JP6026581B2 - ラマン分光法を使用した微生物の分離、キャラクタリゼーションおよび/または同定方法 - Google Patents
ラマン分光法を使用した微生物の分離、キャラクタリゼーションおよび/または同定方法 Download PDFInfo
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Description
本願は、2008年10月31日に出願した米国仮特許出願第61/110,187号「Method and System for Detection and/or Characterization of a Biological Particle in a Sample」の恩典を主張する。この米国仮特許出願の開示内容を本明細書に援用する。
(a)微生物を含むことが既知であるまたは微生物を含む可能性がある試験試料を採取するステップと、
(b)前記試験試料中に非微生物細胞を選択的に溶解させて溶解試料を生産するステップと、
(c)前記溶解試料の他の構成成分から微生物を分離して単離微生物試料を形成するステップと、
(d)単離した前記微生物を1つ又は複数のラマン分光技術を用いて解析して前記微生物の分光測定値を生成するステップと、
(e)前記分光測定値と既知の微生物に関して得られる分光測定値もしくは予測分光特性とを比較することにより前記単離試料中の前記微生物のキャラクタリゼーションおよび/または同定を行うステップとを含む方法に関するものである。
(a)微生物を含むことが既知であるまたは微生物を含む可能性がある血液培養物から試料を採取するステップと、
(b)前記試料中に非微生物細胞を選択的に溶解させて溶解試料を生産するステップと、
(c)前記溶解試料を封止容器内の密度クッション上に積層するステップと、
(d)前記容器を遠心分離にかけて前記試料の他の構成成分から微生物を分離し微生物ペレットを形成するステップと、
(e)1つ又は複数のラマン分光技術を用いて単離した前記微生物をインサイチュで分光解析して前記微生物の分光測定値を生成するステップと、
(f)前記分光測定値と既知の微生物に関して得られる分光測定値もしくは予測分光特性とを比較することにより前記単離試料中の前記微生物のキャラクタリゼーションおよび/または同定を行うステップとを含む方法に関するものである。
(a)微生物を含むことが既知であるまたは微生物を含む可能性がある試験試料を採取するステップと、
(b)前記試験試料を封止容器内に配置するステップと、
(c)前記試験試料の他の構成成分から微生物をインサイチュで分離して前記封止容器内の微生物の単離微生物試料を形成するステップと、
(d)1つ又は複数のラマン分光技術を用いて単離した前記微生物をインサイチュで分光解析して前記微生物の分光測定値を生成するステップと、
(e)前記分光測定値と既知の微生物に関して得られる分光測定値もしくは予測分光特性とを比較することにより前記単離試料中の前記微生物のキャラクタリゼーションおよび/または同定を行うステップとを含む方法に関するものである。
他の実施形態において、前記分光解析は、本発明の方法の間に加えられ且つ特定の微生物または微生物群と相互作用する付加的な作用物質から得られる信号に部分的に基づく。
本明細書で使用する「a」、「an」または「the」は1つまたは2つ以上のものを意味する可能性がある。例えば「細胞(a cell)」という場合は単一の細胞を意味することも複数の細胞を意味することもある。
(a)微生物を含むことが既知であるまたは微生物を含む可能性がある試験試料を採取するステップと、
(b)前記試験試料中に非微生物細胞を選択的に溶解させて溶解試料を生産するステップと、
(c)前記溶解試料の他の構成成分から微生物を分離して単離微生物試料を形成するステップと、
(d)単離した前記微生物を1つ又は複数のラマン分光技術を用いて解析して前記微生物の分光測定値を生成するステップと、
(e)前記分光測定値と既知の微生物に関して得られる分光測定値もしくは予測分光特性とを比較することにより前記単離試料中の前記微生物のキャラクタリゼーションおよび/または同定を行うステップとを含む方法に関するものである。
(a)微生物を含むことが既知であるまたは微生物を含む可能性がある試験試料を採取するステップと、
(b)前記試験試料を封止容器内に配置するステップと、
(c)前記試験試料の他の構成成分から微生物をインサイチュで分離して前記封止容器内の微生物の単離微生物試料を形成するステップと、
(d)単離した前記微生物を1つ又は複数のラマン分光技術を用いてインサイチュで分光測定して前記微生物の分光測定値を生成するステップと、
(e)前記分光測定値と既知の微生物に関して得られる分光測定値もしくは予測分光特性とを比較することにより前記単離試料中の前記微生物のキャラクタリゼーションおよび/または同定を行うステップとを含む方法に関するものである。
本発明の方法によって試験可能な試料(すなわち試験試料)は、微生物の存在および/または増殖が疑われるまたは疑われる可能性がある臨床試料と非臨床試料の両方を含み、また微生物の有無を定期的にまたは臨時に検査する材料の試料も含む。利用する試料の量は方法の汎用性および/または感度に応じて大きく変化する可能性がある。試料調製は当業者に既知の任意の数の技法を利用して実行することができるが、本発明の1つの効果は、複雑な試料タイプ、例えば血液、体液および/または他の不透明物質等を、多くの前処理を殆どまたはまったく伴わないシステムを利用して直接試験することができる点にある。一実施形態では、培養物から試料を採取する。別の実施形態では、微生物学的培養物(例えば血液培養物)から試料を採取する。別の実施形態では、試料が微生物を含むことが疑われるまたは微生物を含むことが既知である。
いくつかの実施形態では、試料を採取した後に実行する本発明の方法の次のステップは、試料、例えば血球および/または組織細胞中に存在し得る望ましくない細胞を選択的に溶解させるステップである。細胞を溶解させることにより試料の他の構成成分からの微生物の分離を可能にすることができる。他の構成成分からの微生物の分離により解析ステップ中の干渉を防止する。非微生物細胞が試料中に存在することが予想されない場合、または非微生物細胞が解析ステップに干渉することが予想されない場合は、溶解ステップの実行が必要なくなる可能性がある。一実施形態において、溶解すべき細胞は試料中に存在する非微生物細胞であり、試料中に存在し得る微生物細胞は溶解させない。しかしながら、実施形態によっては特定のクラスの微生物を選択的に溶解させることが望ましい可能性がある。それ故、このような選択的な溶解を本明細書に記載する方法および当業界で周知の方法に従って実行することができる。例えば、あるクラスの望ましくない微生物を選択的に溶解させることができ、例えばイーストは溶解させるがバクテリアは溶解させないこと、またはその逆が可能である。他の実施形態では、微生物の特定の細胞下構成成分、例えば細胞膜または細胞小器官を分離するために所望の微生物を溶解させる。一実施形態では、非微生物細胞をすべて溶解させる。他の実施形態では、非微生物細胞の一部分、例えば解析ステップに対する干渉を防止するのに十分な細胞を溶解させる。細胞の溶解は、微生物を溶解させるか否かに関わらず、当業界で細胞を選択的に溶解させるのに効果的であることが知られる任意の方法によって実行することができる。このような方法としては溶解溶液の添加、超音波処理、浸透圧衝撃処理、化学処理および/またはそれらの組合せが挙げられるが、これらに限定されるものではない。
本発明の方法の次のステップ(例えば溶解ステップを実行する場合は試料を溶解させた後のステップ)は分離ステップである。分離ステップを実行することにより、試料の他の構成成分(例えば非微生物またはそれらの構成成分)から微生物を分離し、同定およびキャラクタリゼーションのために解析可能なペレットに微生物を濃縮することができる。分離は必ずしも完全なものである必要はない。すなわち、必ずしも100%の分離を行う必要はない。ここで必要なことは、他の構成成分による実質的な干渉がない微生物の解析が可能となる程度まで、試料の他の構成成分から微生物を分離することである。例えば、分離によって少なくとも約10、20、30、40、50、60、70、80、90、95、96、97、98もしくは99%またはそれ以上の純度の微生物ペレットを得ることができる。
Penreco社(ペンシルバニア州)のDrakeol(登録商標)5、Draketex 50、Peneteck(登録商標))、シリコーン油(ポリジメチルシロキサン)、フルオロシリコーン油、シリコーンゲル、例えば血液培養試料の場合は約75〜約100%の濃度のメトリゾエート‐Ficoll(登録商標)(LymphoPrep(商標))、例えば血液培養試料の場合は約25〜約50%の濃度のジアトリゾエート‐デキストラン(PolymorphoPrep(商標))、カルボキシメチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ポリエチレンオキシド(高分子量)、Pluronic(登録商標)F127、Pluronic(登録商標)F68、Pluronic(登録商標)化合物の混合物、ポリアクリル酸、架橋したポリビニルアルコール、架橋したポリビニルピロリジン、PEGメチルエーテルメタクリレート、ペクチン、アガロース、キサンタン、ジェラン、Phytagel(登録商標)、ソルビトール、Ficoll(登録商標)(例えば血液培養試料の場合は約10〜約15%の濃度のFicoll(登録商標)400)、グリセロール、デキストラン(例えば血液培養試料の場合は約10〜約15%の濃度)、グリコーゲン、塩化セシウム(例えば血液培養試料の場合は約15〜約25%の濃度)、パーフルオロカーボン液(例えばパーフルオロ‐n‐オクタン)、ハイドロフルオロカーボン液(例えばVertrel XF)等が挙げられる。一実施形態において、密度クッションはコロイドシリカ、イオジキサノール、イオヘキソール、塩化セシウム、メトリゾエート‐Ficoll(登録商標)、ジアトリゾエート‐デキストラン、スクロース、Ficoll(登録商標)400および/またはデキストランの任意の組合せのうちの1つまたは複数から選択される。密度クッションは材料の組合せ、例えばコロイドシリカと油の組合せで構成することもできる。上記の化合物のいくつかの組合せ、例えば塩化セシウムやイオヘキソールのようなUV消光特性が異なる化合物の組合せは、本発明の分離および読み取りステップに有用である可能性がある。
微生物を分離、単離および/またはペレット化した後は、分離試料、単離試料またはペレットを解析して試料またはペレット中の微生物の同定および/またはキャラクタリゼーションを行うことができる。一実施形態では、解析を非侵襲的に実行する。すなわち、ペレットを分離容器に入れたまま解析を行う。別の実施形態において、解析中は分離容器を終始封止した状態に保つ。微生物を非侵襲的に同定する能力は、任意選択で、分離および同定/キャラクタリゼーションプロセスの全体にわたって容器の封止状態を保ち、手順の一部または全部を自動化する能力と相まって、汚染された且つ/または感染性の試料を絶えず取り扱う状況を回避し、プロセス全体の安全性を高めることになる。更に、ペレットの更なる処理(例えば再懸濁、平板培養およびコロニーの培養)を伴わない直接解析による微生物の同定能力は、同定の可能な実行速度を大幅に向上させる。一実施形態では、ペレットを解析に先立って回収および/または再懸濁し、任意選択で分離容器から取り出す。別の実施形態では、ペレットをインサイチュ解析後に回収および/または再懸濁し、その後更なる解析を実行する。例えば、微生物ペレット以外の単離微生物に適用可能なラテックス凝集試験または自動化した表現型同定試験のような技法を回収および/または再懸濁した微生物に対して実行することができる。
全体のサイズに基づいて3種類の広範な分類カテゴリのうちの1つに含めることができる
。前記群は下記のうちの1つまたは複数から選択される。(a)グラム染色で紺青色に染
色するグラム陽性微生物、(b)グラム染色で赤に染色するグラム陰性微生物および(c
)グラム染色で紺青色に染色するイースト細胞(ただし、形態学的特徴およびサイズによ
ってバクテリアと区別される非常に大きい円形の細胞)。
カテゴリに更に分割することができる。これらのサブカテゴリは熟練した研究室技術者か
ら報告された臨床的に意義のある情報をすべて含むため、陽性または陰性グラム反応より
も高いレベルの同定を実現する。この特定の分類は下記の理由で非常に有用である。すな
わち、グラム染色の品質および/またはスミアを読み取る技術者の技術レベルに左右され
る懸念が、臨床的に意義のある等価な情報に自動化システムを導入することによって解消
されるからである。より詳細には、この分類モデルに基づく微生物のサブカテゴリは下記
のうちの1つまたは複数から選択することができる:(a)球菌(小さい円形細胞)、(
b)双球菌(互いに結合した2つの小さい円形細胞)、(c)矩形の桿菌(rods)お
よび(d)桿状の桿状菌(bacilli)。付加的な形態学的情報によって確認可能なサブカ
テゴリの例としては下記が挙げられる:(i)グラム陽性球菌、(ii)鎖状のグラム陽
性球菌、(iii)房状(すなわち「ブドウのような」房状)のグラム陽性球菌、(iv
)グラム陽性双球菌、(v)グラム陽性桿菌、(vi)内生胞子を含むグラム陽性桿菌、
(vii)グラム陰性桿菌、(viii)グラム陰性球桿菌、(ix)グラム陰性双球菌
、(x)イーストおよび(xi)糸状の菌類。
(a)試験試料を採取するステップと、
(b)任意選択で前記試料中に細胞を溶解させて溶解試料を生産するステップと、
(c)前記溶解試料の他の構成成分から微生物を分離して微生物ペレットを形成するステップとを含む。
ペレットの存在は微生物が前記試験試料中に存在することを示す。一実施形態では、ペレットを肉眼で検出する。他の実施態様では、ペレットを解析により、例えば分光器を利用して検出する。
どうかを判定することができる。他の実施形態では、血液培養物から試料を定期的に、例えば12、6、4もしくは2時間毎、または60、50、40、30、20、15、10もしくは5分毎に採取して陽性検出可能な陽性血液培養物を短い時間で同定することができる。検出方法のいくつかの実施形態では、本明細書に記載するように、任意選択で検出ステップ後に同定方法を実行することができる。他の実施形態、特に試料の反復的なモニタリングを含む実施形態では、検出方法を部分的にまたは完全に自動化する。
ラマン分光分析による血液培養からの微生物同定のための溶解‐遠心分離法
ラマン分光法による、溶解‐遠心分離法を用いて陽性血液培養から処理した微生物片の分析
ラマン分光法による、溶解-遠心分離法で陽性血液培養から処理された微生物標本の非侵襲分析
1. 陽性ブロスの2.0mLの試料を1.0mLの選択性溶解緩衝液と混合し(0.45w/v%のBrij(登録商標)97+0.3M CAPS、pH11.7)、次いで37℃の水浴に1分間入れた。
2. 溶解物の1.0mLの試料を、特注の光学分離チューブに収容した0.5mLの密度クッション上にオーバーレイした(10mMのHEPES(pH7.4)中24w/v%の塩化セシウム+0.005%のPluronic F‐108)。密度クッションの表面上にポリプロピレンボールを配置することにより、これら2つの水相に外乱をもたらすことなく容易な充填を可能にした。
3. 光学分離チューブをねじ蓋で封止し、10,000rpmで2分間遠心分離にかけた(A‐8‐11スウィングアウトローター(Eppendorf社(ニューヨーク州))を装着したEppendorf(登録商標)5417Rマイクロ遠心分離機;図4参照)。
4. 次いで、封止したチューブを特注のアダプタに移した。このアダプタは、RxN1型ラマン顕微鏡(Kaiser Optical Systems Inc., Michigan)による波長785nmでの、チューブ基部の微生物ペレットの解析を容易にする。プラスチックの基線ラマンスペクトルを得るために、空の分離チューブについてもスペクトルを記録した。
Claims (8)
- 試験試料に由来する微生物の同定方法であり、
(a)前記試験試料中の非微生物細胞を、pHが8〜13の溶解溶液で選択的に溶解および可溶化させて溶解試料を生産するステップと、
(b)前記溶解試料を封止容器内の密度クッション上に積層するステップと、
(c)前記容器を遠心分離にかけて前記溶解試料の他の構成成分から前記微生物を分離及び単離して前記微生物が前記密度クッションを通過して前記容器の底部に微生物ペレットを形成するステップと、
(d)ラマンスペクトルを生成するために前記微生物ペレットを1つ又は複数のラマン分光技術を用いて、前記微生物ペレットが前記容器内に存在する間に、1つ又は複数のラマン分光技術を用いた解析を行う、解析ステップと、
(e)前記容器が空のときの前記容器のラマンスペクトルを、前記解析ステップの間に生成されるラマンスペクトルから差し引いて、前記微生物ペレットの分光測定値を決定するステップと、
(f)前記微生物ペレットの前記分光測定値を、既知の微生物に関して得られる分光測定値もしくは予測分光特性と比較することにより、前記微生物ペレットにおける前記微生物を、前記微生物の、属レベル、種レベル、および/または株レベルまで同定するステップ、
とを含むことを特徴とする方法。 - 請求項1に記載の方法であり、前記ステップ(b)、(c)および(d)は封止容器内で実行され、前記解析ステップ(d)は非侵襲的であることを特徴とする、方法。
- 請求項1に記載の方法であり、前記ラマン分光技術は、ラマン分光法、共焦点ラマン分光法、表面増強ラマン分光法、空間オフセットラマン分光法、共鳴ラマン分光法、透過ラマン分光法、およびこれらの組み合わせを含む群から選択されることを特徴とする、方法。
- 請求項1に記載の方法であり、前記同定が、1つまたは複数の表現型特徴および/または形態学的特徴に基づく前記微生物のキャラクタリゼーションを更に含む、又は、
前記微生物のキャラクタリゼーションが、検出時間、培養率ならびに微生物ペレットサイズ、形状、色および/または密度のうちの1つまたは複数の測定値に基づいて行われる、ことを特徴とする、方法。 - 請求項1に記載の方法であり、前記同定が、前記微生物のキャラクタリゼーションを更に含み、該キャラクタリゼーションは、グラム群、臨床グラム群、治療群、および機能群を含む群から選択される1つまたは複数の分類モデルにキャラクタリゼーションされることを特徴とする、方法。
- 請求項1に記載の方法であり、前記溶解溶液が、1つまたは複数の洗浄剤を含み、1つまたは複数の酵素を更に含み、前記1つまたは複数の酵素は1つまたは複数のプロテイナーゼと1つまたは複数のヌクレアーゼの混合物を含むことを特徴とする、方法。
- 請求項1に記載の方法であり、前記密度クッションは、コロイドシリカ、ヨウ化造影剤、スクロース、顕微鏡用液浸油、鉱油、シリコーン油、フルオロシリコーン油、シリコーンゲル、ジアトリゾエート‐デキストラン、カルボキシメチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ポリエチレンオキシド(高分子量)、ポリアクリル酸、架橋したポリビニルアルコール、架橋したポリビニルピロリジン、PEGメチルエーテルメタクリレート、ペクチン、アガロース、キサンタン、ジェラン、ソルビトール、グリセロール、デキストラン、グリコーゲン、塩化セシウム、パーフルオロカーボン液、ハイドロフルオロカーボン液、およびこれらの組み合わせを含む群から選択されることを特徴とする、方法。
- 請求項1に記載の方法であり、前記試験試料が、血液培養試料であることを特徴とする、方法。
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---|---|---|---|---|
US3928139A (en) * | 1973-02-12 | 1975-12-23 | Wadley Res Inst & Blood Bank | Detection of microbial pathogens |
FR2274918A1 (fr) * | 1974-03-30 | 1976-01-09 | Sarstedt Kunststoff | Dispositif de filtrage pour la separation de fractions de sang |
NL179870C (nl) * | 1974-08-16 | 1986-12-01 | Sarstedt Kunststoff | Vat voor het afnemen van bloed met een capillair mondstuk. |
US3932222A (en) * | 1974-12-20 | 1976-01-13 | J. K. & Susie L. Wadley Research Institute And Blood Bank | For isolating pathogenic microorganisms |
US4038150A (en) * | 1976-03-24 | 1977-07-26 | J. K. And Susie L. Wadley Research Institute And Blood Bank | Sample mixing and centrifugation apparatus |
US4131512A (en) * | 1976-11-05 | 1978-12-26 | J. K. And Susie L. Wadley Research Institute And Blood Bank | Method for detecting microbial pathogens employing a cushioning agent |
SU703122A1 (ru) * | 1977-10-17 | 1979-12-15 | Всесоюзный научно-исследовательский институт прикладной энзимологии | Сепаратор |
US4212948A (en) * | 1978-10-18 | 1980-07-15 | J. K. And Susie L. Wadley Research Institute And Blood Bank | Apparatus for detecting microbial pathogens employing a cushioning agent |
US4321330A (en) * | 1980-04-04 | 1982-03-23 | Baker Fraser L | Tissue culture device |
US4410630A (en) * | 1981-12-11 | 1983-10-18 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Lysis filtration culture chamber |
US4693972A (en) * | 1984-01-16 | 1987-09-15 | Becton, Dickinson And Company | Composition and method for rapid detection of microorganisms in clinical samples |
CA1253764A (en) * | 1984-11-20 | 1989-05-09 | Walter Sarstedt | Blood storage device |
US4847198A (en) * | 1987-10-07 | 1989-07-11 | The Board Of Governors For Higher Education, State Of Rhode Island And Providence Plantations | Detection and indentification of bacteria by means of ultra-violet excited resonance Raman spectra |
DE3882040T2 (de) * | 1987-12-01 | 1993-09-30 | Biotope Inc | Verfahren und vorrichtungen zur durchführung von untersuchungen. |
EP0410816B1 (en) * | 1989-07-28 | 1998-01-14 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Detection of heparin binding seminal proteins |
US5257984A (en) * | 1991-10-02 | 1993-11-02 | Norfolk Scientific, Inc. | Blood collector |
US5242660A (en) * | 1992-02-28 | 1993-09-07 | Paul Hsei | Sample preparation device |
US5456885A (en) * | 1993-07-12 | 1995-10-10 | Coleman; Charles M. | Fluid collection, separation and dispensing tube |
SE9500682L (sv) * | 1995-02-24 | 1996-04-15 | Stig Staalhandske | Anordning för testning av resistensen hos i urin förekommande bakterier |
FR2732037B1 (fr) * | 1995-03-20 | 1997-05-30 | Dbv | Procede de detection de microorganismes par separation et culture sur un systeme gelifie, systeme gelifie et necessaire de dosage pour mettre en oeuvre ce procede, utilisation en microbiologie |
JPH0989775A (ja) * | 1995-07-19 | 1997-04-04 | Kdk Corp | 分光測定装置及び自動分析装置 |
JPH09127001A (ja) * | 1995-10-31 | 1997-05-16 | Ajinomoto Co Inc | 密封材料の非破壊検査法 |
JPH09121889A (ja) * | 1995-10-31 | 1997-05-13 | Kanagawa Kagaku Gijutsu Akad | 密封保存凍結乾燥微生物の非破壊生存判定法 |
US5736398A (en) * | 1997-01-16 | 1998-04-07 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Gas permeable pouches for growing cultures |
US5924594A (en) * | 1997-09-12 | 1999-07-20 | Becton Dickinson And Company | Collection container assembly |
KR20010034600A (ko) * | 1998-03-10 | 2001-04-25 | 엔. 레이 앤더슨 | 미생물의 검출 및 성상 확인 |
EP1025904B1 (en) * | 1999-02-02 | 2007-05-09 | Nipro Corporation | Tube for sperm washing and concentration and method for sperm washing and concentration |
US20030091477A1 (en) * | 1999-12-22 | 2003-05-15 | Paul Eric A. | Flow-thru chip cartridge, chip holder, system & method thereof |
WO2002021108A2 (en) * | 2000-09-08 | 2002-03-14 | Large Scale Proteomics Corporation | Method for detecting molecules or chemical reactions by determining variation of conductance |
DE60237005D1 (de) * | 2001-02-28 | 2010-08-26 | Bio Merieux Inc | Integrierte filtrations- und detektionsvorrichtung |
FR2829500B1 (fr) * | 2001-09-13 | 2003-12-12 | Hemosystem | Procede de concentration et de detection de germes pathogenes a partir de produits sanguins et/ou de leurs derives et dispositif pour le mettre en oeuvre |
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US7460223B2 (en) * | 2003-09-19 | 2008-12-02 | Applied Biosystems Inc. | Inverted orientation for a microplate |
US7429464B2 (en) * | 2003-12-09 | 2008-09-30 | Biomerieux, Inc. | Methods for detecting bacterial pathogens |
US7662562B2 (en) * | 2004-08-10 | 2010-02-16 | Becton, Dickinson And Company | Method for rapid identification of microorganisms |
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