JP2023514659A - 免疫原性が低下した修飾インターフェロン－アルファ－２ - Google Patents

免疫原性が低下した修飾インターフェロン－アルファ－２ Download PDF

Info

Publication number
JP2023514659A
JP2023514659A JP2022537837A JP2022537837A JP2023514659A JP 2023514659 A JP2023514659 A JP 2023514659A JP 2022537837 A JP2022537837 A JP 2022537837A JP 2022537837 A JP2022537837 A JP 2022537837A JP 2023514659 A JP2023514659 A JP 2023514659A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
interferon
polypeptide
modified
gmop
amino acid
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2022537837A
Other languages
English (en)
Other versions
JPWO2021126929A5 (ja
Inventor
ムファレーヘ・エドゥアルド・フェデリコ
ジョルゲッティ・ソフィア・イネス
エチェヴェリガライ・マリナ
デ・グルート・アンネ・サールス
マーティン・ウィリアム・ディー
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Giorgetti sofia Ines
Mufarrege eduardo Federico
Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas CONICET
Universidad Nacional del Litoral
Epivax Inc
Original Assignee
Giorgetti sofia Ines
Mufarrege eduardo Federico
Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas CONICET
Universidad Nacional del Litoral
Epivax Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Giorgetti sofia Ines, Mufarrege eduardo Federico, Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas CONICET, Universidad Nacional del Litoral, Epivax Inc filed Critical Giorgetti sofia Ines
Publication of JP2023514659A publication Critical patent/JP2023514659A/ja
Publication of JPWO2021126929A5 publication Critical patent/JPWO2021126929A5/ja
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
    • C07K14/555—Interferons [IFN]
    • C07K14/56—IFN-alpha
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00—Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011—Details
    • C12N2740/10011—Retroviridae
    • C12N2740/16011—Human Immunodeficiency Virus, HIV
    • C12N2740/16041—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2740/16043—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

【課題】本開示は、インターフェロン－α２活性および低減された免疫原性を有する修飾インターフェロン－α２ポリペプチドを含む組成物に向けられる。複数の態様において、前記遺伝子修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、複数のＯ－グリコシル化部位を有するＧＭ－ＣＳＦ由来のペプチド配列の付加など、高グリコシル化されている。さらに、本開示は、前記修飾インターフェロン－α２をコードする核酸分子を含む組成物を提供する。本開示はまた、前記修飾インターフェロン－α２をコードする前記核酸分子を含む組換えタンパク質発現細胞株を含む組成物；ここで、前記組換えタンパク質発現細胞は、前記核酸分子を含むプラスミドまたはベクターを含んでいることを含む組成物を提供する。また、免疫原性が低下したインターフェロン－α２活性を有する修飾インターフェロン－α２を含む医薬組成物、ならびに対象における医学的状態の処置のための前記医薬製剤の使用方法も開示される。【選択図】図１０

Description

関連出願との相互参照
本出願は、「Hyperglycosylated Inteferon with Reduced Immunogencity（免疫原性が低下した、糖鎖を多く含むインターフェロン）」と題し、２０１９年１２月１７日に出願されたアルゼンチン仮出願番号：２０１９０１０３７１５に基づき、その優先権を主張し、その内容全体は参照により本明細書に組み込まれるものとする。
（電子的に提出した配列表の参照）
本出願は、ＡＳＣＩＩ形式で電子的に提出された配列表を含み、その全体が参照により本出願に組み込まれる。２０２０年１２月１１日に作成された前記ＡＳＣＩＩコピーは、「ＥＰＶ００２７ＷＯ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｐａｔｅｎｔ－Ｉｎ＿ＳＴ２５」と名付けられ、サイズは５４ＫＢバイトである。
本開示は、一般に、ヒトに適用するための医薬的な利益を有する治療用分子の開発に関する。より詳細には、本開示は、修飾（ｍｏｄｉｆｉｅｄ）ＩＦＮα－２ポリペプチド（修飾ＩＦＮα－２ａ、修飾ＩＦＮα－２ｂおよび修飾ＩＦＮα－２ｃポリペプチドを含む）、ならびに関連化合物および組成物に関連する。これらの修飾ＩＦＮα－２ポリペプチドは、証明された抗ウイルス生物学的活性、市販のサイトカインに関する改善された薬物動態パラメータ、および低減された免疫原性を示す。これらの修飾ＩＦＮα－２ポリペプチド、ならびに関連する化合物および組成物は、抗ウイルス療法を含むヒトの治療および処置に使用することができる。
治療用組換えタンパク質は、日常診療の一部であり、さまざまな疾患の治療に使用されている。治療用組換えタンパク質は、医薬品市場の２０％以上を占め、その成長率は低分子医薬品の２倍に達している。タンパク質治療薬は、一般的に副作用が少なく、高い有効性を有している。実際、微生物感染症から各種癌、関節炎、自己免疫疾患まで、多くのヒトの疾病の治療において、他のタイプの薬剤では不可能であった医療介入の可能性をバイオ医薬品は提供している。
しかし、タンパク質治療薬の臨床応用には、運用や製造の面から、また製品の臨床的限界の面から、多くの課題を克服する必要がある。例えば、そのような課題としては、タンパク質を治療薬として投与する場合、溶解性が悪い、安定性が悪い、循環中の半減期（half-life in circulation）が短い、生物学的機能の保持に問題がある、などが挙げられる。また、純粋なタンパク質を含む組成物を高い収率で製造することは、多くの課題を伴うため、容易に投与可能な治療薬を実現することは困難である場合がある。このように、長期にわたって有効かつ持続的な生物学的反応を引き起こすことができるバイオ医薬品の開発に対して、取り組みがなされていることは驚くべきことではない。
これらのタンパク質（サイトカイン、成長因子、モノクローナル抗体など）は、ほとんどの場合、人体で作られるものとほぼ同じ分子で構成されているが、これらの薬剤を投与した結果、免疫反応が発現した例が多数報告されている。これらの薬剤に対して発現した抗体（ＡＤＡｓ）はタンパク質の活性に影響を与え、薬剤の種類、循環期間、中和活性などの要因によって、様々な複雑かつ深刻な影響をもたらす。最も一般的な影響には、治療効果の低下や過敏症反応が含まれるが、アナフィラキシーや自己免疫疾患を誘発することもある。誘発される抗体の陽性率は、組織プラスミノーゲン活性化因子（Ａｃｔｉｖａｓｅ）のような薬剤では１％未満、ＯＫＴ３（ＩｇＧ２ａモノクローナル抗体）のような薬剤では７０％と、幅がある。
治療用タンパク質の投与に応じた中和抗体の生成は、様々な要因の結果として起こり得る。これらの要因は、投与経路、用量、製剤、凝集体および／または汚染物質の存在、および／またはグリコシル化の存在および／またはタイプなどの外因性要因と、タンパク質中の免疫原性エピトープの存在などの内因性要因に大別される。
外来因子は、基本的に製造工程の設計と品質に関係する。この意味で、ＬＰＳ（バクテリア・リポポリサッカライド）のような炎症促進物質や変異原性の非特異的化合物の製品への混入や、製品中の凝集体の生成は、免疫反応の誘発に重要なシグナルを発生させる可能性がある。さらに、製剤化中に起こりうる治療薬の変性は、Ｂリンパ球に認識される可能性のある新しいエピトープの存在により、無傷のものよりも免疫原性の高い製品をもたらし、ＡＤＡの誘発を伴う免疫反応の刺激につながる可能性がある。多くの場合、これらの要因は、薬剤を製造する前の段階と、製品を精製する最終段階の両方において、慎重な製造プロセスを開発することによって回避することに成功している。さらに、バイオ治療薬を安定化させる賦形剤を取り入れることで、良好な結果が得られている。
しかし、治療薬が自己のタンパク質とほとんど同じである場合でも、Ｂリンパ球の活性化が抗体の発現に寄与するため、内在性因子の制御は非常に困難である。Ｂリンパ球の活性化は、Ｔ細胞の協力によって媒介される場合とされない場合があり、それぞれＴ細胞依存性反応またはＴ細胞非依存性反応となる。Ｔ細胞非依存的反応は、特定のグループのＢリンパ球が活性化された結果によって発現するものであり、ポリマー反復などのある分子の特定の構造的特徴によって刺激されるものである。このＴ細胞非依存的活性化の結果として生じる抗体は、主に低親和性ＩｇＭ型である。
一方、Ｔ細胞依存性の活性化は、主にタンパク質の一次配列に関連している。Ｔ細胞依存性の活性化では、分子がエンドサイトーシスされ、処理され、得られたペプチドがクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）分子と関連して抗原提示細胞（樹状細胞、マクロファージまたはＢリンパ球）の表面に提示されると、いくつかの配列はＴ細胞「ヘルパー」（Ｔｈ）によって（ＴＣＲ（Ｔ細胞受容体）という細胞表面の受容体を介して）認識され得る。これらの特異的なリンパ球は、いったん活性化されると、Ｂリンパ球の活性化とそれに伴うＡＤＡの産生につながる免疫反応を引き起こす。Ｔ細胞依存性の反応では、生成される抗体はＩｇＧタイプであり、親和性が高く、Ｔ細胞が関与しない場合に比べ、生成も長期間持続する。現在、タンパク質治療薬の免疫原性を評価する方法論は、計算機による、またはｉｎ ｓｉｌｉｃｏでの免疫原性予測技術、インビトロおよびエクスビボ細胞での増殖戦略、動物モデルの使用など、多岐にわたる。これらはすべて、最も中心的な治療用タンパク質に対する免疫反応がＴ細胞に依存することを前提としている。
Ｔ細胞依存性Ｂリンパ球の活性化は、Ｂリンパ球の一群が細胞表面の抗原受容体（ＩｇＭ／ＩｇＤ）を介して特定のタンパク質エピトープと相互作用することから始まり、Ｂリンパ球の活性化の最初の兆候を構成している。このシグナルはタンパク質の内在化を促進し、その後小さなペプチドエピトープに加工され、最終的にはＢリンパ球の表面にあるクラスＩＩ ＭＨＣ分子の「溝」内に露出されることになる。Ｂ細胞はまた、その表面にＣＤ４０分子を共発現している。Ｔｈ（ヘルパーＴ）リンパ球がＴＣＲとＣＤ４０分子のリガンド（ＣＤ１５４）を介して複合エピトープＭＨＣクラスＩＩおよびＣＤ４０（Ｂリンパ球の表面）と相互作用すると、第２の活性化シグナルが発動される。このシグナルは最終的にＢリンパ球を活性化し、Ｔ細胞はサイトカインＩＬ－４（Ｔｈリンパ球２型の反応）またはインターフェロンγ（Ｔｈリンパ球１型）などを産生して免疫反応を成熟させる。注意すべきは、第二のシグナルを提供するＴ細胞の関与がなければ、Ｂリンパ球は予定された細胞死（アポトーシス）を被るということである。このため、Ｔ細胞を介した免疫反応の減衰が、治療目的の組換えタンパク質の「脱免疫」と呼ばれるプロセスで注目されるようになった。
特に、ＩＦＮαやＩＦＮ－βによる治療の場合、自己由来のサイトカインであるにもかかわらず、一部の患者では自己の抗原に対する免疫寛容が破綻し、抗ＩＦＮ抗体の産生が観察されている。これらの抗体は、ＩＦＮ分子に結合してもほとんど効果を発揮しないか、あるいはサイトカインの薬物動態を変化させ、標的細胞表面の特異的受容体への結合ドメインを阻害することにより、その活性を中和させる可能性がある。実際、ＩＦＮα－２ａまたはＩＦＮα－２ｂによる治療を受けたＣ型慢性肝炎や腫瘍性疾患の患者において、抗ＩＦＮ－α抗体の発現が見られることが、数多くの臨床研究によって確認されている。
ＩＦＮα－２（ＩＦＮα－２ｂを含む）をバイオ治療薬として使用する際のもう一つの大きな制限は、循環中の半減期が短いことであり、このため長期の治療が必要となり、結果として前述のような副作用の発生が予想される。この意味で、分子のＰＥＧ化により、血漿中の半減期が長くなり、本来の分子と比較して、週１回の投与が可能になり、効率も改善されている。ＰＥＧ化は、抗原提示をしばしば低下させるエリック障害（erric impairment）を起こすため、組換えタンパク質の免疫原性を低下させる戦略としてしばしば取り入れられる。しかし、ＰＥＧ化ＩＦＮα－２およびリバビリン療法に反応しないＣ型慢性肝炎患者の８％が抗ＩＦＮ中和抗体を有しており、ＩＦＮによる治療後にＨＣＶウイルスを排除した患者では、これらの抗体が検出できるレベルを示したものはなかったというデータもある。
血漿中半減期を改善するためのいくつかの戦略では、腎臓からの***が主な速やかな経路であることから、腎クリアランスをターゲットとしている。糸球体関門は、タンパク質の電荷とサイズに応じてろ過するため、血漿クリアランスを減少させるための出発点は、その流体力学的容積を変化させることであった。そのため、様々なバイオ治療薬の薬物動態を改善する目的で、近年、Ｎ－およびＯ－グリコシル化エンジニアリング戦略が実施されており、糸球体ろ過率が非常に低い糖タンパク質を生成することが可能になってきている。この結果は、糖鎖の存在により流体力学的半径が大きくなることと、糖鎖の末端シアル酸が負電荷を帯び、糸球体孔の負電荷グリコサミノグリカンと反発し合うことによるものである。
しかしながら、この戦略の実施により、半減期の増加という好ましい結果が得られたにもかかわらず、Ｎ－グリコシル化のコンセンサス部位やＯ－グリコシル化に必要なＳｅｒ／Ｔｒｅに富む大きな領域（コンセンサス部位がない）を作り出すために、タンパク質のコード配列に一連の変異を導入すると、通常は治療薬の生物活性にマイナスの影響を与えることになった。この例として、野生型ＩＦＮα－２ｂに４つのＮ－グリコシル化部位を組み込んだ高グリコシル化バージョンの開発があり、野生型タンパク質と比較して修飾サイトカイン（ＩＦＮ－２ｂ－４Ｎ）の半減期を２５倍増加させることが達成された。しかし、インビトロでの生物活性は野生型タンパク質と比較して８０％未満であった。
したがって、薬物動態パラメータが改善され、および／または免疫原性が低減され、それにより患者集団間の安全性が向上するだけでなく、抗ウイルス活性などの生物活性および治療効果を保持し、製造および精製が容易なインターフェロン由来のタンパク質治療薬に対する当技術分野のニーズが存在する。
したがって、本開示は、証明された抗ウイルス生物学的活性を示し、野生型ＩＦＮα－２および入手可能な市販サイトカインに関して低減された免疫原性および改善された薬物動態パラメータを有する、修飾ＩＦＮα－２ポリペプチドおよび関連組成物を提供する。修飾ＩＦＮα－２ポリペプチドでは、患者集団間のより良い安全性、製造および精製の容易さ、低減された免疫原性、改善された薬物動態学的プロファイル、高い相対的抗ウイルス活性、および低い抗増殖生物活性などの種々の理由のために、ヒトを対象とした治療としての使用が見出される。
複数の態様において、本開示は、免疫原性が低下した修飾インターフェロン－α２ポリペプチドを提供する。複数の態様において、前記修飾インターフェロン－α２は、修飾された、インターフェロン－α２ｂポリペプチド、インターフェロン－α２ａポリペプチド、またはインターフェロン－α２ｃポリペプチドである。複数の態様において、前記修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドは、天然のヒトインターフェロン－α２における以下の位置：９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなる群より選択される位置を占める１つまたは複数のアミノ酸の置換を含んでなり、ここでその置換には、その位置のアミノ酸から、アラニン、グリシンまたはトレオニンからなる群より選択されるアミノ酸に変更することが含まれている。複数の態様において、前記修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、天然のヒトインターフェロン－α２における以下の位置：９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７から成る群より選択される位置を占める１つまたは複数のアミノ酸の置換を含んでなり、そのような変異は天然のヒトインターフェロン－α２と比較して修飾インターフェロン－α２の免疫原性を低下させる。上記のポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、単離、合成、または組換えであり得る。
複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２はまた、ＮまたはＯグリコシル化された１つ以上の部位を含むアミノ酸の付加を含んでなる。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２はまた、ＮまたはＯグリコシル化された１つ以上の部位を含むアミノ酸の付加を含んでなり、これらの付加されたアミノ酸は、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥまたはその断片に対して、少なくとも８０％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％の相同性を有する配列を含む。複数の態様において、付加されたアミノ酸は、アミノ酸配列ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ（配列番号２６）またはその断片の付加を含む。複数の態様において、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥの断片は、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９、および／または少なくとも１０のアミノ酸長である。このようなアミノ酸付加は、本願で開示される修飾インターフェロン－α２ポリペプチドのＮ末端および／またはＣ末端に付加されてもよい。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、本開示は、インターフェロン－α２活性を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドに向けられ、該ポリペプチドは、配列番号１２に対して少なくとも６０、７０、８０、９０、または９５％の相同性を含むアミノ酸配列を含み、さらに、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択したいずれかの位置において少なくとも５つのアミノ酸置換を含んでいる。ここで、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含んでいる。複数の態様において、前記置換は、変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａを含んでなる。複数の態様において、前記置換は、以下の変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａ、Ｉ１４７Ｔ、およびＬ１５７Ａを含んでなる。複数の態様において、前記置換は、以下の変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｎ６５Ａ、Ｌ６６Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａを含んでなる。複数の態様において、前記置換は、変異Ｌ９Ａ、Ｌ１７Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｎ６５Ａ、Ｌ６６Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａ、Ｉ１４７ＴおよびＬ１５７Ａを含んでなる。
複数の態様において、本開示は、インターフェロン－α２活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドに向けられ、該ポリペプチドは、配列番号１０に対して少なくとも６０、７０、８０、９０、または９５％の相同性を含むアミノ酸配列を含み、さらに２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置において少なくとも５つのアミノ酸置換を含んでいる。ここで、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含んでいる。複数の態様において、前記置換は、変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａを含んでなる。複数の態様において、前記置換は、以下の変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１ＴおよびＬ１７１Ａを含んでなる。複数の態様において、前記置換は、以下の変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７ＡおよびＬ１４２Ａを含んでなる。複数の態様において、前記置換は、変異Ｌ２３Ａ、Ｌ３１Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１ＴおよびＬ１７１Ａを含んでなる。
複数の態様において、本開示は、インターフェロン－α２活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドに向けられ、該ポリペプチドは、配列番号２２に対して少なくとも６０、７０、８０、９０、または９５％の相同性を含むアミノ酸配列を含み、さらに９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択される少なくとも５つのアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含む。複数の態様において、前記置換は、変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａを含んでなる。複数の態様において、前記置換は、以下の変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａ、Ｉ１４７Ｔ、およびＬ１５７Ａを含んでなる。複数の態様において、前記置換は、以下の変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｎ６５Ａ、Ｌ６６Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａを含んでなる。複数の態様において、前記置換は、変異Ｌ９Ａ、Ｌ１７Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｎ６５Ａ、Ｌ６６Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａ、Ｉ１４７ＴおよびＬ１５７Ａを含んでなる。
複数の態様において、本開示は、インターフェロン－α２活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドに向けられ、該ポリペプチドは、配列番号２１に対して少なくとも６０、７０、８０、９０、または９５％の相同性を含むアミノ酸配列を含み、さらに以下からなるセットから選択されるいずれかの位置２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１および１７１において少なくとも５つのアミノ酸置換を含んでいる。ここで、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含んでいる。複数の態様において、前記置換は、変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７ＡおよびＬ１４２Ａ．を含んでなる。複数の態様において、前記置換は、以下の変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１ＴおよびＬ１７１Ａ．を含んでなる。複数の態様において、前記置換は、以下の変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７ＡおよびＬ１４２Ａを含んでなる。複数の態様において、前記置換は、変異Ｌ２３Ａ、Ｌ３１Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１ＴおよびＬ１７１Ａを含んでなる。
複数の態様において、本開示は、インターフェロン－α２活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドに向けられ、該ポリペプチドは、配列番号２４に対して少なくとも６０、７０、８０、９０、または９５％の相同性を含むアミノ酸配列を含み、さらに、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および １５７からなるセットから選択したいずれかの位置において少なくとも５つのアミノ酸置換を含んでなる。ここで、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含んでいる。複数の態様において、前記置換は、変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａを含んでなる。複数の態様において、前記置換は、以下の変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａ、Ｉ１４７Ｔ、およびＬ１５７Ａを含んでなる。複数の態様において、前記置換は、以下の変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｎ６５Ａ、Ｌ６６Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａを含んでなる。複数の態様において、前記置換は、変異Ｌ９Ａ、Ｌ１７Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｎ６５Ａ、Ｌ６６Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａ、Ｉ１４７ＴおよびＬ１５７Ａを含んでなる。
複数の態様において、本開示は、インターフェロン－α２活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチドに向けられ、該ポリペプチドは、配列番号２３に対して少なくとも６０、７０、８０、９０、または９５％の相同性を含むアミノ酸配列を含み、さらに２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を含む。ここで、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含んでいる。複数の態様において、前記置換は、変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａを含んでなる。複数の態様において、前記置換は、以下の変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１Ｔ、およびＬ１７１Ａを含んでなる。複数の態様において、前記置換は、以下の変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａを含んでなる。複数の態様において、前記置換は、変異Ｌ２３Ａ、Ｌ３１Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１Ｔ、およびＬ１７１Ａを含んでなる。
複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドは、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、および配列番号２０からなる群から選択される。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、配列番号２、配列番号４、配列番号６、および配列番号８からなる群より選択される。複数の態様において、前記遺伝的に修飾されたインターフェロン－α２は、配列番号４および配列番号６からなる群より選択される。
複数の態様において、本願で開示される修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、天然のヒトインターフェロン－α２の抗ウイルス活性に匹敵する抗ウイルス活性を有する。複数の態様において、前記修飾インターフェロン－α２は、天然のヒトインターフェロン－α２の抗ウイルス活性と比較して、１０～９０％の相対的な抗ウイルス活性を有する。
複数の態様において、本開示は、本開示の修飾ポリペプチドの１つ以上をコードするポリヌクレオチド（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ）に向けられる。本願で開示されるポリヌクレオチドの態様では、ポリヌクレオチドは、単離、合成、または組換えであってよい。複数の態様において、そのようなポリヌクレオチドを含む発現カセット、プラスミド、発現ベクター、および組換えウイルスが提供される。複数の態様において、本開示の発現カセット、プラスミド、ベクター、または組換えウイルスを含んでなる微生物または細胞が提供される。複数の態様において、本開示は、１つ以上の本発明の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドをコードする核酸を含む、特徴付けられた細胞株に向けられ、これはまた、低減した免疫原性を提示する。複数の態様において、この細胞株は、低減された免疫原性を有する修飾インターフェロン－α２の産生に適している。好ましくは、この細胞株は、ＣＨＯ－Ｋ１、ＨＥＫ２９３、ＮＳ０、ＢＨＫ、Ｓｐ２／０、ＣＡＰ、およびＣＡＰ／Ｔからなる群から選択される。
複数の態様において、本願の開示は、医薬組成物に向けられており、医薬組成物は、本明細書に開示される１つ以上の修飾ＩＦＮ－α２ポリペプチド、核酸、細胞、および／またはベクターと、任意に薬学的に許容される賦形剤および／または担体とを含む。複数の態様において、少なくとも１つ以上の修飾ＩＦＮ－α２ポリペプチド、核酸、細胞、及び／又はベクターを含む、本願で開示される医薬組成物は、疾患、例えば、メラノーマ（悪性黒色腫を含む）、慢性Ｃ型肝炎（肝臓代償疾患の患者を含む）、急性及び慢性Ｂ型肝炎、急性及び慢性非Ａ・非Ｂ型肝炎、カポジ肉腫（ＡＩＤＳ関連カポジ肉腫を含む）、多発性硬化症、性器いぼ、白血病（有毛細胞白血病を含む）、リンパ腫（濾胞性リンパ腫を含む）、尖圭コンジローム、ウイルス感染（ＳＡＲＳ－ＣＯＶ－２感染、ＺＩＫＶ感染、ＣＨＩＫＶ感染、Ａ型インフルエンザ感染を含む）など、さまざまな疾患の治療に使用できる。
複数の態様において、本開示は、１つまたは複数の本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物を投与することを含む、対象（subject）における１つまたは複数の医学的状態を予防または治療する方法、および本開示の１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物を投与する前記ステップによって、対象における医学的状態を予防または治療する方法に直接関するものである。医学的状態は、例えば、メラノーマ、黒色腫（悪性黒色腫を含む）、慢性Ｃ型肝炎（代償性肝疾患の患者を含む）、急性および慢性Ｂ型肝炎、急性および慢性非Ａ、非Ｂ肝炎、カポジ肉腫（ＡＩＤＳ関連カポジ肉腫を含む）多発性硬化症、性器いぼ、白血病（有毛細胞白血病を含む）、リンパ腫（濾胞性リンパ腫を含む）、尖圭コンジローム、その他のウイルス感染症（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染、ＺＩＫＶ感染、ＣＨＩＫＶ感染、インフルエンザＡ感染を含む）などがある。
複数の態様において、本開示は、メラノーマ（悪性黒色腫を含む）、慢性Ｃ型肝炎（代償性肝疾患の患者を含む）、急性および慢性Ｂ型肝炎、急性及び慢性非Ａ非Ｂ肝炎、カポジ肉腫（ＡＩＤＳ関連カポジ肉腫を含む）、多発性硬化症、性器いぼ、白血病（有毛細胞白血病を含む）、リンパ腫（濾胞性リンパ腫を含む）、尖圭コンジローム、ウイルス感染症（ＳＡＲＳ－ＣＯＶ－２感染ＺＩＫＶ感染、ＣＨＩＫＶ感染又はインフルエンザＡ感染を含む）の治療のための医薬品の製造のための、本開示の１以上の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物の使用、および、本開示に記載の組成物を提供する。
本開示は、以下の図を参照することで、よりよく理解され得る。
図１Ａは、ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｂのｉｎ ｓｉｌｉｃｏでの免疫原性解析の様子を示している。８つの一般的なＨＬＡクラスＩＩ対立遺伝子に対するＥｐｉＭａｔｒｉｘ予測９量体ヒットは、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ２ｂ配列に沿って整列される。ＥｐｉＭａｔｒｉｘの「Ｚ」スコアで１．６４以上得点したペプチド（上位５％）は、潜在的エピトープと考えられる（灰色の棒グラフ）。スコアで２．３２以上（上位１％）のスコアのペプチドは、ＭＨＣと結合する可能性が極めて高い（黒い棒グラフ）。ＥｐｉＭａｔｒｉｘによって同定されたクラスターを枠で囲んでいるのは、上記のそれぞれのスコアである。実験的手法によって決定された公開エピトープ（地図の下のバー）は、ここで定義されたものと重複している。図１Ａは、ＥｐｉＭａｔｒｉｘによって予測されたＧＭＯＰ－ＩＦＮの予測されたＭＨＣクラスＩＩ結合クラスターを示す。合計６つの結合クラスターが予測された。 図１Ｂは、ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｂのｉｎ ｓｉｌｉｃｏ免疫原性解析の様子を示している。８つの一般的なＨＬＡクラスＩＩ対立遺伝子に対するＥｐｉＭａｔｒｉｘ予測９量体ヒットは、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ２ｂ配列に沿って整列される。ＥｐｉＭａｔｒｉｘの「Ｚ」スコアで１．６４以上得点したペプチド（上位５％）は、潜在的エピトープと考えられる（灰色の棒グラフ）。スコアで２．３２以上（上位１％）のスコアのペプチドは、ＭＨＣと結合する可能性が極めて高い（黒い棒グラフ）。ＥｐｉＭａｔｒｉｘによって同定されたクラスターを枠で囲んでいるのは、上記のそれぞれのスコアである。実験的手法によって決定された公開エピトープ（地図の下のバー）は、ここで定義されたものと重複している。図１Ｂは、ＧＭＯＰ－ＩＦＮの全体的な潜在的免疫原性に対する、１０個の選択された変異の影響を示す図である。 図２は、ＥｐｉＭａｔｒｉｘ ＭＨＣ結合クラスター免疫原性スコアを示す。ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂ及びそれらの脱免疫化変異体（ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ１、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ２、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ３、及びＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ４）は、それらの個別のＥｐｉＭａｔｒｉｘスコアに従ってクラスタ免疫原性スコア上にマッピングされる。ＥｐｉＭａｔｒｉｘ クラスター免疫原性スコアは、ランダムペプチド標準に基づくベースライン期待値からの推定エピトープ含有量の偏差を表す。ＭＨＣ 結合クラスターのスコアが＋１０ 以上であれば、免疫原性の可能性があると考えられ、スコアが低ければ、免疫原性の可能性が低いと考えられる。いくつかのポジティブコントロールペプチドとタンパク質も、免疫原性のＥｐｉＭａｔｒｉｘスコアによって、最高（＋８０）から最低（－５０）へと並べられている。 図３は、ワンステップイムノアフィニティークロマトグラフィー後の変性ＳＤＳ－ＰＡＧＥゲルによる、異なる修飾ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｂポリペプチドの純度評価を示す図である。９４％を超える純度が達成された。レーン１は、タンパク質分子量マーカーを含む。レーン２は、非グリコシル化ＩＦＮ－α２ｂを含んでいる。レーン３は、野生型ＩＦＮ－α２ｂを含む。レーン４は、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂを含む。レーン５は、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ－ＶＡＲ１を含む。レーン６は、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ－ＶＡＲ２を含む。レーン７は、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ－ＶＡＲ３が含まれている。レーン８は、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ－ＶＡＲ４を含む。 図４は、等電点集束アッセイを描いている。修飾ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体の電荷不均一性（charge-based heterogeneity）は、ＩＥＦに続いてクーマシーブルー染色（Coomasie blue staining）によって分析された。各タンパク質変異体について異なるシアリル化形態が区別され、ＧＭＯＰ－ＩＦＮについては７つのアイソフォームが、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ２および３については１１の電気泳動バンドが明らかにされた。ＧＭＯＰ－ＩＦＮの脱免疫化変異体は、Ｏ－グリコシル化部位に結合した糖鎖構造の含有率が高いことが示された。レーン１には野生型ＩＦＮ－α２ｂが含まれる。レーン２は、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２Ｂを含む。レーン３は、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２Ｂ－ＶＡＲ２。レーン４はＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２Ｂ－ＶＡＲ３である。シアル酸の含有量は、ゲルの上部から下部へ向かって増加している。 図５－１は、ＩＦＮパルスされた樹状細胞とインキュベートした後のＴ細胞によるＩＦＮ－γの分泌を測定したサンドイッチＥＬＩＳＡを描いている。データは、２０人のドナーから得られた。刺激指数（ＳＩ）は、タンパク質を付与したサンプル（protein challenged samples）からのサイトカイン濃度を賦形剤で処理したサンプル（excipient treated samples）からのサイトカイン濃度で割った比率として定義された。処理間の差は、一元配置分散分析（ＡＮＯＶＡ）により評価した。ｐ＜０．０５のとき、差は統計的に有意であるとみなされた。その後、ポストホックのＴｕｋｅｙの多重比較検定を適用した。修飾ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α分子は、オリジナルの分子と比較して、免疫原性が低下していることが示された。 図５－２は、ＩＦＮパルスされた樹状細胞とインキュベートした後のＴ細胞によるＩＦＮ－γの分泌を測定したサンドイッチＥＬＩＳＡを描いている。データは、２０人のドナーから得られた。刺激指数（ＳＩ）は、タンパク質を付与したサンプル（protein challenged samples）からのサイトカイン濃度を賦形剤で処理したサンプル（excipient treated samples）からのサイトカイン濃度で割った比率として定義された。処理間の差は、一元配置分散分析（ＡＮＯＶＡ）により評価した。ｐ＜０．０５のとき、差は統計的に有意であるとみなされた。その後、ポストホックのＴｕｋｅｙの多重比較検定を適用した。修飾ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α分子は、オリジナルの分子と比較して、免疫原性が低下していることが示された。 図６は、ＤＣによるＩＦＮ由来ペプチド提示のＨＬＡ制限を研究するためのＨＬＡ－ＤＲ抗体ブロッキングアッセイを示す。２つの異なるブロッキングＡｂ濃度を評価したとき、ＩＦＮ－γ刺激指数（ＳＩ）の連続的な減少が観察された。ＳＩは未処理のコントロール（賦形剤）に対して正規化した。ＩＦＮ由来ペプチドは、ＨＬＡ－ＤＲ分子との関連で提示されている。 図７は、Ｗｉｓｔａｒラットの皮下注射後の異なる時間におけるＩＦＮ－α２の薬物動態血漿プロファイルを描いたグラフである。血漿タンパク質濃度は、時間に対してプロットされた。データポイントは、各グループの４匹の動物の平均±ＳＥＭを表す。 図８は、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂの各変異体の製造ラインの上清を用いて行ったサンドウィッチＥＬＩＳＡ試験を示す。ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ－ＶＡＲ１およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ－ＶＡＲ４に対応する上清は純粋であり、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－?２ｂ－ＶＡＲ２およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－?２ｂ－ＶＡＲ３に対応するものは各タンパク質の予備定量を行うために１／２０に希釈されたものである。上清はすべて、目的のサイトカインの存在を示していた。 図９は、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂの異なる脱免疫化変異体を産生する細胞株培養上清に対して行った予備的抗ウイルス活性試験からのデータを示す図である。吸光度データを、ＩＦＮ－α２ｂ（標準）の対応する活性値および試料の希釈値の関数として対数スケールでプロットし、生物学的活性値（ＡＢ）を比較により各分子について計算した。すべての上清は、異なる大きさで抗ウイルス活性を示した。 図１０は、精製されたＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂおよび精製されたその脱免疫化変異体２種ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂ－ＶＡＲ１およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂ－ＶＡＲ４の抗ウイルス生物学的評価試験を示す図である。各分子の比活性の定量は、国際標準（ＮＩＢＳＣ）との比較から決定された。パーセントでの相対的な抗ウイルス活性値を算出した。 図１１は、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂの精製された脱免疫化変異体２種ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂ－ＶＡＲ２およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂ－ＶＡＲ３の抗ウイルス生物学的評価試験を示す図である。各分子の特異的活性の定量は、国際標準（ＮＩＢＳＣ）との比較から決定された。パーセントでの相対的な抗ウイルス活性値を算出した。
発明の詳細な説明
［一般的事項］
特定の態様に関する以下の説明は、本質的に単なる例示であり、本開示の範囲、その適用、または用途を限定することを決して意図しておらず、当然ながら、これらは変化し得る。本開示は、本明細書に含まれる非限定的な定義及び用語に関連して説明される。これらの定義及び用語は、本開示の範囲又は実施に対する制限として機能するように作成されておらず、例示的及び説明的な目的のためにのみ提示されている。 プロセス及び組成物は、個々のステップの特定の順序又は特定の材料を使用するものとして記載されているが、当業者によって容易に理解されるように、本開示の記載が多くの方法で配置された複数のステップ又は部品を含むことができるように、ステップ又は材料が交換可能であり得ることが理解される。
次に、実証された抗ウイルス生物学的活性、市販のサイトカインに関する改善された薬物動態パラメータ、および低減された免疫原性を有する、本願で開示される修飾ＩＦＮα－２ポリペプチド（修飾ＩＦＮα－２ｂ、ＩＦＮ－α２ａ、およびＩＦＮ－α２ｃポリペプチドを含む）、そのような修飾ＩＦＮα－２ポリペプチドをコードする核酸、発現カセット、プラスミド、発現ベクター、組換えウイルス、またはそのような核酸を含む細胞、ならびに修飾ＩＦＮα－２ポリペプチド医薬組成物および製剤の種々の実施形態について詳細に言及する。記載されるように、これらの種々の化合物および組成物では、慢性Ｂ型肝炎、慢性Ｃ型肝炎、および尖圭コンジローマ、ならびに有毛細胞白血病、悪性黒色腫、ＡＩＤＳ関連カポジ肉腫、濾胞性非ホジキンリンパ腫などの種々のウイルス感染症の治療における使用が見いだされる。
本明細書に記載されたものと類似又は同等の任意の方法及び材料を本開示の実施又は試験に用いることができるが、好ましい方法及び材料が記載されている。本開示の他の特徴、目的、及び利点は、本明細書及び特許請求の範囲から明らかになるであろう。本明細書及び添付の特許請求の範囲において、単数形は、文脈上明らかに他に指示されない限り、複数形の参照語を含む。本明細書で引用されたすべての文献は、個々の刊行物、特許、または特許出願が、すべての目的のためにその全体が参照により組み込まれることが具体的かつ個別に示されている場合と同じ程度に、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
［定義］
本開示の理解をさらに容易にするために、多数の用語および語句を以下に定義する。特に定義しない限り、本明細書で使用される全ての用語（技術用語及び科学用語を含む）は、本開示が属する技術分野における通常の当業者によって一般的に理解されるのと同じ意味を有する。一般的に使用される辞書で定義されるような用語は、関連する技術及び本開示の文脈における意味と一致する意味を有すると解釈されるべきであり、本明細書で明示的にそのように定義されない限り、理想化されたまたは過度に形式的な意味で解釈されないことがさらに理解されよう。
本明細書で使用する用語は、特定の実施形態／態様を説明するためのものであり、限定することを意図するものではない。本書で使用される場合、単数形の“ａ”、“ａｎ”、“ｔｈｅ”は、内容が明確に示していない限り、“ａｔ ｌｅａｓｔ ｏｎｅ（少なくとも１つ）”を含む複数形を含むことを意図している。“または”とは、“および／または”を意味する。本明細書で使用される場合、用語「及び／又は」は、関連する列挙された項目の１つ又は複数の任意の及び全ての組合せを含む。本明細書で使用される場合、用語「ｃｏｍｐｒｉｓｅ（で構成される）」及び／又は「ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ（で構成されている）」、又は「ｉｎｃｌｕｄｅｓ（含む）」及び／又は「ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ（含んでいる）」は、述べられた特徴、領域、整数、ステップ、操作、要素、及び／又は成分の存在を規定するが、１以上の他の特徴、領域、整数、ステップ、操作、要素、成分、並びにそれらの群の存在又は追加を排除しないことが更に理解されるであろう。用語「又はその組合せ」は、前述の要素の少なくとも１つを含む組合せを意味する。
本明細書で使用する場合、「生体試料」という用語は、生物の組織、細胞、分泌物などの試料を指す。
本明細書で使用する場合、「医学的状態」という用語は、治療および／または予防が望ましい１つ以上の身体的および／または心理的症状として現れるあらゆる状態または疾患を含むが、これに限定されるものではなく、以前に確認された疾患および新たに確認されたその他の障害も含まれる。
本明細書で使用する場合、「免疫反応（免疫反応）」という用語は、リンパ球、抗原提示細胞、食細胞、顆粒球、および上記細胞または肝臓で産生される可溶性高分子（抗体、サイトカイン、補体を含む）の協奏的作用を指し、選択的に、癌細胞、転移性腫瘍細胞、悪性黒色腫、侵入した病原体、病原体に感染した細胞または組織、あるいは自己免疫または病的炎症の場合には正常なヒト細胞または組織を選択的に損傷、破壊、または人体から排除することにつながる。
本明細書で使用する場合、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物を含む組成物の「有効量」、「治療有効量」等の用語は、所望の治療および／または予防効果、例えば、治療されている疾患と関連する症状の予防、または減少をもたらす量を達成するのに十分な量をいう。対象に投与される本開示の化合物または組成物の量は、疾患の種類および重症度、ならびに個体の特性、例えば一般的な健康、年齢、性別、体重および薬物に対する耐性に依存することになる。また、疾患の程度、重症度、および種類に依存するだろう。当業者は、これらおよび他の要因に応じて、適切な投与量を決定することができるであろう。本開示の化合物及び組成物はまた、互いに組み合わせて、又は１つ以上の追加の治療用化合物と組み合わせて投与することができる。
本明細書で使用する場合、「Ｔ細胞エピトープ」という用語は、７～３０アミノ酸の長さで、ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）分子に特異的に結合し、特定のＴ細胞受容体（ＴＣＲ）と相互作用できるＭＨＣリガンドまたはタンパク質決定因子を意味する。一般に、Ｔ細胞エピトープは直線的であり、特異的な三次元的特性を発現することはない。Ｔ細胞エピトープは、変性溶媒（denaturing solvents）の存在によって影響を受けることはない。Ｔ細胞エピトープと相互作用する能力は、ｉｎ ｓｉｌｉｃｏ法によって予測することができる（De Groot AS et al., (1997), AIDS Res Hum Retroviruses,
13(7):539-41; Schafer JR et al., (1998), Vaccine, 16(19):1880-4; De Groot AS et al., (2001),
30 Vaccine, 19(31):4385-95; De Groot AR et al.,(2003), Vaccine, 21(27-30):4486-504）これらは全て、参照によりその全体をここに組み入れられる。
本明細書で使用する場合、用語「Ｔ細胞エピトープクラスター」は、約４種～約４０種の間のＭＨＣ結合モチーフを含むポリペプチドを指す。特定の実施形態では、Ｔ細胞エピトープクラスターは、約５種～約３５種の間のＭＨＣ結合モチーフ、約８種～約３０種の間のＭＨＣ結合モチーフ；及び約１０種～約２０種の間のＭＨＣ結合モチーフを含む。
本明細書で使用する場合、用語「免疫刺激性Ｔ細胞エピトープポリペプチド」は、免疫反応、例えば、体液性免疫反応、Ｔ細胞による免疫反応、または自然免疫反応を誘導することができる分子を指す。
本明細書で使用する場合、「Ｂ細胞エピトープ」という用語は、抗体と特異的に結合することができるタンパク質決定基を意味する。Ｂ細胞エピトープは、通常、アミノ酸や糖の側鎖のような分子で構成される化学的に活性な表面集団（chemically active surface groupings）からなり、通常、特定の三次元構造特性、および特定の電荷特性を有する。コンフォメーション型エピトープとノンコンフォメーション型エピトープは、変性溶媒の存在下で前者への結合は失われるが後者への結合は失われないという点で区別される。
本明細書で使用する「対象（被験体）」という用語は、免疫反応が惹起される任意の生体を意味する。被験体という用語は、ヒト、チンパンジー、他の類人猿、サル類などの非ヒト霊長類；ウシ、ヒツジ、ブタ、ヤギ、ウマなどの家畜、イヌ、ネコなどの家畜哺乳類、マウス、ラット、モルモットなどのげっ歯類を含む実験動物などを含むが、それだけに限定されるものではない。なお、本用語は、特定の年齢や性別を示すものではない。従って、成人、新生児、雌雄を問わず、胎児も対象とすることを意図している。
本明細書で使用する場合、「ＭＨＣ複合体」という用語は、ＨＬＡリガンドとして知られるポリペプチドの特定のレパートリーと結合し、当該リガンドを細胞表面に輸送することができるタンパク質複合体をさす。
本明細書で使用する場合、「ＭＨＣリガンド」という用語は、１つ以上の特定のＭＨＣ対立遺伝子に結合することができるポリペプチドを意味する。用語「ＨＬＡリガンド」は、用語「ＭＨＣリガンド」と交換可能である。ＭＨＣ／リガンド複合体を表面に発現している細胞は、「抗原提示細胞」（ＡＰＣ）と呼ばれる。
本明細書で使用する場合、「Ｔ細胞受容体」または「ＴＣＲ」という用語は、ＡＰＣの表面に提示されるＭＨＣ／リガンド複合体の特定のレパートリーに関与することができるＴ細胞によって発現されるタンパク質複合体を意味する。
本明細書で使用する場合、「ＭＨＣ結合モチーフ」という用語は、特定のＭＨＣ対立遺伝子への結合を予測するタンパク質配列中のアミノ酸のパターンを意味する。
本明細書で使用する場合、「エピバー（ＥｐｉＢａｒ）（登録商標）」という用語は、少なくとも４つの異なるＨＬＡ対立遺伝子に反応すると予測される９量体ペプチドを指す。
本明細書で使用する場合、「免疫シナプス」という用語は、所定のＴ細胞エピトープが細胞表面ＭＨＣ複合体とＴＣＲの両方に同時に結合することによって形成されるタンパク質複合体を意味する。
「ポリペプチド」という用語は、アミノ酸のポリマーを意味し、特定の長さを意味するものではない。したがって、ペプチド、オリゴペプチドおよびタンパク質は、ポリペプチドの定義に含まれる。本明細書で使用する場合、ポリペプチドは、組換え細胞および非組換え細胞から単離された場合には細胞性物質を実質的に含まないとき、または化学的に合成された場合には化学前駆体または他の化学物質を含まないときに「単離」または「精製」されていると言われる。しかしながら、本開示のポリペプチド（例えば、修飾ＩＦＮα－２ポリペプチド）は、それが細胞内で通常会合していない別のポリペプチド（例えば、異種ポリペプチド）に接合、連結、または挿入され得、そして依然として“単離”または“精製”され得る。ポリペプチドが組換え生産される場合、それはまた、培養液を実質的に含まないことができ、例えば、培養液は、ポリペプチド調製物の体積の約２０％未満、約１０％未満、または約５％未満を表す。
「ポリヌクレオチド」および「核酸配列」という用語は、一本鎖または二本鎖のいずれかの形態のデオキシリボヌクレオチドポリマーまたはリボヌクレオチドポリマーを指すために交換可能に用いられ、他に限定されない限り、天然由来のヌクレオチドと同様に一本鎖の核酸にハイブリッド化するという、天然のヌクレオチドの本質を有する既知の類似体（例えば、ペプチド核酸）が包含される。「ポリヌクレオチド」という用語は、本発明をＤＮＡからなるポリヌクレオチドに限定することを意図していない。当業者であれば、ポリヌクレオチドが、リボヌクレオチド、およびリボヌクレオチドとデオキシリボヌクレオチドとの組み合わせからなり得ることを認識するであろう。そのようなデオキシリボヌクレオチドおよびリボヌクレオチドは、天然に存在する分子および合成類似物の両方を含む。本発明のポリヌクレオチドはまた、一本鎖形態、二本鎖形態などを含むがこれらに限定されない、あらゆる形態の配列を包含する。本明細書で使用する場合、「コードする」または「コードされた」という用語は、特定のポリヌクレオチドの文脈で使用する場合にポリヌクレオチド配列の特定のポリペプチドへの翻訳を指示するために必要な情報を含んでいることを意味する。ポリペプチドがコードされる情報は、コドンの使用によって特定される。ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、核酸の翻訳領域内に非翻訳配列（例えば、イントロン）を含んでいてもよいし、そのような非翻訳配列が介在していなくてもよい（例えば、ｃＤＮＡ）。
本明細書で使用する場合、用語「天然インターフェロン」、「天然ヒトインターフェロン－α２ｂ」（ｈＩＦＮ－α２ｂ）、「天然ヒトインターフェロン－α２ａ」（ｈＩＦＮ－α２ａ）、「天然ヒトインターフェロン－α２ｃ」（ｈＩＦＮ－α２ｃ）、「野生型インターフェロン」、「ネイティブインターフェロン」、またはそれらの変異体とは、人為的な修飾や変異を受けず、自然界に存在するままの状態（すなわち、野生型）であるようなサイトカイン（例えば、ポリペプチド、核酸など）を指す。
本明細書で使用する場合、「アミノ酸置換」という用語は、ｈＩＦＮ－α２などの天然（すなわち、野生型）タンパク質の一次配列における１つのアミノ酸を、別のアミノ酸に変更することを意味する。
本明細書で使用する場合、用語「修飾インターフェロン－α２」、「修飾インターフェロン－α２」、「グリコシル化修飾インターフェロン－α２」、「免疫原性が低下したヒト修飾インターフェロン－α２」、「修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２」、「修飾ＩＦＮ－α２」、「修飾ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２」、「修飾インターフェロン－α２」、「修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２」、「修飾ＩＦＮ－α－２」、「修飾ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２」、「修飾インターフェロン－２」、「修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－２」、「修飾ＩＦＮ－２」、「修飾ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２」、またはそれらの変異体は、適切な天然インターフェロンと比較した場合にアミノ酸または核酸配列に変更を含む、修飾インターフェロンα２分子のことを指し、態様では少なくとも一つのグリコシル化サイトを含み、ＧＭＯＰアミノ酸配列は付いていてもいなくても構わない。複数の態様において、前記分子は、天然のヒトインターフェロンと比較して、低減した免疫原性を有する。
本明細書で使用する場合、用語「ＧＭＯＰ」は、４つの潜在的Ｏ－グリコシル化部位を含むヒト顆粒球およびマクロファージ－コロニー刺激因子（ＧＭ－ＣＳＦ）由来のペプチドのアミノ酸配列（配列番号２６）、およびＧＭＯＰペプチドをコードする核酸配列（配列番号２５）を意味する。「ＧＭＯＰ」は、ＧＭＯＰアミノ酸および／または核酸配列そのものを指す場合もあれば、より大きなアミノ酸および／または核酸配列の構成要素として指す場合もある。
本明細書で使用する場合、「高グリコシル化（hyperglycosylated）」という用語は、ネイティブインターフェロン－α２のものに対して４つ以上の追加のグリコシル化を含む分子を意味する。好ましくは、本開示のグリコシル化修飾インターフェロン－α２は、高グリコシル化されており、ネイティブインターフェロンに存在するよりも４～６個の追加のグリコシル化からなる。
本明細書で使用する場合、「Ｏ－グリコシル化部位」という用語は、Ｏ－グリコシル化に感受性があるアミノ酸配列内のセリンまたはトレオニン残基を指す。「Ｏ－グリコシル化部位」の「位置」は、アミノ酸配列中のＯ－グリコシル化感受性を有するセリンまたはトレオニン残基の位置によって示される。前記配列中の前記ＳｅｒまたはＴｈｒ残基は、Ｏ－グリコシルトランスフェラーゼによるようなＯ型酵素によるグリコシル化が施されていてもよい。特定のタンパク質に対するいくつかのＯ－グリコシル化部位は知られているが、Ｏ－グリコシルトランスフェラーゼに対する既知のコンセンサス認識配列は存在しないことが理解される。
本明細書で使用する場合、「Ｎ－グリコシル化部位」という用語は、Ａｓｎ－Ｘａａ－Ｓｅｒ／Ｔｈｒトリペプチドを指し、ここでＸはプロリン残基を除く任意の残基であり得る。「Ｎ－グリコシル化部位」の「位置」は、Ａｓｎによって置換される、天然のヒトインターフェロン－アルファ２ｂのアミノ酸配列においてアミノ酸残基によって占められる位置によって示され、またはそれは、前記コンセンサス配列のアスパラギンである。前記コンセンサス配列の前記Ａｓｎ残基は、Ｎ型酵素によるグリコシル化が施されていてもよい。
本明細書で使用する場合、「ＰＥＧ化」という用語は、分子（例えば、ポリペプチド）への、１以上のＰＥＧ（ポリエチレングリコール）ポリマー鎖の付加を意味する。ＰＥＧ化は、分子へのＰＥＧポリマー鎖の共有結合および／または非共有結合による付着、および／または共有結合および／または非共有結合によるアマルガム化によって達成され得る。「ＰＥＧ化」は、ＰＥＧ化を受けた（すなわち、１以上のＰＥＧポリマー鎖が分子に付加された）分子を指す。
本明細書で使用する場合、「Ｚスコア」という用語は、ある要素が平均からどの程度の標準偏差であるかを示す。Ｚスコアは、以下の式から計算できる。Ｚ＝（Ｘ－μ）／σ
ここで、Ｚは、Ｚスコア、Ｘはある要素の値、μは母平均、σは標準偏差である。
本願では、以下の略語および／または頭字語が使用されている。
ＡＤＡ 開発した抗体(antibody developed against)
ＡＰＣ 抗原提示細胞
ＤＭＳＯ ジメチルスルホキシド
ＤＲ抗体 抗原Ｄ関連抗体
ＥＤＴＡ エチレンジアミンテトラ酢酸
ＥＬＩＳＡ 酵素結合免疫吸着アッセイ
ＨＬＡ ヒト白血球抗原
ＩＦＮ インターフェロン
ＭＨＣ 主要組織適合性複合体
ＰＢＭＣ 末梢血単核細胞
ＲＰＭＩ ロズウェル・パーク・メモリアル研究所培地
ＴＣＲ Ｔ細胞受容体
Ｔｅｆｆ エフェクターＴ細胞
Ｔｈ ヘルパーＴ細胞
ＴＲｅｇ 制御性Ｔ細胞
［修飾ＩＦＮ－α２ポリペプチドおよび核酸］
複数の態様において、本開示は、証明された抗ウイルス生物学的活性、野生型および市販のＩＦＮα－２サイトカイン（例えば、ＩＮＴＲＯＮ－Ａ、ＰＥＧＩＮＴＲＯＮ、ＳＹＬＡＴＲＯＮ）よりも向上した薬物動態パラメータ、および低減した免疫原性を有しており、したがってヒト抗ウイルス治療を含むヒト治療において使用される修飾ＩＦＮα－２ポリペプチド（修飾ＩＦＮα－２ｂポリペプチド、修飾ＩＦＮα－２ａポリペプチドおよびＩＦＮα－２ｃポリペプチドを含む）を提供する。
複数の態様において、本開示は、インターフェロン－α２活性（例えば、抗ウイルス活性）および低減された免疫原性を有する修飾インターフェロン－α２ポリペプチドまたは核酸を提供する。複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２を得るためにヒトインターフェロン－α２の天然アミノ酸配列において実施される修飾は、天然ヒトインターフェロンをコードするアミノ酸の修飾、または天然ヒトインターフェロン（例えばｈＩＦＮ－α２ａ、ｈＩＦＮ－α２ｂ、およびｈＩＦＮ－α２ｃなど）をコードする遺伝子の修飾の結果として起こる。複数の態様において、本開示の遺伝子組換えＧＭＯＰ－インターフェロン－α２を得るために、ヒトインターフェロン－α２の配列のＮ末端および／またはＣ末端にＧＭＯＰペプチド配列（またはその断片）が任意に付加されたヒトインターフェロン－α２の天然のアミノ酸配列において行われる修飾は、天然ヒトインターフェロンをコードするアミノ酸の修飾、またはそれをコードする遺伝子の修飾の結果であり、例えば野生型ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ａ、野生型ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、および野生型ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｃのような修飾が挙げられる。さらに、前記修飾は、その生物活性（抗ウイルス生物活性など）を維持しつつ、天然ヒトインターフェロンと比較してアミノ酸配列の免疫原性を低下させるような方法で導入される。
複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドおよび関連する修飾インターフェロン－α２化合物および組成物は、天然インターフェロン－α２と比較して、低減した免疫原性を有する。天然インターフェロン－α２と比較して修飾インターフェロン－α２の免疫原性を低下させる変異を、ＥｐｉＭａｔｒｉｘ（登録商標）分析によって同定した。ＥｐｉＭａｔｒｉｘ（登録商標）は、ＥｐｉＶａｘ（Providence, Rhode Island）が開発した独自のコンピューターアルゴリズムで、推定Ｔ細胞エピトープの存在について、タンパク質配列をスクリーニングするために使用されている。入力配列は、各フレームが最後のフレームと８個のアミノ酸で重複している９量体フレームに解析される。得られた各フレームは、８つの一般的なクラスＩＩ ＨＬＡ対立遺伝子（ＤＲＢ１＊０１０１、ＤＲＢ１＊０３０１、ＤＲＢ１＊０４０１、ＤＲＢ１＊０７０１、ＤＲＢ１＊０８０１、ＤＲＢ１＊１１０１、ＤＲＢ１＊１３０１、ＤＲＢ１＊１５０１）のパネルに対する予測結合親和性についてスコアリングされる。生のスコアは、ランダムに生成されたペプチドの大規模なサンプルのスコアに対して正規化される。その結果、「Ｚ」スコアが報告される。側面では、理論的には任意のサンプルの上位５％である１．６４を超える対立遺伝子特異的ＥｐｉＭａｔｒｉｘ（登録商標）Ｚスコアを持つ任意の９量体ペプチドが、推定Ｔ細胞エピトープとみなされる。
推定Ｔ細胞エピトープのクラスターを含むペプチドは、インビトロおよびインビボのアッセイの検証で陽性となる可能性がより高くなる。最初のＥｐｉＭａｔｒｉｘ（登録商標）分析の結果は、Ｃｌｕｓｔｉｍｅｒ（登録商標）アルゴリズムとして知られる第２の独自のアルゴリズムを使用して、推定Ｔ細胞エピトープ「クラスター」の存在についてさらにスクリーニングされる。Ｃｌｕｓｔｉｍｅｒ（登録商標）アルゴリズムは、任意のアミノ酸配列内に含まれ、統計的に異常に多くの推定Ｔ細胞エピトープを含むサブ領域を特定する。典型的なＴ細胞エピトープの「クラスター」は、長さが約９から約３０アミノ酸であり、複数の対立遺伝子に対する親和性や複数の９量体フレームに対する親和性を考慮すると、約４から約４０の推定Ｔ細胞エピトープを含むことができる。各エピトープクラスターは、推定Ｔ細胞エピトープのスコアを合計し、候補エピトープクラスターの長さと同じ長さのランダムに生成されたクラスターの期待スコアに基づく補正係数を減算して、ＥｐｉＭａｔｒｉｘ（登録商標）スコアの集計が計算される。ＥｐｉＭａｔｒｉｘ（登録商標）クラスタースコアが＋１０を超えると有意とみなされる。複数の態様において、本願で開示の修飾インターフェロン－α２分子は、Ｔ細胞エピトープクラスターにおける１つ以上の修飾（例えば、変化、置換、または変異）を含み、それらの免疫原性を低下させる。例えば、本願で開示される修飾インターフェロンα２分子のための修飾インターフェロンα２変異は、分子の免疫原性を低減するだけでなく、その抗ウイルス活性などの生物活性を著しく低減せず、および／またはインターフェロンの生物活性に関与する受容体への結合に影響を与えないものが選択される。複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２分子のためのそのような修飾は、天然インターフェロンの構造または機能を破壊しないものを選択し、天然ヒトインターフェロン－α２中の選択された位置を占める１つまたは複数のアミノ酸を、アラニン、トレオニン、またはグリシンに置換することを含む。
最も反応性の高いＴ細胞エピトープクラスターの多くには、「エピバー（ＥｐｉＢａｒ）（登録商標）」と呼ばれる特徴がある。前述のように、エピバー（登録商標）は、少なくとも４つの異なるＨＬＡ対立遺伝子に反応性であると予測される単一の９量体フレームである。複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２分子は、天然インターフェロン－α２のエピバー（登録商標）内に１つまたは複数の修飾（例えば、変化、置換、または変異）を含み得る。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２分子の前記修飾は、天然ＩＦＮ－α２と比較して、修飾インターフェロン－α２分子の免疫原性を低下させる。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２分子の前記修飾は、さらに、天然のインターフェロン－α２活性の構造または機能を崩壊させない。例えば、修飾されたインターフェロン－α２変異は、その抗ウイルス活性のようなその生物学的活性を著しく低下させない、および／またはインターフェロンの生物学的活性に関与する受容体への結合に影響を与えないものが選択される。複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２分子に対するそのような修飾は、天然インターフェロンの構造または機能を破壊しないものが選択され、天然ヒトインターフェロン－α２中の選択された位置を占める１つ以上のアミノ酸の、アラニン、トレオニンまたはグリシンへの置換を含む。
複数の態様において、これらの特定されたクラスター領域の各アミノ酸のＨＬＡ結合への寄与が、ＯｐｔｉＭａｔｒｉｘツール（ＥｐｉＶａｘ ＩＳＰＲＩ 脱免疫用ツールキットの一部）を使用して評価された。ＯｐｔｉＭａｔｒｉｘはまず、複数の９量体フレームと複数のＨＬＡ対立遺伝子にわたってＭＨＣ結合親和性に最も寄与する「重要な」残基を調べる。次に、このプログラムは、タンパク質配列の任意の位置にある１９個の代替アミノ酸をすべて繰り返し置換し（オペレーターが定義した入力により、リストを自然に保存された変異体に限定することができる）、その変更後の配列の予測免疫原性を再分析する。タンパク質の構造、ひいては生物学的活性への悪影響を避けるために、重要な残基を文献で包括的に検索し、修飾の候補とならないアミノ酸を特定することも行われた。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２分子の前記修飾は、天然のＩＦＮ－α２と比較して、修飾されたインターフェロン－α２分子の免疫原性を低下させる。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２分子の前記修飾は、さらに、天然のインターフェロン－α２活性の構造または機能を崩壊させない。例えば、修飾されたインターフェロン－α２変異は、その抗ウイルス活性のようなその生物学的活性を著しく低下させないもの、および／またはインターフェロンの生物学的活性に関与する受容体へのその結合に影響を与えないものを選択する。複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２分子に対するそのような修飾は、天然インターフェロンの構造または機能を破壊しないものが選択され、天然ヒトインターフェロン－α２中の選択された位置を占める１つ以上のアミノ酸のアラニン、トレオニンまたはグリシンへの置換を含む。
複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、天然のヒトインターフェロン－α２（インターフェロン－α２ｂ（配列番号１２）、インターフェロン－α２ａ（配列番号２２）、およびインターフェロン－α２ｃ（配列番号２４）を含む）における以下の位置９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなる群より選択される位置を占める１つ以上のアミノ酸の置換を含む。である。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、天然のヒトインターフェロン－α２（インターフェロン－α２ｂ（配列番号１２）、インターフェロン－α２ａ（配列番号２２）、およびインターフェロン－α２ｃ（配列番号２４）を含む）における以下の位置９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなる群から選ばれる位置を占める１または複数のアミノ酸の置換を含んでいる。ここでその置換は、その位置から、アラニン、グリシン、またはトレオニンからなる群から選択されるアミノ酸に変更することを含む。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、天然のヒトインターフェロン－α２（インターフェロン－α２ｂ（配列番号１２）、インターフェロン－α２ａ（配列番号２２）およびインターフェロン－α２ｃ（配列番号２４）を含む）中の以下の位置９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなる群から選択される位置を占める１つ以上のアミノ酸の置換を含む。ここでそのような変異は、天然のヒトインターフェロン－α－２と比較して、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの免疫原性を減少させる。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２分子は、修飾されたインターフェロン－α－２ｂポリペプチドである。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドは、修飾されたＩＦＮ－α２ａポリペプチドである。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドは、修飾されたＩＦＮ－α２ｃポリペプチドである。複数の態様において、本明細書に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、高グリコシル化されている。上述のポリペプチドの態様において、修飾型インターフェロン－α２ポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、本明細書に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、高グリコシル化されている。ある種の真核生物タンパク質のグリコシル化は、ポリペプチド骨格の特定の位置で起こり、一般に、２つのタイプのグリコシル化が存在する。Ｏ型グリコシル化は、セリンまたはトレオニン残基の“－ＯＨ”（ヒドロキシル）基にオリゴ糖が結合するもので、Ｎ型グリコシル化は、アスパラギン残基にオリゴ糖が結合するものである。特に、Ｎ型グリコシル化はＡｓｎ－Ｘ－Ｓｅｒ／Ｔｈｒというコンセンサス配列で行われ、Ｘはプロリンとは異なる任意のアミノ酸である。Ｎ型結合でタンパク質に結合するオリゴ糖はすべて、３つのマンノース残基と２つのＮ－アセチルグルコサミン残基からなる５糖の核を共通に持つ。この５糖の核に結合する糖は、実に多様なオリゴ糖のパターンを獲得することができる。このオリゴ糖の有無は、タンパク質の物理的性質に影響を与え、その機能、安定性、分泌、および細胞内の位置において重要であると考えられる。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、Ｎ型またはＯ型グリコシル化の１つ以上の部位を含むアミノ酸の付加を含む。
複数の態様において、本明細書に記載されるような修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、修飾インターフェロン－α２配列に結合したＧＭＯＰ、配列ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ（配列番号２６）というペプチド配列またはその断片を含んでいる。複数の態様において、前記配列ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥの断片は、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９、および／または少なくとも１０のアミノ酸の長さを有する。ＧＭＯＰは、１４アミノ酸長のペプチド（配列番号２６）のＮ末端領域から誘導され、顆粒球コロニーとヒトマクロファージの刺激因子（ｈＧＭ－ＣＳＦ）、様々な細胞系列の造血前駆細胞の増殖と成熟の刺激成長因子、特定のシグナルに応答して多種類の細胞（内皮細胞、繊維芽細胞、マクロファージ、Ｔ細胞、マスト細胞）により分泌されて、パラクライン様式で作用するものである。ｈＧＭ－ＣＳＦは単量体の糖タンパク質で、成熟型では１２７個のアミノ酸からなり、１４．５から３２ ｋＤａの間の分子量を示す。この分子量の不均一性は、Ｎ４４とＮ５４の２つのＮ－グリコシル化部位と、Ｎ－末端領域のＳ２２、Ｓ２４、Ｓ２６、Ｔ２７（それぞれｈＧＭ－ＣＳＦの成熟型のＳ５、Ｓ７、Ｓ９、Ｔ１０に対応する）の４つのＯ－グリコシル化部位に起因している。成熟型ｈＧＭ－ＣＳＦの最初の７つのアミノ酸（ＡＰＡＲＳＰＳ）は、抗ｈＧＭ－ＣＳＦモノクローナル抗体（ｍＡｂ ＣＣ１Ｈ７と呼ばれる）によって認識可能な線状エピトープである。このエピトープと対応するパラトープとの相互作用は、イオン強度の変化により親和性が変化する特性を持ち、特に後者は酵素免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）、免疫親和クロマトグラフィー、ウェスタンブロットなどの免疫化学技術の開発の上で操作上の利点を有する（Perotti、 Oggero、Etcheverrigaray、Kratje、AR057215A1）。
前記ＧＭＯＰ配列の付加により、本発明の分子に４～６個のＯ－グリコシル化部位が追加される。このようにして、１つ以上のＧＭＯＰペプチド配列（ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ）またはその断片が付加された修飾インターフェロン－α２を、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２と呼ぶ（例えば、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２等と呼ぶこともできる）。このペプチド配列の付加は、当業界で公知の技術のいずれかを用いて行われる。実施形態において、前記ＧＭＯＰペプチド配列または標識（ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ）またはその断片は、修飾インターフェロン－α２ポリペプチド配列の末端アミノ末端および／または修飾インターフェロン－α２配列の末端カルボキシル末端に配置することが可能である。複数の態様において、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥの前記断片は、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９、および／または少なくとも１０のアミノ酸の長さである。好ましい実施形態において、ＧＭＯＰペプチド配列（配列番号２６）は、修飾インターフェロン－α２配列のＮ末端上に付加される。
複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２はまた、ＮまたはＯグリコシル化の１つ以上の部位を含むアミノ酸の付加を含み、これらの付加されたアミノ酸は、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥまたはその断片に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有する１または複数の配列から構成されている。複数の態様において、本明細書に開示される修飾インターフェロン－α２は、アミノ酸配列ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ（配列番号２６）またはその断片の１つまたはそれ以上の付加を含む。複数の態様において、前記修飾インターフェロン－α２は、ＮまたはＯグリコシル化の１つ以上の部位を含むアミノ酸の付加を含み、これらの付加されたアミノ酸は、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ（配列番号２６）またはその断片に対して少なくとも７０％、８０％または９０％の相同性を有する１つ以上の配列からなり、ここで、配列番号２６の配列の５位、７位、９位および１０位のアミノ酸が置換されていないことを特徴とする。複数の態様において、ＮまたはＯグリコシル化の１つ以上の部位を含む上記のアミノ酸（例えば、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥまたはその断片に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有する上記の１つ以上の配列）は、本願で開示される修飾インターフェロン－α２ポリペプチドのＮ末端および／またはＣ末端に付加されてもよい。複数の態様において、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥの前記断片は、少なくとも７、少なくと ８、少なくとも９、および／または少なくとも１０アミノ酸の長さである。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
［修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドおよび核酸］
複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、配列番号１２の野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して、インターフェロン－α２ｂ活性、および低下した免疫原性または免疫反応の誘発が低下した傾向を有する、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドである。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂ（配列番号１２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸の置換を有する。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂ（配列番号１２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を有し、前記置換は、前記位置のアミノ酸のアラニン、グリシン、またはトレオニンへの変化を含んでなる。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂ（配列番号１２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を有する。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂ（配列番号１２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を有し、ここで前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含んでなる。上記ポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｂポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂ（配列番号１２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、４７、１１７、１２３、および１２８位においてアミノ酸置換を有しており、前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンへ変更することからなる。複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂ（配列番号１２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、配列番号１２の野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して、低減した免疫原性または免疫反応の誘発を減少する傾向を有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは単離、合成または組換であってもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂ（配列番号１２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、４７、１１７、１２３、１２８、１４７および１５７位においてアミノ酸置換を有しており、前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンへ変更することからなる。複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂ（配列番号１２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａ、Ｉ１４７Ｔ、およびＬ１５７Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、配列番号１２の野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して、低減した免疫原性または免疫反応の誘発を減少する傾向を有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは単離、合成または組換えのいずれであってもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂ（配列番号１２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、４７、６５、６６、１１７、１２３および１２８位においてアミノ酸置換を有しており、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンへ変更することからなる。複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂ（配列番号１２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｎ６５Ａ、Ｌ６６Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、配列番号１２の野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して、低減した免疫原性または免疫反応の誘発を減少する傾向を有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、単離、合成または組換えのいずれでもあり得る。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂ（配列番号１２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７および１５７位においてアミノ酸置換を有しており、前記置換が前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンへ変更することからなる。複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂ（配列番号１２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ９Ａ、Ｌ１７Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｎ６５Ａ、Ｌ６６Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａ、Ｉ１４７Ｔ、およびＬ１５７Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｂポリペプチドは、配列番号１２の野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して、低減した免疫原性または免疫反応の誘発を減少する傾向を有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｂポリペプチドは、単離、合成または組換であってもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、および配列番号２０からなる群から選択される。複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、配列番号１６および配列番号１８からなる群から選択される。
複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは配列番号１４のアミノ酸配列を含み、態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは配列番号２０のアミノ酸配列を含む。好ましい実施形態においては、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは配列番号１６のアミノ酸配列を含む。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは配列番号１８のアミノ酸配列を含む。上記ポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｂポリペプチドは、配列番号１２の野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して、免疫原性または免疫反応を誘発する傾向が低減されている。上記ポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｂポリペプチドは、単離、合成または組換であってもよい。
複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｂ活性を有する本願で開示される修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、配列番号１２の野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して、５％と９５％との間の相対的抗ウイルス活性を有している。複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｂ活性を有する本願で開示される修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、配列番号１２の野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して、１０％と９０％との間の相対的抗ウイルス活性を有している。複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する本願で開示された修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチド、例えば上記の修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、配列番号１２の野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して、２０％～８０％の間の相対的抗ウイルス活性を有している。
複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｂ活性を有する本願で開示される修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、０％から５０％の間の抗増殖性生物活性率を有している。複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、１０％未満の抗増殖性生物活性率を有している。複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、５％未満の抗増殖性生物活性率を有する。
複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドのようなインターフェロン－α２ｂ活性を有する本願で開示される修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、５ｍＬ／ｈ～２００ｍＬ／ｈの間の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、１１５ｍＬ／ｈ未満の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、５０ｍＬ／ｈ未満の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。
複数の態様において、本開示は、上記の修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドなどの、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードするポリヌクレオチドまたは核酸（例えば、ｃＤＮＡを含むＤＮＡ、またはｍＲＮＡを含むＲＮＡ）を提供する。例えば、態様において、本開示は、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、および配列番号２０を含む群から選択される１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸を提供する。複数の態様において、本開示は、配列番号１６および配列番号１８を含む群から選択される１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸を提供する。複数の態様において、１つまたは複数の１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸は、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、および配列番号１９を含む群より選択される１つまたは複数の核酸配列を含む。複数の態様において、１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸は、配列番号１５および配列番号１７を含む群より選択される１つまたは複数の核酸配列を含む。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸は、配列番号１３の核酸配列を含む。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸は、配列番号１９の核酸配列を含む。好ましい実施形態では、修飾型インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸は、配列番号１５の核酸配列を含む。好ましい実施形態では、修飾型インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸は、配列番号１７の核酸配列を含む。
複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ｂは、１つ以上のＮまたはＯグリコシル化部位を含むアミノ酸の付加を含み、これらの付加されたアミノ酸は、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥまたはその断片に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％または９５％の相同性を有する１つ以上の配列含む。複数の態様において、本明細書に開示される修飾インターフェロン－α２ｂは、アミノ酸配列ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ（配列番号２６）またはその断片の１つまたは複数の付加を含む。複数の態様において、前記修飾インターフェロン－α２ｂは、１つ以上のＮまたはＯグリコシル化部位を含むアミノ酸の付加を含み、これらの付加されたアミノ酸は、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ（配列番号２６）またはその断片に対して少なくとも７０％、８０％または９０％の相同性を有する１つ以上の配列を含み、ここで前記アミノ酸の配列番号２６の５、７、９および１０位は、置換されていない。
態様において、１つ以上のＮまたはＯグリコシル化部位を含む前記アミノ酸（例えば、配列ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥに対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有する配列）またはその断片は、本発明に開示される修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドのＮおよび／またはＣ末端に付加されてもよい。複数の態様において、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥの前記断片は、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９および／または少なくとも１０アミノ酸長である。上記のポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、単離、合成、または組換えであってもよい。
複数の態様において、本開示の１つ以上の修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする本開示の核酸、例えば、限定されるものではないが、１以上の、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、および配列番号１９を含む（本質的にからなる、または配列のみからなる）の配列を有する修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ）を含むベクターまたはプラスミドはが提供される。複数の態様において、本開示は、本開示のベクターまたはプラスミドを含む細胞に向けられている。
［修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドおよび核酸］
複数の態様において、上記の修飾ＩＦＮα－２ｂポリペプチドを含む本開示の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチド（配列番号１２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）と比較して、インターフェロン－α２ｂ活性および低減した免疫原性または免疫反応を誘発する低減した性向を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドである。複数の態様において、修飾ＩＦＮα－２ｂポリペプチドは、ＮまたはＯグリコシル化の１つ以上の部位を含むアミノ酸の付加を含み、これらの付加アミノ酸は、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥまたはその断片に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有する１つ以上の配列を含む。複数の態様において、本明細書に開示されるような修飾ＩＦＮα－２ｂは、アミノ酸配列ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ（配列番号２６）またはその断片の１つ以上の付加を含む。複数の態様において、修飾ＩＦＮα－２ｂは、１つ以上のＮまたはＯグリコシル化部位を含むアミノ酸の付加を含み、これらの付加アミノ酸は、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ（配列番号２６）またはその断片に対して少なくとも７０％、８０％または９０％の相同性を有する１つ以上の配列からなり、配列番号２６の５、７、９および１０位のアミノ酸が置換されていない。複数の態様において、１つ以上のＮまたはＯグリコシル化部位を含む前記上述のアミノ酸（例えば、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥに対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有する前記１つ以上の配列）またはその断片は、本願で開示した修飾ＩＦＮα－２ｂポリペプチドのＮ末端および／またはＣ末端に付加されてもよい。複数の態様において、前記配列ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥの断片は、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９、および／または少なくとも１０のアミノ酸の長さを有する。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を有する。複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を有し、ここで前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含む。複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を有する。複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を有し、前記置換が、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含む。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、６１、１３１、１３７および１４２からなるセットから選択されるいずれかの位置に１以上のアミノ酸の置換を有している。ここで、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含んでいる。複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチド（配列番号１２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に比べて、低減した免疫原性または免疫反応の誘発が低減した傾向を有している。上記のポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｂポリペプチドは、単離されたもの、合成されたもの、または組換えられたものであってもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、６１、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を有し、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含む。複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１Ｔ、およびＬ１７１Ａを有している。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチド（配列番号１２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に比べて、低減した免疫原性または免疫反応の誘発が低減した傾向を有している。上記ポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｂポリペプチドは、単離、合成、または組換えであってもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、６１、７９，８０、１３１、１３７および１４２からなるセットから選ばれるいずれかの位置に１または複数のアミノ酸の置換を有してなる。ここで、前記置換は、前記位置のアミノ酸のアラニン、グリシン、またはトレオニンへの変更を含んでなる。複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチド（配列番号１２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に比べて、低減した免疫原性または免疫反応の誘発が低減した傾向を有している。上記ポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｂポリペプチドは、単離、合成、または組換えであってもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を有し、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含んでいる。複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ２３Ａ、Ｌ３１Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１Ｔ、およびＬ１７１Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチド（配列番号１２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に比べて、低減した免疫原性または免疫反応の誘発を減少する傾向を有する。上記のポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｂポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、配列番号２、配列番号４、配列番号６、および配列番号８からなる群から選択される。複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、配列番号４および配列番号６からなる群より選択される。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは配列番号２のアミノ酸配列からなる。
複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは配列番号８のアミノ酸配列からなる。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは配列番号４のアミノ酸配列からなる。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、配列番号６のアミノ酸配列を含んでなる。 上記のポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチド（配列番号１２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に比べて、低減した免疫原性および免疫反応を誘発する傾向が減少したものである。上記ポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｂポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチド（配列番号１２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）に比べて５％～９５％の相対的抗ウイルス活性を有している。複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチド、例えば上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチド（配列番号１２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）と比較して１０％と９０％の間の相対抗ウィルス活性を有している。複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチド（配列番号１２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂ（配列番号１０）と比較して２０％と８０％の間の相対抗ウィルス活性を有している。
複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｂ活性を有する本願で開示される修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、０％から５０％の間の抗増殖性生物活性率を有している。複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、１０％未満の抗増殖性生物活性率を有している。複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、５％未満の抗増殖性生物活性率を有している。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｂ活性を有する、本願で開示される修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチド、例えば上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、５ｍＬ／ｈ～２００ｍＬ／ｈの間の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドのようなインターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、１１５ｍＬ／ｈ未満の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドは、５０ｍＬ／ｈ未満の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。
複数の態様において、本開示は、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドなどの、インターフェロン－α２ｂ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードするポリヌクレオチドまたは核酸（例えば、ｃＤＮＡを含むＤＮＡまたはｍＲＮＡを含むＲＮＡ）を提供する。例えば、態様において、本開示は、配列番号２、配列番号４、配列番号６、および配列番号８からなる群から選択される１つまたは複数の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸を提供する。複数の態様において、本開示は、配列番号４および配列番号６からなる群から選択される１つまたは複数の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸を提供する。複数の態様において、１つまたは複数の１つまたは複数の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸は、配列番号１、配列番号３、配列番号５、および配列番号７を含む群から選択される１つまたは複数の核酸配列を含む。１つまたは複数の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸は、配列番号３および配列番号５を含む群より選択される１つまたは複数の核酸配列を含む。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸は、配列番号１の核酸配列を含んでなる。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸は、配列番号７の核酸配列を含む。好ましい実施形態において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸は、配列番号３の核酸配列を含む。好ましい実施形態では、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸は、配列番号５の核酸配列を含む。
複数の態様において、本開示の１つ以上の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする本発明の核酸、例えば、限定されるものではないが、１つ以上の配列番号１、配列番号３、配列番号５、および配列番号７を含む（本質的にからなる）配列を有する、少なくとも一つの修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドをコードする核酸（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ）を含むベクターまたはプラスミドが提供される。複数の態様において、本開示は、本開示のベクターまたはプラスミドを含む細胞に向けられている。
［修飾されたインターフェロン－α２ａポリペプチドおよび核酸］
複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、配列番号２２の野生型インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して、インターフェロン－α２ａ活性および低下した免疫原性または免疫反応の誘発が低下した傾向を有する、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドである。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａ（配列番号２２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を有する。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａ（配列番号２２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を有し、ここで前記置換は、前記位置のアミノ酸のアラニン、グリシン、またはトレオニンへの変化を含んでなる。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａ（配列番号２２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を有する。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａ（配列番号２２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を有し、ここで前記置換は、前記位置のアミノ酸のアラニン、グリシン、またはトレオニンへの変化を含んでいる。上記ポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ａポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａ（配列番号２２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、４７、１１７、１２３および１２８位においてアミノ酸置換を有しており、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンへ変更することからなる。複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａ（配列番号２２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、配列番号２２の野生型インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して、免疫原性が低下しているか、または免疫反応を誘発する傾向が低下している。 上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、単離されたもの、合成のもの、または組換えのものでありうる。
複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａ（配列番号２２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、４７、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７位でアミノ酸置換を有し、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンへ変更することからなる。複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａ（配列番号２２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａ、Ｉ１４７Ｔ、およびＬ１５７Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、配列番号２２の野生型インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して、免疫原性が低下しているか、または免疫反応を誘発する傾向が低下している。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、単離されたもの、合成のものまたは組換えのものでありえる。
複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａ（配列番号２２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、４７、６５、６６、１１７、１２３および１２８位においてアミノ酸置換を有しており、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンへ変更することからなる。複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａ（配列番号２２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｎ６５Ａ、Ｌ６６Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、配列番号２２の野生型インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して、低減した免疫原性または免疫反応を誘発する傾向が減少している。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、単離、合成または組換えのいずれであってもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａ（配列番号２２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、４７、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７位でアミノ酸置換を有し、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンへ変更することからなる。複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａ（配列番号２２）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ９Ａ、Ｌ１７Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｎ６５Ａ、Ｌ６６Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａ、Ｉ１４７Ｔ、およびＬ１５７Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ａポリペプチドは、配列番号２２の野生型インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して、免疫原性が低下しているか、または免疫反応を誘発する傾向が低下している。 上記ポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ａポリペプチドは単離されてもよく、合成されてもよく、または組換えされてもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、配列番号３１－３４からなる群から選択される。複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、配列番号３２および配列番号３３を含む群から選択される。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは配列番号３１のアミノ酸配列を含む。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは配列番号３４のアミノ酸配列を含む。好ましい実施形態においては、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは配列番号３２のアミノ酸配列を含む。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２ａポリペプチドは、配列番号３３のアミノ酸配列を含む。上記のポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ａポリペプチドは、配列番号２２の野生型インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して、免疫原性が低減し、または免疫反応を誘発する傾向が減少している。上記のポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ａポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドのような、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、配列番号２２の野生型インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して、５％と９５％の間の相対的抗ウィルス活性を有している。複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチド、例えば上記の修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、配列番号２２の野生型インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して、１０％～９０％の間の相対的な抗ウイルス活性を有している。複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドのような、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、配列番号２２の野生型インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して、２０％～８０％の間の相対的抗ウイルス活性を有している。
複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドのような、インターフェロン－α２ａ活性を有する本願で開示される修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、０％から５０％の間の抗増殖性生物活性率を有している。複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドのような、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、１０％未満の抗増殖性生物活性率を有している。複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドのような、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、５％未満の抗増殖性生物活性率を有する。
複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドのような、インターフェロン－α２ａ活性を有する本願で開示される修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、５ｍＬ／ｈ～２００ｍＬ／ｈの間の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドのような、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、１１５ｍＬ／ｈ未満の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドのような、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、５０ｍＬ／ｈ未満の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。
複数の態様において、本開示は、上記の修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドなどの、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドをコードするポリヌクレオチドまたは核酸（例えば、ｃＤＮＡを含むＤＮＡ、またはｍＲＮＡを含むＲＮＡ）を提供する。例えば、態様において、本開示は、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドをコードする核酸を提供し、ここで、ポリペプチドは、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａのアミノ酸置換を有している。複数の態様において、本開示は、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドをコードする核酸を提供し、ここで、該ポリペプチドは、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａ、Ｉ１４７Ｔ、およびＬ１５７Ａのアミノ酸置換を有している。である。複数の態様において、本開示は、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドをコードする核酸を提供し、ここで、ポリペプチドは、配列番号２２のアミノ酸配列を含んでなり、Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｎ６５Ａ、Ｌ６６Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａのアミノ酸置換を有する。複数の態様において、本開示は、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドをコードする核酸を提供し、ここで、ポリペプチドは、配列番号２２のアミノ酸配列を含み、Ｌ９Ａ、Ｌ１７Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｎ６５Ａ、Ｌ６６Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａ、Ｉ１４７Ｔ、およびＬ１５７Ａのアミノ酸置換を有している。
複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ａは、１つ以上のＮまたはＯグリコシル化部位を含むアミノ酸の付加を含み、これらの付加されたアミノ酸は、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥまたはその断片に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％または９５％の相同性を有する１つ以上の配列を含む。複数の態様において、本明細書に開示される修飾インターフェロン－α２ａは、アミノ酸配列ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ（配列番号２６）またはその断片の１つまたはそれ以上の付加を含む。複数の態様において、前記修飾インターフェロン－α２ａは、１つ以上のＮまたはＯグリコシル化部位を含むアミノ酸の付加を含み、これらの付加アミノ酸は、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ（配列番号２６）またはその断片に対して少なくとも７０％、８０％または９０％の相同性を有する１つ以上の配列を含み、ここで配列番号２６の５、７、９および１０位のアミノ酸が置換されていない。複数の態様において、ＮまたはＯグリコシル化部位を１つ以上含む前記アミノ酸（例えば、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥに対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有する前記１つ以上の配列）またはその断片は、本願に開示される修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドのＮおよび／またはＣ末端に付加されてもよい。複数の態様において、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥの前記断片は、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９および／または少なくとも１０アミノ酸の長さである。上記のポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ａポリペプチドは、単離、合成、または組換えであってもよい。
複数の態様において、本開示の１つ以上の修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドをコードする本開示の核酸、限定はされないが、例えば、少なくとも１つの修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドをコードする核酸（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ）を含むベクターまたはプラスミドが、提供される。複数の態様において、本開示は、本開示のベクターまたはプラスミドを含む細胞に向けられている。
［修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドおよび核酸］
複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、インターフェロン－α２ａ活性を有しており、野生型インターフェロン－α２ａポリペプチド（配列番号２２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）と比較して、低減した免疫原性または免疫反応の誘発が低下した傾向を有する、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドである。複数の態様において、修飾ＩＦＮα－２ａポリペプチドは、１つ以上のＮまたはＯグリコシル化部位を含むアミノ酸の付加を含み、ここで、これらの付加アミノ酸は、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥまたはその断片に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有する１つ以上の配列を含む。複数の態様において、本明細書に開示される修飾ＩＦＮα－２ａは、アミノ酸配列ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ（配列番号２６）またはその断片の１つまたはそれ以上の付加を含む。複数の態様において、修飾ＩＦＮα－２ａはまた、１つ以上のＮまたはＯグリコシル化部位を含むアミノ酸の付加を含み、これらの付加されたアミノ酸は、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ（配列番号２６）またはその断片に対して少なくとも７０％、８０％、または９０％の相同性を有する１以上の配列を構成し、配列番号２６の５、７、９および１０位のアミノ酸が置換されない。複数の態様において、１つ以上のＮまたはＯグリコシル化部位を含む前記上述のアミノ酸（例えば、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥまたはその断片に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有する前記１つ以上の配列）は、本願で開示した修飾ＩＦＮα－２ａポリペプチドのＮ末端および／またはＣ末端に付加されてもよい。複数の態様において、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥの前記断片は、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９、および／または少なくとも１０のアミノ酸の長さを有する。
複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を有する。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を有し、ここで前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することからなる。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を有する。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）と少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％相同性のアミノ酸配列を含む。２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を有し、前記置換が、前記位置のアミノ酸のアラニン、グリシン、またはトレオニンへの変化を含んでなる。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、６１、１３１、１３７および１４２からなるセットから選択されるいずれかの位置に１または複数のアミノ酸の置換を有する。ここで、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含んでいる。複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａポリペプチド（配列番号２２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）に比べて、低減した免疫原性または免疫反応の誘発を減少する傾向を有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、単離、合成、または組換えであってもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、６１、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を有し、ここで前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含んで成る。複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１Ｔ、およびＬ１７１Ａを有している。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａポリペプチド（配列番号２２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）と比較して、低減した免疫原性または免疫反応の誘発を減少する傾向を有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、単離、合成、または組換えであってもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、６１、７９、８０、１３１、１３７、および１４２からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を有し、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含んでいる。複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａポリペプチド（配列番号２２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）と比較して、低減した免疫原性または免疫反応の誘発を減少する傾向を有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、単離、合成、または組換えであってもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を有し、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含んで成る。複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）に対して少なくとも７０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ２３Ａ、Ｌ３１Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１Ｔ、及びＬ１７１Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａポリペプチド（配列番号２２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）と比較して、低減した免疫原性または免疫反応の誘発を減少する傾向を有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、単離、合成、または組換えであってもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、配列番号２７－３０を含む群から選択される。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは配列番号２８および配列番号２９のアミノ酸配列を含む。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは配列番号２７のアミノ酸配列を含む。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは配列番号３０のアミノ酸配列を含む。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、配列番号２８のアミノ酸配列を含んでなる。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、配列番号２９のアミノ酸配列を含んでなる。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａポリペプチド（配列番号２２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａ（配列番号２１）と比較して、免疫原性または免疫反応を誘発する傾向が低減されている。上記のポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ａポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドのような、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａポリペプチド（配列番号２２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチド（配列番号２１）に比べて５％～９５％の相対的抗ウイルス活性を有している。複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドのようなインターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａポリペプチド（配列番号２２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチド（配列番号２１）に比べて１０％と９０％の間の相対的抗ウイルス活性を有している。複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドのような、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ａポリペプチド（配列番号２２）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチド（配列番号２１）と比較して２０％と８０％の間の相対抗ウィルス活性を有している。
複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドのような、インターフェロン－α２ａ活性を有する本願で開示される修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、０％から５０％の間の抗増殖性生物活性率を有している。複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドのような、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、１０％未満の抗増殖性生物活性率を有している。複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドのような、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、５％未満の抗増殖性生物活性率を有している。
複数の態様において、インターフェロン－α２ａ活性を有する本願で開示される修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチド、例えば上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、５ｍＬ／ｈ～２００ｍＬ／ｈの間の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドのようなインターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、１１５ｍＬ／ｈ未満の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドのようなインターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドは、５０ｍＬ／ｈ未満の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。
複数の態様において、本開示は、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドなどの、インターフェロン－α２ａ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドをコードするポリヌクレオチドまたは核酸（例えば、ｃＤＮＡを含むＤＮＡ、またはｍＲＮＡを含むＲＮＡ）を提供する。例えば、態様において、本開示は、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドをコードする核酸であって、該ポリペプチドが配列番号２１のアミノ酸配列を含み、Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａのアミノ酸置換を有する核酸を提供する。複数の態様において、本開示は、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドをコードする核酸を提供し、ここで、ポリペプチドは、配列番号２１のアミノ酸配列を含み、Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１Ｔ、およびＬ１７１Ａのアミノ酸置換を有している。複数の態様において、本開示は、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドをコードする核酸であって、ポリペプチドが配列番号２１のアミノ酸配列を含み、Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａのアミノ酸置換を有する核酸を提供する。複数の態様において、本開示は、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドをコードする核酸であって、ポリペプチドが配列番号２１のアミノ酸配列を含み、Ｌ２３Ａ、Ｌ３１Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１Ｔ、およびＬ１７１Ａのアミノ酸置換を有する核酸を提供する。
複数の態様において、本開示の１つ以上の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドをコードする本発明の核酸、限定ではないが、例えば、少なくとも１つの修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドをコードする核酸（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ）を含むベクターまたはプラスミドが提供される。複数の態様において、本開示は、本開示のベクターまたはプラスミドを含む細胞に向けられている。
［修飾されたインターフェロン－α２ｃポリペプチドおよび核酸］
複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、インターフェロン－α２ｃ活性を有し、配列番号２４の野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して、および低下した免疫原性または免疫反応の誘発が低下した傾向を有する、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドである。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃ（配列番号２４）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を有する。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃ（配列番号２４）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を有し、ここで前記置換は、前記位置のアミノ酸のアラニン、グリシン、またはトレオニンへの変化を含んで成る。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃ（配列番号２４）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を有する。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃ（配列番号２４）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を有し、ここで前記置換は、前記位置のアミノ酸のアラニン、グリシン、またはトレオニンへの変化を含んでいる。上記ポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｃポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃ（配列番号２４）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、４７、１１７、１２３および１２８位においてアミノ酸置換を有しており、前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンへ変更することからなる。複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃ（配列番号２４）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号２４の野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して、低減した免疫原性または免疫反応の誘発が低下した傾向を有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃ（配列番号２４）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、４７、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７位においてアミノ酸置換を有しており、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンへ変更することからなる。複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃ（配列番号２４）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａ、Ｉ１４７Ｔ、およびＬ１５７Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号２４の野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して、低減した免疫原性または免疫反応の誘発が低下した傾向を有する。上記のポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｃポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃ（配列番号２４）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、４７、６５、６６、１１７、１２３および１２８位においてアミノ酸置換を有しており、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンへ変更することからなる。複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃ（配列番号２４）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｎ６５Ａ、Ｌ６６Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号２４の野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して、低減した免疫原性または免疫反応の誘発が低下した傾向を有する。上記のポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｃポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃ（配列番号２４）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７においてアミノ酸置換を有しており、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンへ変更することからなる。複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃ（配列番号２４）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ９Ａ、Ｌ１７Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｎ６５Ａ、Ｌ６６Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａ、Ｉ１４７Ｔ、およびＬ１５７Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号２４の野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して、低減した免疫原性または免疫反応の誘発が低下した傾向を有する。上記のポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｃポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号３９－４２からなる群から選択される。複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号４０および配列番号４１からなる群から選択される。複数の態様において、修飾型インターフェロン－α２ｃポリペプチドは配列番号３９のアミノ酸配列を含む。複数の態様において、修飾型インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号４２のアミノ酸配列を含む。好ましい実施形態では、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号４０のアミノ酸配列を含んでなる。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号４１のアミノ酸配列を含んでなる。上記のポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号２４の野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して、免疫原性または免疫反応を誘発する傾向が減少している。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｃ活性を有する本願で開示される修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号２４の野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して、５％と９５％との間の相対的抗ウイルス活性を有している。複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチド、例えば上記の修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号２４の野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して、１０％～９０％の間の相対的な抗ウイルス活性を有している。複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号２４の野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して、２０％～８０％の間の相対的抗ウイルス活性を有している。
複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｃ活性を有する本願で開示される修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、０％から５０％の間の抗増殖性生物活性率を有している。複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、１０％未満の抗増殖性生物活性率を有している。複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、５％未満の抗増殖性生物活性率を有する。
複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｃ活性を有する本願で開示される修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、５ｍＬ／ｈ～２００ｍＬ／ｈの間の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、１１５ｍＬ／ｈ未満の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有する。複数の態様において、上記の修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、５０ｍＬ／ｈ未満の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。
複数の態様において、本開示は、上記の修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドなどの、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドをコードするポリヌクレオチドまたは核酸（例えば、ｃＤＮＡを含むＤＮＡ、またはｍＲＮＡを含むＲＮＡ）を提供する。例えば、態様において、本開示は、γ修飾（γ-modified）インターフェロン－α２ｃポリペプチドをコードする核酸を提供し、ここで、このポリペプチドは、配列番号２４のアミノ酸配列を含み、Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａのアミノ酸置換を有している。複数の態様において、本開示は、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドをコードする核酸を提供し、ここで、該ポリペプチドは、配列番号２４のアミノ酸配列を含み、Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａ、Ｉ１４７Ｔ、およびＬ１５７Ａのアミノ酸置換を有している。複数の態様において、本開示は、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドをコードする核酸を提供し、ここで、ポリペプチドは、配列番号２４のアミノ酸配列を含んでなり、Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｎ６５Ａ、Ｌ６６Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａのアミノ酸置換を有している。複数の態様において、本開示は、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドをコードする核酸を提供し、ここで、ポリペプチドは、配列番号２４のアミノ酸配列を含み、Ｌ９Ａ、Ｌ１７Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｎ６５Ａ、Ｌ６６Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、Ｌ１２８Ａ、Ｉ１４７Ｔ、およびＬ１５７Ａのアミノ酸置換を有している。
複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ｃはまた、１つ以上のＮまたはＯグリコシル化部位を含むアミノ酸の付加を含み、これらの付加されたアミノ酸は、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥまたはその断片に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％または９５％の相同性を有する１つ以上の配列を含む。複数の態様において、本明細書に開示される修飾インターフェロン－α２ｃは、アミノ酸配列ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ（配列番号２６）またはその断片の１つまたはそれ以上の付加を含む。複数の態様において、前記修飾インターフェロン－α２ｃは、１つ以上のＮまたはＯグリコシル化部位を含むアミノ酸の付加を含み、これらの付加アミノ酸は、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ（配列番号２６）またはその断片に対して少なくとも７０％、８０％または９０％の相同性を有する１つ以上の配列を含み、配列番号２６の５、７、９および１０位のアミノ酸は置換されていない。複数の態様において、ＮまたはＯグリコシル化部位を１つ以上含む前記アミノ酸（例えば、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥに対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有する前記１つ以上の配列）またはその断片は、本願で開示される修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドのＮ末端および／またはＣ末端に付加されてもよい。複数の態様において、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥの前記断片は、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９および／または少なくとも１０アミノ酸の長さである。上述のポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、単離、合成、または組換えであってもよい。
複数の態様において、本開示の１つ以上の修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドをコードする本開示の核酸、限定はされないが、例えば、少なくとも１つの修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドをコードする核酸（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ）を含むベクターまたはプラスミドが提供される。複数の態様において、本開示は、本開示のベクターまたはプラスミドを含む細胞に向けられている。
［修飾ＧＭＯＰ－Ｉｎｔｅｒｆｅｒｏｎ－α２ｃポリペプチドおよび核酸］
複数の態様において、上記のものを含む本開示の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、インターフェロン－α２ｃ活性を有し、野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチド（配列番号２４）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）と比較して、低減した免疫原性または免疫反応の誘発が低減した傾向を有する、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドである。複数の態様において、前記修飾ＩＦＮ－α２ｃポリペプチドは、１つ以上のＮまたはＯグリコシル化部位を含むアミノ酸の付加を含み、これらの付加アミノ酸は、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥまたはその断片に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有する１つ以上の配列を含む。複数の態様において、本明細書に開示される修飾ＩＦＮα－２ｃは、アミノ酸配列ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ（配列番号２６）またはその断片の１つまたはそれ以上の付加を含む。複数の態様において、修飾ＩＦＮα－２ｃは、１つ以上のＮまたはＯグリコシル化部位を含むアミノ酸の付加を含み、これらの付加されたアミノ酸は、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥ（配列番号２６）またはその断片に対して少なくとも７０％、８０％または９０％の相同性を有する１つ以上の配列を含み、配列番号２６の５、７、９および１０位のアミノ酸が置換されていない。複数の態様において、１つ以上のＮまたはＯグリコシル化部位を含む前記上述のアミノ酸（例えば、ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥまたはその断片に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有する前記１つ以上の配列）は、本願で開示した修飾ＩＦＮ－α２ｃポリペプチドのＮ末端および／またはＣ末端に付加されてもよい。複数の態様において、前記配列ＡＰＡＲＳＰＳＴＱＰＷＥの断片は、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９、および／または少なくとも１０のアミノ酸の長さを有する。
複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を有する。複数の態様において修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を有し、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含む。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を有する。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置において少なくとも５つのアミノ酸置換を有し、前記置換が、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含む。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、６１、１３１、１３７および１４２からなるセットから選ばれるいずれかの位置に１または複数のアミノ酸の置換を有してなる。ここで、前記置換は、前記位置のアミノ酸のアラニン、グリシン、またはトレオニンへの変更を含んでなる。複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチド（配列番号２４）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）に比べて、低減した免疫原性または免疫反応の誘発が低減した傾向を有している。上記ポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｃポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、６１、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択される任意の位置に１つ以上のアミノ酸置換を有し、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含む。複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１Ｔ、およびＬ１７１Ａを有している。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチド（配列番号２４）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）と比較して、低減した免疫原性または免疫反応の誘発が低下する傾向を有している。上記のポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｃポリペプチドは、単離されたもの、合成されたもの、または組換えられたものであってもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）と少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、６１、７９、８０、１３１、１３７、および１４２からなるセットから選択される任意の位置に１つ以上のアミノ酸置換を有し、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含む。複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａを有する。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチド（配列番号２４）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）と比較して、低減した免疫原性または免疫反応の誘発が低下する傾向を有している。上記ポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｃポリペプチドは、単離、合成、または組換えされていてもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、２３、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置において１つ以上のアミノ酸置換を有し、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含んで成る。複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）に対して少なくとも６０％、７０％、８０％、９０％、または９５％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、変異Ｌ２３Ａ、Ｌ３１Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１ＴおよびＬ１７１Ａを有してなる。上記ポリペプチドの態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチド（配列番号２４）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）と比較して、低減した免疫原性または免疫反応の誘発が低下する傾向したものを有している。上記のポリペプチドの態様において、修飾されたインターフェロン－α２ｃポリペプチドは、単離されたもの、合成されたもの、または組換えられたものであってもよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号３５－３８からなる群から選択される。複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号３５および３６からなる群から選択される。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号３５のアミノ酸配列を含んでなる。複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号３８のアミノ酸配列からなる。
複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号３６のアミノ酸配列からなる。
複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、配列番号３７のアミノ酸配列からなる。上記ポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチド（配列番号２４）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）に比べて、免疫原性が低下しているか、または免疫反応を誘発する傾向が低下している。上記のポリペプチドの態様において、修飾インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、単離、合成、または組換えであってよい。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチド、例えば上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチド（配列番号２４）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）と比較して５％と９５％の間の相対的抗ウイルス活性を有している。複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチド、例えば上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチド（配列番号２４）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）に比べて１０％から９０％の間の相対的抗ウイルス活性を有している。複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドのようなインターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチド（配列番号２４）および／または野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃ（配列番号２３）に比べて２０％と８０％の間の相対抗ウィルス活性を有している。
複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｃ活性を有する本願で開示される修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、０％から５０％の間の抗増殖性生物活性率を有している。複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、１０％未満の抗増殖性生物活性率を有している。複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、５％未満の抗増殖性生物活性率を有している。
複数の態様において、インターフェロン－α２ｃ活性を有する本願で開示される修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチド、例えば上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、５ｍＬ／ｈ～２００ｍＬ／ｈの間の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドのような、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、１１５ｍＬ／ｈ未満の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。複数の態様において、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドのようなインターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドは、５０ｍＬ／ｈ未満の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している。
複数の態様において、本開示は、上記の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドなどの、インターフェロン－α２ｃ活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドをコードするポリヌクレオチドまたは核酸（例えば、ｃＤＮＡを含むＤＮＡ、またはｍＲＮＡを含むＲＮＡ）を提供する。例えば、態様において、本開示は、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドをコードする核酸であって、該ポリペプチドが配列番号２３のアミノ酸配列を含み、Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａのアミノ酸置換を有する核酸を提供する。複数の態様において、本開示は、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドをコードする核酸を提供し、ここで、ポリペプチドは、配列番号２３のアミノ酸配列を含み、Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１Ｔ、およびＬ１７１Ａのアミノ酸置換を有している。複数の態様において、本開示は、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドをコードする核酸であって、ポリペプチドが配列番号２３のアミノ酸配列を含み、Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａのアミノ酸置換を有する核酸を提供する。複数の態様において、本開示は、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドをコードする核酸であって、ポリペプチドが配列番号２３のアミノ酸配列を含み、Ｌ２３Ａ、Ｌ３１Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１Ｔ、およびＬ１７１Ａのアミノ酸置換を有する核酸を提供する。
複数の態様において、本開示の１つ以上の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドをコードする本発明の核酸、限定されないが、例えば、少なくとも１つの修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドをコードする核酸（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ）を含むベクターまたはプラスミドが提供される。複数の態様において、本開示は、本開示のベクターまたはプラスミドを含む細胞に向けられている。
複数の態様において、本明細書に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、異種ポリペプチドに接合または連結（例えば、インフレームで融合、化学的に連結、または他の方法で結合）される。本願の開示の１つ以上の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドに関して、用語「異種ポリペプチド」は、本願の開示の１つ以上の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドが、異種ポリペプチドに対して異種である、または自然には含まれないことを意味することが意図される。複数の態様において、本発明の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの１つ以上は、異種ポリペプチドの、Ｃ末端に（当技術分野で知られているように、リンカーを使用してまたは使用せずに）付加されてもよく、および／またはＮ末端に（当技術分野で知られているように、リンカーを使用してまたは使用せずに）付加されてもよい。
本開示はまた、本願で開示される１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドがその一部であるキメラまたは融合ポリペプチド（態様において、単離、合成、または組換えであってもよい）を提供する。複数の態様において、本開示の１つ以上の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、低分子、薬物、またはドラッグ断片（限定されないが、例えば、定義された受容体に高い親和性で結合する薬物またはドラッグ断片）に接合または連結（例えば、インフレームで融合、化学的に連結、または他の方法で結合）され得る。
本明細書で使用する場合、２つのポリペプチド（またはポリペプチドの領域）は、アミノ酸配列がある割合以上の同一性を有する場合、実質的に相同または同一であり、例えば、以下の通りである。少なくとも約４５％、５０％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％の同一性、通常少なくとも約７０～７５％、より通常少なくとも約８０～８５％、より通常約９０％以上、より通常９５％以上の相同性または同一の同一性を有する場合である。相同性パーセントは、当技術分野で知られているように決定することができる。例えば、２つのアミノ酸配列、または２つの核酸配列の相同性または同一性のパーセントを決定するために、配列を最適な比較目的のために整列させる（例えば、一方のポリペプチドまたは核酸分子の配列に、他方のポリペプチドまたは核酸分子との最適な整列のためのギャップを導入することができる）。次に、対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置のアミノ酸残基またはヌクレオチドを比較する。第１の配列の位置が第２の配列の対応する位置と同じアミノ酸残基によって占められている場合、分子はその位置で同一である（本明細書で用いるアミノ酸「同一性」はアミノ酸「相同性」と等価である）。当技術分野で知られているように、２つの配列間の同一性パーセントは、２つの配列の最適なアラインメントのために導入される必要がある、ギャップの数および各ギャップの長さを考慮に入れた、配列によって共有される同一の位置の数の関数である。ポリペプチドの配列相同性は、通常、配列解析ソフトウェアを用いて測定される。
複数の態様において、本開示はまた、より低い同一性の程度を有するが、本発明の核酸分子によってコードされるポリペプチドによって行われる１つ以上の同じ機能を実現する十分な類似性を有するポリペプチド（例えば、本明細書に開示される修飾インターフェロン－α２ポリペプチド及び修飾インターフェロン－α２組成物）を包含する。類似性は保存されたアミノ酸置換によって決定される。このような置換は、ポリペプチド中の所定のアミノ酸を、同様の特性を有する別のアミノ酸で置換するものである。保存的置換は、表現型的に沈黙している可能性が高い。典型的な保存的置換としては、脂肪族アミノ酸であるＡｌａ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｍｅｔ、Ｉｌｅの１個ずつの置換、水酸基残基ＳｅｒとＴｈｒの交換、酸性残基ＡｓｐとＧｌｕの交換、アミド残基ＡｓｎとＧｌｎ間の置換、塩基残基ＬｙｓとＡｒｇの交換、芳香族残基Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、Ｔｙｒ間の交換が見られる。どのアミノ酸の変化が表現型的に沈黙している可能性が高いかに関するガイダンスが見出される（Bowie JUら , (1990), Science, 247(4948):130610，これは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）。例えば、インターフェロンの機能を有するアミノ酸配列は、これらのタンパク質のアミノ酸配列をクエリとして用いて、非冗長タンパク質配列（non-redundant protein sequences）データベースに対してタンパク質－タンパク質ＢＬＡＳＴ（ｂｌａｓｔｐ）検索を行うことにより同定することが可能である。検索は、National Center for Biotechnology Information (NCBI)のウェブサイト（http://blast.ncbi.nlm.nih.gov）で、デフォルトのパラメータで行うことができる。
開示された修飾ＩＦＮα－２ポリペプチドおよびポリヌクレオチドの断片および変異体もまた、本開示によって包含される。“断片”は、ポリペプチドまたはポリヌクレオチドの一部を意味することが意図される。本明細書に開示されるポリペプチドまたはヌクレオチド配列の断片は、本願で開示のポリペプチドの生物活性を保持し、したがって野生型インターフェロン－α２と比較して免疫原性を低減したインターフェロン－α２活性（例えば、抗ウイルス生物活性）を保持するポリペプチド断片をコードし得る。複数の態様において、本開示はまた、本明細書に記載のポリペプチドおよびポリヌクレオチドの変異体の断片を包含する。
複数の態様において、変異体ポリペプチド（例えば、本開示の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの変異体）は、１つ以上の置換、欠失、挿入、逆位、融合、および切断、またはこれらのいずれかの組み合わせによってアミノ酸配列において異なり得る。変異体ポリペプチドは、完全に機能的であり得（例えば、抗ウイルス生物活性などのインターフェロン－α２活性を保持する）、または１つ以上の活性において機能を欠くことができる。完全に機能的な変異体は、典型的には、保存的変異または非重要残基または非重要領域における変異のみを含む。機能的変異体はまた、機能において変化なしまたは重要でない変化をもたらす類似のアミノ酸の置換を含むことができる（例えば、免疫原性を低下させて抗ウイルス生物活性を保持する）。あるいは、このような置換は、機能にある程度正または負の影響を与えることができる。非機能的な変異体は、典型的には、１つ以上の非保存的なアミノ酸の置換、欠失、挿入、逆位、もしくは切断、または重要な残基もしくは重要な領域における置換、挿入、逆位、もしくは欠失を含む。複数の態様において、本願で開示の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、１つ以上の置換、欠失、挿入、逆位、融合、および切断、またはこれらのいずれかの組み合わせによってアミノ酸配列が異なり得るが、前記変異体が生物活性（例えば、抗ウイルス活性などのＩＦＮα２活性）を保持して、（野生型インターフェロン－α２と比較して）免疫原性が低下していることが条件とされる。
複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２の完全に機能的な変異体は、１つまたは複数の重要な残基または領域において変異を含んでいない。複数の態様において、変異されるべきではない修飾インターフェロン－α２の前記１つ以上の重要な残基は、以下を含む：生物活性に関与する残基、種々の野生型インターフェロン対立遺伝子間で（種間など）保存性が高い機能的ホットスポットの残基、インターフェロンの天然受容体に結合に関与する残基、天然インターフェロンの構造の完全性に重要である構造相互作用に関わる残基、天然インターフェロンのジスルフィド結合（例えば、インビボの自然環境において適切なフォールディングの際に天然インターフェロンにおいて生じる分子内ジスルフィド結合）に関与する残基、および／または天然の野生型インターフェロンにおけるグリコシル化部位である残基（Ｎグリコシル化部位およびＯグリコシル化部位を含む）。
複数の態様において、開示された修飾インターフェロン－α２の完全に機能的な変異体を含む本願で開示された修飾ＩＦＮα－２ポリペプチドは、１つ以上の重要な残基または領域に変異を含まず、ここで、前記１つ以上の重要な残基または領域は、以下からなる群から選択される：機能的ホットスポットの残基、種々の野生型インターフェロン対立遺伝子間で（種間など）保存性が高い残基、天然のインターフェロンのジスルフィド結合（例えば、インビボの自然環境において適切なフォールディングの際に天然インターフェロンにおいて生じる分子内ジスルフィド結合）に関与する残基、および／または天然の野生型インターフェロンにおけるグリコシル化部位である残基（Ｎグリコシル化部位およびＯグリコシル化部位を含む）。
複数の態様において、開示された修飾インターフェロン－α２（例えば、ＩＦＮα－２ｂ変異体、ＩＦＮα－２ａ変異体、ＩＦＮα－２ｃ変異体、ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｂ変異体、ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ａ変異体、およびＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｃ変異体）の完全に機能する変異体を含む、本願で開示されたポリペプチドの機能にとって必須ではないと考えられるアミノ酸残基は、保存的または非保存的に置換されてよく、かかるアミノ酸置換はポリペプチドの機能特性を大きく低下させないだろう。複数の態様において、開示された修飾インターフェロン－α２（例えば、ＩＦＮα－２ｂ変異体、ＩＦＮα－２ａ変異体、ＩＦＮα－２ｃ変異体、ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｂ変異体、ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ａ変異体、およびＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｃ変異体）の完全に機能的な変異体を含む、本願で開示されたポリペプチドの機能にとって必須であると考えられるアミノ酸残基は、保存的または非保存的に置換されてはならず、かかるアミノ酸置換はポリペプチドの機能特性を大きく低下させる可能性があるため、保存的であってはならない。複数の態様において、開示された修飾インターフェロン－α２の完全に機能的な変異体（例えば、ＩＦＮα－２ｂ変異体、ＩＦＮα－２ａ変異体、ＩＦＮα－２ｃ変異体、ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｂ変異体、ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ａ変異体およびＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｃ変異体）を含む本願で開示されたＩＦＮα２ポリペプチドは、ＷＴ天然ヒトＩＦＮ－α２の一つまたは複数の決定的残基または領域に変異を含まない（保存的置換もしくは非保存的置換のいずれかであってもよい）。複数の態様において、ＷＴ天然ヒトＩＦＮ－α２の前記１つ以上の重要な残基または領域は、以下からなる群から選択される：生物活性に関与する残基、機能的ホットスポットの残基、種々の野生型インターフェロン対立遺伝子間で（種間など）保存が高い残基、インターフェロンの天然受容体への結合に関与する残基、天然インターフェロンの構造完全性に対して重要である構造相互作用に関わる残基、天然インターフェロンのジスルフィド結合（例えば、インビボでのその自然環境における適切な折り畳み時に天然インターフェロンにおいて生じる分子内ジスルフィド結合）に関与する残基、および／または天然の野生型インターフェロンにおけるグリコシル化部位である残基（Ｎグリコシル化部位およびＯグリコシル化部位を含む）である。複数の態様において、ｈＩＦＮ－α２の生物学的活性に関与するＷＴ天然ｈＩＦＮ－α２の前記１つまたは複数の重要な残基または領域は、２２、２６、２７、３０、３１、３３、３４、３６、６８、７９、８５、１２０、１２１、１２２、１２４、１２９、１３１、１３２、１４４、および１４６からなる群から選択される。かかるアミノ酸残基に対する最も保存的および非保存的アミノ酸置換は、ポリペプチドの機能特性（例えば、抗ウイルス作用を含むＩＦＮα２活性）を減少させる可能性がある。複数の態様において、機能的ホットスポットであるＷＴ天然ｈＩＦＮ－α２の前記１つまたは複数の重要な残基または領域は、３０、３３、１４４、１４５、１４８、および１４９からなる群から選択される。そのようなアミノ酸残基に対するほとんどの保存的および非保存的アミノ酸置換は、ポリペプチドの機能特性（例えば、抗ウイルス活性を含むＩＦＮα２活性）を減少させる可能性が高い。複数の態様において、様々な野生型ＩＦＮ－α２対立遺伝子間（種間など）で高度に保存されているＷＴ天然ｈＩＦＮ－α２の前記１つ以上の重要な残基または領域は、９１、１２２、１５０、および１５４（さらに：３０、３３、１４４、１４５、１４８、および１４９を含んでいてもよい）からなる群から選択される。そのようなアミノ酸残基に対するほとんどの保存的および非保存的アミノ酸置換は、おそらくポリペプチドの機能特性（例えば、抗ウイルス作用を含むＩＦＮα２活性）を減少させるであろう。複数の態様において、ｈＩＦＮ－α２の天然受容体への結合に関与するＷＴ天然ｈＩＦＮ－α２の前記１つまたは複数の重要な残基または領域は、５、６、１２、１３、１５、１６、１９、２０、２２、２６、２７、３０～３７、３９～４１、４６、６８、７６、７７、７９、８０、８２、８３、８５、８６、８９、９０、９３、９４、９７、１１８、１２０、１２１、１２４、１２５、１２７、１３１～１３６、１４４～１４６、１４８、１４９、１５および１５３からなる群から選択される。そのようなアミノ酸残基のほとんどの保存的および非保存的アミノ酸置換によっておそらく機能特性（例えば、，抗ウイルス活性を含む、ＩＦＮα－２活性）を低下させる可能性が高い。複数の態様において、ｈＩＦＮ－α２の構造的完全性に重要な構造的相互作用に関与するＷＴ天然ｈＩＦＮ－α２の前記１つ以上の重要な残基または領域は、３３、３４、３５、３６、３８、４０、４１、４２、４３、４４、４５、９１、１１４、１１５、１１８、１２１，１２２、１２５、１３２、１５０、および１５４からなる群から選択される。このようなアミノ酸残基のほとんどの保存的および非保存的アミノ酸置換は、ポリペプチドの機能特性（例えば、抗ウイルス作用を含むＩＦＮα２活性）を減少させる可能性が高い。複数の態様において、ＷＴ天然ｈＩＦＮ－α２の、ｈＩＦＮ－α２の構造的完全性に重要な構造的相互作用に関与する前記１つ以上の重要な残基または領域は、３６、４１、４２、９１、１２２、１２９、１５０、および１５４からなる群から選択される。そのようなアミノ酸残基に対するほとんどの保存的および非保存的アミノ酸置換は、ポリペプチドの機能特性（例えば、抗ウイルス活性を含むＩＦＮα２活性）を減少させる可能性が高い。複数の態様において、天然のｈＩＦＮ－α２のジスルフィド結合（例えば、インビボでのその天然環境での適切なフォールディング時にｈＩＦＮ－α２に生じる分子内ジスルフィド結合）に関与するＷＴ天然のｈＩＦＮ－α２の前記１以上の臨界残基または領域は、１、２９、９８、および１３８からなる群から選択される。そのようなアミノ酸残基に対するほとんどの保存的および非保存的アミノ酸置換は、ポリペプチドの機能特性（例えば、抗ウイルス活性を含むＩＦＮα－２活性）を低下させる可能性が高い。複数の態様において、天然の野生型ｈＩＦＮ－α２におけるグリコシル化の部位である前記１つ以上の重要な残基または領域（Ｎ－グリコシル化部位およびＯ－グリコシル化部位を含む）は、１０６からなる群から選択される。記載された改変／置換を有する本願で開示されるポリペプチドは、所望の活性（例えば、抗ウイルス活性を含むＩＦＮα－２活性）を与えるだろうと考えられている。別の言い方をすれば、本明細書に記載されたアミノ酸置換は、本願で開示されたポリペプチドの機能的特性を著しく低下させないだろうと信じられている。
複数の態様において、修飾インターフェロン－α２（例えば、開示された修飾インターフェロン－α２の完全機能的変異体（例えば、ＩＦＮα－２ｂ変異体、ＩＦＮα－２ａ変異体、ＩＦＮα－２ｃ変異体、ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｂ変異体、ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ａ変異体、ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｃ変異体））は変異（例えば、アミノ酸置換）を、ｈＩＦＮ－α２における４、２３、７０、および７７からなる群より選択される位置を占有する１つ以上のアミノ酸において含まない。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２（例えば、開示された修飾インターフェロン－α２の完全機能的変異体（例えば、ＩＦＮα－２ｂ変異体、ＩＦＮα－２ａ変異体、およびＩＦＮα－２ｃ変異体））が、１つまたは複数のアミノ酸におけるＡｓｎ残基のアミノ酸置換を、ＨＩＦＮ－α２において、４、２３、７０、および７７からなる群から選択される位置を占める１つまたは複数のアミノ酸において含まない。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２は、ｈＩＦＮ－α２における４、２３、７０、および７７からなる群から選択されるアミノ酸の位置に１つまたは複数のアミノ酸置換を含まない。
複数の態様において、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２（例えば、開示された修飾ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｂ変異体、ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ａ変異体、およびＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｃ変異体の完全機能性変異体）は、ＧＭＯＰ－ｈＩＦＮ－α２の１８、３７、８４および９１からなる群より選ばれる位置を占める１つまたは複数のアミノ酸における変異（例えば、アミノ酸置換）を含まない。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２（例えば、開示された修飾ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｂ変異体、ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ａ変異体、およびＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｃ変異体の完全機能型変異体））は、ＧＭＯＰ－ｈＩＦＮ－α２：１８，３７，８４，９１において、以下の位置から成るグループから選択される位置を占有している１つまたは複数のアミノ酸におけるＡｓｎ残基のアミノ酸の置換を含まない。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２（例えば、開示された修飾ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｂ変異体、ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ａ変異体、およびＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｃ変異体の完全機能型変異体）は、ＧＭＯＰ－ｈＩＦＮ－α２中の１８、３７、８４、および９１の位置からなる群から選択されるアミノ酸位置において１以上のアミノ酸の置換を含まない。
複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２は、その対立遺伝子もしくは配列の変異体（「変異体」）またはアナログを含み得るか、または化学修飾（例えば、ペギル化、グリコシル化）を含み得る。複数の態様において、本明細書に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、高グリコシル化されている。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２は、本開示の核酸分子によってコードされるインターフェロンポリペプチドによって行われる同じ機能、特に維持された生物学的活性および低減された免疫原性を保持する。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２は、高い相対的な抗ウイルス活性を提供することができる。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２は、免疫原性の低減をもたらし得る。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２は、低い抗増殖生物学的活性をもたらし得る。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２は、改善された薬物動態学的プロファイルをもたらし得る。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２は、タンパク質合成および修飾されたインターフェロン－α２の精製における改善をもたらし得る。
本願の開示のポリペプチドは、アミノ酸置換、欠失、切断、および挿入を含む様々な方法で変更することができる。そのような操作のための方法は、当技術分野で一般に知られている。例えば、即席開示のポリペプチドのアミノ酸配列変異体および断片は、ＤＮＡの変異によって調製することができる。変異誘発およびポリヌクレオチド改変のための方法は、当技術分野でよく知られている。例えば、Kunkel (1985) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:488-492; Kunkelら (1987) Methods in Enzymol.154:367-382;U.S. Pat.No.4,873,192; Walker and Gaastra, eds. (1983) Techniques in Molecular Biology (MacMillan Publishing Company, New York) およびそこに引用された文献を参照されたい。目的のタンパク質の生物学的活性に影響を与えない適切なアミノ酸置換に関する指針は、参照により本明細書に組み込まれるDayhoffら(1978) Atlas of Protein Sequence and Structure (Natl. Biomed. Res. Found., Washington, D.C.) のモデルにおいて見出され得る。あるアミノ酸を類似の特性を有する別のアミノ酸と交換するような保存的置換が最適である場合がある。典型的に保存的置換として見られるのは、脂肪族アミノ酸であるＡｌａ、Ｖａｌ、ＬｅｕおよびＩｌｅ間の１つの置換、水酸基残基ＳｅｒおよびＴｈｒの交換、酸性残基ＡｓｐおよびＧｌｕの交換、アミド残基ＡｓｎおよびＧｌｎ間の置換、塩基残基ＬｙｓおよびＡｒｇの交換および芳香族残基ＰｈｅおよびＴｙｒ間の交換である。どのアミノ酸の変化が表現型的に沈黙している可能性が高いかに関する指針がある（Bowie JUら, (1990), Science, 247 (4948):130610,これは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）。本開示の目的のために、ポリペプチドは、例えば、Ｄ－立体異性体などの天然に存在するアミノ酸の修飾形態、非天然に存在するアミノ酸；アミノ酸類似体；および模倣体を含み得る。
ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２の脱免疫化変異体によって提示される修飾／置換は、サイトカインの生物学的構造または機能に関与しないアミノ酸に対応することを明確にすべきである。すなわち、これらの変異は、以下のインターフェロン変異体、すなわちＩＦＮ－α２ｂ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、またはＩＦＮ－α２の任意の他の変異体（ＩＦＮ－α２ａ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２Ａ、ＩＦＮ－α２ｃ、およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｃを含む）のいずれに対しても行うことができる。
本開示の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの製造方法は、分子を構成する様々な要素の性質に依存して、広く変化するだろう。例えば、単離されたポリペプチド（例えば、単離された修飾インターフェロン－α２ポリペプチド）は、それを天然に発現する細胞から精製されるか、それを発現するように改変された細胞から精製されるか（組み換え）、または既知のタンパク質合成方法を使用して合成され得る。合成手順は、単純であり、高い収率を提供し、高度に精製された安定な生成物を得ることができるように選択され得る。例えば、本願で開示のポリペプチドは、本明細書に開示される核酸から、または組換え技術、変異誘発、もしくは当該技術分野において他の既知の手段などの標準分子生物学技術の使用のいずれかによって製造することができる。単離されたポリペプチドは、それを天然に発現する細胞から精製するか、それを発現するように改変された細胞から精製する（組換え）か、または既知のタンパク質合成技術を使用して合成され得る。複数の態様において、本願で開示のポリペプチドは、組換えＤＮＡまたはＲＮＡ技術によって製造される。複数の態様において、本願で開示のポリペプチドは、適切な宿主細胞における本願で開示の組換え核酸の発現によって産生され得る。例えば、ポリペプチドをコードする核酸分子を発現カセットまたは発現ベクターにクローニングし、発現カセットまたは発現ベクターを宿主細胞に導入し、ポリペプチドを宿主細胞で発現させる。その後、標準的なタンパク質精製技術を用いた適切な精製スキームにより、ポリペプチドを細胞から単離することができる。あるいは、ポリペプチドは、プロテアーゼ消化および精製などのエクスビボ手順の組み合わせによって製造することができる。さらに、本願で開示のポリペプチドは、部位特異的変異誘発技術、または当該技術分野で公知の他の変異誘発技術を使用して製造することができる（例えば、James A. Brannigan and Anthony J. Wilkinson.、2002、Protein engineering 20 years on.Nature Reviews Molecular Cell Biology 3, 964-970; Turanli-Yildiz B. et al., 2012, Protein Engineering Methods and Applications, intechopen.comを参照でき、これらはその全体が参照により本明細書に組み込まれている）。
複数の態様において、本開示はまた、修飾インターフェロン－α２（例えば、修飾ＩＦＮα－２ｂポリペプチド、修飾ＩＦＮα－２ａポリペプチド、修飾ＩＦＮα－２ｃポリペプチド、修飾ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｂポリペプチド、修飾ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ａポリペプチド、および修飾ＧＭＯＰ－ＩＦＮα－２ｃポリペプチド）を合成する方法に向けられている。改善された特性（例えば、免疫原性が低下した）を有する本願で開示される修飾インターフェロン－α２ポリペプチドは、本明細書に記載される種々の方法のうちの１つにおける遺伝子改変によって作成することができる。本明細書で使用される用語「修飾インターフェロン－α２」は、意図的に改変されたアミノ酸配列、すなわち「非野生型」アミノ酸配列を有する本願で開示される修飾インターフェロン－α２の群、または本明細書に記載される特定の、修飾インターフェロン－α２分子に関して（少なくとも）意図的に改変されているゲノムを有する微生物生物（いずれかの用語を形容詞として置くことに依存して）、または両方を指すことができる。このような改変は、１つまたは複数の遺伝子が第２の異なる微生物生物から標的微生物生物に移入される、組換え技術によって達成され得る。組換え技術は、従来の方法を用いて標的微生物生物に導入される完全合成ＤＮＡを用いて達成することができる。このような改変は、工学的技術によっても達成することができ、標的微生物生物内の核酸は、一般に部位特異的変異誘発を介して改変され、その結果、少なくとも１つの核酸が異なる核酸に変換され、したがって１つまたは複数の酵素が修飾される。上記の方法のいずれか、及び本出願を通じて記載される方法の組み合わせも採用され得る。したがって、本願で開示される修飾インターフェロン－α２分子は、インビボ、すなわち遺伝子改変微生物によって、またはインビトロのいずれかで産生され得ることが理解されよう。
複数の態様において、本開示は、免疫原性を低下させるために前記アミノ酸置換を生成する方法を提供する。前記方法は、ヒト天然インターフェロン（例えば、天然ＩＦＮ－α２、天然ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２）をコードする遺伝子のヌクレオチド配列における点変異を、前記遺伝子における部位特異的変異誘発技術によって生成することを含んでいる。本方法は、以下の工程を含む。１．天然ヒトインターフェロン（例えば、天然ＩＦＮ－α２、天然ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２）をコードする遺伝子を適切なプラスミド中でクローニングすること；２．部位特異的変異誘発技術を用いて、本開示の修飾インターフェロン－α２を生成するために必要な変異を生成すること；および３．ステップ２からの改変型遺伝子を、適切な発現ベクターにクローニングすること。複数の態様において、発現ベクターは、本開示の遺伝子を担持することができ、真核細胞において目的の遺伝子を発現させるために必要な要素をさらに含むベクターの群から選択される。
複数の態様において、本開示の部位特異的変異誘発技術は、その目的のために特別に設計されたオリゴヌクレオチドの使用を含む。この技術は、２つの段階からなる。第１段階では、適当なベクターにクローニングされた断片の末端にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドと、変異を導入しようとする遺伝子の内部領域にハイブリダイズする、免疫原性を低減するアミノ酸置換（ここに記載）に対応する点変異を有するオリゴヌクレオチドを用いて、別々に２つのＰＣＲ反応が行われる。逆方向の外部オリゴヌクレオチドと直接オリゴヌクレオチドｍｕｔ ａを用いてチューブａに反応混合物を得、直接外部オリゴヌクレオチドと逆方向オリゴヌクレオチドｍｕｔ ｂを用いてチューブｂに別の反応混合物を得、両方の反応からのＰＣＲ生成物をアガロースゲル電気泳動で精製し、第２段階のテンプレートとして使用する。この第２段階は、直接および逆方向の外部オリゴヌクレオチドを用いた第２ＰＣＲ反応からなる。最初の３サイクルはプライマーを加えずに行い、完全な産物のハイブリダイゼーションと伸長を可能にし（フィルイン）、最後にこれらを加えて増幅を行う。
複数の態様において、本願で開示の修飾インターフェロン－α２内で免疫原性を低下させる複数のアミノ酸置換部位を得るために、前記修飾インターフェロン－α２を以下のように順次構築する：まず、部位特異的変異誘発法を用いて、アミノ酸置換部位を有する修飾インターフェロン－α２を生成し、次に前記改変型インターフェース－α２を新しいアミノ酸置換部位生成用の開始テンプレートとして使用する。
複数の態様において、本開示は、以下のステップを含む、修飾インターフェロン－α２を製造する方法に向けられている。ａ）原核細胞を、修飾型インターフェロン－α２をコードする遺伝子を含む適切な原核生物発現ベクターで形質転換またはトランスフェクトすること；ｂ）修飾型インターフェロン－α２のポリペプチドを発現するクローンを選択すること；ｃ）前記クローンを適切な培養液中で培養すること；ｄ）生成物を精製すること；ｅ）工程ｃ）のクローンが発現した修飾型インターフェロン－α２ポリペプチドをインビトロでグリコシル化すること；およびｆ）修飾型インターフェロン－α２を精製すること；を含む。複数の態様において、前記方法のステップｅ）におけるグリコシル化は、修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドの高グリコシル化である。
複数の態様において、本開示はまた、本開示の１つ以上の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドおよび／または本開示のキメラもしくは融合ポリペプチド組成物の全体または一部をコードする核酸（例えば、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ベクター、ウイルス、またはそれらのハイブリッド、これらはすべて、分離、合成、または組換えの可能性がある）を提供する。複数の態様において、核酸は、発現カセット、プラスミド、および発現ベクター、または組換えウイルスをさらに含むか、またはその中に含まれ、任意に、核酸、または発現カセット、プラスミド、発現ベクター、または組換えウイルスは、細胞、任意にヒト細胞または非ヒト細胞内に含まれ、任意に、細胞は核酸、または発現カセット、プラスミド、発現ベクター、または組換えウイルスで形質導入される。複数の態様において、細胞は、例えば、本開示の１つまたはそれ以上ポリペプチド（修飾インターフェロン－α２ポリペプチド）；本明細書に開示される単離、合成、または組換え核酸、発現カセット、プラスミド、発現ベクター、または組換えウイルス；および／または本明細書に開示される単離、合成、または組換えキメラまたは融合ポリペプチド組成物を内に含むように、形質転換、トランスフェクトまたは他の方法で操作される。複数の態様において、細胞は、哺乳類細胞、細菌細胞、昆虫細胞、または酵母細胞であり得る。複数の態様において、本開示の核酸分子は、ベクターに挿入され、例えば、発現ベクターまたは遺伝子治療ベクターとして使用することができる。遺伝子治療ベクターは、例えば 、静脈内注射、局所投与（米国特許第５，３２８，４７０号）または定位注射（Chen SH et al.、(1994)、Proc Natl Acad Sci USA、91(8):3054-7、これらは参照によりその全体が本明細書に組み込まれている）により対象に送達することができる。遺伝子治療ベクターの医薬製剤は、許容される希釈剤中に遺伝子治療ベクターを含むことができ、または遺伝子送達ビヒクルが埋め込まれている徐放性マトリックスからなることができる。あるいは、完全な遺伝子送達ベクターが組換え細胞、例えば 、レトロウイルスベクターからそのまま生産され得る場合、医薬製剤は、遺伝子送達システムを生産する１つ以上の細胞を含むことができる。そのような医薬組成物は、投与のための指示書とともに、容器、パック、またはディスペンサーに含まれ得る。複数の態様において、本開示は、本開示のベクターを含む細胞に向けられている。複数の態様において、細胞は、哺乳類細胞、細菌細胞、昆虫細胞、または酵母細胞であり得る。
ポリヌクレオチドについて、「変異体」は、本願の開示のポリヌクレオチド配列内の１つまたは複数の内部部位における１つまたは複数のヌクレオチドの欠失および／または付加、および／または本願の開示のポリヌクレオチド配列内の１つまたは複数の部位における１つまたは複数のヌクレオチドの置換を含む。当業者であれば、本発明のポリヌクレオチドの変異体は、オープンリーディングフレームが維持されるように構築されることを認識するであろう。ポリヌクレオチドについて、保存的変異体は、遺伝コードの縮退のために、本発明のポリペプチドの１つのアミノ酸配列をコードする配列を含む。これらのような天然に存在する対立遺伝子変異体は、例えば、以下に概説するポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）およびハイブリダイゼーション技術のように、周知の分子生物学技術の使用により同定することができる。変異体ポリヌクレオチドはまた、例えば部位特異的変異誘発法を用いて生成されたものなどの合成的に得られたポリヌクレオチドも含むが、それでも本発明の所望の活性を有するポリヌクレオチド（すなわち、本明細書に記載されている所望の生物活性、すなわち抗病原性活性、抗真菌活性、抗藻活性（antialgal activity）、および／またはキチンおよび／もしくはポリグルクロン酸に対する酵素活性を有するポリペプチドをコードしている、）をコードしているものである。一般に、本発明の特定のポリヌクレオチドの変異体は、本明細書の他の箇所に記載の配列アラインメントプログラムおよびパラメータによって決定されるように、その特定のポリヌクレオチドに対して少なくとも約４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上の配列類似度を有するであろう。
本開示の特定のポリヌクレオチド（すなわち、参照ポリヌクレオチド）の変異体はまた、変異体ポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドと参照ポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドの間の配列同一性のパーセントを比較することによって評価することができる。任意の２つのポリペプチド間の配列同一性パーセントは、本明細書の他の箇所に記載されている配列アラインメントプログラムおよびパラメータを使用して計算することができる。本発明のポリヌクレオチドの任意の所定の対が、それらがコードする２つのポリペプチドによって共有されるパーセント配列同一性の比較によって評価される場合、２つのコードされたポリペプチド間のパーセント配列同一性は、少なくとも約４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれより多い配列同一性を有している。
本開示の１つ以上のポリペプチドの全部または一部をコードする、本明細書に提供されるポリヌクレオチド（ＲＮＡ、ＤＮＡ、発現カセット、ベクター、ウイルスまたはそれらのハイブリッドにかかわらず）は、種々の供給源から分離し、遺伝子工学的に生産し、増幅し、合成的に生産し、および／または組換え発現／作製することが可能である。これらの核酸から生成された組換えポリペプチドは、個々に単離またはクローン化され、所望の活性について試験することができる。任意の組換え発現系を使用することができ、例えば、インビトロ、細菌、真菌、哺乳類、酵母、昆虫または植物細胞発現系を含む。複数の態様において、本明細書で提供されるポリヌクレオチドは、周知の化学合成技術によってインビトロで合成される（例えば、Adams(1983)J. Am.Chem.Soc. 105:661; Belousov (1997) Nucleic Acids Res. 25:3440-3444; Frenkel (1995) Free Radic.Biol.Med.19:373-380; Blommers (1994) Biochemistry 33:7886-7896; Narang (1979) Meth.Enzymol.68:90;Brown(1979)Meth.Enzymol.Enzymol.68:109; Beaucage (1981) Tetra.Lett.22:1859;米国特許Ｎｏ．第４，４５８，０６６号、これらの全ては、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）。さらに、本明細書で提供されるポリヌクレオチドの操作のための技術、例えば、サブクローニング、標識プローブ（例えば、Ｋｌｅｎｏｗポリメラーゼを用いたランダムプライマー標識、ニック翻訳、増幅）、配列決定、ハイブリッド化などは、科学および特許文献によく記載されている（例えば、Sambrook、編、Molecular Cloning:A Laboratory Manual (2ND ED.), Vols.1～3、Cold Spring Harbor Laboratory、(1989);Current Protocols In Molecular Biology、Ausubel、ed.John Wiley & Sons, Inc., New York (1997); Laboratory Techniques In Biochemistry And Molecular Biology: Hybridization With Nucleic Acid Probes, Part I. Theory and Nucleic Acid Preparation, Tijssen, ed., New York (1997).Elsevier, N.Y. (1993), これらはすべて、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）。
複数の態様において、本開示は、本明細書に開示されるような修飾インターフェロン－α２をコードする核酸を含む特徴付けられた細胞株に向けられる。複数の態様において、前記細胞株は、本明細書に開示されるような修飾インターフェロン－α２を生産するのに適している。好ましい実施形態において、本明細書に開示されるような修飾インターフェロン－α２の産生に適した細胞株は、ＣＨＯ－Ｋ１、ＨＥＫ２９３、ＮＳ０、ＢＨＫ、Ｓｐ２／０、ＣＡＰ、およびＣＡＰ／Ｔのセットから選択される。複数の態様において、本開示はまた、真核細胞株を得るための方法であって、適切な発現ベクターに挿入された、本明細書に開示されるような修飾インターフェロン－α２をコードする前記遺伝子を含む細胞株の形質転換またはトランスフェクションによって、本明細書に開示される修飾インターフェロンα２を製造するための方法に向けられる。好ましくは、真核生物細胞株は、ＣＨＯ－Ｋ１細胞株である。複数の態様において、本開示は、本明細書に開示されるような修飾インターフェロン－α２を製造する方法に向けられており、前記方法は、ａ）本明細書に開示されるような修飾インターフェロン－α２ポリペプチドをコードする遺伝子を含む発現ベクターで前記形質転換またはトランスフェクトした真核細胞株を培養するステップ、およびｂ）培養液から発現および分泌された修飾インターフェロン－α２ポリペプチドを単離するステップ、を包含する。
複数の態様において、本開示は、本明細書に開示されるような修飾インターフェロン－α２ポリペプチドを精製するための方法に向けられている。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの精製の前記工程は、イムノアフィニティークロマトグラフィーによる精製を含む。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの精製の工程は、イムノアフィニティークロマトグラフィーによる精製を含み、イムノアフィニティークロマトグラフィーによる精製は、抗非グリコシル化ｒｈＩＦＮ－α２ｂ ｍＡｂ ＣＡ５Ｅ６抗体の使用を含んで成る。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの精製の工程は、イムノアフィニティークロマトグラフィーによる精製を含み、イムノアフィニティークロマトグラフィーによる精製は、抗ｈＧＭ－ＣＳＦモノクローナル抗体（呼び名、ｍＡｂ ＣＣ１Ｈ７）の使用を含んでいる。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの精製工程は、精製（例えば、イムノアフィニティークロマトグラフィーによる）の後、精製された修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの濃度を決定する工程をさらに含む。好ましい実施形態において、精製された修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの濃度の前記決定は、分光光度定量によって決定される。
複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物（本開示の、１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド、ポリヌクレオチド、１つまたは複数のポリペプチドまたはポリヌクレオチドを発現する微生物、発現カセット、プラスミド、発現ベクター、キメラまたは融合ポリペプチド、組換えウイルスおよび／または医薬組成物など）は、均一に精製することができ、部分精製することも可能である。しかしながら、修飾されたインターフェロン－α２組成物が均質性まで精製されない調製物が有用であることが理解される。重要な特徴は、調製物が、相当量の他の成分の存在下でも、修飾されたインターフェロン－α２の所望の機能を可能にすることである。したがって、本開示は、様々な程度の純度を包含する。一実施形態では、「細胞性物質を実質的に含まない」という言葉は、約３０％未満（乾燥重量で）の他のタンパク質（例えば、汚染タンパク質）、約２０％未満の他のタンパク質、約１０％未満の他のタンパク質、約５％未満の他のタンパク質、約４％未満の他のタンパク質、約３％未満の他のタンパク質、約２％未満の他のタンパク質、約１％未満の他のタンパク質、またはその間の任意の値もしくは範囲を有する修飾インターフェロンα２の調製物を含む。
複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物は組換え生産され、前記修飾インターフェロン－α２組成物はまた、培養液を実質的に含まないことができ、例えば、培養液は修飾インターフェロン－α２ポリペプチド、核酸、またはキメラもしくは融合ポリペプチドの調製物の容量の約２０％未満、約１０％未満、または約５％未満を表わす。「化学前駆体または他の化学物質を実質的に含まない」という表現は、修飾インターフェロン－α２の合成に関与する化学前駆体または他の化学物質から分離された、ポリペプチド、核酸、またはキメラもしくは融合ポリペプチドの調製物を含む。「化学前駆体または他の化学物質を実質的に含まない」という文言は、例えば、約３０％未満（乾燥重量で）の化学前駆体または他の化学物質、約２０％未満の化学前駆体または他の化学物質、約１０％未満の化学前駆体または他の化学物質、約５％未満の化学前駆体または他の化学物質、約４％未満の化学前駆体または他の化学物質、約３％未満の化学前駆体または他の化学物質、約２％未満の化学前駆体または他の化学物質、または約１％未満の化学前駆体または他の化学物質を有する、修飾インターフェロン－α２ポリペプチド、核酸、またはキメラもしくは融合ポリペプチドの調製物を含む。
複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド化合物または組成物は、当技術分野で知られているような標準的な組換えＤＮＡまたはＲＮＡ技術によって製造することができる。例えば、異なるポリペプチド配列をコードするＤＮＡまたはＲＮＡ断片は、従来の技術に従って、インフレームで一緒にライゲーションされ得る。別の実施形態では、融合遺伝子は、自動ＤＮＡ合成機を含む従来の技術によって合成され得る。あるいは、核酸断片のポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）増幅は、キメラ核酸配列を生成するために続いてアニールされ再増幅され得る２つの連続する核酸断片の間の相補的オーバーハングを生じさせるアンカープライマーを使用して実施することができる（Short Protocols in Molecular Biology:A Compendium of Methods from Current Protocols in Molecular Biology, (2ND , 1992), FM Asubel et al. (eds), Green Publication Associates, New York, NY (Publ), ISBN: 9780471566355,これらはその全体が参照により本明細書に組み込まれている）。さらに、本開示（例えば、配列番号２、４、６、８、１４、１６、１８、２０および２７－４２からなる１つまたは複数の配列を含む、で本質的に構成される、またはのみからなる、本開示の１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド）の１つまたは複数のポリペプチド（例えば、修飾インターフェロン－α２ポリペプチド）は、組み換え技術、合成重合技術、変異誘発、または当該技術分野において知られている他の標準的技術を通じて、異種ポリペプチドに挿入することができ、またはポリペプチドの非自然発生位置へ挿入することができる。例えば、変異誘発によるタンパク質工学は、部位特異的変異誘発技術、または当技術分野で公知の他の変異誘発技術を用いて行うことができる（例えば、James A. Brannigan and Anthony J. Wilkinson.、2002、Protein engineering 20 years on.Nature Reviews Molecular Cell Biology 3, 964-970; Turanli-Yildiz B. et al., 2012, Protein Engineering Methods and Applications, intechopen.com, これらはその全体が参照により本明細書に組み込まれている）。
さらに、多くの発現ベクターは、既に融合部分（例えば、ＧＳＴタンパク質）をコードしている市販のものである。本発明の修飾インターフェロン－α２をコードする核酸分子は、融合部分が少なくとも１つの修飾インターフェロン－α２にインフレームで連結されるように、このような発現ベクターにクローニングされ得る。融合部分のこのような連結は、例えば、タンパク質の精製収率を向上させるために行われ得る。
［医薬組成物および製剤］
複数の態様において、本開示の１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド、キメラポリペプチド、ポリヌクレオチド、１つまたは複数のポリペプチドまたはポリヌクレオチドを発現する微生物、発現カセット、プラスミド、発現ベクター、および／または組み換えウイルス（以下「本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物」等という）は、医薬組成物または製剤に含まれうる。複数の態様において、医薬組成物または製剤は、一般に、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物と、薬学的に許容される担体および／または賦形剤とを含んでいる。複数の態様において、前記薬学的組成物は、投与に適している。薬学的に許容される担体および／または賦形剤は、部分的には、投与される特定の組成物、ならびに組成物を投与するために使用される特定の方法によって決定される。従って、本願で開示される修飾インターフェロン－α２組成物を投与するための薬学的組成物の適切な処方は、多種多様である（例えば、Remington's Pharmaceutical Sciences, (18TH Ed, 1990), Mack Publishing Co., Easton, PA Publ）参照されたい）。複数の態様において、医薬組成物は、一般に、無菌、実質的に等張、および米国食品医薬品局のすべての適正製造基準（ＧＭＰ）規制を完全に遵守して処方される。
組成物、担体、賦形剤、および試薬を指す「薬学的に許容できる」、「生理学的に許容できる」、およびそれらの文法的変形は、互換的に用いられ、材料が、組成物の投与を禁止する程度の望ましくない生理作用の生成なしに、対象へのまたは対象に投与できることを表わす。例えば、「薬学的に許容される賦形剤」とは、例えば、一般に安全で、無毒で、望ましい医薬組成物の調製に有用な賦形剤を意味し、ヒトの医薬用途と同様に獣医用途にも許容される賦形剤が含まれる。そのような賦形剤は、固体、液体、半固体、またはエアゾール組成物の場合には気体であり得る。当業者であれば、本開示の修飾インターフェロン－α２組成物の適切な投与のタイミング、順序及び投与量を決定することができるであろう。
複数の態様において、そのような担体または希釈剤の好ましい例には、水、生理食塩水、リンゲル液、ブドウ糖液、および５％ヒト血清アルブミンが含まれるが、これらに限定されるものではない。リポソームおよび固定油などの非水性ビヒクルもまた使用することができる。薬学的活性物質に対するこのような媒体および化合物の使用は、当技術分野でよく知られている。任意の従来の媒体または化合物が、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物と不適合（incompatible）である限り、および前述のように、組成物におけるそれらの使用が企図される。補足的な活性化合物もまた、組成物に組み込むことができる。
複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物は、その意図された投与経路に適合するように製剤化される。本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物は、非経口、局所、静脈内、経口、皮下、動脈内、皮内、経皮、直腸、頭蓋内、髄腔内、腹膜内、経鼻；膣内；筋肉内経路によって投与することができる、または吸入剤として投与することができる。複数の態様において、本開示の修飾されたインターフェロン－α２化合物または組成物は、沈着物が蓄積した特定の組織に直接注入することができる。他の局面では、筋肉内注射または静脈内注入が、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物の投与のために使用され得る。いくつかの方法において、本開示の修飾型インターフェロン－α２化合物または組成物は、Ｍｅｄｉｐａｄ（登録商標）デバイスなどの徐放性組成物またはデバイスとして投与されるが、これらに限定されるものではない。
複数の態様において、本開示の修飾型インターフェロン－α２化合物または組成物は、任意に、本明細書に記載されるような様々な医学的状態の治療に少なくとも部分的に有効な他の薬剤と組み合わせて投与することができる。例えば、本開示の修飾型インターフェロン－α２化合物または組成物は、免疫系の抗ウイルス活性を刺激する、組成物の薬物動態パラメータを改善する、インターフェロン－α２の天然生物活性を増強および／または補完する、および／または組成物の免疫原性を低減する他の薬剤と組み合わせて投与することも可能である。
複数の態様において、非経口、皮内、または皮下適用に使用される溶液または懸濁液は、以下の成分を含むことができるが、これらに限定されるものではない。注射用水、生理食塩水、固定油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコールまたは他の合成溶媒などの無菌希釈剤；ベンジルアルコールまたはメチルパラベンなどの抗菌化合物；アスコルビン酸または重亜硫酸ナトリウムなどの抗酸化剤；エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）などのキレート化合物；アセテート、クエン酸またはリン酸などの緩衝剤および塩化ナトリウムまたはブドウ糖などの緊張度調整のための化合物を含むことができる。ｐＨは、塩酸や水酸化ナトリウムなどの酸または塩基で調整することができる。賦形剤の例としては、デンプン、グルコース、ラクトース、スクロース、ゼラチン、モルト、米、小麦粉、チョーク、シリカゲル、水、エタノール、ＤＭＳＯ、グリコール、プロピレン、乾燥スキムミルクなどを挙げることができる。組成物はまた、ｐＨ緩衝化試薬、および湿潤剤または乳化剤を含むことができる。複数の態様において、非経口製剤は、ガラスまたはプラスチック製のアンプル、使い捨て注射器または多回投与バイアルに封入することができる。
複数の態様において、注射可能な使用に適した医薬組成物または製剤は、滅菌水溶液（水溶性の場合）または分散液および滅菌注射可能溶液または分散液の即席の調製のための滅菌粉末を含む。静脈内投与のために、適切な担体は、生理食塩水、静菌水、Ｃｒｅｍｏｐｈｏｒ ＥＬＴＭ（ＢＡＳＦ， Ｐａｒｓｉｐｐａｎｙ，Ｎ,Ｊ）またはリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）である。いずれの場合も、組成物は無菌であり、そして容易な注入性（ｓｙｒｉｎｇｅａｂｉｌｉｔｙ）が存在する程度に流動性であるべきである。これは、製造および貯蔵の条件下で安定であり、細菌および真菌のような微生物の汚染行為に対して保護される。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２製剤は、凝集体、断片、分解物および翻訳後修飾を、これらの不純物が免疫原性の低下および純粋な修飾インターフェロン－α２と同様の高い相対的抗ウイルス活性を有する程度に、含んでもよい。担体は、例えば、 、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコールなど）、およびそれらの適切な混合物を含む溶媒または分散媒体とすることができる。適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティング剤の使用、分散液の場合には必要な粒子径の維持、界面活性剤の使用などによって維持することができる。微生物の作用の防止は、種々の抗菌・抗カビ化合物、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、アスコルビン酸、チメロサール等によって達成することができる。多くの場合、組成物中に等張化合物、例えば 、糖類、マンニトール、ソルビトールのような多価アルコール、塩化ナトリウムを含むことが好ましいであろう。注射用組成物の長時間の吸収は、吸収を遅延させる化合物、例えば、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンを組成物中に含むことによってもたらされ得る。
複数の態様において、無菌注射液は、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物を、必要に応じて、上記に列挙された成分の１つまたは組み合わせとともに適切な溶媒中に必要量組み込み、次いで、濾過滅菌することにより調製され得る。一般に、分散液は、結合剤を、基本的な分散媒体および上記に列挙したものからの必要な他の成分を含む無菌ビヒクルに組み込むことによって調製される。無菌注射液の調製のための無菌粉末の場合、調製方法は、あらかじめ無菌濾過したその溶液から活性成分＋任意の追加所望成分の粉末をもたらす真空乾燥および凍結乾燥である。さらに、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物は、活性成分の持続的または脈動的な放出を可能にするような方法で調合することができるデポ注射剤またはインプラント製剤の形態で投与することが可能である。
複数の態様において、医薬組成物または製剤の溶液または懸濁液は、修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドがその天然の構造コンフォメーションにあるｐＨで維持される。複数の態様において、前記ｐＨは、ｐＨ１０以下に維持される。複数の態様において、前記ｐＨは、ｐＨ７以下に維持される。複数の態様において、前記ｐＨは、ｐＨ３～１０の間に維持される。複数の態様において、前記ｐＨは、ｐＨ４～９の間に維持される。複数の態様において、前記ｐＨは、ｐＨ５～８の間に維持される。複数の態様において、前記ｐＨは、ｐＨ６～７．５の間に維持される。複数の態様において、ｐＨを所望のレベルに維持するために、緩衝剤が提供される。複数の態様において、前記緩衝剤は、リン酸緩衝剤である。複数の態様において、前記バッファーは、酢酸バッファーである。
複数の態様において、医薬組成物または製剤の溶液または懸濁液は、表面吸着阻害剤を含む。複数の態様において、前記表面吸着阻害剤は、組成物または製剤を封入する表面（ガラスまたはプラスチック製のアンプル、シリンジ、またはバイアルなど）による、医薬組成物または製剤の成分の吸着を阻害するものが提供される。好ましい実施形態において、前記表面吸着阻害剤は、組成物または製剤を封入するガラス表面による１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの吸着を阻害するものが提供される。複数の態様において、医薬組成物または製剤は、ホウケイ酸ガラス製のアンプル、シリンジ、またはバイアルに封入され、医薬組成物または製剤は、表面吸着阻害剤（例えば、ホウケイ酸ガラス表面による１つまたは複数の遺伝子組み換えインターフェロン－α２ポリペプチドの吸着を阻害する表面吸着阻害剤）を含む。複数の態様において、前記表面吸着抑制剤は、ポリソルベート８０である。複数の態様において、前記表面吸着抑制剤は、アルブミンである。
複数の態様において、医薬組成物または製剤の溶液または懸濁液は、分解阻害剤を含む。複数の態様において、分解阻害剤は、修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドの分解を阻害するものが提供される。複数の態様において、分解阻害剤は、修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドの酸化的分解を阻害するものが提供される。複数の態様において、前記分解阻害剤がベンジルアルコールである、修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドの酸化的分解を阻害する分解阻害剤が提供される。
複数の態様において、医薬組成物または製剤は、無菌注射液または分散液の即席調製のための無菌粉末を含み、前記無菌粉末は：１つ以上の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの乾燥粉末製剤、増量剤、および表面吸着阻害剤、を含む。複数の態様において、前記増量剤はグリシンである。複数の態様において、前記表面吸着阻害剤は、アルブミンである。複数の態様において、前記無菌粉末は、１つまたは複数の抗菌防腐剤をさらに含む。複数の態様において、前記１つ以上の抗菌防腐剤は、以下からなる群から選択される：ｍ－クレゾール、ベンジルアルコール、およびフェノール。複数の態様において、前記無菌粉末は、二塩基性リン酸ナトリウムおよび一塩基性リン酸ナトリウムをさらに含む。複数の態様において、前記無菌粉末は、全体として錠剤様固体、断片、および／または緩い粉末として提供される。複数の態様において、１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの前記乾燥粉末製剤は、凍結乾燥粉末である。複数の態様において、前記１つまたは複数の修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドは、所望の特異的活性を有するものが提供される。複数の態様において、前記無菌粉末は、対象への投与前に低温で保存される。複数の態様において、前記無菌粉末は、対象への投与の前に、２℃～８℃の範囲の温度で保存される。複数の態様において、対象への投与の前に、前記滅菌粉末は、希釈剤と再構成されて滅菌溶液を提供する。複数の態様において、前記再構成は、滅菌粉末を希釈剤に溶解して（例えば、撹拌、旋回、反転、振盪、ボルテックス、または当技術分野で知られ理解されている他の手段によって）、滅菌溶液を生成することによって達成される。複数の態様において、前記希釈剤は、以下からなる群から選択される１つ以上の成分を含む：滅菌水、塩化ナトリウム、第二リン酸ナトリウム、第一リン酸ナトリウム、ＥＤＴＡ、ポリソルベート８０、およびｍ－クレゾール。複数の態様において、前記再懸濁は、単回使用のバイアル、アンプル、またはシリンジで行われる。複数の態様において、前記無菌溶液は、所望の濃度で１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドを提供する。複数の態様において、遺伝的に修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドの前記所望の濃度は、１×１０６～１００×１０６ＩＵ／ｍＬである。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの前記所望の濃度は、１０×１０６～５０×１０６ＩＵ／ｍＬである。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドの前記所望の濃度は、１×１０６～１０×１０６ＩＵ／ｍＬである。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの前記所望の濃度は、被験体における状態の維持治療中の維持用量に対して減少される。複数の態様において、前記無菌溶液は、対象への投与前に低温で保存される。複数の態様において、前記無菌溶液は、対象への投与に先立って、２℃～８℃の範囲の温度で保存される。
複数の態様において、医薬組成物または製剤は、１つ以上の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドおよび１つ以上の成分を含む溶液または懸濁液を含み、ここで前記成分は、以下からなる群から選択される：滅菌水、塩化ナトリウム、第二リン酸ナトリウム、第一リン酸ナトリウム、ＥＤＴＡ、１つ以上の表面吸着阻害剤（例えば、，ポリソルベート８０）、１つ以上の抗菌防腐剤（例えば、ｍ－クレゾール）、１つ以上の増量剤、及び１つ以上の分解抑制剤。複数の態様において、前記溶液または懸濁液は、以下を含む：１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド、滅菌水、塩化ナトリウム、第二リン酸ナトリウム、第一リン酸ナトリウム、ＥＤＴＡ、ポリソルベート８０、およびｍ－クレゾールを含む。複数の態様において、前記１つ以上の修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドは、所望の特異的活性を有するものが提供される。複数の態様において、前記溶液または懸濁液は、所望の濃度で前記１つまたは複数の修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドを提供する。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの前記所望の濃度は、１×１０６～１００×１０６ＩＵ／ｍＬである。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの前記所望の濃度は、１０×１０６～５０×１０６ＩＵ／ｍＬである。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドの前記所望の濃度は、１×１０６～１０×１０６ＩＵ／ｍＬである。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの前記所望の濃度は、対象における状態の維持治療中の維持用量に対して減少される。複数の態様において、前記溶液または懸濁液は、対象への投与前に低温で保存される。複数の態様において、前記溶液または懸濁液は、対象への投与の前に、２℃～８℃の範囲の温度で保存される。
複数の態様において、医薬組成物または製剤の溶液または懸濁液は：１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド、塩、および緩衝剤を含む。複数の態様において、前記緩衝液は、ｐＨを所望のレベルに維持するために提供される。複数の態様において、前記緩衝液はリン酸緩衝液であり、前記塩は塩化ナトリウムである。
複数の態様において、医薬組成物または製剤は、無菌注射液または分散液の即席調製のための無菌粉末を含み、前記無菌粉末は、１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの乾燥粉末製剤を含んでいる。複数の態様において、前記無菌粉末は、以下からなる群から選択される１つ以上の成分をさらに含む：無水二塩基性リン酸ナトリウム、一塩基性リン酸ナトリウム二水和物、スクロース、およびポリソルベート８０。複数の態様において、前記無菌粉末は、全体的に錠剤様固体、断片、および／または緩い粉末として提供される。複数の態様において、１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの前記乾燥粉末製剤は、凍結乾燥粉末である。複数の態様において、前記１つまたは複数の修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドは、所望の特異的活性を有するものが提供される。複数の態様において、前記無菌粉末は、対象への投与前に低温で保存される。複数の態様において、前記無菌粉末は、対象への投与の前に、２℃～８℃の範囲の温度で保存される。複数の態様において、前記滅菌粉末は、再懸濁の前に室温で保管される。複数の態様において、前記無菌粉末は、再懸濁の前に１５℃～３０℃の範囲の温度で保管される。複数の態様において、対象への投与の前に、前記滅菌粉末は、滅菌溶液を提供するために希釈剤と再構成される。複数の態様において、前記再構成は、滅菌粉末を希釈剤に溶解して（例えば、撹拌、旋回、反転、振盪、ボルテックス、または当技術分野で知られ理解されている他の手段によって）、滅菌溶液を生成することによって達成される。複数の態様において、前記希釈剤は、滅菌水からなる。複数の態様において、前記再懸濁は、単回使用バイアル、アンプル、またはシリンジ内で行われる。複数の態様において、前記再懸濁は、二重室カートリッジにおいて行われ、第１の室は前記無菌粉末を含み、第２の室は前記希釈剤を含み、注射の前に、２つの室の成分は、無菌溶液を生成するために組み合わされる。複数の態様において、前記デュアルチャンバーカートリッジは、デュアルチャンバーカートリッジの一部である注入器具を介して前記無菌溶液を被験者に注入するために使用される。複数の態様において、前記無菌溶液は、前記１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドを所望の濃度で提供する。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの前記所望の濃度は、５０～５００ｍｃｇ／ｍＬである。複数の態様において、修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの前記所望の濃度は、１００～３００ｍｃｇ／ｍＬである。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドの前記所望の濃度は、１００～２０００ｍｃｇ／ｍＬである。複数の態様において、修飾されたインターフェロン－α２ポリペプチドの前記所望の濃度は、４００～１２００ｍｃｇ／ｍＬである。複数の態様において、前記無菌溶液は、対象への投与前に低温で保存される。複数の態様において、前記無菌溶液は、対象への投与の前に、２℃～８℃の範囲の温度で保存される。
複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物の医薬組成物または製剤は、１つまたは複数の他の医薬組成物の製剤と共投与される。複数の態様において、前記１つ以上の他の医薬組成物または製剤は、リバビリン（例えば、ＲＥＢＥＴＯＬ（登録商標））、ＰｅｇＩｎｔｒｏｎ（登録商標）、およびＩＮＴＲＯＮ－Ａ（登録商標）からなる群から選択される。
複数の態様において、経口組成物は一般に不活性希釈剤または食用担体を含み、ゼラチンカプセルに封入されるか、または錠剤に圧縮されることができる。複数の態様において、経口治療投与の目的のために、結合剤は賦形剤と共に組み込まれ、錠剤、トローチ、またはカプセルの形態で使用することができる。経口組成物はまた、洗口剤として使用するための流体担体を用いて調製することができ、流体担体中の化合物は、経口的に適用され、スワッシュして去痰するかまたは飲み込まれる。薬学的に適合する結合化合物、および／またはアジュバント材料は、組成物の一部として含まれ得る。複数の態様において、錠剤、ピル、カプセル、トローチなどは、以下の成分のいずれか、または類似の性質の化合物を含むことができる。微結晶性セルロース、トラガカントゴムまたはゼラチンなどの結合剤；デンプンまたは乳糖などの賦形剤、アルギン酸、Ｐｒｉｍｏｇｅｌまたはコーンスターチなどの崩壊性化合物；ステアリン酸マグネシウムまたはＳｔｅｒｏｔｅｓなどの潤滑剤；コロイド性二酸化ケイ素などの滑剤；スクロースまたはサッカリンなどの甘味化合物；またはペパーミント、サリチル酸メチルまたはオレンジ香料などの香味剤化合物など。
吸入による投与のために、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物は、適切な推進剤、例えば、二酸化炭素のようなガスを含む加圧容器またはディスペンサー、またはネブライザーからエアゾールスプレーの形態で送達することが可能である。
複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物の全身投与はまた、経粘膜的または経皮的手段によることができる。経粘膜または経皮投与のために、浸透させるべき障壁に適切な浸透剤が、製剤中に使用される。このような浸透剤は、一般に当該技術分野において知られており、例えば、経粘膜投与の場合、洗浄剤、胆汁酸塩、およびフシジン酸誘導体が含まれる。経粘膜投与は、鼻腔用スプレーまたは坐薬の使用により達成することができる。経皮投与のために、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物は、硬質軟膏(ointment)、軟膏(salve)、ゲル、またはクリームへと製剤化し、当該技術分野において一般に知られているように、局所的にまたは経皮パッチ技術を通じて適用することができる。
複数の態様において、本開示の修飾されたインターフェロン－α２化合物または組成物はまた、直腸送達のための坐剤（例えば、ココアバターおよび他のグリセリドなどの従来の坐剤基剤を用いて）または保持浣腸の形態で調製することが可能である。
複数の態様において、本開示の修飾されたインターフェロン－α２化合物または組成物は、インプラントおよびマイクロカプセル化送達システムを含む制御放出製剤など、身体からの急速な排除に対して修飾されたインターフェロン－α２組成物を保護する担体とともに調製される。生分解性、生体適合性ポリマーは、例えば、エチレンビニル酢酸、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステル、およびポリ乳酸のようなものを使用することができる。このような製剤の調製方法は、当業者には明らかであろう。材料はまた、商業的に、例えば、Ａｌｚａ ＣｏｒｐｏｒａｔｉｏｎおよびＮｏｖａ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ， Ｉｎｃ．から入手することができる。リポソーム懸濁液（ウイルス抗原に対するモノクローナル抗体を有する感染細胞に標的化されたリポソームを含む）もまた、薬学的に許容される担体として使用することができる。これらは、当業者に公知の方法に従って調製することができる（米国特許第４，５２２，８１１号、これは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）。複数の態様において、本開示の修飾されたインターフェロン－α２化合物または組成物は、所望の部位への修飾されたインターフェロン－α２組成物の徐放を可能にするバイオポリマー固体支持体内に移植可能であり、または前記固体支持体に連結され得る。
複数の態様において、投与の容易さおよび投与量の均一性のために、経口または非経口組成物を投与単位形態で製剤化することが特に有利である。本明細書で使用される用量単位形態は、治療される対象に対する単位用量として適した物理的に離散した単位を指し、各単位は、必要な医薬担体と関連して所望の治療効果をもたらすように計算された所定量の結合剤を含有する。本願の開示の投薬単位形態の仕様は、結合剤の固有の特性および達成されるべき特定の治療効果、ならびに対象の治療のための本開示のそのような修飾インターフェロン－α２化合物または組成物を配合する技術に固有の制限によって規定され、それに直接依存している。
［使用方法］
本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物（１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド、ポリヌクレオチド、１つまたは複数のポリペプチドまたはポリヌクレオチドを発現する微生物、発現カセット、プラスミド、発現ベクター、キメラまたは融合ポリペプチド、組換えウイルスおよび／または本開示の医薬組成物など）は、メラノーマ、黒色腫（悪性黒色腫を含む）、急性および慢性Ｃ型肝炎（代償性肝疾患を有する患者におけるものを含む）、急性および慢性Ｂ型肝炎、急性および慢性非Ａ、非Ｂ型肝炎、カポジ肉腫（ＡＩＤＳ関連カポジ肉腫を含む）、多発性硬化症、性器いぼ、白血病（有毛細胞白血病を含む）、リンパ腫（濾胞性リンパ腫を含む）、尖圭コンジローム、及び他のウイルス感染（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染ＺＩＫＶ感染、ＣＨＩＫＶ感染、又はインフルエンザＡ感染を含む）に対する保護／治療における使用を見出している。複数の態様において、本開示は、メラノーマ、黒色腫（悪性黒色腫を含む）、急性および慢性Ｃ型肝炎（代償性肝疾患の患者を含む）、急性および慢性Ｂ型肝炎、急性および慢性非Ａ、非Ｂ型肝炎、カポジ肉腫（ＡＩＤＳ関連カポジ肉腫を含む）、多発性硬化症、性器いぼ、白血病（有毛細胞白血病を含む）、リンパ腫（濾胞性リンパ腫を含む）、尖圭コンジローム、その他のウイルス性感染症（ＳＡＲＳ－ＣＯＶ－２感染症、ＺＩＫＶ感染症、ＣＨＩＫＶ感染症、又はインフルエンザＡ感染を含む）等に対する治療のための医薬品を製造するための、ここに開示されるような本開示の化合物または組成物、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物の使用を提供する。
複数の態様において、本開示は、１つまたは複数の本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物を投与することを含む、対象における１つまたは複数の医学的状態を予防または治療する方法、および本開示の１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物を投与する前記ステップによって対象における医学的状態を予防または治療することに向けられている。医学的状態は、例えば、メラノーマ、黒色腫（悪性黒色腫を含む）、急性および慢性Ｃ型肝炎（代償性肝疾患の患者を含む）、急性および慢性Ｂ型肝炎、急性および慢性非Ａ、非Ｂ肝炎、カポジ肉腫（ＡＩＤＳ関連カポジ肉腫を含む）、多発性硬化症、性器いぼ、白血病（有毛細胞白血病を含む）、リンパ腫（濾胞性リンパ腫を含む）、尖圭コンジローム、および他のウイルス感染（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染、ＺＩＫＶ感染、ＣＨＩＫＶ感染、またはＡ型インフルエンザ感染を含む）などが挙げられる。複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物は、有害事象を低減するため、または共投与化合物の効力を高めるために、病状を有する対象を治療するために用いられる他のタンパク質または化合物と組み合わせて使用することができる。
特定の態様において、本開示は、例えば、Ｃ型慢性肝炎を治療する方法に向けられており、前記方法は、本開示の１つ以上の修飾型インターフェロン－α２化合物または組成物を投与する工程、および本開示の前記１つ以上の修飾型インターフェロン－α２化合物または組成物を投与する前記ステップによって対象中のＣ型慢性肝炎を予防または治療する工程を含む。本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物は、有害事象を低減するため、または共投与化合物の有効性を高めるために、Ｃ型慢性肝炎の対象を治療するために用いられる他のタンパク質または化合物と併用して使用されることができる。複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物（例えば、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２変異体、ＩＦＮ－α２変異体など）は、抗ウイルス活性を維持しながら抗増殖特性を欠いており、慢性Ｃ型肝炎治療のための興味深い治療代替物を表している。複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物は、慢性Ｃ型肝炎治療において、免疫原性を低下させつつ、高い相対的な抗ウイルス活性を示す。
複数の態様において、本開示は、例えば、慢性Ｂ型肝炎を治療する方法に向けられ、前記方法は、本開示の１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物を投与する工程、および本開示の１つまたは複数の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物を投与する前記ステップによって対象中の慢性Ｂ型肝炎を予防または治療する工程を含む。本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物は、有害事象を低減するため、または共投与化合物の有効性を高めるために、慢性Ｂ型肝炎の対象を治療するために用いられる他のタンパク質または化合物と一緒に使用することができる。複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２組成物（例えば、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２変異体、ＩＦＮ－α２変異体）は、抗ウイルス活性を維持しながら抗増殖特性を欠いており、慢性Ｂ型肝炎治療のための興味深い治療代替案を表している。複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物は、慢性Ｂ型肝炎治療において免疫原性を低下させつつ、高い相対的な抗ウイルス活性を示す。
ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、ＺＩＫＶ、ＣＨＩＫＶ、Ａ型インフルエンザなどの新興ウイルス感染症は、世界的な公衆衛生上の関心事となっている。これは、それらの病因物質の新しい地域への急速な広がり、ヒト感染の増加、および新しい治療法および／または有効なワクチンの不足のためである。複数の態様において、本開示は、例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染（および／またはＣＯＶＩＤ－１９を含むＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に起因する関連疾患）、ＺＩＫＶ、ＣＨＩＫＶまたはインフルエンザＡを治療する方法、前記方法は、１つまたは複数の本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物を投与するステップ、ならびに１つまたは複数の本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物を投与する前記ステップにより対象において前記感染または疾患を予防または治療するステップに向けられる。複数の態様において、本開示の修飾型インターフェロン－α２化合物または組成物は、有害事象を低減するため、または共投与化合物の効力を増強するために、病状を有する対象を治療するために使用される他のタンパク質または化合物と併用して使用することができる。複数の態様において、本開示の修飾インターフェロン－α２化合物または組成物（例えば、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２変異体、ＩＦＮ－α２変異体）は、抗ウイルス活性を維持しながら抗増殖特性を欠いており、ＳＡＲＳ－ＣＯＶ－２（および／またはＣＯＶＩＤ－１９を含むＳＡＲＳ－ＣＯＶ－２に起因する関連疾患）、ＺＩＫＶ、ＣＨＩＫＶまたはインフルエンザＡ治療に対する興味深い治療代替物を表している。複数の態様において、先に記載したような本開示の１つ以上の化合物または組成物は、ＺＩＫＶ、ＣＨＩＫＶ、またはインフルエンザＡの治療において、免疫原性を低下させつつ、高い相対的な抗ウイルス活性を示す。
上述の方法の態様において、本開示の前記修飾インターフェロン－α２化合物または組成物は、１つまたは複数の他の医薬組成物または製剤と共投与される。複数の態様において、前記１つ以上の他の医薬組成物または製剤は、リバビリン（例えば、ＲＥＢＥＴＯＬ（登録商標））、ＰｅｇＩｎｔｒｏｎ （登録商標）、およびＩＮＴＲＯＮ－Ａ（登録商標）からなる群から選択される。
本明細書に記載の方法は、例えば、本明細書に記載の疾患（メラノーマまたはウイルス感染症および／または関連疾患を含む）の治療および／または予防のための少なくとも１種の医薬製剤または組成物を含む、予めパッケージされたキットを利用することによって行うことができ、これは、例えば、臨床設定において本明細書に記載の、病状又は家族歴を示す対象を治療するために便利に使用することができる。一実施形態では、キットは、本明細書に記載の、医学的状態の症状または家族歴を示す対象を治療するための、本願の開示の少なくとも１つの修飾インターフェロン－α２組成物の使用説明書を更に含む。
以下に示す実施例は、いかなる方法によっても本発明の範囲を限定するものと解釈されるものではない。本開示に照らして、特許請求の範囲の範囲内の多数の実施形態は、当業者には明らかであろう。
（１）治療薬の免疫原性部位のｉｎ ｓｉｌｉｃｏによる同定
Ｔ細胞は、抗原提示細胞（ＡＰＣ）から提示されたエピトープを、ＭＨＣ（主要組織適合性複合体）クラスＩＩ分子との関連で特異的に認識する。これらのＴ－ヘルパーエピトープは、ＭＨＣクラスＩＩ結合溝に適合する７～３０個の連続したアミノ酸からなる線形配列として表現することができる。様々な起源のタンパク質分子内のクラスＩＩエピトープを検出するために、多くのコンピュータアルゴリズムが開発され、使用されてきた（De Groot AS et al,(1997), AIDS Res Hum Retroviruses,13(7):539-41; Schafer JR et al., (1998), Vaccine,16(19):1880-4; De Groot AS et al., (2001), Vaccine, 19(31):4385-95; De Groot AS et al., (2003), Vaccine, 21(27-30):4486-504）。Ｔ－ヘルパーエピトープのこれらの「ｉｎ ｓｉｌｉｃｏ」予測は、ワクチンの設計および治療タンパク質、すなわち抗体ベースの薬剤、Ｆｃ融合タンパク質、抗凝固剤、血液因子、骨形成タンパク質、人工タンパク質足場、酵素、成長因子、ホルモン、インターフェロン、インターロイキンおよび血栓溶解剤の脱免疫にうまく適用されている（Dimitrov DS, (2012), Methods Mol Biol, 899:1-26）．
ＥｐｉＭａｔｒｉｘ（登録商標）システム（ＥｐｉＶａｘ，Ｐｒｏｖｉｄｅｎｃｅ，Ｒｈｏｄｅ・Ｉｓｌａｎｄ）は、クラスＩおよびクラスＩＩＨＬＡリガンドとＴ細胞エピトープの予測に有用なコンピュータープログラムにコード化された一連の予測アルゴリズムである。ＥｐｉＭａｔｒｉｘ（登録商標）システムは、特定のアミノ酸（２０）とＨＬＡ分子内の結合位置（９）の間の相互作用をモデル化するために、２０ｘ９の係数行列を使用する。任意の入力タンパク質に存在する推定Ｔ細胞エピトープを特定するため、ＥｐｉＭａｔｒｉｘ（登録商標）システムではまず、入力タンパク質を解析して、各フレームが最後のアミノ酸と８個ずつ重なる９量体フレームの集合を作成する。次に、各フレームは、ヒトＨＬＡ分子の１つまたは複数の共通対立遺伝子に対する予測される親和性についてスコア化される。通常、ＤＲＢ１＊０１０１、ＤＲＢ１＊０３０１、ＤＲＢ１＊０４０１、ＤＲＢ１＊０７０１、ＤＲＢ１＊０８０１、ＤＲＢ１＊１１０１、ＤＲＢ１＊１３０１、およびＤＲＢ１＊１５０１である（Mackら、(2013)、Tiss Antig、81(4):194～203）。簡単に言うと、任意の９量体ペプチドについて、特定のアミノ酸コード（２０個の天然に存在するアミノ酸のそれぞれについて１つ）および相対的結合位置（１－９）を使用して、予測行列から係数を選択する。個々の係数は、Ｓｔｕｒｎｉｏｌｏ（Sturniolo T et al., 1999, Nat Biotechnol, 17(6):555-61）が最初に開発したポケットプロファイル法と類似するが同一ではない独自の方法を使用して導き出される。次に、個々の係数が合計され、生のスコアが生成される。ＥｐｉＭａｔｒｉｘ（登録商標）の生のスコアは、次に、非常に大規模なランダムに生成されたペプチド配列のセットから得られたスコア分布に関して正規化される。結果として得られる「Ｚ」スコアは正規分布であり、対立遺伝子間で直接比較することができる。
ＥｐｉＭａｔｒｉｘ（登録商標）ペプチドスコアリング
ＥｐｉＭａｔｒｉｘ（登録商標）の「Ｚ」スコアで１．６４以上のスコア（任意のペプチドセットの上位５％程度）を持つペプチドは、予測されたＭＨＣ分子に結合する可能性が有意に高く、「ヒット」と呼ばれることが決定された。スコアで２．３２以上のスコア（上位１％）のペプチドは、結合する可能性が極めて高く、発表されているほとんどのＴ細胞エピトープは、このスコアの範囲に入る。以前の研究では、ＥｐｉＭａｔｒｉｘ（登録商標）が公表されているＭＨＣリガンドとＴ細胞エピトープを正確に予測することも実証されている。
Ｔ細胞エピトープクラスターの同定。Ｔ細胞エピトープの候補は、タンパク質配列中にランダムに分布しているのではなく、「クラスター」化する傾向がある。Ｔ細胞エピトープ「クラスター」の長さは９～約３０アミノ酸で、複数の対立遺伝子や複数のフレームに対する親和性を考慮すると、４～４０の結合モチーフを含んでいることになる。エピトープマッピングの後、ＥｐｉＭａｔｒｉｘ（登録商標）アルゴリズムによって生成された結果セットは、Ｃｌｕｓｔｉｍｅｒ（登録商標）として知られる独自のアルゴリズムを使用して、Ｔ細胞エピトープクラスターおよびエピバー（登録商標）の存在についてスクリーニングされた。簡単に説明すると、分析された各９量体ペプチドのＥｐｉＭａｔｒｉｘ（登録商標）スコアが集約され、統計的に導き出された閾値と照合される。次に、スコアの高い９量体ペプチドは、一度に １ アミノ酸ずつ拡張される。伸長された配列のスコアは、再度集計され、修正された閾値と比較される。このプロセスは、提案された拡張がクラスターの全体的なスコアをもはや向上させないまで繰り返される。１０以上のスコア（多くの異なるＨＬＡ ＤＲ対立遺伝子に対する複数の「ヒット」を含む）を有すると定義される高い免疫原性の領域が、Ｔ細胞エピトープクラスターとして同定された。これらの領域には、相当数の推定Ｔ細胞エピトープと、ＭＨＣ結合とＴ細胞反応性の高い可能性を示すエピバー（登録商標）が含まれている。
［ＨＬＡ結合に関与するアミノ酸の予測］
これらの領域の各アミノ酸のＨＬＡ結合への寄与は、ＯｐｔｉＭａｔｒｉｘツール（脱免疫のためのＥｐｉＶａｘ ＩＳＰＲＩツールキットの一部）を使って評価された。ＯｐｔｉＭａｔｒｉｘはまず、複数の９量体フレームと複数のＨＬＡ対立遺伝子にわたってＭＨＣ結合親和性に最も寄与する「重要な」残基を調べることから始める。次に、このプログラムは、タンパク質配列の任意の位置にある１９個の代替アミノ酸をすべて反復して置換し（オペレーターが定義した入力により、リストを自然保存された変異体に限定することができる）、その変更後の配列の予測免疫原性を再解析する。タンパク質の構造、ひいては生物学的活性への悪影響を避けるため、重要な残基を文献から総合的に検索し、改変の候補とならないアミノ酸を特定した。
［実施例１．ｉｎ ｓｉｌｉｃｏ免疫原性予測および脱免疫化タンパク質設計］
ペプチドとＨＬＡ分子との結合は、Ｔ細胞反応に必要な重要な最初のステップである。実際、タンパク質の免疫原性の最も重要な決定要因の１つは、ペプチドのＭＨＣ分子への結合の強さである（Lazarski CA et al, (2005) Immunity.23: 29-40）。ＧＭＯＰ－ＩＦＮ（配列番号１０）の潜在的な免疫原性を分析するために、ＥｐｉＭａｔｒｉｘを用いて完全なアミノ酸配列がスクリーニングされた。この研究により、タンパク質配列中のＴ細胞エピトープの高い含量が明らかになった（図１Ａ）。ＣｌｕｓｔｉＭｅｒアルゴリズムを用いた更なる分析により、推定９量体ＭＨＣ結合ペプチドの同定およびそれらのクラスター領域への結合が可能となった。ＧＭＯＰ－ＩＦＮ（配列番号１０）の以下２０－４３，５８－７２，７０－８９，１２１－１４１，１３１－１５４，１５８－１７９の残基にまたがる、合計６つのクラスタが定義された。予測された６つのＭＨＣ結合クラスターのうち５つは、以前に報告されたＴ細胞エピトープと重なっていた。
次に、ＯｐｔｉＭａｔｒｉｘを用いて、ＭＨＣＩＩの結合親和性を阻害したり低下させたりする重要な残基を同定した。ＯｐｔｉＭａｔｒｉｘによって示唆された変化の中から、生物学的活性や受容体結合に重要であると同定されなかった修飾が選択された。これらの結果は、ＣｌｕｓｔｉＭｅｒのＭＨＣ結合クラスター予測と共に検討された。この比較に基づいて、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ（配列番号１０）における修飾のための１０部位が選択され、これらはアミノ酸配列における以下の位置に対応する：２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１４２、１３７、１６１および１７１であった。これらの１０個の変異を、異なる組み合わせでＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ配列（配列番号１０）に導入して、変異体を作製した。各アミノ酸をアラニンに変異させる修飾を行った（アミノ酸をトレオニンに変異させた１６１位の改変を除く）。これら全ての変異を導入してＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ１（配列番号２）を生成し、Ｔ細胞エピトープ含量に対する変異の影響を（図１Ｂ）に示す。
ｈＩＦＮ－α２ｂ分子（配列番号１２）のＬ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３ＡおよびＬ１２８Ａの修飾が、特定のＨＬＡ分子との結合に重要であることが発見された。そのため、これらの修飾（配列番号１０のＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂの位置Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、及びＬ１４２Ａに相当する）を変異させて、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ２（配列番号４）を開発した。クラスター１５８～１７９および７０～８９の抗原性をそれぞれ低下させるために、７つの変異を有する２つの追加のタンパク質変異体、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ３（配列番号６）およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ４（配列番号８）も作製された。ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ３（配列番号６）を製造するための改変は、以下の通りであった。Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、Ｌ１４２Ａ、Ｉ１６１Ｔ、およびＬ１７１Ａである。ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ４（配列番号８）を製造するための改変は、以下の通りであった。Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｎ７９Ａ、Ｌ８０Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａである。表１は、作成されたＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ変異体をまとめたものである。
各変異体に対する免疫原性スコアは、上述したように、ＥｐｉＭａｔｒｉｘを用いて算出した。図２に示すように、各変異体のＥｐｉＭａｔｒｉｘ免疫原性グローバルスコアは、元の分子と比較して顕著に低下している。
Figure 2023514659000002
 ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂの脱免疫化変異体によって提示される修飾／置換は、先に詳細に説明したように、サイトカインの生物学的構造または機能に関与しないアミノ酸に対応することが明確にされるべきであると考えられる。すなわち、この実験およびこれらの変異は、例えば以下の変異体を含む、本明細書に開示されるような修飾ＩＦＮ－α２ポリペプチド（または関連する修飾ＩＦＮ－α２化合物および組成物）のいずれに対しても実施することが可能であり、ＩＦＮ－α２ｂ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、または１つ以上のＧＭＯＰ配列が付加され、又は付加されていないＩＦＮ－α２（ＩＦＮ－α２ａ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ａ、ＩＦＮ－α２ｃ、およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｃを含む）の任意の他の変異体が含まれる。
（２）遺伝子発現、およびタンパク質の生産、精製、特性評価
（細胞培養）
細胞培養チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ－Ｋ１）細胞を、以前に記載された基礎培養培地（Kratje RB、Wagner R、(1992)、Biotechnol.Bioeng.39: 233-242）に５％（ｖ／ｖ）子牛胎児血清（ＦＣＳ）（ＰＡＡ、アルゼンチン）を補充した培地で培養した。ヒト胚性腎臓（ＨＥＫ２９３Ｔ）細胞は、１０％（ｖ／ｖ）ＦＣＳおよび２ｍＭグルタミンを添加したＤＭＥＭ中で培養した。Ｍａｄｉｎｅ Ｄａｒｂｙ ｂｏｖｉｎｅ ｋｉｄｎｅｙ（ＭＤＢＫ）細胞は、１０％（ｖ／ｖ）ＦＣＳを添加した最小必須培地（ＭＥＭ；Ｇｉｂｃｏ、米国）中で培養した。バイオアッセイは，２％（ｖ／ｖ）ＦＣＳ添加ＭＥＭ（アッセイ培地）を用いて実施した．ヒトＤａｕｄｉ細胞株は、ＲＰＭＩ１６４０培地（Ｇｉｂｃｏ）＋１０％（ｖ／ｖ）ＦＣＳで維持した。すべての細胞は、加湿した５％ＣＯ２中、３７℃でインキュベートした。
（レンチウイルスベクターの構築とレンチウイルス粒子の組み立て）
ｈＩＦＮ－α２ｂコード配列を有するプラスミド（ＧｅｎｅＷｉｚ、米国）をＳａｌＩおよびＸｂａＩ酵素で消化し、各ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体に対応する放出ＤＮＡ断片をレンチウイルスプラスミド（ｐＬＶ）にクローニングした（A:Oberbek A. (2011) BiotechnolBioeng 108(3):600-610., B:Chusainow J. (2009) BiotechnolBioeng 102(4):1182-1196）。すべての構築物の同一性は、ＤＮＡ配列決定によって検証された。３つのｈＩＦＮ－α２ｂアナログ導入遺伝子を含む研究グレードのＨＩＶベースＬＶ粒子を、Naldiniら(1996, Science, 272: 263-267)およびDullら(1998, J. Virol. 72: 8463-71)が示唆するプロトコルに従って生産した。付着ＨＥＫ２９３Ｔ細胞を１０ｃｍプレートで培養し、４つのプラスミドで同時に共トランスフェクトした：パッケージングプラスミド（ｐＭＤＬｇ／ｐＲＲＥ）（Dullら(1998)、J. Virol.72:8463-71）、Ｒｅｖ発現プラスミド（ｐＲＳＶ－Ｒｅｖ）（Naldiniら(1996)、Science、272:263-267)、VSV-Gを発現するエンヘ゛ローフ゜フ゜ラスミト゛(pMD2.G)(Dullら（1998）、J.Virol.72: 8463-71）、および導入遺伝子を含む対応するトランスファーベクター（ｐＬＶｓ）である。すべてのプラスミドは、LipofectAMINE 2000 Reagent (Invitrogen, USA）を用いて、供給者の指示に従って、リポソーム媒介遺伝子導入により細胞内に導入された。レンチウイルス粒子（ＬＶＰ）を含む上清をトランスフェクション後７２時間後に採取した。
（レンチウイルス導入）
１ウェルあたり６．０×１０４個で６ウェルプレート（Ｇｒｅｉｎｅｒ）に播種した細胞とＬＶＰを含む上清１ｍｌとをインキュベートすることにより、導入が行われた。導入後２４時間で培地を新しい培地に交換した。残存する野生型細胞を排除するために、導入後９６時間から、上清を１０μｇ－ｍｌ－１ピューロマイシン（Ｓｉｇｍａ Ａｌｄｒｉｃｈ， ＵＳＡ）を含む新鮮な成長培地に交換することにより選択圧工程を開始した。選択培地は、対照細胞が死滅するまで、ピューロマイシン濃度を上げながら３－４日ごとに交換した。
（ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体の生産と精製）
ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体産生のために形質転換細胞を拡大し、ｒｈＩＦＮ－α２ｂ濃度の測定と細胞計数により、各細胞株の生産性を評価した。細胞は、成長培地を用いて５００ｃｍ２の三つ口フラスコでコンフルエントになるまで成長させた。その後、培地を０．５％（ｖ／ｖ）ＦＣＳを添加した基底培地（生産培地）に変更した。４８時間または７２時間ごとに、調整培地を回収し、新鮮な生産培地と交換した。収穫物は遠心分離により清澄化し、－２０℃で保存した。タンパク質を、以前に記載されたように、ＣＮＢｒ活性化Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ４Ｂ（ＧＥヘルスケア）に結合した抗非糖化ｒｈＩＦＮ－α２ｂ ｍＡｂ ＣＡ５Ｅ６（これは、種々のＩＦＮ変異体と有効に結合することが証明されている）を用いる免疫親和性クロマトグラフィーによって精製した（セアリオＮら、（２００８）、バイオキミー、９０：４３７－４４９）。精製されたＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体の濃度は、分光光度定量によって決定された。
（ｒｈＩＦＮ－αサンドイッチＥＬＩＳＡ）
培養上清からのＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体収量を、Ｃｅａｇｌｉｏら（2008, Biochimie. 90: 437-449）によって記載された特異的サンドイッチＥＬＩＳＡアッセイによって定量化した。サンドイッチＥＬＩＳＡアッセイは、ポリスチレンプレート上に固定化されたモノクローナル抗体（ｍＡｂ）ＣＡ５Ｅ６によるＩＦＮ－ａ２ｂ（その異なるバージョン）の捕捉、およびウサギ抗ＩＦＮ－２ｂポリクローナル血清（Ｃ７）に存在する免疫グロブリン（Ｉｇｓ）によるその後の認識に基づくものである。
９６ウェルの平底ポリスチレンプレート（Ｇｒｅｉｎｅｒ社製）に、Ｎａ２ＣＯ３／ＮａＨＣＯ３５０ｍＭｐＨ９．６溶液で希釈したｍＡｂＣＡ５Ｅ６１ｇ．ｍｌ－１（１００ｎｇ／ウェル）を１００リットル感作した（感作溶液）。これを３７℃で１時間、４℃で終夜インキュベートした。
非特異的相互作用部位のブロッキングは、ウシ血清アルブミン溶液（ＢＳＡ、シグマ社製）１％（Ｐ／Ｖ）ＰＢＳ中（ブロッキング溶液）を１ウェルあたり２００Ｌ添加したものを使用した。これを３７℃で１時間インキュベートした。
最初のインキュベーションは、細菌由来のｉｆｎ－２ｂ標準物質（Gema Biotech, Argentina）を１０ｎｇ．ｍｌ－１から０．０７８ｎｇ．ｍｌ－１の１：２の連続希釈で、１００μｌを加え、分析する試料から行われた。そのために、ＰＢＳにＴｗｅｅｎ２０を０．０５％（Ｖ／Ｖ）で加えた０．１％ＢＳＡ（Ｐ／Ｖ）溶液を使用した（希釈液）。検体は、曲線の直線性範囲内で標準品と比較できるように、培地に連続希釈して試験した。３７℃で１時間インキュベートした。試薬の可能な非特異的結合を評価するために、ＩＦＮ－２ｂを添加せずにチェックを行った（ネガティブコントロール）。これを行うために、この段階の間、ＩＦＮを１００Ｌの希釈液で置き換えた。
２回目のインキュベーションは、希釈液で１：１，０００に希釈したウサギ血清Ｃ７抗ＩＦＮ－２ｂを１００ｌ添加することにより行った。３７℃で１時間インキュベートした。
第３のインキュベーションは、酵素ペルオキシダーゼを結合させたウサギ抗免疫グロブリンヤギ抗体（ＤＡＫＯ、デンマーク）を１００Ｌを希釈液で１：２，０００希釈で添加することにより行った。３７℃で１時間インキュベートした。
明らかにする反応は、基質としてＨ２Ｏ２（０．０１５容量）をクエン酸／リン酸ナトリウム溶液５０ｍＭ，ｐＨ５．３で希釈したもの（明らかにする溶液）に、ｏ－フェニレンジアミン発色剤（ＯＰＤ，Ｓｉｇｍａ）を０．５ｍｇ．ｍｌ－１の濃度で加えて酵素反応によって明らかにした。当該溶液を１ウェルあたり１００Ｌ入れ、暗所、室温で１５分インキュベートしたところ、酵素が基質の還元を触媒し、同時に発色剤の酸化を行うため、発色の様子が観察された。反応は５０ＬのＨ２ＯＳ４２Ｎの添加により停止し、マイクロタイティングプレートリーダー（Labsystems Multiskan MCC/340、フィンランド）でａ．４９２ｎｍで検色を実施した。
定量は、標準として用いたＩＦＮ－２ｂの濃度とサンプルの希釈率に基づいて吸光度の値をプロットし、いずれも対数スケールで表示した。試料の濃度は、平行直線試験（D: Milano, F. (2001) Bachelor's Thesis in Biotechnology.を用いて決定した。薬剤のインビトロの生物学的評価のためのバイオアッセイの設計と検証。Faculty of Biochemistry and Biological Sciences, UNL, Santa Fe, Argentina.）．
（ＳＤＳ－ＰＡＧＥとウェスタンブロッティング）
ＳＤＳ－ＰＡＧＥ分析は、１５％（ｗ／ｖ）ポリアクリルアミド分解ゲルおよび５％（ｗ／ｖ）スタッキングゲルを用いて標準法に従って実施した。タンパク質はポリビニリデン・ジフルオリド（ＰＶＤＦ）メンブレン（ＢｉｏＲａｄ）に転写した。ブロットをトリス緩衝生理食塩水（ＴＢＳ）中の５％（ｗ／ｖ）無脂肪乳で１時間ブロッキングし、ウサギ抗ｒｈＩＦＮ－α２ｂポリクローナル抗体でプローブした。１時間後、ブロットを、ＥＬＩＳＡで記載したのと同じペルオキシダーゼ標識でインキュベートした。免疫反応性バンドはＥＣＬ（登録商標）Chemiluminescent Western Blotting Analysis System (ＧＥヘルスケア)を用いて可視化した。ステップ間の洗浄は、０．０５％（ｖ／ｖ）Ｔｗｅｅｎ２０を含むＴＢＳ（ＴＢＳ－Ｔ）で実施した。希釈液は０．５％（ｗ／ｖ）脱脂乳を含むＴＢＳ－Ｔで調製した。
［実施例２．ＧＭＯＰ－ＩＦＮ脱免疫化変異体：製造及び精製］
ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体を合成し、第３世代のレンチウイルスベクターにクローニングした後、ＣＨＯ細胞で発現させた。ピューロマイシン（３００μｇ／ｍｌ）を用いて細胞を選択後、安定な細胞株からの培養上清を、サンドイッチＥＬＩＳＡおよび抗ウイルスアッセイによってそれぞれｒｈＩＦＮ－α２ｂ産生および生物学的効力を予備的にスクリーニングした。
タンパク質の精製には、ＣＮＢｒ活性化Ｓｅｐｈａｒｏｓｅにモノクローナル抗体（ＣＡ５Ｅ６）をリガンドとして吸着させた、一段階の免疫アフィニティークロマトグラフィーを行った。上清に含まれるタンパク質の変異体は、理論容量の４０％を超えることなくマトリックスにロードされた。フロースルーや洗浄工程でも、サイトカインの損失は観察されなかった。タンパク質濃度は、λ＝２８０ｎｍの波長での分光光度によって測定された（図８）。
タンパク質の純度は、ＳＤＳ－ＰＡＧＥの後にクーマシーブルー染色を行うことで分析した（図３）。すべてのタンパク質調製物は、ＳＤＳ－ＰＡＧＥにおいて同様の移動度シフトを示した。しかしながら、すべての試料についての非グリコシル化ｒｈＩＦＮ－α２ｂも検出され、これは、より効率的に占有されていないＯ－グリコシル化コンセンサス配列の存在を反映していた。ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ２およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ３のデンシトメトリープロファイルでは、ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）を主な汚染物質として９４％以上の純度を示した。一方、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ１およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ４タンパク質の純度レベルは約８０％で、これはＣＡ５Ｅ６ ｍＡｂへのタンパク質結合が低いことに起因すると思われる。
ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂの脱免疫化変異体によって提示される修飾／置換は、サイトカインの生物学的構造または機能に関与しないアミノ酸に対応することが明確にされるべきであろう。すなわち、この実験およびこれらの変異は、例えば以下の変異体を含む、本明細書に開示されるような修飾ＩＦＮ－α２ポリペプチド（または関連する修飾ＩＦＮ－α２化合物および組成物）のいずれに対しても実施することが可能である。たとえば、ＩＦＮ－α２ｂ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、または１つ以上のＧＭＯＰ配列が付加しまたは付加していないＩＦＮ－α２（ＩＦＮ－α２ａ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ａ、ＩＦＮ－α２ｃ、およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｃを含む）の任意の他の変異体が含まれる。
（３）インビトロの活性測定法
（抗ウイルスアッセイ）
インターフェロンのための抗ウイルス生物学的滴定アッセイは、これらのサイトカインがウイルスの伝播または複製に及ぼす阻害活性を定量する（Familletti Gら、(1981)、Methods Enzymology 78: 387-394）。最も単純で最も便利な手順は、サイトカインの濃度範囲について、溶解性ウイルスの細胞障害効果から感受性細胞を保護するインターフェロンの能力を測定することである。
ｒｈＩＦＮ－α２ｂの生物学的抗ウイルス活性は、ＭＤＢＫ細胞上の水疱性口内炎ウイルス（ＶＳＶ）によって引き起こされる細胞病理効果を阻害する能力によって決定した（Familletti PCら、(1981)、Methods Enzymol.78: 387-394; Rubinstein Sら、(1981 J. Virol. 37: 755-8）。ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体の抗ウイルス活性に対する修飾の影響を評価するために、ＭＤＢＫ細胞を、成長培地媒体［１０％ＳＦＢ（Ｖ／Ｖ）で補充したＭＥＭ］中の培養マイクロタイタープレートに播種し（ウェル当たり２．５×１０４細胞）、３７℃で一晩インキュベートした。
培養上清を除去した後、ｒｈＩＦＮ－ａ２ｂＷＨＯ国際標準（ＮＩＢＳＣ９５／５６６）の２０Ｕｍｌ-１から０．１６Ｕｍｌ-１の１：２の連続希釈液、または各ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体の試験サンプルの１：２連続希釈液を測定用培地に添加した。その後、プレートを３７℃で６時間インキュベートし、上清を除去した後、単層で１細胞あたり１．６ＰＦＵのＶＳＶウイルスを感染させた。ウイルス複製は、コントロールウェル（ｒｈＩＦＮ－α２ｂなし）で細胞障害作用が明確に観察できるようになるまで進行させた。培地を捨て、細胞を固定し、４０％（ｖ／ｖ）メタノール（Ｍｅｒｃｋ）中の０．７５％（ｗ／ｖ）クリスタルバイオレットの溶液で同時に染色した。３７℃で１５分後，プレートを蒸留水で洗浄して色素を除去し，固定した色素を２０％（ｖ／ｖ）酢酸に可溶化させた。読み取り前にプレートをホモジナイズできるマイクロタイタープレートリーダーを用いてλ＝５４０ｎｍで読み取り，各希釈のシグナル強度を５ウェルで測定した吸光度の平均値として報告した。
吸光度データを、ＩＦＮ－α２ｂ（標準）の活性値およびサンプルの希釈値の関数として対数スケールでプロットし、平行線の検定を用いて標準と比較して、各分子の生物活性値（ＡＢ）を計算した。これらの結果から、ＡＢ値と試料中の分子濃度の商を算出し、各タンパク質の比生物活性値（ＡＢＥ）を求めた。
最後に、ＩＦＮ－α２ｂ－ＷＴ分子のＡＢＥ（１８０±５０ＩＵ／ｎｇ）とＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ変異体のそれぞれのＡＢＥの商を作ることによって、パーセントによる相対的抗ウイルス活性値を決定した。
（抗増殖性アッセイ）
細胞増殖を阻害するｒｈＩＦＮ－α２ｂ能力を測定するために、Ｄａｕｄｉ細胞を用いてインビトロのバイオアッセイを実施した（Nederman Tら、(1990)、Biologicals.18: 29-34）。ｒｈＩＦＮ－ａ２ｂＷＨＯ国際標準の５０Ｕ／ｍｌから０．０２Ｕ／ｍｌの１：２の連続希釈液、または各ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体の試験サンプルの１：２の連続希釈液をマイクロタイタープレートのウェルに配置した。次に、あらかじめ洗浄したＤａｕｄｉ細胞を加え（１ウェルあたり５×１０３細胞）、プレートを３７℃で９６時間インキュベートした。細胞増殖は、CellTiter 96TM AQueous Non-Radioactive Cell Proliferation Assay(Promega)を使用して、２つの試薬（ＭＴＳ［３－（４，５－ジメチルチアゾール－２－イル）－５－（３－カリボキシメトキシ－フェニル）－２－（４－スルホフェニル）－２Ｈ－テトラゾリウム）］濃度２ｍｇ．ｍｌ－１およびＰＭＳ［フェナジンメトスルフェート（phenazine methosulfate）］濃度０．９２ｍｇ．ｍｌ－１）を用いて決定した。ＷＨＯ国際標準：大腸菌産生ｒｈＩＦＮ－２ｂ（ＮＩＢＳＣ９５／５６６）を使用した。
９６ウエルからなる滅菌済み平底プレートに、１０％ＳＦＢ（Ｖ／Ｖ）添加ＲＰＭＩ培地（増殖培地）中のｒｈＩＦＮ－ａ２ｂ標準品を、活性濃度５０ＵＩ．ｍｌ－１から０．３９ＵＩ．ｍｌ－１まで１：２で連続希釈したウェルあたり５０μｌ配置した。各タンパク質について、用量反応曲線の直線範囲内で標準品と比較できるように、それぞれ適切な初期希釈を行い、同じ条件で分析を行った。
Ｄａｕｄｉ細胞株は、増殖途中のものを培養した。試験には、１．１０５ｃｅｌｌｍｌ－１の懸濁液を調製し、そのうちの５０μｌを各ウェルに加え、３７℃のストーブで９６時間インキュベートした。
試験を明らかにするために、プレート１枚当たり２ｍＬのＭＴＳ溶液と１００ＬのＰＭＳ溶液を混合してその時に調製した発色試薬を１ウェル当たり２０μｌ添加した。３７℃で５時間インキュベートした。この比色法は、代謝的に活発な細胞に見られるデヒドロゲナーゼ酵素の存在を強調し、その活性が培養中に存在する生存細胞の数に直接関係することで、細胞増殖を測定するものである。デヒドロゲナーゼ酵素は、ＭＴＳの生物的還元を触媒して、波長４９０ｎｍを吸収する可溶性の（青色の）ホルマザン発色剤に変化させる。ＰｍＳは、酸化還元反応において電子供与体として作用する。生成物の生成量は、crop中の代謝活性細胞の数に正比例する。発色剤の吸光度は、マイクロプレートリーダーを使用して、６９０ｎｍのプレートバックグラウンドの読み取りに対して４９２ｎｍで測定された。このアッセイは３反復で再現された。
吸光度の値は、対応する標準活性データと対数スケールのサンプル希釈値を基にプロットした。各新規分子の抗増殖生物活性値は、平行線比較法を用いて標準品を用いて算出した。
最後に、体積活性とタンパク質濃度の比を作ることで、比抗増殖生物活性値を決定した。
［実施例３Ａ．ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ２およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ３は、高い残存抗ウイルス活性および無効化した抗増殖性（null antiproliferative properties）を呈した］
抗ウイルス活性に直接関与する残基を変更することなく、最も免疫原性の高いアミノ酸を変更することを目的として、脱免疫化戦略が用いられた。これらの改変がサイトカインの生物学的活性に及ぼす影響をインビトロの抗ウイルス活性測定で評価した。欧州薬局方で推奨されているため、ＭＤＢＫ細胞がＶＳＶウイルスによりウイルス感染のターゲットとして使用された。ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ（１９０±５０ＵＩ／ｍｌ）に対するＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂ変異体の相対的な抗ウイルス活性は、ＭＤＢＫ細胞上の水疱性口内炎ウイルスによって引き起こされる細胞病理効果を阻害する能力によって決定し、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂの活性に対して正規化した（図９、１０、及び１１）。ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂの各変異体の生産株の細胞株培養上清を用いて、予備的な抗ウイルス活性試験を行った。全ての上清は、異なる大きさで抗ウイルス活性を示した（図９）。
次いで、精製ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ及びＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ変異体を用いて、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ（１９０±５０ ＵＩ／ｍｌ）に対するＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ変異体の相対的な抗ウイルス活性を、上記のように決定した（図１０及び図１１）。ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ１およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ４について、残留する抗ウイルス活性の著しい減少が観察された（それぞれ、０．０６％および０．１７％）（図１０）。その結果、両タンパク質は、さらなる研究から廃棄された。一方、表２に示すように、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ２およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ３は、元の抗ウイルス活性のほとんどを保持していた（それぞれ、７２％および３５％）（図１１）。これは、免疫原性残基の選択を生物学的活性に直接関与しないものに限定したにもかかわらず、ＩＦＮ－受容体相互作用の部分的な低下が依然として明らかであったことを反映している。
Figure 2023514659000003
 ｒｈＩＦＮ－αによる抗ウイルス療法中、最も一般的な副作用の１つは好中球数の減少、すなわち好中球減少症であり、これは用量調節または早期の中止と頻繁に関連している（Saleh MI and Hindi NN, (2018), Naunyn. Schmiedebergs. Pharmacol.391: 953-963）。このため、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ２及びＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ３の抗増殖活性をさらに特徴付けるために、インビトロバイオアッセイを使用して、Ｄａｕｄｉ細胞の細胞増殖を阻害する能力を測定した。タンパク質の生物学的活性に直接関与する残基を変更していないにもかかわらず、両方のタンパク質変異体について、それらの特異的な抗増殖活性の著しい低下が観察された。表３に示すように、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ２およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ３の両方は、元の抗増殖力の１％未満を示した（ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ２については０．５±０．２Ｕｎｇ-１、およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ３について０．４±０．１Ｕｎｇ-１）。これらの結果を総合すると、同じ細胞受容体が両方のｈＩＦＮ－α２ｂの生物学的活性に関与していることを考えると、これは、サイトカイン構造の変化に対するＩＦＮ抗増殖活性の感受性がより高いことを示すものである。一般に、高い抗増殖活性は、重篤な感染症（細菌、ウイルス、真菌など）に対する感受性を生み出す好中球減少など、ＩＦＮ－２ｂ療法の望ましくない副作用と関連していることを考えると、これらの結果は極めてポジティブである。
Figure 2023514659000004
 ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂの脱免疫化変異体によって提示される修飾／置換は、サイトカインの生物学的構造または機能に関与しないアミノ酸に対応することが明確にされるべきであろう。すなわち、この実験およびこれらの変異は、例えば以下の変異体を含む、本明細書に開示されるような修飾ＩＦＮ－α２ポリペプチド（または関連する修飾ＩＦＮ－α２化合物および組成物）のいずれに対しても実施することが可能である。ＩＦＮ－α２ｂ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、または１つ以上のＧＭＯＰ配列が付加しまたは付加していないＩＦＮ－α２（ＩＦＮ－α２ａ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ａ、ＩＦＮ－α２ｃ、およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｃを含む）の任意の他の変異体である。
［実施例３Ｂ．他のインターフェロンと比較した、ＩＦＮ－α変異体の比較残留抗ウイルス活性および抗増殖特性］
ＩＦＮ－α２ｂサイトカインの生物学的活性に対する様々な修飾の影響は、インビトロの抗ウイルス活性アッセイによって評価される。欧州薬局方で推奨されているため、ＭＤＢＫ細胞がＶＳＶウイルスによりウイルス感染のターゲットとして使用されている。ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ（１９０±５０ＵＩ／ｍｌ）に対する高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体１～４（それぞれ配列番号２、４、６、及び８）の相対的な抗ウイルス活性は、ＭＤＢＫ細胞上の水疱性口内炎ウイルスによって引き起こされる細胞障害効果を阻害するそれらの能力によって決定し、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂの活性に対して正規化される。
高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体と生物活性を比較するために、他のいくつかの精製ＩＦＮ－α２ｂ変異体も作製された。これらの変異体には、以下が含まれる。ＰＥＧ化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体１～４（それぞれ配列番号２、４、６、および８）、ならびに４Ｎ－ＩＦＮ。４Ｎ－ＩＦＮは、高グリコシル化ＩＦＮ－α２ｂ変異体であり、ここで、変異は、Ａｓｎ－Ｘａａ－Ｓｅｒ／ＴｈｒトリペプチドからなるコンセンサスＮグリコシル化部位を提供するためにアミノ酸をＡｓｎで置換することによって天然のｈＩＦＮ－α２ｂに導入されており、Ｘはプロリン残基以外の任意の残基でありうる。４Ｎは、ｈＩＦＮ－α２ｂの４、２３、７０、７７の位置のＡｓｎへの変異を含む。
高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ１および高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ４は、残存する抗ウイルス活性の低下が予想される。さらに、ＰＥＧ化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体１－４、および４Ｎ－ＩＦＮでは、残存する抗ウイルス活性の低下が予想される。一方、高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ２および高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ３は、元の抗ウイルス活性の大部分を保持しているか、または保持すると予想される。このことは、免疫原性残基の選択を生物学的活性に直接関与しないものに限定したにもかかわらず、ＩＦＮ－受容体相互作用の部分的な減少が依然として明らかであることを反映している。
ｒｈＩＦＮ－αによる抗ウイルス療法中、最も一般的な副作用の１つは好中球数の減少、すなわち好中球減少症であり、これは用量調節または早期の中止と頻繁に関連している（Saleh MI and Hindi NN, (2018), Naunyn. Schmiedebergs. Pharmacol.391: 953-963）．このため、高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ２及び高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ３の抗増殖活性を、ＰＥＧ化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体１～４、及び４Ｎ－ＩＦＮとさらに比較するために、インビトロバイオアッセイが用いられ、Ｄａｕｄｉ細胞の細胞増殖抑制能力が測定されている。タンパク質の生物学的活性に直接関与する残基を変更していないにもかかわらず、高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ２および高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ３では、いずれも特異的な抗増殖活性が著しく低下していることが観察された。逆に、ＰＥＧ化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体１～４、及び４Ｎ－ＩＦＮについては、特異的な抗増殖活性が著しく低下することはないと予想される。これらの結果を総合すると、同じ細胞受容体が両方のｈＩＦＮ－α２ｂの生物学的活性に関与していることを考えると、ＩＦＮ抗増殖活性がサイトカイン構造の変化に対してより敏感であることが示される。一般に、高い抗増殖活性は、重篤な感染症（細菌、ウイルス、真菌など）に対する感受性を生み出す好中球減少など、ＩＦＮ－２ｂ療法の望ましくない副作用と関連していることを考えると、これらの結果は極めてポジティブであると言える。
ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂの脱免疫化変異体によって提示される修飾／置換は、サイトカインの生物学的構造または機能に関与しないアミノ酸に対応することが明確にされるべきであろう。すなわち、この実験およびこれらの変異は、例えば以下の変異体を含む、本明細書に開示されるような修飾ＩＦＮ－α２ポリペプチド（または関連する修飾ＩＦＮ－α２化合物および組成物）のいずれに対しても実施することが可能であり、例えば、ＩＦＮ－α２ｂ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、または１つ以上のＧＭＯＰ配列が付加しまたは付加していないＩＦＮ－α２（ＩＦＮ－α２ａ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ａ、ＩＦＮ－α２ｃ、およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｃを含む）の任意の他の変異体である。
（４）物理化学的特性評価
（等電点電気泳動）
ＩＥＦ（等電点電気泳動）は、７Ｍ尿素を含む１ｍｍ厚の８％（ｗ／ｖ）ポリアクリルアミドゲルで行い、ｐＨ範囲を確定するために、３０％（ｗ／ｖ）の両性電解質（５－７）、７０％（ｗ／ｖ）の両性電解質（２－４）（Pharmalyte、ＧＥヘルスケア）が混合された。このゲルを１０Ｗ、２０００Ｖ、１００ｍＡで３０分間プレフォーカスした。その後、５～２０μｌの試料をカソードから１ｃｍの位置に塗布し、プレフォーカス工程と同条件で９０分間電気泳動を行った。ＩＥＦ分離された成分は、クーマシーブルー染色により検出した。
［ＧＭＯＰ－ＩＦＮとその変異体における適切なＯ－グリコシル化部位の評価］
Ｏ－グリコシルトランスフェラーゼの既知のコンセンサス認識配列がないことから、ＮｅｔＯＧｌｙｃ ３．１ Ｓｅｒｖｅｒソフトウェア（Julenius K et al., (2005), Glycobiology. 15: 153-164）を用いてムチン型ＧａｌＮＡｃ Ｏ－グリコシル化部位のニューラルネットワーク予測を行なった。
［実施例４．ＧＭＯＰ－ＩＦＮ脱免疫化変異体は特徴的な電気泳動プロフィールを示した］
各タンパク質変異体の電荷ベースの不均一性をさらに特徴付けるために、等電点電気泳動（ＩＥＦ）アッセイを行った。ＣＨＯ－Ｋ１細胞で生産されたＷＴ－ＩＦＮ、ｒｈＩＦＮ－α２ｂでは、４つの電気泳動バンドが観察され、天然のＴｈｒ１０６ Ｏ－グリコシル化部位に結合したシアル酸の含有量が異なるＯ－グリカン構造を持つアイソフォームを表していた。
ＧＭＯＰ－ＩＦＮのＯ－グリコシル化部位に結合した糖鎖構造の含有率が高いことは、ゲルの最も酸性な領域に位置する約７個のアイソフォームの存在によって証明された。興味深いことに、両方の脱免疫化変異体は、オリジナル分子と比較して異なる電気泳動プロファイルを示した。両タンパク質で合計１１本の電気泳動バンドが検出され、そのうちの３本はゲルの最も酸性側の端に位置していた。さらに、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ３では、最も塩基性の高いアイソフォームの含量が低いことも確認された（図４）。これらの結果は、ＮｅｔＯＧｌｙｃ ３．１サーバーソフトウェアを用いてムチンタイプのＧａｌＮＡｃ Ｏ－グリコシル化部位を解析したデータと一致する。このアルゴリズムでは、ＧＭＯＰ－ＩＦＮでは５つ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ２とＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ３では６つのＯ－グリコシル化部位の発生が予測された。
ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂの脱免疫化変異体によって提示される修飾／置換は、サイトカインの生物学的構造または機能に関与しないアミノ酸に対応することが明確にされるべきであろう。すなわち、この実験およびこれらの変異は、例えば以下の変異体を含む、本明細書に開示されるような修飾ＩＦＮ－α２ポリペプチド（または関連する修飾ＩＦＮ－α２化合物および組成物）のいずれに対しても実施することが可能である。例えば、ＩＦＮ－α２ｂ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、または１つ以上のＧＭＯＰ配列が付加しまたは付加していないＩＦＮ－α２（ＩＦＮ－α２ａ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ａ、ＩＦＮ－α２ｃ、およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｃを含む）の任意の他の変異体である。
（５）免疫原性評価
［ヒトＰＢＭＣの調製とＨＬＡ－ＤＲタイピング］
血液の抽出と取り扱いはすべてUniversidad Nacional del Litoral Research Ethics Committee (Santa Fe, AR)の承認を受けた。血液サンプルは、インフォームドコンセントを得た後、１８歳から６０歳の健康なドナーから静脈穿刺により採取した。
ＰＢＭＣはＦｉｃｏｌｌ－Ｐａｑｕｅ（登録商標）ＰＬＵＳ（ＧＥヘルスケアバイオサイエンス、ＳＥ）密度勾配分離により製造者の指示に従い分離し、バフィーコートを回収してＰＢＳで２回洗浄した。ＰＢＭＣは１－３×１０７細胞／ｍｌの濃度で液体窒素中に凍結保存した。前もって一定分量の血液を分離し、ルミナックス配列技術（Luminex Sequencing Technology） (PRICAI, Buenos Aires, AR)によってＨＬＡ－ＤＲアロタイプを決定した。タイピング結果は、Allele Frequency Net Database (The Royal Liverpool and Broadgreen University Hospitals, NHS Trust website: www.allelefrequencies.net)で公開されている世界人口におけるＨＬＡ－ＤＲ頻度と比較された。
［エクスビボＴ細胞アッセイ］
エクスビボＴ細胞アッセイについては、ＪａｂｅｒおよびＢａｋｅｒ（(2007), J. Pharm. Biomed. Anal. 43: 1256-1261)）を改変して実施した。単球は、プラスチックへの差動付着によって各ドナー血液サンプルのＰＢＭＣから単離された（Elkord E et al., (2005), Immunology. 114: 204-12）。付着細胞は分化のために保持し、非付着細胞はさらなる使用のために回収し、凍結保存した。単球由来ＤＣの未熟な表現型を誘導するために、単球を、ヒトＩＬ－４（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ、ＵＳＡ）および顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ－ＣＳＦ、ＧｅｍａＢｉｏｔｅｃｈ、ＡＲ）をそれぞれ１０００Ｕ／ｍｌ含む増殖培地で、３日目に培地を交換して６日間インキュベートした。６日目に、未熟な樹状細胞を集め、数え、ｒｈＩＦＮ－α２ｂ変異体または非抗原（培地または賦形剤）と共にインキュベートした。この研究に含まれる試験抗原は、ＧＭＯＰ－ＩＦＮおよびその脱免疫化変異体であった。一晩のインキュベーション後、ＤＣを洗浄して外来抗原を除去し、組換えヒト腫瘍壊死因子（ｒｈＴＮＦ、ＰｒｏｓＰｅｃ、米国）α、ＧＭ－ＣＳＦおよびＩＬ－４を含む増殖培地に４日間再懸濁し、ＤＣ成熟を誘発させた。その後、ＡｇパルスＤＣを、２ｎｇ／ｍｌのヒトＩＬ－２（Ｔｈｅｒｍｏ， ＵＳＡ）を含む培地で４８時間、自己細胞とインキュベートした。上清を回収し、サンドイッチＥＬＩＳＡによってＩＦＮ－γおよびＩＬ－４の定量を評価した。ネガティブコントロール（培地または賦形剤）、およびポジティブコントロール（フィトヘマグルチニン、Ｓｉｇｍａ Ａｌｄｒｉｃｈ、ＵＳＡ）もまた含まれた。
［ＩＦＮ－γサンドイッチＥＬＩＳＡ］
９６ウェルプレートに濃度２μｇ／ｍｌの一次ｈＩＦＮ－γ ｍＡｂ（クローンＮＩＢ４２、ＢＤ、米国）を１００μｌコーティングし、まず３７℃で１時間、次に４℃で一晩培養した。リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）中の１％（ｗ／ｖ）ＢＳＡで３７℃で１時間ブロッキングした後、培養上清を加え、３７℃で２時間インキュベートした。また、１ｎｇ／ｍｌからのｒｈＩＦＮ－γ（ＢＤ、ＵＳＡ）の連続１：２希釈液も含まれている。次に、５００ｎｇｍｌ-１の濃度のビオチン化ｈＩＦＮ－γｍＡｂ（クローン４Ｓ．Ｂ３，ＢＤ，ＵＳＡ）を１００μｌ／ウェルでプレートに加え、３７℃で１時間インキュベートした。そして、プレートを１：５０００に希釈したホースラディッシュ・ペルオキシダーゼ（Horseradish peroxidase; HRP）標識ストレプトアビジン（Streptavidin）（ＲＰＮ４４０１－ＡＭＤＥＸ，ＵＳＡ）と共にインキュベートした。１時間後、プレートを基質溶液 (0.5 mg/mlの o-フェニレンジアミン、in 50 mM リン酸クエン酸緩衝液中、0.015% (v/v) H2O2)でインキュベートした。反応を２ＮのＨ２ＳＯ４の添加で停止させ、吸光度はマイクロタイタープレートリーダーＬ（Lａｂｓｙｓｔｅｍｓ Ｍｕｌｔｉｓｋａｎ ＭＣＣ／３４０，Ｆｉｎｌａｎｄ）を用いて４９２ｎｍで測定した。各工程の間に、０．０５％（ｖ／ｖ）Ｔｗｅｅｎ２０を含むＰＢＳ（ＰＢＳ－Ｔ）でプレートを洗浄した。希釈液は０．１％（ｗ／ｖ）ＢＳＡを含むＰＢＳ－Ｔで調製した。アッセイは３反復で行った。刺激指数（ＳＩ）は、タンパク質を付与したサンプルからのサイトカイン濃度を賦形剤で処理したサンプルからのサイトカイン濃度で割った比率として定義された。
［統計解析］
処理間の差は一元配置分散分析（ＡＮＯＶＡ）で評価した。ＡＮＯＶＡで有意差が出た場合（ｐ＜０．０５）、さらにポストホックのＴｕｋｅｙの多重比較検定を適用した。
［実施例５．免疫原性解析］
エクスビボヒトＰＢＭＣアッセイは、治療薬候補にさらされた後の免疫細胞の活性化を測定することに基づいている。これにより、Ｔ細胞の抗原特異的な活性化を解析し、治療薬が提示する免疫反応の誘導能を決定することができる。これらの試料の構成は、Ｔリンパ球のようないくつかの関連する免疫細胞だけでなく、抗原提示細胞（例えば、単球、樹状細胞、Ｂ細胞）を含んでいる。治療薬への曝露の結果、免疫反応が生じた場合、活性化した協力なＴ細胞によって分泌される特定のサイトカイン、例えばＩＦＮ－γ、ＩＬ－４、ＩＬ－６、ＴＮＦ－αなどを定量化することによって測定することができる。その結果、治療用タンパク質に潜在的に存在する免疫原性Ｔ細胞エピトープに関連するリスクを評価するのに適した実験プラットフォームが構成される。
（ドナーサンプル）
ヒト免疫細胞ベースのアッセイは、タンパク質の免疫原性リスク評価として広く利用されている（Jaber A and Baker M, (2007), J. Pharm.Biomed.Anal.43: 1256-1261; Mazor R et al, (2012), Proc.Natl. Acad.Sci. U. S. A. 109:E3597-603; Lamberth K, et al., (2017), Sci. Transl.Med.9: 1-12）．これらの実験は、多様なＨＬＡ遺伝子型のドナープールで実施され、世界的な人口におけるＨＬＡの発生を代表する場合に、より信頼性が高いことが今や非常に明確になっている。この研究では、１８歳から６０歳までの健康なドナー２０人から血液を採取した。各ドナーから一定量の血液を採取し、ルミナックス配列テクノロジー（Luminex Sequencing Technology）によってＨＬＡ－ＤＲアロタイプを決定した。簡単に説明すると、この技術はＤＲＢ１遺伝子の抽出物２をＰＣＲ（ポリメラーゼ連鎖反応）で増幅し、オロクロムを付けたポリスチレン球に付着させた特異的プローブとハイブリダイゼーションさせるものである。これらの球はＬｕｍｉｎｅｘチームによって読み取られ、ＰＣＲ産物が球に付着した痕跡にハイブリダイズした場合に検出される。ドナーによって発現されたＨＬＡ－ＤＲＢ１対立遺伝子は高い異質性を示し、表４に示されている。
Figure 2023514659000005
［Ｔ細胞活性化反応］
Ｔ細胞に対する内因性ｈＩＦＮ－α２ｂの抗増殖作用は、ＰＢＭＣサンプルとの直接インキュベーションを制限している。この問題を回避するために、単球由来ＤＣ（ｍｏＤＣ）の生成のための前段階を含む代替プロトコルが適応された。未熟なＤＣを短いインキュベーション時間、高濃度で異なるＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体でパルスし、その後、細胞を洗浄した。このステップの間、未熟なＤＣは抗原をエンドサイトーシスして処理することができる。成熟すると、ＤＣはＭＨＣクラスＩＩに結合したＧＭＯＰ－ＩＦＮ由来のペプチドを細胞表面に提示することができ、そこでＴ細胞応答を刺激することができるようになるだろう。血液サンプルは健康なドナーから入手し、世界の人口に発現する主要なＨＬＡ－ＤＲアロタイプが含まれるように選択した。これにより、特定のＨＬＡ－ＤＲアロタイプに限定されたｈＩＦＮ－α２ｂ特異的なＴ細胞反応を検出することができる。エクスビボＴ細胞アッセイおよびＩＦＮ－γサンドイッチＥＬＩＳＡを、上記のように、ＩＦＮ－γおよびＩＬ－４の濃度を評価するために実施した。分析するタンパク質とインキュベートしたサンプルの培養上清中のこれらのサイトカインの濃度を、ネガティブコントロール（ＰＢＳまたは賦形剤とインキュベートし、リンパ球と遭遇した樹状細胞）の濃度と比較した。最後に、ネガティブコントロールに対するサンプル中のＩＦＮ－γレベルの比から刺激率を算出した。そこから、上清中のＩＦＮ－γレベルが低下したドナーの割合を、ｐ≦０．０５のときサンプル間の有意差を考慮して、オリジナルのＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂを基準として、各変異体について評価した。
図５に示すように、ネガティブコントロールと比較した場合、ＩＦＮ－γ産生の増加によって判断されるように、ほぼ全てのドナーがＧＭＯＰ－ＩＦＮタンパク質に応答した。この結果は、計算上の予測とよく一致する。また、ＥｐｉＭａｔｒｉｘアルゴリズムを用いた知見と一致し、免疫原性の顕著な低下が、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ２について６３％のドナー、及びＧＭＯＰ－ＩＦＮ－ＶＡＲ３について４２％のドナーにおけるＩＦＮ－γ応答の割合の低下によって証明されるように、両方のＧＭＯＰ－ＩＦＮ脱免疫化変異体について観察された。
しかし、ＩＬ－４分泌（Ｔｈ２プロファイル）を分析すると、測定可能なレベルのサイトカインは検出されなかった。ただし、レクチンとインキュベートした細胞は、明らかなＴ細胞の活性化を示した。
［抗原提示のためのＨＬＡ－ＤＲ制限］
抗原提示がＨＬＡ－ＤＲ分子に関して媒介されることを確認するために、３人の応答性ドナー由来のＧＭＯＰ－ＩＦＮパルスした樹状細胞を、自己Ｔ細胞とのインキュベーションの前に抗ＤＲ抗体（２種類の濃度で）で処理した。ＩＦＮ－γ刺激指数（ＳＩ）の減少によって判断されるように、ＤＣが抗ＤＲ抗体で事前に処理された場合、より低いＴ細胞活性化が観察された（図６）。さらに、この効果は抗体の添加量を増やすとさらに顕著になり、ＨＬＡ－ＤＲ分子がＩＦＮ由来のペプチド提示とそれに伴うＴ細胞の活性化に不可欠な役割を担っていることが示された。
ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂの脱免疫化変異体によって提示される修飾／置換は、サイトカインの生物学的構造または機能に関与しないアミノ酸に対応することが明確にされるべきであろう。すなわち、この実験およびこれらの変異は、例えば以下の変異体を含む、本明細書に開示されるような修飾ＩＦＮ－α２ポリペプチド（または関連する修飾ＩＦＮ－α２化合物および組成物）のいずれに対しても実施することが可能である。例えば、ＩＦＮ－α２ｂ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、または１つ以上のＧＭＯＰ配列が付加しまたは付加していないＩＦＮ－α２（ＩＦＮ－α２ａ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ａ、ＩＦＮ－α２ｃ、およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｃを含む）の任意の他の変異体である。
（６）薬物動態プロファイル
バイオ医薬品の生物活性を測定して薬物動態を評価することは、採取した生体液中の活性を有するタンパク質画分を具体的に定量することができるため、貴重な情報を得ることができる。
［実施例６Ａ．ラットにおけるＩＦＮ－α変異体の比較薬物動態プロファイル］
ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂの配列に導入された脱免疫化変異がインビボでのタンパク質特性に及ぼす影響を評価するために、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂとその脱免疫化変異体の薬物動態パラメータを解析した。
生後２ヶ月、平均体重２００ｇの雌Ｗｉｓｔａｒラット（Center for Biological Experimentations and Bioterio, FCV-UNL）を用い、バイオリウム内で温度２４℃、明暗光周期１２時間に制御し、水と餌を無制限に与えて飼育した。ラットを８匹ずつのバッチに分け、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ（ＶＡＲ２）またはＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ（ＶＡＲ３）の単回投与（同じ質量単位）を皮下接種した。ラット血漿試料中のＩＦＮ－αの存在は、残存する抗ウイルス生物活性を評価することにより、異なる注入後時間に血液試料を採取することによってモニターした。試料を室温で１００×ｇで１０分間遠心分離し、血漿を分離し、さらなる分析のために－２０℃で保存した。次いで、血漿タンパク質濃度を時間に対してプロットした（図７）。
皮下接種後に調べたタンパク質の挙動は、一次過程として仮定できる吸収と***の過程を示した。このため、サイトカインの挙動を記述するために、全体の吸収速度と***速度の両方が一次過程として扱えるような数理モデルを作成する作業を行った。このようにして、実験データを、それを特徴づける定数の計算が可能な曲線に調整し、最終的に、表５に示す薬物動態学的パラメータを決定することができた。
データは、一次吸収・***動態を仮定したワンコンパートメントモデルを用いて解析した。ここで考慮した薬物動態パラメータは、最大血漿タンパク濃度（Ｃｍａｘ）、最大血漿タンパク濃度到達に要する時間（Ｔｍａｘ）、血漿タンパク濃度が初期値の５０％となる時間を指す終末半減期時間（ｔ１／２）、薬物クリアランス速度（ラット体内での薬物のバイオアベイラビリティを考慮しない）である見かけの血漿クリアランス（Ｃｌａｐｐ）であった。投与群間の差はＡＮＯＶＡ（ｐ≦０．０５）およびターキー検定により評価した。
表５に示すように、すべてのＩＦＮ－α２変異体は、同様の吸収および分布相を示し、それらの間に有意差はなかった。各タンパク質アナログが血漿中で最大の生物学的活性を達成した時間（Ｔｍａｘ）に有意差は示されず、サイトカインの初期分布段階は、サイトカイン野生型で記録された最大Ｔｖａｌｕｅ（０．６±０．３ｈ）より上で同様だろうということが示された。
***期に関しては、ＩＦＮ－α２の変異体間でｔ１／２の差は検出されず、いずれもＩＦＮ－２ｂ－ＷＴについて記述したもの（０．９±０．２ｈ）よりはるかに高い値であった。
しかし、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ－ＶＡＲ３では、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂと比較して血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）の著しい低下が観察された。これらのタンパク質の違いは、等電点アッセイ（図４）で証明された、タンパク質に付着したグリコシド構造の多様性に関連している可能性がある。
これらの結果から、糖鎖リッチペプチドをＩＦＮ－α２ｂ分子に結合させた結果得られた改善された薬物動態特性は、脱免疫化変異体にも維持されていることが示された。さらに、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ－ＶＡＲ３では、血漿クリアランス率のさらなる向上が検出された。
Figure 2023514659000006
ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂの脱免疫化変異体によって提示される修飾／置換は、サイトカインの生物学的構造または機能に関与しないアミノ酸に対応することが明確にされるべきであろう。すなわち、この実験およびこれらの変異は、例えば以下の変異体を含む、本明細書に開示されるような修飾ＩＦＮ－α２ポリペプチド（または関連する修飾ＩＦＮ－α２化合物および組成物）のいずれに対しても実施することが可能である。例えば、ＩＦＮ－α２ｂ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、または１つ以上のＧＭＯＰ配列が付加しまたは付加していないＩＦＮ－α２（ＩＦＮ－α２ａ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ａ、ＩＦＮ－α２ｃ、およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｃを含む）の任意の他の変異体である。
［実施例６Ｂ．他のインターフェロンと比較した、ラットにおけるＩＦＮ－α変異体の比較薬物動態プロファイル］
ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ配列に導入された脱免疫化変異がインビボのタンパク質特性に及ぼす影響を評価するために、高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂおよびその高グリコシル化脱免疫化変異体の薬物動態パラメータを分析する。ＰＥＧ化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体１～４（それぞれ配列番号２、４、６、および８）、非グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、および４Ｎ－ＩＦＮに関する薬物動態パラメータも分析される。
生後２ヶ月、平均体重２００ｇの雌Ｗｉｓｔａｒラット（Center for Biological Experimentations and Bioterio, FCV-UNL）を用い、バイオリウム内で温度２４℃、明暗光周期１２時間に制御し、水と餌を無制限に与えて飼育する。このラットを８匹ずつのバッチに分け、高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ（ＶＡＲ２），高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ（ＶＡＲ３）、ＰＥＧ化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体１～４、非グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、および４Ｎ－ＩＦＮを単回投与（同一質量単位）で皮下接種した。ラット血漿試料中のＩＦＮ－αの存在は、残存する抗ウイルス生物活性を評価することにより、異なる注射後時間に血液試料を採取することによってモニターされる。サンプルは、室温で１００ｘｇで１０分間遠心分離し、血漿を分離し、さらなる分析のために－２０℃で保存する。次に、血漿タンパク質濃度を、時間に対してプロットする。
血漿中のタンパク質の定量は、その生物活性の評価によって行われる。得られたデータを用いて、各サンプルの生物活性を分子接種からの経過時間に従ってプロットする。皮下接種後に調べたタンパク質の挙動は、一次過程と仮定できる吸収と***の過程を示している。そこで、サイトカインの挙動を記述するために、全体の吸収速度と***速度がともに一次過程として扱えるような数理モデルを構築している。このようにして、実験データを、それを特徴づける定数の計算が可能な曲線に調整し、最終的に薬物動態パラメータを決定する。
データは、一次吸収・***の動態を仮定したワンコンパートメントモデルを用いて解析している。ここで考慮した薬物動態パラメータは、最大血漿タンパク濃度（Ｃｍａｘ）、最大血漿タンパク濃度到達に要する時間（Ｔｍａｘ）、血漿タンパク濃度が初期値の５０％となる時間を指す終末半減期時間（ｔ１／２）、薬物クリアランス速度（ラット体内での薬物バイオアベイラビリティを考慮せず）である見かけの血漿クリアランス（Ｃｌａｐｐ）である。治療法間の差はＡＮＯＶＡ（ｐ≦０．０５）の後ターキー検定により評価した。
高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ（ＶＡＲ２）と高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ（ＶＡＲ３）は、同様の吸収・分布相を示し、両者に有意差はない。各タンパク質アナログが血漿中で最大の生物学的活性を獲得した時間（Ｔｍａｘ）に有意差は認められず、サイトカインの初期分布段階は、サイトカイン野生型で記録される最大Ｔｖａｌｕｅ以上で同様となることが示されている。逆に、ＰＥＧ化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体１－４、非グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、および４Ｎ－ＩＦＮは減少した最大Ｔｖａｌｕｅを示すことが予想される。
***期に関しては、高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ（ＶＡＲ２）と高グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ（ＶＡＲ３）にはｔ１／２の差が認められず、いずれもＩＦＮ－２ｂ－ＷＴについて述べたものよりはるかに高い値を示している。逆に、ＰＥＧ化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体１～４、非グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、及び４Ｎ－ＩＦＮは、ＩＦＮ－２ｂ－ＷＴに関して記述されたものより有意に低いｔ１／２を示すと期待される。
しかし、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ－ＶＡＲ３では、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂと比較して血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）の著しい低下が観察されている。これらのタンパク質の違いは、タンパク質に結合している糖鎖構造の多様性に関連していると思われる。一方、ＰＥＧ化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体１－４、非グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、４Ｎ－ＩＦＮでは高い血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）が予想される。
これらの結果から、糖鎖リッチペプチドをＩＦＮ－α２ｂ分子に結合させた結果得られる薬物動態の改善効果は、脱免疫化変異体にも維持され得ることが示されている。さらに、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ－ＶＡＲ３では、血漿クリアランス率のさらなる向上が検出された。逆に、脱免疫化変異体の薬物動態特性の改善は、ＰＥＧ化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＩＦＮ－α２ｂ、非グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ変異体１～４、非グリコシル化ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、および４Ｎ－ＩＦＮでは期待できないことが判明した。
ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－２ｂの脱免疫化変異体によって提示される修飾／置換は、サイトカインの生物学的構造または機能に関与しないアミノ酸に対応することが明確にされるべきであろう。すなわち、この実験およびこれらの変異は、例えば以下の変異体を含む、本明細書に開示されるような修飾ＩＦＮ－α２ポリペプチド（または関連する修飾ＩＦＮ－α２化合物および組成物）のいずれに対しても実施することが可能である。例えば、ＩＦＮ－α２ｂ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｂ、または１つ以上のＧＭＯＰ配列が付加しまたは付加していないＩＦＮ－α２（ＩＦＮ－α２ａ、ＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ａ、ＩＦＮ－α２ｃ、およびＧＭＯＰ－ＩＦＮ－α２ｃを含む）の任意の他の変異体である。
［同等品］
本願の開示は、その特定の態様に関連して説明されてきたが、それはさらなる変更が可能であることが理解されるであろう。さらに、本出願は、開示が関係する技術分野において公知または慣例的な実施に含まれ、添付の特許請求の範囲の範囲内に入るような本開示からの逸脱を含む、本発明の任意の変形、使用、または適応を対象とすることを意図している。

Claims (108)

  1. インターフェロン－α２活性を有する修飾インターフェロン－α２ポリペプチドであって、該ポリペプチドは、配列番号１２に対して少なくとも８０％の相同性を含むアミノ酸配列を含み、さらに９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に１または複数のアミノ酸置換を含み、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含む、ポリペプチド。
  2. インターフェロン－α２活性を有する修飾インターフェロン－α２ポリペプチドであって、該ポリペプチドは、配列番号１２に対して少なくとも８０％の相同性を含むアミノ酸配列を含み、さらに、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置において少なくとも５つのアミノ酸置換を含み、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含む、ポリペプチド。
  3. インターフェロン－α２活性を有する修飾インターフェロン－α２ポリペプチドであって、該ポリペプチドは、配列番号１２と少なくとも９０％の相同性を含むアミノ酸配列を含み、さらに９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置において１以上のアミノ酸置換を含み、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含む、ポリペプチド。
  4. インターフェロン－α２活性を有する修飾インターフェロン－α２ポリペプチドであって、該ポリペプチドは、配列番号１２と少なくとも９０％の相同性を含むアミノ酸配列を含み、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置において少なくとも５つのアミノ酸置換を含み、前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含む、ポリペプチド。
  5. 変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａを含む、請求項１～４のいずれか１項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  6. 変異１４７ＴおよびＬ１５７Ａをさらに含む、請求項５記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。Ｉ。
  7. 変異Ｎ６５ＡおよびＬ６６Ａをさらに含む、請求項５記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  8. 変異Ｌ１７Ａ、Ｉ１４７Ｔ、およびＬ１５７Ａをさらに含む、請求項７に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  9. 該ポリペプチドが、配列番号１２の野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して低下した免疫原性を有する、請求項１～８のいずれか一項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  10. 該ポリペプチドが、配列番号１２の野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して、５％～９５％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項１～９のいずれか一項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  11. 該ポリペプチドが、配列番号１２の野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して、１０％～９０％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項１～１０のいずれか一項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  12. 該ポリペプチドが、配列番号１２の野生型インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して、２０％～８０％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項１～１１のいずれか一項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  13. インターフェロン－α２活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号１０と少なくとも８０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変更することを含む、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  14. インターフェロン－α２活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号１０の少なくとも８０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変更することを含む、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  15. インターフェロン－α２活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号１０に対して少なくとも９０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変更することを含む、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  16. インターフェロン－α２活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号１０に対して少なくとも９０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変更することを含む、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  17. 変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａを含む、請求項１３～１６のいずれか１項に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  18. 変異Ｉ１６１ＴおよびＬ１７１Ａをさらに含む、請求項１７に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  19. 変異Ｎ７９ＡおよびＬ８０Ａをさらに含む、請求項１７に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  20. 変異Ｌ３１Ａ、Ｉ１６１Ｔ、およびＬ１７１Ａをさらに含む、請求項１９に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  21. 該ポリペプチドが、配列番号１０の野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して低下した免疫原性を有する、請求項１３～２０のいずれか一項に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  22. 該ポリペプチドが、配列番号１０の野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して、５％～９５％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項１３～２１のいずれか一項に記載の改変されたＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  23. 該ポリペプチドが、配列番号１０の野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して、１０％～９０％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項１３～２２のいずれか一項に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  24. 該ポリペプチドが、配列番号１０の野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｂポリペプチドと比較して、２０％～８０％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項１３～２３のいずれか一項に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  25. インターフェロン－α２活性を有する修飾インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号２２に対して少なくとも８０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変更することを含む、修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  26. インターフェロン－α２活性を有する修飾インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号２２に対して少なくとも８０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変えることを含む、修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  27. インターフェロン－α２活性を有する修飾インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号２２に対して少なくとも９０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変更することを含む、修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  28. インターフェロン－α２活性を有する修飾インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号２２に対して少なくとも９０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変えることを含む、修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  29. 変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａを含む、請求項２５～２８のいずれか一項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  30. 変異Ｉ１４７ＴおよびＬ１５７Ａをさらに含む、請求項２９に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  31. 変異Ｎ６５ＡおよびＬ６６Ａをさらに含む、請求項２９に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  32. 変異Ｌ１７Ａ、Ｉ１４７Ｔ、およびＬ１５７Ａをさらに含む、請求項３１に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  33. 該ポリペプチドが、配列番号２２の野生型インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して低下した免疫原性を有する、請求項２５～３２のいずれか一項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  34. 該ポリペプチドが、配列番号２２の野生型インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して、５％～９５％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項２５～３３のいずれか一項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  35. 該ポリペプチドが、配列番号２２の野生型インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して、１０％～９０％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項２５～３４のいずれか一項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  36. 該ポリペプチドが、配列番号２２の野生型インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して、２０％～８０％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項２５～３５のいずれか一項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  37. インターフェロン－α２活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号２１に対して少なくとも８０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は、前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシン、またはトレオニンに変更することを含む、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  38. インターフェロン－α２活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号２１に対して少なくとも８０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変えることを含む、ポリペプチド。
  39. インターフェロン－α２活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号２１に対して少なくとも９０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変更することを含む、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  40. インターフェロン－α２活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号２１に対して少なくとも９０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変えることを含む、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  41. 変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａを含む、請求項３７～４０のいずれか１項に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  42. 変異Ｉ１６１ＴおよびＬ１７１Ａをさらに含む、請求項４１に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  43. 変異Ｎ７９ＡおよびＬ８０Ａをさらに含む、請求項４１に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  44. 変異Ｌ３１Ａ、Ｉ１６１Ｔ、およびＬ１７１Ａをさらに含む、請求項４３に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  45. 該ポリペプチドが、配列番号２１の野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して低下した免疫原性を有する、請求項３７～４４のいずれか一項に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  46. 該ポリペプチドが、配列番号２１の野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して、５％～９５％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項３７～４５のいずれか一項に記載の改変されたＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  47. 該ポリペプチドが、配列番号２１の野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して、１０％～９０％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項３７～４６のいずれか一項に記載の改変されたＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  48. 該ポリペプチドが、配列番号２１の野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ａポリペプチドと比較して、２０％～８０％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項３７～４７のいずれか一項に記載の改変されたＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  49. インターフェロン－α２活性を有する修飾インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号２４に対して少なくとも８０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変更することを含む、修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  50. インターフェロン－α２活性を有する修飾インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号２４に対して少なくとも８０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変えることを含む、修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  51. インターフェロン－α２活性を有する修飾インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号２４に対して少なくとも９０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変更することを含む、修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  52. インターフェロン－α２活性を有する修飾インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号２４に対して少なくとも９０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、９、１７、４７、６５、６６、１１７、１２３、１２８、１４７、および１５７からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変えることを含む、修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  53. 変異Ｌ９Ａ、Ｆ４７Ａ、Ｌ１１７Ａ、Ｆ１２３Ａ、およびＬ１２８Ａを含む、請求項４９～５２のいずれか一項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  54. 変異Ｉ１４７ＴおよびＬ１５７Ａをさらに含む、請求項５３に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  55. 変異Ｎ６５ＡおよびＬ６６Ａをさらに含む、請求項５３に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  56. 変異Ｌ１７Ａ、Ｉ１４７Ｔ、およびＬ１５７Ａをさらに含む、請求項５５に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  57. 該ポリペプチドが、配列番号２４の野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して低下した免疫原性を有する、請求項４９～５６のいずれか一項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  58. 該ポリペプチドが、配列番号２４の野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して、５％～９５％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項４９～５７のいずれか一項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  59. 該ポリペプチドが、配列番号２４の野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して、１０％～９０％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項４９～５８のいずれか一項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  60. 該ポリペプチドが、配列番号２４の野生型インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して、２０％～８０％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項４９～５９のいずれか一項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  61. インターフェロン－α２活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号２３に対して少なくとも８０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変更することを含む、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  62. インターフェロン－α２活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号２３に対して少なくとも８０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変更することを含む、ポリペプチド。
  63. インターフェロン－α２活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号２３に対して少なくとも９０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に１つ以上のアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変更することを含む、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  64. インターフェロン－α２活性を有する修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチドであって、配列番号２３に対して少なくとも９０％の相同性を有するアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、２３、３１、６１、７９、８０、１３１、１３７、１４２、１６１、および１７１からなるセットから選択されるいずれかの位置に少なくとも５つのアミノ酸置換を含み、ここで前記置換は前記位置のアミノ酸をアラニン、グリシンまたはトレオニンに変えることを含む、修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  65. 変異Ｌ２３Ａ、Ｆ６１Ａ、Ｌ１３１Ａ、Ｆ１３７Ａ、およびＬ１４２Ａを含む、請求項６１～６４のいずれか１項に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  66. 変異Ｉ１６１ＴおよびＬ１７１Ａをさらに含む、請求項６５に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  67. 変異Ｎ７９ＡおよびＬ８０Ａをさらに含む、請求項６５に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  68. 変異Ｌ３１Ａ、Ｉ１６１Ｔ、およびＬ１７１Ａをさらに含む、請求項６７に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  69. 該ポリペプチドが、配列番号２３の野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して低下した免疫原性を有する、請求項６１～６８のいずれか一項に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  70. 該ポリペプチドが、配列番号２３の野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して、５％～９５％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項６１～６９のいずれか一項に記載の改変されたＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  71. 該ポリペプチドが、配列番号２３の野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して、１０％～９０％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項６１～７０のいずれか一項に記載の改変されたＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  72. 該ポリペプチドが、配列番号２３の野生型ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ｃポリペプチドと比較して、２０％～８０％の相対的抗ウイルス活性を有する、請求項６１～７１のいずれか一項に記載の改変されたＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  73. 該ポリペプチドが２０％未満のパーセント抗増殖生物活性を有する、請求項１～７２のいずれか１項に記載の修飾ＧＭＯＰ－インターフェロン－α２ポリペプチド。
  74. 該ポリペプチドが１０％未満のパーセント抗増殖生物活性を有する、請求項１～７３のいずれか一項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  75. 該ポリペプチドが５％未満のパーセント抗増殖生物活性を有する、請求項１～７４のいずれか１項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  76. 該ポリペプチドが１１５ｍＬ／ｈ未満の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している、請求項１～７５のいずれか１項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  77. 該ポリペプチドが５０ｍＬ／ｈ未満の見かけの血漿クリアランス速度（Ｃｌａｐｐ）を有している、請求項１～７６のいずれか１項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  78. 該ポリペプチドが高グリコシル化されている、請求項１～７７のいずれか１項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチド。
  79. 請求項１～７８のいずれか１項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの１つまたは複数をコードする核酸。
  80. 配列番号１の核酸配列を含む、請求項７９に記載の核酸。
  81. 配列番号３の核酸配列を含む請求項７９に記載の核酸。
  82. 配列番号５の核酸配列を含む、請求項７９に記載の核酸。
  83. 配列番号７の核酸配列を含む、請求項７９に記載の核酸。
  84. 配列番号１３の核酸配列を含む、請求項７９に記載の核酸。
  85. 配列番号１５の核酸配列を含む、請求項７９に記載の核酸。
  86. 配列番号１７の核酸配列を含む、請求項７９に記載の核酸。
  87. 配列番号１９の核酸配列を含む、請求項７９に記載の核酸。
  88. 請求項７９～８７のいずれか１項に記載の核酸の１つ以上の核酸配列を含むプラスミド。
  89. 請求項１～７８のいずれか１項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの１つまたは複数をコードするプラスミド。
  90. 請求項７９～８７のいずれか１項に記載の核酸配列の１つまたは複数を含むベクター。
  91. 請求項１～７８のいずれか１項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの１つまたは複数をコードするベクター。
  92. 請求項７９～８７のいずれか１項に記載の核酸配列を含む、細胞株。
  93. 請求項８８～８９のいずれか１項に記載のプラスミドを含む、細胞株。
  94. 請求項９０～９１のいずれか１項に記載のベクターを含む、細胞株。
  95. 細胞株が、請求項１～７７のいずれか１項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの１つまたは複数の生産に適している、請求項９２～９４のいずれか１項に記載の細胞株。
  96. 細胞株が、ＣＨＯ－Ｋ１、ＨＥＫ２９３、ＮＳ０、ＢＨＫ、Ｓｐ２／０、ＣＡＰ、およびＣＡＰ／Ｔからなる群から選択される、請求項９２～９５のいずれか１項に記載の細胞株。
  97. 細胞株がＣＨＯ－Ｋ１である、請求項９２～９６のいずれか１項に記載の細胞株。
  98. 請求項１～７８のいずれか１項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドを精製する方法であって、前記遺伝子修飾インターフェロン－α２ポリペプチドをイムノアフィニティークロマトグラフィーによって精製することを含む、方法。
  99. イムノアフィニティークロマトグラフィーによる前記精製が、抗非グリコシル化ｒｈＩＦＮ－α２ｂ ｍＡｂ ＣＡ５Ｅ６抗体の使用を含んでなる、請求項９８に記載の方法。
  100. イムノアフィニティークロマトグラフィーによる前記精製が、抗ｈＧＭ－ＣＳＦモノクローナル抗体の使用を含む、請求項９８～９９のいずれか一項に記載の方法。
  101. 請求項１～７８のいずれか１項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの１つまたは複数の治療有効量を含む、医薬組成物。
  102. 請求項７９～８７のいずれか１項に記載の１つまたは複数の核酸の治療有効量を含む医薬組成物。
  103. 請求項８８～８９のいずれか１項に記載の１つ以上のプラスミドの治療的有効量を含む、医薬組成物。
  104. 請求項９０～９１のいずれか１項に記載の１つ以上のベクターの治療的有効量を含む、医薬組成物。
  105. 請求項１～７８のいずれか１項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの１つ以上の、１つ以上の疾患の治療のための使用方法。
  106. １つ以上の疾患が、メラノーマ（悪性黒色腫を含む）、急性及び慢性Ｃ型肝炎（代償性肝疾患の患者を含む）、急性及び慢性Ｂ型肝炎、急性及び慢性非Ａ、非Ｂ型肝炎、カポジ肉腫（ＡＩＤＳ関連カポジ肉腫を含む）、多発性硬化症、性器いぼ、白血病（有毛細胞白血病を含む）、リンパ腫（濾胞性リンパ腫を含む）、尖圭コンジローム、ＳＡＲＳ－ＣＯＶ－２感染、ＺＩＫＶ感染、ＣＨＩＫＶ感染又はインフルエンザＡ感染を含む、請求項１０５に記載の使用方法。
  107. 請求項１～７８のいずれか１項に記載の修飾インターフェロン－α２ポリペプチドの１または複数を治療有効量で投与し、投与する前記ステップによって対象における医学的状態を治療することを含む、対象における医学的状態を治療する方法。
  108. 前記状態が、メラノーマ（悪性黒色腫を含む）、急性及び慢性Ｃ型肝炎（代償性肝疾患の患者を含む）、急性および慢性Ｂ型肝炎、急性および慢性非Ａ、非Ｂ型肝炎、カポジ肉腫（ＡＩＤＳ関連カポジ肉腫を含む）、多発性硬化症、性器いぼ、白血病（有毛細胞白血病を含む）、リンパ腫（濾胞性リンパ腫を含む）、尖圭コンジローム、ＳＡＲＳ－ＣＯＶ－２感染、ＺＩＫＶ感染、ＣＨＩＫＶ感染又はインフルエンザＡ感染を含む、請求項１０７に記載の方法。
JP2022537837A 2019-12-17 2020-12-16 免疫原性が低下した修飾インターフェロン－アルファ－２ Pending JP2023514659A (ja)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
AR20190103715 2019-12-17
ARP190103715A AR117715A1 (es) 2019-12-17 2019-12-17 Interferón hiperglicosilado con inmunogenicidad reducida
PCT/US2020/065246 WO2021126929A1 (en) 2019-12-17 2020-12-16 Modified interferon-alpha-2 having reduced immunogenicity

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JP2023514659A true JP2023514659A (ja) 2023-04-07
JPWO2021126929A5 JPWO2021126929A5 (ja) 2023-12-25

Family

ID=76478524

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2022537837A Pending JP2023514659A (ja) 2019-12-17 2020-12-16 免疫原性が低下した修飾インターフェロン－アルファ－２

Country Status (7)

Country Link
US (1) US20230127506A1 (ja)
EP (1) EP4076504A4 (ja)
JP (1) JP2023514659A (ja)
AR (1) AR117715A1 (ja)
BR (1) BR112022011975A2 (ja)
MX (1) MX2022007546A (ja)
WO (1) WO2021126929A1 (ja)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20240067691A1 (en) 2022-08-18 2024-02-29 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Interferon receptor agonists and uses thereof
WO2024040247A1 (en) 2022-08-18 2024-02-22 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Interferon proproteins and uses thereof
CN116814595B (zh) * 2023-08-30 2023-11-28 江苏申基生物科技有限公司 一种腺苷脱氨酶突变体及其固定化

Family Cites Families (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2003129056A (ru) * 2001-03-02 2005-04-20 Мерк Патент ГмбХ (DE) Модифицированный интерферон альфа с уменьшенной иммуногенностью
KR20070085227A (ko) * 2004-08-09 2007-08-27 앨리오스 바이오파마 인크. 합성 초글리코실화, 프로테아제 저항성 폴리펩티드 변이체,경구 제제 및 이를 이용한 방법
AU2006255122B2 (en) * 2005-06-03 2010-10-21 Ambrx, Inc. Improved human interferon molecules and their uses
AU2006263331B2 (en) * 2005-06-29 2012-02-16 Yeda Research And Development Co. Ltd. At The Weizmann Institute Of Science Recombinant interferon alpha2 (IFNalpha2) mutants
US20080260820A1 (en) * 2007-04-19 2008-10-23 Gilles Borrelly Oral dosage formulations of protease-resistant polypeptides
BR112017008880A2 (pt) * 2014-10-29 2018-07-10 Teva Pharmaceuticals Australia Pty Ltd variantes de interferon a2b
AR102120A1 (es) * 2015-09-29 2017-02-08 Univ Nac Del Litoral Interferón modificado con inmunogenicidad reducida
WO2019147837A2 (en) * 2018-01-24 2019-08-01 Beijing Percans Oncology Co. Ltd. Cytokine fusion proteins

Also Published As

Publication number Publication date
AR117715A1 (es) 2021-08-25
MX2022007546A (es) 2022-11-30
EP4076504A1 (en) 2022-10-26
US20230127506A1 (en) 2023-04-27
WO2021126929A1 (en) 2021-06-24
EP4076504A4 (en) 2024-04-10
BR112022011975A2 (pt) 2022-08-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11041007B2 (en) Modified interleukin-7 protein
JP2023514659A (ja) 免疫原性が低下した修飾インターフェロン－アルファ－２
JP5396358B2 (ja) インターフェロン−β−１ａのポリマー結合体および使用
JP4988562B2 (ja) 安定化したインターフェロン液体製剤
ES2353006T3 (es) Fármaco de il-7, composición que comprende il-7, preparación y usos de los mismos.
JPH07503851A (ja) 改良インターフェロン及びヒトの末梢血液白血球からのその製造方法
EP2572734A2 (en) Cytokine-based fusion proteins for treatment of immune disorders
EP2633865A1 (en) Use of interleukin-22 in treating viral hepatitis
JP2008545393A (ja) 進歩したインターフェロンαポリペプチド
US7335727B2 (en) Pharmaceutical used for treating HIV infection, the composition and uses thereof
Mufarrege et al. De-immunized and Functional Therapeutic (DeFT) versions of a long lasting recombinant alpha interferon for antiviral therapy
Giorgetti et al. Development of highly stable and de-immunized versions of recombinant alpha interferon: promising candidates for the treatment of chronic and emerging viral diseases
JP2004537964A (ja) インターフェロン、それに関する使用及び組成物
US7595039B2 (en) Methods of healing wounds by administering human IL-18
US20240101629A1 (en) Use of interleukin-7 for the treatment of coronavirus
CA2644127A1 (fr) Variants ameliores de l'interferon-gamma humain (ifny)
US20050008616A1 (en) Recombinant human interferon-beta-1b polypeptides
TW202143996A (zh) 使用可溶性ｃｄ２４治療病毒性肺炎之方法
JP2000515007A (ja) Ｔ細胞選択的インターロイキン―４アゴニスト
Bakhiet Cytokines as Novel Therapeutic Agents for Neuroinflammatory Disorders: A Role for Interferon- in the Treatment of Multiple Sclerosis
CA2495480A1 (en) Interferon and immunoglobulin fc fragment hybrid

Legal Events

Date Code Title Description
A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20231215

A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20231215