JP4967280B2 - Microbe counting device - Google Patents

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Description

本発明は、環境試料、食品検体などの微生物の迅速検出に使用される生菌および死菌の計数装置における夾雑物との識別方法に関する。   The present invention relates to a method for discriminating contaminants in a counting apparatus for live and dead bacteria used for rapid detection of microorganisms such as environmental samples and food specimens.

従来、蛍光色素を用いて微生物の生菌および死菌を検出し、判別する手法の一例として蛍光性酵素基質であるフルオレセイン二酢酸系蛍光色素による方法が知られている。フルオレセイン二酢酸系蛍光色素は、細胞や微生物の細胞膜を透過して取り込まれると、細胞質内のエステラーゼ酵素群により加水分解され、フルオレセイン骨格を有する蛍光物質(フルオレセインなど)に変換されて発光機能が発現する。そこで励起光を照射することで生じる光点を生きている細胞や微生物として判定することができる(例えば、特許文献1参照)。   Conventionally, a method using a fluorescent enzyme substrate, a fluorescein diacetate fluorescent dye, is known as an example of a method for detecting and discriminating live and dead microorganisms using a fluorescent dye. Fluorescein diacetate-based fluorescent dyes, when permeated through the cell membranes of cells and microorganisms, are hydrolyzed by esterase enzymes in the cytoplasm and converted into fluorescent substances with a fluorescein skeleton (such as fluorescein), thereby exhibiting a luminescent function To do. Therefore, a light spot generated by irradiating excitation light can be determined as a living cell or microorganism (see, for example, Patent Document 1).

この特許文献1において、微生物の生死を判定するための蛍光色素として、エステラーゼ活性指標指示薬であるカルセイン誘導体及びヨウ化プロピジウムを用いた方法が提案されている。これは、微生物を上記2種類の色素で染色し、発光点ごとに緑色および赤色の蛍光強度を測定し、その強度の比較を求めることで、生菌であるか死菌であるかをフローサイトメトリーにより判断するというものである。   In Patent Document 1, a method using a calcein derivative and propidium iodide, which are esterase activity index indicators, is proposed as a fluorescent dye for determining the viability of microorganisms. This is done by dyeing microorganisms with the above two types of dyes, measuring the green and red fluorescence intensities for each emission point, and comparing the intensities to determine whether they are viable or dead. Judgment is based on the measurement.

また、更に別の手法として、微生物が混合する試料を膜にろ過し、微生物の発光画像を取得して計数を行う手法が知られている(例えば、特許文献2参照)。   Further, as another technique, a technique is known in which a sample mixed with microorganisms is filtered through a membrane, and a luminescence image of the microorganisms is acquired and counted (for example, see Patent Document 2).

これは、膜に補足した微生物に溶菌処理を施した後、生菌を検出するためのATP反応性発光試薬と、総菌を検出するためのデオキシリボ核酸反応性の発光酵素修飾抗体によって染色し、発光画像を取得して算出された生菌数と総菌数から死菌数を算出するというものである。
特開平11−146798号公報 特許第3129631号公報
This is performed by lysing a microorganism supplemented to the membrane and then staining with an ATP-reactive luminescent reagent for detecting viable bacteria and a deoxyribonucleic acid-reactive luminescent enzyme-modified antibody for detecting total bacteria, The number of dead bacteria is calculated from the number of viable bacteria and the total number of bacteria calculated by obtaining a luminescent image.
JP-A-11-146798 Japanese Patent No. 3129631

しかしながら、上記特許文献1のような従来の方法では、2つの試薬の蛍光強度から生菌および死菌を検出することはできるが、必ずしも全ての細胞を検出できているとはいえない。これはエステラーゼ分解性の色素に共通の課題であるが、微生物の種類によっては酵素の発現量が異なり、全く染色されないものが存在し、またそれ以外にも微生物の置かれている環境や活性状態によって染色性に大きな差があり、一時的な測定結果だけでは正確な生菌の検出ができているとはいえないためである。   However, in the conventional method such as Patent Document 1, viable and dead bacteria can be detected from the fluorescence intensities of the two reagents, but not all cells can be detected. This is a common problem with esterase-degradable dyes, but depending on the type of microorganism, the expression level of the enzyme may not be stained at all. In addition, the environment and active state where the microorganism is placed are also present. This is because there is a large difference in the dyeability depending on the results, and it cannot be said that viable bacteria can be detected accurately only by temporary measurement results.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、高い染色性、標識力を持つ核酸結合性の蛍光性化合物を使用することで、微生物のもつ酵素活性などの不安定要因に影響を受けることなく、安定して高感度な微生物の検出方法を提供することを目的としている。   The present invention solves such conventional problems, and influences instability factors such as enzyme activity of microorganisms by using a nucleic acid-binding fluorescent compound having high staining properties and labeling power. It is an object of the present invention to provide a stable and highly sensitive detection method for microorganisms without being subjected to the above.

また、一般的なフローサイトメータにおいて、当業者に良く知られている事実であるが、微生物を特定するために蛍光強度および前方散乱光を測定し、粒子の大きさあたりの蛍光強度から微生物に相当するかどうかを判断している。そのため、装置には蛍光を検出するための検出器の他に、散乱光を検出するための別の検出器を設ける必要が生じ、装置構成が複雑化するという課題がある。   Moreover, in a general flow cytometer, as is well known to those skilled in the art, fluorescence intensity and forward scattered light are measured in order to identify microorganisms, and the fluorescence intensity per particle size is converted into microorganisms. It is judged whether it corresponds. Therefore, in addition to the detector for detecting fluorescence, the device needs to be provided with another detector for detecting scattered light, and there is a problem that the device configuration becomes complicated.

また、複数の染色試薬を用いる場合、フローセルを流れる細胞一つ一つに対して、複数の励起光源を使用するには、照射位置の距離をおいて高い精度で粒子を流す機構を設け、時間差で出現する発光シグナルを一致させる手段と、流速を頻繁にキャリブレーションする工程が必要となる。そのため、このようなフローサイトメータは高価であり、管理方法も複雑多岐になる。そのため、頻繁に使用される手法としては同一の励起光源で励起することが可能な染色試薬を使用し、同時に異なる蛍光を測定するというものである。しかし、このような手法では使用できる染色試薬に制限があるばかりか、染色試薬を最適な励起波長で使用できないため、感度が低下するという課題がある。   In addition, when using multiple staining reagents, in order to use multiple excitation light sources for each cell flowing through the flow cell, a mechanism for flowing particles with high accuracy at a distance of the irradiation position is provided. The means for matching the luminescence signals appearing in 1 and the step of frequently calibrating the flow rate are required. Therefore, such a flow cytometer is expensive and the management methods are complicated and varied. Therefore, a frequently used technique is to use staining reagents that can be excited with the same excitation light source and simultaneously measure different fluorescence. However, in such a technique, there are not only limitations on the staining reagent that can be used, but also there is a problem that the sensitivity is lowered because the staining reagent cannot be used at an optimum excitation wavelength.

また、フローサイトメータの別形態として、同一の照射位置に複数の励起光源を同時に照射し、得られた複雑な合成蛍光スペクトル波形と、蛍光色素の標準スペクトル波形を比較して、蛍光色素ごとのスペクトルを分離し、強度を比較することができるというものがあり、当業者に良く知られた事実である。しかし、このような手法では、装置が高価になるうえ、既知の試料のみの評価しか行うことができず、未知試料において自家蛍光の多い場合や、蛍光波長のシフトが見られるような場合には、スペクトル波形の分離が行えず、解析が困難になるという課題がある。   As another form of flow cytometer, the same irradiation position is simultaneously irradiated with a plurality of excitation light sources, and the complex synthetic fluorescence spectrum waveform obtained is compared with the standard spectrum waveform of the fluorescence dye. Some are able to separate spectra and compare intensities, a fact well known to those skilled in the art. However, with such a method, the apparatus becomes expensive, and only a known sample can be evaluated. If the unknown sample has a lot of autofluorescence or a shift in the fluorescence wavelength is observed, However, there is a problem that spectral waveforms cannot be separated and analysis becomes difficult.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、蛍光強度と粒子の大きさを同時に取得できる受像素子を使用して装置構成を簡略化することができ、微生物を固定して測定を行うことにより、異なる励起光源を切り替えることで簡便かつ容易に異なる染色試薬の画像を取得することができ、また最適波長で使用することができるため、小型でコンパクトかつ高精度である微生物計数装置を提供することを目的としている。   The present invention solves such a conventional problem, and can simplify the apparatus configuration by using an image receiving element that can simultaneously acquire fluorescence intensity and particle size, and can fix microorganisms. By performing the measurement, it is possible to easily and easily acquire images of different staining reagents by switching between different excitation light sources, and because it can be used at the optimum wavelength, it is compact, compact and highly accurate. The object is to provide a device.

また、特許文献2のような手法の場合、微生物細胞内に残存する構成物質を計測するものであるが、溶菌させるため、それらの構成成分が細胞外に溶出しやすく、発光強度の定量性が低下する。そのため、発光量が少ない場合に、誤って発光していないものとして認識してしまうため、生菌を死菌として計数してしまうなどの誤認識を起こす可能性が高くなる。また、微生物を含むサンプルの前処理の違いによって、発光点によっては1個ではなく、複数個繋がっている場合もあるため、これらを1個として検出してしまい、例えば生菌と死菌が1個ずつ繋がったものでは、生菌数が1個であるものとして計数されてしまい、死菌数を計数することが難しい。   In the case of the technique as in Patent Document 2, constituent substances remaining in microbial cells are measured. However, in order to lyse, the constituent components are easily eluted out of the cells, and the luminescence intensity is quantitative. descend. For this reason, when the amount of light emission is small, it is recognized that the light is not accidentally emitted, and therefore, there is a high possibility of causing erroneous recognition such as counting live bacteria as dead bacteria. Also, depending on the difference in the pretreatment of the sample containing microorganisms, depending on the light emission point, there are cases where a plurality of light emitting points are connected to each other. If the cells are connected one by one, the number of viable bacteria is counted as one, and it is difficult to count the number of dead bacteria.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、微生物を溶菌させることなく染色可能である染色試薬を使用することで、試薬の細胞外流出を防ぎ、発光輝度を安定化させ、定量性を持たせることができるため、試薬ごとの輝度の比較による細胞の特性評価、例えば生死判別や、損傷度の評価などを行う精度を高めた微生物計数装置を提供することを目的としている。   The present invention solves such a conventional problem, by using a staining reagent that can be dyed without lysing microorganisms, prevent the reagent from flowing out of the cell, stabilize the emission luminance, An object of the present invention is to provide a microbe counting apparatus with improved accuracy for performing cell characteristic evaluation by comparing luminance for each reagent, for example, life / death discrimination, damage degree evaluation, and the like because it can have quantitativeness.

また、蛍光染色した微生物を画像として取得し、菌数を計数する装置において、混入している自家蛍光物質や蛍光色素を非特異的に吸着して発光する夾雑物などの影響により、菌数を精度よく計数することが困難である場合がある。   In addition, in a device that acquires fluorescence-stained microorganisms as an image and counts the number of bacteria, the number of bacteria is reduced by the influence of contaminants that non-specifically adsorb the autofluorescent substances and fluorescent dyes that are mixed and emit light. It may be difficult to accurately count.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、微生物の発光点の色彩的特性を示す特性値を抽出することで、微生物か、微生物以外の夾雑物質であるかを判別することで、複雑な前処理をすることなく特異的に微生物を検出することができ、高精度な微生物計数装置を提供することを目的としている。   The present invention solves such a conventional problem, and extracts a characteristic value indicating the color characteristic of the luminescence point of a microorganism to determine whether it is a microorganism or a contaminant other than a microorganism. Therefore, an object of the present invention is to provide a highly accurate microorganism counting apparatus that can specifically detect microorganisms without complicated pretreatment.

また、微生物の発光点の色彩情報を得るために、2次元空間での顕微蛍光スペクトルを取得すると装置構成が複雑化するため、より簡便に取得できる情報から色彩情報を得ることが求められている。   In addition, in order to obtain color information of the emission points of microorganisms, if a microscopic fluorescence spectrum in a two-dimensional space is acquired, the apparatus configuration becomes complicated. Therefore, it is required to obtain color information from information that can be acquired more easily. .

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、各波長で取得した画像から各波長の輝度値を読み取ることで、データを取得する装置構成は適当な受光フィルタと受像素子のみで実施することができるため、シンプルかつ小型な装置で、精度を向上させることができる微生物計数装置を実現することができる。   The present invention solves such a conventional problem, and the apparatus configuration for acquiring data by reading the luminance value of each wavelength from the image acquired at each wavelength is only an appropriate light receiving filter and image receiving element. Therefore, it is possible to realize a microorganism counting apparatus capable of improving accuracy with a simple and small apparatus.

また、色彩情報を抽出し、微生物か微生物以外の夾雑物であるかを判別するとき、新たにデータを取得することなく、同時に微生物の生菌か死菌であるかを精度良く判断することが必要とされる。   In addition, when extracting color information and determining whether it is a microorganism or a non-microorganism contaminant, it is possible to accurately determine whether the microorganism is live or dead at the same time without acquiring new data. Needed.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、色彩情報から生菌、死菌、微生物以外の夾雑物の判別を行うために、生死判断部と、微生物判断部とを別に設け、続けて処理を行うことで、それぞれの特性値を効率的に適用することができ、判別精度を高めた微生物計数装置を提供することを目的としている。   The present invention solves such a conventional problem, and in order to discriminate between living bacteria, dead bacteria, and contaminants other than microorganisms from color information, a life and death judgment unit and a microorganism judgment unit are provided separately. It is an object of the present invention to provide a microorganism counting device that can efficiently apply each characteristic value by performing the processing continuously and has improved discrimination accuracy.

また、生菌、死菌の判別を行うとき、微生物の種類や、環境によっては生菌であっても死菌試薬が入り込むなど、中間的な発光をするものも多く、これらが存在していても精度良く図ることが必要とされる。   Also, when distinguishing between live and dead bacteria, depending on the type of microorganism and the environment, there are many things that emit intermediate light, such as the presence of dead bacteria reagents, even if they are live bacteria. However, it is necessary to improve the accuracy.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、生死菌染色試薬と死菌染色試薬を両方使用し、二つの発光量を比較することで、生菌か死菌かを判断するための、死菌染色試薬の染色量を客観的に評価することができ、単に死菌試薬が入りやすい菌であったとしても、その菌の生菌と死菌での試薬の入り込み方、すなわち染色量を比較することで見極めることができ、中間的な発光を示すような微生物が存在していても、精度良く生死判別を行うことができる。さらに、フラグを立てることでそれ以降の処理を効率化することができる微生物計数装置を実現することを目的としている。   The present invention solves such a conventional problem, and uses both a living and dead bacteria staining reagent and a killed bacteria staining reagent, and compares the two luminescence amounts to determine whether the bacteria are live or dead. Therefore, the amount of staining of the dead bacteria staining reagent can be objectively evaluated, even if it is easy to enter the killed bacteria reagent, how to enter the reagent in the living bacteria and dead bacteria, It can be determined by comparing the amount of staining, and even if there is a microorganism that exhibits intermediate luminescence, life / death discrimination can be performed with high accuracy. It is another object of the present invention to realize a microorganism counting apparatus capable of increasing the efficiency of subsequent processing by setting a flag.

また、生菌、死菌の判別に加え、微生物以外の夾雑物であることを判別する工程の精度が十分でないと、特に菌数の濃度が低い検体でかつ基準値が低い場合には、誤判定による影響が大きく、検査での実使用に耐えうる性能が得られないという課題がある。   In addition to the discrimination of viable and dead bacteria, if the accuracy of the process of discriminating that it is a contaminant other than microorganisms is not sufficient, an error may occur, particularly if the concentration of bacteria is low and the reference value is low. There is a problem that the influence of the determination is large and the performance that can withstand actual use in inspection cannot be obtained.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、生菌、死菌であるかを生死菌染色試薬および死菌染色試薬の発光輝度より判断し、それぞれを生菌群、死菌群としてグループ化したのち、それぞれのグループに対して最適な夾雑物の判別パラメータを与えることで、より高精度に夾雑物を除外することができる微生物計数装置を提供することを目的としている。   The present invention solves such a conventional problem, and judges whether it is a viable or dead bacteria from the luminescence brightness of the live and dead bacteria staining reagent and the killed bacteria staining reagent. An object of the present invention is to provide a microbe counting apparatus that can exclude impurities with higher accuracy by grouping them as a group and then giving optimum determination parameters for the impurities to each group.

また、染色された微生物を画像として取得する場合、微生物が拡散していると、ピントが合いにくく、精度良く輝度を取得することが難しい。   In addition, when acquiring stained microorganisms as an image, if the microorganisms are diffused, it is difficult to focus and it is difficult to acquire luminance with high accuracy.

また、異なる波長のデータを取得しようとする際にも、カラーCCDでは、それぞれの波長に色感度をもつ電化結合素子の配列の問題から、微生物の発光点における同じ位置の情報を取得することが難しく、極端には、一方が菌で、一方が菌周辺の位置の輝度値を拾ってしまうなど、正確な色彩情報を取得できないという課題がある。   Also, when trying to acquire data of different wavelengths, a color CCD can acquire information on the same position at the emission point of a microorganism due to the problem of the arrangement of the electro-coupled elements having color sensitivity at each wavelength. It is difficult and extreme, and there is a problem that accurate color information cannot be obtained, for example, one is a fungus and the other picks up a luminance value at a position around the fungus.

また、複数の画像を取得して、各波長の輝度値を抽出しようとする場合、微生物が拡散していると、同じ微生物が異なる位置に写ってしまうため、各画像での微生物の一致が難しく、色情報を抽出できなくなるという課題がある。   In addition, when acquiring a plurality of images and extracting the luminance value of each wavelength, it is difficult to match the microorganisms in each image because the same microorganisms appear in different positions if the microorganisms are diffused. There is a problem that color information cannot be extracted.

また、微生物を染色する場合、検体スケールが大きい場合や、検体中の微生物濃度が低い場合には、濃縮するための前処理を行う必要がある。例えば、水道水であれば100mLあたりの菌数検査が必要であり、さらにはボトリングされた飲料であれば、ボトル1本の容量(例えば500mLや1.8mL)での検査が必要になる。さらにはこのような検体に対しても染色試薬は同濃度で染色処理をするために大量の蛍光色素が必要となるため環境負荷影響が大きく、また検体に含まれる成分の影響によって染色力が異なるため、安定して染色できるように検体成分を分離して観察することが要求されている。   In addition, when a microorganism is stained, if the specimen scale is large or the microorganism concentration in the specimen is low, it is necessary to perform a pretreatment for concentration. For example, in the case of tap water, inspection of the number of bacteria per 100 mL is necessary, and in the case of a bottling beverage, inspection with a capacity of one bottle (for example, 500 mL or 1.8 mL) is required. Furthermore, even for such specimens, the staining reagent requires a large amount of fluorescent dyes for staining treatment at the same concentration, so the impact on the environment is large, and the staining power varies depending on the influence of the components contained in the specimen. Therefore, it is required to separate and observe specimen components so that they can be stably stained.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、検体中の微生物を表面に固定することで、発光点ごとに色彩情報を精度良く求めることが容易になり、簡便かつ精度の高い微生物計数装置を提供することができる。   The present invention solves such a conventional problem, and by fixing microorganisms in a sample on the surface, it becomes easy to obtain color information accurately for each light emitting point, and it is simple and highly accurate. A microbe counting apparatus can be provided.

また、検体をろ過して捕集するする手段を用いた場合、メンブランフィルタなどの表面に微生物を濃縮し、検体中に溶解している染色阻害成分を除去することができ、安定して細胞内での経時的な発光を観察することができる。また最小限の蛍光色素を使うことため環境負荷影響を最小限に低下させた微生物計数装置を提供することを目的としている。   In addition, when a means for collecting and filtering the specimen is used, microorganisms can be concentrated on the surface of a membrane filter or the like, and staining inhibitory components dissolved in the specimen can be removed, and the intracellular The light emission over time can be observed. Another object of the present invention is to provide a microbe counting apparatus in which the influence of environmental load is minimized by using a minimum amount of fluorescent dye.

また、色彩情報を取得する方法において、発光点が非常に小さいものであった場合、RGBなど波長が異なる画像の輝度情報を取得するためにカラーCCDのようなカラー情報が取得できる受像素子を使用すると、受像素子上の色感度をもつ素子が並んで配列されており、同一画素での色情報とはならないため、1画素のズレが影響してしまうような微小な発光体では、正確に色彩的特性を取得することが困難であるという課題がある。   In the method of acquiring color information, if the light emitting point is very small, an image receiving element that can acquire color information such as a color CCD in order to acquire luminance information of an image having a different wavelength such as RGB. When used, the elements having color sensitivity on the image receiving element are arranged side by side and do not become color information in the same pixel. However, there is a problem that it is difficult to obtain color characteristics.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、色彩的特性を算出するために必要な波長の異なる画像の輝度値を、それぞれの色ごとに取得した画像から抽出することで、1画素のズレもなく、正確に同じ位置の色彩情報を取得することができ、微生物のような微小な発光点であっても、精度良く色彩的特性を取得でき、生菌、死菌、または微生物以外の夾雑物であることを判別することができる微生物計数装置を提供することを目的としている。   The present invention solves such a conventional problem, and by extracting the luminance value of an image having a different wavelength necessary for calculating a color characteristic from an image acquired for each color, Color information at the same position can be obtained without any pixel shift, and color characteristics can be obtained with high accuracy even at minute light emission points such as microorganisms. An object of the present invention is to provide a microbe counting apparatus capable of discriminating a foreign substance other than a microbe.

また、微生物の発光点を含む画像から色彩的特性を示すデータを取得し、解析する手法において、全画素の輝度データから、目的の発光物の輝度値を効率的に抽出し、各画像の発光物のデータから色彩的特性を効率良く算出することが求められる。   In addition, in the method of acquiring and analyzing data indicating color characteristics from an image including luminescence points of microorganisms, the luminance value of the target luminescent material is efficiently extracted from the luminance data of all pixels, and the luminescence of each image is obtained. It is required to efficiently calculate the color characteristics from the object data.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、画像から発光点を抽出する発光点抽出部と、抽出した発光点を位置補正して各画像の発光点を照合する発光点照合部とを設け、これらを連続的に行うことで、画像の全画素データから、必要なデータのみを抜き出し、結合させて目的のデータを効率的に作成することができ、さらに処理データを必要最小限に留めることができるため、処理速度を速め、計測時間を短縮することができる微生物計数装置を提供することを目的としている。   The present invention solves such a conventional problem, and a light emission point extraction unit that extracts light emission points from an image, and light emission point verification that corrects the positions of the extracted light emission points and collates the light emission points of each image. By performing these operations continuously, only the necessary data can be extracted and combined from all the pixel data of the image, and the target data can be created efficiently. Therefore, it is an object of the present invention to provide a microorganism counting apparatus that can increase the processing speed and shorten the measurement time.

また、発光点を特定して抽出する際、できるだけ漏れがなく、かつある程度発光点を選別して抽出し、次の工程を効率化することが必要とされる。   Further, when specifying and extracting the light emitting points, it is necessary to make the next process more efficient by selecting and extracting the light emitting points to a certain extent with no leakage.

また、微生物が繋がって存在している場合、画像上の発光点は一つのオブジェクトを形成しており、色彩的特性が混合されてしまうために、発光点の判別および計数精度が悪化してしまうという課題がある。このとき発光点の中で個別の微生物の位置を特定し、細胞一つ一つを別々に検出して計数することが必要とされる。   In addition, when microorganisms are connected to each other, the light emitting points on the image form one object, and the color characteristics are mixed, so that the light emitting point discrimination and counting accuracy deteriorate. There is a problem. At this time, it is necessary to specify the position of individual microorganisms in the light emitting point, and to detect and count each cell individually.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、発光点をあらかじめ設定した範囲にある輝度と面積のものとし、そのときの輝度値は発光点の中の最大輝度値や、輝度の重心の値を使用することで、個々の微生物の中心地を特定し、微生物の特性を最も反映させた値を使用することができるため、精度の高い色彩的特性を取得し、検出漏れも少ない微生物計数装置を実現することができる。   The present invention solves such a conventional problem, and it is assumed that the luminous point has a luminance and area within a preset range, and the luminance value at that time is the maximum luminance value in the luminous point or the luminance. By using the value of the center of gravity, it is possible to specify the center of each microorganism and use the value that most reflects the characteristics of the microorganism. A small number of microorganism counting devices can be realized.

また、発光点を抽出して照合させた際、使用した補正値が適正であり、発光点の照合が正確に行えているかどうかを客観的に判断する指標が必要とされる。   In addition, when the light emitting points are extracted and collated, the correction value used is appropriate, and an index for objectively determining whether or not the light emitting points are correctly collated is required.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、発光点を照合した際に、重なったものの一致率を算出し、表示させることで、補正値が適正であり、結果が妥当であるかどうかを判断することができる。もし不適であった場合に補正値を再設定して計測し直すことができ、計数精度が高い微生物計数装置を実現することができる。   The present invention solves such a conventional problem, and when collating the light emission points, by calculating and displaying the coincidence ratio of the overlapped ones, the correction value is appropriate and the result is appropriate. It can be determined whether there is. If it is inappropriate, the correction value can be reset and measured again, and a microorganism counting device with high counting accuracy can be realized.

また、複数の染色試薬で蛍光染色し、蛍光発光を示す微生物が、ある染色試薬のみ発光して画像に発光点を形成するが、他の波長で発光せず、画像に発光点が形成されなかった場合、発光しなかった波長では発光点が抽出されないため、輝度値を取得することが困難になる。しかし、画像から発光点に該当する輝度情報を正確に抽出して色彩的特性を算出することが必要である。   In addition, microorganisms that are fluorescently stained with a plurality of staining reagents and exhibit fluorescence emission emit light only with a certain staining reagent to form emission points on the image, but do not emit light at other wavelengths, and no emission points are formed on the image. In this case, since the emission point is not extracted at the wavelength at which light is not emitted, it is difficult to acquire the luminance value. However, it is necessary to accurately extract luminance information corresponding to a light emitting point from an image and calculate a color characteristic.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、発光点が抽出されない場合に、別の画像にある発光点の座標をもとに、同じ座標の輝度値を抽出することにより、発光点が得られなかった画像からも、発光点の輝度値を精度良く取得することができ、精度の高い発光点の判別、生菌、死菌の計数を行うことができる微生物計数装置を実現することができる。   The present invention solves such a conventional problem, and when a light emitting point is not extracted, based on the coordinates of the light emitting point in another image, by extracting the luminance value of the same coordinate, Realizes a microbe counting device that can accurately acquire the luminance value of a light emitting point from an image where a light emitting point was not obtained, and can perform high-precision light-emitting point discrimination, counting of live bacteria and dead bacteria can do.

また、発光点の輝度情報を取得したのち、そのデータに対して使用する評価パラメータを調整する必要があるが、処理端末のメモリキャッシュ上では、1回分の測定データしか保存することができず、それ以前に測定したデータを評価することができない。   In addition, after obtaining the luminance information of the light emitting point, it is necessary to adjust the evaluation parameter used for the data, but only one measurement data can be stored on the memory cache of the processing terminal, Previously measured data cannot be evaluated.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、測定し、各画像から発光点の輝度値を取得して収集したデータを一度出力させ、蛍光評価部の前に評価するデータを読み込ませる工程を設けることで、過去に取得したデータを繰返し評価することができるようになり、データの再検証を行って、より精度の高い判別、計数を行うことができる微生物計数装置を提供することができる。   The present invention solves such a conventional problem, and measures, acquires the luminance value of the light emitting point from each image, outputs the collected data once, and evaluates the data to be evaluated before the fluorescence evaluation unit. By providing a process for reading, it is possible to repeatedly evaluate data acquired in the past, and to provide a microbe counting apparatus capable of performing more accurate discrimination and counting by performing re-verification of data. be able to.

また、微生物の生菌および死菌の総数を算出するためには、捕集面の全体面積に対する測定面積を知る必要があるが、測定エリアは、機械的誤差に起因して装置間や測定毎に差が生じる。そのため、総数の算出を精度よく行うためには、測定した有効面積を各種パラメータから算出することが求められている。   In addition, in order to calculate the total number of living and dead microorganisms, it is necessary to know the measurement area relative to the total area of the collection surface. There will be a difference. Therefore, in order to accurately calculate the total number, it is required to calculate the measured effective area from various parameters.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、有効エリア算出部を設けることで、測定毎に最適な有効面積を求めて、算出に使用することが可能になり、精度の高い微生物の検出方法を提供することを目的としている。   The present invention solves such a conventional problem, and by providing an effective area calculation unit, it is possible to obtain an optimum effective area for each measurement and use it for the calculation, with high accuracy. It aims at providing the detection method of microorganisms.

また、画像から発光点を抽出して生菌、死菌を計数する手法において、検体中の全数を測定するために、微生物が存在する領域を全て測定することが必要であるが、測定面積が極めて広くなり、測定に膨大な時間がかかってしまうという課題がある。   In addition, in the method of extracting luminescent spots from images and counting live and dead bacteria, it is necessary to measure all the areas where microorganisms exist in order to measure the total number in the specimen. There is a problem that it becomes very wide and takes a long time for measurement.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、全ての領域を測定せずに、測定した領域の面積を算出して、測定有効エリア面積とし、微生物が存在する全表面積との値から、検体中の微生物の全数を算出して、迅速に微生物数を算出することができる微生物計数装置を提供することができる。   The present invention solves such a conventional problem, and calculates the area of the measured area without measuring all the areas to obtain the measurement effective area area, and the total surface area where microorganisms are present. It is possible to provide a microorganism counting apparatus that can calculate the total number of microorganisms in a specimen from the value and can quickly calculate the number of microorganisms.

また、CCDなどの受像素子を使用した場合、受像素子の画素ごとの感度差が大きい場合や、画素が機能せずデータを取得できない場合に、画像上で白い発光点が形成されいわゆるドット欠けと呼ばれる現象がおきる。このとき、画像上の発光点を菌と誤認識することや、ドット欠けの部分と微生物の発光点が重なって輝度が正確に得られない場合など、検出精度が低下する原因となりうる。   In addition, when an image receiving element such as a CCD is used, when the sensitivity difference for each pixel of the image receiving element is large, or when the pixel does not function and data cannot be acquired, a white light emitting point is formed on the image, and so-called dots are formed. A phenomenon called chipping occurs. At this time, the detection accuracy may be lowered, for example, when the light emission point on the image is mistakenly recognized as a bacterium or when the luminance of the light is not accurately obtained due to overlapping of the dot missing portion and the light emission point of the microorganism.

本発明は、このような従来の課題を解決するものであり、受像素子のドット欠けを削除するために、あらかじめドット欠けのみが移り込んでいる暗視野画像を取得し、発光点を含むサンプルの画像から減算することで、ドット欠けの部分を削除し、発光点のみの画像を取得することができる微生物計数装置を提供することを目的としている。   The present invention solves such a conventional problem, and in order to delete a dot defect of an image receiving element, a dark field image in which only a dot defect is transferred in advance is obtained, and a sample including a light emitting point is obtained. It is an object of the present invention to provide a microbe counting apparatus capable of deleting a dot-missing portion and obtaining an image of only a light emitting point by subtracting from the above image.

本発明の微生物計数装置は上記目的を達成するために、請求項1記載のとおり、微生物を蛍光染色する工程をもち、前記微生物の細胞を発光点として画像に取得可能な受像素子と、前記画像から少なくとも発光点のRGBの輝度値より演算されて与えられた色度または色相角の色彩的特性を示す値から微生物の生菌、死菌、もしくは微生物以外の夾雑物のいずれかであることを判断する蛍光評価部とを備え、前記蛍光評価部は、生菌群または死菌群のいずれかであることを判断する生死判断部と、それ以降に微生物か微生物以外の夾雑物であるかを判断する微生物判断部とを設け、前記微生物判断部において、生菌群または死菌群を示すパラメータから発光点が生菌群もしくは死菌群のいずれかであることを判断し、発光点が生菌、死菌、もしくは微生物以外の夾雑物のいずれかであるかの判断は、生菌群、死菌群それぞれに設定されたしきい値と比較して行い、生菌または死菌の総数を算出し、前記生死判断部において、2種類の蛍光色素で生菌・死菌を染色し、該2色の蛍光の輝度を2軸においた座標の値の差異から生菌・死菌の他に、それらに分類されない微生物を損傷菌として設定し、死菌の損傷度の評価を行うことを特徴としたものであり、微生物の発光点の色彩的特性を示す特性値を抽出することで、微生物か、微生物以外の夾雑物質であるかを判別することで、複雑な前処理をすることなく特異的に微生物を検出することができ、同じ死菌であっても、損傷度合いや、損傷しやすさを比較することが可能となり、高精度な微生物計数装置を実現できる。また顕微蛍光スペクトル解析機構などの複雑な装置構成を必要とせず、受光フィルタと受像素子で行えるため、よりシンプルかつ小型な微生物計数装置を実現することができる。また、色彩的特性により生菌、死菌をあらかじめ分類することで、生菌のような発光を示す夾雑物と、死菌のような発光を示す夾雑物を、それぞれ精度良く分離することができるため、微生物の認識力の高い微生物計数装置を実現できる。また、生死判断部の後段に微生物判断部を設け、それぞれに色彩的特性を算出して夾雑物を判別して除外することで、生菌だけでなく、死菌の検出精度も高めた微生物計数装置を実現することができる。 In order to achieve the above-mentioned object, the microorganism counter of the present invention comprises a step of fluorescently staining a microorganism as claimed in claim 1, and an image receiving element capable of acquiring an image with the cells of the microorganism as a light emitting point, From the value indicating the color characteristics of the chromaticity or hue angle calculated from at least the luminance values of RGB of the light emitting point from the image, it is any of living microorganisms, dead bacteria, or non-microorganism contaminants A fluorescence evaluation unit for determining whether the fluorescence evaluation unit is a live or dead group for determining whether it is a viable group or a dead group, and whether it is a microorganism or a non-microorganism contaminant thereafter. A microorganism judging unit for judging whether the luminescent point is either a live bacterial group or a dead bacterial group from a parameter indicating a live bacterial group or a dead bacterial group, and the luminous point is Live bacteria, dead bacteria, Ku is determination of whether either of contaminants other than microorganisms, done by comparing Namakingun, the set threshold to each dead bacterial group, and calculates the total number of viable or killed, the In the life and death judgment section, live and dead bacteria are stained with two types of fluorescent dyes, and the brightness of the two colors of fluorescence is classified into those other than live and dead bacteria based on the difference in coordinate values on two axes. It is characterized in that the microorganisms that are not treated are set as damaged bacteria, and the degree of damage of dead bacteria is evaluated, and by extracting characteristic values that indicate the color characteristics of the luminescence points of microorganisms, microorganisms or non-microorganisms are extracted. It is possible to detect microorganisms specifically without complicated pretreatment by determining whether it is a contaminant, and compare the degree of damage and the ease of damage even if the same dead bacteria Therefore, a highly accurate microorganism counting device can be realized. In addition, a complicated apparatus configuration such as a microscopic fluorescence spectrum analysis mechanism is not required, and a light receiving filter and an image receiving element can be used. Therefore, a simpler and smaller microorganism counting apparatus can be realized. In addition, by classifying live and dead bacteria in advance according to color characteristics, it is possible to accurately separate impurities that emit light such as live bacteria and impurities that emit light such as dead bacteria. Therefore, it is possible to realize a microorganism counting apparatus with high microorganism recognition ability. In addition, a microorganism determination unit is provided after the life / death determination unit, and the color characteristics are calculated for each to discriminate and exclude contaminants, thereby improving the detection accuracy of not only live bacteria but also dead bacteria. An apparatus can be realized.

また、請求項記載の微生物計数装置は、請求項記載の微生物計数装置において、生死判断部において、発光点ごとに生死菌染色試薬と死菌染色試薬の染色量を求め、あらかじめ設定されたしきい値を使用して、発光点ごとに生菌群または死菌群のいずれかを示すパラメータを与えることを特徴としたものであり、生菌または死菌であることを判別するために、生菌および死菌の両方に浸透する生死菌染色試薬と、生菌には浸透しにくく死菌に浸透しやすい死菌染色試薬を使用し、2つの染色試薬の染色バランスから死菌染色試薬の染色量を判断することで、例え微生物の菌種や、環境によって生菌でも死菌染色試薬が浸透しやすい場合であったとしても、生死菌染色試薬の浸透量から、死菌試薬の浸透量が多いかどうか、すなわち死菌であるかどうかを客観性を高めて判断することができ、より生菌、死菌の判別感度が高い微生物計数装置を実現できる。また、生菌群、死菌群を分類し、パラメータを与えることで、以降の処理工程の中で、生菌、死菌の分類を行いやすく、処理速度が速い微生物計数装置を実現することができる。 Further, the microorganism counting apparatus according to claim 2, wherein in the microorganism counting apparatus according to claim 1, wherein, in the life and death determination unit obtains the staining of death bacteria staining reagent and killed staining reagent for each light emitting point, a preset Using a threshold value, it is characterized by giving a parameter indicating either a viable group or a dead group for each luminescence point, and in order to determine whether it is a live or dead group, Using a viable and dead bacteria staining reagent that penetrates both live and dead bacteria, and a dead bacteria staining reagent that does not easily penetrate viable bacteria and easily penetrates dead bacteria. Judging the amount of staining, even if it is easy for the dead bacteria staining reagent to permeate, even if it is viable due to the type of microorganism or the environment, the penetration amount of the dead bacteria reagent Whether there are many, ie dead bacteria Rukado or to be able to determine by increasing objectivity, it can be realized more live bacteria, the determination sensitivity of the dead high microorganism counting apparatus. In addition, by classifying live bacteria groups and dead bacteria groups and giving parameters, it is possible to easily classify live bacteria and dead bacteria in the subsequent processing steps, and to realize a microorganism counting device with a high processing speed. it can.

また、請求項記載の微生物計数装置は、請求項1または2記載の微生物計数装置において、微生物を固定する固定部を設けたことを特徴としたものであり、例えばメンブランフィルタなどのろ過膜や、スライドグラス表面、培養ディッシュ底面などの表面に固定する固定部により、微生物の画像を取得する際の露光時間を上げて感度を向上させ、またピントの調節が容易になるため簡便な操作性を実現でき、さらに色彩的特性を求めるために複数の画像にて複数の発光点をまとめて取得することができるため、精度の良い判別装置でかつまとめて処理するため計測を迅速化することを両立させた微生物計数装置を実現することができる。 Further, the microorganism counting apparatus according to claim 3, wherein, in the microorganism counting apparatus according to claim 1 or 2, wherein, which was characterized in that a fixing portion for fixing the microorganism, for example, Ya filtration membrane, such as membrane filter In addition, the fixed part that is fixed to the surface of the slide glass surface, the bottom of the culture dish, etc. improves the sensitivity by increasing the exposure time when acquiring images of microorganisms, and the focus can be easily adjusted, making it easy to operate. In addition, it is possible to obtain multiple emission points in multiple images in order to obtain color characteristics. It is possible to realize a microorganism counting apparatus.

また、請求項記載の微生物計数装置は、請求項から3のいずれかに記載の微生物計数装置において、撮像エリアごとに波長が異なる画像を連続的に取得し、微生物判断部において各画像の輝度から色彩的特性を示す値を算出することを特徴としたものであり、色彩的特性を示す画像を各撮像位置で連続して取得することで、サンプルの変化の影響を受けず、精度の高い画像を取得することができる微生物計数装置を実現できる。 According to a fourth aspect of the present invention, there is provided the microorganism counter according to any one of the first to third aspects, wherein images having different wavelengths for each imaging area are continuously acquired, and the microorganism determination unit determines each image. It is characterized by calculating a value indicating color characteristics from luminance, and by acquiring images showing color characteristics continuously at each imaging position, it is not affected by changes in the sample, and accuracy A microorganism counting apparatus capable of acquiring a high image can be realized.

また、請求項記載の微生物計数装置は、請求項1からのいずれかに記載の微生物計数装置において、取得した各画像に含まれる発光点の座標を抽出する発光点抽出部と、画像ごとに抽出した発光点の座標に補正値を与え、発光点を照合する発光点照合部を備えることを特徴としたものであり、画像の全画素数の膨大なデータから、必要なデータのみ抽出して以降の解析操作を行うことができるため、迅速に計数を行える。また発光点の照合も画像をそのまま行うのではなく、画像から発光点の情報を抜き出した後に行うことで、画像処理時に膨大なデータをメモリに保存して繰返し読みに行く画像処理の負荷が軽減され、迅速な微生物計数装置を実現することができる。 Further, the microorganism counting apparatus according to claim 5 is the microorganism counting apparatus according to any one of claims 1 to 4 , wherein a light emitting point extracting unit that extracts coordinates of light emitting points included in each acquired image, and each image. It is characterized by providing a correction value to the coordinates of the light emission points extracted in the above, and a light emission point collation unit that collates the light emission points, and extracts only the necessary data from the enormous data of the total number of pixels of the image. Since subsequent analysis operations can be performed, counting can be performed quickly. In addition, the comparison of the light emission points is not performed directly on the image, but after the light emission point information is extracted from the image, the load of the image processing for saving a large amount of data in the memory and performing repeated reading during image processing is reduced. Thus, a rapid microorganism counting device can be realized.

また、請求項記載の微生物計数装置は、請求項記載の微生物計数装置において、発光点抽出部において、あらかじめ設定された面積および輝度の範囲内のものを発光点とし、発光点の輝度値を、抽出した対象物の最大輝度値とし、座標を最大輝度値のピクセルの座標とすることを特徴としたものであり、抽出する発光点を輝度と面積で範囲を限定することにより、画像中のゴミやノイズなどをあらかじめ除去し、それらを解析するのにかかる時間等の負荷を軽減し、迅速な微生物計数装置を実現できる。 Further, the microorganism counting apparatus according to claim 6 is the microorganism counting apparatus according to claim 5, wherein the light emission point extraction unit uses a light emission point within a preset area and luminance range, and the luminance value of the light emission point. Is the maximum luminance value of the extracted object, and the coordinates are the coordinates of the pixel of the maximum luminance value, and the range of the light emitting points to be extracted is limited by the luminance and area. It is possible to remove the dust and noise in advance and reduce the load such as time required to analyze them, thereby realizing a rapid microbe counting apparatus.

また、請求項記載の微生物計数装置は、請求項記載の微生物計数装置において、発光点の照合後に一致率を算出し、出力することを特徴としたものであり、発光点の照合に使用する位置補正値が適当であったかを評価する指標とすることができ、もし、一致率が悪かった場合に、補正値を修正して繰返し評価することも可能となり、計数精度を保つことができる微生物計数装置を実現することができる。 Further, the microorganism counting apparatus according to claim 7, wherein, in a microorganism counting apparatus according to claim 5, calculates the matching rate after verification of emission points is obtained by means outputs, used to match the light emitting point That can be used as an index for evaluating whether the position correction value to be used is appropriate. If the matching rate is poor, the correction value can be corrected and repeatedly evaluated, and the microorganism can maintain the counting accuracy. A counting device can be realized.

また、請求項記載の微生物計数装置は、請求項記載の微生物計数装置において、照合する画像に対応する発光点が抽出されない場合に、対応する各画像の座標の輝度値を使用することを特徴としたものであり、発光点を抽出して処理する際に、発光点が一方の画像で検出されなかった場合に、他の発光点を認識してしまう場合や、また対応する発光点が見つからずにエラーを起こしてしまうことを防止することができる。さらに個別の発光点として抽出されないような塊の発光点から、他の画像にある発光点の情報を元に、分離して個別に色彩的特性を求めることができるため、塊に繋がったような微生物であってもそれぞれ生菌、死菌の判別を行うことができ、計数精度が高く、確実な微生物計数装置を実現することができる。 The microorganism counting device according to claim 8 uses the luminance value of the coordinates of each corresponding image when the light emitting point corresponding to the image to be collated is not extracted in the microorganism counting device according to claim 5. When extracting and processing a light emission point, if the light emission point is not detected in one image, the other light emission point is recognized, or the corresponding light emission point is It is possible to prevent an error from occurring without being found. Furthermore, since it is possible to obtain separate color characteristics separately from the light emitting points of a lump that cannot be extracted as individual light emitting points based on the information of the light emitting points in other images, it seems to be connected to the lump. Even if it is a microorganism, it can discriminate | determine a living microbe and a dead microbe, respectively, can implement | achieve a reliable microbe counting apparatus with high counting accuracy.

また、請求項記載の微生物計数装置は、請求項記載の微生物計数装置において、発光点ごとに座標値および取得した各輝度値を持たせたデータを作成し、出力する出力部を備えることを特徴としたものであり、一度測定したデータに対し変数を調整し、再度解析することが可能となり、データの見直しが行えるため、安全性の高いシステムに適用できる微生物計数装置を実現することができる。 In addition, the microorganism counting apparatus according to claim 9 includes an output unit that creates and outputs data having a coordinate value and each acquired luminance value for each light emitting point in the microorganism counting apparatus according to claim 5. It is possible to adjust the variables for the data once measured, analyze it again, and review the data, so that it is possible to realize a microorganism counting device that can be applied to a highly safe system. it can.

また、請求項1記載の微生物計数装置は、請求項1からのいずれかに記載の微生物計数装置において、測定した有効エリアの面積を求める有効エリア算出部を設け、有効エリア面積をもとに生菌または死菌の総数を算出することを特徴としたものであり、微生物の固定部の全表面をスキャンすることによる膨大な検査時間を短縮するために、固定部の一部を測定し、測定した有効エリア面積を算出して全面積から割り返して微生物の全数を求めることにより、大幅に検査時間を短縮することができ、迅速な微生物計数装置を実現することができる。 Further, the microorganism counting apparatus according to claim 1 0, wherein, the original in a microorganism counting apparatus according to any one of claims 1 to 9, the effective area calculating unit for obtaining the area of the effective area measured is provided, the effective area area In order to reduce the enormous amount of inspection time by scanning the entire surface of the fixed part of microorganisms, a part of the fixed part is measured. By calculating the measured effective area and dividing the total effective area to obtain the total number of microorganisms, the inspection time can be greatly reduced, and a rapid microorganism counting apparatus can be realized.

また、請求項1記載の微生物計数装置は、請求項1から1のいずれかに記載の微生物計数装置において、受像素子のドット欠けを含む暗視野画像を取得し、微生物の発光点の画像から減算して除去する輝点除去部を備えることを特徴としたものであり、ドット欠けを誤認識し、発光点を隠してしまうなどに起因するポジティブまたはネガティブエラーを防止し、精度の高い微生物計数装置を実現することができる。 Further, the microorganism counting apparatus according to claim 1 1, wherein, in the microorganism counting apparatus according to any of claims 1 1 0, obtains the dark field image including the missing dots of the image receiving element, the light emitting point of the microorganism It is characterized by having a bright spot removal unit that subtracts and removes from the image, and prevents positive or negative errors caused by misrecognizing missing dots and concealing light emission points. A microorganism counting device can be realized.

本発明の微生物計数装置によれば、死菌の損傷度の評価を行うことにより、同じ死菌であっても、損傷度合いや、損傷しやすさを比較することが可能となり、微生物以外の夾雑物を除外することができ、微生物の発光点を認識する認識力を高め、検出精度を高めることができる。 According to the microorganism counting apparatus of the present invention, it is possible to compare the degree of damage and ease of damage even if the same killed bacteria are evaluated by evaluating the degree of damage of killed bacteria. An object can be excluded, the recognition power which recognizes the luminescent point of microorganisms can be improved, and detection accuracy can be improved.

また、色彩的特性によって微生物を精度良く判別することができる装置を小型かつコンパクトで実現することができる。   In addition, it is possible to realize a small and compact apparatus capable of accurately identifying microorganisms based on color characteristics.

また、微生物を高精度に判別しつつ、迅速に計数を行うことができる。   Further, it is possible to quickly count while distinguishing microorganisms with high accuracy.

また、生菌群、死菌群をあらかじめ分類することで、色彩的特性による夾雑物の判別精度を高めることができる。   In addition, by classifying the live bacteria group and the dead bacteria group in advance, it is possible to improve the discrimination accuracy of the contaminants based on the color characteristics.

また、生死菌染色試薬と死菌染色試薬を使用し、二つの染色試薬の染色量の割合によって死菌染色試薬の染色量を評価することで、一見死菌染色試薬が浸透しているものでも、客観的に染色の妥当性を評価することができ、擬陰性を防止することができる。   In addition, by using a living and dead bacteria staining reagent and a dead bacteria staining reagent, and evaluating the staining amount of the dead bacteria staining reagent according to the ratio of the staining amount of the two staining reagents, it seems that the dead bacteria staining reagent permeates at first glance The validity of staining can be objectively evaluated, and false negatives can be prevented.

また、生菌群、死菌群に分類したときに、パラメータを与えて判別しやすくすることで、夾雑物の判別工程を簡便に行うことができる。   Moreover, when it classify | categorizes into a living microbe group and a dead microbe group, by providing a parameter and making it easy to discriminate | determine, the discrimination | determination process of a foreign substance can be performed simply.

また、微生物を固定することで、画像のピントあわせが容易に行うことができるようになる。   Further, by fixing the microorganisms, it is possible to easily focus the image.

また、複数の波長の画像を切り替えて取得することが可能になり、簡便な装置構成で位置精度の高い色彩特性を取得することができる。   In addition, it is possible to switch and acquire images of a plurality of wavelengths, and it is possible to acquire color characteristics with high positional accuracy with a simple device configuration.

また、微生物を固定することで、2重に数えることなく、正確に計数を行うことができる。   Further, by fixing the microorganisms, it is possible to accurately count without counting twice.

また、微生物を固定することで、複数の微生物を含む発光点を一つの画像に同時に取得することができ、計数を迅速化することができる。   Further, by fixing the microorganisms, it is possible to simultaneously acquire light emitting points including a plurality of microorganisms in one image, and to speed up counting.

また、微生物を固定することで、複数の画像との比較をした際、照合が容易になり、間違えて他の発光点と照合してしまうことを防止することができる。   In addition, by fixing microorganisms, when comparing with a plurality of images, collation becomes easy, and it is possible to prevent mistaken collation with other light emitting points.

また、微生物を固定することで、発光が微弱な染色試薬を使用した場合でも、露光時間をあげて感度を向上させて使用することができ、様々な染色試薬を使用することが可能になり、計数装置のバリエーションを広げることができる。   In addition, by fixing microorganisms, even when a staining reagent with weak luminescence is used, it can be used with improved sensitivity by increasing the exposure time, and it becomes possible to use various staining reagents, The variation of the counting device can be expanded.

また、画像から発光点を抽出することで、膨大な画像データから必要なデータのみを抽出して解析に使用することができ、使用メモリの削減、処理時間および検査時間の削減を図ることができる。   Also, by extracting the light emission points from the image, only the necessary data can be extracted from the vast amount of image data and used for analysis, and the memory used, the processing time and the inspection time can be reduced. .

また、発光点を抽出したのちに発光点のデータを照合することで、画像をあわせることによるデータ処理時間に比べ、データ量が少ないため処理時間を削減することができ、検査を迅速化することができる。   Also, by comparing the data of the light emission points after extracting the light emission points, the processing time can be reduced and the inspection speeded up because the data amount is small compared to the data processing time by combining the images. Can do.

また、発光点を抽出する際に、適切な輝度値と面積の範囲のものを抽出することにより、発光点のなかからゴミなどをある程度削除し、処理を迅速化することができる。   In addition, when extracting the light emitting points, by extracting those having an appropriate luminance value and area, dust or the like can be deleted to some extent from the light emitting points, and the processing can be speeded up.

また、同一撮像エリアにおいて、連続的に波長を切り替えて画像を取得することにより、測定のタイムラグを与えることなく、退色などの経時変化の影響を受けないで精度の高い色彩情報を得ることができる。   In addition, by acquiring images by switching the wavelength continuously in the same imaging area, it is possible to obtain highly accurate color information without being affected by temporal changes such as fading without giving a measurement time lag. .

また、一致率により、発光点の照合精度を常に確認することができ、間違いの少ないデータを得ることができる。   In addition, the matching rate can always check the collation accuracy of the light emitting points, and data with few errors can be obtained.

また、発光点以外の輝度も使用することで、発光点として抽出されなくても、本来の輝度値を取得できることになり、精度を高めることができる。   In addition, by using the luminance other than the light emitting point, the original luminance value can be acquired without being extracted as the light emitting point, and the accuracy can be improved.

また、出力部を設けることで、過去に取得したデータもあらたな条件で確認する事ができ、データを取り直す必要がなくなる。   Also, by providing an output unit, data acquired in the past can be confirmed under new conditions, and there is no need to re-acquire data.

また、有効エリア面積を算出させることで全エリアを計測しなくても、微生物の全数を算出させることができ、測定を省力化することができる。   Further, by calculating the effective area, the total number of microorganisms can be calculated without measuring the entire area, and the measurement can be saved.

また、ドット欠けを除去させることで、擬陰性、擬陽性を防止し、認識精度を高め、安全管理に使用することができる。   Moreover, by removing dot defects, false negatives and false positives can be prevented, recognition accuracy can be improved, and it can be used for safety management.

また、位置ズレ誤差を削除し、各画像の発光点について座標をもとに比較することができるようになり、微生物の判定処理を効率化することができる。   In addition, the positional deviation error can be deleted, and the light emission points of the respective images can be compared based on the coordinates, so that the microorganism determination process can be made efficient.

また、発光点が一方の画像で検出されない場合があっても、発光点のない部分の輝度値を利用することで、より正確性を高めることができる。   Even if the light emitting point may not be detected in one of the images, the accuracy can be further improved by using the luminance value of the portion without the light emitting point.

また、補正値を用いることで、発光点が多い場合に、画像あわせ処理を簡略化し、時間を短縮することができる。   Further, by using the correction value, it is possible to simplify the image matching process and reduce the time when there are many light emitting points.

また、補正値を使用することで、発光点が非常に少ない場合にも、発光点が一致しているかどうかを判断する事ができる。   Further, by using the correction value, it is possible to determine whether or not the light emission points match even when the light emission points are very small.

また、補正値により画像を補正することで、画像処理工程を簡略化し、迅速かつ低コストな画像処理方法とすることができる。   Further, by correcting the image with the correction value, the image processing process can be simplified and a quick and low-cost image processing method can be obtained.

また、蛍光染色試薬の蛍光発光を精度良く評価することにより、より確実に微生物だけを検出することができる。   Further, by accurately evaluating the fluorescence emission of the fluorescent staining reagent, it is possible to detect only microorganisms more reliably.

また、微生物だけを検出することにより、検査結果の確実性が向上し、安全性の高い食品や化成品、水などの製品を提供することができる。   In addition, by detecting only microorganisms, the certainty of test results is improved, and products such as highly safe foods, chemical products, and water can be provided.

また、微生物だけを検出することにより、より確実に微生物の発酵工程を管理することができ、品質の安定した製品を提供することができる。   Further, by detecting only microorganisms, the fermentation process of microorganisms can be managed more reliably, and a product with stable quality can be provided.

また、微生物だけを検出することにより、廃水や土壌などの汚染処理の工程管理が迅速に行えるようになり、効率化された処理技術が実現できる。   Further, by detecting only microorganisms, it becomes possible to quickly manage the process of contamination treatment of waste water, soil, etc., and an efficient treatment technique can be realized.

また、色度、色相角、彩度、明度などの色彩的特性を使用することで、複数の画像の輝度から判別精度の高い蛍光発光の特徴量を示す値を簡便に求めることができる。   In addition, by using chromaticity characteristics such as chromaticity, hue angle, saturation, and brightness, a value indicating the characteristic amount of fluorescent light emission with high discrimination accuracy can be easily obtained from the luminance of a plurality of images.

また、画像あわせにより位置ズレを補正することで、微生物のような非常に小さい発光点であっても、正確に一致させることができる。   Further, by correcting the positional shift by image alignment, even a very small light emitting point such as a microorganism can be accurately matched.

また、各画像から輝度を抽出し、色彩的特性を判別する工程を実行することができる。   Further, it is possible to execute a step of extracting luminance from each image and discriminating color characteristics.

また、同一の発光点の範囲を細胞の大きさ程度とすることで、走査時間を最小限に抑えることができる。   In addition, the scanning time can be minimized by setting the range of the same light emission point to the size of a cell.

また、同一の発光点の範囲を細胞の大きさ程度とすることで、つながった細胞でも、それぞれで輝度値を求め、生菌、死菌の判断をすることができる。   In addition, by setting the range of the same light emission point to be about the size of a cell, it is possible to determine the brightness value of each connected cell and determine whether it is a live cell or a dead cell.

本発明の請求項1記載の発明は、微生物を蛍光染色する工程をもち、前記微生物の細胞を発光点として画像に取得可能な受像素子と、前記画像から少なくとも発光点のRGBの輝度値より演算されて与えられた色度または色相角の色彩的特性を示す値から微生物の生菌、死菌、もしくは微生物以外の夾雑物のいずれかであることを判断する蛍光評価部とを備え、前記蛍光評価部は、生菌群または死菌群のいずれかであることを判断する生死判断部と、それ以降に微生物か微生物以外の夾雑物であるかを判断する微生物判断部とを設け、前記微生物判断部において、生菌群または死菌群を示すパラメータから発光点が生菌群もしくは死菌群のいずれかであることを判断し、発光点が生菌、死菌、もしくは微生物以外の夾雑物のいずれかであるかの判断は、生菌群、死菌群それぞれに設定されたしきい値と比較して行い、生菌または死菌の総数を算出し、前記生死判断部において、2種類の蛍光色素で生菌・死菌を染色し、該2色の蛍光の輝度を2軸においた座標の値の差異から生菌・死菌の他に、それらに分類されない微生物を損傷菌として設定し、死菌の損傷度の評価を行うことを特徴としたものであり、微生物の発光点の色彩的特性を示す特性値を抽出することで、微生物か、微生物以外の夾雑物質であるかを判別でき、複雑な前処理をすることなく特異的に微生物を検出することができ、同じ死菌であっても、損傷度合いや、損傷しやすさを比較することが可能となる作用を有する。また、顕微蛍光スペクトル解析機構などの複雑な装置構成を必要とせず、受光フィルタと受像素子で行えるため、よりシンプルかつ小型化が可能になるという作用を有する。また、色彩的特性により生菌、死菌をあらかじめ分類することで、生菌のような発光を示す夾雑物と、死菌のような発光を示す夾雑物を、それぞれ分離することができるため、微生物の認識力が高まるという作用を有する。また、生死判断部の後段に微生物判断部を設け、それぞれに色彩的特性を算出して夾雑物を判別して除外することで、生菌だけでなく、死菌の検出精度も高めることができるという作用を有する。 According to the first aspect of the present invention, there is provided an image receiving element having a step of fluorescently staining a microorganism and capable of acquiring an image of the microorganism cell as a light emission point, and an RGB luminance value of at least the light emission point from the image. A fluorescence evaluation unit that determines whether the calculated chromaticity or hue angle is a value indicating the chromaticity or hue angle of the microorganism, viable bacteria, dead bacteria, or contaminants other than microorganisms, and The fluorescence evaluation unit is provided with a life / death determination unit that determines whether the group is a viable cell group or a dead cell group, and a microorganism determination unit that determines whether it is a microorganism or a contaminant other than a microorganism after that, In the microorganism judging section, it is judged from the parameter indicating the viable cell group or the dead cell group that the light emitting point is either the live cell group or the dead cell group, and the light emitting point is a live cell, dead cell, or a contaminant other than the microorganism. Whether it is one of things Determination, Namakingun performed compared with set threshold to each dead bacterial group, and calculates the total number of viable or killed, in the life and death decision unit, live bacteria, at two fluorescent dyes Dyeing dead bacteria, and setting the microorganisms not classified into live and dead bacteria as well as live bacteria and dead bacteria based on the difference in the coordinates of the two colors of fluorescence intensity on the two axes. By extracting characteristic values indicating the color characteristics of the luminescence points of microorganisms, it is possible to determine whether they are microorganisms or contaminants other than microorganisms. It is possible to specifically detect microorganisms without carrying out the process, and it is possible to compare the degree of damage and the ease of damage even with the same dead bacteria. In addition, since a complicated apparatus configuration such as a microscopic fluorescence spectrum analysis mechanism is not required and the light receiving filter and the image receiving element can be used, there is an effect that a simpler and smaller size can be achieved. In addition, by classifying live and dead bacteria according to color characteristics in advance, it is possible to separate impurities that show luminescence like live bacteria and impurities that show luminescence like dead bacteria, It has the effect of increasing the ability to recognize microorganisms. In addition, a microorganism determination unit is provided after the life / death determination unit, and color characteristics are calculated for each to discriminate and exclude contaminants, thereby improving the detection accuracy of not only live bacteria but also dead bacteria. It has the action.

また、請求項記載の発明は、生死判断部において、発光点ごとに生死菌染色試薬と死菌染色試薬の染色量を求め、あらかじめ設定されたしきい値を使用して、発光点ごとに生菌群または死菌群のいずれかを示すパラメータを与えることを特徴としたものであり、死菌であるかどうかを客観性を高めて判断することができ、生菌、死菌の判別感度を高めると同時に、パラメータによって処理を効率化することができるという作用を有する。 Further, in the invention according to claim 2 , in the life / death determination unit, the dyeing amount of the life / death bacteria staining reagent and the death bacteria staining reagent is obtained for each light emission point, and a preset threshold value is used for each light emission point. It is characterized by giving a parameter indicating either live or dead bacteria group, and it can judge whether it is dead bacteria with increased objectivity, and sensitivity for distinguishing live and dead bacteria At the same time as increasing the processing efficiency.

また、請求項記載の発明は、微生物を固定する固定部を設けたことを特徴としたものであり、例えばメンブランフィルタなどのろ過膜や、スライドグラス表面、培養ディッシュ底面などの表面に固定することにより、微生物の画像を取得する際の露光時間を上げて感度を向上させるという作用を有する。またピントの調節が容易になるため簡便な操作性を実現できるという作用を有する。さらに複数の画像にて複数の発光点をまとめて取得することができるため、精度良く迅速に行うことができるという作用を有する。 Further, the invention described in claim 3 is characterized in that a fixing part for fixing microorganisms is provided. For example, it is fixed to a filtration membrane such as a membrane filter, a surface of a slide glass, a bottom surface of a culture dish, or the like. This has the effect of increasing the exposure time when acquiring an image of the microorganism and improving the sensitivity. In addition, since it is easy to adjust the focus, there is an effect that simple operability can be realized. Furthermore, since a plurality of light emitting points can be acquired collectively in a plurality of images, it has the effect that it can be performed accurately and quickly.

また、請求項記載の発明は、撮像エリアごとに波長が異なる画像を連続的に取得し、微生物判断部において各画像の輝度から色彩的特性を示す値を算出することを特徴としたものであり、色彩的特性を示す画像を各撮像位置で連続して取得することで、サンプルの退色などの経時変化による影響を受けず、画像の輝度情報の精度を高めることができるという作用を有する。 The invention described in claim 4 is characterized in that images having different wavelengths for each imaging area are continuously acquired, and a value indicating a color characteristic is calculated from the luminance of each image in a microorganism judging unit. There is an effect that the accuracy of the luminance information of the image can be improved without being affected by the temporal change such as fading of the sample by continuously acquiring the images showing the color characteristics at each imaging position.

また、請求項記載の発明は、取得した各画像に含まれる発光点の座標を抽出する発光点抽出部と、画像ごとに抽出した発光点の座標に補正値を与え、発光点を照合する発光点照合部を備えることを特徴としたものであり、画像の全画素数の膨大なデータから、必要なデータのみ抽出して以降の解析操作を行うことができるため、迅速に計数を行うことができという作用を有する。また発光点の照合を、画像をそのまま行うのではなく、画像から発光点の情報を抜き出した後に行うことで、画像処理時に膨大なデータをメモリに保存して繰返し読みに行く画像処理の負荷を軽減することができるという作用を有する。 According to the fifth aspect of the present invention, a light emission point extraction unit that extracts the coordinates of the light emission points included in each acquired image, and a correction value is given to the coordinates of the light emission points extracted for each image to collate the light emission points. Equipped with a light-emitting point matching unit, and since it can extract only necessary data from the enormous amount of data of the total number of pixels in the image and perform subsequent analysis operations, it can quickly count Has the effect of being able to. Also, by comparing the light emission points after extracting the light emission point information from the image instead of performing the image as it is, the image processing load of storing a large amount of data in the memory and reading it repeatedly during image processing is reduced. It has the effect that it can be reduced.

また、請求項記載の発明は、発光点抽出部において、あらかじめ設定された面積および輝度の範囲内のものを発光点とし、発光点の輝度値を、抽出した対象物の最大輝度値とし、座標を最大輝度値のピクセルの座標とすることを特徴としたものであり、抽出する発光点を輝度と面積で範囲を限定することにより、画像中のゴミやノイズなどをあらかじめ除去し、それらを解析するのにかかる時間等の負荷を軽減することができ、迅速化するという作用を有する。 Further, in the invention according to claim 6 , in the light emission point extraction unit, a light emission point is within a preset area and luminance range, and the luminance value of the light emission point is set as the maximum luminance value of the extracted object, The coordinates are the coordinates of the pixel with the maximum luminance value, and by limiting the range of the light emitting points to be extracted with the luminance and area, dust and noise in the image are removed in advance, It is possible to reduce the load such as time required for analysis, and to speed up the operation.

また、請求項記載の発明は、発光点の照合後に一致率を算出し、出力することを特徴としたものであり、発光点の照合に使用する位置補正値が適当であったかを再度評価する指標とすることができるため、データの精度を向上させることができるという作用を有する。 The invention according to claim 7 is characterized in that the coincidence rate is calculated and output after collating the light emitting points, and it is evaluated again whether the position correction value used for collating the light emitting points is appropriate. Since it can be used as an index, it has an effect that the accuracy of data can be improved.

また、請求項記載の発明は、照合する画像に対応する発光点が抽出されない場合に、対応する各画像の座標の輝度値を使用することを特徴としたものであり、発光点を抽出して処理する際に、発光点が一方の画像で検出されなかった場合に、他の発光点を認識してしまう場合や、また対応する発光点が見つからずにエラーを起こしてしまうことを防止し、安定して計測を行うことができるという作用を有する。また、個別の発光点として抽出されないような塊の中の発光点から、個別に色彩的特性を求めることができるため、複数個繋がったような微生物であっても別々に生菌、死菌の判別を行うことができ、計数精度を高めることができるという作用を有する。 The invention described in claim 8 is characterized in that when a light emitting point corresponding to an image to be collated is not extracted, a luminance value of coordinates of each corresponding image is used, and the light emitting point is extracted. If a light-emitting point is not detected in one image during processing, the other light-emitting points are not recognized, or the corresponding light-emitting point is not found and an error is prevented. It has the effect that measurement can be performed stably. In addition, since the color characteristics can be obtained individually from the light emission points in the lump that cannot be extracted as individual light emission points, even if there are a plurality of microorganisms connected to each other, live and dead bacteria can be separately obtained. Discrimination can be performed, and the counting accuracy can be increased.

また、請求項記載の発明は、発光点ごとに座標値および取得した各輝度値を持たせたデータを作成し、出力する出力部を備えることを特徴としたものであり、一度測定したデータに対し変数を調整し、再度解析することが可能となり、データの見直しが行えるため、測定結果の精度を高めることができるという作用を有する。 The invention according to claim 9 is characterized in that it includes an output unit that creates and outputs data having a coordinate value and each acquired luminance value for each light emitting point, and is measured once. Therefore, it is possible to adjust the variables and analyze again, and the data can be reviewed, so that the accuracy of the measurement result can be increased.

また、請求項1記載の発明は、測定した有効エリアの面積を求める有効エリア算出部を設け、有効エリア面積をもとに生菌または死菌の総数を算出することを特徴としたものであり、微生物の固定部の全表面をスキャンすることによる膨大な検査時間を短縮するために、固定部の一部を測定し、測定した有効エリア面積を算出して全面積から割り返して微生物の全数を求めることにより、大幅に検査時間を短縮することができるという作用を有する。 The invention of claim 1 0, wherein the effective area calculating unit for obtaining the area of the effective area measured provided, which was characterized by calculating the total number of live bacteria or killed based on the effective area size Yes, in order to shorten the huge inspection time by scanning the entire surface of the fixed part of the microorganism, a part of the fixed part is measured, the measured effective area is calculated, and it is calculated from the total area and divided. By obtaining the total number, the inspection time can be greatly shortened.

また、請求項1記載の発明は、受像素子のドット欠けを含む暗視野画像を取得し、微生物の発光点の画像から減算して除去する輝点除去部を備えることを特徴としたものであり、ドット欠けを誤認識し、発光点を隠してしまうなどに起因する擬陽性または擬陰性を防止することができるという作用を有する。 The invention of claim 1 1 wherein the one obtains the dark field image including the missing dots of the image receiving element was characterized in that it comprises a bright point removal portion is removed by subtracting from the image of the light-emitting point of the microorganism It has the effect of preventing false positives or false negatives caused by misrecognizing missing dots and hiding the light emission points.

(実施の形態1)
まず、微生物を含む試料を測定するために、固定部となるスライドグラスや、培養ディッシュ、マルチウェルプレート、またはろ過膜や、測定に適した形状を持つセルの観察面表面の表側、もしくは裏側の一方に微生物を固定する。固定は、ポリ‐L‐リジンのような試薬や、ゼラチンなどの粘着性、付着性をもった高分子材料を表面に薄く塗布し、微生物を含んだ試料を滴下し、表面に吸着させる。またメンブランフィルタのようなろ過膜の場合、上方から液体試料を吸引してろ過し、メンブランフィルタ表面に微生物を平面状に捕捉し、固定する。本発明において、最も好適に実施するものとしては、このようなろ過膜を使用することで、以下の染色や洗浄などの操作が簡便かつ微生物を流失することなく扱うことができるのでよい。また、メンブランフィルタは、薄く、小さいため、そのままでは取り扱いが容易でない。そのため、専用の支持台、吸引口付きのホルダーを使用したり、もしくは膜に保持部を結合するか、一体化させたデバイスとすることで容易に膜を取り扱うことができる。
(Embodiment 1)
First, in order to measure a sample containing microorganisms, a slide glass as a fixed part, a culture dish, a multi-well plate, or a filtration membrane, or the front side or the back side of the observation surface of a cell having a shape suitable for measurement Fix microorganisms on one side. For immobilization, a reagent such as poly-L-lysine or a polymer material having adhesiveness or adhesion such as gelatin is thinly applied to the surface, and a sample containing microorganisms is dropped and adsorbed on the surface. In the case of a membrane filter such as a membrane filter, a liquid sample is sucked from above and filtered, and microorganisms are captured and fixed on the surface of the membrane filter in a flat shape. In the present invention, it is most preferable to use such a filtration membrane because the following operations such as staining and washing can be handled easily and without losing microorganisms. Further, since the membrane filter is thin and small, it is not easy to handle as it is. Therefore, the membrane can be handled easily by using a dedicated support base, a holder with a suction port, or by connecting the holding portion to the membrane, or by forming an integrated device.

また本発明において微生物を含有するか含有する可能性のある検体は液状検体であるが、検査対象が飲料水などの液状サンプルの場合は、それ自体が液状検体となる。検査対象が野菜や肉をはじめとする食材などの固体サンプルの場合は、それをホモジナイズして液状検体としたり、その表面から綿棒などを用いて細胞および微生物を採取し、これを生理食塩水や燐酸緩衝液などに遊離させて液状検体としたりする。また、まな板などの調理器具などが検査対象となる場合、その表面から綿棒などを用いて微生物を採取し、これを生理食塩水などに遊離させて液状検体とする。こうした液状検体をメンブランフィルタで吸引および加圧濾過、また場合によっては超音波を利用して加振ろ過することでメンブランフィルタ上に細胞および微生物を捕捉することができる。   In the present invention, the specimen containing or possibly containing the microorganism is a liquid specimen. However, when the test object is a liquid sample such as drinking water, the specimen itself is a liquid specimen. If the object to be inspected is a solid sample such as vegetables or meat, homogenize it to obtain a liquid sample, or collect cells and microorganisms from the surface using a cotton swab, etc. It is released into a phosphate buffer or the like to make a liquid sample. When a cooking utensil such as a cutting board is an object to be inspected, microorganisms are collected from the surface using a cotton swab or the like and released into physiological saline or the like to obtain a liquid sample. Cells and microorganisms can be captured on the membrane filter by aspirating and pressure-filtering such a liquid specimen with a membrane filter, and in some cases, by vibrating and filtering using ultrasonic waves.

また、固定部としては、メンブランフィルタ以外にも、プレパラート表面や、可視光の透過性が高く、平面性の高いプレートの表面や、プレート間の間隙に固定し、もしくは粘着性を持ったシート状、ディスク状のチップデバイス表面、平板培地表面、もしくはシャーレやディッシュ、マルチウェルプレートなどの表面、電極材料や吸着材料の表面などに行う。このとき、固定は、遠心力や、静電気力、誘電泳動力、疎水力などの物理吸着力以外にも、ゼラチンなどの接着成分によるものや、抗原・抗体反応、リガンド・レセプターの反応などの生物的な結合力を用いることができる。   In addition to the membrane filter, the fixing part is fixed to the preparation surface, the surface of a plate with high visible light transmission and high flatness, and the gap between the plates, or a sticky sheet. It is performed on the surface of a disk-shaped chip device, the surface of a flat plate medium, or the surface of a petri dish, dish, multiwell plate or the like, the surface of an electrode material or an adsorbing material. At this time, fixation is not limited to physical adsorption forces such as centrifugal force, electrostatic force, dielectrophoretic force, and hydrophobic force, but also due to an adhesive component such as gelatin, or an organism such as an antigen / antibody reaction or a ligand / receptor reaction. Bond strength can be used.

また、蛍光染色試薬の浸透を調整するために、必要に応じて、適当な濃度の2価金属錯体や、カチオン性界面活性剤を混合した水溶液などを液体試料に混合させるか、もしくは細胞および微生物が固定部の上方から接触、またはろ過するか、または下方から接触させるなどの手法により、細胞および微生物の細胞膜透過性を一定に保たせることができる。   In addition, in order to adjust the penetration of the fluorescent staining reagent, an appropriate concentration of a divalent metal complex, an aqueous solution mixed with a cationic surfactant, or the like is mixed with a liquid sample, or cells and microorganisms are mixed. The cell membrane permeability of cells and microorganisms can be kept constant by a method such as contacting from above the fixed part, filtering, or contacting from below.

なお、2価金属錯体としては、エチレンジアミン四酢酸などを0.5から100mM程度の濃度範囲にて使用する。   In addition, as a bivalent metal complex, ethylenediaminetetraacetic acid or the like is used in a concentration range of about 0.5 to 100 mM.

なお、カチオン性界面活性剤としては、Tween20やTween60、Tween80、TritonX−100などの細胞に対して侵襲性が低いものが使用でき、これらを0.01から1%程度の濃度範囲にて使用する。   As the cationic surfactant, those having low invasiveness to cells such as Tween 20, Tween 60, Tween 80, Triton X-100 can be used, and these are used in a concentration range of about 0.01 to 1%. .

次に蛍光染色手段として、乾燥防止成分を混合し、生死菌染色試薬または死菌染色試薬のいずれか、または両方を一定濃度含む染色試薬を固定表面に一定量滴下する。   Next, as a fluorescent staining means, a drying prevention component is mixed, and a fixed amount of a staining reagent containing a fixed concentration of either a live or dead bacteria staining reagent or a dead bacteria staining reagent or both is dropped onto the fixed surface.

蛍光色素は、核酸結合性の構造をもつが好ましく、生死菌染色試薬として使用するものは、紫外励起で青色蛍光を発するものであれば、1,4−ジアミジノ―2−フェニルインドール、青色励起で緑色蛍光または黄緑色、黄色蛍光を発するもので、例えばアクリジンオレンジ、オキサゾールイエロー、チアゾールオレンジや、SYTO9、SYTO13、SYTO16、SYTO21、SYTO24、SYBR Green I、SYBR Green II、SYBR Goldなどのポリメチン架橋非対称シアニン色素系化合物が使用できる。また、用途によってはグラム陽性菌を染色し、グラム陰性菌は染色されないヨウ化ヘキシジウムなどの生死菌染色試薬を使用することも有効である。   The fluorescent dye preferably has a nucleic acid binding structure, and the one used as a viable and dead bacteria staining reagent is 1,4-diamidino-2-phenylindole or blue excitation if it emits blue fluorescence under ultraviolet excitation. It emits green fluorescence, yellow green, yellow fluorescence, for example, acridine orange, oxazole yellow, thiazole orange, polymethine cross-linked asymmetric cyanine such as SYTO9, SYTO13, SYTO16, SYTO21, SYTO24, SYBR Green I, SYBR Green II, SYBR Gold A dye compound can be used. Further, depending on the use, it is also effective to use a viable and dead bacteria staining reagent such as hexididium iodide that stains Gram-positive bacteria and does not stain Gram-negative bacteria.

また、死菌染色試薬としては、緑色蛍光を発するもので、例えばアクリジン2量体、チアゾールオレンジ2量体、オキサゾールイエロー2量体などのモノメチン架橋非対称シアニン色素2量体や、SYTOX Green、TO−PRO−1などのモノメチン架橋非対称シアニン色素系化合物、赤色蛍光を発するものであれば、ヨウ化プロピジウム、臭化ヘキシジウム、臭化エチジウム、LDS−751、SYTOX Orangeなどのポリメチン架橋非対称シアニン色素などが使用できる。   In addition, the killed bacteria staining reagent emits green fluorescence. For example, monomethine cross-linked asymmetric cyanine dye dimers such as acridine dimer, thiazole orange dimer, oxazole yellow dimer, SYTOX Green, TO- Monomethine-bridged asymmetric cyanine dye compounds such as PRO-1 and polymethine-bridged asymmetric cyanine dyes such as propidium iodide, hexium bromide, ethidium bromide, LDS-751, and SYTOX Orange are used as long as they emit red fluorescence. it can.

なお、これらの蛍光色素は、細胞および微生物を含む試料に対して、あらかじめ0.1から100μMとなるようを混合しておき、同時に作用させるか、もしくは別々に、時間を置かず、もしくは適当な時間間隔を開けて所定の濃度で作用させることとする。   In addition, these fluorescent dyes are mixed with a sample containing cells and microorganisms in advance so as to be 0.1 to 100 μM and are allowed to act simultaneously or separately, without taking time, or appropriate The action is performed at a predetermined concentration with a time interval.

なお、メンブランフィルタ上に捕捉した細胞および微生物を含む物質表面が、測定中に乾燥し、発光強度が変化することを防ぐための手段として、染色試薬には10から60%w/vのグリセロールや、10から90%v/vのD(−)−マンニトールやD(−)−ソルビトールなどの糖アルコール類のいずれかを1種類以上混合させておく。   As a means for preventing the surface of the substance containing cells and microorganisms captured on the membrane filter from being dried during measurement and changing the luminescence intensity, 10 to 60% w / v glycerol or One or more sugar alcohols such as 10 to 90% v / v of D (-)-mannitol and D (-)-sorbitol are mixed.

なお、乾燥固化して保存する目的として、ポリビニルアルコールを10から80%程度の適当な濃度にて混合、もしくは後から表面を覆うことで、蛍光発光を比較的安定に保存することができる。   In addition, for the purpose of drying and solidifying, it is possible to store fluorescence emission relatively stably by mixing polyvinyl alcohol at an appropriate concentration of about 10 to 80% or covering the surface later.

なお、固定部として適しているメンブランフィルタとしては、例えば、孔径が0.2μm〜1μmのポリカーボネート製など公知のものを用いることができる。   In addition, as a membrane filter suitable as a fixing | fixed part, well-known things, such as the product made from a polycarbonate with a hole diameter of 0.2 micrometer-1 micrometer, can be used, for example.

また、画像検出には、蛍光色素に対して特定の波長を照射するための励起光源、分光フィルタ、励起光を直径3mm程度に集光する為の集光レンズ、励起光の成分を除去する為のハイパスフィルタ、試料から発せられる蛍光から特定の波長成分を取り出すための受光フィルタ、拡大する為のレンズユニット、蛍光像を画像の電気信号に変換するためのCCDやCMOSなどの受像素子により構成される。   For image detection, an excitation light source for irradiating a fluorescent dye with a specific wavelength, a spectral filter, a condensing lens for condensing the excitation light to a diameter of about 3 mm, and an excitation light component are removed. High-pass filter, light receiving filter for extracting specific wavelength components from fluorescence emitted from the sample, lens unit for enlarging, CCD and CMOS image receiving elements for converting the fluorescent image into electrical image signals Is done.

蛍光染色試薬として使用する蛍光色素の主な発光波長であるが、例えば、青色励起の場合には波長が470nmから510nm付近の波長成分を含む励起光を照射した場合、波長が510nmから540nm付近の蛍光を発する。緑色励起の場合には、510nmから550nm付近の波長成分を含む励起光を照射し、波長が560から620nm付近の蛍光を発する。オレンジ色励起の場合には、波長が540nmから610nm付近の波長成分を含む励起光を照射した場合、波長が560nmから630nm付近の蛍光を発する。   This is the main emission wavelength of the fluorescent dye used as the fluorescent staining reagent. For example, in the case of blue excitation, when the excitation light containing a wavelength component in the vicinity of 470 nm to 510 nm is irradiated, the wavelength is in the vicinity of 510 nm to 540 nm. Fluoresce. In the case of green excitation, excitation light including a wavelength component in the vicinity of 510 nm to 550 nm is irradiated, and fluorescence having a wavelength in the vicinity of 560 to 620 nm is emitted. In the case of orange excitation, when excitation light including a wavelength component having a wavelength of 540 to 610 nm is irradiated, fluorescence having a wavelength of 560 to 630 nm is emitted.

そのため、検出手段である励起光源として、発光ダイオードを使用する場合、青色のものでは、好ましくは480nm付近の波長を発することができるもの、緑色のものでは、好ましくは535nm付近の波長を発することができるもの、黄色からオレンジ色のものでは、好ましくは560nm付近の波長を発することができるものを使用する。   Therefore, when a light emitting diode is used as an excitation light source as a detection means, a blue light source can emit a wavelength of preferably around 480 nm, and a green light source preferably emits a wavelength of around 535 nm. Among those that can be produced, those that are capable of emitting a wavelength of around 560 nm are preferably used.

なお、発光ダイオードを使用する場合、励起光の成分が広帯域に渡る場合が多く、蛍光画像のバックグラウンドの増加の要因となりうるため、適切な干渉フィルタを使用して、特定の波長成分を切り出して使用する。   In addition, when using a light emitting diode, the excitation light component often extends over a wide band, which may increase the background of the fluorescent image, so use a suitable interference filter to cut out a specific wavelength component. use.

また、励起光源としてレーザーを用いる場合には、青色のものでは、好ましくは475nm付近の波長を発することができるもの、緑色のものでは、好ましくは535nm付近の波長を発することができるものを使用する。   When a laser is used as the excitation light source, a blue light source that can emit a wavelength of preferably around 475 nm is used, and a green light source that can emit a wavelength of preferably around 535 nm is used. .

また、励起光源としてハロゲンランプや水銀ランプを使用する場合には、適当な分光フィルタとして、染色試薬の励起波長に合わせて最適な干渉フィルタを使用することができる。また、0.1から10nmの波長分解能を有する反射型や透過型の回折格子により、最適な角度を与え、任意の波長を含む励起光を取り出すことができる。   When a halogen lamp or a mercury lamp is used as the excitation light source, an optimum interference filter can be used as an appropriate spectral filter according to the excitation wavelength of the staining reagent. In addition, the reflection angle or transmission type diffraction grating having a wavelength resolution of 0.1 to 10 nm can give an optimum angle and extract excitation light including an arbitrary wavelength.

集光レンズは、蛍光染色された細胞および微生物が展開されているメンブレンフィルタに対し、照射範囲が、例えば直径が3mm程度の一定面積となるよう励起光を照射することができる。さらに光を散乱させるための拡散板などを上流側に組み合わせることでより均一な励起光を照射することもできる。   The condensing lens can irradiate the membrane filter on which the fluorescently stained cells and microorganisms are spread so that the irradiation range is, for example, a constant area having a diameter of about 3 mm. Furthermore, a more uniform excitation light can be irradiated by combining a diffuser plate for scattering light on the upstream side.

サンプルに照射された励起光により発生した蛍光は、ハイパスフィルタを通過することで、色彩的特性は損なわれず、効果的に励起光由来の光成分がカットされる。   The fluorescence generated by the excitation light applied to the sample passes through the high-pass filter, so that the color characteristics are not impaired, and the light component derived from the excitation light is effectively cut.

当該蛍光はレンズユニットを通し、受光部として単板カラーCCDや、赤色(R)、緑色(G)、青色(B)の3原色を取得できるRGB3種類の蛍光フィルタを含む3CCDなどの電荷結合素子ユニットを用いて露光時間0.1秒から10秒程度の露光時間でRGB3色からなる画像撮影することにより取得される。   The fluorescent light passes through a lens unit, and a charge coupled device such as a single CCD CCD as a light receiving unit, or a 3CCD including three types of RGB fluorescent filters capable of acquiring three primary colors of red (R), green (G), and blue (B). It is obtained by photographing an image composed of three colors of RGB with an exposure time of about 0.1 to 10 seconds using the unit.

取得する色の輝度情報は、蛍光染色試薬である蛍光色素の蛍光波長範囲であれば、使用可能である。例えばシアニン色素であるSYBR Greenの場合、極大蛍光波長は521nmであるが、蛍光スペクトルは620nm付近まで広がっており、生死菌染色試薬として使用した場合、530nm付近の緑色(G)を画像(a)、610nm付近の赤色(R)を画像(b)として取得することができ、(a)、(b)を使用して微生物と夾雑物との判別が行える。   The luminance information of the color to be acquired can be used as long as it is in the fluorescence wavelength range of the fluorescent dye that is the fluorescent staining reagent. For example, in the case of SYBR Green, which is a cyanine dye, the maximum fluorescence wavelength is 521 nm, but the fluorescence spectrum extends to around 620 nm, and when used as a staining reagent for viable and dead bacteria, green (G) around 530 nm is image (a). , Red (R) in the vicinity of 610 nm can be acquired as an image (b), and microorganisms and contaminants can be discriminated using (a) and (b).

また、単板モノクロCCDやCMOSを使用した場合、適切な受光フィルタを切り替えて使用することで、必要な波長の輝度情報を含む画像を取得することができる。このとき、別の利点として、同一のCCDを使用することで、異なるCCDによる感度特性の差の影響は全く受けずに測定を行うことが可能となり、感度補正を行う工程を省略することができる。   In addition, when a single-plate monochrome CCD or CMOS is used, an image including luminance information of a necessary wavelength can be acquired by switching and using an appropriate light receiving filter. At this time, as another advantage, by using the same CCD, it becomes possible to perform measurement without being affected by the difference in sensitivity characteristics between different CCDs, and the step of performing sensitivity correction can be omitted. .

これらの操作により取得された複数の蛍光画像は、演算部であるマイコンや外部端末上のプログラムによって処理される。   A plurality of fluorescent images acquired by these operations are processed by a microcomputer as a calculation unit or a program on an external terminal.

演算部には、画像からドット欠けなどの輝点を除去するための輝点除去部と、画像から発光点を抽出するための発光点抽出部、複数の画像の発光点を照合し、一致させる発光点照合部、照合されて数値が結合されたデータを出力する出力部、蛍光発光を評価する蛍光評価部、染色試薬の輝度より微生物の生死を判別する生死判断部、そして色彩的特性を表す変数によって発光点が微生物もしくは夾雑物であることを判別する微生物判断部、そして測定した画像の有効面積を算出する有効エリア算出部により構成される。   The calculation unit collates and matches the luminescent spot removing unit for removing luminescent spots such as missing dots from the image, the luminescent point extracting unit for extracting luminescent points from the image, and the luminescent points of a plurality of images. A light emission point collation unit, an output unit that outputs collated numerical data, a fluorescence evaluation unit that evaluates fluorescence emission, a life / death judgment unit that distinguishes the life and death of microorganisms from the brightness of a staining reagent, and a color characteristic It comprises a microorganism determination unit that determines whether a light emitting point is a microorganism or a contaminant, and an effective area calculation unit that calculates an effective area of a measured image.

まず、輝点除去部であるが、これはCCDなどの受像素子に見られる画素ピクセルの感度ムラや、感度消失した部分によるドット欠けと呼ばれる現象があるが、このドット欠けの輝点が画像上に現れると、微生物の発光点と間違える恐れがあるか、または微生物の発光点を取得できない原因となり、誤差の要因となりうる。そのためこのような輝点は除去する必要があるが、輝点除去用の画像として、光源を照射しない暗視野画像を、露光時間をサンプル測定と同程度かもしくは長めに設定して取得し、輝点のみが写っている画像を得る。そして発光点を写した各画像から輝点画像を減算することにより、輝点のみを削除することが可能となる。そのようにして輝点を除去した画像を以下において使用する。   First, there is a bright spot removing unit. This is a pixel pixel sensitivity irregularity found in a CCD or other image receiving element, or a phenomenon called dot missing due to a loss of sensitivity. If it appears above, it may be mistaken for the luminescence point of the microorganism, or the luminescence point of the microorganism cannot be obtained, which may cause an error. For this reason, it is necessary to remove such bright spots, but as a bright spot removal image, a dark field image that is not irradiated with a light source is acquired by setting the exposure time to be the same as or longer than that of the sample measurement. Get an image with only points. Then, it is possible to delete only the bright spot by subtracting the bright spot image from each image showing the light emitting spot. The image in which the bright spots are removed in this way is used below.

発光点抽出部について、画像中に含まれる発光点のうち、設定された面積、輝度の範囲に該当するものを抽出する。例えば、面積を2から15、輝度を15から255とすると、面積が16以上であるような大きい夾雑物はあらかじめカウントから除外することができ、また輝度が14以下のバックグラウンドノイズ(暗ノイズ)を除去することができる。このしきい値は、レンズの倍率や、励起光源の強度、露光時間などにより最適な値が変化するため、微生物を最適に抽出できる値は、あらかじめ検証して確認することが必用である。   About a light emission point extraction part, the thing corresponding to the set area and the range of a brightness | luminance is extracted among the light emission points contained in an image. For example, if the area is 2 to 15 and the luminance is 15 to 255, a large foreign object having an area of 16 or more can be excluded from the count in advance, and background noise (dark noise) having a luminance of 14 or less. Can be removed. Since the optimum value of this threshold value varies depending on the magnification of the lens, the intensity of the excitation light source, the exposure time, etc., it is necessary to verify and confirm in advance the value at which microorganisms can be optimally extracted.

なお、最大輝度を示した座標の(x、y)の値、RGBの値を含む場合、それぞれの輝度も数値として同時に抽出される。この処理は、汎用的な画像処理ソフトウェアであるImage Pro Plusなどを使用して実行できる。また、同様の処理を組み込んだプログラムとすることもできる。   In addition, when the value of (x, y) of the coordinate which showed the maximum brightness | luminance and the value of RGB are included, each brightness | luminance is simultaneously extracted as a numerical value. This processing can be executed using Image Pro Plus, which is general-purpose image processing software. Moreover, it can also be set as the program incorporating the same process.

次に発光点照合部によって、抽出された発光点の数値データと、異なる輝度情報を含む同位置の発光点の数値データとを、座標をもとに比較、照合され、結合される。   Next, the light emission point collating unit compares the numerical data of the extracted light emitting points with the numerical data of the light emitting points at the same position including different luminance information, collates them, and combines them.

このとき、異なる輝度情報を含む画像とは、異なる受光フィルタで取得された画像のことを指すが、画像間では受光フィルタの特性や、機械的誤差に起因する座標ズレがわずかに生じる為、そのまま画像のピクセル座標を照合した場合、一致しないことがある。そこで、一方の座標に画像ズレを補正する座標補正値を補って照合させるのだが、特に機械的誤差については温湿度などの使用環境の影響により、使用するごとに座標ズレの値が変化してしまう場合がある。そのため、座標補正値を測定毎に更新して使用することで、測定ごとに最適な値を使用することが有効である。   At this time, an image including different luminance information refers to an image acquired by a different light receiving filter, but there is a slight difference in coordinates between the images due to the characteristics of the light receiving filter and mechanical errors. If the pixel coordinates of the image are collated, they may not match. Therefore, the coordinate correction value that corrects image misalignment is added to one coordinate and collated, but especially for mechanical errors, the value of the coordinate misalignment changes with each use due to the influence of the usage environment such as temperature and humidity. May end up. Therefore, it is effective to use the optimum value for each measurement by updating and using the coordinate correction value for each measurement.

画像中に見られる微生物の発光点を示すオブジェクトは、拡大レンズ系の合計が200から300倍程度のときは、オブジェクトの面積は受像素子上で1から20ピクセル程度になる。これは微生物の細胞1個の直径が0.6から5μm程度であるときに撮像された値である。一方、微生物細胞が2から複数個繋がっていた場合、発光点のオブジェクトの面積は大きくなり、20ピクセルを越えるものも見られる。このような大きな発光点のオブジェクトは、共焦点光学系などの特殊な光学系を使用しない限りは、殆どの場合一つのオブジェクトとして検出され、二つのオブジェクトを分離して検出することが難しい。このとき問題となるのは、二つのオブジェクトが異なる発光特性をもつ場合に、各画像を比較して発光点を照合して輝度を結合したときに、同一のオブジェクトとして検出される、隣り合った微生物の発光輝度を誤って結合してしまうと、本来の微生物の発光特性とは全く異なる不正確なデータが形成されてしまうという恐れがある。そのような事例を防止するためには、発光点の座標をオブジェクトの最大輝度値を示す座標とし、画像間の発光点を照合するときは、その座標から非常に近傍に限定された誤差範囲エリア内にあるもう一方の画像の座標をもつ発光点とのみ結合されるようにすることが必要である。   When the total of the magnifying lens system is about 200 to 300 times, the area of the object showing the luminescence point of the microorganisms seen in the image is about 1 to 20 pixels on the image receiving element. This is a value taken when the diameter of one microbial cell is about 0.6 to 5 μm. On the other hand, when two or more microbial cells are connected to each other, the area of the object of the light emission point becomes large, and some objects exceed 20 pixels. Such an object having a large light emitting point is detected as one object in most cases unless a special optical system such as a confocal optical system is used, and it is difficult to detect two objects separately. The problem at this time is that when two objects have different light emission characteristics, adjacent images are detected as the same object when the luminance is compared by comparing the light emission points by comparing the images. If the light emission luminance of microorganisms is mistakenly combined, inaccurate data that is completely different from the light emission characteristics of the original microorganisms may be formed. In order to prevent such a case, the coordinates of the light emitting point are the coordinates indicating the maximum luminance value of the object, and when collating the light emitting point between images, an error range area limited to the very vicinity from the coordinates. It is necessary to be coupled only with the light emitting point having the coordinates of the other image inside.

そのため、同一の発光点のオブジェクトとして抽出されているものであっても、照合した場合に一致しないことがありうる。そのとき結合する輝度データが存在しなくなってしまうことを防止するために、照合するもう一方の画像に一致する発光点が検出されなかった場合に、もう一方の画像中の同じ座標のピクセルの輝度値を抽出し、この値を結合させることが有効である。これにより、発光点が一方の画像でしか抽出されなかった場合でも、輝度情報を欠如させることなく、精度よく照合データを作成することができることになる。   Therefore, even objects extracted as objects with the same light emission point may not match when collated. In order to prevent the luminance data to be combined from being lost at that time, the luminance of the pixel of the same coordinate in the other image is detected when the light emitting point matching the other image to be compared is not detected. It is useful to extract values and combine these values. As a result, even when the light emitting point is extracted from only one image, the collation data can be created with high accuracy without losing the luminance information.

また、最終菌数の検出精度にも関連するが、生菌と死菌が繋がって存在している場合、上記のような工程を持たせなければ、オブジェクトを死菌として検出してしまう可能性があるが、これにより生菌と死菌が繋がったものとして検出することができるようになり、培養法などとの相関性が向上することに繋がる。   In addition, although related to the detection accuracy of the final number of bacteria, there is a possibility that an object will be detected as dead if it does not have the above-mentioned process when living and dead bacteria are connected. However, this makes it possible to detect that live and dead bacteria are connected, leading to improved correlation with culture methods and the like.

照合されて結合されたデータは、出力部によりデータファイルとして出力される。この時点でデータファイルとして保存することで、この後の工程を一度にまとめて処理することも可能となるため、作業が効率化される。   The collated and combined data is output as a data file by the output unit. By saving as a data file at this time, it is possible to process the subsequent processes all at once, thus improving the efficiency of the work.

発光点の輝度情報をもつデータファイルに対して、生死判断部によって発光点が生菌群であるか、もしくは死菌群であるかいずれかに分類される。このとき、生菌群、もしくは死菌群であることを示すパラメータを与えることで、以降の処理が行いやすくなり、処理を効率化することができる。尚、パラメータとは生菌群であれば1、死菌群であれば2であるというように、発光点のデータの変数を与えることにより行うこととする。   For the data file having the luminance information of the light emission point, the life-and-death determining unit classifies the light emission point as either the live bacteria group or the dead bacteria group. At this time, by giving a parameter indicating that it is a viable cell group or a dead cell group, the subsequent processing can be easily performed, and the processing can be made efficient. Note that the parameter is set by giving a variable of the data of the light emission point, such as 1 for the live bacteria group and 2 for the dead bacteria group.

生菌群または死菌群であるかを判断する為には、以下のようにグラフを使用することが望ましい。まず、発光点のデータのうち、生死菌染色試薬の輝度と、死菌染色試薬の輝度を用いて、この二つの値よりドットプロットを作成し、表示させる。これは、横軸に生死菌染色試薬の輝度値、縦軸に死菌染色試薬の輝度値をとり、検出された発光点毎にプロットしていく。尚、ドットプロットの表示は、画像処理を行うプログラムのインターフェース上に行うことが良く、発光点のデータファイルを読み出した場合に表示させるようにするとよい。   In order to determine whether the group is a live or dead group, it is desirable to use a graph as follows. First, a dot plot is created from these two values and displayed using the luminance of the living and dead bacteria staining reagent and the luminance of the dead bacteria staining reagent in the light emission point data. This is plotted for each detected emission point, with the horizontal axis representing the luminance value of the viable and dead bacteria staining reagent and the vertical axis representing the luminance value of the dead bacteria staining reagent. The dot plot is preferably displayed on the interface of a program that performs image processing, and is preferably displayed when a data file of light emission points is read.

次に、表示されたドットプロットに対して、カーソルを使用して境界線を作成する。境界線は、1本ないし複数本の直線や曲線、多角線などで自由に作成することができるものとし、プロットを見ながら、プロットの集団を分類しやすいように、作成する。なお、境界線の作成工程は、簡単に行えるようにグリッドなどを使用したり、輪郭やプロットにトラップさせるような機能を持たせると、作成が容易であり、かつ正確に行うことができる。   Next, use the cursor to create a boundary for the displayed dot plot. The boundary line can be freely created by one or a plurality of straight lines, curves, polygonal lines, etc., and is created so that the group of plots can be easily classified while viewing the plot. It should be noted that the creation process of the boundary line can be easily and accurately performed by using a grid or the like so that it can be easily performed or by providing a function of trapping the outline or plot.

また、多角線の場合には、線が交差しないように、一方の方向のみに作成可能とすると確実である。   In the case of a polygonal line, it is certain that it can be created only in one direction so that the lines do not intersect.

作成した境界線は、取り消すことや、保存することができるようにし、繰り返し使用することができるようにする。   The created boundary line can be canceled or saved, and can be used repeatedly.

次に、作成した境界線をもとに、境界線に相当するしきい値を算出する。算出されたしきい値に対して、グラフの上・左側にあるものが死菌群、反対が生菌群として分類し、パラメータを与えて処理する。   Next, a threshold corresponding to the boundary line is calculated based on the created boundary line. The calculated threshold values are classified as dead bacteria groups on the upper and left sides of the graph and as viable bacteria groups on the opposite side, and processed by giving parameters.

生菌群、死菌群が判断された後、微生物判断部によって夾雑物を分離除外する場合は、以下の処理を行う。微生物と夾雑物の判別は、色彩的特性の値を算出することによってなされる。   After the viable bacteria group and the dead bacteria group are determined, the following processing is performed when the microorganism determination unit separates and excludes the contaminants. Discrimination between microorganisms and contaminants is made by calculating the value of the color characteristic.

色彩的特性とは、RGBの輝度値より演算されて与えられた色度、色相角などの色彩的特長を示す値のことである。色彩的特長を示す表色系は、Lab表色系や、LCh表色系、XYZ表色系などの表色系が使用される。ここではXYZ表色系に基づいた色度を用いる。取得される輝度はRGBの色空間のものであるため、このRGBそれぞれの輝度値から、XYZ表色系への変換が行われる。   The chromatic characteristics are values indicating chromatic characteristics such as chromaticity and hue angle, which are given by calculation from luminance values of RGB. Color systems such as Lab color system, LCh color system, and XYZ color system are used as the color system indicating the color features. Here, chromaticity based on the XYZ color system is used. Since the acquired luminance is in the RGB color space, the RGB luminance values are converted into the XYZ color system.

(数式1)
X=0.3933×R/255+0.3651×G/255+0.1903×B/255
Y=0.2123×R/255+0.7010×G/255+0.0858×B/255
Z=0.0182×R/255+0.1117×G/255+0.9570×B/255
さらに、
x=X/(X+Y+Z)
y=Y/(X+Y+Z)
式中のR、G、BはそれぞれR輝度値、G輝度値、B輝度値であることを示す。これにより細胞および微生物または夾雑物かの判断に必要な値として、最終的にx、yの値が算出される。
(Formula 1)
X = 0.3933 × R / 255 + 0.3651 × G / 255 + 0.1903 × B / 255
Y = 0.2123 × R / 255 + 0.7010 × G / 255 + 0.0858 × B / 255
Z = 0.0182 × R / 255 + 0.1117 × G / 255 + 0.9570 × B / 255
further,
x = X / (X + Y + Z)
y = Y / (X + Y + Z)
R, G, and B in the formula indicate an R luminance value, a G luminance value, and a B luminance value, respectively. As a result, the values of x and y are finally calculated as values necessary for determining whether the cells and microorganisms or impurities are present.

発光点毎に算出された色度の値であるが、発光点はそれぞれ生菌群、死菌群であるかを判別するためのパラメータが与えられており、生菌群であった場合には、生菌群に対して設定された色度しきい値と比較し、死菌群であった場合には、死菌群に対して設定された色度しきい値と比較して、それぞれに夾雑物が除外される。夾雑物が除外され、生菌、死菌として判断されたものは、積算され、カウントされる。   It is a chromaticity value calculated for each luminescent point, but the luminescent point is given a parameter to determine whether it is a viable cell group or a dead cell group. , Compared to the chromaticity threshold set for the live bacteria group, and if it was a dead bacteria group, compared to the chromaticity threshold set for the dead bacteria group, Contaminants are excluded. Contaminants are excluded, and those judged as live or dead are added up and counted.

次に、このカウント値に対して、実際に使用した検体に含まれる単位量あたり(たとえば1mLや1グラムなど)の菌数の総数を算出する。そのためには、測定した画像のうち、画像処理して使用した有効エリア面積を有効エリア算出部にて求める。測定に使用した有効エリアは、画像の補正値を変数とした関数で求められる。   Next, the total number of bacteria per unit amount (for example, 1 mL, 1 gram, etc.) contained in the actually used specimen is calculated for this count value. For this purpose, an effective area area used for image processing among the measured images is obtained by an effective area calculation unit. The effective area used for the measurement is obtained by a function using the correction value of the image as a variable.

画像の縦の長さをP、横の長さをQ、縦方向の座標補正値をα、横方向の座標補正値をβとすると、1画面あたりの有効エリア画素数Mは数式2のように表される。   Assuming that the vertical length of the image is P, the horizontal length is Q, the vertical coordinate correction value is α, and the horizontal coordinate correction value is β, the number of effective area pixels M per screen is given by Equation 2. It is expressed in

(数式2)
M =(P−α)×(Q−β)
また、有効エリア面積は、レンズ系の倍率などから、画素あたりの面積を求め、画素あたりの面積をsとするとし、測定視野数をNとして、1画面あたりの有効エリア面積Sと全有効面積は、
(数式3)
S = Ms
全有効面積:S×N
となる。
(Formula 2)
M = (P−α) × (Q−β)
Also, the effective area area is obtained by calculating the area per pixel from the magnification of the lens system, the area per pixel is s, the number of fields of view is N, and the effective area area S per screen and the total effective area. Is
(Formula 3)
S = Ms
Total effective area: S × N
It becomes.

得られた面積に対して、微生物の固定部の固定部分の表面積(例えば、メンブランフィルタの全面積)の値を割り返す。これにより得られた数値を、カウント菌数に掛け合わせることで、最終的な、微生物の生菌または死菌の総数を算出し、菌数を求めることができるのである。   The surface area (for example, the total area of the membrane filter) of the fixed part of the fixed part of the microorganism is divided with respect to the obtained area. By multiplying the numerical value obtained in this way by the number of counted bacteria, the final total number of living or dead microorganisms can be calculated to obtain the number of bacteria.

以上の手法を用いて、試料中や細胞培養液に含まれていた微生物の生死を判別し夾雑物と分離して、数を計量することができるのである。   By using the above-described method, it is possible to determine the life and death of microorganisms contained in the sample or the cell culture solution, separate them from foreign matters, and measure the number.

図1は、本発明を好適に実施するための微生物計数装置の一態様を示す概念図である。この微生物計数装置1は、検出手段として励起光源2、干渉フィルタ3、集光レンズ4、ハイパスフィルタ5、受光フィルタ6、レンズユニット7、受光素子8を含む。励起光源2から発せられた励起光から目的の波長を取り出すために干渉フィルタ3で分光する。分光された励起光は集光レンズ4を経て検査台9にセットされたメンブランフィルタ10(別途の操作によりメンブランフィルタ上に発光手段である核酸結合性の蛍光色素で染色された微生物を捕捉してあるもの)上に集光される。励起光源2から発せられた励起光は、集光レンズ4によって集光されるが、その際、集光レンズ4によって励起光を照射する範囲は直径3mm程度の微小な一定面積に集光される。励起光により発する蛍光は、励起光成分を除去するためにハイパスフィルタ5を経て、受光フィルタ6、レンズユニット7により拡大され、受光素子であるCCDユニット11に到達し、電気信号化される。これにより得られた信号は画像化され、演算部12によって画像処理される。   FIG. 1 is a conceptual diagram showing an embodiment of a microorganism counting apparatus for suitably carrying out the present invention. The microorganism counting apparatus 1 includes an excitation light source 2, an interference filter 3, a condenser lens 4, a high-pass filter 5, a light receiving filter 6, a lens unit 7, and a light receiving element 8 as detection means. In order to extract a target wavelength from the excitation light emitted from the excitation light source 2, the light is split by the interference filter 3. The split excitation light passes through a condenser lens 4 and captures a membrane filter 10 set on an examination table 9 (by a separate operation, microorganisms stained with a nucleic acid-binding fluorescent dye, which is a light emitting means, are captured on the membrane filter. It is focused on (something). The excitation light emitted from the excitation light source 2 is condensed by the condensing lens 4. At this time, the range in which the excitation light is irradiated by the condensing lens 4 is condensed on a small fixed area having a diameter of about 3 mm. . The fluorescence emitted by the excitation light passes through the high-pass filter 5 to remove the excitation light component, is enlarged by the light receiving filter 6 and the lens unit 7, reaches the CCD unit 11 which is a light receiving element, and is converted into an electrical signal. The signal thus obtained is converted into an image and subjected to image processing by the calculation unit 12.

図2は、演算部12における演算工程フローを示した図である。輝点除去部13、発光点抽出部14、発光点照合部15、出力部16、蛍光評価部17、そして有効エリア算出部18から構成されている。   FIG. 2 is a diagram illustrating a calculation process flow in the calculation unit 12. It comprises a bright spot removing unit 13, a light emitting point extracting unit 14, a light emitting point collating unit 15, an output unit 16, a fluorescence evaluating unit 17, and an effective area calculating unit 18.

まず座標補正用画像を読み込んで座標補正値を算出する。次にしきい値などの変数を入力し、輝点除去部13によって輝点を除去した画像を作成する。続いて、発光点抽出部14により画像中の発光点を特定し、数値データを抽出する。画像によっては座標補正値により座標を補正する。異なる輝度情報を含む発光点のデータは、発光点照合部15によって照合し、結合される。これにより集合された数値データは、出力部16によってデータファイルに出力され、保存される。発光点の数値データは蛍光評価部17によって蛍光の色情報の解析が行われる。蛍光評価部17は生死判断部19と微生物判断部20から構成される。生死判断部19はデータファイルに対して生菌群または死菌群であるかを判別し、発光点毎に生菌もしくは死菌のフラグを立てる。微生物判断部20により、フラグを検出して生菌群か死菌群かを判断した後、各群ごとに設定した微生物もしくは夾雑物であるかをしきい値と照合して判別する。また有効エリア算出部18では、得した画像から有効エリアを求め、全面積に対して割り返すことで最終の菌数を算出、出力する。これらは画像処理をプログラミングされたマイコン等であり、外部接続した端末などによって操作されるソフトウェアと通信して使用されるものも該当する。 First, a coordinate correction image is read and a coordinate correction value is calculated. Next, a variable such as a threshold value is input, and an image from which the bright spot is removed by the bright spot removing unit 13 is created. Subsequently, the light emission point extraction unit 14 specifies light emission points in the image and extracts numerical data. Depending on the image, the coordinates are corrected by the coordinate correction value. The light emission point data including different luminance information is collated by the light emission point collating unit 15 and combined. The numerical data collected in this way is output to the data file by the output unit 16 and stored. The fluorescent color information is analyzed by the fluorescence evaluation unit 17 for the numerical data of the light emission points. The fluorescence evaluation unit 17 includes a life / death determination unit 19 and a microorganism determination unit 20. The life / death determining unit 19 determines whether the data file is a live cell group or a dead cell group, and sets a flag of live cell or dead cell for each light emission point. The microorganism determination unit 20 detects a flag to determine whether the group is a live or dead group, and then determines whether the group is a microorganism or contaminant set for each group by comparing with a threshold value. Also the effective area calculating unit 18, taken images seek effective area from that obtained, calculate a final number of bacteria by returning dividing the total area, and outputs. These are microcomputers programmed for image processing, and those used by communicating with software operated by an externally connected terminal or the like are also applicable.

図3(a)は、微生物判断部の詳細を示す。E.coliを含む水検体をメンブレンフィルタにろ過し、生死細胞用蛍光色素であるSYTO9と、死細胞用蛍光色素であるヨウ化プロピジウムを用いて染色したものを、単板モノクロCCDと、青色励起光照射におけるG輝度画像とR輝度画像を取得したデータの一例を示す表である。このとき、B輝度画像は、励起光の波長と重なるために取得できず、数値を代入して使用している。この変数は、最適な値に調整することができる。   FIG. 3A shows details of the microorganism determination unit. E. A water sample containing E. coli is filtered through a membrane filter and stained with SYTO9, a fluorescent dye for living and dead cells, and propidium iodide, a fluorescent dye for dead cells. It is a table | surface which shows an example of the data which acquired the G luminance image and R luminance image in. At this time, the B luminance image cannot be acquired because it overlaps the wavelength of the excitation light, and is used by substituting numerical values. This variable can be adjusted to an optimal value.

図3(b)に示される工程は、RGBの輝度から、XYZ表色系の(x、y)の値への変換を示す。この工程はまず、RGBの輝度を測定する手段によって取得されたRGBそれぞれの輝度値から、リニアRGBへの変換、ガンマ補正がなされる。これにさらに視覚的特性を重み付けし、微生物または夾雑物かの判断に必要な値として、最終的にx、yの値が求められる。そして、しきい値と比較することで、微生物か夾雑物であるかを判別する。このときのしきい値は実験により決定する。   The process shown in FIG. 3B shows conversion from RGB luminance to (x, y) values in the XYZ color system. In this step, first, the RGB luminance values acquired by the means for measuring RGB luminance are converted into linear RGB and gamma correction is performed. The visual characteristics are further weighted, and the values of x and y are finally obtained as values necessary for the determination of whether the substance is a microorganism or a contaminant. And it is discriminate | determined whether it is a microorganisms or a contaminant by comparing with a threshold value. The threshold at this time is determined by experiment.

E.coliを含む菌液と、水道水(塩素除去済み)の中の菌数を測定する。これらの液体試料を、孔径が0.45μm、直径9mmの黒色メンブランフィルタに表面を金属蒸着したものの上方からピペットにて滴下し、吸引ろ過した。メンブランフィルタは、そのままでは表面に触れてしまう恐れがあり、扱いにくいため、周囲を樹脂枠で覆い、一体化させたものを使用した。吸引ろ過圧は、あまり高すぎるとろ過できず、低すぎると微生物へのダメージとなってしまうばかりか、メンブランフィルタが破損することがあるため、100から400Torr付近のポンプ圧に設定して行った。メンブランフィルタ上にろ過するとき、計数しやすさや、逆算する精度の問題から、微生物などの発光物はできるだけ均一に分散させる必要がある。そのため、メンブランフィルタのろ過性能を均一にするために、メンブランフィルタ下方の吸引口にはろ紙などを挟み、吸引圧を拡散して、メンブラン全体に均一にかかるようにして行った。また、それとは別に、メンブランフィルタのポアの通過抵抗を減少させるため、液体試料をろ過する前に、少量の界面活性剤希釈液(Tween20 0.1%)をろ過した。液体試料は、E.coli菌液の場合は0.1mL、水道水の場合は20mLろ過した。   E. The number of bacteria in the bacterial solution containing E. coli and tap water (chlorine removed) is measured. These liquid samples were dropped with a pipette from above a black membrane filter having a pore diameter of 0.45 μm and a diameter of 9 mm with a metal deposited on the surface, and suction filtered. Since the membrane filter may touch the surface as it is and is difficult to handle, the membrane filter was used by covering the periphery with a resin frame and integrating them. If the suction filtration pressure is too high, filtration cannot be performed. If the suction filtration pressure is too low, the membrane filter may be damaged and the membrane filter may be damaged. . When filtering on a membrane filter, it is necessary to disperse luminescent substances such as microorganisms as uniformly as possible because of ease of counting and accuracy of back calculation. Therefore, in order to make the filtration performance of the membrane filter uniform, a filter paper or the like is sandwiched in the suction port below the membrane filter, and the suction pressure is diffused to uniformly apply to the entire membrane. Separately, in order to reduce the passage resistance of the membrane filter pores, a small amount of surfactant diluent (Tween 20 0.1%) was filtered before the liquid sample was filtered. The liquid sample is E. coli. In the case of E. coli bacterial solution, 0.1 mL was filtered, and in the case of tap water, 20 mL was filtered.

続いてメンブランフィルタ上に捕集された微生物に対して、蛍光染色を行った。染色試薬は、生死菌染色試薬であるSYTO24と、死菌染色試薬であるSYTOX Orange(いずれも商品名)を使用した。これらの染色試薬は、空気中で光を吸収して分解しやすいため、ジメチルスルホキシドにて500μMに調整し、少量ずつマイクロチューブに分注してストック液とし、保管した。保管は、マイクロチューブ内に窒素を封入し、マイナス20度のフリーザーにて暗所保管した。必要本数を解凍し、それぞれの試薬10μLに対して希釈液を全量が1mLになるように加え、混合した。この希釈液は、試薬の溶解性と、保存性、細胞への浸透性、乾燥防止性、低自家蛍光性である必要があるが、このような条件を満たすものとして、D−ソルビトールを蒸留水で50%程度に希釈しTris−HClと少量の界面活性剤(Tween20)を混合したものを使用した。   Subsequently, fluorescent staining was performed on the microorganisms collected on the membrane filter. The staining reagent used was SYTO24, which is a viable and dead bacteria staining reagent, and SYTOX Orange, which is a dead bacteria staining reagent (both are trade names). Since these staining reagents absorb light easily in the air and are easily decomposed, they were adjusted to 500 μM with dimethyl sulfoxide, and dispensed into microtubes in small amounts as stock solutions and stored. For storage, nitrogen was sealed in a microtube and stored in a dark place with a minus 20 degree freezer. The required number was thawed, and the diluent was added to 10 μL of each reagent so that the total amount was 1 mL, and mixed. This diluent must have reagent solubility, storage stability, permeability to cells, anti-drying properties, and low autofluorescence. D-sorbitol must be distilled water to satisfy these conditions. The mixture was diluted to about 50% and mixed with Tris-HCl and a small amount of surfactant (Tween 20).

終濃度5μMに調整した試薬は、1種類ずつ微生物が捕集されたメンブランフィルタ上方から滴下し、常温にて数分間染色し、余剰の試薬は吸引ろ過にて除去した。染色順序は限定されず、生死菌染色試薬、死菌染色試薬いずれから行っても同様に染色することができる。   Reagents adjusted to a final concentration of 5 μM were dropped from above the membrane filter where microorganisms were collected one by one, stained at room temperature for several minutes, and excess reagents were removed by suction filtration. The order of staining is not limited, and the staining can be performed in the same manner regardless of whether the staining reagent is viable or dead.

染色したのち、余剰試薬を吸引によってできる限り除去した後、メンブランフィルタを微生物計数装置に設置し、計測を行った。   After staining, the excess reagent was removed as much as possible by aspiration, and then the membrane filter was placed in a microbe counting apparatus and measured.

微生物計数装置1は、図1に記載されたものであるが、今回、青色LED(約470nm)と、黄色LED(約560nm)を使用し、受光フィルタ6として緑色は530から550nmに透過性をもつものと、赤色は590から610nmに透過性を持つものを使用した。なお、光源には、光束を撮像範囲に照射しやすいよう集光レンズ4を設けている。   The microorganism counting apparatus 1 is the same as that shown in FIG. 1, but this time using a blue LED (about 470 nm) and a yellow LED (about 560 nm), the green color is transmissive from 530 to 550 nm as the light receiving filter 6. Those having a red color and those having a transmittance from 590 to 610 nm were used. The light source is provided with a condensing lens 4 so as to easily irradiate the imaging range with a light beam.

また、メンブランフィルタ10の設置ステージには着脱可能な機構を設け、さらにステージ部材がメンブランフィルタ10を裏側から平面かつピントが合う高さに固定できるようにし、ピント調節を不要とした。メンブランフィルタ10を固定したステージは、モーター駆動のXYステージにより移動可能であり、プログラムによってあらかじめ指定した位置への移動を連続的に行うことができるものとした。   In addition, a removable mechanism is provided on the installation stage of the membrane filter 10, and the stage member can fix the membrane filter 10 from the back side to a flat surface and at a height that is in focus, thus eliminating the need for focus adjustment. The stage to which the membrane filter 10 is fixed can be moved by a motor-driven XY stage, and can be continuously moved to a position designated in advance by a program.

メンブランフィルタ10表面の蛍光画像の取得は、メンブランフィルタ10の上方に設置された赤外カットフィルタを施した単板モノクロCCDカメラと、拡大レンズ系にて行った。画像を取得する際には、励起光となるLEDが点灯して照射され、受光フィルタ6を切り替えて目的の波長の画像を取得できるものとし、これらのカメラ、光源、フィルタ、およびステージは、動作をプログラムされたマイコンを使用して制御されるものとした。   The fluorescence image on the surface of the membrane filter 10 was acquired using a single-plate monochrome CCD camera with an infrared cut filter installed above the membrane filter 10 and a magnifying lens system. When an image is acquired, an LED serving as excitation light is turned on and irradiated, and the light receiving filter 6 is switched to acquire an image of a target wavelength. These cameras, light sources, filters, and stages operate Were controlled using a programmed microcomputer.

画像の取得は、同一の位置で(a)青色励起,緑色蛍光、(b)青色励起、赤色蛍光、(c)黄色励起、赤色蛍光、の3種類の画像を、露光時間が0.1から3秒程度で連続的に取得し、ステージによって次の撮像領域に移動し、同様に画像を取得するものとした。また、測定の最初には、LEDを点灯させずに画像を取得し、ドット欠けのみを含む画像を取得しておいた。   Images are acquired at the same position using three types of images (a) blue excitation, green fluorescence, (b) blue excitation, red fluorescence, and (c) yellow excitation, red fluorescence, with an exposure time from 0.1. Images were acquired continuously in about 3 seconds, moved to the next imaging region by the stage, and images were acquired in the same manner. In addition, at the beginning of the measurement, an image was acquired without turning on the LED, and an image including only missing dots was acquired.

画像を全て取得した後、演算部によりドット欠けの除去、発光点の抽出、照合が行われ、発光点ごとに輝度値を求めたデータを作成した。   After all the images were acquired, the dot missing removal, light emission point extraction, and collation were performed by the calculation unit, and data for which a luminance value was obtained for each light emission point was created.

図4の(a)はE.coliと水道水中にみられる発光点のプロットを生死菌染色試薬であるSYTO24の蛍光波長である青励起、緑蛍光での輝度と、死菌染色試薬であるSYTOX Orangeの蛍光波長である黄色励起、赤蛍光での輝度を2軸におき、ドットプロットを作成したものである。   (A) in FIG. A plot of emission points seen in E. coli and tap water is blue excitation, which is the fluorescence wavelength of SYTO24, which is a viable and dead bacteria staining reagent, and brightness of green fluorescence and yellow excitation, which is the fluorescence wavelength of SYTOX Orange, which is a death bacteria staining reagent. The dot plot is created with the brightness at red fluorescence on two axes.

このとき、任意に設定できる境界線として、cがy=100、dがx=yのような直線を設定し、cより小さく、かつdより小さい領域を生菌群、それ以外の領域を死菌群として指定し、該当する領域の発光点に対してフラグを立て、発光点の分類を行った。   At this time, as a boundary line that can be arbitrarily set, a straight line such that c is y = 100 and d is x = y is set, and an area that is smaller than c and smaller than d is a viable group, and other areas are dead. Designated as a fungal group, flags were set for the luminescent spots in the corresponding area, and the luminescent spots were classified.

次に、生菌群として分類された発光点の集団を、XYZ表色系における色度データのうち、xとyの値をグラフ上にプロットした(図4の(b))。このとき、E.coli生菌がx<0.37、y>0.54の領域に分布していたのに対し、水道水中の発光物はxが0.3から0.6、yが0.3から0.6と幅広い領域に分布していることが確認された。このとき、しきい値は、E.coliの値を参考に設定し、xはe=0.37、yはf=0.54として、x<e、y>fの領域に分類された集団を微生物として判別し、水道水中に含まれる発光物のような夾雑物を判別した。その結果、検出された発光点のうち夾雑物の大半を分離することができ、水道水では図4の(a)のとおり生死判断部によって100個の点から32個の点が抽出されたが、さらに図4の(b)によってそのうちの8個が微生物の生菌であると判別することができた。   Next, the value of x and y among the chromaticity data in the XYZ color system was plotted on the graph for the group of luminous points classified as the viable bacteria group ((b) of FIG. 4). At this time, E.I. E. coli live bacteria were distributed in the region of x <0.37 and y> 0.54, whereas the luminescent materials in tap water had x of 0.3 to 0.6 and y of 0.3 to 0.00. 6 was confirmed to be distributed over a wide area. At this time, the threshold is E.D. The value is set with reference to the value of E. coli, x is e = 0.37, y is f = 0.54, and the group classified into the region of x <e, y> f is identified as a microorganism and included in tap water The foreign matter such as the luminescent material is discriminated. As a result, most of the detected emission points can be separated, and in tap water, 32 points are extracted from 100 points by the life / death determining unit as shown in FIG. Further, it was possible to determine that 8 of them were viable microorganisms by (b) of FIG.

このしきい値は一例であるが、染色に使用する蛍光色素の種類や、濃度、希釈する溶液の極性などによっても変化することから、使用が想定される環境に最も適した値をあらかじめ設定しておくことが好ましい。   This threshold is an example, but it varies depending on the type, concentration, and polarity of the solution used for staining. It is preferable to keep it.

なお、最終菌数の妥当性については、培養困難である菌も存在する為、適切な培養方法、培地の種類を複数組み合わせて使用し、評価することが望ましい。   In addition, since there are bacteria that are difficult to culture, the appropriateness of the final number of bacteria is preferably evaluated by using a combination of appropriate culture methods and types of media.

実施例の1に示された微生物計数装置において、E.coliを含む菌液と、水道水(塩素除去済み)をそれぞれ一定量メンブレンフィルタ10にろ過し、値を測定した。   In the microorganism counting apparatus shown in Example 1, The bacterial solution containing E. coli and tap water (chlorine removed) were each filtered through a fixed amount of membrane filter 10, and the values were measured.

図5はE.coliにおいて、生死判断部における生菌と死菌を判別するしきい値の設定結果である。照合されて結合された発光点の輝度情報のうち、第1と第2の染色試薬の輝度をx軸とy軸にとり、データを対応させたドットプロット21をプログラムのウィンドウ上に表示し、さらにこのドットプロット上において、カーソル22を操作してプロットを分離するしきい値となる多角線27の始点23、頂点aは24、頂点bは25、終点26を設定した。設定した多角線27は、プログラム上で演算され、しきい値が求められた。判別を行い、計数した結果、生菌群120個、死菌群80個として簡便に検出することができた。   FIG. In E. coli, the result of setting a threshold value for discriminating between live and dead bacteria in the life and death judgment unit. Of the luminance information of the luminous points that have been collated and combined, the luminance of the first and second staining reagents is taken on the x-axis and y-axis, and a dot plot 21 in which the data is associated is displayed on the program window, and On this dot plot, the start point 23, the vertex a is 24, the vertex b is 25, and the end point 26 are set as threshold values for separating the plots by operating the cursor 22. The set polygonal line 27 was calculated on the program to obtain a threshold value. As a result of discriminating and counting, it was possible to easily detect as 120 live bacteria groups and 80 dead bacteria groups.

実施例1に示された微生物計数装置において、E.coliを含む菌液と、水道水(塩素除去済み)をそれぞれ一定量メンブレンフィルタ10にろ過し、値を測定した。   In the microorganism counting apparatus shown in Example 1, E.I. The bacterial solution containing E. coli and tap water (chlorine removed) were each filtered through a fixed amount of membrane filter 10, and the values were measured.

図6は、生死判断手段における生菌と死菌を判別するしきい値の設定方法の設定結果である。表示したドットプロット21に対して、カーソル22を操作して、選択したい領域の多角形の始点28と頂点29から32を連続的に設定し、頂点の最後は、始点上で選択することで一致させるように多角形33を設定した。設定された多角形33に対して、しきい値が自動的に算出され、領域をチェックボックスで死菌として指定したところ、死菌数は78個として検出できた。   FIG. 6 shows a setting result of a threshold value setting method for discriminating between viable and dead bacteria in the viability determining means. By operating the cursor 22 on the displayed dot plot 21, the polygon starting point 28 and vertices 29 to 32 of the region to be selected are set continuously, and the end of the vertex is matched by selecting on the starting point. Polygon 33 was set so that A threshold value was automatically calculated for the set polygon 33, and when the area was designated as dead by a check box, the number of dead bacteria could be detected as 78.

実施例1に示された微生物計数装置において、E.coliを含む菌液と、水道水(塩素除去済み)をそれぞれ一定量メンブレンフィルタにろ過し、値を測定した。   In the microorganism counting apparatus shown in Example 1, E.I. The bacterial solution containing E. coli and tap water (with chlorine removed) were each filtered through a fixed amount of membrane filter, and the values were measured.

図7は、生死判断手段における生菌と死菌を判別するしきい値の設定結果である。表示したドットプロット21に対して、カーソル22を操作して、選択したい領域の楕円形の中心34と長軸35または短軸36と、長軸の長さ37、長軸の角度38を設定した。楕円形39、40はそれぞれ死菌、損傷菌として設定したところ、死菌数が72個、損傷菌が9個であると検出され、この集団ごとに楕円の中心座標と長軸の角度38、長軸の長さ37の数値を抽出し、微生物の集団の特性を示す特徴パラメータとして集団を定義できる。それぞれの値は、様々な菌種や、活性状態のものを示すものであり、比較することによって、例えば同じ死菌であっても、損傷度合いや、損傷しやすさを比較することが可能となる。図7の場合、長軸35の傾きが大きく、死菌染色試薬で強く染色された楕円形39の領域の方が損傷度が高いものであると推定することができた。   FIG. 7 shows a result of setting a threshold value for discriminating between live bacteria and dead bacteria in the life / death determining means. For the displayed dot plot 21, the cursor 22 is operated to set the elliptical center 34 and the long axis 35 or the short axis 36, the long axis length 37, and the long axis angle 38 of the region to be selected. . Ellipses 39 and 40 were set as dead and damaged bacteria, respectively. As a result, it was detected that the number of dead bacteria was 72 and the number of damaged bacteria was 9. A numerical value of the long axis length 37 is extracted, and the group can be defined as a characteristic parameter indicating the characteristics of the microorganism group. Each value shows various bacterial species and those in an active state, and by comparing, for example, it is possible to compare the degree of damage and the ease of damage even for the same dead bacteria. Become. In the case of FIG. 7, it can be estimated that the oval 39 region having a larger inclination of the long axis 35 and more strongly stained with the dead bacteria staining reagent has a higher degree of damage.

実施例1に示された微生物計数装置において、E.coliを含む菌液と、水道水(塩素除去済み)をそれぞれ一定量メンブレンフィルタにろ過し、値を測定した。   In the microorganism counting apparatus shown in Example 1, E.I. The bacterial solution containing E. coli and tap water (with chlorine removed) were each filtered through a fixed amount of membrane filter, and the values were measured.

図8は、生死判断手段における生菌と死菌を判別するしきい値の設定結果である。表示したドットプロット21に対して、あらかじめ縦横をN=5、M=5、合計25領域として輝度が51ずつになるようあらかじめ各領域に番地を設け、それぞれに番号(A〜Y)を定めた。次に、プロット結果から、死菌領域をA、F、K、Pとして設定して、領域内の菌数を算出した。その菌数は97個として検出された。   FIG. 8 shows a result of setting a threshold value for discriminating between live and dead bacteria in the life and death judgment means. For the displayed dot plot 21, N = 5 in the vertical and horizontal directions, M = 5, and a total of 25 areas, an address is provided in each area in advance so that the luminance is 51, and a number (A to Y) is assigned to each area. . Next, from the plot results, the dead bacteria area was set as A, F, K, and P, and the number of bacteria in the area was calculated. The number of bacteria was detected as 97.

本発明は、細胞および微生物を含んだ検体から蛍光染色を用いて微生物の生菌および死菌を検出する方法であって、従来から知られている方法と比較してより正確性を持たせた検出を行うことができる判別方法を提供することができる点において産業上の利用可能性を有する。   The present invention is a method for detecting viable and dead microorganisms from a specimen containing cells and microorganisms by using fluorescent staining, and is more accurate than a conventionally known method. The present invention has industrial applicability in that a discrimination method capable of performing detection can be provided.

本発明の実施の形態1の微生物検出装置を示す概念図The conceptual diagram which shows the microorganisms detection apparatus of Embodiment 1 of this invention. 同実施の形態1の演算部による演算工程フローを示す図The figure which shows the calculation process flow by the calculating part of the same Embodiment 1. 同実施の形態1のE.coliの輝度と色度の演算結果と色度の演算工程フローを示す図((a)E.coliの輝度と色度の演算結果を示す図、(b)色度の演算工程フローを示す図)E. of the first embodiment. The figure which shows the calculation process flow of the brightness | luminance and chromaticity of E. coli, and a chromaticity ((a) The figure which shows the calculation result of the brightness | luminance and chromaticity of E. coli, (b) The figure which shows the calculation process flow of chromaticity ) 同実施例1のE.coliと水道水中の発光物の輝度のドットプロット及び生死判断部による分類方法と、生菌群の色度図と微生物判断部による判断方法を示す図((a)E.coliと水道水中の発光物の輝度のドットプロット及び生死判断部による分類方法を示す図、(b)同生菌群の色度図と微生物判断部による判断方法を示す図)E. of the same Example 1. The figure which shows the dot plot of the brightness | luminance of the luminescent material in E. coli and tap water, the classification method by a life and death judgment part, the chromaticity diagram of a living microbe group, and the judgment method by a microorganism judgment part ((a) Emission in E. coli and tap water The figure which shows the dot plot of the brightness | luminance of an object, and the classification method by the life-and-death judgment part, (b) The figure which shows the chromaticity diagram of the same-bacteria group, and the judgment method by a microbe judgment part) 同実施例2の微生物判断部におけるドットプロットの多角線による境界線作成を示す図The figure which shows the boundary line creation by the polygonal line of the dot plot in the microorganisms determination part of the Example 2 同実施例3の微生物判断部におけるドットプロットの多角形による境界線作成を示す図The figure which shows the boundary line creation by the polygon of the dot plot in the microorganisms determination part of the Example 3 同実施例4の微生物判断部におけるドットプロットの楕円による境界線作成を示す図The figure which shows the boundary line creation by the ellipse of the dot plot in the microorganisms judgment part of the Example 4 同実施例5の微生物判断部におけるドットプロットの領域指定による分類方法を示す図The figure which shows the classification method by the area | region designation | designated of the dot plot in the microorganisms judgment part of Example 5

符号の説明Explanation of symbols

1 微生物計数装置
2 励起光源
3 干渉フィルタ
4 集光レンズ
5 ハイパスフィルタ
6 受光フィルタ
7 レンズユニット
8 受光素子
9 検査台
10 メンブランフィルタ
11 CCDユニット
12 演算部
13 輝点除去部
14 発光点抽出部
15 発光点照合部
16 出力部
17 蛍光評価部
18 有効エリア算出部
19 生死判断部
20 微生物判断部
21 ドットプロット
22 カーソル
23 始点
24 頂点a
25 頂点b
26 終点
27 多角線
28 始点
29 頂点
30 頂点
31 頂点
32 頂点
33 多角形
34 中心
35 長軸
36 短軸
37 長軸の長さ
38 長軸の角度
39 楕円形
40 楕円形
DESCRIPTION OF SYMBOLS 1 Microorganism counting device 2 Excitation light source 3 Interference filter 4 Condensing lens 5 High pass filter 6 Light receiving filter 7 Lens unit 8 Light receiving element 9 Inspection table 10 Membrane filter 11 CCD unit 12 Calculation part 13 Bright spot removal part 14 Light emission point extraction part 15 Light emission Point verification unit 16 Output unit 17 Fluorescence evaluation unit 18 Effective area calculation unit 19 Life / death determination unit 20 Microorganism determination unit 21 Dot plot 22 Cursor 23 Start point 24 Vertex a
25 Vertex b
26 End point 27 Polygon line 28 Start point 29 Vertex 30 Vertex 31 Vertex 32 Vertex 33 Polygon 34 Center 35 Long axis 36 Short axis 37 Long axis length 38 Long axis angle 39 Ellipse 40 Ellipse

Claims (11)

微生物を蛍光染色する工程をもち、
前記微生物の細胞を発光点として画像に取得可能な受像素子と、
前記画像から少なくとも発光点のRGBの輝度値より演算されて与えられた色度または色相角の色彩的特性を示す値から微生物の生菌、死菌、もしくは微生物以外の夾雑物のいずれかであることを判断する蛍光評価部とを備え、
前記蛍光評価部は、生菌群または死菌群のいずれかであることを判断する生死判断部と、それ以降に微生物か微生物以外の夾雑物であるかを判断する微生物判断部とを設け、
前記微生物判断部において、生菌群または死菌群を示すパラメータから発光点が生菌群もしくは死菌群のいずれかであることを判断し、発光点が生菌、死菌、もしくは微生物以外の夾雑物のいずれかであるかの判断は、生菌群、死菌群それぞれに設定されたしきい値と比較して行い、生菌または死菌の総数を算出し、
前記生死判断部において、2種類の蛍光色素で生菌・死菌を染色し、該2色の蛍光の輝度を2軸においた座標の値の差異から生菌・死菌の他に、それらに分類されない微生物を損傷菌として設定し、
死菌の損傷度の評価を行うことを特徴とする微生物計数装置。
It has a process of fluorescent staining of microorganisms,
An image receiving element capable of acquiring an image with the cells of the microorganism as a light emitting point;
From the value indicating the color characteristics of the chromaticity or hue angle calculated from at least the RGB luminance values of the light emitting points from the image, it is any of living microorganisms, dead bacteria, or contaminants other than microorganisms A fluorescence evaluation unit for judging
The fluorescence evaluation unit is provided with a life / death determination unit that determines whether the group is a live bacteria group or a killed bacteria group, and a microorganism determination unit that determines whether the microorganism is a contaminant other than a microorganism or a microorganism after that,
In the microorganism judging unit, it is judged from the parameter indicating the viable cell group or the dead cell group that the light emitting point is either the live cell group or the dead cell group, and the light emitting point is other than the live cell, dead cell, or microorganism. To determine whether it is a contaminant, compare it to the threshold set for each of the live and dead groups, calculate the total number of live or dead bacteria,
In the life and death judgment unit, live and dead bacteria are dyed with two kinds of fluorescent dyes, and the difference in coordinates between the two axes of fluorescence intensity of the two colors is used in addition to live and dead bacteria. Set unclassified microorganisms as damaged bacteria,
A microorganism counting apparatus characterized by evaluating the degree of damage of dead bacteria.
生死判断部において、発光点ごとに生死菌染色試薬と死菌染色試薬の染色量を求め、あらかじめ設定されたしきい値を使用して、発光点ごとに生菌群または死菌群のいずれかを示すパラメータを与えることを特徴とする請求項1記載の微生物計数装置。 In the life and death judgment unit, determine the dyeing amount of the viable and dead bacterial staining reagent and the dead bacterial staining reagent for each luminescent point, and use either a preset threshold value to determine whether the live or dead bacterial group for each luminescent point. The microorganism counting apparatus according to claim 1, wherein a parameter indicating is provided. 微生物を固定する固定部を設けたことを特徴とする請求項1または2に記載の微生物計数装置。 The microorganism counting apparatus according to claim 1 or 2, further comprising a fixing unit for fixing microorganisms. 撮像エリアごとに波長が異なる画像を連続的に取得し、微生物判断部において前記各画像の輝度から色彩的特性を示す値を算出することを特徴とする請求項1から3のいずれかに記載の微生物計数装置。 4. The image according to claim 1, wherein images having different wavelengths for each imaging area are continuously acquired, and a value indicating color characteristics is calculated from the luminance of each image in a microorganism determination unit. Microbe counting device. 取得した各画像に含まれる発光点の座標を抽出する発光点抽出部と、画像ごとに抽出した発光点の座標に補正値を与え、発光点を照合する発光点照合部を備えることを特徴とする請求項1から4のいずれかに記載の微生物計数装置。 A light emission point extraction unit that extracts coordinates of light emission points included in each acquired image, and a light emission point verification unit that applies correction values to the coordinates of light emission points extracted for each image and compares the light emission points, The microorganism counting device according to any one of claims 1 to 4. 発光点抽出部において、あらかじめ設定された面積および輝度の範囲内のものを発光点とし、発光点の輝度値を、抽出した対象物の最大輝度値とし、座標を最大輝度値のピクセルの座標とすることを特徴とする請求項5記載の微生物計数装置。 In the light emission point extraction unit, a light emission point is within a preset area and luminance range, the luminance value of the light emission point is the maximum luminance value of the extracted object, and the coordinates are the coordinates of the pixel of the maximum luminance value. The microorganism counting apparatus according to claim 5, wherein: 発光点の照合後に発光点の一致率を算出し、出力することを特徴とする請求項5記載の微生物計数装置。 6. The microbe counting apparatus according to claim 5, wherein the coincidence ratio of the light emission points is calculated and output after the light emission point is collated. 照合する画像に対応する発光点が抽出されない場合に、対応する画像の座標の輝度値を使用することを特徴とする請求項5記載の微生物計数装置。 6. The microorganism counting apparatus according to claim 5, wherein when a light emitting point corresponding to an image to be collated is not extracted, a luminance value of coordinates of the corresponding image is used. 発光点ごとに座標値および取得した各波長の輝度値を持たせたデータを作成し、出力する出力部を備えることを特徴とする請求項5記載の微生物計数装置。 6. The microorganism counting apparatus according to claim 5, further comprising an output unit that creates and outputs data having a coordinate value and an acquired luminance value of each wavelength for each light emitting point. 測定した有効エリアの面積を求める有効エリア算出部を設け、有効エリア面積をもとに生菌または死菌の総数を算出することを特徴とする請求項1から9のいずれかに記載の微生物計数装置。 10. The microorganism count according to claim 1, further comprising an effective area calculation unit that calculates an area of the measured effective area, and calculating the total number of viable or dead bacteria based on the effective area area. apparatus. 受像素子のドット欠けを含む暗視野画像を取得し、微生物の発光点の画像から減算して除去する輝点除去部を備えることを特徴とする請求項1から10のいずれかに記載の微生物計数装置。 The microorganism according to any one of claims 1 to 10, further comprising a bright spot removing unit that obtains a dark field image including a dot defect of the image receiving element and subtracts and removes the image from a light emitting point image of the microorganism. Counting device.
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