (서열번호 10) 및 역방향 프라이머 5'-TTCGTCGACACCAGCTTTTTGTGAACCACGGGAGCCGTCAGCTTCATCACCGCCTCCGGATCCGCCACTTGAACCGGAACCGCCGCTTGAACCAACAACAGTAGT-3' (서열번호 11)를 위의 두 PCR 증폭된 단백질 유전자와 섞어준 후 HBV 유전자의 정방향 프라이머와 p19 유전자의 역방향 프라이머를 사용하여 PCR 증폭(변성 단계 95℃/30초, 어닐링 단계 60℃, 신장 단계 72℃/2분, 30 사이클)함으로써 HBV 캡시드, 링커 펩타이드 및 p19 단백질의 각 유전자가 연결된 유전자 컨스트럭트를 얻을 수 있었다.
RGD 펩타이드를 삽입하기 위하여 이에 해당하는 정방향 프라이머 5'- GAAGATCCATGTGACTGCCGCGGTGATTGTTTCTGTAGGGATCTA-3' (서열번호 12) 및 역방향 프라이머 5'-TAGATCCCTACAGAAACAATCACCGCGGCAGTCACATGGATCTTC-3' (서열번호 13)를 위의 재조합 유전자와 섞은 후 HBV 유전자의 정방향 프라이머와 p19 유전자의 역방향 프라이머를 사용하여 PCR 증폭(변성 단계 95℃/30초, 어닐링 단계 60℃, 신장 단계 72℃/2분, 30 사이클)함으로써 상기 실시예 1-1에서 디자인된 재조합 유전자를 증폭할 수 있었다.
이 때 증폭된 유전자는 NdeI, XhoI 제한 효소자리를 포함하고 있으므로 제한효소를 처리한 후 정제하였다. 마찬가지로 pET28a 벡터(NEB Inc.)도 동일한 제한효소로 처리한 후 정제하였으며 상기 재조합 유전자를 DNA 연결효소를 이용하여 삽입한 후 competent cell에 Hanahan method를 사용하여 형질전환하고 콜로니 PCR 방법으로 유전자삽입을 확인한 후 최종적으로 DNA 시퀀싱을 통하여 서열을 확인하였다.
유전자가 삽입된 발현벡터를 BL21(DE3) 숙주세포(Novagen) 에 형질전환을 시킨 후, LB 배지(Sigma-Aldrich)에서 37℃에서 키운 후 OD600 값이 0.5에 도달하면 IPTG(Isopropyl Β-D thiogalactoside) 1 mM을 이용하여 발현을 유도하였다. 이 후 18 ℃에서 6시간을 더 배양한 후 세포를 수거하고 용해 버퍼(50mM Tris-HCl, 8.0, 100mM NaCl, 1mM PMSF(phenylmethylsulfanylfluoride))를 이용하여 세포를 파괴한 후 용해된 부분만을 정제에 이용하였다.
발현 벡터의 특징상 재조합 단백질의 N-말단에 히스티딘-태그가 위치하는 것을 이용하여 친화성 크로마토그래피(affinity chromatography) 및 크기 배제 크로마토그래피(size exclusion chromatography)를 통하여 단백질을 순수하게 정제하였다.
친화성 크로마토그래피는 Ni-NTA 컬럼(GE healthcare)을 사용하였으며 A 버퍼(50mM Tris-HCl, 8.0, 100mM NaCl)로 컬럼 준비와 단백질 로딩 후 수세하였다. B 버퍼(50mM Tris-HCl, 8.0, 100mM NaCl, 500mM Immidazole)로 컬럼에 붙어있는 단백질을 용출시킨 후 전기영동(Laemmli, U. K. Nature 1970, 227, 680-685.)을 통하여 분자량을 확인하였다. 또한 크기 배제 크로마토그래피는 Superdex 200 10/300 GL column(GE Heathcare)을 이용하였고 주입 부피(injection volume)는 2mL이였으며 버퍼는 50mM Tris-HCl(8.0), 100mM NaCl을 사용하였다. 정제 후 단백질의 농도는 약 1mg/mL로 농축하였으며 보관조건은 50 mM PBS(7.4)으로 하였다.
실험예
1. 본 발명 재조합 단백질의 구형
파티클
형성 확인 및
siRNA
결합력 조사
상기 실시예 1-2에서 제조한 siRNA 전달용 재조합 단백질 내부에 siRNA 를 봉입하여 siRNA 결합력을 조사하였다. 본 실험에서는 RFP(Red Fluorescent Protein) 유전자를 타겟으로 하는 siRNA 를 사용하였으며, 사용한 siRNA의 염기 서열은 다음과 같다 :
센스 가닥 : 5'-UGUAGAUGGACUUGAACUCdTdT-3' (서열번호 14)
안티센스 가닥: 5'-UGAAGUUGCACUUGAAGUCdTdT-3' (서열번호 15)
상기 siRNA 의 봉입 여부를 확인하기 위하여, FITC(fluorescein isothiocyanate) 형광물질을 siRNA에 부착하여 재조합 단백질에 결합을 시킨 후 크기 배제 크로마토그래피를 수행하였다. 크기 배제 크로마토그래피는 Superdex 200 10/300 GL 컬럼(GE Heathcare)을 이용하였고 주입 부피(injection volume)는 2mL이였으며 버퍼는 50mM Tris-HCl(8.0) 및 100mM NaCl을 사용하였다
그 결과, 도 4는 재조합 단백질이 자가조립을 통하여 파티클을 형성하는 것을 보여주고 있으며, 구형 파티클 형성을 보이는 피크에서 수집된 단백질을 형광분광기에 분석하였을 때 siRNA가 봉입되지 않은 재조합 파티클(control)은 FITC 방출 스펙트럼이 관찰되지 않았으나(도 4, 갈색라인), siRNA가 봉입된 재조합 파티클의 경우 농도별로 각각 FITC 방출 스펙트럼이 관찰됨으로써 siRNA가 재조합 파티클 내부에 결합되어 있음을 확인할 수 있었다.
또한, 재조합 파티클에 결합하는 siRNA의 mole ration를 결정하기 위하여, free siRNA 의 농도를 고정한 상태에서 재조합 바이러스 파티클의 농도를 증가시키면서 siRNA 결합량을 전기영동으로 분석하였다.
그 결과 도 5에 나타낸 바와 같이, 재조합 파티클의 농도가 높아질수록 결합에 참여하지 못하는 siRNA의 양이 감소하면서 재조합 파티클에 결합되어 gel shift를 보여주는 밴드의 두께가 증가하였으며, 정량적 분석을 통해서 하나의 재조합 파티클 당 결합되는 siRNA의 개수는 120개임을 알 수 있었다.
또한, 전자현미경(CM 20 electron microscope, Philips) 분석 결과, 도 6에 나타낸 바와 같이, 본 발명에 따라 제조된 재조합 단백질이 HBV 와 동일하게 약 36 nm 외경을 가진 구형 파티클을 형성하며, siRNA와 결합한 재조합 단백질도 마찬가지로 같은 크기의 구형 파티클을 형성하는 것을 확인할 수 있었다.
실험예
2. 본 발명의 재조합 단백질의 세포독성 실험
본 발명의 재조합 단백질의 세포 내 생체적합성을 조사하기 MTT 분석을 수행하였다. 구체적으로, 기하급수적인 증가 단계(Exponential growth phase)에 있는 HeLa 세포를 96-웰 플레이트에서 웰당 20000 세포가 되도록 키운 후, 다양한 농도의 재조합 파티클을 각 웰에 처리하고 24시간 동안 배양하였다. MTT 용액 (0.5mg/mL)을 웰 당 200uL씩 첨가하여 4시간 동안 반응시킨 후 DMSO 200uL를 넣고 10분간 반응시키고 570nm 파장에서 ELISA를 이용하여 측정하고 그 결과를 도 7에 기재하였다. 보다 구체적인 과정은 인용문헌(Choi, Y. H.; Liu, F.; Kim, J. S.; Choi, Y. K.; Park, J. S.; Kim, S. W. J. Control. Rel. 1998, 54, 39-48.)을 참조하였다.
그 결과 도 7에 기재한 바와 같이, 본 발명의 재조합 파티클은 1 μM 까지 우수한 생체적합성을 보여주었으며, 바람직하게는 본 발명의 재조합 파티클의 농도를 800 nM 로 결정할 수 있었다.
실험예
3. 본 발명의 재조합 단백질의
pH
에 따른
siRNA
결합력
siRNA 전달체는 엔도시토시스(endocytosis)에 의하여 세포 내 투과 후 세포질로의 방출을 위해서 엔도솜(endosome)의 산성조건을 이용하여 엔도솜에서 세포질로의 방출 기전(endosomal escape)에 이용할 경우 매우 유리하다. 이에, 본 발명의 재조합 단백질의 pH 에 따른 siRNA 결합력을 측정하기 위하여, pH 7.4 조건은 PBS 버퍼, pH 6.5-5.0 조건은 50 mM 아세트산나트륨 버퍼을 사용하였고, 결합된 재조합 파티클과 siRNA 결합체는 상온에서 10분간 각각의 해당되는 pH 조건에서 방치한 후 전기영동(200V, 100mA)을 이용하여 결합 정도를 분석하였다. 분석의 용이성을 위하여 형광체 FITC가 부착되어있는 siRNA를 사용하였다.
그 결과 도 8에 나타낸 바와 같이, 본 발명의 재조합 바이러스 파티클은 중성 pH에서는 siRNA 결합력이 우수하였으나 점점 pH가 감소할 경우 약 6.5에서부터 siRNA의 해리가 관찰되며 약 5.5에서는 대부분의 siRNA가 해리됨을 보여주었다. 이러한 결과는 본 발명의 재조합 파티클이 세포 내 투과 후에 엔도솜에서의 방출 기전(endosomal escape)에 의하여 세포질로 siRNA의 전달이 가능함을 보여주는 것이다.
실험예
4.
본 발명의 재조합
파티클에
봉입된
siRNA
의 생체안정성 조사
본 발명의 재조합 파티클의 내부에 봉입된 siRNA는 캡시드 단백질에 의하여 물리적으로 외부환경으로부터 보호를 받음으로써 naked siRNA에 비해 각종 리보뉴클레아제(ribonuclease)에 의한 분해 저항성이 뛰어나다. 이를 확인하기 위하여 siRNA를 분해할 수 있는 각종 리보뉴클레아제들이 혼재해 있는 10% FBS (fatal bovine serum) 조건하에서 naked siRNA와 재조합 파티클에 봉입된 siRNA를 각각 실온에서 시간별로 방치한 후 전기영동을 통해 분해되는 정도를 비교하였다.
그 결과 도 9에 나타낸 바와 같이, naked siRNA의 경우 30분 이내에서 완전히 분해되었으나 본 발명의 재조합 바이러스 파티클에 봉입되어 보호를 받는 siRNA는 6시간이 지나도록 안정함을 보여주었다. 이러한 결과는 본 발명의 재조합 바이러스 파티클이 siRNA의 생체 안정성을 획기적으로 향상시키는 우수한 전달체임을 보여주는 것이다.
실험예
5. 본 발명의 재조합
파티클의
세포투과 활성
본 발명의 재조합 파티클의 선택적 세포 투과성을 확인하기 위하여 마우스 미엘로마 세포주인 B16F10에 대한 세포투과 실험을 수행하였다.
구체적으로 형광현미경에서의 형광관찰을 용이하게 하기 위하여, 먼저 재조합 파티클 표면에 위치한 라이신(Lysine) 잔기를 이용하여 Cy5.5 형광체를 결합시켰다. B16F10 세포에 상기 재조합 파티클을 0.25 μM 처리한 후 10 분 간격으로 형광현미경을 이용하여 관찰하였다. 형광현미경으로 Achroplan IR40 x/0.80W lens, Axiocam black and white CCD camera(Carl Zeiss)가 부착된 Axioskop2 FS plus imaging microscope (ZEISS)을 사용하였다.
그 결과 도 10에 나타낸 바와 같이, 본 발명의 재조합 파티클을 처리한 후 10 분 경과부터 세포 내 투과가 관찰되기 시작하였으며 약 30분 경과에서 최대의 세포투과성을 보여주었다. 상기 결과로부터, 본 발명의 나노 파티클은 세포투과성이 매우 우수함을 알 수 있다.
이러한 우수한 세포투과성은 재조합 파티클 표면에 노출되어있는 RGD 펩타이드에 의한 엔도시토시스(endocytosis)에서 기인함을 확인하기 위하여, 합성된 RGD 펩타이드(CDCRGDCFC 아미노산 서열)를 재조합 파티클보다 100배, 200배, 400배 고농도로 선처리한 후 재조합 파티클을 처리하였다.
그 결과 도 10A과 같이 세포 투과력이 현저히 감소함을 관찰하였고 이러한 결과는 재조합 파티클 표면에 노출된 RGD 펩타이드에 의한 세포투과성을 확인시켜주고 있다. 도 10B는 RGD 펩타이드 처리를 하지 않은 재조합 파티클의 세포투과성과 비교시에 RGD 펩타이드를 100배, 200배, 400배 선처리한 결과는 각각 40%, 95%, 95% 감소됨을 보여준다.
실험예
6. 본 발명의 재조합
파티클에
의한 세포 내
siRNA
전달 및 유전자 사일런싱(
gene
silencing
) 조사
본 발명의 재조합 파티클을 전달체로 이용한 siRNA가 세포 내 유전자에 대하여 유전자 사일런싱(gene silencing)을 일으키는 효과를 기존의 siRNA 전달체인 리포펙타민과 비교하였다. RFP 형광 단백질을 발현할 수 있는 B16F10 미엘로마 세포주에 동일한 양의 siRNA를 각각 리포펙타민과 본 발명의 재조합 파티클에 섞어 준 후 세포 처리하고 24 시간 후 형광현미경으로 관찰하였다.
그 결과 도 11에 나타낸 바와 같이, siRNA를 처리하지 않은 대조군 세포는 RFP 형광단백질이 발현되어 강한 형광강도를 보였으나 리포펙타민과 재조합 파티클로 처리한 siRNA는 세포에서 RFP 형광단백질의 발현을 억제함을 관찰할 수 있었다.
또한, 도 12에 나타낸 바와 같이, RFP 단백질-코딩 유전자와 매칭(matching)되지 않는 scramble siRNA를 재조합 파티클과 처리하였을 때는 유전자 사일런싱이 거의 관찰되지 않았다. 이러한 RFP 형광단백질의 유전자 사일런싱을 정량적으로 분석하였을 때 리포펙타민을 처리한 siRNA는 약 93%, 재조합 파티클 처리한 siRNA는 약 95%의 유전자 발현억제를 보여주었다.
또한, 본 발명자들은 RT-PCR을 이용하여 세포 내의 mRNA의 양 분석을 통해 본발명의 재조합 파티클의 siRNA 전달 효과를 확인하였다. 보다 구체적으로 RFP mRNA에 매칭될 수 있는 프라이머(정방향 프라이머 5'-GGCTGCTTCATCTACAAGGT-3' (서열번호 16) 및 역방향 프라이머 5'-GCGTCCACGTAGTAGTAGCC-3' (서열번호 17)) 및 대조군 실험을 위한 β-actin과 매칭되는 프라이머(정방향 프라이머 5'-AGAGGGAAATCGTGCGTGAC-3' (서열번호 18) 및 역방향 프라이머 5'-CAATAGTGATGACCTGGCCGT-3' (서열번호 19)를 이용하여 세포 내의 RFP 유전자의 mRNA의 양을 정량하기 위한 RT-PCR을 수행하였으며 (변성 단계 95℃/30초, 어닐링 단계 51℃/30초, 신장 단계 72℃/30초, 20 사이클), 전기영동 후 각각의 밴드에 대한 정량은 DNR's GelQuant (image analysis) 프로그램을 이용하였다
그 결과 도 13에 나타낸 바와 같이, 대조군과 비교시, 리포펙타민과 함께 처리한 siRNA는 약 85%, 재조합 파티클과 함께 처리한 siRNA는 약 90%의 감소를 보여주었다.
<110> KOREA INSTITUTE OF SCIENCE AND TECHNOLOGY
<120> Recombinant protein for siRNA delivery and composition comprising
the same
<130> DPP20111911KR
<160> 19
<170> KopatentIn 1.71
<210> 1
<211> 185
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HBV capsid protein (GenBank CAA26537.1)
<400> 1
Met Asp Ile Asp Pro Tyr Lys Glu Phe Gly Ala Thr Val Glu Leu Leu
1 5 10 15
Ser Phe Leu Pro Ser Asp Phe Phe Pro Ser Val Arg Asp Leu Leu Asp
20 25 30
Thr Ala Ser Ala Leu Tyr Arg Glu Ala Leu Glu Ser Pro Glu His Cys
35 40 45
Ser Pro His His Thr Ala Leu Arg Gln Ala Ile Leu Cys Trp Gly Glu
50 55 60
Leu Met Thr Leu Ala Thr Trp Val Gly Asn Asn Leu Glu Asp Pro Ala
65 70 75 80
Ser Arg Asp Leu Val Val Asn Tyr Val Asn Thr Asn Val Gly Leu Lys
85 90 95
Ile Arg Gln Leu Leu Trp Phe His Ile Ser Cys Leu Thr Phe Gly Arg
100 105 110
Glu Thr Val Leu Glu Tyr Leu Val Ser Phe Gly Val Trp Ile Arg Thr
115 120 125
Pro Pro Ala Tyr Arg Pro Pro Asn Ala Pro Ile Leu Ser Thr Leu Pro
130 135 140
Glu Thr Thr Val Val Arg Arg Arg Asp Arg Gly Arg Ser Pro Arg Arg
145 150 155 160
Arg Thr Pro Ser Pro Arg Arg Arg Arg Ser Pro Ser Pro Arg Arg Arg
165 170 175
Arg Ser Gln Ser Arg Glu Ser Gln Cys
180 185
<210> 2
<211> 172
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> p19 protein of Carnation Italian ringspot virus (GenBank
CAA59481.1)
<400> 2
Met Glu Arg Ala Ile Gln Gly Asn Asp Thr Arg Glu Gln Ala Asn Gly
1 5 10 15
Glu Arg Trp Asp Gly Gly Ser Gly Gly Ile Thr Ser Pro Phe Lys Leu
20 25 30
Pro Asp Glu Ser Pro Ser Trp Thr Glu Trp Arg Leu Tyr Asn Asp Glu
35 40 45
Thr Asn Ser Asn Gln Asp Asn Pro Leu Gly Phe Lys Glu Ser Trp Gly
50 55 60
Phe Gly Lys Val Val Phe Lys Arg Tyr Leu Arg Tyr Asp Arg Thr Glu
65 70 75 80
Ala Ser Leu His Arg Val Leu Gly Ser Trp Thr Gly Asp Ser Val Asn
85 90 95
Tyr Ala Ala Ser Arg Phe Leu Gly Ala Asn Gln Val Gly Cys Thr Tyr
100 105 110
Ser Ile Arg Phe Arg Gly Val Ser Val Thr Ile Ser Gly Gly Ser Arg
115 120 125
Thr Leu Gln His Leu Cys Glu Met Ala Ile Arg Ser Lys Gln Glu Leu
130 135 140
Leu Gln Leu Thr Pro Val Glu Val Glu Ser Asn Val Ser Arg Gly Cys
145 150 155 160
Pro Glu Gly Ile Glu Thr Phe Lys Lys Glu Ser Glu
165 170
<210> 3
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> RGD peptide
<400> 3
Cys Asp Cys Arg Gly Asp Cys Phe Cys
1 5
<210> 4
<211> 31
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Linker peptide
<400> 4
Gly Ser Ser Gly Gly Ser Gly Ser Ser Gly Gly Ser Gly Gly Gly Asp
1 5 10 15
Glu Ala Asp Gly Ser Arg Gly Ser Gln Lys Ala Gly Val Asp Glu
20 25 30
<210> 5
<211> 357
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Figure 1
<400> 5
Met Asp Ile Asp Pro Tyr Lys Glu Phe Gly Ala Thr Val Glu Leu Leu
1 5 10 15
Ser Phe Leu Pro Ser Asp Phe Phe Pro Ser Val Arg Asp Leu Leu Asp
20 25 30
Thr Ala Ser Ala Leu Tyr Arg Glu Ala Leu Glu Ser Pro Glu His Cys
35 40 45
Ser Pro His His Thr Ala Leu Arg Gln Ala Ile Leu Cys Trp Gly Glu
50 55 60
Leu Met Thr Leu Ala Thr Trp Val Gly Asn Asn Leu Glu Asp Pro Cys
65 70 75 80
Asp Cys Arg Gly Asp Cys Phe Cys Arg Asp Leu Val Val Asn Tyr Val
85 90 95
Asn Thr Asn Met Gly Leu Lys Ile Arg Gln Leu Leu Trp Phe His Ile
100 105 110
Ser Cys Leu Thr Phe Gly Arg Glu Thr Val Leu Glu Tyr Leu Val Ser
115 120 125
Phe Gly Val Trp Ile Arg Thr Pro Pro Ala Tyr Arg Pro Pro Asn Ala
130 135 140
Pro Ile Leu Ser Thr Leu Pro Glu Thr Thr Val Val Gly Ser Ser Gly
145 150 155 160
Gly Ser Gly Ser Ser Gly Gly Ser Gly Gly Gly Asp Glu Ala Asp Gly
165 170 175
Ser Arg Gly Ser Gln Lys Ala Gly Val Asp Glu Arg Ala Ile Gln Gly
180 185 190
Asn Asp Thr Arg Glu Gln Ala Asn Gly Glu Arg Trp Asp Gly Gly Ser
195 200 205
Gly Gly Ile Thr Ser Pro Phe Lys Leu Pro Asp Glu Ser Pro Ser Trp
210 215 220
Thr Glu Trp Arg Leu Tyr Asn Asp Glu Thr Asn Ser Asn Gln Asp Asn
225 230 235 240
Pro Leu Gly Phe Lys Glu Ser Trp Gly Phe Gly Lys Val Val Phe Lys
245 250 255
Arg Tyr Leu Arg Tyr Asp Arg Thr Glu Ala Ser Leu His Arg Val Leu
260 265 270
Gly Ser Trp Thr Gly Asp Ser Val Asn Tyr Ala Ala Ser Arg Phe Leu
275 280 285
Gly Ala Asn Gln Val Gly Cys Thr Tyr Ser Ile Arg Phe Arg Gly Val
290 295 300
Ser Val Thr Ile Ser Gly Gly Ser Arg Thr Leu Gln His Leu Cys Glu
305 310 315 320
Met Ala Ile Arg Ser Lys Gln Glu Leu Leu Gln Leu Thr Pro Val Glu
325 330 335
Val Glu Ser Asn Val Ser Arg Gly Cys Pro Glu Gly Ile Glu Thr Phe
340 345 350
Lys Lys Glu Ser Glu
355
<210> 6
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Forward primer for HBV capsid protein
<400> 6
atggacattg acccgtataa a 21
<210> 7
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Reverse primer for HBV capsid protein
<400> 7
aacaacagta gtttccgg 18
<210> 8
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Forward primer for p19 protein
<400> 8
cgagctatac aaggaaacga c 21
<210> 9
<211> 29
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Reverse primer for p19 protein
<400> 9
ctgagctcct cgctttcttt cttgaaggt 29
<210> 10
<211> 105
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Forward primer for linker peptide
<400> 10
actactgttg ttggttcaag cggcggttcc ggttcaagtg gcggatccgg aggcggtgat 60
gaagctgacg gctcccgtgg ttcacaaaaa gctggtgtcg acgaa 105
<210> 11
<211> 105
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Reverse primer for linker peptide
<400> 11
ttcgtcgaca ccagcttttt gtgaaccacg ggagccgtca gcttcatcac cgcctccgga 60
tccgccactt gaaccggaac cgccgcttga accaacaaca gtagt 105
<210> 12
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Forward primer for RGD peptide
<400> 12
gaagatccat gtgactgccg cggtgattgt ttctgtaggg atcta 45
<210> 13
<211> 45
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Reverse primer for RGD peptide
<400> 13
tagatcccta cagaaacaat caccgcggca gtcacatgga tcttc 45
<210> 14
<211> 19
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> sense strand of siRNA
<400> 14
uguagaugga cuugaacuc 19
<210> 15
<211> 19
<212> RNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> antisense strand of siRNA
<400> 15
ugaaguugca cuugaaguc 19
<210> 16
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Forward primer for RFP
<400> 16
ggctgcttca tctacaaggt 20
<210> 17
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Reverse primer for RFP
<400> 17
gcgtccacgt agtagtagcc 20
<210> 18
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Forward primer for beta-actin
<400> 18
agagggaaat cgtgcgtgac 20
<210> 19
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Reverse primer for beta-actin
<400> 19
caatagtgat gacctggccg t 21
Claims (17)
- HBV(Hepatitis B virus)의 캡시드 단백질 및 siRNA 결합 단백질을 포함하며,
상기 siRNA 결합 단백질은 CIRV(Carnation Italian ringspot virus) 의 p19 단백질이고,
구형의 HBV 캡시드 단백질의 내부에 siRNA 결합 단백질이 위치함을 특징으로 하는 siRNA 전달용 재조합 단백질.
- 제1항에 있어서, 상기 HBV 캡시드 단백질은 서열번호 1의 아미노산 서열로 구성된 서브유닛 단백질을 포함하는 것인 재조합 단백질.
- 제1항에 있어서, 상기 HBV 캡시드 단백질은 서열번호 1의 아미노산 서열 중 1 내지 149번째 아미노산 서열로 구성된 서브유닛 단백질을 포함하는 것인 재조합 단백질.
- 제1항에 있어서, 재조합 단백질의 표면에 RGD(Arg-Gly-Asp) 펩타이드가 도입된 것인 재조합 단백질.
- 삭제
- 제4항에 있어서, 상기 HBV 캡시드 단백질은 서열번호 1의 아미노산 서열 중 1 내지 149번째 아미노산 서열로 구성되며 80번째 및 81번째 아미노산 자리에 RGD 펩타이드가 삽입되어 있는 서브유닛 단백질을 포함하는 것인 재조합 단백질.
- 삭제
- 제1항에 있어서, 상기 siRNA 결합 단백질은 서열번호 2의 아미노산 서열로 구성된 것인 재조합 단백질.
- 제1항에 있어서, 상기 HBV 캡시드 단백질과 siRNA 결합 단백질 사이에 링커 펩타이드를 추가로 포함하는 재조합 단백질.
- 삭제
- 제1항에 있어서, 하기 구조를 포함하는 siRNA 전달용 재조합 단백질:
A-B-C
상기에서, A 는 아미노산 서열 중에 RGD(Arg-Gly-Asp) 펩타이드가 삽입되어 있는 HBV 캡시드의 서브유닛 단백질이며;
B 는 링커 펩타이드이며; 및
C 는 HBV 캡시드 단백질의 내부에 위치하게 되는 p19 단백질이다.
- 제1항에 있어서, 하기 구조를 포함하는 siRNA 전달용 재조합 단백질:
A-B-C
상기에서, A 는 서열번호 1 의 아미노산 서열 중 1 내지 149번째 아미노산 서열로 구성되며 80번째 및 81번째 아미노산 자리에 RGD 펩타이드가 삽입되어 있는, HBV 캡시드의 서브유닛 단백질이며;
B 는 서열번호 4의 아미노산 서열로 구성된 링커 펩타이드이며; 및
C 는 서열번호 2 의 아미노산 서열 중 3 내지 172번째 아미노산 서열로 구성되며, HBV 캡시드 단백질의 내부에 위치하게 되는 p19 단백질이다.
- 제1항에 있어서, 서열번호 5 의 아미노산 서열로 구성된 재조합 단백질.
- 제1항의 재조합 단백질 및 siRNA 를 포함하며, 상기 siRNA 가 siRNA 결합 단백질에 결합하여 HBV 캡시드 단백질의 내부에 위치함을 특징으로 하는 siRNA 전달용 조성물.
- 제14항에 있어서, 상기 siRNA 는 20 내지 30 개의 뉴클레오타이드로 이루어진 것인 조성물.
- 제14항에 있어서, 상기 siRNA 는 서열번호 14의 센스 서열 및 서열번호 15의 안티센스 서열로 구성된 것인 조성물.
- 삭제
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