JP2022513599A - Staphylococcus細菌の栄養要求性株 - Google Patents
Staphylococcus細菌の栄養要求性株 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2022513599A JP2022513599A JP2021526566A JP2021526566A JP2022513599A JP 2022513599 A JP2022513599 A JP 2022513599A JP 2021526566 A JP2021526566 A JP 2021526566A JP 2021526566 A JP2021526566 A JP 2021526566A JP 2022513599 A JP2022513599 A JP 2022513599A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- alanine
- staphylococcus
- recombinant
- staphylococcus bacterium
- knockout
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 241000191940 Staphylococcus Species 0.000 title claims abstract description 48
- QNAYBMKLOCPYGJ-UWTATZPHSA-N D-alanine Chemical compound C[C@@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-UWTATZPHSA-N 0.000 claims abstract description 46
- QNAYBMKLOCPYGJ-UHFFFAOYSA-N D-alpha-Ala Natural products CC([NH3+])C([O-])=O QNAYBMKLOCPYGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 45
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 30
- 108010041525 Alanine racemase Proteins 0.000 claims abstract description 19
- 208000010201 Exanthema Diseases 0.000 claims abstract description 17
- 201000005884 exanthem Diseases 0.000 claims abstract description 17
- 206010037844 rash Diseases 0.000 claims abstract description 17
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 16
- 108010078895 D-Alanine Transaminase Proteins 0.000 claims abstract description 15
- 241000191963 Staphylococcus epidermidis Species 0.000 claims abstract description 12
- 230000012010 growth Effects 0.000 claims abstract description 7
- 150000008541 D-alanines Chemical class 0.000 claims abstract description 3
- 150000001294 alanine derivatives Chemical class 0.000 claims abstract description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims abstract description 3
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 claims description 40
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 claims description 35
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims description 11
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims description 11
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 10
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 claims description 9
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 6
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 claims description 5
- 229940076838 Immune checkpoint inhibitor Drugs 0.000 claims description 3
- 239000012274 immune-checkpoint protein inhibitor Substances 0.000 claims description 3
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims description 3
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 claims description 3
- 101800003838 Epidermal growth factor Proteins 0.000 claims description 2
- 229940116977 epidermal growth factor Drugs 0.000 claims description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims description 2
- VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N uroanthelone Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O)C(C)C)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CS)NC(=O)CNC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O)C(C)C)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N 0.000 claims description 2
- 102000009024 Epidermal Growth Factor Human genes 0.000 claims 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 abstract description 5
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 33
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 24
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 17
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 17
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 16
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 12
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 10
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 10
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 10
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 10
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 10
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 10
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 9
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 9
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 9
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 8
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 6
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 6
- 238000003209 gene knockout Methods 0.000 description 6
- MSFSPUZXLOGKHJ-UHFFFAOYSA-N Muraminsaeure Natural products OC(=O)C(C)OC1C(N)C(O)OC(CO)C1O MSFSPUZXLOGKHJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 108010013639 Peptidoglycan Proteins 0.000 description 5
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 5
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 5
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 5
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 4
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 4
- WHUUTDBJXJRKMK-GSVOUGTGSA-N D-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-GSVOUGTGSA-N 0.000 description 4
- 229930182847 D-glutamic acid Natural products 0.000 description 4
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 4
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 4
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 4
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 4
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 4
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 4
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 4
- 241000894007 species Species 0.000 description 4
- OFVLGDICTFRJMM-WESIUVDSSA-N tetracycline Chemical compound C1=CC=C2[C@](O)(C)[C@H]3C[C@H]4[C@H](N(C)C)C(O)=C(C(N)=O)C(=O)[C@@]4(O)C(O)=C3C(=O)C2=C1O OFVLGDICTFRJMM-WESIUVDSSA-N 0.000 description 4
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 4
- 108010082126 Alanine transaminase Proteins 0.000 description 3
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 3
- 201000004624 Dermatitis Diseases 0.000 description 3
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 3
- 108700016167 Glutamate racemases Proteins 0.000 description 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 3
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 3
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 3
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 3
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 3
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 3
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 3
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 2
- 102000008096 B7-H1 Antigen Human genes 0.000 description 2
- 108010074708 B7-H1 Antigen Proteins 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- 102000001301 EGF receptor Human genes 0.000 description 2
- 108060006698 EGF receptor Proteins 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- 239000005551 L01XE03 - Erlotinib Substances 0.000 description 2
- 241000186779 Listeria monocytogenes Species 0.000 description 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 2
- 102100040678 Programmed cell death protein 1 Human genes 0.000 description 2
- 101710089372 Programmed cell death protein 1 Proteins 0.000 description 2
- 208000003251 Pruritus Diseases 0.000 description 2
- 241000191965 Staphylococcus carnosus Species 0.000 description 2
- 241001147691 Staphylococcus saprophyticus Species 0.000 description 2
- 241000191978 Staphylococcus simulans Species 0.000 description 2
- 241000192086 Staphylococcus warneri Species 0.000 description 2
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 2
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 2
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 2
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 2
- 229960005091 chloramphenicol Drugs 0.000 description 2
- WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N chloramphenicol Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N[C@H](CO)[C@H](O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N 0.000 description 2
- 101150012893 dat gene Proteins 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 2
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 2
- 229940121647 egfr inhibitor Drugs 0.000 description 2
- AAKJLRGGTJKAMG-UHFFFAOYSA-N erlotinib Chemical compound C=12C=C(OCCOC)C(OCCOC)=CC2=NC=NC=1NC1=CC=CC(C#C)=C1 AAKJLRGGTJKAMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 2
- XGALLCVXEZPNRQ-UHFFFAOYSA-N gefitinib Chemical compound C=12C=C(OCCCN3CCOCC3)C(OC)=CC2=NC=NC=1NC1=CC=C(F)C(Cl)=C1 XGALLCVXEZPNRQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960002989 glutamic acid Drugs 0.000 description 2
- 230000000415 inactivating effect Effects 0.000 description 2
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 2
- 230000007803 itching Effects 0.000 description 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 2
- 238000001823 molecular biology technique Methods 0.000 description 2
- 229960001972 panitumumab Drugs 0.000 description 2
- NGVDGCNFYWLIFO-UHFFFAOYSA-N pyridoxal 5'-phosphate Chemical compound CC1=NC=C(COP(O)(O)=O)C(C=O)=C1O NGVDGCNFYWLIFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000009469 supplementation Effects 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- MKLSLVKLQOIPCY-QRLADXQJSA-N (2r)-2-aminopropanoic acid Chemical compound C[C@@H](N)C(O)=O.C[C@@H](N)C(O)=O MKLSLVKLQOIPCY-QRLADXQJSA-N 0.000 description 1
- 241000158640 Acanthodactylus aureus Species 0.000 description 1
- 208000002874 Acne Vulgaris Diseases 0.000 description 1
- 201000004384 Alopecia Diseases 0.000 description 1
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 1
- 102000016938 Catalase Human genes 0.000 description 1
- 108010053835 Catalase Proteins 0.000 description 1
- 108010016626 Dipeptides Proteins 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 102400001368 Epidermal growth factor Human genes 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- 102000037984 Inhibitory immune checkpoint proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091008026 Inhibitory immune checkpoint proteins Proteins 0.000 description 1
- 229930010555 Inosine Natural products 0.000 description 1
- UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N Inosine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- 239000005411 L01XE02 - Gefitinib Substances 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 108091005461 Nucleic proteins Proteins 0.000 description 1
- 206010033733 Papule Diseases 0.000 description 1
- 201000004681 Psoriasis Diseases 0.000 description 1
- 108090001066 Racemases and epimerases Proteins 0.000 description 1
- 206010037876 Rash papular Diseases 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- 206010040844 Skin exfoliation Diseases 0.000 description 1
- 241000458595 Staphylococcus agnetis Species 0.000 description 1
- 241000461232 Staphylococcus argenteus Species 0.000 description 1
- 241001147686 Staphylococcus arlettae Species 0.000 description 1
- 241001147687 Staphylococcus auricularis Species 0.000 description 1
- 241001147736 Staphylococcus capitis Species 0.000 description 1
- 241001147695 Staphylococcus caprae Species 0.000 description 1
- 241000201854 Staphylococcus chromogenes Species 0.000 description 1
- 241001147698 Staphylococcus cohnii Species 0.000 description 1
- 241001220267 Staphylococcus condimenti Species 0.000 description 1
- 241000520126 Staphylococcus delphini Species 0.000 description 1
- 241001617353 Staphylococcus fleurettii Species 0.000 description 1
- 241000192085 Staphylococcus gallinarum Species 0.000 description 1
- 241000191984 Staphylococcus haemolyticus Species 0.000 description 1
- 241000192087 Staphylococcus hominis Species 0.000 description 1
- 241001379473 Staphylococcus leei Species 0.000 description 1
- 241000147121 Staphylococcus lentus Species 0.000 description 1
- 241000010986 Staphylococcus lutrae Species 0.000 description 1
- 241000507187 Staphylococcus massiliensis Species 0.000 description 1
- 241000937219 Staphylococcus microti Species 0.000 description 1
- 241000192101 Staphylococcus muscae Species 0.000 description 1
- 241001582999 Staphylococcus nepalensis Species 0.000 description 1
- 241001642616 Staphylococcus schweitzeri Species 0.000 description 1
- 241000192097 Staphylococcus sciuri Species 0.000 description 1
- 241000967959 Staphylococcus simiae Species 0.000 description 1
- 241001503679 Staphylococcus stepanovicii Species 0.000 description 1
- 241000861996 Staphylococcus succinus Species 0.000 description 1
- 241001234013 Staphylococcus vitulinus Species 0.000 description 1
- 108700009124 Transcription Initiation Site Proteins 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 206010000496 acne Diseases 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 1
- 231100000360 alopecia Toxicity 0.000 description 1
- 230000001195 anabolic effect Effects 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 230000000844 anti-bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 1
- 208000010668 atopic eczema Diseases 0.000 description 1
- 208000037896 autoimmune cutaneous disease Diseases 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 230000006696 biosynthetic metabolic pathway Effects 0.000 description 1
- 230000001925 catabolic effect Effects 0.000 description 1
- 229960005395 cetuximab Drugs 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 1
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229940127089 cytotoxic agent Drugs 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 230000035618 desquamation Effects 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 229940082789 erbitux Drugs 0.000 description 1
- 229960001433 erlotinib Drugs 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 239000012737 fresh medium Substances 0.000 description 1
- 229960002584 gefitinib Drugs 0.000 description 1
- 239000000710 homodimer Substances 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 230000002757 inflammatory effect Effects 0.000 description 1
- 229960003786 inosine Drugs 0.000 description 1
- 229940084651 iressa Drugs 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 1
- 208000002741 leukoplakia Diseases 0.000 description 1
- 230000033001 locomotion Effects 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 210000002200 mouth mucosa Anatomy 0.000 description 1
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 101710135378 pH 6 antigen Proteins 0.000 description 1
- 208000012963 papular rash Diseases 0.000 description 1
- 230000004260 plant-type cell wall biogenesis Effects 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 235000007682 pyridoxal 5'-phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000011589 pyridoxal 5'-phosphate Substances 0.000 description 1
- 229960001327 pyridoxal phosphate Drugs 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 201000000306 sarcoidosis Diseases 0.000 description 1
- 239000013605 shuttle vector Substances 0.000 description 1
- 208000017520 skin disease Diseases 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 229940120982 tarceva Drugs 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 1
- 229940121358 tyrosine kinase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 239000005483 tyrosine kinase inhibitor Substances 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/90—Isomerases (5.)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K35/00—Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
- A61K35/66—Microorganisms or materials therefrom
- A61K35/74—Bacteria
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/02—Bacterial antigens
- A61K39/085—Staphylococcus
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
- C12N1/205—Bacterial isolates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/74—Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1096—Transferases (2.) transferring nitrogenous groups (2.6)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y206/00—Transferases transferring nitrogenous groups (2.6)
- C12Y206/01—Transaminases (2.6.1)
- C12Y206/01021—D-Amino-acid transaminase (2.6.1.21), i.e. D-alanine aminotransferase/transaminase or D-aspartic aminotransferase/transaminase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y501/00—Racemaces and epimerases (5.1)
- C12Y501/01—Racemaces and epimerases (5.1) acting on amino acids and derivatives (5.1.1)
- C12Y501/01001—Alanine racemase (5.1.1.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
- C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
- C12R2001/01—Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
- C12R2001/44—Staphylococcus
- C12R2001/45—Staphylococcus epidermidis
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Virology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
Abstract
Description
本出願は、2018年11月16日出願の米国仮特許出願第62/768,485号(その内容全体は、全ての目的のためにその全体において本明細書に参考として援用される)の利益を主張する。
アラニンラセマーゼは、細菌細胞壁におけるペプチドグリカン層の生合成において重要な構築ブロックである、l-アラニンをd-アラニンに変換することを触媒するピリドキサールリン酸含有ホモダイマー酵素である。アラニンラセマーゼは、代表的には、真核生物には存在しないが、原核生物の中では広範に分布し、これは、この酵素を、新規な抗菌物質の開発のための魅力的な標的にしている。
従って、本開示は、成長に関してD-アラニンに依存するStaphylococcus細菌の必要性に対処する。
本開示は、成長に関してD-アラニンに依存する組換えStaphylococcus細菌に関する。
I.定義
別段定義されなければ、本明細書で使用される全ての技術用語および科学用語は、本発明が属する分野の当業者によって一般に理解される意味を有する。以下の参考文献は、本発明において使用される用語のうちの多くの一般的な定義を、当業者に提供する: Singletonら, Dictionary of Microbiology and Molecular Biology(第2版. 1994); The Cambridge Dictionary of Science and Technology(Walker編, 1988); The Glossary of Genetics, 第5版, R. Riegerら(編), Springer Verlag(1991);およびHale & Marham, The Harper Collins Dictionary of Biology(1991)。本明細書で使用される場合、以下の用語は、別段特定されなければ、以下に帰する意味を有する。
本開示は、D-アラニン栄養要求性株である三重ノックアウトStaphylococcus細菌を記載する。本開示は、二重アラニンラセマーゼ遺伝子ノックアウトおよびアラニンアミノトランスフェラーゼ遺伝子(dat, SE1423)ノックアウトを有するように遺伝的に変化している、操作されたStaphylococcus細菌(例えば、Staphylococcus epidermidisのような)を提供する。本開示は、所望のD-アラニン栄養要求性を有する三重ノックアウトS.epidermidis株(SEΔalr1Δalr2Δdat)を提供する。
本発明は、遺伝的に変化した微生物、例えば、細菌を提供する。本明細書で記載される方法は、任意のStaphylococcus細菌細胞において、その細胞におけるdatのタンパク質ホモログをコードする遺伝子を不活性化もしくはノックアウトすることによって、またはこのタンパク質の発現もしくは活性を別の方法で不活性化することによって行われる得ることが企図される。株をStaphylococcus属に割り当てることは、クラスターを形成し、カタラーゼを生成し、適切な細胞壁構造を有する(ペプチドグリカンタイプおよびタイコ酸の存在を含む)グラム陽性球菌およびDNAのG+C含有量が30~40モル%の範囲であることを必要とする。例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:S.aureus群(S.argenteus、S.aureus、S.schweitzeri、S.simiaeを含む); S.auricularis群(S.auricularisを含む); S.carnosus群(S.carnosus、S.condimenti、S.massiliensis、S.piscifermentans、S.simulansを含む); S.epidermidis群(S.capitis、S.caprae、S.epidermidis、S.saccharolyticusを含む); S.haemolyticus群(S.devriesei、S.haemolyticus、S.hominisを含む); S.hyicus-intermedius群(S.agnetis、S.chromogenes、S.felis、S.delphini、S.hyicus、S.intermedius、S.lutrae、S.microti、S.muscae、S.pseudintermedius、S.rostri、S.schleiferiを含む); S.lugdunensis群(S.lugdunensisを含む); S.saprophyticus群(S.arlettae、S.cohnii、S.equorum、S.gallinarum、S.kloosii、S.leei、S.nepalensis、S.saprophyticus、S.succinus、S.xylosusを含む); S.sciuri群(S.fleurettii、S.lentus、S.sciuri、S.stepanovicii、S.vitulinusを含む); S.simulans群(S.simulansを含む); S.warneri群(S.pasteuri、S.warneriを含む)。1つの実施形態において、Staphylococcus細菌は、Staphylococcus epidermidisである。
本発明は、標準的な分子生物学技術、例えば、(Sambrookら 2001)に記載されるものを利用する。pJB38(Bossら, 2013)は、pJB38(アレル交換E.coli-staphylococcalシャトルベクター)に基づき、機能性を改善するために、プラスミド上に追加のデザイン特徴をさらに含むノックアウトベクターのプラスミド骨格として使用した(Bose, J.Lら., Applied and environmental microbiology. 2013;79(7):2218-2224)。特異的プライマーを、SE1423ノックアウトを作製するためにデザインした(表1)。
本発明のStaphylococcus細菌を、疾患を処置するために、そのまま使用し得るか、または治療用ポリペプチドを発現するように改変され得る。1つの例では、本発明のStaphylococcus細菌は、皮膚の疾患または障害を処置するために使用され得る。別の実施形態において、本発明のStaphylococcus細菌は、皮膚の疾患または障害を処置するために治療用ポリペプチドまたはそのフラグメントを発現するように改変され得る。
本発明に従う使用のための製剤は、治療上有効な量の所望のポリペプチドを生成するために、任意の薬学的に有効な量の組換えStaphylococcus細菌、例えば、遺伝的に操作された微生物、例えば、細菌の重量で少なくとも約0.01%、約0.05%、約0.1%、約0.2%、約0.3%、約0.4%、約0.5%、約0.6%、約0.7%、約0.8%、約0.9%、約1.0%、約1.5%、約2.0%、約3.0%、約4.0%、約5.0%、約6.0%、約7.0%、約8.0%、約9.0%、約10.0%、約11.0%、約12.0%、約13.0%、約14.0%、約15.0%、約16.0%、約17.0%、約18.0%、約19.0%、約20.0%、約25.0%、約30.0%、約35.0%、約40.0%、約45.0%、約50.0%またはこれより多くを含み得、その上限は、遺伝的に操作された微生物、例えば、細菌の重量で約90.0%であることは、さらに明らかである
本開示は、(i)D-アラニンアミノトランスフェラーゼ(dat)ノックアウトを含むプラスミドを、Staphylococcus株のコンピテント細胞(SEΔalr1Δalr2)へと形質転換する工程;(ii)形質転換した細胞において上記ノックアウトプラスミドの存在を検出する工程;(iii)工程(ii)において識別した形質転換した細胞をインキュベートする工程;および(iv)単離したコロニーを精製する工程を包含する組換えStaphylococcus細菌を作製する方法を特徴とする。好ましい実施形態において、形質転換体におけるノックアウトプラスミドの存在は、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を使用して検出される。ある特定の実施形態において、上記方法は、D-アラニン栄養要求性に関して単離したコロニーを試験する工程をさらに包含する。
本発明はまた、キットを提供する。1つの局面において、本発明のキットは、(a)本発明の組換えStaphylococcus細菌および(b)その使用説明書を含む。本発明の組成物は、上で記載される。いくつかの実施形態において、本発明の組成物は、成長に関してD-アラニンに依存する組換えStaphylococcus細菌を含む。
pJB38(Bossら, 2013)を、ノックアウトベクターのプラスミド骨格として使用した。特異的プライマーを、SE1423ノックアウトを作製するために設計した(表1)。
Gm2163から単離したpJB-1423KOプラスミドを、TAS+クロラムフェニコール(10μg/mL)のプレートを使用して、S.epidermidis株のコンピテント細胞(SEΔalr1Δalr2)へと形質転換した。形質転換体におけるpJB-1423KOプラスミドの存在を、プライマー1423-5F(EcoRI)および1423-3R(SalI)を使用して、1.5KbのPCR生成物を検出することによって確認した。試験した全ての26個のクローンにおいて、1.5KbのPCR生成物を観察した一方で、2.3KbのPCR生成物を、SE宿主細胞に由来する細胞溶解物を含む反応において観察した。2つの確認したクローンの細胞は、TSA+Cm(10μg/mL)+D-アラニン(40μg/mL)の新しいプレート上で画線培養した。プレートを、相同組換えを介するプラスミド組み込みに関して、43℃において24時間、インキュベートした。単離したコロニーを、43℃において精製のために再び画線培養した。4個の単離されたコロニーを、2回目の相同組換えを介してプラスミド骨格を除外するために、250mL バッフル付き振盪フラスコ中で50mL TSB+D-アラニン(40μg/mL)へと接種した。その培養物を、30℃において24時間振盪した。0.5mL 培養物のアリコートを、50mL 新鮮培地を含むフラスコへと移した。移動を3回反復した。そのフラスコからの細胞を、TSA+アンヒドロテトラサイクリン(ATC 2μg/mL)+D-アラニン(DA, 40μg/mL)上でプレートした。30℃でのインキュベーションの2日後に、約100~200個のコロニーは、10-5希釈において100μlの培養物でプレートしたプレート上に形成された。上記コロニーのさらなる分析を、以下に記載する。
TSA+ATC+DAプレートからの合計25個の単離されたコロニーを、TASプレート上におよびTAS+ATC+DAプレート上にパッチ状にまとめた。プレートを、30℃において一晩インキュベートした。全てのクローンを、D-アラニン補充プレート(TSA+ATC+DA)上で十分に増殖させた。図1に示されるように、3個のクローン(#7、#12および#18)は、D-アラニン補充なしのTSA上では増殖できず、D-アラニン栄養要求性を示した。栄養要求性の表現型を、TSA+ATC+DAプレート上のパッチからの細胞をTSAプレート上で再びパッチ上にまとめたときに、再び観察した。TSA+ATC+DAプレートからの幾つかのクローンが、野生型SE1423遺伝子座を保持することが予測されたことに留意のこと。なぜなら第2回の相同組換えが、SE1423をノックアウトすることなく、プラスミド骨格の除去を生じ得たからである。
Claims (16)
- 組換えStaphylococcus細菌であって、
2種の不活性化アラニンラセマーゼ遺伝子(Δalr1Δalr2);および
不活性化D-アラニンアミノトランスフェラーゼ(dat)遺伝子、
を含む組換えStaphylococcus細菌。 - 前記Staphylococcus細菌は、成長に関してD-アラニンに依存する、請求項1に記載の組換えStaphylococcus細菌。
- 前記Staphylococcus細菌は、Staphylococcus epidermidis(S.epidermidis)およびその亜種である、請求項1に記載の組換えStaphylococcus細菌。
- 前記Staphylococcus細菌は、1またはこれより多くのさらなる変異をさらに含む、請求項1に記載の組換えStaphylococcus細菌。
- 組換えStaphylococcus細菌を作製する方法であって、前記方法は、
(i)D-アラニンアミノトランスフェラーゼ(dat)ノックアウトを含むプラスミドを、Staphylococcus株(SEΔalr1Δalr2)のコンピテント細胞に形質転換する工程;
(ii)形質転換した細胞において前記ノックアウトプラスミドの存在を検出する工程;
(iii)工程(ii)において識別された前記形質転換した細胞をインキュベートする工程;および
(iv)単離したコロニーを精製する工程、
を包含する方法。 - 前記単離したコロニーを、D-アラニン栄養要求性に関して試験する工程をさらに包含する、請求項5に記載の方法。
- 形質転換体におけるノックアウトプラスミドの存在は、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を使用して検出される、請求項5に記載の方法。
- 前記組換えStaphylococcus細菌は、Staphylococcus epidermidis(S.epidermidis)およびその亜種である、請求項5に記載の方法。
- 請求項5に記載の方法によって生成される、組換えStaphylococcus細菌。
- 請求項1~4または9のいずれか1項に記載の組換えStaphylococcus細菌を含むキット。
- 被験体において発疹を処置または防止する方法であって、前記方法は、前記被験体に、請求項1~4または9のいずれか1項に記載の組換えStaphylococcus細菌の集団を、前記被験体において発疹を処置または防止するために有効な量において投与する工程を包含する方法。
- 発疹を有する前記被験体は、がん処置を受けている最中である、請求項11に記載の方法。
- 前記がん処置は、放射線療法である、請求項12に記載の方法。
- 前記がん処置は、化学療法である、請求項12に記載の方法。
- 前記化学療法は、上皮増殖因子インヒビターを含む、請求項14に記載の方法。
- 前記化学療法は、チェックポイントインヒビターを含む、請求項14に記載の方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201862768485P | 2018-11-16 | 2018-11-16 | |
US62/768,485 | 2018-11-16 | ||
PCT/US2019/061439 WO2020102507A1 (en) | 2018-11-16 | 2019-11-14 | Auxotrophic strains of staphylococcus bacterium |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2022513599A true JP2022513599A (ja) | 2022-02-09 |
JPWO2020102507A5 JPWO2020102507A5 (ja) | 2022-11-17 |
Family
ID=70731220
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2021526566A Pending JP2022513599A (ja) | 2018-11-16 | 2019-11-14 | Staphylococcus細菌の栄養要求性株 |
Country Status (10)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20210269791A1 (ja) |
EP (1) | EP3880241A4 (ja) |
JP (1) | JP2022513599A (ja) |
KR (1) | KR20210092767A (ja) |
CN (1) | CN112969781A (ja) |
AU (1) | AU2019378003A1 (ja) |
BR (1) | BR112021007471A2 (ja) |
CA (1) | CA3120185A1 (ja) |
IL (1) | IL282681A (ja) |
WO (1) | WO2020102507A1 (ja) |
Family Cites Families (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6685943B1 (en) * | 1997-01-21 | 2004-02-03 | The Texas A&M University System | Fibronectin binding protein compositions and methods of use |
US6703025B1 (en) * | 1998-08-31 | 2004-03-09 | Inhibitex, Inc. | Multicomponent vaccines |
AU2001251370A1 (en) * | 2000-04-06 | 2001-10-23 | Pharmacia And Upjohn Company | Antimicrobial methods and materials |
EP3613430A2 (en) * | 2013-10-11 | 2020-02-26 | Servizo Galego De Saúde (Sergas) | Live attenuated vaccines |
EP3148569B1 (en) * | 2014-05-30 | 2022-07-06 | Azitra, Inc. | Therapeutic treatment of skin disease with recombinant commensal skin microorganisms |
CN115715781A (zh) * | 2015-05-05 | 2023-02-28 | 加利福尼亚大学董事会 | 抗微生物疗法 |
CN117866859A (zh) * | 2018-01-05 | 2024-04-12 | 阿兹特拉公司 | 葡萄球菌属细菌的营养缺陷型菌株 |
-
2019
- 2019-11-14 AU AU2019378003A patent/AU2019378003A1/en active Pending
- 2019-11-14 CN CN201980075152.9A patent/CN112969781A/zh active Pending
- 2019-11-14 EP EP19885205.5A patent/EP3880241A4/en active Pending
- 2019-11-14 KR KR1020217017945A patent/KR20210092767A/ko active Search and Examination
- 2019-11-14 JP JP2021526566A patent/JP2022513599A/ja active Pending
- 2019-11-14 WO PCT/US2019/061439 patent/WO2020102507A1/en unknown
- 2019-11-14 BR BR112021007471-6A patent/BR112021007471A2/pt unknown
- 2019-11-14 CA CA3120185A patent/CA3120185A1/en active Pending
-
2021
- 2021-04-27 IL IL282681A patent/IL282681A/en unknown
- 2021-05-14 US US17/320,987 patent/US20210269791A1/en active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP3880241A4 (en) | 2022-08-17 |
WO2020102507A8 (en) | 2020-07-16 |
CN112969781A (zh) | 2021-06-15 |
AU2019378003A1 (en) | 2021-05-20 |
IL282681A (en) | 2021-06-30 |
BR112021007471A2 (pt) | 2021-08-10 |
KR20210092767A (ko) | 2021-07-26 |
EP3880241A1 (en) | 2021-09-22 |
WO2020102507A1 (en) | 2020-05-22 |
CA3120185A1 (en) | 2020-05-22 |
US20210269791A1 (en) | 2021-09-02 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US6207384B1 (en) | Systematic identification of essential genes by in vitro transposon mutagenesis | |
Gottelt et al. | Deletion of a regulatory gene within the cpk gene cluster reveals novel antibacterial activity in Streptomyces coelicolor A3 (2) | |
WO2015133554A1 (ja) | 標的化したdna配列の核酸塩基を特異的に変換するゲノム配列の改変方法及びそれに用いる分子複合体 | |
JP2021509582A (ja) | ブドウ球菌(Staphylococcus)属細菌の栄養要求株 | |
US8911999B2 (en) | Self-deleting plasmid | |
Kwong et al. | Staphylococcus aureus multiresistance plasmid pSK41: analysis of the replication region, initiator protein binding and antisense RNA regulation | |
US20220145298A1 (en) | Compositions and methods for gene targeting using crispr-cas and transposons | |
He et al. | Roles of E. coli double-strand-break-repair proteins in stress-induced mutation | |
WO2018195136A1 (en) | Compositions and methods for regulated gene expression | |
Prather et al. | Identification and characterization of IS1 transposition in plasmid amplification mutants of E. coli clones producing DNA vaccines | |
Maksimenko et al. | Regulatory elements in vectors for efficient generation of cell lines producing target proteins | |
Ward et al. | Identification of cellular targets of a series of boron heterocycles using TIPA II—A sensitive target identification platform | |
CN110195070B (zh) | 大肠杆菌全局调控因子的突变基因crp及应用 | |
JP2022513599A (ja) | Staphylococcus細菌の栄養要求性株 | |
US20230114119A1 (en) | COMPOSITIONS AND METHODS COMPRISING IMPROVED GUIDE RNAs | |
KR20070007288A (ko) | 세포의 자발적 돌연변이율의 감소 | |
US6696268B1 (en) | Production and use of antimicrobial agents | |
Lehner et al. | mCloverBlaster: A tool to make markerless deletions and fusions using lambda red and I-SceI in Gram-negative bacterial genomes | |
RU2712838C1 (ru) | Генотерапевтический ДНК-вектор GDTT1.8NAS12, способ его получения, штамм Escherichia coli JM110-NAS, способ его получения, штамм Escherichia coli JM110-NAS/GDTT1.8NAS12, несущий генотерапевтический ДНК-вектор GDTT1.8NAS12, способ его получения, способ производства в промышленных масштабах генотерапевтического ДНК-вектора | |
Dümig et al. | Controlling fungal gene expression using the doxycycline-dependent Tet-ON system in Aspergillus fumigatus | |
Blanco et al. | Chromosomal Integrons are Genetically and Functionally Isolated Units of Genomes | |
Liu et al. | Nlp enhances biofilm formation by Yersinia pestis biovar microtus | |
Lim et al. | Transcriptional analysis of the iagB within Salmonella pathogenicity island 1 (SPI1) | |
CN116926068A (zh) | 转录中介体med31基因及其互作转录因子在提高三角褐指藻中岩藻黄素含量的应用 | |
CN112430550A (zh) | 一种调控蛋白降解诱导基因协同致死的菌株及应用和方法 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20221109 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20221109 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20231020 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20231025 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20240123 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20240325 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20240329 |