JP5651585B2 - 体重管理のための遺伝子マーカーとその使用方法 - Google Patents
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Description
本願は、2008年5月16日に出願された米国仮特許出願第61/053,888号の利益を主張し、この米国仮特許出願の全体の内容は、本明細書中に参考として援用される。
本願は、被験体の代謝遺伝子型を決定する方法、ならびに有害な体重管理の問題に対する被験体の代謝プロファイルおよび感受性に基づいて適切な治療/食餌レジメンまたは生活習慣の推奨を選択するための方法に関する。
世界保健機関(WHO)によって1998年に発表された報告によれば、肥満症は、世界中で蔓延の比率に達した:世界の約17億人が、過体重であり、そのうちの3億人が、肥満である。米国では、約1億2700万人の成人が、過体重であり、6900万人が、肥満である。肥満の被験体は、糖尿病、心臓疾患、高血圧および高血中コレステロールをはじめとした1つ以上の重篤な病状を発症するリスクが高い。肥満症の有病率は、過去25年間で2倍超増加し、現在、20歳以上の米国成人の31%に達する。より高い肥満症の割合が、アフリカ系アメリカ人およびラテンアメリカ系アメリカ人において、特に、女性において見られる(30%〜50%)。
本発明は、被験体の代謝遺伝子型を決定するため、および被験体にとって適切な治療/食餌レジメンまたは生活習慣の推奨を選択するための方法およびキットを提供する。いくつかの実施形態によれば、被験体の代謝遺伝子型を決定し、その被験体が応答性である可能性のある一連の栄養カテゴリーおよび運動カテゴリーの1つ以上にその被験体を分類し、そしてその被験体にとって適切な治療/食餌レジメンまたは生活習慣の推奨について被験体に伝える方法が提供される。この様式において、個人仕様の減量プログラムは、被験体の代謝遺伝子型に基づいて選択され得る。そのような個人仕様の減量プログラムは、遺伝情報を考慮に入れない従来の減量プログラムに対して、明らかな利益を有し得る(例えば、体重減少および体重維持に関してよりよい結果をもたらし得る)。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
(項目1)
被験体にとって適切な治療/食餌レジメンまたは生活習慣の推奨を選択するための方法であって、
a)FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;およびADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のいずれか4つに関して該被験体の遺伝子型を決定する工程;および
b)起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに該被験体を分類する工程であって、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、ここで、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択される、工程
を包含する、方法。
(項目2)
FABP2(rs1799883)1.1、PPARG(rs1801282)1.1、ADRB2(rs1042714)1.1およびADRB2(rs1042713)2.2ならびにADRB3(rs4994)1.1という組み合わせ遺伝子型を有する前記被験体が、低脂肪もしくは低炭水化物のカロリー制限食;通常の運動;またはその両方に応答性であると予測される、項目1に記載の方法。
(項目3)
前記低脂肪食が、総カロリーの約35パーセント以下を脂肪から提供する、項目2に記載の方法。
(項目4)
前記低炭水化物食が、総カロリーの約50パーセント未満を炭水化物から提供する、項目2に記載の方法。
(項目5)
前記カロリー制限食が、総カロリーを前記被験体の体重管理レベルの95%未満に制限する、項目2に記載の方法。
(項目6)
ADRB2(rs1042713)2.2およびADRB3(rs4994)1.1と組み合わされる、FABP2(rs1799883)1.1または1.2のうちの1つおよびPPARG(rs1801282)1.1、ならびにさらにADRB2(rs1042714)1.1、1.2または2.2のうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する前記被験体が、低脂肪のカロリー制限食;通常の運動;またはその両方に応答性であると予測される、項目1に記載の方法。
(項目7)
前記低脂肪食が、総カロリーの約35パーセント以下を脂肪から提供する、項目6に記載の方法。
(項目8)
前記カロリー制限食が、総カロリーを前記被験体の体重管理レベルの95%未満に制限する、項目6に記載の方法。
(項目9)
ADRB2(rs1042713)2.2およびADRB3(rs4994)1.1と組み合わされる、PPARG(rs1801282)1.2もしくは2.2のうちの1つおよび/またはADRB2(rs1042714)1.2もしくは2.2のうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する前記被験体が、低炭水化物のカロリー制限食;通常の運動;またはその両方に応答性であると予測される、項目1に記載の方法。
(項目10)
前記低炭水化物食が、総カロリーの約50パーセント未満を炭水化物から提供する、項目9に記載の方法。
(項目11)
前記カロリー制限食が、総カロリーを前記被験体の体重管理レベルの95%未満に制限する、項目9に記載の方法。
(項目12)
ADRB2(rs1042713)2.2およびADRB3(rs4994)1.1と組み合わされる、PPARG(rs1801282)1.2または2.2のうちの1つおよびFABP2(rs1799883)1.1または1.2のうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する前記被験体が、低炭水化物のカロリー制限食;通常の運動;またはその両方に応答性であると予測される、項目1に記載の方法。
(項目13)
前記低炭水化物食が、総カロリーの約50パーセント未満を炭水化物から提供する、項目12に記載の方法。
(項目14)
前記カロリー制限食が、総カロリーを前記被験体の体重管理レベルの95%未満に制限する、項目12に記載の方法。
(項目15)
ADRB2(rs1042713)1.2もしくは1.1のうちの1つまたはADRB3(rs4994)1.2もしくは2.2のうちの1つと組み合わされる、FABP2(rs1799883)1.1およびPPARG(rs1801282)1.1の組み合わせ遺伝子型を有する前記被験体が、低脂肪または低炭水化物のカロリー制限食に応答性であると予測される、項目1に記載の方法。
(項目16)
前記低脂肪食が、総カロリーの約35パーセント以下を脂肪から提供する、項目15に記載の方法。
(項目17)
前記低炭水化物食が、総カロリーの約50パーセント未満を炭水化物から提供する、項目15に記載の方法。
(項目18)
前記カロリー制限食が、総カロリーを前記被験体の体重管理レベルの95%未満に制限する、項目15に記載の方法。
(項目19)
前記被験体が、通常の運動に対してより低い応答性であるとさらに予測される、項目15に記載の方法。
(項目20)
ADRB2(rs1042714)1.1、1.2または2.2のうちの1つ、およびADRB2(rs1042713)1.1もしくは1.2のうちの1つまたはADRB3(rs4994)1.2もしくは2.2のうちの1つと組み合わされる、FABP2(rs1799883)1.1または1.2のうちの1つおよびPPARG(rs1801282)1.1の組み合わせ遺伝子型を有する前記被験体が、低脂肪のカロリー制限食に応答性であると予測される項目1に記載の方法。
(項目21)
前記低脂肪食が、総カロリーの約35パーセント以下を脂肪から提供する、項目20に記載の方法。
(項目22)
前記カロリー制限食が、総カロリーを前記被験体の体重管理レベルの95%未満に制限する、項目20に記載の方法。
(項目23)
前記被験体が、通常の運動に対してより低い応答性であるとさらに予測される、項目20に記載の方法。
(項目24)
ADRB2(rs1042713)1.1もしくは1.2のうちの1つまたはADRB3(rs4994)1.2もしくは2.2のうちの1つと組み合わされる、PPARG(rs1801282)1.2もしくは2.2のうちの1つおよび/またはADRB2(rs1042714)1.2もしくは2.2のうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する前記被験体が、低炭水化物のカロリー制限食に応答性であると予測される、項目1に記載の方法。
(項目25)
前記低炭水化物食が、総カロリーの約50パーセント未満を炭水化物から提供する、項目24に記載の方法。
(項目26)
前記カロリー制限食が、総カロリーを前記被験体の体重管理レベルの95%未満に制限する、項目24に記載の方法。
(項目27)
前記被験体が、通常の運動に対してより低い応答性であるとさらに予測される、項目24に記載の方法。
(項目28)
ADRB2(rs1042713)1.1もしくは1.2のうちの1つまたはADRB3(rs4994)1.2もしくは2.2のうちの1つと組み合わされる、PPARG(rs1801282)1.2もしくは2.2のうちの1つおよびFABP2(rs1799883)1.1もしくは1.2のうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する前記被験体が、低炭水化物のカロリー制限食に応答性であると予測される、項目1に記載の方法。
(項目29)
前記低炭水化物食が、総カロリーの約50パーセント未満を炭水化物から提供する、項目28に記載の方法。
(項目30)
前記カロリー制限食が、総カロリーを前記被験体の体重管理レベルの95%未満に制限する、項目28に記載の方法。
(項目31)
前記被験体が、通常の運動に対してより低い応答性であるとさらに予測される、項目28に記載の方法。
(項目32)
前記治療/食餌レジメンが、栄養と薬効のある食品を投与する工程を包含する、項目1に記載の方法。
(項目33)
被験体の代謝遺伝子型を同定する方法であって、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座および/またはADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座のうちの少なくとも3つに関して該被験体の遺伝子型を同定する工程を包含する、方法。
(項目34)
被験体の代謝遺伝子型を同定する方法であって、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座および/またはADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座のうちの少なくとも4つに関して該被験体の遺伝子型を同定する工程を包含する、方法。
(項目35)
a)FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;およびADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のうちのいずれか4つに関して被験体の遺伝子型を決定するための試薬;および
b)該被験体の代謝遺伝子型を決定するための使用説明書、ならびに起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに該被験体を分類するための手段であって、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択される、使用説明書および手段
を備えた、キット。
(項目36)
FABP2(rs1799883)1.1、PPARG(rs1801282)1.1、ADRB2(rs1042714)1.1およびADRB2(rs1042713)2.2ならびにADRB3(rs4994)1.1の組み合わせ遺伝子型を有する前記被験体が、低脂肪または低炭水化物のカロリー制限食;通常の運動;またはその両方に応答性であると予測される、項目35に記載のキット。
(項目37)
ADRB2(rs1042713)2.2およびADRB3(rs4994)1.1と組み合わされる、FABP2(rs1799883)1.1または1.2のうちの1つおよびPPARG(rs1801282)1.1、ならびにさらにADRB2(rs1042714)1.1、1.2または2.2のうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する前記被験体が、低脂肪のカロリー制限食;通常の運動;またはその両方に応答性であると予測される、項目35に記載のキット。
(項目38)
ADRB2(rs1042713)2.2およびADRB3(rs4994)1.1と組み合わされる、PPARG(rs1801282)1.2もしくは2.2のうちの1つおよび/またはADRB2(rs1042714)1.2もしくは2.2のうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する前記被験体が、低炭水化物のカロリー制限食;通常の運動;またはその両方に応答性であると予測される、項目35に記載のキット。
(項目39)
ADRB2(rs1042713)2.2およびADRB3(rs4994)1.1と組み合わされる、PPARG(rs1801282)1.2または2.2のうちの1つおよびFABP2(rs1799883)1.1または1.2のうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する前記被験体が、低炭水化物のカロリー制限食;通常の運動;またはその両方に応答性であると予測される、項目35に記載のキット。
(項目40)
ADRB2(rs1042713)1.2もしくは1.1のうちの1つまたはADRB3(rs4994)1.2もしくは2.2のうちの1つと組み合わされる、FABP2(rs1799883)1.1およびPPARG(rs1801282)1.1の組み合わせ遺伝子型を有する前記被験体が、低脂肪または低炭水化物のカロリー制限食に応答性であると予測される、項目35に記載のキット。
(項目41)
ADRB2(rs1042714)1.1、1.2または2.2のうちの1つおよびADRB2(rs1042713)1.1もしくは1.2のうちの1つまたはADRB3(rs4994)1.2もしくは2.2のうちの1つと組み合わされる、FABP2(rs1799883)1.1または1.2のうちの1つおよびPPARG(rs1801282)1.1の組み合わせ遺伝子型を有する前記被験体が、低脂肪のカロリー制限食に応答性であると予測される、項目35に記載のキット。
(項目42)
ADRB2(rs1042713)1.1もしくは1.2のうちの1つまたはADRB3(rs4994)1.2もしくは2.2のうちの1つと組み合わされる、PPARG(rs1801282)1.2もしくは2.2のうちの1つおよび/またはADRB2(rs1042714)1.2もしくは2.2のうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する前記被験体が、低炭水化物のカロリー制限食に応答性であると予測される、項目35に記載のキット。
(項目43)
ADRB2(rs1042713)1.1もしくは1.2のうちの1つまたはADRB3(rs4994)1.2もしくは2.2のうちの1つと組み合わされる、PPARG(rs1801282)1.2または2.2のうちの1つおよびFABP2(rs1799883)1.1または1.2のうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する前記被験体が、低炭水化物のカロリー制限食に応答性であると予測される、項目35に記載のキット。
(項目44)
被験体の代謝遺伝子型を決定するための試薬および使用説明書を備えたキットであって、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座および/またはADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座のうちの少なくとも3つに関して該被験体の遺伝子型を同定する工程を含む、キット。
(項目45)
被験体の代謝遺伝子型を決定するための試薬および使用説明書を備えたキットであって、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座、および/またはADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座のうちの少なくとも4つに関して該被験体の遺伝子型を同定する工程を含む、キット。
本発明のキットおよび方法は、ある特定の代謝遺伝子の対立遺伝子のパターンと、特定の食餌および運動レジメンに対する被験体の応答性との間に関連があるという知見に少なくとも部分的に依存する。すなわち、代謝遺伝子の対立遺伝子のパターンと、体重管理に関する臨床成績および表現型との間に関連が存在する。ある特定の遺伝子は、体重に影響を及ぼす様々な経路に影響し、肥満症に対する高いリスク、および遺伝子型による体重管理介入に対する被験体の応答を識別する能力に関連する。本発明の目的のために、そのような遺伝子は、「代謝遺伝子」または「体重管理遺伝子」と称される。これらの遺伝子としては、脂肪酸結合タンパク質2(FABP2);ペルオキシソーム増殖因子活性化レセプター−ガンマ(PPARG);ベータ−2アドレナリン作動性レセプター(ADRB2);およびベータ−3アドレナリン作動性レセプター(ADRB3)が挙げられるが、これらに限定されない。
代謝遺伝子としては、脂肪酸結合タンパク質2(FABP2);ペルオキシソーム増殖因子活性化レセプター−ガンマ(PPARG);ベータ−2アドレナリン作動性レセプター(ADRB2);およびベータ−3アドレナリン作動性レセプター(ADRB3)が挙げられるが、これらに限定されない。これらの遺伝子の1つ以上に関する被験体の遺伝的多型パターンは、被験体の代謝遺伝子型を明らかにする。より好ましくは、被験体の代謝遺伝子型は、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座および/またはADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座のうちの1つ以上(すなわち、2、3、4または5つ)に関して被験体の遺伝的多型パターンを同定することによって決定され得る。
FABP2遺伝子は、脂質の輸送および代謝を調節するタンパク質のファミリーである脂肪酸結合タンパク質の腸管型をコードする。FABP2タンパク質は、小腸上皮細胞において見られ、そこで脂肪吸収を制御する。インビトロにおいて、Thr54型のこのタンパク質は、長鎖脂肪酸に対して2倍高い結合親和性を示し(Baierら、J Clin Invest 95:1281−1287,1995)、腸における強い脂肪吸収と関連すると示された(Levyら、J Biol Chem 276:39679−39684,2001)。したがって、Thr54バリアントは、腸による食餌性脂肪酸の吸収および/またはプロセシングを高め、それより、脂肪酸化を高める。最新の肥満症遺伝子マップによれば、合計5つの研究から、FABP2遺伝子と肥満症との間に関連があるとの証拠が示され;それらのうちの4つが、Ala54Thr多型を含んでいた。54Thrバリアントは、高いBMIおよび体脂肪(Hegeleら、Clin Endocrinol Metab 81:4334−4337,1996)、日本人男性における多い腹部脂肪(Yamadaら、Diabetologia 40:706−710,1997)、および肥満症ならびに女性におけるより高いレプチンレベル(Albalaら、Obes Res 12:340−345,2004)と関連している。
ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体レセプター(PPAR)は、転写因子の核内ホルモンレセプターサブファミリーのメンバーである。PPAR−ガンマ(PPARG)は、脂肪細胞において大量に発現され、脂肪細胞の形成、脂質代謝および2型糖尿病の発症において鍵となる役割を果たす。PPARGノックアウトマウスは、正常な脂肪組織を発生せず、高脂肪食を与えられたとき低い体重増加を示し、インスリン抵抗性を示さなかった(Jonesら、PNAS 102:6207−6212,2005)。12Alaバリアントは、レセプターと標的遺伝子におけるPPAR応答エレメントとの結合親和性の低下、ゆえに、これらの標的遺伝子の発現を調節する能力の低下と関連する(Deebら、Nat Genet 20:284−287,1998)。2006年の肥満症遺伝子マップ(Rankinenら、Obesity 14:529−644)によれば、合計30の研究から、PPARG遺伝子と肥満症との関連の証拠、およびPro12Ala多型に関わる正の知見の大部分が示された。
ベータ−2アドレナリン作動性レセプター(ADRB2)は、脂肪細胞において発現されるレセプターの優勢な形態であり、それは、カテコールアミンに応答してエネルギーのための脂肪細胞からの脂肪の分解において鍵となる役割を果たす。アミノ酸を変化させるこの遺伝子のいくつかの多型が同定されており、Arg16GlyおよびGln27Glu多型が、白人において最も一般的な多型であり、肥満症について最も頻繁に調査されている多型である。この2つの多型は、強い連鎖不平衡にある(Meirhaegheら、Intntl J Obesity 24:382−87,2000)。チャイニーズハムスター線維芽細胞におけるこれらのレセプターの組換え発現のインビトロ研究から、この2つの多型の機能的影響が示された(Greenら、Biochemistry 33:9414−9419,1994)。それぞれの正常な対立遺伝子と比較するとき、16Gly対立遺伝子は、アゴニスト(イソプロテレノール(isoproteranol))処理に応答してADRB2発現の大きなダウンレギュレーションと関連し、27Gluは、ADRB2発現のいくらかの増加と関連した(すなわち、ダウンレギュレーションに対して抵抗性)。興味深いことに、両方の変異対立遺伝子(16Glyおよび27Glu)の組み合わせが、レセプター産生を大きくダウンレギュレーションさせた。最近の肥満症遺伝子マップによれば(Rankinenら、The human obesity gene map:The 2005 update.Obesity 14:529−644)、合計20の研究が、ADRB2遺伝子と肥満症との関連についての証拠を示し、その正の知見のほとんどが、Argl6GlyまたはGln27Glu多型を含んでおり、より強い関連が27Glu対立遺伝子とともに存在するという示唆がいくつかある。いくつかの研究は、これらの多型による肥満症に対するリスクにおける性差を証明した(22.Hellstromら、J Intern Med 245:253−259,1999;Garencら、Obes Res 11:612−618,2003)が、証拠が数でまさることは、このパネルにおける性別特異的遺伝子型の解釈を裏付けない。
アドレナリン作動性ベータ−3レセプター(ADRB3)は、白色脂肪組織における脂肪分解の制御に関与し、肥満症関連代謝合併症と密接に関連する脂肪の貯蔵所である内臓脂肪組織において主に発現される。単離された脂肪細胞におけるインビトロ研究から、突然変異が、64Arg対立遺伝子を保有する細胞における特定のアゴニストに応答して脂肪分解の低下をもたらすことが示された(Umekawaら、Diabetes 48:117−120,1999)。64Argバリアントを含む、ADRB3遺伝子における3つのバリアントから形成されるハプロタイプは、高いBMI(n=208)、および選択的β3−レセプターアゴニストに対する内臓脂肪細胞の感度(誘導される脂肪分解)の10倍低下に関連することが見出された(Hoffstedtら、Diabetes 48:203−205,1999)。これらの3つのバリアントは、連鎖不平衡にあることから、64Argバリアントが、低いレセプター機能と関連すると示唆される。合計29の研究が、ADRB3遺伝子と肥満症との関連についての証拠を示した。9,000人を超える被験体を用いた31の研究に基づく1つのメタアナリシスは、ホモ接合性の64Trp/Trp被験体よりも64Argバリアントの保有者のほうが高いBMI(平均して、0.30kg/m2高い)を示した(Fujisawaら、J Clin Endocrinol Metab 83:2441−2444,1998)。22の研究からの6,500人を超える被験体(主に日本人の被験体)に基づく第2のメタアナリシスもまた、非保有者よりも64Argバリアントの保有者のほうが高いBMI値(平均して0.26kg/m2高い)を示した(Kurokawaら、Obes Res 9:741−745,2001)。
栄養カテゴリーは、通常、被験体の代謝遺伝子型に基づいて被験体に対して推奨される多量養素(すなわち、脂肪、炭水化物、タンパク質)の量に基づいて分類される。被験体にとって適切な治療/食餌レジメンまたは生活習慣の推奨を選択する主要な目標は、被験体の代謝遺伝子型を、その被験体が応答性である可能性が最も高い栄養カテゴリーと対にすることである。栄養カテゴリーは、通常、被験体の食餌に対してまたはカロリー制限(例えば、被験体に与えられる総カロリー数の制限および/または特定の多量養素から被験体に与えられるカロリー数の制限)に関して提案される多量養素の相対量に関して表される。例えば、栄養カテゴリーとしては、1)低脂肪の低炭水化物食;2)低脂肪食または3)低炭水化物食が挙げられ得るが、これらに限定されない。あるいは、栄養カテゴリーは、被験体の代謝遺伝子型に基づいて被験体に対して推奨されるある特定の多量養素の制限に基づいて分類され得る。例えば、栄養カテゴリーは、1)バランス食もしくはカロリー制限食;2)脂肪制限食または3)炭水化物制限食として表され得る。
運動カテゴリーは、通常、代謝遺伝子型が与えられた被験体が運動に対してどのように応答性であるかに基づいて分類される。例えば、被験体は、軽い運動、中程度の運動、強い運動または非常に強い運動に応答性であり得る。
通常、被験体の代謝遺伝子型は、単一の栄養カテゴリーおよび単一の運動カテゴリーに入ることになる。したがって、いくつかの実施形態によれば、被験体は、その代謝遺伝子型に基づいて栄養カテゴリーおよび運動カテゴリーに分類され得る。例えば、被験体は、以下の6つのカテゴリーのうちの1つに分類され得る:1)脂肪制限に応答性かつ運動に応答性;2)脂肪制限に応答性かつ運動に低い応答性;3)炭水化物制限に応答性かつ運動に応答性;4)炭水化物制限に応答性かつ運動に低い応答性;5)脂肪と炭水化物とがバランスをとれていて運動に応答性;および6)脂肪と炭水化物とがバランスをとれていて運動に低い応答性。
いくつかの実施形態によれば、試薬(オリゴヌクレオチド、塩、酵素、緩衝液など)およびキットを使用するための使用説明書を備えた、被験体の代謝遺伝子型を検出するためのキットが提供される。
対立遺伝子パターン、多型パターンまたはハプロタイプパターンは、種々の利用可能な手法のいずれかを用いて構成対立遺伝子のいずれかを検出することによって同定され得、その手法としては、1)核酸サンプルと、その対立遺伝子にハイブリダイズすることができるプローブとの間のハイブリダイゼーション反応を行うこと;2)その対立遺伝子の少なくとも一部を配列決定すること;または3)その対立遺伝子またはそのフラグメント(例えば、エンドヌクレアーゼ消化によって生成されるフラグメント)の電気泳動移動度を測定することが挙げられる。対立遺伝子は、必要に応じて、増幅工程に供された後、検出工程が行われ得る。好ましい増幅方法は、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、リガーゼ連鎖反応(LCR)、鎖置換増幅(SDA)、クローニングおよび上記のものの変法(例えば、RT−PCRおよび対立遺伝子特異的増幅)からなる群から選択される。増幅に必要なオリゴヌクレオチドは、例えば、目的のマーカーに隣接する(PCR増幅に必要とされる)か、またはそのマーカーと直接重複する(対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチド(ASO)ハイブリダイゼーションにおけるとき)、代謝遺伝子座内から、選択され得る。特に好ましい実施形態において、サンプルは、血管疾患関連対立遺伝子に対するセンス配列またはアンチセンス配列における5’および3’にハイブリダイズするプライマーのセットとハイブリダイズされ、そしてPCR増幅に供される。
別段定義されない限り、本明細書中で使用される専門用語および科学用語のすべては、本発明が属する分野の当業者が通常理解している意味と同じ意味を有する。本明細書中に記載されるものと類似または等価な方法および材料が、本発明の実施または試験において使用され得るが、適当な方法および材料が、以下に記載される。本明細書中で述べられるすべての刊行物、特許出願、特許および他の参考文献の全体が、参考として援用される。矛盾する場合、定義を含む本明細書が、支配する。さらに、材料、方法および例は、単なる例証であって、限定と意図されない。本発明の他の特徴および利点は、以下の詳細な説明および請求項から明らかになるだろう。
体重管理試験は、体重管理に関係する代謝における遺伝子と変異との相関を同定する臨床研究;食餌および生活習慣を変更することによって潜在的に改変可能である方法においてどの遺伝的変異が代謝経路に影響するかを特定する受け入れ基準を確立する臨床研究;どの遺伝子型がリスクを高めると示されるかを決定し、食餌および/または生活習慣の介入によって改変可能であり得るリスクを示唆する臨床研究;ならびに、選択される試験形状、試験結果の解釈、食餌/生活習慣の介入、および利益/リスク解析を裏付ける証拠を集める臨床研究の包括的な再検討から開発された。
この試験に対する科学的論拠は、2007年4月から入手可能な科学文献の大規模な再検討に基づく。公開されている証拠を、先を見越して関連づけられた受け入れ基準のセットに対して評価した。この証拠を、遺伝子>多型>複合遺伝子型という階層で組み立てることにより、そのパネルに対する試験結果の解釈を定義し、かつその根拠とした。
1.体重ホメオスタシスに関係する代謝経路の著しい改善を特定することによって候補遺伝子を確定すること。
a)遺伝子型と表現型との同じ関連を示した3つ以上の独立した研究によって証明されるとき、多型は、関連性のある表現型(体重、体脂肪またはボディマス指数)との著しい関連を有する。
試験パネルに含めるために、先を見越して開発された基準を満たすかまたはそれを超える遺伝子/多型を同定した後、5つすべての多型について生じる複合遺伝子型が、特定の解釈を裏付け得る異なるカテゴリーに分配され得るかを判定するために、組み合わせを解析した。食餌性多量養素に対する応答(脂肪制限に対する応答性、炭水化物制限に対する応答性および脂肪と炭水化物とのバランス)の証拠に基づいて結果を3つのカテゴリーに分けた。また、それらを、運動に対する応答(運動に対する応答性および運動に対する低い応答性)の証拠に基づいて2つの別個のカテゴリーに分配した。得られたカテゴリーまたは遺伝子型パターンに関する3×2(6セル)マトリックスを表7に示す。
このカテゴリーは、複合遺伝子型:FABP2 Ala54ThrおよびPPARG Pro12Alaを有する人から構成される。FABP2 Thr54対立遺伝子の保有者でもあるPPARG 12Pro/Pro遺伝子型を有する人も、このカテゴリー内に入る。これらの被験体は、特定の脂肪摂取を制限せずには体重管理が困難であることを示す。FABP2 Thr54バリアントは、長鎖脂肪(1)酸に対する2倍高い結合親和性、ならびに腸による高い脂肪吸収および/または食餌性脂肪酸のプロセシング(2)を有する。Thr54バリアントは、腸による食餌性脂肪酸の吸収および/またはプロセシングを増加させる。PPARGは、脂肪細胞の形成(脂肪の貯蔵)および脂質代謝(脂肪動員)において鍵となる役割を果たす。PPARGは、脂肪細胞の核に位置するレセプターである。PPARGレセプターは、食餌性脂肪によって活性化されるとき、特定のDNA配列に結合し、次いで、脂肪細胞における食餌性脂肪の貯蔵を促進するある特定の遺伝子を「オンにする」。ヒトでは、高いPPARG活性は、高い脂肪蓄積と関連する。Ala12バリアントは、低いPPARG活性と関連する(43,44)。12Pro/Proである人は、12Ala保有者よりも、食餌性脂肪の量に対して応答性である可能性がある。Ala12バリアントの保有者は、介入に応答して脂肪の貯蔵および動員においてより大きな代謝順応性を有する。したがって、12Pro/Proである被験体は、食餌からの脂肪の蓄積においてより有効である。Ala12保有者と比較すると、12Pro/Pro遺伝子型を有する被験体は、DNAへのPPARGの結合が強く、それにより、レセプターのより効率的な活性化がもたらされ、脂肪貯蔵が促進される。
このカテゴリーは、2つの異なる遺伝的組み合わせ:PPARG Pro12AlaおよびADRB2 Gln27Gluのうちの1つを有する人を含む。PPARG 12Ala/*遺伝子型(Ala対立遺伝子保有者)を有し、かつ/またはADRB2 Glu27対立遺伝子を保有する人は、炭水化物の食餌性摂取を制限しない限り、体重管理が困難である。2つの別個の研究(各々がその2つの遺伝子/SNPのうちの1つだけに焦点を当てている)において、研究者らは、50%を超えて炭水化物を摂取していた同じ遺伝子型を有する被験体と比較して、炭水化物摂取が総カロリーの50%未満に制限されたときの、このバリアント対立遺伝子を保有する被験体における体重増加/肥満症に対する低い傾向を見出した(30,38)。このことは、これらの変異の各々が、炭水化物制限下における肥満症に対するリスクに差があることを示すことを示唆している。さらに、それらの研究のうちの1つが、炭水化物摂取が総カロリーの50%未満だったときの、そのバリアント対立遺伝子を保有する被験体におけるインスリン抵抗性のリスクが低いことを証明した(30)。Ala12保有者を用いた介入研究の結果は、低カロリー食(19)および運動トレーニング(45〜47)に応答して、非保有者よりも、大きな体重減少(18)およびインスリン感度のより大きな改善を有することを示唆している。これらの結果は、Ala12バリアントと関連する低いPPARG活性(より少ない脂肪蓄積(脂肪を貯蔵する低い能力)、そしてより高いインスリン感度を引き起こす、PPARG標的遺伝子のより有効でない刺激をもたらす)によって説明され得る。Ala12またはGlu27対立遺伝子のいずれかの保有者であることは、高炭水化物食の際に肥満症のリスクを高めるので、炭水化物制限食をそれらの対立遺伝子の保有者に推奨することが適切であり、これらの遺伝子型は、食餌/運動介入とともにインスリン感度の改善と関連する。
ADRB3遺伝子またはADRB2遺伝子のいずれかにおいて特定の遺伝子型を有する人は、体重を管理するストラテジーとしての運動に対して自身を低い応答性にする傾向がある遺伝的素因を有する。これらの多型の両方が、カテコールアミンに対する応答を媒介することによって脂肪組織からの脂肪の代謝(脂肪分解)において鍵となる役割を果たす。ADRB2 Gly16バリアントは(インビトロ研究においてGlu27バリアントと組み合わされるときでさえも)、より低いアドレナリン作動性レセプター応答性と関連する(21)。これらの2つの多型は、密接な連鎖不平衡にある。したがって、Gly16バリアントについての試験は、同じ素因と関連するGlu27バリアントを保有するほとんどの被験体も同定する。ADRB3 Arg64バリアントは、低いレセプター機能および低い脂肪分解と関連する。運動において、そのバリアントの保有者は、低い脂肪分解、ゆえに、脂肪を燃焼する低い能力を示す可能性があり、それは、運動に応答して小さい体重減少をもたらし得る。複数の介入研究が、Arg64バリアントを有する人が、非保有者よりも、食餌/運動に応答した減量がより困難であることを一貫して示している。ADRB2のGly16バリアントの保有者は、非保有者よりも、運動(23)または食餌と運動の組み合わせ(28)によって減量する可能性が低い。両方のアドレナリン作動性レセプターが、運動中にカテコールアミンに対する応答に影響することと、ADRB2 Gly16とADRB3 Arg64の両方が、低いレセプター機能を有することを考慮すると、これらの多型のいずれかを有する被験体は、より低い運動応答性の複合パターンに含められるべきである。
DNAを、頬側スワブ(SOP#12,バージョン1.3)から抽出するか、またはCoriell Cell Repositoriesから購入した。単離されたDNAを用いることにより、5つのSNP周囲の配列の領域をPCR増幅した(SOP#29,バージョン1.0)。各サンプルから得られた4つのアンプリコンを、エキソヌクレアーゼI(Exo)およびエビアルカリホスファターゼ(SAP)で処理することにより、過剰なプライマーおよびヌクレオチドを除去した(SOP#29,バージョン1.0)。精製されたアンプリコンを、そのSNP標的に特異的なプライマーとともに、一塩基伸長(SBE)反応において使用した(SOP#30,バージョン1.0)。いったんSBEが完了したら、SAPを再び加えることにより、組み込まれていないヌクレオチドを除去した(SOP#30,バージョン1.0)。次いで、SBE産物を、既知の泳動サイズの標準物質とともにBeckman Coulter CEQ8800において解析した(SOP#15,バージョン1.4およびSOP#16,バージョン1.3)。PPARG(rs1801282)を除くすべての遺伝子型を、順方向DNA鎖についてアッセイした。PPARG(rs1801282)は、逆方向DNA鎖に対してアッセイされ、CEQ8800の追跡において相補的な(complement)塩基として表示される。得られた遺伝子型を記録し、次いで、Agencourt Bioscience CorporationにおけるDNA配列決定によって生成された遺伝子型またはNCBIに記録されている公知の遺伝子型と比較した。シングルプレックス(singleplex)形式:標記のPCR産物を、別々に増幅し、対応するSBEプライマーによって主題的に(subjectly)遺伝子型解析した。プールプレックス(poolplex)形式:標記のPCR産物を、別々に増幅し、次いで、共にプールした。プールされたDNAを、SBEプライマーの混合物を用いる単一反応において、5つすべてのSNPについて遺伝子型解析する。マルチプレックス(multiplex)形式:4つすべてのPCR産物を単一反応において生成した。マルチプレックスのPCR産物を、SBEプライマーの混合物を用いる単一反応において5つすべてのSNPについて遺伝子同定した。
市販のサイズ標準物質(Beckman Coulter part#608395)を、遺伝子型解析に対する内部基準としてサンプルとともに泳動した。
正確な遺伝子が、標的化され、正確に遺伝子型解析されることを保証するために、PCR産物を、配列決定および遺伝子型解析のために、独立した研究室(Agencourt Bioscience Corporation)に提出した。Agencourtでは、その配列をSNPに隣接するゲノム配列と比較し、次いで、各サンプルの遺伝子型をInterleukin Geneticsに報告した。次いで、AgencourtおよびInterleukinの結果を、一致するか比較した。
以下のSNPの名称および省略形が、このアッセイの確認において使用される:ADRB2(R16G)、rs1042713=A1;ADRB2(Q27E)、rs1042714=A2;ADRB3(R64W)、rs4994=A3;FABP2(A54T)、rs1799883=FA;PPARG(P12A)、rs1801282=PP。
PCRの結果
単離されたDNAを、別表Bに列挙されているプライマーセットを用いてPCR増幅した。ADRB2(rs1042713)およびADRB2(rs1042714)は、33ヌクレオチド離れており、単一のPCR産物として増幅された。PCR産物をアガロースゲルにおいて泳動することにより、A1/A2=422bp、A3=569bp、FA=311bp、PP=367bpという予想される産物のサイズが確認された。
ピーク移動
CEQ8800キャピラリー電気泳動装置において泳動したときに既知のサイズ標準物質に対して特定の位置にピークをもたらすような独特の長さで各SNP特異的単一塩基伸長プライマーを設計した。ピークの位置は、色素の移動度、プライマー配列および解析ソフトウェアの影響に起因してプライマーサイズと正確にマッチしないことがあるが、常に一貫して移動する。単一塩基伸長プライマーは、予想されるピーク移動とともに別表Cに列挙されている。
一塩基伸長反応は、蛍光標識された塩基をSNP特異的プライマーの3’末端に付加する。この産物は、CEQ8800内の2つのレーザーによって読み出される。その結果は、CEQ8800ソフトウェアによって解析され、色づけされたピークとして表される(各色は、異なる塩基を表す)。特定の遺伝子座における1つの単色ピークの存在は、ホモ接合体を示し、異なる色の2つのピークは、ヘテロ接合体を示す。確認において遺伝子型解析された39個のサンプルは、5つすべてのSNPについて、ほとんどすべてのホモ接合性遺伝子型およびすべてのヘテロ接合性遺伝子型を表した。1つの例外は、PPARG SNPに対するホモ接合性のC遺伝子型である。一般的な集団におけるC対立遺伝子の頻度が、たった0.1であるので(rs#1801282に対するdbSNPデータベースによって示されるとき)、これは、予想外ではなかった。しかしながら、ホモ接合性C遺伝子型は、この確認の範囲外の他のサンプルにおいて生じている。
15個のCoriell DNAサンプルにおいてシングルプレックス形式で遺伝子型解析を行った後、その結果を既知の遺伝子型と比較し、その結果が、100%一致した(表8を参照のこと)。
Claims (39)
- 被験体の遺伝子型を、該被験体にとって適切な治療/食餌レジメンの推奨または生活習慣の推奨の指標とする方法であって、
a)配列番号14の301位に対応する、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;配列番号15の401位に対応する、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;配列番号16の256位に対応する、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;配列番号17の303位に対応する、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;および配列番号18の336位に対応する、ADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のいずれか4つに関して該被験体の遺伝子型が決定され;そして
b)該被験体は、起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに分類され、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、ここで、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択され、
FABP2(rs1799883)G/G、PPARG(rs1801282)C/C、ADRB2(rs1042714)C/CおよびADRB2(rs1042713)A/AならびにADRB3(rs4994)T/Tという組み合わせ遺伝子型を有する該被験体が、低脂肪もしくは低炭水化物のカロリー制限食;通常の運動;またはその両方に応答性であると予測される、方法。 - 前記低脂肪食が、総カロリーの35パーセント以下を脂肪から提供する、請求項1に記載の方法。
- 前記低炭水化物食が、総カロリーの50パーセント未満を炭水化物から提供する、請求項1に記載の方法。
- 前記カロリー制限食が、総カロリーを前記被験体の体重管理レベルの95%未満に制限する、請求項1に記載の方法。
- 被験体の遺伝子型を、該被験体にとって適切な治療/食餌レジメンの推奨または生活習慣の推奨の指標とする方法であって、
a)配列番号14の301位に対応する、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;配列番号15の401位に対応する、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;配列番号16の256位に対応する、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;配列番号17の303位に対応する、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;および配列番号18の336位に対応する、ADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のいずれか4つに関して該被験体の遺伝子型が決定され;そして
b)該被験体は、起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに分類され、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、ここで、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択され、
ADRB2(rs1042713)A/AおよびADRB3(rs4994)T/Tと組み合わされる、FABP2(rs1799883)G/GまたはG/Aのうちの1つおよびPPARG(rs1801282)C/C、ならびにさらにADRB2(rs1042714)C/C、C/GまたはG/Gのうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する該被験体が、低脂肪のカロリー制限食;通常の運動;またはその両方に応答性であると予測される、方法。 - 前記低脂肪食が、総カロリーの35パーセント以下を脂肪から提供する、請求項5に記載の方法。
- 前記カロリー制限食が、総カロリーを前記被験体の体重管理レベルの95%未満に制限する、請求項5に記載の方法。
- 被験体の遺伝子型を、該被験体にとって適切な治療/食餌レジメンの推奨または生活習慣の推奨の指標とする方法であって、
a)配列番号14の301位に対応する、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;配列番号15の401位に対応する、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;配列番号16の256位に対応する、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;配列番号17の303位に対応する、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;および配列番号18の336位に対応する、ADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のいずれか4つに関して該被験体の遺伝子型が決定され;そして
b)該被験体は、起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに分類され、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、ここで、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択され、
ADRB2(rs1042713)A/AおよびADRB3(rs4994)T/Tと組み合わされる、PPARG(rs1801282)C/GもしくはG/Gのうちの1つおよび/またはADRB2(rs1042714)C/GもしくはG/Gのうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する該被験体が、低炭水化物のカロリー制限食;通常の運動;またはその両方に応答性であると予測される、方法。 - 前記低炭水化物食が、総カロリーの50パーセント未満を炭水化物から提供する、請求項8に記載の方法。
- 前記カロリー制限食が、総カロリーを前記被験体の体重管理レベルの95%未満に制限する、請求項8に記載の方法。
- 被験体の遺伝子型を、該被験体にとって適切な治療/食餌レジメンの推奨または生活習慣の推奨の指標とする方法であって、
a)配列番号14の301位に対応する、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;配列番号15の401位に対応する、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;配列番号16の256位に対応する、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;配列番号17の303位に対応する、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;および配列番号18の336位に対応する、ADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のいずれか4つに関して該被験体の遺伝子型が決定され;そして
b)該被験体は、起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに分類され、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、ここで、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択され、
ADRB2(rs1042713)A/AおよびADRB3(rs4994)T/Tと組み合わされる、PPARG(rs1801282)C/GまたはG/Gのうちの1つおよびFABP2(rs1799883)G/GまたはG/Aのうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する該被験体が、低炭水化物のカロリー制限食;通常の運動;またはその両方に応答性であると予測される、方法。 - 前記低炭水化物食が、総カロリーの50パーセント未満を炭水化物から提供する、請求項11に記載の方法。
- 前記カロリー制限食が、総カロリーを前記被験体の体重管理レベルの95%未満に制限する、請求項11に記載の方法。
- 被験体の遺伝子型を、該被験体にとって適切な治療/食餌レジメンの推奨または生活習慣の推奨の指標とする方法であって、
a)配列番号14の301位に対応する、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;配列番号15の401位に対応する、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;配列番号16の256位に対応する、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;配列番号17の303位に対応する、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;および配列番号18の336位に対応する、ADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のいずれか4つに関して該被験体の遺伝子型が決定され;そして
b)該被験体は、起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに分類され、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、ここで、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択され、
ADRB2(rs1042713)G/AもしくはG/Gのうちの1つまたはADRB3(rs4994)T/CもしくはC/Cのうちの1つと組み合わされる、FABP2(rs1799883)G/GおよびPPARG(rs1801282)C/Cの組み合わせ遺伝子型を有する該被験体が、低脂肪または低炭水化物のカロリー制限食に応答性であると予測される、方法。 - 前記低脂肪食が、総カロリーの35パーセント以下を脂肪から提供する、請求項14に記載の方法。
- 前記低炭水化物食が、総カロリーの50パーセント未満を炭水化物から提供する、請求項14に記載の方法。
- 前記カロリー制限食が、総カロリーを前記被験体の体重管理レベルの95%未満に制限する、請求項14に記載の方法。
- 前記被験体が、通常の運動に対してより低い応答性であるとさらに予測される、請求項14に記載の方法。
- 被験体の遺伝子型を、該被験体にとって適切な治療/食餌レジメンの推奨または生活習慣の推奨の指標とする方法であって、
a)配列番号14の301位に対応する、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;配列番号15の401位に対応する、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;配列番号16の256位に対応する、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;配列番号17の303位に対応する、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;および配列番号18の336位に対応する、ADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のいずれか4つに関して該被験体の遺伝子型が決定され;そして
b)該被験体は、起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに分類され、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、ここで、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択され、
ADRB2(rs1042714)C/C、C/GまたはG/Gのうちの1つ、およびADRB2(rs1042713)G/GもしくはG/Aのうちの1つまたはADRB3(rs4994)T/CもしくはC/Cのうちの1つと組み合わされる、FABP2(rs1799883)G/GまたはG/Aのうちの1つおよびPPARG(rs1801282)C/Cの組み合わせ遺伝子型を有する該被験体が、低脂肪のカロリー制限食に応答性であると予測される、方法。 - 前記低脂肪食が、総カロリーの35パーセント以下を脂肪から提供する、請求項19に記載の方法。
- 前記カロリー制限食が、総カロリーを前記被験体の体重管理レベルの95%未満に制限する、請求項19に記載の方法。
- 前記被験体が、通常の運動に対してより低い応答性であるとさらに予測される、請求項19に記載の方法。
- 被験体の遺伝子型を、該被験体にとって適切な治療/食餌レジメンの推奨または生活習慣の推奨の指標とする方法であって、
a)配列番号14の301位に対応する、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;配列番号15の401位に対応する、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;配列番号16の256位に対応する、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;配列番号17の303位に対応する、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;および配列番号18の336位に対応する、ADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のいずれか4つに関して該被験体の遺伝子型が決定され;そして
b)該被験体は、起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに分類され、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、ここで、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択され、
ADRB2(rs1042713)G/GもしくはG/Aのうちの1つまたはADRB3(rs4994)T/CもしくはC/Cのうちの1つと組み合わされる、PPARG(rs1801282)C/GもしくはG/Gのうちの1つおよび/またはADRB2(rs1042714)C/GもしくはG/Gのうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する該被験体が、低炭水化物のカロリー制限食に応答性であると予測される、方法。 - 前記低炭水化物食が、総カロリーの50パーセント未満を炭水化物から提供する、請求項23に記載の方法。
- 前記カロリー制限食が、総カロリーを前記被験体の体重管理レベルの95%未満に制限する、請求項23に記載の方法。
- 前記被験体が、通常の運動に対してより低い応答性であるとさらに予測される、請求項23に記載の方法。
- 被験体の遺伝子型を、該被験体にとって適切な治療/食餌レジメンの推奨または生活習慣の推奨の指標とする方法であって、
a)配列番号14の301位に対応する、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;配列番号15の401位に対応する、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;配列番号16の256位に対応する、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;配列番号17の303位に対応する、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;および配列番号18の336位に対応する、ADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のいずれか4つに関して該被験体の遺伝子型が決定され;そして
b)該被験体は、起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに分類され、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、ここで、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択され、
ADRB2(rs1042713)G/GもしくはG/Aのうちの1つまたはADRB3(rs4994)T/CもしくはC/Cのうちの1つと組み合わされる、PPARG(rs1801282)C/GもしくはG/Gのうちの1つおよびFABP2(rs1799883)G/GもしくはG/Aのうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する該被験体が、低炭水化物のカロリー制限食に応答性であると予測される、方法。 - 前記低炭水化物食が、総カロリーの50パーセント未満を炭水化物から提供する、請求項27に記載の方法。
- 前記カロリー制限食が、総カロリーを前記被験体の体重管理レベルの95%未満に制限する、請求項27に記載の方法。
- 前記被験体が、通常の運動に対してより低い応答性であるとさらに予測される、請求項27に記載の方法。
- 前記治療/食餌レジメンの推奨が、ニュートラシューティカルの摂取についての推奨である、請求項1、5、8、11、14、19、23および27に記載の方法。
- a)配列番号14の301位に対応する、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;配列番号15の401位に対応する、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;配列番号16の256位に対応する、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;配列番号17の303位に対応する、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;および配列番号18の336位に対応する、ADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のうちのいずれか4つに関して被験体の遺伝子型を決定するための試薬;および
b)該被験体の代謝遺伝子型を決定するための使用説明書、ならびに起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに該被験体を分類するための手段であって、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択される、使用説明書および手段
を備え、
FABP2(rs1799883)G/G、PPARG(rs1801282)C/C、ADRB2(rs1042714)C/CおよびADRB2(rs1042713)A/AならびにADRB3(rs4994)T/Tという組み合わせ遺伝子型を有する該被験体が、低脂肪もしくは低炭水化物のカロリー制限食;通常の運動;またはその両方に応答性であると予測され、
該試薬が、表5から選択される1または複数のプライマーを含む、キット。 - a)配列番号14の301位に対応する、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;配列番号15の401位に対応する、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;配列番号16の256位に対応する、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;配列番号17の303位に対応する、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;および配列番号18の336位に対応する、ADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のうちのいずれか4つに関して被験体の遺伝子型を決定するための試薬;および
b)該被験体の代謝遺伝子型を決定するための使用説明書、ならびに起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに該被験体を分類するための手段であって、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択される、使用説明書および手段
を備え、
ADRB2(rs1042713)A/AおよびADRB3(rs4994)T/Tと組み合わされる、FABP2(rs1799883)G/GまたはG/Aのうちの1つおよびPPARG(rs1801282)C/C、ならびにさらにADRB2(rs1042714)C/C、C/GまたはG/Gのうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する該被験体が、低脂肪のカロリー制限食;通常の運動;またはその両方に応答性であると予測され、
該試薬が、表5から選択される1または複数のプライマーを含む、キット。 - a)配列番号14の301位に対応する、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;配列番号15の401位に対応する、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;配列番号16の256位に対応する、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;配列番号17の303位に対応する、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;および配列番号18の336位に対応する、ADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のうちのいずれか4つに関して被験体の遺伝子型を決定するための試薬;および
b)該被験体の代謝遺伝子型を決定するための使用説明書、ならびに起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに該被験体を分類するための手段であって、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択される、使用説明書および手段
を備え、
ADRB2(rs1042713)A/AおよびADRB3(rs4994)T/Tと組み合わされる、PPARG(rs1801282)C/GもしくはG/Gのうちの1つおよび/またはADRB2(rs1042714)C/GもしくはG/Gのうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する該被験体が、低炭水化物のカロリー制限食;通常の運動;またはその両方に応答性であると予測され、
該試薬が、表5から選択される1または複数のプライマーを含む、キット。 - a)配列番号14の301位に対応する、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;配列番号15の401位に対応する、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;配列番号16の256位に対応する、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;配列番号17の303位に対応する、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;および配列番号18の336位に対応する、ADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のうちのいずれか4つに関して被験体の遺伝子型を決定するための試薬;および
b)該被験体の代謝遺伝子型を決定するための使用説明書、ならびに起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに該被験体を分類するための手段であって、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択される、使用説明書および手段
を備え、
ADRB2(rs1042713)A/AおよびADRB3(rs4994)T/Tと組み合わされる、PPARG(rs1801282)C/GまたはG/Gのうちの1つおよびFABP2(rs1799883)G/GまたはG/Aのうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する該被験体が、低炭水化物のカロリー制限食;通常の運動;またはその両方に応答性であると予測され、
該試薬が、表5から選択される1または複数のプライマーを含む、キット。 - a)配列番号14の301位に対応する、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;配列番号15の401位に対応する、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;配列番号16の256位に対応する、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;配列番号17の303位に対応する、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;および配列番号18の336位に対応する、ADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のうちのいずれか4つに関して被験体の遺伝子型を決定するための試薬;および
b)該被験体の代謝遺伝子型を決定するための使用説明書、ならびに起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに該被験体を分類するための手段であって、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択される、使用説明書および手段
を備え、
ADRB2(rs1042713)G/AもしくはG/Gのうちの1つまたはADRB3(rs4994)T/CもしくはC/Cのうちの1つと組み合わされる、FABP2(rs1799883)G/GおよびPPARG(rs1801282)C/Cの組み合わせ遺伝子型を有する該被験体が、低脂肪または低炭水化物のカロリー制限食に応答性であると予測され、
該試薬が、表5から選択される1または複数のプライマーを含む、キット。 - a)配列番号14の301位に対応する、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;配列番号15の401位に対応する、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;配列番号16の256位に対応する、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;配列番号17の303位に対応する、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;および配列番号18の336位に対応する、ADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のうちのいずれか4つに関して被験体の遺伝子型を決定するための試薬;および
b)該被験体の代謝遺伝子型を決定するための使用説明書、ならびに起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに該被験体を分類するための手段であって、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択される、使用説明書および手段
を備え、
ADRB2(rs1042714)C/C、C/GまたはG/Gのうちの1つおよびADRB2(rs1042713)G/GもしくはG/Aのうちの1つまたはADRB3(rs4994)T/CもしくはC/Cのうちの1つと組み合わされる、FABP2(rs1799883)G/GまたはG/Aのうちの1つおよびPPARG(rs1801282)C/Cの組み合わせ遺伝子型を有する該被験体が、低脂肪のカロリー制限食に応答性であると予測され、
該試薬が、表5から選択される1または複数のプライマーを含む、キット。 - a)配列番号14の301位に対応する、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;配列番号15の401位に対応する、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;配列番号16の256位に対応する、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;配列番号17の303位に対応する、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;および配列番号18の336位に対応する、ADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のうちのいずれか4つに関して被験体の遺伝子型を決定するための試薬;および
b)該被験体の代謝遺伝子型を決定するための使用説明書、ならびに起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに該被験体を分類するための手段であって、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択される、使用説明書および手段
を備え、
ADRB2(rs1042713)G/GもしくはG/Aのうちの1つまたはADRB3(rs4994)T/CもしくはC/Cのうちの1つと組み合わされる、PPARG(rs1801282)C/GもしくはG/Gのうちの1つおよび/またはADRB2(rs1042714)C/GもしくはG/Gのうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する該被験体が、低炭水化物のカロリー制限食に応答性であると予測され、
該試薬が、表5から選択される1または複数のプライマーを含む、キット。 - a)配列番号14の301位に対応する、FABP2(rs1799883;G/A)遺伝子座;配列番号15の401位に対応する、PPARG(rs1801282;C/G)遺伝子座;配列番号16の256位に対応する、ADRB3(rs4994;C/T)遺伝子座;配列番号17の303位に対応する、ADRB2(rs1042713;A/G)遺伝子座;および配列番号18の336位に対応する、ADRB2(rs1042714;C/G)遺伝子座からなる群から選択される多型遺伝子座のうちのいずれか4つに関して被験体の遺伝子型を決定するための試薬;および
b)該被験体の代謝遺伝子型を決定するための使用説明書、ならびに起こり得る利益を該被験体が得ると予測される栄養カテゴリーおよび/または運動カテゴリーに該被験体を分類するための手段であって、ここで、該栄養カテゴリーは、低脂肪食;低炭水化物食;高タンパク質食;およびカロリー制限食からなる群から選択され、該運動カテゴリーは、軽い運動;通常の運動;および激しい運動からなる群から選択される、使用説明書および手段
を備え、
ADRB2(rs1042713)G/GもしくはG/Aのうちの1つまたはADRB3(rs4994)T/CもしくはC/Cのうちの1つと組み合わされる、PPARG(rs1801282)C/GまたはG/Gのうちの1つおよびFABP2(rs1799883)G/GまたはG/Aのうちの1つの組み合わせ遺伝子型を有する該被験体が、低炭水化物のカロリー制限食に応答性であると予測され、
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