JP4864857B2 - 有糸***活性の測定 - Google Patents
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Description
a)有糸***像に関連づけられる輝度を有する画像データにおける画素を識別する工程と、
b)基準色を提供するために、位置および輝度が他の識別された画素と十分に近い基準画素を、識別された画素の中から選択する工程と、
c)可能性がある有糸***を示すために、輝度が基準色の輝度と十分に近い画像データにおける画素を位置特定する工程と、
d)画素をそれに追加することによって、位置特定された画素からの可能性がある有糸***像に対応する画像領域を増加させる工程であって、画像領域に対する可能性がある増加は、それら画素の輝度がそれぞれの画像領域輝度に十分に近く、かつ画像データ背景輝度から十分に遠いか否かに応じて実施または拒絶される、画像領域を増加させる工程と、
e)画像領域面積に関する閾値、緻密度に関する閾値、および幅/高さ比に関する閾値に基づいて、成長画像領域を選択する工程と、
f)当該領域の数の閾値に基づいて、有糸***像を実際に示すものとして選択され成長画像領域をカウントする工程とを有することを特徴とする方法を提供する。
a)有糸***像の画像に関連づけられる強度が欠如した画素を除去するために、色画像データの閾値を定め、
b)すべての色に存在しない画素を除去し、かつ
c)小さすぎたり、大きすぎたりするため可能性がある有糸***像にならない画素を除去するために、画像領域面積の閾値を定めることによって、有糸***像を示すことに関しての受け入れまたは拒絶のために編成されうる。
a)有糸***像の画像に関連づけられる強度を有する画素を識別するために分割し、
b)小さすぎたり、大きすぎたりするため可能性がある有糸***像にならない画素を除去するために画像領域面積の閾値を定め、
c)画素の画像領域が十分に大きいクラスタであるか否かを判断するためにクラスタ解析を行い、かつ
d)壊死性またはヘアリ(hairy)エッジフィルタリングを行うことによって、
有糸***像を示すことに関しての受け入れまたは拒絶のために編成されうる。
a)可能性がある有糸***像に対応する画像領域の強度プロファイルを測定する工程と、
b)その強度プロファイルが、有糸***像の画像に関連づけられる強度を有する強度プロファイル内の位置における予め設定された閾値より大きい値を有する場合に、有糸***像を示すものとして画像領域をカウントする工程とを有することを特徴とする方法を提供する。
a)画像データを重複する副画像に分解し、
b)PCAを副画像に適用して、第1の主成分画像を導き、
c)ブロブ(blob)および背景の2値画像を生成するために、第1の主成分画像の閾値を定め、
d)副画像境界に隣接または交差するブロブを拒絶し、
e)ブロブの穴を満たし、
f)小さすぎて可能性がある有糸***像に対応しないブロブを拒絶し、かつ
g)工程a)で先述した画像領域プロファイル測定のために、副画像を単一画像に再編成することによって、画像データを前処理することを含むことができる。
a)有糸***像の画像に関連づけられる強度が欠如した画素を除去するために、色画像データの閾値を定め、
b)すべての色に存在しない画素を除去し、かつ
c)小さすぎたり、大きすぎたりするため可能性がある有糸***像にならない画素を除去するために、画像領域面積の閾値を定めることによって、有糸***像を示すことに関しての受け入れまたは拒絶のために編成されうる。
a)有糸***像の画像に関連づけられる強度を有する画素を識別するために分割し、
b)小さすぎたり、大きすぎたりするため可能性がある有糸***像にならない画素を除去するために画像領域面積の閾値を定め、
c)画素の画像領域が十分に大きいクラスタであるか否かを判断するためにクラスタ解析を行い、かつ
d)壊死性またはヘアリエッジフィルタリングを行うことによって、有糸***像を示すことに関しての受け入れまたは拒絶のために編成されうる。
a)有糸***像に関連づけられる輝度を有する画像データにおける画素を識別する工程と、
b)基準色を提供するために、位置および輝度が他の識別された画素と十分に近い基準画素を、識別された画素の中から選択する工程と、
c)可能性がある有糸***を示すために、輝度が基準色の輝度と十分に近い画像データにおける画素を位置特定する工程と、
d)画素をそれに追加することによって、位置特定された画素からの可能性がある有糸***像に対応する画像領域を増加させる工程であって、画像領域に対する可能性がある増加は、それら画素の輝度がそれぞれの画像領域輝度に十分に近く、かつ画像データ背景輝度から十分に遠いか否かに応じて、実施または拒絶される、画像領域を増加させる工程と、
e)画像領域面積に関する閾値、緻密度に関する閾値、および幅/高さ比に関する閾値に基づいて、成長画像領域を選択する工程と、
f)当該領域の数に関する閾値に基づいて、有糸***像を実際に示すものとして選択された画像領域をカウントする工程とを、実行するようにプログラムされることを特徴とするコンピュータ装置を提供する。
a)可能性がある有糸***像に対応する画像領域の強度プロファイルを測定する工程と、
b)その強度プロファイルが、有糸***像の画像に関連づけられる強度を有する強度プロファイル内の位置における予め設定された閾値より大きい値を有する場合に、有糸***像を示すものとして画像領域をカウントする工程とを、実行するようにプログラムされることを特徴とするコンピュータ装置を提供する。
a)有糸***像に関連づけられる輝度を有する画像データにおける画素を識別する工程と、
b)基準色を提供するために、位置および輝度が他の識別された画素と十分に近い基準画素を、識別された画素の中から選択する工程と、
c)可能性がある有糸***を示すために、輝度が基準色の輝度と十分に近い画像データにおける画素を位置特定する工程と、
d)画素をそれに追加することによって、位置特定された画素からの可能性がある有糸***像に対応する画像領域を増加させる工程であって、画像領域に対する可能性のある増加は、それら画素の輝度がそれぞれの画像領域輝度に十分に近く、かつ画像データ背景輝度から十分に遠いか否かに応じて、実施または拒絶される、画像領域を増加させる工程と、
e)画像領域面積に関する閾値、緻密度に関する閾値、および幅/高さ比に関する閾値に基づいて、成長画像領域を選択する工程と、
f)当該領域の数に関する閾値に基づいて、有糸***像を実際に示すものとして選択された成長画像領域をカウントする工程とを、実施するようにコンピュータを制御するための命令を含むことを特徴とするコンピュータプログラムを提供する。
a)可能性がある有糸***像に対応する画像領域の強度プロファイルを測定する工程と、
b)その強度プロファイルが、有糸***像の画像に関連づけられる強度を有する強度プロファイル内の位置における予め設定された閾値より大きい値を有する場合に、有糸***像を示すものとして画像領域をカウントする工程とを、実施させることを特徴とするコンピュータプログラムを提供する。
Li=0.299×Ri+0.587×Gi+0.114×Bi (8)
RatioR=(255/LumMaxR)×1.05 (9)
RatioG=(255/LumMaxG)×1.05 (10)
RatioB=(255/LumMaxB)×1.05 (11)
BalancedRi=Ri×RatioR (12)
BalancedGi=Gi×RatioG (13)
BalancedBi=Bi×RatioB (14)
Li=0.2999×Ri+0.587×Gi+0.114×Bi (15)
|(0.299×Ri+0.587×Gi+0.114×Bi)−(Lpicked colour)|<20 (16)
マスク画像画素が受け入れられ、同位置にある対応する「成長」の画素が0である場合は、
「成長」の画素を真(1)に設定する。
「成長」の画素の位置を「アクションリスト」という名称のリストに入力する。
アクションリストが空でなければ、
最後に追加された画素をアクションリストから除去するが、画像位置をメモリに保持し、それを「除去された画素」と呼ぶ。
除去された画素の最も近い画素である4つの「成長」の画素、すなわち、対角線上の近隣画素ではなく、同じ列または行のみで除去された画素と隣り合う画素を選択する。
まだマスク画像画素と比較されていない最も近い近隣画素の1つを選択する。
以下の3つの基準、すなわち(a)マスク画像画素と選択された最も近い近隣画素の輝度の差がLT未満であること、(b)マスク画像画素と背景色の輝度の差がLTより大きいこと、および(c)マスク画像画素と白色画素の輝度の差がLTより大きいことが満たされる場合は(または満たされる場合のみ)、
選択された最も近い近隣画素と同じ位置に配置された「成長」の画素を偽(0)から真(1)に変更し、選択された最も近い近隣画素の位置をアクションリストに追加する。
基準(a)、(b)および(c)のいずれか1つ以上が満たされない場合は、該当する成長の「画素」を変化させず、その位置をアクションリストに追加しない。
まだマスク画像画素と比較されていない次の最も近い近隣画素についても繰り返す。
アクションリストへの次のエントリについても繰り返す。
他のすべてのマスク画像画素についても繰り返す。
面積A(ブロブにおける画素数)
周長P(ブロブの境界上の画素数)
緻密度(4πA/P2)
幅(ブロブを横切る行における最大画素数)
高さ(ブロブを下がる列における最大画素数)
幅/高さ比
輝度百分率:ブロブの画素と同じ位置に配置された中央値フィルタリングされた画像画素を使用して、最も暗い中央値フィルタリングされた画像画素の輝度を、背景色の輝度で割った結果に100をかけることによって測定値を計算する
摂動差(perturbed difference)(それぞれ予め設定された増分および減分によって摂動された、LTに対応する閾値を用いて得られた成長ブロブサイズ間の差)
色相差(平均色相と入力画像からの背景色相との差の絶対値)。
本例では摂動係数PF(PF=4)を加えることによって閾値LTを調整し、
成長プロセス68を適用して、より大きい新たなブロブを得て、
摂動係数PFを減算することによって閾値LTを調整し、かつ
成長プロセス68を適用して、より小さい新たなブロブを得る。
M=(R、G、B)の最大値 (17)
m=(R、G、B)の最小値 (18)
このとき
newr=(M−R)/(M−m) (19)
newg=(M−G)/(M−m) (20)
newb=(M−B)/(M−m) (21)
RがMに等しい場合は、H=60(newb−newg) (22)
GがMに等しい場合は、H=60(2+newr−newb) (23)
BがMに等しい場合は、H=60(4+newg−newr) (24)
Hが360以上の場合は、H=H−360 (25)
Hが0未満の場合は、H=H+360 (26)
最大ブロブの面積を取得し、
中央値ブロブの面積を取得し、
最大ブロブの面積が、中央値ブロブ面積のBパーセントより大きい場合は、
最も暗いDパーセントのブロブの輝度を取得し、Dパーセントの位置にブロブが存在しない場合は、より暗く、かつ輝度リストにおける概念的なDパーセントのブロブの位置に最も近いブロブの輝度をとる。
最大のCブロブの各々に対して、
ブロブ輝度が、最も暗いDパーセントのブロブ以下である場合は、
検知された有糸***像であるとしてそのブロブを受け入れ、
有糸***像のカウントを1だけ増加させ、
未評価のブロブがなくなるまで最大のCのブロブの残りについて繰り返し、有糸***像のカウントを出力する。
最大のFパーセントのブロブの面積を取得し、Fパーセントの位置にブロブが存在しない場合は、面積リストにおける概念的なFパーセントのブロブの位置に(面積が)最も近いブロブの面積をとる。
最も暗いEのブロブの各々に対して、
ブロブ面積が、最大のFパーセントのブロブの面積以下である場合は、
検知された有糸***像であるとしてそのブロブを受け入れ、
(最初は0である)有糸***像のカウントを1だけ増加させ、
未評価のブロブがなくなるまで最大のEのブロブの残りについて繰り返し、有糸***像のカウントを出力する。
現在の細胞は有糸***細胞である。
それ以外の場合、すなわちビン(1)≦7.6である場合は、
ビン(2)>25.5、びん(4)>0、かつ最小プロフィル<0.15であれば、
現在の細胞は有糸***細胞であり、
それ以外の場合、ビン(2)≦25.5、かつ/またはビン(4)≦0、かつ/または最小プロフィル≧0.15であれば、
現在の細胞は有糸***細胞ではない。
Claims (17)
- 組織病理検体画像データから有糸***活性を測定する方法であって、
a)可能性がある有糸***像に対応する画像領域の強度プロファイル、すなわち平均断面を測定する工程と、
b)1組のビンを生成するために、所定の強度に関連する画素の数をカウントする工程であって、各々のビンがそれぞれの強度値を有する画素の数を含む、前記カウントする工程と、
c)有糸***像の画像に関連づけられる強度を有するビンが、予め設定された閾値より大きい値を有する場合に、画像領域が有糸***像を示すものと判断する工程とを有することを特徴とする方法。 - 有糸***像の画像に関連づけられる強度を有するビンが予め設定された閾値を超えない第1の値を有し、他のビンが予め設定された第2の閾値より大きい第2の値を有し、さらなるビンが予め設定された第3の閾値より大きい第3の値を有し、強度プロファイルの最小値が予め設定された第4の閾値より小さい場合に、画像領域が有糸***像を示すものと判断することを含むことを特徴とする、請求項1に記載の方法。
- 第1の値が、強度プロファイルの一端にあり、第1および第2の値が、強度プロファイル内で互いに隣接し、第3の値が、第2の値と隣接していないことを特徴とする、請求項2に記載の方法。
- 画像データが、着色画像データの主成分解析(PCA)によって得られた第1の主成分を含むことを特徴とする、請求項2に記載の方法。
- 工程a)が、
a)画像データを重複する副画像に分解し、
b)PCAを副画像に適用して、第1の主成分画像を導き、
c)ブロブおよび背景の2値画像を生成するために第1の主成分画像の閾値を定め、
d)副画像境界に隣接または交差するブロブを拒絶し、
e)ブロブの穴を満たし、
f)小さすぎて可能性がある有糸***像に対応しないブロブを拒絶し、かつ
g)工程a)で先述した画像領域のプロファイル測定のために、副画像を単一画像に再構成することによって、画像データを前処理することを含むことを特徴とする、請求項2に記載の方法。 - 工程g)の後に、画素が、
a)有糸***像の画像に関連づけられる強度が欠如した画素を除去するために色画像データの閾値を定め、
b)すべての色に存在しない画素を除去し、かつ
c)小さすぎたり、大きすぎたりするため可能性がある有糸***像にならない画素を除去するために画像領域面積の閾値を定めることによって、有糸***像を示すことに関しての受け入れまたは拒絶のために編成されることを特徴とする、請求項5に記載の方法。 - 工程g)の後に、画素が、
a)有糸***像の画像に関連づけられる強度を有する画素を識別するために分割し、
b)小さすぎたり、大きすぎたりするため可能性がある有糸***像にならない画素を除去するために画像領域面積の閾値を定め、
c)画素の画像領域が十分に大きいクラスタであるか否かを判断するためにクラスタ解析を行い、かつ
d)壊死性およびヘアリエッジフィルタリングを行うことによって、有糸***像を示すことに関しての受け入れまたは拒絶のために編成されることを特徴とする、請求項5に記載の方法。 - 組織病理検体画像データから有糸***活性を測定するためのコンピュータ装置であって、
a)可能性がある有糸***像に対応する画像領域の強度プロファイル、すなわち平均断面を測定する工程と、
b)1組のビンを生成するために、所定の強度に関連する画素の数をカウントする工程であって、各々のビンがそれぞれの強度値を有する画素の数を含む、前記カウントする工程と、
c)有糸***像の画像に関連づけられる強度を有するビンが、予め設定された閾値より大きい値を有する場合に、画像領域が有糸***像を示すものと判断する工程とを、実行するようにプログラムされることを特徴とする装置。 - 有糸***像の画像に関連づけられる強度を有するビンが予め設定された閾値を超えない第1の値を有し、他のビンが予め設定された第2の閾値より大きい第2の値を有し、さらなるビンが予め設定された第3の閾値より大きい第3の値を有し、強度プロファイルの最小値が予め設定された第4の閾値より小さい場合に、画像領域が有糸***像を示すものと判断するようにプログラムされることを特徴とする、請求項8に記載の装置。
- 第1の値が、強度プロファイルの一端にあり、第1および第2の値は、強度プロファイル内で互いに隣接し、第3の値は、第2の値と隣接していないことを特徴とする、請求項9に記載の装置。
- 画像データが、着色画像データの主成分解析(PCA)によって得られた第1の主成分を含むことを特徴とする、請求項9に記載の装置。
- 組織病理検体画像データから有糸***活性を測定するのに使用されるコンピュータプログラムであって、命令が、
a)可能性がある有糸***像に対応する画像領域の強度プロファイル、すなわち平均断面を測定する工程と、
b)1組のビンを生成するために、所定の強度に関連する画素の数をカウントする工程であって、各々のビンがそれぞれの強度値を有する画素の数を含む、前記カウントする工程と、
c)有糸***像の画像に関連づけられる強度を有するビンが、予め設定された閾値より大きい値を有する場合に、画像領域が有糸***像を示すものと判断する工程とを、実施させることを特徴とするコンピュータプログラム。 - 命令は、有糸***像の画像に関連に対応づけられる強度を有するビンが予め設定された閾値を超えない第1の値を有し、他のビンが予め設定された第2の閾値より大きい第2の値を有し、さらなるビンが予め設定された第3の閾値より大きい第3の値を有し、強度プロファイルの最小値が予め設定された第4の閾値より小さい場合に、画像領域が有糸***像を示すものと判断させることを特徴とする、請求項12に記載のコンピュータプログラム。
- 第1の値は、強度プロファイルの一端にあり、第1および第2の値は、強度プロファイル内で互いに隣接し、第3の値は、第2の値と隣接していないことを特徴とする、請求項13に記載のコンピュータプログラム。
- 命令が、
a)画像データを重複する副画像に分解し、
b)PCAを副画像に適用して、第1の主成分画像を導き、
c)ブロブおよび背景の2値画像を生成するために第1の主成分画像の閾値を定め、
d)副画像境界に隣接または交差するブロブを拒絶し、
e)ブロブの穴を満たし、
f)小さすぎて可能性がある有糸***像に対応しないブロブを拒絶し、かつ
g)工程a)で先述した画像領域プロファイル測定のために、副画像を単一画像に再編成することによって、画像データを前処理することを工程a)に含めることを特徴とする請求項13に記載のコンピュータプログラム。 - a)有糸***像の画像に関連づけられる強度が欠如した画素を除去するために色画像データの閾値を定め、
b)すべての色に存在しない画素を除去し、かつ
c)小さすぎたり、大きすぎたりするため可能性がある有糸***像にならない画素を除去するために画像領域面積の閾値を定めることによって、
後続の有糸***評価のために、有糸***像を示すことに関しての受け入れまたは拒絶のために画素を編成することを含むことを特徴とする、請求項1に記載の方法。 - a)有糸***像の画像に関連づけられる強度を有する画素を識別するために分割し、
b)小さすぎたり、大きすぎたりするため可能性がある有糸***像にならない画素を除去するために画像領域面積の閾値を定め、
c)画素の画像領域が十分に大きいクラスタであるか否かを判断するためにクラスタ解析を行い、かつ
d)壊死性およびヘアリエッジフィルタリングを行うことによって、
後続の有糸***評価のために、有糸***像を示すことに関しての受け入れまたは拒絶のために画素を編成することを含むことを特徴とする、請求項1に記載の方法。
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