JP4892648B1 - 新品種、植物品種の鑑別方法、及びイネ個体を早生化する方法 - Google Patents
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Abstract
【選択図】なし
Description
(1) イネ品種コシヒカリの染色体中、
イネ個体の第3染色体中の、イネ品種日本晴の第3染色体中の31,689,690番目の塩基から32,363,157番目の塩基までを含む領域に相当する領域が、イネ品種ハバタキの当該領域からなる染色体断片にホモ置換されており、かつ前記染色体断片の上流端が、イネ品種日本晴の第3染色体の31,521,443番目の塩基から31,689,690番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在し、かつ当該染色体断片の下流端が、イネ品種日本晴の第3染色体の32,363,157番目の塩基から32,384,798番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在していることを特徴とするイネ品種、
(2) 前記(1)記載の品種の個体及び前記(1)記載の品種の個体の後代個体からなる群より選択される2個体を交配して得られる後代個体、
(3) あるイネ個体が、特定の品種であるか否かを鑑別する方法であって、
イネ品種日本晴の第3染色体中の31,521,442番目のSNP(一塩基多型)に相当するSNP(イネ品種コシヒカリではA、イネ品種ハバタキではC)をDNAマーカーM1とし、
イネ品種日本晴の第3染色体の31,689,690番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではC、イネ品種ハバタキではT)をDNAマーカーM2とし、
イネ品種日本晴の第3染色体の32,208,924番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではA、イネ品種ハバタキではG)をDNAマーカーM3とし、
イネ品種日本晴の第3染色体の32,363,157番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではA、イネ品種ハバタキではT)をDNAマーカーM4とし、
イネ品種日本晴の第3染色体の32,384,799番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではT、イネ品種ハバタキではG)をDNAマーカーM5とし、
当該イネ個体のゲノム解析により、前記DNAマーカーM1〜M5をタイピングし、
得られたタイピング結果が、前記DNAマーカーM1はA(アデニン)であり、前記DNAマーカーM2はT(チミン)であり、前記DNAマーカーM3はG(グアニン)であり、前記DNAマーカーM4はTであり、前記DNAマーカーM5はTである場合に、当該イネ個体がイネ品種コシヒカリかずさ5号であると鑑別することを特徴とする、イネ品種の鑑別方法、
(4) イネ個体の第3染色体中の、イネ品種日本晴の第3染色体中の31,720,064番目の塩基から31,724,043番目の塩基までを含む領域に相当する領域を、前記(1)に記載のイネ品種又はイネ品種ハバタキの当該領域からなる染色体断片にホモ置換することを特徴とする、イネ個体を早生化する方法、
(5) イネ個体の第3染色体中の、イネ品種日本晴の第3染色体中の31,720,064番目の塩基から32,314,677番目の塩基までを含む領域に相当する領域を、前記(1)に記載のイネ品種又はイネ品種ハバタキの当該領域からなる染色体断片にホモ置換することを特徴とする、イネ個体を早生化する方法、
(6) 前記染色体断片の上流端が、イネ品種日本晴の第3染色体の31,689,691番目の塩基から31,720,064番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在し、かつ当該染色体断片の下流端が、イネ品種日本晴の第3染色体の32,314,677番目の塩基から32,363,156番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在するように、当該染色体断片を置換することを特徴とする前記(5)記載のイネ個体を早生化する方法、
(7) イネ個体の第3染色体中の、イネ品種日本晴の第3染色体中の31,689,690番目の塩基から32,363,157番目の塩基までを含む領域に相当する領域を、前記(1)に記載のイネ品種号又はイネ品種ハバタキの当該領域からなる染色体断片にホモ置換することを特徴とする、イネ個体を早生化する方法、
(8) 前記染色体断片の上流端が、イネ品種日本晴の第3染色体の31,521,443番目の塩基から31,689,690番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在し、かつ当該染色体断片の下流端が、イネ品種日本晴の第3染色体の32,363,157番目の塩基から32,384,798番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在するように、当該染色体断片を置換することを特徴とする前記(7)記載のイネ個体を早生化する方法、
(9) 前記(4)〜(8)のいずれか一つに記載のイネ個体を早生化する方法により作出されたイネ品種、
(10) 前記(9)記載の品種の個体及び前記(9)記載の品種の個体の後代個体からなる群より選択される2個体を交配して得られる後代個体、
(11) イネ個体の第3染色体中の、イネ品種日本晴の第3染色体中の32,309,502番目の塩基から32,314,677番目の塩基までを含む領域に相当する領域を、前記(1)に記載のイネ品種又はイネ品種ハバタキの当該領域からなる染色体断片にホモ置換することを特徴とする、イネ個体を晩生化する方法、
(12) 前記(11)に記載のイネ個体を晩生化する方法により作出されたイネ品種、
(13) 前記(12)記載の品種の個体及び前記(12)記載の品種の個体の後代個体からなる群より選択される2個体を交配して得られる後代個体、
を、提供するものである。
また、本発明のイネ個体を早生化する方法により、イネ個体を元品種よりも早生化することができる
コシヒカリの染色体のうち、(QTS4+QTS14)領域を含む一部のみがハバタキ由来の染色体断片に置換されている染色体断片置換系統を親個体とし、元品種コシヒカリよりも少し収穫期が早い新品種を作出した。
まず、染色体断片置換系統とコシヒカリとを交配させ、DNAマーカーM3−Agが、コシヒカリ由来アレルとハバタキ由来アレルとのヘテロ染色体領域である後代個体(種子)を10個収穫した。得られた種子を全て栽培し、自殖(自家交配)させ、さらに後代個体である種子を収穫した。
収穫された種子をさらに栽培した。圃場に移植できる程度に成育させた後、各栽培個体の葉からDNAを回収し、DNAマーカーM1−Acがコシヒカリ由来アレルのホモ染色体領域であり、DNAマーカーM2−Ct及びDNAマーカーM3(DNAマーカーM3−Ag)がコシヒカリ由来アレルとハバタキ由来アレルとのヘテロ染色体領域である栽培個体を選抜した。
この選抜された栽培個体を自殖(自家交配)させ、さらに後代個体である種子を収穫した。この収穫された種子をさらに栽培し、圃場に移植できる程度に成育させた後、各栽培個体の葉からDNAを回収し、DNAマーカーM1−Ac及びDNAマーカーM5−Tgがコシヒカリ由来アレルのホモ染色体領域であり、前記DNAマーカーM2−Ct、DNAマーカーM3(DNAマーカーM3−Ag)、及びDNAマーカーM4−Atがハバタキ由来アレルのホモ染色体領域である栽培個体1個を選抜した。この選抜された栽培個体が、(QTS4+QTS14)領域を、ハバタキ由来染色体断片に置換した新品種であり、本発明者はこの新品種を「コシヒカリかずさ5号」と命名した。図6はコシヒカリかずさ5号のゲノムを模式的に表した図である。
Claims (13)
- イネ品種コシヒカリの染色体中、
イネ個体の第3染色体中の、イネ品種日本晴の第3染色体中の31,689,690番目の塩基から32,363,157番目の塩基までを含む領域に相当する領域が、イネ品種ハバタキの当該領域からなる染色体断片にホモ置換されており、かつ前記染色体断片の上流端が、イネ品種日本晴の第3染色体の31,521,443番目の塩基から31,689,690番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在し、かつ当該染色体断片の下流端が、イネ品種日本晴の第3染色体の32,363,157番目の塩基から32,384,798番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在していることを特徴とするイネ品種。 - 請求項1記載の品種の個体及び請求項1記載の品種の個体の後代個体からなる群より選択される2個体を交配して得られる後代個体。
- あるイネ個体が、特定の品種であるか否かを鑑別する方法であって、
イネ品種日本晴の第3染色体中の31,521,442番目のSNP(一塩基多型)に相当するSNP(イネ品種コシヒカリではA、イネ品種ハバタキではC)をDNAマーカーM1とし、
イネ品種日本晴の第3染色体の31,689,690番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではC、イネ品種ハバタキではT)をDNAマーカーM2とし、
イネ品種日本晴の第3染色体の32,208,924番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではA、イネ品種ハバタキではG)をDNAマーカーM3とし、
イネ品種日本晴の第3染色体の32,363,157番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではA、イネ品種ハバタキではT)をDNAマーカーM4とし、
イネ品種日本晴の第3染色体の32,384,799番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではT、イネ品種ハバタキではG)をDNAマーカーM5とし、
当該イネ個体のゲノム解析により、前記DNAマーカーM1〜M5をタイピングし、
得られたタイピング結果が、前記DNAマーカーM1はA(アデニン)であり、前記DNAマーカーM2はT(チミン)であり、前記DNAマーカーM3はG(グアニン)であり、前記DNAマーカーM4はTであり、前記DNAマーカーM5はTである場合に、当該イネ個体がイネ品種コシヒカリかずさ5号であると鑑別することを特徴とする、イネ品種の鑑別方法。 - イネ個体の第3染色体中の、イネ品種日本晴の第3染色体中の31,720,064番目の塩基から31,724,043番目の塩基までを含む領域に相当する領域を、請求項1に記載のイネ品種又はイネ品種ハバタキの当該領域からなる染色体断片にホモ置換することを特徴とする、イネ個体を早生化する方法。
- イネ個体の第3染色体中の、イネ品種日本晴の第3染色体中の31,720,064番目の塩基から32,314,677番目の塩基までを含む領域に相当する領域を、請求項1に記載のイネ品種又はイネ品種ハバタキの当該領域からなる染色体断片にホモ置換することを特徴とする、イネ個体を早生化する方法。
- 前記染色体断片の上流端が、イネ品種日本晴の第3染色体の31,689,691番目の塩基から31,720,064番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在し、かつ当該染色体断片の下流端が、イネ品種日本晴の第3染色体の32,314,677番目の塩基から32,363,156番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在するように、当該染色体断片を置換することを特徴とする請求項5記載のイネ個体を早生化する方法。
- イネ個体の第3染色体中の、イネ品種日本晴の第3染色体中の31,689,690番目の塩基から32,363,157番目の塩基までを含む領域に相当する領域を、請求項1に記載のイネ品種又はイネ品種ハバタキの当該領域からなる染色体断片にホモ置換することを特徴とする、イネ個体を早生化する方法。
- 前記染色体断片の上流端が、イネ品種日本晴の第3染色体の31,521,443番目の塩基から31,689,690番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在し、かつ当該染色体断片の下流端が、イネ品種日本晴の第3染色体の32,363,157番目の塩基から32,384,798番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在するように、当該染色体断片を置換することを特徴とする請求項7記載のイネ個体を早生化する方法。
- 請求項4〜8のいずれか一項に記載のイネ個体を早生化する方法により作出されたイネ品種。
- 請求項9記載の品種の個体及び請求項9記載の品種の個体の後代個体からなる群より選択される2個体を交配して得られる後代個体。
- イネ個体の第3染色体中の、イネ品種日本晴の第3染色体中の32,309,502番目の塩基から32,314,677番目の塩基までを含む領域に相当する領域を、請求項1に記載のイネ品種又はイネ品種ハバタキの当該領域からなる染色体断片にホモ置換することを特徴とする、イネ個体を晩生化する方法。
- 請求項11に記載のイネ個体を晩生化する方法により作出されたイネ品種。
- 請求項12記載の品種の個体及び請求項12記載の品種の個体の後代個体からなる群より選択される2個体を交配して得られる後代個体。
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