JP5361484B2 - プラスミドベクター - Google Patents
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Description
1)配列番号2で示されるアミノ酸配列において、(a)48位、(b)262位、(c)149位及び(d)198位から選ばれる1以上のアミノ酸残基が下記アミノ酸残基;
(a)位置:Ala、Gly、Thr、Arg、Glu、Asn又はGln
(b)位置:Gly、Ser、Thr、Cys又はVal
(c)位置:Asn
(d)位置:Glu
に置換してなるプラスミド複製タンパク質をコードするDNAを有するプラスミドベクター。
2)配列番号2で示されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列において、配列番号2の(a)48位、(b)262位、(c)149位及び(d)198位の各位置に相当する位置から選ばれる1以上のアミノ酸残基が下記アミノ酸残基;
(a)位置:Ala、Gly、Thr、Arg、Glu、Asn又はGln
(b)位置:Gly、Ser、Thr、Cys又はVal
(c)位置:Asn
(d)位置:Glu
に置換してなるプラスミド複製タンパク質をコードするDNAを有するプラスミドベクター。
3)さらにバチルス属細菌由来アルカリセルラーゼ産生遺伝子のプロモーター領域及び分泌シグナル領域に由来する塩基配列を含む上記1)又は2)のプラスミドベクター。
4)前記バチルス属細菌由来アルカリセルラーゼ産生遺伝子のプロモーター領域及び分泌シグナル領域に由来する塩基配列が、配列番号13で示される塩基配列からなるセルラーゼ遺伝子の塩基番号1〜659の塩基配列、配列番号14で示される塩基配列からなるセルラーゼ遺伝子の塩基番号1〜696の塩基配列、あるいは当該塩基配列のいずれかと70%以上の同一性を有するか又は当該塩基配列の一部が欠失した塩基配列である、3)記載のプラスミドベクター。
5)上記4)のプラスミドベクターを含有する形質転換体。
6)宿主が微生物である上記5)の形質転換体。
7)以下の工程を含むポリペプチドの製造方法:
目的ポリペプチドをコードするDNAと、配列番号2で示されるアミノ酸配列において、(a)48位、(b)262位、(c)149位及び(d)198位から選ばれる1以上のアミノ酸残基が下記アミノ酸残基;
(a)位置:Ala、Gly、Thr、Arg、Glu、Asn又はGln
(b)位置:Gly、Ser、Thr、Cys又はVal
(c)位置:Asn
(d)位置:Glu
に置換してなるプラスミド複製タンパク質をコードするDNAを有するプラスミドベクターを構築する工程;
前記プラスミドベクターで宿主微生物を形質転換する工程;および
前記宿主微生物を培養し、生産された目的ポリペプチドを採取する工程。
8)以下の工程を含むポリペプチドの製造方法:
目的ポリペプチドをコードするDNAと、配列番号2で示されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列において、配列番号2の(a)48位、(b)262位、(c)149位及び(d)198位の各位置に相当する位置から選ばれる1以上のアミノ酸残基が下記アミノ酸残基;
(a)位置:Ala、Gly、Thr、Arg、Glu、Asn又はGln
(b)位置:Gly、Ser、Thr、Cys又はVal
(c)位置:Asn
(d)位置:Glu
に置換してなるプラスミド複製タンパク質をコードするDNAを有するプラスミドベクターを構築する工程;
前記プラスミドベクターで宿主微生物を形質転換する工程;および
前記宿主微生物を培養し、生産された目的ポリペプチドを採取する工程。
9)前記プラスミドベクターが、バチルス属細菌由来アルカリセルラーゼ産生遺伝子のプロモーター領域及び分泌シグナル領域に由来する塩基配列をさらに含む、7)又は8)記載の方法。
10)前記バチルス属細菌由来アルカリセルラーゼ産生遺伝子のプロモーター領域及び分泌シグナル領域に由来する塩基配列が、配列番号13で示される塩基配列からなるセルラーゼ遺伝子の塩基番号1〜659の塩基配列、配列番号14で示される塩基配列からなるセルラーゼ遺伝子の塩基番号1〜696の塩基配列、あるいは当該塩基配列のいずれかと70%以上の同一性を有するか又は当該塩基配列の一部が欠失した塩基配列である、9)記載の方法。
11)7)又は8)記載の方法により製造されるポリペプチド。
(i)配列番号2で示されるアミノ酸配列において、(a)48位、(b)262位、(c)149位及び(d)198位から選ばれる1以上のアミノ酸残基が下記の(a)〜(d)のアミノ酸残基に置換してなるタンパク質。
(a)位置:Ala、Gly、Thr、Arg、Glu、Asn又はGln
(b)位置:Gly、Ser、Thr、Cys又はVal
(c)位置:Asn
(d)位置:Glu
(ii)配列番号2で示されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列において、配列番号2の(a)48位、(b)262位、(c)149位及び(d)198位の各位置に相当する位置から選ばれる1以上のアミノ酸残基が下記の(a)〜(d)のアミノ酸残基に置換してなるタンパク質。
(a)位置:Ala、Gly、Thr、Arg、Glu、Asn又はGln
(b)位置:Gly、Ser、Thr、Cys又はVal
(c)位置:Asn
(d)位置:Glu
配列番号2で示されるアミノ酸配列と80%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなるプラスミド複製タンパク質としては、配列番号2で示されるアミノ酸配列とは異なるが、配列番号2で示されるアミノ酸配列と80%以上、好ましくは90%以上、更に好ましくは95%以上、更により好ましくは98%以上の同一性を有するものが挙げられる。
斯かるプラスミド複製タンパク質としては、例えば、配列番号2で示されるアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたものが包含される。
具体的には、例えば、Staphylococcus saprophyticus由来の複製タンパク質などが挙げられる。
このうち、配列番号2で示されるアミノ酸配列からなるプラスミド複製タンパク質が有する、プラスミドの自立増殖に関する機能を有するのが好ましい。
なお、アミノ酸配列の同一性は、リップマン−パーソン法(Lipman-Pearson法;Science, 227, 1435, (1985))によって計算される。具体的には、遺伝情報処理ソフトウェアGenetyx-Win(Ver.5.1.1;ソフトウェア開発)のホモロジー解析(Search homology)プログラムを用いて、Unit size to compare(ktup)を2として解析を行なうことにより算出される。
尚、(a)48位、(b)262位、(c)149位及び(d)198位等のアミノ酸置換は、何れか一でも、複数を同時に行っても良い。
本発明のプラスミドベクターには、目的の異種遺伝子と、転写、翻訳及び分泌に関わる制御領域とが、作動可能に連結されている(例えば、異種遺伝子の上流に制御領域が連結されている)。当該制御領域は、好ましくは、転写開始制御領域、翻訳開始制御領域及び分泌シグナル領域からなる3領域であり、より好ましくは、分泌シグナル領域は、バチルス(Bacillus)属細菌のセルラーゼ遺伝子由来のものであり、転写開始領域及び翻訳開始領域は、当該セルラーゼ遺伝子の上流0.6〜1 kbの領域である。さらに好ましくは、当該制御領域は、バチルス(Bacillus)属細菌KSM-S237株(FERM BP-7875)又はKSM-64株(FERM BP-2886)由来のセルラーゼ遺伝子の転写開始制御領域、翻訳開始領域及び分泌シグナルペプチド領域である。さらにより好ましくは、当該制御領域は、配列番号13で示される塩基配列の塩基番号1〜659の塩基配列、配列番号14で示される塩基配列からなるセルラーゼ遺伝子の塩基番号1〜696の塩基配列、また当該塩基配列に対して70%以上、好ましくは80%以上、より好ましくは90%以上、さらに好ましくは95%以上、さらにより好ましくは98%以上の同一性を有する塩基配列、或いは上記いずれかの塩基配列の一部が欠失した塩基配列である。上記塩基配列の一部が欠失した塩基配列とは、上記塩基配列の一部を欠失しているが、遺伝子の転写、翻訳、分泌に関わる機能を保持している配列を意味する。
バチルス エスピー KSM−64株(FERM BP-2886)のセルラーゼ遺伝子のプロモーター領域及び分泌シグナル領域の下流にバチルス エスピーKSM−KP43株由来のKP43プロテアーゼ遺伝子を連結させ、さらに複製領域としてpAMα1、薬剤耐性遺伝子としてテトラサイクリン耐性遺伝子を連結して構築した組換えプラスミドベクターにおいて、KP43遺伝子の下流に存在する制限酵素サイト(XbaI)を挟むように双方向のプライマー(図1中aとd)を作成する。また、Ori−pAMα1遺伝子の下流に新たに制限酵素サイト(NheI)を作成するように双方向のプライマー(図1中bとc)を作成し、PCRにより得られる2断片(TcとKP43を含む領域とpAMα1を含む領域)は、双方XbaI、NheIにて消化後、連結可能となるようにする。図中プライマーbとdにより増幅されるpAMα1を含む領域において、増幅過程でのエラー導入を促進させることにより、複製蛋白質にランダムに変異が入ったプラスミドベクターを構築することができる。
特開2002−218989号公報、特開2002−306176号公報又は特開2004−122号公報に記載のバチルス エスピーKSM−KP43株由来のアルカリプロテアーゼで分泌能力や比活性の向上している変異プロテアーゼ(配列番号3及び4において、46位のPheをLeu、65位のThrをPro、195位のTyrをHis、273位のValをIle、359位のThrをSer、369位のAspをAsn、387位のSerをAlaに置換したアルカリプロテアーゼ)(以下、KP43H2と称する)の生産量を指標にRep48位変異の効果を検証した。
実施例1同様、バチルス エスピーKSM−KP43株由来の変異アルカリプロテアーゼの生産量を指標にRep262位変異の効果を検証した。
pHA64−KP43H2を鋳型とし、0.1〜0.5ngに対して変異導入プライマー対(配列番号5と配列番号11または配列番号7と配列番号12)を用いて実施例1と同様な手法により増幅した2断片を得、両端を挟むプライマー(配列番号5と配列番号7)にて1断片として増幅させた。得られたDNA断片を電気泳動にて確認した後、NheI、XbaIで消化し、配列番号6および配列番号8のプライマーを用いてpHA64−KP43H2を鋳型に常法により増幅させたテトラサイクリン耐性遺伝子およびKP43H2遺伝子部分を含む断片をNheI、XbaIで消化したものとDNA Ligation kit ver.2(Takara)を用いて連結させ、形質転換を行った。
スキムミルク含有アルカリ寒天培地(実施例1)上に生育してきた形質転換株のスキムミルク溶解斑の形成状況により、プロテアーゼ遺伝子導入の有無を判定した。プロテアーゼ遺伝子がpHA64に挿入されたプラスミドを保持している形質転換株を選抜し、実施例1と同様の培養に供した。
特開2002−218989号公報、特開2002−306176号公報、特開2004−122号公報又は特開2004−305176号公報に記載のバチルス エスピーKSM−KP43株由来のアルカリプロテアーゼで分泌能力や比活性の向上している変異プロテアーゼ(配列番号3及び4において、15位のSerをHis、16位のSerをGln、46位のPheをLeu、65位のThrをPro、166位のAsnをGly、167位のGlyをVal、187位のAsnをSer、195位のTyrをGln、273位のValをIle、346位のLysをArg、359位のThrをSer、369位のAspをAsn、387位のSerをAla、405位のAsnをAspに置換したアルカリプロテアーゼ)(以下、KP43H3と称する)の生産量を指標にRep48位変異の効果を検証した。
Claims (10)
- 配列番号2で示されるアミノ酸配列において、(a)48位、(b)262位、(c)149位及び(d)198位から選ばれる1以上のアミノ酸残基が下記アミノ酸残基;
(a)位置:Ala、Gly、Thr、Arg、Glu、Asn又はGln
(b)位置:Gly、Ser、Thr、Cys又はVal
(c)位置:Asn
(d)位置:Glu
に置換してなるプラスミド複製タンパク質をコードするDNAを有するプラスミドベクター。 - 配列番号2で示されるアミノ酸配列と90%以上の同一性を有するアミノ酸配列において、配列番号2の(a)48位、(b)262位、(c)149位及び(d)198位の各位置に相当する位置から選ばれる1以上のアミノ酸残基が下記アミノ酸残基;
(a)位置:Ala、Gly、Thr、Arg、Glu、Asn又はGln
(b)位置:Gly、Ser、Thr、Cys又はVal
(c)位置:Asn
(d)位置:Glu
に置換してなるプラスミド複製タンパク質をコードするDNAを有するプラスミドベクター。 - さらにバチルス属細菌由来アルカリセルラーゼ遺伝子のプロモーター領域及び分泌シグナル領域に由来する塩基配列を含む請求項1又は2記載のプラスミドベクター。
- 前記バチルス属細菌由来アルカリセルラーゼ遺伝子のプロモーター領域及び分泌シグナル領域に由来する塩基配列が、配列番号13で示される塩基配列からなるセルラーゼ遺伝子の塩基番号1〜659の塩基配列、配列番号14で示される塩基配列からなるセルラーゼ遺伝子の塩基番号1〜696の塩基配列、あるいは当該塩基配列のいずれかと90%以上の同一性を有する塩基配列である、請求項3記載のプラスミドベクター。
- 請求項3又は4記載のプラスミドベクターを含有する形質転換体。
- 宿主が微生物である請求項5記載の形質転換体。
- 以下の工程を含むポリペプチドの製造方法:
目的ポリペプチドをコードするDNAと、配列番号2で示されるアミノ酸配列において、(a)48位、(b)262位、(c)149位及び(d)198位から選ばれる1以上のアミノ酸残基が下記アミノ酸残基;
(a)位置:Ala、Gly、Thr、Arg、Glu、Asn又はGln
(b)位置:Gly、Ser、Thr、Cys又はVal
(c)位置:Asn
(d)位置:Glu
に置換してなるプラスミド複製タンパク質をコードするDNAを有するプラスミドベクターを構築する工程;
前記プラスミドベクターで宿主微生物を形質転換する工程;および
前記宿主微生物を培養し、生産された目的ポリペプチドを採取する工程。 - 以下の工程を含むポリペプチドの製造方法:
目的ポリペプチドをコードするDNAと、配列番号2で示されるアミノ酸配列と90%以上の同一性を有するアミノ酸配列において、配列番号2の(a)48位、(b)262位、(c)149位及び(d)198位の各位置に相当する位置から選ばれる1以上のアミノ酸残基が下記アミノ酸残基;
(a)位置:Ala、Gly、Thr、Arg、Glu、Asn又はGln
(b)位置:Gly、Ser、Thr、Cys又はVal
(c)位置:Asn
(d)位置:Glu
に置換してなるプラスミド複製タンパク質をコードするDNAを有するプラスミドベクターを構築する工程;
前記プラスミドベクターで宿主微生物を形質転換する工程;および
前記宿主微生物を培養し、生産された目的ポリペプチドを採取する工程。 - 前記プラスミドベクターが、バチルス属細菌由来アルカリセルラーゼ遺伝子のプロモーター領域及び分泌シグナル領域に由来する塩基配列をさらに含む、請求項7又は8記載の方法。
- 前記バチルス属細菌由来アルカリセルラーゼ遺伝子のプロモーター領域及び分泌シグナル領域に由来する塩基配列が、配列番号13で示される塩基配列からなるセルラーゼ遺伝子の塩基番号1〜659の塩基配列、配列番号14で示される塩基配列からなるセルラーゼ遺伝子の塩基番号1〜696の塩基配列、あるいは当該塩基配列のいずれかと90%以上の同一性を有する塩基配列である、請求項9記載の方法。
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